Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593 | Staphylococcus aureus strain GD705 chromosome, complete genome | 11 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,TnsE_C,WYL | 7 | 5 | 9 | 3 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019593_1 | 260724-260923 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP019593_1
>1.1|260755|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder GGCGAAAATACAGCTTACAATAATG >1.2|260811|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder TTGGAACAGCAATTTCTACAGACAA >1.3|260867|26|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder AGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_1
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_1 >merge|NZ_CP019593|1|260724-260923|CRISPRCasFinder GTTATATTGGCGGATCCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAATACAGCTTACAATAATGTGCGAGTTGGCAGGCCTCCAACACAGAGAAATTGGAACAGCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTAGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGGCCCCAACACAGAAGCT >NZ_CP019593|1|1|260724-260923|CRISPRCasFinder GTTATATTGGCGGATCCCCAACACAGAAGCT GGCGAAAATACAGCTTACAATAATG TGCGAGTTGGCAGGCCTCCAACACAGAGAAA TTGGAACAGCAATTTCTACAGACAA TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCT AGCGAAAAGTCAGCTTACAATAATGT GCAAGTTGGCGGGGGCCCCAACACAGAAGCT
>NZ_CP019593.2|WP_000164008.1|259221_260658_+|6-phospho-beta-glucosidase MTKLPQSFMWGGALAANQFEGGYDKGGKGLSVIDVMTSGAHGKARQITESIDPNHYYPNHEGIDFYHRYKEDIALFKEMGLKCLRTSIAWTRIFPNGDEDVPNEEGLAFYDRIFDELIAQGIEPVVTLSHFEMPLHLAKHYGGFRNREVVDYFVHFARVVFERYKDKVTYWMTFNEINNQMDTSNPIFLWTNSGVALTENDNPEEVLYQVAHHELLASALAVRLGKEINPKFKIGTMISHVPIYPYSCHPKDMMEAQIANRLRFFFPDVQVRGYYPSYAKKMLARKGYDVGWQEGDDSILQQGTVDYIGFSYYMSTAVKHDVNTTVENNIVNGGLNHSVENPHIATSDWGWAIDPDGLRYTLNVLYDRYQLPLFIVENGFGAVDEVVDGHIHDDYRIEYLKAHITAAIEAVDQDGVDLIGYTPWGIIDIVSFTTGEMKKRYGLIYVDRDNDGHGTMERLKKDSFYWYQQVIASNGDKL >NZ_CP019593.2|WP_000066924.1|258414_259206_+|hypothetical-protein MSNKYKDQAQDILTAVGGVENIVDVSYDTVRMTIHMHHAIPSTANEVTQIDGVASVDENETQLVIVFNEEVKYVYQQLQLLMDDAKHQEDTNHDAVDTQETEQKAQAKVTTPILVKAPIAGRRILLKEVRDSIFREKMVGEGLAIKAHKEFKVIAPFSGKVSMIVPTKHAVGIQSEDGVDIVIHIGVNTVDLEGKGFKCFVKQNDRVEAGQTLLQFDQQYIQEQGYNSDVIVVISNSSDFNKVELTMNEIITTEDVIFKIFKN >NZ_CP019593.2|WP_000922329.1|257561_258266_-|GntR-family-transcriptional-regulator MLKYEHIAKQLNAFIHQSNFKPGDKLPSVTQLKERYQVSKSTIIKALGLLEQDGLIYQAQGSGIYVRNIADANRINVFKTNGFSKSLGEHRMTSKVLVFKEIATPPKSVQDELQLNADDTVYYLERLRFVDDDVLCIEYSYYHKEIVKYLNDDIAKGSIFDYLESNMKLRIGFSDIFFNVDQLTSSEASLLQLSTGEPCLRYHQTFYTMTGKPFDSSDIVFHYRHAQFYIPSKK >NZ_CP019593.2|WP_000062646.1|255044_257336_+|nitric-oxide-reductase MSMQSSYKRLVKVLLTILVIVFSILLVGGWYIFKNEAPRPTKIVDQQGHTLVTKGELISGQAIYEKYGLTDYGSYLGNGSYLGPDYTAEALHHYLIGMRKYYAQDIYHKQLHKLNHVEIAVVKDKVMKEIRINRYSEKEDQLVLTPGQVYGLKYLQDYYKKEFVNNPKQVGLNENMIKQFQNDDYMVAGNKIEHLSQFFFWGAWLSSTDRPGKTFSYTNNWPYDVDAGNTLPSAGILWTAISVTLLIAGLAFIIYIQKRYEFDMKPTYESERELPKIEVDSKITDSQRKVGKYLVVVMLLFLVQILLGELLAHYYVENKFFGIEIQRLFPFNIVKTWHVQLVIFWVATTWLAAGIYIVPKVLGNEPKKQGVLVDILFWALIIVVMGSMIGEWSHILGWIDSHWWLFGHFGWEYIELGKFWQILFIVGMVLWVIILCRGFLPAIRNKVQVNHDKRHLLTLLFVGAIAIPLFYLASLFIMPNSHVTFADYWRWWIVHLWVEGIFEAFAVVLIGFLMVNMKLTTIETTIRALYFQLILLLGTGIVGMGHHYYWQGDHSIWLALGSCFSALEVVPLCLLIWEAYTHYRLYKKSDIAFPYKGTFIFLASTGLWNAIGAGALGFLINTPAVNYFEHGTQWTAAHAHGSMAGVYGMFSIAIALYVFKNITKKEFWTPKVEKWIKISCWALNVGLAGMVFVTLIPVGYIQLKDGLEDGYWHSRLTSFYEQPLVKAIMWGRMPWDIIFTVGVIILVVIFIRGYRHLKPKYRV >NZ_CP019593.2|WP_000607067.1|254002_254704_+|antiholin-like-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF >NZ_CP019593.2|WP_001792906.1|253566_254010_+|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MVVKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >NZ_CP019593.2|WP_000645457.1|252713_253454_+|DNA-binding-response-regulator MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKDDNSASTIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPAYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >NZ_CP019593.2|WP_000925394.1|250971_252711_+|sensor-histidine-kinase MLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >NZ_CP019593.2|WP_000608834.1|250035_250710_+|iron-sulfur-cluster-repair-di-iron-protein-ScdA MINKNDIVADVVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAASLEKKNVDLNELLQRLNEVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKETYDTFKNGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVDDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >NZ_CP019593.2|WP_000975356.1|248170_249892_+|glycosyltransferase-family-2-protein MMKFSVIVPTYNSEKYITELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTALLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTMKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKVEDQPQWINALGDFIQAVPVRVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGQYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLSVNANKQYRFNIMLEDIKAYLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISMKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMVMGMLSQTSENEVQILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >NZ_CP019593.2|WP_000031255.1|261233_261995_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKEAGHTFLAKLGKTRLRPGGKAATDWLIQQGAFSQDKHVLEVACNMCTTSIYLAHTYGCHIQGVDINKKALEKAQENISAAGLESYIQVQQANAVKLPFDDNQFDIVLNEAMLTMLPIAIKEKALREYYRVLKPGGILLTHDIVIVNESHATHVVKSLSAAINVNVSPQTKLGWLDLYHQAGFNHVHYHTGPMSLMTPKGLIYDEGIVGTIKIINNALKKENRPMFCKMFKTMTRLRKDMNYITFVAKKEH >NZ_CP019593.2|WP_000182750.1|262246_263161_-|ribokinase MTNKVVILGSTNVDQFLTVERYAQPGETLHVEEAQKAFGGGKGANQAIATARMQADTTFITKIGTDGVADFILEDFKAAHIDTSYIIKTTEEKTGQAFITVNAEGQNTIYVYGGANMTMTPEDVINAKDAIINADFVVAQLEIPIPAIISAFEIAKAHGVTTVLNPAPAKALPNELLSLIDIIVPNETEAELLSGIKVTNEQSMKDNANYFLSLGIKTVLITLGKQGTYFATKNQSQHIEAYKVNAIDTTAAGDTFIGAFVSRLNKSQDNLADAIDFGNKASSLTVQKHGAQASIPLLEEVNQV >NZ_CP019593.2|WP_000750483.1|263188_263593_-|D-ribose-pyranase MKKTAVLNEHISKAIATIGHFDLLTINDAGMPIPNDHRRIDLAVTKNLPRFIDVLATVLEEMEIQKIYLAEEIKEHNPTQLQQIKQLISSEIEIIFIPHEEMKSNLAHPLNKGNIRTGETTPYSNIALESNVTF >NZ_CP019593.2|WP_000029208.1|263607_264489_-|ribose-transporter-RbsU MSIVALLIGLGPLIGWGFFPTVASKFGGKPVHQIIGATVGTLIFAIILAVVTSSGFPTGTNLLFALLSGAGWGFGQIITFKAFELVGSSRAMPVTTAFQLLGASLWGVFALGNWPGIGHRIIGFTALVVILIGARMTVWSERKEASNAKNLRRAVVLLLIGEFGYWLYSAAPQATSIDGLTAFLPQAMGMVIVAVIYGFMNMKAENPFRNKITWLQIISGFFFAFGALTYLISAQPNMNGLATGFILSQTSVVLATLTGIYFLKQHKTSKEMVITIIGLVLILVAASVTVFIK >NZ_CP019593.2|WP_000757874.1|264720_265719_-|LacI-family-transcriptional-regulator MKKVSIKDVAREAGVSVTTVSHILNHNDSRFSATTIKNVHAVSECLGYAPNKHAKQLRGSKIQTIGVILPSLTNPFFSALMQSIHDHKPSDVDLCFLTSTATDLYDNIKHLIDRGIDGLIIAQYISSPDALNNYLKKHHVPYVVLDQNDHQGYTDFVRTNEYQGGQLAAQHLIELGHNNMMIVAPYDMMANMSTRVTGFVDTLRANQLPEPQIVHTELSKRGGLTIVDDIMVQSATAIFAINDELAIGILRGLIEHGISIPKDISLIGYDDIDYAAYVSPPLTTVAQPITDIGKTSLTLLLQRLQHLDKSIDMIELPTTLKIRATTGYHLSN >NZ_CP019593.2|WP_001159764.1|266099_266492_+|hypothetical-protein MQFKLKEEEIISFLELKYPEKEFEYGRLLVGQHKRDDLDVYYFGDTFLMCTIISFKTFEIKETVELSYDAVNRIVLKDGWLFRKMRIETMQKVLKYGTSKLMLTDFQKDNYNKYIQGQKQRVIFENGHFV >NZ_CP019593.2|WP_001066542.1|266620_267997_-|MFS-transporter MNNTQSSPRSNIIIAIMLSALTYWLFAQSFINIGPLVGQTYQTSPAVLNLSISLTSFATGIFMVAAGDIADKIGQLRMTYMGLIISMFASLLLIISDITALLIIGRILQGLSAAILLPSTVGVLNNQFKGDHLRRAISYLMISTVGGIGLAGVIGGLIATNFGWQTNFIISIVIAFIAILLLKGTPEKVSQHSHRHPFDYKGMSIFAVMIGSFTLLLTQGFEQGWFSTFSFICLSIIIITTLIFIIIERRHEVPFIDFSVLRNRPFIGAFLNNFVLNSGLGVTVVFFIYAQTHLGLSAAQSGLVTLPYAIVAVAMIRLGEKATLRFGGKLMLIIGPLFPVIGITIISMTSLQPSQYIIAVVIGFVICAIGNGLVATPGLTIAIFSMPNEKVGLATGLYKMSGTLGGAFGIALSTTVFSMLQLNYAPSVAATITFIVSIVLMILGSLSAYMIIPKTVKS >NZ_CP019593.2|WP_000337367.1|268230_269223_+|linear-amide-C-N-hydrolase MCTGFTIQTLNNQVLLGRTMDYDYPLDGSPAVTPRNYRWTSRTGTTGQTQYGFIGTGTDMEGFIYGDGVNEHGVAISTQYFRGYSSYGSIHKADAMNITQNEIVTWILGYTTSIEDMKQQASQIHVVAVYLNDIGEVPPLHYHVSDATGHSVEVSFKEGEVVIKDNPIGVLTNHPDLDWHYSNLRQYINISPYPAPANLLEGVTIEPLGNEAGTFGLPGGFTSTERFVRMAFMKANIAQNNDKEMDLMNAFYLLDAVNIPIGIVRPHDADNHYTMYQTVINLTTRTLYIKYYGSNEIVALKLTDDLINRKDMTIFKPEKHITIRKLNDNQ >NZ_CP019593.2|WP_000736798.1|269548_270499_+|glycine-glycine-endopeptidase-LytM MKKLTAAAIATMGFATFTMAHQADAAETTNTQQAHTQMSTQSQDVSYGTYYTIDSNGDYHHTPDGNWNQAMFDNKEYSYTFVDAQGHTHYFYNCYPKNANANGSGQTYVNPATAGDNNDYTASQSQQHINQYGYQSNVGPDASYYSHSNNNQAYNSHDGNGKVNYPNGTSNQNGGSASKATASGHAKDASWLTSRKQLQPYGQYHGGGAHYGVDYAMPENSPVYSLTDGTVVQAGWSNYGGGNQVTIKEANSNNYQWYMHNNRLTVSAGDKVKAGDQIAYSGSTGNSTAPHVHFQRMSGGIGNQYAVDPTSYLQSR >NZ_CP019593.2|WP_000570073.1|270550_271210_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEINNLSKRYRNKQIFNHLTMSFDSNRLTVLLGDNGAGKSTLLRMIAGIEKANDGTINYFGEKWNQRQIQNHIGYVPQDIALFEHMTVAENIKFFKSLCKNSINDTTINEYLQQLNFNDTSAKVSTLSGGNKRKINILVGLLGQPRILILDEPTVGIDLKSRHDIHQLLNIMKSKCLIILTTHHLDEVEALADDIKLIGQDPFYQHVLEDKQWAYTYY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_2 | 614719-614827 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019593_2
>2.1|614758|31|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder AGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_2
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_2 >merge|NZ_CP019593|2|614719-614827|CRISPRCasFinder AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTTAAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA >NZ_CP019593|2|2|614719-614827|CRISPRCasFinder AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA AGCCTCTAATCACTAGAGTTCAAGAGGCTTT AAAGGAACGCAGTTGGATGCTACCGCACAACTGCATAAA
>NZ_CP019593.2|WP_000901759.1|613913_614549_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIRPSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKAELRKELLTLKGIGSETADVLLVYIFERIEFIPDSYTRKIYNKLGYENTKSYDQLKKVITLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_CP019593.2|WP_001021133.1|611767_613429_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNILLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIVKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_CP019593.2|WP_072434949.1|611387_611771_+|DUF1934-family-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQATTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_CP019593.2|WP_001200750.1|610068_611079_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADVIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_CP019593.2|WP_016187113.1|609048_609570_+|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKVILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_CP019593.2|WP_000180233.1|607725_609021_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGKIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_CP019593.2|WP_000477504.1|607209_607686_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_CP019593.2|WP_000633790.1|606503_607040_+|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQGLDYQWIDVTQHRFKPIRDVRHIEESITDYEDDYQEILDKVLASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTANKPGDIMKDNYALARATEWNQLLQ >NZ_CP019593.2|WP_000808883.1|605119_606058_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINFLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVNALEKIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVIENIKAADIVLSKDEIQYIDELFPIED >NZ_CP019593.2|WP_000923047.1|604223_604850_+|DUF443-domain-containing-protein MLLCESKIINKNPKYRIIKYNDEYLMVDIISTWISLFFPFINWFIPKRYVKISKEDFENLNIVKPAKKNVFWPVAGISALFAVTLRKYTHLLDTQLDKKLVIAICCITFIGILIFYVRLIKKSSLNIYNPKNERSKIILIPTLKNFCFTLFGYILFGGLTMLFLDALLSMSHQNIIVYFTWIAVIMGFFLVNIALIIDKNIYVILKNQ >NZ_CP019593.2|WP_016187114.1|614938_615766_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKDNDKQSSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_CP019593.2|WP_010922824.1|615916_616867_+|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_CP019593.2|WP_000365352.1|616921_617641_+|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKIDNKGENYGSIY >NZ_CP019593.2|WP_084570052.1|617624_618425_+|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMSGIIGADISVRYPEFTSSLMLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >NZ_CP019593.2|WP_000735556.1|618560_619067_+|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLANTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNENGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_CP019593.2|WP_001222139.1|619228_619945_+|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFILNFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTLDAMIHNPQSAQTFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >NZ_CP019593.2|WP_001045424.1|620113_620902_+|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLESHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFLSYYLNFLKSVS >NZ_CP019593.2|WP_001018677.1|621165_621540_-|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_CP019593.2|WP_001807864.1|622487_623417_-|DMT-family-transporter MLLFYIIGVIVGMFIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIVLNIFINPDVFSLHFFSNQTFNYTWFVGGLLGVGYLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIITMNQINKCNLLLTNQKHLIFWLLLGFTFGFFPPIQTTINSLLASHTHSPAFASLVSFTIGSITLLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >NZ_CP019593.2|WP_000169038.1|623609_623834_-|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNIVTEQVARDSMNALVDLNILKSNSGAITKVHSAQIIDKTTTVLFEAKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_3 | 776805-776893 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019593_3
