Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022247 | Staphylococcus epidermidis strain ATCC 12228 chromosome, complete genome | 4 crisprs | csa3,DEDDh,cas3,DinG,cas9,cas1,cas2 | 0 | 0 | 9 | 0 |
NZ_CP022251 | Staphylococcus epidermidis strain ATCC 12228 plasmid pAMT3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP022249 | Staphylococcus epidermidis strain ATCC 12228 plasmid pAMT1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP022250 | Staphylococcus epidermidis strain ATCC 12228 plasmid pAMT2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP022248 | Staphylococcus epidermidis strain ATCC 12228 plasmid pAMT5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP022252 | Staphylococcus epidermidis strain ATCC 12228 plasmid pAMT4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022247_1 | 389270-389412 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022247_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022247_1
>1.1|389325|33|NZ_CP022247|CRISPRCasFinder ATTTTAATATTATGCGGGAGTAGTTCAACTCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022247_1
The CRISPR arrays of NZ_CP022247_1 >merge|NZ_CP022247|1|389270-389412|CRISPRCasFinder AGAACACATTCCTTCCCGGAATGAGATATAGGTGCAAATCCTATCTTCCGCTCCAATTTTAATATTATGCGGGAGTAGTTCAACTCTCAGAACACATTCCTTCCCGGAATGAGATATAGGTGCAAATCCTATCTTCCGCTCCA >NZ_CP022247|1|1|389270-389412|CRISPRCasFinder AGAACACATTCCTTCCCGGAATGAGATATAGGTGCAAATCCTATCTTCCGCTCCA ATTTTAATATTATGCGGGAGTAGTTCAACTCTC AGAACACATTCCTTCCCGGAATGAGATATAGGTGCAAATCCTATCTTCCGCTCCA
>NZ_CP022247.1|WP_002458536.1|380984_381437_+|peroxide-responsive-transcriptional-repressor-PerR MSAELESIDHELEESIASLRQAGVRITPQRQAIMRYLISSHSHPTADEIYQALSPKFPNISVATIYNNLRVFKDIGIVKELTYGDSSSRFDFNTHNHYHIICEKCGKIVDFHYPQLDEVEQLAQHVTDFDVTHHRMEIYGVCKDCKEEEN >NZ_CP022247.1|WP_002458537.1|379938_380889_+|2-hydroxyacid-dehydrogenase MKIVSLNRLNEIENELRKQFPNEEFKFYDKAINIPINDRKTMDILIGYDGKIDRHFIEHCINLKWIAWFATGVNNLPLNYIKERDIILTNGKGIQAKQVSEYIMTFILDDYKKMKTSYRNQIEKNYDSRITGKRLNEETLLLLGTGAIAQRAAYLAKAFGMKVIGVSKSGKNVEQFDEVYTIEELDNVIEKANIIVNALPETEETIHLLKRKHFIQMDNNVLFINVGRGTIVDEEMLINVLKDRLIRHAYLDVFEKEPLSKDNPLYDLDNVTITAHITGNDSNNNREATDIFKKNLEHFLNNYDVIENKVDLDYGY >NZ_CP022247.1|WP_002458538.1|379477_379936_+|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MISKGEQFPSFSLENQDGNFISNETIKGRKTILYFYPRDNTPTCTTEACEFRDHIEDFNQLDVDIYGISADSKKKHQNFIKKHQLNFDLLVDKDYQLADKVGVYQLKKSFGKENMGIVRTTFILDENGNIIDVIENVKVKTQIETIKNILEG >NZ_CP022247.1|WP_002447425.1|378107_379397_-|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MKFTESERLQQLSNEYILGGVNSPSRSYKAVGGGAPVVMKEGHGAYLYDVDGNKYIDYLQAYGPIITGHAHPHITEAIQDQAAKGVLYGTPTELEIKFSKKLREAVPSLEKIRFVNSGTEAVMTTIRVARAYTKRNKIIKFAGSYHGHSDLVLVAAGSGPSQLGSPDSAGVPQSVAQEVITVPFNDIESYREAIDYWKDDIAAVLVEPIVGNFGMVMPQPGFLEEVNKISHDNGTLVIYDEVITAFRFHYGAAQDLLGVKPDLTAFGKIVGGGLPIGGYGGRQDIMEHVAPLGPAYQAGTMAGNPLSMRAGIALLEVLEQEGVYDKLDQLGRRLEEGLQKLIDKHQITATINRIYGSLTLYFTNEKVTHYEQVENSDGDAFAQFFKLMLNQGINLAPSKFEAWFLTTEHTEEDIDRTLEAADYAFSKMK >NZ_CP022247.1|WP_002447426.1|376706_377801_-|aromatic-acid-exporter-family-protein MRLGARIFKTGIAIILAMSIASLLPDNIGLKTLAGVSAVVAMQPSVYRSIKTVSEQAIGNVIGALLAVTMVTIFSDNFIIMGVTVILLIAILFQFNLAHVATLASVTALIIMGQHTGSFYVAAFFRFVLVMIGVLSSSIVNLIFLPPKFETKIYYNSMNISSDIFVWFKLVLNDTSEFHNIKQDGDQLNSRINKLEKIFDYYNEERPLTKKHIYQQNRKKILFREVVRTTRQAYEVLKRMSRYQNDLYQLNNQLLLQIKLELDSLVTLHEQIFKSLSKKARYDVTQLDYEVDNPQKKNLMDAFQQELIKNPHQTQYSYSNMMQIIAEIEEYRYQLEHLDRIRLSFFTYHRSDTDIDISDEDFDL >NZ_CP022247.1|WP_070853678.1|374819_376556_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKRYLKFVKPYRYRIIATIIVGIIKFGIPMLIPLLIKYAIDGVINNHSLTNQEKFSHLGVAIGIALFIFLIVRPPIEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKQLYNHLQALSARFYANNQVGQVISRVINDVEQTKDFILTGLMNIWLDCITIIIALSIMFFLDVKLTFAAIFIFPFYILTVYFFFGRLRKLTRVRSQALAEVQGFLHERVQGMSVIKSFAIEDNEAKNFDNHNKNFLQRAFQHTRWNAYSFAAINTVTDLGPIIVIGVGSYLAITGSITVGTLAAFVGYLEQLFGPLRRLVSSFTTLTQSFASMDRVFQLMDEDYDIKNGIGAQLIKISEGQIDLKHVSFKYNENEKEVLHDINLKINKGETVAFVGMSGGGKSTLINLIPRFYDVTQGEILIDHHNVKEFLTGSLRNQIGLVQQDNILFSDTVKENILLGRPDATDDEVVEAAKMANAHDFISNLPNGYDTEVGERGVKLSGGQKQRLSIARIFLNNPPVLILDEATSALDLESEAIIQEALDVLSKDRTTLIVAHRLSTITHADRIVVMENGRIVETGTHQQLINKRGAYEHLYSIQNL >NZ_CP022247.1|WP_001830384.1|374035_374578_+|DUF402-domain-containing-protein MVKESIPKEGENIKIQSYKHDGNIHRVWSETTILKGTEHVIIGGNDHTLVTESDGRTWITREPAIVYFHSEYWFNVICMFREDGIYYYCNLSSPFACDEEALKYIDYDLDIKVYPNGKYHLLDEDEYEQHMNQMNYPHDIDIILRRNVDILQQWIEQKKGPFAPDFIKVWKERYKKIRDY >NZ_CP022247.1|WP_002495654.1|372885_373929_+|A/G-specific-adenine-glycosylase MYLENSFKKDIEDWFHKNQRDMPWRETTNPYYIWLSEVMLQQTQVNTVIDYYYRFIHRFPTIQSLSEASEDEVLKYWEGLGYYSRARNFHTAVKEVNNNYDGEVPYDPETFKKLKGVGPYTQAAVMSIAFNHPLATVDGNVFRVWSRLNNDYRDIKLQSTRKAFEQELHPYVLKDAGTFNQAMMELGALVCTPKSPLCLFCPIQEHCEAFHMGTAQELPVKTKNLNKKNVEQKVFLIRNDNGQYLLEKRKEKLLNGMWQFPMREQTNANDVISDDLGKRIETINEPVFKLKHQFTHLTWDIEVYNVTAPLNIQENDLPQQMTWFNLDDRDKYTFPVPMDKIYKFIEG >NZ_CP022247.1|WP_002447429.1|371731_372706_-|metal-dependent-hydrolase MDTATHIVMGVGLTALATQDPVMAGSFAATATTLIAGSLIPDGDTVLKLKDNATYISHHRGITHSLPFTILWPILITFFIFVIFSHTNPLHVWLWAQLAVFLHVFVDIFNSYGTQALRPITNKWIQLSVINTFDPIIFIILSIGVLLWILGIHPYIVFFPIILILIGYYIVRFKMQAAIRKQALQKIEQSHTPVKVFVAPTMKFHVWRVAIQTDKHDYVGVSKWKNVVFTDKVKRQSMTPDSILWKVKGNKDIYTFLNFSSIYRWQTTPLDDGTTEIRLMDLRYLNKGRYSFVAIAHLTHENEIDHSYIGWVFSEDKLQRKLFS >NZ_CP022247.1|WP_002458541.1|370719_371535_+|hypothetical-protein MIDNLIVYIKNLPHLFSFCTQRLKQTWKWFAISLIIGLVIILALEGFFNFNHTTDIVQVRWLFRISSLIIFSIIIQSIYIAYKYYIRDFVVMKSFHISAVTPTIVIAMLGLITILILGIVIIILKPVNFEASILSFLYYLVIIAIFISVTSIMLGLLNYAIKHVKLIFIIVSAISFFMVPITYIPKTNLNVINHIMMLNPLYYFVNGSSQAIVFGTVSMSNLPYHLYIIILIGIMCVINYALVRHIAFDKYQSQSNQKSYSKEKKNKEKER >NZ_CP022247.1|WP_002457889.1|389937_390786_+|serine-protease MKKRFLSICTMTIAALATTTMVNTSYAKTDTQSHNHSSLGTENKNVLDINSSSHNIKPSQNKSYPSVILPNNNRHQIFNTTQGHYDAVSFIYIPIDGGYMSGSGVVVGENEILTNKHVVNGAKGNPRNISVHPSAKNENDYPNGKFVGQEIIPYPGNSDLAILRVSPNEHNQHIGQVVKPATISSNTDTRINENITVTGYPGDKPLATMWESVGKVVYIGGEELRYDLSTVGGNSGSPVFNGKNQVIGIHYGGVDNKYNSSVYINDFVQQFLRNNIPDINIQ >NZ_CP022247.1|WP_020360852.1|391012_392071_+|PTS-transporter-subunit-IIC MSHSQINGKRFFNNILNAVGAGVVIALLPNALLGELLKFFKEGNHVLETIFQLVTIIQSFMAFIIGVLAAHQFKFKGTGAAIIGISAMLGSGAVHYNGQTIELKGIGDIINVILVVILACFIYMFLEGKLGSLEMIILPVLVPVISGLIGLLTLPYVQVITQSLGKLVNRFTELNPLLMSILICVTFSLLMVTPISLVAIATAINLTGLGSGAANMGIVAACVTFLFGSLRVNSLGVNVVLLIGAAKMMIPVYLKHLIIAIPLTINGVICGIVAYILKIKGTALSAGFGYTGLVGPINALNRMSGNPSMNIILLAIGYFVIPFVCAFIVHKICKKVLSTYSDEIYKFEISKD >NZ_CP022247.1|WP_088922671.1|392310_393768_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein/permease MKCLFKMLSIIILMLSTFTLFISPSTYANEDENWTKIKNRGELRVGLSADYAPLEFEKTIHGKTEYAGVDIELAKKIAKDNHLKLKIVNMQFDSLLGALKTGKIDIIISGMTTTPERKKEVDFTKPYMITNNVMMIKKDEAKRYQNIKDFEGKNIAAQKGTDQEKIAQTEIEDSKISSLNRLPEAILSLKSGKVAGVVVEKPVGEAYLKQNSELTFSKIKFNEEKKQTCIAVPKNSPVLLDKLNQTIDNVKEKNLIDQYMTKAAEDMQDDGNFISKYGIFFIKGIKNTILISLVGVVLGSILGSFIALLKLSKIRPLQWIAGIYIEFLRGTPMLVQVFIVFFGTTAALGLDISALICGTIALVINSSAYIAEIFRAGINAVDKGQTEAARSLGMNYRQTMQSVVMPQAIKKILPALGNEFVTLIKESSIVSTIGVSEIMFNAQVVQGISFDPFTPLLVAALLYFLLTFALTRVMNFIEGRMSASD >NZ_CP022247.1|WP_080034503.1|393754_394483_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MPVINIKNLNKKFGANEVLRDINLTVDKGEVVAIIGPSGSGKSTLLRCMNLLDVPSKGKVIFEDNELTQHNVQLDNLRQKMGMVFQNFNLFPHKKVIENVMLAPLLLHKDSKDQLKEKALYLLEKVGLKDKADSYPNQLSGGQKQRVAIARALAMEPDVMLFDEPTSALDPEVVGDVLKVMRQLANEGMTMVIVTHEMNFAKEISDKVVFMADGVVVESGTPQNIFENPQHSRTRNFLSRVL >NZ_CP022247.1|WP_088922672.1|394818_395961_+|tRNA-epoxyqueuosine(34)-reductase-QueG MAKLMNNKLKKEIIDFAHSIGIDSIGFTTADPFDELKQKLEEYHAKGYASGFEESNISLRTEPKLSLPSARSIIAIAVGYPNKLKGAPKSVKGDRRGMFARASWGQDYHSIMRKRLDKLADFIKEKVPDVEIQSMVDTGVLSDRAVAERAGLGFTGRNGFVISPELGTWSYLGEMLVSIPFEPDDPLLDSCGDCTICVDRCPTGALVGNGQLNSQKCISFLTQTKGYLQDEYRYKIGNRLYGCDTCQQVCPKNRGINTQHDDIVLEPEILKPRLVPLLQMSNKKFKSTYGHLAGAWRGKKPIQRNAIIALAHFKEESAIPELKEVVLNDPRPMIRGTAYWAIGQILEDDAIPFIDAHYENEIEEVQIEMKKGLQMRREQK >NZ_CP022247.1|WP_002446764.1|395957_396428_+|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MTNHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTLTHLHLIKPLGFSTEDKMLKRAGLDYWEHVNITYHDSIEEFFANTEGHYYLLTKFGKQTYSDFNFSNTNEDYYFIFGKETTGLPDWVKEKYAKTALRIPMSDNIRSLNLSNTAALLIYEALRQQDYPNLS >NZ_CP022247.1|WP_002501163.1|396585_397185_+|glucosamine-6-phosphate-isomerase MAMNFKVFDNSEKVAEYTADILRKQFNNNPTTIAGFHLSKEHAPVFDELKKNVENHAVDFSQINILDYDDNHSYYEALGVPTGQIYSISYENDAIDFISDKIKTKENKGKLTMQVLTIDENGKLDVSVRQGLMEAREIFLVITGANKRDMVEKLYRENGKTSFEPSDLKAHRMVNVILDKEAAAGLPEDVKEYFTARFA >NZ_CP022247.1|WP_002457885.1|397208_397391_+|hypothetical-protein MANKKDSKLNYHEEENAMVTDLDDLKELGKEMEQISQENDEEKLNQPHDNEVRSDFKNSK >NZ_CP022247.1|WP_002446761.1|397542_397947_+|hypothetical-protein MLRKYWIHFVIVTVIVSLLSIKGFPLALGALYLPLLFKIVQLQLNLSKGIIDNVNAHTFIKSNQSGVMISVVCCLLITGVLTYTLDDFYNELPGFLGVLVSISPVTLTIGVILFVLTAIAIVQATKAKYQQPKN >NZ_CP022247.1|WP_002447846.1|398138_399524_+|class-II-fumarate-hydratase MSVRIEHDTFGEIEVPEDKYWGAQTERSKRNFPVGKEHMPIEVIYGFAQLKRGAALANHELGKLSDEKKNAIVYACDRILNGELDDHFPLVVWQTGSGTQSNMNVNEVVSYVANEYLKKHGSKEAIHPNDDVNKSQSSNDTFPTAMHVALFHEVETKLEPALNHLRQTFKEKEDQYQSIIKIGRTHLQDATPIKLGQEISGWRYMLEKCEQLLSESKKHILNLAIGGTAVGTGINAHPEFGHKVAKYISKNTGYAFVSSENKFHALTSHDEIVQLHGTLKALATDLMKIANDIRWLASGPRAGLAEISIPENEPGSSIMPGKVNPTQCEMLTMVAVQVMGNDTTVGIASSQGNFELNVFKPVIMHNTLQSIYLLADGMNTFNKNCAIGIQPIEENINNYLNQSLMLVTALNPHIGYEKAAQIAKKAHKEGLTLKESAIESGYVTESQFEEWIKPEDMVDPH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022247_2 | 1645975-1646063 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022247_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022247_2
>2.1|1646000|39|NZ_CP022247|CRISPRCasFinder CATTAGTGGTTCTTATGCAGGTGAATCCTTCTCCTGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022247_2
