Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022037 | [Haemophilus] ducreyi strain FDAARGOS_297 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas3,DinG | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP022037_1 | 1464907-1465055 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022037_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP022037_1
>1.1|1464930|40|NZ_CP022037|CRISPRCasFinder TAAATTATTGGCTGCAAGCTCTGAATCATTATTTAACGTA >1.2|1464993|40|NZ_CP022037|CRISPRCasFinder CATGTTGCCCGCTGTAAATTTGGATTTGTTCTTTAAGGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022037_1
The CRISPR arrays of NZ_CP022037_1 >merge|NZ_CP022037|1|1464907-1465055|CRISPRCasFinder ACATTCTTAGTCACGTTTAAGGTTAAATTATTGGCTGCAAGCTCTGAATCATTATTTAACGTAACATTATTAGTCACGTTTAAGGTCATGTTGCCCGCTGTAAATTTGGATTTGTTCTTTAAGGTGATATTGTTAGAAGTGTTTAATGT >NZ_CP022037|1|1|1464907-1465055|CRISPRCasFinder ACATTCTTAGTCACGTTTAAGGT TAAATTATTGGCTGCAAGCTCTGAATCATTATTTAACGTA ACATTATTAGTCACGTTTAAGGT CATGTTGCCCGCTGTAAATTTGGATTTGTTCTTTAAGGTG ATATTGTTAGAAGTGTTTAATGT
>NZ_CP022037.2|WP_010945344.1|1449101_1450673_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MNNIHNHKILILDFGSQYTQLIARRIREIGVYCELWAWDVTEKQIREFNPTGIILSGGPESTTETNSPHAPEYVFKAGVPVLGICYGMQTMAMQLGGLTEASEQREFGYAAVELQHADQLFAKLNDDLTASQPKLDVWMSHGDKVTRLPAGFQTTAVTPTCPIAAMSDEKRRFYGVQFHPEVTHTKSGLALLTNFVENICGCARSWTPENIIEDAVAKIKQKVGNDQVILGLSGGVDSSVTALLLHRAIGKNLHCVFVDNGLLRLNEGDQVMEMFGDKFGLNIIRVNAEERFLEALKGIDEPEAKRKIIGKVFIDIFDDEAKKLTDVKWLAQGTIYPDVIESAASKTGKAHVIKSHHNVGGLPDYMKLGLVEPLRELFKDEVRKIGLTLGLPAEMLNRHPFPGPGLGVRVLGEIKKEYCDLLRNADAIFIEELYKSGWYYKVSQAFTVFLPVKSVGVMGDGRKYDWVVSLRAVETIDFMTAHWAHLPYELLGKISNRIINEVNGISRVVYDVSGKPPATIEWE >NZ_CP022037.2|WP_010945343.1|1447488_1448952_+|IMP-dehydrogenase MLRIKQEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLSTQLTKTIRLNIPMLSAAMDTVTETKLAISLAQEGGIGFIHKNMSIERQADRVRKVKKFESGIVSEPVTVSPELTLAELAQLVKKNGFAGYPVVDNENNLVGIITGRDTRFVQDLTQTVSKVMTHRDRLVTVKENAKREEILALMHEHRVEKVLMVDDAFKLKGMITVKDFQKAEQKPNACKDEFGRLRVGAAVGAGPGNEERIDALVKAGIDVLLIDSSHGHSEGVLQRVRETRAKYPDLPIVAGNVATAEGAIALADAGASAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIAEAAEALKDRDIPIIADGGIRYFGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGEIELYQGRVFKSYRGMGSLGAMSKGSSDRYFQSDNAADKLVPEGIEGRIPYKGYLKEIIHQQMGDLRSCMGLTGSATIEDLRTKAQFVRISGAGIKESHVHDVTITKEAPNYHMG >NZ_CP022037.2|WP_010945341.1|1446592_1447219_-|23S-rRNA-(uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase-RlmE MGKKRSASSSRWLAEHFKDQFVQKAHKQKLRSRAYFKLDEIQQSDRLFRPGMTVVDLGAAPGGWSQYAVTQIGNQGRIIACDILDMNPIVGVDFLQGDFREVSVLNALLARVGDEMVDVVMSDMAPNFSGMPSVDIPRAMYLVELALDMCRQVLAPKGSFVVKVFQGEGFDDYLRDIRSMFTTVKVRKPEASRDRSREVYIVATGYKG >NZ_CP022037.2|WP_010945340.1|1444631_1446551_-|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MVKNIVLWVVVAIVLMTAFEGFNSNFNNSNTVSYSTFLNDIKSNQLKEVNFKRNDETISVIKNDGTEYKTVMPMNDQYLLSDLAKTNATITGQPQERRGVLFQTFISWFPMVMLIGFWLFYMRQMQGGGRGAMGFGKSKAKMLTPEQVKTRFSDVAGCDEAKEEVSEVVDFLTEPSKFQKLGGRIPKGILMVGPPGTGKTLLAKAIAGEAGVPFFTMAGSDFVEMFVGVGASRVRDLFDQAKKNAPCIIFIDEIDAVGRKRGGAGLSGGHDEREQTLNQMLVEMDGFEGSEGVIIIAATNRADVLDDALTRPGRFDRQVTVDLPNVKGREQILKVHMKKVPLASSVDPMIVARGTPGYSGAQLANLVNEAALFAARKNRTVVTMDDFDKARDKINMGPERRSNTMTEKELMNTAYHEAGHVIVGYLMPEHDPLNKVTIVPRGQALGFAQFLPEGDRVSETFTKLESQLSTLFAGRIAEGLIFGDDKITTGASSDIHRATQIARAMVTQWGFSKELGPLFYQNEDGMGAIKGVSEASQKLIDQEMRIIIDRNYARAKQTLEENIDILHAMKDALLKYETLDRKQIDDLMHRRPVGEPEGWNDDKEENSSNDSSDATSASNTIEEAKPNTDADVADNRVDA >NZ_CP022037.2|WP_010945339.1|1443217_1444435_-|tyrosine-transporter MKNKILGSALMIAGTTIGAGMLAMPLTSAGMGFGATLFLLISLWGLLAYTGLLFMEVYQTAPKRDVGVASLAEQYFGIVGRVLATATLLVLLYALLAAYITGGGSLLSGILPEIMDSQLTNKIAILLFTTLLGTFVVVGIKGVDGLTRVLFMGKIIAFLLVLAMMLPKAKIENLFAMPLDNLLVISVVPIFFTSFGFHVIMASINNYLEADIGKIRIAIYIGTAIPLIAYLLWQLATHGVLTQAEFVEILKSDPSLNGLVKATSQITGSTFLGEMLRLFSALALITSFLGVAMGIFECIGDLLKRINLPTNRLVLTLVTFIPPLLFALFYPNGFIAALGYAGLLFAFYGMLLPIGLAWRARKLHPNLPYRVSGGNSALLIALLMGIIIMIIPFLIQFGYLPQVMG >NZ_CP022037.2|WP_010945338.1|1440149_1440536_+|YhcB-family-protein MEQWTTEIWFSISIAFLIGTLCGVLVMRFFKGNIQQQIQLKSELASAEAKIEEQKQQLERHFEQSANLLENLAEDYKKLYTHFAQNSEQLLPESNQVEFFKRLKNHANGDEDNQPRDYSDGSSGLLKS >NZ_CP022037.2|WP_010945337.1|1439419_1439842_-|50S-ribosomal-protein-L13 MKTFVAETVKRDWYVVDAAGKTLGRLATELASRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVINAEKVVVTGKKETDKIYYWHTGYVGGIKDATFKEMISRRPEAVIEIAVKGMLPKGPLGRDMFRKLKVYAGNTHNHAAQQPQVLDI >NZ_CP022037.2|WP_010945336.1|1439007_1439403_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTAANQNYGTGRRKSSSARVFIKPGSGNITINQRSLEVYFGRETSRMVVRQPLELVELLDKLDLYITVKGGGISGQAGAIRHGITRALMEYDETLRPALRAAGFVTRDARRVERKKVGLHKARRRPQYSKR >NZ_CP022037.2|WP_010945335.1|1437580_1438120_-|hypothetical-protein MRLLLIIFCCFLTACQMLKKTFVVPESIPFQGKSYFKVTDNMLEGMRHLLFLPAEGNQHPDNWHNAIFIFLDQNKTSTMMQRMALRKKVFSNQQDTIAQIKIIENELYSAIIYPPTERFNDILLEVSRGRDSACGFAQIQVANKRAILTEKNANLTAYQAELNSLAQQLSTLAWQVACQ >NZ_CP022037.2|WP_010945334.1|1436629_1437553_-|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MEQQYAKLVKRAANVAIIVACSLILIKTFAWWKTGSISILASMTDSMVDLFASMTNILVLRFALQPADKTHTFGHGKAESLAAIAQSAFITGTAVFLLLQGIHNLNNPVLIEDSQLGVIVSIISIVFTAALVFYQKKVVSITQSPAIQADSLHYQTDLFMNAAILVAMLLNIYGFIYADAIFAIGIALYISINAFKMFWEAVQVLLDKALPEEDINQILTIVANQPQIIGIHDLLTRQAGAVRFIQLHLELEDHLSLLEAHTITDNLEQKILAAFPLSEVIIHQEPTSIVQQELVLGQVKNYVPSYR >NZ_CP022037.2|WP_010945060.1|1466681_1468451_-|ShlB/FhaC/HecB-family-hemolysin-secretion/activation-protein