CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP022132	Francisella halioticida strain DSM 23729 chromosome, complete genome	1 crisprs	DEDDh,cas3,csa3	0	0	29	0

1. NZ_CP022132

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP022132_1

• CRISPR_ID: NZ_CP022132_1
• CRISPR_location: 671817-671927
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP022132_1

Consensus_repeat	Method
TAGTTGTGGTGGTAAATGTGCTAGTGGATCATG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP022132_1

>1.1|671850|45|NZ_CP022132|CRISPRCasFinder
TGGCTCGCATAGTAAGTCTAAAGCGGGTATTAAAGCTCAAGATAG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022132_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP022132_1

>merge|NZ_CP022132|1|671817-671927|CRISPRCasFinder
TAGTTGTGGTGGTAAATGTGCTAGTGGATCATGTGGCTCGCATAGTAAGTCTAAAGCGGGTATTAAAGCTCAAGATAGTAGTTGTGGTGGTAAATGTGCTAGTGGTTCATG

>NZ_CP022132|1|1|671817-671927|CRISPRCasFinder
TAGTTGTGGTGGTAAATGTGCTAGTGGATCATG	TGGCTCGCATAGTAAGTCTAAAGCGGGTATTAAAGCTCAAGATAG
TAGTTGTGGTGGTAAATGTGCTAGTGGTTCATG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP022132.1|WP_088773441.1|666954_667134_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022132.1|WP_088772143.1|672074_672881_+|DUF692-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235447
NZ_CP022132.1|WP_088772146.1|675556_676309_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP022132.1|WP_088772138.1|667194_667347_-|lipocalin-like-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|372819
NZ_CP022132.1|WP_088772142.1|670674_671457_+|enoyl-ACP-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|223696
NZ_CP022132.1|WP_088772111.1|668054_668270_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022132.1|WP_088772151.1|682422_683448_+|UDP-glucose-4-epimerase-GalE	unknown	unknown	gnl|CDD|187558
NZ_CP022132.1|WP_088772144.1|672890_673595_+|putative-DNA-binding-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225760
NZ_CP022132.1|WP_088772150.1|681696_682365_+|ribulose-phosphate-3-epimerase	unknown	unknown	gnl|CDD|235515
NZ_CP022132.1|WP_157671428.1|674079_675138_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022132.1|WP_088772147.1|678420_679119_+|putative-DNA-binding-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225760
NZ_CP022132.1|WP_088772140.1|669560_669806_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022132.1|WP_157671353.1|675098_675323_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP022132.1|WP_088772137.1|662414_665237_+|cyanophycin-synthetase	unknown	unknown	gnl|CDD|237586
NZ_CP022132.1|WP_088772148.1|679729_680695_-|KpsF/GutQ-family-sugar-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|182814
NZ_CP022132.1|WP_157671285.1|668302_668611_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225511
NZ_CP022132.1|WP_088772141.1|669818_670532_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224527
NZ_CP022132.1|WP_088773440.1|665265_666951_+|Mur-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|237586
NZ_CP022132.1|WP_157671430.1|680788_681571_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP022132.1|WP_157671644.1|667425_668118_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP022132.1|WP_088772146.1|675556_676309_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	1.14303e-40
NZ_CP022132.1|WP_088772138.1|667194_667347_-|lipocalin-like-domain-containing-protein	gnl|CDD|372819	pfam13924, Lipocalin_5, Lipocalin-like domain. This family includes domains distantly related to lipocalins. However, they do contain the important GXW motif in the first strand. The protein in this family include aln5, which is involved in biosynthesis of alnumycin. The family also includes the ZFK protein from Trypanosoma brucei which is a protein kinase. This domain is at the C-terminus of that protein. The domain is also found as the C-terminal domain in StiJ a protein involved in producing stigmatellin. This domain has been assumed to catalyze a final cyclisation reaction.	3.48156e-06
NZ_CP022132.1|WP_088772142.1|670674_671457_+|enoyl-ACP-reductase	gnl|CDD|223696	COG0623, FabI, Enoyl-[acyl-carrier-protein].	2.3289e-134
NZ_CP022132.1|WP_088772151.1|682422_683448_+|UDP-glucose-4-epimerase-GalE	gnl|CDD|187558	cd05247, UDP_G4E_1_SDR_e, UDP-glucose 4 epimerase, subgroup 1, extended (e) SDRs. UDP-glucose 4 epimerase (aka UDP-galactose-4-epimerase), is a homodimeric extended SDR. It catalyzes the NAD-dependent conversion of UDP-galactose to UDP-glucose, the final step in Leloir galactose synthesis. This subgroup has the characteristic active site tetrad and NAD-binding motif of the extended SDRs. Extended SDRs are distinct from classical SDRs. In addition to the Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet) core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids. Extended SDRs are a diverse collection of proteins, and include isomerases, epimerases, oxidoreductases, and lyases; they typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	0
NZ_CP022132.1|WP_088772144.1|672890_673595_+|putative-DNA-binding-domain-containing-protein	gnl|CDD|225760	COG3219, COG3219, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	1.72514e-09
NZ_CP022132.1|WP_088772150.1|681696_682365_+|ribulose-phosphate-3-epimerase	gnl|CDD|235515	PRK05581, PRK05581, ribulose-phosphate 3-epimerase; Validated.	5.04517e-113
NZ_CP022132.1|WP_088772148.1|679729_680695_-|KpsF/GutQ-family-sugar-phosphate-isomerase	gnl|CDD|182814	PRK10892, PRK10892, arabinose-5-phosphate isomerase KdsD.	8.518e-134
NZ_CP022132.1|WP_088772147.1|678420_679119_+|putative-DNA-binding-domain-containing-protein	gnl|CDD|225760	COG3219, COG3219, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	3.36195e-06
NZ_CP022132.1|WP_088772143.1|672074_672881_+|DUF692-domain-containing-protein	gnl|CDD|235447	PRK05409, PRK05409, hypothetical protein; Provisional.	8.05833e-124
NZ_CP022132.1|WP_088772137.1|662414_665237_+|cyanophycin-synthetase	gnl|CDD|237586	PRK14016, PRK14016, cyanophycin synthetase; Provisional.	0
NZ_CP022132.1|WP_157671285.1|668302_668611_-|transposase	gnl|CDD|225511	COG2963, COG2963, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.08341e-05
NZ_CP022132.1|WP_088772141.1|669818_670532_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein	gnl|CDD|224527	COG1611, COG1611, Predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein [General function prediction only].	9.45032e-59
NZ_CP022132.1|WP_088773440.1|665265_666951_+|Mur-ligase	gnl|CDD|237586	PRK14016, PRK14016, cyanophycin synthetase; Provisional.	3.73531e-68
NZ_CP022132.1|WP_157671430.1|680788_681571_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	8.44448e-66
NZ_CP022132.1|WP_157671644.1|667425_668118_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	3.82991e-68

Protein sequences

>NZ_CP022132.1|WP_088772142.1|670674_671457_+|enoyl-ACP-reductase
MGFLTGKKIIVTGLLSNKSIAYGIAKALHREGAELAFTYVGQFKERVEKLSAEFDPVAVLPCDVTSDQEIKDLFVELGNVWDGLDGIIHSIAFAPRDQLGGDFVDTVTREGFSIAHDISAYSFVALAREGRAMMKGSNGSIVGLTYIGAEKAMPSYNTMGVAKASLEATMRYTALALGEDGINVNSVSAGPIKTLAASGISNFKKMLDYNASVSPLKKNISIMEVGNTVAFLCSDMASGITGENIHVDAGYHSVLMGNVL
>NZ_CP022132.1|WP_088772141.1|669818_670532_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein
MNRNNKKIVPTHNGQVTFDRAKETWNILKITSELVEGFERLDKLTPAISIFGSARLKKDDKYYLKTIEIAEKLSNHGFTVITGGGPGIMEAGNKGALEGSSSSVGLNIALPHEQKPNKYQDISLFHRYFFTRKAMFIKHSMAYIVMPGGFGTMDELFDISTLIQTEKKTYMPVILFGKNFWGGLVSWIKTTMLKSGVIDKNDLKILHLVDTIDETIEIIREYYQNSYHSKEHAHIVF
>NZ_CP022132.1|WP_088772140.1|669560_669806_-|hypothetical-protein
MDINTISSTLIHNSLPIIVAFNVLIHIFCGLGIAKDIPKILNKRLTTILLPKNIWILVGLVFGIWGLLIYWLLHHSTISRG
>NZ_CP022132.1|WP_157671285.1|668302_668611_-|transposase
MLRKGDKMRYTKEFKDEAVKLCLQPDANRREIADNLGVKYKTICSWISKAMSNPQKEIKIDYKTQYQQLSFENTDLKKKLKQAETEREILKKAAAYFAKQNL
>NZ_CP022132.1|WP_088772111.1|668054_668270_-|hypothetical-protein
MPVTTLCKPLNVSTSSYYSWIHKPIGKRQYNDAELDDAILMNINLDMEVLGYTKSLKIWVGKLLNLEYLNV
>NZ_CP022132.1|WP_157671644.1|667425_668118_-|IS3-family-transposase
MYKELKDMGWKVTQPRVSKRMKLLGLHAKAARKHKKTTDSNHNKHVYDNLLEQNFTALSVNHRWVTDITYVPTQEGWLYLCVIIDLFSRSVIGWTMDSRMKADLVCNALNMALFRRNFPSGVIIHSDKGSQYCSKQYQDIIKEHWLLSSMSSKGCCYDNAACESFFGTLKVELVHDESYKTREETKLSIFEYIEAYYNTKRRHSTINYMTPYQFEYIMENEVVNCPKLTG
>NZ_CP022132.1|WP_088772138.1|667194_667347_-|lipocalin-like-domain-containing-protein
MANRLLGAWSLEKVYAKSDDRQISFPLGARPNGLLIYTENKMSGSGKLSE
>NZ_CP022132.1|WP_088773441.1|666954_667134_-|hypothetical-protein
MIDNKIIHYVELSNEIAWENWELVREFKFIDSETHEIKSEEVLGKKKYNMIFTWLKCNK
>NZ_CP022132.1|WP_088773440.1|665265_666951_+|Mur-ligase
MIPEGYSRRLVGPNLFFKETGTVLDVPLVENREELTKLFYQEAKKKLPALGWEQIKITHNFFNNGVRFAFIAPVDITMPACDVIDFVWASAREGFETGNFKSIEEAKKELISTIDEDKNLTYRKLYELAKSKGFNAFRDRDRDTAFIGSGTGCYEFDLIKDSIDDISWQNVYDIPAVIVTGTNGKTTTVRLTDYICRVAGKVTGYTSTDWVKVNDELIDEGDYSGPTGHQFVLTNKKVEVALLESARGGLLKRGLIETFINAAAVTNVSTDHLGEDGIETVAELAEAKSIVFRTMGEGSHAIINLDNSYMKDKFDTLDCAKIVVTQNPEAHDMEYYLAKSEYACIVENGNFVWIDGGLKRTIVSVVDAPLTVKGFAKHNIENAMIAICLSFKLGIDLDIVAQALKSYSNDTKVNRGRANIFEWNDKVAVVDYAHNEAGMDALLGMMKAYDKGGKTYLMIGTTGDRKYLIPGINDVILKHDIDFIVLKETEMYLRGAEPMELPLLIRKDLDDKGFDISKTYISHGELEGVKYILNKLEDNDMAILCCQAEVPEVIEYLEKIV
>NZ_CP022132.1|WP_088772137.1|662414_665237_+|cyanophycin-synthetase
MKILATNVYVGPNIYANFPVIRHEIDLGILEKWPSAKIGKDFINKLIESLPGIQEHGCSYREHGGFVRRLKEDEGTWMGHIWEHVILELQGIAGSDVTYGRTRSTGEVGQYNMVYEYKQKDVGLRAMELARDLLLSLLPEHLKKEVSFSNDNFDFEYEKIRFIKFAQSKEFGPSTGSLVEAAKKRDIPYLRLNDHSLVQFGYGKYQQRIRATITGKTTSIAVDLSCDKEQTNTILSGLGLPMPKQRMVTSEEGALRAAKILGFPLVVKPLDGNHGRGISINLKTMEEIKEAFVEANKVSRYVLLEQFATGFDHRMLVVDGKLIAVAKRVPGHVVGDGKHTITELVDIVNEDPRRGVGHEKVLTKLELDYQAKTLLNTAGYDENTVLEDDQVFYLRSTANLSTGGTAIDVTDIVHPDNKDMAERAIKAIGLDVGGVDFLIDDISQSYHDIGGAICECNAAPGFRMHVAPSEGKPRDVAGAVVDMLIPKEFGNARIPIAAITGTNGKTTTSRMVAHMWKNAGKVVGLTTTDGVYINGKLTVSGDTTGPASAQMVLKDPSVEMAILETARGGLLRSGMGYDYCNVGACLNISSDHLGLKGVNTLDDLAKVKSIVVQAAKDVAILNADDPNVLKMSAKVTAKHIFYVTMNPGHALVKQHIRAGGKACIIEKGVNGDMITIFDNHVHIPVLWTHLIPATMEGKAIHNVQNSMFAIAISYSMGMSLDDVRDGLRTFVTSFYQAPGRMNWFEEHLFKVLMDYGHNPAAIKLVSQMVDNMEFAGKKICVLASPGDRRDQDIIEIAATAAPYYDYFICNRDDALRGRAPDEVPRILKESLISSGVSANNIETIESEKEAVDAALAMAEEGDLVVIFADKLKRTWKQIIYFDKDSEEVYKDEKPEKKEMFSASIIAQDASLSEEISEVIKAGIIADESGIRVVYEEEDND
>NZ_CP022132.1|WP_088772143.1|672074_672881_+|DUF692-domain-containing-protein
MTKKAQGIGLRSEHQSILSAKKVSGIDFLELAPENWMGLGGFKQNFLEKAAEIYPIVAHSLNLSIAGFRPLNKEFLNEVRIFLDRYNIKIYSDHLCFTDDEKGYLYDLLPVPREKETVSHICNRIEQVQDIIKRPLVLENISYYYQYDNDMNELEFINSILEKSGAKLLLDINNVYVNGHNHGYDPYEFVSNIKKDSISYYHIAGHYKSDDFIIDTHGKSVIEEVKKLAKFTIEKHGWYPLLLERDNFIPKLDDLIAELNSITSFVGN
>NZ_CP022132.1|WP_088772144.1|672890_673595_+|putative-DNA-binding-domain-containing-protein
MDIPDVIKIKMQNFTDAIRCGNSTNKNILIYRDSIIANISSVLDNTFPYFSTYASTDLKKQIIKVFLEENTSLDPAFHQIATELLKCSKNLEMSEQLSKLIEFEWLLFSVEISDSKVCKSSEKISNIDFADIKGIDINPTVEFLSLPFDASSLDKNVDLKEESFYIVYRNLNHRTYYREISPIEFALISSALKNGVEVFDSADFKNLDDSYKEYLIQQLIIWHNLNIITMSLSN
>NZ_CP022132.1|WP_157671428.1|674079_675138_-|hypothetical-protein
MGQWVVPVNLQRVTAADSGISVSLDQFHKYISNQENSGDINVLIGDSKYSSMECIHRVYSEHNNTLLLSRLNSVRNLSFQDHSDNKLKKYGESFKLNDESTWTTAPSDSEQCEIVTTRGKVYTVKLTRWNNLIIHGKRNMPMHENCFDIVKVQVFKDNGDPVYYKNMWLMLAGKDRGKLTSFKIFSRYSSRFNIEHFFRFSKQHLLLGKYETPDTPTLDIWNQVSVLAYINSLACASLLDTDLLHPWQKQMRKNNSISTPYQVQRNLSTILQEIGSPAKHCVYKSHGYGRAPGTVLNKRASYQPYKKSENSEYGKKQKIPDSKIVLKKSKNEIIGVLELTNHQTNLLNSYIN
>NZ_CP022132.1|WP_157671353.1|675098_675323_-|hypothetical-protein
MINEIKLNNSSNIHFYALDETSILKPNSKSMDRRRFVYGLTNGTGKVGIGHSYSYLVYLGRRWGNGWYLLICSE
>NZ_CP022132.1|WP_088772146.1|675556_676309_-|IS3-family-transposase
MVNEHKEEVKAKLIQIHEEIPCYGYIKAHKQLIEDGFSICENTVQKYRKELGIKAILAVKKPNLNLSEPNKEHAIYSYKLKGLSILRPNQVWSTDITYIKTDAGTVYMAAIIDWYSKAVLSWEISNTMDSSLVMKVLNEALYKYGVPEIFNTDQGSQYTSNIHIQTLLDKKITISMDGKGRATDNICIERFWRSAKCERFYLNQYPGIVELRNDVDDYIDFYNNRRFHESINYKKPMEFYYDNLLEKRAA
>NZ_CP022132.1|WP_088772147.1|678420_679119_+|putative-DNA-binding-domain-containing-protein
MNIPESIKNKMQSFTHAIRYGNSTDEKIEMYREFIVGNVSSVLENTFPYFNTHASQKLKDKIIKVFLEDNVAFEPAFHQIATEILKSSREIEMDKELYKLIEFEWLLFSIEISEFEVSENTEITKAVGFKNIRKVKANPTLTFISLPFDINSLNEEISVDQKILYALYLNVNHKTSHQRLSPLESAILSSVLEDDVSIFNSEDFKQINNEYKEHLMNRLVFWHNQNMVTLSV
>NZ_CP022132.1|WP_088772148.1|679729_680695_-|KpsF/GutQ-family-sugar-phosphate-isomerase
MSHVENAKKTFEMEIKALEDLKNSISGSFKKACDIILTNNKGRVIITGMGKSGHIGKKMAATFASTGTPAFFVHPGEAGHGDFGMITCNDILIAISNSGNSNEIMGLMPMIKHLNIPIISITSNPESLMAKNSDIHLNLGVNKEACPLNLAPTSSTTATLVLGDALAIALLKAKNFSAEDFAFSHPSGALGRKIILRVENIMRKGSEIPKIDPTDTIRKAILEISNKGIGNTLITSKDSKLLGIFTDGDLRRIFESDNFDSYIPISNVMSKHPKTISKDDMAMTALEKMEEFEIMSLAVIDNNDYVLGAVTMHDLIKLGLK
>NZ_CP022132.1|WP_157671430.1|680788_681571_-|IS3-family-transposase
MLRKGDKMRYTKEFKDEAVKLCLQPDANRREIADNLGVKYKTICSWIYKELKDMGWKVTQPRVSKRMKLLGLHAKAARKHKKTTDSNHNKHVYDNLLEQNFTALSVNHRWVTDITYVPTQEGWLYLCVIIDLFLRSVIGWAMDSRMKTDLVCNALNMAFFRRNFPSGVIIHSDKGSQYCSKQYQDIIKEHWLLSSMSSKGCCYDNAACESFFGTLKVELVHDESYKTREEAKLSIFEYIEAYYNTKRRHSTINLYDSISI
>NZ_CP022132.1|WP_088772150.1|681696_682365_+|ribulose-phosphate-3-epimerase
MKSFQINPSILSANLAKLGNDVKDVLAAGADNIHFDVMDNHYVPNLTFGPMVLKALKDYGINAGMDVHLMVKPVDNLIEAFAKAGASSIVFHPEASEHIDRSLQLIKSFDIQAGLSLNPATNIDCLKYVESHIDRVLIMSVNPGFGGQKFIPAMLDKAREVSLWIKSTGRDILLEIDGGVNPSNIAEIASCGVNAFVAGSAIFNSQSYKETIDIMRSQLSKI
>NZ_CP022132.1|WP_088772151.1|682422_683448_+|UDP-glucose-4-epimerase-GalE
MDKKVLVTGGTGYIGSHIVVELLNRDYQVIVVDNLSNSKISVVDRVKTITGKDFDFYQMDLLDKVNLNTVFQDHNIHAVIHFAGFKAVGESVKKPLEYYHNNIQGTINLLELMQDYKVYDFVFSSSATVYGINNEPPFTEDMSLSTTNPYGATKLMLEEILKDLQNANNKFNITCLRYFNPVGAHESGMIGEDPQGIPNNLMPYIGLVGAGKLAKLSIFGGDYETKDGTGVRDYIHVVDLAIGHILALEKLAQGKSAWRAYNLGSGNGYSVLELVKAYEKVLGKEIPYHIVDRRAGDIAASFADVSKAKKELCFGTKKSMDDICQDMVRWQEFEKKNDVRK

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3000 : 51357	54	Shigella_phage(42.86%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_2	73051 : 100355	29	Acinetobacter_phage(33.33%)	transposase,integrase,tRNA	attL 81997:82056|attR 93813:94107
DBSCAN-SWA_3	121970 : 180519	60	Vibrio_phage(14.29%)	transposase,integrase	attL 109038:109054|attR 169495:169511
DBSCAN-SWA_4	188242 : 293745	112	Shigella_phage(20.69%)	transposase,integrase,tRNA	attL 180465:180523|attR 289192:289228
DBSCAN-SWA_5	348172 : 357740	8	Staphylococcus_phage(28.57%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_6	436402 : 517754	87	Shigella_phage(25.0%)	transposase,integrase,tRNA	attL 490283:490297|attR 518133:518147
DBSCAN-SWA_7	527857 : 584037	53	Shigella_phage(27.27%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_8	594413 : 636939	47	Acinetobacter_phage(23.08%)	transposase,integrase,tRNA	attL 583437:583490|attR 596684:596737
DBSCAN-SWA_9	656223 : 689168	34	Acinetobacter_phage(30.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_10	701604 : 750944	53	Acinetobacter_phage(22.22%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_11	766110 : 824301	54	Acinetobacter_phage(37.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_12	831072 : 880045	49	Bacillus_phage(13.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_13	885506 : 941926	54	Acinetobacter_phage(23.08%)	transposase,tRNA	NA
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DBSCAN-SWA_15	1117588 : 1156979	41	Acinetobacter_phage(12.5%)	transposase,tRNA,integrase,protease	attL 1107257:1107274|attR 1158008:1158025
DBSCAN-SWA_16	1167252 : 1217319	46	Bacillus_phage(42.86%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_17	1236988 : 1287853	45	Shigella_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_18	1312321 : 1347326	33	Bacillus_phage(30.0%)	transposase,integrase,tRNA,protease	attL 1302797:1302814|attR 1337027:1337044
DBSCAN-SWA_19	1362607 : 1480874	117	Shigella_phage(21.21%)	transposase,tRNA,integrase	attL 1360659:1360676|attR 1482284:1482302
DBSCAN-SWA_20	1486437 : 1532919	52	Shigella_phage(26.67%)	transposase,integrase,tRNA	attL 1494232:1494249|attR 1537518:1537535
DBSCAN-SWA_21	1545930 : 1615445	57	Acinetobacter_phage(25.0%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_22	1624723 : 1676854	45	Acinetobacter_phage(12.5%)	plate,transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	1693673 : 1700552	8	Enterobacteria_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_24	1826225 : 1872047	53	Synechococcus_phage(16.67%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_25	1875374 : 1929124	59	Shigella_phage(50.0%)	holin,transposase	NA
DBSCAN-SWA_26	1939991 : 1982000	38	Acinetobacter_phage(13.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_27	2015615 : 2056773	42	Klosneuvirus(28.57%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_28	2077299 : 2112447	28	Bacillus_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_29	2139082 : 2176665	53	Escherichia_phage(30.0%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP022132|3000:51357|DBSCAN-SWA
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MSKLNAYFGEFGGQYVPQLLVPALEQLEQEFIKAQNDESFRKEFKELLQEYAGRPTALTLTKNLVKGTKTKLYLKREDLLHGGAHKTNQVLGQALLAKRMGKKEVIAETGAGQHGVATALACALLDLKCKVYMGAKDVERQSPNVFRMRLMGAEVIPVHSGSATLKDACNEALRDWSGSYNRAHYLLGTAAGPHPFPTIVREFQRIIGEETKQQILAKEGRLPDAVIACVGGGSNAIGIFADFLDEESVKLIGVEPAGKGIDTGKHGAPLKHGKLGIFFGMKAPLMQDINGQIEESYSISAGLDFPSVGPQHAYLQSIGRAEYVSATDDEALDAFKLLCRKEGIIPALESSHALAYALKLAFANPNQEQTLVVNLSGRGDKDIFTVHDILKQRGEVQ