The CRISPR arrays of NZ_CP022247_2 >merge|NZ_CP022247|2|1645975-1646063|CRISPRCasFinder TCCACTCTATACTTTGATCTCTGATCATTAGTGGTTCTTATGCAGGTGAATCCTTCTCCTGCGCTCCACTCTATACTTTGATTTCTGAT >NZ_CP022247|2|2|1645975-1646063|CRISPRCasFinder TCCACTCTATACTTTGATCTCTGAT CATTAGTGGTTCTTATGCAGGTGAATCCTTCTCCTGCGC TCCACTCTATACTTTGATTTCTGAT
>NZ_CP022247.1|WP_002438741.1|1644559_1645927_+|FAD-containing-oxidoreductase MFWQIFYRRGKTMKNYDLIIIGFGKAGKTLAAHAASHGQKVAVVEQSTKMYGGTCINIGCIPTKTLIHDGIEGSSFKEAITRKKEVVQALNNKNYQGLNSKDNIDVLNYKANFISNEVIELQDNNGTIQETITADKIVINTGSRANIPDIKGIDTAQNIYDSTGLLNIDYQPQELVIIGGGYIALEFASMFANFGTHVTILERGDAIMTNEDQDIANLIVKDLQDKGVTINTNTSTIAFSNNKDQTIIHTNHGEISADTVLLATGRKPNTNHLGLENTDVKIGKQGEVIVNTHLQSTVKHIYAAGDVKGGLQFTYISLDDYRIIKSHLFGDGSRTTENRGAIPYTVFIDPPLSRVGLIASEAKLQGYDILENKVFVSNIPRHKINNDSRGLFKAVINKDTKEILGASLYGKESEELISLIKLAIDQHIPYTVLRDNIYTHPTMTESFNDLFLEPL >NZ_CP022247.1|WP_001832072.1|1644168_1644591_+|Rrf2-family-transcriptional-regulator MNLEFNIAVHVLCFLAQHDQEQFNSKELAKLTCLNPVQLRRVLAYLTEHNYIKVQRGKAGGYQANQHTAQVDLAKLYQHFVLDKNNSQRRFTGASDSHCQISKKIAHTMSHYYSQEHQIILDFYKDKNITDVLADILQEG >NZ_CP022247.1|WP_001832085.1|1643073_1644012_-|aldo/keto-reductase MVKQVRLGKSDVNVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKEVVRQAIDNGITLLDTAYIYGPERSEELVGQVVKEYPREKVQIATKGSHVIKENEEVVQNNDPEYLKQQVENSLERLQVDYIDLYYIHFPDDDTPKDKAVAALKELKDEGKIKAIGVSNFSLEQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEEVMAYAAENNITFVPYFPLASGILAGKYDENQTFEDHRAERPDFQPDVFKDNVRRVKALTDIAEAHDTTIANVVLAFYLTRPSLDVVIPGAKRAEQVVENIDAANIELSQGEIDKIDSLFPIKK >NZ_CP022247.1|WP_001832045.1|1639931_1642613_-|MMPL-family-transporter MAKLLYKLGKFIAKNKWLSVIGWLVILGVIITPLMINSPKFDSDITMNGLKSLDTNDKISKEFHQDSEKASMKIVFHSNKNDGLNNKDTKKDIEDALDNIRQNDDYIQNISNPYDSGQVNDEGDTAIANVSYVVPQTGLKDSSKHIIDKELKDVTDNHNVQIEKTQGGAMNSEPGGTSEIVGIIVAFVILLITFGSLIAAGMPIISAIIGLGSSVGIIALLTYIFDIPNFTLTLAVMIGLAVGIDYSLFILFRFKELKKKGVDTVEAIATAVGTAGSAVIFAGLTVMIAVCGLSLVGIDFLAVMGFASAISVLFAVLAALTLLPALISIFHKSIKIKDKPTKSKDPKDHSWAKFIVGKPVIAVIVSLIILILAAIPVSGMRLGIPDDSLKPTDSSEYKAYKLISDNFGEGYNGQIVMLVNTKDGGSKSTIERDLNNMRSDLEDIDNVDTVSKAQLTDNNNYALFTIIPEKGPNSQSTENLVYDLRDYHSQAQEKYDYGTEISGQSVINIDMSEKLNNAIPVFAGVIVVLAFFLLMIVFRSILVPLKAVLGFILSLMATLGFTTLVIQHGFMGSLFGIENTGPLLAFLPVITIGLLFGLAIDYELFLMTRVHEEYSKTGDNDHSIRVGIKESGPVIVAAALIMFSVFIAFVFQDDSAIKSMGIALGFGVLFDAFVVRMTLIPALTKLFGKASWYLPKWLGAVLPNVDVEGKALEEDNHHDTSSEKGHVNDKNSEYSRQDKDNYVYQNDKRNYNRNYNDEDYNRSVHLNNHHDQHHRQHQYDNQRDDIDYESLYTQDGDHTHHDERNYNDRHYQDNYDRNDDYRHNNHDHQNDNHDYHDSNFDKTTNLYKELTDSNIDQDVLFKALMLYARENNKGVYDRYNRSSQHRHDDELRD >NZ_CP022247.1|WP_001832065.1|1638963_1639908_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MLKRRSSKFLGLLATLALAIVLSACGNSGNGSGSSDDSQTSLGNKEIEISYIASDNSTPRSLVIAEVLKKAGYDVTTTPVTASGPLYAAVSENSDSFHASGIFPTTDKSYYDKFKSKLTIYDDKHLIDNAKVGLAVPKYVQDVDSISDLKNSDFGKSVDWAIQGTDARNGVMQETKDELDSDNLDKYSLKESSDQDQFKKIQSAFKQQEPIVFTAMEPSWFSKELDVKMLKDPDNIYGNNNQHIDLVFNKDFKEAHPAAYTVATRMADDWSKSDEDKLAKKIFVDNKNPEQVAKDYVDDNDNKVDEWLEGIETI >NZ_CP022247.1|WP_046044338.1|1638044_1638614_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MPSANQKRMIKHIHETVFILLHDYHFDEITVQKICDIAEINRSTFYRYFQDKYELLYTLPDFITQQIIAKSDTSADITTPESFEDFIYYIGNNKKIFKHLLVSSRQADVFRSLTNVSREMMLNNPTRKRGPLAQKIRESKHPEIVADFYSSGVIEVLRRWVENDYNYTVEEVFVTLNNVLETSLYCYDK >NZ_CP022247.1|WP_001832122.1|1637159_1637834_-|IS6-family-transposase MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYQIWKKKHKKAYDKWRIDETYINIKGKWNYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYVFIKRLIKQFGKSQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS >NZ_CP022247.1|WP_001832180.1|1636234_1636711_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MYSVRQATEKDAVAIRDVATKAWYNTYLNIYAASTVNELLAASYNETHLKKRLNEQLFLVAEEDSEIVGFANFIYGEELYLSAHYVRPESQHKGYGTRLLEAGLKRFKDQYETVYLEVDNNNSNGIEYYQNHGFEIIRSYQPEMYGEIMDLALMKKSF >NZ_CP022247.1|WP_001832138.1|1634844_1636143_-|HD-domain-containing-protein MTLSSYATSKLTEEKVFKDPIHRFIHVQDQLIWDLIKTKEFQRLRRIKQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRMIDETFIGQDAWDNTDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAFTQAIITGNTEVNGVLSRVSDNFPKQVADVINKTHDNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVTYGSFDMERILRLMRPSKEEVLIKDSGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKMYPKDFIPFFEGTMTIEQYVELDEAVVLYYLKKWIHENDPILSDLSRRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLKSNGGITEISNQSLVINSITGINREDHKLYYPKEMILKIKDYQIKGSIINLLNELN >NZ_CP022247.1|WP_001832182.1|1634281_1634788_-|hypothetical-protein MSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDIENQKAFVDIGGMHARAEVEKGVKWITDKSQVEGEEAKAYWLCWVTTERSEQGPYYAGVTACYLLVNKSIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHQFIIDQIGDDNKQILKEFLQNHNVEMWNNSSEELYRAFE >NZ_CP022247.1|WP_002438738.1|1646315_1646657_-|DUF1450-domain-containing-protein MKNKFLICDECQAVNLKSLKRKLEKLDPEAEIEIGCQSYCGPGRRKTFAFVNNRPLAALTEEELMEKVTKQLKKPRDPEEEERLRKRNEERKRRKEEQDRKLKEKLKKHKAEK >NZ_CP022247.1|WP_001832075.1|1646867_1647944_-|phosphomevalonate-kinase MIQVKAPGKLYIAGEYAVTEPGYKSILIAVNRFVTATIEASNKVEGSIHSKTLHYEPVKFDRNEDRIEISDVQAAKQLKYVVTAIEVFEQYVRSCNMNLKHFHLTIDSNLADNSGQKYGLGSSAAVLVSVVKALNEFYGLELSNLYIYKLAVIANMKLQSLSSCGDIAVSVYSGWLAYSTFDHDWVKQQMEETSVNDVLEKNWPGLHIEPLQAPENMEVLIGWTGSPASSPHLVSEVKRLKSDPSFYGDFLDQSHACVESLIQAFKTNNIKGVQKMIRINRRIIQSMDNEASVEIETDKLKKLCDVGEKHGGASKTSGAGGGDCGITIINKVIDKNIIYNEWQMNDIKPLKFKIYHGQ >NZ_CP022247.1|WP_002458370.1|1647956_1648940_-|diphosphomevalonate-decarboxylase MVKSGKARAHTNIALIKYWGKADETYIIPMNNSLSITLDRFYTETKVTFDPDFTEDRLILNGNEVNAKEKEKIQNYMNIVRDLAGNRLHARIESENHVPTAAGLASSASAYAALAAACNEALSLNLSDTDLSRLARRGSGSASRSIFGGFAEWEKGHDDLTSYAHEINSNGWEKDLSMIFVVINNQSKKVSSRSGMSLTRDTSRFYQYWLDHVDEDLNEAKEAVKNQDFQRLGEVIEANGLRMHATNLGAQPPFTYLVQESYDAMAIVEQCRKANLPCYFTMDAGPNVKVLVEKKNKQAVMEQFLKVFDESKIIASDIISSGVEIIK >NZ_CP022247.1|WP_002445774.1|1648944_1649865_-|mevalonate-kinase MTRQGYGESTGKIILMGEHAVTFGQPAIAIPFNAGKIKVLIESLDEGNYSSITSDVYDGMLYDAPEHLKSIINRFVEKSGVKEPLSVKIQTNLPPSRGLGSSAAVAVAFVRASYDFMDQPLDDKTLIKEANWAEQIAHGKPSGIDTQTIVSNKPVWFKQGKAETLKSLKLNGYMVVIDTGVKGSTKQAVEDVHVLCESDEYMKYVEHIGTLVHRASESIEQHDFHHLADIFNACQEDLRHLTVSHDKIEKLLQIGKEHGAIAGKLTGGGRGGSMLLLAENLQTAKTIVAAVEKAGAAHTWIEHLGG >NZ_CP022247.1|WP_002445773.1|1650557_1651397_-|lipoate--protein-ligase-family-protein MDLATKYFNQINWRYVDHSSGLEPMQSFAFDDTFSESVGKDLSCNVVRTWIHQHTVILGIHDSRLPFLSDGIRFLTDEQGYNAIVRNSGGLGVVLDQGILNISLIFKGQTETTIDEAFTVMYLLISKMFEDEDVSIDTKEIEQSYCPGKFDLSINDKKFAGISQRRVRGGIAVQIYLCIEGSGSERALMMQQFYQRALKGQTTKFHYPDIDPSCMASLETLLNREIKVQDVMFLLLYALKDLGANLNMDPITEDEWTRYEGYYDKMLERNAKINEKLDF >NZ_CP022247.1|WP_002445772.1|1651396_1652386_-|phosphate-acetyltransferase MADLLSVLQDKLSGKNVKIVLPEGEDERVLIAATQLQKTDYVSPIVLGNEDNIKSLASKHALDLTQIEIIDPATSELKDELVDAFVERRKGKATKEQAVELLDNVNYFGTMLVYTGKAEGLVSGAAHSTGDTVRPALQIIKTKPGVSRTSGIFFMIKGDEQYIFGDCAINPELDAQGLAEIAVESAKSAQSFGMNPKVAMLSFSTKGSAKSDDVTKVQEALKLAQEKAEADQLEHVVIDGEFQFDAAIVPSVAEKKAPGAKIQGDANVFVFPSLEAGNIGYKIAQRLGGYDAVGPVLQGLNSPVNDLSRGCSTEDVYNLSIITAAQALQ >NZ_CP022247.1|WP_002458373.1|1652556_1653306_+|heme-dependent-peroxidase MSEAAETLDGWYSLHLFYAVDWTTFRLIAEDDREAMITELETFVKDKAVARESHQGDHAIYNITGQKADLLLWFLRPEMKELNQIENEFNKLRIADYLIPTYSYVSVIELSNYLAGKSDEDPYENPHVKARLYPELPHSEYICFYPMDKRRNETYNWYMLPIEDRKTLMYNHGMIGRKYAGKIKQFITGSVGFDDYEWGVTLFSNDVLQFKKIVYEMRFDETTARYGEFGSFYIGHILNIEDFKQFFSI >NZ_CP022247.1|WP_002445770.1|1653809_1654574_+|threonine/serine-exporter-ThrE-family-protein MNKDTIETSHEALIKDVVMITARILLESGAEGTRVEDTMARIATKLGYPESNSFVTNTVIEFVLHNEAYPRLYRIKTRDTNLIKISQANEISRQITNGTMTLEEAKYQLEEIYVAKRDSSLPFKGIAAAIIASSFLYLQGGRLVDIITAVLAGTIGYLVVEILDRKLHAQFIPEFIGSLVIGIISVIGHAFVPSGDLATIIIAAVMPIVPGVLITNAIQDLFGGHMLMFTTKSLEALVTAFGIGAGVSSILILV >NZ_CP022247.1|WP_002445769.1|1654586_1655039_+|threonine/serine-exporter-family-protein MFWIFNFIFSFLASLFFCVIFDAPRKLYFACGFVGACGWMVYTLLFNGFELHTIYSSFFGSLALGLLSHYMARRKKEPVIIFMVTGIIPLVPGGLAYDATKNLVLLHFGKAINTMLEVTLIAGAIALGLLFADQISKIVISGFARTRKRL >NZ_CP022247.1|WP_002445768.1|1655199_1656690_-|APC-family-permease MENKNNNVDRGNLKQNLSEKFVWAIAYGSCIGWGAFILPGDWIKQSGPIASSIGIVIGALLMILIAVSYGALVEKFPVSGGAFAFSFLSFGRYVSFFSSWFLTFGYVCVVALNATAFSLLIKFLLPNVLNNGKLYTVAGWDVYITEIVIATVLLIVFMLITIRGASVSGSLQYYFCVAMVLVVALMFIGSFFSSHFSLSHLEPLASVDKGWFQSIIMIVSIAPWAYVGFDNIPQTAEEFNFSPNKTFKLIVYSLLAASLTYVVMLLYTGWLGTQATSLNGNLWLTGAVTQDAFGFIGLAVLAVAIIMGIFTGLNGFLMSSSRLLFSMGRSGIMPTVFSKLHSKHKTPYVAIIFLVAVSLIAPWLGRTALTWIVDMSSTGVSIAYFITCLSATKLFSFNKQSNTYAPVYKIFGIIGSIVSFVFLCLLLIPGSPAALSIPSYIALGIWLVIGLIFFIIRLPKLKKMNNDEMSRLILNHSEDEVLEMIHEPGQSNSTNK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022247_3 | 1953993-1954160 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022247_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP022247_3
>3.1|1954032|27|NZ_CP022247|PILER-CR TTATCTTCATCATTTGGACAAGCCCAC >3.2|1954098|27|NZ_CP022247|PILER-CR ATAAACCAGTCATACCTCTTGCCCAGT |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022247_3
The CRISPR arrays of NZ_CP022247_3 >merge|NZ_CP022247|3|1953993-1954160|PILER-CR GGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATAAGGTATATTTATCTTCATCATTTGGACAAGCCCACATGGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATAAGGTATATATAAACCAGTCATACCTCTTGCCCAGTATAGTTTTAGTACTCTGTATTTTAGGTATAAGGTATAC >NZ_CP022247|3|1|1953993-1954160|PILER-CR GGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATAAGGTATATTT ATCTTCATCATTTGGACAAGCCCACAT GGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATAAGGTATATAT AAACCAGTCATACCTCTTGCCCAGTAT AGTTTTAGTACTCTGTATTTTAGGTATAAGGTATAC
