Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018624 | Clostridium chauvoei strain DSM 7528 chromosome, complete genome | 4 crisprs | csa3,DEDDh,cas3HD,cas3,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7b,cas8b1,cas6,WYL,DinG | 0 | 5 | 4 | 0 |
1. NZ_CP018624
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018624_1 | 208476-208570 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018624_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018624_1
>1.1|208499|49|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder TTTAGTTAATTTAAAGACATTATCTTTAAATTCAAACTTAATTGAAAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018624_1
The CRISPR arrays of NZ_CP018624_1 >merge|NZ_CP018624|1|208476-208570|CRISPRCasFinder TTACCAGAAGGAATATTTGATAATTTAGTTAATTTAAAGACATTATCTTTAAATTCAAACTTAATTGAAAGTTTACCAGAAGGAATATTTGATAA >NZ_CP018624|1|1|208476-208570|CRISPRCasFinder TTACCAGAAGGAATATTTGATAA TTTAGTTAATTTAAAGACATTATCTTTAAATTCAAACTTAATTGAAAGT TTACCAGAAGGAATATTTGATAA
>NZ_CP018624.1|WP_096145305.1|205699_206798_+|peptide-chain-release-factor-2 MLIKLENELAKLSNIKNNIEEMGASLDKEALEKRVQELEMQMQEKGFWDNVKRAEEVTKETKQIKGKIERYELLKSRIEDVEVLSELMEEDDLESAEEIIAEIKSIEKTLDEYKVEILLSGEYDRNDAILTLHAGVGGSDANDWTDMLLRMYTRWCEKKGFKVEVIDLLQGDEAGIKSVTLKVKGEFAYGYLKAEKGVHRLVRISPFNANGKRQTSFASLEVLPELTEDQDIDIKSEDLKIDTYRASGAGGQHVNKTESAIRITHIPTGIVVQCQNERSQFSNKDTAMAMLKSKLIELKERAHKEKIEDLTGELKDMGWGSQIRSYVFHPYNMVKDHRTNEETSNLNAVMNGEIDNFIKAYLNNF >NZ_CP018624.1|WP_021876580.1|203121_205641_+|preprotein-translocase-subunit-SecA MGFLEKLFGSYSDREVKRLEKTANQIEALDADMQKLSDEELKSKTDEFKKRIQDGESLESILPEAFAVCREASWRVLGMKHYKVQLIGGMVLHQGRIAEMRTGEGKTLVATLPLYLNALTGKGVHLITVNDYLAKRDQEWMGQLYSFLGLTSGCIVHGLTAEQRREAYGSDITYGTNNEFGFDYLRDNMVIYKEERVQRGLNFAVVDEVDSILIDEARTPLIISGAGEKSTKFYNVADNFVKQLLAERDYTIDEKANAVMLTEEGVEKAERAFGIENYADAANLELQHYITQALKANYSMKRDKDYMVKDDQVVIVDEFTGRLMEGRRYSDGLHQAIEAKEGVKIERESKTLATITFQNYFRMYDKLSGMTGTALTEENEFREIYALDVIVVPTHRPIARIDNPDLIYKNTNGKYNAIIEDIIKSYEKKQPVLVGTVSIEKSEIISALLKRRGIKHQVLNAKYHEQEAEIISHAGELGMVTIATNMAGRGTDIKLGEGVLEVGGLKIIGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDKGESTFYISLEDDLMRIFGSERIQGLMEKLGLEDDEAIDHKMVSKALENAQKKVEGNNFDIRKNLIGYDDVMNMQREVIYKQRAEVLEGKNLKDQIQNMISEIVTSAVNSHLTGEEDDYETEINKLLKYLEDICLPHGVIALSDVVDLSNEEIINKINAILREIYTGKELEFGEEHFREIERVVLLRVVDQKWMAHIDNMDHLKQGIGLRAYKQVDPIQAYQMEGSAMFEEMIEGIKLDTVRFLFHIQVERPVERERVAQETSASHASTGDSAEVKKEPVRNEDKVGRNEVCPCGSGKKYKNCCGREA >NZ_CP018624.1|WP_021876581.1|202458_202983_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MKVTVVTRNTKLTPALKEMVERKISKMDRYFEPHVSAKATLTVQKNRHIVEVTIPFNGIILRAEEATDDMYKSIDLVEEKLERQIRKQRTKLARRNNESLRFSHIDEVAMEEDDGKVVKTKKFGLKPMSSEEAVLQMELLGHSFFVYQDADKNKLCVMYKRKDGDYGLLEPEYI >NZ_CP018624.1|WP_079481629.1|200361_201378_+|hypothetical-protein MGYEKIINHKEFTNCLTKINKWYLRKSKILNIITSPYNSTLIYSSIINEIARKGGNILYIWGNNSPNDELIKEIKLKDKGITYSYIEKGESEKTITFTSFKNMINVRGEYDLCIIDDISKFSLMNKDELIELIEAMYIYSKRIIVYSIERIVSMGEKVEISSLISNKPYVEPRILNTRIKLDDDIPYSLYDYLLWFRDNKSKVIIYAPTEEKARRVYKQYSNTIKISGAKFLLLLRDGPLKELESSLKIKDKGVFIITNYFGDYLKAITELNIVALFSDNRFYSYKKIIYLCAEAGKNPEKHGEILLVSRDISNDMEEAKKFSRNLNKKIWEKGLLRY >NZ_CP018624.1|WP_021876584.1|198118_200350_+|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MEILNGVIETIVFKSEDTGYVVSKVRVDKELINAVGVVPLLKEGQQVKIKGDWVLHKQFGRQFNINEYEEVLPSSVEGIEKYLSTGIIRGIGPVTAKKIVGKFGEKTLDILDNHIEMLQDIEGIGEKKYKIIYESYLEQKDLKDIIIYFQNNGMTTNQCIKIYKKYSNAAIDVVKENPYVLSDEISGIGFITADRIAKSLGIENTSPFRIQSGIRYVLNQFSAAGNTYMPKEMLIDETSKVLVVDKELVEENIYNASLDGKIKIEKIGEIEGVFLIPYYYCELGVTNKIITLGIENFRTINTDVEFEIKSFEKKNNIEFAQSQREAIIGAFDNGIEIITGGPGTGKTTIIKAIIEIYENNGMKVLLAAPTGRAAKRMTESTGREAKTIHRLLEMGVSDEENSFFGKGETSPLEGDVIIIDEASMIDIMLMHSLLKAVKLGTRLIIVGDVDQLPSVGPGNVLKDLIESEFIKVVRLKDIFRQGKESMIVTNAHKINNGEMPETNKKEGDFFFENKQELDDILNTIIDLINRRLPNFNKSWDKLRDMQVLTPTRKGILGVQNLNNKLQEVLNPKSPNKKEKESKEMVFREGDKVMQTKNNYSLKWFRINGDGDNEGVGVFNGDMGFIEKINESEKTITIIFDDERRVIYDYIYLDELELAYAITIHKSQGSEFKVIITPAFMGSPFLMNKNLLYTGITRAKELVVVVGIPKALKYMVSNVRSMDRYSSLKERILDVKSEEVFSEE >NZ_CP018624.1|WP_021876585.1|196849_197986_-|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase MLIKNCNIIFLDRIENGSVLIEDGKIKEINPTNINCNDVINGEGLYLSPGFIDVHIHGAAGYDTMDGTVEAINEISKAIVKHGTTSFTPTTMTVSIDDIRKSMESIKKCKENGTDGAIVLGAHLEGPFISPSAIGAQNPKFLIPPTIENYNSMVGDAKDAVISITIAPEVPGATDLIKHLSVEGIVCSMGHTKTTYAEAMEGIKCGCCHSTHLFNAMTPFSHREPGVVGAIFDSNITTETISDGIHISYPSLRVAYNQKTTDKVLLVTDAMMACGMPDGMYSLGGQDVVVSDGAARLTTGSLAGSVLTLDKAIRNVYNNTNYSLNEVVKMATFNGARHCKVEDRKGLIKEGYDADLVLFDENINVKKVIVNGKVVHTA >NZ_CP018624.1|WP_079481630.1|195605_196781_+|methionine-adenosyltransferase MRRLFTSESVTEGHPDKICDQISDAVLDSILEKDPNARVACETAVTTGMVLVMGEISTNCYVDIPKVVRETIKEIGYDRAKYGFDCATCSVLTSIDEQSTDIAMGVDEALESRQGEKDAVEAVGAGDQGMMFGFATNETEEYMPLPIAMAHRLSRRLSEVRKNGQLSYLRPDGKTQVTVEYDDNKVIRIDAIVISTQHGEDVTQEQIRQDLMEHVIRAVVPAELLDENTKYFINPTGRFVVGGPQGDSGLTGRKIIVDTYGGAGRHGGGAFSGKDPTKVDRSAAYAARWVAKNLVAAGIADKLEVQLAYAIGVAKPVSISIETFGTGKKSEEEIASIVEKVFDLRPGAIIRDLGLRRPLYKQTAAYGHFGRNDLNLPWEQLNKVEEIKKYI >NZ_CP018624.1|WP_079481631.1|193842_194373_-|spore-protease-YyaC MIKHKVFYESDLAYYEIANVLKNYISKNTVIVCIGTDKCIGDCLGPLVGTYLIDNQFKLPVYGTIEAPIHALNIEHRLSQIKKLHPNANIIGIDACLGDAKSIGEIHVRNYPIHPGKGVGKRLPDVGSTSIIGIVDSSDNAEFFTSRSIRLHLIMSMAKVIARGICKGYYLSNIDN >NZ_CP018624.1|WP_021876588.1|192750_193785_+|rod-shape-determining-protein-MreB MWFWRNGTNLGIDLGTATVLVYAKGKGIILKEPSVVAINKSNNKVLAVGEEARKMIGRTPGNIVAVRPLRDGVISDYDITEKMLKEFIKKAYGKSKITAPKVMVCVPSQATEVEKRAVMDATRNSGAKRVHIIEEPLAAAIGAGLDITKPNGSMVVDIGGGTTDIAVISLGGVVVRASIKVAGDTFDDAIIKYVRNKYKIMIGEKTAEDLKITVGAAFVGSRDLTTTMKGRNLVTGLPDEVTVATSEIAEALKESVTLIVEQVKSVLEKTPPELAADIIEKGILMTGGGSLLDGLDKLIEKETGVGVSVANNPVEAVVEGTGKVLGYLDKLDSSLIGQEITLID >NZ_CP018624.1|WP_021876589.1|192371_192623_+|sporulation-transcriptional-regulator-SpoIIID MKDYIQERVLEVAQYIIDSKDTIRKTAKVFGVSKSTIHKDMTERLPKINPVIAEQTHTILELNKAERHIRGGKATKLKYKAVD >NZ_CP018624.1|WP_161493118.1|209812_210523_+|NEAT-domain-containing-protein MARDVQFTVAHDKDSAKLISGNNENKDNKPVIDNSNDIKPNTTKPIENKTSNNGLNIAKVDSKATEKLEDEVIKGKLYSVQNTVSHDRQIGREMARKYLEKTSKIEEIDGNMYATITFNNSQFMKEFKIGVNGQDVNYEIVGRNGDLLSLRFAIPNIDANVKVRMFVIPMNSNVEFGVNFLKDTLNLEKEYEVKKSELKQGGKLPYTGGMASGGLVTALGSMLLAAGSFMSRRKRK >NZ_CP018624.1|WP_021876577.1|210531_211161_+|NEAT-domain-containing-protein MRHFRIIFSIFLIGILVSVFSTTNTKAVENNAIESGIYELENDVYHSSEIGRSMARTYLNNIMTLEARGGELFCTIGFSSSDYMENYKMIVDEQEVANEIVDKNEENKTVKIKFKINSLDSKINANMYVIPMGRDVSFDIIPKKDTLKLIEKIEEPKVESSDSKEKDVEEKDKEESMGKTSTITVGAIIIGLAAMVIIGSKVKNKYKQV >NZ_CP018624.1|WP_021876576.1|211274_212150_+|heme-ABC-transporter-substrate-binding-protein-IsdE MKRLLSAIIVGLVMTSFTGCYGPKEGNEESKSKQEGDVVVATSVAVTEILDKLGVSLAGVPTTAYTLPESTKDAVKVGNPMNPDLEKIKSLNPTVVVSVDTLGDDFKNTFIENNIPSEFVTLTSLKGLKEAIKTLGDKFNKETEADNLLNDISAKEGEIVKKNDGKEKENILIIFGAPGSIMIGTSKCYVGNLVDVVGGKNIVENNSTSFVQLNIEEVLKSNPDKVLVMTHGNPEESKAMVAKELKNNPMWQKLSAVKEDKVYYLDSKKFGMSANLKVTEALDELASILNN >NZ_CP018624.1|WP_021876575.1|212248_213157_+|iron-ABC-transporter-permease MKIGSIDITLRELLIGIFTNNGSETWEIIRDLRMPRVISAILVGASLAVSGVLLQAVIRNPLAEPSITGISSGASLFSILIMVFLPSLNPYRYLFGFLGGILACIIVYSLAFKNTLSPIRIVLSGIAVNAMLGGFISIMTIFNGNNASSVQMWLTGSLVAVTWKDVIPLLIYTTIGLVCALILCKTCNVIVLGDKTSKGLGFNADKTRIIISLVAVFLAGISTSIAGIISFVGLVVPHICRIIIGSDHKYLIPFSCTLGAILLLIADTLGRIVAKPYEIPVGIVMAILGAPFFLYLLRKSNV >NZ_CP018624.1|WP_021876574.1|213190_213967_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLAGEKLSFSYDDKEFINNLDIKVEKGKITTIIGPNGSGKSTLLSMLCSVNKIKKGSIYIDGKNIVNYKSKSLARIIATVYQQNNVPEDIIVEDLVGYGRIPHKGYFEKNNEDDNKIIEWAIKSTNVEHLKNKPISHLSGGERQRVFIALALAQKPKILFLDEPNTYLDIFNQIELLELVKKLNEENNITVVMVLHDINQAVKYSDNLVIMKNGKIIKVGKSDDVINAEIIESVYNVKGIVAEVESKEKYFIPLSVVH >NZ_CP018624.1|WP_021876573.1|214070_215414_-|Zn-dependent-exopeptidase-M28 MKKKVSYYLLLFIITIAFGFSIFFNITYSSFNSDNVKKNIASFSSQTYSGRLPGSDENNLVAEIIRKDFQDNKLVPLNDDYKESFNTICPVKTNTMPYMQISANGITLEELKYGVDFKDDMLNFKNNTISFSKADNVNIYKKSIDVITPNGKCLFYVNTKDGFSFRSSFCSEFPYDMVICITTDTYNKILDSVRKGLEVSVHVPFKNEEKTISNIVGVIEGSSGKLPPLVLTAHYDHLGKDGLENIYSGALDNASGTSFLLELQRSLSTYGKPKRDIIFVALNAEEFGLLGSKEFAEKNLDKLNGAEVINFDMIGSEGYPITLMQGLSFKDKDSKLLKSIEKIAKKKGVQTEVAYEDASDHASFNNAGIDSVSLCHSDTSKIHTPKDTVEFISTDAIDTAYQVVETKILDSSYGFLTKFFYDKVSIIFSSVLLILLIAYGIRKKKTA >NZ_CP018624.1|WP_021876572.1|215499_215841_-|hypothetical-protein MNKLASILNKTINILLIFFVVFLVLNEYYVVEFSATLRNVIAFLTMILILISAMKELLTNKSGLSRFINGVILFTSIVGGVFAIISKQLNLFLYTCILFSVVYGFVDLVYKKA >NZ_CP018624.1|WP_021876571.1|216035_218207_+|RNA-binding-transcriptional-accessory-protein MVKIEDRLAEELGIKLSQVNNVIGLLDEGNTVPFISRYRKEQTGGLTDELLRKFQERLTYLRNLEERKSDVSRLIEEQGKLTEEITNSLKKAMTLTEVEDIYRPYKQKKRTRATIALEKGLKPLSELIINGEFKGNLLEEASKFVNEEKGVKTNEEALSGALDIVAEMISDEAKYRKWIRELVLREGKIESKGGSDDTTQYEMYYEYSEDVNKIPPHRILAINRGEKEKILSVKIIVNEEKILNYLEREVLKGNKVTDDYLKLAVKDSLKRLIYPSIEREVRAELTNIGEEGAIKIFKENLKALLMQPPIKGKVVMGYDPGFRTGCKVAVLDSTGKFLEKATVFPTVPKRDIEGTKRILKDLVKKYNVDVISLGNGTASRESEEVISEMLSEIKNEMGKELAYVIVSEAGASVYSASELATKEYPDLDVTIRGAISIGRRLQDPMAELVKIDPKAIGVGQYQHDVTQKRLEESLAGVVEDSVNKVGVDLNTATPSLLNHIAGINTTIANNIVLYRDEVGGFKTRKELLKVKRLGQKAYEQCAGFLRVMESKEALDNTSVHPESYDIAKKLIGLLGYTKDDLQNKNLNDIEKRVNEKGLSNLVKELEVGEPTLRDIIKELQKPGRDPREEMPKPILKTGVIELKDLTPGMVLMGTVRNVSDFGAFVDIGVHQDGLVHKSQMANRFVKHPLDIVKVGDVIKVRIMEVDEKRNRISLSMKDIKEEE >NZ_CP018624.1|WP_079481626.1|218547_219144_+|ECF-transporter-S-component MNNQNKNLNKFVKISLLGAIAVVLMYLDFPVIPLFPWLKIDLSDVPALMGAFAFGPVAGIVIELIKNLLILIVKGTGTVFVGEIANFIVGISLVVPASWFYHRNKSKKTALIGMALGFIGIEIMGIIANVYFLLPAYGMHMESAQLLEYVTVGLLPFNGIKAVLVCGITYMLYKKVSMAIFKVDSHFEPNKDKNLTTV >NZ_CP018624.1|WP_079481625.1|219203_219653_-|ribosomal-protein-S18-alanine-N-acetyltransferase MKIAYNLMTSNDIDGVYEISNLCFSVPWSIESIKSELNNPLAKYIVAKEIASNRIIGFVGVWIIAGEGDITNIGVHPNYRKNHIATNLLQCLFKLCEDLNCNTINLEVRESNIPAQNLYTNFEFKNIGLRKGYYEDNKENAVLMQYNKF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018624_2 | 1506834-1507523 | TypeI-B |