>3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder GCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_3
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_3 >merge|NZ_CP019593|3|776805-776893|CRISPRCasFinder TCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCATT >NZ_CP019593|3|3|776805-776893|CRISPRCasFinder TCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTCGCATT GCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATT CTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTCGCATT
>NZ_CP019593.2|WP_000134958.1|775468_776404_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIETKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP019593.2|WP_000057561.1|773962_775402_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVIENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP019593.2|WP_001224800.1|773469_773955_+|acetyltransferase MRKFLSKTYHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP019593.2|WP_000513301.1|772622_773462_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP019593.2|WP_000958224.1|771684_772617_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP019593.2|WP_000662684.1|768228_771075_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNINLSEQDQAIANQILKEIISRLAFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKINRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDN >NZ_CP019593.2|WP_000229253.1|766235_768221_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP019593.2|WP_000638419.1|765730_765967_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP019593.2|WP_000538141.1|765083_765734_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP019593.2|WP_010956549.1|762354_763465_+|peptide-chain-release-factor-2 MELSEIKRNIDKYNQDLTQIRGSLDLENKETNIQEYEEMMAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >NZ_CP019593.2|WP_000369722.1|777171_778083_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP019593.2|WP_001248939.1|778079_779075_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP019593.2|WP_000006551.1|779183_780128_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP019593.2|WP_001049165.1|780697_781285_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP019593.2|WP_084570057.1|781467_783102_+|NAD-dependent-malic-enzyme MKGIELLNNPFLNKGIAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKRLFLMAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANGRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTAAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLNDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVNYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSKTVNWKNLKEVIENIKPTVLIGTSTQTGAFTEDAVKEMLKHTERPMIFPLSNPTKLAEATAQDLLKWTNGKALIGTGIPYNDIEYNGVNYSIGQANNALMYPGLGLGLIASKAKKVNQQILSAASHALGGMVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETIYDIDKAIEAEIWYPEYKSYI >NZ_CP019593.2|WP_000816293.1|783308_784211_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQKIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >NZ_CP019593.2|WP_000070836.1|784913_785543_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQNQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP019593.2|WP_000654030.1|786317_787331_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP019593.2|WP_000279414.1|787383_788394_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP019593.2|WP_001074744.1|788532_789723_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPDLGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_4 | 826269-826349 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019593_4
>4.1|826294|31|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder AAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_4
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_4 >merge|NZ_CP019593|4|826269-826349|CRISPRCasFinder TCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCCAAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGATTCTTTATCATTTCTCTCCCACTCCC >NZ_CP019593|4|4|826269-826349|CRISPRCasFinder TCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCC AAGAACCAATACATAATAAAGCATAAGTGAT TCTTTATCATTTCTCTCCCACTCCC
>NZ_CP019593.2|WP_000732338.1|824862_825684_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGSKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGNVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP019593.2|WP_000520233.1|824149_824845_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP019593.2|WP_000571213.1|823131_824157_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_CP019593.2|WP_001065802.1|822585_822882_+|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFQSVTDLLENLK >NZ_CP019593.2|WP_001018957.1|822206_822593_+|hypothetical-protein MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKFDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPFLPNINNERLVLVNE >NZ_CP019593.2|WP_000932205.1|820626_821505_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPILPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPISDLSLKDIQAHLKSLNADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQGLKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_CP019593.2|WP_000662306.1|820511_820625_+|hypothetical-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >NZ_CP019593.2|WP_000290492.1|820066_820447_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEVSDESQLEALLSAEKYAEMIGE >NZ_CP019593.2|WP_000589549.1|819552_819909_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_CP019593.2|WP_001147955.1|819088_819409_-|thioredoxin-family-protein MQAIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NZ_CP019593.2|WP_000752917.1|826491_826686_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NZ_CP019593.2|WP_084570061.1|826919_827771_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEFVKLNFAGLPILLAVGFGVLSGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_CP019593.2|WP_000168845.1|828098_828860_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NZ_CP019593.2|WP_000205572.1|828958_830266_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >NZ_CP019593.2|WP_001825559.1|830371_831622_+|cysteine-desulfurase MNEVAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSTIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF >NZ_CP019593.2|WP_001010508.1|831611_832076_+|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MNFNNLDQLYRSVIMDHYKNPRNKGVLDNGSMTVDMNNPTCGDRIRLTFDIEDGIIKDAKFEGEGCSISMASASMMTQAVKGHSLGEAMQMSQEFTKMMLGEDYVITEEMGDIEALQGVSQFPARIKCATLAWKALEKGTVAKEGKAEGTTEEE >NZ_CP019593.2|WP_001074405.1|832226_833624_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MAKKAPDVGDYKYGFHDDDVSIFRSERGLTENIVREISNMKNEPEWMLDFRLKSLKLFYKMPMPQWGGDLSELNFDDITYYVKPSEQAERSWDEVPEEIKRTFDKLGIPEAEQKYLAGVSAQYESEVVYHNMEKELEEKGIIFKDTDSALQENEELFKKYFASVVPAADNKFAALNSAVWSGGSFIYVPKNIKLDTPLQAYFRINSENMGQFERTLIIADEGASVHYVEGCTAPVYTTSSLHSAVVEIIVHKDAHVRYTTIQNWANNVYNLVTKRTFVYENGNMEWVDGNLGSKLTMKYPNCVLLGEGAKGSTLSIAFAGKGQVQDAGAKMIHKAPNTSSTIVSKSISKNGGKVIYRGIVHFGRKAKGARSNIECDTLILDNESTSDTIPYNEVFNDQISLEHEAKVSKVSEEQLFYLMSRGISEEEATEMIVMGFIEPFTKELPMEYAVEMNRLIKFEMEGSIG >NZ_CP019593.2|WP_000274033.1|833955_834270_-|hypothetical-protein MYFVLAIFTIISASVSLGYSIQACASSHNINAYYALSRSLPLFLLAIFSLVIHSAIFLITISIAMILVQFLDAIVGYKSNDVFKTYGPLATSVVNLILLIVFLF >NZ_CP019593.2|WP_000582322.1|834638_835679_+|DUF21-domain-containing-protein MIIAIIILIFISFFFSGSETALTAANKTKFKTEADKGDKKAKGIVKLLEKPSEFITTILIGNNVANILLPTLVTIMALRWGISVGIASAVLTVVIILISEVIPKSVAATFPDKITRLVYPIINICVIVFRPITLLLNKLTDSINRCLSKGQPQEHQFSKEEFKTMLAIAGHEGALNEIETSRLEGVINFENLKVKDVDTTPRINVTAFASNATYEEVYETVMNKPYTRYPVYEGDIDNIIGVFHSKYLLAWSNKKEDQITNYSAKPLFVNEHNKAEWVLRKMTISRKHLAIVLDEFGGTEAIVSHEDLIEELLGMEIEDEMDKKEKEKLSQQQIQFQQRKNRNVSI >NZ_CP019593.2|WP_000267231.1|835692_836760_+|nitronate-monooxygenase MWNKNRLTQMLSIEFPIIQAGMAGSTTPKLVASVSNSGGLGTIGAGYFNTQQLEDEIDYVRQLTSNSFGVNVFVPSQQSYTSNQIENMNAWLKPYRRALHLEEPVVKITEEQQFKCHIDTIIKKQVPVCCFTFGIPNESIIKRLKEANIKLIGTATSVDEAIANEKAGMDAIVAQGSEAGGHRGSFLKPKNQLPMVGTISLVPQIVDVVSIPVIAAGGIMDGRGVLASIVLGAEGVQMGTAFLTSQDSNASELLRDAIINSKETDTVITKAFSGKLARGINNRFIEEMSQYEGDIPDYPIQNELTSSIRKAAANIGDKELTHMWSGQSPRLATTHPANTIMSNIINQINQIMQYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019593_5 | 1738810-1738943 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP019593_5
>5.1|1738842|25|NZ_CP019593|PILER-CR TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAA >5.2|1738899|29|NZ_CP019593|PILER-CR AGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATG >5.3|1738883|29|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder AGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_5
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_5 >merge|NZ_CP019593|5|1738810-1738943|PILER-CR,CRISPRCasFinder GGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAAGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATGTGCAAGTTGGGCTGGGGCCCCAACATAGAGAA >NZ_CP019593|5|1|1738810-1738943|PILER-CR GGGGCCCCAACATAGAGAATTTCGAAAAGAAA TTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGT GGGGCCCCAACATAGAAGGTGACGTAATGTCA GCTTACTTTAATGTGCAAGTTGGGCTGGG GCCCCAACATAGAGAA >NZ_CP019593|5|5|1738854-1738940|CRISPRCasFinder TGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGA AGGTGACGTAATGTCAGCTTACTTTAATG TGCAAGTTGGGCTGGGGCCCCAACATAGA