>NZ_CP022247.1|WP_070592998.1|1952973_1953963_+|hypothetical-protein MYEAILEINIDAIPIVILNTSVYTSIYNEDLTHEEYILDTLKNYFQPRNSNKDTVTITNLTDFERVSHNQFRGFLLDHSTIENEHQLSATSMMTKKIMREMQNDLEIDGYINSINVLLDDLRDNLKGTLPLSIKSFDLKQFIKLLSFEYDYSEDYARLITRLEQVVPLVVDEMDYQAKEKSFVIYLYPEAGLSIKEQIRFRKILNNLPVPVIVLTESPRFLSESIKGLNYFINNIQMITESFFEDSYWNAPINVEKERIKERFEYLFVKYCSVLEIKPIISNYLLADIIVFNDIDLYIIVSFLKHCNLEYQLDIDKTKISLALSTYLFS >NZ_CP022247.1|WP_070592996.1|1952654_1952963_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRVMIMFDLPTDSKEERRLYSKFRKGLISEGFLMMQYSIYIKSCINKDAANSSVNYVKRILPPNGHVRALIITEKQYEKMKILLGNEDKNIEILGDNRTILF >NZ_CP022247.1|WP_070592994.1|1951737_1952643_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAWRIVYLSEVDKLALNLNNLKVAKGDLEVKIPLSDIFAIVIEDLTTTITSRLMIELSKYNILVIFCNQHHLPECMIQPINGHFNQYGQMKEQLQWSEERKAELWKHILVQKLQNQIQCMKHYGVDEERIIKMKKLQSMVTPKDEMNIEGQAAKYYFNTFFKDFRRDDDFLVENMVLNFGYTILNSAIARTIVAKGLIPALGIHHIGARNHFNLASDIIEVFRPLVDLYLLKQPPKVEYMTREYRLELINLMHARVQIDGKQHTVIRAIEIMVQSIIEYFRTGRYETLKFPNIKQYSFYKS >NZ_CP022247.1|WP_088922804.1|1948568_1951730_+|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MKKNYILGLDIGITSVGYGVIDYKTRDVIDAGVRLFKEANVENNEGRRSKRSTRRLKRRRRHRLQRVKKLLFDYNLLTDHSELTGINPYEARVKGLSQKLSEEEFSAALLHLAKRRGVHNVNEVEEDTGNELSTKEQISRNSKALEKKYVAELQLERLKTDGEVRGSINRFKTSDYVKEAKQLLKVQKAYHQLDQSFIDTYIDLLETRRTYYEGPGEDSPFGWKDIKEWYEMLMGHCTYFPEELRSVKYAYNADLYNALNDLNNLVIARDENEKLEYYEKFQIIENLFKQKKKPTLKQIAKEILVNEEDIKGYRVTSTGKPEFTNFKVYHDIKDITARKEIIENAELLNQIAEILTFYQSSEDIQEELAKLNLELTQEEIEQISKLKGYTGTHNLSLKAINLILDELWHTNDNQMAIFNRLKLVPKKVDLSQQKEIPTTLVDDFILSPVVKRSFIQSIKVINAIIKKYGLPNDIIIELAREKNSKDAQKIINEMQKRNRQTNERIEEIIRTTGKENAKYLIEKIKLHDMQEGKCLYSLEAIPLEDLLNNPFNYEVDHIIPRSVSFDNSFNNKVLVKQEENSKKGNRTPFQYLSSSDSKISYETFKKHILNLAKGKGRISKKKKEYLLEERDINRFSVQKDFINRNLVDTRYATRELMNLLRSYFRVNDLDVKVKSINGGFTSFLRRKWEFKKERNKGYKHHAEDALIIANADFIFKEWKKLDKAKKVMENQTVEDNQAESMPKIETEQEYKEIFITPHQIQHIKDFKDYKYSHRVDKKPNRELINDTLYSTRKDDKGNTLIVNNLNGLYDKDNDKLKKLINKSPEKLLMYHHDPQTYQKLKLIMEQYGDEKNPLYKYYEETGNYLTKYSKKDNGPVIKKIKYYGNKLNAHLDITDDYPNSRNKVVKLSLKPYRFDVYLDNGVYKFVTVKNLDVIKKENYYEVNSKCYEKAKKLKKISNQAEFIASFYNNDLIKINGELYRIIGVNNDLLNRIEVNMIDITYREYLENMNDKRPPRIIKTIARKTQSIKKYSTDILGNLYEVKSKQNPQMIMKG >NZ_CP022247.1|WP_070592987.1|1947465_1947945_+|23S-rRNA-(pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase-RlmH MKITILSVGKLKEKYWKQAIAEYEKRLGPYTKIELIEVLDEKAPENMSDKEIEQVKEKEGQRLLNKIKPQSTVITLEIKGKMLSSEGLAKELQTRMTQGQSDFTFVIGGSNGLHQDVLQRSNYALSFSNMTFPHQMMRVILIEQIYRAFKIMRGEAYHK >NZ_CP022247.1|WP_002447628.1|1945614_1946415_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MSRLIRMSVLASGSTGNATYVESEKGSLLVDVGLTGKKMEELFSQIDRNIKDLNGILVTHEHIDHIKGLGVLARKYKLPIYANENTWKAIEKKDSRIPMDQKFIFNPYETKSLAGFDIESFNVSHDAIDPQFYIFHNNYKKFTMITDTGYVSDRMKGMIQGSDVFMFESNHDVDMLRMCRYPWKTKQRILSDMGHVSNEDAGLAMSDVITGNTKRIYLSHLSQDNNMKDLARMSVGQVLNEHDIDTEKEVLLCDTDKAQATPIYTL >NZ_CP022247.1|WP_002474930.1|1944199_1944991_+|hypothetical-protein MNWKLTKTLFIFVFILVNIFLVIVYIDKVNKSQVNDSEKVNEVNFQQEEIDVPKDVLNQSVKDTELEQITARSKNFSSYAKDHSSMQTSDSDKTLEGDIDKGVQVSDKNLQDIKEYIAKKIFNGKEYQLSDLTKDKVTYEQTYKDYPIMNNSKARLTFNLSDGKATSYKQTAMDDIQVAKGSNSTKKQVITPRKAIEALYYNRYLKQNDQVLDARLGYYSVVKETNVQLLQPNWEIKVKHKGKDEVQTYYVEATNHNPKVIDY >NZ_CP022247.1|WP_088922803.1|1942852_1944199_+|hypothetical-protein MIGMNNKEHTKSIILVLLVLMSIVLTYMVWNFSPDLSNIDNTDNSKSDKPKPLTKPMTAEMEGTITPFQIVHSRDEKSQGTVASGAVLDKMIQPLKNQEVKSVSHLKREHNLVIPELSNDFIVLDFTYDLPLSTYLSQVLDIDAKVPNNFNFDRLLIDQDHNNHVVLYAISKDRHEVVKLKTTMKGNNVDKAFKSIESDMQPYTEIITNKDTIDKATHVFAPSKPKDLKTYRMVFNTISVERMNSILFDDSTIVRSSQSGTTTYNNNTGVANYNDKDEMYHYKNLSEDAKSSSNMQETIPGTYEFINSHGGFLNEDYRLFKTDNRTGKLTYQRFLNGHPTFNKHNFNEIQVTWGDKGVYDYQRSLLKTDVTLNSEESKSVPTVESVRSALANHPDIDFEKVTNIAIGYDMDDKANNEDIEVQRNCELIPRWFVEYDGNWYAYKDGRLE >NZ_CP022247.1|WP_002437327.1|1941036_1942869_+|cell-wall-metabolism-sensor-histidine-kinase-WalK MKWLKQLQSLHTKLVIVYVLLIIIGMQIIGLYFTNSLEKELLDNFKKNITQYAKQLDVNIEKVYKDKDKGSVNAQKDIQDLLNEYANRQEIGEIRFIDKDQIIMATTKQSNRGLINQKVNDGSVQKALSLGQTNDHMVLKDYGSGKERVWVYNIPVKVDKQTIGDIYIESKINDVYNQLNNINQIFIVGTAISLFITVILGFFIARTITKPITDMRNQTVEMSKGNYTQRVKIYGNDEIGELALAFNNLSKRVQEAQANTESEKRRLDSVITHMSDGILATDRRGRVRIANDMALKMLGLAKEDVIGYYMLGVLNLENEFSLEEIQENSDSFLLDINEEEGIIARVNFSTIVQETGFVTGYIAVLHDVTEQQQVERERREFVANVSHELRTPLTSMNSYIEALEEGAWQDKELAPSFLSVTREETERMIRLVNDLLQLSKMDNESDQITKEIIDFNMFINKIINRHEMAAKDTTFVREIPQQTIFAEIDPDKMTQVFDNVITNAMKYSRGEKRVEFHVKQNALYNRMTIRIKDNGIGIPINKVDKIFDRFYRVDKARTRKMGGTGLGLAISKEIVEAHNGRIWANSVEGQGTSIFITLPCEIIEDGDWDE >NZ_CP022247.1|WP_001831816.1|1940322_1941024_+|response-regulator-transcription-factor MARKVVVVDDEKPIADILEFNLKKEGYDVYCAYDGNDAVDLIYEEEPDIVLLDIMLPGRDGMEVCREVRKKYEMPIIMLTAKDSEIDKVLGLELGADDYVTKPFSTRELIARVKANLRRHYSQPAQEVSGATNEITIKDIVIYPDAYSIKKRGEDIELTHREFELFHYLSKHMGQVMTREHLLQTVWGYDYFGDVRTVDVTIRRLREKIEDDPSHPEYIVTRRGVGYFLQQHD >NZ_CP022247.1|WP_083310252.1|1954856_1955057_+|hypothetical-protein MKELEKVLKNPYISEDVKRTVQSMNKDVMQLLNDYYDENFNLYQRAQPETIANEFYADPNIIKKLY >NZ_CP022247.1|WP_070593003.1|1955219_1955849_+|hypothetical-protein MNKVRMVTYEPMIFKKRKGNKIVKNNVDILPYLDASFRTEPSLNVEYPGISSLCRGEKLAPKLKKGDKVVYIAKKNKYDQDFKHWRLVAILEVIEIKNCHYAASKWYEENNYILPKNCIVDGNPPLSLDKTTVKDQSTIDERERGYNYRAKKYPQFNICKKLYLNLETPPIITEEKMKEIFDNKIPVIQNYKILNENQYRELETLSQNN >NZ_CP022247.1|WP_070593005.1|1956181_1956961_+|tandem-type-lipoprotein MKHSKKLVLFASFLILTIFNGGCGSMTKEDNKEEKIKKSFEKTLGMYPIKNLEDLYDKEGYRDEEFDKDDKGTWTLYSEMAIQRKGDDLETRGMVLKVNRNTRTSKGNYIINKISTDSKGVSQNTQKKYPIKMENNKIIPTERIENFNVKKEIEEFKFFSQYANFNSLKDYKNGKIATNPKVPSYSAEYDLENSDYNVKQLRKRYDIPTQQPPKLLLKGTGDLKGSSIGSKDIEFTFIEKPKENIYFSDSLDYKPSEGH >NZ_CP022247.1|WP_088922805.1|1956963_1958328_+|hypothetical-protein MSSTEYQIKTENITSNSEETSTVSKVSYEIENANDHNLGDDKIRGQLEKLKAKGTFPNNLNYLKSYTDPNTGTTSTAFLNKDTGKVTVGMAGTNVHGKQLKNTLNPFNFIKDKQEAIDARGSMLDFAADTNIGLNTVTDKDVRFKNTQQFIKDIKKDYEIDTITGHSLGGRDAIIIGVSNDIDNVVAYNPAPLTVKDFRRIIKGPISSLHDKEKDAYIESFIKSYDGNILRIVSDKDELNGIIKKTEYVSAGNEMVIKNGKGHSMLGFLGKREQREIKAELEKLKGYQDANNKSFVTAKKQASKKLQQIDAVKANMVQASGGALSSSQQKILEFLTALSIAVSLSQMVEEEIQQLRKLYADMKKLFKKNWEDARESGSALGKHLSDGEVLDALDVGNVNENKLVTMPHSKISYKLTQLTNVSSQYDTYISKIKTSINEIIEKDQSLASQIGDLA >NZ_CP022247.1|WP_070593021.1|1958327_1958654_+|hypothetical-protein MFSEYKQLNELEDVYDTEKKQVDQALQKLNELRHQIRRENEESYDLFLHLKEKMNYSNEANGRMLNNIEEYEYEVNQRLRQSEIKLENYKDELRKEYLKQFEKIKEGD >NZ_CP022247.1|WP_070593009.1|1958657_1958945_+|hypothetical-protein MLMANPVAFDGSAVSELKKMMEKNRITNVIAPEHNKRHHDHENKMKNEEKKLIEQTISHCNSFRSEFEKSAKGDWVDNAMSELDKIGESLKQIID >NZ_CP022247.1|WP_070593011.1|1959508_1961239_+|DUF2075-domain-containing-protein MGNLLKIENINYSLENLDNSVRKWNTSANGKFLLRYPTVYIINDKKSENNFEVYVGETADIRNRTRQHLNADTKVKSFWEDFSESKKSSMYVIGHELFNKSLTLDIENRLMQYLLSVENISRVHNSRTNQQNEYYTSEMLDEIFSEIWQSLNKKNKSLFPIESIIKDSAIFKASPFHKLTQEQINAKEEILTKIKESILSNEDGQLIIVEGEAGSGKTVLMSTLLYELGKYNLDLDENLDIHLLVNHNEHVSIYSQIASKLGIANKKNKIVQKPTSFINNNSSDEKVDVVIVDEAHLLLTQGKQSYQGKNHLDDLLARAKVVVIVFDIKQVLTTEQIWEIDKLNEYFDKAKSNSNHVTLRNQMRINSDISTVNWIRNLVDYQVINSIPKDKLGYDIKIFDTPDELEKAIKIKATHTDSGISRMLATFDWKYGTKPPNHEDFWRVKIGNWSMPWNYQLKANRNQVSLPWVEQDQTIDEIGSTFTIQGLDLNFAGVIIGPSVKYRNGKIIFDKSESANKKATQRRTLKDGSKQYFSEMLLKNELNVLLTRGVNGLYIYAVDDQLREALKIAAKGESNG >NZ_CP022247.1|WP_070593013.1|1961231_1961573_+|nucleotide-pyrophosphohydrolase MDEINDIVKEINKFRDARNWRQFHNEKDLSLSITLEAAELLELFQWKTSDEVVETNRERLAEEIADVLIYSYMLADNLNFDINDIIRKKLVKNAEKYPIAKSKDNKIKYNELS >NZ_CP022247.1|WP_032606884.1|1962440_1963220_+|tandem-type-lipoprotein MKHSKKLLLCISFLLITFFIGGCGSMTKEGNKETQIKKSFEKTLSMYPIKNLEDLYDKEGYRDEEFDKDDKGTWLLHSEMAIQRKGEDLETRGMVLKINRNTQTSKGDYITNKITYDNKGRPQSNKKKYPVKMKNNEIIPIKKIEDSKIKREIGEFKFFAQYADFKELKDYKNGNISYNPNVPSYSAEYDLENSDYNVKQLRERYDIPTKQAPKLLLKGTGDLKGSSIGTKDVEFTFTEGKQENIYFSDSMNFMPSEDD >NZ_CP022247.1|WP_099816528.1|1963344_1963782_+|DUF1433-domain-containing-protein MMNKNKIILFATSIIIIIAIILGGGYMLHESKRQHYIDIQKKRIELFFKENINNYQSIKVTDIGKTPMGGYSIKGYINNNKKLDFIAIMNEDKGFQFDDEINYSKKLSHLFKQKNPSNKFPSQIIKEKNLNENDYKADPPLIFGF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022247_4 | 2336584-2336667 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022247_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022247_4
>4.1|2336611|30|NZ_CP022247|CRISPRCasFinder ACCATGGACAAAGCAAGTTGGGGTTGGGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022247_4
The CRISPR arrays of NZ_CP022247_4 >merge|NZ_CP022247|4|2336584-2336667|CRISPRCasFinder CCCAACAGAGAGAATTTCCGAAGAAATACCATGGACAAAGCAAGTTGGGGTTGGGGCCCCAACAGAGAGAATTTCCGAAGAAAT >NZ_CP022247|4|3|2336584-2336667|CRISPRCasFinder CCCAACAGAGAGAATTTCCGAAGAAAT ACCATGGACAAAGCAAGTTGGGGTTGGGGC CCCAACAGAGAGAATTTCCGAAGAAAT
>NZ_CP022247.1|WP_002495966.1|2334453_2336481_+|PTS-transporter-subunit-EIIC MFKKLFGQMQRIGKALMLPVAILPAAGLLLAIGTAFQGEALQHYLPFIKNDIVQQIANMLTGAGGIIFDNLPIIFALGVAIGLAGGDGVAAIAAFVGFIILNKTMGAFLHVTPDKLSDPTNGYANVLGIPTLQTGVFGGIIIGALAAWCYNKFYNITLPSYLGFFAGKRFVPIMMATTSFILAFPMAIIWPTIQNGLNAFSEGLLDSNTGLAVFLFGFIKRLLIPFGLHHIFHAPFWFEFGSWKNAAGEIIRGDQRIFIEQIREGAHLTSGKFMQGEFPVMMFGLPAAALAIYQTAKPENKKVVAGLMISAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPFLFVIHAVLDGLSFLTLYLLNVHLGYTFSGGFIDYVLLGILPNKTAWWLVIPVGIIYAVIYYFVFRFLIVKFNYKTPGREDKKSTVTTTSASQLPFDVLKAMGGKENIKHLDACITRLRVEVNEKSKVDVAGLKSLGASGVLEVGNNMQAIFGPKSDQIKHDMAKIISGEITKPSETTIDEEVSDEPVHVEDIVETEIYAPGHGEIIPLSEVPDKVFSEKMMGDGIGFVPDSGEIVAPFDGTVKTIFPTKHAIGLESDSGVEVLIHIGIDTVKLNGEGFESLVNTDEPVTQGQPLMKIDLEYLKEHAPSIITPVIITNQEDKTLTIEDVKQVDPVKAIMTIK >NZ_CP022247.1|WP_002447089.1|2332471_2334211_+|pyruvate-oxidase MAQIKANEALVKALQTWNIDHLYGIPGDSVDAVVDSLRTVRDQFKFYHVRHEEVASLAAASYTKMTGKIGVALSIGGPGIVHLLNGMYDAKMDNVPQLIIAGQTNSTLLGTKFFQETNISKMVDDVAVYHHQIQKGDNVFEITNEAIRTAYEKKGVSVIICPNDLLTQKIKDTTNRAVDTTKPKPVSPKFKSIKKAAKLIDKAKKPVMLIGLGTQHAKDELREFIEAAKIPVIHTLPAKTILPDDHPYSIGNLGKIGTKTSYQTIQDADLLIMAGTNYPYVNYLPKKNIKAIQIDTNEENIGARFKINVGILGDSKVAFHQLTENIKHVAKRPFLDKTLERKAVWDKWMKQDLNNDNSPLRPERLMKAINANLKDDAIISADVGTSTVWSTRYLNLSVNNKFIISSWLGTMGCGLPGAMAAKIAYPNRQAVAITGDGAFQMVMQDFATAVQYNLPMTIFVLNNKQLSFIKYEQQAAGELEYAIDFSDMDHAKFAEAAGGKGYVVRDVSRLDDIVEEAMAQDVPTIVDVHVDPNAAPLPGKIVNEEAFGYSKWAYRSITEDKNLDFDQIPPISVAAKRFL >NZ_CP022247.1|WP_002447088.1|2331732_2332422_+|LrgB-family-protein