Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP017069 | Staphylococcus lugdunensis strain K93G chromosome, complete genome | 5 crisprs | WYL,csa3,DEDDh,cas3,DinG | 1 | 0 | 9 | 0 |
1. NZ_CP017069
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP017069_1 | 219446-219536 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017069_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017069_1
>1.1|219479|25|NZ_CP017069|CRISPRCasFinder AGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017069_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017069_1 >merge|NZ_CP017069|1|219446-219536|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCTTTGCTTGATGAATTTCTTTTTAGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCGCCCCAACTTGCTTTGCTTGGTGAATTTCTTTTT >NZ_CP017069|1|1|219446-219536|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCTTTGCTTGATGAATTTCTTTTT AGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCG CCCCAACTTGCTTTGCTTGGTGAATTTCTTTTT
>NZ_CP017069.2|WP_002492523.1|218600_219173_+|thiamine-ABC-transporter-permease MKRLTLADILVTVLISFIFGIIYKMVGLTVAALKPLGLHLDQIAYGLWFIAAIVAFLIIRKPGVAILAELAAGAGETILSGELNMSIIMHSLAQGLACELIFLIFKYKSTKASVAMLAGATAGIFTVPVDWFFNYLGNMPWWNVILLYAIRILSGTILSGLFGYYIVLSLEKTGVTRLYQSSTKKDIDSL >NZ_CP017069.2|WP_002460757.1|217031_218099_-|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase MDITQIKQQMTNFITDGKSEDFPQMALTLFNFQFNHNLDYQKFCIAQGKTPQTVRQWQDIPAVPIDAFKQATFSAIPPEDAAYVFMTSGTTRGIKGKNYHLDLDVYDLAMTKFFKQKVMPQIERIDMGILFPSPNDMPHSSLAHYLEVVKQQFGTSLSDTFINQQGIQFESVVQSLRHAEAQGTPYALLGASYSLVHFLDYLADHGLYFKLPKDSFIFDTGGYKNQSRDVPQSEFYSTLEKRFGVPKDKCINMYGVTELSTQFYDDGNAVSPSIKHGPHWCRSRIVNPLTLEPVPNGEKGVLIHYDLANYNSVAAIMMEDIGEARNDGFILHGRTEGALAKGCSLAVESFLNTMK >NZ_CP017069.2|WP_002492392.1|215585_217019_-|acyl-CoA-reductase MTIQLGYVPFLKAEDIHYQTIQVGNYTVKVPDLTQSQLTNVCHQIKSARYHLQAYTINDIIDVIDHAIQILLDRTSKWRQLAEEILPQSTGYPFDKIKVGLTRYLMTFRKHQLHRFIAEDLPNPQILNQFIPNHKGGYTKAVSPALITHLWSGNIPGLPLWSFISSLLVKSGSICKLPHAEPFLASWFAEIIAEIDPVIAQCFAVIYWPGGEIQLESIAIEQSDVILGYGNNDVLSAIAQRIPVTKRFLAYGEKVSLALIGNETLSPNKVEQVTRNIAREIANYDQQGCYSPQMIFIQQGGNYHPLQVAQMIAHQLQQIEQLFPVQSFNLQDSMTRSHWLQQAETQALLTDDIHVFKGAHASWIVTFHKQLTFLPSPLNRFVRIMPFTNITQLTQLLTPYRSYLQTVGIAAATEKMFQWSEALAQVGVCRFSSLETMTLPEAGWHHDGGFNLRDLLSFVDIEQPLLSSSEHFVDYEI >NZ_CP017069.2|WP_002460759.1|214794_215565_-|SDR-family-oxidoreductase MMTTLQDQVILITGASRGIGSAIAEACAQSGAHVIINYKSNTQAAQKTVSRCQAHGGIAEAIQADINQRQQVDEMMHYIQNNYGKLSCVVNNAFRPFEFNAETRQVADEMNWQDYATQFEGALLYTHNVIQAALPYLKQQQAASIINMTTNLIKRPIVPYHSYNVAKSALEAYTKNLAIDLGKYGIRVNCVAPGLVYPTNNTLATKEQLKQQLIQQTPLGRYTVPDDIAGPVMFLASDWSRFMTGQVLYVDGGLTI >NZ_CP017069.2|WP_002492409.1|213053_214589_+|PTS-transporter-subunit-EIIC MNKVFEKAQQFGKSFMLPIAILPAVGLLLGIGGALSNPNTVKTYPVLDVAILQNIFTLMSSAGNIVFQNLPVIFAIGVAIGLARSDKGTAGLAALIGFLIMNATMNGMLVITDGLAKTTELAKHGQSMVLGIQTIETGVFGGIVTGILTAYLHNKYNKITLPAYLGFFSGSRFVPIVTAISAIFLGVILFYIWPTVQSGIFNAGGLVEKTGVIGTFFFGFILRLLGPFGLHHIFYLPFWQTGLGGSLEVGGHMVRGTQNIFLAQLGDPHVTHYFSGISRYMSGRFITMMFGLCGAALAIYHTAKPQHKKVVGGLMLSAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPVLYLIHAFLDGLAFMMADIFNITVGQTFSGGFIDYILFGVLQGNDKTNYLWVIPIGIVWFVLYYVIFRTLITVFNFKTPGREDKEAQHTVAATERAETIVQGLGGKENIEIVDCCATRLRVTLKDGDLLDKSTLLKTDAKGVIVRGNGAQIVYGPHVTTIKNEVEELLEQS >NZ_CP017069.2|WP_002492576.1|212227_212806_-|hypothetical-protein MEEVLTNDSFSNLTYTKLKRFNKDYWKFVLIMFPTIPISAILPYLGNIYLKNNKDNIFVHGTIFPDNWTIIAGLIFALLFFYLIVLSPLLSFKNDVQTEIDIVNSVFINNQGELHSFIHLIKCDHFETEYYEHLITFISREYTRVTKQDLSHEQQTRYDEVQPHLSLDEAHRYVRELYLTLEKRYNNINLPE >NZ_CP017069.2|WP_002492541.1|211368_212124_-|SDR-family-oxidoreductase MFKLTNQIALVTGGANGIGKGIAAALAQAGAKVIIGDIDDTRGKETARELNGDFIELDVKQHDQVKDVVDQIVAKYERIDILASNTGVYPQIDIESLTEADWDYIQNINLKGMFFVTQAVLKVMKAQRYGRVIITSSVTGPITGYPGWAHYGASKAGQLGFMRSAALEYAKYGITVNAVQPGNVLTDGLKAQGEAYLEGTRKIIPTHELGEPLDIGYAVTFFASQEAKFITGQSLVIDGGQLLPEEPDGVL >NZ_CP017069.2|WP_002492472.1|210433_211231_-|N-acetyltransferase MMNIRAFEHYMSIDSERYSEPSLEALNDYATRFMYTVPFENINVQNGIPISVDINDLYHKIVDNHRGGFCYELNTLFQAYLKAKGFDAQMMSATVHTANGGHRLEGSHVSLVVPLQGTYYVTDVGFGDLPLHAMPITLEQDSQPVQDISGTFRAIFENENKTRFFVQKWESDTWKTKYDAILKASSIDAFKDKINYNETHPDSIFVQNLLITQPKSYGRVTMSQQHLTVTEQNRKVQYDVTPQNYRQLLQDYFNLNVTIDRLELS >NZ_CP017069.2|WP_002479052.1|209790_210060_+|hypothetical-protein MSERRRSIISSLLLILAVIIISAVVLCDIINFIAGISVNHHIINTQYNMYFVFVSMLLWIISEVFDKQYVKAVIIALVVGVLTIIALII >NZ_CP017069.2|WP_002492383.1|209406_209727_+|hypothetical-protein MVNHCSDVKNILKKGDIIFNKEQHPKLLTVLHIIMIVFVGLAVLTLLISIIAHFIVGGRPFYHFAYVLFIIGMLAEVSINIIQRQTQAAVLSIIMIVLAIIIIFAD >NZ_CP017069.2|WP_037540733.1|219602_220979_-|MFS-transporter MSNSYQKGKQLIIGIILGILTYWLFAQSLLNIAPHVQHDYKIDMSVVNIAVSLTSLLTGVFIVVAGGLSDKLGRVKMTNIGLILSIIGSLALIISNMPILLLTGRVLQGLSAACLLPSTIALINQFFTGEERQKALSFWSFGSYGGTGLASLFAGTIATYVGWRWIFILSIIFAFIAIILLRGTPESKDRSSDGKRFDVIGIIVFVIMMVSVNVVITQGSKIGWLSPIILTLMIIFVLTLFIFYFYEQRQRHPFIDFSLFSNKVYIGTTIANLLVNTVIGSLALFNIFAQAGLGLTGAQAGLITIPYMLGSLLMIRIGERFMQKKGPQIPLMAGPISISVGILLLALNFLPHILYYIIALIGFSFIGLGLGFFATPALSTAVSNAPESKVGMASGIIKMTSTLGAAFGIAVVTTVYSTLEINHTPHMAATIALIVGACMVISAFIVAFLVIPKQHVKA >NZ_CP017069.2|WP_002492376.1|220991_224024_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MDKHITDQLTLHCGATLKNRVLMAPMTIQAGYFDGSVTREMIDYYQFRAGSASAIIVESCFVEDHGRGFPGAIGIDTDEKIPGLTRLADAIKSKGSKAILQLYHAGRMANPKLNAGETPISASPVAALRPDASVPREMTHNQILNMIERFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANTYLLQQFFSPHSNRRQDDWGGSREKRTNFPVEVLKKVQQVASEHHAQNFIIGYRFSPEEIEEPGIRFEDTMFLLNTLAQYHPDYFHISANSYKRTSIVNQDDTEPLINKYLSLQNETLAEIPIMGVGSIAQRADAEEALTLGYDLMSVGKAYLVEPNWLEKILNDETVEDFADIHDQQTLHIPSPLWKVMDFMILDKAEEHRKYEKLKALQNKKVAFKAGVYNVYAKGHNGNLPMQVELSKDKIISVHVDDSGESEGIANPVFERLPRDIIDGQTLNVDVISGATVTSQGIIDGIADAITQAGEDPDILRARPKPVVQWSNETIEETTDIVVIGTGGAGLSAAATALDNNKEVIMLEKFPAIGGNTIRTGGQVNAPEPQWQNRFPALAGERDTLRELLSLDEANIAEDYLEDFHKVKDQIKDYLNATEEEKPYLFDSIELHRIQTYLGGKRTDKYGEEISGQYDLVKTLTDNVLTSVKWLTDKGVHFDRSFVDMPVGALWRRGHKPMKAQGLEYIETLSNYVKTNGGRIFTETTAEKLIVEDHKVVGVEARKANGAKVHIRARYGVILATGGFGANTKMLQQYNTYWDNIPDDIKTTNSPAITGDGIRLGAQAGAQLVGMGFTQMMPISDPKTGALFTGLIVTPSNFIFVNKDGKRFVNEFESRDVLSKAALEQPDGLFYIIADANIKELAMNTSEDKINHELEDGTLVKADTLVALAEKLNINPDTFINTIERYNAAVDKGHDDDFGKNAFDLKIEKAPFYATPRKPAVHHTMGGLSINTGAQVLDINGQVIQGLYASGEVAGGIHAGNRLGGNALADIFTFGRIAAQTASEHQVIKE >NZ_CP017069.2|WP_002492444.1|224101_225022_-|FAD:protein-FMN-transferase MNKRQIKAMGTLIQLSINHDDAEYLFDLAEAKIRAWEQRFSANNTQSELMAINQQAGIRPVQVHPELFHLIKKAHQASMSSNLKLNILIGPLVKLWRIGFEDAQLPTNTEIQQRLRRIQPHHLYLNDAKHEIFLAQRGMEIDLGAIAKGYFADELQAFFLQNGVTSGIINLGGNVITIGSPATHKTWHVGIRDPFHHDGLPLLTVEIQQQSVVTSGIYERYFYQDGQLYHHILDSTTGYPVNNDIASVTIISNHSIDGEIWSTLCSFGYAQQNIDLLNQIDRVEGVIIRKNHDILFTHQLRTKLHL >NZ_CP017069.2|WP_002492417.1|225317_225830_+|membrane-protein MMRKQNDKLKWSSLIMGTLLLITAIIIFSHPVKNFYALTWLIGVFIVINGILGLFFRRAAKAMTGSGTLTTFMAVIDIIFGLLVMFNIGVGSAFFIYMFAVWFVISSVIGLMTLSGQGRFKGLSILINMLGLLFGIILLFNPMMGMVIVSMMIGISFTIIGVMYIVDGLA >NZ_CP017069.2|WP_002492387.1|226342_227542_+|putative-C-S-lyase MTYNFDEIIDRRSTNAMNVEGYLPYLFGNADVSDLQHADDLIRLWIADMDFATPDVVLNAIRRRLDQKILGYTQVFHVDYYNAFVKWTQSRYGYHFPQEQLVFSHGIVAGLIELVSYICNNDDHALILTPSYGPFKMACDENQVEVHYSPLINEEEYYRIDFDDVERQIVQHNIKLCIFCNPHNPSGRVWSREELERFGNIMKAHDVWLISDEIHCDIMRKGMQHLPFATVLPDYDKVITAMSQSKAFNIAGLMFSNLIIRHKGLLNTWKQQHFGSENPLSIAATQAAYEQGEDWLQAMNTYLDGNFEWLKQFLQQELPNAKFKIPEATYLAWVDLSDYITQQHISEPMAKYFIKRAGVIIEGQEQFVHNADGHIRINLAVPRTVLQQGLTKIKAALMS >NZ_CP017069.2|WP_002492524.1|228853_230206_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MTEKYDVIIIGAGPGGYVSAIRAAQLGKTVAIIEKNNAGGTCLNVGCIPSKTLLEHGKKVHDIQSADEWGIHTSNLTIDAAQLTSRKVQVVQTLTSGVTHLLKKNKVSYYKGEAKINSDLTVTVNDETLSSQDVVLATGSRPFVPSIPGLENVDYETTDTFFDMEALPKSLVVIGGGVIATELASSMADLGVKVTIVEVADDILLTEIDEVRALLREHLESQGIEIITSADIEKVEKKSLHLKGQDKISFDRLLVATGRQPNIEIVNDLELSRDGKYLQVDVHYQTSKAHLYAIGDLTSGYQLAHAASAHGIHVAEHLAGMQPKTIKQEDITRCIYTRLEAASVGLSAEQAEALGYEVKVTTSGFQGNAKAIIKGEGQGFVQLVIDEKYKEILGAFIVGPHATDLIGELLGVKASEGTIAELSEIIQPHPALLEAIGEGADAYYNQAIHM >NZ_CP017069.2|WP_002479037.1|230294_231242_+|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MEKEQARWIYKTMNEIRYFEEKVHKIFSDGKIPGFVHLYVGEEAVATGVMSQLEDDDYITSTHRGHGHAIAKGCDLNGMMAEIMGKKTGLGHGKGGSMHVAEIDKGMLGANGIVSGGFGLAIGAGISIRNQQKENVAVCFFGDGAANEGNFHEGLNFASILNLPVIFVCENNQFGEGTTHDYASASETIAERASAYNMPGVRVDGMDVMAVLEATEEAVARAKKGEGPTLIECDTYRKYGHFEGDEQKVKSPDDRNADKNATEEFRKQAIEEGWLTEDEADDIEKAAEQAVEDAVKYADDSDLPDVESLYKDVFA >NZ_CP017069.2|WP_002479036.1|231257_232298_+|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MTETRKLTFMGAINEAIDQSMEQDENVILIGTDVSGGAGVKHIKDDDTFGGVFGVTKGLAKKYSRNRVIDTPIAEHITLSAGVGAAATGLRPIAELMFNDFLGFGLDPILNQGAKMRYMFGGKAKIPLVVRTVHGAGAGAAAQHSQSLYNVFAAIPGVKVVVPSNPYDAKGLLMAAVQDDNLVVFSEDKTLLGQKGNVPEEPYTVDIGKARVVREGEDLSIVAIGKMVAVAEETADRLKDDNISVEVIDLRTVSPWDEETVLTSVKKTGRLIVIDESNPQCNVAGDIASVMGDRAFDYLDGPIKKVTAPDTPVPFAANLEQAYIPNADKVLDVAAELVDDLRKVKS >NZ_CP017069.2|WP_002492516.1|232315_233608_+|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MSQNIIMPKLGMTMTEGTVEEWFVAEGDDVNEGDSIATISSEKLTQDIEAPATGTLLKIEVQAGEDAKVKGVLGIIGDADEATDNSSSSTESTNETADTSEHDQHETSTETAKDDAQSYSTEKSTADVEKSPQQHTRIFISPLARNMAEDKALDINRIKGTGGNARITKLDIQRVEAQGYDYDDSKATETSVQTSKNVDVTNIGEGLNPMRKRIAQNMRESLANTAQLTLHRKVDADRLLDFKDKLTVELNQADKDVKLTVTALLAKAVVLALKDYGAMNARYDNGELLEYEDVHLGIATSLEEGLMVPVINEADTKSIGALAEEIKKTSQAVRDGHTDDVQLSGATFTITNMGTSGIEYFTPILNLGETGILGVGALMKEVTLDGDSLRQVSRIPLSLTFDHQILDGAGAAEFLKVLAKYIENPYLLIL >NZ_CP017069.2|WP_002460740.1|233753_234092_+|PadR-family-transcriptional-regulator MSVSNQMMKGLLDGAILGLIAKGETYGYEILEKLKENQFPEISDGSIYPVLLRLSKKGYVHTTTRKSDNGGPKRKYYTISDSGLDELTRFKEKWQYLNIGMTNLFGSEINVK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP017069_2 | 1023281-1023370 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017069_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017069_2
>2.1|1023305|42|NZ_CP017069|CRISPRCasFinder TATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017069_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017069_2 >merge|NZ_CP017069|2|1023281-1023370|CRISPRCasFinder TGATTGAGAAGTCAGTCGAAAAACTATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAATTGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACG >NZ_CP017069|2|2|1023281-1023370|CRISPRCasFinder TGATTGAGAAGTCAGTCGAAAAAC TATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAAT TGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACG
>NZ_CP017069.2|WP_002445345.1|1022539_1023214_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MIRNRLSELLSERGLKISRVAKDVKIARSSLTSMTQNDSEMIRYDAIDKLCSYLHISPSEFFEHNPINFDFTFDEEPNYKINDVFEGFEVTANITHAFSIENFDFEILVDVELDNRQKLNFDLDVSYKETEKITNSQHRFIFTIKNEDENIGLKKYVDSLSAGLKNLLFKKINQKLSGYVSEIIVKNIDDIEELFPNKGEKCTTLHKEILQTDSRLSSDIFKEY >NZ_CP017069.2|WP_002492309.1|1021353_1022526_-|site-specific-integrase MASYEKRGNTWRYRISLGKDAKTGKYKYISNSGFKRKSDAKHHAEMVERQLRTGDYIAPSTSTFKQVANDWLKQYANEVKVSSVRAREKAIHHAIERFNNKPIQTINKHDYQRFVNDISAQYSKNYIDSIIASTNMIFKYAYDMKLIRIMPSEGIKRPKKKVSVEELEDTEIHKKFLEKDELFQFLEIAKNHHSPQNSFEVFCTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTINITKTYYNPNNNKKQYQILTPKTESSIGKIPVDPHVIKLLKNYKVDVQDTWKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSKLMENVSKDLF >NZ_CP017069.2|WP_002461409.1|1019662_1021285_+|chaperonin-GroEL MAKDLKFSEDARQAMLRGVDKLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEYAAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAIEALHDISQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGQYISEAMDKVGNDGVITIEESSGFNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMTAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSSRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLELKDATMDMLGSANKVEVTKDNTTIVDGDGDNNNIDARVSQIKAQIEETDSDFDKEKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYKKVSDIQAEGDVETGINIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSIIVERLKHADSGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVANIPEPESNNQPPMGGGMPGMM >NZ_CP017069.2|WP_002461410.1|1019318_1019603_+|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVVIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVVIAVGLGRQLENGQRITPDVNEGDRVVFQEYAGTEIKQGNDTYLILNADDILAIIE >NZ_CP017069.2|WP_002461411.1|1018397_1019138_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MSRIWISFLTIVIYALAQYLPVFIIKLTSFQIKSPTQLLHVAIYIQVILFIIAAIIIILLQKVIKNPTKLESDYKEPKRYLVQYALLGFIVVMIYQMFAGLINTWIFGELKASPNTERLMDIARQAPIFIILISIVGPILEEYVFRKVIFGEILDRLKGNIVMRFLIASVVSSLLFALAHNDITFIIVYFGMGMIFSLAYVLTKRIAVSIMIHMMQNGFVVIMQVCFGDVLKHLQTQANAIFHLFF >NZ_CP017069.2|WP_002492303.1|1016566_1017979_+|hypothetical-protein MTRKKTKIKYLSASFAIAVSTQVISPHITHAQDNTLYNKVTNEKSTAHSDNLSQDNSNQKDSDNTNQPSNSSNSANNEGKDNRPNKPSDGTDNGGKDNRPNKPSDGTDNEGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPSDGKDNGGTPSHPQPPTQNGGHGHKPTNQPNNKDNNNGQNNGNGNQGWNTSNGQQYPQNGEKTDHNVSDDFINQINGRGHDSGRNSSSYFPRNHYDEGPVANNQRQSIMKRFKSLAIGSFKYNPFIIEQVNKLGESGNQVSDQDLYALFRKQNFSGNSYLNSLQRGSNYFRFEYFNPTNSSKYYKNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPVDKKGEDNHTQRSEDKIISAEGEDHKQGMTDVKFNRLNITLIGSMCVIFVAVMVYWFINRQKEKEQ >NZ_CP017069.2|WP_002461413.1|1015749_1016373_-|nitroreductase-family-protein MGLFSKNSEKSFLNAIEGRRTVYNLKESISISDEELEQIMTQAIKHVPSAFNSQSTRIVLLLNNKNKQFWDNTKAVLKEKMGADRDFTATEQKIDNFKHSYGTILYFEDQSVVKGLQEQMPSYAENFAIWSTQANAMHQFAIWTALSTKGIGASLQHYNPLVDAVTHQDFDIPETWELMAQMPFGDVREEPNEKEIQPVDARFLVRK >NZ_CP017069.2|WP_002492308.1|1014829_1015615_-|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKLQLLQFNVAYADVNANEHKIKTWFSNSLQQDTDVVILPEMWNNGYALEQLEEKADFDLERSTDFIKNLALQYQVDIIAGSVSNKHHDHIFNTAFAIDKTGKVINQYDKMHLVPMLDEPAFLTAGKNVPETFKLSNGVKVTQMICYDLRFPELLRYPARSGAAIAFYVAQWPSARLNHWQVLLKARAIENNMYVIGCNGCGYDGKTQYAGHSVVINPNGEIIQELSTTEKELTVTIDIDAVEQQRKAIPVFDSLVPHLYK >NZ_CP017069.2|WP_002461415.1|1013635_1014283_-|accessory-gene-regulator-AgrB MRIKQLGINDQMNCVKLYNDTKERDANLKAIDKKIERFARYLQRQNNLDHIQFLKIRLGIQVALGNFFKTIVTYGVALLFHTFLYTLITHLTYFFVRRFAHGAHARSSLLCHIQNLVLFVALPWSIVHFQVSWTFMILLAFIAFIIIICYAPAATKKQPILPHLRKKKKRNAILISICFLVLMLFVSEPYMQLIALGMCLEAITLLPIFFSKEET >NZ_CP017069.2|WP_002461416.1|1013489_1013633_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MNLLSGLFTKGISVIFEFIGNFSVQDMCNGYFDEPEVPQELIDLHRN >NZ_CP017069.2|WP_000153640.1|1023386_1023605_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTILANTRKFKEAMFLKGFNLSDLSRETGVGISYLSQIINGKKIPSPKLAKKMAEVLQVEVNELFEFEVKEA >NZ_CP017069.2|WP_002445364.1|1023609_1023927_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MFNINIDEDEARELLEQAINVRVDELAKEKYFMTYKELSNYLNLSKPTIEELLINNGMKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEQLTAHMNIQNNDFKQVNIKKLLEARQ >NZ_CP017069.2|WP_002445365.1|1023923_1024070_+|hypothetical-protein MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGCNLTGGLENE >NZ_CP017069.2|WP_001058489.1|1024062_1024272_+|hypothetical-protein MNNEQKEVIEHVVYQLELSVMNNLESYEHTEYVDGIEVVSEVSREKHLELIMKWCAQELKNNFQLEKGE >NZ_CP017069.2|WP_002445368.1|1024274_1024598_+|DUF1474-family-protein MNWEIKNLFSDLKLLKDSFEDLKDNHGWHFEELYPHEPNHNLNKDELIREGFSYHERRIHNNQMFDLFHLYIEQFDKIIQKFHELEKASSENFGEESDDAQKLKITE >NZ_CP017069.2|WP_002445370.1|1024661_1025531_+|hypothetical-protein MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFKSFSKPKWSKLINKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKDGANDHGEIIKKHRNDKNVIYRNVIVLDYDEINDLKQLHEAISSALSNVAWFWHTSFSHTTEQSRIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALTVIQKGHIFIKRVNDCPIMDVDMLEQWSKEYKQSNASPNVIGYTRRDSAYWRELSFGTTEGNRNNALASLVGHLLRCHVNDYIVYSYALLWGQFACKPPMKEQEINATFQSILNKHYNN >NZ_CP017069.2|WP_002445371.1|1025544_1027254_+|DUF927-domain-containing-protein METGKSDVLDKIEKINKKDSALQEIIPKGYEIEHHQCGVALYQLIPSKKEGEPDKKVFITSTIPQITERFEDIESNEVSFNMLFYDNKTPVNIAVSAEEISDSRQLLKLVNKKLDVTSSTSTKLVDYINVSKRYNPPLNVKVATRLGHVKGYFIYPYQEVMKDSNVKLFSNDKGFQKLIDSFRSKGTLQGYSKKVFAQIKDLPMVMVMLYASLGSVLLREFGLQPFIVEISGSTSTGKTFTLNLVSSVWGTSDLITTWSSTQNSIESMASFLNSFPMFKDDTRNTHPKFVTSATYNFSSGESKSRSNINLTLNAKKEWRNILISTGESSIANMADEKAGVSARVVTLQDQPYPDNFDFTTLDKSFRENYGTLGLAFIKQYESKKDVYKKAFESYQRYFNQKGSNEIMQRLGRAFALLQVTGEVLNDIDGFEHDHFKIIEQAYDSMVKNNKTIDKPKQLLEELLQYLDANRNNIVGDGYDSVNYGDVKAVYKHDFLCIKNETVKNKLGHEMQTITGQWNKKGYLITDKKRLQKQVKHKSERHLGYAIKKEIIEELGFDFSHSHNPYNENY >NZ_CP017069.2|WP_002445372.1|1027601_1027967_+|hypothetical-protein MEKEQLKQYMYDYVKEYEEIPIYQLEDLFKELDHDYKGKTSVTHDQDKNIVFWSGWNKLTMYALIELVKGEHLDLVYRGSYVMRYLLDGRVPSLPLAITYPEYGQQTEVPSWVPMLLRVTK >NZ_CP017069.2|WP_002492310.1|1027980_1028622_+|pathogenicity-island-protein MNIEIIANQFETRAAALLRYYTGLLESSKKTPFGFKIYNDPFDMVYVVMEGNLYGHIYIKDCNVRKAFELASPKHTEGLIRSIEGHYAGYEIPDGTHDTISDMMASFMFDNDYFMYGLETFAESNNTDMFTYIEGGLNVEELEGVQSSNADVIGNIEILYQLATGINEPASELVEGLKLVTAFVQDENATLDDYKALERKLSELKSSYYSLSK >NZ_CP017069.2|WP_094449183.1|1028909_1029254_+|pathogenicity-island-protein MQKLVEKEKTYNLPDEHRQVLNVIRNTSKKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRKVINSLVYDYAYPIGCSYKRNERGYYIITTEQEKQQAMVSIKKLADGSMKRYEALKRIEV |
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| NZ_CP017069_3 | 1259537-1259627 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017069_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017069_3
>3.1|1259561|43|NZ_CP017069|CRISPRCasFinder AATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017069_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017069_3 >merge|NZ_CP017069|3|1259537-1259627|CRISPRCasFinder AAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGCAATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACTAAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC >NZ_CP017069|3|3|1259537-1259627|CRISPRCasFinder AAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC AATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACT AAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC
>NZ_CP017069.2|WP_002458881.1|1257645_1259355_+|PAS-domain-containing-protein MLKFHQRLLLLLCTITIISFIGLGAIMHHSIYQTLTDKKVADLTKKTENYSKLEEQGKTEEIKNIAKNENISVKITEGNKIIFETKSHYDINPAIDNAANPSNIIYDRADEGYHYTFKNKFSNEAIYISGIDDEMVNLQKELWKYIALIGVVVLIAIYLAVRSIKRTYIRPINEVTYATSLLADGYYHVRVPESNVKETKALFVTTNELARRLQKLNNKQKIQSNRLKTTLENIPSSVLMIDKYGEIVVANHSYYEVFGLEEKVENKDYNDFIDDKIKQLILEAFKTEKSMYNQVEVNINNVHHKYFDVSCVPILSKSKKHLQGMVVVLHDITNLKKLENLRREFVANVSHELKTPITSIKGFAETLIEGAKDDVASLDMFLNIILKESNRIESLVMDLLDLSHIEQQRELETAYVNLSELAHNTVDNLQNQAKDKNIEIIDEISPDIIFKANKNKIAQVITNLLSNAINYSLENNRVIVRVYRQQSKVYLEIQDFGIGISKEEQKHIFERFYRVDKARSRDSGGTGLGLSITKHIVEAHHGVISVKSEPNKGSTFKVTFTDNYSNNEV >NZ_CP017069.2|WP_037540804.1|1256935_1257646_+|response-regulator-transcription-factor MSQKILVVDDEQSIVTLLKYNLETAGYIVEVAYDGEEALEKVEKVQPDLIVLDVMLPKKDGIEVCKTIRSDKNLVPILMLTAKDDEFDRVLGLELGADDYMTKPFSPREVVARVKAILRRSQFVNESANDAANEEDILIENIRIRPEFFEVYKDDELLELTPKEFELLLYLIERQGRVITREHMLNSVWNYEFAGDSRIVDVHISHLRDKLEENPKQPKLIKTVRGLGYKLERPKA >NZ_CP017069.2|WP_002478051.1|1255463_1256732_+|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MSAEKIVKTQDGLQVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKQIVWKEVLAGQKAYDETGEWLPSETLKTIEEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQQLDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTEEVKKVIDFLQNEMGASNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNGRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLAHNEFADKVFTWQQYDEIVENDGKEAANKAQERAEQQGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSELLSSVLMLEHLGWQEAADKITDAIESTIASKIVTYDFARLMDGATEVSTSEFADELIKNLK >NZ_CP017069.2|WP_002458878.1|1254297_1255416_+|citrate-synthase MAELKKGLEGVIAAETKISSIIGSQLTYAGYDIDDLAENAEFEEIVFLLKNYRLPTEEELADLKKKLNYYMTLNPRVYKHFEEYVTDNVHPMTALRTSVSYIAHFDPNAEGESEEKILERSIRIQAKVASLVTAFARVRDGKEPLKPKAELNYAGNFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALVLHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANERVMNMLSEVKSVDQVDDYLDEKFANKEKIMGFGHRVYKEGDPRAKYLREMSRKITSETGRSELYDISIAIEKRMKEEKGLIPNVDFFSATVYHSMDIPHDLFTPIFAVSRTAGWTAHILEQYRDNRIMRPRAKYIGEKDRKYIPIEER >NZ_CP017069.2|WP_002458877.1|1252597_1253956_-|amino-acid-permease MEDKLQRELSNRHVQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIAMTGPSILLTYILIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNKYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPQIPNWVSALFCVLILMTFNLLSARLFGELEFWFAIIKIATIVGLIVVGLVMILMAYKTQFGSASFANLYQNGIFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPQKTIPKAINSVPLRILVFYVGALAVIMSIIPWDKVSPDDSPFVRLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLADQQQAPPIFRSTNKQGVPHIAIIGSSVFLLVAALLNYIFPDATLVFTYVTTISTVLFLVVWGLILWAYINYSRRNPELHKQSTYKLPGGKYMGYIILLFFVFVFALLFVNVETRRAIYFTPVWFIILGLMYYRYKQMAKKTK >NZ_CP017069.2|WP_062248820.1|1251607_1252090_+|IS200/IS605-family-transposase MSSDTNSLAHTKWNCKYHIVFAPKYRRQVIYGKIKKDIGMILRQLCERKGVEIIEAEACKDHIHMLVSIPPKIGVSSFVGYLKGKSSLMIFDRHANLKYRYGNRKFWCKGYYVDTVGRNKKVIENYIRNQLQEDIVADQISMEEYLNPFTGEEIKKRKKK >NZ_CP017069.2|WP_002478049.1|1249545_1251306_+|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMLEKLMKAGMNVARLNFSHGSHEEHKARIDTIRKVAKKLGKTIGILLDTKGPEIRTHDMKDGLIMLEKGKEVIVSMTQVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLVELEVKEIDKANGEVRCEILNTGELKNKKGVNLPGVRVNLPGITDKDADDILFGIKEDVDYIAASFVRRPSDVLDIREILERENNHNITIFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPESVPIVQKDLIRKCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSFVNAIGVSVAHTALNLNVKAIVAATESGSTAVTISKYRPHSDIIAVTPSAHTARQLALVWGAYPVIKKGRKTTDDLLNNSVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGEKGTTNMMKLHLVGDEIAKGQGVGRESVVGQSVVADDASDLEGKDLSNSIIITTSVDETLVPYIEKAAGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTIVGVEHATKEIKDGILITVDAAQGKIFEGYANVL >NZ_CP017069.2|WP_002458875.1|1248559_1249528_+|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNNIEVYGIYQGYQGLLDDNIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPQFKEAEHRKVGIDNLRKRGIEGLVVVGGDGSYRGAQRISEECPEIQTIGVPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIECVDKIRDTASSHARTFIVEVMGRDCGDLALWAGLSVGAETIMVPEVKTEIKDVAEKIESGIKRGKKHSIVMVAEGCMSGQECADELMKYINVDTRVSVLGHIQRGGSPSGTDRVLASRLGGHAVDLLIQGKSGLGVGITHNQLTATPFDEIFKISDHKFNNDIYELAKKLSI >NZ_CP017069.2|WP_002492588.1|1247452_1248397_+|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLYDIKNKIESLKESQQKNDVDLQDEIDLLEASLKRETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTLLDYIPHIFDAFIEFHGDRNFRDDPAMVGGIAYLNEMPVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIAKNLIEMASLSVPVIAIVIGEGGSGGALGIGVANRILMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSSLAKMAAETMKITANDLLQLKIIDNVIEEPLGGAHRDIEIQAQHIKAAFENELAELSKLNKKQLAEDRYNKFRHIGSFVD >NZ_CP017069.2|WP_002458873.1|1246593_1247451_+|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRSSKKKKYLTVQDSKQNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAVSDEGSFQEFDKGMTSANPLDFPGYEEKIEKDQQKTDLQEAVVTGIATLENLPFGIAVMDSRFRMGSMGSVVGEKICRIIDYCTEHRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPEDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRKDMKETLAQILKMHQEVN >NZ_CP017069.2|WP_002493149.1|1259674_1262308_+|DNA-polymerase-I MNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAIYGFAMLLEKILKEEQPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQSTPPELSEQFPYIRQLLDAYHIKYYELENYEADDIIGTLSKQAEASGLETIIITGDRDLTQLATDHVTIYYTKKGVTDVDHYTPEFIAEKYNGLLPKQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFHSVEGVYNHLDEVSGKKLKENLENSKADAFMSKDLATINCDSPIKVNLKDTIMGDLNDNKDKIELFQKLEFKQLLNDIDSSASENNSETEHNFEVIHHFDNINFKKLDNAIIHFEIYGSNYLKDKILKFGLYAQNQYIVISAEDIHQYTELIEWLENDHNNKIVFDAKKTYVAAHRLEINLQHIDFDVMLASYIIDPSRTIEDVQSVVSYYNQNFVKSDIAVYGKGKKRQVPLDDVLEVHIAAIMQAIYNCKPLMSDILSDHNQMDLLNNLELPLARILADMEETGIYTDVNDLKEMQNELQEKLDNLVSEIYEAAGESFNINSPKQLGIVLFETLKLPIIKKTKTGYSTAVDVLEQLQGKHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSIDPNLQNIPIRLEEGRKIRKAFKPTSDDYVILSADYSQIELRVLAHMTQDESLKEAFIHGDDIHAATAMKVFGVEKNQVNDLMRRQAKAVNFGIVYGISDYGLSQNLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMTDIVKDAKANGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRSFAERTAMNTPIQGSAADIIKLAMVQFDKNVRETNYHAKLLLQVHDELIFEVPKSEVQDFSEFVEEIMDNALTLAVPLLVDSSYGATWYDAK >NZ_CP017069.2|WP_002493150.1|1262324_1263197_+|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVEHVKRGIEPFIINTIIKSVTFSSKVIDGKSDGKETIIKGINLDGFRQFTEGYKIYKVERRSKYINIYIEKNQERRVLISHLGMAGGFFIVNHLDEIYAPNYRKHWHVIFHLSNGKLLVYSDIRRFGEIRNVQALNNYASFKNMAPEPFDESALDHYLTYLNQPKVKHKPIKQLILDHKVIAGCGNIYACEALYRAAIHPATEVQSLNQQARQNLFLEVQAVLNEGIKYGGTSISDYRHADGKTGTMQLRLNVYKQQQCKKCGHKIEQQVIATRNSHFCPVCQK >NZ_CP017069.2|WP_002493142.1|1263212_1263818_+|dephospho-CoA-kinase MPKVIGLTGGIATGKSTVSELLTAYGFKVVDADIAAREAVKKGSAGLEQIRQTFGNEAINDDGEMNRQYMGQLVFNHPDKRTELNEIVHPIVHQLMDKEKSHYLNQGYNVVMDIPLLFENELEDTVDEVWLVYTSESIQIERLMERNNLSLEEAKARVYSQISIDKKSRMADIVIDNLGDKLELKQNVERILTDQGYINQE >NZ_CP017069.2|WP_002458885.1|1263964_1264966_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MSTNIAINGMGRIGRMVLRIALKNEALNVVAINASYPPETIAHLINYDTTHGRYDKRVEPIESGIRVEGHDIKLVSDRNPENLPWKDLEIDIVIEATGKFNHGDKAKAHIQAGAKKVLLTGPSKGGKVQMVVKGVNDQDLDTDTYDIFSNASCTTNCIGPVAKVLNDSFGIENGLMTTVHAITNDQNNIDNPHKDLRRARSCGESIIPTSTGAAKALKEVMPELNGKLHGIALRVPTQNVSLVDLVVDLKQKVTVDEVNHAFRDANLQGIIDVEEAPLVSKDYNTNPHSAVIDAKNTMVMGDNKVKVIAWYDNEWGYSNRVVEVANQLGELIK >NZ_CP017069.2|WP_002493146.1|1265138_1266146_+|biotin-synthase-BioB MNLANQIINGKYLTQAECLKIYRDASLATLDLVHEAYLIRRHYFGHKVKLNMILNAKSGICSEDCGYCGQSREMKHKQRYALVSNETICKGADVASNNKIGTYCIVMSGRGPSDKEVEHITKTVKDIKKDHPQLKICACLGLANEEQAEKLKAAGVDRYNHNINTSESYHGQVVSTHTYDERIQTLSYMKEHHISPCSGVICGMGESDEDIIDMAFALKKIDADSIPVNFLHPIQGTKFGSMDDLTPMKCLRILSIFRLINPTKEIRVAGGREVNLRSLQPLALQIANSIFVGDYLITGGQPNELDYQMLEDLGFEIDYGNDDEITFSHPQFKSK >NZ_CP017069.2|WP_002458887.1|1266462_1266933_+|transcriptional-repressor-NrdR MKCPKCSSTHSKVVDSRHADEANAIRRRRECEKCGTRFTTFEHIEVSPLIVVKKDGTREQFLREKILNGLVRSCEKRPVRYQQLEDITNKVEWQLRDEGHTEISSRDIGEHVMNLLMHVDQVSYVRFASVYKEFKDVDQLLASMQGILNDNKRSDS >NZ_CP017069.2|WP_002478057.1|1266933_1268310_+|helicase-DnaB MTMQAYQFDLRPRDSFEVIRHFELSQAHLEILNRLYAPLIGTHAIGLYHYLNQFVSENNQELLTHYTIMNELKVNLLDFRKTMDYLEGIGLLKSFVRHQSDNSNFIYELIQPPTAYQFFNDPMLSVFLFSEVDKKRFVQLKQYFEQDRKDLTNYQNITHKFTEVFKMPNKDIKIDSQNIKSSQYYKGLDLSNEHFDFELLKELLQHHFISSEIVTDEAKALILQLATLYGLTVEAMKRMILNSITSAQTLSFEELRKQARSYYLIEHEQQLPKLAINADKYYDSESQHTRDNSTNTKQDEWLSSLDNISPVDMLSSWSGSEPTHQQKLMIEELVSREKLPLGVINILLQFVMLKNEMMLPKKYIFEVASNWKKLGISNAKEAYERALKMNEPKQVERKPQNAKNRYYGKQIVSREKTPKWLENRDTAKRQEKIKKKDDNLEKDRQQFLEQLKKDWGDD >NZ_CP017069.2|WP_002458889.1|1268309_1269230_+|primosomal-protein-DnaI MKSFKNIMGSDSNLEQRISQIKQQVINDPDVKQFLTMHQSELTNAMIDRDLNVLQEFKDQQKHYDGHDYHSCPNFVKGHIPELYVEDERIKIKYLPCPCKIKYDEARFDSQLVTSHHMQRDTLNAKLNDIFTEDRDRLEIAIKANHICKSIINGESVKGLYIYGPFGTGKSFILGAMANQLKSQKVASTIVYLPEYIRSLKNGFKDGSYEQRLARIREAGILMLDDIGAEEVTPWVRDEIIGPLLHYRMVQELPTFFSSNLSFEELEHHLSITREGAEKTKAARIIERIKSLADDVYLEGKNYRNN >NZ_CP017069.2|WP_002493141.1|1269589_1271527_+|threonine--tRNA-ligase MTKINIQFPDGNKKAFDKGITTEEIAQSISPGLRKKAVAGKFNQQLIDLARPLEEDGEIEIVTPGSEEALEVLRHSTAHLMANALKRLYGNVQFGVGPVIEGGFYYDFDMENKISSDDFEKIEKMMKQIVNENHKIERKVVSREEAKEFFKDDPYKLELIDAIPQDEMVTLYSQGDFTDLCRGVHVPSTAKIKEFKLLSTAGAYWRGDSNNKMLQRIYGTAFFDKKDLKAHLQLLEERRERDHRKIGKDLELFTNNQLVGAGLPLWLPNGATIRREIERYIVDKEVSMGYDHVYTPVLANVDLYRTSGHWAHYRYDMFPPMKLDENEEMVLRPMNCPHHMMIYKNKPHSYRELPIRLAELGTMHRYEASGAVSGLQRVRGMTLNDSHIFVRPDQIKDEFKRVVHMIQDVYKDFGFEDYTFRLSYRDPEDKEKYMDDDDMWNKAESMLKEAVDELGLPYVEAIGEAAFYGPKLDVQVKTAMGKEETLSTAQLDFLLPERFELTYIGSDGEYHRPVVIHRGVVSTMERFVAFLTEETKGAFPTWLAPKQVEIIPVNVDLHYDYARNLQDELKSQGVRVEIDDRNEKMGYKIREAQMQKIPYQIVVGDKEVENNQVNVRQYGSQDQQTLERDEFIWNLVDEIRLKKHR >NZ_CP017069.2|WP_002493144.1|1271990_1273484_+|amino-acid-permease MSKIESQNGGIIRGLKDRHISMIAMGGCIGTGLFMTSGGAIHDAGALGALIAYAIIGIMVFFLMTSLGEMATYLPVSGSFSTYATRFVDPSLGFALGWNYWFNWVITVAADVTIAAQVIQYWTPMAGIPAWLWSCIFLVIIFSLNSLSVRIYGESEYWFALIKVVTVIIFIAIGLLTIIGIMGGKFVGFETFTKGEGPILGGNFGGSLLSILGVFLVAGFSFQGTELIGITAGESENPERAVPKAIKQVFWRILLFYILAIFVIGMLIPYDSNALMGGDNSISTSPFTLVFKNAGLAFAASFMNAVILTSVLSAGNSGMYASTRMLYSMSKDKLAFPIFGKTNKYGVPYLSLLLTAILVIIIFLVQKVSGNAYEYIVAASGMTGFIAWVGIAVSHYRFRRAFQRQHHNKKELKYKAKWFPFGPIFAGILCVIVIIGQDVDFIKTGEFDLNRFVITYMGIPVFLVFFIYHKLRYKTKKIPLEEVDLRQDVHMNEIKHH |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP017069_4 | 1689962-1690048 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017069_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017069_4
>4.1|1689992|27|NZ_CP017069|CRISPRCasFinder GGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017069_4
The CRISPR arrays of NZ_CP017069_4 >merge|NZ_CP017069|4|1689962-1690048|CRISPRCasFinder GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAATGAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGTG >NZ_CP017069|4|4|1689962-1690048|CRISPRCasFinder GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGTG GGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAT GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGTG
>NZ_CP017069.2|WP_002491838.1|1688685_1689558_-|DNA-protecting-protein-DprA MDDIVLLKLRYSGIQAPQFQRLIHAYPNFLSFSEDDLLNLLSKTEIKKWFGDIAAQYKRISEDYILTSLYDASVKFITINSQCYSTLLKEIYDFPPILFYRGDISLLNSNTTLAVVGSRKATSYSYKALDFLFSQFNRRFTIVSGLAKGADSMAHELAIQHHHATIAVLGFGHLTHYPKETYILRQKIEAHHLSISEYLPFEPVTKYHFPQRNRLISGISKGVLITEAEKRSGSQITIAHALDQNRNVYVLPGDLFNPLTQGNLYRAREGACIVTGAEDILMDYDINKVF >NZ_CP017069.2|WP_002459295.1|1686444_1688514_-|type-I-DNA-topoisomerase MADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKKYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDVDDNFEPKYITIRGKGPVVKELKKYAKKAKKVFLASDPDREGEAIAWHLSNILELEDSKENRVVFNEITKDAVKESFKHPRDIEMDLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWTIEGEFRYQKSKFTAKFLHYKNKPFKLQNKDDVNKVTAKLDGDQFEITNVNKKEKTRNPAQPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMIAQQLYEGIDLKRQGTVGLITYMRTDSTRISDAAKNEAKSYITENYGSNYVSKRQAKGKQGDQDAHEAIRPTSAMRTPNEMKSYLSRDQHRLYKLIWERFVASQMAPAILDTVALDVTQNDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVEAKDDKENDKENKLPNLKEGDKVTATQIEPAQHFTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLDSKRFVPTELGEIVYEQVKEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDMKWRKVIDDFYNSFKLDVARAEKEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKTIGVTCPTCKKGDVVERKSKKNRIFYGCSNYPECDFISWDKPIGRDCPKCEHYLVEKKKGRSSQVVCSNCDYQEEAQK >NZ_CP017069.2|WP_002459294.1|1685085_1686393_-|FADH(2)-oxidizing-methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)-C(5))--methyltransferase-TrmFO MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAQRGINVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNALTNAVGVLKEEMRRLDSLIIKAADQAKVPAGGALAVDRHDFAGYVTDALRSHPNVTVLNEEITQIPDGHSIIATGPLTTSSLAQEIVNITGKDQLYFYDAAAPIIEKDSIDMDKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEEEFNRFYDAVLAAEVAPVNEFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGKRPFAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIQLIPGLENVEIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELIGNEHIQFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGVNLAHKLLAKGEVIFPRETMIGSMAYYISHAKNDKNFQPMNANFGLLPVLEKRIKDKKERYETLANRALEYLEKYKKTL >NZ_CP017069.2|WP_002491833.1|1684060_1684954_-|tyrosine-recombinase-XerC MNEIQKAFLYMLKVERNFSDHTIKSYHDDLMQFNEFLAQEMLTLSAFEYKDARNYLSYLYNKNLKRTTVSRKISTLRSFYEYWMTQDETVINPFVQLVHPKKEQYLPQFFYEAEMDALFETVLHDAKKGLRDRVILELLYSTGMRVSELVHIKKMDIDLTLPGVKVLGKGSKERFLPFGEFCKQSIEQYLLEFGPVKQNDHPFLLVNMNGQPITERGVRYVLNDIVKRTAGVTDIHPHKLRHTFATHLLNQGADLRTVQSLLGHVNLSTTGRYTHVSKDQLRKVYLNAHPRAKKERN >NZ_CP017069.2|WP_002459292.1|1683517_1684060_-|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MSTSIHATTIYAVRHNGEAAMAGDGQVTLGQQVIMKQTARKVRRLYDDKVLAGFAGSVADAFTLFEKFETKLQQFSGNLERAAVELAQEWRGDKQLRQLEAMLIVMDKSGILVVSGTGEVIAPDDDIIAIGSGGNYALSAGRALKRHAAHLSAKEMAYESLKVASDICVFTNDNIIVETL >NZ_CP017069.2|WP_002478282.1|1682067_1683471_-|ATP-dependent-protease-ATPase-subunit-HslU MDTNGIKLTPKDIVSQLNEYIVGQDDAKRKVAIALRNRYRRSLLDEETKQEIAPKNILMIGPTGVGKTEIARRMAKIVGAPFIKVEATKFTEVGYVGRDVESMVRDLVDVAVRLVKNQKKAMVKDEAVAKANDKLVKLLVPSMKKKAAQGNNPLENLFGGAIPNFGNNQEDEEEPPTEEIKTKRSEIRQQLLAGKLEDEKVRIKVEQDPGALGMLGTNQNQQMQDMMNQLMPKKKVEREVPVKTARNILADDFADELIDQETANQEAIELAEQMGIIFIDEIDKVATNNQSSGQDVSRQGVQRDILPILEGSMIQTKYGTVNTEHMLFIGAGAFHVSKPSDLIPELQGRFPIRVELESLTVNDFYRILTEPKLSLVKQYEALLKTEEVTVNFTDGAITKLAEIAYQVNQDTDNIGARRLHTILEKMLEDLSFEAPNMPNAVVDITPQYVDEKLKSISTNKDLSAFIL >NZ_CP017069.2|WP_002459290.1|1681272_1682046_-|GTP-sensing-pleiotropic-transcriptional-regulator-CodY MSLLSKTRELNTLLQKHKGIAVDFKDVAQTISNVTVTNVFIVSRRGKILGSSLNELLKSERINQMLESKHIPEEYTEQLMEVKQTQSNIDIDNVLTVFPPEDRETFINSRTTVFPILGGGERFGTLVLGRVKDDFNENDLVLGEYAATVIGMEILREKHNEVEKEARDKAAINMAINSLSYSEKEAIEHIFEELGGNEGLLIASKVADRVGITRSVIVNALRKLESAGVIESRSLGMKGTFIKVKKEKFLDELERNK >NZ_CP017069.2|WP_002459289.1|1680265_1681054_-|30S-ribosomal-protein-S2 MAVISMKQLLEAGVHFGHQTRRWNPKMKKYIFTERNGIYIIDLQKTVKKVEEAYNFIKQVSEDGGKVLFVGTKKQAQESVKAEAERAGQFYVNQRWLGGILTNYKTISKRIKRISEIEKMEEDGLFDVLPKKEVVELKKEYDRLIKFLGGIRDMKSMPQALFVVDPRKERNAIAEARKLNIPIVGIVDTNCDPDEIDYVIPANDDAIRAVKLLTGKMADAVLEGQQGVSNEEVAAEQNIDLDEKEEAKDAETTEENTSVESN >NZ_CP017069.2|WP_002459288.1|1679203_1680082_-|elongation-factor-Ts MAISAKLVKQLRERTGAGMMDCKKALTETDGDIDKAIDYLREKGIAKAAKKADRIAAEGLVHVEVKGNEAAIVEINSETDFVARNEGFQELVKEIANQILDTKPESVDALMETKLPNGQSVDEKMKEAISTIGEKLSIRRFAVKSKSDNDAFGAYLHMGGRIGVLSVVEGSTDEEAAKDVAMHIAAINPKYVSSEQVSEDEINHEREVLKQQALNEGKPANIVEKMVEGRLRKYLQEICAVDQNFVKDPDQTVEAFLKSKGGKLVDFVRYEVGEGMEKREENFADEVKGQMK >NZ_CP017069.2|WP_002459287.1|1678344_1679067_-|UMP-kinase MTQTSKYKRVVLKLSGEALAGEKGFGINPIIIKSVAEQVAEVAKMDCEIAVIVGGGNIWRGKTGSDLGMDRGTADYMGMLATVMNALALQDSLEQLDCDTRVLTSIEMKQVAEPYIRRRAIRHLEKKRVVIFAAGIGNPYFSTDTTAALRAAEVEADVILMGKNNVDGVYSADPKVDPNAVKYEHLTHIQMLQEGLQVMDSTASSFCMDNNIPLNVFSIMEEGNIKRAVMGEKIGTLITK >NZ_CP017069.2|WP_037540675.1|1690216_1691452_-|aminoacyltransferase MNFTTLTCEEFNTYVSKHFSHYTQSIQLYEYRKQQHKGVHLVGVKNIYGEVIAACLLTEARVLKIFKYFYSHRGPVMDYNDLSLVKFFFKHLTRYLKKQRGLFVLIDPYILENIRNAEGEIIHTYNNEKLIDTMHRLGYEHQGFSVGYSDMSQIRWHSVLNLQQKSEDQLLKEMSYQTRCNINKTFEMGVEVITLPIEETDRFYRLFKMAEEKHGFNFREESYFEEMQKIYHDNGYIKLAYINLADYLTRLEKQRQKLIVLLNDVKETLEINPNSKKSKTKYQQLTQQLASIDKNIAKTQDLQQEDGNILDLAAALYVYNNHEMYYLSSGSNPKYIQYMGAYRLQWDMICFAKSHHIHRYNFYGITGDFSSQAEDYGVQQFKKGFNAFVEEYIGDFIKPLRPWLYKFYSRK >NZ_CP017069.2|WP_002478289.1|1691614_1692523_-|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTQIVAGVTPGKGGQVVEGVPVYNTVAEAKQETGANVSVVYVPAPFAADSILEAADADLDMVICITEHIPVVDMVKVKRYLEGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNDDEETKAVVMIGEIGGTAEEEAAEWIKANMTKPVVGFVGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTAAEKIKTLNSCGVKTADTPSEIGTTLIAAAKEAGIYEQLLTIDK >NZ_CP017069.2|WP_002493081.1|1692544_1693711_-|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAKEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYANELLGKQLVTHQTGPEGKEVKRLYIEQGCDIQKEYYVGFVIDRATDRITLMASEEGGTEIEEVAATTPEKIFKETIDPVVGLSPYQARRIAFNINIPKESINKAAKFLISLYNVFVEKDCSIVEINPLVTTGDGEVLALDAKINFDDNALFRHKDIQELRDLEEEDPKEIEASKYDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDVGGGATKEKVTEAFKIILGDDNVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVAAVKEVELTLPLVVRLEGTNVKRGKEILNDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >NZ_CP017069.2|WP_002493079.1|1693821_1694589_-|ribonuclease-HII MKITIKEAKAQLNKVTTLEALSNHALHLDERKGIQQAIRVRQRQLEKELKLEQDYQRMMKYEQEILQQQPDAIICGIDEVGRGPLAGPVVACAVILNANHHYLGLNDSKKVSAVNRAQLNQDLMANVRGYAYGIASAAEIDQLNIYRATQVAMQRAINQLQVRPTHLLIDAMSIDSTISQTAIIKGDAKSVSIAAASIMAKEYRDHLMRDYAQVYPHYGFDKNVGYGTKAHLAGLEQYGVTPIHRRTFEPVKSML >NZ_CP017069.2|WP_002493074.1|1694572_1695457_-|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MAIQWYPGHMAKAKREVTEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDDVIKQKPRVVILNKKDMTNLKEMSKWEHYFVEQGFYPVAVDAKHGKNLKGVEAAAIEATKDKFAKEQAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLARKNIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGKVLQLLDTPGILWPKFEDELVGKKLSLTGAIKDSIVHLDDVAIFGLNFLIQHDIETLRQHYHISVEEDAAILEWFDAIGRRRGLLQKGNEVDYEAVIELLINDLRNAKMGTYCFDLYSEMKRDIAHENND >NZ_CP017069.2|WP_002493075.1|1695713_1698305_+|YfhO-family-protein MTKKLLMIMLFLTLAIIGHTYILYRFIHDGILFTGPNDGIEQMIPMQMYLYDKWSQGQFFYATDFGLGGDFFSDLSYYFSTNLLFIINAIIIYITNLIVSLPTGNVTFWTINAIVISIVKATIAMLVTYLFSMRIVKHRVNSSLIAFLFVMSPLYYRFTVYWPFFSDVFIGLHLLLYAIEHMLQQKKIGLLILAITIIMINNFYFAYYFLLIGAGYLLIRITFPHKDDRMKRITALWLSVLCAFLGLANALFMFYYSAQSYINNRRIPYKDHVPVFESLNINNNIFIDNYLIILLFITIQALLTFKLYKHYYFRLFAFLTCITILFNFMPIVDQIFNGFSAPQKRWHFLLAFNSAMVIGLFIKYFSTIRLKTYIWTNIVAQSAVFISVIVYHQYVPWLVLVPIVSLIGLFTLIIKDATSRLIIKQIYVFSIISLSILVSAVFIKNQIYFKDHEQRANNMYIHSSLYNSELQRQLLSYMTHTKEPWERIDWRVNEQDNTPMYQKFKGLSLYSSIFHHNILDLYYDDLKINLAEESLSRYQSTNGRQNIASLFSVRYMMLKDYQNNLPAYFQKIKSSGQYAIYENKLNLPAVKVTNHLYNDQSIKTSIDREHAMLDGVIVHNGGNNYRKHSKNLLNKVSQSSQHIQCLSNKHIKVNSQQGGMIKLHVPKSIRQHYTDFYLTMYIKRGQPDSNYSVAINGYVNHRLYNQSTYRTGVNTQLYRTQPDENGNISIQLTPSGTFDMKLISLHGENYHKLVQTHRQANFDHRYQDIHDGVRITLAPHSQGMAVVNIPYRKGMMAYVDGKRINPIRVNTMMTGIPVKKSTTSIIIKYLPPHWIVMLLLSSISILCSIMITRIFTKKRKDEE >NZ_CP017069.2|WP_002493078.1|1698309_1700916_+|YfhO-family-protein MQKRTVQAMKTFVMITLISFIATLIIYFPFIKDWISKGYVFSGVGDGFRQMMPFQMYLYEHYTQLKGFYDHSFGLGGDYVKSLAYYYSLSPTMWCNFIMIWLGERLLHWNPHVIGFWPFNQLIVALGRSLLTFICAFYYFRYLKLKQAPLMIATILYGASTVGLYYNFTWSFYGDLLIFLPLSLWGMERFFQRGKIGVFIVAIAITLFSNFYFSYYQAIVLGIYFLLRIIFEYRYDIVTRWQKFYLLMFGTILALFSSIIGFYTGVSSFLNNDRQQNSDFKISLFTDLTQDNYYIFSNGFYITISIIALVALLSFKLYKHYYYKLFAIITWFLLIGSLTQYFDSAFNGFSLPQRRWVYFLVLSTSALMALYIQHISELSIKQYCFTAIPVFIFGLCRYLFAEHFVNWMLISLILIIILALLVWRKKWLYHPLVLLGIVVIFFVQQVVMTIESSKRTIGPYSTTMSTITDPSYYNTKLAKVIQQINHKNNNPLHRIDYMSFYALNSPFIYHYNGISLYSSIFDGSILNYYDHLMQINMPVDKNSTYRYLSNRANLEALWNVQDRFRHPNDLNIPYGFKKIDTIKNGNDTLIHSKNTINYPATHVTNKVFNASDLKSPLDREQAMLQGIVPSDGSIKANTAFKANQNLIDEAKRSTHNATWQNHSHLKVDKNNGGVTYTLPKNVAKKYKDLYVEMDVELLTPDKNHEVGVNEYAQDRNELTYKYRRFVTPVTMRVKASDKLNIHLSQGTYRLSVKGIYGEDYSSLQQSAKDLKAVSVKENKNGYTISKSKSTSGYVVLPMVYADGMKATVNGRHEDVKKVNGIMTAIPVNKGDTHIRLTYTPPHWHLLFIMSILGIILSIAFRFWVKRKV >NZ_CP017069.2|WP_002459304.1|1701162_1701513_-|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRTGDTLRVHVRIIEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRNLRGKAARIQEIR >NZ_CP017069.2|WP_002459305.1|1701618_1702356_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKGIINVNTINFRDYAVNKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMKDIQHNDETRVILMCPQGRPFTQKIAQELSSTEHIVFICGHYEGYDERIREHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNQQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFQGMTVPDVLLSGNHAHIEKWRHKQKLIRTYLKRPDLLMAYPLSEQDKEIIESFKKQLKKG >NZ_CP017069.2|WP_037540673.1|1702355_1702856_-|ribosome-maturation-factor-RimM MQVEVGQIVNTHGIKGEVKVKSHSDFTDTRFQPGEVLTLKHNNDNVELTVTSYRIHKGFHMLKFEGFDNINDVESFKGDYLYQERDHEGIELAEHEFYYSDIIGCTVFNGEIPIGRVTNIIETGANDVWVVKGDKEYMIPYIADVVKDVDIENKTIMITPLEGLLD |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP017069_5 | 2206255-2206335 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017069_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017069_5
>5.1|2206278|35|NZ_CP017069|CRISPRCasFinder ACCAAGCATTTCTACGTGCAACGCAAGCTGGGGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017069_5
The CRISPR arrays of NZ_CP017069_5 >merge|NZ_CP017069|5|2206255-2206335|CRISPRCasFinder GGGGCCCCAGCACAAAGAAATGCACCAAGCATTTCTACGTGCAACGCAAGCTGGGGGTGGGGCCCCAGCACAAAGAAATGC >NZ_CP017069|5|5|2206255-2206335|CRISPRCasFinder GGGGCCCCAGCACAAAGAAATGC ACCAAGCATTTCTACGTGCAACGCAAGCTGGGGGT GGGGCCCCAGCACAAAGAAATGC
>NZ_CP017069.2|WP_002492952.1|2204902_2205355_-|hypothetical-protein MKKGLVLLLAAIFLLTACGKGNDEKQSLEQDIQKLEKEKKDLEKQEEKLKSDKEKYKSQRETLEKEVEEMQSNSSDDDKDNKEKTSDKSKEKSSQHQTTHDQNKDQQNQHQNSNNTDNTQTDKDKTNKQQSSQSTKNDTQKQSKQPKQQQ >NZ_CP017069.2|WP_002459790.1|2204480_2204777_-|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELETLTGRTIVDSTGEINRVVAHLPNFDSDFDTFVATYKLNHQNDFIDAIFTAPKAQRNRLKEIPVHIELISYISKA >NZ_CP017069.2|WP_002492957.1|2203824_2204367_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTVYIETERLKLRDWEENDLLPFQKLNANPQVRRYFPSLLSYRRSALDMKQMQKNITATGIGLFAVELKETNEWIGFIGLNYIPKDSQYPFNNLPFYEIGWRLIPEVWGNGIATEGAEAVLKYAQKKGVYDIYSLTAETNLSSRKVMEKIGMKVFDRFEFPELNKYHPLKMQVRYYKNLK >NZ_CP017069.2|WP_002479382.1|2203226_2203793_+|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKKIAVFCGASKGSNPTYVNEAYNLGKYMAQKGYELIFGAGSVGIMGAIQNGVLDHNGTVIGVMPKELDTKEITSQRVSELILVDSLHQRKEKMAELADAFILAPGGAGSLEEFFEIYSWTQIGIYQKPIGIYNLNGFFEPLHQLIIHMIQEGFIDEKYKALAPLYHTKEDLLHGLQNAKPLGERSYD >NZ_CP017069.2|WP_002492972.1|2202764_2203211_+|YaiI/YqxD-family-protein MTSIIIDGDACPVIQSVIELTSGTGIFVIIVRSFSHYTTQTYPEHVKTIYVDDGPDAVDYKIVQLAQSKDIVITQDYGLASLLLNKVKTVLHHKGYIYNSTNIDMLIQQRYNHAQLRKQGGRHKGPTPFSNKDQQHFEHIFRRVLSQI >NZ_CP017069.2|WP_002459786.1|2202079_2202760_+|hypothetical-protein MDQKKRHLIKTLINVLPIFIVPLVTERKHIKNHSEVKKVTAATSRASKTVANKATDVKEFVIDKKQEHDNKRELKKIAKENDPEYIEKKGEKLAKKNRKEADKMDKKLQKNIEQRHKEEAKAREKNEKQRIKDLKKTQKYQEKVGLTPGALDDETEKKGEKLAKDNKHDIKKLAKKLQKNIEQRHHDEEKNRDKNKKARIKEIKKYEEHDAQSVTKQNNKETHHES >NZ_CP017069.2|WP_002459785.1|2200890_2201763_+|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MFLLELIKGIILGIVEGLTEFAPVSSTGHMILMDDMWLKSTDFLGSESAFTFKVVIQLGSVFAAAWVFRERFFELLHIGKQHQAPISEEFRSKPRRLNLLHVLVGMIPAGILGLMFDDLIEKYLFSVPTVMIGLFLGAIYMIIADKYSEKVKHPQNVDQINYFQAFVIGISQAIAMWPGFSRSGSTISTGVLMKMNHKAASDFTFIMSVPIMLAASGLSLIKHYEYIHLAHIPFYLLGFLAAFIVGLIAIKTFLHLINKIKLVPFAIYRIILVVIIAILYFGFGIGKGIY >NZ_CP017069.2|WP_002459784.1|2200068_2200509_+|MarR-family-transcriptional-regulator MSEHHNLKEQLCFSLYNAQRQVNRYYSNKVFKKYNLTYPQFLVLSILWDESPVNVKKVVTELALDTGTVSPLLKRMEHVDLIKRERSEVDQREVFIHLTEKSEGIKPDLKDASSKVATASSLSADEAQELNRLLGKVINAFTENKE >NZ_CP017069.2|WP_037540845.1|2198911_2199844_-|GTP-binding-protein MKKHNCRNTYISIVSGFLGSGKTTFLQEYMQYLLKTDEKITIIMNEFGTFDVDSLTFNNEVAINALVNGCVCCDLKADLVAQLKNIIADGQTTHIIIEATGIAHPLEIMMACQDPEVIHLISEVKMIGILDASRFLHRHRYSLTTVELMEEQLAYSSTIIINKMDLINDQEQKKLSAELTQINLQATTCYTTFGQLDITTFNNIKHVDNIKSPAKHAHHHGIKSMQYTFSGPIDRQLFYQFILKLPQNVFRLKGFVRFRDCADVIYEFQYAHGLPSYGEVDKEVPLTIVIIGEHIDVERLRNNLDMLQFT >NZ_CP017069.2|WP_014533356.1|2198702_2198804_-|type-I-toxin-antitoxin-system-Fst-family-toxin MMEILVHITTTVISGCIVALFTYWLRTRNNKKK >NZ_CP017069.2|WP_002492997.1|2206704_2207190_-|DUF456-domain-containing-protein MTVLLWLLIIFAFILAFVGLIKPVIPSVLMLWVGFLIYQFAFNNGELSWIFYVSMIVLTVLMFISDFAMNKYFVNKYGGSKISEYVALIGVLVGCFVFPPFGIIIIPFVAVFAVELMQDFDVNKAFKASLGSIVAFLTSNIAKAIIMFIMIVCFFIDVFVI >NZ_CP017069.2|WP_037540843.1|2207191_2208409_-|MFS-transporter MFKALLHIKNYKLFVVNMMLLGMGIAITVPYFVLFATNELGMTTNQFGILLALAAVSQFTINSIVARFSDTHNINRKFLIITALFMGAVSFSIYFYIHDIWLFIITYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINISSSRKNAKFANTVLRSMFSFGFLFGPLIGSRLIHFNGYAGLFGGTVAIILFTLLLQVFFYQDLKLTGDQQVGGTAHIETTAPNMLKDVTLFLPFVAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTKQLHISEDYVGTLASLCAGLEVPFMVILGMLATKLQTRTLLIVGALSGGAFYFSIGIFNNIYMMMLGQVFLAFFLAILLGLGISYFQDILPDFPGYASTLFANAMVIGQLCGNLLGGAMSQCVGLENVFFVSASSIFIGMVLIFFTKDQKFTEEKVIS >NZ_CP017069.2|WP_002459796.1|2208494_2209349_-|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAELLYISQPAVTQRLKAIENNFGVDIFIRTKKQLITTTEGAMIIEHARDMLKRERLFYDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPDVLSLYNTQFPNVEIQVQVGSTEHIKAHHRDYHVMITRGNKVMNLTNTHLFNDEHYFIYPKDKRAEVDKLPFIEFQADPIYINQIKEWYNDNLGQDFHATITVDQVGTCKEMLLSGVGVTILPEVMMKYIDKNQFECEKVLIEGQPLIRSTFMSYEANMLQLPQVDSFVNLMYNFIR >NZ_CP017069.2|WP_155265856.1|2209601_2209769_-|hypothetical-protein MGPQHKDFRSERQRTTQVGVGPQHKGFRSERQRTTQVGVGPTQRNAVNISTSKAS >NZ_CP017069.2|WP_002493006.1|2209856_2210471_-|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLIEREYIEVKVNNKRFKGIIGLVTMNKVREPLEVTVVGKHMVVADDHYQWLQILPEKKRYSITAMFDDKGQPLEYYFDINIKNITQKGNARTLDLFLDVLVLPTGKYELVDEDDLMNALVNEQITKRQYHEAYMIAHQLMIEINDNFDELERRIMHCYRKMNQKKHKAKRHHHQAPQPQQRHKRKKRFTED >NZ_CP017069.2|WP_002459798.1|2210854_2211322_-|cupin-domain-containing-protein MISAEEWINRLELMPHPEGGYYKETLRPDDKKRASYSSIYFLLKDADVSHFHRIDADEVWYHHSGETLLIHMITTEGKYYVEQLGQNVADGDVLQCVVPKGTIFASSLKHSKGYGIVGCMCQPAFEFEHFELLAQAILLEKYPQHQEIIKAYAVE >NZ_CP017069.2|WP_002493004.1|2211321_2212038_-|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPDPNSNQALRLVLERAKTYSVPNHIIDKAIDKAKGAGEENFDHLRYEGFGPSGSMIIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDDTATFAIEGKSADDVLEALMEQDVDVRDVIDEDGLTVVYAEPDQFAQVQDALRAIGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSAEDQETFEKLVDALEELEDVQNVFHNVDLK >NZ_CP017069.2|WP_002492965.1|2212271_2212631_-|MarR-family-transcriptional-regulator MSKDKLNQLLNLYKKHKLLSEYIDKKYKLTLNDLAVLKLAKDYTSEKKVLMQSFLKLAIEELDLSRTKLLVSIRRLIDKEKLSKQRSEEDERKIFIYMNDDNIESFNDLFKDVEELLEI >NZ_CP017069.2|WP_002493010.1|2212774_2214919_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTNTFFRILTKEEYQPTRCIDGIIVILPIQGDLTIQHFANSTTISDEIYIINNKDIFTIKQNHKSLMLYITSDWFKNHDYVFFDYKYSVNLIKSINKLKQLMLKIAINYINQMPITSNENYIKQMVEVIATEGSVDLETAENQYKFLFYGELSQILEYINKHSHEKLTLNALSQNLFTSKSNISAQFHQNLNMGFKQYVDSLKIAESIEYLLTENSTISHISDKLGFSNSASYTKMFKSYIGITPNDYRSLNIKDKYLLMNYEVLSEDNEQHLKTVLRQQINYYQENIERKIFIDNNKVKTKQNFELVTQINTVEEFKELFFIKIKGKANINTENLIIYVNFGTGTLINNLSDAEIGDMFKKIAANNLHIAFKIQSLEIMDYIERIYVQVVERLNYKKSLANGDRGIIMLVFDMEVIELKEIYRLILKIQNKQFGLRFGLAISCLLNETVMFKTLESQIKRIGFDYLFIDNAHLEQPYLLEDSQHLLLKNILEYQNIEKILTQIDLSYSKVIFLNIENHQFLNNENDLSNSAPLIIETFLKTAELFDGMGVNLYFSRNSFNAIHIFDENGFKTVLGIIIGQIKWMMNQSRTIKDNYIVVENEAQYTLFLYDWRVFESEASITYFGDTEVLIHFEEVAEQSIRLIKSEKVDEKNGNINHIINRHIREKYNWTQELLKEIEDHLHTTMRIIEHDFRKDYFKVNLGYDSLRIIKIFK >NZ_CP017069.2|WP_002459802.1|2215227_2215881_-|membrane-protein MNDFSKKQRHMTDHSQSKSWAYSQVWLYFMYYWLIFGIGCYFGQYLPDEWRMPLSIGLLVLIFSTLIFKRARKYGLIISHIYAIIVGLLSYAMFTTYLQNLGADVFYKNIVLAIGAFVIFGVIGFFFIKDASSIGRYLFVTLLALIVASLIGLFIHNPVFYTVITVVSLFLFLLYTLYDFNRMKRGQFSPREMGFNLFINLLNIILDILSLANRFRN |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP017069_4 | 4.1|1689992|27|NZ_CP017069|CRISPRCasFinder | 1689992-1690018 | 27 | NZ_CP017069.2 | 2247423-2247449 | 2 | 0.926 |
1. spacer 4.1|1689992|27|NZ_CP017069|CRISPRCasFinder matches to position: 2247423-2247449, mismatch: 2, identity: 0.926
gggccccaacaaagagaatttcgaaat CRISPR spacer gggccccaacaaagagaaatgcgaaat Protospacer ****************** * ******
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
278645 : 316356
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017069|278645:316356|DBSCAN-SWA 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34 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(33.33%) | protease,integrase,transposase | attL 291603:291620|attR 318502:318519 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
1019318 : 1032491
