CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP023174	Lactiplantibacillus plantarum strain BDGP2 chromosome, complete genome	1 crisprs	cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL	0	0	8	0
NZ_CP023178	Lactiplantibacillus plantarum strain BDGP2 plasmid pLtBDGP2D, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP023175	Lactiplantibacillus plantarum strain BDGP2 plasmid pLtBDGP2A, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP023177	Lactiplantibacillus plantarum strain BDGP2 plasmid pLtBDGP2C, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP023176	Lactiplantibacillus plantarum strain BDGP2 plasmid pLtBDGP2B, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0

1. NZ_CP023174

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP023174_1

• CRISPR_ID: NZ_CP023174_1
• CRISPR_location: 2107890-2107975
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP023174_1

Consensus_repeat	Method
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP023174_1

>1.1|2107913|40|NZ_CP023174|CRISPRCasFinder
CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023174_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP023174_1

>merge|NZ_CP023174|1|2107890-2107975|CRISPRCasFinder
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATTCGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAATAAGAAACTTAAAGTATCTTATT

>NZ_CP023174|1|1|2107890-2107975|CRISPRCasFinder
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT	CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA
TAAGAAACTTAAAGTATCTTATT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP023174.1|WP_022638459.1|2111664_2112660_+|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_CP023174.1|WP_022638462.1|2097840_2100423_-|SH3-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|119382
NZ_CP023174.1|WP_044432936.1|2108712_2109594_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238558
NZ_CP023174.1|WP_022638460.1|2106396_2107875_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|129794
NZ_CP023174.1|WP_003642340.1|2100708_2100993_+|DUF1905-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378097
NZ_CP023174.1|WP_003642355.1|2114583_2115330_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674
NZ_CP023174.1|WP_003642358.1|2116958_2117339_+|MerR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|133384
NZ_CP023174.1|WP_003643401.1|2112903_2113416_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|274100
NZ_CP023174.1|WP_011102039.1|2101276_2101642_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224647
NZ_CP023174.1|WP_003642346.1|2105326_2106280_-|aldo/keto-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381318
NZ_CP023174.1|WP_022638457.1|2115346_2115802_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|100047
NZ_CP023174.1|WP_011102040.1|2102661_2103228_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP023174.1|WP_022638458.1|2113396_2114290_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187572
NZ_CP023174.1|WP_022638461.1|2103354_2104392_+|aldehyde-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187538
NZ_CP023174.1|WP_003642345.1|2104540_2105107_-|DUF1211-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226078
NZ_CP023174.1|WP_003642350.1|2109878_2110673_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224045
NZ_CP023174.1|WP_011102046.1|2116111_2116948_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|212492
NZ_CP023174.1|WP_003643398.1|2107992_2108592_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP023174.1|WP_003642338.1|2096157_2097570_+|NAD-dependent-succinate-semialdehyde-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|143418
NZ_CP023174.1|WP_003642342.1|2101774_2102503_+|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP023174.1|WP_022638459.1|2111664_2112660_+|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	2.20451e-78
NZ_CP023174.1|WP_022638462.1|2097840_2100423_-|SH3-domain-containing-protein	gnl|CDD|119382	cd06522, GH25_AtlA-like, AtlA is an autolysin found in Gram-positive lactic acid bacteria that degrades bacterial cell walls by catalyzing the hydrolysis of 1,4-beta-linkages between N-acetylmuramic acid and N-acetyl-D-glucosamine residues. This family includes the AtlA and Aml autolysins from Streptococcus mutans which have a C-terminal glycosyl hydrolase family 25 (GH25) catalytic domain as well as six tandem N-terminal repeats of the GBS (group B Streptococcus) Bsp-like peptidoglycan-binding domain. Other members of this family have one or more C-terminal peptidoglycan-binding domain(s) (SH3 or LysM) in addition to the GH25 domain.	2.40303e-70
NZ_CP023174.1|WP_044432936.1|2108712_2109594_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|238558	cd01138, FeuA, Periplasmic binding protein FeuA. These proteins have predicted to function as initial receptors in ABC transport of metal ions in some eubacterial species. They belong to the TroA superfamily of periplasmic metal binding proteins that share a distinct fold and ligand binding mechanism. A typical TroA protein is comprised of two globular subdomains connected by a single helix and can bind their ligands in the cleft between these domains.	2.72098e-56
NZ_CP023174.1|WP_022638460.1|2106396_2107875_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit	gnl|CDD|129794	TIGR00711, Uncharacterized_MFS-type_transporter_YhcA, drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily. This subfamily of drug efflux proteins, a part of the major faciliator family, is predicted to have 14 potential membrane-spanning regions. Members with known activities include EmrB (multiple drug resistance efflux pump) in E. coli, FarB (antibacterial fatty acid resistance) in Neisseria gonorrhoeae, TcmA (tetracenomycin C resistance) in Streptomyces glaucescens, etc. In most cases, the efflux pump is described as having a second component encoded in the same operon, such as EmrA of E. coli. [Cellular processes, Toxin production and resistance, Transport and binding proteins, Other].	1.10264e-72
NZ_CP023174.1|WP_003642340.1|2100708_2100993_+|DUF1905-domain-containing-protein	gnl|CDD|378097	pfam08922, DUF1905, Domain of unknown function (DUF1905). This domain is found in a set of hypothetical bacterial proteins.	1.07383e-22
NZ_CP023174.1|WP_003642355.1|2114583_2115330_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	2.40011e-91
NZ_CP023174.1|WP_003642358.1|2116958_2117339_+|MerR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|133384	cd01109, HTH_YyaN, Helix-Turn-Helix DNA binding domain of the MerR-like transcription regulators YyaN and YraB. Putative helix-turn-helix (HTH) MerR-like transcription regulators of Bacillus subtilis, YyaN and YraB, and related proteins; N-terminal domain. Based on sequence similarity, these proteins are predicted to function as transcription regulators that mediate responses to stress in eubacteria. They belong to the MerR superfamily of transcription regulators that promote transcription of various stress regulons by reconfiguring the operator sequence located between the -35 and -10 promoter elements. A typical MerR regulator is comprised of distinct domains that harbor the regulatory (effector-binding) site and the active (DNA-binding) site. Their N-terminal domains are homologous and contain a DNA-binding winged HTH motif, while the C-terminal domains are often dissimilar and bind specific coactivator molecules such as metal ions, drugs, and organic substrates.	8.88832e-19