MNEYLQAVLMILLTIVLYYISKKIQDKYKNPLLNPALIASIAIIIVLLVCGVSYKGYMKGGTWINHVLNATVVCLAYPLYQNKKKIKKYLTIIFTSVLTGVVLNFVLVFTTLKIFGYSKDTIVTLLPRSITAAVGIEVSQELGGTDTITVLFIITTGLIGSILGSMLLRMGGFKSSIARGLTYGNASHAFGTAKALELDIESGAFSSIGMILTAVISSVLIPVLILLFY >NZ_CP022247.1|WP_002447087.1|2331343_2331736_+|CidA/LrgA-family-protein MEKAKFVIKLILQLALIMLITFIGTEVQKLLHIPLAGSIVGLMLFFLLLQFKIIPESWINVGADFLLKTMVFFFIPSVVGIMDVASNITMNYILFFIVIIIGTCLVALSSGYIAEKMLEKNNTRKGTDHS >NZ_CP022247.1|WP_002447086.1|2330145_2331030_+|LysR-family-transcriptional-regulator MDIKHMKYFVEVVKQGGMTNASKSLYIAQPTISKAIKDIEAEMTVPLFDRSKRSLVLTDAGKIFFKKCQEIIALYDNLPTEINSLYGLETGHITISMSAVMSMRKFIGVLGDFHQLYPNITYNLIESGGKTTENLILNDEVDIGVTTLPVDHHKFECISLNKEELTVVLNKEHPLAQKSSIKMEELADENFILFNEDFYLNDKIIENAKNAGFVPNMASQISQWNVIENLVINQLGISILPATIAQLLNDDVKIVRLENAHTTWELGVVWKKDKRLSHATNKWIEFLKERLSEE >NZ_CP022247.1|WP_002447085.1|2329742_2329958_-|hypothetical-protein MSFYEFMQNFLGDDTPLGELVDWINQDINFPKDVKSQNEILTYFRNHPCPENIPVASIKRALAVFNQFTKV >NZ_CP022247.1|WP_002447084.1|2329050_2329485_-|CHAP-domain-containing-protein MKFKKLLSRIIIATMITFTGTLSYQAIEPTHISHAASHNYYGKKQCTWWAFKRRAQLGKPVSNRWGNAKNWYSNARQSGYATGHKPRKYAVMQSTRGYYGHVAVVEKVYKNGKIKISEYNYNVPLGYGTRIISKSSARNYNYIY >NZ_CP022247.1|WP_002447083.1|2327696_2328974_+|hydroxymethylglutaryl-CoA-reductase,-degradative MKSLDKGFRHLTRKDKLKELVEYGWLEDENYEILLNYPLINEEVANSLIENVIGQGALPVGLLPQIIVDGKEYVVPMMVEEPSVVAAASYGAKLVNQSGGFKTISSERLMIGQIVFDDVDDTGSLANSIYQIESQIHQIADEAYPSIKARGGGYQRIEIDTFPDQQLLSLKVFVDTKDAMGANMLNTILEAITAHLKVKFSNQNVLMSILSNHATASVVKVQGEIDIEDLHKGERSGEVVAQRMERASVLAQVDIHRAATHNKGVMNGIHAVVLATGNDTRGVEASAHAYASKDGHYRGIATWEYDRSRNKLVGTIEVPMTLATVGGGTKVLPIAKASLDLLNVENAQELGQVVAAVGLAQNFSACRALVSEGIQQGHMSLQYKSLAIVVGAKGEEIAQVAEALKYESQANTAKAQEILMNIRES >NZ_CP022247.1|WP_001832323.1|2326285_2327452_-|hydroxymethylglutaryl-CoA-synthase MNIGIDKISFYVPKYYVDMAKLAEARQVDPNKFLIGIGQTEMAVSPVNQDIVSMGANAAKDIITEEDRKNIGMVIVATESAIDNAKAAAVQIHHLLGIQPFARCFEMKEACYAATPAIQLAKDYLAQRPNEKVLVIASDTARYGIRSGGEPTQGAGAVAMMISHNPSILKLNDDAVAYTEDVYDFWRPTGHQYPLVAGALSKDAYIKSFQESWNEYARRHNKTLADFASLCFHVPFTKMGQKALDSIINHADETTQERLNSSYQNAVDYNRYVGNIYTGSLYLSLISLLETRDLKGGQTIGLFSYGSGSVGEFFSGTLVDGFKEQLDVERHKSLLNNRIEVSVDEYEHFFERFDHLELNHELEKSNEDRDIFYLKSIDNNIREYHIAE >NZ_CP022247.1|WP_002447081.1|2325513_2326032_+|methylated-DNA--[protein]-cysteine-S-methyltransferase MYQSMYDSPVGLLQLITNDGISLSHVLYPNQHLKGIKTKDTLDIFKDTKAWLREYFKGNYPEIKVPLAPKGTDFQQKVWNELQTIRYRELKTYGEIAKTIGRAMNKPAMSAQAVGGAVGSNPISILIPCHRVVGKDGNLTGYGGTLDNKIKLLKLEKIDMTHLYRPKKTTKP >NZ_CP022247.1|WP_020362481.1|2336828_2337596_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MIIMDDLKQNQSANEKPKGNKIVNILIFIGMILLIQIPIGVSLIALPFSVKFSQLTSIALSMLITGIALLIIWLVRNYYLSHTYERQYQSMRGKDIFINIGFLILAMVFSILSSLLMVIFTGNDTTANEKEINESLDLLLQKDHLPHISIVATVVLMICIIGPYLEELLFRGIFKETLFMKYRFWLPFIISSIIFSSQHLSTNIFSYAIYFLMGCVLYLAYNRRRNIKDSMMVHMLNNSVSTLPVFVGYLWLYFR >NZ_CP022247.1|WP_002458223.1|2337660_2338713_-|zinc-dependent-alcohol-dehydrogenase-family-protein MKAYEYLKPGHAQLTDKEKPTITSSTDAIIRIVKTTICGTDLHIIKGDTPEVQSHTTLGHEGIGIIEEIGDNVNNFKVGDKVIISCISSCGKCYYCKKGIYAHCENGGGWILGHLVNGTQAEYVKVPFADNSLYHAPSNLKDDALVMLSDILPTGYEIGVLKGKVKPGCTVAIVGAGPVGLAALLTAQFYSPSKIIMIDLDDNRLETAKELGATHLINSKETETAIKKVKSLNPRGVDVAIEAVGIPQTFDLCQNLIGVDGTIANVGVHGLPVQLDIDKLWIKNINVTTGLVSGNTTEELLEALKSKIIQPEQLVTHYSKLSEIESAYDLFRNATDHKAIKLIIENDITI >NZ_CP022247.1|WP_002447094.1|2338936_2339263_+|thioredoxin-family-protein MYENLQNIEDFYRFINVHDLAVVHIMRDNCTVCHAVLPQIQDLLKDYPKAQLGVINQSNVEEIAGELSIFTVPVDLIFFNGKEMHRQARFIDMQSFEKQLYMMQNAID >NZ_CP022247.1|WP_023474120.1|2339431_2340295_+|YitT-family-protein MKEAKMKKQQNKVHMINISLCLIGTLLIAIAVNSFVIPGNLGEGGSIGLSLILNYTLGISPALSSFIINAILIIVGWKFLSRTTAIYTAITITASSIFLDLTHTFGLGIHDNFINSIFAGLMLGIGSGLVITAHSTLGGTSVIARIISKYSEIKTSQALLILDAIIVLSFIVVLPITNVLYTIVMLFIVEKSMSFVVEGFNPKKAVTVISKYNKEISADIYEMTGRGATLLSGKGAYQKSDTEVLYAVVSQNQVGAIKKIVNQYDENAFLVIHDVRDVLGNGFINIK >NZ_CP022247.1|WP_002490611.1|2340377_2341358_+|alpha/beta-hydrolase MFKKIATIIGSTLFGTVLFAKVKEKRSYKSFLQEKMIRMSGMKKTFESVDDAKKALNETKYQTAGKYSGTTYEFKHKVQIRDYYGSLVYVVNDQGLLDQRTVLYVHGGAWFQDPLENHFEYLDLLVDALDARVIMPVYPKIPHRDYRTTFELLTKIYKRLLTKIDKPENLVIIGDSAGGQIALAFAQMLKKEQLSQPGHIVLISPVLDATFKNPESRKYEKEDPMLGIDGSKYLVELWAGDTPLDDYKMSPMNGDLEGLGHITLTVGTKETLYPDAVKFSHMLNDKGIKHQFIPGYNLFHIYPLFPIPERQRFLEQLKKIIVTKEL >NZ_CP022247.1|WP_088922846.1|2341429_2341747_-|hypothetical-protein MEKSVKLAVGIYLAIILIICSSYLAFILIGSLNGKDMSNSVLDTDHSRINNTSRNSNEDVTSSNNESNDTKAHSFSNSEYKAVNINEAYKNNKHIKKANSSYQYY >NZ_CP022247.1|WP_002490674.1|2342197_2343355_+|poly-gamma-glutamate-synthase-PgsB MLLIIACVALILWLGIKEKKRHANRLEKIPLRININGIRGKSTITRMAYSVLREDQYRVIGKTTGTDARMLYWFTEKEYPVIRKPQGANIGEQRDIIRKVVKQKANALVNECMAVNPDYQITFQNDLVKANIGVIVNVMEDHMDVLGPTLKDVAQAFTATIPYNGKLVVMKDDYTSFFAKEAKKRNSELIVVDKDVIPESYLRKFDYLVFPDNVAIVLGIAQAVGVDEETALQGMLNAPADPGAVRIKYFHANRTKNVFVNAFAANEPQSTKAILNKVESYNYPYDKKIIILNCRSDRVDRTQLFVDNFLGEVDYDVLICTGKSTQMVTQFMETMPEKTYINYEGRDFVEIEKGILHEAENALVFCVGNIHGPGGRIAEFIEGIE >NZ_CP022247.1|WP_001832320.1|2343356_2343809_+|poly-gamma-glutamate-biosynthesis-protein-PgsC MIGSELYFSLFVGVVLSLIFAEKFGINPAGLVVPGYLALIFDQPIMLLSVLIISCLTYFIVSNGISKWVILYGRRKFAAMILTGMVIKFIFDLLYPLTPFEMVEVSGIGVVIPGIIANTIQKQGVVITLSTTMLLTCITYIILFLYSFIN >NZ_CP022247.1|WP_002490689.1|2343832_2344906_+|CapA-family-protein MTKKKRLSPSEWLLKQSKRHKRKNTLYTAIVLLVALVLLIFAVNSIKVEPVKSDARDKDSIRLTYLGNVTLNKHIRQTNLNDVFKGIQDTLDHSDFSTGSLIVNDFSKKQKDNINKNIENIMFLRKHNVKSVNLINESMDNIQATAMMRKIDSQAGYNFLTGNGSNPINSKTVQQDIKGKKIANVSFTDIESNYTNSLKNTTSISLDPDIFYPLIKKLKENNDYVVVNVDWGIPNERNVTTRQKEYAHALANAGADVIIGHNTVIQKVENYKRTPIFYSLGNTTSDNFLSKNQKGMIVQQDWKGSHNQFHITPIQSKDGKISKDNMNKMDHIRFKNNIKDKSIDLKSDQNGGYTFEY >NZ_CP022247.1|WP_002447100.1|2344880_2345057_+|hypothetical-protein MEDILLNIKKHWLPIVVVILVVVIFLLVTFARANEGLDNYEQHELNNGEQQYLSKGAS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
426539 : 467468
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022247|426539:467468|DBSCAN-SWA TGTGAATTTTTGGTTACAGGAACAAGCTCAATCAAATGGAAATCGATTGGCGATTGTTACAAATCAGTTATCTTTAACGTACGAAGAATTATATCATCGTGCAAAAACAATCGCGCAATATTTAACTTCTTTAAATCAGAAAAGGATTGGTTTATATATAAGCAATGATATTGATTCAGTTGTTTTGATTCATGCTTGTTGGTTAGCTCATATTGAAATCGCTATGATAAATACACGTTTAACGCGACATGAGATGATAAATCAAATGAATTCGGTCGACATAACAACGATTGTACACACGTTACCTTTAGAATTAGAAGGATTTAATTTATATCATTTTAATGATTTAACACAATTGGATAAATATGATGTTTCAAGTTACAAATTTAATTTAGAATCGATTGCATCAATTATGTTTACGTCTGGAACGACGGGACCTCAAAAAGCTGTGCCTCAAACGTTTAATAATCATTTAGCCAGTGCTATAGGCTGTAAACATAGTTTAGGATTCGAACAAGATACTGTGTGGCTTTCGGTCTTACCTATATATCATATTTCTGGTCTCAGTGTGATTTTACGCGCAGTGATAGAAGGATTCACTGTCAGACTTGTTAAAAAGTTTCAAACTGATGATATGTTAACACAAATAAAGACTTATCCAATCACCCACATGTCTCTTGTTCCACAAACGTTAAAGTGGTTAATGGATGCAGGATTGACTCAACCATTTTCTTTAGAAAAAATTCTGCTAGGTGGTGCTAAATTATCACCACAATTAATTGAGCAAGCATTGACTTATCGTTTACCTGTATATAATTCTTTTGGTATGACAGAAACATGCTCTCAGTTTCTAACAGCCTCACCTCAAATGTTAAATGAACGTTTCGATACTGTTGGAAAACCAAGTGAAAATGTTGAAGTGAAAATAAAAAATCCCAACGCATATGGCCATGGAGAGTTATTAATTAAAGGTGAAAATGTGATGAATGGTTATTTATATCCCAAAGATTTAAAAGACACATTTGATAATGATGGGTATTTTCAAACTGGAGATATAGCTGAAATAGATGATGAGGGTTATGTCATGATATATGATCGGCGCAAAGATTTGATTATAAGTGGCGGAGAGAATATTTACCCTTACCAAATTGAAACAATAGCAAAAGACTTTGAAGGCATTGAAGATGCCGTATGTGTGGGAATATCAGATGATACTTGGGGGCAAGTGCCAATATTATATTATGTGACAAATCAAGATATTAATCGTAATGAATTAATAGAACATTTTGAAAATCATGTAGCTAGATATAAAATTCCTAAAAAATATTATCAGGTAGAATCTTTACCTTATACATCGACAGGTAAATTACAACGTAAAAAGGTCAAAAGTGAAGACTTGAATGAGGGGAAAAATAATGAAAGTTAAGGCAATCAATCTATATACTTATAAGGAACCTTTTAAATCACCAATTTCAACACCGAAAGTGAAGTTAACACATCGAGAAAGTTTGTTTACGGAAATAGTAACTTATAGTGGAGAAATTTATTATGGAGAGTGTAATGCATTTTTAACTCATTGGTATGATAAAGAAACAATACTCACAGTCGCAAATAGATTAAGAAAGTGGATACCACAAGTACTTCATCAAGATATGATATCTTTTGATTCATGGTTACCTTACCTCAATCAAATGAATGATGCGCCAGCTGCTCGATCAATGGTTGTCATGGCTGTTTATCAAATGTATAACGATCTGCATGATTTTGAAGTACAATATGGTGCTACAGTTAGCGGCTTAACTAATAGTCAAATTGAAACATTATTAGAAACAAGACCGAAACGTATTAAACTTAAATGGTCAACATCACTTATCAAAGATCTTGAAACCATACGTTTATTAAATCTTGAGTGTGATATTGCAATAGATGCAAATGAATCATTAACAAAGCCATCATTTTTACAATTAGCCAATGAAAAAACATCAGATATTATATATATTGAAGAACCTTTTAAAATTCTAGAAGATTTAAATGATATTGATATGTCTATTTTTCCTAGAATTGCCATCGATGAAAAGGCACTTTCTATAGAAAAAATACAATCAATAATTCAACAATATCCCATACAAGTCGTCGTGTTAAAACCATTTAGACTTGGAGGAATAGATAGAATTTTAGACGCCATGAAAATTTTGAAAGAAAAAAATATAAGGTTTGTAGTTGGGGGCATGTATGAGTTTGGTCTAAGTAGATATTTTACAGCAATGTTAGCTAAAGAAGGAAATTATCCGGGTGATATAACGCCACACGGTTATTATTTTGCTAATGATATCGTAGAAACAAGTGGCGTATTAAAAGAGGGAATGATTTATTTCACTCCCCCTAAAGTCAAGCGTTCTTTACTTAATAAAGTTTAATGATGATGTGTGGTCTTAGAATTTTTATTCTTTTTTAATGGAACAGGATCAAAGCCACCTTTATGCAATGGATGACATTTAAGTATGCGCCGTACACCGAGATAAAGTCCTTTTAGAGCACCATGGTATTCGATGGCTTCTCTAGTGTATTGTGAACATGTTGGATAAAATCGACATGTTGGGGGTGTAAGTGGCGAAATAAAACGTTGATAAAATACAACTAGAGATAACAATATTTTTTTCAACATTGATAAAGGCCTCCAACTAAATATTTGATAAATATATTTTAACATAGGATGAGAGGAAGTGAGGAACGTGGAGTTTGAGGATAAAGATGGAAGGGTTGTAACATTGAACTATAAAAATGAAAATGATATGCCAAATGGTAATCACGTTCTTGCAATTCCTGTATACAATAGTCAGTTATTATTTACACACCATCAACAACGTGGGATAGAGTTTCCTGGTGGTAAAGTTGAAATAAGCGAACAAAGTAAAGAAGCAGTAATTAGAGAGTTATACGAAGAGACGGGTGCAATCGCAAAATTTATCTACTATTTTGCACAGTATCGTATAAAAACGGAGCATGATGAGCCGTTTATTAAGGATGTTTACTTCGTTGAAGTAAGTCATTTGGAATATGTAGATACCTATTACGAGACTTTAGGCCCTTGTCTTTATCATCATATTAATGATATTCCTTTAAATAAAAGAAGTTTTTTAATCAATGATAAGGCGATTCTTCATTGTTTGGAAAGGGTGAGAGCACTTGGATTTTATTAAGGAAAAGCGCATGCCAATCGAATATGAAACTCATTTTTTTAATGAAGTAACATATATTGTAGATTATTTAAAAGTTAAGGCTCTGATGATGATTCCGAAAAGCAAAAAAGATATCAAACGTATTGTTATATACTTAAGAGGTGGTAAAGGGCAAGTTGGAAGAGTGAGAGCCGCAAGACTTATGCAATTTGCAAATGAACATACCTTAGTTATAGGCCCATACTATAGAGGAAATAATGGAAGTGAAGGAAGAGATGAATTTTACCGTGGTGATTTAAATGATGTAACGCATTTGATTCGACTTTTAAATCAAAACTATCCTTCTGCATTTATACATATGGTAGGATTTTCACGTGGAGGTCTACAGGGATTACTTACTTTTAATGATTTGTCTGTAGATAGTTATATGATTTGGGGTGGCGTATCTGATATACATTTAATGTATGAAGAACGAGTTGATTTGAGAGGAATGTTACGACGAATGGTTGGACATCCAAAAAAAGATACGAAAGCTTATAAGAGCAGAGATGCAATGCAATTTATAAAAAAAGATAGTCCTCCTATTCTCATTATTCATGGTGGCAAAGATATTCAAGTTGGAATACACCAAGCTTATGATTTAGAAAAAAAATTAAAATCCAAAGGAACCTATTATCAAACCTATTATCAATTGGATGAAGGTCATGTACCACGACCTGCTGCGATGAAAGATGTAATTCAATATATACATCAATGGATGAACGACGTCGAAAATAAAAATTTAAGTGCCTGAGCTATTGAAAGTTTTCTCAGGCACAATGCTTTTAAATTTAACATATAAATGTGCATATTAATTATTGATTAAATGCACCTTTGTTGGCAATATGTTCGACTTCCTTGCCGAATTTTTTAAAGTTATTATTAAAGCGTTGAATCAAATCGTAAGCCTGTGCTTTGTAGTTATCTTTATTGTTCCAAGCATTGATAGGATTCAGAATAGTTGTAGGTACATTGTCAATCTGAACTGGAATATTTAAGCCAAATGTATCATCTTTAATATATTTAGTATTTTTTAATTTACCTGATATAGCTTGATCTACCATTTCACGAGTATAGTGTAGACTAATTCTTCGCCCTATACCATATTTGCCACCTGTCCATCCAGTATTTACTAGATATACATCAACATCATGAATATCGATTAAATTTCCAAGTAGATCAGCATACTTTGTTGGATTTAAAGGTAAGAATGGTGCACCAAAGCAAGTTGAAAACGATGGTTGAGGTTCAGTAACACCACGTTCTGTTCCAGCTAGTTTAGACGTAAACCCACTTAAGAAATGATACATTGCTTGATCTTTAGTTAGCTTTGAAATAGGAGGGATAACTCCAAATGCATCAGCGGTTAAGAATATAATCGTATTCGGATGTGCTGCCTTTGAAGGTGTAACAATATTCTCTATATAGTCAATAGGGTAGGCGGCACGAGTGTTTTCAGTATAGGTGTTATCATCAAAATCTACTGTACCGTCATCATTTGTAACTGTATTTTCTAAGATTGTTCCATATTTAATAGCGTTATAAATTTGAGGCTCTTTCTGTTTAGATAAATGAATTGCTTTTGCATAACATCCACCCTCAATATTAAAAACGCCATTTTTATTCCAACCGTGTTCATCGTCACCAATTAACTTACGTTTTGGATCGGCAGAAAGCGTCGTCTTACCAGTTCCTGATAATCCAAAGAATAATGCTACATCTCCTTTTTCTCCAACATTAGCTGAACAATGCATACTCATGATATCCTGCATTGGAAGCAAA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32 | Staphylococcus_phage(96.3%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