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_088771581.1|29435_30695_-	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	2.7e-45	33.1
WP_088771582.1|30736_31246_-	cytochrome b/b6 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088771585.1|33773_34526_-	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_088771586.1|34868_35861_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.8e-23	30.3
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WP_088771595.1|41512_41911_+	DUF3568 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088771596.1|46012_47170_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.1e-23	30.3
WP_157671267.1|47203_48016_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_157671270.1|50263_50551_-	ester cyclase	NA	NA	NA	NA
WP_088771600.1|50667_51357_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.4e-34	38.9

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP022132|73051:100355|DBSCAN-SWA
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MIKRYDVSEISKIWADENKYRKMLEVELAILEALEDKMVPKGTAAEIRSKAEIRSGRIDEIEKVTKHDIIAFCTSIAEQFTAETGKFFHFGVTSSDIIDSALSLQVCESLEFVVKDLEALCDSLLVKAQETKEIITMGRSHGMFAEPMSFGQKFLGAYVEFKRRLKDLKEFQKDGLTVQFSGAVGNYCILTTEDEKRAADILGLPVEEVSTQVIPRDRIAKLISIHGLIASAIERLAVEIRHLHRSDVFEVYEGFSKGQKGSSTMPHKKNPISTENLTGMARMLRSHVSVALENCVLWHERDISHSSAERFYLPDNFGIMVYALRRMKNTIDNLVVQKDIIEDRVRSTSAYLSSFYLHFLVANTRFMREDCYKIVQQVAFDLKPGESFSKNLQKVMQNEHTIIIDVPEMDFEGIKKTYLKEIDNVFERSIK
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MSNPQKEIKIDYKTQYQQLSFENTDLKKKLKQAETEREILKKAQRTLQSKICKVRLY
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MNKPTEHFEHTITYIGRYIKKPPIAMSKIKEYDGNTIKFRFLNHRNSKHQDLELTMDEFIERFIQHIPEKGFRMIRYYGFLANAVRGELLPKIYEILGHKPKVKVDISYQQMSLLSFNVDPLKCILCGAQLLPSFRVIGKSTKQLMQFHT

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_088771618.1|73459_73912_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771619.1|74043_74772_+	galactose mutarotase	NA	NA	NA	NA
WP_088771620.1|74834_75089_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771621.1|76724_77363_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773412.1|77687_78983_+	adenylosuccinate lyase	A0A1B3B081	Gordonia_phage	6.1e-16	29.3
WP_088771622.1|79249_79633_-	ATP-binding protein	A0A2L1IVB6	Escherichia_phage	3.6e-17	36.4
WP_088771623.1|79802_80114_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771624.1|80120_81800_-	energy-dependent translational throttle protein EttA	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	3.9e-39	26.7
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WP_157671631.1|82292_82694_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	4.5e-26	44.6
WP_157671285.1|82870_83179_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671288.1|83183_84080_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.6e-23	30.3
WP_088771629.1|84181_85072_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	7.6e-26	33.1
WP_088771630.1|86294_87224_-	aspartate carbamoyltransferase	A0A1J0F9B8	Only_Syngen_Nebraska_virus	4.2e-51	38.9
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WP_088771632.1|90681_91848_-	glutamine-hydrolyzing carbamoyl-phosphate synthase small subunit	R4TGJ8	Halovirus	4.9e-49	33.0
WP_088771633.1|92299_92587_+	histidine-type phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_157671291.1|92802_93111_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771820.1|93143_93359_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773413.1|93316_93868_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.4e-33	39.0
WP_088771635.1|94167_94848_-	thiopurine S-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
93813:94107	attR	NA	NA	NA	NA
WP_088771636.1|94980_96327_+	dihydroorotase	NA	NA	NA	NA
WP_088771637.1|96345_96822_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671294.1|97050_97419_+	SH3 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771639.1|98119_98671_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.4e-33	39.0
WP_157671298.1|98852_99026_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771640.1|99221_99512_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771641.1|99917_100355_+|tRNA	D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP022132|121970:180519|DBSCAN-SWA
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MKANHIRILLLVTIAIMFISLMGRWEQTFPSNNNEQQTAKTQENSHYTKSADSKAGNGVKDQTPNLTAKTSFSKYDKADSVTINTKVFKNLKISLLNGAITSSSLKDYTISLKDKTPMNLLTEKQGSEYIAKINIVIKKKPAIIEFKNKGVKNQGDKQVLTLSGSVDGLDITRIYTFDDSKYNISISQKITNTSSKPIDIIVDDSLARNFNPAGDSFSLLNAHSYTFTGVAYSTPQDKFRKESFKDISKTNGKPTVVDNNGQGWVAFIEHYFMTAWIPQSSNSKIYYKNLNDDVFEAGEYTSVTIAQNQSQNVSSVLYTGPIIKDNLVSLAPNLEKTLDYGMLSFFSEIIFWVMSHIHALVGNWGLSIILVTVLIKLIFYPLSAKSYRSMAKMRMLQPRIKRLQETYKDDRQVLGKKMMGMYKEEKVNPLGGCLPMVIQIPIFISLYWVLLESVELRHAPFIFWIHDLSMKDPYFVLPVLMGISMFLQQRLSPAPADPMQAKIMMFLPVIFTFLFASFPSGLVLYWLTNNLISILQQWLITRRYQATHKK
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MWYAYLAAIIDWHSKKILAWKISNTMDTHLTTSVLKEALFKYGKPDIFNSDQGTQYTAKEHIKIISDNKINISMDAKGRSIDNIAIERFGRTLKYENVYPASYITMKEAKVGIKNILIFTTMKDYILVLDI
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MIELQEYLKKLHLSTVLDGLKEIDKDDTQYYKWLEEQLEKEVSYRAVKSINNQIKLAKFPTAKSLDEFDFDKSVINKELVIGLQSTGLVDSKRNIILVGGYWHW
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MNKILNKILEKYSYTGKNNFEIINPATGEFICQLEEKSALYVKDSILVSKHTQNIFKDKPAIDRSRFLSKWYDLVVENIDYLAEIITLESGKPLAESKGEVQYGANFIRWYSEKANRIDSRIFDPNIKATEGRVDYQPVGVVAAITPWNFPFAMITRKVAPAIAAGCSVILKPSELTPLAAFAARELLIEAGADENLLQVVCGDSKVVGKEFQQSNIVRKITFTGSTRVGKLLMQQAADTVKKVSLELGGNAPFIVFEGANIEKAIEGIIVSKVRNAGQVCIAPNRIFVQNSIRKEFVAKLKQVIKELKQGNGLKPDVKVGPLINKSAVEKVQSHVNDALARGAELICGGKVNPKLGGNFFEPTILDNMQDNMVASCEETFGPVIAIFGFDSEDEVIQRSNNTKYGLASYFFSSDINQIRRVRNVLEYGMVGINSGAISSEKAPFGGIKQSGLGREGSDDGIYEFLEAKYSLQSFI
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MRLYILSQPQKIKKWYLILSSSFCAWVKSNSISKISSSQVKVWKSSFIKSRLSIRRFETPVFNLDNEFIKNTYPGTILPVLANDKNYYRVLLPTQTKTNDLAFIDGKVIKHDATEIPILTTPRNFVKIIRETQGYPYGWGNQYFYNDCSSELRAIYQAFGIWLPRNSKGQLKAYNFINLDQKTPEERTKVLLTKSRPFLDFIYIKGHVMLYIGKTSNPYNPKQIVPATYQQVWGLKDKDNTKRSVIGESIFLPLLEKYPEDPSLESELKKQIFRVVQIS
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MAKGTVNKVILLGRLGNDPEVRTTQNGTVVATLSIATNDGMGENITTEWHRVVVFGKTAEIIQRYSSKGSQLFIEGRLRTNKWQDKNGNMQYTTEIVANNFQFIGGGNSQGNSNPNYQNSSDSSQQPTSNFNQNQQQPKKQNEMPDFAEINSSNFDDDIPF
>NZ_CP022132|121970:180519|154975_155191_+|WP_157671307.1|DBSCAN-SWA
MPVTTLCKSLNVSTSSYYRWIHKPIDKRQYNDAELDDAILMNINLDMEVLGYTKSLKIWVGKLLNLEYLNV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
109038:109054	attL	NA	NA	NA	NA
WP_088771658.1|121970_122366_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_088771659.1|124424_125276_+	Mrp/NBP35 family ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773416.1|125318_125852_+	dCTP deaminase	S5VM63	Pseudomonas_phage	4.6e-71	74.1
WP_169709694.1|125853_126693_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771661.1|126699_127266_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771652.1|130645_132874_-	Fe(2+) transporter permease subunit FeoB	NA	NA	NA	NA
WP_088771653.1|133502_134039_-	oligoribonuclease	M4M9I5	Vibrio_phage	2.1e-23	34.1
WP_088771654.1|134045_134615_-	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_088771655.1|134661_135066_-	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771656.1|135078_136002_-	lysophospholipid acyltransferase family protein	A0A1W6JP29	Morganella_phage	6.9e-30	31.3
WP_088771657.1|136063_136966_-	LPS biosynthesis protein	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.5e-32	34.2
WP_088771662.1|136973_138626_-	membrane protein insertase YidC	NA	NA	NA	NA
WP_088771663.1|138625_138904_-	membrane protein insertion efficiency factor YidD	NA	NA	NA	NA
WP_088771664.1|138858_139257_-	ribonuclease P protein component	NA	NA	NA	NA
WP_088771665.1|139198_139333_-	50S ribosomal protein L34	NA	NA	NA	NA
WP_088771666.1|139436_139805_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771667.1|139927_140701_+	shikimate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_088771668.1|140767_142126_+	UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_088771669.1|142118_142994_+	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	6.1e-36	35.6
WP_088771670.1|142986_143550_+	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_088771671.1|143623_144379_+	regulator	NA	NA	NA	NA
WP_088771672.1|144401_145067_+	regulator	NA	NA	NA	NA
WP_088771673.1|145068_147813_+	DUF3427 domain-containing protein	Q5YA94	Bacillus_phage	1.1e-25	27.6
WP_088771674.1|147886_148723_+	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771675.1|150109_150727_+	carboxyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771676.1|150728_151427_+	LamB/YcsF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771677.1|151429_152236_+	hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_088771678.1|152722_153379_+	PhoU family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_088771679.1|153394_154390_+	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	3.3e-09	27.9
WP_157671304.1|154634_154943_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671307.1|154975_155191_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773418.1|155148_155700_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	5.2e-33	39.0
WP_088771682.1|156107_157043_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_088771683.1|157113_157779_-	nitroreductase	NA	NA	NA	NA
WP_088771684.1|157908_159279_+	class II fumarate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_088771685.1|159578_160271_+	DUF1275 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771686.1|160267_161473_-	amino acid transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088771687.1|161581_162202_+	16S rRNA (guanine(527)-N(7))-methyltransferase RsmG	NA	NA	NA	NA
WP_088771688.1|162191_162863_+	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_088771689.1|163287_163605_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771691.1|164790_165105_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671310.1|165085_165502_+	ATP-binding protein	A0A059NT77	Lactococcus_phage	8.5e-20	35.8
WP_157671313.1|165655_166060_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771694.1|167511_167862_-	ferredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_088771695.1|167948_168875_+	S49 family peptidase	A0A2H4UUF9	Bodo_saltans_virus	2.0e-08	26.1
WP_088771696.1|168955_169495_+	OmpH family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771697.1|169625_170048_+	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
169495:169511	attR	NA	NA	NA	NA
WP_088771698.1|170070_170514_+	protein-export chaperone SecB	NA	NA	NA	NA
WP_088771699.1|170538_171573_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.6e-112	59.8
WP_088771700.1|171559_172012_+	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_088771701.1|172130_172616_+	single-stranded DNA-binding protein	I3PUY5	Vibrio_phage	7.8e-25	42.8
WP_088771702.1|172761_173922_+	acetate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_088771703.1|173931_176019_+	phosphate acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088771704.1|176191_177622_+	NAD-dependent succinate-semialdehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_169709695.1|177766_177898_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771586.1|177931_178924_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.8e-23	30.3
WP_088771705.1|179153_179378_+	BCCT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_157671249.1|179405_179714_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771706.1|179746_179962_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671632.1|179898_180519_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.9e-46	46.6

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP022132|188242:293745|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
180465:180523	attL	NA	NA	NA	NA
WP_157671249.1|188242_188551_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
180465:180523	attL	NA	NA	NA	NA
WP_157671320.1|188555_188786_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771714.1|188986_190510_-	bifunctional GNAT family N-acetyltransferase/carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I1L7	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.6e-07	25.0
WP_088771715.1|190740_192516_+|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L3L6	Tupanvirus	2.4e-15	23.6
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WP_157671323.1|200478_201183_+	ThiF family adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_088771729.1|204654_205077_-	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088771730.1|205718_206045_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771731.1|206041_206623_-	molybdenum cofactor guanylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088771732.1|206606_207059_-	molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaE	NA	NA	NA	NA
WP_088771733.1|207081_207345_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771734.1|207368_208598_-	molybdopterin molybdotransferase MoeA	NA	NA	NA	NA
WP_157671326.1|208621_209566_-	bifunctional molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC/MoaB	NA	NA	NA	NA
WP_088771736.1|209797_209965_-	zinc-finger domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771737.1|210094_211894_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_088771738.1|211913_213230_+	nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	1.3e-34	40.8
WP_088771739.1|213892_215407_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088771740.1|215472_217698_+	exodeoxyribonuclease V subunit gamma	A7KV33	Bacillus_phage	1.4e-108	37.4
WP_088771741.1|217800_218823_+	HlyD family secretion protein	NA	NA	NA	NA
WP_169709696.1|218806_219829_+	FUSC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771743.1|219830_220076_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.9e-11	48.5
WP_157671328.1|220118_220556_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.7e-26	45.4
WP_088771589.1|220890_221043_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771745.1|221101_222301_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088771746.1|222577_223801_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088771747.1|223848_225348_+	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
WP_088771748.1|225352_226882_+	glycerol-3-phosphate dehydrogenase/oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_088771749.1|226895_227660_+	aquaporin family protein	M1HWZ0	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	4.1e-28	35.0
WP_088771750.1|227671_228376_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771751.1|228362_228854_+	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_088771752.1|228853_230263_+	AAA family ATPase	A0A0N9Q195	Port-miou_virus	1.2e-30	29.3
WP_088771753.1|230733_231918_+	elongation factor Tu	A0A1V0SLW6	Klosneuvirus	2.6e-13	27.1
WP_088771754.1|232148_232577_+	preprotein translocase subunit SecE	NA	NA	NA	NA
WP_088771755.1|232594_233128_+	transcription termination/antitermination protein NusG	NA	NA	NA	NA
WP_088771756.1|233199_233637_+	50S ribosomal protein L11	NA	NA	NA	NA
WP_088771757.1|233636_234332_+	50S ribosomal protein L1	NA	NA	NA	NA
WP_088771758.1|234502_235021_+	50S ribosomal protein L10	NA	NA	NA	NA
WP_088771759.1|235084_235462_+	50S ribosomal protein L7/L12	NA	NA	NA	NA
WP_088771760.1|235614_239691_+	DNA-directed RNA polymerase subunit beta	A0A2P0VMZ3	Tetraselmis_virus	3.9e-24	26.6
WP_088771761.1|239749_244006_+	DNA-directed RNA polymerase subunit beta'	A0A2I7QNZ7	Vibrio_phage	1.0e-67	26.3
WP_088771762.1|244104_244341_+	LapA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771763.1|244340_245351_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	2.2e-82	50.2
WP_088771607.1|245436_245898_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671331.1|245858_246041_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088771765.1|246297_247011_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.7e-23	31.8
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WP_157671333.1|248891_249215_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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250015:250073	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_088771772.1|252940_253819_-	site-specific tyrosine recombinase XerD	A0A0B5GXV1	Mycobacterium_phage	6.4e-17	29.3
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WP_088771789.1|272371_272752_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088771797.1|279762_280455_+	FtsQ-type POTRA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_169709697.1|283032_283890_+	UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase	NA	NA	NA	NA
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WP_088771802.1|287006_288689_+|tRNA	lysine--tRNA ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	6.1e-93	35.9
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WP_088771807.1|291205_292114_-	patatin-like phospholipase family protein	A0A1B2LRS3	Wolbachia_phage	1.1e-22	30.6
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WP_157671636.1|293051_293510_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.8e-29	43.3
WP_088771809.1|293499_293745_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.1e-11	51.5

