Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP021058 | Macrococcus caseolyticus strain IMD0819 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3 | 0 | 0 | 10 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP021058_1 | 1947954-1948047 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP021058_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP021058_1
>1.1|1947987|28|NZ_CP021058|CRISPRCasFinder TCTGTGTAGTTCGTCACCTACAGTTGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP021058_1
The CRISPR arrays of NZ_CP021058_1 >merge|NZ_CP021058|1|1947954-1948047|CRISPRCasFinder TTTGTCCTCTTTCACTTGTCTAGGTGGCGGACTTCTGTGTAGTTCGTCACCTACAGTTGGCTTTGTCCTCTTTCACTTATCTAGGTGGCGGACT >NZ_CP021058|1|1|1947954-1948047|CRISPRCasFinder TTTGTCCTCTTTCACTTGTCTAGGTGGCGGACT TCTGTGTAGTTCGTCACCTACAGTTGGC TTTGTCCTCTTTCACTTATCTAGGTGGCGGACT
>NZ_CP021058.1|WP_086039201.1|1947100_1947646_+|hypothetical-protein MKLLKIFAIVMLLMLIPETIDAGGTTSSSGSSSSGSSASSSVARASTTSRAAMNASRINTMSRMNNTSRMSSSQNLQRAKSNAVTLAPPMRSKFSGPLKYQAAHNQFVNNQIFYGAMYGHSSNVQRQQALIRQQLGNRKAYTISVKRNGRERLYVVSKEIYDRVESGDSVHIKNGVVTLKE >NZ_CP021058.1|WP_086039200.1|1946725_1947094_+|hypothetical-protein MKRLSYIVILTLLLAACGNAKEKEAPDASGENVKKYDLVYAEVLNNGSESKMSMEVGYKDNKKLKSERFDTENVVEHILKDESAKPYILIKKNDVHIFRQPYIIFDNEGEFDAKVEKKSVVE >NZ_CP021058.1|WP_086039199.1|1945934_1946492_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MMFWSFFVLYFNKRSDDMIQPCTIEDKQALQHIAYQTFDETFRAQNKKENIDHYLKTAFTDEKVERELSNPHSFFYFIFHEEQLAGYLKLNIKDAQTESFDEHHLEIERIYILKQFQKHGLGKALYQHALQKARALSCEHIWLGVWEKNTNAIDFYQKMGFTKVDQHAFFMGDDEQIDIIMLKNI >NZ_CP021058.1|WP_086039198.1|1945343_1945697_-|hypothetical-protein MKCVHCNYKFTFKERMKAAWKPSTDTIVICPKCGGRQYISNKSMAKSYGLMLLVELILIIAAPLIKIPIPLLTVLMIIALALVIVLFPLSLKLVAEKDGLLEEQFRKMEKKQKRKSL >NZ_CP021058.1|WP_041636183.1|1944941_1945145_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKNRLKELRAREGYNQTQLAKLAHVSRQTISLIERDDFMPSILTAVRIARIFNEQVEDIFIFEEDEL >NZ_CP021058.1|WP_086039197.1|1944213_1944945_-|DUF3169-family-protein MSKKKNSGFLKIMIGMAFGAIAGYSIPALYDAVTSLQATYNIRILWYIVPILFVIALYLYFKSIHQFKAMNSDINLSEDDRFIYQVTHHNKASANVVNAYHILLLSLCLSITILIEPETSHIIIFAVYFIACAIFYTFISKQTAKVLAAYPMITNSDVSIEFGDPNLMEKVIDGIDEGERLVMLRSLSKTYEIMILMLSVILMLLGIYQAATGENQYLAMFAIAAVLIYSTVVYYKKNEEFNR >NZ_CP021058.1|WP_086039196.1|1943838_1944201_-|hypothetical-protein MRHIKRKPKQFVLIVILTLVYSSIHLYGNDHILWSIVYCLLIFIMWMTFFITTSDEEEMNEQLDQEVKRLNMPRERLYQVTGYNRYEVSKSEDGQIIFWIPMSKKKVLLKKLKGMEPEQE >NZ_CP021058.1|WP_086039195.1|1943063_1943723_-|response-regulator-transcription-factor MAHILIIEDDRDIADLLALTLSGHYDVTLAHDGKEGYMYIKEQAFDLILLDLMIPYMNGETLLGEIKHHTNTKVIIITAKHELEHKVNLLTLGADDYITKPFYQEEVLARVMVQLRNVEKGGSLITHRALELDTEKREVTLNNKGIQLTNSEFDILTILMKHPEVPLSKQKIFNALGNGTYVGDDNTVSVHVSNIRKKFSQITDEPYIKTVWGIGFMLI >NZ_CP021058.1|WP_086039194.1|1942067_1942976_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MESIIRTHQLEKTFTTNKGLKPLDFQLFKGEICAIIGKNGAGKSTFFKLLAGQLQPTRGEMAFFDYAAAESNRARKRMGFMIESPEFFAELTAYENLNYFRLQRGISSKDAVKRVIEAVDLSKYPATRFKEYSMGMKQRLGLALTLMTGPDCLVLDEPTNGLDAEGISDIRKLLLKLNKEQDITILISSHILSELQLVATRFLFIDKGQVIEDISREELHNRNRKSLKLIVDHPSRAARVLEESFTDLKYSVLPDNTLKLDNHVEHAAQINRILMQHDIDVKEIMTETNSLEDYFLSLAVTP >NZ_CP021058.1|WP_157821106.1|1941321_1942068_-|ABC-transporter-permease-subunit MNYMISETYKLLRTKGIYITYALCIMLLIIAALTLYYFGHNGEYFPYYRADFYYNNVFGMWLFIVMIGAVINSFLTNKESKRVLKQSISYGISRATIYFSKYLVALIAFTILCILGTIVLLTCGQLFFPKDTSAVEEFLLSLINFSPILLGAFSLVHAFNMVIRRETTAIVSFIFILLGTSTVAYILTKINKAFDVFYNLTPKVLSDRVLSEFMNHNVELSADFWISSLIITSLSLFIGYRLFKKEDF >NZ_CP021058.1|WP_086039202.1|1948071_1948566_-|hypothetical-protein