579428 : 588581
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022247|579428:588581|DBSCAN-SWA AATGGATAAAAGAATGGTCGATCAAGAATTTCATAATGAAGATACTGACTTGGAATTATCACTAAGACCAACACAATTAAAGCAGTATATAGGTCAATCCTCTATAAAAAGTAATTTAGAAGTCTTTATCAAGGCTGCCAAACTTAGACAAGAGCCTCTCGATCATGTCTTGTTATTTGGTCCTCCAGGACTAGGTAAAACGACTCTATCAAATATCATTGCTAATGAGATGGATGTAAATATTCGTACTATTTCAGGACCATCTTTAGAAAGACCAGGTGACTTAGCAGCGATATTATCTGGGTTACAGCCAGGTGATGTGTTATTTATCGATGAAATTCATAGATTAAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTTCTGTACCCTGCTATGGAGGACTTTTTCTTAGATATCATTATTGGTAAAGGCGATGAAGCAAGAAGCATTCGAATAGATTTGCCGCCTTTTACATTAGTTGGAGCAACGACAAGAGCCGGTAGTTTGACGGGTCCGTTAAGAGATCGTTTTGGTGTGCATCTTAGATTAGAGTACTATAATGAAAATGATTTAAAGGAAATAATCACGCGAACTGCAGAGGTGCTTGGAACGGACATCGATAAGGAAAGTGCTTTAGAATTAGCTCGTCGCTCTAGAGGTACACCTAGGATAGCGAATAGGTTACTAAAACGTGTAAGAGACTTCCAACAAGTAAATGAAGACGATCAGATATATATTGAAACGACTAAACGAGCATTACAATTATTGCAGGTCGATCAACAAGGTTTAGATTACATCGACCATAAAATGATGAATTGTATTATTAATCAATACAACGGTGGTCCTGTTGGATTAGATACAATTGCAGTTTCAATAGGTGAAGAACGAGTGACTATAGAAGATGTATATGAACCTTTCTTAATCCAAAAAGGTTTCTTGGAAAGGACTCCACGCGGGAGAAAAGCAACTGCTTTAGCCTATGAACATTTTAATACTACTAACGAAAAGAGGGAATAAATTGAATATCGAAGATTTCGATTATCATTTGCCAGAGTCTCTCATTGCACAAACACCACTAAAAAACAGAGACCAAAGTAGATTGTTAGTTCTTAGAAAAGACACTGGTGAGATGACACACTTACATTTTAGAGATGTCATCCATTATTTTGAGCCTGGTGATACATTGGTCCTTAACGATACACGTGTTATGCCTGCTAGATTATTTGGCCTAAAAGAAGAAACTGGTGCTAAAGTTGAAATGCTAATGCTCACCCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTTTTACTTAAACCTGCAAAGAGAATTAAAAAAGGTCATCGTCTAAATTTTGGAGATGGTAAAATCGTTGCTGAGTGTATTGAGGAACTTGAACAAGGTGGGCGTATTATGCGTCTACATTATGAGGGTATACTTCAAGAACGCTTAGATGAATTAGGTGAGATGCCATTACCTCCATACATTAAAGAAAGATTAGATGATCCTGATAGGTATCAAACGGTTTATGCTAAAGAGAGTGGATCAGCAGCTGCACCAACAGCAGGTTTACATTTTACTGATGATTTATTAAATAAAATTGAACAAAAAGGGGTTCATATTGCCTTTATTACATTACATGTTGGATTAGGAACCTTTAGACCCGTAAGTGTTGATAATATCGATGATCACGAAATGCATAGTGAGTATTATCAAATGACACAAAAAACGGCTGATTTATTAAATCAAACAAAAGAAAATGGTAAGCGTGTGATATCAGTTGGAACAACATCAACGCGTACATTAGAAACGATACGTCGTGATCATCCTCAATTTGTTGCCACAAGTGGATGGACTGATATCTTTATTTATCCTGGCTTTGAGTTTAAAGCGATAGATGGGTTAATTACTAATTTCCACTTACCCAAGTCTACGTTAGTCATGCTAGTTTCAGCATTTAGCAGTAAAAAATATATTTTAAACGCTTATCATAAAGCTGTTGAAATGGAGTATCGATTCTTTAGCTTTGGAGATGCAATGTTAATTATATAAAAGAATGTGAGGTTTAACATATGCCTGCAGTGACATATGAGCATATAAAAACATGTAAACAATCCGGTGCCAGATTAGGAATTGTACATACACCGCATGGATCTTTTGAAACACCAATGTTTATGCCGGTTGGGACAAAAGCAACAGTTAAAACAATGAGCCCGGAAGAATTAAGAGACATAGAAGCAAAGATTATATTAGGAAACACATATCATTTGTGGTTACAACCAGGAAATGATATTATCAAGCACGCTGGGGGATTACACAAATTCATGAATTGGGACGGTCCAATTTTAACAGATTCTGGTGGTTTCCAAGTATTTAGTTTAAGTAATTTGCGCAAAATTTCTGAAGAAGGTGTAGAATTTAGACACCATACTAATGGCTCAAAGCTATTTTTGAGTCCCGAGAAGTCTATGCAAATACAGAATGATTTAGGTTCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCAATGCCAGCTGAATATGAGTACGTCAAAGATTCAATCGAACGTACAACTCGATGGGCAGCCAGATGTTTAAAAGCACATCAACGCCCTGAAGATCAAGCACTGTTCGGTATTATTCAAGGCGGAGAATACAAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCTAAAGAACTTGTCAGTCTTGATTTTCCAGGGTATGCGATAGGAGGGCTGTCTGTAGGTGAGCCAAAACCTGTTATGTATGACATGGTTGAACATACAGAACAATTTATGCCGAAAGATAAACCTAGATATTTAATGGGAGTAGGTTCTCCTGATGCTTTGATTGAATGTAGCATTAGGGGTATGGATATGTTTGATTGTGTATTGCCTACTAGAATTGCTAGAAATGGTACTTGTATGACATCAAATGGTCGATTAGTTGTTAAAAACGCTAAATATGCAGATGATTTAAGACCACTTGATGAAAAATGTGACTGTTATACATGTCAACATTACACAAGAGCTTATATTAGACATCTAGTTAAAGCGGAAGAGACTTTTGGTATCCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATTAGACAAGCCATTCGAGAAGACCGTCTTTTAGATTTTAAAGATGAATTCTTTGAACAATATGGATTAAATGTAGAAAACCCTAAAAACTTTTAAAGAGGAGTAACTAAAATGGAATTAACTTCATTGATTATACCAATTTTATTATTGGTTGTAATGTATTTCTTATTAATAAGACCACAACAAAAACGTGCAAAAGAACATCGTGCAATGATTAACCGTGTAGAAGCGGGTCAAAGGATTACTACAATCGGTGGTATTAAAGGAACTATTAAAGCTGTAGATGAAACTTCTGTAATCATTACTGTAAATAGTAATGGAACAGAAATGACTTTTGAAAAACCAGCTATAAAACAAGTAGATCCTTCATAAATACAGATTGATACCTAAATGTATGGGATAAATTGCTTATGGAATGTTTTCTTTTTACAGTAATAGAATTTTAGTCTTGAATGAATAAGATAAATACATTTTAACTTCTGTATTGATTATTATAATGTTAAGAATGCCTGGGACAATTTCTGTCTCAGGTTTTTTTAGCATTGTTTAAATAGAAAAATTATTATAAAATTGTTGCATTTTTAGACAATAATTTCACTATTTCTATGAGTATGTTAATATAAGTAAGTCCGTTAAAGTGAACGTAATATCATTTTAACTTGCACGATAATTTATTCATCGAGTATTCTAGATACATAAGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAACGAGTAGAATAATTGCATTCATACTCCTCGTAGCTCTACTATTCACTGGAATGGGTATGACGTATAAGAATGTAGTTAAAAATGTTAATTTAGGTCTAGATTTGCAAGGTGGTTTTGAAGTCCTCTTCCAAGTAGATCCTTTAAATAAAGGAGATAAAATTGATAAAAAAGCACTTCAGGCTACATCTCAAACATTAGAAAATCGTGTAAATGTTCTAGGTGTATCAGAACCGAAAATACAAATCGAAGATCCTAATCGAATTCGTGTACAATTAGCAGGTATAAAGGATCAAGCACAAGCGCGTAAATTATTATCGACACAAGCTAATTTAACAATTAGAGATGCTGAAGATCATGTTTTAATGTCTGGTTCAGACATTAAACAAGGCTCTGCTAAACAAGAATTTAAACAAGAAACTAATCAGCCAACAGTTACATTTAAAGTAAAAAGTAAAGATAAATTTAAGAAAGTAACTGAAAAGATTTCTAAAAAACGTGACAATGTCATGGTAGTTTGGTTAGATTTCGAAAAAGGCGATAGTTACAAGAAAGAAGCTAAAAAGCAACAAGAAGGTAAAAAGCCTAAATTTATATCTGCAGCGAGTGTAGACCAACCTATTAATTCTAGTAGTGTTGAAATTTCAGGTGGGTTCAATGGTAAAAAAGGTGTTGAAGAAGCGAAACAAATAGCCGAGTTATTAAATGCCGGTTCATTACCAGTTGATTTAAAAGAAATTTACTCTAACTCTGTTGGTGCACAATTTGGTCAAGATGCTTTAGATAAGACTATATTTGCATCAATTGTAGGTATAGCATTAATTTATTTATTTATGCTTGGTTTCTATCGTTTGCCTGGTTTAGTTGCAATCATTGCTTTAACCGCTTATATTTATTTAACTTTAGTCGCATTCAATTTCATATCAGGTGTATTAACTCTACCTGGATTGGCGGCATTAGTTTTAGGTGTAGGTATGGCTGTCGATGCCAATATCATTATGTATGAACGTATTAAAGATGAACTAAGAATTGGACGCACGCTTAAACAAGCGTATTCTAAAGCAAATAAAAGTTCATTCTTAACTATATTTGATTCCAATTTAACAACTGTCATTGCTGCGGCTGTGCTTTTCTTCTTTGGAGAAAGTTCAGTCAAAGGCTTCGCAACGATGTTACT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022247|579428:588581|582635_582896_+|WP_002446618.1|DBSCAN-SWA MELTSLIIPILLLVVMYFLLIRPQQKRAKEHRAMINRVEAGQRITTIGGIKGTIKAVDETSVIITVNSNGTEMTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP022247|579428:588581|585770_588044_+|WP_002499833.1|DBSCAN-SWA MIKSKYNWDITQPDTFISESSSDQFKLSPIVKKVLESKNIVDNQEIQNLFKDTNISHDYMLLSDMQKAIDRIKLAIDQNERILVYGDYDADGVTSTTILVSTLRILGAQVGWYIPNRFTEGYGPNELAFKNAYDEGISLIITVDNGIQGHHEISTIQELGVDVIVTDHHEIGETLPDAFAIVHPMHPNFEYPFKYLCGAGVAYKLAQGLIKHPPQHFIALAAIGTIADLVSLTDENRYIVKQGLKILNSHTPSSIKAILNQAGFNDEITEETIGFIIGPRLNAVGRLEDASLAAELLLSDEFEEAEFLAEQVEHFNQERKDIVSKITDEALILAEEQINQGHLFLLLAKEGWHEGVLGIVASKIVETYALPTLILNIDENQNHAKGSARSIEQVSMFDILNDHQQLIDKFGGHHMAAGMTMPIDNIEGLHKELDEWMKELTVTTSLEPSIKVDAQLEETEINIKNIKDIFQLRPFGTDFNSPLFMVRDLIVKSTKGIGQDNKHLKLTLGHSGLTALFWNHGHLASELEASQPIHIIGTLQINEWNGNQTPQFIIKDIAIDQLQILDYRSKRKTIQFKETESNVAYVIHPKLKKSNSHYYHYGEAIDRPYDKIVFRDLPNTMVEIEQTLEHSQISQLYLVLQHEKSIYFEGIPSKSLFKKCYKALINKKETDLIKEGMLLCDYLNIKPEILTFMLKVFKELEFIYDEKGLIKINPAPNKQDIENSRIYQMRQARMEVEERLLYDDFLNIKEWIISKLT >NZ_CP022247|579428:588581|583243_585535_+|WP_002490169.1|DBSCAN-SWA MKKTSRIIAFILLVALLFTGMGMTYKNVVKNVNLGLDLQGGFEVLFQVDPLNKGDKIDKKALQATSQTLENRVNVLGVSEPKIQIEDPNRIRVQLAGIKDQAQARKLLSTQANLTIRDAEDHVLMSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKSKDKFKKVTEKISKKRDNVMVVWLDFEKGDSYKKEAKKQQEGKKPKFISAASVDQPINSSSVEISGGFNGKKGVEEAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTIFASIVGIALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTAYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRGLLSLLVSSNFFKKQYWLFGVKKKNRHDINEGKDVHDLKTSYEKLNFVKLAKPLISLSILIVIIGLIIISIFKLNLGIDFSSGTRADIQSKNAITQAQVEKTVKSAGLEPDQIQINGSGNKNATVQFKKDLSREEDNKLSAKVKSEFGDNPQINTVSPLIGQELAKNAVTALILASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIIAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLHKVKVITHTDQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVVVVVVSILILGAPTIFNFSLALLIGLLSGVFSSIFIAVPLWGMLKKRQFKKTKNNKLIVHKEKKSNDEKILV >NZ_CP022247|579428:588581|588062_588581_+|WP_001832698.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVKDWPSAGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVEYAKEKNIDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYNLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEQLGGIVVGIAFIIELKYLNGIDKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP022247|579428:588581|580395_581460_+|WP_080035765.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNILILLTKRGNKLNIEDFDYHLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLRKDTGEMTHLHFRDVIHYFEPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKKGHRLNFGDGKIVAECIEELEQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDDLLNKIEQKGVHIAFITLHVGLGTFRPVSVDNIDDHEMHSEYYQMTQKTADLLNQTKENGKRVISVGTTSTRTLETIRRDHPQFVATSGWTDIFIYPGFEFKAIDGLITNFHLPKSTLVMLVSAFSSKKYILNAYHKAVEMEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP022247|579428:588581|579428_580433_+|WP_002499834.1|DBSCAN-SWA MDKRMVDQEFHNEDTDLELSLRPTQLKQYIGQSSIKSNLEVFIKAAKLRQEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMDVNIRTISGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNENDLKEIITRTAEVLGTDIDKESALELARRSRGTPRIANRLLKRVRDFQQVNEDDQIYIETTKRALQLLQVDQQGLDYIDHKMMNCIINQYNGGPVGLDTIAVSIGEERVTIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATALAYEHFNTTNEKRE >NZ_CP022247|579428:588581|581480_582620_+|WP_002446619.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRDIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKISEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYEYVKDSIERTTRWAARCLKAHQRPEDQALFGIIQGGEYKDLREQSAKELVSLDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYDMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSNGRLVVKNAKYADDLRPLDEKCDCYTCQHYTRAYIRHLVKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKDEFFEQYGLNVENPKNF |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
