Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020816 | Lactiplantibacillus plantarum strain LP2 chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,DinG,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP020816_1 | 2767715-2767800 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020816_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020816_1
>1.1|2767738|40|NZ_CP020816|CRISPRCasFinder CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020816_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020816_1 >merge|NZ_CP020816|1|2767715-2767800|CRISPRCasFinder TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATTCGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAATAAGAAACTTAAAGTATCTTATT >NZ_CP020816|1|1|2767715-2767800|CRISPRCasFinder TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA TAAGAAACTTAAAGTATCTTATT
>NZ_CP020816.1|WP_013355933.1|2766221_2767700_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit MQAKAKISKATMTIAWVVVFGAMAPLLDSTMINIAINNLVTSFHSSVTTVQWAVTGYLLATGVAVPFSSWLLNRFDGKAVFVAGEILFGLGSIFAAVVPNIQLLIIARLVQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAVMGQMMATVGLPMILGPLIGPVIGGIIIKFASWHWIFWINVPVVLISIALILWKMPNYPAQNRTAKMDFIGILLLIVSSSAIIYSLVNAAHTDRFNNATSIEMLILGAIALISYVVWAAWQKERAVVPLHLFKFASFDGAGLGLFIAGTVLNGAMLLLPLYFQNVRGMSVINAALALLPQGAGMLVSRTLTGRLTDQIGAKYVVLGSVVITFVGTLPFYWFGQQTSYWILALILFVRGIGAGGILMPLMADAYTGMQPGQVPAATIGTRIIQNIGSAFGSALITTIVTAYSTHQVNVFERHLKAGTYHVDAAHLQVFTTSHLQAIRLAAFQQGFLVIAIAAIVIILPTLLLTNKLKAAK >NZ_CP020816.1|WP_013355932.1|2765651_2765891_-|hypothetical-protein MKKVYLRYQKQVDSFININKIMLLLEFVLLFVVKGSIDHYNQLPYDWFAYLTTLIHYFLGTFAFFGIILVIECVWNKFK >NZ_CP020816.1|WP_013355931.1|2765213_2765405_+|hypothetical-protein MAAFSEKQLKKAPITDQEFEKVVAVAKPDVQGIHSVCQQLVISFIAEERFLAVFGDGTCHPSN >NZ_CP020816.1|WP_003642346.1|2763748_2764702_-|aldo/keto-reductase MKTIQIGASQLKASAVALGIMRMVRLDTDAAANVLETVHDRGVNFIDSADIYGNGDSERIFGQALKQSSLKREDFFIQSKGGIVLDPEKSSGELVFGQRYDFSKQHLIATVDKILQRMQLDYLDSFLLHRPDPLMDPAEVAAAFDELQATGKVRHFGVSNFNPMQVEMLQAAVSQKLMINQLQFGVMHTGPIQFGLHTNMQDTASLNHDGEIIEYSRLHHMTIQAWSPYQYGMFAGTFIDNPKFPELNAKLQELADQYHVTKNAIATAWILRHPANMQVILGSMNPQHLDESIAGTDVTLTRQEWYDVYFAAGNDLP >NZ_CP020816.1|WP_003642345.1|2762962_2763529_-|DUF1211-domain-containing-protein MNKARLEAFTDAIIAIVLTLLVLDLPRPQTPSVRALFAEWQSIYVYIITFTLLISIWLNHHDLFVQVKKIDRVVFWANSFWLLCQSFIPFMASWITKFPHSKWPAVFYILTGFVWMLAYQLLVAAVRRLNPHIHRMSSPALSVVFGGFLVVLTVALINPDVGLFLIPVHAFASVILATKRKWHLRKYF >NZ_CP020816.1|WP_003642344.1|2761776_2762814_+|aldehyde-reductase MQKQLVVVTGGSGFIAIHIIRQLLQQGYAVRTTVRSLAKAPVIKEMLTNGGITDLSALEIVVADLAHDEHWSEAMAGATYAIDVASPTPKLNFKNKAEMIRPAVDGVRRVLTASRDAGVKRVVLTSAYGAIFAGHKNRTTPYTEADWSDLNWKAIHPYQESKTRAELAAWDFINHEGRGLELTTVNPVAVMGPVLSAKYSHSNIQIQQFLEGQVKAVPNVDSGYVDVRDVASLHLLAMTAPQANGERFLATTGETLSMLDVANVLRQAFPAFASQLPTKTIPNAAVKLAAKARPELRMVASLVGTYAETSNHKAQTLLDWHPRPAAESIIATAQSMIDLGIVTKP >NZ_CP020816.1|WP_011102040.1|2761083_2761650_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAATNHAQAIKKDSQTYLTTALLQLLRTHDLDTITVTQVVKRAGVSRMAFYRNFTTLEDLLTAYFAPAIAARFQDVLQHVPANRKLLAMGQFFSDFAPTLRLAEQRGFENIIQQLFNANMTNYYQATMTNGMLTAVQLKYWTRFMSAGVYAIWREWLLGGQLESLTTIHEILATLQTATMQALTQAQK >NZ_CP020816.1|WP_003642342.1|2760196_2760925_+|SDR-family-oxidoreductase MKPLVVITGASSGFGAEIAKLFAADNYPLLLLGRRQAKLAALSANFENAMIDTVDVTNYHQFETAVRKAEAKYGKTDLLVNNAGLMLLGNVQNQDPQEWQTMLNTNVMGVLNGTQIVLNDMRDREHGTILNMSSLAGKKTFVNHAAYVASKFGVHGLSETLREENAPKNVRVMLVAPGAAETELLTHVTSKSALSDYEAWKASMGGLTLDPKHVAATVKFMYDMPQNVNIREVDIAATAQDA >NZ_CP020816.1|WP_013355080.1|2759169_2760093_-|IS30-family-transposase MSTTILSFQNRVVIETLHNEGRSLRYIANYLGFSKTTIFNELHRLNSEYQAGLAQTDFERKVSQRGRKSSLTKNLKHLIEEKIQVHKWSPEQVAHVVGIAYKTVYNWIDQGWLDIQLPDLPDHGIRRHRAKEKRGTFNHGRSIEERPHKVETRQEFGHFEADTVLSGKRKGQAVATFVERKSRLTIVKRLHGRDSQSMTQAVLELASQLQDKLKTLTVDHGKEFANYQTIERRTGTQVYFAHAYSPHERGSNENRNRVLRRFIPKGQAIEELSDHQLVQINWYLNSRPLKCLNWHTPIEIFLLNLRH >NZ_CP020816.1|WP_011102039.1|2758640_2759006_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MLKERVTAQPRYRNEFDATMQLIRGKWKIMILFELAEVKVSRFADLQHHIQAVSHKTLASQLKELEQDELIERHDFKTAQPHVEYRLTAKGQSLIPILDAICTWGDQHVDPALIERSLCDE >NZ_CP020816.1|WP_003643398.1|2767817_2768417_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MTKTRRRGAELENAIYQAARDILNQDGLEQLTFANVAEQAGTSKPVIYRRWRSPLELAIAAIQDQIITENHGQLDEVSLTGQTLSEDLFQVLKRFTVSINTFNQALVITWFHHLDQQANPEVKDLLNAVKKIDAHAIERVCQRAQQRGELRTGTLSCDLQLMPFDWLRYRAFANEPITDATLHLLVDDLLVPAYQHALG >NZ_CP020816.1|WP_049788012.1|2768537_2769419_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MGSLLLGACGAKQPTSTTVTRTDYLKHKVKVPKHPKRIVASYLEDDLVALGIKPVVQWSVKNGSGTQAYLKEQLKGVPLIDYSLPYEAVTKAKPDLILMGTSSAVANGKYAQYNKIVPSYVVKNGTTVTWRQTFLDVAKVVNRQAKAKKVLAKYDKQVQTTRQALKKSGQHKVAVLWVTNNTAYMVNDNSASGALLYQDLQLGEPSLVKQVSKSATADWSAVSLEKLAKLDADDIFLVNSQKSASLFKDPLWKNIKAVKNNHLYQYGDSSSWQYSGPIAYSQMIDMVKTDLLK >NZ_CP020816.1|WP_003642350.1|2769703_2770498_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNTIEAQNISIGYGDKVIVDQLSITIPHGQITTLIGPNGSGKSTLIRAIAHLLPPTTGVILLDHQNIQQIKSKTFAKKIAVLPQTNQTANDLTVEELVSFGRLPYRRPLSGLTTTDHQKIEWALTQASLQDLRQRPLSTLSGGQRQRAWIAMAVAQDTDTIILDEPTTYLDLTHQLEVMQLVKKLNEQAHRTIIMALHDLNHAARISDQLIALKDGHVLAHGPVSTVMTAANLKTIFNIDATLVDYHGTPLILTYNGCQEVAPA >NZ_CP020816.1|WP_003642351.1|2770494_2771493_+|iron-ABC-transporter-permease