Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019342 | Nonlabens sediminis strain NBRC 100970 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas3,cas3HD | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019342_1 | 2197924-2198273 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019342_1
|
4 spacers
spacers of NZ_CP019342_1
>1.1|2197950|55|NZ_CP019342|CRISPRCasFinder TCCATTGAATGCAGCAAGACCTTTTACATTTGGACAATCATCTGCGCTATCTTTA >1.2|2198031|55|NZ_CP019342|CRISPRCasFinder ACCCATTAAAGCTACAAGACCTGCAGTTTCAGGACATTGATCGTCTTTGTCAAGA >1.3|2198112|55|NZ_CP019342|CRISPRCasFinder TCCTTGATTTTCTGCTGGTCCAGCATTATTAGGACAAACATCTTCACTGTCTTGG >1.4|2198193|55|NZ_CP019342|CRISPRCasFinder ACCCATGAACTCTTCTAATCCTGGAGTTTCTGGACACTTATCATTATTATCAGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019342_1
The CRISPR arrays of NZ_CP019342_1 >merge|NZ_CP019342|1|2197924-2198273|CRISPRCasFinder ATACCATCTCCATCAGTATCAGGACATCCATTGAATGCAGCAAGACCTTTTACATTTGGACAATCATCTGCGCTATCTTTAATACCATCTCCATCAGCATCAGGACAACCCATTAAAGCTACAAGACCTGCAGTTTCAGGACATTGATCGTCTTTGTCAAGAACACCATCTCCATCAGTATCAGGACATCCTTGATTTTCTGCTGGTCCAGCATTATTAGGACAAACATCTTCACTGTCTTGGATACCATCACCGTCAGAATCTGGACAACCCATGAACTCTTCTAATCCTGGAGTTTCTGGACACTTATCATTATTATCAGTTATACCATCTCCGTCTGTATCAACAGC >NZ_CP019342|1|1|2197924-2198273|CRISPRCasFinder ATACCATCTCCATCAGTATCAGGACA TCCATTGAATGCAGCAAGACCTTTTACATTTGGACAATCATCTGCGCTATCTTTA ATACCATCTCCATCAGCATCAGGACA ACCCATTAAAGCTACAAGACCTGCAGTTTCAGGACATTGATCGTCTTTGTCAAGA ACACCATCTCCATCAGTATCAGGACA TCCTTGATTTTCTGCTGGTCCAGCATTATTAGGACAAACATCTTCACTGTCTTGG ATACCATCACCGTCAGAATCTGGACA ACCCATGAACTCTTCTAATCCTGGAGTTTCTGGACACTTATCATTATTATCAGTT ATACCATCTCCGTCTGTATCAACAGC
>NZ_CP019342.1|WP_105018143.1|2197001_2197337_+|translation-initiation-factor-IF-2 MAFSINSIAQNNTQVEETTVNELFAKKVALEKDGKFKDRFTIQLIYGGREVATKTKAKYDNLNLSWPSELKWESPNHKVWIGKFRNRLEADRALLEIREHFPDAFILKPQS >NZ_CP019342.1|WP_085775322.1|2195444_2196782_-|c-type-cytochrome MINKKLHFSAWRFVLALAIVLFSTTAMAQDDASAGEPAAAQASGADAAKGKELFNANCAACHKLYKKAVGPALNGVSEKYDREWLYKWINNSAALIASGDPQAVALYNEWGQQNMNAFPGLSTQDIDNILAYTDTPKPEKAAGAVAGVQQGGAVTGGDNSMTNNIILAALAIVLLLLVVLLVVVNKTLKRFAEANGIQTEIVDEEELDRKPIWKAFVENQFLVLVTSIVLLFASLYFVYGAMMSVGVDQGYAPVQPIHYSHRIHAGTNQIDCKYCHSSARESKHSGIPSLNVCMNCHKSIAEVSEETYQEGMNEYGIDYNKEIQKLYKATGWNPDEMKYAGEGEPVRWVRIHNLPDLAYFNHAQHVTAGKIECQTCHGPVEEMEVMYQYSPLTMGWCINCHRETNVDLKGNGYYEQIHKELSEKRGGRQLTIADLGGLECGKCHY >NZ_CP019342.1|WP_085775321.1|2192352_2195424_-|TAT-variant-translocated-molybdopterin-oxidoreductase