NZ_CP023174.1|WP_003643401.1|2112903_2113416_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|274100	TIGR02366, conserved_hypothetical_protein, probable dihydroxyacetone kinase regulator. The seed alignment for this family was built from a set of closely related uncharacterized proteins associated with operons for the type of bacterial dihydroxyacetone kinase that transfers PEP-derived phosphate from a phosphoprotein, as in phosphotransferase system transport, rather than from ATP. Members have a TetR transcriptional regulator domain (pfam00440) at the N-terminus and sequence homology throughout.	3.33884e-08
NZ_CP023174.1|WP_011102039.1|2101276_2101642_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224647	COG1733, COG1733, Predicted transcriptional regulators [Transcription].	1.16334e-31
NZ_CP023174.1|WP_003642346.1|2105326_2106280_-|aldo/keto-reductase	gnl|CDD|381318	cd19092, AKR_BsYcsN_EcYdhF-like, Bacillus subtilis YcsN, Escherichia coli YdhF and similar proteins. Bacillus subtilis YcsN and Escherichia coli YdhF are prototypes of this family. They are uncharacterized aldo/keto reductase family oxidoreductases.	5.65843e-131
NZ_CP023174.1|WP_022638457.1|2115346_2115802_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|100047	cd03357, LbH_MAT_GAT, Maltose O-acetyltransferase (MAT) and Galactoside O-acetyltransferase (GAT): MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively at the C6 position of the nonreducing end glucosyl moiety. GAT specifically acetylates galactopyranosides. Furthermore, MAT shows higher affinity toward artificial substrates containing an alkyl or hydrophobic chain as well as a glucosyl unit. Active MAT and GAT are homotrimers, with each subunit consisting of an N-terminal alpha-helical region and a C-terminal left-handed parallel alpha-helix (LbH) subdomain with 6 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X).	4.35635e-53
NZ_CP023174.1|WP_011102040.1|2102661_2103228_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	7.31502e-05
NZ_CP023174.1|WP_022638458.1|2113396_2114290_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|187572	cd05262, SDR_a7, atypical (a) SDRs, subgroup 7. This subgroup contains atypical SDRs of unknown function. Members of this subgroup have a glycine-rich NAD(P)-binding motif consensus that matches the extended SDRs, TGXXGXXG, but lacks the characteristic active site residues of the SDRs. This subgroup has basic residues (HXXXR) in place of the active site motif YXXXK, these may have a catalytic role. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	2.26987e-130
NZ_CP023174.1|WP_022638461.1|2103354_2104392_+|aldehyde-reductase	gnl|CDD|187538	cd05227, AR_SDR_e, aldehyde reductase, extended (e) SDRs. This subgroup contains aldehyde reductase of the extended SDR-type and related proteins. Aldehyde reductase I (aka carbonyl reductase) is an NADP-binding SDR; it has an NADP-binding motif consensus that is slightly different from the canonical SDR form and lacks the Asn of the extended SDR active site tetrad. Aldehyde reductase I catalyzes the NADP-dependent reduction of ethyl 4-chloro-3-oxobutanoate to ethyl (R)-4-chloro-3-hydroxybutanoate. Extended SDRs are distinct from classical SDRs. In addition to the Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet) core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids. Extended SDRs are a diverse collection of proteins, and include isomerases, epimerases, oxidoreductases, and lyases; they typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	1.1504e-93
NZ_CP023174.1|WP_003642345.1|2104540_2105107_-|DUF1211-domain-containing-protein	gnl|CDD|226078	COG3548, COG3548, Predicted integral membrane protein [Function unknown].	5.75015e-29
NZ_CP023174.1|WP_003642350.1|2109878_2110673_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224045	COG1120, FepC, ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components [Inorganic ion transport and metabolism / Coenzyme metabolism].	5.60764e-114
NZ_CP023174.1|WP_011102046.1|2116111_2116948_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|212492	cd05327, retinol-DH_like_SDR_c_like, retinol dehydrogenase (retinol-DH), Light dependent Protochlorophyllide (Pchlide) OxidoReductase (LPOR) and related proteins, classical (c) SDRs. Classical SDR subgroup containing retinol-DHs, LPORs, and related proteins. Retinol is processed by a medium chain alcohol dehydrogenase followed by retinol-DHs. Pchlide reductases act in chlorophyll biosynthesis. There are distinct enzymes that catalyze Pchlide reduction in light or dark conditions. Light-dependent reduction is via an NADP-dependent SDR, LPOR. Proteins in this subfamily share the glycine-rich NAD-binding motif of the classical SDRs, have a partial match to the canonical active site tetrad, but lack the typical active site Ser. This subgroup includes the human proteins: retinol dehydrogenase -12, -13 ,and -14, dehydrogenase/reductase SDR family member (DHRS)-12 , -13 and -X (a DHRS on chromosome X), and WWOX (WW domain-containing oxidoreductase), as well as a Neurospora crassa SDR encoded by the blue light inducible bli-4 gene. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet), an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Classical SDRs are typically about 250 residues long, while extended SDRs are approximately 350 residues. Sequence identity between different SDR enzymes are typically in the 15-30% range, but the enzymes share the Rossmann fold NAD-binding motif and characteristic NAD-binding and catalytic sequence patterns. These enzymes catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser (Ser-138, 15-PGDH numbering) and/or an Asn (Asn-107, 15-PGDH numbering) contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Extended SDRs have additional elements in the C-terminal region, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif. Some atypical SDRs have lost catalytic activity and/or have an unusual NAD(P)-binding motif and missing or unusual active site residues. Reactions catalyzed within the SDR family include isomerization, decarboxylation, epimerization, C=N bond reduction, dehydratase activity, dehalogenation, Enoyl-CoA reduction, and carbonyl-alcohol oxidoreduction.	1.88105e-54
NZ_CP023174.1|WP_003643398.1|2107992_2108592_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	4.95133e-09
NZ_CP023174.1|WP_003642338.1|2096157_2097570_+|NAD-dependent-succinate-semialdehyde-dehydrogenase	gnl|CDD|143418	cd07100, ALDH_SSADH1_GabD1, Mycobacterium tuberculosis succinate-semialdehyde dehydrogenase 1-like. Succinate-semialdehyde dehydrogenase 1 (SSADH1, GabD1, EC=1.2.1.16) catalyzes the NADP(+)-dependent oxidation of succinate semialdehyde (SSA) to succinate. SSADH activity in Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is encoded by both gabD1 (Rv0234c) and gabD2 (Rv1731). The Mtb GabD1 SSADH1 reportedly is an enzyme of the gamma-aminobutyrate shunt, which forms a functional link between two TCA half-cycles by converting alpha-ketoglutarate to succinate.	0
NZ_CP023174.1|WP_003642342.1|2101774_2102503_+|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	1.6523e-89

