Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011037 | Pseudoalteromonas nigrifaciens strain KMM 661 chromosome II, complete sequence | 0 crisprs | c2c9_V-U4,cas14j,csa3,cas3,DinG | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP011038 | Pseudoalteromonas nigrifaciens strain KMM 661 plasmid unnamed, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
NZ_CP011036 | Pseudoalteromonas nigrifaciens strain KMM 661 chromosome I, complete sequence | 3 crisprs | cas14j,c2c9_V-U4,cas5f,cas7f,cas6f,DEDDh,cas3,RT,WYL,csx1,DinG,csa3 | 0 | 2 | 10 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011036_1 | 439946-440161 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011036_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP011036_1
>1.1|439982|24|NZ_CP011036|PILER-CR CCTTGCTGCGGTGGTGCAGGTGTG >1.2|440042|24|NZ_CP011036|PILER-CR ATATGCACGGCAATAATACAGCGT >1.3|439982|31|NZ_CP011036|CRISPRCasFinder,CRT CCTTGCTGCGGTGGTGCAGGTGTGTTTTTAT >1.4|440042|31|NZ_CP011036|CRISPRCasFinder,CRT ATATGCACGGCAATAATACAGCGTTTGCAAA >1.5|440102|31|NZ_CP011036|CRISPRCasFinder,CRT GATTTGGATTACATGCGCCATCGAAATAAAG |
cas6f,cas7f,cas5f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011036_1
The CRISPR arrays of NZ_CP011036_1 >merge|NZ_CP011036|1|439946-440161|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTATAGTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATGCCTTGCTGCGGTGGTGCAGGTGTGTTTTTATGTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATGATATGCACGGCAATAATACAGCGTTTGCAAAGTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATGGATTTGGATTACATGCGCCATCGAAATAAAGGTGACCTGCCGTATAGGCAGCTGAAGATA >NZ_CP011036|1|1|439946-440101|PILER-CR TTTTATAGTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATG CCTTGCTGCGGTGGTGCAGGTGTG TTTTTATGTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATG ATATGCACGGCAATAATACAGCGT TTGCAAAGTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATG >NZ_CP011036|1|1|439953-440161|CRISPRCasFinder GTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATG CCTTGCTGCGGTGGTGCAGGTGTGTTTTTAT GTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATG ATATGCACGGCAATAATACAGCGTTTGCAAA GTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATG GATTTGGATTACATGCGCCATCGAAATAAAG GTGACCTGCCGTATAGGCAGCTGAAGATA >NZ_CP011036|1|1|439953-440161|CRT GTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATG CCTTGCTGCGGTGGTGCAGGTGTGTTTTTAT GTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATG ATATGCACGGCAATAATACAGCGTTTGCAAA GTGACCTGCCGAGTAGGCAGCTGAGAATG GATTTGGATTACATGCGCCATCGAAATAAAG GTGACCTGCCGTATAGGCAGCTGAAGATA
>NZ_CP011036.1|WP_089367676.1|439211_439823_+|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MQRYYFIVQFLPKQANLALLTGRCISIMHGFILKHNIEGMGVTFPAWSDSSIGNVIAFVHKDMEILNSLKEQAYFVDMQDCGFFKISQILAVPESCKEIRFIRNQAVAKIFTGESRRRLKRLQKRALARGENFNPKKIEAPREVDIFHRVAMTSKSSQEDYILHIQKQNADSQVEPDFSNYGFASNEKFKGTVPDLSPLIESN >NZ_CP011036.1|WP_089367675.1|438156_439209_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MELCNILKYDRSLYPGKAVFFYKTADSNFVPLEADINKIRGPKYGFTEAFTPQFLPKNISPQDLTHNNILTLEECYVPPNVEHIFCRFSLRVQANSLAPSGCSDPDVFSLLKELAETFKECDGYKELATRYCRNILLGTWLWRNQNTGNTQIEIKTSKGNSYLIDNTRKLAWESKWTSDVQKVLEELSDEIECALTDPNVFWSADITAKIEASFCQEIYPSQILNDKVKQGEASKQFVKAKCADGRYAVSFNSVKIGAALQSIDDWWDEDASKRLRVHEFGADKEIGIARRPPDSEQNFYAIFKNTEWYLSALKNCITNKNENIDPAIYYLFSVLIKGGMFQKKAESKKA >NZ_CP011036.1|WP_089367674.1|436054_438142_+|hypothetical-protein MHLKELLEITDITERDRLLRRAFSPYTAMTDITGSEATALIILLNLTYRKNQVDDLLDKQLAKQALKSEDHINKCIKEIAWFHTHNLKYPDIRVSKQNLAVEPPLLHSYVLSSANYPKAYGWSHDSAKVNVAKLFISYFKWQNQVSCLAQVLATNSDNWKAAFTSLGLSVKAFKSLCVTVKKSLPEEAIPDSVDRYSRQIRMPYHDGYLAVTPVISHVVQSRIQQAAIDKRARFSNVEFTRPAAVSMLAASLGGVVNVLNDPPYIRSKYHGLSNSRAFKLNNGQTVFNVEALLKPELIKALEGIIFSNNALALKQRRQQKVKNIKELRNTLLEWFSPVFEWRLDVIENGDDLEQLESASDRLEYKILSLPDDELPSLTIPLFRLLNEMLGGVSMTQRYAFHPKLMSPLKAALQWLLINLTDQKNEPIEVDEEHFRYLHLSGIRVFDAQALSNPYCSGVPSLTAVWGMLHSYQRKLNEALGIKVRFTSFSWFIRDYSAVAGKKLPELSLQGAQQNKLKRPGIIDGKYCDLVFDLIVHVDGYDCDLQVIDSEPDILKAHFPSNFAGGVMHQPELTSNVNWCCLYSNENQLFEKLRRLPLSGCWVMPTDHKIEDLDELLLLLNNDSKLSPSMMGYLLLTEPKARVGALEKLHCYAEPAIGVVKYETAISIRLKGISNYFKTSFWMLDAREKFMLMKKV >NZ_CP011036.1|WP_089367673.1|434820_436050_+|hypothetical-protein MTFLFSPKARAFSDESLESYLLRVVSENFFDSYQELSLAIREELHELDFEAHGAFPIDLKRLNVYHAKHNSHFRMRALGLLETLLDLPRYELQKLALLKSDIKFNSSAALYKNGVDIPQKFFRYHAEAAVDSIPVCPQCLAEEAYIKQSWHIKWVDACTKHQCTLAHNCPECCAPINYIENESITHCSCGFELTCASTSPVNALSIEHLNKLLDKSERNDSNPLFSNTTLTECSAALLWYQGRYSQTDNFCLDDAVDYFSMWPAVFYKELDELSKNAEMKLIDLFNKTEFKFIFGDAILACPSTQMQRELHFIYRALLDYLVTLVESNPKTKKPNAADLLVSVLEAATLLGTSVEQVYRLYQDGILQTAFRHKMNQRINPYKGVFFLRQVIEYKTSFGNDKARMYLSAW >NZ_CP011036.1|WP_089367672.1|433275_434655_+|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MLRSWQKECVELAVKKYTASDKHFLCQATPGAGKTIMAALLAKTLFDKGMIDRVICFSPSVEVANNIKRTFGKIIGCSFDGSFTAVGASMTYQSLCSIPESTWDRLRKYRTFFIFDEIHHCSFSQDKSKINTWGERVVFHLQDIATYTLALSGTPWRSDALPIALVSYSNPEGELICDYQYSLIQAIRDNVCREPKIVLVDSNSISDGHDTYGSIAEFVKQAQSTYQEVLNNDSALRYLLKLAVLKLSEIRDSNPIAGGLVVASSVKHAEMINSLLIEEFNQTSTIVTYLHDNSTRKINSFKSSTEQWIVSVGMISEGTDIPRLQVCCHLSSIKTELYFRQVLGRILRSGKGKIEFAWLFTFAETRLVEFAERINIDIPGSCSYVDMECDSISVGEDIFRRFKPPLRDTCSKLKVNIDKLILGDLSSGLNTAYDERLLGCSLSNIQIKSLRTRVIEAFL >NZ_CP011036.1|WP_089367671.1|432733_433282_+|hypothetical-protein MPQVIKLNQHIYSLLIEKECNGFTIVELRDELLTVTDTYQDIDEARKFIYRQTTALERKELLNSKGSGRHKKYFKTGLFNNATFVAKQAVIEQEKLSTSNIDNQASPLIETLLNEKKQFEAELAILLGEVDEYKALQKRFPEHLSLFYSALDDAKNNSAKLLGKVNALTTILASLNNDAPQC >NZ_CP011036.1|WP_089367670.1|432228_432537_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MFQNPIPIRLKQARAKSGITQKQLGILIGMDENSASGRMNHYEKGRHIPDLATLKKIADELNVPLNYFFCEDNTTAELVIEISKLDIEKKFELIKQLKATAK >NZ_CP011036.1|WP_089367669.1|430881_432072_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKVKMFPAENGDAFLLCSTNINILIDGGYAKTFDKYIKPDLEDLASKGKVLDLVIVTHIDADHIGGIIRFLTLNGIQNLKKIIPINKIWHNSLRSLSSPKKIDVPPEGIDILKAIIKRGHPKESIFKSSNIEEISAKQGCTLAALIREGGYRWNESNGFDSICVEEFSFSETYNDSIKVINPTRAKLQELLLYWKKELRRFGHLDDIGSNEIIDDAFEFNFEHHQDSNITGQTLVAAGCKNELKDVYRPDRSPTNASSIATIVKLDGVRILMLADALAEDILNELIKMQADGESMLFDAIKISHHGSNYNTSPDLLSIIDAPKYFISTNGGGKHNHPDIELLRAIVNRAADFTRTLYFNYSTDASKEIRNFQATYSNFIIEENFTGWIEIIKEKSC >NZ_CP011036.1|WP_089367668.1|425119_430888_-|trypsin-like-serine-protease MLDAEAKYATCKVNCGGEQGTGTLITNKVVMTAAHCVNSTIDNKFTIEVVFDFNDKPLALEARVIAYSLDLDIALLELDKDCGIRPISLRSTSPVSGSRFFSYGFPANKLTMGHRLEGNLEQVFDNFKLGSDIEISIDAALSLDNYQGFSGAAIICEGACVGVIRVSIEKTMGAISISAVYDFLNEYGIHIKPEETHKKSSHLISREIFIEEFDSFVCSQINKYIFIKGAHGLGKSVFCETYSPSNSTLEKFGAYSFTTKKSSKNAIQLAQPQEFFNWLNIQVSMLITSNPGRKEILDYQKIIDKTGELFIQLAEFYTLKNKVGILFIDGLDEVERQDAETLNKLIGLMPARLPPGLVIVFSAPNYDQFATRLGNRLSNESCISLPPLNHEPVQAFCYQSLREKHSNSKTVNLICERAQGHPLYLHYLIDLANSGTSADEIKSLPLIEGSIRKYYDIIWMQLREDNDAVNLLAIAVRLRWGIPISHFTDILNSHEQAILISTLGRMQHLLLDNSETTIYHSSFSDFIIEKTQLRERDIQLRLAKHCEEMKLRRYCLLNLIYHNLKAKGAEKTHVMELCNQNWVDDCVYNDVEPDTLIDDLHSVLKVATEQGNLVETVRILLLSQRIQFRYNTLLSQSADLTANALISIDKKQEVIKHISRYGHLIVSFDEALSIALKLIDSNNNEEALELLNIVESHLTENLEAVFKSNGLSYKNFLYIYDLQIQQFLLRVRAGHHSSKLAIANFQHHWMNIIDKTSENEEASKLIRSEMFTYMQTASMCLIDRFITISELQKVYSGPLNELAEPIVFSAYYYQMLCEKYGINQNILLLEQAFSDIKTLISEAWNAQMKVHPNVVDSFILNGAPRDIIIALSKDNSSAPAPINFISSDSVFVDEEALNDGMSEWRMKAFIEANFPRPNLVKLHSETWIVGIKSTLQLIAWCDGSARRFKSTGNIASLESVWNILHVDILNQLKFRLSERAEWIDSYGLPEDILPYIYESIIKLVSDIFPEKAYEILSFIEGQFKHQCGIYSEGFRRILSEVLDIFTRSGLNLEAEDKAFDLVELWLKFVIPNLKNRHELVPDLLKIIPLFTKLGATEKAAETYRLVLAYSMGPNWYKEDQLGLSITALKSQNSELTLPSGSVNQIAGLLDAAGGEMTFQRYVRYAKRDFLSALCSRSDYLNAVNYFIKQTYGTIYQMYQDVTHDDIDRVSKLRGTRFPGTALDEQDSVLVIIESLAPNADWQLCWALLESYQFGDSRYITRFAEVYGLLIDKVSEDDKSMSLIIDRLEIICESEFSNKSNCSEFIASIAPFIPEQYKNIFEDKFCELLAVSSTGKFKVQTAEEKKDKVDNIGNQQAEETSDLLYMPGTFGRKDSIDEAATAFSNAERFLRRQNYSEGQKEIISGLNSIQTAGWPIWAGQMSESVVAQSLLLETTNSVTNLIKLYSPLILNERYADNWRIADCLIKWLTSHSSDNEQLELIRVTCEHTKLMVGNINEETAIFSSHDNMKESSNCLVTLLLHAIEHPSWQRREKASDMLIWLSQSFSKFVHLFGAKAFTMDSGAHPDLICGALEQLSSSSPKLWETLSKELDFCFIEKNCKHLGRYSVLVKLARDAASKELESAEEALNTLMTRFDCVGADKDKKNYIELPSWAECISDKWEKLNSLGFLSTGVVTEAESILKVICSSFSANISLELEQLLAEGYYGNVKNPVRWQDKVCFVLQVALQNFRDESDYKKIESIFRKYNPSRLDNLRVKKFKSPALHWLESKKISPMQEDIIFLDYCERVFFQGKLRLVRLTAYLSDKPNEISLPSGRFLSVDKPMLDNTSLLDTCANVSPLPAYFGSFTPAIPTTDFMRNTNSSSSSIKRAWWRSGRLKDTYKGAPSHEGCFLSIKASSLQLPQGFKLIWIFELDHKPVSIISFG >NZ_CP011036.1|WP_089367667.1|424867_425107_-|hypothetical-protein MNFETYDTPRTRLEFELRFHYLHSTMKKGKFSVSADVSIEGILNVRKLPNGRIDFLSVNESARLHANTVFHMRNFKPPE >NZ_CP011036.1|WP_089367677.1|440405_440855_-|DUF2384-domain-containing-protein MPSYIQPSANRKFVEILSDGTINLNSNPLDEIELIQRGLDINCVEKFRLELRWDLQSFTKAIGTNTKAFERYIKEHKRLNVTLSENIVELAHLASACIDYFESVERWTTWLNTRSLQFSSEMPLTFVNTIAGRELIKKTVDSLNHGYNA >NZ_CP011036.1|WP_089367678.1|441176_441641_+|DUF2059-domain-containing-protein MKKLLLIVLLLPFFINANELVFKLLEVNGAKAFFAQSKGQMAKVMYMTDPSLKPYSGLVEKWEEDYFSWEKVKLSIAPIYSSKFTNSELEEIVNFYTTGKPDSFLVTNTGKKFQSLLPEINQEFTMNGHKYMSHVSPFLYEAVSNSTKSLKQDK >NZ_CP011036.1|WP_089367680.1|442488_443469_+|hypothetical-protein MAETGNIEKLAKLVSKDIFKWFKWETCLPKDENWECVTEHHGKTTHPSDVVFYYDDPYSGDTKYLNTDLKSYKAGSINTSSVSKALKSLAMSVECANISESWQSTFLLDDVGFGSVAGLLFIYNHDDKYDYDFSDLMGRVGFREIPLLEDKEIVVMGPHLIKRLCDVVSDMQKLKADDSFPSPKDFTFFYPDLIRARRCGDEWDKPATVEALTSPWLIIKHRSGDDFDSGFVIYYHQSGETVDEFIYLIDAMSHYQMLSSDYTIRVRFTDASKHASVNFEKAKREYLKMWGNDDAREKQMTVIEAETITKFTTCFNPMEIGMREDV >NZ_CP011036.1|WP_089367681.1|443461_444574_+|hypothetical-protein MSKLRTGPSIYIPTDKNIFDALQHKKVTHSELVLFLRGRGILVSSSTSKDALIEKISSLALSYSDFNWIGKLLENPNRKDKTTHSKLKGEIEDSQIQAACSAVKANLTAIGDDSVKVTKSGDTTTLTVSYVDHDFTKTEMRQRTLKTCEIKLEKGKDGVVMKLPSTKKAKEVSETLKKAVQAQVIKDTGTELEEFSISLQSITNASCRSEFFDSLIRNVPDFKFDNVSSVDVYHLEQEEKDELDEDDTVEARLASYINKAALAGEGVLDSTEFKQLHKRGFYIYKIIWTAIDRTHEGPKVEFEACFGRPDLCTEFMYTVRGLYPYNSRTLEYNVTRKAATPYENEKYNVNLRDASEKALAKTIEAYDKKV >NZ_CP011036.1|WP_089367682.1|444577_445249_+|hypothetical-protein MIKAKWLYSELPLTLTELSRLMKEQQYSEETGLGFLLSVSTPSKLSGKYVEKQVQRSVVEDPFGEVTEIESVSYYTCQFNWSSSSKYMYITNPPRSLRKFLNKLHEMTGLGLVLSEVNVAPERWVGYLERASDSLKVTQLSSYGIRVSQGASAKITVNGIKDIRDDFSTIISDKRYLVDSVKFKAEFGSLELLCELTRLGVCRLKSANVNFVLDKLREALEGV >NZ_CP011036.1|WP_089367683.1|446035_446776_-|divergent-polysaccharide-deacetylase-family-protein MKVIIGLILMLGFASLNAKAKQIAIVIDDIGYHQRDLELLTLPGQVSYSILPHTPYAQAFATLASKTNKELLLHIPMQALNGKELGPGALTLNMNKEQIQQILGTALASLPQVKGVNNHMGSALTQQGQAMRWIMEVLKKRHLYFLDSRTTELSQAQNAANFLGVENIGRHIFLDNITTREQLQLRLDELKQHATEHKFAIAIAHPYPETIAFLRHVLPQLSKQGFELVPVSKLVERKYIQLAEKR >NZ_CP011036.1|WP_089367684.1|446848_448114_-|S41-family-peptidase MDKKSTEAKWFKNTGFTLNLSLYLLALLIFISFSANVFSSSIKELKSQQITEILFNIHTYYVEDLALQNTTHTSYNNQQFAHLYAQLDPYSKYLDEHELNTLFDNTNGRYTGLGIEVKQINNSVTIVNVVSNSPAKSAGVMAGDIIISVNNQTTQNSTVEHVAQLITASKLSNISLTIKRDNQPQPLNFNVSRRKIKLESVTSQRLDLGSGYLAINSFSNHTLHEVALQIAAMQNHFGDPLKGLVIDLRDNPGGTLRSAVAVSDLFLQNGTIVTTKGRYNEANKAFYAKHGDILKGAPIVVLINENSASAAEILAAALKDNNRAKVVGSQSFGKGSVQSLIPLGDGSTALKLTTAKYFTPLGKSIEGVGITPDVAINQTTLSQSDKAVIIKNQQAKSKQTQLASKVTDLQLAKAKQLLNLQ >NZ_CP011036.1|WP_089367685.1|448182_449325_-|peptidoglycan-DD-metalloendopeptidase-family-protein MQKCINSVTKLILILTFLATATAVANEDRTKKDLSEVQTALKQSQSEYNAQRKKVATLQKNLQQHELEIAKNAKALNMAEQSIKKTEQQQQLQQQKADQLEQQHAQFQHALAAQLKSAYMAGGDDDYAKMLLNQEDTAKFERTLSYYNYLNKARIEQLEELKALQLQIAKNQAELAKTKQKLVNLHDEQKRRQTALVSAQSERQANLKNLQAQLNSTKSSINYLKENQQTLITTIEELEKEKNKKVELLGLNNSKGKLNWPSRGKLEHTFGQRKHGGIDWKGVLIGAKEGSNINSVHNGQVVFADWLKGYGWVIVVDHGEGFMSLYGHAQTLLKDVGDMVREGETVALVGQSGGQASSGLYFEMRHKGRAVNPEKWCKRI >NZ_CP011036.1|WP_089367686.1|449328_450873_-|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MSEHKKPLVLMILDGWGYREDEQSNAILAANTPVLDELWATRPRTLISASGFDVGLPDGQMGNSEVGHVNLGAGRVVYQDFTRITKAINDGEFDSTPALVDNIDKAVSADKAVHIMGLLSPGGVHSHEDHIVASIELAAKRGAKEVYFHGFLDGRDTPPRSAKASIERIEAVFAKLQCGRLASLIGRYYAMDRDNRWNRVEKAYNLLTLAQGDFSYPTGVSALEAAYERDENDEFVAASTITPAGAEPVQINDGDTVIFANFRADRAREITRAFVEPNFDGFAKQKSPALSAFVMMTEYAADIDAPVAFGPTPLVNVLGEWFEKHGKTQLRISETEKYAHVTFFFSGGREDEFNGETRELIPSPQVATYDLQPEMNSEMLTDKLVAAIKSGKYDAIICNYPNGDMVGHSGVFAAAVKACEAVDHCIGRVVAALNEYGGEALITADHGNAEQMANLKTGQAHTAHTSEPVPFIYVGRDATPSEGKALSDVAPTMLHLMGMEQPTEMTGKPIMTLK >NZ_CP011036.1|WP_058372459.1|451501_451933_+|rhodanese-like-domain-containing-protein MDQYIEFITNHPILSAAWVGIVFLIVSGWIKSKLSAVRQINPQQLTLLINREDGQVIDMRAQKEFNTGHIAGAQHLSPENAKKSDFSSLEKYKSKPIILVCTTGMTASGTATAMHKAGFEQVSVLSGGMGAWQSASLPTTTGR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011036_2 | 459818-459923 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011036_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP011036_2