MTYEAMFKRYNKMRRLSNDKENIEALLKQYKAFEIPVHSIHHDDYHNDEEVDPLYIYKLFHISDKHALNKIMDAAYKDKGDDTYPLGSELTYRSLIGRHNSGRGVSIVLESKDGKKVSNFKIYGQAQKLSELLLCYIPFEAMTEDIRSSDFQYFLECLDGNGFL >NZ_CP021058.1|WP_086039203.1|1948777_1949392_+|amino-acid-transporter MIQSILHGFLLAFGLILPLGAQNVFVFNQGANHKSFKKIIPVVVIAGLCDTLLILLAVFGVSLLLNQYPALQLIIYSIGFIFLLYMAWSLWHESPSSKSDSTPMSAKKQISFALSVSLLNPHAIMDTISVIGTNAAMYQHAEKIVFTITTISVSWIWFISLGLIGKLVGNIDQEGKFILVLNKVSSIIIIAVAVLIAKNIVEII >NZ_CP021058.1|WP_086039204.1|1949912_1951532_-|chaperonin-GroEL MVKEIKFSEDARRAMLAGVDKLADAVKVTLGPKGRNVVLDKKFVAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVAEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGIRQGIDKAVAVALEELAAISKTVSSKEEIAQVGSISAADEEIGQFISEAMEKVGNDGVITIEESKGFKTELEVVEGMQFDRGYASPYMVTDSDKMIADLENPYILITDKKISSFQDILPILEQIVQTSRPILIVAEDVDGDALTNIVLNRLRGTFTAVAVKAPGFGGRRKAMLEDLAILTGGQVITDDLGLDLKDTTVEMLGNAGKVHVTKDNTTIVEGRGDASNIDARVGQLKAQIEETTSEFDKEKLQERLAKLAGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVSIYNKVAAVEATGDVATGVKIVLKALEAPIRQIAENAGLEGSVIVEKIKHAETGVGYNAATDEWVNMIDAGIVDPTKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVAEMPEENPAPDMGMGGMPGMM >NZ_CP021058.1|WP_015912210.1|1951591_1951876_-|co-chaperone-GroES MLKPYGNRVVIQKTERETTTASGIVLTDSAKEKTNEGTVVAVGTGRILNNGERVEIGVSVGDRVVYEPFGGTEVKTGDESYIVLKEEDIIAIVE >NZ_CP021058.1|WP_086039205.1|1952085_1952301_+|hypothetical-protein MKHNRKWINILTVLLYIGSQLFVLIPTSIFLKQGLDNDAAFLKAIPYYVGSFVVASILVIYINTKINNKTR >NZ_CP021058.1|WP_086039206.1|1952257_1952839_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MLFISIRKLTIKRVERSVKTDTLSTIGLIVGGLFISLFTQMMLGMVNTYILNQPMESQNTTQIMGIAKQAPIFIILIAIVGPILEEFVFRKVIFGELYELIKGNRAVAFTISVLISGFIFSAAHSDFNHTLIYMGMSVVFSGLYVLSNRIIVPIAAHMLMNGFVVLMQVVFADKVIEAQKQLEQANLIWHLFN >NZ_CP021058.1|WP_086039207.1|1956515_1957028_-|hypothetical-protein MKSINRLSANNRSTNTEVPTTEQPAPAFPSHDDADSTPPKYDDNDYSAGVVPPSPGTIDIPELPDTPVSPVELSDSESEYSSLEEDDDLLGIKPGKFKPTDGEAYYAALDKQVCELVTREIGKSKKSHQDKESKATSKQKQKVKKHAKLPDTGENVFMYVLASVSCCYQD >NZ_CP021058.1|WP_086039394.1|1957138_1957414_+|hypothetical-protein MDQYLTNGTARSIPIFVFLDATDHQYAVWGPRAQVVQDYVTEVRQDLPSKDAPDFEEQQKAVHHTIHEKYKNTPEFWEEIYNSIVERLIHL >NZ_CP021058.1|WP_086039167.1|1957519_1957939_+|hypothetical-protein MNNLYDEVRNSRNELLEQAKQLSTSELNYNFGSKFKSIKYNLLQIAYAYHEGLDQYKDQIGDYDLFKENGPKLNIIDIENYFDNIDYAIEQNPVSPETVMPYIFNDYEYRGKIKFLMTFFEVIDGNVDVERKNVKVKRS >NZ_CP021058.1|WP_086039168.1|1957989_1959102_-|NAD(P)-binding-protein MRIGIIGAGIGGLTAAILLERLGHSVEVLEKRHVLKQEGVGLGIGENAIHALERYDIAADIKRDGNILVEAQLRDANDTYLNRVIFNKAGEDNITIQRSSLHNILRYHYKGNVRLIKEVIKITDFDAGIIKTTDGTSNQYDLVIAADGLHSQVRRQMFPGSEAKYQGYTCFRGTSVNPGLNDKTALEYWDARGRFGIVPLRDNEVYWFLCINALERDTEFRNYNLKKLKRYFEEFPHAVTDVLDNTVGEPLHHDIYDIEPLKTFVKGRVVLLGDAAHAATPNMGQGASQAIEDAVCLANQLEQYPLKEALANYDRLSVPHTKKVILKSRKIGKAAQSESRVFIRLRNALVKRMPERILNQQTDFLNKRKL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP021058_2 | 1998564-1998657 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP021058_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP021058_2
>2.1|1998597|28|NZ_CP021058|CRISPRCasFinder TCTGTGTAGTTCGTCACCTACAGTTGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP021058_2
The CRISPR arrays of NZ_CP021058_2 >merge|NZ_CP021058|2|1998564-1998657|CRISPRCasFinder TTTGTCCTCTTTCACTTGTCTAGGTGGCGGACTTCTGTGTAGTTCGTCACCTACAGTTGGCTTTGTCCTCTTTCACTTATCTAGGTGGCGGACT >NZ_CP021058|2|2|1998564-1998657|CRISPRCasFinder TTTGTCCTCTTTCACTTGTCTAGGTGGCGGACT TCTGTGTAGTTCGTCACCTACAGTTGGC TTTGTCCTCTTTCACTTATCTAGGTGGCGGACT