MKSTSRYWGWLALSTGVLILVMGLSLRFGADQMRTATVWHALTTTHTGNLDQQIIRHIRVPRVLGAALIGAALAGSGALMQAVTRNPLADSGLLGINAGAGLMLTLCLAFFPKLSTLQTTGWAIIGAAASAGLIFSISTARHVQLDPTILVLAGIAISSLLTALSEGLALVLQLKQDLAFWYFGGLGAVSWTQLKFLGPGLVLGLLLTLLLAPQLNLAYLTDDNAQSLGKSLPLLRGLALICAVILSGISVALVGTITFVGLMIPHMARWLAGANYRNSMPLTLILGATLTVGADLIARLVNPPHETPFGIIISLIGVPCFIYLARKEPMKA >NZ_CP020816.1|WP_013355935.1|2771489_2772485_+|iron-ABC-transporter-permease MSPNRRLIIWSLLLTASMLGLAILNLSTGTMTISWPALLGILTGRGNATDMLVLVNFRLPRIVLAIMVGWALALSGNVLQTVTNNPMADPSLLGINNGAGLAVMLLIIGAGTNASLTLSLPIVALAGAWLSTALIFLLANQRQRGISSKRLLLVGVALSGCFSALMVLMTLKLSPDNYQFVMNWLAGSLWGTDWSYIGWALPWLAVGSGILFIQLPVLDAFTLGTTTAQTLGINLKRQQLGLISVAAMLAGVSVAISGGISFIGLITPNLARRIVGSRQRYQLPLAGLLGSTLLLAADTLGKLITTTTELPAGVLVALIGAPYFIYLLVRG >NZ_CP020816.1|WP_003643401.1|2772729_2773242_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MANQRNQRMQATILLAYENLLSDKPFRKITVQDISDAALVHRSTFYKHFQDQYDLLEALFEQKRQQSKLTIDQIFTHPFETLNSFGNARFQETLRHQFNDDAFRDAFLNYLIHLCKDTVDDDQRLVRFLAVGRIKGLTLWITVGNAPYNIFTDTATLDNIFSNPLNTVNY >NZ_CP020816.1|WP_013355936.1|2773222_2774116_-|SDR-family-oxidoreductase MKVFITGGTGFVGSAVVQELVANGFEVVGLARSETSAQKLISWGAQPVRGSLTSLSTLATAAAQADAIIHLGFNNDFRHFFQAGAMDRRAIETMGRAISGTNKPLVVTYGTTGIRKHVETEHEVADTGLLKWLTPRKSEIVARQLMAQNINAFVVRLSPAVHGAGDMGFTRTVIERAKKSHRAEYFGLGTHAWSAVHRLDAAHLFYLVTMYGLEHPTTNERVFNAVAEESITTAAIARTISRKLNVPLKAKYNPLSFGDTAMLYLINCPTSSQLTRQILGWVPVQPDLLTDISSSRY >NZ_CP020816.1|WP_003642355.1|2774409_2775156_-|SDR-family-oxidoreductase MSIKGKVVVITGASSGIGAATAKLLAAKGAKVVLGARREERLQALSQAIGDNAVYQVTDVTDRQQVRALIDLAVSKFGRVDVLYNNAGTMPQGNLSDREYDKWQMMLNVNIMGVLNGIGEVLPIMQKQHDGLIIATDSVAGHVVYPASAVYNGTKYAVRAIMEGLRQEEKEHGIRSTIVSPGAVRTELVNTIGNTQIQAGISELMNADDRQGLALNPEDIANAVLFAIDQPKHVAISEVLVRPAQQEV >NZ_CP020816.1|WP_003643403.1|2775172_2775679_-|acetyltransferase MQTIQPIVDANQRRIQALNVTREPSEIRERLAEITGQTIDISVEIRVPLWTDYGRNLKIGKRVFINDNVQITDLGGIELADDVLIGPGAMLLSVNHPLDPAKRHAVEVQPIHIERNAWIGAGAKVLAGVTVGENAVVGAGAVVTKSVPANTVVAGVPAKVIKTIEQVD >NZ_CP020816.1|WP_003642357.1|2775937_2776774_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MQSKLAVIIGGTSGVGKHTAIDLANQNYHVIIVGSRADKGRQAQADISQATGNQAVQLALADLSTKTGVQQFAHQLAAMTDHIDILLNSIGVMLPERHLSADGYDLNLVLNYLTHFWTIQALLPLLKHSDQARILLVGALPFVINHAKVSLPDFDAPATSKYNAMTVTAQATAARVLLTLALSERLTATNVTINIFHPGYVPDSNFGAGGSWVSRLAGRILGESFSRKNSPIGAWLATAPELTHTSGHFYDDRLRQVRLSKQYTRSKANDLWRLSSQY |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
298525 : 400823
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020816|298525:400823|DBSCAN-SWA TATGTCCCAAGACCATTCTACTAAAGTACTGCTCCAAATTAAAGACCCAAATATTACTGATTTAGTTGTTCAAGAAGCTACTAACGGAAGCTTACAAGTGCTTGCAAAGCTAACGTATCCGGTTACTGTTTGCGCACGTTGTGGCAAACGTTCCATGGTTAAGAATGGCTTTAAGACCGTTCACATCAGAATTCCTAGAATTAGCGAACGAGTCACCATCCTTAACTTAAAGAAGCAGCGATTTATCTGTAAAAATTGTGGTAAAAGTAGTTTAACAACGACTACGCTGGTTAAAAAACATCATCAAATATCTGAAAACAGTCTGCATGCCATTGATCTATCATTAACTGAAGACCGTACGATGGCGAGCATTGCGGCTCAATACAATGTCTCGACCAATACGATTAGTCGCCGAATAAAGTTACTCGGACAAGGTACCCAACCAGCTTTCAACGGACTACCAACGATGCTTTGTATCGACGAATTTCGTTCAACTGGTAAACAAATGAGTTTTATTGCGGTGGATGCCCAAACCCACGACATCATTACAATTTTACCAGGACGTAAGAATGCCGATATTAAAGACTTCTTTCTCAATCATTATTCTAAACGTCATCGTGACTGCGTAACCCGGGTTGTGATGGACTTTAATTCTCAATATCAACCCGCGATTCGAACACTCTTTCCACACGCCAAACTAGTCGCAGATAACTTTCATCTTGTTCAAATGGCCTTACGATCTTTGAATCAAACTCGGGTCCAACTCATGAAACGCTTTAACCCTAAGAGTCGTGAATACCGAGTGCTTAAATATTATTGGCGGTTATATTTAAAAGATTATGACAGCCTCGAAAAGCGCAAACCTCAATGGTTTGCGCATCTTAAAGATCGCATGACACCAGAGCAATTAGTCGTAGCCGGTTTAAATCTAGACCAACAGTTTCGACAAACCTACCAAGCCGCACATGCCTTAGTTAAGGCTTTTCAAAAGCGTGATTATCGATCTTTCAAAGCAGCACTAGGTCATGTCGAAAATGTCAGTCCTCAGCTAATGACCAATATTAAAAGCTTTATCAAGAACCGGCAACTCATCAAAAATATGACTACCGGCCGATTATCAAATGGTCCCGTCGAAGGTGTGAACCGTAAAATCAAGCAAATCAAAAGAACCGCGTATGGTTACAAGAACTGGCAAAACTTTATTTATCGAATTCAAATTGAGTTCAAAATCAAAATCGAAAAAAAGAACCCAATTCGTAAATGAATTGGATTCTAAATATAACTTCATCAACACCGGTTGACAGAGACCCCTTTTTTGGGGAACTTGGGACTGACTTACCACCTGGGAGTGCCAGTGTTAGTGTGCCCTTTTCTGGTTGCTATTATCGGGGAACCGATTATAGCGTGATTTTTAATTTTGCGGTTTGTTAAAATAATCGTAACTTAATGGGATGCTGTTGGTATCCAATTGAATGAAGGAAAAAATGAGGTCAGTGATTCTCGCATGCCGAGGGTCACTGACCTCATTTTGGTGTTAAGAACGGATAACTAAACATTAATCGCGTCTTGCAATTGCTGCTCATTGTAAAAAATTAATACGATAAACATCACCACGTAAAGTAATAATGGTAACCACGCATAGTTCAGGGTAATCATATGCTGAGTGGCGATATTTTGCGCATGATTGGCGGTGTAGCCACTTAGATGAAAGAGTCCGGCGGTGACTAGGCCACCAAGTCCTAAGCCGACATTGACGCCGAAGTCATCAGTAGAGGCTAAAATACCTTCAGCTTGAATGCCAAGCGCCGTGCCATAACGGATCGTATCAGCAATCATAATTGAGACCAAACCAATGATGAGACCGTTACCGACAGCGTTGATCAACGTACCACCGAAGACGAAGGCCAGTTGATTGATGGCTGTCCCGAGACCGAGGATCAGTTGTCCCACAGCGGCGATTGCGATACCCGCCAACATGGTATTCTTTTTCCCGTGGTGGTTGGCTAAGCGGACAATCAAAATGACACCAATCAGTGACGCAAACGTAAAGCCGTTAACGACTGGCACTAAGTCCTCACGCTGAATCAAATATTTAAAGTAGTAGATGGTCGTTTGATTCTTGATGGCGGTTGTTAGCCAATACAGTAAAATCACGCTGGATAAAATAAACCATGGCTGGTTTTGCTTGAGCATGCCCCACACCGCACTGAGTGATTGGTGCGGACGCTCAGGTTGACTAAAGCGTTCCTTGACTTGGAAGAAGGTGTTGAGGATCAGTACCAACGAAATAATGCCAAATAGAACGATTGTCAGTAAAAACCCTCGTTGCTGATCACCCTGACCAAATAAAGCAACTAGTGGCAAGGTGAAGACAGCGACGATAATTTGAACGCTACTACCGAAGAATTGACGAATCACGCCTAGTAAGGTTAATTCACGTTCATTCTGGGAGAGTGCTGGTAAAATCGATGTGATTGGTAGGTTGACGGCGGTATAGAAGAATCCTAACCCTAAATAGGTCACATAAGCCCAGACGAGTTTACCAGTTGCTCCGAAATTCGGGGTCACAAAGGTCAAAACGGCGAACAAGACGTAGGGTAACGCGTACCATAAGAAAAACGGGCGGCTTTTACCGAAGCGCGAATGGGTATGGTCAATCATGACGCCGATAATCAGACTTTCAACGACATCGGCTAAGCGCGCAACGACAAATAAAATCGCCGCTGCACTCGTGGATAGGCCGTAAACATCGGTATAGAAGAATAATAAGTATGTGGTCATCATCTGAAAGACTAAGTTATCCGCGGCATCACTGAGCCCATAACTAATTCGTTCCGGCCAAGCTGTTTGCCAAGGTTGTTTCAATATTAACACCTCTAAGTATGGTTTTGCACAATCTAATTCTAACCTAGTTGCACGCTTAAACCTAACGGAAAGGTTTACAAAATTGATTAGGTCTTAGATTGATCAGAAAAAAGCCTGCAGGTGGCGTTCGTCAACCTGCAGGCTGTGCATTGTTTGTCCTGATTAAAAGCTACTTAGTTGTTAATTTGCTGACCTTGGTGAGTGCTGGGATTAAGCCCAAGCTATCTAACGTTTGGTTTGGTAAAACAACGGTGTTGGCATTGCCGTCCGCTAAGGCTTTGACAGCTTCCGTGTTTTGGAAGATAAAGTAGTTTTCGGATGATTGTGCCAAGGCTTCGTTTAAGATCCGCGTACGGTAAGCATCAGCATCTGCTTCAGTTTGAACGGCTGTTGCTTTCGCCTTTGCACTATTCACTAAAGCTTCGTTTTGGGCTTTATTGGTGGCTAATAAGGCCCGGTTATTGGCTTCATTTTCCAGTGTGATTGACTTACTCTTACCTTCAGCAGTTGCGATGGTGGCATCCCGTTCCCGCGTAGCTTGCAGGAGTTTATTCATGGAAGCCTGAATATCTGCCGAAGGGTTAACGGAATCAATATTGACCCGGTCAACGTTTAAACCGTAGCCCGCCGTAACGGAGGAGATCTCCTTGAAGAGGGCGGCATTGATTTCTTGCGTCCCATTCAGGACTTCGTTTAATTCTTTGTTCCCAATGATACCACGTAGTGCCGCGCGGGTATCTTGAATCATACTACGAACGGAGTCTTCGTTTTTAAAAACGAAGTCTTCAATATTAGTGACGTGGTACTTAAGCGAAATCTTAACTGAGATTTCAGCGTTATCTTTGGTGATAACGACTTGTTGATTAAGATCAACGGGTGTCTGAGCCGTGTTAACGGTGATGACACGTGAGATGAACGGTTTAATAAAGTGAAAGCCGGAACTAATGACGCGCTCGAACTTTCCAAATGTTAAGACGACACCTTGGTTCGGTTGGGTGATGATGCGGATGGAAGCGATTAGGACTAAAACGACCAGTAGAATGACAATAATTGCAACGATGATACCTACCATAATAATTTCCCCCTATTGTTGTGGTGCGATAATCGTTACCGTTAGACCATGAGCACTGACGGCCGTGATTTCAACGGTATCGCCGGTGTGCAATGGTGTTGCGGCGTGCAAATGGTACAAGATGCCATAGAATGCGACGCCGTCAGTTAGATCGGTCGGTTTGATAATTAAGCGCTGACCGATTAAGCGCTGATCTAAGTATCCCTCTTGCATAGATGACCCACCTTTAATGTGATAATAATTAAATTATATGCTGTTTTTGGTTAGATTGATAGGGCCGTTATAAAATAGTGGGTGAGTTTTGGATTGTTGATAAAGTATGGCGATAAATGGTGAATTCATGCTGCATATCGCTCAGTAACTATTTGGATAAGCTCGTTTTAGAGGGCGGTTCAGTAATACGGAGTTAAAGGAGCGCTTGAAGTATTTAAGCCGACAAAAAAACCTTCGTACGGGAATACGAAGGTCAAAAGGAGTAGGTCAGCATATGACGGGGAATCATATGCTGATAACTTGATGAGCGTTTATTCATATAAGCGGGGGGACGTTCACATGCCGCTCATCAAGCTGTCAAAGTTGTTACGCTTTGACGGATTTCATTACTTTGGAGGAGTAAATGAAAAGAATGTTAATTATTATAGTAGCAATCTTGGAGGGGGATCCTTAATTGCTATAGATACATATTAACAACGAATTGTGAAGAAAATGTGACGATGATTTTTCAAATTTAAGAATTATTGATTAGATTACGAAAAGATTTATGACTATTGATAAATTTATCGGCAATTAAAATTGCGTAAGAATTATCTGTCAGCGCTTTCGCAATGGTGGCTTTTTAAATTAGAGCGTGTATCATTAATAATGATCACGGAAATTAAAGACAGGAGATGCTTGCATGTACGAACAAGCTTGTACCACAATTTTAGTTGGGAAGAAGGCGACCGTTGATGGTTCAACGATGATTGCCCGCAATGATGATACGTTTATGCCGATTACACCGCAAAAATTTATCGTCCATCCCGCCGTTCATGGTCGCAACGAAACGTTAACTTCTGGGAAGAAT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96 | Staphylococcus_phage(14.29%) | tRNA,protease,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
569332 : 577956
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020816|569332:577956|DBSCAN-SWA CATGTATCGGGCACTATATCGGGTTTGGCGTCCCCAACGCTTTGATGAGATTGTCGGGCAACAGATGATTACCCAGACACTAAAAAATGCCATTATGACCCACCAGACGAGTCATGCGTATCTGTTTACCGGTCCCCGGGGAACTGGGAAAACGTCGGCAGCGAAGATTTTTGCCAAGGCAATCAACTGTCACCATCTTGTTGATGGGGAACCTTGCAATGAATGTGAGACTTGTACGGCGATTACCAAGGGGCAACTAAATGATGTCATCGAAATTGATGCGGCTTCTAATAATGGTGTGGAAGAGATTCGTGATATTCGGGACAAAGCGAAGTATGCCCCAACGCAAGCGGACTATAAAGTCTACATTATTGATGAAGTTCATATGTTATCGACTGGCGCGTTTAATGCGTTGCTCAAAACGCTAGAAGAACCCCCAGCTAACGTTATATTTATCTTAGCGACAACGGAGCCCCATAAGATTCCATTAACGATTATTTCACGGACGCAACGGTTTGATTTTCGGCGGATTACGGCTAAGGATAGCTACGATCGGATGGTGTACATCCTCAATGAGAAGGATGTGACCTATGATGAAAAAGCGCTACGCGTCATTGCAGCGGCTGCTGAAGGTGGAATGCGGGATGCTTTAAGTATTCTGGATCAAGTAATTTCGTTTGGGGATAACACGGTTACGTTGGATGATGCGTTAATGGTGACGGGAAGTGTGACCAAGCAGTTGCTGGCTAACTATGTCAGTGAGGTCACCGACCATGATACGAAGCCGGCACTAGAGACGATGCGACAAATCTTACAAGAAGGTAAAGATGCGAACCGTTTCATTGAAGATTTGATCAGTTATACGCGTGACGTGTTACTCTATCAACAGGCCCCTGAAATGGTCGATAGTGTGGCGATGGGCGAGGATGATCAACAATTTGAAGCATTTGCCAAGCAAATCGATGCTGAAGTCCTGTACCAAATGGTCAAGACGTTGAACGATATTCAACAACAAATGCGGTTCACGACGCACCCCGACGTTTATTTAGAAGTGTTGACGGTCAAGCTAGCTCAGTTGGATGGTCAAGCGGCCGTTCAACCGGTAGATGCGGCAACGGTCAATCCTGAAGATCCCACTGTGCATAAACTGGCACAACAAGTTGAACAGTTACAAAGCGAGGTCAAAACGTTACGTTCTCAAGGTGGTAGTGTCACTAAACCTGCACCGGCTAAGCCGCGGTCGAGTAATGGCCCGGTTGTTAAGAAGGTTAATGTCAGTCAGATTTATCCTATTCTGGGAGCGGCAACGAAGAATGATCTCATTAAGGTGCGCGATGTTTGGACTGATTTGATGAATATTTTGAGTGTGACGCAGCGGGCCCTAATGCACGTGGCCCAACCAGTTGCGGCCAGTTCAGAAGGTGTTGTGGTTGCGTTTGACTATGCGTTTGTTTATCAAAAAGCGATTGATGACCAGACCTTGATCGATGCACTCGGAAATGGTTTGGATCGGCTGATGGGACAGGCACCCAAGATTGTCTGTGTGCCTAAAGAACAGTGGCCACAAATTCGTAAGGATTATTTGGCCACTCACCAGCCAGGAGGTGCAACATCAGAGCAACAAGCACCGGCCAAAGAACCGGTCGTTGAAGAAGCTAAGAACATGTTCGGTGATTTAGTTGAAGTACAGCCGGACTAAAGACGAAAGGAACTGATAATTATGATGCGTGGAATGGGCAATATGCAAAGTATGATGAAACAAATGAAGAAGATGCAGGCGCAAATGACAGCCGAACAAGCGGCTTTAAATGAACAAACCTTCACGGGTGCGGCGCCAGACGACATGGTCAAAGTCACTTTTACTGGTGATAAGAAGATGAAGGATATTACGATTAACCCTGATGCTGTTGATCCTGATGATGTGGATATGTTACAGGACTTAGTCGTTGCTGCGGTGAACGACGCGTTGACTAAGGTCGATGAACAGACACAAAGTACGATGGGAAAATATACTAAGGGATTACAGTAAAAACGAGGTAAGTACATGCAGTATCCAGAACCAATTGCTAAGTTGATTGATAGTTATATGAAGTTGCCCGGCATTGGTGGCAAGACTGCGACGCGGCTGGCGTTTTATACAATTGATATGAACGGTGATGACGTCACCGAGTTCGCTAAGTCGCTGATTGCGGCCAAACGGGACCTGCATTTTTGTAGTATTTGCGGTAATATCACCGAAGATGATCCGTGTGTGATTTGTAAGGATAAGTCGCGTGATCAAAGCACCGTTCTGGTTGTTGAAGAGGCCAAGGATGTCATGGCAATGGAAAAGATTAAGGAATACAACGGGCTGTATCACGTCTTACATGGGGTATTGTCACCCATTGATGGCAAAGGTCCGGAAGATATCAACATTGCCAGTTTATTGAAACGGCTACAGCAAAATGAAGCCATCAAGGAAGTCATTATTGCCACCAATGCCACGCCTGAAGGTGAAGCAACAGCGATGTACATCTCGCGGTTAGTTAAGCCGGCGGGGATCAAAGTGACCCGATTGGCGCATGGCTTGTCGGTTGGTAGTGATATTCAATATGCGGATGAAATGACCTTATTCAAAGCAGTTGAAGGTCGCCAAGAAATGTAATTGGAGGTGCCACCATGTTTAAACGTAAACAGAAGATCAAGCATCCCAAGGAAGTTTTTGATGAACAGTTATTGTCGACCCTGAATGCCGCTAAGTTGGACTGGGACCGTGCGAAGCAGAACCAAGAAGCGGTCTATGATAATAATACGAGTGAACTAGTTACGCAGACCGCCTTAGCGCGTGCTAAGTATTTATATCTGTATCGTGAAGCACGTTTACGTCAAGTTCATGGGCAGACGATTCAGCGCTCGGTCATTGATAAATAGACTGTTAGTGATTTAAGAGATAACTTGTTTCAAAATAAAGACGCACGTCGTTGATTTTTGTAAATCTACGGCGTGCGTTTTTGATTTAGAACCCTAGCATTATTTTACCAGTTAATCTGTCATGCATTGTGATTAAGACATGCTAGGTGCGGCAATTGGAATAGAAGATGTGTATCTACTAATGAATAACAAACTAAAATCGGTATTTATCAATCGTGGGTAGTACTACCTAATAACTTTTTAGCAATTCACCGAATAAATCATTAAAACCACAATTGGTAGTAGCCGACCCACGTAAAAATCGTGAAAAAGTACCCTCACTAGTGGTAACCGTATTAGACAGGTACTCAAAAATCAAGTACAATTGCTACATATAAGAAAATAGATGGGATTGGGAATGTTGACAGGAAAATTAGTTACTTTTGAAGGGCCAGACGGTGCCGGCAAAACGTCAGCTTTAAACGCGATTGTGGCCAAATTACAGCCACAATTAGGGGATCGCTTAGTTGTGACGCGTGAACCGGGCGGGAATCAAATCTCAGAAGCAATTCGAAAAATCATTTTAGACCGTCATAATACGGCGATGGACGACCGTACGGAAGCGTTACTCTATGCGGCAGCACGGCGACAACATATCGTCCAAACCATTCAACCAGCATTGCAGAACGACCAACTTGTCTTGTGTGATCGCTACATCGATAGCTCGGTCGCTTATCAGGGGGCCGGTCGTGGTATTGGGGAACAAGCGGTTTATGATATGAATCAGTTCGCGACCGCGGGGTTAACCGCAGATTTAACGTTGTATTTTGACGTAGATGCTGCCGTTGGATTAAACCGCATTCAACAACATCGCCAAAATGAAATTAATCGCTTGGACGTGGAAGCCTTAAGTTTTCATCACCGGGTGCAAGCAGCGTATTTGAGATTACTGGCTGATCATCCTGACCGTATCAAGCGCGTCGATGCAAGTCAGCCATTGGACCAAGTTGTGACGCAGGCCTTAGAGATTATGGCGTCACAGTTACCGACTTATGTGGCATCCAAGGGAGGGGAAGACCAATGAAATTAATTATTGCAATCGTTCAAGATAAGGACAGTAACCGGTTGAGCAGCCAGTTCATTGAAGCCAATGTTCGGGCCACGAAGCTCTCAACGACGGGGGGCTTCCTACGTTCAGGTAATACCACTTTTATGATCGGTATTGATGATGACCGTGTGGATGAAGTTTTAGCCATGATTAAAGAAACGAGTCATGCGCGGGAACAGTTTATGACACCACCAGTCAATCTAGACGTGACGATGGATGGCGCAGCTGCCTATCCAGTTGAAGTTCAAGTCGGTGGTGCCACGGTCTTTGTTCTACCAATTGAACAATTTCACCAATTTTAATGAAGGATGATTATTAATGGCAACAACCGAGTCATTTGCGCAAACGTTAGCGGCGAAACAGCCCCGCTTATTAGCGGCATTTAAACACATCATCGCCCAGAACCATCTGGCCCACGCGTACTTATTCGCGGGGATGGAAGGCGCTGGACAACCAGAACTGGCCCATTGGATTGCGCAACGGTTGTTCTGCCTGCATATTAATGATGGTGAACCAGATGGCACTTGTGAGGAGTGCGTCCGGATTGCTAATGGGTCGCACCCTGATATTGTGACAGTGGCTCCCGAGGGTCAGCGAATTCACGTTGATCAGGTTCGTTACTTAAAAGCTGAATTCTCTAAGAGTGCGGTCGAAGGTAACCGGAAACTGTTCATCATTAATGATGCGGAGAAGATGACAGCGAGTGCTGCCAATAGCTTATTGAAGTTTATTGAGGAGCCAAGTGGTAACGTCACGGCCTTGTTATTAACGACTAATAAGCAACTGATGCTACCAACGATTATTTCACGAACCCAGGTGATCGAATTCCCACCATTAAATGCGCAGGCGTTACAGCAGACGTTTGAACAGGCCGGGATTGCGCCAAACCAAGCACAGATGTTACGGGGCCTGACAAATAGCGTGACCCAGGCGCAGGCGTTGCTAACGGATGATTGGTTACCACAAGCTGCGCAAGCATTGTGGCGGTGGTTTGACCAGGCTGTTAAGGGTGACCCACGGAGTTTTGTGGCTGTGCAGGTCAATTTAGTTGGTTTGGCTAAGGACGCTGACCATCAGCTGGTTATGTTGGATTTAATTGCGGCCTTGTTCCAAGATCTATTGCAATTACATTTTGAGGTGGCAACGACAGCGTTAACCTTTGGTCAGTACCAAAAAGAATTGGCCGGGTTAACGGCTGAAGTCAGCGATGAGCAGTTGATTGCGGCGACAGAACTAGCTTTAACGGCCAAGCGCCAGCTAGCTAGCAATATTAGTTTTCAAAATGTCTTAGAAGGCTTAACGTTAAAGTTATGGCCGATTTTTCAAACAAACGCTTAAATAAAGGAAAACGAGGGTGAGCGCGTGGATAAGCGTGATTTATACGATAGTTTCGGTGAAATGGAACAACAGATGCAACAAATGCTAGACAAAATGGCTAAGTTACGCGCCGATATGACAACGGTGTTAGAGAAAAACGCGGAATTGGTCATTGAAAATGAACATTTACGTGAACACATGGTCGAAATTGAAAATGAATTGCCGAAAAAAGCGGCTAGCACGACCACGCTCTCAAAGTCACGGCAAAACTTGGAAAAACTCTATGATGAGGGCTTCCACGTCTGCAACCAGTTTTACGGCAAACGGCGTGACGATGACGAATCCTGCGTTTTTTGTTTGGAAGTCATTTATGGTGAACGTGAACGCGCATAGTCGAAAAAGTCTGGGAGTAGTCCCAGACTTTTTGTGCTTTTCACCACGAGTCACTCATAGGAACAAGTCACGGTCGAGAGGATTGTTAGGAGGACGTTTTGGAAACACAACAAAGTTTTGCAGATCATGCGGGTATCGGGACCTTGTACTTAGTACCGACGCCAATTGGCAACTTACAGGATATGACTTATCGGGCAGTGGCGATGCTTAAAACGGTTGACCTAATTGCCGCAGAAGATACCCGGAATACCCAAAAGTTATTGAATCATTTTGAAATTACAACGAAACAAATTAGCTTTCATGAACATAACACCCAAGAACGGATTCCCCAGTTAATTGAAAAATTACAGACGGGCGTTAACTTAGCACAAGTTAGCGATGCGGGGATGCCGTCAATCAGTGATCCCGGCAAAGAACTTGTGGCAGCCTGCATTGCCGCGAATATTCCAGTCGTGCCACTACCAGGTGCCAATGCCGGCCTGACTGCGCTGATTGCTTCTGGCCTAGTGCCACAGCCATTTTATTTCTACGGCTTTTTACCGCGTAAGAAGAATGAACAAAAAGCTGATTTGGCTAAATTGGCTCGGCGACATGAAACAGTGGTCTTGTACGAATCGCCATTCCGTGTTGCCAAGACCTTGACCCTCCTAGCGACCGTCTGTGAAGGGACGCGGCCAATTGTGGCGTGCCGGGAATTGACTAAGCGTTACGAGGAATTCGCGCGTGGAACCTTGGCTGAAATGGTGACGTGGGCGCAGGATCATCAGTTAAAGGGCGAATTTGTCCTTTTGATCGGTGGTAATCCGGATAAGGATGAACCAGAAACAACGGATGAATTGGCACAGTTGCCAGTCAAAGCCCAAGTCGAAGCGTTGATTGCAGCCGGAGATAAGCCCAACGTGGCCATTAAGACGATTGCGAAGCGACGAAATATTCCCCGGCAAAGCGTTTATAATCAATTTCATGAACTAAATACCAACGATGAGGAGTCTTGATGAATGGCAACTTTAGGCGCAAATGCGAGTCTTTACAGTGAACAGCACCGGATTACGTATTATGAATGTGACCGCACTGGTCGCGCAACCTTAACGACATTAATTGATATTGCTGTACTGGCATCAGAGGATCAAAGCGACGCCCTTGGTTTAACGACGGAAATGGTGCAAAGCCATGGTGTCGGTTGGGTCGTCACGCAATATGCCATCGATATTACACGGATGCCCCGCCAAGACGAAGTCGTTACGATTGCCGTTCGGGGTAGTGCTTATAATCCATATTTTGCTTACCGTGAATTTTGGATTCGGGACGCAGATGGTCAACAGTTGGCCTATATTACGAGTATCTGGGTCATGATGAGTCAAACGACCCGGCGAATCGTAAAAATTTTACCAGAACTGGTCGCGCCGTATCAGTCGGAAGTCGTCAAGCGTATTCCGCGCTTGCCACGACCGATTAGTTTTGAAGCGACCGATACAACGATTACGAAGCCGTACCATGTCCGCTTCTTTGACATTGATCCCAACCGGCATGTTAATAATGCACACTATTTTGATTGGCTCGTAGATACGCTACCCGCGACGTTCTTGCTTCAACATGATTTAGTTCACGTTGACGTTCGCTATGAAAATGAAGTCAAGTACGGGCAAACGGTGACTGCTCATGCGAACATCTTACCGAGCGAAGTGGCCGATCAGGTCACGACGAGTCATTTGATCGAAGTTGATGATGAGAAGTGTTGTGAGGTCACGATTCAATGGCGGACTTTACCAGAGCCGATTCAGTAATTTGCTGGGTTGGTATTTACACTAGTGTGTTAATGATGTGGTCATGAGCGACTTGGTCGATTAGAACGCACGTTTTTATTAGAGTCGCTAGCGATTCAGTATGCTATGATTAATACATCCATACAGGGGAGGTTCATTATGTCAATTTTAGTTTTAGGGGGAGCTGGCTACATTGGTTCTCACATGGTTGATCGGTTAGTAGAACACGGTACGGACGTCGTGGTCGTTGATAATTTGGTCACGGGACACCGTGCTGCTGTTAATTCGGCGGCCAAGTTTTATCAGGGTGATTTGCGGGATGCGGATTTTTTGAATCACGTTTTTGATACTGAGGATATTGAAGCTGTCGTGCATTTTGCCGCCTTTTCAATCGTACCAGAATCAATGAGTAAGCCACTGAAGTACTTTGATAACAATACTGGTGGGATGATCACGTTACTTGAAACGATGCAGGCCCATAATGTGAAGCAAATCGTCTTCTCATCAACGGCCGCTACTTATGGGACACCTAAGCAGATTCCAATTAAAGAAACTGATCCACAGTTACCAATCAACCCGTATGGCGCCAGCAAGTTAATGATGGAACAGATTATGCACTGGGCGGACGTCGCCTATGGCATTAAGTTTGTCGCGTTACGTTACTTTAACGTTGCGGGTGCCAAGCCAGATGGCAGTATTGGCGAAGATCATGGCCCCGAAACACATCTGGTTCCAATCATTTTACAAGTTGCGCAAGGAAAACGCGATGAACTTAAAATCTTCGGCGATGACTATAATACGCCGGATGGGACGAATGTGCGTGACTATGTGCATGTTGTCGACTTAGCTGATGCACATATCTTGGCTTTGAAGTACTTGGCTGCAGGAAATGACAGCAATGCCTTTAACCTGGGTTCTTCAACTGGTTTCTCTAACAAACAAATGTTAGCGGCTGCTCGTGAAGTTACCGGGCAACCAATTCCAGCTAAGCTAGCACCACGGCGGCCTGGTGATCCAGACTCATTGGTTGCGGCGAGTGATAAGGCGCGTGACGTGCTAGGTTGGCAACCAAATTATGACAATGTTAACGATATTATTGAAACAGCGTGGGCTTGGACGCAGAAGCATCCCAATGGCTACGATGATCGTGACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020816|569332:577956|571375_571975_+|WP_003637790.