MATTKKYWKSTAQLQDDNEIIQSLEQNEFASPIPTDEFLGNDEAMESSGTSRRDFLKYVGFSTAAASLAACEGPVINSVPYVNQPERIIPGMANYYATTIANGYDFASVLIKTREGRPIKVENNKDAAFRGSASARAHASVLSLYDTNRLQYPTANGEQVEWSQLDRQVKEKLAGVAGKEIAILSRTFASPTYNKVISKFKEAYPTTTITIYDTVSEDAALDAFNAKYGVRALTDYDFTDAVSIVSVGADFVGDWQGGGFNKGYGQSRVPKNGKMSQHIQFESNMSLSGANADRRFPVTPTEQKHIIAALYSKIVGGPSPKLSDKLSKAVEQAAISLKRAGSKAVVLCGLPSMEAQLLTLEINDALASSIADVKAPIMTRQGNRKAVNGLVSRMNAGQVGVVIFADVDPVYSYDDNDAFAKALTKVSTKISLATRADATAVKSDYVAATPHYLEAWGDTEIKKGYVYLTQPTINTLFDTRQAEDSLLVWAGSTSSYSDLVKETASANGASWNQSLHDGFYAYSGPVVEEGEVDAPVSSTVSAASALSKLSAAKQPSDYELVLYTKAGLGDGTMANNPWLQELPDPITRTTWDNYVTISQKDAESLGIENYNVANGALDGSYVNVTVNGKTEKLPALIQPGQAPGTIGVALGYGKKEAIQEEMQTGVNAYPFYKDGLNVQSASVALADGIHEFACTQLQNTMMGRDIIRETDLATYKTGNKDEFNPMPEVSLNHIETPVTSPDVDLWESFDRSVGHHFNMSIDLNACTGCGACVIACHAENNVPVVGKTEVRKSRDMHWLRIDRYYSSTESFEGDESKKDGFEGLFGDNGSLGGFGELEIPADNPQVAFQPVMCQHCNHAPCETVCPVAASSHGRQGQNHMAYNRCVGTRYCANNCPYKVRRFNWFLYNGNDEFDYHMNNDLGRMVINPDVTVRSRGVMEKCSLCIQMTQMTILEAKKDGRPVKDGEFATACSNACSDGAITFGDINDKDSEIFKVKQQDRMYHLLEEVGTEPNVMYQVKVRNV >NZ_CP019342.1|WP_042279509.1|2190888_2192325_-|polysulfide-reductase-NrfD MAHYEAPIRRPLVTGDKTYTDVTRDIAAPVEGVANKQWWLVFTISLIAFLYGLGCITYTVATGIGVWGLNKTIGWAWDITNFVWWVGIGHAGTLISAVLLLFRQKWRMAINRSAEAMTIFSVIQAGLFPIIHMGRPWLAYWVLPIPNQFGSLWVNFNSPLLWDVFAISTYLSVSLVFWWTGLLPDFAMLRDRAITPFNKKIYSLLSFGWSGRAKDWQRFEEVSLVLAGLATPLVLSVHTIVSFDFATSVIPGWHTTIFPPYFVAGAIFSGFAMVNTLLIVMRKVCHLENYITIQHIELMNIVIMITGSIVGVAYITELFVAWYSGVEYEQYAFLNRATGPYAWAYWAMMTCNVFSPQFMWFKKLRTSILFSFAISIVVNIGMWFERFVIIVTSLHRDYLPSSWTMFSPTFVDAGIFIGTIGFFFVLFLLYSRTFPVIAQAEVKSILKASGSKYKALRDNKQTTTHGDASGDTLAHPNA >NZ_CP019342.1|WP_042279511.1|2190346_2190883_-|DUF3341-domain-containing-protein MAASNKKLHVMYTDDDVLLNAVKQVREKHYHIEEVFTPFPVHGLEKAMGIADTRLAINAFLYGLVGLAVATTMMNYIMIEDWPQNIGGKPSFSYLENMPAFVPIMFELTVFFAAHLMVITFYLRSRLWPFKKAENPDVRTTDDHFLMEVDVKGDIEEMSRFMYDTGATEIKVIDKEEH >NZ_CP019342.1|WP_060523680.1|2189648_2190347_-|cytochrome-c MNRIFKTFIYAALGLVMVSCMNDNETSTKTDRSVQYFPNMYRSAGYETYQEAEIFPGNVEAQKPVEGTISRGWMPYDYENNNEGYASAKANLNNPLPYTEANLAKGKELYDIYCAVCHGTSGNGKGILVKNEKILGVPSYDSREITQGSIYHVMYYGINTMGSYASQTSIEERWQIAHHVDALTRDLKGEEKREFVNGDDAGKAPVMEAPADETQQADSNDTDNNSTTTEGE >NZ_CP019342.1|WP_085775320.1|2188268_2189630_-|quinol:cytochrome-C-oxidoreductase MYTLSSKLKVFAGILFVVGLIMTVFGFINSPADLAEVEQMLEKEHHGDHHGASTVNFEDATNDHHNTHGEESHGDEAHGESHEMSHAEHVYHQLTNRPWSAVYVAAFFFFMIGLGVLAFYAIQKAAQAGWSPVLFRVMEGISSYILPGGIIMFILLLISAFHVNHIFIWMDEDVVAHDEIIQGKTGFLNIPFFLARAAAFLIGWNLYRWNIRKFSLKQDEAKDGDIAWYKKGFKHSAAFLVFFIVTESIMSWDWIMSFDPHWFSTLFGWYVFASMFVSGITTIALVTIYLKSKGYLEFVNDSHIHDLAKFMFGVSIFWTYLWFSQFMLIWYSNIPEEVTYYVTRIEDYNLVFFGMVAINFLFPLLILMNSDFKRINWFVVTAGLFILVGHYLDIYVMVMPATVGASWFIGLPEIGSFLMFGGIFLFYVFNTISKAPLLAKGDPYLKESKHFHY >NZ_CP019342.1|WP_085775319.1|2187161_2188241_-|cytochrome-c-oxidase-subunit-II