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DBSCAN-SWA_1 |
1210059 : 1227137
Sequences of DBSCAN-SWA_1
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022133|1210059:1227137|1210059_1211694_-|WP_088768100.1|DBSCAN-SWA MTTSPHSNTQKSYDYIIVGAGSAGCTLANRLTESGKYSVLLLEAGASHGGLFSDMPSGFARFMHSRKFNWLYRAEKEPHLTSAKGSYTPRGKMLGGSSGINAMIYTRGLASDYDHWVALGNRGWGYNDLLPYFIKSENNSRGANAYHGAEGPLHVSDVTPYYCVSRQFLSACQEYGLPRNTDFNGAQLEGHGPYQFTMKDGKRCSTYHAYLKPALHRTNLTVLTDSLTERVLFCGKTATGIAYQRSGESYIAMANKEVILSAGTFNSPQILMRSGVGPANEIENAGINLVHELPGVGKNLQEHVDISLHYKNKAKDGLTLTPWNLLKLSVPFLKYLFTGKGQLAHSIAEVGAFYRSSEAVNEPDIQVHLLPVMFNDSGYDWLPTLVNGFTCHVCLLRPKSRGQVQLNPDSPMGKPTITYGFLKEKDDQQALLHGIKKAFEIMKQPALAKHNGGRLFPTEGATNDSLLLEEIKSRTGLIYHPVGTCKMGPDNDSEAVVDASLKAHGIKRLRVVDASIMPTVISGNTNAPTIAIAEKSADLIKADA >NZ_CP022133|1210059:1227137|1218922_1219183_-|WP_088768105.1|DBSCAN-SWA MTKTFKVKVNGGPELAVDATEGTLLETLEKHQLEMHYHCRSGFCGACRTKLKSGQVRYTTEPLAYVRKGDILPCCCVPESDLDIEH >NZ_CP022133|1210059:1227137|1211671_1213111_-|WP_088768101.1|DBSCAN-SWA 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12 | Catovirus(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1372945 : 1415039
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022133|1372945:1415039|DBSCAN-SWA 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41 | uncultured_Mediterranean_phage(12.5%) | integrase,tRNA,transposase,protease | attL 1390296:1390351|attR 1425089:1425144 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1487415 : 1495721
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP022133|1487415:1495721|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP022133|1487415:1495721|1489134_1491711_+|WP_088769378.1|DBSCAN-SWA MPDFSEKHIQSHTPMMQQYLRIKAQHTDMLLFYRMGDFYELFFDDAKRSAELLDISLTARGQSNGEPIPMAGVPYHAVENYLARLVNLGESVAICEQIGDPATSKGPVERKVVRIVTPGTVTDESLLTERQQKLLVAISALKDDLYAISSLELSSGRFWLTQANSHEQLAAEMQRLEPAELLYPDTMSLAGLPLAKANCKRRPTWEFEQTTAFELLTRQFATQHLEGFGLKADEPTLGAAGAILHYVKETQRSALPHIQSIVTEHPSDALILDAATRRNLELQQSLGDANTHLSAVLDKTASAMGSRQFQRWLQRPIRNQYALNKRYDAVAALLENNAYEPLQTSLKSLSDIERIVARVGLRTARPKDFARLRDSLKQLPDIKSQLKHRSLNQLNEAILLFPEVVDRLERAVIDNPPLLIRDGGVIAEGYDSELDDLRDLATGATDYLHQLEQRERQQTGITTLKVGYNKVHGYFIEVSRQNAELVPDHYQRRQTLKNTERYIVPELKEHEDKVLNAQARSLAREKWLYDQLFEQLMPYVADLQRTASALAQLDTLSCFAQLANNWDYCRPELTDDSSLVELEQARHPVIEQLSETPFIANDVALNNTQRMLMITGPNMGGKSTYMRQAALIVILAHMGCYVPAKTARIGCIDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETANILHNATPNSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAWSCADYLAQKLQCLTLFATHYFELTELADELPATSNVHVNAKEHGDTIAFLHTVSEGAANQSFGLQVAKLAGVPEHVIQQAKLKLKELETAHHGSHKSMPAKPNEKQPSLPLEPERPNPIIEHLQTTDLNDLSPRQALELLFSWKSKL >NZ_CP022133|1487415:1495721|1494968_1495721_-|WP_088768334.1|DBSCAN-SWA MMKILLSNDDGVHAPGIRALYLALKEVAEVRVIAPDRNCSGASNSLTLHNPLRIRKLDNGFYSVNGTPTDCVHLGTNSPIAEDVDLVVSGINDSPNMGDDVLYSGTVAAAMEGRFMGLPSIAVSMGGRGHDYYETAAKIVADIVSDMEKAPLRLDTVLNINVPYTTYDKLKGTKVTKLGRRHRADTMVHDRDPFGNEIFWYGPIGHHTSDEPQTDFAAIHDGYVSITPLSLDMTAQRHTDTLTEWLDQKK >NZ_CP022133|1487415:1495721|1492838_1493723_-|WP_088768332.1|DBSCAN-SWA MLQSLIVLSLLPIVLQGCSSRSQPAPVDTLYTGKTYRDFQPDSLDAKKYEVQKGETLYSIAFRANMDVDDIARLNNLARPYTIYPGQTLDLVGSAKSTGTSEPTQRPQSNKQTANRAQNNIKTPVAKTQKKEYGQKVDTKKTVKKQTDTRKQRRRKPVRVRSEAAMPSNAELAWQWPSTGKIIERFSLKDRGNKGLDFAGNRGDPVKAAAAGKVVYVGNALRGFGNLIILKHNDDYITAYAHNEDILVKEQEWVDIGETIARMGDSGAKGIKLHFEVRFRGKSVNPEHYLPSSR >NZ_CP022133|1487415:1495721|1491770_1492760_-|WP_088768331.1|DBSCAN-SWA MSQIKEEAVDTIEISEEEALLENADEAQQSATSSDEELEEALSSSSSQYQKKMDATQLYLGEIGFSPLLTAEEEVFYSRRALKGDKAARRRMIESNLRLVVKIARRYSNRGLALLDLVEEGNLGLIRAVEKFDPERGFRFSTYATWWIRQTIERAIMNQTRTIRLPIHVVKELNIYLRAARELAHKLDHEPTAEDIAKSLDKPVGDITKMLRLNERIASVDTPVGGENDKALLDILADEDDHGPEGVLQDENLKTNITDWLESLNDKQKEVLARRFGLLGYEASTLEDVGREIGLTRERVRQIQVEALRKLRDSLKQQGLTLDSLFAGQ >NZ_CP022133|1487415:1495721|1494324_1494969_-|WP_088769379.1|DBSCAN-SWA MKTISGQARAKKLIQQLSDLGITNQQVLQVIAETPRHVFMPESLAHKAYENTALPIGNGQTISQPLMVATMTQLLMQHNCHNVLEIGTGSGYQTAILAQLVDKVFSVERIAQLQYQAKRRLRQLDLHNVSMRHGDGWKGWSSKAPFDGIIVTAAASEIPSDLVAQLADGGVMIIPVGGTNEAQSLTVIRRFGDSVEQQQIGDVRFVPLVKGELS >NZ_CP022133|1487415:1495721|1487415_1488498_-|WP_088768329.1|DBSCAN-SWA MSNDRQKALDAALGQIERQFGKGSIMRLGDNQTLDIASVSTGSLGLDIALGIGGLPFGRVIEIYGPESSGKTTMTLEVIAEAQKMGKTCAFVDAEHALDPIYAEALGVNVDDLLVSQPDTGEQALEICDMLVRSGAVDVVIVDSVAALTPKAEIEGEMGDSHVGLQARLMSQALRKLTSNIKKSNTMCIFINQIRMKIGVMFGNPETTTGGNALKFYSSVRLDIRRTGALKEGDEVVGNETRVKVVKNKVAPPFKEANFQILYGKGISKEGELIDLGVKHKMVDKAGAWYSYKGDKIGQGKANSMKFLQENPKIADELESRIRELLLSKPEKKTKEDREAERAAAKEAENSPEPSDDNVL >NZ_CP022133|1487415:1495721|1488605_1489103_-|WP_088768330.1|DBSCAN-SWA MVTTTVITPQTLELAEQLGQCLLEKQQTIATAESCTGGGIGYAITEVAGSSAWFNGGLITYTNDLKRQLLNVSQRTLEKDGAVSAECVKQMALGAQAQCNTSWAIAVSGVAGPGGGTVEKPVGLVWMALVGPGCEEVWSQTFAGNRQKVRSQTIDEVLTKAINQF >NZ_CP022133|1487415:1495721|1493743_1494328_-|WP_088768333.1|DBSCAN-SWA MKLFSALYDRVLSWSEHPRAKAILALLSFSESVIFPVPPDVMLAPMAMTQPDKAWRLAFLTTVSSAAGGVLGYFLGFWAFETVVLPAVETLGYESKLEVVKSWFATWGFWIVFIAGFSPIPYKLFTVTAGVMQIAFFPFLLASVISRGLRFYLVAWLLKTGGPKMAVKLREYVDRIGWSLVILLIVAYIVVQLV |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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