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP022132|348172:357740|DBSCAN-SWA
TATGAAAAATATAAGAAACTTCTCAATAATAGCTCATATCGATCATGGGAAATCAACACTTTCAGATAGATTTATTCAGGTGTGTAGTGGTTTGGCAGAACGAGAAATGAAAGAACAAGTGCTGGACTCTATGGATATAGAAAGAGAGCGTGGTATTACAATCAAAGCACAGTCTGTGACATTAGATTATATAGCAAGAGATGGTCAGACATATCAACTTAATTTTATTGACACTCCAGGACATGTTGATTTCTCATATGAAGTTTCGCGTTCATTAGCTGCTTGCGAAGGGGCTTTACTTGTCGTGGATGCAGCTCAAGGGGTTGAAGCACAAACTGTTGCTAACTGCTATACAGCAATAGAACAAGACTTAGAAGTGATTCCTATTTTAAATAAGATAGATCTACCATCTGCTGAACCAGATAGGGTGGCAGAAGAGATTGAAGAGATAATCGGCATAGATGCAACAGGGGCAACTACTTGTAGTGCTAAAACTGGTATAGGTGTTGAGGATGTACTAGAAACAATCGTTGCTAAAGTACCAGCACCAGAAGGTGATGTTAATGATAAATTGCAAGCTTTGATTATTGACTCATGGTTTGATAACTATTTAGGAGTTGTTTCATTAGTTAGGATTAAAAACGGCACCTTGAAGAAAGGTGAGAAGTTTAAAGTTATGTCAACAGGCGTTTCTTATCAAGCTGATAGAGTAGGTGTATTTACGCCTAAAATGAAAGACCTTGACCATCTAAAAGCAGGTGAGGTTGGTTTTATTATTGCTGGTATTAAAGATATTCATGGTGCTCCAGTTGGTGATACCCTTACACATACTCATAATCCTACAGATAAGCCAGTACCAGGGTTTAAGAAAGTACAGCCACAAGTTTATGCTGGAATGTTTACTATAAGTTCTGATGATTATCCAGACTTTAGAGAAGCGTTAGAAAAGTTAAGCTTAAATGATGCATCGTTATTTTTTGAGCCAGAAGTGTCTCAAGCTCTAGGTTTTGGCTTTAGGTGTGGTTTTCTTGGGATGTTACATATGGAGATTATCCAAGAAAGGCTAGAAAGAGAATATAACCTTGATTTAATTACTTCAGCACCAACAGTTGTTTATAAAGCAGTCAAAAAAGATGGTGAAATGATTGAGGTTGATAATCCATCTAAGCTACCAGAACCAGGAGCTATTGCGGAAATTCATGAGCCAATAGTAAGAGCAAACATTCTTGTACCAAAAGACTATGTTGGGAGTGTAATTACAATTTGTATTGAGAAAAGGGGTGTGCAAGTTGATCTAAACTATGTTGGTAGTCAAGTTTCAATAACTTATGACTTACCAATGATCGAAGTTGTATCTGACTTTTTTGATACTTTAAAATCTGTAACTAAAGGTTATGGTTCATTAGATTATGAACTTATTCGTTATGAAGCTGCGAATATGCTGCGCCTAGATGTGCTTATCAACGGGAATAAAGTTGATGCTCTAGCAAGTATTGTGCATAAAGATCAAGCTAAATATAAAGGTAGAGAGCTAGTTGAAAGGCTAAAAGAGCTTATTCCTAGGCAGATGTTTGAGGTTGCTATACAAGCGGCTGTTGGTGGTACTATCGTTGCTAGAAGTACAGTTAAAGCTTTACGTAAGAATGTCTTAGCAAAATGTTATGGCGGAGATGTGTCACGTAAGAAAAAGCTTTTGGAGAAACAAAAAGAAGGTAAAAAAAGAATGAAAAATATTGGTTCAGTTGAAATTCCTCAAGAAGCTTTCTTATCAGTGTTAAAGAAATAGATTATGTCAAAAAAAATAGTAGTAGGTATTTCAGGTGGTGTTGATTCATCAGTTTCAGCATTATTACTAAAACAGCAAGGTTATGATGTAACCGGCGTTTTTATGAAAAATTGGGAAGAGGATGATACTGAGGAGTTTTGCTCAGCTGAGCAAGATATTGCTGATGCTCAAGCAGTTTGTGATTCTATAGGCATTCCCTTTAAGAAAATAAATTTTGCTGCAGAGTACTGGGATAATGTTTTTGAGCATTTTTTGACTGAATATAAAGCAGGAAGAACGCCTAACCCAGACATTCTCTGTAACAAAGAAATCAAGTTTAAAGCTTTTCTAGGCTATGTTCATATGCTTGGAGGGAATTATATAGCAACAGGCCATTATGCACGAACAAGAGCATTAGAAGACGGTTCTGTAGAGCTTATTAAAGGTTTGGATGATAATAAGGACCAAACATACTTCTTATATACTCTTGGTCAAGAGCAACTAAGGCAAACAATATTTCCAATAGGGGATATTGAAAAAGAAAAAGTTCGTCAAATAGCGAAAGAAAATAATCTTGTCACATTTGATAAGAAAGATAGTACAGGTATTTGTTTTATTGGGGAGCGTAAATTTAAAGAATTTTTATCCAAATATCTGCCAGCTCAAAAAGGTGAAATTCATGATGAAAATGGTATCAAGATTGGTGAGCATGATGGGCTTATGTACTACACAATAGGGCAAAGGCAAGGTTTAGGTATTGGAGGTGTAAAAAATCGTCCGGAAATACCTTGGTTTGCCGCAAAAAAAGATTTGAAAAATAATGTACTTATTGCAGTACAAGGTCATGATCATCCAATGCTGTTTAGAGACTCCTTAGAAGCTATTGATTTAAGTTGGGTTGCAGGAAATCCTCCAGCAGATAAGTTTAAATGTAAAGCTAAAGTTCGTTATAGACAGAAGGATCAGCCTTGTGAAGTAAATGTAATACAAGATGGTTTAATCAATGTGGTTTTTGACCAGCCTCAAAGAGCTATTACTCCAGGTCAATCAGTGGTTTTTTATAATGAAGATATCTGTCTTGGAGGCGGAGTTATAATTTAGGAAATATAAATTTTGATTTAGATTATGTAGTTATTTATTCACTATCTAGTTTTCCAATAATAGCAGTATTCTTTTGATTTACTGAACCAAAATCACTGTTGCTCTCTCCGGAGTTGCTTGCTATAGAGCTACCACTATTTATTGAGCTAGAGACACCACTATTTGCATTTTCATCATCTAATTTTTTAGCTGTAGGGTTATTGCTATTAGTTGAGTTAGAAATACTGTTATTGTTTTTAGTCATGGAGCTACCACTATTTATTGAGCTAGAGACACCACTATTTATTGAGCTAGAGACACCACTATTTGCATTTTCATCATCTAATTTTTTAGCTGTAGGGTTATTGCTATTAGTTGAGTTAGAAATACTATTATTGTTTTTAGCAGTAGTCATGGAGCTACCACTATTTATTTTCTTGGATTTATCTTTTTCAAGATCACTTTTTGTTACTATGTCACTATCTTGAGCAGCTATTTCATTAGCCATACTTTCTTCAGGATTACTACCATTAGCTTTTTTATCTTGATCTACAACATTGTTAAGATAGCTTACAATTTCTTTTTTAACTTCTTTTTGATTATTTAGTACATCTTTTTGCATATAGTGTGCTTCATGTACAGTATCTATAGTCATGTGAGTATATAGGTATTCAGGATCTATAACAAATGGTCTAAGTTCAGTGCCATAGCGTTTTTCTAGCCCAGGGAAATCAACAGTATAAGCAACTTTAATGCGTCTTTTACCATTATCATCTGTCATGACCATTGCAACAAGATTAGCCTGTACTTTATATTTTTTTCTGACTAAGTGGTATTGTTGTTTTCTATCAATAACAATTTGTCTAATAGGTGTTGCATATACACTTTTGATTTTAATTGGTTTATTAACAGTTGTTATCCCGGCTTTTTGTAATTCAGCAATAGCGTAACTACCGTAATTATCTTTTGCTAGTCTTAGATCTATTTCAATCATCTTGACTAATACTTTTTGCCTGAACTCTCTTGCTTGCTGTAATGTTAAGGCAAAACATGTTCCTGTATCATTTTTCTGGAAGCAGCCATTTCGCTTATCTATAAGAACAAACATTTTACGAGTTTTATCATAATATAGCTGATAGTCAGGAGTGTTTTTGCTATGTCCAATATAAACAAATTTATCGCCAGTTAGCATGCCACATGATGCTATTATTAGAACAAATAAAAGTAATGATGTCTTTTTTAAAAAATTGTGCATATTAATTCCGTTTTATACTTTTACAAAAGAAATTTTGCCTAGTTGCTATCAAAAGTAAAGTCTTGTTTACCAAAATGGTTAAAAAAACTATACTTGATAATTAGAATTTTCTTTCATAAGTTTCTTATACTTTTTTTCTATCATTTTTCTCTTAAGAGAACCTAGGTGATCAAAAAATGTTATACCATTTAGATGATCTATCTCATGTTGAATACAACGAGCTAAGAATCCATCTTTTTGAATTATAACTTCTTTACCAAACTCGTTTAAAGCAGATATCTTAACATTTGTAGCCCTTTTTACTTTTGCAGAGACACCAGGAAAGGAAAGACAACCTTCTTCATCAATCACTTCACCATCTTGCGCTATTATCTTGGGATTTATAATAGCAATAATTTCTGGAGATGAATCATCTAAATTATCAAACATTATGAAGAATCTCTTTTTGATACCTACTTGTATAGCTGCTAGTCCAGCACCATTTGCATCAAGCATCATCTCACGCATTTCATCTAGAGTTGTACGTAGTTGATTATTTATTTCTTCTTTCTTAAGCTCCTCAGCTACCTCTTTTAAGATTGAGTGAGGATATTTTAAGATTTCCAAAGACATATTTATACTCCTTGTTCTAATATATCTTTCTTGATTTTTGCCATAGTTAGTGCAGCTTGCACGCAGTACTTACCTTTGTGACCTTTTTTACCACCAACTCTTTCTAAGGCTTGCTCTTTGTTATGTGTAGTTAATATACCAAAAATTACCGGTAAATTATACTCATGCATAACTCTTTGGGTGCCGTAGCTTACTTGATCACAAACATAATCATAGTGATCTGTTTGTCCACGAATTACACAGCCTAACAGCACTATAGCATCAAATTTAGAAGTCTCAGCTAAAAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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>NZ_CP022132|348172:357740|352885_353329_-|WP_088771859.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_088771859.1|352885_353329_-	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	8.4e-26	44.3
WP_088771860.1|353337_354546_-	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	1.5e-96	48.3
WP_088771861.1|354538_355144_-	riboflavin synthase	A0A2I2L4R9	Orpheovirus	8.3e-24	40.5
WP_088771862.1|355136_356207_-	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A1V0SE20	Indivirus	4.4e-52	35.5
WP_157671350.1|356774_357740_+	cation:proton antiporter	A0A2H4J178	uncultured_Caudovirales_phage	6.3e-26	34.8

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP022132|436402:517754|DBSCAN-SWA
TCTACCCCGTCAATTTGTGACAGTTTACTACTTCATTTTCCATTATATATTCAAATTGATATGGAGTCATATAATTTATTGTAGAATGTCTCCTTTTTGTATTATAGTAAGCTTCAATATATTCAAATATTGATAGTTTAGCTTCTTCTCTAGTTTTATAGCTTTCATCATGTACTAACTCTACTTTTAAAGTTCCAAAGAAACTTTCACAAGCAGCATTATCGTAACAGCATCCTTTAGAGCTCATACTTGATAGTAGCCAGTGTTCTTTAATAATGTCTTGATATTGTTTGCTACAGTACTGTGACCCTTTATCAGAGTGTATAATCACACCACTAGGAAAATTTCTTCTAAAGGATGCCATATTTAAAGCATTACAAACTAAATCCGCTTTCATCCTAGAATCCATTGCCCAACCAATAACTGATCTTGAGAATAAATCTATAATCACACAAAGATACAGCCACCCCTCTTGTGTAGGTACATAAGTTATATCTGTAACCCACCTATGATTTACAGATAAAGCAGTGAAGTTTTGTTCTAATAAATTATCAGAAACATGTTTGTTGTGGTTAGAATCTATAGTTTTCTTATGCTTACGAGCCGCTTTAGCATGTAAACCAAGTAATTTCATACGTTTAGATACTCTAGGTTGAGTAACTTTCCAACCCATATCTTTAAGCTCTTTGTATATCCTAACACTTCCATATCTAGATTTATGTTCATTAAAATAGCATCATCTAGTTCAGCATCATTATATTGCCTTTTACCTATAGGTTTATGAATCCATCTGTAATATGAAGATGTGCTCACATTCAAAGATTTACATAGTGTTGTTACTGGCATAACTTTATAATGCTCCTTAATAAAGGCGTACCTTACAGATTTTGCTTTGCAAAGTACGCTGTGCCTTTTTTAGTATTTCACGCTCTGTTTCTGCCTGTTTGAGTTTTTTCTTCAAATCAGTATTTTCAAAAGATAGTTGCTGGTACTGCGTTTTATAATCTATCTTTATTTCTTTCTGAGGGTTTGACATGGCTTTGGATATCCAACTGCAAATGGTTTTATATTTAACCCCTAAATTATCTGCTATTTCTCGTCTATTTGCATCTGGTTGTAAACATAATTTAACAGCTTCATCTTTAAACTCTTTTGTATATCTCATCTTGTCTCCTTTTCTTAACACCTAAGTGTCCCAAATAGGAGGGTATGATCATTTTGGAGAAGTGCTAAATGTGAGAGATTTTATTTAAATCAATATCCTGGCATTGTTGAACTAAGAAACGATGTGGATGATTATATAGATTTTTATAATAATAGAAGATTTCATGAGTCTATCAATTATAAAAAACTTATGGAATTTTATTACGATAACTTATTGGAAAAACGGGCGGCTTAGATGGGAACTAAATAATTGAAAATATTGTTTAATTTATTAGGGTAGTATAGTTGAGATCCTGTAGAATATCCATCTACAATTCCAATTGTTAATATACTCATAATGACCTCTTAAAATAAATTTTTGTTGTTTTAGGTATTGATTTTTAAAACTAAAATCATTTCCGTACTCTTAATAGTTTGTTCTATAAACTTTTGGGAATACTTTCCTCGTAACAGAAATGCTTAGGAATAAATGCTTTCTTGACTCCACTAACAAATAAGTCTAGATTTTCATGGGAATTTGAAATTGCGATAGTATAAAAATTCACACTATTCCAAATTAATTCTGCATATAAAAAAGAACATTTAATTGCTTCTAATAGCTTATCCAATGTTACCATTCCTTCATACATAGTGTTAAGTATTGTTTTTTTTTATGGCAATTTGGTTTATGTCATAATATTGAGATTTGAAAAGATGATCTTTTATTTGTTCTCTATGATCATAATCATCACTATTACATTGTTTTAATTTTTCTTCTAAAATTATTATTCCATCTTCTTGTAATACGTTTGTGAGGATTTTTATTTGATTGATTCTATCTGGGTTGTACATTTGAAATACATTTCTTTCATAAATAACATTAAAGCCACCAGTAAAGATTTTTAAGTCTTTATCTGAGAGTATTCTCTTTTTTGTTATTTCATAGTAAGGTATGTTCTTAAAAATAGCTTTGTGGCTATTTACATACTTATCAAACTCTACTTGATTTTCTTTTGTCGATGAAGTGCATAAAGATGCTATTCGATTAAAACTTATCTCTGATAAAATTCTACTTAAATCTCCGCATCCACCACCTGGTTCATAAAAAGAAAAATTATTTCCATTTATGCTTTTCTTCTGTTGGTAAATGTAAATTGCATCTATTAATCTAATGCAGTTTTCAAGAGCATATGGACAACTTGAATAAAAGTGTTCATTGAACACGCCTAATCTCCCTTTTAATTTAGTATAAATTAAATTAAGAGAATGATTTTTTTTGAGGTACTCTTTATTTGGTCTTACTAGGCGCTTTGGTTTTTGAATTTCTCCACTAGCTATATCTGCAAAGTGCTTAGACAATGACCCTACTCGCGGAGATATATTTAAGTGTTCAAAAAAATCATCTGGAATTTTATTACTTATCATATATACCAATGAATCTTAGTTATATTATTATCCTAAGCTGTATTTTTTAAAGCTTCTAGTTATTTTTTCCAATTGTCTGCTCATTGACCACTATTTACTGCCAGCCTAACTATCAAAATAGCATGTAATCTATCTCTAGGCCAGCTCATGTTGTTTATCTTTATATTTTTGATTTATTAAACTTCCAACTATAATTTGTATTAATTTAGCCATAACTTTGACTCTATCTAAATATTTTTTGGTATAAAAGTCAAACCCTATAAGGGTTACAAGATATTATCAAAATTTAGACCATGGTTCAAATCCATTTAACAAAATAAGGGTACTGTTGTAACTATTCAGAAGCTATCAAAAAAACTCTGTTGTTTGTTTTCTGCAGAATATTGAATAATCCAATAATAGGTGATTGTATGATCTGCATCTCCTCCTCTTTCTTTAAGTATCTCCTCTAATTCTCTATAGCTAACACCATATTTTAAATACCAACGGATCGTCCATAAGATAACTACGCCATTAAATTGTTTGTATTTAAACTCATTCATAACATATAGATGATAAAATAATTATAGATGAAATCTAGAATATTTAAAATTATTGATCAATAGTTGTAATAGTGCCAAATTATTTACCAAAAATTTTCATTTTGTGAGTTTAAAATAAAAAAATCTTGAAAAAATAATAATAACTCTCATATATATCTTTGTCATAAATTTATTTAAAAGAGTATAACAAAAGAGGGTTATATAAAATGTCAGAAAAAAAATATACTTTTGAAACTGAGGTAGATAAATTACTTCATCTTGTAATTCATTCACTATATTCAAATCGTGAAATTTTCCTAAGAGAGTTGGTATCAAATAGCTCAGATGCGATTGAGAAATTAAGATATGAGAGTATCTCAAATGCAGAATTAAGTGAAGATGATACTAATTATGCAATAAAACTAGATTTTAATAAGGATGCGAAGACTATTACAGTTAGTGATAATGGTATTGGTATGACAGAAGAAGAAGTTATTGAAAATCTTGGCACTATTGCAAAATCAGGGACTAAAAAGTTTTTGGAAAGTTTAAGTGGTGATAATAGCAAAGATAACGAGCTTATTGGTCAGTTTGGTGTTGGATTTTATTCTTCATTCATCGTTGCTGATAAAGTTACTGTTAGAACAAGAAAAGCAGGGCAAGATAAGGCTCAAGCTACTAAATGGGTTTCTGATGCACAAAGTGGTTTTACAGTAGAGACTATCACTAAAGAAAAGCGTGGTACAGAGATAACTCTTCACATTAAAGAAGATCAATTAGATCTATTAGAGCATAATTTACTAAAAGGTTTAGTTAATAAGTATTCTGATTGTATCAACACTCCAATTCAGATGAAAAAAGTTGAAACTGATGATAAAGGTGAGCAAACAGTCAAAGATGAGTATGAAACAGTAAATAATACTAAAGCTATCTGGTTAAGATCAAAAGATGAAATAACTGATGAAGAGTATCAAGAGTTTTATAAATATCTCTCTCATGATTTTGCGGATGCTTCAATGTGGATACATAATAAAGTTGAAGGTAACCTTGAGTACAATAGTTTGTTATATATCCCGGAGAATAAACCTTTTGATTTCTGGAATAGAGACAAAGATTATGGTTTATCTTTATATGTACGTAGAGTATTTATTATGGAGAATAAGGAATTATTACCTCCATATTTAAGATTTGTTAAAGGTGTAATTGATTCCGCTGATTTACCATTAAACGTATCACGTGAAATTTTACAGCATAACAAAGTTATTGATAAAATTAGAAAGGCTACAGCTTCTAAAGTTCTTGGTGAACTTAAAAAGCTTGCTAATAAAGATACAGAAAAATATCAAAAATTCTGGGATAACTTTGGTCAAGTGCTTAAAGAAGGTATATCTGATGATCACTCAAATAAAGAAAAGATCGCTGGTTTAATGAGATTTGCGACTACTGAAAGTGGTGATTCTAAGCAGATAGTTTCTTTAGCTGACTATATTTCTCGTATGAAAGAAGGTCAAGATACTATCTACTATATTACATCTGATAGTCATAAGGCAGCTGCTAATAATCCTCAGCTTGAAGCATTTAAGAATAAAGGTATCGAAGTAATCCTTATGTCAGATAGAATTGATGAGTGGATGATGTCTACATTGACTGAGTTTGATGGTAAGCATATGAAATCCATTATCAAAGGTGACATTGATCTTGATAAGTTTGAAACTGAAGAAAATAAAGAAAAATTTGAAAAAGAATCTAAAGATTTTAAAAAAATCTTAGAAGAAGTAAAAGAATCTCTTAAAGAAAAAGTTGAAGATGTACGTTTATCTAAGCGTCTAACTGATTCTCCAAGCTGTGTAGTTGTAAATGACTATGGTATGAGCTTACATATGCAAAAGATGATGGAAGAAGCTGGACAAT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MNIINGGLECSKPTPAKVDGRVAFFKRYAQMLNTTTGDNLYCNNMQHY

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_088771820.1|437031_437247_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671387.1|437263_437587_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671389.1|437984_438173_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771948.1|438198_438969_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771949.1|439307_439511_-	hypothetical protein	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.4e-12	49.2
WP_088771950.1|439717_441604_+	molecular chaperone HtpG	A0A1B1ISV4	uncultured_Mediterranean_phage	7.8e-105	35.1
WP_169709695.1|441712_441844_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771951.1|441877_442870_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	3.9e-23	30.3
WP_088771952.1|442967_443879_-	ornithine carbamoyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088771953.1|443875_444682_-	acetylglutamate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_088771954.1|444678_445869_-	bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase ArgJ	NA	NA	NA	NA
WP_088771955.1|445883_446909_-	N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase	NA	NA	NA	NA
WP_088771956.1|447069_448254_+	ornithine--oxo-acid transaminase	A0A1V0SKB7	Klosneuvirus	6.1e-31	28.1
WP_088771957.1|448242_448698_-	ArgR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_088771958.1|448933_450127_-	argininosuccinate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_088771959.1|450131_451388_-	argininosuccinate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_169709691.1|452453_452864_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771960.1|452961_453153_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771961.1|455520_457161_+	CTP synthase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	1.2e-149	50.9
WP_088771962.1|457230_457653_+	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.4e-17	40.5
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WP_088771991.1|490045_491683_+	chaperonin GroEL	A0A240F779	uncultured_virus	1.1e-168	59.1
490283:490297	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_157671393.1|492301_492460_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	U5P429	Shigella_phage	2.3e-10	58.8
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WP_157671399.1|495768_496050_+	DUF2062 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088771820.1|502822_503038_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671640.1|502974_503424_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.0e-28	41.7
WP_088772001.1|503420_503666_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.5e-11	51.5
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WP_088772013.1|511498_511855_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773433.1|512222_514154_+	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_169709741.1|514157_514808_-	DUF4124 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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518133:518147	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP022132|527857:584037|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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>NZ_CP022132|527857:584037|565549_566314_-|WP_088772053.1|DBSCAN-SWA
MKRIILLLALLISSEYLFASNNIYQEGTITALTNGIYSSDTSLKTLESKGRYGLGTIEGAKGEMIIFKGKAYLSDISGKAVPLKGSVTVPFADVFNFSKPQINSSYNSLTIPSIFSMISNKLYGDNYFYIIKISGKYSKIHARTIPPAQKGYTLSKWIAKNQKFHDLKNVEGTLIGIYSPKYLSSITVPGFHFHFITKDHSRVYHVYSFRSAQVNVQIEKMNNLQIILPNTKEYQNGSIESFSHDTISKMEEGK
>NZ_CP022132|527857:584037|534895_536032_+|WP_169709704.1|DBSCAN-SWA
MTLKKNISDKIRMVDQISFREYMQLALYYPELGYYSGSKDKISSQGDFITATTQSSLFARTFARQFALVLSELGDDTSIIEFGAGNGKFATDCMDELEKLELLPNKYIIIELSNDLKSRQRNHVKKNIPKLYDKFIWLNELPKQKMKAVVFANEVLDAMPVDIFKSNEGQLFQQGVVMGNNYEFELENMPENENRFSLEVSRVLDDGVIFETGYTSEINTWIRPWIKALKDSLSQGMVFLCDYGYHRAEYYSKERSMGTLACYYQHKVNFDPFINIGNQDITAHVDFTTVAEAATEEGFQFDGYMTQANFLKRSGISEVFSDFSKSLSLKQRLKYNNDIKDLLLNDKLAEVFKVIGFSLGFDFVMDVFDNDDNVDYLL
>NZ_CP022132|527857:584037|531370_532375_-|WP_088772026.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MSQKIILTGVTPSGTPHLGNYVGAIKPAIEMVQNADFKCLYFIADQHSLIKLWDKKLRQQYIYEIASSWLALGLNYNKAHFYRQSAIPEIMELTWIISTTAAKGLLNRAHAYKAVVDQNIQEENVDPDKGITMGLFNYPVLMAADILMFDADLVPVGKDQIQHIEIARDIANRFNHIYKKTVLKTPQALTSEDSQTILGLDGRKMSKSYDNTIPIFSTEKKLRKQIMKIITNSQLPEEKKDPDDCTVFSIYKSIATESETAFLRDKYIAGGLGWGDAKQILFEKVNEYLADARERYEYYINNPKIVDDILSQGAERIRPYAINKLKEIKDIIGI
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MDRLLKNIRIVLVEPSHSGNVGSTARAMLNMGLTNLWLVNPKKGIDDEAIALSCHATEVVKGAIIVNSLDQALEGIYYVVGTSARVRKVSLPIEPISKVATNILNKIQKSDEKIAILFGRERTGLLNEELLMSNVHAYIPSNEGYTSLNLAQAVQLVAYEIHKQMIESIDAKSVPEYNHLHKKASIKELQGLYQHLENSMLNTGFLDKDKPGHVMDKLKRLFQRSELESQEVNILRGFLSSLNIKE
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MRYTKEFKDEAVKLCLQPDANRREIADNLGVKYKTICSWISKAMSNPQKEIKIDYKTQYQ
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MSTSSWKKALKESFYSPLELLEFLQINNNKFRVSLKATSKFKMVVTRSFVNRMEKRNINDPLLKQVLPIIDEEVIDSNYCSDPLQERKYNKIPGLLHKYHGRALLIAQTSCAIHCRYCFRKEFDYKDNIPGKKDWFRAFDYIKNDTSIEEIILSGGDPLLNNDKVLDFFLKNLKDISHIKRVRIHSRIPIVLPERITIDLLNVFSKYKFNVILVIHANHPNEIDNNIIEVLRKIHKSGIVILNQSTMLKNINDDANTLYVLSTKLVEARVIPYYIHLLDPVSGTRHYSVNNARSIMKKLSEISSGYMVPMLTKEIPGYPSKKWISFHE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_088771596.1|527857_529015_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.1e-23	30.3
WP_088772024.1|529323_530628_-	sodium:proton antiporter	A0A2H4J178	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-25	35.6
WP_088772025.1|530639_531365_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772026.1|531370_532375_-|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_157671405.1|532585_532738_-|transposase	transposase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772028.1|533066_533633_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772029.1|534144_534759_-	dephospho-CoA kinase	NA	NA	NA	NA
WP_169709704.1|534895_536032_+	SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772030.1|536353_539032_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_088772031.1|539049_540918_+	pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772032.1|540931_542344_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	4.4e-44	28.7
WP_088772033.1|542352_543339_+	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_157671630.1|548954_550088_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671641.1|550282_550768_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.7e-35	44.3
WP_157671407.1|550704_550905_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772035.1|551042_551225_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671408.1|551304_551451_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671630.1|551792_552926_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772036.1|553349_554294_-	glycerate dehydrogenase	M1I539	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	6.8e-25	28.9
WP_088772037.1|554562_555132_-	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_088772038.1|555420_556017_-	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
WP_169709705.1|556026_556185_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772039.1|556269_557196_-	cysteine synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772040.1|557410_557608_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772041.1|557611_558964_-|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis GTPase MnmE	NA	NA	NA	NA
WP_088772042.1|558967_559219_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772043.1|559348_559657_+	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_088772044.1|559692_560148_+	PTS sugar transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_088772045.1|560140_560881_+	RNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772046.1|560891_561464_+	ribonuclease HII	G4YAY0	Emiliania_huxleyi_virus	4.9e-26	41.2
WP_088772047.1|561709_562879_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772048.1|562922_563468_+	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772049.1|563464_563872_-|protease	ClpXP protease specificity-enhancing factor	NA	NA	NA	NA
WP_088772050.1|563873_564491_-	glutathione S-transferase N-terminal domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772051.1|564551_564941_-	30S ribosomal protein S9	NA	NA	NA	NA
WP_088772052.1|564956_565385_-	50S ribosomal protein L13	NA	NA	NA	NA
WP_088772053.1|565549_566314_-	acetolactate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_157671410.1|566514_568131_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772055.1|568404_569580_-	NAD(P)-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772056.1|569572_570790_-	murein transglycosylase A	NA	NA	NA	NA
WP_088772057.1|570895_571471_+	nucleotide exchange factor GrpE	NA	NA	NA	NA
WP_088772058.1|571565_573497_+	molecular chaperone DnaK	G8DDB7	Micromonas_pusilla_virus	3.0e-144	50.1
WP_088772059.1|573585_574713_+	molecular chaperone DnaJ	E3T4P7	Cafeteria_roenbergensis_virus	6.5e-30	34.0
WP_088772060.1|575107_576265_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.1e-23	30.3
WP_088772061.1|576352_577714_+	sugar porter family MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772062.1|577726_578584_+	phytanoyl-CoA dioxygenase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772063.1|578588_579566_+	Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_157671412.1|579777_579921_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671639.1|579922_580615_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.0e-49	46.0
WP_088772065.1|580845_582000_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772066.1|582283_583441_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.3e-22	29.9
WP_088772067.1|583437_583626_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671249.1|583728_584037_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP022132|594413:636939|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_157671285.1|636630_636939_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP022132|656223:689168|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_088772142.1|670674_671457_+	enoyl-ACP reductase	NA	NA	NA	NA
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WP_088772147.1|678420_679119_+	putative DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088772150.1|681696_682365_+	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_088772151.1|682422_683448_+	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	8.9e-87	49.1
WP_088772152.1|683444_684110_+	pyrimidine 5'-nucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_088772153.1|684096_685203_-	carbohydrate kinase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088772155.1|686301_687165_+	isoaspartyl peptidase/L-asparaginase	NA	NA	NA	NA
WP_088772156.1|688022_688322_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671432.1|688484_689168_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.2e-47	45.7