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017069|1019318:1032491|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017069|1019318:1032491|1029243_1029501_+|WP_002445375.1|DBSCAN-SWA MKFKGVYYMKANQYEELSEVLDLTESQKLKLYVYQERQNKNIKQDSKESKQNNEEANREKRQKILDIKDDVTRQNAIAKNRELFK >NZ_CP017069|1019318:1032491|1028909_1029254_+|WP_094449183.1|DBSCAN-SWA MQKLVEKEKTYNLPDEHRQVLNVIRNTSKKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRKVINSLVYDYAYPIGCSYKRNERGYYIITTEQEKQQAMVSIKKLADGSMKRYEALKRIEV >NZ_CP017069|1019318:1032491|1029512_1030034_+|WP_002445376.1|DBSCAN-SWA MKTLDQIEKYKTNIEDYRKEIKNLDAEVKNDGKQLDDINQEYQDLVINGEVEKADKLYTKIEKLESDYRAKSKRLMVMKQSFKKVVIKNCENMQDVADELSDEYNETYQDDLKRYETLNQQLKDAKDKLLGYNDEYSAKQRTLTQYIDRLKRENNIQPVEFIGNVNIIQPFNI >NZ_CP017069|1019318:1032491|1030948_1031458_+|WP_002492698.1|DBSCAN-SWA MAEQKYLTTVENIIGLMKEEIKNISPLRLQKTLYFLFAYYGASYGQLSKSKEYEVTKSESLNLPEYLFDAQFEAWQYGPVIRDVYKNNKYSLGYNDIDFSMSNFEIEDKTMQQEITEYLREIIKSTLKISDFGLVERSHEDEEWKNKITQQEIMNNDLIIKEYIGLVNA >NZ_CP017069|1019318:1032491|1024661_1025531_+|WP_002445370.1|DBSCAN-SWA MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFKSFSKPKWSKLINKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKDGANDHGEIIKKHRNDKNVIYRNVIVLDYDEINDLKQLHEAISSALSNVAWFWHTSFSHTTEQSRIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALTVIQKGHIFIKRVNDCPIMDVDMLEQWSKEYKQSNASPNVIGYTRRDSAYWRELSFGTTEGNRNNALASLVGHLLRCHVNDYIVYSYALLWGQFACKPPMKEQEINATFQSILNKHYNN >NZ_CP017069|1019318:1032491|1019662_1021285_+|WP_002461409.1|DBSCAN-SWA MAKDLKFSEDARQAMLRGVDKLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEYAAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAIEALHDISQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGQYISEAMDKVGNDGVITIEESSGFNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMTAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSSRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLELKDATMDMLGSANKVEVTKDNTTIVDGDGDNNNIDARVSQIKAQIEETDSDFDKEKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYKKVSDIQAEGDVETGINIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSIIVERLKHADSGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVANIPEPESNNQPPMGGGMPGMM >NZ_CP017069|1019318:1032491|1023386_1023605_+|WP_000153640.1|DBSCAN-SWA 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MNIEIIANQFETRAAALLRYYTGLLESSKKTPFGFKIYNDPFDMVYVVMEGNLYGHIYIKDCNVRKAFELASPKHTEGLIRSIEGHYAGYEIPDGTHDTISDMMASFMFDNDYFMYGLETFAESNNTDMFTYIEGGLNVEELEGVQSSNADVIGNIEILYQLATGINEPASELVEGLKLVTAFVQDENATLDDYKALERKLSELKSSYYSLSK >NZ_CP017069|1019318:1032491|1027601_1027967_+|WP_002445372.1|DBSCAN-SWA MEKEQLKQYMYDYVKEYEEIPIYQLEDLFKELDHDYKGKTSVTHDQDKNIVFWSGWNKLTMYALIELVKGEHLDLVYRGSYVMRYLLDGRVPSLPLAITYPEYGQQTEVPSWVPMLLRVTK >NZ_CP017069|1019318:1032491|1024062_1024272_+|WP_001058489.1|DBSCAN-SWA MNNEQKEVIEHVVYQLELSVMNNLESYEHTEYVDGIEVVSEVSREKHLELIMKWCAQELKNNFQLEKGE >NZ_CP017069|1019318:1032491|1019318_1019603_+|WP_002461410.1|DBSCAN-SWA MLKPIGNRVVIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVVIAVGLGRQLENGQRITPDVNEGDRVVFQEYAGTEIKQGNDTYLILNADDILAIIE >NZ_CP017069|1019318:1032491|1021353_1022526_-|WP_002492309.1|integrase|DBSCAN-SWA MASYEKRGNTWRYRISLGKDAKTGKYKYISNSGFKRKSDAKHHAEMVERQLRTGDYIAPSTSTFKQVANDWLKQYANEVKVSSVRAREKAIHHAIERFNNKPIQTINKHDYQRFVNDISAQYSKNYIDSIIASTNMIFKYAYDMKLIRIMPSEGIKRPKKKVSVEELEDTEIHKKFLEKDELFQFLEIAKNHHSPQNSFEVFCTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTINITKTYYNPNNNKKQYQILTPKTESSIGKIPVDPHVIKLLKNYKVDVQDTWKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSKLMENVSKDLF >NZ_CP017069|1019318:1032491|1030096_1030669_+|WP_002445377.1|terminase|DBSCAN-SWA MPKLTPKQERFVNEYIRTLNVTQSAITAGYSPKTAHVTGSRLLKKKHINEYIQEQKKKVIDESILSANELLHLLTNSAVGDETETKEVIVKRGEYKENPQNGKIQLVYNEYVELIEIPIKPSDRLRARDMLGKYHKLFTEKKEFTADTPVIINIGEWDEEDEEDKQRTLDKINDNYPNRTMIVDDIPLED >NZ_CP017069|1019318:1032491|1031450_1032059_+|WP_002445379.1|DBSCAN-SWA MPRFNSNVTSKKRKKNVHVEIVNKDFLPTRNEFETDKVEIELRNAEVKEVVFFNEEVKYSKQNNDLKFTNFISDFTQQNQINAITHFSENISIVKNNPDEATNINYDERMLSILSLYTQQDIRNIKGLMKTDIRGLLDVQEGLRVYWYYDLIDNEIKIVCIDPQHLVLPSQHGKMNKDKMMITTYQSVTNSKKHCISRYFIN |
20 | Staphylococcus_phage(62.5%) | terminase,integrase | attL 1021268:1021287|attR 1035097:1035116 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1153358 : 1183613
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017069|1153358:1183613|DBSCAN-SWA 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32 | Staphylococcus_phage(96.15%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1300849 : 1309880
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017069|1300849:1309880|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017069|1300849:1309880|1304058_1304319_+|WP_002458927.1|DBSCAN-SWA MNLTAILIPVLFLLVFYFLIIRPQQKRAKEHREMVNRVEAGQKITTIGGLKGTVKAVDETTVVITVNGHGTEMTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP017069|1300849:1309880|1300849_1301854_+|WP_002478078.1|DBSCAN-SWA MDDRMVDQSFHQEDSAFEYSLRPTYLKQYIGQTTIKSNLEVFIQAAKLREEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLIGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNEHELKEIIIRTADVLGTSIDDESAVELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNGDDQIYIETTKKALKLLQVDEQGLDYIDHKMMNCIINQYQGGPVGLDTIAVSIGEERVTIEDVYEPFLIQKGFIERTPRGRKATAFAYEHFMKSKEKRE >NZ_CP017069|1300849:1309880|1302900_1304040_+|WP_002458926.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELTDIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKQAGGLHKFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKISEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMEIQNDLGSDIMMAFDECPPMPSEYKYVKDSIERTSRWAERCLKAHKRPDDQALFGIIQGGEYKDLREQSAKELVALDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYDMVKHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSIGRLVIKNAQFANDFRPLDENCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEAFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP017069|1300849:1309880|1304504_1306793_+|WP_037540792.1|DBSCAN-SWA MKKGSRIVAFILLIVLLFAGMGLTYKNVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVKPLQKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPRIQVEDPDRIRVQLAGVKNQNQARDVLSSQANLTIRDANDNVKLTGKDIVQGSAKQEFKQQTNEPTVTFKLKDRDKFKKVTEEISKKKENMMVVWLDYEKGDSYHKELQKKNENDRKYVSVASVNQPINSDSVEISGGFHGQEGVKKAKQISELLNAGSLPVKLDELTSTSVGAQFGQDALDKTIFASFIGIAVIYLFMVGFYRLPGFVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYTKANRSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRGLLSLLVSSNYFKKKFWLFGVKKKQRHDINEGKDVHDLKTSFERWNFVKLAKPLIGLSILILIVGIVILSIFKLNLGIDFSSGSRVDVESNHSLSQAKVEKTMKDVGLKADEIQINGDGKKQATIMFKHDLAKKDIAKLNDKFKNEFGHSPSVNTVSPVIGQELAKNALKALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDAFMIVAVFSLFRIEVDITFIAAVLTIIGYSINDTIVTFDRVRENLHKLKVITSPEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILLFGAPSIFNFSLALLVGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSDKGKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP017069|1300849:1309880|1309361_1309880_+|WP_002458930.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKAGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVTYAKEREVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEALGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP017069|1300849:1309880|1301856_1302882_+|WP_002492120.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEDFDYHLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLNKETGDMKHQHFKDVINYLNPGDTLVLNDTRVMPARLFGVKEETGAKVEMLMLTQIENNDWEVLLKPAKRIKVGNQLSFGEGKIIAECIKELDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKARLDDPDRYQTVYAKENGSAAAPTAGLHFTDNLLKDIKAKGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVENINEHEMHSEYYQMTENTAQLLNNTKLQGHRIIAVGTTSTRTLETIRRDHSQFIATSGWTDIFIYPGFEFKAIDALITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRQFILTAYRKAVELEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP017069|1300849:1309880|1307065_1309342_+|WP_037540789.1|DBSCAN-SWA MIKSKYTWNHNEPTQYIDEQIAKKYKLSPIIKKVLESKHIVNEKDIEGLLNGQQQLHEPWLLSDMTKAIERINLAIDKHERILIYGDYDADGVTSTTIMVKTLQSLGAEVGWYIPNRFSEGYGPNELAFKNAYDEGVSLIITVDNGIQGHREIEMIQELGVDVIVTDHHEMGSTLPDAFAIVHPMHPEFDYPCPNLCGAGVAYKVSQALLKNNVPPYYIALASIGTIADLVSLTDENRTIVKTGLSILNDYQPIQIAALLNEANYNDPIDEETIGFIIGPRLNAVGRLEDASLAAELLMTEDAEEAAFLAEQVNHFNNERKDIVSKITEEALLLAKEEVAKGRQFLLLAKENWHEGVLGIVASRIVETYGLPTLILNIDDEQHYAKGSARSIEQVSMFEILSDHQNLISKFGGHHMAAGMTMPIENISELREGLNTWMANLAETTSFDQKKQIDVKITEDEITVNNIYDIERLKPFGIDFNKPLFELDDVNVNSLKVIGKDKNHLKMTIGNSNLATLYWNSGSLVDELELNQPINMIGQLQINEWNGNQSPQFIIQDIAINQQQILDYRSKRKQLSIDFHDEQLAILIHPQKEKLDHNYYHYGESIDEHVSRVVLRDLPLSLAHLSESMNGHQFSQIYVVLQHQHSIYFEGMPDKKTFKACFKILMSKQKVNLISDGMALSKFLGIQPNTLKFMLKVFLELGFIIDSNGIISVNQNPNKQDIEASQVYQTRKARIEVEKLMLYDDFQHLKHWIIEQMG |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1436513 : 1445208
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017069|1436513:1445208|DBSCAN-SWA AATGTATGAAGTAAAATTAGACGCTTTTAGCGGTCCACTCGATTTATTGCTCCATTTAATTCAGAAATATGAAATAGATGTTTATGACATTCCAATGAAAACATTAACTGAGCAATATATGCAATATGTACATACGATGAAGCGTCTAGAAATTAATATTGCTAGTGAATATCTCGTTATGGCGTCTGAACTCTTAATGATTAAAAGTAAATTACTTCTACCTCAATCAGATGATCATGTAGAATTTGAAGAAGATCCACGTGAAGATTTAGTAGGTAGACTAATTGAATATCAAAACTATAAAGAATATACAGAAATACTTGATAGTATGAAAGCAGAACGAGATCTCTACTTTACAAAACATCCGACAGATTTATCTCATTTAGAAACTAATGAAAGTTGGGATAAATCAAACACCATTGATTTGACAGAACTGATTGTTGCTTATCAAAGAGTGAAAAATCGCGTTGAGTATCACACACCAAAAACTGTAGAAATCAGTAAAGAAACATTCACTATTGAAGAAGCAACAGAAATTGTAACGACAAGATTACGTACACAAACAGCGTTTAATTTTTTCAGCTTATTTACTTTTCATGAACCAATTGAACAAGTCGTTACGCATTTTCTTGCTATTTTAGAAATGTCTAAGGCTGGCATAATAAACATAAGTCAAAAGCAAAATTTTGATGATATTGATATTGTAAGGGGAGTGAATTATCAAGTTGGATAAACAAGCAATCTTAGAGGCATTATTATATACAGCTGGCGATGAAGGTATTGACACAAAACAATTACTAGAGATACTGGACATTACTAAACCACAATTGATTGAATTAATCGATAATTATTCATCTCATGGACTAGAAATTCATCACTACGGTCAAACTTATGTATTAACTACAAAAAAAGATGCTGCTAATTATATTGAAAAACTCGTTCAACAAAAGTCAAATATGAAATTATCACAAGCTGCAATGGAAACGTTATCAATCGTTGCTTATAATCAACCTATTACACGTAGTGATATTGAATTAATACGAGGTATTAATTCAGATGGTGCTGTTAGAACATTAGTTGCTCGTGGTATGATTGAAGCTAAAGATGTTGAACATTCAAGAAGCCATCACTTGTATACAACTGAATTATTTTTAAATGTATTTGGATTAGAAACAATAGAAGATTTACCGACTACCGAAGAAGATGATGAAGAAATGGAAGATTTCTTTAGTCAATTAGTTAATCAAAAGGGAGAATGATTATGAGCAAAGAACTAGAGCGATTGCAAAAAAGAATTGCTAATAGTGGTTATACGTCTAGAAGAAAAGCTGAAACATTGATTACTGAAGGTAAAGTCAAAGTGAATGGAGAAGTTGTCACTGAACTTGGCACAAAAGTAAAACCATCAGATCAAGTTGAAGTAGAAGGAATCAAAATGGAACAAGAAGATAAAATATATATTCTGTTTCATAAACCAGCGCAAGTCATTACTAGTGTATCAGATGACCGTGGAAGAACAGTTGTGACTGACTATTTTAAAGACTTAGATACTAGAATATATCCTGTTGGTCGTTTAGATTACGATACATCCGGAGTATTACTACTAACAAATGATGGTGAGTTCACTAATCTTATGACCCATCCACGGTACCATATACCAAAAACATATGTTGCCAAACTCAAAGGTTACCTTATGCGCGAAGAAGTAAAAGCACTTGAAGCAGGAATAGAACTTGAAGATGGTTTAACTCAACCCGCTACTGTTAAAATTAAACGCCAAGATAAAGACAAAAATACAACGTTAGTTGAGATTACCATTAGTGAAGGAAGAAATCGACAAGTACGTCGTATGTTTGAGCATTTTGGCCATAGCGTTAATAAATTAACACGTATACAATTCGGTTCACTAAATTTAAAAGGTCTTAACGCTGGAGAAGGACGCGTATTAACACCTCATGAAGTAAAAGTATTACGTCATCAAGCAGAAAACGGTAATTAGTAAGCGGTTACATGTAGTTTGCTGAAGTTAATTTTATGGTTATAAAATCATTGCTAATTTTTTCACAATCAAATTTGAAATTAGAGATTTAACAATTACCATATGCTATAATAAACAAGAAAATAGCATGTGTAGGAGGTATATGAATTAATGAGTAAGGAAATACTTATCGTAGATGATGAAGACAGAATTAGAAGATTACTCAAATTATACTTAGAGAGAGAATCTTTTAACATTCATGAGGCTAGTGACGGCAAAGAAGCCTATGAATTAGCCATGGACCACAATTATGCATGCATACTTTTAGACTTAATGCTTCCTGAAATGGATGGAATCGAGGTCGCATCAAAACTACGGGAGCATAAAGATACACCTATCATTATGCTTACTGCTAAAGGCGAAGAAACTAACCGAGTTGAAGGATTCGAATCAGGTGCTGATGATTATATTGTTAAACCATTCTCTCCACGTGAAGTGGTCTTAAGAGTGAAAGCGCTATTAAGACGTACACAATCAACAAGCGCCGAACAAAGCGAGCCTCATGCGAGAGATATCATAGAATTTAATCATTTACTTATTGATAATGATGCGCATCGTGTATTAGCTGATAATCAACAAGTTAACTTAACACCCAAAGAATATGAACTACTAATATATTTAGCTAAAACACCAAACAAAGTATTTGATAGAGAACAATTACTTAAAGAAGTTTGGCATTATGAATTTTATGGTGACTTAAGAACTGTTGATACCCATGTTAAACGCTTAAGAGAAAAACTTAATCGTGTTTCAGAAGATGCAGCACAAATGATTCAAACAGTATGGGGTGTTGGCTACAAATTTGAAGTTAGAGCTAGCGATGAGCCGACTAAATAGTGTTGTAATAAAACTGTGGTTAACTATTATCTTTATAGTAACGACAGTTTTAATTTTATTAAGTGCTGCATTAATAACTTTTATTCAATACTATTATACTGAGCAAACAGAAAAATCAATTCGTGATGATGCCAGAAGAATCAGTCAAGTTGTTGAAACATCTAAAAATAAAAAGTTAGCTATTGAACATAGCCAAAAACTGATTAGTGGTTCTGGTGGCGTTATTATTATGAAAGACAAGTCAACACATCATAATGCTAAAGAGTCACAATTAAATAATCAAATGTTGGCTAAGATTAATCAAAACGAACACTTTTCTCCAGTGTTTAATAAAGGTCAATCTGCAACTCAAAATGTAACATTAAAACATAATGACCATTCTCGTTCTTATATCTTACTGGGTTATCCTATGAAAGCTCAAAAGGGAAGTCACAGTCATTATAGTGGCGTCTTTATTTATCAGGATTTAAAATCCATAGAAGATACCAATAACGCTATTACGATTATTATTCTGATAACTGCAATTATTTTCCTAGGTATTTCAACTGTCTTCGCCTTTTTCCTATCTAATAGAATTACTAAACCACTTAGAAAGCTTAGAAATCAGGCTAAAAGTGTTTCTAAAGGGGATTATTCTCAAATTTCATCTGTAACAACTAAAGATGAAATTGGTGAACTATCTCGCGCATTAAACGACATGAGTTTCGAAATTCAGGAAAATGTTCAAGCACTATCAACCTCAAAAAATATTCATGATAGTTTAATTAATTCAATGGCTGAAGGTGTTGTAGGTATCAATGATCATCGCGACATTATATTATCAAATAAAATGGCAGATGAAATTTTACCAACTATTGATCAATCTATGTATGAACGAATTGAAGACCAAATCGAAGATACTTTTACAAGTAAAGGCACAGAATTTCGAGAATACGATTTTGACACACGCTATTATGTCTTCATTATGAGTTACATTCCTCAGATTCAAGAAGATGGTCGCAGTGGAATTGTCGTTATTATTCGTGATATGACTAATGAGCATAACTTAGATCAAATGAAAAAAGATTTCATTGCTAATGTTTCTCATGAATTGCGTACACCTATTTCATTATTACAAGGATATACAGAATCAATTGTTGACGGTATCGTTACGGAACCAGAAGAAATTAAAGAGTCATTATCAATTGTCTTAGATGAAACGAATAGGCTCAATCGTTTAGTTAATGAATTACTCAATGTTGCAAGAATGGATGCTGAAGGGTTATCTGTTAATAAAGAGATACAACCTATTGCACCATTATTAAACAAAATACAAACAAAGTATAGACAACAAGCTAGTGATTTATCATTAAATATGTACTTAACTCCAGAAACTAATGACGCATTGTGGTACTACGATTCTGATCGAATCGATCAAGTGCTCACAAATCTTATTGATAATGCTACAAGATATACTCAACCTGGTGATACAATTTCTATTACTAGCGAAGATACTGATAAGTACAATGTGCTTCACATAAATGATACAGGCAGTGGTATTGCTCCTGAACATTTAAATCTTGTTTTTGATCGCTTTTACAAGGTTGAAGCATCCAGAACACGTGGCAAACAAGGAACCGGCTTAGGATTATTCATTTGTAAAATGATTATAGAAGAACATGGAGGTACGATCACTGTATCAAGTGTCGTTGGAGAGGGAACAACATTTACAATCAAGTTACCGAAGCCTTAATCTTCAGGCTTATTTATAAAATTTATCAAAGATAATATCACTGAATTCAGACAGGGACATAAACCCGCAAATAATAGCACAAAGATGATTTAAAATTAAAAATCGTCTTTGTGCTTTTTTATATTCAATACTTTGTATGATTGACTCGCATGCTTAGGAGACTACTTCAGCTTGCTTTGTTAAAAAATGGTTTAGTCAGTTTTTTCTGTGCTGGACTTTGACTTAATATAAAAATAAGGACGAAGGCTATTTAAGCAGAGACGTTTATGAGCCGGCCTGACCTTATATATAGTTAATATCAGTTAAAACATATTGAGATTAACTATGCACGATATATTGGCAGTAGTTGACTGAATTGAAAATATCCTTATACCAAGCTTTTTCCATCCTAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017069|1436513:1445208|1438661_1439387_+|WP_002459064.1|DBSCAN-SWA MSKEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFNIHEASDGKEAYELAMDHNYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSTSAEQSEPHARDIIEFNHLLIDNDAHRVLADNQQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAQMIQTVWGVGYKFEVRASDEPTK >NZ_CP017069|1436513:1445208|1442523_1442772_-|WP_002449743.