>NZ_CP021058.1|WP_086039201.1|1997710_1998256_+|hypothetical-protein MKLLKIFAIVMLLMLIPETIDAGGTTSSSGSSSSGSSASSSVARASTTSRAAMNASRINTMSRMNNTSRMSSSQNLQRAKSNAVTLAPPMRSKFSGPLKYQAAHNQFVNNQIFYGAMYGHSSNVQRQQALIRQQLGNRKAYTISVKRNGRERLYVVSKEIYDRVESGDSVHIKNGVVTLKE >NZ_CP021058.1|WP_086039200.1|1997335_1997704_+|hypothetical-protein MKRLSYIVILTLLLAACGNAKEKEAPDASGENVKKYDLVYAEVLNNGSESKMSMEVGYKDNKKLKSERFDTENVVEHILKDESAKPYILIKKNDVHIFRQPYIIFDNEGEFDAKVEKKSVVE >NZ_CP021058.1|WP_086039199.1|1996544_1997102_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MMFWSFFVLYFNKRSDDMIQPCTIEDKQALQHIAYQTFDETFRAQNKKENIDHYLKTAFTDEKVERELSNPHSFFYFIFHEEQLAGYLKLNIKDAQTESFDEHHLEIERIYILKQFQKHGLGKALYQHALQKARALSCEHIWLGVWEKNTNAIDFYQKMGFTKVDQHAFFMGDDEQIDIIMLKNI >NZ_CP021058.1|WP_086039198.1|1995953_1996307_-|hypothetical-protein MKCVHCNYKFTFKERMKAAWKPSTDTIVICPKCGGRQYISNKSMAKSYGLMLLVELILIIAAPLIKIPIPLLTVLMIIALALVIVLFPLSLKLVAEKDGLLEEQFRKMEKKQKRKSL >NZ_CP021058.1|WP_041636183.1|1995551_1995755_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKNRLKELRAREGYNQTQLAKLAHVSRQTISLIERDDFMPSILTAVRIARIFNEQVEDIFIFEEDEL >NZ_CP021058.1|WP_086039197.1|1994823_1995555_-|DUF3169-family-protein MSKKKNSGFLKIMIGMAFGAIAGYSIPALYDAVTSLQATYNIRILWYIVPILFVIALYLYFKSIHQFKAMNSDINLSEDDRFIYQVTHHNKASANVVNAYHILLLSLCLSITILIEPETSHIIIFAVYFIACAIFYTFISKQTAKVLAAYPMITNSDVSIEFGDPNLMEKVIDGIDEGERLVMLRSLSKTYEIMILMLSVILMLLGIYQAATGENQYLAMFAIAAVLIYSTVVYYKKNEEFNR >NZ_CP021058.1|WP_086039196.1|1994448_1994811_-|hypothetical-protein MRHIKRKPKQFVLIVILTLVYSSIHLYGNDHILWSIVYCLLIFIMWMTFFITTSDEEEMNEQLDQEVKRLNMPRERLYQVTGYNRYEVSKSEDGQIIFWIPMSKKKVLLKKLKGMEPEQE >NZ_CP021058.1|WP_086039195.1|1993673_1994333_-|response-regulator-transcription-factor MAHILIIEDDRDIADLLALTLSGHYDVTLAHDGKEGYMYIKEQAFDLILLDLMIPYMNGETLLGEIKHHTNTKVIIITAKHELEHKVNLLTLGADDYITKPFYQEEVLARVMVQLRNVEKGGSLITHRALELDTEKREVTLNNKGIQLTNSEFDILTILMKHPEVPLSKQKIFNALGNGTYVGDDNTVSVHVSNIRKKFSQITDEPYIKTVWGIGFMLI >NZ_CP021058.1|WP_086039194.1|1992677_1993586_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein 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MIQSILHGFLLAFGLILPLGAQNVFVFNQGANHKSFKKIIPVVVIAGLCDTLLILLAVFGVSLLLNQYPALQLIIYSIGFIFLLYMAWSLWHESPSSKSDSTPMSAKKQISFALSVSLLNPHAIMDTISVIGTNAAMYQHAEKIVFTITTISVSWIWFISLGLIGKLVGNIDQEGKFILVLNKVSSIIIIAVAVLIAKNIVEII >NZ_CP021058.1|WP_086039204.1|2000522_2002142_-|chaperonin-GroEL MVKEIKFSEDARRAMLAGVDKLADAVKVTLGPKGRNVVLDKKFVAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVAEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGIRQGIDKAVAVALEELAAISKTVSSKEEIAQVGSISAADEEIGQFISEAMEKVGNDGVITIEESKGFKTELEVVEGMQFDRGYASPYMVTDSDKMIADLENPYILITDKKISSFQDILPILEQIVQTSRPILIVAEDVDGDALTNIVLNRLRGTFTAVAVKAPGFGGRRKAMLEDLAILTGGQVITDDLGLDLKDTTVEMLGNAGKVHVTKDNTTIVEGRGDASNIDARVGQLKAQIEETTSEFDKEKLQERLAKLAGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVSIYNKVAAVEATGDVATGVKIVLKALEAPIRQIAENAGLEGSVIVEKIKHAETGVGYNAATDEWVNMIDAGIVDPTKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVAEMPEENPAPDMGMGGMPGMM >NZ_CP021058.1|WP_015912210.1|2002201_2002486_-|co-chaperone-GroES MLKPYGNRVVIQKTERETTTASGIVLTDSAKEKTNEGTVVAVGTGRILNNGERVEIGVSVGDRVVYEPFGGTEVKTGDESYIVLKEEDIIAIVE >NZ_CP021058.1|WP_015912211.1|2002698_2003454_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MKHNRKWINILTVLLYIGSQLFVLIPTSIFLKQGLDNDAAFLKAIPYYVGSFVVASILVIYINTKINNKTRVERSVKTDTLSTIGLIVGGLFISLFTQMMLGMVNTYILNQPMESQNTTQIMGIAKQAPIFIILIAIVGPILEEFVFRKVIFGELYELIKGNRAVAFTISVLISGFIFSAAHSDFNHTLIYMGMSVVFSGLYVLSNRIIVPIAAHMLMNGFVVLMQVVFADKVIEAQKQLEQANLIWHLFN >NZ_CP021058.1|WP_015912212.1|2003789_2005229_-|polyphosphate--AMP-phosphotransferase