Protein sequences

>NZ_CP023174.1|WP_022638460.1|2106396_2107875_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit
MQAKAKISKATMTIAWVVVFGAMAPLLDSTMINIAINNLVTSFHSSVTTVQWAVTGYLLATGVAVPFSSWLLNRFDGKAVFVAGEILFGLGSIFAAVAPNIQLLIIARLVQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAVMGQMMATVGLPMILGPLIGPVIGGIIIKFASWHWIFWINVPVVLISIALILWKMPNYPAQNRTAKMDFIGILLLIVSSSAIIYSLVNAAHTDRFNNATSIEMLILGAIALISYVVWAAWQKERAVVPLHLFKFASFDGAGLGLFIAGTVLNGAMLLLPLYFQNVRGMSVINAALALLPQGAGMLVSRTLTGRLTDQIGAKYVVLGSVVITFVGTLPFYWFGQQTSYWILALILFVRGIGAGGILMPLMADAYTGMQPGQVPAATIGTRIIQNIGSAFGSALITTIVTAYSTHQVNVFERHLKAETYHVDAAHLQVFTTSHLQAIRLAAFQQGFLVIAIAAIVIILPTLLLTNKLKAAK
>NZ_CP023174.1|WP_003642346.1|2105326_2106280_-|aldo/keto-reductase
MKTIQIGASQLKASAVALGIMRMVRLDTDAAANVLETVHDRGVNFIDSADIYGNGDSERIFGQALKQSSLKREDFFIQSKGGIVLDPEKSSGELVFGQRYDFSKQHLIATVDKILQRMQLDYLDSFLLHRPDPLMDPAEVAAAFDELQATGKVRHFGVSNFNPMQVEMLQAAVSQKLMINQLQFGVMHTGPIQFGLHTNMQDTASLNHDGEIIEYSRLHHMTIQAWSPYQYGMFAGTFIDNPKFPELNAKLQELADQYHVTKNAIATAWILRHPANMQVILGSMNPQHLDESIAGTDVTLTRQEWYDVYFAAGNDLP
>NZ_CP023174.1|WP_003642345.1|2104540_2105107_-|DUF1211-domain-containing-protein
MNKARLEAFTDAIIAIVLTLLVLDLPRPQTPSVRALFAEWQSIYVYIITFTLLISIWLNHHDLFVQVKKIDRVVFWANSFWLLCQSFIPFMASWITKFPHSKWPAVFYILTGFVWMLAYQLLVAAVRRLNPHIHRMSSPALSVVFGGFLVVLTVALINPDVGLFLIPVHAFASVILATKRKWHLRKYF
>NZ_CP023174.1|WP_022638461.1|2103354_2104392_+|aldehyde-reductase
MQKQLVVVTGGSGFIAIHIIRQLLQQGYAVRTTVRSLAKAPVIKEMLTNGGITDLSALEIVVADLAHDEHWSEAMAGATYAIDVASPTPKLNFKNKAEMIRPAVDGVRRVLTASRDAGVKRVVLTSAYGAIFAGHKNRTTPYTEADWSDLNWKAIHPYQESKTRAELAAWDFINHEGRGLELTTVNPVAVMGPVSSAKYSHSNIQIQQFLEGQVKAVPNVDSGYVDVRDVASLHLLAMTAPQANGERFLATTGETLSMLDVANVLRQAFPAFASQLPTKTIPNAAVKLAAKARPELRMVASLVGTYAETSNHKAQTLLDWHPRPAAESIIATAQSMIDLGIVTKP
>NZ_CP023174.1|WP_011102040.1|2102661_2103228_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
MAATNHAQAIKKDSQTYLTTALLQLLRTHDLDTITVTQVVKRAGVSRMAFYRNFTTLEDLLTAYFAPAIAARFQDVLQHVPANRKLLAMGQFFSDFAPTLRLAEQRGFENIIQQLFNANMTNYYQATMTNGMLTAVQLKYWTRFMSAGVYAIWREWLLGGQLESLTTIHEILATLQTATMQALTQAQK
>NZ_CP023174.1|WP_003642342.1|2101774_2102503_+|SDR-family-oxidoreductase
MKPLVVITGASSGFGAEIAKLFAADNYPLLLLGRRQAKLAALSANFENAMIDTVDVTNYHQFETAVRKAEAKYGKTDLLVNNAGLMLLGNVQNQDPQEWQTMLNTNVMGVLNGTQIVLNDMRDREHGTILNMSSLAGKKTFVNHAAYVASKFGVHGLSETLREENAPKNVRVMLVAPGAAETELLTHVTSKSALSDYEAWKASMGGLTLDPKHVAATVKFMYDMPQNVNIREVDIAATAQDA
>NZ_CP023174.1|WP_011102039.1|2101276_2101642_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
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>NZ_CP023174.1|WP_003642340.1|2100708_2100993_+|DUF1905-domain-containing-protein
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>NZ_CP023174.1|WP_022638462.1|2097840_2100423_-|SH3-domain-containing-protein
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>NZ_CP023174.1|WP_003642338.1|2096157_2097570_+|NAD-dependent-succinate-semialdehyde-dehydrogenase
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>NZ_CP023174.1|WP_003643398.1|2107992_2108592_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
MTKTRRRGAELENAIYQAARDILNQDGLEQLTFANVAEQAGTSKPVIYRRWRSPLELAIAAIQDQIITENHGQLDEVSLTGQTLSEDLFQVLKRFTVSINTFNQALVITWFHHLDQQANPEVKDLLNAVKKIDAHAIERVCQRAQQRGELRTGTLSCDLQLMPFDWLRYRAFANEPITDATLHLLVDDLLVPAYQHALG
>NZ_CP023174.1|WP_044432936.1|2108712_2109594_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MGSLLLGACGAKQPTSTTVTRTDYLKHKVKVPKHPKRIVASYLEDDLVALGIKPVVQWSVKNGSGTQAYLKEQLKGVPLIDYSLPYEAVTKAKPDLILIGTSSAVANGKYAQYNKIAPTYVVKNGTTVTWRQTFLDVAKVVNRQAKAKKVLAKYDKQVQTTRQALKKSGQHKVAVLWVTNNTAYMVNDNSASGALLYQDLQLGEPSLVKQVSKSATADWSAVSLEKLAKLDADDIFLVNSQKSASLFKDPLWKNIKAVKNNHLYQYGDSSSWQYSGPIAYSQMIDMVKTDLLK
>NZ_CP023174.1|WP_003642350.1|2109878_2110673_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MNTIEAQNISIGYGDKVIVDQLSITIPHGQITTLIGPNGSGKSTLIRAIAHLLPPTTGVILLDHQNIQQIKSKTFAKKIAVLPQTNQTANDLTVEELVSFGRLPYRRPLSGLTTTDHQKIEWALTQASLQDLRQRPLSTLSGGQRQRAWIAMAVAQDTDTIILDEPTTYLDLTHQLEVMQLVKKLNEQAHRTIIMALHDLNHAARISDQLIALKDGHVLAHGPVSTVMTAANLKTIFNIDATLVDYHGTPLILTYNGCQEVAPA
>NZ_CP023174.1|WP_022638459.1|2111664_2112660_+|iron-ABC-transporter-permease
MSPNRRLIIWSLLLTASMLGLAILNLSTGTMTISWPALLGILTSRGNATDMLVLVNFRLPRIVLAIMVGWALALSGNVLQTVTNNPMADPSLLGINNGAGLAVMLLIIGAGTNASLTLSLPIVALAGAWLSTALIFLLANQRQRGISSKRLLLVGVALSGCFSALMVLMTLKLSPDNYQFVMNWLAGSLWGTDWSYIGWALPWLAVGSGILFIQLPVLDAFTLDTTTAQTLGINLKRQQLGLISVAAMLAGVSVAISGGISFIGLITPNLARRIVGSRQRYQLPLAGLLGSTLLLAADTLGKLITTTTELPAGVLVALIGAPYFIYLLVRG
>NZ_CP023174.1|WP_003643401.1|2112903_2113416_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
MANQRNQRMQATILLAYENLLSDKPFRKITVQDISDAALVHRSTFYKHFQDQYDLLEALFEQKRQQSKLTIDQIFTHPFETLNSFGNARFQETLRHQFNDDAFRDAFLNYLIHLCKDTVDDDQRLVRFLAVGRIKGLTLWITVGNAPYNIFTDTATLDNIFSNPLNTVNY
>NZ_CP023174.1|WP_022638458.1|2113396_2114290_-|SDR-family-oxidoreductase
MKVFITGGTGFVGSAVVQELVANGFEVVGLARSETSAQKLISWGAQPVRGSLTSLSTLATAAAQADAIIHLGFNNDFRYFFQAGAMDRRAIETMGRAISGTNKPLVVTYGTTGIRKHVETEHEVADTGLLKWLTPRKSEIVARQLMAQNINAFVVRLSPAVHGAGDMGFTRTVIERAKKSHRAEYFGLGTHAWSAVHRLDAAHLFYLVTMYGLEHPTTNERVFNAVAEESITIAAIARTISRKLNVPLKAKYNPLSFGDTAMLYLINCPTSSQLTRQILGWVPVQPDLLTDISSSRY
>NZ_CP023174.1|WP_003642355.1|2114583_2115330_-|SDR-family-oxidoreductase
MSIKGKVVVITGASSGIGAATAKLLAAKGAKVVLGARREERLQALSQAIGDNAVYQVTDVTDRQQVRALIDLAVSKFGRVDVLYNNAGTMPQGNLSDREYDKWQMMLNVNIMGVLNGIGEVLPIMQKQHDGLIIATDSVAGHVVYPASAVYNGTKYAVRAIMEGLRQEEKEHGIRSTIVSPGAVRTELVNTIGNTQIQAGISELMNADDRQGLALNPEDIANAVLFAIDQPKHVAISEVLVRPAQQEV
>NZ_CP023174.1|WP_022638457.1|2115346_2115802_-|hypothetical-protein
MNVTREPSEIRERLAEITGQTIDISVEIRVPLWTDYGRNLKIGKRVFINDNVQITDLGGIKLADDVLIGPGAMLLSVNHPLDPAKRHAVEVQPIHIERNAWIGAGAKVLAGVTVGENAVVGAGAVVTKSVPANTVVAGVPAKVIKTIEQVD
>NZ_CP023174.1|WP_011102046.1|2116111_2116948_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase
MQSKLAVIIGGTSGVGKHTAIDLANQNYHVIIVGSRADKGRQAQADISQATGNQAVQLALADLSTKTGVQQFAHQLAAMTDHIDILLNSIGVILPERHLSADGYDLNLVLNYLTHFWTIQALLPLLKHSDQARILLVGALPFVINHAKVSLPDFDAPATSKYNAMTVTAQATAARVLLTLALSERLTATNVTINIFHPGYVPDSNFGAGGSWVSRLAGRILGESFSRKNSPIGAWLATAPELTHTSGHFYDDRLRQVRLSKQYTRSKANDLWRLSSQY
>NZ_CP023174.1|WP_003642358.1|2116958_2117339_+|MerR-family-transcriptional-regulator
MLTFKIPEQQHYFTTKEVTAMTGMTKDALRYYEHLGILPDVQRNQYNYRQYSHKNLETLQLIKIFRDLDLDLSLLTPAHLALDGQAKVVAFKQYQQVIRDRIRHLEAIDQLLATKIDYFEHQSIDT

