Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP017083 | Proteus mirabilis strain T21 plasmid pT211, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 34896
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017084|0:34896|DBSCAN-SWA
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36 | Salmonella_phage(45.45%) | integrase,transposase | attL 433:445|attR 11477:11489 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
44881 : 49517
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017084|44881:49517|DBSCAN-SWA CTCACCAGTAGAACGTCTCTACTTCTTCCGGCAAATCATCAAGAGGAGCAAGCACGTCCTCATCAACAATGTACCGTGGCTTCACAGAGCCAGTAACCGTTACACGGCACCGCTCTGATGACTTCTCTCTGTACTGGTCAACATCCTCAGGCTTCACGCCTGACGCCTTATCAGCCAACAGCTTTTTGTAGTCTACCCGGCCAGCCGCTTTGTATCTCGTTACCATCACACCGCAGTAGTCGGCATGGAAGTATTCCCCCATGAGGGACTTCATGGTGTCGAGATGAGGCTTTTGCCTTTCTTGAAGCTCAGACAGTCGCTGTTTCAGCTCCTGAATCTCAGCATCATAGAGGCGGTATTCCTCAGCAGCAGCAATCCAACGGTTGACCTCTTCACCTTGCGGTATGTACAGGTCTCTCTCTGGATCTTTGTCGGGCTCCTTCTTGTCTACTACCTGTTGCCAGAACTTTTTAGCCTCGGCCAAGATTTCTTGAATCATGGCTTCGTCTCGGAGTATTGGAAACTCCTGAATCTGACCTTCAAAGTAGAAGACTAACCAGCCTTGCTTGGCCCCCGTTACCAGGAGCTGGTGTTGCACCTGCGGGTAATAAAGCTGGTATGCCTTGCTGTTTGCTTTCTCAGCACAAACATCTTCCCAGACAGTCGCACTCGGGCTTTTCAGCTCGACGGGCTCCCCGTTATCTCTCAGGCCATCCAGGGAGGCCCTCATGAGCGGGTATTGAACCGATTCGACACAGGCGGGGAGCAGCATGTCATCATACTTCTCCTCGAAAGCGCGTCTTGCAGCATCTTCGTTTTCTATCCCCCGGCGAACCAGCGGATTAAGACTCAGATCGACTTCACGCGCATACCCAGTCTTCTCGGCCCACAGTCTCCATCGTGTTTTGTACGGAGACCGATTGAGCAGGATAGCGGCGTCAGTGGCTGTTACACCTTGACGCCGCCAATCAAGCCAATCTTCCTCTCGTTGCGATAGGTTGACTATTTTCATGGACCTCTCTCCAATGGTTAGGAGGGAGATCTCCCCCAGCGGGGGAGTCCCCCCCGTTGGGGTTAGTAGTAACTGCCTTCCGCGCCCTCCTCTTCTGTAACAGGGATCATGTCCTCGTCACTCAAAGGCGGCATTTCTTCGGCACCAGGTTCAGCATTTGCAGAACCACCAGCGGCGGACTCTTGCTCGTGCGCTTCCTGGTAGTCAGGTTTCGGAGGCTCCATTTGATCCATCTCCTTGTCACGAAGGAATTGAGTCGCATATTGCAGTTCCGAACCTTCATACCGTCCCTTCACATACTCATGCGCCGCAGACCATGCGTTTTCAGCAATGGCGCGATTTGCGAGTTTGGTTAGGATCGGGTCAAGCTCTTTGTGCTCAATAGCCAAAGGCTCTTGGCTTTGAACTTGAGATGGTGAAGGGAGATTGGCAATAGCCGGGTTAATGGCCGATGCCTGCTCCATTTCACGGATGCGTTCAGCTTCATCCTGGTCATAAATACCAGAGAAACCAAATGCGACACGAGAACACTGGATCAGCGACTTGTGCCGGAGTTGACGCTTGGTGTGCGTTTGCCAGGGGCCATCAACAGTGTAAGCACCATTGCGACCTTGACCCTGAAACGGTTCACGGTACACCTCATCAATGAACTCCTTGATGCGGATAGGGCGAGATCTGTCCTTACGGTAAATCACGCATTCAATCCACTCAGGGCAGTCAACTTTCGCCCCCTGCATTCTGACCATCTTGTCCGAATACACGAACTCGACGCCATCATACTGGGGATGCTCGTTGATGATGCGGCTCCAACCATCAACACCTACTACCGGAATGATCCCATTTTGCTTGTCAGGAAACGCATAGATTTCCCGAGTGAAAGGGTTCAAACCGTACTGTTCAGCCACGATCAGGAGCGTCATCATCTGCTCATCGGTCGGGGCACTTCCATCTCGCTGCTTGAATGCGGTCGCCTTCAAAGTTTCATAGAACTTTCGGGTGTCCACGCCAAACCGGCTTGCGATACGGGTTACAAGAGATTTGTTATCAGACATGGTGTTTCTCCAATTCACGAATGAACGGTTTGAGGACACCATGACCCCCTCGGGGCATGAGTGCCCCCGTGGGGTTTAGTAAGAGTTGGCGGTGTTACCCGCCAGCCAAGTGGTGCAGCCGCATGAACGGGATGTCATCATCCCAGCCATCAGGAGCGGGACCATAGCCTCCGCCCATACCACCTTGCGGTGCTGATTGCTGCACAGGAGCAGATTGCGTACCGGCTCCTGTACGTTGCCCTTTTTGGGGCGCTGCACGTTGAGAGTTGTCCTGAGGTGCATTTCCACGACCACCAAGCATCTGCATTTCAACGCAGTGTACTTCGGTGGTGTAGCGCTCGATTTGTTGGCTGTCAGTCCACTTCCGGGTGCGGTTGCTCCCTTCGAGATAGACTTGGGAGCCCTTTTTCAGGTACTCACCAGCGACTTCTGCCAAACGACCTTTAAGCACAATACGGTGCCACTCAGTATGCTCTCTTTGCTCGCCAGACTGCTTATCGCGCCACGTATCCGTTGTTGCAACGTTGAAGTTGGCAACGGCAGTTCCGCTTGGCATGTAGCGAATTTCCGGGTCAGAACCGAGATTACCGACCAGAATTACTTTGTTGACGCCTTTAGACATCATGACCTCCAAGTTATTTGGAGAGGGCCAACGCCCCTTTCGGGGAGCAAGCCCCCGTAAGGGTTAAAAAAAGTGATCCTCTTGTTCGGCGTCGATCTCTGCCAGGCGAATCAGCTCAGATACAAGGCCAAGCCTTTCTGCATCTGCTCTTACTTCGTCGTAGCTGAAACCAAACCGTTCAATGAGGGGTTTTAGTGAATCAAAACGCTCGTAGTCGAAGGTATCACCCTGTTCATCACAGAATGCCACCAGCGGCTTCTCTACGTTTGAAAAGTCATCCGCGAAACGCTGTTGCAGGTAAACCAACATCAGCAGGGGTTTGTGACCATGTTCCGGGCGGAGTTCACCAGCGCCTTCCAGCGTAGCTGGATGGATAGTGTTTTCGCCTAGTCCAGTGCTAACCCCAAGCTCATAACCGCTGTCAGTACGCATCAGCACACTGGGTAGCAAGTCATTTGAGCCTTCGCTCCGAGCAACCTCAAAGCCGATTAAACCGGCTCCTTTGGCAAAAACCCCAGCAACAAAACCTTTGAAGAGGTTTATGTCACCTGGAGGTAACTCAGAGGGCGGAGATAACAGCCAGTTGAGAGATCCCAAGCTGGCTGTTTGTCCGGCTGAAACATTCCCCCCTTCCAGCACCGTCTGTGTCTCTGCGTTTACCAGCACCTCATCCAGAAAGGTGTACCCCTGGCTGAGAAACTGTGACACATACTGGCTTTCTTTGTCCTTGTAGGACATTGGGATCGTGTCTGGGCCGTTAGCTTCAAAAGGTCCTTCGAGCTTTGTCTCAGACCAATTTTCAGCTTTCCCATCAGTGACGGTTCGGCGTAGCTCGACCATCGTGAATTGGCCTGGCTCCGAGGAGCTGGGCTCCCGGAGCAACTTGTAGCCAATGAAGACTTCTATTGTGGTTTCGTCATTGCCCCACTCTTTAGCAGTGTAACGACGGCACAAACAGTCATTTTTCTTCATGCGTCACCCCTTAGCGCCATTGGTCCCCGAACACATCCTTCGCAACACGCAGGATGGCTTCACGCTCCTCTTTGGCCGCACGGATAAGCAGAGCTTGATCCAGGGCGTATTCAAGAGCATTTGGGGCACCACGGAACGCTAGAGACAGTTTCGCCCAACGCACCAACGTCCGAGTGGACATGGTGACGCTGATCTGACCATCTTCACCGTTTTCGCCAAGAAACAGTTTGCGGACCTGATTAGCAATCCGAACCATTCCCTTCCGCACATTTTCCGGAAGTTTCGGAGTAACACGGCCAAGAATGCTGAGTTCAGCTTCCTCATCCGCATACCCTACTTTGGTGAAACGATAGCGATCCATAGCTGCGAGGTTCTGCATCATCACCCCCTGGTACAAACCAGAAGCATCACCGGACCCCGTAGAGTTACCAGTAACGACCACACGAAACATCGGGTGCGGCTTGATGATTTCCCCGCCATTCTGAGCGATCACAAGGGGACGCCCTTCAAGGACATCGTTGAGACCAGCCAGCTCGGCAGGGTCGGCCAAATCCACCTCGTTGATGAGGAGCAGATGACCTTCACGCATAGCGACTGCCAGAGGTCCATACATGAACTTCATGACAGGTGGTTGACCAGGCTTTTCCGCGACCAGAGCGTGATGTCCAATCAGATCTGTCAGCTCCATCCGCCCGTGGGCAGTGATTTGCTGAACAGGCCAGTTGAGACGACCAGCGATCTCGGTGATACCTGAGGTTTTGCCAGACCCGGTAGGGCCGGTTACGAACAATGCGTCACCGCCAGGCTCTTTGAGATAGGCCAAGACCTCTCGCAGAAACTCTTTGCGGAAAACGTAGTTGGTATCAGTGGCAGGGATGAAAGGGTTTGAACCGTCAGCGTAGCCGATGGCCGTTACCTTCTCCGGAATGCTGGGCATACCGAAAACCTTGCTTACTGAGAATTGAGAGTATTGAGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017084|44881:49517|47038_47569_-|WP_000987165.1|DBSCAN-SWA MMSKGVNKVILVGNLGSDPEIRYMPSGTAVANFNVATTDTWRDKQSGEQREHTEWHRIVLKGRLAEVAGEYLKKGSQVYLEGSNRTRKWTDSQQIERYTTEVHCVEMQMLGGRGNAPQDNSQRAAPQKGQRTGAGTQSAPVQQSAPQGGMGGGYGPAPDGWDDDIPFMRLHHLAGG >NZ_CP017084|44881:49517|47629_48538_-|WP_000739139.1|DBSCAN-SWA MKKNDCLCRRYTAKEWGNDETTIEVFIGYKLLREPSSSEPGQFTMVELRRTVTDGKAENWSETKLEGPFEANGPDTIPMSYKDKESQYVSQFLSQGYTFLDEVLVNAETQTVLEGGNVSAGQTASLGSLNWLLSPPSELPPGDINLFKGFVAGVFAKGAGLIGFEVARSEGSNDLLPSVLMRTDSGYELGVSTGLGENTIHPATLEGAGELRPEHGHKPLLMLVYLQQRFADDFSNVEKPLVAFCDEQGDTFDYERFDSLKPLIERFGFSYDEVRADAERLGLVSELIRLAEIDAEQEDHFF >NZ_CP017084|44881:49517|45954_46944_-|WP_001282585.1|DBSCAN-SWA MSDNKSLVTRIASRFGVDTRKFYETLKATAFKQRDGSAPTDEQMMTLLIVAEQYGLNPFTREIYAFPDKQNGIIPVVGVDGWSRIINEHPQYDGVEFVYSDKMVRMQGAKVDCPEWIECVIYRKDRSRPIRIKEFIDEVYREPFQGQGRNGAYTVDGPWQTHTKRQLRHKSLIQCSRVAFGFSGIYDQDEAERIREMEQASAINPAIANLPSPSQVQSQEPLAIEHKELDPILTKLANRAIAENAWSAAHEYVKGRYEGSELQYATQFLRDKEMDQMEPPKPDYQEAHEQESAAGGSANAEPGAEEMPPLSDEDMIPVTEEEGAEGSYY >NZ_CP017084|44881:49517|44881_45892_-|WP_000706865.1|DBSCAN-SWA MKIVNLSQREEDWLDWRRQGVTATDAAILLNRSPYKTRWRLWAEKTGYAREVDLSLNPLVRRGIENEDAARRAFEEKYDDMLLPACVESVQYPLMRASLDGLRDNGEPVELKSPSATVWEDVCAEKANSKAYQLYYPQVQHQLLVTGAKQGWLVFYFEGQIQEFPILRDEAMIQEILAEAKKFWQQVVDKKEPDKDPERDLYIPQGEEVNRWIAAAEEYRLYDAEIQELKQRLSELQERQKPHLDTMKSLMGEYFHADYCGVMVTRYKAAGRVDYKKLLADKASGVKPEDVDQYREKSSERCRVTVTGSVKPRYIVDEDVLAPLDDLPEEVETFYW >NZ_CP017084|44881:49517|48548_49517_-|WP_000085162.1|DBSCAN-SWA MSQYSQFSVSKVFGMPSIPEKVTAIGYADGSNPFIPATDTNYVFRKEFLREVLAYLKEPGGDALFVTGPTGSGKTSGITEIAGRLNWPVQQITAHGRMELTDLIGHHALVAEKPGQPPVMKFMYGPLAVAMREGHLLLINEVDLADPAELAGLNDVLEGRPLVIAQNGGEIIKPHPMFRVVVTGNSTGSGDASGLYQGVMMQNLAAMDRYRFTKVGYADEEAELSILGRVTPKLPENVRKGMVRIANQVRKLFLGENGEDGQISVTMSTRTLVRWAKLSLAFRGAPNALEYALDQALLIRAAKEEREAILRVAKDVFGDQWR |
5 | Mycobacterium_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
81668 : 84755
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017084|81668:84755|DBSCAN-SWA AATGGACCTTTATATCTGCGAGAAGCCTTCTCAGGCCAAAGATTTGGCTGGCGTAATGAAGGCCTCCCAACGAGGTGATGGATTTCTCCATGATGGAGGAAACCGCGTTATTACGTGGGCGTTCGGCCACCTGCTGGAATTGTATATGCCAGACGATTATGACGAACGCTACAAGTCATGGTCACTGGAGACCCTCCCTATTGCACCAGAGTCATGGCGGTACAACGTTCGCAAGAGTGCGTTCAAACAGTACAAAATTGTTGAGGGACTGGTCAAAAAGGCGAGCACCATCTACATCTCAACGGACTACGACCGAGAAGGTGAGGCTATCGCCCGTTCGCTTCTGGATCGATTCCGCTACTCTGGCCCTATTCGCCGGGTTTGTTTGACGGCTCTCGATGAGTCAAGCATCAAGAAAGCGCTGAACAACGTAAAGGATGGCAAGGATACGGTCTCACTCTACTACGCCGCATTGGCACGGCAACGCGCTGACTGGTTGGTAGGCATGAACGTGAGCCGCCTCTACACAGTGCTGGCCCGAGATGTCGGCTTCAACCACACTCTTCACGTTGGCAGAGTTATCACCCCAACCGTCGCTCTTGTTTGTCAACGGGACCGAGAGATCGCCGGTTTCACCCCCTCACCATACTGGACTCTGGGTGTGAACGTGTCCGTACAGAATGGACAGTTTGCCGCCCAATGGATACCACCAGAAGAGTGCAGTGACGAGCAAGGCCGGTGCGTCAATAAGGCCTATGCCGAGCAGGTAGCCTCCCAGGTCAATGGTGCCAATGCTGTTATCAGCAAAGCAGAAACCAAACCAGGTAAAGAGTCAGCCCCCCTCCCCTTCGATCTAACGTCGCTGCAACAATACGCAAGCAAACGATGGGGATACACCGCTCAGCAGGTACTGGATGCAGCTCAAGCTCTGTACGAGACGCACAAAGCGACCACCTACCCTCGTACTGATAGTCGTTATCTACCCGAGAGCCAAAAGGAAGACATTCCGGACATTCTCCAGGCGCTCATTTTGTCCGATCAGAACGTCTCTGGGCTGGTGGCTGGCGCAGATCCTCATCGCAAGGCCAGGGTATTCAATGACGCCAAAGTGACCGCGCACCACGCGATCATTCCAACACCGGCCAGAACAGACATCAGTGCCATGTCTGAGATCGAGTTCAATCTTTACGACGCCATCCGTCGTTTCTACATCGCGCAGTTCTACAGCGAGTTCGAGTTCACCAAAACCTCCATCGAGGTGCAGTGTGGGCGTCACCTCTTTGCGGCCTCTGGTAAGACACCTGCCAAACAAGGCTGGAAGGTTTTGTTTGCTTCTGATAGTGAAAGCAGTCCCAAGGACGAGGGGGAAGACACCGACGCGCCGGTTGAACAAGAGAAGCTCCCCAGGGTTAGCCAGGGCGAACCCGCTTTGCTTAATGGTGCCGAGCTGGCAAACAAAATGACGCGGCCAGCACCGCACTTCACCGAAGCCACATTGCTTGCCGCGATGGAGAACATTGCCCGGTTCGTGACTGAGGAGAAGTTCAAGCAAATTCTCAAAGACACAGCCGGTTTAGGCACTCCAGCAACACGCGCAAGCATCATCCAGGGCGCTGTTGATAAAGGCTACTTCAAACGTCAGAAAAAGGTACTGCTTGCAACTGATAAGGCTCATGCGCTTATCGCAGTGCTTCCACCAGCCATCAAATCACCCGGCATGACTGCGGCTTGGGAGCAGGAGCTTGAGAAAGTCGCCTCCGGCTCCGGGAATATGTCTGTCTTCATGAAGCAGATTTCCACCTGGATCTGCCAAATGGTTGAGCAGCTCAAAGTGCCCGCACCGGTTCTGACCAAAGAAGGTGGCGCGATGGCTAAAGCCTTCGAGGGCGCTAAGCCGCCTTCACACGAATGCTTCAACTGCGGTGGAGAGATGCACCGGATCAAAGGGAAGAACGGATTTTTCTGGGGCTGCCAGAACGAGGCTTGCAAGAAGACGTTCCCAGACAACCGAGGGAAACCCGAGAAGCGTATCGCGGCTGAGGATTGTCCAGACTGCCCAGATTGCGGTAGCCCGATGCGTCTCAGGAAAGGAAAAGCGCCCGGCAAGAAGCGAGCTTCTAAGTTCTGGGGCTGCACCGCCTATCCCGATTGCAAAGGCACTATGCCCTTCAAAAAGTCGGACTTTATGGATTGATAGAGGAATTAAGTATGTTTGGAACAATCATTTTAACTGCGATGCTCACCACCAGCTCAGCCACTGCCGAAGATGCAGGGAAGAACATCGCCTCAGGCTTGGCGGCGGCATCCGCCAGCCAAATGGGGCAGGCCGTAATGCCAACTTTAGCTACCAGCTCGGCCATTGCAAAAAGCGCAGGTAAAGGCATGGTGTCAGGTTTGGCTGCGGCGACTGCCAGCTACATTCCCCAAGACGAGCTGAGCTTTACTCGAAGCTATAAGAACTCTGAGGCTGTGGATATGGCAAAGGGCCTGGGGACATTGAAAGAAGCGCCTGAGTTTCTCTACGTTGTTACAGACGTAAATGCCAACATGGCGGTCAAATGCAAGCGCGTCTGGGAGCCTCAATCTCTGGCTTTAAGTCCAGTGATTGTTGAGCTGGTGGAACTACGTAAGACGAACAACAAAGACAGCTACGAACAAGCACTATCCCACCTCGATTGTTCAATGTTCACAGACTAAAACAATTAAGGGGCCGATGGCCCCTAATTTTTAATAACCCAATTTCTTTTGATACCTGATTTTCCTACCAAGCACAGTTGTCATACACCATTCAATTCACATGGATAGCGAATACTTCAACCGGACAATCTCCAAAGTGCGGGTGCGTTATAACACTCCTTGAGAAGCCACGCCAAGGGCGAATCTCTATCCTGGACATATCTCCAGCCTTTGGGTAGCCACACTTAACATGGACTTCATCATACTCGCGCCCCTCTAGTCTTTTTATCCAGTAGTCTGTAACGAGGCGATATTCATCTGGTTTTTCTCCAGATTTGATCTGATCGAAGTAAATCTTTTTTACGGGCAGATGAAGTATTCTCTTTTTCATAATCACCACCTGATAGCCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017084|81668:84755|84455_84755_-|WP_000542259.1|DBSCAN-SWA MGYQVVIMKKRILHLPVKKIYFDQIKSGEKPDEYRLVTDYWIKRLEGREYDEVHVKCGYPKAGDMSRIEIRPWRGFSRSVITHPHFGDCPVEVFAIHVN >NZ_CP017084|81668:84755|83875_84364_+|WP_000468105.1|DBSCAN-SWA MFGTIILTAMLTTSSATAEDAGKNIASGLAAASASQMGQAVMPTLATSSAIAKSAGKGMVSGLAAATASYIPQDELSFTRSYKNSEAVDMAKGLGTLKEAPEFLYVVTDVNANMAVKCKRVWEPQSLALSPVIVELVELRKTNNKDSYEQALSHLDCSMFTD >NZ_CP017084|81668:84755|81668_83861_+|WP_000366822.1|DBSCAN-SWA MDLYICEKPSQAKDLAGVMKASQRGDGFLHDGGNRVITWAFGHLLELYMPDDYDERYKSWSLETLPIAPESWRYNVRKSAFKQYKIVEGLVKKASTIYISTDYDREGEAIARSLLDRFRYSGPIRRVCLTALDESSIKKALNNVKDGKDTVSLYYAALARQRADWLVGMNVSRLYTVLARDVGFNHTLHVGRVITPTVALVCQRDREIAGFTPSPYWTLGVNVSVQNGQFAAQWIPPEECSDEQGRCVNKAYAEQVASQVNGANAVISKAETKPGKESAPLPFDLTSLQQYASKRWGYTAQQVLDAAQALYETHKATTYPRTDSRYLPESQKEDIPDILQALILSDQNVSGLVAGADPHRKARVFNDAKVTAHHAIIPTPARTDISAMSEIEFNLYDAIRRFYIAQFYSEFEFTKTSIEVQCGRHLFAASGKTPAKQGWKVLFASDSESSPKDEGEDTDAPVEQEKLPRVSQGEPALLNGAELANKMTRPAPHFTEATLLAAMENIARFVTEEKFKQILKDTAGLGTPATRASIIQGAVDKGYFKRQKKVLLATDKAHALIAVLPPAIKSPGMTAAWEQELEKVASGSGNMSVFMKQISTWICQMVEQLKVPAPVLTKEGGAMAKAFEGAKPPSHECFNCGGEMHRIKGKNGFFWGCQNEACKKTFPDNRGKPEKRIAAEDCPDCPDCGSPMRLRKGKAPGKKRASKFWGCTAYPDCKGTMPFKKSDFMD |
3 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
88188 : 98929
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017084|88188:98929|DBSCAN-SWA GTCAACCTCTTTTCTTCTTGTTTTGCTCGCGCTTCACCATTGCTCCAGCAGCTTTCAGAAGTCTCTGGTTCTCCGCCAGCTCCTCTTGGAGTTCCTGAGTATCCTCTTCTGTCTGAGGCTTTTTCAGCTCGGCCTCGCAATATTGGACCTCTTCCTGCAAGCTGACTTTCGCAAACTTGAGAGCGGCCAGTCGCGTCGTATAAACGCCAAAAGGCAATTCGCCACCTTCCCGGAACTGCTTCAAACACCAGCTCGGTATAGATGGCAACCAACCAAAGTCCCCATTCTTCCGTGACCTTTTCCCCCACGTAATCCCATCTAACTTTTGGGCAAGATTGACATAGCGTTGATCGCTGGTTGAGTTGCGTCGTTTCTGAATAGAGCGAACTATCCACTCTGTAACCTCGACCTTTGCTTTATCATCATCAGAGATGTAATAAAGGGCTGCGTACAACACAGCGCCTTTACGAATGACTGATGGTGGGTATGCCTGGGCTTTCATCTATCCCCCTATCGCTTTTTCTGTCCGACAAGACGGAGATGATCGGCGGCCAAGTCATACTGCTCGTTTTTGTCGCGGCGGCGGAATCTGTCAAAAAACTTCCCTCGTGGCAGGGTTTCTTCCATAGCGATCAGGCGGTTCAGCCACACTTCTTGAGGTAGCATCCCTGCTGGAGTCGGCCCGAGCTTACGTCCTTCCTTGACGTGCTCCATTGTTTGCGTGGCAGTAAAAATCGCACCACCAAACTTTCTCCACTTGAATTGCAGGGGCATATCTGGAGACTCATCCAGCATCAATTTCTTATTGGTTTGTTCTGTCACGACAATTACTCCACCATCCATTCTTCACTAAGCAGGAACGCCCAGCGCTCTTCTGCTTTTTCTGGGTTGTCTTTGGCCTGTTTGATCATGATCTCGGCGGCGTTAAAGCCTACCTCTCCACTGAACCGGCCCCATGAATGGCTATGCCACTCGCGCATCACACTTCGGCCAAGCGATGCAAGTTCTGGACTTACACCCTCATGGAGGGCATAGAGCTCCCAAGCATCCCACCCGTATCGTAATAGGTTGTGCCCTGGGGCGTTAAAGGCCTGAGCAGCCTTGAACCGCTCTCCAGGCTCCTTCCCTCTAACATCCACACCCTGGAGCACCAACCCCATTACCACTTCAATGACCGGCTCGCGTTGCTTCTTTGCCAGCTCGATGGCAGCCACCAGCATTGCTTTGGCGTCAGCAAATTTCCCATGCCCTTGGCACATACCGCAGGTTTCTTTGGAAGGGGAAAAGTCATAAACACCGGAACCAGCACAGAGGCGGCATGTCATGTCAATCATGGGCTCTTCTCTCCTCATACTCTTCGATGCGCTCTTTCAGACGCTGAACCACTGGTGCGAGCTCAGGGATAGCTTCCGCTTCCTCAAGCGTGTATCGCTTGTCTTCCTGGTAATCGACTATTTGAGGAGGCCTTGGCTGTTTAGGGAACTCAGCAAAGTCATTCAGCGACATCGAGGTAGGAAGTCCTCCTTCAATCTCACCTTTTTCGTTGAGTGACTGGGTGACGATAAGCTGTGTTCCGCCCACCTCGGTATCAAAGCGGTCATCAAAGCGCTCACCGATAGTCCAGCCGCCACGGCCAAGAACACAGGTCGTACTCATACGTAGGCGATTGAATGCTTTAGCGTCATCCCAGTTCAAAGGATTTTCATCCATGAGGAAAAAAGGCGCTTCGTCCCGAACGAACACCTTGGACTTGGCGTTATCGAAGATCGGCCCAAACACCCCCTGCTGGAGGTATGGTTCGACCTTCTCTGCAAGATCCTGGTGCCCTTGAGAACGCAGCGCCTCATAGAGCTGGGTGATTGTTTGTTTGCCGGTGCCCGGAAGGCAGGACAATACTGTCTGCTTTTCCTCGTCACTCAGGCTTACCATTCTGGACAAAAAGCTGACTACCAGCTCGTTGTGCCCATCGACCGTTTCAATGTTGAGCTTGTTCTCGTCCATCTTCTTCCTCAGTAATCGGTTCGATAAATTCAATGGAGTCCATGCTTACATGACTGATAATGGCTTTCAGGCCGCAGCAGTCGCATGGTTCAAAGGTCAGTTCTGATCCCTTGGGAGACTGATGCGTGACCGTTGCCACAGCCCCTAGAGGGATCACCCCCCAGCCGTTTTTTAGTACCCGAGTAGTTCTGACCAGCCGACCTTTGTACTCTCGTTTCAGTTTCGGATGCGGCACTACCGCATATCGCTTACTCATTTCGGTCCCCTTGTACCAAAGGCTCGACAACCAGCTCTTGAGCTTCGTCCCAGTCGGACACCTTTGCATCACCAAACGCAAAGGCAATTCGCATAGCCACTGTCGGCCTGCCTATTTTCATCAAGTAAGCCGCAGCACCGGCACACATCGACTCTTGTCCCGAAGGTGCATAGTTACCCTCTTCATCCCATTCACCACCTGACTTTGAATGCACGGTCTTGTGGCAATGAAACGTCGTCATGTCGTTTTCAACGATGTCGTTGATGATGCCTTCTAATCGCCCAGGGACCAGCTCGATAGCGCCCTCCTTCCGGAATGGACAGTTGGCGCAAGGTTTCTTCAAACGGAGATGATTTGCTTGCTTTGGCATACATATCACTTTTACAGTATCATTTTATGATTCTATGATATAGCCATATTCCGTGTAGTCAATATCTCACTAACAATTACTTTCTATCGGACGCTTACGCGCCCATTTTGGGCAGATAGACAAGTTATTTGGGCGTTTGGAGTGTGCGAGGTGGACAGCGGGGAGACTTTCACATGTGAAAGTTTTGTTTCTTGGTATCGTTTTATTGTCCCTTGATATTATTTTATGATGCTGTAATAATCATAAATAAGGGCCGCATCGCTCTTCGACCTTCGTTGCAGCCCTTACAACACAATCAAGCAATTAAGGAGCTTTGTTATGCTGCAAGGCAATACTAACACGAATAAGCGCATCCCGCTCGCGGCGTTCATGAAATGGCCGCTGGCGAAACGTCAGGACTTCATCGACCGGGAAATGTCCGGTTGCCCCGACTTTATCAAGACGTCTTTGCTTCGGCATTAAGGCGATCAGGCAGGAAAGCAAAGAACCTCGCTTCGGCGGGGTTCTTCGTTTCTACCTCTTGAATGTTTCGTCAGAACAAACTGGAGCGCTTATGTCACCAGAAACACAGCAACTTACATCCAAGGCTTTATCTCTCATCGAGCAGTCCCGATACAGAATGGGCACATCTCGGTTTGTTGAGGCCTTTATTGACCAGTGGGCATACTTGCAGACTGGCCTATACCCAGCCAAGGAGGAGATCCCGGAAGAACTTCAGCCGGTCGCCTTCGAGCTCTCTCACGTCCTGTCTGCCGCCATTAAGCGCGACCCCACCAGCGATGTTTTGGGTTACGTCCTAAGCATGTCTGGCTTCCACAAGAAGGGCACCAATTACTTCCCCACTCCTCCAGAGATTGGCCGCTTGATGTCACTCATTGTTGGCTCACAGTCTTCGGCAGACTTTTATGAGCCCTGCTGTGGTTCTGGCATCAACGCCATTCACTGGATGGAAAACCTGATCGAGAACCACGGTCCCGAAGCATTGAGAGAAGCCTCAATCTACCTGGAAGACATCGATCCGTTGATGGTGAAGTGCTGCATGATCCAGCTATTCCATTATTTCGAGTCCCGCAATACCACTCCCAAAACGCTGAGTATCGTCGGCATAGACACCCTTAGCAGACGAACCAAGAACATCGCCTACTACGCCGAAAAACCTCCAGCAACCGCCGCTACCGTGGCAGCATAAAAAAACCCGCCGATTGGCGGGTTTTGCATTCAATGCGCTGCTCTATGGCACCTTACAGTTTTCCGTACCGGTTCAAGAACGAAGACCTGTCTAAGATCCCCCAGTCTGTCAGCATGTAGTAGCCGGTGGCACCTCGTTCGCCGGTAGACTCCCTGACGAACAAGATATTCATTCCGAACTCATCACGCAGGGCAGACAACTGTCTCTTGATCGTTGATTCAGGAATATTTGTTGCCTTGTGAAGGTCTTGGAGACTTGGCTTCTCCGTTTTAGACAGGGCATTCACCAAAGCAAATTTTCTTTTCATGTCCTGTGAGATCTTCATATTCACCTGTTCTTGACAGGCCCAACCTCTCTGGCTGGGCCTCCTTTATTAGCCTTCGACACTCAGGAGTTCAATGTCTGACACAGGCACATGAACATGCTTTTCCTTGCCTTCGCCATCGAGCGTTTTAACCCAGACAGTAGACGGAACCAGAGCAACACGGTCGGTCATGATGACTCCACGTTTGGTCTCGCCATCCAGGTTAACGTTGACAGCAAAAATCAAACTGTCAGCCCGGACGTTCTTCCATTCCTTGTCCTTCGGCAGAGGAGGAAGAGCATCACCGCCTTCTTCATCTTTGTCCTTGCCGCTGTTATCTGGCTGCTTGACAGGATCTTTGTGCTCACCCTCTTCATCACGCAAAGGGTCTTCGTCATCATCGTCCTGACCATTGGAATTTTTACCCCCTTCCAGTTCCTCCTGGGCAAGGTTCAGGTCGTCATTCCCGGTTTGTTCCGACGTACCATCCCCACCCGAGTTGAGGGATTGCTCGTCGGTGTTGCCAGCGCCAAGCTCATCATTCTGGTGGGAGCCAGTCAGTGGGCCTTTTTCCATTTCGTCTTTGATACGTTTGGCATCATTCAGCAGCTCACGGCTTTGTTTACGAGTAATCCCGTCAGACATAGCCACCGCGCAGACGGCGCGACATCTTTCTTCATTCAGATCGAACAAGAGACGAAGGTTATTCAAGGTCTCTGTATCAGAACATACTTCATTATCGTATAACTCACGCACACAGTCAGGTAGCTTGAGCAACGACAGATGCGTAGATACGAAAGTGATATTCTTACCGAGCCGATCAGCAATATCCTTTTGCTTCCAACCTTCTTCAATAAACAGGTTTAACGCCTCGGCAATCTCTACCGGAGTCAAGTCATCCCGCTGGATGTTTTCGATCAGCTCACCAGCAGTCTCGTCCAAGTTGTTCTGGACCTTATCATTCACCACCAAGTCAATGGTCTCGATACCAGCGTGTTTACACGCTCTCCAACGCCGCTCCCCTTTTTGGATGACGAACTTGCCTTCTTCGTTCTTCGGGAACACGATGATCGGAGACTGCTGCCCTTCGGTCAGCAAGGTTGCCGCCAGCTCTTCAATGTTACGGAAGCGCTTACGAACCTGGACCTTGGATACAACGTCGTCAACAGGTACGGTAAGAACCTCTTTGCCTTTCTTGCCTTTGGCGGCTTTAGCAAGTTCGGACAGGCCTTTTAAATTGTTCAATGCCATCGCTTAGCCCACCTTCTCTAATAGTTCTTCCAACACCGCCTCAACTTCTTTGGCCGCGACATGTCCATAGCGAAGCTCCCAGACAGGGATGCCATCAGTCGTCGCCGTATCGAGCGGAGGCCGGTGCATAATTTTGTTCTCAAACAACAGATCCGGAACTGTGTTCTCCAGCGACTTGAGGGCTTTGTCGTGATTGACAGAGCGGTCCATGTCGTTGATCACGATGCCCAGGATCTCCAAATCTTGGTTGTACGCCTCGCGCACACCAATAATCGTGTTCAGGAGACCTTCTACGCCGTCCACAGCGAAGCCAGAGAGCTTTACTGGACATGCCACATGGGTAGACATCACCAACGCTGCCACCAGCTTTCTGCCGAGGCTAGGCGGACAATCAATCAGCACGTAGTCGTAGTTCTCAAACAGCTCAGCCAAATGGCGAGCCGGATTCATGGCCTGGTCAAGAGGCACAGCCTCCATCTCAAACAGATCCGGGTCGTTTTTCGGCGTATGAATGAGGTCTGCACCGCAAGGGCAGTGCATGACCTCAATGCCGTCCAGCTCGTAAGCGAACAGCTCTGCGGTTTTGGTTCCTGTGAGGATGGGCTCGTAGTCACCATCCTCAAGCTCTCGTCTGGGGGCCAGTCGAGAGGACGTGTTCCCCTGACCATCCATATCCAAGACCAGCACTTTCTTTTTCTTCTGTAACGCCAGATAAAAGGCCTGCTGGATACAGAGGGTACTCTTACCCACTCCGCCTTTCTGGTTGGCGAAGCTGATTACTTTTGCCATACCCACCTCTATTTTGGTTTCTCGCAGGTGATCAAGACCACCCCCAAACTTTCACATGTGAAAGATTGTAGCGATCATAAAATGATACTGCAATATCTAATTATGGTTCTGTTAAAACAAACTTTAAACAAAAAAACGGCCATGAAGGCCGCTTATTGACAAGGTTTGTGCTGTCAGCGCAATTGATTTGCTGCTCCAAGCCCATTCGCCAATAACTGCATCGCATCGTTGAACAGCGCGGAGCCCCGTTCCGGTGTGAGCAATTCCGGCATATCTTCTCGCGGCCAAGTACCGGCTACTTGAATGAGCAAACTGGCAGCCCAGTGGATCTGCTTTTCTTCACTTTCATCGGCCAGAGTGCATACGACGGGGAAACCGTACTTACGCCCCCAGCGACTCACCTCTTTGAACGATACCAGCTCAGGCTTTTGCAAATCCCGGCTGTAGGCCTCAGCTATCATGTGGTTCAGTTCTTTAGCGTCCATTTATCCCACTCTATTGTAAACAAGACATTTTTATCTTTTATATTCAATGGCTTATTTTCCTGCTAATTGGTAATACCATGAAAAATACCATGCTCAGAAAAGGCTTAACAATATTTTGAAAAATTGCCTACTGAGCGCTGCCGCACAGCTCCATAGGCCGCTTTCCTGGCTTTGCTTCCAGATGTATGCTATTCTGCTCCTGCAGCTAATGGATCACCGCAAACAGGTTACTCGCCTGGGGATTCCCTTTCGACCCGAGCATCCGTATGAGACTCATGCTCGATTATTATTATTATAGAAGCCCCCATGAATAAATCGCTCATCATTTTCGGCATCGTCAACATAACCTCGGACAGTTTCTCCGATGGAGGCCGGTATCTGGCGCCAGACGCAGCCATTGCGCAGGCGCGTAAGCTGATGGCCGAGGGGGCAGATGTGATCGACCTCGGTCCGGCATCCAGCAATCCCGACGCCGCGCCTGTTTCGTCCGACACAGAAATCGCGCGTATCGCGCCGGTGCTGGACGCGCTCAAGGCAGATGGCATTCCCGTCTCGCTCGACAGTTATCAACCCGCGACGCAAGCCTATGCCTTGTCGCGTGGTGTGGCCTATCTCAATGATATTCGCGGTTTTCCAGACGCTGCGTTCTATCCGCAATTGGCGAAATCATCTGCCAAACTCGTCGTTATGCATTCGGTGCAAGACGGGCAGGCAGATCGGCGCGAGGCACCCGCTGGCGACATCATGGATCACATTGCGGCGTTCTTTGACGCGCGCATCGCGGCGCTGACGGGTGCCGGTATCAAACGCAACCGCCTTGTCCTTGATCCCGGCATGGGGTTTTTTCTGGGGGCTGCTCCCGAAACCTCGCTCTCGGTGCTGGCGCGGTTCGATGAATTGCGGCTGCGCTTCGATTTGCCGGTGCTTCTGTCTGTTTCGCGCAAATCCTTTCTGCGCGCGCTCACAGGCCGTGGTCCGGGGGATGTCGGGGCCGCGACACTCGCTGCAGAGCTTGCCGCCGCCGCAGGTGGAGCTGACTTCATCCGCACACACGAGCCGCGCCCCTTGCGCGACGGGCTGGCGGTATTGGCGGCGCTGAAAGAAACCGCAAGAATTCGTTAACTGCACATTCGGGATATTTCTCTATATTCGCGCTTCATCAGAAAACTGAAGGAACCTCCATTGAATCGAACTAATATTTTTTTTGGTGAATCGCATTCTGACTGGTTGCCTGTCAGAGGCGGAGAATCTGGTGATTTTGTTTTTCGACGTGGTGACGGGCATGCCTTCGCGAAAATCGCACCTGCTTCCCGCCGCGGTGAGCTCGCTGGAGAGCGTGACCGCCTCATTTGGCTCAAAGGTCGAGGTGTGGCTTGCCCCGAGGTCATCAACTGGCAGGAGGAACAGGAGGGTGCATGCTTGGTGATAACGGCAATTCCGGGAGTACCGGCGGCTGATCTGTCTGGAGCGGATTTGCTCAAAGCGTGGCCGTCAATGGGGCAGCAACTTGGCGCTGTTCACAGCCTATCGGTTGATCAATGTCCGTTTGAGCGCAGGCTGTCGCGAATGTTCGGACGCGCCGTTGATGTGGTGTCCCGCAATGCCGTCAATCCCGACTTCTTACCGGACGAGGACAAGAGTACGCCGCAGCTCGATCTTTTGGCTCGTGTCGAACGAGAGCTACCGGTGCGGCTCGACCAAGAGCGCACCGATATGGTTGTTTGCCATGGTGATCCCTGCATGCCGAACTTCATGGTGGACCCTAAAACTCTTCAATGCACGGGTCTGATCGACCTTGGGCGGCTCGGAACAGCAGATCGCTATGCCGATTTGGCACTCATGATTGCTAACGCCGAAGAGAACTGGGCAGCGCCAGATGAAGCAGAGCGCGCCTTCGCTGTCCTATTCAATGTATTGGGGATCGAAGCCCCCGACCGCGAACGCCTTGCCTTCTATCTGCGATTGGACCCTCTGACTTGGGGTTGATGTTCATGCCGCCTGTTTTTCCTGCTCATTGGCACGTTTCGCAACCTGTTCTCATTGCGGACACCTTTTCCAGCCTCGTTTGGAAAGTTTCATTGCCAGACGGGACTCCTGCAATCGTCAAGGGATTGAAACCTATAGAAGACATTGCTGATGAACTGCGCGGGGCCGACTATCTGGTATGGCGCAATGGGAGGGGAGCAGTCCGGTTGCTCGGTCGTGAGAACAATCTGATGTTGCTCGAATATGCCGGGGAGCGAATGCTCTCTCACATCGTTGCCGAGCACGGCGACTACCAGGCGACCGAAATTGCAGCGGAACTAATGGCGAAGCTGTATGCCGCATCTGAGGAACCCCTGCCTTCTGCCCTTCTCCCGATCCGGGATCGCTTTGCAGCTTTGTTTCAGCGGGCGCGCGATGATCAAAACGCAGGTTGTCAAACTGACTACGTCCACGCGGCGATTATAGCCGATCAAATGATGAGCAATGCCTCGGAACTGCGTGGGCTACATGGCGATCTGCATCATGAAAACATCATGTTCTCCAGTCGCGGCTGGCTGGTGATAGATCCCGTCGGTCTGGTCGGTGAAGTGGGCTTTGGCGCCGCCAATATGTTCTACGATCCGGCTGACAGAGACGACCTTTGTCTCGATCCTAGACGCATTGCACAGATGGCGGACGCATTCTCTCGTGCGCTGGACGTCGATCCGCGTCGCCTGCTCGACCAGGCGTACGCTTATGGGTGCCTTTCCGCAGCTTGGAACGCGGATGGAGAAGAGGAGCAACGCGATCTAGCTATCGCGGCCGCGATCAAGCAGGTGCGACAGACGTCATACTAGATATCAAGCGACTTCTCCTATCCCCTGGGAACACATCAATCTCACCGGAGAATATCGCTGGCCAAAGCCTTAGCGTAGGATTCCGCCCCTTCCCGCAAACGACCCCAAACAGGAAACGCAGCTGAAACGGGAAGCTCAACACCCACTGACGCATGGGTTGTTCAGGCAGTACTTCATCAACCAGCAAGGCGGCACTTTCGGCCATCCGCCGCGCCCCACAGCTCGGGCAGAAACCGCGACGCTTACAGCTGAAAGCGACCAGGTGCTGGGGTCTGACGCTCAGTGGAACGAAAACTCACGTTAAGGGATTTTGGTCATGAGATTATCAAAAAGGATCTTCACCTAGATCCTTTTAAATTAAAAATGAAGTTTTAAATCAATCTAAAGTATATATGAGTAAACTTGGTCTGACAGTTACCAATGCTTAATCAGTGAGGCACCTATCTCAGCGATCTGTCTATTTCGTTCATCCATAGTTGCCTGACTCCCCGTCGTGTAGATAACTACGATACGGGAGGGCTTACCATCTGGCCCCAGTGCTGCAATGATACCGCGAGACCCACGCTCACCGGCTCCAGATTTATCAGCAATAAACCAGCCAGCCGGAAGGGCCGAGCGCAGAAGTGGTCCTGCAACTTTATCCGCCTCCATCCAGTCTATTAATTGTTGCCGGGAAGCTAGAGTAAGTAGTTCGCCAGTTAATAGTTTGCGCAACGTTGTTGCCATTGCTGCAGGCATCGTGGTGTCACGCTCGTCGTTTGGTATGGCTTCATTCAGCTCCGGTTCCCAACGATCAAGGCGAGTTACATGATCCCCCATGTTGTGCAAAAAAGCGGTTAGCTCCTTCGGTCCTCCGATCGTTGTCAGAAGTAAGTTGGCAGCAGTGTTATCACTCATGGTTATGGCAGCACTGCATAATTCTCTTACTGTCATGCCATCCGTAAGATGCTTTTCTGTGACTGGTGAGTACTCAACCAAGTCATTCTGAGAATAGTGTATGCGGCGACCGAGTTGCTCTTGCCCGGCGTCAACACGGGATAATACCGCACCACATAGCAGAACTTTAAAAGTGCTCATCATTGGAAAACGTTCTTCGGGGCGAAAACTCTCAAGGATCTTACCGCTGTTGAGATCCAGTTCGATGTAACCCACTCGTGCACCCAACTGATCTTCAGCATCTTTTACTTTCACCAGCGTTTCTGGGTGAGCAAAAACAGGAAGGCAAAATGCCGCAAAAAAGGGAATAAGGGCGACACGAAAATGTTGAATACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017084|88188:98929|91132_91276_+|WP_000939033.1|DBSCAN-SWA