MTKIDKQLQLTTAELVRKTHEAGIPVMIVFEGIPASGKSRLSNELLLTLDAKYTNFYATKRPDEELLRYPFLYPYWNNIPKKGGVTLFFRSWYAQKLDFEEHGYKKDIIKDYDLLTQEIKGFESMLSDDGYVIIKFYLSVNEQKRQEHIEQTKKNPLTRWKAQEYEASIPTKVYQDGMIDLMKATEEIAPWTHIDYTERGKAVNEMYEVIIKRLEKALKAKEKSKQDERDGAFTEDFTTDMFEDTSDNMSKAEYKELLPKLQARIRELQYALYERKIPLMLVYEGMDAAGKGGNIKRVRESLDPTGYEVNAISAPTETELSYHYLWRFATDVPRSGHIEIFDRSWYGRVLVERVEGFATNKEWQRAYDEINKFEKALTIEGAIVIKFFLVLDKDEQLKRFEERQVTPEKQWKITDEDWRNREKWDLYLEASKDMIDNTTTEHAPWVIIPANNKRAARIKALKTIISVCEERLWNVKKLW >NZ_CP021058.1|WP_086039208.1|2005362_2007054_+|M3-family-oligoendopeptidase MITFQNYKYERPDLHAVNQSIDQLLEQFEAATSAEAQIKLIDDINVVRKHLDTAMNLAYVRASINTNDAFYSEERDYLDAHSGEVIQIESKFYNALANSKFKDALRETYGDQLFDLAELFVKQYDDSIKDLLNKENKISSEYSKLVASAEIEFKGETYTFAQMGQFLDSADRSVRKEAKLAMEEYRAAQLAQYDEIYDRLVKVRHEIATKLGFKNFIELGYVRMNRVDYTPDMVKRYRDQIHKHVVPVAQSLYQSQMKRNGWDSLKPYDESIVFLSGNEKPKDDGKTILENGRKMYKELSAETDEFYQFMMDRELFDAEAKKGKEAGGYCTFIQDYKSPFIFSNFNGTDHDITVLTHEAGHAFQVYRSQDLIPDYLWPTHESCEIHSMSMEFFTYKWMDLFFNNPDKFKYKHIGDAIKFLPYGVTVDEFQHIVYEHPELSPQERRAEWTKLEQKYLPHKDHDGIAALEGGAFWHRQGHIFGSPFYYIDYTLAQVCAFQFFKRSIEDFEEAWKDYLHICDIGGSLPFNKIVEAANLRSPFQDGALEDTMTFLEDYLDEIDTSNF >NZ_CP021058.1|WP_086039209.1|2007118_2007967_-|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MYKFKVKAVAALVCMLGLSTQNATLSEAADNSVTAEQPSSEQVESIKKESSLKSAEDKSPESPVIEIVSTEIIKEDETTEMPTTEAPTTEIPSKEQTPTTELPSVEVDQPTERPTTEVPTTEVPTTEQPAPAFPSHDDADSTPPKYDDNDYSAGVVPPSPGTIDIPELPDTPVSPVELSDSESEYSSLEEDDDLLGIKPGKFKPTDGEAYYAALDKQVCELVTREIGKSKKSHQDKESKATSKQKQKVKKHAKLPDTGENVFMYVLASVSLLLSGLILLRKS >NZ_CP021058.1|WP_086039210.1|2008186_2009035_+|VOC-family-protein MERQFFSKDTHIGAVHLNVNFMDNSVKFYHEILGLDIIEHTPSFSALGVNDSVLIYLYQTNHARVQTAGLFHFALLVPSRAALGNIFYHLIKTEYPLAGASNHDVSEAIYLQDPEGNGIEIYRDVPSNEWQFEPNGDIVMGTSEMDYAAVIEANHNRPFDGMPKDTIIGHMHLSVIDLNQSIAFYNELFGLDVMTRYGSQAAFMATAGYHHHLGLNTWQHQTERARLDYPGLRKFDLNIPNEEDLQHFLETLSEKGLTQSKDENSNIVYDPSGIGVRIMTKN >NZ_CP021058.1|WP_015912217.1|2009188_2010046_-|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MYSVLGQITKMYDSFTPVEKRIADVVIEYPEKVVNLPIKEIAHLSNTSEAAIVRFSKRLGLSGIKVVKVELARELHTIADKKVPTKIELTDDEEVMKEKVFNNTIQALYNTEKVISAKVIDEAAQAITSAKRVMIFGVGNSRVVATDLHVKLMNIDQSAILATDLLSAITLLGHYEAGDVLFVTSETSKNKVITDICKYAKEKGIKIILLTQKFSSPAIRMADIVLAMAKEENEINLGYMTVRTAQLTIVDVLYLRVCAYLKDTVLSNMQNLNETRKITHEQENL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
15956 : 77395
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP021058|15956:77395|DBSCAN-SWA AATGTTAGACATTAAATTATTTAGAACAGAACCAGAATTCGTTAAGAAAAAATTAGAAATGCGTGCGATTGATACTTCCATCGTTGATGAAATATTAGAGCTTGATATAGCGGCGCGTGAGCTTACAGCAAGAACTGAAGAATTAAAAGCAAAACGTAATAAAACGAGCGAAGAAATTGCACAGAAAAAACGTAATAAAGAAAATGCAGATGATGCAATTAAAGCAATGCGTGAAGTAGGTGAAGAAATAAAGCGTATTGATACGGAGTTGAACGAAGTATCTCAGACGTTGAAGGATAAACTTGTACGTTTGCCGAACTTAGTAAGCGATGAAACACCATTTGGCAAAGATGAGGATGAAAACGTTGAAGTCAAGAAATGGGGAACACCACGTACATTTGATTTCGAAGCAAAAGCGCATTGGGATATCGTCGAAAATTTAAAAATGGCTGATTTTGAGCGTGCTGCTAAAGTTTCAGGTGCACGTTTCGCATTCTTAACTAAAGATGGTGCGCGTCTAGAACGTGCATTAATGAACTTTATGTTAGATACACATCGTGCAAATGGATATGAAGAAATGGTGACACCACAACTGGTAAATGCTGCTTCTATGTTCGGTACAGGACAACTTCCTAAGTTTGAAGAGGACTTATTCAAAGTTGAAAAAGAAGGTCTATATACAATTCCAACTTCAGAAGTGCCATTAACGAACTTCTATCGTGATGAAATTTTAACCAATGATATGTTACCTACGAAATTTACAGCTATGACAGCATGTTTCAGAAGTGAAGCAGGTTCAGCAGGCCGTGATACACGTGGATTAATTCGTATGCATCAATTTAACAAAGTCGAAATGGTACGCTTTGAACGTCCTGAAGATTCTTATGCTGCGTTAGAAGATATGACACGTTCAGCTGAAAGCATTCTGGAGAAATTAAATATTCCTTATCGTACGATCGCTTTATGTTCAGGAGATATCGGATTTGGCGCTGCAAAAACTTATGATGTTGAAGTATGGTTGCCAAGTTATGATGCCTATAAAGAAATTAGCTCATGTTCAAATATGACAGACTTTCAGGCACGACGTGCAAATATTCGTTTCAAGCGCGATAAAAATGCAAAAGCTGAACTTGTAAATACACTGAATGGTTCAGGACTAGCTGTAGGACGTACTTTTGCTGCAGTAGTTGAAAATTATCAAAATGAGGATGGATCTATCACAGTTCCAGAAGTACTCGTTCCATATATGGGTGGACAAACTGTAATTAAATAATAATCAGGGGCGGTTCAATGTTATCATTTGAATCGTCTTTTAATGTGATGTTATAATAAGACAGAATTATCAGAATACAAAAACTTTTTGCTATATAATTTTTATATTTGAATATAATTTTTATATTTGATATATTAATTATAACGAAGGGGAAGGTCATAATTATTTAACGATATGAGCTGACATTTCTGAATCGGTATAAAAAACTTAAAAGGTGGAACTTAATGATGACAAACTTTAAACTAGACCCAGTACACAGTAACGTAGAATTCTCTATCAAACATTTAATGGTATCAAAAGTGAAAGGTGAATTTACTGAATTTGATGGACAAGCTACAGGAGACATCAACGATTTAACATCTTTACAATTAACAGCTTCTGTAAAAGTAGATTCTATTAACACGAACAATGCCGACCGTGACGGGCATTTAAAATCTGCTGATTTCTTCGATGTAGAAAAATATCCGGAGATTAAATTTGTATCTAAGTCTATTACTCAAAATAAAGTAACAGGTGACTTAACAATTAAAGATCAAACACATGAAGAAACATTTGATTTAGAATTTAATGGTATTCATAAAAATCCAATGGATGGAAGCAGTGTAACTGGATTTATCGTAAATGGAACAGTTAACCGTGAAAAATATGGTATCAACTTTAATCAAGCTTTGGAAACAGGTGGCGTTATGATTGGTAAAGAAGCTAAATTCGAAGTTAACGCTGAATTTGCAATCGAAGATTAATAAATATAGTTATAGCTGGGGCAAATTTGCCTCAGCTTTTTATTTTGTTCTGAAAAATTGAGACTTGAGAAAGAAAGTTGTAAAATAGAGTAGTTATCGAAATTTTTGTTTTAAGAAAGTGAGATTTTAATTTGAAGATTGATATAAGAAAAACGATTGTAACTTCTACTATTATGCTATTAGCAGCAATTACCATTCATTTTGTACCAGGGCTATTCTTAATTATTGTACCTTTTTTGCTTATTCCTGCAGTGACTTTATATTATCACTCCAGAGAAAGTTACTACATGATGAGTTTTGTGGTTCTTATCGCTGTTATATTTACTTCGATATTTACAATGCAAATTATGTTAAGTGTTATTTTTGGAGGCTATATTGTAGGTCAATTATTAAAAGAGAAAGCATCTAAGGAACGTATACTATACATTTTGACCGTATTTTATACCATTTTTTCGCTAATCGCTATAATTATATTGCAAATGGCTGGTGTTATGCCGAAGATGACGGATATTTTTGCCCCTGCTACAGATACTTACTATAACTTATTGATGGCAGAGGTAGAAAAAGGTACAGTTACTAAAACATATGCTGATCTATTTTTAACGAGTATGGATGCATTAGTGTTACAAATACCAGGGTTATTAATTTTGTTTTTATTCATATTATCCCTTATTCAAATCAGCATTACTTTTCCGTTTGTAAGAAAGTTTAAAGTATCGACACCAAATTTCCGACCATTATATATGTGGCGTATTCCAAAAGTAGTGCTATATTTATACTTTCTTACGCTTTTTACTGCACTCTTCATTACAGATACTGATGTCGTGCTGTTAGGCATAGTCACAAACTTTAAGTATGTGTTAGAATGGATTATATTCATCCAGGGACTCTCGCTGTTTAGCTTTTTTATAAAAGTAAGACGTACACATCCAGTATTAAACATTTTAATATACATATTTGCATTTATTTTCTCACCAGTGACACAAATCTTTGGAATGATAGATATGATATTGAATTTAAAATCTAATATTAAGCGCAAGTAAGATTATAAATTTAACGAAGAGGTGTCAAAATGAACAGAAAGTATAATAGGCAGACATTGATCATACCCTTTATTGTTATGACGCTTGCTGCTATCATCGTAACGGGGATTTTGTATACTGAAGATGCGCTGTTAGCTGTAGTGACCAGTGTGATTCTATTTATTATTATCTGCATTTCCTATTCTTACTTTAAACGTAGTTTGAGACAAAATGAACGTTATATTGAGAATTTATCCACTGTAATCGGTAATGGGAAGGACTATGCGATAAGTGAGTTACCAATAGGGGTTCTGCTGTTAGATGAAAATGAGCATATTGAATGGTATAACCATTTTATGAATGAAAAGATTAGTGAGCCTATTATTTCGGAGTCTATTCATGATATTTTTCCGAACTTACTGAACCAACTTAAGGTAAGCGCGGTTAATGAGGCGAATGCTCAATATAAAGACTACAAATTTAAAGTGATGTTTTCTGAAGAAAATAATGTATTATATTTCTTCGATATTACTGATAAGATTGAAACACATCAATTATATGAAGATGCAAAGCCTGTAATTGGTATCATGTTTTTAGATAATTTTGACGAAGTTACTCAAAATATGACCGATGCCCAACGAACTGAGATTAATAGCTTGATGTCTATGGAAATTAATAAGTGGGCAGAAATTAATAATGTTTATATCAAAAGATATCAATCGGATCAGTTTATGATGTTCTTTAACCAAAAAATATTGCACTCAATTGAAGAAACAAAATTTAATTTACTTGATAATATTAGAGATAAAAGCCGTGAAATTAAGACACATGTCACTTTGAGTGTAGGGATTGGTGAAGGTGCTGATAACTTAATTGAGTTAGGTACACTTGCACAATCAAGTTTAGATTTAGCTCTTGGACGTGGTGGAGATCAAGTAGCAATTAAACATATAAATGGTAATGTGAGATTTTATGGTGGTAAGACTGATCCTATGGAAAAACGTACACGTGTTAGAGCTCGTGTAATATCACATGCATTGAAAGATATTCTTGTTGAAGGGGATAATGTGATGATTATGGGGCATAAACGTCCTGATATGGACGCTATTGGTGCTGCAATCGGTGTGGCACGATTTGCAAAGATGAACAATTTAAAGGCAAATATTATACTCAATGATCATGATATCGACGATACGTTATCTCGTGTAATGGCAGAGATTGCTGAAAAGCCAGAGTTAAACGAAATTTTCATTAGTTCAGAAGAAGCTTGGAATCTAATGACGAAACGCACAACGTTAGTCATTGTGGACACACATAAACCAGAGATGGTCATAGATGAAAATATATTAAACAAAGCTTCCAGAAAGGTTGTTATTGACCATCATAGACGAGGAGAAGAATTTGTTTCAAACCCATTACTCGTTTATATGGAACAATATGCTAGTTCGACAGCTGAACTGGTAACAGAGTTGCTGGAATATCAACCGACCGATCATAAATTAACGCGACTAGAAGCGACTGTAATGCTTGCGGGTATTATTGTCGATACCCGCAACTTCACATTACGCACAGGTTCGAGAACATTTGATGCAGCGAGTTTCTTAAGAAATCATGGTGCAGATACGATATTATGTCAGCATTTCTTAAAGGATGATATGGAGACTTACATTAAGCGCTCAGAAATTATTCAGACAGTGGTTCTTGAAGACAATGGTATTGCGATTGCGCATGGTCCGAGTGATGAAGTGATTCATCCTGTTATTGTTGCACAAGCAGCAGATCAGCTCCTTAATATTGAAGGTGTTGAAGCTTCATTTGTAGTAGCTAAACGTAAAGATAATGTTGTCGGAATATCAGCGCGTTCATTAGGTGAAATCAACGTACAGCTTGTAATGGAGAAGATGGGTGGCGGTGGCCATTTATCTAATGCTGCAACCCAAATCGAAGACATGACTGTTGAAG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57 | unidentified_phage(23.08%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
