Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP007461 | Listeria monocytogenes serotype 4b str. 02-1792 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DinG,cas3,WYL,casR,csa3,DEDDh,RT | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP007461_1 | 551198-551782 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP007461_1
|
7 spacers
spacers of NZ_CP007461_1
>1.1|551237|39|NZ_CP007461|CRT TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG >1.2|551315|39|NZ_CP007461|CRT TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTG >1.3|551393|39|NZ_CP007461|CRT TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG >1.4|551471|39|NZ_CP007461|CRT TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA >1.5|551549|39|NZ_CP007461|CRT GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG >1.6|551627|39|NZ_CP007461|CRT CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA >1.7|551705|39|NZ_CP007461|CRT GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP007461_1
The CRISPR arrays of NZ_CP007461_1 >merge|NZ_CP007461|1|551198-551782|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATGTGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTGGATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGTCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTGGATGTAAGCAACCTTGATACCGGTTCAGTAACTAATATGTATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTGGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATGTATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTAGATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATGGTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTGGATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATGCGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTAGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGGCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTTGATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG >NZ_CP007461|1|1|551198-551782|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATG TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG GATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTG GATGTAAGCAACCTTGATACCGGTTCAGTAACTAATATG TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATG TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA GATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATG GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG GATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATG CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT GATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG
>NZ_CP007461.1|WP_003725193.1|548251_550405_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGNANVSIAQERDTTNKLPEEELSSLDTSNIIAEEVAQEKPAEVENLEEIPTTDELMQNPDVREQPVADSDNPDLTVVSSGAYWTIYRNTVNGEYSLHMFGNVPSSIPSAWKSYLSNIKHIEIEEATLTGSFETYFKSKIGGFLALESVRIERSNLSGVTSFREAFFNPILQKVIIRDNDYPTVPSLLTMESMFENSYNLTELDVSGLDTSAVTNMKNMFYKCSVLKELDLSNWDTSAVNNMNSMFGYCESLEKLNVSNFDTSSVNDMHYMFRDCKALEKLDVSDFDTSSVTTMYGMFVNSTSLKELDVSNFNTSSVTTMQGMFSTCRALEKLDVSNFDTSSVTTMLGMFAACNSLEELDVSNFDTSSVTNMYSMFADCELLEKLDVSHFDTSSVTDMRTMFNNCQSLEKLDVSNFDTSLVTNMQGMFQNCTALKSLYLDNFTTAKTMTDMFTGTTSLTYLFVSHNLQSFYGLANTNWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRNQSEPTGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKISGEYWEEVIPVKEGHYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVVIPASISLNETSELKVEGINRGSKTLSVGLNQLATSISESNKLTLANTADTTVQCLAPLSWDGSENNPENAILTLAPGSEITEGDAVVEIESPENIQAGKYTGNLVFSINYE >NZ_CP007461.1|WP_003740432.1|546450_547989_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLASFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELSERNLYISTGNQVEITGDEFSLRIFYTFLFLVAYSGDRWPFSFVRYDEITDLLESCPKEIYRANSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASERVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTDLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDSLKPFEERLASDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEILNQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIIYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKD >NZ_CP007461.1|WP_003728092.1|544264_545815_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIAHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGRAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIAEMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NZ_CP007461.1|WP_003728093.1|543171_544272_+|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTGSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NZ_CP007461.1|WP_003728992.1|541887_543171_+|cytosine-permease MTEKKSVEQTQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVLFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPVLLFVCIYGLVVSLNDGGLAIVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMITVGAVLALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAVAGGLGTILAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVSGVNWLGVSSWLVGAVIAGIPVILTFFPELPQLPNQPLIGIILSLAVYLIGAKVLSGKTNNVENLEGK >NZ_CP007461.1|WP_003740428.1|540158_541754_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKMDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHTSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERIIEASKQIGEHELVQLTLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGVLTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRDNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKPLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRILGGNNNNK >NZ_CP007461.1|WP_003721242.1|539055_540003_-|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NZ_CP007461.1|WP_009929138.1|537902_539051_-|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLAFRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRRFVKNTYHDGDLIDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPASFGNVSARQQVVYPLFKKHFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPDVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEDNGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCIDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEPASLLSRWEREAK >NZ_CP007461.1|WP_003725186.1|535746_537906_-|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTANWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHIVMIIFVSGIYYAKGGILAGNWFVSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRVMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIAAPNRISADSLKRNGLFYHIFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPVPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSADVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSNDYMPYPYGTQTVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIERYLSASGTFTYSTEDAKETPRGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTADKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVTLLALAIIFRRRIRRYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFSTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQIYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NZ_CP007461.1|WP_003734632.1|534874_535630_-|DUF4866-family-protein