>NZ_CP019593.2|WP_000626092.1|1737720_1738662_-|pApA-hydrolase-Pde2 MISTMNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGRKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLKQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLAKALRTKLN >NZ_CP019593.2|WP_000226933.1|1734502_1737700_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDTCIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLAKDNNGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKNVADEHRDIVQVFDSHEDTYLDHRSVLVQGIKHVWIQDVCYQTRHDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTENEIQQLDVNPEYFTQADRIAQKCDAELKYHQSLLPQYQAPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRREKVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVEERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKKFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDLRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSQIDMFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >NZ_CP019593.2|WP_000058389.1|1732824_1734054_-|NAD-dependent-malic-enzyme-4 MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >NZ_CP019593.2|WP_000471571.1|1731772_1732630_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NZ_CP019593.2|WP_000883646.1|1730828_1731773_-|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >NZ_CP019593.2|WP_000717561.1|1729591_1730560_-|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NZ_CP019593.2|WP_001232654.1|1727812_1729570_-|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >NZ_CP019593.2|WP_000818532.1|1726107_1727469_+|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAYKTQFGHASFTNLYEHGVFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKKATYKLFGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVETRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIAAKSNN >NZ_CP019593.2|WP_000829167.1|1724638_1725760_-|citrate-synthase MAELQRGLEGVIAAETKISSIIESQLTYAGYDIDDLAENAQFEEVIFLLWNYRLPNEEELAHLKGKLNQYMTLNPRVYTHFEEYVTDHVHPMTALRTSLSYIAHFDPDAENESDENRYERAMRIQAKVASLVTAFARVRQDKEPLKPNPDLSYAANFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALILHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANEQVMTMLSEIGSIENVDAYLDEKFANKDKVMGFGHRVYKDGDPRAKYLREMSRQITKDAGREELFEMSVKMEKRMAEEKGLIPNVDFYSASVYHCMEIPHDLFTPIFAVSRSAGWIAHILEQYKDNRIMRPRAKYIGETNRKYIPLEERK >NZ_CP019593.2|WP_000123161.1|1723321_1724590_-|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MTAEKITQGTEGLNVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKRIEWKEVLAGQKAFDTTGEWLPQETLDTIKEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQELDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTTEVEKVIDFLQNEMGATNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNNRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLALTEFGDQVFTWQQYDEIVEKEGRDAANVAQEKAEKEGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSVILSSVLMLEHLGWQEAADKITDSIEDTIASKVVTYDFARLMDGAEEVSTSAFADELIKNLK >NZ_CP019593.2|WP_000160430.1|1739031_1740330_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVIDFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NZ_CP019593.2|WP_000277602.1|1740534_1740948_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_CP019593.2|WP_000777188.1|1741453_1742143_-|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >NZ_CP019593.2|WP_000161656.1|1742317_1743373_+|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEINKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSQEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK 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---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_6 | 1741274-1741356 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019593_6
>6.1|1741299|33|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_6
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_6 >merge|NZ_CP019593|6|1741274-1741356|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTACTATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC >NZ_CP019593|6|6|1741274-1741356|CRISPRCasFinder GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC TATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACACA GAAGCTGACGAAAAAGTCAGCTTAC
>NZ_CP019593.2|WP_000277602.1|1740534_1740948_+|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_CP019593.2|WP_000160430.1|1739031_1740330_-|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVIDFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANQTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NZ_CP019593.2|WP_000626092.1|1737720_1738662_-|pApA-hydrolase-Pde2 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_7 | 1829628-1829712 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019593_7
>7.1|1829653|35|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder CCAACATAGAGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_7
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_7 >merge|NZ_CP019593|7|1829628-1829712|CRISPRCasFinder GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGCATTGGGGTGTGGGGCC >NZ_CP019593|7|7|1829628-1829712|CRISPRCasFinder GCAATGCGCGTTGGGGTGTGGGGCC CCAACATAGAGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAG GCAATGCGCATTGGGGTGTGGGGCC
>NZ_CP019593.2|WP_000492903.1|1828700_1829321_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKILNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDTFAPPTLNEILIDEESEDAPYHIALLSTAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFYSGLIFGYTYLKTKRLEVPILIHFINNLLAM >NZ_CP019593.2|WP_001168915.1|1827898_1828534_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFLITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFKINLLSFKKLTMSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHMPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILLWG >NZ_CP019593.2|WP_001030475.1|1827157_1827601_-|hypothetical-protein MNKASFDKKVKKQLWFLNKKEKQALDQRLSSITDKDNVNFNKPITFANTYLRENVFRSKETKSYSIFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFVNPKVDLSTTVVILTIIGAILLMLVSIYLIKITTSYFTKKLLEHKFNGH >NZ_CP019593.2|WP_001153741.1|1826727_1827171_+|competence-protein-ComK MQDNSTKYLLYIQTATSNHLETNCVFLHCDYILKVPINKLVSYYAKLHLSSQSVLIETAKNILNINKLVPIYINAKTILFPLKHKRAPIQIYINAHYIVGMTAIENSTLIHFQEGIQLEVDEPFSLVSKKCHESLALKHFIENTNDH >NZ_CP019593.2|WP_000671058.1|1826144_1826615_+|RNA-polymerase-sigma-factor MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSNQSLSSFLFMRLNFYLIDLFRQQKRLNDIILCENHSPILTEQPTYFNEYDLRLQDVCALLKHRERQWLMLYLEGYKQYEIADIMSLSTSTIKLIKASVKRKCQRFLN >NZ_CP019593.2|WP_000384171.1|1825721_1825946_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK >NZ_CP019593.2|WP_001032832.1|1824591_1825446_-|autolysin MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEIDGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLKK >NZ_CP019593.2|WP_000989103.1|1823212_1824505_+|arsenite-efflux-transporter-membrane-subunit-ArsB MMTTLATFIFLVTLLFVLWQPKGLDIGFTALAGAFIAVITGVVSFSDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGSGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGAALILTPIVLAMVKNIGFSKRAIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLASLLVLWLYFRKAIPKSFDANHIKKPIDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLILARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVIFGLRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNVHGMLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKTGIIITIPVLFFTLIGLYLTLILF >NZ_CP019593.2|WP_000221190.1|1822898_1823213_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >NZ_CP019593.2|WP_001261673.1|1820753_1822256_-|FAD-dependent-oxidoreductase MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTNYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTNSEQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNELDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSANLPSVRGTMIDVTFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFEKLVHRRTGNHIADLKYDLARPTEMGIFQSIIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSKMIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYKVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQEQRSDNQ >NZ_CP019593.2|WP_001096494.1|1829883_1830597_-|transaldolase MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >NZ_CP019593.2|WP_000091443.1|1830855_1831158_+|hypothetical-protein MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIILILSIIFADRSIKSLKPDADWIRIASKSLPWIILIVILVHIFSIVHTFGFI >NZ_CP019593.2|WP_001200546.1|1831412_1831778_+|fluoride-efflux-transporter-CrcB MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIEFFSNHPTLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDYQQFITLLLYAVTSYVFGILLCYVGIKLGGGLS >NZ_CP019593.2|WP_000623484.1|1831774_1832128_+|CrcB-family-protein MISIILVMIGGGLGAIARSAVTDYFNHIFTSKLPIATLIVNLVGSFLIGLTIGLSISISWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFDIKLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI >NZ_CP019593.2|WP_000453302.1|1832377_1833211_-|aldo/keto-reductase MEVKTFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGAGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAIMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFRIFDFELSDEQMTRIDDLNQDKRIGPDPKTFEG >NZ_CP019593.2|WP_000366160.1|1833422_1834331_-|NERD-domain-containing-protein MDLSSPVVIGLIIAVVIALIFFVLFLVALGSKKKVKRQTEEKYEQQEQNIKKSHEEALEKERIQNKKTITKQQEDYNHMISTKDREIDALKLFSKNHSEYVTDMRLIGIRERLVKEKRIRPEDMHIMANIFLPKDGFNNIERISHLVLTRTGLYIIDSQLLKGHVYNGISGGQFKDLPPMEQVFDTLDLDKSRPQTIVMDQNDDKRSLSFVNYSDQIEAIKQLAEDLQKHLGAKYTPTSILYFNPKNEGDVTISNYNQNSAVKVLVGAEQLDEFFNKFVFHGRIQYNVEDLQQMMDKIESFN >NZ_CP019593.2|WP_000933822.1|1834455_1835649_-|methionine-adenosyltransferase MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINEQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKDAVK >NZ_CP019593.2|WP_000109913.1|1836020_1837613_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase-(ATP) MSVDTYTETTKIDKLLKKPTSHFQLSTTQLYNKILDNNEGVLTELGAVNASTGKYTGRSPKDKFFVSEPSYRDNIDWGEINQPIDEETFLKLYHKVLDYLDKKDELYVFKGYAGSDKDTMLKLTVINELAWHNLFAKNMFIRPESKEEATKIKPNFTIVSAPHFKADPEVDGTKSETFVIISFKHKVILIGGTEYAGEMKKGIFSVMNYLLPMQDIMSMHCSANVGEKGDVALFFGLSGTGKTTLSADPHRKLIGDDEHGWNKNGVFNIEGGCYAKAINLSKEKEPQIFDAIKYGAILENTVVSEDGSVDFEDNRYTENTRAAYPINHIDNIVVPSKAAHPNTIIFLTADAFGVIPPISKLNKDQAMYHFLSGFTSKLAGTERGVTEPEPSFSTCFGAPFFPLHPTVYADLLGELIDLHDVDVYLVNTGWTGGKYGVGRRISLHYTRQMVNQAISGKLKNAKYTKDSTFGLSIPVEIEDVPKTILNPINAWSDKEKYKAQAEDLIQRFEKNFEKFGEKVEHIAEKGSFNK >NZ_CP019593.2|WP_016187361.1|1837909_1838656_-|S9-family-peptidase MPIESFTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPHHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTQLLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVSSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGAAHETFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHR >NZ_CP019593.2|WP_000672013.1|1838660_1839134_-|nucleoside-triphosphatase-YtkD MKFRDKDNRQVNLTFKKDNEIADGNHVLAIPTFKNQLLFTKHNLRGIEFPGGKRERGESSAEAVTRELYEETGAKVKNIHYIAQYTIETHDQTDFVKDVYFIEVESLVSKNDYLETAGPVLFNCINDIELAQRSFLLQDSTILKCVERVQSLGFYQT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_8 | 1893076-1893203 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019593_8
>8.1|1893114|52|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder ATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATTATTATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_8
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_8 >merge|NZ_CP019593|8|1893076-1893203|CRISPRCasFinder AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTACACCTATACCTCATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATTATTATTAAATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTGCACCTATACCTC >NZ_CP019593|8|8|1893076-1893203|CRISPRCasFinder AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTACACCTATACCTC ATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATTATTATTA AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTGCACCTATACCTC
>NZ_CP019593.2|WP_000063551.1|1891351_1892413_-|PTS-transporter-subunit-IIC MSNAKNADNKQFFSKILNSIGAGVVIALVPNALLGEVLKIFKSGNEILELTYQLVILIQSFMAFIIGVLAAHQFKFNGAGAAIVGTSAMIGSGAVVYSNNSFMLKGIGDIINTSLVVIIACLIYMVLQNKLGSFELIILPVLVPIVSGGIGLITLPYIRKITQAIGNVIHSFTDLNPLLMSILISVAFSLLMVTPISLVAIATAISLNGLGSGAANLGIVAACVTFLFGSLRVNSIGVNAVLLIGAAKMMIPVYLKNLIISIPLTINGIITGIIAYVLQVKGTPLSAGFGYTGLVGPINAFNRMSGDPTMNIILLALGYFVIPFVSAFIVHELCKKFIPIYSNDIYKFEVPKQ >NZ_CP019593.2|WP_000649908.1|1889637_1891095_-|ABC-transporter-permease-subunit MKCLIRFILVLGLLISSAMVYINPTAHAEQDQTWEKIKERGELRVGLSADYAPMEFEHTVNGKTEYAGVDIDLAKKIAKDNNLKLKIVNMSFDSLLGALKTGKIDIIISGMTSTPERKKQVDFSDSYMMTKNIMLVKKDKVNEYKDIKDFNNKKVGAQKGTEQEKIAQTEIENASITSLSRLPDVILALKSGKVEGAVVEKPVAEAYLKQNPKLGISNVKFNEEEKDTVIAVPKDSPKLLSQINKTIKEVKDKGLIDKYMTNAANAMNDDSGFISKYGSFFLKGIKITILISLIGVALGSILGAFVALMKLSKIKIISWIASIYIEILRGTPMLVQVFIVFFGITAALGLDISALVCGTIALVINSSAYIAEIIRAGINAVDKGQMEAARSLGLNYRQTMKSVIMPQAIKNILPALGNEFVTLIKESSIVSTIGVGEIMFNAQVVQGISFDPFTPLLVAAALYFVLTFVLTRIMNMIEGRLNASD >NZ_CP019593.2|WP_001144059.1|1888922_1889651_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MPVIKINNLNKVFGDNEVLKDINLEINQGEVVAIIGPSGSGKSTLLRCMNLLEVPTKGQVIFEGNDLTEKRTQVDKLRQKMGMVFQNFNLFPHKKVVDNIILAPKLLKKDNNDELHKEALSLLDKVGLKEKADVYPNQLSGGQKQRVAIARALAMHPDVILFDEPTSALDPEVVGDVLKVMKDLAKEGMTMVVVTHEMGFAKDVSDKVIFMADGVVVESGTPVEIFEQPQHERTQNFLARVL >NZ_CP019593.2|WP_001793998.1|1887644_1888787_-|tRNA-epoxyqueuosine(34)-reductase-QueG MGGIRLDTKQLKQDIIDYAYTIGIDSIGFTTADPFDELKQKLEAYHANGYASGFEESDIALRTEPKLSLPTARSIIAIAVGYPNKLKGAPKSVRGDRRGLFARASWGQDYHTIMRKRLDMLAAFIESKVPDVEIKSMVDTGVLSDRAVAERAGLGFVGRNGFVINPKLGTWTYLGEMLVSIPFEPDDPLLDSCGDCTICVDRCPTSALVGNGQLNSQKCISFLTQTKGYMPDQYRYKIGNRLYGCDTCQQVCPKNRGINTEQDDIILEPEILKPRLVPLLRMSNKEFKQTYGHLAGAWRGKKPIQRNAILALAHFNEVDAIPELKKVATTDERPMIRATAYWAIGQILGEEARDFINANYDQEDAEVQNEMIKGLDTRRE >NZ_CP019593.2|WP_000181394.1|1887169_1887640_-|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MTNHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTNTHLHLIKPLGFRTDDKMLKRAGLDYWEFVNITYHDSIEAFFEATNGEYYLLTKFGKKTYSDFDFSNHDKDFYFIFGKETTGLPDWVKEKYQDTALRIPMSEHIRSLNLSNTAALLIYEALRQQDFPGLN >NZ_CP019593.2|WP_001251224.1|1886411_1887011_-|glucosamine-6-phosphate-isomerase MAMNFKVFDNSQLVAEYAADIIRKQFNNNPTTIAGFHLDTDQAPVLDELKKNVEKHAVDFSQINILDYDDKKSYFEALGVPAGQVYPIAYEKDAIELIADKIKTKENKGKLTLQVVSIDEQGKLNVSIRQGLMEAREIFLVVTGANKRDVVEKLYQENGKTSFEPADLKAHRMVNVILDKEAAAGLPEDVKAYFTSRFA >NZ_CP019593.2|WP_000031108.1|1886234_1886387_-|hypothetical-protein MSKDKDPKLNYHEEENSMVTDFEDLKELGKEMEQISDQNDQEKNSEEDSQ >NZ_CP019593.2|WP_000901018.1|1885296_1885692_-|hypothetical-protein MLGKYWIQLLIATVIISLISIKAFPLAIGALYLPIIFKVIKLQLNLSKGLIDDVNAQTFIKSNQSGIVISVICCLLITGILYYTLDGFYASLTGVLGTLVALNPYTTIVSAILYILTAIATVEATKTKYRN >NZ_CP019593.2|WP_000116238.1|1883715_1885101_-|class-II-fumarate-hydratase MSVRIEHDTFGEIEVPADKYWGAQTERSKRNFPVGKERMPIEVVYGFAQLKRAAALANFDLGKLSEAKKDAIVYACDQILSGELDEHFPLVVWQTGSGTQSNMNVNEVVSYVANMYLKDHQSDESIHPNDDVNKSQSSNDTFPTAMHVALYQEVETKLEPALKLLRNTLKEKEDKFDSIIKIGRTHLQDATPIKLGQEISGWRYMLDRCETMLSESKKHILNLAIGGTAVGTGINAHPEFGDKVAQYISENTGYPFVSSENKFHALTAHDEVVQLHGTLKALAGDLMKIANDVRWLASGPRAGLAEISIPENEPGSSIMPGKVNPTQCEMLTMVAVQVMGNDTVVGFASSQGNFELNVYKPVIMHNTLQSIYLLADGMETFNNNCAVGIEPIEENIDNYLNQSLMLVTALNPHIGYEKAAQIAKKAHKEGLTLKESAIQTGYVTEEQFEAWIKPEDMVDPH >NZ_CP019593.2|WP_000669380.1|1882439_1883261_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MKFKIPENFNDLSLRDIFQQLKVPKKDLHHLNMSKDITINDKPARLMDKVHTGDDVFVPTIDEKSNYVPSYRYAQIKYEDDDMAIVMKPKGVKTHPNDLKESNTLMNHVIYTVDSDYVEPIHRLDQETVGLLIVAKNPLMKKILDRMLEDNDITRIYKANVKALLPLKPQTIDMPIGKDKFHSNKRRVSPTGQRAITHILTSKMIKETVCQLEIKLDTGRTHQIRVHLAEIGHPVIGDPLYGDSTLRQLELESYKIEFVHPLTKEVISVSLDD >NZ_CP019593.2|WP_000110011.1|1901270_1901717_-|peroxide-responsive-transcriptional-repressor-PerR MSVEIESIEHELEESIASLRQAGVRITPQRQAILRYLISSHTHPTADEIYQALSPDFPNISVATIYNNLRVFKDIGIVKELTYGDSSSRFDFNTHNHYHIICEQCGKIVDFQYPQLNEIERLAQHMTDFDVTHHRMEIYGVCKECQDK >NZ_CP019593.2|WP_000869465.1|1901813_1902764_-|2-hydroxyacid-dehydrogenase MKVVGLNRMREVETELQQRFSDVDFKFYKKASEIPESDLANLDILVGYDGGINEAFLRRCTNLKWIAWFATGVNTLPLDYIADHGILLTNGKGVQAKQLSEYILAFILDDYKKMKLSYDNQRQHIYDSKITGKRLSGQTVLFLGTGAIATRTAKLAKAFNMNLIGLSKSGQNKDEFDEIYTIESLESTLPNADIVINALPETQETIHLLKKKHFELMKDEALFINIGRGSIVKETLLIEVLKSRVIRHAYLDVFENEPLKPNHELYELDNVTITAHITGNDYEAKYDLLDIFKNNLVNFLNKNGLIENEVDAKKGY >NZ_CP019593.2|WP_000939521.1|1902769_1903225_-|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MLQKGEQFPIFKLENQDGTVITNDTLKGKKAIIYFYPRDNTPTCTTEACDFRDNLEMFNDLDVAVYGISGDSKKKHQNFIEKHGLNFDLLVDEDFKLAKETGVYQLKKSFGKESMGIVRTTFIIDEQGKVLDVIEKVKVKTQIEELKNILG >NZ_CP019593.2|WP_001011603.1|1903305_1904595_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MNFSESERLQQLSNEYILGGVNSPSRSYKAVGGGAPVVMKEGHGAYLYDVDGNKFIDYLQAYGPIITGHAHPHITKAIQEQAAKGVLFGTPTELEIEFSKKLRDAIPSLEKIRFVNSGTEAVMTTIRVARAYTKRNKIIKFAGSYHGHSDLVLVAAGSGPSQLGSPDSAGVPESVAREVITVPFNDINAYKEAIEFWGDEIAAVLVEPIVGNFGMVMPQPGFLEEVNEISHSNGTLVIYDEVITAFRFHYGAAQDLLGVIPDLTAFGKIVGGGLPIGGYGGRQDIMEQVAPLGPAYQAGTMAGNPLSMKAGIALLEVLEQDGVYEKLDSLGQQLEEGLLKLIEKHNITATINRIYGSLTLYFTDEKVTHYDQVEHSDGEAFGKFFKLMLNQGINLAPSKFEAWFLTTEHTEEDIKQTLKAADYAFSQMK >NZ_CP019593.2|WP_001807907.1|1904887_1905982_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MRLGARIFKTGIAIILAMSIASLLPDDVGLKALAGVSAVVAMQPSIYRSFKTVSDQALGNIIGAILSVTMVTIFSDNFIIMGVTVVVLIAILFKFNLAHVATLASVTALIIMGQHTGSFYITAFYRFVLVMIGVISSSLVNFVFLPPKFETKIYYNSLNISSDIFMWFKLVLNDTTEFNNIKQDSHNLKQRVEKLEKIYDYYSEERPITKKHIHQQNRKKILFREVVQTTRQAYEVLNKLSRYQNDLYLLNNNFLLQIKLDLDSLTAFHEQILASLSKKARYNVTHVDYELDNPQKKDLLSTFQHELINHPYQTEYSFANVMQIVAAIEEYRHHLEHLDRIRISFFTYHRSDADIEIVEEDFDL >NZ_CP019593.2|WP_000597248.1|1906172_1907909_-|SAV1866-family-putative-multidrug-efflux-ABC-transporter MIKRYLQFVKPYKYRIFATIIVGIIKFGIPMLIPLLIKYAIDGVINNHALTTDEKVHHLTIAIGIALFIFVIVRPPVEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKKLYNHLQALSARFYANNQVGQVISRVINDVEQTKDFILTGLMNIWLDCITIIIALSIMFFLDVKLTLAALFIFPFYILTVYVFFGRLRKLTRERSQALAEVQGFLHERVQGISVVKSFAIEDNEAKNFDKKNTNFLIRALKHTRWNAYSFAAINTVTDIGPIIVIGVGAYLAISGSITVGTLAAFVGYLELLFGPLRRLVASFTTLTQSFASMDRVFQLIDEDYDIKNGVGAQPIEIKQGRIDIDHVSFQYNDNEAPILKDINLSIEKGETVAFVGMSGGGKSTLINLIPRFYDVTSGQILIDGHNIKDFLTGSLRNQIGLVQQDNILFSDTVKENILLGRPTATDEEVVEAAKMANAHDFIMNLPQGYDTEVGERGVKLSGGQKQRLSIARIFLNNPPILILDEATSALDLESESIIQEALDVLSKDRTTLIVAHRLSTITHADKIVVIENGHIVETGTHHELIAKQGAYEHLYSIQNL >NZ_CP019593.2|WP_000251253.1|1908199_1908742_-|DUF402-domain-containing-protein MVRESIPKEGENIKIQSYKHDGKIHRVWSETTILKGTDHVVIGGNDHTLVTESDGRTWITREPAIVYFHSEYWFNVICMFREDGIYYYCNLSSPFVCDEEALKYIDYDLDIKVYPNGKYHLLDEDEYEQHMNQMNYPHDIDIILRRNVDILQQWIEQKKGPFAPDFIKVWKERYKKIRQY >NZ_CP019593.2|WP_000284749.1|1909044_1910082_-|A/G-specific-adenine-glycosylase MYQQSSFKENLIHWFDENQREMPWRQTTNPYYIWLSEVMLQQTQVKTVIDYYHRFVERFPTVEVLSQASEDEVLKYWEGLGYYSRARNFHTAIKEVHDKYEGLVPKDPDQFKALKGVGPYTQAAVMSIAYNVPLATVDGNVFRVWSRLNDDYRDIKLQSTRKSYEQELLPYVTTEAGTFNQAMMELGALICTPKNPLCLFCPVQENCEAFDKGTFEKLPVKSKNVSKKVIEQSVFLIRNNQGQYLLQKRSEKLLHGMWQFPMFESEHARREMTEKIGHDIQPVETPIFELKHQFTHLTWKIKVYAVSGTINIERLPDDMIWFDLSDRDQYTFPVPMSKIYQFING >NZ_CP019593.2|WP_000379101.1|1910233_1911211_+|metal-dependent-hydrolase MDTATHIAIGVGLTALATQDPAMASTFGATATTLIVGSLIPDGDTVLKLKDNATYISHHRGITHSIPFTILWPILITFLIFTFFSGTNPFHVWMWAQLAVFLHVFVDIFNSYGTQALRPITNKWIQLSVINTFDPIIFTVLCIGIVLWVVGLHPFAVFFPIIALLIIYYMIRFKMRAVIKQQALKAIQQEHHPVKVFVAPTIKFMEWRVAIQTDAHDYVGKAYGRNVVFSDKVERQKLSTDSILWKVKGNKDIRTFLNFSSIYRWQTTTLADGSTEIRLIDLRYLKNDHYSFVAIAHVTNDNVIDHSYIGWVFTEDKLQRKLYAK >NZ_CP019593.2|WP_000886473.1|1911471_1912308_-|membrane-protein MLDNIILYFKNLPHTKRYVTERLKQSWKSFLIVLAACLILIIASETLFSFSHLTDVKEVRWLFRLIALIVFAVLMFTIYISYHHYMNDFLVTKLFNISAATPVVIMSILSFIMLVILTMVSALVKPVNFETSYIALFYFIVMATIFVGLISVTFGLIRLLTEKINIIFYGICVLCFFVLPIIFIPNPNHVFINHILMLNPMYYIVNGIAQSIIFGISSMENIPYHFYFILFLCLIAAVNFVLARYTTHAIYNKTSKVTQTDKQQDVSKDSTDEADTSS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_9 | 2104152-2104364 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_9
|
2 spacers
spacers of NZ_CP019593_9
>9.1|2104199|34|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder TGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTA >9.2|2104280|38|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder TGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_9
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_9 >merge|NZ_CP019593|9|2104152-2104364|CRISPRCasFinder TGACGTATTGTTGCGGGAACTTGGTGTCATGACATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCGTGCCATGCTACTTTGATGTGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTTTGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCATGCCATGCTACTTTGATG >NZ_CP019593|9|9|2104152-2104364|CRISPRCasFinder TGACGTATTGTTGCGGGAACTTGGTGTCATGACATGTTACTTTGATG TGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTA TGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCGTGCCATGCTACTTTGATG TGCTGTTGTGGGAGCTTGGTGTTGGTGCCATGTTACTT TGATGTGCTGTTGTGGAAGCTTGGTGTCATGCCATGCTACTTTGATG
>NZ_CP019593.2|WP_001187614.1|2103470_2104118_+|HD-domain-containing-protein MQQSDIISAAKKYMESIHQNDYTGHDIAHVYRVTALAKSIAENEGVNDTLVIELACLLHDTVDEKVVDANKQYAELKSFLSSLSLSTEDQEHILFIINNMSYRNGKNDHVTLTLEGQIVRDADRLDAIGAIGVARTFQFAGHFGEPMWTEQMSLDKINDDLVEQLPPSAIKHFFEKLLKLESLMHTDTAKMIAKERHDFMMIYLKQFFTEWNYHD >NZ_CP019593.2|WP_000571550.1|2101958_2103443_+|cardiolipin-synthase MIELLSIALKHSNIILNSIFIGAFILNLLFAFTIIFMERRSANSIWAWLLVLVFLPLFGFILYLLLGRQIQRDQIFKIDKEDKKGLELIVDEQLAALKNENFSNSNYQIVKFKEMIQMLLYNNAAFLTTDNDLKIYTDGQEKFDDLIQDIRNATDYIHFQYYIIQNDELGRTILNELGKKAEQGVEVKILYDDMGSRGLRKKGLRPFRNKGGHAEAFFPSKLPLINLRMNNRNHRKIVVIDGQIGYVGGFNVGDEYLGKSKKFGYWRDTHLRIVGDAVNALQLRFILDWNSQATRDHISYDDRYFPDVNSGGTIGVQIASSGPDEEWEQIKYGYLKMISSAKKSIYIQSPYFIPDQAFLDSIKIAALGGVDVNIMIPNKPDHPFVFWATLKNAASLLDAGVKVFHYDNGFLHSKTLVIDDEIASVGTANMDHRSFTLNFEVNAFIYDQQIAKKLKQAFIDDLAVSSELTKARYANRSLWIKFKEGISQLLSPIL >NZ_CP019593.2|WP_000138932.1|2101499_2101793_-|copper-sensing-transcriptional-repressor-CsoR MTEQDNAHHSEQIKTNLKSRLNRIEGQVRAINRMIEEDVYCDDVLTQIRATRSALNSVAIKLLEQHMKSCIMNKVNQGAQEEAMEELLVTFQKLIKD >NZ_CP019593.2|WP_000581792.1|2101278_2101488_-|heavy-metal-associated-domain-containing-protein MIHQNTIYTAGIETEEQVSQLTERISNMIGVHQVNINIIDGQVTVSYETPANLNSIEKEIYDEGYKIVF >NZ_CP019593.2|WP_000828354.1|2101013_2101151_-|hypothetical-protein MKRPEKIQNVVKLLSSLGVNIKKTKSRLDIINTLPASNKVSHELK >NZ_CP019593.2|WP_001109939.1|2099547_2100750_+|rod-shape-determining-protein-RodA MNYSSRQQPDKHWLRKVDWVLVATIAVLAIFSVLLINSAMGGGQYSANFGIRQIFYYILGAIFAGIIMFISPKKIKHYTYLLYFLICLLLIGLLVIPESPITPIINGAKSWYTFGPISIQPSEFMKIILILALARVVSRHNQFTFNKSFQSDLLLFFKIIGVSLVPSILILLQNDLGTTLVLAAIIAGVMLVSGITWRILAPIFITGIVGAMTVILGILYAPALIENLLGVQLYQMGRINSWLDPYTYSSGDGYHLTESLKAIGSGQLLGKGYNHGEVYIPENHTDFIFSVIGEELGFIGSVILILIFLFLIFHLIRLAAKIEDQFNKIFIVGFVTLLVFHILQNIGMTIQLLPITGIPLPFISYGGSALWSMMTGIGIVLSIYYHEPKRYVDLYHPKSN >NZ_CP019593.2|WP_000159641.1|2098159_2099230_-|D-alanine--D-alanine-ligase MTKENICIVFGGKSAEHEVSILTAQNVLNAIDKDKYHVDIIYITNDGDWRKQNNITTEIKSTDELHLENGEALEISQLLKESSSGQPYDAVFPLLHGPNGEDGTIQGLFEVLDVPYVGNGVLSAASSMDKLVMKQLFEHRGLPQLPYISFLRSEYEKYEHNILKLVNDKLNYPVFVKPANLGSSVGISKCNNEAELKEGIKEAFQFDRKLVIEQGVNAREIEVAVLGNDYPEATWPGEVVKDVAFYDYKSKYKDGKVQLQIPADLDEDVQLTLRNMALEAFKATDCSGLVRADFFVTEDNQIYINETNAMPGFTAFSMYPKLWENMGLSYPELITKLIELAKERHQDKQKNKYKID >NZ_CP019593.2|WP_000611457.1|2096789_2098145_-|UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D--alanine-ligase MINVTLKQIQSWIPCEIEDQFLNQEINGVTIDSRAISKNMLFIPFKGENVDGHRFVSKALQDGAGAAFYQKGTPIDENVSGPIIWVEDTLTALQQLAQAYLRHVNPKVIAVTGSNGKTTTKDMIESVLHTEFKVKKTQGNYNNEIGLPLTILELDNDTEISILEMGMSGFHEIEFLSNLAQPDIAVITNIGESHMQDLGSREGIAKAKSEITIGLKDNGTFIYDGDEPLLKPHVKEVENAKCISIGVATDNALVCSVDDRDTTGISFTINNEHYDLPILGKHNMKNATIAIAVGHELGLTYNIIYQNLKNVSLTGMRMEQHTLENDITVINDAYNASPTSMRAAIDTLSTLTGRRILILGDVLELGENSKEMHIGVGNYLEEKHIDVLYTFGNEAKYIYDSGQQHVEKAQHFNSKDDMIEVLTSDLKAHDRVLVKGSRGMKLEEVVNALIS >NZ_CP019593.2|WP_001178939.1|2094753_2096274_-|DEAD/DEAH-box-helicase