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP022132|701604:750944|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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MKPIDFVRSFEKDLLEFSDYTSNDARTFIGCINPSKKTVILEKADISTNAKYDFQFVLLKQRNVSWDSNLLNKAYDSVRNRKSGVCTTFAYAAAHIISSGRLAEAPLIEIVAYSNHIFIIVGRNHSYNGNLRNRNYLDDISYWGGEYVIIDPWAIAMGYDIAFYTKSNFNSYPYKNMIRNLSLEMANKPPESAGNQEQDSYNNFMSAFNF
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MSRVKRGVTARARHKKVLKQAKGYYGARSRVYRVAKQAVIKAGQYAYRDRKVKKRTFRSLWIVRINAAARQHDISYSQLINGLNKAGVELDRKVLAELAVYNKDAFATVVEKAKAALA
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MIAIIDCCGSNFASIKYAFEKLGQEIVLTHDAEVIKKAACVIFPGVGHAKSAVANLKKYDLDKLIQQLKQPVLGICLGMQIMYSFSEEGNTACLGIIPEKVKAFKKTQGFSIPHMGWNSLQNINKNHFLFKDIAEDDYVYFVHSFYAELNRFSIATNDYINDFTAMVNKDNFYGIQFHPEKSGNVGMKILENFIQGVL
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MIKKNILLLSILFFTSYSYSTNIQIDRGNIPIEYFPYSIQQQILASENDTPTYSGPIANSIDNIQDSMSIDELFEDRLTNKVRRKIALKDRDSCNQNASDCDDFGRYLATSIFEIAEDRGFVALINISITEQIVQGRVEYTYTSPSTDRLYTSYYDPSIDDPAQQIYENFAPTKNG
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MIGIYNWQNISLVKQKELLNRPINANKSSLIEGVKNILSEVKQKGDSALLSFTAKFDGVDLDSIEISQDEIKNAYSLVSQNDIDLIKSSIARISNYHEIMKPKTTICDTSDGVICKKVYKPIEKVGLYVPGGSAPLVSTLIMLAVPAQIAGCKEVYVTTPCDKSGNVHPLILIAADICKVSKIYKLGGAQAIAASAYGTETVAKVNKIYGPGNSWVTEAKQQVSNDSQGAAIDLPAGPSEILVIADESSDPRFVAADLLAQAEHGIDSQALLIITDKNLADKVKQEVFKQTSSAERKAIIEKSLENSAIIVVDTLSQAINIANEYASEHLILNIKNADDYIDSIENAGAVFVGPWAVEALGDYITGSNHVLPTYGYAKAYSGLATIDFMKAISIQNVSKQGIKNIGEMAMRLAYIEGLKAHENAVKIRLESL
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MKNTLLTIGGSDSSSGAGIQADIKTAKNIGVHASTVISCVTAQNSETVLDIENVSINIFKKQLQAVVSDFNIKVIKTSLLVSIEQIDVIVDLLSTLQGVIYICDPVMISTTGKSLVSKEVIEYARVKLYPLADILTPNLDEAKLLLDHNINNFSLSNAAQAIQEKYLCESILLKGGHNLEKSICTDFYYSNKKNGYSLVSVKYKRDIKIRGTGCTLSSAIASFLVLEFDINNSIVMAKSYITNAIKNSQKLTTGASYLATINLLSFDKDFPRVFFDKIFSNLEFRSISKIGFYPIIDDANKIPHLVNLGVKTIQLRIKSKDISYVERHIIRAIKYQNKYRLQLFINDYYELAIKHNAFGIHLGHEDLLKLFKFSKKTLFKISDSNIALGLSTHDYYELAIALAIKPSYIALGPIYATTTKEMKFEPQGLNKIHQWLEILDLPLVVIGGIKKKHIKAIKNIGADGIAVVSLVDEILDSELEAIVKFLG
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MQQYDNVHSVRWRVKDPAHLLRKIVRKKKEANKKYADISVKNYLKIITDLIGIRALHLFKNEWEDIYHYINQKYETYEKIVYIRKGDNEVAEPKDYNVPRKSY
>NZ_CP022132|701604:750944|750197_750944_-|WP_088772215.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MTKTEKKLRHYITKAIADYKLIKKSEKVMLCLSGGKDSFGLLKVLHGLIKDKTYDIDLHVYTLDQSQPGWDDSQLRKYLDNLRVSYEIETKNTYGVVMAKVPEGKTYCSLCSRLRRGNIYRYAKEHKMDKIILGHHRDDLIESLLMSILYQGQIKSMPPKFITQDGENTVIRPMVLVQERDLIEFAKEEEFPIIPCNLCGSQENLKRKKVKKLIQDLAHENPKVPSNILNSLSNVLPSHLMDKNLYNI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_088772170.1|701604_703512_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L6B6	Tupanvirus	3.1e-125	37.3
WP_088772171.1|703518_704055_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	9.9e-13	32.1
WP_088772172.1|704094_704292_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_088772173.1|704339_704696_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_169709710.1|704806_705451_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671645.1|705461_706154_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.0e-49	46.0
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WP_088772176.1|706681_707356_-	ribose-5-phosphate isomerase RpiA	NA	NA	NA	NA
WP_088772177.1|707357_708728_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772178.1|708743_709133_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772179.1|709148_711029_-|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
WP_088772180.1|711175_712273_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_169709711.1|712247_713141_+	FUSC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671438.1|713334_713469_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_088772181.1|713631_714528_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_088772182.1|714640_715363_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_088772183.1|715484_716117_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772184.1|716547_716847_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772185.1|717078_718527_+	exodeoxyribonuclease I	NA	NA	NA	NA
WP_088772186.1|718527_720534_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_088772187.1|720564_721362_+	NERD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772188.1|721361_722156_+	glutamate racemase	NA	NA	NA	NA
WP_088772189.1|722423_724202_+	phosphomethylpyrimidine synthase ThiC	NA	NA	NA	NA
WP_088772190.1|724194_725259_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_088772191.1|725269_725470_+	sulfur carrier protein ThiS	NA	NA	NA	NA
WP_088772192.1|725474_726254_+	thiazole synthase	NA	NA	NA	NA
WP_088772193.1|726263_727727_+	bifunctional hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_088772194.1|727731_728490_+	HesA/MoeB/ThiF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772195.1|729836_730370_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_157671646.1|730441_731407_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772134.1|731470_731611_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772197.1|731950_732193_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772198.1|732696_734067_+	exodeoxyribonuclease VII large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_088772199.1|734066_734264_+	exodeoxyribonuclease VII small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_088772200.1|734266_734797_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772201.1|735049_736219_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	5.9e-26	33.1
WP_157671440.1|737001_738126_-	YdcF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772203.1|738241_739513_+	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	3.9e-39	26.1
WP_088772204.1|739705_740002_+	His repressor	NA	NA	NA	NA
WP_088773444.1|740003_740894_+	ATP phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772205.1|740903_742202_+	histidinol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_088772206.1|742206_743280_+	histidinol-phosphate transaminase	A0A1X6WGT4	Pacmanvirus	3.3e-15	25.3
WP_088772207.1|743266_744343_+	bifunctional histidinol-phosphatase/imidazoleglycerol-phosphate dehydratase HisB	NA	NA	NA	NA
WP_088772208.1|744339_744936_+	imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH	NA	NA	NA	NA
WP_088772209.1|744936_745662_+	1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5- phosphoribosylamino)methylideneamino]imidazole-4- carboxamide isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_088772210.1|745655_746429_+	imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF	NA	NA	NA	NA
WP_088772211.1|746437_747061_+	bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP diphosphatase HisIE	NA	NA	NA	NA
WP_157671442.1|747475_747787_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_169709706.1|747848_747980_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671647.1|748484_749165_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	4.9e-49	46.0
WP_157671333.1|749325_749649_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772214.1|749653_749962_+|transposase	transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.2e-10	38.6
WP_088772215.1|750197_750944_-|tRNA	tRNA 2-thiocytidine(32) synthetase TtcA	A0A0U2S5Z2	Escherichia_phage	9.4e-62	45.9

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP022132|766110:824301|DBSCAN-SWA
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MSVVFINTPFTRLKLGYTNNTQGFSKEKYAKLNLSDNVGDKHLVVEKNRNLFKSYVNADVKWLRQNHTNIVKNFDEYDGEFCDAIFTSRPKQACVVLTADCLPIILFDKRMTKVAAIHAGWKGLSKGILEETLKEFVGLDIVAWLGPCISEPYYEVGGDIHNKFLQQHENFGQAFRQKSDDKYLFDMKFIAKQILNDNHCFDIVDSSLCTYSNKRFYSYRKEGITGRQATFVWFE
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MSIILIFFIIILIFLQVKKLSFNIRTILALIAGILIGIIYNLIDYHSTVFIQISDVLGNGYISLLKMLIIPIVLTSITHSIINLKNYDGSYVIKFAYKTIAILLILTGISAAIGALVAIIMNLGHGLDLASITGDATKQHTSTISQTILGFLPNNLVYSMNKNNVMAVVIFAILLGFSMLIAHRENSKLAAPFIDFIDSVFFVIKKLARIIISITPYGVLGLMIQMSVELDKNSISTVLYFILTCYIALMFVLIMHILLLLIFRTNLINFYKNIWRAMLVAITSRSSMGTLPLSIDGLSNYGTTRSIATFAPTMGTTLGMNGCAGVFPAVLVIMAMNAAGTPITFSTILLISFICMIASLGVSGIPGTAFIAAGVVFSYFGLPWHMIALIIGVDAIIDSFRTPINIHGTMVTAIIVDKTTKKSQQF
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MKQIKTDICVIGGGSGGLSVAAGAVQMGARVVLCEGGKMGGDCLNYGCVPSKAMIEASRIIHNCHKAKEFGIDIKNFATDYKKVQEHVANVIAKIEPHDSVERFESLGVDVIQDYAHIVDKKTVQAGDIQIKAKYIVLATGSRAKIFPIEGLADVDYLTNETIFSLDKQPEHLLVMGGGPIGVELAQAHALLGSKVTILEAEPTILGPVDSDCRQILLDEFEKLGINVVTNTKVTKVSKQDTQIQLETSGGVYSGSHLLVATGRQPNIEKLNLEKVGIKHSARGVNVDTRLRTNYKNIYAIGDLASQYQFTHTAGYHAGIVIQNILFKLPAKVNYSSFPWAIYTTPEVAHAGMPIKQAEQEGATILTLPYDSNDRAQANLSTNGVVKIAVNKKGYILGASIVGEQAGELITQWTLAIKNKLKIKQMASHIVPYPTLSELNKRVAGSYFTPSLYSEKVKRIVSFLLKF
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MQGKIITNFGGNILVKLTNNEKISALYRGSFKGELTVGDNVELEYMNSTYVITNLLERKNLISRPNQYQRKNKNVAANIDYAVIIITHSPAPVEHYIDRYLVALHNSDIEPIIVVNKIDSQTPKDKEFIENLVNVYKNIGYKVFYISAKNNIGINKLLETLEGNTSIFLGQSGVGKSETLNTILGKKITETTAVSNSTKKGRHTTTCSTLYDIKDNTNIIDSPGIREFGLWHISREELFDGFLDFKKYKGMCQFRNCSHEESPKGCEIVRQLNQGNIDPTRFKNYHRILAKIK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_088772227.1|766110_767280_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	5.9e-26	33.1
WP_088772228.1|767363_767831_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772229.1|769114_769927_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772230.1|770016_771372_-	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_088772231.1|771429_771888_-	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772232.1|771894_772332_-	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_088772233.1|772333_773161_-	symmetrical bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase	A0A172Q076	Acinetobacter_phage	4.9e-11	26.5
WP_088772234.1|773172_773952_-	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_088772235.1|773953_775369_-	SurA N-terminal domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772236.1|775368_777972_-	LPS assembly protein LptD	NA	NA	NA	NA
WP_088772237.1|778098_779844_+|tRNA	arginine--tRNA ligase	M1PAX3	Moumouvirus	1.7e-61	30.4
WP_157671450.1|780036_780204_+	FAD-dependent monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_088772238.1|780230_781010_+	FAD-dependent monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_157671648.1|780952_781645_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.6e-47	44.5
WP_088771820.1|781581_781797_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671347.1|781829_781988_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772240.1|782161_782473_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772241.1|782755_783004_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772242.1|783104_783299_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772243.1|783473_784355_-	ribosome small subunit-dependent GTPase A	NA	NA	NA	NA
WP_088772244.1|784510_785227_+	DUF2147 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772245.1|785292_785946_+	DUF2147 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772246.1|785960_787754_+	DNA mismatch repair endonuclease MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	7.2e-92	34.4
WP_088772247.1|788304_789474_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671452.1|790040_790196_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671454.1|790554_790737_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772249.1|791136_791835_+	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772250.1|791831_793235_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_088772251.1|793246_793834_+	CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772252.1|793835_794657_+	DUF547 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772253.1|797103_797328_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671456.1|797712_797895_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772254.1|798235_800053_-	translational GTPase TypA	NA	NA	NA	NA
WP_169709713.1|800316_801201_-	1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_088772255.1|801206_801377_-	rubredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_088772256.1|803353_804745_+	YdiU family protein	A0A075BSJ0	Microcystis_phage	7.4e-44	31.5
WP_088772257.1|804741_806022_-	dicarboxylate/amino acid:cation symporter	NA	NA	NA	NA
WP_088773449.1|806200_807232_+	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772258.1|808687_809434_-	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772259.1|809531_810737_+	flavodoxin-dependent (E)-4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl-diphosphate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_088772260.1|810758_811466_+	peptidoglycan editing factor PgeF	NA	NA	NA	NA
WP_088772261.1|811494_813279_+	aminopeptidase P family protein	A0A0P0I8D7	Acinetobacter_phage	5.5e-92	35.1
WP_088772262.1|813336_814398_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_088772263.1|815793_816156_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772264.1|816127_816367_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671458.1|816908_817082_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772265.1|817105_817399_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772266.1|817420_818470_-	DNA replication/repair protein RecF	NA	NA	NA	NA
WP_088772267.1|818471_819218_-	TatD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_088772268.1|819477_820044_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772269.1|820153_820423_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772270.1|820712_822800_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_088772271.1|823143_824136_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	5.2e-23	29.9
WP_169709695.1|824169_824301_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP022132|831072:880045|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP022132|831072:880045|865091_867689_+|WP_088772306.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MTTTKELRNKFINYFKSKNHSYQPSSSLIPFGDETLLFTNAGMVQFKDVFLGFEQRDFSRAVTVQKCLRAGGKHNDLDNVGYTARHHTFFEMLGNFSFGDYFKKEAIEFAWEFLTKEIKLSVEKLWVTIYATDEEAFDVWHNHICLPKERIIRIDSSDNFWSMGDTGPCGPCTEIFYDHGEDVSGGLPGTPEEDGDRYIEIWNIVFMQYNRHADGSTSDLPKPSVDTGMGLERIAAILQNVHNNYDIDLFQALIKKAQQITNTEDADSASLKVIADHIRSCTFLIADGVLPSNEGRGYVLRRIIRRAIRHGNKLGANEVFFYKLVDELVNQMGDAYPQLVEKRELIEKALIKEEELFLKTIEKGIKIFEAEIGNLKDNRISGDVAFKLYDTYGFPLDLTADMAREKGLMVDEPTFQKLMQEQKQRSKDAGKFNIDYNNMINSQVKSEFKGYSTLIEDAKVLEIYQDGILVDEVVEQTLAIVVLDKTPFYAESGGQVGDKGFLEGAGIEFIVEDVQKSGSAILHLGKISKGVLRKSDEVTARVNDQQRLAIAANHSATHLLHKALNIVLGDHAEQKGSLVDQRKLRFDFIHDKALSRKQIEQIETLVNQQIRINHPVNTIETSQEKAENMGAEALFGEKYGDIVRVISMGNFSIELCGGTHVSYTGDIGLFKIVSEGGIASGIRRIEAITTQQAIDYTFEIENKVVTIKKFLKANDSNIFDKLESLLEQVKNQEKQIAKLKKDLLSGSSSDIKEQRYGDTIVVVANIEGADVKMLREKIDDYKSKNDKVVAVLSTINSSKVQFVIGVSKSLTSLIKAGDIARELSSHIDGKGGGRPDMAQGGGNNSANLDGALAKVEKFICRNIKE
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MKALTQKLHKEIKRLHSSQGRKKSPYYIIEGVRCCQEAIERLSKLEIYAIITTEKLDNKLYHSDKKHIHIVSEKDFNELSQTQNPQGILILAYKKDFKELKFNDNFILVLDRIQDPGNIGTILRTAIAVGLKEIILTNGTVDPFNPKAIRAGMGAQFSLDFYYLDNLKQLKTISKLKNYKVWLTTPHEGVSCYDRKFQLKDSILVFGEEANGIQDFSVGEKTMIPTLSNIESLNVAQAATIYLFEGLRQKLLK
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MAFITEKQSREIEEYAISQELNLMENASDEIVEFISNKFNKQNKILVVVGSGNNGSDGIAAAIKLYKNQYDVDICRIFPKGNQDNQRYYDGFSKLKNPLKELVSIDDYDVVIDGVFGIGLDRTLQGDALELVKTINQNSKYILAIDVPSGLGAFNARVYEDAIQANETITFLANKQGLHTGDGLDYAGKVTVKELIDSKNIKLSQSEYQVYKNNIQAINLENILRKKKNTNKGTYGNLAIVGGNVGMNGALQLAGKSALYSGCGKVSMISLDMDFRVDMSMPELMTKSLQNIPKDLDTFSALVVGVGFDTTDDSQQILKLIIDNLTQPAIFDADALNIIAINQQIREKFINLENKVITPHPAEAARLLGCTTQEIQEDRFTAVRALAKKYNTTVVLKGAGSLICKDNEIYINATGNQGMAVAGQGDVLSGIIGAFLSQGLDTLSASRLATYVHGLAGDNLAKKLGGYVGILPSRVIEEVCEVLNKLNKKTIVIDN
>NZ_CP022132|831072:880045|832337_832526_+|WP_088772280.1|DBSCAN-SWA
MDHSVLNVLVCPVCKSSLYYDKENKVLICKADKLAYPIRENIPVMLVEEAKKLTLEEVKKYD
>NZ_CP022132|831072:880045|834803_835829_-|WP_088773450.1|DBSCAN-SWA
MNISQEVSQMKLSHRRKNILTDEWVLVSPHRLNRPWQGQSEETQKNSLPEYDKKCYLCPTNTRANGETNPSFEETFVFENDFSALSKEKISTNLEINDDLFQISGATGVAKVFCFSAKHNLTMASMQEKDIAKVVNLWSDEVSALSKKYKWVQVFENKGSIMGCSNPHPHGQIWACDFLPTEAQKEQLSQKKYFEKNKSNMLLDYVNREISEKERIVCQNDDWIVVVPFWATWPYETLLLPKFKCSHLNYLNLEQKKSLANTLKTLLVKYDKLFDTSFPYSMGWHGSINAKVCDYWQLHAHFYPPLLRSATIKKFMVGFELLGESQRDITPELAAKVLREL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_088772278.1|831072_832119_+|tRNA	tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772279.1|832119_832338_+	sulfurtransferase TusA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772280.1|832337_832526_+	Trm112 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772281.1|832518_833271_+	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772282.1|833263_833659_+	HIT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772283.1|833655_834804_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_088773450.1|834803_835829_-	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772284.1|835936_837319_+	sugar porter family MFS transporter	O13311	Aichi_virus	5.0e-32	28.4
WP_088772285.1|837474_837711_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772286.1|837820_838990_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.5e-26	33.5
WP_088772287.1|839246_839525_+	peptidylprolyl isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_088772288.1|839591_841298_+	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	5.9e-51	33.9
WP_088772289.1|841882_842455_+	guanylate kinase	A0A0B5J7X1	Pandoravirus	1.5e-06	31.4
WP_088772290.1|842473_843499_+	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
WP_088772291.1|843508_844372_+	carboxylating nicotinate-nucleotide diphosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_088772292.1|844374_845865_+	L-aspartate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_169709714.1|845986_846334_+	chorismate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_088772294.1|846361_846832_+	glutathione peroxidase	Q70H87	Fowlpox_virus	1.4e-18	37.3
WP_169709695.1|847093_847225_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772295.1|847258_848251_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.8e-23	30.3
WP_088772296.1|850471_851113_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_088772297.1|851475_852318_+	YHYH protein	M1TUM2	Synechococcus_phage	7.2e-10	32.5
WP_088772298.1|852392_853880_+	NAD(P)H-hydrate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_157671462.1|854129_854303_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771820.1|854319_854535_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671643.1|854471_855164_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	5.9e-50	46.0
WP_157671464.1|855188_855299_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772299.1|855901_856663_-	RNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088773451.1|856906_857761_+	bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772300.1|857761_858961_-	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772301.1|859076_860087_-	thioredoxin domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772302.1|860106_860403_-	phage infection protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772303.1|861306_861642_-	ribosome silencing factor	NA	NA	NA	NA
WP_088772304.1|862401_864462_+	ATP-dependent helicase	G3MA40	Bacillus_virus	1.3e-28	24.4
WP_088772305.1|864462_864930_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772306.1|865091_867689_+|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	1.6e-84	39.0
WP_088772307.1|867693_869076_+	TolC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772308.1|869078_870461_+	leucyl aminopeptidase family protein	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-30	27.6
WP_088772309.1|870589_871555_+	transaldolase	A0A1D8KNT7	Synechococcus_phage	1.8e-09	34.4
WP_088772310.1|871568_872084_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772311.1|872173_872920_+	amino acid transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772312.1|872913_874926_+	UvrD-helicase domain-containing protein	A7KV33	Bacillus_phage	6.4e-105	36.4
WP_088772313.1|874953_875469_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_169709715.1|875489_876224_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772315.1|876404_877244_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_157671466.1|879009_879168_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771820.1|879200_879416_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671649.1|879352_879781_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.0e-28	42.9
WP_088771625.1|879799_880045_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.1e-11	51.5