MLQGNTNTNKRIPLAAFMKWPLAKRQDFIDREMSGCPDFIKTSLLRH >NZ_CP017084|88188:98929|89014_89446_-|WP_005507681.1|DBSCAN-SWA MCQGHGKFADAKAMLVAAIELAKKQREPVIEVVMGLVLQGVDVRGKEPGERFKAAQAFNAPGHNLLRYGWDAWELYALHEGVSPELASLGRSVMREWHSHSWGRFSGEVGFNAAEIMIKQAKDNPEKAEERWAFLLSEEWMVE >NZ_CP017084|88188:98929|90436_90814_-|WP_001125905.1|DBSCAN-SWA MPKQANHLRLKKPCANCPFRKEGAIELVPGRLEGIINDIVENDMTTFHCHKTVHSKSGGEWDEEGNYAPSGQESMCAGAAAYLMKIGRPTVAMRIAFAFGDAKVSDWDEAQELVVEPLVQGDRNE >NZ_CP017084|88188:98929|95138_95954_+|WP_001043260.1|DBSCAN-SWA MNKSLIIFGIVNITSDSFSDGGRYLAPDAAIAQARKLMAEGADVIDLGPASSNPDAAPVSSDTEIARIAPVLDALKADGIPVSLDSYQPATQAYALSRGVAYLNDIRGFPDAAFYPQLAKSSAKLVVMHSVQDGQADRREAPAGDIMDHIAAFFDARIAALTGAGIKRNRLVLDPGMGFFLGAAPETSLSVLARFDELRLRFDLPVLLSVSRKSFLRALTGRGPGDVGAATLAAELAAAAGGADFIRTHEPRPLRDGLAVLAALKETARIR >NZ_CP017084|88188:98929|92376_93558_-|WP_001207227.1|DBSCAN-SWA MALNNLKGLSELAKAAKGKKGKEVLTVPVDDVVSKVQVRKRFRNIEELAATLLTEGQQSPIIVFPKNEEGKFVIQKGERRWRACKHAGIETIDLVVNDKVQNNLDETAGELIENIQRDDLTPVEIAEALNLFIEEGWKQKDIADRLGKNITFVSTHLSLLKLPDCVRELYDNEVCSDTETLNNLRLLFDLNEERCRAVCAVAMSDGITRKQSRELLNDAKRIKDEMEKGPLTGSHQNDELGAGNTDEQSLNSGGDGTSEQTGNDDLNLAQEELEGGKNSNGQDDDDEDPLRDEEGEHKDPVKQPDNSGKDKDEEGGDALPPLPKDKEWKNVRADSLIFAVNVNLDGETKRGVIMTDRVALVPSTVWVKTLDGEGKEKHVHVPVSDIELLSVEG >NZ_CP017084|88188:98929|90162_90444_-|WP_000044824.1|DBSCAN-SWA MSKRYAVVPHPKLKREYKGRLVRTTRVLKNGWGVIPLGAVATVTHQSPKGSELTFEPCDCCGLKAIISHVSMDSIEFIEPITEEEDGREQAQH >NZ_CP017084|88188:98929|98068_98929_-|WP_000027057.1|DBSCAN-SWA MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW >NZ_CP017084|88188:98929|93561_94347_-|WP_001151304.1|DBSCAN-SWA MAKVISFANQKGGVGKSTLCIQQAFYLALQKKKKVLVLDMDGQGNTSSRLAPRRELEDGDYEPILTGTKTAELFAYELDGIEVMHCPCGADLIHTPKNDPDLFEMEAVPLDQAMNPARHLAELFENYDYVLIDCPPSLGRKLVAALVMSTHVACPVKLSGFAVDGVEGLLNTIIGVREAYNQDLEILGIVINDMDRSVNHDKALKSLENTVPDLLFENKIMHRPPLDTATTDGIPVWELRYGHVAAKEVEAVLEELLEKVG >NZ_CP017084|88188:98929|92055_92328_-|WP_000703827.1|DBSCAN-SWA MKISQDMKRKFALVNALSKTEKPSLQDLHKATNIPESTIKRQLSALRDEFGMNILFVRESTGERGATGYYMLTDWGILDRSSFLNRYGKL >NZ_CP017084|88188:98929|96014_96818_+|WP_001082319.1|DBSCAN-SWA MNRTNIFFGESHSDWLPVRGGESGDFVFRRGDGHAFAKIAPASRRGELAGERDRLIWLKGRGVACPEVINWQEEQEGACLVITAIPGVPAADLSGADLLKAWPSMGQQLGAVHSLSVDQCPFERRLSRMFGRAVDVVSRNAVNPDFLPDEDKSTPQLDLLARVERELPVRLDQERTDMVVCHGDPCMPNFMVDPKTLQCTGLIDLGRLGTADRYADLALMIANAEENWAAPDEAERAFAVLFNVLGIEAPDRERLAFYLRLDPLTWG >NZ_CP017084|88188:98929|94520_94832_-|WP_000338945.1|DBSCAN-SWA MDAKELNHMIAEAYSRDLQKPELVSFKEVSRWGRKYGFPVVCTLADESEEKQIHWAASLLIQVAGTWPREDMPELLTPERGSALFNDAMQLLANGLGAANQLR >NZ_CP017084|88188:98929|89513_90188_-|WP_000344151.1|DBSCAN-SWA MDENKLNIETVDGHNELVVSFLSRMVSLSDEEKQTVLSCLPGTGKQTITQLYEALRSQGHQDLAEKVEPYLQQGVFGPIFDNAKSKVFVRDEAPFFLMDENPLNWDDAKAFNRLRMSTTCVLGRGGWTIGERFDDRFDTEVGGTQLIVTQSLNEKGEIEGGLPTSMSLNDFAEFPKQPRPPQIVDYQEDKRYTLEEAEAIPELAPVVQRLKERIEEYEERRAHD >NZ_CP017084|88188:98929|91367_92003_+|WP_000074431.1|DBSCAN-SWA MSPETQQLTSKALSLIEQSRYRMGTSRFVEAFIDQWAYLQTGLYPAKEEIPEELQPVAFELSHVLSAAIKRDPTSDVLGYVLSMSGFHKKGTNYFPTPPEIGRLMSLIVGSQSSADFYEPCCGSGINAIHWMENLIENHGPEALREASIYLEDIDPLMVKCCMIQLFHYFESRNTTPKTLSIVGIDTLSRRTKNIAYYAEKPPATAATVAA >NZ_CP017084|88188:98929|88697_89030_-|WP_000348669.1|DBSCAN-SWA MDGGVIVVTEQTNKKLMLDESPDMPLQFKWRKFGGAIFTATQTMEHVKEGRKLGPTPAGMLPQEVWLNRLIAMEETLPRGKFFDRFRRRDKNEQYDLAADHLRLVGQKKR >NZ_CP017084|88188:98929|88188_88689_-|WP_000647189.1|DBSCAN-SWA MKAQAYPPSVIRKGAVLYAALYYISDDDKAKVEVTEWIVRSIQKRRNSTSDQRYVNLAQKLDGITWGKRSRKNGDFGWLPSIPSWCLKQFREGGELPFGVYTTRLAALKFAKVSLQEEVQYCEAELKKPQTEEDTQELQEELAENQRLLKAAGAMVKREQNKKKRG >NZ_CP017084|88188:98929|96817_97654_+|WP_000480968.1|DBSCAN-SWA MFMPPVFPAHWHVSQPVLIADTFSSLVWKVSLPDGTPAIVKGLKPIEDIADELRGADYLVWRNGRGAVRLLGRENNLMLLEYAGERMLSHIVAEHGDYQATEIAAELMAKLYAASEEPLPSALLPIRDRFAALFQRARDDQNAGCQTDYVHAAIIADQMMSNASELRGLHGDLHHENIMFSSRGWLVIDPVGLVGEVGFGAANMFYDPADRDDLCLDPRRIAQMADAFSRALDVDPRRLLDQAYAYGCLSAAWNADGEEEQRDLAIAAAIKQVRQTSY |
16 | Colwellia_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
104978 : 118731
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017084|104978:118731|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017084|104978:118731|109123_110092_+|WP_013362812.1|transposase|DBSCAN-SWA MKDQITYLPDNADRSVAKQKFKITNWPTYNKALINRGSITFWLDDEAIQAWYESATPSSRGRPQRYSDLAITTVLVIKRVFRLTLRAAQGFIDSIFSLMNVPLRCPDYSCVSRRAKSVNISFKTPTRGEIAHLVIDSTGLKVFGEGEWKVKKHGQERRRIWRKLHLAVDSKTHEIICADLSLNNVTDSEAFPGLIRQTHRKIRSAAADGAYDTRLCHDELRRKKISALIPPRKGAGYWPGEYADRNRAVANQRMTGSNARWKWTTDYNRRSIAETAMYRVKQLFGGSLTLRDYDGQVAEAMALVRALNKMTKAGMPESVRIA >NZ_CP017084|104978:118731|112159_112720_+|WP_001161490.1|DBSCAN-SWA MQGHRIGYVRVSSFDQNPERQLEQTQVSKVFTDKASGKDTQRPQLEALLSFVREGDTVVVHSMDRLARNLDDLRRLVQKLTQRGVRIEFLKEGLVFTGEDSPMANLMLSVMGAFAEFERALIRERQREGIALAKQRGAYRGRKKALSDEQAATLRQRATAGEPKAQLAREFNISRETLYQYLRTDD >NZ_CP017084|104978:118731|107115_107613_+|WP_001083725.1|DBSCAN-SWA MNSESVRIYLVAAMGANRVIGNGPNIPWKIPGEQKIFRRLTEGKVVVMGRKTFESIGKPLPNRHTLVISRQANYRATGCVVVSTLSHAIALASELGNELYVAGGAEIYTLALPHAHGVFLSEVHQTFEGDAFFPMLNETEFELVSTETIQAVIPYTHSVYARRNG >NZ_CP017084|104978:118731|108020_108812_+|WP_001206356.1|DBSCAN-SWA MREAVTIEISNQLSEVLSVIERHLESTLLAVHLYGSAVDGGLKPYSDIDLLVTVAVKLDETTRRALLNDLMEASAFPGESETLRAIEVTLVVHDDIIPWRYPAKRELQFGEWQRNDILAGIFEPAMIDIDLAILLTKAREHSVALVGPAAEEFFDPVPEQDLFEALRETLKLWNSQPDWAGDERNVVLTLSRIWYSAITGKIAPKDVAADWAIKRLPAQYQPVLLEAKQAYLGQKEDHLASRADHLEEFIRFVKGEIIKSVGK >NZ_CP017084|104978:118731|117219_118731_+|WP_000811656.1|DBSCAN-SWA MKQLPPDTPEQSLITQYKGPRLVVKAYAGTGKTTTLVKYAHNNLDSRILYLAYNRAIRDEAREKFPANVDCKTSHQLAYATIGRGYQHKLSGNLRLTDIAQAVNTKNWTFAKDILDTLNAFMCSADMRILYTHFARADTGKVLTSKQERYQIQVVEGAELIWKRMTNVQDPFPTVHDCYLKQYQLGMPNLSRRYTTILFDEAQDANPVTSSIVLQQNCKVILVGDRHQQIYRFRGANNALDSKELMNADQLYLTHSFRFGPNVSLVANALLELKGETRPVVGRGPADQVLMFLPGDVGHRAILHRTVMGVIETALSATESGAQVFWVGGIDAYQINELQDLYWFSMAEPDRVKNKKLLDEYEDYFEYQEVAKATKDPEMMRAVKIINSYDEIPERLTTLRRNTVKEEFGADITVSTAHRCKGLEWDFVQLYDDFPDVLDPELDPMARDDEINLLYVASTRAMRILALNSAVEMVIRYITQKRMVEKQMKMAAEATEVEEDTTK >NZ_CP017084|104978:118731|115892_116933_+|WP_000101568.1|DBSCAN-SWA MARKLVEFDDVAAAAQKLKDAGKRPTVIAIRDIIGKGSFTTISTYLKQWSEEHSLDEELVEVVLPESVMSDAELFLQKIYTVAKASADEQLERERELLRQKEIEYQEDMQQAVDMANDATERAELLEEQLEALTNKKSELDAALGKAENSLSLKSAELERSLADIDKLEKRIVELEGKLEAKAADLTRAQDHLEQAKSENRSLSQKLATTEGELEEQKGKSIEQTEKLRAAQEQKTSLKEQLENVQAKLAQSQDSLATAKAHGESAERECQRLSGEVEKLDAKLSSAEAEARALVQDKGMMAGQLQEKDQQAKSLEQRLNDALTKISGLEQELAKAGKGGKKKEEN >NZ_CP017084|104978:118731|112723_115690_+|WP_001138014.1|transposase|DBSCAN-SWA MPRRLILSATERDTLLALPESQDDLIRYYTFNDSDLSLIRQRRGDANRLGFAVQLCLLRYPGYALGTDSELPEPVILWVAKQVQAEPASWAKYGERDVTRREHAQELRTYLQLAPFGLSDFRALVRELTELAQQTDKGLLLAGQALESLRQKRRILPALSVIDRACSEAIARANRRVYRALVEPLTDSHRAKLDELLKLKAGSSITWLTWLRQAPLKPNSRHMLEHIERLKTFQLVDLPEGLGRHIHQNRLLKLAREGGQMTPKDLGKFEPQRRYATLAAVVLESTATVIDELVDLHDRILVKLFSGAKHKHQQQFQKQGKAINDKVRLYSRIGQALLEAKESGSDPYAAIEAVIPWDEFTESVSEAELLARPEGFDHLHLVGENFATLRRYTPALLEVLELRAAPAAQGVLAAVQTLREMNADNLRKVPADAPTAFIKPRWKPLVITPEGLDRKFYEICALSELKNALRSGDIWVKGSRQFRDFDDYLLPAEKFAALKREQALPLAINPNSDQYLEERLQLLDEQLATVTRLAKDNELPDAILTESGLKITPLDAAVPDRAQALIDQTSQLLPRIKITELLMDVDDWTGFSRHFTHLKDGAEAKDRTLLLSAILGDAINLGLTKMAESSPGLTYAKLSWLQAWHIRDETYSAALAELVNHQYRHAFAAHWGDGTTSSSDGQRFRAGGRGESTGHVNPKYGSEPGRLFYTHISDQYAPFSTRVVNVGVRDSTYVLDGLLYHESDLRIEEHYTDTAGFTDHVFALMHLLGFRFAPRIRDLGETKLYVPQGVQAYPTLRPLIGGTLNIKHVRAHWDDILRLASSIKQGTVTASLMLRKLGSYPRQNGLAVALRELGRIERTLFILDWLQSVELRRRVHAGLNKGEARNSLARAVFFNRLGEIRDRSFEQQRYRASGLNLVTAAIVLWNTVYLERATQGLVEAGKPVDGELLQFLSPLGWEHINLTGDYVWRQSRRLEDGKFRPLRMPGKP >NZ_CP017084|104978:118731|105957_106971_-|WP_000845039.1|integrase|DBSCAN-SWA MKTATAPLPPLRSVKVLDQLRERIRYLHYSLPTEQAYVHWVRAFIRFHGVRHPATLGSSEVEAFLSWLANERKVSVSTHRQALAALLFFYGKVLCTDLPWLQEIGRPRPSRRLPVVLTPDEVVRILGFLEGEHRLFAQLLYGTGMRISEGLQLRVKDLDFDHGTIIVREGKGSKDRALMLPESLAPSLREQLSRARAWWLKDQAEGRSGVALPDALERKYPRAGHSWPWFWVFAQHTHSTDPRSGVVRRHHMYDQTFQRAFKRAVEQAGITKPATPHTLRHSFATALLRSGYDIRTVQDLLGHSDVSTTMIYTHVLKVGGAGVRSPLDALPPLTSER >NZ_CP017084|104978:118731|104978_105683_+|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP017084|104978:118731|107724_108015_+|WP_001336345.1|DBSCAN-SWA MFIQTAFSFSGVIQCLFCLFSGLRLHGLRRFSVFLASSPCVASASSYRFCSAVPPRWRSVFSRLAPVAKFKLSVLASGSNISVKPTRILRSAYLAR |
10 | Salmonella_phage(42.86%) | integrase,transposase | attL 104132:104145|attR 107731:107744 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
126059 : 129806
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017084|126059:129806|DBSCAN-SWA AATGGATAAATGCCAATTGATAGACATCCCAAGCGACCCAGAGAAGAAACGTGAGTGGATCAAGTACAAACTCAAGATCCAGGGGCTTTCTCTGGCCGCATTGGGCAGAAAACACAAAACATCTCGGCAGGTGGTGTCTACGGCACTCTATAAGCCCAGTCCACGCTGGGAACATGAGATAGCTACAGCTTTGGGTGTGAAGCCGTCTGAGATTTGGCCGGAGCGGTACGACGAAGAACACGAAATACCCCTCAGACATAAGGAGGCAAGCTGATGAAGAACAAAGCCAAGGCGCTAGTTCTGTCTGCGGCTCTCCTTTCATCAACAGCGAATGCTATTGACCTGAGCGGAACCATCTTCGACAAAGCAGCGAAAGCATATAACCTCGACCCTCTTCTAGTGTATTCGGTCGCATTGGCCGAATCTGCATCAGGGAGAGGTAATGGCTCTATAAGTCCTTGGCCTTGGACGCTTCGCGTTCCTGGGCTTCCTTTCTATGCTAAGTCGGAAGATCAGGCAAAGGCTAAGCTCGCTGAGTTTCAGCAGCAGTACGGTCGTGCCATTGATGTCGGGTTTATGCAAGTGAGCATCCGGTGGAATGGTCATAGAGTTTCTTCTCCAGCAGATCTTCTCGACCCAGAGACCAACGTCATGGTTGGGGCAGAGGTGCTATCAGAAGCCATTCAGTCATCTCCAAATGACTTGGAGCTTGGCGTTGGCCGCTATCACGCCTGGGAAGACGAAATCCGAGCCAGAAACTATGGTAGCCGAGTCTTGGCTATCTATCGCAACCTTCGTGATTTGTGAGGGGGGCGGAATGTTGGAACTGGATATTATTGGTGCGTGGGATGCAAGAGCCGTCAACCTCGATCAAGAAGAAGCTGATAGAAACGTCTACGAGTTCGATCTGACATTGTGGAACCTGCTATCCACTCTGGCAAAAGAACGTCCAGATGATGCGGCCTCACAATTTTCTTTGGGCATGGACACCGTTCAAAAGCTGTCACTGGCAACACCTTCCCAATTGGAAGCTCTGGCCTCTGGCGTGTTGATCTCTTTCAAACTCGAAACAGCAGAGCAGAACATCATCACGCGACTCTCTGGCGACTACGACCCTGTAGTTTTTATCAACCATAGTGTTGATGAATTTGATGCTGCCTACTGGTTGCTATTTAACCGCGTCGCATCGAGAGACCCGGAGATGGCAAAGGAAGTTTTCGGGGTTTCGAGAGAGCTTGCGGAGCTGGTGGCTAAGGCAACAGACAGCCAGTTGCGCCACATGTCTGGAACAACGGTTACGCATTTTACGCTTCGTTTTGCTCCGAGCATCATTGAAGAAATTCTCGATGACAGCCGGGAAGAGTTAACACACCCGGTATTGAAAAAACTGCAACAGTCTCTACAGGGACGTGGGAGGTGGAGATGAACATTGGCAACTCTGGTACATTGGGTCGCTGGGTTACAGCTCGACACATGGCCCTTGCTGGGTACATCACAAAAATCATCATGATCGAGACTGGTCTGACCTACAAACAGGTCAGACGGCTTTACCAGGATCTGGAGAGGGACGGATATACTCTGGAACGAAAATCCAGAACTTTCCGGGGTGGTGCGACACTGATTCATAGTCACACATCCAAGATACAGGCCTCTCTTCTAATGCAGCTCTACTTCAACATTGGTGGAGAAGCCGTGTTGCGGTCTGTGAACATCAAAGCCTTGAACAAGGCATTTAGAATGTATCACGCAATCCGCAAAGAAGTGCCCGGAATGAAAGGTGCTCGGTGGGCTCCGTTTGATATTACTGATGCCTGGTGTCTTGCTTCGGAGCTGAGAAGTGGGGACGCAATGCTGGAGGTGTGCGACAACTGCAAGTGTACGTACTTCACCTCTGTTAATCAAAGAACCTGCGTTGAATGTCCGTTCTGCAAAGAACAAGGAAGGCATGGTGGTGGGGAGAAAGAGTGTGCTTGAGTAGACTATGACATTTCGGACCAGAAGATGAGCGCCCAAACTTTGCGGCGCTCATTTTTTTACTTCTTCTGTGGGATACGGTAGCGCTCCAGCTCGACAGCTCCCAACCCCTTGAAAGCATCCGGGCGACGTCCTTGCCCACTCCACGAAACTCCGTCTTTTGAATATTTAGCATTATCAGGTTCTGATCTGCTCGTGAACATTTCGTTGAGCAAGCCGATGTCCACACCGCAGGATTCCATGTCGCTCATTATTCGCTCAGCCTGAGCTCGCTTTTCTTTTTCTTCTTCTTCTCGCTTTTTGTACTCTTCCTCCAGTTCATTGAGAACGCCCTTCATTCTGTCAATGATCTCCCGAACTTCATCTAACGGGAGTCCTCGCAACAGGGTGCGAATGCGGCTTTTACGCTTTAACTCTGCGATTATTAACTCTCTACGTTCAGCCGCTGATAGCGTAGAGAACTCCTCGTGGTCTTTCATGTCATACGGAGCCCATCAGTTTTCCTTTAAGTGAATCACGTTGAGAGTTCAGTTTTGCGTCAGTCTGCACTGGCGAATTTTGATGCTGTGCAGGTTGACTCTCTGAACTCTGTTGCTCAAAAGACCCAATGTTGCCAGAAAATCGAAGAGAATAAAGACCCAATAGAGCAAGGGCGCGGAGCCGATCACTACGCGCCTTATGCTGCATCTGGGACAGTTCACGATAGAGCTCCGGAAAGGCTTGCTCCGATATGTTCAGATTAGATATTTTTCCATCCCATTTGCTACCAGCCACAACGACCTCCTATCTATCAGCCGCAGAACCAGAAGCCCCTGGCATTGGATGCCACGGATTCGTTGGGCAGTACGATCCTGCTCTTAGGGAAAAGCTCCTTGGCCGCATCTTGGTAAGCCTCGGCACCGCCGCCAGCCAGCAGAACTACGTCAGCATCCATCCCGTCCTCACGCATTGACTTCCGCATAGGGATCAAGGCGTTTTGAGCGACTTTGGTTGAGGCTTTCTTGAAGTAGTCTTTGATCGATACCTTTTCACCGTAGAGGAAGATTTCGGCCTTACCGGCACGAATAGCTTTCTCGATCTTTTCGATGCCAGGGGCACCGCCGTGGTCTTCCTGAATTAGCCGGTCCGTTTCCTGTAGCAACACCGACATCGCCTTGAGGCTGGTGCCAGATGAGTGATAGCGGACCTCTCCCTCTTCAAGAGCTACCCAGTCTACAGAAAAGAACCCAGGGTCAATTACAACGGTTTTTCCTCCCTGGATAATCTCCAGGAGGTCTTCATCTTTGGTTGAACTTACAACATCCATGTAAGCACCGGCAGGTTGAGGTACAACCACGACAGACTTAACCGCTACCGATCGTTTTGGCGTGATCTGGTGTTCACCCTCAAGCCGAGATTTCAACGCCTCTCTGCGCTCTACGTCCATGTACTGACTAACAGGCAGGCCAGTCACCAGCACATCGATCTCCTTCTGCTCGGACATCAGGAGTGCAGCGTAGAAAAGAGCCTTGTATGGATTGGTCGAAGGATAGTCGCCGTGAAGCTCACGCTCCCATCCTTGCAATCGGTCAGGCTCGACGCCTGCAACCCATTTCTCTCCATCAATCACAACCTGAATGCAGGTCCCTGCACCGCCAGTTAACTGTTGTGGCATCAGTTCCAATGGACCTGCCCCCACCGGCATGACGACTGTGCGAGCTTCCTCACCTTTATACCCCATTGCCATTTTCAGGTTGGAGTAACCAATATCCAAACCCAGAACAAATTGACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017084|126059:129806|126059_126332_+|WP_000356489.1|DBSCAN-SWA MDKCQLIDIPSDPEKKREWIKYKLKIQGLSLAALGRKHKTSRQVVSTALYKPSPRWEHEIATALGVKPSEIWPERYDEEHEIPLRHKEAS >NZ_CP017084|126059:129806|126875_127484_+|WP_000891157.1|DBSCAN-SWA MLELDIIGAWDARAVNLDQEEADRNVYEFDLTLWNLLSTLAKERPDDAASQFSLGMDTVQKLSLATPSQLEALASGVLISFKLETAEQNIITRLSGDYDPVVFINHSVDEFDAAYWLLFNRVASRDPEMAKEVFGVSRELAELVAKATDSQLRHMSGTTVTHFTLRFAPSIIEEILDDSREELTHPVLKKLQQSLQGRGRWR >NZ_CP017084|126059:129806|128091_128511_-|WP_000651490.1|DBSCAN-SWA MKDHEEFSTLSAAERRELIIAELKRKSRIRTLLRGLPLDEVREIIDRMKGVLNELEEEYKKREEEEKEKRAQAERIMSDMESCGVDIGLLNEMFTSRSEPDNAKYSKDGVSWSGQGRRPDAFKGLGAVELERYRIPQKK >NZ_CP017084|126059:129806|127480_128032_+|WP_001020646.1|DBSCAN-SWA MNIGNSGTLGRWVTARHMALAGYITKIIMIETGLTYKQVRRLYQDLERDGYTLERKSRTFRGGATLIHSHTSKIQASLLMQLYFNIGGEAVLRSVNIKALNKAFRMYHAIRKEVPGMKGARWAPFDITDAWCLASELRSGDAMLEVCDNCKCTYFTSVNQRTCVECPFCKEQGRHGGGEKECA >NZ_CP017084|126059:129806|128822_129806_-|WP_000077458.1|DBSCAN-SWA MSQFVLGLDIGYSNLKMAMGYKGEEARTVVMPVGAGPLELMPQQLTGGAGTCIQVVIDGEKWVAGVEPDRLQGWERELHGDYPSTNPYKALFYAALLMSEQKEIDVLVTGLPVSQYMDVERREALKSRLEGEHQITPKRSVAVKSVVVVPQPAGAYMDVVSSTKDEDLLEIIQGGKTVVIDPGFFSVDWVALEEGEVRYHSSGTSLKAMSVLLQETDRLIQEDHGGAPGIEKIEKAIRAGKAEIFLYGEKVSIKDYFKKASTKVAQNALIPMRKSMREDGMDADVVLLAGGGAEAYQDAAKELFPKSRIVLPNESVASNARGFWFCG >NZ_CP017084|126059:129806|126331_126865_+|WP_000790610.1|DBSCAN-SWA MKNKAKALVLSAALLSSTANAIDLSGTIFDKAAKAYNLDPLLVYSVALAESASGRGNGSISPWPWTLRVPGLPFYAKSEDQAKAKLAEFQQQYGRAIDVGFMQVSIRWNGHRVSSPADLLDPETNVMVGAEVLSEAIQSSPNDLELGVGRYHAWEDEIRARNYGSRVLAIYRNLRDL >NZ_CP017084|126059:129806|128512_128806_-|WP_000919078.1|DBSCAN-SWA MAGSKWDGKISNLNISEQAFPELYRELSQMQHKARSDRLRALALLGLYSLRFSGNIGSFEQQSSESQPAQHQNSPVQTDAKLNSQRDSLKGKLMGSV |
7 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
133709 : 134825
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017084|133709:134825|DBSCAN-SWA ATCAATCAGAACCACAGGCCTCTCGGCCAAATGCGCCACCAGGGAGAACCCACTTCTGCCCCTCCGGCACAAAAATCGGGAGCGTGTAATCTTCTCTGGATACCTGCTCCAATGCCTCAACATCACTAATCTGTATCGGCGCAACAGCAGAACCTAAATCTATTACGTCGATTTTTTTTCTTGATACCGTCACACCAAAGGTTTGTTCATACTGAGCAATTTTCCCAGCTCGTTCAGGCCAGTAGTGACGGATCGTGGACCAGATACGCTGTGAGTTGTAGATGCAGGTCATACACGACGACCGGCTCCAGCCAAGGCGATAAGGGACTGGGGCCAGGATGCGGTGACGCTCGATTACTTCCCATACCTCCTCCTCAGTCCAATGAAGAACGGGCCTCCAGGCATCAACTAACCGTGCAGTCTTCCCATATCTTCTGTCACAGGCATGAGCCTCAAGCTGGTTGTACTTGGATCTGTTTGCACTTTCCTCCCGGCGCTCACCAGTGATGAAAAGGATCTTCTTCCCCTTGAAGCGCTCCTGGTTATTAAGAGCTCTGCGGCCAACATCGATCTTCAAGGCTGATGAGCACCACCTTGTTTGGAGTGATGGCGATTGCTGAGGGAAACGAAGGCGCGTACCAGGCTTAGAGCGCTTATGGTCTCTAGGCAGCACCAGAAGCCCCTCAGGCGTCTCTACACGATGGGGGTGGCTATAGGCATTGTCTTTGAGCATTTTGCCCTCAAAGCCGCCCTCAAGCCACGAGAAGTACATTGGGATACCCAGTTCTTCCCCGAGCTGACGACAGTAATCACGCATGAAGGCCCAATCCATCAACGAACTGCCTTCCTGACCATCAACATCATGGTGCCAGAACTCCACCTTTGACTTATCAACACCCATGTCCACCAGCCGCAAGTACGCAGCAATCGAGTCTTTGCCTCCAGACAGGCAAACAATGATGTGATCGTACAAACTCAGGTCCACATCCGGAGCGGAGAAGTACGTTGTTCTATCGTCACAACGCTGACTGGAAGATATGCCGGTAAGAACCGACTCCAGTGATGGCAACACCACCTGGTCATCGAACAAATCTCCTTGGTTTTCTCGTCTCAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017084|133709:134825|133709_134825_-|WP_014342195.1|DBSCAN-SWA MLRRENQGDLFDDQVVLPSLESVLTGISSSQRCDDRTTYFSAPDVDLSLYDHIIVCLSGGKDSIAAYLRLVDMGVDKSKVEFWHHDVDGQEGSSLMDWAFMRDYCRQLGEELGIPMYFSWLEGGFEGKMLKDNAYSHPHRVETPEGLLVLPRDHKRSKPGTRLRFPQQSPSLQTRWCSSALKIDVGRRALNNQERFKGKKILFITGERREESANRSKYNQLEAHACDRRYGKTARLVDAWRPVLHWTEEEVWEVIERHRILAPVPYRLGWSRSSCMTCIYNSQRIWSTIRHYWPERAGKIAQYEQTFGVTVSRKKIDVIDLGSAVAPIQISDVEALEQVSREDYTLPIFVPEGQKWVLPGGAFGREACGSD |
1 | unidentified_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
138466 : 144321
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017084|138466:144321|DBSCAN-SWA CATGCAAAAGGAAAAACTAATGGCAGAAAACAAAGAGATCCCCTGGGAGAAAGAACTCATTGAGAAGTACATGTTCACCCTGCATAAAGAGCAGGTGAAAGACCGGCGCTGGCGGACCATGTTGCGTGTGCTTCGCGCATCTGGTTTCGTGCTTCTCATGATCGGCTTCATCATTTTGGCATCTAATCCGGGTGGGATGCCGTGGCAAAGCGCCAAGGCAGGAGCCCCTCACACCGCGTATATCAACATCCGTGGTGAAATTGCTGCTGGCACTCTGGCCGATGCTGATCACCTTATCCCGTCCATCCAAGCTGCATTCGACAACCCGAACTCACAAGCTATCGTGCTTCGCATAAACAGCCCTGGCGGTAGCCCGGTTCAAGCAGGACGGATTTATGACGAAGTGAAGGCGCAGCGAGCCCTTCATCCGGAGAAAAAGGTCTACGCCATCATTGATGACATCGGTGCCTCTGGCGGTTACTACATCGCCTCTGCTGCGGATGAAATCTATGCTGACCGCGCCAGCCTTGTCGGTTCTATCGGCGTCATCAGCTCGGGGTTTGGATTCACCGGCTTGATGGACAAGCTCGGCATCGAGCGCCGGGCTATCACTTCCGGAGAGCACAAAGCGCTTCTCGACCCATTCTCCCCTCTTACCTCTGACATGAAGAAATTCTGGGAGGGCGTTCTATCGAAAACCCACCAGCAGTTCATCGAACGAGTGAAGGCTGGGCGGGGTGATCGACTGAAAGACGACCCAGAGGTGTTTTCTGGATTGCTCTGGAACGGGGAGCAGGCCAAAGACATTGGGCTGATTGATGGCCTGGGTAGTTTGAACTCCGTGGCGCGAGACGTCATCCACCAGAGCAACTTGGTGGACTACACACCAACCGAAGACATCATCCGGCGACTGACCCAACGAGCGAAGCTCGAAGCCAGTTCCTTCGTGCAAGAACTCAGCGCTGTGAAAGTTTACTGATAGGAGCAGTTTGATATGACAGAACAAAGTACCAAATCACTACGTCTCGGGGTTGTTGCCGCCATTCTTTTGGGGCTCGTAGGAACCGGGTTCGGGATCTACCAGTTCGTGAAAGAGAAGGATCTGGCGCAAGAGATCGCCAACGTGAAGTCTACGGTCAACCAGGTGAAGGATGCCGAAGGCGTCACCTTCAAAAGCAAGGCAGAGTTTGAAGCTGCTGTGGCCGAAAGCATCAACAAGTTTGTCGCGCAGAAACAACAAGCCGACATCGATCAGAAGTATGCCCAGTTCGAGGCAGCACCTGAGAAGGTCGAAGAAGGCAAACACATCTACGGGGACCTTGGTGCTCGGTTCACGCTGGTGGAGTTCTCCGATATGGAGTGCCCATTCTGCAAGCGATTCCACGACACACCCAAACAAATTGTGGATGCCAGCAAAGGCAATGTGAATTGGCAGTGGAAGCACATGCCTCTCGATTTCCATAACCCGGCAGCTCACAAGGAAGCTCTGGCCGCTGAATGTATTGCTGAGCAGAAGGGCAACCGTGGCTTCTGGGTCTTCGTTAACGACATTTTCCACCATACCCAGGGGAATGGTGGCGGTGTTGCTGACCTGGCCTCTGTTGTCACTGGTGTTGGTGCTGATCTGGATGCGTTCCGGGAGTGCCTCGGCTCAGGAAAGTACGAAGACAAGGTTGAAGCTGACATCCAGAAAGCCAAGAGCTATGGCGTCAACGGGACACCAGCCACTTTTGTAGTGGACAACCATACCGGCAAGAGCCAGCTTCTCGGCGGCGCTCAACCGGCGCAAGCCATCATGGCCGTGATGCGAAAAATGATGATTGAGTCGCAACAAGACGACTCCGCGAACCAATAAAAACTTTCACATGTGAAAGTGGAGTGAGAACTGATGATCAAGATTACAACTAAATTGGGATGCCTTCTGGCGGGGCTGCTTGTCCTGTCGGCTTGCTCAAGCGTCCCTCAGCCAAACAACGAATACGCGAAGGCCTTGGATGATACCAAACAGGTATGCGCTGCCTGTGCCCTGGTTGGTAATGACCTGCTGGTTGCCCTCAACAAGTCATGCGACACCCCAATGACCCCCGAGACTCTTACAAGCGTCATGAACAGTAACCCGATGTTTGCCGCCATGATGGCAATTAACTCCATAGGTGGAACCGACTTCTATCAGGTTTACCGTGATGCGGCCATAGACACCCTGCGGTGCAATGAAATGGACAGTTGGCCTGATCGGACCAAGGTGCGTTTCCAGCAGCCCGACATGCAAAAGGCGCTGGCCTTGAGGGTTTCTGCCAGACAGCAGAAGGCAAATTAACTTTCACATGTGAAAGTCAGGCTCTCCGGGGCCTGATTTCACTATGAGGTGAATCTATGGAGTTACAAGAAGCAAAAGAGGCTCTCGATAGCCTTCATCCACACAAGGCCTCAGCGCCTTTGAGGCTTGTCATCCACCAGCCAGGTGGGATTGGTGGAACCCCTACAGTGGGGGTGAAAGCTATTCACGCAGGCTTTGACTGGGACAGCAACACCATCCTGATCTATCCGGAAGAGCAGCTCACCCGGTTGACGCCGGATGAGGTCGCCGCCATCACGAAGTCAGTATCGAAAGGACAGTCCTGGCATTCATATCAGCAGTTCAAGAAGTATCGGGAGCAGTTGGCCGAAGCCACGGAAGAAATTAATAGGCTCAGGGCTGAGCTGGGCAGGTATCAGAATAACGGGAGGGGGTAATGCTAAAACGCGGAATTATCAATCTCGCTGCTAGTTACATCATTGTTGATGCCCTACTCCGGAATGCAGCAATTTGGATCTTTGGCTTGTCCTTCTCCGTTGGTGGCACTTACGTCACTGGCGAGGCCAGTACATGGGTCGTTTACCTAGCCACTTCTGGTGCCATGACACTCTGTTCTGTCGTAACAGCCTACCTGCTCGTGACCTATCACCGCTGGGGGCTGATGACGGCCAGGGTCTGGTTGCTATTGAGTGCCTGCCTAAACGGCTATGCCGTCTATTTGAGTAGCCACAACATCCAGTTGGTGGTGGCACTGCTTTCCAGCCTGTTTATTGCTTTGTGGATGCTCAAGACCCTTGAGCAACCAGCAGTGAAGGGGACGTACAAGGTAATCGCTGATCTTCACCGTCAGCTATGGGGAATGTTGAAGGGGCAAACACAATGACGACGAATACTCAAAACGCGAACGCCAACCAGGTTCGGTCTTTACGCGACATGCTTGTCCCCGCCCTGTTGTTCTATGTGGTGATGACGGCCATGTTTGTGGGTCTTGACGCATTCATGGATAAACCCACCAGCATGAACCTGCCATTTATGCCGTTCCTTGTCTCGATGGTGAGTTTTACCAGTGACGCACGTCGAGCGTGGGACTGGCGAAACGGGACCAAGGTTGTAGCTGTATTGACTGCGGTAGCCATGCTGTTGGCATTCATCTATCAGCTCGCGGTCGGAGAGATGAATCTCTTAGGGGTTGGTATATACCCGGCCACAGCCATCCTTCTGTTGGCAATCTCCTGGGTGATTCGCGCTATCGGAAAGACAGCACCTTTCCAGTTCCTGGGGAGACACCTGGCGCGGTTTGGTGCATCGAAGTGGGTCCAGCGTACCGCCGCAGTCATTGTGCTCGCGGGAGGCCTTGCCATCACTATCTATGCCTACTGGCTTAACCACGGGAGCTGATGATGATCATTGCAACGAAGAACGGCTTTCTGGTGGCCGCAGAACTAATCAGGGAAGAGTCCGGGTACTGGCTACTACAGCCTCGTGACCAAAAGACGCCGGTCAGGGTGAATAAGCAGGATAACAATAAACGCGCTTTCACGCATATGGGAGACGCCCTTCGCTGGGCCGGTGATCCTGAGCTTGCAAAGCAATTCGATGCCGAGGGGGAAGAACATGCAAATTCGTGACTACATGACAAAGTTGTTTGACGCATTTGGTGATGTGGAGGAAGTCACCCGAGAAATGCTTCTGGAGCAGGCGGAGCTCATTCATACGATCAGCGATAAGTGTCAGAGCACAGGCCTGTTTCTGGATAGTCAGGTTCGTTTCAACCAGTTCGTTCAAGAGATTGAGGCTGACGACAAGGTAGAGGATCGGTTGCTTCATGCTTGGTGCTGGGTAATGGACCGAATAGTGAAGGCTCCAACATCCTTTCACATGGATGGGGCTGTGATTTTGACAATGCCTCTGGTCGCCAGATACCTGCCACCGGTTGAACAGGAGCCGGAAACCATCGTGGTGAATCTCGATGAGGACTACAAGGCTCCTGTAGGCAACCAAACGCTCTGCGAGCTCGTTATGGAACGGAGGCATTGGCCGCAAGGTGCAACCTGTGCGACCCAAGAAGCGGACGGGGGAGTCCTCTACTGGGACGCCCCGGTTGATGTGGTAGAGGAAGGCAGAAAGGTCGCCGGTAAGCACGGCATGATGGCCGAGATCGGATTGAAACATCAGGTTGATGCCTGGTATGCAGATATGGACGAAACACGGCTCGCAACCGATTGGAACACCGCCGTCATTACGCCTCACTGCTTGCTGCTTTCCTATCTGGATGTGCTTCAAAAGAACAAAGTTCCCTTTGATGAAGGTGTGCAGCTCGCTGCCGAATGGGTGAAGCAACTTGGCGGGGAATTTCGTGAAGACACTGAGGAAGCGCCGGAAGCTGAGGCTTCAGTGCTTTCCCTGGGGAGAGCCACGGCTCATTGCTTTAAACCCTATCCGGACACAAAAAATTTCTATTACGAGGCCTAAGCCTCACCCAAACAGGAGGATCAACATGCGATACCAGGTATTTAAAACGAAGGAAGGGGGCCAGCCGGTGTTTACGGCACCGTGGTACTGGTTGGCCTCTGCCATTGCTCACTGGTCATCTCTTAACTGGGATGCCTGTCGAATCGTAGACAGCAAGGTGGATGAAACAAGGCTCTGTTGGGCCAAGGCTCTACCGGCTGGGAAAAAAAAGTAATTTGGATGGAGTGATTATGAGGTTAGGTTTTGTGAAAAATACGGGGGTTTCAGCGTTCCTGGTAGCCATGCTGGTGGTGGCCCCTCAGGTATGGGCAGAAACCTTTACTGCGAAGGTTGTGGGGGTGTCTGACGGTGATACGGTCAAGGTCCTGACTGAACAAAGCTGTGACTCCGGGAAAGATTGCCGGAGCGGCAAAATCCAGTACCGGGTAAGGCTGGCGGAAATCGACACCCCAGAGAAGAAACAACCCTACGGCTCAAAGGCGAAACAGGCGTTGTCCGATCTGGTGTTTGGTCGAATGATTAAAGTCGAGCAAATCGACAAAGACCGTTATGGCCGTCTGGTCGCCAACCTTTATGTCGATGGCAAATGGGTCAATGCCGAAATGGTCCGTTCTGGGAGTGCGTGGGTGTACCGGCAGTACGCCAAAACACCGGAGCTGTTCAAGCTGGAGGCCGAAGCCAAAGCCGATAAGCGAGGTCTCTGGGCATTACCGGAATCGGAGAGAACTCCCCCTTGGGAGTGGCGAAGAAAGCACTAACCACACCCCAGAGTATGCAGGTGTAAACAGTAACCAAGAAAACAAACAGGAATAACGATGAACAAAAGTGAACTGATTATGAAAGTGGCCGAAGACGCTGACATTAGCAAAGCAAAGGCCGAAGCTGCGGTAAATGCGCTGATCAACTCAGTGACAGAGGAGCTTAAAGCGGGTGGGACAGTAGCGCTCACTGGGTTTGGTACTTTCCACGTTAAGGAACGCGCAGCGCGAACCGGGCGGAATCCCCAGACTGGAGAGAACATCCAGATCGCGGCGGCCAACATTCCTGGGTTCAAAGCTGGTAAGGGGTTGAAAGACTCCGTGAACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017084|138466:144321|143463_143991_+|WP_001236377.1|DBSCAN-SWA MRLGFVKNTGVSAFLVAMLVVAPQVWAETFTAKVVGVSDGDTVKVLTEQSCDSGKDCRSGKIQYRVRLAEIDTPEKKQPYGSKAKQALSDLVFGRMIKVEQIDKDRYGRLVANLYVDGKWVNAEMVRSGSAWVYRQYAKTPELFKLEAEAKADKRGLWALPESERTPPWEWRRKH >NZ_CP017084|138466:144321|141197_141644_+|WP_000919345.1|DBSCAN-SWA MLKRGIINLAASYIIVDALLRNAAIWIFGLSFSVGGTYVTGEASTWVVYLATSGAMTLCSVVTAYLLVTYHRWGLMTARVWLLLSACLNGYAVYLSSHNIQLVVALLSSLFIALWMLKTLEQPAVKGTYKVIADLHRQLWGMLKGQTQ >NZ_CP017084|138466:144321|142375_143233_+|WP_001167032.1|DBSCAN-SWA MQIRDYMTKLFDAFGDVEEVTREMLLEQAELIHTISDKCQSTGLFLDSQVRFNQFVQEIEADDKVEDRLLHAWCWVMDRIVKAPTSFHMDGAVILTMPLVARYLPPVEQEPETIVVNLDEDYKAPVGNQTLCELVMERRHWPQGATCATQEADGGVLYWDAPVDVVEEGRKVAGKHGMMAEIGLKHQVDAWYADMDETRLATDWNTAVITPHCLLLSYLDVLQKNKVPFDEGVQLAAEWVKQLGGEFREDTEEAPEAEASVLSLGRATAHCFKPYPDTKNFYYEA >NZ_CP017084|138466:144321|138466_139444_+|WP_001326179.1|DBSCAN-SWA MQKEKLMAENKEIPWEKELIEKYMFTLHKEQVKDRRWRTMLRVLRASGFVLLMIGFIILASNPGGMPWQSAKAGAPHTAYINIRGEIAAGTLADADHLIPSIQAAFDNPNSQAIVLRINSPGGSPVQAGRIYDEVKAQRALHPEKKVYAIIDDIGASGGYYIASAADEIYADRASLVGSIGVISSGFGFTGLMDKLGIERRAITSGEHKALLDPFSPLTSDMKKFWEGVLSKTHQQFIERVKAGRGDRLKDDPEVFSGLLWNGEQAKDIGLIDGLGSLNSVARDVIHQSNLVDYTPTEDIIRRLTQRAKLEASSFVQELSAVKVY >NZ_CP017084|138466:144321|140353_140782_+|WP_000591074.1|DBSCAN-SWA MIKITTKLGCLLAGLLVLSACSSVPQPNNEYAKALDDTKQVCAACALVGNDLLVALNKSCDTPMTPETLTSVMNSNPMFAAMMAINSIGGTDFYQVYRDAAIDTLRCNEMDSWPDRTKVRFQQPDMQKALALRVSARQQKAN >NZ_CP017084|138466:144321|139459_140320_+|WP_000139698.1|DBSCAN-SWA MTEQSTKSLRLGVVAAILLGLVGTGFGIYQFVKEKDLAQEIANVKSTVNQVKDAEGVTFKSKAEFEAAVAESINKFVAQKQQADIDQKYAQFEAAPEKVEEGKHIYGDLGARFTLVEFSDMECPFCKRFHDTPKQIVDASKGNVNWQWKHMPLDFHNPAAHKEALAAECIAEQKGNRGFWVFVNDIFHHTQGNGGGVADLASVVTGVGADLDAFRECLGSGKYEDKVEADIQKAKSYGVNGTPATFVVDNHTGKSQLLGGAQPAQAIMAVMRKMMIESQQDDSANQ >NZ_CP017084|138466:144321|142158_142389_+|WP_096043120.1|DBSCAN-SWA MMIIATKNGFLVAAELIREESGYWLLQPRDQKTPVRVNKQDNNKRAFTHMGDALRWAGDPELAKQFDAEGEEHANS >NZ_CP017084|138466:144321|140838_141198_+|WP_000422768.1|DBSCAN-SWA MELQEAKEALDSLHPHKASAPLRLVIHQPGGIGGTPTVGVKAIHAGFDWDSNTILIYPEEQLTRLTPDEVAAITKSVSKGQSWHSYQQFKKYREQLAEATEEINRLRAELGRYQNNGRG >NZ_CP017084|138466:144321|144048_144321_+|WP_001043047.1|DBSCAN-SWA MNKSELIMKVAEDADISKAKAEAAVNALINSVTEELKAGGTVALTGFGTFHVKERAARTGRNPQTGENIQIAAANIPGFKAGKGLKDSVN >NZ_CP017084|138466:144321|141640_142159_+|WP_000210756.1|DBSCAN-SWA MTTNTQNANANQVRSLRDMLVPALLFYVVMTAMFVGLDAFMDKPTSMNLPFMPFLVSMVSFTSDARRAWDWRNGTKVVAVLTAVAMLLAFIYQLAVGEMNLLGVGIYPATAILLLAISWVIRAIGKTAPFQFLGRHLARFGASKWVQRTAAVIVLAGGLAITIYAYWLNHGS |