MQNFKELGISDNTVQSLESMGFKEPTPIQKDSIPYALQGIDILGQAQTGTGKTGAFGIPLIEKVVGKQGVQSLILAPTRELAMQVAEQLREFSRGQGVQVVTVFGGMPIERQIKALKKGPQIVVGTPGRVIDHLNRRTLKTDGIHTLILDEADEMMNMGFIDDMRFIMDKIPAVQRQTMLFSATMPKAIQALVQQFMKSPKIIKTMNNEMSDPQIEEFYTIVKELEKFDTFTNFLDVHQPELAIVFGRTKRRVDELTSALISKGYKAEGLHGDITQAKRLEVLKKFKNDQINILVATDVAARGLDISGVSHVYNFDIPQDTESYTHRIGRTGRAGKEGIAVTFVNPIEMDYIRQIEDANGRKMSALRPPHRKEVLQAREDDIKEKVENWMSKDSESRLKRISTELLNEYNDVDLVAALLQELVEANDEVEVQLTFEKPLSRKGRNGKPSGSRNRNSKRGNPKFDSKSKRSKGYSSKKKSTKKFDRKEKSSGGSRPMKGRTFADHQK >NZ_CP019593.2|WP_001190840.1|2093705_2094401_+|response-regulator-transcription-factor MQSKILIIEDDHAITHLLDVALTLDYYNVTTADNATQAHFKIQIDKPDVILLDLGLPDKDGLCLISEIRQHTDIPIIVISARQEEQTIIQALDNGANDYMTKPFNVDELRARIRVIERIAKSHQETNFVFTNGLLSIDFGSKSVVINNQEVHLTPNEFSLLELLSNHKGKVLTYEMILKRIYGYVNKTEMPSLRVHMTSLRQKLSQCHEDAKDIIKTHPRIGYQMLQWKEK >NZ_CP019593.2|WP_001825748.1|2104397_2104718_+|hypothetical-protein MIWRCGVMGGIARGIDAMPLQFYDMALGRCNVYYAVVTLLFHTVTCICELLWKCCDIYCYTDESLCQDDIAMMNSNSVINHFLHAEISLILFGSMSNWTDAFNIGS >NZ_CP019593.2|WP_000725800.1|2106359_2107232_-|membrane-protein-insertase-YidC MKKKALLPLFLGIMVFLAGCDYSKPEKRSGFFYNTFVDPMKNVLDWLGNNLLNDNYGLAIIILVLVIRIILLPFMLSNYKNSHMMRQKMKVAKPEVEKIQEKVKRARTQEEKMAANQELMQVYKKYDMNPIKSMLGCLPMLIQLPIIMGLYFVLKDQLVDGLFKYPHFLWFDLGRPDIWITIIAGVLYFIQAYVSSKTMPDEQRQMGYMMMVISPIMIIWISLSSASALGLYWSVSAAFLVVQTHFANIYYEKVAKKEVQPFIEAYEREHNGGNNKKGKNTQVVSKKKKK >NZ_CP019593.2|WP_000483161.1|2107317_2107959_-|thiamine-phosphate-synthase MFNQSYLNVYFICGTSDVPSHRTIHEVLEAALKAGITLFQFREKGESALKGNDKLVLAKELQHLCHQYDVPFIVNDDVSLAKEINADGIHVGQDDAKVKEIAQYFTDKIIGLSISDLGEYAKSDLTHVDYIGVGPIYPTPSKNDAHTPVGPEMIATFKEMNPQLPIVAIGGINTSNVAPIVEAGANGISVISAISKSENIEKTVNRFKDFFNN >NZ_CP019593.2|WP_001108486.1|2107960_2108752_-|hydroxyethylthiazole-kinase MNYLNKIRIENPLTICYTNDVVKNFTANGLLSIGASPAMSEAPEEAEEFYKVAQALLINIGTLTAQNEQDIIAIAQTANEAGLPIVFDPVAVGASTYRKQFCKLLLKSAKVSVIKGNASEILALIDDTATMKGTDSDANLDAVAIAKKAYAIYKTAIVITGKEDVIVQGDKAIVLANGSPLLARVTGAGCLLGGVIAGFLFRETEPDIEALIEAVSVFNIAAEVAAENENCGGPGTFSPLLLDTLYHLNETTYQQRIRIQEVE >NZ_CP019593.2|WP_000594965.1|2108735_2109566_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MIKPKIALTIAGTDPTGGAGVMADLKSFHSCGVYGMGVVTSIVAQNTLGVQNIHNLNHQWVDEQLDSVFNDTLPHAIKTGMIATADTMETIRHYLMQHESIPYVIDPVMLAKSGDSLMDNDTKQNLQHTLLPLADVVTPNLPEAEEITGLTIDSEEKIMQAGRIFINEIGSKGVIVKGGHSNDTDIAKDYLFTKEGVQTFENERFKTKHTHGTGCTFSAVITAELAKGRPLFDAVQKAKKFISMSIQYTPEIGRGRGPVNHFAYLKKEGLDDELSK >NZ_CP019593.2|WP_000396068.1|2109558_2110248_-|thiaminase-II MEFSQKLYQAAKPIINDIYEDDFIQKMLLGNIQADALRHYLQADAAYLKEFTNLYALLIPKMNSMNDVKFLVEQIEFMVEGEVLAHDILAQIVGESYEEIIKTKVWPPSGDHYIKHMYFQAHSRENAIYTIAAMAPCPYIYAELAKRSQSDHKLNREKDTAKWFDFYSTEMDDIINVFESLMNKLAESMSDKELEQVKQVFLESCIHERRFFNMAMTLEQWEFGGKVND >NZ_CP019593.2|WP_000751995.1|2110634_2111330_-|lytic-transglycosylase-SceD MKKTLLASSLAVGLGIVAGNAGHEAHASEADLNKASLAQMAQSNDQTLNQKPIEAGAYNYTFDYEGFTYHFESDGTHFAWNYHATGANGADMSAQAPATNNVAPSADQANQVQSQEVEAPQNAQTQQPQASTSNNSQVTATPTESKASEGSSVNVNDHLKQIAQRESGGNIHAVNPTSGAAGKYQFLQSTWDSVAPAKYKGVSPANAPESVQDAAAVKLYNTGGAGHWVTA >NZ_CP019593.2|WP_000932694.1|2111718_2112114_-|single-stranded-DNA-binding-protein MLNKIVIVGRLTKDAQIFEKEDRKIATFCVATHRNYKDENGEIVCDYLFCKAFGKLASNIEKYTNQGTLVGITGQMRSRKYDKDGQTHFVTELYVETIKFMSPKSQNNEILSDSILDIDSQNIDNHDLLEI >NZ_CP019593.2|WP_001789631.1|2112244_2112748_+|hypothetical-protein MTLNLLNNSKIINIKLMGCGNMKTFKAVRFQIVNEHGRIIEYELEDGVIINKEESGTGWLLEIVISNEHYETFKEYQDNEQLLDIRVVITRPANDPALFESTVKSIKNFKTTMSIVFECHIYTLRQQYAESLLEQLIDDGLSGEELKKSFNRMMQSKPKLKDEKLEE >NZ_CP019593.2|WP_000447678.1|2112804_2113245_-|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ METIFDYNQIKQIIPHRQPFLLIDKVVEYEEGQRCVAIKQVSGNEPFFQGHFPEYAVMPGVLITEALAQTGAVAILNSEENKGKIALFAGIDKCRFKRQVVPGDTLTLEVEITKIKGPIGKGNAKATVDGQLACSCELTFAIQDVK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_10 | 2159783-2159933 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_10
|
2 spacers
spacers of NZ_CP019593_10
>10.1|2159811|29|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA >10.2|2159868|38|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder GTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC |
csa3,TnsE_C |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_10
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_10 >merge|NZ_CP019593|10|2159783-2159933|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTAAACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGAGCTTCTTTCTA >NZ_CP019593|10|10|2159783-2159933|CRISPRCasFinder AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA AACTTTAGTTGTAAGGGGCTCTTATGCA GTTGATGCATAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC AACTTTAGTTGTTAGGAGCTTCTTTCTA
>NZ_CP019593.2|WP_000495673.1|2158673_2159765_+|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQTIAIYSQFGQKPPGDAYLKVIALLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLVGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPVFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILYVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP019593.2|WP_000019735.1|2157427_2158408_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVNTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALIAFIYAEKNATATKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP019593.2|WP_000003759.1|2157105_2157426_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP019593.2|WP_001024099.1|2156288_2156954_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFEGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >NZ_CP019593.2|WP_001127960.1|2154916_2155855_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP019593.2|WP_000808818.1|2154655_2154886_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQTSASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP019593.2|WP_000123402.1|2152610_2153984_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP019593.2|WP_001123309.1|2151739_2152153_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQQPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP019593.2|WP_000070865.1|2151096_2151540_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP019593.2|WP_000160304.1|2150265_2150976_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NZ_CP019593.2|WP_001802298.1|2160262_2160367_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP019593.2|WP_001792784.1|2161046_2161205_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP019593.2|WP_000220902.1|2161640_2161733_+|hypothetical-protein MTYGSIVAILCALFAIFFIPYMEKKDKKKK >NZ_CP019593.2|WP_000370942.1|2161862_2162720_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWLRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIEHFGINQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP019593.2|WP_000908191.1|2162787_2163570_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQVGRMKQGKTILKNISWQINGGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGSVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP019593.2|WP_000101714.1|2163859_2164468_-|TIR-domain-containing-protein MARKTFISYKYSEAKDLRDKIVESLGEDAKYYQGETSDSPDMSDRITEYIKKELKNKIYSTSVTIVVISPNMKESNWIDWEIEYSVKQMKRGDRTSSTNGVVGVVMKHNGDYSWLRNSVINSDGHTAIHTDNSYLYDIIVKNRFNQEPIEYTCDECKNIDALTGSFISLVEEDEFLGNPTKYIENAYEKSKKATNYNICRRK >NZ_CP019593.2|WP_000876896.1|2164495_2165530_-|toll/interleukin-1-receptor-domain-containing-protein MKYPIRQVAEVLPEKYTRYILLKEFQRLFPYQWNIIVERQQTYKEKAQHLYKVKKIKNRYNTKSAEEYFFSIPQVKYILSAGRMKKHKENYNASEIKIKKAALEKSRKNKNWKIEERLIKAKRYTQKVDPEYLNIYMKAYHKKDITTEEKLEILTELKKFDTENIVRFFRKLNDAEQNKMIRNLAFKYLQDYGHYVKLRKNFKGKKKVYQTERASLDTKKPEDLYNDLTNKNIQSQKVYDIFISHSTKDKKTVEDIIRVFNEQNKTCYCDWTMDQDYLKRKYVGEYTKQVLKARMEQSKMLVLLRTENSVQSDWVSFEIEYFENLKKPIYIVESLEELLEAFSD >NZ_CP019593.2|WP_044555027.1|2165623_2167093_-|hypothetical-protein MNGDGKMTIDKKKFIEKYVKALESNTAAIFAGAGLSCGAGYVNWKTLLNEAAEELELNIDKEEHDLVGLAQHYINKKRSRGNLNTVIMEQFSTRAELTENHKLLAKLPIDTYWTTNYDCMIEKALDSEGRIVDVKRNQNQLTVSVADKDATVYKMHGDIDSIDKIILTRDDYEKYNLTHPKFREILEGDLLSKTFLFIGFSFTDPNISYILSRIRLVLEDNTRPHYCILKEVEEKEYDNTEEFMYAKIKQQLHIEDLSRFSIETLLVKDYIEITEILESIYKRYRRKTIFISGSATEYLPFNSETGKYFLHQLSKKLVENDFKLVTGFGLGVGSYVINGVADYINSNKKSKLQNHLNILPFSQDSSGDLDLKEVWKKNRLEMISECGMALFLFGNKEKDGKIVLADGLEEEYKIAERQELVRLPINVTGYKTKNLSEQYNEEINIQFKEKILKMYNEINEYKCDFSNKQSIDELVQKIVNLVIEIKKTK >NZ_CP019593.2|WP_099184063.1|2167152_2167443_-|DUF3387-domain-containing-protein MVMEENAFYDALASHDTAEHVLGDDTLKIIAHELTQSIKENMSIDWNLCESARAKMRVIVRRLLKKYGYPPEISKQAVETVIEQAELMSEQLAMEL >NZ_CP019593.2|WP_001156920.1|2167567_2167972_-|hypothetical-protein MQELEDYKEVQLIIIQMSSLPIGDGKRVFSYLEDGVTPRQYALATVSLFNGNEFKILEVERENCALSMLILSSTGLVNWNPLIDSLLLNLVNSSGTWVKESLEILERSNVIIQKAKHSKKEYAHRAKLLIHKML |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_11 | 2337168-2337253 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019593_11
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019593_11
>11.1|2337198|26|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019593_11
The CRISPR arrays of NZ_CP019593_11 >merge|NZ_CP019593|11|2337168-2337253|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NZ_CP019593|11|11|2337168-2337253|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NZ_CP019593.2|WP_000684154.1|2335672_2336797_-|NAD(P)-binding-protein MKIAIIGAGIGGLTAAALLQEQGHTIKVFEKNESVKEIGAGIGIGDNVLKKLGNHDLAKGIKNAGQILSTMTVLDDKDRPLTTVKLKSNTLNVTLPRQTLIDIIKSYVKDDAIFTNHEVTHIDNETDKVTIHFAEQESEAFDLCIGADGIHSKVRQSVNADSKVLYQGYTCFRGLIDDIDLKHPDCAKEYWGRKGRVGIVPLLNNQAYWFITINSKENNHKYSSFGKPHLQAYFNHYPNEVREILDKQSETGILLHNIYDLKPLKSFVYGRTILLGDAAHATTPNMGQGAGQAMEDAIVLVNCFNAYDFEKALQRYDKIRVKHTAKVIKRSRKIGKIAQYRSRLVVAVRNRIMKMMPNALAAGQTKFLYKSKEK >NZ_CP019593.2|WP_000417008.1|2334627_2335581_+|2-hydroxyacid-dehydrogenase MEKVYVAGAIPEVGLKLLQEHFEVEMYEGKGLVDKDTLIKGVKDATALISLLSTNVDKDVIDAGKDLKIIANYGAGFNNIDIEYAREKSIDVTNTPKASTNATADLTIGLVLAVARRIVEGDQLSRTTGFDGWAPLFFRGREVSGKTIGIIGLGEIGSAVARRARAFDMDVLYTGPNRKEEKEREIGAKYVDLDTLLKNADFITINAAYNPKMHHLIDTEQFKMMKSTAYLINASRGPIVHEQALVQALKNNEIEGAALDVYEFEPDITDDLKSLNNVVLTPHIGNATFEARDMMSKIVANAAISAVQGEKPQFVVN >NZ_CP019593.2|WP_000737699.1|2333764_2334265_+|CHAP-domain-containing-protein MKKLVTATTLTAGIGTALVGHAQHADAAENYTNYNNYNYNTTQTTTTTTTTTTTSSISHSGNLYTAGQCTWYVYDKVGGEIGSTWGNANNWAAAAQGAGFTVNHTPSKGAILQSSEGPFGHVAYVESVNSDGSVTISEMNYSGGPFSVSSRTISASEAGNYNYIHI >NZ_CP019593.2|WP_000206106.1|2333105_2333528_+|DUF4870-domain-containing-protein MTTEMNDVTNHQPNRKSNDENIMAMLIYLLSLFTSIIGPLIIWLLKKDESKLVDRAGKNYLNYTISYIIWSIVLVVITFIGVFLIATDIDFIIIIGFIITFIGILSIFAFSILSFVFTIIACVKYYNGQEYVIPLTIRFI >NZ_CP019593.2|WP_000684571.1|2331775_2332858_-|octopine-dehydrogenase MKIAIVGSGNGAVTAAVDMVSKGHDVKLYCRNQSISKFQNAIEKGGFDFNNEGEERFVKFTDISDDMEYVLKDAEIVQVIIPSSYIEYYADVMAEHVTDNQLIFFNMAAAMGSIRFMNVLEDRHIETKPQLAEANTLTYGTRVDFENAAVDLSLNVRRIFFSTYDRSCLNDCYDKVSSIYDHLVKEESLIKTNLENGNPEVHPGPTLLNVGRIDYAGEFALYKEGITKHTVRLLHAIELERLNLGRRLGFELSTAKESRIERGYLERDKEDEPLNRLFNTSPVFSQIPGPNHVESRYLTEDIAYGLVLWSSLGRVIDVPTPNIDAVIVIASTILERDFFEEGLTVESIGLDKLDLEKYLK >NZ_CP019593.2|WP_000988993.1|2330280_2331681_-|Na+/H+-antiporter-NhaC MMTRKPTFLESISTMIVMVIVVVTGFVFFDIPIQVLLIIASAYAAWIAKRVGLTWQDLEKGIAERLNTAMPAILIILAVGIIVGSWMFSGTVPALIYYGLDLLNPSYFLISAFFISAVTSVATGTAWGSASTAGIALISIGNQLSISPGMAAGAIIAGAVFGDKMSPLSDTTNLAALVTKVNIFKHIRSMMWTTIPASIIGLLVWFIAGFQFKGHSNDKQIQTLLSELAHIYQINIWVWVPLIVIIVCLLFKMATVPAMLISSFSAIIVGTFNHHFKMTDGFKAIFSGFNDSMIHQSHISSSVKSLLEQGGMMSMTQILVTIFCGYAFAGIVEKAGCLEVLLTTISKGIHSVGSLICITVICCIALVFAAGVASIVIIMVGVLMKDLFEKYQVSRSVLSRTLEDSSTMVLPLIPWGTSGIYYTNQLHVSVGEFFIWTVPCYLCAIIAIIYGFTGIGIKKSSNSRLT >NZ_CP019593.2|WP_001826088.1|2329912_2330107_-|hypothetical-protein MTKLIENLKASIFVSTLTKNLSMYSRFDAPKFGCVNGCMLFILYYRVNRIGENRSFEISTNPIF >NZ_CP019593.2|WP_000717395.1|2329034_2329844_+|CHAP-domain-containing-protein