Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020814 | Alkalihalobacillus krulwichiae strain AM31D chromosome, complete genome | 5 crisprs | RT,PrimPol,cas3,csa3,DEDDh,DinG | 0 | 4 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP020814_1 | 2116239-2116339 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020814_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020814_1
>1.1|2116274|31|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder GGGAATGGGGCCAGGAATGGGACCAGGATTC |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020814_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020814_1 >merge|NZ_CP020814|1|2116239-2116339|CRISPRCasFinder GGCCCGCAAGTAGCAGGAGCAATGTCGCCAGGACCGGGAATGGGGCCAGGAATGGGACCAGGATTCGGCCCGCAAGTAGCAGGAGCAATGTCACCAGGACC >NZ_CP020814|1|1|2116239-2116339|CRISPRCasFinder GGCCCGCAAGTAGCAGGAGCAATGTCGCCAGGACC GGGAATGGGGCCAGGAATGGGACCAGGATTC GGCCCGCAAGTAGCAGGAGCAATGTCACCAGGACC
>NZ_CP020814.1|WP_066151352.1|2114364_2115621_+|ribonuclease-H-like-domain-containing-protein MTMKNKLSRMKNHMGIKSNADPTSMKEQLEQKQEIPYEREWEALQTKPYWFEDGYTLIREKDYDINHPHGRYLFSDIKQVLEKWQNHQNDHPLSAKGRKLEDLVFFDTETTGLSSGAGNTIFMLGYCRVQSESVKIKQYFLPGPESEVALYHYFLTDIGNLGNLVTYNGKAFDWPQVKTRHTFVRNQVPQLPKFGHFDLLHASRRFWKDVLPSCKLSIVEQEILKFNRIEDTPSYMAPMLYFDFLKEQDPEFVKGIFQHHEWDVLSLMTLYTHLSKVILDCDSDAVLPREKFEVARWYEAIGEREIAMELFNQLKGLGSYEAESSMFSYAKARKQRGEFEIALSAFQKLIGTEAFTYFAAIESSKICEHKLKDYEKALFFSYEALKGSSFLSKSSKEKQKKLIADANQRISRLENKLR >NZ_CP020814.1|WP_066151354.1|2112087_2114346_+|DEAD/DEAH-box-helicase MFKQNLEHVLNELKYDQQWKEQIVHWHEIDAVDAKVKPFPEALDTRIEKALSKRGIGALYSHQLEAFLYTRNKENVVAVTPTASGKTLCYNLPVLQEIVDNEESRALYLFPTKALAQDQKSELNEMIDEIGINVKCFTYDGDTAPNIRQAVRKAGHIVITNPDMLHSAILPHHTKWVAFFENLKYVIVDELHTYRGVFGSHVANVIRRLKRIAKYYGSDPVFICTSATIANPKELAQELTGDPMRLIDQNGAPRGKKHFLFYNPPILNKALNIRQSATVEVNQLARKFLENKIQTIVFARSRVRVEIILSHLQQLTRKYLGPETIRGYRGGYLPKQRREIERGLRQGEIVGVVSTNALELGVDIGQLQVCIMTGYPGSVASAWQQAGRAGRRQNESVIIMVAGSNPIDQYIIQHPEYFFERNPESARINPNNLIILVDHLKCAAYELPFKRGETFDGVDIEEILEFLTEEQVLLERANKWYWMNDAFPAHGISLRSASQENVIIIDQSDVSNSTVIGEMDRFSAMTLLHDEAIYLHQGVQYQVEFLDWDEKKAFVREVNVEYFTDANLAIQLRVLEEDQKRPEDDITVSYGDVMVNAKATIFKKIRLSTFENIGSGPIHLPEEELHTNAMWISFSQEITNRFGEGTFDQALTGLAQLLQQVAPVFVMCDRHDLHVVPQMKAEHSELPTIFLYDRYPGGIGLAKEVFNNLSKILKQVEHLITACPCDQGCPSCVGASEVNSKMLVKRFINLLS >NZ_CP020814.1|WP_066151355.1|2111691_2111877_-|hypothetical-protein MEMFGRKRKKKNGNGLMMSMVGIGIGAAAYSMMRNRNGNGMNMNNMMEPIKDMISQNRDQS >NZ_CP020814.1|WP_066151356.1|2111091_2111526_+|hypothetical-protein MEATHYNDLSIHVPKKQLDKLISGVLENKYRIFWGFNKGKMILNIYNSEVNNKLIFKRHKGYLELIEAKLKSANVLKVLDNDIDFTIKAASKQIDVKRSNESVYREIDYFLIELSHFQKIGDLKAVENIKSKLRELSDEWNSLN >NZ_CP020814.1|WP_085449790.1|2110201_2110879_+|hypothetical-protein MGNHSVRRVSNPLSQLNLNEAMMYSDNIYFAKVATDLGIESFEEGLQQFAFNEKLPFSYPNFAESQIAQNQIDSDVLLADTAYGQGQLLVNPLHLALMYSTFVNNGSIPNPILLEEEQPTFWLEGVISEQNASIVLDAMIEVIQNHNGTASHVNLDQVKLAGKTGTAEHKASRDAESGGAETGWFIGMDVEDPELLILMMMENVEDKRSSYYVASKVKELFMEIY >NZ_CP020814.1|WP_180319900.1|2108849_2110256_+|hypothetical-protein MLNKKIYIGFFISVLFLVLAACSESITPPEEVFQNFISSWESGDYEDMYEYLTLSSQTNLSAEEFKELFQSTYDEIKASDIAIQLLQPEIEEDESARGTEVQLQYEKSLSMFTGDLTFDSIATMIFDEEEKKWGVEWTPSMIFPLMEDDDQVKLRIMFPEERGEIYDRNGKPLAINAEIYEIGLVPGRMENEEEIDEVSEKVGVSVEYIQAQLDQSWVGPDTFVPIKKVGSNEKEFVEELYESIPVATYREVSARVYPAGEAAAHLIGYIGMVRQEELENDTDYKYQNDSTIGRTGLEAIFEERLRGQSGGEVYIESIDGIEKHIIQKKESVNGESIQLTMDLGIQEAMFDKFDQDQDMGTGVAIHPITGEVLALVNYPSYNPNDFILGMSSEQYTELESDPDRPLTNRFAQSFIPGSTIKPITAAIALENGLDPEVRIESSDAGWKKDESWVIILLDVSLIRFRNLI >NZ_CP020814.1|WP_034633915.1|2108495_2108699_+|cold-shock-protein MAQTGTVKWFNAEKGFGFIEVEGGNDVFVHFSAITGEGFKSLDEGQSVEFEIVEGDRGPQAANVVKL >NZ_CP020814.1|WP_066151360.1|2106712_2107684_+|DUF1722-domain-containing-protein MRVFATPKVIVSKCMEFEACRYNGGKINEALIAKLGEYVDFIPVCPEVEIGLETPREAIRLVTDGEATQLIQPKSQLNLTEQMKGFAQEFLANRKEVDGFVLKSRSPSCAITDAKVYANVEKSPVIRTGSGMFTERVLALFPFLPIEDEGRLKNFILREHFFTHLFTVADFRIVKQSRKINELINFHAKNKYLFMACNQEKVRELGRVIGNHSGEQMERVFQVYEKGLYELFSIPIKATSHINVCQHVFGYFSKYLTIAERTHFIQLLEQYREKKIPLSSLIGILRSWCYRFENKYLLNQTYFEPYPEGLIAISDSGKGRAFS >NZ_CP020814.1|WP_066151362.1|2106085_2106271_+|hypothetical-protein MYLATLIILLSAFFLMFFWVMMLGNRVSHTIEQILAKDADEELANINLMMSEYEQKENKKK >NZ_CP020814.1|WP_066151364.1|2105403_2105967_-|hypothetical-protein MKKNSVILLIGASIVLSSCGAEDEANIVNDVEAQQLQTEQIAPEAPSIRQQNRERNRQDNDYSIYANEAGFYLSQTATLLEQIAPIFDKNNVNTNKLNQTLSLIEQIQSESESFMNLDRPEPFDGFHHVHLATLIEVDALKRVMSDMKNPIHPLQLTNARVYYENAVQSHKLMEREYLSITEELGIY >NZ_CP020814.1|WP_066151348.1|2116494_2117055_+|DUF1273-domain-containing-protein MKSIVVSGYKSHELGIFDQKHKGIYFIKKAFEQKLRGLIDEGLEWVIISGQLGVELWVADVVLELKNEIPQLQLAVLTPFLNQEENWQETSQQYYHEIISQADFVDSITRRPYESPLQLKQKNEFLISKAEGLLLLYDEEKQGSPTYYLEAAKRRADKEYFPILIITPLDLDILVQEEQFENFDGF >NZ_CP020814.1|WP_066151344.1|2117135_2117447_+|cell-division-regulator-GpsB MSQQSIRFTAKEILEKDFKTSMRGYSPDEVDKFLDAIIQDYELFQRKVELLEQENATLKREVKKLSERSQRQAPAQTVGSTNYDILQRLSNLEKKVFGSKLYE >NZ_CP020814.1|WP_066151342.1|2117458_2117851_+|reverse-transcriptase-like-protein MVEVYIDGASAGDPGWSGAGIFINYKNGQVEHHAVPLGPMSNHEAEYEALIYALEICLEKKINMVSFRTDSKLIDDAIEKRYVKNKKYQPYLEEAVKMIDQLDLFFMKWIPSNQNKTADALARQAIRKNK >NZ_CP020814.1|WP_066151338.1|2118610_2119759_+|class-I-SAM-dependent-RNA-methyltransferase MEKVTLIATATMGLEALVAREVKDLGYEDVQVENGKVTFTADVSAIPRANLWLRTADRVKLKVAEFKAFTFDELFEKTKALPWADLIPVHAEFPVIGRSVKSKLFSVSDCQAIVKKAVVESMKKRYKRGWFDEDGPLYRIEVALHKDVATLTIDTSGQGLHKRGYRYLHNQAPLKETLAAAMIMLTPWKADRPFVDPFVGSGTIPIEAAMIGQNIAPGFNRDFVSEDWHWIGKKVWNEARQEVEDVANYDQKLDILGTDIDHRSVELASNNAMEAGFGDLIQFKQMQVKDLRHRGEYGILVGNPPYGERLGERPEVEQMYKEMGNAFSQHLDTWSIYILTSHEGFEELYGKKATKKRKLYNGNLKVDYYQFFGPKPPRKEEN >NZ_CP020814.1|WP_066151336.1|2121851_2122106_+|DUF2564-family-protein MTNPSGFNDIKQVEMSILSAEHMVGQATRSMDEEQLQAATNALNDAKVQLHKAMSHQTGVDEAFFEMSQELLAKADHQLKEAKK >NZ_CP020814.1|WP_066151334.1|2122163_2122472_-|HesB/YadR/YfhF-family-protein MNFTITDSAASLYKKEIPLSDGETIRLYVRVGGIGSGGFSVGVMKEQPSDTSFKVKKQGITFFVNEDDFWYLDDMTIDYNEDTGYLDFINPRFSQLDHPENH >NZ_CP020814.1|WP_066151330.1|2124189_2124489_+|hypothetical-protein MRIVELLPREGCTITAIDNDLNRYFNGESIMLQCTFAGKSYNFICYQEGVQVKNNQVKALYGPAIVCDEGLVGLSEQEAQFIKTCVNENQFDLNQISLK >NZ_CP020814.1|WP_066151328.1|2124625_2124958_+|hypothetical-protein MLYFTKISTVLSYFLPFVTKNKKDDSWVPSLVPTLTGRVTKVEEQWLLIDHTVYIDIKEAKMFDQEHVSLKLTDIEEGDVVHIWTIERNLIQTTPALGTASYVELQEKEM >NZ_CP020814.1|WP_066151325.1|2125124_2125619_+|small-multi-drug-export-protein MDLLNVIWAYVLVFILSAIPFFEALVVVPLAILGGLHPLLVTVIAVIGNLLTVYLVIVFIEKIKSWRKKKKKDEDQKESKRSRRAQVIWKKYGLPGLALIGPFFVGSHLTALMSITLGGTKKGVAYWMTISLVAWCIGLAILAYLGFDLLGSGDRGFIIEIFNR >NZ_CP020814.1|WP_066151323.1|2125631_2126354_+|hypothetical-protein MWMQTWWLVKKEMINKAGSIFLTALFVMLVGVITATMLGQFIEGQRSNQFLLDLIFIGITPSFAALVMSGPYLTFQTIKTDPFTKVMGFYRSLAIPFRVLVLSRTVFMLFTLVAMSAVYYLTIFLRLQVSFIALFEVSNYLMFALFWFGYALALGGINSFIEYGTSGKMLYIFSFVMTISVVAFVLLFSLTFHVGFVELSIRLLEQYQWYAVCLSLVLGCLGFTLWYKLLYIRLGTRDYV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP020814_2 | 2880317-2880389 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020814_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020814_2
>2.1|2880341|25|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder AAAAATACAGGTTCCCTACGCGTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020814_2
The CRISPR arrays of NZ_CP020814_2 >merge|NZ_CP020814|2|2880317-2880389|CRISPRCasFinder TTAGATCGATCTAATTAATTGGTAAAAAATACAGGTTCCCTACGCGTAATTAGATCGATCTAATTAATTGGTA >NZ_CP020814|2|2|2880317-2880389|CRISPRCasFinder TTAGATCGATCTAATTAATTGGTA AAAAATACAGGTTCCCTACGCGTAA TTAGATCGATCTAATTAATTGGTA
>NZ_CP020814.1|WP_066150847.1|2878857_2880291_-|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MTILEAKPFINGKWISSDREVLEVTSPYSGEVIGKQYLATSDDVEEALAATFAAKKDIAKITSYNRAKILKKAAALLEQEKERFAKLISLELGKPLKNTLDEVARSIETLELSGEEAKRLTGETLPGDVSERGSQAIATTFRVPVGVVAAITPFNAPLNLVCHKVGPSFAAGNSTILKPAPQTALIATELLKLLLEAGLPENAVNMVLGGIETGQQIVKDDRVNIISFTGGTVASKNICEIAGMKKVLLELGGNASTIVHEDADLKRAADICAKTGFSNSGQSCISVQRVYVHKSVVEEFAELLKTEIEKLKVGDPLLPDTDVGTLVHEGAAERIEQWINEAVQEGATLVTGGKRNGASVQPTLLLNPAKTSNVVCQEVFGPIVGIIPYETIEEAIEETNNSEFGLQAGIFTNKMDVAYQVAHALEVGGVVINGSSNFRLDHWPYGGVKNSGIGREGPRYAIEDMTETKMIVLRIPE >NZ_CP020814.1|WP_066150844.1|2877800_2878796_-|alcohol-dehydrogenase-catalytic-domain-containing-protein MLGLYLNKPSELELREFSSVSSLKDDEVKIKLIHAGICGSDIGVFKGKIPHATYPVRPGHELIGTVIEAGKLANYEVGKRVVVGPNTFCDECEYCRKGKKNICINKGSLGVNMDGGFAEEFVISSKFVMPIPEELSDIKAVLIEPFSVIVHALEKVNISKGSSVAIIGCGTEGMLAISLAHYLGANITAIDINKEKLAKAQNSFSGLKAVLPEEIEADSFEIVIEAAGVGASVIQAVDIVKPGGDVVLVGMPQEVKLPIVRVVRKEITIHGSIIYNFPNDFQKSAQFLAQESFNVEPVISKVLPFKEYAQAYEDAVSGKYGKIILDFKEEV >NZ_CP020814.1|WP_066150841.1|2876041_2877799_-|thiamine-pyrophosphate-binding-protein MKKLVSHLLVKYLEDRGVEHIFGLCGHTNIAVLTELEKSSIRFVNVRHEQIASTAADGYARVKNKASVVLSHVGPGLTNAATGVANAALDSIPMVVIAGDIPSHYYGKHPHQEINLHSDAAQVDVYKPFVKRAWRVERPEHIAEILEKAFQLAESGNPGPVLVSVPMDIFSKEVEESTFERVKHHTKKLEKPSIDDVTAKKVVETLVEARNPIIYVGGGVVLANATAELKELVDHLRIPVAHSLMGKGVLPDDHPLTLGMTGFWGTKFINEKTRTADWILGLGTRFAEADSSSWEPEYTFDIPNTKLIHIDIDASEIGRNYPAEMGIVADLKQTLKVINRVAKELYPEGFKNEAVENEIAKQRAEFKENNRQFETDSAFPMQPQRILSELREVLPRDAYITTDVGWNKNGVGQQFPIYTPGSVLTPGGFATMGFGAPAALGAKIAKPDKVVLSLVGDGGFGQNPALLATAKEENIPVIWVIMNNYAFGTIAGLQKAHFGTTLGTLFEIDGESYSPDYAAIAKAYGIEGIKVNSAEEFKPALEKAISLNKPVVIDVPMINNPTPTAGHWNIMDIYSPGKKVHHVTT >NZ_CP020814.1|WP_066150838.1|2874920_2875706_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MSGAIESRKAVKVRGIELGDGNAQICIPLVGTNKTEIIKELEVSLQKKPDLVEWRADFFEDLHDTKKMIEALSTIRSYVNDLPILFTIRSTKEGGNPIPLSEEKKLELIVNLCATGNLDIVDYELVNKKEDIHFVREQTNKYNVRLILSYHNFERTPEATVLMDKCIAAKENSADLVKLAVMSQSLDDVMLLMQVTQEAAKSTTLPLVTISMGKYGAITRMFGFVFGSTITFGVGQNSSAPGQIPVDDLRQVINIIKRATN >NZ_CP020814.1|WP_066150833.1|2873973_2874681_-|FadR-family-transcriptional-regulator MEKSPFSSVKNERLYEKIVHQLLQLIEEGKLQPGDRLPAERKLAEILGCSRTSLREACRVLESEGVIISKPGGGRFIQRVDQKLTVKYQFNTVDMIEKTAIIYFLEAREALEPKIAELASKRATPENIAKLEKVMEKMEEKLKHPKDHVEADSSFHLALAEATQNFVFVSMMESNLNMIRQVRKQTLNNESRYLASLREHRAILDAIKRRDSQEAINACLVHLNHIRQHVLGESK >NZ_CP020814.1|WP_066150830.1|2872746_2873952_-|CoA-transferase MNQMKFGPLTGVKILDISTMIAAPFGATLLADLGAEVTKVELPGKGDTLRTVGPWKGTEPLRWPGLARNKKSVTLDIRSDEGKAIFLKLIAKVDVLIENFRPGTLEKWGLGYEELKKVNPKLIMTRCSGYGQTGPYREKAGFGTPCTAFSGHTAIQGYPDRAPVSPSYSLLDYITGVYLAFATVSALYGQEFNKDEEGQVVEMGLYESIFRMLEFLVAEYDQNGKVRERSPGLAGHSSPAGTYETKDGKFVVLVCSTDSTFNRLAEAMDRMDMLEDDRYYTNSERLKNDDEVQGIVSSWIKQFSQKDLQEKLDSYGVPVSPILTIEDIFNDPQYKARENIVEVEHPRLGKIKVPGVVPKFSKTPGAIRHRAPELGEHNEEVLLDLGLTSEEVANLKEKGII >NZ_CP020814.1|WP_066150826.1|2871790_2872747_-|hydroxymethylglutaryl-CoA-lyase MANHNQLLIPKKVEICEVAPRDGFQAETEWIPTETKLNIIRKLASTGVKSMEITSFVHPKAIPQLKDAEEVVRRSQDLTDIKLRALVPNVKGAERAIDAGIKKLKLMLSATDSHSLSNANSTSEEAQNKLEPIIEVATKRGVKVGGSISVAFGCPYEGEVPVSRLASILNRYIKMGIDEVSLADTTGMANPVQVHSILGQLKEQFSMMTFSMHLHNTRGMALANAVAALQQGVIHFDSSIAGLGGCPYAPGASGNIASEDLVHSFHEMGIETGIDLGQMIEVAKGVKQIIGHDGGSYMLQAGPCSELHVKPASQEKLG >NZ_CP020814.1|WP_066150822.1|2870995_2871697_+|purine-nucleoside-phosphorylase MSVHIGAKQGDIAETILLPGDPLRAKYIAETFLEGAVCYNEVRGMLGFTGTFQGKRISVQGTGMGVPSISIYINELMQEYNVQNLIRVGTCGAIQKDVKVRDVILAMSASTDSQMNRLTFGGVDYAPTANFDLLRKAYDVGVEKGLNLKVGNVFTADMFYNDNSELEKWAKYGILAVEMETAALYTIAAKFGRNALSVLTVSDHILTGEETTSEERQTTFSDMMEVALEAVTK >NZ_CP020814.1|WP_085449862.1|2870613_2870721_+|YjcZ-family-sporulation-protein MLLPPPPRRYGTGFGFALIVVLVILLIILGASCYK >NZ_CP020814.1|WP_066150819.1|2869381_2870458_-|ethanolamine-utilization-protein-EutH MGINEIILYIMVVFLIIGAIDKCFGNRWGFGQGFTDAFMAMGPLTLAMVGIVSLAPVIARGLTPIVEPIFGLVGADPATFANMMLALDMGGYALAVEMSHNKDAELFAWVFLGTMMGPTIVFTIPIALGMIRKEDQPFFAKGILVGIITIPIGCLIGGLIAGFNLIMILLNLIPAMIFSLCIAYGLWKATTLMIKGFRFFGKAIEIVAIVGLTANIIETLTGITVIPNLIPLDEGIQVVGMIVIVLAGAFPMIAFIQKIFHSRLKKIGKILGVSETATTGIIASLAHVIPMFTILKEMDNKGKVINVAFAVSGAFVLGGHLGFVAGIQQEMVFAMMIGKLTAGFSAIALAKVMFRNET >NZ_CP020814.1|WP_066150850.1|2880652_2881201_+|shikimate-kinase MTNIIQSPREKSIVFIGFMGVGKTTIGKLVAQKLYRSFIDIDQEIEKEYGMPIPEIFQTIGEKAFREKEKETISRFCQQKLKVISLGGGAFLQEEIREMCLSNCIVFALDISWDRWKERLNIIIDNRPVLKGRSIDEIEELFYSRQEIYSNHNSKLVTDDLDVEEVADYITESLKLAWDLYE >NZ_CP020814.1|WP_066150856.1|2883698_2884256_-|TRAP-transporter-small-permease MKTFKWLEKHFEEIFLVIFTVIMVTAIFVQVVMRYVLGSSLAWSEELARYCFIWLVYLGISYGVKKQRHIKVDIILLFLKDRWKIVVNILANVIFLSFAIFVVVYGYDIAKTVLTYGQKSPALQIPMGLVYLATPVGMGVTALRLIQQIVRQVRTLINNEEFDVKTEQEMILENSQLANDKEKKE >NZ_CP020814.1|WP_066150859.1|2884399_2885398_-|DctP-family-TRAP-transporter-solute-binding-subunit MNKLLTALLFICLLMLTACGAQDADSKGTKTMKLAVVTPEERSLTQGLYKFQEIVEAETEGSIKIQIYPNGQLGGDREVLEGLQIGTIEGTTISTGPIAQFAPRFSMFDLPFLFPTADIAYDVLDGTIGTELLEDLPDQGIVGLNYWENGFRHVTNNVKEITSIDDLRGLKLRTLENELHIDMWRQLGTNPTPMAFTELFAGLQQGVVDGQENPVGNVTTSRFYEVQNYLTKTNHVYNASVFMISKGFWNTLSEEEQLIISEAADEARDYQRKLNQKEDKEAFVFLEKSGMTISEFSVEELQKGFKLVQPVYEKYSTRIGEELLSELLEAVQ >NZ_CP020814.1|WP_066150862.1|2885619_2885877_-|HPr-family-phosphocarrier-protein MEKASKQIIVNISEEQTITELSQLVQPFASEIFLKKLVNGNIIEVNLKSLLGLITLQLKNNDRITVRTVGEDCHEALNKVVAFLT >NZ_CP020814.1|WP_066150865.1|2886048_2886336_-|spore-coat-protein MPNNINGRGLTDREMLQLCLELEKGRCRSISNTMVETTHQQLHDIYERAFNNACNNQHKLFDVMNEKGWYKTELASTDQIANVQEYMQNNLHPGE >NZ_CP020814.1|WP_066150868.1|2886351_2886555_-|hypothetical-protein MNQLTTKELAFIEDEIRAEEITAKTLNWCASQCKDEQIRTILEQLAEQHQLQIGELAQYFNRAGMIQ >NZ_CP020814.1|WP_066150871.1|2886720_2887629_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MLEQLKKHFGEKMVVANDEHYSENFSWFMTNDHIKIGISTEQLTEEEQSLLNVFLTPVTRKQLETPQSVEEKFWSQILFGAAKNVTKPHGLTKTFRFIHFYLRGETSDTSHLVEAITSLLPETAIILLESDSSGVIIDTDPDSTDQIENLFESISNTITSDFYLDLALYIGLKNSCYSEAHNRYLWEKNCFEIMKQTSSKTVYYGEEVVPYLLLFQANQKTLEDISTQLLGNVVDDKELIKSIRIYLDCNMNVSHAAKKLYLHRNTLQYRVEKFIERTGIDIRHFNNAVSIYLALLINNSKA >NZ_CP020814.1|WP_066150874.1|2887740_2888838_+|sn-glycerol-3-phosphate-ABC-transporter-ATP-binding-protein-UgpC MGEIRLENVYKIYDGDVTAVTDFNLHIDDKEFIVFVGPSGCGKSTTLRMIAGLEEISKGDLYIGERRVNDVAPKDRDIAMVFQNYALYPHMNVYDNMAFGLKLRKFKKEEIDRRVKDAAKILGLTEMLDRKPKAMSGGQRQRVALGRAIVRDPQVFLMDEPLSNLDAKLRVQMRSEISKLHQRLQTTTIYVTHDQTEAMTMASRIVIMKDGFIQQVGTPKEVYDNPDNIFVGGFIGSPAMNFLHGTLTDNVFNIGDVKIKVPEGKLKALKENGYSGKKVVLGVRPEDIHDELLFLEASPDSKIEATIDVAELLGAESYLYSKLEGQDFIARVDARSDFQNGQKIQLAFDMNKVHFFDPETEKRIR >NZ_CP020814.1|WP_066150877.1|2888892_2891067_-|malate-synthase-G MSDYVKVGKLQVESILYQFINEEALPNSGVESNEFWAGLEKVIHDLAPQNKALLTKRDEIQQQIDTWHRENETFDFTTYKTFLKSIGYLEPEVEDFQVTTDGVDDEITLQAGPQLVVPVNNARYAINAANARWGSLYDALYGTDAISEEEGATRQGAYNPIRGEKVIAFAKDFLNLAIPLSSGSHTEAVTYQIENGALSIELSNGEKTTLNSPDKLIGFQGKPERPSTILLRNNGLHFEIQIDRNHPIGSSDQAGIKDIVMESALTTIMDCEDSVAAVDAEDKVLVYRNWLGLMNGSLSSTFHKGNETVTRTLNADRVYTAVTGEEITLSGRSLMFVRNVGHLMTSNAVLDEAGQEVPEGILDTVITSLIAKHDLLKNENNNSAKGSIYIVKPKMHGPEEVAFANDLFDRVEDMLGLQRHTIKIGVMDEERRTSVNLKACIREVKDRVVFINTGFLDRTGDEIHTSMEAGPVIRKNHMKASKWLAGYEKANVHVGLASGLNGRAQIGKGMWAMPDLMAAMLEQKGGQLKAGANTAWVPSPTAATLHALHYHEINVREVQEELGAHTADLLDDILTFPISSDANWSPEEIQQELDNNAQGILGYVVRWVEQGVGCSKVPDINNVGLMEDRATLRISSQHIANWLRHEICTEEQVLETLKRMATIVDKQNVNDPEYRPMSPNYEQSVAFQAACDLVFKGCEQPNGYTEPILHRRRQEAKAKITQQA >NZ_CP020814.1|WP_066150883.1|2892637_2893606_-|sugar-phosphate-isomerase/epimerase MKLGVFTVLFSHKNLDDMLDYVKDAGVKAVEIGTGGYPGNAHCDIDALLESEENRNIYLEKISSRGLTISAFSCHGNPISPDKTFAKQSHDALVKTIKLASLMNVPVVNCFSGTAGDHEDAKYPNWPVTPWPNEYGDVIKWQWEEKLIPYWKEWGQFAKDHNVKIGLELHGGFLVHTPYTLLKLREETCDAIGANLDPSHLWWQGIDPVAAIKILGKANAIHHFHAKDTYIDQENVNMYGLTDMQPYGEVQTRAWTFRSVGCGHSVQEWSDMISALRTYGYDYVVSIEHEDPIMSIEEGFKRAVTNLNSILIEEKPSDMWWV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020814_3 | 3444754-3444825 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020814_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020814_3
>3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder ACAGAAGAAGAACCTGAAGATGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020814_3
The CRISPR arrays of NZ_CP020814_3 >merge|NZ_CP020814|3|3444754-3444825|CRISPRCasFinder CCTGAAGACGATTCTAAAGAAGAAACAGAAGAAGAACCTGAAGATGATTCTGAAGAAGATTCTGAAGAAGAA >NZ_CP020814|3|3|3444754-3444825|CRISPRCasFinder CCTGAAGACGATTCTAAAGAAGAA ACAGAAGAAGAACCTGAAGATGAT TCTGAAGAAGATTCTGAAGAAGAA
>NZ_CP020814.1|WP_066153549.1|3440417_3441659_-|tyrosine--tRNA-ligase MEKEFTLTEAQQKEVERQLAHLKRGVVEIVPEDEFRKKIEKSVVTGKPLKIKLGMDPSAPDVHIGHTVPLHKLRQFQELGHEVQMLIGDFTGRIGDPTGKSETRKQLTDEEVKQNAATYVEQYGKILDMDKVTIYYNSEWLKPLQFEDVVKLAANMTVARMLERDDFEKRYKSGQPISVHEFFYPLMQGYDSVALETDIEIGGTDQKFNLLMGRTLQEAYGQEKQVALTLPLIEGLDGERKMSKSLNNYIGIDEAPNEIFGKSMSIPDELMIKYYKLATDLPMEEIDKLETDLKEGSVHPRDAKMNLGAKFVEMYHGEEAANEAKAYFQTVFQKRALPTDIPEVQWTGESPIWIVDLLVELKMQSSKGEARRMIQNGGVKINEEKVEDVQLQVEIEDDLVLQVGKRKFMKIKK >NZ_CP020814.1|WP_066153546.1|3439727_3440330_+|30S-ribosomal-protein-S4 MARYTGPSWKLSRRLGISLSGTGKELAKRPYAPGQHGPNQRKKLSEYGLQLQEKQKLRHMYGVNERQFRRIFDDAGKMAGIHGENFMILLESRLDNLVYRMGLARTRRAARQLVNHGHILVDGGRVDIPSYRVKPGQTISLREKSRNLDVVKESLEANDFVPAYVTFDADSLQGTYTRLPERSELPAEITEALIVEFYSR >NZ_CP020814.1|WP_066153543.1|3438969_3439449_+|GAF-domain-containing-protein MFQTKLYKGTLEERYQTVTKQLDALLSGEEDLIANLANTSALLSQFLEDINWVGFYLLKEQGLLLGPFQGLPACVRIPVGKGVCGTAIVKQQTMLVEDVHQFPGHIACDAASRSEIVIPVRRDGEIIAILDIDSPSLARFTVEDQKHLEAFVTVLEKHI >NZ_CP020814.1|WP_066153540.1|3438081_3438729_-|forespore-capture-DNA-binding-protein-RefZ MKETKKDLIIDAAVRLFYTQGYDGTSVRDIAQKANVNVALVSYYFGGKKGLYEELMIQFLEGYLQVIKTELERTHNSVKDQLLQMTRSLLEYQKSQHFVARMVHREMTFDSMLVRELMSTYLRKEKHDLEELVRSGMRRGEFRKQPIDLVVVHIRTMMMMPYLSPHYLSELYQITTTEPYFIEKYMRHIESWVERWLCIEEYRSSPAYLMPRSIS >NZ_CP020814.1|WP_066153640.1|3437265_3438093_+|histidinol-phosphatase-HisJ MIHDGHVHTPFCPHGSKDSFIKYCETAISHKLTGITFAEHAPLPRSFVDPTPLQDSGMSWDDLYTYLKEVRALKKEYKGHLNIYVGLEVDYIEGFEKETTDFLNEIGPSLDDSILSVHFLKLGTEYVCIDYSPDVFHYACNQLGSTEAVYELYYQTVLKSVKSNLGHYKPNRIGHMTLVRKFQKKFPIDRSFQTETSSILAEIKKKGYELDYNGAGYIKPLCREPYPYDSIIEETIKRNIPLVYGSDAHQASSLLNGYTELHPKSILAKPNPLRD >NZ_CP020814.1|WP_066153536.1|3435291_3436977_-|septation-ring-formation-regulator-EzrA MYLIYSIIAVAVIFIIISSVLRKRIYKEVDRLEEWKNGILNRDIPEEIGKVKKLHMSGQTEEKFETWRNEWDDIVGGILPDIEERLFDIEDLAAKNRFTKAKQLIGVTEQRLNGIEEQIKELLKDVHQLVESEEQNRTEIDSVRTAYKDLSTLITKKRGSLGAGLPTIDEKLDKVNELLTAFDTATEDGSYLLARQHLVEAQSFVDNLNDLVDRYPKLLVQVDTKIPAELTELQGGIAEMEEAGYQLEAFSLESRLEHIAGELEKVKEDLKHLKYEGAEDKLTELSNQIEQLYDTLDYEVESKGYVENKIEQLSEQVEAIKEKVDLLETEMFEVQQSYFVSKEQIEAQKDMKENVVDLMNDLYVIINLADNQKQTYTSIRELVDEWQDELEKLDQSIEVEKATLYELREDERKAKETLLKLRGTMVEINRALKKSNIPGLPQRAIDQLSEAEEKLIDATNHLEQLPLELGRMNVLVEEAEELVSKNNELILQTIEQAKVAENVIQYGNRFRSKSDSVSAGLIEAELLFRQYEYEEAIECAVKVIEPYEPDVLDIVKGYVAV >NZ_CP020814.1|WP_066153534.1|3433990_3435133_-|cysteine-desulfurase MIYLDNSATTKPYKEVVDAYTAVASNFFGNPSSLHTLGMKAEGLITESRNRIAELLDVKPVEIIFTSGGTEGNNLAIKGAAKAKQKRGKHLITTVVEHPSVMEAFAQLEQDGYEVTYLPVDQEGRVEVAQVEAAIRPDTTLLSIIHVNNETGAIQPIEKIGEMLERYPRIYFHVDHVQGISKVPLNLRKARIDFSTFSAHKFHGMKGTGFLFVREGIKLAPLFEGGSQENGLRAGTENTAGIVSMAKALRMAKNQENEHEQLYKLRETFIRKLNAIDGIVINSPADQVAPHIVNFSIPGAKPEVVVQSLSSKGIYVSTKSACSSKLSAPSRVLSAMGLSDERAISGIRVSFSFDTTAAEVNQLLTELEVIIPELLEVVKS >NZ_CP020814.1|WP_157076794.1|3432791_3433994_-|tRNA-4-thiouridine(8)-synthase-ThiI MIYDHILVRFGELALKGKNRSVFEKHLLENIKMSVKSIPNLKLKRTYGRIVIELNGQNHEPVVEKLKHIFGIHSFSLAFKVENDLQAMQKGALTVLQDRANVRTFKITAKRAYKPFPLDTMQLNREIGGYVLTNTEGITVDVHNPDVNIHVEVRETATYITSASYDGPGGLPVGTSGKVLLLLSGGIDSPVAGYLTLKRGAKIEAVHFHSPPYTNERAKQKVIDLAQSLTKYGNSVVLHLVPFTEVQKHIHSEIPSNLQMTVMRRMMLRISERIANERGILALGTGESLGQVASQTLHSMNTINEVTNLPIIRPLVTMDKLEVIDIAQKIGTFETSILPFEDCCTIFLPPDSKTRPKREQTNKYEQYIEIDKYVDDAVARTEKLLLTNTKRINNEVEDLF >NZ_CP020814.1|WP_066153522.1|3432467_3432677_-|alpha/beta-type-small-acid-soluble-spore-protein MANNNSNNSNQLLVPGVQQALDQMKYEIASEFGVQLGPDATSRANGSVGGEITKRLVQMAEQQMGGFQQ >NZ_CP020814.1|WP_174521904.1|3429830_3430649_+|NAD-kinase MKGCFCKVSKRKNLYLFYKRTIEMEELIQPLKEIAEQNEFTLVTDVEKANIIASIGGDNAFLQATRKTNFNEDCLYVGVNTDSMGFYTDFSMENIEQMVLAMKNEEVEVRRYPLLKVTVDNEMPFYCLNECSIRSNVIKTFVIDVMIDDFHFETFRGDGMIVSTPTGSTAYNLSVNGAVVDPALPSIQVSEIASLNNNEYRTLGTSFLLSPERKLTLNVVQDGNDHPIIGVDNEALSIRHAKEINLSLAEKQIKVLKLKNNSYWQKVQKKFL >NZ_CP020814.1|WP_066153555.1|3445120_3446836_-|acetate--CoA-ligase MKLQALSPVKGNHNLPNYEEAVQSFDWKSVESEFSWGETGKVNLAYEAIDRHAEGDKKDKVALYYSDANRVEEYTFHDMKTYSNKAANVLKEAGVVKGDRVFIFMPRSPELYFSVLGAIKLGAIVGPLFEAFMEGAVRDRLEDSAAKVLITTPALLERVPVGDLPNLESVFIVDEQYEENGSYYNFLTRLNAASDQLEIEWVDREDGLILHYTSGSTGKPKGVLHVHNAMLQHYQSAKWVLDLKEDDIYWCTADPGWVTGTSYGIFGPWLVGVSNVIRGGRFSPQDWYETLEKYKVTVWYSAPTAFRMLMSAGDELVKKYDLSNLRHMLSVGEPLNPEVVRWGVKVFDLRIHDTWWMTETGAQVICNYPSMEVRPGSMGKPLPGIKAAIIDDKGNELPPNRMGNLAIQKGWPSMMRAVWNNEEKYNSYFEIDGWYVSGDSAYMDEDGYFWFQGRIDDVIMTSGERVGPFEVESKLVEHPAVAEAGVIGKPDPVRGEIIKAFVALREGYEVTDELKEDIRNFVKKGLAAHAAPREIEFREKLPKTRSGKIMRRVLKAWELDLPTGDLSTMED >NZ_CP020814.1|WP_066153558.1|3447042_3447675_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIHQKTYYSMTIPFQDRSLILEGPLSGEAIESFEFHSGLVAFRPPEKQKIALIGIADLPEGRINVVRDGNTIVGYVTFVYPDPMERWSEGKVENLIELGAIEIAKEYRGAQVGKNLLRLSFMDDAMEDYIIITTEYYWHWDLTGSGLDVWGYRKMMEKMMNAGGLEWYATDDPEICSHPANCLMARIGKRVNTDSILRFDQLRFQNRFMY >NZ_CP020814.1|WP_066153561.1|3447696_3448335_+|CBS-domain-containing-protein MIIEYIMKRNVITIKDTATIKEAMQLLELHQIRHIPITNERNRLVGIVSDSDIRDASPSIFHFTDHLEDFLKPISTIMKRNVITAHPLDFVEEVSTLFYEHHIGCLPILDDDELVGIVTETDMLHTLVELMGAHQPSSHIEVKVENITGKLADIAAIFKELNVSIISVLVYPYHDPSYKILVFRVQTIDPRRIIKVIEANGYNVLWPSEPGL >NZ_CP020814.1|WP_157076795.1|3448331_3449498_+|acetoin-utilization-protein-AcuC MIKRDASFVFSTEQLAYKFNDDHPFNHLRLQLTFELLKELKALDDNIIIPPRMATDEEIALIHDEAYIEAVKSAGRGELNEATAVNYGLGTDDTPIFANMHEASALLVGGTLTAVDEVMQGRSNHALHLGGGLHHGFKGKASGFCIYNDSSIAIEYMKKHYGARVLYVDTDAHHGDGVQWAFYDDPDVCTLSIHETGRYLFPGTGQVHEKGSGRGYGFSINVPVDAFTEDHSFIEVYETALREVVSFFKPDVIITQNGADAHHFDPLTHLCSTIETYKAIPKLAHQLAHEYCDGRWIAVGGGGYDIWRVVPRAWSLVWLTMTGQQDQLPRRLPDNWLRKWSRQAEEELPLFWDDQNIVPTIPRKQEITEKNFKTLEKALYHIRTEQRR >NZ_CP020814.1|WP_066153564.1|3449544_3450240_-|5'-methylthioadenosine/adenosylhomocysteine-nucleosidase MKIGVIGAMNEEIERMKAEMVVTNTYEFATVEFYEGRLKEKEIILCKCGVGKVNAALTTQLLVDRFAITHLLFTGVAGAVDESLDVGDLVISTSAMQHDLDVTALGFKKGQIPYFEGSSDFLANSELVELAVSAAKQSTSRHIVRGRIVSGDQFIANADYVQSLREEFEAACVEMEGAAVAQVAAMNKIPFVIIRSMSDKANGKASVNFAEFTQLASEQSHLLVSTILENM >NZ_CP020814.1|WP_066153567.1|3450305_3451064_-|flagellar-motor-protein-MotB MKRRSRPQEKGAPKWMVTFSDMMTLILVFFILLFSMSVVDAQKFRAIADSFNHRQTFDHMPSIIDFENPAEEIKEEGRKDPIDSQSESNLDMDELLQEVEDFLEDHDLTELISASRDERGVVLVLQERTLFETAEAELLASAEPFLAKVGTLLEAIPNIVKVEGHTDGRPISTYRYPSNWELSGARASSVIRFLIDNHDLEPNRFIATGYGDTRPAVPNTSVANLQTNRRVVIVISDPEYDDDEAYELKETP >NZ_CP020814.1|WP_066153570.1|3451053_3451857_-|flagellar-motor-protein-MotP MKKFDITTPIGIIVGISVLLLAVFSNAGASGLIFFIQLASVLIVGGGLIAGLIINFSFTELKILPKVLRESFRDQDHDLRILIDTFVDLSGKARREGLLALEAGLDEVEDPFIKKGILLAVDGIEPDVIKDIMMAEVVAMEERHRKGRAILEKAAEYAPAWGMIGTLVGLILMLQNLNDPATLGPNMAVALLTTLYGTVLANLVFTPMASKLANKTDEEVFVKQIIIEGVIGVQSGQNPKVLQEKLSAFLSNNDKIIDETMGEAYEA >NZ_CP020814.1|WP_066153573.1|3451913_3452915_-|catabolite-control-protein-A MNTTIYDVAREAGVSMATVSRVVNGNPNVKPATRKKVLDAIERLGYRPNAVARGLASKKTTTVGVIIPDISSIFFAELARGIEDIATMYKYNIILCNSDQNQDKEIHLINTLLEKQVDGIVFMGGQITEEHVEQFKRSPVPIVLAATLDTNNEIPSVNIDYKQAVYDAITHLIEKGHSRIGMLSGTLDDPVNGYLKFLGYREALDNAGITFNEDLIAIGDYTYDSGIEAMNTFLELDEKPTAIFASTDEMALGVIHGAQDEGYSIPNDFEVVGFDNTRLATMVRPTLSTVVQPMYDIGAVSMRLLTKLMNKEEVTDHIVVLPHRIEFRQSTKS >NZ_CP020814.1|WP_066153576.1|3453150_3454227_-|bifunctional-3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase/chorismate-mutase MSNEKLDLLRTELDEVNLKLLEVINERARLVQEIGKVKSTSGVNRFDPVRERSMLDHIAAHNKGPFETSTLQHLFKQIFKASLELQEEDNSKALLVSRKKHPDNTVVDLKGVMMGDGAQRLVMGPCAVESYEQVLTVAKALKERGIRLLRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLEILKRVADELDMVVISEIVNPADIEKAIDYVDVIQIGARNMQNFELLKAAGNVNKPVLLKRGLSATISEFIHAAEYVVASGNNDLMLCERGIRTYETATRNTLDISAVPILKQETHLPVLVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPQFNKFVDELLASGLYKG >NZ_CP020814.1|WP_066153579.1|3454574_3455021_-|YtxH-domain-containing-protein MSEMNTKDFLIGSLIGGIVGASAALFLAPKSGKELRSDITEQAQAAKEKTNQFTTTAYEKGNEWATYAKEKSSSIAKVVSDQSNQVVEKVKGATSNLKAEAEEAKASAEDIVGDLAGDVQEAGEEIVETVKNEVDEIQARVEEEKPVG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020814_4 | 3909620-3909958 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020814_4
|
6 spacers
spacers of NZ_CP020814_4
>4.1|3909647|25|NZ_CP020814|CRT GATTCCTCTCTTTTTGGGGCTCGAC >4.2|3909699|25|NZ_CP020814|CRT GATCCTCTCCTCTTTTGGCTCGGAC >4.3|3909751|25|NZ_CP020814|CRT GATCCTCTCCCCTTTTGGCTCGGAC >4.4|3909803|25|NZ_CP020814|CRT ACTCCCGCTCTTTTTAGCTCGATTT >4.5|3909855|25|NZ_CP020814|CRT GATTCTCTCCTCTTTTGGCTCGGAC >4.6|3909907|25|NZ_CP020814|CRT ACTCCCGCTCTTTTTAGCTTAATTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020814_4
The CRISPR arrays of NZ_CP020814_4 >merge|NZ_CP020814|4|3909620-3909958|CRT TTCTCCTTTTGATGCTTCTATTGGACAGATTCCTCTCTTTTTGGGGCTCGACTGTCCTTTAGCGCCCTCCTATTGGACAGATCCTCTCCTCTTTTGGCTCGGACTGTCCTTTAGAGCCCTCCTATTGGACAGATCCTCTCCCCTTTTGGCTCGGACTGTCCTTTAGAGCCCTCCTATTGGACAACTCCCGCTCTTTTTAGCTCGATTTTGTCCTTTAGCGCCCTCCTATTGGACAGATTCTCTCCTCTTTTGGCTCGGACTGTCCTTTAGCGCCCTCCTATTGGACAACTCCCGCTCTTTTTAGCTTAATTTTGTCCTTTAGCTCCCTTAATACAAGTG >NZ_CP020814|4|1|3909620-3909958|CRT TTCTCCTTTTGATGCTTCTATTGGACA GATTCCTCTCTTTTTGGGGCTCGAC TGTCCTTTAGCGCCCTCCTATTGGACA GATCCTCTCCTCTTTTGGCTCGGAC TGTCCTTTAGAGCCCTCCTATTGGACA GATCCTCTCCCCTTTTGGCTCGGAC TGTCCTTTAGAGCCCTCCTATTGGACA ACTCCCGCTCTTTTTAGCTCGATTT TGTCCTTTAGCGCCCTCCTATTGGACA GATTCTCTCCTCTTTTGGCTCGGAC TGTCCTTTAGCGCCCTCCTATTGGACA ACTCCCGCTCTTTTTAGCTTAATTT TGTCCTTTAGCTCCCTTAATACAAGTG
>NZ_CP020814.1|WP_066158334.1|3908845_3909472_+|cell-wall-hydrolase MKKLLLSSTLSLLLAVTIVLFPNQTSAATVLQLEDEGSAVVELQQQLIALGYLPTSATGYYGDYTKEAVRQLQRDFNLFQDGVAGPQTWAKLRDIEKIAKIVHGEARGESYEGQVAVAAVVKNRLQSPHFPSTVEGVIYQRNAFTAVQDGQYDLTPTYISYRAVKDAWKGWDPSQGATYYYNPHIATSEWIFANTTPKFSIGKHLFAD >NZ_CP020814.1|WP_066158264.1|3907699_3908608_-|LCP-family-protein MRQEMNKKKVFITLGLVIGVIFLTVFAYGVYLYKSVTDTAKEIHEPFIPTRDIDLNDQEPISFLLAGVDSTGDEHAGRSDTIIVMTVNPNERSIKMLSIPRDTRTEIIGRGTQDKINHAYAFGGVQMTADTVSNFLDIPIDHYISINMEGMKNLVDAVGGVKVDNAFAFSQDGFSFAEGEIYLNGDEALAYARMRKQDPRGDFGRNDRQRQIVEAVIQEAAHFGTITKAGSVLDAVGNSVRTDMTLDHMWRIQSNYRDARHHVDQMEIKGNNTTINGIYYLQIPDEELARVRSELRTHMELE >NZ_CP020814.1|WP_066158262.1|3907191_3907650_+|hypothetical-protein MKFKNRQQPIQLFMIFGVFLVVIALLFAFFPTNSGVQVIKTFYKHEQKQEFWNSYELFHPFMKERFTRNRYIDQRSHIFVSHFGVETYELEFGRSKKVKNWKMTQDHEPIEEVFKVPVTKTYESDYGRFTIQQDVFAAKEDGNWYVLWDYKY >NZ_CP020814.1|WP_066158260.1|3905445_3907032_+|acylphosphatase MNQSNWLPQLKSLVPKDAYGFTSVMYTIALEAWKRGLTVKFYKTYSKGKVRIRYAISSEGTEQTFQYSLADSIPKEARKITKNKETTKEYLLKANVPTPKGRSFGPESDIPEMVEFSKTLTYPLVIKPTSSSLGKGVTTGIMTEEELSTHLTYLRKDKGYENIIVEEEATGEDTRVFVVGYQVVSAYKRIPANVTGDGKHSIAELIEVKNNARLENPHASDYQIKINDDITTFLSKSNYSLDSVPAEGERVFLSDSTLHSLAAETVDVTDQLTEESKQVAVNAAKALPGLSCCGIDIMIDNERGTNYVLELNSRPNIGGGLFPVHGMQRDIPKALIDYFFPETASHEHSKESHQFYYDYKRIADTLYTGIAEEIILPAIPKQQPVCKKIVIARKVSSNILSNKIYKKAIGLKINGYVRTLKNKNLLIVAAGDQDKIEMFLEALPELSSKQLDMKVEEWEKPVMIGFRVKSSNSRKTTKSTVQPIPLETELIQQRDQAIDQLKRIEESKSWKYTMPIRKLVKKVRGKAN >NZ_CP020814.1|WP_066158258.1|3903729_3905157_+|alanine:cation-symporter-family-protein MTSIIESIVSVGNDILWSYLLIALLIIAGIYFTVASRFVQFRYIGEMFRLLTDKETVTSGKKSVSSFQAFCISTASRVGTGNLAGVASAIALGGPGAVFWMWLIALLGSATAFVESTLAQIYKVKDGESFRGGPAYYMEKALGARWLGIIFAILITFCFGLVFNSVQSNTISMAMGSAFGSDTFVIGLVIAGLTAIIIFGGVHRIAKVTSIVVPIMALIYLLVALIVIVMNLTAIPSVFVLIFQSAFGIEQAVGGGFGAALMMGIKRGLFSNEAGMGSAPNAAATANVSHPAKQGLIQAFGVFVDTLIICSATAMIILVSGDFTSGAVGIELTQNALASQIGEWASIFVAIAIFLFAFSSIVGNYYYGETNIEFIKKSKTSIMIYRLAAVGMVFFGAIAEFALVWDMADFTMGLMALMNIAVILLLGKFAFAALDDYSKQRKAGKNPVFYADSVPNLKNVEHWQKEATEEKAVNK >NZ_CP020814.1|WP_157076884.1|3903230_3903389_+|hypothetical-protein MAKLFCKTYALLRLIDDNDYVTDKMLKSLIYLQNNQSFSSSCNWLGAFVYLI >NZ_CP020814.1|WP_066158256.1|3902279_3903056_+|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MKLFLYAGSIVLSIAIIIFGNFYYKGKLASIAEESAAYSATIVKADTEISSETSDEDGDKEATGLLKDLMNDHEHVKITVFGSNSNILDDNSDRSWPYLVETQLQSYQDASEITTVVIDGERSTSIEILNSEYHNEVIDSDPDLLLFEPFILNDNGNIRIEDSIDALDLMLQRLTSSLPETTIVLLPANPLPGAGFYLSQIEALETYAKEHDYLYADHWTGWPSTDDSSLEDYIENARPNEDGHQLWADSMVEFLTAE >NZ_CP020814.1|WP_066158254.1|3900641_3902252_+|hypothetical-protein MPKKIVIPSLSIIILFFAGVLLLFPFESSGQIKQLEQKATTAFDQANFDESISYYEEILQVDPLHVNARLGLAKSYHSIAKLERAEMTLLEGIELLPDEARFYTHLSDLYVSQSDIVSTLSILKQGFEQTKSDDFQEKYETFLSQITIEIERPFIQVGHKRELKLVWSDEKERTLPIDAEWTVSDSDIANLDLQEKETWMLTGEAPGSMTVTAAAEDLTRKLEVEIKDQVVEEMEWLTAEEPTVMLNETLPITLQAFDANGEKMDIRPNWSVKGERGLLSESSHDNEILFLASEVGTETVEAEVDGLEISLEIEIVDENMLTTYVTGDGTVTAFPAKTHYTYGETIELQAVAAPGWTFKHWTGDLTGSVASQTITLEQPLSIGAVFERDLPSFTLQISKSGQGTIVQSTLDNPIQEGETVTVTARPDPGYVFERWTGTLSSSNASITFTMDQSISLQAVFKKQVTSSPQPAQQVEKPQPPQGKKESESETEQSKPVQKPTEPDEKEPDETPEQPETKPEPVPEPKPDPDEGSDESE >NZ_CP020814.1|WP_066158253.1|3899234_3900356_-|glycosyltransferase MKKVKILFFIYQMGGGGAARTLLNIINNLDRSKFEPYLVTLNFDGSYEKELKDDVKFIKLDTKRLSRSILRLAKIIKEEGIDVAFSTIPRVNTIAIIASKLSFSKVKSVIREADNLGGSLRENMQLLGFGMVYKTSDQIVSLSEGVKANLVNRYKVKPERIEVIYNPVDLNSINDKVEHGKIDPEHEALFLTDDKVIITAGRLVEQKDQRTLVKAFAKVNNEISSRLVILGEGPLKEELMELARELSVLDRVHFIGFQSNPYSYFTKADLFVLSSKHEGFSHVIAEALATGTPVVSTNCKSGPEEVLNFGEFGALCDVGNDEQMAGEMLKVLSVSEQERLQIIEKGYARARDFDAKQIVKQYEQLFLSTLSKQ >NZ_CP020814.1|WP_066158251.1|3898040_3899201_-|glycosyltransferase MTNRKKVVHITTVHHPLDPRIYYKECQSLQEAGYDVTLIAPDGKETIKESNVNVVSITKRKNKILRMLLSTVEAYKAAKKQKADFYQIHDPELLPVAWLLKKKDNVVIYDIHEDYETSIMQKDYIKKPMRKLIAKAYRTIEGIFAQKLELCLAEKYYKEKYPRGTCVLNYPILNPEARTARKTKEPVVDEIIYTGNVSVERGALLQARIPVVDPSMSIHFYGKCPKHLAENMLEQAGDYRSQVKIEGIDRYVPKDEIDQAYSSRNWLAGIALFPRDDHYMKKELTKFFEYMSYGLPIICSNFPVWKQFVETHRCGIAVDPTNDTELKAAIEYIRTHPEEAWNMGENGKKSVREQLNWDKEAEKLVQWYQELELAQDQTESFKQRNF >NZ_CP020814.1|WP_066158267.1|3909960_3910716_-|3-hydroxybutyrate-dehydrogenase MNQERTVIITGAAQGIGYAIAQEFIANGDFVAIFDLNEEAAIVAAEQLGNAKGYHVNVADEQSVKSAIDSVITERGSVDVVVNNAGLQYISKVEDFPVEKWDLLNDVILKGTFLMTKHSLPSMKAQKYGRIINIVSAHGRIPDAYKSAYCAAKAGQTGFTKVVALENATEGITCNTIEPGPVRTELIEKQIPVLAEKDGTTEQEALDQHILGKQWIKRLLEPSEIGKTAVFLASEGAGAITGESIPVTGGM >NZ_CP020814.1|WP_066158269.1|3910974_3911154_+|H-type-small-acid-soluble-spore-protein MEAKRAQEISSSQTTIPVMCNGQQVYIEHVDQDKGLATVHPMNDPSQKQSVSVDSLTEG >NZ_CP020814.1|WP_066158271.1|3911648_3912299_+|GGDEF-domain-containing-protein MGYKGRVFSIGVVILFNVMRYFYYHSYYGLPFEANFFILTTVFLFVAWWTGKQYDKAKYYSEKDPLTDTYNRRTINRRFQKPTTRDKKMILVMIDLDNFKEINDTHGHQAGDDLLVEIAQLLKRLSSGRDDCIARWGGDEFLLLVGNPDQNFKSTFTHSLLAELQNIKALEYTSFGASIGFATFPDDGQTLEQLIQKADSEMYKMKESKPVQRTSR >NZ_CP020814.1|WP_066158273.1|3912801_3914511_-|adenine-deaminase MKLDILIENVQVFNSYYKRFTTENVAVIDGKFLYIGKRGAETFDACKVIDGTGKYMVPGLIDIHLHIESTMVTPETFSFGLIQNGVTTIVPEPHEMANVFGIKGVTEMMKASRDCVVDMFYAIPSSVPATSLETTGGAIEIEDIDKLLQTGEIICLGEIMNYVDVISDPTCKTNQILNHIREQYPQLTIEGHVPKLLDLDLHKMIYKGVDSDHTHQTIEGMEARIAAGMFIEIQEKSMSQEVIDYLIEHDVAEHYCFITDDVMTDSLQRRGHLNHIAKKAIQMGMSAEQAIYACTYTPSRRMKMLDRGVIGPGKVADFLLLSELDTFKIEQVFKNGKEVYDARSAYKQEVTPKQFPASFYESVKLSSLCKEDFMIMTDKADGYYPCRVMVVQDGSTFTKEIIAEMEVNKQKVNWEQSQYGLIATFERYGKNGNRAHGLIGGDIIKNGAIATTYSHDNHNLLVLGQNGRDMEIAANAVIKNQGGICVVSEGKVLQMLKLPVGGILSEEPLELLAQQVEELRRTLADLGYKHYNSIMSISTLSLPVSPALKITDFGLINVNEGEVVPLVVS >NZ_CP020814.1|WP_066158275.1|3914526_3915588_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MALLSLNNVTVAYQKQDILKDFNLNIEKGQLISLLGPSGCGKTTTLRLIAGFLEARAGKFLFQDKDYTKVPVNKRNFGFVFQNYALFPHLSVYENVAFGLRLRKMSKGEIDKRVAEMLEVVNLSGFEKRFPQELSGGQRQRVAIARALIIEPDLLLFDEPLSNLDANLRVNMRVEIRRIQQELGITTVYVSHDQEECFSISDQVAIMNKGLIEQLDDPATIYKFPKTKFVADFIGFKNFIHFESRNDQKEEIALSLDGHSFLVERIPEGVDQTGLIGAIRPDNIEIQALEEQVESLNSLEGTVRVCTFLGRSYQYDVETKIGTFTVNEETENPYHIGHSVLLTFPKEKLVLVQ >NZ_CP020814.1|WP_066158277.1|3915602_3916391_-|ABC-transporter-permease MQEKNKILALFTLFVFTFLLGPLVIISVTSFEPGNVLKFPPEGFSFKWYLNIFEVQMFLETFKISILVSLAGNLLALVLGIPAAYALSRADFRGKEIVNAVFLSPILIPGIVLGFTLLKYIIVTYQLPIYAGLFIGHTIIMLPFVIRVISSSLSNFDFSIEEAALSLGAGRLETFFKVVLPNIKTGIIAAVIIAFLESFNNVDISVFMTGPGISTLPIQMLTYVQYYFDPTIASISVLLMILTAILMFLIERLLGLSYFTKR >NZ_CP020814.1|WP_066158279.1|3916398_3917220_-|ABC-transporter-permease MKKRTLYLLILPGLLFLTIFMIIPIALTIGSTFVPEGGFSFQGYLQFFTDDYFRSILFTTLQVSLVTTVACIILGFPAAYYISKLGPRKKVILLLLTIFPLLTSPVVRSFSWMVILGKNGLLNNILLSIGLRQEPLEILYSPTAVMIGLIHLFLPLIIITLVGVLENIDHDLLRAAESLGASKVEAFRKVVLPLCVPGLMIGSILVFVGSFTAYTTPALLGGKQRVISTFLYQNAITLNDWYLASIIATIMIVVTFAIITLMNKAAKKLNPKG >NZ_CP020814.1|WP_066158282.1|3917289_3918225_-|nucleoside-hydrolase MTNRKLILDVDTGVDDALGIILAVKSRQFDILGITTTNGNVSLETATTNTCKILELLQVDREIPVIKGADQPLKREAFFEHRIHGNDGLGGALLNMKVTKEVTEGFAPDFIIEQVQAYPNEVTLVMTGPLTNLALAIERYPKLVNEVKEVIFMGGVVKGVGNVTPTAEYNMYVDPEAAKAVMKAGIPRLTLVGLDVTRKALLNAAHVDRILDPKLREYVQASTADYTKRYFERNGVMACALHDPLAVGVALNKQIVETNAYYVDVEANSELCDGQTVCDFQNRLQKKANVQVCVDVDSEAFLNLFIETLNA >NZ_CP020814.1|WP_157076885.1|3918240_3919290_-|extracellular-solute-binding-protein MMKKVMLSLGLVGFLLGLTACGGSNSASEEAPTELVVSTWGFAEDFFRSEVYAPFEEEHNVKIVLDTGNNAERLSRIEQGSSKVDVIYLSDYYAQQGIEAGLFETIDHSNIPNIDEIYEMAKAPLGAEYGPAYTVAQFGIAYNPAATDLEISSWADLWNSELARNITIPGITTTSGPMFLDVASRVAGEPTFNEDAAFEKLVELNPNVVTEYGGTSEFVNMFVQGEIAAGPIMEMFFSQVQDSVEEAKFVSPEEGGYAVINTVNIVKGTENKELAEKFINWHLSKEVQEAAAISKIDSPVNTTLDLTEEEAAGLTYGADVVESLILLDMEFVNENNDTWIDRWNRELTK >NZ_CP020814.1|WP_066158336.1|3919507_3919849_-|hypothetical-protein MIQIDTSQNKKVLAHIYNEVSKELFGSGTTLLKVSIDQNIITFQAKHRRSPRSAALEGEDPGLKLEVDFKLSLLYKRKLKEKLEQELNLPIEAVLRDYDGATQRAFTNIVLVN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020814_5 | 3963307-3963385 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020814_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020814_5
>5.1|3963334|25|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder CAGGCCGGTCCTCTTTCTTCCTCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020814_5
The CRISPR arrays of NZ_CP020814_5 >merge|NZ_CP020814|5|3963307-3963385|CRISPRCasFinder TTTGTCCTTTAGACGCTTCCTCTCGGACAGGCCGGTCCTCTTTCTTCCTCCATTTGTCCCTTAGACGCTTCCTCTCGGA >NZ_CP020814|5|4|3963307-3963385|CRISPRCasFinder TTTGTCCTTTAGACGCTTCCTCTCGGA CAGGCCGGTCCTCTTTCTTCCTCCA TTTGTCCCTTAGACGCTTCCTCTCGGA
>NZ_CP020814.1|WP_066156985.1|3961813_3962995_-|sensor-domain-containing-diguanylate-cyclase MKKDRGVALGVGGGVLVFVGLIFSSSHLIWIVLLGLVVIVLGAWSLWRKFSVLQASYEKLVKEKQQIEKENERLVKLSQEYELLFNSFTRVALVMVDKSSNDVHFSKGVEDLFGFSQQELNAYPNLWKSLIHQEDRAKVDQVEKALECNEEAEVDCRILLDGEEKWIQLYWKAYKDGTGHSEKVFGKFRDISKQKRLELELRQMAFFDDLTDLPNRKMLDRHIEKALSRAKRHQHNFTLMFVDLDDFKIVNDTHGHDVGDQLLKQVVSRLHESIREEDLIARIGGDEFIVVFEETTKEEIEDIAKRIVSNVSLPYDLEGIEAKISLSIGVSMYPEDGEDKSTLIQNADKAMYHAKHNGKNHFVLYTPELEEMEPSEVGVWARWKNFVQSTKFW >NZ_CP020814.1|WP_066156982.1|3960676_3961420_-|alpha/beta-fold-hydrolase MVLEKETIIFLHGIVGNKNAFKKEIAKLKEQYHCICYDLYDVHEVGLSLTVLIERLSHQYKKAKLKKAHLCALSFGSLIAVAFAKKYPDMVESITVVGGYCCQVPSRFYTNVTTMLEKKDQIDYEEWVCEYARLLNPNVDSIAEDSEAIFIQYAKQVHPVVLEKLIRMQLEFDSKTALAGLTMPVLWVMGEYDELYKGTLSHLKTQIPHVEYHEIQRAGHVAHIHQPELFMLLFQTFLRKGHHSKIA >NZ_CP020814.1|WP_066156976.1|3958089_3960612_-|EAL-domain-containing-protein MSIKKKLPLIFTSLVLCILIANSTLHYIRSKEKLIEYNEREIELITQEVSYQVENSRNGAQYVEDIIARELRTASIAIRNALPAEHENVTNEQLSELAEELLISHITLLAQTEDDIIGVKSSDAHEINMSTKDWLFWYDAFLELLELTPVTVEEGLALPNYWAGPIEVAASNPDHTDKWGYFHDGTTDYIINPYYRDNQVLEYEKLFGPANIMERFTSKLEGVLELTVFNPDKFGKETKWMHNNGNSFIRIVDQPIWYGTYDFENQAIDAGLIQEAIETETSQKYTDEVNGKLVTKTLVPIDTGSQDPYVIGVVYDYSLIQKELEKELIQHLILAIPFMLLVLLTSFIFSRSITKPIGKIVVKVNEIAHGHFGESILLKRKDELGHLAQNVNALSNSLQTYVTDLEKSQELIQFQAYHDPLTGLLNRRYFQEELEKRLSEADKTGETVAILFIDVDRFKDVNDTLGHARGDQLIRLISERIKLSLTNGNSVLTRQGGDEFVILVSGLEEEKITALAKDLVSTISQPYLIEGNEVIVSASCGISLAPKHTNKMETLMIYADGAMYAAKKDGGNHVVVYNEEINKEKNEKLRIEKRLRKAIANEEIEVYYQPKIDAKSDQLRGVEALLRWTDEELGFVPPDKFISIAEETGLIHPLWKIAMKQACSQISIWNSQRNEPIRLAVNFSAKQFQDPCSLVNQVKDILAEHQLAPNLFEVEITESTLLFKTTETIKALKSLQEYGISVSIDDFGTGYSSLSYLKTLPINCLKIDRSFIQDITEDNRNAEIPLTIINLARSLHLDVVAEGVEENHQKEFLVQNQCNYMQGFFFSKPLSKDDFEKNWL >NZ_CP020814.1|WP_084372336.1|3956517_3957744_-|voltage-gated-chloride-channel-family-protein MIGFIIGSTTSFLLHTNDFLGETRKDNSWLILFLPLAGLVLGYIYMNLGTSAGTELYKGNNLVIEGVHGKAKILRRLGPIVYLGTFMTVLFGGSTGREGAAIQMGGSVAEAVNTFFKVNVIDTKILLMSGISAGFGAAFGTPITGAIFGMEMVALGKMKYEAIVPCLVSSFVGHYTAEKIWGTEHETFIIQTVPELSLLSFAKVILLAILFGLVSVLYSQLRHGIHKVSEKYTKKNHAVRAFIGGMIIVVLTFIIGTNDYNGRSLDMLEESFSQDVPPFAFLAKLVFTAVTLGTGFVGGEAIPLFFIGATLGNTLYHFIDFPMSFVAAVGMIATFCGGANTPIAAFLLAVEMFDGQGMEFFFVACFTSYLFSGHHGLWPSQMIYEPKSRLFKIANGKTIKDVEQKKKY >NZ_CP020814.1|WP_066156972.1|3955737_3956298_-|sugar-O-acetyltransferase MKTEKEKMLSGELYDPADPVLVEERKEARRKVRIYNQTVETEGDKRTKLLKELLGSTGENVSMEPNIRFDYGYNTHVGENFYANFDCTILDVCEVRIGDNCMLAPGVQIYTATHPLHPTERNSGKEYAKPITIGDNVWIGGSAVLNPGVTIGDNVVIASGAVVTKDVPSNTVVGGNPAKVIKEIEV >NZ_CP020814.1|WP_066156968.1|3954834_3955707_-|LysR-family-transcriptional-regulator MEERDWLILKVLYEKKNITKTAQSLYISQPTLTKRIQQIEKEFDQPIISRGAKGVQFTPQGEYLVDCADEMLARLRKIKDTVKNMDHEVNGTLQLGVSNYITRHKLPALLKRFREQFPKVKYKVVTGWSRDIFTLAYHHDVHIGIVRGDYQWAGSKELLFEETICIASKEKIALNDLPQLPRIQYETDATLKTLIDNWWTGTFTEPPLIEMEVDKADTCKEMIVNGLGYGILPSVLVDDQPDLYRVDIKNEQGQPLKRKTWMLYHNESLEMKVVKEFVEFMRKLDIKNDL >NZ_CP020814.1|WP_066156965.1|3953740_3954667_-|AEC-family-transporter MDVFFLILLNVILPVFLLIGLGAFLHRTFKFDMGTLSKLNTYLLLPAVGFANVYQSKMGGETLLLILNFLVLQSLILMGISAGISKMFNFERSLSSTFKNSVVLSNSGNFGLPVSQLIFQYNPLGLSIQIVVMIFQNLLTYTYGLFNSVSVQSNGFKAMKVFLKNPVLYAFLLGMLLQATSISIPEYLWTPIESISSAFLAIALITLGAQSAFLKIYRFSTPLILSLLGRLVLSPCIAFIVIMTLNLEGTTAQALLIASSFPTSRNSSLFALEYGNHPEYAAQAVLLSELCSMVTVTTVVYLAQVIFL >NZ_CP020814.1|WP_066156962.1|3953247_3953679_-|hypothetical-protein MDNKGNIFILVILVMILGLAPVSAQEPNAFTRPTSVAFKGESPNWIVEHRLYLVGTDVDYETKITYRGEDQTIIGSPSLRYTIDDQEGGYITDTFSLNKAHLFQSKRLACYGCKYLDKKKEITVTIGEWEDYEEKIVLKALKK >NZ_CP020814.1|WP_066156961.1|3952830_3953151_-|YckD-family-protein MRKKLSGLLAAVVIALVFLPGGVGAEGKPEAEVTLTEEQKTEMAALQTQMLEQKKVILNKYVEYGVFTEEKAQKIIAHMDKHYKKLEENGFIPTWDRKHGKHHNEE >NZ_CP020814.1|WP_084372409.1|3948204_3951438_-|X-prolyl-dipeptidyl-aminopeptidase MIVKMKKWLSVFAAFVMLLSVIAPTSSPVLASASVETAEEVELEVSRSLFSMTEVRMVDVRADFDEEIDLSQLDWTFGGKSLSEWKKWSGGTNFNGEPFITVVEEPHFVDGTTIVQATLEFGLPFNTTNLSNRTIRVQYPSLIGEYELALLNKETGSKAATDVKLNVYDEFLSYEELKPAIDKVFLAADEDDDNNRYLEYQKAGTSVEGRDIHFVILARDQEAVDKYLNETLPTALEDPASLLEKVENGTIGDYQIPVWFNNIHPDEVEGVDAQIELFETFALEEEVKFTSVTEDGEEAITLHIDDVLDDVIFLYMFTSNPDGRVANTRANANGFDLNRDNAYQTQPETQQVNELIAKWTPLSFLDMHGYVNGFLIEPTTPPHNPNFEYDLLNQNMINQAHAMGQAGVGQSSLESYFIPKLDWEDGWDDMTPAYTAVFSMLHGSLGHTIEVPELSQDSYYAMVGTGLGATAFVIENKDELYANQLKVFKRGVNGEDNRAVDEYYVNANGESIGRVRGEHDNFFPDYYVIPANQEMQKNTLEAYKMVDYLLRNGVKVEQTTKKIKVNNTMYPEGTFVVPMNQAKRGLANAVLYNGDDVSDWNAMYDPIVVNFPALRGFDIDQIREAGAFATNTVEVESVTGPSATITGNTPKQVVKNTNTDTIKLVNELLANGKKVEVAMETTARVEKGDYIVATNDIRPYVDHYYFETLPLGNGQNIKTNELREPKVAVTGSAQLKNTLNELGFELVGQADADVIVSDGGTFNKDHIKGKTFIGFGATPLSHVKNSGLLPGFSFGLTRTNHEGLVQANVADHLLTSGYEAEEQLYVTTGAWISEVPEGADVLATFSDRDDFYLAGWWPGNEQAQGQTLAFTQELDQTTITLFANALAFRAHTDHSYRFLANSIYQSASSEVEKKYKGQGKAKGKEVQVKASDVKVAKEANQVKAIVNKDALKEAASNERIDNVTIALDRAGQEIVEIQLFASTLEQLQATHADARLTVDFGAESYSFPLTDFELGKVAKNKGKDTTISIKTELEKEATDETKDEEAVIFDKGYVTISALVGNAEVELTSFPTLLERQ >NZ_CP020814.1|WP_066156989.1|3963460_3965923_-|EAL-domain-containing-protein MFREIIPSWFVERMGRISYSKKFFLHFIALTIPLMFAMSLIVIDVHTNLKQNQLEQQAIDSFLHTSELLMYAQIHRGLNQSYLRGYDDFTEQVQETQQAVDEKISDIDSKREQWPAFFHAEKWDQIKAQWHRVKEENHLLKSYYIHNQLNEEILIFVNEIGEQARIYLNPDAKMNRLSSVLNGDLLLATEALGKLRAYATSLSFADTRTPEQQEELAIMIGGAQFFVQSVAVRNPDLNGETKLDVELEQFTTSAKQFLRLIKADELSAIGPEGVFSSGSNAITSGFTLYEKGNGILLEHLQEKEKQSRLLIGLVVVSFLCSIGMVCLLFGSSYVSVMQTIQALNKGTRRWIDGDFSSRVEIKTQDELKYIGDSFNQIAHSFEQKIKEQEQANERIYALAFTDQLTQLPNNHQLQLIVERDMEAGMKQATILRLDIGRFKNVNYSRGFQIGDETLKQFARRLQEVLGEEEVLSRQNGDKFTLYLPHQADVEQVNEKIERILEQLKKPFDISGFTFYLSIRIGLSQYPKDGQTFTALMQQAEEAMYEAKEDKEKQYVYYHDGIHQGFKQEYELENNLRVALANNELFLTYQPKQNVKTGEITGMEALVRWKHPTIGIISPLNFIPIAEKTGLIYQIGEWVLHEACRQTKQWQVEGFQPLVVSVNLSANQFNRKDYLLPLIDRILAETGLDPTYLQLELTESGFQDPVLVKPILEQMKERRLTISIDDFGTGYSSLSYLKQFPIDVVKIDRAFIREICENKGDQQLTKSMIDLGHVLGMKVIAEGVEEIEQIELLRELGCDEVQGFFIAKPLTNEEFIEFLRK >NZ_CP020814.1|WP_066156991.1|3966366_3967791_-|Na+/H+-antiporter-NhaC MKQEEKQISFGWAIIPLIIMIAAMSYTIVIVGGDPHIPLILGTVVAALIALKCGFSWGEIEGGLYKGIRLALPAIVIIIMVGIIIGAWIGGGIIATMVYYGLKLISPSLFLVSITVIAAIVALAIGSSWSTMGTIGVAGMGIGLSMGIPAPMIAGAIISGAYFGDKMSPLSDSTNLAAGVVGVDLFEHIKHMFFTTIPGLVIALVVYWFLGRQFSTISMEDGQISEIMTQLQANFVITPWLLLVPAIVILLVAKKVPALPALTVGVFLGLVSQVFVQGGQIGDAINTLQGGFSIVSGNEMIDSLFNRGGIDDMMYTVSLTIVAMTFGGVLENTGMLKSIVNQILKVAKTGKGLVSTAISTAFITNVTAAEQYISVVVPGRMYAQSFRDKKLHPKNLSRAVEDGGTLTSVFVPWNTCAIFIFATLAVHPLEYAPYAILNLVVPIISFIYAWTGFSITPLPPGGDVKVDQDDRKVI >NZ_CP020814.1|WP_066156994.1|3967825_3968944_-|M20-peptidase-aminoacylase-family-protein MKQIVESLHDRLLQIFDHLHSHPELSWKEEKTTAYIKQLLEQEGVVVRTFPDCTGLVAEIGSGMPVVAVRADIDALGQEVNGVIQANHSCAHDAHMTIAIGVLLTLRKQELPKGTVRFIFQPAEEVGNGALKMVEKQVVDDVDYLYGVHVRPVQELKGGQATPAIIHGAGLFFEGKIIGEDAHGARPHLAVNAIEVGSAIVEQLKGIYADPQVPHSVKLTKFQAGGENANIIPGSAVFSIDLRAQSNEVLDQLQTKVEHVIEAIGKLYDVEIRLDVLDYVPAAEVHKQAESMMEAAINEVIGQERFVGPIVTSGGDDFHYYTIKRPHLKATMLGLGANLTPGLHHPYMTFEREAIFTGVEILAQAVVKTLKN >NZ_CP020814.1|WP_066156998.1|3968940_3969660_-|hypothetical-protein MEILARGTLVNQTTKCEEPFLVRTLTKQHLSQVLQVQQQVTWHLEVKESLQPLTVEEFEHVFSDGGLMIGAFVGEQLIAFRVLLFPRDHPENLGRDLGLSLEEQEKVVHQELSCVLPQYRGNRLQNQLAQLIMKKFQEQKLPYRYLCCTVFPTNVPSVKDKFKQEMLIVKITEKYSGKRRYIFLKDLEQHRLLDLQTVIAVVMTDYEQQKALLTTGYYGFDTKEENGERKILFAKGGAL >NZ_CP020814.1|WP_066157001.1|3969661_3970780_-|dipeptide-epimerase MKITAVHLYGIHLPLKEPFIVSYETYTSIPSVIVKIETDNGLSGYGEAVADEHVTGETWASTYQVLKNTLIPAVIGENPFHLEKIHDKMNQVIHHAPTAKAAVDIACYDLIGKALKQPVYQLLGGKYHEQFPVAHVVSILEPEEMAADALRAVQQGYKVLKLKVGTDKRKDIERIRAVREKVGNEIVIRVDVNQGWTTSADSLFVLNKIEDCEIDWIEQPVLADDLDALVEVKQKSRLPVMADEALHSKKEMREIIAKRAADKVNIKLMKCGGIYPAMKLVHQAEMAGITCQVGSMVESSIASAAGFHLSFSKKNITSVELTGPLKFTKDVGNLTYDLPYIQLNDLPGLGVEVDEDVLFELTDMHDVIKGDC >NZ_CP020814.1|WP_157108294.1|3970900_3971041_+|hypothetical-protein MKIKIAVFGSQEFFNQVKTYEDQVKKIELIPYIYKDPGIRLFLLRT >NZ_CP020814.1|WP_157108295.1|3971157_3972213_+|HTH-domain-containing-protein 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MGLTKDFFIFLSQNKLLNNSAKKWGLKVGAQSVVAGTNIEEMVQSVKKLNEKGISATIDNLGEFVFEKEEATKATEQIIAVIEAIQENKLDAHISLKPTQLGLDIEYNFCLENLRKIVEVAHKYNIFINFDMEDHSHLQPSFDIIDELLRDFENIGTVIQAYFYQSQTNIEKYKGYRLRIAKGAYKEPESLAYQDKDEIDRNFMKLIEYHLLNGKFTSIATHDHNIINRVKAFVKEKKIPNEKFEFQMLYGFRKDLQLKLAEEGYNVCIYVPFGVDWYGYFMRRLAERPQNLNLVVKQMFNKRTNAVIGTLAGGFILGRVSKRRQI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MT774390 | CrAssphage cr85_1, complete genome | 14423-14446 | 2 | 0.917 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MT521993 | Gordonia phage RedWattleHog, complete genome | 113452-113475 | 3 | 0.875 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MN586040 | Gordonia phage Stormageddon, complete genome | 114417-114440 | 3 | 0.875 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MN562221 | Photobacterium phage PDCC-1, complete genome | 166082-166105 | 3 | 0.875 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MK368614 | Vibrio phage 2 TSL-2019, complete genome | 72553-72576 | 3 | 0.875 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MN693880 | Marine virus AFVG_250M607, complete genome | 15773-15796 | 3 | 0.875 |