926252 : 962637
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP022247|926252:962637|DBSCAN-SWA TATGCAACAAGAACGACAATCGTGGTACCAAAAATCTTGGTTTATTATTCTCACATTGCTATTTATTTTTCCATTAGGTCTCTTTCTAATGTGGAGGTATGCGCATTGGAAAATTTGGTTGAAATTGGTTGTTTCATCAGTCTATACTATTGGTTTAGTTTTAACAGTTTTATTTCAAGTTAGTCTATTAAATGAAAACAAACCAAATCAAACAGAACATGCATCAACTATGAAAGAAAAGTCTGATATAAATAATGTAAAAACAACTAGAAATAAAAATATTGAAAAATCAATACACAAAGACAAACAAAACTCTGTGAACTTAAAGCAAAACACAAAAGATCAAAACAATAACGCAAATGATGAAGTAGCTTCTCCAACTAGCGAACAAAATGCAGCTATAGCACAAGCAAAATCATATGCAAATTCATTACCTATCTCTAAGAAAAGTTTATACAAACAATTAACTTCGGAATACGGAGAGAAATATCCGGCAGACGTAGCACAGTATGCTGTTGACCATATCAGTGTAGATTATAAAAAGAATGCATTGAGATTAGCAAAAAGTTACGTAAAAAATATAAACATTTCTAATCAAGCGTTATATGATCAACTCGTTTCAGAAAATGGAGAAGGATTTACTCCTGAAGAAGCACAATATGCAATGAATCATTTAGATAGGTAATCATTAAGAAAGAGTTTTAACATTAAACATACTAAGATTAGCTATGAAGAAATCTATGACGATAGATTTTTTCATAGCTATTTTTTATAGTTATAGAGAGAAGTAGACTGTCCAGACTCTTGGATTTTAAATCCGTATAAAAAACAAGTCAGCTTTACTCTCGCCTTTTGAAATTCGTTTGTAGTATGTTGGGTTCTTGAAACCGTGTATAGGAAAATGAAATGAGAAAGGTTAAGTAAAGTTTTTAGCTTCTCAATTATTCAAAGGAGGTTTTTTTATCGATTACTTAGGTGTTGATATTAGTAAAAGAAGTAGTGTAGTTGCACATTATAAAAATGGAAAATTCCAAAAAGAGTTTTTCATCCAGAATAATAAAAATGGTTACAATTATTTACTCAAGTATTTGAATGACTTAGACCACCCACAACTCATTTTTGAATCTACAGGTATCTATTCAAGAGGTATGGAACGATTTTGTTGTGTAAATCAAATTAACTATATTCAAATGAATCCGTTAGAAGCCAAATTTAAAACGAGCGCTCTAAGATCATGGAAAACTGATCAGGCAGATGCTCATAAGCTTGCTTGTTTAGGACCGACGCTTAAACAAACAGACAGCTTACCTATACATGAGTTAATATTCTTTGAATTAAGAGAACGCGTCCGTTTTCATCTAGAAATCGAGAATGAACAAAATCGACTTAAATTTCAGATCCTTGAATTACTCCATCAAACATTCCCTGGTTTAGAAAGATTGTTTAGTAGTCGATATTCAATCATTGCACTCAACATCGCAGAAATCTTTACTCATCCAGACATGGTTCTTGATATCGACAAGGAGGTACTGATTACACATATATTCAATTCTACAGATAAGGGAATGTCAATGGATAAAGCTACAAAATATGCACTTCAATTAAGGGTGATTGCTCAAGAAAGCTATCCTAATGTCGATAGACATTCCTTTCTAGTCGAAAAATTACGCTTACTTATTCAACAATTAAAACAATCTATTCATCATCTCAAACAATTAGATGATGCCATGATTCAATTAGCACAACAACTCGATTATTTTGAAAATATTCATTCGATACCTGGTATTGGTAAGCTAAGCACAGCTATGATTATTGGGGAGATTGGTGATATTAAGCGATTTAAATCAAATAAACAACTCAATGCTTTTGTTGGCATTGATATCAAACGATATCAATCAGGTCATACACACTGTAGAGATACCATCAACAAGCGTGGTAATAAAAAAGCGAGAAAACTTTTATTTTGGGTGATTATGAATATAATAAGAGGGCAGCATCATTATGACAATCATGTCGTCGATTATTACTACAAACTAAGAAAGCAGCCTAATGAGAAACCTCATAAGACTGCCATCATTGCTTGTATAAATCGATTATTAAAAACAATTCATTATCTTGTAATGAATCATAAATTGTACGATTATCAAATGTCACCACATTAGCCAAACGTACAATTAAATATAGTTTAACACCTTATTCAAAAAAATTAAAATGAACGGTTTAGTTAAGTAATGCTTATTTTAATTATAAGTACTTGACTAATCGTAGGAAAGAGTCCGGGGCATAAAGTTTTAGTATAAGTAACAAAAGACAATTTCTATTAAAATAATATAGAAATTGTCTTTTTTATAATTTTTTGATTATTTTCAGCTCGTTGAGCTGTTACTTTTTTTATATTAAGTGCCATTAGCACAAATCCTAGTTCTCTTTTGACTTTATTTATCCCTCGAACGGACATTCGAGGGAAACCCAAAATAGCCTTCATAAATCCAAAAACAGGCTCCACATCAATTTTTCTTTGACTGTAGATGGTTTTTGTTTTTGATTCTGAAAGCTTTTTATTAATTTGGGCTTTAAAATATTACAAATTATAATTCTTCATTATTTTTTATTTGCTTTTGAATTGAAGTTCAAACAATGGTGTTTCAGAGGACCCTCTGAACAATCATCACATTCATATAATTTAAAGTCTCGTTTAAAAACATATTTATCATAGCGATAGGCATATCTTTTAAATCCTAGTCTTTTATTGTTCGGACAAATGAATTCATCATTAATTTCGTCATATTTCCAATTTTGAGTATTAAAGATGTAATTGTTATATTTTTCATTTTATGTTTCTTCTTAAGTTTAAAGAATATTACATATTTTAGTTTCATACTTTTAATTGCTTCTCAATTTCCTGTTCTAATGCATCTTGTAAAAATCTATAATCTCTTTGATTTCTTTTGTAATCTTCAGAAATACCAACTTTCAATGTATTAGGATTTTTCTTTTCTACAACTTCTTTTTGTATGCTTTTTAATAAACTAATATGATTGGTGTTTACAGTAATGTCTATCTCTATAACTTTATAAAAAATCTCATTTGAAAAATAGATTTTGTTTACATTCATAAATGCAATAAACTCTCGACAAGCTTTTTTTAATCTATTTATATTTGTTTCAATATTATAATATATTCTATAAATTTCTTCTTTTTCATACTTTCTTCTTTCATTTTCTGGTAGTTTACTTAAAAGTTCCAAATTCAAATCACTATATGAATCTATGTCGTTGTATGTATCTATAAAAGCTTGATTTAATTTATTAACTTTAATATGTGCTTCTTGTAATATAGGTCTTATATATTCTAAATTGTATTTAGCTTTATGAATCTTTTTTTCATTAAAATATCTAATACATTCTTTAATAGAATAAATTATAATCCCTAACGCAATTGTAAAGAAAGAATAATAAATAGATGGTGTTTTATCAAGTATATCTAATAATAAGCATTCTATATGTGTATATAAGTCCATTTAATCACCCCATATTTTATATATTAAAATATTTTTTGAATAGCAGACAAGTATAAATTCTATAATATAATTTAATAGTATTGTCCATCTAAACTATATAAAAAAGAAGCTAAGGCAAAATGCCTTAACTCCTTACCCCTATTAGGTTTTCCCTGAAATTGTTTAGCGCTTAGTATTGCTTAATATACTGTTCTCTTTCCCATTCGGATACTTGAGTTCTATTTTAGCAAATTGGGTATAATAAGGTTTATTAAATTGTTAAATCGCTTTATATCAATGTTTTTACTTTTTATTAATGTATCGTAAATTAATTGTAGTTGCCCATTTAGTTGCCCAATATAATAAATTATTTACACTGGGCAACTAACAAGGCTCTATCCCTTATGTAGCAAAAGATAGAGCCTTGTTTTATTTTTCATCACTTTGTTCTAATTCTACTTGATAATTATATAGCTTTATAACCGTTCTAAATCTAGCGTCTTCAATTGATGTTTTACCATTCTTCAAATCTTGAACGGTTTGATAAGGTACACCGCTACCTTTTGATATTTTATAGCCCGTATCCTTATTTAATAGTCCTCTTATACTTTCAATAATATTACTGATTTCGTCCATTTTTTCCCCCCTTTAATAAATTTATTAATGCTAATGTTGTTAATAATGCGATAATACCTTGACTTATATCATTACCTAAAAACAAGTTTAACCATATCAGTACAATTAAAATAATATAAATTGTTTTCATATCATTTATTAAGTGTTAGAGTATAATTAGACAAGCCCTTTCGGGCTTTGTCTCATTACTTATCGTCTTTTATTAATGTCTTGATTATGGCTAATGTGGACATTATATAAAAGGCGATTTCTGTTATAGTTTTAATATTTTCTAACACTTTTTTGTCCTCCTTTCAACTGGTATAGCTTATTTTATCACGATTAACCGTTATAAACAACCCTTTTTTTTACTTTTTTTATCTTTTTTAATCATAAAAATAAGGTAACTGTTACAACAGTTAACCTCAAATATATTTCGCAAATATAGAAATCTTTTTCTTATATTCTACCAAAAAATAGCCATAACCCGAATAAAGTTATGACTATATAACAAAATTTATATTGTTTTGTTACTCAGAATCCTTCGTTGTAGCTTTTAATATATTAGCAACTATACTTCCTAGTGATAATACTCCGATTATACCAGAGGCCCATGGTTGACCCATTACACCAAGAATCACAGAACCAGCTATACCACATATAGAAATTATTGTGCTACTTATTACACCTAAAATTGTTAATTTATCATTGCTTTTATAATAGTTTTCTTGTTCATTTTTAGTAATTGCAATGCGATTCTCTTGTTCTTTCTCAGCCATTTTTAAAATTCTATCTCCTGCTCCAGGTAATGCCCTTTCATACTCTTTAAACTCTTTTGAGTCGGGAAGCGGTCCTCTTTTAGTTATAGAGAGTTTACGCATAATAA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48 | Staphylococcus_phage(55.0%) | portal,terminase,integrase,capsid,head,plate,transposase,holin,tail | attL 943294:943311|attR 963986:964003 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
1202953 : 1211423
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP022247|1202953:1211423|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP022247|1202953:1211423|1204543_1206028_-|WP_002446152.1|DBSCAN-SWA MSNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNHETLKGERGLGLLTEAIKDEHMSNIKGYPHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEEQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRLIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMENGAYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVITDEGIEVKTYTRQTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKRLAQENPAKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKDIVLVDDSIVRGTTIKRIVKMLKDSGANRIHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKNHIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYHGLCVESFTGDYPAGLYDYEKNYKKHLSERQKSYIANNKHYFDSEGNLHV >NZ_CP022247|1202953:1211423|1206006_1208196_-|WP_002446151.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSNEEIKLEKLYQDMGLSDKEYDKVVEILGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELTVKQNQRLLKGVVSGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGIIDHDMVQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFNKHELDSAVIGEVTDTDRFVLTYDDEVYADIPVQPLADEAPVYILEGEEKEYNTSKNDYSDIDVHDTFIKLLQHPTIASKHHLYEQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTQKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEVLQTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIEDVSYLKEFKPKAGDKIYLVGETRDDFGGSQLEKLLYGSVNHEFESIDLSDEISKGKSIKQAIRNGIASHVQTVGKGGLLVTLAKISAHYDLGMQAQLDVTNAQLFSETQGRYIVIVKEGQTLDIDQAQEIGQLTHQQSFDISNSDVKIKENVSDIKQKWEGAIVQCLTTQD >NZ_CP022247|1202953:1211423|1210940_1211423_-|WP_002446146.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMKESCSMLEEFEIPYEKKVVSAHRTPQMMFNFARQARQNGFDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARMLGITNESVQNNLENYEKYLVAKVEEMQNELQ >NZ_CP022247|1202953:1211423|1203519_1204551_-|WP_002446153.1|DBSCAN-SWA MSKAYEESGVNIQAGYEAVERITSHVERTLRKEVLGGLGGFGATFDLSQLNMKAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPSTIEQIVKGISDGCEQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDIAGFAVGAVEKEDYIDGSNVEEGQAIIGLASNGIHSNGYSLVRKMIKESGVQLHDQFNGQTFLETFLAPTKLYVKPILELKKHVDIKAMSHITGGGFYENIPRALPKGLSAKIDTQSFPTLEVFDWLQKQGNISTNEMYNIFNMGIGYIVIVDKKDVQTTLTTLRAMDTTAYEIGEIIKDDDTPIHLLEVE >NZ_CP022247|1202953:1211423|1209826_1210954_-|WP_002446147.1|DBSCAN-SWA MNFSKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVIVLDPNEDCPCRYVAHQFIHANYDDEQALNQLGENSDVVTYEFENISSEQLKKLTQLYHIPQGYQAIELLQDRLTEKQTLLEANTQIVPFIQIQTNQDLLKAIDKLGFPFIVKTRFGGYDGKGQILIRDDSELDEVYQLVEKQECVAEQYLDIKKEVSLTVTIGNEQQTTYFPLQENEHQNQILFKTVVPARTDKEYEARKEVEKITRAIHFVGTFTVEFFIDKEDNLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAITGQKLPQAIELLKPTVMMNLLGRDLDLLENEFSRHPDWHIHIYGKKERKPDRKMGHMTLLTDDVNQTEQYMLMKFEGRDK >NZ_CP022247|1202953:1211423|1202953_1203520_-|WP_002446154.1|DBSCAN-SWA MTNIAIFASGSGSNFENIVKHIQSGQLSGINVTALYTDNEGVPCIDRAKNLNIPIHINKPKDFSSKSLYEQHLLKLLSSEEVQWIVLAGYMRLIGQDLLQAYEGRILNIHPSLLPKFKGLDAIGQALESGDTVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQQQCDIKPDDTKVQLEDRVKHLEYELYPRVIAKIIK >NZ_CP022247|1202953:1211423|1209121_1209826_-|WP_088922740.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRVFTTNIDGQLRVEYKDEVTAGNGAKKDTMIGKGKLNNQITSIIFDYLTHNHIDNHFIKQLSQTEQLVQQVDIIPLEVVVRNIATGSITKRLGFKKGHKFEEPLVEFFYKKDELNDPLITDDHVKLLGIVNDEEITQLKQMAKDINQVLIQLMNEMSLRLVDFKVEFGKTNSGKILLADEISPDTCRIWDKNTDTNFDKDVYRNNTGSLIEIYQTFLNKLEDLK >NZ_CP022247|1202953:1211423|1208861_1209122_-|WP_002446149.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYEQVNDIRVGKVLYMTVNEPTDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVIDEKEQA >NZ_CP022247|1202953:1211423|1208188_1208860_-|WP_002475236.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKSGVDAAYVDYRETTLDGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIIKEVKRFAKEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNENLKITNNQTPFTHLYMKNENVVYPVAHGEGHYYCTDEIYRELNDNNQIILKYTNNPNGSYEDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETLLGTNSGVKLFESMVKSWREQNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1416104 : 1431720
