Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP017065 | Lactobacillus casei strain LC5 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DinG,WYL,DEDDh,csa3,c2c9_V-U4,cas3,cas14j | 0 | 0 | 4 | 0 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
784152 : 889642
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017065|784152:889642|DBSCAN-SWA 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112 | Lactobacillus_phage(90.0%) | portal,terminase,protease,tRNA,integrase,holin,transposase,tail,head,capsid | attL 781376:781397|attR 856827:856848 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1132575 : 1167304
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017065|1132575:1167304|DBSCAN-SWA 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45 | Lactobacillus_phage(85.0%) | portal,terminase,integrase,holin,tail,head,capsid | attL 1121552:1121568|attR 1160705:1160721 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2361498 : 2418088
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017065|2361498:2418088|DBSCAN-SWA 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56 | Streptococcus_phage(16.67%) | bacteriocin,tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2424458 : 2447801
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017065|2424458:2447801|DBSCAN-SWA TTTATCTAAAAAATAGACTAAAAACACTCGCCTCACCGTTATAGCGTTCACCCATCGGTCCAATTGCTGTAAAGAGTCGTCCCGCCGCAGCCGGCATTTGCAAATGGTTCAGCAAAACGTACCGCGAAATCGTCCGCTTCAACTTAACCGCAACTATCTGATGAGCCGTCCCGTTTTGCAATTCTTGGGCTGCCATTAATAAGTCACGCCGAATTTGTGGGTAGGCCGTCATTTCAGGATCGTTGTAAGCTGTGTCAATCGCCTGAAATAACTGGGTTTCTTTTTTATTCATTTTGGGCACCTCCGGGATGAGTGCAGTTTAGCGCTTTACCGTATTTGATGCAATGTTACATCGCTTTTTGTCTAGAAGAACGTGTCGTTTTGACAACTTGAAAAATAACGCAACGTTTATTTTGGAAAACCCAACGTTTATTTAAATTTTGTCACAACGCGGCGGTTTTGTCGCAAACTGAGGGTTAGTAAAAGCATTCATTGCAAAGCAACGGGAGGGCGCATATGACCGATTCAACCTACAAATTCGCTGTCGAACCAACCCTAGGGCAAAATTTACGAGGTGGCTGCTCATCATGAACGCAAAAGAAGCGCTTATCAGTACCTGTGTTTTCACGGTTTTCCTTTTTGGCGTTGATTTATTTTTAGGCGGCCACTTTCAGGTCTTCAGAAATCTGTTTACTGGAGTCGTGTTCTTTTTGATCGTCTGGATCTCGGGATACCTATTCCATAAGGAGGCGTAAATCTTGTTCGAGCCTGAGCCCATCGCGGATTTTATTGCGATGGGTTTTTGAATGTCCAATTCTCGTGTCTGCCCGAAACTCCCTAATCCTCTTGCAGCCAATCCTATTAAATCCGTATTGCATCGACACAAAATTATTTGTAAAGTTGAGATGGTGTTACGTCTCGCTTCGTGAAGTTTTTGGGGACCGAACCTTAGTGCAATGGATAGCTACCAAGACAGCGCGATCCGCTTTTAATCAGTGTCGCGCCTGCTGTTACAAAAATTGGAAATCGTATTCAGGTTAAGAAAGGATCTTTCAAGTGAAATATCGTTTATTAGGCAAAACCGGCTACAAAGTGAGTGAAGTTTCCCTTGGCACTTGGCAATTAGGCGGCAAGTGGGGTGCGCCGTTTGATGCCAAGGTTGCGCGCGAAACTTTGGAAGAAGCTTATGCTCATGGCGTCAACTTTTTTGATACTGCCGATGGTTATCAAGGCGGTGAAAGCGAAAAAATGGTCGGCGCTTTTGTCAAACAGCATCCCGACGTTCATTTCACGACCAAAATCGGCCGTAAAGAAGAACCGTTGACTGCCGAGCATTTTGATCCTGATCATGTACGCCGCTATGTCGATGAATCATTACAAAATATGGGCTTGGACAGTCTGGACATTGTCTTGTTGCACTGCCCGCCAATGCAGGTCTATTACCAACCCGCAACGTTCTTTGCACTGGATGCCTTGCAAAAAGCCGGCAAGATCAAGCATTACGGTGTCAGCATCGAGCGCGCCGAGGAAGGTATTAAGGCTTTGGATTATGACACGGCTGTCGTTGAAGTGATCTTCAACATGTTCCGCTTGCGCCCTGCCGAAACCTTCTTCCCGCTTGCTAAGCAGCATGATGTTGGCATTCTCGCTCGCGTCCCATTAGCAAGCGGCTTACTAACCGGCAAGTTCGATGAAAACACCAAATTTGCCCCGACAGATCAACGAGCCAACAATCGCCACGGCGAGCACTTCAGCAAAGGTGAAACTTTCTCTGGCGTCGATTATTTGACCGGCGTTAAAGCTGCCCGTGAACTTAAGGAACGACTTGGCTCCGATAATCTCGCCGCAACCGCATTGCGTTTTATCTTAATGTATGATGCTGTTTCAGCCGTCATCCCGGGCGCCAGCAACCCTACCCAAATCGAACGCAACACCGATGCTGCGGACGTGCCGCCACTGACGCCTGAACAGATGGCAGTGGTCAAAGATGTGTATGATCGCCTCATCAAAAATCCAGTTGGATACGAATGGTAACAGCTTCATCACTGTTGTCAAAAGCTGCCGCTCACCGATTTATATTGATGTAAGGGTACATTTACACGCCACCCAAGTGTGATCAAGGCCAGCTCACATGTTAGCTAGGTGGCATCAGGATTTATGCACCACTCATCGCTGCCGGCAGCTTTCTTTGGCAACAGCGCTGTTGCGACATAACGATTTGTTTCATTGCTGACAAATCAAATCATTCAAGCAATCAACGCAACAACCCCCACTTTGCCAGGCAAAGTGGGGGTTGTTTGTGTGCTTCGGATGACTAGAGGCTCAATCGCTTTTCCGCCACCGCGAATCCATAATCAGACGCGCGGTAAATAAGCCCAGTGGCAAAAACATGATAATCAGCGCCGCGCGGGTCATCCACTCCGCGCCAACCCCGATGTTGTTAAGACCGATATTATACACAGCCCGATAAATATAAAGGCCCGGAACCATGATCACAATTGATGGCACGGTCAGCGAAATTCGCGGATAGCCGTCAACCCGGTTGATCGCCGAGGCAATCAAACCAGCCACCAAGGCACCGATAAACGCTGCCGCAGCTGGCGGAATCGTATTTAAATCCACTAGTTCAAGCCGCAACGTGTTGGCGACGGCTCCGATCAAACCAGCCTGAACTGCCATGCGCCGCGGGCTGTTGAACATCACGGAGAAACCGAAAACCCCACAAAAACTGGCGATGAGTCGGAAAACCAGTAAAAGTGCCGGATTAAGGCCTAAATCGGCAAAATTCTCTGGGCGCAAGTGCACCACCATGGCCACTAACCACCCAACCAATGAAGCGACAATCGTGATCATCAAGGCATATAACAGCCGCTCCATGCCTGAGCGCATATCCTGCTTGGAAATATCCAACATACTGGTGATGAATGGAAAGCCTGGAATGACGAATAACATGGCACCGATATAGCCAGCCTCATGCCGTGCAGCAATTCCCAAGCTCATTTCCAGGCCTCGGAAAACAAGAAAGTAAACCAGACAGGCACCCGCAACACTGACCCCGATGCACGCCAACAACGTCCAATTGCGCCGAATCATGATCCCACGCAGCCAGTTACCGATACCCGCACCGACAAAACAACAAATCATCTCAATCGGACCGCCACCAAGCAGGAAAACGAAGGCACAGCAGGCCAATGCCGCAGCAAGACCTGCACGAAGCGGATCATAGTTGCCGGACATTTTCTGAATCTGATCAAGCCGGTGATGAATATCTCGTACCGTCTCTTTGGCATACTGCGCATCAAACTCGCGCACAAATCGTTCTAGCGCATCCAACTTGTCCGTATTCACACCACTTTGCGGCAACGACAGCACTTCGGAATAAGCGTGGTTATTGCTGAAACAGGTATACGACAATGAAATTAACCCAATATCAGCCGAACACGACATCCGCAAGGCTCGCGCCACCGTGTTCATGGCTTCCCGAACCCGCCACGCTCCCGTGCCGCACGCTAGCAACATAATGCCAACTCGGCCAACAAGTGATGCCCGTTCTTCAAGCGTTGCATGATCCGCCTGACGTTCTTCGCTAACGATGACGTCATACCAAGGAATCTGCATATGGTGTTTTTCTGAAAGCGGTGGATTCCCCTGCGCCGCCTGATGACTTTTTGACGTCATAACTTGTGCCAATCCTTCTTCTTATAGGAATATTCGTTTTGAAAAATGAAAAGAAACATTCACTATTTTAGCACAACTTTTGCTGGCTTATTTTAAAAATATCGCCGCACTTGTTACTGGCGATTGAACATTTTATCAACAAAATACTGCCAATACGTCTTTGTGCCGGTAATAACGGTTGCTTCTCCAGCGATGCCATAGTAGAGCGACTGTTGATGTGTTTTAGACAAGTGCACCCTAGCCTGGGCTTTAAAGTAGTTGCCGGTTTTGGGATTCACGGTCGGTGCAACGTCAACTGCATAAATCCGGCCGGTTATCGTCATAGGCGTCGGTACGTTCCGAGCGATTCGTAAGCGCACATTTTGGCCACGTTTTAGGCTCATGACCTCGGCCGGCGAAATTGCCAGTTTCAAATCAGCTTCTTTTTGCTTAGCCAAGTCCGGTAAAATCTGGGCTAAGACAGTGCCGGTCGGAATGTACTTGTTGCCACTTAAAGACGCTTCAAGGTGCAGAATACCGCTGACTGGTGCCTTGACTTGATAATTGTTGCGCTGATCTTTAAGTGCCGTGAGTTTTGCCTCACCTTCTTGAGTGGCTTGTTGCACTTTCAGCTGCTCTGCCGCGATGGTTTGCTGCATTTTATTTTGTAAAGAAGCCAACTTCGCCTCATTCTGACTCGTCTGTTGTGCAGACAGATCGGCTTGCTTTTGGTTGGCGCGTTGGGTTTTCAGTGCAGCAAGCGCCTCTTTTTCACTTGTCAGCAGATTTTGCAGCTGTGACTGGTATTGACCCTTTAAGTTGGCAAGATTAGCCGACTCCGTGTTTTCCGCTTCGGCTTGATATTGCCCATAAAGATAACTGTAAGCATGATCGGCTTTTAGCGGCTGATCGGTTCGGATGGCGTTTTGAGCTTCGCGAATCGCTGCTATTTTATCCTCGCTGGCTTGCATACTAGTCCGTAACAATTGATCAATTTCTTTGTTCTTGGCATTCGCCACGTTTTGAGTCGCATTCACGGCCTCCGACTCTAGTTCATAAACTCGGCGCTGATTGAGATAGTCGCGCACTTGTTGTTGATAGCCGAACTTGTCGGCACTGTTAAAAAGATCCTTATTGGCCGCAATACTCCGGCTGAGTGTGTCCAATTGGGCTTTTTGATCTTTTAACGTGGCCAACTGTTGGTTCAACACCTTTAATTGTGCAGGATTGGCTACGTCGTGATACACCAGCAGCGTCTCGCCTTTTTTGACCCGCTTGCCTTCCTTCATATGATTCGTCACAATCCGATTCGCCGCTGTCCCCTGAATGGTCACGGCCGTTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017065|2424458:2447801|2444096_2444855_+|WP_162494871.1|DBSCAN-SWA