10 | Wolbachia_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
147950 : 151943
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017084|147950:151943|DBSCAN-SWA CATGTACAGATACCGTCTGGAAAGGGATGTGCAACCCGAAGGCCTTGTGTTCGGTTATTTTGGTGTAAACGGCTCTACGGCCACGGCCACCGAGGACGATCACACGGTCAGAAAGTGGATAGGGTTTACCAAGGTCAACGGAGGGAGGCGATTCATAGTCGGTAATGCTTTTGCTTTTCGGGCGACCGACGTTCGAGAGCTGGCTACGGCGGTTGATCCTGTCGGGCCTGAAAATGAAATCCACTTGGAAAGGATTATTCGGGATGCTGATGTCTTGGTGCCCTGCTGGGGGAGCCGAACTAAGCTGCCTAAGTCTTTGCATGTTCATTTGGACAGGCTTTTAGAGCAGCTCGTTGCATCTGGGAAGCCGGTATTGGCATTTGGCGTGACTGGTTCGGGGGACCCGAAGCACCCACTAATGCTTGGATATTCGACAAAACTTGTGCCCTGGGGAGGAAAATAATTATGTCGATGCTTGAAGCACGTTACTTCGTGGCAAAGATAAGCGATGCACAGGCCGTGCTCTGCGATGAGGAGCTGGCGACACTGGAAAGGCTGATCCGGAAGGTTGATGATGGCCGCAGAGCAAATGGCAAGAGCTCGCTTACTTGCGTTGTTGTCGAAGAAGATTGGCCGAACTGGCAGCAAACGGTTGACTCTGTACTTTCACTTGCTGACGGGAAAGACAACGATTGGACCAATGCCACACCAGAACAAATCAAGGCCTTTTGGGTCGATGACTCAGTTTGGAAAACTCTGGATGGCCGGGATAAATGGATTGAAGATCTCGACCTGCTGGTGGACGGTTCCCCGGTGGCTTCTGAGTGGGAACCTTTTGGCTTGGAATCAGGGCAGTCTGTCGTCATACGAGGCGGATGGATAGAAGGGAATGCCTTGAGTGATGATGGCGTACCGCTAGTGCAGGCATTCGTCGCTTGGAAACAGGGCCAAGACAACCACTAAAGGAAAATTACTTCGGAAGGGCGGCTATGGCCGCTTTCTTTTTAATATTTACAGCATCACATAATGATACTATGATGTTGTTAATTTACTTGGGGAGGCGCTTATGCTCACTGCTAAATGTATAGGGTGCGGATGCACCGATGATCACGCTTGTGTTGAAAACGGTCAACCGTGTCACTGGCTTCGCGTGAATAGAGTGGAAGGTATCGGGGTCTGCTCTTCGTGCCCGGATGCTCTCAATCAATTCGCATCGACCAGCCAGGAACAAGCAACTGGACAGGATGACTACCGGAACAGTCCAGAATGGAAGGATTTTTCATCACGCATTGGTAATGCACTATGCGGGGGCCGGAGCAAAGCAAAGTAAGGTAAAAACGGCTATGCCGTTTTTTATTTGTCTATTACGGCATCACATTATAAGCCTGTAAATGCTGAATCTGTAATTGCCCAAAATGGGCGTGAGCAGGGGCGGGGTGTGAGGTCGTTCTAAGGCAAAATACTTTGTACTGGCAGAACAAAGAAAGAATGAACTTTCACATGTGAAAGTTTTTGGGGTACGGGATGGAACAAGCAATTCAAAGTTACTTGGCTGACGACCGGCAATATCAAGACAGGATTACCGCAGCTCTCAGCCAGGTTGAAGAGAAAGGTGCAGAGTACGAAGCTCTTTGCCAACAGCGTGCTCAGTTGGGGATCTGGCAAAAAATTATAACGTTCTGGCAGTTTCGTCGAGACATCGCCGTTATACGTTCAGCACTAAAAGGCCATAACAGCGATTTGCGGTATTTGCGCCGTGGGAGAGACCAGCTCAAAGAGGGATTGGTTTCTCGGGCCGTGAAGCAAGCGATTGACGGTAGCCAGATTCTGGAACGAATCACCCAAGCTCAAGATAGGCTTGACGCCGCATCTCGACTCCACGAGAGCAACAAGCGACTGGTGGACATGGGGCAAAAAGCCTTACGTGAAATCAGTGAGGCCTCTTCCAGTGTTTCATCAGCACAAACAATGGAGGTTCTCGACCTTGTGACTGACAACAAGGGCATTTCCGTCATGTCGTCGATGTCAAACTCCTCGGCCAGCAGTGAAATAGACGATGCGAAGAGAGCTGTGAAAGCCTTCGCAAATGCGCTGGGGGATCATCGTGACATTGTGGGCTCACTGCACCACTCAATGGCAACTGAGTTTATCGATCTGGGTATGGACTTTGCCGGTTTGAATGATGGTTTCGACTTTGGGAGCGTCTTCTCGCTGTTCAGCTTGTCGTCTGCCAGTTCCTCTCTGGACAAAGTAGAGTCTCGCGTTGAATCTCTGATGCCAGATCTAAGACGAGCCGCCTCCAATTCGGCAGCAGAGTATGCCCGTGTTAACGAAGAGTTCTTTGGCCTGAAACAACAGGCCTGTTGCCAAGTGCATGAGTTGCTGGTGACAAATGGTATAGACGTGTCAGTCAAGCGCGTTGAGTCCGCCGTGAACAGCTACAGAGTTGGAAGGTGATATTTACAGCATCATAAAATGAACTTATGATGTGAGGTGATCAACAAGTCGAAATTTATTTAAAGGATAAGCGATGAGCGATATTACACAGCAAATGGACAAACTTGAGATTCCAATCAAGTTGTCCTTTCCAGTCATCAACGTTAGCACTTTTGAGCTGGGCCGCGCAGAGAGCGTTTTCTCTGACATTGCAAAGAAAGTCGGCAAGCACTTTATTGTAATGCCATTCAAGAAGCTGCCTGATCCAGGCACGATGAAGGCAATGGTGGACGAGTCCAAGAAGTCCTCCAAAAACGGAGTTGTCGTGTTCGACACTTTCTTTTTCGACCGCCAACGTGCAAACCCGGAAACACTCCCAGCCCTCAAGTCATCACTGACCTATCTGGAGAATGAGGGGATCAACTACATCATCGCTGGCAAAGACGTCTTCAATGAAGAGTTCGTTTATCACATCGATCTCCCGGCTATGAGCAATCAGGAAATCCTGAAACTGCTCCAGACCTGTGAAGATAACGTGAAAGATGGTGGAGTCTTCGAGAGCAACGAACGTGCTGTCATCGCAAACCACGCCTTGGGCTTGTCACACACCCAGATGAAGAACGTCTTCACCTACTCCGCTTACTTGAAATTCAAGGGTGAAGAATACCTGGGCGAGATCCGAAAAGAAAAAGCTCACATCTTGCGTGATGTCGGCCTCGATGTGCTTGAGGCCATTGATATTGGGAATGTCGGTGGTCTCGAAAACCTCAAGGAGTTCCTCCAGATACGTAAAGCCGGTTGGGACAAAGACCTTCCGGTAAAAGGTGTCCTTCTGGCCGGTGTACCTGGTGGTGGTAAATCGCTGACGGCAAAAGCCGCTGCCGGTGTACTTGGCACTACCTTGGTTCGCCTGGATATGGGCCGTTTCTATAGCAAGTATCTCGGTGAAACCGAGCGCCAGTTCAATCGTGCATTGCAGACCATTGAGCAGATCGCACCCGTTGTTGTGTTGATTGACGAGATGGAGAAGTTTTTTGGTAATGCCGATGGCGAACACGAAGTATCCAAGCGCCTGCTGGGCTCTTTCCTCTACTGGCTTCAAGAGCGCAAGAAGAAGATCTTCATTGTGGCGACGGCCAACCGGGTTCAGTCGCTGCCTCCTGAATTGATGCGAGCTGGCCGCTGGGACCGAGCATTCTTCATTGATCTGCCAAGTGTGGCTGAGCGCCAGAAGATTTTTGAGATCCACCTCGCCAAGCAGAAGGCCAACATCGCCGCGTTCGATATGCCTACGCTACTTCGTACCACCGAGGGATACACCGGGGCAGAGATTGAACAGGCCGTCATTGACGCGATGTATCTGGCGAACGCTCAGGACAAAGAGCTCAACAATGAAGCGCTGGTGGATGCGGTCACTCGCATTACCCCGACCAGTGAAACTCGCCGGGAAGACATCAACCAGATTCGCAGTTTGCGGGATCAAGGCTTCTATCCGGCCAATAACTTCGATGTTCAAGAGCAGAATGGCTCTGGACGCAAACTTGCCATCGAGGACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017084|147950:151943|148414_148912_+|WP_000062185.1|DBSCAN-SWA MSMLEARYFVAKISDAQAVLCDEELATLERLIRKVDDGRRANGKSSLTCVVVEEDWPNWQQTVDSVLSLADGKDNDWTNATPEQIKAFWVDDSVWKTLDGRDKWIEDLDLLVDGSPVASEWEPFGLESGQSVVIRGGWIEGNALSDDGVPLVQAFVAWKQGQDNH >NZ_CP017084|147950:151943|147950_148412_+|WP_000286591.1|DBSCAN-SWA MYRYRLERDVQPEGLVFGYFGVNGSTATATEDDHTVRKWIGFTKVNGGRRFIVGNAFAFRATDVRELATAVDPVGPENEIHLERIIRDADVLVPCWGSRTKLPKSLHVHLDRLLEQLVASGKPVLAFGVTGSGDPKHPLMLGYSTKLVPWGGK >NZ_CP017084|147950:151943|149473_150406_+|WP_000434071.1|DBSCAN-SWA MEQAIQSYLADDRQYQDRITAALSQVEEKGAEYEALCQQRAQLGIWQKIITFWQFRRDIAVIRSALKGHNSDLRYLRRGRDQLKEGLVSRAVKQAIDGSQILERITQAQDRLDAASRLHESNKRLVDMGQKALREISEASSSVSSAQTMEVLDLVTDNKGISVMSSMSNSSASSEIDDAKRAVKAFANALGDHRDIVGSLHHSMATEFIDLGMDFAGLNDGFDFGSVFSLFSLSSASSSLDKVESRVESLMPDLRRAASNSAAEYARVNEEFFGLKQQACCQVHELLVTNGIDVSVKRVESAVNSYRVGR >NZ_CP017084|147950:151943|150479_151943_+|WP_001280522.1|DBSCAN-SWA MSDITQQMDKLEIPIKLSFPVINVSTFELGRAESVFSDIAKKVGKHFIVMPFKKLPDPGTMKAMVDESKKSSKNGVVVFDTFFFDRQRANPETLPALKSSLTYLENEGINYIIAGKDVFNEEFVYHIDLPAMSNQEILKLLQTCEDNVKDGGVFESNERAVIANHALGLSHTQMKNVFTYSAYLKFKGEEYLGEIRKEKAHILRDVGLDVLEAIDIGNVGGLENLKEFLQIRKAGWDKDLPVKGVLLAGVPGGGKSLTAKAAAGVLGTTLVRLDMGRFYSKYLGETERQFNRALQTIEQIAPVVVLIDEMEKFFGNADGEHEVSKRLLGSFLYWLQERKKKIFIVATANRVQSLPPELMRAGRWDRAFFIDLPSVAERQKIFEIHLAKQKANIAAFDMPTLLRTTEGYTGAEIEQAVIDAMYLANAQDKELNNEALVDAVTRITPTSETRREDINQIRSLRDQGFYPANNFDVQEQNGSGRKLAIED |
4 | Pseudomonas_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_10 |
159433 : 166259
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017084|159433:166259|DBSCAN-SWA AATGAAAAACTTAGCAACCTGGCTTCTGGCCGCAGCATTTACGACAGCCGCCCTGCCCGCCTTTGCGGTGGAACCATCCGTTCAGGTTGGCTACTCGCCTGAAGGAAGCGCCCGCGTTCTCGTCCTGAGCGCCATTGACTCCGCAAAAACCTCGATACGGATGATGGCTTATTCTTTTACCGCCCCGGATATTATGAAGGCACTGGTAGCAGCCAAAAAACGGGGAGTTGATGTGAAAATCGTAATTGATGAAAGGGGCAATACGGGGCGCGCCAGCATTGCGGCCATGAACTACATAGCGAACAGCGGCATCCCTTTGCGTACTGACAGTGATTTCCCTATCCAGCATGACAAGGTGATCATCGTGGATAATGTGACCGTTGAAACTGGCAGCTTTAATTTCACCAAAGCGGCCGAAACGAAAAACTCGGAGAATGCGGTGGTGATCTGGAACATGCCTAAGCTCGCTGAATCATTCCTCGAACACTGGCAAGACCGCTGGAATCGGGGGAGAGACTACCGTTCCAGCTACTGAATACTGACCGCCGAAAGGCGGTTTTTTTTGTTCAAAGAAACTGATCTCAGTATCGCGCACGGGGCAGCTGGCCAACGTCGCCGGCATCGCGCCGGCAAAAATCGAAAAACAGAAATATCAGCAAGATAGCTTAAACAGGTGTCGGGAAATTTCGTTGAGATATTTTGAAGGAATCACAGTGTAAGCAGGCGGCCTATTTCAAAAAAGGCGGCTGTACGGTAGTCACTGACTCTCTCGCAGATCTTCCCGCTCATGTACCAGTAATACCCGTCAGTGCTGACAATATCGAGCAAATACCGCATATCATAAACCGTATCGGGTATTACCTCACCCTCACCGGCCAGAACGCCGCTGGCAATAGAATGGTTCCCTCCTCGTACAAAGCCTATCCGCCAGGGCAACCACAAAGTAACGCGGTGGTTAATATCCTGTACCCACGGATTGCCCTTAGCGCTGCCTATATGGGGTCTGAGGTCCAACCATGCGAAAAACCACGTTAAGAAAGCAACCTTCTGAAAAGGCGACGTTTATCAGTTTTTTTTCCGGCCATAAAGGGGGCGGAAATTATTCCCTGCACGGGTATTCGCAAGGATTTCGGTAGTGCTCTGGCTCTGCCCCCCATAACCTGGCGGACAGAGCATGATTGGGAAAGCGGTACCCTCACGGCAGAAACGATTGACGCAGGCTATATTTCTATTATTCTGGAAATATAGATAAAGGAGGTATTATGGATTTAAACACTGCTGCAAACGCACTTCGAGAACTGGGCCACCCGACACGTCTCAGCATATACCGGGAGCTGGTCAGGGCGGGTCATGAAGGCCTGCCGGTTGGCGAACTGCAGAAGCACCTTGAGATTCCTGCCTCCACGCTCAGCCATCATCTTTCAGCGCTGATATCCGCTGGACGGCACTGTTGCAAATAGTCGGTGGTGATAAACTTATCATCCCCTTTTGCTGATGGAGCTGCACATGAACCCATTCAAAGGCCGGCATTTTCAGCGTGACATCATTCTGTGGGCCGTACGCTGGTACTGCAAATACGGCATCAGTTACCGTGAGCTGCAGGAGATGCTGGCTGAACGCGGAGTGAATGTCGATCACTCCACGATTTACCGCTGGGTTCAGCGTTATGCGCCTGAAATGGAAAAACGGCTGCGCTGGTACTGGCGTAACCCTTCCGATCTTTGCCCGTGGCACATGGATGAAACCTACGTGAAGGTCAATGGCCGCTGGGCGTATCTGTACCGGGCCGTCGACAGCCGGGGCCGCACTGTCGATTTTTATGGCACTGTTGCAAATAGTCGGTGGTGATAAACTTATCATCCCCTTTTGCTGATGGAGCTGCACATGAACCCATTCAAAGGCCGGCATTTTCAGCGTGACATCATTCTGTGGGCCGTACGCTGGTACTGCAAATACGGCATCAGTTACCGTGAGCTGCAGGAGATGCTGGCTGAACGCGGAGTGAATGTCGATCACTCCACGATTTACCGCTGGGTTCAGCGTTATGCGCCTGAAATGGAAAAACGGCTGCGCTGGTACTGGCGTAACCCTTCCGATCTTTGCCCGTGGCACATGGATGAAACCTACGTGAAGGTCAATGGCCGCTGGGCGTATCTGTACCGGGCCGTCGACAGCCGGGGCCGCACTGTCGATTTTTATGGCACTGTTGCAAATAGTCGGTGGTGATAAACTTATCATCCCCTTTTGCTGATGGAGCTGCACATGAACCCATTCAAAGGCCGGCATTTTCAGCGTGACATCATTCTGTGGGCCGTACGCTGGTACTGCAAATACGGCATCAGTTACCGTGAGCTGCAGGAGATGCTGGCTGAACGCGGAGTGAATGTCGATCACTCCACGATTTACCGCTGGGTTCAGCGTTATGCGCCTGAAATGGAAAAACGGCTGCGCTGGTACTGGCGTAACCCTTCCGATCTTTGCCCGTGGCACATGGATGAAACCTACGTGAAGGTCAATGGCCGCTGGGCGTATCTGTACCGGGCCGTCGACAGCCGGGGCCGCACTGTCGATTTTTATCTCTCCTCCCGTCGTAACAGCAAAGCTGCATACCGGTTTCTGGGTAAAATCCTCAACAACGTGAAGAAGTGGCAGATCCCGCGATTCATCAACACGGATAAAGCGCCCGCCTATGGTCGCGCGCTTGCTCTGCTCAAACGCGAAGGCCGGTGCCCGTCTGACGTTGAACACCGACAGATTAAGTACCGGAACAACGTGATTGAATGCGATCATGGCAAACTGAAACGGATAATCGGCGCCACGCTGGGATTTAAATCCATGAAGACGGCTTACGCCACCATCAAAGGTATTGAGGTGATGCGTGCACTACGCAAAGGCCAGGCCTCAGCATTTTATTATGGTGATCCCCTGGGCGAAATGCGCCTGGTAAGCAGAGTTTTTGAAATGTAAGGCCTTTGAATAAGACAAAAGGCTGCCTCATCGCTAACTTTGCAACAGTGCCGATAAAAATATATCATCATGAACAATAAAACTGTCTGCTTACATAAACAGTAATACAAGGGGTGTTATGAGCCATATTCAACGGGAAACGTCTTGCTCGAGGCCGCGATTAAATTCCAACCTGGATGCTGATTTATATGGGTATAGATGGGCTCGCGATAATGTCGGGCAATCAGGTGCGACAATCTATCGATTGTATGGGAAGCCCAATGCGCCAGAGTTGTTTCTGAAACATGGCAAAGGTAGCGTTGCCAATGATGTTACAGATGAGATGGTCAGACTAAACTGGCTGACGGCATTTATGCCTCTTCCGACCATCAAGCATTTTATCCGTACTCCTGATGATGCATGGTTACTCACCACTGCGATCCCCGGGAAAACAGCATTCCAGGTATTAGAAGAATATCCTGATTCAGGTGAAAATATTGTTGATGCGCTGGCAGTGTTCCTGCGCCGGTTGCATTCGATTCCTGTTTGTAATTGTCCTTTTAACAGCGATCGCGTATTTCGTCTCGCTCAGGCGCAATCACGAATGAATAACGGTTTGGTTGATGCTAGTGATTTTGATGACGAGCGTAATGGCTGGCCTGTTGAACAAGTCTGGAAAGAAATGCATAAGCTTTTGCCATTCTCACCGGATTCAGTCGTCACTCATGGTGATTTCTCACTTGATAACCTTATTTTTGACGAGGGGAAATTAATAGGTTGTATTGATGTTGGACGAGTCGGAATCGCAGACCGATACCAGGATCTTGCCATCCTATGGAACTGCCTCGGTGAGTTTTCTCCTTCATTACAGAAACGGCTTTTTCAAAAATATGGTATTGATAATCCTGATATGAATAAATTGCAGTTTCATTTGATGCTCGATGAGTTTTTCTGATAGTTAGTCTTTGTAGAGACACAAACCTGAAATTCCGGACACCGCGCTTGGCACTGTTGCAAATAGTCGGTGGTGATAAACTTATCATCCCCTTTTGCTGATGGAGCTGCACATGAACCCATTCAAAGGCCGGCATTTTCAGCGTGACATCATTCTGTGGGCCGTACGCTGGTACTGCAAATACGGCATCAGTTACCGTGAGCTGCAGGAGATGCTGGCTGAACGCGGAGTGAATGTCGATCACTCCACGATTTACCGCTGGGTTCAGCGTTATGCGCCTGAAATGGAAAAACGGCTGCGCTGGTACTGGCGTAACCCTTCCGATCTTTGCCCGTGGCACATGGATGAAACCTACGTGAAGGTCAATGGCCGCTGGGCGTATCTGTACCGGGCCGTCGACAGCCGGGGCCGCACTGTCGATTTTTATCTCTCCTCCCGTCGTAACAGCAAAGCTGCATACCGGTTTCTGGGTAAAATCCTCAACAACGTGAAGAAGTGGCAGATCCCGCGATTCATCAACACGGATAAAGCGCCCGCCTATGGTCGCGCGCTTGCTCTGCTCAAACGCGAAGGCCGGTGCCCGTCTGACGTTGAACACCGACAGATTAAGTACCGGAACAACGTGATTGAATGCGATCATGGCAAACTGAAACGGATAATCGGCGCCACGCTGGGATTTAAATCCATGAAGACGGCTTACGCCACCATCAAAGGTATTGAGGTGATGCGTGCACTACGCAAAGGCCAGGCCTCAGCATTTTATTATGGTGATCCCCTGGGCGAAATGCGCCTGGTAAGCAGAGTTTTTGAAATGTAAGGCCTTTGAATAAGACAAAAGGCTGCCTCATCGCTAACTTTGCAACAGTGCCGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGATGAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAACTGTCAGACCAAGTTTACTCATATATACTTTAGATTGATTTAAAACTTCATTTTTAATTTAAAAGGATCTAGGTGAAGATCCTTTTTGATAATCTCATGACCAAAATCCCTTAACGTGAGTTTTCGTTCCACTGAGCGTCAGACCCCGAAAACGATTTAGGAGACACCGATGAACATCAACGATGCCCTCACCTCCATCCTGGCCTCAAAAAAATACCGCGCCCTTTGCCCGGATACCGTGCGGCGCATCCTGACTGAGGAATGGGGGCGGCATAAATCCCCCAAACAGACCGTAGAGGCTGCACGCACCCGGCTGCATGGAATTTGCGGGGCATATGTCACCCCGGAATCGCTCAAGGCTGCTGCCGCCGCGCTTTCTGCGGGCGATGTAAAAAAGGCATTGTCGCTGCATGCCTCCACCAAGGAGCGACTGGCCGAGCTGGATACCCTGTACGATTTTATCTTTTCAGCCGAAACTCCCCGCCGCGTGCTGGATATCGCCTGCGGTCTTAACCCCTTGGCGCTATACGAGCGCGGCATTGCATCCGTGTGGGGCTGTGATATCCACCAGGGATTGGGGGATGTCATCACCCCCTTTGCTAGGGAAAAAGATTGGGATTTTACCTTTGCCCTGCAGGATGTGCTGTGTGCGCCGCCCGCCGAAGCCGGCGACCTGGCGCTGATTTTTAAGCTTTTGCCCCTGCTGGAGCGGGAGCAGGCCGGTTCTGCCATGGCACTTTTACAATCCCTCAATACCCCGCGCATGGCTGTCAGCTTTCCCACGCGTAGTTTAGGCGGGCGTGGAAAAGGCATGGAGGCGAACTACGCCGCATGGTTCGAGGGCGGCTTGCCCGCCGAGTTTGAGATTGAGGATAAAAAGACCATCGGAACAGAACTTATATACTTGATAAAAAAGAATGGATAAGCCAATCAGAAGGCAAATCATCTAAAAAAGAGGAACGAAAAATATTTTTCGTTCCTCTTTTGTTCTATCGAACAAGCACACTACGACTGCTGTTTTTGAAGCAGCCTTTTATAGCTCAGCTCGATGCCCAACGCCCCCAGCGGCGCTGTAAGTATAATGGCAAGAACCGCCACCGCAAGTATGGTTTCCCCACTGCCAAGCCCCATCGCCAGCGGAATAGCGCCGATTGCAGCCTGCACCGTTGCCTTGGGCAGATAGGCAATCATGCAGAACAGGCGCTCCTTCCGGGATAGGTCTGTACCCAGCGTACTCATCCACACGCCCAGCATGCGAAACAGCAGCGCAGCTGTGATCAGCAGCATGCCGCTTAGCCCGGCGGAGAAAAGGTAACGGATGTTGACCGTTGCACCCACCAGCACAAACAGCCAGATTTCTGCCGCCACCCAAAGCTTTGAAAATTTGCCGGATATACGCTTTGCAACCGGGGCGTTGGTTTTTAAAAGGGTGACGCCCATCCCCATCACCGCCAGCAATCCGGAAAATAGCGCCCTTTCGCCCAGGGTTTTCTCCAACGCAACCAGCGCAAAGGATGCGCCCAGCAGCAGGAGCACCTTGATCGTATCACGCATATGTACCCGCTTAAAAAGGGCTGCCGGCCGGCAAGGTGCTGTGCACGGATCTGCCCTGGCAGGGCATCAACGAAGACCAGAACCTGGGCATCGCCATCACCCGCCGTGCGCTGGAAGCCCCGCTGCGCGCCATCGTGGCCAACGCCGGTGAAGAACCGAGCGTGATCGTGGCCAACGTCAAGGCCGGCGAAGGCAGCTACGGCTACAACGCCGCCACCGGCGAGTTCGGCGACATGATCGCCATGGGCATCCTGGACCCGACCAAGGTGACCCGCTCGGCCCTGCAGCACGCCGCTTCCGTCGCCGGCCTTGCGATCACGACCGAAGTGGTCGTGGCCGAAGTGCCGAAGAAGGAAGAGCCGGCCATGCCGGGTGCTGGCGGTATGGGCGGCATGGGCGGCATGGATTTCTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017084|159433:166259|163445_164150_+|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP017084|159433:166259|161694_162399_+|WP_001067855.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIIGATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP017084|159433:166259|162517_163333_+|WP_000018326.1|DBSCAN-SWA MSHIQRETSCSRPRLNSNLDADLYGYRWARDNVGQSGATIYRLYGKPNAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTAFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGKTAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDASDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGIADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF >NZ_CP017084|159433:166259|165866_166259_+|WP_099147893.1|DBSCAN-SWA MPAGKVLCTDLPWQGINEDQNLGIAITRRALEAPLRAIVANAGEEPSVIVANVKAGEGSYGYNAATGEFGDMIAMGILDPTKVTRSALQHAASVAGLAITTEVVVAEVPKKEEPAMPGAGGMGGMGGMDF >NZ_CP017084|159433:166259|159433_159967_+|WP_000792636.1|DBSCAN-SWA MKNLATWLLAAAFTTAALPAFAVEPSVQVGYSPEGSARVLVLSAIDSAKTSIRMMAYSFTAPDIMKALVAAKKRGVDVKIVIDERGNTGRASIAAMNYIANSGIPLRTDSDFPIQHDKVIIVDNVTVETGSFNFTKAAETKNSENAVVIWNMPKLAESFLEHWQDRWNRGRDYRSSY >NZ_CP017084|159433:166259|164461_165217_+|WP_012372818.1|DBSCAN-SWA MNINDALTSILASKKYRALCPDTVRRILTEEWGRHKSPKQTVEAARTRLHGICGAYVTPESLKAAAAALSAGDVKKALSLHASTKERLAELDTLYDFIFSAETPRRVLDIACGLNPLALYERGIASVWGCDIHQGLGDVITPFAREKDWDFTFALQDVLCAPPAEAGDLALIFKLLPLLEREQAGSAMALLQSLNTPRMAVSFPTRSLGGRGKGMEANYAAWFEGGLPAEFEIEDKKTIGTELIYLIKKNG >NZ_CP017084|159433:166259|165297_165846_-|WP_014342204.1|DBSCAN-SWA MRDTIKVLLLLGASFALVALEKTLGERALFSGLLAVMGMGVTLLKTNAPVAKRISGKFSKLWVAAEIWLFVLVGATVNIRYLFSAGLSGMLLITAALLFRMLGVWMSTLGTDLSRKERLFCMIAYLPKATVQAAIGAIPLAMGLGSGETILAVAVLAIILTAPLGALGIELSYKRLLQKQQS >NZ_CP017084|159433:166259|161316_161658_+|WP_002210549.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYGTVANSRW |
8 | Escherichia_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017082_1 | 662638-662719 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017082_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017082_1
>1.1|662666|26|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder CTGGGCTTCTTCTTCGGCTAAACGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017082_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017082_1 >merge|NZ_CP017082|1|662638-662719|CRISPRCasFinder CTTGTTCAGCTTCAAGTTGCGCTTGACGCTGGGCTTCTTCTTCGGCTAAACGCACTTGTTCAGCTTCTAGTTGCGCTTGACG >NZ_CP017082|1|1|662638-662719|CRISPRCasFinder CTTGTTCAGCTTCAAGTTGCGCTTGACG CTGGGCTTCTTCTTCGGCTAAACGCA CTTGTTCAGCTTCTAGTTGCGCTTGACG
>NZ_CP017082.1|WP_004245385.1|660350_661016_-|cell-division-ATP-binding-protein-FtsE MIRFEHVSKAYLGGRQALQGVDFHLRPGEMAFLTGHSGAGKSTLLKLICGIERPSDGAIWFAGHDISRLKNSEIPFLRRQIGMIFQDHHLLMDRTVYDNVSLPLIIAGASEEDIRRRVSAALDKVGLLDKAKNYPIQLSGGEQQRVGIARAVVNKPTVLLADEPTGNLDGELSEGIMRLFEEFNRVGVTVLMATHDMTLVERRNYRILTLGQGRMVGGQNG >NZ_CP017082.1|WP_004248880.1|659380_660358_-|cell-division-protein-FtsX MAKGKHSRKAMPTPKAKTKALRGGRREQWRYAWRNTMADFLRQPLSSFLTVMVVAISLTLPSICYIVWKNVSTAAEQWYPTPQLTVYLDKSLDDSLAQATIKNIEALDKVEEVNYLSRQDSLVEFRSWSGFSSALDMLEENPLPAVAIVTPVMDPNDEQLMVNLRDAVANIAGVDEVRMDDSWFTRLSTLTSLVGQIAMVIGSLMIVALLLVIGNSVRLNIFSRRDTINVMKLIGATDGFIMRPFLNWGLVLGFIGAIFAIIFSALLVWKLSDVVTQAATVFGTTFSISGLGFDESVILILVSMTIGWFAAWLTTMQHLRQFTPE >NZ_CP017082.1|WP_004245383.1|658184_659039_-|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoH MTKEMQSLALVPQGSIEAYIRAANSYPMLTAEEEKELAERLHYEGDLEAAKTLILSHLRFVIHVARSYSGYGLPQADLIQEGNIGLMKAVRRFNPEVGVRLVSFAVHWIKAEIHEYVLRNWRIVKVATTKSQRKLFFNLRKNKKRLGWFNQDEVELVAKELGVSESDVREMESRMSAQDMAFDMSADDSDDSHPVAPVLFLEDKSSDFADGIEEDNWDNHAADRLTLAIKTLDERSQDIIRARWLEDDNKSTLQELADKYGVSAERVRQLEKNAMKKLRLAIED >NZ_CP017082.1|WP_004245382.1|656941_658090_-|glycerate-kinase MKEIKIVIAPDPFKESLSAKEVAEAIKQGFSRYLPDADYCCIPMADGGEGTVTSLVDATHGRFITTPVCDPLGKQVTATWGVLGDNTTAVIEMAQASGLHLIPSSQRNPNLTTSYGTGELICAALDLGVKKIILGLGGSATNDGGAGMMQALGLGLKDKSGTSLPFGGHALSQLHSIDINQLHPKLASVDIEIACDVTNPLCGELGASKVFGPQKGATEQDIAQLDSALHHFGTYLEKMTQRTLINIAGSGAAGGLALPLLAFTQATLSPGIDLVANAVELEKQLIDADLVITGEGRMDSQSAQGKTPIGVAKLAKKYHRPVIALVGGYLPDYDVVHQQGIDAVFSIMPGVATLQQAFDNAEQNLQETAYNVARLYALSLQK >NZ_CP017082.1|WP_004245381.1|656549_656966_+|aspartate-1-decarboxylase-autocleavage-activator-PanM MKLTIENLPQLSAQDKIDLGKIWQDSEYQMALTAPITTEHALFVARFNGRLLAACRIKYQAKTALISDFMVREVTRRRGVGHYLLTQCLEKNPTITHWQALLKTGQINDPVAQAFLAHHHFATSLQADTYDYFCNDKA >NZ_CP017082.1|WP_017628210.1|655350_656538_+|MFS-transporter MKLSIRSLFYLVCFSALLGSLAQNIYTPVLPLIQQQFNTTLSLVNLTVSAFTFAMAVMQLCYGSLIDKWGRKPILLSGLTISIIGAFICIWANSINLLIFGRVIQAIGIAAIPVVAATILGDLYQGNERAKAMGSYQMLLALAPASGPLLGGYLAQHYHYQSIFVFLSMVGLVLLIAHLFYLPETRPEQKQSVKSLSAMRQVLAAPEGKSVFVISFMVFYNYFCLLVFLPLIAFHLYHLNSSEIGGLYVPMSIALVLGSYLYRKVCHLFSAEYGVIITSCINLAMLSLFALFWQISLPIMLILTVLYGLSLGLTMPTHTTLLTSHFSSVRATAMGIYNFIRYCGMAAGPMVASYFVTDNHYQYVFYSCVILTSLALCFAIKTLLSTLKQQRQTID >NZ_CP017082.1|WP_017628211.1|654759_655236_-|MarR-family-transcriptional-regulator MTRQQVTTQELLNGLSELLHLKEANNDEGHKKVLAEKGLENYSLTELHVIHCIGEESMRNLTTISDYMAMTRGAVSKICRRLQSKGAIEKIKLADNQKEIFFILTTEGEKLFHTHELLHQQSQAKWITLFEQYDQNERLAIKRFLADVANRFRHKEKA >NZ_CP017082.1|WP_063073875.1|653967_654720_+|M48-family-metallopeptidase MKIKLLATVMVSAALLSGCKNLDTSMLAQSGTQLFQAATLSDDDVKALTNDACKEMDAKNKIAPANSNYTKRLNNIAKALGNEVNGTPVNYKVYLTKDVNAWAMANGCVRVYSCLMDIMTDNEVEGVLGHEMGHVALGHTRKAIQVAHATVAARTAASSAGGVAAQLSSSQLAEMGEKLVNAQFSQHQETQADNFSYDLLKKRGVNTSGLVTGFEKLAKLGGSDSSMFDSHPPSKERADNIRNRIAEDKK >NZ_CP017082.1|WP_004248885.1|652383_653478_+|sn-glycerol-3-phosphate-ABC-transporter-ATP-binding-protein-UgpC MTTVTLTNLEKRYPNGYQAISTLNLSIEQGEMVVLVGPSGCGKSTLLRMIAGLETITDGDLLIDNRRVNEHEPSERDIAMVFQNYALYPHMSVYDNMAYGLRNRKVPKAEIIARVDRAAHMLEISHLLDRKPKELSGGQRQRVAMGRAIVRDPKVFLFDEPLSNLDAKLRVQMRLEIKKLQQKLATTSVYVTHDQVEAMTLADKLVVLNQGHIEQVGSPLEIYESPASVFVATFMGSPAMNILTTHINRGIIEIADGHLAISAHSLPNGEIQLGLRPEHLLINQQNPLFHANVDFIEALGADVLIYATTCDQQSIVIRAANDHGVNVGNRIGVAIYPENLHFFDRQTQKRIERPTMLLSERLVS >NZ_CP017082.1|WP_063073876.1|651533_652382_+|sn-glycerol-3-phosphate-ABC-transporter-permease-UgpE MVERRPLFHAFCHLILIVGILSVAFPVWIAVVATTHQNTEFATGSPLWFGQEGIEVFKTLFSSAGTTQNSAITINGMLLNSLVMALVITIGKLVISIASAYAVVFFRFPGRMLAFWTIFFTLMLPVEVRIMPTFEVVTNLNMLNAYAGLTIPLIASATATFLFRQFFLTITPELIEAAKIDGAGPIKFFFTILLPLSRTNIAALFVITFIYGWNQYLWPMLITTDTQYYTIVMGIKQMVAVSDGVIEWNKIMATTLIAMLPPVFIVILMQRAFVKGFVDTEK >NZ_CP017082.1|WP_017628208.1|663087_663672_+|16S-rRNA-(guanine(966)-N(2))-methyltransferase MAKKPQKTPMGQIRIIGGRWRGRKLPVLDSQGLRPTTDRVKETLFNWLMPVIQDARCLDCFAGSGGLGIEALSRYAKETTFIEFDRKVAQQITANLALLGADNGHVIQDSALNYLAKQGTAYDVVFLDPPFHQGMLANTLQLLENNQWLAEGCYIYIEEEVNAQVYSLPENWRLHREKIAGQVAYRLYIRNLSA >NZ_CP017082.1|WP_004248877.1|663689_663983_+|DUF1145-family-protein MLIFLGRFLMIGVWGFLCLNLISPFPKPLKYFMDIALIFMVIMHGLQIAMYKAGQPEDKKPSGLLQFKIFFFGIFELLRIQKELRKEYLEKQKNKNQ >NZ_CP017082.1|WP_017628207.1|664046_664451_-|DUF2500-domain-containing-protein MSVMNKAGMLGIAVLIIIIASATYRFFEQRKQRISDDNSPVKLYMVEVVDKQQIPKNDRRSRENDINGPETTYYYQVTFRLTTDSQQDIILRVDKTTFSNVALEMKGRLFMQGSRFVQFETDAPDNESSKTSAK >NZ_CP017082.1|WP_004248875.1|664597_665224_+|lysoplasmalogenase MSWPFLAVLFSGWLYIDAAYRGPNWQRWLFRPITLLLLLLWAWQVPEHSINSYLIVGALLATLLSDVLKMFEGKYLLPSLALLFLSYILYLISFALPLQISFYLPLLGFVIVAAIIVLAIIWTKLDKFAIPVLLTLLAAFAMFWVAGEKFFYLSNDYNFSIMIGSLLLVIAYSIWLINRFRFSFSASKGLVSACYFIGHFFIVRALFL >NZ_CP017082.1|WP_017628206.1|665394_667785_+|zinc/cadmium/mercury/lead-transporting-ATPase MSKHAHQHDNHKHTDACCSSSQCCSNQADNSSMHSHTESGHTHSKIDKSDPECEEEHHHGHQHEHNHHAHDGHDHAHGCCDSNAPVSNVEPEKIAQQRFSWKVQGMDCPSCAQKIETAVLKVVGVKQAKILFATEKLVVDADTDLRTDVISAVKSAGFELFDISSAGSQPPAKQSLLKESSFVIILAILMAISWGAEFIDPQAGRAAFIATTLIGLFPIVKKSLRLIRSGTPFAIETLMSVAAIGALFINATEEAAMVILLFMIGEMLESYAAGRARRGVSALMALVPEEAVVIKEGKKQTVPVAQLRPGDIIEIAPGARLPTDAELITAFASFDESALTGESVPVERLQGEKVAAGCLSVDRSVQMKVVSEQGQNAIDRILQLIEEAEERKAPIERFVDRFSRYYTPLIMLFSALVIIIPPLLFAQPWETWFYRGLTLLLIGCPCALVISTPAAITSALAAATKRGALIKGGAALEQLGTVNTVALDKTGTLTEGKPQVTDVIANAGFNEKELLMLASSVEVGSHHPLAKAIINKAQEQQIDVVEADNRKALAGKGIEGYLNNQHILVSAPTQLSETTPLSAQWQQQVARLEDEGKTVVVVLKEDQFIGVIAMQDTLRNDAIESMKVLKSMNINAVMLTGDNPRAAAAIAQKLGMDFRAGLLPEDKVTSVMEISQTHNTMMVGDGINDAPAMKAATIGVAMGSGTDVALETADAALTHNRLTGLPEIIQLSRATRKIIRENITIALGLKAIFLVTSLFGITGLWVAVLADSGATALVTANAVRLLKVKLKSPHQD >NZ_CP017082.1|WP_004252755.1|667871_671006_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MSRFFINRPILSWVMAIVIMIAGGLSLIKLPVSQYPEIAAPAIMITAVYPGASAETVQDTVVQVIEQELSGLDGFRYLSSNSNTDGSFEVIATFEQGTDSDIALMQVQNKLQLATPKLPLEVQRQGMRVVKFQINFMQVVALVDESGKLDAFDLGNYLASHMKDPISRIDGMGDILLLGSPRAMRIWLDPDKLTNYHLMPKDIAAAIQDENVQVSAGQLAGLPALKGVELNATITSSSRMVSVDEFNHILLKVNLDGSQVLLQDVAKVEVGADNFSISSLYNGKPSAGMAMRLAPGANLLDVSKKVKEVVEAQSQFFPQGVKALFPYDTTPSVKSSISSVVRTIVEASILVFLVMFLFLQNIRATLVPTLAIPVVLLGTFGVLAALGLTINVLTMYAMVLAIGLLVDDAIVVVENVERIMHEQAISVKEATILSMTQIQGALVGIGLVLSAVFVPMAFFGGSAGIIYRQFAATIVVAMALSVLIALTFTPALCASILKKPQPKVKKRRGFFWLFNRFFDRGTNYYEKGVRNILYRRGRYMFIFLIITVGTGWLFTQLPKAFLPNEDQGVVMIEVRMPANSTAERMEQTMAEFRDYLLTEEKHLVKTVFTVNGFNFAGRGQNAGMAFVNLADWSERKGKGEDVFSLVARAQQHFNSIRDGMVIAFPPPAIMEMGNAMGFDFYLQDNAGLGHTELVKARDKFLELAAQSPVLTNVRPNGKNDEPQLRVVIDKERARALQLRLSDINDTLSAAWGSMYVNDFIDEGRVKRVYLQGEASARMLPTDLDKWHVRNQRGEMIPFNAFATTQWYMGPPKLERFNGLSAIEILGEPAPGYSTGDAMLAIADIMKQLPSEISLSYSGLSYEEIQTQDQAPALYVMTILFVFLSLAALYESWSVPFSVALVVPFGILGAVIATLLRGLSSDVYFQIGLMTTIGLSAKNAILIVEFAKHLYEKDGKPLIDAAAEAARMRLRPIIMTSLAFTFGVLPMALASGAGQGSQHSVATGVIGGMLASTFLAIFFVPLFYVFVVKLFSRKKAHVSIEEIDK >NZ_CP017082.1|WP_017628205.1|671031_672171_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKKTKHLFKTKGCNIPFTSVMMVSFVLMGCNDQSTQPTKPAIPEVGVYTVKEEILPLTVDLPARTASYRVSQVRPQVDGILEKRLFTEGSDVKKDQPLYQIDKKPYETQVAKAQAAYDNVKKLAARYKSLRATNAISQQEYDDVVSRLDQAKADLNQAKINLGYTQVLSPISGKISRSFVSEGALVSSGQSQPLATITQLDPIYVDITQPITNQLKLKSLIQQGVVTDSEDKMDVTLFLEDGSQYPYIGTLSFSEVQVEPSTGSVTLRAKFPNPQHQLLPGMYTKARIMQGTQEKAIVVPQQAITFDARGKSITYIVDQQQVLQARDVEILKPQGNGWIIKQGLQAGDRIMTEGHHRAKPGVKVNAVPANNISLKTTLE >NZ_CP017082.1|WP_004245397.1|672881_673136_-|sulfurtransferase-TusA MNAQFDDATKTLDTLGLRCPEPVMLVRKTIRNMAQGETLLVIADDPATVRDIPGFCRFMEHDLLQQETQATPYRYLIRKKEGQL >NZ_CP017082.1|WP_004245398.1|673132_673330_-|hypothetical-protein MIGVREPNKTYDFLSSGEDAHHTLVAQQKQRSAITQREVDECAVMCEAKRDIIVLSVSAKKWLIQ >NZ_CP017082.1|WP_004245400.1|673346_674021_+|7-cyano-7-deazaguanine/7-aminomethyl-7--deazaguanine-transporter MYRFTSRQKAAALLWLSLFHILIITSSNYLVQLPISIFGFHTTWGAFTFPFIFLATDLTVRIYGAPLARRIITAVMIPALAISYLISTLFFQGSWQGFASLNDFNIMVARIATASFMAYVLGQIMDVSVFNRLRQQQKWWVAPSAAMFFGNFLDTVAFFFIAFYRSTDAFMAANWVEIALVDYTFKLTICMLFFLPAYGVLLNFILRYFFAQENQQQSYAQIRP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017082_2 | 2472188-2472330 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017082_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP017082_2
>2.1|2472211|37|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder ATAATTAGAGTTATGTTTTATTACATTTGCTATGCCG >2.2|2472271|37|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder TTGTGTAACATCAGATTTAATGACATTACCAGCGCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017082_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017082_2 >merge|NZ_CP017082|2|2472188-2472330|CRISPRCasFinder CCACCAGTAAAGTTGGTATTACCATAATTAGAGTTATGTTTTATTACATTTGCTATGCCGCCACCTGTAAAATTGATATCACCTTGTGTAACATCAGATTTAATGACATTACCAGCGCCACCACCTGTGAAATTGATATCACC >NZ_CP017082|2|2|2472188-2472330|CRISPRCasFinder CCACCAGTAAAGTTGGTATTACC ATAATTAGAGTTATGTTTTATTACATTTGCTATGCCG CCACCTGTAAAATTGATATCACC TTGTGTAACATCAGATTTAATGACATTACCAGCGCCA CCACCTGTGAAATTGATATCACC
>NZ_CP017082.1|WP_004244077.1|2458310_2459738_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MSTEIKAQVVVLGAGPAGYSAAFRCADLGLDTVLVERHSTLGGVCLNVGCIPSKALLHVAKVIEEAKALSEHGVVFDAPKTDIDKIRIWKDKVISQLTGGLAGMAKGRKVNVVNGEARFTGSHTLSVEGSEGTTTITFENAIVAAGSRPIELPFIPHEDPRVWDSTDALQLKTVPERLLVMGGGIIGLEMGTVYHALGSQIDVVEMFDQVIPAADKDVVKVFTKRISKKFNLMLETKVTAVEAKEDGIYVTMEGKKAPAEPQRYDAVLVAIGRVPNGKLLDAGKAGIEVDDRGFIHVDKQMRTNVPHIFAIGDIVGQPMLAHKGVHEGHVAAEVISGKKHYFDPKVIPSIAYTEPEVAWVGMTEKEAKEKGVSYEVATFPWAASGRAIASDCADGMTKLIFDKETNRVIGGAIVGSNGGELLGEIGLAIEMGCDAEDIALTIHAHPTLYESIGMAAEVFEGSITDLPNPKAKKKK >NZ_CP017082.1|WP_017627936.1|2456243_2458109_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-acetyltransferase MSIEIKVPDIGADEVEVTEVMVKVGDRIEEEQSLITVEGDKASMEVPSPQAGIVKEIKIAVGDKVETGSLIMIFDTEEGAQAPAQEAAPAPSAAAPAASELKEVHVPDIGGDEVEVTEVMVNVGDTISEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVSTGSLIMVFEVAGSAPAPSASAPAPAASAPAASAIKDVNVPDIGGDEVEVTEVMVKVGDTIAEEQSLITVEGDKASMEVPAPFAGVVKEIKIAVGDKVKTGSLIMTFEVAGAAPAAQAPAAPATSTSAAPSAPAKAPASAPAAKEEFVENEAYVHATPVIRRLAREFGVNLAKVKGTGRKGRILREDVQSYVKELIKRAESAPANAGGGLPGMLPWPKVDFSKFGEIEEVELSRIQKISGANLSRNWVMIPHVNLFDEADITEVEEFRKQQNKEAEKKKLDVKITPLVFVMKAAAKALADMPRFNSSISEDGQKLILKKYINIGIAVDTPNGLVVPVFKDVNKKGILELSYELAEVSKKARAGKLTASDMQGGCFTISSLGGIGTTGFAPIVNAPEVAIMGLSRSSMKPVWNGKEFVPRLMLPMSLSFDHRVIDGADGARFITLINQYMSDLRRLVM >NZ_CP017082.1|WP_004244080.1|2453564_2456231_+|pyruvate-dehydrogenase-(acetyl-transferring),-homodimeric-type MSDMLKNDVDPIETRDWLQAIDSVIREEGVERAQFLIDQVLKQARNGGLDIALGGSVHSDYINTIPVEDEPAYPGNLELERRIRSAIRWNAVMMVLRASKKDLELGGHMASYQSSATLYEVCFNHFFRAHNDNDGGDLVYFQGHISPGIYARAFLEGRLTEEQLNNFRQEIGGKGLSSYPHPKLMPEFWQFPTVSMGLGPLSAIYQAKFLKYLDHRGLKDTTKQRVYAFLGDGEMDEPESKGAITIAVREKLDNLCFVVNCNLQRLDGPVTGNGKIVNELEGIFAGAGWNVIKVMWGDRWDALLRKDTSGKLIQLMNETLDGDYQTFKSRDGAYVREHFFNRYPETAALVKDMTDDEIWALNRGGHDPKKVFAAFQKAKETKDKPTVILAQTIKGYGMGETAEGKNIAHQVKKMNMDGVKHFRDRFNIPVSDEKVAELPYITFDKDSEEYKYLHARRQELEGYLPARRTRFDEKLEIPTLEDFSQLLEEQSKEISTTIAFVRALNVMLKNKSIKDRLVPIIADEARTFGMEGLFRQIGIYSPNGQQYTPQDREQVAYYKEDVKGQILQEGINELGAGASWLAAATSYSTNNLPMIPFYIYYSMFGFQRIGDLCWAAGDQQARGFLIGGTSGRTTLNGEGLQHEDGHSHIQSLTIPNCISYDPAFAYEVAVIMQDGLERMYGDKQENVYYYITTLNENYHMPAMPAGAEEGIRKGIYKLESLEGAKGKVQLLGSGSILRHVREAAQILSTEYGIGSDVYSVTSFTELARDGQDCERWNMLHPSEEPRVPYIAQIMNDAPAVASTDYMKLFAEQVRTYVPADDYRVLGTDGFGRSDSRENLRHHFEVDTSYVIVAALGELAKRGEIDVKVVEEAIKKYNINPEKVNPRLA >NZ_CP017082.1|WP_012368227.1|2452630_2453401_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-transcriptional-repressor-PdhR MAYTKIRQPKLSDVIEQQLEHLILEGTLRPGEKLLPERELAKQFDVSRPSLREAIQKLEAKGFLLRRQGGGTFVQDNLWQSFSDPLAQLLSGHPESQFDLLETRHALEGIAAYYAALRGTDDDLERIKASHARIIDAHDKGDIAAESDAVLQYQLIVTEAAHNVVLLHLLRCMVPMLEQNIRQNFEFLYTRKEMLTAVSEHRTQIYQAIINREPEAAREASHRHLAFIEDVLLDMSREHTRRERSLRRLQQHPDLF >NZ_CP017082.1|WP_017627935.1|2451761_2452304_+|1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine-amidase-AmpD MEIKQGWLTGVKHVPSPNYDNRPEGEIPSLLIIHNISLPPGQFGGPYIDQLFTNTLAVDDHPFFNEIAHLRVSAHCLIRRDGEIVQYVPFTARAWHAGVSFYKGREKCNDFSIGIELEGTDECDFTPLQYQQLSTLTQQLIEHYPGIKENITGHSDVAPGRKTDPGPHFNWSYYRALLAK >NZ_CP017082.1|WP_004244084.1|2451107_2451551_-|prepilin-peptidase-dependent-pilin MNTLNYHSTENGFTLMELMIVIAIISILSSVAIPAYHGYIQKAALTDVLQTLSPYRSAVELCHYEHQYNQCHADASFMPQQFRSRYLTDIHVANGVISAKGKAQLEGLTIVMTPATNSKETLPHWQINCTSTNTALQTLCHKVFKSH >NZ_CP017082.1|WP_004250359.1|2449904_2451008_-|Flp-pilus-assembly-complex-ATPase-component MNNTIHTATEFIEQLLRHSLAQRVSDLHLEPQQNSLRIRARIDNHLVLFSPPDNQLANEILTRLKILANINIAEKRLPQDGQFNWSYQKNNYSIRVATLPTLYGEKIVLRLMNNLQQPQLAQLGFQTIHLTLLKKYLTQPQGMILVTGPTGSGKTLTLYSCLQYLNKDNRNINSIEDPIELPLHGINQTQITEKAGITFATILRALLRQDPDVIMIGEIRDQQTAEIAIKAAQTGHLVLSTLHTNSTQATLARLANLGIAKDLIDSCVKLIISQRLVRCLCSNCKYPSPEQKNFIINNQQIILPNWQATGCQFCYSGYKGRTAIYDCFELAKQSLPSPYALFNSGIELIKKGITSLDEVYQVVGDIE >NZ_CP017082.1|WP_012368229.1|2448708_2449908_-|transporter MKLHFIYRYNALTYQGKWLSGNVVAQSKHEVIDQLIQQQKLPVKIRLYRVIIFQNSDKQYRIQLLEQLALLLHSGLALLPALTLLKEECRYLHWQCVLNDIIFHLNQGGALSKQLSRYPLYFPANLTHFIYIGEESGKLDEVLLLQTTQLKNQRDLIKKIIKAFQYPLFLLLTLIVITISMLIYVLPEYQSLYSAFNTELPMLTLTLIRCSQWFSQYSLIILLFILIISYSYYTIKHHSAKFRDIEQRCWLNLPYLGVLLRYHQLHIIFQIMTITQQAGLPLLQGLKIITEQLTHSLYQRALTDMIAHITQGKSLSSFMRHNPLFPPICYQLISSAENSGQLQFFCQQLTHWFYHQLEERLDSVKTWLEPILMTLIALITGTLIIAMYLPVLQLGDTIH >NZ_CP017082.1|WP_004244087.1|2447816_2448431_-|dephospho-CoA-kinase MTYTVALTGGIGSGKTTIANGFASLGVPLVDADVIARLVVEPDSPGLKALQQHFGDTILLPDGKLNRAQLRHIIFQNQQEKAWVNQLLHPLIQQETQKQIQQIRAPYFIWVVPLLVENKLTHLADRILVVDVTEEEQITRTMQRDGVSRDHVLKILQAQAKREQRLAVADDIIENHDNSLNQDEQIKQLHQHYLELAQKSNTGQ >NZ_CP017082.1|WP_004244089.1|2447061_2447814_-|cell-division-protein-ZapD MSEETSTIIFEHPLNEKMRSWLRIENSLIQLNSFQSINSLSSALSFFRAVSEFIEVLDRGEIRAELLKELEKRQKKLQQWLSFPNVDKEIVSHIINELSESACALSKAPRIGQHLKQDKIISLVKQRLSIPGGCCSFDVPTLHLWLNLPQTVRTEKLTCWQEGLYPLQNALNALLTLIRQSDTFKPVLSHNGFYQDSTEEGELLRIKLLASQQIYPQVSGHKNRYAIRFLPLDSEHGTIPSELPFEISCC >NZ_CP017082.1|WP_004244072.1|2474040_2474244_-|hypothetical-protein MIHIPASGFIYMASIIKSMLENPCINKEFEKLIAADLLPILQNETNMTENFTALHLIKKTNNRRIIL >NZ_CP017082.1|WP_004244067.1|2475064_2477662_+|bifunctional-aconitate-hydratase-2/2-methylisocitrate-dehydratase MLEEYRKHVAERAAEGVVPKPLDATQTAALVELLKSPPKGEEEFLLDLIVNRVPPGVDEAAYVKAGFLTALAKGETTSPLITPEKAVELLGTMQGGYNIHALIEALDNDKLAPIAAKALSHTLLMFDSFYDVEEKAKAGNVYAKQIMQSWADGEWFTERPELAEKITVTVFKVTGETNTDDLSPAPDAWSRPDIPLHALAMLKNAREGIEPDQPGSVGPIKQIEALNKKGFPLAYVGDVVGTGSSRKSATNSVLWFMGDDIPYVPNKRGGGVVLGGKIAPIFFNTMEDAGALPIEVDVSKLNMGDVIDIYPYKGEIRNHETNELLETFALKTEVLIDEVRAGGRIPLIIGRGLTSKARSALGLPPSTLFRHAKAVEQSDRGFSLAQKMVGRACGRDGIRPGEYCEPKMTSVGSQDTTGPMTRDELKDLACLGFSADLVMQSFCHTAAYPKPVDVTTHHTLPDFIMNRGGVSLRPGDGIIHSWLNRMLLPDTVGTGGDSHTRFPIGISFPAGSGLVAFAAATGVMPLDMPESVLVRFKGKMQPGVTLRDLVHAIPLYAIKEGLLTVEKKGKKNIFSGRILEIEGLPELKVEQAFELADASAERSAAGCTIKLDKAPIIEYLQSNIVLLKWMIAEGYGDRRTLERRITAMENWLADPQLLEADADAEYAAVIEIDLNEIKEPILCAPNDPDDARLLSEVANSKIDEVFIGSCMTNIGHFRAAGKLLDQHKGQLPTRLWVAPPTKMDAAQLTEEGYYSVFGKSGARIEVPGCSLCMGNQARVADGATVVSTSTRNFPNRLGTGANVYLASAELAAVASLLGRLPEPQEYLDFINKVDETAEDTYRYLNFDQLEQYTDKATQVIFQTTV >NZ_CP017082.1|WP_004244066.1|2477832_2478204_+|YacL-family-protein MDYEFQRDLTGGILARFSMDHEAIGYWLNDEIQGDISLIDQILTEMDEVKGSEKQWQLIGKEYSLSIDDEEIMVRANTLHFETDDLEEGMSYYDNESIAFCGLDDFATMLQKYRLFILENRRS >NZ_CP017082.1|WP_004248539.1|2478295_2479156_+|small-conductance-mechanosensitive-channel-MscS MNELPASLDEATGWFVANQELFIQYAVNIVAAFLILFIGLFVAKMVSKGVARILTLRHIDATVVTFLSVLVRYTVIAFTLIAVLGRLGVQTASVIAVLGAAGLAVGLALQGSLSNFAAGVLIVIFRPIRAGEYVMIGAVEGTVRDVQIFSTTLRSADDRIIVIPNSKIISSEVINLSREPNRRTQIIVGVAYDADIDKVKKVLGDVVAQDKRIQHNQGVTIRLHEMAPSSLNFVVRVWTTNDDAWPVYWDLMENFKRALDANNIGIPFPQMDVYMHQAQNTVMKAE >NZ_CP017082.1|WP_004244063.1|2479324_2479948_+|arginine-exporter-ArgO MLTTFFQGFLLSAAMILPIGAQNAFVLQQGSKKQYHLMSAFLCALSDVILISGGVFGGSALLSQSEYLLLLITWGGVAFLLWYGWNAFKTAFTKEIELSQHKNQVKSRWRVIVTLVAVTWLNPHVYLDTFVVLGSIGGQLSAELRPWFTFGAVFASISWFFALSLLAAWFSPILSQVTAQRIINLFVGCVMWFIALQLAAQGWKNLF >NZ_CP017082.1|WP_004248538.1|2480038_2480773_+|oxidative-stress-defense-protein MKVKAMVLASMLALGAPSIALAGAVPEGPHITTSGNATIKATPDMATLNIQVSEKAKDAAQAKKQVDERVAKYFAFLKENGVTKEDIDAANIRTQPNYEYDKKAERSVINGYTATRTVDVKIKKLDQLNTLLDGALAAGLNEINNVEFGVNDPEQYKAKAREVAIKNAIQQASSVAKGFGADLGAVYSVSYRAPEATPYPIARMKMDAMALSAPSPEAVKETYQQQSIEFKDYVDVVFELKTAK >NZ_CP017082.1|WP_004244061.1|2480940_2481369_-|hypothetical-protein MADIATLIAKWRNGLEVEIYTENYEFRYGRIKSSRFNASGEESVYYATYFHTRAKPKDNDPFLIITFDPVVGQDDFMFIETIIDHRTYFGSPGAGKTKSHIERRSSDLKRRIENGKKISSEPSSSVQNVNKNNNDSPDQENK >NZ_CP017082.1|WP_017627938.1|2481436_2481658_-|hypothetical-protein MSTFIRRSRNVALAIDAGRKSGSANIEGNTPADIQASLLKSLGEFTASIPTTKQQPYVKGSHGANHKKNYFGR >NZ_CP017082.1|WP_004244059.1|2481860_2482760_-|LysR-family-transcriptional-regulator-ArgP MKRPDYRALQALDAVIRERGFERAAQKLCITQSAVSQRIKQLENLFGQPLLVRTVPPQPTEQGQKLLALLHQVEMLEEQWLGDENSGSTPLLLSLAVNADSLATWLLPALHPVLTQLPIRLNIQVEDETRTQERLRRGEVVGAISIQPQALPSCLVDQLGALDYLFVASPDFAQRYFANGVTKSSLLKAPAVAFDHLDDMHQAFLQQNFGLSPGSVPCHIVNSSEAFVQLAKQGSTCCMIPHLQIADELKSGELIDLTPGLCQRRMLYWHRFAPESRTMRKVTDALLDYGRKVLKQDEE >NZ_CP017082.1|WP_004244058.1|2482920_2483577_+|ribose-5-phosphate-isomerase-RpiA MTQDELKKAVGWAALEYVKPGTIVGVGTGSTASHFIDALATMKGQIEGAVSSSEASTAKLKSYGIPVFDCNEVDSLDIYVDGADEINHQMQMIKGGGAALTREKIIAAVAKTFVCIVDESKQVDVLGKFPLPVEVIPMARSYVARELVKLGGLPEYRENVVTDNGNVILDVYNLTILNPIELENKINSIAGVVTVGLFANRGADIVLMGTSEGVKTIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017082_3 | 2716181-2717002 | TypeI-E |
I-E
Consensus repeat of NZ_CP017082_3
|
13 spacers
spacers of NZ_CP017082_3
>3.1|2716210|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATAGAACGTATCGCAGCTGTTATTTCTGTT >3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGATTACGTTTCTCTCAGCAAAACAGAAAAA >3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGTTAATGACTTTAGATGTTTATAACCGTTTA >3.4|2716393|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTACAATGTTTTATTAAATGGTGTTCGACT >3.5|2716454|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTAAACCGCATCTTGTTCAGGGATTTCTTT >3.6|2716515|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGCGCAGACGACCTTTTAAGGCTTGGTTAT >3.7|2716576|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGGAACCGTTCCGCTTTGCCATCTTATTTGCA >3.8|2716637|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCGAATATTCACAGGTTGCATTGATTGCAG >3.9|2716698|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCGAATATTCACAGGTTGCATTGATTGCAG >3.10|2716759|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGAAATGATTGTTCGCAATGATATCCGAGGC >3.11|2716820|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATCTTCAAAGACTTTCTGACTGTATGGCTGA >3.12|2716881|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAACGTGATGACCAAACACATGTACACACCA >3.13|2716942|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder,CRT AATGGGCTGAGGACGAGGCAATGAACAATGAG |
cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017082_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017082_3 >merge|NZ_CP017082|3|2716181-2717002|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGAAATAGAACGTATCGCAGCTGTTATTTCTGTTGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGTTGATTACGTTTCTCTCAGCAAAACAGAAAAAGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGCGTTAATGACTTTAGATGTTTATAACCGTTTAGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGTTTTACAATGTTTTATTAAATGGTGTTCGACTGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGGTGTAAACCGCATCTTGTTCAGGGATTTCTTTGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGAATGCGCAGACGACCTTTTAAGGCTTGGTTATGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGGGGAACCGTTCCGCTTTGCCATCTTATTTGCAGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGTATCGAATATTCACAGGTTGCATTGATTGCAGGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGTATCGAATATTCACAGGTTGCATTGATTGCAGGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGGTGAAATGATTGTTCGCAATGATATCCGAGGCGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGCATCTTCAAAGACTTTCTGACTGTATGGCTGAGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGCGAACGTGATGACCAAACACATGTACACACCAGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCGAATGGGCTGAGGACGAGGCAATGAACAATGAGGTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAATCG >NZ_CP017082|3|1|2716181-2716941|PILER-CR GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG AAATAGAACGTATCGCAGCTGTTATTTCTGTT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TTGATTACGTTTCTCTCAGCAAAACAGAAAAA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG CGTTAATGACTTTAGATGTTTATAACCGTTTA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TTTTACAATGTTTTATTAAATGGTGTTCGACT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG GTGTAAACCGCATCTTGTTCAGGGATTTCTTT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG AATGCGCAGACGACCTTTTAAGGCTTGGTTAT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG GGGAACCGTTCCGCTTTGCCATCTTATTTGCA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TATCGAATATTCACAGGTTGCATTGATTGCAG GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TATCGAATATTCACAGGTTGCATTGATTGCAG GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG GTGAAATGATTGTTCGCAATGATATCCGAGGC GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG CATCTTCAAAGACTTTCTGACTGTATGGCTGA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG CGAACGTGATGACCAAACACATGTACACACCA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG >NZ_CP017082|3|3|2716181-2717002|CRISPRCasFinder GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG AAATAGAACGTATCGCAGCTGTTATTTCTGTT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TTGATTACGTTTCTCTCAGCAAAACAGAAAAA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG CGTTAATGACTTTAGATGTTTATAACCGTTTA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TTTTACAATGTTTTATTAAATGGTGTTCGACT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG GTGTAAACCGCATCTTGTTCAGGGATTTCTTT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG AATGCGCAGACGACCTTTTAAGGCTTGGTTAT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG GGGAACCGTTCCGCTTTGCCATCTTATTTGCA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TATCGAATATTCACAGGTTGCATTGATTGCAG GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TATCGAATATTCACAGGTTGCATTGATTGCAG GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG GTGAAATGATTGTTCGCAATGATATCCGAGGC GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG CATCTTCAAAGACTTTCTGACTGTATGGCTGA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG CGAACGTGATGACCAAACACATGTACACACCA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG AATGGGCTGAGGACGAGGCAATGAACAATGAG GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAATCG >NZ_CP017082|3|1|2716181-2717002|CRT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG AAATAGAACGTATCGCAGCTGTTATTTCTGTT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TTGATTACGTTTCTCTCAGCAAAACAGAAAAA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG CGTTAATGACTTTAGATGTTTATAACCGTTTA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TTTTACAATGTTTTATTAAATGGTGTTCGACT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG GTGTAAACCGCATCTTGTTCAGGGATTTCTTT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG AATGCGCAGACGACCTTTTAAGGCTTGGTTAT GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG GGGAACCGTTCCGCTTTGCCATCTTATTTGCA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TATCGAATATTCACAGGTTGCATTGATTGCAG GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG TATCGAATATTCACAGGTTGCATTGATTGCAG GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG GTGAAATGATTGTTCGCAATGATATCCGAGGC GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG CATCTTCAAAGACTTTCTGACTGTATGGCTGA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG CGAACGTGATGACCAAACACATGTACACACCA GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAACCG AATGGGCTGAGGACGAGGCAATGAACAATGAG GTGTTCCCCGTATGCACGGGGATGAATCG