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSYMKLPGIGGKTATRLAFYTIDMNGDDVTEFAKSLIAAKRDLHFCSICGNITEDDPCVICKDKSRDQSTVLVVEEAKDVMAMEKIKEYNGLYHVLHGVLSPIDGKGPEDINIASLLKRLQQNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIQYADEMTLFKAVEGRQEM >NZ_CP020816|569332:577956|576036_576822_+|WP_003640969.1|DBSCAN-SWA MATLGANASLYSEQHRITYYECDRTGRATLTTLIDIAVLASEDQSDALGLTTEMVQSHGVGWVVTQYAIDITRMPRQDEVVTIAVRGSAYNPYFAYREFWIRDADGQQLAYITSIWVMMSQTTRRIVKILPELVAPYQSEVVKRIPRLPRPISFEATDTTITKPYHVRFFDIDPNRHVNNAHYFDWLVDTLPATFLLQHDLVHVDVRYENEVKYGQTVTAHANILPSEVADQVTTSHLIEVDDEKCCEVTIQWRTLPEPIQ >NZ_CP020816|569332:577956|573646_574666_+|WP_013355238.1|DBSCAN-SWA MATTESFAQTLAAKQPRLLAAFKHIIAQNHLAHAYLFAGMEGAGQPELAHWIAQRLFCLHINDGEPDGTCEECVRIANGSHPDIVTVAPEGQRIHVDQVRYLKAEFSKSAVEGNRKLFIINDAEKMTASAANSLLKFIEEPSGNVTALLLTTNKQLMLPTIISRTQVIEFPPLNAQALQQTFEQAGIAPNQAQMLRGLTNSVTQAQALLTDDWLPQAAQALWRWFDQAVKGDPRSFVAVQVNLVGLAKDADHQLVMLDLIAALFQDLLQLHFEVATTALTFGQYQKELAGLTAEVSDEQLIAATELALTAKRQLASNISFQNVLEGLTLKLWPIFQTNA >NZ_CP020816|569332:577956|573300_573630_+|WP_003640965.1|DBSCAN-SWA MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIDDDRVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGAAAYPVEVQVGGATVFVLPIEQFHQF >NZ_CP020816|569332:577956|571051_571360_+|WP_003640956.1|DBSCAN-SWA MMRGMGNMQSMMKQMKKMQAQMTAEQAALNEQTFTGAAPDDMVKVTFTGDKKMKDITINPDAVDPDDVDMLQDLVVAAVNDALTKVDEQTQSTMGKYTKGLQ >NZ_CP020816|569332:577956|576960_577956_+|WP_013355240.1|DBSCAN-SWA MSILVLGGAGYIGSHMVDRLVEHGTDVVVVDNLVTGHRAAVNSAAKFYQGDLRDADFLNHVFDTEDIEAVVHFAAFSIVPESMSKPLKYFDNNTGGMITLLETMQAHNVKQIVFSSTAATYGTPKQIPIKETDPQLPINPYGASKLMMEQIMHWADVAYGIKFVALRYFNVAGAKPDGSIGEDHGPETHLVPIILQVAQGKRDELKIFGDDYNTPDGTNVRDYVHVVDLADAHILALKYLAAGNDSNAFNLGSSTGFSNKQMLAAAREVTGQPIPAKLAPRRPGDPDSLVAASDKARDVLGWQPNYDNVNDIIETAWAWTQKHPNGYDDRD >NZ_CP020816|569332:577956|571989_572241_+|WP_003640957.1|DBSCAN-SWA MFKRKQKIKHPKEVFDEQLLSTLNAAKLDWDRAKQNQEAVYDNNTSELVTQTALARAKYLYLYREARLRQVHGQTIQRSVIDK >NZ_CP020816|569332:577956|569332_571030_+|WP_013355236.1|DBSCAN-SWA MYRALYRVWRPQRFDEIVGQQMITQTLKNAIMTHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCHHLVDGEPCNECETCTAITKGQLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRTQRFDFRRITAKDSYDRMVYILNEKDVTYDEKALRVIAAAAEGGMRDALSILDQVISFGDNTVTLDDALMVTGSVTKQLLANYVSEVTDHDTKPALETMRQILQEGKDANRFIEDLISYTRDVLLYQQAPEMVDSVAMGEDDQQFEAFAKQIDAEVLYQMVKTLNDIQQQMRFTTHPDVYLEVLTVKLAQLDGQAAVQPVDAATVNPEDPTVHKLAQQVEQLQSEVKTLRSQGGSVTKPAPAKPRSSNGPVVKKVNVSQIYPILGAATKNDLIKVRDVWTDLMNILSVTQRALMHVAQPVAASSEGVVVAFDYAFVYQKAIDDQTLIDALGNGLDRLMGQAPKIVCVPKEQWPQIRKDYLATHQPGGATSEQQAPAKEPVVEEAKNMFGDLVEVQPD >NZ_CP020816|569332:577956|575136_576033_+|WP_013355239.1|DBSCAN-SWA METQQSFADHAGIGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVAMLKTVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLIEKLQTGVNLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIAANIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAKLARRHETVVLYESPFRVAKTLTLLATVCEGTRPIVACRELTKRYEEFARGTLAEMVTWAQDHQLKGEFVLLIGGNPDKDEPETTDELAQLPVKAQVEALIAAGDKPNVAIKTIAKRRNIPRQSVYNQFHELNTNDEES >NZ_CP020816|569332:577956|572638_573304_+|WP_011101140.1|DBSCAN-SWA MLTGKLVTFEGPDGAGKTSALNAIVAKLQPQLGDRLVVTREPGGNQISEAIRKIILDRHNTAMDDRTEALLYAAARRQHIVQTIQPALQNDQLVLCDRYIDSSVAYQGAGRGIGEQAVYDMNQFATAGLTADLTLYFDVDAAVGLNRIQQHRQNEINRLDVEALSFHHRVQAAYLRLLADHPDRIKRVDASQPLDQVVTQALEIMASQLPTYVASKGGEDQ >NZ_CP020816|569332:577956|574690_575038_+|WP_003640967.1|DBSCAN-SWA MDKRDLYDSFGEMEQQMQQMLDKMAKLRADMTTVLEKNAELVIENEHLREHMVEIENELPKKAASTTTLSKSRQNLEKLYDEGFHVCNQFYGKRRDDDESCVFCLEVIYGERERA |
11 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
780785 : 829359
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020816|780785:829359|DBSCAN-SWA CTTGGCAAAAACGGATACCGCGTCTTTCGATTCCATTTTGGTATTGGATTTCGGTAGTCAGTATAATCAATTGATTACCCGGCGCATTCGTGATTTCGGCGTTTATTCGGAACTACTTCCGAACACGATCACCGCTGAAGAAATCAAGGCCCGTCACCCGAAAGGTATTATCTTTTCTGGTGGCCCCAACAGTGTTTACGATGATGGCGCCTTTCGGGTTGACCCGGAGATTTTCAAGTTGGGCTTACCAATCTTGGGGATTTGTTACGGCATGCAACTGATGACCTACACGCTTGCGGGCGGGAAGGTCGAATCAGCTGATAACCGTGAATACGGCAAGGCGAACATTGACGTGACGAGTGACTCGGCGACCCTATTTAAGAACATGCCAGCTGAGCAGTCAGTGTGGATGAGTCATGGTGACTTGGTTACTCAGGCACCTGATGGTTTTGACGTGGTGGCCACTTCTAAGAACTGCCCGATTGCGGCAATTCAAGATGTTGACCGGAAGTTATATGGGATTCAATTCCATGCTGAAGTTCGGAATACGGACTACGGTAATGATATTCTACGGCACTTTGCATTTGACGTTTGCCAAGCTGAAGCTAACTGGTCAATGGATGATTTCATTGATATGCAGATTGAAAAGATCCGCGCTGAAGTTGGCGACAAAAAGGTCTTACTGGGACTTTCCGGTGGGGTTGATTCCAGTGTCGTCGGTGTGTTATTGCACAAGGCCATTGGCACGCAATTAACCAGTATTTTCGTTGACCATGGTTTGTTACGGAAGGGCGAAGCTGATCAAGTTATGGCGAGCCTAGAAGGTAAGTTCGGCTTGAACATCATCAAAGTTGATGCTAAGGACCGCTTCTTAAGCAAGTTGGCTGGTGTCAGTGATCCTGAACGGAAACGTAAGATTATTGGTAACGAATTTATCCAAGTGTTTGATGAAGAAGCCACGAAGTTAAACGGGATGGAATTCCTCGCACAGGGGACCCTCTACACCGATGTGATTGAAAGTGGGACTTCAACGGCCCAAACAATCAAGTCACATCATAATGTTGGTGGTTTGCCAGAAGACATGCAGTTCAAGTTGATTGAACCGCTACGGACGTTATTTAAGGACGAAGCACGGGAACTCGGTGAAAAGCTAGGGATGCCGTCTGACCTTGTTTGGCGTCAACCATTCCCCGGCCCTGGTCTCGGAATTCGGGTTATTGGTGAGATTACGGAAGATAAGTTAGAAATCGTGCGCGATAGTGACTTTATCTTACGTGATGAAATCAAAAAAGCCGGCTTGGACCGTGAAATCTGGCAATACTTCACCGTATTACCAGGTATCAAGTCAGTCGGTGTCATGGGTGACGGCCGGACCTACGATTACACCGTTGGTATTCGGGCCGTAACATCAATCGACGGTATGACCGCCGACTTTGCACGTATTCCATGGGATGTCTTACAAAAGATCTCAGTGCGGATCGTCAATGAAGTCGATCACGTTAACCGCATCGTGTACGATGTTACGAGTAAGCCACCTTCGACAATTGAATGGGAATAGGATTTATTGAAATTCAACAGTTCCTATCAGTGCCAATTGGCAATAAACGCTGATTCTTGCGGTGGTTAGCAAAAATCAAATACGATACAATCAGATACAATTTGATAAAAAGAGGCTGTGACATAACTAGCCTCTGTATAAGTAAATGGGACGAGAAACCGAATTTTGGTTTCTCGTCCCATTTGTTTACGCCTTTGATTTTTAAAGCTGGTCCCTACCGTGACCAGTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTACGTTGAGCGTAGATCTGACCAGTTTCTGGAGCTGAAAGTAATTCTCGTTGTTTCGATTTGAAATATTCCCAATTTTCGTTCACGGAAATCCTTTTAAGATATCCTTTTGGTGTTAGTGCCGCGGCAATTAGTTGATGATTTTCATCATACTTTTCGGCAATGTATTCTTTAAAGTCACGGGTAAAACCATACTTATCAGTCCGTTGACGATAAGCATTAAAATTAAACCGGACGTTTTGTGGATTGATAAAATAATCATCTTTTTCATGATAGTCCCAGTTCATAACCTTACGGTCATCGCTTTGCCATTTTCGACTATTCTCTTTAAGCATTGTGCCGTATGGAATTAAAACGGTATGCTGACCGAATTCATCTTCCAAGTACCGATAATTACTTTCGGAACCGTATCCGGCATCGGCAACGATGGTGTGACCTAACACATTGTTGGCCTTTAAATGTTCAATAAACGGTTGTAAGGTTCGTGTGTCGGTTGGATTTTGGAAAAGCCGATATCCCGTAATGAACTGATTACTCGTGGCGATTTGAACGTTGTAGGCAGGTTTTAATTGACCGTTTTGCATCGGATCTTCCTTGACCCGCATAAAGGTGGCATCGTGATCCGTCTTAGAGTAGCTGTTACGTTGATCATAAATAGCTTGCTGTGCTTGGTGTTCACGCATTTTATCACGTCGTTTATCCAACTTACGTTTTTGTGATTTAACAGTCCGGCGTTGCTGTTTGGCTGGGTTCGGGGAAACCTGCTTAGTTGCTTCCACGGTTTCATTAAGGACCACTAAGTGATCCTCAACCTTGCTAATCATGATATCCAATAGTTCGGGAGTCAGCTCTGATCCTGCCGGAATTTCACCGACAATTTTAGCTTCATGAAGCTCGCCTAACAGGTCAACGAGTTTTTCGCGATTCATCTTGTCAAATCGTATCGTATTCTTCTTCCAAACAAAGCTATACTTGTTGGCGTCGGCTAGGATCTTAGTTCCATCAATAAATGAAACATCATCAATCATGCCATTTTGACGAAGATATTGGGTTAGCTGTGATAAGCTATCGGTTGTCAAAGTGGCCAGTTCATCAGAAATTCTAAAGCGACAAATCGTCCGGTAGGACGGAATTTGGTCGGCAATTAACCACCCAGCTGGCTTGTTTTCACGGGCAAACTGTTCAATTTTACGACTGCTGAAAATGCCATAGCTGTACGCTAAAAGGACCAGTTTTAACATGGCACCGAGGTTATATTCCCGCGGACGGCCAAACTGGTAATCATATTTTAGTTTTAAACTCTCAACAAGCTGGTTGATGTAACGAGCAGAATGATGATCTTCTGGTTGGTAATCCAAGGCAATACTCAAAGTGGTTTGATTCATGTTATAATAATCTTGCATATTAGGAATGTCCTTTCGAGGATAATTTCGTAGAGTATCGGGTGCGACCGATGCTCTTTTTTTATTTTCTATTATATCAAAAGCAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGCTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTTTTATTTTGCACAGCGGGTGGTACAGAATTTCAAATGTCGTTTTTGATCCCGTTAAATACATTCATGGCACCTTCTTTTGAAGCACGGGTGTAGTCGTTAGTTTGCTGGATATTGGCGTGTCCCAACCAGTGCATAACATCTGAGTCGGATAGGCGGTCTGATTTTGCGCGAGTAGCAAAGTAATGACGCAACTGATGGGGATGAACTTTAATCCCACATTTTCCTGATAATCGCTTCATGAGCGTTGAAGGTTGTGCCGGGTGAAATGGATTACCTGTCTGAGGATTCAGCCATAGAAAGTGATCCTGTGGAACTGGTTTTCCTAAGTTCATCAGGATATTATCTGATGCTTTAATAGCAAACCGAATCGTATCGACCATTTCACCGTAGACCCAGATTGTTCGGTATGCGGATGGCGTCTTTAACGGGCCACCATCTTTGGCCTCCGAGGTTCGTCCCATGTCGAACTTAATGGCACAGACCTCACGTTGATTAACCTCATCAAATTCAAATTGAAATGATGAACGGGTTCGCAGACCCATTAACTCCGCGCGACGTTCTCCAAGAGTTAGCATATAGATCATACTATAGTCATAGCGACTCAGATGTTCCTTAGCGTACTTCATGTACGCATCAAAATCATCCTTAGATAGAGACTGGTCACGCGGTGCTTTACCATTGATATTCATATGGCGTAATTTATTTTTATAAATGATGTCGTTAGTTTCGGCATCATTCATGATTAATTGCATCACGCTGTTAATTCGTTCAACCGTGTTTTTGGCAAGATCCTTTTCGGCTAAACTATCAATAAATTCTTGGTAGGCGGAGCGACTGAGCTCATCAAGCTTGACATTCCCAAAGGGCGCTTGAAACCATTCCTTGTAATAATTTTTCATGCTCCTAGAAGTGATGGGCCGCCAGATGTTGAGTTTTACTTTACGGTCATAGATTCGCCAGAAGTAAGCGTCTACTGTGACTTTATGCCCTTCAATTTGGCCAACTTTGTCGGTGGCTAGTTCTAGCTCAAATTTTTTCAAAAGTAAGTCGGCATCGGCTGCACTTAAGAATCCTGACTTACTCCAATAGTCCGACTTGCCAGTACTTGATTTATACTTGCGCCTTGTCCCATAACGTTTACCTTTCTGGGTTGGATACGAGTAAACACCGGGGTAGCGTTTAAGTGGAGTCCATTTACGTGGCACTTAGCTCATTCCTTTCTTGTACGTTCGTAGTCCGTAATAGTTGAGTCCATAAATTTGATGGTGTGGATAAACTGTTGATAACTTTCTTTATCTGTTGGGAAGGGAATATCTGTATTAAGAAAGTTGCAGTTTGTAGATTCCAAATCATCTTTTAGGTGTTCTATGACTTCTATACGATTGCTAAAATCCATGATTATAAGGCCTCCTTTCAATTATTCTTGAATATCAAAATGTACCGTATTTGAACCGTGAGTACTTAGCGAACGTACGTTCTTTTGGCGGCTTAAATAAAAGGGCTAATGCCCTTAATTAAGTTTCTTTGGTGAAT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40 | Staphylococcus_virus(20.0%) | integrase,protease,transposase | attL 828213:828230|attR 829431:829448 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1255178 : 1267956
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020816|1255178:1267956|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020816|1255178:1267956|1258954_1259569_+|WP_003643097.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATIEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE >NZ_CP020816|1255178:1267956|1263559_1264927_-|WP_022638019.1|DBSCAN-SWA MRNFSGQSNAAQITRTFTVIILLIILLTGVSIAGVVGYRLTKNRMDDAQILITSLKRSFIDDAPDWQQWKMNSPINTKDTYVKVSTKISNQKHQIFYSPNARKFLHAKEWQVPGFNNIRYRNGFGFFYRSGAESRHIYYETWTSLHDVIHIFRLILEDLLLVIIIGGILGYLITAWLARRLNRPLAALTNAAAQINHAENISYHEALPVPIEPTEVHDLGVEINQLLQSLNKQVLRDHQFVADASHELRTPLTAIRGHISLINRRGKEHPEVISRSLKFIDHESIRMQTLVENLLQLTRMDHTEATLSYQSVDKVIRETVTNYETSLPQTITMALTPTNAYFNSANLQQILLALLSNASKYSPESGTVQVTVAIQNDQPTITIADQGIGISDVDKSHVFERFYRVDQARSQAIPGTGLGLAIVARLAELNQAQISVSDNLPHGTIFTIHLARQLK >NZ_CP020816|1255178:1267956|1262728_1263169_-|WP_013355470.