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP022247|1416104:1431720|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP022247|1416104:1431720|1425305_1425647_-|WP_060554416.1|DBSCAN-SWA MSNLEQNIKQMKNEVIEAELNTKINTVITMIGEHMDSNERFRSHLDAQGKVMESYMLKEYYQNYYVLMAVLNSILKDVNFMNDEITTFYDRALDELDKTKASSENFGEESLNA >NZ_CP022247|1416104:1431720|1426036_1426255_-|WP_032603302.1|DBSCAN-SWA MANLAYPMLYITRKEKGDTQKEVATKLGISPQRYQLKESGKAIFNLNECQILSEMYDMPIDELFSSKIKANS >NZ_CP022247|1416104:1431720|1416104_1416359_-|WP_080392076.1|DBSCAN-SWA MGRRLKHVKENDLAHGEFGKWLERVNITRDYSSKYMRVYEEFNNSNVVSTRHLGVTALNELAQIPEIERTKEHTTSKGAKLVKT >NZ_CP022247|1416104:1431720|1418280_1418754_-|WP_060554431.1|DBSCAN-SWA MKTQKNFIIVENLQKKSDVGMNIDDRAIPITFMDFRNRYKIDKNNLLPIPVTQRNFIKLIWKIFDEEIQIENIEIENNEDLSEKITKNIEQKNKVEIKQNINEIKDNNFEIKKIEVKMKNKTYKINKKGVLTVSYEENDDNIIDVLNDDFIFDAIGV >NZ_CP022247|1416104:1431720|1418902_1419388_-|WP_060554429.1|terminase|DBSCAN-SWA MDKLTPKQERFANEYIKTLNVTQSAIKAGYSPNSAHVTGSRLLRKDKVDEYIKSKKDEIMDDTILSAKELLYLLTQAAIGDETETKEAVVKKGTFEQNPDTGRMNLVYNEHVETVDVPIKPSDRMKARDLLGRYHSLFTEKVDLNVATPVFIDNISEDDEN 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MNNIKNKIIKYITENAGTSFVEIEKIFDENHFEYKGNGAYTSAENNNIIFWYGWNEQAFNVVSSLVNEGLIDMKICEPVIYMVDGKELNLPVLKSYDIDTYHWLPITFSVNKEVAYE >NZ_CP022247|1416104:1431720|1417568_1418279_-|WP_060554433.1|DBSCAN-SWA MKTNFGFEFIKTIASLIFTFLISRFIPEYLKSNEELYTGIILILAFALYFIVKLLFAIIFPIRIDNIIKNNSSPNKQETHIVYSQTKKFEKEIKIQIKITFKYLTKVIFPLLNWLMKDTSVLITIETSEESIYLRGDSYKIMQPYNEHNASIDITNKLEKMLSIKDVKDDNSNVYNIYVRIKNIDPVLINTNIVTNLIFESESKFKKSLLKILTLKKRQKHTEHKIYIYEQEYGNE >NZ_CP022247|1416104:1431720|1427160_1428267_+|WP_060554440.1|integrase|DBSCAN-SWA MEHNLNLSHNIYKDAKRGTYYFRIKYYDKFNQRKEIKKSGFKQRKEALKKCNEIMDELEGVGQINKLPFDKLVDEYIEWYSARRKSSSVKALKTHTNNHLLPYFKSMDVFNMTTQDIMKFQNTKLKEGHSGEYLKKMHVFLVSLLNHAMKFHDLKQNVASLVGNFEIESNKRLNYWTLEQFNQFYEALATQQQKLFFKLLFYSGARKGEIRALTWRDINYDDDFIHINKTDYHGEVTAPKTKAAIRDIYLPVHMMNDIKEYLKWYKENNVYKDDYVLFGTFFKAYSESTIDRWFTAALKVLDEQLPDGQTFPRIVIHELRHSHASMLVNHGASIMVIAQRLGHADSNEVYNRYGHLYPSTQKEIVKYL >NZ_CP022247|1416104:1431720|1426408_1427146_+|WP_032603303.1|DBSCAN-SWA 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MNEIKLEYDTQVSVIWYGTLDSRSFKQFSQPKWSELVNRLSIPQNNTNKYARGVAVYGDMKDDTDENGNEYKKYRKDGNVIYRDVLVLDYDDITKLRLLHDAITETLKGVSWMYHTTFNHRTESPRVRLYIALNEHISADEYRKYTKVLANKIGHPVDEGSFQPSRAMALPVYIKGKYPFLYKYNDAPILDTKTLNQWCDKYREKHKELTKFKYPKRRDNDFWKSIAFGVSTGNRNQTLTSLIGVLLNRRVPDPLVYAYCYMWNENCKPPLSSREFNATFESIYKREHQ |
19 | Staphylococcus_phage(46.15%) | terminase,integrase | attL 1408764:1408778|attR 1432623:1432637 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1444586 : 1450834
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP022247|1444586:1450834|DBSCAN-SWA TATGAAAAGAGTTTCTTATTCAGTAGAAACAAAGTATAAAGCAGTTGAAATGAAAGCAGCAGGATTTTCAACAAAAGAAATTATGAAAGAATTAAATATTAAAAATAGAACACAAGTGAAAACTTGGTGGCGATGGTATCGAAATGGGGAAAGTTATAGATTTTCACAACATGTGGGTAAACAATATACCTACGGTAAAGGATTAGAAGAGCTGTCAGAAGTAGAACAATTAAAATTAGAAAATAAGAGAAAAGATATAGAATTGGATATTTTAAAAAAGTACAAGGCATTGGAAAGGAAGTGGTACCAACAGTAGTCATAGATTTAGTGGATCAATTAAAAGTAAAATATTCAATCAAATTGATACTAGAAGTATTAAACATACCTAAATCAACATATTACCGATGGAAAAACAAAACTCATAAAGATGATGCCGTAACACAAAAAGTCATTGAATTATGTAAAGCTAACCACTATACCTACGGTTATCGCAAGATTACAACATTGATTAATCAATGTTATACATCACCAATTAATCATAAGAGAGTACAGAGAATGATGCAGAAGCATCATTTGAACTGCCGAGTTAGAACGAAAAAGACGACAAGAATAGGTAAACCGTATTATAAAACGGACAATTTATTACAAAGACAATTTAAAGCGAGTTGTCCAATGGAAGTATTAACAACCGATATTACTTATTTACCATTTGGCCATTCTATGTTGTATTTATCTTCGATAATGGATATTTATAACGGAGAAATTGTGGCGTATAAAATAGATGATAAACAAGACCAAAGTTTAGTTAATGATACATTAAATCAAATCGATATACCTGAGGGTTGTATATTACATAGTGATCAAGGCAGCGTTTATACATCTTATGCTTATTATCAATTGTGCGAAGAAAAAGGCATTATCAGAAGTATGTCCCGAAAGGGAACACCTGCCGATAACGCCCCGATAGAAAGTTTCCATTCCTCGCTAAAGTCTGAAACTTTTTACATCAATAATGAGCTTAATCGCTCTAATCATATTGTAATAGATATTGTCGAAAAGTACATTAAAAACTATAATAATAATCGAATTCAACAAAAACTAGGCTACTTAGCCCCTGTAAAATACAGAGAATTAATAGCCTAGAACATGGTGTTTTTATTAAGTTCCCGTTTTAAGGGTTCAGTGCCAATATACATTTTCGTCTACTAGGGTTTTGTGTATTAATCAATAATAATGAAACGTTTATTTTATTATTTTTCTGGCTCCATTACTTCATCAATTAATCCATATTCTTTAGCTTCTGCAGCTGTTAAGAAGTTGTCGCGATCAGTATCTTGTTGAATTTTTTCAATAGATTGACCTGTACGTTCTGATAAAATACGATTTAATTTTTCACGTGTTTTTAAAATATGATTTGCTGCAATCTCAATTTCAGTTGCTTGTCCTTGTGCACCACCTAAAGGTTGGTGAATCATAACTTCAGCATTAGGTAGTGCAAATCGTTTACCTTTTGCACCTGCTGCTAACAAGAATGAACCCATAGACGCTGCCATACCAATACAGATTGTTTGTACGTCTGGTTTGATATGCTGGATAGTATCATAAATAGCAAATCCAGCAGTTACACTGCCACCTGGTGAATTAATATATAAATAAATATCCTTTTCAGAATCTTGCGCTTGCAAGAATAATAATTGTGACACAATAGAGTTAGCTACGTTATCATCAATTTGAGAACCTAGCATGATAATACGGTCTTTCAATAAACGTGAATATATATCATACGCACGTTCACCGCGGTTAGTTGTTTCAATAACTGTAGGAATTAAATTCATTTATTTTTCCTCCTTATAATAACTGTTAAAATTATTTTACCTTAAAAGTCAAAAATGGTCAAAGATTAAGCTTATTAATCAAAAATTCAATTTGACGCTTAACCTTTTCATTTGTAAACTAGAATTATCGTTTTTATTGTACCGTCCTTATTGAACGACGTACAGAAATGTGATTATTTCACTATTTACCCCTCGTAGTGTAATGGATAACACATAAGATTCCGGTTCTTAAAATAGAGGTTCGATTCCTCTCGAGGGGGTTGCTTAATAATGTTGAGATTTTAATGTCTGAGATTATTTGTAATCTCAGTCTTAAAATCTCATTTTTTATAATTCAATTTGTTCACCATTTCTTATTTTATCCGCTAATTCATTCAACTTTCTTAAACGGTGATTCATACCTGATTTAGATATAGGCCCTGTAGAAACCATCTCACCCAATTCTTTTAAAGATATTTCTTGATGTTCTACTCTGAGCTTCGCTACTTCTCTCAAACGATCAGGTAAATTTTCAAGCCCAATCTCTTCATCAATTAATTGTATACTTTCTACCTGTTTCATTGCTGCGCTAACAGTTTTATTAAGATTTGCTGTTTCACAATTTACGAGACGGTTAACCGAATTACGCATATCACGGACAATTCTTACATCTTCAAACTTTAGTAATGCTTGATAGCCACCTATCAAACTAAGAAAGTCGGAAATTTTTTCAGCTTCTTTAAGATACGCAATACTCCCTTTTTTACGTTCTAAATGTTTCGCATTGAGTTCATAACTATTCATCAATTTAGTAAGACCTTCGGAATGATCTTCATATTGTGAAAAAATTTCGAGATGATATGAAGACGTTTCAGGGTTATTTACAGAACCACCTGCTAAGAAAGCCCCTCTTAAATAACTTCTTTTCATTTCATCATCTTTGATCATATCCGGATCAATATCGTGAGTAAAAACTCCCTCTTTTAAAATACCTAAATCATTTAGTATTTCTTTCGCTAACATCTTTGTTCGACATATATAAATATTGTTTTTTTTCAATTTCATCTTTTTTCTAACTAAAATTTCAACTTCAACATTAAATATACGTTTGATAAGAGAATATATTCGACGAGCTGTTGTTGCATTTTCTGTCTGTACATTAATTACAAACTGTTGATTTGATAGACTAAGTGCGCCATTCATGCGAATTAATGCACTGAGCTCTGCTTTAGCATTCGATTCGTCAACTTCTATGCGTGTTAGTTCATTTTTCATATCTGATGCAAAGCTCATTGAACACTCATCCTTCCTAATCCTTTTTTTCTATTCTTATTTATAGTATCGCCAATGAGGTGTAAAGTTATTTTCTAATTCTAAACAAACACTTAAGTTATCATATCATAAACTACGATTTCGCTTATAATTATTTCTTTTTATCACTAGGAGTAAAGCGAATTGTACTTGTTAAATCTAAGGCAAGTTCATAAATCATTTTTGATAATACTTTTGTGTTATGTCTGACATAGTGTTCATTAGATATTTCAACTAAATTAGACGCCGTTAAAACTCTAATTCCACTATCTTTTAATTGTTCTTTATGTACTGCTACTGGTTTTGAATTCTTTTCTTCATATCGTTGTAAAACATCTTTACTATAGGATTCAGAGCTACATATGACAAAATCAATAAATGGTTCACCAACTTGTCGAGTAAGTGCATCAATATGCTCTTTAACATCATAATTATCTGTCTCGCCTGGTTGTGTCATAACATTAGATACATAAAGTTTTGGGGCAGAGGTACGTAATAATGCTTCTGAAATGCCTTTGACACATAAATTTGATATAACACTTGTATATAATGAACCTGGTCCTAAGACGATTAAATCTGCTTGTTCTAAAGCTTCTACCGCTTCATTCATTGGTTCAACATCACTTGGCTCTAAAAACACACGATTTATTTTTTTATGTGTTTTAGGTATATTGGTTTCTCCATGTACAATTTCACCGTCTTCCATCACCGCGTTGAGTTGCACACTTGTGTTTGTTGAAGGGATGACTTGGCCTTTAATATTTAAAACTTTACTTAATTCTTTAATAGCGTGCCCAAAGTCATTGGTAATGTTAGTCATTCCAGCAATAACTAAATTACCTAATGAATGTCCATCTACTTGATTTTCACCAAAACGGTACTGGAACAATTGAGTTAATATCGATTCCGAGTCACTTAAAGCAGCAATGACATTACGAATATCACCAGGCGCTGGAATATCCATGACATCTCTGATTTTCCCCGTGCTCCCACCATTGTCCGCTACAGTAACAATGGCAGTAATGTCTATTGGAAATTCTCTAAGGCCTCTAGCAAGGACAGAAAGTCCAGTGCCACCACCAATAAGTACTACATTCATTTGTTTCATTATCTCTCTCCACTTTCAATATGCGCATCTCTATGATGCACATAAACATTATATTCAAAAATCTCGTTAAGATATTCAGCTAAACGTTTAGCTAATGCAACTGATCGATGTTGTCCACCCGTACAACCTATAGCAATAACCAATTGCGATTTACCTTCTTTTTTGTAGCCAGGAATCATATATTTTAGTAAATCTGTTAATTTATCAAAAAATATTTGGGTTTCTTTCCACTTCATAACGTAATTGTACACTGGCTCATCTAAACCAGTAAATGGACGCAATTCCTCTACATAGTAAGGATTAGGTAGAAATCTGACATCAAAAACTAAATCAGCATCCATTTGTATACCATGCTTGAAACCAAAACTTGTCACGTTGATAGTAAATGTTTCAAAGTTTTCATCTAAATAAAACTTTGAAATGCGTTGCTTTAATTCTTTAGGTTTTAATTTTGTTGTATCAATTACGTAATTAGCGATACTTCGGATTTCTGATAGATGTTCACGTTCCTCATTTATTGCATCTATTAATGATCTTTGTCCTTGTTCATTTAGTGGGTGCGCTCTTCTTGATTCTTTATAACGCGAAATAATTTTTTCAGTTTTAGCTTCCAAAAACATAACATCTAAAATCACGTCATTGCGACTTTTAATAATATCAATTTCTTTAACTAGAGATTTAAATAATTCCTTACCTCTTAAATCTATTGCAATTGCTACTTTTTGCAATGAAGGATTTCCTTGAGCCATCAATTCTACAAATTTAGGTAACAGTACAGGTGGTAAATTATCTACACAGAAAAAGCCCATATCTTCGAGACTTTGAATCACCAATGATTTACCCGCTCCAGACATACCTGTAACAACTAACAATTCACTTTTACCCATTTCTTTTTCGTTGCTTGCCATTTTCTTAAGTCACCGCCAATTATAATCTTCAATCAATATCATTATATTAAATTCATCTTATCACACTCAAATATGCAAAGTAACATACTTATATTGTAATTAAAAAAGCTAGAATCATTGATGACGATACTTTGACGCAAACAATGTTCTAGCTATGTGTAAAATGAGTTAAATTTTAATTATCTTTTAATTCTGTAATATAATCAGCTGCACTTTGCGCCGCAATACTACCGTCTCCTGTAGCAGTAACAATTTGACGTAATCCTTTATCACGAACGTCACCTGCAGCAAAAATACCTCGTACTTTAGTACTCATGTCATCTTGTGTGACAATGTATCCTGCGTCATTTGTAATACCAAGATTTTCGAATGGCGCTGTGAGTGGTTTCATTCCAATATAAATGAATACACCATCGGCATCATAAGTTTGTTCAGCACCATCTTTAGTTGATTCAAGTGTAACTGAACCAACTTTACCATCTTTTTCATTAATTGTTTTAAGTGTATGACTCCAAATAAAGTCAACCTTATCATTTTTGAAAGCACGTTCTTGCAAGATGTTTTGTGCACGTAATTCATCTCTACGATGAACAATCGTTACTTTATCTGCAAATTTAGTTAAGAAAGTTCCTTCTTCTACCGCTGAATCTCCACCGCCAATTACGAAAAGACGTTTATTTTTAAAGAATGCTCCATCACAAACCGCACAATAACTTACTCCACGTCCTCCTAATTCTTGTTCACCAGGAACGCCAATCTTTTTATACTCTGCTCCAGTTGAGATAATAACTGCATGAGCTGTTACTTCTTTATTCCCTAAATTGATAACTTTATAGTCACCTTTATCTTCAACAGATTTAATATCGCCATATTGGTATTCCGCACCAAATTTTTTTGCATGTTCAAACATTTTCGTAGATAAATCAGGGCCTGTGATCATCTCAAATCCTGGAAAATTCTCTACTTCTTCAGTGTTTGCCATTTGACCGCCTGGCATACCGCGTTCAATCATGACAGTTTTTAAATTGGCACGTGATGCATATACTGCTGCTGTCATGCCGGCAGGACCTGCACCGATTATTGCTACGTCAAAATCTACTTCAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP022247|1444586:1450834|1444586_1445727_+|WP_088922760.1|transposase|DBSCAN-SWA