Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022059 | Enterococcus faecalis strain FDAARGOS_338 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas2,cas1,cas9,cas3,csa3,WYL,DEDDh,cas14j,DinG | 0 | 9 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022059_1 | 4162-4791 | TypeII |
II-A,II-B
Consensus repeat of NZ_CP022059_1
|
9 spacers
spacers of NZ_CP022059_1
>1.1|4198|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT ATATGTAAATCATAATGAGCATTTACATTG >1.2|4264|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAGCGATGGAGCAGGTTGGTCTGCTATGA >1.3|4330|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCACGCTCCGGCAATTTCCCGACAACTGAT >1.4|4396|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCATTGACAACAATATTCTTTTGTTGCAC >1.5|4462|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTATAATGCCTGTGAGTAGCGTGTGTGTGC >1.6|4528|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCCGTCTGTAATACACGTAACAACAAGCCA >1.7|4594|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATAGTTGCGCTAATATCAATCGTGCTTCG >1.8|4660|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGCTTCGACCAGCACCACCAAAGTCTGCA >1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGATCCATATTCTGATATGTACAGAGGGAT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022059_1
The CRISPR arrays of NZ_CP022059_1 >merge|NZ_CP022059|1|4162-4791|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTATCTGCGAAAACTAAACAACATGACTCTAAAACATATGTAAATCATAATGAGCATTTACATTGGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACCAAGCGATGGAGCAGGTTGGTCTGCTATGAGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACCCACGCTCCGGCAATTTCCCGACAACTGATGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACACCATTGACAACAATATTCTTTTGTTGCACGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACCTATAATGCCTGTGAGTAGCGTGTGTGTGCGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACCCCGTCTGTAATACACGTAACAACAAGCCAGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACGATAGTTGCGCTAATATCAATCGTGCTTCGGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACATGCTTCGACCAGCACCACCAAAGTCTGCAGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACGGATCCATATTCTGATATGTACAGAGGGATGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC >NZ_CP022059|1|1|4162-4791|CRISPRCasFinder CGTATCTGCGAAAACTAAACAACATGACTCTAAAAC ATATGTAAATCATAATGAGCATTTACATTG GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CAAGCGATGGAGCAGGTTGGTCTGCTATGA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CCACGCTCCGGCAATTTCCCGACAACTGAT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC ACCATTGACAACAATATTCTTTTGTTGCAC GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CTATAATGCCTGTGAGTAGCGTGTGTGTGC GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CCCGTCTGTAATACACGTAACAACAAGCCA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC GATAGTTGCGCTAATATCAATCGTGCTTCG GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC ATGCTTCGACCAGCACCACCAAAGTCTGCA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC GGATCCATATTCTGATATGTACAGAGGGAT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC >NZ_CP022059|1|1|4162-4791|CRT CGTATCTGCGAAAACTAAACAACATGACTCTAAAAC ATATGTAAATCATAATGAGCATTTACATTG GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CAAGCGATGGAGCAGGTTGGTCTGCTATGA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CCACGCTCCGGCAATTTCCCGACAACTGAT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC ACCATTGACAACAATATTCTTTTGTTGCAC GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CTATAATGCCTGTGAGTAGCGTGTGTGTGC GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CCCGTCTGTAATACACGTAACAACAAGCCA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC GATAGTTGCGCTAATATCAATCGTGCTTCG GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC ATGCTTCGACCAGCACCACCAAAGTCTGCA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC GGATCCATATTCTGATATGTACAGAGGGAT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC >NZ_CP022059|1|1|4228-4791|PILER-CR GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CAAGCGATGGAGCAGGTTGGTCTGCTATGA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CCACGCTCCGGCAATTTCCCGACAACTGAT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC ACCATTGACAACAATATTCTTTTGTTGCAC GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CTATAATGCCTGTGAGTAGCGTGTGTGTGC GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC CCCGTCTGTAATACACGTAACAACAAGCCA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC GATAGTTGCGCTAATATCAATCGTGCTTCG GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC ATGCTTCGACCAGCACCACCAAAGTCTGCA GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC GGATCCATATTCTGATATGTACAGAGGGAT GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC
>NZ_CP022059.1|WP_002381241.1|2766_3780_+|acyltransferase-family-protein MENDKRIYKWDNVKLFLIFLVIFGHILDREASPSRLMETINFWIYSFHMPAFIFVSGLFSKHAIKQRKYLRLLSFVWLYLLAKLLITLANFAFANKMNFDLLNETGVPWYLLSLASFYLITIFLQRVQPKIMLPIIIVIGCASGYLPVEGFLSLGRTLGFFPFFYCGYLMDIQKLQTFLDHRKVKWAAIGVILSSFLFVNSQWSLATKFWGFLTGWASYAEISPAFEYSSFIQLFFYVAAALVSLSWFALLPKRKLPLSALGKDTLYPYLLHMPLIILLESGLQLDTLFKEWFTFRILALFFLALFILAITNMPVVKRGADYLFNPQSIMIPKKIYK >NZ_CP022059.1|WP_002367993.1|1577_2531_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKFQNVSKVYQENAVLSDVNLTIQQGEFFVLVGPSGSGKTTTLKMINRLIEPTTGEVALNEQAVTNYPLRELRLKIGYVLQQIALFPNLTVAENIELIPEMKKWPKEQRRERTIELLKKVQLNPEEYLHRKPAALSGGEQQRIGILRAIAAEPEVILMDEPFSALDPISRHHLQRLVKELHQELASTIVFVTHDMNEALLLGERICIMDAGKIIQVDTPEAIQKHPKNNFVGQFFKQSSPELANYCGADLTAFLEAADETIEPVPTVFMETNLKEIVQLINAQEKANLVEKQQVLGCITSKTITRFMEQLLESEGQ >NZ_CP022059.1|WP_002355507.1|59_1577_-|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MQALIETFFARKEEYLQALIEHMQLSFISLLFAALIAIPLAIYLTSHRKLAESLLQVTGIFQTIPSLALLGLLIPLIGIGRPPAIVALVIYALFPILQNTYTGLTEIDPSLEEAAEAFGMSKKEKLFKFELQMALPFIISGIRTATVLIIGTATLAALIGAGGLGTFILLGIDRNNLSLIFIGALSSAALAVLFNYGIHWLEKANGRRLIIGGTILGLLLGGSFFWNQQTSSKEKQLTIAGKLGAEPDIIINMYKALIEENSDIQVTLKPNFGKTTFLYNALKSDEIDLYPEFTGTVIETFLKNPPQLDNQPQVVYEAARAGLKKQENLTLLKPMRYENTYAVAVKRSFAKAHQLKTISDLQKISNQLKAGFTLEFIDRQDGYKGLQEKYHLNLNVQSMEPALRYQAINNGEVNVIDAYSTDSELRQYDLVTLEDDQALFPPYQGAPLIKTATLEKYPELAEILNKLAGKISEEEMSEMNYQVNVEGQDPSIVAKDYLKEKNLLK >NZ_CP022059.1|WP_002364832.1|4883_5543_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MRVNFSLLEEPIEIEKATFLTIKDVQTFAHLVKLIYQYDGENELKLFDAQQKGLKPTELFVVTDILGYDVNSAATLKLIYGDLEAQLNDKPEVKSMIEKLTGTISQLIGYELLEHEMDLEEDGITVQELFKALGIKIETTSDTIFEKVMEITQVHRYLSKKKLLIFINACTYLTEDEVQQVVEYISLNNVDVLFLEQRVVQNRFQYILDENFYLSYEKA >NZ_CP022059.1|WP_002364833.1|5543_5873_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSYRYMRLLLMFDMPTDTASDRKAYRKFRKFLINEGFIMHQFSVYSKILLNDTANKAMLARLKQNNPQRGLITLLNVTEKQFSRMIYLHGEQDNRVANSDERIVFLGEE >NZ_CP022059.1|WP_002364834.1|5869_6736_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRTVVVNKHSKLSYKNNHLVFKAIDHQELIHLSEIDVLLLETTDISLTTMLLKRLIDEKILVLFCDDKRLPIGKILPFYGRHDSSLQLTRQLAWTEERKGQVWTAIIAQKITNQSLHLAQRDYGQKAAALLAMRAELRLFDPANREGHAARSYFNTLFGNDFTREQENDINAGLNYGYTLLLSIFARELVQTGCFTQLGLKHANQFNDFNLASDLMEPFRPLVDQIIYENRKEAFPIMKRKLFALFMNTYMYKKKQMFLTNIATDYTKHVVKVLNQEEEGVPEFGI >NZ_CP022059.1|WP_002364836.1|6736_10750_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKKDYVIGLDIGTNSVGWAVMTEDYQLVKKKMPIYGNTEKKKIKKNFWGVRLFEEGHTAEDRRLKRTARRRISRRRNRLRYLQAFFEEAMTDLDENFFARLQESFLVPEDKKWHRHPIFAKLEDEVAYHETYPTIYHLRKKLADSSEQADLRLIYLALAHIVKYRGHFLIEGKLSTENISVKEQFQQFMIIYNQTFVNGESRLVSAPLPESVLIEEELTEKASRTKKSEKVLQQFPQEKANGLFGQFLKLMVGNKADFKKVFGLEEEAKITYASESYEEDLEGILAKVGDEYSDVFLAAKNVYDAVELSTILADSDKKSHAKLSSSMIVRFTEHQEDLKKFKRFIRENCPDEYDNLFKNEQKDGYAGYIAHAGKVSQLKFYQYVKKIIQDIAGAEYFLEKIAQENFLRKQRTFDNGVIPHQIHLAELQAIIHRQAAYYPFLKENQEKIEQLVTFRIPYYVGPLSKGDASTFAWLKRQSEEPIRPWNLQETVDLDQSATAFIERMTNFDTYLPSEKVLPKHSLLYEKFMVFNELTKISYTDDRGIKANFSGKEKEKIFDYLFKTRRKVKKKDIIQFYRNEYNTEIVTLSGLEEDQFNASFSTYQDLLKCGLTRAELDHPDNAEKLEDIIKILTIFEDRQRIRTQLSTFKGQFSAEVLKKLERKHYTGWGRLSKKLINGIYDKESGKTILGYLIKDDGVSKHYNRNFMQLINDSQLSFKNAIQKAQSSEHEETLSETVNELAGSPAIKKGIYQSLKIVDELVAIMGYAPKRIVVEMARENQTTSTGKRRSIQRLKIVEKAMAEIGSNLLKEQPTTNEQLRDTRLFLYYMQNGKDMYTGDELSLHRLSHYDIDHIIPQSFMKDDSLDNLVLVGSTENRGKSDDVPSKEVVKDMKAYWEKLYAAGLISQRKFQRLTKGEQGGLTLEDKAHFIQRQLVETRQITKNVAGILDQRYNANSKEKKVQIITLKASLTSQFRSIFGLYKVREVNDYHHGQDAYLNCVVATTLLKVYPNLAPEFVYGEYPKFQTFKENKATAKAIIYTNLLRFFTEDEPRFTKDGEILWSNSYLKTIKKELNYHQMNIVKKVEVQKGGFSKESIKPKGPSNKLIPVKNGLDPQKYGGFDSPIVAYTVLFTHEKGKKPLIKQEILGITIMEKTRFEQNPILFLEEKGFLRPRVLMKLPKYTLYEFPEGRRRLLASAKEAQKGNQMVLPEHLLTLLYHAKQCLLPNQSESLAYVEQHQPEFQEILERVVDFAEVHTLAKSKVQQIVKLFEANQTADVKEIAASFIQLMQFNAMGAPSTFKFFQKDIERARYTSIKEIFDATIIYQSTTGLYETRRKVVD >NZ_CP022059.1|WP_002355504.1|11222_11456_-|hypothetical-protein MSETLIVNYLIKGRVKMNVEELVQKAKDLIGEGNVEHAQQFIEEHKDELGEHYHKITAMLADTTTDGLFDKIKGLFQ >NZ_CP022059.1|WP_002358655.1|11600_13016_-|dipeptidase-PepV MTIDWTKEVEARKDDLLEDLQNLLRINSERDDAQATPEAPFGPGPVAGLKHMLAYGERDGFTVKNVDNYAGHIEYGEGDETLGIFGHMDVVPAGDGWETDPYEPVIKDGKIYARGASDDKGPSMAAYYAMKIIKELGLPVSKKIRFVVGSDEESGWGDMDYYFQHEEAPDFGFSPDAEFPIINGEKGNVTIRLTFRGGNGADYKLESFKSGLRENMVPGTADAVVTAASADEAASLAASFETFIKQEAKISGNAELSDKTVTFHVVGKGAHGASPQSGINAATFLATFLNDYSFAEGAYSFINTIAEFIHEDFYGEKLGVAFEDEKMGKLTMNAGIVNFDPENPENSLVTLNFRYPKGTSAEELQAKVQATVGETVTATQGDRNQEPHYVPVDDPLVATLLQVYEDHTGEKGQEQIIGGGTYGRLLKRGVAYGAMFPGYTDTMHQANEFMELDDLFRAAAIYADAIYRLAK >NZ_CP022059.1|WP_002381239.1|13149_13884_-|rRNA-pseudouridine-synthase MRLDKFLADVGIGSRKEIKQLLKKKVVTVNGDVVKEAKTQVNEETDQIALMGEILTYQKFFYYMLHKPQGVISATEDQRDETVIDLLTDQDYRADLFPVGRLDKDTEGLLLLTNDGQLAHQLLSPKKHVDKEYLAEVEGLVTAEDCQLFAQGFALKDGEIVKPSRLVIETINEEEGTSVVRLVIQEGKFHQVKRMLATVGKPVTYLKRLRMGELWLDETLELGGYRPLTEAELQQLQPKQSYLN >NZ_CP022059.1|WP_002364837.1|13992_15642_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MINQPNSVDQPILTNQEKMVKGSAWMTASNIISRMLGAIYIIPWYAWMGEHGNEANSLFSMGYTIYALFLMISTAGIPGAIAKQTSHYNSLNEYKISRQLFYRALQLMGGLGVVFAIVMYLASPALAALSGGGPELVPTMRSLSLAVLVFPSMSVIRGYFQGNQEMMPFALSQIVEQVARVFYMLLTAFIIMKVFEGNYVTAVTQATFAAFIGMLASFAVLGYYMYKQKPLFDYLEEHSANEHEIAPKELLIETFKEAIPFIVVGSGVTVFKLVDQFTFSNFMRLFTDYSDTQLRELFGIFNANPDKLTMIVVALATSISATGLPLITEAVTLKNHRELARLISNNLQLFVFVMLPATFGMIVLAQPLYTVFYMPDALGTSLLVQACYASLFLGLYMLVSNMLMGMYENRDAMRYLGIGLAVKLIVQFPAIRLFEVYGPLLATMIGFTVSCVLILRRIRQVTRFNYKLTLRRTLLMFCITVIMMIIALIFRQFLYLFLDPTRRFQAFIIVVIVAAAGGAFYGYSVLKIRLADRLLGKNAAKLRAKFNIK >NZ_CP022059.1|WP_002393823.1|15821_17372_+|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--L--lysine-ligase MKRLEAKKVTISLFAIRDCLEKEDLLKEFISPEGWHLTLSDTLGQREVTALSYDSRDVTAETLFFCKGLNFKEIYLENAVKDGLEIYVSEVPYEVPAQLGIIVTDIKKAMAVLSMAFYDYPQNKLKLIGFTGTKGKTTAAYFTKYILDVATQQKTALLSTMNSTLDGKTFFKSALTTPESLDLYRMMATAVANGMTHFIMEVSSQAYKTNRVYKLFFDVGIFLNITPDHISPIEHPTFDDYFYCKRQLITHSKVIVLNHEADYFPLLKETAQQQKVPAIVYGSQPAPEVDYSFAVSSEDSLRFIVESPADALGLAGSYHLRLGGDFNKGNALSAAIASVLVGASKEECQQGIAATTVPGRMESLTNTNGATVYVDYAHNYDSLKNLLTFVREEHPDGRLIVLVGSTGDKAISRRKDFGRVLSELADVAVLTTDDPASEDPAKICQEIQAHITKEMPVYTILDRGEAIAHALSLSTTADDAIVLAGKGADLYQKVNGVDEPYAGDFALAEAFINKKN >NZ_CP022059.1|WP_002358653.1|17438_18011_-|hypothetical-protein MKQFFQKGSKPNQLVVAFHGTGGNEYQLLTTIATLYPEASVLSYLGTEGVGEQRRFFAPLVNGALPRANFDERVTAFLEEVWQPQKLYDEVIFIGYSNGANFILGLLEKNPTIANTVILLHPSNLGYQYVSGEFATKVIVTTGAQDELSIPGQVLSLANQLKKHFPVDFLLVDGGHGLSEEEVTKIKEVL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022059_2 | 2231014-2231314 | Orphan |