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAQNPTVMDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFQQLPKGDFIGEIL >NZ_CP020816|1255178:1267956|1266321_1266987_+|WP_013355473.1|DBSCAN-SWA MLARNGNETKIAWSFWGAFGFLAILVGLNADVIQNIDNIVFNSLVRIDNPSLTAMFKIVALLASPAVSVLIIVIFSGWLYLNHQRTLGLLALTTLLGGDTLALGFKYLVHRARPVQPLVTDSGYSFPSGHVFGTILLVTILLAIGLPFITSSCKRVSLIGLGVVWILIVMISRVYLRDHYASDTIGSWLLACGCWYQAKAWYGRWRCHVQDYLMHLSHRHF >NZ_CP020816|1255178:1267956|1255178_1256417_+|WP_013355467.1|DBSCAN-SWA MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEHEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGDDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQDQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPESAAPLTLTAEQLPAVMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVNQLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITLMQGLSLAIEFFDQLEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDTLNDETTANWADAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEEDEDESEEDGAARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWLRKLIF >NZ_CP020816|1255178:1267956|1256507_1257479_-|WP_013355468.1|DBSCAN-SWA MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNAMPAITYMSKYGIINHRPQWQAMLHATDHGRKITSLTQLNQILRAANLHSFAVANLRQVEHATRPTKTLSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTTDLILNFAANTGGSSAPMIAGLAAIIPDGTLYTGITNHHRNRPRVMYHGRITGGLGQDDFNFSQPTAAHFRHIYAIIGNQTASAAEVTIMALKRNPHVTLVGRSSAGYTSLNGGVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLKPDIPTLYQPLAPLQLGQSPHLDADFLSELRTIMKHYH >NZ_CP020816|1255178:1267956|1257664_1258612_-|WP_003643099.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDYFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGITFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFPAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS >NZ_CP020816|1255178:1267956|1264919_1265612_-|WP_021356352.1|DBSCAN-SWA MPKILLVDDEASVIDFLQQELAFEDYAVLTATDGQAAFTTYQQNQDDLDLIILDWMLPKMDGLEVLRRIRKHDTIPVIMMTARDYVSDKVAGLDGGADDYITKPFDTEELLARVRVILRHADQQQNLQAVYKFADLELNTKSRQVKRNHHLVQLTQREYELLLTLMKNAPITFTRDELLDQVWGVDFEGQPNIVDVYIRYLRHKIDTDTQRKLIHTVRGVGYCLRDDTHA >NZ_CP020816|1255178:1267956|1267011_1267956_+|WP_013355474.1|DBSCAN-SWA MKKISIIVPCYNEQTAIPLFYKAVQQVYQTQIQPLWPQYQLEYWFIDDGATDETLVTLQQLVCQDSDHVHYVSFSRNFGKEAALYAGLQHATGDLVVVMDVDLQEPPALLPQMMSGVLTEQYDVIGVKRLDRQDEPVICSLCSRLFYWFINQISMTKIEQGARDYRMMTRQVVDAVLDMPEYNRFSKGLFSWIGFRTKYLSYENQERVASTTHWSFWNLVNYSIDGVIDFSDKPLAMASFLGIISFIIAIGALIFIVGRAWLFGDPTGGWPSLVAITLMLGGLQLFCLGIVGKYISKSYLESKRRPIYISKDER >NZ_CP020816|1255178:1267956|1259571_1262010_+|WP_022638021.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTIIQNFATKIATADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAVKEVTTDVVVVGAGGAGMTAAAKVLQAGHQAVVLEKYPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFVALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAQQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDPDAHVLNTDGQIIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA >NZ_CP020816|1255178:1267956|1262097_1262658_+|WP_013355469.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDIELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLTDSLQLATSDINWPNLTDDQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW |
11 | Lactobacillus_phage(70.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1756205 : 1848892
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020816|1756205:1848892|DBSCAN-SWA CTTAATTGACCGCAAACATTTTGAACGGCTTGTACCGCTGTTCGTCCGGTCGATAACTATATAGACATTTTAGGCTGTTTTGGTAAACTAACGCAACCATCGTGTTCGCATCTGGATCAGTTTGTTGCCCTTCTGCCGCCGTAATAAAGGCCCCATTTTTGACCCGTTGCCACTGCTCATCCGTTAACGTGACTCGCGGGTACTGACTTAAAGCTTTATCAATTGGCGCCAATAATGCTCCGGCCGTTCCAGCATCGACGTGGGCCGCGATTTCCTCAAAGGTCACGGTTTCATCTAAAGTAAAGCCGCCACTCTTTAATCGGGTCAAATCACTCATCACAGCGGGTACCCCGAGCACTTTGCCGACATCCACCGCTAGCGTGCGAACATAAGTCCCTTTACTACAAGCGACCGTAAAATAGATCGTCTGAGTCTGGGTTGCCGAGTCATAGGTAGATGCCTGCCGTTGCTTGAAGCTGCTAATTGTGATATGCCGTTCTGGGCGCTCGACAGTTTCACCACTGCGCGCATAGTCATATAAACGCCGCCCATTTACTTTTACTGCTGAAAACATCGGTGGAATTTGCGTAATGGCCCCCGTCATCTGTGCCAGCGCAGCATCAACTTGGTCACTTGTGAACGGCTCTGTGACCGCTTGGCGCGCAATCTCCTCACCATCTAAATCTTCAGTAGTCGTTGCAAATCCGAGGGTAATGCTCCCTTGGTATTCTTTGCCAGAAGCCACTAAAAATTGCACAACTTTAGTCGCATTCCCAATACAAATCGGTAAAACGCCATCCACATTTGGGTCCAGTGTCCCTGAATGACCTACTTTGCGGGTCTGATAGAGTCGTCGGATTTTAGCGACACAGTCAAAGCTCGTCATCCCACGAGGTTTATATAATGGTAGAATCCCGTTCAACATAAAAAACGCCTTCAATCATTTAAATTCGGTTTCTAGTGGCAGCCAATCGCCGTGCCACGGATTCGATCGTTCTTAATCGACGGTTTTCAGTATACCACACCTCACAAATATGTAAGCGGATTATCACAGAATTCAAGGCCCTGAGCACCGCAACTAAGATACCCCAAATCGACACGCTGGTCCGGTGCCACTGACGACCACGTATGTGCCTGGCAAAGCTGTATTTAACTCATTGATCCAGAAAACCGTGAGCTTAATCCCTATTAGTCAAATAAAACGACTGAAAAACAAGAATCGCACAAATTAGTCCCCTTATCAAAAGGATACCGCGCGGGACCGTCCCTAATTACGCCGATGACTTTCAACATATGCTGCCATCAAAAAAGCGTGCAACGGCCTTAGTGTGGCTGATGTACGCTTATTCAATGTTATCGTCTTAAAATGCAACCGGCACGCTAACCACAGTTACATGGTTCTTCAAGCCTGGAGCGCAACTGGTTGCTGATTCAGCCACTGCTGAATTTGGCGGGCAATCTGCTGGGGTGTCAGTTGATCGGTTGCGATCGTCAAATCGGCCGCAGCGGCATATAAGGCTTGGCGCCGTTGCTTCAACGCAATCAGTGCCCCTGTATCCAATTCATTGACAAGTGGTCGGCTAGTATCATTTTTAACACGGTTAATAGTGGTTTGATCACTAGCCGTCAACCAGATAACTGGCACCGTGCTTTGTTTCAGACTAATTGCATTCATTGCAATGGTCGGAGTACCACCACCGGTCGATAAAATCCCGGGTGTTTCGAGTGCTTGGAGCAAAGTCTGATGCTCCAATTGCCGGAAGTACCCCTCTCCTTGCTCCGCAAAAATAGTCGTAATCGACCGTCCCGCCCGCTGAACAATCAAATCATCTAAATCAGCATGTTTAGTTGCTAACCCGGCCGCCAAAAGCCGACCGACCGTTGTTTTCCCACTACCCATAAATCCAATTAAAATTGCTCGCATTCTTAATTCCTCCTTACAATCTGATAACCCGCATCAGCTAACAACGACGATGCTTGCGTTCTCGTCTTTAGATCACTAAATGTCAGTTGCAAGACACCATCAATCTCTTCACGAATCTCTAAAATATGAATATTGACTAAGCTCAGCTGAGCCTGTGCGAGCCGCTGAGTGACATCCGCGAGAGCGCCAACACGGTCGGGGACGTTCAAAAACAAATCATAAAAGTTTGGTAGTCCTCCCAACTGTTCCGGTCCCAAGTGATCACGCGTCACCTTAGCTGTCGCAAAAAATTCGTACAATGTTGCTTGATCATGCACCCTAATGGCTGTCTTGATGCGCAACAGTTGGTCAATATAACCCTGCAATTGATTGGTTATTAGTTCAGCATTAGTCATCAGGATGGCCGCCCACATCGTGGGGTCCGAACTGGCAATCCGAGTAATACTTTTAAACCCACCAGCCGCTAATCGCAACCCGAGTGCCGAATCTGCCAAAGCCACCTGAGTCTGATCAACTAATGCCGCAGCGACAATATGTGGCAAATGACTTAACTGTCCTACAATCCGGTCATGCTGTATTGCAGTGACCGTCAACCATTTGACGTGAGTCGCTTGTAACAATGCTTGCAGCCGTTGAACGGCTGCTTGATTAGTCCGGCCCGGCACTAACAAGTAAAAGGCATTCTCGAATAAGTTGGCGCGGCCAGCCGTCACACCCGATTTATGTGAACCCGCCATTGGATGACCGCCGATGAAAGTCACACCGTGCTGTTGTATGGCAAGCGCGGCATGCATCACCACTTGTTTAGTACTCCCGACATCCGTCACAAGCACCCCTGCCTTGAGTGGCATCATAGCCAGTCGGTGCAAATCAGCAACGATCAAATCAACTGGCCCCGCTAAAATAATCACATCAGCGTCGCTCGCGACCGCGGCCAAATCAGTGCCACTAGCATCGATCATACCCTGTTGACGCGCATAACTCAGGCTGACATCGTCACGATCAATCCCAATAATGTGCACCGTGGGATGGGCCTGCTTAATGCTTAGTGCCAACGAACTGCCAATTAGCCCCAAACCTTTGATCAATACAGTTGTCATCTTCACACCCCCTGGCTTAAACGTGCTAAATCTTCAAAGAACGTCGGGTATGAAATGTTCACAGCTTCGGCGGACTCTAGTTCGGCGGGAGCGGCTAATCGCAACGCTGCAATTGCCATCATCATACCGATTCGGTGATCGCCATGGCTGGCTAATGGCTCGGTCGGCTGCCGCCAAGACTTGCGACCATCAATCACGAAGCCATCCGGTTGCGAAGTGATCTGCACACCAAGTTTTCGAAGCTCGGTCACAATCGTTGCAATGCGATCGGTTTCCTTGACTCGTAATTCAGCAGCCCCACTGATTGTGCTAATACCATTCGCAGTCGCAGCCAACAATGCAACTAGTGGCAGTTCATCGATTACGGCAGGAATTTCAGTAGCAGTGACTTGGACCGGATGCAGTTGTGCAAACCGCACGTCAAGCGTGCCAACTGGTTCGCCCATCCGGTGTTCATGATCGACCGTCACTTGACCACCCATCCGTCGTAAAATGTTTAAGAAACCCGTTCGTGTCGGATTCAGTCCCACGTTCGTTAACCGGACATGTGAATTTGGAATAATCGTCGCGGCTGTCACGAAAAACGCAGCCGAGGAAAAATCGCCAGGAATCGTTAGTGACTGACCAACCAAGGCTGGCTGCGGTTGGACCGTGATTGTTCGTTGATCAGGCGCCGTTTCAATTTGACCACCAAATTGTTGCAACAACCGTTCAGTGTGGTCACGAGTCGGTAATTTTTCAATAATCGTACTTGCTTGATCGGCTTGCAGGGCTGCTAAAATCAAGGCGCTCTTAACTTGTGCACTAGCGACCTGCATCTCGGTACGACTACCATGTAAAGTCCGACCAGTGATCGTCATCGGTAAGTGCCCGGCTGTTAATTGTACCTGCGCCCCCATGGCTTGTAATGGTTGACGCACTCGCTCCATCGGCCGTTGACTAAGGGACGTATCGCCGACCAAGGTCGTCTCAAACGGTTGACCGGCTAACAACCCAGTTAATAAGCGAGTGGCCGTCCCCGCATTCCCCATGTCTAATGGTTGTTGTGGTTGGGTCAACCCACGTAAGCCGCGGCCACTGATCGTAACGGTCGTATCGACACGCTTGATTGGCACCCCTAACTTTTGCAGCGCCGTTAAAGTCGATAAGCAATCGGCGGCTGGCAAAAAGTGGTGCAAGGTCGTCGTCCCTTGACTAATTGCCCCTAAAATCAAGCCTCGATGTGAGACACTTTTATCGCCTGGTACACTTAAGTCACCTTGTAACCCACTAGCTGGTTGAATACTTAGTTTTTTTATCATTAATCATCATCACCTAATTTATTTGATAGACGCACCACACCATCGAAGGTGTCAAACGTGCAAGTTCACGTTCATGAGTCGTCAGTGTCACGTTTTTCTCATTAGTTAGCACGTAGGCCGCCTGATTACGTTGATAAGCCTGATACGCTAAATACTTACTGGCGACTGTTTGCACCACGACCTGATGCACGACCCTCGTCAACAATTGGGCGGTCGCTGCATGCGTGTAACCAATTTGATTATCGGCATTTACTCGTTGGAGCACGACAAGTGGATCGAGCTGGGTCATAAAACAACTGCTCAACGTTAATTGGGACAATAATGCGTAATGTATATCCCCCCAGCTGGCATTCAGTGTGTCTGATTTGAAAGCAGCTGGTATCACCAGTTGGTCACCAGAATAGGCCGTTAAATCAGTTAAAATGGTTTCAAAGCTCGGGTGTTCGACAATCACCGCTTGGTCCTGCCAGTTGCGATGATTATAAACTTGCGCGGCCGCGTAACTATCCGTGGCGGTCGGGCCTAAAGTATGAATCTGCATAGGCCCTCCTAATATTGTCGGAGTTCTTCGCGGTATGCCGTCACTGTTTGCTGGAGGCGAGCTAAGTTACTCCCGTCAAACGTTGCCGTCAATGCTCGCGTTAATTCAATCGCTACCACACTTTCAACCACAAT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100 | Lactobacillus_phage(83.33%) | capsid,protease,tail,head,tRNA,terminase,holin,integrase,portal | attL 1824329:1824388|attR 1851679:1857710 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1852586 : 1867612
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP020816|1852586:1867612|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP020816|1852586:1867612|1865945_1866281_+|WP_013355650.1|DBSCAN-SWA MAYFDPDEILQTKEEALDYMEAHGIMTDATFPKLNDTENTDKHMAPVYKYLRENGMYIFHTGFYDRIFNFGAIYFMFDAIYFMFDANRFDYQTAPAEVKKILSIWSNSQSK >NZ_CP020816|1852586:1867612|1861790_1862006_-|WP_003644552.1|DBSCAN-SWA MFIRMETNNKAEAIKSWLANHRQLESQGTIADHFKKSITFVNLALNKKITTNGAERLVNEVYDYLVKKYKI >NZ_CP020816|1852586:1867612|1862619_1863009_+|WP_003641360.1|DBSCAN-SWA MQYAWDHGISCILTDKLDAYTPSSAKPENNIVLINLKWHNPSEIAFQMAHELGHVINHDEGILYFSSFSNKSKYERMANLEALKILIPIYLSEVDTYADNSVMPFMENFGIPKRLEDDVVNAFRTNVSN >NZ_CP020816|1852586:1867612|1852586_1853057_-|WP_013355637.1|DBSCAN-SWA MVTFPDHYCQQHYEHEAEYLASRQRWARSHDKHYTHKYNTVTRYRNDTKRQQYNFYRTRQWSHLRQQVLERDHYLCAYCKVQGVITPAKTVDHIVPIEFDETSKANVDNLAVICGKCHRLKTDWEQSYYGTGQGNELQSVTPINDVSAIVVLMDKE >NZ_CP020816|1852586:1867612|1858423_1858624_-|WP_003641371.1|DBSCAN-SWA MKVHVGDRVSYKAEYSCGQLIREAGVGKVVDIKKIPFTLRTQKDVAVVEQNGQQFEIITNGIQVLK 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27 | Lactobacillus_phage(88.24%) | integrase | attL 1846775:1846790|attR 1870006:1870021 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2169042 : 2207965
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP020816|2169042:2207965|DBSCAN-SWA 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MKTDGEFVSEHLMELITQQNLTINRVATLAGLNQSTVNAMFEGRSKRPTITTIRKVCGTLGISVHDFFDFPPYNEVEK >NZ_CP020816|2169042:2207965|2188088_2188265_-|WP_003642820.1|DBSCAN-SWA MKVRVKDYPIRYKDTRYKKGDELSITQDAFNDELFVCLDKQKDEKTADNAQLETDDEE |
50 | Oenococcus_phage(39.39%) | capsid,protease,tail,head,terminase,holin,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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