MTAFLIILIAALIAVSAWQISKIVSLGKASSGSNGAEAQIANDEDNKRNGQFMLYFGIGIYIMMIACFIAYDDFFLPDAASEHGTEYDSLLFTSTIIIMIVQVLTQGLLHYFSYKYHGRKGQKALFYADNDRLEFIWTAIPVVVLAGLILWGLFSWNDIMDANMDDDPIVVEVYAYQFGWKARYSGADNTLGDANVRFIEGANQLGVDPTDADGQDDVVTTELHLPVDRPVLFKFRSQDVLHSAYFPHFRAQMNVVPGMVTQFKFTPTVTSEEYKSTEFMTEKVSKINEIRRQRSKELEANGDVALDPYEFEYYLLCNKICGASHYNMQMKIVVEEKEDFDAWIAEQKTIGTTLANAEN >NZ_CP019342.1|WP_060523684.1|2185333_2187157_-|cbb3-type-cytochrome-c-oxidase-subunit-I MGQAISVSTENAHDDGHHHHKETFVTKYIFSQDHKMIAKQYLITGLIMGAIGIAMSILFRIQLAYPEQPNALFSLFLGERWAEGGVMNPNMYLALVTLHGTIMVFFVLTAGLSGTFSNFLIPLQIGARDMASGFLNMVSYWLFFLSSVIMIASLFVETGPAAAGWTIYPPLSALEEAMPGSGAGMTLWLVSMAIFIASSLLGSLNYVVTVINMRTKGMSMTRLPLTIWAFFVTAIIGVVSFPVLLSAALLLIMDRSFGTSFFLSDIYIKGEVLAHQGGSPVLFEHLFWFLGHPEVYIVLLPALGITSEVIATNSRKPIFGYRAMVASILAIAFLSTIVWGHHMFVSGMNPFLGSVFTFTTLLIAIPSAVKAFNYITTLWKGNLQMNPAMLFSIGLVSTFITGGLTGIILGDSTLDINVHDTYFVVAHFHLVMGISALYGLFAGVYHWFPKMFNRMMDKNLGYAHFWLTAIGAYGVFFPMHFIGMAGLPRRYYTNTNFPYFDDLADTNKLITWFAIFTALAQLFFVYNFVKSIFYGKKAPANPWKSNTLEWTTGDKHIHGNWDGPIPHVYRWAYDYSKVNENGEYVIPGQDYAPQHIPLQDGEEEMNH >NZ_CP019342.1|WP_042279524.1|2184136_2185165_-|Holliday-junction-branch-migration-DNA-helicase-RuvB MNEYLDASSENLSNEEHDIERALRPLSFDDFAGQDQVLENLKVFVQAANLRGEALDHTLFHGPPGLGKTTLAHILANELGVGIKVTSGPVLDKPGDLAGLLTNLDERDVLFIDEIHRLSPIVEEYLYSAMEDYKIDIMIETGPNARTVQINLAPFTLIGATTRSGLLTAPMRARFGIQSRLQYYTTELLSTIVTRSAHILNVPIDIDAAIEIAGRSRGTPRIANALLRRVRDFAQIKGNGSIDLNISQFSLKALNVDAHGLDEMDNKILTTLIEKFKGGPVGITTLATAVSENAETIEEVYEPFLIQQGFIMRTPRGREVTELAYKHLGKTRHNNLGGLFDT >NZ_CP019342.1|WP_042277207.1|2198969_2200163_-|glycine-C-acetyltransferase MYGSIKEHLQKEIAEIKEAGLYKRERIITSPQDAVITLNDGSEVINFCANNYLGLSSHPEVVEAAKKSLDSHGFGMSSVRFICGTQDIHKELEQKLADFYGAEDTILYAACFDANGGVFEPLLTKEDAIISDSLNHASIIDGVRLCKAGRYRYASGDMSDLEKQLIQANEDGARFKVIVTDGVFSMDGLLAPLDEICDLADKYDALVMVDECHAAGFLGDTGRGTLEAKGVLGRVDIITGTLGKALGGAMGGYTCAKKEIIEILRQRSRPYLFSNSLAPSIVGASIKALELIDSSTALIDKVQSNTAYFKKGLQDLGFDIIDGDSAIVPVMLYDAQLSQNMADALLKEGIYVIGFFYPVVPKEKARIRVQLSAAHDQIHLDKALKAFEKVGKELGII >NZ_CP019342.1|WP_085775323.1|2200196_2203337_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MTQQPTTIYSASAGSGKTYTLARDFLTKLLSQKTNRGYRYILAVTFTNKAVAEMKTRILEYLKELGQAEWSDKIVPIAQHVQSQSGLSEQQLKDKSHRVLQYLLHDYAAFDVVTIDTFNHRLLRTFSKDMKLPDGFQVALDTDELIEKAVNQVIDRAGNDKQLTDILVEYALEKIDNDRSWNIAVDLQKMAKRIGSENNYRYLKDLKNKDISEFVRFRESVKKKIQSLRQSITDGAIEIDSQRLKMGWTIDDFSYKSTGAIGQIQKLSDGNWDLKLSSRLLNANEGNLLPKSTRIELTDSFIKLIDDYIPVYKSIMQQLFLLNNIYNSLVPLSLLGVIAREIEKIKDKERLLPIYEFNTLLREQIKDEPAPFIYERLGEKYRHYFIDEFQDTSVMQWQNMQPLIAHAVQSMSVDEQGGTLMLVGDAKQAIYRWRGGDVNQFLQLMSSQELFFSGVNKEPLEFNWRSYDEIVNFNNDFFTFLGNKLQSPVYNELYKNYLKQKTSNKPGGYVQIDILKDDYLDYLDPEKLIPEVSKASSYHVLEQIKHARTAGYLNDEICILVRNNSLASEIARFLELNGERVVSAESMLVSHSPKVAYLVALLNYIASDQPELKYNFLLEHSLNSGTENKHDFINSLMNKSQELIFKELFNQPSLRDELSRRSLYSFVQWLVECTAIMQKQDARLSQFLEMVFEFSSQNQTGLTGLLQHWTTIENKLSLSGSDTTGAIQVMTIHKSKGLEFSVVIVAGCDTKYNDLKRTSEWLQVDPNDFEGFEYLLLSMKEECKQYPDPVPKLYERSLEQEKLDNINVWYVAFTRSVERLYINTQKPYSKKDTMFEFLEQYVNDSMLLSSKEFENFTSYALGQDEKLSTSHALDLPMYLDQFHSNSNHSGIQISTRKGQLWSTGKDISIERGNLIHHYLEKLITQEDLSYVKELIHQSTTLSKDEKLELSSTCEKLIAHDEMKDYFNNKFKVLIERPIIDKNGFKFIPDRVVIYKDEVTIIDYKTGKPDISHKEQVDHYGILYDNMGYLVSSKVLVYLDTMTIIKW >NZ_CP019342.1|WP_042277203.1|2203487_2204096_+|superoxide-dismutase MSFELPNLPYAHDALEPHIDARTMEIHHGKHHAGYTSKLNNAVEGTDLEGKSIENILSNLDMSNTAVRNNGGGFYNHRLFWEVMSPNGGGNPDGELATAINESFGSFEDFKNKFSDAAKGQFGSGWAWLCVHEGGKLEVCGTPNQDNPLMPEVGCGGTPILGLDVWEHAYYLNYQNRRPDYVEAFFNVINWTEVSKRYAEGK >NZ_CP019342.1|WP_085775324.1|2204173_2206072_-|amidophosphoribosyltransferase MSDALKHECGIALIRLLKPLEYYKQKYGTAFYGINKMYLMMEKQHNRGQDGAGFASIKLDVDPGQRYISRVRSNQPQPIQDIFGQINDRINTELYNSPEIREDVAAQKSQIPYLGEVMIGHVRYGTFGKNSIESVHPFLRQNNWMHRNLIMAGNFNMTNVKQLFDKLVSLGQHPKDLADTITVMEKVGHFQDRQVRKLYKKFKNEGYSKVEASPKIAEELDVAKILRKSARDWDGGYAMGGLMGHGDAFLLRDPAGIRPAYYYQDDEVIAIASERPVIQTAFNAPFEQVQELEPGNAIIIKKDGRVSIEQIKEPLERKACSFERIYFSRGSDAEIYKERKELGRLLFPRIMDSIDHDIENSVFSFIPNTAETSFYGMVEAAHAALDQQKTDAILAGNGQLTREQVESTLSRKLRTEKIAIKDAKLRTFITEDSSRDDLVAHVYDVTYGVVKQDDNLVIIDDSIVRGTTLKKSILKMMDRLQPKRIVVVSSAPQIRYPDCYGIDMARLEDLVAFRAALELHKERGTYQMVEDIYEKCLTQVNFEDVDVVNYVKEFYDPFTDEEISNKIALLLSDEDLNAEVKIIYQKVDDLHKACPKNLGDWYFTGNYPTPGGNRVVNRAFINFFEGNKERAY >NZ_CP019342.1|WP_085775325.1|2206138_2207059_-|bifunctional-hydroxymethylpyrimidine-kinase/phosphomethylpyrimidine-kinase MSKLVVVGTVAFDAIETPFGKTDKILGGAATFIGLSASHFNTDVALVSVVGGDFPQEYLEMMKNRGMNIDGIEVVEDGKTFFWSGRYHNDMNSRDTLVTELNVLADFNPIVPEEYKDAEVVMLGNLHPAVQMGVLDQTPNAQLVILDTMNFWMDIELELLKKVIERVDVITINDEEARQLSGEYSLVNAAKKIHEMGPKYVVIKKGEHGALLFHNGDIFFAPALPLEEVFDPTGAGDTFAGGFAGFLAASGDYSFENMKRAIIYGSNFASFCVERFGTERMQSITNDEIETRLKQFQALTKFEMKA >NZ_CP019342.1|WP_042277195.1|2207127_2208648_-|GH3-auxin-responsive-promoter-family-protein MGNTILNSVVSWFLKKRIHDMELFIKHPQELQDNVLQDLIYFARNTEYGKKYGFKDIKSYKDFAAIMPVVEYSDVQADIERCKSGENNIFWPTDIKWFAMSSGTTSARSKFIPVSQESLEDCHYAAAKDLLCMYLNNNPESKLFTGKGLRLGGSKKLDKKAGTAAGDLSSILIDNMPFWADYSSTPGNETALLADWETKLPAIVNETIKERVTSLAGVPSWMMVLLNKVLETTGKDNILQVWPDMEVFFHGGVSFDPYIEEYRKLLPSDRVKYYEIYNASEGFFAIQDKNDSKELLLMLDYGIFYEFIPMDNYGTPDEEIIPLNQVELGKNYAVIITTNAGLWRYKIGDTVRFTSTSPYRIKVTGRTKHHINVFGEELIIENAEEALKNTMISVPCAIKEYTVAPVFMQGKEKGAHEWMIEFNTAPVDELAFAKALDENLQKVNTDYEAKRYNNTTLTAPRIHHAKENTFYNWLKDKNKLGGQHKIPRLSNSREYMEELLKIHNSL >NZ_CP019342.1|WP_085775326.1|2208712_2209507_+|DUF2797-domain-containing-protein