MLQSQNVLHIYILEDDPDYLTFLYKMLQRRISFEEWPAKIELATTSPNELISNIDQRIANDSIFFLGFGFTNSSKDGVDVALAIRKKSLYADIIFVTGHTEQALTILSHKIAPLDLITKDSSIPVDSLVQDNVEYSLKRLRARKLMSPRLFSYSMDSSVFSFPLNEIIYIQTIPEKSSMLEFHVKSESVPFSGNLKDLTLKYPTLFRCHKSILLNPLHVISVNTSERFAYMDNHDKVEVSFRKMVALRQMLR >NZ_CP017065|2424458:2447801|2439392_2439602_-|WP_087912749.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MNTVSDRFNTVTEDELSVVSGGNAWGNAVNGALNGAATGARFGKNLGPWGMIGGMALGAGIGGYFGYNG >NZ_CP017065|2424458:2447801|2437169_2437613_-|WP_087912744.1|DBSCAN-SWA MITFKNMFICNKAWKDLVEIVRRSSVNAIQKDEMRGRYNVFREGFRANHELGMPYHFYSALKAVTLAIPVATFVGTLNGSWSNYGLIPGLWMWVFLFGNYECGIVKRIKARTLQELRPSKKEWVLRASISAGSSLLFATINLSLING >NZ_CP017065|2424458:2447801|2425513_2426491_+|WP_087912735.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP017065|2424458:2447801|2439619_2439811_-|WP_087913295.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MDSELTDAVGGRNTWQQNVSGVAGAAAGGAALGAVVGGPAGAFLGAHYGPILWTAVTGFTGGF >NZ_CP017065|2424458:2447801|2433762_2434569_+|WP_087912740.1|DBSCAN-SWA MTTNRTTLKIFILEDDATFLRFIEKTLNNYIMIEELHAEIKIATQSATDLLNAIDLQQINDSFFLLDIDIPGSSINGIDIANIVRKHSLYADIMFITSHTEQALAILSQKILPLDLVDKSVPAEVETRLRTNLVQGIKRLRSRQLESPRLFSYQIGANLFSLPLDDVLYIQTVLGTPSTLELHAKHETTTFPGNLKEVASRYPTLFRCHRSFLLNPLHVHKLNATGRFVYMDNQDKLEVSIRKVSALRRLMAAANRSHAEDNNLADDA >NZ_CP017065|2424458:2447801|2436376_2436661_-|WP_087912742.1|DBSCAN-SWA MVSKDRLIGTMEKLSIELNRHHTHSETARFVSQELEVLKKSSGLAFPNKLQYFFNHAPVVKFSDSISFSEAEKDLWDCVFEYKQLGNYSWIASE >NZ_CP017065|2424458:2447801|2440288_2440630_+|WP_087912751.1|transposase|DBSCAN-SWA MYTLSAVQLQCNPNIQLTCDGGQLTNDAGLSLLIDFCHRLHLDQLLRQTVHFVDQRKCFTASYADICFQKILLSMAGYHHNVHANDFQRDPALTAILGKQNLVSQPSISRFLP >NZ_CP017065|2424458:2447801|2438018_2438177_-|WP_087912746.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MTNLKDSELCQINGGFAPIVIPVATILGILATDAFNHADQLIDGFKKGWERP >NZ_CP017065|2424458:2447801|2432145_2432292_-|WP_191981858.1|DBSCAN-SWA MTDQKSIQKETTMSDYNLSQVRGGTNRVSSQPFEDLKSWIAGLFRGKH |
26 | Bacillus_phage(50.0%) | bacteriocin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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