>2.1|459842|58|NZ_CP011036|CRISPRCasFinder GGGTTGGGGGTTTATTGTAGGCGGGGCTTTATGCCGCCTAGTTAAACTCTAAAACTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011036_2
The CRISPR arrays of NZ_CP011036_2 >merge|NZ_CP011036|2|459818-459923|CRISPRCasFinder TGCGCGAGGTAAACTCCCGCCTACGGGTTGGGGGTTTATTGTAGGCGGGGCTTTATGCCGCCTAGTTAAACTCTAAAACTATTGCGCGAGGTAAACTCCCGCCTAC >NZ_CP011036|2|2|459818-459923|CRISPRCasFinder TGCGCGAGGTAAACTCCCGCCTAC GGGTTGGGGGTTTATTGTAGGCGGGGCTTTATGCCGCCTAGTTAAACTCTAAAACTAT TGCGCGAGGTAAACTCCCGCCTAC
>NZ_CP011036.1|WP_086996570.1|458968_459454_+|hypothetical-protein MTKVNTLSKLVLICGLATATFGATSVMAKGDMHKQGRHSQAHFLLSERGADKLDLTQEQQTKLEAIFAAQKTQMQALKGTDKEARKAQRTAHKAKMESLLSAATFDENAAKELLAQRHEKGEEMGLIKLKTQHQVWQVLNAEQQEKFAKMQKRMGKKKHSK >NZ_CP011036.1|WP_089367689.1|458114_458804_-|response-regulator-transcription-factor MKLLMIDDDTGLCELLSEYLTAQGFNVQSVHDGEQGLKLAQANDYALILLDVMLPTLDGFEVLKQLRQTKLTPVIMLTAKGEDFDRIFGLELGADDYIPKPFNHRELLARVKAITRRIEHITTMNATSNNKLVVNGVTINLAAREALIKQTTLTLTGTEYEILALLAKRAGEVVSKEQISEDVLGRRLASFDRSIDMHVSNIRKKIAEHLPNELIKTIRGTGYVFIQGE >NZ_CP011036.1|WP_089367688.1|456721_458137_-|HAMP-domain-containing-protein MSLFKANKLASFSWLKHPRHYLFFKIFTWFWLTIIGTGAALIFLSSVTTINSVSYNPLHGPMEKNLAYTAKNIERSTIKHKRSLNDTLKHPRRTNGKLLYLNAEQLEDSLTNKSIPADVDLSLLNFTKSMPPQVIYTEKYQAIGPIKIRVPEGDFYLYEIDIYNHTPLYLRLKLMPGWIKISIAIIASLILSFLFSRNLIAPINSLKKAAIKLSAGDLTARAAISANRKDELGILGRDFNRMADQLAQLISAQKRLLADISHELRSPLTRLKMATGLAQMQANEASQSYLLRIEKEANQLDKMIADVLQVSRLEANSQALSLHKQSLQDIVDHVLNDATFEAKQHNKQLQVSGSAAVTLNCDEALIASALENLLRNAIKYAQHTISLTLKHGDAIYIEICDDGPGVPNNQLSKLCEPFFRQSDARDRVSGGTGLGLAIAKNAIIAHGGSLILSNKPQGGLCAMVTLPIIKE >NZ_CP011036.1|WP_089367687.1|455785_456718_-|alpha/beta-fold-hydrolase MFYSSENELIDNQPSINDFYNNTLVKAYLNTPAGQLFYAYAKPEHAHTAIVISSGRIEGLDKYKELLWELYTNNFAVFIVDHQGQGRSYRQLANKHKGYVKCFTDYRHDLHLFNQQIVDNHWQGKKILLGHSMGGAIAFDYLAHFENSFSGLFLSAPMFDIHTKNTPKPLAKLIANAAVFFGFSQSYALGQNDYSPEEFALNSLTSSQVRYKNFRQTYQDPLLQLGGVTYGWLQAAFTFIASVDKLSINIPLFIASAERDEVVDNTAQYKLANRHNQAIIKSFAGAKHELLFERDEIRQPLLTSLYQFCE >NZ_CP011036.1|WP_083497533.1|454568_455435_+|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MVMVSLMIAAKTWAWLASGSASMLGSLTDSLMDITATAMSFLVLGYALRPADDDHRFGHGKAEALAGLGQAAFIAGSGCLLAFHSIERLFNPLELTHSLLGVWVSIFAIACTLVIVFVQNKVVKHTESIAIKADSVHYKGDLILNAAVLLAILLSYYGVLYADPIFAVGVAGYLLYNSWDIARDSADHLMDKELPDEEKQRILDVSKSHTDVRGVHGVRTRQGGKVKFIQLHLELDDHLSLIRAHNVADEVEAMITKEFESEVDILIHLDPLSSVELSDTEGAAVTEP >NZ_CP011036.1|WP_011327082.1|453943_454408_-|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MLDIVLYQPEIPPNTGNIIRLCANTGYSLHLIEPLGFAWDDKRIKRAGLDYHEFSHVQRHASFEAYLEACKPKKIYACTTKGSQFHHQAQYEAGDCLVFGPETRGLPDELIQSLPNEQRVRIPMQANSRSMNLSNAVSVFVYESWRQLGFPGAK >NZ_CP011036.1|WP_058372461.1|452754_453762_+|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase MSTATSAVTVLGAGSYGTALAICLARNGHQVTLWGRNSDDVATLAAERKNQRYLPDIPFPDTLTLEADLQRAAASNEIVLVVVPSHAFGDTLKQIKPALQQGAKVAWATKGLEPNTGRLLQEVAVQELGDAIPLAVLSGPTFAKEMAMGSPTAISVSSTSTEFAKQLADLLHCGRSFRVYNNDDFIGIQLGGAVKNVIAIGAGISDGVGFGANARTALITRGLAELTRLGCALGAKPETFMGMAGLGDLILTCTDNQSRNRRFGLALGKGESVEAAIESIGQVVEGFRNTKEVYLLAQRSGVEMPITEQIYKVLYENKDMKEAAMALLGREQRSE >NZ_CP011036.1|WP_011327080.1|452262_452751_+|protein-export-chaperone-SecB MNEETQNAAAQQETGAQFTIQRIYTKDVSFETPNSPAIFQKEWTPEVKLDLDTRSNKLDEGVFEVVLALTVTASIGEETAFLCEIQQAGIFTIADVEETQLAHMLGAFCPNVLFPYAREAVSNLVNRGTFPQLNLAPVNFDALFAQYMQQRTAQAEQASVDA >NZ_CP011036.1|WP_086996610.1|451964_452222_+|glutaredoxin-3 MSNVVLYTKAYCPFCQRARALLDSKGVQYTNFDIGVQPELRDEMIAKAGGASTVPQIFINDEHIGGCDDMMAIEAQGQLDKKLNA >NZ_CP011036.1|WP_058372459.1|451501_451933_+|rhodanese-like-domain-containing-protein MDQYIEFITNHPILSAAWVGIVFLIVSGWIKSKLSAVRQINPQQLTLLINREDGQVIDMRAQKEFNTGHIAGAQHLSPENAKKSDFSSLEKYKSKPIILVCTTGMTASGTATAMHKAGFEQVSVLSGGMGAWQSASLPTTTGR >NZ_CP011036.1|WP_011327088.1|459995_460226_-|DNA-gyrase-inhibitor-YacG MPTIVNCPTCKSKVEWSEQSPHRPFCSKRCQLIDLGEWSFENNRISAPITSAEDFSQDMIEDIEAMMAKNEDDFFK >NZ_CP011036.1|WP_089367690.1|460898_462572_-|type-IV-A-pilus-assembly-ATPase-PilB MNINSPLLRKFITLGRVDADIVKTKQQEFASTAELIAKCGKIESKDLAAQCIDLFRVPFFDLKDFNTALISPELIKEKLIRKHHILPLVQKGRKVYIAASDPTDYGAFENFEFSTGLSCEVVVVDYIQLDKKIEQLLDATGSLNLSDDEFKEFAELDADIQKDTSKDDDKDDAPIIVYINKILMDAIKKGASDLHFEPYEHKYRIRFRIDGILHEVASPPNTLATKLSARIKVMSRLDIAEKRKPQDGRIKLKITERKSVDFRVSTMPTLWGEKIVMRILDSSSAMLGIDVLGYEPEQKKLYMDALEQPQGMILVTGPTGSGKTVSLYTGLNILNQPERNISTAEDPVEINLEGVNQVQINIKADMTFANALRAFLRQDPDVVMVGEIRDLETAEISIKAAQTGHLVLSTLHTNSAPETITRLLNMGVPAYNVASSISLIIAQRLARRLCPKCKTPENLPSEELLRQGFSQQQISEMTLYAPKGCENCTDGYKGRVGIYEVMKITPEIAQIIMRGGNSLEIAEVSLKAGFNNLRLSGIRKAADGMTSLAEINRVTSF >NZ_CP011036.1|WP_089367691.1|462692_463325_-|dephospho-CoA-kinase MSEQTVKVTNINNWVLGLTGGIGCGKTAVSNMLEALGICVVDADIIARQVVEPGSAGLKAIVAHFGADILLADGNLNRSALRKLVFSNTEHKNWLNTLLHPLIRQQIITDLNNATSPYVVLVAPLLFENGLDKYCNRTLLIDVPKNVQIERTVKRDNISLEQVNSIIAAQMSREHKQQQADDILNNDRSLTLVKHDLIALHKGYLKLALK >NZ_CP011036.1|WP_089367692.1|463326_464247_-|prepilin-peptidase MQSFFLDITTVMQSQLWFYLTTIGLVSLCVGSFLNVVIYRLPLMIQREWQGECRLLLESELKSNKANTNEPFSSGLNSTFNLVKPNSTCPKCKTAIKAWQNIPIISWLFLKGQCASCSNPISARYPIVEAITALLSLVVAYKLGATEQALLYIAITWALVALTFIDIDHMLLPDQITLPLVWLALIAAVLGYTVNPTDAIIGAACGYLSLWSVFWLFKLLTGKEGMGYGDFKLLAVFGALLGWQSLLIIILLSSVVGAIIGIALLTIQGKDKATPIPFGPYLAIAGWITMLWGEQLQASYFNLIGY >NZ_CP011036.1|WP_089367693.1|464704_465088_-|GxxExxY-protein MEIDLLTQKVIGCAIEVHNQLGPGLLESSYEKCFIYELQQAGIVAKSQVELSINYKNILIDAGYRLDILLPNQLIIELKAVDKLQPIHSAQLLTYMKLTSISSGLLINFNVKKLTDGVKRFNLPKGE >NZ_CP011036.1|WP_089367694.1|465748_466966_-|type-II-secretion-system-F-family-protein MKKNSDLDTFQWIGVSTRGKRLEGEMTGASIALVKAQLRKQGITPSKVKRKAKPLFGVRMQAITPKDIALVTRQIATMLMAGVPLIQSIEMIGSGSSNKSVSKLMETIADEVKAGQPLSQALRRHPRYFDDLYCDLVASGEQSGALDKIFDRVAIYKEKSEALKSKIKKAMFYPIAVLVIALIVTSILLIFVVPQFQDIFSGFGAELPAFTLMVIGISEFMQEYWWMMLIVIVAFGWAFKEAHLKSLKLRDATDRAILKLPVIGMILNKAAVARYARTLSTTFAAGVPLVDALDSAAGASGNAVYRYAILEIKAEVSSGNQMNWAMRNSKIFPDMVIQMVAIGEESGSLDSMLGKVATIYEQEVDDAVDGLSSLLEPMIMAVLGVLVGGLIIAMYLPIFQLGSVI >NZ_CP011036.1|WP_089367695.1|466976_467417_-|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MNIYNVINKPKGFTLIEMLITLAIIGLLASIAIPQYNLYLNRAKFSEVILATSIYKNSIEIAFATNSYTSLDEFDGGNLGIPENNSPQIIPHKHIANSTVINGVIYIESSISLDGSNVTYILTPTISAKNTLSWNTTGSCIDAGLC >NZ_CP011036.1|WP_089368925.1|467437_467854_-|prepilin-type-N-terminal-cleavage/methylation-domain-containing-protein MTQQSQKGFTLIELMIVVAIIGILAAVALPAYQNYTNRAKFAEAVLAVTPYKTAMELAIQTKNITAKTDLNAATFGIPADIALTANDHGVVAADGVITVTWKTDKSPLDGVTYTLTADGVTPPVNWAEGGTCLTNGFC >NZ_CP011036.1|WP_089367696.1|468327_469173_-|carboxylating-nicotinate-nucleotide-diphosphorylase MPIPHTLVSQLVTLALGEDLNYQSAENGDITAQLIPANEQANAKVITREDCIFCGKDLIIEVFKQVDPSVVVNVLVNDGDAVKANSTLFTATGSARAILTAERTALNFVQTLSGTATTTAHYVKELAGTKTQLLDTRKTIPGLRILQKYAVKCGGGANHRIGLYDAFLIKENHIAACGGINKAVAQAKQNQPNKPIEVEVESLVDLKQALDAGADIIMLDNFNVEQIKQAVVVTNKRAKLEVSGNMTLETLRTYSQAGVDFISSGALTKNLQSIDLSMRFE >NZ_CP011036.1|WP_089367662.1|469399_470946_-|IS3-family-transposase MRRQFTQEFKVQAVEKALSQCDDVRLEDIADDLGVGYSTLQRWIALAKKHQLETHQTGSQMTAEKRPQDWSLEERLSAIIDCGHLDETAINEYCRNKGLYPHHIKQWKQDFAQGPTTKLAKSDSKQLKQEIKQLQKELNRKDKALAETAALLVLKKKADAPLGFQRGRLTTATERHELITLITNAQASGARKEKACELLGLTLRTVQRWIEADDMTDKRTSTKKQPPNRLTELERQRIINTVNSAEYGHLPASKIVPKLLDKGIWIASESSFYRVMKAHNLLTHREKVKPAKPMKKPRALKAVRANEVYTWDITYLPTSVKGQFLYLYLVMDIFSRKVVGWQVYDTQLSELAADLMKDICSREQIKREQVTLHSDNGSPMKGATLLATLQELGIVPSFSRPSVSNDNPYSESLFKTLKYRPEYPEKAFEDISAAREWVSGFVDWYNNEHLHSGIKFVTPNQRHSGLDKEILAKRQQVNDAAKLNNPSRWSGKSRDWSMINEVNLNPEKKEEMRAA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011036_3 | 573909-574161 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011036_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP011036_3
>3.1|573970|69|NZ_CP011036|PILER-CR TCGAGGTCACGAGTTCGAGCCTCGTGTGCCGCTCCAATTTCTAACCAAAAGAAATTGCAGTGTTGAATA >3.2|574100|39|NZ_CP011036|PILER-CR CCAGAATGTTGAACGCGATTTTTCGCGCACCAACGGACG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011036_3
The CRISPR arrays of NZ_CP011036_3 >merge|NZ_CP011036|3|573909-574161|PILER-CR AATTACTGACTACTTTATAATGCGGCACTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCGACCTTGCCAAGGTCGAGGTCACGAGTTCGAGCCTCGTGTGCCGCTCCAATTTCTAACCAAAAGAAATTGCAGTGTTGAATAAAAATGCGGTACTAGTTCAGTTGCCAGAATGTTGAACGCGATTTTTCGCGCACCAACGGACGAATTACTGACTACTTTATAATGCGGTACTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCGACCTTGCCAAGG >NZ_CP011036|3|2|573909-574161|PILER-CR AATTACTGACTACTTTATAATGCGGCACTAGCTCAGTTGGTAGAGCGCGACCTTGCCAAGG TCGAGGTCACGAGTTCGAGCCTCGTGTGCCGCTCCAATTTCTAACCAAAAGAAATTGCAGTGTTGAATA AAAATGCGGTACTAGTTCAGTTGCCAGAATGTTGAACGCGATTTTTCGCGCACCAACGGAC GAATTACTGACTACTTTATAATGCGGTACTAGCTCAGTT GGTAGAGCGCGACCTTGCCAAGG
>NZ_CP011036.1|WP_058372577.1|573005_573551_+|oligoribonuclease MNINKSNLIWLDLEMTGLEPETDKILEIATVVTDADLNILAEGPTIAIHQSNELLDSMDEWCTTQHGKSGLTARCKASTYDEAYAVEQTIAFLKQWVPAGASPMCGNSIGQDRRFMNKYMRELEDFFHYRNLDVSTIKELARRWKPEVLAQVNKKGSHLALDDIKDSIMELKVYREKFFNL >NZ_CP011036.1|WP_011327196.1|571825_572884_-|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA MAKQKKLSKGQSRQIKANHQKRISSADARPAKKGAQEWQTDNLGQVESAIVISRFGQHADVEVESGEVLRCNIRRTVSNLVCGDEVLFRRAKVSEGDLAGVIEATQERRSQLTRPDFYDGVKVIAANIDQILMVSAVLPEFTPSIIDRYLIACEDMGIEPILVLNKIDLIDAQGLSEIQKVLDVYRKLDYKVLLVSNISTDGIDELKDVLVGKNNIFVGQSGVGKSTLVNTVLPDAEILTKEVSENSGLGQHTTTVSRLHHLPSGGNLIDSPGIREFGLWHLEVDRVTWCFKEFREFIGGCRFRDCKHLNDPGCIIKEAVADGKISQLRFDSYHRILETMADGRAGSRAPRV >NZ_CP011036.1|WP_011327195.1|570943_571771_-|phosphatidylserine-decarboxylase MPKHFISRVVGKLAAAKAGVLTTTLIKLFIKQYKVDMSEAKHPDPAHYESFNEFFTRPLKDGARPIVADSDIIIHPVDGAISQLGDIVDGQLIQAKGHDYSLQALLGGNKDDTTPFLGGKFATIYLAPKDYHRIHMPIDGTLSKMIYVPGDLFSVNPLTAQNVPNLFARNERVVAIFETEIGPLAMVLVGATIVASIETIWAGTVTPPAGSDVFSWNYPTKGENAISLKKGEEMGRFKLGSTVVLAWGDDKADILDDQLPETVTRLGTPFAKIDD >NZ_CP011036.1|WP_086993126.1|570008_570755_+|HesA/MoeB/ThiF-family-protein MNELSDKEMLRYSRHILLKEVGLAGQLKLKSASVAVVGAGGLGSPALLYLAAAGIGKLILIDDDAVELSNLQRQVLYKVNHLGQKKVVAAGKVLASLNNQITIITHAEKLTQDNSAALLNNADIVLDCSDNFTTRYSVNRFCVQHKTPLISGAALATKGQLISLDLRNANSPCYGCIFPQSDIAPLINCDNAGVISPLLGIIGSMQAQLTLNMLLGHSSDCVFMSINALTLQQQQFKVVKDIDCKECR >NZ_CP011036.1|WP_089367754.1|568459_569986_+|thiamine-phosphate-synthase MNNVVWTIAGSDSGGGAGIQADIKAMQSFGVHGCTAITALTAQNSLGVEAINAVSTDIIESQLLALEKDMKAKVIKIGMLANVQQIQLISEHISHYKAKWPVSPVIVYDPVAIATSGDLLTEEDTVSAIKECLLPLVDVITPNTHETQLLTGVYLIGPAAIKEAANKLLSWGAKAVVIKGGHWDYPSGYCIDYCINNFTQKGEEYWLGNEKIQTPHNHGTGCSMASVIAACLAKDYPLKDAFILAKAYINQGLKVAVRYGEGIGPVAQTSFPTNLADYPQVIEAGSWLGDELDFDVPLDFNMAADFAPCESKSLGLYAVVDSVDWLEKCLQQGVKTAQLRVKNKDDAQLDELVAKAVALGEQYNAQVFINDYWQLAIKHGAYGVHLGQQDLENTNLAAIKNAGLRLGLSTHGFYEMLRAHNYRPSYLAFGAIYPTTTKDMTGQIQGLEKLFKFVPLMQSYPTVAIGGIDLKRASQVAKTGVGSVAVVRAISEADDYVQAISALQAAIN >NZ_CP011036.1|WP_089367753.1|567656_568448_+|thiazole-synthase MLNNDYLTIYGEQIKSRLLIGSALYPSPAVMNESIVASGAEIVTVSLRRQQSAAAGDDFWQLIKNTGLKILPNTAGCHSVKEAITLAKMCREVFATDWIKLELIGDDYNLQPDPFALLEATKILIDDGFKVLPYCTDDLVLCQRLNALGCEVLMPWGAPIGTGKGLLNSYNLKTIRERLPETTLIVDAGLGLPSHACQALELGYDAVLLNSAIAGAGCPITMSRAFKAAVEAGRFAYNAKAMPEKDVAAPSTPTMGMPFWHQE >NZ_CP011036.1|WP_011327191.1|567456_567651_+|sulfur-carrier-protein-ThiS MNITINGELIAISSNKLINCLQDFGGVAPFAVAINGEFIPQSQHSDYQLTEGDSIELLSPIQGG >NZ_CP011036.1|WP_086993122.1|566447_567449_+|FAD-dependent-oxidoreductase MFYNIAVVGFGLTGRLAALELSKQHRVTVFEADNEHTQNSAGKVAAAMLAPLAESVLCEADLALMGLDSIKRWPGVIDELDSEVFFQQQGTLVVAHQQDKGDLLSFAQRLKPLANYTGESVNSQQIEMLEPELANRFSQGLFLPCDGQIDNQAFYQASFTQLNKRKVKFVFNQRVTINDNKINNREFDYIIDCRGLGAKDDKPLRGVRGEVARLYAPEVSLTRPVRLMHPRYPIYIAPKPNNEYVIGATEIESQDTGPATVRSALELLSAAYTVHSGFAEARLLNIQTGLRPAFCDNRPQVTHVGRVISINGLYRHGYMLAPSLVANALLCIE >NZ_CP011036.1|WP_058372571.1|564406_566359_+|phosphomethylpyrimidine-synthase-ThiC MSNTAKKSSRRETRAAASEYIYNLTGQPFPNSHKVYVEGTQNNIRVGMREITLSDTYIGGSDENPVYEPNEPLRVYDTSGPYTDPNFELDVRQGLAKFREQWIESRGDTELLESVTSRFTQQRMADEGLDHLRFEHLPKIRRGKAGKNVTQMHYARQGIITPEMEYVAIRENMGRKKIHAELLAAQHKGESFGASIPDFITPEFVRDEIARGRAILPNNINHPETEPMIVGRNFLVKVNANIGNSSVSSSIEEEVEKMVWSTRWGADTVMDLSTGRYIHETREWVVRNSPVPIGTVPIYQALEKVNGVAEDLTWEIFRDTLIEQAEQGVDYFTIHAGVLLRYVPMTAKRVTGIVSRGGSIMAKWCLAHHKENFLYTHFEDICEILKQYDICFSLGDGLRPGSIADANDEAQFSELRTLGELTKLAWKHDVQVFIEGPGHVPMHMIKANMDEQLKHCDEAPFYTLGPLTTDIAPGYDHITSGIGAAQIAWYGCAMLCYVTPKEHLGLPNKEDVKEGLITYKIAAHAADLAKGHPGAQERDNALSKARFEFRWHDQFNIGLDPERAREYHDETLPQESGKVAHFCSMCGPKFCSMKISQEVREYAKDLEARGIDPANAADTITIKMIDVEAQMKAKSDEFKKTGSEIYHKAI >NZ_CP011036.1|WP_089368929.1|563581_563959_+|META-domain-containing-protein MLIIGLCVGCASTQTVTSEQLKHTQWQLSRIDGLAIPPSFNASVGFIEALQVNGFAGCNNFFGEGELDDSSLTVNKIGMTRKSCGQQLDKFEQQLLHALQQGAQLKMQDQQLVMQGEKTFVFIAK >NZ_CP011036.1|WP_089367755.1|574486_574915_-|YjbQ-family-protein MSWQQKVITLKPRIRGFHLIDNEILIQIPELTNYKVGLLHLFIQHTSASLTINENADPTVRMDMESHFNEFVPQCQPYYRHDYEGDDDMPAHIKTSILGCELSIPITNGYLALGTWQGVYLGEHRDSGGTRRIVATIQGELF >NZ_CP011036.1|WP_089367756.1|574911_575379_-|chemotaxis-protein-CheX MNVEFINPFLSSLINVLSTMAQTQLKPGKPRIKTDEKACGDVSGLIGMVGPQTRGSFSITFDEQLALTIMERMLGERPDSINEEVTDMVGEITNMVTGGAKNLLGQKGFDFNMATPIVVSGKDHTITHKSQGKKILMPFTCDAGNANIEVSFDKL >NZ_CP011036.1|WP_089367757.1|575442_575880_-|transcriptional-repressor MNIESLVSKAKQVCDNRGARFTPIREKVFRLLASAQGGVGAYDLLEQLKVTETGAKPATIYRALDFLAELGFIHKIESTNAFMLCHHFDHIHPVQLLICDTCGFVKELHSTVISHELNSLAAEGGFVVSAQTIEAHGRCESCRVA >NZ_CP011036.1|WP_089367758.1|582648_583617_+|tRNA-dihydrouridine(20/20a)-synthase-DusA MKPLDRRFSVAPMLDWTDRHCRTFHRKMTKHTVLYTEMITTGAILFGRGDYLHFNQHEGPVALQLGGSDPQALAQCAKLAGERGYDEINLNVGCPSDRVQNGRFGACLMGEPQLVADCVAAMKAEVNIPVTVKTRIGIDEQDSYEFLCALIEASHNVGCDDFIIHARKAWLKGLSPKENREVPPLDYPRVYKLKKDYPQLDLSLNGGVKTIEQSLEHLQHIDGVMIGREAYSNPFILNEVDEKIYGDIANTQSRHEVVRSMYSYIEDEMRLGANFWHVARHMLGIFQGQPGARGFRRHLSENGHGKQADLSVMDKALSFVPK >NZ_CP011036.1|WP_089367759.1|583870_584551_+|phage-shock-protein-PspA MGIFNRVTDIVQANIVSILDKAEDPEKLLNLMISEMQDALTECRITTAALLCEEKTLKRQIENKNNNLVYWQDKAELAIERGRDDLAKSALLEKQAISNTVVAKQLQLETLQQSITKMTADCQRLQQKIAEAKAKQTQLVQRHNIVAARGQINSQLQSEKVAHALSRFEKVEQRVEGIEAQVEAYELTDSENTIAAQIDALAKNEQVDAELARLKADLKTNLKQSA >NZ_CP011036.1|WP_086996915.1|584561_584768_+|PspC-domain-containing-protein MNSFNSKRGWYKDPLDKKISGVCSGLAQRLDLPVWSTRLVTILLFLSFPFAIALGYFIAHCCLEEKAI >NZ_CP011036.1|WP_086996934.1|585207_585717_+|copper-chaperone-PCu(A)C MIKQCISIVLVSVLSLFSSSSMAHSGHDHDADVAIIKVSNAQVREFLPATTSSVGYLSIINHSDTVATLTKATIDGLGRVEIHEHSHVDGMMKMQKVESLTINAHQQIDFKPGGYHLMIFEPQEPLKVGQQRKLTLYFSDGNRVFTNAQVVSLASQAEQSQASKQHTHH >NZ_CP011036.1|WP_089367760.1|585725_586712_+|DUF2333-family-protein MSQHKGKIVAALAILLIIFYAIAVYWNTEPARFNVVEKAKQQAQQRNEQFVIGYTTTSTLITVASTLLEKPGGYLSNDVLPPSIIMDDMPAWEYGALEMVRDLALSMRKDFSRSQSQSTEHEALKKAQPQFNISSEAWAWPSAEGEYQKGIDYLLVYRTQIANDHERDSQFYARADNLRSWLKEAEKRLGSLSQRLSASVGQDKVNTDLAGNTSNTQATFSPLQQQAKTPWLDIDDVFYESRGATWALLHFLQAVEYDFADVLEKKNARVSVQQIIRELEATQETVWSPMILNGNGFGYVANHSLVMANYISRANAALIELSELLTQG >NZ_CP011036.1|WP_089367761.1|586715_587492_+|TIGR04219-family-outer-membrane-beta-barrel-protein MKKYCLAAALSMACLAPAAQADTLLGLYVGVDGWKADNEGSFSYKGNALQDFNFDDETFVSYYAALEHPVPLVPNIKLRYTELELAGATELNSQFIFGDQSFEKGRNINTVSDLTHIDYTFYYEIFDNDLISIDLGINAKQFDGEISVEYIPQNNASDSKQSETVEFSGFVPLVYGRAEAGLPFTGLSVFFEGSFLAIDDSKVQDYQMGIAWEFIDNLAIDVAVKAGYRSMTLELDDVDDINTNIDASGPFAGIQVHF >NZ_CP011036.1|WP_089367762.1|587528_588398_-|TIGR03899-family-protein MAVKTAQARINLANTIESLLGYPIIKVGNNEQSYGPQGKVKPLYRINSDNTVLARAQKRQDLLLIKQQQNIETILAMAMDFCPDVASSKQPDADWVEHFVALCGDTSNQSMQSLWAKILTGETLNPGTFSIKSLQTLKHMTQREADSLQKCVPLSGYNEKDDSHFILLGFYKKPSLFDLLRKGNKVSLNLGKTGISFPDILTLMDLNLLYRKEIESAVLKTGQELTLSFLSQKVTLKAKNSDLVLSYYKFTQTGDELSKLINYPVNKVYKQLLNSALESEFELAWHTTK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011036_1 | 1.2|440042|24|NZ_CP011036|PILER-CR | 440042-440065 | 24 | MK424903 | Pseudoalteromonas phage GXT1010, partial genome | 298-321 | 2 | 0.917 |
NZ_CP011036_1 | 1.4|440042|31|NZ_CP011036|CRISPRCasFinder,CRT | 440042-440072 | 31 | MK424903 | Pseudoalteromonas phage GXT1010, partial genome | 298-328 | 2 | 0.935 |
1. spacer 1.2|440042|24|NZ_CP011036|PILER-CR matches to MK424903 (Pseudoalteromonas phage GXT1010, partial genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.917
atatgcacggcaataatacagcgt CRISPR spacer acatgcacggcaacaatacagcgt Protospacer *.***********.**********
2. spacer 1.4|440042|31|NZ_CP011036|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK424903 (Pseudoalteromonas phage GXT1010, partial genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.935
atatgcacggcaataatacagcgtttgcaaa CRISPR spacer acatgcacggcaacaatacagcgtttgcaaa Protospacer *.***********.*****************
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DBSCAN-SWA_1 |
297619 : 351599
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011036|297619:351599|DBSCAN-SWA AATGTCACGTAGTTTTAAGTCTCACTTGAGTGATGATATTGCCACGGTAACAATGGGCAATCGAATTGCGGCTATTATAGAGCAAGGTGCGGTAATTTATTTACATGGCGATTTAGGCGCGGGTAAAACCACCTTTACACGTGGCATAGTGCAAGGTTTTGGCCATACAGGTAAGGTTAAAAGTCCAACGTATACCTTAGTAGAGCCATATGAGCTGGAGCGCGCTAATGTTTACCACTTTGATTTGTATCGTTTAGGCGATCCAGAAGAACTTGAATATATGGGAATACGCGATTACTTTTCAGCGCAAGCAATTTGTGTGGTTGAATGGCCAGAAAAAGGCGGAGAGTTTATTCCTGTGCCAGATTTAAATATTACCTTAAGCTATGTAGGCGATGAGCGAAATATCGTTATTAATAGTGCCAGTGAGCGTGGTAGCGTAATTATTGAAAAACTAAATAACTTAACCTCAGAGTAATAAAATTGGTTATATAACAAATAATAAAATAGTCAAGGCAGTCACTATCAACATGAGTCGCGGTGTAATTAAACTCTTTATTTATCTTGTAGCTATCACTATGAGTTCGTCGCTATGGGCACAAAATACCATTAATAGTGTGCGTGTTTGGCCATCTCCCGATAGCACTCGGGTGGTATTTGATTTAACTGAAAAGCCTGACTTTAGTTATTTTATGCTTAAAAATCCTAGCCGTTTAGTGGTTGATTTAGAGCAAACACGGGAGCTTAAAGTGTTACCCGGTATTCCGCCTGAGCATCAAATTGTTAGTAAGCTTCGTTATTCTAAACCAAAAAATAAACACAGCGTGCGCTTTGTATTTGAATTGAGTGCCCCGGTAAAGCCTGTGGTTTTTGCATTAGCACCAACGGGCCCCTATAAAAACAGGTTGGTTGTTGATCTATATGATAAAAGTGAATCATCCACAGCAGTATCACCAGCGCAAACAGCGGCTAAAAACCGTCAATTAAGCCAAGAGCGCGATATTGTTATTGCGATTGACGCTGGTCACGGTGGCGAAGACCCTGGCTCAATTGGCCCATCGGGTACCTATGAAAAAACGATTACATTACAAATAGCTAAACGCTTAGAGAGGATGATTGACTCTGAGCGCGGGATGATTTCGCGTATGGTGCGCAGCGGCGATTACTTTGTAAAGCTCAATACCCGCACCAATCGTGCTCGTGAGAAAAAAGCTGATTTTTTTGTCTCTATTCATGCTGATGCATTTACGAGCCCAGGTCCAAATGGTGCCTCAGTGTGGGTGTTATCACTGCGCCGTGCTAACTCAGAAATAGGTAAATGGATTGAAGATAAAGAAAAACACTCTGAGCTTTTAGGTGGCGCGGCAGATGTAATAAAAGATGCCGCCAATGAAAAGTACTTAGCGCAAGCACTGCTTGATATGTCGATGGATCATTCGATGAAAACCGGTTTGAGCGTTGCTGATGAAGTAGTAAAAGAGCTGCGTAAGGTGGCAAAGTTACATAAAAAAGACCCTCAACATGCGAGTCTTGCAGTATTAAAGTCACCAGACATTCCTTCTATTTTAATCGAAACAGGGTTTATTTCTAATCCCCGTGAAGAAAAATTGCTAAAAAGTGCTAATCACCAAGAGCGTTTAGCCAAAGCTATATTTACCTCAATTAAAAATTATTACTTAAAAAATCCACCTGACGATTCTTTATTTGCCAAGTTAAAGTCGCAATATCCAACCAAGCATAAAGTTCGCCCGGGGGAGTCGTTAAGCATGTTAGCGAGTCGCTACGGCATAACTATAAACAAGTTAAAGCAGGCGAATAAATTAAGCTCTAATACCTTATTTATTGGCCAAGAACTCGATATACCGCAAAGTTAATTGCTTATCATTAGAGCCATGTTTGTTAGGAAGTTGAATGAGTATTGAAATACTACCCGCACGTTTAGCGAACCAAATTGCTGCAGGTGAAGTGGTCGAGCGCCCCGCGTCGGTGGTAAAAGAATTAGTAGAAAACAGCCTAGATGCTGGTGCTACACGCATTCAAATAGATATTGAGCGAGGTGGGCACAAACTAATTCGTATTCGTGACAATGGTGCGGGTATTGCTCAAGACGAGCTTACATTGGCGCTTTCTCGCCATGCAACCAGTAAATTGAAATCCCTCGATGATTTAGAAAATATTTGCTCACTGGGATTTAGAGGTGAAGCACTGGCGTCAATTAGTTCCGTTTCGCGCTTAACGCTAAGCTCAAAAACTAAACATCAAGAAGCCGCTTGGCAAGCATTTGCACAAGGCCGCGATATGGCTGTGCAAGTAAAACCAGTAGCGCACCCAGATGGCACCACCATAGAAGTAAAAGATTTATTTTTTAATACGCCAGCCCGGCGCAAATTTTTACGTACCGAAAAAACAGAGTTTAGCCATATTGATGAGCTTATAAAGCGCATTGCGCTGAGTCGATTTGATGTATCTATTACCCTTACTCATAATGAAAAAGTAGTCAGGCAGTACCGTGCTAAAACTGATCCTAGCCAAGCAATTGCCCGTGTAGCGCAAGTGGCGGGTAAAGCATTTGCTGAGCAAGGCTTGCATATTCAATCGGGCGAGGGGGGCTTGCAGCTCCATGGCTGGGTATTGCCGGTTGGTTCTGCTAACACCGTGCAGTATACCTATGTAAACAATCGCATGATGCGCGACAAGCTTATACTGCACGCTATTCGCCAAGCATTTGAAGAAGTAAGTGGTGCCCAAGAGTTACCCGGTTTTGTTATTTATATTGATATTGACCCTCGTCAAGTTGATGTAAATGTTCATCCGGCAAAACACGAAGTACGTTTTCATCAAGGGCGTTTAGTACACGACTTTATACTACAAGCAATTAAACAAGTTGTTGTGCCACTGCAAGGTGAGTTTACTAATGAGCCTTTAAATAACCTAGCCGATACGGCATTTAGTCAGACAGACACTGCGCGTTCTCCCACTGGGAATTTTGAGTCGGGTGAGGTATTTGATTATCCTAAATCGCAATTGCAACCATCTCATAGTGTCAGTTCTGGCGGCGCATCGCTAGGTTCGCGTAGTGCGGGAGGGAGTGGCGGCGCCTACAGAGCTACACCTAGCACTAATCATCATGATATTAATGCTTTTTATCAGGGCGTGAGTGAGCAGCATGCCGCGCATTTTGACCAAGGCGCTCACGTATCTGTTGGGGTTAACCAGTCACACGCTGTGGAGCAGGCAGTGGCTTTAAAAACGGTTGCTATTATCAGCATCAACGAAGGCGTGTGTGTGTTTAGCAGCGAGCAGCAATTGTATTGCTCACATTTTAAATATGCATTAGTTGATGATTGGCATGAGCAAATAAAAGAGCAGGGCAGCTTAGAGGGCAAAGCGCTGTTGTTGCCAGTACGGGTTAATTTATCCAAGCAAGACTGTGAGCTAATAGCAGCGCAACAGTCGTGGTTTACGCTATTAGGTTTTGAGCTAATTATTGAAAAACAGTTTGTGATGGTTAAAAAACTTCCTGCGTGCTTATATTTATTAGACGTTACTAGCGCGGTTGAAAGCCTGCTGGAAGCGTGTAAAGCACCACTTGAAAACATAGAAAGCTGGTTGGCGTGGCAGATGCAGCACACACCAGCGCGTTTTTATTCCAGCAATATCTTTTTAGCGCAGCAAGCCCGCATGCAAAATAATCCGCAAACAATTGAACGTTTGCATGTAAAAGCAGTTAAAATAGATATAGAGCACTATTTAACGCAATTAGATTAAGGTATTCGTGTTGAGTAATTTACCAGTCATATTTTTAATGGGTCCAACTGCAGCGGGTAAAACGGCGTTGGCAATTTCATTGTGTGAGCATTTAAATACCGAAATAATTAGTGTTGATTCAGCGTTAGTATATAAGGGTATGGATATTGGCACGGCTAAACCCGATGCATCAGAGTTAGCACGTGCTCCGCATCACTTAATTGATTTACTTGACCCAAGTGAAACTTATTCAGTTGCTGATTTTAGACGTGATGCGATAATAAAAATAGATGAATTTCATCAGCAAGGTAAGGTGCCGGTATTAGTTGGCGGCACCATGTTGTACTTCAAGGCTCTGATTGATGGTTTATCACCACTGCCAGAAGCTAACGTGGAAATAAGAGCCGAACTTGAAGCGCAAGCTGCGCAATATGGCTGGCCACATTTGTATCAAGAACTGGTAAAAATAGACCCGCAAGCAGCGCAAAAAATGAGTGAAAACGATTCACAAAGAATTAATCGTGCTTTAGAGGTATACAAATTAACAGGTAAAACCATGACCGAGCTGCAAAAGCAAAAACAGCCGGTTTTACCTTATACTTTTCATCAATTTGCTATTGCGCCAACGCAGCGCAGTGAATTACATCAGCGAATTGAAAAAAGGTTTAAAATAATGCTCGAACAGGGGTTTGAAAATGAAGTTTCGACCCTATATCTACGTAAGGATTTACACCCCAATATGCCTTCTATTCGTTGTGTAGGTTATAGACAAATGTGGGATTACCTTGCGGGTGAAATTGACCATGATGAAATGGTATTTCGCGGCATTGCGGCTACACGTCAATTGGCTAAACGCCAATTAACTTGGTTAAGAAGCTGGCCTGATGTTACATGGTTAACAACGGGTGATGAAGAAAACTTGCATCGTGTAGTAAGTTCGCTAAGCTAGTAGTAGTTGAATAAAATTTAGCTTTGTTAAATAAGTTCAGCCACTTAATTATAATAACACCTAGAACGAAGGAATAATAACATGGCAAAAGGCCAATCGTTACAAGACCCATTTTTGAATGCACTACGCCGTGAGCGCATCCCAGTATCAATCTTTTTGGTTAATGGCATAAAATTACAAGGTAAAATTCAGTCATTTGATCAATTTGTTATTTTACTAGAAAACACCGTAAATCAAATGGTGTATAAACATGCAATTTCAACAGTTGTTCCTGCTCGTGCAGTTAATTTCCAAGGTGTTCAAG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48 | Streptococcus_phage(16.67%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
355757 : 430888
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP011036|355757:430888|DBSCAN-SWA 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56 | uncultured_Mediterranean_phage(15.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
