Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP022360 | Shewanella bicestrii strain JAB-1 plasmid pSHE-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP022358 | Shewanella bicestrii strain JAB-1 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,csa3,cas4,WYL,DinG,DEDDh,csx1,RT | 0 | 0 | 6 | 0 |
NZ_CP022359 | Shewanella bicestrii strain JAB-1 plasmid pSHE-CTX-M, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP022358_1 | 3225938-3226023 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP022358_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP022358_1
>1.1|3225963|36|NZ_CP022358|CRISPRCasFinder AATCCTAGAGCCACGCAGTGGCGTTCTAGAGGCCGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP022358_1
The CRISPR arrays of NZ_CP022358_1 >merge|NZ_CP022358|1|3225938-3226023|CRISPRCasFinder AGGCCGTCCTAGATTCAAGGGCCTAAATCCTAGAGCCACGCAGTGGCGTTCTAGAGGCCGAAGGCCGTCCTAGATTCTAGGGCCTA >NZ_CP022358|1|1|3225938-3226023|CRISPRCasFinder AGGCCGTCCTAGATTCAAGGGCCTA AATCCTAGAGCCACGCAGTGGCGTTCTAGAGGCCGA AGGCCGTCCTAGATTCTAGGGCCTA
>NZ_CP022358.1|WP_086904803.1|3225516_3225894_-|four-helix-bundle-protein MRFEQLDVWKRACRLSCDVYKELKNCRDYGLRDQMTRAAVSIPSNIAEGEERESTAESARFLYFAKGSSGELITQIYIAIEIGVIDKQNGMTLIKEAKEISAMIASLIKIRKGSVREESADYKST >NZ_CP022358.1|WP_089068177.1|3224439_3225405_-|LPS-O-antigen-length-regulator MNTQITQNPNTYQSDARFPQVQDDEIDLRELFSVIWRGKWIILAITAVFTIGAVIFAIKQPNIYKSEALLAPASEEQGGGLSALASQFGGLASLAGVNLGSKGGTDKTELAIEVLKSRQFTSEFIQKHNILTDLMAAEKWDRDADKLIYDPELYNEQTNTWVREVKAPFKPEPSMQEAYKVFSKMIVVNKAKDTGMVTLSVEHLSPTVAQQWVTWLIQDINKVMKERDVAEAHRSTEFLNKQIALTNVADIKTVLYKLIEEQAKTIMFAEVRDEYVFKTIDPALAPEEKAKPKRALICVLGTILGGMLGMMLVLVRHFIRK >NZ_CP022358.1|WP_089068176.1|3223274_3224345_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase MKILVTGGAGFIGSAVVRHIISNTHDSVINLDKLTYAGNLESLVSVAASERYAFEQVDICDRVELDRVFAKHQPDAVMHLAAESHVDRSITGPADFIQTNIVGTYTLLEAARHYWMQLDAERKAVFRFHHISTDEVYGDLLHPDEVAADSELLLFTESTPYAPSSPYSASKASSDHLVRAWSRTYGLPTIVTNCSNNYGPYHFPEKLIPLVILNALEGKPLPIYGKGDQIRDWLYVEDHARALYKVVTEGKIGETYNIGGHNEKRNLEVVQTICSILDSLVPQNTPYSEQITYVADRPGHDRRYAIDASKMNAELDWQPQETFETGLRKTVEWYLANQEWCKHVQDGTYQRERLGI >NZ_CP022358.1|WP_089068175.1|3222321_3223197_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA MKGIILAGGSGTRLYPITKGVSKQLLPVYDKPMIYYPISVLMLAGIRDILIITTPEDQSSFQRLLGDGSEFGISLQYAVQATPDGLAQAFIIGEEFIGNDNVCLALGDNIFWGQGFSPILKKAAARPTGASVFGYQVKDPERFGVVEFDQDLKAISIEEKPQKPKSNFAVTGLYFYDNRVVNIAKNVKPSERGELEITSINQAYLEMGELNVELLGRGFAWLDTGTYESLLEAASFVETIEKRQGYKIACLEEIAWRNKWLSNEQILKVANEMSKNSYGHYLSTLFKSTVR >NZ_CP022358.1|WP_089068174.1|3222064_3222283_-|acyl-carrier-protein MSNETKLMEIIAEILEVDIGELTFNTELNEDLWDSLAVVTFISEVDSNFEKIISPAEVSAAKTVADLLSLVK >NZ_CP022358.1|WP_089068173.1|3221037_3222048_-|ketoacyl-ACP-synthase-III MLAIKNISIKGISCTVPSRKVKNIDLSNVYGNKETLKLVSSIGVETRHVVDSMTTASDLCLSSAFKLIHSLNWSPKDIGALIFVSQTSDYQLPATACVLQNKLGLSSSALAFDINLGCSGYIYGLQVAASLVNSGINKILLLVGDTISKIVKPGDRSTELLFGDAGSATALQYEESNDVIYFELGSDGAGWESIVSREQIKSDAIRGANNAYLEMNGGEVFTFTLKTVPSLVNNFLKDLNVEAKDIDLCVYHQANHFMLKHLSKKSNFNHDQVPISIDEFGNTSCASIPLTLCARERDNYKKTLLVGFGVGLSWGVVMCDLSRTLLLPVEVMPYGE >NZ_CP022358.1|WP_089068172.1|3220289_3221048_-|SDR-family-oxidoreductase MVNNLLLNKIILVTGASSGIGREVSKYFSSQGAKLVISGRSKERLTQTLNLLSGDGHYAIPADLCSENEIKNFMDQVFEVAGPLDGLVHCAGIMKTLPLQALKEIDFDDCFNINVKSAQFLVKNFRRRGKFNPLNSSVVFLSSVAASCGEPANTTYAASKAALEGLSKSLAMELAKSNIRVNCLAPGLVETEMMMDFSKQLTEAQLNKVVNKHPLGLGKPEDVAYSAAFLSSDLSKWITGTTLFVDGGYSAQ >NZ_CP022358.1|WP_089068171.1|3219262_3220312_-|ketoacyl-ACP-synthase-III MVVIVHNEKKSIKAYILGVSSYLPKNVLSNEQLSSDFPEWSVDKIYEKTGIRTRYIASTDETCSSMAINAAKNLFKKYNLNATQVDYVLLCTQSPDYVLPTTACIVQNELGIPTTAGALDFNLGCSGYVYGLSMAKALIESKQAKNVLLLTSELYSRYINVNDKSVRTLFGDAATATLIQGKLADRDFIHSVKFGTDGKGAINLIVPHGGSKYPISSQSFIESVDSSGNKRSLCNLYMNGAEILTFTLKTVPKAILEILNETNLNQAQVDKVIFHQANKFMLDKLRQKTGFSAEQFLVSYEEYGNTVSSTIPLGIERALYKSELNANEKLLICGFGVGYSWAGCIVEWC >NZ_CP022358.1|WP_089068170.1|3218730_3219252_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MLIEGFGIKLHPLSNQYLDILRCWRNSDFVQAFMQQKVSITLEMQIEWFSTLDKEKNHYFIIEYENILVGCCNIKNIDDLGVGEGGVFLCAEEFLNGMVASKAVFLMYDWAFKNNIISSAKSEILLENKRAIRFNKMLGFSIEIKESIVQGFLNKESFYNQYHRFYKILNQQE >NZ_CP022358.1|WP_089068169.1|3217596_3218727_-|dTDP-4-amino-4,6-dideoxygalactose-transaminase MINFNKPYLNGKELVYISQAVTSGKISGDGHFTKKCHNFFEQRYGFKKALLTTSCTDALEMAAILLDIQPGDEVIAPSYTFVSTVNAFALRGAKIVFADSYPDHPNIDPIEISKLITPKTRAIVVVHYAGVACDMDAIMDIANQHNIPVVEDAAQAIDSYYKGKPLGSIGTFGTFSFHETKNIIAGEGGLLAINDERYIHRAEIIREKGTNRSSFFRGEVAKYGWVDIGSSFLPSDIIAAYLYAQLENLDQIQARRKAIWNRYYDKLSVSVANTGVALPIVADYSTNNAHMFYLVCNSLEQRTGLIQYLKDNGVHAVFHYLSLNKSEYYLDKNILRDLSNSDLFTDSLVRLPLYYELTDEQVDYICDLVNSFFIAK >NZ_CP022358.1|WP_167373708.1|3226041_3228477_-|sugar-transporter MGTQAQAITPSPQMIEQFKQLPKSEQERLARQYGIDPSMITGASSTATVVENPPVVTPRTENGNKVVDQSEDDKLNQATKSEAKVEAIESKKEDQLKRFGYDLFAGSPSTFAPVSDVPVPSEYMIGPGDTLNVQFFGKENNQFTLTVGRDGAVQFPNLGPISLVGLTFAETRELLQQKISQSMIGIESNITMGELRSIRIFVAGDAYKPGSYTVSSLSTITQALFISGGVNEIGSLRDIQLKRSGKTIARLDLYDLLLRGDASGDMRLQSGDVVFIPSAGGSVSVIGEVRRPAIYELKNNETMADVINMASGLNPGAYPKASTIERYSREAVKTVVSVDLTENSGLSTLAKNGDLLNVRSASSRIDNAITVSGAVIRPGKYQWTNGLTVADLLPSIWGDLTISADLDYSLLVREINQRGDIEVERINLGRAIGEPKSHYNLALKPRDSVIVFDYADREELLKPIIKKLKEQSRFGDAAKLVNINGNVRFPGQYPITVNADVKDLLIAAGGLEEGAYTLSAELTRQQVSEQNGVTVEHVQLSLDRVMQNDPAANIKLQSRDILTVRTLPDWQETRWVTIKGEVKFPGTYSIQRGETLKQVLARAGGMTSDAAPRSAVFLRKSIQEKEQQELAKLADELRREIAAKALTKDTPTVGYNDAQMMLNQLENVKTVGRLVVDINAIELGIESADLMLEDADALYIPPANQTVSVMGQVQHPSTHRFKTGLTYEQYLALSGGARKRADESRTYILKADGSVQMPESSLWFTGGSSMEPGDTIVVPLDTEYKDNLTLWTQVTGIIYNTAVAVSAISGI >NZ_CP022358.1|WP_011622099.1|3229337_3229838_-|transcription/translation-regulatory-transformer-protein-RfaH MKAWYLLYCKPRSEARAQQNLALQNLETYLPMVSEEKSQRGQKRICRVPLFPNYLFINFDPSQTSVKQVNSTRGVSRIVNCQEKMTPIDDRIIHAIRMKELTPSQAVLDHELELKTGEKIRFKDGPFIDLEGIFQEKCPNKRCQVLFNIMGQIKTLTVPMQSVERV >NZ_CP022358.1|WP_011716441.1|3230312_3231782_+|peptide-MFS-transporter MSVAKPQGTMLGHPKGLFLLFTTELWERFSYYAMRAILVLYLVDKVQSEGGHGLGWTQADAISLYGTFTGLVYLTPLIGGWLADTFLGQRRAIMIGGTLMAAGQFILGTPHAWVPGMETEVFYVGLGTLILGNGLFKPNISTMVGDLYEEGDHRRDGAFTIFYMGINVGAFLSGIIVGSVVAAYDGNFQAGFICAGIGMILSLIIQLVFAQKLLGDIGRTPAAKLEKQKAAEKGEVRKEPLTKVERDRIKVIMVMGLFTIIFWAGFEQAGGLMNLFTNDFTDRMIGTWEVPTTWFQSLNAMFIVIFAPVVASIWVRLGKNEPNSPVKFALGLVLLAVGFLFMIGAVVEMGGDASAKSSMWWLVGAYFFHTMGELCLSPIGLSMVTKLAPLRIASLMMGSWFLFVAAANKIGGVVGSFIGHGGEKEEQLANAMAIFSGIAITAALSGVVLYFMADKLVDWMHGAESKHHNEAEALEDEIAVTGEHEAIKR >NZ_CP022358.1|WP_089068179.1|3231974_3233078_-|response-regulator MALNDVSILWVEDDPVFRQIVATFLIGRGAEVVQACDGEQGLSIFKQQRFDIILADLSMPKLGGLDMLKEMSKLEPLVPSIVVSGNNVMADVVEALRVGACDYLVKPVPDLFIIEQAIKQGLQRHHSDDVTQAEFDALSNQELKDNLVLLEQSVEAAKQVQQQLFPASNISYPTAKVDYSLFKSSDISSYFIDSTMVGSDYLIMYMAHLYPEDNRAAFACVLLRSFVNQKLKSYRSGQSKTIIEPFNMLSYLNERLVKSGLDITVDIIYVAIELTRYRAAIAQAGKGLRCYLRNDEGLSPLALSESLQLGMLDWGKPRIQFRTILPQEQLCIATSEPEHKQQLLENQFKGLVYDSQLPAGGFMQLSL >NZ_CP022358.1|WP_089068180.1|3233200_3233986_-|VacJ-family-lipoprotein MKFKSLGVLLGFALLPKVYGAEATVPETTPKDTASAVKITYDDPRDPFEGFNRAMWDFNYLYLDRYIYRPVAHGYNDYLPLPAKTGINNFVQNLEEPSSLVNNALQGKWGWAANAGGRFTVNTTIGLLGVFDVADMMGMPRKQDEFNEVLGYYGVPNGPYFMAPFAGPYVVRELASDWVDGLYFPLSELTVWQSIVKWGLKSLHARASAIDQERLVDNALDPYTFVKDAYLQHMDYKVYDGNVPQKQEDDELLDQYMQELE >NZ_CP022358.1|WP_089068181.1|3234207_3236280_+|flagellar-hook-length-control-protein-FliK MESIPLINTANAQLITSAASIDAASVSSRPIPAEVQISPEGDSIILNGTEYNLKLVNAQQRQALIVASHFLVNQIAPQANTTVNATVPNAQLLTLGATLTLKLPDAIAQLAQQNGISLDKLYTLAARPQGYPLPNVTVTTKEFQFVNGTVVPQDPGTRLSAGEFQANISFSQGRPILVLTPILSKLEIQIGAPINETQLPIIDKQAANVVISKTEPVQVIATFLRKLEGLTPQAELLNTSKPSIQAQVAPDNKAAVGVTTSSATDNPTSKNNASALSIQTSLQANTEPKLTTVNQTLNTTAQSQETSQNQQKAQVLDAKTLESKAFESKPFESKSLESKPLELKPLEAKTMASGASNLDSSRNSLLAAKAQQELPPTSSTKTGLVGNELPLSLKPQAMEAQLGEKTNKSTEAQISVNEVLQKAFTKAGALPLEQMLARGGANLAAELLKHLPHLSPPTLGQLSDPGELKETMFGLSALNLAAPQLNPATVLMNANAITSLFQLLLGFRANNANNSISQKLADYLELLQAKTGLSTNLLGQLSKAGGLESMGQLASSLHLYQQASGENNGNLVWFFALPYGINQRHEQLEGKFERDANDDEQQKYKGWHLQLKFNLAQGPLLISARFHQQVLDIQFKGNSQQLLNRVDNFLAPLGQKLSQLGFTPGELSTQIAQVPATLLPGDHFLVKTRA >NZ_CP022358.1|WP_041417170.1|3236295_3236604_+|flagellar-biosynthesis-protein-FlhB MDEEPKTQQAVALSYDGKHAPKVVASGEGLVADEIIALAKASGVYIHQDPHLSNFLRLLELGEEIPKELYLLIAELIAFVYMLDGKFPEQWNNMHKKIVEKA >NZ_CP022358.1|WP_011622093.1|3236630_3237029_-|DUF2802-domain-containing-protein MGDEFLIAALVYVIACLGLVLYLQKQLSKLRSKVEALTVLVKEGDRQRESFKRELQELRSGTIGMGRRVIELEKRLHQQSERIEESTQQDPQAKLYTRAMKMVALGAGVDELIKECELPKAEAELLIRLHRK >NZ_CP022358.1|WP_011073088.1|3237183_3237678_-|chemotaxis-protein-CheW MKDTRNVAAVAASKDDAVLQWVTFKLDNETYGINVMQVQEVLRYTEIAPVPGAPHYVLGIINLRGNVVTVIDTRSRFGLQSAEVDDSTRIVIIEAEKQVIGILVDSVAEVVYLRRSEIDNAPNVGTEESAKFIQGVSNRDNELLILVDLDKLLSDEEWAELNQL >NZ_CP022358.1|WP_011716436.1|3237685_3238693_-|chemotaxis-protein-CheW MSKSVDETVFDFFELLLHEEDCKAVDSPSAPQHEVVAPLVGKKNEAQLLDDAILAEHSQAKVHASVTIAAEVQPQKAKSVSNMPHLDEPAPLVNKQALEKLLAPVLKTVVIEDKPAEVLSEVAPEMDKVPEEIQESISSLPECDASVTIEQPSTVVDDEIIIETTPETQVGFAPPSITKDLQEVLDDEFQVLFFKVAGLTLAVPLVSLGGIVKVERINHIIGRPSWFLGVQTHREEQLNLVDTCAWVMPEKYTDKLAQSVNYQYLVLLEGSNWGLACESLVNAVKINKSQVNWRSKAGKRPWLAGVVKEQMCGILHVQALVEMLDAGLGCQDSIG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
2145344 : 2155553
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022358|2145344:2155553|DBSCAN-SWA TATGAAGCTTCCTATCTATTTAGATTATGCCGCCACCACGCCAGTTGATCCGCGAGTCGCGGAAAAAATGTTCCAATACATGACGATGGATGGCATCTTCGGTAACCCAGCATCACGTTCTCACCGTTATGGCTGGCAAGCGGAAGAAGCGGTGGATGTGGCGCGCAGCCAAGTGGCTGATTTGATCAATGCCGATCACCGTGAAATCGTGTTTACCTCAGGTGCAACCGAATCAAACAACCTGGCGATCAAAGGCGTAGCGCATTTCTACAATAAGAAAGGCAAGCACATCATCACCAGCAAGACTGAACATAAAGCGGTACTCGATACCTGCCGTCAGCTTGAGCGTGAAGGCTTTGAAGTCACTTACTTAGAGCCAGATGCCAACGGCATCATTCCGATGGAACGTTTAGAAGCGGCGATGCGCGACGACACCATTCTTGTCAGCATCATGCATGTGAATAACGAAATCGGCGTGATCCATGATGTGGATGCCATCGGCGAGTTATGCCGCTCAAAAGGCATTATCTTCCATATGGATGCTGCACAAAGCGCGGGCAAATTACCTATCGATGTACAAACGACTAAGGTCGACCTGATCTCTATTTCTGGCCACAAAATGTATGGTCCAAAAGGGATTGGTGCTCTGTACGTGCGTCGTAAGCCACGTATTCGCTTAGAAGCCCAAATGCACGGCGGTGGCCATGAGCGTGGTATGCGCAGCGGTACACTGGCGACTCACCAAATCGTTGGTTTAGGTGAAGCGGCGGCGATTGCAAAAGCTGAAATGGCAACAGACAACGCCCGTATCGCTAAACTGCGTGACAAGTTATGGAATGGCATCAAGCACATCGAAGAGACGTATGTAAACGGCGACATGACTCACCGTGTGAGCGGTAGCCTGAATGTCAGCTTCAACTATGTTGAAGGTGAGTCGCTGATGATGGCATTAAAAGATTTAGCGGTTTCATCGGGTTCTGCCTGTACGTCAGCCAGTCTCGAGCCAAGCTACGTGTTACGTGCGCTCGGTTTAAATGATGAAATGGCGCATAGCTCAATTCGTTTCTCAATCGGTCGTTTTACCACCGAAGAAGAAATCGACCACGCTATCGAAACTATTACACAATCTATTGATAAATTAAGAGAAATGTCTCCATTGTGGGAGATGTTCAAAGATGGCATCGACCTGAATCAGGTGCAGTGGGCACATCATTAATTCGACCATTTACAATAGATAATTTTGGAGCAGTACCATGGCTTACAGTGAAAAAGTGATAGATCATTATGAGAACCCACGTAACGTTGGTTCTTTCGACAAGAACGATCCTTCGGTCGTGACCGGTATGGTGGGAGCACCTGCCTGTGGTGACGTGATGAAGTTACAGCTGAAAATCGGCGCAGACGGCATCATCGAAGACGCTAAGTTCAAAACCTACGGTTGTGGCAGCGCTATTGCGTCTAGCTCACTGGTAACCGAGTGGGTGAAAGGCAAGACTATCGAGCAAGCGGCGGCTATCAAAAACACCGATATCGCGGAAGAATTAGCCTTGCCACCAGTGAAAATCCACTGTTCCATTTTGGCAGAAGATGCCATTAAAGCGGCGATCGACGAGTACAAATCGAAACAAGCTAAGTAACATCTGGAGTTAAGATGGCGATTACAATGACCCCAGCGGCAACTGAGCGTGTCAGATCTTTCTTAGCGAATCGAGGCAAGGGCATCGGCCTGCGCCTCGGCTTAAAGACCTCTGGCTGTTCCGGTATGGCTTATGTGCTTGAGTTTGTTGATGCGCTGAATGATGACGATGAAGTGTATGATATTGATGGTGTTAAAATCATTATCGATGCGAAAAGCTTCATCTATCTACAGGGCATTGAGTTGGATTTTGTTAAAGAAGGCCTGAACGAAGGTTTCCAATTTAACAATCCTAACGCAAAAGGTGAGTGCGGTTGCGGTGAGAGCTTCACTGTTTAATTGCCGAATTGACGCATGAATTATTTCGAGCTGTTTAAGTTTTTCCCTGCCTTCGATATTGACACCGCTGTGCTTGCAGAACGCTACCGCGAACTGCAACGGGCGGTGCATCCCGATAAGTTTGCCAACGATACCGAGCAACAACGTTTATTGTCGGTGCAACGCACTGCGCAAGTCAATGACGGTTATCAAACCCTAAAAGATCCTATCCGCCGTGCCGAGCATATGCTGTCGCTACGTGGTATCGATTTAAGCCACGAAACCACCACAGTGAAAGACACTGCATTTTTAATGCAGCAGATGGAATGGCGTGAGGCGTTAGAAGACATTCGCGATAGCGCCGATCCTCAAGAAAGCATTGATGAGTTATACGACTCTTTCGCGGCGTATCGGACAAAGCTGACGAAATTGCTCACCGCACAGCTAAGCAGTGACAGTGAAGAAGATGCCTTGTTAGCGGCAGATCAAGTACGCAAGCTTAAATTTATGGCAAAATTACACGATGAGCTGACGCGTATCGAAGACGCGCTGCTCGATTAATTTTCCCTATTGCAGTTATTTAGCCGATTCAGACGGGTCTGAGTCGGCGTTACTAAGTTGGATACATATGGCCCTTTTGCAGATTGCAGAGCCCGGACAAAGCGCCGCGCCGCACCAACATAGACTTGCCGTTGGCATCGATTTAGGTACCACTAATTCCCTCGTGGCCGCGGTTCGCAGCGGCGTAACGGCGACCTTACCCGATGAAAATGGGCAGCACTCTTTACCTTCTATCGTCCGTTATACCCAAGATGGCATTGAAGTCGGTCAGGTGGCGGCGTTAAGTTCTGCGCAGGATCCTAAAAATACTATCGTATCGGTCAAACGCTTTATGGGCCGCAGCCTCACGGATATTCAATCTGGTGAGCAAGCGTTCCCATACCAGTTTGAAGCCAGTGAAAACGGTTTACCGCTGTTTGTTACGCCTCAAGGGCAAGTGAATCCGGTGCAAGTGTCGGCGGAGATTTTACGTCCTCTGGTTGAACGCGCCGAGAAAACCCTTGGTGGCGAACTGCAGGGTATCGTGATCACTGTGCCGGCGTATTTCGATGATGCGCAGCGTCAAGGGACTAAAGATGCCGCGTCTTTGCTCGGTGTTAAAGTATTGCGCCTGCTAAACGAGCCTACCGCGGCGGCAATCGCCTACGGGTTAGATTCTAAGCAAGAAGGTGTGATCGCGATTTACGATCTCGGCGGCGGCACCTTTGATATCTCTATTCTGCGTTTAAATCGCGGCGTTTTTGAAGTGCTGGCCACGGGCGGCGATTCGGCGCTGGGCGGCGATGACTTTGACCATCTGTTGCAGGCGCATATGCAGCAAGTATGGCAATTGACGAACCTTGATCCGCAGCTAAGCCGTCAGTTATTGATTGAAGCGCGCCGCGTGAAAGAAGCCTTAACCGATGCGAGTGACGTCGAAGCGAGCCTGACGCTTGCCGATGGCACTGTGCTCAAGCAAGTGGTGACCAAAGCTGAATTTGATAACTTAATCAGCGCATTAGTGAAGAAAACCATCGCCAGCTGTCGTCGCACCCTACGTGATGCGGGCGTAACGGCTGATGAAGTGTTAGAAACCGTGATGGTAGGTGGTTCAACCCGCGTGCCATTAGTGCGTGAACAGGTTGAAGCCTTTTTCGGTAAGGCGCCATTAACCTCTATCGACCCAGACCGTGTTGTTGCGATTGGCGCGGCGATTCAGGCCGATATTCTGGTCGGTAACAAACCCGAGTCTGAATTATTACTGCTCGATGTGATCCCTTTGTCATTAGGGATTGAAACCATGGGCGGTTTAGTGGAGAAAGTGGTTTCTCGTAACACCACGATTCCAGTGGCCCGCGCCCAAGAGTTTACCACCTTTAAGGATGGTCAAACGGCGATGGCCTTCCATGTGGTGCAGGGCGAGCGTGAGTTAGTCGATGATTGTCGCTCACTCGCACGTTTTACGCTTAAAGGTATTCCCCCGTTAGCGGCGGGCGCAGCCCATATTCGTGTGACCTTCCAAGTCGATGCCGATGGGTTGCTTAGCGTTACCGCGATGGAGAAATCCACCGGCGTGCAATCGAGCATTCAGGTCAAGCCTTCGTTTGGTTTATCGGATACCGAAATCGCGACTATGCTCAAGGACTCGATGAAGCATGCGAAGGAAGACATCAGCCGTCGTATGCTGGCCGAGCAGCAAGTAGAGGCGGCAAGGGTACTTGAGTCGTTAAATTCGGCGCTTGCAAAAGATGGCGACTTGCTGACAAGTGATGAGCGTCAGCAGATTGATGCGGTCATGGCGCAGCTTGCCGAAATTGCCCGTGGTGATGATGCCGATGCGATTAAGCAAGCGATTGAAGTCCTCGATGAACATACTCAGGATTTCGCCGCGAAGCGTATGGACAATTCTATTCGAGTGGCCTTTAAGGGTCAGTCAATTGACAACATATAGGTGATGTGATGCCCCAGTTAGTCTTTCTTCCCCATGCTGAGTTATGTCCCGATGGCGCAGTGTTGGAAGCCAAAGTAGGTGAAACGATTCTCGATGTGGCGCTGCGTAACGGCATCAATATCGAACATGCCTGTGAAAAATCCTGTGCCTGCACCACATGCCATTGCATCGTGCGTGAAGGCTTTGATGAGCTAGAACCAAGCGATGAGCTTGAAGATGATATGCTCGATAAGGCATGGGGACTTGAGCCAGAGAGCCGCTTGTCTTGCCAAGCCAAAGTTGTCGATAGCGATCTGGTGATTGAAATTCCGAAGTACACTGTGAATATGGTGAGCGAAGGTTAATCAACCCGATGCGATGATATCGTCAAAAACCAGTCCATGTGACTGGTTTTTGGCTTCTGGCGCCCAGCATTTGCGCAAGCAATAATTGCCATGATTGATTTATCCTAATCCGAGCGTATGATGCGCTCAAAATGAAATGGTTGTCGGAGACCAAAATGAGAATCGCGATCCTATCGCAAGGGCCTGAGCTATATTCCACAAAGCGACTCGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022358|2145344:2155553|2149796_2150132_+|WP_011622515.1|DBSCAN-SWA MPQLVFLPHAELCPDGAVLEAKVGETILDVALRNGINIEHACEKSCACTTCHCIVREGFDELEPSDELEDDMLDKAWGLEPESRLSCQAKVVDSDLVIEIPKYTVNMVSEG >NZ_CP022358|2145344:2155553|2153834_2155553_-|WP_088211645.1|DBSCAN-SWA MEKLSGASMIVRSLIDEGVKHIFGYPGGSVLDIYDALHLIPGIEHILVRHEQAAVHMADGYARATGKVGVVLVTSGPGATNAITGIATAYMDSIPLVVLSGQVPSNLIGNDAFQECDMIGISRPVVKHSFLVQDPTQIPEIIKKAFYIASTGRPGPVVVDLPKDCLNPALLHDYIYPESIKMRSYNPTTSGHKGQIRRGLQALLAAKKPVLYVGGGAIISSSEKQILALAEKLNIPVVSTLMGLGAFPGTHKNSLGMLGMHGRYEANMTMHNCDLIFGIGVRFDDRTTNNIEKYCPNATILHIDIDPSSISKTVRVDIPIVGSADIVLDSMLALLEESKESNDSEAINQWWQEITVWRNRNCLAYDKESNRIKPQQVIETLYKLTNGEAYVASDVGQHQMFAALYYPFDKPRHWINSGGLGTMGFGLPAAMGVKMAMPDETVVCVTGDGSIQMNIQELSTALQYDTPVKIINLNNRFLGMVKQWQDMIYSGRHSHSYMDSVPNFAKIAEAYGHVGMTISDPAELESKMAEALAMKDRLVFIDIMVDETEHVYPMLIRGGAMNEMWLSKTEKC >NZ_CP022358|2145344:2155553|2151650_2151818_+|WP_041408760.1|DBSCAN-SWA MKLLFALLFTLLPALAWAHPGHGGVGIFHHLLDLAPAIILVALIAWASIWAKNKK >NZ_CP022358|2145344:2155553|2151255_2151453_+|WP_011622517.1|DBSCAN-SWA MSLKWIDSLDIALELLEKHSEVDPHKLHFTQLYEWVLALDDFDDDPKHCNERILEAIQQCWIEEK >NZ_CP022358|2145344:2155553|2147333_2147858_+|WP_089067687.1|DBSCAN-SWA MNYFELFKFFPAFDIDTAVLAERYRELQRAVHPDKFANDTEQQRLLSVQRTAQVNDGYQTLKDPIRRAEHMLSLRGIDLSHETTTVKDTAFLMQQMEWREALEDIRDSADPQESIDELYDSFAAYRTKLTKLLTAQLSSDSEEDALLAADQVRKLKFMAKLHDELTRIEDALLD >NZ_CP022358|2145344:2155553|2145344_2146559_+|WP_086903271.1|DBSCAN-SWA MKLPIYLDYAATTPVDPRVAEKMFQYMTMDGIFGNPASRSHRYGWQAEEAVDVARSQVADLINADHREIVFTSGATESNNLAIKGVAHFYNKKGKHIITSKTEHKAVLDTCRQLEREGFEVTYLEPDANGIIPMERLEAAMRDDTILVSIMHVNNEIGVIHDVDAIGELCRSKGIIFHMDAAQSAGKLPIDVQTTKVDLISISGHKMYGPKGIGALYVRRKPRIRLEAQMHGGGHERGMRSGTLATHQIVGLGEAAAIAKAEMATDNARIAKLRDKLWNGIKHIEETYVNGDMTHRVSGSLNVSFNYVEGESLMMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLNDEMAHSSIRFSIGRFTTEEEIDHAIETITQSIDKLREMSPLWEMFKDGIDLNQVQWAHH >NZ_CP022358|2145344:2155553|2146994_2147318_+|WP_011072278.1|DBSCAN-SWA MAITMTPAATERVRSFLANRGKGIGLRLGLKTSGCSGMAYVLEFVDALNDDDEVYDIDGVKIIIDAKSFIYLQGIELDFVKEGLNEGFQFNNPNAKGECGCGESFTV >NZ_CP022358|2145344:2155553|2150287_2151187_+|WP_011622516.1|DBSCAN-SWA MRIAILSQGPELYSTKRLVEAATLRGHEVKVINPLECYMNINMRQSSIHIGGEELPPFDAVIPRIGASITFYGSAVLRQFEMMGVYALNDSVGISRSRDKLRSMQLMSRRGIGLPITGFANKPSDIPDLIDMVGGAPLVIKLLEGTQGIGVVLAETRKAAESVIEAFMGLKANIMVQEYIKEANGADIRCFVLGDKVIAAMKRQAMPGEFRSNLHRGGTASLVKLTPEERSVAIRAAKTMGLNVAGVDLLRSNHGPVVMEVNSSPGLEGIEGATAKDVAGAIIEFVEKNALKAKKPTQA >NZ_CP022358|2145344:2155553|2152773_2153217_+|WP_011622519.1|DBSCAN-SWA MRTYDLTPLYRSAIGFDRLAQMAEHAAANNGNSGYPPYNIELLGENRYRITMAVAGFSMEELEISSEGEKLLVKGNKAESQTERKYLYQGIAERGFERTFQLADYVTVLGASLENGLLNIDLVREIPEALKPRKIEITTSRLLDGQS >NZ_CP022358|2145344:2155553|2152038_2152470_+|WP_011622518.1|DBSCAN-SWA MAIERTFSIIKPDAVAKNHIGAIYNRFETAGLKIVAAKMLHLTKEQAEGFYAEHSERGFFGALVAFMTSGPIMVQVLEGENAVLAHREILGATNPAQAAPGTIRADFAQSIDENAAHGSDSLESAAREIAYFFSAEELCPRTR >NZ_CP022358|2145344:2155553|2146596_2146980_+|WP_011072277.1|DBSCAN-SWA MAYSEKVIDHYENPRNVGSFDKNDPSVVTGMVGAPACGDVMKLQLKIGADGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLVTEWVKGKTIEQAAAIKNTDIAEELALPPVKIHCSILAEDAIKAAIDEYKSKQAK >NZ_CP022358|2145344:2155553|2147925_2149788_+|WP_089067688.1|DBSCAN-SWA MALLQIAEPGQSAAPHQHRLAVGIDLGTTNSLVAAVRSGVTATLPDENGQHSLPSIVRYTQDGIEVGQVAALSSAQDPKNTIVSVKRFMGRSLTDIQSGEQAFPYQFEASENGLPLFVTPQGQVNPVQVSAEILRPLVERAEKTLGGELQGIVITVPAYFDDAQRQGTKDAASLLGVKVLRLLNEPTAAAIAYGLDSKQEGVIAIYDLGGGTFDISILRLNRGVFEVLATGGDSALGGDDFDHLLQAHMQQVWQLTNLDPQLSRQLLIEARRVKEALTDASDVEASLTLADGTVLKQVVTKAEFDNLISALVKKTIASCRRTLRDAGVTADEVLETVMVGGSTRVPLVREQVEAFFGKAPLTSIDPDRVVAIGAAIQADILVGNKPESELLLLDVIPLSLGIETMGGLVEKVVSRNTTIPVARAQEFTTFKDGQTAMAFHVVQGERELVDDCRSLARFTLKGIPPLAAGAAHIRVTFQVDADGLLSVTAMEKSTGVQSSIQVKPSFGLSDTEIATMLKDSMKHAKEDISRRMLAEQQVEAARVLESLNSALAKDGDLLTSDERQQIDAVMAQLAEIARGDDADAIKQAIEVLDEHTQDFAAKRMDNSIRVAFKGQSIDNI >NZ_CP022358|2145344:2155553|2153340_2153835_-|WP_011622520.1|DBSCAN-SWA MRRIISVLLENQSGALSRVVGLFSQRGYNIESLTVAPTDDNTLSRLNITVVADEKVLEQIEKQLHKLVDVLKVSNVTESAYIERELALVKVRAQGELREEIKRTADIFRGQIVDVTANLYTIQLVGTTEKLDAFIHSMGEVTKVVEVSRSGVVGLARGEKAMRA |
13 | Faustovirus(12.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2375826 : 2387126
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022358|2375826:2387126|DBSCAN-SWA TTCAATCTGCTTGATTTTGCTTCGTATCTGCATTGATCCCAAGACGAGCAGGATCCGGCGCAGTAAAGTGTTTGGCAAAATCCGCCCAAGTTTGCTCGGTTTTTAACAGGTAACCCAAGATCACCACTAATGAACAGCTCAGAATGCCCCAACCTATGGCGACTTCTCCTGAACTTGCCCAGAGCGCGACTAAACTCGAGGCGCCAAAGGCGATGGTGATTTGCAAAAAGTTCTGTAATCCTGCCGCCTTAGCCGCATTTTGAGTGAATTGTTGTAAAGCACTGTTCACCACAATGGGATAAATCGCCCCGTTTGCCGCTGCGAGTATCGAGAAGGAAATCAGCAGTGGGAAAATGGTTTCCGCCTTCATTAATAAGGTGAAAAACACAATCGAGATAACGCAGAGTCCAAAAATGGCCAGTAATACGTTGAGTGTACGGTCGGCACCAATGCGTTTTATCAATAGCTTACTCGCGTATCCACCCACAATAAACATGATGGTTTGCGGAATAAAGCTCAGCCCAATCTCTGTTGCCTGATAGCCGTGTTGCTCCATCACAATCGGCCATACAGTAAGATATGCGAAAAACGCACCCGAACAGGCACCAAAAATCACCACATTGCCAAGGTAACGGGGATTTTTCAAAATCTTGCCGTAGGAAACGGCGCTTGGCTTAGCATCCTTATGCTCTGCATGGCTCGGCACGAAGTATAAGGTCATCAACACCAATAAAAAGGCAATCACACACAATGAGATAAAGATTGCACGCCATCCAAAATCGTTCAGAATATAAGCGCCAAGGATGGGGGCTAATGCGGGAGATAATGCCACTAACGGCATAATGTTACTGAAAATCCCCTGCGCTTTTTCGGCATCATATTGCTCGACCACAATCGCTTGCCAGATGACCCCTGCACTACAGGCGCCTACGGCTTGGAAGAAGCGAGCGATGTTTAGCATCAGTATCGAGTCGCTATTGGCGATGGCCACACTGGCGAGCGCAAAAATGCCAAGGCCGAGGATCAGGGCGTAACGTTTGCCGAGTTTACTGACCAAAGGGCCATAAATCAGTTGCCCTAAGGCTAAACCAGCCAAGAAACAGGTGAGCGACATCGCCACTTGAGACGGTGAAGAATTGAACGAACTTTCAATTGCTTTGAAAGCAGGCAAATACATGTCAGTGGCAATGAAGCCTAACATGCTTAGCAAGGCCAAATAGAATAAGAATATAAAAAACTTCATATTTACAAAGATATTACTAGACGTTTTCATAAAATAATCATGTCGAAAGACTTAAGGCGTGCAGTCTAAATACTTGTTAATTTGATTGGAAACGTTTATTTTTGACAGATGCTATCAATTATTTTCATCACAATGGATGTCAGCTATGCTCTCGGAACAAGCGTTAGAACTCATTGATATCGTGGCCCGTGTTGGGAGTTTTACGGCGGCAGCCAATCGACTGCACAAGGTCCCTTCTGCGGTCAGTTATGCCGTTAAACAAATCGAAGAAGAACTTGGCGTAGTGTTATTTGAGCGCCACCACCGCAGCGTGACCTTAACCCCTGCGGGAGAGCATTTTGTTAAGCAAGCCAGAAACTTGCTGACTCAAATGGATGAAATGAAACGCGGTACTCAGCGTGTGGCCAACGGCTGGCAACCCACATTATCTATCGCCTTAGATAACATAGTTCGCGCCGACAGAATTAGCGTATTAATTGCCGACTTTTACCGTCATTTCCAAGATATTGAGCTTATCATCCGCATCGAGGTGTTTAACGGTGTGTGGGAGGCGCTTGCGACTGGTCGCAGTGATATCGCCATTGGTGCAACAACGGCGATCCCTGTGGGGGGCGTATACCAATATAAAGACATGGGCGACATTCAATGGGCGTTTTTGGTGAGTAAAAACCATCCATTAGCCAGTATTGACCGGCCCTTGACCGATGATGAATTGCGCCCCTTCCCCTCTATTTGTTTGGAAGATACCTCGCGGGAAATTCCTAAGCGCATGACCTGGTTATTGGAGAATCAACGCAGACTTGTGGTGCCGGATTGGATCCGCGCAATTAACTGCTTTAGAGAGGGATTAGGTATCGGCTATATGCCAGTACATTTGGCCAGCGTATTTATTAAAGCGGGCGCCTTGGTTGAAAAGCAGCTTGAAAATCCGAAATTAACCAGCCCTTGTTGCTTAGCTTGGAACGCCGATAAGATGTCGCCCGCCTTAGCTTGGGTGCTCGACTATTTAGGGGATACCGATAAATTACACCGTGAATGGCTGGCGTAATATTTCCGTATTACCACTGGATTAAGCTTGTTTTAAAGTCTTTGTGTTGCACTGGTGTAACGAAATACGCCTTAAGCGTTAGGTCGCACAGAAAAATCAGTCATTACAACTTGTTATTTGTGGCGTGAATCCTTTAAGCACAGCGCTGTTTTCGGTAGTATTCACCCAGTTTTACTGGATTTGCGATATTGATGGGAACTCTCGTCCCCGTTAAAAATCAAAATGATCAGTTCGGATTTAAAAGCTAATGGAGAAAGATATGACTCAGCAAACCTTGTACTCAGCGAGTGCATCCACCCTAGAAGTGAATAAACTTCTTAAAAATACCTATTTATTGTTGGCCATGACCCTCGCCTTCTCGGCATTGTGTGCAGGCTTAGCGATGGCACTCAATATCAGCCCTCTGATGTCACTCGGTTTATCTATCGGTGGTTTAGTGCTGTTGTTCGTTACCCTACGCAAAGCCGACTCCGCTGCGGGCATCTTCTGGGTATTTGCATTTACCGGTATGGAAGGCGCCTCATTAGGTTACATGCTTAACCACTACGCTGGCATGACCAATGGCTCTGAGCTTATCATGCAAGCTTTAGGATTAACCTCGGTTATCTTTATTGCGCTCTCGGCCTATGCAGTCACGACGAAGAAAGATTTCTCTTTCCTACGTGGTTTCCTGTTCGCCGGATTGATTGTGGTGATCGCCGCTGCGCTGATTAACATTTTCGTGGGTAACAGTGTGGCCTTTATGGCGATTAACGCGGGTCTTGCGCTGTTAATGACCGGCTTTATCCTGTTCGACACTAGCCGCATCGTGAATGGTGGCGAGACTAACTATATCCGCGCCACTATCTCCTTGTATCTGGACTTTTTAAACCTATTCATTGCCATTTTGCATTTGCTTGGCATTGGTAACGATGATTAATCCCCTTTTCGGGAAACTTACGCTAAAATGGCCCTACTTTTAGGGCCATTTTTTTTATAATGAGCAAATTTATTATCCAAGTAAACGGGCCAGCCTATGGCACGTCGGCAAGTGTGAATGCCCTACGTTTCACCCAAGCCTCCCTGCAAAGCGGACATGAGATTGTCTGCGTGTTTTTCTATCAGGATGGCGTGTATAACTCGACGGACTTTAATTTACCCGCATCCGATGAATATGATGTGGTTAAAGGTTGGAAACAACTGGCAGCCGAGCATCAAGTCTCGTTAGTAAACTGTGTCTCAGCGGCATTACGACGTGGCATAGTCTCGCAGCAAGAGGCGCAGGAAAACGGGCTAAGCCACTGGAATGTTGAACATTCTTTTATTATGGGCGGACTGGGTGAACTGGTCACGGGAATTGAATCAGCCGATCGTTTGGTCTGCTTTTAAGCTTCGGAAATGTTATGAAAAAAATCTGTATATTGTTCCGAAGCGCGCCCCATGGCACCACTAAGGGCCGCGAAGCCTTAGACTTTGCCCTGTTAAGCGCCAGCTTTGAGCAAGAAGTGAGTTTAGTGTTTGTTGATGAAGGCGTGTTACATCTGCTAAAAGACCAACAACCCGAGCTTATCGGCGGTAAAGATTACCTTGCGGCGCTAAAAGCGCTCCCGCTGTACGACATCGAATCAGTGTTCGCCTGCAAACAGTCCTTAGGTGATTACGGCTTAAGCCATGGCCTGTTGTCGATTCCGGTGACTATCTTAAACGATGAAGCCATCTCGGCTCACTTCAAAGCCGTCGATGAGGTCTTAGTATTCTAATGATTTTACATCATATCCAAACCTCGCCCAGCCGAGACAATGCCCTCAAACTTTGCCTGCGTTATGCTTGCAAAGAGGATGCGATTTTACTCTCGAGCGATGGCGTTAACGCATTATTACTGCGCCAATGGGCCATGGCGCTTTCGCCCTTTAAGGTGATGGTGCTGAAGGACGATGTTATCGCCCGCGGCTTAACGGAACGTCTTAAAAACATTAGTCAGATTGATTACAACGAGTTTGTCGCTCAATCTTTGCAGCACGATAAGGTGATCACGTGGTAAATCCGCTTATATTCAATGGCGTCGAAATTGAACGCGACCATCAAGGCTATTTGAAGAATATCGCCGACTGGCAGCCGGATATGGCGCCGCTGTTAGCCCAAGAAGAACAGATTGAACTGACCAGTGCCCACTGGGAAGTGATCCATTTTGTTCGAGATTTTTATCTGGAATATAAAACCAGCCCTGCGATCAGGGTGTTAGTCAAAGCCATTGGCCAAGCCTTAGGGCCGGATAAAGGTAACTCTAAGTACCTCTATACCCTCTTTCCTGTTGGTCCTGCCAAACAGGCGACAAAGATTGCGGGCCTGCCTAAACCTGCCAAGTGTATTTAAGGTTTAATCACTTCTGCTAACAAAAAAGGTATATTCCACTGGAATATACCTTTTTATTTGAGTCGTGCTATTTCACGTTTTCTAACACAACCCAGACGGCTTTACCTAGGGTGGCCAACATCACAGCGCAAAACACGGCGATGACAGCAGTGTAGGAAAGCCAACGAAGATAACGTTGACCTTTATCCATGGTGTTGTGTTACGCCAATTAACCGATCTGAGTCAGTCCGCCCATGTATGGACGCAGCGCTTCAGGAATGGTCACACTACCATCGGCATTTTGATAGTTCTCTAAAATCGCAACTAAAGTACGACCTACCGCTAGGCCTGAGCCGTTTAAGGTGTGCAGCAAGGCTGGCTTGTTATCGGCCTTAACGCGGTAACGGGCTTGCATACGACGGGCTTGGAAGTCTTTCATGTTTGAACATGAAGAGATCTCGCGGTAAGTGTTTTGGCCTGGTAACCACACTTCGATATCATAGGTTTTGCTTGAACCAAAGCCCATGTCACCGGTACACAGGATCACTGTGCGGTATGGCAGGCCAAGGCGTTGCAGTACGGTTTCAGCGTGGCCCGTTAATGCTTCGAGCGCTGCCATTGAGTCTTCTGGCTTAACCAGTTGCACTAATTCCACTTTATCGAATTGGTGCTGACGGATAAGACCACGGGTATCTTTACCGTATGAGCCAGCTTCACTGCGGAAACAGGCGGTATGCGCGGTTAACTTAATCGGTAATTCGTCTTCATCGACAATGCTGTCGCGCACTAAGTTCGTTAATGGCACTTCTGCGGTTGGGATCAGGCTTAAACCTTGGCCTTCTTCGGTCGCAGGTTTAGTGTGGAACAAGTCTTCACCAAACTTAGGCAATTGGCCTGTACCCAGTAAGCTTGCTTCGTTAACCAGTAATGGCACGTAAGCTTCGGTATAACCGTGCTCAGTAGTGTGCAGATCTAACATGAACTGACCTAAAGCGCGGTTTAAACGGGCGATTTGGCCTTTCATAACGATAAAGCGTGAGCCAGTGATTTTCACGGCGCTCTTAAAATCTAAACCGTTTAGGCCTTCACCTAAGTCAATATGATCTTTAACAGGGAAATCGAAGCTGCGTGGTGTGCCCCAACGGCGGATCTCGACGTTTTCAGTCTCGTCAGCACCGATAGGTGCTGACTCATCCGGCAGGTTTGGCATCGACATGGCAATCGCGTTCACTTCTTCAAGTACCGCAGCCAGCTCGACTTTCTTCGCATCTAATTGCGCACCTAAATCGCCAACCTGCGCCATGATGGCATCCACATCTTCGCCGCGGGCTTTTGCTTGTCCGATGGACTTGGAAATAGCATTACGCGAAGCTTGTAGCTCTTCAGTCGCCACTTGCAGTGACTTACGTTTTTCTTCTAATTGAGTGAGATGAGCGACATCTAAAATAAAACCACGGGTAGCTAATCGCTCAGCGGTAACTGCTAATTCGTTGCGCAAAAATTTAGGATCTAACATGTGATATATTCTTAATAGTTAAATGCGAGAAAAAACCAGTTGTTGGCCTAAGTAAACCATAAACAAACATAGACTTAGGTTCAACACCACATTCAAAGCCGCCTTCAACCAATCTCCTTCTTGCATCAGCAATAAAGTTTCGTTTGAGAAAGTTGAAAACGTTGTCAAAGCGCCTAACAGGCCAACGCCGATCAGGGCTTTGAGTTCTGGGCTGATATGACTCATTTGTCCCAGTGCGTAAATGACGCCCATTAAAAATGAACCGAGGACATTGACCAACAGTGTACCAAAAGGAAAACTGCTGCCAAATACTTGGATCATGAATATTGAAATAAGATAGCGAAAAACCGCACCAATGGAACCACCCAAGGCCACAAGTAGGAGATTATTCATACCTTTTTCTCCCACTGGCTTGATCTAATTGCGCTAATTGCGCCAATTTGTCCTTAATTCGCTTCTCAAATCCGCGTTCGGTCGGGAAATAAAATTGCGAAGCTTGTAAGGATTCGGGGAAATAATTCTCGCCGCTGGCATAGGCATTGGGTTCATCGTGGGCATAGCGATACTCGGCGCCAAAGCCCATTTCCGCCATGAGTTTGGTCGGCGCATTACGCAGATGATAAGGCACGGCCTCTTGGCCCGTTTCGCGGGCGAGCGCCCTCGCCGCTTTAAAGGCGGTGTAAACGGCATTACTCTTAGGCGCACTGGCTAAATACACAATCGCTTGGGCAATCGCACGCTCACCTTCGGCAGGTCCGACACGGTGGAAACAATCCCAGGCATTGAGCGCGACTGTCATGGCATTAGGATCGGCATTGCCCACATCTTCCGAGGCTATAGCTAATAAGCGTCTGGCGACATATAACGGATCGCCGCCGCCTTCTAGAATGCGGCAGAACCAATACAGCGCTGCATCGGGCGCCGAGCCACGAATCGATTTGTGTACCGCCGAAATCAAATCGTAAAACTGATCGCCATTTTTATCGAATCCCGCCACTTGATGGCCAGCGACTTGTACCAGCATCTCTGTGGTAAAACTGCCGCCATCGGCCACCATATCGCTCATCAACTCAAGCAGGTTTAGCGCCTTGCGCGCATCGCCGTCACAGAGCTGCGCCAGCTTATTAAGCACATCCGTTGGCATAATTAACTGACGCTGCCCTAAACCACGTTCGGTATCCGTTAAGGCTTGGGTGATGATATGCACTATCTCGTCTTGGCTTAAGCGCTTGATAAGATAGACACGTGCCCGCGACAGTAAGGCGTTATTGATTTCAAATGAAGGATTTTCAGTGGTCGCCCCAATAAAAATCACAGTGCCATCTTCAATAAACGGCAAAAAGGCGTCCTGTTGACTCTTATTAAAGCGATGCACTTCGTCGACAAACAGCAAGGTGCGTTGTCCACGGGATTGGGCAACGGCTTGGGCCTGCTCGATGGCGGCGCGAATGTCTTTTACACCCGAGGTAACCGCCGAAATGCGTTCAACATGGGCATTGGAATAATGGGCAATAAGTTCGGCAAGTGTCGTTTTACCTGTGCCCGGCGGTCCCCATAACATCATCGAATGGGCACGGCCCGCTTCTAATGCTTGGCGCAATGGTTGGCCTTCCCCCAACAAATGGGCTTGACCTATATACTCGGCAATCGTCCTTGGCCGCATACGCGCGGCTAAGGGACGAAAATCAGGCGCAAAATTAAACGATAAACTGCTCACGCGCTAACCTATTGGGTTTTAAGACGTTGATCATCCACATCAACGTTCTCTGGCAACACAAACTTAAACAGCGCTTTATCCGCGGTGCTAATGCTGTGTTGATTGCTCAAGTCAAACTGGCTCAGGTTGCCTTTATCATCGAGCACATTAAATTTATTCAGTGTGCCTTTGTTAAAACAGACATTGACTGAGGTAATCCCGGCATCCGTGGACTTAGGTTTGATTTCATAACAGTCTTGCTTTTTGGTCACGCTATATTGCGACCAAGTGGCGTCATCGCGGTGCACCAATAAGGCGATGGGCGATGCATTAATGGCTTCGGCAAAATCCATGATCACCACTTCTTCGGCGAAGGGATTGTAGATCCATAAATCTTTACCATCGGCGACAATTTGGGATTCATCGGGCGCGGTTAAATGCCAATAAAACTGGTTCGGATGGGCCAGTGCGAATACACCCGCGCCCGTTTGGATAATCTTTTTATTGATATCGGTAACGGTTTGTTTGAAATCGGCCTTGAGTGACTCAGTGCCGTTTAAGGTTTCGCGTAATTGCTTTGCGTCATCGGCCAATACTGCATTGCTGTATAACAATGGTGATAACAACACAGCACACAACAGTTTTTTCATAGGTATCCTTTGGACTAAAAGTTGAACTCGCCGCATTATGGCGAGTTCAAACTGACATCTAGCTTAACATTAATAGTGTTTCGGGGCCGGCGGTGCCAGCACTTCGCGGTTACCATTATGGCCCTGAGCCGAGACCACACCCTGCATTTCCATTTGTTCGATAATACGCGCTGCGCGGTTATAACCAATCTTAAATTTACGCTGCACGCTCGAAATTGAACCACGGCGGGTTTCGGTCACGAAGGCGACGGCCTCATCGTAAAGCGGATCGTATTCTTCATCGGATTCGGCGGTTTCACCCGGCAAGAGCACTTGTTCGCCCTCACTCACGCCATTGAGGATCTCATCGATGTATTGTGGCTTACCCCGGGCACACCAATCGGCCACCACACGGTGAACTTCATGGTCATCGATAAAGGCACCATGAACACGGTTTGGCACCGCGGTTCCGGGTGGTAAATACAGCATGTCACCCATACCCAATAAGGTTTCAGCACCCTGCTGATCCAAAATGGTACGGGAGTCGATACGGGAAGACACTTGGAAGGCCATCCGTGTCGGGATGTTGGCTTTAATTAAGCCCGTGATCACATCCACCGATGGACGTTGGGTCGCGAGGATTAAATGGATACCCGCAGCACGGGCCTTTTGGGCGATACGGGCGATCAGTTCTTCCACTTTCTTACCGACAATCATCATCATGTCAGCAAATTCGTCGACGACAACCACAATCGATGGCAGTTTATCTAAGGCTGGCGCCTCTGGCTCCATGCTGTCAGATGACTTCCACATGGGGTCTAAAATCACTTCACCATTAGCTTTCGCTTCGGCAATCTTGGCGTTATATCCTTTGATGTTACGAACGCCCATCATAGACATTAGCTTGTAGCGGCGCTCCATCTCACCCACACACCAGCGCAGCGCATTGGCCGCTTCTTTCATGTCGGTAACCACTTCACAGAGTAGATGCGGGATGCCTTCATAAACCGATAATTCCAGCATTTTCGGGTCGATCATGATAAAGCGAACATCTTCAGGGCCAGACTTATACAATAAGCTGGTGATCATAACGTTCACCCCGACCGATTTACCTGAACCTGTGGTACCGGCAACCAGTAAGTGCGGCATTTTGCCTAAATCAACCACCACAGGCTCGCCGGAAATGTCTTGGCCAAGCACCATGGTCAGGTTCGATTTGCTCTCGGTAAAAGCTTCGCAATCGAGCACATCGCGCATGTACACGGTTTCGCGGAACTTGTTTGGCAGTTCGAGACCCACATAGGATTTACCCGGAATCACCTCAACCACACGCACTCGCTCGGCCAGTAGCGAACGCGCTAAGTCGTTTGCGAGGTTTGAAATCTTCGAGGCTTTAATACCTGGCGCTAAATCTAGCTCAAAACGGGTGATCACTGGACCGGGATAAACCCCCACTACAGTGGCCACAATGTTAAAGTCGGCAAGTTTGGCTTCGACTAAGCGGGCAACTTGCTCTAATTCCTCAGGGCTTATCGGATTCTTTTTACGATTAGGCACATCCAGCAAGCTGATGCTTGGCAGCGGATCCATAGGTTTTGCAGGTACAGGTTTATCCTCTTGTCCCGGTAAAACCACAATACCATCGACAATCTTCGCCTTTGGCGCTTCTTTTTGACGTTGCGCCTGAGTCACTGCGCCCGTTGAGGCTTTAGTATCAAAATCGATGACATCTTCATCGTTGAAACCCAGTTCGTCTTCATCCTCGTCATCGAGCATGGTTTCACGATGGAATACGGGTTCATCGTCGTCATCTTCATCTTCGAAAACGTGCGCCTTGAACTCAGTTTCATCATCTAAATCTAACTCGGCCTCTTTAGGCTTGGCGACCCAAGGCGGCGCCTCAAAATGACCATGCTCAGCTACGGCACTGGCTTGGTCTAATTGGGGCTCAACTCTTTGTAGGCCTTTAGGTTCAGCCTTGGGTTTATTGCTGTTTAAACTTAAGATTTTTGCGAGCGCCGACAGCTTACCCTTACCGGAGCTTGCTTCGGTGATGATTTCGTCGCTGACCTCTTCTTCCTTCGCGGGGCGAGTCGTGAAGATACGACTCGGTGTCACCTCTGGCTCACGCACCCGGGCTTTTTCAAGCTGATGCTGTGAGTCACGGCGTTGTTTAAACTTATCAACGACCGTCATAAAACCGCGGGTATCTTCGGTTTCACGCTCGCGTTTTAACGCTTGTGGCAGACGTTTGAGCTTTCTAAAACACCAAATGGAGACAAAGCCAACCTTCTCGACCACAGTCAACCAGCTGATCCCCGTTAACAGCGTAAAGCCCGAGCCTAAGAAGCACAGCAGCAACAAGGTAGTACCGAGCTTATTAAAATACGGCAACATGGCTTGGCCGATAACATCCCCTGCCACGCCGCCTGCGGAAAACTCATAGATATTATTGGCATTCATGCTGGCTAATGCTGAAAAACCAAGAATAAGCAGCAGAAAACCTATGATGCGCAGTGCGACTGAAAAGTAGTCAATTTCTAATAAATCATGGGCGCGTTTGAAAAGCAGCCAACCTGTAGAGGCTACAATGATCGGCATGATGTAAGCAGTGACGCCAAAAAAGTACAACAGAATGTCGGCAATCCACGCCCCTACTGCACCCGTCCAGTTTTTGATATCGCCTTGAAAATGAGACTGGCTCCAGCCCGGATCCGACGGACTAAAACTGGTTAAGGCAAGCAAAATATAGGTGGCTAAAACACAGCAAATGATGAGTCCGCCTTCGAGCAGACGCTGCAGCCCTGAGAGCGTGCGTACACTATTTCCTTGAGACAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022358|2375826:2387126|2381981_2382356_-|WP_011622732.1|DBSCAN-SWA MNNLLLVALGGSIGAVFRYLISIFMIQVFGSSFPFGTLLVNVLGSFLMGVIYALGQMSHISPELKALIGVGLLGALTTFSTFSNETLLLMQEGDWLKAALNVVLNLSLCLFMVYLGQQLVFSRI >NZ_CP022358|2375826:2387126|2382348_2383680_-|WP_089067795.1|DBSCAN-SWA MSSLSFNFAPDFRPLAARMRPRTIAEYIGQAHLLGEGQPLRQALEAGRAHSMMLWGPPGTGKTTLAELIAHYSNAHVERISAVTSGVKDIRAAIEQAQAVAQSRGQRTLLFVDEVHRFNKSQQDAFLPFIEDGTVIFIGATTENPSFEINNALLSRARVYLIKRLSQDEIVHIITQALTDTERGLGQRQLIMPTDVLNKLAQLCDGDARKALNLLELMSDMVADGGSFTTEMLVQVAGHQVAGFDKNGDQFYDLISAVHKSIRGSAPDAALYWFCRILEGGGDPLYVARRLLAIASEDVGNADPNAMTVALNAWDCFHRVGPAEGERAIAQAIVYLASAPKSNAVYTAFKAARALARETGQEAVPYHLRNAPTKLMAEMGFGAEYRYAHDEPNAYASGENYFPESLQASQFYFPTERGFEKRIKDKLAQLAQLDQASGRKRYE >NZ_CP022358|2375826:2387126|2380129_2380468_+|WP_011622735.1|DBSCAN-SWA MVNPLIFNGVEIERDHQGYLKNIADWQPDMAPLLAQEEQIELTSAHWEVIHFVRDFYLEYKTSPAIRVLVKAIGQALGPDKGNSKYLYTLFPVGPAKQATKIAGLPKPAKCI >NZ_CP022358|2375826:2387126|2379498_2379855_+|WP_089067794.1|DBSCAN-SWA MKKICILFRSAPHGTTKGREALDFALLSASFEQEVSLVFVDEGVLHLLKDQQPELIGGKDYLAALKALPLYDIESVFACKQSLGDYGLSHGLLSIPVTILNDEAISAHFKAVDEVLVF >NZ_CP022358|2375826:2387126|2378375_2379035_+|WP_011717039.1|DBSCAN-SWA MTQQTLYSASASTLEVNKLLKNTYLLLAMTLAFSALCAGLAMALNISPLMSLGLSIGGLVLLFVTLRKADSAAGIFWVFAFTGMEGASLGYMLNHYAGMTNGSELIMQALGLTSVIFIALSAYAVTTKKDFSFLRGFLFAGLIVVIAAALINIFVGNSVAFMAINAGLALLMTGFILFDTSRIVNGGETNYIRATISLYLDFLNLFIAILHLLGIGNDD >NZ_CP022358|2375826:2387126|2380676_2381963_-|WP_011622733.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDPKFLRNELAVTAERLATRGFILDVAHLTQLEEKRKSLQVATEELQASRNAISKSIGQAKARGEDVDAIMAQVGDLGAQLDAKKVELAAVLEEVNAIAMSMPNLPDESAPIGADETENVEIRRWGTPRSFDFPVKDHIDLGEGLNGLDFKSAVKITGSRFIVMKGQIARLNRALGQFMLDLHTTEHGYTEAYVPLLVNEASLLGTGQLPKFGEDLFHTKPATEEGQGLSLIPTAEVPLTNLVRDSIVDEDELPIKLTAHTACFRSEAGSYGKDTRGLIRQHQFDKVELVQLVKPEDSMAALEALTGHAETVLQRLGLPYRTVILCTGDMGFGSSKTYDIEVWLPGQNTYREISSCSNMKDFQARRMQARYRVKADNKPALLHTLNGSGLAVGRTLVAILENYQNADGSVTIPEALRPYMGGLTQIG >NZ_CP022358|2375826:2387126|2375826_2377098_-|WP_089067792.1|DBSCAN-SWA MKTSSNIFVNMKFFIFLFYLALLSMLGFIATDMYLPAFKAIESSFNSSPSQVAMSLTCFLAGLALGQLIYGPLVSKLGKRYALILGLGIFALASVAIANSDSILMLNIARFFQAVGACSAGVIWQAIVVEQYDAEKAQGIFSNIMPLVALSPALAPILGAYILNDFGWRAIFISLCVIAFLLVLMTLYFVPSHAEHKDAKPSAVSYGKILKNPRYLGNVVIFGACSGAFFAYLTVWPIVMEQHGYQATEIGLSFIPQTIMFIVGGYASKLLIKRIGADRTLNVLLAIFGLCVISIVFFTLLMKAETIFPLLISFSILAAANGAIYPIVVNSALQQFTQNAAKAAGLQNFLQITIAFGASSLVALWASSGEVAIGWGILSCSLVVILGYLLKTEQTWADFAKHFTAPDPARLGINADTKQNQAD >NZ_CP022358|2375826:2387126|2377213_2378116_+|WP_041412630.1|DBSCAN-SWA MLSEQALELIDIVARVGSFTAAANRLHKVPSAVSYAVKQIEEELGVVLFERHHRSVTLTPAGEHFVKQARNLLTQMDEMKRGTQRVANGWQPTLSIALDNIVRADRISVLIADFYRHFQDIELIIRIEVFNGVWEALATGRSDIAIGATTAIPVGGVYQYKDMGDIQWAFLVSKNHPLASIDRPLTDDELRPFPSICLEDTSREIPKRMTWLLENQRRLVVPDWIRAINCFREGLGIGYMPVHLASVFIKAGALVEKQLENPKLTSPCCLAWNADKMSPALAWVLDYLGDTDKLHREWLA >NZ_CP022358|2375826:2387126|2379094_2379484_+|WP_167373615.1|DBSCAN-SWA MSKFIIQVNGPAYGTSASVNALRFTQASLQSGHEIVCVFFYQDGVYNSTDFNLPASDEYDVVKGWKQLAAEHQVSLVNCVSAALRRGIVSQQEAQENGLSHWNVEHSFIMGGLGELVTGIESADRLVCF >NZ_CP022358|2375826:2387126|2379854_2380136_+|WP_011622736.1|DBSCAN-SWA MILHHIQTSPSRDNALKLCLRYACKEDAILLSSDGVNALLLRQWAMALSPFKVMVLKDDVIARGLTERLKNISQIDYNEFVAQSLQHDKVITW >NZ_CP022358|2375826:2387126|2384378_2387126_-|WP_089067797.1|DBSCAN-SWA