II-A,II-B
Consensus repeat of NZ_CP022059_2
|
4 spacers
spacers of NZ_CP022059_2
>2.1|2231051|29|NZ_CP022059|CRT AGCACAAGCGATACGAAGAATGTAATAGG >2.2|2231117|29|NZ_CP022059|CRT,PILER-CR AAGCGGGGTTAGTAAATTTCGGATAGATA >2.3|2231183|29|NZ_CP022059|CRT,PILER-CR TACTTGTAAATAACTACGATAGTTTAAAC >2.4|2231249|29|NZ_CP022059|CRT,PILER-CR AGCTTGTCAGCGCCTGTATACGGAGTATG >2.5|2231051|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder AGCACAAGCGATACGAAGAATGTAATAGGG >2.6|2231117|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder AAGCGGGGTTAGTAAATTTCGGATAGATAC >2.7|2231183|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder TACTTGTAAATAACTACGATAGTTTAAACG >2.8|2231249|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder AGCTTGTCAGCGCCTGTATACGGAGTATGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022059_2
The CRISPR arrays of NZ_CP022059_2 >merge|NZ_CP022059|2|2231014-2231314|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR GGTGATAGTTTGTTTTTAAACAACATGACTCTAAAACAGCACAAGCGATACGAAGAATGTAATAGGGGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACAAGCGGGGTTAGTAAATTTCGGATAGATACGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACTACTTGTAAATAACTACGATAGTTTAAACGGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAACAGCTTGTCAGCGCCTGTATACGGAGTATGGGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC >NZ_CP022059|2|2|2231014-2231314|CRT GGTGATAGTTTGTTTTTAAACAACATGACTCTAAAAC AGCACAAGCGATACGAAGAATGTAATAGG GGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC AAGCGGGGTTAGTAAATTTCGGATAGATA CGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC TACTTGTAAATAACTACGATAGTTTAAAC GGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC AGCTTGTCAGCGCCTGTATACGGAGTATG GGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC >NZ_CP022059|2|2|2231015-2231314|CRISPRCasFinder GTGATAGTTTGTTTTTAAACAACATGACTCTAAAAC AGCACAAGCGATACGAAGAATGTAATAGGG GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC AAGCGGGGTTAGTAAATTTCGGATAGATAC GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC TACTTGTAAATAACTACGATAGTTTAAACG GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC AGCTTGTCAGCGCCTGTATACGGAGTATGG GTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC >NZ_CP022059|2|2|2231080-2231314|PILER-CR GGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC AAGCGGGGTTAGTAAATTTCGGATAGATA CGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC TACTTGTAAATAACTACGATAGTTTAAAC GGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC AGCTTGTCAGCGCCTGTATACGGAGTATG GGTTTTGGTACCATTCTAAACAACATGACTCTAAAAC
>NZ_CP022059.1|WP_002356974.1|2229189_2230608_-|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I MFDIVTLARIQFAMTTVFHFFFVPFSIGLALVVAIMETMYVVKKEERYRKMAKFWGNIFLLSFAVGVVTGIIQEFQFGMNWSDYSRFVGDIFGAPLAVEALLAFFLESTFLGLWIFTWDKMNPKVHVTFIWLVVFGSMMSAFWILVANSFMQHPVGYVINNGRAEMVDFVAVISNPKVWYEFSHVIMGAFTLGGMAVAGMAAFQLLKKRDISFHKASMRIGLWVTLFGSIGVLLAGDLQMKALIEGQPMKFAAMEGAYEDSDDPAAWTLIAWADEREHKQVFGIDIPYMLSILSYNKLSGSVDGMDTVNKRLVEKYGDDKNYYPPVNTLFWSFRIMAGFGALMLLVAALGLFFTRKKKPSLYEKKWMLWIVALCTFAPFLANTTGWLVTELGRYPWTVYGLFTIEQSVSPNVSVASLITSNVIYFLLFAGLGSVMVYLVILELRKGPDYEAKKLAKENEPALDPFDKGVFGE >NZ_CP022059.1|WP_002356976.1|2228179_2229193_-|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MSTLQLLWFVLIGVLFSGFFFLEGFDFGVGMAVQTLAHNDDEKDQVVATIGPVWDGNEVWLLTAGGAMFASFPYWYASLFSGYYLILFTILFGLIIRGVSFEFRHNMPEGKRRRMWNWTLSIGSFLVPFFFGILFISLVQGMPLDANGNMHAQFTDYFNLFSIVGGVALTLLCYLHGMNYIALKTEGPIRERARNYAEILYGVLYVGLVVFAVLMYFKTDFYEKNFAVTLILTLAIVVLTVIANVGVFKRKEMLAFLASGLTLVVLVALLFSGLFPRVMIGSEGFDLLIKDATSTPYTLKIMTWISLSILPFVLAYTAWSYYIFRKRISQTAVPEGY >NZ_CP022059.1|WP_002381709.1|2226441_2228175_-|thiol-reductant-ABC-exporter-subunit-CydD MIDKDILQMPKIKKILVLLAGFSFLQAVFIIGQAFFLSKAIVGLWSSGHLNQQLQSILLFFIFYLGRHVITYFRERMLDTFSYERSKELREQLLTKIFRLGPNVVQKNGTGNMVTMALEGISQTENYLQLILTKMMNMMIIPWIILAFVFTQDIRSGVTLLIVFPIIIIFMIVLGYAAQSKADKQYAAFQMLSNHFIDSLRGIDTLKLFGLSKKYAGSIYHTSERFRKATMSTLKIAILSTFALDFFTTLSVAVVAVFLGLSLLNGTILLFPALVTLILAPEFFLPIRDFSSDYHATLDGKNSFQAIQAVLALPEAEQTDVLTLDDWHQESQLSVTALNFSYEDATQEAIQSLQFSVDGRKKIGIIGASGSGKSTLINLLSGFLLPTEETSQLAINGQTIPHFLQKDWQKQILYIPQAPYIFQDTLANNIRFYTPEATDEAIQQAIQLVGLDELVKDLPEGIHTLIGESGRMLSGGQAQRVALARAFVDQKRHVLLFDEPTAHLDIETEVEMKERMLPLMNNHLVFFATHRLHWMEEMDYILVMEKGQLVEQGTLAELIEKDGYYVQLMKQMRGGRQ >NZ_CP022059.1|WP_002381710.1|2224678_2226445_-|thiol-reductant-ABC-exporter-subunit-CydC MMEKQPTTKDVWKNDQWVRPFLKRYKKTLYFALLLGFLTFFSAGALMFTSGYLISRAASLPENILLIYIPIVLTRAFGIGRPVFRYVERLTSHNWVLKMTSDLRLKLYNVLEKDAIFFKTKYRTGDILGLLSEDINHIQNLYLRTIFPTVIAWILYIFLVIALGFFSWWFALCMLLMLGVVVFLLPLVSVLVNGARQEKHKYAKNELYQTLTDNILGVSDWVFSQRGSEFVARYETDEANVRALDEKMKQFNRGRDFVLQLLFGVIAIAVLAWTSVRFPGNHGGAANWIGAFVLTVFPLIDAFAPLPAAAQETTIYKDSIRRFNELPEGEDDSTEAPVQPNGTSLSIEHLSFAYENQEKKVLNDLSLTIPEQQKLAILGRSGSGKSTLASLIRGDLRPTSGEILLGNIPTEAFGETMTEYIGVMHQAPYLFRTTILNNIRIGREEASEAEVWAVLEKVGLKEMVTQLPEGLQTMVDEAGLRFSGGERHRLALARILLQDTPIVLLDEPTTGLDPITEQQLLETFFEALKDKTVIWITHHLQGVTLMDQVIFIEDGQLEMSGTPEELLATNAHYQKLYRIDRGISSFEE >NZ_CP022059.1|WP_002360015.1|2223618_2224599_+|polyprenyl-synthetase-family-protein MNTFWKSFPDVERSLTETCELIEQTLHTRNEDIEEALVTLARSGGKLLRPAFFFLFAQLGDEEKQEKQQLLKIAASLEILHMATLIHDDIIDDSPLRRGAVTIQSQYGKDVAVYTGDLLFTEFFTLIADAMNGSEFMKINAQGMKRLLLGELDQMSHRFDRRMSIPAYLRSVNGKTAELFSLSCLEGAYFGHSSKEVQRLAKRIGRHIGIAFQVYDDILDYTADTETLKKPALEDLSQGVYTLPLLFAYQAAPDVFSPYLDKGRAITLEEAAEVAALVNDYHGVTEAQAFAKKVTNKAITDIQQLPDGTAKETLLSLTELLLHRSF >NZ_CP022059.1|WP_002360016.1|2222591_2223497_-|prenyltransferase MNREIFFELVELKAKTASVLPFLLGICFSWYQYGRLHVGYVLIFFIAMFIFNMAVDILDNYNDYHHATEVHDYKEKTNIIGRENLSLPLIRKMIFWMILVSALMGIGLSFIVGWPLLIMGLYCYLIGIFYSSGPKPLSSLPLGEVFSGFTMGFMITLICVYINTFEVFNWSAANLWGIFLVALPNTCYIANLMLANNICDLEEDENNKRYTLVHYLGKASSLKLFVGLNTIAMLAILLAVGLGLTPPTMLLMLLTLPFVRKQTQALLKEQVKSKTFVCAVKILAVGATAQVLFFAIGLWWL >NZ_CP022059.1|WP_002380449.1|2221351_2222563_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MNKKHVVILGAGYAGLKTLRELQKGAKDVEITLVDRNNYHYEATDLHEVAAGTQPAEKITYNIMDVVNEKMTTFIQGTVKTIDAATQTVALEDGQTINYDYLVVSLGFESESFGIPGVQEHALQMVDVKTALNVYEHIQEQMRQYKATQNEEFLKIVVCGAGFTGIELLGSLVENKPKFAEIAGVSADQIQIYCVEAVTRLLPMFNEKLANYGVQLLKDSAIHLLLGKPIKEIKPGAVVYQDNEAGDLAELSAKTIIWTTGVSGSHVVGDSGFEARRGRVMVQPDLTDANHSNVYIIGDCSAVMDTETNRPYPTTAQIALKMGAHAAKNIQAQLKGEATKPFSFKSQGSVCSVGNTRALGIVGKTDIKGYPASFMKKIIMNKALFETGGTKEMMAKGRFDLYH >NZ_CP022059.1|WP_002380448.1|2218614_2221038_-|DNA-translocase-FtsK MAQKRSTNKKKSTTKKKTKKQQQQQERLNYMFLGLIFILFGVFGLFRLGFLGTLLANCLRLVVGNTFPFAAILLILYGLLVMIYGKDFPLKRGRPIFGAVLIYISVLLLFHAFMFRNVSGSQPDILGNTWEFLQSDLKANQVTQNVGGGMIGALLYQGTYFLVAQFGSYLIATLLLLAGIFLMSMWDFQQIVDHFQSIQDRLSHVSAKSQARQEEKEAKRAAKKEAKAAERQAKIEAAAQQKLQERERMEQAAAERLTKTPVETHQPMVEEPATPTPVQIDSFQQQNQAMPVPPIAATKPQREQEEEAADEAGVLEFEISEEAEDRDYQLPPTDLLDTIQATDQSGEYEKIEKNIGVLEQTFKSFGVDAKVVKASLGPSVTKFEVQPAVGVKVSKIVNLTDDIALALAAKDVRMEAPIPGKSLIGIEVPNSAISTVSFRDIVEAQPSHPDKLLEVPLGRDISGMVQTADLSKMPHLLIAGSTGSGKSVAINGIITGILMQAKPHEVKLMMIDPKMVELNVYNGIPHLLTPVVTNPRKAAQALQKVVQEMEFRYEKFAATGVRNITGYNQLIQQKNAEDGENRPILPFIVVIVDELADLMMVASNEVEDAIIRLAQMARAAGIHMILATQRPSVDVITGIIKANVPSRMAFAVSSGTDSRTIIDTNGAEKLLGRGDMLFLPMGENKPIRIQGAFISDQEVERVVAFVTDQQEAEYQESMMPTDEPTTSGGGEAPQDELFEEAKNLVVEMQTASISLLQRRFRIGYNRAARLVDELEAHGVIGPSEGSKPRKVFLQAESEEAAPETPEQ >NZ_CP022059.1|WP_002364244.1|2217782_2218484_-|GntR-family-transcriptional-regulator MRRKSVLYLEVADQIKEDILSGKYPVGTFLPTETELEELFNVSKITIRRAIEMLATEEFVEKKSGRGTTVLSNRPYNKLSKAGTFTEFLNESGQKVTKKVLQVENLTLSKEMPAYQFLGEEVVHLSRLYLIDEQPYIYFNYYLPAAMKDVSLTEYKEESLYRLMDRHAIEIYKFEDRFEVATLTEAEQKMLQTTETTGLKRIRRSLSPTGRCVEYSEAIYNTKIHPYVIEYEA >NZ_CP022059.1|WP_002381711.1|2216915_2217665_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLEVQNLKKVYGNEIKYEALKGINLTVQDGEFIGIMGPSGSGKSTLLNLLATIDSPTDGEILLNGKNPNNLNQEQIAKFRRTELGFVFQSFNLMPTLTVEENIILPLTLDGEKVSVMKRQLAELSERLGINHLLKKRIAEISGGQAQRVAVARAMIHHPQLLLADEPTGNLDTKSSKDVMGLLQQLNEEEAATILMVTHDPLAASYCKRIVFIKDGELIDEIVQNGNQKEFYDLIMVKLAEIEGVDNEF >NZ_CP022059.1|WP_002381708.1|2231471_2232335_-|AraC-family-transcriptional-regulator MLANLNQAMDYIEEHLTEEVSFDELAKKTGISVYHFKRTFSFVAGMSLAEYIKKRRLAEANLALLAGEKVTDVAFKYGYQSIEGFSRAFRDWTGQAPSEVMKTQIQKTFPKFSFYIDIKGGQSMDVKLIEKPAFQIVGVSQKVPLQYQGENQAIMELTQRITPQQRAEMHTFDDVYPHQVVNASFDFQEGRTTEGGEMTHMIGFATSQENTYEDLEQLSVPAHTWAVFPNEGPFPQTLQETWARIFSEWLPSSGYQVVAAPEISFTQYQGPAEAKYSEIWLAVTATK >NZ_CP022059.1|WP_002398605.1|2232419_2234669_-|DNA-topoisomerase-III MAKQNSANGKLFETHEFKEKPQGIFFKLFFYSRNLEKIELIFGIIRKDSTQKGAKLVVAKQLIIAEKPSVAKDLSRVLGANQKNKNYYEGPNVIVTWALGHLLGLKMPEDLNKEWQTWQMETLPMIPKNLGIKPLPKTGHQLKAIKQLANRKDVSEAVIATDAGREGELVARWILEYVRFNKPVKRLWISSQTDKAIKDGFKKIRPAKDYDNLYYSALARAKADWLVGLNVTRALTVKYQDNLSAGRVQTPTLAMVRQQEKTIEQFKPQTYFTISLTVESEKAKMTQKNPYALKERQEAEQLVKELSKQKGLVTDIQEKVKTENAPLPYDLTEIQREANQRFQFSAKKTLSLVQSLYETHKIVSYPRTDSKYLTTDMKGTMKERLQAIADFSPEVKGYLKNGAVVKQQKVFQNAKVTDHHGLIPTEQRPRYEKLSNDEQKIYQMIVQRFLGLFAEPNQTKQTKVTVAFGKETFVFHQNKVVVAGWKTTAEQPLSTVQWQKGMTVAPNFTINKELTSPPKPLTEGTLLGKMEKHSLGTPATRAEIIEKLIKSELMERTNSGLSVSAKGKQLLDLVNPSLVTPELTEKWEKSLEAIASGQQKSQLFLKDIEEDTKKLVREIKQSEKKYQDFSITQKKCPDCGSNLREKNTKDGKIYVCTDQECSYRRRKDPKVSNHRCPQCHKKMVIIEGKNGRSFKCKFCSITEKIPDKKERKQKMTKHEERRLMKKYSQPDEPEESALAQALKAAMNQE >NZ_CP022059.1|WP_002356966.1|2234631_2234997_-|DUF1033-family-protein MYQVITMYGDNEPWWFFDDWQEDIVQEKTFDNLTDAETYYVEVWQKLSQNYTYVNTKPNYLTAFWNDGEERWCEECDEDLQQYFGLALLENHHAVTFENKAEFTTISNHFGKTKFCKRKVI >NZ_CP022059.1|WP_002381706.1|2235094_2235664_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAKKRNLTKAKILESARNLAEELGVQQLTFQNLAVDLGIKYPSLYNHFKNIAEVKNALVDLLIQELNDALRRALVGKSGAEAIRIYAETYQQFAFENSAVYELLIRVPKTQNQQLIEGIHETNQIILQLLAFYPFNNEERLHKSRELRSLIHGYITLRFLGYFQREEATPEESYRRMIEDFIASLEVAG >NZ_CP022059.1|WP_002362073.1|2235796_2236312_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MHITNRSHLADRYGKRTSAEFLLHERPILSFPISLAAIPKEARYLSWELIDYDTIPLIGFPFIHWLAANVPVTNEIPEDFSRTALKPTIQGKNSLASPLGKQMIPALATETLPELTERYLGLSPRSGVHTYTLYVYATKNPLNLKEGFFANELHQALNDQRLAKAKFEFLY >NZ_CP022059.1|WP_002356962.1|2236328_2237567_+|multidrug-efflux-MFS-transporter MYELIKSKIFRPRQPWEKNLLVLWFGTFMAGIGFSLVMPFMPLYINTLGTFTHQQLNFWSGITFSSTFLVTTIVSPWWGRLADRKGRKLMLLRASLGMAIVISLMGAVTSVYQLIGLRLLQGVFSGYISNATALVATGTPKEKSGQVLGTLATGSVTGTLLGPLLGGVTASIFGYRPTFFITGTILLLVFVLSLVFVHEEFVPIEKNQAASGKQILKKLEHPHVILGMFITTLIIQASNNSISPIISLYIQQLLGGHGNVTLISGVIASIPGIATLIAAPRFGRLGDRIGSERILTIGLILAIFVYLPMAFVQNVWQLAMLRFLVGISDACLLPAVQTLITRYSPSDAAGRIFSYNQSFQATGNVIGPMIGSSVSAAFGYRGVFISTSCLVLINLLWVRRSTAELKKEKNDD >NZ_CP022059.1|WP_002362075.1|2237746_2238871_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MADNSKTRVVVGMSGGVDSSVTALLLKEQGYDVIGIFMKNWDDTDENGVCTATEDYKDVAKVADQIGIPYYSVNFEKEYWDRVFEYFLAEYRLGRTPNPDVMCNKEIKFKAFLDYAMQLGADYVATGHYAQVETDENGVVHMLRGIDNNKDQTYFLSQLSQAQLAKTMFPLGGMEKSEVRAIAERAGLATAKKKDSTGVCFIGEKNFKEFLSNYLPAKKGNMVTEDGEIKGQHDGLMYYTIGQRQGLGIGGGGKTQEPWFVIGKDLTTNTLYVGQGFHHEKLYATHLEASEVHFTVDTPMPKEFDCTAKFRYRQADIPVHVSLSEDGTKATVTFKEPARAVTPGQAVVFYDGMECLGGGLIDRAYQDEKELQYV >NZ_CP022059.1|WP_002356959.1|2239096_2239441_-|DUF1831-domain-containing-protein MAFTTTAAVEGSTVFYKVHPSAKRYTLKDNGFTETKSGNFQLIRSLDPTPQRNEGFKLKITITADLKELKMSITTANGLKPMNIFKNEQHEMSKEKYFFLMDGLISRGVLEKVE >NZ_CP022059.1|WP_002360007.1|2239508_2240654_-|cysteine-desulfurase MEPIYLDHAATTPLHPTVIQAMTENMQTTFGNPSSIHQFGRKAHGLLEEVRQTIAESLQAKPHEIIFNSGGTEGDNTAILAVAFSRQKEGKHIITTAIEHPAVLRTMEYLETLGFEVTYLPVNENGQISMDQFKKSLREETILVSMMYGNNEIGNRLPIAEVGAILKNHSAIFHTDAVQAYGSEVILPHELGIDLLSISAHKINGPKGVGFLFKSDAIQLPPLLHGGEQEEKRRAGTENLAGIIGMGTAVSLLTSAEKQARKTAYQSFQTIILKALEEANIDFSINGEPTNRLAHVLNLHLKGIPSDLLLMHLDLRGIAISTGSACTAGTVDPSHVLTAMYGENSSAIKESIRISFGYGNTPEEIATFSEVLVAVIQQLKK >NZ_CP022059.1|WP_002362076.1|2240810_2241785_-|ribose-phosphate-diphosphokinase MTENYQDDTLRIFSLNANRPLAEKIAASVGTELGKSTVRQFSDGEIQINIEESIRGDHVYIIQATNAPVNDHLMELLILIDALKRASAKTINVILPYYGYARQDRTAKPREPITAKLVANMLVEAGATRLLTLDLHTVQVQGFFDIPVDNLFTMPLFAHYYRQQALVGEEIVIVSPKNSGVQRARSLSEYLDATLAIVDHEEIDGVRQEGYVIGNVAGKKCILVDDILNTGQTLATAAEVLMKNGAQEVYACASHGLLSEGAKATLENAPIKEISITDSVYTTADRQPATLNIISCAELMGEALLRIHENKPMSPLFRLEPKGE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022059_3 | 2250839-2250946 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022059_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022059_3
>3.1|2250865|56|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder TCGGTCATCTTGTACTGTTCATCATCTACTCTGTCGCTTCGCGCCAGTCGTAGTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022059_3
The CRISPR arrays of NZ_CP022059_3 >merge|NZ_CP022059|3|2250839-2250946|CRISPRCasFinder TTCGTGCAAATGATACAACCTGCCCTTCGGTCATCTTGTACTGTTCATCATCTACTCTGTCGCTTCGCGCCAGTCGTAGTGATTCGTGCAAATGACACAACCTGCCCT >NZ_CP022059|3|3|2250839-2250946|CRISPRCasFinder TTCGTGCAAATGATACAACCTGCCCT TCGGTCATCTTGTACTGTTCATCATCTACTCTGTCGCTTCGCGCCAGTCGTAGTGA TTCGTGCAAATGACACAACCTGCCCT
>NZ_CP022059.1|WP_002369140.1|2249248_2250319_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKNISVTFQQKKQEIQAVQDVSLTIDKGDIYGIVGYSGAGKSTLVRVINLLQRPTAGTVIINKENILTFSKKELRQQRKKIGMIFQHFNLMKERTIFSNIDFSLKYSGLSKSERRQKISHLLELVGLSEKRDAYPSQLSGGQKQRVAIARALANDPEILLCDEATSALDPKTTGQILALLKKLNQELNLTIVLITHEMQVVKEICNKVAVMENGCVVESNDIVSIFSQPQQPLTKDFIRTATHIDQALTTILEHPKLADLDKNQELIEFSYVGDQTNEPLIAQLYSQYQVYTNILYGNVEIVQNVPIGHLIVVLSGDEAQRQQALAYLAKQGVRTNVLKTYQQTKQKQNLQVI >NZ_CP022059.1|WP_002381703.1|2248549_2249230_-|ABC-transporter-permease MYQLFEKYFPNVVQLKQEFLQSTWETVYMVFWTALIAGVLGVLLGVVLVSTGPSGVLKNPPLYSILEKIINVCRSIPFIIMLALIQPLTRILAGTTIGTTAALVPLVIGVIPFFARQIENALLEVDPGVIEAAEAMGTSPLGIIFRVYLIEGLPSIIRVSAVTIINLIGLTAMAGAIGAGGLGNLAITRGYNRFQTDVTFMATLIILIMVFISQAISNQLIKKTSH >NZ_CP022059.1|WP_002370363.1|2247696_2248530_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKFSKLIGLIGVLAFTIAGCASGSAKDTKTETVKLGVVGTKNDEWESVKDRLKKKNIDLQLVEFTDYTQPNAALAEKEIDLNAFQHQIFLDNYNKEHGTKLVSIGNTVNAPLGIYANKLKDITKIKDGGEIAIPNDPTNGGRALILLQTAGLIKVDPAKQQLPTVSDITENKRQLKITELDATQTARALQDVDASVINSGMAVDAGYTPDKDAIFLEPVNEKAKPYVNIVVAREEDQENKLYQKVVEEYQQEETKKIIAETSKGANVPAWETFGKK >NZ_CP022059.1|WP_002381704.1|2246488_2247682_-|amidohydrolase MSITTIQTIQEAIATEKEWIIHLRRHFHQYPEASLKEYETIKRIKEELLALAIPFVEVGETGVLATIEGGLGAGKTILLRADIDALELPDATGAAYASKNPGLNHACGHDGHAAALLGAAKVLKKHQDTFSGTIKLAFQPAEEIGAGARQFVEGNYLEAIDQVFGIHLDSSVPVGKLVATKGATNASCDIFKIEVSGQSSHVAQPQNGRDAVLAAASIVVELQKIVAREIDPLDSVVVGIGVLQAGTRYNIVANQATIEGTVRTFSQETRQFVLQRVEEIAHEIAQSHRTEIADFSVYAAANPLINEEQATNRAQQVASEIVGFENVVTDHPKSLGADDFADYLAVIPGIYGRVGSRNPENPATHFGHHHEQFDIDERALLLAAEYHVRYALNYLSE >NZ_CP022059.1|WP_002362078.1|2244580_2246119_-|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MSILTIEHLTHRFGEKVLYEEASLQVNKGDHLGLTGQNGVGKSTLIKILTGEVLPDEGTIQWQKNCKIGYLDQHVSVEQSLTMVDFLKQAFQELFDKEAKLTKLYEEYSQTASEKLLEQAGKLQTDLDESNFYQIDTIIQDLANGLGLQAIGLDKKLGELSGGQRSKVILAKLLLEAPDVLLLDEPTNYLDDTHIQWLVRYLNNFEGSFLLVSHDYQFLNEVTNCIADIEFGKLTKYTGNVEKSFAQKEQNKQTYLKQYQAQQEKIEKMEAYIRKYKAGNRATMAKSRQKQLDRLERLTPPGSLTKPAIEFPYQGLVATQALTTQKLVVGYREPLLEPLDLMVHVGEKVALKGFNGIGKSTLIKTLTKVIPSLDGEFHYPLNTKIAYFTQDLAWPNEQLTPLDYLSDRFPDTTIKERRSHLARAGLPDKLAMQSLALLSGGEQTKVKLAELMMQTSNLLFLDEPTNHIDEAAKKSLQEAIHVYPGTVFLVSHEADFYEEIVDRVIDIEELVK >NZ_CP022059.1|WP_002356954.1|2243599_2244526_+|metal-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKFSLFFLTLLAGLTLAACGNQAAEKKEKLAIVTTNSILSDLVKNVGQDKIELHSIVPIGTDPHEYEPLPEDIAKASEADILFFNGLNLETGGNGWFNKLMKTAKKVENKDYFSTSKNVTPQYLTSAGQEQTEDPHAWLDIENGIKYVENIRDVLVEKDPKNKDFYTENAKNYTEKLSKLHEEAKAKFADIPDDKKLLVTSEGAFKYFSKAYDLNAAYIWEINTESQGTPEQMTTIIDTIKKSKAPVLFVETSVDKRSMERVSKEVKRPIYDTLFTDSLAKEGTEGDTYYSMMNWNLTKIHDGLMSK >NZ_CP022059.1|WP_002364373.1|2242743_2243613_+|metal-ABC-transporter-permease MIAAFIDGLFRYQFLQNALLTSIIVGLISGVIGSFIILRGMSLMGDAISHAVLPGVAVSYMFGFNYIFGASIFGLLAALSIGFITQKSPLKNDTAIGVVFSSFFALGIIFISFAKSSTDLYHILFGNVLAVADTDILITCVVGVIVLIFVALFYKELQLTSFDPTMAQAYGLNIQFFHYALMFLLTLVAVSSLQTVGTILVIAMLITPAATAYLLTNHLPTMIGLASTFGILSSVIGLFFSYSYNLASGATIVLTAALFFLLAFFFSPKKGLVFVNREKEMEESTNEKI >NZ_CP022059.1|WP_002360005.1|2241997_2242747_+|metal-ABC-transporter-ATP-binding-protein MRKSFNLAVQALTVQYQGRTALNNIHVTIPSGKITGIIGPNGAGKSTFIKGLLGLIKTKERDVLLNNQAIDQQKTTIAYVEQRSALDLSFPISVFETVLLGTYPNLGLLKRPGKKEKQAAMAALKMVQLEDYAQRQIGELSGGQLQRVFIARVLAQGAEVIFLDEPFVGIDMSSEKVIMDILKSLKNQGKMIIIVHHDLHKVSHYFDELIVLKNRLIAAGPVEQTFTAETLQEAYGDLLGDLLIQGVAK >NZ_CP022059.1|WP_002362076.1|2240810_2241785_-|ribose-phosphate-diphosphokinase MTENYQDDTLRIFSLNANRPLAEKIAASVGTELGKSTVRQFSDGEIQINIEESIRGDHVYIIQATNAPVNDHLMELLILIDALKRASAKTINVILPYYGYARQDRTAKPREPITAKLVANMLVEAGATRLLTLDLHTVQVQGFFDIPVDNLFTMPLFAHYYRQQALVGEEIVIVSPKNSGVQRARSLSEYLDATLAIVDHEEIDGVRQEGYVIGNVAGKKCILVDDILNTGQTLATAAEVLMKNGAQEVYACASHGLLSEGAKATLENAPIKEISITDSVYTTADRQPATLNIISCAELMGEALLRIHENKPMSPLFRLEPKGE >NZ_CP022059.1|WP_002360007.1|2239508_2240654_-|cysteine-desulfurase MEPIYLDHAATTPLHPTVIQAMTENMQTTFGNPSSIHQFGRKAHGLLEEVRQTIAESLQAKPHEIIFNSGGTEGDNTAILAVAFSRQKEGKHIITTAIEHPAVLRTMEYLETLGFEVTYLPVNENGQISMDQFKKSLREETILVSMMYGNNEIGNRLPIAEVGAILKNHSAIFHTDAVQAYGSEVILPHELGIDLLSISAHKINGPKGVGFLFKSDAIQLPPLLHGGEQEEKRRAGTENLAGIIGMGTAVSLLTSAEKQARKTAYQSFQTIILKALEEANIDFSINGEPTNRLAHVLNLHLKGIPSDLLLMHLDLRGIAISTGSACTAGTVDPSHVLTAMYGENSSAIKESIRISFGYGNTPEEIATFSEVLVAVIQQLKK >NZ_CP022059.1|WP_002398603.1|2251775_2253266_+|glucosyltransferase-domain-containing-protein MMKQLPTESKKFDLKNWCIENKAYLLLIILIYQVAVLSIGIINFPYLDDNARQVAGMTDFGTTYARWGSEFLSWFVQGSRHLTDLGLTTPILTGLILSLTSILAIYIINDQKISWGSSLVATLIGLNPWFLQCLSFRFDSPYMALSIFCSFLPFYWWQRNSFTFFLVSVFSLFVMFNTYQASSGIYIVIVLFLTFKQLLAGENFIALCKKVALAAIAYLLSIVSYLIELKFVPSATNNIGGSQALPSFHDIPSVAYQNSYHYFSELLNQSNRLWLLLLLLLLVLFFISHLSNSKINLGLSFLYCILYLGLASLLSFGIFIVYSRNIAGDAPRYIYGFAVFVTISMLSLFNNRQVKAIYLTSLLVASLLSYYILSFVLVYSSTLNYQKEAFNRQAAVLTDDLKNVVTNERKKVYLNTFFKNSTVYANTSRNYPILSKIVPPNDGLYFPNYVWFNTSSNLGVEMAPLTDTDMSKNQKVVSNHFYDIYTNNKEIFVFMK >NZ_CP022059.1|WP_002383739.1|2253479_2253659_+|hypothetical-protein MRTRQKKLFLFSMILWLVEFLITRISDSFPGATPLFVVICLIQGILFTYFCLAFFYYPQ >NZ_CP022059.1|WP_002381700.1|2253746_2254712_-|hypothetical-protein MSTIHEFPKNYERFIAQGEEALVEHNQIAALENFQQAYQLQQTPPVNQKIVQLLLEMDEADEALALAEAFQDSYFENLETAAIYMQIYSQSRRFIEGYILLKQLLQTNKITLAQQKTLEQQLMQVEEAYRQLETQQIQAIKRNLLVSDQLPVYQQLANIKTSLYLPKPVFVEVAKDLVMNQALSYFAREWFIEELALLQFSEPLTFLWYDNQPQTVLLEGKTGPLNTPIYSEIYTELRNRLENDDPIMLQHLEEEIRLHLAYLYPLAEKVISDPTIWVLGYLATYYPEYIEKELTEAKGHQIAAVQNVQQAIRTAFTQIML >NZ_CP022059.1|WP_002359936.1|2254885_2255176_-|hypothetical-protein MENQVEVMTYAQLKEIMQALEANEAITEDTKVFIDTGWDSVQEVAPDAVSIEKVAKFTVADVLTNESFAGYSLEEKAEKMNAEGDLETAIIIRNLY >NZ_CP022059.1|WP_002384322.1|2255223_2256504_-|aminoacyltransferase MLIYLTKKDCELFDMDQFSTLTEQEFTTFAMTHPAGNFLETPEMKHLLERRGWHCEYVGVKREGQLIAACILSKKKVKIGYAFDIDGGILMDYTDKKCVEAFFTGLKKYVKKNDGLYLTFTPNKQICLRDFNGGEVEKVNQETFDYFTSIGFEHQGFDVHNFDGAPRWLFVKDMAGLTEEELWKSYGKDAKYDIKKTWEYGVTTRELRYEELPLFKKLTEETSARRNFEDKDLAYYQAVYEEFGERAKFMVAELNFATYLENLHEKLRKLQETLNEVNEALIANPKSRKKNNQKREFEDEVRTVRKRIDEAKEMKTSDEPEILAGALFIVHPQEVVYLFSGTYEKYKQYYAPYLIQHKMLTYTVENNIPKYNFYGVDGVFDGSDGVLKFKQSFGGHVEELMGNFQWKAKPMKYALYHALKTIKEKV >NZ_CP022059.1|WP_002381698.1|2256772_2258581_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGMIGKENVTESLIQGLTKLEYRGYDSAGICVNDQSQQPHVVKAVGGIADLAAKLTPEIDGTVGIGHTRWATHGEPTVANAHPHVSSDQRFALVHNGVIENFEELKEQFLSGAHLIGDTDTEIVVQLIAHFAENGFSTKDAFKAALAEIKGSYAFALMDKMDPNTIYVAKNKSPLLIGLGEGFNVICSDAMAMIKETNQFVEIVDGEIVTVTADKVVIETPEGQVINREPFEAQLDLNDIEKGTYPFYMLKEIDEQPAVMRKIVQAYTQGEKVTLDEALLEKINQCDRIYIIACGTSYNAGWVGKSLIETIASIPVEVHLSSEFGYNMPILSEKPFFIFLSQSGETADSRQVLVQVNELGHPSLTLTNVAGSTLSREADDTLLLYAGPEIAVASTKAYTAQIAVLAILAKAIGEERQTLAAVSFDVAHELSVVAAVMETLIDEKQQMKALVEDYLTYTRNAFYIGRGVDYYVSMEAALKLKEISYIQAEGFAAGELKHGTIALIEEGTPVIGIVTDAKVAAHTRGNLKEVESRGARNIVIALESLAKPQDQLIIPDVHPLLSALVSIVPGQLLAYYATLQRGYDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP022059.1|WP_002356939.1|2259023_2259857_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_CP022059_1 | 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4726-4755 | 30 | KJ019148 | Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C19, complete genome | 7304-7333 | 7 | 0.767 |
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NZ_CP022059_1 | 1.2|4264|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4264-4293 | 30 | NZ_CP045319 | Roseivivax sp. THAF197b plasmid pTHAF197b_a, complete sequence | 226475-226504 | 8 | 0.733 |