453943 : 520643
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP011036|453943:520643|DBSCAN-SWA 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51 | Bacillus_phage(18.18%) | transposase,tRNA,integrase | attL 489632:489649|attR 521144:521161 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1090416 : 1101183
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP011036|1090416:1101183|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP011036|1090416:1101183|1096503_1096959_+|WP_041454374.1|DBSCAN-SWA MTKLEQDLVAMLTPAVEMLGFELHGLEFVQAGRHSTLRVYITHEAGISVDNCADASRQISAILDVEDPITNEYDLEVSSPGVDRLLFKQDHYEQAQGEEVQLRTKLPQDGRRNFKGDLIAVTSDMITLSSDGTEHLIMLSNIERANIIAKF >NZ_CP011036|1090416:1101183|1093040_1093487_+|WP_089367959.1|DBSCAN-SWA MRTVDLSPLYRSFIGFDHLASLMDAAASSDKQPSFPPYNIEALDKDKYRITMAVAGFSNSELTIESENNTLKVSGVKQSKYDSKERKFIHQGIADRNFERKFQLGDHVRVIAADLAHGLLSIDLQREIPEALKPRKIAIGGNDLLEDK >NZ_CP011036|1090416:1101183|1090416_1092267_-|WP_089367958.1|DBSCAN-SWA MSEPVTFESLNLSPAILKAVEELGYKTPSEIQAQCIPLLLERKDVLGLAQTGTGKTAAFALPLLNNIDPSVKQPQILVLTPTRELAIQVAEAFEQYAKHVRGIEVLALYGGQSYSIQLSALRRGAQVIVATPGRLIDHINRGTIKFDALQALVLDEADEMLRMGFIDDVENIMEKTPREKQTCLFSATMPKQIQNISSKYMNNPEQVHISARNSTVSSVEQVFWNASIHKNKAIVRFLEAEQYEGAIVFVRTRNDTVQLAELLEREGFSAAPLNGDMNQQARERTVERLKSGMLNVVIATDVAARGLDVDRLSLVINYDIPQDSEAYVHRIGRTGRAGRTGKAILFVKHNERYLLKNIIRHTNSDIAQVELPTAKIVEEKRIEALQAKLTLALENKDITFFNEVAANMAQKLELSAEDLAGALLCLAQQQSPIKVEEVKIQPRERNERNDRNPRSNDRGDRGRRNERGGERGGERAERKPRERNSRDAGPMDTYRIEVGREHGVQVKNIVGAIANEADISSKFIGDIRLHDNHSTVQLPKNMPKDVLDHFQKVFICKRPMGLTITADQGPAEPRGERSERPAGGEKRSFNKDDSARGDKRSGPRKERRPVSFTTPK >NZ_CP011036|1090416:1101183|1096997_1098497_+|WP_089367961.1|DBSCAN-SWA MAKEILLVAEAVSNEKAVPKEKIFEALEFALATATKKKHGGDIDVRVAIDRKTGDYDTYRRWQIAAVLEDGSLENPYSEITLEAAQVEEPDLQMGDFVEEQIDSIKFDRITTQMAKQVIVQKVREAERALVVEEYKSKEGELVTGVVKKATRDAIVLDLGNNAEAVIYRDDMLPRENFRPGDRIRGLLYEVKPEARGAQLFVTRSKPEMLMELFRIEVPEIGEEMIELRAAARDPGSRAKIAVKSNDKRIDPIGACVGMRGARVQAVSSELGGERVDIVLYDDNPAQFVINAMAPAEVASIVMDEDTHSMDIAVEADNLAQAIGRNGQNVRLASQLTGWELNVMTVEDMRSKNEAESDKLLNLFTENLDIDDEFASLLINEGFSSLEEVAYVPASEFLEIDGLDEEMVDLLRSRAKDALTTKALKTEESLDGAEPAEDLLTLEGLERHLAFVMASKGVITLEDLAEQGIDELVDITELSPEKAGELIMAARNICWFADE >NZ_CP011036|1090416:1101183|1094303_1095857_-|WP_089367960.1|DBSCAN-SWA MTHFNTLRLILGDQLNPAHSWYKDKKTNTLYVIAELKQETSYVKHHIQKICAFFCAMENFATALNQAGFNVLHLTLNETCNDEDLPALLTRIAAQHQCNTIEYQYPDEYRLKTQLAHFANTSPLTVSRVDSEHFLLPFEEIKHRFIKDKHITMEHFYRAMRKQFNILMDSNKPHGGKWNFDSNNRNKFSAADLAQIPPPKLFNNDVSAIIARLNKHNVSYFGKAAEQLPWPTTRKQAISCLDYFCLYLLPHFGQFQDAMTEQSKHNSSLYHSRLSFALNAKLIHPLFVIKRVIAQYEQRPNDISIAQVEGFVRQILGWREYVRAIYWINMPDYATKNQLKAKNTLPPYFWHAKTKMNCMHHALCESLTTAYAHHIQRLMVIGNFCLLTAINPDDVDAWYLGVYIDAIEWVEMPNTRGMSQFADDGIIATKPYAASGNYINKMSDYCKNCHYKVKQKVGDDACPFNSLYWHFMHTHRAKLEKNPRIGMVYKNWDKQENTLQQSTLQQATYYLNNIASL >NZ_CP011036|1090416:1101183|1093777_1094224_+|WP_011327682.1|DBSCAN-SWA MRTVDLSPLYRSFIGFDHLASLMDAAASSDKQPSFPPYNIEALDKDKYRITMAVAGFSESELSIESENNTLVVAGIKTGKEQASERKFIHQGIAERNFERKFQLGDHVKVLGADLANGLLSINLEREIPEALKPRKIEIGSGSLIEGK >NZ_CP011036|1090416:1101183|1092427_1092691_-|WP_011327680.1|DBSCAN-SWA MLTVIFGREGCPFCVRAKDVAEQLSNERDDFKFRYIDIIKEGISKEDLEKSAGKPCPTVPQIFVDQKHIGGFTEFEAYAKENLGLYQ >NZ_CP011036|1090416:1101183|1098522_1101183_+|WP_011327686.1|DBSCAN-SWA MAEVNVEKLAGDIGTTVDKLLQQFSQAGITKQAGESVTEAEKATLLDHLSKQHGGTGSDGPARMTLQRKSKSTLSVTGSTGKAKSVQVEVRKTRTYVKKSAMEQEQEELRLAAEEKLRLEEQQKAAQEAAELKAKQEAERKAKEDADRKAKEEAKRKADAERKAKQKQMTPEQSAKSEKDRIEAERLQKEAEEAALKKAEEEAKRQAEEARKLAEENSARWKKEEEERKKREETSDHHLTTSTYAREAEDVADARDEQGTRRAKKKKKAPAKDKFAASKGRNKGKLKAPTSLQHGFTKPTADVKNEVRISETITVAELASRMAVKGAEVVKTMMKMGDMVTINQVIDQEAAQLVAEEMGHKVIIVKENELEQKVLNDRHEDGKSEPRAPVVTVMGHVDHGKTSTLDYIRSAKVASGEAGGITQHIGAYHVDVNGNMITFLDTPGHAAFTSMRARGAQATDIVILVVAADDGVMPQTKEAVQHARAAGVPLIIAVNKMDKEGVDPDRVKNELAQLDVIPEEWGGDTQYVHISAKTGLGIDELLEAVLNQSELLELTAPTVGMAAGVVIESRLDKGRGPVASILVQSGTLNQGDIVLCGLEYGRIRAMRDENGKDIKSAGPSIPVEILGLSGIPAAGDEATVVKDERKAREVALYRQGKFRDVKLARQQKAKLENMFSHMTEGDVSEVNVVLKADVQGSIEAISDSLTKLSTDEVKVKIVGSGVGGITETDATLAAASNAIVVGFNVRADASARKVIESENLDLRYYSVIYSLIDEVKQAMSGMLAPEFKQEIIGLAQVRDVFKSPKIGAIAGCMVTEGVIKRSAPIRVLRDNVVIYEGELESLRRFKDDVADVRNGMECGIGVKNYNDVRVGDQIEVFETVEIQRTL |
8 | Agrobacterium_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1343054 : 1397004
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP011036|1343054:1397004|DBSCAN-SWA 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71 | uncultured_Mediterranean_phage(59.09%) | portal,capsid,terminase,integrase | attL 1342826:1342841|attR 1398228:1398243 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1452323 : 1483537
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP011036|1452323:1483537|DBSCAN-SWA 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40 | Pseudoalteromonas_phage(80.56%) | portal,capsid,terminase,head,tail,integrase | attL 1452136:1452158|attR 1484375:1484397 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1768248 : 1775531
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP011036|1768248:1775531|DBSCAN-SWA TTTAAAGTTTTTCAGCAGCTACGATGGTATTAAACTGTGGGCCTAGTTCTATTGTGACCATGAAACCTTGATACGATAATTTTAGTTGATTACCTATATAAGCAAACGTATTTGGATTTTGAACAGCGTTCATTAGGTTGTGTATTTGCTCAATGCTAAGTTGCCCAGCTAACAGCTTTTCAATCTGAGAGCTGCTTATTGTAATAGTGCTACTATATATAGGTGCGTTTTTACGTGACAGTTCGTTTAGTAAATTAACAGGCAAGTGCCCTAGCGTAAATTCTTGGCCATCTGGTACTGACTTATTAAGCGCTACCTTTGCTGCTTTTAAATTTACCTGCTTTATATAGTACTGCTGAGACTTTAAAACCGCTTCGTTAAATTGTGGTACCGCCAATGCTTGTAAATCCTTTGAAAGATTTATTACCGATTTCCCCGCAGATATATCCGCACCCAACCAGGCTTTGCCCGGATTATAATCCCAACCTAAGTCTATACCAGGTAACTTATTAAGTTCTTCGCCTGTTGATGAGTCTGTTACTTTGAACGACTCCATAAACTTATTAACCGATTCTGGCTTAGTTACTGATAAGCCCATTCGTGCAATATCACGTGCGTTAAGTGATACGACCTTACACCTACAGTTATAACCATTTGGCGGATAATGCGTATCCCAAAACGGATGGTCAACAGGCAGTAAAATGTAATTCCACTTATTGTGATCAGGTCTTACACGACTATCGCCAGCGGTTAAATATAATAAGTAAGGTCTGCGCTCTTTTAAACGCGCTTGTTGTTGCCAACGGCCAGCCGCCCGCGCGGTATTTTTATTATTCTGATAGATAACTTTTGAGCGCCAGCCACGCTTACCATTGTATGACCAACCATGATCAGCGACTATTTTGTCAAAACGTTTTCTAAAGTCCGATATAGTTTCGCCATCACTAATTGCAGCATCAACCGCTTTATAAAAGTCATTAAGTATTGTGAGTTCAGTTGCTCCAGCCACAGTAAATGCTTTAGCGTGTATTAAGCCCTGCAAATCTTTATAGCTTTCGCTGGTAAGCTTAATTTTGTCTTTGAAGTGAGAAATGGCTTCCTTGAATTTAACAAGGTCGCCATATTGTGGAGCTGGTAAAGTCATTTTAGTACTCTTTTAGAGACTGTTGAATGTCTTGAATTTCATTTCTACGTGAATTATCACGGCTGTTACCAAAGAAAAAGTTCAAGATTGACGCTATAACCGTGCCTAAAATAAAGCCCAGTATAGTATCTGCAAAACGTGTTGCAGTATCGGGTATAGTTATAAAGGTAATGCAACCTATGTATACCACAGTAGAAAACGACCAAAACCACGCGTAATAATAAATAAAACGTTTCGAAAACTTATCATCTTGGTTTAATGCCTGAATTTGCATGGTGCGAGCACTTTGGGTATTTTTAAACGCTAAATCATCAAGCTCTTTTTCACGGTTTAAAATGGTTTGCCTTAACTCTTGCTGCAAAGCACTTGATTGTTGAACAAGATTTAATGCTTGCTCAGGTGTGCCACCATTGGTAAGGGTTTGTGCCATATCAACCACTTTAGACGCAACCTTTGCGCCATTATCGCCCCCTATCCAACTGCCAATTTTTTTATCCAGGCCTGTGAGTTTTGCAAGGCCAAGTGCTATTGTTACTGGGTCCATGGTGATACCTTTATATAGTCAGCAAAAGATTTGCCGCCAATTTTAATAAGCTCTAAATTTTCGAGCTTATTATATTGGCGAACTAGGCTTTTAGCGGTTGAAAAATCGCATACGTGGTATTCATTTTTTTCATATAGCTCTGGCATTTCTTTTTTTGCACGGCGTTTACCCCATATTTTTTCAGCATTTTTGATTGATTTAGACGTGTATTTGGCGCGGGTTCGTTTACGCCACACATCAGGAATACATGAAGGGCGTTCTTTATCTTCAATAAACCAAGCGCCCTTAATTACATCGTCTACGTACACAACTAAACTTGTTTTAGACTCAGATACACGGCCACGAGTGACGGTGATTTCAAACTCACCGTACTTGAAAATAACCGAGCTAAACAAACCAGCTAAGTGTTTTTCTATCTCTGCCCACTGCTCTTTTGTAATGGCCATAAGCGCCCCGCTACAGTTTTGCTATATCAAGTGAAATAGGTTGCTCAATGCCTTTATCGTCTTGTTTGTAAAAACGTATAAAGCGGCATGAATCAACAACACCAACCGACTCGGCAATAATATTCATTGCCTTAGTCCACTTGCCAGAATCGTCAGATATTTCGAGCTTACGCAAGCCTAAAATACGCTGTGGATTAAGTGAGCCTTGCTTGTCGGTATTAAATACATTGCTAACAATAGCGCGAATATTTTGATTTCCGCCTTCAGTCCATTCGTCCAGGCATTGATCAATTAACTGCTTAGCAAGTGCTAATTCAGGGCCCAACTCAATACGTTCTTGTGTTTGAAGGGTTACTTTTAACTGGCTATCAAAGGTGCGCAGAGTCACATTGCCTTTTTTACCGCCAAGGTTTACGCCATGTTCTTGTGCTAATAGCTCTATAAAGTCGTCGGCTTCAGCCATTAAAGCGAGCTTAAACTCAGCCAATTGGGCTTGCATATCTTCAGCGCACTTAATGGCTTTTTTTACAAACTCGTCTTTAATTAAATCAGTTGCTTTTACATTGGCAACAGCGACTAAATTGCCTTTGCCATCTTTTAAATAACCTTCAGGTACTTCATTCATCATCTATCTCCACAGTTTTAGAATTAGCCTCATTCATACCCGCCATATACTCGTACTCCATTGCTGTTTGGGCTACTTGGGCCAAAGCAGTGGTTGAAATGTCGGGAAATTGTGAGGTGATTTTTTGTTTAAGTTCGTCCAGGTCTTTAGATGCCTGAGCAAAATGAAAAAGCTTTTTAATGGTGTCGTCGGTAGCGTGATCAAACACATCAAATTCGTCTGTCAGCTCAACGTTGTTACTTAATGCTTTAGCAAACTCAGACTTAGCTGCCGTAGCAATGCCTTTACTTTCTTCGGGAATGTCTAAAATAGCTTCGCTGTCATTCGGTTTTGGTATGCCAAGTTCGTTGTAAGCCCAATCAACACCAATAGGCACAAGGCGTGCTGATTCGCGCACGCGAGTTACCGTTTCGCTGTTTATTTCGCGTTTATCTTTAAAAATAAATTTCGGGGGTTCGCCACCATCAAAATTTACTGTGTGCAGAGCATTGGTTATTTGATTACGAAAAGACGCTACAAGTGCCCTGTCTGATCGTTGATTATCGCCCGCACGTTTTGCGTGAGTTTCGCTGGCAGCACGTGCGCCACCGCCTTTTTGTTCAGTGGCTAATGTTTGGCTAGTGAGTGCTTTACTTATTTCGGCATTACAAAAGTTAACTAGGCGCTCAGGAACTGGCTCGCCCGATAATTTGCTTTCTATTATTTCAATTGTTGTATCATCAGGAATAGCAGCAATACCGTCTTGCACTAGTTTGGCAAGGCCATTTAATAAGTTGTCTATGTCTTTATCTTGTGAGCCAACCGGGTATTTACCCACAGGAAAAGGAATACCAAAACGCTCACACAGCTGTACAAAAAACTTAAAACCACCGTGTTTAAAGGTCCATGGCCAAAAACAGCTGCTAAGTAATGCAATGCCGTATGGGTTTTCGGCGCTCGGCATATGGCGAACACACGACCAACGACGGTGATCAACTAACTCGCCCTGTGGATTTTCGCTGGTTTTTACCATCAGCTCACTATCGCTACTAAACGCAAAGCGACTATTGCGCCAGGTTTCTACATATTCGGGTTGCCAGTTGCCATTATGTTTTATGTATTTGCCCAAGTGGGTAACACTAAAACCGTTTAAAATAGCGCTGTAGTTGTGCCAATCCATATCGGCCCACTCGGTATGGTGGCATGGCTTTTTAGCAAAAAATGCCTTAGCAAGTTCATAGCTTTTTAAGCTTGCGGCATCGTCGCCACCTGGTACTAGCTCGGTATTAAAGCTAAATAAACCACTACGCAAAGAGCGCAACTCACCTATTACATGCGCATCGCGCGAAATTTCTTCGTAAATAGCCGTGTTTTTGCCTGCACGGCGTAAAATAGGGTCTGGATTAGGCAGCTCAGTAATAAGCGATGTAAGGCTAGGATCTAATCGGTTTTGATCAAACATACGATTAAGTGCAGCGTATGCTTTAGATGTTATACGTGGCTTGCTTTTAAACATAATAGCCTCTTATTTGTTTAGTTACTTTGCGGCTACTTACACGCGGAATACCGCCTGCACCAGTGCTCGACACCATCCATAAAATGGCAAGTGCACAGCTTAAATCGTAGTGATGCATGGTTTGTTTTTCGGGCCAGTTTTCTAGCTCGTCGAGTAGTAAACGGCACCGCGTATGAAACGCAATTTGAGCCGGTGTATTGGTTACATAAGTTTCAAGTGAGCCTATGCGCTCTTCTGCAGGTATAGTTGCAGTAACTCCACGCAGTGGCAGTGCAATGCCTTGCTCTAACCCCGTTTTAATAAACTGGCTGCGCATAAAATCAAACGCATTATTGTTTTCAAAACCCCACACACGGCAGTTATATTCTTTTTGCGCACGTATTAAATCGTTAAGCAAACGGCTGGTACCACGTACTTTGCGGCTTTCGTATTCAACGTGCAGCTTGTGTAAATCTTGAGAATAAAATCCCACTAATATAGCGCTGGGGTCGGCTTTTTCGGTTTTACCCATACTTGGATCACATGCACCATAAGGCACCCACTCGTTTAAGCGATCTACCCAAAAATCGAATTGGTAAAAAATAGACTCTTCATCGCTTTTGGCAATGCCTTGCATTTCACGGTTAAATTCGCGTTTATTAGCTGCCCACATACACATTAAATCGTAAAGCGTTCGCACACTTGGCCAGCTGGTTTTAGCGCCCTTAAGCATTTGCTTTTTATTTTTTAGCCAAAACTTAAACGACGGTTTAGCCTCAGTTGAAACGGCTTCGCCTTTAGTGGCAGCGCGTTTTTCAAAGCGCTTATCGTCGTGCACCATTAAATCGCGACATTGTTCCCATAAATCCATGCGTTCAGGCATTTGCTTAATGGCTTTAAAGCGATGAACGATATGGCCAGGCGCATCTTCGGCGCGGCTTATTGGGTCGTCATTATTTAAAACTGTATTAACACCTAAAAACTTAACGCTGCCATCAGGCGGGCCTAGGTATTGCACCGCGGCTTCTAAAAAGCGCCAACGGTTATCGCGCTCAGTCGGCGATTTAGCTTCAGCATCGGTAATAATGTCATCAGAGAGCAGTAACTTAGGGCGACTAGCTCCGTGGAACGTACCGCGAACTGACTGCTCAGCACCCCGGCTTTCAAAGCGCACACCTTGAGCTGTTACAAACTCACCCAATTTCCACACAGGTGATGCTGTGCACACCTCAGGAAAGTCTAGCGCCAAGTTATTATTGTTAAGCAGTTCGGTTTTAACTACCTCTAATGTTTTGGTTGGCATTTTTGTTTCAGCGCCAAACAAAATTACAAAATCAATAAATTGCTTTATTTTTTCTAAGCCCAGGTCTTGGCAAATTTCAGGGTCTTGCAATAGCGCCAGCACAGCTACATACACAGGCGCAATTTTTACCCCTAGGGTACTTTTGCCCTCACCACGCGGGGCTACAAACCAGTTTTTCCAGCCATTTTTAAGCTTGAGTGCTTCGGGAAACCACTTCATAAAATAGCTTTGAAATTCAGACGCATTTTGGTCGTCATCAAGCCACATATGATGCGGAAAGTAGGTGTATACAAAAAACTCAAAATCGCCACCCAGTACGCGTTTGCGGCGCTGTTTAATGGCGGCTGGGCTTGGATCTATATTGCGCTCTTTTGCTTCAATATCGCGGCGCAGAGAACCGGTTATTTGTTCTATTTCAGCTAAAAATTCACGTGAGTTCATATCGGCCATTAGTCGTCTAACTCCTTATCGAGCCGTGGACCAAACGCCGTGAGTATTTCAACAAACTCAGGAGCAAACTCTGGGTATTTGGTTGATACAAACTTAGCCAAAATTTTAAGTACCTCGGTTGCAATGGTACGTTTTTCAAGGCGTTTATTACCGCCCGACACTTTCATTACTTTGCTCATCATGTCGGTTAGTGAGCTTAAAACCTTGGTGCGTTGTTCAAGTGGTAGCGCAGCGCCTTCAGCTGACTTTAAAAGCTCAAAGGTTTCGTTTACTTGAATAGTAAACTCTTCAATAAAGTCGGTAGTAAACTCCCCTGCAGTGCCTTCACTTCGTCGGCTTGCTGCGCGGGCTAAATCCCAATCGTCGCCATTGTCTTTGGCTTCCATTTTCCAGCGTCGTGCGGTGCCATCGGCCACACTGTGTTTAATACCCGCAACACTCAGTGCTAGTAGCTCGGTTACATAGCTGTGGCGTACTGCGTTTTTTTTCTCTGCGGGGTGTGCCATTAGTTCATCAATCCATTTTTTACGGCGTAGGCGATTAACGTTACCGCCAAACCCGCAGACCCACCCATAGCCGCTACTTTAAGCCGCTGGTTAGTAAGTTTTTCTTCAACACTTTTTAACCGTTCATCGTGTTTATTAATTGCGATAAGTTGGCGTTTTTCGCTTTCTTTTAAATCGGTTTTTAATGCGTCGGTTACTACTTTTTGGCGTGCTTCGCTTTTTTCGATACTATGATGAATATCGGCTTTTATCTCAGCAACACTGGTTAAAATGGCCTCTTGGCTTGCTTTAATAGAGCCAATAGATTCAAAAAGTAGGTTTTCTTGTTCTGGGGTCATTGGCTAATCCTTACGGGTTAAATACTTTAATGCCCGTCCACGTAGGCGTGCGTACATCAAAATGAAACCAACTTACTAAACCTTCAATGGCGGTAATGTCTGGAAACTCTTCAGGGTGGGCTAATACGTAATCACGTACTTGTTGAGCAGTGTAATTTTTAAAGCTGCAGTCAAACCCTTTGCCAAGTTTGTGCTGGCTGCGCTTAGCACCAATGGTGCAATCAAGTGGACGATAACCACGGTATTGATTAGCGCCGCCCCAATACCAGTTGTTTACAGTGCATGGGCCAAACTTTTCACGTAGTTTTTGCAACATGCGCAGCGCACGAGCATCAAAGCAATTGATTAAAAATAGAGGTGAATCTTTAAATAGTTCAAAGGTTGCTTTAGGTACCAGTTCTTGAAATATAAAGCTGGGTGCTAAAGGAACCGCCACACGTTGTTTAAGTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP011036|1768248:1775531|1768248_1769391_-|WP_089368277.1|capsid|DBSCAN-SWA