MKIKNNSVNSKIILSYLFMLSGVATSGYSEQSNNPKLELTEDLIKQARAADPLNQELPHLKNKEAYENTDQQLAKAEQFLTAEESSETVKLEQQNTAQKSTIKMVTIDMGDKKTKIDFDRITKQYIGHPLNKKVIFSLVKALTEALHKAGYSTSGITLKQAEAKTGKLEFNIVWGTVDKLIVAGKAPTTFREKAMLFVLPNLSGKIFSIHDLDQLVEVLNTVNKRAEIKVLASKAYGKSNLNILTERTRKWPTVTLSINNSGKENNQNGRNQMTLNVSWSDLLGTNDVWSFKTGYRLYKETKKNTQQNYSLSYIQPFSYYTLEIKASQSAYNKELTGFYTYPSSGKTQTANIKLSKLLKRNKEVILLTYGELEFRKQKSYVANRLVTNVRHSKATVGFSYIGQLWKGKLYTDISFASALNWLKSNRLAYDDSGETTLRLVSTSINWYRSIPFFKRSANYHMRIGAQYGFSSLYSDNQFSIGDEYTVRGFKGNSVAGDKGVYLSQTLTLPFNSKREYGSSISPFIGIDVGYVAQRKPKKQDDILVGMALGIKARIKKLSLSFTYGIPLKGFDKTSKAKRHVYYVNGSISF >NZ_CP022037.2|WP_010945058.1|1469784_1471221_+|glycerol-3-phosphate-transporter MFGPFKPSPHITELPSNKIDARYKFLRWQVFAGIFFGYAAYYFVRANFDLAQKGLIEAGLYNKAELGIIGTSAGLAYGLSKFVMAGISDRSNPKVFLPFGLLLSDLCMTMMGLMPWVTSGIAVIFIMIFLNGWFQGMGCGRTMVHWWSKSERGTIVSIWNCAHNVGGMVPGAMVLLASAIYFSNTGEHATAKDVWQQALYYPGIAAMIAAIPVYLVMKDTPQSCGLPPIEKWKNDYPDDYDEKTAEQDLTTKEIFVNYVLKNKLLWYIAIANVFVYLIRYGILKWSPVYLGEVKHFNIKGTAWAYTIYELAAIPGTLLCGWISDKVFKGKRGLTGFIFMILTTIAVIALWKNPATPEAELAQYAGRPFYDNPYQLMDFTLMTTVGFLIYGPVMLIGLHALELAPKKAAGTSAGFTGLFGYLGGTVSASAVVGWAAEYYGWDGGFYVMITGGILAVLLMFIVMVEEGKHKAKLEDHYGK >NZ_CP022037.2|WP_010945057.1|1471414_1473823_+|endopeptidase-La MAQRTKKSIALPLLPLRDVVVFPYMVMPLFVGREKSIQALHLAMDSNKQLFLVTQQDPNKEDPSTDDVHHVGIIANIIQMLNLPDGTVKVLVEGQQRAKIEQIHDNENGLWAVVQPLLSKTTKNNEELTAIAKLTTNEFENYVKNNKKIPAEILPKLQKISSAERLADTISSNLIAPVKSKQAWLEETNLITRFEALLIAMATEIDSLETENRIRNRVKQQMEKNQRDYYLNEQIKAIQKELNDGEDAEQSELDKLKDKIDATKLPVTVKEKLDSEFKKLKAMPQSSSEATVVRSYIDWVLQIPWHKKSAVKKDLPQAQAVLDKDHYGLERVKERIVEYLAVQSRLNKLKGPILCLVGPPGVGKTSLGKSIANATGRKYVRMALGGVRDEAEIRGHRRTYIGSMPGQLMMKMAKVGVKNPLFLLDEIDKMAQDMRGDPASALLEVLDPEQNNTFNDHYLEVDYDLSDVMFVATSNSMNIPPALLDRMEVIRLSGYTEDEKMHIAQEHLIAKQQENNGLKASELQIKESAILSIIRYYTREAGVRALEREIAKICRKAVKALILDNKTKKITVTDKNIQDYLGVKRFDYGKMDTQNRVGEVTGLAWTEVGGDLLTIETASVAGKGKFSYTGSLGDVMKESIQAAMMVVRARAKKLGIAENFHEKRDIHIHVPDGATPKDGPSAGIAMCTALISSLTGNPVRATVAMTGEISLRGKVLPIGGLKEKLLAAHRGGITTVIIPKDNEKDLEEIPANAKNSLMIHAVETIDEVLAIALENPPAGIEIMPAKSAGIKVRKTRSKTAIQ >NZ_CP022037.2|WP_010945056.1|1475472_1476255_-|aquaporin MQNTLKGACIAECIGTGLLIFFGVGCVAAAQLAGATLGLWEISIIWGIGVALAVYATAGVSGAHLNPAVTIALWKFACFDGKKVLPYIIAQCLGAFLAAALVYFLYKDLFIVAETAKNIVRGESVGFASVFSTYPNPNISVLQAFFVETVITMVLMGLILALTDDGNGLPKGPIAPFLIGLLIATLGGAFGPLTGFAMNPARDFGPKVFAFLAGWGEVAFTGAREIPYFIVPIFAPIIGALLGAWGYQRFIGKNLPCNCK >NZ_CP022037.2|WP_010945055.1|1476622_1477513_+|CNNM-family-magnesium/cobalt-transport-protein-CorC MSEELPNITTSEKKSFLQSLFSCLFQSEPKNREDLVEVIRDSLENELIDNDTKEMMEGVMEISELRVRDIMIPRPQIVYIDANLPLEACVDLIIESAHSRFPVILDDGKDNIQGMLLAKDLLKYLRSDSAPFDMQKMLRPAVIVPESKRVDRMLKEFRSERFHMAIVVDEFGAVSGLVTIEDILEQIVGDIEDEFDEEEIEPIRQLSRHTYAVSALTDIEKFNAVFATDFVDEEVDTIGGLVMQAFSHLPQRGEQVNLHGIDFKVTSADSRRLIQLRVTVSDEQLEQMERITDLEE >NZ_CP022037.2|WP_010945054.1|1477573_1479091_+|apolipoprotein-N-acyltransferase MNLVNPSILVACILSFCLGAIGCLAFSPFDIWLIAYLSAAGLIWAATLVERKTAMLATFAWSIGYFGVGVQWVNVSMTQFGGVPVIVSYLAVLLLASYLGLYNLLFSYLARRFGLISPFVLASLFTFTEYLRGVVFTGFPWLQFGYTQIDSPFAQLAPIFGVEGLTFLVILLSSYLVDIVKNPTRKIATFTKIAVIIGFSLASNLLQFVQIDQQKPPVKVALIQANIEQQLKWDPAHFENTLRTYQQLINSSLAENEVIILPESAIPALESKINPLLNQLQKMAAAKNTEIIIGTLYENEQQQLFNSALVLGNQTKPYQLHQSLRYNKHHLVPFGEYVPFGSLLDWMREVFILPVNLAKGPFIQPALFTNKGKFNMAICYEVIFGHQLQQNQLAQQADYLITITNDAWFGDSIGPWQHLQMARMRALELGKPLLRAANTGITAVVGFDGKVIKKLPQFETNTLTAEIATTKGHTLFGQFGHWLIYSLSFICVAFGLFRRQKHKKH >NZ_CP022037.2|WP_010945053.1|1479271_1480498_+|HAAAP-family-serine/threonine-permease MVRLSNRFSKTWVLNLFGTAVGAGVLFLPINAGMSGFYPLIIMTLIVGPMTYLAHRGLTRFVLSSQKPGSDITNVVREHFGEQAGKFITLLYFFAIFPILLIYGVGITNTVSSFIENQLHMTSPPRVLLSGALIAVLISVMLLNEQAMLRITTYLVYPLVLILFGLSIYLIPEWNSAALEQMPSTGDFITTLWLTIPVLVFAFNHSPAISSFALSQQKHHQDPEKNDVESGKVLRSTATILVLFVMFFVFSCVLTLTPVELAEAKVQNISILSYLANKFDNPIISYLGPFIAFLAIGSSFFGHYLGAREGLEGLVNQLRDKPIASHKIHKITAVVFFLILWIVATINPSILGFIESLGGPIIAMILFIMPVYAVYTVPALAKYKGQFSNIFVAIMGSIAISAILYGLL >NZ_CP022037.2|WP_010945052.1|1480608_1481988_+|L-serine-ammonia-lyase MISVFDIFKVGIGPSSSHTVGPMKAAKQFVDELSEHKLLAKTDRLVADVYGSLSLTGRGHSTDIAIVMGLMGYLPDNVDIERIDSVIQQVKQEHKLVLAEANPAETKIIDFDFYNDMPFHSTFLARHENGMTLKAFAGETLLYEKTFYSIGGGFIVDDEHFEQQTNADVNVPFPYKNAEDLLKHCHDQGLPLSSLVWKNEMALHHKQAISDYLTKIWKTMEACIEHGLHTEGLLPGPLKVIRRAPSLRHTLESTGKFNTDPMQIIDWVNMFALAVNEENAAGGRVVTAPTNGACGIVPAVLAYYQQFIAPLNQEKIERYLLVCSVIGSLYKMNASISGAEVGCQGEVGVACSMAAAGLTEIMGGTPEQVCMAAEIGMEHNLGLTCDPVSGQVQVPCIERNAIASVKAINASRMALRRTTQPRVSLDKVIETMYETGKDMNAKYRETSTGGLAIKILPCD >NZ_CP022037.2|WP_010945051.1|1482046_1484050_-|bifunctional-tRNA-(5-methylaminomethyl-2-thiouridine)(34)-methyltransferase-MnmD/FAD-dependent-5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34)-oxidoreductase-MnmC MHKLTFAQLSFNSDNTPVSEQFDDIYFSTEDGVQESYYVFQDGNQLWQKWQNHHRSAFVIAETGFGTGLNFLAVAEKFQQFRSTFPDSPLKRLYFISFEKYPLTQQQLADIHQHYPQFTQLSATLIACWQPRQAGCQRYHFDDVYLDIWFGEMLENLPQLGDLYNATVDSWFLDGFSPDKNPTMWHEQLYQHMFRLTRVGGSFATFTAASHVRCGLQAVGFTVYKRKGFAKKREMLCGEKAQKSQTAEVNFPYFYSPPAIVNDDIAIVGGGIASLFVALSLLERGKQVTLYCQDSQVAQKASGNAQGAIYPQLSDDDPRNVRFYVHCFDYALQRLKQFEKLVPFEHALTGVVLSAYNEKTAQKLQKIARQTQNQDLFKWCQAEELTEYLGVAIANEGAFIPQAGWLSPVQFVQQAFAYLQTKGLKIVLNHTVTDPQFVEGKWQWQYQGVQFAHHILVLANGHSFTQFSQAEGIPLYPVRGQVSQIPTTPALQKLKCVICYDGYLTPMATNGYHCIGASHVRDNTDMAFSAIEHQQNLAKLQQNIGAYHWTQGIDLSANLAKQGIRSALRDRVPMVGPIPHFAVQKQQYSNIYNLLRRKKAVENAVNFPHLYMVNGLASRGLTTAPLLGEMLASLIVNEPIPISQDIWHALLPNRTWLRKWLKGSKVV >NZ_CP022037.2|WP_041603674.1|1484358_1484670_+|YqcC-family-protein MKTKVRQHLNDLELALRLHKQWQVTAPSLDQLANDQPFCLGSLTATEWLQWIFIPRMHALLDADADLPRNFSITPYLEEALKQEAYLPAIQQPILLLELLLKD |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
