Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016305 | Rickettsia sp. MEAM1 (Bemisia tabaci), complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 14 | 0 |
1. NZ_CP016305
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
2531 : 64612
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016305|2531:64612|DBSCAN-SWA GTTAAAAATCATTTTCTAATAATTCATATTTAAAATTTCCACATAGTATCTCAAATTGATTCAAAGCAAGAGACCATTCTTTAATAGGCATGGTCCACTTTTTTGCAGCATGTTTAAGAGCTAAGTAGACAATTTTTGTGATAGATTTATCATCTGGGAAAACCCCTTTATTTTTGATAATTTTACGGATTTGTCTATTTACCGATTCTATCGTATTGGTAGTATAGATTACCTTTCTAATCTCTTTAGGGAACGCAAAGAAAGGTACTATACCACTCCAATTACGTATCCATATATCAGAAATAACTGGGTATTTACTATCCCATTTTTTAGCAAACTCTTCTAATGCTAAATTAGCCATATTCTCATTATTTGCTGTATAGATTTGTTTTAAGTCAGCTGCTACTTCTTTAAGATTTTTGTAAGAAACGTACTTTAAAGAATTACGTACCATATGTACTATACAAAGTTGTACTATGGTATTTGGGAAAACACTGTTTATTGCATCTCTAAAACCTTTAAGACCGTCAACACATGCTACATAAATTTGTTCTACACCTCGGTTCTTTAATTCGCTTACAACCTGCATCCAAAACTTTGAACCCGCATTCTTGCTAATCCAAATACCCAAAAGCTCTTTCTTGCCTTCTATATTTATACCAATAACAAGGTAAACAGCCTTATTTATAACTATATTATTATCTCTTGCTTTTACCATGATGCAATCTAAATATACAATTGGGTATATTCTATCTAATGCTCGGGCTTGCCATCTTATTACCTCTTCCATAACTCCATCTGTAATAGTCGAGATAAGCTCCTTAGATACTTCTGTATGATACATTTCCTCTAAATGGGATTGAATCTCACTCATGGTCATACCTCTTGCATAAAGTGAAATAACGCTATCATCAAATCCAGTGAATCTTCTAACTCCCTTAGGAACTAAACAACCCTCAGCTATAAGCTGAGGGGTTATAAAGTGGAATCGATTAGAAATCGATCATCATTCACAGGTTCACCTTCCTGTTCATCAATATAGTGCTGTATCATTTCATCAGTTATATTACCTGAACTGACTGCCATATAGCCCCTAGCCCACAAATGATTGCCCCAAAATTGTTTTCGTAAATGAGTAAATTCTTGCAATAAAATTCTTGAGCTAATGCCTTTTAAATACTGTACTAACTTGCTAAGAGATATTTGCGGCTTATATGAGATAAAAATATGTACGTGATCACATGATATTTCCCCTGAAATTATATGTACTTCATGTTCCATACAAATCTGCCTCAGTAAATCTCTAGTCCTTTCCGATACTTTGCCTATCAATATTCTCTTCCTATATTTTGGTATCCATATAAGATGCACTTTTAAATCATACTGACTATGACTATTCTTTCTATAACTTCTCATATTTCGTGATATAAATTCATTGCTAAAGCAATTTCATTATATCTTCCCTTCGCCTAAAGGCGAGGGATTTTTGATCCCCGAAGGGGGACATTAATTGAGGCTCAAAACTATTGTCTCTATCTCTTGGAATATCAAGTACTATCTTTTGACCACTGTCATCTATTACTGTCTTTTCGCTCGTACCATTACGACGATTGCTATCTTGCTTTGATGCCTTGCTATGCCTCGAATAACCTAATTCATGACTTAGCTCGTCCTCTAGTATTCTCTCTACTAACCTCTTCTTTAATTGCTGAAACAATCCATCCTTTCCAAATAACTCTTTAGGATTAGATTGGGATAATATTTCCTCTACTAACTTAGTATTTATATGTGCACTTCTAACACCAGCTTCTATTTTCTTAGCCATATTTTTTACCTTTGTTCTAGTTGTATTTTAACAGTATTTCTTTCTCTGTTGCTTTACAACTTACACAAAATATATGATAGCCTCTGCAGGCGTTGTTGTGTAGATCAAAAAACACTCTTGGTGTCATACCATGGCGGTATTATTGCGTAGATCGAAAAATGCCCTAAGGTAGTCATCTAGTTGCTTGACCACGGCATCCAGAAAATAATAAAAAATACTAATTTTATTAGTATTTTTTAGCTGGCTCTAGTTCATAAATCACGGGATGACAGGGGAAAATGATCCACGCGGGCAATGCCTTCTCGCAATGACGGGAACTAAGTTATAACTGTTTTTTCTCTTGAATCAGCTCAAATACCTCGACTGTATCACCCTCTCTGATATCTTCGTAATTCTCAAATGCGATACCACACTCATAGCCTTCTCTGACTTCTTTAACTTCTTCTTTAAAGCGTTTTAAAGTCTTCAGCTTACCCTCATGAATTACTATATTATCACGTAATAAGCGTACTCCTGCTCCTTTCTTAATAATACCTCTAGTGACATAAGAACCAGCGATTTTACCAATCTTGGTAATGTTAAATATCTGCCTAATTTCTACTGATCCAATATATTGTTCTCTAATAATCGGATCAAGCATTCCGCTCATAATTGCTTTCACGTCATCTAATAGATCGTATATTATGCTGTAATATCTAATTTCAACTTTTTCTTTCTCTGCAGCAGTTTTTGCGTTTGTACCTGCTCTAACATTAAAGCCAACAATAATAGCTGAAGAAGCATGAGCAAGTGATACATCCGATTCTGTTATAGGACCTACACCACTGTGAAGAATGCGGAGCTTAACTTCATCATTTGGTAATTTTAATAAACTACCAGCAATAGCTTCAACTGAACCATGAACATCACCTTTAATAATTAAAGGTAATTCTTTAATTTTACTACTACCAGAAGCTTTTAAGAATAAATCTTCTAGACTTGAACGTGGTGCTATAGATATTTTCTTTTCTTTAGCAACTCGCTCTCTATATTCTGCTATGTCTTTTGCTTGCTTTTCAGTTTGTACTACGTTAAACATGTCACCAGCATGAGGAACATGACTCAAGCCCTGAATTTCTATTGGAACGGATGGGGTAGCTTCTAAAACTTCTATTCCTTTATCGTTAGTCATTTTTTTGACTTTACCATACGCAGTTCCAGCTATTATAATATCGCCACTTTTTAAAGTACCACGCTGAACTAGCATGGTTGTTAACGCACCTCTTCCTTTTTCGATTTTTGATTCGATCACGACGCCGCTAGCTGATCCGAATGGACTTGCTTTTAAATTTTGCATTTCTGCAATTAATAAAATAGCTTCTTCAAGCTTGCCTAAATTAATTTTTTTAAGTGCCGAGATCGGAATAACCATAACGTCACCACCAGCTTCCTCACCGATAATTTCATACATATAGAGTTCGTTTTTTACACGCTCAATATCAATATCAGGTTTATCAATCTTATTAATGGCAACTATTATAGGAACATTTGCTGCTTTTGCATGGTTAATCGCTTCAACAGTTTGCGGTTTTATACCATCATCTGCTGCAACTACTATGATAACTATATCAGTGACACCTGCCCCTCTTGAACGCATTTCTGAGAAAGCTTCATGACCAGGAGTATCAATAAATGTAATAGCTCTACCATCAGCAAGCGTTACTCTATAAGCCCCGATATGCTGGGTAATTCCCCCTGTCTCACCGGATGCTACATCTGTAGATTTCAGAACATCAAGTAGAGAAGTTTTTCCGTGATCAACATGCCCCATAACTGTAACAACTGGTGCACGTGATCTTAAATCTTCTTCTTTATCATTGGTAATTAAGATATTTTCAACATCCGATTCTTGGACTCTTTTGACAGCATGACCTAGATGGGTAGCTACTAACTCTGCAGTATCTGCATCAATTGTTTGACTAGCATTAGCAAGAATGCCAAGCTTCATTAATTCTTTAATAACATCAGCCACACGCTCAGACATTGCGTTTGCAAAATCACCAACTCCAATAACTTCAGGTAGCGTTATTTCTCTATATACTTTTTCAGGTGCTTGTACTAATGATTTATGCTTTTCTTTTTCTCTTGCCCTTTTTATAGAAGCAAGACTTCTAGTTCTATTTCTATTGTCGTTTTCATCGTCACCAACCATATTAAAGAGGTCAGTCTTTTTAAACTTTCTTGATTCTTCAACTTTAGGTTTTGGTGCAGTTACCTTATTTTCGGTTACTTTATCTACAGTTTTTTCTGATTCTATAACGTAACGTGTTCTAGTTCCTACTAATGGAGACTTTACAAAAATATCCTCTTTCTTTTTAAGAGTTTGAAGTGCAGACTCCTCAGTATCTTTTACTTCTTCTATTTTTGGCTCTTCTTTAACTTTGTTAGTATCGCTGCTTTCTTCTTGCTCAATTTCTATAGGATCTTCTTGTGAAGCAATAGATTGATTAATACTTGCAAGTTTACTTAAAGTACTTATTTGTGAATTATCATTTAATTTTGATTGTTCTGCAGCTTTTTTTAGAATAGATAAGCGTCTGTTAAATTCTTCACTACCACTACTTGAACCAGTTTCTAAACTACCTTTCTCTTTATTTAATGAAAGGGTAGTAGTAGAACCACTAGAGCTTTTTCTAACCTCTACTAATGTTTTCGACTTAGCATTGACAAAATTTTGAGTACTCGCAAGAGAGTCAAAAGACTTGTTAAGTGACAATTTTGTATTGCTAAGTGTCAACTTTTTGGGTTTGTTTTCCTGGTTATCCGTCATATTTAAACCTTTGTGTTTAGTAATAGAACCCTTTGCTAGAGTAATATGGTGTCTTAACTGAAGACCGTCATTGCGAGGAGCGTAGCGACAAAGCAATCTCAGGACATTCTCATGAGATTGCCACACCACTTTCAGCGGCTCGCAATGACGAATATGACACCAAAATTTTTTTATTCTTCTTTTAGCTCGCTATGTTGTTTAGCAGTCTTAATTAATAATTTAATATTTTCATCTGTTATATTAGAATTTGGAGCTAAATTTTTAAATTCATTTACGCTCATTTCACCTAAATCTTCTATGGTCTTAATACCATATTCAGCAAATTTTAGTATTAATTCAGGTTGTATTTCTAATATGTCTATTAAT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51 | Sulfolobus_monocaudavirus(30.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