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NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | NC_042112 | Campylobacter phage CP81, complete genome | 106238-106261 | 3 | 0.875 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | KP703175 | ANMV-1 virus from uncultured archaea, genomic sequence | 24612-24635 | 3 | 0.875 |
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NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | NC_016562 | Campylobacter phage CPX, complete genome | 22214-22237 | 3 | 0.875 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | NC_048702 | Erwinia phage vB_EamM-Bue1, complete genome | 56698-56721 | 4 | 0.833 |
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NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MN694642 | Marine virus AFVG_250M1139, complete genome | 34274-34297 | 4 | 0.833 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MN694501 | Marine virus AFVG_250M1038, complete genome | 7339-7362 | 4 | 0.833 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MN694309 | Marine virus AFVG_250M1141, complete genome | 6827-6850 | 4 | 0.833 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MN694135 | Marine virus AFVG_250M1039, complete genome | 7336-7359 | 4 | 0.833 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MN694086 | Marine virus AFVG_250M1072, complete genome | 33856-33879 | 4 | 0.833 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MN694450 | Marine virus AFVG_250M1140, complete genome | 34041-34064 | 4 | 0.833 |
NZ_CP020814_3 | 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder | 3444778-3444801 | 24 | MN694438 | Marine virus AFVG_250M1133, complete genome | 6631-6654 | 4 | 0.833 |
NZ_CP020814_4 | 4.3|3909751|25|NZ_CP020814|CRT | 3909751-3909775 | 25 | NZ_CP021923 | Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus strain SRCM101468 plasmid pAP1468-1 | 58205-58229 | 4 | 0.84 |
NZ_CP020814_4 | 4.3|3909751|25|NZ_CP020814|CRT | 3909751-3909775 | 25 | NZ_CP021511 | Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus strain SRCM101342 plasmid pAP1342-2, complete sequence | 99175-99199 | 4 | 0.84 |
NZ_CP020814_4 | 4.3|3909751|25|NZ_CP020814|CRT | 3909751-3909775 | 25 | NC_013211 | Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-020, complete sequence | 148688-148712 | 4 | 0.84 |
NZ_CP020814_4 | 4.2|3909699|25|NZ_CP020814|CRT | 3909699-3909723 | 25 | NC_009929 | Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4, complete sequence | 119840-119864 | 5 | 0.8 |
NZ_CP020814_4 | 4.5|3909855|25|NZ_CP020814|CRT | 3909855-3909879 | 25 | NC_009929 | Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4, complete sequence | 119840-119864 | 5 | 0.8 |
1. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134399 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.917
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer agagaagaaaaacctgaagatgat Protospacer * *******.**************
2. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MT774390 (CrAssphage cr85_1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.917
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer acagaagaagtatctgaagatgat Protospacer ********** *.***********
3. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MT521993 (Gordonia phage RedWattleHog, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer cgagaaggagaacctgaagatgat Protospacer *****.****************
4. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MN586040 (Gordonia phage Stormageddon, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer cgagaaggagaacctgaagatgat Protospacer *****.****************
5. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MN562221 (Photobacterium phage PDCC-1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer gtagaagaagatcctgaagatgat Protospacer ..********* ************
6. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MK368614 (Vibrio phage 2 TSL-2019, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer gtagaagaagatcctgaagatgat Protospacer ..********* ************
7. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MN693880 (Marine virus AFVG_250M607, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
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8. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to KX879627 (Campylobacter phage vB_CjeM_Los1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer attgaagatgaacctgaagatgat Protospacer *. ***** ***************
9. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to NC_042112 (Campylobacter phage CP81, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
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10. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to KP703175 (ANMV-1 virus from uncultured archaea, genomic sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer aaggaagaagagcctgaagatgat Protospacer * .********.************
11. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MH494197 (Escherichia phage CMSTMSU, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer aaagaagaagaacctgaagataaa Protospacer * *******************.*
12. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to KF148616 (Campylobacter phage CP8, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer attgaagatgaacctgaagatgat Protospacer *. ***** ***************
13. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to NC_049953 (Escherichia phage Lambda_ev099 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer gctgacgaagaacctgaagatgat Protospacer .* ** ******************
14. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to NC_016562 (Campylobacter phage CPX, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.875
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer attgaagatgaacctgaagatgat Protospacer *. ***** ***************
15. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to NC_048702 (Erwinia phage vB_EamM-Bue1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer caggaagaagaacctgaagatgag Protospacer .********************
16. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to NZ_LN997849 (Magnetospirillum sp. XM-1 isolate XM1 plasmid II, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer ctatcagaagaacctgaagatgat Protospacer .* *******************
17. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MN694642 (Marine virus AFVG_250M1139, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer gaagaagaagaaccagaagatgag Protospacer . ************ ********
18. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MN694501 (Marine virus AFVG_250M1038, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer gaagaagaagaaccagaagatgag Protospacer . ************ ********
19. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MN694309 (Marine virus AFVG_250M1141, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer gaagaagaagaaccagaagatgag Protospacer . ************ ********
20. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MN694135 (Marine virus AFVG_250M1039, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer gaagaagaagaaccagaagatgag Protospacer . ************ ********
21. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MN694086 (Marine virus AFVG_250M1072, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer gaagaagaagaaccagaagatgag Protospacer . ************ ********
22. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MN694450 (Marine virus AFVG_250M1140, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer gaagaagaagaaccagaagatgag Protospacer . ************ ********
23. spacer 3.1|3444778|24|NZ_CP020814|CRISPRCasFinder matches to MN694438 (Marine virus AFVG_250M1133, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.833
acagaagaagaacctgaagatgat CRISPR spacer gaagaagaagaaccagaagatgag Protospacer . ************ ********
24. spacer 4.3|3909751|25|NZ_CP020814|CRT matches to NZ_CP021923 (Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus strain SRCM101468 plasmid pAP1468-1) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
gatcctctccccttttggctcggac CRISPR spacer gatcctctcccagtttggctcggga Protospacer *********** **********.
25. spacer 4.3|3909751|25|NZ_CP020814|CRT matches to NZ_CP021511 (Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus strain SRCM101342 plasmid pAP1342-2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
gatcctctccccttttggctcggac CRISPR spacer gatcctctcccagtttggctcggga Protospacer *********** **********.
26. spacer 4.3|3909751|25|NZ_CP020814|CRT matches to NC_013211 (Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmid pAPA01-020, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.84
gatcctctccccttttggctcggac CRISPR spacer gatcctctcccagtttggctcggga Protospacer *********** **********.