256642 : 271900
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022037|256642:271900|DBSCAN-SWA 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11 | Enterobacteria_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
286504 : 309044
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022037|286504:309044|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022037|286504:309044|305975_306542_-|WP_041603379.1|DBSCAN-SWA MKLCKCPICHSDLTLEALIEDDSGRELLNTITNMSHGCGRAAVAYLGLFKPVKSSLSNSRSLKLLQSLLEIYPPSNVLEKALIDTVEQVRRNRRESGRIEPLTNHNYLKKVYESVKVQFAVVRSDKDFKQHKHESPEQQQRNEEDKLRGAIQYVERMRRLGQLDSIKNTESYQLWLKWQEEKANATAN >NZ_CP022037|286504:309044|301698_301953_-|WP_010944509.1|DBSCAN-SWA MNKRKHKQTDSEKLDLILAATAEINEKVDKQNGRIDELQSELHKTRLLLDEMSRKNRKQAIIAGGVGGGLVAIGFELLRLKLGM >NZ_CP022037|286504:309044|307078_307375_-|WP_010944496.1|DBSCAN-SWA MRKKQAYKICLEVIFEDEQSLNQVEVNAKTDVLGGRIARIDFNGNSFDILERYEEFITPMQLAFLNSKEAYKTRMQQAINKTLSDLYEEEDWENEEEE >NZ_CP022037|286504:309044|296520_297831_-|WP_010944513.1|capsid|DBSCAN-SWA 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33 | Mannheimia_phage(36.0%) | protease,capsid,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
596331 : 615392
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP022037|596331:615392|DBSCAN-SWA 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31 | Vibrio_phage(21.05%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
862096 : 872678
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP022037|862096:872678|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP022037|862096:872678|871385_872678_+|WP_010945590.1|DBSCAN-SWA MQNLRYPIDSKPPFGLSVLLAVQHLLAALGGIIAVPLVIGNVLKLPTSDTIVLVNAALLVSGIVTIIQCRGIGPIGLRLPSVMGTSFTFVAAALAIGFSEYGVAGIMGSSLIGSLVMIIGSFFMPYVRKLFPPVVTGIVVMMIGLSLIPVAVDWFAGGQKGDPHYADPANLAMATFVLVLVVILVQWGKGIFSAAAIVIGMLVGYAVALALGWINFEAIQNAEAFAIPQPLHFGLAFPISGIIGMSIAYLVTIVESSGNFLALGNATQTEITGKHLRGGVLCDGLGSAFAAVMSTTPFSSFAQNIGVISLTGVASRYVVTVMGVLLVLAGVFPWLGAIIVSIPSPVLGGAGLMMFAMIIAAGIQMLDKVERSKRNGLIIAISIGCGLAVTTRPELLDKLPNFFKEVFGSGITVGSVLALLLNLILPEDKH >NZ_CP022037|862096:872678|863016_865080_-|WP_010945598.1|DBSCAN-SWA MSYQVLARKWRPQRFSEVIGQQHVLSALENGLRQDKLHHAYLFSGTRGVGKTSIARLFAKGLNCETSITATPCGKCENCKAIEEGRFIDLIEIDAASRTKVEDTRELLDNVQYKPTVGRFKVYLIDEVHMLSRHSFNALLKTLEEPPEYVKFLLATTDPQKLPVTILSRCMQFHLRALTPTQLSQHLEFILTQENIPYELAAIEKLAKAAQGSIRDSLSLTDQAIAVSNTNITLPIVSEMLGLIDDDQPLELVMALAQANGDQVMAIIQNIATKGIDWQQLLNDVAETLHQIAMLQLLKQETPSDTPLHLLAKQIPPEDVQFFYQLMLIGKKELAYAPEQSIGVEMVFLRALAFHPKRTEEINQRAQLNQANNEQSAMVDNTQHKLEQLKANLTQVTTDKTSAQAVESSSKRSIKSAQQTVPANITDSTNNTLISPALVAMQARKQLQQKHVELNQHEKKKRKSITVNSTSSPTEITTNTQHQSLDLQERLMNLAHSTAKVTSQPSEPEVDSQSTEEDYCWTWLDPELAIENKSTKPAEIKQAILQDKTPELVAKTIELACEQDQWCQIINTLNLSSFSRQIALNSYLAQTTAQQLDLVLKPSMSHLDNEESRKSLTLALADKGFTYKLVIGESAEHKTPLEIRRMIFEKLTLAAKQALNNDEKLMLLRDTFAAEIDESTIRAVANI >NZ_CP022037|862096:872678|867980_868646_-|WP_010945593.1|DBSCAN-SWA MENRLIANTAHNQSLLSTHKVLRNTYLLLSMTLAFSAIVAYFAMAMNAPALPWWGLLIGFYGLLFLTNTNANSAIGLACVFALTGFLGYTLGPILNRYVGAGLGDAVMLALASTALVFFSCSAYILTTKKDMSFLSGMMMALFIVLLVGVIANIFLAIPALSLAMSVLFALFSTGAILLTTSNIIHGGETNYIRATVDLYVSLYNLFLSLLQIFGVLSKDD >NZ_CP022037|862096:872678|865852_866611_-|WP_010945596.1|DBSCAN-SWA MNNITQATASISVDKLTVRYNNGHLALENVSFQLQHGTVCALIGVNGGGKSTLFKSLMGLVKPLTGQVLLNQMPIQKALKQNLVSYVPQSEEVDWQFPVSVYDVVMMGRYGYMNFLRNPSALDKQKVEQAMQRVDISHLQHRQIGELSGGQKKRVFLARALAQESQIILLDEPFTGVDVKTENAIVALLQQLRSEGHLVLVSTHNLNSVSSFCDQVLMINRTLLASGPTATTFNHQNLEKVFGGIVHYLQAS >NZ_CP022037|862096:872678|866607_867513_-|WP_010945595.1|DBSCAN-SWA MNLSFLKKTLIIACAMGTTVAIAAPFKVVTTFTVIQDIAQNVAGDKAIVESITKPGAEIHDYQPTPKDIVKAQKADLILQNGMNLERWFERFFENVKNTPAVVVTEGIQPIAILEGEYKNLPNPHAWMSSANALQYIENIRAALVKYDPENAVSYNQNAKAYAEKIKAISEPLRQRLSVIPEKQRWLVTSEGAFSYLAQDYGLQELYLWPINAEEQGSPQQVRKVIDGVKANHIPVVFSESTVSDKPAKQVAKETGALYGGVLYVDSLSTKEGPVPTYLDLLKVTISTIVDGFEASKKEPK >NZ_CP022037|862096:872678|865107_865647_-|WP_010945597.1|DBSCAN-SWA MNQLDLIKSSIKSIPNYPKVGIIFRDITSLLENPTAFKASIDAIVAEFKNKGITKVVGTESRGFIFGAPVALALGLPFVLVRKPHKLPRAVISQSYALEYGEDTLEMHLDSINQDDNVLVVDDLLATGGTIDATAKLIRQLGGQVKNAAFVIGLPDLGGKARLEQIGIKSFTLVEFDGH >NZ_CP022037|862096:872678|862096_863005_-|WP_041603563.1|DBSCAN-SWA MNALEIHQLVKTYPTGVQAVKGIDLVVKQGDFYALLGHNGAGKSTTIGIISSLVNKTSGTVKAFGYDLDTQKIQLKQQIGLVPQEFNFNQFEKVINVLTQQAGYYGIPYQQALIRAETWLKKLELWEKRYHLTRELSGGMKRRLMIARALMHNPKLLILDEPTTGVDIELRRSLWDFLREINQQGTTIILTTHYLEEAETLCRNIGIIQNGLLIENTSIKALLAKLESETFVLDLQKTDKNQSLTINDYTFKWLDDNTIEVEVKRTQGLTKLFQQLAQQGIEVQSMRNKSNRLEELFIKMAN >NZ_CP022037|862096:872678|869469_871308_+|WP_010945591.1|DBSCAN-SWA MSQFNAKAFLADVPHLPGVYRMYDANQAIIYVGKAKDLKKRLASYFRSQVASKKIEALVGNIHHIDTTITHSETEALLLEHNYIKQHQPKYNVLLRDDKSYPYLLLTKHQHPRLTAFRGSKKVAGEYFGPYPNVSAVRESLNLLQKIFPIRQCEDNYYKNRSRPCLQHQIGRCLAPCVTGYCSQQEYDNQVKWVRLFLQGKDSQVIDYLMQKMEIAASELDFETAARFRDQIQSVRAVQEKQFVANQRLDDLDIISIAYQSGLACAHILFIRQGKVLGNRAYFPKVPSHTDLTELADTFIGQFYLQLNQHRSIPNQIILDQPLTESNALAQLLTEQAGHKVTIITNHVRGDKSRYLALAQTNARAALSLQLKQSTTIHKRYDALKILLKLPTIKRMECFDISHTMGSQTVASCVVFDENGPLKSDYRRFNIEGITGGDDYAGMEQALVKRYDKPLPIEKIPDIIFIDGGKGQLNRALQVFEKLTVAWDKHKPLLIGVAKGAERKAGLETLIIGRLKKEIHLPIDSPALHLIQHIRDESHHHAISGHRKKRQKAFVESGLESIAGVGAKRRQALLKYLGGMQGVKSATLAEIESVPGISKTLAGVIFDTLHNS >NZ_CP022037|862096:872678|867583_867919_-|WP_010945594.1|DBSCAN-SWA MHMIECNGKQYLTDPTGYLLNLNDWSTELAIAIASKEQINLTEEHWEIIWLVRDFYQEYKTSPAIRMLVKAMTLKFGEEKGNSRYLQRLFPEGPAKQATKIAGLPKPIKCL >NZ_CP022037|862096:872678|868831_869383_+|WP_041603561.1|DBSCAN-SWA MKLNFPTYLTLFRVVLIPLFIAAFYLPEGWYAPEISTLIFFIASITDAFDGYLARKWNQTTRLGAFLDPVADKILVTVAFVCIVEYYHSWWITIPVSIMIAREILISALREWMAEIGERASVAVSIWGKVKTACQMLALGGMLWRQSTFMEILAFILLYISAILTIWSMLQYLKASKKSLMKS |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1098180 : 1116166