72135 : 145287
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016305|72135:145287|DBSCAN-SWA 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60 | Catovirus(11.54%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
153690 : 209936
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016305|153690:209936|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(78.57%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
217269 : 525865
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016305|217269:525865|DBSCAN-SWA 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293 | Streptococcus_phage(35.45%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
544623 : 596167
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016305|544623:596167|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016305|544623:596167|557983_558895_-|WP_068041349.1|DBSCAN-SWA MLDTQTQELIIKWQKYLSLQKNYSNHTMISYNNDLKHFLEFMNYYNSDIVTMDYIRAADIRLMRSWLAKRKYDNFVTSSIARGLSAIKNFYKFLEKTAELHNHVVFSIKSPKKSKLLPKALSEEEVNISLDHIEEYGNSQWIEIRNKALLVLIYASGLRISEALWITKLHLQNLEFIKIMGKGNKERIIPWLAIARNLITEYLEKLPYELKDDEPIFRGKQGKKLQPTVFNRELIKLKRFYGLPEHLSAHSFRHSFASHLLENGADLRSIQELYKSLSTTQSYTKTSIKHLETAYVTAHPIKK >NZ_CP016305|544623:596167|554494_555469_-|WP_016948416.1|DBSCAN-SWA MTLEKAVKPVIIGISDTKLTDKEKALLHEHSPLGIALFARNIKTDEKGKQNKEALAQLITDIKEILGENSIIAIDQEGGRVQRLTKPTFYNAPPAKDFGDLAKDQGLEIAIEKCKQNYSNIGKELKALGINLDFAPVGDISHKGAHDVIGNRSFGAEPEIVVPLCIAALEGLQQEKVKGCIKHMPGHGRAKADSHKELPQVNASIEELNETDFKVFKELATFNKIKLAMTAHIVYKSIDANNPATLSPKVIKYIRNEIGYKGLIISNAIEMKALNGDMKDIAKKALEAGVDIVLECTGKLENMVEVLDSVSKISINKFANLLLN >NZ_CP016305|544623:596167|565044_565287_-|WP_068041359.1|DBSCAN-SWA MIKTNGARTRDFLMSTFGCPASEADTIFMSVAIIEAKSGRILWANATPNAQPFIGSIFSSRDKSEIENFHFVINVLLSKL 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50 | Sulfolobus_monocaudavirus(38.46%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
601231 : 647514
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016305|601231:647514|DBSCAN-SWA 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54 | Streptococcus_phage(50.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
655207 : 702335
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP016305|655207:702335|DBSCAN-SWA 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46 | Streptococcus_phage(47.83%) | tRNA,transposase,integrase | attL 644906:644965|attR 683951:684811 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
718852 : 778710