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEEEPFDGDALKFE >NZ_CP017069|1436513:1445208|1439370_1441119_+|WP_094449175.1|DBSCAN-SWA MSRLNSVVIKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQYYYTEQTEKSIRDDARRISQVVETSKNKKLAIEHSQKLISGSGGVIIMKDKSTHHNAKESQLNNQMLAKINQNEHFSPVFNKGQSATQNVTLKHNDHSRSYILLGYPMKAQKGSHSHYSGVFIYQDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFLGISTVFAFFLSNRITKPLRKLRNQAKSVSKGDYSQISSVTTKDEIGELSRALNDMSFEIQENVQALSTSKNIHDSLINSMAEGVVGINDHRDIILSNKMADEILPTIDQSMYERIEDQIEDTFTSKGTEFREYDFDTRYYVFIMSYIPQIQEDGRSGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPEEIKESLSIVLDETNRLNRLVNELLNVARMDAEGLSVNKEIQPIAPLLNKIQTKYRQQASDLSLNMYLTPETNDALWYYDSDRIDQVLTNLIDNATRYTQPGDTISITSEDTDKYNVLHINDTGSGIAPEHLNLVFDRFYKVEASRTRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGTITVSSVVGEGTTFTIKLPKP >NZ_CP017069|1436513:1445208|1436513_1437245_+|WP_002459061.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFSGPLDLLLHLIQKYEIDVYDIPMKTLTEQYMQYVHTMKRLEINIASEYLVMASELLMIKSKLLLPQSDDHVEFEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEILDSMKAERDLYFTKHPTDLSHLETNESWDKSNTIDLTELIVAYQRVKNRVEYHTPKTVEISKETFTIEEATEIVTTRLRTQTAFNFFSLFTFHEPIEQVVTHFLAILEMSKAGIINISQKQNFDDIDIVRGVNYQVG >NZ_CP017069|1436513:1445208|1437237_1437771_+|WP_002492337.1|DBSCAN-SWA MDKQAILEALLYTAGDEGIDTKQLLEILDITKPQLIELIDNYSSHGLEIHHYGQTYVLTTKKDAANYIEKLVQQKSNMKLSQAAMETLSIVAYNQPITRSDIELIRGINSDGAVRTLVARGMIEAKDVEHSRSHHLYTTELFLNVFGLETIEDLPTTEEDDEEMEDFFSQLVNQKGE >NZ_CP017069|1436513:1445208|1437773_1438511_+|WP_002478163.1|DBSCAN-SWA MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGEVVTELGTKVKPSDQVEVEGIKMEQEDKIYILFHKPAQVITSVSDDRGRTVVTDYFKDLDTRIYPVGRLDYDTSGVLLLTNDGEFTNLMTHPRYHIPKTYVAKLKGYLMREEVKALEAGIELEDGLTQPATVKIKRQDKDKNTTLVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHSVNKLTRIQFGSLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKVLRHQAENGN >NZ_CP017069|1436513:1445208|1443828_1445208_+|WP_002459069.1|DBSCAN-SWA MLEDKLKSWFGFDNFKAGQKEIIKSVLDSNHTLGILPTGSGKSLCYQMATYELQQSTLIISPLISLMDDQVAQLKMSGEQSVAYIHSGMDDNEKNWNMKRLAKSRFIFLSPEFILQPQNFKLISTIDFGLIVLDEAHCISEWGYDFRPHYALISKITNYYKNATILALTATAPPHLEQDLNQLLNVSFHVIKTHMNRPNISFQHINFRNDQEKMNWLMHYIEQSGPTIIYVSSKKMCVELAKTIYKHGYLTGIYHGDLSYQERQTVQQQFINNDIPVIVATSAFGMGVNKKDIRTVIHFHLSTSPSSYLQEIGRAGRDQQPSQAISLFQPDDRYLLETILFADMILPYDIDCYELGANIEPLKQDILEILHSHFTYAQLKQIFQIAQERKQLALNRMLSYSQLDQCRRKYLLEFFGEVPDIPSICCDHDTDIKPLKIYNRKKVKRQMSYEDKLKNLFLS >NZ_CP017069|1436513:1445208|1442882_1443842_+|WP_002492332.1|DBSCAN-SWA MKDIILYSKQHSFTYKTNKSIFNLLTGKKTHQTFFDACSQQLLSLYHSLPNLKYPSFERFMAQNVNNDMTIKVHPRYTYDSLVHTFNCIQLLIQTLSNTQQKVYSFIPISQHGLIQRKVKQIYYYIKKEDKDSAFITELNQLFKALYTNNNNYCCLHYYLQGYEEPMYTRQQISLIESIPEQHLFNLEMNELVTLMYELEIEYRYPILSQCIIKPSLLHKTHITQQQLKQRFSMTQIAQKQHVKLNTIEDHILELFIKGYITHYFDFISEDGFHQFNEFYNKHRGERLKAYKQAFPNLSYFEIKLMIVGIERGELIARG >NZ_CP017069|1436513:1445208|1441839_1442382_+|WP_002478165.1|DBSCAN-SWA MQQNKRLITISMLSAIGFVLTFLKFPLPFFPPYLTLDFSDVPTLLATFSMGPIAGIIVAFIKNLLNFFFNMGDPVGPVANFLAGISFLLTAYYVNKRGHVANKAMITALVMATLVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIFNLADIVKNIKIIIVSGIIPFNIIKGAIISIIFILLYRRIKSVLK |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1849512 : 1857982
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017069|1849512:1857982|DBSCAN-SWA CTTATTTAATAACCTTAGCTATAACACTAGGATAAAGTTCATATTCTAATTGTTTGACTCGTTCTTCCAAATTTTCTTTGGTATCATCCGGTTTGATCTCGCATTGTCTTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATGCCACTATCAACATAATGAACTGTTGATCCTGTAACATTATCACCACTATTAAAAGCCTGACCAATAGCATCTTTCCCCTTATATTTTGGCAATAATGATGGATGAATATTTAAAATCTTACCTTCGTATGCGTCTAACAAATCAGGACCAATTAGCCTCATATAACCTGCGAGAATAATCCATTCAACTTCTTCACGCTCTAGTATACGAATCAAATGGTGTTCATAGGCAGATTTTGAGTCAAAATCTTTTGGTTCGTTGATATTAACTGCTACCTTTAACTGTTTTGCGCGTTCAATACAATACGCATCGTGATGATCAGTATAAAGTGAAGTAATTTCTATATTGTTGAGTTCTCCTTTATCCACTTTTAAAACAATATTTTCGAAATTACTTCCCGATCCAGAGGCAAAAATAGCTACCTTAGTCACTATTCTACCCCCTTGAGATAAATAGGCACATGTGCATCTTCTATAACATTGCCTATGTGATAAGCAGGGACATCGTGTTTTTTTAGGACATCTAGTGCTTTAGCAATGTCATCTTGACTAACGATGACCGTATACCCTATTCCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATCCGTAGAAATTTGTCCTTGTTGTTGTAACCAGTCAAAAATAGGAGGTGTTGGGAATGTATTCACATCAATTTGCGCAGCTAAACCATCAGGTAACACTCTAGGAATATTTTCATAAAATCCACCACCAGTGATATGATTCATCCCCATGATTGTTACTTTATCTTTTAAATCAAGTATCGGTTTCACATAGAGTCGCGTAGGTGTTAAGAATGTATCTAAATATGTTTGACCATTGAAGTCATCGTATAAATCAATGTCAGTCTGTTTAATTAATTTACGTACTAAGCTATAACCATTTGAATGTATCCCACTAGAAGCTAAACCAATAATTGCATGACCTGCTTTTATATTTGAGCCATCAATGTATTCTGCTTTTTCAACAGCACCGACAGCAAAGCCAGCTAAGTCATACTCACCTTCATGATACATTTCTCCCATCTCCGCGGTTTCACCACCAATCAGTGCGGTATTTGTTTGTTGACATCCTTCGCTGACTCCTTTTACAATCTGCTCAATAACTTCTGGAACAACTTTATTTGCTGCAATATAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCTCCAGTCGTAAGAATGTCATTCACACACATGGCTACGGCATCAATTCCAATGGTGTCATGTCTGTCATGATCGATAGCTAACTTTAACTTTGTTCCTACACCGTCTGTACCTGACACAAGCATAGGCGCTGTCATCTGCAATTGTGATAAGTCAAATGTCGCACCAAAACCACCTAAGCCACCTAAGACTTCTTTTCGTAGTGTTCGCTTTACATGTGCTGACATTCTTTCTACTGCTTCATATCCTGCTTCTATATCTACTCCAGATTGTTCATAAGCTTTAGACATTTTTATTTCCCTCTCGATCATAATAGTGTTGGTGATTCTCGATATATGCTTTTTGTCGTGGGCTCAAGTGCTTAAAATAATTTTCTTCATAATCATACAAACCAGCTGGATAATCACCTGTAAAACTTTCTAAACATAGACCACTATATGGCGCATCATAGTCTAAGCCAATAGCTTCTATTAAACCATCAACGCTTAAATAGGCTAATGAGTCGGCACCTATATGGTCACAAATTTCTTCAGGTGATTTACTCGCTGAAATCAACTCAGCAGTAGTTGAAACATCAATACCATAAAAGCTTGGAAACATAAATTCTGGTGATGCGATCCTTACATGTACTTCTTTAGCACCGGAATCTTTGAGCATTTTGACTATACGTTTAATAGTTGTGCCACGTACAATTGAGTCATCGACTAAAATAATTTTTTTACCTTCTACAATGTCTTTGACAGCTGATAGTTTGACACGTACACCTTGTTCTCTCAATTCTTGAGTTGGTTGGATGAACGTTCTAGCGACATATTGATTTTTAACTAATCCCATTTCATAAGGCAGCTGGCTTTCTTCAGCATAGCCACTAGCTGCTGATAATGATGAATTAGGTACACCAATAACCATATCTGCTTCTACAGGATTTTCTTGAGCTAATTTCTTTCCAGAAGCTTTACGAACTGCATGCACATTCTTACCAGCTATTGTAGAGTCTGGACGCGCAAAATAAATATATTCCATTGCTGAAATCGCAGTACTTGTGTGTTTTGTATATGATTTTATTTTTATACCTTCGTCATTGACAACGACATATTCTCCTGCGTGAACATCTTGGATAAATTCTCCACCTAAAACATCAATAGCGCATGTTTCACTTGCTAATATATAAGTTCCATCTTGCATTTTTCCGACCGCTAATGGTCTAATGGCATTAGGATCAACTGCACCATATAAAGCATCCTTCGTCAAAATCGTAAAGGTAAAACCACCTTTAATTTGGCGTAGACTTTCTTTTAGTGCTTCTTCAAATGTTGGTGCTTTACTTCTACGAATTAAATGCATAATCACTTCAGTATCTGACGACGAATGAAATATTGCCCCATGCTTTTCTAAGTATTGTCGTAATGATTGTGCGTTGATCAAATTTCCGTTATGACATACTGCAACGCTCATATCATAAAAATGATAGAGAAATGGTTGAATATTCTCGATACCTTTATTGCCTGATGTTGCATAACGTACATGACCTATAGCGTTACGACCTGTTTTTAATTGTTCCATTTGCACTTCTTTGATTGCTTCAGTTAACAGCCCTACACCACGTTCACCTTTTAATGTGTTACCATCTGTGACAACAATTCCAGCGCCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAATCCCATATATGTCAATTGAGCTGCCTCTGCATGGTTCCAAATTCCAAATACGCCACACTCTTCGTTTAATCCACTGTAGTTAAACATTGCGCAATAGCTCCTTCCCATTGTGCTTTTATATCAGAAGCTCTCTTAGAAATTGATGTATGAGCAGCTGCAACATTAAATTCATCCGTATCTGTAAGTTGACCTATTTCAATTGCATGCTCAATATTTAATTCTTGTCCTGCTTTAACAGCAATCACATAACGTCCTTGCGTTTCACTGAATAACTGTGCATCTGAAAGATTTACTTTAGCTTTTAATCCAAGACTATAATGCGCACTGATTCTAGCGAGAGTAATTAACAATCCACCTTTGCCAACAGTCTGTACGTGTGAAGCCACACCATTTCTAATTGCCTTTTTAACGGCTTCACCCTTTGTCACTTCATCGCTTAAATCAATCGCTTCAAATTCATGATTCACTTTGCCGTATAACAATTTTTCAATTTGACTGCCACCGAAATCATCCCTAGTATCTCCAACTAAGTACAATTTATGTCCTGCTTGAGGATGGAAATCATTTAAATATTCGATATTTTCAATTAGCCCTACCATACCAACAACTGGTGTTGGAAAAATAGATGTACCACGTGTTTCGTTATAAAGCGAAACATTACCAGATACTACTGGTGTTTTTAAAATTTCACATGCTTCTGACATCCCTTTTGTTGAATCTATTAATTGTTGATAGATTTCTTTTTTCTCAGGAGAACCATAATTTAAGCAATCTGTCATGGCAAGTGGTGTGGCACCAACAGCAATTAAATTGCGATAGGCTTCTGCCACTACCATTTTTCCACCTTCATATGGTTGATTAAAGACATAACGTGCTTCGCCATCAATGGTAGAAGCAATCGCTTTTTGGGTACCTTCAACACGAACAACTGAAGACTGTAAACCTGGTTTAATGATTGTATTGGCACCCACTTGTTGATCATATTGTTCATATAAATAATGTTTTGATGCAATTGTTGGATGTGTGAGTAACTGGTCAAATACCTCTTGAACATTGATAGAATTATAATCATTTTTAGAAGTATTATATGCCTTTTCTTCGCCTTCAAGCACATAAACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGATTGCACAGGAATATCTGCAAATACTTCATCCTCATATTTAAGTACAAAACGGTCTGTATTTGTTACTTCACCAATAACAGCACTATCTAATTCATGTTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCCGTACCCTTTTCAACAACAAGTAACATTCTTTCTTGTGTTTCAGAAAGCATCATTTCATAAGGAGATATGCCAGGTTCTCTAGTCGGCACTTGGTCTAAATTTAATATTAAGCCACTGCCACCTTTAGCTGCCATTTCAGACGATGACGATGTTAATCCGGCTGCTCCCATATCTTGAATACCTACGAGCTCTTTGTATGTAATTGCTTCTAGGGTAGCTTCCATTAATTTCTTACCTACAAAAGGGTCACCAATTTGAACTGAAGGACGTTTACTTTCACTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGACGCAAACGTTGCACCATGAATACCATCACGACCTGTTTTCAAACCAACATATATAACTGAATTTCCTTCGCCTTTAGCCGTCCCTTTTTGAATCATATCATGGTCAATAATACCTACACACATCGCATTAACTAATGGATTGCCATCATAACGATCATCAAATTCAATTTCACCTGCAGTAGTAGGAATACCGATACAGTTACCATAGCCACCTATACCGCGAACGACCCCTTTTAGTAGTCGTTGATTTTGTTTCACTGATAATTCACCAAAACGCAAACTGTTTAATAAATTAATAGGTCGTGCACCTATTGACACAATGTCACGAATAATCCCACCTACGCCAGTTGCTGCACCTTGATATGGTTCAATTGCTGAAGGGTGATTATGTGATTCAACTTTAAAAACGACCGCTTGGTTATCACCAATATCAACTACACCAGCACCTTCACCTGGTCCCATCAATATACGCTCACCTGTAGTGGGAAATTGTTTTAAAAATGGTTTAGAATGTTTATATGAACAATGTTCACTCCACATAACAGAAAATATACCTACTTCAGTAAAGTTTGGTTCTCTACCTAGAACATCACAAACTTTAGTGTACTCAGCATCACTTAAACCCATATCTTGATATAATTTTTCAACTTTAATTTCTTCAATACTAGGTTCAATAAACTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTATTAACCATTGCTTCGAATAATTTTACGCCACTATCAGTACCAAGAATTGTTTCAAGTGCACGTTCTGGATGAGGCATCATACCACACACATTCCCTTCTTTATTCACGATGCCAGCAATATCTTTATATGAGCCATTAGGATTGTCTTGATACGTTAATATGATTTGGTTATTGGTTACTAATTCTTCATATATGTCATCAGTGCAATAATAGTGCCCTTCACCATGTGCTACTGGATATACTACGAGATCATTGTTTTCATATAAGTTAGTAAAAGGCGTTTGATTATTAACAATTTTTAAGGTTTCATTTCTACTAATAAATAAATGGGAATCGTTATGAAGTAAAGCTCCTGGTAATAAGCCAATTTCAGTTAAAATTTGAAAACCATTGCATACACCTAATACTGGTTTACCTTCACTTGCTAAACGTTTAACTTCATCAATTACTGGGGCTACGCTAGCCATGGCGCCTGAGCGCAAATAATCTCCAAATGAAAATCCTCCTGGTATAAGTACACCATCAAAACCTTCAAGTGATGTCTCACGATAATCTACATATTCAGCTTCAGCACCTGTTTTAATCGCCGCGTTATACATATCTCTATCACAATTAGAACCAGGGAATACGAGAACTGCAAATTTCATATCATGCATTCTCCTTTTCATCAACGATTTTATAGCTGTATTCTTCAATGACTGTATTGGCAAATAACTTTTCACTAAGCGTTGTAATGATGTTATCAACTGCTTCATCCGTAGCTTCATCAACAGACATATATAATACTTTGCCGACGCGGATATCATTGACTTGCGTATAACCTAAGTCATGTACAGCACGATTTAATGCTTGCCCTTGAGTATCTAATACTTGTGGTTGTAAAGTAATATGAAGTTCAATCGTTTTCATTATTTAACTTCCTCCAATTTATTTAAAAATGTTTGATATGTGTCAATCAGTGAGCCTGTTTCATTTCTGTATACATCTTTGTCAAAATTCGTACCTGAATCCTTGTCCCATATACGACAAGTGTCTGGTGAAATTTCATCTGCTAATAAAATTTTTCCATCTTGTGTTTTTCCAAATTCTATTTTGAAATCCACAAGCTGTAAATCCATTTCATCCATAAGTTGTATCAGTACATGATTGATATCCTTAGCCATTTGTTTTAATGTTTGTATTTCTTCATCGTTGGCAATGTTTAATAGTTTGACATGGTCATCAGTAATTAGCGGATCATTTAAGTCATCATTTTTATAGAAAAATTCAACTAGTGGTTCGTTAAATTGATATCCTTTATCTAAACCTAAGCGTTTCGTGATGGAGCCCGCTGCAACGTTACGAACAACAACTTCTAATGGAATAATCTTTACTTCTTTAACTAATTGTTCTGTCTCAGATAATTGTTTAATAAAATGACTCTCTATACCTTTATGGCTTAAATAATCAAATATAATAGATGTAATTTGATTGTTTAAGCGACCTTTGCCTTTCATGGTATCTTTTTTCGCACCATTGCCAGCCGTTACTTCATCTTTATACTCAACACGCAATTGATTTTCTACTTCAGTAGAAAATACTCTTTTTGCTTTACCTTCATATAATAATGCCATTTATAACTCTCTCCCTTCGAATTGTTTAAGCATGGTAGCTTCAGTGGCATTTACATCATCTGTTAGTATCGTCATGTGACCCATCTTGCGATCTGGTTTACGTTCAGCTTTGCCATAAATATGAACATGCCATTCTGGATGTTGACCAAAATCGTCTTCTAATAAATCTAAATCTCGACCAAGTAAATTCATCATAACGGCAGGCTTTAGCAATTCTATAGTCTGAGGTAATGTCTGACCAGTTATCGCAAGAATATGCGTATCGAATTGAGAATAATCACATGCTTCAATAGAATAGTGACCTGAATTATGTGGCCTTGGTGCAATTTCATTAACATATAATTGATTTTGTTTATCGATAAAGAATTCCACTGTAAACGTGCCAACAAAATGTACAGTATCGATGATTTTGTTTACTTCTATTCTTGCTAGTTGTTCTTTGTCACTGCGTGCTGGAACAATTGTTTTAAATAATATTTGATTGCGATGTTCATTTTCTTGTAATGGGAAATACGTCGTTTGTTTTTGATTACCGATTGTGACAGTTAATGATACTTCGCGTTCAATGTCGAGGTATTGCTCAGCTACACATTCTTGTTGCGCAATAAGCTGTTTGGCTTCTTCTATCGCCGTATGATCTTTAACTAAAATTTGTCCTTTCCCGTCGTAACCACCAAATCGTGTTTTGATGATAAAAGGATAGCCTAACTCTTCTATGGCATTGTATAAATCATCTATATTGTTTATTGATAAAAATGGAACAATATGAGCCCCGGCTCGCTCTAATGTTTGTTTTTCGGTTAGTCGATCTTGAAGTAATTCTATTGCTTGGTAACCTTGAGGAATATTAAATTGTTCAGATAACGTCCTTAATTGTTGTGCTGAGATATTTTCAAATTCATACGTAATGACATCTGATTTTTCACCAAGTTCTTGTAAAGCTTGTGTATCATCATAGGCAGCAGTGATAAACTCATTAGCAATATGATGGCATGGGCAATCTGTATTTGGATCTAAACAAATAACTTTAAAACCCATTTTTTGAGCAGATTGGGTCATCATTTTTCCTAACTGTCCACCACCAATAATGCCTATAGTGTCGCCAAACTTTAACTTATTGAAGCTCATGCTGCATGTCCCCTACTTTCTTAACGAGTGTTTTTTCATAATTTTCTAACTTTTCAAGTACTGACTTGTGACTGATACTTAGAATTCTCGCAGCTAAAATACCCGCATTTTTAGCACCAGATTTCCCTATAGCTGTTGTAGCAACAGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGACAATAGCGAATCTAGTCCTTTTAAGCTTTTTGATTCGATTGGCACACCAATCACCGGTAAGGTTGTCATTGATGCTACCATACCCGGTAAATGCGCTGCACCACCAGCTCCCGCAATAATGATATCGTAATCATTAGCGCGCGCTTGGTTTGCGAAATCGTACATTAATTTTGGTGTACGATGTGCCGAAACAACTTTCTTATCAAACGGAATACCAAATTCTTCTAACATCGCACAACTTTCTTGCATAATCTTCCAATCTGAAGAACTACCCATAATGACTGCTACTTTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017069|1849512:1857982|1854747_1855419_-|WP_002478380.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKTGAEAEYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVIDEVKRLASEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLKIVNNQTPFTNLYENNDLVVYPVAHGEGHYYCTDDIYEELVTNNQIILTYQDNPNGSYKDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETILGTDSGVKLFEAMVNSWREQHV >NZ_CP017069|1849512:1857982|1855420_1855681_-|WP_002459451.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYTQVNDIRVGKVLYMSVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKIVDEKENA >NZ_CP017069|1849512:1857982|1851102_1852587_-|WP_037540539.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHAEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVTDGNTLKGERGVGLLTEAIKEVQMEQLKTGRNAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAVCHNGNLINAQSLRQYLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRQIKGGFTFTILTKDALYGAVDPNAIRPLAVGKMQDGTYILASETCAIDVLGGEFIQDVHAGEYVVVNDEGIKIKSYTKHTSTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQENPVEADMVIGVPNSSLSAASGYAEESQLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVEGKKIILVDDSIVRGTTIKRIVKMLKDSGAKEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEICDHIGADSLAYLSVDGLIEAIGLDYDAPYSGLCLESFTGDYPAGLYDYEENYFKHLSPRQKAYIENHQHYYDREGNKNV >NZ_CP017069|1849512:1857982|1856385_1857513_-|WP_002492672.1|DBSCAN-SWA MSFNKLKFGDTIGIIGGGQLGKMMTQSAQKMGFKVICLDPNTDCPCHHIANEFITAAYDDTQALQELGEKSDVITYEFENISAQQLRTLSEQFNIPQGYQAIELLQDRLTEKQTLERAGAHIVPFLSINNIDDLYNAIEELGYPFIIKTRFGGYDGKGQILVKDHTAIEEAKQLIAQQECVAEQYLDIEREVSLTVTIGNQKQTTYFPLQENEHRNQILFKTIVPARSDKEQLARIEVNKIIDTVHFVGTFTVEFFIDKQNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAITGQTLPQTIELLKPAVMMNLLGRDLDLLEDDFGQHPEWHVHIYGKAERKPDRKMGHMTILTDDVNATEATMLKQFEGREL >NZ_CP017069|1849512:1857982|1850078_1851110_-|WP_002478378.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVDIEAGYEAVERMSAHVKRTLRKEVLGGLGGFGATFDLSQLQMTAPMLVSGTDGVGTKLKLAIDHDRHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIAANKVVPEVIEQIVKGVSEGCQQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKAEYIDGSNIKAGHAIIGLASSGIHSNGYSLVRKLIKQTDIDLYDDFNGQTYLDTFLTPTRLYVKPILDLKDKVTIMGMNHITGGGFYENIPRVLPDGLAAQIDVNTFPTPPIFDWLQQQGQISTDEMYNIFNMGIGYTVIVSQDDIAKALDVLKKHDVPAYHIGNVIEDAHVPIYLKGVE >NZ_CP017069|1849512:1857982|1855680_1856385_-|WP_002478381.1|DBSCAN-SWA MALLYEGKAKRVFSTEVENQLRVEYKDEVTAGNGAKKDTMKGKGRLNNQITSIIFDYLSHKGIESHFIKQLSETEQLVKEVKIIPLEVVVRNVAAGSITKRLGLDKGYQFNEPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLNIANDEEIQTLKQMAKDINHVLIQLMDEMDLQLVDFKIEFGKTQDGKILLADEISPDTCRIWDKDSGTNFDKDVYRNETGSLIDTYQTFLNKLEEVK >NZ_CP017069|1849512:1857982|1857499_1857982_-|WP_002478383.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCAMLEEFGIPFDKKVVSAHRTPKLMYDFANQARANDYDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARILSISHKSVLEKLENYEKTLVKKVGDMQHELQ >NZ_CP017069|1849512:1857982|1849512_1850079_-|WP_002492152.1|DBSCAN-SWA MTKVAIFASGSGSNFENIVLKVDKGELNNIEITSLYTDHHDAYCIERAKQLKVAVNINEPKDFDSKSAYEHHLIRILEREEVEWIILAGYMRLIGPDLLDAYEGKILNIHPSLLPKYKGKDAIGQAFNSGDNVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCEIKPDDTKENLEERVKQLEYELYPSVIAKVIK >NZ_CP017069|1849512:1857982|1852565_1854755_-|WP_002478379.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSIEEIKVEKLYQDMGLSDAEYTKVCDVLGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGERILMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSVKQNQRLLKGVVRGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMIQKGTAKGEGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYKELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLILNLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTNTDRFVLKYEDEVFADIPVQSLADEAPVYVLEGEEKAYNTSKNDYNSINVQEVFDQLLTHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQSSVVRVEGTQKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEILKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIENIEYLNDFHPQAGHKLYLVGDTRDDFGGSQIEKLLYGKVNHEFEAIDLSDEVTKGEAVKKAIRNGVASHVQTVGKGGLLITLARISAHYSLGLKAKVNLSDAQLFSETQGRYVIAVKAGQELNIEHAIEIGQLTDTDEFNVAAAHTSISKRASDIKAQWEGAIAQCLTTVD |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2143728 : 2161509
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017069|2143728:2161509|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017069|2143728:2161509|2155850_2156351_+|WP_002479355.1|DBSCAN-SWA MTQGRQEEEMKDITLLGNQNNNYQFDYRPDVLETFVNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPDTKYARMAEHRLMNHDMYPEKIDNR >NZ_CP017069|2143728:2161509|2150420_2151389_-|WP_002459741.1|DBSCAN-SWA MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTDDERNTFKRALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKADKIIENYHKLWGKEASIYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGIDAQSLRNELSENEKQQADKEMYVLLEDLYSNEVSYTHMLYDDIGLTEDVLNYVKYNGNKALSNLGFDPYFEEKDFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEALRDEDFIFEN >NZ_CP017069|2143728:2161509|2153696_2154095_-|WP_002459743.1|DBSCAN-SWA MKVIYFSFSGNVQRFIKRTELSDVMEITEDNCQEEVNEPYILVTGTIGFGEVPQEVQQFLQVNHQHLQAVAASGNRNWGQNFAKAGQTISEQYNVPLLMKFEVQGSNSDVKEFKDKVGQFNENYEREKIQSY >NZ_CP017069|2143728:2161509|2160453_2161509_-|WP_002459751.1|DBSCAN-SWA 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15 | uncultured_Caudovirales_phage(58.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_8 |
2176773 : 2183394
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017069|2176773:2183394|DBSCAN-SWA TTTATAGCATCTCCAAAATTTTAGCTTTATCACGAAATTCTTGCACTTCATTTTCAGGATCAGAATCAATAGTAATACCCGCGCCGACACCGTATATCGCTTTATTATCACGATATTCAATTGTGCGAATAGGTACATTAAAAATCATCTTGTCATCTGGCATCAATATGCCAAGCGTACCACAGTAAATATAACGCGGTTGGTCTTCTAATTTGTGAATATATGACATCGTGTTTAATTTAGGTGCACCTGTTATGGAACCACAAGGAAATAGCGCATGAAATAACGTTGCTAATGGTAATGTTGCATTTGAGAGTTGACCTGCAACCATACTTGTCATTTGATATACAGTGGCATAAGTTTCAATAAAAAACGGACGATACACATGTACCGTACCTTTTCGTGCAATTCTAGCAATATCATTTCTCAATAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCTCTATCCTTTAATGATTGTTGTAAATATTTATAATTATATTGATCTTGCTGTTTGACATCTGACCTTGGCATGGTGCCTTTCATAGGCTTACTCACAACTACATTATCTTGACCATCAAATGGCCCTTTCTGAAAGAATAATTCGGGTGAAATAGAAGCGACTTGTACGTCTTCAGTATCCATTAACATGGTGTAATTGCCATTTTTAGTTTGCGTTAATTTATCATACAGGTCTTTAATTGGCATTTGTACTGGCGAACTCACTCTTGTTGTATAGTTTACCTGGTAAGTTTCGCCATCAATAATTGCTGCTTGTACTGCTTTGATATGTTGAATCATAGTTGCCTCTTTTACTTGAAAGGCAAACTGGTGTTGTGGCTTATTATTATAATGCTTTATTGACGTCTCTTGTTGTATGGGCTGTGCCGATTGATAACTATAAGCCGCTGCTAATATTGCATCGTCTGCAGTTGGATGCACAGCCATGTCAGGATTAAAGTATTGTGCCGCTTCATACGTCATATAAAGCGCCACATATTTCCCTTCTTTCTGCTGTTGTTCTGCAAAATTGATAACGTCTCCCACATCTTTCATCTCATATGCTAGATATTGCCCTAACCTTTCTGTGAGTTTAAGTTGGTGCGTTTCGTAGCGTGAATCGTCTAAATAATATCTATAATTAAATTGTATTGTCACACTGATTCACCCCCAAAGTTTTAATAAACAGCTCAATTTGTGCATGACCATGTTCACTGAGAATTGATTCAGGATGATATTGCACCGCATAAATAGGCCATTGTCGATGCTGAACTGCCATAATAATACCTTCATCATTTTCAGCACTAATTTCAAGTTGTGCCGGCAGTGATTGACGCTCTGCAATCAAAGAATGGTAACGCATCACTTCAAAATGTTGTGGCAGTTGAGCAAAAATCCCCTTATTATTATGATTAAGCTTTGTTGTGTGGCCGTGTACAGGTCGTTTACCATGAATAATACGGCCCCCAAAATAATCGTAAATGCATTGAAATCCTAAGCAAACACCTAATATGGGAATACGCTTTTTAAATGCTGCAATAATCTGTGCGATTATCGGATAATCACTAGGCTTACCCGGGCCTGGGGAAATAACTAGCGCTGACGGATTAAGCTGTTGTAATGATTGTATTGTGACTTGATTGATACGATAAACAATGATTTCTATATCAGTAACTGTTTTAAAATAATCTATCAAGTTATATGTAAATGAGTCGTTATTATCTATGACTAATATCATTTTATGCTTACCTTCTTTAGTTTCATTCGTAAAAATTACCACTTTATTATAATATATATGTAAGGGGTTACGTTTCTATTATCCCAAAATATTTCTTGATTTTACATAGTTTCTGTATTATTCTAGCTAGCGTATTCAAAATAAATAATCAGAGGTTCCTAGCCGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACACCGAATGTTTCAATCAATATTTAAAGTAACTTATCATCATATGCATTTACTTATTCTGTGGTCTATCTTTTTTATAGAGATAGCTTTTTTTATGTCTAAAAATAGGTTGCATTACCCTCAACGCACTTAAATTGGAGAGATGGACAATGACTGAAACAACTTTAAACAATAACAAAGCCATAGTCGTATTTAGCGGTGGTCAAGATAGTACTACATGCTTATTTTATGCTAAAAAGCACTTTGACGAAGTCGAACTTGTTACGTTCAATTATGGACAGCGTCATAATACTGAAATTGAAGTAGCCAAAAGCATAGCGCATGAACAAGGACTAGCACATCACATTCTTGATATGTCGCTATTATCACAATTAACGCCAAACGCATTAACGCAACACGATATGAAAATTGAAACCAACGAAGACGGTATGCCTAATACATTCGTACCTGCACGTAATCTATTGTTTTTATCATTTGCAGGTGCCCTTGCTTACCAACTCAACGCCAAACATATTATCACTGGTGTATGTGAAACAGATTTCTCTGGCTACCCAGATTGCAGAGATAACTTTATTAAATCAATGAATGTGACACTAAGTTTAGCTATGGATAAAGATTTTGTCATTCATACACCCCTCATGTGGCTAAACAAAGCTCAAACATGGGCGCTAAGTGATGAACTTGGTGTCTTAGACTATATCCGTCATCAAACATTAACATGCTATAACGGCATCATTGGTGATGGCTGCGGAGAATGTCCAGCTTGTCACTTAAGAGCACGTGGTTTACAACAATATCTTAATTCTAAAGGAGCGAAATAATATGTTACAACAAATTTACCCGTCTGTCTCACATCCTTACCAATTCGAACTCAATAAAGACTTTAATTTTTCTGCAGCACATTTTATACCATGTAAAGATGCTGGAAAATGCGTACGCACTCATGGACATACGTATTTCGTAAATTTAACAATTGCGGGTGACACGCTTGATCATAATGGTTTCCTTATCAATTTCCAAGAGTTAAAAGCATTGATTCACGATCAATTTGATCATTATTTATTGAATGATTTGCCCCACTTTAAAGACCAAAGCCCCTCTACTGAAATTGTGGCACAGACAATATATAACATGATTGAAAATCATCTGATGCAATATACAAATCGTCCACATTGTGTTCAAGTCTACTTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTTGTTTATCGTCCGAAGGTGCAACATTAATGGCTGCTAAAATACCTGTATTAGAAATTTTTGGCCCCACAATTCAAGGTGAAGGCCGTGTCATTGGACGTAAAACGATGTTTGTTCGAACTGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGTTGGTGCGATTCCGCATTTACCTGGGATGGCAGTGCAAAAGATCAAATTCAATTAATGAGCGCAACAGAAATTTATGAAAAGTTAATTGAAATTGGTGGTGATTGTTTTGATCATGTAACGATATCAGGAGGTAATCCTGCATTAATTAAAGGTATACAAGATCTTGTCGATTTATTTGAAACTGAGCATATCGCAACTGCTTTAGAAACACAAGGTAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAGATTAATGATTTGACGATAAGTCCTAAACCACCTAGCTCTTCAATGACACCTAATTTAGAAGTTTTAGATCAAGTCATTGCACAATGTGTGCCACAATCCTTAAATTTGAAAGTGGTTGTTTTTGATGATGAAGATTATGCTTTTGCCAAAATGATTCATCATCGTTATCCAGACATACCTTTCTATTTGCAAGTAGGCAACCCATACTTAGCAGATGACGTAGCAAATCACACTGAAAAACTATTGTCACGATATGAACAATTGGTTGAAAAAGTAATGCATAGCAATGATATGAATCGCGCTTATGTCTTACCACAACTTCATACATTATTATGGAGCAACAAAAAAGGTGTTTAAATTTATCGCTATAAAATGTTTTGTAAGTGTTATGAAATGATTAAGTTGTGTTAAATTGCTATAATATGGCAATGAAGTATTTGCGATAGGAGTTCATCATGATTATATACGTACTATTAAACATTGCTGTAGTTATGGCTATCGTTGGGTTTGATTTATATAGGCAGCAATATAAACAACTTAAATTTAGTTCTCTACTATTAGCGATTGTCATTAACACAACAATAAATATGTTTATTATTCAAAAGTATAATTTTATTTCAACTTATACCACTGCATTACTAATCATATGGTTATTACTGCAACTGTATGTTAATTATAAGGTACATCCTTTTGTAATTAATAACCAAAAATTTCTTGCCAGCATATTTGCGATTATTTTAAGCTTATCAGCATTTATTATGGATATTTCGAGCGACCAATCTGTCTATATGTCCATTCCTTATCTGTCACCAGCTATTTTTCTAATTGGGGCAATCATTTTATTTACGGGTACATTTAAATCAACCGAACGCAATCGCTTGCCATTATTCAAACGAATACAAGCCCCTATCATGATAGGAACAATTATTATTGCATTATCATTTGTTGTTATGATGATGTTAACACCATTCTGGTACATATTTTTAGGAATCTATGTATTATTTATAGCATTTATTATTTGGCAAAAAGTATTTCAACATTATTAAAATAACCGGAACACACTTGTCGGCGTGTTTCGGTTATTTATTATATATGCTCTTTTTCTTTATCTTTCACGGTATGCTCATGGTTTATATTACATTGATATGCATTGGGACTATGACCATTTTCATAGGTTAAATTCGAAGCTTGTACAATGTACTTAGGTCTTTGCTTCACTTCATAATAAATCCGTCCGATATATTCTCCGACAACACCTATAGAGATAAGTTGAATACCACCAAGTAACAAAATAGCAGCTATCGTCGTGAAATAACCTGGATTACTAATGCCATTTACGATAATGCCTATAGACAAATAAATAATATAGATAAGGCTAATTGCAAAAATAAATAATCCAAAATAAATCATTGTCCGTAATGGCTTACTATTAAATGAAATTAAACCATCAATACCATAATTAAATAACTTTCTAAAATTCCACTTTGATTGTCCCGCTTCACGTTCTACATTTTTATATGAAAAGACTTTTGTATTATAACCAATCCAAGCAAATAATCCTTTTGAAAAACGATTGTTCTCTTGCAACTCAGCAATTGCACACACAGCCCGTTGACTCAACAATCTAAAATCTCCTACCCCATCGACAAACTGGACATCTTCAACAAATGCATTAATCAATTTATAATACATCTTTGTCACTATTTTACGTGATAGCTGTTCGCCTTCTCTATCACGTTGGGCAATGACTTGATCATAACCCTCTAGATAACCATCAATCATATTGGGTATAAATTCAGGAGGATGCTGTAAATCACCATCTATCATAATGACAGCGTCTACATCAACACTATGGTGAAAACCTGCAATCATCGCTGATTCTTTACCAAAATTCCTACTAAATGAAATAAACTTTACGTGTTTATCTTCTAACGACAATTGCTGTATGTGTTGAATCGTACTATCTTTGCTACCATCATCAATAAATAATAAATCATAGTCATAATTTTTTTCGTTACTGTCTTTCAACATAATTTCAGTCAATCGCTCATATGTTTTTAATACGACTTCTCCTTCGTTATAACAGGGGACAATGACTCTGATTTTCATCCGATTACTTCCTTTACTTATTTCTTAATACTATTTTATCAATTTATTCATAAAACGCGCTAGTATCGTTCTTTAATTTTACAAAAAATTAATAAAGTTGCAAGCGAACTAGTTTTTAAAGCTATTTTATTTTTTTAAGTAGGCTTATCATTTGTACTATTTTAAATCGCCAATGCTAACATCATCAGGATCTTTCCCTTGTCTTGCATTGCGATTCAAACTATCAATTTCTGCAATTTCAGCTAATTCCAAATTAAAATTAAATAAATCGAAATTTTCTTTAATTCGTGAAGGTGTCTGAGACTTAGGTATAATGATACGATTATGTGCTAAGTGCCAACGCAACACGATTTGAGCCGGTGTCTTGTCGTGTTGTTGGGCAATATGTTGAATTGTTGAATCATCTAATAATCCGCGATTGCGCATTAATGGCATCCATGCCGTTACAGTAATATCGTGTTTATCGCAAAAGTCTTGAACATCCTGTTGATTAAAGTAAGGATGCACTTCAATTTGGTTAATTTGTGGAACGATATTGGTTTCTTGCATTAATTTTTCCAAGTGATGAATTTTAAAATTACATACGCCAATCGCTTTTACTTTACCTTCATGATATAAATCCTCTAGTGCTTTATATGTTTCAATATATCGTCCATTCTGTTCACATGGCCAATGAATCAAAAATAAATCAAAATAATCAAGGCCCATGTTATCTAAAGAACGTTGGAAATAGGCTTTCGTCTGTTCATAACCTTGATGATCATTCCATACCTTAGACGTGATAAACAATTCTTCACGTGGCAGACCACTATTCTTTAAAGCCTGTCCTAATGATGCCTCATTGCCATAAAAATATGCAGTATCAAATGCACGATAGCCGGTTTCTATAGCTTGTTGAATGACTTTCGGCATATCTTCATCAGTGATTTTATAAACACCAAAACCTACTTTGGGCATAGGATAGCCATTATTTAATAATTGCGTATCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017069|2176773:2183394|2180747_2181338_+|WP_002493007.1|DBSCAN-SWA MIIYVLLNIAVVMAIVGFDLYRQQYKQLKFSSLLLAIVINTTINMFIIQKYNFISTYTTALLIIWLLLQLYVNYKVHPFVINNQKFLASIFAIILSLSAFIMDISSDQSVYMSIPYLSPAIFLIGAIILFTGTFKSTERNRLPLFKRIQAPIMIGTIIIALSFVVMMMLTPFWYIFLGIYVLFIAFIIWQKVFQHY >NZ_CP017069|2176773:2183394|2178840_2179512_+|WP_002492964.1|DBSCAN-SWA MTETTLNNNKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFDEVELVTFNYGQRHNTEIEVAKSIAHEQGLAHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMKIETNEDGMPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQLNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDNFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAQTWALSDELGVLDYIRHQTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRARGLQQYLNSKGAK >NZ_CP017069|2176773:2183394|2182557_2183394_-|WP_002492999.1|DBSCAN-SWA MNDTQLLNNGYPMPKVGFGVYKITDEDMPKVIQQAIETGYRAFDTAYFYGNEASLGQALKNSGLPREELFITSKVWNDHQGYEQTKAYFQRSLDNMGLDYFDLFLIHWPCEQNGRYIETYKALEDLYHEGKVKAIGVCNFKIHHLEKLMQETNIVPQINQIEVHPYFNQQDVQDFCDKHDITVTAWMPLMRNRGLLDDSTIQHIAQQHDKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSQTPSRIKENFDLFNFNLELAEIAEIDSLNRNARQGKDPDDVSIGDLK >NZ_CP017069|2176773:2183394|2176773_2177925_-|WP_002459762.1|DBSCAN-SWA MTIQFNYRYYLDDSRYETHQLKLTERLGQYLAYEMKDVGDVINFAEQQQKEGKYVALYMTYEAAQYFNPDMAVHPTADDAILAAAYSYQSAQPIQQETSIKHYNNKPQHQFAFQVKEATMIQHIKAVQAAIIDGETYQVNYTTRVSSPVQMPIKDLYDKLTQTKNGNYTMLMDTEDVQVASISPELFFQKGPFDGQDNVVVSKPMKGTMPRSDVKQQDQYNYKYLQQSLKDRAENVMIVDLLRNDIARIARKGTVHVYRPFFIETYATVYQMTSMVAGQLSNATLPLATLFHALFPCGSITGAPKLNTMSYIHKLEDQPRYIYCGTLGILMPDDKMIFNVPIRTIEYRDNKAIYGVGAGITIDSDPENEVQEFRDKAKILEML >NZ_CP017069|2176773:2183394|2181378_2182401_-|WP_002459768.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCYNEGEVVLKTYERLTEIMLKDSNEKNYDYDLLFIDDGSKDSTIQHIQQLSLEDKHVKFISFSRNFGKESAMIAGFHHSVDVDAVIMIDGDLQHPPEFIPNMIDGYLEGYDQVIAQRDREGEQLSRKIVTKMYYKLINAFVEDVQFVDGVGDFRLLSQRAVCAIAELQENNRFSKGLFAWIGYNTKVFSYKNVEREAGQSKWNFRKLFNYGIDGLISFNSKPLRTMIYFGLFIFAISLIYIIYLSIGIIVNGISNPGYFTTIAAILLLGGIQLISIGVVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQASNLTYENGHSPNAYQCNINHEHTVKDKEKEHI >NZ_CP017069|2176773:2183394|2179513_2179933_+|WP_002459765.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSVSHPYQFELNKDFNFSAAHFIPCKDAGKCVRTHGHTYFVNLTIAGDTLDHNGFLINFQELKALIHDQFDHYLLNDLPHFKDQSPSTEIVAQTIYNMIENHLMQYTNRPHCVQVYLRETPTSYVVYRPKVQH >NZ_CP017069|2176773:2183394|2177908_2178505_-|WP_002479366.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYFKTVTDIEIIVYRINQVTIQSLQQLNPSALVISPGPGKPSDYPIIAQIIAAFKKRIPILGVCLGFQCIYDYFGGRIIHGKRPVHGHTTKLNHNNKGIFAQLPQHFEVMRYHSLIAERQSLPAQLEISAENDEGIIMAVQHRQWPIYAVQYHPESILSEHGHAQIELFIKTLGVNQCDNTI >NZ_CP017069|2176773:2183394|2179932_2180649_+|WP_002459766.1|DBSCAN-SWA MAAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKDQIQLMSATEIYEKLIEIGGDCFDHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFETEHIATALETQGSKFQPWMTQINDLTISPKPPSSSMTPNLEVLDQVIAQCVPQSLNLKVVVFDDEDYAFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLADDVANHTEKLLSRYEQLVEKVMHSNDMNRAYVLPQLHTLLWSNKKGV |
8 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2519007 : 2535432
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017069|2519007:2535432|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017069|2519007:2535432|2525226_2525529_-|WP_002492064.1|DBSCAN-SWA MNWELRNLFDDLEVVQEKINDVVTSFVWFDDEYFTHEPNHMLTKKEIYTHGWKYHEHRIKNTQVIDLMLMYMRDFDDIMKKIRDIEKTLPENFGEESDNA >NZ_CP017069|2519007:2535432|2530906_2531692_+|WP_002461100.1|DBSCAN-SWA MFIKISRSIITLLILLTTLCTTTALAEKPVYQYHKGTMGSGYKQYINSGAGGRGGMPTKPRANVSSSSKRILDISEWQGALTDAQVKALKKNYDFIIIRGQYGSEYVDKCLANNSALLDKYNMKFGVYSYSMYENADDARYEARTLHQRAPKADFYINDYEQQTVKSGDENAATQAWAAEMKKLAGNKKVLFYSYENFMLNHVANAINAYDGCWLAAYQQTEPQSEHVLWQYTDHYYASELKQNVDANYVSQNLNQNFFIN >NZ_CP017069|2519007:2535432|2533514_2534396_-|WP_002479237.1|DBSCAN-SWA MNQIKNVLASLFEPLTKVETYENLITKLALILIYILVAIIVISILNKIIAQAFKIQNKSKKGNKKRSKTLISLVQNVVKYIVWFIVITTVLSKFGISVEGIIASAGVVGLAVGFGAQTIVKDVITGFFIIFENQFDVGDYVKINSGGTTVAEGTVKSIGLRSTRINTITGELTILPNGSMGEITNFSITNGTAIVVIPVSVEENLDAVEKKLNKLFVSMRSKYYLFVTDPVVLGIDAIENNKVTFRISAETIPGEGAAGARILRKEIQKLFVQEGIKLPQPVFSQYESQQKSK >NZ_CP017069|2519007:2535432|2533281_2533497_-|WP_002479238.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP017069|2519007:2535432|2519007_2519580_-|WP_002445377.1|terminase|DBSCAN-SWA MPKLTPKQERFVNEYIRTLNVTQSAITAGYSPKTAHVTGSRLLKKKHINEYIQEQKKKVIDESILSANELLHLLTNSAVGDETETKEVIVKRGEYKENPQNGKIQLVYNEYVELIEIPIKPSDRLRARDMLGKYHKLFTEKKEFTADTPVIINIGEWDEEDEEDKQRTLDKINDNYPNRTMIVDDIPLED >NZ_CP017069|2519007:2535432|2522540_2524250_-|WP_002492057.1|DBSCAN-SWA MNFTNDEIMNEIKENMNKKTYTPNLIPDGYKVKPNSYGAALYQIIPSRKDGEPDKERFITTTIPEINTRYENIENGEVSYNMHFFDNRTPVNLNVTAEEITDNRQLLKLANRKLDVTSNTSSKLVDYINQSKRYSPPINIKVATRLGHVKDYFIYPYKDEMEHENIKFFNNDKGFQKLVNSFKSKGTIEDYSKKVFIKIKDLPMVMVMLYASLGSVLLYEFDIMPFIVELAGSTSTGKTFTLNLVASVWGTTDLTTTWSSTRNSIEAMAAFLNSFPMFKDDTRNISPNFIANAVYNYSSGESKSRSNKNLTIDEKKEWKNIMLSTGEASITNMAEDKAGVSARVVTLEEQPYPDNFDFISLDHEFRENYGTLGIEFIKQYQSKKDEYKESFESYLRYFNEKGINEVMQRIGKCFALLQLTGEILNDIDGFEHDYYKIINQAYENMLKNNKTIDKPKQMLEDMLQYLDAHRNNITGDGYSHVKNGEIKAVYKRGYLCILGDTVKDILGHEMYTTTKQWDKKGYLVKKEKDRLQIQVRHETKKHRGFAIKDEVIKEMGFDFSNSHNPHSKF >NZ_CP017069|2519007:2535432|2529472_2529715_-|WP_002461103.1|DBSCAN-SWA MAGGPRRGGRRRKKVCYFTANGITHIDYKDTELLKRFISERGKILPRRVTGTSAKYQRMLTTAIKRARHMALLPYVKEEN >NZ_CP017069|2519007:2535432|2530292_2530589_-|WP_002461101.1|DBSCAN-SWA MRTYEIMYVVRPNIEEDAKKAVVERFNGILASEGSEVLEEKDWGKRRLAYEIEDFKEGFYNIVRIKTDNNRATDEFQRLAKINDDIIRYIVIREDQDK >NZ_CP017069|2519007:2535432|2525528_2525948_-|WP_002492019.1|DBSCAN-SWA MNNKQELNKQIKFREENEKMKNLTNQDFKTIKGKLNYEHMVNGKKHTSKMIKLLQKRHAKNVSVIKSEYPYLSDNEILEILADYREYEDLLSATETFIDFPNIYEGSNISKFLTLDDVAELKIAIEEMTIFVESLEDNE >NZ_CP017069|2519007:2535432|2532184_2533282_-|WP_002479239.1|DBSCAN-SWA MALTAGIVGLPNVGKSTLFNAITKAGALAANYPFATIDPNVGIVEVPDTRLDKLTEMVEPKKTIPTAFEFTDIAGIVKGASKGEGLGNKFLSHIREVDAICQVVRAFDDDNVTHVAGRVNPLEDIEVINMELVLADLESVEKRLPRIEKMARQKDKTAEMEMRILNRIKEALEEGNPVRSLEFNEEDQKWVNQAQLLTSKKMLYIANVGEDEIGDVENDKVTAIREYAAKEDSEVIVISAKIEEEIATLDDEDKAMFLEDLGIEEPGLNKLIRTTYDLLGLSTYFTAGVQEVRAWTFKQGMTAPQCAGIIHTDFERGFIRAEVTSYKDYVEYNGEQGAKEAGKQRLEGKDYIMQDGDIVHFRFNV >NZ_CP017069|2519007:2535432|2528106_2529327_+|WP_002492008.1|integrase|DBSCAN-SWA MWHEKFTNKHGDVQYRFYEKYKDPLTAKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQKLLNKRIEAKLNDKTPTTLKSLTFHAACDEWLEYYKNHSGSKATTIKEKISNTNTVKNAIDKEVLINNITHTYLQDIINEWAKLHSKGHVQSLVIIIRSVFKYAFKYYDLQDISVLDKIDIPKKAKTRDELQAKRNNYLEDSEVKELLDCFDYLIKHKNHSSRKRNYNMVKAIVQFQIANGMRIGELLAIKKDNINFEHKTLEIDGTINWVTDKETGAFGVKETTKTSKSYRTIGLTTQSINLLKTLILENKKENQWNEDFIDRGYVFTNTAGSPIDLNKINNIIKEATDISSIKKRVTTHTLRHTHISTLAQLGINLKAIQDRVGHSDYKTTLEIYTHVTDQMTKDMMNKLETINIV >NZ_CP017069|2519007:2535432|2534604_2535432_-|WP_002492025.1|DBSCAN-SWA MAIENDHRLQINEDEQIRWIAIEEIMPNPYQPRKNFDAERLNDLAESIKIHGILQPIVLRQTVQGYYIVVGERRYRASQLAGLTKLPSIIKELSDADMMELAIIENLQREDLNAIEEAESYQRLMDDLQLTQQEVAHRLGKSRPYIANMLRLLHLPPSLKDSVQRGELSGAHGRTLLGIKDKQRMIQVGRKAFKESWSVRYLEKYVNNIQEGSQPYPKVTKEPLKPKFIQKQERLLREQYGAKVDISTKKQVGAITFEFKSKEEFERLIKLLHDK >NZ_CP017069|2519007:2535432|2521051_2521693_-|WP_002492071.1|DBSCAN-SWA MNVEIIANEFETRAATLLRYFTGLCESSYKLPFAFKIYNDPFNVVYLVSKGKMYAHVLIKDCEVRQSFELASYKHTEGLIRSIEGHYTGYDIEDDKHISISDMMAKFMFDNDYFMYGLETFAESNNSDMFDYMSRDFNIDELEGVQSSNADVIGNMEMLYQLATGINGPAPELVEGLKLVTEFVQDENATQDDYKALVSKLSELKASYYSLNK >NZ_CP017069|2519007:2535432|2519642_2520164_-|WP_002445376.1|DBSCAN-SWA MKTLDQIEKYKTNIEDYRKEIKNLDAEVKNDGKQLDDINQEYQDLVINGEVEKADKLYTKIEKLESDYRAKSKRLMVMKQSFKKVVIKNCENMQDVADELSDEYNETYQDDLKRYETLNQQLKDAKDKLLGYNDEYSAKQRTLTQYIDRLKRENNIQPVEFIGNVNIIQPFNI >NZ_CP017069|2519007:2535432|2526112_2526385_-|WP_002492070.1|DBSCAN-SWA MPRTKLQDFPSKENTVTEPKQVVVKPIMAKPNAIAKLFGISYSSVNRILKEYDKDNKGVEDLYFSLSSTMTVISIDGFREYLSKRHKGWL >NZ_CP017069|2519007:2535432|2526778_2527351_+|WP_002459648.1|DBSCAN-SWA MQQNSLEDFSNILKKFRKEEDLTLDTLSKYLGVSDVYVSKLENGKRFPSKNILFWYVLFMDQSQMHDDIEKLLTIFSENKKISYEQLRTEYDQFVKKFQEEQKKHSSKIQRKEIKLTMNEFNQYQIEEIDEPYFDLKWLLNQSEYKLFYSGIDNKNSFGFNEVLSESDKKMLSEIVNSVIQRIYNDENQK >NZ_CP017069|2519007:2535432|2531753_2531945_+|WP_002479240.1|DBSCAN-SWA MQLNLDWSKDFQEFQDILNSGIHPDWLYCAKANLVLQPAYTGEGKQFFSTEDIVEASKVIPFF >NZ_CP017069|2519007:2535432|2529761_2530271_-|WP_002461102.1|DBSCAN-SWA MLNRVVLVGRLTKDPEYRTTPSGVSVATFTLAVNRTFTNAQGEREADFINCVVFRRQAENVNNYLNKGSLAGVDGRLQSRSYENQEGRRIFVTEVVCDSVQFLEPKNAQHGGQRSQNNEFQDYGQGFGGQQSGQNTSYNNNNASKSNQNDNPFANANGPIDISDDDLPF >NZ_CP017069|2519007:2535432|2527377_2528070_+|WP_002459649.1|DBSCAN-SWA MKINKWIMWVILFSSLFGIANKGISIIAFILSIVALTKFVLVDKKSINTNAENNNTKVQQPKQTSNKEFKQNERLRKKEEKIKEKERAREQEKQIAIQRSHDYFGVDFIDANVTNSKATAYYNKIKTDTEHVIDVVNARATKNVKNYKRYGYHLETTDKGILILTTENIYFLTAQNGFAKTVYPIKNVNGINTSMANLYITYGRTKHIYNVEGWKRSDLFMKNYIKYFYS |
23 | Staphylococcus_phage(46.15%) | terminase,integrase | attL 2516333:2516392|attR 2529414:2529487 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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