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP022037|1098180:1116166|DBSCAN-SWA CTTAATACTCCGTTGTTGTCTCAATCACAAAATAATCTTTGGTTGCCACACGATAGCCCCCATTAAATACCAGTCCTGTACGCCCTTCAGCGATAGTGACTTGGTCACTGGCGGCACGCTGAATACCCGGAATCCAATACACGCCATCGAAAGCTCCCCAGCGGTTGCGACCTTGGCTAGAATCCTTAAGGCTAATAAATTCCACAGGGATTAAAGGATAAGCACCGCCTTGACTTTCACCCATCGAATCAATACTGCGTGGCTGTTGATATGAGCTGAACATATCGTAATTGCATAACGGATATAATGCTTGGTAACGAGAGTCCGTACGTAGATTCTTATCGCTGCTACCGTAAAAATCGCGCCAACTTTGGTCGGGCATGAAAAGCCAACAGTTGCCGTATTTAGCGTCCACAATAGAGGAATGTAATTCGCCGGTTTGTGAATAACGCACCCGCACAGCACGATTGTTTTCATCCACAATCGGTGCGCTACCAGCAACACAAAGCGGATAGGGATATTCCGTCGGTGGTACGGTTGGCAAGATAAAGCCAAGGTATGCACTTGAACACACTTGCGAAATCCGCGTGACAATCTTGCAACAGCGTCCGCTTGCAACAATGTGATATTCAATCGGGCGGTTATCGGCAAATAACACCACACCAGGTGAAGCATTAATTAAGCCTTTATGTATTTCAGTCGGCGTCACGGATTTTTCATTGAAAAATGTGCCGCCCCAGAAATTCAGGTTGTAGGTGTCAGCTGAAATTAAGTTATCGGTTGAAGCCACAAGATAAATATCTTGCTCAACGCCGGTACCGGTTGATTTCCATGCGATTTGACGGATTTCTTTTTGAGTTGCGGTTTCATTTAATTTTCGGTCAAGTAATACTGTCCACGTTTGTCCATCGCGCTTCAGTGTTTCATCTTCCGTTAAAAACTTATTGATTTTATCTAATAAATCACGCTCGTTTTGTGCCGTGCCTGTTGCGTATGCCATTAGCCTAACTCCTGTTTTAATGTTTGCTTATTCGCCCGAATCACGGTCATTACCGCACGTTCGCCCGCTACCGTATTAATACCGGCTGTAAATAACTCAGCACTATCAACCGCTAAAGTTTGCTGAATATTCACGGGGCTTGCTACCGCCTGTTGTCCTGCCGTGCCGTTTTGCATTTCGTGGGTTAATGTCGGTTCGTTGTATGACGGCATTGAAGGTGCGGAAACAAGCCCACCGGTGGCATACTTGCGTAAATGACCGCGGTTAATGGCATGTAAGAAGCCCACACCATATTTCTGTACGCTTGCCGCACGTACCACAAATTCGCCATTGGATAAGCGTGCCGGAATGGAGTCTGAAGTGCCTGTACCGGGTCCGGAAATAAAACCGCCGGTTGCGGCAGTCACCGCAGCCCCCGCACCGCCGAAAAAGCCACTAATAGCACTGGTCGCTTGCATGGCAAGCTGTTGTGCGGCAATTTGCGCCATACTGTTGATCACGGTCAGTGCTAATTGCTTGACCGCATCACCCAAGCTCATCGTGCCTTCAGCCAAGCCCATTAAGGCACTTTGAATGCCTTGTGTTAAACCCTGTTTAAACGCATTTTCAAGCTCATTTCCCGTCTGTTTAAGCTCCTGAATTTTTAGCTTCATCTGCTCAAGCATTGCCCCGGCTGCTTCGCCTTGTGCGTCCGGCATTTGTGCCAATCGTTCGAGTAACGGTAATTGTTTTTCAATTTCTGCCACCGTTTGCGCATACATATCTTTTAAGCGTTGCTGTCCTTCAAAGTGTGAAATAAGCCCGGTTTGAACTTGCGCTTGAATCTGCTGTTCCTTGGCAGATTGTTGCTGAATGACGTTATTTACTTCGGACTGTATGCCGTTTAATTGCACTTTCGCTCCTTCAAGCGGCAGCATTTTTTTAACTAAATTGATACCCTCTTGATTATTGGCTTTGCTAAATAAAGCGAGTAGCTGGTTGTATTTACTTTGTACATCAAGCAAATCTGCTTTTGCCGTTTGTCCGGTTAAACGTAAATAATCGCTATTGAGTTCGCGCAGCTTATTTGTGGCTTCTTCTGCCGTGCGTCTTGTATCTTGTGCCGCTTTTTTCGCATCGCTTTCCGCTTTACGTTGCGCTTTGTTTGCTTCAGCCTTGGCTTTGCGGTCAGCTTCCGCCTGTTCACGCAGTTTTTTCTGATTTGCCTCAATGGTTTGATACAGTGCTTCGGCTTCTTTTTTCTGTTCTGCCGTCCAGTTGCTATTGTTACGTGCGTTATCAAGATTCTTTTCAAGCTCGCTCATGCCGGATTGACGTGCACGAGTACGCAGTTTTTCTAACTCATCGCCGCCTTTTTTCTCTGCTTGCTTTTGTTCAAGTTGCGTTTGCAAGCCGATGGCTTCATTGATTTTGTTGATAAAACCCTGTACCGCATTGCCGGACATTCCGGCTTGGGCTGCAATCCCTTCAAATTTTGTACGCATTGCTTCTAAGCGTTCGATTGCGGTCGTGGATGCCTGACTCAAGTCTTTCTTGAGCTTTTGAGTGAGCTCTTCCACTTCCGTTTTCATCGCAAGGGCTTCGGTTTCGCTGCCTTTTATCGCTTCAGTGAGCAATTTGACTGCTTCAGGGTGTTGCGGGTCGCCAATTTCCGTCAATTTTTCAGCGAGCGTACCACCAGCTTCGATGGCAGCGTCCCAAGCCACTGCTAATTGCGCTTGCGTAATATTGGCTAATTCGCTGCTCGCAGTACTCATTGAGTCAATTTTTTGCTGTAGCTCATCAATTTGCGTATTAAGCGCATTCACTTCATCGGCGTTAATCAATCCACCCATGACGCTAGTGCGGTTTTGATTCAGCAATTTATCGCGCTCGGCAATGAGTGCTTCAAGTTTTTGTTTCGCTCCGTCTAATGACGCCGTATTGACTTTTAACTGTTCCATGCGGTCACTAAAACCACCCATTTCACCTAATTGAGTGCGTGCTTCAACTAAGGCTTTAGTTTTCTCAATATTGGCATCAAGCGTAGTGAGAGATTGGGCAAATTGGCGTTCAGCTTCTTCTTCCTGACTTTTTAAATAAAAATAAGCAGCGGCTAAACCTGCGAGTGCCGTAACCGCAAACCCAAAAGAACCGCCGATAAGAGAGAACAAGCCTGCGCCAACATTGACTGCAGCGGCACGTGCTTTGGCAACAGCAAGCGCACCATAGGCTTGCGTTGCACGCCCGACTGATACCGTCTCGCCATTAACTGCCTGCATTAAAACCACTGTCGCTTGTGCTTGGCGCACTGAAGCCGTTGCGCTCGCGTTAATTGCAGTCATGTGCGCACTTTCAGCAATCGCCGCTTTACTTTTTACCCCAATACTGGTGTACATTGCCGAAAGATAGCGGGCGGTATATGCCGTACCGACTAAAATGGCAATGCCTGCTAACCCTTCGAGATTATTTGCCAGCGTAGAAATCGCAGCCGAAACAAGGGTAGAAGCACCAAGGGTTTTATCAGTATTACCAATGAACTCAAGCCATGTGTTAGATAATTGCGTGACTGCTTTGCCAATCGTAAGCGGCATTTGCTCATATTGTTTTTGAATACTGTCTGCACCTTCAGCCACGGCAGTCATAATCACTTCTGTGGTTAATTGACCTTCTTCCGCCATTTTGCGTAATTCACCGCGTGTTTTACCGAGGGATTTTTGCAAGAGTTCTAAAATAATCGGGGCTTGTTCAGACACCGAGTTAAATTCTTCGCCACGTAATGCACCGGCTGCCATACCTTGCGAGAGCTGAATGATTGCTGCTTGCGCTTCTTGTGCACCAGCACCGCTGACTGTCATCGCCTGTGAAACGGTTTTAGTAAAACGTAACACTTCACCGGAATTTGCAGTGTCGCCCAAGGAACGGAAAACACGCGTGTAAAGCTCCGCCGTAGCAGAAAATGCCGTCCCCGTTTCTTGTGCTACAGCCATCAAACCATGAAAAGTCCCTTTTGCTTCAAGATTCGAGCGAGAAACTAATTTGATACGCGCTTCAAGGCTTTTAAATTCGTCACTGGTTTGTACTAAATTGCCAATGGCAACTTTCCCTAAAGTAAAACCTAACGCCTGTTTTTTTAATTCAGCTAATTGCTTACTGATAGATTCAACACCGGCGCGTGTTTTACCAAGTTTTGAAGTCGCTTCATCGGCTTTTTTAGCAAGACCGTCTAAGCCACCAGCACCGGTTTGCGCGCCTTTGCCTAGCCCTTGGCTTGCAGCAGCACCAGCTTGCAATTCTTTTTCAAGCGTTTTAAACTTGCTTAATGCGTCGTTTAAATCGGCTTTAATCTTTAACGCTAAATTTAATTCACTGTTTGCCATAGGAATCCGTTGTAATGATTGAAAACAAATCAACCCAAGAAAATACCACCACACCGAATGCGCTCTTTATTGGCTTAAGTGTGTGCTTGTTGGGCTTTATGGGGCTGTCCTTGTTAGTTATGTGTTTTACCGATTTCAGCTTTTGGCAAAGTGCTAAAGCACTTTTCGGTTTGCTAGCGGTCGTGGCGGTATTAATGACGATGGTTGGCGCACTGAATAAACTTTCGGTTGGCTCACTGCTCGGATTATTCATTGGTAGCCGTTTATAGTCCCTTAAGCTGTTCAAGATAATCTTTAATTTCCTTGCCACCATTCACCCCGAAAGCCACATCCATTGTGCGACTTGCCCTTAAATTCCGCTCCCGTTTAAGGGTTTTTGTATAAAAAAGCTCTGTTTGTCGAGCGGTGTAATGGCAAATTTCCGAGAAAATATGACCGCTTGCAATTAGTTGCTCGACGATTTCACCCCAACAGATTTCAGGTTCGCCTGCGCCATTTTCTCTAACATCGGCTGTACCGCCTGACGGGTAAAAAAATCGCTATTTACCGTCCACCACATCATTAACACCGTTTCGGCATCTTCGCCTGTCAGATTCTGTACCCATTCAAGTGGTTTACCCACCGAAATACTGACTAAATGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP022037|1098180:1116166|1102552_1102807_+|WP_010944522.1|DBSCAN-SWA