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
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DBSCAN-SWA_2	1159741 : 1226695	74	Lactobacillus_phage(79.49%)	portal,integrase,tail,holin,capsid,terminase,protease,head,tRNA	attL 1181308:1181324|attR 1220968:1220984
DBSCAN-SWA_3	1386699 : 1470263	94	Lactobacillus_phage(73.33%)	portal,integrase,tail,capsid,terminase,protease,head,tRNA	attL 1414942:1414958|attR 1463577:1463593
DBSCAN-SWA_4	1500413 : 1572975	83	Lactobacillus_phage(60.61%)	portal,integrase,tail,capsid,transposase,terminase,head	attL 1543947:1543962|attR 1578876:1578891
DBSCAN-SWA_5	1758268 : 1766779	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_6	2617162 : 2677858	50	Streptococcus_phage(17.65%)	portal,integrase,terminase,capsid,head,tRNA	attL 2626533:2626549|attR 2672910:2672926
DBSCAN-SWA_7	2942228 : 3045970	96	Staphylococcus_phage(14.29%)	bacteriocin,transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	3185259 : 3275141	102	Lactobacillus_phage(54.0%)	portal,integrase,tail,holin,terminase,capsid,protease,tRNA	attL 3191864:3191879|attR 3229436:3229451

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP023174|182150:296589|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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178392:178405	attL	NA	NA	NA	NA
WP_003644097.1|182150_182939_+|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
178392:178405	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_022638235.1|189337_191296_+	AAA family ATPase	A8ATK7	Listeria_phage	4.1e-72	33.5
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WP_095762359.1|192385_193144_+	MBL fold metallo-hydrolase	A0A0H4TGC9	Bacillus_phage	4.8e-53	42.3
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WP_022638231.1|194108_194609_+	hypothetical protein	O03915	Lactobacillus_phage	9.4e-58	67.9
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WP_022638228.1|195331_195562_+	hypothetical protein	O03916	Lactobacillus_phage	1.2e-20	56.6
WP_022638227.1|195564_196011_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
195564:195577	attR	NA	NA	NA	NA
WP_152520223.1|195950_196202_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
195564:195577	attR	NA	NA	NA	NA
WP_022638225.1|196218_197289_+	DNA cytosine methyltransferase	A0A2H4PBE1	Lactobacillus_phage	3.6e-123	58.3
WP_022638224.1|197355_197514_+	hypothetical protein	O03920	Lactobacillus_phage	6.9e-15	78.8
WP_054598403.1|197529_197955_+	hypothetical protein	K4I239	Lactobacillus_phage	8.1e-34	55.8
WP_022638825.1|198027_198225_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054598399.1|198221_198638_+	hypothetical protein	E9LUP3	Lactobacillus_phage	2.7e-34	53.3
WP_022638323.1|198634_198802_+	hypothetical protein	E9LUP4	Lactobacillus_phage	8.1e-14	89.1
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WP_022638318.1|200795_201059_+	hypothetical protein	Q5ULN6	Lactobacillus_virus	4.8e-29	68.6
WP_022638317.1|201098_201968_+|terminase	terminase small subunit	V5URT8	Oenococcus_phage	4.2e-53	46.0
WP_022638316.1|201951_203238_+|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	A0A2H4IYR5	uncultured_Caudovirales_phage	2.8e-114	50.4
WP_022638315.1|203227_204886_+|portal	phage portal protein	D2IZF6	Enterococcus_phage	9.7e-67	33.3
WP_022638314.1|204885_205830_+|capsid	minor capsid protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638313.1|205938_206586_+	DUF4355 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638311.1|207688_208054_+|head,tail	phage head-tail connector protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638310.1|208058_208382_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_022638305.1|210511_210748_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_095762363.1|210747_214983_+	tape measure protein	E9LUR1	Lactobacillus_phage	6.1e-65	34.8
WP_063491256.1|214992_215889_+|tail	phage tail family protein	A8ATA8	Listeria_phage	1.0e-17	28.2
WP_187337712.1|215888_217067_+|tail	phage tail protein	Q9T1A5	Listeria_phage	6.3e-20	24.5
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WP_063491253.1|217310_217601_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_187344837.1|217601_219761_+	hypothetical protein	M4ZSB3	Bacillus_phage	3.8e-39	33.6
WP_063845630.1|219772_220084_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_095762365.1|220083_220233_+	XkdX family protein	U5U4L4	Lactobacillus_phage	2.7e-05	56.8
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WP_095762369.1|221984_222158_+	XkdX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_095762371.1|222246_223419_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	E9LUR8	Lactobacillus_phage	1.5e-199	89.7
WP_063491248.1|223419_223716_+	hypothetical protein	A0A2K9VCD4	Lactobacillus_phage	1.2e-36	71.4
WP_063491247.1|223702_224077_+|holin	holin	A0A2K9VCG4	Lactobacillus_phage	3.3e-15	63.8
WP_063491246.1|224308_225223_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003646619.1|226002_226194_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642761.1|226598_228593_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.2e-32	41.3
WP_003642762.1|228610_230188_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003642763.1|230159_231923_+	ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	4.8e-96	40.9
WP_003639252.1|232862_233006_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101805.1|233528_233672_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063491245.1|234359_236909_+	MucBP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_013355761.1|237008_238985_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642771.1|239039_239525_+	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_022638133.1|239573_239846_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642773.1|239870_240104_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642774.1|240516_240723_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638132.1|241073_242195_-|integrase	site-specific integrase	D6PSS4	Lactobacillus_phage	8.4e-46	32.1
WP_022638131.1|242301_243180_-	DUF3037 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638130.1|243143_244169_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642778.1|244366_244543_-	hypothetical protein	A0A2P0ZL93	Lactobacillus_phage	2.6e-10	51.7
WP_022638129.1|244918_245200_-	antibiotic biosynthesis monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_022638128.1|245230_245590_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_021356373.1|245616_245994_-	large-conductance mechanosensitive channel protein MscL	NA	NA	NA	NA
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WP_022638126.1|247038_248118_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013355756.1|248801_249521_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013355755.1|249627_250050_-	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	A0A0S2SXM3	Bacillus_phage	3.0e-12	35.1
WP_013355754.1|250064_250568_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	S6C481	Thermus_phage	1.7e-22	42.6
WP_033099030.1|250713_250968_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_013355753.1|251024_251339_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101085.1|251376_251613_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0K2CNE2	Brevibacillus_phage	8.5e-09	30.7
WP_011101086.1|251759_251960_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003642792.1|252118_252289_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642793.1|252300_252606_+	DUF771 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638124.1|252673_253186_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	D6PST4	Lactobacillus_phage	2.0e-23	39.4
WP_022638122.1|253556_253937_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638121.1|253939_254827_+	recombinase RecT	E9LUM3	Lactobacillus_phage	4.6e-63	53.3
WP_161325284.1|254858_255611_+	PD-(D/E)XK nuclease-like domain-containing protein	A0A0P0IZH9	Lactobacillus_phage	6.3e-74	52.2
WP_003642799.1|255689_256598_+	DnaD domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638119.1|256594_256882_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638118.1|256878_257397_+	hypothetical protein	O03915	Lactobacillus_phage	1.9e-53	68.4
WP_022638117.1|257393_257774_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_022638116.1|257984_258446_+	hypothetical protein	D6PSV8	Lactobacillus_phage	4.1e-39	57.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP023174|1159741:1226695|DBSCAN-SWA
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MELTIKGTPEEIKKLLAIDGSEKQSELLKIVKQIREDHRPFTHKELQKIRNQY