NZ_CP022059_1 | 1.8|4660|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4660-4689 | 30 | NZ_LT984809 | Cupriavidus taiwanensis isolate Cupriavidus taiwanensis STM 8555 plasmid I, complete sequence | 150352-150381 | 8 | 0.733 |
NZ_CP022059_1 | 1.8|4660|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4660-4689 | 30 | MN694737 | Marine virus AFVG_250M893, complete genome | 29654-29683 | 8 | 0.733 |
NZ_CP022059_1 | 1.8|4660|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4660-4689 | 30 | KT630647 | Salmonella phage SEN8, complete genome | 20437-20466 | 8 | 0.733 |
NZ_CP022059_1 | 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4726-4755 | 30 | NZ_CP039340 | Ralstonia solanacearum strain UW386 plasmid pUW386, complete sequence | 311358-311387 | 8 | 0.733 |
NZ_CP022059_2 | 2.2|2231117|29|NZ_CP022059|CRT,PILER-CR | 2231117-2231145 | 29 | NZ_CP045296 | Paenibacillus cellulositrophicus strain KACC 16577 plasmid unnamed1, complete sequence | 93630-93658 | 8 | 0.724 |
NZ_CP022059_2 | 2.4|2231249|29|NZ_CP022059|CRT,PILER-CR | 2231249-2231277 | 29 | CP022016 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence | 290427-290455 | 8 | 0.724 |
NZ_CP022059_1 | 1.2|4264|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4264-4293 | 30 | NZ_CP042333 | Bosea sp. F3-2 plasmid pB32-2, complete sequence | 30149-30178 | 9 | 0.7 |
NZ_CP022059_1 | 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4726-4755 | 30 | NC_048704 | Pectobacterium phage Nepra, complete genome | 13975-14004 | 9 | 0.7 |
NZ_CP022059_1 | 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 4726-4755 | 30 | KY514265 | Pectobacterium phage vB_PatP_CB3, complete genome | 60666-60695 | 9 | 0.7 |
NZ_CP022059_2 | 2.6|2231117|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder | 2231117-2231146 | 30 | NZ_CP045296 | Paenibacillus cellulositrophicus strain KACC 16577 plasmid unnamed1, complete sequence | 93629-93658 | 9 | 0.7 |
1. spacer 1.1|4198|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK867354 (Synechococcus phage S-SCSM1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
atatgtaaatcataatgagcatttacattg CRISPR spacer atatggaaatcataatgaggattttccatc Protospacer ***** ************* **** * *
2. spacer 2.8|2231249|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder matches to CP022016 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
agcttgtcagcgcctgtatacggagtatgg-- CRISPR spacer agcctgtcatcgcctgtatacg--gcagggct Protospacer ***.***** ************ *.* **
3. spacer 1.4|4396|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016597 (Bacillus cereus strain K8 plasmid pBCK802, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
accattgacaacaatattcttttgttgcac CRISPR spacer acaattgacaacaatatccttttataaaaa Protospacer ** **************.*****.* . *
4. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019095 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US34, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
5. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019086 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US17, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
6. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019106 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US50, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
7. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019107 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US52, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
8. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019143 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C12, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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9. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019103 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US44, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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10. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019102 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US43, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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11. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019066 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C9, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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12. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019142 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C11, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
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13. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019149 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C21, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
14. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019105 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
15. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019098 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US39, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
16. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019159 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C34, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
17. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019123 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US7, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
18. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019111 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US57, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
19. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019148 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C19, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
20. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047712 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C7, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
21. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019090 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US24, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
22. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019146 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C16, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
23. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019152 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C25, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
24. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019093 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US30, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
25. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019151 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C24, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
26. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019150 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C22, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
27. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_026927 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C90, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
28. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019097 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US37, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
29. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019045 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
30. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019037 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C58, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
31. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019099 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US3, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
32. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019155 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C29, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
33. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019141 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C10, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
34. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019053 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C80, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
35. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019147 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C17, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
36. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019100 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US40, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
37. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019101 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US42, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
38. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019085 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US13, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
39. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019096 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US36, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
40. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019091 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US26, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
41. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019144 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C14, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
42. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019145 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C15, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
43. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019058 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803C8, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
44. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019092 (Synechococcus phage ACG-2014f isolate Syn7803US2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer agatccagcttctgatatgtacaggagttt Protospacer .****** ***************..* *