MTLPAPQYGDLVKFKEAISHFKDKIKLTSESYKDLQGLIHAKAFTVAGATELTILNDFYKAVDAAISDGETISDFRKRFDKIVADHGWSYNGKRGWRSKVIYQNNKNTARAAGRWQQQARLKERRPYLLYLTAGDSRVRPDHNKWNYILLPVDHPFWDTHYPPNGYNCRCKVVSLNARDIARMGLSVTKPESVNKFMESFKVTDSSTGEELNKLPGIDLGWDYNPGKAWLGADISAGKSVINLSKDLQALAVPQFNEAVLKSQQYYIKQVNLKAAKVALNKSVPDGQEFTLGHLPVNLLNELSRKNAPIYSSTITISSSQIEKLLAGQLSIEQIHNLMNAVQNPNTFAYIGNQLKLSYQGFMVTIELGPQFNTIVAAEKL >NZ_CP011036|1768248:1775531|1774232_1774739_-|WP_011328189.1|DBSCAN-SWA MAHPAEKKNAVRHSYVTELLALSVAGIKHSVADGTARRWKMEAKDNGDDWDLARAASRRSEGTAGEFTTDFIEEFTIQVNETFELLKSAEGAALPLEQRTKVLSSLTDMMSKVMKVSGGNKRLEKRTIATEVLKILAKFVSTKYPEFAPEFVEILTAFGPRLDKELDD >NZ_CP011036|1768248:1775531|1775087_1775531_-|WP_011328191.1|DBSCAN-SWA MALKQRVAVPLAPSFIFQELVPKATFELFKDSPLFLINCFDARALRMLQKLREKFGPCTVNNWYWGGANQYRGYRPLDCTIGAKRSQHKLGKGFDCSFKNYTAQQVRDYVLAHPEEFPDITAIEGLVSWFHFDVRTPTWTGIKVFNP >NZ_CP011036|1768248:1775531|1769922_1770381_-|WP_089368279.1|DBSCAN-SWA MAITKEQWAEIEKHLAGLFSSVIFKYGEFEITVTRGRVSESKTSLVVYVDDVIKGAWFIEDKERPSCIPDVWRKRTRAKYTSKSIKNAEKIWGKRRAKKEMPELYEKNEYHVCDFSTAKSLVRQYNKLENLELIKIGGKSFADYIKVSPWTQ >NZ_CP011036|1768248:1775531|1772493_1774233_-|WP_089368281.1|DBSCAN-SWA MADMNSREFLAEIEQITGSLRRDIEAKERNIDPSPAAIKQRRKRVLGGDFEFFVYTYFPHHMWLDDDQNASEFQSYFMKWFPEALKLKNGWKNWFVAPRGEGKSTLGVKIAPVYVAVLALLQDPEICQDLGLEKIKQFIDFVILFGAETKMPTKTLEVVKTELLNNNNLALDFPEVCTASPVWKLGEFVTAQGVRFESRGAEQSVRGTFHGASRPKLLLSDDIITDAEAKSPTERDNRWRFLEAAVQYLGPPDGSVKFLGVNTVLNNDDPISRAEDAPGHIVHRFKAIKQMPERMDLWEQCRDLMVHDDKRFEKRAATKGEAVSTEAKPSFKFWLKNKKQMLKGAKTSWPSVRTLYDLMCMWAANKREFNREMQGIAKSDEESIFYQFDFWVDRLNEWVPYGACDPSMGKTEKADPSAILVGFYSQDLHKLHVEYESRKVRGTSRLLNDLIRAQKEYNCRVWGFENNNAFDFMRSQFIKTGLEQGIALPLRGVTATIPAEERIGSLETYVTNTPAQIAFHTRCRLLLDELENWPEKQTMHHYDLSCALAILWMVSSTGAGGIPRVSSRKVTKQIRGYYV >NZ_CP011036|1768248:1775531|1774738_1775077_-|WP_089368282.1|DBSCAN-SWA MTPEQENLLFESIGSIKASQEAILTSVAEIKADIHHSIEKSEARQKVVTDALKTDLKESEKRQLIAINKHDERLKSVEEKLTNQRLKVAAMGGSAGLAVTLIAYAVKNGLMN >NZ_CP011036|1768248:1775531|1769392_1769935_-|WP_089368278.1|DBSCAN-SWA MDPVTIALGLAKLTGLDKKIGSWIGGDNGAKVASKVVDMAQTLTNGGTPEQALNLVQQSSALQQELRQTILNREKELDDLAFKNTQSARTMQIQALNQDDKFSKRFIYYYAWFWSFSTVVYIGCITFITIPDTATRFADTILGFILGTVIASILNFFFGNSRDNSRRNEIQDIQQSLKEY >NZ_CP011036|1768248:1775531|1770998_1772501_-|WP_089368280.1|DBSCAN-SWA MFKSKPRITSKAYAALNRMFDQNRLDPSLTSLITELPNPDPILRRAGKNTAIYEEISRDAHVIGELRSLRSGLFSFNTELVPGGDDAASLKSYELAKAFFAKKPCHHTEWADMDWHNYSAILNGFSVTHLGKYIKHNGNWQPEYVETWRNSRFAFSSDSELMVKTSENPQGELVDHRRWSCVRHMPSAENPYGIALLSSCFWPWTFKHGGFKFFVQLCERFGIPFPVGKYPVGSQDKDIDNLLNGLAKLVQDGIAAIPDDTTIEIIESKLSGEPVPERLVNFCNAEISKALTSQTLATEQKGGGARAASETHAKRAGDNQRSDRALVASFRNQITNALHTVNFDGGEPPKFIFKDKREINSETVTRVRESARLVPIGVDWAYNELGIPKPNDSEAILDIPEESKGIATAAKSEFAKALSNNVELTDEFDVFDHATDDTIKKLFHFAQASKDLDELKQKITSQFPDISTTALAQVAQTAMEYEYMAGMNEANSKTVEIDDE >NZ_CP011036|1768248:1775531|1770391_1771006_-|WP_011328186.1|DBSCAN-SWA MNEVPEGYLKDGKGNLVAVANVKATDLIKDEFVKKAIKCAEDMQAQLAEFKLALMAEADDFIELLAQEHGVNLGGKKGNVTLRTFDSQLKVTLQTQERIELGPELALAKQLIDQCLDEWTEGGNQNIRAIVSNVFNTDKQGSLNPQRILGLRKLEISDDSGKWTKAMNIIAESVGVVDSCRFIRFYKQDDKGIEQPISLDIAKL |
9 | Vibrio_phage(42.86%) | capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1786981 : 1793157
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP011036|1786981:1793157|DBSCAN-SWA ACTACCCATAAAAGTCAAAAGACAATTGTTTTGTTTCATAACCCATTATAGAAAGTATAATTTCTGCAAACATATCCGCTTGCCATTCAGCATCTTCTATTTCTTCAGCTGGTTTATCGGAATAATGCATTAACGACCGATGTCCTAGAAATAAATGACCCAACTCATGCAACATTACTGCTAAAGCTTCCTGCTCCCCAATGCATGCATTATTGTATATAGACTGTGGTACACAGATTATTGCTTTACTTGGGTCGCAGTGACCTTTAGTTAAAAATATCCAATCTTTATCATCTACAACTTCTAACGTAACTCTGAGTTGATACAAAAGCTCAAAGTTTTTGTCTAAGTTTCGTCTGTTTCGACGTTTAAAGTCGAAAGCTTTGGCAAAATTCTCTGCAACGACTTTAATTTGACTGAGAGGTAACGGCGAAACTCTGTTCCCTCTCAATCGGTAATTTTCAGGCATAATTATTCCTTACTACATTTGTTAATATCCTCTAAGAACTCTGCAAACTTTTTTAACTCATCCGGAGTAAAAGGTGAATGCGCGAATCCAGCTATAAGCATTTGCTGTTGCTGAGATAAACCACTTAACGATACGTTCTCATTGGCTACGTCTGCTAGCTGCCCTAAATTACTTATTGGGTGACCTTTTGATTTAAAAAAAGTATATATTTTACTAACCCAATTTTTTGATATTTTTTTACTACCAGTTTCTAATCCACTTAGATAGGCAGTCGAAGTTTCTAGCTCTTGAGACATAGTTTTCAATGTGTAACCTACGTCAATTCGAGCTTTACGAATTGTTTTACCAAATTCAGAAAGTGCCATTGTTCCTCCTCGCTTCATGACCCGATTTGAAGCTATTTATAATTTACCATAAAAGAATAATAATTCAACTAAAAAGGTTAATTTATTTTACCATTAATAATGGTTGATACTTTTTAGATACCCGCTTAGCCTATATAAGCAACCCCAATACACCCGCTGTAAAGTCTATTCCAGCGGTTGGGGCTCTCCTCCTCACATACACTGGTGCCACTTAGTTAGTTTATTGGCACTGGGAACATGGCAAACAAAACAAGCACAAACACCAAATTCAATTGGTTTGAAGTATTTAGAGCCGGTACACAAACCGATTCTAAAGGCGTAACACACACATTTAGCGATGCAGATTTAAACAGCGTTGTAACCAACTTTAAACCTAAAACCGCTCCGCTGGTTATTGGCCACCCTAAAATGCACGATGCTGCATGGGGCTGGGCCAGTGATTTAAAAGCTGAAGGCGGCTCTTTGTTTGCTAAAGCAGACGATGTTTGCGCTGAATTTGCCCAAGCTGTAGCCGATAAGCGCTACCCTAACCGCTCGGTACGATTAGAAAAAGTAGCTAATGGCTACCAACTTGCGCACATTGGTTATTTAGGTGGCAAGCCCCCTGCTGTTGAAGGCCTTGCCTGGCAGTTTAACCAAGCCGATGATGCCGACACCCTTACCCTAGAATTTGCTGCAGGCGATATTGACAACATATCGCTGCACACATCAAACACCCTTACCCGCCTTATGAGTAATTTACGTGGCTTTATAACTGACCGCTTTGGTAGTGAAGCAGCAGATAAAGTTGTGCCTAATTACGAAGGTGAATGGTTAAAAGAAGAAACCATTATTGCTGAGCATGAGCGTGCTAAAGCCAATAGCGACAATACAGAATTTAATAAAGGCGATGATGCTATTAATACCGATATAAATAGCAACGCCACCCCACCCACCCATGAGGACAATGCAATGGATGAAAAAGAGAGAAAGGCGCTGCAAGACCAAATTGATGCAGCGAACGCTAAAAACGCTAAGTTGGAATACGCGCAGCGTGTTGCCGCGGCCAGCACCTTTATTAATACCGAAGTAAACGGTGGTAAAGCGCCGCGTTTAACGAATACCGATGGTGTGGCTGAGTTTATGGCCAAGTTAAATGATGGCGATGCCACGTTTGAATTTGCAGCCAGCGACGGTAAAAACCAAGAGCTTAAACCTGCGACCTGGTTTGAAGGGTTTTTAAAAGGTTTACCAGAGCAAACTGGCTTAACAAGCGAGTTTAATAAAGACGATAAAAACGGCGAAGTAACTGACGATAGTGCAGAAACACTGGCAGCTAAGGCGCTTGATTATCAACAATCACAATCTAGTAAAGGCGTGACTATTAGCATTACCGCTGCGCTGGACCAAATTAAAAAGGCATAAGACTATGGCAAATCCAGGATTTATTAAAAACTTTGCGGCAACAGCTACTATTGCTGCTAACCGCTTGGTTGTTGTATCGCCAGTGGCTGACTTTGCTGTAGCAAGTGCGGTAGATGCAAGCGCAGCGTATGCCGGCGTAACTGAGCAAGGTACAGACGATCATTTACGAATAGATGTGGTTATGACTCAAAGTGCGCCGGTTGAATTTGGTGGTGTAATTGAAGCGGGTGATTTAATTATTGCAGACGCAGACGGTAAGGCAGTGGCATTTGACTTAGCGACTAGTGTGGGTGCGACACAAATACATATTGCAGGCTGGGCCATGGAAGACGGTGACGTGGGTGTAATTGGTGACATATTTTTAGCGCCACAAGTAATAGCGACTATTCCAACTGCATAGCGCAGCTGGGTTAACTTAAATATATATAATAAGGATTTGTCATGAGTAATGGTATGCCATTTACCCCTGATGTTGAGCAAACGGCGATTGCCATTGCTTACAAAAATAAAGCCTTGGTTGCAGATACACTTGCACCTTATTCACCGGTTGGGTTACGTAACTACAAATGGACCGAGTATAAAAAAGGCGAAAAATTTACCGTTGTAGACGATAAAATTGGCCGTAAATCGTCTCCTAATCAAGTTGAGTTTAGTGTTGAAGATAGAACAGGCTCAGTTGTTGATTTTGGCTTAGCAGATGTTGTGCCAAATGACGATGTTACGAATGCGCCAGCAAACTATAACCCGCGTTTACATGCTGCTGAAAGTTTAACTGATTTGGTATTGCTTAATCGTGAAATACGCGTTGCTAATATGTACAACAAAGCTGCTAACTTTGGTAGCACTCAATCATTAGCGGCGGGCGGACAAAAGCGTTTAGATGATGCAACACTGGATATTTTGCCGTTCTTTTTAGACATGCTTGATGCACCACTTATGCGCCCGAATGCCATGACGCTATCGCAAAGTGTGGCCACTAAGCTGCGTACCCACCCTAAGTTACTAAAAGCGTTTAACGGTACTAGTGGTGATCAAGGCCTAGTGCCATGGAGTTATATTAAAGAAGTACTTGAGCTTGATTATATAACCGTAGGCCAAGCGCGACTGAACACAGCTAAAAAAGGCCAGGCACTTGATCTGCAACGTGTGTGGAAAGATAGCTTGTCGTTTACTTACCACGATCCGCTTGCGTCGTTTAACAATAACCGTATGACCTTTGCGCTAACCGCCCGTTATGGCTCGCGTACATCGGGCAATCGTGATGTTGCTGCTGGTTTAAACGGTGGTGTTGAAATTATGGTAGGCGAAGCTGTACAAGAGCAAGTTATTGCAAAAGATTGCGGTATTTTACTTACCAACGTATTAACGCCTGGCTAACGCTAGATTTAATTTTTCATTGTTCCCTAGTTAAAAGGCCTCTTTTTTTGTTTTTTTGGGGCCTTTTTTTACTAACTGAGGTGTGTATGTTTACGACAGTTCAAGCAGTTATCGACAAAGTTGGCATTAATGTGCTGTTGCAATTTGCTACGGCTAAGTTTGCGGTGGCGGGCAGTCGCCCTACTCGTGACGATGTAGAAGCCGCACTTTTAAGTGAAACGTATAGTGAGTTACAAGCGCAGATTAATGCTTGGTATAACCAAGCGCAAAAAAATGTAAATTCAGTTATTGCAGGGTATGTAGCGCGGTTTGAGCTAAACCAACGCGACATTGATGGATCGTTATTACCGGGCATAGCTAATGATTTAATGCATTGTGAACTTGCCCCTAACATTGCAGACGAACACCTTAAAAACCTTAAAAGCAGTGCTATGGCGATGCTAGACAAGGTTAGTAAAGGCGTGATCCAAATTAAGGAAGACGGGCCCGCAGCCACAAGAACAGGGATGCGCACGAGAGTTGCGGGCACTCAATTTAACTGGCCAGGCTATTAAATTGGCGGGTGTATTTATAAATATAACGGGTAATGCACTGCCCCGCTTAACCCAAATTGCAAACACAAGCGGTGAACCAGCTGATGTACTGGACGACATTGGTGCATTTTTAGACATGGACGTCACCACTCGATTTTTACGTGAAGTAACACCCGAAGGCCGTAAGTGGGAGCAGTCGCAAGCGGCCAAAGACCGTGGTGGTTTAACGCTTACTGATGAGCGTAACCTGGCAGGCTCTGTTACGCATAACGTAAATGGTAATACGCTTGAGCATGGCTTAGGTGAAAAGTACGCAGCCATACACCATTTTGGCGGTAAGACCGGCCGTAATAAAAGCGTGACCTTACCCGCACGGACAATACTGGGTATTGCTGCTGTGCAAGAGACTGAAATTAACGACATCATTACTGATTGGTTAATTTAAACAGCCCCTTGGTTAAGTTTAAACAGTATTTAAAGAGCATTTAAATGGCATTTAACTTTGATTTAAACAACATAGAAACCTTGCTAAGCAACACTGTGCTTAATGCAACCGTTGGCTTTGCAAGCGACTTTAACTACGTGCGTGAACATGCAGTACACAGTGCCCAGCTGTTTGTATTGCCACTGGCCGATGACAATATCAATACCAATGAAGTGCCTGGGCTTGATGAGTACCAGGTTAAAGATGTGTTTGCGGTGATGATTGTGATCCCCTGCTCTGCAGGGAATGCCACCACTGATGAGCAAATTAAACAATTGCGAAGTGATATTAAAACCGCCGTGGCTGGGTGCCAGTATGCGGGGTGGGATGCAATAAAACTTGATAAAGGCCGCACGATTGAGCTTAGCAAGAAAACAAATAATTTAATTTATCAGTGTCAGTTTAGTGTAACTGGCATACATACCGTAGCTGTGAGGGCAATGCCATGAGCAAAAAAACAGAGCCGCAATTAACAAAACCCGCTGAACAAAAGGCTGACGTTAACATAAAGCCTAAAATGTCGCGAGCGATGACAATTGCACAAAACGTTAACCAAACTTTGGCAAATGCTAAAGGTAACAGAGATGAGCTAGCCGGCGCTTTTGATTTAAAGAGCGGTGAGCTAATTAAAGTGGAGGTTACGGCATGAGCACGTGGCGATTTAAAGACAAACTCATTTTAGCAGATGCAGCTGGTACGACGCTAACTGGCCTACATGCAATATATGCCAGTGACGTGGAGTTTACGCCAGAGAGCGAAAGCGAAAAAGACGAGTTAGAAACGAGCTACAGCGGTGCAAGCATGGAAACCTTTTATGGCGAGCATGTAAGCCTAAACTTTAAAACACCGCTGGCAATGAGTGGTACAGCGGGTACAGCACCAGCATATGCGCCACTTCTGCTTGCCTGTGGCATGGTGCAAGTGTCTGATGTTAGTAGCGTTACCTTTACTAAAGGTGCGGCAGTGGCTGCTAAGTGCACGTTACGCTTTGGTAAAAACACCCATAACATTACACAAATGAAAGGCAATGTGAGCTTTGCACTTGAAAAAGGCAAGCCCATGCTTAACTGGCAGTTTAAAGGTTTGTTTAGTCCGCCGGTTGCAAGCAGTGCCCCGCCAAGTGTTGATTGGGATCGTTGGGTACGCCCCGAAGTGCTAGGCGTAAGTAACAGCTCTGACTTTAAACTAAGTGACACCCAACGCACGCTGCATAAGTTAACAGTTGATTTGGGTAATAACGTGGTGTTTGACCGTGCCATTAACCACGAAGAAATTATGATTACCGGGCATGAAAGCAGCGCTAACTTTACACTAAGCGCCGATGAGCTAACAAACTTTGATCCATGGAAAGACGTGGGCAAAGTGCAAACGTTTGAGTTTACCCATGGCACAGCCGTAGGTAAAAAAGTAACCATTATTGGGCGTTACCAAATGCCGTGGCCCAAATACACTAGCTTGGACTCGGAATTAACCGGTTACGAATTTGACGGCAAACTAGTACCCAGTGGCACAGGCTATGACGAACTAACGATTGTTTTTGAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP011036|1786981:1793157|1789659_1790595_+|WP_089368302.1|capsid|DBSCAN-SWA MSNGMPFTPDVEQTAIAIAYKNKALVADTLAPYSPVGLRNYKWTEYKKGEKFTVVDDKIGRKSSPNQVEFSVEDRTGSVVDFGLADVVPNDDVTNAPANYNPRLHAAESLTDLVLLNREIRVANMYNKAANFGSTQSLAAGGQKRLDDATLDILPFFLDMLDAPLMRPNAMTLSQSVATKLRTHPKLLKAFNGTSGDQGLVPWSYIKEVLELDYITVGQARLNTAKKGQALDLQRVWKDSLSFTYHDPLASFNNNRMTFALTARYGSRTSGNRDVAAGLNGGVEIMVGEAVQEQVIAKDCGILLTNVLTPG >NZ_CP011036|1786981:1793157|1790681_1791149_+|WP_089368303.1|DBSCAN-SWA