II-B
Consensus repeat of NZ_CP018624_2
|
10 spacers
spacers of NZ_CP018624_2
>2.1|1506864|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATATACTCATCATCATAGTCAAAACTATAAATC >2.2|1506930|37|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTAGTATAAGTTCCAACAAATATATTGCCTACCAT >2.3|1506997|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATTGCAATCAGTTGCTTTTGAAAGTTAAATATGT >2.4|1507063|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGAATGGTATAACTGGTATGGGCAGATGGATAAG >2.5|1507128|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCAATCTCTTATAATCAATTAACCATTCCATCAAT >2.6|1507194|37|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAGCTTTGAAGAAACACAAGACTATCCTAAGCAGAT >2.7|1507261|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACAAGCCAAAGATTAATAGAAGAGTGGTATTTTA >2.8|1507326|37|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAGAGTTTAAGCAAAAGGTATATTTTACCAAGTGCC >2.9|1507393|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTTATCTAAAAAATACGGAACAAGAAATCCTTT >2.10|1507459|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAAAAAAAGAATCAGTGATACTAGTTTCAATTA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas3HD,cas5,cas7b,cas8b1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018624_2
The CRISPR arrays of NZ_CP018624_2 >merge|NZ_CP018624|2|1506834-1507523|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATATATACTCATCATCATAGTCAAAACTATAAATCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCTTTAGTATAAGTTCCAACAAATATATTGCCTACCATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGAATTGCAATCAGTTGCTTTTGAAAGTTAAATATGTATTTAACTACATCTCATGTTAATGTTAATCTGGAATGGTATAACTGGTATGGGCAGATGGATAAGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTCAATCTCTTATAATCAATTAACCATTCCATCAATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCTAGCTTTGAAGAAACACAAGACTATCCTAAGCAGATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTACAAGCCAAAGATTAATAGAAGAGTGGTATTTTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGCAGAGTTTAAGCAAAAGGTATATTTTACCAAGTGCCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTAATTTATCTAAAAAATACGGAACAAGAAATCCTTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGAAAAAAAGAATCAGTGATACTAGTTTCAATTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC >NZ_CP018624|2|1|1506834-1507523|PILER-CR ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TATATATACTCATCATCATAGTCAAAACTATAAATC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC CTTTAGTATAAGTTCCAACAAATATATTGCCTACCAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC GAATTGCAATCAGTTGCTTTTGAAAGTTAAATATGT ATTTAACTACATCTCATGTTAATGTTAATC TGGAATGGTATAACTGGTATGGGCAGATGGATAAG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTCAATCTCTTATAATCAATTAACCATTCCATCAAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC CTAGCTTTGAAGAAACACAAGACTATCCTAAGCAGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TACAAGCCAAAGATTAATAGAAGAGTGGTATTTTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC GCAGAGTTTAAGCAAAAGGTATATTTTACCAAGTGCC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TAATTTATCTAAAAAATACGGAACAAGAAATCCTTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC AAGAAAAAAAGAATCAGTGATACTAGTTTCAATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC >NZ_CP018624|2|2|1506834-1507523|CRISPRCasFinder ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TATATATACTCATCATCATAGTCAAAACTATAAATC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC CTTTAGTATAAGTTCCAACAAATATATTGCCTACCAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC GAATTGCAATCAGTTGCTTTTGAAAGTTAAATATGT ATTTAACTACATCTCATGTTAATGTTAATC TGGAATGGTATAACTGGTATGGGCAGATGGATAAG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTCAATCTCTTATAATCAATTAACCATTCCATCAAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC CTAGCTTTGAAGAAACACAAGACTATCCTAAGCAGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TACAAGCCAAAGATTAATAGAAGAGTGGTATTTTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC GCAGAGTTTAAGCAAAAGGTATATTTTACCAAGTGCC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TAATTTATCTAAAAAATACGGAACAAGAAATCCTTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC AAGAAAAAAAGAATCAGTGATACTAGTTTCAATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC >NZ_CP018624|2|1|1506834-1507523|CRT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TATATATACTCATCATCATAGTCAAAACTATAAATC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC CTTTAGTATAAGTTCCAACAAATATATTGCCTACCAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC GAATTGCAATCAGTTGCTTTTGAAAGTTAAATATGT ATTTAACTACATCTCATGTTAATGTTAATC TGGAATGGTATAACTGGTATGGGCAGATGGATAAG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTCAATCTCTTATAATCAATTAACCATTCCATCAAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC CTAGCTTTGAAGAAACACAAGACTATCCTAAGCAGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TACAAGCCAAAGATTAATAGAAGAGTGGTATTTTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC GCAGAGTTTAAGCAAAAGGTATATTTTACCAAGTGCC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TAATTTATCTAAAAAATACGGAACAAGAAATCCTTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC AAGAAAAAAAGAATCAGTGATACTAGTTTCAATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC
>NZ_CP018624.1|WP_161493089.1|1506462_1506624_-|hypothetical-protein MYLATVIDLFDRRITGWAMDSTMTRRLVIDAFNTAVLKDVVMIMLVQNYSSYL >NZ_CP018624.1|WP_079481817.1|1506289_1506517_-|IS3-family-transposase MKGCCYDNACAELFFLSLKKHFLYGRKFKTRAESKQAIVEYIELFYNAKRLHSTLGYKSPREYRKNYYNNLNKAA >NZ_CP018624.1|WP_079481277.1|1505848_1506088_-|hypothetical-protein MTGDLITANIKIKSTEYPCFSVSENSDNTDLEGNALINPSETREIHYVAEVPKTDATGQIEVTLTINGKNYSNKFLLDC >NZ_CP018624.1|WP_096145388.1|1505009_1505546_-|DUF4825-domain-containing-protein MRISNFKRLVILAVFMVLLGMVGCGKYIEQKEAINESKVNLTKVLKYKGSYVGDNSAIVNIINNLPANIYKEGVELQTTSKSYEITIQYKYFEDLDIRFEDGSFISSSLSQIMKNNALILLSLVKNVDIVNFNIDDGTIITYEGTDLINDNKDAFGNDLKEITKDKSSLENFIKTNKN >NZ_CP018624.1|WP_021875397.1|1504189_1504837_-|hypothetical-protein MYLIKNIKQIFDYKIKEFLALSGGLTLIFLLTRLDNPEFIDGYMIAILITISMIGRYNFVSEHIVKEDYIYLKKYKATLKYIISKNIVTLLLVISLVFIVFLLEFIITRATLSYEFYFESLILSILTIAFNNISFMFNNKTEKSTSDKFDEWTSIVLGFKSLINSLPSILIVFIILYFNKYLYNINLYDALIVEIMSIILLNFKLKNQFKVNLKN >NZ_CP018624.1|WP_079481819.1|1502373_1504125_-|DUF4091-domain-containing-protein MVKDVYLGASIGSTDFHYLQKNYNEIKLLNKTTWHDTAWIGDELNSKIVTWTKNSPVSNVTIASSDFVNKNGDIINSNNVEISWLKETLANIGRGNSSAPVELFPDIIHKSGSLNIEANKVSSAWVNISIPRDINTGIYNGTITVNAEGLEAPYVFDYSFEVLNLIQPLPKETNTQIEIWQHPYAVARYYDIPKEELFTERHFNYLRESLEEYRDMGGKGVIAHIVEEAWNHQSYDSDPSMVKWTKKSNGNFKFDYTDFDRWIQFNIDLGVINPKDGVGQIKCYSIVPWNNRIEYYNEVTGSKESISPTPGTSEWRIPWTEFLRDFMKHLEEKGWFKITYISMDERNMNDLRASVELIESIKNTNGESFKISSAMNYQSGSDYSFLDRIDDISIGLSHINHDLEDMRNMAKHRQERGLLTTIYTCTGDYPSSFTISDSSESAWTMWYSLSQNTDGFMRWSWDGWVENPLENVSYKYWEPGDPWFIYPAEKNSDSKTFYSTPRYERLKEGIRDINKAKYLMENSLELKRQVETLVQSLRRPNKGNNSYGSAVAATEMDRELTNNEVKRIRDGVNKLAKQYIKSK >NZ_CP018624.1|WP_079481279.1|1501284_1502160_-|hypothetical-protein MNNNLSRVRELKEIKKEPKTNLQILLAIILGVIVVFTTLKVIQKVVYPPEKIVEDFRAAMVNEDVEGVKNVIKVYDKRVEVNDENVKVLINYFKENKDELTSICNSLNNKNLRNKRENPIYLDKETGFSRLLGKHKVIINPIFIKVSSKINNTEIFINDKKQCTINKDETQEFGPLMPGKYDISAKYSTDYIETQDKVTIDRIKKFNDRSNYTMFKDIKKVILYTHLETAEIIVNGKDTGKTVKEINKILSPVNKDTKVQLKMMVDGKEVITDEEVVGDNDYIYFGELKNS >NZ_CP018624.1|WP_021875400.1|1500096_1501227_+|hypothetical-protein MFIKSYNSQTKELTLSIYNNDVALINEVRDISKAKLNSTIEYSDISKLIYENSVIIQGAEVSQINFNYKCYNDNNSKNKETICSKCLNTFIDAITIEAKSINSTDIRLYYLSGGIKWTSSYTLILKSQKLDLEAWINISNKSGISYNHANLKCIAGDVNISSSTSTPYSKTSYVASSSSENTSLENLEDYYIYNLKGLYNLENNSTKRIKSFLAEDISYSTLYDFGYYNNSADILIEFENTQSNNLGTPMPSGVINVYTTSGKTLAFLGSDSIKNTSIDENLSLNIGKAFDITCERKIIDYQKYDTYEFKEIELIISNAKNEEVPIKICYPIFAPWESTSSTENYSKDNNGNPCFMVNVSANDKKSIFFTYKVKIS >NZ_CP018624.1|WP_079481280.1|1499152_1499941_-|endonuclease/exonuclease/phosphatase-family-protein MKNNFMTFNLKYDFTDDKENRWEDRAKRIVTVIKENNPICFGTQEGLIHMLKDINELLEEYSWFGEGREGNEEGEFNAIFYKREALELIENGQFWLSETPNIKGSISWKSGCKRICTWGVFKEKQYGNIFRIYNTHLDNASDLAREEGIKVILDFAKEKYDKDKLPFIITGDFNSYMEENLFKIIRSYNNENFNIKNSYNEVSHNIKGTFHDFKGGYSGGIIDYILFSKEISCNKINIDDRLINGGYPSDHYAVTANLNIEN >NZ_CP018624.1|WP_021875402.1|1498759_1499098_-|hypothetical-protein MGSDKKNLEGIIFIGISTIAWCIAGNISYFFIRNGIYNSLVHLVDIESSIIMVSLPLIAMAIGTFANYKIEVTEEKLYEINKKMLSFKLLNIIFIGYIAFTLFAVRNGKIIL >NZ_CP018624.1|WP_079481276.1|1507739_1508978_-|IS256-family-transposase MTRKIDTNFDYNEEIKRCKTIDDVMGKNGLIQRLVKDVLENILEGEMEEHLGRNKYERVEAVDQTKKNYRNGYSRKNLRSSFGDVDLDVPRDRNAEFEPQIIKKYETVCTELDKKIISLYAKGMSTSDIQAEIEDLYGITISPSMVSKITDKVLASAAEWQNRVLDKIYPIVYLDAMYFKVRSNGKIVNKAVYICLGYTMEGYKDILGIWVDEAEGAKFWLGICNDLKNRGVKEILIACMDGLKGIPQAIKTVFPSVNIQTCIVHQIRNSIKYIASKDKKAFMKDLKEVYKATTEELALAQLDNLKEIWGDKYGIVIDSWYNNWSNLSTFFDFSPTIRKMIYTTNILEGFNRQIRKFTKVRVIFPTDESLNKCVYLATMEILEKWTQPIHNWGATLAELSIIFEDQLKDELA >NZ_CP018624.1|WP_079481275.1|1511451_1511742_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKKQINYNYVFIFYDIKEERVNKVFKVCKKYLSHFQKSVFRGGITPSKLILLKKDLNKVIEKEEDFICIIKLLNGDVFGEEIIGVQGQTTGESLII >NZ_CP018624.1|WP_021875392.1|1511743_1512742_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTKYITSMGELTRKDNSLCFRKDGKNVYIPVEGTSEIYCLNEISINTKLLDFISRNNITVHFFNYYEGYSGTFYPKNKYNSGKLLINQVKTFERNRIIIARSIVRGIGINIMEVLYHYYKHNKKEVKETIDWIKKDFLKKVDYIENINSLMALEGEVWQRFYSEFKNILPEDFIMNKRVKRPPDNPINAMISFGNSLLYTKTISAIYKTHLDQRISYLHEPSEGRFSLSLDISEVFKPIIVFKTIFELVNNRRIQVSKHFDKSVNYCLLNEDGRNIFIKAFEDRLESVFLHPKLKRKVTYRTAIKLDCYKLIKFIMEDKTFLPFNLKDGM >NZ_CP018624.1|WP_079481815.1|1512751_1513240_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKINGTLINYYFHCKRQCYLHGNRLNFEDNSENVKIGKALHEIKENKNTEIEIDNIKIDKLTKDYLTEIKKSDADPEAAKWQLIFYLNALNDKGIRRKGKLEFIEKNKTKNKIIYVELNSELIKELEKHIRDIKILINSNNVPDILNKSKCKRCAYYEYCYI >NZ_CP018624.1|WP_096145389.1|1513242_1513575_-|hypothetical-protein MKLINDDKNDISIFINYKVNKNGKEILGEEVWNNYKTLLKDNKLSFAEQAVKLSEVRANMNYFIYRIKTKENFSYNDRVGDIIYIDNGEDYFIDGKLDKKRFESTVGEFI >NZ_CP018624.1|WP_096145390.1|1513637_1514513_-|hypothetical-protein MILTTHVSIFRYLFGVNKEDVFPVFQLANSIIVLDEIQSYKNKIWGEIIEFLHDYAEILNIKIIIMSATLPDLDLLLESDTRSVNLIEDRKKYFENRIFKERVKIDFRLLDSKNIIEDLYEMINKHKNKKILVEFISKKSAYDFYSYLIERKELGELEFDIRLLTGDDNTIERENILNEIRTLNNILLISTQVIEAGVDIDMDIGFKSISIFHSEEQFLGRINRSCLKENSLVYFFKLDDIKGIYKEDVRSHEDLTIENKNIRQCLIDKSFTSYYEEVLKRLKKTQKSLVN >NZ_CP018624.1|WP_096145391.1|1514536_1515805_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas3'' MYIEYLEEINIDELINKDYKIYAHINENKKETLKEHIDLCKKYLKRIVKDKNLEDIFLKVENIMLEDYSEEARKIYREMLVSTITLHDMGKLNGVFQKKKMNNNLNIEHLKTRNDSNHSIISSIIYLDIYFQKVCKNIKSKKERTGILTFMILNSYIISRHHGGFITDLEEYQMKICKDLRSVLPLLDKYIELYKYAYSREIKLTDKKINSIYDYFKLYMTKLKESEDCIRKINTIYIYERLLLSILIACDYYSTSEFMNNIEIIDLGSIEDCNIFRKAYEGGVIYNSIRNYEKNNYGKINDFTNIDDINILRNEMFLDAEKSLMKSRNSNIFYLEAPTGSGKSNVANNLAFKLLEENKRKIFYVYPFNSLVEQNIKNFKNIYEKTPNVLDKIAIINSLYPIKRVLVKMKKKLNLKNMKNHY >NZ_CP018624.1|WP_021875388.1|1515851_1516631_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MEAIKFTLRGRTAFFKKPEVNSYLYFTYGHIHKVALVGIFGAILGYKGYNQMKKDDQYPEFYQKLKDIKISIVPNNKNGIIDKKINIFNNSVGYASQEKGGNLIIKEQWLENPSWEIYLLLNDDESQKIANALMDRTYIYLPYLGKNDHLAEITNIKRINNIKTIDRFIKIDSFFKKNEFKYKELDLDDLDDLDDLDDLDDDNVTDEELIFKYEEMLPVGLDLQTNRYKLEGLVYTNKPIEKRLNCEVYEIEGKILTFI >NZ_CP018624.1|WP_021875387.1|1516633_1517581_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MNKRVYGLIGISSKMANWNADFSGYPKTTSKGEIFGSDKALKYPMKKLWDNSGEKVLYIKSMKLSKTKDSVVLVPRSLKERYEYIFGIEDLKKEKNTETVLKNLFDAVDVKNFGATFAEEGNNISITGAVQIGQGFNLYDETVADEQQILSPFRDASIKPGKEDKEEAKNSTLGTKIVTDEAHYCYPFTINPLSYKDYIDLGVTEGYTEKDYIKFKEVALNSATAFATNSKVGCENEFCIFIETEQTLYLPNLDNYISFEKSEDQNIIRFKATNILNEVKEKISNIEIYYNPYTTIVEADIEGAKYYNIITKKEV >NZ_CP018624.1|WP_021875386.1|1517583_1519317_-|hypothetical-protein MLSEIIDSFKRVFKDNLDEAILGSYVPTDGTYIFLKEDEHNNLKVIQKEEIKLNKKTKDVDRTINNFSLLAKADYYSKLTDMNKPIDSKKIIHSNNYLSFFVKKESLKNGKLTNEIIENYYNVLLNPISKYEKKSKAKELYIEIERELGEVNKDRIFKIKEWIKENIYKVEEDIEKKDYLKIFFIYDEDDFIKESKRYLIPNIYNNNDFNIKVDNEILGLPNDNMGLNSKKPYLENKTRKVKIPHLITQEEALFQKKVFDYLLNQSAQGFYNIYIGDEVIPLKDNETLNRDFNGYYIRLKKGKEAEIHNFDVISKYNPMLINPFEFINVLGINYETLYLNKKINWEYGFIDTRKEMQELINSIIFNNYLKTNYFSEDISIKENVLKRSILLSRAKLFDWFYKGNDYNIWPLLNKVSRDLMKSSIESGYSIKAMNQFNLRYSLKLYFEGGEEKMADILSKVKNDLREKIEVRDSSISNDNEYFFAIGQLANFFITRSKGKNKPLSLANPIINAKKDNIIKEKLKSLYKKYNYDINSSFIKFKNMYYMVLAYQVEGKINEDLIIAGYLSSSLLFEKKED |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018624_3 | 1509087-1511284 | TypeI-B |
II-B
Consensus repeat of NZ_CP018624_3
|
33 spacers
spacers of NZ_CP018624_3
>3.1|1509117|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAAACAATATTTTATTTCATCATTATTTTCTACC >3.2|1509183|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCATTTTACCAATTATACTGTTGTACATTTCCTTA >3.3|1509249|34|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCAATTGGTCCTTGATTCCCATCAGCTCCTTTT >3.4|1509313|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCCGGTGTTGGGAAAGGTCTCACTTGATTTACAAT >3.5|1509379|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATCGTACTCTTTATTAGAATTCCTAGCCTTTCTG >3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAGATAGTTAAATATAGAGATAAAAGCAAAGAAT >3.7|1509510|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACCATATCGGGTGTTATGAGGAAAACCCTAAGTA >3.8|1509576|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATTATTTTTTGATGTACTATATTCTTCTTGCTC >3.9|1509641|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAAAAAATAGGCATATTAATACACCTCTTTCAAA >3.10|1509707|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGGGAAAATATGGACGTAGCTAACCGAAACTTTAA >3.11|1509773|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCCCGCTTATTTTGTTAGCTAGTTCGTAAGTTGT >3.12|1509838|37|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATGTTTTATAGCTCTCTTTATCCTCCTACTTAC >3.13|1509905|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATACGGGAATGTTAGATTTAGCTGAAATAATATA >3.14|1509971|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCTTTCCACTATTCTTTATTCTTGCACTTGTAC >3.15|1510036|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTAAACAGTAAAAGCTTTTATGCTCATTCAATCTA >3.16|1510102|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTTCTCTTCATCATTTAACTTCTTCAAAGCATC >3.17|1510167|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATTCTCGTTATCAAGGATTGGGATATGTTAAAAG >3.18|1510233|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAATATACCCATTTAAATTATCCCTCCAAATTT >3.19|1510298|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTATATGCGATTTGCAAATACAGAAAGCTAACAA >3.20|1510364|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTTAAAAAATAATAAGCTTGGGAGGAAAGTCCA >3.21|1510430|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGCTTTTGGATTAATCCACACATAAACTGACTT >3.22|1510495|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTATTTTCTTTCTAATTTCCTTTTCTTTTTCACT >3.23|1510560|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTATAAAAGTTCCTTGTGGGTGAAAATTTTTAAC >3.24|1510626|34|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACAACTTATAGCAAATGTTATATCATCAGAAGG >3.25|1510690|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAAATCTCTAGTTCTATTTTATTAGTGTCAGATG >3.26|1510756|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAACTTGCACTTGCTATATCTATAGTATTGCACAAA >3.27|1510822|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTGTTATATCAACATTGTCCTCACCAGATTCAGC >3.28|1510888|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAATTTTCCAGCAGGGTCACTACCTAGCTTATCT >3.29|1510954|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTAAAAGATTCATTCTTATCATCTTTAGGAGAAT >3.30|1511020|36|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATATTTTTTTATCAACTCTATATATTTCTCCTTT >3.31|1511086|37|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATATTCATGTATTTCATCAAATACAACGACTCCTG >3.32|1511153|37|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATATAAGGGAATTTTGCACCCGGCGGAACACAATTT >3.33|1511220|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTCTTCTATAGGTTTTATTCTCCAGTTGTTATCT |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas3HD,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018624_3
The CRISPR arrays of NZ_CP018624_3 >merge|NZ_CP018624|3|1509087-1511284|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTAAAAACAATATTTTATTTCATCATTATTTTCTACCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTCATTTTACCAATTATACTGTTGTACATTTCCTTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCCAATTGGTCCTTGATTCCCATCAGCTCCTTTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAGCCGGTGTTGGGAAAGGTCTCACTTGATTTACAATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCATCGTACTCTTTATTAGAATTCCTAGCCTTTCTGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAGAGATAGTTAAATATAGAGATAAAAGCAAAGAATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATACCATATCGGGTGTTATGAGGAAAACCCTAAGTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCATTATTTTTTGATGTACTATATTCTTCTTGCTCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAAAAAAATAGGCATATTAATACACCTCTTTCAAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCAGGGAAAATATGGACGTAGCTAACCGAAACTTTAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACCCCGCTTATTTTGTTAGCTAGTTCGTAAGTTGTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTAAATGTTTTATAGCTCTCTTTATCCTCCTACTTACATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTGATACGGGAATGTTAGATTTAGCTGAAATAATATAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTCCTTTCCACTATTCTTTATTCTTGCACTTGTACATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGTTAAACAGTAAAAGCTTTTATGCTCATTCAATCTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAACTTCTCTTCATCATTTAACTTCTTCAAAGCATCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGTATTCTCGTTATCAAGGATTGGGATATGTTAAAAGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTAATATACCCATTTAAATTATCCCTCCAAATTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAATTATATGCGATTTGCAAATACAGAAAGCTAACAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTGTTTTAAAAAATAATAAGCTTGGGAGGAAAGTCCAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAATGCTTTTGGATTAATCCACACATAAACTGACTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCTTATTTTCTTTCTAATTTCCTTTTCTTTTTCACTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTGTATAAAAGTTCCTTGTGGGTGAAAATTTTTAACATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCACAACTTATAGCAAATGTTATATCATCAGAAGGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTGTAAATCTCTAGTTCTATTTTATTAGTGTCAGATGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGAACTTGCACTTGCTATATCTATAGTATTGCACAAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAATTGTTATATCAACATTGTCCTCACCAGATTCAGCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTGTAATTTTCCAGCAGGGTCACTACCTAGCTTATCTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCATTAAAAGATTCATTCTTATCATCTTTAGGAGAATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAATATTTTTTTATCAACTCTATATATTTCTCCTTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCATATTCATGTATTTCATCAAATACAACGACTCCTGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATATAAGGGAATTTTGCACCCGGCGGAACACAATTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCTTCTTCTATAGGTTTTATTCTCCAGTTGTTATCTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC >NZ_CP018624|3|2|1509087-1511284|PILER-CR ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TAAAAACAATATTTTATTTCATCATTATTTTCTACC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTCATTTTACCAATTATACTGTTGTACATTTCCTTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TCCAATTGGTCCTTGATTCCCATCAGCTCCTTTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC AGCCGGTGTTGGGAAAGGTCTCACTTGATTTACAAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TCATCGTACTCTTTATTAGAATTCCTAGCCTTTCTG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC AGAGATAGTTAAATATAGAGATAAAAGCAAAGAAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC ATACCATATCGGGTGTTATGAGGAAAACCCTAAGTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TCATTATTTTTTGATGTACTATATTCTTCTTGCTC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC ATAAAAAAATAGGCATATTAATACACCTCTTTCAAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC CAGGGAAAATATGGACGTAGCTAACCGAAACTTTAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC ACCCCGCTTATTTTGTTAGCTAGTTCGTAAGTTGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTAAATGTTTTATAGCTCTCTTTATCCTCCTACTTAC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TGATACGGGAATGTTAGATTTAGCTGAAATAATATA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTCCTTTCCACTATTCTTTATTCTTGCACTTGTAC 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>NZ_CP018624.1|WP_079481276.1|1507739_1508978_-|IS256-family-transposase MTRKIDTNFDYNEEIKRCKTIDDVMGKNGLIQRLVKDVLENILEGEMEEHLGRNKYERVEAVDQTKKNYRNGYSRKNLRSSFGDVDLDVPRDRNAEFEPQIIKKYETVCTELDKKIISLYAKGMSTSDIQAEIEDLYGITISPSMVSKITDKVLASAAEWQNRVLDKIYPIVYLDAMYFKVRSNGKIVNKAVYICLGYTMEGYKDILGIWVDEAEGAKFWLGICNDLKNRGVKEILIACMDGLKGIPQAIKTVFPSVNIQTCIVHQIRNSIKYIASKDKKAFMKDLKEVYKATTEELALAQLDNLKEIWGDKYGIVIDSWYNNWSNLSTFFDFSPTIRKMIYTTNILEGFNRQIRKFTKVRVIFPTDESLNKCVYLATMEILEKWTQPIHNWGATLAELSIIFEDQLKDELA >NZ_CP018624.1|WP_161493089.1|1506462_1506624_-|hypothetical-protein MYLATVIDLFDRRITGWAMDSTMTRRLVIDAFNTAVLKDVVMIMLVQNYSSYL >NZ_CP018624.1|WP_079481817.1|1506289_1506517_-|IS3-family-transposase MKGCCYDNACAELFFLSLKKHFLYGRKFKTRAESKQAIVEYIELFYNAKRLHSTLGYKSPREYRKNYYNNLNKAA >NZ_CP018624.1|WP_079481277.1|1505848_1506088_-|hypothetical-protein MTGDLITANIKIKSTEYPCFSVSENSDNTDLEGNALINPSETREIHYVAEVPKTDATGQIEVTLTINGKNYSNKFLLDC >NZ_CP018624.1|WP_096145388.1|1505009_1505546_-|DUF4825-domain-containing-protein 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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018624_4 | 2231514-2231589 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018624_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018624_4
>4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder CAAATCTTTTAGGTTTTTCTGTTGCCTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018624_4
The CRISPR arrays of NZ_CP018624_4 >merge|NZ_CP018624|4|2231514-2231589|CRISPRCasFinder CCAACGGCGTGCAATTAAATCACGCAAATCTTTTAGGTTTTTCTGTTGCCTACCAACGACGTGCAATTAAATCACG >NZ_CP018624|4|4|2231514-2231589|CRISPRCasFinder CCAACGGCGTGCAATTAAATCACG CAAATCTTTTAGGTTTTTCTGTTGCCTA CCAACGACGTGCAATTAAATCACG
>NZ_CP018624.1|WP_021874741.1|2231158_2231440_-|hypothetical-protein MAKLNKKDVLKTIISSAKLYKKALSGKLSVNDFELRTDGTTELKLLVLPSLMDFKDHVRMIGEFEDCSPKLFTEVLAGNIQGALGFVHDNKGE >NZ_CP018624.1|WP_021874742.1|2229914_2230874_-|sugar-ABC-transporter-permease MLKKSKKEESTKKNRFKTFKSNKELLLLTIPGAIWFLIFAYLPMFGVVVAFKDWRIHGGFLESLVKSEWVGFDNFKFLFQSSDAWLITKNTIAYNVVFIVLGIVIPVTLAILLKELLNKRGSKFYQSSMFLPYFLSWVVVSYCLYAFLSPEKGYINGLLTSFGMDKISWYTEPKFWPFIIIFMSQWKGIGYGTVVYLAAICGIDKTYYEAAIIDGASKWQQIKHITIPLLKPVLIIMFITAVGGMFKSDFGLFYQLPKNSGALYPVTNVIDTYVYRGLMNLGNIGMSSAASLYQSIVGLVLILVTNGIVRKVDNENAFF >NZ_CP018624.1|WP_079481772.1|2228929_2229886_-|carbohydrate-ABC-transporter-permease MNRKTARFRGKKSKEPAEEISKFNSISKGTNVGFNILFMILAALCIIPFIFVVIISLTSEQALQANGYRFWPQEWSFAAYKYIFSSGSQIMRAYGVTIIVTVSGTLLGLAIMSMYGYALSRKSFAYRKFFTKLIFIPMLFSGGMVSSYLVVTKFLGLKNSILALILPMCVSSFNIIILRTFFKTTVPDAIVESAKIDGASEWKLFLKIVLPISLPGIATIALFLTLGYWNDWFNAMLYIDDNSLMPLQYLLIRIESSMEFLSNNAALMGANAIEASANMPKDTAKMAIVVITTLPIIFAYPFFQRYFVNGLTIGAVKE >NZ_CP018624.1|WP_021874744.1|2225671_2228803_-|alpha-mannosidase MHYLLERIEKTCGEIAKYVYRDQINLEDYKYIDGNYHNIDLIKEAPEEGWREFKTGDLWGGKDCHGWFKCSVEVPEHFKGQTIALNFHTFEEGWDATNPQFILYVNGEQIQGVDINHREIILTHDAVPGTRYDIDLHAYAGMLADKLATLHGKLVVIDMVARDLYFNLKVPVDVCKELDKEDKNRIDMITVLNDAINLIDLRRPKSKEYNESVIKANEFLNEKFYGELCGHEYVTATCVGHTHIDVAWLWTVAQTREKVARSFSTVLKLMEEYPEYIFMSSQPQLYKFLKEDHPKIYKKVKEKVKEGVWEAEGAMWLEADCNVTSGESLVRQILHGKRFFKEEFNVDNKVLWLPDVFGYSAALPQILKKSDVDYFMTTKIAWNQFNKIPNDTFMWRGIDGTEVLTHFITTTCPGQDRASHFTTYNGHIQPDAIMGAWRRYQNKNINDDVLISFGWGDGGGGATLEMLENGRRLAKGIPGAPRVKMGTALDYFKRLDEKTKNNSKLPKWVGELYLEYHRGTYTSMARNKRDNRACENLYTSAEKINSLSMLYGKNYPYRSITDSWETVLLNQFHDIIPGSSIKEVYDVTEVEYKELLENGSKLVNEGVDYIASKINLKDRSVVVSNTLGFERSDIATFEVPEDIKNPAVIDNNGEELVCQRIEENKAIFFAKNVPANGHKSFKIVESTKEVTLDTVLTDKEAENKFVKIKFDDKGQIVSFIDKASGREILKDGAIGNELQAFEDKPMCFDNWDIDIYYKEKMWKVDDVRSIEVVEKGPVRSTLRIERKFLESTIVQKIYIYNDLQRVDFDSYADWKEFDVLLKTAFPIEVNANEATYEIQYGNVTRSTHNNTSWDVAKFEVCGHKWADLSEGEFGVSMLNNSKYGHDIKDGNMRLTLIKSSTDPNPDADKEEHYFTYSIYPHLGTWKDAETTQKAYELNVPLYTKVEEAHEGELSDELSLVKVNKNNVMIEVIKKAEDTDHLVVRMYEFHNKRTTATLEFLSDIEEIFECNLMERNLEAIEAHGNKIEFTIKPYEIKTFKFKLK >NZ_CP018624.1|WP_079481079.1|2225257_2225641_+|hypothetical-protein MKISKGNKYLLTITILFCSFYTLMISPVKEDRLSMGFIVLFIPALTIFILLMENSKLKKVLLSILLVLTALFIIVVVYLIAISGNFYPINGDRFNFSMFLQVCLFTSPILICYILLLRSIFKEIVSI >NZ_CP018624.1|WP_021874746.1|2223545_2224991_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MRKVKKLLALATCAVLTTSLALTGCGNSSSSGSKGDETVNLTWYTIGQEPKDLQLVEDEINKYLKDKINATIDMKFADFGDYDQKLSVVINSGEAYDLAFTCSWAGNYVGNARKGAFLELDDYLETTGKDMKKEIDQRFWDGAKVEGKTYAVPNQKELGVQPMWVFTKELVDKYNIPYQDIHELEDLEPWLKVIKEKEPEVVPLYIDKNLSPPQYFDFFSEPFGVEYEDEGLTVKNIFDTDKFKSTLKTLRKYYEAGYINTDSSIAQYDKSIKRFVTKADGQPYAEGIWAKDVGYELVASPIMDTHITSASTTGSMIAVSKNSKNPEKAVEFLNLLNTDEHLRNLVNYGIEGTHYDKVADKQIKLLPRSVDYGVAYFSTGNLFKTYVLDTEPTTKWDEFEEFNKNSKVSPALGFKFNPEPVSTQIAGISNAYQEFRALIFSGSVDIDEYIEKLNTKLKEQGMDEVMKEMQKQLDEWKKENK >NZ_CP018624.1|WP_021874747.1|2221069_2223460_-|chitobiase/beta-hexosaminidase-C-terminal-domain-containing-protein MISIVNIYNFIRKTVYPSGEFVLDDYETVVRQIEILKQYGLPSTYALKYDALMDERYSNLIKSSVDEYDEVGVWWEFDKQLAEKAGVKWKGETPVDDHVDMGYSLGYLPEDRIKMVDVYMEDFKSIFGYYPKSVGSWVIDIVTLNYFKEKYGVVAAAICRDQIGTDGFTLWGGYFNQGYYPSKLNEYMPAQNKENQVDLPIFRLLGPDPIYCFEDGLRKGISDVYTLEPAGRMGGTKEWIEWIFDRLTKEKTLGFSYAQVGQENTFLWNTMMKGYEIQIPYVAKLAKEGKVRVETLEESGKWFKKKYKLTPPTTFVASEDWNKEEDLRTLWYNSRFYRVSLLWDDNELSIRDLHLFNEDYKSRYYNDVLNGNESVFDTLPILDAHRWSDGDFRASIDVVLVDEDGNIEKLKGEEPEFYIEDDSTYKIVWKCSQGKIKIICDEAKITFEAIESFKNNEKLALYINTLPVLKNSDTKVLKCSHNGFNYSLIAENGEFKLKENKVIVLSENNKITFTFSKGEGNKKYDFFNKEYVENKETIDNYIPKYKRIKSTSKVMPRAFAPIITPKVILKEAPYEGEFRIENINKGGEVYYTLDGSEPNKNSSLYKTPIKVKGETIIKAIAYNEGFKESSIIEGRLYTTLPIKDIKGLTKATENKKYNNNGVYDLIDGQKGTTSYREGGWLGYTDDMDVIVDLGEVLDINKITVGFLQDTRAWIYYPRYVDFSVSIDGENFEKLDRVNYKNRVPRQEVGVENISIQNKIKARYIRVFAKNEGVCPPWSIMKGEGPAFMFVDQITCM >NZ_CP018624.1|WP_021874748.1|2220458_2220935_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MHQEQFIENNNDKILKVITAVKTLILVFAALTYIFESLTLAVLILLVYVIVHFLTLSFFVEYEYELTEDELDLSKIMSKKKRKLIKTINLRNAEFFKDASEFSPQRYSNVKVVKLYTKEYVNKEKQVILINESGDMRAYELSLKDDLKKAIERIKRRG >NZ_CP018624.1|WP_021874749.1|2218601_2220452_-|family-20-glycosylhydrolase MYLIPSPKKLVNSSGSFNIRRDTEIILNYNCNFNDFEGALILKKEIEDNLGFDIKINKAYIDEKSKNAIKLIKSEVVGNEECYELEINKDSITIIGYGDSGLFYGIQTLRQILRQEGAILSNVKINDEPYFKNRGFYHDVTRGRVPKLETLKKLVDKAALYKINQIQLYIEHTFAFKGMSEVWIDKDPLTAEEILILDKYCKSRHIELIPSLATFGHLYEVLRTKSYSNLCELENMEDDEYSFVDRMAHHTLDVSNAESLKLVENMLKQFIPLFTSDKFNICGDETFDLGKGKSKELGEKLGQGKLYTGFLNKIIDIVKGYNKEVMFWGDVILNHTEVIKDIPQDVICLNWNYGAEATEEGTRKIHEAGREQYVCPGVAGWSHLMNLMDNGFENITRMISYGVKHEAKGVLNTNWGDYGHINILEASIPGMAYGGALSWNPKGEKEFETIYKGLSLLEYGDTSLTVVSILRDLSKTQVVTWSDLVRWKELFDKNSEVREGIKNLNIEDIIEGYNNATEIEIKLTALLNKVKNKEALQEFIVCTRGIILINKFFISLLKAKFKQECIGFDFDNNTLAKELEEWFYDYSYIWKKDSKESELNRIREVIKYTSKELRTF >NZ_CP018624.1|WP_021874750.1|2217002_2218451_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKFKKLLALAACATLTTTTLLTGCGNSGAKAGNKGDEPVTLTWYTIGQEPKDLQMVEDEANKYLEEKINAKIDMKFIDYGDYNQKLSVIINSGESFDLAFTCSWAGDYLGNSRKGAFLELNDYLDTTGKDMKEAIDQRFWDGATIDGKIYAVPNQKEISTAPMWVFTKEYVDKYNIPYQDIHTIQDLEPWLKVIKENEPGVTPLYITKGFSAPQYFDQLVDPVGVEHNDDSLKIKNMFETDKMKEQLEVLRKYYQAGYINADAATAQDDKSVKRFVTKADGQPYAENLWSKDLKYDVVASTIMDTYITNASTTGSMIGISKNSKNPEKAVEFLNLLNTDEYLRNLINYGVEGTHYEKVGDKQIKLLPKEEDYRVGYYTVGNLFLTYVLDKEPLTKWDEFEDFNNKAKNSPALGFKFDPAAVSTEIAAVNNVLEEFKSTIYSGSMDIDEYLPKLNAKLKEQGVDKIIAEMQKQIDEWAKTNKQ >NZ_CP018624.1|WP_021874740.1|2231842_2232229_+|hypothetical-protein MLIVASVLKIKETITASKIVAALSKPKWLGEECNRKAFKGAYEQDKYKTLTEFPVYTGTTSKSRRIDVLVAENLRVKEHFNLNLHGIEIKVSKSDLVNDMKYSEYAEFINYLWLELLSICLFLILIRL >NZ_CP018624.1|WP_079481078.1|2232443_2232749_+|hypothetical-protein MDIQGLLAYLDGIYPSLKLIVNNSTKRQKTTIYVERKLILKLLYQPLSTVKGLDTKLFELLCSQYTNVSKILELVNRFRSILKAKDITKLDLWNILSILDI >NZ_CP018624.1|WP_021874739.1|2233468_2233972_-|hypothetical-protein MLKVFKNEGTKKENIEFDIYTPINIEFGVWNISKEPTIYWRTGDFSSSLIEIGIGQYKKDIRSITLTICKNVYELDNYSENNFNIFKGSPILELENINDEIYTDEKGTLKVYIESKNVSIIFSENEISDCLQNDNVDFYLDANKSLVGLSVNNISEENKAILKEALV >NZ_CP018624.1|WP_021874737.1|2234373_2235138_-|hypothetical-protein MDSVKASANIFTRECQEYWVFSLDGAATHNNSITDEQDQLIENKLNLEKLGYGNLRNYNGQITAEWNEQFNKVVNQFISDFGLKDKYDKLGGNKKTQLYVWISQAVNGQIIKVQRDTGSQGTNNKTHKEVITLESIRENFYLGIGDALIGAVKGVFEFVSHPIDGVIGVANGIQFLNKVISNPNCEEAIILDKIIVEAVNNFIDSNLNEKSRVLGRIVGEILIIVATDGIAESIMEHLPQIANQVKNGGKVEKY >NZ_CP018624.1|WP_079481077.1|2235536_2236751_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MDSIITYLITYNQYLIAIIGQLLLFISQHIPLNQMIFDDSNSPEYQKFKVDKLPTIIRFEKVDYILLLAYYKHKYNKTVKPAQRRNGKSIPKKTKCPKCGAPHEYIYDNNGSKGQFQCKVCGLTFKETNYTTKPIVFICPYCGATLTEQKQRKHFKIHKCNNSKCLYYQRNLKNLPKNIDPCDKYKYKLHYIYREFNINFLKLNPISKHATGFSFKKFSPHIMGLCLTYHVNCKMSILGYQVSDTRATDPCILTMRMAFDKFKDFSGKALNFVADGYSSYPLAKQQFELEKNKEFNLTQVIGLTNDDPVSEEFRWVEQVVERLNRTFKSSYRGTCGYGSDEGALYGFSLWVAYYNFLRPHPYNYWRPLNELKQLDGIDNMPAKWQILISLGQQTILHMQESQTS >NZ_CP018624.1|WP_021874736.1|2237018_2237306_+|hypothetical-protein MDGTGTVIGGSLYNTNGAKNSANASTANKSNNKYRAYVQLYAYKTNGVIDRNSTRTGAESGDVGVSSYAANVGIWESLHSTDQSIDQNCGLRLYM >NZ_CP018624.1|WP_161493077.1|2237396_2238425_+|FtsX-like-permease-family-protein MKKNINTLLTLGFSIALFTISFIISSNYINIKYVIDENKFNDTFSYLDIHLQTPLSLLESNKLLKSIGINKYATQPSLVVNRIGETDYANKLIGVSENFNIEDYFNIEWLSNGKNDFYNRTDVVIIGNSLMQALNKLNSSTEYIEIQGENRKIAGVLKDSQYASFMTFMPIEYLRKENELSNIIQCFVDKNTNIAFGNLKGAIHNSPAKNVLKFAIDKSMTIEGEIVDIILGILTIVIFSICYVQINKRKFSIMRLVGAKQKHILYEYIRCLLPMFSIAFFIAIYFSSITINYISNNIDDIFFKVDLINICMTGIIGFILILLTSLLCMINTLRFRILEDIR >NZ_CP018624.1|WP_131431558.1|2238427_2239621_+|ABC-transporter-permease MKDKLFFTFRKDKVINIILIIQLTLSIFCIYNFLTTFFFKTEYTKLYNSSYDIENGIIIKFTPANISGQNVNPLPILKSLEKNNIKGGIMLEMPDEKYSIPLKTLNISPKLLMNREEYIFGDNTAILPIKMNYTSLNRHSDKINGQIEENMWKIEGNTIPVVVGVNFSNKFKIGDIIKFNGNDFHIIGVMSESILYQTHYDSILTAKDTSGKFIIPIEDKDYTSSYNNDPIIISNSDITSVETALKDFSNLFEIRNYGEDYEWFSKEIKYDLFKKNIRTLILMLATIGSLFITLLIKILSSKDRFGILYSLGFKQKEINNIFILEFSPILYIIIITSFILTNTVGKFSFRRFLVQNKVCYWGVSISIVILLIIICFKFIFNKINKLSPKEMMEDFNK >NZ_CP018624.1|WP_079481076.1|2239617_2240310_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MITLLNIEKIYGKNENQTIALKNINLQINEGDFISIMGSSGCGKSTLLNILGMIDKPTKGDYIFENQKINFNNINSLSEIRNTKISFIFQNFALINDMTVLNNCLLPLKFRKGKKSDKHNLIDKYLSELGILNIKNKLIKELSGGQQQRVAIARALVQDTKIILADEPTGALDEENSIKILEIFKLLNEKYKKTIILVTHDLDVSKYAHTTYIIKDGKFISNSKDFILNE >NZ_CP018624.1|WP_079481036.1|2240786_2242226_+|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MDSIITYLITYNQYLIAIIGQLLLFISKHIPLNQMIFDDSNSPEYQKFKVDKLPTIIRFEKVDYILLLAYYKHKYNKTVKPVQRRNGKSIPKKTKCPKCGAPHEYIYDNNGSKGQFQCKVCGLTFKETNHTTKPIVFICPYCGATLTEQKQRKHFKIHKCNNSKCLYYQRNLKNLPKNIDPCDKYKYKLHYIYREFNINFFKMDLYPISKHATGFSFKKFSPHIMGLCLTYHVNCKMSTRQTAHVLKEVHGIKISHRTVANYALTAAAVIKPFVDTFDYKPSKILSADETYIKVKGIKHYVWIVMDACKRSILGYQVSDTRDTGPCILAMRMAFDKFKDFPGKALNFVADGYSSYPLAKQQFELEKNKEFNLTQVIGLTNDDPVSEEFRWVKQVVERLNRTFKSSYRGTCGYGSDEGALYGFSLWVAYYNFLRPHPYNYWRPLNELKQLDGIDNMSAKWQILISLGQQTILHMQESQTS |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP018624_3 | 3.31|1511086|37|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1511086-1511122 | 37 | GU233956 | Bacillus phage 11143, partial sequence | 909-945 | 6 | 0.838 |
| NZ_CP018624_4 | 4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder | 2231538-2231565 | 28 | AP014333 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C55, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 176-203 | 6 | 0.786 |
| NZ_CP018624_4 | 4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder | 2231538-2231565 | 28 | NZ_AP018256 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome | 20366-20393 | 6 | 0.786 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 208366-208400 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NZ_CP004872 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB64, complete sequence | 49358-49392 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NC_017205 | Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72, complete sequence | 52490-52524 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NZ_CP010581 | Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB68, complete sequence | 60071-60105 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NZ_CP015179 | Bacillus thuringiensis serovar alesti strain BGSC 4C1 plasmid pBMB57, complete sequence | 44583-44617 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NZ_CP015156 | Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC6, complete sequence | 57641-57675 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NZ_CP004869 | Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB67, complete sequence | 13874-13908 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NZ_CP010093 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB71, complete sequence | 44424-44458 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NZ_CP021065 | Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh4, complete sequence | 21905-21939 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NC_018488 | Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04, complete sequence | 34185-34219 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NZ_CP011358 | Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC2226, complete sequence | 45960-45994 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NC_018879 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p, complete sequence | 9313-9347 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NZ_CP013057 | Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-2, complete sequence | 45135-45169 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_3 | 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509445-1509479 | 35 | NC_020382 | Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68, complete sequence | 15049-15083 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP018624_4 | 4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder | 2231538-2231565 | 28 | CAJDKA010000002 | Enterococcus phage 163 genome assembly, contig: phage163-genome, whole genome shotgun sequence | 140826-140853 | 7 | 0.75 |
| NZ_CP018624_4 | 4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder | 2231538-2231565 | 28 | MN241318 | Enterococcus phage PEf771, complete genome | 76284-76311 | 7 | 0.75 |
| NZ_CP018624_4 | 4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder | 2231538-2231565 | 28 | NZ_CP006904 | Clostridium botulinum 202F plasmid pCBI, complete sequence | 23073-23100 | 7 | 0.75 |
| NZ_CP018624_3 | 3.22|1510495|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1510495-1510529 | 35 | NZ_CP042875 | Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence | 367216-367250 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP018624_3 | 3.31|1511086|37|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1511086-1511122 | 37 | NZ_CP026602 | Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed2, complete sequence | 9474-9510 | 8 | 0.784 |
| NZ_CP018624_3 | 3.22|1510495|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1510495-1510529 | 35 | NC_010858 | Campylobacter fetus subsp. venerealis plasmid pCFV108, complete sequence | 1505-1539 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP018624_3 | 3.3|1509249|34|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509249-1509282 | 34 | MG788324 | Lactobacillus phage PM411, complete genome | 33624-33657 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP018624_3 | 3.3|1509249|34|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509249-1509282 | 34 | NZ_CP024415 | Lactobacillus plantarum strain ATCC 8014 plasmid pLP39, complete sequence | 15902-15935 | 11 | 0.676 |
| NZ_CP018624_3 | 3.3|1509249|34|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1509249-1509282 | 34 | NZ_CP018210 | Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence | 34470-34503 | 11 | 0.676 |
1. spacer 3.31|1511086|37|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to GU233956 (Bacillus phage 11143, partial sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
tcatattcatgtatttcatcaaatacaacgactcctg CRISPR spacer tcatattgatgtatttcatcaaatacaactgcaccat Protospacer ******* ********************* .* **
2. spacer 4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder matches to AP014333 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C55, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
caaatcttttaggtttttctgttgccta CRISPR spacer aaaaacttttaggtttttctgttaaatc Protospacer *** ******************. *
3. spacer 4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP018256 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
caaatcttttaggtttttctgttgccta CRISPR spacer gaaatattttaggttgttctgttggttg Protospacer **** ********* ******** .*.
4. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat----- CRISPR spacer agagatatttaaatatagagata-----aaaaaatttcaa Protospacer ******* *************** ***.***
5. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004872 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD-1 plasmid pBMB64, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
6. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017205 (Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
7. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010581 (Bacillus thuringiensis serovar morrisoni strain BGSC 4AA1 plasmid pBMB68, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
8. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015179 (Bacillus thuringiensis serovar alesti strain BGSC 4C1 plasmid pBMB57, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
9. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015156 (Bacillus thuringiensis strain Bc601 plasmid pBTBC6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
10. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP004869 (Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. YBT-1520 plasmid pBMB67, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
11. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010093 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB71, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
12. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021065 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
13. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018488 (Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
14. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011358 (Bacillus thuringiensis strain YC-10 plasmid pYC2226, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
15. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018879 (Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
16. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013057 (Bacillus thuringiensis strain YWC2-8 plasmid pYWC2-8-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
17. spacer 3.6|1509445|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020382 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-68, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
agagatagttaaatatagagataaaagcaaagaat CRISPR spacer agatatagataaatatagagataaaaaataacaaa Protospacer *** **** *****************. ** **
18. spacer 4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder matches to CAJDKA010000002 (Enterococcus phage 163 genome assembly, contig: phage163-genome, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
caaatcttttaggtttttctgttgccta CRISPR spacer tttgaatattaggtttttctgttgccta Protospacer . . * ********************
19. spacer 4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder matches to MN241318 (Enterococcus phage PEf771, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
caaatcttttaggtttttctgttgccta CRISPR spacer tttgaatattaggtttttctgttgccta Protospacer . . * ********************
20. spacer 4.1|2231538|28|NZ_CP018624|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006904 (Clostridium botulinum 202F plasmid pCBI, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
caaatcttttaggtttttctgttgccta CRISPR spacer atgatctttcaggtttttctcttgccat Protospacer .******.********** *****
21. spacer 3.22|1510495|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042875 (Bacillus cereus strain 09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
cttattttctttctaatttccttttctttttcact CRISPR spacer cttattttctttttaatttcctcttcaaaatctgt Protospacer ************.*********.*** ** *
22. spacer 3.31|1511086|37|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026602 (Clostridiaceae bacterium 14S0207 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
tcatattcatgtatttcatcaaatacaacg-----actcctg CRISPR spacer tcatattcatgtatttcatcaaaaataaggcaagcac----- Protospacer *********************** *.** * **
23. spacer 3.22|1510495|35|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010858 (Campylobacter fetus subsp. venerealis plasmid pCFV108, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
cttattttctttctaatttccttttctttttcact CRISPR spacer gtatagttctttctaattttcttttatttttgtct Protospacer * *************.***** ***** **
24. spacer 3.3|1509249|34|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG788324 (Lactobacillus phage PM411, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tccaattggtccttgattcccatcagctcctttt CRISPR spacer gccaattggtttttgattcccatcaccagttaag Protospacer *********..************* * .*
25. spacer 3.3|1509249|34|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024415 (Lactobacillus plantarum strain ATCC 8014 plasmid pLP39, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tccaattggtccttgattcccatcagctcctttt CRISPR spacer gccaattggtttttgattcccatcaccagtcaag Protospacer *********..************* * ..
26. spacer 3.3|1509249|34|NZ_CP018624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018210 (Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_1, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tccaattggtccttgattcccatcagctcctttt CRISPR spacer gccaattggtttttgattcccatcaccagtcaag Protospacer *********..************* * ..
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
138222 : 194373
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP018624|138222:194373|DBSCAN-SWA TATGGAAAAAAAATTAATATTGTCAATAGAATCAAGTTGTGATGAAACATCAGCAGCAGTAATAAAAAATGGAAGAGAAATTTTATCAAATATTATTGCTACTCAAATAGATACACATATGAAATATGGTGGAGTTGTCCCAGAAGTAGCTTCTAGAATGCATATAGAGGTAATAAATGGAGTTGTAATGGAAGCATTAGAGAAGGCTAGCGTTACATTAGATGACATAGATGCAATTGGAGTAACTTATGGTCCAGGGCTAGTAGGAGCTTTGTTGGTAGGTCTTCAATATGCTAAAGGATTAGCCTTTGCAACAAAAAAACCTTTAGTTGGTGTAAATCATATAGAAGGTCATATTAGTGCAAATTACATAGAACATAAAGATTTAAAGCCTCCGTTTGTTTCTTTAGTAGTATCAGGAGGGCATACTTTTATAGTTCATGTTAAAGATTATGGTGAATATGAAGTTATAGGTCAAACAAGAGATGATGCAGCAGGAGAAGCATATGATAAAGTAGCAAGAGCTTTAGGACTTGGATATCCTGGTGGACCTAAGATAGATAAGTTAGCTAAAGAAGGTAACGAAAATGCTATAGAGTTTCCAAAAGCTAATTTTCATGAAGAAACATTAGATTTTTCATTTAGTGGAGTTAAATCAGCTGTATTAAATTATCTTAATAAATGTAAGATGCAAAATATTGAGGTTAATAAAGCCGATGTAGCGGCATCTTTCCAAAAAGCTGTAATAGAAGTTTTAAAAGAGAATGTAATTAAAACTTGTAAAAAGAAAGATGTTAAGAAAATAGCAATTGCAGGTGGGGTAGCATCAAATTCAGCTTTAAGAAAAACCTTAATAGATGCGGCAGAAAAGATAGGAATAGAAGTATTATTTCCATCACCAGTATTGTGTACAGATAATGCAGCTATGATAGGAAGTGCAGCATATTTTAACTTTATTAGTGGAAAGATTAGTCCTTTAAACTTAAATGCAAAACCAAATTTAAAGTTATAGTAATATAATAGGGGGAGAGGAATAAGGATGAAGTTATTGCCACATTCTAACGGGGTGTATAAAGTCAATATGAGAACGCCAATGAAACCGAAAGATATAATAAAAAGAGTATTAATTATATTAGGTATAATTTTACTTTTTGGCTTTATATTTCAAAAGGTTAGTAATTTTATCGCTAAAGAAACCCTAAAAGATAGGGTTGATTATACTAGAGTAGACGATAAAAGATTAGACTATATAGTTAAAGGGGACGGAAAATATACAGTTATTTTTGATGGGAGTATTGGTGGAAATTTAAATCAATGGAATGCAGTTTGTGATAAATTATTATCAGAATACGACGATATAACTGTATTTGTATACAATAGAAGAGGATATGGATTTAGTGACGGGGGAGCAACTAGAACTCCTTTAGATCAAGCAAATGATTTAAAAATATTATTAAGAAAAGCAGCAGCACCATCACCTTATATTTTAGTTGGGGAAGAATATGGTAGCTTAATTTTAACTAATTTTGCAAAAGAATATAAAGATACAGTAGCAGGAGTGGTTTTAGTAAATCCACTTATAGAGGAACAAATAAAAAATAAAAACTTCTCAAAAGGAATTAGGTTTGAAAAGTTTAGAAGGAAGATTGAAGACTTTGGTTCACATATAGGACTTACAACTTTATTAGATAAGTTGAATTTAGATGCTAAAATAAAAGGCTTTGAAGATAAAATAGAGGGAGACGAACTAGAAGAATTTAAAGTACATAGAACTAAAAGTGATTATACAAGTGCTGTATATAATGAGTTGGGAAATATTACTAAGGGGTTAAGTAATAGCCAAGAAGAAGGATTATTTTCAGGTATTCCATATTATCTTATTGCAAAAGAAGGACAGGAATCGTTGCAAAATTTAGGAGATTCAGCATTAACAAAAGTATATAAAACTAATTGTGAAACAAATTTTATATCATTAGAAGATCCAGACTCAGTAATAATAGGAATAAGACAAGTTATTAAGCAAGTTAATGATATAGAAAGAAAGAATAAAAAGAATAATTAAGAGGATTTTACAAAAGATGTCTATGATATTAAAATTATAATAGATGTCTTTTTAATTTTTATTAAAGATAAAATAAGAAGAGAATAATGTCATATAATTGACACAAAAACAGGGTATATTATATTCATAGAGTTAATGATTAAGGAGGCATAACATATGAGTGATGATAATAAAATATATGATGTTGATAATTATGAAGATTTAAGTAAGGTAGAGGAAAAAGAGGATACTTATATAGAAAAAGAAAATAACATTAATGATTTTGATTCGGAAGAAAAAGAAAGAGAAGAACAAGAGAGTATTAATGATGTTAATTTAGAAGATAATAATAATAGAAAGAAGAAAAAGAATGGGTTAAAGAACATAGCTCTTATATTAGTAGTAGGACTTTTAGGTGGTATAGTTGGAGGGGGAGCTACTTATTATGCTGTTAAAAATATAAATGGTAATACTGGAAATGTAACATCAACTCCAAATCCACCAACATTTAATACAGATGGAGAAAGTGTATTAACTAAAACACAAGCTTTTGAAAAAGTTGCACCAGCAGTTGTTATAGTATCTACTAAGGGAACAACTAATTATGGAGGATTTATACCACAAAAAGTAGAGGGGATAGGGTCAGGATTTATAATAAATGAAGAAGGTTATATTTTAACTAATTATCATGTTATAGAAGGAGCTCAAGAAGTTACAGTTACTTTAAGTGATAAAAGGGAAGTTAAAGCAAAAGTAGTTAATTACGATAAAAATCAAGATGTAGCAATGATTAAAATTGTTGATAATATAAAGGTTCCAGCAGTAGTTCAACTTGGAGATTCAGATGCATTAAAACCTGGAGAAGAAGTTCTTGCAATAGGAACACCACTTTCAAAAGAATTTTCTCAAACAGTAACAGGCGGTCTTGTTAGTGCTATTAACAGAAATGTTGAAACTAAAAATGGTGTTAAGTTAAACTTAATACAAACAGATACAGCTATAAACCCTGGTAATAGTGGAGGACCTTTAATAAATACAAAGGGTGAAGTTATAGGAATAAACACAATGAAGATTAGTGGTGAAGCAGAAGGTATAGGATTCTCTATTCCAATTAATGAAGTAAAAGATAGAATAGACTCTTTATCAAAACCTATCTTAAATTTAGGAGTATCAATTAGAGAAGTAAATTCAGATTTATCAAAACAATATGATATGCCAGAAGGATTATATGTAGTTGAAGTAATGCAATTCTCACCAGCAGAAAAAGCAGGAATAAAAGGTGGGGATGTAATTACAAAATTTGATGGTCAAAGAATTAAAAACTTTGATGAGTTAAAAAAGATTAGAGATTCTAAAAGTGAAGGAGATATAGTAAAAGTAGAAGTTGTTAGAAATAAAGAAAGTATAAATGTGGATTTACAGTTAACTGCACAACAATAAGGATTAATAGGGATAAGAAGTTAATTTTTAACGTCTTATCCTTTAACTATTTTTTTTGTAATAATAATAGTGTTGATTTTAAAATAATTTGTGATAAAGTAGTGTATATTGATATTTAAAATAATTTAGTGAATATATAGTTTGTAAAAAACACAAAGTATAATATTAAGATTAAATTTAAGGAGGATTACTAAATATGAAAAGAATAATGCTAGTATGCTCAGAAGGTATGTCAACTTGTTTTCTAGTATCAAAGATGAAAACAGAGGCAGATAAACAAGGTTTTGAATGTACAATAGATTCTTGCTGTGAATCGGATTTAGATTTATATAAAGATAAAGTAGATATTTTACTTTTAGCACCTCAAGTTAAATTCTTAAAAAATGCAATTAGTGAAAAGTTTAATAATATTCCAGTTGAAGTTATAAGTTCTATAGATTACGGAACAATGAATGGTGTCAAAGTATTTAATCAAATATTAAATTTATTAAAGTAAATAGACAAAAAAGTAAATTACATTTAAATTAAGCTCGTAATTCACCTTTTTACTCCTAAGGCATATTCTATATTATAAACAAATTTTAGAGATAAACTTAGGAGGCAAAGTTATGAGCGGAAGAATAGCATCATGTCCTTTAACAACAGGTGTTAATGAACAAATAGAGGCAATAGTTAGATTACCAGAAGAAAAGAGATCAGTTATATTTGGAACTGTATTAGATCCTAATGGAAACCCAGTACCAGATGCAGTAGTAAAACTATTAAAAGTAGTAGATGGATGCAAATATCCTTATCCATTAACCCATACATTCACTGATTGTTATGGTCAATTCTTATTAGGACCTTTATGTCCAAACACTAAATATATGCTAAAGATTTATAAAGATAATATAAATATAAAATTTACAACATTACAACCAAACCCATATAATGGTCAATGTTTAGGAAAGAATGTATGTGAATCTAATCCAGAACCAGAAAATCCACCATGTGGATGTGGCTGTGGCTGCGGTTGCGGTTGTTAAGATAACTGAAAAAAGTTAAATAACAAAAAAGCTTTTTACTTTTGTAAAAGGCTTTTTTGTTATTTAAAAATCTGTTAAAATCTTATTAATTGTGATAAGGAGGAAAAATTAAATTATGGAAAAAATAGTATTATATATAGTTTCTATATTTTTTATTATTGGAGTACTAGATTACATATTAGGGGATAGGTTTAAATTAGGAAGATATTTTGAAGAAGGAATTAATAATATGGGTCCATTAGCATTATCAATGGTAGGAATATTATCTGTTACTCCGATAATTTCAGAATTAATTCTTAAATATATAGTTCCTATAACTAATAAAATTGCTATTGATTCATCTATAGTGGCATCTAGTTTTATAGCTATAGATATGGGAGCTTTTAAAATAGCTGAGAATATAAGCTCTACGCAGGAGATGATTTATTTTTCAGGAGTACTAATAGCATCTATACTTGGATGTACCATTAGTTTTACCCTTCCTTTAGCATTAG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53 | Clostridium_phage(22.22%) | integrase,protease,tRNA,transposase,coat | attL 154231:154290|attR 176241:176397 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
792697 : 829927
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP018624|792697:829927|DBSCAN-SWA 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46 | Clostridium_phage(45.45%) | integrase,portal,head,capsid,terminase,transposase,tail | attL 787500:787517|attR 824489:824506 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1538371 : 1551452
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP018624|1538371:1551452|DBSCAN-SWA ATTAGTGTTTAAAATGTCTTATTCCTGTAAATACCATTGCAATGTCATGTTCATTACATGCATCTATTGATTCTTGATCTCTCATTGAACCACCTGGTTGAATTATTGCTTTTACTCCATATTTAGCACAAGTATCCACTACATCTCTAAATGGGAAGAATGCATCTGAAGCTAAAATTGTAGCTCCTTTTCCTCTTCTTAAAGCATCTTCTGTAGGCCAGATTCTATTAACTTGTCCTCCACCTATTCCTACTGCTACTCCATCTTTTATTGTAACTATCGCATTAGATTTTACATATTTTACTACCTTCATACCAAAGATTAAATCTTTCATTTCTTCTTCTGTTGGTGCTTTTTCTGTTACTACTTTTATTTCTTCAACTAATTTCTTATCTTCCTCTTGTACTAGCATACCACCATCTACTGTTACCATAAATTTTTCATCTTTAGGAGCATTATTGCATTTAATTACTCTTAAATTCTTTTTAGTTTTTAATACTTCTAAAGCATCTTCATCAAACTCTGGGGCTATTACTACCTCCAAGAATATTTTAACCATTTCCTCTGCTGTAGCCTTATCTATTTTTCTATTTATTGCAACTATTCCACCAAATATTGATGTAGGATCTGCATTGTAAGCCTTAGTATAAACTTCAAATGGAGTTTCTCCTATTGCTACTCCACAAGGAGTATTATGTTTAAGTCCACAACAAGCTGTTTCTTCAAATTCACAAGCTACCTTCCAAGCTATATCTAAATCTTTTATATTATTATAAGAAAGTTCTTTACCATTTAAAATTTCAAAACTATTCATTGCCCCATTTACTTCTGTTCTTCCATAATATGCAGCACTCTGATGTGGATTTTCTCCATATCTTAAGTTTTGCATCTTCTTATATGAAACTGAAAGATATTCTGGATATTCTTCATCTCCTAATAAGAAATTTGAAATTGCAGCATCATAGGCACTCATTAAATTAAATACTTTTCCTGCTAGTTTTTTTCTAAGCTTTAAAGTAACTTCTCCTAATGATTGAATTTCTTCCATTACTAACTTATAATCGTCTTTATCTGATATAACCACTACATCTTTAAAGTTTTTAGCTGCTGCTCTAAGCATTGTAGGCCCACCAATATCTATAAACTCAACTTTTTCATCAAAGGATAAGTCTTCTCTAACCTTCTTAAAAAATGGATAAAGATTAACTATAACCATATCTATAGGCTCTATATTTCTTTCTTTAATTGTATTCATATGTTCTTCATTATCTCTAATTGCTAGTATTCCAGCATGTAGTATCGGATGCAGGGTCTTAACTCTTCCATCTAACATTTCTGGAAAATTTGTCACCTCATTTACTTCTGTAACCTTAACTCCATTTTCTTTTAGATGTTTAAAAGTACCTCCAGTTGAGATTATTTCTACTCCCTTGCCAGATAGAAAGTTTGAAAAATCTAGTATTCCTTCTTTATCAAATACACTTATTAAAGCTCTTTTAATCATTGTTTAAAACCCTCCATTTATTCTACTATCTTAACTCTACCATTAATTATTTTTATATTACCTTTAACTATTAAATCTATAGCTCTTGGTAATAATCTATGTTCTAAAACTAAAACCTTTTTTTGAATCTCTTCTTTAGTATCATAAAAATCAATTTTTACAGTTTCTTGTAGAATTATTGCTCCACCATCTACTTCTTCATTTACAAAATGAACAGTACATCCTGTAACCTTAACCCCTGACTTTAAAACTGCTTCATGAACCTTTATTCCGTACATATTGGATCCACAAAATGATGGTATAAGAGATGGATGAATATTTATAATTCTATCTTTAAACTCTTTTAAAATATCTCCTTGTAATATTGAAAGATATCCAGCTAAAACTATTAAGTCAACTTTACTTTTTGTTAACTCTAGTATTTTATCTGATGTCTTATTTCCATATTCTTTTTTTGAAACTATATAAGTTTCAATATTATTTGCCTTAGCCCTATCTAATGCAAATATCCCTTCTTTGCTTCCTATAACCATTTCTATTTTACAATTTAATCTTTTGCTTTCTATAGCATCTATAATTGCTTGAAGATTTGAACCAGAACCTGATGCTAATACTGCTATTTTAAACAACAGCCCTCACCTCCAGCTGTTACATATCCTATTTCATAAGCTTTTTCTCCAAGTTCAATTAATCTTTTTATTATATCTTCTACATCTGATTCTTTAACGCAAAGTACAAAACCTATCCCCATATTAAAGGTGTTGTACATATGATTCTTGTCTACACCTTTTTCTATTATTTTCTCAAAAATAGCTGGTAGTGGATAACTATCCTTTTTAATTACTGCTGTTAAATTATTGCCATTAAACATTCTTGGAACATTTTCTATAAAGCCTCCACCTGTAATATGTGCCATACCTTTTATTTCAAAGTTATTTAAAAGTTCTAAAATTGGTTTTACATATATTTTAGTTGGAGTTATTAAAGTTTTCCAAACCTCTTCTCCATTTAAATCTTCATTTAAATCAGTAAATATTTTTCTAACTAATGAATACCCATTTGAGTGTAGTCCAGAAGATGAAATTCCAATCAGTTTATCTCCTTCTTTAATATTTTTACCATTTATTATTTTATCTTTATCAACGATACCTACAGCAAAGCCAGCCATATCATATTCTCCATCTCTATAGAAGCCAGGCATCTCTGCTGTTTCTCCACCTACTAAAGCACAATCACCTTGAACACATCCTTCTGAAACTCCTTTAACTAAATCAGCTGCCACTTCAGCCTCTAGTTTTCCACAAGCAATATAATCTAAGAAAAATAATGGTTTTGCTCCATGACATAAAATATCATTTACACACATTGCAACGCAATCAATCCCAACAGTATCATACTTTTTAGTTTTAAAAGCTATATCAAGTTTAGTTCCAACTCCATCTGTACCTGAAACTAAAACTGGCTTTTTATATCCTTCTGGAAGTTCTACCATTCCTGCAAAACTCCCAAGTCCATTTAAAACATACTCACTCATGGTTCTACTTGCATATTCTTTTATAAGTTTTACTGATTTATATCCTTCTTCTATATTAACTCCAGCCTCTTTGTAAGTTATCATTATTAAACACTACCTTTCAAGATGATCTTTTGATGTTTCTATTGGTGTTGCTACTGGATATACTCCATTAAAGCATCCTACACAATATCCACTATTTTCTTTGAAACATTTATACATATTTTCTATATCTAAATATCCTAAGGTATCGCAACCTATCATTTCTCTTATTTCATCTACACTTCCCTTTGTGCCAATAAGTTCACTTCTATATGGAGTATCTATTCCAAAATAACAAGGGAATTTAACTATTGGTGAAGCTACTAAAAAGTGAACTTCTTTAGCTCCAGCTCTTTTTAATGAATCAACTAAATGTTTTGAAGTTGTTCCTCTAACTATAGAATCATCTATTAATACAACCTTTTTACCTTTTATGTTAACCTTTAGTGGATTTAGTTTAACTGCTACAGCTCTTTCTCTTATTTCTTGAGATGGTGTAATGAAAGTTCTTCCCACATATCTATTTTTTACAAATCCTGTATCATATGGTATTCCTGAAGCCTTTGCATATCCAACCGCTGCTGGTATCCCTGAATCTGGTACTGCAACTACTACATCTGCCTCTATTGGATATTGTTTAAATAACTCTTGTCCCGCCTTAACTCTTGATTCATGTACATCTAATCCATCAATAGTTGAATCTGGTCTTGCAAAGTATATATACTCAAAAGCACAAGTTTGACATTGTGTATTTTCTGAATATCTATAAGAGCTTATCCCACTTTCATCTATAACTACAATTTCACCTGGATCTATATCTCGAACTAACTCTGCACCTATAGCATCTAAGGCACAACTTTCTGAGGAAAGAATATATCCATCTTCAAATTTTCCAAGGCATAAAGGTCTAATTCCATGGGGATCTCTAACGCCAATTAGTTTATTTTCTGTAAGAATAACCATTGCAAAAGATCCTCTTACTGCTTGTATAGCATCTAAAACAGCTCGTTGAATCCCCTTTTTAGCTCCTCTTGCAATTAAGTTAGCTATAACTTCTGAATCTATTGAAGTATGGAAGACATGACCACCATCTTCTAGTAACTCTCTTATAACTTCAGCATTTACTAATGTACCATTATGTGCCATAGCTATAGAACCTAACTTAGTTTTACTAAGTAATGGTTGTGCATTTTCTATTCTTGTATCTCCTGAAGTTGAATATCTTACATGTCCTATTGCAGAATTCCCTTGTAGCTTGCTTAAATCATCTTGAGAAAAGGCTTCTGTTATAAGCCCCATACCCTTATGAAGGTTTACCATATTTCCATTTGCTACTGCAATACCTGCACTTTCTTGTCCTCTATGCTGAAGTGCATACAGCCCATAATAAGTCATAGAAGCTACATCCATTTCTCTATTTGCATATACCCCAAAAACACCACATTCATCTTTAAATTTATCATTACTTGGATCTAAAATTAGCTCTAAGCTTGAATTCATCTTTCTAAAACACCCCTCATTTTATTAATTGAAAATTGAGCTATATGTTTCTTTACTTTGAAATTCTATTTAAGATTTCAACATATGCATCTTTAACATTTCCAAGGTCTCTTCTAAATCTATCCTTATCTAACTTTTCACCTGTTTTTGCATCCCAAAATCTACATGTATCTGGTGAAATTTCATCTGCTAATACTATTTCTCCATTATATCTACCAAACTCTAGCTTAAAATCTATAAGTCTTATATTTTGCTCTTTAAAGAATTTCTTTAATAATTCATTTATTTTAGCAGTCATATCATATATTTTTTGTAATTCTTCAAAGGTTGTTGCCCCAATACCTACAGCATGATAATCATTGATTAGTGGATCTCCAAGAAAATCATCCTTATATGATAATTCAAACACTGTAGTTTTAAGTTCAAAACCTTCTTCTAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP018624|1538371:1551452|1549132_1549288_-|WP_021875363.1|DBSCAN-SWA