528481 : 542210
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP021058|528481:542210|DBSCAN-SWA 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12 | Acinetobacter_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
553214 : 560589
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP021058|553214:560589|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP021058|553214:560589|556401_557040_-|WP_086038266.1|DBSCAN-SWA MKNFITIKQNIEQETVINKSRFITYLFKVENEDEAKAKIDEIKALHKDATHNCSAYTVGDSHQIQKANDDGEPSGTAGVPMLESLKKNDIHNVVAIVTRYFGGIKLGSGGLIRAYQGRVSEAIQLAGKVIYKNGMIIQVTLPYELSGKFEHAIDDKFIIINQTYTDKVIYDVQLVSEDKDEFINFVTELTQGLPVIQVKSELMLPFDIKNNI >NZ_CP021058|553214:560589|555341_556388_+|WP_086038264.1|DBSCAN-SWA MLTLKLIIITALFSFVLTPIIIRFSYFIGAVDKPNYRKVHTKPVSMLGGVIILCAFLFGLWIGQPVEKEIYPIIIGAILIQITGLIDDFIDLPAIIKLIAQIGVATIVVYHGITLDLITLPFGIVIEFGIFSIPMTILWIVAVTNAINLVDGLDGLAAGVSGIALATIGFIAIIQQNIFIMMLCSVLIGALLGFLKYNFYPARIFLGDNGALMLGFIIGVLSLLGFKNITLISLFFPVIILAVPFIDMSFAMIRRYRQGKPIMQADKSHLHHKLLQLGYTHPQTVILIYSIAALFSVASVILYLSSVWGAILIVLLLLITIELIVEFTGLIDDTHQPLLNFMRSIIKK >NZ_CP021058|553214:560589|557218_558322_+|WP_076688030.1|transposase|DBSCAN-SWA MTHINGNTKTVKGKHLSRDERIIIQTLINEGYSNRKIAGKLGRAPQTINNEIKRGMYTQKSQQVQNNKIYTYYKCVYSPDLAQDRYFENRIKSGRRPLPITDNPFVEWADNLMIHQEMSPASVIMLAKKAKLFPERFIPCIKTLYNWIDRKLIKTRNINLLMKLKLKNKKPTGFTRINKKVLGQSIELRPQAVDTRTTFGHWEIDTVVGQKSAEDQVLLTMVERKSRYELILKIDGKQTCHVVNALRRLIKETGDAFPKIFKSITSDNGPEFSDLSECLKGLSEVYFTHPYASWERGTKENQHRFIRRHIPKGIPISTVKASTVHKIQEWMNRYPRKILNGQSAMEVFLKELIKENILSESLGFYMN >NZ_CP021058|553214:560589|559371_560589_+|WP_162485201.1|DBSCAN-SWA MLQHITDNANIPSVITKGNKYHCNYCLNDRQYSFHSFYHEGVGKEIVYCRTCLSHYATTENFIALEPSPKKAEVVTLHLPFELTAQQKRASDYIVRQFRKNQDSLLYAVTGAGKTEMMLQAVVEARKEGCNVAITAPRTDVVKELALRMQEYMPEIQIDVLYGGHQVLTAGHLVVTTVQQLIQFNGHFELIIVDEIDAFPMNYDSRLLKVLKRAMHEKGTIIYLSATPPAHLMKLPHIYLPSRYHNRPLPLPKLRYYKITSRSLEQKLKNIVNTTLIFFNDIKQMKKYYAALPESLQAEGTIVYSNDDERHDKVEAIRCGEYRFIFTTTILERGFTQENLSVWVINSEQFTWDSLVQIAGRVDRKGASMNGEVVFFHEGLSSHMTKAIQTIKRMNKKHDQSMSSV >NZ_CP021058|553214:560589|558454_559306_+|WP_086038267.1|DBSCAN-SWA MKTAIITDSTSYLSQEMIDRYDIRVISLNVIFKDQVFVEAEYAPTQFYERMRSEKQLPTTSQPTTGEYITLLEQLKSDGYTDCIAIHLSSGISGTYQNAITAGEMVEGINMYAFDSEIACMVAGMYTLRAAELKDVLSPEQIIEELKLIRADSKAYFLVDDLKNLQKGGRLNGAQAIIGSMLQVKPILHFEDKVIVPYDKVRTKKKAVQFVQNKIKQEVAAPATIVVIHANAEEEADVIIQHFKSHFPEADVIKSYFGPVIGTHLGEKALGVGYVHHKFEFFQ >NZ_CP021058|553214:560589|554293_555151_-|WP_086038262.1|DBSCAN-SWA MQLNRTIMDIFYTLIGSIIVGISYNLFLLPGKIAAGGISGLSTILNHLFHSDPSLVQFIFNLPIFIIGWFTLGRSFSLKTLIATFIVPLTIFLTQDIVQYGTKDALLSSLYGGIVLGIGLGLVYRGNGSTGGTATLAQIVKKYSGLSSGYAQLVVDAFVVIFSAFVFNFELALYALISIFVTSKVIDIVQLRTGDNKLVFIITSKETQVIDIIHNKIERGVTSVNAFGGFDRNGKTILFSVMEQTEAIYFKNLITEEEPDSFVIFINTSEIIGRGFSTAKIYRSK >NZ_CP021058|553214:560589|553214_554279_-|WP_086038260.1|DBSCAN-SWA MIEAIIYNIAVTVSGIYLFHRIQFFEDREIVFKKPYIALLMTIIAILLLTYPIGYKEISFNLAFVPLLFLGRYTNFFYTFLSACIIVVVDLYLLGTSFPSSLYLLIIATVVSMVGPFIKLQDIQAILVLNLISVLIIAVYTWIKQTFIINEMILLIISSFILSLSSSVMFVDIWRVQKMLSRFNKEHVVDYLTGLGNVRAFDRYLNIISRQSSEQKQSLSLLLIDIDDFKEVNDKFGHDAGDAVLKQMSQVLNNYVPDQSKIFRNGGEEFSVIFNDKSLNDTVKIAESIKNGVINSTFHLQNRETIHLTVTIGVGYIPRSEIKTHRKIFKEADEMLHAAKNQGVNTIMFNPIIK |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
604742 : 643319