MFTTVQAVIDKVGINVLLQFATAKFAVAGSRPTRDDVEAALLSETYSELQAQINAWYNQAQKNVNSVIAGYVARFELNQRDIDGSLLPGIANDLMHCELAPNIADEHLKNLKSSAMAMLDKVSKGVIQIKEDGPAATRTGMRTRVAGTQFNWPGY >NZ_CP011036|1786981:1793157|1787451_1787814_-|WP_089368299.1|DBSCAN-SWA MALSEFGKTIRKARIDVGYTLKTMSQELETSTAYLSGLETGSKKISKNWVSKIYTFFKSKGHPISNLGQLADVANENVSLSGLSQQQQMLIAGFAHSPFTPDELKKFAEFLEDINKCSKE >NZ_CP011036|1786981:1793157|1791617_1792061_+|WP_011328223.1|DBSCAN-SWA MAFNFDLNNIETLLSNTVLNATVGFASDFNYVREHAVHSAQLFVLPLADDNINTNEVPGLDEYQVKDVFAVMIVIPCSAGNATTDEQIKQLRSDIKTAVAGCQYAGWDAIKLDKGRTIELSKKTNNLIYQCQFSVTGIHTVAVRAMP >NZ_CP011036|1786981:1793157|1792057_1792261_+|WP_011328224.1|DBSCAN-SWA MSKKTEPQLTKPAEQKADVNIKPKMSRAMTIAQNVNQTLANAKGNRDELAGAFDLKSGELIKVEVTA >NZ_CP011036|1786981:1793157|1789222_1789618_+|WP_089368301.1|DBSCAN-SWA MANPGFIKNFAATATIAANRLVVVSPVADFAVASAVDASAAYAGVTEQGTDDHLRIDVVMTQSAPVEFGGVIEAGDLIIADADGKAVAFDLATSVGATQIHIAGWAMEDGDVGVIGDIFLAPQVIATIPTA >NZ_CP011036|1786981:1793157|1788051_1789218_+|WP_089368300.1|DBSCAN-SWA MANKTSTNTKFNWFEVFRAGTQTDSKGVTHTFSDADLNSVVTNFKPKTAPLVIGHPKMHDAAWGWASDLKAEGGSLFAKADDVCAEFAQAVADKRYPNRSVRLEKVANGYQLAHIGYLGGKPPAVEGLAWQFNQADDADTLTLEFAAGDIDNISLHTSNTLTRLMSNLRGFITDRFGSEAADKVVPNYEGEWLKEETIIAEHERAKANSDNTEFNKGDDAINTDINSNATPPTHEDNAMDEKERKALQDQIDAANAKNAKLEYAQRVAAASTFINTEVNGGKAPRLTNTDGVAEFMAKLNDGDATFEFAASDGKNQELKPATWFEGFLKGLPEQTGLTSEFNKDDKNGEVTDDSAETLAAKALDYQQSQSSKGVTISITAALDQIKKA >NZ_CP011036|1786981:1793157|1786981_1787449_-|WP_089368298.1|DBSCAN-SWA MPENYRLRGNRVSPLPLSQIKVVAENFAKAFDFKRRNRRNLDKNFELLYQLRVTLEVVDDKDWIFLTKGHCDPSKAIICVPQSIYNNACIGEQEALAVMLHELGHLFLGHRSLMHYSDKPAEEIEDAEWQADMFAEIILSIMGYETKQLSFDFYG >NZ_CP011036|1786981:1793157|1791150_1791573_+|WP_089368304.1|DBSCAN-SWA MAGVFINITGNALPRLTQIANTSGEPADVLDDIGAFLDMDVTTRFLREVTPEGRKWEQSQAAKDRGGLTLTDERNLAGSVTHNVNGNTLEHGLGEKYAAIHHFGGKTGRNKSVTLPARTILGIAAVQETEINDIITDWLI >NZ_CP011036|1786981:1793157|1792257_1793157_+|WP_089368305.1|DBSCAN-SWA MSTWRFKDKLILADAAGTTLTGLHAIYASDVEFTPESESEKDELETSYSGASMETFYGEHVSLNFKTPLAMSGTAGTAPAYAPLLLACGMVQVSDVSSVTFTKGAAVAAKCTLRFGKNTHNITQMKGNVSFALEKGKPMLNWQFKGLFSPPVASSAPPSVDWDRWVRPEVLGVSNSSDFKLSDTQRTLHKLTVDLGNNVVFDRAINHEEIMITGHESSANFTLSADELTNFDPWKDVGKVQTFEFTHGTAVGKKVTIIGRYQMPWPKYTSLDSELTGYEFDGKLVPSGTGYDELTIVFE |
10 | Pseudomonas_virus(33.33%) | capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1987974 : 2044226
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP011036|1987974:2044226|DBSCAN-SWA TATGAAAAAGCAGCTGTACCAGCTAAGTAATACCGATATAGCATTTCCACCTATAGAGTGCGCTCTCGACTCCCCCGACGGTTTACTCGCTATTGGTGGCGATTTAAGTTTAGCGCGGCTAAGTAACGCTTATAATAATGGTATATTTCCGTGGTTTAGCGAAGACGAGCCAATAATGTGGTGGTCGCCCAGTGAGCGCGGCATTGTAGAGCTCGATAATTTTCATATTAGTAAAAGCCTGCGCAAGCATTTAAAAAAGCACCCGGTCACCGTTACTATAAATAATGCCTTTATTGAAGTGATTGAAGCATGCTGCGAGCAACGCATTGATACCGATGGTACGTGGATAACCTCTGACATGCTCACTGCGTACATTAACGCCCATAACGCAGGCATTGCTCATAGTGTAGAAGTGTGGCGCGAGGGAGAGCTTGCAGGTGGCTTATATGGCATTATGCAAAATGGTGTTTTTTGTGGCGAGTCGATGTTTCATCATCAAACAAACTGCTCTAAGCTGGCTATGTGGGCGTTGGTTAATTGGCTTAAGCGCCATAACGCGCATTTTATTGATTGTCAGCTCGAAAACCCCTATTTAATGTCGTTAGGGGCGACAGTGATCCCACGCCCTGCATTTTTAGCTAAACTACACGCAGCGCAAAATTATAAAGTAGACCCTGCTATGTGGATACCACAGGAGCTTAACGCTATTTATGAATGAACATATTCCTGCACGCGCTGGTTTAAGCCAAGAGTTTGCTTGTAGTTATTTACCCAACCGCCAAGAGCAGTTATTGGTCATTCTTGATCCAAGTTGCTACAGCAGCGATAAATTTGAGTCTTTGCTGGCGTTAGGTTTTCGTCGCAGCGGTAACCAAATTTACCGCCCGCACTGTCCAACTTGCAGCGCATGTAGCTCTGTACGTGTATTAGCACAAGAGTTTATTGAGACAAAATCGCACAAACGTAAACTAAACAAAGCAAAAACACGCTTTGAAGTTAAATATTCTAACCAAGAGCGCCCGCAATACTACGCGCTGTACAGTAAATATATTAGTTTGCGCCATCAAGACGGTAGTATGTATCCTCCTGATAAAACACAGTTTCAGAGTTTTTTATTATGCAGTTGGTTAAACATCACTTTTATAGAACTTTGGGATCAAGACAATTTAGTTGCGGTTGCCGTAACTGATTGTATGGACAAGGCTATTTCAGCTATTTATACTTTTTTTGACCCCGACTATGAGCAGTATAGTTTGGGTACTGTGATGATTTTACAGCAGCTAATATTTGCTAAAGCACAAAATAAGCACTACGTGTACTTGGGCTACCAAATAGACGAATGTCCTAAAATGAACTACAAAACGCAATTTTTACCGGCGCAAAAACAAGTCAAAGACCAGTGGTTGACTATTTAATTTGCAAAAATAGCCGCTGCGCCTTTACTTATTGGCGTATTTTGGGCAGAATCTGCAGCGTTTAACTATTAAAGAGGTGTTACGCTAAACATGGCGAAAGAAGACGTAATCGAAATGCAAGGGACAGTCCTTGATACTTTACCAAATACAATGTTCCGAGTTGAGCTAGAAAATGGTCACGTAGTTGTGGCTCATATTTCAGGCAAAATGCGCAAAAACTATATCCGTATTTTAACCGGCGATAAAGTAACGGTAGAAATGACTCCTTACGATTTATCGAAAGGTCGTATCGTATTCCGTGCTCGCTAAGTAAGTGCGTAAACGAGATTTAGTTTTTGGCTAGTGTTTCACTAGCTTTAAGCGTTTATTAAATGTAATTGATGGATATTAACTAGCAATTACATTTAATAAACAAAAAACCCAGCCTTGCTGGGTTTTTTGTTGTCTATAAAACATTACAAAAAAGGCCTGCTTTTTAAAAGCAGGCCTTTTTATTTAACTCATTTAGCGAATATTAAACTAAGCTGGTGTTAAATCACTTTGATAATCAAAGCGAATTTTTTTATCTTTAACCGATACTTTAACCGTACCGCCTTCAACAAGTTCACCAAAGAGTATTTCGTTGGCTAATGGTTTTTTAAGCTGCTCTTGGATAATACGTGCCATAGGACGTGCCCCCATCGCTTTGTCGTAACCTTTGTCAGCCAACCATTCCCGTGCTTTAGCACTTAGCTCAAGATTAACTGACTTTTTATCCAGTTGCGCCTGAAGCTCCACAATAAACTTATCAACCACAAGTAAAATAACGTCTTTATCAAGGTGATTAAACCAAATAATGTTATCTAAACGGTTTCTAAATTCTGGTGAAAATACTTTATTAATTTCACCCATTGCATCGTGCGTATGGTCTTGCTCGCTAAAACCAATTGACGCACGCGTTGTTTCTTGCACGCCCGCATTGGTGGTCATTACCACGACTACATTTCTAAAATCGGCTTTGCGGCCGTTATTATCAGTTAATGTACCGTGATCCATTACTTGCAGCAATATGTTGTAAATATCTGAGTGCGCTTTTTCAATTTCATCTAACAGTACTACCGCATGCGGGTTTTTAATTACCGCTTCAGTGAGTAAACCACCTTGCTCAAAACCAACATAACCTGGTGGCGCACCAATTAGTCGACTAATTGCATGGCGCTCTACGTACTCCGACATATCAAAGCGAATAAACTCAACACCCATACACTTAGCTAGCTGTTTAGTTACCTCGGTTTTGCCTACCCCTGTTGGGCCTGCAAATAAGAACGACCCTACTGGTTTTTCTTCGTTGGCTAAACCAGAGCGCGATAAGCGAATAGCCGATGTAAGCGCATCAATAGATTGATCTTGCCCAAACACCAACATTTTTAAATTGCGGTCTAAGCTTTTAAGCGTTTCTTTATCGCTAGATGACACACTTTGCGGTGGAATACGCGCCATTTTAGCCACAATATTTTCTATATCGGCAACGCCAATGGTTTTTTTACGTTTAGAGCTAGGCAGTAAACGCTGGCTTGCACCGGCTTCGTCAATTACGTCAATTGCTTTATCGGGTAAATGGCGTTCATTAATATATTTTGCACTTAACTCTGCCGCTGCTTTTAACGCTTTTTGCGTATAACGAATACCATGGTGCGCTTCGTAACGCTCTTTTAAACCATTTAATATTTTAGTGGTATCGGCAACACTCGGCTCAAGCACATCAATTTTTTGAAAGCGACGTACCAAAGCACGGTCTTTCTCAAAAATATTTTTATACTCGTTATAAGTTGTCGAACCCATACAGCGTAATTGCCCACTAGAGAGTAGCGGCTTAAGTAAGTTTGATGCATCCATAACGCCACCCGATGCCGCGCCGGCACCAATAATGGTATGAATTTCATCAATAAATAAAATAGAGCCCGGCTGTGCTTGCAACTCTTTTAGTAAGCTTTTAAAGCGTTTTTCAAAATCGCCACGGTACTTAGTACCTGCCAATAATGCGCCCATATCAAGCGAGTAAACAACGGCATCGGCAATTACTTCGGGTACTTGCTTATTTACAATACGATACGCTAGGCCTTCTGCAATTGCTGTTTTACCAACACCTGCTTCGCCTACTAATAATGGGTTGTTCTTTTTACGACGACACAACACCTGCACAGTACGTTCTACTTCACTATCGCGCCCTATTAATGGGTCAATGTGGCCTTCGAGCGCTTGTACGTTTAAATTAGTGGTAAAGCTGTCGAGCTTGCTCGCTTCTTCGCTTTGCACTTCTTGTACGTCTTCGTGAATATCGTCGGTATCATCGCCTAATTCATCATCGCTTTTGGCAATGCCATGCGAAATAAAATTAACAATATCAAGACGTGATATATCGTGTTTTTTAAGTAAATATACTGCTTGGCTTTCTTGCTCAGAAAAAATAGCCACCAGCACGTTTACGCCTGTTACTTCGTTTTTACCCGATGATTGCACATGAAAAACAGCACGTTGCAATACACGTTGAAAACCAAGTGTTGGCTGAGTTTCACGCTCTTCTTCTAAATCTGGAATAACTGGTGTGGTTTCGTTAATAAACTCAAGTAGTTCAGTTTTTAACTCTGCAACATTTACTGCACAGGCACTTAGCGCTTCCCCAGCAGATGGATTGTCCAAAAGCGCAAGTAAAAGGTGTTCTACCGTCATAAACTCATGACGACGTGTACGCGCTTCGCGAAACGCGCTGTTCAAAGTAAGTTCTAAATCTTTATTTAGCATTGGCAACCCCTTACAGAGATAATAATTTTATACCATTACAATCGAACGAAAGATCATTCGCTTGGTATTTATTCCTGCTCACAACTACATAGCAGTGGATGCTCGTTATCCCTTGAATATCGGTTAACTTGTTCAGCTTTTGTATGGGCTACATCTGAGCTAAATACGCCGCAGATCCCCTTCCCTTGTTGATGAATTTGCAGCATCACGTCGGTTGCTCTATCGCTATCCATATTAAAAAATGTCATCAGGATCTCTATCACAAAATCCATTGGCGTGTAATCGTCGTTATTTAAAACAACTTTATATTTTCGCGGTGGTTGCAGCTTTTGCTTTTCCTTGTCGCGAACGATGTCTATAACACCTGAATCTTTCATACCACTCATAATTAAATATAGTCTTGTCTTTGTAACTCAAGCAAACTTGAATAAAAAAATAAATAAAATGTTAATTAATAGATCAAAACACTTGACTGACTGGCTAAATAAACTACAGTCAAACATAGATTGATTAAACCTTAGTCAGTCTAGCAAATTATACAGTTTAGATTAACTAAATTAGTGAACTTATAGAAGGATGTAGAAGTATGGCTTGTGGTAAAGTCAAATGGTTCAATAATGCCAAAGGTTTCGGTTTCATCGTAGAAGACGGCTGCGAGAATGATATTTTCGCTCATTACTCAACAATTGTAATGGACGGCTATAAAACACTTAAAGCTGGTCAAGATGTAACATTCGAATTAGAACAAGGCCCTAAAGGCTTACACGCTAAAAATATAGCGCCTAACGGTGATATTATTGAGTG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52 | Leptospira_phage(38.46%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3052721 : 3092120
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP011036|3052721:3092120|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP011036|3052721:3092120|3060726_3061719_+|WP_011329282.1|DBSCAN-SWA MTLRIAITPGEPAGIGPDLLLKLAQQTWDAQLVAIADANMLKQRAKHLGLSIKLIEFDQHAAATPAPAGSLYLHQVDVAEPVELGVLNDANGQYVLDTLRIASEKNMDGTFAAVVTGPVHKGIINKAGISFSGHTEYFAQQSNTADVVMMLATQGLRVALVTTHIPLAYVSRAITEDRLIKVASILNHDLQTKFGIEKPRILVCGLNPHAGEDGHLGREEIDTIIPTLEILNNQGMNLIGPLPADTLFQDKYLNEADAVLAMYHDQGLPVLKYKGFGNSVNITLGLPFIRTSVDHGTALDLAGKGTADVGSFELAIREAIKLAQEKAQNQ >NZ_CP011036|3052721:3092120|3089167_3091306_-|WP_089368777.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA MELPRNSVWGLKGSDLAEDGLYRILEIMLDVTSIILFPLNTKSVTTRPFAVSIEAFTENVKSRNASKAGFNLPSFLLVAEENIAKEHITRRDKNYSLIEGIISDRGFIFDYATKKRVSHLAKHAKKVGVDRKALSRLLMQYWRYGQDKMALLPAYNNSGGFGTDKKPTDKPLGSPKQPRTVAVERSVKFIVTDIDKNKFRKALKKYYLKQTGLTLSKTYKNMLIDSYADEVRLANAYGKPPVVPTLKQFSYWSKKIFSKDEFIKSRTSENDHLRNKRGLLGSVIQDSYLPGAHFEIDATVADVHIVSELGSQYVLGRPIIYIVVDRASRMIVGMHVSLFHASWRAARQALSNCFMPKSRYCEEFGIDIDDSEWPCSHIPKELVCDNGEMIGLQPKKALNPMTKLSFTPPYRPDCKGVVEKRFDILNKEVIHEFLGTTRGANVIRGSRDPRKDAIYTLKEVTVQIIKAVLEHNKSIFADLAFSSPLLVESDLSPNPINYWKIHLARHKHELQAALPQDVISRLLPPAQVSMTRNGIHFNGLYYSNKEIEERNLASIARSSGQWKLEARIDENTTNHIYVKLDKNKSFELCYLSPRSRMFKDKSMYESEFIQDWLDSKKELTPISVTSIDDHQNRHHVTKNAKKRSYNAEKITFSEKTKNVRQRREDELQATTNILQPKIQSNKNIDITPSENRSDKIVSLPVGRKRRTKGESS >NZ_CP011036|3052721:3092120|3067019_3067256_-|WP_041454777.1|DBSCAN-SWA MAKVCQVTGKRPAVGNHRSHARNATKRRFLPNLQTHRFWVESEKRFVTLRTTTKGMRIIDKKGIDTVLTEIRARGVKV >NZ_CP011036|3052721:3092120|3069699_3070287_+|WP_011329292.1|DBSCAN-SWA MPATKRSNRKEQILQALAQMLETSPGQRITTAKLAAEVGVSEAALYRHFPSKARMFEGLIEFIEDTLLSRINLILENEKESQARVYNILHLLLTFAEKNPGITRILTGDALQGEQERLRERVQSFFEKLETQFKQVLRERKLREGKNFQSDELTLANFLLAYVEGKMNQFVRSNFSTKPSAQFEKQWPELQKIWL >NZ_CP011036|3052721:3092120|3081777_3082980_+|WP_008465246.1|transposase|DBSCAN-SWA MTQSFDFNKALAELQAGKGLTGEDGVLTPLIKQLTEAALKAELEQHLESETQVNRKNGSTKKTVKSSIGQFELETPRDRSGSFEPQLVKKNQTKLTPEIDEKILSMFALGMSYRDIRGHIQDMYGVEVSEATITAVTDQLIPELKAWQARSLDTLYPFIWLDAIHYKIKENGRYVSKAIYTVLGVNIEGRKELLGLYISESEGANYWLSVLTDLHNRGVSDILIACVDGLKGFPEAIATIYPDAEVQECVIHQIRNSMKYVASKHQKEFMADLKPVYKAATKDAAEAALAELDAKWGKLYPIVIESWRRKWGNLSVYFKYPDYVRKAIYTTNAIEAVHRQFRRLTKTKGAFPNENSLMKLLYAGILNASKKWTMPIHNWNLTLSQLAIHFEGRLDGVLDI >NZ_CP011036|3052721:3092120|3078271_3078709_-|WP_013463093.1|DBSCAN-SWA MRVDANVHYFNGNQRTKPSTEASTSFSAALTAAQTDNDKTDSSTKQADFTSMTRQEMRDWANTQIRNGEMSLDDGRPFMAMTMKIPVNGGELAGAHSDETRYNFIQKTRDGIQGALSRNDETTLKMLESAMSIMQDKSTGVNIRI >NZ_CP011036|3052721:3092120|3067529_3068204_-|WP_011329290.1|DBSCAN-SWA MQLTSLPNSQRPREKLIEKGAKALSDAELLAIFLRTGLPGMNVIELAQHLLNENKTLHNLFNASMEEFCAQKGLGTAKYVQLQAVLELSQRYMQERCQRDAIFNSPNAVYDYLTLQMRGLQQEVFMVLYLDSQNRLIKDEILFYGTINSASVYPREVVKAALKNNAAAVIFAHNHPSGIAEPSQADKLITNKLQQALQLVDINVLDHIIVGGETCVSFAERGLI >NZ_CP011036|3052721:3092120|3073348_3074455_+|WP_089368773.1|DBSCAN-SWA MLHFWYKEFPQYPRDHKDYWRTGLIAHSLLICCCYFLILTLLNVFYFSSYDIALIDALGLIASLSICIWFNKTAQVSKAAWVVALMIVGLIMLFIVSAKGHAHSLFWATLIPPFTFFLVGRNWGSILSSIAFGICAYLVYLQQQLSITIGLSALFNFIEVSIAHVLLFRFYEKTRFSAYSHLSKRNAEIKQLAETDKLTGLYNRQKFDFELSQLLSENNNERKSNIVMICDIDHFKKVNDTYGHLAGDNVLSEFANILQNKLTNSALIARWGGEEFTIILRDSSLDNAINEAEELRAFIATHLIDNRALTISIGIAKAHVDDTALHLLERADKALYKAKLQGRDQVCVASDNLTKTHYENTLSKSAAI >NZ_CP011036|3052721:3092120|3085598_3086273_+|WP_013463096.1|DBSCAN-SWA MKISTNLLPTLFESKISIFTNSDDEKIKSFSTKTSESGLKININTTHLDPKVKEKKDNNAFDSSLIEGSAYEKVFKKEELNFSNMSIKELHSIVKNVNEMEREYTQKYDSDEPVRLGKSGNPIISKKREDMNSLESKLRILSYGGGDVDPDKKINVMEYFSNSSEKLDGLAKEYPERQTYQVRASYMKEIINTFDKFISDDTFDLYQEKAALLLTDKKKVDVFI >NZ_CP011036|3052721:3092120|3083015_3083330_+|WP_089368985.1|DBSCAN-SWA MDPVSANQFSTTQNHGGGQVRVYVFQFGYGNTNNATFAGSSVSATSSTPRCGANLSTCSAGQTVTGFLHQFDFFGASNISGTVNVSANSIASPFGFWSDSVFVQ >NZ_CP011036|3052721:3092120|3054460_3055321_-|WP_089368767.1|DBSCAN-SWA MWGKILGFIFGFMFGKIFGAIFGLYLGHMFDKSLKKDFDKAGGFSNLFKGDDVNERQALFFSSCFAVMGHIAKSNGRISEVHIKAATLFMDEMGLQGEERREAQHAFQSGKENDFSLKETVQDFKERFAKRYDLLQLFLEIQIQMAFSDGVLAEQEKLLLQEVSKQLGVSRAHFAFVLKRYQAEFSFRQQQQRYKQQQQGQSSSYREGSGHHVPPNNNINRAQALALLGLNDSATAREIKLAYRKLMAQHHPDKLVSQGLPKHMMELAVKKSQDIQAAYEYLKKSA >NZ_CP011036|3052721:3092120|3066852_3067008_-|WP_004335545.1|DBSCAN-SWA MRDKIRLVSTAGTGFFYTTDKNKRNMPEKMEIKKFDPKIRKHVLFKEAKIK >NZ_CP011036|3052721:3092120|3087229_3088448_+|WP_089368776.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKSNRYTSEFRERAIRLVTTQQHEYPSLWAALVSISDKLGCTPETLRAWVKKSQAQPSKPSSNTPSTEERLAILERENKELKRTNDILRQAAGFFRPSGARPQTEVIVDFIDACREHYGVESICKELPIAPSTYYSHKQIQREPERLSNRKKRDAELIILIREVWEDNMSVYGARKIWKQLQLDDHQVARCTVERLMRVMGIQGVRRGKAHKTTIPDEQQDKPLDLVNRQFTAEQPNQLWVADITYVATWSGFVYVAFVIDVFSRYIVGWRVSTTMHTELILDALEQAIWHRGNPEGLIHHSDRGSQYLSIRYTERLAEAGIQASVGSVGDSYDNALAETINGLFKTEIIRRNGPWKNVDAVEYATLEWVNWFNNQRLLSSIGYISPAQYETDYYDNLNESGKVA >NZ_CP011036|3052721:3092120|3068347_3069541_+|WP_011329291.1|DBSCAN-SWA MINLTNKKIVLGISGGIAAYKCAELVRRLKEHGCSVKVVMTESAKHFITPLTMQAVSGEMVADSLLDPSAEAAMGHIEFAKWADLILVAPATSNIIAKMAAGIADDLLTTLLLATPAKVAIAPAMNQQMYAHPATQANLATLKARNVLIWGPGKGEQACGDVGAGRMLEPHELVALCIAKEQPQLLAGKTITITAGPTREAIDPVRFISNHSSGKMGYALAEAALLLGAKVNLISGPVTIKAPTGVNLINIESAEQLLNESLNYAPRSDAFIGCAAVADYRAATVAAQKMKKQGDELTLTLVKNPDVIAHVANLQQNRPYTVGFAAETQNVANYAKGKLKNKNLDMICANDVSQSDLGFNADNNALTLYWHNEQLELPTNSKTAIALTVIQQLAQRI >NZ_CP011036|3052721:3092120|3084247_3084841_-|WP_024604507.1|DBSCAN-SWA MSKIGYARVSSTGQSLEVQLDKLNQVGCDKIYHEKQSGKTAARPEFQKCMNYLREGDTFVITRLDRLARSVIHLSQVAERFQAENIDLVVIDQAIDTSTPTGRLMFNMLAAIAEFETDLRSERQLEGIAKAKEHGVKFGRPTKRTDEIDLEIYNKRKEGVPIGQLAKDYDLGSATIYRILNDVFEKVSTEATKLSLG >NZ_CP011036|3052721:3092120|3057083_3059330_+|WP_041454580.1|DBSCAN-SWA MSKTWGILMLSVLSAPSLAETELTHKFCGTSMQTRAWQPLPGLKLGMVDIRANDVELLGTQSAEFTGNVDINTVNMSLSAQTALIDKQRGLLNATGPITYRDKISEVNSTGLNADLNNSAISLLGAQYSLTQQLGKGGAEKLTVDESGLMLMNASFTACPGEVPVWAIEADEINLSREEGWGETYNAVLRILDTPVLYLPYFTFPLDERRKSGLLTPSFSSSDRYGLETITPYYWNIAPNLDATITPRYMSRKGLQLQTEFRYLTQEHEGLVGIEYLNKDDSDPDLGDRYMFHWQQKSYLGENWRANVDITNVSDDNYLTDLDSNYASKTDTQLYRTGSLTHMGDTWRTDITVQNFEVLGDHLESYTALPQISFTQTAPWQYDNFDFSVSGEVSHFTNSSAIIDQATRIHIEPKARFDYKEHAWSFLSEVSILQTNYKQHGDLEGTQYSESVSRTLPKVRLYTQLNFERETSYFIDDGIQTLEPQLQYLYTPNEDQSDIGLFDTAKLQDDFFGLFRDTRFSGVDRIAAANQFTLGATTRLFDKKHQEVFNFSAGQIFYLSDSAKPTEQGLNSDTNYNALFAAQTMVHWHRRWYLSAGIQYDTDGKQIIQSNVTLDYKGDDNELVQLNHRYSDDVSGNAIEQTGLFTSIPVSDEWQFIASYHRDLENNRSIEVLSGLQYESCCWAFQITGHRQIVTDLNQSIGQQQATFDSSIRLNFVLKGLGSKSRYDAKKLLQQGIFGYRRPYFLND >NZ_CP011036|3052721:3092120|3078949_3079330_-|WP_024606317.1|DBSCAN-SWA MAILSIRIDDKLKESLSSEAQKEGISLSEYVKKSLEIKSVDTHILATEKNLKSSVDSIKDLALVSQETVHEVELNIQRLNESLKNANHLKEIKKLKWILISISLIFVSISIPIFHFNIAYFKTFFY |
36 | Burkholderia_virus(18.18%) | transposase,tRNA,integrase | attL 3074577:3074598|attR 3092220:3092241 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011038_1 | 6033-6150 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011038_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP011038_1
>1.1|6069|46|NZ_CP011038|CRISPRCasFinder ACCCCTATAGGGGCGCTATTTTAGAACACACTTAATTAAAATTGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011038_1
The CRISPR arrays of NZ_CP011038_1 >merge|NZ_CP011038|1|6033-6150|CRISPRCasFinder AAACTGCCCCAATTAATGGGGCGAATAAACTTTCCCACCCCTATAGGGGCGCTATTTTAGAACACACTTAATTAAAATTGAAAACTGCCCCCAATTAATGGGGCGAATAAACTTTCCC >NZ_CP011038|1|1|6033-6150|CRISPRCasFinder AAACTGCCCCAATTAATGGGGCGAATAAACTTTCCC ACCCCTATAGGGGCGCTATTTTAGAACACACTTAATTAAAATTGAA AACTGCCCCCAATTAATGGGGCGAATAAACTTTCCC
>NZ_CP011038.1|WP_089369341.1|3892_5419_+|IS66-family-transposase MPDTILITELQNQLALMQAKLDALEKDKISLQEDKVEMQARIDHLLAELKLSKSQKYGKKSEKAPRGTFNEAEQHKSTEPPKHHKKGKQTLAAHFEREEVEHTLTVLDCPCCGEQLHHCGSEDSEQVKIIPAKVSVIKHKQFKYACRHCEHEQLTSKIITAPKPKQPIPGSIASPEALAAIVTGKYCDALPLYRLVDILGRGGLELSRGTLANWCIKAGLLIKPLVAAMQRHLLGEHSLCADETRTQVLDEGENPNSNSYMWVYRSNEASDEPVVIYGYQAGRSRACAEEFLAGYQGYLQCDGYCVYDGIEGIIPVGCWAHARRKYDEALKAESKNKGRAHKAISFISQLYKLETQAKNKKLSPQARYQLRQEKALPILLQFKAWLDEASDKVTAGSYIGKAIKYNLNQWHKLIRYVEDCHLGIDNNITERDIRPFTTGRKNWLFSKSVNGAQASATLYSIVMTCRANDINTYYYFLHLFKTLPSRDVGDDDFTDLMPWNVQLDFDYS >NZ_CP011038.1|WP_147207684.1|3530_3836_+|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MRKSINGLSIIVSDTLSLDPLSQAWFVFCNKQRDKLKILFWDTNGFWLYYRRLEQGRFQWPKETNEHTAMGIEQRQLQWLLSGLPVSNQTRHLALSGLSVM >NZ_CP011038.1|WP_086998905.1|2824_3085_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSIRSFSRYFKANQGISFKLWLNNLRLNRSQELLESTALSITHISEQAGFSSEQIFRKHFKQRFDTTPNAWRNLFRSKVASAEPHI >NZ_CP011038.1|WP_089369340.1|1369_2452_+|chromosome-partitioning-protein-ParB MARKRGIRSPLGNAVGAQDAIESGQKSNIESLAKQLKAEVTGSKLSIMDVLQTHLGISNVGESVSWKLKSGKIAQFVPVTLSYQQVKELTSVTFEVNGRDQSGLTKESLQDLDSLCIQQYYPAIGRRVNGVIDLLDGSRRRARFLLEVGKINSFKILVTDDDISSGDAKALAKQLQVSKEHNLREIGMRCQLESQLYEKKYNKKLTQSELAEEMGLSQAKVSKALTAASIDSAIIELFPDISLLSHSDYKVLNTVQKTLGENVNEFIKDIESNIININSELVQDDYKEAVLKIVTDAIKTYKPKPTEQAIVTPLANFSKKNTYARKRVKGRKFAYEFSQLTKEVQDTLDQAIAKVLQDSL >NZ_CP011038.1|WP_089369339.1|159_1365_+|ParA-family-protein MTIEKTTHIFQDLKEGADRYIKRRNQRLLVNHRKELRSFTRAEASIYLDIDVKTLDRYCASLGIDPRRHEDAQWSIDIEEIYKVRDSLSVELRKEPKFKRSDKQKAQIIVIQNQKGGVGKTVSSATIGSGLATEFHQEYRVGLIDMDGQATLSMYYAPESAQEGCLSVGDLIMGNYELDENETKKEAISSAFLPTTIPNLRILPASQSDRGIEGWFHEGVFNKSLSSPYSILSKILNEVEDEFDIIIIDTPPSLGYATYNAYYAATSVLFPLSITENDIDATCSYFSYIPQVWGLLNNAKHQGYDFMKILITNHKDSSTTTELLNSLNDSFSPYLYSKEFKNSEAVRQASSLLSTVFDMSKSEYPKSKMSYQVAQQNAYEVTSQLQRDIVNVWRKQEQEQE >NZ_CP011038.1|WP_089369342.1|6520_7009_+|hypothetical-protein MNNDVLEIIEYLTSKKDELASQLESLVDEYWVTWRDTNRNIISQSGNPDSVARVGAVAPSIRVYATKAHDRIILRWRIYENSWARLNAAKQDKQTLRYAKEIKRNKDGTTSCFKLTKEAVSWEVEQIDRFLSEAEPVITLINSIHQSLKLLNKLNTKATTEL >NZ_CP011038.1|WP_157696016.1|7010_7175_+|hypothetical-protein MTNKTQKAKSLTPEIKTQAQQRAVTKHSGRMKTITTTIKYKTDHTHSFLNQPPA >NZ_CP011038.1|WP_089369343.1|8376_8658_+|hypothetical-protein MSSKYNRTDGRYVEFLFRPIYEVNTAIAYGIGAITTPFMTLGSFQPGVTISFGIAGILAGGSYLYARKATPLIQRQQNQVINEFKRQNLNEEK >NZ_CP011038.1|WP_089369344.1|9432_10978_-|IS3-family-transposase MRRRFTHEFKVQAVEKALSQCDDVRLEDIALDLGIGYSTLQRWIALAKNHELETKNNGSHMTTEKRPHDWSLEERLNAIIECASLDEAALNEYCRAKGLYPHHIKQWKQDFAKGPSTKPVKSDSKQLRQEIKQLQKELNRKDKALAETAALLVLKKKQMRFLGFQRGRLTHSTERHELIKLITDAQKSGARQAKACELLGLTARTIQRWIEADDMTDKRTSTIKRPPNRLTELEQQRIIKTVNSIEYGHLPPSKIVPKLLDKGVWIASESSFYRVMKSHKLLTHREKVKPNKKIKKPKALKATRVNEIYTWDITYLPTAVKGQFLYLYLVMDIYSRKIVGWQVHDTQLSTLAADLMIDICRREQVKPDQVTLHSDNGSPMKGATLLATLQELGIVPSFSRPSVSNDNPYSESLFKTLKYRPEYPEKAFESMGSARKWVSGFVDWYNDEHLHSGIKFVTPNQRHLGLDKAILAKRHQVNEMAKLQNPSRWSGKSRDWTMINEVNLNPEKKEAMRAA >NZ_CP011038.1|WP_089369361.1|11163_12036_-|DNA-replication-terminus-site-binding-protein MHFITDRFDELKNNIRSLNTILTHTQPLAALAYPLPCTSKGMESEPVKYIAAEEHTGHKAVELAASCYQDLYIQPGYSQKSARRTVGVIWLSPAQNPTSITIPELVDKINAAKTDIENHIIQTYETRQDRFEALRAECPGIMTMHLYRHIRCYSEQNIQSIRFAWQRKDSLSKPVKKDLLLKIEEEFDRSGPEYRVPLEQLINRIKQTPGELLRIRRQVRVQPAANIRFDAGIKTVTAPMPIIIIQSNELKLKALTDFDAKSQRKIRSDKAVSEVIGSFGGVTIEVFSAR >NZ_CP011038.1|WP_089369345.1|12329_12869_-|hypothetical-protein MQKLKGKLTDITVSHTFKTNKTTLNIYDYLEIDSVRYGNVQVPDVINRHLVDGVGKEFELDYLEVKDGKNLKRTIVGITTENGKYDHIPDIELKGDLTAISTLYNIRTFMYFMIWFIVGGLLSLYLNFKTKSDVAAYALLIVGFIVIFIFSTKEKKRKVVPIKEILEYVKQRKKQSDIR >NZ_CP011038.1|WP_089369346.1|12933_13704_-|DUF2726-domain-containing-protein MSLTLIVFIIAVFVFIAIALSGIEKTGSGSPDYTKIGPLFTPAERSFLGVLEQAISNNYRIYGKVRVADVLKTKATKQRSSWQTAFNKIAAKHFDFVLCNMSTMEVICVIELDDKSHNSKRAQERDLFLNNACQGADLKLVRFKAQKSYQIEAVRNAILEATNSLSVSEDVGTPTCNKLELINSERLTSSKLAKKHGLKTSEFLDKMVEYGYLTEINGTHQLTEKGLRNGGEFIEKGRYPAHFKWIEENVPLFKMK >NZ_CP011038.1|WP_089369347.1|13774_14020_+|hypothetical-protein MGNKPLIEKYKFKSGKEKLLMLVALAAAAYGLLGLTREYQEGGISLYIIPAFIAIAIGAWSLTKLLNKPIEIDKDKNKENK >NZ_CP011038.1|WP_089369349.1|14352_14559_+|OmpA-family-protein MQIIKVAIQGNASSEGGRGYNYNLGKERANAVKGLFLELGVDEKQLVVLSVGERHNNFIPKRTVMQGY >NZ_CP011038.1|WP_089369350.1|14632_16504_+|hypothetical-protein MLIKQQVVFQYKSTKNKYFFYILMVLFYLWLEVSFNYFVVSTASDLAVTTDELKFIELFGRFLSCIGCLVLLSRRIKPSGSAAKYCAKFFIMAALAIPTVYFGQKLLIDTLSSMASGDDRMKAVQSDLVKGSFIVAGTPLNITKKINAALLPAFYYSNSTPFVLSDMHLTEITKQKQSKLLSKMYSQFSGLNSKLDEKYQQYVELNKSVDQLNVAYDEKINKTKAAVDTYWEKLKLTENKAWETYRATIKEISNEKLDADLMNKLDSGFRSYRHGGSYSFFKKYEHFTKETVLKGTTPQDWQNGIYLPPKIWGGVDVAAAKRFYHKRYRALLREAKTGFFDEIKDKQNFITQDKVKSQIKEKLASIMTNNIDVEQVNIDDKQGFENSLLKSLYEAKETAILKGSGGVPLGLNKVGFVAYSIEQSPLNLPFTLSTKQSALLFSDYSQENFNAIVATPVTESSIDNIISALNSPPSSFENQSENSQIGTNHFKALLVIPFAISISLFLIIMLSFDLLLHINRYSQINFAKRTESRKIYNKPFYYAQMNPRVALLITMLATLCLISYLHSEWPVKFAFEKVCSFVMAILEGIYYIGESTNGYISIKELFEPLIEYLEALDDLVFPK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011038_1 | 1.1|6069|46|NZ_CP011038|CRISPRCasFinder | 6069-6114 | 46 | NZ_CP011038 | Pseudoalteromonas nigrifaciens strain KMM 661 plasmid unnamed, complete sequence | 6069-6114 | 0 | 1.0 |
NZ_CP011038_1 | 1.1|6069|46|NZ_CP011038|CRISPRCasFinder | 6069-6114 | 46 | NZ_CP011038 | Pseudoalteromonas nigrifaciens strain KMM 661 plasmid unnamed, complete sequence | 6151-6196 | 2 | 0.957 |
1. spacer 1.1|6069|46|NZ_CP011038|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011038 (Pseudoalteromonas nigrifaciens strain KMM 661 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
acccctataggggcgctattttagaacacacttaattaaaattgaa CRISPR spacer acccctataggggcgctattttagaacacacttaattaaaattgaa Protospacer **********************************************
2. spacer 1.1|6069|46|NZ_CP011038|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011038 (Pseudoalteromonas nigrifaciens strain KMM 661 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.957
acccctataggggcgctattttagaacacacttaattaaaattgaa CRISPR spacer gcccctttaggggcgctattttagaacacacttaattaaaattgaa Protospacer .***** ***************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
452408 : 461437