MKVTGTVRKMQTEIQEQVQYYLVFPDQFVHMNQLLDKSITIKHVANECLNCGLDKKIWRQGFCYDCFTAIPQAGDWIMKPELSKAHLDEEDRDLEYEKKVQLQPHIVYLANSSNIKVGVTRKSQIPTRWIDQGAHEAIAILETPNRYLAGISEVALKEHVSDKTNWRKMLTNEVEDVDLLRFRESLLQHLPQETLPYTLDNAKEWEIEFPVLEYPKKVKSVNLTKRPEHNGVLKGIKGQYLIFNDGHVMNLRSHEGFVIDIEVH >NZ_CP019342.1|WP_085775327.1|2209503_2214903_-|DUF4011-domain-containing-protein MNDYRKSFFSLLDEIKASNGNTTVDFIAQVLPLLEKALYAHNQDKVLKITSIDQVLYNGRILIIEQETSSAVISTGLPQKPKEDGAVKVSDTIYQNRSNNVTSFENQSDYLHLDNASPVKNPAYVMHYKAWDYEMGTYDPLTEVFLLGMLMASLAYGLDFRDKDELLRFVENRERLYFLNKELDPTIHHVIREMTPIYREDRIPNLEEVVAKLKNYQDFNPENYQDLTETIGFKSINIKERGTYILDKLRRRLFDISRRNKLLYFKSTSSFLNLTEASIPLLLDHKNITEKDIIFWGPVMEGKLLGKKSLLLNRYLDITNNRFLNPILNKIRLEARKSRNEYGFDQLRLVVAFLHWYNFKENREERISSPLLLLPVSLVKKKGVEDRYQLEVTTTDAEINPVLSYYLKDLYDIELPDFIDLKESSLEDLIGNIRNQILNSGNGVELQWREKPQIQLIHKAARRNFKLKKRKLNRRTSNLNLRQFDYSYKEDDFKPLGIELFKTLVHKKINDLEYIINEDINPYSDLAVAEKERSFYRNDNYGVVNPLVWEVDTCNMTLGNFNYRKMSIVRDYNDIINADIKDEVFEELFSENPRKLIEEEGISTQLNDLYPIIAADPTQTKAVYKARSGRNYIIQGPPGTGKSQTITNLIADYVARDQKVLFVCEKRAALDVVYHRLKNKQLDELCCLIHDSQTDKKSFIMNLKGTYESFLKDKMKSNAIVKERNEIIDKIQTHINRLESFHNIMRSGETPIFQVYQEVISDIDKFERLAKAEYFVIPDFDEWKSNENWIKEFLNQIRINHYGDSIKNFPLNGISPELLSTSDYKTTIHKELSSALTILEQINEWIDENDGDTTMVWDDWIKEVNLMEKSKEIIAKGNLAILTPDNPQATALLNDNRKLEKSRKKWQDKQDENRFWKVKWNAIDAYEIKNQWDRANANILKFLNPKWYRLKKQIKEAYDFQKHKVKPEIDSVLSRLVDEYDLLNSFENEKRKLENRYGFTNYDDGIQWLKQLHNTGSPIVAKWIEIDNRDYLSGLISVLPLFNSLRNSLSKIAKSFGNYSIATLEDRISVALTMTNSLSLFKPHIEKLNNADFKLQSLLRDRNWREDEINFHCAYKTILDNSDNNPVFAQMNEDSLQFSIREIQNLLDKYYNANVAFIRSRIRDQFLNKIRITESTAAQLTNEEKKLKKIYKSSRKILENEFNKKMRYKSIRELATGEAQEIMTSLKPVWLMSPLSVSDSMPIDTSIFDVVIYDEASQITVEEGVPSLFRTHQTIIVGDEMQMPPTNFFSTTSVDVDEDEEEQEQRIGINLDADSLLNQGARKLPSVMLGWHYRSRRESLISYSNAAFYKRELLTIPDNQLSIHGAGELTHVLNPDQEIDINDVLQRSISYHYLENAVYHKRSNKDEATYIAHLVRKLLTQQVDKSIGVVAFSMEQQSVIESALEELALLDTRFGKLLEEEYNRTEEDQFTGLFVKNLENVQGDERDIIIMSVCYGFNTQGKMLMNFGPINRRGGEKRLNVIFSRAKRNMMIVSSILGEHIKNDYNEGARYFKRFLQYAKQISDGNIQNASSILDSLHVSQNLDLKGKEIPLKSKLKEVLKAKGYVVYNDIGQSHFKVDIAIISSNDTQFKMGILLDYKSHYHGDNVLEQYCQKTSVLETFGWKILRVYVKDWVEQPNRVLERIRQTIENEEKLSPVTATNHEREMQEIVSEEVQQVSDSTIESQSSQTSDDFKRYEYVQGNSNKFWEIKVIGNEVHTRFGRIGNKPQTNVKSLSTRADALKEEMRLTGVKLRKGYRRS >NZ_CP019342.1|WP_085775328.1|2214895_2216137_-|M48-family-metalloprotease MNQSTETLLQRSLPTFNYHKKIRDYFKSRSKTWQWFKDEKVKSHQIDALKSSLLKNTYRLDRDSHFDLYKVSDQVCENLNLTAQVTFYQEQNSIQDNCAISIIEDEAHIVFSGNLLELLDERQLTALIAHELGHFLFFKIENGEFEITQRIILALANDSQSDSVFVETARKFQLFLELFCDACSFQVCREHYSVIQCLVKVSTGLKRVNAQSYLDQAKEILQGEENSSLNTTHPETYIRTYALDQLSRSAHNLEEVIKPLIIGKIDVNNLDLFQQKELSSFTYQFLEFILLPEWMRTSRNMTHASSFFSKFYVSDEKQEVNSIKKFINDAAIGTHNYLCYVLLDFSKLDADLELLPLAHTLEIANLLGIKEEYERIVRKEYQLTIREFKSLKDEAMKDLNKLSQEQRSIYDHE >NZ_CP019342.1|WP_085775329.1|2216335_2217541_-|GTPase-HflX MLEQESHEYENAVLIGIVTQQQSEEKLTEYLDELEFLAYTAGASVKGRFTQKMQHPNPKTFIGTGKMEEVAQFVEANDIGTVIFDDELTPTQQRNIEKILKAKIIDRTYLILDIFAQRAQTSYARTQVELAQYEYLLPRLVGLWTHLERQRGGIGMRGPGETEIETDRRIVRDRISLLKKKLTTIDRQMKTQRGNRGKLVRVALVGYTNVGKSTLMNVVSKSDVFAENKLFATLDTTVRKVVVKNLPFLLTDTVGFIRKLPTQLVESFKSTLDEVRESDLLLHVVDISHESFEDHIDSVNAILQDIEAIDKPTIMVFNKIDQYQPEEYDDEFDERTTAHNTLEDWKRTWMNRAGDDVIFISAIEKENMEQFRKKVYDRVREIHVSRFPYNAFLYPDYSEEE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
816669 : 824761
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019342|816669:824761|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019342|816669:824761|822435_823554_+|WP_085775670.1|DBSCAN-SWA MVKCLVVFGTRPEAIKMAPLVKEMQRTESVSCKVCVTAQHREMLDQVLEFFEINPDYDLNLMKPNQNLYGLTADIIRELKSVLEDFNPDFVFVHGDTTTTMATSIASFYNQSRVCHVEAGLRTFNKWSPFPEEMNRQIAGRISDLHFAPTQTSANNLLSENVDSSKIIITGNTVIDALIGSVEKVNEKPSELIQQLDEKLNGRDLILVTGHRRENHGQGFNNICEALKNIALAKPEIEIVYPVHLNPKVQEPVNRILSDVSNITLIDPLAYQDFIWMMNRSKIIITDSGGVQEEAPSLGKPVLVMRDTTERPEAVEAGTVILVGTDPELIYKEAIDLLDNEERFNKMSALHNPYGDGKACKRIVETILNYNE >NZ_CP019342|816669:824761|823546_824761_+|WP_085774541.1|DBSCAN-SWA MSKQPEVVMIGLGYIGLPTAALIASNDVHVHGVDINQHVVETINQGKIHIIEPDLDTAVASAVKHGFLKASTKAVEANNYLIVVPTPFKDKNEPDISFVESATRGIIPLLKKDDLYIIESTSPVGTTEKMAELIYSERPELKGEIYIAYCPERVLPGNVMHELVHNDRVIGGINEQSTQKALNFYSAYVKGDLHPTNARTAEMCKLVENSSRDVQIAFANELSLICDKAGINVWELINLANKHPRVNILQPGCGVGGHCIAVDPYFITADFPMESQIIGKAREINNYKSFWCAEKIKSAKLEFQLKHGRKPAIAIMGLAFKPNIDDLRESPAKYIAQKVLQDANDENYFIVEPNISDHKVFKLTDYEDAYNKADIIAYLVAHNEFKTLPKDSDKVILDFCGVNK >NZ_CP019342|816669:824761|821089_822367_+|WP_085774540.1|DBSCAN-SWA MNKKICVIGLGYVGLPLARLFATQYDVVGFDINQARVDELNKGRDNTLEVDEETLQKVLKNESNDSYGLYCTTQLEDIADAQIYIITVPTPVDKNNRPVLIPLQKASETVGQVLKKGDIVIYESTVYPGATEEECIPVLEQVSGLRFNTDFYAGYSPERINPGDKLHTVDKILKVTSGSTSEIGQEIDELYKSVITAGTHLAPTIKVAEAAKVIENSQRDINIAFVNELAKIFNLLEIDTHAVLEAAGTKWNFLPFKPGLVGGHCIGVDPYYLAQKAQEVGYHPEIILAGRRMNDSMGAYVAGQFVKLMLAENISVKDAKVLVLGITFKENCPDIRNTKVVDVIQNLKEYGIDVSVHDPMANPDEVFEEYGYYSHKEFKKERYSGILLAVAHEEYLDIDLNKYLEKESIIYDVKNVLGTKSHGKL >NZ_CP019342|816669:824761|818099_819149_+|WP_085774537.1|DBSCAN-SWA MRKTIVITGGAGFIGSEVVRLFVTEYPDAHIINLDALTYAGNLENLKIIEHKENYTFYRVNINDAHAIETVFKNHSIDVVIHLAAESHVDRSISDPLAFARTNVLGTLNLLEVCRSTWNKDFTNKLFYHISTDEVYGALGEKGLFTEESPYSPNSPYSASKASSDHFVRAYHETYGLPIVISNCSNNYGPYQFPEKLIPLFINNIKHGKPLPVYGDGNYTRDWLYVKDHALAIKTIMEQGQLGETYNIGGHNEWKNIDLVQLLCDEMDVMLDNDAGTSRSLITFVNDRPGHDLRYAIDASKMLNELGWMPSVSFEQGLKETISWYLENPLWLQRVTSGAYKEYYNQQYK >NZ_CP019342|816669:824761|820057_821044_+|WP_157546888.1|DBSCAN-SWA