45. spacer 1.2|4264|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP000662 (Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caagcgatggagcaggttggtctgctatga CRISPR spacer ggagcgatggagcacgatggtctgcaccgc Protospacer .************ * ******** .*
46. spacer 1.2|4264|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045361 (Roseivivax sp. THAF40 plasmid pTHAF40_a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caagcgatggagcaggttggtctgctatga CRISPR spacer taagcgatggcgcaggttggtcaggccgca Protospacer .********* *********** * . *
47. spacer 1.2|4264|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045319 (Roseivivax sp. THAF197b plasmid pTHAF197b_a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
caagcgatggagcaggttggtctgctatga CRISPR spacer taagcgatggcgcaggttggtcaggccgca Protospacer .********* *********** * . *
48. spacer 1.8|4660|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LT984809 (Cupriavidus taiwanensis isolate Cupriavidus taiwanensis STM 8555 plasmid I, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atgcttcgaccagcaccaccaaagtctgca CRISPR spacer cccattcgaccagcaccatcaacgtctggt Protospacer . **************.*** *****
49. spacer 1.8|4660|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694737 (Marine virus AFVG_250M893, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atgcttcgaccagcaccaccaaagtctgca CRISPR spacer agatttccaccagcaccaccaaagtcaaag Protospacer * ..*** ****************** . .
50. spacer 1.8|4660|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT630647 (Salmonella phage SEN8, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atgcttcgaccagcaccaccaaagtctgca CRISPR spacer ccggcgagagcagcaccaccaaagtcagca Protospacer .* . ** **************** ***
51. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP039340 (Ralstonia solanacearum strain UW386 plasmid pUW386, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer cgatccatattctgatttggacaggatatt Protospacer *************** ** ****.. . *
52. spacer 2.2|2231117|29|NZ_CP022059|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045296 (Paenibacillus cellulositrophicus strain KACC 16577 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
aagcggggttagtaaatttcggatagata CRISPR spacer tgccggggttagcaaatttcggatcgccg Protospacer . *********.*********** * ..
53. spacer 2.4|2231249|29|NZ_CP022059|CRT,PILER-CR matches to CP022016 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar India str. SA20085604 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
agcttgtcagcgcctgtatacggagtatg CRISPR spacer agcctgtcatcgcctgtatacggcagggc Protospacer ***.***** ************* . .
54. spacer 1.2|4264|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP042333 (Bosea sp. F3-2 plasmid pB32-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
caagcgatggagcaggttggtctgctatga CRISPR spacer ggggcgttggagcaggttgggctgctggcc Protospacer ..*** ************* *****.
55. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_048704 (Pectobacterium phage Nepra, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer caacccatattctgatctgtacagaataca Protospacer .*.************ ********. .
56. spacer 1.9|4726|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY514265 (Pectobacterium phage vB_PatP_CB3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ggatccatattctgatatgtacagagggat CRISPR spacer caacccatattctgatctgtacagaataca Protospacer .*.************ ********. .
57. spacer 2.6|2231117|30|NZ_CP022059|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045296 (Paenibacillus cellulositrophicus strain KACC 16577 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aagcggggttagtaaatttcggatagatac CRISPR spacer tgccggggttagcaaatttcggatcgccgg Protospacer . *********.*********** * ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
60472 : 116041
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022059|60472:116041|DBSCAN-SWA GTCAAATTAAGTTAGAATAAAATGCTTCTTGTACATAGCTCAAAAATATCTCAATTGGTGTTCTGTAATTCAATGATTTTCTTGGAATATGATTACGTTGATTGCTGACACTGGAAATAAATGTCTGATTCACTTCTCTAAAATCCATTGATTTCGGCAGTCCATTACGACGCAGAATCCCGTTAGAATTCTCGTTTAATGGGCGTTGAGAAGGTGTTCCAGGGTCCGCAAAATATATATCAATATCGTGTTGGTTACTAATGGCTTTCCAGTTAGAAAATTCTTTTCCACAGTCAAACGTAATAAATTTAAAGAAGTTTTTAGGGAAGCGAGAAAACCATTGATTAAGGGCGGTTTCAATATCTAATGCCTTACGGCCGTTGGGTTTAATCGTGATAATGACTTTAGATAATCTTTCAACTAAAGTAATGACGGCACTTTTATGATGAATGCCAACGATCGTGTCACCTTCAAGGTGACCAAACTCAGAATTGAAATCAGGATAATTATCAGGTCGATCATGGATTGAGCGCTGATATTGTTGTTTTCCCCGTTTTTCCTGATGGCCATTGGGTTTTCTTTTACCTTTTATCGGTAGTGTGTCAATATCAAATATCCCTTTAGAAAATAAACGATAAAGTGTTCTCATACCGCATGAAACAGGCCTTTCTTTTCGCCCGATAATGACGTCAGGCGTCCAACCAAGAGTGACTTTCTCTTTAATGTAATCTACTTCATGAGCAGGTAATTGAATGACTTTTCTACCACATTTTTTCTTATTTTCTTTATACTGGTGCCAATAATCAAGAGCAGTCTTGCCTTGCTTGAACTTATTGACTACATTATAAATAGTTTGTATAGCACGTCCCATTCGGTTAGCGATTTCAACCGGTTTATTATGTTGAAGATAATATGATTCTATCATTGTCAGTTCGTCTATGGTAAGATGTTTGTAGGTCATTTATGGTTACACTCCTTTGTTTTCTTTCGTCGGAAATACAATTTGAGTGTACCATAAATGCCTTTTTATTTTTCTAACTTAATTTTACAATTCGCGTAACTAAAAACATGCGTGCTAACATACTTGAAGATTTGGAAAAGGATGGTCTTTAATATGCGAAATTTTTCCCTTTTTCTGCCCTTTACACTATATGTAAAAGACAAAACTCATTAGAGCCCTAGAGCCCCAACGGTTTTTTGCAGAATTATTTCACTGCGCCTTTTTGGTAATAATATAACACTGGTAAATATAGATTTTTACAACCGTTTTACCCAGAAAGAAGACATTACTGTAATCTTACAATACTAAAAATAGTAACCACTTCTCTAAAATAAGTCAGATTTTATTAGTAAATATAATAATCAGGACTTCCTTTTTTCTCAATACTAATAACTAATTTATGGGGTAAGCAAATACTAGTCTGACCAGGATTTGATATCCATCCAGTTCTAACTGCAATCTGATCAGGACTATTATCTTCTCTATCTCGGATCTTTCCATCTTTAATCTCAATAATATTATATTGTCCCTTAGCTGGATAATACTTCACATATTTATGACTGATTTTATCTAAATTAAAGCGATCTACTTCCTTGCCATTAATTCGAACAACAGCATATTTAGTAGTTCCTTGGTTCCCCTTCTCAAGAGAAAAAATAAATAAAGGTATAAAGGAGCTAATAATCAAAATCCCAATAATTATTACGTCTCCTATCTTCATATCAATTTTTCCTAAACCAAGATAGTCAGTTAGGATTGTAATAGTTTTTTTCATAGGAATCCTCTTTCTATGCATAATAAAGAGCAGGTTAAATCTAACTAAAGGAAAACTATCTCATAGCCAGTAGTATAATAATCTTTGTACTCAGCAGCTGTCATGTCTTTATTGAGTTTTGCTTTGTAATCGAAAACTTCATCCAAAATTCCATCTTTTAACAACGGATAAACAGATTGCCATTCACCTGTATAATCACTCAATTCGGGATCCTTCACATCGACATCTTTAAAGTACCCACTAGCAACTGTCTTTTCATCCTTCGCTTCTTTTTCTGGAACTACCTCTTCACCAGCAACCATAGTTGTTTTCTCTAACGCTTTTAGATTGTCTTCCATTACTGAAACATAATCTTCACCATTATTCATTTGTTCTTTTATAAGACTTTCAAGAGGATTCAATACTTCCAATTTTATCCCAGCTTCGTTGGCCAAAGTTTTTGTATCATTAGCATTCTTTTCAAAACAAATATAATTGATATTATTTTTTTGGCATACTCTTTTAATTCAGCGAATTGACCAGAAGATGGCTCTTCTTCAGGACTTAGTCCAGCAATAGGAACTTGTATCAATCCATAATCCAAAGCTAAATATCCAAAGGCTGCGTGTTGTGTCTCAAATACTTTTGCTTTTTCCAGATAGAACTTTAACTAATAAGGATTAGCATTCTTGATACTCTTTATCAATTTGTTTTGCTTAACTTTTTTTCTGAGAGAGAAACTACAAATATAACTTCTTCACGTACCTAGCAATTTAATAACAGTCAGTCTACTAACCGTTCATCATTCATACCAAAATATTGATGTAATGGTTTTTGTTTTCCTGACAATAGTTGATCGATCGTCACAAATTCGTATCCTTCATTTTTTAACATAGTGATCAATCCTGGTACAGCTTTGACTGATTCATGATGGATATCGTGGATTAAGATGATTGCGCCATTAAAGACATTCTGTTTGACAACATTATTGATTGCTTCAGGATTTCTTGTTTTCCAATCTAGCGAATCAATATTCCATTGAATAATTGGCATGCCAATTGTTTCAGCACTTTTTTTATCAATAGCGCCATAAGGAGGACGGATATTGCGAGGCAAGACGCCTGTAGCCTTAAAAATTGCTTTATTAGCTTTATTAGCTTTATTCATTTCACTTTGTAATTCATCTGTCGAAAGTGTATTCAACTGTGGATGAGAATACAAGTGACATGCTACCTCATGACCCTCGTCGTGGACTTGTTTTGCAACATCTGGGTTTTGATCCACCATCTGTCCTAACATGAAAAAAGTAGCCTTCACGTTGTTTGTTTTTAGTATATTCAACAAATCAAGTGTTGAGCTATTATTGGGTCCATCATCAAAAGTAAGAGCGACATACTTTTTATTTTCATCTAATGCAGGTAACGCATCTTTTATACTTTCTTGCGAAACCAGATCTGTATCAATAAAAGGCGCAATGTCTCTGTATTTTAGAGTAACTTTAGTAGTTTCAGTTGTGTTCTTTGGTAGGTCGATGGTCAATTCATCAGGTGTATAAGTCATTTTACTCTCGTAAGAAATTCTATCTATCGTTAATACAGCATCAATTATTTTTTCAAGCTCTTTGGCGTGATCAAGAATGGATTGCTGAATCACCTGTTGAATACCTAAGAGACTTCCTTCATCTGGAATCAAATCCTTATTTGTGATTTCTTTACCAGTTTTTTCGGAAACATAAATGGTTTTCTCAGAAATACTGTCTAGCTTTTTAAAATTTTCCTTACTGCGATCCCAGATAAAACTATCTGCTTCAATTCTATACTGACCAATTTTAGAAGATATTGCTGTTGCTTTTATTCTGGCAACTGTAAGCACTTCTTTTTCACGATGCTTCTTTTGTTACTTTTGAGCAAGCTCGTCTACGAGCTGGTTTGCATTTTTGAAAGGAACAGTACTTTCATAAACTGGACTGTAAACAAGGCACTTATTTTCTCCGTCATTTATAGTATCTATTTTCGTTGAAATTCCACTTTGGTCTTGCTCTTCTTGGATTGAAGCCATGAGATTTTTTGCAGCAGTTTCATATTTGGTTTGAGCTTCTACTTCTTGCTGTTTTAATGTATAAACAATATAACCGCCAGTAGCGACAATTACTAGAATATGTGCGGTAAACAATGCGAATATATACTTGCTATAATTAGATTTTTTCTTCGGTATTTTTGGTTGTTTGTTTTCGTTTCCGGTTTTGGACTTTACAGCTTCATTCAATTGATTTGTATTTTCACAGATATCAGGTTCTTGTTTGTGACGTTGGCTACGACGTGCATAGGTATTTTTATCAGACATATGACTTTATCTTTCCTTTTATCATCATAAAGTAAAATAAAACAGCGCAATTGTAATAAAAACTAATTTATAGATAATTTTTACAAGAAAGTTTTCTCTATTATTCTTTTTCTTTCGGCGTAGTAATTATTGCTAATTCCTCACCATTTTAGATACTGTGGCTACTTAATGTTCAACTCAGTTTTGATATCATTAGAATTACTAGTTTTGATTTTAGTTTTTGGAATTGTACCCTTCGATAGGTTAATCAGTGTGGTTGCAGTCTTTGAATCACCAATAATGGTCTAGGATTAAAAATATAAACTATTATCCAATCTTGTTCTATTTGATTAAACATACTACTTTAATACCTTTAATTTGTGATCAATTCCAACTTCACCAAACTCATTTTCAATTATAATAATTTCTTCCCTGGGATAGGGTGAGAATTGCAAGGCTTGATTGATTAGCGTTGTTTTTCCAGCACCTAAAAACCCAGAAACGATTGTAACTGGTATGCTCATTTTGTCACCTTTTTACCACTTACCTATTTCACTTCTTTGAAAATTGCCCGCCTGCGCAATTTTGGAGAATACTTTTTTAATTCTAGCCGTTCAGAGTTATTCCGTTTATTTTTGCTGGTGAGATACAGACGTTCTCCAGTTTCGACACATTCCAAAATAATATTTTGACGCATAAATCTTCCTCCTTCAATACTTATCGATCTTCAAGATACGCTTGAATTTGTTGTGCATCTTCAAAATTTAACTCGCCAGATTCCAATTGTGAAACTAAATTTTCTTTCATATCAACAGGTATCTCCCAATAACCATCGATACATTGAAATAACTCCTTGTCATACTCTTCAAAAATTGGATAGATTCTTAAAAACTCATCAAATGATAACCCTTGATCCTCGTAGTA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49 | Bacillus_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
129849 : 200337
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022059|129849:200337|DBSCAN-SWA 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64 | Streptococcus_phage(38.89%) | protease,integrase,transposase | attL 169248:169264|attR 204158:204174 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
725092 : 743838
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP022059|725092:743838|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP022059|725092:743838|741397_742615_+|WP_001291561.1|integrase|DBSCAN-SWA MSEKRRDNKGRILKTGESQRKDGRYLYKYIDSFGEPQFVYSWKLVATDRVPAGKRDCISLREKIAELQKDIHDGIDVVGKKMTLCQLYAKQNAQRPKVRKNTETGRKYLMDILKKDKLGVRSIDSIKPSDAKEWAIRMSENGYAYQTINNYKRSLKASFYIAIQDDCVRKNPFDFQLKAVLDDDTVPKTVLTEEQEEKLLAFAKADKTYSKNYDEILILLKTGLRISEFGGLTLPDLDFENRLVNIDHQLLRDTEIGYYIETPKTKSGERQVPMVEEAYQAFKRVLANRKNDKRVEIDGYSDFLFLNRKNYPKVASDYNGMMKGLVKKYNKYNEDKLPHITPHSLRHTFCTNYANAGMNPKALQYIMGHANIAMTLNYYAHATFDSAMAEMKRLNKEKQQERLVA >NZ_CP022059|725092:743838|741112_741316_+|WP_000814511.1|DBSCAN-SWA MKQTDIPIWERYTLTIEEASKYFRIGENKLRRLAEENKNANWLIMNGNRIQIKRKQFEKIIDTLDAI >NZ_CP022059|725092:743838|736879_738799_+|WP_105577399.1|DBSCAN-SWA 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21 | Streptococcus_phage(94.74%) | integrase | attL 724841:724854|attR 742627:742640 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1078702 : 1088442