MKRVSYSVETKYKAVEMKAAGFSTKEIMKELNIKNRTQVKTWWRWYRNGESYRFSQHVGKQYTYGKGLEELSEVEQLKLENKRKDIELDIFKKVQGIGKEVVPTVVIDLVDQLKVKYSIKLILEVLNIPKSTYYRWKNKTHKDDAVTQKVIELCKANHYTYGYRKITTLINQCYTSPINHKRVQRMMQKHHLNCRVRTKKTTRIGKPYYKTDNLLQRQFKASCPMEVLTTDITYLPFGHSMLYLSSIMDIYNGEIVAYKIDDKQDQSLVNDTLNQIDIPEGCILHSDQGSVYTSYAYYQLCEEKGIIRSMSRKGTPADNAPIESFHSSLKSETFYINNELNRSNHIVIDIVEKYIKNYNNNRIQQKLGYLAPVKYRELIA >NZ_CP022247|1444586:1450834|1449901_1450834_-|WP_002457584.1|DBSCAN-SWA MTEVDFDVAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGMPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAEYQYGDIKSVEDKGDYKVINLGNKEVTAHAVIISTGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQNILQERAFKNDKVDFIWSHTLKTINEKDGKVGSVTLESTKDGAEQTYDADGVFIYIGMKPLTAPFENLGITNDAGYIVTQDDMSTKVRGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAADYITELKDN >NZ_CP022247|1444586:1450834|1448817_1449726_-|WP_002457583.1|DBSCAN-SWA MASNEKEMGKSELLVVTGMSGAGKSLVIQSLEDMGFFCVDNLPPVLLPKFVELMAQGNPSLQKVAIAIDLRGKELFKSLVKEIDIIKSRNDVILDVMFLEAKTEKIISRYKESRRAHPLNEQGQRSLIDAINEEREHLSEIRSIANYVIDTTKLKPKELKQRISKFYLDENFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVEELRPFTGLDEPVYNYVMKWKETQIFFDKLTDLLKYMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAKRLAEYLNEIFEYNVYVHHRDAHIESGER >NZ_CP022247|1444586:1450834|1447822_1448818_-|WP_002499912.1|DBSCAN-SWA MKQMNVVLIGGGTGLSVLARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDVMDIPAPGDIRNVIAALSDSESILTQLFQYRFGENQVDGHSLGNLVIAGMTNITNDFGHAIKELSKVLNIKGQVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVHGETNIPKTHKKINRVFLEPSDVEPMNEAVEALEQADLIVLGPGSLYTSVISNLCVKGISEALLRTSAPKLYVSNVMTQPGETDNYDVKEHIDALTRQVGEPFIDFVICSSESYSKDVLQRYEEKNSKPVAVHKEQLKDSGIRVLTASNLVEISNEHYVRHNTKVLSKMIYELALDLTSTIRFTPSDKKK >NZ_CP022247|1444586:1450834|1446747_1447692_-|WP_002445957.1|DBSCAN-SWA MSFASDMKNELTRIEVDESNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRIFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMLAKEILNDLGILKEGVFTHDIDPDMIKDDEMKRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQYEDHSEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSIAYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIQLIDEEIGLENLPDRLREVAKLRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGMNHRLRKLNELADKIRNGEQIEL >NZ_CP022247|1444586:1450834|1445835_1446420_-|WP_001829659.1|DBSCAN-SWA MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQQDTDRDNFLTAAEAKEYGLIDEVMEPEK |
6 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1482989 : 1493425
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP022247|1482989:1493425|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP022247|1482989:1493425|1485942_1486911_-|WP_002445923.1|DBSCAN-SWA MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTDSEKNTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKSDKIVENYHKLWGKEASIYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQSLRNELSESEKQKADQEMYKLLNELYDNEVSYTHLLYDDIGLADDVLNYVRYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTSTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEPLRDEDFVFDN >NZ_CP022247|1482989:1493425|1485746_1485968_-|WP_002445924.1|DBSCAN-SWA MKTLFLIISIVLLKRFLLKLVGISFFMKVGIIKYSDELLLLDKTFIKFLKKYEKLLKKENRVYNIDVNDNHYH >NZ_CP022247|1482989:1493425|1487029_1489135_-|WP_002495827.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRKDNGFFNLEKDQEALKVYLEEIHDKMISFDDEIERLHYLVDNNFYFNVFEKYSEAELSEITEYAKSIHFQFASYMSASKFYKDYALKTNDKTKFLEDYNQHVAIVALYLANGNVKQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEIDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKALEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNIEKKKKDAREMLNMIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSVINDYGTEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVFTGMDALTVVSDEANIQNAPGVKKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMIMNYYSIERSMEIAKERGEKYQDFEQSDYANGKYFEFYTSQEFEPKFEKVRQLFDGIDIPTSNDWKELQNKVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLVATIQTHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHHKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >NZ_CP022247|1482989:1493425|1489097_1489496_-|WP_001829589.1|DBSCAN-SWA MKVVYYSFSGNVRRFISRAGIKDTFEITQDNCNESVNEPYILVTGTIGFGEVPQPVQSFLNVNHTQLQAVAASGNRNWGQNFAKAGHTISEEYKVPLMMKFEVQGTNKDIIEFKDKVGNFNENHGRKEIQSY >NZ_CP022247|1482989:1493425|1484708_1485683_-|WP_038812497.1|DBSCAN-SWA MKFIFKGYTLFILLVILTIVSLFIGVSQLSLIDIFHLSDEQMNILYSSRIPRTVSILLSGSSLALSGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILLSLLFFPNGHILIKLLFAVVLSIVGSFLFVQLINLIRAKDVIFVPLLGIMIGGILSSFTTFVALRTNALQSIGNWLTGNFAVITSGRFEVLYLTIPLLILAFVFANHFTIAGMGKDFSHNLGVSYEKIIKIALFITATLTALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISIYRGDHLKNALPHTLMLGAIFVLIADIIGRIIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYANEH >NZ_CP022247|1482989:1493425|1490248_1491124_+|WP_002445920.1|DBSCAN-SWA MILNPKVKGIIAILISAVGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNFVAMFIPLFFIYKYRQPMFGKLSSQPLLISRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADTLMKLNPFWTIVLSLIFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSVIPSIAGLLSGIFAASAYTCVRALSTREKPYTIVFYFSLFSVVVLIPFSIFTYTPMTTIQILFLLGAGLSAAVGQIGITLAYSFAPAKDISIFTYASIIFTALFGFILFGESPDMLATVGYIVIIGASYYMFDKARRETTLNQNN >NZ_CP022247|1482989:1493425|1482989_1483769_-|WP_001829596.1|DBSCAN-SWA MIQIRNLDKTIDNKPILKDISVDIKKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAISRLFSYENGSILIEDKEISEYKTDDLAKKLSILKQSNHTDMNITIEQLVKFGRFPYSKGRMKQEDYDKVEYALDLLQLNEIKHRNIKTLSGGQRQRAYIAMTIAQDTDYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRDLCRQLNKTIIIVLHDINFASCYSDDIIALKQGELVKADDKDNVIQSDILKSLYEMEVRIEEIRGQRICLYYDETTFDSV >NZ_CP022247|1482989:1493425|1491919_1493425_+|WP_002445918.1|DBSCAN-SWA MTSNKSHEQEVQEIPQHGFFGHPKGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLIFYMYFALQENGLGMDKTTAMSIMSVYGSLIYMSSIPGGWIADRITGTRGATLIGAILIIIGHICLSLPFAMVGLFTSMFFIIVGSGLMKPNISNIVGRLYPENDVRMDAGFVIFYMSVNMGALVSPIILQHYIDIRNFHGGFLIAAIGMALGLVWYLLFNRKTLGSIGMKPTNPLSSSEKKKYGTIIGIVVIAIVLILMIAYFTHTLSFNLISNTVLILGIALPIIYFTTMIRSKEVTDTERSRVKAFIPLFILGMLFWSIQEQGSNVLNIYGIENSDMKLNLFGWKTHFGEAIFQTINPLFILLFAPVVTLLWQKLGKKQPSLPIKFAIGTILAGASYILMGAIGHIYGDTQFSVNWVILSYVICVIGELCLSPTGSSAAVKLAPKAFNAQMMSLWLLTNASAQAINGTLVKLIKPLGQTNYFIFLGVVATVITLIILAFIPKISKAMKGIR >NZ_CP022247|1482989:1493425|1483765_1484725_-|WP_088922766.1|DBSCAN-SWA MQMSTSKKISILVVIAICMSIFYLLVGLDFDIFEYQFQSRFKKFILILLVGAAIGTSVVIFQSITINRLLTPSIMGLDSVYLFVKVLPIFILGEQATVVTNIYLNFLITLIAMVFFSLLLFQVIFKLGHFSVYFILLVGVILGTFFRSITSFLQLIMNPESFLAVQNVMFASFEASNSKLVTVSGILLVILIIVTIILRPYLDVLLLGRAQAINLGVSYENMTRMFLILVALLVSISTALIGPVTFLGLLTVNLAHEFMKTYEHKFILPATILFSWISLFIAQWVVENLFEATTEFSLIVDLVGGSYFIYLLVKRRNAN >NZ_CP022247|1482989:1493425|1491137_1491638_+|WP_002445919.1|DBSCAN-SWA MTQGRQKDELKDITLLGNQNNTYEFDYRPEVLETFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLINLMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNTKYEKIAEHRLMNHDMYPEKIDNR |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1830572 : 1843671
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP022247|1830572:1843671|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP022247|1830572:1843671|1831696_1831885_-|WP_002447709.1|DBSCAN-SWA MDKVNYFLKALVLAFMIRCTMNYLLPSPEKLLFRFLDGLTFGVLTVFLINWIIGIFKKYSQK >NZ_CP022247|1830572:1843671|1840553_1840844_-|WP_002497054.1|DBSCAN-SWA MNWETKSLIEDVDIIKRKINDAVTTFCWFDDEYFTYDSGHQLTKDEILKHGASYHEHRCYITQHIDLLNMYLKELDTVLKDIENASLSTDQSESNA >NZ_CP022247|1830572:1843671|1832880_1833411_+|WP_088922785.1|DBSCAN-SWA MIDFEEKSKNNLEKLISVRRFILMIILTYFICSKYEKIIVNNLLTSHEIKVSFFAGNVATTLTILGIIINVLLVSLYELLLIFIDDSNKKGLILFFKIICALLLIRVYNEYLGLLNLSFFNALDKNIPLLFDYKFIYISFGIVYLLLLLIHLTDYLKSLKIFWKNFWKNLILFLKH >NZ_CP022247|1830572:1843671|1839587_1840460_-|WP_032605633.1|DBSCAN-SWA MEFHKVKLNNDFKIQIVQYKNLYSNSCNGSGLCEWSKWLDKLQIPRINSDKYIRGLCVYGDFEDVEKDNQTISKYRSDQTLINRTAITLDYDEIKDFRGLYEVLKTKLEHISWVFHTTYSYTVEKPRIRLIVPLNEPVSASDYRKYSNGLARYIGYTVDEASFVPSQAMALPVKKSKDSIYIFKYNDAPAISTEELNKMVVKNEAITVNYSNQLKKHDSAYWREIAFGVGKGERNQTLASLTGYLLRRYVDANLVYGLVSAWAMTCRPPIEQKEVNRTFKSILKKDSKNK 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21 | Staphylococcus_phage(86.67%) | terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2413662 : 2433599
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP022247|2413662:2433599|DBSCAN-SWA 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17 | Bacillus_phage(20.0%) | protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 18849
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022250|0:18849|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022250|0:18849|5905_6484_-|WP_001829991.1|DBSCAN-SWA MKIGYARVSTGLQNLNLQEDRLNQYGCEKIFSDHISGSRSKRPGLDKAIEFARSGDTIVVWRLDRLGRNMEDLITLVNELNNRGVSFHSLEENITMDKSSSTGQLLFHLFAAFAEFERNLILERSSAGRMAARARGRYGGRPEKLNKQDLTLLKTLYDNGTPIKTIAEQWKVSRTTIYRYLNKLNNQENKDK >NZ_CP022250|0:18849|8981_9827_+|WP_000733268.1|DBSCAN-SWA MKKLIFLIAIALVLSACNSNSPHAKELNDLEKKYNAHIGVYALDTKSGKEVKFNSDKRFAYASTSKAINSAILLEQVPYNKLNKKIHINKDDIVAYSPILEKYVGKDITLKELIEASMTYSDNTANNKIIKEIGGIKKVKQRLKGLGDKVTNPVRYEIELNYYSPKSKKDTSTPAAFGKTLNKLIANGKLSKENKKFLLDLMLNNKSGDTLIKDGVSKDCKVADKSGQAITYASRNDVAFVYPKGQSEPIVLVIFTNKDNKSDKPNDKLISETAKSVMKEF >NZ_CP022250|0:18849|1710_1833_-|WP_001807343.1|DBSCAN-SWA MAPYTNKGYAVKELCSYLQINMDDVYTIGDRKLIYLCLIP >NZ_CP022250|0:18849|2673_4218_-|WP_000622776.1|DBSCAN-SWA 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17 | uncultured_virus(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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