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP022132|885506:941926|DBSCAN-SWA
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MSEQDNTPETPKEEAKPLASKNKKIIKILIGVAVIAVCTIGINSYLDYSHQAFLQEHSNAITTIKNKNIKGYKAAFEILKDLADDDEATASDYYYLGHLYQYGFGIQKNYSNAYKYYKKANTAQSFYQIAILYKYGQGVNKDDKKAIEYFKKSYKAGNKKAIVGLAKLLESNPNLISTTDPELIYQIYLAYQSNKLTKKKSKEKNKYLSIAASRGYEPAIIEQAIIFEENKNYHRALMLWQTLSYSSNPNVVDLAEKEIAKSEAFSQATT
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MRKIIKIGILTLSITSTCLATPGRLGLTESKADNKPNVIIFVWDGLRPDSISPNITPNLYSLTQKGVWFNDNHSSYPTFTMMNASSFATGDFAGETGFYGNTLWQPKAIGVDSTDQKVDFKAPVFTEDYKILQDLNNVPKEPLLEVTTLFQQAQKNGIKTAAVGKSGAAFMQDYTSGGVIFDEKHVFPEAFAKYLNNKGYTLPLDTKYAYKDFDLKGDANPTGYGKVATLKDGVTSDPIAGITSPYSKDNTYLMKNYLNEVMPYAKPQLSVVWLRNPDTTEHNYGVGSTAYYDALKNQDYLLGLLITKLKKQHLWKKTDLIIVSDHAHSNVSGSLEDFPLRNINEKTKTVGSFDETNGFSVSGDFRPAGLLTRAGFKAFDGSGCQYDPVLSGITRDKKHVYPTKYDTTGKICGGAVKEFDTNGHRHANLGIKYTTPSYKLPHKLPEDSVIVAANGGSTYLYVPSHNKLLIEKLVKFLQSRQEFGVIFVDGRRYGSISGTFPMSLVHLENKSKRNPDIIVGSNFNSFARIKGYAGTEFNSDGSDRGMHGSFSPIDVHNTMVAYGPSFKSKFTDEIPTGNVDLAPTIAHILGFYLHHTDGRILYEALKGQNVNYTIKPYQISTKTVNNLTIQSAENPEGKVIVPNKSNYKSEISIKELNIGNKVYSYFDQAKAIRF
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MKKCGYISIIGRPNVGKSTLLNNILKYKVSITSRKPQTTRHKITGVRTIGDTQFIYVDTPGIHTKEPKAINKFMNKAATTMVKDVDVILFVVEMGKWTELEDNIVEKLKYSEIPIFLVVNKVDKKKSLEASMFIESIKEKLSFYDVIYVSAKQGHNVNELESRIEKLLPESEYFFYEDDQVTDRSIKFLVSEVIREKIMRTIGNEVPYQIAVEIDSYKVDHEKSIVDIYASILVERDSQKGIVIGAKGSKLKKIGMDSRIDIERLVDMKVNLKTHVKVKSGWSDDDRALRSLGYDLM
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MIKKEKKFKLISKAIEAFHNAYAPYSNFKVGSALLMKNGKIILGANIENCAYGSSNCAERSALFSAYSQGYIKEDILMIAVVTDTPKASTPCGVCRQVIAELMDKYCPIILSNLDQLDIRETNIKKLLPDSFVLS
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MIIASNIQKFQSVRSSFAQDKKVGFVPTMGTLHSGHISLIKKAQLENDLVIVSIFVNPTQFNSKYDFQTYPNHLQQDIEILESLRVDILFNPNQKDIYPDGDSLKIQPNVEIASILEGKARPGHFSGMLTVILKLLQITKPNNIYFGEKDYQQLILVKQLVKDFFIDTKVIGCPTTREDFGLPLSSRNKNLTNSNTQITKEIYNILKQDNFSDLKSLSNKIGATEAKLEYIKEMDKRIFLAFYVGKVRLIDNFLKKTGPSC
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MLQEFKSKVSDFLGDNQIVENKLLRYAYSTDASLYRMVPKLVLIVKKEHEVIQIINLASQYDIKLTFRTAGTSLSGQAVTDEVLVVLAPDSWLDYQILNNGEKIKLQPSIIGAEANKYLKIYDRKIGPDPGSINTAKIGGIIANNSSGMCCGTAKNSYATLSSMRVVFADGVVLDTADKTSIINFKENRKYFVNLILNIQQQIKGNLELIESITKKFAIKNTSGYSLNAFLDFDDPIKIIERLIIGSEGTLGFVSSVTLNTVPEYKQKALNLIYGQLDELINLTIKIAPLNPSSVELLDYLSLKSVSDVADLQPFLISLDDKNIAAIMVEFAEEDYQTLELKLAKVNGYIKQTDIVHQVGFRKDENEIQTLWKARNGVLPTIAGQRPKGSSVLIEDIAVNIPDLVNLIKDVKKIFVKYNYLNAAIFGHVLAGNIHFVLTPNFNNKNEVLEYDEFMHELTSLVAKKYNGSLKAEHGSGRNISPFAIVEWGEKCLDIMWQIKSLFDPKNILNPDVKLTKNKNLHTKNLKKLNSVDSQIDKCMECGFCEPVCPSRNLTLTPRQRNTVARKIETLEREQKEQWLKDYQYYGIQTCATTSLCKTCCPVDIDTGTFILGKKKHNDKILDHARQINVAKQKVKLGNLAGNIFGKKNLQRLTESLHGKFKSIPIYLETMPEAQKSKFTDSQSLSNEKVLLLPSCPNRIFAGDNNYEKYPSQILLENLGFDVSYPNEINKLCCGQMYHSQVNHKQQQASQEFLKNSIDFDCYDYVVTDNSSCANFVKDHDVKILNIHDLILDNLKKLDLERKFKKIALHIDCSTKKQNIDNKYVDALNKCCDEIIIPERIYCCGFAGDKGFTTPELNKASLNSLKDQVDGCEIGVSFNKSCQIGLSYYGAIKYTSFIELLLECSN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_157671468.1|885506_886232_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.2e-47	45.2
WP_088772322.1|886379_887549_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	5.3e-27	33.8
WP_088772323.1|887801_888731_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772324.1|888864_889956_+	succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772326.1|890436_891549_-	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase	A0A0B6VT43	Edwardsiella_phage	1.7e-78	44.3
WP_088772327.1|891585_892962_-	signal recognition particle protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772328.1|893476_894592_+	saccharopine dehydrogenase NADP-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772329.1|894612_896103_+	aldehyde dehydrogenase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772330.1|896109_896904_+	DUF1338 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772331.1|897037_897526_-	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_169709716.1|897690_897822_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771983.1|897855_898848_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.0e-22	29.9
WP_088772332.1|898918_899386_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772333.1|899873_900740_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_088772334.1|900854_901379_+	peroxiredoxin	A0A1D8KSL1	Synechococcus_phage	1.4e-48	54.4
WP_088772335.1|902014_902674_-	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_088772336.1|902660_903713_-	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	1.6e-59	37.0
WP_088772337.1|903968_904349_+	YceI family protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671470.1|904400_905111_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	3.6e-26	35.3
WP_157671472.1|905156_905570_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772338.1|905765_906692_-	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_088772339.1|907088_908201_+	alanine dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_088772340.1|908208_908412_-	cold-shock protein	A0A1W6JNX5	Morganella_phage	1.1e-09	49.2
WP_088772341.1|908611_908941_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772342.1|909189_909390_+	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_088772343.1|911932_912745_-	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772344.1|912946_913819_-	ribosome biogenesis GTPase YlqF	NA	NA	NA	NA
WP_088772345.1|913881_915015_+	N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_088772346.1|915018_915654_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
WP_088772347.1|915656_916463_+	class II glutamine amidotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772348.1|916472_917663_+	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772349.1|917807_918701_+	GTPase Era	NA	NA	NA	NA
WP_088772350.1|918706_919123_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773453.1|919342_922063_+	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_088772351.1|922072_922723_-	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_157671249.1|924323_924632_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671307.1|924664_924880_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671650.1|924816_925509_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	5.9e-50	46.0
WP_088772352.1|925572_926343_-	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_088772353.1|926346_926682_-	aspartate 1-decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_088772354.1|926675_927461_-	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_088772355.1|927447_928245_-	3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772356.1|928241_928958_-	DUF2520 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772357.1|929257_931294_+	NAD-dependent DNA ligase LigA	A0A0K2QQN8	Ralstonia_phage	1.1e-115	36.9
WP_088772358.1|931290_931839_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772359.1|931940_933110_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	3.4e-26	33.1
WP_157671476.1|933167_933839_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.1e-48	45.9
WP_088772361.1|933888_935913_+	alkaline phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772362.1|936026_937505_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772363.1|938922_939330_-	cytidine deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_088772364.1|939623_940235_+|tRNA	tRNA-(ms[2]io[6]A)-hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_088772365.1|940231_940717_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772366.1|940768_941761_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	4.4e-22	31.3
WP_169709702.1|941794_941926_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP022132|990848:1106236|DBSCAN-SWA
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MSANEVYAKVNSIIVEQLGVKEEDLKPEASFIDDLGADSLDTVELVMALEEEFDTEIPDEDAEKIRTVKDVYDYIDSKVN

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_088772409.1|995701_997243_+	SulP family inorganic anion transporter	A0A2H4J153	uncultured_Caudovirales_phage	4.5e-82	38.8
WP_088772410.1|997244_997625_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772411.1|998067_999222_+	amidohydrolase	NA	NA	NA	NA
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WP_088772413.1|1000424_1001579_+	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772414.1|1001597_1002377_+	Asp/Glu racemase	NA	NA	NA	NA
WP_088772415.1|1002395_1003316_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772416.1|1003581_1004094_-	MAPEG family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773459.1|1004332_1007365_-	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_157671652.1|1007689_1007893_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772417.1|1007898_1008804_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772418.1|1008987_1010526_+	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_088772419.1|1010540_1011821_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	9.1e-97	55.3
WP_088772420.1|1011823_1012153_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772421.1|1012506_1013400_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773460.1|1013470_1014727_+	oligosaccharide flippase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772422.1|1014729_1014936_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772423.1|1014968_1015418_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671480.1|1015440_1015587_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772424.1|1015845_1017627_+	cysteine/glutathione ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD	A0A1V0SE00	Indivirus	3.0e-29	37.6
WP_088772425.1|1017623_1019270_+	cysteine/glutathione ABC transporter ATP-binding protein/permease CydC	A0A1V0SE00	Indivirus	3.4e-27	31.2
WP_088772426.1|1019586_1020756_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	3.7e-28	34.2
WP_088772427.1|1020836_1021097_-	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_088772428.1|1021149_1022382_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772429.1|1022617_1023109_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772430.1|1023086_1024370_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_088773461.1|1024369_1025161_-	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_088773462.1|1026373_1027576_-	MFS transporter TsgA	NA	NA	NA	NA
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WP_088772432.1|1028248_1029508_-	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_004287370.1|1029586_1029829_-	acyl carrier protein	A0A1S5R3K8	Pseudomonas_phage	1.5e-05	47.3
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WP_088772483.1|1085260_1086010_-	Fe-S cluster assembly ATPase SufC	W5SAS9	Pithovirus	2.7e-08	27.4
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WP_157671496.1|1093736_1094060_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772491.1|1094083_1094305_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772492.1|1094388_1095177_+	exodeoxyribonuclease III	E3T4M6	Cafeteria_roenbergensis_virus	4.1e-31	30.9
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WP_157671498.1|1097201_1097999_+	carbonic anhydrase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772496.1|1098021_1099383_+	glutathione-disulfide reductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	4.1e-39	25.9
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WP_088772498.1|1100201_1100600_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088771820.1|1101477_1101693_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671655.1|1101629_1102322_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.5e-49	45.5
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WP_088772500.1|1103647_1104499_+	isocitrate lyase/PEP mutase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088773466.1|1106134_1106236_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP022132|1117588:1156979|DBSCAN-SWA
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MWAIIGSSGFESFDDFEILEELSRETPFGLCSNGLFKIKIEGREALFLNRTGLEESILPHQINYKANIYALKKHGATSIIALSSVRSLRDELKPGDMVIPYQFIDRTKSLREFTFCEQGLLNYVSLSKPITESIAEEVREKKQEFEFDIHFKQSYVCIEGPQFPTIMDAKCFQSMGGGVIGMTAFPEFALAREAGLNYISCNFIVDYVPWSYDVKNLYNVLEIRETNNLKAEKLLKWLVNNLPFYAENDCHELGIARYLSTPIDSLPPSKKAWLKVIAKDNSKHEKAREAEVLKKVPDLYGGIKTIPPKLQDLLTFIGKYDREGSRKDLEATRKAAASLSLYSYVKEPVENVENIKISHQDGHSIPVRVYNPNTQEKLKVIIFSHGGGFVSGTLDSFDAFCRKLALTTNRVVFAVDYRLAPEHKFPAGLNDVECVAEHVFKYYKKFEISRKEFTLMGDSAGANLTILATYNLLQSDKAKIYNNIILYPSVDLSHMPTKSLDDFESGYILTKAKTMWYSELYVPEGLNRRSPEISPFYIKQLENMPRTLVMTAGYDPLKDEGLLFAERLLRHNVEVQHYHFDSLVHGFINFSKLIPKEMDVLHSRVVKFLR
>NZ_CP022132|1117588:1156979|1152338_1153139_+|WP_088772542.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MIDTNKQNLKKLEKQILRKTAQAVNQYNMIEDGDKIMVCLSGGKDSYCLLEMLLLLQQKAPIKFDITAVNLDQKQPGFPVEILPNYLRSKEVDFHIIERDTYSVVKKVIPEGKTTCGLCSRMRRGILYDFAEENNITKIALGHHRDDIIETFFLNIFYNGTIKAMPPKLLSDDKRNIVIRPLAFVNEKETSQYSELKSFPIIPCNLCGSQDNLQRVFTKDMLNKWEEKNPDRKNVIFKALSNISPSQMLDKGLFDFFNISKNNIQR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1107257:1107274	attL	NA	NA	NA	NA
WP_088772510.1|1117588_1118362_-|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
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WP_088772512.1|1119774_1122501_-	preprotein translocase subunit SecA	NA	NA	NA	NA
WP_088772513.1|1122634_1123663_+	LPP20 family lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_088772514.1|1123666_1124092_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772515.1|1124092_1124815_-	purine-nucleoside phosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_169709719.1|1124971_1126912_-|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	E5ESM9	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	1.6e-113	41.2
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WP_088772517.1|1127627_1128797_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.5e-26	33.5
WP_088772518.1|1129284_1129425_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	4.4e-05	54.5
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WP_088772521.1|1133342_1133942_-	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088772523.1|1135551_1136205_-	thiamine diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_088772524.1|1136396_1138229_-	alpha/beta hydrolase fold domain-containing protein	L7RDF8	Acanthamoeba_polyphaga_moumouvirus	1.7e-27	30.3
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WP_088772526.1|1138840_1139572_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A285PWH2	Cedratvirus	1.0e-20	31.5
WP_088772527.1|1139605_1140439_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772528.1|1140425_1141073_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_088772529.1|1141079_1141619_-	HAD-IIIA family hydrolase	E3T535	Cafeteria_roenbergensis_virus	5.3e-22	35.4
WP_088772530.1|1141867_1142389_-	inorganic diphosphatase	A0A2H4J8U1	uncultured_Caudovirales_phage	1.7e-46	53.3
WP_088772531.1|1142548_1143883_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	B6DZZ7	Stx2-converting_phage	2.1e-43	30.5
WP_169709720.1|1143901_1144177_+	DUF493 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_169709721.1|1144210_1144813_+	lipoyl(octanoyl) transferase LipB	NA	NA	NA	NA
WP_088772534.1|1144818_1145205_-	DUF3568 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772535.1|1145328_1147062_-	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	8.4e-37	32.9
WP_088772536.1|1147089_1148907_-	DNA primase	A0A1S5RH70	Helicobacter_phage	3.0e-45	28.3
WP_088772537.1|1148928_1149375_-	GatB/YqeY domain-containing protein	A0A292GL36	Xanthomonas_phage	1.7e-21	41.5
WP_088772538.1|1149434_1149641_-	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_088772539.1|1149896_1151303_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_088772540.1|1151302_1151914_+	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772541.1|1151929_1152346_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_088772542.1|1152338_1153139_+|tRNA	tRNA 2-thiocytidine(32) synthetase TtcA	A0A0U2S5Z2	Escherichia_phage	4.2e-84	59.3
WP_088772543.1|1153152_1153884_+	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_088772544.1|1154114_1155092_-	polyprenyl synthetase family protein	A0A1V0SE37	Indivirus	6.2e-13	25.8
WP_088772545.1|1155174_1155609_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772546.1|1155833_1156037_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.2e-11	48.5
WP_157671328.1|1156079_1156517_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.7e-26	45.4
WP_088772156.1|1156679_1156979_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
1158008:1158025	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP022132|1167252:1217319|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP022132|1236988:1287853|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP022132|1236988:1287853|1287373_1287688_-|WP_088772652.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP022132|1236988:1287853|1287108_1287396_-|WP_088771627.1|transposase|DBSCAN-SWA
MRYTKEFKDEAVKLCLQPDANRREIADNLGVKYKTICSWISKAMSNPQKEIKIDYKTQYQQLSFENTDLKKKLKQAETEREILKKAAAYFAKQNL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_088772637.1|1267702_1268872_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	3.8e-25	32.7
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WP_088772643.1|1274077_1274953_+	class A beta-lactamase	A0A1B0VBP7	Salmonella_phage	7.2e-37	31.6
WP_088773469.1|1274945_1275521_+|tRNA	aminoacyl-tRNA hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_088772644.1|1275642_1276734_+	redox-regulated ATPase YchF	NA	NA	NA	NA
WP_088771550.1|1276933_1277221_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771820.1|1277253_1277469_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088771625.1|1286231_1286477_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.1e-11	51.5
WP_157671657.1|1286495_1286924_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	6.0e-29	42.9
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WP_088771627.1|1287108_1287396_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772652.1|1287373_1287688_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_169709695.1|1287721_1287853_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP022132|1312321:1347326|DBSCAN-SWA
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MVTIIITTCLLITPFIIAFLHSSIIYNKHYVSVYVNYFIGSNISLTTLINSYAYLVYGDSMSKFQGWIFTPAVFQIGIFQLCLFIFSVLALFKNSQFKAACLIFFSIYIILDSLTSFSGSIYNQAVEAVFFINLIAALIAYILYRLLSKN
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MIHPKIVDPDLKIHVISDEFVYFVVSSNINIISKKFSSIKSLREIEFIGAETITIFDEIVKECLQKYSLNKELDKEVKSFDTIRQFVSEGLGYSLLPEKAIDHTLKTIGKPHKNKMPLVIDYKKSRILSRAAKKWIEIIKKEYRF
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MPVTTLCKSLNVSTSSYYRWIHKPIGKRQYNDAELDDAILMNINLDMEVLGYTKSKLSLLFNTTL
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MSKLLKIILVLVIIAVILILSSKFVVKQGTESVVLRLGELVKKDGKVIEYEPGIHVKIPFLDTVKNYDMRNRVLTTDSSRVVTKEKKDVLINAYVVWRVNDISKFFTSTSGQVFRAETLLKQFLESSLRAEVGKNDIQSLVNNDRDKLMIALTKDVAVQSKEIGISIVDVRVNQIDLPDTITESIYQRMKSSRHKEASRIRAEGERAAEKTKAAADAKVTVTLAESEKKSKVIRAQADAKAAKIFTETYSSSVPLYEFLKSMNSYKQSFDGKNQIVFMLKPDSKFFEGFKLEPNSQLAEDMKKAK
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MNKSELVSAIAKEADVTKEVAGNTLDATIDAVTKALKKGDSVTLVGFGTFQVKERSAREGRNPKTGETIQIAASKVPSFKAGKGLKDAVK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1302797:1302814	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_088772679.1|1314259_1314457_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671529.1|1314489_1314798_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772681.1|1314870_1315308_+	LysR family transcriptional regulator substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772682.1|1315497_1315815_-	acetolactate synthase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_088772683.1|1315819_1317517_-	biosynthetic-type acetolactate synthase large subunit	A0A0P0CDR3	Ostreococcus_lucimarinus_virus	9.3e-57	30.6
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WP_088772685.1|1319366_1321163_-	threonine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_088772686.1|1321440_1322874_+	NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_088772687.1|1327405_1327999_-	YihA family ribosome biogenesis GTP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772688.1|1327995_1328481_-	low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_088772689.1|1328485_1329403_-|protease	protease modulator HflC	NA	NA	NA	NA
WP_088772690.1|1329404_1330472_-|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
WP_088772691.1|1330658_1331840_+	FAD-binding domain	NA	NA	NA	NA
WP_088772692.1|1331836_1333147_-	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_088772693.1|1333318_1333648_-	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_157671658.1|1333958_1334351_+	DUF3573 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671659.1|1334402_1335164_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	3.8e-26	34.0
WP_157671531.1|1335124_1335595_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772695.1|1335638_1336781_+	DUF3573 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772696.1|1336818_1337742_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase MiaA	NA	NA	NA	NA
1337027:1337044	attR	NA	NA	NA	NA
WP_088772697.1|1337742_1339182_-	SurA N-terminal domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772698.1|1339288_1339561_-	HU family DNA-binding protein	Q6QIE5	Burkholderia_phage	4.5e-22	60.0
WP_088772699.1|1339645_1341970_-	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	1.7e-194	47.8
WP_088772700.1|1341997_1343254_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.2e-120	52.6
WP_088772701.1|1343276_1343882_-	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	1.1e-55	56.1
WP_088772702.1|1343907_1345224_-	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_088772703.1|1345386_1345839_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671526.1|1346156_1346759_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	9.1e-23	39.4
WP_157671533.1|1346762_1347326_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP022132|1362607:1480874|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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1360659:1360676	attL	NA	NA	NA	NA
WP_088772719.1|1363870_1364485_+	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
WP_088772720.1|1364471_1365524_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.3e-29	37.4
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WP_088772722.1|1367055_1368270_+	amino acid transporter	NA	NA	NA	NA
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1390727:1390744	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_088772810.1|1470143_1470389_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.9e-11	48.5
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WP_088772816.1|1479887_1480874_-|tRNA	tRNA dihydrouridine synthase DusB	NA	NA	NA	NA
1482284:1482302	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP022132|1486437:1532919|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_088772825.1|1488644_1488860_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772826.1|1488856_1489207_+	isochorismatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772827.1|1489629_1489818_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772828.1|1489853_1491167_-	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	1.4e-55	34.4
WP_088772829.1|1491294_1491909_+	GTP cyclohydrolase I FolE	A0A218M2Y0	Acidovorax_phage	9.9e-41	42.0
WP_088772830.1|1491922_1492606_+	YdcF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_169709728.1|1492775_1492898_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772831.1|1492931_1493924_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.4e-23	30.3
WP_157671549.1|1493957_1494263_-|transposase	transposase zinc-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
1494232:1494249	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_157671551.1|1494629_1495046_+	ATP-binding protein	A0A059NT77	Lactococcus_phage	1.1e-19	35.8
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WP_169709729.1|1501620_1502865_-|integrase	integrase arm-type DNA-binding domain-containing protein	A0A077KET4	Ralstonia_phage	2.2e-15	26.6
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WP_088772839.1|1504168_1505407_-	AAA family ATPase	A0A127AWE7	Bacillus_phage	2.7e-69	38.5
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WP_088772840.1|1506752_1507076_+	thioredoxin	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	5.2e-17	44.4
WP_088772841.1|1507115_1508378_+	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
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WP_088772844.1|1510523_1511927_-	mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase	A0A1V0SH58	Hokovirus	3.3e-60	32.6
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WP_088772851.1|1519404_1521288_+	protein-disulfide reductase DsbD	NA	NA	NA	NA
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WP_088772853.1|1521826_1522072_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.9e-12	56.2
WP_157671664.1|1522068_1522506_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.0e-28	42.4
WP_088772855.1|1522454_1522658_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671255.1|1522690_1522999_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088772856.1|1523063_1523549_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671553.1|1523517_1523787_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772858.1|1523863_1524595_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772859.1|1524698_1525373_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772860.1|1525448_1526441_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.0e-22	29.6
WP_169709695.1|1526474_1526606_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_088772864.1|1528196_1528916_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772865.1|1528925_1529615_-|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_088772866.1|1529681_1530320_+	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
WP_088772867.1|1530398_1530764_+	TM2 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772868.1|1530755_1531643_-	NAD(+)/NADH kinase	NA	NA	NA	NA
WP_157671526.1|1531749_1532352_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	9.1e-23	39.4
WP_157671533.1|1532355_1532919_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
1537518:1537535	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP022132|1545930:1615445|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_21