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP022059|1078702:1088442|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP022059|1078702:1088442|1085629_1086226_-|WP_002356379.1|DBSCAN-SWA MRNPKPQEWKTEDYSQKKIADYKAFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAVQNFNYGTPFTESLMNQIIEDLSHDYVQGLTLLGGEPFLNTDVCLSVVKRVRETFGSAKDIWSWSGYTFEELLLETPDKLELLHSIDILVDGRFELAKRNLNLQFRGSSNQRIIDVPKSLAAGKAVIWEKCHDAETSYEQIKKSI >NZ_CP022059|1078702:1088442|1082936_1083599_+|WP_002356375.1|DBSCAN-SWA MSNLLRAEGVSYQVNGRSILSDIDLSFETGSNTTIVGPSGSGKSTFLKILSSLLSPTEGEIFYQEAPITTMPIETYRQKVSYCFQQPTLFGETVYDNLLFPFTVRQEAFNQEKVVALLQQVKLPAAYLEKKIAELSGGERQRVALLRNIIFVPDVLLLDEVTTGLDEESKQIVNQLLNQLNKEQGVTLVRVTHDTEEIQQAQQVIRIVAGKVAPTDGFSS >NZ_CP022059|1078702:1088442|1082049_1082922_+|WP_002359438.1|DBSCAN-SWA MQKQKSFDKQTTKGKLYLVPTPIGNLEDMSIRCLNILKEATVIASEDTRNTQKLLNHFEITTPQISLHEHNYKERIPQLITRLLNGETIAQVSDAGMPSISDPGHELVTACLEEELAVIALPGPTAGMTALIASGLLPQPFTFYGFLPRKKKEQKDVLSALKEERPTQIFYESPYRIAKTVATFAEVYGQERPAVICRELTKLHEEYLRGTLGELTEYLAENTLKGECCLLVSGFTGEKETIAAMPAISLKEHVQVLMEEEGRSSKEAIKEVAKLRNVKKQEVYKEYHSI >NZ_CP022059|1078702:1088442|1086258_1088442_-|WP_002382497.1|DBSCAN-SWA MMKITDEKAEDVNLSTIKVVKRDGRLVTFDDQKIYDALIKAEQKIHDQVTPLTHQKVQSIVADVNREIAERFTNNVKIYEIQNIVEHTLLSNNEYALAEEYIHYRTQRDFERSKATDINVSIGKLINKDQTVVNENANKDSDVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKMLPSHVANAHQKGDIHYHDLDYHPYTPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNADVESPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRIDELLAPFAERNYEKHLADAQEWIEGEERQKAFAQKKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSLGFGLGTNWFEREIQRAILQIRINGLGIEKRTAIFPKLIFTIKRGVNAQPTDPNYDIKQLALECATKRMYPDVLNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKDEQGEEVNVGRMNLGVVTLNLPRIALEAQGSQEKFWQILNERLAIVKDALVYRVERVKEAKPANAPILYMYGAFGKRLATQDAVDELFKNKRATVSLGYIGLYEVASAFYGGAWEDNQEAKNFTLDILKELKKNADNWGNEYGYHFSVYSTPSESLTDRFCRLDTEKFGIVENITDKEYYTNSFHYDVRKNPTPFEKLDFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPMLQQNPKALEAVWDYAYDKVGYLGTNTPIDHCYACGFEGDFHPTERGFECPECGNHDPKTCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEISSRVKHLKN >NZ_CP022059|1078702:1088442|1083582_1084341_+|WP_105577414.1|DBSCAN-SWA MDLAVNNLSLFFSAMLVVVALIISTKEKLGFTKDIIISVIRAVIQLVAVGYLLKYVFQVNNLILTLIMVLVIVSNAAFNAKKRSQQLQKGFLISFIAIGCSTGITIGILIFSGSIKFIPSQIIPISGMIASNSMVAIGLCYRNLDTLFQNQRQAVMEKLALGATIKLASLPIIQQSVKIGMAPTIDSAKTVGIVSLPGMMSGLIFAGVDPVHAIKYQIMVTFMLLSATSIGSVIATYLAYKGYYNQQKQLIV >NZ_CP022059|1078702:1088442|1079360_1079690_+|WP_002356367.1|DBSCAN-SWA MKIILAIVQDKDSNRLANEFIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIIGIDDERVDETLALIKETCQSRKQYVSTPVTLDITMDGQIPYPVEVEVGGATCFVLPVEGFHQY >NZ_CP022059|1078702:1088442|1079691_1080642_+|WP_002381409.1|DBSCAN-SWA MNEAQQLQQMQPLLYKQLQKSFEHGRLAHAYLFEGDTGTGKQEFGLWMAKHVFCTNLVNQQPCNECHNCVRINENEHPDVLRIAPDGQTIKVNQIRELKAEFSKSGVETAKKVFLIQEADKMSTGAANSLLKFLEEPEGQILAILETTSLSRILPTIQSRCQTLHFQPLVKKTLIDRLIKQGIGEKTATLLAELTNSFEKAVEISQDEWFNEAREIILQWFNYLKSNDLQAFIYVQKKMVKVFKEKEQQALSFDLLMVYYRQLLKESVATQQAKKVTEEQAERLALILKARQKWTANVSWQNVCEQLVIQMIHPKS >NZ_CP022059|1078702:1088442|1084466_1085585_+|WP_002381412.1|DBSCAN-SWA MMSELRFPLKKDTSRKIIHIDMDAFFASVEERDHPELVGHPLVIARHPSDTGGKGVVTTANYIARQYGIHSAMSAQKAYELCPSAIFKPGNYQKYSEISQEIREIFRRYTDVIEPVSIDEAYLDVTENKVNSKSAIKIAKMIQYDIWHELQLTCSAGVSYNKFLAKLASDFQKPKGLTVVLPEEAEDFLKALPIEDFHGIGKKTVPKMHELGIFTGADLYKQDEMTLIRLFGKMGYSLYRKVRGIHDAPVQVTRDRKSVGKEHTYGTPLTTEEQVTAQLRQLAAGVEHALQRVQKHGKTVVLKVRYTDYTTITKRVTLPEYISKKEELFYQANLIWEDILGLEQGIRLLGITLTNLDPLAYENIVLPLWEKS >NZ_CP022059|1078702:1088442|1081590_1081938_+|WP_002381410.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNSLETDLDSSVAQLREIKAALHDLVEKNTTLEIENQRLREHLQELNKLAGNTTETEKQELSKSRMNLEKLYEEGFHVCNILYGSRRENDEECAFCLDVIYGERTR >NZ_CP022059|1078702:1088442|1078702_1079341_+|WP_002356366.1|DBSCAN-SWA MQGIFITFEGPDGAGKTSVLKEVSERLAKESKRKIVTTREPGGIPIAEKIRTVILDPRNDRMDERTEALLYAAARRQHLVEKILPALEAGHLVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGIAPIASINAFATEGVSPDFTIYLDVDSDTGLRRIQENRTQQIDRLDSEGLEFHQRVRHEYLKLAEENPQRIKKIDARMSLELVVEATYQAIIERYPENF >NZ_CP022059|1078702:1088442|1080758_1081598_+|WP_002356371.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRFREAGHIYYFAPGKSEYIYNEKVLVESQQSKQLATVAIPKKTVDSDDLPEDLKPILNKATANDLEKEQKNLADAEAAKSIANEKIRAHDLKMKLVRVEYTFDRSKMIFYFTADGRIDFRELVKDLAAIFRTRIELRQIGVRDEAKILGGIGPCGRQLCCSTFLGDFMPVSIKMAKDQGLSLNPVKISGLCGRLMCCLKYENDEYEAAKKELPDYGKEVITPDGKGKVVGLNLLSRIVKVRLHGREIAADYDYEEIKEATAKVAAEKGDQNG |
11 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1211631 : 1219548
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP022059|1211631:1219548|DBSCAN-SWA AATGACTATGGAAAAAGTATTAGAAGTTAAAGACTTAAGAATCTCCTTTGATACATTTGCAGGTAAAGTCAACGCCATTCGTGGTGTGAGTTTTGATCTTTATAAAGGTGAAACGTTAGCCATCGTAGGTGAATCAGGGAGTGGTAAATCTGTTACAACTCGCAGTATTATGCGTTTGTTGAGCAGTAATGCCAATATTGATAACGGGGAAATTTTGTTTAAAGGGCAAGATATTGTTCATAAAACAGAAAAACAAATGCAAGCCATTCGTGGTAAAGAAATCGCAATGATTTTCCAAGATCCGATGACTTCATTAGACCCAACGATGCCAATTGGCAAACAAGTGGCGGAATCATTAATCAAACATAATAAAGTCTCAAAAAAAGAAGGCTTAGCGCAAGCATTAGAATTACTAAAATTAGTCGGCATTCCTAATGCTGAAAAACGTTTGAAAAACTATCCACACCAATTTTCTGGTGGACAACGTCAACGGATTGTCATTGCAATTGCTTTAATTTGTTATCCAGAAGTTCTAATTGCAGATGAACCAACTACAGCGTTGGATGTAACCATCCAAGCACAAATTTTAGAGTTATTAAAAGATTTACAAGAAAAAATTAGCACTTCGATTATTTTCATTACCCATGATTTAGGGGTAGTAGCAAACGTGGCTGACCGTGTCGCTGTCATGTACGGTGGACGTCTGGTTGAAGTGGGAACAGCAGAAGAAATTTTCTATAATCCACAACATCCATATACTTGGGGACTTTTAGGGTCAATGCCAACGATGGAAGGAACAGAAGACAAACTTTATGCGATTCCAGGTTCACCTCCAGATTTATTAGATCCACCAACTGGAGATGCCTTCTATCCACGGAATGAGTTTGCTTTAAAAATTGATACAGAAAAAGAACCACCTTATTTTGAAGTATCACCAACCCACAAAGCAGCAACGTGGTTATTAGCACCACAAGCACCAAAAGTTACGCCTCCAGCAGAGATTGTTCGTCGTTGGGCAATTTATGCAGAGCGTCAAAAAAATCCAGGAGGTAGTAATTAATGGCAGAAGAGAAAAAAGTCCTATTAGAAGTCACTGGTTTGAAACAGTATTTCAATGTTGGTCGTAAAGACGAAGTAAAAGCCATTGATGACATTAGTTTTCATATTTATGAAGGCGAAACCTTTGGATTAGTTGGCGAATCAGGAAGTGGAAAATCAACAACTGGTCGCAGTGTCATTCGTTTATATGATCCAACTGCTGGTGAAATTCTTTTCGATGGAAAAGACATTAGCAAAATTAAATCAAAAGCGGACATGCAAGCATTCCGTCGCGATGTTCAAATGATCTTCCAAGATCCATATGCTTCATTGAATCCAAGAATGAAAGTCAATGATATTATTGCTGAAGGAATCGATGTCAATGGATTAGCTAAAACACCAAAAGAGCGGGAAGAAAAAGTCAATGAACTTTTAAAAACGGTGGGATTAAATCCAAGTCACAGTACGCGTTATCCTCATGAGTTTTCTGGTGGGCAACGTCAACGGATCGGGATTGCTCGTGCTTTAGCGGTTAATCCACGTTTCATTATCTGTGATGAGCCAATTTCGGCTTTGGATGTGTCGATTCAAGCCCAAGTAGTAAACTTATTACAAGATTTACAAAAAGAACAAGGCTTAACTTACTTGTTTATCGCACATGACTTATCGATGGTAAAACATATCAGTGACCGAATTGGCGTAATGCACAGTGGGAAATTATTGGAAATGGGCACAAGTGATGATGTCTATAATTTCGGCGTTCATCCTTATACAGAAAGTTTGCTTTCTGCGATTCCATTACCAGATCCAGACTATGAACGCACACGTAAACGGATCGTTTACCAGCCTGCAGCGGCAGATGGGAAAGATCGTGAGCTCCGTGAAATTCTCAATGGACACTATGTTTATTGTGCTGAAGACGAAGTTGCAATGTACCGTGAAAAAATTGAAGAGAAGAAAAGAAAAGCTGGTTTATAACCAGCTTCTTTTCTAACTATCTTGGTAGGGTGGTTATGAGATGAAGGCTCTGAAAGCTTATAAATACAGACTTTATCCAACCTCAAAACAAGAAGAGTTTATTCAAAAAACATTTTCTTGTGTTCGCTTGGTGTATAATTTAATGTTACAAGACCGGATTGATATCTACAAAGAGATGCGAAAAAATCCTCAACAAACGTTTAAAATGCCAACGCCAGCTAAATATAAGAAACAATACCCTGTCCTCAGAGAAGTTGATAGTTTAGCCTTGGCAAATGCACAAGTTTATTTGGATCGAGCCTTTAAAAATTTTTATCGGGAAAAAGGGATGGGCTTTCCAAAAAAGAAAAAGAAAGAAACGGTGCATTCCTACACTACGAACAATCAACATGGCACGGTCAAAATTTTGGATAATCGTTATTTGAAAGTACCTAAATTGAAATCTTTAATTAAAATGAAGGTACACCGCCAACCGCTGGGGGAGATAAAATCTGTAACCATTTCTATGAGTGCGAGTCACAATTATTATGTTTCCATTTTGTGTGAAGCGCCGATTGAAACGAAAACAAAGCAACAAAAAATGGTGGGAATTTGTAGCAGTAGGGAAAAATTTGCGCTGCTTTCGAATGGTGAAAGCTTCGAAAAAAGCTATTGTTCAAAGCATTTAAAGCAAAAACTACGTCAAGAAGAACGAAAATTAAACAAGCGTAAAATGATTGCTTTGGAAAAAGGTGTCGATCTTTCGCAAGCAAAAAATTATCAAAAACAAAAAATAAAAGTCGCAAAAATTCGCGAAAAAATAGCCAACCAACGAACGGATATTTTAAACAAAATTACAACGGAATTGGTTTCAAGTTACGATGTTATTTGTATTGAAAAAGCCCATCACAGTAATGAGCGGCCGCCAAAACATGATCGTTCTGAACTGGCTTGGTCTTTATTTTTAGCTAAATTGTTGTATAAAGCACAATGGTATGGCAAAGAACTCATTTGTATTGAGTCAGAGGAGATCGAAACAGAGTTGTCTTTTTCTGAAAGTACAGAAAATTCAGAGTATCTTAGAAGCCAAAAAATCTTAGAACGTGGCTTGTCTAAACGAGAAACCTTATAAATAGAAGAACTGTAGGGACTACAGGGATCGCCTAGGGGATAGAAAATGTACACCATGTGTTGAACCATTTATTTCTAGGAAGTCACATTGGGACAGTCCACTAATTATTAATGATCAAAATACGAGTTCAAACGAATCTAGTGCTAGATTCGTTTTTTTTGAGGAAATATATTGACAACTAGGATAAACTAAGGTAAACTAGTGAAGTTGAGAAATGAAAGCAGAAGCACCCGCTTCTCGCCTTAGTTGAGTATATCGCTGGGCTAGATAAAGTATTCCTTATTTTTTTAAGTAAGGCAGACTGTTGGCGGGTTCTGGATAGGAACCTGTTTTTTTATTGCATTTAGCAAACAAAGCAGACTTCCGTTAGGATTTTCTCTTAAAAATTTTGGAGGTGAATGACCATAGCAAAGGATATGATGGTTAACGACGGCATTCGTGCACGCGAGTTACGTTTGATCGGACAAGATGGTGAACAATTAGGTGTAAAAACCAAAGCAGAAGCATTACAAATCGCTGAATCTGCAAACTTGGATTTAGTACTTGTAGCGCCAGGAGCGAAACCACCAGTTGCGCGAATTATGGATTATGGAAAATTCCGTTTCGAACAACAAAAGAAAGAGCGTGAAGCTCGCAAGAAACAAAAAGTGATCAACGTCAAAGAAGTTCGTTTAAGTCCAACAATTGACGTAAATGACTTCAATACAAAACTTCGTAATGCGCGTAAGTTCTTAGAAAAAGGAGACAAAGTGAAAGCTTCTATCCGTTTCAAAGGCCGTGCCATTACCCATAAAGAGATTGGTCAGAAAGTTCTTGATCGCTTAGCTGAAGAAACTGCGGACATCGCCACAGTGGAACAAAAAGCGAAAATGGACGGACGCAGCATGTTTCTAACGCTGGCACCGAAAAACGACAAGTAAACGAAGAGACCGAGCATTCGGACTTTTGGTAATTTCTACAAGAAGGATATTCGACAGTTGTGACTGTTAGAGTCTTTCACTTGAAGCAAAGATTTTGAGGAGGAAAATTAGTCATGCCAAAACAAAAAACACACCGCGGATTAGCAAAACGTGTAAAACGTACTGGTGGAGGCGGCTTAAAACGTGGCCGTGCCTTTACATCTCACCGTTTCCACGGTAAAACTAAAAAACAACGCCGTCAATTGCGTAAAGCAAGCATGGTTGCAAAAGGCGATTACAAACGTATCCGCCAACAATTAGCAAGAATGAAATAAAACAACTCGGTGACTTTTAGATTACCGTCAAGAGAAACAAGATATTAGGAGGAATTCAACATGGCACGTGTTAAAGGTGGAACAGTAACCCGTAAACGTCGTAAAAAAGTCCTTAAGTTAGCGAAAGGCTACTACGGATCAAAACATACTTTATTTAAATCAGCAAAAGAACAAGTAATGAACTCTTATTACTATGCATTCAGAGACCGTCGTCAAAAGAAACGTGACTTCCGTAAATTATGGATTGCACGTATCAACGCGGCAGCTCGCATGAATGGCTTAAGCTATTCTAAATTAATGCACGGTTTGAAATTGGCAGAGATTGATATCAACCGCAAAATGTTAGCTGACTTAGCCGTTAACGATGCAGCAGCATTTACAGCGTTAGCTGAACAAGCAAAAGACGCTTTAAGCAAATAAGCTTAAATAATCTTTCACACCCTACTCCTTGAGTAGGGTGTTTTTTTTAATAACTCCGTTGGTAACTTTCATCTATAAATGAAAAAACTTGTGAGAGCGGAATTTCTTCAGAAAGACTTAACCAATGCTCTTTATTCATATGATAGGCAGGAAAATAGCCAGGTTGGTTCTTTAATAAGGCAATCAATTCAGGCGCAAATTTAACGGTTAAAATAGTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP022059|1211631:1219548|1215790_1215991_+|WP_002355798.1|DBSCAN-SWA MPKQKTHRGLAKRVKRTGGGGLKRGRAFTSHRFHGKTKKQRRQLRKASMVAKGDYKRIRQQLARMK >NZ_CP022059|1211631:1219548|1218372_1219548_-|WP_002355804.1|DBSCAN-SWA MLFSFKKSEWLGNERNDLFAGLVSSVAILPEVIGFAIIAGVHPLSAVFASAVTLLVITFTGGRPAMVSASAGSMALVLAGLIQAHGLSYMLAATILTGFLQFILGYLGIHKLMRFIPKTVMYGFVNALAILIFMAQVQQLPHQTLWSYGMIICSILLIYLLPKFITIVPPALIVILFMTILSYFLKGHLQTVGDLGEMSQFHPAIRWPNVPVNLETLWIILPSSVALAMVGLIESLLTIPIVDKMTTSQSDSQREVKAQGFANIITGFFGGQAGCAMIGQAVINVKSGGRKRLSTLISGITLLLFIFVFKSVMVAIPTAALIGIMMTVAVDTFDWESLQLFRTFEITEIVILLVTVGVIVYTHNLAIGIILGVLLSGLLYHFFKKEPKKSC >NZ_CP022059|1211631:1219548|1217841_1218357_+|WP_002355803.1|DBSCAN-SWA MRVIVTEYQPAWVEQFEEEAQALKQILKENCLKVEHIGSTSVPNLAAKPIIDFLVIVEEIEKVDLLQGEFERIGYEYMGEFGLSGRRYLRKGPIKRTHHVHIYQFDNTQEILRHLAFRNYLRENPAIATTYGTLKKQLAQAHPDSIDKYMDGKDAFIKKIEKAALKKYWEK >NZ_CP022059|1211631:1219548|1213686_1214757_+|WP_002355796.1|DBSCAN-SWA MKALKAYKYRLYPTSKQEEFIQKTFSCVRLVYNLMLQDRIDIYKEMRKNPQQTFKMPTPAKYKKQYPVLREVDSLALANAQVYLDRAFKNFYREKGMGFPKKKKKETVHSYTTNNQHGTVKILDNRYLKVPKLKSLIKMKVHRQPLGEIKSVTISMSASHNYYVSILCEAPIETKTKQQKMVGICSSREKFALLSNGESFEKSYCSKHLKQKLRQEERKLNKRKMIALEKGVDLSQAKNYQKQKIKVAKIREKIANQRTDILNKITTELVSSYDVICIEKAHHSNERPPKHDRSELAWSLFLAKLLYKAQWYGKELICIESEEIETELSFSESTENSEYLRSQKILERGLSKRETL >NZ_CP022059|1211631:1219548|1215155_1215677_+|WP_002355797.1|DBSCAN-SWA MTIAKDMMVNDGIRARELRLIGQDGEQLGVKTKAEALQIAESANLDLVLVAPGAKPPVARIMDYGKFRFEQQKKEREARKKQKVINVKEVRLSPTIDVNDFNTKLRNARKFLEKGDKVKASIRFKGRAITHKEIGQKVLDRLAEETADIATVEQKAKMDGRSMFLTLAPKNDK >NZ_CP022059|1211631:1219548|1212689_1213646_+|WP_002355795.1|DBSCAN-SWA MAEEKKVLLEVTGLKQYFNVGRKDEVKAIDDISFHIYEGETFGLVGESGSGKSTTGRSVIRLYDPTAGEILFDGKDISKIKSKADMQAFRRDVQMIFQDPYASLNPRMKVNDIIAEGIDVNGLAKTPKEREEKVNELLKTVGLNPSHSTRYPHEFSGGQRQRIGIARALAVNPRFIICDEPISALDVSIQAQVVNLLQDLQKEQGLTYLFIAHDLSMVKHISDRIGVMHSGKLLEMGTSDDVYNFGVHPYTESLLSAIPLPDPDYERTRKRIVYQPAAADGKDRELREILNGHYVYCAEDEVAMYREKIEEKKRKAGL >NZ_CP022059|1211631:1219548|1211631_1212690_+|WP_002355794.1|DBSCAN-SWA MTMEKVLEVKDLRISFDTFAGKVNAIRGVSFDLYKGETLAIVGESGSGKSVTTRSIMRLLSSNANIDNGEILFKGQDIVHKTEKQMQAIRGKEIAMIFQDPMTSLDPTMPIGKQVAESLIKHNKVSKKEGLAQALELLKLVGIPNAEKRLKNYPHQFSGGQRQRIVIAIALICYPEVLIADEPTTALDVTIQAQILELLKDLQEKISTSIIFITHDLGVVANVADRVAVMYGGRLVEVGTAEEIFYNPQHPYTWGLLGSMPTMEGTEDKLYAIPGSPPDLLDPPTGDAFYPRNEFALKIDTEKEPPYFEVSPTHKAATWLLAPQAPKVTPPAEIVRRWAIYAERQKNPGGSN >NZ_CP022059|1211631:1219548|1216051_1216411_+|WP_002355799.1|DBSCAN-SWA MARVKGGTVTRKRRKKVLKLAKGYYGSKHTLFKSAKEQVMNSYYYAFRDRRQKKRDFRKLWIARINAAARMNGLSYSKLMHGLKLAEIDINRKMLADLAVNDAAAFTALAEQAKDALSK >NZ_CP022059|1211631:1219548|1216905_1217265_+|WP_002355801.1|DBSCAN-SWA MTLISTILVTLVAVEFFYIMYLETIVPTSETTSRVFKMDKQELQRKSVTTLFKNQGIYNGLIGAGLIYSVYFAQATMEMTKFLLIYIILVAAYGSLSSDKKIILTQGGLAIVALISLLV >NZ_CP022059|1211631:1219548|1216457_1216838_-|WP_002386182.1|DBSCAN-SWA MPSLNERKKPMTFQETISAYIQERYQITPDFPFKKHPDYLVFRHPRNAKWFALIMPLDAQLLGATENKQLTILTVKFAPELIALLKNQPGYFPAYHMNKEHWLSLSEEIPLSQVFSFIDESYQRSY |
10 | Planktothrix_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1577324 : 1585925
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP022059|1577324:1585925|DBSCAN-SWA CATGGGAAAAAAAAGAATTTATGAACTAGCAAAAGAAATGAATAAAGCAAGCAAAGACGTTGTCGATAAAGCGCATCAATTAGGTATGGATGTTAAAAACCATATGGGCGCAATTAGTTCCGAGCAAGAAACAAAGCTTCGTCAAGCATTCGGAGGAGGAAGTACCGTAAATACTCAATCAAAAGCAACAAACAACCAAAAGCAACAAACAACACAAAATAAACCAGCCAATAAGAAACCAATGAACAATAAACCTGGTGAACAAAGAAATAACCAAAATCGTCCAAACAATCAATCAACGAATGGACAACAAAGAAACAACAACAACCAAAATCGTCACGGCCAAAGCAACACACAAAACCGTAGCAATCAAACAAATACAAACAATCAAAACCGCAATACCCAAAACAATAACGGTTCTACAACGAATCAAAATCGGACCAGCCAAAATAACAATGGCGGGAACAACCAAAACCGTGGCGGCCAAAACCGTAACAACAATTTTGGTGGCGGTCAAAATCGTAATAACCGGAATAACTTTAATAACCAAAACCGCAATCGTTTCAACAAAAAAGGGAAAAAAGGCAAACATCAACAAGAATCAGCGAAGCCAGCAGTACCAGCACGTAAATTCCGTGAATTACCAGATGTTTTAGAATATACAGAAGGTATGAACGTGGCAGATATTGCGAAAAAAATCCACCGCGAACCAGCGGAAATCATCAAAAAATTATTTATGATGGGTGTCATGGTTAACCAAAACCAAGCCTTAGATAAAGATACAATTGAATTATTAGCTGTGGACTATGGCATGGAACCGCAAGAAAAAGTCCAAGTTGATATTGCGGACATTGATAAATTCTTCGAACCGGAAGCAGTTGTTGAAGAAAACTTAACTACACGTCCCCCTGTTGTCACAATCATGGGACACGTAGACCACGGGAAAACGACATTATTAGATACATTGCGCCATTCTCGTGTGACTTCAGGTGAAGCGGGCGGTATCACGCAGCATATTGGTGCCTATCAGTTAGATATTGATGGCAAACCAATTACGTTCTTAGATACACCAGGACATGCGGCCTTTACAAGTATGCGCGCACGTGGTGCCAGCATCACTGATATTACCATCTTAGTTGTTGCAGCGGACGATGGAGTAATGCCACAAACAATCGAGGCGATTAACCATGCGAAAGCGGCAAAAGTGCCGATTATTGTAGCAGTTAACAAAATTGATAAGCCTGGTGCAAATCCTGATCATGTGAAACAAGAATTAAGTGAACATGAATTAATTCCTGAAGAATGGGGTGGAGATACGATTTTCGTCAATATTTCAGCGAAATTCAATCAAAACATTGATGAGCTATTGGAAAATATTTTATTGATTGCTGAAGTAGAAGACTTAAAAGCTGATCCAACGCAAAAAGCAATTGGAACAGTGATTGAAGCGCGCTTAGATAAAGGTAAAGGTCCGGTTGCGACATTACTCGTTCAACAAGGAACTTTACATGTTGGTGATCCAATCGTTGTTGGTAATACTTACGGACGTGTTCGTGTGATGACCAATGACATGGGCCGCCGTGATAAAGAAGCAGGACCCGCAACTCCTGTAGAAATTACCGGATTAAATGATGTTCCTCAAGCGGGTGATCGTTTTGTGGTCTTTGAAGATGAAAAAACAGCACGTCAAGCAGGGGAAGAACGGGCTAAACGTGCGTTGCTTGAACAACGTTCAGCAAGTAGCCGTGTGACATTGGATAACTTATTTGAAAGCCTAAAAGAAGGCGAATTAAAAGAAGTTAATATCATTGTCAAAGCAGACGTACAAGGATCTGCCGAAGCCGTTTCAGCAAGTTTACAAAAAATTGATGTAGAAGGCGTTCGTGTGAAAATTGTTCACGCGGCAGTTGGGGCCATCAATGAAAGCGACGTAACTTTAGCCGCAGCAAGTAATGCGATTATTATCGGCTTTAACGTTCGCCCAACACCACAAGCGAAACAACAAGCAGAACAAGAAGAAGTTGATATTCGTTTACACCGTATTATCTATAAAGCCCTAGAAGAAATCGAAACAGCGATGAAAGGGTTATTAGATCCAGAATTTGAAGAAAAAATTACGGGTCAAATGACGGTTCGTGAATTGTACAAAGTATCTAAAGTTGGCACAATCGCTGGCTGTTATGTTACAGAAGGCTTTATTCGCCGCGATAGTGGCGTGCGTGTCATTCGTGATGGTATTGTTATTTATGAAGGTAAATTAGCAAGCTTGAAACGCTTTAAAGATGACGTGAAAGAAGTCAAACTTGGTTTTGAATGTGGCGCTATGATTGAAAACTTCAATGATTTACGTGTAGATGATGCGATTGAAGGCTTCATTATGGAAGAAATCAAACAATAATTTTAGTAATTGGAGGAAGACACTATGGCAAATTATCGTGACCGTCGTGTAGGTCAAGAAATCATGCGTGAAGTGAATGATTTCTTGAACAAACGCATCAGAGATCCACGCGTCCAAGGCATCACTATTACAGATGTTCGTGTGACCGGTGATTTACAACAAGCAACGATTTATTACAGCTTGTTATCTGATTTAGCTTCCGAACAACAAAAAGCTCAACAAGGCTTAGACAAAGCCAAAGGACTGATTCGTAAAGAATTAGGACAACGGTTAACCTTGTATAAAACACCAGAGTTGATTTTTGAAAGAGACGAATCTGTCCAATACGGAAATCACATTGATGAGTTGATTCGTAAGTTGAATCAAGGTGAATAATTAAAAAGAAAAAGCACACCAGACGAATGGTGTGCTTTTTCTTTTCATGATTTCTTGATAAAATAGTCATGGAGGTGCAAAGATGAAAAGAATTGTTGCTTTCTATAAAAATGGAGATCGTTATTTAAAAGAAATGGGTTCAGGCAAGAGTTCCCTGTACTTTTTTCTTTTCTTCTTTGTACTACATAGTATGCGGGAACATATTATTCAGTTCATCGGATTTTGGCCGTCATTTATATTCGTCCTCATACTTGTCCCAAATCTTATGCTTGGCGTCGGACATATTAACCATTGGTACAAAAACCGCTCTTGAATTTTCCAGAATACTTTTAAGCATGGAACAAAATCCTTATTGATTTTGTTCCATGCTTTTTAAGTTAACCCAGTATTTAATACCATCACAGAATAATCCCTAAATTCAAAAATCCGTCCTTTATAAAGATAAGTGGCGCCATACTTTTGTCGATAGTACGTAATCACATTTTTTAATGTTTCAACATCGATTTCCAAAAATTCAGCACAAGAATAATGGTTACTTAAGCCAGCTTCAGAGCAACGAATTAAATCGTCTAATGTAACTAATTGCTCTAAGGCCACATTGCGAGCTTTCAACTCTTGCTTCCGATTTTCTGTACAATTTTGATTTAAAATAGTGCCAACGGATGTTTGATAATGCCCGTATTCCTCGGCTAAAATGTTCTTCTTTTGACGGGTACTCAATGTTTTTTCAATATAAATTTTGCCATTTCGATACAACCCATAACAACCTGTTTGATTGTATAAATCAATTTCTAAAACCGTCACATCCTTTTGAATGGAACTGACGAGTTTTTCATAATCATTCACTTTACCATTCACCTGCCATTACTTAATAAAAAGAGTAGATGGGAAGTTAATCCTCTTTTTTGTCAGAAGAAATCGATTGTTGATATTTGGCATCAATTTCATCCAAGTAATCGTGAATTTTCTCGATTTCTTCTTTTGAAAATATCTTTTCTGGATCCCCAGCGTGGGCAGCCAGTGTCATTTCGTCACGGCGAGGGAATGAGAGAATTTCTGCTTGCGTTTGTTGTTCGTGTAATTGTTGTTCGGCAAATTGATAAACGATGGCTTGTCGTTGGGGCTCTAATTTTTTATAAATGCGGTCGATAGTTGAGGCATTTTTTTCCATGGGAACTTCTTGTCCCATCAACCAGGCCTCATTAATGTCTAATGCATCTGCAATGCGATAAACTTTGTCTTGTTTTGCTTCGTAACGACCAGCTAGCCAATCGCTGATCGAAGATTTACCGATGCCAGTTTTTTTCGCTAATTCACTAGGTTTGATGTTCTTGGCTGTTAAAGCTTCTTTTAAACGGATAGCAAAAATGTTCATATTTCCGAACCTCCTATTGCCTCAAAGTATACTATACCTGTTTAGAGAAGGCAAGTAACAATCGCAATTAAAATTAGCGGTTCATAAAACCGAACTTATGAGTTGACAGTGAAAATATTTGATGCTAAGATAGAGCCATTCGAATGTTCGGTTAACTGAACTATTTTTTTGAACACTTCGTTCGGAAAACCGTATTTTTGTAGAAAGGGTGAAGAAATGAGTCGGAATTATAAAAAAACGTTGTCGGATATGTTACTTTTAGCAATTATTTTATTAATAAGCAGTGTCTCAATAAAAATTGGAGCCATCGTGATTGGTATGATTGGCCTCATGGAATTACTAACAGAATAACAATAATTTAGTCAAAAGGAGAGAAGCGGATTGGCAGAACGACGCATGTTTGCAAAAACGATTATTGATAGTGATGCGTTTTTAGATATGCCCTTATCAAGTCAGGCCCTGTATTTTCATTTAGCGATGCGTGCCGATGATGATGGATTTATCAATAATCCCAAAAAATTGCAGCGAATGGTCGGTTGTGGGGAAGACGATCTAAAATTGCTAATGGTTAAAAAATTTATTCTAGTATTTGAAAGCGGTGTGATCGTTATCAAACATTGGAAAATTCATAATTATATTCGCAGTGATCGTTACAAACCAACCTTGTATCAAGAAGAGAAAAATCAGATTGTTGAAAAAAATAGCAAAGCTTATACGTTTAAAGCAGAATCGTCTGTCAGTGGTCAACCAGCTGACTACCAACGGTTACCACAGGAAAGCATAGTCCAGTCTAAGTTAGGTCAGAGTCAAGGTAGTAGTTCAGAAAACGATTGTTTAAAGATGATTTATCATTTTTATGAGGAAAACGGCTTTGGTACACTGGCCTCAAAAACAAGCCAAGATTTTAAGTATTGGTTGCAAGATTTTATGCAAAAAGGGGCTAGCCAAGAGGAAGCATGCCAATTAATCTTGCATGCTTTAGGAATTGCCATCGATCGAAATAAACGGAATTATGGCTATGTAAATGCTATTTTGAAAAGTTGGGAGCAACAAAATTATTTATCCGTACATGAAGTTCTGGTAAATGATAAAAAACAAGTGTCGGAGCATGCGCCGCAAATGACAGAAGAATATCAAGAGTTAGGTTTTTAAAGAAAGGAGGAAATCAGTATGCATGCGACAGATCAAACTTTTCAAATACTATTGAGTCAATTGTTAGAAAAAGTTGAAGACCGTTGTCCTGAATGTGGCAGTGAACAATATGTTTGGCAACAAAAAAATAAAGATGGCACAGAACGTTGTGCCCCAACTTGTTGGTCGTGTGGGTATAAAATGCTAAAAAAACATGAACAAGAAGCCACTCAACAACGTTCTCAAGAGAGTTTTATGGCACGTACACAAAAATTTTTTCATCAAGGGTCCTTAATTGCTGATGATGCGCTACGGCAATGTCGCTTAACCAATTACCAAACCACTGAATTAGAAACAAGACAAGCAAAAGAACGGGCCTTAGCAGCAGTTTCAGCGATTGTTGAAGGAAAGCCAATCCACGTTATTTTTTCAGGGAAACCTGGTGTTGGTAAAAGTCATTTGGCTATCAGTATTTTAGTTGAAGTCTTAGAACGCTCTGCATATCAAAAGTATTGTTTATTTGTCAGCTACTCTGAGTTATTAGAAAAACTAAAAATGTCCATGAATGAATCGGCCAAAAGCCAAGCAAAGGCTCAAGCGTATATTACTAGAATGAAAAAAGCAGACGTTTTGGTTTTAGATGATTTAGGTGCTGAATTAGGAATTAAAAATAAAGTTAGTACGGATTTTAATAATGACATCTTAAACCGAATTTTAGAAGGTAGACAGAATAAAGCAACTATTTTTACTACTAATTTTTCTGGAAAACAACTGGTGGAGGCCTATGGAACACGCATTATTTCTCGTCTAATGAAGCACGCCAGTGGCTATGTTTTCCAATACAAAGACACAACAGACAAACGAATGAGGAGTGTGAAATAAATATGTTAACAATTATTATTGGGTTTATCTTTTGGACAATGACACTAATGTTAGGTTATCTAATTGGTGAAAGAGAAGGCCGTAAACATGAGTAATTTAACAAAATGTAAAAAAGATTTATTTGAAATGAAAAGCGTTGTATTTAAAGATATTTCAAAGCAACAAAGCGAAAAAGCACAAAAAAGAAAACGACTCTTACAACTAATGAATCAATATCCCGATTGGGCAAGTCAAAAAAATAAACTTATTATGCAGGAAATTCAAGAATTAGGACAAGCAATCGGTAATTGGTCGATGGATCAATCAAGACCCATCCAATCCATCAAGGCCACATCGTTTACAAAAAGCGAGTATCTCTATTTAATTTGGCTCGGTTATTCAGATGAAGCGATTCGTCACGGCTTAGACATGTCGAAAGAGTGTTATTTTATTTATCGATTAACACTTTTAAATGAATAAAAGTAAAGGAGATTAACCAATGCGTACGTCAACATTTAATTATATCAAAGATATTTTAGCAGACTTTTATAAAACAGATGAGTATATCCAGCAACGGGAAGAAGAATTACGGCACCCTTATCAAGAAGCAGATTTAAATGCTGGTATTAGAGGACAAGGACTTCACTCTGTAGTGACCGAACGAATGGCGATTACGATAGCTATGGATCGTCGTCTGTGGAACTTAGAGAGAAATCGAGACATTATCAAAAATTGTTTAGCTGAAGCGGATGAACAAACGCGCGTGATTATTGAAGAACTATATATGAAAAAACGGCCCTCTTTAACATTAATTGGACTTGCCCAGCAATTATTTATTAGTAAAAGCCAAGCCTATAAATTAAGAAATCATTTCTTTGAAGCGGTGGCGGATGAACTAGGGATGTAAACATGGAAAAAGCGTGGAATTTTTTCAGGTGTCAACATGGTAAATTAATAGTGTCGAAAGAGATAGATAAACGTGAGGCAACCAAAAAAATGAAGACACGGAATTCTATGATTTTGACTGCTTTCTTGTGTCAGCTATGAAGGAGCAGAAAATGCCGGCTACTTTCAAGATCCTTCATTTTGACTAGAAGAGAGCCAATTTGTTAACCAATCCTGAATTTTTTGAATGGAAAGGTGGCGCTAAAAATGAATGAAGCGGAACAAGAGTTATATGAAGCCCTTGTTGCAATCTGCCAGACGTCAGGATTTTTGTTGCTAGAGGAACTGCCGACAGATTTACCAGATCAGCCATTTGTTTACTTAGGTGATAGTAAAGAATTACCTAAGCCAACTAAATCAGCTATTTTGGGTGAAATTGAATTAATAATGCATGTTTATGGTGCGTTATCTGAACGACAACAAATTTCTACAATTAAAGGAACGATTTTACGGCAGGCAACCAGTAACTTAAAACGAACGGCTCATTTTAATTGGGGTATCAAACATCAAGAAGTCAAAGCACAAATGGTAAAAGATACCAAACAAATGAAAAAAACAATTTGGCATGCTGTACTACCATTACACATGCAATTTTACTAGGAGGAATTATCAATGGGAGAAGTTATGCAAGGAAAAGACCGTATTTTATTAGTTCGTCGCTTGGATGAAGCAGCGACAAAGAAAGCAATGAAACCCTTATTTCAAATTGAACATGAATGGGAATTCTCACGTGAATCGAGCGGTACGCAAACAAAAGATGGCGTTGCGAATGCTGTTTCTGGTTTAGAAGTTACGTTATCGTTAAGCGGTTTAGCCTCTCGAGATGATGAAAATTTATACATGAAAGACGCAGTTGAAGATGGCATCTTAATGGAATTTTGGGATGTTGATTTAAAAGGTGAAAAAAATGCGGAAGGTAAATATCCAGCAATTTATGCCCAAGGTTATGTAAATTCATGGAGTTTACCAGCCAATGTAGAAGAATTAGTAGAAATCGAAACAGAAGCCTCTATTAATGGCAAACCACAAGATGGTTTTGCAACAGTAGAAGCAGATATTATTGCAGAAGCACAATATGCGTTCCAAGATACCGTTCCAGATAAAGCACCACAACCTGGCGCATAATCAAAAAGTGTTGAATTTTAGGAGGATAAAAAATGAATTTAGAGATTAACGGAAAAACAATTGAAGTGAAATTTACGATTGGCGCGATTCGTGAATTAGATAAACGTTACCAAATTGAAAATGGCGCTGCCAAATTCGGCATGGGCATCAGTTCAGCAATGATTTATTTACGCCAATACAATCCAGTAATCTTAGTTGACATCATGGAAGCTTTACAAAGTGGGCAATTAAAAATAGGTAAGTCGGAAATTGAAGCATGGTTAATGACCCAAGATGTCAAAAAACTTTCAGATGATTTGCTTAAAGAAATGGGAAAGCAACCTCTTACAAAACCAATGATCGATCAGTTCAGCAAAGAAGCGAAGAAAGCAGAAGCGCAAGCGACCAACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP022059|1577324:1585925|1585565_1585925_+|WP_002357848.1|tail|DBSCAN-SWA