CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP019924	Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp36, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP019922	Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp17, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP019919	Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP019923	Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp28-1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP019921	Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-9-4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP019917	Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp26, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP019926	Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp56, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP019918	Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-5-1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP019925	Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_lp54, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP019920	Borreliella burgdorferi strain PAbe plasmid p_cp32-3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP019916	Borreliella burgdorferi strain PAbe chromosome, complete genome	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP019918

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	8495 : 39728	44	uncultured_Mediterranean_phage(33.33%)	integrase,terminase,holin	attL 12745:12768|attR 43414:43437

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP019918|8495:39728|DBSCAN-SWA
AATGGATACTATTAAATTAACCGAACTTCTTATCAATTTAAACGAAATTAAACTTATAGCGGTAATGATTTTTGTAACAGTGCTGGTTTTAGGAGTATTAATTCTTCTCAAGCCTTTACTAAAAGACATATTGACTATTGTAATAGGCAAGATTTTTAAGAATGGTAATGGTAATGGCAAAAATCACATTAAAAAAAGAGATTAACTTATGAAATTATCCAAAGATAATGTTGAGCTTGGACTTACGTCTTTATCAACCCTTATTGATATATTTTCTAAATTTGAAGATGAATTTGATGAAATTGCACATAAAGGATTCTTTTTGGTTTATGAGCTGTATTCTCATTATAAATTAATCTATACAGCAAATATGGAAAGACTTGAGAGTGCATTAACCCCAGCAATAAATAAAGCACTCGCTCCATTAAATGAAAAAATCAATCAATGCATTGACTTAGTTAATTCTGATGAAAAAAATCTCAAAATATCTAATGATCTGAAATTCAATCAGGAAGGAAAACCTATCTATAAGGAAAGAACAAATAATGCAAAATAACACTATTGGTTTAGGACTTAATTTACTATCCAGCTTAACTAACATAGCTAAAACTGATACAAACATAGATCATAATTACATTAATACTTTTAGTAAAGTAATAGATTTTTTCTACAAAACATATATAAGCACACTAAAATCTATAGAAACAGCTGAGTCAACTAAAATATTTGAAGAAATAAAAGACATTTTAAAATACAATATTGAGATAATAGAGGCTATCTCTTATGACAAAAATAAAAAAATTATCACTTCACTTAAAGCAAAACGCAACAAAATTATGAAAGAATACATCAAAATGCTTAAAAGGAGTGAAAATGCTTAAAAGATTGCATTGTTTACTAATTGTTTTGTTGTTATGTTGCACCACTATTGCTAACCTACCAGAAGAACCAAAACCGCCAATTATTCCAACGCTAAAATCTTTAGCTAAATATGAAACACAACTTTCAGAATATGTTATGTATCTTGTAACATTTTTAGCTAAAACAAAAGTGAAAGTTAATGACCCCAATTATCCAGAATATCCTTATCCAGACTTATCAACACTAAAAGACGAACACTCTATACCTGCGGTAAAACATAACATCAAGATATATTTAGAGTACATTAAAAAAGCAAAACCAATAGCGGAAAAAGTATATCATCAATATTCGAAGTTAAAAATGTAAATTACAAAAAGGTTTTTCTTGCAAGAAATTCTAATTTATGATCAAATCGGCTTTTGCAACAAAAGAAAAATCTAGATATTAGATTGACGCAGATTTAATATCTAGATTTTAACATTTTCAACAGGAATATTTGCTAATTAATTAGTGCCCTCTTCGAGGAACTTTATTACTTTGTCTATCTGTTCTACAGCGTTTTTAGACATTTTATCCCCATTACCAGAAGTATTGCTTCCAAGAAGTGGTACAGTTACTCCAACTAATTTTGCTTCTGACCATATTTTTCTTTTTGAAATATCCTGATCCTTGTCAGTAATGTTTTCAATGGTATTTTTAGCTGCTTTTAACGCTGCTAATTTGGCCGCTAATTTATCCTGAAAGGAATTTTGCAAATTTAATAGTTTTTCTTTAAGCTCCGCATTGCCTATATCTTTTAAATTTTCTTTTAATTCATTTATTTTGTCTTTATAATCTTTAAATTTGCCTCCAGAAGAATCATTTACAAGAGCTAAAACATCCTCCATTAATGAATCTATTTCTTTCTTTTCTTCTACATATGCTTTACAAGCCATTACAAATAACATTGCTGCAAAAAATAATTTAAATATGTTTTTATTTCTCATTAGTTACTCCTATATTCAATAATAATGAGATAAAAGCTAGCACAACATTTGAAAAATATAAATCTCTCAATTAATATTTTTAAAGATTTTTAAAAATAAGCTCTATAATTACAAGAATAAATTTTATTTTTACTCAACATATTGTACTGGAGATAAGGAAAGGAAATAACAATGAAAATCATCAACATATTATTTTGTTTATTTTTACTACTACTAAATAGCTGCAATTCTAATGATAATGACACTTTAAAAAACAATGCACAACAAACAAAAAGCAGGGGAAAGCGTGATTTAACCCAAAAAGAAGCAACACCAGAAAAACCTAAATCTAAAGAAGAACTACTTAGAGAAAAGCTATCTGAAGACCAGAAAACACACCTTGACTGGTTAAAAGAAGCTCTGGGTAATGATGGAGAATTTGATAAATTTTTAGGATATGATGAAAGTAAAATAAAAACAGCACTTGATCATATAAAAAGTGAACTTGATAAATGTAATGGAAATGATGCAGACCAACAAAAAACCACTTTCAAACAAACAGTTCAAGGAGCTCTTAGTGGGGGGATAGATGGATTTGGTTCAAATAATGCAGTTACTACCTGCGGCAATGGGTCCTAATAGTTAACAGCCCCCATATTGGGGGCTTTAATCTTGCTATGCTGCAAATATCTCATCAAACCGTTCGTATTCTTTTAAGATACTAAAGAATATTAATGGACTAGGGCCATAAATAGGCCTCTTAAGCCCCATAAACCTTTCAAAATCTTGTAAATCCTTTAATCTATTATTTTTCTTGAAATAGTTTTTTATAATCTCGGCCCAATAGTTTATGCTTTTAAAATCACTATTTTTCTCAAAATACGAGATTAAATCAGATTCAATTTTCTTGATATCATCAAAATTATTGGGGTCTATATTCTGAATAAAGCTTATTTTTTGAATAATTGAGTTTATATTATCTTTTGTTGTAGGGCTATTTACCCAGTCTTTTATATTAGACAAAGCTTCTTTAAAAACACCGTAATAATAAAGCCTATCTTTTTTTTGTTCTTGCTTAATATCTCTTTTCTGGTTTTGAATAGTGTTATTTTTTTGAATTTGATTAATCTCTTGTTTTTGTTCTCTTTTTTGTTCTTGCTTTTGATTAACACTAACTTGCTTGCTAGGCATAGAATTTTCGTTTTCGTGGTTATTGTAAATAGGAGCTGCATCAGTATCTATTTCACTTTCTATACCAAGAGCTGCAACTAAAGCATACCTTTTGACATAAGTAATGCCTGAACCAAACATCTGATACACTGTATTTGTAACTTTAGACCCATTTTCATTGTTCCATTGTAAATTTTCTGTAGGAATTCGCGTATCAAAAGAAAATTCATATCCAGTACTTGTACTGTAGAATGTAGTCCTAATATAATCAACTATGCCATATTGACCCTCTATAGAAATTGGATATTGCTCAATATCAAGCTCCAAATTGTGCTTTTTAATAACATTTTTAATTTCTCTAACTATTTCATTGAAATTTTGATATTTATATCCATATCCTTTAAGACTTTTGTCAATCCCTGGTAAATTCATTTTTAGGGTTTTCATATCTTTTCGGAAGCTTATTTTTGCTTGAATATTATTTTGTATTTCTTGATTATTATTGTTTGAAAGATTTTCCATCTTTTTCCTCCTTTAATTGGTATTAATAAATATAAGTATATAGCAAAAACTATTTTTGCCAACTTTTTTACAAAAATTTTTACAAAAAATTAGGGCTTAGCTAAATTTTCTATTATCTACTAAAAAACTTAGTTAATCCCTAATTTCTTTTTTTTTTGAAAATTCCAATTAAAGGTAGTTAAAACTGAAAAATGTTCAAATAACTACGCTGTTTGTAGTGTAGCCCAATTTTTAATTAAAATCAATCAATCTTTTTATCAAGTTACAAAATGTATATTAATTTAACAAAATTAACAATTAAAATTTAATATTCTTTTAGAAAAGTATTTACTTTTAAATCAAAATTTTGCATTATAATAATTAATTATTAATACCAATTAAAGGAGAAAAAACATGAAAGGTTTTTCAAAAAATCCCACTTGCCACAATAAACACCAACACAAACTAATATCTCTTACTTCAACACTAGATTTTTTAAACAAAAAAGATAAAAAATACACACAACAAAACATACTCTATTACTATAATAAAAATCTAAAAAGAAATGGTTTGGCTCCCACTACTTTAAGAACAATGCAAAACTATCTTTACAAATTAGAAAAAGTATTAAAAGTTACAACTAATTACTACCAACACATGGGAGTAAATTGTGGAACTGAAATTTACTATAAGCTAAAGTATCCTAAAAAAGATTGTTACCAGAAAATCAACAAGTACTTTAAAGAACGAAAAAACTCTAGATTTAAATCTAGAGTTAATAAACATTTAAAAGACAATGTTTCTAAAAATAGTAGTGTAAATTTAGTGGAGTGTTTAAGTAATAAAAATAATATAAAAGAAGAAAGAAAGATTAAAGAAATAGAAAAATATCAACTAAGAAATTATTTCAATAATTGTAACTTTAAAACGGAAGAAGCTCTTTCTATTTTGTATTTAAATACTGATAAAGATACTAAGATTGAGGCAATAAATATCTTAAAACAAAATGAAATTGCCCTAATAAAAAAATTCAATATAAAAAAATCTTGCATGAAAGAAAAACAAAAAAAATTAAAAGAAATTCTATACAACACTAGGAAAAAATTAGAAGAAAACGGGTATAATCCCAAACAATTAGAAATAAATTTACAAAAAGTATACGAAAATTACAAATATAAGCCCCATTTTATTATTGAAAATCATAAATATAGCGATTTAAACAATATAAAGCGTAAATTAGAAGAGTCGATTGAAAGAAAAAAAGAAAATCCTCAACAAAATTATCAAAATTTAAAGGAAAATATTTTCAATATCCTTATTGAACAACTAAAAAAAGAAACAAATATTGAAATTCTAAAGCCAATTATCAAAAAATATTTGAATAACCAAAAGAAAATAGAATACAATAAAGTATTTGGTATATATCATCTTGAATTATTAGAAATAATAAAAAATGAAAAAAATTCTTTAACCACAGAAGAATTTAGCATAAGGGCCGTATAA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MDTIKLTELLINLNEIKLIAVMIFVTVLVLGVLILLKPLLKDILTIVIGKIFKNGNGNGKNHIKKRD

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010258449.1|9367_9721_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883730.1|9858_10341_-	fibronectin-binding protein RevA	NA	NA	NA	NA
WP_010883731.1|10512_10959_+	Mlp family lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_086440108.1|10995_12012_-	ERF family protein	A0A1B1INV1	uncultured_Mediterranean_phage	3.3e-09	31.6
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12745:12768	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_012663371.1|14045_14819_+	ParA family protein	S5VTM9	Leptospira_phage	2.9e-13	32.1
WP_010257945.1|14880_15405_+	chromosome replication/partitioning protein	NA	NA	NA	NA
WP_012644880.1|15418_15967_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_083013126.1|16443_17766_+	DUF244 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_012663370.1|17817_18243_+	DUF261 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010883865.1|19455_19977_+	plasminogen-binding protein ErpA	NA	NA	NA	NA
WP_010883724.1|20004_21141_+	ErpB	NA	NA	NA	NA
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WP_010883742.1|22043_22610_+	DUF603 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010883743.1|26533_27298_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_044283624.1|27327_27900_+	DUF228 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_002658423.1|27921_28881_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_002658432.1|29726_30116_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883726.1|30112_30679_+	DUF764 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_002658668.1|32230_32686_+	DUF1473 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010883745.1|32926_34201_+	DUF759 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010883747.1|34910_35861_+	DUF693 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883748.1|35878_36424_+	DUF777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_002658459.1|36453_36786_+	DUF2634 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883867.1|36782_37658_+	DUF276 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_002658699.1|37667_38273_+	DUF735 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883727.1|38282_39098_+	DUF685 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_002658481.1|39173_39377_+|holin	holin BlyA	NA	NA	NA	NA
WP_010883728.1|39380_39728_+|holin	holin, BlyB family	NA	NA	NA	NA
43414:43437	attR	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP019916

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	446967 : 456387	9	Streptococcus_phage(28.57%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP019916|446967:456387|DBSCAN-SWA
ATTATGAACGACTTCTGCTGACTAGAATAGTAAACTCTCCTTTAACCTTATCCTTACTCGATTCAAAATATTTTTTTAATTCTAAAGGTTTGCCAATTTGATATTCTTCATAAATTTTTGTCATCTCGCGACCAATAAGAACCTTCGCATCTAAACTAACAGAAGAAATTTCAACAAGCAATTTCAAAATTCTATGACCAGATTCAAGCAGAACAAAAGCATCTCCCCTTTTATATAGCTCAGCAATTCTTTTAAATCTTTTAAGGCCTTTGTTAGGCAAAAATCCCTCAAAAAACACTGATTTATCTCTAAAAGGATTAACACTTACAATTGTATTAAAAGAACTTACTCCAGGAATTGGACAAACTTTGTATCCCTCTCTAAAAGCAGCAGCAACTAATAAGCTACCCGGATCACTAAGCCCCGGAGTACCAGCATCGCTAACAAAAGCAACAGAATTTCCTTTTGCCAAATAATCCAATAGCAAGCTTATCTTCTTGTTTTCTGTTACGGCATTACAAGAAATCATTTTTTTATTAATTTTATATCGAGACAAAAGTTTGCTAGTTACTCTCGTATCTTCCGCAAAGATAACATTTACCGATTTTAAAACATCAATTGCTCTATAAGTAATATCTTCTAAATTGCCTATTGGCGTACCAACAATATATAACACAGGCCCTTTTAATTCCTCCAAAACTAAAAATAAATAAAATATATTAAAAACATTTTTCTTAATGATAAAAATCCAAAACCTTTTACTTACCAAATACAAGAATAAGACATAAGCCATATTTTATATGTCTATCAAAATACTTGCTTTTGTATTACATTTAGTTATATCATTAAGTATTAATGATTAAAAAGTTAAAAGAAAGGGAAAATTTATGTTTGCATTAATTAGAAAAATATTTATGATCTATTTTTTATGCATTACTCTTGCAGGTTTTGCCATGATTTTTATTGACAGCAAATTTACCGAACAGCCTAATGTTAAAGAAAATCAAAGCAAAATTAATCAACATACAATTGAACCCAATTTAATCATGTTTACATCTTCTATAGGAGGATTTTTAGGTGTTTATGTTGGAATTTGGATCTTTAACTATGACAAAAGCAATTTTTACCTAAATTGGGGAAATTTAATAATATTAATATACAACATAGCCCTAATTATCACTGTATACTCAAAATCACATAGTTAGCTAACATATGGCTCAACTATTTTCATAATTTATAAATTATTAACTATAATACCTCTTTTAATCATATACTTATAAACCTCTTCGGGATTTTCTAAGCTTTCAATCAAGCTTTCTGCCCTGTCATTTATTTTTTCTACCAATTTTTTATAAGCCACTTTAATTCCTCTGCTTTCTAAAAAATCCTTTGCGGGTTGAGAAACAACCCCAGCTTGAACATTTTGAAGCCCTATATTATAAATAATAACGGCTGCTGCCTTGCCCACAACTTTATCATAAATTTCAAGTCCTTCTTTATTCTGGATATACTTATTGATAAAATTATCTACTTCTAAAAGAGGCTTCAATCCTCTTTCCATATTAGAATAAAGTATTTTATGATCTTTAAACAACCTTAATGTTGGATTCAAGCCTGATATCATTTTTACCTCTTTTCTGGATATTTATAAAAATCAATAATAAAAACAAACACTATTAATAATATACATAAACAATAAATACTGCAATATCTAAAAAGATAGTATACTTACGTTATATGATGTTTGTGCCAAAAAACAATAGTAATTCTAAAATTGAAATAAAGAAATCCATCTTTGTTTCATATATTTTTAATATTGAAAAAAAAGACGATATAAATAAAACTATTAAAAAATACAAAATAAAATTTAAAAATGCTACGCATGTGGTTTATGGATTTAGAATCGGAAACAAAAACTCATTTCTAAATGGAATGAGTGATGATCGAGAACCTAATTTAACAGCTGGAAAGCCCACATTGGATGCCATAATACATAACAATTTAACCGATACTTTAATAATCACATTGCGATATTTTGGAGGCACTTTACTTGGTAGAGGGGGATTAATCAAAGCGTATTACAAGTCTGCCAAAGAAGTTATTAATAATACATCTATAATGGAAAAAGAGGAATTAGAAATTTTAAGCTTAAATTTAACTTACAACCAATACAATTCATTATTAAAAATGAAAAATAAACTTGAAATAGAAATAATAGATTCAAACTTTTCAAACAAAATAAACACTTCAATTAAATTCAAAACAAAAAATAAACAAAAAATATCGGAATTTTTTATAGAAAATGGCTTAATTCAAGAAATCTTAAAGTTTAATAAAGAATAATATGCATGTCAAATAATCAAATATTTAAAAACTAATTTAAAATATTATTATTTTTATCATTTATGTTTTAAAATATAAAAACAAAACCAAATAAAAAGAGAAATTTATATGAAAATAATATCTGTAATCAATCAAAAAGGAGGCGTAGGAAAAACCACAAGCGCCATTAATATTTCTTATTCAATGACCCTGCTTAATAAAAAAATTCTTCTAATAGATATTGATTCGCAAGGAAACTCTACTAGCGGCACAAATACCTCAAAGCATATAGCCGAAAAATCAAGCTATGAACTTATTAACAAAAAAATAAAGGTCAAACCTTTAAATCATTTTGGATTAGACATAATTCCTTCTAGCATTAAATTAGCTTTGCTTGAAAAAGAATTAATAAATGAACTTTCAAGAGAAAATTTTTTAAAAAATGCATTAACACTGTATGAAAAAGACAAATATGATTTTATTATTATCGACTGCCCCCCTACACTTTCAATATTAACTATAAATGCACTTATTGCAAGCAATTACTTGTTAATACCAATTGAAACGGAATTTTTTGCATTTGAAGGCATAAATCAACTAATAGATACAATAACTACTGTAAAGCAAATAAATAAAAATTTAGAGATTGCGGGTGTTTTTATAAATAAATACGACATAAGGAACAAAAGTAAAGAAAAATATGTAAGCTCGCTAAAAAAAGTTTTTAAAGAAAAGCTTTTAAATACAAAAATAAGGAAAAATATAACTATCTCAAAATCTCAAGAAGCAAAAATGCCTGTATATGAATATGACAAGGAAAGCAATGCTGCAAAAGATTTTTTAGAGCTCTCAAAAGAGATAATAAACAAAATTAAGGAATAGCTATGTCTGACAATTTAGAAACTTTAATGTTTCTAATGGGTAAAAAATTAGAAACATCTTCAAATAATTCAGAAAATACTGAAAAAAAAGAAATTATTTCGATTGAAAGAAAAAACTTTGACTACAATAAGCTAGATAAAGATATTTCTGATTTTTTAAAAAAAAAGCAATATGAAATTTTCAATATTTTCAACAACACTTATACAAAAATTGGAAAGATACTTAAAGACGCTCAAGACAAATTAAAAGGAAACAATCAATATAACGGGCTTTTTTATCAGTGGTTCAAAAGTATGGGATTTAAAAAAGACAAGGTTTACGCCTTAATATCAAGATACAATCTGCTTGTCGAAAATTCCGACAAGCAGCTCACTATAGAAAAATTACCTTTATCATTATCATATGAAATATCTAAAAAATCTTGTCCCCCTATTTTAAAAACCGAAGTTCTAAATGGAAAAATAAATTCTTTAAAAGAATTTAAAATTGTTTATAAAAAAAGTTTTGATTTAAAGGATACGCGCAAACCATTACTTAAGAAAAACGAAAAATATGAAAATGACATAAAAGAAGTATTAGATTTTATATTAAAAAATATAAAAGAATTTAAAAATATCGAATTTAACAAATTAAGACAAGAAAACTTAAAATTATTTTTTAATTCTATTTTGGAAATAAAGAAAAAAATAAAATATATTAAAAATAATTCTATTTAAATTTACAGCTGCACTAATAAGAATATATAAAATATATTCTTATTGTTCATTTTTTAAATATTATTTTTTTACTTTTAAATTTAACTACAAATAACAAAATATAAACTTTGCCCTTCTTTTAAAGCCCAATATTTCTTTATAAAAACTAAACAATTTTAAAATAAGCTTAAAAAATTTATGCATTGTGACAAATGCCTAAAAAATAAAAATTCTCATAAAATATTTTACAATCTTTAAATTATAAAAATAATTTAGCTACTATGACCAAAAAGGGAAACAATCCTTTTTAAATCGCCAGCAGTAAAATACTCTATCTCTATTTTGCCTTTATTTTGATTCCCTTTGATATCTATTTTTGTTTGGATTTTATCAAATAGAAATTCTTTTATATTATTTAAAAAAGGATCTTGTTCTAGCTCTCTTTTTTTTACTATGGATTTGGAAAAATTTTTAACATATTTTTCTGCATCCCTTACAGAAAATTTTTTTTTAAGTATAATTAAATAAAGATTATACCTGTCTTGCCTGTCTTTTAAGGATAAAATAACTTTAGCATGCCCAAAAGAAATTTCTTTTCTATGTATTGCATTTAATATTTCTTGCTCAAGATCTAAAATTCTAACTAAATTTGAAATATAGGTCCTGCTTTTACCAATTTTTTCAGATAAATCCTTTTGAGTTAACGAATATTTATTCATTATATTTTTATAGGCATAAGCCTCTTCAACAGGAGTAAAATTTTCTCTTTGAATATTTTCAACCAAGGGCATAAAATCTTTACAGGATTCTTTTATGTCAACCTCTATGACAGGAATATTTGTCAACTGAATAAGTTTAGCAGCCCTAAACCTTCTTTCTCCTACTATTATTTTATATCTATCATTTGCTTTACAAACAATTAAAGGTTGCAAAATTCCATTTTCTTTTATAGAAATGCTTAGCTCTTCTAATTCAACAAGACTAACAGATTTCCTTGGCTGATCATTATCAATATCTAAAAGATGAATATCTATCATTTTAAAAACTCCATCCATATTGTCAAAACCTCCTACAACACAAAATTTTACCAGGTTATAATATTGAATTACAATTTAAGAATAAAAAAAAAGAATGTTCCACGTGGAACATTCTTAAACAAGAAAAACCAATTCTTTATTTAATAAATTTTGAAACAGAAACCAAGCTGTCATTATCAAGAAATAATACTTGAATTCCTCTAGCATCTTTGCCTTGTTCAGATACTTTTCCAGCTACTGTTCTTAAAGCTTTTGAACGTTTACTTACAAGCAAGATTTCATCATCCTCTGAAACTGCTATAGCATCAACAACACTACCCGCTTTTTTATCAGATTTTTTATAACTAGTATAACCAGTGGCTCCTCTTTTAAGCTCAGATATTTTAGACATGTTTAACCTTTTTCCATACCCATTTTCAGAAACAATCAAAAGATAAGGATTTTCTTTAACCGATAAAACTTTAACAAACAAATCACCTTCTTTTAATTTCATTCCACAAACACCTTGGGTACCTCTATTAGTAAGCCTAACATCCCTTGAATTAAATATAAATGCACTACCCTTTTTAGAAAGACAAATTACTTTTTCATCCTTAAAAACAATCTCTGCACTTGTAACAAAATCTTTATCATTCAGTTTAATAACAATAACACCTCGTGACTTTACTGCTTTAAAATCTGTAGATTCGAATCTAGCTATCTTTCCACTTGCAGTTGTAAGCAATAAATAAGCATCATCAGTTAAATCTTTACTATTCTTAATAGTTAATATTTCTTCTTGATCTCCTAAATTAATAAGCTCACTAATATTCTGACCTTTTGAAGCTCTTGAAGAATCTTTTATTTCATAAGCATTGATTAAATAAAGCTTTCCTTCATTTGAAATCATAAATAAATAATCATGAGTATTGACACACAAAGCAATAACAATCTCATCTCCATCATTTAGATCAAACGAACTTAGTCCTTTTCCTCCCGTACCTTGCAATTTATACTCATTTTGTGAAAGTCTTTTAAGGAAACCTTTCTTTGTAAGCATAACAACAATATTTTCTTTTTGCATTAAATCCGACATACTAGTTTTTAAAACCTCCTCATCATAAATTATTTTAGTTCGACGTTCATCGCCAAATTTCAAACCTAAATTAATAGTTTCTTCTCTTATAATATTAATAATCCTTACTGGATTCAAGAGAATATCTTCATAATCTTTTATTAAGCTTAACAGTATATTAAGCTCCTCTTCAAGCTTAAAAATCTCAAGGGCTGTAAGTTTTTGTAACCTCATATCAAGAACTGAATTGGCCTGAATCTCTGAAAGACCAAAATTCGAAACAAGCCTCTCCCTTGCATCTTTTGCTAATTTAGATGATTTAATAATCTTAATAACCTCATCTATATTATTTAAAGCAATATTTAATCCCTCAAGAACATGTGCTTTCTCTTTTGCCTTTCTCAAGTCAAATTCAATACGTCTTTCGATAATATTTTTTCTATGCTCAATAAATTCAAATAACAATTCTTCTAAATTTAACTGTTTGGGAATACCATTAACAAGGGCTAAATTATTTATACTAAAATGCTTTTTAAATTCAGTATATTCATAAAGCAAATTCATAATAACATGAGGATCAAATCCTCTTTTAACTTCAAGAACTATCCTAATACCTTCTCGATCAGATTCATCTCTTATATCTAAAAGTCCTTCTAGCTTTTCTTCTTTTGCTAAAAGCGCAACTTTCATAAGAAGTGCAGATTTATTTACCGTATAAGGTATTTCTGTAACAATTATAGCATTTCTATCTTCTGCTCTTTCTTCAATATGATATCTTGCCCTAATAACAACACTTCCCTTGCCAGTTTTGTATGCTTTAATTAAATTATCATTATAAACAATCTCTCCAAAAGTTGGGAAATCAGGCCCTTTAACTATTTTAAGCAAATCAAATATAGAAGCATTCTCATTATCTAGCATGTAAACAATGGCATCACAAATTTCTCTTAAATTATGAGGTGCCATATTAGTAGCCATTCCAACAGCAATTCCACTAGAGCCATTTACCAAAAGAAATGGAAATGATGACGGCATAATCTCAGGCTCACTTAAAGAATCGTCATAATTAGACTTAAAATTAACAGTCTCTTTGTCTATATCCTTAACAATATATTCAGTTATTTTTTCCATTTTAGCTTCAGTATATCTCATAGCAGCGGGGGGATCTCCGTCAATAGATCCAAAATTTCCCTGTCCCCGTATTACGGGATATCTAAGCGAAAAATCCTGAGCAAGTCTTACAAGAGCATCATAAATTGATTGATCTCCATGAGGATGATATTTCCCAAGAACATCTCCCACTATTCTACCAGCTTTTTTAAAAGCCTTATCAGAACGAAGTCCCATCTCATACATAGAATAAAGTATTCTCCTGTGAACTGGTTTAAGACCATCTCTTACGTCTGGAAGAGCTCTAGAAACAATAACTGACATTGCATAATTTAAATAAGAAGTTTTTATTTCATCTTCTATCCTAACATTTAATATTTGTTCTTTATTTTCTCCAACTGCCATTAACGCTCCAATTACACATCAAGATTAATTACATTAAGTGCATTCTGTTCAATAAATTCTTTTCTGGGCTCAACTAAATCTCCCATAAGAGTAACAAAAATTTTTTCAGCTTCAATAGCATCATCTATATTCATCAATCTCATTTTTCTTCTAGCAGGATCCATAGTTGTTTCCCAAAGCTGCGTTGGATTCATCTCCCCAAGCCCTTTATATCTCTGAAGAGAAATACTATTGCGATTTTTAGTTTCAATAGAATCTAAAAATTTTTCTTTTTCTTTCTCTTCATAAAAATAATAAATACGATTGTCATACTTTATTTTATAAAGAGGAGGCATGGCTATATATATATATCCATTTTCAATTAAATCTCTCATATATCTAAAGAAAAAAGCTAAAAGCAAAGTTCTAATATGAGATCCATCAACATCGGCATCTGCCATAATAATGATCTTGTGATAACGAAGTTTTGTAATATCAAAAGTTTTACCAACTCCTGCACCAAGAGATGCAATTATGGGAATAAGCTTATCATTGGTGATAACCTTATCTTCTCTTGTTTTCTCAACATTAAGCATTTTCCCCCACAGTGGCAAAATGGCCTGAAAAAATCTATTTCTACCCATTTTAGCACTTCCTCCAGCAGAATCACCTTCTACAATATAGATTTCTCTTTCCAAAGGATTTTTAGAAGTACAATCAGCCAATTTTCCAGGCAATGCCAAGCTTTCAAATGCATTTTTTTTTCTTTCTGATTCTCTTGCTTTTCTTGCAGCTTCACGAGCACGAGCAGCTTTTATTGCTTTTCCAAGAATAGTGTCTATCTCTAAAGGATTTAAATTAATAATTTCCAATAAATGTTCATATACAACAACTTCAACTATTTTTCTTATCTCAGAATTACCAAGCTTACTTTTTGTTTGACCTTCAAATTGAGGTTCTGGTACTTTGACAGAAATAACAGCTGTAAGCCCCTCTTTAAAATCATCTCCTGTAAGATTTGGAATATCTTTTTTACTTATTTTTGAATTTTTAAAAGCTTCATTCATGGCCTTAGTAAGTCCACTTCTAAATCCCATAACATGAGTTCCCCCTTCTCTTGTATTAATGTTATTAACAAAAGAAAGAATGTTGTCAGAATAGCTTTCAGTCCATTTAAGCCCCACATTAACAATAACATCATTAATAAAACCATCAATATAATAAGGTTCTGATTGAAAAGCTTTGCTGTCATTAGTTAAATAATCTACAAAAGATTTTATCCCACCCTCAAAATAAAATTTTGAAGATTTTTCTTTACCAATTCTTTTATCTTCAATTGAAATGTATATTTTATCGTTTAAAAAAGCAAGCTCTTTAAGCCTTTTTTCAAGAACATCGAAATTATAATCTAAAGTTTCAAAAATTTCAGAATCCGCCAAAAAAGTAACCTTAGTCCCCGTAACAGAAGATTCCCCCACAACTTCTACTTTAGAAGTCGGAATACCTTTTGAAAAAGTTTGCCTAAAAATTTTTCCATCTCTATTAACATAAACCTCTAAAAACGAAGATAGAGCATTTACAACCGAAATTCCAACGCCATGAAGTCCCCCAGAAACTTTATACGTGCCTTTATTAAACTTACCACCAGAATGTAATTTTGTTAAAACAAGTTCAAGGGCACTAATACCCTCCTCTTCATGAATATCGGTAGGAATACCTCTCCCATTATCAATTACAGTTATAGTATTATCTAAATTGATAATAACATCTATTCTATCACAAAACCCAGCTAAAGCCTCATCAATGCTATTGTCAACCACCTCATAAACCAAATGGTGCAATCCATTAATAGAAACTGAGCCTATATACATGCCAGGCCTTTTCCTAACAGCCTCAAGTCCTTTTAAGACCTGAATGTTACTAGCAACATAATTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP019916|446967:456387|452038_454471_-|WP_002656784.1|DBSCAN-SWA
MAVGENKEQILNVRIEDEIKTSYLNYAMSVIVSRALPDVRDGLKPVHRRILYSMYEMGLRSDKAFKKAGRIVGDVLGKYHPHGDQSIYDALVRLAQDFSLRYPVIRGQGNFGSIDGDPPAAMRYTEAKMEKITEYIVKDIDKETVNFKSNYDDSLSEPEIMPSSFPFLLVNGSSGIAVGMATNMAPHNLREICDAIVYMLDNENASIFDLLKIVKGPDFPTFGEIVYNDNLIKAYKTGKGSVVIRARYHIEERAEDRNAIIVTEIPYTVNKSALLMKVALLAKEEKLEGLLDIRDESDREGIRIVLEVKRGFDPHVIMNLLYEYTEFKKHFSINNLALVNGIPKQLNLEELLFEFIEHRKNIIERRIEFDLRKAKEKAHVLEGLNIALNNIDEVIKIIKSSKLAKDARERLVSNFGLSEIQANSVLDMRLQKLTALEIFKLEEELNILLSLIKDYEDILLNPVRIINIIREETINLGLKFGDERRTKIIYDEEVLKTSMSDLMQKENIVVMLTKKGFLKRLSQNEYKLQGTGGKGLSSFDLNDGDEIVIALCVNTHDYLFMISNEGKLYLINAYEIKDSSRASKGQNISELINLGDQEEILTIKNSKDLTDDAYLLLTTASGKIARFESTDFKAVKSRGVIVIKLNDKDFVTSAEIVFKDEKVICLSKKGSAFIFNSRDVRLTNRGTQGVCGMKLKEGDLFVKVLSVKENPYLLIVSENGYGKRLNMSKISELKRGATGYTSYKKSDKKAGSVVDAIAVSEDDEILLVSKRSKALRTVAGKVSEQGKDARGIQVLFLDNDSLVSVSKFIK
>NZ_CP019916|446967:456387|448706_449309_+|WP_010889749.1|DBSCAN-SWA
MFVPKNNSNSKIEIKKSIFVSYIFNIEKKDDINKTIKKYKIKFKNATHVVYGFRIGNKNSFLNGMSDDREPNLTAGKPTLDAIIHNNLTDTLIITLRYFGGTLLGRGGLIKAYYKSAKEVINNTSIMEKEELEILSLNLTYNQYNSLLKMKNKLEIEIIDSNFSNKINTSIKFKTKNKQKISEFFIENGLIQEILKFNKE
>NZ_CP019916|446967:456387|447853_448171_+|WP_002657899.1|DBSCAN-SWA
MFALIRKIFMIYFLCITLAGFAMIFIDSKFTEQPNVKENQSKINQHTIEPNLIMFTSSIGGFLGVYVGIWIFNYDKSNFYLNWGNLIILIYNIALIITVYSKSHS
>NZ_CP019916|446967:456387|451137_451920_-|WP_002657907.1|DBSCAN-SWA
MDGVFKMIDIHLLDIDNDQPRKSVSLVELEELSISIKENGILQPLIVCKANDRYKIIVGERRFRAAKLIQLTNIPVIEVDIKESCKDFMPLVENIQRENFTPVEEAYAYKNIMNKYSLTQKDLSEKIGKSRTYISNLVRILDLEQEILNAIHRKEISFGHAKVILSLKDRQDRYNLYLIILKKKFSVRDAEKYVKNFSKSIVKKRELEQDPFLNNIKEFLFDKIQTKIDIKGNQNKGKIEIEYFTAGDLKRIVSLFGHSS
>NZ_CP019916|446967:456387|454482_456387_-|WP_010889750.1|DBSCAN-SWA
MNYVASNIQVLKGLEAVRKRPGMYIGSVSINGLHHLVYEVVDNSIDEALAGFCDRIDVIINLDNTITVIDNGRGIPTDIHEEEGISALELVLTKLHSGGKFNKGTYKVSGGLHGVGISVVNALSSFLEVYVNRDGKIFRQTFSKGIPTSKVEVVGESSVTGTKVTFLADSEIFETLDYNFDVLEKRLKELAFLNDKIYISIEDKRIGKEKSSKFYFEGGIKSFVDYLTNDSKAFQSEPYYIDGFINDVIVNVGLKWTESYSDNILSFVNNINTREGGTHVMGFRSGLTKAMNEAFKNSKISKKDIPNLTGDDFKEGLTAVISVKVPEPQFEGQTKSKLGNSEIRKIVEVVVYEHLLEIINLNPLEIDTILGKAIKAARAREAARKARESERKKNAFESLALPGKLADCTSKNPLEREIYIVEGDSAGGSAKMGRNRFFQAILPLWGKMLNVEKTREDKVITNDKLIPIIASLGAGVGKTFDITKLRYHKIIIMADADVDGSHIRTLLLAFFFRYMRDLIENGYIYIAMPPLYKIKYDNRIYYFYEEKEKEKFLDSIETKNRNSISLQRYKGLGEMNPTQLWETTMDPARRKMRLMNIDDAIEAEKIFVTLMGDLVEPRKEFIEQNALNVINLDV
>NZ_CP019916|446967:456387|450172_450886_+|WP_002657904.1|DBSCAN-SWA
MSDNLETLMFLMGKKLETSSNNSENTEKKEIISIERKNFDYNKLDKDISDFLKKKQYEIFNIFNNTYTKIGKILKDAQDKLKGNNQYNGLFYQWFKSMGFKKDKVYALISRYNLLVENSDKQLTIEKLPLSLSYEISKKSCPPILKTEVLNGKINSLKEFKIVYKKSFDLKDTRKPLLKKNEKYENDIKEVLDFILKNIKEFKNIEFNKLRQENLKLFFNSILEIKKKIKYIKNNSI
>NZ_CP019916|446967:456387|449417_450170_+|WP_002656688.1|DBSCAN-SWA
MKIISVINQKGGVGKTTSAINISYSMTLLNKKILLIDIDSQGNSTSGTNTSKHIAEKSSYELINKKIKVKPLNHFGLDIIPSSIKLALLEKELINELSRENFLKNALTLYEKDKYDFIIIDCPPTLSILTINALIASNYLLIPIETEFFAFEGINQLIDTITTVKQINKNLEIAGVFINKYDIRNKSKEKYVSSLKKVFKEKLLNTKIRKNITISKSQEAKMPVYEYDKESNAAKDFLELSKEIINKIKE
>NZ_CP019916|446967:456387|448200_448590_-|WP_002557021.1|DBSCAN-SWA
MISGLNPTLRLFKDHKILYSNMERGLKPLLEVDNFINKYIQNKEGLEIYDKVVGKAAAVIIYNIGLQNVQAGVVSQPAKDFLESRGIKVAYKKLVEKINDRAESLIESLENPEEVYKYMIKRGIIVNNL
>NZ_CP019916|446967:456387|446967_447735_-|WP_010889748.1|DBSCAN-SWA
MVSKRFWIFIIKKNVFNIFYLFLVLEELKGPVLYIVGTPIGNLEDITYRAIDVLKSVNVIFAEDTRVTSKLLSRYKINKKMISCNAVTENKKISLLLDYLAKGNSVAFVSDAGTPGLSDPGSLLVAAAFREGYKVCPIPGVSSFNTIVSVNPFRDKSVFFEGFLPNKGLKRFKRIAELYKRGDAFVLLESGHRILKLLVEISSVSLDAKVLIGREMTKIYEEYQIGKPLELKKYFESSKDKVKGEFTILVSRSRS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_010889748.1|446967_447735_-	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.2e-35	40.8
WP_002657899.1|447853_448171_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002557021.1|448200_448590_-	DUF1893 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010889749.1|448706_449309_+	YigZ family protein	A0A1X9I5T8	Streptococcus_phage	9.7e-17	30.5
WP_002656688.1|449417_450170_+	ParA family protein	H7BUL8	unidentified_phage	1.4e-17	27.5
WP_002657904.1|450172_450886_+	hypothetical protein	A0A1P8CWU6	Bacillus_phage	1.2e-24	38.7
WP_002657907.1|451137_451920_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	I3NLC2	Bifidobacterium_phage	3.8e-13	30.1
WP_002656784.1|452038_454471_-	DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.3e-104	32.9
WP_010889750.1|454482_456387_-	DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	3.1e-133	43.9

3. NZ_CP019921

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	15311 : 56093	53	Streptococcus_phage(25.0%)	integrase,terminase,holin	attL 26319:26339|attR 56599:56619

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP019921|15311:56093|DBSCAN-SWA
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MSKRNRDIDKAIASLDETRKKYFNLLDEIKNDKYFFPVIMNICSYYSVKKLPYDELLEVNRLAEIKLEKELYELILSK
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MKDFLITTKNPTCHNKHQHKLIYLTSTVDFLNKKDKKYTQQNILYYYNKNLKRNGLAPTTLRTMQNYLYKLEKVLKVTTNYYQHMGVNCGTEIYYKLKYPKKECYQKINKYFKERKNSRFKSRVNNHFKDNVSKNSSVNSVECLSNKNNIKEERKIKEIEKYQLRNYFNNCNFKTEEALSILYLNTDKDTKIEAINILKQNEIALIKKFNIKKSCMKEKQKKLKEILYNTRKKLEENGYNPKQLEINLQKVYENYKYKPHFIIENHKYNDLGYIKRKLEKSIERKKENSQQNYQNLKENIFNILIEQLKKEVNIEILKPIIKEYLNNQKKIEYNKVFGIYHLELLEIIKNEKNSLTTEEFSIKAV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_002658481.1|15311_15515_+|holin	holin BlyA	NA	NA	NA	NA
WP_010883868.1|15518_15866_+|holin	holin, BlyB family	NA	NA	NA	NA
WP_002658486.1|15855_16191_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883877.1|16183_16537_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883878.1|16641_17196_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883879.1|17301_17730_+	Mlp family lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_010883880.1|19163_20264_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883881.1|20274_20841_+	DUF226 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883882.1|20816_21572_+	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	1.2e-11	33.5
WP_010258840.1|21613_22174_+	chromosome replication/partitioning protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883883.1|22183_22723_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883884.1|23193_24519_+	DUF244 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883885.1|24571_24997_+	DUF261 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010883886.1|26209_26770_+	plasminogen-binding protein ErpP	NA	NA	NA	NA
26319:26339	attL	NA	NA	NA	NA
WP_010883887.1|26797_27829_+	ErpQ	NA	NA	NA	NA
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