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP016305|718852:778710|DBSCAN-SWA 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51 | uncultured_virus(35.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
783770 : 860230
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP016305|783770:860230|DBSCAN-SWA 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63 | Streptococcus_phage(20.69%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
882824 : 949562
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP016305|882824:949562|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP016305|882824:949562|896045_896855_+|WP_095568311.1|transposase|DBSCAN-SWA MLEEVTAWQNRALDNVYPIMYLDCIHVKARDNHVIINKAVYLAIGVNMDGKKELLGIWIGKNEGCKFWMQVVTELKNRGVAQIYVACVDGLKGFPEAINSIFPKTIVQLCIVHMVRNSVKYVSYKDLKAVTADLKAVYSAINEAEGLRELQNFAKKWDEKYPVIFDIWQRNWSGIAPFFSFPEDIRKAIYTTNAIESTNRQIRKIIKNKGVFPDNKSIQKIIFLALTNASKKWTMPIKNWAMALNQFAILCDTNLQNWANGEIVLTQKI >NZ_CP016305|882824:949562|942901_943339_-|WP_011477847.1|DBSCAN-SWA MTIDITEIMDLIPHRYPFLLVDKVVEIDPNKSITGIKNVTVNEPQFTGHFPARPVMPGVLMVEAMAQLAAILVAKSLGSTKNKEVFLMAIENSKFRKVVQPGDTMHIHATIDQQRANVWKFSSTVKVDGEMAAESKFTAMIKDKS >NZ_CP016305|882824:949562|932998_933475_-|WP_016947897.1|DBSCAN-SWA MKHLKIILAFIIFTCSPIIFAEELDSVTTTEDIENDIFNLINNDPLVLNSNQAISDSTAFKNCDNCEIIALNKTTAKSEKLTFKVGEEQYFGNIKIKIHKCVKNLDPYNEDNYILMTITEYIIDEDPKLLFQGWMTSGSISLSTFENPIYEIFAKECF >NZ_CP016305|882824:949562|907582_908917_-|WP_068041984.1|DBSCAN-SWA 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72 | Streptococcus_phage(47.37%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
985158 : 1014438
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP016305|985158:1014438|DBSCAN-SWA 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32 | Sulfolobus_monocaudavirus(66.67%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
1041606 : 1087314
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP016305|1041606:1087314|DBSCAN-SWA 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63 | Sulfolobus_monocaudavirus(26.32%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_13 |
1091710 : 1132366
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP016305|1091710:1132366|DBSCAN-SWA 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42 | uncultured_virus(38.89%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_14 |
1151650 : 1346267
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP016305|1151650:1346267|DBSCAN-SWA 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170 | Streptococcus_phage(24.56%) | coat,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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