Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028799 | Acinetobacter junii strain WCHAJ59 plasmid p2_010059, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP028798 | Acinetobacter junii strain WCHAJ59 plasmid p1_010059, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP028800 | Acinetobacter junii strain WCHAJ59 chromosome, complete genome | 2 crisprs | TnsE_C,csa3,RT,cas3,DEDDh,WYL,PrimPol | 0 | 1 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
20432 : 29346
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP028798|20432:29346|DBSCAN-SWA GCTATTCACTAACTTGTAAATATCGGTATACCGCCTGACGACTAATCCCAAAAGCTTTCCCTAATGCCATTTTCGATGGATACTTCCCCTCCTTCCATGCTTGTCGTAAAGCTTCAGCTTGGTCAGGCTTTAGTTTATGCACCCGACCTTTGTACTTCCCCTGAGCAGAGGCGAGTTTTATTCCTTCCTTTTGCCGCTCTAAAATGATCTCACGTTCGAACTGTGCAAAAGCACCCATCATTTGAAGCATCAAATTATCCATCGGGGTGGATTCGGCTGTAAAAGTAATATTTTCTTTTACAAACTGGATGGCGATCCCTCGTTTGACCAGTTTATCTACTTCAGTGACCAAATCTTTTAGGCTTCGCGCAAAACGATCCATTGAATGTACAATCACCCTGTCCCCTTCCCGGACATAGTTCAACATTTCCTGAAATTTAGGTCGGTCAGTATTTTTACCTGAAGCACGGTCAACAAAAATCCGGTCGACCTCAATTCCTTCAAGTTGACGTCCAGTGTTTTGCTCGACAGAACTTACCCGGACATACCCTACTTTTTGGCCTTTCACTTTTTCACGCCCCAATTGGATAAAAATGAAAAATTTCGTAAATTATAATTCTTTAACACTAAAGTTACATGTTACTTATGATTAAAAATCATTTAAATGATACATAATTTCATGAACTTTCAGATTGTAACTTTAGGGTATAGTCTAATATTACAAATATCAATAAGAAGATACTTTGATTTTTAAATCTCTGAGCAAAATCATTTACAAACTCACATACACAAAGTATGTTTATAAAACACAAAACTGAACCATAGTTTGTGTTCTCTAGTGGTTAATGGTAATGATTATTACCATTAGTGAAGCGCACAGTTTTTCAAATTGGGCGTTTTAATTAATAATTAAAATTCAATAAATTTCATTTAGTTAAATTACAAAATACTGAATAAAATGACTACGCATTCTTGTTCATAGTCTATCACTCATTCCTTCTTCCAATAGCCCATCAATAATTAAATTACATGGCTAATTTTGCAAATACCTTCAGTTTTAATGGAAACACTAGAAAAGATTCAATATAAGTTTAGCAAGACAAAACTGGTACTTGGAGCAAGTATGCTACCCAATAGGACATGGAAGATGACCAGAGATAAGTTGACGCATAACTACTTTAAGTGGGATCAACTCTGGGTTGTGAAATAGAGATGATCCCCTATTAAATGCACAATTATAGTTTCTAATTAGTTTTAATTTAGTTTCAATTAAATATTAAAAAACAACTAAAATCTGTAAGATATATTCCATATGTGCATTAAGCAGGAATTCCTTAATGAAAGAATTCCTGCTTAATGCAATCAATTACTTATGAATGTCGAGAGTTGGCTTCATCATACACAGCATTGTTTTCACGTCTGCCTACGGCAATGACGATGAAAATAACCTCATCATCAATCACTTCATAAACCAAACGATAACCAACACTGCGAAGTTTGATCTTGTAGCGGTTAGGATGTCCTGGGAGCTTATTCTTGGGAATGCGAGGATTCTCTAGTACCTTGATCAGTTTCTTCTTCAATGGTTGCTTAATACTTGGATTAAGCTTATTCCATTCTGCTAATGCTTCTTCTAAAAAGTCTAACTTATAGGTCATCAATATTTACTCGAATGCGTTTTTGATTCGCACGAGCATCTGCAATTTTGTTGAGTTCCAGGTCTTCCAGTTGTTCCATCATGGTTTCATACAAATCAGCCGGAACACAGTAAAACGCTGGTATATTACGATTAAGGATCGCTACAGGTTCACCTTTACCTGCTAACACTGTATCCATCGGACTCTTTTTGAGTTCAGTAATACTTGCAGTCATTCGTGCATGGATTAATTGAGTCATAGTTAGGCCTTTATAAAGTTAAGTGTTTGCAGTTTGGGTTGAATCACTACAAGTAGGTTCGGGTAGCTAATCTCAGCATACCTCTCTAATGTGCATCTTAATTTGATAAGTAGGGTTGAATCAGTGACGAGGAGCATCTTTGCAAGATAAGGCATCGCTGAACGAAATGCCTTTAACCACTTACGATGTTGCTCAATAATATCTATAGGTTGTTGCATCTCTAGCTCAGCTAACCCAGGAGCTACGTCAAGATCACACCATGAAAGTATCTTTAGAGCTTTTTCTAATGTAGTAGTTTTAGTTACCTGCCACTCTTCCTCTCTTTCATCCATCAAATCGAATAGATGTCTGAGTTCCTGCATACGAACTTCATCCTCTCGTTTCAAACGAGATTTTTCAGTCATATTCCAAACAGCATCAGAATTCATAGATTCTCCTATTCAACGCTATGACTATAGCATTCCTAGAAGCACATTTAAAGATGCGATTAAAAAAACCATAATGAGTACTTTTCGCTACTCGATAAACGGTAGAAACTCCACAACCAACTGCTTTAGCTATTTCATCCTTGGTCATGTTCCGACATGATATAGGTCTAACAAATACAAAAAAGCCCTTAATCATTAAGGGCTTTTCCACAAGCAAATCACAACCAATTAAAAACTAAATTAGTTTTATATTAGTTTCAAATTAGTTAATTTTCTTCACTAAGTTTCTTCAGAGCAAATCTGATAATTCCATTATGGGTTTGACCATATTTTTCAGCTAACTCAGCCAATAGCTGATACTCATATTCGTTCATTGGAATCGTATGCGTCTTAAATTTTCGAGGTGCTTTGGGATCTAGTTTTTGAGTAGTCTGCTCATTTGCCCCATTGATGAATGCGTCAATTTCGGGTGATGAAGGCTTCGTAATTTCTCTTTTCTTAATCACGCTAAAAGCTCCTTCATAAATGATTCAAACTCTTCGATTGCTTTTGGATTATTTGATTCAACAACACCTTTCCCTTCAGCAGTAACATCACGATAAACCTTCCTGTCATGAATTACTGACGACAACGCTGTGAATAATGGAAAATCCGCCAGGTAATCATTTGCTTGTTGTACTTCAGATACAGATGGATTGGTTGGTGCCAGCGTTAATAAACCAAATGGTTTTAAGTCTTCATTAAATGACTTGGCTTGATCTATGACTTCAGAGAGATGAGGTAAAGTATCAAGATCGAACTGTGATGGTCTAAATGGTACTACAAGGTAATGAGCTGTTAGCATTGCTGTTCTAAGCTCTTTACTATCATGTCCAGCCACATCAACAATCACATAGTTATAACGGCTATCCAGGTCTTTCAGTGTGTTCTTGATGTCACCATAGCGTTGAACACAATGAACTTTTGGCAGATCAGTTTCATCTCTGTCTTTTACCCAATTAGCTGAACTTTGTTGAGGATCTGCATCAACTAATACTATGTCTTTCTTATGTTTAGCAAGATATGCTGCAATGTTGATGGCTATTGTTGATTTACCACATCCGCCTTTTTGACTTCCAATTAAGATAATCATTTTACTTGTAATTTGTAACTAATTTGAATTCAATATAGTTTTATTTTTCATTGGTGTAAATACTTACTTAAAAAATCTTGTTGTCCATTGATTTAGTATTAGTCTACATTTTCCCACCTAAATTAGGGTTATACTTCATGCTAATTCATCACTGTAAATGGATACTCGTAAAACAAGAAATTCTCTTAAATTTTTAAGCAATAACATTTTTATTTTTAAATAATTTTAATATTTTTATTTTTAAATCCTCTGTAAGCCTTATCTAGAAAGTGTTTGAGAGCTTATTAGTCTACATTTTCCCACCTTTAAGTCTACATTTTCCCACCTTTAAGTCTACATTTTCCCACCTTTAAGTCTACATTTTCCCACCTTTAAGTCTACATTTTCCAACCTTGTGCCTACACTGTTTGTTAGTGTATGCTAATCTGATAATTACATGGGGAAGTCTCAGTGAAAAATGAGCTCGTAGTTAAAGATAATGCGTTAATTAATGCTAGCTATAATTTAGACACAACGGAACAACGATTGATTTTATTGGCAATTGTCCAAGCGAGAGAGTTAAGTAAGCATGTGGATGCTAATAGCACGCTAGAGGTTCATGCTCATCATTACATGAAGCAGTTCAACGTCGATAAACATGCAGCCTATGAGGGGCTTAAAAACGCAGCTAGCAACCTATTTGAGCGCAAATTCAGTTACAAGGGTATCCATGAGGGGACTCAACAGGAAAAGATAGTGAAATCACGTTGGGTTTCCAAAATAGCCTATGTTGATTCAGCCGGGATTGTAGAGCTCACTTTTGCACCTGATGTCATACCCTTGATTACACAGTTAGAGAAGTCTTTCACTGCTTATGAGCTGAAACAGATTAGCTCTCTTACAAGCAAATATGCAATTCGTCTTTACGAGTTACTGATTCAATGGCGTAGTGTTGGTAAGACACCTATGTTTGCGTTAGATGACTTTCGCTTTAAGCTTGGATTAGCAGAGAGTGACTATGTCAAAATGGCGAACTTCAAAGCCAGGGTACTCGATACAGCATTAAACCAAATTAATGAATTAACAGATATCATTGCTTCTTATGAGCAACATAAAAATGGACGTGTGATTAGTGGCTTCTCATTTACGTTCACAACAAAGCAGCAACCTAAGGAAGTCACTCACACCAAAGCCAAGAAGCTAACGGATAAGCAGATTCAATTTTTTGCCAACAAGCTAGCTCACCATGACCCATTTGCAAGCCAAAAAGCTGCAGTAGGGGAAAGCTATGCTGATCTAGAAAAAAGGCTTCTAATTGAATTAGAGGATGTTCAAAATGTTAGAAAGTATTCTGGTGTTCTAAAAGAGTTGGGATTAGAAGTTTAATGGTGAAATAAAATTAGTTGTTAAGTGAAACTAATTTGGTTTTGTTTTAGTTCTAATTTAAGTTAAGCTTTATAAAATCATATTTTAAACTATTTATGTAACAAAGCTAAATCCCTACTTCCTCTCGGATTGAGCAAAGCGAAAACCTAAGCTTTCGAAAGTCATGTCCTTGATTTAAATGGCAAAACCTGACATTGAAATAATTCTAAAATTAATCCATGCCAAAGCAGCAAGAAGTGGATTCAGGTTGGTATATCAATTTTTACTGAGTTAAAAAATCACTGACGTATTTTTATGTCAGTGATCAAACTTTTTTTTCAAAATCCCAACTTTTGGATAATCATTTTTTTTTTATTTGTTAATGTCCGTTACTGAGTACACGTCGAGGACATATAGCTGATTACTTAATGAATAGTGAGTGAGCTATAGACCTGACTGTATTCAAAAATATTGCTTCAGAAGTTAAAGTCTCATAAATAAAAAACCCCAATAGCTAAATCTTGTGGCGGAACTAGCTATCGGGGTCTGAAATACAGGAACATTGTAACGTGTTCAAAAACAATATACACGAATTTTTGTTAAATCTAGGCTACGAAACGAACAATTTACCGTTTCAATTTGTGCTAGAGAAACACTATCGAATCCCAAGTATCGGGAAAAGCAGAAAAAACCGTTCTACTGACGTTATTTTAAAAAGCAATGGTCTGTATCTGATCTATGATCATTCGACTGGCGAAAGCTACACGTTCAATCCTGAATGGAAGCAAGAACAGCAGAGCCATGATGCTGAGTATCTGCAAAAACGCCAATTAGAAATCGAAAAACAGCGCAAAGCTGAAGAAAAATCGAAGATCATTCAATTTGCATCAAAAGCCAATGAAGCCAAAGAGATTTGGAACAAGGCACAGCATTGTGAAGATCATCCTTATATGGCAGTTGCAGGGATTAAGCCAATCAATGCGCGAACAATGCCAGTGGTGAAAACTTCAGGCGGTCAGACTTTCCATAATCCGTTGATCATCCCTTTGTTTGATGTTCATTCACATGAACTTGTGAATCTGCAATTCATTACACCTGAAGGTGAAAAACGCCCATTATCAGGCGCGCAAAGCCAGAATTTTTACTTTGTCATCGAAGGTGCAGAACCGACCATTTTTGTTGAAGGTTACAAGGATGCTTGCAATGTGCATCTTGCAACTGGACGCCGTGCGATTGCGTGTATTACTGCTGACAAGATCAAGGAAGTCTATCCGATACTTGGGAAACAGCAGGACGCTATCCTTTCCGACAACGACAACAAAGCCAAGATCAATGATGATGGTTCAAGAAAGGTCTTACATAACAGAAAGCAGATCGCTGCTTATGGAAAGGGGCATAAGGTTGCAACTGAACTTGGTACAAGATTTTATCTAGCCCCTGAACTTGGTTCGGATGCGGGAAGCATGACGCATGATCAGATCAATGCACTGCTGAATCAAAAGCCAACTTCAGAGCTACCGATATTCGATGTATGGACACAGCTAAAAGATCAATCCTGTGATGTTGAAACCAAAGCACTGATCAATGCGCTGCTGAATGAAAAAGATGCTCAGAAATGCGCTGGATTGGCTTATCAGTACATGATCAGGAACTCGGTGCATGTTCCCTATAAGAAAAGCCTGATCGAGCTTAGAAACGAAATAGAGCTAATTTGTGCGGGCCGTGTGCATCCAGTCACTTTAGATAATATTGTGCTGTATGTTCACAAAAGAATTGAGTTCATCAAGAATCAAGGTCTGACGGCGGTCACGATTCAAGATTATAAAAATCATAACTTGATTAACCTGGTATCACTGGATCAGTTCAAGCCGAATTATCGCGGTGCATACCTAATCAAAGCCCCAACAGGATCGGGAAAAACTCAAAAAGTAGGACGGCCTTTCCGTGACTGGTGCAGATCAGAGGGCTATTCATTCTTAACGATTGCTCACTTGCGTAGTCTGATCCGTGAAATGGCTTCACGTTTGGATACAGCTCACTATGATGATGAGAAAAAAGGCATTGCTGAAGCGCGTAAAATCGGTCTGGATGCTGCGTTAAGTCATTCAATCGAATCATTGTCTGTCTGTCTGCCAAGTCTGGCGAATGAGCTGTTCACGCCGTTCATTAAGAACTGCAAGCATGTGTTCATTGATGAGATCAGCCAAGTAATCGAAACTTTCAACAGTGACAAGCTATTCAATAAAACCGACATTGAACACGTTTATCAGTTGCTCAAGGTCATTATTAAGAATGCTGAATGTGTCATTGTTGCGGATGCCAATATTAACCAACAGACGTTGGATTTTATCGAGTCATGCCGACTTGTTGAAAAGCTGAATATTGTTGAGGTTGCTCCAAAGAACGAAAACAAAACGGCTCACTTGTATAACAGTTTTGCAGAGTTGCAGAGCTTCATGCTGCAACGGGTCATGGTAGAGAATCAAAACGCATGGATTACATGCGATTCAAAAAGCCACGTTCAAGCGCTGCAAGCTATTCTCAATGACTTGGATATTAAGAACATTGCGATTGTTGGGAACGAAAACACAAAAAGAGAAACGGCCGAATTTCTGAAGAATCCCGAAGCTGAATCCTTAAAGTATCAAGTTGTCATTTCTACAAGTGCAATCGCTTCAGGCGTATCAATTGAGCATGATCATTTTGATTTTGTTGCTGGATTCTTTACGGGTTCAAGTGTTCAGCCTACTGATGCTTATCAGATGCTTGGACGGGTTCGCCAGTGCAAAGAGTTCCACTTGTTCGCGGATCAAAACCGCCGTTATGTAATGGATGTTCTGGACGCATTACAAGGAAAGCAGCAGGCCAGTGTCTTAGAGGGATCGAAAGCAAAAATCACAGAGTTCTCATTATTTAAAACTGAACTTGAAAAAGTGCGTGAAACTCGCCGTTCTAACTTTGCTAATAATCTAATCTGGATTCTGGAAAACAAAAAGTTCGCTGTTAAACGTGTGCAGCAGTTTGATGCTCAAGGTCATGCAGAGATATTTAAATACAACAAAGACAAGATCAAAGCAGATCATAAAGAGCAGATCAAAGCAGCTTATAAGATTGATGCAGAAACAGCGCAAAGACTTCAGCGCAAAGACTTCCTGTCTGATCCTGAAGCATACGCCCTACAAGCTCATGAAATGCGAATGAAGTTAGGACTTCAGCATGATGCAGAGTTGAATGATCAGCACTTTGATATTGATTTAGGTCAATTGATACGTTTTAACGCCTTCATGGGCCGTTTTAAGACAAGCCAAGATAAGGCCAAAGACTTAGCAGTTAGACGATACCGCGAAGCTATGGGGAAAGTTTATAAACTGGCCTTCGATGGTGTGCTGATGCAGCCGAATGCGGTATTCACAGAAACAGGTGCTAAGGCCCTTATTCAACAGGTCACAAAATACAGATTGTTGCTTGCTGCGATTGGTGCAATCCCGACTCGGTTCGGTGCGCCGTCATGGAAACCGTCCGAATACTCAGCCAGAGATTTAAATGAGATTCTGAAGCATATCGGGATCAATTCCAAACGATGCAGAAACCCCTTCAAGCTGCGTTTGAAAAGAAAATTAAGTGTGCAGATGCCCCATAATCTATATATAAGAATAGAGCCATCTGCACAGATAAGTGATGAATACGCATACAAGATTGATGCTGAACACTTCGTCATGATGCAGCAGCTTTGTGATTCTCTATTCAATGCCAGTGAACAGCAGATCGCGCCTGAAGATATGCAGCAGCTTGCTGATGTTGTCGCTTCAGTCGGGAAGCCTGACTTTGTTTCTGATGTTGTTTCTTTGGATGAGGTGCAGATTGATATTGCATCCGTTGCAGTCGTAACCACAGCATCAGAACAGCAGCTTGCTATTGAGCCATGCAATGACGCGGTATTCATTGATGTGATGCAGGAGCTTATGCGGTCAGACTTAACCCTTGCTGATTTGTACCGTTTGAAAGATTACGCAGAGCATTTACCGAAACAGCACGTTTCTGCTGGCAGTGCTCAACAGGTATTAGAGCTGGATTTAATCAATTCAATGATCAGTAGCCGGGCGTCGATTGGATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP028798|20432:29346|21801_22089_-|WP_005130374.1|DBSCAN-SWA MTYKLDFLEEALAEWNKLNPSIKQPLKKKLIKVLENPRIPKNKLPGHPNRYKIKLRSVGYRLVYEVIDDEVIFIVIAVGRRENNAVYDEANSRHS >NZ_CP028798|20432:29346|22329_22755_-|WP_005130376.1|DBSCAN-SWA MNSDAVWNMTEKSRLKREDEVRMQELRHLFDLMDEREEEWQVTKTTTLEKALKILSWCDLDVAPGLAELEMQQPIDIIEQHRKWLKAFRSAMPYLAKMLLVTDSTLLIKLRCTLERYAEISYPNLLVVIQPKLQTLNFIKA >NZ_CP028798|20432:29346|21491_21641_+|WP_079878061.1|DBSCAN-SWA METLEKIQYKFSKTKLVLGASMLPNRTWKMTRDKLTHNYFKWDQLWVVK >NZ_CP028798|20432:29346|22078_22327_-|WP_005130375.1|DBSCAN-SWA MTQLIHARMTASITELKKSPMDTVLAGKGEPVAILNRNIPAFYCVPADLYETMMEQLEDLELNKIADARANQKRIRVNIDDL >NZ_CP028798|20432:29346|24337_25252_+|WP_004843977.1|DBSCAN-SWA MKNELVVKDNALINASYNLDTTEQRLILLAIVQARELSKHVDANSTLEVHAHHYMKQFNVDKHAAYEGLKNAASNLFERKFSYKGIHEGTQQEKIVKSRWVSKIAYVDSAGIVELTFAPDVIPLITQLEKSFTAYELKQISSLTSKYAIRLYELLIQWRSVGKTPMFALDDFRFKLGLAESDYVKMANFKARVLDTALNQINELTDIIASYEQHKNGRVISGFSFTFTTKQQPKEVTHTKAKKLTDKQIQFFANKLAHHDPFASQKAAVGESYADLEKRLLIELEDVQNVRKYSGVLKELGLEV >NZ_CP028798|20432:29346|25800_29346_+|WP_087540686.1|DBSCAN-SWA MFKNNIHEFLLNLGYETNNLPFQFVLEKHYRIPSIGKSRKNRSTDVILKSNGLYLIYDHSTGESYTFNPEWKQEQQSHDAEYLQKRQLEIEKQRKAEEKSKIIQFASKANEAKEIWNKAQHCEDHPYMAVAGIKPINARTMPVVKTSGGQTFHNPLIIPLFDVHSHELVNLQFITPEGEKRPLSGAQSQNFYFVIEGAEPTIFVEGYKDACNVHLATGRRAIACITADKIKEVYPILGKQQDAILSDNDNKAKINDDGSRKVLHNRKQIAAYGKGHKVATELGTRFYLAPELGSDAGSMTHDQINALLNQKPTSELPIFDVWTQLKDQSCDVETKALINALLNEKDAQKCAGLAYQYMIRNSVHVPYKKSLIELRNEIELICAGRVHPVTLDNIVLYVHKRIEFIKNQGLTAVTIQDYKNHNLINLVSLDQFKPNYRGAYLIKAPTGSGKTQKVGRPFRDWCRSEGYSFLTIAHLRSLIREMASRLDTAHYDDEKKGIAEARKIGLDAALSHSIESLSVCLPSLANELFTPFIKNCKHVFIDEISQVIETFNSDKLFNKTDIEHVYQLLKVIIKNAECVIVADANINQQTLDFIESCRLVEKLNIVEVAPKNENKTAHLYNSFAELQSFMLQRVMVENQNAWITCDSKSHVQALQAILNDLDIKNIAIVGNENTKRETAEFLKNPEAESLKYQVVISTSAIASGVSIEHDHFDFVAGFFTGSSVQPTDAYQMLGRVRQCKEFHLFADQNRRYVMDVLDALQGKQQASVLEGSKAKITEFSLFKTELEKVRETRRSNFANNLIWILENKKFAVKRVQQFDAQGHAEIFKYNKDKIKADHKEQIKAAYKIDAETAQRLQRKDFLSDPEAYALQAHEMRMKLGLQHDAELNDQHFDIDLGQLIRFNAFMGRFKTSQDKAKDLAVRRYREAMGKVYKLAFDGVLMQPNAVFTETGAKALIQQVTKYRLLLAAIGAIPTRFGAPSWKPSEYSARDLNEILKHIGINSKRCRNPFKLRLKRKLSVQMPHNLYIRIEPSAQISDEYAYKIDAEHFVMMQQLCDSLFNASEQQIAPEDMQQLADVVASVGKPDFVSDVVSLDEVQIDIASVAVVTTASEQQLAIEPCNDAVFIDVMQELMRSDLTLADLYRLKDYAEHLPKQHVSAGSAQQVLELDLINSMISSRASIG >NZ_CP028798|20432:29346|20432_20999_-|WP_000678311.1|DBSCAN-SWA MKGQKVGYVRVSSVEQNTGRQLEGIEVDRIFVDRASGKNTDRPKFQEMLNYVREGDRVIVHSMDRFARSLKDLVTEVDKLVKRGIAIQFVKENITFTAESTPMDNLMLQMMGAFAQFEREIILERQKEGIKLASAQGKYKGRVHKLKPDQAEALRQAWKEGKYPSKMALGKAFGISRQAVYRYLQVSE >NZ_CP028798|20432:29346|23257_23887_-|WP_005130378.1|DBSCAN-SWA MIILIGSQKGGCGKSTIAINIAAYLAKHKKDIVLVDADPQQSSANWVKDRDETDLPKVHCVQRYGDIKNTLKDLDSRYNYVIVDVAGHDSKELRTAMLTAHYLVVPFRPSQFDLDTLPHLSEVIDQAKSFNEDLKPFGLLTLAPTNPSVSEVQQANDYLADFPLFTALSSVIHDRKVYRDVTAEGKGVVESNNPKAIEEFESFMKELLA >NZ_CP028798|20432:29346|23021_23261_-|WP_005130377.1|DBSCAN-SWA MIKKREITKPSSPEIDAFINGANEQTTQKLDPKAPRKFKTHTIPMNEYEYQLLAELAEKYGQTHNGIIRFALKKLSEEN |
9 | Salmonella_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028800_1 | 423899-424192 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028800_1
|
4 spacers
spacers of NZ_CP028800_1
>1.1|423923|39|NZ_CP028800|CRT TAGCTTCGATGATAAACCACGTGGTGAACGTCCATCATT >1.2|423986|33|NZ_CP028800|CRT CGAATTCAATTCTGATCGTCCACGTCGTGAAGG >1.3|424043|39|NZ_CP028800|CRT TAACTTTGATGATAAACCACGTGGTGAACGTCCATCGTT >1.4|424106|63|NZ_CP028800|CRT CGAATTCAATTCTGATCGTCCACGCCGCGAAGGTGGTTTTGATGATCGTCCAAAGCGTACATT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028800_1
The CRISPR arrays of NZ_CP028800_1 >merge|NZ_CP028800|1|423899-424192|CRT AGGTGGTGATGATCGTCCACGTCGTAGCTTCGATGATAAACCACGTGGTGAACGTCCATCATTTGGTGGTGAAGATCGTCCACGTCGCGAATTCAATTCTGATCGTCCACGTCGTGAAGGTGGTTTTGAAGACCGTCCACGTCGTAACTTTGATGATAAACCACGTGGTGAACGTCCATCGTTTGGTGGTGAAGATCGTCCACGTCGCGAATTCAATTCTGATCGTCCACGCCGCGAAGGTGGTTTTGATGATCGTCCAAAGCGTACATTTGGTGGTGAAGATCGCCCACGTCG >NZ_CP028800|1|1|423899-424192|CRT AGGTGGTGATGATCGTCCACGTCG TAGCTTCGATGATAAACCACGTGGTGAACGTCCATCATT TGGTGGTGAAGATCGTCCACGTCG CGAATTCAATTCTGATCGTCCACGTCGTGAAGG TGGTTTTGAAGACCGTCCACGTCG TAACTTTGATGATAAACCACGTGGTGAACGTCCATCGTT TGGTGGTGAAGATCGTCCACGTCG CGAATTCAATTCTGATCGTCCACGCCGCGAAGGTGGTTTTGATGATCGTCCAAAGCGTACATT TGGTGGTGAAGATCGCCCACGTCG
>NZ_CP028800.2|WP_087539559.1|421323_422154_+|inositol-monophosphatase MEPMVVMAARAAQTVGQELLKAHQNRHKLNLQVEEKGIDGPVTRVDRYLEQLTIDTLRKSYKNHSFLGEEFGMQEGKGHDADWCWVIDPLDGTQNFINGFPHFCISIAVQHKGVTQHGVIYDPVRDELFSASRGRGAVMNQRRIRANVKDTLDKTFLAVGHPYRAQRNGEIVSYAEQHFASLLAVTKSGAQIRRAGSAALDLAYVAAGRFDGFFELGLKPWDIAAGELIVKEAGGVVVDARGGNDSMENGQVIACSMKMLKPLMQAVVPAWSEAAK >NZ_CP028800.2|WP_004909436.1|419305_421201_+|1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate-synthase MLYTEIPTQRPVTPLLDEIDHPEQLRQLEQSQLPQVADELRQYILYAAGQSGGHFGANLGVIELTVALHYCFNTPDDRLVWDVGHQAYPHKVLTGRRERITTIRSKGGLAAFPARDESDFDTFGVGHSSTAISAGLGMALARRYQQKPCEVVAIIGDGAMTAGMAFEAMNDAVAHNADLIVVLNDNDMSISCSTGGFAKHLAAIWETGQLVNVNEQGEAYVQPHPKWTYNSRLHQSATDAADNLFKAIGFDYFGPFDGHNVEQLAQVFHALKKRKGPRLVHVYTKKGKGFAPAEADPITYHAITKITPTASAPVKKSPPKYSDVFGQWLCDEAAQDARLLAITPAMCEGSGMVKFAQQYPERFFDVAIAEQHAVTLAAGMACEGLKPVVAIYSTFLQRGYDQLIHDVALQNLDVTFGIDRAGLVGEDGPTHAGAYDYAYMRTVPNMVIMAPKDENECRQMLHTAYHYKGPTAVRYPRGAGTGVEIQQQMTALEIGKAEIVAEFNLDADQQISILAFGSRVAASVEAAQQFANKHAIGVRVVNMRFVKPLDEQMIRTLAERTQLFVTVEEHAVMAGAGSAVNEFLAQAKIVKPILNLGLPDEFLHQATHQQMLADCGLDAHGILASIERAWF >NZ_CP028800.2|WP_005403269.1|418396_418999_-|GTP-cyclohydrolase-II MPIEFIATSKLPTAFGDFNISVFQDPKTGEEHVALSKGLETPPNTPVLVRIHSECLTGDAFASLKCDCGPQLQATQRLINEAGQGVILYLRQEGRGIGLTNKIRAYALQDQGHDTVDANLLLNLPADARRYDMCSIMLDHLQVKEVKLITNNPLKLKALTDLGINVVERVPLTVGKNPFNEQYLKTKRERMDHLYQKDDF >NZ_CP028800.2|WP_087539561.1|417323_418265_-|oxygen-dependent-coproporphyrinogen-oxidase MQHPTSADIQRVREFLLDLQTRICAGLEQQERADGGTAEFIIDDWERTEGGGGRSRVLQNGEVIEKGGVMFSHINISKLPASATERHPQIAGAKAQALGVSLVIHPKNPNIPTSHANVRLFVAEPEGQDPVWWFGGGFDLTPFYPDDQDIQNWHQTAYDLCKPFGENVYAEHKQWCDDYFYLKHRDEQRGVGGLFFDDLNQWDFETCFKYIQAVGNGYLEAILPIFEKHREQPYTEAQREFQLYRRGRYVEYNLVYDRGTLFGLQTGGRIESILVSLPNLAGWSYRPEWDADSQEKRLTDYYLKPRDWLGLTK >NZ_CP028800.2|WP_087539563.1|416118_416907_-|shikimate-dehydrogenase MTKQFAVIGNPIEQSRSPELHHAFAAKTGVDLNYKKILAPLDGFESAVKAFFDQNGVGMNVTVPFKEQAFALCDQLTERAKIAKAVNTLWMQDGQLYGDNTDGQGLVAAIQALNWNLTNSRILILGAGGATRGVIYPLVQAGAKQIVIANRTLARAEQLVEDLKTAVPDTKLHAICLDQLTGEFDIVINATSASLTGEALQLPQTLIFHHAYEMAYGKPSSFLDQALIRQVPSTDGFGMLVGQAIEAFSIWNGVKPELKDFL >NZ_CP028800.2|WP_087539565.1|413746_416068_+|hypothetical-protein MRLKYLTLCLFGLSISGCSQHVIKTNSSSSSLEQKAINSINAMYEYPSYDYRGKFNIHVDLDQHKAEADQQKDVLDAALKQKVDQYLREQKVNLDAKQKQALYKALAEQPKGLGNSKFDKFARVMANILNDMQFEYDGSVHYRQKMGSFNLTARYEKPTLLVQAKVPMVLDLNNYKFYINYFALMPYLVNKENQNNLAYLDFSKYQGLFKQVDYKKFAEYIKASSAIYYRLADPNSIQTLSVSSADQAAGVVEKIRLKTTIEELVLQANLYSKVNEKYLMQSILKFDEQNLEKLISEQDKTDTASKAEQSGTLLNSKAAADDASVVSQELYRLVNQHFGVEELEDEYTEEADATKVAAEDVAQEAEDITEEADAVAESATATEQVLTAEQCTALQNAAKTNFGDIQYCQTMYDVDVLGEQKTPLGFLSYIEKLVAVEKEFVQYDQNQFIDDQGFKALWLKHQADIQKALPPVEKRNPFVMDVGLDAQGRAVKLDYDLNYALPELKSSFNIKADMLVTNYGKATPIDQAQLKQAKTWAEASKGSILEQAIGSFSEKLGQTGIQERSAQPYTLSLDDQLKVIAEQRYDATQSYEQTYKAVFIAKLVESNPILAKRYTSQELQEVASVYAYWFSDEEVYSPEGKALKQIESLQKKHHLEQEDQFDDKLGQAVNRLVTDAMRGDQDRQQWKKLKAQYKQPQQLFAKQYQIQFEQTNGISSEEKILLEQTANVLGQVYIDARKNQLSDKSLKALKIEHNEFIDYEIFKDVYQKMISTK >NZ_CP028800.2|WP_004909455.1|411683_413507_-|acyl-CoA-dehydrogenase-C-terminal-domain-containing-protein MPAYKAPLRDIRFLMNEVFDYPAHYQTLTSGQNADADTVDMILEGAADYCENVLSPINQSGDEEGCTFNNGEVTTPKGFKEAYDQFVMGGWQGLSYPEEFGGQGLPMSLNLIKSEMMGTANWSFTMYPGLSTGCMNTIMQFGTDEQKNTYMPKLVEGTWSGTMCLTEPQCGTDLGQVKTKAEAAADGTYKISGTKIFISAGEHDLTENIIHIVLARLPDSPAGTRGISLFIVPKFIPTADGGVGERNTVSCGSIEHKMGIRASATAVLNFDNATGYLIGEINKGLHAMFTFMNTARIGTAVQGIAHAELSFQGALPYAKDRMSMRALSGKKEPERVADAIIHHADVRRMLLTQKAVAEGGRAMIYHAAKLADKMADALASGDQAAYEAADDKLGFYTPILKGFLTELGLEAANHGIQVYGGHGFIKEWGMEQIARDARISTLYEGTTGVQALDLLGRKVLLSSKGKVVRDYTAEILKFCAAHARNKYLRRFAWDLTKLCAQWNTLTVRIMLAARKDRDIVSSASNDFLMFSGYVMMAYFWAQQAVIASEKLEAGNGAETPEFYKAKIKVADFYFDRLLPRAQGHAESMVSTSRTLTSLAPEHFSFDY >NZ_CP028800.2|WP_087539651.1|410961_411630_+|hypothetical-protein MQFRLFLQPLSVGTLLVLGLTACDGHHPEPAISHSQTQPKPVEAAVSTVLVDDQAVSSEGVALTKVAGQATIPHVASKHIEKPSPQDLIYAGRYHARIPCSDPFAGCVNNENEAEYIINLLDDGSVFWTNTSFGRLGTDSSQNIAKIEQTCKQVHWHVHKDQNEIMIRCDAADVNLYYQINANQDLVMNLDKIWNGDHGQNRKFFNEYPFPKKAYVFEKVKS >NZ_CP028800.2|WP_004760601.1|410348_410618_-|PspC-domain-containing-protein MANSGLYRSNQQSMIAGVMGGIAERFGWNANLLRLIFVIISIMSAAFPGILVYLIMWLVIPKRQANRVEHVQGYNQPVKTVYEDQGIKR >NZ_CP028800.2|WP_087539567.1|409174_410284_+|HPP-family-protein MNLTQLDWINLLKPNYKVLPVKERVFSGFGALCGLAISSLISWYVLGGMNAWYIAPMGASSVLLFAVPNSPLAQPWNVVVGNTLAGFIGVACTQLLPDLTTAFSVAVGLAIFMMMTTDSLHPPSGAVAITAVLGGEAVHKLGFHFILYPVLLNSVLLLVFAVFFNRLIGRNYPTMPHLNERSKDPTPTQKVSIQPKDIEYALEQHTELLDISQYDLEKIILEAQEHANERLNHSFVCQDIMSRDVIKLYENDDIHQALDKFKSVNLMSLPVVNDQEQLVGTLALYEVVEWFKGATDPRNSWQHYVKQIMSRRVVKVDPLQPIQDLVPYFVEKSFNYIPVVEELRLIGIISRADMIAALHQQIKQQSSVF >NZ_CP028800.2|WP_004964390.1|424643_424859_+|hypothetical-protein MNNIKQNNSFVAQAWSFVCNEGLPCLFVILMLCNGLFFAYALFDENNSDSFNANNTMHVASESASKNNYIN >NZ_CP028800.2|WP_004909426.1|424954_425773_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNNKTPRDTEALIEVKHLSFNRGERVIYDDVCLKIRRGQITAIMGPSGTGKTTLLRLIGGQLTPDRGEVLIDGKNIAAMSRPELFTARARMGMLFQSGALFTDMSVYENVAFPIRAHTKLPEHIIAELVALKLESVGLRGAEQLMPSELSGGMNRRVALARAIALDPELIMYDEPFAGQDPIVKGVLTRLIRSLREALDLTTIIVSHDVAETLSIADYIYVVAEGKIQGEGTPEQLENHASPFVRQFLTGSAEGPVEYQFTHQAYLDNEVRP >NZ_CP028800.2|WP_004909424.1|425769_426546_+|lipid-asymmetry-maintenance-ABC-transporter-permease-subunit-MlaE MNTIAWLGRLVIERVKGIGAASLMLIQILFSMPSKGGFQRFIYQMYRVGVMSLLIISVSGLFIGLVLGLQGYSILVNVGSEAMLGTMVSLTLLRELAPVVAALLFAGRAGSALTAEIGSMKQSEQLASMEMIGVDPLKQIVSPRLWAGIVSLPMLTVIFAAIGIVGGKLVGVDFLGVDEGSFWGGMQSSVQFGHDVVNGIIKSVVFALICTWVAVYQGYACDPTPEGIATSMTRTVVYSSLCVLGFDFVLTAVMFGGI >NZ_CP028800.2|WP_004909422.1|426545_427220_+|outer-membrane-lipid-asymmetry-maintenance-protein-MlaD