Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015578 | Campylobacter lanienae NCTC 13004 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas9,cas1,cas2,cas4,c2c9_V-U4,DEDDh,WYL | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015578_1 | 195281-195369 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015578_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015578_1
>1.1|195305|41|NZ_CP015578|CRISPRCasFinder ACAAATAACTATTTAAGGTTATTTGGCTATTACTCTAAATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015578_1
The CRISPR arrays of NZ_CP015578_1 >merge|NZ_CP015578|1|195281-195369|CRISPRCasFinder GGTTAATTATTTCAAATTTTCGCCACAAATAACTATTTAAGGTTATTTGGCTATTACTCTAAATTGGTTAATTATTCCAAATTTTCGCC >NZ_CP015578|1|1|195281-195369|CRISPRCasFinder GGTTAATTATTTCAAATTTTCGCC ACAAATAACTATTTAAGGTTATTTGGCTATTACTCTAAATT GGTTAATTATTCCAAATTTTCGCC
>NZ_CP015578.1|WP_096013910.1|192308_192842_+|DUF2393-family-protein MSYFNLFHILVLIIIIVLFIGFTALIILKEKRVKVAISFLIVNVTVMSCITVISMMLIDKYTKVAVIENLMGKRTLINESISYSGIIRNVGYGYINSCVINIELINTPVEKLEASAFEARGFFDTYISGSRGPKSSQKGEFLIVKDLKSGEYKSFSFTMPYPSHFNNHSTNYTLNCK >NZ_CP015578.1|WP_096027901.1|191784_192309_+|DUF2393-family-protein MINNLSTTIKFYINNFGFYDYVAISWVILLFFALLVLALYLLFKKPLLALFIFIFDFGGLGAGLFYSLKFIDDTMRPRELVIAPLRQLSYSDTLIADINLTNTSKRAFKICRVKLSFHNIGQNRIQDFKFRLSPFHTQTTIIQDIMPSQMKEIKFIIKDFRPQNYNTILNSECF >NZ_CP015578.1|WP_100590368.1|191057_191795_+|bifunctional-phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP-diphosphatase-HisIE MSVIVNWDKIDGLLPVVVQEYSSGEVLMLAYMNQEALELTQSSNLAHYYSRTKSQIWKKGQESGNFQIVKSISLDCDNDALLLKVEQIGNAACHTGAKSCFFNHLNLEKNSDLDLNKTIKYDILDHLYHIALDRKLNPSDKSYISKLYSKSPDSYLKKMAEESCELNLAIKELQRFKLYSNLNLENFGEHKPNDPKYDIIYEAADLLFHMIIALADCDIHPNAILDELKRREGVSGIIEKNSRDK >NZ_CP015578.1|WP_096016677.1|189962_191048_+|hypothetical-protein MPADLNDYFNKKNSNSNSDDKKPNFNFKKPNVPNLSGGLGKFSGIIYALIAIIVILVVAKPFVVINSGEVGIKSTAGKFDPNPLQPGFHFFLPFIQEVRTVDTKVRQINYTSTEGRNEANLRGSGIETKDTISVLDSRGLPVSMDITVQYRLNPQNAPQTIAAWGFSWENKIIDPVVRNVVRNVTGKYTAEELPERRNDIAAAIDMGIRSDIDKQPNQPVELASVQLREIILPPKVKEQIERVQIAKQEAERTKYEVERANQEALKKAALAKGTAEAVKIEAQGRADAVKIEADAQAYSNSQIARSLTNNLLELKQIETQKGFNEALKTNQDAKIFLTPGGAVPNIWVDTKDKQKQISAQN >NZ_CP015578.1|WP_100590367.1|189027_189951_+|branched-chain-amino-acid-transaminase MALPEAEHIWYDGKLVKWHEATIHVLTHSLHYGNAVFEGVRAYMTPKGLAILSLEAHTKRLFESAKVCGIKIPFTQEEINQAHVNLLKSNTYTDNVYIRPIVFLGYGKMGVSHIGCPTNVAIAAWQWGAYMGEEALEKGIKVKISSWIKPAPFSMMAKAKASANYFNSQMANFEAREAGCDEALLLDPQGFISEGSGECFFIVKDGVIITPPNDTSLESITQKNVIQVVKDLGYTLLRQRITRDEAYNADEAFFTGTAAEVTPISSIDGRIIGNGKRGPISKALQEAYFDLVMGKNPKYENLLTYIN >NZ_CP015578.1|WP_096025813.1|187941_188934_+|UDP-glucose-4-epimerase-GalE MNILITGGAGYIGSHVLKALLEKNSDKITVIDNFYSGSRDALVALESVGKFEFIKCDLADTALLEEIFSTHKFDAIIHFAAYIEVFESMQNPLKYYLNNTANTANLINLALKFGVKKFIFSSTAATYGEPENGVVCENSPQNPINPYGNSKLMSEQILKDAAAANSDFKFGILRYFNVAGASLDGLIGQNYPNATHLIKVATQTITGKRANMSIFGRDYDTKDGTCIRDYIHIEDLADAHLAVLDYLDDNDSDIFNVGYGHGFSVLEVINMAKKISGVDFEVMDAPRRLGDPAILIADSSKLRNLTSWKPKKDSLETIISSALEWEKKIF >NZ_CP015578.1|WP_096023810.1|187452_187926_+|UDP-4-amino-4,-6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine-N-acetyltransferase MLERIIDKIKLVNFKDFNSSEIELVYKWRNDPKIAKYMVNKHIDLKEHLSFIKSLKNSSDKRYFLVYQSGEPIGVVSFVNISEISCEFGIYANPNLRQMGDILMSVIIDYAFDILKVSKILAKAYKDNLKAINLYQKFKFEIYENSDLMVYFCRKAK >NZ_CP015578.1|WP_096013903.1|187235_187472_+|hypothetical-protein MRKLAILCLVVAALNAVIYYEPKTKEQKEGYKYGQTMRMLGFEKWECNKFKNIDEVKFEWCEYGWVDKSEEIDARKDY >NZ_CP015578.1|WP_100591035.1|186477_187236_+|DNA-ligase MLLKEYKDENLTGWVMSEKYDGVRAIWDGKVLKSRSGKIINAPTKFINELPDFALDGELWSGVGEFEFIASTVLDETPDDRAWDKIKYMVFDLPKFDGNLYQKMDYLNNFLKANPSEFIRVIEQIEIKDNNHAFAFLDELVASGAEGVVVRDPNAKYISGRSSSILKLKKWHDSECEIVAINEGKGRLKRTMGSLNCVDIFSKIEFKIGSGFSDEMRANPPKIGTIITYKFQNLTKNNKPRFPIFLRIKRSE >NZ_CP015578.1|WP_096027923.1|185615_186428_+|3'-5'-exonuclease MMSGYICVFDCETIPDSDSLRVAYGYDGDDESVAKMALKAQKEQSGSEFLPVCFHKVVTISAVIADEFGRFKRVSTIAGSSEKEKISEFIKFINEHNPRLISYNGRGFDLPMLMIRAMRYNLDASEYFNTNDRANGKDKWCNYRSRYDGIFHLDLLDHISDFKAVSGLKLDLLCSSLNLPGKYDVCGDEVMSLYYNNKQDKIDEYCESDVLNTYWLFLKYELLRGKLNIDDYIDYLNLMSEYLKDKKPDMSYTPVFCQYIQNEFDRIKVD >NZ_CP015578.1|WP_096013912.1|195551_195752_+|4-oxalocrotonate-tautomerase-family-protein MPIINIKLADPMPSRQKLDEIAVKITDIMVNDLGKKPERVVINFDEIRSDATYFGGKSVQAMKEGK >NZ_CP015578.1|WP_100590369.1|195751_196261_+|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MEAKNPNFTQEDLERKVTLKAGDKAPEFELENADGVKISLKDFKGKNVILYFYPKDNTPGCTTEACEFSANYDEFIANDCVIVGISPDSPKSHAGFTLKHSLRHILLSDMDKEVAKAYGVWQVRKNYGKEYLGIVRTTFIIDKDGKISKVYKSVKAAGHALKVLDELTK >NZ_CP015578.1|WP_100590370.1|196267_197341_+|epoxyqueuosine-reductase-QueH MLVHICCSVDSHYFIAELKKLYPNERIIGYFYDPNIHPYSEFLLRFQDVKRSSKKLGVEVICGEYEYEEWLKGTKGLEDEPEKGKRCAYCFDFRVGNSAKEAIKLGCKKITTTLLMSPKKDFKQLESALNNAIKGTNLEAIAVDLRKNGGTQKQFELAKNDKLYHQNYCGCIYGLIKQRHNETVIDELCEPLGAQIQPGSIGYRLKLYKKVRKLEKSKIKFDLIREKILNYRLRFGSLKADNIAIPSYFLFYSHFRLKSSKFSIEKSSNFVAINKDDIKLISLAKFNKLGRFKYKNTLELIYNPPKLNQELKIRKKIVKSKFDISPIIVIDEIKTAKYTLQADSEIFPASIEAIKVK >NZ_CP015578.1|WP_096015425.1|197441_197888_+|3-hydroxyacyl-ACP-dehydratase-FabZ MIDVVEIQKILPHRYPFLLIDRVVELEPNKHIKGYKNVTIAEQVFQGHFPGHPIYPGVMIIEGMAQAGGILAFKSIAEKEQINAEDKVVYFMSIDGAKFRSPVRPGDRLEYRLEVLKHRGNIWVLGGQAYVDDTLVAEAELKAMIVDK >NZ_CP015578.1|WP_096016180.1|197901_198687_+|acyl-ACP--UDP-N-acetylglucosamine-O-acyltransferase MQIHSTAVVEDGAILGDGCVIEPYAFVSSKAVLGDNVIIKQGARIIGDTHIGKGGKIYSYAIVGDIPQDISHSIEDTGGVRIGDNVTIREFATINSGTKKGDGYTNIGDNNFIMAYTHIAHDCRLGDGIILANGVTLAGHVVIDDYAVIGGLTPVHQFVHIGESCMIAGASALSQDIVPFCLAEGNRAYIRSLNLVGIRRRFDKDIVEQINKAYKFLFRSGGGLKDRALELLDQNPTLEARKMCEFIINTKRGIPLDKGRD >NZ_CP015578.1|WP_096022965.1|198686_199901_+|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit-ClpX MARKCSFCGESEADDRKLLANESDSSFICEFCVDAAYNAVHGEEIGQRASLNANYKDITPKILKGVLDDYVIGQERAKKVFSVGVYNHYKRIFKQHSIDDDTEISKSNILLIGPTGSGKTLMAQTLARFLDVPIAICDATSLTEAGYVGEDVENILTKLLNAAGGDVERAQQGIVFVDEIDKIARMGENRSITRDVSGEGVQQALLKIIEGSVVNIPPKGGRKHPNQDFIQIDTTNILFVCGGAFDGLKDIIERRLGKNVLGFNQEKRGKNEKSNLLSLVEPDDLVHFGLIPELIGRLHAITTLNEITIDDMVNILTQPKNALLKQYEKLFAIDGARLKFEDEAIKEVANQAIKRKTGARGLRSIMEDVMIDIMYDLPELNGYDVIISKSVIDGEAKPLLMKAK >NZ_CP015578.1|WP_096013918.1|199910_200945_+|rod-shape-determining-protein MILDQLVGLFSSDMGIDLGTANTLVLVKDKGIVINEPSVVAVQREKYGKQKILAVGHDAKEMVGKTPGDIEAIRPMRDGVIADFDMTEKMIRHFIEKTHRRKTFLRPRIIISVPYGLTQVERKAVRESALSAGAREVFLIEEPMAAAIGANLPIREPQGSLVVDIGGGTTEIGVVSLGGLVISKSIRTAGDKLDASIVNYVKEKYNLLIGERNGEEIKIKIGSAMQLPKELSMVVKGRDQVSGLLSRIELTSEDIREAMREPLKEIADALKTVLENMPPDLAGDIVERGVVLTGGGALIRGLDKYLADIVKLPVYVADEPLLAVARGTGKALEEIGLLQQLINE >NZ_CP015578.1|WP_096017643.1|200937_201684_+|rod-shape-determining-protein-MreC MNKIKFILIIICLGFISFYLSDYARSVVINSTNFVLSLYQDTRDFIAQTIEEHFNQADEIKALREQNAELEHSATLLSAFAYKLDALLSEQNSTRFNPDVKLVRALSYMNIGDHDKIWIDFDEFDEDRIYGLISQGKTAGIVVNKDGNPLALLQTDPKSTFSVSIGEEHIAGIAMGNGSGITIKFIAQWLNPKVGDEVYTSGLDGIFFGGVPVGKISKVYEEELYKSAIVETDLKIQVPSYLYIITNQ >NZ_CP015578.1|WP_100590371.1|201840_205095_+|carbamoyl-phosphate-synthase-large-subunit MPKREDIKTILLIGSGPIIIGQACEFDYSGTQAAKTLKELGYRVVLINSNPATIMTDPDFADATYIEPITKESISRIIQKESVDAILPTMGGQVALNVAMELYENNMLGNVKFLGANPEAIKKGEDRVAFKEAMIKIGMDLPKSMYAYNMQEALNAANEIGFPLIIRASYTLGGAGSGVAYNIDEFRDIAESGIEASPINEILIEESLLGWKEYEMEVIRDRADNCIIVCSIENFDPMGVHTGDSITIAPALTLTDKEYQYMRDASFKILREIGVDTGGSNVQFAINPKNGRMTVIEMNPRVSRSSALASKATGYPIAKVATMLAVGFTLDEIKNDITGTPASFEPVIDYIVTKIPRFTFEKFPGSNPYLGTAMKSVGEVMAIGRSFKESVQKALCSLEKDYSGFNHLSLSDDELVFGLRNAHENRILYIAQAFRNGKSVEEVYELTKIDRWFLTQIYEIIEFENLIDMDILNDKELLRKAKTWGFSDKMIAYLINYKDNLELSQNDIYYARMRHKIALEYSEVDTCAGEFLALTPYLYSSTNITPNLPNLPLNSNNKKVLIIGGGPNRIGQGIEFDYCCVHASYALRDLGITTIMYNCNPETVSTDYDTSDILYFEPIDFEHLRAVIERENPDGVIVHFGGQTPLKFSKRLSMIGAKIIGTTARVIDIAEDRKKFSEFIRSIAVAQPDNDTATSESEALEKAGKIGYPVLVRPSYVLGGRAMRRVHSESELKEYMSEAVKVSNNSPVLLDKFLQDATELDVDAISDGKDVYIGAIMEHIEEAGIHSGDSASILPPQNLSQDIIDQVEKCTKDIALKLGVIGLMNIQFAVYDNKLYIIEVNPRASRTVPFVSKATGLPMAKVATRVMWQGNLKEALEFYDQFKVVKFDGEIYKPSLNGVVCVKESVFPFNKLSGADLILGPEMKSTGEVMGISDSFEKSFVKSQIAAKNNLPSGGTVFISLADADKNRGIELAKKFENLGFEIVATGGTYKTLAQAGVKCEMVYKISEGRPNIEDRLKNGDIALAVNTSDNKSSTSDAVKIRQAVLRFKIPYFTNMNAALVAASSISSNEAALEVKSLQEYLKK >NZ_CP015578.1|WP_141082139.1|205405_206386_+|hypothetical-protein MKEKLIRFLRIILFDAFKSRWAWRRVPTQWYFKYMTSKRKLNIINTKLPPEYEMIYKKSADPFYKDTLVIVFSQGSFWSGGSYFKSNFIDIKYTSEYINTFLKSKCGYGNVNFLHHIDELVNYLIERIREFGYTRVIIFGGSSTGRAALLYSQILSGKCAFTQFYTIACAPASDHSEKIYNISDVHIKDHIVNIRKYGPVDVLKHKLQLPRQNLFIYVIIGKFNERDYKNAQSFSDCKYLKIFDDIKTHIHQVTFMMFLDHKYVDDNKKMLNLVRRHQGAEKIDEDNNKAVEIVNQIFYQDGKSLQNLNILIDELITTGKITSLYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015578_2 | 262649-264001 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015578_2
|
18 spacers
spacers of NZ_CP015578_2
>2.1|262686|37|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAATTTGTCTAGGCTAAAATTAGCTACTATATCTG >2.2|262760|35|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCTACATTTTCATTATAAGCTTGCTCTAATTC >2.3|262832|34|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGTGATGATTTTCCAAAATCGCTTAAAATACC >2.4|262903|37|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCCAATATTTGCCTTTTAAAACATCCTTAACTACAT >2.5|262977|35|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCAAAGTGGAGCCTATAAAAATACAATTAGAAAC >2.6|263049|37|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAATGCGTTTATTTTCTCTCTAGGGCTTGATTTTT >2.7|263123|38|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATTTATGTTAAATGGATATTCCGTGAGCCACATTAA >2.8|263198|35|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAAGCAACATTAGCTCTAAGAAAACCAGTATCA >2.9|263270|36|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATATCACTATGCGAGTATATGTAGAAGCTAAT >2.10|263343|37|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGATATAAGCTCCAAAATACTCTAGGCACGGACGCCC >2.11|263417|35|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAGATAATTATTGCCCCCATTCCCAAAACTCCA >2.12|263489|37|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCATCGTCACTCTCTCGCCTTTCAGCAAAATTTGGC >2.13|263563|35|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATGGGGAGTAAAAATCAAATAGCTAAAGAGCT >2.14|263635|35|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCAATTGATGGGGTAAGTGTGAGTTATCAAAATA >2.15|263707|37|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAAAGTCCGTCAAGAAAAAATGTCAAAAAAGTTAA >2.16|263781|35|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTAATTTGTCCCGCACTGCCTAAAGCTTGAGAT >2.17|263853|38|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTTCTTTAATTACTTCACGTCTGTCTAGCGTTTCA >2.18|263928|37|NZ_CP015578|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATTAAGCTTCATACCAGTAAGACAGGGGGATATAT |
cas4,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015578_2
The CRISPR arrays of NZ_CP015578_2 >merge|NZ_CP015578|2|262649-264001|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACAATAATTTGTCTAGGCTAAAATTAGCTACTATATCTGGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTTTTCTACATTTTCATTATAAGCTTGCTCTAATTCGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACATAGTGATGATTTTCCAAAATCGCTTAAAATACCGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTCCCAATATTTGCCTTTTAAAACATCCTTAACTACATGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACCTCAAAGTGGAGCCTATAAAAATACAATTAGAAACGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACACAAATGCGTTTATTTTCTCTCTAGGGCTTGATTTTTGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTCATTTATGTTAAATGGATATTCCGTGAGCCACATTAAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTAAAAGCAACATTAGCTCTAAGAAAACCAGTATCAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTTAAATATCACTATGCGAGTATATGTAGAAGCTAATGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACGGATATAAGCTCCAAAATACTCTAGGCACGGACGCCCGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTATAGATAATTATTGCCCCCATTCCCAAAACTCCAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACAGCATCGTCACTCTCTCGCCTTTCAGCAAAATTTGGCGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTATATGGGGAGTAAAAATCAAATAGCTAAAGAGCTGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACCTCAATTGATGGGGTAAGTGTGAGTTATCAAAATAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACATTAAAGTCCGTCAAGAAAAAATGTCAAAAAAGTTAAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTGCTAATTTGTCCCGCACTGCCTAAAGCTTGAGATGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAACTAATTTCTTTAATTACTTCACGTCTGTCTAGCGTTTCAGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAATATATTAAGCTTCATACCAGTAAGACAGGGGGATATATGTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC >NZ_CP015578|2|1|262649-264001|PILER-CR GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AATAATTTGTCTAGGCTAAAATTAGCTACTATATCTG GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTTTCTACATTTTCATTATAAGCTTGCTCTAATTC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATAGTGATGATTTTCCAAAATCGCTTAAAATACC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCCCAATATTTGCCTTTTAAAACATCCTTAACTACAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAAAGTGGAGCCTATAAAAATACAATTAGAAAC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ACAAATGCGTTTATTTTCTCTCTAGGGCTTGATTTTT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCATTTATGTTAAATGGATATTCCGTGAGCCACATTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAAAAGCAACATTAGCTCTAAGAAAACCAGTATCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTAAATATCACTATGCGAGTATATGTAGAAGCTAAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC GGATATAAGCTCCAAAATACTCTAGGCACGGACGCCC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATAGATAATTATTGCCCCCATTCCCAAAACTCCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AGCATCGTCACTCTCTCGCCTTTCAGCAAAATTTGGC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATATGGGGAGTAAAAATCAAATAGCTAAAGAGCT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAATTGATGGGGTAAGTGTGAGTTATCAAAATA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATTAAAGTCCGTCAAGAAAAAATGTCAAAAAAGTTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TGCTAATTTGTCCCGCACTGCCTAAAGCTTGAGAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAATTTCTTTAATTACTTCACGTCTGTCTAGCGTTTCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAT ATATTAAGCTTCATACCAGTAAGACAGGGGGATATAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC >NZ_CP015578|2|2|262649-264001|CRISPRCasFinder GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AATAATTTGTCTAGGCTAAAATTAGCTACTATATCTG GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTTTCTACATTTTCATTATAAGCTTGCTCTAATTC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATAGTGATGATTTTCCAAAATCGCTTAAAATACC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCCCAATATTTGCCTTTTAAAACATCCTTAACTACAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAAAGTGGAGCCTATAAAAATACAATTAGAAAC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ACAAATGCGTTTATTTTCTCTCTAGGGCTTGATTTTT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCATTTATGTTAAATGGATATTCCGTGAGCCACATTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAAAAGCAACATTAGCTCTAAGAAAACCAGTATCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTAAATATCACTATGCGAGTATATGTAGAAGCTAAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC GGATATAAGCTCCAAAATACTCTAGGCACGGACGCCC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATAGATAATTATTGCCCCCATTCCCAAAACTCCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AGCATCGTCACTCTCTCGCCTTTCAGCAAAATTTGGC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATATGGGGAGTAAAAATCAAATAGCTAAAGAGCT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAATTGATGGGGTAAGTGTGAGTTATCAAAATA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATTAAAGTCCGTCAAGAAAAAATGTCAAAAAAGTTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TGCTAATTTGTCCCGCACTGCCTAAAGCTTGAGAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAATTTCTTTAATTACTTCACGTCTGTCTAGCGTTTCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAT ATATTAAGCTTCATACCAGTAAGACAGGGGGATATAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC >NZ_CP015578|2|1|262649-264001|CRT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AATAATTTGTCTAGGCTAAAATTAGCTACTATATCTG GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTTTCTACATTTTCATTATAAGCTTGCTCTAATTC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATAGTGATGATTTTCCAAAATCGCTTAAAATACC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCCCAATATTTGCCTTTTAAAACATCCTTAACTACAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAAAGTGGAGCCTATAAAAATACAATTAGAAAC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ACAAATGCGTTTATTTTCTCTCTAGGGCTTGATTTTT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TCATTTATGTTAAATGGATATTCCGTGAGCCACATTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAAAAGCAACATTAGCTCTAAGAAAACCAGTATCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TTAAATATCACTATGCGAGTATATGTAGAAGCTAAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC GGATATAAGCTCCAAAATACTCTAGGCACGGACGCCC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATAGATAATTATTGCCCCCATTCCCAAAACTCCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC AGCATCGTCACTCTCTCGCCTTTCAGCAAAATTTGGC GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TATATGGGGAGTAAAAATCAAATAGCTAAAGAGCT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC CTCAATTGATGGGGTAAGTGTGAGTTATCAAAATA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC ATTAAAGTCCGTCAAGAAAAAATGTCAAAAAAGTTAA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TGCTAATTTGTCCCGCACTGCCTAAAGCTTGAGAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC TAATTTCTTTAATTACTTCACGTCTGTCTAGCGTTTCA GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAT ATATTAAGCTTCATACCAGTAAGACAGGGGGATATAT GTTGCAAATTATACCACAATCCAACTTGGTTTGAAAC