MIENKSTQENTTTPNALFIGLSVCLLGFMGLSLLVMCFTDFSFWQSAKALFGLLAVVAVLMTMVGALNKLSVGSLLGLFIGSRL >NZ_CP022037|1098180:1116166|1108001_1108493_-|WP_010945386.1|DBSCAN-SWA MSGVKVEINTQQLTTILNKAVQTLANPKAMFGEMGETLLEIHSIRFTQQQAPDGTPWQPLANWYRDSKKYNQDKILTLHGDLRGTLRYQADNHGVIFGSDRPYAAIHQFGGTIKPKNKKILKLGTLYARSIIIPARPWLGISADNEQRLIEIARNHLENAFNA >NZ_CP022037|1098180:1116166|1115320_1115695_-|WP_010945377.1|holin|DBSCAN-SWA MKGFFNALKQGRLLSWVVSSLVLLIVIALVSPQQLPVVLYKLALVCMAAIIGYHLDRALFPYSSPGSYLAINWKVYFKHQHTKNSDQAKPEYPVHKGYELIFALVVLRRALIVGTVILGVTLGL >NZ_CP022037|1098180:1116166|1103460_1104204_-|WP_010944520.1|DBSCAN-SWA MRTESYSYGQGAVYLAERLPNGQPGAFRWVGDVSELSVSLSVEEFTHKESYSGQRQEVKKIITGKSGEVLIKFHEMSKENLSLMLLGEASTIKAGNVTKEALPDDIKAGDRIALAHQNVSDVKIAELKENTDFVVDAIFGTIEFLKEQKSKKLTVDYNYGDVDVIALLTTNPKDLFLRFEGINLAETNEWNLVELYKINFNPTEALNLINNENALDALSAKAKVLADTTKAGDSTLGRFGRVVKIKK 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22 | Pseudomonas_phage(75.0%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1120231 : 1127358
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP022037|1120231:1127358|DBSCAN-SWA GATGAGCCGTGAGAAATTAAACACCACGCAACGGGCGTTGCGGATTTTGAAAGCCTTGAAAGGCAGAAGTTTGACAGGACTAACCAATAAGGAACTGTGTGAAGCGATTGGCGAAACGCCAGTGAATGTCACCCGAGCTATTGCCTTTTTAGAAGCGGAAGGTTTTGTGCAACGGTTAAACACTGGGGCGTATGGTTTGAGTTATCAGATTTTGCAGATTGCAGTAAGCCACGAGACGGAAATGCAGAAAGCCTCGGAACGATTGGCACAGGTGCGAGCAAGGGTGCAAGCGGGTGCTTTTTAATAAAAATTTGCAATCAGGAGAACAGAACAATGAGTGAATTAACGTTAAGCCAAGAACAGAATGCGGTGGCGTTAGCAGCCAAGGCGATGACGCAGGATTTAGCGGAAGCCCACGAAGCGATGGGAATGATTAAAGCATTTACTTTTGTAGGAAAACTGGCGACGGTCGCCACTTTGAAAAAACTGGCAGAAGTCAAAGAAGCTAGAAATTACAAGGGTTTGCAGTATGTGAACGCTGATGGAGAACTGGCGACGGTCGCCAGTTGGGAAGAATTTTGTACCGCTTGCGGAACCAGTCGCAGAAAGGTTGATGAAGACCTTCAAAACTTAAATCAATTTGGTGAAGAGTTTATGGAAACCAGCCAACGCCTAGGCTTGGGTTACCGTGAAATGCGAAAACTTCGCCAGTTGCCGGAAGAAGCCCGAGCGGAGATTGTGGATGCGGATTATTCGGAAACCACCGACAAGGAAGATTTGATTGAGAAAATCGAAGATTTAACCGCTAAGCACGCCAAGGAAAAAGAGAGCCTGACCAAGCAACTGGAAAGCGTGAAAGCAAACTACGATGCACAGGCGAAAGTGATTGCTAATAAGGACGAACGTTTAAACAAACTGGATAAGGAATTGGCGAAGAAAACCCTGCTGATAGAAACCCAAACGCCAGACCAACGTGGTGGAATGTTGAGAGAAGAAGCTGCACAGATTAGCTACAAAGCGGAAGCCATTTTGCGTGGGCAGGTGTTTCAGGCTTTTGAAGCCTTACAAACTCATCAAGAAGAACACGGTATTGACCATCGTCAGTTTATGAGTGGTGTGCTTGCCGAGTATCAGTTGATTTTATCGGAGCTTAAAGAACGCTTTAACTTAACCGATGAACCAACGGGCGATAACCTGCCTGAATGGGCAAAACCTGAATACGCTGATAAGCCTTCGGTTGAACCGAGTATAGCGGCAATTTTAGACGAAGTAAGCGATGCACAAATCGTGGAGTAAGGACGATGCAATGGCAATTTTACCGAGTGTGCTATCCCACTGGGCAAACCGTGTGGAGACGGCAAAGTTTGGCGAGACGGAGAAAGTTATTGACGAAGGCTGTAAGCAAACAGGATTAAGCCGAGCCACTTTCTTACGCCAAATTAAACCCTACCGTCCTAAAAGCAATCGTAAAGTGCGGTCGGATAAAGGCAAGCATCAGCTAGAAAAAGCTGAGCTTGATTTGATTAGTGCTGCTTGGTTGCACCTTAGACAGAAAAACGGCAAGACGATGGCAACATTAGAACGCGTATTGGATATTCTACGAGCAAATCATCGTATTAAAGCTGAATTTATCGACGAAAATACTGGTGAAGTTCGTCCTTATTCCGCTACTTCAGTGGAGCGTGCATTACGCAATGCCAATTTGCACCCTGACCAATTGTTACGCCCCGCCCCTGTGGTTCAGTTGCAAAGTAAGCACCCAAACCACGTGTGGCAAATCGACCCGTCATTGTGTGCTGTATTACTTAAAAGAAACAGGCAAAGGCAATGGGTTGTGCATTATGGAAGAAGGTGAGTTTTACAAAAACAAGCCTGCCAATGTAGCGAAAGTCGAGCCACAACGAGTATGGCGATATGTCATTACTGACCACACATCAGGCGTGATTTATGTGGAATATGTGTACGGCGGTGAAACGGCAGAAAACGTGAGCCAATGCTTTATTAACGCTATTCAACCAAAAGCCAATAAGGCTGAACCGTTTTTCGGTGTGCCGAAAATTTTGATGTTTGACCGAGGTACAGCAAATACCTCACAAATGTTCAGCCACTTACTGCATCAGCTTGATGTGAAAGTGGAAATCCCGAAAGCCAAAAACGCCCGAGCTAAAGGGCAAGTGGAAAAAGGCAACGATATTGTAGAGCGACAATTTGAGAGCGGCTTGCGGTTTATGAATGTATCAGGGCTTGATGAGTTAAATCAACTTGCCCATCAATGGATGCGATATTTTAACGGCAAAATGGTGCATTCACGCCACGGTCGGACACGCTATCAAATGTGGCAATTTATTCGCCCCGAGCAATTGATTATGCCTCCGAGCCGAGAAATTTGCCAAGAACTGATGATTACCGCACTTTCCGAGCGTGTAGTTAGCGACAAATTGGAAATTAGCTTTGAAAGCCGCCGTTACGATGTACGTGATGTGCCTGATGCAAAAGTGGGCGAGAAAATCACAGTGGGTAAGAATCCGTATCGCCCTGAATGTGTGCAGGTTCAATGTTTTGAGCGTGTTGTTGATGAAGACGGTTCGGAAAACCTGAAACCTTATTGGGTGGTAGTTGAGCCAGTTGAAGTCAATGAATATGGCTTCCGTGTGGACGCTGCGATGATTGGTGAAGAATATAAGGCTCATAAGAAAACCGAGTTTGAAACCCATAAAGAGCAAGCTGAACAGCTGGCTTACGGTGTAACCAATGAAGATGATTTGAAACGTGCGAAAAAGGTAAATAAACCGTTATTTAACGGCGAAATTAACCCTTACAAGCATATTGAAGAAACGAATTTGAACTGGTTTGTACCGAAAAAAGGACAAGATCATGAACTTACTACCAACGCGAGACGTGTGGAACAGAAACCTGTGAATTTGGTGGAATGTGCAAAACAGTTGAAAGAACGATTCCCTGAATGGAACGGTAAGCATTATAAAAACTTGGCAAAACATTTTTCCGAGGGCGTGCCGATAACTACGCTGGAAGATTGGTTGCAGGGCAATAAATTACCTGAAGTTTTAAACCCTGAAACGAAGATTTTACAGCTGAATGCCGCCTAATTTTGATAAATGGAGGTTCTATGTGTTAAAGCTAAAACAGGTGCTGATTGACAAGGGCGTGAGCCTGCGACAGTTGGCACAACAGATGAACGTTTCACCTGCGACGGTTTCACAGTTGATTAACCATAATCAGCGGGTGAAACAGTGGGTGGAATTTGAGAAGAATTTGGGCAGTGCGTTGCAAAGTTTGGGGATTATTGAACCGCTTGCAAGCCTGCTTGAAATGGAAGGCACTGGGGAAAGTTTGGCGACCGAGCCAGTGCCTTCCGCCCCTAAAACCACAGATGAAATTAAGGACGAGATTATGTTACTCGCAAAACAGGCTTTATTTCCAGCCACAAAGAAACATTTTGGGCTATTTCGTGATCCGTTTGCTGAAGATGTACGCAGTGCGGACGATGTTTTCAGCTCTGCCGACGTGCGTTATGTACGTGAAGCATTATTTCAAACCGCTAAACACGGTGGCTTTATGGCGGTCGTCGGTGAAAGTGGTGCTGGCAAATCCACGCTCCGCCGTGATTTGATTGATCGCATCAACCAAGAAAACGCTCCGATTACGGTGATTGAGCCGTATATCATTGCAATGGAAGACAACGACGTGAAAGGCAAAACATTGAAAGCTGCCCATATCGCCGAAGCGATTATTTCTACTCTTTCACCGCTTGAAAGCGTGAAACGTTCGCCCGAAGCACGCTTCCGCCAGTTGCACAAAGTGCTAAAAGAAAGCGTGAAAAGCGGTTACAGCAATGTGTTAATCATCGAAGAAGCACACGCTTTACCGATTCCAACGTTGAAACATTTGAAACGCTTTTTTGAGCTGGAAGATGGCTTTAAAAAACTGCTTTCTATTGTGTTGATTGGTCAGCCTGAGTTGAAAATCAAACTTTCTGAACGTAATACCGAAGTGCGTGAAGTGGTGCAACGTTGTGAAATTGTCGAACTTGCACCGCTTGATGCCGAGCTTGAGCGTTATGTGGAACATAAGCTGGAGCGCGTGGGCAAAAAGCTGAGCGATATTTTTGAAGAAGATGCGTTCGTAGCAGTTCGACAACGTTTAACTGCGGTAGGACGAAACAAAACGAGCCAAAGTTTGCTTTATCCGTTAGCTGTAGGAAATTTACTAACTGCAGCAATGAATTTAGCGGAAAGTTTAGGCATTCCTAAAGTAAATGGACAGGTGGTGATGAATGTGTAAAAAAGTATTAGGAAGTATCACTCGTGCTAATGAAGAAGCATTTGCTAATTTTTGCTATGACTTTATAAAACTAGTAATCAATTCACCAGAAGTTATTGTATCAGCCTTGATATATGGGATTGAACAGTTTGACTTAGTTGAAGATGAAAATGGCAAAAAAAGCATTGAAGTGAAACTTTATGATAAGGAGAAAGAAAATGGCGAAGAAAGCAGTACGAATTAAGGCAGATGTTCACGAATTGAACCTGCAAACGGCTGATGATGTAGCGTTAGCAATTAAGGAAATCGGTGATTTGGAGCGTGAACGGGTACGACTTGCTACCCTGCAAGCAGATGAGAAAGCGGTGATTGATGAAAAATATACAGCTAAATTGACCGCACTTAAAGACAAAGTGAAACCGTTGCAAAAGGCGGTACAGGCTTATTGTGAAAGTCGTCGAGACGTGCTGACCAACGGCGGCAAACAGAAAACCGCTTACTTTCCAACGGGCGAGGTACAATGGCGAGTGAAACCACCAGCAGTAGTAGCAAAAGGGCTTGAAAGCATTTTGGATAGTTTACGCAAACTAGGATTGTTTCGCTTTATCCGTACCAAAGAAGAACTCGACAAAGAAGCAATGTTGAAAGAGCCTGAGATTGCTCGTTCAATTTCGGGGATCTCTATTCGGGAAGGTGTGGAAGAGTTTGTGATTAAACCGAATGATGAGGAGGTGCGAAAATGACACCTTCCGCCAAAACTGAACGTCAGTTTATGTATAAAGAAAAAGCGGAAGCTGCAGCACGCTGTGAGCAGTTAGGTAATTATCAACAAGCCTATAATTTGTGGTGTGAAGCAATGAAATTAGCGACAACTGAAAAACAAAAGCAATGGTGTAGCACTAGAGCAAATTATTGTCATACTTGGCAAGGCAAGCGGGAGCGTGTGAGATGATTGATTCATTAGAACAATTAAAAATGCAATTACAGCAGGCAGTTCGTCAGCTTGAGCAAGCAGAAAAAGCTATTGATGAAAATGAGCTACCTTTAGCACAATGCTATGTATTTACTGCCAAGAACCTGATTATGAAATTAGGCTTGAAAATGACTTAATAAAAAACCGCCTTCGGGCGGTTTTGTTGTATTTGGAGAATAAAAATGAAAGTGAAATGTAGTGCCTGTGGTGCGGTACATTCGTTAGATGCGTTAGTGGCAAATCAGGCAGCAAGCGATGCACTTAATGCAGCGTTAATGGTAAATGGTGAACTTGGCAAGGCGTTGATTGGCTATTTAGGGTTATTTCGCCCGGCTAAAAAATCTCTGACCTTTGAGCGTGTAGCAACGATCTTACATGAGCTTACACCAATGATTACTGCTGGCAAAATTCAACGTGATGGGCGTGATTTTCCTGCACCCGTAGAGAGTTGGATTTATGCCATTAATCAGATGTTGGCAAGTCGGCAGACGTTGAAGTTGCCGATGAAATCCCACGGTTATTTGTTGGAGATTATTGCAAGTTTCAAACCTGCCAATACTACGGTGGTTTTGCATAATTCTGAGCAAAATCGACCGCTTGTGAGTTCAAAAACAGTGAATGCAGTGAATAAGGTGGCAGAATGGATCAACAATGGTTGAAAGCAACATTGGGTAAAGGAGTTGCAATGTTGCTGATATTACGTTTAAAAAACTCTCCTCCCGAAGATTCAATTAGTGCAACTTTAGAAACGTGGTTACGTGTGCTTACTTATAAAAAGCACTATGAGCAAGAACTCGACCAATGGCGATTTGAAGAGGCATTTATGTATTTAGCACAAACTTGTGATTGGTTTCCTAATCCCAAACAGTTACTTGATGCAATGCCTAAACGCAAGATTAAAGAACTACCGCCACCACCGCCAAAAACAGTGGAACAAGAAGAAGCTGAAAGGCTAAAGGCATTGAGCAATTTACAGAAAATTAAAGCAATGTTAAGGGGATGTTATGCGAAATAAACTGTTGCAGTTAGTGCATATTGGAAAAACACAGTTGGGAATGGATGATGAAACTTATCGGAGCCTACTTTCTCAACAATTCTACCAAAATTCTGCAAAAAATATAAGCTATTCAGATCTGATTAAATTAGTAAAATTATTGCAGACAAAAGGGGCTAAAATTCAGCTGCCGAGAAGTAAATCATCTCTCTCGCCTATTCAACGTAAGCTGTGGGCAGTATGGAAACAGATGCACGCTGATAGCGTGATTGATGATGGCTCTTCTCATGGACTGAATAGCTTTGTGAAGCGGTCATTAAATGGTGATATGCAGTGGAATGAGCTGACAAATTCACAAGCCACTTTGATTTTAGAAAATTTGAAACAATGGCAAAAACGAGTAGGTAAATAAAATGAATATCGCCAAATTTGACAATGGTATTCTTTAAGTTAAAGGCTCTAAGTTATTGGCAGATTTGGCGAACCATATCTCTAATATTATTGGTTTATATAAATTAGGAAAAACAAGATGATCACTCAAATGGAAATAGCACGACATGAGCTTTTGCGCGACATTGAAGATAACGTGAGTGCACTATGCAAAAATTACAACCTTGATACAGAAATTTGCGAACAAATTTCAACAAGTGTTGCTGACTTCTTAGCTGAACATTATGCTGGTCAAGTCATTTCTTTTCCTAAAGATTTTTATTATAAAATTGCTCAACGAGATTTAGATATTTATAATGATTTTACTGGTAATAATTGGTTCTTTTTAGTTAAAAAGTATGGCATGACTGAATCAGGCATTCGTAAAGTTATTAATCGTGTACGAAAACGTATAATGAAACATCAGCAACCAGATTTGTTTTGTGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP022037|1120231:1127358|1125459_1125621_+|WP_010945357.1|DBSCAN-SWA MIDSLEQLKMQLQQAVRQLEQAEKAIDENELPLAQCYVFTAKNLIMKLGLKMT >NZ_CP022037|1120231:1127358|1126488_1126890_+|WP_010945353.1|DBSCAN-SWA MRNKLLQLVHIGKTQLGMDDETYRSLLSQQFYQNSAKNISYSDLIKLVKLLQTKGAKIQLPRSKSSLSPIQRKLWAVWKQMHADSVIDDGSSHGLNSFVKRSLNGDMQWNELTNSQATLILENLKQWQKRVGK >NZ_CP022037|1120231:1127358|1123359_1124532_+|WP_041603531.1|DBSCAN-SWA MLKLKQVLIDKGVSLRQLAQQMNVSPATVSQLINHNQRVKQWVEFEKNLGSALQSLGIIEPLASLLEMEGTGESLATEPVPSAPKTTDEIKDEIMLLAKQALFPATKKHFGLFRDPFAEDVRSADDVFSSADVRYVREALFQTAKHGGFMAVVGESGAGKSTLRRDLIDRINQENAPITVIEPYIIAMEDNDVKGKTLKAAHIAEAIISTLSPLESVKRSPEARFRQLHKVLKESVKSGYSNVLIIEEAHALPIPTLKHLKRFFELEDGFKKLLSIVLIGQPELKIKLSERNTEVREVVQRCEIVELAPLDAELERYVEHKLERVGKKLSDIFEEDAFVAVRQRLTAVGRNKTSQSLLYPLAVGNLLTAAMNLAESLGIPKVNGQVVMNV >NZ_CP022037|1120231:1127358|1120563_1121526_+|WP_010945364.1|DBSCAN-SWA MSELTLSQEQNAVALAAKAMTQDLAEAHEAMGMIKAFTFVGKLATVATLKKLAEVKEARNYKGLQYVNADGELATVASWEEFCTACGTSRRKVDEDLQNLNQFGEEFMETSQRLGLGYREMRKLRQLPEEARAEIVDADYSETTDKEDLIEKIEDLTAKHAKEKESLTKQLESVKANYDAQAKVIANKDERLNKLDKELAKKTLLIETQTPDQRGGMLREEAAQISYKAEAILRGQVFQAFEALQTHQEEHGIDHRQFMSGVLAEYQLILSELKERFNLTDEPTGDNLPEWAKPEYADKPSVEPSIAAILDEVSDAQIVE >NZ_CP022037|1120231:1127358|1126124_1126499_+|WP_010945354.1|DBSCAN-SWA MDQQWLKATLGKGVAMLLILRLKNSPPEDSISATLETWLRVLTYKKHYEQELDQWRFEEAFMYLAQTCDWFPNPKQLLDAMPKRKIKELPPPPPKTVEQEEAERLKALSNLQKIKAMLRGCYAK >NZ_CP022037|1120231:1127358|1124524_1124755_+|WP_010945360.1|DBSCAN-SWA MCKKVLGSITRANEEAFANFCYDFIKLVINSPEVIVSALIYGIEQFDLVEDENGKKSIEVKLYDKEKENGEESSTN >NZ_CP022037|1120231:1127358|1120231_1120534_+|WP_010945365.1|DBSCAN-SWA MSREKLNTTQRALRILKALKGRSLTGLTNKELCEAIGETPVNVTRAIAFLEAEGFVQRLNTGAYGLSYQILQIAVSHETEMQKASERLAQVRARVQAGAF >NZ_CP022037|1120231:1127358|1127007_1127358_+|WP_010945352.1|DBSCAN-SWA MITQMEIARHELLRDIEDNVSALCKNYNLDTEICEQISTSVADFLAEHYAGQVISFPKDFYYKIAQRDLDIYNDFTGNNWFFLVKKYGMTESGIRKVINRVRKRIMKHQQPDLFCE >NZ_CP022037|1120231:1127358|1125666_1126143_+|WP_010945355.1|DBSCAN-SWA MKVKCSACGAVHSLDALVANQAASDALNAALMVNGELGKALIGYLGLFRPAKKSLTFERVATILHELTPMITAGKIQRDGRDFPAPVESWIYAINQMLASRQTLKLPMKSHGYLLEIIASFKPANTTVVLHNSEQNRPLVSSKTVNAVNKVAEWINNG >NZ_CP022037|1120231:1127358|1125250_1125463_+|WP_010945358.1|DBSCAN-SWA MTPSAKTERQFMYKEKAEAAARCEQLGNYQQAYNLWCEAMKLATTEKQKQWCSTRANYCHTWQGKRERVR >NZ_CP022037|1120231:1127358|1124729_1125254_+|WP_010945359.1|DBSCAN-SWA MAKKAVRIKADVHELNLQTADDVALAIKEIGDLERERVRLATLQADEKAVIDEKYTAKLTALKDKVKPLQKAVQAYCESRRDVLTNGGKQKTAYFPTGEVQWRVKPPAVVAKGLESILDSLRKLGLFRFIRTKEELDKEAMLKEPEIARSISGISIREGVEEFVIKPNDEEVRK |