MKSRTSELAVGIFVIIFGIALFFLAMKVSGLVGTNLRDSYSMTAQFDNVNGLKPRAKVTMSGVTIGRVESITLDPITRLATVKFELDGKLTSFNAEQLKEVQKNALEELRYSSDYQQADAAKQKEMEQQLIGNMTSITSLDEDAYIMVATNGLLGEKYLKVVPGGGVNYLKRGDVVSNTQGTMDLEDLISKFITGGAGKSTSSSSTESSASQPATDDAEPSFVE >NZ_CP028800.2|WP_153569569.1|427287_427872_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MLASAAFAAPKETPPDFVKRVADGLITRLKADKPKLQNNPALVRTIIRQNLDPYVDSQAFTRIVLGTYANNQYTNAAQRAQFEKNFREVIIENYGGAFAKYTNESYTMRPFKSTNSKNPVVTLDFMHNGEKIPVSFQLTDKGDQWKVRNINVSGIDLGLQFRNQFAATVQRNGGNIDKAIATFKPDADAAVNKK >NZ_CP028800.2|WP_004964385.1|427883_428171_+|STAS-domain-containing-protein MIQYIDQQLVVPKTIDFENAEQVYQSGLAYIQQHQSFPLVVDLAQLENGNTLSLAVLVQWLRQTPESKGLHFKNVSEKMLKIIQACHLQDDLKLI >NZ_CP028800.2|WP_005003123.1|428306_429461_+|IS4-family-transposase MSHQNTVFHQLLKPILRQDFERLAKLHHSGQKLRSATRWDQFVAILMSQLSCRQSLRDIQSNLESQQEKLYHLGAKRIARSTLARLNEEQPASLYQQLFTQLLQRCENSKTAHKFRFKNPLYSLDASHIDLSLSLCAWAKVHESKASIKLSVGLNHSNTIPEFVALGDGIENDMVQGRAFKFPAGSIIVFDKGYVDYQWFAQLTLQNVSFVTRLRPKTVYQVKSSRSVLETKGIIADECIELSSAHAKKRGAPELLRRIEFYDTDKKRTFEFLSNNFHLAASTIAAIYKDRWKIELFFKAIKQNLKLKSFLGRSRNAIQTQIWIALIAYLLVNFAKHMAQEGWSVQRLLRIIQVNLFERKLLRSLFVPDKKWRKQEEPQLRFFL >NZ_CP028800.2|WP_004964378.1|429484_430036_-|hypothetical-protein MKGLFLCIGITLSIPTTFACAPLSPNDVFIARVKSVQKINSINHTKFKLQHPDFAFKNLLSKIISPRPKEWMSDFPVKTIKTNDLIMGLAYPSNHNAPQKYQIVSLALLHCKENTISIDLPIAPFTAWNRRIKGCNNESSIRLLDGFLEHDESFYLKKTTSKISNLRSSFFSLSQIIPIKKRA >NZ_CP028800.2|WP_004964376.1|430037_431051_-|magnesium-and-cobalt-transport-protein-CorA MLEAFYATERGSLEDATINGSFDLHPELVWIDLIAPSQEEQQWVLDAYERNLPTLKSLEDISSSARFYRDDDGILHISTYFLTKNKNYQVDGDTDDSSHMLAMVQTVAFILHKDRLFTMRGEKLVAFRAFRARARRNDYDMDYKDPTWILLGLLEAKLDELADILEDIHKDLERYSTEVLNNHHREKILDLDDMITRLAQQEDMLGKAQLCLIDLRRVLTFLSRPRALGSHIYDADIRELSEDVRSLVEHDAFLFQKVRFLLDTTSGFINTEQNDTIRRFSILPSMLAPPMLIASIYGMNTDELPFAHGSLSFLIVAGILMAFLVLPMVYFRWKKWI >NZ_CP028800.2|WP_004964372.1|431201_431786_+|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MNSICVFCGSSLGNDVVYEQITQATGQIIAEQGLTLVYGGGRSGLMGVVANSALEAGGKVIGVIPEALVDRELAHAELSELYVVKDMHERKTKMAELADGFIALPGGAGTLEEIFEQWTWNQLGIHQKPCAFLNINGFYDDLIKMLQTSVEHGFSQARFVDTLIVSDNIHDILAAFQKYQPAVPKWTSRNEIQA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP028800_2 | 1612481-1612632 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP028800_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP028800_2
>2.1|1612536|42|NZ_CP028800|CRISPRCasFinder ACCCATCATCACATGTTCAGACTGGTGCGGAACAGTAGAAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP028800_2
The CRISPR arrays of NZ_CP028800_2 >merge|NZ_CP028800|2|1612481-1612632|CRISPRCasFinder CTTACAAGAATGATCATCACCAAATAGGGCAACAACACCACCATGTTCGGCTGTAACCCATCATCACATGTTCAGACTGGTGCGGAACAGTAGAAGACTTACAAGAATGATCATCACCAAATAGGGCAACAACACCACCATGTTCGGCTGTA >NZ_CP028800|2|1|1612481-1612632|CRISPRCasFinder CTTACAAGAATGATCATCACCAAATAGGGCAACAACACCACCATGTTCGGCTGTA ACCCATCATCACATGTTCAGACTGGTGCGGAACAGTAGAAGA CTTACAAGAATGATCATCACCAAATAGGGCAACAACACCACCATGTTCGGCTGTA
>NZ_CP028800.2|WP_087540105.1|1606515_1608711_+|OsmC-domain/YcaO-domain-containing-protein MEIKVNYLDNLRQEAKFDDFTVIADQPIRYKGDGSAPGPFDYFLASSALCAAYFVKVYCAARDIPTDNIRLSQNNIVDPENRYKQIFKIQVELPADISEKDRQGILRSIDRCTVKKVIQTGPEFVIEEVESIDADAQALLMPNLASESTTYIQGKDLPLEETIANMSAILAGLGMKIEIASWRNIVPNVWSLHIRDAQSPMCFTNGKGSTKESALASALGEFIERLNCNFFYNDQFWGEEIANAEFVHYPDEKWFKPGPNGELPKEILDEYCLEIYDPEKELLGTHLYDTNSGNIERGICSLPFVRQSDGETVYFPSNLIENLYLSNGMSAGNTLEEAQVQCLSEIFERAVKREIIEGEIALPDVPEEVLAKYPSIVAGIQGLEEQGFPVLVKDASLGGQFPVMCVTLMNPRTGGVFASFGAHPSFEVALERSLTELLQGRSFEGLNDLPQPTFQSEAVTEPNNFVEHFIDSSGLVSWRFFSSKSDYDFVEWDFTNEGENSNADEAAELFGILEEMGKEVYMAVYEHLGATACRILVPDYSEIYLVEDLIWDNTNKALAFREDILNIHRLDDARLEALVERLEECELDDYTEITTLIGIEFDDNTVWGQLTLLELKLLIYIALKQFEEAKDLVEQFLQYNTNTVERGLFYQCMNVVLEVILDDEMELQDYEKNFRRMFGDERMDAVIGSVEGNVRFYGLTPTSMKLEGLDRHLRLIESYKKLHAARAKAVS >NZ_CP028800.2|WP_087540106.1|1604050_1604983_+|LysR-family-transcriptional-regulator MELRFLRYFVAVVEEQSFTKAAERLFIAQPPLSRQIQNLENELGVQLFERGSRPLQTTTAGQFLYQHALKLLSNAEEVKSMTKRIGLIERTLTIGFVGSLLFGLLPRIIYLYRQQHPHLNIQLIELSTTEQLQALKEGRIDVGFGRLRISDPAVKRVLLRKERLVVAAHSSHPIAQRVEGVHLADLVDEKLFVYPNTPKPNFSSQLLNIFAEHSLVPKNVRELREIQLALGLVAAGEGLCVIPASADTIRFPHLLYIPILDSGAVSPIFITARAMDNSEDIQSLYDTIYQVYDLEGIEYKRTTFQWAQTE >NZ_CP028800.2|WP_087540108.1|1602823_1603939_-|muconate-cycloisomerase MYKTIETILVDIPTIRPHKLSVTTMQTQTLVLVKITTTDGFVGWGEATTIGGLNYGEESPESVKANIDTYFAPLLLSIKSSINVAQTLKLIRKTINGNRFAKCAIQTALLDIQAKQLNLPLSEVLGGRLRDRLPVLWTLASGDTEKDIAEAKKMIELKRHNIFKLKIGSNPVQHDVDHVIAIKKALGPEISIRVDVNRAWSELECIQGIQQLQDGGIDLIEQPCAIEQTQVLARLTQRFDVAIMADEALTGPDSAYRLAKQHASDVFAVKVEQSGGLIEACEVAKIAKLAGIDLYGGTMLEGPIGSIASAHAFSTFDSLAFGTELFGPLLLTQDILKTPLRYENFELVVPNTAGLGIDIDEDKIEQLRRKA >NZ_CP028800.2|WP_004911173.1|1602520_1602811_-|muconolactone-Delta-isomerase MLFQVRMDVHLPVEMPAEQANQIKAVEKAYSQDLQRQGKWRHIWRITGQYSNISIFDVESNEELHNILQGLPLYPYMDIEVMALNRHPSSIREDDR >NZ_CP028800.2|WP_004911176.1|1601456_1602377_-|catechol-1,2-dioxygenase MNRQDIDALVKKMNVDTATGAVDQRVQSIVVRLLGDLFQAIEDLDIQASEVWKGLEYFTDAGQANELGLLAAGLGLEHYLDLRADEADAKAGVSGGTPRTIEGPLYVAGAPESVGFARMDDGSESDKIDTLIIEGTVTDTDGNIIEGAKVEMWHANSLGNYSFFDKSQSDFNLRRTILSDVNGKYVALTTMPVGYGCPPEGTTQFVLNKLGRHGNRPSHVHYFVSAPGFRKLTTQFNIEGDKYLWDDFAFATRDGLVATAVDVTDEAEIQRRGLDKPFKHITFNIELVKEAASAPSTEVDRRRASA >NZ_CP028800.2|WP_004954312.1|1599997_1601374_-|benzoate-1,2-dioxygenase-large-subunit MPKIPVINTTHLDRIDELLVDNEETGEYKLHRSVFTDQAMFDLEMKYIFEGNWVYLAHESQIPKNNDFYTTYIGRQPIIIARNRNGELNAMINACSHRGAQLCRHKRGNKATYTCPFHGWTFNNSGKLLKVKDPTDAGYSDCFNQDGSHDLKKVAKFESYKGFLFGSLNPDVPSLKEFLGETTKIIDMIVGQSEQGLEVLRGSSTYTYEGNWKLTAENGADGYHVSAVHWNYAATTQHRKETEAGDNIRAMSAGSWGKQGGGSYGFEHGHMLLWTQWANPEDRPNYPKADEYTEKFGAAMSKWMIERSRNLCLYPNVYLMDQFGSQIRVLRPLSVNKTEVTIYCIAPVGEEPEARARRIRQYEDFFNASGMATPDDLEEFRACQAGYAGLELEWNDMCRGSKHWIHGPDDAANEIGLKPKLSGIKTEDEGLYLAQHQYWLKSMKNAIATEKKLAESQI >NZ_CP028800.2|WP_039047310.1|1599485_1599986_-|benzoate-1,2-dioxygenase-small-subunit MNTTTQATLENIAQFLYREARFLDDEQWDEWLSCYSPEASFWMPAWDDDDQLTEDPQSEISLIYYPNRQGLEDRVFRIKTERSSATMPDTRTSHNISNIEVLERDGDKVTVRFNWNTLSFRYKTNYSYFGMSRYVIDFSNEQPKIISKYVVLKNDYINQVIDIYHL >NZ_CP028800.2|WP_087540109.1|1598398_1599415_-|ring-hydroxylating-dioxygenase-ferredoxin-reductase-family-protein MSNHNVALQFEDGVTRFITVTQGETLSDAAYRQKINIPLDCRDGACGTCRAFCESGSYNMPEETYIEDALTPEEAEQGYILACQCRPTSDAVFQIQASSDVCKTEIHSFQGTLSRVENLSDSTITFDIQLDDGQPEIHFLAGQYVNVGIPGTSETRSYSFSSKPGNRLTGFVVRNVPNGQMSEFLSKNAKAGDKMHFTGPFGSFYLRPVTKPVLMLAGGTGIAPFMSMLQVLEEKGSDHPIRLVFGVTNDFDLVAIEKLDELQSKYPWFEYRTVVAHPESQHERKGYVTGHIENDWLNNGDVDVYLCGPVPMVEAVRSWLDQEGIKPANFLFEKFSAN >NZ_CP028800.2|WP_087540111.1|1597595_1598381_-|1,6-dihydroxycyclohexa-2,4-diene-1-carboxylate-dehydrogenase MIFQDRFKNKIVIVTGAAQGIGRSVAIRVAAENGYVVLADRSELVDEVASEIRSTGGHAITVQADLERYDGAQAVVDKAIQEFGRVDVLINNVGGAIWMKPFDEFSEEQIIKEINRSLFPTLWCCRAVLPEMLKHQYGVIVNVSSIATRGINRIPYSAAKGGVNALTASLAFEHAKNGIRVNAIATGGTDAPPRKVPRNSTPLSEDEKVWMQQVVDQTKERSLMGRYGTIDEQVNAILFLASEESSYMTGSVIAVGGGDQG >NZ_CP028800.2|WP_087540112.1|1596338_1597556_-|benzoate/H(+)-symporter-BenE MTNLLTSLKNDWSISATIAGFLAVLISYSGPLIIFFQAAQKANISTEMMISWIWGISIGAAVAGIYLSIRYKTPVITAWSAPGTALLVSLFPNISLNEVVAAYITSAIVIFIVGATGYFDKLLKWIPQGIAAGMMAGILFQFGLGLFVATDSMPLIVFSMLLCYLLAKRYSPRYTMLWVLLCGVSLSLIWGKMNPVEMQFSFAIPHFIYPEWTWHSTFNLALPLILVSLTGQFLPGMAIMKLSGYDTPAKPIITASSIASLAVACVGGITIVLAAITAALCMGKDAHELKEKRYIAGVANGIFYILGGLFAGSIVMLFSLLPKELIAALAGLALLGAIGTNVMIAMKDDHQRDAALITFLATVSGMHFLGLSSVFWGICIGVIAQILLNPHAHPNTVMTQSSSEK >NZ_CP028800.2|WP_087540142.1|1613263_1614220_+|LysR-family-transcriptional-regulator MRKNLDGGLLHAMHAFLKVIDSGSFTAAAEQMDLTTAQVSRLISELESRLGVKLMQRSTRQHALTDIGALYAERCRQVLSIIDEAESEATGTATKPKGRLRILSMASFGHYYISPVMAKFCQSYPDLTVEYRTSQNTPDLLGKGIDVSLYLTESLTDSRFVSRRIGTIFSVLCASPAYLEKHGIPNSPEDLYNHACLRLVNPSITPEWHLINEKGGFHEISTSGQIVADTPELLLDVVQQDMGIALLPMFSVIEAVRAGRLCHVLPDWRSPDIGVYTLLPSRDYVDAKTRAWLDWVEQYISPKIKSDTSYFYQLTHTE >NZ_CP028800.2|WP_005080679.1|1614319_1615222_-|hydroxymethylglutaryl-CoA-lyase