>NZ_CP017082.1|WP_004243721.1|2714793_2716050_+|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MDFFRFLMSDVLSEPAILVGLIALIGLIAQKKPATECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKYIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGAVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVVSGFIGSKFGNKAHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFILYALDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >NZ_CP017082.1|WP_012368108.1|2714495_2714783_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDLAVNADVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLNAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL >NZ_CP017082.1|WP_017627985.1|2714022_2714466_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MLKTLLTPDVVQVIPQVKDWREAIKIACQPLIDKGCIEPRYVDAIYKSHEQIGPYYVLGPGIAMPHARPEEGVNQLSLALTIIEKGVEFGANENDPVKLLIVLAATDNDSHINAIVKLAELFDNQDDIDTLLQAKSKAEVLAVINHY >NZ_CP017082.1|WP_004243725.1|2712749_2713796_-|LacI-family-transcriptional-regulator MIKTRKRRNTGRVTLQEVAKHAGVGSMTVSRALRTPELVSDKLREKVNQAVAELGYIPNASAGALASAQSHIIAVLLPSFTDKASADFMQSLQQILSRHHYQILVGCYEYQLHKATDVINMLLQSNPAALVAFGSQLSDVQFLHISNANVPVVSVASQSNEQSAISIDCGYEKAAFDLTHYLIQQGKRCVGYVGALQGQRLHHQQITGWSRALLKNYLNAEQSVTTPDPASMAYGRQALTEILLRQPELDAVICSHESIALGMMFECQRRLIKIPQDLAIACLEGSENSAQIAPSLTSIHFNYHKIGKEAGKHLIALLQHLRDEVDNAMFENTVINYAYRLELGQSTP >NZ_CP017082.1|WP_004243726.1|2712210_2712753_+|NUDIX-hydrolase-YfcD MEQENTAVVEWVDIVDEKNEVVAQATRQQMRAENLRHRATYIVVHDGMGKILAQRRTETKDFYPGWLDATAGGVVQQGENALESARREAEEELGIAGVPFAEHGQFYYDDESCRVWGSLFSCVSHGPFALQPEEIEEVCWLTPLEITERCDEFTPDSLKALSLWLTRNNSTRLDTKETTD >NZ_CP017082.1|WP_017627984.1|2711399_2712014_-|thiol:disulfide-oxidoreductase MIDLYYANTPNGQKITLFLEEVAMPYTLHHVDIGKGDQFKPEFLAISPNNKIPAIVDNAPADGGEPLSIFESGAILIYLAEKSGKLLSHDLREKMTQLQWLFWQVGGFGPILGQNHHFTRYAPEKVPYAINRYTKETERLYQVLESRLAQSPYLGGNDYSIADIATYTWARYHDTHHIDLADYPAVEKWLNTISQRPAAKKLFG >NZ_CP017082.1|WP_017627983.1|2710429_2711335_-|TIGR01777-family-protein MNILITGGTGLIGRALICQLALDKHNITVLSRSPQKVYSHFCNEMACWTHLDDKENLNQFDAVINLAGEPIADKRWTPEQKQTLVNSRCKLTQKLVDLIKASDSPPSVLISGSAVGFYGDQGENNVTEETPPKDEFTHQLCAKWENIALDAQTPLTRVCLLRTGIVLSTKGGALPKMSPPFKLGLGGKLGNGKQYMPWIHIDDMVNAIVFLLNNNNTQGAFNLTAPHPVQNKAFTTTLAHVLKRPAFMTIPATILKLMMGESATLVLGGQQAFPKKLLDAGFSFRYPQLEGALEDIIRHKK >NZ_CP017082.1|WP_004243729.1|2709828_2710410_+|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MKKLIVGLTGASGAIYGIRLLEILKSVPTVETHLVISQAARRTISLETDYSLKDIHALADIIYDDRDIGATISSGSFRVNGMVILPCSIKSLSGIVHSYTDTLVTRAADVVLKEGRKLVLCVRETPLHLGHLRLMTQAAELGAIIMPPVPAFYFQPKTIDDIVNQTVNRVLDQFDIDLPDDLFQRWQGDKPAR >NZ_CP017082.1|WP_004243730.1|2708189_2709707_+|amidophosphoribosyltransferase MCGIVGIAGVNPVNQSIYDALTVLQHRGQDAAGIATIDENNGFRLRKANGLVKDVFETRHMLRLKGTIGIGHVRYPTAGSSSASEAQPFYVNSPFGITLAHNGNLTNAHLLRRQLFETARRHINTTSDSEILLNVLAYELDRFDHFPLEPDNIFTAVAAMHKKLRGAYACVALIIGHGLLAFRDPYGIRPLVLGKRTLEDGRSEYMVASESVALDTLGFEFLRDVAPGEAVYITEQGQLFTRQCAENPQLVPCLFEYVYFARPDSFIDKISVYNARLRMGQKLGAKIAKEWEDLQIDVVIPIPETSCDIALEIAHILNKPYRQGFVKNRYVGRTFIMPGQQERRKSVRRKLNANRAEFRDKNVLLIDDSIVRGTTSEQIVELAREAGAKKVYFASAAPEVRFPNVYGIDMPNANELIAHGREVDEIRKLIGADGLIFQDLSDLIAAVQEENPDINQFECSVFDGVYITKDIDQGYLDYLENLRRDDEHKIRDQHEAENLEIYNEG >NZ_CP017082.1|WP_004243731.1|2707667_2708159_+|colicin-V-production-protein MVWIDYAIIAIIGFSALVSLIRGFVREALSLITWGCGFFVASQFYPYLAVYFTRFEDELVRNGIAIVTLFIATLIVGAVINYVISSLVQRTGLSGTDRVLGICFGALRGVLIVSALLFVLGAFTPMADSADWQRSELIPQFNHIIRWFFDYLQNASSFVSEKM >NZ_CP017082.1|WP_017627986.1|2717246_2719940_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MDKDYYSYWGKFKSENNHEYYHLLPYHSLDVAAVGMILFPENSKIIKDISTFLQIHPKEFSKLFLLLLSLHDVGKFSSSFQYINPNIIDKLKVPESRFSYDGNNYRHDRLGYYFWRKIKNTIFSSIIISNADYKERKISDGFWIIFETALGHHGKPINKNNIDESIENYIHKDNDKAAIDFTLDILKLFSPKLSVENFYDKGWKERLKQISWLLAGMVTLSDWIGSNRDYFPYYKKKIPLSEYWFLALNRAKKAVLSSGFNRNYQISPFISVEYHFGYKPTPLQQWAEKVTINEHPQLFILEDTTGSGKTEAALTLAHRLMEVDAADGFYFGLPTQATSNAMFLRIINHYKKIFDEKKEVPSIVLAHSASNMNEQFTKIIRDGNERYNISDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLSMLPRRHQSLRLLGLNRKIIIFDEIHSADEFMFEIIEKLLSTHLHQGGSVILLTATLSLKQRKRIIDSWFNAFDQISPEIESKSFPLATHLTCFPKVIKKEYPLKSRNQVSRKVKVEIINKEEQCIDIIISAINNGNCVVWIRNTVNDAIKSYYDIKKRLSKDNNCLLFHSRFNLKDRKIREEQVLKYFGKNSTAQQRKGTVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTKYGDYTSETIDKRRPPILYVHAPLFIETPSSCWLTEQFSSTEAVYRSPGRLWLTLRSLTRLGEINMPKDARKLIESVYSDNAYNEIPQSLIQKENNDIGEKKARVSKAKIQLLKITKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEMVNILLLKKIKDNYVPWIEDSHFSIALSTVKISKKKYADKLVSVPQEVIDTINKQYPQARYLQLWIPDEDQYYQYDHLIGFCERQELS >NZ_CP017082.1|WP_017627987.1|2719936_2721535_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNIINQPWLPFRFRDGEIKTLPISAISHPDIIDFSLNRADFKGAAYQFAIGLLQTIFAPEDEDEWEEYFETPPSSKKLQSAFDKVAHAFNIMGDGPLFMQDFSTLEEQKNIPIAQLLIDAPGENGIKQNTDHFIKQGIADVMSLEMAVLALFTLQINAPSGGKGHLVSLRGGGPLTTLVYPAEENSTLWQKLWLNVINREFWEYDEPNFDDGSVFPWLIPLNLKEGKGEKVSPDDVHPLYMYWAMPRRIRLKVENKSVTCQISDMKSNFSVKYYVTKNYGLDYQEGWLHPLTPYYWDPKKPEMFPNSIKGRQGGIHYNLWDRLFLSSNENGQKSATVVSHYLKLYQLLEFTRKPRLLIFGYDMDNMKPRGWYNLEMPIFHVKDEYNNKIINEIKIIQKLTIDCLRSVKEQVKKAWFSSPKDMKGDISFIDLTFWQRSENIFFEVVQNIIVQIQKNDFLTHEQAKKWLNSIRKISISIFDEYALSALGTQKSVSGCIKARNGLIKDLYSNKRIKKFAEDFKITKENGEQYGIL >NZ_CP017082.1|WP_017627988.1|2721521_2722109_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MGSYKSKNITLYNYPELKINVLRWWESLFLSPNELSKKGILPAPNRYKSELKRCDSITAIMLTEGFRALWLSFPVDLINNATTEDIERWAIIVAILVYITQDSEKHFATIAGEKDESKKSCISESRFLQLQSSRTYDEFIRRLRRILIQIKGKSSVLSMCKDIEKWVLEKQRFSSIQTNKQIIIEWAMKYYQAAI >NZ_CP017082.1|WP_017627989.1|2722175_2723210_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHILTSYAPSNLNRDDLGRPKTAIMGGFERLRISSQSLKRHWRTSELFNIALSGNIGIRTKKFGLQLYDALIEGGVSEKNAKKWVGLIIEQYGKIKKDSIETEQLVHISHLEKSLAFDLINLLIKEQREPTKQELESLKTINTSVDIALFGRMLASAPKYNIEAACQVAHAISVHSTVIEDDYFTAVDDLNNGETDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKTQLIESLDGNEELANKAIQALTEVAIKVSPTGKQNSFASRAYASYVLAEKGSYQPRSLSVAFLKPIDDEDMENAAINALKFRMENFDKVYGTCAESRYQLNAVQGEGSLSGLLQFVAE >NZ_CP017082.1|WP_017627990.1|2723222_2723960_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MAQYLVFRLYGPLASWGLPAVGGDRQTGIAPSRSAILGLLSASLGINRKDESKLLQLQQSVLVATKQLVPSMLLRDFHTAQVPSKRKNITHPTRRSELAEKDQNTILSSRDYRCDAIWIIAIKLTGHSQYTLEQLKNALLKPVYILSLGRKSCPLSLPMMPKIVEVEQLKEALDTQFPYITTSDKADSYWFHSDGWVTYFWEGNYQDIKGENIMTLYPWDDPINRQHWQFRQRKMYQMSVKRESE >NZ_CP017082.1|WP_017627991.1|2723959_2724637_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRISIDYSADYLHSLLANKLPDGYTIHQLLWRLFTEEKERSFLYRLEIGKNGKPIFYILSSIAPTTKNNFFKIETKPFLPKLVKKMKLAFSLRANPTVCITDKEGKRQRHDVLMHAKKQAQLDGKDYSHDDIHHLMQQAALNWISSDDRLNKWGISLTQLPDIKAYTPERIKKPSGKIMSFSSVDYQGVLTIEEPHLFWQQYQQGFGRAKAFGCGLMLIRNI >NZ_CP017082.1|WP_017627992.1|2724637_2725558_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFIPLRPIPIKDRHSMIFIGMGRIDVKDGAFVVIDEINGERMLIPVGSLACILLEPGTRISHAAVKLAATVGTLLIWVGEAGVRLYSVGQPGGARSDKLLYQAKLALDNDLRLKVVRKMFELRFGESAPLKRSVDQLRGIEGARVRKQYQMLAKKFKIDWKGRRYDPKDWEAGDIINRCISAATACLYGVTEAAILAAGYAPAIGFVHTGKPLSFVYDIADIIKFDTVVPVAFKVASYKAIAPDREVRIACREAFRKYQTLNKLIPLIEEVLSAGEITPPEPPIDAQPPAIPQAHPFGDEGHREK >NZ_CP017082.1|WP_017627993.1|2725560_2725857_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSMIVVVTEAVPPRLRGRLAVWLLEVRAGVYVGNVSARIREMIWQQINEFAEDGNVVMAWGTNTESGFDFQTYGENRREPIDFDGLRLVLFKPYKEDV >NZ_CP017082.1|WP_017627994.1|2726479_2727703_+|alanine-racemase MSLAIRYLALLPLFVITACQQPVNYNPPATQVAQAQPAIVNNSWIEISRSALDFNVKKVQSLLGKQSSLCAVLKGDAYGHDLSLVAPIMIENNVQCIGVTNNQELKEVRDLGFKGRLMRVRNATEQEMAQATNYNVEELIGDLDMAKRLDAIAKQQNKVIPIHLALNSGGMSRNGLEVDNKSGLEKAKQISQLANLKVVGIMSHYPEEDANKVREDLARFKQQSQQVLEVMGLERNNVTLHMANTFATITVPESWLDMVRVGGIFYGDTIASTDYKRVMTFKSNIASINYYPKGNTVGYDRTYTLKRDSVLANIPVGYADGYRRVFSNAGHALIAGQRVPVLGKTSMNTVMVDITSLNNIKPGDEVVFFGKQGNSEITAEEIEDISGALFTEMSILWGATNQRVLVD >NZ_CP017082.1|WP_004247166.1|2730409_2730553_-|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017082_4 | 2725916-2726311 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017082_4
|
6 spacers
spacers of NZ_CP017082_4
>4.1|2725943|33|NZ_CP017082|PILER-CR GACCGCCACCTATCGCAGCGCCCCATGGACCAC >4.2|2726003|34|NZ_CP017082|PILER-CR CGTTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA >4.3|2726064|35|NZ_CP017082|PILER-CR CGAGGGTCTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC >4.4|2726126|34|NZ_CP017082|PILER-CR CGTTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA >4.5|2726187|35|NZ_CP017082|PILER-CR CGAGGGTTTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC >4.6|2725945|31|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder CCGCCACCTATCGCAGCGCCCCATGGACCAC >4.7|2726005|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder TTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA >4.8|2726066|33|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder AGGGTCTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC >4.9|2726128|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder TTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA >4.10|2726189|33|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder AGGGTTTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC >4.11|2726251|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder AGACTGCAGACGCGCACCGGTAGCAGTTTCTA >4.12|2725936|40|NZ_CP017082|CRT AATGAACGACCGCCACCTATCGCAGCGCCCCATGGACCAC >4.13|2725996|41|NZ_CP017082|CRT AATGAACCGTTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA >4.14|2726057|42|NZ_CP017082|CRT GATGAACCGAGGGTCTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC >4.15|2726119|41|NZ_CP017082|CRT AATGAACCGTTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA >4.16|2726180|42|NZ_CP017082|CRT GATGAACCGAGGGTTTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC >4.17|2726242|41|NZ_CP017082|CRT GATGAACCGAGACTGCAGACGCGCACCGGTAGCAGTTTCTA |
cas2,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017082_4
The CRISPR arrays of NZ_CP017082_4 >merge|NZ_CP017082|4|2725916-2726311|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTGTTCCCCGTGTATACGGGAATGAACGACCGCCACCTATCGCAGCGCCCCATGGACCACGTGTTCCCCGTGTATACGGGAATGAACCGTTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTAGTGTTCCCCGTGTATACGGGGATGAACCGAGGGTCTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGCGTGTTCCCCGTGTATACGGGAATGAACCGTTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTAGTGTTCCCCGTGTATACGGGGATGAACCGAGGGTTTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGCGTGTTCCCCGTGTATACGGGGATGAACCGAGACTGCAGACGCGCACCGGTAGCAGTTTCTAGTGTTCCCCGTGTATACGGGGATAAATTA >NZ_CP017082|4|2|2725916-2726248|PILER-CR GTGTTCCCCGTGTATACGGGAATGAAC GACCGCCACCTATCGCAGCGCCCCATGGACCAC GTGTTCCCCGTGTATACGGGAATGAAC CGTTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA GTGTTCCCCGTGTATACGGGGATGAAC CGAGGGTCTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC GTGTTCCCCGTGTATACGGGAATGAAC CGTTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA GTGTTCCCCGTGTATACGGGGATGAAC CGAGGGTTTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC GTGTTCCCCGTGTATACGGGGATGAAC >NZ_CP017082|4|4|2725916-2726311|CRISPRCasFinder GTGTTCCCCGTGTATACGGGAATGAACGA CCGCCACCTATCGCAGCGCCCCATGGACCAC GTGTTCCCCGTGTATACGGGAATGAACCG TTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA GTGTTCCCCGTGTATACGGGGATGAACCG AGGGTCTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC GTGTTCCCCGTGTATACGGGAATGAACCG TTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA GTGTTCCCCGTGTATACGGGGATGAACCG AGGGTTTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC GTGTTCCCCGTGTATACGGGGATGAACCG AGACTGCAGACGCGCACCGGTAGCAGTTTCTA GTGTTCCCCGTGTATACGGGGATAAATTA >NZ_CP017082|4|2|2725916-2726302|CRT GTGTTCCCCGTGTATACGGG AATGAACGACCGCCACCTATCGCAGCGCCCCATGGACCAC GTGTTCCCCGTGTATACGGG AATGAACCGTTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA GTGTTCCCCGTGTATACGGG GATGAACCGAGGGTCTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC GTGTTCCCCGTGTATACGGG AATGAACCGTTGTATCGCTTTCACTTTGTCATTCTGGCTTA GTGTTCCCCGTGTATACGGG GATGAACCGAGGGTTTGGTACCAAAATGATCCGCAACTACGC GTGTTCCCCGTGTATACGGG GATGAACCGAGACTGCAGACGCGCACCGGTAGCAGTTTCTA GTGTTCCCCGTGTATACGGG
>NZ_CP017082.1|WP_017627993.1|2725560_2725857_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSMIVVVTEAVPPRLRGRLAVWLLEVRAGVYVGNVSARIREMIWQQINEFAEDGNVVMAWGTNTESGFDFQTYGENRREPIDFDGLRLVLFKPYKEDV >NZ_CP017082.1|WP_017627992.1|2724637_2725558_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAFIPLRPIPIKDRHSMIFIGMGRIDVKDGAFVVIDEINGERMLIPVGSLACILLEPGTRISHAAVKLAATVGTLLIWVGEAGVRLYSVGQPGGARSDKLLYQAKLALDNDLRLKVVRKMFELRFGESAPLKRSVDQLRGIEGARVRKQYQMLAKKFKIDWKGRRYDPKDWEAGDIINRCISAATACLYGVTEAAILAAGYAPAIGFVHTGKPLSFVYDIADIIKFDTVVPVAFKVASYKAIAPDREVRIACREAFRKYQTLNKLIPLIEEVLSAGEITPPEPPIDAQPPAIPQAHPFGDEGHREK >NZ_CP017082.1|WP_017627991.1|2723959_2724637_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSRISIDYSADYLHSLLANKLPDGYTIHQLLWRLFTEEKERSFLYRLEIGKNGKPIFYILSSIAPTTKNNFFKIETKPFLPKLVKKMKLAFSLRANPTVCITDKEGKRQRHDVLMHAKKQAQLDGKDYSHDDIHHLMQQAALNWISSDDRLNKWGISLTQLPDIKAYTPERIKKPSGKIMSFSSVDYQGVLTIEEPHLFWQQYQQGFGRAKAFGCGLMLIRNI >NZ_CP017082.1|WP_017627990.1|2723222_2723960_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MAQYLVFRLYGPLASWGLPAVGGDRQTGIAPSRSAILGLLSASLGINRKDESKLLQLQQSVLVATKQLVPSMLLRDFHTAQVPSKRKNITHPTRRSELAEKDQNTILSSRDYRCDAIWIIAIKLTGHSQYTLEQLKNALLKPVYILSLGRKSCPLSLPMMPKIVEVEQLKEALDTQFPYITTSDKADSYWFHSDGWVTYFWEGNYQDIKGENIMTLYPWDDPINRQHWQFRQRKMYQMSVKRESE >NZ_CP017082.1|WP_017627989.1|2722175_2723210_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHILTSYAPSNLNRDDLGRPKTAIMGGFERLRISSQSLKRHWRTSELFNIALSGNIGIRTKKFGLQLYDALIEGGVSEKNAKKWVGLIIEQYGKIKKDSIETEQLVHISHLEKSLAFDLINLLIKEQREPTKQELESLKTINTSVDIALFGRMLASAPKYNIEAACQVAHAISVHSTVIEDDYFTAVDDLNNGETDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKTQLIESLDGNEELANKAIQALTEVAIKVSPTGKQNSFASRAYASYVLAEKGSYQPRSLSVAFLKPIDDEDMENAAINALKFRMENFDKVYGTCAESRYQLNAVQGEGSLSGLLQFVAE >NZ_CP017082.1|WP_017627988.1|2721521_2722109_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MGSYKSKNITLYNYPELKINVLRWWESLFLSPNELSKKGILPAPNRYKSELKRCDSITAIMLTEGFRALWLSFPVDLINNATTEDIERWAIIVAILVYITQDSEKHFATIAGEKDESKKSCISESRFLQLQSSRTYDEFIRRLRRILIQIKGKSSVLSMCKDIEKWVLEKQRFSSIQTNKQIIIEWAMKYYQAAI >NZ_CP017082.1|WP_017627987.1|2719936_2721535_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNIINQPWLPFRFRDGEIKTLPISAISHPDIIDFSLNRADFKGAAYQFAIGLLQTIFAPEDEDEWEEYFETPPSSKKLQSAFDKVAHAFNIMGDGPLFMQDFSTLEEQKNIPIAQLLIDAPGENGIKQNTDHFIKQGIADVMSLEMAVLALFTLQINAPSGGKGHLVSLRGGGPLTTLVYPAEENSTLWQKLWLNVINREFWEYDEPNFDDGSVFPWLIPLNLKEGKGEKVSPDDVHPLYMYWAMPRRIRLKVENKSVTCQISDMKSNFSVKYYVTKNYGLDYQEGWLHPLTPYYWDPKKPEMFPNSIKGRQGGIHYNLWDRLFLSSNENGQKSATVVSHYLKLYQLLEFTRKPRLLIFGYDMDNMKPRGWYNLEMPIFHVKDEYNNKIINEIKIIQKLTIDCLRSVKEQVKKAWFSSPKDMKGDISFIDLTFWQRSENIFFEVVQNIIVQIQKNDFLTHEQAKKWLNSIRKISISIFDEYALSALGTQKSVSGCIKARNGLIKDLYSNKRIKKFAEDFKITKENGEQYGIL >NZ_CP017082.1|WP_017627986.1|2717246_2719940_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MDKDYYSYWGKFKSENNHEYYHLLPYHSLDVAAVGMILFPENSKIIKDISTFLQIHPKEFSKLFLLLLSLHDVGKFSSSFQYINPNIIDKLKVPESRFSYDGNNYRHDRLGYYFWRKIKNTIFSSIIISNADYKERKISDGFWIIFETALGHHGKPINKNNIDESIENYIHKDNDKAAIDFTLDILKLFSPKLSVENFYDKGWKERLKQISWLLAGMVTLSDWIGSNRDYFPYYKKKIPLSEYWFLALNRAKKAVLSSGFNRNYQISPFISVEYHFGYKPTPLQQWAEKVTINEHPQLFILEDTTGSGKTEAALTLAHRLMEVDAADGFYFGLPTQATSNAMFLRIINHYKKIFDEKKEVPSIVLAHSASNMNEQFTKIIRDGNERYNISDNTASAQCYQWLSDSRKKALLATIGVGTLDQALLSMLPRRHQSLRLLGLNRKIIIFDEIHSADEFMFEIIEKLLSTHLHQGGSVILLTATLSLKQRKRIIDSWFNAFDQISPEIESKSFPLATHLTCFPKVIKKEYPLKSRNQVSRKVKVEIINKEEQCIDIIISAINNGNCVVWIRNTVNDAIKSYYDIKKRLSKDNNCLLFHSRFNLKDRKIREEQVLKYFGKNSTAQQRKGTVLIATQVFQESLDADADIMISDICPIDDLIQRSGRLHRHTRTKYGDYTSETIDKRRPPILYVHAPLFIETPSSCWLTEQFSSTEAVYRSPGRLWLTLRSLTRLGEINMPKDARKLIESVYSDNAYNEIPQSLIQKENNDIGEKKARVSKAKIQLLKITKGYSEESSEFWTEDHYDISTRYSDIEMVNILLLKKIKDNYVPWIEDSHFSIALSTVKISKKKYADKLVSVPQEVIDTINKQYPQARYLQLWIPDEDQYYQYDHLIGFCERQELS >NZ_CP017082.1|WP_004243721.1|2714793_2716050_+|PTS-ascorbate-transporter-subunit-IIC MDFFRFLMSDVLSEPAILVGLIALIGLIAQKKPATECIKGTVKTIMGFVILGAGAGLVINSLGDFSTIFQHAFGIQGVVPNNEAIVSIAQKSFGKEMALIMFFAMLINILIARLTPWKYIFLTGHHTLFMSMMVAVILATAGLEGAVLVAVGSLVVGVSMVFFPAIAHPYMKKITGSDDVALGHFSTISYVVSGFIGSKFGNKAHSTEEMNVPKSLLFLRDTPVAIAFTMGIIFIITCLFAGDTFVREVSGGKNWFMFSLMQSITFAAGVYIILQGVRMVIAEIVPAFKGISDKLVPNAKPALDCPVVFPYAPNAVLVGFLSSFAAGVIGMFILYALDWTVIIPGVVPHFFVGATAGVFGNATGGRRGAILGAFAQGLLITFLPVFLLPVLGDIGIANTTFSDADFGVIGILLGIIVR >NZ_CP017082.1|WP_012368108.1|2714495_2714783_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKITVVCGNGLGSSLMMEMSIKSILKDLAVNADVDHVDLGSAKGTPSDIYVGTRDIAEQLNAQAVNGKIVSLDNMIDKVAMKEKLSTALRELGAL >NZ_CP017082.1|WP_017627994.1|2726479_2727703_+|alanine-racemase MSLAIRYLALLPLFVITACQQPVNYNPPATQVAQAQPAIVNNSWIEISRSALDFNVKKVQSLLGKQSSLCAVLKGDAYGHDLSLVAPIMIENNVQCIGVTNNQELKEVRDLGFKGRLMRVRNATEQEMAQATNYNVEELIGDLDMAKRLDAIAKQQNKVIPIHLALNSGGMSRNGLEVDNKSGLEKAKQISQLANLKVVGIMSHYPEEDANKVREDLARFKQQSQQVLEVMGLERNNVTLHMANTFATITVPESWLDMVRVGGIFYGDTIASTDYKRVMTFKSNIASINYYPKGNTVGYDRTYTLKRDSVLANIPVGYADGYRRVFSNAGHALIAGQRVPVLGKTSMNTVMVDITSLNNIKPGDEVVFFGKQGNSEITAEEIEDISGALFTEMSILWGATNQRVLVD >NZ_CP017082.1|WP_004247166.1|2730409_2730553_-|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP017082.1|WP_004247166.1|2730949_2731093_-|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIGLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP017082.1|WP_073969838.1|2731490_2731634_-|type-I-toxin-antitoxin-system-Hok-family-toxin MTKLALIRLITVCITVLCFTLLRHERLCSFNISSGNTLVQANLSCDK >NZ_CP017082.1|WP_017627996.1|2731970_2734115_-|phosphate-acetyltransferase MSRTIMLVPTDTRVGLTSVSLGVIRSMEQKGVRLSVFKPIAQPRVKGALDQTTAIIRSHSTIQSAEPLNMDYVESLLSSNKKDVLMEEIVARYHENTADAEVVLIEGLVPMRKHPFAQSLNYEIAKTLGAEIVFVTALGNNTAEQLKERIEFARAEFGGVKNQNITGVIVNKLNAPVDDQGRTRPDLSEIFDDSSKAIISNVDLNTIEKNSPLPLLGCIPWNFDLIATRATDMAKHLNATIINKGDIETRRIKSVTFCARSIPHMLEHFRPGSLLVTSADRPDVLVSACLAAMNGVEIGAILLTGGYQIDAPIKQLCERAFETGLPIFMVNSNTWQTSLNLQSFSLEVPADDHERIEKIQNYVAQHINNQWIDSLTANSERPNRLSPPAFRYQLTELARKAKKRIVLPEGDEPRTVKAASICAERGIATCVLLGDPEEIRRVAAAQGVELGTGIELVNPKEVREIYVPRLVELRKNKGMTEVVAREQLEDNVVLGTLMLEKGVVDGLVSGAVHTTANTIRPPLQLIKTAPGSSLVSSVFFMLLPEQVYVYGDCAINPDPTAEQLAEIAIQSADSAKAFGIDPRVAMISYSTGNSGAGSDVEKVREATRLAQEKRPDLIIDGPLQYDAAVMADVAKSKAPNSPVAGKATVFIFPDLNTGNTTYKAVQRSADLVSIGPMLQGMRKPVNDLSRGALVDDIVYTVALTAIQASQQENA >NZ_CP017082.1|WP_004243716.1|2734192_2735395_-|acetate-kinase MSSKLVLVLNCGSSSLKFAIINPENGEEFLSGLAECFNLPEARLKWKMDGQKHEAALGAGAAHSEALNFIVNTILAEKPELSQQIAAIGHRIVHGGEKFTKSVVITDEVIKGIEAAIPFAPLHNPAHLIGIEEARKAFPHLINKMVAVFDTAFHQTMPEEAYLYALPYSLYKDHSIRRYGAHGTSHFFVSREAAKMLNKPVDELNVITCHLGNGGSVSAIVNGKCVDTSMGLTPLEGLVMGTRSGDIDPAIVFHLHDTLGMSVEDINKLLTKESGLLGLTEVTSDCRYVEDNYETKADAKRAMDVYCHRLAKYIGSYCALMEGRLDAIIFTGGIGENAAMVRELSLKKLALLGFEVDHQRNLDARFGKSGTITTDNSRLAVVIPTNEELVIAQDASRLTA >NZ_CP017082.1|WP_004243712.1|2735786_2736242_+|DUF412-domain-containing-protein MNEPTVTPPGFFKKLRLGNEYLKTWPVEKQLAPVFPENRMIKATRFGIRYMPPIAIFTLTWQIALGGDLGPAITTALFACSLPMQGLWWLGKRAATPLPAVLLNWFYEIREKFEQAGIALAPVEKTPTYLSLAHLLKRAFKQLDRSFLDDV >NZ_CP017082.1|WP_023843594.1|2736382_2736877_+|YfbU-family-protein MEMTHAQRLILSNQYKMMTMMDPDNAERYRRYQTIIERGYGLQLRELDRDFDEMSEETCRTIINIMEMYHALQVSRENLKSPEMPDARRVAFMGFDAATESRYLSYVRFMVNTEGRYTHFDSGSHGFNSQTPMWEKYQRMLAVWLACPRQYHLSSVEIQQILNA >NZ_CP017082.1|WP_012368105.1|2736911_2737574_+|sugar-phosphatase MTITCKGFLFDLDGTLVDSLPVVEYCWALFGERVGVSTQEINNYIHGKPAIESIRHFMPNATQAQIEETFRWLEKLEATQTEGLAPLPGAIELINRLNDLAIPWAIVTSGTVPIASTRQSVTGIPEPKHWVTAECITQGKPNPEPYLLGAKKLGLAPEECVVFEDAAAGIYSGLDAGCQVIAVHAPISLPRRNEIDLIIDSLNDLQIDKENQQVVIKHKC >NZ_CP017082.1|WP_017627997.1|2737683_2739513_+|SLC13-family-permease MNSELLWVLSLLLIAIVLFTTNKIRMDVVALLVIVAFVLSGTLSLNEATVGFSDPNVLLIAALFVIGEGLVRTGVAYQMGDWLVRVAGSSEVKMLVLLMICVASLGAFMSSTGVVAIFIPVVLSVAARMKTSPSRLMMPLGFAGLISGLMTLVATPPNMVVNSELVREGLPSFQFFSITPIGIAVLVAGVLYMLVVRRWLGSSEGGKQKEVYRRTFRDLIRDYQLAGRARRLAIRKGSPLIGHSLDELHLRSRYGANVVGIERWRRFRRVMVSATGGTELRERDVLLVDMSASEVDLREFCREQMLEPMVLRGEYFSEQSRDVGLAEVSMNPDSELLGKSLREIKFRTRYGLNVVAIRREGSALPGKIVDEPLRLGDVLLVIGDWKLIRILSTKPRNFIVLNLAAEIDTVAPASSQAPHALFSLALMVALMVTNEVPNFIAALIACLLMGKFRCIDMESAYRSIHWPSIILIVGMMPFAAALQKTGGIELIVNGLMDVAGNAGPQVMLVCLFVLCATIGLFISNTATAVLMAPIAIAAAHQMDVSPLPFAMVIGVAASAAFMTPVSSPVNTLILEPGGYKFADFIKIGVPFTIIVMLISVFLIPLLFPF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017082_3 | 3.10|2716759|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716759-2716790 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 3002-3033 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017082_4 | 4.7|2726005|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 2726005-2726036 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10207-10238 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017082_4 | 4.9|2726128|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 2726128-2726159 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10207-10238 | 0 | 1.0 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 38520-38551 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017082_3 | 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716332-2716363 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 30688-30719 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017082_3 | 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716332-2716363 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 16342-16373 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017082_3 | 3.8|2716637|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716637-2716668 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 5814-5845 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017082_3 | 3.9|2716698|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716698-2716729 | 32 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 5814-5845 | 1 | 0.969 |
NZ_CP017082_4 | 4.2|2726003|34|NZ_CP017082|PILER-CR | 2726003-2726036 | 34 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10205-10238 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017082_4 | 4.4|2726126|34|NZ_CP017082|PILER-CR | 2726126-2726159 | 34 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10205-10238 | 1 | 0.971 |
NZ_CP017082_3 | 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716332-2716363 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 14969-15000 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017082_3 | 3.4|2716393|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716393-2716424 | 32 | MN840487 | Proteus phage 2207-N35, complete genome | 29623-29654 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017082_3 | 3.4|2716393|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716393-2716424 | 32 | NC_041925 | Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome | 17491-17522 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017082_3 | 3.4|2716393|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716393-2716424 | 32 | MG575420 | Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome | 16116-16147 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017082_3 | 3.11|2716820|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716820-2716851 | 32 | MW057862 | Providencia phage PSTCR7lys, complete genome | 14912-14943 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017082_4 | 4.11|2726251|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 2726251-2726282 | 32 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 38267-38298 | 2 | 0.938 |
NZ_CP017082_1 | 1.1|662666|26|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 662666-662691 | 26 | NZ_CP013981 | Staphylococcus equorum strain KM1031 plasmid unnamed1, complete sequence | 34337-34362 | 4 | 0.846 |
NZ_CP017082_1 | 1.1|662666|26|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 662666-662691 | 26 | NZ_CP017461 | Staphylococcus nepalensis strain JS1 plasmid pSNJS101, complete sequence | 43353-43378 | 4 | 0.846 |
NZ_CP017082_1 | 1.1|662666|26|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 662666-662691 | 26 | NZ_CP017467 | Staphylococcus nepalensis strain JS11 plasmid pSNJS1101, complete sequence | 14719-14744 | 4 | 0.846 |
NZ_CP017082_1 | 1.1|662666|26|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 662666-662691 | 26 | NC_009130 | Staphylococcus sp. 693-2 plasmid pLEW6932, complete sequence | 9745-9770 | 4 | 0.846 |
NZ_CP017082_4 | 4.6|2725945|31|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 2725945-2725975 | 31 | NC_047890 | Escherichia phage PGT2, complete genome | 28402-28432 | 4 | 0.871 |
NZ_CP017082_4 | 4.13|2725996|41|NZ_CP017082|CRT | 2725996-2726036 | 41 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10198-10238 | 4 | 0.902 |
NZ_CP017082_4 | 4.15|2726119|41|NZ_CP017082|CRT | 2726119-2726159 | 41 | MK047640 | Phage NV18, complete genome | 10198-10238 | 4 | 0.902 |
NZ_CP017082_3 | 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716332-2716363 | 32 | NZ_CP034684 | Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence | 63621-63652 | 5 | 0.844 |
NZ_CP017082_3 | 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716332-2716363 | 32 | NZ_CP038617 | Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN5, complete sequence | 108841-108872 | 6 | 0.812 |
NZ_CP017082_3 | 3.11|2716820|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716820-2716851 | 32 | MN018232 | Synechococcus phage S-B43, complete genome | 100212-100243 | 7 | 0.781 |
NZ_CP017082_3 | 3.11|2716820|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716820-2716851 | 32 | MK016663 | Synechococcus phage S-H68, complete genome | 34447-34478 | 7 | 0.781 |
NZ_CP017082_3 | 3.4|2716393|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716393-2716424 | 32 | MH616823 | Phage sp. isolate ctbf364, complete genome | 482-513 | 8 | 0.75 |
NZ_CP017082_4 | 4.17|2726242|41|NZ_CP017082|CRT | 2726242-2726282 | 41 | KY420199 | Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome | 38258-38298 | 8 | 0.805 |