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP021058|604742:643319|DBSCAN-SWA 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55 | Staphylococcus_phage(51.61%) | capsid,portal,integrase,tail,terminase,head | attL 607825:607849|attR 645589:645613 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
806524 : 816401
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP021058|806524:816401|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP021058|806524:816401|811901_813320_+|WP_086038469.1|DBSCAN-SWA MYDIRGLNEECGVFGIWGHPNAAELTYMALHSLQHRGQEGAGIVCSDEKNIYGARGMGLLPEAISEMKLESLSSFHHAIGHVRYATTGASELSNVQPFIFKHSKGDIGLAHNGNLTNAEQIKLALESEGAIFQTSSDSEVLGHLLLKAKSDNKLNNLKASLNQIKGAFSFLVLHPEKLFVARDSHGVRPLMLGKVDGAYCVASETCAFTAVGAEYIRDIEPGEVLTLSHDGLAEDVYTTNTQSSMCSMEYVYFARPDSEFRKHSLYEIRKALGRKLYEEMNIEADVVIGVPDSSLQAAKGFSLASGIPNEQGLLKNRYVGRTFISPDQKMRERAVRMKHAPIRDVIEGKRVVVIDDSIVRGTTSKFIVKTLKQAGAKEVHMAISSPPLIHPCYYGIDVSTHAELIAANKSVAEIEAELEVDSLTYLSVDGMHEVFRSFDSKGECNACFTGNYPIEIVDHVLPEEKDKKKKGV >NZ_CP021058|806524:816401|809071_809734_+|WP_086038467.1|DBSCAN-SWA MKFAVIEFPGSNCDRDMFNAALKTGFEAEYVDYRKTSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRCGAMARVAPIVPEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALMHNTKHQFICQNEPLKIVNNNTKFTHKYDKDETVIYPIAHGEGNYYCSDETLAELKANNQIILTYHDNPNGSIEDIAGIVNKAGNVCGMMPHPERAMEALLGTDDGVKLFESILESWGK >NZ_CP021058|806524:816401|814344_814911_+|WP_086038471.1|DBSCAN-SWA MIKVAIFASGNGSNYEKIMEHIQAGFLDHIEVTGLYTDKRSAFAIERARRFDTPVHLFELKTFKDKTAYETAILKQLKRDDVEWVILAGYMKLVDRTLLDAYEGKMINIHPSILPSFPGVNAVGQALDYGCRVSGATVHYVDSGMDTGKIIDQMSCPIYEEDTEETLQLRIQNLEYELYPRVIKKIIR >NZ_CP021058|806524:816401|806524_807007_+|WP_086038464.1|DBSCAN-SWA MTVAVIMGSSSDWETMKEAVTILETFGIDYETSVVSAHRTPLTMVDFAKSARKKGIEIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKALKGMDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKAGAKNAGILAARMLSLKDTALVAQLDDYEASLVKKVEAMQHDLK >NZ_CP021058|806524:816401|814922_816401_+|WP_086038472.1|DBSCAN-SWA MRKALLSVSDKTGIIPFAKSLTELDFELYSTGGTKKALEDNNIAVKSVSELTNFPEIMDGRVKTLHPNIHGGILADRNNPEHIKAMETHGIQPLDLVVVNLYPFEATVANPDVTEMDAIENIDIGGPTMLRSSAKNFRHVITVVDPADYDEVIEKLKADTLDETFRKQLMIKVFTHTNKYDAAIVNFFSDNTSTLRYGENPHQKARFIKTDAKPNTLAGARVLHGKPLSFNNIKDADATLFLVKQFDMPAAVAVKHMNPCGVGTGEVISEAFQNAYDADSQSIFGGIVALNREVDKATAEKMHAIFLEVIIAPKFSDEALEILTAKKNIRLLEIDMDTDKDEEEFVSVSGGYLVQDKDLLNVTRNDMRVVTETEPTEAQWKAIELGWKVVKSVKSNAIVLANDKQTVGIGAGQMNRVGAAKIAIERAIEMNDNVVLASDGFFPMSDTVETAYAAGIKCIVQPGGSIKDQDSIDKANEYGMAMVMTDVRHFKH >NZ_CP021058|806524:816401|809736_811923_+|WP_086038468.1|DBSCAN-SWA MVKFLEPTANEIKENKLYQDMGLSDKEYDKVVDILGRMPNYTEIGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGERVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIVRDIVSIGARPIQLLNSLRFGELTEKQNQRLFKGVVAGIGGYGNCIGIPTVAGEIEFDRQYEGNPLVNAMCVGIIDHDKIQKGTAKGEGNPVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELSEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLKAITFPELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGIHLELEKVPTREAGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDHYELDSAVIGEVTDTDRFVLTYEGEVFADIPVQPLSDEAPVYVLEGRAAQFDAVNHDYSNIDAQDTLMKLLSHPTMASKNWAYSQYDQQVGANTIIKPGLSAGVTRVEGTKKAIAATLDGEARYVFNNPYEGGKMVVAEAYRNLISVGSLPLAMTDCLNYGNPEKPEIYQQLADSTRGMAEACGALNTPVVSGNVSLYNETKGDAIFPTPVVGMVGLIEDVDYLVDFKPSKGDTIYFVGEVKPDFGGSQLEKLLFNEVAHTDVAIDLEQEVARGEAIRQHIIDGKLGHVQAVGKGGIGVKLAQIAAYFNTGLEAQLDVNDAELFAETQGNYIVIAKQGKEIDIDGAQAIGTFGTESFKLSTNQGEVTLDVNRMTEAWKGAIHACMTSEV >NZ_CP021058|806524:816401|813322_814348_+|WP_086038470.1|DBSCAN-SWA