Homologous phage analysis in the prophage region

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1181308:1181324	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_187344839.1|1207083_1207230_-	hypothetical protein	E9LUP6	Lactobacillus_phage	6.8e-17	89.6
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WP_022638754.1|1210361_1210520_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLB5	Lactobacillus_phage	3.9e-18	92.3
WP_022638753.1|1210512_1210821_-	hypothetical protein	E9LUN7	Lactobacillus_phage	1.7e-49	96.1
WP_095762396.1|1210956_1211742_-	ATP-binding protein	E9LUN6	Lactobacillus_phage	1.4e-132	91.2
WP_068874454.1|1211741_1212458_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0P0I7Q1	Lactobacillus_phage	1.2e-32	39.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_022638740.1|1448032_1448785_-	phage antirepressor KilAC domain-containing protein	E9LUT0	Lactobacillus_phage	6.4e-58	96.5
WP_022638739.1|1448797_1449013_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638738.1|1449272_1449602_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0P0IZG9	Lactobacillus_phage	1.8e-12	38.7
WP_033607910.1|1449632_1450022_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	D6PSS8	Lactobacillus_phage	7.1e-37	55.8
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WP_022638735.1|1450666_1450867_+	hypothetical protein	E9LUS6	Lactobacillus_phage	3.2e-25	98.5
WP_022638734.1|1451317_1452499_+|integrase	site-specific integrase	B4XYR4	Lactobacillus_phage	1.2e-58	37.4
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WP_003638174.1|1455281_1455482_-	cold-shock protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	3.1e-20	71.4
WP_003641352.1|1455825_1456191_+	DUF4828 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_013355365.1|1456346_1457123_-	lysozyme	A0A141HSE6	Bacillus_phage	2.6e-06	31.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

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MEQFPNFKLFIDKYLPWLAVIGFVVTVSVNGNVWLYFMSVLIIFVVVAIIDLLFKYWNHAKILGIMIVLLVLGLWLNR