NZ_CP017082_4 | 4.11|2726251|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 2726251-2726282 | 32 | NZ_CP007054 | Opitutaceae bacterium TAV5 plasmid unnamed, complete sequence | 3726-3757 | 9 | 0.719 |
NZ_CP017082_4 | 4.11|2726251|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 2726251-2726282 | 32 | NZ_AP022593 | Mycolicibacterium arabiense strain JCM 18538 plasmid pJCM18538, complete sequence | 5035602-5035633 | 9 | 0.719 |
NZ_CP017082_4 | 4.11|2726251|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 2726251-2726282 | 32 | NZ_CP030074 | Streptomyces sp. ZFG47 plasmid unnamed1, complete sequence | 655666-655697 | 9 | 0.719 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_KY020154 | Klebsiella pneumoniae strain Kpn-431cz plasmid pKpn-431cz, complete sequence | 140146-140177 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP016763 | Citrobacter freundii strain B38 plasmid pOZ172, complete sequence | 64514-64545 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP021328 | Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence | 226363-226394 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP025467 | Klebsiella pneumoniae strain JS187 plasmid p187-1, complete sequence | 73407-73438 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NC_018107 | Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence | 300176-300207 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP022441 | Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence | 100165-100196 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | KU318421 | Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence | 128822-128853 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NC_023911 | Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence | 76769-76800 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP025964 | Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence | 3356-3387 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP038277 | Raoultella ornithinolytica strain WLK218 plasmid pWLK-238550, complete sequence | 74106-74137 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP046614 | Klebsiella pneumoniae strain WCGKP294 plasmid pWCGKP294-2, complete sequence | 129348-129379 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP043515 | Enterobacter kobei strain EB_P8_L5_01.19 plasmid unnamed4, complete sequence | 100842-100873 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP026014 | Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence | 209150-209181 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP026019 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence | 60850-60881 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_CP026019 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence | 118203-118234 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MF344561 | Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence | 129894-129925 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MF344566 | Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence | 126137-126168 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MF344565 | Klebsiella pneumoniae strain 19051 plasmid p19051-IMP, complete sequence | 87406-87437 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MF344562 | Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence | 134790-134821 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MF344563 | Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence | 128738-128769 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MF344564 | Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence | 129893-129924 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MF042354 | Klebsiella pneumoniae strain 6TM plasmid pNDM_6TM, complete sequence | 114817-114848 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MF042353 | Klebsiella pneumoniae strain 1TM plasmid pNDM_1TM, complete sequence | 114278-114309 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MF042351 | Serratia marcescens strain 12TM plasmid pNDM_12TM, complete sequence | 112901-112932 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MF042352 | Serratia marcescens strain 4TM plasmid pNDM_4TM, complete sequence | 112901-112932 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716271-2716302 | 32 | NZ_MG736312 | Klebsiella pneumoniae strain KP91 plasmid pKP91, complete sequence | 23551-23582 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716332-2716363 | 32 | NC_009819 | Streptococcus phage P9, complete genome | 38290-38321 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.6|2716515|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716515-2716546 | 32 | LR721753 | Aliivibrio wodanis 06/09/160 plasmid 2 complete sequence | 145987-146018 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.10|2716759|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716759-2716790 | 32 | AX059140 | Sequence 1 from Patent WO0075335 | 67129-67160 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.10|2716759|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716759-2716790 | 32 | NC_004735 | Rhodothermus phage RM378, complete genome | 67129-67160 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_4 | 4.7|2726005|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 2726005-2726036 | 32 | MK416018 | Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome | 7126-7157 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_4 | 4.9|2726128|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder | 2726128-2726159 | 32 | MK416018 | Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome | 7126-7157 | 10 | 0.688 |
NZ_CP017082_3 | 3.1|2716210|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716210-2716241 | 32 | MN694201 | Marine virus AFVG_250M801, complete genome | 7954-7985 | 11 | 0.656 |
NZ_CP017082_3 | 3.1|2716210|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716210-2716241 | 32 | MN694455 | Marine virus AFVG_250M805, complete genome | 8019-8050 | 11 | 0.656 |
NZ_CP017082_3 | 3.10|2716759|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2716759-2716790 | 32 | MN657098 | Psychrobacter sp. strain ANT_P42 plasmid pA42P5, complete sequence | 7907-7938 | 11 | 0.656 |
NZ_CP017082_4 | 4.2|2726003|34|NZ_CP017082|PILER-CR | 2726003-2726036 | 34 | MK416018 | Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome | 7126-7159 | 11 | 0.676 |
NZ_CP017082_4 | 4.4|2726126|34|NZ_CP017082|PILER-CR | 2726126-2726159 | 34 | MK416018 | Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome | 7126-7159 | 11 | 0.676 |
1. spacer 3.10|2716759|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gtgaaatgattgttcgcaatgatatccgaggc CRISPR spacer gtgaaatgattgttcgcaatgatatccgaggc Protospacer ********************************
2. spacer 4.7|2726005|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtatcgctttcactttgtcattctggctta CRISPR spacer ttgtatcgctttcactttgtcattctggctta Protospacer ********************************
3. spacer 4.9|2726128|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtatcgctttcactttgtcattctggctta CRISPR spacer ttgtatcgctttcactttgtcattctggctta Protospacer ********************************
4. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer ttgattacgtttctctcagtaaaacagaaaaa Protospacer *******************.************
5. spacer 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
cgttaatgactttagatgtttataaccgttta CRISPR spacer cgttaatgacgttagatgtttataaccgttta Protospacer ********** *********************
6. spacer 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
cgttaatgactttagatgtttataaccgttta CRISPR spacer cgttaatgacgttagatgtttataaccgttta Protospacer ********** *********************
7. spacer 3.8|2716637|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
tatcgaatattcacaggttgcattgattgcag CRISPR spacer tatcgaatattcacaggttgcattgattgcgg Protospacer ******************************.*
8. spacer 3.9|2716698|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.969
tatcgaatattcacaggttgcattgattgcag CRISPR spacer tatcgaatattcacaggttgcattgattgcgg Protospacer ******************************.*
9. spacer 4.2|2726003|34|NZ_CP017082|PILER-CR matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cgttgtatcgctttcactttgtcattctggctta CRISPR spacer agttgtatcgctttcactttgtcattctggctta Protospacer *********************************
10. spacer 4.4|2726126|34|NZ_CP017082|PILER-CR matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
cgttgtatcgctttcactttgtcattctggctta CRISPR spacer agttgtatcgctttcactttgtcattctggctta Protospacer *********************************
11. spacer 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
cgttaatgactttagatgtttataaccgttta CRISPR spacer cgttaatgacgttagatgtttataaccgctta Protospacer ********** *****************.***
12. spacer 3.4|2716393|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN840487 (Proteus phage 2207-N35, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
ttttacaatgttttattaaatggtgttcgact CRISPR spacer ttttacaatgtttcattaaacggtgttcgact Protospacer *************.******.***********
13. spacer 3.4|2716393|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041925 (Proteus phage VB_PmiS-Isfahan, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
ttttacaatgttttattaaatggtgttcgact CRISPR spacer ttttacaatgtttcattaaacggtgttcgact Protospacer *************.******.***********
14. spacer 3.4|2716393|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG575420 (Proteus phage vB_PmiP_RS10pmA, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
ttttacaatgttttattaaatggtgttcgact CRISPR spacer ttttacaatgtttcattaaacggtgttcgact Protospacer *************.******.***********
15. spacer 3.11|2716820|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MW057862 (Providencia phage PSTCR7lys, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
catcttcaaagactttctgactgtatggctga CRISPR spacer catcttcaaatactttctgactgtacggctga Protospacer ********** **************.******
16. spacer 4.11|2726251|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
agactgcagacgcgcaccggtagcagtttcta CRISPR spacer agactgcagacgcgcaccggtggcggtttcta Protospacer *********************.**.*******
17. spacer 1.1|662666|26|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013981 (Staphylococcus equorum strain KM1031 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
ctgggcttcttcttcggctaaacgca CRISPR spacer atctgcttcttcttgggctaaacgca Protospacer * ********** ***********
18. spacer 1.1|662666|26|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017461 (Staphylococcus nepalensis strain JS1 plasmid pSNJS101, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
ctgggcttcttcttcggctaaacgca CRISPR spacer atctgcttcttcttgggctaaacgca Protospacer * ********** ***********
19. spacer 1.1|662666|26|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017467 (Staphylococcus nepalensis strain JS11 plasmid pSNJS1101, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
ctgggcttcttcttcggctaaacgca CRISPR spacer atctgcttcttcttgggctaaacgca Protospacer * ********** ***********
20. spacer 1.1|662666|26|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to NC_009130 (Staphylococcus sp. 693-2 plasmid pLEW6932, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.846
ctgggcttcttcttcggctaaacgca CRISPR spacer atctgcttcttcttgggctaaacgca Protospacer * ********** ***********
21. spacer 4.6|2725945|31|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to NC_047890 (Escherichia phage PGT2, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.871
ccgccacctatcgcagcgccccatggaccac CRISPR spacer gcgccaccaatcgcagcgccccacggacccc Protospacer ******* **************.***** *
22. spacer 4.13|2725996|41|NZ_CP017082|CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.902
aatgaaccgttgtatcgctttcactttgtcattctggctta CRISPR spacer agttaaaagttgtatcgctttcactttgtcattctggctta Protospacer *.* ** *********************************
23. spacer 4.15|2726119|41|NZ_CP017082|CRT matches to MK047640 (Phage NV18, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.902
aatgaaccgttgtatcgctttcactttgtcattctggctta CRISPR spacer agttaaaagttgtatcgctttcactttgtcattctggctta Protospacer *.* ** *********************************
24. spacer 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034684 (Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
cgttaatgactttagatgtttataaccgttta CRISPR spacer ccctaatgactttaaatatttataaccgttca Protospacer * .***********.**.************.*
25. spacer 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038617 (Arsenophonus nasoniae strain FIN plasmid pArsFIN5, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
cgttaatgactttagatgtttataaccgttta-- CRISPR spacer cgttcaagactttagatgtttat--ctgttttgt Protospacer **** * **************** *.****
26. spacer 3.11|2716820|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN018232 (Synechococcus phage S-B43, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
catcttcaaagactttctgactgtatggctga- CRISPR spacer catcttcaaaaacttactgactgc-tggtgcat Protospacer **********.**** *******. ***. *
27. spacer 3.11|2716820|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK016663 (Synechococcus phage S-H68, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
catcttcaaagactttctgactgtatggctga- CRISPR spacer catcttcaaaaacttactgactgc-tggtgcat Protospacer **********.**** *******. ***. *
28. spacer 3.4|2716393|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH616823 (Phage sp. isolate ctbf364, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttttacaatgttttattaaatggtgttcgact CRISPR spacer atttaaaatgttttattaaatgttgttttgta Protospacer **** **************** ****. ..
29. spacer 4.17|2726242|41|NZ_CP017082|CRT matches to KY420199 (Proteus phage vB_PvuS_Pm34, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.805
gatgaaccgagactgcagacgcgcaccggtagcagtttcta CRISPR spacer aaaaagaagagactgcagacgcgcaccggtggcggtttcta Protospacer .* .*. **********************.**.*******
30. spacer 4.11|2726251|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007054 (Opitutaceae bacterium TAV5 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agactgcagacgcgcaccggtagcagtttcta CRISPR spacer gctttgcagacacgcaccggtagcatttgaca Protospacer . .*******.************* ** .*
31. spacer 4.11|2726251|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022593 (Mycolicibacterium arabiense strain JCM 18538 plasmid pJCM18538, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agactgcagacgcgcaccggtagcagtttcta CRISPR spacer aacccacagacgcgcaccggtatcaggttgct Protospacer *. *..**************** *** ** .
32. spacer 4.11|2726251|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030074 (Streptomyces sp. ZFG47 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agactgcagacgcgcaccggtagcagtttcta CRISPR spacer gctctgcaggcgcgcgccggtagcagcgtccg Protospacer . ******.*****.**********. **..
33. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY020154 (Klebsiella pneumoniae strain Kpn-431cz plasmid pKpn-431cz, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
34. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016763 (Citrobacter freundii strain B38 plasmid pOZ172, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
35. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021328 (Raoultella ornithinolytica strain Ro24724 plasmid pRo24724, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
36. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025467 (Klebsiella pneumoniae strain JS187 plasmid p187-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
37. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018107 (Klebsiella michiganensis E718 plasmid pKOX_R1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
38. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022441 (Klebsiella sp. LY plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
39. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU318421 (Klebsiella pneumoniae strain KP04 plasmid pKP04VIM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
40. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_023911 (Raoultella planticola strain KpNDM1 plasmid pKpNDM1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
41. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025964 (Klebsiella pneumoniae strain WCHKP34 plasmid pIMP4_LL34, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
42. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038277 (Raoultella ornithinolytica strain WLK218 plasmid pWLK-238550, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
43. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP046614 (Klebsiella pneumoniae strain WCGKP294 plasmid pWCGKP294-2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
44. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043515 (Enterobacter kobei strain EB_P8_L5_01.19 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
45. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026014 (Klebsiella variicola strain 13450 plasmid p13450-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
46. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026019 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
47. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026019 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
48. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344561 (Klebsiella pneumoniae strain 11219 plasmid p11219-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
49. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344566 (Klebsiella pneumoniae strain A324 plasmid pA324-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
50. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344565 (Klebsiella pneumoniae strain 19051 plasmid p19051-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
51. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344562 (Klebsiella pneumoniae strain 12208 plasmid p12208-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
52. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344563 (Klebsiella pneumoniae strain 13190 plasmid p13190-VIM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
53. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF344564 (Klebsiella pneumoniae strain 13450 plasmid p13450-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
54. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF042354 (Klebsiella pneumoniae strain 6TM plasmid pNDM_6TM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
55. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF042353 (Klebsiella pneumoniae strain 1TM plasmid pNDM_1TM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
56. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF042351 (Serratia marcescens strain 12TM plasmid pNDM_12TM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
57. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF042352 (Serratia marcescens strain 4TM plasmid pNDM_4TM, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
58. spacer 3.2|2716271|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MG736312 (Klebsiella pneumoniae strain KP91 plasmid pKP91, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgattacgtttctctcagcaaaacagaaaaa CRISPR spacer agaattacgtttatctgagcaaaacaatgacc Protospacer .********* *** *********. .*
59. spacer 3.3|2716332|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009819 (Streptococcus phage P9, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cgttaatgactttagatgtttataaccgttta CRISPR spacer aaaaatcgactttagatgtttattatcgttat Protospacer . * .**************** *.****
60. spacer 3.6|2716515|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR721753 (Aliivibrio wodanis 06/09/160 plasmid 2 complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aatgcgcagacgaccttttaaggcttggttat CRISPR spacer taaatctgaactaccttttaagacttggttat Protospacer * .. ...** **********.*********
61. spacer 3.10|2716759|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AX059140 (Sequence 1 from Patent WO0075335) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gtgaaatgattgttcgcaatgatatccgaggc CRISPR spacer gagaaatcattgttcacaatgatatatatatg Protospacer * ***** *******.********* .. .
62. spacer 3.10|2716759|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004735 (Rhodothermus phage RM378, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gtgaaatgattgttcgcaatgatatccgaggc CRISPR spacer gagaaatcattgttcacaatgatatatatatg Protospacer * ***** *******.********* .. .
63. spacer 4.7|2726005|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to MK416018 (Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgtatcgctttcactttgtcattctggctta CRISPR spacer gaagatcgctttcactttgtcactcagggcgg Protospacer . ******************.** ** . .
64. spacer 4.9|2726128|32|NZ_CP017082|CRISPRCasFinder matches to MK416018 (Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttgtatcgctttcactttgtcattctggctta CRISPR spacer gaagatcgctttcactttgtcactcagggcgg Protospacer . ******************.** ** . .
65. spacer 3.1|2716210|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694201 (Marine virus AFVG_250M801, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
aaatagaacgtatcgcagctgttatttctgtt CRISPR spacer caattgaacatatcgcagctgttaacgagaac Protospacer *** ****.************** . . .
66. spacer 3.1|2716210|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694455 (Marine virus AFVG_250M805, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
aaatagaacgtatcgcagctgttatttctgtt CRISPR spacer caattgaacatatcgcagctgttaaccagaac Protospacer *** ****.************** .. . .
67. spacer 3.10|2716759|32|NZ_CP017082|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN657098 (Psychrobacter sp. strain ANT_P42 plasmid pA42P5, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
gtgaaatgattgttcgcaatgatatccgaggc CRISPR spacer aattaatgattgttcgcaattttatccatctt Protospacer . **************** *****. .
68. spacer 4.2|2726003|34|NZ_CP017082|PILER-CR matches to MK416018 (Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cgttgtatcgctttcactttgtcattctggctta CRISPR spacer ctgaagatcgctttcactttgtcactcagggcgg Protospacer * . ******************.** ** . .