27. spacer 4.2|3909699|25|NZ_CP020814|CRT matches to NC_009929 (Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
gatcctctcctcttttggctcggac CRISPR spacer ctagctctcctcttttggctgggac Protospacer **************** ****
28. spacer 4.5|3909855|25|NZ_CP020814|CRT matches to NC_009929 (Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.8
gattctctcctcttttggctcggac CRISPR spacer ctagctctcctcttttggctgggac Protospacer **************** ****
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
341608 : 351387
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020814|341608:351387|DBSCAN-SWA 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GCTGAATCTCAATCTCGTTTTATCGTTACAGTTCCAAGTGATAAAGCTGAGCAATTCGAGGAGCTTGTTGCTTGTGTGAAAATTGGAGAAGTAACAGATACAAAAGAACTTCAAATAAAAGATGATGAACAACGTATCATCCTTAAAGCAACTCAGGATGAAATTGTAACGGCTTGGAAAGGAGCCATTCCATGTTTGCTGAAATCAAAGGCCTAAATGAAGAATGTGGAGTGTTTGCGATTTGGGGTCACAAAGACGCAGCGCACTTAACGTATTATGGTCTTCACAGTTTGCAGCACCGCGGACAAGAAGGTGCCGGTATTGTTGTAACGGATGGAGAACAGTTGAAGGTTCATAAAGGGTTAGGACTAGTAAATGACGTATTTAGTCCAGATAATTTTTCAGATTTAAGTGGGCATGCTGCAATTGGTCATGTTCGTTACGCGACAGCAGGAGGTGGGGGATTTGCCAATGTGCAACCCCTCCTTTTCCGCTCGCAAACAGGTAGCTTAGCGATTGCTCATAATGGTAACTTAGTAAATGCCAATAGCATGAAACATCAGCTCGAGTATCAAGGAAGTATTTTCCAATCGACTTCAGATACAGAGGTTGTTGCTCATTTAATTAAACGTAGTGGTTATAACACACTTGAAGATCAGCTACGCAATGCACTTGAAATGCTAAAGGGAGCTTATGCTTTCGCGGTTTTAAACGAGAAACAGTTAATGGTAGCGCTCGATCCGAATGGACTTCGCCCGCTTTCTATTGGCCGATTAGGTGATGCATACGTTGTTGCATCAGAAACTTGTGCATTTGATTTAATTGGTGCTGTTTATGAGCGTGAAGTAGAACCGGGTGAACTCGTTATTATTGATGAAAATGGGCTTCGCTCAACAAGATTTGCAGGTTCTGCTACAAGAGCCATCTGTAGTATGGAATATGTCTATTTTGCTCGACCTGATAGCAATGTAGATGAAATTAATATTCATAAAGCTAGAAAAAGTTTAGGCAAACAGTTAGCAATTGAGTCTCCGGTAGAAGCAGATGTTGTAACTGGAGTCCCTGATTCTTCTATATCTGCTGCAATTGGCTATGCAGAGCAAACAGGAATACCTTACGAGCTTGGGATGATAAAAAATCGATATGTAGGACGTACATTTATTCAGCCTTCACAAGAGTTACGTGAACAAGGGGTGAAAATGAAACTTTCTGCTGTTCGAGGAGTAGTCGAAGGGAAACGTGTTGTGATGATTGACGACTCAATCGTACGCGGGACGACAAGTAGAAGAATTGTGAAAATGCTTCGTGAAGCTGGGGCAAAAGAGGTTCACGTGCGTATAAGCTCCCCACCGATTACACACCCATGTTTTTACGGAATTGATACTTCAAATTCAGGAGAATTAATCGCAGCGAACCATTCACTTGAAGAGATGAGAGAAATAATGGGAGCTGATTCTCTTGCGTTTTTATCAACAGAAGGGTTAAAAAAGGGAATTGGACGTTCAGATGCAACATCTAATTGTGGCCAATGTCTCGCATGCTTTACTGGAGAGTACCCGACGGAAATTTATCCAGATACGTTACATCCATATGCTAAGGTTTAGAGGAGAAGGGAGCAAGAAGAATGTCGGAAGCTTATAAAAAAGCAGGAGTCAGTCTTGAAGCAGGTTATGAAGCTGTAGAGCGAATGAAGAGTCATGTAAATAGAACACAACGTGCTGGAGTTATGGGTTCACTTGGTGGCTTTGGTGGAATGTTTGATCTATCTACATTAAATCTAAAGGAGCCTGTGCTTGTTTCTGGAACAGATGGAGTAGGGACAAAGTTAATGCTTGCCTTTATGCTAGACAAACACGATACAATAGGTGTTGATGCAGTTGCGATGTGCGTGAATGATATTGTTGTTCAAGGAGCAGAACCACTTTATTTCCTTGACTATATTGCTTGTGGGAAAGCAGTTCCAGAACGTTTAGAAGCTATTGTAAAAGGGGTAGCAGACGGTTGTGAACAAGCTGGCTGTGCGTTAGTTGGCGGTGAAACGGCAGAAATGCCTGGCATGTATTCAGAGAATGAGTATGACTTAGCTGGTTTTTCTGTAGGAGCTGTTGAAAAACAACAGTTAATCAGTGGGGAAGCAATCAAGCCTGGGGATGTCGTCATTGGTCTTTCATCAAGTGGTGTCCATAGTAATGGCTTTTCATTAGTAAGAAAGGTTTTCCTTCATGATCATTCTTTCTCTTTAACGGATTATGTTGAAGTGCTTGGGAAAACACTGGGAGAAGAACTTCTAACACCTACGAAGATTTACGTAAAACCACTACTCGCTTGTTTGCAACAACATACGGTAAAAGGCATGGCTCATATTACAGGAGGCGGCTTCTATGAAAATATTCCGCGTATGTTGCCAGAAGGAGTGCAAGTAAATATCGAAAATGGTTCTTGGCCGGTTCCTCCGATCTTTACTATGTTACAAAAGTACGGAGAGTTAACAGAGAAGGAACTTTTCTCGACGTTTAATATGGGTATTGGAATGGTAGTGGTTGTTCCAGAGGAAGAGCATTTAGCTGTTCTTCGTCTTCTTGAAGAGAGTGGTGAATCTGCTCATGTAATTGGTAGAGTAGAACAAGGCTCAGGTGTGAAAATTGGAGGCATTGAGTAATGAAGTTGGCTATTTTTGCTTCGGGTAGTGGCACGAATGCAGAAGCGATCATTCATGCAGCGCAGCAACAAACACTTGAGATGGAAATTGCTCTTGTTGTGACAGACAAGCCAAAGGCAAAGGTCATTGAAAAAGCAGAACGGTTGAATGTGCCTATGCTTATTTGCGATCCCAAGTCATTTGAGACAAAGGATGCTTACGAAGAACAGGTCGTCAGAGAGTTGAAGAAAAGGCAAGTAACCTTTATCGCATTAGCCGGTTACATGCGATTAATTGGTTCAACTTTACTAAACGCTTATGAAGGAAGGATCGTTAATATACATCCTTCCTTGCTTCCTTCTTTCCCAGGTCTTGATGCAATTGGACAAGCCTTTCAAGCGGGCGTGAAGATAACTGGTGTAACCATTCATTATGTTGATGAAGGAATGGACACGGGTGAAATCATCGCTCAAGAGGCTGTTCGAATAGAAGAGACGGACACTGTGGAGACGTTGCACCAAAAAGTACAAGCAGTCGAACATCAATTGTATCCCAACACATTACAGAAGATCTTTAGATCAGACAGAGAGGTTGAGTAAGAACATGAGCAAAAAGCGAGCATTAGTTAGTGTTTCAGATAAAACAGGAATTGTCGAGTTTGTCCAAGAGTTAGTGAATCTCGGTTTTGAAGTTGTTTCTACTGGCGGAACAAAGAATGCATTACAAGCAGCCGGTGTCCCTGTTATTGGGATTTCTGAGGTAACAGGTTTTCCTGAAATTTTAGATGGTCGTGTGAAAACACTGCACCCTAATATTCATAGTGGTTTACTTGCAATGAGAGAACGTGAAGAACATCAACAGCAGCTTACAGAACATAATATTACGCCAATTGATTTAGTAGTGGTGAACTTATACCCGTTCAAAGAGACCATCGCTAAACCAGATTGTACATTTGAAGACGCGATCGAAAATATTGATATCGGTGGACCGAGCATGTTGCGTGCCGCTGCTAAAAATCATCAGCATGTAACAGTAGTGGTCGATCCAGCTGATTATGAGACAGTAGTATCAGAGTTTTCAAATGCACAAGCTGTTTCAATCGAAACGAAGCGTCGTTTAGCTGCGAAAGTATTTAGACATACAGCGGCTTATGATGCGTTAATCGCAGAGTATTTAACTGAGGCTGTTGGAGAAGAGGAACCTGAAACATTTACGGTGACGTATGAGCGCAAACAGGGCTTACGTTACGGAGAAAATCCTCATCAGAAAGCAACGTTTTATAAGAAGCCGCTAGCAGATCAAAGTTCGATTGCAAGTGCGATTCAACTACATGGTAAAGAACTTTCTTACAATAATATTCATGATGCAGATGCAGCTCTTGCCATTGTAAAAGAATTTGAAGAGCCAGCAGTTGTAGCAGTGAAGCATATGAATCCATGTGGAGTAGGGACAGGTACAACGATTGAAGAAGCATATGGTCGTGCATATGAAGCCGACTCTGTTTCAATATTTGGAGGGATTGTTGCAGCGAACCGTGAAATTGATGAAGCTACGGCACTTAAAATGAAAGAGATTTTCTTAGAAATCATCATTGCTCCTTCATTTACACAAGAAGCATTAGATGTACTAACAGCTAAGAAAAACCTTCGTCTATTAACGGTTCCAATGGACAAACAAGAGCAGCCTGAAGCGATGTTGACATCGATTCATGGAGGTCTTCTAGTTCAGGATGAGGATCATTATGGGTTAGAGAATGCGGAACTTTCTATCCCAACGGACCGCAAGCCGACTGAAGAAGAATGGGAAGCATTAAAGCTGGCATGGAAAGTAGTCAAACACGTGAAATCAAATGCGATCGTTTTGACAAATGGTCAAATGACAGTTGGTGTTGGAGCTGGTCAAATGAACCGTGTAGGTGCTGCTGATATTGCAATCACACAAGCGAGTAAACGTATTGAGGGTGCGGTCATGGGTTCTGATGCCTTTTTCCCAATGGGAGATACGGTTGAACTAGCAGGAAAAGCAGGTGTAACAGCGATTATTCAGCCAGGTGGTTCAATTCGTGATGAAGAGTCTATTGAGATGGCTAATAAATATGGAATTGCAATGGTCATGACAGGAGTCAGACACTTTAAACATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020814|341608:351387|344597_346823_+|WP_066158512.1|DBSCAN-SWA MSLLLEPTAERVKEEKIYREMGLTDDEFAMIEEILGRTPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKVVLKKFPTEGERVLQGPGEGAGIIDIGDEQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGILRDVFSMGARPISLLNSLRFGELTSPRVRYLFEEVVAGIAGYGNCMGVPTVGGEIQFDPCYEGNPLVNAMCVGLIDHKDIQKGQAKGVGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELGEDSDEKRPAVQVGDPFMEKLLLEACLELIQNDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGSGIEMNLDLVPQREKGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIKEIFDRWGLLSAEVGHVTDDKRLRLLHKGEVVADLPVDALAEEAPVYHKPSAVPAYYEKFQQLEEKTPVVENYKETLLNLLAQPTIASKEWVYDQYDYMVQTNTVVEPGSDAAVVRIRGTRKALAMTTDCNSRYIYLDPEVGGQIAIAEAARNVVCSGGVPLGLTDGLNYGSPDKPEIFWQLEKSTDGMSEACRVLETPVIGGNVSLYNETAGVAIYPTPVIGMVGLIEDVDHITTQSFKQAGDYIYLVGETKPEFGGSELQKLVEGDISGKAPTLDLELEKRLQKQLLTAIRSGLVASAHDVAEGGVSVALAESMTSGEVGASVTLSGEKTAALFAESQSRFIVTVPSDKAEQFEELVACVKIGEVTDTKELQIKDDEQRIILKATQDEIVTAWKGAIPCLLKSKA >NZ_CP020814|341608:351387|348231_349266_+|WP_066158509.1|DBSCAN-SWA MSEAYKKAGVSLEAGYEAVERMKSHVNRTQRAGVMGSLGGFGGMFDLSTLNLKEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMLDKHDTIGVDAVAMCVNDIVVQGAEPLYFLDYIACGKAVPERLEAIVKGVADGCEQAGCALVGGETAEMPGMYSENEYDLAGFSVGAVEKQQLISGEAIKPGDVVIGLSSSGVHSNGFSLVRKVFLHDHSFSLTDYVEVLGKTLGEELLTPTKIYVKPLLACLQQHTVKGMAHITGGGFYENIPRMLPEGVQVNIENGSWPVPPIFTMLQKYGELTEKELFSTFNMGIGMVVVVPEEEHLAVLRLLEESGESAHVIGRVEQGSGVKIGGIE >NZ_CP020814|341608:351387|342972_343695_+|WP_066158519.1|DBSCAN-SWA MEKGILLYEGKAKQIFQTSNEDELWISYKDDATAFNGEKKETLIGKARLNNEITSLIFEYLQENGVESHFVRKLSETEQLVKKVDIIPLEVVARNVVAGSLSKRLGIEEGTVLAEPIVEFYYKDDSLGDPLVTEDHIAVLQVATPADLQVLREKTIEVNKRLIKLFDGLNVRLIDFKLEFGRTTAGDILLADEISPDTCRLWDKETNERFDKDIFRKNLGNLQEGYQEILSRLGGASCTK >NZ_CP020814|341608:351387|341608_342907_+|WP_066158522.1|DBSCAN-SWA MIERYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEIVACEAWAELGDIPKEDVAKIRENASFDINRINEIELETRHDVVAFTRAVSETLGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYLLKQANEILLSDIERFIEILKDKAQEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLQRFKDAAEGVRVGKLSGAVGTFANIDPSIEAFVCEKLGLEAAPVSTQTLQRDRHADYLAAIALIATSIEKFAVEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGHMLTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMTRTYGLIYSQRVLLSLINKGMVREEAYDLVQPKAMEAWEKGIQFRELVEAEERITSVLTPDEIEDCFNYEHHLKHVDTIFTRVGLQE >NZ_CP020814|341608:351387|349848_351387_+|WP_066158504.1|DBSCAN-SWA MSKKRALVSVSDKTGIVEFVQELVNLGFEVVSTGGTKNALQAAGVPVIGISEVTGFPEILDGRVKTLHPNIHSGLLAMREREEHQQQLTEHNITPIDLVVVNLYPFKETIAKPDCTFEDAIENIDIGGPSMLRAAAKNHQHVTVVVDPADYETVVSEFSNAQAVSIETKRRLAAKVFRHTAAYDALIAEYLTEAVGEEEPETFTVTYERKQGLRYGENPHQKATFYKKPLADQSSIASAIQLHGKELSYNNIHDADAALAIVKEFEEPAVVAVKHMNPCGVGTGTTIEEAYGRAYEADSVSIFGGIVAANREIDEATALKMKEIFLEIIIAPSFTQEALDVLTAKKNLRLLTVPMDKQEQPEAMLTSIHGGLLVQDEDHYGLENAELSIPTDRKPTEEEWEALKLAWKVVKHVKSNAIVLTNGQMTVGVGAGQMNRVGAADIAITQASKRIEGAVMGSDAFFPMGDTVELAGKAGVTAIIQPGGSIRDEESIEMANKYGIAMVMTGVRHFKH >NZ_CP020814|341608:351387|343930_344614_+|WP_066158514.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDSDMFFAIQDALQEEVEYVRYDETSLEGFDGVLLPGGFSYGDYLRSGAIACFAPIMEAVKQFAIDGKPVLGVCNGFQMLLELGLLPGAMKRNDGLKFICRPVDLVVENNQTMFTSSYEKGEVISVPVAHGEGNYECDEATLATLEENNQVVFRYKEAINGSKANIAGITNEQGNVLGMMPHPERAVEKLLGSADGLRLFQSIVRNWRESHVTTS >NZ_CP020814|341608:351387|343682_343934_+|WP_066158517.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGGAVKRALHTMNYSEVEEVRIGKYMELTLTNTDDVEKRIDEMCSKLLANTVIEDYRYEIEEVVPS >NZ_CP020814|341608:351387|349265_349844_+|WP_066158506.1|DBSCAN-SWA MKLAIFASGSGTNAEAIIHAAQQQTLEMEIALVVTDKPKAKVIEKAERLNVPMLICDPKSFETKDAYEEQVVRELKKRQVTFIALAGYMRLIGSTLLNAYEGRIVNIHPSLLPSFPGLDAIGQAFQAGVKITGVTIHYVDEGMDTGEIIAQEAVRIEETDTVETLHQKVQAVEHQLYPNTLQKIFRSDREVE >NZ_CP020814|341608:351387|346798_348211_+|WP_066158510.1|DBSCAN-SWA MFAEIKGLNEECGVFAIWGHKDAAHLTYYGLHSLQHRGQEGAGIVVTDGEQLKVHKGLGLVNDVFSPDNFSDLSGHAAIGHVRYATAGGGGFANVQPLLFRSQTGSLAIAHNGNLVNANSMKHQLEYQGSIFQSTSDTEVVAHLIKRSGYNTLEDQLRNALEMLKGAYAFAVLNEKQLMVALDPNGLRPLSIGRLGDAYVVASETCAFDLIGAVYEREVEPGELVIIDENGLRSTRFAGSATRAICSMEYVYFARPDSNVDEINIHKARKSLGKQLAIESPVEADVVTGVPDSSISAAIGYAEQTGIPYELGMIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVKMLREAGAKEVHVRISSPPITHPCFYGIDTSNSGELIAANHSLEEMREIMGADSLAFLSTEGLKKGIGRSDATSNCGQCLACFTGEYPTEIYPDTLHPYAKV |
9 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
379463 : 457253
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020814|379463:457253|DBSCAN-SWA 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110 | Bacillus_phage(50.0%) | portal,capsid,terminase,integrase,tRNA,tail,holin | attL 394306:394324|attR 467102:467120 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
658839 : 666733