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003641313.1|1505056_1506439_-	class II fumarate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_013355355.1|1506931_1507168_-	flagellar biosynthetic protein FlhB	NA	NA	NA	NA
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WP_003644111.1|1509031_1509946_-	citrate (pro-3S)-lyase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_003641303.1|1509945_1510236_-	citrate lyase acyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_095762412.1|1510225_1511281_-	[citrate (pro-3S)-lyase] ligase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP023174|1758268:1766779|DBSCAN-SWA
CTTAAATTGCTCCTTCATTAATGAGTGTCTGTAATACATCTGGATAAAATTGGTGTTCACAATCATGAATCCGGGTCGCCAGGCTGGCTAGCGTATCGTCTGGTGCAACCGGAACGACCCGCTGGGCAATAATTTGCCCGGTATCGATTCCGGCATCGATATAGTGAATGGTAACGCCCGTCTCAGTCACACCAGCGGCAAAAGCATCCTCGATGCCGTGACGACCAGGAAACTTTGGTAACAATGCTGGGTGAATATTGATGATTTTATGAGCATACGCATTCAAGAGGGTCGGACCAATAATGCGCATGTACCCGGCCAATAATACCAGTTCAATTTGCCGTGCTTGCAAGGCCGTCAAAATGATTGCTTCCGCGGCCGCTTTATTCGCATAATCATGAAAATCAACAATTAATATCGGTACGTTAGCTGCCCGGGCCTTGTCAATTACCGGCGCTGTCGGTTGATCACACACAAGTAACCCAATCACTACCGGTAATTGTCGTTCAATAATCGCTTGGTGGAGTGCAACAAAGTTGGTGCCATTACCCGAAGCAAATACTGCAATTTTATTAGGCATGCTCAGCCTCCTCAAAAACGACGGGTGTCGTACCAGTTTGGACTGTTCCAACTCGATAATAGGACTGAGCGTTGGCCGTCAAATTAGCCGTCACAGCTGCCACTTGGTCGGGGTGAACGATCAGAACCATTCCCAAGCCCAGGTTAAAGGTCGACCGAAGATCCGTAGCAGTCAGCCCACCGAGTTCGGCCAATAACGTCATAATTGGCGGTACCGGCCATTGACCCAATTCAAGGTGCGCACTCAAGCCCGCCGGTAACGCTCTGGCGACGTTCTCAATCAAGCCGCCCCCGGTAATGTGGGCGATACTCGTCACTAATTTCTGCTGTAACAATGGTTGAACTGCATCAACGTAAATGGTCGTTGGTCGTAAAATTTCCGTTTGTAAATCATGACCAAGTTCGTCAAAAACCGTGGTCAATTGGTAGTCGTGTTGTTTGAATAAAATATCACGAACTAGACTAAACCCATTCGAGTGGAGGCCATTAGACGGCAACCCAATCAAGACGTCCCCAGCCCGAACATTTGCTGGTGATAACAGGTCCGCGCGGTTCGCAATTCCGACCGCAAAACCAGCGAGGTCGTAATGGTCCTGACCATACATATCGGGCATCTCCGCAGTCTCGCCACCAATCAACGCTGTATGGGCCTGCTGACAGCCCGCGACAACGCCAGTCAAAATGGCTTTGACCCGCTTCTGGTCCGTATGTCCAAGACCTAAGTAATCTAAAAAGAACTGGGGGGTCGCGCCTTGTGCCAAAATATCATTCACACACATTGCGACCAAGTCAATTCCAATCGTGGTATGTTGATCAGCAGCGATTGCGACTAAGAGCTTAGTCCCCACACCATCCGTCCCCGCTACTAACACGGGATCGTTGGCAGTTGCATCCGGACTAAGTGGAAACGCTCCCCCAAACGCGCCTAATTGCTGATTACCACTCATTTGTTTGACCGTCTTTAAGACGTCGTAACCAGCGTTGATATCAACGCCAGCCCGCTTATACGCATCGCTCACTTGATCACCCCTTCATGATTGGCTTGTAATTGCGCAATTTCCGCATCATACTCGGCTTGGTAATCATACAGGGCCGTTGGATAATCCCCATTAAAATAGGCCATGCATAGTCCACCATACGGTTCGGTGGTCGACAAGCCAACTGCATCAACGACGCCCTGTTCACTGAGAAAACCAAGTGAGTCCGCACCAAACGTCTGACACATCTCCCGAATCGTTTGCTGAGCCGCAATCAATTCATTAGTCGATTGAATATCGATACCGTAAAAACATGGATAGCGTAATGGTGGCGATGCAATTCGTAAATGAACTGACTTTGCACCCGCATCTTTCAATAATTTGACGATCCGCCGACTGGTGGTACCACGTACAATCGAATCATCGATTAAGACGACTCGTTTACCAGCGACAACACCTTTGACCGCTGAAAGCTTCATCCGAACCCCCTGTTCTCGCAATGCTTGGGTCGGCTGAATAAAGGTCCGTGACGAATATTGATTTTTAATTAATCCCATCTCGTAAGGCAGGCCACTCGCTTCCGCATAGCCGGTCGCCGCTGATAAAGATGAATTGGGTACCCCGACAACAATGTCGGCGTCCACGGGCTGTTCAACAGCGAGCTGAGCACCCATTCGTTTACGTGCAGAATGGACGTTGACGCCGTGAATATCAGAATCTGGACGTGCAAAGTAGATAAACTCCATTGAACAAATCGCCAACTGTGTATCAGTCGTATAATGGTCGATCGTCAAACCATGATCATCGATCGTTAACAATTCTCCCGGCTGAACATCTTGAACAAACGTCGCACCAATCGTATCAAGCGCGCAAGTTTCACTACAAACGACGTACCCGCCCGTGGGTAACTGACCGACGACTAATGGTCGTAACCCGTTAGGATCCAAAGCGGCAATCAAACAATCATTCGTTAGTAGTAAGTAAGCAAAGCCTCCGTGGACTTGACGTAAAGCATCCTTAACCTGTTCCGTTAACGTTGCTGCGGGGCTGCGTCGAATCAGATGCATTAAAATCTCACTATCAGAACTAGCATGAAAAATGGCACCATGCTGTTCCAACCGTCGCCGCAGTGTCACCGCGTTCGTCAAATTGCCGTTATGTGCGAGTGCAAACTGTGAGTCGCTAAAATTAAAACTCAAGGGTTGAATGTTTTCCAATCCATGATTACCAGCCGTGGCATAGCGTACATGGCCGACTGCAGCTTGACCCGTCAAACGTGCCAACCGCCGTGGGTCCCGAAAGACATCAGCCAACAACCCTAGTCCGCGTTCCGTCTGCAGTTTGCCGTGATCATTCGCCGTGATACCGGCTCCTTCTTGCCCCCGGTGTTGTAACGCATGGAGCCCAAAGTACGTTAATTGGGCGGCGTCCGGCGAGCCCCAAACCCCAAAGACGCCACATTCTTCATTCAGACTTCTTACTTCAGTAGGCATGGTAAGGCCCCTTCCCACAACTGTTTGGCGAAACTAACCTTAATATCAAACGCCTGATCAGCAGTTTGAACGTGTAGCCGATCCGTTGCAGTTGTTCGTCCTAAATAGGTCACATATGGTTCCATTAAACTTTCAAACGCGGCTTGCTGTGCTGGTGTCACCGAGATAACAAATCGTGACTGCGTTTCCGCAAAGAAGTTGGCAGCGGGCAAGTCACTGGCCAGTTCCACCCCGATATTTTGTGGAAAACATGATTCGGCAATCGTCGTAATCAAGCCACCTTCAGAAACATCGTGGGCACTAGCAACTAGTCCTTTTTGAATCGCAGTTAACAATAGACGCTGATTACGATTTTCAGTCACAAGGTCAAAATCAAACAGCTCGCCACTGATCGTTCCCGTCAACATCTTTTGCAGCTCACTACCATTGAAATCGGCTTCTGTGGTACCTAACACGTAGACTGCATCGCCAGCGTGTTTAAAATCGCTAGTCGTAATATCTTTCTGATGCTTAATTAACCCGACCATCCCAATCATTGGGGTGGGATAGATGGCTTCCCCGTTCGATTCATTGTTCAACGAGACATTGCCAGAAATCACGGGCGTATTGAATAATTGGCATGCACGAGCGATGCCCATCGCCGATTCGTCCAAATCGTAAAATTGTTCAGGTTTCTCTGGATTACCATAGTTCAAGCAATCAGTGATGCCTAAAGGTTGCCCACCGGAAGCGACAATGTTTCGAGCAGCTTCCGCAACGGCGATTTCCCCACCGACACGGGGGTTTAAGTATAAGTATCGCCCGTTAACATCGGTGGTGACCGCCAACGCCTTATCCGTATGTCGAATCCGTATGACCCCCGCATCGGAACCCGGCTTGACGACCGTATTCGTTTGGACCTGCGAGTCATACGTTCCATATAACGACGCTTTGGAAGCAATCGTTGGCTGTTGGAGCATCTTCTTCAATGTGCCAGTTGCATCAACTAGTCGTGGCATAAATTGATGATGGCTCTGATGGTTCAAGCGCGTTGGTCGTTTCTTTTCGCGTTCATAGACCGGCGCTTTGGTCGCAAGTGCATCGACGGGAACATCTGCAACTAACTTACCATGATGGAATAATTGATACTGGTGGCCGGCTGTCACTTTACCAATTGTGACAGCATCAAGACCGTACTTTTCAAAGACTTGATAAATTTCTGCTTCGGCACCAGCTTTGACACATAGTAACATCCGCTCCTGTGATTCAGAGAGCATCAGTTCAAACGGCGTCATGCCAGTTTCACGTTGTGGTACCAAGTCAAGATTCAGTGACAACCCACTGCCTGCTTTGGACGCCATTTCGGCTGAGGAGGAAACTAGGCCCGCCGCGCCCATATCTTGAATCCCGATTAAAACATCACGATGTTCATGAATAACCTCGAGACACGCCTCCATCAATAATTTTTCCATAAAGGGATCACCAACTTGAACCGCGGAACGCTGGGTTTCATTGGCGTCATTAAATTCAGCAGAGGCAAAGGACGCACCGTTAATGCCGTCACGCCCCGTTTTTGCGCCGACATAAATAACGGCGTTGCCAATTCCTGTTGCTTGGCCCTTCTGAATATCAGCTTGATCCAAGATTCCAACACACATGGCGTTCACCAACGGGTTCTTCTGATAACTCGCATCAAATACCGTATCACCACCGATTGTCGGAATTCCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATGCCGGCGACTACTTGCGAAATCAAGTATTTCGTATGAGCATCAGTCGGTTCCCCAAAGCGAAGACTGTCCAGCAGCGCAATCGGCCGGGCCCCCATCGAAAAGATGTCCCGAATGATACCACCCACACCCGTTGCCGCACCCTCATAAGGTTCAACTGCAGACGGATGATTATGACTTTCAGCTTTAAAGACCACGGCCTGACCATCACCGATGTCGATAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP023174|1758268:1766779|1766296_1766779_-|WP_003645861.1|DBSCAN-SWA
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MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK
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MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASLANLKGEQ
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MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA
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MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK
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MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL
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MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI
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MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSPDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVAGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTEILRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPVPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLIVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTPVVFEEAEHA
>NZ_CP023174|1758268:1766779|1763512_1764193_-|WP_022638052.1|DBSCAN-SWA
MMKFVVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003645867.1|1758268_1758847_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	1.3e-21	33.9
WP_013355836.1|1758839_1759865_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3F760	Synechococcus_phage	5.4e-60	40.7
WP_003642591.1|1759861_1761316_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	2.5e-50	34.0
WP_003645864.1|1761300_1763520_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	4.5e-144	39.3
WP_022638052.1|1763512_1764193_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_003642588.1|1764192_1764447_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_003642587.1|1764448_1765180_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4SM18	Cyanophage	1.6e-37	37.3
WP_011101896.1|1765182_1766313_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_003645861.1|1766296_1766779_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	2.3e-16	41.0