MKKIATATIATAGFATIAIASGNQAHASEQDNYGYNPNDPTSYSYTYTIDAQGNYHYTWKGNWHPSQLNQDNGYYSYYYYNGYNNYSYNNYNNGYSYNNYSRYNNYSNNNQSYNYNNYNSYNTNSYRTGGLGASYSTSSNNVQVTTTMAPSSNGRSISSGYTSGRNLYTSGQCTYYVFDRVGGKIGSTWGNASNWANAAARAGYTVNNTPKAGAIMQTTQGAYGHVAYVESVNSNGSVRVSEMNYGYGPGVVTSRTISASQAAGYNFIH >NZ_CP019593.2|WP_000131824.1|2326469_2328425_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTDNYSLHIFKSMKMSSVKEANLKIIYWLQGTGVVSINLQQYDVKRNDVTVIMLNDLYQIDGHDDSVCCVVEVSAKTFLKFMNANYMMRGKILTNEVASTLRILIKYLIYSKIKQQPYNANDKIINYMCVELMSLNTYDGSRHLVAEEVHDYLTNNHHKKINRKDVINQVSITNKALSDMFKATPYSNFIQYLNHIRLEHCLIDILTSKKPIEEIASSHGFNHYSRFIHLFKETYGDTPKLIRKRNSPTSHSINHSQLVEIDKNIIELFDDTNQSSSSMREIDIPFEPTKRSQMYQPKNIYIKGSNFYWMDYYTIKQIIQRLGVNPENLHIIVTIDTSNELSIEQITLLLQKIVNYNVNVVFRIKHEYKELLTSTERGKIEKLVATIFNMTFESNRCKIAFLINDLNTTAIQKLKRLIDNYIGVFELIYHLEPNELNTRYDKEIDHLIDYFILPLRQIEQVSIARSKIICDVDLINENNDLKEKITMSDINKVTELLTNYTKFRGLIMHMSIISEASKEINLTRLSIFIFIINILNQLRGIVIYQNDTMIVTKFKHEVQCVICLPAALLNENSDAIRLSCKGLQQFSHAKTKQIVLSIDKDNHTSENGVLVNDIMQQHSYWKANFIERNIYDHSLMVSSNSIVHLKYHLEI >NZ_CP019593.2|WP_000032840.1|2325700_2326444_-|transcriptional-regulator MSKFKVKRLTAHILMLKVINDMLKYSFHLTLTQVKLLNLLVKYDNSDSNSASIDRLLKMKEIQSKMALLQMLSYLNNHQWLLKARDQRDQRKLTISINKMHIDKIEYMNNELSDYIERYFGQYTFDFSCDYVSYLLSSQELLLNLKCYLNMCQLSLEELYVLGILNLHKGQLTVKELQGEFHHPIFAVSPILKCLILKGLVKKERCELDERRVIVTIKREKFSKVTMLIQACYNYLEKGIQVKLNNK >NZ_CP019593.2|WP_072460394.1|2337405_2338044_-|autolysin MQQGKGIVQTKEEDGKFVEANNNEIAKAMTISHKDNDMKYMDITEKVPMSESEVNQLLKGKGILENRGKVFLEAQEKYEVNVIYLVSHALVETGNGKSELAKGIKDGKKRYYNFFGIGAFDSSAVRSGKSYAEKEQWTSPDKAILGGAKFIRNEYFENNQLNLYQMRWNPENPAQHQYASDIRWADKIAKLMDKSYKQFGIKKDDIRQTYYK >NZ_CP019593.2|WP_000921246.1|2338203_2338437_-|hypothetical-protein MLKTSAVISNTLLVIGLVCLFMMKLVLAITFFAVSLSISLVVFNMMFRDRTTMKVIVNASFLIVILAIVVAYFLLSK >NZ_CP019593.2|WP_000840813.1|2338731_2339205_-|DUF1641-domain-containing-protein MAERISSKIRRLEKSEEQIKLESLNEVTEAIAANKDSILKAIKLIKVLDDAKILDALNGAVRGRQVIINKFAVELNKDIYTGLLSNMASMVFLLGELNVSDLSDFLNKVNKGLHVANQASPNAKTSVRSLFGVLKDDDMNRSLTYMLNMLKGMSRED >NZ_CP019593.2|WP_001155267.1|2339204_2342159_-|formate-dehydrogenase-subunit-alpha MQEHLVVTLDGKDYLVEPGTNLLEFIKSQDTFVPSICYNESMGPIQTCDTCTVEIDGKIERSCSTVIDRPMTVNTVNNDVKDAQKEALDRILEKHMLYCTVCDYNNGDCEIHNTMDAWGLQHQTYEYKEKPYEKDYGPFYRYDPNQCILCGRCVEACQDIEVNETIRIDWDREHPRVIWDNDVPINESSCVSCGQCATVCPCNAMMEVNMEGNAGYMTDTEPGSLAAMIDLTKKAEPGYGPLFAISDSEAEMRKERIKKTKTVCTYCGVGCSFEVWTKDREILKVQPSHDSPANKIATCVKGKFSWGHINSDQRLTKPLVRKNGEFHEVEWDEALNVIADNFTSIKEKHGPDALSFISSSKATNEESYLMQKLARQVIGTNNVDNCSRYCQAPATKGLFRTVGHGGDSGSIEDLEKAAMSVLIGTNTAEAHPVIASRMKRAQKLFGQKIHVFDIRKHEMAERADRFYQPKPGTDLAWLSAVTKYIIDHDLHDKAFIEEWVEDFDEYYKSLETFTMAFAEEATGIPEAELIKFAEECAKAESVVICWAMGITQQDIGSDSSTAISNLLLVTGNYRRPGTGAYPLRGHNNVQGCSDMGSMPDKITGYQSIEADDIRAKFEKEYGVKLNPKAGKDNHEMVEGIHDGQIHSLYLYGEDTGIVDSNINFVQAAFEKLDFMVVQDEFLTFTATFADVVLPASPSLEKDGTFTNTERRIQRLYQALKPLGESKPDWKIFQAIANKLGFDWNYKHPSEIMDEIARLTPLYAGVSYERLEGFNSLQWPVHPDGTDEPILYLEGFNFDNGKAKLFPLSFDNYFKQDEVYDIHVNNGRLLEHFHEGNMTYQTPMLKYKVPRAFVEISPELAEDRGIHEGAEVKLISETGEAVLQVHVTDRVKGKEIYIPLNNDAMENGDLGAINLLTNSDVDQYTDTPSYKRTSCRLEVITKRGKSPLNPNNFRVNKKRHPQYSVQVQKKWERPDYVFPGNQVDK >NZ_CP019593.2|WP_016187165.1|2342760_2343684_-|putative-transcriptional-regulator MSLPKKIFLWVFGILVILAIVAVVYVAAKIFITGNKIHNPLDRNHSELRDKKVSLNDGDPFTIALFGVDSDADRKKKGGGERSDSIMILSINPKTKKTEIVSIPRDTRAEIVGRDTTEKIAHAYAYGGPNMAVKSLEKLMNVPIDHYATIDMDGLHNMIDSIGGVDVVSNDTFTVDGVRFTKGQQTHVNGDQALKFIRSRKEEGAGGDFGRQQRQQIVLEAMANKIASPSSITHFNSLMNEIQNNVKTDLTLGDLNTIRSNYKDANDTINKHQLSGQGGIQSDGLYYFIPSEQSKAESTKLLKDNLE >NZ_CP019593.2|WP_000130460.1|2343840_2344638_-|inositol-monophosphatase MTDKTLQQIDKLICSWLKQIDNVIPQLIMEMTTETKRHRFDLVTNVDKQIQQQFQQFLATHFQEHQLLAEEKSNEMITNEINHLWIMDPIDGTANLVKQQEDYCIILAYFYEGKPMLSYVYDYPHKKLYKAIRGEGAFCNGIKMEEPPSLKLEDAIISFNAQVMNLDTVQDLFDASFSYRLVGACGLDSMRVAKGQFGAHINTNPKPWDIAAQFLFAELLNLKMTTLDGKAIDHLKGAPFIISNKACHETVLKILNANGGYQKYR >NZ_CP019593.2|WP_001030125.1|2345022_2345715_+|YafY-family-transcriptional-regulator MNKAERQNLIITAIQQNKKMTALELAKYCNVSKRTILRDIDDLENQGVKIYAHYGKNGGYQIQQAQSKIALNLSETQLSALFLVLNESQSYSTLPYKSEINAIIKQCLSLPQTRLRKLLKRMDFYIKFDDTQHMTLPMLFSDILIYCTERNVMLVDHRVDDNIKAENVIFIGLLCKHGHWHAVIYDIAQDKTAELEIENIIDISYSFGKTIQTRDISIDNYHQFLNPIDS >NZ_CP019593.2|WP_000426692.1|2345739_2346477_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease-SdpB MENEKKKYTFKDIAWRDLFIIPIIGVLSFALTIAAYIVPILFGYYEIDSNLIFVGTITQALAYTIGIGAFYLFHLKVMPSRLRAGFAYIKKYWLRLSITYIIALILIYTYEYMTQFLPKHLQYSETANELELNKMFEVPVFLPVAFLLIVIVGPIVEEIVFRHILIGELGKKFNFIAMSIVSVFLFAFIHVTDAKSPFEFGPYLILSIILVFTYIKSGRNLGSTIALHIANNFVSFVISVISIYA >NZ_CP019593.2|WP_000606724.1|2346525_2346855_+|hypothetical-protein MINETKYMRQQITNLIQIIDTIKYNTLMTDWNIQTHIYKFNQIVTNELNKFKGFETSYIINENQVFYYEIITLLNKRPLRQVDYGNKIQYLNFYHTELSNALFAIKFAH >NZ_CP019593.2|WP_000073196.1|2347299_2348172_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MSNVLTEIDSQYPYMTKNEKKIAKFILNSPQKVIKMRSQDLASLLDISTSSVIRFSKKITDGGFHDLKINISKYVPKASSIYNVELMNNESTESLRTKLHTRTTRALNHANNELNDKTIDQICHCLKRSETIFIYGFGASFVVATDLYQKLSRIGLNIQLVQETHIFATLLATHNSNDSVILITNNGTQSEMQSMVKVIDDYHIPIITITSTRDNPVAQASNIVLTYGKTDENEMHMGATTSLFAQMFTIDILYYRYVALNYHASLDYITQSKMALDNYRKHLSNINFKH |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_3 | 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | NZ_CP019593.2 | 891983-892007 | 0 | 1.0 |
NZ_CP019593_5 | 5.1|1738842|25|NZ_CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | NZ_CP019593.2 | 730521-730545 | 0 | 1.0 |
NZ_CP019593_5 | 5.1|1738842|25|NZ_CP019593|PILER-CR | 1738842-1738866 | 25 | NZ_CP019593.2 | 2029394-2029418 | 0 | 1.0 |
NZ_CP019593_7 | 7.1|1829653|35|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 1829653-1829687 | 35 | NZ_CP019593.2 | 1927338-1927372 | 0 | 1.0 |
NZ_CP019593_11 | 11.1|2337198|26|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 2337198-2337223 | 26 | NZ_CP019593.2 | 1618818-1618843 | 0 | 1.0 |
NZ_CP019593_3 | 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | NZ_CP019593.2 | 242726-242750 | 1 | 0.96 |
NZ_CP019593_3 | 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | NZ_CP019593.2 | 242784-242808 | 1 | 0.96 |
NZ_CP019593_3 | 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | NZ_CP019593.2 | 242842-242866 | 1 | 0.96 |
NZ_CP019593_3 | 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | NZ_CP019593.2 | 336521-336545 | 1 | 0.96 |
NZ_CP019593_3 | 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | NZ_CP019593.2 | 606202-606226 | 1 | 0.96 |
NZ_CP019593_3 | 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | NZ_CP019593.2 | 871217-871241 | 1 | 0.96 |
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NZ_CP019593_3 | 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | NZ_CP019593.2 | 1085275-1085299 | 1 | 0.96 |
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38. spacer 5.1|1738842|25|NZ_CP019593|PILER-CR matches to position: 984949-984973, mismatch: 2, identity: 0.92
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52. spacer 11.1|2337198|26|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to position: 871006-871031, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagaagctggtgg Protospacer *************.*********.**
53. spacer 11.1|2337198|26|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to position: 1289804-1289829, mismatch: 2, identity: 0.923
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54. spacer 11.1|2337198|26|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to position: 2115264-2115289, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacaaaagctggcgg Protospacer *************.*.**********
55. spacer 11.1|2337198|26|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to position: 2469094-2469119, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacagtagctggcgg Protospacer *************.** *********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019593_1 | 1.1|260755|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 260755-260779 | 25 | NC_014792 | Enterobacteria phage vB_EcoM-VR7, complete genome | 154175-154199 | 3 | 0.88 |
NZ_CP019593_1 | 1.2|260811|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 260811-260835 | 25 | MW117966 | Synechococcus phage S-H9-1, complete genome | 42366-42390 | 4 | 0.84 |
NZ_CP019593_3 | 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 776837-776861 | 25 | NC_041884 | Acinetobacter phage vB_AbaM_ME3, complete genome | 74208-74232 | 4 | 0.84 |
NZ_CP019593_1 | 1.2|260811|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 260811-260835 | 25 | NZ_CP038259 | Acinetobacter baumannii strain 39741 plasmid pEH_gr13, complete sequence | 11151-11175 | 5 | 0.8 |
NZ_CP019593_1 | 1.2|260811|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 260811-260835 | 25 | NZ_CP047617 | Lactococcus raffinolactis strain Lr_19_5 plasmid pLraf_19_5_1, complete sequence | 79395-79419 | 6 | 0.76 |
NZ_CP019593_7 | 7.1|1829653|35|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 1829653-1829687 | 35 | MT150133 | Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540, complete genome | 25913-25947 | 11 | 0.686 |
NZ_CP019593_7 | 7.1|1829653|35|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 1829653-1829687 | 35 | MK234886 | Escherichia phage AnYang, complete genome | 114962-114996 | 11 | 0.686 |
NZ_CP019593_9 | 9.1|2104199|34|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 2104199-2104232 | 34 | NC_027332 | Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome | 68639-68672 | 11 | 0.676 |
NZ_CP019593_9 | 9.1|2104199|34|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder | 2104199-2104232 | 34 | KY000079 | Acinetobacter phage AM24, complete genome | 74925-74958 | 11 | 0.676 |
1. spacer 1.1|260755|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to NC_014792 (Enterobacteria phage vB_EcoM-VR7, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
ggcgaaaatacagcttacaataatg CRISPR spacer gacgaaaatacatattacaataatg Protospacer *.********** ***********
2. spacer 1.2|260811|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to MW117966 (Synechococcus phage S-H9-1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ttggaacagcaatttctactggtat Protospacer ******************* *..*
3. spacer 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to NC_041884 (Acinetobacter phage vB_AbaM_ME3, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
gcttgtagaatttcttttcgaaatt CRISPR spacer tcttgtagaagttcttttctaaatc Protospacer ********* ******** ****.
4. spacer 1.2|260811|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038259 (Acinetobacter baumannii strain 39741 plasmid pEH_gr13, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ctggaacagcaatttctccagaggt Protospacer .**************** **** .
5. spacer 1.2|260811|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP047617 (Lactococcus raffinolactis strain Lr_19_5 plasmid pLraf_19_5_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
ttggaacagcaatttctacagacaa CRISPR spacer ctggaacagcaatttctacattatc Protospacer .*******************
6. spacer 7.1|1829653|35|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to MT150133 (Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
ccaacatagagaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer atggtatagagaattttgaaaaagaaattctcttt Protospacer ....***********..************* .
7. spacer 7.1|1829653|35|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to MK234886 (Escherichia phage AnYang, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
ccaacatagagaatttcaaaaaagaaattctacag CRISPR spacer atggtatagagaattttgaaaaagaaattctcttt Protospacer ....***********..************* .