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020814|658839:666733|DBSCAN-SWA AATGAAAAGAAGAGGACAATTAACGGAAGAAGAATTGATGATTATTAGGAAAAAAGTCAATGATACGGAAGCTTTTGAGAAGTTCTTTAAAGACTGCTATTTGAGAAACTTGAGACCAGCAACAATTGAATATTATCAAAATGAGTTTCATGCAGCAAAGAAATTTAGTGACAAACAGTTGGTAGATTGGAAACAGTCAGACATTGAAAATCTGATTCTAGAAAGTAAAAAGATAATGAAAATTACAACTATCAACACTCGTTTGAGGGCACTTCGTTCGTTTTACAACTTTTTATTTAGAAATAAGTTAATTAGTAAAAACCCAATGGCAAATATTAAGTTGCTTCGTGACAGACAAAAGACCATTGAGACGTTTGATAGCAAAGAAATTGAAAAGTTAATAAGCACTATTAGAAAACAAAAGACATTTGTTGGTTTTAGGGATGAAGTTATTGTGCTTGTATTTCTTGATACAGGAGTAAGATTATCAGAGTTGGTGGGCATAGAGGTTATTGATGTAAAAGAAAATAAAATAATAATTAGAAAAACAAAAAACTTATTTGAGAGAATAGTTTATTTATCTGAGACAACTCAAGAACAACTGAAAAGATACATTAAAATTAGAGGAGAAATAGATACAAACAAATTGTTTATTAGTATAGATAATAAACCATTGAACCCTCATAGCATTCAAACAAGGCTCACTAGGTATGGAAAGGAAGCAGAAATTAATAAAAGAGTTAGTCCTCATACATTTAGACACACAATGGCAAAAAGAATGATCGTTTCAGGCGTTGATGCTTTTTCTTTAATGCACTTACTTGGACATACAGATATTACAGTTACAAAAAGGTACGTTAATTTATGGGGGCAAGATTTGGAACAAAAACATAAATTACATGGAGCATTAAAAGGGTTAAAATTATAATTTACGAACGTGTGTTTGTGTTATAAAATTATTAAAAGAGATGGCATTTGAGTTTGGCGGCTCTACCATCTCTTCATAAAAACCCGCAGAAGAATTAACTTCTATAATAAGATGATAGCAAGTCTTTTTCTTCTGTGTCAAGAAGGAGAGAAGGAAAATGAGTTTAATTTCAATCTTAAGTGGTAAAGGATTTGTAATGTTTAATAAGGATTTAGCACATGAAGTATCAGTTAATGGGGCAATTCTTTTTGGTCAGTTATGTTCAAGTTACGAGAGTTTTAAAAATAAGGACATGCTGACAAAGAAGGATGGAAAAGAATATTTCTTTCTAACAGGAGAAACTGTTGAAGAAGAAACAGCTCTAACTTACAAACAACAACTAAAAGCATTTAAAGAGTTGGAGGAAGCTGGTTATATAGAAACTGTTCTCATGGGTCAACCGAGAAGAAAATATTTTTATATTACAGATAAAATTTTTACTCTTTTCAGATCTGACAAAAGGGAAGAACTGAAAGCTGATATTAATACAAATGAACCTAAAGAACACCTAGAACAGCAACGTGATAATGACCAAAAGGGAAAATTGTTAAATGACAAAAGGGAAACACTAGATATGACAAAAGGGAATAACAAGCGTTTACCTTTGGGCATAGCATATAAAAATAAAAATAAAAAAGAACAATATAATAATAAAGAAATTTTTGTTAACAAAGGAGTTAACAACAAATTAAATAATATAGACGATACAATTCATAAATTATCTAATGAATATAGGTTAAAAGGTTTGAATAAAAAAGTCTGTGAACTAGTAGTTAATGAAGCATTGGAGAAAATTGACACAATTAATAATTTTGGAGCTTATTTAAGAATATGCTTTGAAAACACTCTATACAAAAGTAAACTTAAAAAAGGCGAAATTGATTTTGAAGAGAGATTTGGAAGAATGCCATTCTTTAACTGGCTAACTAAAGGAACGGAAGAAAATAATTTTGAAAAGGTATTCTTTCAAGCTGATTTGAATGACAATGTTGAGGGATATCAAAAGGAAAACAGATAAATAATAAAGACTTACCTTGGTAACATTATAATAATCATCAGAAGCCCCAGATTGTACCGTGTGGAATAGAAATCTAGTTTAAATATTAACACTTAGTAAATATAAAATTTAATCATATGGAAAGCGAGGTTTAACTAGATGAGTAGAGAAAAAAAGACAGCAATAGATGTTATAGAAGCTATTGAGTATATGGATAATGAGGAAAGATGGAAATTAATACATGAACTATATTTTAAATATTTCAATAAAGAAGGTCATGATTATCAACCGTTAGATTTAGATTATTAAAAAATTTTATATTTTGATTTACATTTTCTTTTTAGACGATATAACAACTCCGTAAGATGAATTCAAACTTATGGAGGTAATTGAATTATGTACATGAACGAAATAATTAAAGAAACTGATACTTTATTTAAGGGATGGCTATCGCAATTAACTGAAAAAGAAGAAGGTATAATGCAATTGCTATTACAAGTGGGGATAGATTCACGATATGAAACCTATACAACAGGAAATAAGAAAGCGTTTATGAGAAATTTAAAGTCTAAAATTAAGAAAATAAAACTACAAGGACCAACTATTACTTTTCAGCCAACTTGGAATGAAACATTAAGAACAATCAAGAAACTTGAACGCATCGGAATGATGAAAATTGATGAGGAAGGACTTCCAGTTTGGATGTACCAAGATATAGATAGAATTTTAGAGATGATTGAAGATCGGGCTTAAAGCTTGGTCTTTATTATTATCTTTTTATTAAATTTCATGTTGGAGGTCGACCACTTTATGAATATTTAGAAGTTCTAAGAAAGATTAAATCACTAGGTGGTACTGAATTTGATGAATACTGGGATGATGACCGAGCTTAGTGCTTGGTCTTTTTACTTAATAGTCCTAAATAAGAATAAATAGTTGTTCATTTATAGAACATCTCCAAGAATACAAACATGGTTTAAAATGAAACAACACTTGTTTTAATATGGTACTCACGACATGTTTCAAAATTGTACTCTATCTATACTTATAACTATACTTATTATAAAAACTTAATTTTGTTTCAAAGAAACAAGTTTCTTCGAAAAGAAAAAATATTCTTTATGTTGTTTACAAATGATACAAGTCAGATATAAAAAAAATATCAATTAGAAATTTTTCATTTAGTAAACAACGGAGGAATTATATGGAGAATAAATTTATAAAAGTTTATAAAGAAATATATCAACATGATAAGTATAGATGCTTAGACGGTGATTGTATAATTTATTATTCTTGGCTGCTTGATTTAAACGAACTCTCAAAGAAGAATGCAATAGATTATACAGACAGTAATGGTAGGGTATTCGTAATCTTTACAGAAGAAGATGCTTACAAATACTGTAATATAAAGAAAGGTAAGTTATATAGAATAAAAAAGAAGTTAAAAGAAGTAGGTTTAATTGATTATGAGGAACAAAAAGTAAAAAAATATGGAGTCTCAACACCAATTTATGTGACACCATATGAGCACTGGAAAAGAAAGTATGAAAATGAAGAATACAATTATACAAGAGTTGCTTTTGAAATGCCAGACTTTAACTAGTAAAAGGAAGTGATTAGGTGTTTAAACCAATAAATGCACATGGTTTTGGACAAAGGGTTAAATTAGATAAAACTTTAGAGTTGAAAAATCAAGTGACATTCATAAGAGTAGAAGTAGTCAAAGAAGTAGAAAATGAGAATGTAAAGAGGTTAAGAAAAACTTGGGAAGAATTGAAAAAAACGCAGCCTCCCGAACGTAAAGCGGGGACTTTAATTGACATGGACTCTTTAATCTAATCAAAAATTAATTTCTATATTTTGTTTCAAAACTTCTAGTTGTATATATATATTATAGAGGTTGCTAGATTAAGCAAAAAAAATTGGTAAAAACTGTATAAAAACTTCTAGTTGTATATATATATTATAGAGGTTGCTAGATTAAGCAACTCTCCCATTTCAACTTTTTCCATAAATTTTTTCTCCTTATTTTAAATCATTTGATATAATCATCAAAACGAATTACTTTTTTGGTAAAATCACCTCCGATTTGAGCTGGCTAATATCAGTTAGCTCTTATTTTTTTAATAAGACTACAATAGTAGTTATTATAAATTTGAATTAAATCTCTTTAATCTTATCTCTTTTAATCACTTTAGGGCATTGGCGGTCAAGGAGTTAGCTGATTTATTTCAGCTAACTTACATAAAGTAAATTACGCCTTATGGCGTGTAAATAAATAACATGTTTCATCTCCTTTCCCCTTTATAGTAGCATGAGTATGGTTGTTACATTGCATAAGTTCAGGAACCTAGTAATAGCTCCTGGACAATACATATTGGTGTACCCAATTGGGTATGCCTTTTTTATTTGCTCTTAAATTGCTAAATCTAGCAATTTTAAATATAAATCATTTCATAAAGGAGAGAAAATAAATGGCGAGTTTATTTAGATGGGGAAGTAAAGAAAAAGGTAAAGACTACTTCTCAACTGCTTTCTTTAATACCACTCCCACTGTTTTTCTTACAGAAGAACAAGTTATGAAAATTCCTGCTGTTAAAGCTTCTGTTGAGTTAATTAGTTCGTCTATTTCTCAACTACCTATTTATTTATACATTGAGCATGATGATACTTCTACTGAAAAAATGGACGATCCTAGAATTTCAGTTCTAAATCATGAAGCTAATGATTTTGATACTGCACAGGTTATAAAGAAGAAAGTTGTTCAAGATTACTTACTTCGAGGAAAAGCCTATTTATATCATAAAGATAATAAACTTCATCATCTTCCAGCTAAATCAGTTAAAGAAGAATTATATACCGAAGATGGAATTACAGTGGCTAAGAAACAATTCAACTATACTGGAATGAGTAATGTCACTCTTGAAGAAGATGAAGTAATAGTGATTGATAGTGGAACAGATGGACTATTAGTAGACGCTGGAGAGCTTCTAAAATCTGCATTAGCGCAACAAGAATATAGTCAATCTATTTTAAGCAACGGAGCACTTCCAGCTGGCATTTTACAAACAGCTACTCGATTAACTGAGAATGCAATGAGCCGATTACGAGAGTCTTGGAAGTCTCTTTATCAAGGAAGCAAACAAGCTGGAAAAACAGTTATTTTAGAAGAAGGCTTAGAGTTTAAGCCAATAACTCTTAAACCTGATGAAATGCAAATGACTGAAACTCATAAAATCTTAGTTTCTGAAATTGCTAGAGTTTTTAATATACCAGAGTCAATGATAAACAGTGCTGCTAATAAATATAACAGCTTGGAGCAAAACAACTTACAATTCTTACAAAATTGTGTTGGTCCTATTATTACTGCAATTGAAAGTGCCCTTGATAAGAACCTACTAACTCGTATCGAAAAAGATACGGGTTTTTATTTTAGATTTGATACTTCTGAACTTCTAAGAACTACTGAAAAAGAAAAAGTTGAAACAGTATCAAGTGCTTTAAAAGGTGGCTTAATCAGCTTTAATGAAGCTCGTCACAAATTAGATATGAGTCCTGTTGAAGAAGATTATTTTGTTCTTTCATTAGGAAATGTTCTTAAGTCAGCCAAAACAAACGAGCTGACTATTTTAAATTTAAACCAGACTTCTAATGGAGGTGAGATCAACAACAATGGACAAGAAGGAAAAGATTAAATATTTGCAAGAGCAAGCTGATAAAAAGTTGGAGTACCTCGAAACTCTTGAAGCAAGAGGTGTTCTTAAAAAGAACAAACAAGCTCGTTTAATTTATGAAAGAGAGAAAATTGCTCTCAGAGATATAGTTGATGAACTTGAATTGCTAACTCAACAAACAAAAGAAGAAGAAAGAGGTAATGAAGAAATGAAGAAAATGGAAGTAAGAAATAACGATTTTGAAGCTATTCTACGTGGTGAAACTCGTTCTCTAAATACTACAAATGATGGCGCTTCAGTTATTCCGGAAAATGTTCATGGTGAAATTATTGTAAAGATGGAAGAAATTTCACCAGTGTTCGCAAAAGCTAAAAAAATCAACTCTGTTTCTGGAACTTTAAAAGTTGCTCGTGAAGATGATAAAGTTCAAGCTGGATTTGTTGGCGAAGGAGAAAAAGTTCTTGAAGGTGCTTTAGGATTTACACATGTTGAATTAAAACAAAAACGTGTTGGTGCTGCAATTACTCTAGCAAATCAGCTAATCAATGACTCTGCTGTTAACATTCAAGATTATACTAAAAATCTATTAGCTCGTCGAACTGTTAAAGCTATTGAAAAGTCAATGTTAACTGGTCAAGGTGGAGTAGAATTCAACGGAATTATTCACGATGCTGATGTAGAAGCAGTTAATGTTGCTAACACTATTGAAATTGATCAATTACAAGCTCTTTACTTAGCAATCCATCCTGAGTTTTTAAGTGGAGCAAGTTTCGTAATGGCTCGTAACTTCTTTAATGAGATTGCTAAACTTAAAGATGGAAATGAGCACTATTACATTCAAAATGGTGTTGTTAACGGAAAACTAACTTACACTTTATTCGGTATGCCAATCGATATTACTGATGCTCTTCCTGCTGAAACTCCAGTAGTATTTGGAAATATCGAAGAAGCTTACTCTGTAATGATTAAGCAAGAAAGTGGAATTCAAGAAATTGTTGACTCTCAACAAGCTCTACGTGGTAGCAAAATGTTTGTATTCGATATGTATGCAGACGGAGTTGTAGTTAATCCTCAAGCTGTTGCAAAATTAGTTGTGGGTTAATTTGTGAATTTTTTCACGATTTAAGAAGTCGGAATATTCTGTATTCTGACTTCTTCTATTTTATTCAAAGGATGTATGTCTTATGAAAGACATTTTAATAACAGAACTTGATTTAGATTTAGTTAAACAGTATTTGAGAATTGACCACAACGAAGATGATGTTCTTCTAACTACCATGCTGTACTCAGCTAAAAGTTTTATCCAATCTTACTTAAATAAGAGATTTGAAGAATTCGAAACAATTCCAGATGAGTTTACTATTGCTTGCTTAGCTATTTTAGCGCATTGGTATGAACGACGAGAGATACAAGGTGACAAGGATACTCGTGGAGAGCTAAAGTACGTTTTTTCTGGACTACTGGACTTACATCGAAATTGGAATTAAAGAGGTATCTAACATGAGAAAAAACAAATATAACCCTGCTAGATTTGATAAAAGAATTCAAATTTTAGAATACACCAAGACTTCGGATGGTGGTGGTGGTTATGAAGAAGTCCTTATTCCAATTTTGAATGTTTGGGCTAATATCCACCCTCTTCATGGTCGAGAACTGTATCAAGCTCAACAAATTCAAGCACAAGTATCTCATAAAATTACTATTCGTTATTCAAACAAAGTTAATCGATCACATGTAGTTTTCTTTAATGATAAGTACTACAACATCCAATATATAGTGAACGTCAATGAGGCAAACAAAACTCTAGAGCTTCACGTTTTAGAAAGACAGTAATAATAGAAAGGAAGTAATATAAATGGCTAAGATGACAGGAATGAAATGCCTTGTAAAGATTTTAAAAGAAGGTACTGATCTTGTACTTGCGGGGCAAAGAAATGCAAGTCTTACTCGTTCTGCAGAGTCTATTGATGCTACTTCAAAAGATACTGAAGGCTTCTGGAAAGAGAGTTTACAAGGTTTCAAAGAATGGTCAATTGATGCAGATGGTGCTTATGTAAGTAATGATGCAGCTTATACTGAGTTAGAACGTTCATTCATTAATTCCGAGAATGTTGACGTACTAATCGAACTGCCAAGCGGAACAAAGTATGTTGGTAATGCGACTATTACTGATTTCTCTATGGAATTTCCATATGACGATCTCGTTACGTATTCTATCTCATTACAAGGTAACGGTGCTTTAGATATTGTCGAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020814|658839:666733|662422_662641_+|WP_066161000.1|DBSCAN-SWA MFKPINAHGFGQRVKLDKTLELKNQVTFIRVEVVKEVENENVKRLRKTWEELKKTQPPERKAGTLIDMDSLI >NZ_CP020814|658839:666733|664474_665578_+|WP_066160994.1|capsid|DBSCAN-SWA MDKKEKIKYLQEQADKKLEYLETLEARGVLKKNKQARLIYEREKIALRDIVDELELLTQQTKEEERGNEEMKKMEVRNNDFEAILRGETRSLNTTNDGASVIPENVHGEIIVKMEEISPVFAKAKKINSVSGTLKVAREDDKVQAGFVGEGEKVLEGALGFTHVELKQKRVGAAITLANQLINDSAVNIQDYTKNLLARRTVKAIEKSMLTGQGGVEFNGIIHDADVEAVNVANTIEIDQLQALYLAIHPEFLSGASFVMARNFFNEIAKLKDGNEHYYIQNGVVNGKLTYTLFGMPIDITDALPAETPVVFGNIEEAYSVMIKQESGIQEIVDSQQALRGSKMFVFDMYADGVVVNPQAVAKLVVG >NZ_CP020814|658839:666733|660961_661111_+|WP_169801174.1|DBSCAN-SWA MSREKKTAIDVIEAIEYMDNEERWKLIHELYFKYFNKEGHDYQPLDLDY >NZ_CP020814|658839:666733|666331_666733_+|WP_066160983.1|tail|DBSCAN-SWA MAKMTGMKCLVKILKEGTDLVLAGQRNASLTRSAESIDATSKDTEGFWKESLQGFKEWSIDADGAYVSNDAAYTELERSFINSENVDVLIELPSGTKYVGNATITDFSMEFPYDDLVTYSISLQGNGALDIVE >NZ_CP020814|658839:666733|665660_665963_+|WP_066160989.1|head,tail|DBSCAN-SWA MKDILITELDLDLVKQYLRIDHNEDDVLLTTMLYSAKSFIQSYLNKRFEEFETIPDEFTIACLAILAHWYERREIQGDKDTRGELKYVFSGLLDLHRNWN >NZ_CP020814|658839:666733|659923_660823_+|WP_066161009.1|DBSCAN-SWA MSLISILSGKGFVMFNKDLAHEVSVNGAILFGQLCSSYESFKNKDMLTKKDGKEYFFLTGETVEEETALTYKQQLKAFKELEEAGYIETVLMGQPRRKYFYITDKIFTLFRSDKREELKADINTNEPKEHLEQQRDNDQKGKLLNDKRETLDMTKGNNKRLPLGIAYKNKNKKEQYNNKEIFVNKGVNNKLNNIDDTIHKLSNEYRLKGLNKKVCELVVNEALEKIDTINNFGAYLRICFENTLYKSKLKKGEIDFEERFGRMPFFNWLTKGTEENNFEKVFFQADLNDNVEGYQKENR >NZ_CP020814|658839:666733|665976_666309_+|WP_066160986.1|head|DBSCAN-SWA MRKNKYNPARFDKRIQILEYTKTSDGGGGYEEVLIPILNVWANIHPLHGRELYQAQQIQAQVSHKITIRYSNKVNRSHVVFFNDKYYNIQYIVNVNEANKTLELHVLERQ >NZ_CP020814|658839:666733|662006_662405_+|WP_066161003.1|DBSCAN-SWA MENKFIKVYKEIYQHDKYRCLDGDCIIYYSWLLDLNELSKKNAIDYTDSNGRVFVIFTEEDAYKYCNIKKGKLYRIKKKLKEVGLIDYEEQKVKKYGVSTPIYVTPYEHWKRKYENEEYNYTRVAFEMPDFN >NZ_CP020814|658839:666733|658839_659766_+|WP_066161012.1|integrase|DBSCAN-SWA MKRRGQLTEEELMIIRKKVNDTEAFEKFFKDCYLRNLRPATIEYYQNEFHAAKKFSDKQLVDWKQSDIENLILESKKIMKITTINTRLRALRSFYNFLFRNKLISKNPMANIKLLRDRQKTIETFDSKEIEKLISTIRKQKTFVGFRDEVIVLVFLDTGVRLSELVGIEVIDVKENKIIIRKTKNLFERIVYLSETTQEQLKRYIKIRGEIDTNKLFISIDNKPLNPHSIQTRLTRYGKEAEINKRVSPHTFRHTMAKRMIVSGVDAFSLMHLLGHTDITVTKRYVNLWGQDLEQKHKLHGALKGLKL >NZ_CP020814|658839:666733|663276_664497_+|WP_066160997.1|portal|DBSCAN-SWA MASLFRWGSKEKGKDYFSTAFFNTTPTVFLTEEQVMKIPAVKASVELISSSISQLPIYLYIEHDDTSTEKMDDPRISVLNHEANDFDTAQVIKKKVVQDYLLRGKAYLYHKDNKLHHLPAKSVKEELYTEDGITVAKKQFNYTGMSNVTLEEDEVIVIDSGTDGLLVDAGELLKSALAQQEYSQSILSNGALPAGILQTATRLTENAMSRLRESWKSLYQGSKQAGKTVILEEGLEFKPITLKPDEMQMTETHKILVSEIARVFNIPESMINSAANKYNSLEQNNLQFLQNCVGPIITAIESALDKNLLTRIEKDTGFYFRFDTSELLRTTEKEKVETVSSALKGGLISFNEARHKLDMSPVEEDYFVLSLGNVLKSAKTNELTILNLNQTSNGGEINNNGQEGKD >NZ_CP020814|658839:666733|661198_661555_+|WP_066161006.1|DBSCAN-SWA MYMNEIIKETDTLFKGWLSQLTEKEEGIMQLLLQVGIDSRYETYTTGNKKAFMRNLKSKIKKIKLQGPTITFQPTWNETLRTIKKLERIGMMKIDEEGLPVWMYQDIDRILEMIEDRA |