MSQGNSVRTLSGLQRLLEGGLIICCVLATYILLALTSFSPSDPGWSQSHFQGDIKNWTGAVGAWIADILLYFFGVTAYIMPIIVASTGWLLFKRAHDLLEIDYFSVALRIIGFLLLILGFSALASMNANNIYEFSAGGVAGDVIGQAMLPYFNKLGTTLLLLCFLGSGFTLLTGISWLTVVEKVGFVSIWCFRKLKRLPQALKRERETEDTRGFMTVVDKFKQRRDSQHQLEKARVREPEVTPSRIFTTRPAKEEEVSDEIITEASSGKGKLSALAKILSLNSNKPKAEPKGLQRVEPQLDQASAVAEHGHFEAPPWVAKPKEAELDLDDETEFKAHVFEDEDDDDEPVFHRETMLDDEDEDELGFNDEDVIDFDTKASTGAVTQAQRQKEAPKAKIVDGIVVLPGQEDKPVPAKPMDPLPSISLLDVPNRKKNPISPEELEQVARLVEAKLADFNIVATVVGVYPGPVITRFELDLAPGIKASKISNLANDLARSLLAERVRVVEVIPGKSYVGLELPNKFRETVYMRDVLDCEAFTESKSNLTMVLGQDISGEPVVVDLGKMPHLLVAGTTGSGKSVGVNVMITSLLYKSGPEDVRFIMIDPKMLELSVYEGIPHLLCEVVTDMKEAANALRWCVGEMERRYKLMSMMGVRNIKGYNAKIAEAKANGEVILDPMWKSSDSMEPEAPALDKLPSIVVVVDEFADMMMIVGKKVEELIARIAQKARAAGIHLILATQRPSVDVITGLIKANIPTRMAFQVSSRIDSRTILDQQGAETLLGMGDMLYLPPGTAVPNRVHGAFIDDHEVHRVVADWCARGKPQYIDEILNGVSEGEQVLLPGETAESDEEYDPLYDEAVAFVTETRRGSISSVQRKFKIGYNRAARIIEQMEMQGVVSAQGHNGNREVLAPPAPKHY >NZ_CP022358|2375826:2387126|2383688_2384309_-|WP_089067796.1|DBSCAN-SWA MKKLLCAVLLSPLLYSNAVLADDAKQLRETLNGTESLKADFKQTVTDINKKIIQTGAGVFALAHPNQFYWHLTAPDESQIVADGKDLWIYNPFAEEVVIMDFAEAINASPIALLVHRDDATWSQYSVTKKQDCYEIKPKSTDAGITSVNVCFNKGTLNKFNVLDDKGNLSQFDLSNQHSISTADKALFKFVLPENVDVDDQRLKTQ |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2432659 : 2504446
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP022358|2432659:2504446|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_virus(18.75%) | tRNA,protease,integrase,transposase | attL 2433064:2433079|attR 2445557:2445572 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3438450 : 3453555
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP022358|3438450:3453555|DBSCAN-SWA 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13 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3475301 : 3482757
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP022358|3475301:3482757|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP022358|3475301:3482757|3477752_3478898_-|WP_089068233.1|DBSCAN-SWA MNWSELDNQMMSRAIQLARKGFYTTRPNPSVGCVIVKDNQIVGEGYHQKAGEPHAEVHALRMAGEFARGATAYVTLEPCSHYGRTPPCALALINIGVKRVVVAVEDPNPQVGGRGIQMLRDAGIQVDVGLHRDEAYALNLGFMKRMESGLPWVTVKLAASLDGKTALSNGVSKWITGPEARRDVQRLRLRACALVTGIDTVLADDPSLNVRYSELGCLSSQLSEAQILQPLRVILDSRCRMPITAALLAIESPMLLVSTVPYSPAFMAQLPAHVTCLQLPAIDGRISLPALLSYLGKSCNQVLIEAGATLAGAFIGAGLADELVLYQAMKILGAQGRNLLELPDYQMMADIPTLKLVDERKVGADTRFTLRLTSNPSLANK >NZ_CP022358|3475301:3482757|3475917_3477021_-|WP_011716202.1|DBSCAN-SWA MALHSIEEIIEDIRQGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAELVTPEAINFMAKYGRGLICQTMTKARCQQLNLPLMVTNNNAQFSTNFTVSIEAAEGVTTGISAHDRAVTVKAAVAKDAKASDLVQPGHIFPLMAQDGGVLTRAGHTEAGCDLARLAGLEPSGVIVEILNEDGTMARRPDLEIFSELHGIKIGTIAALIEYRNTKETTVVREAKCKLPTRFGEFDMVTFRDTIDNQLHFALVKGEVKPDCLVRVHLQNTFNDLLHSERDQQRSWPLEKAMERISAEGGVLVLLGNQEHTCEILSKVKAFEAEDQGQAPASAKWQGTSRRVGVGSQILASLGVTKMRLLSSPKRYHSLSGFGLEVTEYVAE >NZ_CP022358|3475301:3482757|3477088_3477745_-|WP_011621887.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEAVGTLRKLERKGDDIRLTVASGKLDLSDVRLGDSIATNGVCLTVVQQLADGYVADVSAETVSLTGFANYKVGTKVNLEKAVTPTTRLGGHMVSGHVDGIATVEQRLARGQAIEFWLAAPAELARYIAHKGSITIDGVSLTVNEVDGHRFRLTIVPHTAGETTLVDLKAGDKVNIEVDLIARYLERLMRFDTKETQGGGVTMEMLARAGFVR >NZ_CP022358|3475301:3482757|3479645_3480899_-|WP_011625551.1|DBSCAN-SWA MLKKDMNIADYDPELFNAIQNETLRQEEHIELIASENYTSPRVMQAQGSQLTNKYAEGYPGKRYYGGCEYVDVVETLAIERAKQLFGATYANVQPHSGSQANSAVYMALLKPGDTVLGMNLAHGGHLTHGSPVNFSGRLYNIIPYGIDESGKIDYDEMERLAVEHKPKMMIGGFSAYSGIVDWARMREIADKIGAYLFVDMAHVAGLIAAGVYPNPVPHAHVVTSTTHKTLAGPRGGIILSAADDEELYKKLNSAVFPGGQGGPLMHVIAGKAVAFKEALEPEFKAYQQQVVKNAKAMVEVFLERGYKIVSGGTDNHLMLVDLIGRDLTGKEADAALGSANITVNKNSVPNDPRSPFVTSGVRIGTPAITRRGFKEAEAKELTGWICDILDDAHNPAVIERVKGQVLALCARFPVYG >NZ_CP022358|3475301:3482757|3481089_3482757_+|WP_089068234.1|DBSCAN-SWA MAQFVYSMLRVGKVVPPKKQILKDISLSFFPGAKIGVLGLNGSGKSTLLRIMAGIDTEIEGEARPMPGLKIGYLPQEPKLDPTQTVREAIEEAVSEAKNALKRLDEVYAAYADPDADFDALAKEQGELEAIIQAQDAHNLDNILERAANALRLPDWDEKIEVLSGGERRRVAICRLLLEKPEMLLLDEPTNHLDAESVAWLEHFLQEYSGTVVAITHDRYFLDNAAGWILELDRGEGIPWEGNYSSWLEQKDARLKQESAAESARQKTIAKELEWVRQGAKGRQSKGKARMARFEELNTSDYQKRNETNELFIPPGPRLGDKVIEVKNLTKSYGDRVLIDNLSFSIPKGAIVGIIGANGAGKSTLFRMLSGSEQPDSGTIELGETVQLASVEQFRDSMNDKNTIWQEISGGQDIMRINNMEIPSRAYVGRFNFRGADQQKVIGTLSGGERNRVHLAKLLQAGGNVLLLDEPTNDLDVETLRALEEAILEFPGCAMVISHDRWFLDRIATHILDYRDEGQVNFYEGNYTEYSAWLKNTYGADVVEPHRLKYKRMTK >NZ_CP022358|3475301:3482757|3478985_3479435_-|WP_011073317.1|DBSCAN-SWA MHCPFCSATDTKVIDSRLVAEGHQVRRRRECTECHERFTTFEGAELVMPRVIKRDGTRQPFDEEKLQAGMLRAVEKRPVSMDEIEQALSKIKSTLRATGEREVPSEMIGNLMMEQLMSLDKVAYIRFASVYRAFEDVSEFGEAIAKLQK >NZ_CP022358|3475301:3482757|3475301_3475778_-|WP_011073313.1|DBSCAN-SWA MNVVQGNIEAKNAKVAIVISRFNSFLVESLLEGALDTLKRFGQVSDENITVVRVPGAVELPLAARRVAASGKFDGIIALGAVIRGGTPHFDFVAGECNKGLAQIALEFDLPVAFGVLTTDTIEQAIERSGTKAGNKGGEAALSLLEMVNVLQQLEQQL |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
4001941 : 4070176
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP022358|4001941:4070176|DBSCAN-SWA 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53 | Klosneuvirus(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
37256 : 51279