MTTIFPKEQNVAPLFEQILANPTACRRFKDVFLDNLESYQETRGFEKDDTLFAKIILSAYRQSDVSALLLGVCGRTLFELLRQAFLIPKKLTVDNPFFLTDKEGNFIAKKDDISNREQEKFQEIYQSDLHHSETTIFLVDDDDIIHSYEPDFSISTKRINKKRGILVLYSLPDTLKLGMTESEVYAFIWKTFLHIQEIIPSSRIFYGQETSENADELGVFLPIHHFEKKMLQNIEQVNELVDALREQMVNK >NZ_CP007461.1|WP_003721252.1|552675_553149_+|hypothetical-protein MKKKRVVIISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDHSAVDWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NZ_CP007461.1|WP_003721253.1|553168_553654_+|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVFFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELQRVGAISDVITSSFKSNNSVVPMANPVIGSFSGYAMEETEVSKIQIGNPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NZ_CP007461.1|WP_003727318.1|553681_553987_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFFLSPDRVQASQTVVEVLISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQPILPKAGDTVTNYTLLGLVLVLIWLIMQRKRKKKE >NZ_CP007461.1|WP_003730795.1|554060_554327_+|hypothetical-protein MARIEYEEKIQKSLLVLYFRGSTIQSICREYGIPRYEFYKWMKLHDADKLETKEVKTFLQIRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NZ_CP007461.1|WP_010958743.1|555062_555680_+|hypothetical-protein MLMSLSVLPLATYASETENTPTESYGGENFIATQTGNTLVIEDKKTGETVKIEMNDEENGVITSDDGTIENVHRDEEGNVYVDNELELEAPPLDIEDGINIATQPRLLKASKWIYVQTTKYNTTTQGNMRSLALGILSFMPITGPIFGIVAIIDAARSMGAKTLYVRVKQYRTSGYQFYKYDSYYYANASLTKLVKKTSQTKRMW >NZ_CP007461.1|WP_010958744.1|555989_556334_+|hypothetical-protein MQKDTYSGIRLSVIQLIDSKKENLKENNIKLTIIKDEKDGYVVELDNDKCMAEIVVEEPTYAPYRYISFEVVSLMDGKVKIIYSWYDDETSQWSDIEKELNKGIQFLNNFKTME >NZ_CP007461.1|WP_003734774.1|556740_556983_+|hypothetical-protein MKRIILTSTLIVWTIVCIYMSISMVSNNTGIAFPIWLHIILLICFLATGIVNVKKKEYLWSTMLFEGVLVVLLSLIIVLV >NZ_CP007461.1|WP_010958745.1|557065_558043_-|HD-domain-containing-protein MKMTDPLYGTFEIEPVLAELIQSPLVSRLAHVHQGGSSYLVNPLWDLSRLDHSIGVMLFIRKFGGSLEEQIAGLLHDVSHTAFSHVVDYALDFEEEDYHEQIFEDFVKTSTIPAILEKYGYSFEGIFDDISKWKILEQEAPELCADRIDYTLQDLYRHRKISLAEVEEFLQALVMVDGRLYLANIALAEWFVAQYYSEVIDYFYDPLNVYSYEILAEAMRIAFQQETITTADLRLTDTELLAKLNANSDAREKIQLLASAHLEENEADFTYHHKKKMRLINPSILVDGRLIPADELSEKVRKMNDWASERSKHGIYIKATKKSKQ >NZ_CP007461.1|WP_010958746.1|558146_558482_+|hypothetical-protein MAEDAIDKMKTNSSGVRLVLVGSGSVIILDEISGVAKNFRDKNGPVANAIGASISQIKRDEALQDAEQKAREQPTLAGSVTDSIEVVEEIPLVHHLANAPRLRMKVVGNLV >NZ_CP007461.1|WP_010958747.1|558942_559302_+|DUF3139-domain-containing-protein MKKYKKWWITIGIIFLLSVIGYVYWFAIPKNTANKAVGNYLAEQKIKSNQIETRVIKKDWKMGGYLTKIVFKDDPNLKYEYSYDERYEFPHHIYVLVFKDGSSQEDDQVKHPPLQEQND |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
92483 : 180876
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP007461|92483:180876|DBSCAN-SWA GATGACAGCGAGCGTATTTGTGGCAGGAAAATTACTACCAGAAACGATGGAAGCTCTTAGCAAATGGGACGTTAAAGCTTTTTCAGGTGAGGAAAATATTACAGAAGCAGAGTTAATAAAAAATGTAACGGAAGTGGATGCGATTATTTGCCCGCTTTCTTCCCCAATTTCGGCAAAGGTATTGGAATCGGCAAAAAATCTTAAAATCGTGGCGAATATTGGTGCCGGTTTTGACAATATCGATGTAAAAAAAGCGCAAGAATTGGGCATTGCAGTGACCAATACGCCAGATGTGTCAACGGAAGCAACGGCGGAACTAACGCTTGGATTGATTTTGGACGTAGCACGGAGAATTTCAGAAGGCGACCGATTATGCCGCGAAACCCCCGAGCAATTCAAAGGCTGGGCACCAACGTTCTTTTTAGGTACTGAATTAAGTGGCAAAACGCTCGGAATTATTGGATTAGGAAGAATCGGACAAGCTGTTGCAAAACGTGCGGCTGCTTTTGGAATGAAAATTATTTATTCTGGGCACCATCCGAAAGAAGCAGCGAAAGAGTGGAATGCAGAGTTTGTGAGTCAGGAAGAATTATTGAAGCGCAGCGATGTTGTAACAATCCATGCGGCATACAGTCCCAGCTTGAAGTATCTGTTGAACGAAACAACACTGAAAACGATGAAATCAAGTGCCTTTTTGATCAATGCTGCTCGCGGTCCTGTTGTAGAGGAAGCTGCACTGATTAAGGCATTAGAAACAGGCGTTATCGCCGGCGCTGCGCTGGATGTGTTTGAGTTCGAGCCTAAGATTGGCGAGGATTTGGCTAAACTGGATAATGTCGTATTAACACCCCATATCGGAAACGCAACTGTGGAAACACGCACAGCAATGGGCAAAATAGCCATTGCAAATGTTGAAGCTGTCTTAGCAGGAAAAGCACCACTACATTCTGTTTATTAATACCGAAAAATATAGCCGCAGCGAGTGGCTGCGGCTGTGTTTTATCGCTGAATTATGGTATAATATTTTTTGTCGGAATACGACAACGGGTTGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGCTGACTCTTAATCAGCGGGTCGGGGGTTCGAAACCCTCACAACCCATATATAAAAACCGCCTAAACAAAGCGTTTAAGCGGTTTTTTGTTTGTGAAATTTTAGTTTAAAATTGCCTTTTTTTATTAAGTGGGGCAGAGGTGGGGCAGAAAGCTTAAAAAGGGTTCTCAAAATCGCTAGCTGCATCTTTGTGCGTATCTTTCAAAACATGTGCATAAATGTTTGAAGTGGTCACACTAGATTTATGTCTAAGCCGCTCTTGGATAATTTTTATATCTCTACCTTTGTTCAATAAAAGTGTAGCAGATGTGTGACGCAAATCATGAAAACGAATCACCGGCAAGTTGTGTCTTTCTAAAAATCGTTTCCAACGCTGATAAATCGAATCAGGCCTAATCGGTTTGCCTTCCATGTTGGCGAATAAAAATTTGTGATTGGTCCATTTCCCTTCAGTTTTTAGGTCTAAAACTTCATTGCTTATATATGTTTCTATTAAATTAGTTAACCAAGCGGGTATAGAAACTATCCCAGCTACATCATTCTTAGTTGATTCTTTAAGAAGTAAACCTTCTCCTGCTTTTGCAACTAGCGTTTGTTCGAATGTTAGCTCATCTTCTATTAAGTTCACGTGTTTTACTTCTAATGCTGCTAATTCAGCTTCTCTACAACCTGAAATCAGCGCTATATAAATCATTACTTGCAATCTAAGTGGCTCTTTCACTAGAGCTGCATTTAACAATTCAATTTCAGCAGGAGTATAAATAGTAGGCGGTCTTTTAGTTGTTTTTGGAAGCCTTACACCCTCTGCGGGGTTAATTGGGATTACTTTCCACTCAACCGCAGTTTCAAATACTGAATTTATCGCAAAATAAATATTTCTGATAGATCGTGGCGAAAGTGGCTTATTTTTCTTTTCGTCTGAATCTGTAGGTTTAACATCTAATCTTGCGCCGGGCTTTTGTAATTTTGCGACTAAGTTAACTATATGAAGTGTAGTTATTTTATCCATTTGAACGCCGCCAAAGGCTGGGTAAGCTCTTGCTACTATAGATTTGTAGTATTCTGTCCATGTTTTAACTTCTAGGTTATTTTGTGCATGTTTTGGCATATACTCATTCTCAACAAATGCTTTAAATGTCATTCTTGCAGGAGCTGTATATCCATTTTGCTCTAATTCTGTGATGAAATTTCTTAACTCTCTTTCTCGCTCCCTCTCATTTTTTGTTCGCGTCGTTCTGTCAGCCCGAATCGGCGTACCTTTGTAGTCATAGCCTACAGTCACGCGCATACGCCATGAATTTTTGCTACGTTGTTCAATAGAACCCTCATAACGCCTACCTTTTACTTTTTTTACCATAAATAAGTCCTCCTTTCGCACATACGTTCTTTTTTCGGTAAAAAGAAAAGCCCAGAGGCTCTCTTTTAAATTTTTGCATGGAACGTTAAATTTGCATCAGAAAATAAGTTGAAGATTATTTCAATATTTCCACTTTCATTAACTCCCGCATGGAAGTCTGCGTTCATATTTTTTCCGTTTGGTATTTTCCCGGTTGTGTTATCCAATGGGTATCTTTCGCCCATTGTACCTTTAGAATCGTATACATCAATGTCAGAATCGACAAAGTACTCAGAGCCAGAATTATTTTCAACTTTATAACTTATTTTAACTACATTCTTAGGCTTGGTATCATCAAATTGATTTCTTTCGTTCGTTTTCTCAACACTAGTTAAAGTTACTTTTATCCCGCCGATTTCTTGTGTATCACCAACGCTGTATTCTTTCAGAGTGGGTGGAAGTATAGTTACAATTTGTACATTATCAGTTTTTCCAGCTTCTTTAGCTGTAACAGTATATTGAATTTCTTCCGAGCCGGTGTAGTTGCTAGAAGCAACGAACATCCCCGATGAATTAACTTCTGCTTCTTCTGACTCAATATAAACAGATGCACCTTCATCGACAACGCCCATTATGCTAAAGTCGCCTTTATCATTTGGTGTAATTTCTGTTTCTGTTAACTTCATTTGAGCTTCTTCTTTTTCTTTGAAATTACTTTTATCATTGGTATTTGTAACTTGTATATCATTTTTTTCATTTCCACAACCTACTAAAAAAATACTAAAAGCTAATAAAAACCCCGTTAATAAAACCATCCCTTTTTTCATCTTATCTGCTCCCTTTATATTTTATTTTCCTTTGAGCTTCATATTAGTTTTATCAAAAGCACTACTTCCAGCCATCTTTGTCTCATCTTTATATCTGAACTCAACCATTGGTCTTAGATTGTTATCTCCACCAAAGAGCGTACCTAGAGCACGTTGCTGTATTTCGCTTCCTAAATAATCAACATTTTTTTGTTTAGTTGCTTCATCTTGATATTTTAAATCTTGAGATACGTACGCAATTAACATATCATATTCATTTTCAAATGGAACCACTTTTATTAGTACCCCGCTCGAATCAGAAATCAAGCGATCAATTGACTCATTAAATAACTCTATACTATCTGATGTAATTTTAGAGGGTGTAGATACATCATCTTGAGCAGGTTCTTCTGCTTGCTCGTCCTCGGCAGCGTCTTCTTGAGCGGGTTTTTCCGTTTGCTCATCTTGGACAGTATTCTTTTTTTGCTCATTTGCTGTAGTTTCTTCTGGATTATTAATAACATAGTTATACATCTGTACAACTCTTATTAGTGAAAAGGTGATTAGAAATATAGCGGATATAGTCAATATTATTGTGTATTTTCGTCTGTTTTCATTTTTAACAACTTTTACTATCCCGAATATTAAGGAAGCTAGTGCCACCAAGTATATTATTACCCAAAAGCTGTAAAATAAAATAACTAAAAATAATATAGCAAGAGCCCAAAACCACCATTTTTTTAACAAGTAACTATACTTACTCATCCCGTTATCTCCTTTTTATAAAAACATAATTATTAAAATTACTATGACAGGAATAGTTATCAACAATGTCATTAAACAACCACATCCTGACATTAATTTACCAGATTCTTCCATAATTTCGCCGGCTTTTTGTGCTTTTCCGTTGTTGTTGCTTTGATAAATGATTGGTGTTAGACAGTTAGGACATTGATTTTCGTGATTGTCTAGTGCATGTCCGCATTTAGGGCAATACATATGTTCACCTCGTCAAAATTTATTAGCACCCATAATCATAAGGATAAAAAGAGTTATCCTCCTGGAAAACTTGAATGGTAGAGCCAAAATGTATAATATAATTACCATTATTATACATTAGTCCATATTTTTCTCTATAATTCTCTACTGCTTCAATCAAAAATTTTTCAGTAACATTTAAAAAAGTAGCAGCTTCATAATATGTTCTGTAGCCAAGATCGTAGCATAAAGCGAGTGATTGTATATTTACTAAATATTCATGCGCTTTACGACGCGCAAATTTCTCCTGCTTGATATTTTCTACATTATTAAATTTTGTTATATCTCCAGCGGTATATTTCCAGTGCATTGCTTCTTCTATTATAGTACATCTAAGTTCATTTTCTGACAAATCAGGATGAAGATGTACTACTTTATTCTGTATAAGTCCGAAAAGTTTTGTTGGTAAGTTGTTATTTATAACAAAATTCAATTCTGGAAACTCTTGCTTTAATTCATAACTTGTTTTATTCATCAATTAGCCCCCTAATGTTAATTTTTAGGCAACTACTCTTTTTGTGATCTGATAAATTTTAAATATTTTTCTATCTCTATTCGTTCTTCTTCCGTCAAATCATTGTCAATATGCGCAGCTAGTAAGTCGCTGTTGTCGAATTTTTCACGACCTAATAAATAATCAGTTGTTACATTAAAGTAATCGGCTAACTGAACGATTAATTCATCTTTTATAGCACGTTTGTCTGTTTCCCACATTCCTATAGTACTTGTTGAAACATTTAAATCTTTTGC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111 | Listeria_phage(85.92%) | holin,integrase,portal,capsid,tail,plate,terminase | attL 93558:93602|attR 134954:134998 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1341743 : 1398588
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP007461|1341743:1398588|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_virus(17.65%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1891521 : 1899807
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP007461|1891521:1899807|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP007461|1891521:1899807|1892084_1893134_-|WP_003726210.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERLGAMGALGSFGGMFDLSSLHLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGAEDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVKEGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNELTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLSELEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRENDAVIFTGGTKG >NZ_CP007461|1891521:1899807|1891521_1892088_-|WP_003726209.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGNGSNFQALVDDAFIKPHVKLLVCDKPNAYVLERANTHQIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRGLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSETGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVPIEHAETVDTLAGKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >NZ_CP007461|1891521:1899807|1897720_1898434_-|WP_003726214.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAGAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGELIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLELATTSEMDIIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDATGNILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NZ_CP007461|1891521:1899807|1894564_1896784_-|WP_009918191.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEESFVPVMEDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPKVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLTTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFELNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK >NZ_CP007461|1891521:1899807|1893152_1894580_-|WP_003722245.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NZ_CP007461|1891521:1899807|1898514_1899807_-|WP_003726215.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATIIENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >NZ_CP007461|1891521:1899807|1896776_1897460_-|WP_003726212.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYVWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTGLYKEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKDNNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >NZ_CP007461|1891521:1899807|1897463_1897709_-|WP_003722248.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2575215 : 2583060