MQIFKVKSIKVLVTGAAGFIGSNLCEFLLNNNYNVIGLDNFSNGHRYNIEPFIQHPNFTFIEGDIRDLDTCHSAVADCDYVLHQAALGSVPRSIKDPITSNDVNVSGFLNMLVACKDAGVKKMVYAASSSTYGDSESLPKVEDKIGRPLSPYAITKFVNELYADVFYKTYGLNTIGLRYFNVFGRKQDPNGAYAAVIPKFTSSLMKKESPIINGDGTYSRDFTYIDNVIQANVKAMLVDSQESENQVFNVAYGDRTTLIELIEYLKKHLSKFDSDIRDVVIKHGPNRAGDIPHSLASIEKAKRLLGYEPKFNIDQGLKEAVEWYWNNL >NZ_CP019342|816669:824761|816669_818061_+|WP_085774536.1|DBSCAN-SWA MVKNICCIGAGYVGGPTMTVIAAKCPHLKVNVVDINTKRIEAWNHSDVSKIPIYEPGLSDLVKQARGRNLFFSTEVDQAIKEADMIFISVNTPTKTYGVGKGMAADLKYIELCARQIADVAEDDKIIVEKSTLPVRTAEALKNILDNTSKDVKFQILSNPEFLAEGTAVQDLLNPDRVLIGGEQTEEGRMAQKALVDIYANWVPSDRILTTNVWSSELSKLTANAFLAQRVSSINALSELCEKTEADVNEVARAIGTDSRIGSKFLKASVGFGGSCFQKDILNLVYISRSYGLQEVADYWEQVIIMNDHQKRRFASNIVKTLYNTVSGKKIAMLGWAFKKDTNDTRESASIYVADDLLNEQAEIVVYDPKVNAEQIYADLDYLNTRSSEENRKGVTVVNDPMECFDQAHAIAIMTEWDEFKDFDWKSIYNKMLKPAFLFDGRMILDHDKMEDIGFKMYTIGKG >NZ_CP019342|816669:824761|819149_820022_+|WP_085774538.1|DBSCAN-SWA MKGIVLAGGSGTRLHPLTIAVSKQLLPVYDKPMIYYPLSVLMLAGIREILIISTPHDLPNFKKLLGDGSDYGIRLQYKEQPSPDGLAQAFIIGEDFIGDEDVAMVLGDNIFYGAGFSQVLQSAVRTVTNEKRAVVFGNYVKDPERYGVASFDKDGQLISIEEKPKQPKSNFAVVGLYFYPNSVINVAKRLKPSDRGELEITSLNQYYLEKRELSLEILSRGFAWLDTGTHEALSEATEFVKAIENRAGLKISCLEEIAIKMGWVDKNEVAERVKTLKGSYFEYLKRITFS |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1679186 : 1688465
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019342|1679186:1688465|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019342|1679186:1688465|1680189_1681035_-|WP_085775076.1|DBSCAN-SWA MKKFIKNIVQFFGFEISKSASKRSVKIPYKIQVIQRLEKKFLNFNYSCLNPKQYEINVANSNFIISTKEEFFILNEIFFDDCYSFKLPEKTIVYDIGMNIGIASVYFSVDSKIDKVYSFEPVLDTYNLGRDNINRNAIAKEKCTTFNIGLGEKDKELTFSFNESFKGSVGLVHSSNIDSEEIGTKSVKVTIKDSYQVLLPLVEQHKSNFKLLKIDCEGGEYEIIDRLYETKLLSSFNIIVLEWHVNSPDIVINQLMDSGFVLHTSSQSDKLGLIYAYRINV >NZ_CP019342|1679186:1688465|1681031_1682177_-|WP_085775077.1|DBSCAN-SWA MKRVVIVPTDPLNTYDLKGTSEVVRRVYNPDNYFEEVVIVSPFENKDFVWQGYKVYAAPKYVDFKQKLKLINPDFVRVYGSYTSCTFSIFARLRKYPVIVSIHDDRDSFIHSSIRYADHIFAVSDLLKNILINKGVNPSKINVIGNRIDYDTFKPLKNQNHLDNSTRHNHKTILHIGKKTKQKNLDNVIRALQYLPENVLLKAVGVGDDEVYMDIVKELNLIGKVQFIQSIPNNKLNKLYNECDVFCVPSRNEGFGVVFIEAAAACAKIVTSDKKPMNDILPNKYKNVFLVKDYESPRAIGVALNEALSLSRIECREDALELRSIHKRKYSFEAVDKKEIMLYSELFTKPRQTPFILFLMSSIYSFKVKLAKKLNQLNLGI >NZ_CP019342|1679186:1688465|1683062_1684325_-|WP_085775079.1|DBSCAN-SWA MDDVILKVENLSKQYRLGLVGTGTLSHDLNRFWHKIRGKENPYLKVGAVNDRSKKASSDYVWALQDINFEVKRGEVLGIIGKNGAGKSTLLKILSRVTAPTTGSIKTKGRIASLLEVGTGMHPELTGRENIFLNGAILGMTKAEIAGKIDEIVEFSGCEMYIDTPVKRYSSGMRVRLGFAVAAFLEPDILVVDEVLAVGDAEFQKKAIGKMQDVSSQGGRTVLFVSHNMTSIRSLCSRVVVLENGGVVFDGDTNTGIERYLESNNESNTNINDKSDFIKSISFIKDNKEVEQICIGDSFQIHVEFKDFQITQKIDYCFIGLEDNDRRVLSLGTHHDVNFNGEIKPNNTLSCKVNNLPLNQGVYRILFAVGTNMPRQNIEVLENVRMIKIINNDFFNNGIDVLKNQGDLIIKSDWSIISNQ >NZ_CP019342|1679186:1688465|1679186_1680197_-|WP_085775075.1|DBSCAN-SWA MYKDLISIILPVYNGEQYISECIDSCLNQTYQNWELIIVNDCSTDNTPVILSKYIKKDQRLKLYNNKANLKLPKSLNLGHEMAKGEYLTWISHDNILKRNFLEEMIEEIIKSNSDIVYSNFSVINGDGILQEKRVLSNLNNFLLGNPVQASFVYKRIVYNHLNGYKDHLFLIEDYDFWLRSSICFKISHLSKDLYFFRKHKDSLTTSIKKNQARYNLFSNNLSRCFSELNLHLNAHTIEFLVLLHSYSEIWSRKINVNDIKNIHSFFRDIEIFCLKIKIDSHQQKLNIKKRIREIILFKGKVEFTLLFYLIIFRPNAVIKNNKDILKLVKSYFSNE >NZ_CP019342|1679186:1688465|1686002_1688465_-|WP_085775081.1|DBSCAN-SWA MSEEAKDLDALSGIFDIRQFLNKLIRLWWFFLLCLIIGISYAYYKNQFIQTYYSASSLISIKDNTNPLFTSNQSLTFNWGGTTDKVTTVITKFKSRTHAERVVDELQFYINYIKEGEYYNVDAYKATPFFIYADTAKAQLYGKNIRINVLDQDNFKLSASFSAETSLAYDYTNKAHEQVKTPIGEWSQQFKFGDSIQLPFLNVVIEKTREDIQTGQWLFNFGNYWATVKKYKDIRIMQKPEGSSILELSLSGTNKARLIDYINTSSIVLETEELELKNKFATATIQYIDSSLVAQIKSVKAAEDELEDFKGKTTLLDAQEQSTDLNQRLTDYEKQETGIKRQLDYYENLENYLKNKSDYTLIQAPSIVGIEESSIGGAVARLVSLSEERKKREFSMRTDAPVFQQIDRDINTVKEVIFENIRSSKSLLNRDLNDLYSKINRIESEIKKLPKEQQAFLRKQRQLEIEQDAFNIFKAKKAEAELVKAANVSDVFVIDKARDTGGGGSRRDGNINYLIALLMAVALPVGLAFFLTVLDNYLHVPKDLERMSSVPLIGVIGKMNHPSNLVVNDQPKSTIAEAFRGIRSSLHFMYKGEASHGCRTIMVTSSVSGEGKTFMSINLATVYAMSGKRTLLIGLDLRKPKIFDDFGIENTLGVSNYLVNDASLEQVIHNTRVDNLDLILSGPVPPNPSELILSERAGNMIEELKKSYDYIILDTPPLGLVADALEIAKHADASLYMVRQGYTKKGMIEVINDKYSKNEIENVSFVFNYYDDRGKYGYGYGYGYGYGYGYGAYGNGYHINKIKKPWYKKILDYTLLRKRK >NZ_CP019342|1679186:1688465|1685135_1685990_-|WP_042277753.1|DBSCAN-SWA MKSDNWLYEIKPKGKFIDLNLKEIWRYRDLLILFVKRDIVTVYKQTVLGPLWFLIQPLFTGVIFTLVFNKLGGINTYGVPSFLFNLSGITLWSYFKESLSTTSKTFLTNSSLFGKVYFPRVIAPASKVISGLLKYIIQLGIFFVFYLFFLWNGEDLQLGPYWYLLPIPVFSVAILGLGVGMILSSLTTKYRDLSILIDFGIQLLMYISAVMYSLQFASEQLGEYAWLVTYNPLAQLIELYRNMLLNVGQDSLWQLLIAVVISIATLFIGLVIFNRTEKTFIDTV >NZ_CP019342|1679186:1688465|1684317_1685136_-|WP_085775080.1|DBSCAN-SWA MNQRLYWWSECFIQKKPYENYGDLIGAYLFGKITGEKPLFYRKKDKPWWRRHKSYYATCGSIISHLDEKAIVWGSGIIHQDSKVPKATFLAVRGPLSRKRILESHIDCPTIYGDPALLLSHYYKSKKVKTAAVGIIPHINDYQKIKEWYKNIEEIKVINLNTNDVESTTNEIVSCERIISSSLHGLIVPHSYGIPSMHVEFSKNIHGDGIKYLDYFESVQLESMVTPFIDTKQKLDRLIHQTVGFHLPNKELITKLCMGLMDTCPFKPLKNG >NZ_CP019342|1679186:1688465|1682183_1683053_-|WP_085775078.1|DBSCAN-SWA MLSSIVKVITKRDLSYNTIVNSNTYKRYLYKKNKRKKQCYLWLCQNFSWLLKVYYKLSIRPEAATREDILSNYSLKSNEFVVLQVGANDGFDNDPIHKFIIRDNWSGVLIEPQQQVYVNYLTKTYSKIKGIKLINAAIDNQTGEKDMYIISFSKDRWATGLASFGEESMKKLIDSGYIDKHARLQNIRTPEKKDEYIAKVKVTTYSFHDVIKNNDMNHIDLLQIDAEGYDFELLKMFPFDLIKPVFLNFEFSHLNDNDKKDCYNFLSSIGYSYSKIGNDLFCELQSLNH |
8 | Catovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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