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011037|452408:461437|DBSCAN-SWA CATGAGTAGAATTATTGGAATAGACTTAGGTACTACAAACTCTTGTGTTGCAGTACTTGATGGTGGCAAAGCACGTGTTATTGAAAACGCGGAAGGCGATCGCACAACCCCGTCTGTTATTGCTTATACGCAAGACGGTGAAACTTTAGTTGGTCAGCCAGCTAAACGTCAAGCGGTTACTAACCCAACAAACACAGTATTTGCTATTAAGCGTTTAATTGGTCGTCGTTTTGAAGACGAAGAAGTACAACGCGATATCGGCATCATGCCATTTAAAATTGTTAAAGCCGATAACGGTGATGCATGGGTTGAAGCGGGCGGCGAAAAACGCGCTGCACCACAAATCTCTGCTGAAATCCTGAAAAAAATGAAGAAAACGGCTGAAGACTTCTTAGGTGAAGCAGTAACTGAAGCGGTTATCACAGTACCGGCATACTTTAACGATTCACAGCGTCAAGCTACAAAAGATGCGGGTCGTATTGCTGGCCTTGAAGTTAAACGTATCATCAACGAGCCAACTGCTGCAGCACTTGCTTACGGCATGGACAAAAACCGTGGTGAAAACATTGTTGCAGTATACGACTTAGGTGGCGGTACTTTCGATTTATCAATTATTGAAATTGATGAAGTTGAAGGCGAGCACACGTTTGAAGTACTTGCTACAAATGGTGACACGCACTTAGGTGGTGAAGATTTCGATAACCGCGTAATCAACTACCTAGTAGCTGAATTTAAGAAAGACCAAGGTCTAGACTTAAAAACTGACCCACTTGCAATGCAACGTGTTAAAGAAGCTGCTGAAAAAGCGAAGATTGAACTATCTTCTGCACAATCTACAGAAGTAAACCTTCCGTATGTAACTGCAGATGCAACAGGTCCTAAGCACATGAACGTGAAACTAACACGTGCTAAGCTTGAGTCACTTGTTGAAGACTTAGTAACTAAGTCAATTGAACCATTAAAACGTGCACTTGCTGATGCTGATTTATCAGTAAGCGACATCAACGACATTATTCTTGTTGGTGGCCAAACACGTATGCCTTTAGTACAAAAAACAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCACGTAAAGATGTTAACCCTGATGAAGCTGTTGCAGTAGGCGCGGCAATTCAAGGTGGTGTACTAGCTGGTGACGTTAAAGACGTACTATTACTAGACGTTTCTCCATTATCTCTAGGTATTGAGACAATGGGCTCGGTAATGACAGCACTGATTGAGAAGAACACCACGATTCCTACTAAGAAATCGCAAACTTTCTCAACAGCTGAAGATAATCAGTCTGCAGTAACAATTCATGTACTGCAAGGTGAGCGTAAGCGTTCAAGCGACAACAAATCTCTAGGTCAATTTAACCTAGAAGGTATTCGTCCAGCACAACGTGGTACACCACAAATCGAAGTAACATTCGATGTGGATGCCGATGGTATCTTACATGTATCTGCTAAAGATAAAGATACAGGTAAAGAGCAAAAAATTACGATTCAAGCATCTTCAGGCTTAAGTGATGAAGAAGTTGAACAAATGATTCGTGATGCTGAAGCGCATGCTGAAGATGACAAAAAATTCGAAGAGCTAGTAGCGACTCGTAACCAAGCAGATGCAATGGTTCACGGTACACGCAAGCAAATTGAAGAAGCTGGCGATGCACTTCCAAGTGAAGACAAAGAAGCGATTGAAGCGGCTGTAGTTGACCTTGAAACTGCTATTAAGAGTGACAAGAAAGACGAAATTGAAGCTAAAACTCAAGCGCTTGCTGAAAAGTCTCAAAAGCTTATGGAAATTGCACAAGCTAAAGCTCAACAAGGTTCAGCTGACGCAGGCGAGCAACAACAATCTGCTAAGCAAGATGACGACGTAGTTGATGCAGAGTTTGAAGAAGTTAAAGACGACAAGTAATTGTTGCTTACGCTTCTAGCTAACACAAAGCACTGTAACTTAGTTAAGTGTTTAAGTTAGAATGAACGATTGAGGCGCGCAGGCAATAGCTTGACGCGCCTTTTGCATGAGAATTAGGTGGTAAATCGATACGATTTATCGGTTTATCAAGCAGCCTAGCTGCAAATAGAAAAGAGTAGTGTGGTAGATATGTCAAAACGCGATTATTACGAAGTCCTCGGCGTAAGCAAAGATGCGAGTGAGCGAGACATTAAAAAAGCGTATAAACGCTTAGCGATGAAATATCATCCAGATCGTACTTCAGGCGACAAAGAGCTTGAAACAAAGTTTAAAGAAGTAAAAGAAGCTTACGAGATATTAACTGACGCGCAAAAACGTCAAACTTACGACCAATACGGCCATGCAGCTTTTGAGCAAGGTGGCGGCGGTGGTGGTCATGGTGGTTTTGGCGGCGGTCATGGCGACTTTGGCGATGTTTTTGGTGATGTTTTTGGCGATATTTTTGGTGGCGGCGGTGGCCGACGTCAATCTCGTCAGCAACGTGGATCTGATTTGCGTTACAACATGGACTTAAGCTTAGAAGAAGCGGTTCGTGGTAAAGAAGTCGAAATTAAAATACCAACTTGGGTAGGTTGTGATCCATGTGATGGCAGCGGTGCAAAAGCCGGATCCAAGCCTAAAACATGTACTACGTGTCATGGTGCTGGGCAAGTACAAATGCGCCAAGGCTTTTTTGCTGTTCAGCAAACGTGTCCTACGTGTCAGGGGCAAGGTCAGATTATATCTAACCCTTGTGACAGCTGTCATGGACAAGGCCGCGTAGAAAAAACGAAAACCTTATCGGTTAAAATTCCTGCGGGTGTAGATACCGGCGATCGTATTCGCTTAACGGGTGAAGGCGAAGCGGGAATGCATGGTGCGCCTTCTGGCGACTTGTACGTGCAAGTATCTGTTCGTGAACACCGTATTTTTGTACGTGACGCAAATAACTTACATTGTGAAGTTCCTATTAGCTTCACTACAGCGGGTCTTGGTGGCGAAATTGAAGTGCCAACACTTGATGGTCGCGCTAAGCTTAAAATTCCTTCTGAAACACAAACGGGCAAAATGTTCCGTATGCGTGGCAAAGGCGTTAAATCTGTTCGCAGTGGTGCAATTGGCGACTTAATTTGTAAAGTGGTTATTGAAACACCAATAAACCTGAACGAACGTCAGCGTGAATTATTAGAAGAATTAGAAGAAAGCATGGGCAAAGATAGCTCAAAAAACCGTCCTAAAGAGCAAGGCTTTTTTGACGGTGTTAAAAAGTTTTTTGATGATTTAACTAAATAATTAATGTGTTTTATAATATTAAACGGCGCTCTTTAGAACGTCGTTTTTTTTGCTTAAAATAATAGCGTAGCAACATATGACACCAGCAATAGAGTTACTGAAAAAACAAAAAATTGGTTTTGAATTATTAAGCTATGAGCACGATCCAAACACCACTAACTTTGGCCTTGAAGCAGCCCAAAAGCTAAACCTTAATAGGGATCAGGTTTTTAAAACCATAGTGCTGGAAAACCAAGATGGACAGCTCATAGTCGCCATTACACCTGTTTCTCAGCAAGTTAACTTAAAGCTGCTTGCCTCATTGTGTGGCGCTAAAAAGGTAGCTATGGCTGCGGCAAAAAAAGTGCAAGCAAGCACAGGTTATGTATTAGGAGGCGTGAGCCCACTGGGACAAAAAAAATGTCTTGCCACTTTTTTGCACAGCAGTGCTGCACAATTTGCATGTATTTATGTAAGTGCAGGTAAACGAGGCTTAGACATTGCAATTAACCCCCATGAGTTAGCCAAATTAACAGCAGCAGTGTTGGGGGAATTTTAATCAGCATTGATTTTATAACACTTAGTTAATTAAATTACTGCAAAAATGGAGGACAAATGGCAAAGCCAAATAAAAAAGGGCCAACCAAAACGGTCGATATATTTTGCTCAAGCTGCAGGGCACCTCTATTTAAGTATCGTAAAGGGGGAAAAGGTGCGTTAGTTAAATGTTTTATTGAGCGCATTAGCCAAGACTATACTAAGCAGCCTTGTATTTGCCCAAAATGCGAACGCCCATTTGCGCGGCCTGCAATTATTAAAGGCACAGCTGCATATAAAATGATTGGTGGAAAAGTTACTTTTAAATAAGGCATCTGTAGTGGTCAATAAAATTTGGCCACAGTTTTAGAATCTTTGTATCTGATCTCAGACTCATTTGGCGCTAAACCAGCATTATAATGATGCGGCCTAACGTTGTTATAATATCCGTTGATATAATCACTTACACTATATTTAGCTTCTTTAAAGTTTTCATATCCAACCTTTGGCATCCATTCCGTTTTAAAGCTTCTAAAAAACCGCTCCATTGGCGCATTATCCCAACAATTTCCGCGTCGACTCATGCTTTGTGTAATTTTATAGCGCCACAAACGTTGGCGGTACTTCAAACTCGTATAATGGCTACCTTGGTCTGAGTGAAACATCAATCCACTTGGCCTGCCTCTGCTTTCATAAGCCAACTCAAGCGCTTTTAGCGTTAAGTTAGTATCTGGCGACAACGACATTGCCCAGCCAACGACTTTGCGCGCAAATAAATCAATAACGACTGCTAAATAAGCCCAGCGATTACCTGTCCAAATATACGTCACATCACCGCACCACACAGTATTCGGTTCAACAACATCAAACTGCCTATCTAGCAAATTTGGGATTTCAAAATGCTCATTACCACCACGTTTATATTGATGTTGTGGTACTTGGCAGCTCTCTAGTTTTAGTTTAACCATCAGCTTAGCGGCACGATAACGGCTTAATTCAAAATCGTTATTTGTTGCTATTGCTGCTATTGTTCGCGCCCCTGCTGAACCACCGCTCATCGTATGTATTGCTTTAACTTCAGCTTCTAACCTTACTTGCTCAGGTGTTGGCGTTGTATCCCGTATAGCCCAATATCTATAGCTGCTACGATGCACATTGAATACGCTACACAGCAGACTAATTGGATAACGCTCTCGTTGATTTAACTTCTCGATTAACGAGAATTGTTCAGGGAGTCGGACATCAAGAGAGCGGTAGCCTTTTTTAATATATCCTTTTCTAATTCAATGCTTTGTATTTGCTTTTTAAGTTCACGGATTTCAATTTGTTCGGGCGTCATTGGTGAAGCAGCTGGTGACTGACCATTACGTTCTTGTTTTAATTGAGTAACCCAGTTACTTACGGTTGATTTACCAACCCCCATAGCTTTGGCTGCTTCTTCTTGTGTATAGCCTTGGTCAACTACAAGCTGAGCTGTTTCTAATTTGATTGCCGCAGAATATGTTGCACGTTTTAATTTCGTCATTTTTTCACCCAAATTTGTATGCTTATTAGCATAACACTTCTTTCTTAATGGGTGGCCAAAATCACTGTACCACTACAATCTGTTTATTTCAATATTCCGATTAGGGCGGACATAAGCCCTTGATTGAATTTGCTACATTGATAAACTTAACCGGTTTTGCTGTTTCAATGATTGAAAAATACCCTCCCCACGGATCGGGCCAGTCAATTGGGTTTTTAAAATGGAAAAGGATAGACGTGTGATTGCACTTTTATTTGATATTGTAGGTATGACGGGTACTGCTTTAGTAGTGGGTTCATTTTTTTTGTTACAACTAAATAAAGTATCACCAGCGAGTTTGCTTTATAACATGATGAACTTAACCGGCGCTATATTGCTGCTTATTAGTCTTTGTTATAACTTTAATTTAGCCAGTTTTGTAATTGAAATATTTTGGATTGCAGCCTCTTTAATTGGTTTATATAAATATGTTAAAAATAAACCAAAGCTAGGCAAAGCTTAATTATACTTTTATACCGTGAAATTGCCTTATTTCACGGTTTTTATGTTTTTAATACAATTGTTAACAAAAAGTTTATATCTCTCTTTGCATTATGCAGATAAACTATACCCCATTATTAATAGCTAACATTACCCGTTTTATAGGCGTTTATGTTCTTCATTCCTAAAAAAATTATTTTCGCATTTTTATTGCTACTCTTGTTGTTAACAGTCACTTTTTGGTTTGGTCGAATACATGACTTAGAGCAAGCAAAAAAACAAGCCGACCAACAAGTAAGCCAATTAAATAACTACATTGATAATGAGCTTGCTCGATTTGCTGCGATCCCGCAATTACTCACCAATAACAACTTACTCATTCGCTTTACTAATAATGAAGAAGAGCATTATAGCGCTATTAACAACTACTTAGCGGATATACAAAAAGCCAGTGGCGCATCTGATATTTATATACTTAATACTCAGGGCGAGGTCGTTGCGAGTAGCAATTGGCAGGCCGATTATACATTTTTAGGGAGTAACTTTTCATTTCGACCGTATTTTAAACAAGCATTTGCGGGTGAAAAGGTAGCTTATTTTGCGCTTGGTCAGCGTTCAAAAGAGCGTGGATTATATTTTTCGCAGGCTATTTATCATGAAGGTAAAGCAATTGGGGTTGTGGCGCTAAAAGTAAATGTTGCTAAGTTTGAAGACGACAGATCGCTGCTTAATACGGCAGCAGGTAGTCATTTTTATTTACAATTAGCAGATAATGTTATCGCTATGTCGGATGAGCCTAATTGGCGTTTAAACAGTTTTCAAGAGCTGGATATTGCAGCCAGGCGGGAAATAAATCAACGTCGTGCTTATTTAGATTACCAGCCTGGTCTTATTCCTTTACAACAATTTAATAGCCAAGATATTACACAATTTAAAATTGCTAAGCGTTTATATGTAGTGGCCTCTAAGCCATTAAAACATTTTAATGCTCAAATGAGCGTATTAGTAGATGTTTCTAACATAGCGGCCATGCAGTTACCTCGGTTATTATGGTTGATGATTTTTTATTGTGTGTTTATTTTTATTGTTTATAGTTTACTTGCACGCTTTGCCGGTTATAAAAAACTACTTTATTCTAGGCACAGTTTAGAGCAAAAAGTGATTGAGCGTACCCAAGCACTTGAAAAAGCTCAAACCGCTCTAGTGCAGTCTGCAAAACTTGCCACCATAGGGCAATTAAGCGCTGGCATAAACCACGAAATTAACCAGCCTTTGTGTGCCATGAATGCTTATTTAGCCAGTGCAAAGATATTGCTCAATAAAGGTAAGTTAACAGCATTAAACGAAAACTTAGTCATTATTGAGGGCTTAGTAGAGCGGGTGCATAAAATTGTTGCGCAATTAAAACACTTTAGTAAACCTTCAAAAATGCAACTGAGACCGCACCCTTTGTCGGCATTATTAAATAACGCTTTAATGATCACCCATTCACAACTAAAACAAGATGATATTAGTGTTATTCCTCCGCAGTTTGAGCAAAATATTACCGTTTTGGTCGACTCGCTTAAGTTTGAACAAGTATTAGTTAACGTTATTACTAATGCATCGCAGGCAATGAGTAACTGCGCAACGCGGCAATTAAGTTTTGAAGTTGAATGCTTTGATGGACGCGTAAAACTATCGATATTAGATACAGGATCTGGCATAGAACACCATACTTTAGGCTCTATTTTTGAACCATTTTATAGTACCAAGTCGAGTACCGGTTTAGGCCTTGGTTTATCAATATCTAAGCAAATCATCGACTCGTTTGATGGTCGTTTAAGTGCGCATAATCGCCCAGAAGGGGGGGCGCAGTTTATTATTTGTCTTTGGAGTACTGCGGAGTCACAACATGATTGAGCCACTGCTTTGTAAGCAGGTAATGGTTATTGATGATGAGGCGATGATCCGCGATTCGTTAAATCAATTACTCACTTTGGAAGGCTACCAAGTTCAATGTTTTAGTGATGGGGCAACGGCGCTTAGTCGCTTAAGCCGAGGCTATAGCGGCGTGGTCCTTAGCGACATTAATATGCCAGCAATGGACGGGCTTACGTTACTTGAGCAAATAAAAGCGTTTGATAGTGAGTTACCGGTTATATTTTTAACTGGGTATGCCGATGTGTCGGTGGCGGTAAAAGCGATGCAGTTAGGCGCTTATGATTTATTTGAAAAACCCCTTAACGAGCATTTAATAGATTGTATTGCCAGAGCGTGCGATAAACGCAGCCTGGTAATGGAAAACCGCGCTCTTAAACGCGCGGTAGAAAAAACCTCAGCGCCGGGTGTGCGTATTTTAGGTGATACGCCTAAAATGCAGCACATGATGAAGCTGCTTAATACCGTGATAGATACTCCTGCAGATATATTAATTGAAGGTGAAACCGGGACTGGCAAAGAGCTGGTTGCACGTTACTTACACGACCACAGTAACCGTTCAAGCTGTCAATTTGTAGCGATTAACTGTGGTGCTGTGCCAGAGCAGCTCATAGAAAGTGAACTGTTTGGTGCTGTAAGCGGTGCATACACTGGGGCCACAAAAAATAGAAAGGGTAAATTTGAATTTGCCCAAGGTGGCACTGTTTTTTTAGATGAAATAGAAAGCACCCCGTTGTCGTTACAAGTAAAGTTACTGCGTGTACTAGAGGAGCGAAAGGTAACGCCGGTTGGCGCTAATCATACCGTTAACTTAGATATTCGCATTGTTGCTGCTACTAAAGTTGATTTGCTGGCATTGGTGAATGAAGGTGGGTTTAGAGCCGATTTATATTATCGCCTTAGTTTGGTCAAAGTAAGCATTCCAGCGCTGCGCGATCGAAAAGCTGATATTCCTTTATTATTTAAGCATTTTAGCTCAATTGCGGCAACGCGGTTTTATAAACCACTTGGGGCATTAAATGTAGAGTTAGAACAACGTTTATTAGCCTATGACTGGCCAGGTAACGTGCGTGAACTAAGAAACCAAGCAGAACGAGCAGTATTGTTAGGGCCTGAATTAGCATTTGCGCAAAGTGATTCAGCTGATCAACAAGTGTTATCACAAGATTTAAGTTTGGCCGAAAAGGTCAGTTATTATGAGCAATCTTTAATAGAAGAAGCGTTAGAGCGTAACCATGGCAGTATAAAAAACACCATGGGCACGCTGCAAATTGCGCGTAAAACCTTGTACGACAAAATGAGTAAATATGGTCTAAATCGGGATATGTTTACTGATTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011037|452408:461437|458349_460080_+|WP_089369224.1|DBSCAN-SWA MFFIPKKIIFAFLLLLLLLTVTFWFGRIHDLEQAKKQADQQVSQLNNYIDNELARFAAIPQLLTNNNLLIRFTNNEEEHYSAINNYLADIQKASGASDIYILNTQGEVVASSNWQADYTFLGSNFSFRPYFKQAFAGEKVAYFALGQRSKERGLYFSQAIYHEGKAIGVVALKVNVAKFEDDRSLLNTAAGSHFYLQLADNVIAMSDEPNWRLNSFQELDIAARREINQRRAYLDYQPGLIPLQQFNSQDITQFKIAKRLYVVASKPLKHFNAQMSVLVDVSNIAAMQLPRLLWLMIFYCVFIFIVYSLLARFAGYKKLLYSRHSLEQKVIERTQALEKAQTALVQSAKLATIGQLSAGINHEINQPLCAMNAYLASAKILLNKGKLTALNENLVIIEGLVERVHKIVAQLKHFSKPSKMQLRPHPLSALLNNALMITHSQLKQDDISVIPPQFEQNITVLVDSLKFEQVLVNVITNASQAMSNCATRQLSFEVECFDGRVKLSILDTGSGIEHHTLGSIFEPFYSTKSSTGLGLGLSISKQIIDSFDGRLSAHNRPEGGAQFIICLWSTAESQHD >NZ_CP011037|452408:461437|454514_455657_+|WP_011329986.1|DBSCAN-SWA MSKRDYYEVLGVSKDASERDIKKAYKRLAMKYHPDRTSGDKELETKFKEVKEAYEILTDAQKRQTYDQYGHAAFEQGGGGGGHGGFGGGHGDFGDVFGDVFGDIFGGGGGRRQSRQQRGSDLRYNMDLSLEEAVRGKEVEIKIPTWVGCDPCDGSGAKAGSKPKTCTTCHGAGQVQMRQGFFAVQQTCPTCQGQGQIISNPCDSCHGQGRVEKTKTLSVKIPAGVDTGDRIRLTGEGEAGMHGAPSGDLYVQVSVREHRIFVRDANNLHCEVPISFTTAGLGGEIEVPTLDGRAKLKIPSETQTGKMFRMRGKGVKSVRSGAIGDLICKVVIETPINLNERQRELLEELEESMGKDSSKNRPKEQGFFDGVKKFFDDLTK >NZ_CP011037|452408:461437|456517_457698_-|WP_089369332.1|transposase|DBSCAN-SWA MTKLKRATYSAAIKLETAQLVVDQGYTQEEAAKAMGVGKSTVSNWVTQLKQERNGQSPAASPMTPEQIEIRELKKQIQSIELEKDIFKKGYRSLDVRLPEQFSLIEKLNQRERYPISLLCSVFNVHRSSYRYWAIRDTTPTPEQVRLEAEVKAIHTMSGGSAGARTIAAIATNNDFELSRYRAAKLMVKLKLESCQVPQHQYKRGGNEHFEIPNLLDRQFDVVEPNTVWCGDVTYIWTGNRWAYLAVVIDLFARKVVGWAMSLSPDTNLTLKALELAYESRGRPSGLMFHSDQGSHYTSLKYRQRLWRYKITQSMSRRGNCWDNAPMERFFRSFKTEWMPKVGYENFKEAKYSVSDYINGYYNNVRPHHYNAGLAPNESEIRYKDSKTVAKFY >NZ_CP011037|452408:461437|452408_454325_+|WP_089369222.1|DBSCAN-SWA MSRIIGIDLGTTNSCVAVLDGGKARVIENAEGDRTTPSVIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPTNTVFAIKRLIGRRFEDEEVQRDIGIMPFKIVKADNGDAWVEAGGEKRAAPQISAEILKKMKKTAEDFLGEAVTEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKNRGENIVAVYDLGGGTFDLSIIEIDEVEGEHTFEVLATNGDTHLGGEDFDNRVINYLVAEFKKDQGLDLKTDPLAMQRVKEAAEKAKIELSSAQSTEVNLPYVTADATGPKHMNVKLTRAKLESLVEDLVTKSIEPLKRALADADLSVSDINDIILVGGQTRMPLVQKTVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQGGVLAGDVKDVLLLDVSPLSLGIETMGSVMTALIEKNTTIPTKKSQTFSTAEDNQSAVTIHVLQGERKRSSDNKSLGQFNLEGIRPAQRGTPQIEVTFDVDADGILHVSAKDKDTGKEQKITIQASSGLSDEEVEQMIRDAEAHAEDDKKFEELVATRNQADAMVHGTRKQIEEAGDALPSEDKEAIEAAVVDLETAIKSDKKDEIEAKTQALAEKSQKLMEIAQAKAQQGSADAGEQQQSAKQDDDVVDAEFEEVKDDK >NZ_CP011037|452408:461437|456251_456503_+|WP_041454920.1|DBSCAN-SWA MAKPNKKGPTKTVDIFCSSCRAPLFKYRKGGKGALVKCFIERISQDYTKQPCICPKCERPFARPAIIKGTAAYKMIGGKVTFK >NZ_CP011037|452408:461437|455733_456195_+|WP_089369223.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTPAIELLKKQKIGFELLSYEHDPNTTNFGLEAAQKLNLNRDQVFKTIVLENQDGQLIVAITPVSQQVNLKLLASLCGAKKVAMAAAKKVQASTGYVLGGVSPLGQKKCLATFLHSSAAQFACIYVSAGKRGLDIAINPHELAKLTAAVLGEF >NZ_CP011037|452408:461437|457936_458200_+|WP_041454922.1|DBSCAN-SWA MIALLFDIVGMTGTALVVGSFFLLQLNKVSPASLLYNMMNLTGAILLLISLCYNFNLASFVIEIFWIAASLIGLYKYVKNKPKLGKA >NZ_CP011037|452408:461437|460072_461437_+|WP_011329990.1|DBSCAN-SWA MIEPLLCKQVMVIDDEAMIRDSLNQLLTLEGYQVQCFSDGATALSRLSRGYSGVVLSDINMPAMDGLTLLEQIKAFDSELPVIFLTGYADVSVAVKAMQLGAYDLFEKPLNEHLIDCIARACDKRSLVMENRALKRAVEKTSAPGVRILGDTPKMQHMMKLLNTVIDTPADILIEGETGTGKELVARYLHDHSNRSSCQFVAINCGAVPEQLIESELFGAVSGAYTGATKNRKGKFEFAQGGTVFLDEIESTPLSLQVKLLRVLEERKVTPVGANHTVNLDIRIVAATKVDLLALVNEGGFRADLYYRLSLVKVSIPALRDRKADIPLLFKHFSSIAATRFYKPLGALNVELEQRLLAYDWPGNVRELRNQAERAVLLGPELAFAQSDSADQQVLSQDLSLAEKVSYYEQSLIEEALERNHGSIKNTMGTLQIARKTLYDKMSKYGLNRDMFTD |
8 | Micromonas_pusilla_virus(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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