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022359|37256:51279|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP022359|37256:51279|48296_48851_-|WP_063840321.1|DBSCAN-SWA MTNSNDSVTLRLMTEHDLAMLYEWLNRSHIVEWWGGEEARPTLADVQEQYLPSVLAQESVTPYIAMLNGEPIGYAQSYVALGSGDGRWEEETDPGVRGIDQLLANASQLGKGLGTKLVRALVELLFNDPEVTKIQTDPSPSNLRAIRCYEKAGFERQGTVTTPYGPAVYMVQTRQAFERTRSDA >NZ_CP022359|37256:51279|37256_38462_-|WP_089066614.1|transposase|DBSCAN-SWA MTTPTFDINAAIQALREGKDLTGKDGILTPLIKQLTEAALAAELDGHLASTEGANRKNGKTTKTVKSPIGNFELNTPRDRAGTFEPQLVKKHQTQLTDEMERKIIGLFSLGTSYQDIRAHIEDMYGMSVSNGTVNAITDKLLPELQAWRERELEPLYPVIWLDAIHYKIKENGRFISKAVYTILALNVEGKKELLGLYLSDNEGAHHWLSVLTDLYNRGVKDILIACVDGLKGFPEAIETIYPQTEVQLCVIHQIRNSMKYVASKHQKAFMADLKCVYKAATLNAAEMALDELETKWGDKYPVVIKSWRNKWALLSVYFKYPDYVRTAIYTTNAVEAVHRQFRKLTKTKGGFANENSLLKLLYAGILKASERWTHPIQNWNLTLSQLSIHFEGRLENHIDL >NZ_CP022359|37256:51279|39925_40258_-|WP_001393253.1|DBSCAN-SWA MRPHRHPHTFELLLPLRGRFVVLNFDDRGTVTHRAILGETCTVLEMAAGTWHAVLSLDTGGIIFEVKHGGYQPVAADDYAHWAPAEGEPGTTELMAWYAQAQVGDSTFAV >NZ_CP022359|37256:51279|42579_43284_+|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP022359|37256:51279|39003_39879_+|WP_000239590.1|DBSCAN-SWA MVKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGGYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTDGL >NZ_CP022359|37256:51279|45999_46704_+|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP022359|37256:51279|44477_45020_-|WP_002063889.1|DBSCAN-SWA MIIWINGPFGAGKTTLAERLRDRRPKSLIFDPEEIGFVVKETVPIPASGDYQDLPLWRGLTIAAVSEIRRNYSQDIIIPMTLVHPDYLTEILDGLRQIDDQLLHIFLMLNEDLLRHRISNQTMHPDPNRNAEIREWRLANVARCLAARERLPSTTRVLDSGAHTSDELAAMVLDRLDQRT >NZ_CP022359|37256:51279|43229_44386_-|WP_165587319.1|transposase|DBSCAN-SWA MTRRPRRNHSPAFKAKVALAAIRGEQTLVELSQQFDVHANQIKQWKDQLLEGATGVFGDETKAEPSGPTIDVKTLHAKIGELTLENGFFIRCARQGGIAGRKEMIDREHKLSVVRQAKLLGFSRGSVYYLPRPVSDGDLALMRRIDELHLDYPFAGSRMLQGLLRGEGLETGRRHVATLMKKMGIKAIYRRPNTSKPAPGHIRKLAVTRPNQVWAMDLTYIPMARGFVYLCAVVDWFSRKVLSWRLSITMEAAFCIEAVEEALARHGRPEIFNTDQGSQFTSIDFTAVLKRSQIAISMDGKGAWRDNVFVERLWRSIKYEEVYLHAYKTVSEARAGIARYLNFYNTRRPHWHCCKVSDEAAFCLIQRPYISKTLLTRRISPRGSP >NZ_CP022359|37256:51279|48994_49699_-|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP022359|37256:51279|45032_45893_-|WP_000557452.1|DBSCAN-SWA MHTRKAITEAIRKLGVQTGDLLMVHASLKAIGPVEGGAETVVAALRSAVGPTGTVMGYASWDRSPYEETLNGARLDDKARRTWPPFDPATAGTYRGFGLLNQFLVQAPGARRSAHPDASMVAVGPLAETLTEPHELGHALGEGSPVERFVRLGGKALLLGAPLNSVTALHYAEAVADIPNKRWVTYEMPMLGRNGEVAWKTASEYDSNGILDCFAIEGKPDAVETIANAYVKLGRHREGVVGFAQCYLFDAQDIVTFGVTYLEKHFGATPIVPAHEAAQRSCEPSG >NZ_CP022359|37256:51279|49689_51279_+|WP_012783960.1|transposase|DBSCAN-SWA MGSCAAPSAKGDDKFITTDYLQQCHFDDYLLPAEKFAALKREQALPLAINPNSDQYLEERLQLLDEQLATVTRLAKDNELPDAILTESGLKITPLDAAVPDRAQALIDQTSQLLPRIKITELLMDVDDWTGFSRHFTHLKDGAEAKDRTLLLSAILGDAINLGLTKMAESSPGLTYAKLSWLQAWHIRDETYSAALAELVNHQYRHAFAAHWGDGTTSSSDGQRFRAGGRGESTGHVNPKYGSEPGRLFYTHISDQYAPFSTRVVNVGVRDSTYVLDGLLYHESDLRIEEHYTDTAGFTDHVFALMHLLGFRFAPRIRDLGETKLYVPQGVQAYPTLRPLIGGTLNIKHVRAHWDDILRLASSIKQGTVTASLMLRKLGSYPRQNGLAVALRELGRIERTLFILDWLQSVELRRRVHAGLNKGEARNSLARAVFFNRLGEIRDRSFEQQRYRASGLNLVTAAIVLWNTVYLERATQGLVEAGKPVDGELLQFLSPLGWEHINLTGDYVWRQSRRLEDGKFRPLRMPGKP >NZ_CP022359|37256:51279|47335_48166_-|WP_001334766.1|DBSCAN-SWA MKNTIHINFAIFLIIANIIYSSASASTDISTVASPLFEGTEGCFLLYDASTNAEIAQFNKAKCATQMAPDSTFKIALSLMAFDAEIIDQKTIFKWDKTPKGMEIWNSNHTPKTWMQFSVVWVSQEITQKIGLNKIKNYLKDFDYGNQDFSGDKERNNGLTEAWLESSLKISPEEQIQFLRKIINHNLPVKNSAIENTIENMYLQDLDNSTKLYGKTGAGFTANRTLQNGWFEGFIISKSGHKYVFVSALTGNLGSNLTSSIKAKKNAITILNTLNL |
12 | Escherichia_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
78217 : 123662
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022359|78217:123662|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP022359|78217:123662|98851_99787_+|WP_002123001.1|DBSCAN-SWA MDVLSEILDKVELTSSYWYRTSFAGDWGISLPQEENLARFHIVTHGEFWYEVPKLKLKALAEQGDILIFFKGMEHTMASAPKIKAEPAVEFRAKANLTEAQVLEYGDQSKLKANVVCGHFCFNGGPDHPFLNSLPNVVHIKSADNSHSPWLAMLLSIIEQEAKSGLPGSNTLVRKLTEIIFVQALRIHMYKSNKNAGFFKLIENPQLSKTLEAIHHSLDKKWGLDDLAGIAGMSRTNYSVKFKELSGMTPLDYLTYCRLEKAKQLLKESGKSVPEVSEAIGYPAHEHFQKLFKKKIGKTPSAYRKENSEKV >NZ_CP022359|78217:123662|114703_114979_+|WP_089069034.1|DBSCAN-SWA MELKWTSKALSDIARLYEFLATDHPQAAARTVQSLTRAPTVLLINPQIGEQLFEFMPREVRRLLIGQYELRYELQGQTVYLLRLWHTREAR >NZ_CP022359|78217:123662|104575_104920_-|WP_089069021.1|DBSCAN-SWA MKKLTALILGVGLALASQQVLAHGNHADVEPITQAEASTKAQQVLEKLVAGNKLGGSWGSVKAKEISEKKSHHGDPVWVALYVNADEKDAGKQNLYIVLDEVGNVVSAEHTEKL >NZ_CP022359|78217:123662|97204_97450_-|WP_011711656.1|DBSCAN-SWA MLIKLFGHKDCHKTKIYHSYLQEKGSQFVFLDVHEDDAAADELCSLYSNGKLNFPTIVVGTKKLRNPKFKDLDRWLEASMK >NZ_CP022359|78217:123662|87964_88201_+|WP_001087807.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP022359|78217:123662|112528_112879_-|WP_089069031.1|DBSCAN-SWA MVWLLTKYAITALLVVAISEIAKRSDRLGGLIAALPMVTVLTLVWLYLERQPTEKIGNHAWYTFWYVLPTLPMFLVFPRLLQKFGFWPALLLCAVLTMVLFVVLAYVLRQFDIQLW >NZ_CP022359|78217:123662|95139_96117_+|WP_002119794.1|DBSCAN-SWA MTFSLAQTASAETTLKAPAEADQNLRDITELACYICDAPVAMVTRTDDTKLNLIAKVGISRTSVLIKESFCVYAMETPDAVMVVPDATLDHRFSTNAMVISGPGYRFYAGSPLIDPEGAVIGTICVYDHVPKQLNQRQISSLQALSRQVIAILELKKVGEQLHNTSMTDALTGVNNRRAFDLKFEAEFARWQRTGQSFVLALIDIDHFKSFNDSYGHAAGDEALSQVAALFQRHSRNYDFFARYGGEEFVLILPGTDTASANKTLEKLRLVVANHEWLLRQLTVSIGLASADLFDDKKQLLEVADQMLYKAKTQGRNQTSVFATL >NZ_CP022359|78217:123662|99789_100530_+|WP_004911216.1|DBSCAN-SWA MNIYNSPVTKIAFWVIVIGGAACLLIPLFAPLLPLQYLKGYGEIGDALGGISSPFLQILGSVLLFLVLKAQIDANGILHQQIEKEYTKEQLRHELNQLHELYMFVERNIKNFSYDQEKMIDGKSQMILLHSRRAIKCFIEDLESLDVDIHKDDDILRFDGVKEIMSILNSVDLYFDKIKDSEIAPYHKSFYKTLMQHELLFSVFPYQDLDNQAYLKQEHCPECGEYHANYPPLIYDRLQKIKKSFS >NZ_CP022359|78217:123662|90256_90703_-|WP_011711653.1|DBSCAN-SWA 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48 | Salmonella_phage(33.33%) | integrase,transposase | attL 121394:121409|attR 126314:126329 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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