69. spacer 4.4|2726126|34|NZ_CP017082|PILER-CR matches to MK416018 (Klebsiella phage ST147-VIM1phi7.1, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
cgttgtatcgctttcactttgtcattctggctta CRISPR spacer ctgaagatcgctttcactttgtcactcagggcgg Protospacer * . ******************.** ** . .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
680 : 25955
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017082|680:25955|DBSCAN-SWA GTTACTTTCCCTCTTCGGCAGTCAGTTTAATCATGACGCCAGCGGTTAATTTGTTGCTAGTGAAATGCTTCTTCCAGTTACCTGCGGTGCCTAACTGTGTTAAATCAGGGTTTTTTCCTTTTGATTCATCCCAGCTATAGCCCAGAACGCCAACGTTAACCACGCCTTCACCACGATAACCAACTTCCAAGTTCTCCTTGTCATTGATTTCATAAGATCGGAAAGTCGGCTCTTGGGATTCAGTGATAGTCACAGCACCCGGCACTAAACCAAAGATGGCATCTACTGGCGCTGTATCCGTTACCAGCACAGGTTTACCTAATGTGCCTGGCTGTCCACCGTAGATAACCACACCCGCTTCTTCATACACTTTGTTGTCAATGGCCTGATCAACAATATCGAAGTAGGTGGTTGAGTGCATAACAAACAGATTTACGCGGTTGAACTTATCACCATATCTGCGTAAACCTTTGGTCAGTGTTTTCTTGCCATCTGTCGCAATATCCGCAGTCACCACCATTTCTTTGTTATTGCCAATAGCGGCACCTAAAGCAGCTAAAGAGTATTTGATATAACCCTCTAGTGAAGCATCTGCCGCATCGGTACCCACTAACTCAGAGAACTCCGATACATCACGGCCACGGCGTTTAAATGCTTCTTCTGTCGTTGCATAAGGACCATATTTCCAAGGTGCTTTTACATCAACAGATTCGCCCGCGCCGATTTTTTTGTTCTCTACAGATGCTGTGGAGTTTACATCACGATGCTCAATCGAACCGCCGATCTGATAAAATGCACGCTTACGGAAGTCCCCCTCAATAAAAAGGTTATCCAGCACAATTGCGCCGTTTGATGCCTGATTAAATACTGCTAAATTATCTTGACGGCGTTCTAAAAACGCAGTTTGTGCTAAATCGTTATAAATTACTAAATCATTATTAGTCGTCGTAGCCATTACTTATATTTCCTTACTCTTTTGGAAGTTTTAAATATGCGTCACGCCCGTATCGGCGAATATAATCAGCCTTGTCACTGGCGGACATTTGAGAACGTTTAAAATGTGCACCACCTTGTTTATGTTTCCCTGCATCTGTACCAGAGGCTGCGGGGAATAAGTGAGGAGCACTTTCTTTTAGGGATTCAATCCATTCAATAGGTGATAATGGCGTGCGACCATCTTTGCCCATGATTGGATTGCCATCTTCATCAACGGCTACGGCCTGACCTTCATCGTTGATCTGAAAAATGCCTTTGGCACGTAAAATTAAATCTTCTTGAGCGCTGGTTAATGCACCCGCTTTCCCTGCTGCAGAACGAATTTCATCGCCTAACACACGAGCACGGAATTTATTTGCAAACGCCTCTGCCTTTTCAGCTTTAGAGCTTGCTTCTTTTAACTTCTTGTCGAAATCACCACGCAAACGCTCAGTGCGCTTATTGAGAACCTCGTCAATCTTGCCATCTGCAATGAGCTTGGCTTCTTCGTCATTCTCAAAGCGTTTAAGCATGCCCTTCACAGTGTCTGGGTCAATGCCTTCAAAACGTTTCAGGTTATCGCCTTGCTCTTTGAGCTTGCCTAGCAACTCACTGTTTTTAGCCTTTAGCCCTGAAACCTGCTGGTCGATAATAGCTTGAATTTCTGGAGTGATTTCCGGTGTTCCACCACCTCCACCTTGCGAACCATCATCAGCCTGTGAATAATATTTGCGTTCGATATTCATAAATAACATGTGATTCCCCTTGGGATTAGATGCGCCTAGCGCGTTGTAATAACTCAGCCCTGAGCTGAGTTTAGGTAATAAAAAAGGCCACCGAGGTGACCTTGTTAAATGGTTTATTGATTAGCTATATCCAGCCTCTCTAAATGCATGCCCATCTATCTCTCTAAGTCGCTCTAGTGAAATAAACTCTCCCTTATCGGTATAAAACTCAGAAGGATGCATACCGCCCTCTTTCATTAGTCTGAATCGCGTTTCTCCGAAAACTTGACGCTGTCGCCATTCAGGTTGCCGTTGTATCCAATCAAGAAAATTGGTATCTGCTGGCACCTGCCCGTCCATTGAGGCACGAGTTCCTGCGTCCATCTCATCTAAATCGATACCTAATTCACGCCACGATTTGGTAACCAGCGTTTCTGTTGAGCGGCAATTGAAGTGGATTTTTCCGGGGCCTTGTAGATAAGGAACTTTATGACCAATAGGCTTACCTTCCAGCGTGTATCTCAACCTATCCCGAATAATGCAATCGTGAGATGTTTTATTATCGAGGGTAGATAACCATTGTTTACAATCAAGAATGTCTTTATTGGCATCAGCAAACTGATCTCGCGCTGTTGCTTGTAAATGGCTAATGGCCGTTTTAGCTATTGTCGTCGCATTAGCTCGGCTTAGTTGCAATACGCCATCCTTATAACCTTGGTTTGCATGTCCTCTGATTTTACGTCCGATTTCTACCGCACTATCACCATTTAAATAACCATTCCGAACAGCGTTATTTATGCGTGTCATGCGATCTGATTCTAATCCATCAGCCCATTCAGAAAGTAATTTCCCTTGAAATGGGCGAGACATGACTGAGGAAAATAGCATTTCCTCTGTAATGCTCATTAGTGGATATTTGCGTAGAACAACATCAGGTAGTAGAGCATCAAACAGTGATGGGTAGTAGCCAGCCTCATATAATGCATGCGCTCTCATTTCTTCTGTTAACAATGAAAAAGCACTATCAACTGCACGCTTATTAATACTTCTAACGCTGGACAGCAACGACTCCAATCGCCTTGCAGTGAAACTATTAACATCGATGGAGGTATCATCTAAAGACACTATAAGTGAAGCAGTTAATTCAGCATCAAACTCATTAAGTGCCTTTATCATGCGTCTAGCCACCCCTGTAGAATAGCGACCAGAAAACAGGGAGTGAGCAATCAATTCATCCATTAACCGCTCATTCACTGATCTCATGTCTCACCTACCATTGTCGGCTCTTGATTATTAAGCTCATCCACCACCACATCAACATCATCAGCGGGGTCGATAACATCATATTTCTGCAAACTTCTCACTAAGTCAGATTTACGCGTTGCGCCAGATTGCCATGCTGCGACGATTTCACGGATCATCGAACTATCGGCAATGTGATTAACGAGGTCTTTGTTAATCTCAAACGAAATGCCTGCAGTATCTAAACCTAAGTATTCAGCACACCATATTAGCGATTTACTGCATGCATCGGAAACATTAGAGCAACAGATGCTCAGGATAGAGGTTTGTGCGTTCTGTTCACCGACAGACTGAATAACCGTTTTAACTTTGCTATCAGCAGAAACCAATTGAGCACCGAGCGCAACCATATAATCGCGTTTACTGTCCATTGCTTCTTTTGCCAGCATGTTAGGTTGAGCCTGAGCGTAACCAAAGAAACCTTTTTCTGGCAACATAATTGGCGAGCGAGAACCAACCATAACGCCTTTCTTTTCTAGATAGTCACGCCATTCTGTTCCTAGCCCACCTAGATAAGGTTGTATTTGCCCACAGAAGAAAACAGAATCTTCATAATCAGCAGAGTTTCGATAATGCCCTAGGTTGATTTTTGCCAATCCTAGAAGTGGGGCTTCATCAATAGTGTGATCATTATTCTGTGCACCAATAAATGTAAATGGAATTTCATTCCACACACCGTTACCAGCACGCGCAGGTATATACTCAGAAGAAATTTCAAAAACGCTACTTCCACTGGGCTTGCGATAGACACGACAGACAAACTTACCTTCTTCTATCGACAATACACGGTATTGAACCTCATCCTTAAAACCAAACCCGTCCTCTTCTTCCACCGTTTCACGCAATACCACCAGCGTTAACATCGTGCGCCCATTAATACGAGCTGTACGCCAGTTAATGATGTCTTCAGCACGATATTGGAATATGTACGGGAGTTTCGAATCACTGTTGTAATCAACATACAGACCATGCCGACCGACTTCCAATACTGACTCAAGTGAAGACTGAGCCAATTGATAGATACTTGAACCCGCCCCGTCAGCATCGTCTTTTAAACACGACAGCTTTTCGACGACAGCAACTAAGGGATCTTTTTTAAATGCCATCCCTATCATGCCGTTGCGAGTATTGCCCGTTATTGGATAGAACACCGCACGGTCTTGATAATCTTTATTGCGCTTCTTTTTACGCTCACTATCTTGCTCTTCAAGCTCAGGAAGATAGCTTTTTATATCTTCACCACCTCGACAAACAGAGCGCACTAACTCCCACTGAGGAGCAGCCGTTTTATACTCCGGTCGAGTGAAATCTACATTTGTTGTACTCATCAGAAGGTTGTTCCTAGGTTAATTTCGAATGCTGGGCGCTTGGTATTTCTTCTGCTCACCGCAAAATATCTAAATCCATCAGCATCATGTGACGTGTAATCGTGAAGCGGTTTATCTTTCCAACAGCCCCGCTTGTCATCCCACTCTTTGCGATAAGCTTCTAGATGAGCAATGCCTTCACTGCATTTGTGTTCATCGAACACGCAAAGTGGCAGAATTTCACGTACTGCCTCGATACCTTCATCGACTGAAAGCTTTGGCACCACTTCAAATCGGATTGAGTAAATTTGTCCGTCTATTTCGTACCCTTCACGCGCTAATTCACGTCGTGATTTCGCATCCGAGCCAAACTCACGGTTATCGATATCATGAGGGCCATTGTGACTTGCATATGTGTAGCCTTTGTCTTTCAGTACTTTCATGTAGTGCCGTAGACCTTCACCACTGTTTGAGTAGTGGTCTATAATGTGGAACTCCTCGCCCACTTCACGAATAAACCAAATTGACGTTGAGTCACCCACACCAATATCCCAGTACGTGTGAACCGGTAAGTGCGAGTTATCAGGAAGTGTGCCAATGCGTTTATTTTCGTACAGGAAGCGGAACTGCTTGGCGTAGTAAGCGCCTTCAACCGATTGTTGGAATGCCTCAGACGGTATTGACGGATATT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36 | Proteus_phage(29.63%) | lysis,integrase | attL 18209:18224|attR 28300:28315 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
61860 : 73821
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017082|61860:73821|DBSCAN-SWA AATGAAACAGACACGCCCAGTGAAATTACTAAGAACACGTCTATTTAGTGCAACCTTTATATTATTAGCTATTAGCCATCATGCTATTGCTGATGACACATTAAAAACAATGATACCCGCTGTTCCTAATATCGAAGCCGAATCCTATATTCTTATCGACTATAATTCTGGGAAAGTCCTCGCGGAAAAAAATGCAGATGTCCGTCGTGATCCAGCCAGTTTAACCAAAATGATGACCAGTTATGTTATAGGTCAAGCCATTCGTGCAGGAAAAATATCAAACAACGATATTGTTCCTATTGGTGAAGAAGCATGGGCAACGGGCAACCCTGTCTTTCGCGGTTCATCATTAATGTTTTTAAAACCCGGTGATAAAGTCACCGTTTCACAATTAACACGCGGTATCAATCTACAATCAGGTAATGATGCCTGTGTAGCAATGGCCTCTTATGTTGCGGGAAGCCAAGATACTTTTGTCACTATGATGAATGACTATGTTAAGCGTCTAGGTTTACAAAACACACAATTTCAAACTGTACATGGTTTAGATGCACCTGGGCAATACAGTAGTGCACGAGATATGGCATTGATTGGCGCCGCATTAATTCGTGATGTTCCAGAAGAATATGCCATTTATAAAGAAAAAGAGTTTACCTACAATAATATCCGTCAAACTAACCGTAATGGTTTACTTTGGGATACTAGCCTCAATGTTGATGGTATTAAAACGGGTCATACTGAAGCTGCAGGTTATAATCTTGTTGCCTCTGCAACAGAAGGAAATATGCGCTTGATTTCTGCCGTGATGGGGGGACACTCATCTAAAGGCCGTGATGCTGAAAGTAAAAAACTACTTACTTGGGGTTTTCGCTTCTTTGAAACGGTAAAACCACTGCAAGTGGGTAAAGAATTTGCTGCTGAACCTATCTGGTATGGTGATACTGATAAAGTGCAATTAGGGGTTGATAAAGATGTTTATCTCACGATCCCCCGTGGCCGACTCAAAGATCTAAAGGCCAGCTATGTATTAGATAATGTTGAATTACATGCCCCAGTCAGTAAAAACCAAGTGGTTGGCACCATTAATTTCCAACTTGATGGGCAAGTCATTGAACAACGTCCACTTGTTGTTATGAATGAAGTGAAAGAAGGTGGCATTTTCAGCCGCTTGATTGATTACATCAAATTATTATTTTCACGTTGGTTTGGTTAAGGCTTGAAAAGGATAAATGTGTCCATATATAAAGATTATATCGATATTGGAATAAACACATTTACCCATTCTATATTTACCCTAACTATCAGTATCGCATTCCTCATTATAGGAGGAATGCGCTTTTTATTTGTGCTGATGAGGTGTAAAAGAGATTATTAAAACAACATCGCCTGTTGTCTTAAGGATTACATTATGATGAAAACAAAATTAAACGAACTATTAGAGTTCCCTTGCTCATTTACTTACAAAGTCATGGGACATGCTAAACCTGAATTAGTTGACCAAGTCGTTGAAGTGATCCAGCGTCATGCACCCGGTGATTATACACCTTCAGTAAAACCAAGTAGCAAAGGTAACTATCACTCAGTCTCTGTGACTATCAACGCAACGCATATTGAACAAGTAGAAACCCTCTATAAAGAGTTAGGTGAATTAGAGCTTGTTCGCATGGTGTTATAATTTTTTTCTATTTGCCCCCTTACCCTATTAGGGGGCATTAGACGTACTTAAGAAGCAATATTACGCAGTATCTTCTCTTTATCTTTCTCTTTCTCTTTCACCTTACTTCTTATATTAATTCTTATTATTTCGTTATTGATTTGTCACCTAGTTTTAGCAAGTCTCACTAAAATAAAAGCCTAATTGGGGTTAATCGCCAATTAAGCTCTTCTTGGTTAATCACATCTATCCCCCTTCTCACTACGTCGTTTTTTTATCAATATTCCTTTATCAAACACAAACTGAAGCAATAATCTCATCTCATTCTGGTAGTTCATTTGTTGGAGCGTTATACTGCCTTTCACAATTACGCTACAAATGAAGATTTTCACGGTGCAAGATAAAACAATCATTATTCGCCAATTGGGTATGAAACCCTATTTACCGGTTTCTGATTCTATGCATCAGTTTACGGAAAAACGGGAAAGTCATACACCTGATGAAATTTGGCTGGTTCAACATGAACAGGTTTTTACCCAAGGTCAAGCGGGTAAAGCAGAACACCTTTTAAACACAGGCTCTATACCGGTGATCCAATCTGACCGCGGTGGACAAGTAACCTACCACGGCCCTGGCCAACAAGTGATGTATGTTTTGCTTGATCTAAAACGTAACCATATTGGCGTTCGCCAATTAGTCACTGTTTTAGAGAATACTGTGATCAACACACTCGCAGAATTTAATGTAGACGCATATGCTCGTGCAGATGCACCGGGCGTGTATGTTAATGGTGATAAAATTTGCTCTTTGGGATTACGTATACGCAAAGGTTGCTCTTTTCACGGTCTAGCACTTAATGTTGATATGGACTTATCTCCTTTTACGCGAATAAATCCTTGTGGTTATCCTGATCTAAAAATGACACAACTGGTTGATTTGGCGCCGAATGCAACATCGGAACAAGTGGCATCATTATTAATCAACCATTTTTGTACACAACTGGGATTCCAACCACAGCAATAAAAATGCTATAATTTTTTTAACATTTATCATTTTTTTTTAAAACCTTGATTACCTCAGTCACATCGTGTTAATCACCCTAGATAACTGGAACTGGCACAATTATGAGTAAACCTATTCAGATGGAACGCGGCGTAAAATATCGTGACGCCGATAAAATGGCACTTATTCCTGTTAAAACAATCGTTACAGAACGTGAAGAACTGCTACGCAAACCTGAGTGGATGAAAATAAAGTTGCCCGCAGATTCAAGTAAAATTCAAGGTATTAAAGCGGCCATGCGTAAAAATGGCCTGCATTCTGTTTGTGAAGAGGCTTCATGCCCTAATCTTGCAGAATGTTTTAACCACGGTACCGCAACCTTTATGATCTTAGGGGCAATCTGTACGCGTCGTTGCCCATTTTGCGACGTTGCTCATGGTCGTCCTAACGCACCCGATCCCCAAGAGCCAATTAAATTAGCCCAAACGATAAAAGATATGGGATTACGTTATGTTGTTATCACCTCAGTAGATCGCGATGACCTACGCGATGGTGGTGCACAACATTTTGCCGATTGTATTACCGCTATCCGTGAAAAAAATCCTAATATTCGCATCGAAACTTTAGTCCCTGATTTCCGTGGTCGTATGGATAAAGCATTAGAGATCCTCACTGACACACCACCAGACGTCTTTAACCACAATTTAGAAAACGTACCTCGTGTTTATCGTCAAGTGCGTCCTGGTGCGAACTATCAATGGTCTCTAACGTTACTAGAACGCTTTAAACAAGCCCACCCAAATATTCCAACTAAATCGGGGTTAATGGTCGGTTTAGGTGAAACAAATGAAGAAATTATTGACGTGATGCGCGATCTGCGTAAACATGGTGTAACGATGCTGACATTAGGGCAATATTTACAACCCAGTCGTCACCATCTTCCTGTTCAACGCTACGTCAGTCCTGACGAGTTTGAATATATGAAAGAGCAAGCATTAGCAATGGGCTTTACCCACGCCGCTTGTGGACCATTTGTTCGTTCGTCTTATCATGCTGATCTTCAAGCTCAAGGGATTGAGGTTAAATAACGATTAATCTCTCTTATGCTTAACATTGCAATAGCTGTATTTATCGGCGGTGGTTTAGGTAGCGTACTACGCTGGCTAATTAGCTACCGCCTTAATTCTCTTTTTCCCCATTTTGCAACGGGGACCTTGGTCGCTAACTGTATTGGTGCCTTTATTATCGCCTTTGGCATTGCTTGGTTTAGTAAAGCTCCCAATATTGACCCTATTTGGAAAATCATGCTTACCACAGGTTTTTGTGGTGGCTTAACCACCTTTTCTACTTTTTCTGTTGAGGTGGTCGCCTTATTTAATGAAGGACGAATAGGCTGGGCATTAGGCACCATGGGGGCAAACTTAGCAGGTTCGTTTCTGATGACGGCATTCGCATTCTGGCTACTCCGTGAAATGTAGTCTCTTTAACAAGATAAAAACCGTTAATCATAAAGTTGTACTCTTTTAGTTAAGCGATTTATAAGGCCTGAACTTAATATTCAACCAATGTCAGGCCTTTTAATTTGATTTTGTTCCCGGTGGTATTACTCAATAAATTAGCCAATTTTATCAATACATTCATTGATATTTTAAAATGATAGCTATGATGTATTCTTGATTTTAATAATTTAAAAAACTTTCAACCACGGTATTTATCCCGCAGCTAAATACGCAAGCTCCTCTTTAAATTTCTCAAGTCTTTTTTCATCATCAAAACGAGCGAGAGTTATGCAGTGTGGCAAGCATTGTCACCCTAAGTAGCAATGATGATGTTTAAATCCCCCCTGTATTTGACATAAAAAGACCCCCAATAATGGGTTGTCCAACTATTAGAGTATTTCAAATAGTATTTTTAAGAAAACAGTTTAATTTATTATTATCTATTTTCAATTTTTGTTATTTTTAGGTTTTTTATTATTGTTTTTGATGAGGGTTTTATATCTAATAAATGAAATTTTTTGTTGGTATCTTGATGATTTAATTGTTATTAAATTAATTCAATTATTTTTATAATAATGAGAAATTAAATGCCTCACCATTCACATTACATTTTACATGATGAGCTTATTGGTTTTGATATCTTTAAATATATAGATATTAAATTTATTTTTTTCAATAATAGGAAAAGGAGTGTTTAAATGTTTACGTTGAGGAGGCTTATTTTGTTATACAAACAAATATCTAAAAAGAAAAACGACAATGTTGACTATAACGCTATTAAAGTCCAGAAAAATGAGTTACTTCTTCGTTTTCAGCAGGCTAAAAAGAAGGCAGAACAAGATAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017082|61860:73821|71044_72013_+|WP_012367584.1|DBSCAN-SWA MSASYLSRVNAINWNRIEDEKDLEVWNRLTMNFWLPEKIPLSNDIPSWNTLTQAEKQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPTLMPDAQTPHEEAVLSNICFMEAVHARSYSSIFSTLCLTTDVDDAYRWSEENTYLQKKSDIILRYYQDSDPLKKKIASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAVHGYYIGYKFQNQLLNKSSLEKQNIKDFAFSLLLDLYDNEVKYTEDLYDSVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDEITNVSPAILSSLSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKTINTEDDDWDF >NZ_CP017082|61860:73821|61860_63072_+|WP_004246054.1|DBSCAN-SWA MKQTRPVKLLRTRLFSATFILLAISHHAIADDTLKTMIPAVPNIEAESYILIDYNSGKVLAEKNADVRRDPASLTKMMTSYVIGQAIRAGKISNNDIVPIGEEAWATGNPVFRGSSLMFLKPGDKVTVSQLTRGINLQSGNDACVAMASYVAGSQDTFVTMMNDYVKRLGLQNTQFQTVHGLDAPGQYSSARDMALIGAALIRDVPEEYAIYKEKEFTYNNIRQTNRNGLLWDTSLNVDGIKTGHTEAAGYNLVASATEGNMRLISAVMGGHSSKGRDAESKKLLTWGFRFFETVKPLQVGKEFAAEPIWYGDTDKVQLGVDKDVYLTIPRGRLKDLKASYVLDNVELHAPVSKNQVVGTINFQLDGQVIEQRPLVVMNEVKEGGIFSRLIDYIKLLFSRWFG >NZ_CP017082|61860:73821|63891_64536_+|WP_004246056.1|DBSCAN-SWA MKIFTVQDKTIIIRQLGMKPYLPVSDSMHQFTEKRESHTPDEIWLVQHEQVFTQGQAGKAEHLLNTGSIPVIQSDRGGQVTYHGPGQQVMYVLLDLKRNHIGVRQLVTVLENTVINTLAEFNVDAYARADAPGVYVNGDKICSLGLRIRKGCSFHGLALNVDMDLSPFTRINPCGYPDLKMTQLVDLAPNATSEQVASLLINHFCTQLGFQPQQ >NZ_CP017082|61860:73821|64637_65603_+|WP_004246057.1|DBSCAN-SWA MSKPIQMERGVKYRDADKMALIPVKTIVTEREELLRKPEWMKIKLPADSSKIQGIKAAMRKNGLHSVCEEASCPNLAECFNHGTATFMILGAICTRRCPFCDVAHGRPNAPDPQEPIKLAQTIKDMGLRYVVITSVDRDDLRDGGAQHFADCITAIREKNPNIRIETLVPDFRGRMDKALEILTDTPPDVFNHNLENVPRVYRQVRPGANYQWSLTLLERFKQAHPNIPTKSGLMVGLGETNEEIIDVMRDLRKHGVTMLTLGQYLQPSRHHLPVQRYVSPDEFEYMKEQALAMGFTHAACGPFVRSSYHADLQAQGIEVK >NZ_CP017082|61860:73821|65618_65993_+|WP_004246058.1|DBSCAN-SWA MLNIAIAVFIGGGLGSVLRWLISYRLNSLFPHFATGTLVANCIGAFIIAFGIAWFSKAPNIDPIWKIMLTTGFCGGLTTFSTFSVEVVALFNEGRIGWALGTMGANLAGSFLMTAFAFWLLREM >NZ_CP017082|61860:73821|67468_67942_-|WP_004246069.1|DBSCAN-SWA MYQDYLNTPKGFPKPYISITADDDGITSLNFVSEKEALVNSNAIIDLCIKQLKEYFSGKRTLFSVPLAPKGTEFQIRVWQTLQSIPYGEIWSYKKLALTLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIIPCHRVIGHNGKLVGYTGGLDIKRWLLHYEKVDIDE >NZ_CP017082|61860:73821|72621_73821_+|WP_096043046.1|DBSCAN-SWA MAIKLEVKNLYKIFGEHPKRAFELLGSGMNKDQIFDKTGLTVGVQNANLAIEEGEIFVIMGLSGSGKSTLVRLLNRLIDPTKGEVLIDGENITTMSDKDLRQVRRKKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELAGISKEERYEKAMAALEQVNLSSHAQSWPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVRTFFRGVNISHVFSAKDIAKRRPETLLHIAPGFGPRSALKVLEDEDRNFGYLIERGRKFAGIVSVTSLEEALKAKQPIGSAILTEPCAINGDTPLNELISTVAQSPCAIPVIDEKNRYIGLISKGMLLQALDKETPNE >NZ_CP017082|61860:73821|68459_68864_+|WP_004246072.1|DBSCAN-SWA MQSTAPLIYFSSRSENCHRFVQKLNLQATRIKEDEPLQATQPFVLLCPTYGGGGVKGAVPKAVIQFLNIPENRQLIRGVIASGNTNFGSAYGLAGDIIAQKCQVPFLYRFELLGTPEDVKRVKTGLSTFWSASK >NZ_CP017082|61860:73821|68892_71019_+|WP_004252248.1|DBSCAN-SWA MTHSIEQLDYHALNAMLNLYDEQGNIQFDKDKLATHHFFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVQQHYYEAQVLEQYDFPFIKQLFKHAYSKKFRFQSFLGAFKYYTSYTLKTFDGERYLERYEDRVCMVALTLAQGNTKLATHLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRAVNSALQLSKRGGGVAFLLTNLREAGAPIKRIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIYHFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFELAKRNEDMYLFSPYDVERVYGVPMSEISISEKYTEMVNNAEIRKKKIKARAFFQTLAEIQFESGYPYIMFEDTVNRANPIAGRINMSNLCSEILQVNSASEYNPDLSYRQIGHDISCNLGSMNIAMAMDSPDFAHTVNVAIRALTSVAQMTKIESVPSIEKGNQASHAIGLGQMNLHGYLAREGIYYGSEEGLDFTNIYFYTVTYYALLASNQLAIETKQRFKGFEQSKYATGEYFDKYLSKQWLPKTQKVHQLFSQSNIHIPTQEDWQKLKLSIMTHGIYNQNLQAIPPTGSISYINHSTSSIHPIVAPIEIRKEGKIGRVYYPAPFMTNENRHFYQDAYEIGAEKIIDTYAQASQHIDQGLSLTLFFSDEATTRDVNKAQIYAWRKGIKTLYYIRIRQTALAGTEIKGCVSCAL >NZ_CP017082|61860:73821|67061_67271_-|WP_004246068.1|DBSCAN-SWA MSKLKGNVKWFNETKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIVSEGFKTLAEGQKVEFEVTDGAKGPSAANVVAI >NZ_CP017082|61860:73821|63270_63534_+|WP_026090527.1|DBSCAN-SWA MKTKLNELLEFPCSFTYKVMGHAKPELVDQVVEVIQRHAPGDYTPSVKPSSKGNYHSVSVTINATHIEQVETLYKELGELELVRMVL >NZ_CP017082|61860:73821|68223_68448_+|WP_004246071.1|DBSCAN-SWA MSVILYTKPNCVQCSATERALQQQKIPFTAVDLTQDTQALAKIVSMGYRQVPVVVNGDEHWSGFCPDKIRQIAR |
12 | Mycobacterium_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
174069 : 227952
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017082|174069:227952|DBSCAN-SWA 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34 | Bacillus_phage(33.33%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1309878 : 1371340
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017082|1309878:1371340|DBSCAN-SWA 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51 | Escherichia_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1967041 : 1975885
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017082|1967041:1975885|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017082|1967041:1975885|1970815_1971841_+|WP_004245605.1|DBSCAN-SWA MVSTHIGFPTETVIVFVVLAIGAIFIDLFMHRADKPITLKNAVFWSIFWVVVAMAFAGFLYVHHGAEVASLFVTGYALEKVLSVDNLFVMMAIFSWFAVPDRFRHRILYWGIIGAIVFRAIFVAIGTGLLSLGPYVEIVFALIVAWTAVMMLRSGNDSEEIEDYSQHLAYRLVKRFFPIWPKITGHAFLLTQKEVDVELAKPENKDITIGRGTKAALYATPLMLCVAVVELSDVMFAFDSVPAIIAVSREPLIVYSAMMFAILGLRTLYFVLEALKQYLIHLEKAVIALLFFIAVKLGLNATDHIWQHGYSISATTSLFVVLGVLALGILASFVFPEKKNK >NZ_CP017082|1967041:1975885|1972563_1973139_+|WP_004245603.1|DBSCAN-SWA MAVSLVKGGNVSLTKEAPTMTVAMVGLGWDARVTDGAEFDLDASVFMVGEDGKVLSDASFIFFNNKVSQCGSVEHQGDNRTGEGEGDDEQVKITLSKVPAEVKKLVFAVTIYDAENRKQNFGMVSNSFMRVYNNDNNTEIARFDLSEDASTETAMIFGELYRHGSDWKFKAVGQGFAGGLGALAAQHGVNI >NZ_CP017082|1967041:1975885|1969164_1970301_+|WP_017628547.1|DBSCAN-SWA MTLTPGGNISVPDQTLMVRIHSGSPVDVSAFRLYASGKVNGDADMVFYGQTTNDDRTIIYATAGNSTSFTVDLTRLRPDVDRIAFTATCEGQQTIAHLQHLSIQVDANNNVVANGHVDINGRTEAALILGELYRRNGSWKFRFIAQGFNGGLKPLAEYFGVDIADPEPAPAPSSVNLSKVSLTKEKPAISLTKKDDFGKIRINLDWHRESKSGGSGLLGGLFGGNKGIDLDIGAFVELQDGYKSVIQALGNGFGDFNRMPYVELQGDDRTGDVAGGEWIFINGREWKNIKQVLIFTFIYEGVPNWSKTDGVVTIHVPEQPPIETRLTDGNNGRAMCAIARLINENGSIKVERLNEFFKGHRDMDNAYGWGFRWTAGSK >NZ_CP017082|1967041:1975885|1971908_1972487_+|WP_004249446.1|DBSCAN-SWA MSVSLSKGGNVSLSKAAPTMKNVLVGLGWDARSTDGQDFDLDASAFLLAANGKVRSDADFIFYNNLRSADGSVVHTGDNRTGEGDGDDEALKIKLDTIPSDVEKIIFVVTIHEAQARRQSFGQVSGAFIRLVNDDNQIEVARYDLTEDASTETAMLFGELYRHNGEWKFRAVGQGYAGGLGSVCAQYGINAS >NZ_CP017082|1967041:1975885|1970325_1970781_+|WP_004245607.1|DBSCAN-SWA MSFFNKLKEGFNSGRAELTKQVSRFKNKKFMQGTVAVCARIAIASDGVSSEEKQKMLGFLKASEELKVFDTSEVIEFFNKLISSFEFDTEVGKGETMKYILAMKDQPEAAQLAIRVGIAVAKSDGDFDNDEKEAVRAIAVALGFEPAEFDL >NZ_CP017082|1967041:1975885|1967041_1968187_-|WP_017628546.1|DBSCAN-SWA MNSLIGSSVYRRQLTCGTLSVTPNCSLEHLDELFDIAERRNPKRAFLFVSKVLGRHIPVSPKKMRETYQQMAKQFPQSLEGPILFIGMAETAVGLGAGIFDEVRDRYPQALYLTSTRHPIADGELFCKFKENHSHATDHLLYLPHNLEQRQWILQAKTIVLIDDEATTGNTFLNLLSALREEGKLTQIKQIIAVTLTDWSGDALQKRSPLPITTFSLVQGKWQWQANPDAPLPVMPNVNITASGQVAITGKQSWGRLGMTTPANDLGLFIHVSEGEKILVLGSGEFVWEPFLLAERLEKQGAIVKYSSTTRSPIATNFAIQSAITFTDNYGLGIPNFVYNVAHQQFDRILLCCETPAESIDSQLIEALYKVAPIVEVISYD >NZ_CP017082|1967041:1975885|1974316_1975885_+|WP_004245601.1|DBSCAN-SWA MSIKRTVKLGSSLLLLIFILSSALSSFFIYKMQNNFTQVDVLSARYDDVLMARYQLAIMRSNVNYLLQDKDSRVADRNKIIQQNKKLAIMAKNTMETWVKEKKMTVAAQKNADDISTLFYNLIDKLVLDPNKLATIKIKANQFDQDFEHLDQLFEKYIQTRNKNSLYLTHKQDSMVEFSIYSTIISLIILLIVLYFVLHWINKTFVSNLNTLSEILNKVGNADLVFSVPQVKNDEFGKLFSRVSDMQKALTSTIFSVKKEAMDIKGGAFKIASGNQELSSRTEEQSSALQQTAASMEQIKIAVANNTDNTIEANNIINQSTDIVMDGANVMKEAVLSMKKIEQGAVKVGEINDVINKLANQTNILALNAAVEAARAGEQGRGFTVVAAEVRNLAAKSAEAAKEISQVLKASINDVTYGTNLVNKSGECMQEIVSSISKVNKIMQGISLASEEQRLGVEQIAVAINQMDTVVQQNASLVDLAASSTMMLNDKAQVLMDNVAVFNIDDLEKEPEQKQELINEQE >NZ_CP017082|1967041:1975885|1968579_1969164_+|WP_004250201.1|DBSCAN-SWA MVSLRKDQTVSLSKQAPALSHLMFGLGWDPIKKKGFLGGLFGGNNSIDLDASCVLLDVNGKQIDTIWFRKLKSTCQSVIHSGDNLTGEGDGDDETIFVDLNRLPSLVEYLVFTVNSFRGQTFNEVENAFCRVVDKTTNKELAHYKLTEQGAHTGIVIAALQRNQGQWDFTAFGSPCKGLVIDEMMPDILATVVR >NZ_CP017082|1967041:1975885|1973235_1973916_-|WP_012368337.1|DBSCAN-SWA MQPQFENAKNTVKTLSVFDFDGTLTYHDSFIPFLKFAFGRRKFARRIIKMVFPTLRCFRRKLTRDELKEVLIKTFLTDIKEEWLKEKAEAFCKAYWSKLMRPAGLLAVAEEINRHAEVTICSASPAMVLQPFADRLGIKLIGTTLEVVDGVLTGKIIGNNCRCGEKIKRLERVYGDLTQYHLRAWGDSRGDHELLYAAQDPHWRYFHTGSNKSKKSPIKITLKKDS |
9 | Caulobacter_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2243761 : 2314298
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017082|2243761:2314298|DBSCAN-SWA 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95 | Salmonella_phage(18.06%) | lysis,head,terminase,integrase,holin,tRNA,tail | attL 2269205:2269240|attR 2318782:2318817 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2790908 : 2809711