>NZ_CP015578.1|WP_100590404.1|261877_262444_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MILVSHIRQFIFCPRIFYFYNFCHFSPKYPEYVKHGSEFHAYQDELFKSRKFLKFRLNFKKAHKNLYLENEKFGGVLDLVFECDDEIIVVEFKNQSKPILSKGAKMQLIAYSKLASKHFKKPFHRVILCYSNNLKFKIFEIYKEDLAYFDKTLTQIQDLLEKGYFPQSSASITACAQCEFKNYCDDRE >NZ_CP015578.1|WP_141080632.1|261598_261868_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MDYLIAYDIEDNKNRSKVFEMLKDFGLRAVQKSVFFGELSNAEKIEIKIFLSRYCDKNDKVIITKFDLKFEDLIGYEKSDFEKLEFHII >NZ_CP015578.1|WP_100590403.1|260643_261597_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKHLVLNSFGLFLGLKSQRLVVYKNREIIKEIALKSLKTISINSNGINISSDLVFACSIRGIKIFYANFTNFSATHTLYEHKGVNVLKEQFASATNGKDIILAKELIIGKIKNQRSTILYFSRNFTAKQKENILASFQKALQILKNKNLNKDEIFGIEGSVANAYFEYLKQNGLFADSFEIRTKRNSTEITNQALNYGYAILLNFVYKSIINAGLNPYFGVLHSMRSSKPSLALDIMEEYRSFVVDRNIIKLRSSLKNSLEQDDKRLIASNILNTMRKKLIYNHRKLTLESIIQRQIYKISAFFCDNKKYKSYIFRW >NZ_CP015578.1|WP_147525226.1|258494_260663_+|hypothetical-protein MEKIVEHNSNFSFKAPFDTSTISTNFNYLTQLGDIIFDEKSRGFAKTCKFHTLENLIRSSAKSAIASRLASNSARLINGKIEMYLDRLAHEIIKKIDFTDIYNIQINVEMNKFNFESNLSKLGLAKERQKDEESFICPYSGAKISQINCEYDHILPRSKGLYNSLTNLIPTSSTSNQIKSNTKYLLSNLDENYLKYIFAKTQTTDLNSFKTFIDENISKIDENDFTNFRNLSFFEQIAFRHALFLDTDDNSFKKALRLLKLDTIKTHSNGTQKRFINILIEKISKLTKSEIDINFIDSKLVSSTRKDLAQNDTSIAKQEFQDSHSHCVDASIVFYLANSKIIKGQIEPDYDYFKDIYPKNSDIILPQSKQYLELNQKSQKSKKLFDDSVYSLVYEGKFDEKQKKILTQYELLKENGFVDTHKVFELIFKSFKDKDTSVLKDIKFLDNYLKSYIRKDIFSIFFNEKGELKEAKELKSATKNIDKFYTILSQNQDKIYTIKLDEKAKEKKTLQRNKVIELYKEIFYTKNAKPRARDKNRVTFSLPVYAKDTKYAIKRNSGFAGLKNKDIATKTYIDIDSREILKIPYYSTNVLPIRISDILVILSLQSKNAKQIYKVKIADNLPKQIISLDFILSQANRHEVLVSFDKSKLEIQNINDDNDENAFIQKYLCDDFKEFLGKPRDNKIEIIKNNDDILAIKYCVESTSKANKEIIVKALSDEAPSA >NZ_CP015578.1|WP_100590401.1|256917_257883_+|hypothetical-protein MKSLSINIDMGAINNGIFIATCQDDKIIDKNAFDIKFDKGKLNFSKIDRTLRRHTRRSFDRDRFVLRLLGEILPLENLSNNQKEKLFGLFKNRGFNYLNVNFNAEIDSDSLEILNALDGYYFKDCRVLSDFENSISKIFNELENDEILVFLDDQAQILNQAKEQKNKILNKNINAILEFLESIKNESFKNNKHRKSYLKDIKNEIENSFKDIILKLKIFKNSQEFYYFIGNIANFQTRILRRYFNAKFDLVFDDAKLKKNILRNINYLDFISTDEKANKSRILENLNAFSTLEFLKNTEPIITIHLMKTPKTKNLNLAKPL >NZ_CP015578.1|WP_100590400.1|255513_256074_-|c-type-cytochrome MKISNLIYLSIIPMLAWGQDSYIIEADGEFGKELKNLVEKHAKDNNLSVKIYEKSDSTEDYETGRFLNIGVDKRANYNSSKGKELYDKQCKSCHGDKGSKKAMGVSERLSDISGDEIADSIAGYRGDAQYGGNLKYLMAPIATKLNLRDLGHIIAYLKGDNAFIVDDDSDSGEMRTTPTKQGSYLE >NZ_CP015578.1|WP_100590399.1|254374_255493_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLSLIALAAAIAISSAATKEIKIGVIMPITGSVAAYGQTAWAGIKLANQLEPTLKNGDKISLVLVDNKGDKVETATATTRLVSEDKVSGLIGAMVTGNTQQVLQIADEKKVPMIAPAATADKLLDRSKYGARVTFMDSFQGTSFASWAIKQDMKNAILIIDQSTSYSIGLARAFKKEFEKQGGKILKELKISSGDKDFKAIVSQINSLNPDLVYMPFYHPEAALLVRQARQIGIKSQFASGDGVSNDTFIELAGDASNGYLYTDAFDSSNPPTAKSKAFIEAYTKANGNGNVPGFSALGADSYYLMIDAMNRCADATDKECINKEIKNTKNFEGVSGIINIDKKGNAERSIVIKEIASGKAMYKDTVNPN >NZ_CP015578.1|WP_100590398.1|253247_254186_+|thioredoxin-disulfide-reductase MLDVAIIGGGPAGLSAGLYATRGGLKNVVMFEKGMPGGQITNSSEMENYPGVATVMDGMSFMSPWLEQCTRFGLKHEMAAVEKVSKNSDGSFTITLEGGKTEQAKAVIVCTGSTPKRAGFKGEDEFFGKGVSTCATCDGFFYKNKEVAVLGGGDTAIEEAEYLTRICSKVYLIHRRDTFRAAPSSVEKVKKNEKIELILNATIDEVYGDSAAGVKGVKVKLADGSIRDLAVPGIFTFVGLNVRNEVLKDGDKFICDILPSGQVKVDLKMQTSIPGLFAAGDLRQDAPKQVVSAAADGAVAALSAMSYIESLH >NZ_CP015578.1|WP_086287782.1|252814_253129_+|thioredoxin MGKYIELTAENFNIAKEGVALVDFWAPWCGPCRMLAPVIDELAEEFDGKAKICKVNTDEVQDLAVEYGVRSIPTLLFFKDGEIKETLIGAQSKTAIAEKLNSLL >NZ_CP015578.1|WP_096018522.1|252304_252643_+|YraN-family-protein MGLKEYLFGHAAEKKAAKYLATKGYKILGLNYKTKFGEIDIIATSRSTLHFIEVKASTKDYETIYRVTKSKLEKIIKAIDFYILSNGLDMPYQIDLVCINGDEIELVENISY >NZ_CP015578.1|WP_100590405.1|264104_264458_-|hypothetical-protein MQNTYLDRVSEALTLLNRLDNFKPPTNGNGNAVKSYSIKLFILLFTIAKHEGETQAFYAELLGWTTANTSIHARYLYDNGFISKAYDDRDTRNLARKLFITPKGREFIENLLRKERN >NZ_CP015578.1|WP_100590406.1|264469_265441_-|hypothetical-protein MAIIKAQGGIIEAHHADPIWVREHFKHDIELLRTGELPKKSEVEIAKANELLLRIWAVWGIALLACIAYGYNPWFIAVIVIGFIFCIGATGAISGHNSGRSLWLTARNNGFRYDSDSDVTYIAQLQLMGLSLIPKELKEKAEADCRILKGHTMYRYPITYEKIHLSRRCNNWLNAKISFKLVDRVRTIEVTTKDRKVVIEIAKLKKYEKYIQGMGGFTNNFEMDGRSFNKLFSSKTVYNNASISLYTLYERHKGELGIVKKPQAFRELHITIHPKTGDNNYRLEKTVEDWEIVELVDERFNPDVYRALEDDKALDKAIKAELI >NZ_CP015578.1|WP_096014874.1|266001_266253_+|hypothetical-protein MNFKQRKKNEKKFSDWCFSSWIFNGCATLTEAYSDTVNSINETAREINAKNEQNRNKNNKSTNTNNKYEALSEDGDTGFGTVY >NZ_CP015578.1|WP_167368916.1|266293_266449_+|hypothetical-protein MIELFKNIGLGIFVNGAFAWQFGEATVKGFLAIIEGIAIMAIAIYIEKRSK >NZ_CP015578.1|WP_096017684.1|267145_267787_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKALNLSHKFDYLLFNDINLDIRPATTTAIMGVSGSGKSTILHILSTLLSPTDGEVIYNDKSLYKLSSDELLKIRRYDFGIIFQAHYLFKGFNGFENIELATILSGQKINLNLLKALKIDKVVNQKIGELSGGQQQRVSIARVLAKNPKIIFADEPTGNLDQTTAKEVMSVIFDYVKTNNAALVLVTHDKDIAKLCDIKYQLSNQHLTQYQI >NZ_CP015578.1|WP_086226836.1|267789_268854_-|elongation-factor-Ts MEISANMVKELRESTGAGMMDCKKALQEANGDMQKAVDILREKGLGKAAKKADRLASEGLVSVVVSSDNKTATITEINSETDFVAKNATFVDLVKNTTLHVQTNAITTIDELKESSIGGVKFEEFFQSQIATIGENLVVRRFETIKASKNGIVAGYIHSNSRVGVLIGAACDSEATASKIGDFLRNLCMHAAAMKPQVISYKEFSPDFVEKEYLALKGELEKENEELVRLKKPLHKIPEFASRAQLSDEVIAKATEKLKEELRKQGKPEAIWDKILPGQIERYIADNTQLDQRLTLLGQFYVMDDKKTIEQVIAEEAKKLGGEIEIVSYVRFEVGEGLEKKTEDFAAEVAAQMA >NZ_CP015578.1|WP_086225552.1|268853_269630_-|30S-ribosomal-protein-S2 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
78739 : 85866
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015578|78739:85866|DBSCAN-SWA GATGAAAAAGTGCTTTGATATTAATAAACTAAATTTACATTATGGGACATTTCACGCATTAAAAAATATCAATATGGAGATTGCTAAAGGCGAAGTTACAGCCTTTATAGGCCCTAGTGGGTGTGGTAAATCTACATTTATCAAAACCCTTAATCGTATGAATGATTTAGTAGAGGGTTGTAAGATTGAAGGGGGGATATTGTTTCATGATAGGGATATTTATAGCAAAGATTATGATATAAATTTGCTTAGAAAGCGTGTAGGGATGGTATTTCAAAAGCCAAATCCATTTGCTATGAGTATATATGATAATATCACTTTTGGCCCTAAGACTCATGGCATAAAAGATAAAGATACCCTAGATGGCATAGTAGAAAAGAGCTTAAAAGACGCTGCTTTGTGGGATGATTTAAAAGATAGATTATATAGCTCGGCTTTAGGGCTTAGTGGCGGCCAGCAACAAAGATTATGTATCGCTAGAACCTTAGCTGTAGATCCAGAAGTTATCTTGATGGATGAGCCAACTAGCGCACTTGATCCTATATCCACGGCCAAAATAGAGGAGTTAGTCTTAAAGCTCAAAAAAGATTATACAATCATAATAGTAACTCATAATATGCAACAAGCTCACAGAATTTCGGATAAAACGGCGTTTTTTTTGATGGGCGAAGTGATCGAATATGATGATACAAAAAAGATATTTAACAAACCAAAAAACAAAAAAACTCAAGATTATGTTATGGGGAAATTTGGGTAAGTTTGCTATAATTTGGTAAATTTAAAGGAATTTAAGTGATCTATGTCTTAGAAGATGAAGGGGCGATTTTAGATCTTATTTGCTATGCTTTAAAATCCCAAAATATCCCAGTAAAAGGCTTTAGTCTAGCTAAGGATTTTTATAAAGCCTTAAAAGATCAAATCCCTCAAATTCTAGTGCTTGATGTTATGCTTCCAGATGGCGATGGATTTGAGATTTTAAAAGATCTTAAAAATAGTGCTAAATATAAAGATATTTGTGTTTTGATGCTTACAGCTCTTGATAGTGAGATAAATAAGGTCAAAGGCCTTGATCTAGGTGCTGATGACTATATCGCAAAACCTTTTGGAGTGATGGAGCTTTTGGCTCGTATTAGGGTGATTTCTAGACGCAAAGCCAAAGAAGAGCCAAATAGCGATATAAGCTTTAATGGATTGGAGTTTTCATATAAAAATCATATTGTTAAAGTTAATGGCAAGCCTTTGGAATTAACCTTAAAAGAATTTGAATTACTTGGGTTTTTATTACAAAATCCAAATCAAGTTTTTAGCCGTGATATGCTTTTAGAGATGATATGGGGCTATAGCTATGATAAAGAGAGTAGAACGATAGATATGCATATTAAAACACTAAGAAAAAAGCTTGGTAATATGTCAGATATGATTAGGACAATTCACGGAGTTGGTTATAAGTTAGTAAGAGAGTAGGATGCAAAAAAGGGTATTTTATTTCATTATTTTTTCTACATTAGCACTAGCTTTATTTATCAATATATTTTTGATATTTTCTATAGAATCTGTGCTTAAAAATGAGCTTTTTGATAGATTGAAAAATTATGCTTATAGCATTAAAAGTGAGGTTTTATCATCTATCCAAAATGGCTCTATACAAAGCTTAAAAGACCTAGATGAGACTTATAGAATTAGCATAATTGACCAAAATGGAGTTGTGATATATGATAATTTTGCCAATAATCTAAATTTGGATAATCACAGCAATAGAGCCGAGTTTAAAGAGGCGATAGAATATGGAGAATCCACAAATATACGCTATTCTAATACACTTTTAAAGCGAAATTTATATTATGGGCTTAAAATCTCTAATGAAAAAGGGGAATTTGTTTTAAGAATTTCAAAAGAACAAGATTATCTATATGCGATATTTATGAGCTTTATACCTTATATTGTTGCTGAGATTATAGCGGTGCTGATATTTTCATTTTTATTAGCTAAATACCTTACGCATATAATTTTACGCCCAATTTACAATATAGATTTAAAGAATTTAGATGAGAATTTACCATATCCAGAGCTTAGAGTTTTGATAGAAACTCTCAAAAAACAAAACAAAATTATCAAAAGCCAATTTAAACATCTAAAACAAAAAAGACAAGAGCTACAATCTCTAACCAAAGGTATGAAAGATGGCCTTATCATCATCAATCGCTCCGGAGAGATACTAAGCATAAATCCAAGCGCTCAAAAATACTTTGCTAATTTAGCCAAACATACTAATATATCTCAAATTCAAAATGATCTATTTTTAAAGCTTTTATTACAAAATTTAAGAGATTTCAAAGATGGCAAGATATCTTGCGAGATAAGAGAGCAGATAGTGTTTATGCAAGAGACTTTGGTGGAGTGTGAGATTGTCTTTTCGCCGATTTTTTCGCAAAAAGGCAAATTCAAAGGGCTAATTATCGTTATTTGCGATATTACAGAGCTTAAAAGAAACCAAAATTTAAGCAAAGAATTTAGCGCTAATGTAACTCACGAGCTTAAAACCCCGCTAACTTCTATAATGGGAAATGCCGAGATGATTAGAAATAATCTTGTAAAAAGTGATGATATTCCGCATTTTATAGATACAATTTATAATGAATCTAAAAGATTATTACACCTAATAGAAGATATTTTGAAATTATCATTTTTAGATGAATCCCATACCAAAAATATCCCATTTTCCAAAGTAGAGCTTAAAAATCTACTCTTAAAAGTCTATTCTAACTTAAAAAGCGTAGCCAAAAAATATGATATTGAGTTTAAATTTGAGCTTGAAGAGGCCTATATCCACGGCTCAAAAGAGCTATTAGAACACGCTATTTTCAATCTATGTGATAACGCTATTAAATACAATCACCCAGGTGGCTATGTCAAAATCAAGATAAGAAATTTGCAAGATTGCGTAGAGCTTAGCATTAAAGATAGTGGCATAGGAATTGAGCCAAGCTCACAAGAGCGGATATTTGAGAGATTTTATTGCGTGGATAAAAGTTATAGCAAAAAAGTAGGTGGCACAGGATTAGGACTATCAATAGTTAAATCAGTTTTAAATATGCACCACGCCAAAGTAAAATTAAAAAGCCAAAAAGATATAGGAAGTGAGTTTATAATCATCTTTCAAAAATCTTAGTTAAAAACCACTAAGCAAATTTAAATAAATTTCAAATTAATATCCAAATTTTATCGGTGTATTAGCTTTTTTAAGATACAATTACCCCATTTGTATAATCAAAATCACAAGGAAAATTATGGACGAAAATAAGAAAAAAAGTCTTGATTTAGCCCTTAAACAGATAGATAAAGCTTTTGGCAAGGGGACTATTTTAAGACTAGGAGATAAGGAGATTGAGCCTATTGATAGTATTAGCACCGGCTCAATAGGTCTTGATATCGCCCTTGGAATTGGTGGAGTACCAAAGGGTAGAATTATCGAAATTTACGGCCCTGAAAGCTCTGGTAAGACCACTCTTACATTGCATTTGATAGCTGAATGCCAAAAAGCTGGTGGCGTGTGTGCTTTTGTGGATGCCGAGCATGCTTTAGATGTCAAATATGCCAAAAATTTAGGTATAGATACTGATAACTTATATATATCTCAACCTGATTTTGGCGAACAAGCTCTTGATATTGTAGAGACTCTAGCTAGAAGTGGGGCAGTGGATCTAATCATAGTTGATAGCGTAGCAGCACTCACGCCAAAAAGCGAGATAGAAGGCGATATGGGAGATCAGCATGTAGGTCTTCAAGCAAGATTAATGAGTCAAGCCTTAAGAAAGCTTACTGGTATCGTCCATAAAATGGGAACTACGGTTGTATTTATCAACCAAATTCGTATGAAAATTGGCGCTATGGGTTATGGCACGCCAGAGACTACAACAGGCGGTAATGCGCTTAAATTCTACGCTTCAGTTCGCCTAGATGTCCGCAAGGTCGCCACACTTAAGCAGAGCGACGAGCCAATTGGAAATAGAGTTAAGGTAAAAGTAGTTAAAAATAAAGTAGCACCACCATTTAAAGTAGCTGAATTTGATATAATGTTTGGCGAGGGAATCAGCAAAGAAGGTGAGATCGTAGATTATGGAGTTAAGCTAGATATAATCGATAAAAGTGGTGCTTGGTTTAGCTATGAAAGCACCAAAATAGGCCAAGGTAGAGAAAATGCCAAGGCGTTTTTAAAAGAGAATTTAAATATAGCCGAAGAGATCACAACTAAAATCCGTGAAAATATAGGCGATAGCATGATGAGTAGTGCAGATGATGAAAATGAAAGCGAGGAAGAGTAATGCCAGTAATTAAAGATATAAAAGCGATAGAAGTTTTGGATAGTCGTGGAAATCCTACGATAAAAGCCTTCGTAACACTATGCGATGGAAGCACAGGCTCAGCAATAGTCCCAAGTGGTGCTAGCACCGGTAAAAGAGAGGCTTTAGAGCTTAGAGATGGCGGAGAAGCATATGGTGGCAAGGGCGTTTTAAAGGCTATTAAAAATGTAAATTCAATGATAGCAGAAGAGCTTTGCGGTAAAGACGCTTTAAACCAAAAAGCGATTGATGATGCTCTAATCGCACTAGATGGTACTGATAATTTTAGCAAAATCGGTGCTAATGCAGCTCTTGGCGTATCCATGGCAGTAGCTAGAGCGGCGGCAAATTCGAGCAAACTTCCGCTATATAAATATCTTGGCGGGGCTAATGCTTCTATTCTTCCTGTGCCGATGTTTAATATCATAAATGGCGGAGCTCATGCTAATAATAGCGTGGATTTTCAAGAATTTATGATTATGCCTTTTGGTTTTAACAAATTTAGCGATGCTCTAAGAGCTGTAGCAGAGATATATCAAACACTTAAAAAATTATTAAATGACGCCGGCCATAGCACCGCTGTTGGTGATGAGGGTGGATTTGCGCCAAATTTAAAAGACAATGAAGAGCCATTAGAGTTAATAACTCAAGCTATTATAAAAGCCGGATATAAACCAAATGAACAGATCAAACTAGCTCTTGATGTCGCCGCTAGCGAGCTATATGATGGTAAGGTCTATAAGCTAGAAGGCAAGGAATTTACAAGTCAAGAGATGGTAGAAAAATACGCAAAATTGTGCGAAAAATATCCGATAGTATCAATTGAAGATGGCCTTAGCGAAGATGACTGGGATGGATGGAGAGTGCTAACAGATAGGCTGGGAGATAAAATTCAATTAGTTGGCGATGATCTATTTGTAACAAATGAGAAGATTCTAAAAGAAGGAATCCAAAAAGGCATAGCAAACGCAGTATTAATCAAGCCAAATCAGATTGGCACAGTTAGCCAAACTATGCAAACAGTCCGCCTAGCTCAAAGAAATGGTTACCACTGTATAATGAGTCATAGAAGCGGTGAGAGTGAAGATAGCTTTATAGCTGATTTTGCTGTAGCTCTAAATACCGGCCAGATAAAGACAGGCGCCACAAGCAGAAGCGAAAGAAACGCAAAATATAATCGCTTATTAGAGATTGAGTGCGAAACAAGCGAATATCTAGGCGATAGAATTTGAATCCAATTTTGGTCGAGCTAGATTATAAAAAATCTAGCTCATTTAGAAGAGTTGTCGCATACTTTTTGCTTATATTAGTTACGATAATATTTGCTATTTATGTTGGCAATGTCTTTTTTGGCAGTCGCTCAGCATCTGTCTTATATGATCTAAAAGAGCAAAAAGATAACTTAAATAGCGAAGTAAAGAGATATCAAGAGTTAAATTCAGCTTTACAAAAAGAGTATTTTGAGTTAATCGGGCTAGACCCAGATAGTTATAAGTGAGTAAAAGATGAAAAGAGTTATTTTATTAGCAAGTTGTGCTATGGTGCTGTTAGCTAGAGAGAATCCATTTGTCCCAGATGATATCAATACCACTACGCTAAACTCTACAAATATCAGCCAAAACTCTCCAAAACTAGATAAAATCATAGCCAAATTTCCAAGTGATGCTAGAGAGTTAGTGAGTGCGACTTTTAATTACAAATCCATAGATGGTAGTATAAAGCAAAAGAGTATTGATATTAATGCAAGTTTTGATTGGCATGATGATATCATCATCTCATCGCAATCCCCAGTGACAAATGAGACTACCCCAGCCCTTGATGTATCAGTTACTACCACAGATGAACAGACCAAACAAGCCGCAGCCAAAAAGGCCGCACCAAAGCCACTTAGCGTCCCACCTAAGATAGAACCGCCACTAGATAGTGTCTCATTTATGGATTTTATCAAATTCGATATTTTTAACTCAAAAATCGAAATTATCAATCAAGATAGATTGATAAGGGATTTTATCATCAATAAACCGGATAAAATTGTTATGGATTTTCATAAAAATAGCGAATTCAATACCCAAACCATAAGAGTCTATAAAGGCCCATTAAAAAAGATAACAATTGGAGCTCATAAAGATTATTATAGAGTTGTATTATTCTTAGATGGCAACTACCACTACGGGCTTCGCCAAAGTGGCAATGGATATACTCTCACACTTAGATAATTATGCCTAGCATTTGCGGCGTAGATGAAGCTGGTAGGGGTGCTTTGGCCGGTGAGTTGGTGGTATGTGGATGTGCTTTTAAGGCTGATGTGAGTGAGCTTGGATTAACTGATTCTAAAAAGCTCACCCCCAAAAAAAGAGAGCAGATATACCAAAATTTGATTTTGAAATCGAATTTTATAACTATATATTTTAATAACAAAATTATAGACCAAATCGGTCTTAGCGAATGTTTAAGAGCTGCTTTGAGAGTGGTGAAATTTCACTTTAAAGATCATTTGATAATCTATGATGGTAATTGTGATTATGGTATTAAGGGGATTAGCACGATGATCAAAGCCGATGCGAAAATCCCACAAGTAAGCGCAGCTAGCATAATAGCCAAGGTAAGCCGAGATAGACAGATGAGATCTTTTGATAGCTTATACCCAAATTTTGGCTATGCCAAGCACAAAGGCTATGGAGTTAAGGCTCATATAGAGGCACTTAGACGATTTGGATCAAATGATTTAACTAGACTTAGCTTTAAGCCAAAAGCCCTTGAAAGCTCACTTTTTAGGGATGAAATTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015578|78739:85866|82025_83060_+|WP_096013822.1|DBSCAN-SWA