11 | Pseudomonas_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1156409 : 1162922
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP022037|1156409:1162922|DBSCAN-SWA TATGACAGATGTTGACTATATGGCTCGTGCGATAGCACTGGCAGAACAAGCACGTGGTTGGACTAATCCTAATCCATTAGTGGGCTGTGTGATCGTTAAAAATGATCAAATCATCGCAGAAGGCTATCACCAAAAGGTAGGCGAATGGCACGCAGAGCGTAATGCTATTTTAAATTGTCAGCAAGATCTCACAGGGGCCACTGCTTACGTTACACTTGAGCCTTGTTGCCATCATGGGCGCACACCGCCTTGTACTGATTTGCTTATTGAACGAGGAATTAACAAAGTGTTTGTGGGCTCTCGTGATCCTAATCCACTGGTTACGGGGAAGGGGATTAAACAATTACAAGCAGCGGGCATAGAAGTGATCACTGATTTTATGCGAGAAGCTTGCGATCAGCTCAACCCCATTTTTTTTCATTATATGCAAACTACATCTCCTTATGTGTTGCTTAAATATGCAATGACAGCAGATGGTAAAATTGCTACCGCTACAGGTGAATCCAAATGGATTAGCGGTGAATTAGCACGCCAAAATGTGCAAATCACACGTCATCAATATAGCGCCATTATGGTTGGAGTGGGCACCGTATTAGCGGATAATCCGATGTTAAATAGTCGAATGCCGAATGCTAAACAACCAATACGCGTTGTGTGCGATAGCCACTTACGAACGCCTCTAGCGTGTCAATTAGTTCAAACAGCGCGCCAATATCCAACCATTATTGCAACCGCTTCAACTGATAGTACAAAAATAGCGCAATTGAAAGCCTTTGGCGTGCAAATTATCCAATGTAAGGTAGCCAACAAACAAGTTGATTTAGTTGATTTATTAGCCAAATTAGGTGCAATGCAAATTGACAGTGTCTTGCTTGAAGGGGGATCAACACTGAATTTTAGTGCATTGAAAGCTGGCGTTGTTAACAGAATTCATTGTTATATTGCACCTAAATTATTAGGCGGAAGCACTGCCAAAAGTCCTATCGGTGGTGCAGGTATTTTGCAACTAGCGGAAGCGGTTAATTTAACGCTTAAATCCACACAATACATAGGCGACGATATCTTGTTAGATTATGACGTTTCATCATCGCAAAAATTAGCAAGCTGACAGCAGGAGAATTTATGTTTACAGGTATTATTGAAGAAGTGGGTAAAGTTGCGAATATCAAGCAATCAGGTGATTTTGCGGTACTGACCATTAATGCTTGCAAGGTACTCAAAGATGTACATTTAGGCGATAGCATAGCCGTGAATGGTGTCTGTTTAACCGTCACTTCTTTTAACTCAACACAATTTACAGCCGATGTGATGGCGGAAACTTTACGCCGTACATCGTTGGCACAGTTACACGTAGCTAGCCCGGTTAATCTAGAACGTGCAATGCCAATGAATGGCCGTTTTGGTGGTCATATTGTATCTGGCCATATTGATGGCACCGGTGAAATTATTCAAATTACTCCCGCAAATCACTCTACTTGGTATCGGGTTAAAACTAGCCCTAAATTAATGCGTTATATTGTAGAAAAAGGCTCAATTACCATTGATGGTATTAGTTTAACTGTAGTTGATACTGATCAGGAGAGTTTTCGCGTGTCAATTATTCCGCATACGATTAATCAAACTAATTTAGCCACAAAAACGATAGGTAGTATAGTGAATTTAGAAAATGATATCGTTGGTAAATATATCGAACGGTTTGTAATGAAGCGGACAAATACACCATCTAAAAATGCAATTACTGCTGAGTTTTTAGAAAAAGTAGGTTTTTAATTTATTCCACAATGATTACGTGGCGTTGCGTATTTAAGTTTAACAAGAGAAAACAATGTTTCAATTTTCAACAGTAGATGAAGCCTTAGCAGCAATTGCGGCGGGCAAAATTATTTTAGTTTCTGATGATGAAAACCGTGAGAATGAAGGCGATTTCATTTGTGCCTTAGAATTTGCTACACCAGAAAATATTAATTTTATGGCGACTTATGGCAAAGGTTTGATTTGTACGCCAATTTCACAAGCGCTAGCGGATAAATTAAGTTTTCATCCAATGGTAACAAATAATACGGATAATCATGAAACAGCTTTCACTGTATCCGTTGATCATATTAATACGGGCACCGGTATTTCAGCCTTTGAACGCTCACTGACCGCATTAAAAATGCTTGAGCAAAATGCACAAGCGGCTGATTTTCGTCGCCCAGGGCATATGTTCCCACTGATTGCTAAAGAGGGGGGCGTGTTGGTACGTAATGGCCATACAGAAGCAACAGTCGATTTAGCGCGCTTAGCAGGCTTAAAGCCTGCAGGCTTATGTTGTGAAATCATGGCTGATGATGGCACTATGATGACTATGCCACAATTGCAAGCCTTAGCCGTTAAACATAATATGCCTTTTATTACCATTGCGCAGCTACAAGAATATCGCCGTAAATATGACAGCTTGGTTAAATTGGTTTCAGTTGTGAAAATGCCGACTAAATATGGTGAATTTATGGCGCATAGTTTTGTTGAAGTGATTTCAGGCAAAGAACATATCGCTTTAGTAAAAGGCGAGATTGGTGATGGTCAAGCCGTATTAGCACGTATCCATTCAGAATGCTTAACCGGCGATGCCTTTGGTTCTCAACGTTGTGATTGTGGCCAACAATTTGCTGCAGCAATGACGCAAATTGAGAAAGAAGGGCGAGGCGTTGTATTATATTTACGCCAAGAAGGTCGCGGTATTGGTTTAATTAATAAATTACGTGCCTATGAACTACAAGATAAAGGTATGGATACGGTTGAGGCAAACCTTGCGCTAGGTTTTAAGGAAGATGAACGCGAATACTATATTGGTGCGCAGATTTTCCAAGCCTTAGGCGTGAAATCCACTCGCTTATTGACCAATAATCCAGCCAAAATTAGTGGCTTAAAACAACAAGGCTTAAATATTATCGCACGTGAGCCAATTATTGTTGAACCAAACCAAAATGATATTGATTACTTGAAAGTAAAACAGATCAAAATGGGGCATATGTTTAACTTTGAACAATAGCGTCGTGTTGGACAAAATGGCGCTCTTACACAAACAATCCATCTTATTTTAACCACAAGTATTAATACTTGTGATCTCACAATTTTTTATTTGATAAGGACAGATCAACATGGCAAAAATTACCGGTAATTTAGTCGCTACAGGTTTAAAATTCAGCATTGTAACGGCACGTTTTAATGATTTTATTAATGATAAATTATTAAGTGGTGCAGTAGATACACTCGTGCGCCACGGTGCGGTAGAATCGGATATTGACACTGTTTGGGTGCCAGGTGCTTTTGAAATTCCACTTGTTGCCAAAAAAATGGCAGAAAGCGGTAAATATGATGCAGTAATTTGCTTAGGTACGGTGATACGTGGCTCAACCACGCATTATGATTATGTTTGTAATGAAGTAGCAAAAGGCATTGGTGCAGTAGCGTTACAAACGGGTGTGCCAATTATGTTTGGTGTATTGACCACAGAAAGTATTGAACAAGCCATTGAGCGTGCGGGCACAAAAGCGGGCAATAAAGGCGCAGAATGTGCTTTAGGTGCAATCGAAATGGTGAATGTATTAAAAGCACTATAATGGTGAGCTGAAGCGGTTTATTTTGGCAAATTTAGGCCAAAAATAACCGCTATTTGAGAGCCAAGTGAAGGGAAGTAATCAGTTGGCTTAATAAAGCGATTTTGTGTCATACCAAATTTTATTGATATAAAACACAGCTTTGCCTGTTGGCGTTTGTACTTCAATTTCATCATCAACGCATTTACCGATTAAAGCACGTGCAACGGGCGAATCAATCGAAATCCAATTTTTGGTTGGGTCAAATTCATCACAACCGACAATTCGATATTGATTAATTTCGCCCTCATTGTTTTCTAATTCTATCCAAGCACCAAAGAACACTTTGCCAGCTTGTTGTGGATGATAATCAATGATTTGTAAGGCTTCTAGTCGCTTCGAAAGAAATCGAATCCGCCGATCAATTTCGCGTAACCGCCGTTTACCGTAAATATATTCAGCATTTTCACTGCGATCGCCTAATGCAGCTGCTTCTGAAACTGATTGTGTTACCTTTGGGCGTTCTTCTTTCCAAAGATATTTCAGCTCTTGATCGAGTGCTTGCCAGCCGGCACGGGTAATATAATTTGATTTTGCCATTTTATCCTTAGTTTGAAAATTCAAGAATGCCAGAAACTTGCCCAATGTCATTTACGGCAATTAATGAATGAATGTGTAGCGCTTTCATCATTTCTTCGGCTTTAGCTAAATAAACAGAATCTAAAATAGTTTTCGGTTTTTTCGTCATAATTTGTTCAGCGGTTTTGCTTAAACTTGTCGCTCCAAATTGTGCAAGTGTACGTCTAATATCACCATCAGTAATGATACCGCATAATTGTTCGCCTTGCATAATCAGCGCTAATCCCATTCTGCCTTCATTCATTACACTTAAAATGGTACTAAAATCGGCAGTGGGTGAAGTAATGGGCAATTTAGTTTGCATTACATCTTTTACTCTATTCAGTAATTTACGCCCTAGGCTGCCACCAGGATGAAAGCGGGCAAAATCGTGTGCTTTGAAATCACGTGCTTTTATCAAGGCAATTGCTAAAGCATCGCCTAATGCCATTGTGACTAAAGTGGACGTCGTGGGCGCAAGATTATTTGGGCAAGCCTCACGTTCAACACTAATATCCAATACTAAATCAGCATGTTGTGCCAATGTTGAATGGCGATTACCCGTCATTGCAATAATTTGGTTACCAAAATTTTTTAAGCTCGGCAGTAATTTGATTACATCATCAGTTTCGCCACTGTTTGATATTAATAATACAATATCAATAGCTTTTAACATTCCTAAATCACCGTGAAAGGCTTCAGTTGGGTGTAAATAAAAACTTGGTGTGCCGGTTGAGGCAAAAGTTGCTACCATTTTTTTACCGACTAATCCAGATTTGCCAATTCCTGCCACCACTACGCGTCCTGCACAGTTTAAAATCATTTCGACTGCTTGATTGAAATGTTGGTCAAGATTGTGTTGCAATCGGTCGATCGCCTGACTATATAAACTGAGTGTCTCCGTTGCCTGCGTCAGATAGTTCATAATATCCTAAATAAACCTCATCTAAGGGAAATTATCATTAATTAGCTCGTTATGTAACCGCTTACGTTATTGAAGTAGATGCGGTCAAATTCTACGTGTTTTTGGCAGTTGCTTTGCTTAGTAATAAATTAGCTAAGGTTCTAATGCCTAATCCTGTTGCTCCCACCGCCCATAGATCGCTTGCAGAACGGTGGAAAGTGGCGGAAGCGTCAATGTGTAGCCAATTCTGCTGATAATTTGGCACGAAATACGATAAAAAGCCACAAGCAGTGCTAGCACCTGCTGCGACAGGTACAGAGCTAATGTTAGCAATATCTGCAAAGCAAGAGCTAATTTGTGTTCTATGAAATTCAGCAAAAGGCAATCGCCAAAAAGGTTCATTTTCCGCGTCAGCAGCAGTTAATAACTGGTTGACTAATTGAACATCCATTGCTAACACAGTATGGTAATCATTGCCAACAGCCACTTTGGCTGCGCCGGTTAAGGTGGCAGCGTCAATAATAAATTGTGCTTGGTCAGCAGCTGCATCAATCAGGCCATCAGCCAATACTAATCTACCTTCTGCATCCGTATTTAATACTTCAACTGAAATACCATTGCGGTAATGAATAAGATCACCGAGCTTAACCGCGCGACTGCTCACCATATTTTCAGCACAACAGAGATATAGTTTAACACGTGCGGTTAAACCGCGAGCAATTGCTAGGCCTAATGCGGCAGTAACTAATGCTGCTCCGCCCATATCGGTACGCATGGTACTCATTGAATCACTGGGTTTAAGGCTATAACCTCCGCTATCAAAGGTGATGCCTTTACCAACTAAAGAGGCTAATACCGGCGCATTTTCATCACCGGTTGGATTAAAATCTAATTTAAGTAAAGCGGGCGGATTAGCTGAACCTTTGCCAACCGCCCAAATGCCGGCATAATTTGCGGTATCTAATGCCTGACCTTGTATTATTTCAAATTTAACAACGTTGTGAAGGTTATATTTGATCGCTTGTTGTGTAATAAATTCAGTCGCTTGTTTAGCGAGTTGTTCAGGGGTTAATGTATTTGATGCTTCGTTGATAATTTTTCGCGCAAAATCAGTACAGCTTAACCGTGCTTCTAATTCAGCGTGCTGTTCAGCAAGTGGTGGATACTGTATTTTTCCACGATGGTGAACACTCACAAACCCTTGCTGAAAAGCCCAACACTCTTCCAAGCCCCACCCTTCGCCAACTAGTGATACGTTGAGGATATTTTGATTTTTAATTTTACGTGCTGCTTTTTGAATAGTGGTTAGGCTATCAGCGTGAAGATGAATGGTAAAGCCATTTTGATGGGCAGAAAGGATAGCTTTTTCTCCCCATATTGATGGCGCAGGCTGTTGGGAGAGGTTAATTTGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP022037|1156409:1162922|1156409_1157516_+|WP_010945065.1|DBSCAN-SWA MTDVDYMARAIALAEQARGWTNPNPLVGCVIVKNDQIIAEGYHQKVGEWHAERNAILNCQQDLTGATAYVTLEPCCHHGRTPPCTDLLIERGINKVFVGSRDPNPLVTGKGIKQLQAAGIEVITDFMREACDQLNPIFFHYMQTTSPYVLLKYAMTADGKIATATGESKWISGELARQNVQITRHQYSAIMVGVGTVLADNPMLNSRMPNAKQPIRVVCDSHLRTPLACQLVQTARQYPTIIATASTDSTKIAQLKAFGVQIIQCKVANKQVDLVDLLAKLGAMQIDSVLLEGGSTLNFSALKAGVVNRIHCYIAPKLLGGSTAKSPIGGAGILQLAEAVNLTLKSTQYIGDDILLDYDVSSSQKLAS >NZ_CP022037|1156409:1162922|1160097_1160586_-|WP_010945070.1|DBSCAN-SWA MAKSNYITRAGWQALDQELKYLWKEERPKVTQSVSEAAALGDRSENAEYIYGKRRLREIDRRIRFLSKRLEALQIIDYHPQQAGKVFFGAWIELENNEGEINQYRIVGCDEFDPTKNWISIDSPVARALIGKCVDDEIEVQTPTGKAVFYINKIWYDTKSLY >NZ_CP022037|1156409:1162922|1161620_1162922_-|WP_041603676.1|DBSCAN-SWA MQINLSQQPAPSIWGEKAILSAHQNGFTIHLHADSLTTIQKAARKIKNQNILNVSLVGEGWGLEECWAFQQGFVSVHHRGKIQYPPLAEQHAELEARLSCTDFARKIINEASNTLTPEQLAKQATEFITQQAIKYNLHNVVKFEIIQGQALDTANYAGIWAVGKGSANPPALLKLDFNPTGDENAPVLASLVGKGITFDSGGYSLKPSDSMSTMRTDMGGAALVTAALGLAIARGLTARVKLYLCCAENMVSSRAVKLGDLIHYRNGISVEVLNTDAEGRLVLADGLIDAAADQAQFIIDAATLTGAAKVAVGNDYHTVLAMDVQLVNQLLTAADAENEPFWRLPFAEFHRTQISSCFADIANISSVPVAAGASTACGFLSYFVPNYQQNWLHIDASATFHRSASDLWAVGATGLGIRTLANLLLSKATAKNT >NZ_CP022037|1156409:1162922|1160593_1161529_-|WP_010945071.1|DBSCAN-SWA MNYLTQATETLSLYSQAIDRLQHNLDQHFNQAVEMILNCAGRVVVAGIGKSGLVGKKMVATFASTGTPSFYLHPTEAFHGDLGMLKAIDIVLLISNSGETDDVIKLLPSLKNFGNQIIAMTGNRHSTLAQHADLVLDISVEREACPNNLAPTTSTLVTMALGDALAIALIKARDFKAHDFARFHPGGSLGRKLLNRVKDVMQTKLPITSPTADFSTILSVMNEGRMGLALIMQGEQLCGIITDGDIRRTLAQFGATSLSKTAEQIMTKKPKTILDSVYLAKAEEMMKALHIHSLIAVNDIGQVSGILEFSN >NZ_CP022037|1156409:1162922|1159548_1160010_+|WP_010945068.1|DBSCAN-SWA MAKITGNLVATGLKFSIVTARFNDFINDKLLSGAVDTLVRHGAVESDIDTVWVPGAFEIPLVAKKMAESGKYDAVICLGTVIRGSTTHYDYVCNEVAKGIGAVALQTGVPIMFGVLTTESIEQAIERAGTKAGNKGAECALGAIEMVNVLKAL >NZ_CP022037|1156409:1162922|1157530_1158178_+|WP_010945066.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEVGKVANIKQSGDFAVLTINACKVLKDVHLGDSIAVNGVCLTVTSFNSTQFTADVMAETLRRTSLAQLHVASPVNLERAMPMNGRFGGHIVSGHIDGTGEIIQITPANHSTWYRVKTSPKLMRYIVEKGSITIDGISLTVVDTDQESFRVSIIPHTINQTNLATKTIGSIVNLENDIVGKYIERFVMKRTNTPSKNAITAEFLEKVGF >NZ_CP022037|1156409:1162922|1158233_1159439_+|WP_010945067.1|DBSCAN-SWA MFQFSTVDEALAAIAAGKIILVSDDENRENEGDFICALEFATPENINFMATYGKGLICTPISQALADKLSFHPMVTNNTDNHETAFTVSVDHINTGTGISAFERSLTALKMLEQNAQAADFRRPGHMFPLIAKEGGVLVRNGHTEATVDLARLAGLKPAGLCCEIMADDGTMMTMPQLQALAVKHNMPFITIAQLQEYRRKYDSLVKLVSVVKMPTKYGEFMAHSFVEVISGKEHIALVKGEIGDGQAVLARIHSECLTGDAFGSQRCDCGQQFAAAMTQIEKEGRGVVLYLRQEGRGIGLINKLRAYELQDKGMDTVEANLALGFKEDEREYYIGAQIFQALGVKSTRLLTNNPAKISGLKQQGLNIIAREPIIVEPNQNDIDYLKVKQIKMGHMFNFEQ |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1520188 : 1537224
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP022037|1520188:1537224|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP022037|1520188:1537224|1526029_1526551_-|WP_010945000.1|DBSCAN-SWA MRNPFSLFNLPVQFQIDNAQLSERYLALQKQFHPDNFANESADKQLAALQQSADVNEALQILKDPIARATAIIEINTGIVKNLEENSRQDLDFLMQHMEWHEKLDSIENSRSEQQLAGFLKQIKTEQRNVEQQLATLLNQQQWQKADLLTERLRYFKKLIIQIEKVEEKLLEY >NZ_CP022037|1520188:1537224|1520188_1520698_+|WP_010945007.1|DBSCAN-SWA MITLHTNYGDIKIELYYDKAPITAQNFTDYCQQGFYNGTIFHRVIDGFMIQGGGMSAGLIEKPTNAPIQNEASNGLSNKRGTLAMARTADPHSASSQFFINVADNTFLDYRAKEMFGKTVIQEWGYAVFGEVTEGMEVIDKIKAVKTGNKGFHQDVPVEDIVIESVTVA >NZ_CP022037|1520188:1537224|1525352_1525985_-|WP_010945001.1|DBSCAN-SWA MKTLEQLLSKQSAWLILRDWFAQTRNHYQILASYPEDANQTLVSLQLSTRSLLGAIVYETGGIFIDYGWLRILGSGNEKLARGLFDWNFGKTFKQSGEQPGYLLIADDAVGGYFAINAGALGDNMGEIYYHHPIAKQWQSLKLTYSEFLGWALSDDLIDFYQDLRWQNWQADIADLQGHQVLDLESKIPVPIERHYQSVFAPENMGYSVV >NZ_CP022037|1520188:1537224|1533627_1537224_-|WP_010944992.1|DBSCAN-SWA 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17 | uncultured_virus(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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