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP007461|2575215:2583060|DBSCAN-SWA ATTAACTATTACTGATTTTCAGTCCTACTTGTGCTGGTGTTTCCCCACTTCTAAGGCGCTCTGCAATCTGATCTAGTTTCCGGAGACGATGATTAATACCTGATTTACTTACTTGACCTGTTGTCAGCATTTCGCCTAGCTCTTTTAAGGTAACATCTTCATTAGCTATACGAAGCGCTGCAATCTCACGCAGTCGTTCTGGTAAAGCTTCTAGCCCAACGGTTGATTGGATATACTTGATATTATCGATTTGCCTAACAGCCGCATTAATTGTCTTGTTGAGATTCGCCGTTTCACAGTTCACTAGCCTGTTCACCGAATTCCGCATATCACGCATAATCCGAACATCCTCAAAATGAAGAAGCGCGCTAGTTGCTCCGATAATACTCAAGAATTCCGTGATTTTTTCCGCTTCTTTCAAATAGGTAATAAAACCATTTTTCCGTTCAAGCGTTCGCGCATTGAGATCGAATTGATTCATCAAAGCGCAAATCGCCTCATTGTGCTCCTCATAAACAGAGAAAATTTCTAAATGATAAGAAGAAGTTTCCGGATTATTAACTGACCCACTTGCCAAAAAGGCTCCACGTAAATAAGCACGTTTGGCGCTCCTCTTCTTAACAAATCCCCTATCAATCGATTTCGTAAACGTCATCGGTGGCTCTAGTATCCGTAAATCTTCCAAAATCCCCCGTGTACCTGACTTCAAGCGAACTATATAAACATTATTTTTTTTCAACTTCATTTTGCGACGTACAAGAAGTTCTATTGGCACTTCGTATAAGTCTTTCAGTAATTGATACATTCGTCTAGCTATGGCTGCATTCTCGGTTTGGACATCCATTATCACTAATTGATTCGAAAACGAGATGGCACCATTCATTCGAATAAAAGCTGCGAGTTCCACTTTTGCATCGCTATCACTTACGTCCATATGGGTTAATTCTTTCTTGGTTTCCGATGCAAATGACATGGCTTACTCACTCCTTTTCAATAGTTTGGTTAGGTAACATCGCTAAAACCGCGTCCGCCACCTTTTCAGCAGCATGGCGCACAAGGCCATCCTCTGTAGAAAGAAAATCTTGATAAATGGCTTCTACGCCAAGCTCTTCCATTCCTTTGGCATTATGCTCTACTTGCGCAACATCCTCTGGGAATAAAAGTTCTTTCGGAACAGTCGTCGTATTAATTAACGTTTTATCTATAAAAGATTTTCCCACATGCTCATGGATAACTTTAATATGATCCGCATCTGAGAAAAAGTCGGTTTCGCCAATTTGCGTTAAAATGTTCGTAATGTATACTTTCGGAGCCTTACTTGCTATAATTTCATCGGCTAATTCCGTAAGTAATAGATTTGGTAAAATACTTGTGTATAAACTTCCTGGACCAATAACAATCAAATCAGCCTCTTTCACTGCTTCGACTGCTGTCGGATATGGTTTTACATTTTCTGGTTCGATATACACACGATTAATATGCTTTCCTTGTAACGGGATAAGCGATTCACCGTGCACAATAGAACCATCTTCCATTTCGGCATTTAAGATGAGTGGTTGATCCGTTGCTGGAATAACTTTGCCGCGGATTTTCAGCACCGTTGCTAGCACATTAATCGCATCAACATAACTATCATTCAATTGCGATAAAGCCGTTAAAATCAAATTTCCAATAACATGCCCCGATAAATCACCATCTACCGCAAAACGATATTGAAATAAATCGACAACCCGTGGATCAACATTGGATAAAGCTAGCATGACATTGCGTATATCACCTGGGGGAAGCACATCCATTTGCTCGCGAATTTTACCAGAACTACCACCATCGTCCGCTACGGTCACAATGGCCGTTAAATGAATATCCTTCTTTTTAAGCCCTTTTAAAATGACTGGAAGACCGGTCCCGCCACCGATTACTACTACTTTAGGTTTCATTTCCTTTTTCATATTAACGGCCCTTTCTACGTTTCATATCTCGGTGTGAAATCGTTGTTTCATATTTTTGTTGAATTGCCTTACCAACGAACTCTGTCAAAGCTACTGAACGATGCTGTCCTCCAGTACATCCAATGGCAATAACTAATTGTGTTTTTCCTTCTCGTTTGTAAAAAGGAAGTGTAAACATTAATAGATCTACTAACTTATCTAAAAAGGTCTGCGTTTCTGGCCATTTCATCACATATTCATACACATCTTCATCAAGTCCTGTCAACGGACGCATTTTGTCAATGTAATGCGGATTCGGTAAAAAGCGCACATCAAACACTAAATCAGCATCAATCGGAATGCCGTATTTGAAACCAAATGACATCAATTGCACATTGAATATATCTTTATCTTCGGTTTGGAATTCATTGTTAATTCGCTCGCGTAACTCACGTGGCGCCATATTCGATGTATTAATAACTAACTGCGAACGGCCTTTTAAATCACTAAGCAGTTCGCGCTCTGCATTAATCCCGTCTAGCACAGACCCATTAGGCTCCAGTGGATGGTGGCGGCGCGTTTCTTTATAACGCGAAACAAGTACCTTATCATCAGCCTCTAAAAAGAGGATTTTCGTTGTTATAAAATTGGTATTATCTAGCTCATCTAGCGCTGGTTCAATGGAATCGAAAAACTCACGGCCGCGAAGATCCATTACGAGCGCGATTTTATCCATTTTATCGCTTTCTTTCATTAGCTCCCAGAACTTTGGAAGTAAACTTGGCGGTAAATTATCTACACAAAAATAACCGAGATCTTCTAAAGACTGCATTGCGACTGTTTTTCCTGCTCCAGACATCCCAGTAATGATTACTAATTTTAATTGTTTAGAAGCCATATCTGCCTCATCCTTTCGCACAAATAATATCTATCTTCCATTTTAGCACACTTCTCACTAGAAAATCCCGGAAAAGTCTCTAAAGCGAGTTTCCGGGATTTTTCTTTTTAAGCTTCGATATGTTGCATCAAATCAGCTTTCACTTTTTCTAATTTTGTTGCACTTTCTTCTTTACTTTCACCACGAATACTAAAGTAGAATTTGATTTTCGGTTCTGTGCCGGATGGACGTAAACAGAACCATGAACCATCTTCAAAATAACATTTAATGACATCTGCTGTTGGCAAATGAATCGCTTCCGTTTTTCCGGTAGCAATCCAAGTTGTTTCGCTTCTTAAATAATCTTCCGCACGTTCCACGGGGAATCCACCCATACTTGTTGGTAGTTGCTCGCGAAAATTACTTGTAATTTCTTTGATGCGCCGAGAACCATCCTTACCGCTTAAAGTTAAGGAAACTAGATCTTCTTTGTAATAGCCAAACTCAGCATAAATTTGCTCTAAATCTTCTAGTAAACTTCCACCTTCTACTTTGCTAACGAGCGCCACTTCCGCAATCGCAAGCACCGCTTGAATCGCATCTTTATCACGCGTAAACGGCTTAACCATATAACCATTACTTTCTTCATAACCAAATTCAAACGTATGCTTGCCAGTTTCTTCAAAGTGCTTAATTTGTTCTGCAATAAATTTGAAACCAGTTAATACTTCAATCATTTCCGCACCGTAATGTTTCGCGATTTCTGTTCCAAGATTACTTGTTACAATAGATTTTAATACCGCTGCATTAGCTGGCAATTCATTTTGCGCTTTCTTTTGTTTTAATAAATAATGTAAAATAATCGCGCCAATTTGGTTTCCAGATAACACTTCATATTCGCCGTCAAGATTACGAACTGCCACGCCTAAACGGTCAGCATCCGGATCTGTTCCGACTAAAATGTCGCCACCAAACTTCTTACCATATTCAATCGCAAGTAAAAAGGCTTCGCGGTTTTCCGGGTTAGGCGATTTTACCGTTCCAAAATCGGGATCATTCACAAATTGCTCGTCAACCTTAACAATATTCGTAAAGCCAACACTTTCAAGCGCAGGAACGCCAAGAATTCCGCCAGTACCATGAAGGGGCGTGAAAACAATTTTCAAATCCTCCCCTCGTTCTTGAACAAGCTCTTTATTGACAATAACCTCTTTTAATTTTTCCAAATATGGACGGTCTACTTTTTCACTGATTACCTCAAGTAAACCATTTTCAATTAATAGCTCTTGGTTCGCTACTTCTACAGAAAAAATATCCTCTACCGCGTTTATGTATTCAATTACAGCACTTGCCCCTGTTGGAGGCATTTGTCCGCCATCTTCACCATAAATCTTGTAGCCATTGTATTCTGGTGGGTTATGGCTAGCTGTAATAACAATCCCACCAAACGCATTTAAATGACGTACTGCAAAGGAAAGTTCGGGTGTTGGTCGAAGCGCATCAAAAACATAGCTTTTCACACCATGATGCCCTAATACCGCCGCCGATTCAAAAGCAAATTCACGCGACATATGACGAGGATCATACGCAATAACTATCCCACGTTTTTTAGCCTCTTCCCCGTTCTCCGCCACAAATTGCGCCAAACCTAGAGAAGCCTTACGAATAGTATAGATATTCATGCGGTTTGTTCCAGCGCCTAGTACACCACGCATCCCAGCCGTTCCAAATTCCATATTACGATAAAAACTATCCTCAAGTTCTTTTTCATTTGCTTCCATATTCGTTAATTGTTTTCTTAATGTGCTATCTAATTTGTCATTAGCAACCCATTTTTGATATTCTTCTTGCCAATTCATTCTCTACACTCCTTCATTTAGAACTCTTTAATTAAAATTTATCAGCTCTCCACTGTGAAACGAAAAGCTGTTCTAGATGTAAAAGGTTTTTCTGGTCGAAGTACAATATCACCAAATCCGTCATGGTTAATCGCATCTACTAAACCCTGTGTTTCCATTGTTATGCCAGCATATTTTGGCACAGTTCGCTCGCCAATCTCAAAAGAGCCATCCAAACTATTCGCCGTATAAATTAATACCGAGTCAGCTTTGGTTTCCATTTCCAAGCGCCGTCCTGACTTTGGATCAAACAAAACTGCATCTGGACGACTATTTTCATGTTTTAAAATGAATGCATGATCCAGCCCCGCACCAACTAATTTTACTTGCTGGTCCTGACTTTGTGTAATCTCCGCTACTTCACGACCTGCACGCAAATCAAAGATAGTATTTTCCGCTAACCGCTTTTCCCCAATTGGGAGAAACTCTTCATCAATTGGTAGGAAGCTGTCACTATTAACCCAAAGCTGATGTTGTAAAACCGTTGAACCAGCTTCTCCGCTTAGATTAAAATAAATATGATTGCTCGGGTTATATATAGTCGGCTGATCGCTTTTCGCTTCATAATCAAGCAGCCATTCATTTTTATTATTTAACGTATATGTCATTTTTGCATCAATATTTCCTGGATAGCCATTTTCTCCATCCGCCCAGCAGTATTCAAAAGTCATCACAATTTGATCAAGACTTTTTTCTACTGAAACATCCCAAAGCTTCTTACTAAAATTGAATTTCCCACCGTGACGATGGTTAGCTCCTTCATTTTGAATCAGTTGAAATTGTTTACCGTCCAAACTAAATTGCCCATTTGTAATGCGTCCAGCAACAGGGCCAAGTGTCGCGCCGAAGTATGGGGAGTGTGCCAAATAATCATCTAAATTTGTAAAACCAAGACTAATATTCGCAAAATCACCAAATTTATCTTTTGTTTCAAGGGAAGTAACAATCGCTCCGTAATTTAAAACACTCATGCGCATACCATGATCATTTACCATCGTCCACTTCCAAACAGTTTCTCCCTCAAACTCCCCAAATCGCTCCTTCATTACTTCGATAAAAATCACATTCCTTCATAAGTTATTAATAGCCATTTGGATGAGATACGTGCCATTTCCAAGCAGTGGCGATAATATCTTTTACGTCTGTATAAGTTGGCTCCCAACCAAGAATTTCACGCGCTTTATCACTTGAAGCAATTAACGTTCCTGGATCTCCTGCACGGCGTGGTACAACTTCAGCTGGAATTTCTTTACCTGTTACAGTACGAGCTGCTTCAAGCATTTCTTTCACTGAAAAACCGTTACTGCTACCAAGGTTGAAAATATTACTTTCCCCGCCATTTTTCAAGTATTCTAGCGCTTTAATATGCGCGTCAATTAAATCTTCTACTTGTACATAATCACGAATACAAGTACCATCAGGCGTATTGTAGTCGTCACCGTAAATCGCTAATTTTTCTCGTTGACCAAGCGCAACTTGTAAAATAATTGGGACTAAGTGTGATTCTGGTTTGTGATCTTCCCCAATTGAACCATCCGCTTTGGCGCCAGCAACATTAAAATACCGGAGTGCAACATATTTCATATCATACGCTTTATCGCACCATTTCATCATTTTTTCCATGATTAGCTTCGTTTCGCCGTAAGTACTTTCCGGATTTGTTGGCATATCTTCCGTAATCGGTACTCGTTCTGGCTCACCATATGTTGCAGCGCTAGAAGAAAAGACAATATGCTTCACACCAAATTGCTCCATCACTTCTAAGACAATTTGCGTACCATAAACATTATTATTTAAATAAACAAGCGGTACTTCCATCGATTCTCCTACAAGTGAACTAGCAGCAAAGTGAATCACACCATCTACCTTTTCTTTTTCAAAAACTGAACTTAAAAATGCCTTATCTCGAATATCTCCTTCATAAAATTTTGCCTTTGTATGAATGGATTCCTTGTGCCCTGTTCTTAAATTATCAATAACTACTACTTCATATCCGCGAGTAATTAACTCATCTACTGCATGTGAACCGATATAGCCAGCGCCACCAAGTACAACAATACTCATTATTATCTCTCTCCTAACAATAGTCTTTGTCTTCCATTTTACACTACTCAAGTCTATATAGTCACGCAAAAATGGGTCTAAGATAAATAATCTCAGACCCATTCGAGTTTTCTTTACTGTTATTTAGCTGCCTCTGCTTCTAGCGACTCTTTTAATTCTTCTACATATTTTTGAGCGTTTTGTCCAGCAAGTCCGCCATCGCCTGTTGCTGTTACAATTTGGCGTAAGCTTTTCGCACGAACATCACCAGCTGCAAAAATACCAGGAAGGTTTGTACGCATTTCCTCGTCCGTTACGATGTATCCTTCATCATCTGTAATACCTAAATTTAAGAATGCTTTCGTAAGTGGAACAAGTCCAACATAGATGAAAACACCATCCACTGGCATAATAGATTCGGAACCATCCACTGTGGAAACAAGTTTTGCTCCAGTTACTTTTTTGCCATCGCCAACAATTTCTTCTACTGTACTATTCCAAATGAAATCAACTTTTTCATCTTTGAAAGCACGATCTTGTAAAATTTGTTGTGCGCGCAATTTATCACGACGGTGTACTATCGTTACTTTATCTGCATAACGAGTCAAATAAGTTCCTTCTTCCACTGCAGAGTCTCCGCCGCCAACCACGATTAATTCGCGATTTTTGAAGAAAGCTCCATCACAAACAGCACAATAAGAAACGCCGCGTCCACTAAGCTCTTCTTCGCCAGCTGCACCAAGTTTCCGGTGTTCAGCACCAGTCGCAATAATAATCGCCCGAGCTTTATAGGTTTTCGATCCAGCCGTTACAGTTTTAAATTCTTTGCCATCAACGACTTCTTTAATGTCCCCATAAGCATACTCAGCGCCAAATTGTTTCGCACCGCTAAGCATCTTATCGGATAAATCTGGTCCTAAAATACTATCAAATCCAGGGTAATTTTCAACCTCAGCTGTGTTAACCATTTGTCCGCCGGGTACTCCGCGTTCAATCATTAACGTATCTAAATCTGCACGGGAAGTATATAAAGCAGCTGTCATTCCAGCTGGTCCCGCTCCAATAATAATCACATCATAAATTTTTTCTTCACTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP007461|2575215:2583060|2576194_2577163_-|WP_003725408.1|DBSCAN-SWA MKKEMKPKVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEIIASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADAVLAMLPNQTIEKE >NZ_CP007461|2575215:2583060|2578147_2579878_-|WP_003734494.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMEANEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGEEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNLDGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVEGGSLLEDLEQIYAEFGYYKEDLVSLTLSGKDGSRRIKEITSNFREQLPTSMGGFPVERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESATKLEKVKADLMQHIEA >NZ_CP007461|2575215:2583060|2579919_2580981_-|WP_003741152.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMVNDHGMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGANHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGNIDAKMTYTLNNKNEWLLDYEAKSDQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHAFILKHENSRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIGERTVPKYAGITMETQGLVDAINHDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >NZ_CP007461|2575215:2583060|2577164_2578040_-|WP_003722606.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKAIQQKYETTISHRDMKRRKGR >NZ_CP007461|2575215:2583060|2582100_2583060_-|WP_003722610.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NZ_CP007461|2575215:2583060|2580997_2581981_-|WP_003725411.1|DBSCAN-SWA MSIVVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHKESIHTKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVIHFAASSLVGESMEVPLVYLNNNVYGTQIVLEVMEQFGVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYDMKYVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIKALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY >NZ_CP007461|2575215:2583060|2575215_2576187_-|WP_003725407.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSNQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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