MEDKKIICKDCGNEFVFTVGEQEFYKEKGFDNEPVRCIDCRRARKAQNNRR >NZ_CP018624|1538371:1551452|1550037_1550448_-|WP_079481268.1|DBSCAN-SWA MTLLENISYIFLGLSFLTYIFVGLAMYNIAKKDGFNKSWLSWIPIAQDYVVIKYGKGIPWALLLYIPFFFTTGLISSVIAFTIGIYLTIMAVKICKEFKVSYVWVILGLFIPGFSIISYYKLYKTTKNNELLLENK >NZ_CP018624|1538371:1551452|1548272_1548899_+|WP_021875364.1|DBSCAN-SWA MNFATKRETITFLTILILFILLSFFNNYTTFFHYIIDFITILIIIYILYASIFKRLCIKKKRKKFLGNHRYSFKPTPCYSTLFVIFILIFNFFSSSLNNYFTGTSTSVEVLNLVSVLIALLFSFIYDFKNETAFYENGILTCDGEAINYDDILKIEKFTFSTTIKYKIKVKNYYNKLELLMYIEDIDIVNNLFNEKFPNYVDLEKLNK >NZ_CP018624|1538371:1551452|1544177_1547924_-|WP_021875365.1|DBSCAN-SWA MLGTRCIFVEKKKGFNVEAKSLLQDFKSNLGVSGLESVRLINKYTLGEINEEFYKKALYTIFSEKTVDNVYENNLELKDGEIAFAVEYLPGQYDQRADSAAECYQILTAEDKVEVKSAKVIILNGTINDEEINKIKDYYINPVDSREVSLDSMELTSFFTEPKEVEFLTGFINKDNKELEAFHKELGLAMSLEDIKIIRDFFKKEERDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTAIEKVNIEEGLYSKPVSKAYEAYLKSRDYVYGKTNRDETLMDIAVITMKEMRKRGMLEDLDVSEEINACSIKVNIETNNGIEEYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGSADPTTPVEETIKGKLPQRTITLGAAHGYSSYGNQIGLATGQVSEVYHPNYVAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPKAGDVVILLGGRTGRDGLGGATGSSKEHTEDSINECGAEVQKGNAPTERKIQRLFRNKEVCQMIKRCNDFGAGGVSVAIGELTRGLDIDLDRVPKKYEGLDGTELAISESQERMAVVVEKENADRFIALSKEENLEAVVVAKVTDKERLRMYFKGNKIVDLKREFLDTNGARQTTEVEVKAPTNYPFEVKDIDVKEKWINVLKNLNVASQKGLVERFDSTIGTGTVLMPFGGKYQNTEAEGMAAKIPVLNGESKDATLMSYGFNPYLGTWSPYHMAYYSVIEAVTKLAAMGGNYKKARLTLQEYFEKLGTNKEKWGKPFAALLGAYKAQMELGIPAIGGKDSMSGSFGNIDVPPSLVAFAVGVEKAANIISSEFKEVGSEIIFLMGQRKEDMTLDIESYKKNLEVLYKLILEGKVISASAIKFGGVSEALTKMALGNRIGVEFKNLTKEELFGLNYGSLVLEVKLGVNIKDEFEGCAYKAIGNTINSGAIISKEYDINFKIEKLSDVLEEKLSKVFKIKTEDKNEKVETVLYKEGTIKSPGIKVAKPRVFIPVFPGTNCEYDCARAFRNEGADVSELVLNNLNKDSLKESILKMEKTIRESQIIMLPGGFSAGDEPDGSGKFIATVFRNERIKDAVMDLLKNRDGLMLGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIEEDMATLTYNEINRHMSAMVRTKVVSNKSPWFSEVTPGDIHTIAISHGEGRFVASEKLISKLRENGQIATQYVDLNGDISMDMPYNPNGSVLGIEGITSEDGRILGKMGHSERIGENLYKNIPGDFDQKIFKSGVNYYK >NZ_CP018624|1538371:1551452|1539891_1540503_-|WP_079481269.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLASGSGSNLQAIIDAIESKRLNCKIEMVIGSKEGIFALDRAKANNIETYIVSKKEYGNKTSDKILELTKSKVDLIVLAGYLSILQGDILKEFKDRIINIHPSLIPSFCGSNMYGIKVHEAVLKSGVKVTGCTVHFVNEEVDGGAIILQETVKIDFYDTKEEIQKKVLVLEHRLLPRAIDLIVKGNIKIINGRVKIVE >NZ_CP018624|1538371:1551452|1541501_1542929_-|WP_021875368.1|DBSCAN-SWA MNSSLELILDPSNDKFKDECGVFGVYANREMDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVANGNMVNLHKGMGLITEAFSQDDLSKLQGNSAIGHVRYSTSGDTRIENAQPLLSKTKLGSIAMAHNGTLVNAEVIRELLEDGGHVFHTSIDSEVIANLIARGAKKGIQRAVLDAIQAVRGSFAMVILTENKLIGVRDPHGIRPLCLGKFEDGYILSSESCALDAIGAELVRDIDPGEIVVIDESGISSYRYSENTQCQTCAFEYIYFARPDSTIDGLDVHESRVKAGQELFKQYPIEADVVVAVPDSGIPAAVGYAKASGIPYDTGFVKNRYVGRTFITPSQEIRERAVAVKLNPLKVNIKGKKVVLIDDSIVRGTTSKHLVDSLKRAGAKEVHFLVASPIVKFPCYFGIDTPYRSELIGTKGSVDEIREMIGCDTLGYLDIENMYKCFKENSGYCVGCFNGVYPVATPIETSKDHLER >NZ_CP018624|1538371:1551452|1538371_1539874_-|WP_021875371.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKEGILDFSNFLSGKGVEIISTGGTFKHLKENGVKVTEVNEVTNFPEMLDGRVKTLHPILHAGILAIRDNEEHMNTIKERNIEPIDMVIVNLYPFFKKVREDLSFDEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFKDVVVISDKDDYKLVMEEIQSLGEVTLKLRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLGDEEYPEYLSVSYKKMQNLRYGENPHQSAAYYGRTEVNGAMNSFEILNGKELSYNNIKDLDIAWKVACEFEETACCGLKHNTPCGVAIGETPFEVYTKAYNADPTSIFGGIVAINRKIDKATAEEMVKIFLEVVIAPEFDEDALEVLKTKKNLRVIKCNNAPKDEKFMVTVDGGMLVQEEDKKLVEEIKVVTEKAPTEEEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVTIKDGVAVGIGGGQVNRIWPTEDALRRGKGATILASDAFFPFRDVVDTCAKYGVKAIIQPGGSMRDQESIDACNEHDIAMVFTGIRHFKH >NZ_CP018624|1538371:1551452|1549592_1549748_-|WP_008677523.1|DBSCAN-SWA MEDKKIICKDCGKEFVFTVGEQEFYKEKGFDNEPVRCIDCRRARKAQNNRR >NZ_CP018624|1538371:1551452|1540490_1541492_-|WP_021875369.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYKSVKLIKEYASRTMSEYVLNGLGSFAGMVELPEGYKKPVLVSGTDGVGTKLDIAFKTKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAADLVKGVSEGCVQGDCALVGGETAEMPGFYRDGEYDMAGFAVGIVDKDKIINGKNIKEGDKLIGISSSGLHSNGYSLVRKIFTDLNEDLNGEEVWKTLITPTKIYVKPILELLNNFEIKGMAHITGGGFIENVPRMFNGNNLTAVIKKDSYPLPAIFEKIIEKGVDKNHMYNTFNMGIGFVLCVKESDVEDIIKRLIELGEKAYEIGYVTAGGEGCCLK >NZ_CP018624|1538371:1551452|1550513_1551452_-|WP_021875361.1|DBSCAN-SWA MGMILMGVLLVFLLFIVLSTIKIVNTGYLYVVERFGQYHRILEPGWHFLIPFVDFVRKRISTKQQILDVPPQTVITKDNVKISVDNVIFYKLLNARDAVYNIEDYKAGIVYSATTNMRNIIGNMTLDEVLSGRDKINQDLLSIIDEVTDAYGIKILSVEIKNIVPPEEIQEAMEKQMKAERDKRAMILQAEGLRQSEIEKAEGEKQSQILRAEAEKQANIRRAEGLKESQLLEAEGKAKAIAKIAEAEAEAIRKVNEAIIQSGTNETVIALKQVEALKEMANNPANKLILPNETLSSLGSIAAIGEMLKGEK >NZ_CP018624|1538371:1551452|1543685_1544165_-|WP_021875366.1|DBSCAN-SWA MKVAIFFGSKSDTDVMRGAANCLKEFGVSYEAYILSAHRVPEKLTETLKNAEKSGCEVVIAGAGLAAHLPGVIASQTIMPVIGVPIKGSVEGLDALFSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILAVKDKAIREKLNKFRENMKEKFIEENAEGVDL >NZ_CP018624|1538371:1551452|1542981_1543686_-|WP_021875367.1|DBSCAN-SWA MEKLEMMYEGKAKKIYATESKDEVIVYYKDDATAFNGEKKGEIEDKGVLNNAITSMLFEMLNKKGIKTHFVKKLSDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGFELKTTVFELSYKDDFLGDPLINDYHAVGIGATTFEELQKIYDMTAKINELLKKFFKEQNIRLIDFKLEFGRYNGEIVLADEISPDTCRFWDAKTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILNRISK |
12 | Cyanophage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2036595 : 2083627
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP018624|2036595:2083627|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP018624|2036595:2083627|2056723_2057998_-|WP_021874895.1|DBSCAN-SWA MVFKFLYEGISKKITFSLLTILQFTIAIVCIYVSIQFLSDANNLIESVNKQFGNDKYYKMDEKLAIENIRGADIEKNKKNLKILQDINNYFNENEDIEFMSAVREVVFIKKEQAIPDTVVTYSTENIDSTEYIRVQGIYLNKLFLEKMNYDFIDGGFDNFKRVDEDNIPIVLGNIYKDKYSVGDKIETITTDKDGEYKQVKLEVIGILADNSYINLGGIQFNQQSLKNAILIPFREEYMMQQGKNDRVKLIQRVELFSYMQGGYIILKNNESIDNINDYLFESGLKFQINDFNKSIQEYRKESNDTIKPAIYVSSIVILFSTISVIIVMINTIYKERKEYGINIMMGATMKDIRNRVLGQVFILLGISGLISSIILTNFTIFRFNIIYFILTIGVLIFITIIISIIIRINLNKYSINDLVRRSE >NZ_CP018624|2036595:2083627|2057998_2059045_-|WP_021874894.1|DBSCAN-SWA MKKLKKLIKKYWVLFSTFILINVFFISVIINILSFEQDIKTKNSLISKDAKIILFETAEDIKINNLINTLKDKNVVLEGKVLINNDYKATEIIGVYYNYNIDKTYPLTEGRMFTLEEIKRGERVALVGYKLKDNIQDQKVKIQNQEYKVVGILGNKSTKGLGDSIYINMNSQDFNLNRKSITIDVLDGSTAYTAKKIYEQLNERNKVIMEISEPIVEPLNEAISSNSIYLIMGLLASMSLISTVINISSYWIEKEKVIIGIKSLVGESKSSIFLNLFIEYEFVIIASIIIAYLIFGICGGLNSINLLIALKSLLIITLINVIVSITCIIPSVIKISKMNINSIIKENI 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38 | Planktothrix_phage(33.33%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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