MAESYKQSGVDIHAGYEAVERMKKHVNKTMRKEVLGGLGSFGAAFDLSQLNMKAPVLVSGTDGVGTKLRLAIDSDRHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAMPLYFLDYLALNKVDPVIVEQIVKGVADGCAESECALIGGETAEMGDMYHTGDYDIAGFAVGAVEKDAYITGERIAEGDVILGLASSGIHSNGYSLVRKIIKDNNLDLDAEFDNGKTLLDVVLEPTRLYVKSAKAILDAADVHGMCHVTGGGFIENVPRVFVTDGLYPEIDVTNIPRQKIFDLLQEKGSIDKMEMYNIFNMGIGFIFIVPREAVEKVRSAVNEEVFEIGHVVCGDKAIDIKGVI >NZ_CP021058|806524:816401|806993_808112_+|WP_086038465.1|DBSCAN-SWA MTLNKFALGDTIGIIGGGQLGKMMAQSAQRMGFKVAVLDPDERCPARFVAHHFVHAPYNDIAGLKALSRYSDVITYEFENINAEALEVIAKENHVPQGFETVHILQNRLSEKEAIARSGATVVPYRRIEGPADVDDAVREIGLPLVLKTVFGGYDGKGQLVVTEKAQLEEAYNMADGNVLVAEKRIALDREISITASRNLQGEVVYFPVQENVHRNQILFSTTVKQAHDYRAAAIAEVEKIIHKIHFVGTFTVEFFIDKAGRLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILSVLGYRLPKQIKLHSSAVMYNLLGQDLDLMEHLFPEHPEWHVHVYGKEARKENRKMGHITLLLDDDTDTYYPIYEELMK >NZ_CP021058|806524:816401|808811_809072_+|WP_012656598.1|DBSCAN-SWA MTKIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYTQVNDIRVGKVLYMTVDEASEQAVANVVNTLSEKLFANTVIEEYSYKIVEDEETK >NZ_CP021058|806524:816401|808108_808810_+|WP_086038466.1|DBSCAN-SWA MTLVYEGKAKRVYSTDEDHVFRIEYKDEVTAGNGAKKDSMAGKGRLNNLITSYFFERLARQGLESHFIKKLSDTEQLVKAVTIIPLEVVVRNYAAGSIVKRLGFDKGVQFKSPLVEFYYKEDALNDPIITDDHVKLLGIADDNDIAELKRQALIINDMLVKIMDEMNLQLIDFKIEFGKDQDGNILLADEISPDTCRIWDKDTKENFDKDVYREDTGSLIDTYTQFYNKLEAL |
10 | Synechococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1039848 : 1098228
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP021058|1039848:1098228|DBSCAN-SWA 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72 | Staphylococcus_phage(38.71%) | capsid,portal,holin,tRNA,integrase,tail,transposase,terminase,head,protease | attL 1063001:1063015|attR 1072850:1072864 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1327388 : 1374605
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP021058|1327388:1374605|DBSCAN-SWA 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72 | Staphylococcus_phage(27.5%) | terminase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1458345 : 1476320
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP021058|1458345:1476320|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP021058|1458345:1476320|1462531_1462984_-|WP_012657175.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRVLVQRVKEASVKSGDYYGSVQKGLLLLVGVHELSTESDADALADKIVKSRIFEDDAGKMNLSVQDIAGEILSISQFTLYADVKKGNRPSFTKAMQPQKAEQIYHYFNTQLKNKGLKVVQGCFGEMMDIALINEGPVTIMYESKDGKLV >NZ_CP021058|1458345:1476320|1469218_1470334_-|WP_012657180.1|DBSCAN-SWA MKITKITGYQIELPLKEPFVINYATYPHMPAFILAIETDEGITGYGEAVPDEHVNGEHVNAAFEIMQHVIAPALINRNPLNINAILDSLDSLIIHNSSIKAAVDIALHDILGKKAGLPLYELLGGKTKDRLSYAKVLSVKPFEQLKNDIDVLLEQGYNVIKVKLGGDVVSDCRKLQQILDYVDESIEVRVDCNQAWSSPKRVAQMVNQLDYPNLMWIEQPLSYNEIEGLNYLYNHMKVPLMVDESILNVKQLVQLNINTDLINVKLMKCGGIKAAIHIINYAEAHDIPCQIGSMVESSIGSAAGYHVAMSHHNVQSTELTGPLLFSEEIGNLKYEIPYVYLSDAPGLGIEIDQQSLNAITTRQFEMSETNE >NZ_CP021058|1458345:1476320|1465821_1468083_-|WP_086038889.1|DBSCAN-SWA 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14 | uncultured_Mediterranean_phage(27.27%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1655004 : 1732116
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP021058|1655004:1732116|DBSCAN-SWA 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85 | Staphylococcus_phage(50.0%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1751417 : 1785246
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP021058|1751417:1785246|DBSCAN-SWA 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33 | unidentified_phage(28.57%) | integrase,transposase | attL 1768101:1768129|attR 1774871:1774899 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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