MDENKKKSLDLALKQIDKAFGKGTILRLGDKEIEPIDSISTGSIGLDIALGIGGVPKGRIIEIYGPESSGKTTLTLHLIAECQKAGGVCAFVDAEHALDVKYAKNLGIDTDNLYISQPDFGEQALDIVETLARSGAVDLIIVDSVAALTPKSEIEGDMGDQHVGLQARLMSQALRKLTGIVHKMGTTVVFINQIRMKIGAMGYGTPETTTGGNALKFYASVRLDVRKVATLKQSDEPIGNRVKVKVVKNKVAPPFKVAEFDIMFGEGISKEGEIVDYGVKLDIIDKSGAWFSYESTKIGQGRENAKAFLKENLNIAEEITTKIRENIGDSMMSSADDENESEEE >NZ_CP015578|78739:85866|78739_79495_+|WP_100590295.1|DBSCAN-SWA MKKCFDINKLNLHYGTFHALKNINMEIAKGEVTAFIGPSGCGKSTFIKTLNRMNDLVEGCKIEGGILFHDRDIYSKDYDINLLRKRVGMVFQKPNPFAMSIYDNITFGPKTHGIKDKDTLDGIVEKSLKDAALWDDLKDRLYSSALGLSGGQQQRLCIARTLAVDPEVILMDEPTSALDPISTAKIEELVLKLKKDYTIIIVTHNMQQAHRISDKTAFFLMGEVIEYDDTKKIFNKPKNKKTQDYVMGKFG >NZ_CP015578|78739:85866|79530_80202_+|WP_086233894.1|DBSCAN-SWA MIYVLEDEGAILDLICYALKSQNIPVKGFSLAKDFYKALKDQIPQILVLDVMLPDGDGFEILKDLKNSAKYKDICVLMLTALDSEINKVKGLDLGADDYIAKPFGVMELLARIRVISRRKAKEEPNSDISFNGLEFSYKNHIVKVNGKPLELTLKEFELLGFLLQNPNQVFSRDMLLEMIWGYSYDKESRTIDMHIKTLRKKLGNMSDMIRTIHGVGYKLVRE >NZ_CP015578|78739:85866|84583_85294_+|WP_096013825.1|DBSCAN-SWA MKRVILLASCAMVLLARENPFVPDDINTTTLNSTNISQNSPKLDKIIAKFPSDARELVSATFNYKSIDGSIKQKSIDINASFDWHDDIIISSQSPVTNETTPALDVSVTTTDEQTKQAAAKKAAPKPLSVPPKIEPPLDSVSFMDFIKFDIFNSKIEIINQDRLIRDFIINKPDKIVMDFHKNSEFNTQTIRVYKGPLKKITIGAHKDYYRVVLFLDGNYHYGLRQSGNGYTLTLR >NZ_CP015578|78739:85866|83059_84310_+|WP_100590297.1|DBSCAN-SWA MPVIKDIKAIEVLDSRGNPTIKAFVTLCDGSTGSAIVPSGASTGKREALELRDGGEAYGGKGVLKAIKNVNSMIAEELCGKDALNQKAIDDALIALDGTDNFSKIGANAALGVSMAVARAAANSSKLPLYKYLGGANASILPVPMFNIINGGAHANNSVDFQEFMIMPFGFNKFSDALRAVAEIYQTLKKLLNDAGHSTAVGDEGGFAPNLKDNEEPLELITQAIIKAGYKPNEQIKLALDVAASELYDGKVYKLEGKEFTSQEMVEKYAKLCEKYPIVSIEDGLSEDDWDGWRVLTDRLGDKIQLVGDDLFVTNEKILKEGIQKGIANAVLIKPNQIGTVSQTMQTVRLAQRNGYHCIMSHRSGESEDSFIADFAVALNTGQIKTGATSRSERNAKYNRLLEIECETSEYLGDRI >NZ_CP015578|78739:85866|84306_84576_+|WP_096029736.1|DBSCAN-SWA MNPILVELDYKKSSSFRRVVAYFLLILVTIIFAIYVGNVFFGSRSASVLYDLKEQKDNLNSEVKRYQELNSALQKEYFELIGLDPDSYK >NZ_CP015578|78739:85866|85296_85866_+|WP_100590298.1|DBSCAN-SWA MPSICGVDEAGRGALAGELVVCGCAFKADVSELGLTDSKKLTPKKREQIYQNLILKSNFITIYFNNKIIDQIGLSECLRAALRVVKFHFKDHLIIYDGNCDYGIKGISTMIKADAKIPQVSAASIIAKVSRDRQMRSFDSLYPNFGYAKHKGYGVKAHIEALRRFGSNDLTRLSFKPKALESSLFRDEI >NZ_CP015578|78739:85866|80203_81907_+|WP_100590296.1|DBSCAN-SWA MQKRVFYFIIFSTLALALFINIFLIFSIESVLKNELFDRLKNYAYSIKSEVLSSIQNGSIQSLKDLDETYRISIIDQNGVVIYDNFANNLNLDNHSNRAEFKEAIEYGESTNIRYSNTLLKRNLYYGLKISNEKGEFVLRISKEQDYLYAIFMSFIPYIVAEIIAVLIFSFLLAKYLTHIILRPIYNIDLKNLDENLPYPELRVLIETLKKQNKIIKSQFKHLKQKRQELQSLTKGMKDGLIIINRSGEILSINPSAQKYFANLAKHTNISQIQNDLFLKLLLQNLRDFKDGKISCEIREQIVFMQETLVECEIVFSPIFSQKGKFKGLIIVICDITELKRNQNLSKEFSANVTHELKTPLTSIMGNAEMIRNNLVKSDDIPHFIDTIYNESKRLLHLIEDILKLSFLDESHTKNIPFSKVELKNLLLKVYSNLKSVAKKYDIEFKFELEEAYIHGSKELLEHAIFNLCDNAIKYNHPGGYVKIKIRNLQDCVELSIKDSGIGIEPSSQERIFERFYCVDKSYSKKVGGTGLGLSIVKSVLNMHHAKVKLKSQKDIGSEFIIIFQKS |
8 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
102945 : 112947
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015578|102945:112947|DBSCAN-SWA AATGGCAAGCAACCACCAAAGAGAAGAATTACATAAAGCGATATGGTCCATCGCTGATGATTTGAGAGGTTCAGTAGATGGCTGGGATTTTAAGCAGTATGTGCTAGGTATTATGTTTTATAGATATATATCAGAAAATATAGCAAATTATATAAATGAAGGGGAGAGAGCAGCAGGCGAAGCTACTTTTGATTATGCGAATTTAAAAGATTGCGAGGCCGAATTTGAAAGGGATAATCTTGTCACAGAAAAGGGATTTTTCATTCGTCCTTCAGAGTTGTTTTGTAATGTGATTAAATCAGCTAAAAGCGATAGCGCTACATTCACAGATAGCGAGGGCAAAACTAAAAATATAAAAGATAATTTAAATGAATATTTAGAAATGATATTTAACAATATCGAAAACTCCGCCAAAGGCACGCAGAGTGAAGATGACTTTTCTGGGTTATTTGATGATATAGATGTCAATAGCAATAAGCTAGGCGCCACAGTTGCTAAAAGAAATGAAAAACTTCTAAAAATATTAGATGGAATAGCTGGGATAAATTTAGACTATAAGGATAATGATATAGACGCATTTGGGGATGCTTATGAGTTTTTAATGTCCATGTATGCTTCAAATGCTGGTAAATCAGGTGGAGAGTTCTACACACCACAAGAGGTTAGCGAACTACTTACCAAACTCGCTATTTTGGATAAAAAAGAGGTTAATAAGGTTTATGATCCAGCTTGTGGAAGCGGGTCATTGCTTTTGAAATCTGCGAAAATTTTAGGCAAAGAAAATGTAAGAAACGGCTTTTATGGTCAAGAGATAAATTTGACTACCTATAACCTTTGTAGGATTAATATGTTTTTACACGATATTGGTTATGATAAATTTAACATAGCTTGCGAAGATACTTTGACCATGCCTAAACACTGGGATGATGAGCCATTTGAGGTGATAGTATCTAATCCGCCATACTCTATCAAATGGGCTGGAGATGATAATGCTATTTTGATAAATGATGAGCGCTACTCTCCGGCTGGAGTTTTAGCGCCCAAATCAAAAGCGGATTTTGCCTTTATAATGCACTCATTATCGTGGCTAGCATCTAATGGCACAGCTTCTATAGTATGCTTTCCTGGGATATTATATCGAGGCGGAGCAGAACAAAAGATTAGAAGATATTTAATTGATAATAATTTTATAGACTCGATTATCCAACTACCTGATAATCTCTTTTTTGGGACAAGTATAGCAACTTGTATAATGGTATTAAAAAAGGGTAAAAAAGATAATAGCACACTCTTTATAAACGCTTCCAAAGAGTGCGTCAAAGTAACTAATAACAATAGATTAACCGATAAAAATATAGATAATATAGTTAAAATATTTAAAGATAGAAAAGATATTAACCACATTGCCAAATTAATCCCAAATAAAGAGATAACAGACAATAACTACAATCTATCAGTATCAACCTATGTAGAACAAGAAGACACAAGAGAAAAAATAGATATAGTAAAGCTAAATAATGAAATAGCCCAAATAGTAGCTAGAGAAAACGAGCTTCGCAAGGAAATAGATAAAATCATCTTAGAAATCGAGGCGTAATCTGTGAGTAAATTAGAAGAATTAATCAATAAATTATGCCCGAATGGGGTGGAATTTAAAAAAATTGAAGAAGTATGTGATAATGTTTTTGCTGGTGGTACACCAAGAACATCAAATAAAGATTATTATGGCGGAAATATTCCTTGGCTAAGATCAGGTGAGATAAATTTTAATATAATAGATGATGCTGAAATTAAAATTACAGAAAAAGGCCTTAATGAATCTTCTGCAAAATGGATAAAGGAATATTCTGTTTTAATTGCAATGACTGGGGCGACAGTTGCTAGGAGTGCCGTTAATATAAAAAGAATAACTGCAAATCAATCTGTATGCGCAATGGAACCTTCTGAAATAGTTAATTATAAATTTTTATATTATTATGTAGAAAGTATGTATAACAATATAAAAGGAATGGCTCAAGGTGCTTTAACAAGTATAAATCTATCAATTATAAAATCAATAAGTATTCCTGTGCCTCCGTTGGAAGTGCAATGTGAAATTGTCCGTATATTGGATAATTTCACATTGCTTTCAGCAGAGCTTTCAGCAGAGCTTTCAGCTAGGCAAAAGCAATATGAGTATTATTCAAAAGAATTATTCAATTTTAATGATGATGTTGAATTTATTAGTTTAGAATCAATTGCGGATATAGGTACGGGTAGTAGTAATACAAATGAAGCAGTTGAAGATGGACAATATCCATTTTATGTTCGTTCTCAACAAGTGTATTATAAAAATAATTATGAGTACGATGATAATTCTATAATAACATCAGGTGATGGAGTAGGAGTTGGAAAAATATTTCATTACACTGATGGAAAATATGCATTACATCAAAGAGCATACAGAATTAATATAACAAACAATAAAGTAAATTCAAAATATTTTTATTATTATATGAAGTCAACATTTTATGATTATATACAAAAAAATGCTTTTAATTCTTCTGTAACATCTATTAGGAGACCTATGTTAAATAAGTATCCAATACCTATACTATCATTAGAAAAACAAAATAAGATAGTAAATATTTTAGAAAAATTTGACAAATTATGTAACGACCTTTCTGAAGGTCTTCCCGCTGAAATAGAAGCAAGAAAAAAGCAATATGAGTATTATAGAGATAAATTATTAACTTTTAAGGAGTTAAAAAGTTAATAAATGAAAGATAAGAAAGGATGATTTTGGAAGAAAATAGCATTATAATCTATACGCCAGAAGATGGTAGCACTAAAATAGATGTTAGATTAATCGATGAAACAGTGTGGTTGTCGCAACAACAAATGGCAGTTTTGTATGATACAACTAAGCAAAATATAAGTTTGCATATAAAAAATATTTTTGAAGAAGGAGAGTTAAACGAAAGCTCAACTATCAAGGAAATCTTGACAGTTCAAAAAGAAGGCAATAGAAATGTTGAAAGAAATGTAAAATATTATAATTTAGATATGATAATTTCACTTGGATATAGGATAAAATCCAAAGTAGCAACTAATTTTAGAAGATGGGCGACTCAAAAGTTAAAAGAGTATTTGATAAAAGGTTTTACTATAGATGATGAAAGACTAAAAGGAAATGGCGGTGGGAGCTATTGGAAAGAATTATTAGATAGAATTAGAGATATTCGTTCTTCTGAAAAAGTGCTTTATAGACAAGTTTTGGATCTTTATGCGACTAGTGTTGATTATGATCCAAAAAGCGAAGAATCAATCGAATTTTTTAAAATAGTACAAAACAAGCTACATTATGCTACACATGGTCATACCGCAGCTGAGATTATTTATCAAAGAGCTGATGCCAAAAAAGAATTTATGGGATTAAAAAATTTTAAAGGCAAATTTCCTGTGTGGAGTGATGCAAAAATAGCCAAAAATTACTTAGATGAAAATGAATTAAAAGTTTTGAATAATCTAGTTTCAGGTTATTTTGATTTAGCAGAAATCAATGCTTTTGAACATAAACCAATGTATATGAGTGATTATATTTCAATGTTAGACTCCGTGCTTACATCTGGAAACAGACAAATATTAACCGGTGCGGGAAATATAAGCCACGAACAAGCTTTAAAAAAAGCTAAAAACGAATATTTAAAATACCAAAATAACGAACTATCCCCAGTTGAAAAAGAGTATATAAAAAGTTTAAAAAAAGCCGAAAAAGAAGCTAAAAATCAAATAAGAAAAATAGGAAAATAATATGAATAAATACAATATAGTTATGGAAATGAGCAATTCTACTGTGGTGGCTGAGTATGAGCCATTAAAGAAAAAATCTGATAGTTATCAAAGCGAAGCAGCCTTAGAAAATGAATTTATAAAAATGCTTAGTGAGCAAGGCTATGAATATCTAAAAATCAATGATTCAAAGGCACTTATCAGTAACCTTAGAGCTCAATTAGAGATATTAAATGATTATAAATTTAGTGATAATGAATGGGATAGATTTTATAAAAATAGTATCGCTAATAACAATGATGGAATAGTCCAAAAAACCAAAAAAATCCAAGAAGATCATATCCAAGTATTAAAAAAAGATGATGGAACGAGTAGAAATATCTATCTAATTGATAAGAAAAATATCCATAATAATATATTACAAGTTATTAACCAATATGTAGAAAAGGGCGGAAACTATGAAAATCGCTATGATGTTTCGATTTTGGTCAATGGATTGCCTTTGATTCATATAGAGTTAAAAAGACGGGGAGTAGCCTTAAAAGAAGCATTTAATCAGATTAATAGATATCAAAGAGATAGCTTCTGGGCTGGTAGTGGGCTATATGAGTATATACAAATATTTGTAATTTCAAATGGCACAAATACAAAATACTATTCTAACACCACAAGAGAGAGCCATATAAAAGAAAAAACCCAAACACAAAATAGAAGCAAGAAAACAAGCAATAGCTTTGAATTTACTTCATACTGGGCTGATGCGAGTAATAAGGTAATACCCGATTTAGTGGATTTTACTAAGACATTTTTTTCAAAGCATACGATACTAAATATATTAACCAAATATTGCGTATTTACGGCTGAAGAGTTATTGCTGGTGATGCGTCCATATCAAATAGCCGCCACTGAAAGAATACTAAATAAAATTCAAATAAGCACAAATTATAAAAAAATGGGAACGATAGAAGCTGGTGGCTACATATGGCATACCACAGGCTCTGGCAAGACCTTGACATCATTTAAGACCGCTCAACTAGCAAGTAAATTAGACTATATAGATAAGGTGCTGTTTGTAGTTGATAGAAAAGATTTGGATTATCAGACGATGCGAGAGTATGATAGGTTCGAAAAGGGTGCGGCAAATGGCAATAGAAATACCAAAATACTACAAAAACAGATTGAAGATGATAACGCTAAAATCATAGTTACAACTATCCAAAAGTTAAGCG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CAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015578|102945:112947|109929_110475_+|WP_096015336.1|DBSCAN-SWA MKKFGFVASALMLASSSLLAANMTIFDPKSVDHIEIKVDLLGQDKNTPVGSVIAVKTNYGVAFFPDLKGLEPGLHGFHVHANPDCGATDKGLGMKAGGHWDPANSGNHSLPWDDKGHKGDLPALYVASDGTATNPVLSPKIKDLSELKDHSLMVHIGGDNHSDHPKALGGGGARMACGVIK >NZ_CP015578|102945:112947|112197_112947_-|WP_100590316.1|DBSCAN-SWA MRNLLFMLFISLIFISCSSSKSPYYPPIMDDNFTHNSLKTPIFNKLDLADPSNPLANTTPSNNQSNSSNQPPQITQPPLLTAPATLGSSPSLGSKSTPLTIINPKGGSAITVWALAPGNWLWGYTLDNSKEFGRARSWQVLNLGNDIALIINFLTNTCIHDEGGGITHRNCDINNKSQQWQLSAMDNGAIQIKSSASSKCITTDLGSLTQTGSYYSLAMRECNFKPNFNQQWVFIPEAAPTSPLLGYQQ >NZ_CP015578|102945:112947|105719_106736_+|WP_100590312.1|DBSCAN-SWA MILEENSIIIYTPEDGSTKIDVRLIDETVWLSQQQMAVLYDTTKQNISLHIKNIFEEGELNESSTIKEILTVQKEGNRNVERNVKYYNLDMIISLGYRIKSKVATNFRRWATQKLKEYLIKGFTIDDERLKGNGGGSYWKELLDRIRDIRSSEKVLYRQVLDLYATSVDYDPKSEESIEFFKIVQNKLHYATHGHTAAEIIYQRADAKKEFMGLKNFKGKFPVWSDAKIAKNYLDENELKVLNNLVSGYFDLAEINAFEHKPMYMSDYISMLDSVLTSGNRQILTGAGNISHEQALKKAKNEYLKYQNNELSPVEKEYIKSLKKAEKEAKNQIRKIGK >NZ_CP015578|102945:112947|110621_111380_-|WP_100590314.1|DBSCAN-SWA MKIAIKISLISLISIFIISCSGAKIDQPKQDMSFLKLDSSKGFAGDISKAPDETKAPDRAPLLNDKIKTPILTSSNNQDGFDPFTLPLSLRSLDTGMPLVVNLGKSDETFNYNLREVKAFEPTIIDEIKRVDSFAHLSLEYVQFVSANDINSCLGIDESGFFALKNCIGDLDRKKFETVFQLIPLLSDAVEIRSLVLGGKECISTFFNPNLEPWQRVGILRCELREGFSVDLAKLWAIMPEIKQAAIIQPVD >NZ_CP015578|102945:112947|102945_104541_+|WP_100590310.1|DBSCAN-SWA MASNHQREELHKAIWSIADDLRGSVDGWDFKQYVLGIMFYRYISENIANYINEGERAAGEATFDYANLKDCEAEFERDNLVTEKGFFIRPSELFCNVIKSAKSDSATFTDSEGKTKNIKDNLNEYLEMIFNNIENSAKGTQSEDDFSGLFDDIDVNSNKLGATVAKRNEKLLKILDGIAGINLDYKDNDIDAFGDAYEFLMSMYASNAGKSGGEFYTPQEVSELLTKLAILDKKEVNKVYDPACGSGSLLLKSAKILGKENVRNGFYGQEINLTTYNLCRINMFLHDIGYDKFNIACEDTLTMPKHWDDEPFEVIVSNPPYSIKWAGDDNAILINDERYSPAGVLAPKSKADFAFIMHSLSWLASNGTASIVCFPGILYRGGAEQKIRRYLIDNNFIDSIIQLPDNLFFGTSIATCIMVLKKGKKDNSTLFINASKECVKVTNNNRLTDKNIDNIVKIFKDRKDINHIAKLIPNKEITDNNYNLSVSTYVEQEDTREKIDIVKLNNEIAQIVARENELRKEIDKIILEIEA >NZ_CP015578|102945:112947|104544_105699_+|WP_100590311.1|DBSCAN-SWA MSKLEELINKLCPNGVEFKKIEEVCDNVFAGGTPRTSNKDYYGGNIPWLRSGEINFNIIDDAEIKITEKGLNESSAKWIKEYSVLIAMTGATVARSAVNIKRITANQSVCAMEPSEIVNYKFLYYYVESMYNNIKGMAQGALTSINLSIIKSISIPVPPLEVQCEIVRILDNFTLLSAELSAELSARQKQYEYYSKELFNFNDDVEFISLESIADIGTGSSNTNEAVEDGQYPFYVRSQQVYYKNNYEYDDNSIITSGDGVGVGKIFHYTDGKYALHQRAYRINITNNKVNSKYFYYYMKSTFYDYIQKNAFNSSVTSIRRPMLNKYPIPILSLEKQNKIVNILEKFDKLCNDLSEGLPAEIEARKKQYEYYRDKLLTFKELKS >NZ_CP015578|102945:112947|111376_112201_-|WP_100590315.1|DBSCAN-SWA MKNILIILLFSFISLYANIDDFKTATWNMQGSSASSEAKWSISIAQMFSGANGIDVLAIQEAGTLPATAEPTGREFRAFGTSVVVTEHVWNIGTRLRPDLIFIYYARTDLGGNRVNLALASRRQADEVFLRPPPTTASRPMLGIRINNDAFFSIHALANGGADASAIVHNIDLFFQSTPTLANTNWIIMGDFNREPVDLLSTFELELRLRTRIVTNNAITQISARRTLDYAVVGNSNRAIAPAPLPPISASTFFSGFRTHIASDHFPVTFRRFP >NZ_CP015578|102945:112947|106737_109761_+|WP_100590313.1|DBSCAN-SWA MNKYNIVMEMSNSTVVAEYEPLKKKSDSYQSEAALENEFIKMLSEQGYEYLKINDSKALISNLRAQLEILNDYKFSDNEWDRFYKNSIANNNDGIVQKTKKIQEDHIQVLKKDDGTSRNIYLIDKKNIHNNILQVINQYVEKGGNYENRYDVSILVNGLPLIHIELKRRGVALKEAFNQINRYQRDSFWAGSGLYEYIQIFVISNGTNTKYYSNTTRESHIKEKTQTQNRSKKTSNSFEFTSYWADASNKVIPDLVDFTKTFFSKHTILNILTKYCVFTAEELLLVMRPYQIAATERILNKIQISTNYKKMGTIEAGGYIWHTTGSGKTLTSFKTAQLASKLDYIDKVLFVVDRKDLDYQTMREYDRFEKGAANGNRNTKILQKQIEDDNAKIIVTTIQKLSEFVKRNPKHPAFQKHLVLIFDECHRSQFGGMHISIAKSFKNYHLFGFTGTPIFAKNATNKSNPNFCTTEQAFGDKLHTYTIVDAINDGNVLPFRIDYVNTIKKKDEIKDKEVARIDEAGALADDKRVKKIVEYIIEHFDQKTKRSSYYDLKGQRMSGFNSMFAVASIEMAKKYYLEFKKQLEEKQKDLTIATIFSFSANEEDRADGIIDDEGFETELLDKSSREFLDFAISEYNKKFKTNFSSEGNGFQDYYKDLSDKVKKREVDLLIVVNMFLTGFDATTLNTLWVDKNLKQHGLIQAFSRTNRILNSVKSYGNIVCFRDLQDETNDAIALFGDKNASGIVLLRSFEDYYYGYDDDKKHIMGYEEKIAQLIQKYPPDEQIIGESAKRDFIISFGSILRLRNILSSFDKFKGMEILSEEDFRDYLSEYEDLNDEFKSKSEDSESIKDDLVFEMELVRQLEVNIDYILMLVTKYHKSNCKNQEIRSSIDKAIRASMSLRSKKDLIDGFINKINADTDVMTDWAKFVKEQKESDLKDLIKDENLKESETRKFIDSSFRDGQVKTIGTDIEKILPPMGRFNGGNRNERKQAIIEKLLKFFDKYFGLGI |