8. spacer 9.1|2104199|34|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to NC_027332 (Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgctggtaccacgatgcgtcttgatgtagtgcta CRISPR spacer gatcaataccacgatgcgtcttgaagtggtagaa Protospacer .....****************** **.**. *
9. spacer 9.1|2104199|34|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to KY000079 (Acinetobacter phage AM24, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tgctggtaccacgatgcgtcttgatgtagtgcta CRISPR spacer gatcaataccacgatgcgtcttgaagtggtagaa Protospacer .....****************** **.**. *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
708694 : 716514
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019593|708694:716514|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTCTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCAAGTGGAACAATAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCTATGACTGGTACTAGACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGCTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGAATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGATAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAATTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTTAAGTAAGAAAATATTTGTCTGAACTACTTATCACTAAAAAACACTTCTGATATAGCGAATTAAGAATATCAGAAGTGTTTTTTAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCAAAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTATTATTATTTTCAGCAGATTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAATAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAATTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTTACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019593|708694:716514|713766_714435_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP019593|708694:716514|708694_709750_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP019593|708694:716514|714785_715379_+|WP_000604516.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAVEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP019593|708694:716514|712628_713342_-|WP_001062968.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP019593|708694:716514|713345_713765_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP019593|708694:716514|710410_710884_-|WP_001037805.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIIVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP019593|708694:716514|711945_712530_-|WP_000637685.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDESAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLFWQKVYKF >NZ_CP019593|708694:716514|711224_711665_-|WP_001093557.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP019593|708694:716514|709749_710436_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP019593|708694:716514|715362_716514_+|WP_084570056.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCSHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQITSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
728484 : 742801
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019593|728484:742801|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019593|728484:742801|728484_729543_+|WP_000663034.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFIPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP019593|728484:742801|738786_739758_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP019593|728484:742801|740128_741100_+|WP_000876311.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP019593|728484:742801|736561_738667_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP019593|728484:742801|731988_732096_+|WP_014936998.1|DBSCAN-SWA MVINEIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILISCI >NZ_CP019593|728484:742801|742039_742801_+|WP_000616865.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILDDISIEIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRKRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVAMKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP019593|728484:742801|729701_730244_+|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP019593|728484:742801|734532_735399_-|WP_001068490.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGKLSSQPLLLTRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQTQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKVIKK >NZ_CP019593|728484:742801|736200_736599_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP019593|728484:742801|732167_733673_-|WP_000193750.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVILAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP019593|728484:742801|734012_734513_-|WP_000930016.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEQMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP019593|728484:742801|741086_742043_+|WP_001245567.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTFLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVIILVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWIVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP019593|728484:742801|730980_731898_-|WP_000429003.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKAKDYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTYDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISITTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
914658 : 966673
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019593|914658:966673|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(40.0%) | bacteriocin,protease,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
986456 : 994929
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019593|986456:994929|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019593|986456:994929|989022_989694_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP019593|986456:994929|989686_991876_+|WP_000032750.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPIVGMVGLIENVDYLNDFQPQVGDKLYVIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESIDLSSEVKKGESIKTAIRQGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSLIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP019593|986456:994929|991854_993339_+|WP_084570067.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKMLAQESPVKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLRHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP019593|986456:994929|993331_994360_+|WP_000030815.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIETNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP019593|986456:994929|986925_988050_+|WP_001010409.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP019593|986456:994929|988053_988758_+|WP_000174055.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP019593|986456:994929|994362_994929_+|WP_000238668.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLDSFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP019593|986456:994929|988757_989021_+|WP_000848351.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEDEKENA >NZ_CP019593|986456:994929|986456_986939_+|WP_001807816.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILATRMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1251175 : 1257935
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019593|1251175:1257935|DBSCAN-SWA TATGAATTGCTATGATGAAATATACAATACAATCAAAAAATTGATAGAAAACAAAGAGATATCGAGTTATCAAATTAATAAAGATACTGGGATAAGTTACGGTAATATTAATGCTATGCGCCGTGGAGAAAGAAGAATAGAAAATTTAAGCTTAAAGAATGCAAAGATCTTATATGAATATGCGAAAAAGGTATTATAATATAAGCATTGAGTTCAATAGGCATACAATAACTGCCCAAACTAGTGACTGAGTGGGTGTTTTTATAGTATTAAAAGTTTTCTAAAAGTGAAAGAAATCATGTTTAGTGGTTTACTTATGTTTTTCAAAATAGTATAATAATTTTATATAATACATAGAACTTCAGTATACCTTTTGAGTATATATGGAGTTCTTTCTTTTTTACAAGATGTATATGTATAAATGGAAATGTTTATTACATTACATAAAAACCTTTAGGTGCTCTTAGATGGATGTTAATCATAAAACAAAGTGATTTTGAAAAATATAGGTTATTATAATTTAGAATTGGAAATTATAAATCTTGTCATTGGATATGGGAATTCAAACATATCACTTACAACAATTTGTGGAATGTTAAATAACTATAAAGAGGAAAGGAGAAAAAATGATAAGAATGGTTAAAGAAAAAGAACGAATAGCAAAATTAAATTTCGAATAGCTGTGACGAGCATAATAATTCAAGTGCTTAATTTTATCAAATCGTTCTTTTAAAAAGGTAAAGAACAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTATCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACAAGAAAAAAATAAAATATTCTTTAATTTTTACAAAAATTACGAACCAGTTTAAAGAAATTTATAATACAATAGAAAAATTACTAAATGATAAATCAATATCTAATTATAGAATTAATCAAGACACTGGTGTTTCTTATGGTGGTATAAGTGAATTAAGAAGCGGGAAAAGAAAAGTGAATAATTTAACTTTAGAAACAGCGGAAAAACTCTATAATTACCAAAAACAATTAGAAATAATGATTGAAGATTAAAATAAGGCCATATCTTTTGAAATATCATGGAGTGAGCCTTTTAAATCATCTAATTTTAAAGTATATTAAATATGGATAGCTTAATGTGAATATAAATAAAAAATTATCAAATAATATAATATAATATAGAATAGATTGAGACAAGGAATTTTATCAATATATAATAAAAAACGCCAATACTATTAGGCATTAGTTTATGAATTAACTAGTTTGGCAACTACAAAGAAACAATGTATTGCTAAACGTAGTTACTGCATTAGGATAATTATAATTATAAATAGAAAGAGAGCGTGATTAAAAATGAATGAGATTGAAACTATTATAAGTGAAATAGAAAAGTTATTAACTAACAATACACCATATAGTATTTCAAAAAACTCAGGTGTACCACGTCAAACAGTTACTGATTTAAAGGTAGGTAATACTAAAATAAAGGATGCCAAATTTAAAACAATAATCAAGTTATACGAGTATCAAAAGTTGTCAGAAAATAATTCAGAGTGCTAATAAATATACCTTGTTTGATTAGGTGGACAAGAAATTAAATTTCTAATGATTTCATGGTTGTCTGTCCATGCTTTGTCCACCTCAATAAAATTATCTCTAGGTTTTTAAAATTGTACATGTTTAAACAATCAAATGTATGCATTTTTATATTATCATTTCCATAAAAATTTAAATGATCTTTAAGTGATGATATAGAAGGCTGAACACAGTAAATAAGTTAACTTTAATGCAGTATTCTATACTATACATATTTTGTAATAATGTTTATGTGCATAATTTTTCATTGACAATTTTTTATATTAAATTGTGTAATTGGCATATATGATGATTTGTGATAATTATATTGTAATATAGCATTTGGTTTTATGATTCTAAAATTAATAGATTTGAAAAGTATACTTTATTTCATGAAAGTTTTTGGTACATTTATTTGAAAATGTTTTTATTACAAAGTTACATGCCTAAATGTTTCTTAACAAAATTAATTCATCGAGTGTAAAGAATCGTGTGGTAAACATAATTTATATAGATTATAAGGAGGTGAAAATGGTCGAGGAAGTAAAAACGATAAAATAGTTTGAATGTTTTGATTTTAATTCTGATAGGACTATTGAATTTGCAAACTAATAAGAATGTGAGGTTTGATTTAATACGAAGTCATATTCTTTGAATAAAATATTACTTTCTCACCATTAGTAAAATGAAGATGACTATTAAAGTGCGAAAAACAAATAAAAAAGAGAAAATAGAATTTTTAATAGGGACGTTTATAATTATTTTAGTAATATTAGGGTTCAAAATTATGAAATAAATGTATAGTATTTGAGAAGTCTATATGACTCCGGAAAAATTAAAGTCTAAAGATATCTCTATATCTCAAATTTAATAGACTACTGGAGTTAGTAGTTTGAATATTGAAAGACACTAATCTAATAAAAATACATAAAAGGTTAAACATTGAAGTTTAGTAAAAGGCGTAAGGTATACAAGACAAATCGTTTGTCTTTGACAAAGTAATTGATGATGAAAAGTTGTTAATATGTAGAAACAAAAATTGAAAATATGAAATTTAACTATTATGAAGTGATGATAGCTATTAATGAATAGAAAAATAATAAAATCATTTATAAATAAAAAATACGTTGAGTTCACAGAATTTCGAAAAAAAGTAGTAAACATTGTACAGATATGGAGATGAAAAAAATGTCAGAATACAAGAAAAAGATAATTGAATTAATTGAAAGTAATTTAACAGGATATGAAATTTCTAAAAAAACTGGAGTTTCTCAATATGTACTTTCACAATTAAGACAGGGCAAACGCGAAGTAGATAATCTAACCCTGAATACAACAGAAAAATTATATGAATATGCCAATAAAGTTTTGTAATATAACTACTGTATAAATTAATCAAGCTATGTTTATTTGATTAAACTATTAATAAAAATCATATGGTGAATAGATATTATAATAATTAAAATACAAAAATAGTAGATTCCAATTTGTGAAAAAGGAGTATGTCGTTTCATTTAGAATTTATTGCACGAAATTAGCATCGAATAAGGGAAAATAAGTGTTAAGTTTTAAATGATAAAAAAGATTGGAATGGATCGTCTTGAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTCAATGTCTACTTCGAAGGGGGCATTTCCATTAAATTGTTATAGCTATTTATATTTGTATAATGAACATATAAGGTTAAGTAGGTGCGAGTGAAGGAAATAAAAAAGCTCAAATGTACTAAATTTTTAATCTTAATAAATCTCTACTTTATAAAGATTGAATGGACATTCGAGCGTTAATCAGTCAGGAGGGAATTTCACTCCTACAATGTAATAATAATACTTGCTTCACCACTATACAAGGAGTGAGTTGTTATGTTCAAAGTGAATTATTCGATTTTAAGTTATTATCCAGATATTTATCTCCATAGTAATTTAGCTGTAGGTGTGGCATTTGAAATTATAGGAGAAAGTTATCATAAGAATGAAATTAAATTTATAACCCAAAGAAGAAAAATTTCATCATTTGATGATGAAATAGACAATTTAGTACTTATTAATATGTTTTTGGATGGACTTAAATGTGAATTCGAACAAACTAATCAATCAATAAAAAATTATAAGAAAAAGTTTGTTAATAATTTTTACTTTGAGAATATTGAATATAAAATGTTTGACTCATTAAAAGAAGTTAATAATTTTATTGAAAAAACATATAAATATGTATTACATATTGGTTTAGATAAAAAAGAAAGACTTAAGAAAACTGAGAAAGAACTTTTGAATAGCTAAGTAAAAAGGTCAAACATATTGTTCTGAATATAAATAAGTAATAACCGTACCTTTATTGATGCGGTTATTTTTTATGTAAAAAAACGAAAAAAGTTTTAAAAAAAGTGTTGGATACAAAACAGGTTGGAAAGAGAAGAAAAAATGACAAATATCGCAAAAGCCAAAAGCGAAATCTTCCGCAACTACACTTTAGGCTTTGCAACACTTGCCACAATAATAAAAATGTTTTTTATAGAGGGGGATATCCCCTCCCTCGTATTATATTACGAGGTGATGAAAATGACAAACTTAACTAAAATTAGAATAATAATCTTTATTAATTATCTAATCGGAATTTTAGCTTTAATATTTGCCTTTTATATAATCTTAATGTCAATAGCGGTTTAAAAATGCTGTTTTATGGCGGTTTGAAAATGTAGTTTTTTAGCAGCTTAAGATTGTCGTATATTTAATGATTTTTCGGTTTTATAATCTTTTAATCGATATGATTCTCCAGTAATTTTAAATACTTTTGAATGGTGAACTAACCGATCAATTATAGCTGCTGATACAATCTTATTACTAAATGACTCTCCCCAACTCGAAAATGTAATATTAGTCGTAATTATTGTTGATTTCATTTCATATTTTAGTGACATTAACTGGTAGAATAAATCAGCTTGTTCTTTGGTGATGGCAGAATAACAAATTTCATCAATGATAAGTAACTCTATTCTGCTTAATTGTTTTAATGTTTTATTAATGATTTCTTTGGAATCTGTGACAGTTAATAAGTCTATTAATTCTTTGAAAGTATAGAATCTAGTCTTTATATTTTGTTTACATGCCTCAATTCCTAATGAGATTGTTAGGTGTGTTTTACCAACAACACGGTTATCTAAGAAACAAATATTTATATTATCTTCAAAAAATGTTATTTTTTTAGTCTCATTTTGTATTTTATTTTTACAGTATTCTCGTAGAATAGTATATTTACCTTCATATCCCTTTTCCTCTATATATTTAAAAATGGCCATAGCTGTATATCCTAATTCAATTTTTTTATTATTAATTTCTTTAAATGAATCTAGTTTTGATGTTTACTTATTTTGTTGTCTTTTCTTCAATCGTTCTAATTCATTTTCTTTTCCTGCTTCATAATATTTTTTAACTGTTATTGGATCACAATTATATTGTCGACCAAGCTCAGCATAATTTGGTTTAATACCTTTCGTAATGTAAAATAGCACTCCTTCATAAATGTCATGTCTCAATTAAATAAGCTCCAATCGAAGATTGAGTTAAAACATGATTATATAATTTAAAAAAGAAAAAATGTATTATAAATCAGTACGTCAAAGGAATAAGGATATAGAAGTAGATATAATTTCTAAAAATACCAATTTGAATTAAAACCTAGTTAAAAGAGCGTATGAACATTTGTTTAAGAATAAATATGATTAGATAACTGTATTAATAATTTCTATCCAGATTATAATATTGCAGTAAGTTGGCAATGTTTAAGAGAAGGAAAAACAATAAAAAACAAGATTTAATACTACTTCGTCAAGAGGCACTTGAACATTATTTGATGAATAAATATAATTATTACTATAGAGAAGCACATGGGATTGTAGAAAGAAAATACAATTTTTCTAGTTATATTGAGAAATAGGGTGATATGATTGATTATTATGAGAAAGTTAAAAGAAGATGATCAAGTTATTGTATATGAGTATATTCCACAAGATAAAATAGAAAAAGGGAAAGGTGAAATAACAGTAAATAAATTAGATTCAAAGGTAATTGACTATAAATTATCAAAAGTTGAAAATGAAAAAGGTATTTTAGTTTATAGAGATAAATCATTTCATGCAATATTAAATTTTATTGATGAAAATAAATTTCCAAATGAATATATATATGCATGGTATTAAAGCATCCTTTCTACATAGATAAAGAGAAAGTGGTGCTATTTTTATATGCTTTTTTAACTATTTACTGAAATAGCAGAATCACAAAAGTTAACATATTTAAAAGAACTTGGTGAAGATGGCGAATATAAATATGTTGCCAAAATAGATAGTAAAACATCTAAATTATGTCATTCACTCAACGGAAAAATATTTAAAGTTAAAGATATGATACCAGGTGTGAATGCGCCACCTATGCATCCTTGGTGTAGAAGTACCACAGTGCCACATGTCGGCAGTTGGCGAGACAAGTTCTTTAAAGAGCGTGAAGGTAAATATCAAGTAGAAGATGACACAACCAAAGATGAATTACAACAAGCTAAAGTATTAGGAAAGAAAATATATATTACTGATCAAGCGATTGATAAAGTAAGATACGTTGATATTCCAACACATACCAAAGAAGAAAATCAATTTATACAAGAACAACATAAAGCCTTGCTTAAAGACGCCAAAGAAAACAATGATAGCAATGAAGTAGCTTATTTATTAAAAGATGGTAAAGTTACAAAAGTATATGGTGATCAAGATAGTGTATCTTTTGCACCAGGGGAAAAAGAAACAGAATTGTTATTTAACAGTAAACCGAATTCAATTGTTATGTTACATAACCATCCTGGGCAGTCTAGTTTTTCTCTTACAGACTTGTATTTATTTATATTTAATAATTCTATTAAAACACTGACAATTGTTACAAATAAAGGTCAAACAAAGTACTTAACTAAGACAAAAGAATATTGCAAATCAACTTGTATTGATTGTATTAAAAAATATAATAAAAATAATAATATAAAAAAATTCAATCATAAGGATATTGATATGATTCTAAAGAGATTATATAATAGTGGTAACATAATATATAAAGTTAGGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019593|1251175:1257935|1253494_1253605_+|WP_001788716.