MSDYVKIVEVGPRDGLQNEKQALSIEQRLSFINDLIDAGLKSIEVGSCVSAKWVPQMAQSDELFKLLPQRDELNLSLLTPNLKGFEAALAVGCKEVAVFTAASESFTRKNINCSIDESLERFSEIFQAAQANNVRVRGYVSCMVDCPYEGAIDPKQVVNVVKRLHDMGCYEISLGETIGTATPDRVQKVWQACLAELDSKILAGHFHNTYGMAIANIYQSLQQGIRVFDSSLAGLGGCPYAKGSSGNVATEDLYYLLSHIGYETGIHLEKLMLASQNINQTLNRKNLSNYANTYLQQSCA >NZ_CP028800.2|WP_087540103.1|1615218_1617210_-|acetyl/propionyl/methylcrotonyl-CoA-carboxylase-subunit-alpha MFEKILIANRGEIACRVIRTAKKLGIATVAVYSDADAHAQHVKLADEAIYIGQSPATQSYLQVDRIIQAAIDTGSQAIHPGYGFLSENDQFALACQQHNICFIGPPVDAILAMGLKATSKALMEKAGVPLTPGYHGTNQDAEFLKQQADRIGYPVLIKASAGGGGKGMSLVERSEDFLHSLASCKREAKSSFGNDDVLIERYVIQPRHIEVQVFGDTHGNYVHLFERDCSVQRRHQKVLEEAPAPQMPSEKLDAMRQAAIDAARAVNYVGAGTVEFIVEQDGTAYFMEMNTRLQVEHPVTEMITGEDLVEWQLRVAYGEPLPKLQHELQIHGHALEARIYAEEPEKGFLPAIGKIDYLRYPTQNQYVRVDSGIVEGDEITTFYDPMIAKLIVWGKNREAALIQMQHALSQFHVDGLGNNIAFLEKIVRCDSFKQAKLDTNLIQREEQFLFSPANIKPEFVVATAFIEFLSQMQSNQSTQKQLWLAQPLWRINVSYQHSIKLNYLNQNIQIKFSAAEQGFNSEFNGQQYHITGQLTDQHSANIQIGGIQQKLAFNRGVQGITLFNAGQSYKFSYLRQDYNQTDGQSEQGHLKAPMPGVVTQLLVGANHTVKKDDVLLTLEAMKMEYTIRAPKDGVILDAYFQVGDQVKAGDELVDFQAAEEEVA >NZ_CP028800.2|WP_087540102.1|1617221_1618025_-|enoyl-CoA-hydratase/isomerase-family-protein MSYQFLQVEQHDQVAYVWLNRPELHNAFNTTVIEELHTCFKQIAIRDDIRVVVLAGRGKSFSAGADLNWMKQAGQASAEENEADALKLAKMLEALATLNQPTIARVHGIAFGGGIGLASACDICIASTDAKFATSEVRLGLAPSTISPYVIRAIGARQASRYFLTAERISAHEAKQIGLAHEIADAEDLDKKVQEIIDALLLGGPHAQAASKQLIQMVSNQSMNDELLRQTAQHIAQVRQGSEAKEGLTAFLNKQAPAWTSNSNNNN >NZ_CP028800.2|WP_087540100.1|1618034_1619636_-|methylcrotonoyl-CoA-carboxylase MNQLQSKINVRSEDFKTNQQAMQTLVNDLTQVAQNIALGGGENARQKHLARGKLLPRERIDQLIDVGTAFLEIGQLAAYKVYEDDIPAAGVIAGIGQVNGVTCMIVANDATVKGGTYYPLTVKKHLRAQEIAEQNHLPCIYLVDSGGAYLPMQDQVFPDRDHFGRIFYNQARMSSQGIAQIAVVMGSCTAGGAYVPAMSDETIIVRNQGTIFLGGPPLVKAATGEVVSSEDLGGGDVHTRLSGVADHLAENDEHAIAIARNIVANLNKKSNELNKQIDEPLFDAKELYGVVPTDARKLFDVREVIARIVDGSRFDEFKARFGSTLITGFASLYGMPVGIIANNGILFSESAQKGAHFIELCTQRNIPLLFIQNITGFMVGRQYENEGIAKHGAKLVMAVATANVPKLTLIIGGSFGAGNYGMCGRAYSPRFLWTWPNSRISVMGGEQAASVLSTLKRDQIEQKGTEWSAQEEDEFKQPIRDQYERQGHPYYASARLWDDGVIDPAQTRQVLGLSLAAALNAPIQPTKFGVFRM >NZ_CP028800.2|WP_087540099.1|1619660_1620833_-|isovaleryl-CoA-dehydrogenase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP028800_1 | 1.2|423986|33|NZ_CP028800|CRT | 423986-424018 | 33 | NZ_CP030363 | Salinibacter ruber strain SP73 plasmid pSR118, complete sequence | 70669-70701 | 8 | 0.758 |
1. spacer 1.2|423986|33|NZ_CP028800|CRT matches to NZ_CP030363 (Salinibacter ruber strain SP73 plasmid pSR118, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cgaattcaattctgatcgtccacg------tcgtgaagg CRISPR spacer cgaattccattctgatcgaccacggccatctcg------ Protospacer ******* ********** ***** ***
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
74400 : 141449
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP028800|74400:141449|DBSCAN-SWA 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55 | Staphylococcus_phage(18.18%) | integrase,tRNA,transposase | attL 94398:94412|attR 104270:104284 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
842820 : 894606
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP028800|842820:894606|DBSCAN-SWA 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44 | Escherichia_phage(18.18%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
898743 : 991103
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP028800|898743:991103|DBSCAN-SWA 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57 | Enterobacteria_phage(20.0%) | integrase,transposase,protease | attL 903439:903455|attR 954068:954084 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1379293 : 1430685
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP028800|1379293:1430685|DBSCAN-SWA 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47 | Shigella_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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