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017082|2790908:2809711|DBSCAN-SWA TATGAGATTAGCTGACTTACCTAAGTATTTTTCTCCAAAAAGTGTTGTATTAAGTGATGTTAGAACGCCTAAAGCTGTTGATTCATTATCCATTACGGATGTAATGGCTTCAATAAGCTTAGCGACACGTAAAGGGCGAATGGGAATAGAGCTATTTTTAGCGAAACACCACATTAACCGTCCCGAAGAAGCGATAGAAAGCCTGTATCAATGTGCATTAACTCAAGTTAACCAATATAAGATGATTGATAAGTTAGCTGAACATGATAAAGCTAAAGTTTTACATATTATCGCTGAATATGCTTTTCAGGATTATGCCAGAAGTGCAGCCAGCAAGAGAGCATGTCCTGATTGTGATGATGGCTTTATCGAAGTTGAAGTTTTTACCACCAAATGCCATGGTCGAAAAACAACCCAGCAGGTTACTCAAAATGCCAAACCTCATCTAAAAACAACCTCATCAAATAAACCTTCTTTTCGAGAGGTAAGGGAAGTAACACGCGTTATTTGCCCTACATGCAAAGGTAAAGCGGAAATTCGTTTAGCATGCCGTTGCCATGGACGTGGAAAAATTATTGATAAAAAACAGACTGAATTACAAGGAGTTGCCGTATTTAAACCTTGTCGCCAATGTGCTGGACGCGGTTATCCTCGCCTTAAATTCAGCGAAGTCTTACAACAATTGCAACATGTGGTGAGTATTTCAAAAACGGCTGCTTATAGTCATTATAAACCGCTATTTGATTTTTTAGTGGCGGAATGCTTTAAAGAAGAGTCTTTATCAGATAAATTTCTACAAGAAGTTACTGTAAAATAATAATTTTCTATTTTTATTTATTTTTATGAAAAAATATTGTTGACTTAAAGGAAAAATAAGCATACTATAACTCCACAGTGAGAGATTTGTATCTAACAAGCTCTCAGCAAAATCTAAGAAGCCTCACTTTTGAAGTGGGGCTTTTTTGTTTTCAATATTTATCACTATCACACTGACCATTATATAAGCTTGGCGAGTTAATCGATCTCACTGCCAATAGGTTTATGTTATGGCATTTTTTATACTACGCTTTTATCTAATTTATTAGATAAATAAAACCGTCAATATATTCATATTAGCGTTGTGATTAAAATTAGATATGAAGAATGAATATATTATTAATGACATTTCCTCTGATTGGAGGTAAGCCATAAGAAATAATGAAAGAAAATCCAGATCTATGGGAACAAATATGCATTGTTCTTTATTCAATGAAAGAGCAAGGTATATCAGCCTTACTCGCTGGGGGAATGGCTATTCTTCGAAGTTTATATAACGCAGGAGGATGGAAAAAAACTTTTTTAGATGGACTGATGTGTGCAATGTTTGCTTGGTTTATCAAAGATATTCTCCTTTTATTTAGTATTAATCATCAATTTGCTTACTTAGCCAGTGTCTTTATTGGTTATGTAGGCATTGAACCTGTAAGCAAACTTCTTATCAGGAAAAATAGGAGTTAAAAATGGCTAAAATAGCGCGGGGTGAACGTAATAATAACCCAGGTAATATACGCCATGGTGCAAAATGGCAAGGATTAGCAAGCACGCAAACAGATAAAGATTTTTGTCAATTTATTTCACCAGAATATGGCATCAGAGCAATTTATAAATTAATTCAAACCTATCAAAATAAATATGGTTTAAATACAATTAAATCTATTATTTATCGCTATGCACCACCTAATGAGAATAATACATTAGGTTATATTGAGCGCGTATCAAAAGAAATAGGGATTGAAAGTAATAAACCTATTGATACCCAAATAAAAAAAGTTTGTATATCTTTATCTATAGCCATTATTAATATTGAACTGGGTTATCAACCCTATGCCAAAAAAGTATTTGAAGATGCTTGGTTGTTATTATGAACTATCTTACAAAAATCATAATAATTATTATGTTATGTTTAATTGCTGGACTTTTTGGGGTTATTGATAGAAATAAAATATTAAAACAAAAATATGTGAAAATTAATGAAACACTGACGCAACAGATTGTAGAAAACAAAAACTATCAATTAAGAATAAAGCAATTATATCAAATGGATACTCAACGTTTACAGGAGTTAGCCAGTGCCAAGAGCGAAATTAACCGGTTGCGTAGTTATGCTGAGCGTGATCCTGAGCGGGTGTACATCAGAGCCAGTTGTGCAACAAACGACGCCAATTCCACCCCCCGCGTGGATGATGCAACCCGCGCCAGACCTACTGACGCCGCTATCCGAAATTATTGGATACTCAGAGAAAGAATTGCTCAGTCAGAGTCCATCATCTTAGGTCTACAAGGTTATATTCGCCAAGAGTGTATTAATTAAAGTGATTAAAAAGGAGTGTAAAATAAAGGAGATGAAATGAATGATAATGATATTAATAAAGCTATTCGAGAGCAATTAATAAAACAATTAATAAAAACAGATATCAATGCTGAAGTTATTACAGGATATCAACCGGAAGAAATCACTGATAATAATATTATTATGTTTTTTCCTATTAAGGAGGTGAGCCAAGGTTGGCAGAAAAGAAGTTATGATGTTCAAGGTAATAATGCCAATCACACTGAACAACAACTTGTTGAGTTAACTTATCAAGTTCAGAGCTTTACTAAAAAACAATCTGATTTTACTGCAGGTGATTTAATTAGAACAACGCGAATGATCATTCATTCGCTGCCTTTTATTGAATCAATGAGAAAAAAAGGAATAGGAATACAACGTGCGACAGAAATTAGGCGTGCGCCAATAATTAATGAAGGAAATAGCTATGAACATAATCCTTCATTTGATTTTAATGTCACTTTTCCCAGCTCGTTATCTCTAAACACTGCAGCTACACATTTACTTATATCTAATCTATCTCGTATTTAAGGATAAATATGTCTATTAAACAAACACGCTATGTTGATATTGCGAGTGCGGTGATTGGTGCCTCTACTGCACCAATGCGTAAACTGACCGCACGTATTTTTTCAACAAACCCTAAAATTCCAGCAGGGAAAGTACTCGAATTTACTTCTGGTCAAGTTGATGCGTTTTTGGGAGCTGATTCTCCAGAAGCGCAATTTGCCCGCCAATATTTTAGTTATGTGAGTCCGGCTCCCGTCAGCAAGCCTAAAGAGCTACAGATTGCCTCTTATGAGCCAATGGGACGAGCGCCAACACTCTTTGGTGGGCCGGTTGCCACACTGGATAAATTAAAGCTGATTGAAGAGGGTGAGTTAACGCTGGTGATTGGCGATGTGACCACAAAAATCAGCAAGCTCTCTCTTCAAGACGTGACGTCCTATAGTGATATTGCATCTTTAATTCAAGCAAAACTCAATGCTGAAAGTGAGCCACAATTTGCCAGTTGTTATGTGACTTTTAATGCTATGGATAGTGCTTTCTTAATCAGCGGCGGTGTGCAAGAAAAAGCGCAGATTAGCGTCAACAACTCACCTCTTGCTGATGCCTTAGGGTTAAGTCAGGGACAAACTTCTGAGGGTAATGCATCACAGACTGCCCTTGAAGCCTTTATGGCTGCAGAAGCTATCTCTGACTCATTTGGTAGTGCAACATTTTTAACCGAACTATCTATTGAGCAAAGTGTGGAACTGGCTGAATACGTAGCAGGTGAAAATGTCAAATACCAACTTTATTTATCGGTGCCAGATCAACAAGCTGAAATGTACAGCAAGGCATTAATGAATACCGCATCGACAGGGTTGAATTTAAAAACCGAGGAAAACTTTTTTGTGCAAGCGTTGCCTATGGCAATTATGGCAGCAACAGATTTTGAGCGTACTAATGCCACCACAAATTACATGTATCGACAATTTGGTATTACATTCCCATCGCAAGTTACCACAGATATGGCGGCCGATCGCTTAGATAAATTGCGCGTGAACTATTATGGTGAAACGGCGGTATCTGGCTCTGAGATTAGTTTCTATCAACGTGGCTTTTTATGTGGTAATGGTGCTAATCCAGTAGATATGAGCGTACATGCCAATGAGCAATGGCTAAAAGCGTATATTGCACAGCAGTGGCTTAGTTTACTACTGTCAACGCGCGGTATTCCTGCGAATAAAGATGGTGAAGCAAGAGCGATGATGATCATTGCTGGGGCAGTAACAAAGGCATTAAATAACGGCACTATTCAAACGGGTAAAGCATTAACAGAAGTACAAAAAATCGCAATTACAGATGCGGCAGGTGATGATTTAGCGTGGCACGATGTACAAAACAAAGGTTATTGGTACAACGCTGAAATCGTTGAACAAACAGGGCCAGGGAATTTACCGGAATACACCATGAAATATGTATTGATTTACGGTAAAGGCGATTGGGTTCGTAAAGTTGAAGGCTCACATAATTTAGTTTAAGGAACAAACAATGAACGATATTTCAGCAACAGGCTTAAGCCTTATTATTCAAGCAAGTAAAACATTTCCAGCGGGTATTCCGATCACCACCTTTTCTGATGAAGGTGATCCTTTAGATTTACCGACAGTTAATATTACACAAACAGCGGTAGATATTAATGGTAATTTGGTCAGTTGGTCTTCACCAACACCTCAAACGGTCACCATTAATGTGTTAGCGGGAAGTGAAGAAGACGAAAATCTAGCTATTTTGTTTGATGCTAATACGGCAAGACGGGGACGACGTCCTGCCAGTGATGTGATTACTTTAGTCGCTTCTTATGGTGATGGCTCTATTACCACGGCACGTAATGGACGTATTACTGACGGTTGCCGAGGTAATTCAGTCGCAGGGGCAGGACGCCTTAAATCTAAGCAGTACACTTTTATTTTCCAAGATTTTGACCGTGTTAGAGCGCGTTAATTATTAATCTTACTTTTTATCATGGCGACTTCGGTCGCCTTTTTTTATGGAGTTTTTATATGTTGATTAAACCAAAAGAGATCACGGTGATTGATAGTGATCGTCAACAGCATACCTTTATTATTAGCCGGTTACCCGCCAC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21 | Burkholderia_phage(21.43%) | holin,lysis | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2998168 : 3031890
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017082|2998168:3031890|DBSCAN-SWA 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39 | Escherichia_phage(22.22%) | holin,tail,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3622313 : 3638960
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017082|3622313:3638960|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017082|3622313:3638960|3623641_3624238_-|WP_004251569.1|DBSCAN-SWA MSILEWPKAVIPIQENWQLLSNSKTFTSPFNGSSQTVRFPGSRWRCELTFNNLNEEKSRQLEALVASLDGMSGRVKISSWIRKGRYGYGSPRIAIPSQLGNRLETKDWKRNMRVLQQGDRLTVGNELKMVVADVVSDNQGHAIILISPMLRTSPTVNEMLEVERPFGVFRLVDNEQGKFQHRRLGYTYITLSFEEVLY >NZ_CP017082|3622313:3638960|3622313_3622712_-|WP_004251558.1|DBSCAN-SWA MKQQNWTLQLPETIRAAMSRPFSWGEFDCCIFASECIYAQCGFSPIKPYLNHYKTKAEAFNLLKSKFGSLEKAVSRYFKSIEIERVQRGDLVLFKGEDGDSLAVVWARHYWGVTPQGVKPVQINPIKAWRVE >NZ_CP017082|3622313:3638960|3624238_3627514_-|WP_036905771.1|tail|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP017082|3622313:3638960|3638690_3638960_-|WP_036905789.1|DBSCAN-SWA MRMEKLTNVTYGTAGLTAFFASLSLYEWGFVIGMAFSMLLGLATYFMTRREQRKRTQLFEELVRHVDPQNPTETLKRLAELMVKAPKDI >NZ_CP017082|3622313:3638960|3628612_3629278_-|WP_004251580.1|DBSCAN-SWA MTKPKNHKATPFLGTKIFVQTGLGEAMTVTEATLSPATITIANNKLKADDMIMLSGLGELDGRFPVAQVDGNKVTLCDEVDWSDKTLPTDFSSAKAQRIQWSNNFCAVKSFSKDGSTTEQIDVTTICSDGKEYESGDTEYGSIKLTFFLRYSSSEVQRLLRKYENSKEKFAVKMVLTRDEGSMFYYGSVETGMNIDGSVGQMMDSGISIKLSGRDYLNAKK >NZ_CP017082|3622313:3638960|3628131_3628548_-|WP_004251577.1|DBSCAN-SWA MSNALLRELVLNQALKVTPFTYLDNTFYVKELDVGTMNYIQRKLRQIKIKLAEEQDIYLDEDDPEQFNEAINRVYDEYDVARMLAFKLCDEKGELLFDAENEEDLKGLNRLGQGFSNAVFTAEAGNSEKNLENGDNFN >NZ_CP017082|3622313:3638960|3630764_3631931_-|WP_004251594.1|capsid|DBSCAN-SWA 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23 | Salmonella_phage(12.5%) | lysis,head,terminase,protease,capsid,portal,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3643264 : 3654379
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017082|3643264:3654379|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017082|3643264:3654379|3648607_3649090_+|WP_004247128.1|DBSCAN-SWA MLNGKDLGRAIEQAINKKLSSGSVKSKTEIARHFNVKLPSIYDWIKKGSISKDKLPELWSYFSDVVGPEHWGLKEFHLPVNKAESRCTHDEHQLNSLIHAYMSASAERKEIIKYLLLQNNTKEPSWVNSDTRAYIITLERQASEWLNNNKSNKKSSKRPA >NZ_CP017082|3643264:3654379|3651062_3651593_+|WP_004247124.1|DBSCAN-SWA MSYIATATNKHFYYLDVRIEDIDIQDIATGLANECRFNGQIDNFYSVAQHSVYASYLVAPEFALEALLHDASEAYVKDLPSPLKKLLPEYKLIELRVEKMIRKKFGLPENISDEVHFADLVMLATEKRDLDIDAGSNWLMLEGIPASDFAVTPLTPRQAKSLFLRRFNELYKEKKG >NZ_CP017082|3643264:3654379|3646149_3647241_-|WP_004247133.1|DBSCAN-SWA MSLLLLKSRPLVVIPELAVRLGLNEAMLLQQIQYWLTETTSGVEYDGSRWIYNTVEEWKNQFPFFSESTIKRAFTNLKKQGVLRIEQINKSNHDRTNYYAINYDHHLLTDEVNMTQSNGDNSSDRTVQNDLIDKRKLKPSNSAKCAVLNGSKWPVLTENTTEITSESTTETDHSSQNSDESSDQSKNDFLTRYPEAVIYSANGQKWGDEDDLKTAKWMFGRVKKLNPSALEPTWYDWANDIRLMRQIDGRTHEKICALFDWANKDSFWHKNILSPRKLRKHFDELTIRSQEPRNEPKVQVDTIERDSAFSRLIGSRSKPKNRIEEIALELAGKTGIRRMSEFSGRQAWNSIWKQAIEMLQETQ >NZ_CP017082|3643264:3654379|3650178_3651006_+|WP_004247125.1|DBSCAN-SWA MSQLDGNAISQIQDMTVASLSLEAIEKSLCPAIVLPNDFKVSSLENLQEGRFRFRGEMKTTSISDFVKYSIKNAIDEGVSCFIDADEMSAETIFNLGTIGKAGHADNTAIVKLKQTAPFTALLKMDGVKYRQKQLAEWLEDWHDYLMAFDADGNVLDIKQAISAVRRITIESTRSAEHENADFSAKRSVLENVEARSKDIMPATFQFTCTPYDELKERSIKLRYSVLTGDDIPVLVLRIIQLEKLEEQIAQEFRDMLCNEFNESKIETFIGKFSA >NZ_CP017082|3643264:3654379|3649738_3650113_+|WP_004247126.1|DBSCAN-SWA MSQEDRKTNVPDFLSELDAGVFENKVSAVLNDVALGVLNNGGKGKVTIELDFARLSNSMEEKRVEITHKLKFSAPTPRGKRTEEDTTKTPMYVGKGGKLTIMQEDQGQLFSLQGQPDGKLKAIN >NZ_CP017082|3643264:3654379|3643819_3644218_-|WP_004247136.1|DBSCAN-SWA MRDMQEVLSRWGAWSANEGNSIDYSSIAAGFKGLIPSSRRSQEQCSDDDGLKINKAVLHLKINNSYLFQLVIMYYVKNYPLRSMASKLGISHNEVAKRLQAAEGFIEGCLSVDNVKLDMDKIIKKYPIYSLA >NZ_CP017082|3643264:3654379|3653125_3654379_-|WP_004247120.1|DBSCAN-SWA MESKVVVPANGAKITLDAKGKLVVPNNPVIPYIEGDGIGIDVTPAMLKVVDAAVEKAYGNERKIEWMEVYTGEKSTQIYGKDVWLPEETLDLIREYRVSIKGPLTTPVGGGIRSLNVALRQQLDLYVCLRPVRYYKGTPSPVKHPELTDMVIFRENSEDIYAGIEWKAGSAEADKVIKFLQDEMGVTKIRFPQDCGIGIKPCSEEGTKRLVRAAIEYAIDNDRDSVTLVHKGNIMKFTEGAFKDWGYELAREEFGGELLDGGPWVKIKNPKSGKDIIVKDVIADAFLQQILLRPAEYDVIACMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANIGDECALFEATHGTAPKYAGQDKVNPGSIILSAEMMLRHMGWTEAADLIIKGMEGAIEAKTVTYDFERLMDGAKLLKCSEFGDAIIKHM >NZ_CP017082|3643264:3654379|3651877_3653005_+|WP_004251675.1|integrase|DBSCAN-SWA MAARPRKNNVNIPNLYPLLSRKSSKVYWRYRHPVTGKYHALGDNEAEAKAIAIEANTRLAEQRSRQVMAISDRVAKIKGKEITVNTWLDKYWAIQEERLKEGDIKPNTYKQKRKPVDLMRQALSMKPLPAVDARDIAGILDEYKSNGQHRMAQVIRSVLIDVFKEAQHAGEVPPGYNPALATKQPKRKVTRQRLNFDEWKKIFEIADKQHRYMGNAMLLALITGQRLGDISAMKFSDIWDDHLHIIQEKTGTKLAIPLSLRSEQLNMSLREVVARCRDRVISPYLIHYFHTTSQSKRGDQVTANTLTTNFKKARNKTDIDWGEGTPATFHEQRSLSERLYRAQGINTKDLLGHKNQIQTDKYHDDRGKDWIKIVI >NZ_CP017082|3643264:3654379|3645270_3645978_-|WP_004247134.1|DBSCAN-SWA MMQKIMEVSVLPIMNRELTMSSREIASLTGSNHSDVKRSADRLFVAQILTQPLAEFPFEHNGNQYTEYRFNKRDSLVLVARLSPQFTAKIVDRWQELESKMQPVIPQTLPEALRLAADLAEEKQKLESELAIATPKAQFVDNYVLSHGSMTFRQVCKLLQAKETDFRCFLIDKKIMYRLNNTFTPYQTHVDLGRFEIKTGTNQKNNHAFAQSRFTTKGVKWIAGLWAEYKVEDEI >NZ_CP017082|3643264:3654379|3644245_3645271_-|WP_004247135.1|DBSCAN-SWA MKLLLTPYIQSDLGVVLLKPGAELLKQFKPHSRVIISDVPKSLDKWPSGALTGNEQPLLDNKGIVDFLNNKKVLQAMGGLSSMNMWIGRNIHCCQINDKHDSYHHHELTTTWHKDGVIRTCWYHDNHIRHSSAEWVAELAHKNRIAWMVDTIRSRLRLDNGHQLTVPDFFSFAVMHKLVDELPDAILRQILDWSEKPKERRVHGGFPEADIIPSNVTALSTMNERLDMIRPVIKVAIDPEPLASFLLKPKMQRWENSQWLQWVKTQPCCVCGQQADDPHHIIGHGMGGMGTKVHDLFTIPLCRQHHDELHRDPKLWEATYGNQIELLFSFLNRSLGIGALV >NZ_CP017082|3643264:3654379|3647253_3647433_-|WP_063108983.1|DBSCAN-SWA MSNENPNQLDRYYKNHRGIVVHVVRYHREKQRVIFMLDGCDDPQCEPVQRFKEKYTRIK >NZ_CP017082|3643264:3654379|3647721_3648180_-|WP_004247130.1|DBSCAN-SWA MSCQSIKQVVKAMCEATAGGREAMAGALGLSLTSFNNKLYEKNGCRSFDLNELLAMQDISKTVLFAEFVARESNRLLVDRVNPAELDTTELFTLRSNVDEMQGHLALLMKNSLADGVIDNEEEQKIKMMLDGLISQIHTFMNAFVLLHQKRN >NZ_CP017082|3643264:3654379|3648264_3648504_-|WP_004247129.1|DBSCAN-SWA MDQISATTAIKKACNYVGGQSEMAKRLGISPPTVNQWINGTRKIPARRCPEIEKVTSGVVRCEELRPDVDWSYLRGTQQ >NZ_CP017082|3643264:3654379|3649532_3649715_+|WP_004247127.1|DBSCAN-SWA MGVKKSNLQPARNPNPNRADATTGGPLFLIMTLTISKGTNITCEMSYPGCINSLVPFLIV >NZ_CP017082|3643264:3654379|3643264_3643477_-|WP_004247137.1|DBSCAN-SWA MSNTMTGTVKWFNDDKGFGFITPKDGSKDVFVHYSAIQSDDFKSLMEGQEVSFTMENGMKGPAAGNVVAL >NZ_CP017082|3643264:3654379|3651654_3651897_+|WP_004251672.1|DBSCAN-SWA MQMLTLEEWAQERYKSRPPKLGTLQRYARGGLFYPPARKEGGIWRVREDADLVGNLTSPVINNNDNLILQRILKDGCQTS |
16 | Morganella_phage(28.57%) | integrase | attL 3638487:3638500|attR 3653972:3653985 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3765021 : 3823279
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017082|3765021:3823279|DBSCAN-SWA 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50 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | transposase,protease,integrase,plate,tRNA | attL 3771695:3771711|attR 3814320:3814336 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
4077794 : 4090305
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP017082|4077794:4090305|DBSCAN-SWA GTTATTGCTGATCTTCTGTATAAATACCTGCGGAAATGATTGCCCCACCTACCTCTCGCCTGTCCAGTCCATAAAGTAAAGGAACTGGATTTCCTTGCGCAGTAGAGTTTACAGCTCCGCCAAAGGCATAAGATGGTTTGTTATCTGAATCTTGCCTCATTGATAGACCTCGCGGTTGGGGTGAAAGCATCTGGTAAACACCACCAAGAGCCACACCAAGACCTATGGCCCCAATCAAGTCACTTGCAAATAAGGCAGTACCCCAAGGAGCAAATGTCGCGACACCGATCATGGCAATGCCCAACATAGTTTGAAAGAATCCTCCTCGTTTACTTCCTTTAATGATTGGTGCTATGCGGATCTCTTCTGTGGTATCAAGATGCAGCTCTTCTTCATTAATGTTTCGTTTCCCCTTAAATACAGCAAACTCCATTCCTTTTAAATGAGCATTAGCAAGAAACTGCTCAAAGCCATCATAAAGCACAGAGAGCGCCTTAATTGCTTCGCGAGGTGAATCTATATCTAATTTGTGTTCACGCCCAAATTTTGCGCCAAGAACACCATATAGACGTATTGCTTTTAGGCTCATACAAACTCTTTCCTCCGCACAATTTTTACGGTTCTATCTCGCCAATAATCGCTGTAGGGGACCAACCTGCTGAGTTGACCATAAAGATGGTGAAGTAACATACCATTCATAATCACACCAGCGTGATTAGGTACATCGGCTTGTACTTGCATAATCACCATATCGCCCTCTTTCGGCTCGCCAGTAACGTCAACAAAACCCGCTTTCTCGTAGTTATCCATATACAGGTTTTCGCCTTCTTCCCACCAGTGCCGATCAACGCTGTAATTATGTAACTCAATACCGTGCTTTTGGTGGTAGTAATCCATGATTAACGACCAGCAATCAGCATAACCAAGCACAAAAGGACGGCCTTCTAATTCGCGTTCACCTCGAGGGTAAATAATTCGAATATCACCCTCTGGACATGATGCGATCACCCAAGGTAATCCTGTCGCATCACACTGTAATTTATCTATTTCGCTAGGTTGAGTCGTTGCACCATCACCACAATGGCTGTGCACAATTGCTATTGGCTCACCCCAGTCCTCAGCAAGAGCGTAATCTTCTGGAGAAAGCTCAAAATGCTCTGTTGGGTTATCTGAAAGATTGCTACAAGGAAAGTATTTTTTAACTCGACTTTTTTGACAGATAACTCCGCAAGCTTCTTTGGGATATTCGGATTTTACATGTTGAAATATCGATTCTCTTAATTTTTTTGTGATCATCTCGTTAATCCCGCAGCGGGAAACCCTCCAAAATCTAATGGCTCATTCTCACCAAAGCGTTTTTTGCAATCACTAATAAGACCACCGCAACTATCCAATGCCGGATCATCAACAGGATTGCCTCGCTCATCGAAATATTTATTCCCCGAATATGAGCACCCATTGCCACTGCGATAATCGCCTTTCATGCACCAATAACAAAGGTTATGAATTTGTCGAACGGGTATCATTACTCCCTGTAAATCAAATGGGCTAGACAGCTCGAACTCTACGGATTCGCCAGCCACCTCATTAGTTTTACGATCGATGTAATAAACCTGTTTAAAACACTCATCAGGGTTAGCGGTTGGATTACCATCAGGAAAATTTTTGGCATCAAGATAATGAGAGAATGTCTCATAAATAGTAACCTTTGCTTGCACCATATCGTCAAACTGGAGGCACAAAGATGAGATTAAACCATCTATGTTGGCAACCTTTAGAGATGGTCTTGCCGGGCTGCCATCGCTATTTTTTGCCATCCCTTCAATTTCATAGGGCCATGCACCGTATTCATTGCCTTGCCACCAGATTGGCTTTGGTTTGATATCACCATTAGACTCCTCTATCTCTTCTGGCGTATGAGGTAGATTGTAAGCATGGAAGCGAAGAATTGGCCCATCAAACTCACTACCATCCACCTCAATTAATTGAACCTTATTACCCGGCTCTAATTTTTGTACATCTGCTGTGATATTCATGCGCTAAATGCCTGTTCAAACGTTGCTGTTAATTTCATTACTCCACCAGAGATGGGGATCATCGATATTGAATCAGCTTTAACTCGATAAAGACCTTTTTCACCAAACGGAGGAGTCCAAATAAATGATTTTGCTGTGTGTCGCCGAATGAATTTAAAAATAGGCATCACCTCATCTTTTAGTCCCATATAAGCAAATGGCCACGTTTGAGATTCTGGATTAATACCATCACCCGCAACTTGTTTGTAACCATCTCCAAATTCAACTTCTTTAATGCGATGTTTGAACTCACCGCTTGGCGAATCTTGTATTTGTGTTCGCCATTTAAACTCTTCCATTGGTTACTCCAATAAAAAAGGCGACACAAAGTCGCCTGATCAAATATCAGGATATTAATAAATATCCATTAGGTTATTTTATATATTCAGCCCAGAGAAACTTACCGAAGGAATGGCTGACTTACTTCGATGGAGAATTGAATATGTTAGTTAGTGAAATGGCAAAAGACATAGAGACCCTTCAAACACGTACTCTTGCTTTAGAGTATATAATTCAAGTAATGATTAGGAATATGTCTGATATTGAAAAAGAAAAACTTATTAGTGAATTAAATAAAGTATCGCATGATAGTCCTGTAACTATCGAGGCGTTTGGTATCATTCAGTCACATTTACATAATTAGTACCATATTATAAAGGCGGTTACTGTGCCGCCTTTATGCGATCTATCATGGTTCTTGCATATTTTTCCGCTCTCCCCATAAATGAAGTAAATGTTTCATTTGGGTTATAATCCTCTGTGTACTTAAATTGTAACTTTGGTTCTTCATCTTGGGTATTATTTCCCACTATCTCCGTTACTGTAATTTCTGACGTTAATATAGGTTTTTCACTTATTTTTATAGCCCCAATGCCATATCTTTTCACATCCCCTGTAATTTCCACTCCTGAAAATTTGTTTGATAACAATGGGAACTCTACTTTGATTTTCATAACTACCTCTCATTAAAAAGCCACAGAATTTGGTGGCTATTATTGGTTTAATTCTTTAATTGTTTTTCTTGCATATTCTTCGGATTCTTTAAAATATTCCGAAAGAGGCTTATTAGCATCAAAGCTAGTTTGATAAACCAGATATGCTTTTGGTGGTTCAAAATCAGCTTCATTTCCCATGTATACATCTACTGGAATGCTAATTTCTTTATCTTCTGGACGAATACAAATATTTCCTAATTTTAATTTCATAAATACCTCTCTTATTAAATGATTATCTATTTCCTGATACTGCTTTAATGATCTTGTACAAATCACCACCTTCTCGCCCTTCACTAATAAAAAGGCTTTTAACTTTATTCTTTAACGATTGCTCAGCAGCTCTCACATCTATATTTGGCATTGCACTTTGTTGCTGTTCGGTTTCAATCTTGACGCCGCTCATATCAATTGTCACATTCACCCCACCACCAGCAATTTGAGGATTGCGAGCGATAAATGCTGTTGGCTGTGTAACCGACATGGGCGCAGAACCACCGACATGACCACCTGAAGCATAACCTCTCTTTCCTGCATCCATTAGTCGATAGAGATTATCTACACCTAATCGTTGCGTTGCTTCCTTGGTAAAGACGAACTCGCCTTTATGTACTACACCCGCTGGATCATGTTTTCCACCATCGCCTGTATAACCACCACTTGCAAACCCAAAGAAATTACCTACCGCATTACCACCAAATGCCGCTTTCATAGCATTTAGCATAGCCATCTGCATTAACATCTTGGTGGTCATTTCTAAGAATGAGCGAGTGAAGTCAGCAAAATTAGCTTTGCCCGTCAATACAAAATCAGAGAGACTGTTACTCATGCCTTGGAATGCTGATTGACTAATTTGAGCTACGTTACCGTAAACGTTTGTTGCCTGTTCTTGGAATTCAGCAAAGCCTTTCTTAACGCCTAACTCCCAGTTAGCACGAATAGAGTCTTCCTTAGCATAATACTCCTCTAAGGCTTTTCTCTCGTCTGGTGATTTAGCTTTCTCTAGTGCGATGTCTCGTTGATACATGCGGCCAGACTTACCAGCTCCCAACTCTAAGGCGCGACTTCTGGCATTGATTTCTTCAACACGTTTAAGTTGCTTATCTAACTCACGATTATGTAACTCCTGAAGCTTAACCTCATCACCAGCTATGGCCAATGCTTCTTGAGAAGCAAGAATGTAGTCCTTTTTAGCAAGCAACGCCTTTTCGTCCTTGGTTAACTGCCTTGTTTTCTGAGCCTCCTCAAGGATTGATATTTTCGCCTCCATATCCCACAGCTTTTTACGCTCAGAGCTAATAACATCACTAACTGTTTTATGCTCTTTTAACACCTTCAATTGTGCTTGTAGGGATAATAGGGCTTGATTTGCTGATTCGTCTACTCTAGTACCATAATCTGGTCGGTAGGTTGAGGTTTTAGATGTTCTATCTTTAAATTTATTATTTATATTTTGTACTGCTAACTTCCTTTTATCTTCAGTCCAAAATTCAGGGTCTCTTCTAACTTGCTCCCATAGCTTATTTAGGGCCGCTGTTCTTTTTTGAGCGTTAGTTGCAGTATCTTCTAATAATTTATTATATTCTCTAATTGATTCTTTTCTTTTTTCATCCGCCTCCTTGGATTTGTTTTGTGCTTTTTCATAACCTTCATGAGAAGATACGACGAAACTTAAAATCTTTTGTTGCTCCTTTAAGTTGCGAATCATATTTTCTCTTTGTTCTTTGGTTCCATGCCAAAATCCAGCATTTTCCCATTCTTTTATTCTGTCGTTTATCTCAGCTAACGCCTCCGCATCGGAAAGAGGTTTACCAATATTTTTTAAAGCATTTCCTGCATTCTTTATTGCGGTTGCAACATCATTCCATGCTCTCTCTAATGAACCTATATTTTGATTCATAGATCTAGTTCTTCTATCAGTTTCCTCTGACAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP017082|4077794:4090305|4080860_4081073_-|WP_004247512.1|DBSCAN-SWA MKLKLGNICIRPEDKEISIPVDVYMGNEADFEPPKAYLVYQTSFDANKPLSEYFKESEEYARKTIKELNQ >NZ_CP017082|4077794:4090305|4086282_4086672_-|WP_049195353.1|DBSCAN-SWA MIKNNSIAKRLTELRAQKGLSQSELAELSGVAPAQISRYESGINVPRAHIIAKLAKALGVQYSFLENGFSMDGENLLTQMSMNKDNTATISLELDNETLEIAKKSAEIRGISLEDYLKWLLVYGITGPK >NZ_CP017082|4077794:4090305|4085042_4085276_-|WP_049195350.1|DBSCAN-SWA MRQLLLIIVILIAGFLIYGAIMSSSPESKEKSKDRNAISYCWKEYDKKSLSDEQKRFIASSCEKMESDFRSRYGVNP >NZ_CP017082|4077794:4090305|4088989_4089277_-|WP_049195199.1|DBSCAN-SWA MYGGMSSKESAEFERAFGFPPDIDDVEVWPDVWDSYQVFSAMNTQWRVGMNGITGLDYNPLNQIMDLLNIKDRATVFSDIRIMEAKALEVMHKRS >NZ_CP017082|4077794:4090305|4087944_4088433_-|WP_049195202.1|DBSCAN-SWA MSREFGYHLEGVNYLSVDDIIYINEALIKAQTPDEPIRVLNQSNLESSQARPSLIRYYEQTEDMFRLSSVLIESLIQNHPFANANKRTAMMCGYVFLLINGYELTAPGDDMVDIASGLATKNYSCEDLEDWLCHWSREYDAAELCNPDFGKLCCSVIKLKNT >NZ_CP017082|4077794:4090305|4089648_4090305_-|WP_004247505.1|DBSCAN-SWA MAYNIPNGSRVYVASKYDDEIKITEATNAEEAVLTVDDVGDIAKGDIVHVTSGWKKASGAFRVASVAESKITLEGVDTSDKNVFPAGGGTGTLKKVLSWEVMPQVMTLSTEGGEQQTQEVQFLEDEQAETIDTYKNGVVQVYTFAHDAKLPIRKLLTKLDDSKQVTAIRFFNKRAEEDRYYTASISFQRVPNTAINEVENVTARFSLKSEMQIYTNAS >NZ_CP017082|4077794:4090305|4081095_4084035_-|WP_049195348.1|tail|DBSCAN-SWA MADIATISLKADTSDLERGTQKLKEFGDTAEKVSGSSRNLNDQFNRGVDHQKRAADAIKRQKKELDDLLNSINPTNKAFDALDKATQKLIEANKKGILPKDQFADYNAILEQTRDKLTRVNMSLTAEGRALLAQEAATNRAKQAADDFLNSLKNQTEIIGKTRTEILELKAAQLGVSQQAAPMINRLKEQEKAFMNGSITIGQYRNAMRQLPAQMTDIVTSLASGMPVWMVMIQQGGQIKDSFGGIGNSLKALASIITPTKIAIATATTASLALAYSAYKGSQEFAEFNKQLIMTGRYAGKTAYELNQLSKTLVGNWITQGDMASALTKVVGSGRFQGDQILLVARAAAQMEQSTGKSIDETINQFKRLKDDPVNAILELDKTLHLLTASEYEHIKSLEIAGKTQEASEFSIKKLSEETDRRTRSMNQNIGSLERAWNDVATAIKNAGNALKNIGKPLSDAEALAEINDRIKEWENAGFWHGTKEQRENMIRNLKEQQKILSFVVSSHEGYEKAQNKSKEADEKRKESIREYNKLLEDTATNAQKRTAALNKLWEQVRRDPEFWTEDKRKLAVQNINNKFKDRTSKTSTYRPDYGTRVDESANQALLSLQAQLKVLKEHKTVSDVISSERKKLWDMEAKISILEEAQKTRQLTKDEKALLAKKDYILASQEALAIAGDEVKLQELHNRELDKQLKRVEEINARSRALELGAGKSGRMYQRDIALEKAKSPDERKALEEYYAKEDSIRANWELGVKKGFAEFQEQATNVYGNVAQISQSAFQGMSNSLSDFVLTGKANFADFTRSFLEMTTKMLMQMAMLNAMKAAFGGNAVGNFFGFASGGYTGDGGKHDPAGVVHKGEFVFTKEATQRLGVDNLYRLMDAGKRGYASGGHVGGSAPMSVTQPTAFIARNPQIAGGGVNVTIDMSGVKIETEQQQSAMPNIDVRAAEQSLKNKVKSLFISEGREGGDLYKIIKAVSGNR >NZ_CP017082|4077794:4090305|4085343_4085616_-|WP_064971710.1|DBSCAN-SWA MEARIAKLEANVESIQATLTDIKSDMKTSKGDISTLKSDTAVIKSNYATKQDIEGVKTEVQKAISTQTKWLMATIFIALGAGITIAKLLF >NZ_CP017082|4077794:4090305|4085728_4086130_-|WP_049195351.1|DBSCAN-SWA MNTERIAFLHPYNPSDDESPLLSFDCDEIPVVLDFHFKVFMLDLKDDEPISLQNRLFRIDGEKITPICDPKSILIKVKDTQGKPNEVMASIKLTFEKCKFIEEGTYFIESSFIKNAEMINSNRAYFKVSKTNE >NZ_CP017082|4077794:4090305|4080530_4080821_-|WP_049195346.1|DBSCAN-SWA MKIKVEFPLLSNKFSGVEITGDVKRYGIGAIKISEKPILTSEITVTEIVGNNTQDEEPKLQFKYTEDYNPNETFTSFMGRAEKYARTMIDRIKAAQ >NZ_CP017082|4077794:4090305|4078378_4079089_-|WP_049195341.1|DBSCAN-SWA MITKKLRESIFQHVKSEYPKEACGVICQKSRVKKYFPCSNLSDNPTEHFELSPEDYALAEDWGEPIAIVHSHCGDGATTQPSEIDKLQCDATGLPWVIASCPEGDIRIIYPRGERELEGRPFVLGYADCWSLIMDYYHQKHGIELHNYSVDRHWWEEGENLYMDNYEKAGFVDVTGEPKEGDMVIMQVQADVPNHAGVIMNGMLLHHLYGQLSRLVPYSDYWRDRTVKIVRRKEFV >NZ_CP017082|4077794:4090305|4089291_4089597_-|WP_049195198.1|DBSCAN-SWA MPKFTLVPNPTFKANVKIPVAGKEKPEVVTFTFKHHSVSELDGMREKPISEFFERIIADWAIEEPYNKENLNILLDNYPSASRAISSTYYNELLGNREKNS >NZ_CP017082|4077794:4090305|4086836_4087673_+|WP_049195354.1|DBSCAN-SWA MNTISTINVPFHGNNLYVVNYKGQPYVPMKPIVEGMGLTWQSQFEKIKQRFKSTITEIVIVAADGKERNMICLALRKLAGWLHTISPNKVKPEIRDKVIKYQEECDDVLYEYWTTGEVKKKHKSTVQERNPLKNAVNLLVSKKGIMYPEAYSLVHQKFNVSSIEELTVDQIPDAVEYIHKFVLEGEYIPKQEENILFEPNQNSITVTIPKEGRWLVSYKNGKQQVVSVDGHNVVSVEYIQKLQRDSNALIELLQNFRLRTQVMQGEKSGDILNTPLIA >NZ_CP017082|4077794:4090305|4077794_4078382_-|WP_036976694.1|tail|DBSCAN-SWA MSLKAIRLYGVLGAKFGREHKLDIDSPREAIKALSVLYDGFEQFLANAHLKGMEFAVFKGKRNINEEELHLDTTEEIRIAPIIKGSKRGGFFQTMLGIAMIGVATFAPWGTALFASDLIGAIGLGVALGGVYQMLSPQPRGLSMRQDSDNKPSYAFGGAVNSTAQGNPVPLLYGLDRREVGGAIISAGIYTEDQQ >NZ_CP017082|4077794:4090305|4079825_4080167_-|WP_049195345.1|tail|DBSCAN-SWA MEEFKWRTQIQDSPSGEFKHRIKEVEFGDGYKQVAGDGINPESQTWPFAYMGLKDEVMPIFKFIRRHTAKSFIWTPPFGEKGLYRVKADSISMIPISGGVMKLTATFEQAFSA >NZ_CP017082|4077794:4090305|4080310_4080511_+|WP_004245944.1|DBSCAN-SWA MLVSEMAKDIETLQTRTLALEYIIQVMIRNMSDIEKEKLISELNKVSHDSPVTIEAFGIIQSHLHN >NZ_CP017082|4077794:4090305|4079085_4079829_-|WP_049195343.1|tail|DBSCAN-SWA MNITADVQKLEPGNKVQLIEVDGSEFDGPILRFHAYNLPHTPEEIEESNGDIKPKPIWWQGNEYGAWPYEIEGMAKNSDGSPARPSLKVANIDGLISSLCLQFDDMVQAKVTIYETFSHYLDAKNFPDGNPTANPDECFKQVYYIDRKTNEVAGESVEFELSSPFDLQGVMIPVRQIHNLCYWCMKGDYRSGNGCSYSGNKYFDERGNPVDDPALDSCGGLISDCKKRFGENEPLDFGGFPAAGLTR >NZ_CP017082|4077794:4090305|4084095_4084917_-|WP_053089294.1|DBSCAN-SWA MKGFGWVLLVIGILAAFAAFNMDVSVATSYGGRVNNFGLMAQRQNYILISCFVIFCGLMMVIFGGRRTIESGQVKCPFCAEFISNEAIKCKHCGSDLSEHKRLQKEKETNLKIKFNAINYDQTELYDTSSGKAVLNYEKLAKLVQRIKFEDEDISGEALLARQKFNIETIQSRLPKEIKKEFRDKASQLILDSFIKSDKLGELHYRFISIDNGNYRINKDEIKKFAEHLISKLPYGHDVFTDFNDEISKAMKSIPSDVRGDFMSNLHHFVYGK |
18 | Cronobacter_phage(50.0%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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