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP023174|2617162:2677858|DBSCAN-SWA
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MRGATLMNNRIAMLRKKNGLTLDQMQKETGINRVTISQYERGKREPKLETWKRLADFFKVSVGYVQGISDIKSPKDFDELILNPNINYNSGSLNKAELQYIVDNLDAKIDDQYINTFNSLNHAFLSAPNIGKHEKENYLQIINSLEYPKDKRSLADINKYFITFYELLLLKFSTQDNNSHTERLLTLLDSFHKEQFHEELKHM
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MVDLEQLGQQAQQASYTLGLLSTAQKNQVLTAMATALTSHQDEILAANAQDLENPQVPVKFVDRLRLTADRIQDMAIGLKQVVSLPDPIGNVDRAWRNEAGLMIAKERVPLGVIGMIFEARPNVTVDASALCFKTGNAVILRGGKEALHSNQALVQVLRGALRAEAVDENAIQLITDTSHATAAKFMQLTDYVDVLIPRGSARLIQTVLAKATVPVIETGAGNCHVYVDKDAQLQMATDIVINGKVQRPSVCNATEKLLIHREVAADYLPSMIQALREQGVEVRGDAATQAIVPDVVPATDADWGTEYNDLIIAVKVVDSEAAAITHINRYNTQHSEAIVTDNYQAGKLFQQRVNAACVYINASTRFTDGFEFGFGAEIGISTQKLHARGPMGLAELTSYKYVIDGNGQIRH
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MADSDLSNNRISDVNLSKTMRTSFLSYAMSVIVARALPDVRDGLKPVHRRILYGMSELGVTPDKPYKKSARIVGDVMGKYHPHGDSAIYESMVRMAQDFSYRYMLVDGHGNFGSVDGDGAAAMRYTEARMSKIAVEMLRDINKDTVDWQPNYDDTEREPAVLPARFPNLLVNGATGIAVGMTTNIPPHNLAEVISAIHLLMDNPDATVADLMEVLPGPDFPTGGIVMGKSGIRKAYQTGRGNIIVRAKVDIQDQKNGKQRIIVTELPYMVNKAKLIERIAGLARDKEIEGITDINDESDREGMRIVIDVRRDASASVILNNLYKMTLMQTNFGFNMLAIVKGAPKVLSLKQILIYYLEHQEDVIRRRTEFDLKKAQARAHILEGLRIALDHIDEIIAIIRQSQTSEIAKNQLMDNYGLSDKQAQAILDMRLVRLTGLEREKIESEYQDLLKAIADYKEILASKDRINQIIYEELMEIQRKFGDKRRTELMVGEVLSIEDEDLIEEEEVAVTLTHNGYIKRLPTTEFKSQHRGGRGIQGMDVHDDDFIEHLLTTSTHDVLLFFTNAGKVYRMKAYEIPEYGRTAKGIPVINLLGVNSGEKIQAVVNVTGDASASDNYLFFTTVKGVVKRTPVQEFANIRSNGLKAITLKDDDELIGVTITDGHQNVIIGTHDGYAVSFDETTVRSMGRTASGVRGIRLRDDDFVIGFDVLKPDSNVFIITEKGYGKQTPAADYPIKGRGGKGIKTANVTEKNGHLAGLTTVDGQEDIMVMTNQGVMIRFNIATVSQTGRATLGVRLMRLGDDGQVATMAKVDPEPEVDETVATDATTEAPVDDQTVNADATTTEPTTDSNDSNE
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MRREQVSAIINLLEPSDALQPLTAVRPVGMLPFGGRYRLVDFQLSSVINAGIQNVMVTVPRSGRSVADHLRSGRDWSLNTIRGGLFLSPYNDLKLVAPEKKAALLHHYYDNSIQFLKCSQSEYSVVMSTRNVGNIDLKALLRYHEERNSPVTAVYKRVDPASLIPENTILQLTAKGEATAVVPMSKAKISPKTKQVAKSMAIYLMSTVDLIELLQSANQRGDMISLEELMRQAVIQHNANAFEYTGFQANIHDINSYFAANMAVLDEANFRALFYSSRRIYTKVKNEIPTFFATGSQCRDSLCGTGGYIEGQLDHSVIFRDVLINRDSQVKNAIIMQGARIGAGCKLENVIIDKDAVIGPNLVLKGTSTTPLVISKGQHVFQQAEVAVHD
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MTVFEGNTVAAAIAAGLKQLHRTRDQVEVEVIAEAKKGFLGLGKHPAQVRLTVVPASAAPATTPTSATATAQQSVATESTTAPTMPRPTVQTPKSTPTRQAKTSQATTSAAKPATSKAKAVAKPASMAVTTGPVIADTDQSKPATTSKTKSVAADQSQTPRTPAEIAARQAANETAVRALCDYLLAVVKELGVTADLDVDFGNRYATLNFDTTKQGLLIGKHGRTINALQDLAQVYMNHHGASHVNVVLDVDDYRERRAATLKRLAESTAREVIATGKQVFLDPMPSFERKLIHAELANNHHVTTFSEGRDPHRAVVVAIRK
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MTENEKETKLEQAREYDASQIQVLEGLEAVRKRPGMYIGTTSSQGLHHLVWEIVDNGIDEALAGFANVIHVTVEKDNSITVTDNGRGIPVDIQEKTGKPALETVYTILHAGGKFGGGGYKVSGGLHGVGASVVNALSSTLDVKVTRNGHVYYMDFERGKVKTPMKIIGDAPDDAHGTAVHFVPDPDIFRETTTYDINILTTRIRELAFLNKGLRITIRDNRPDEPTEDDFLYEGGIRHYVEYLDKNKTVLFPEPIYVEGEQNGITVEVALQYTDDYHSNLMTFTNNIHTYEGGTHEEGFKRALTRVINDYARKNNLLKESDANLSGEDVREGMTAVVSVKHPDPQFEGQTKTKLGNSDARAAVDRLFSEHFSKYLMENPSVARKVVDKGLLASKARVAAKRAREVTRKKSGLEISNLPGKLADNSSKDPEISELFIVEGDSAGGSAKQGRSRLTQAILPIRGKILNVEKASIDKILANEEIRSLFTAMGTGFGGDFDLSKANYHKLIIMTDADVDGAHIRTLLLTLFYRYMRPLVDAGFVYIAQPPLYQVRQGKFVKYIDSDEELSEVMGQLAPSPKPVVQRYKGLGEMDAEQLWETTMDPDKRRLLRVRDEDAADADGVFSMLMGDQVKPRREFIEDNAKFVQDLDV
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MQVIFLNDVRGKGKRGQIKNVPDGYAQNFLIKKGLAKEATKAAINTLKAEQKSEAARAAEELAEAKQVKTVLEADETVVELKAKAGTDGRLFGSIPSKQIATALADQYQVKLDKRKIELPEPIRVLGYTNVPVKLHPEVTAKIRVHVVEK
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MAQKQLIKTPWLIAGQFMNNIGMSFIWPLTTIYMHNVLGKSLTETGIVLMLNSVANVLASTIGGRIFDRGNPYHLLLMGITLNGLANFALIFFHGWPWYPMLLVVTGFASGWLNTMFNALAASVPRDKVRRTFTLMYLAANLGVVFGTMLVGIVYSMGMALLFSMTTSLFVIFLIIALFEYNVDSSNVTGVDPRQGQDVHLPRANFHIVWTFFISLFIIWLLYEQWVSNLSVYMTNLGMPLRNYSFLWTINAGLLVLIQSILSLLGNRIKNLYNQFFFGMLFVGLSFLSLVIAHDYPHFIFAMILLTIGEATWSPAMPTLVSQLSPVSAKGRYQGLVQAFCALGRSLGPLFGGVIIDNWSYKVLFLLAFVVLLIVLAVNIGVVHFNLRKAVNYMKTDVQTDVSRETK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_022638275.1|2617162_2619073_-|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
WP_003641622.1|2619091_2620483_-|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis GTPase MnmE	NA	NA	NA	NA
WP_011102290.1|2620714_2621683_-	Jag N-terminal domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011102291.1|2622168_2623422_-	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_015826199.1|2623554_2625192_-	peptide ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641627.1|2625906_2626740_-	membrane protein insertase YidC	NA	NA	NA	NA
2626533:2626549	attL	NA	NA	NA	NA
WP_003640224.1|2626755_2627100_-	ribonuclease P protein component	NA	NA	NA	NA
WP_003640225.1|2627210_2627345_-	50S ribosomal protein L34	NA	NA	NA	NA
WP_003641628.1|2627850_2629218_+	chromosomal replication initiator protein DnaA	NA	NA	NA	NA
WP_003641629.1|2629395_2630535_+	DNA polymerase III subunit beta	D0R7I4	Paenibacillus_phage	4.3e-13	29.9
WP_003641630.1|2631059_2631293_+	S4 domain-containing protein YaaA	NA	NA	NA	NA
WP_003641631.1|2631293_2632418_+	DNA replication/repair protein RecF	NA	NA	NA	NA
WP_003641632.1|2632414_2634361_+	DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	5.5e-146	46.7
WP_003641633.1|2634525_2637087_+	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	2.8e-113	37.4
WP_003637271.1|2637709_2638009_+	30S ribosomal protein S6	NA	NA	NA	NA
WP_003641634.1|2638045_2638648_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A218MNB4	uncultured_virus	3.7e-40	72.1
WP_003641635.1|2638686_2638923_+	30S ribosomal protein S18	NA	NA	NA	NA
WP_003643610.1|2639103_2641116_+	DHH family phosphoesterase	NA	NA	NA	NA
WP_003641637.1|2641128_2641581_+	50S ribosomal protein L9	NA	NA	NA	NA
WP_003641638.1|2641596_2643021_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	9.7e-124	53.1
WP_003641639.1|2643242_2644466_+	MFS transporter	A0A2H4PQR6	Staphylococcus_phage	2.4e-54	33.6
WP_003643611.1|2644487_2645285_+	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	1.0e-45	39.2
WP_003641641.1|2645303_2646542_+	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.1e-110	52.9
WP_003641642.1|2647002_2648619_+	peptide ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638277.1|2648949_2650854_+	1,4-alpha-glucan branching protein GlgB	NA	NA	NA	NA
WP_003641645.1|2650843_2651983_+	glucose-1-phosphate adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003641646.1|2651979_2653152_+	glucose-1-phosphate adenylyltransferase subunit GlgD	NA	NA	NA	NA
WP_003641647.1|2653144_2654584_+	glycogen synthase GlgA	NA	NA	NA	NA
WP_003643612.1|2654603_2657000_+	glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase	Q8B3H5	Iris_mild_mosaic_virus	1.6e-09	42.9
WP_022638278.1|2657017_2658835_+	glycoside hydrolase family 13 protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641650.1|2659167_2659935_+	Cof-type HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003641651.1|2660086_2660758_-	beta-phosphoglucomutase	NA	NA	NA	NA
WP_003641653.1|2663882_2664332_-	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003643615.1|2664529_2664730_+	cold-shock protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	2.8e-21	74.6
WP_003641655.1|2664821_2665046_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638279.1|2665503_2666658_-|integrase	site-specific integrase	A0A172LN96	Lactococcus_phage	6.1e-60	36.7
WP_080241804.1|2666713_2667325_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	L0P7E1	Lactobacillus_phage	4.6e-14	58.2
WP_022638281.1|2667461_2667659_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638282.1|2667663_2667843_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638283.1|2668126_2668345_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638284.1|2668341_2669145_+	bifunctional DNA primase/polymerase	NA	NA	NA	NA
WP_095762446.1|2669144_2670719_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_068874258.1|2670980_2671337_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_022638523.1|2671336_2671528_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033607856.1|2671514_2671853_+|head	phage head closure protein	A0A2P0ZLF0	Lactobacillus_phage	7.9e-08	34.7
WP_033607857.1|2671845_2672235_+	HNH endonuclease	A0A1J0MFT4	Staphylococcus_phage	1.0e-19	45.2
WP_022638526.1|2672850_2673324_+|terminase	phage terminase small subunit P27 family	NA	NA	NA	NA
2672910:2672926	attR	NA	NA	NA	NA
WP_022638527.1|2673320_2675024_+|terminase	terminase large subunit	A0A2H4JBN3	uncultured_Caudovirales_phage	4.4e-123	41.3
WP_022638529.1|2675178_2676285_+|portal	phage portal protein	A0A2H4J9Q5	uncultured_Caudovirales_phage	3.2e-50	33.6
WP_022638530.1|2676274_2677858_+|capsid	phage major capsid protein	A0A1J0MFW8	Staphylococcus_phage	2.5e-40	34.3