MNLEINGKTIEVKFTIGAIRELDKRYQIENGAAKFGMGISSAMIYLRQYNPVILVDIMEALQSGQLKIGKSEIEAWLMTQDVKKLSDDLLKEMGKQPLTKPMIDQFSKEAKKAEAQATN >NZ_CP022059|1577324:1585925|1580468_1580954_-|WP_002382232.1|DBSCAN-SWA MNGKVNDYEKLVSSIQKDVTVLEIDLYNQTGCYGLYRNGKIYIEKTLSTRQKKNILAEEYGHYQTSVGTILNQNCTENRKQELKARNVALEQLVTLDDLIRCSEAGLSNHYSCAEFLEIDVETLKNVITYYRQKYGATYLYKGRIFEFRDYSVMVLNTGLT >NZ_CP022059|1577324:1585925|1582641_1583484_+|WP_002381951.1|DBSCAN-SWA MHATDQTFQILLSQLLEKVEDRCPECGSEQYVWQQKNKDGTERCAPTCWSCGYKMLKKHEQEATQQRSQESFMARTQKFFHQGSLIADDALRQCRLTNYQTTELETRQAKERALAAVSAIVEGKPIHVIFSGKPGVGKSHLAISILVEVLERSAYQKYCLFVSYSELLEKLKMSMNESAKSQAKAQAYITRMKKADVLVLDDLGAELGIKNKVSTDFNNDILNRILEGRQNKATIFTTNFSGKQLVEAYGTRIISRLMKHASGYVFQYKDTTDKRMRSVK >NZ_CP022059|1577324:1585925|1577324_1579721_+|WP_002357859.1|DBSCAN-SWA MGKKRIYELAKEMNKASKDVVDKAHQLGMDVKNHMGAISSEQETKLRQAFGGGSTVNTQSKATNNQKQQTTQNKPANKKPMNNKPGEQRNNQNRPNNQSTNGQQRNNNNQNRHGQSNTQNRSNQTNTNNQNRNTQNNNGSTTNQNRTSQNNNGGNNQNRGGQNRNNNFGGGQNRNNRNNFNNQNRNRFNKKGKKGKHQQESAKPAVPARKFRELPDVLEYTEGMNVADIAKKIHREPAEIIKKLFMMGVMVNQNQALDKDTIELLAVDYGMEPQEKVQVDIADIDKFFEPEAVVEENLTTRPPVVTIMGHVDHGKTTLLDTLRHSRVTSGEAGGITQHIGAYQLDIDGKPITFLDTPGHAAFTSMRARGASITDITILVVAADDGVMPQTIEAINHAKAAKVPIIVAVNKIDKPGANPDHVKQELSEHELIPEEWGGDTIFVNISAKFNQNIDELLENILLIAEVEDLKADPTQKAIGTVIEARLDKGKGPVATLLVQQGTLHVGDPIVVGNTYGRVRVMTNDMGRRDKEAGPATPVEITGLNDVPQAGDRFVVFEDEKTARQAGEERAKRALLEQRSASSRVTLDNLFESLKEGELKEVNIIVKADVQGSAEAVSASLQKIDVEGVRVKIVHAAVGAINESDVTLAAASNAIIIGFNVRPTPQAKQQAEQEEVDIRLHRIIYKALEEIETAMKGLLDPEFEEKITGQMTVRELYKVSKVGTIAGCYVTEGFIRRDSGVRVIRDGIVIYEGKLASLKRFKDDVKEVKLGFECGAMIENFNDLRVDDAIEGFIMEEIKQ >NZ_CP022059|1577324:1585925|1584591_1585008_+|WP_002382237.1|DBSCAN-SWA MNGKVALKMNEAEQELYEALVAICQTSGFLLLEELPTDLPDQPFVYLGDSKELPKPTKSAILGEIELIMHVYGALSERQQISTIKGTILRQATSNLKRTAHFNWGIKHQEVKAQMVKDTKQMKKTIWHAVLPLHMQFY >NZ_CP022059|1577324:1585925|1579745_1580096_+|WP_002357858.1|DBSCAN-SWA MANYRDRRVGQEIMREVNDFLNKRIRDPRVQGITITDVRVTGDLQQATIYYSLLSDLASEQQKAQQGLDKAKGLIRKELGQRLTLYKTPELIFERDESVQYGNHIDELIRKLNQGE >NZ_CP022059|1577324:1585925|1580178_1580409_+|WP_002393873.1|DBSCAN-SWA MKRIVAFYKNGDRYLKEMGSGKSSLYFFLFFFVLHSMREHIIQFIGFWPSFIFVLILVPNLMLGVGHINHWYKNRS >NZ_CP022059|1577324:1585925|1583962_1584370_+|WP_002357851.1|DBSCAN-SWA MRTSTFNYIKDILADFYKTDEYIQQREEELRHPYQEADLNAGIRGQGLHSVVTERMAITIAMDRRLWNLERNRDIIKNCLAEADEQTRVIIEELYMKKRPSLTLIGLAQQLFISKSQAYKLRNHFFEAVADELGM >NZ_CP022059|1577324:1585925|1583550_1583943_+|WP_002357852.1|DBSCAN-SWA MKEKAVNMSNLTKCKKDLFEMKSVVFKDISKQQSEKAQKRKRLLQLMNQYPDWASQKNKLIMQEIQELGQAIGNWSMDQSRPIQSIKATSFTKSEYLYLIWLGYSDEAIRHGLDMSKECYFIYRLTLLNE >NZ_CP022059|1577324:1585925|1580988_1581471_-|WP_002357856.1|DBSCAN-SWA MNIFAIRLKEALTAKNIKPSELAKKTGIGKSSISDWLAGRYEAKQDKVYRIADALDINEAWLMGQEVPMEKNASTIDRIYKKLEPQRQAIVYQFAEQQLHEQQTQAEILSFPRRDEMTLAAHAGDPEKIFSKEEIEKIHDYLDEIDAKYQQSISSDKKED >NZ_CP022059|1577324:1585925|1585020_1585533_+|WP_002381948.1|tail|DBSCAN-SWA MGEVMQGKDRILLVRRLDEAATKKAMKPLFQIEHEWEFSRESSGTQTKDGVANAVSGLEVTLSLSGLASRDDENLYMKDAVEDGILMEFWDVDLKGEKNAEGKYPAIYAQGYVNSWSLPANVEELVEIETEASINGKPQDGFATVEADIIAEAQYAFQDTVPDKAPQPGA >NZ_CP022059|1577324:1585925|1581867_1582623_+|WP_002392532.1|DBSCAN-SWA MFAKTIIDSDAFLDMPLSSQALYFHLAMRADDDGFINNPKKLQRMVGCGEDDLKLLMVKKFILVFESGVIVIKHWKIHNYIRSDRYKPTLYQEEKNQIVEKNSKAYTFKAESSVSGQPADYQRLPQESIVQSKLGQSQGSSSENDCLKMIYHFYEENGFGTLASKTSQDFKYWLQDFMQKGASQEEACQLILHALGIAIDRNKRNYGYVNAILKSWEQQNYLSVHEVLVNDKKQVSEHAPQMTEEYQELGF |
12 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2156834 : 2209325
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP022059|2156834:2209325|DBSCAN-SWA CTTATTCGTCAATGGCTGTTACATCAATGTTTAATTCAAACAATTGTAATGGAGAAACTAAACTTGGTGCGTTGTTCATTGGGTCAATTGCTTTCCCGTTTTTAGGGAAGGCAATCACTTCACGAATATTTTCTTCCCCAGCCAATAGCATTGCTAAGCGGTCTAGCCCTAAAGCAATCCCTCCATGTGGCGGGAAGCCGTAATCTAATGCGTCTAGCAAGAAACCAAATTGGTCTTGTGCTTCTTCTTTTGTAAAACCTAACGTTTCAAACATTTTTTCTTGTAATTCTCGTGTATGGATCCGTAATGAGCCGCCACCTAATTCGTAGCCGTTTAAGACAACATCGTAAGCTTCCGCATACACAGAGGCTGGGTCTGTTGCTAAGCGGGCCACATCCTCTGCTTTTGGTTGTGTAAATGGATGATGAGCAGAAACATAGCGGCCAGCTTCTTCATCATATTCAAACAACGGCCAATCCACAATCCATAAGAAATTGAATTTCGATTCATCAATTAAACCTAATTCTTTACCTAAACGTGTACGTACCGCACCTAAAGCAGCGGCTACGATTTCAGGTTTATCGGCACCAAACATTAAAATATCACCGACTTCTGCATTGGTAGCAGCAATTAATTCATCACTAACTTCTGTTAAGAATTTAGCAATTGGTCCTTTTAAGCCATCTTCTTCAACTTTTAACCAAGCTAAGCCTTTTGCGCCAAATTGACTCACATACTTACCTAAGTTATCCATATCTTTACGAGAATACTTATCTGCGGCGCCTTTTGCATTCAAAGCCTTCACATGTCCGCCATTTTCCAACGCTGCTTGGAAAACTTTGAAGTCTACGTCTTTCACTACCTCTGCAACATCAATTAATTCCATAGCAAAACGAGTGTCGGGTTTATCGCTACCATAGCGTGCCATTGCTTCGTCATAGCTCATTCGTGGAAACGGAACAGAAATCTCAATTCCTTTTGTCTCTTTCATCACTTCAGCCAACATATTTTCTGTATATGTTTGAATTTCTTCTGGTGTTAAAAAGGTCGTTTCGATATCGATTTGTGTAAATTCTGGTTGACGGTCGCCTCGTAAATCTTCATCACGGAAACAACGAACGATTTGGTAATAGCGATCGAAGCCTGCTCCCATTAATAATTGTTTAAAGAGTTGTGGTGATTGTGGTAAAGCATAAAAATGACCGGCATGGACACGAGAAGGAACCAAATAATCGCGAGCGCCTTCTGGTGTTGATTTGCCTAAATAAGGAGTTTCAATGTCTAAAAAGTCATGATTATCTAAATAGTGACGGATTGTTTTCGTTACTTGGTGACGTAATTTAATGTTGTTTGTCATTGATGGACGACGTAAATCTAAATAACGATATTTCATGCGCAATTCGTCATTAACGTTATTGTCATCTTCAATGGTAAATGGCGTTGTTTTCGCAGTATTTAAAATCGTAATGTCAGTCGCCATCACTTCAAACTCGCCAGTTTTCATTTTGGGATTAATCGCTTCTTTATCACGATAAACGACTTGACCTTTAACTTCGATGACGTATTCACTACGACATTTATCAGCAATTTCCCATGCTTCTTTTGACTTTTCTGGGTTAAAGACCACTTGGACGATTCCTTCACGGTCACGTAAATCAATAAAGATAACCCCTCCTAAGTCACGACGTTTTTGAACCCATCCTTTTAATACAACTTCTTTTTCAATAAATTCGGCAGATACATTGCCGCAATAGGTTGTGCGTTTTGCCATTTCTCAATCTCTCCTTTTTATTCTTCAATCATTTTTGTCATCATTTCGTCATACACTTCATCAAATGAATCATGGATAGCACTTAACGGGAAGGCTTTTTCTTCGCGTGTTGCCATTGATTTTACGTTGACAATGCCTTCATTCAATTCATTTTCACCGATTGTTAAAACTAATTTTGCTTGTAATTTATCGGCCGTTTTAAATTGCGCTTTTGGTTTGCGATTCATGTAATCACGATCAGCTGAGAAACCAAAGTTACGAATGCTTTGAACAAGTTGCAAAGCTGCGATGTTGGTTTCTGAACCAATCCCAACCACATATGCGTCTAATTCAGATAACGCTGAAATCACAACTTCTTCAGCTTCCATTGTTAACAACACTCGCTCAATGCCCATACCAAAACCAAAACCTGGTGTGTCTGGGCCGCCTAATTCTTCAACTAAACCATTGTATCGGCCTCCTGCACAAATAGTTGATTGCGCCCCCATTTTAGGCGCTTCACTCATAATTTCAAAAATTGTGTGTGTATAATAATCCAAGCCGCGAACCATATTACTATCAATTTCATAAGGAATTTCTAGTAAATCTAACATATCAGTTACTGCTTCAAAATGTGCTTTAGATGGTTCATTTAAATAATCTAAAATGGAGGGCGCTTCTGCGACAATCACCTTGTCTTTTTTATCTTTGCTGTCTAACACCCGCAATGGATTTTCGTGTAAGCGACGTTGTGAATCCTCGCTTAATTCTGCCATATGGGGCTCTAAATAATCGATTAATGCTTGACGGTACGTAGCACGTGTTTCTTTATCCCCCAAGGAATTAATAACTAATTTGATTTGTTGGATGCCTAATTGTTTGAAGAAGTCCAAAGCCATAGCCATGATTTCAACATCCAATGCTGGGTTTTCACTACCAAATGCTTCCACACCAATTTGATGGAATTGACGCAAACGACCAGCTTGTGGGCGTTCATAGCGGAACATCGGCCCCATGTAATAGGTTTTATATGGTTTCGTATATTCCGGACCATATAATTTATTTTCAACGAAGGCCCGAACAATTGGCGCTGTCCCCTCAGGACGTAGCGTCACGTGACGATCTCCTTTATCATAAAAATCATACATTTCTTTTGAAACAATATCTGTAGTATCGCCAACACTGCGAGATATTACTTCATAATGTTCAAAAATCGGGGTTCTGATTTCTTGGTATTGATAATCTTTAAAAATCAAACGAGCTGTTTCTTCCACAAATTGCCATTTTTCAGAAGTTCCTGGCAAAATATCGTTTGTTCCTTTTGGTTTTTGATAACTCATTGTCTTTCTCTCCTTCTATCATTCCACAAAAATGTGTGCGCCATTTTCTTTTTTCTAAAAATGAAAAAAGCCCTTGTATGTTGAACATACAAGGGCGTAAAAGTCTCTTTTACACGGTACCACCTAGTTTTGAAAGATTTTACTCTTTCCTCAACGATTAACGCTCGTAACGGGACGGCTTTTCTTCCGTCCATCTCCAGAATGTCTTTCACTTTCACTGTTGAAGTTGCTCTCAGCCACGGCAACTCTCTCTTCGCAGACAGATGAAACTTACTCGTTCCTTCGTAGATTTTTAATATTATCTATAAACTACTAAAGTTCTCTTAGAAAGTCAAGAGGTTCCGATAGGAAAATCAATTATTTTTCTCGTGTATCGATCACAATGGTCACTGGACCATCATTGGTCAACGACACTTGCATATCCGCGCCAAATTCTCCTGTGGCTACCGCTATTCCTTCTGCTTCTAATTGTTGATTAAATAATTCATACAAAGGAATCGCCACATCTGGACGAGCCGCTTCAATAAAACTGGGACGATTGCCTTTTTTAGTTTTTGCATAGAGGGTAAATTGAGAGATACTTAGAATTGATCCTTCAATCTCTTGAATGCTGCGATTCATTTTTCCTTCGTCATCTTCAAAAACACGCAATTTACTGATTTTGCCAACAACATAAGCCACATCTTCTGGCGTGTCTTCTTGATGAATGCCCACCAGCACCATGAAGCCTTGTTTGATTTGTCCCACTATCTGCTCTTCTATCGCAACTTGTGCTTGACTGACTCTTTGAATAACTACTTTCATCTTTTTTGCCTCACTTTTAACACTTACCCATTGGTTCGACGAACACTATAAACATCTGGTACACTTTTAATTTTGTCAACGATGGTTTTTAAATGAGAAAGGTTTTGAATTTTCACAGTAACATGAATCTGGGCCATCTTATCTTTGGATGGACGAGCTTCAACGCCGACTAAATTTTTTGTCATCGAACTAATGACTTGTAAAACATCACTTAGTAAGCCACTACGATCATAGCCGTAAATCTCCAAATCGGCAGCGTATTCTTTGCGACTGTGCTCGGTATCTTCCCACTCAACTTCAATTAGACGTTGTGCTAGTTCTTCTTGATGTTGTACGTTAGGACAGTCCGCACGATGAATTGAAACGCCACGTCCTTTGGTAATGTAACCAACGATTTCATCACCAGGCACTGGATTACAACAGCGGCTTAAACGAATCAATAGGTTGTCCACCCCTTGAATCACGATGCCGCCTTCATGACGAACTTTCATTTTTTCTGATTCTTTTTTAGCTGGCTGATTTAGCAACTCTTCCGCTTCTTGACGTTGGCGTTCCAACTCTTGTTCGCGGCGTTCTTTTTCTGTTAAACGATTGCACACTACTTGCGCACTTACTTCGCCATAACCTACTGCCGCAAATAAATCATCTTCCGTTTGAAATTTAAATTTATCTAGCACTTCCGCCATTTTATTCTTCGTTAAAAATTCTTTCGGTGTAAAGCCGATTTCTATCATGTATTTAATGACAGCATCATGCCCTTTAATAATGTTATCTTCACGGTCTTGTTCTTTAAAGAAACGTTTGATTTTATTTTTGGCTTTACTTGTTTTAACCATTTTCAGCCAGTCGCGACTAGGTCCGAAAGAATTCGGTGATGTTAGGACTTCAATAATATCCCCATTTTTTAGGACATAGTCTAACTGTACCATTTTGCCGTTGACCTTCGCACCGGTTGTTTTATTCCCAATTTCAGTATGGATACTGTAAGCAAAATCTAGTGGTCCGGAGCCTTTTGGCAGTTCGGTTACATCTCCACTTGGCGTAAAGACATAGACTTTGTCGCTAAAAATGTCTTCTTTCACACCTTGCATAAATTCAGAAGCATC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62 | Enterococcus_phage(38.24%) | holin,head,portal,integrase,tail,terminase,capsid,tRNA | attL 2172237:2172255|attR 2209381:2209399 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2273233 : 2380011
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP022059|2273233:2380011|DBSCAN-SWA 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119 | Enterococcus_phage(73.44%) | holin,head,portal,integrase,tail,terminase,capsid,tRNA,protease | attL 2319423:2319449|attR 2360400:2360426 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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