8 | Enterobacteria_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
142779 : 159796
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015578|142779:159796|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015578|142779:159796|148520_149270_+|WP_100590316.1|DBSCAN-SWA MRNLLFMLFISLIFISCSSSKSPYYPPIMDDNFTHNSLKTPIFNKLDLADPSNPLANTTPSNNQSNSSNQPPQITQPPLLTAPATLGSSPSLGSKSTPLTIINPKGGSAITVWALAPGNWLWGYTLDNSKEFGRARSWQVLNLGNDIALIINFLTNTCIHDEGGGITHRNCDINNKSQQWQLSAMDNGAIQIKSSASSKCITTDLGSLTQTGSYYSLAMRECNFKPNFNQQWVFIPEAAPTSPLLGYQQ >NZ_CP015578|142779:159796|153287_154226_-|WP_100590345.1|DBSCAN-SWA MSKKVLITGGAGYIGSVLTPILLEKGYEVCVIDNLMFDQISLLSCSHNKNFTFINGDAMDENLIKQEVAKADIIIPLAALVGAPLCKRNPKLAKMINYEAVKMISDFASPSQIFIYHNTNSGYGIGEKDAMCTEESPLRPISEYGIDKVHAEQYLLDKGNCVTFRLATVFGISPRMRLDLLVNDFTYRAYKDKFIVLFEEHFRRNYIHVRDVVKGFIHGIENYDKMKGQAYNMGLSSANLTKRQLAETIKKYIPDFYIHSASIGEDPDKRDYLVSNAKLEATGWKPDNTLEDGIEELLRAFKMMKVNRFANV >NZ_CP015578|142779:159796|155852_156989_-|WP_100590348.1|DBSCAN-SWA 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MLLYQFLNQYYSQISVLNLEELRDKTIFITGSNGLIGSNFVSYFYYLNKNFNFNIKIIAHSFSKPIWFLPQDDNITYLNSDLNNLKIDFKFDYLIHAATYGQPKKVLENRVGTILYK >NZ_CP015578|142779:159796|146846_147515_+|WP_100590339.1|DBSCAN-SWA MVQKRLAIQFFGHTRTYKKTYDSFFKYIVEPNQQDGWEIDIFIHTWDMSSSSSGSWHEGQDIFDIYPLSQSDIDDIKQIYNPKAILIEHLEDGIHGVVESKKRGNRLRERYEIENNIKYDYFLYTRLDVLFATPLNISKYIDFYIVDDMMKYFKLPEKHCFCPFNPFVRMPVIDMRHINEGDIVFSQTIRMMHLRHTFIQKFLQFLSIINCIEIFSYKEEIL >NZ_CP015578|142779:159796|152193_153213_-|WP_100590344.1|DBSCAN-SWA MKTIRTQTPLRLGLAGGGTDINLYCDKYTGYVLNATISLYIHCTLIEREDGKIIFDSPDTNSYSEYESKEFLGNDGKLDIFKSIYNRIVKDFTKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGVIKAFAEWLNLPLGEYEIAKLAYEIEREDLGIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYDNKRVIVNPLRIKNWIASELEARTVLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDEKSLEAMHAIKQDAIKMKEALFKADFDTLAQILGKSWQSKKIISEIVSNDELERIYHLAMQNGAYSGKTSGAGAGGFMFFFVDPTKKYNLIKALNKEQGYVQDFSFTKEGVKSWRI >NZ_CP015578|142779:159796|151609_152206_-|WP_100590343.1|DBSCAN-SWA MENLNSYIKEHFQESILVKEQILKDENLITLIKNASLEVIKAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALTTDTSILTAIGNDYGYENLFARQVQAQGVKGDVFIGISTSGNSANIIEALKVCKEKEIISIGLTGQSGGKMADLCDYCIKVPSNCTPRIQESHIVIGHIICAIVEEEIFGKGFK >NZ_CP015578|142779:159796|144460_145789_+|WP_100590338.1|DBSCAN-SWA MAKVALCISGAFRGENFIEYLNDTIGKFKSLNPDVFIASWDSYKIWPGVGGLGVGWIRNWYSQDIIEFAPKEFIGSNSDFKKLFPEVYKILEKEIDKHIDNDLLEKIKRLDNVKSIKLSNEQEYLKQYPSNLEIVNSTKMFYGFWQVVNLLLEYETKNNFYYDYIIVLRPDKIYSIDFDLKFIETLQQDNEIICEEYDWGMMDISLYGKRYAMIELLSLFDKASRYRHLDYFKYFPSGICCAPIGFLDHSILVRCVKFIGLKINNTNFIKYNKIDYNPRIPNIQKALLKDLENIDTNRDQDYILFFDILNCPKLLSTRLATQIIKNHLSYKLGEAMIANSKSLLGYIKMPFKLNHIKKEHNNEQKSYEKIIKKHPNLKLPPLETYPDYNEAIKIKNHLSYKLGEALIKANNKGFITGGGGYWLLFEIRRIIKEHKKAKNENR >NZ_CP015578|142779:159796|157548_158676_-|WP_100590349.1|DBSCAN-SWA MDKTSKIYIAGHTGTLGSAILTELKEQNYTNLIYKSRLELDLTNQKAVADFFKTQKPEYVFLCAAKLDTLGLFTPANVIYENSMLQANIINSAYENNVKKLIFYGSAWAYPQKANNPITEQDLLNGKLDTKAVAYGLSKIIGTKMCEAYNLQYNTNFITLYLSNLYGQTAEFDLTKAKVLPALLRKFHLAKLLNEDKFDLVLKDLNLDKNEAKKVLDKFGISKEYVEIWGSGNVVREFLHAKDLADASIFVMKNVNFDSLKSEQETHLNVGSGEFLSIKELAFLIKDIVGFNGDIKFNTDKPDSTMDRMLDTSKIKSLGWKHKINLEEGVKMLYQWYKNGGGYELNLKSINNSKFTHLYSNCNFTMPFGLGSKAA >NZ_CP015578|142779:159796|149266_150091_+|WP_100590315.1|DBSCAN-SWA MKNILIILLFSFISLYANIDDFKTATWNMQGSSASSEAKWSISIAQMFSGANGIDVLAIQEAGTLPATAEPTGREFRAFGTSVVVTEHVWNIGTRLRPDLIFIYYARTDLGGNRVNLALASRRQADEVFLRPPPTTASRPMLGIRINNDAFFSIHALANGGADASAIVHNIDLFFQSTPTLANTNWIIMGDFNREPVDLLSTFELELRLRTRIVTNNAITQISARRTLDYAVVGNSNRAIAPAPLPPISASTFFSGFRTHIASDHFPVTFRRFP >NZ_CP015578|142779:159796|142779_143415_+|WP_100590336.1|DBSCAN-SWA MSQIKAVIFDMDGVLIEAKDWHYEALNRALRLFGLEISYLEHLTTFDGLPTKKKLEILSVDRKLPKSLHNFINQIKQLYTMEIVYQSCKPRFYHQYALSKLHKEGYKMAVCSNSIYNTIDVMMQKAALNPYLDFYISNEDVKHGKPDPEMYNKAIAKFGLKPNECMIVEDNENGIKAARASGANVMIVKEVSDVNYENIKEHIFKFQKGDL >NZ_CP015578|142779:159796|144126_144468_+|WP_100590337.1|DBSCAN-SWA MLKRLTQDYIDSFNAKDLDAISSMLSDEFSLEDPVVKRLEGKDKCLKAILNIFNNCQNLNFKAKNIYTDDKTSFIEFVLILDDKHLEGVDIIEWNENNQISALRAYLYEVVDG >NZ_CP015578|142779:159796|150087_150849_+|WP_100590341.1|DBSCAN-SWA MKIAIKISLISLISIFIISCSGAKIDQPKQDMSFLKLDSSKGFAGDISKAPDETKAPDRIKISDLNDKPNLKSNNSNNQDGFDPFTLPLSLRSLDTGMPLVVNLGKSDETFNYNLREVKAFEPTIIDDIKRVDSFANLGLEYVQFVSANDINECLGIDESGFFALKNCIGDLDRKKFETVFQLIPLLSDAVEIRSLVLGGKECISTFFNPNLEPWQRVGINRCELREGFSVDLAKLWAIMPEIKQAAIIQPVD >NZ_CP015578|142779:159796|145775_146117_+|WP_086304115.1|DBSCAN-SWA MKIDNLDSMIRGWFVGDFEPNVLKSDQVEVGVKSYKKGDYEERHYHKIATEITVITKGKVKMNGVIYSEGDIITIAPFEDTDFEALEDSQNVVVKIPAAKNDKYLGKYGENNE >NZ_CP015578|142779:159796|147475_148213_+|WP_100590340.1|DBSCAN-SWA 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MKALITGFTGQVGSQMADFLLENTDYDVIGMMRWQEPMDNIYHLSDRINKKDRISIFYADLNDYSSLQKLFESQRPDVIFHLAAQSYPKTSFDIPIETLQTNIIGTANILENIRILKAKDGYDPVVHICSSSEVYGKAKVGIKLNEETAFHGASPYSISKIGTDYLGRFYGEAYNIRTFVTRMGTHSGPRRSDVFFESTVAKQIALIEAGYQEPVIKVGNLSSVRTFQDCRDAIRAYYLLSLESQKGNIPCGEAFNIAGEEAFKLPEVIDILLNFSDMGGGIEVRQVEDRMRPIDADYQMFDNSKIKSFIDWKAEIPVRQMLKDLLNHWRNEIKRGRIPLNR >NZ_CP015578|142779:159796|143411_144134_+|WP_096024618.1|DBSCAN-SWA MINIVIPLAGKSNFFKEDEIIFPKPFVEICGKTMIEILIDNYKEITNKQFIFILKDDDVSEFHLDEAIKVLDPSAHIITLKNPTQGMACSALLAIDYIDDNSPLIIANADQIFDINLNIVLDYFKDYDAGVIAFDSIHPRWAYVRVDNNSNVIEAVEKKPISKNAIAGFYYYKQGVDFIQASQKMIINDSHLNGQFYIAPTLNELILMGKNVGVYKIDNELYHTFYSMEKIRDYERIKNA |
20 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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