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_088772895.1|1557678_1559343_+|tRNA	glutamine--tRNA ligase/YqeY domain fusion protein	A0A222YZ70	Escherichia_phage	1.3e-172	53.6
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WP_088772910.1|1578320_1579700_-	UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_088772911.1|1579785_1580178_-	DUF4156 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772912.1|1580246_1581680_-	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase	NA	NA	NA	NA
WP_088772913.1|1581820_1582216_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772914.1|1582217_1583102_-|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_157671557.1|1583544_1584228_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772916.1|1584609_1584837_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772917.1|1585101_1586541_-	4-alpha-glucanotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772918.1|1586756_1589030_-	glycogen/starch/alpha-glucan family phosphorylase	Q8B3H5	Iris_mild_mosaic_virus	3.5e-06	33.3
WP_088772919.1|1589137_1590604_-	glycogen synthase GlgA	NA	NA	NA	NA
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WP_088772921.1|1591941_1593576_-	alpha-D-glucose phosphate-specific phosphoglucomutase	NA	NA	NA	NA
WP_088773482.1|1593876_1595799_+	1,4-alpha-glucan branching protein GlgB	NA	NA	NA	NA
WP_088772922.1|1595845_1599061_+	type I pullulanase	NA	NA	NA	NA
WP_157671559.1|1600648_1600810_-	Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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WP_088772926.1|1602338_1603724_-	aminomethyl-transferring glycine dehydrogenase subunit GcvPA	E3SN07	Prochlorococcus_phage	7.1e-55	37.8
WP_088772927.1|1603796_1604180_-	glycine cleavage system protein GcvH	NA	NA	NA	NA
WP_088772928.1|1604322_1605399_-	glycine cleavage system aminomethyltransferase GcvT	NA	NA	NA	NA
WP_088772929.1|1605488_1607630_-	lysine decarboxylase LdcC	NA	NA	NA	NA
WP_157671561.1|1607717_1607894_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772930.1|1608038_1609208_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671555.1|1609315_1610374_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772878.1|1610334_1610796_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671563.1|1610833_1611007_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772931.1|1611090_1611345_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772932.1|1611544_1612228_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.4e-37	39.0
WP_088772933.1|1612220_1613483_-	lipoprotein-releasing ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_157671496.1|1614268_1614592_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671666.1|1614752_1615445_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.7e-49	45.5

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP022132|1624723:1676854|DBSCAN-SWA
AATGAGTAATAAGAGAAAAATATATACCGTTGAATTTAAGACTAAAGTTGTCTTGGAAGTATTGGGGAAAGATCAAACAATCACACAGTTATCAGTAAAATATAATATTACGCCCAAAAACATAAATAATTGAAAAACAGCCTTTTTAGAAAATGCTGAGTTGGCAATGGATCCATCCAAATCAGTATCACAATATAAAAAAGACAATGCAAAGCTTCAAACCAAGATAGATCAGTATTCTAAGAAGGTTGGACAACTAACAATTGAGAAGGAATTTCTTGAGTGAAAGCTCGTAAGCTTGGGATTATCTGATAGAAAAGCAATGATTGATCCTAAGCATAAATTATCTGTTGTAAAACAAAGTTTCTTATTAGAAGTTTCTAGAGCTGGTTTATATTACAAGCCTGTGGTTAACGAACATAAAGAAGAAGTAAAAGCAAAGCTTATACAGATACATGAGGAGATTCCCTGCTACGGCTATATAAAAGCTCATAAGCAATTAATAGAAGATGGGTTTAGCATCTGTGAGAACACAGTACAAAAGTATCGTAAAGAGTTAGGCATCAAAGCTATATTGGCGGTGAAAAAACCAAACTTAAACTTATCTGAACCTAACAAAGAGCATGCTATTTATAGTTACAAACTAAAAGGTTTAAGCATATTGAGACCTAATCAAGTTTGGTCTACAGATATTACATATATTAAGACTGATGCTGGCACAGTTTATATGGCAGCTATTATTGATTGGTACTCTAAGGCTGTACTAAGTTGGGAGATATCCAACACTATGGATAGTAGTTTAGTTATGAAAGTTTTAAATGAAGCTCTGTATAAATATGGAGTACCAGAAATATTTAACACTGATCAAGGTAGCCAGTACACATCTAACATTCATATCCAAACATTATTGGATAAAAAAATTACTATATCTATGGATGGTAAAGGTAGAGCAACTGATAACATTTGCATCGAAAGATTTTGGAGAAGTGCTAAATGTGAGAGATTTTATTTAAATCAATATCCTGGCATTGTTGAACTAAGAAACGATGTGGATGATTATATAGATTTTTATAATAATAGAAGATTTCATGAGTCTATCAATTATAAAAAACCTATGGAATTTTATTACGATAACTTATTGGAAAAACGGGCGGCTTAGATGGGAACTAAATAATTGAAAATATTGTTTAATTTATTGGGGTAGTATACTAAACGACTCTTTACTCCTAACATACCCATTGCAAAAATAGCTTGATAATGCATTTTATTATATGCTGCCACTTCTTCTAAATCATAAACTTGAAATCTATCTCTACTATTAAATTTCTCTCTTATAATCCAACGCCATAGTCTAGTAGAATCTTTATACTGTTTAGCATTATACAAAGCTATGGCTTGATAAATATTGTGATCTTTTAATAGCTCAGAATATTTTGATTTAGATATCGTAGTTGCATTTCTAGAACCTAAATCATACGATTGTCCTAAAGCATCTGTTGATAATAAAACATAATAGTCAAAACCTTTTTTCTTAGCAAGCTTCTGATAAATAGTATTAGCTTTTGCTTTATAGTCCTTTTTAGCATAACTATATGCCAAACAATACTTCCAGACATTCTCCTTTTGTAGATGCTTAGGTAGTTTTTGATATGTTCTGATGTAATTACTAAAATCTGAATTATATAAATCTGCTCTTAATAACCACTGCCAAGCATCATCACTATAATATTTCTTATTAGCTTTTAAAAACCATTGTTCTGAATTAGCATCATGATTTTTAGCTAAACTAATAGCTATAGGTAGTACAGCTTGACTATAAAGCTTTGTATCCAAATATTTTGTATTTTTTAATTCTGACCATATCTTTGCATAACGCTGAAGATTATGTTTTGTTAAATCATTTGATATATCTATCAGCACTTCACTAAACTTTGGATAATTATGATATTTCGCAATGAATTCATCTAAGTTCTAAGGATTTTTTATAATTTCTTTCCATGCACTTATATAGTCACTATATGACCGTTGTTTAATATGCTTATCAAGTAGTCTTAATGCGTTATCAAAACTATTATTAAATGCAAGAGTATAAGCTTTATTTACTACACAGCCTTTACCTTTATTTGGATAGCCTTTACCTTTATTTAGATATCTGACACTCTAAGGCTGACGAGGTCTCATCTTTTTGCCAAAGTTTAGTAAAATCTATAATAGATTTTTGTCTGAACTCTTCATTTTGATCATCTTGTGCTATCCAACATTTACCATCTGTTTCCAAATTTCCATCATAAAATTTTTTAAACATTTGCCAGTTTTTATTTTTAGCATAATGTATAGCTAAATCATCACATAATGCTGATGCCCAATACTCATCTTGATGATTATTGATATAGTTTGCAATCTGCTTTTGTGTAAATATTTCAGGATTTTGAGATATATTTTTATATTTAAGGTAACTATCTAAGTTAATAGTTTTTAAGCTAGATTTAATCTGTAAATTATTGTTACTTTGTTTTTGCTGTATTTGTTTAAGTTGTTGTTTTACATCATTAATTTGTCTATCTGTCAAACCATAAGATAAGACCTAGAAAAAACTAATACTACAAATAATAAACTTCTTAAAACACAAACTAATCTCCTTTTTATATTCTCTCAACTAGATTTATAACAAAATTTGCTGATTTTTGAGCTGCACTTTTCGCAAATTCATCAAAATTTTCAGTAGCATCACCATCTGCAGCATCAGAAATGCTTCTTAAAATTAAGCTTGGTATATTCATTTCATTACATACAAGGTTAACACTACCACCTTCCATTTCTATAGCTTTTGCCATAAATTCTTTAACAACAAAGTCCTTTTTTTCAGCTGAGCTAATAAATTGATCTCCAGTTGCTATAATCCCAGTGTGAAGATCAAGATCAAGGTCTTTTGCAACATCTTTAGCATGATCAAGAATAAAATCCGAAGTCTTAATTTGTACTTCTGAAATAGGAATCTTACCATGTGGATAACCAAATGGTGTAAGATCTACATCATGTTGTACAGTAGCAGTAGCAGCAATCATATCACCAACTTTTAAATCTTGTAAACCTCCAGCGACACCTGTAAATAGTAAGGCTTGTGCGCCAAAATGTTCTATCATTATAGTTGCTGTTAAACTAGAAAATACTTTGCCTATTTTACTATAAGCAATGATAAGTTCTTTATCTTTATATGTTGCTAAATAATATTTATTATTTGCATATTCAACTGTTTCATAACTATCTAGTTTCTCTAATATTGGTTGGATTTCTATTTCCATAGCTCCTAAAATTGCTATTTTTTTCATTTTATTTACCTTCTAGCTCTATTTTTGTTATTTTTCTAAACCCTTGTGGTAAAAGTACTCCTCCACCAGAGGGCTTGTCAGTTAGATATGTTTCTATATTTTTATTATCTATACGTATAAATCTTTTACCTGCATTTAAGATAGCCTCTTGTTCTGAACTTAATAGCTCTACAAACCTTAGCTTATCTCTTTTATCAAGCCTAATAATTAATTTACCTTTACCTTTTTTAAGTATAGCAAAATTAGCAAAACCTCTAATAACAGTTCTACCATTAGAGCTTACACCAAGCATCTTCATATTCTCATCAAATGGTATGAATTTAAACACATCATCTGCATCAAAAATATTCTTACCGGTAACTTTATTGGTAATAAGATCATTCGCAGCAATAACAAAGCCTTTACCACTAGTGCTAGCAATTAAAAAATGCGAAGCTGTATTGACAAACTCCATATTGATAATTTCATCTTTTTTATCTAGTGGGATATATGTAGTAATGTGTTCACCATACCCCCTGGCTGAAGGAAATTTATCGACATACATCGAGTAAGCTTTACCAAGCTTTGTAAAAAATATTACTTTAATATTGCTATTACCTGAAACTGCAAGAAAAAACTTGTCCTCTGGTTTATAATTTAAGCCATTAGGATCAACATTATCTCCTTTGGCGCATCTGACCCAACCAGCTTTTGATAAAATCACTGTAACTTTTTCACTAGGGATTAAATCCTTCTCTTCTAACGCTTGGGCCTTCTCAGTTTGAGTAACTTTTGAACGTCTATCATCACCAAAGTCTTTTAATATTTGTTTAAACTCTTTTTTCATTAAGTTTTTAAATTTAACTTCACTATTTAGATAACCTTCTAAAAGCTCTTTTTCTTTTACTAATTCTTTCTGCTCTTTTTTTATCTCAATTTCTTCAATTTTTGCTAACTTACGTAATCTAATATTTAAAATTGCTTCTGCCTGAATTTCTGAAAGAGAAAATTTATTTTGTAATTCAATACTCGGATCATCGTAATTCCTGATAATATCAATAACTTCATCTATATTTAAAAATGCTATCAACAAACCTTCTAAAATATGCAATCTTGCAAGCACTTTATCTAAACTAGTTTGTAACCTTCTGCGTAAAGTTTGTCTACGATATTCAAGCCACTCATTTAAAATATCTAATAAATTTTTAACTTTAGGCTTATAATCTAAACCTATCATATTCATATTAACGCGGAAACTTTTTTCAAGATCTGTTCTAGCTAATAAGTGCCCCATGATCTTACTAATATTTTTTCTTGTAGTTCCAGAATATAAAACTATCTTAACCGGCTCTTTATCATCAGACTCATCTTGAATATTCTTAATCCAAGTAATTTTCTGCTGTTTTAGCTGATTTGCTATTTGCTCCATAACAGCAGAACTTGAGACTTGATGAGGTAGTTTTGTAATTACAACATTACCACTACTATCATAATCATATATTGCTTGTTGTCTAATTGAGCCTATACCAGATTTATATACATCTGCTATTTCTTCTCTAGTACTAATTATATTTGCACCACCTGGATAATCTGGAGCTTCTACTATCTCTAGAATATCTTCTATTGAGGACTTAGGATTTGATAAAAGATGCAAACAAACATTCATAACTTCTGTAATATTATGAGGAGGTA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MDLFSSLENKQSVGEFSEQAYLNYSMYVILDRALPHISDGLKPVQRRIIYAMSEIGLSHLSKYKKSARTVGDVLGKYHPHGDSACYEAMVLMAQDFSYRYPFIDGQGNWGSVDDPKSFAAMRYTESRLSKYAVLLLDELKKGTVDWVKNFDGTMDEPKLLPAQVPNILLNGAMGIAVGMSTYIPPHNITEVMNVCLHLLSNPKSSIEDILEIVEAPDYPGGANIISTREEIADVYKSGIGSIRQQAIYDYDSSGNVVITKLPHQVSSSAVMEQIANQLKQQKITWIKNIQDESDDKEPVKIVLYSGTTRKNISKIMGHLLARTDLEKSFRVNMNMIGLDYKPKVKNLLDILNEWLEYRRQTLRRRLQTSLDKVLARLHILEGLLIAFLNIDEVIDIIRNYDDPSIELQNKFSLSEIQAEAILNIRLRKLAKIEEIEIKKEQKELVKEKELLEGYLNSEVKFKNLMKKEFKQILKDFGDDRRSKVTQTEKAQALEEKDLIPSEKVTVILSKAGWVRCAKGDNVDPNGLNYKPEDKFFLAVSGNSNIKVIFFTKLGKAYSMYVDKFPSARGYGEHITTYIPLDKKDEIINMEFVNTASHFLIASTSGKGFVIAANDLITNKVTGKNIFDADDVFKFIPFDENMKMLGVSSNGRTVIRGFANFAILKKGKGKLIIRLDKRDKLRFVELLSSEQEAILNAGKRFIRIDNKNIETYLTDKPSGGGVLLPQGFRKITKIELEGK
>NZ_CP022132|1624723:1676854|1662754_1663720_-|WP_088772967.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_088771628.1|1625020_1625881_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.5e-23	30.3
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WP_088772943.1|1627364_1628051_-	5'-methylthioadenosine/adenosylhomocysteine nucleosidase	S5VTE5	Leptospira_phage	1.2e-10	24.8
WP_088772944.1|1628052_1630269_-	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.5e-78	33.6
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WP_088772946.1|1631200_1631971_-	type I methionyl aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_088772947.1|1632096_1632996_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_088772948.1|1633097_1634570_+	ketol-acid reductoisomerase	NA	NA	NA	NA
WP_088772949.1|1634979_1635183_+	cold-shock protein	A0A1W6JNX5	Morganella_phage	6.8e-15	56.7
WP_088772950.1|1635182_1635380_+	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_088772951.1|1635470_1635890_-	DUF962 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772952.1|1636569_1638411_-	glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)	A7IW18	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	6.2e-123	42.3
WP_088772953.1|1638432_1639800_-	bifunctional UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase GlmU	M1PC96	Moumouvirus	6.0e-38	38.4
WP_088772954.1|1639815_1640862_-	bifunctional nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase/Nudix hydroxylase	A0A1B0V161	Roseobacter_phage	2.0e-54	35.3
WP_088772955.1|1640870_1641845_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772956.1|1641941_1642787_+	phosphatidylserine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_088772957.1|1642759_1643095_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671249.1|1644176_1644485_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771820.1|1644517_1644733_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671663.1|1644669_1645362_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	5.9e-50	46.0
WP_088773485.1|1650803_1653278_-	chitinase	I6LMN1	Fathead_minnow_nidovirus	1.4e-05	25.5
WP_088772958.1|1653672_1654866_+	glycine C-acetyltransferase	D2TEZ5	Emiliania_huxleyi_virus	1.3e-36	27.4
WP_088772959.1|1654923_1655982_+	L-threonine 3-dehydrogenase	R9TPW0	Vibrio_phage	1.8e-13	62.7
WP_088772960.1|1655978_1657232_+	serine permease	NA	NA	NA	NA
WP_088772961.1|1657234_1657927_-	2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772962.1|1657916_1658207_-	septum formation initiator family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772963.1|1658217_1659594_-	phosphopyruvate hydratase	W6LP63	Streptococcus_phage	2.1e-139	61.3
WP_088772964.1|1659701_1660943_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088772965.1|1661025_1661790_-	nicotinamide mononucleotide transporter	U5J9C5	Bacillus_phage	2.5e-33	36.4
WP_088772966.1|1661807_1662755_-	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772967.1|1662754_1663720_-	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772968.1|1663731_1665078_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	A0A1X9I6F4	Streptococcus_phage	1.2e-38	28.7
WP_088772969.1|1665150_1665717_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772970.1|1667398_1667707_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771820.1|1667739_1667955_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671663.1|1667891_1668584_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	5.9e-50	46.0
WP_088772971.1|1668753_1669383_-	glutathione S-transferase	NA	NA	NA	NA
WP_088772972.1|1669476_1670031_-	peptide-methionine (R)-S-oxide reductase MsrB	NA	NA	NA	NA
WP_088772973.1|1670192_1670414_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772974.1|1670704_1671874_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.1e-27	34.2
WP_088772976.1|1673243_1674491_-	HAMP domain-containing histidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_169709730.1|1674456_1675203_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_088772978.1|1675648_1676854_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP022132|1693673:1700552|DBSCAN-SWA
TTCATATTTTTTTACGAAGAATTTTCAAAAAATGTAGAGTTGAACTAAGAAAATAATGCATTAGTGGAATTTCATTATTAAGTAGAAGATCTGCTAACATACAAATACCTTTCCTATACCCAATATCTGAATTTCTATTCGATATGGAATTATTGTGAACTCTATAATTAAGTAACCTCTCTTTTAAAATACATATATTGTTACCTGATAATTTCATATCTATCCAAAATCTCCAATCTTCGATTGCAATATAATTTCTTTGTTCAATAAATCGAAGCTTTGGAACCCCTCTAATCATTACAGAGTTTATATTTATAAAATTAGTATAAAATAATTGATTCTTGCTATTTACAAATAATCTGAGAAATCCTCTAGTTCTTTGATTTTTGAATTTACCAATTAACTTACTATTCTCATCCATTTTGTTAGCCAAAGTATGTATAATATCACATCCCTTATTATTCGCTAAAAAAGTCAATTGTGATTCTAACTTAGATGGAAGCCATACATCATCGGCATCTAAGAAAGCAACATAATCTCCTTTAGCATTATCTAGCCCAACATTTCTTGGCTTTGCTGGCCCCCCAAAATTATATTTTGACTCTAAAAGTTTTATTCTAGAATCTTTTTTTACATACTCTTTAACAATATTTAGGCTATTATCTGTTGAAAGATCATCAACAATTATCATCTCCCAATTTTTATATGTCTGATTTATAACACTATCTATAGTGTCTGTTATATAACTCTCAGAATTATATAATGGCGTAATTATTGTAACTTTTTCATTACTATTTCCAACCATTCTCTCTACACTCATCTATATAATTTTCCAAACTAATTTGCGGCTTCCAACCTAACGCTATTGTTTTATCACTTATAACACTTGCTATCATTCGATTACCTTTTCTAGGTGGTAACATTTTAATATCTCCACCAAAGAGTTTTGCAACCTCTAAAATAGTGTAACTCTTAGGATTTGCTATTCCATATTCATCGCCATAGCCATACTTACCTATAAGAACAAGCGCTTTAACGGTATCAGTTACATGAGTAAAGTTTCTCTTCTGGTTACCTGGTTTAACAATTGTTAGAAGATCTTTATTTTTCATCTTCTCTTTAAACAATGCTATTAATGTGGCATATTTACCAGTATTAATTTCTCTTGGACCATATACGTTATAAAAATATGTGATTACATAATCTATACTAAACCATTCACCGTAATTTTTAACAAGTAGCGTATTAGATGATTTACTCCATGAGTATGGACTTGCATTTGAATTTTCTCCATTATCACCAAATTTTGTACTACTACCTGCATATAGCAACCTACATTTATGCTTTCGTACAAACTCAAGCACTGCTAATGTACCATTTTTATTAAAATCTAAGATTTTTTCAAAATCTTCGAAACTTTGTTCAACTCTCGAATATTCACCTAAATGATATATCATATCTGGTGAGAATGTGATTAATGAAGCAATATCTAAACTACTACCTTTTATATAATTCACACCAGTCACATGATTTTGCTCACTCCCTGTAAAATAGTTATCTAAAGAATACACCTCATTACTATCATCTTGTAACAATATTTCACATAAATGTGTCCCAATAAATCCTGCACCACCTGTGACCAATATTTTTTTTCTCATTATGTCAAAGCCTTATATATCACTATTAAAAATATCTCTAGTATATACCTTATCTATAACATCAAGCAACGTCTCATCAACTCTATTCGCAACAATAAGACTCGACAATATTTTAAAACTATCTAGATCATTAACAACTTTTAGTCCTCTAAAATTATTTTCTTTCAAAACTGGCTCATATATAACTATATTTACTTTTTTTACCTGTAATCTATCAATAATATCTAGTATAGCGCTATATCTAAAATTATCGCTTTCTTGTTTCATTATTAGCCTATATACACCTACGATCTTAGGCTTTTTAGAAATTATTTGATTAGTTATGAATTCTTTTCTTATTTCATTAGAGTCAACTATAGCATTTATAAGTGCATTTGGAACTTCTAAAAAACTTGCTCTAAGTTGCTTTGTATCCTTAGGAAAACAATATCCACCATATCCAAAACTTGGATTATTATAATATTTTCCAACTCTTGGATCTAACCCAACACCTTCTATAATATCTTTTGTGCAAAGGTTAAATTTTTCAGAATATGAATCTAACTCATTAAAGTATGCAACCCTCATAGCTAAATATGAGTTGGAAAATAATTTAATTGCTTCTGCTTCAGTAGAATTAGTATATAACACCGGCACATCTTTTTTTATAGCTCCACGAACCAATAAGCCAGCAAATATCATAGCTCTATCTGACTTATCACCTACAACGATTCTACTTGGATATAAGTTATCTAATAAAGCTTTACCTTCCCTTAAAAATTCTGGTGAAAATATAATATTTAACGCATTAAACTTTTTTCTTACTTTTTCTGTATATCCAATAGGGATTGTCGATTTAATAACCATTATTGCATCTGGATTTATCTCTAGAACATCAATTACTACACGCTCTATACTTTCAGTATCAAAGCGATTTGTAACCGTATTATAGTCTGTTGGTGTAGATATAATTATATAGTCAGCATCTTTATAAGCTTCTTTTATATCTGATGTCGCTTTAAGGTTTAGCTTTCTATTTTTTAAATACTCATCTATTTCTTTATCTTCTATTGGTGATAATCTGTTCTGAAGCATCTCGACTTTTTTACAATCTATGTCATAGATAATTACTTTATTATGCTGCGCTAAAAGTACAGCATTTGATAAACCAACATACCCTGCACCAGCTACTGTCACCTTCATATATATAATTCCTTTATCTTAATCTCTTAATATTTTTTTACATATCATATGTTTCAATGATACTCCCTTTTTATCTTTCAAAGTTGGCATATTTGTATCTATATACTCTACCAGCTCAAAGCCGGAGTTATGCAAAGCTTTTTTCCAGTACCATAAAGGGTATGCTCTATCTCCAAGATATGGATCATATTCAAAACCAGATGCAGAAATTTTAGGAGAATTCTTCTCATAAAGCCTTAAAGCAACCTTTAATATTGTTTTTATAAATGAAAGCTTCAATCTAGCAATATACCTAAAATACTTTTCTGGAGTCTCATTTAATAAAATTAATGTTCCTCCTTTTTTTAACTTAGTATTTAACTCTACTAATAAACTTTCCAGGTTCTCAGCATGGTGTACAGCAGCAGAGGCTACAATTATATCTAAGGAATCATCTTCCAACAAAAGTGGAGAAAACATTGCCTCAATAGGAATTATCTTATTCTGCTGACCTTTTAAAATACTTACAACTCCAGGTAAAATATTGAACAAATAATTTTTACTGGAATCTAAAGCTAATATTGTCTTTACATTTTTAAATTTTGATAAATATGCACTTAGCCAACCGCCTCCGCAACCAAGATCTAATACTACAGAATCTTTTTTATTTATATATTCACTCCATTTTATTTCTTTTACTGCTTCCAAATAATTACATTTCTGACATACTTGCTGAAAATATATATTTGAATTAGTGTTCCAATTTTCTACTCCTGAACTCCTATCAGATAATATATTATCCCATTGAGCTACATTATTTTGGCATTGCTCTACTATCCAATTTTGACTAATCATAATCCTTCTTTATCCTGTTTTAAGTACCATTGAACTGTTTTCTTAACACCTGTATCAAAGCACTCATCTGCTTTCCAACCTAGCTCCATTTTAATTTTTGTTGCATCAATTGCATATCTTCTATCATGTCCAGCTCTGTCTTCAACAAAAGTAATTAATTTTTTATAACTATTCTTTCTTGGGACTTCTTTGTCTAAAATATCACATATTGTATTAGCTATCTGAAGAGTAGTTTTTTCATTCTCTCCACCTATATTATAAACCTCACCTTTTTTACCTTTATGATAAACCAAATCAACTCCTCTACAGTGATCTAAAACATAAAGCCAATCCCTAATATGTTTTCCATCTCCATATATAGGTATATTCTTCCCTGCTAAAGCTTTCCTTATAATTGTTGGTATTAGCTTTTCATTATGTTGCCTAGGTCCATAATTATTAGAGCAATTAGTAATAACTGTATTTAATCCATAAGTTTCATGATATGATCTGACTATCATATCACTTGATGCCTTGGAAGCGGAGTAAGGAGAATTAGGCGCATAAGGAGAAGCTTCAGTAAACAAACCTTTTTCACCTAGTGTCCCATACACTTCATCTGTTGAAATATGATGGAATTTACAACTCTCATATCCTTTTTTATAAACAAATGGCTTATCCATCCAATAATTATATGCCACATCAAGCAAAGTATATGCTCCATTAATATTAGTTTTAACAAACATATCTGGGTTTTCAATAGAATTATCAACATGAGACTCTGCTGCAAAATTGATTACACCACGAATATCATAGTTCTGAAATATAAACTCTATCAATTCTCTATTACATATATCACCTTTAATAAAATGATATTTTTTTTTTAACTTACAGTTCTCCAAATTTTCTAAACGACCGGCATAAGTCAACATATCTAGATTAACAATGTTATATTTAGGGTATTTACCTAAAAAATAATCTATAAAATTAGATCCTATGAATCCAGCTCCCCCTGTTAAAAGGATACTTCTTTCATTTTTCATAATAATACTTAAACACCTTAAACAGTTTATTTTTAAATTCATTTTCAAAAAAAATAGTTTTATTACATAGAGTATTCTCTCTAAACTCTAATAAATAATCTTCAACTTCGCCTAATGTTACTTCAAATGACTTACCTGCTTCCATGTAGTTTAATTTGTCATTTTGTATTGAAATACATTCATAAAAATCGCATACTATATCTTGTACATAAACATATGTTATTTTAATACTTCTATCATAAATATTAATAGGAATACCATTTATAATGTTATATATCCATGTACTAATTGCTGAATTATAGTTTGGTTTACACCCCTCACCGAACACATGAGGAAGACGATATATGTAACTTGAAATACCATTTTCTATTGAATATTTTTTAACTAATTCCTCAGCTGCTTTTTTACTTATCCCATACTGTCCACCACTTGATCTCTCAGCATGAATAGTTGATGATAGCAATATAGGCTTCTTTCCATAATTAACAAGATTATCAAGTATATATTCTGTTAAAGTAACGTTTGATAATACAAAAGATTCTTCTGTAGACCTTGGCCTTACCTCACCAGCTAAATGGAAAATAAAATCACATGATTTTAATTTTTTTTTCAAACTAGTAAGACTATGTATTCTATTATGCTCTATAACATCAACATTTCTATTCTTTAAATAGCTAGTTAGGTTTCTACCAATAAACCCACTTGCTCCAGTAACTAAAACCTTATTCATAATAATCAGTTCCATAATTAAACAAATTACTGACTTCTGACAAAAGAGGAAGTATTTTATCTTTAGGAGATATTATAAGATTTGATATATCATTTCCTTTCCAATCAATATTAAGCGTATGATCATTAAAAAGTATTCCTCTTTCAGCAGTAGGAGTATAGTAATTATCAACCTTATATGAAAAAATCGTATTATCCTCTAATACCAGAAATCCATGAGCGAATCCTCTAGGTATCAGAAGCTCATTCTTATCTAAATCATTAAGTTCAACCGTTAAGCTTTTTCCAAAAAATGGAGAGCCAACTCTCAAATCAACTATGATATCTAAAATTTTTCCCTTTATCACACGAATCAATTTTGTTTGCGAAAAAGGAGGAAGTTGATAATGTAAGCCTCTAAATACTCCTTTCTTACTTTTTGATTCATTATCTTGGCAAAACTTAATATTAATACCCATTTCTTTTTTGATTAACTCATCTCTAAATGTTTCAAAAAAATACCCTCTATCATCAGCATATATTTTTGGAATTAGTATTTTAACATCAGGTATTTCTGTTTCAAGAAACTCCATAGATTTTCCCCTGTCTTGCTCTACTAACTAAATACTTACCATAATCTGTTTTACTTAAAGGTTTAGCTAAATCAAGTAATTGTTCTCTTGATATATATCCTTTTTCATAAGCAATCTCTTCTAAACAAGCTATTTTGAGAGACTGTCTATTCTCTATAGAATATACAAACTGACCAGCTTCAAGCAATGATTTATGTGTTCCTGTATCTAACCACGCGAATCCTCTACCCATAGTCTCAACTTTCAATCTCTCTTCATTAAGATAATCTTGATTCACAGATGTTATTTCAAATTCGCCTCTATCACTTTTCTTAACTTTTTTTGATTTTTCAATGACATCATTTGGATAAAAATACAATCCTACAATAGCATAATTAGTATTAGGTTTCTTGGGTTTTTCCTCTAAAGATAAAACCTTTCCATTATTATCAAATGTCACTACTCCATACCTTTCTGGATCATTAACATAATACCCATATACTGTCGCATATTTATTTTCTTGAGCATTTAAAATTCCTTTAACTAATAGTTTTGATAAACCATGCCCATAAAAAATATTATCTCCTAATATTAAACAAACACTATCTTTACCAATAAAGTTTTGTGCAATTGAAAAGCTTTGTGCCAAACCTTCTGGCTTAACTTGTATTTGATATTTTAAGCATATACCTAAGGATTCACCATCTCCTAAAAGATCTCTATAAATACCAATATCTTCAGGAGTGGTTATAATAAGAATTTCTTTGATACCAGCTATCATTAATGTGGATAATGGGTAATAAATCATTGGCTTATCATATACATTAAGCAGATGCTTATTAACACCACGTGTCACCGGATACAATCTAGTCCCACTGCCGCCAGCTAATACAATCCCTTTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP022132|1693673:1700552|1698357_1699098_-|WP_157671567.1|DBSCAN-SWA
MNKVLVTGASGFIGRNLTSYLKNRNVDVIEHNRIHSLTSLKKKLKSCDFIFHLAGEVRPRSTEESFVLSNVTLTEYILDNLVNYGKKPILLSSTIHAERSSGGQYGISKKAAEELVKKYSIENGISSYIYRLPHVFGEGCKPNYNSAISTWIYNIINGIPINIYDRSIKITYVYVQDIVCDFYECISIQNDKLNYMEAGKSFEVTLGEVEDYLLEFRENTLCNKTIFFENEFKNKLFKVFKYYYEK
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MKGIVLAGGSGTRLYPVTRGVNKHLLNVYDKPMIYYPLSTLMIAGIKEILIITTPEDIGIYRDLLGDGESLGICLKYQIQVKPEGLAQSFSIAQNFIGKDSVCLILGDNIFYGHGLSKLLVKGILNAQENKYATVYGYYVNDPERYGVVTFDNNGKVLSLEEKPKKPNTNYAIVGLYFYPNDVIEKSKKVKKSDRGEFEITSVNQDYLNEERLKVETMGRGFAWLDTGTHKSLLEAGQFVYSIENRQSLKIACLEEIAYEKGYISREQLLDLAKPLSKTDYGKYLVSRARQGKIYGVS
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>NZ_CP022132|1693673:1700552|1693673_1694492_-|WP_088772992.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP022132|1693673:1700552|1695342_1696512_-|WP_088772994.1|DBSCAN-SWA
MKVTVAGAGYVGLSNAVLLAQHNKVIIYDIDCKKVEMLQNRLSPIEDKEIDEYLKNRKLNLKATSDIKEAYKDADYIIISTPTDYNTVTNRFDTESIERVVIDVLEINPDAIMVIKSTIPIGYTEKVRKKFNALNIIFSPEFLREGKALLDNLYPSRIVVGDKSDRAMIFAGLLVRGAIKKDVPVLYTNSTEAEAIKLFSNSYLAMRVAYFNELDSYSEKFNLCTKDIIEGVGLDPRVGKYYNNPSFGYGGYCFPKDTKQLRASFLEVPNALINAIVDSNEIRKEFITNQIISKKPKIVGVYRLIMKQESDNFRYSAILDIIDRLQVKKVNIVIYEPVLKENNFRGLKVVNDLDSFKILSSLIVANRVDETLLDVIDKVYTRDIFNSDI
>NZ_CP022132|1693673:1700552|1697342_1698371_-|WP_088773487.1|DBSCAN-SWA
MMKNERSILLTGGAGFIGSNFIDYFLGKYPKYNIVNLDMLTYAGRLENLENCKLKKKYHFIKGDICNRELIEFIFQNYDIRGVINFAAESHVDNSIENPDMFVKTNINGAYTLLDVAYNYWMDKPFVYKKGYESCKFHHISTDEVYGTLGEKGLFTEASPYAPNSPYSASKASSDMIVRSYHETYGLNTVITNCSNNYGPRQHNEKLIPTIIRKALAGKNIPIYGDGKHIRDWLYVLDHCRGVDLVYHKGKKGEVYNIGGENEKTTLQIANTICDILDKEVPRKNSYKKLITFVEDRAGHDRRYAIDATKIKMELGWKADECFDTGVKKTVQWYLKQDKEGL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_088772992.1|1693673_1694492_-	glycosyltransferase family 2 protein	A0A1V0SAH6	Catovirus	9.5e-15	38.3
WP_088772993.1|1694463_1695330_-	NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein	M4QPK0	Synechococcus_phage	7.7e-31	32.1
WP_088772994.1|1695342_1696512_-	nucleotide sugar dehydrogenase	A0A1J0FA55	Only_Syngen_Nebraska_virus	4.0e-107	52.8
WP_088772995.1|1696530_1697346_-	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088773487.1|1697342_1698371_-	dTDP-glucose 4,6-dehydratase	H9NC62	Sphingomonas_phage	2.5e-73	44.5
WP_157671567.1|1698357_1699098_-	NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088772997.1|1699090_1699669_-	dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase	I7HJC4	Enterobacteria_phage	3.8e-34	43.3
WP_088772998.1|1699655_1700552_-	glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RfbA	I7I009	Enterobacteria_phage	4.0e-99	60.1

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP022132|1826225:1872047|DBSCAN-SWA
TTTATGCAGCATCTAAAATACCAGAATATACTTCATCATGAGTCATATATCCAATACTAGAATGTAGTCTTTCATTGTTGTAAATATCAATATATTCTTTGATACCTACTTTAGCCTCTTTCATAGTTATATATGATGCCGGATAAACATTTTCATATTTCAGTGTTCTCCAAAATCTCTCAATTGCAATATTATCTATAGATCTTCCTTTAGCATCCATAGATATATTTATTTTATTATCAGATAATATTTTAATATGCTCTTTTGCTGTATATTGAGTTCCTTGATCAGAGTTCAAGATATCAGGTTTACCATATTTAAATAACGCTTCTTTTAACACACTAGTTGTTAGATGTGTATCCATAGTATTAGAAATCTTCCAAGCTAGTGTTTTCTTGCTATGCCAATCTATTATGGCTGCTAAATATGCATACCCACATTCTAGTCTAATATACGTGATATCAGCACTCCATACCTTATTAGCTTTATCTATAACAACCTGATTCGTCTCATTTTTAAATACATTAAGTAAGTATGGATATTTCTTGTGTTGCTTATTAATGACAGTTGTCTTTTTTTTAGGATACAATGCCTTAATACCCATGAATTACATAGCACTTTTGATTAGCTTCCTTCCAACTAGAAATCCTAATCTATTTAGCAACTTTACTAGCCTTCTCGTACCATAATATGGATGTTTAGTATGTATCAAATCTATTGCATTTAATAGTCTAATATCATCATTACTACTAAATTTTGATATTGGTGTATAATAGTACACACTCTTAGATACAGATAATAGTTTAAGCTGATTATTTAAAGATAATTCTAGCTTAGTATCTACAGAGTTTACTCTATCATTTGATGATACCAAGCTTTTTAGCTTTCCCATTAAAAAATCCCTCTCTACTATTACCTCGACTAGTTTTTTACTTGTTGCATCTTTATCTTTTCTAAGCTCATCTATTTCCTGCTTATACTCCTTAACAACAGAGCTTTTATCAAATGCTAAGCAAGCATTAGATAAAAATTACTGCTTCCAATTGTGCACGTTTTTAGGAAGTAAATCATACTTACTTGCTATCTCATTAACTGTCATATCGCCTTCTAGCAATTCTATAATTACTTTAGCTTTAAAATCAGCTGTATACGTTACTCTTTTTTTACTCATTTATCTATTTCCTAATTTATCTAGTTAAGTTTAACATCTAGGAATAAAAATCTTTCTAAAATCAGTAGCTTTTTCTGGGGACATTATAAATCTATTACTTTATTTTTTTGTAAATGCTCTTCTGCTCTAACTATATTATGATTTTTGTCATATGACTTTGATTGATTAACAAACGGCTCAATAAATAGATTTATTCCAAAAACTGATCCTATCTTTAAAGATTTCTTTACCTCTAATATAAACTCTTCTAGCTGCTGAATACTTAAATATCCACTAGAAATCATACCTAACATACCACTATTACTTACCACTGATACCATCTCAGGAGTAACAATCCCTCCAGCCATAGGAGCTTGAATAATATTAAACTTTAACTTTTCTAACATATAGAACACTCCAAAAACATCCTAAATATCAAAGCTTATTAATATATAGATTTTTAGTTAAACACAAACAATGGTACTATTTTAACAAGACAATATAAGCTTATAAAATAAAAAGTGAGCAAAACTAAATTTGCTAAAGCTGAAGAAATGCTTACTTACAGTAAACAGCAAAAACTTATAAAAACAGCAAACATTTTCTTACAACAAAATCCTGTTTATGAAAATTATGAATGTCGCTTTGATCTAATCGCAATAAATGATAACGATATTAACTGGATAAGAGATGCTTTTGTAGTAATGTGAAATAACTTATAAACCACTGCAAAGATCCGTAAAACTGCCTGTAACAAAAGATGCCTTATCGCTTAACAGCCACATAATTGCTTCAGCAACCTCTTCAGGTTTACCGCCACGGTTCATTGGTAGACTTTTTGCAATTCTATCAACTCTATTTGGCTCACCACCATCAGCATGTATATCAGTGTATATAAAACCAGGCCTTACACAATTTACACGAATGCTATCAGCAGCAACTTTTTTTGCAAGACCAGTCGTTAATGTATCTATAGCACCTTTAGAAGCAGCATAATCAACATACTCAAATGGTGCCCCTTTTCTAGAGGTCCCAGATGAGACATTAACTATAGCGCCACCTTGACCGCCTTTAGCTTTAGAGATCCTAACTATTGCTTCTTTACAACAGTAAAAATATCTCATAATATTTGTATTAATAACAGTTTTAATACGCTCACCACTCATTTCTATTAGAGGAATTTTAGTTTTTAAAATACCGACATTATTGACTAAATGAGTGATTACCCCTATTTCATTATCATTTTTTTTAAATAATTTAAAAACCTCACTTTCATCAGAAACCTCAGCTTGTATAGCAATACATTTAGCCCCTATTCTTAAAATCTCATCCCTAACTTTAAAAGCTGCGAGCTCATCACTCAGATAATTAATACAAACAGAATAACCCTTCTCTTGCTGCTTGAATTGCTGTAGCAGCTCCAATACCTCTACTTGATCCAGTACTAGTAAAACTTTATTATCCATACTCATACTTAACTTTTTTGTGATTATTAAAGAATACACTTTCAATTGGCTTCTGGAAATACATTGTAAGAAAACAAATTTTATATCTTGATAACTGTTAGAGCTAAGTTTTAATTAAAGCTTCTCAGAAAGAGCAATCAATTTCTTAGCCTGCAAAAGTTGATACTCATCAGTTTCATCATTAAGATTAAGGTTTAAATGACCAACCTTACGCCCTTTTCTAGACTCTTTATTGTAATTATGAATTTTAACCCTATCTAAAGCAGATAAATCTTTTGTTGAAGGCATACCGCCTATACAATTTAGCATCACTGTTTTTCTGCTTGAAGTATCGCCTAAAATCAATCCAACTATAGCTCTTACATGATTTTCAAATTGTGATGTAATTGCACCATCTATACTCCAATGGCCACTATTATGCACTCTAGGAGCTATTTCATTTACAATCAATTCATTACCTTTAACAAAAAACTCTATTGCAAGAGTTCCAACATAGCCAAATTCTTTGACTAAAATTTTTGCTATTTGCTGAGCTTTGACTTCTAGAGCCTCATTTTCAAAAGGTGCTTCTGATTCAACTATAACACCCTGCTTATGAGTATTTTTAGCTAATGGATAAAATGCAATATTACCTTTAATATCAGCTGTACATATTTGAGAAACTTCATAATCAAATTTAACAAAAGCTTCATAGATAAGACCATCGGGAGCATCTTTAAAAATACCCCAAGCCTTAGTAACATCATTTTGAGACTTGATCACAAACTGGCCTTTACCATCATAGCCAAATCTACGTGTTTTAACTATAGCTGGTAATCCATACTGTTTCACCGCATTTTCAAGTTTATCCAAATCATCAATATTGACAAAATTTGCTGTCTCAATGCCATGATCTCGCATAAAAGATTTTTCAAGTAAACGATCTTGTGAAATTACTATAGCTTTAGCAGATGGATATACACTTACCTCATGATCTATTGCCTTAATAAGTTCATGAGATATATTCTCATTTTCGAAGGTTATTACATCGAACTGCTTAGCCCAGTTTACAACATCATTAACTTTATCTAAATCAATATCTATAACACTTTTTACAACGTTCTCTGCACAATCCCCAAGTTTACCTAAACAGTGAAACTCTAGCCCAAGAGGTGTACCTGCGATACTTAACATTCTAGCAAGTTGCCCAGCTCCTATAATACCTATTTTCATAACTACCCTATATTTTATTTTACTCTTGGATCAGCATTATCTAAAACAGTTTGAGTTTGATCGGCTCTAAATTTCTCTAAAGCTTGACCTATATCAGGGTTTGTATGTTGCAAAATACTAGCTGCAAATAGTGCTGCATTTTTACTGCCTGCTACACCAATTGCAAAAGTAGCAACTGGAATACCTGCAGGCATTTGCACTATAGATAACAGACTATCTTTGCCACTTAATGTACTAGATTTAACTGGCACACCTAAAACTGGAAGATCTGTTTTTGCAGCAACCATACCAGGCAAATGTGCAGCTCCACCAGCCCCAGCTATTATAACTTTAAGGCCTCTTTTTTTAGCAGTTTCAGCATAGCTAAACATTTTATCTGGAGTTCTATGTGCAGATACTACTTCACACTCATAGTTAACACCCAAACTATCTAAAATATCACAACATTCTTTCATTGTGCTCCAGTCAGATTTAGAGCCCATTATTACACCAACATCTATACTCATTTTTTATCTCCAGCTTTTGATAACTTCAACCCAAGCTTTACTTTCCAAAGTCTGTACCTTAGCCTTTAAGGTTTTAGCCGTGTCACTCTTATTAACGTCACACTTAAGTTGTAAAACAATACCTCCTCCATCAACATCTTCTGTCACATGGTGTATAGTACAACCTGAAACATAATCGCCAGCATTAATCACAGATTGATGAACATCTAGATCCATTAACCCAGCATGTTTTGGTAAAAGTGATGGATGAATATTTAGAACCTTATCTTTAAAGCTATTTATAAAAAAAGGACTTAAAATACGCATAAAACCAATTAATAAGATTAAGTCTGGGTTATATTTTTGTATTTCATCGGCAAGAGTTCTATCATACTCCTCTCGACATAGCCCTTTAGCTCCTATAAATTTATTTGGGATATTATAATTTTTAGCTCTTTCCAAAATATATGCAGTTCTCTTATTTGAAATAACTATTTCTACATTTGCATCTACTTCTTTAGCAGCTATAGCATCAATTATAGCTTGCATATTAGTGCCACGAGTTGAACCTAGTATTGCAAGTTTTAACTTAGTCACCACTTATAGTTCCTGATACTTATTACCACGTAATAAATTCATATGCCTTATTCGCTTATTAATAAGCTCTTTTGTACCAATATCTGGGCG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MSFPFGNFAYTNSFREELYDSFETYADTTFELIDALSSSNAKTAVELSLSPFFTRQYSSISQILKIESQSSILGKVGTKLINEIKLNNSSNIHFML