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >NZ_CP019593|1251175:1257935|1255541_1256126_-|WP_000974166.1|DBSCAN-SWA MAIFKYIEEKGYEGKYTILREYCKNKIQNETKKITFFEDNINICFLDNRVVGKTHLTISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVTDSKEIINKTLKQLSRIELLIIDEICYSAITKEQADLFYQLMSLKYEMKSTIITTNITFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >NZ_CP019593|1251175:1257935|1251175_1251373_+|WP_001807853.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEISSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL >NZ_CP019593|1251175:1257935|1252587_1252794_+|WP_001002341.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKLSENNSEC >NZ_CP019593|1251175:1257935|1256189_1256363_-|WP_001215406.1|DBSCAN-SWA MRHDIYEGVLFYITKGIKPNYAELGRQYNCDPITVKKYYEAGKENELERLKKRQQNK >NZ_CP019593|1251175:1257935|1252059_1252287_+|WP_074347689.1|DBSCAN-SWA MFTKITNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >NZ_CP019593|1251175:1257935|1256774_1257026_+|WP_000585092.1|DBSCAN-SWA MIIMRKLKEDDQVIVYEYIPQDKIEKGKGEITVNKLDSKVIDYKLSKVENEKGILVYRDKSFHAILNFIDENKFPNEYIYAWY >NZ_CP019593|1251175:1257935|1254693_1255110_+|WP_000477489.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPDIYLHSNLAVGVAFEIIGESYHKNEIKFITQRRKISSFDDEIDNLVLINMFLDGLKCEFEQTNQSIKNYKKKFVNNFYFENIEYKMFDSLKEVNNFIEKTYKYVLHIGLDKKERLKKTEKELLNS >NZ_CP019593|1251175:1257935|1253997_1254183_+|WP_000006110.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >NZ_CP019593|1251175:1257935|1257095_1257935_+|WP_074347678.1|capsid|DBSCAN-SWA MAESQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVPHVGSWRDKFFKEREGKYQVEDDTTKDELQQAKVLGKKIYITDQAIDKVRYVDIPTHTKEENQFIQEQHKALLKDAKENNDSNEVAYLLKDGKVTKVYGDQDSVSFAPGEKETELLFNSKPNSIVMLHNHPGQSSFSLTDLYLFIFNNSIKTLTIVTNKGQTKYLTKTKEYCKSTCIDCIKKYNKNNNIKKFNHKDIDMILKRLYNSGNIIYKVR |
10 | Staphylococcus_phage(71.43%) | capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1439489 : 1535294
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019593|1439489:1535294|DBSCAN-SWA ACTATATTTTGACATGATTATTCACCCATTTCAAAATTTCAGTTTCTTCGTTGCTTACTTTACCTGTTACAATCGCTATCTCAATTTGTCTTAGCACATCTTTTAACCACGGACCACTTTTGGCATTTAAATGTGCCATAAGTACACCGCCATTAACCATCATGTCTTTTCTATTATGCATAGGTAAATGATGTAATGTTTCATCAATCGTTTGAAGGTTAACGATTAATGGTTCATGTCCTTGAATATCATTTGCCTTTAACACGTCTGCTGCAACCATTACATTTTTAATGAGATTCGTATCATAATCATAAACAAACATTTTTAATTGTTCTTTTGTAATAATACTTGGTAATGCATTCATAATTTGAATATATTGATTGATATCTTTTACTTGTCGGTTACTTAGCTTTAAAGGCTTCAATGAGTAATTAATATCAAATTTAACTGACACTATAGCAATCAACAATTCTAAATCAATTGGTTCAGTTACATTAATTTGATTCATATCAAGATGTTCGAAATATGGCATATAATTAAATGCTTTCAGCGATTTTAAATGATTAAAACTCTCTTCAACATTAATACCTCGCATTAATTTAGTTAGTTCAATCACTATACGCTCAATTGATAAAAATTTAATATCTGCCATTTGTGTACGCATCGCTTCAAATGTTTCCGTTGCAATTTCAAATGATAATTGTGACTGGAATCTTAAACATCGAATCATGCGTAAAGCATCTTCTTGGAATCGTTCCGCAGCTATACCTACAGTTCTTATTATTCGATTATTAATATCTTGTTGACCATCAAAATAATCATACAATTTGTATGCTGTATCCATTGCTATCGCATTCATCGTGAAATCTCTTCGTTGCAAATCTTCGTATAAATCACGAACAAATGTAACACCACTTGGTCTACGGTGATCGACATAATCTTCTTCAGCCCGGAATGTTGTCACCTCATAATTTTCATCATTAAAAACTACATTTATGGTGCCATGTTCTTTACCTACAGGTATCGTATGACTAAAGATAGATTCTATTTCATCTGGCGTTGCACTTGTTGTGATATCTATATCATGAATATTTCTTCCCATGACATAATCTCTTACAGAGCCACCTACATAATATGCTTCAAAACCATTGTCTTGAATTTGTTCTAATATAGGCCTTGCCTGTTCAAATAATGATTTATCCATATTATTACTCGCCTTTACTTTTGTTATGCTCATTTAGCATTTTTTGATAGTAATACTCATATTGATCTGTAATGAGTTCTGATCCAAAACGTTCAGCAATATCTGCTAGCATGTTTTTCTGAAGTTTGTTGTATAACACCTTATCTTCAAGTAATCGAATAGCATAGTCACTCGCCGAATCACAATCACCCACATCTACGACAAATCCAGTTTCACCATGTTTAATAACCTCTTTAATTCCACCGGCATTTGAACCAATTGGAACGACGCCTGTTTTCATAGCCTCAAGTAAAGTTAGTCCAAAGCTTTCTTTTTCACTTAATAATAATACTAAGTCAGATAATTGGTAAAATTCACTTACGCAATCTTGTTTCCCTAAAAATAAAACATCCTCTTCTACGTTTAACTCTTTCGTCAATTGACGCATTGGCACTAATTCAGGACCATCTCCAAGTAAAATTAATTTACTAGGTATCTTATCACGTACTTTTGCAAATGTTTCTATAATAGTATCTATGCGTTTTACTTGTCTAAAATTCGATACATGTATTAACACTTTTTCATCTGGTGCTATACCAAATTGTGATTTTAACGCTGTGTTATGTTTAGTTGGAAACTCATTTTCACGTACAAAATTATAAATCGGTATAATCTCTTTGTTAGTTTCGATAATTTCATGTGTTTCTTGCGCTAAAGATTTACTCACACTTGTCACAATATCACTTTTTTCAATGCCAAATTTAATTGCACCTTGGAGTGAATGATCATAGCCCAAAACAGTAATATCAGTACCGTGTAACGTTGTCATAATTTTTATATCTTTACCTGACATCTCACGAGCTAAAATCCCACAAATTGCATGAGGTACAGCATAGTGCATATGCAACAAATCAAGATCATATTCTTTAATAACTTCAGCGATTTTAGTACTTAACGTAATATCGTACGGTGGATACTGAAAAACTGCATATTGATTCACTTCAACTTGATGAAAAATCATATTCGGTAATGGTTTTCTTATTCTAAACGGGATATTTGAAGTGATAAAATGTACTTCGTGACCTCGCTCTGCTAATTTAATCCCTAATTCTGTGGCAATAATTCCAGAACCACCCATGGACGGGTAACATGTTATACCTATCTTCATTCGCTTGCCCATCCTTTCTTTCTATTTCTCTTTCTATTATTCTCGATGCGTAGATAATTGTTTAAATTTAAGTTTATAGTAATGTTGAGTTTATAATTTCAAATATCTAAAAAACAGGTGTTGTATATATAATCATTTATCTAGTTATACTTACTTTAAAAATAATATGATTTCATGCGATGCAATTCATTGATGGATGTTTTTAATCTTAATCAAATCCAATTAAAGCATATATTTTTATATTCACTTTCTTTCGAATCGATTTTTATCTCTTGTATTAAACTTTTCCATTGTTTCATTAAAGCTCTCTGTCATATCTATTCCCATTGAATTCGCTAAACATAATAACACAAATAAATTATCACCTAATTCTGCTTTAATCGTATTTGCTTCCTCTGAATCTTTCTTCTTTTTTTCACCATAGGTATGATTTATTTCACGTGCAAGTTCGCCCACTTCTTCAGTCAATCTAGCTAAGTTAGCTAATGGTGAAAAGTATCCTGTTTTAAATTGTCCAATATATTCATCAACTTCACGTTGCATTTCTACCATTGATTTCATTTCTACGTTCTCCTTATATTGCATTTCTAATATAGTATATATCAATTTGAAGTCTCATGCATGTTTAGTGCAATCTACTGACTCTAGCTAAACTAGATGACAAGTTGTTTATTTTAGAAGTTTAATCATTCAGTTTATATAAATGTAATGCATTCCTAACTAAATTAAATCAATTGAAATTGAGATTATAACTTTATGATTCGTACCACTACAATAAAATAATATAGTTAATAATCTACCATTAGAAAATAAGCACAAAAAAACTAGCAATCACACAAAATGTGATTAGCTAGTTAATAAGTGTCTAATTTAAGTTAATTGTTAATCTATAAGATTAATCACTTGAACGCGCAATCAAAATAATACGTACAAGCTCTGCTACAGCGACAGCAGTTGCTGCAACATAAGTCATTGCTGCTGCAGATAATACTTTACGCGCATGTTTGTATTCCTTTTCATTTACAATGTTCAATGCCGTAATTTGTTTCATCGCTCTTGAACTCGCATCAAACTCAACTGGTAACGTAACAATTGAGAATAATACCGCTAATGACATTAAACCAGCACCAATCCATAAAGCAGTTGAACCAAATGCACTACCTATCGCTGTTAAGATAAAACCTAACATGATGATCATATAACTTAATGAACTCCCTAGGTTTGCAACAGGTACTAATGCTGCTCTGAATCTTAAGAACCAATATCCTTGGTGATCTTGAATGGCATGACCAACTTCGTGGGCTGCAATTGCAGTTCCAGCAACTGATGGTCTGTCATAGTTTGCAGGAGATAGTGAAACAACTTTCTTTTTAGGATCGTAATGATCTGTTAAGAATCCTTCACCTTTAACAACTTCGACATCATAAATACCGTTTGCATGTAAAATTTCTAATGCAACTTCACGACCCGTTTTACCACTAGTTGATCTAACTTGTGAATATTTCTCATAGTTAGATTTAACCTTGTGTTGTGCCCATAAAGGAAGCACCATTAATATTACGAAATAAATTATCATAGTAAAAATTGAAGACAATAAACTCACTCTCCTTTATAAATATTTTACTGTCATTTGCCGTTTTTATCAAATCATTTACACTTTAATAATTTGTTTAATTCAATATAAAGCAAAAGTCCAAAAACACTCAGACAACATGATAATACACCAATTTGCCACACATGTGTAGTTATAAAATCATAATATGGAAATTGAAGGTGAAAATAGTCAATATAATCATTCAAAAATACCCAAGTCATCGCTACACTGATTCCAATCATAGAACGTTTAAACCTAGGATAGAAGTAAATTGCCTGAACAGCCATTATACTGTGGGAAAACATTAATACCAGGCCATTTACTGTAATATCACCTTGTTCAATAATAAATAATATATTCATAATAACTGCCCAAATCCCATATTTGAATAATGTTACAAATGCCAGTGCATCGATAATACTATTTTGTTTTCGGATTAATATCAATGAGATAGAAATAACTAAGAATAATATTGCAGTTGGGCTATCTGGAACAAAAATCTTAAACTGCCACGGCGTATGACTTAATTGTTCACCATACCATATATAACCATAAATCATCCCTAATATATTACAAATGAGTAGCATCATTAACCAAGAACGTTGATAAAGTGTATATTGCCAAAATGTATTAATCGTCATCTGCTAAGTCCTCAAATTGATTATGTTTATTTACTAGCTTGAGTGTATTTAAAATTTGCGTTAGTTGATAAAAACGTTGCTTTTCATTCATCTGTAAACTTAAATCAATATTATGTAGCAAGTAATCTATTAATAACGCATGTTTATGCCGATCTATAGACATACTATTTAAATCATGAAGATAAGTTTGATAGCTGGGCGATTCCGTTAGTTGAGCAACTATTAAATCATCTAGCCTTTGCTCACGCTTTGACACGTTTGCGAACTGAATTTGAATATCAAAAGCACAGTTATGATTAGCGATATAATCAAATATTTCATTTGTATTCATTAACTTTATATTATGCTTAGTAAATTGAATTGCAGAAGCGTGACTTCCCACTTCTGCAATTTCTAATGTTTCATGATGATTAA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119 | Staphylococcus_phage(76.25%) | terminase,tail,transposase,plate,capsid,portal,tRNA,head,protease,integrase,holin | attL 1469137:1469154|attR 1532527:1532544 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1668152 : 1677195
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019593|1668152:1677195|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019593|1668152:1677195|1675163_1676189_-|WP_001019177.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSNRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP019593|1668152:1677195|1673722_1673983_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP019593|1668152:1677195|1668152_1668671_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP019593|1668152:1677195|1668692_1670966_-|WP_000595008.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDVNHDALQLSDMTKAIDRIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSILPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPMSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCEHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP019593|1668152:1677195|1674001_1675141_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP019593|1668152:1677195|1676190_1677195_-|WP_001005766.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDAIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP019593|1668152:1677195|1671168_1673448_-|WP_000749801.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQYWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1800930 : 1848776
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP019593|1800930:1848776|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(91.89%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1938493 : 2035621
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP019593|1938493:2035621|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP019593|1938493:2035621|1941392_1941695_-|WP_000170162.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTKVTREEVEHIANLARLQISPEETEEMANTLESILDFAKQNDSADTEGVEPTYHVLDLQNVLREDKAIKGIPQELALKNAKETEDGQFKVPTIMNEEDA >NZ_CP019593|1938493:2035621|1981593_1981773_+|WP_000669789.1|DBSCAN-SWA MKFKTTKECKSNNIFKRSQEINNRESEKGCLWGISMLILLFLLILFGITACSSSIHFIN >NZ_CP019593|1938493:2035621|2008720_2009371_-|WP_001005262.1|DBSCAN-SWA MNEQIIGSIYTLAGGVVLYSVKEIFRYFTDSNLQRKKINLEQIYPIYLDCFKKAKKMIGAYIIPTEQHEFLDFFDIEVFNNLDKQSKKAYENVIGFRQMINLSNRVKAMEDFKMSFNNEFSTNQIFFNPSFVMETIAIINEYQKDISYLKNIINKMNENRAYNHIDSFITSEYRRKINDYNLYLDKFEEQFSQKFKINRTSIKERIIINLNKRRFK |
111 | Staphylococcus_phage(85.33%) | terminase,tail,capsid,portal,head,tRNA,protease,integrase,holin | attL 2001642:2001659|attR 2025484:2025501 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019593.2|WP_000384171.1|1825721_1825946_-|hypothetical-protein |
1825721_1825946_-
Protein sequences of NZ_CP019593.2|WP_000384171.1|1825721_1825946_-|hypothetical-protein>NZ_CP019593.2|WP_000384171.1|1825721_1825946_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK |
74 aa aa | NA |
LuxR_C_like
LuxR_C_like HTH domain information
|
NA | 1800930-1848776 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|776837|25|NZ_CP019593|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019593 position: 1829629-1829605, mismatch: 1 gcttgtagaatttcttttcgaaatt CRISPR spacer gcttgtagaatttcttgtcgaaatt Protospacer **************** ******** 2. spacer 5.1|1738842|25|NZ_CP019593|PILER-CR matches to NZ_CP019593 position: 1829607-1829631, mismatch: 2 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgacaagaaattctacaagcaa Protospacer ****** **************.*** |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP019593.2|WP_000681966.1|1976623_1976800_-|hypothetical-protein |
1976623_1976800_-
Protein sequences of NZ_CP019593.2|WP_000681966.1|1976623_1976800_-|hypothetical-protein>NZ_CP019593.2|WP_000681966.1|1976623_1976800_-|hypothetical-protein MKHLTKIFVALAIILFIVGYYLQATNHESQGIKLLLAAIMFMICAFISRSNDRRKNNK |
58 aa aa | NA |
WHTH_GntR
WHTH_GntR HTH domain information
|
NA | 1938493-2035621 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|1738842|25|NZ_CP019593|PILER-CR matches to NZ_CP019593 position: 2029418-2029394, mismatch: 0 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaaacaa Protospacer ************************* |
|||||||||||||||||||||||||
NZ_CP019593.2|WP_000990056.1|1977041_1977140_-|hypothetical-protein |
1977041_1977140_-
Protein sequences of NZ_CP019593.2|WP_000990056.1|1977041_1977140_-|hypothetical-protein>NZ_CP019593.2|WP_000990056.1|1977041_1977140_-|hypothetical-protein MMWWQEGMMTLITGGLLIIFRLWLELKWKNKK |
32 aa aa | NA |
WHTH_GntR
WHTH_GntR HTH domain information
|
NA | 1938493-2035621 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.1|1738842|25|NZ_CP019593|PILER-CR matches to NZ_CP019593 position: 2029418-2029394, mismatch: 0 tttcgaaaagaaattctacaaacaa CRISPR spacer tttcgaaaagaaattctacaaacaa Protospacer ************************* |