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP023174|2942228:3045970|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003641974.1|3005694_3005895_+|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003641977.1|3007537_3008284_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
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WP_003641982.1|3011689_3012433_+	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
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WP_003643811.1|3013609_3013768_-|bacteriocin	two-peptide bacteriocin plantaricin EF subunit PlnF	NA	NA	NA	NA
WP_003641985.1|3013792_3013963_-|bacteriocin	two-peptide bacteriocin plantaricin EF subunit PlnE	NA	NA	NA	NA
WP_003641986.1|3014229_3016380_+	peptide cleavage/export ABC transporter	W8CYL7	Bacillus_phage	6.1e-45	27.9
WP_003641987.1|3016395_3017772_+	HlyD family secretion protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641990.1|3018618_3019287_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_003641991.1|3019373_3020054_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

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MTIVNNSEELKRVYRPDKPCGKIMNHSNVTAYACRTLIEFDAWGKHWHSRKWFINDDNELIFNIEQNLFINLDMFNDGTSAMHNLVAYDQLRDPEPQLSLF

Homologous phage analysis in the prophage region

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3191864:3191879	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_003640949.1|3247250_3247826_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1G5S9X4	Enterococcus_phage	6.4e-26	41.7
WP_003640950.1|3247907_3248918_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A096XT60	Enterococcus_phage	3.1e-108	60.5
WP_013355235.1|3248945_3251111_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A8E2R1	Enterococcus_phage	2.2e-268	63.3
WP_003640952.1|3251249_3251480_-	redoxin NrdH	X2KRY7	Enterococcus_phage	2.8e-09	40.0
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WP_003643940.1|3253345_3255043_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1U9WR94	Streptococcus_virus	3.9e-55	37.0
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WP_003637790.1|3255388_3255988_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
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WP_003643941.1|3256651_3257317_+	dTMP kinase	M1PSC7	Streptococcus_phage	1.4e-53	52.7
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WP_013355239.1|3259149_3260046_+	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	4.4e-82	55.7
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WP_003640976.1|3266498_3267551_-	PhnD/SsuA/transferrin family substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_003640977.1|3267830_3268556_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
WP_011101142.1|3268539_3269118_+	ribosomal protein S18-alanine N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003640979.1|3269110_3269566_+	ribosomal protein S18-alanine N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011101143.1|3269570_3270617_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	1.0e-61	41.4
WP_013355247.1|3271503_3273486_-	ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L0W2	Tupanvirus	4.4e-50	29.2
WP_003640983.1|3273654_3274332_+	redox-sensing transcriptional repressor Rex	NA	NA	NA	NA
WP_011101144.1|3274496_3275141_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA