Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019760 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-9, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP019765 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp54, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP019755 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp26, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP019763 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp36, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP019757 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP019762 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp28-1 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP019767 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 chromosome, complete genome | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
| NZ_CP019759 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP019756 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-1_1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
| NZ_CP019761 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp17, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP019758 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_cp32-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP019764 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp38, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP019766 | Borreliella burgdorferi strain B31_NRZ isolate B31 plasmid p_lp56, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
1. NZ_CP019767
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
446160 : 455580
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019767|446160:455580|DBSCAN-SWA ATTATGAACGACTTCTGCTGACTAGAATAGTAAACTCTCCTTTAACCTTATCCTTACTCGATTCAAAATATTTTTTTAATTCTAAAGGTTTGCCAATTTGATATTCTTCATAAATTTTTGTCATCTCGCGACCAATAAGAACCTTCGCATCTAAACTAACAGAAGAAATTTCAACAAGCAATTTCAAAATTCTATGACCAGATTCAAGCAGAACAAAAGCATCTCCCCTTTTATATAGCTCAGCAATTCTTTTAAATCTTTTAAGGCCTTTGTTAGGCAAAAATCCCTCAAAAAACACTGATTTATCTCTAAAAGGATTAACACTTACAATTGTATTAAAAGAACTTACTCCAGGAATTGGACAAACTTTGTATCCCTCTCTAAAAGCAGCAGCAACTAATAAGCTACCCGGATCACTAAGCCCCGGAGTACCAGCATCGCTAACAAAAGCAACAGAATTTCCTTTTGCCAAATAATCCAATAGCAAGCTTATCTTCTTGTTTTCTGTTACGGCATTACAAGAAATCATTTTTTTATTAATTTTATATCGAGACAAAAGTTTGCTAGTTACTCTCGTATCTTCCGCAAAGATAACATTTACCGATTTTAAAACATCAATTGCTCTATAAGTAATATCTTCTAAATTGCCTATTGGCGTACCAACAATATATAACACAGGCCCTTTTAATTCCTCCAAAACTAAAAATAAATAAAATATATTAAAAACATTTTTCTTAATGATAAAAATCCAAAACCTTTTACTTACCAAATACAAGAATAAGACATAAGCCATATTTTATATGTCTATCAAAATACTTGCTTTTGTATTACATTTAGTTATATCATTAAGTATTAATGATTAAAAAGTTAAAAGAAAGGGAAAATTTATGTTTGCATTAATTAGAAAAATATTTATGATCTATTTTTTATGCATTACTCTTGCAGGTTTTGCCATGATTTTTATTGACAGCAAATTTACCGAACAGCCTAATGTTAAAGAAAATCAAAGCAAAATTAATCAACATACAATTGAACCCAATTTAATCATGTTTACATCTTCTATAGGAGGATTTTTAGGTGTTTATGTTGGAATTTGGATCTTTAACTATGACAAAAGCAATTTTTACCTAAATTGGGGAAATTTAATAATATTAATATACAACATAGCCCTAATTATCACTGTATACTCAAAATCACATAGTTAGCTAACATATGGCTCAACTATTTTCATAATTTATAAATTATTAACTATAATACCTCTTTTAATCATATACTTATAAACCTCTTCGGGATTTTCTAAGCTTTCAATCAAGCTTTCTGCCCTGTCATTTATTTTTTCTACCAATTTTTTATAAGCCACTTTAATTCCTCTGCTTTCTAAAAAATCCTTTGCGGGTTGAGAAACAACCCCAGCTTGAACATTTTGAAGCCCTATATTATAAATAATAACGGCTGCTGCCTTGCCCACAACTTTATCATAAATTTCAAGTCCTTCTTTATTCTGGATATACTTATTGATAAAATTATCTACTTCTAAAAGAGGCTTCAATCCTCTTTCCATATTAGAATAAAGTATTTTATGATCTTTAAACAACCTTAATGTTGGATTCAAGCCTGATATCATTTTTACCTCTTTTCTGGATATTTATAAAAATCAATAATAAAAACAAACACTATTAATAATATACATAAACAATAAATACTGCAATATCTAAAAAGATAGTATACTTACGTTATATGATGTTTGTGCCAAAAAACAATAGTAATTCTAAAATTGAAATAAAGAAATCCATCTTTGTTTCATATATTTTTAATATTGAAAAAAAAGACGATATAAATAAAACTATTAAAAAATACAAAATAAAATTTAAAAATGCTACGCATGTGGTTTATGGATTTAGAATCGGAAACAAAAACTCATTTCTAAATGGAATGAGTGATGATCGAGAACCTAATTTAACAGCTGGAAAGCCCACATTGGATGCCATAATACATAACAATTTAACCGATACTTTAATAATCACATTGCGATATTTTGGAGGCACTTTACTTGGTAGAGGGGGATTAATCAAAGCGTATTACAAGTCTGCCAAAGAAGTTATTAATAATACATCTATAATGGAAAAAGAGGAATTAGAAATTTTAAGCTTAAATTTAACTTACAACCAATACAATTCATTATTAAAAATGAAAAATAAACTTGAAATAGAAATAATAGATTCAAACTTTTCAAACAAAATAAACACTTCAATTAAATTCAAAACAAAAAATAAACAAAAAATATCGGAATTTTTTATAGAAAATGGCTTAATTCAAGAAATCTTAAAGTTTAATAAAGAATAATATGCATGTCAAATAATCAAATATTTAAAAACTAATTTAAAATATTATTATTTTTATCATTTATGTTTTAAAATATAAAAACAAAACCAAATAAAAAGAGAAATTTATATGAAAATAATATCTGTAATCAATCAAAAAGGAGGCGTAGGAAAAACCACAAGCGCCATTAATATTTCTTATTCAATGACCCTGCTTAATAAAAAAATTCTTCTAATAGATATTGATTCGCAAGGAAACTCTACTAGCGGCACAAATACCTCAAAGCATATAGCCGAAAAATCAAGCTATGAACTTATTAACAAAAAAATAAAGGTCAAACCTTTAAATCATTTTGGATTAGACATAATTCCTTCTAGCATTAAATTAGCTTTGCTTGAAAAAGAATTAATAAATGAACTTTCAAGAGAAAATTTTTTAAAAAATGCATTAACACTGTATGAAAAAGACAAATATGATTTTATTATTATCGACTGCCCCCCTACACTTTCAATATTAACTATAAATGCACTTATTGCAAGCAATTACTTGTTAATACCAATTGAAACGGAATTTTTTGCATTTGAAGGCATAAATCAACTAATAGATACAATAACTACTGTAAAGCAAATAAATAAAAATTTAGAGATTGCGGGTGTTTTTATAAATAAATACGACATAAGGAACAAAAGTAAAGAAAAATATGTAAGCTCGCTAAAAAAAGTTTTTAAAGAAAAGCTTTTAAATACAAAAATAAGGAAAAATATAACTATCTCAAAATCTCAAGAAGCAAAAATGCCTGTATATGAATATGACAAGGAAAGCAATGCTGCAAAAGATTTTTTAGAGCTCTCAAAAGAGATAATAAACAAAATTAAGGAATAGCTATGTCTGACAATTTAGAAACTTTAATGTTTCTAATGGGTAAAAAATTAGAAACATCTTCAAATAATTCAGAAAATACTGAAAAAAAAGAAATTATTTCGATTGAAAGAAAAAACTTTGACTACAATAAGCTAGATAAAGATATTTCTGATTTTTTAAAAAAAAAGCAATATGAAATTTTCAATATTTTCAACAACACTTATACAAAAATTGGAAAGATACTTAAAGACGCTCAAGACAAATTAAAAGGAAACAATCAATATAACGGGCTTTTTTATCAGTGGTTCAAAAGTATGGGATTTAAAAAAGACAAGGTTTACGCCTTAATATCAAGATACAATCTGCTTGTCGAAAATTCCGACAAGCAGCTCACTATAGAAAAATTACCTTTATCATTATCATATGAAATATCTAAAAAATCTTGTCCCCCTATTTTAAAAACCGAAGTTCTAAATGGAAAAATAAATTCTTTAAAAGAATTTAAAATTGTTTATAAAAAAAGTTTTGATTTAAAGGATACGCGCAAACCATTACTTAAGAAAAACGAAAAATATGAAAATGACATAAAAGAAGTATTAGATTTTATATTAAAAAATATAAAAGAATTTAAAAATATCGAATTTAACAAATTAAGACAAGAAAACTTAAAATTATTTTTTAATTCTATTTTGGAAATAAAGAAAAAAATAAAATATATTAAAAATAATTCTATTTAAATTTACAGCTGCACTAATAAGAATATATAAAATATATTCTTATTGTTCATTTTTTAAATATTATTTTTTTACTTTTAAATTTAACTACAAATAACAAAATATAAACTTTGCCCTTCTTTTAAAGCCCAATATTTCTTTATAAAAACTAAACAATTTTAAAATAAGCTTAAAAAATTTATGCATTGTGACAAATGCCTAAAAAATAAAAATTCTCATAAAATATTTTACAATCTTTAAATTATAAAAATAATTTAGCTACTATGACCAAAAAGGGAAACAATCCTTTTTAAATCGCCAGCAGTAAAATACTCTATCTCTATTTTGCCTTTATTTTGATTCCCTTTGATATCTATTTTTGTTTGGATTTTATCAAATAGAAATTCTTTTATATTATTTAAAAAAGGATCTTGTTCTAGCTCTCTTTTTTTTACTATGGATTTGGAAAAATTTTTAACATATTTTTCTGCATCCCTTACAGAAAATTTTTTTTTAAGTATAATTAAATAAAGATTATACCTGTCTTGCCTGTCTTTTAAGGATAAAATAACTTTAGCATGCCCAAAAGAAATTTCTTTTCTATGTATTGCATTTAATATTTCTTGCTCAAGATCTAAAATTCTAACTAAATTTGAAATATAGGTCCTGCTTTTACCAATTTTTTCAGATAAATCCTTTTGAGTTAACGAATATTTATTCATTATATTTTTATAGGCATAAGCCTCTTCAACAGGAGTAAAATTTTCTCTTTGAATATTTTCAACCAAGGGCATAAAATCTTTACAGGATTCTTTTATGTCAACCTCTATGACAGGAATATTTGTCAACTGAATAAGTTTAGCAGCCCTAAACCTTCTTTCTCCTACTATTATTTTATATCTATCATTTGCTTTACAAACAATTAAAGGTTGCAAAATTCCATTTTCTTTTATAGAAATGCTTAGCTCTTCTAATTCAACAAGACTAACAGATTTCCTTGGCTGATCATTATCAATATCTAAAAGATGAATATCTATCATTTTAAAAACTCCATCCATATTGTCAAAACCTCCTACAACACAAAATTTTACCAGGTTATAATATTGAATTACAATTTAAGAATAAAAAAAAAGAATGTTCCACGTGGAACATTCTTAAACAAGAAAAACCAATTCTTTATTTAATAAATTTTGAAACAGAAACCAAGCTGTCATTATCAAGAAATAATACTTGAATTCCTCTAGCATCTTTGCCTTGTTCAGATACTTTTCCAGCTACTGTTCTTAAAGCTTTTGAACGTTTACTTACAAGCAAGATTTCATCATCCTCTGAAACTGCTATAGCATCAACAACACTACCCGCTTTTTTATCAGATTTTTTATAACTAGTATAACCAGTGGCTCCTCTTTTAAGCTCAGATATTTTAGACATGTTTAACCTTTTTCCATACCCATTTTCAGAAACAATCAAAAGATAAGGATTTTCTTTAACCGATAAAACTTTAACAAACAAATCACCTTCTTTTAATTTCATTCCACAAACACCTTGGGTACCTCTATTAGTAAGCCTAACATCCCTTGAATTAAATATAAATGCACTACCCTTTTTAGAAAGACAAATTACTTTTTCATCCTTAAAAACAATCTCTGCACTTGTAACAAAATCTTTATCATTCAGTTTAATAACAATAACACCTCGTGACTTTACTGCTTTAAAATCTGTAGATTCGAATCTAGCTATCTTTCCACTTGCAGTTGTAAGCAATAAATAAGCATCATCAGTTAAATCTTTACTATTCTTAATAGTTAATATTTCTTCTTGATCTCCTAAATTAATAAGCTCACTAATATTCTGACCTTTTGAAGCTCTTGAAGAATCTTTTATTTCATAAGCATTGATTAAATAAAGCTTTCCTTCATTTGAAATCATAAATAAATAATCATGAGTATTGACACACAAAGCAATAACAATCTCATCTCCATCATTTAGATCAAACGAACTTAGTCCTTTTCCTCCCGTACCTTGCAATTTATACTCATTTTGTGAAAGTCTTTTAAGGAAACCTTTCTTTGTAAGCATAACAACAATATTTTCTTTTTGCATTAAATCCGACATACTAGTTTTTAAAACCTCCTCATCATAAATTATTTTAGTTCGACGTTCATCGCCAAATTTCAAACCTAAATTAATAGTTTCTTCTCTTATAATATTAATAATCCTTACTGGATTCAAGAGAATATCTTCATAATCTTTTATTAAGCTTAACAGTATATTAAGCTCCTCTTCAAGCTTAAAAATCTCAAGGGCTGTAAGTTTTTGTAACCTCATATCAAGAACTGAATTGGCCTGAATCTCTGAAAGACCAAAATTCGAAACAAGCCTCTCCCTTGCATCTTTTGCTAATTTAGATGATTTAATAATCTTAATAACCTCATCTATATTATTTAAAGCAATATTTAATCCCTCAAGAACATGTGCTTTCTCTTTTGCCTTTCTCAAGTCAAATTCAATACGTCTTTCGATAATATTTTTTCTATGCTCAATAAATTCAAATAACAATTCTTCTAAATTTAACTGTTTGGGAATACCATTAACAAGGGCTAAATTATTTATACTAAAATGCTTTTTAAATTCAGTATATTCATAAAGCAAATTCATAATAACATGAGGATCAAATCCTCTTTTAACTTCAAGAACTATCCTAATACCTTCTCGATCAGATTCATCTCTTATATCTAAAAGTCCTTCTAGCTTTTCTTCTTTTGCTAAAAGCGCAACTTTCATAAGAAGTGCAGATTTATTTACCGTATAAGGTATTTCTGTAACAATTATAGCATTTCTATCTTCTGCTCTTTCTTCAATATGATATCTTGCCCTAATAACAACACTTCCCTTGCCAGTTTTGTATGCTTTAATTAAATTATCATTATAAACAATCTCTCCAAAAGTTGGGAAATCAGGCCCTTTAACTATTTTAAGCAAATCAAATATAGAAGCATTCTCATTATCTAGCATGTAAACAATGGCATCACAAATTTCTCTTAAATTATGAGGTGCCATATTAGTAGCCATTCCAACAGCAATTCCACTAGAGCCATTTACCAAAAGAAATGGAAATGATGACGGCATAATCTCAGGCTCACTTAAAGAATCGTCATAATTAGACTTAAAATTAACAGTCTCTTTGTCTATATCCTTAACAATATATTCAGTTATTTTTTCCATTTTAGCTTCAGTATATCTCATAGCAGCGGGGGGATCTCCGTCAATAGATCCAAAATTTCCCTGTCCCCGTATTACGGGATATCTAAGCGAAAAATCCTGAGCAAGTCTTACAAGAGCATCATAAATTGATTGATCTCCATGAGGATGATATTTCCCAAGAACATCTCCCACTATTCTACCAGCTTTTTTAAAAGCCTTATCAGAACGAAGTCCCATCTCATACATAGAATAAAGTATTCTCCTGTGAACTGGTTTAAGACCATCTCTTACGTCTGGAAGAGCTCTAGAAACAATAACTGACATTGCATAATTTAAATAAGAAGTTTTTATTTCATCTTCTATCCTAACATTTAATATTTGTTCTTTATTTTCTCCAACTGCCATTAACGCTCCAATTACACATCAAGATTAATTACATTAAGTGCATTCTGTTCAATAAATTCTTTTCTGGGCTCAACTAAATCTCCCATAAGAGTAACAAAAATTTTTTCAGCTTCAATAGCATCATCTATATTCATCAATCTCATTTTTCTTCTAGCAGGATCCATAGTTGTTTCCCAAAGCTGCGTTGGATTCATCTCCCCAAGCCCTTTATATCTCTGAAGAGAAATACTATTGCGATTTTTAGTTTCAATAGAATCTAAAAATTTTTCTTTTTCTTTCTCTTCATAAAAATAATAAATACGATTGTCATACTTTATTTTATAAAGAGGAGGCATGGCTATATATATATATCCATTTTCAATTAAATCTCTCATATATCTAAAGAAAAAAGCTAAAAGCAAAGTTCTAATATGAGATCCATCAACATCGGCATCTGCCATAATAATGATCTTGTGATAACGAAGTTTTGTAATATCAAAAGTTTTACCAACTCCTGCACCAAGAGATGCAATTATGGGAATAAGCTTATCATTGGTGATAACCTTATCTTCTCTTGTTTTCTCAACATTAAGCATTTTCCCCCACAGTGGCAAAATGGCCTGAAAAAATCTATTTCTACCCATTTTAGCACTTCCTCCAGCAGAATCACCTTCTACAATATAGATTTCTCTTTCCAAAGGATTTTTAGAAGTACAATCAGCCAATTTTCCAGGCAATGCCAAGCTTTCAAATGCATTTTTTTTTCTTTCTGATTCTCTTGCTTTTCTTGCAGCTTCACGAGCACGAGCAGCTTTTATTGCTTTTCCAAGAATAGTGTCTATCTCTAAAGGATTTAAATTAATAATTTCCAATAAATGTTCATATACAACAACTTCAACTATTTTTCTTATCTCAGAATTACCAAGCTTACTTTTTGTTTGACCTTCAAATTGAGGTTCTGGTACTTTGACAGAAATAACAGCTGTAAGCCCCTCTTTAAAATCATCTCCTGTAAGATTTGGAATATCTTTTTTACTTATTTTTGAATTTTTAAAAGCTTCATTCATGGCCTTAGTAAGTCCACTTCTAAATCCCATAACATGAGTTCCCCCTTCTCTTGTATTAATGTTATTAACAAAAGAAAGAATGTTGTCAGAATAGCTTTCAGTCCATTTAAGCCCCACATTAACAATAACATCATTAATAAAACCATCAATATAATAAGGTTCTGATTGAAAAGCTTTGCTGTCATTAGTTAAATAATCTACAAAAGATTTTATCCCACCCTCAAAATAAAATTTTGAAGATTTTTCTTTACCAATTCTTTTATCTTCAATTGAAATGTATATTTTATCGTTTAAAAAAGCAAGCTCTTTAAGCCTTTTTTCAAGAACATCGAAATTATAATCTAAAGTTTCAAAAATTTCAGAATCCGCCAAAAAAGTAACCTTAGTCCCCGTAACAGAAGATTCCCCCACAACTTCTACTTTAGAAGTCGGAATACCTTTTGAAAAAGTTTGCCTAAAAATTTTTCCATCTCTATTAACATAAACCTCTAAAAACGAAGATAGAGCATTTACAACCGAAATTCCAACGCCATGAAGTCCCCCAGAAACTTTATACGTGCCTTTATTAAACTTACCACCAGAATGTAATTTTGTTAAAACAAGTTCAAGGGCACTAATACCCTCCTCTTCATGAATATCGGTAGGAATACCTCTCCCATTATCAATTACAGTTATAGTATTATCTAAATTGATAATAACATCTATTCTATCACAAAACCCAGCTAAAGCCTCATCAATGCTATTGTCAACCACCTCATAAACCAAATGGTGCAATCCATTAATAGAAACTGAGCCTATATACATGCCAGGCCTTTTCCTAACAGCCTCAAGTCCTTTTAAGACCTGAATGTTACTAGCAACATAATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019767|446160:455580|447046_447364_+|WP_002657899.1|DBSCAN-SWA MFALIRKIFMIYFLCITLAGFAMIFIDSKFTEQPNVKENQSKINQHTIEPNLIMFTSSIGGFLGVYVGIWIFNYDKSNFYLNWGNLIILIYNIALIITVYSKSHS >NZ_CP019767|446160:455580|447896_448502_+|WP_044283515.1|DBSCAN-SWA MMFVPKNNSNSKIEIKKSIFVSYIFNIEKKDDINKTIKKYKIKFKNATHVVYGFRIGNKNSFLNGMSDDREPNLTAGKPTLDAIIHNNLTDTLIITLRYFGGTLLGRGGLIKAYYKSAKEVINNTSIMEKEELEILSLNLTYNQYNSLLKMKNKLEIEIIDSNFSNKINTSIKFKTKNKQKISEFFIENGLIQEILKFNKE >NZ_CP019767|446160:455580|446160_446835_-|WP_002664138.1|DBSCAN-SWA MLYIVGTPIGNLEDITYRAIDVLKSVNVIFAEDTRVTSKLLSRYKINKKMISCNAVTENKKISLLLDYLAKGNSVAFVSDAGTPGLSDPGSLLVAAAFREGYKVCPIPGVSSFNTIVSVNPFRDKSVFFEGFLPNKGLKRFKRIAELYKRGDAFVLLESGHRILKLLVEISSVSLDAKVLIGREMTKIYEEYQIGKPLELKKYFESSKDKVKGEFTILVSRSRS >NZ_CP019767|446160:455580|453675_455580_-|WP_010889750.1|DBSCAN-SWA MNYVASNIQVLKGLEAVRKRPGMYIGSVSINGLHHLVYEVVDNSIDEALAGFCDRIDVIINLDNTITVIDNGRGIPTDIHEEEGISALELVLTKLHSGGKFNKGTYKVSGGLHGVGISVVNALSSFLEVYVNRDGKIFRQTFSKGIPTSKVEVVGESSVTGTKVTFLADSEIFETLDYNFDVLEKRLKELAFLNDKIYISIEDKRIGKEKSSKFYFEGGIKSFVDYLTNDSKAFQSEPYYIDGFINDVIVNVGLKWTESYSDNILSFVNNINTREGGTHVMGFRSGLTKAMNEAFKNSKISKKDIPNLTGDDFKEGLTAVISVKVPEPQFEGQTKSKLGNSEIRKIVEVVVYEHLLEIINLNPLEIDTILGKAIKAARAREAARKARESERKKNAFESLALPGKLADCTSKNPLEREIYIVEGDSAGGSAKMGRNRFFQAILPLWGKMLNVEKTREDKVITNDKLIPIIASLGAGVGKTFDITKLRYHKIIIMADADVDGSHIRTLLLAFFFRYMRDLIENGYIYIAMPPLYKIKYDNRIYYFYEEKEKEKFLDSIETKNRNSISLQRYKGLGEMNPTQLWETTMDPARRKMRLMNIDDAIEAEKIFVTLMGDLVEPRKEFIEQNALNVINLDV >NZ_CP019767|446160:455580|447393_447783_-|WP_002557021.1|DBSCAN-SWA MISGLNPTLRLFKDHKILYSNMERGLKPLLEVDNFINKYIQNKEGLEIYDKVVGKAAAVIIYNIGLQNVQAGVVSQPAKDFLESRGIKVAYKKLVEKINDRAESLIESLENPEEVYKYMIKRGIIVNNL >NZ_CP019767|446160:455580|450330_451113_-|WP_002657907.1|DBSCAN-SWA MDGVFKMIDIHLLDIDNDQPRKSVSLVELEELSISIKENGILQPLIVCKANDRYKIIVGERRFRAAKLIQLTNIPVIEVDIKESCKDFMPLVENIQRENFTPVEEAYAYKNIMNKYSLTQKDLSEKIGKSRTYISNLVRILDLEQEILNAIHRKEISFGHAKVILSLKDRQDRYNLYLIILKKKFSVRDAEKYVKNFSKSIVKKRELEQDPFLNNIKEFLFDKIQTKIDIKGNQNKGKIEIEYFTAGDLKRIVSLFGHSS >NZ_CP019767|446160:455580|448610_449363_+|WP_002656688.1|DBSCAN-SWA MKIISVINQKGGVGKTTSAINISYSMTLLNKKILLIDIDSQGNSTSGTNTSKHIAEKSSYELINKKIKVKPLNHFGLDIIPSSIKLALLEKELINELSRENFLKNALTLYEKDKYDFIIIDCPPTLSILTINALIASNYLLIPIETEFFAFEGINQLIDTITTVKQINKNLEIAGVFINKYDIRNKSKEKYVSSLKKVFKEKLLNTKIRKNITISKSQEAKMPVYEYDKESNAAKDFLELSKEIINKIKE >NZ_CP019767|446160:455580|449365_450079_+|WP_002657904.1|DBSCAN-SWA MSDNLETLMFLMGKKLETSSNNSENTEKKEIISIERKNFDYNKLDKDISDFLKKKQYEIFNIFNNTYTKIGKILKDAQDKLKGNNQYNGLFYQWFKSMGFKKDKVYALISRYNLLVENSDKQLTIEKLPLSLSYEISKKSCPPILKTEVLNGKINSLKEFKIVYKKSFDLKDTRKPLLKKNEKYENDIKEVLDFILKNIKEFKNIEFNKLRQENLKLFFNSILEIKKKIKYIKNNSI >NZ_CP019767|446160:455580|451231_453664_-|WP_002656784.1|DBSCAN-SWA MAVGENKEQILNVRIEDEIKTSYLNYAMSVIVSRALPDVRDGLKPVHRRILYSMYEMGLRSDKAFKKAGRIVGDVLGKYHPHGDQSIYDALVRLAQDFSLRYPVIRGQGNFGSIDGDPPAAMRYTEAKMEKITEYIVKDIDKETVNFKSNYDDSLSEPEIMPSSFPFLLVNGSSGIAVGMATNMAPHNLREICDAIVYMLDNENASIFDLLKIVKGPDFPTFGEIVYNDNLIKAYKTGKGSVVIRARYHIEERAEDRNAIIVTEIPYTVNKSALLMKVALLAKEEKLEGLLDIRDESDREGIRIVLEVKRGFDPHVIMNLLYEYTEFKKHFSINNLALVNGIPKQLNLEELLFEFIEHRKNIIERRIEFDLRKAKEKAHVLEGLNIALNNIDEVIKIIKSSKLAKDARERLVSNFGLSEIQANSVLDMRLQKLTALEIFKLEEELNILLSLIKDYEDILLNPVRIINIIREETINLGLKFGDERRTKIIYDEEVLKTSMSDLMQKENIVVMLTKKGFLKRLSQNEYKLQGTGGKGLSSFDLNDGDEIVIALCVNTHDYLFMISNEGKLYLINAYEIKDSSRASKGQNISELINLGDQEEILTIKNSKDLTDDAYLLLTTASGKIARFESTDFKAVKSRGVIVIKLNDKDFVTSAEIVFKDEKVICLSKKGSAFIFNSRDVRLTNRGTQGVCGMKLKEGDLFVKVLSVKENPYLLIVSENGYGKRLNMSKISELKRGATGYTSYKKSDKKAGSVVDAIAVSEDDEILLVSKRSKALRTVAGKVSEQGKDARGIQVLFLDNDSLVSVSKFIK |
9 | Streptococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
2. NZ_CP019756
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
15211 : 46444
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019756|15211:46444|DBSCAN-SWA AATGGATACTATTAAATTAACCGAACTTCTTATCAATTTAAACGAAATTAAACTTATAGCGGTAATGATTTTTGTAACAGTGCTGGTTTTAGGAGTATTAATTCTTCTCAAGCCTTTACTAAAAGACATATTGACTATTGTAATAGGCAAGATTTTTAAGAATGGTAATGGTAATGGCAAAAATCACATTAAAAAAAGAGATTAACTTATGAAATTATCCAAAGATAATGTTGAGCTTGGACTTACGTCTTTATCAACCCTTATTGATATATTTTCTAAATTTGAAGATGAATTTGATGAAATTGCACATAAAGGATTCTTTTTGGTTTATGAGCTGTATTCTCATTATAAATTAATCTATACAGCAAATATGGAAAGACTTGAGAGTGCATTAACCCCAGCAATAAATAAAGCACTCGCTCCATTAAATGAAAAAATCAATCAATGCATTGACTTAGTTAATTCTGATGAAAAAAATCTCAAAATATCTAATGATCTGAAATTCAATCAGGAAGGAAAACCTATCTATAAGGAAAGAACAAATAATGCAAAATAACACTATTGGTTTAGGACTTAATTTACTATCCAGCTTAACTAACATAGCTAAAACTGATACAAACATAGATCATAATTACATTAATACTTTTAGTAAAGTAATAGATTTTTTCTACAAAACATATATAAGCACACTAAAATCTATGGAAACAGCTGAGTCAACTAAAATATTTGAAGAAATAAAAGACATTTTAAAATACAATATTGAGATAATAGAGGCTATCTCTTATGACAAAAATAAAAAAATTATCACTTCACTTAAAGCAAAACGCAACAAAATTATGAAAGAATACATCAAAATGCTTAAAAGGAGTGAAAATGCTTAAAAGATTGCATTGTTTACTAATTGTTTTGTTGTTATGTTGCACCACTATTGCTAACCTACCAGAAGAACCAAAACCGCCAATTATTCCAACGCTAAAATCTTTAGCTAAATATGAAACACAACTTTCAGAATATGTTATGTATCTTGTAACATTTTTAGCTAAAACAAAAGTGAAAGTTAATGACCCCAATTATCCAGAATATCCTTATCCAGACTTATCAACACTAAAAGACGAACACTCTATACCTGCGGTAAAACATAACATCAAGATATATTTAGAGTACATTAAAAAAGCAAAACCAATAGCGGAAAAAGTATATCATCAATATTCGAAGTTAAAAATGTAAATTACAAAAAGGTTTTTCTTGCAAGAAATTCTAATTTATGATCAAATCGGCTTTTGCAACAAAAGAAAAATCTAGATATTAGATTGACGCAGATTTAATATCTAGATTTTAACATTTTCAACAGGAATATTTGCTAATTAATTAGTGCCCTCTTCGAGGAACTTTATTACTTTGTCTATCTGTTCTACAGCGTTTTTAGACATTTTATCCCCATTACCAGAAGTATTGCTTCCAAGAAGTGGTACAGTTACTCCAACTAATTTTGCTTCTGACCATATTTTTCTTTTTGAAATATCCTGATCCTTGTCAGTAATGTTTTCAATGGTATTTTTAGCTGCTTTTAACGCTGCTAATTTGGCCGCTAATTTATCCTGAAAGGAATTTTGCAAATTTAATAGTTTTTCTTTAAGCTCCGCATTGCCTATATCTTTTAAATTTTCTTTTAATTCATTTATTTTGTCTTTATAATCTTTAAATTTGCCTCCAGAAGAATCATTTACAAGAGCTAAAACATCCTCCATTAATGAATCTATTTCTTTCTTTTCTTCTACATATGCTTTACAAGCCATTACAAATAACATTGCTGCAAAAAATAATTTAAATATGTTTTTATTTCTCATTAGTTACTCCTATATTCAATAATAATGAGATAAAAGCTAGCACAACATTTGAAAAATATAAATCTCTCAATTAATATTTTTAAAGATTTTTAAAAATAAGCTCTATAATTACAAGAATAAATTTTATTTTTACTCAACATATTGTACTGGAGATAAGGAAAGGAAATAACAATGAAAATCATCAACATATTATTTTGTTTATTTTTACTACTACTAAATAGCTGCAATTCTAATGATAATGACACTTTAAAAAACAATGCACAACAAACAAAAAGCAGGGGAAAGCGTGATTTAACCCAAAAAGAAGCAACACCAGAAAAACCTAAATCTAAAGAAGAACTACTTAGAGAAAAGCTATCTGAAGACCAGAAAACACACCTTGACTGGTTAAAAGAAGCTCTGGGTAATGATGGAGAATTTGATAAATTTTTAGGATATGATGAAAGTAAAATAAAAACAGCACTTGATCATATAAAAAGTGAACTTGATAAATGTAATGGAAATGATGCAGACCAACAAAAAACCACTTTCAAACAAACAGTTCAAGGAGCTCTTAGTGGGGGGATAGATGGATTTGGTTCAAATAATGCAGTTACTACCTGCGGCAATGGGTCCTAATAGTTAACAGCCCCCATATTGGGGGCTTTAATCTTGCTATGCTGCAAATATCTCATCAAACCGTTCGTATTCTTTTAAGATACTAAAGAATATTAATGGACTAGGGCCATAAATAGGCCTCTTAAGCCCCATAAACCTTTCAAAATCTTGTAAATCCTTTAATCTATTATTTTTCTTGAAATAGTTTTTTATAATCTCGGCCCAATAGTTTATGCTTTTAAAATCACTATTTTTCTCAAAATACGAGATTAAATCAGATTCAATTTTCTTGATATCATCAAAATTATTGGGGTCTATATTCTGAATAAAGCTTATTTTTTGAATAATTGAGTTTATATTATCTTTTGTTGTAGGGCTATTTACCCAGTCTTTTATATTAGACAAAGCTTCTTTAAAAACACCGTAATAATAAAGCCTATCTTTTTTTTGTTCTTGCTTAATATCTCTTTTCTGGTTTTGAATAGTGTTATTTTTTTGAATTTGATTAATCTCTTGTTTTTGTTCTCTTTTTTGTTCTTGCTTTTGATTAACACTAACTTGCTTGCTAGGCATAGAATTTTCGTTTTCGTGGTTATTGTAAATAGGAGCTGCATCAGTATCTATTTCACTTTCTATACCAAGAGCTGCAACTAAAGCATACCTTTTGACATAAGTAATGCCTGAACCAAACATCTGATACACTGTATTTGTAACTTTAGACCCATTTTCATTGTTCCATTGTAAATTTTCTGTAGGAATTCGCGTATCAAAAGAAAATTCATATCCAGTACTTGTACTGTAGAATGTAGTCCTAATATAATCAACTATGCCATATTGACCCTCTATAGAAATTGGATATTGCTCAATATCAAGCTCCAAATTGTGCTTTTTAATAACATTTTTAATTTCTCTAACTATTTCATTGAAATTTTGATATTTATATCCATATCCTTTAAGACTTTTGTCAATCCCTGGTAAATTCATTTTTAGGGTTTTCATATCTTTTCGGAAGCTTATTTTTGCTTGAATATTATTTTGTATTTCTTGATTATTATTGTTTGAAAGATTTTCCATCTTTTTCCTCCTTTAATTGGTATTAATAAATATAAGTATATAGCAAAAACTATTTTTGCCAACTTTTTTACAAAAATTTTTACAAAAAATTAGGGCTTAGCTAAATTTTCTATTATCTACTAAAAAACTTAGTTAATCCCTAATTTCTTTTTTTTTTGAAAATTCCAATTAAAGGTAGTTAAAACTGAAAAATGTTCAAATAACTACGCTGTTTGTAGTGTAGCCCAATTTTTAATTAAAATCAATCAATCTTTTTATCAAGTTACAAAATGTATATTAATTTAACAAAATTAACAATTAAAATTTAATATTCTTTTAGAAAAGTATTTACTTTTAAATCAAAATTTTGCATTATAATAATTAATTATTAATACCAATTAAAGGAGAAAAAACATGAAAGGTTTTTCAAAAAATCCCACTTGCCACAATAAACACCAACACAAACTAATATCTCTTACTTCAACACTAGATTTTTTAAACAAAAAAGATAAAAAATACACACAACAAAACATACTCTATTACTATAATAAAAATCTAAAAAGAAATGGTTTGGCTCCCACTACTTTAAGAACAATGCAAAACTATCTTTACAAATTAGAAAAAGTATTAAAAGTTACAACTAATTACTACCAACACATGGGAGTAAATTGTGGAACTGAAATTTACTATAAGCTAAAGTATCCTAAAAAAGATTGTTACCAGAAAATCAACAAGTACTTTAAAGAACGAAAAAACTCTAGATTTAAATCTAGAGTTAATAAACATTTAAAAGACAATGTTTCTAAAAATAGTAGTGTAAATTTAGTGGAGTGTTTAAGTAATAAAAATAATATAAAAGAAGAAAGAAAGATTAAAGAAATAGAAAAATATCAACTAAGAAATTATTTCAATAATTGTAACTTTAAAACGGAAGAAGCTCTTTCTATTTTGTATTTAAATACTGATAAAGATACTAAGATTGAGGCAATAAATATCTTAAAACAAAATGAAATTGCCCTAATAAAAAAATTCAATATAAAAAAATCTTGCATGAAAGAAAAACAAAAAAAATTAAAAGAAATTCTATACAACACTAGGAAAAAATTAGAAGAAAACGGGTATAATCCCAAACAATTAGAAATAAATTTACAAAAAGTATACGAAAATTACAAATATAAGCCCCATTTTATTATTGAAAATCATAAATATAGCGATTTAAACAATATAAAGCGTAAATTAGAAGAGTCGATTGAAAGAAAAAAAGAAAATCCTCAACAAAATTATCAAAATTTAAAGGAAAATATTTTCAATATCCTTATTGAACAACTAAAAAAAGAAACAAATATTGAAATTCTAAAGCCAATTATCAAAAAATATTTGAATAACCAAAAGAAAATAGAATACAATAAAGTATTTGGTATATATCATCTTGAATTATTAGAAATAATAAAAAATGAAAAAAATTCTTTAACCACAGAAGAATTTAGCATAAGGGCCGTATAA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44 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | holin,terminase,integrase | attL 8268:8327|attR 38946:47147 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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