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_157671585.1|1826831_1827116_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_088773106.1|1827478_1827781_-	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_157671587.1|1827895_1828084_+	YraN family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773107.1|1828954_1830052_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_088773108.1|1830066_1830558_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	3.3e-23	43.5
WP_088773494.1|1830561_1831134_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	2.5e-22	33.2
WP_088773109.1|1831137_1833447_-	phosphoribosylamine--glycine ligase	A0A0M4JBD3	Mollivirus	5.2e-26	30.4
WP_088773110.1|1833446_1834490_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3F760	Synechococcus_phage	1.3e-53	37.8
WP_088773111.1|1834638_1835505_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	2.9e-30	37.5
WP_088773112.1|1835628_1836345_-	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773113.1|1836566_1836977_+	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773114.1|1837651_1839301_-	DNA repair protein RecN	NA	NA	NA	NA
WP_088773115.1|1839457_1840648_+	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_088773116.1|1840774_1841269_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773117.1|1841299_1842412_-	S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase	A0A0K0KVL7	Prochlorococcus_phage	1.7e-27	28.3
WP_088773118.1|1842674_1843037_-	phosphomannose isomerase type II C-terminal cupin domain	NA	NA	NA	NA
WP_088773119.1|1843904_1844477_-	superoxide dismutase family protein	Q9MC02	Salmonella_phage	1.4e-33	49.7
WP_088771586.1|1844587_1845580_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.8e-23	30.3
WP_169709692.1|1845613_1845745_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088773120.1|1845850_1846396_+	peptide-methionine (R)-S-oxide reductase MsrB	NA	NA	NA	NA
WP_088773121.1|1847458_1848517_+	chorismate synthase	A0A291AU41	Pandoravirus	2.1e-78	44.0
WP_088773122.1|1848519_1849119_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773123.1|1849115_1849859_+	PilZ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773124.1|1849865_1851236_+	DNA repair protein RadA	NA	NA	NA	NA
WP_088773125.1|1851241_1851778_+	CvpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773126.1|1851781_1852780_-	NAD(P)-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_088773127.1|1852975_1853341_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_088773128.1|1855052_1855664_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	7.1e-23	40.0
WP_088773129.1|1855644_1856562_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773130.1|1856597_1856888_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671591.1|1856925_1857348_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088773132.1|1857866_1858922_-	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_088773133.1|1860046_1860622_+	LemA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773134.1|1860623_1861685_+|protease	zinc metalloprotease HtpX	NA	NA	NA	NA
WP_088773135.1|1861833_1862154_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773136.1|1862166_1862874_-	ribonuclease PH	NA	NA	NA	NA
WP_088773137.1|1862970_1863483_+	chorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_088773138.1|1863475_1864333_+	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088773139.1|1864943_1865531_+	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_157671593.1|1865929_1866088_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_157671595.1|1866092_1866293_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771820.1|1866433_1866649_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671669.1|1866585_1867035_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	9.8e-30	42.4
WP_088773141.1|1867031_1867205_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088773142.1|1867145_1868063_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.9e-16	30.5
WP_169709695.1|1868096_1868228_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088773143.1|1868305_1869028_+	Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773144.1|1869397_1870156_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773145.1|1870182_1870794_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671597.1|1871342_1872047_-|transposase	IS6 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP022132|1875374:1929124|DBSCAN-SWA
TTTAGAAACAGTAAACCTCTTTAGCTGCTTCTTGCCATATATTCACCGCTTCATTAAATTTAGTTCTTTGCGTTTCTCTAGAATTTAAATATCTACCTACTGGCACTGCAAATAGATTTCTAACTTTACCCATGAGTGTTAATGTTCTTTGAATTCCACCAGGTGATTTAAATTTGATTAAACTCTTTTCCTTTCTACGTGTAGGTTGATGTGCATTCTCTACTCTATTATTTAGACCTTTGTGTCTTCTATGGTCTGCCTTAGTCATGTGTTTGATTGGCTTTGTATAACTCTGCAACTTATCAGTGACAATAACTCGTGGTGATGGGTAAGAACCTAATAGTCTAGTTAGAAAGCGTATAGCTGCTTTCTTATTCTTACGCTTCTGTAGAAATACATCCAACTCATTACCATTAGAGTCTACAGCTCTCCATAGTATAAACTTAACTCCATTCATTTTAATAATCATCTCATCTAGATGCCATTTGTCTGTCGGTTTAGGCTCTTTCTTTTTTATTACATCAGCAAAAGATTTACCAAATTTATTACTCCATATTCTTACTGTTTCATAACTTACTAGAATGCCTCTGTATCTGAGCATTTCTTCTATATCTCTATAACTGGTATTAAACCTATGATACATCCAAATAGCATAACCGATAATCTCTGCTGGATAACGATATCGTTTAGGTTTGTGTGTAAGCATGATTAAGAAAAATAATATGATTTTTTATAATTATACACTAGATGGATTTAGACGTAGTTAACTTGACGGTGCCGGTACAATAACTATTATTGCCATAGTTTCAAACATACCAAACCAATCTAGTTTGATACTTTTTGAGAAGAAAAAATAAATAATTAATGGCATAAATATTGGAGCTAATAAAGTAGTTAAGAAAGTTAAACTAACAACCAATGATATATTTGCTCTAGCTAATAAGGCCATTACCCCAGAAGCCGTGCCTCCAGGACAAGTTCCCACAATAACCAAACCTATTAATGCCATCAAATTTAAGCCTAAAAGCTTTCCTATTATAAAGGCTGCTACAGATGTCACAATCAATTTTAGAAACAGTATAATTAATAGCTTTCCTTTTAAACTAGCCACTTTCACAAAATCTTTTGCTTTTAAATGTATCCCTATAATCAACATAATTCCAGCCAATAAATAGGTGATATAAGGCTTTAATGGTATAAATACAGATGGTATAGAAATAGCCAATACAACACTTAGGATAACTATAACTGCAAAATATTTTTGTATAAAATTCATTTTCATATAAAACTATCTTCAAATTTAATTAATTTTTAAACTATTTTACATTATTAGTCAATTATAATAGGACTTTTGATGTGTAGTAATCTCTTCCACCTATCAGCGGAATCTCAAATACTATATAATTTTCTAAAATCTGCCTAATTTATATAGGAATTTAACAAATTAGGGCACCGTCAAGTTAACTACGTCTAAATCCATCTAGTGTATAATTATAAAAAATCATATTATTTTTCTTAATCATGCTTACACACAAACCTAAACGATATCGTTATCCAGCAGAGATTATCGGTTATGCTATTTGGATGTATCATAGGTTTAATACCAGTTATAGAGATATAGAAGAAATGCTCAGATACAGAGGCATTCTAGTAAGTTATGAAACAGTAAGAATATGGAGTAATAAATTTGGTAAATCTTTTGCTGATGTAATAAAAAAGAAAGAGCCTAAACCGACAGACAAATGGCATCTAGATGAGATGATTATTAAAATGAATGGAGTTAAGTTTATACTATGGAGAGCTGTAGACTCTAATGGTAATGAGTTGGATGTATTTCTACAGAAGCGTAAGAATAAGAAAGCAGCTATACGCTTTCTAACTAGACTATTAGGTTCTTACCCATCACCACGAGTTATTGTCACTGATAAGTTGCAGAGTTATACAAAGCCAATCAAACACATGACTAAGGCAGACCATAGAAGACACAAAGGTCTAAATAATAGAGTAGAGAATGCACATCAACCTACACGTAGAAAGGAAAAGAGTTTAATCAAATTTAAATCACCTGGTGGAATTCAAAGAACATTAACACTCATGGGTAAAGTTAGAAATCTATTTGCAGTGCCAGTAGGTAGATATTTAAATTCTAGAGAAACGCAAAGAACTAAATTTAATGAAGCGGTGAATATATGGCAAGAAGCAGCTAAAGAGGTTTACTGTTTCTAAAATTTAGTGGAAGTGCTTTTCTACACCACAATTAGTTAACTTGACGGTGCTCTTATTATTTATAAATAAATTATATTTTTTCATCTTTTTTCTCCGTCGGTATTATAGAACCATATAGAATAAATTCTCCTTATTTTTAATCCTCATTCTATACTCTTAGCTTTACAACTAAATTCTCTTATTTATCATCCCATAAAGCAAATGAATAATATTTACCATCTCTATTATAGAAAGGAATAGTAATTTAACTAGCTTATTTTGTTAATATGATCTATTTATTAAATCTCTAGATAATAAAAACATTGAGAAAATTAGCTTACAAATATAGTAGCCTAAAACATTAGATCTTCTTAAATAAATGATCATATATTAATCTGAGTTCGATATAAGATAACCTTAAAGTAGGTATCAAAACTAAAAGAATGAAAGCTAGATGTATACTACCCCAATAAATTAAACAATATTTTCAATTATTTAGTTCCCATCTAAGCCGCCCGTTTTTCCAATAAGTTATCGTAATAAAATTCCATAGGTTTTTTATAATTGATAGACTCATGAAATCTTCTATTATTATAAAAATCTATATAATCATCCACATCGTTTCTTAGTTCAACAATGCCAGGATATTGATTTAAATAAAATCTCTCACATTTAGCACTTCTCCAAAATCTTTCGATGCAAATGTTATCAGTTGCTCTACCTTTACCATCCATAGATATAGTAATTTTTTTATCCAATAATGTTTGGATATGAATGTTAGATGTGTACTGGCTACCTTGATCAGTGTTAAATATTTCTGGTACTCCATATTTATACAGAGCTTCATTTAAAACTTTCATAACTAAACTACTATCCATAGTGTTGGATATCTCCCAACTTAGTACAGCCTTAGAGTACCAATCAATAATAGCTGCCATATAAACTGTGCCAGCATCAGTCTTAATATATGTAATATCTGTAGACCAAACTTGATTAGGTCTCAATATGCTTAAACCTTTTAGTTTGTAACTATAAATAGTATGCTCTTTGTTAGGTTCAGATAAGTTTAAGTTTGGTTTTTTCACCGCCAATATAGCTTTGCTGCCTAACTCTTTACGATACTTTTGTACTGTGTTCTCACAGATGCTAAACCCATCTTCTATTAATTGCTTATGAGCTTTTATATAGCCGTAGCAGGGAATCTCCTCATGTATCTGTATAAGCTTTGCTTTTACTTCTTCTTTATGTTCGTTAACCACAGGCTTGTAATATAAACCAGCTCTAGAAACTTCTAATAAGAAACTTTGTTTTACAACAGATAATTTATGCTTAGGATCAATCATCGCTTTTCTATCAGATAATCCCAAGCTTACGAGCTTTCCCTCAAGAAATTCCTTCTCAATTGTTAGTTGTCCAACCTTCTTAGAATACTGATCTATCTTGGTTTGAAGCTTTGCATTGTCTTTTTTATATTGTGATACTGATTTGGATGGATCCATTGCCAACTCAGCATTTTCTAAAAAGGCTGTTTTTCAATTATTTATGTTTTTGGGCGTAATATTATATTTTACTGATAACTGTGTGATTGTTTGATCTTTCCCCAATACTTCCAAGACAACTTTAGTCTTAAATTCAACGGTATATATTTTTCTCTTATTACTCATTTACATTTATCCTAAATTGCTCATTTATAGTTTAGCTACTTTAGGAACTAAATTCTCAAAATTGTTGTTAAAATTTCATGGGGTATTATAATGGGATCAAAAATTCTTATTCAAACTAATCGAATAATTTTAATACACTTGCCCTGCTTAGCTTAACTTTTTCTCCAGTTATTGACAATAGTGCGTCACTCTTAACTTTGCCATCCACTCCTTTACCTTCGCGAGTATTACCAAAGTAACTTTCATCTACTTCAATCTCTCCAACAAACACTTCTTAATGCTTATTGTTTTCATAAATAAACAGTCTTAATATATAAAAATAATAGCTAGCTGTAGTCTTATTTATTCATACTAGTTCTGATACAGTTCGTGCTGTACTTCCCGCTATAAATAACTCTATTAATTTATCTTGCTTATATGCCTCAATCTACTTCTTCTCATGAAAGCTATCATAGCATAACTTAGTTATCCTAGGACAGTCTCAAAGCTTAGTATTCAAAAATGTTTAATAAGAGGAAATTAGTCAGCAATTAAATCATACTCAGTAGACTCTGTAATCCTAACATTAGCAAATTCACCTACCTTTAGACCTCTCTCTGCAGCATCACCAACTATAACTTGTCCGTCTACTTCTGGAGCATCATACCTTGTACGACCAATTGCATAGTTTTCTTCATGGTTTATCGAATCAATGATAATCTGCTGTTCCGTACTAACAAAACCTTCAAGCTTATCGGCACTTATTTGAGCTTGTAACCCCATAAACTGATCTAATCTTTGTTGCTTAACTTCTTCAGAAATCAAGTTATCAAACTTGTTAGCCCTTGCACCATCTACTTCTGAATACTTAAAGCAACCAACTCTATCAAGTTGTGCTTTATCAGCGAAGTTTAATAAGTGTTCAAAATCTGCTTCCGTCTCACCAGGGAAACCAACGATAAAAGTACTACGAATAGTTATATCTGGACAAATATCACGCCATTTATTGATTCTGTCAAGAGTTTTTTGTGTATGAGCCGGACGCTTCATTCTTTTTAGAACTTCAGGAGATGAATGTTGTAGTGGTACGTCTAAATAAGGAAGTATTTTTCCTTGAGCCATAAGTGGTACAATCTTATCAACATGAGGATA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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP022132|1939991:1982000|DBSCAN-SWA
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MITKLIFFVLGVVVVFILSFLWSSDRKKIRYNYLGIILIVQILLAYFLLRSSIGEDIVGVIVRGFDVLLQCANDGTRFIFGSLTDMDGGHLFFFTVGMPIVLMSALIGILQYFKILPVIIKVVGFILSKITGMGRLESFNAVSSLSVGQSENFIAYKKIIGHLPSNVLYTMAATAMSTVSLAISGAYMQMLSVKNGFDPKFVIVAMVMNMFGTFFVLTVINPYDKSEDISFDSLHEAYDERSEKQSFFEMLTEYILDGFKVAVIVCAMLIGFIALISLLNTLFISIFSISFTGILGYVFYPFAWVLHIPNNQIHLAGQIMGTKIVTNEFAAIDFMVKHSAELTSHTKAVVSVFLISFANFASIGIIIGAIQALSKEASVKVAKFSLKILYGAVLVSLLSAVIVGFVV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_088771820.1|1940620_1940836_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671496.1|1940852_1941176_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088773201.1|1941212_1942415_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088773202.1|1942437_1943415_-	50S ribosomal protein L3 N(5)-glutamine methyltransferase	M1HV90	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	7.4e-06	28.2
WP_088773203.1|1943418_1944798_-|tRNA	cysteine--tRNA ligase	A0A1V0SAQ2	Catovirus	1.3e-56	32.1
WP_088773204.1|1944874_1946749_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_169709692.1|1947317_1947449_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088771586.1|1947482_1948475_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.8e-23	30.3
WP_157671607.1|1948503_1948980_-	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773503.1|1948996_1949323_-	pilus assembly protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773206.1|1949844_1950783_-	peptide chain release factor N(5)-glutamine methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_088773207.1|1950775_1951861_-	peptide chain release factor 1	W8EDB3	Pseudomonas_phage	5.7e-07	40.5
WP_088773208.1|1951861_1953106_-|tRNA	glutamyl-tRNA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_088773504.1|1953276_1953912_+	tetratricopeptide repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773209.1|1953922_1955284_+	outer membrane protein assembly factor BamB	NA	NA	NA	NA
WP_088773210.1|1955276_1956458_+	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088773211.1|1956548_1958432_+	DNA topoisomerase IV subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	1.2e-89	34.6
WP_088771586.1|1958520_1959513_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.8e-23	30.3
WP_169709695.1|1959546_1959678_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088773212.1|1960077_1961598_-	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	3.4e-42	28.0
WP_088773213.1|1961882_1963052_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.2e-26	33.5
WP_088773214.1|1963227_1964217_-	signal recognition particle-docking protein FtsY	D6PHS7	uncultured_phage	1.2e-16	37.2
WP_088773215.1|1964247_1965654_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773216.1|1965728_1967306_-	peptide chain release factor 3	A0A2K9L6L3	Tupanvirus	1.1e-11	33.6
WP_088773217.1|1967496_1968120_-	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	2.6e-28	38.4
WP_088773218.1|1968130_1969354_-	NupC/NupG family nucleoside CNT transporter	NA	NA	NA	NA
WP_088773505.1|1969343_1970078_-	deoxyribose-phosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_088773219.1|1970070_1971312_-	phosphopentomutase	NA	NA	NA	NA
WP_088773220.1|1971331_1972099_-	type III pantothenate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_088773221.1|1972117_1974811_-	DNA polymerase I	A0A218MKQ4	uncultured_virus	1.9e-75	31.1
WP_157671609.1|1975202_1975385_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671675.1|1975475_1976180_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157671279.1|1976237_1977296_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088771607.1|1977256_1977718_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_088773224.1|1977999_1978965_-	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
WP_088773225.1|1978969_1980799_-	lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA	W8CYL7	Bacillus_phage	3.4e-52	30.4
WP_088773226.1|1980896_1982000_+|tRNA	CCA tRNA nucleotidyltransferase	K4IEX3	Salmonella_phage	4.2e-50	53.1

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP022132|2015615:2056773|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP022132|2077299:2112447|DBSCAN-SWA
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MIKKAIWSKDKSNILKSLSDCINTDDISSILAELKEELSDQYKDVNQRIKSKENEYIKIDENGGKVTWRLPYKREDDSADNPYYEKFTSTGISEVIDFAANNTNFFDSFKHILNKGSKSKPRNKDLKAYLVSQGEAIGHKKVAESSDVSYQNLIDIEGKFIRVDSLVEAGDIIIDAISKLPIFKYYNLSDYGIHASLDSQKIEIKYQTILSRYSTKYFGYGKGVVSYSLIANHLPVSTKIIGANEHESHYVLDIIYNNSSDLNITTVSGDMHSVNRVNFALLKLFGYSFMPRMPSINLKAEHSLVAFKGMKSFKNDLIKPSYTVDEALIISEWDEIQRILASIAKKDTSQSTIIKKLSSYSRKNRTLRALTEFDKIVMSIYVLKYIDDIQLRRNVHRALNRGEAFHQLRKAHYSKLMAKKY

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP022132|2139082:2176665|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_088773358.1|2139426_2140299_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	8.8e-27	33.5
WP_157671624.1|2140282_2140597_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_088773359.1|2141014_2141377_+	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_088771625.1|2141475_2141721_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.1e-11	51.5
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