11 | Staphylococcus_phage(33.33%) | portal,capsid,head,integrase,tail | attL 658657:658708|attR 674541:674592 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2373493 : 2381867
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020814|2373493:2381867|DBSCAN-SWA AATGACACAAAATATTAGTGAAATTATGTCAAAGGATGTTGTGACCATAAATTTTGATCAATCTATTCAAGAAGCAGCATCATTAATGAAATCTTATGATATTGGTTCGATTCCGGTTGTTAAAAATGGTCAACTTGTTGGAATTATTACAGATCGTGATATTACTCTTCGCTCTACTGCAAGTGGTAAAGATAGCCATATTTCAGTTAAAGAATGCATGTCAACAAATTTAACTGTTGCTTCACCTTCAACAGACCCACATGAAGCTGCAAACATAATGGCGCAACACCAAATTCGTCGCTTACCTGTCGTCGAGAATGGTCAAATTGTCGGAATCGTAGCAATAGGCGATTTAGCAACTGAGAATATCTATGAGAATGAAGCCGGTGAAGCATTATCAGAAATCTCAGAACATCACCATAATCAATAAAGATAAACGTACTGAAAAATCCGAGAGCCTTTTTGAGGGGATTTATCTCACAAAAGGCTCTGCTTGTTTTAGTTAAACAAATAAAAACAGGTTGGAAATGTTCCAACCTGTTAAGCCAAATTATTCATTGATTCCATTAAACTGCTGTTCTGCTTGTTGAACAAGACGTTTTGTTATCTCTCCACCAACAGAACCATTAGCACGAGCAGTCTCGTCAGACCCTAAACGAACCCCAAACTCCTCAGCGATTTCATATTTCATTTGATCTAAAGCTTGCTCAATTCCTGGTACAAGAAGCTTATTGCTACTAGAGTTATTAGCCATTTTCTTCACCTCACTTGATCTGTTGTAGTCCTATCGTTTGTAAAGATCCGTTTTCCTATGTAAGAAGAAGGTTGGTAATATGTTGAATTTTTCATCATGAGGACAAACAGTCTCAATCCTCTTTTTTTTAATTATTTTAATTTTCTAACACTAAAAATAGACCTTCATGATATAATCTCACTAAAGATTATTTCGCCCCTAGAAAGAAGGTATATTGATGGAAGCTAAACAAATTAAGACTGCTTCTACACCATTACAATCAAAAACATCTTATAGAATCTTACTTATTATTGGTTTTGTTCATTTGCTTAATGATGCTATTCAAGCTCTTGTACCTGCAATGTTTCCAATCTTACAGCAATCAATGGGATTAACCTTTACACAGTTAGGTTTAATTGCTTTTGCTTTGAACCTTACCTCTTCACTTATTCAACCCTTTGTTGGCATTTATACAGATAAGAAACCTAGCCCTTACGCACTACCTATTGGATTATGCTTTACTTTAATTGGAGTATTTGGGATTGCTTTAGCACCTTCCTTTTGGTTTGTGATCATTTCTGTCTTATTTATTGGTCTAGGATCAGCTACCTTCCATCCAGAAGGCTCACGGGTCGCTTATATGGCTGCTGGTAACCGACGTGGTTTAGCGCAATCCATTTATCAAGTTGGTGGGAATGCTGGTCAAGCATTAGCCCCGTTGATTACAGCTCTAATACTTGTTCCCCTAGGGCAGTTTGGCTCGATTTGGTTTACAATAATTGCTGCTTTAGCAATAATTATGCTACTTTACATAGCACGTTGGTATAAATTTAAAATGACCGAATTTAATAACAACAAAAAATCTAGTCAAGAAAAGACAAATCATTCGAGTGATTCCAGCAAAAAGGTGATAACGTTCGCAGTTATTTTGCTTATCTTTTTAGTTTTTGCTCGTTCATGGTTTCATGCCGGCATTTCAAACTTTTATGCTTTTTACGTAATTGATCAATTTGGCTCAACGATTGCACAAGCACAAGTTTATTTATTTGTTTTTTTAGCGGCTGGTGCTATCGGAACGTTTGCTGGCGGACCGCTTGCCGATAAATATGGTAAGCGAACCATTTTAATCTTTTCTATGCTTGGCTCAGTACCTTTTACACTCCTTTTGCCTCATATTGGTCCAATCTCTGCTTACTTTGTAATATTTTTAATTGGTTTTATTATTTTATCAAGTTTCTCTGTATCTGTTGTGTATGCGCAAGAGCTTGTACCCGGGCGGATAGGTTTAGTTTCTGGACTCATTGTAGGATTAGCTTTTGGGATGGGAGCGATAGGTTCAGTTGCATTAGGAATCCTTGCTGATCTTATTGGTCTTCAAAAAACTTTTATTATCATTACAAGCCTCCCAATCATTGGTTTATTAACTTTTTTCCTGCCTTCTGATAAATGGATTAAAAATAACAACCAAAAATAAAGAGCTGATTCAAGAGGTAGTACAACCTCTTGAATCAGCTCTTTGATACATCGTAAAAATGTTAAATCAAAGATCCTTGTACGGAAAGAATCTTGTCCAGATTTTTCAATTCTAGTTCATTAAATTTATTCACCATTTTGCCGTGTTCTATATTGAATTTTGCTTCATCTAAGGAACAACATACATCAACTGAACAATTAATTTCTGCTAATTTCCTGCATAGATGCAGCATTTCAAGGTCATTCTCAATTTTTTGTTTTTGTGATTTTGTTAAGCTGTCTAAATTATCAAGGATTCCTTCGATACTTTCATAGGTTTGTAGTAATTTTAGAGCGGTCTTTTCACCAATTCCTTTAACACCAGGATAATTATCACTACTATCTCCCATAAGTGCCTTTAAATCAATCATTTGTCTAGGGTTAATTCCTTTTTCTTCAAGAAATAAAGCCTCGTTATAAACTGCATAATTGCCGTATCCTTTTTTAAGTAAGATAACGGAAATATTCTCTTTTAGAAGCTGTAGAATATCTTGATCGCCTGTGAGAATGTACACTTCTGAATCCTCACTTAATGTTTGAGCTAATGTTCCAATACAATCATCAGCTTCATAACCCACTAATCCGATATTAGGAATATCTAATTCTGTTACGACTTCTTTTACTAAATCAAATTGTGGAACTAATTCAATTGGTGGTTCTCCACGATTTGCCTTATAATCAGAATACAATTCTGTACGATACGTTTTGCTTCCCATATCCCAACAGCATACTACGTGGGAAGGCTTGAACTCATTAACCGCTGTAAACAAGTGTTTAATAAATCCATGTATCGCATTTGTCGGTACTCCATTGCTATTAATCATATAATACCCACTCATAGCAGTAGCAAAAAAAGAGCGAAACAATAAAGCCATCCCATCTACTAATAGTACTTTGTCTTTTTCCACTTTAATAACCTCTCCTTTATAACGGAAAAGACATGTGGGTTACACATGCCTCTTTACGATTCCAACCATTTTATTTACTTATTGTACTATAAATTACTGTTGATATGTCGATTCAATTATTGCCATTATTTTAGGATCAATTTAATTGCGCATATTTGTGATCGGCCACCAATGAAAACCATCTTTCTTTAACAAATCATCTGCTTCCTTCGGTCCCATTGTTCCCGATTCATACGTCGCAAGGTGAACATCTTTACTCTCCCATGCCTTTGAAATGGAGTCGATAAATGTCCATGATAGATCAACCTCATCCCAATGTGCAAAGTTCGTTGCATCCCCTTGAATACAATCATAAATTAAACGTTCGTATGCTTCCGGCGTGTTTGATGTATCCACACAATCATGACAATAGTCTAATTGAACTGGTGTCGTTTCACCTGAAGTACCAATCTTCTTCCCATTTAGATGAAGGGTAAGACCTTCATCAGGTTGAATTGAAATAATTAGTAAATTCGAATACATTTTTGAGTCTTCGTTGTAATATAAGTTCATAGGTCTATCTTTAAATTGAATGACAATTTTAGTTGATTTTTCCTTCAATCTTTTCCCTGTACGAATATAGAATGGCACACCTGCCCAACGGTGATTATCAATTAATAATTTACCAGCTACATATGTTTCAGTAAAAGATTCAGGGTTTACATTTTTTTCTTCTCGATAGCCAATTACATTACCTTCATCAACGTTTCCTGCTTCATATTGTCCCCTAACGAAGTAATTAGGAACTTGCTCAGGAGTTAAGTCTCTCAAAGCACGTAATACTTTAATTTTTTCACTTCTAATTTCATCAGTAGTTAATTTAATTGGTGGTTCCATAGCAAGTAGAGAGACCATCTGAAGCATATGGTTTTGAACCATATCACGAAGAGCTCCTGATGTTTCGTAATAACCGCCACGGTCCTCTACTCCCAATGTTTCACTTGATGTAATTTGAATATTAGATATGTATTGATTATTCCACAATGGTTCAAAAATAGCATTGGCAAATCGAATGACTTCAATATTTTGAACCATATCTTTACCAAGATAGTGGTCAATCCGATAAATTTCGTCTTCTCTAAACGCTTGACGAATTTCATTATTTAGCTTTTCTGCCGATGGTAGATCTCTTCCAAAAGGCTTTTCGATGATTAGTCTAGTCCATCCGCTTGTTTCCGTTACTTTTTCTTCTTTTAAATTTTGAGCGATTGTACCAAAGTACTCAGGAGACATCGCCATATAGAAAATCCGATTTCCAGGTATCCCATAGTCACGCTCTAATTGTTGTAATAACGAATCTAGATCATGATAAGATGCTTTATTTGTCACATCAAATGGCAAATAATAAAAATGAGAACAAAACTTTTTAATTAGTTCTTCACTTTCATTCTTCGGCAAGGAATCAGTTACCTTTTCTCGAAGAACTTCATCTGTCCAATCTCTTCTTGCAACACCAACTACAGCAAACTCCTCTGATAGCTTTCCCGCTTTATATAATTTAAAGATGGACGGGAATAATTTTCTTTTTGCTAAATCCCCCGTTACACCAAAGATCACTAAAGTTGTTTTAGGATTATTCGTATTTGTCATGTTATTCCGGCCTCTCTTTACTTAGTTCCTATAAAAAAAGTAACTCAAATGAACATCAGAAGTCAACTTTTCAGTTCTGATATTACTTTACTGTTAATAATCGATTGTTTCAACTTAAAAAATAAAAAAAATGTCTAACCAGGGAGAAGGCAGCCGGTTACCTATAGGAGGAAAAAGGAAATAATCTTTTTTTATTTATTAATTTGCACCACTCTAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020814|2373493:2381867|2380297_2380993_-|WP_066149377.1|DBSCAN-SWA MIFEMEPNSFIFKLMIATILCIVIGLERELKRKPLGLKTCLVIGIMSCLLTHVSIIGAEHYSQELSKPMDPLRLAAQIVSGIGFLGAGVILRRNNDMISGLTTAAMIWGAGGIGIASGAGFWLEAIIATVLLLISVEILPFLFKFIGPRALREKELKARIIVHSENQLTAILKELKQNHMKAKKVRVKDLKDSEAKQMDVILLVNEKIYTTDVYYTLKQMEYVDGVDIESL >NZ_CP020814|2373493:2381867|2381231_2381867_-|WP_066149380.1|DBSCAN-SWA MKRVNVFMLGIVLMMSIFSVQPQADAAVKMFNEPPFSHYKVSRGDTFWFIAQRYGLDYRELMRLNPDVVPTNMQVGEVIRLKPEASHHSAFEDQVVSLVNQERRQRGLQPLQHRADLKNVAHKKAEDLINANYFSHNSPNYGSPFDMLRTFGISYRSAGENIAKGQTTPEQVMRDWMNSPGHRQNILKPEYNAIGVGFYHGAWVQMFIQTN >NZ_CP020814|2373493:2381867|2378843_2379557_-|WP_066149371.1|DBSCAN-SWA MRKYSYLDFLAELEVNHAHPGGAASSYKMFENEDLDETKTVLDLGCGLGGTVVHLANTYKCNIYGVDNHSTMVKKAKDRIANQNLNAKILMASVENLPFKKETFDLIVVESVLSFVDITKALSECMRTLKKGGTLILNEMIVLQSISKEEQTRLKDFYQFSECNQDSDWVDLLINHGYIRIERLMFNDSQENEGIELELKPSIDPLLFDILDEHEKLMSDFKGKIGNVVLRCHKKND >NZ_CP020814|2373493:2381867|2373493_2373922_+|WP_066149362.1|DBSCAN-SWA MTQNISEIMSKDVVTINFDQSIQEAASLMKSYDIGSIPVVKNGQLVGIITDRDITLRSTASGKDSHISVKECMSTNLTVASPSTDPHEAANIMAQHQIRRLPVVENGQIVGIVAIGDLATENIYENEAGEALSEISEHHHNQ >NZ_CP020814|2373493:2381867|2379720_2379966_+|WP_174521893.1|DBSCAN-SWA MSYYDLCCRYHGKVVTITCLDGRRYSGKITHVTDTHVYLQPTGNFGGFGYGWGYYRPWGWGVPIALAAIGGFALGAALFWV >NZ_CP020814|2373493:2381867|2375760_2376651_-|WP_157076733.1|DBSCAN-SWA MKVEKDKVLLVDGMALLFRSFFATAMSGYYMINSNGVPTNAIHGFIKHLFTAVNEFKPSHVVCCWDMGSKTYRTELYSDYKANRGEPPIELVPQFDLVKEVVTELDIPNIGLVGYEADDCIGTLAQTLSEDSEVYILTGDQDILQLLKENISVILLKKGYGNYAVYNEALFLEEKGINPRQMIDLKALMGDSSDNYPGVKGIGEKTALKLLQTYESIEGILDNLDSLTKSQKQKIENDLEMLHLCRKLAEINCSVDVCCSLDEAKFNIEHGKMVNKFNELELKNLDKILSVQGSLI >NZ_CP020814|2373493:2381867|2374463_2375699_+|WP_066149366.1|DBSCAN-SWA MEAKQIKTASTPLQSKTSYRILLIIGFVHLLNDAIQALVPAMFPILQQSMGLTFTQLGLIAFALNLTSSLIQPFVGIYTDKKPSPYALPIGLCFTLIGVFGIALAPSFWFVIISVLFIGLGSATFHPEGSRVAYMAAGNRRGLAQSIYQVGGNAGQALAPLITALILVPLGQFGSIWFTIIAALAIIMLLYIARWYKFKMTEFNNNKKSSQEKTNHSSDSSKKVITFAVILLIFLVFARSWFHAGISNFYAFYVIDQFGSTIAQAQVYLFVFLAAGAIGTFAGGPLADKYGKRTILIFSMLGSVPFTLLLPHIGPISAYFVIFLIGFIILSSFSVSVVYAQELVPGRIGLVSGLIVGLAFGMGAIGSVALGILADLIGLQKTFIIITSLPIIGLLTFFLPSDKWIKNNNQK >NZ_CP020814|2373493:2381867|2376786_2378274_-|WP_066149369.1|DBSCAN-SWA MTNTNNPKTTLVIFGVTGDLAKRKLFPSIFKLYKAGKLSEEFAVVGVARRDWTDEVLREKVTDSLPKNESEELIKKFCSHFYYLPFDVTNKASYHDLDSLLQQLERDYGIPGNRIFYMAMSPEYFGTIAQNLKEEKVTETSGWTRLIIEKPFGRDLPSAEKLNNEIRQAFREDEIYRIDHYLGKDMVQNIEVIRFANAIFEPLWNNQYISNIQITSSETLGVEDRGGYYETSGALRDMVQNHMLQMVSLLAMEPPIKLTTDEIRSEKIKVLRALRDLTPEQVPNYFVRGQYEAGNVDEGNVIGYREEKNVNPESFTETYVAGKLLIDNHRWAGVPFYIRTGKRLKEKSTKIVIQFKDRPMNLYYNEDSKMYSNLLIISIQPDEGLTLHLNGKKIGTSGETTPVQLDYCHDCVDTSNTPEAYERLIYDCIQGDATNFAHWDEVDLSWTFIDSISKAWESKDVHLATYESGTMGPKEADDLLKKDGFHWWPITNMRN >NZ_CP020814|2373493:2381867|2374042_2374246_-|WP_066149364.1|DBSCAN-SWA MANNSSSNKLLVPGIEQALDQMKYEIAEEFGVRLGSDETARANGSVGGEITKRLVQQAEQQFNGINE |
9 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2437653 : 2464291
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020814|2437653:2464291|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP020814|2437653:2464291|2455602_2455929_-|WP_066149607.1|DBSCAN-SWA MSNIIDLSLLTQEPLILKFAEDNQFTIPPEPSVHLVNQLLDFEDKALKAKTNKAQFGSFVKMVTLILSQDESKDVTEEFVEKNVSVSQMRRIVQIYQSKVVENAESKN |
36 | Bacillus_phage(42.86%) | portal,capsid,terminase,head,integrase,coat,tail | attL 2436159:2436173|attR 2445965:2445979 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2943590 : 3016470
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP020814|2943590:3016470|DBSCAN-SWA 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58 | Bacillus_phage(27.27%) | tRNA,protease,integrase,coat | attL 2941796:2941810|attR 3017828:3017842 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3808327 : 3854491
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP020814|3808327:3854491|DBSCAN-SWA 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70 | Bacillus_phage(28.57%) | portal,capsid,terminase,protease,head,integrase,tail,holin | attL 3810358:3810374|attR 3849445:3849461 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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