Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_AP017902 | Mycoplasma bovigenitalium strain HAZ596 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_AP017902
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
173482 : 181664
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP017902|173482:181664|DBSCAN-SWA GATGTTTGCGGACGAAAAAACACTAAAACCAGCTATTAGATTTAAAGAATTTACTAACGCTTGAGAACAGAGAAGGTTGGGAGATATGTGCATTATTTCGACTGGTAAACTCGATGCAAATGCAATGGATAAAGGCGGAAAATATAATTTTTATACCTCTGGTGTTGAAATTTATAAAATAAATAGGTTTGCTTTTTCAGGTGAAGCAATAACGATTGCTGGTAATGGAGCAAATGTTGGATATATGCATTTAGCAGAAGGACAATTCAACGCGTATCAAAGAACATATGTTTTACAGGCGTTTTCGGAAAATAGAATATTTTTAAATTATGCAATTAAAAATGCATTAAATAAAAAGATACAAGAAGAAGTTAGAGGTTCGGGTATACCTTACATTGTTTTAGATATGCTGAACAGTTTGAACCTTAATATTTCATCGAAAAATGAACAACAAAAAATCTCTAACACATTCTTAAATTTAGACTCCCTAATCACCCTTCATCAGCGTAAGTTAGAAAAGCTAAAAAACATTAAAAATATGCTTTTAGAAAAGATGTTTGTAAATGCATAAATCATTAAAACCAGCCATTAGATTCAAAGAATTTACTAACGATTGAGAACAGAGAAGGTTGGGAGATTTTCTATTTGATCCGCCCCTGGAAAAAGTCGAAGTAGAAGATGAAAATGACTTAATAACTATTGGACTAAATTTAACTGGTATTAGAATTGGCGGCAATAGAAATAAGTTTTCATTTGGTGCAACACAATACTATAAAAGGCTTGCGGGACAATTAATTTATGGAAAGCAAAACTTTTTTAATGGTTCAATTGCACTAATAAGCCCAATTTATAGCGGAAAATGTACATCTGGTGATGTTCCATCATTCAATATAGAAAATATAAATAAATATTTTTTATATCAGTTTATTGCTAGACCAGACTATTACAAATCTAAAGAATCATATTCTATCGGAACTGGTTCTAAGAGAATTCACCAATCAGAAATTAAAAAATTTCAAATAACAAGCCCAATTTCATTAATAGAACAAGAAAAAATTTCGGACACTTTTATTGAATTAGACTCCCTAATCACCCTTCATCAGCGTAAGTTAGAAAAGCTAAAAAACATTAAAAATATGCTCTTAGAAAAGATGTTTGCAGACGAAAAAAACCTTAAACCAGCCATTAGATTCAAAGAATTTACTAACGATTGAGAACAACACAAGTTTAATGAATTACTAATTAAAATAGTTGATAAAGGTCATCCAAATATGCCAACTTTAACCGCTTCTGTAACTGGAGATGTATTTCGCAGAATCGATACAGGGTATACTGTAAGCGTATCAAATGCAAGTTTAATGAACTATGTTCGAGTTTTAAAAAATGATTTCATACTTCACCTCTCATCTTTTAGAAGTGGTTTAGCATTCTCAGATTTTGATGGTATTACTTCACCAGCATACATAGTTTTAAGGCTAATTGGTCAAAATGTTAATAACCCAAAATACTGAAAACACTTTTTTAGAACTGAAGCATTTATAAAATCATTAGTTCCATTCACATACGGATTAAGAGTTGGTAAAACAATTAATCTTGATGAGTTAAATTATTCAATACTTAATGCTCCGTCATTTAAAGAGCAAACAAAAATTGCTTCATTATTAGAGTCAATTTTTAGCTCAATCACCCTTCATCAGCGTAAGCATTATTATTGATTTTTTTCATTTTTATACATAAAAAAGTATTTATTTATATGGGTGTAGAAAGGTAAAATGAAAAAATCAGAAATACTTTTATATAAATATTTTCAAAATTGAATTGATGTATATAAAAAAGGTTCAATAAGAAAAATAAGTTTTAAAAAATATCAATTGACATTAGATTGGATAATTAAAATTGCTAGAGATGTACGTTTGTGCGATTTGGATAGAACTTTATATCAACGCATACTTAATGAGTATGCACTAACTCATGAAAGACAAACTACAATGGATTTTCATCATCATTTAAAAAGTTGTTTATTAGATGCTTTTGATGATGGATATTTGACTAATGATCCTACTCGTAAAGTGGTAATTAAAGGTAAAAATCCTCGTAAGAAAAAAGTTAAATATTTGAGTCAATTTGAATTGCAATTATTAGTTAAAAATTTAAAATTAAAAGACTTTATCAATATGGATTGACTTATTTTATTGATAGCTAAAACAGGTTTAAGATATTCAGAAGCATTGGCACTTACACCACAAGACTTTGATTTTGCAAAGCAAACTCTAAATGTGTCAAAAACTTGGGATTATAAAGAGCAGGGTGGCTTTCTGCCAACCAAAAACAAGTCTAGTATAAGAAAAATCCAACTTGACTGAATGACAGTAAGTCAATTTTCTGGAATCATTAAAAATATGCCTGAAAATGAACCGATTTTTGTCACTAAAGAGCGTATTTATAACTCAACTATTAATGATGTATTAATGCGCCGTTGCAATGCGGCAGGCATTCCTGTTATTAGTGTGCATGGTTTGCGCCATACTCATGCTTCATTATTGCTTTATGCTGGAGTTTCTATTGCTTCAGTAGCTAAGCGTTTAGGTCATGCTAGTATGAACACCACCGAGAAAGTTTATTTACATATTATTAATGAATTAGAAAACAAAGATGTTGACTTAGTAATGAGATCGATATCACTACTTAATTAAAAAATTATTATTACACCCATAAAAAACAAAAAGCCACTTTTGTGGCTATTTTTTGTCTTTTTGTTCTTCGATTCATTTTTCAACAAACGAAATAAAGTCTGCTGGCAGAGCTTTTTTTGGTTTTCTATTTAGTTTTAGTGCAAATTTTTCCCTTATTTCATTTGTATATGATTTTTCACATAAATCATGCAATCTATTATTAACATTGATTGGTTCAGTTGAGTTAATGATTTTATTAATAGCTTTAGAATCAAAGTTTCACTCGTTGCAAAATTCTTTTAGAATTTCACTCTCGATATTTAAAATAGCTTCAGTAAATTCTTCATTAATGTCTAGATAATCTCAGTTTTTTTGATTATTAAAATATGGTTCTAAAATTCGCAATAATATTTCTTGGTGTTCAGCTGTAAAACTTGCAATTGCATGCACGATGCGTTCTCTTGTGCGATCTAATTTGATAATATCATTAAGTTTAGCTAAATTTAATGGAATTTTTTCCCGATAAGGGCTATATTCTGTTGATAAATTTTGCAATTCTAGAGGATCTGATTCATCTTTAGTGCCAGAAGCGTGATTTTCTTTTTGATGTTCTTTCAAATAGCGAGTTATATCCTCGTTTCTAGCAACTAACGCATCAAAATCATGTTCTGTATATGTTATAGTACTACAAATGTCATTAGGATTTTTTGCTCTTTCTCAACTAAAGCCCATAATCTTAGCTGCTCTTACATCATTAATAATTTTATTTATTAATTTATTAGCTTTTCTCATGTTTTCTGTGTATTGCAAATTATTATTGTGTTGTTCGGGGTAAATTGAGCCAAATCAGGTGTGTTTACTATACATTAAGAAAAATTTTTTTACTTCTGCAAATGTATTATTGATGCTTAATAGACGATCTTCAAAACTTGTAGTAAGTATTGATTCAATATTTATATCTGCATACTTGCTTAGAGCTTTATCAAGGTTGTAGTTCATTGTGTTGGGTTGACGATAGAATATTACATTACCAAAATCCTTGCCAGGAAGTGTTCTGTTAGTTCTTGAAATAGCTTGAATTAAATGCTCATAAGTCATAACCTTGTCAAAATAAATTGTATTAATATATTTAGAGTCAAAACCAGTTAGCATCTGGTTAACTACAATTAAAAGTTGCAATTTATCTTTATTTTCAATGTTATTAAAATTACCTTTTCGTGATAATCTTTTTGATAAATCTTGCTTAAATTGAGCACTATCATTCACATTTATTACTTTGCTAAAATCATTGTTATATCTATTAATGATATTATTAATAGCATCTGCTTTGTATTCAGTTTTTGTTAACTCTTCTTCGCGGTCAAGGCTTTGGTCAAAAAGAGCAGTAAATTTAAAGTCTTTGTATTTTTCATTATTATCACAAGCCTCTGCAAATAATTCAAAATACTCAATAGCATCTGGAATGCTTTTAACAGCAAATATAGCACTATAGCGTTTATCGTCTAAAAAGTATTCTTGAGTGTTTAATATATCCTCAACAATCAATTTTTTAAAGCGTTTATCATCATAGTACCCACCCCTCAATAAATCATCTTCATAATCTCGATTAATTTTTTTATCATCGTTATTAAGGTCTCTAAAATGACTTAATTTATCTACTATTTTGCTAATTTTGTCAGTATACAAACCTTTTTTAACGAATTTTATAGCACTTTCTTTAATGTTTTTTATAGCACTTTCAATGTATTTAGTAAATATATTATATTCAATATTAAAGTCTAATATCTTTTTATCTTGAATACCATTCTTTAATGTGTAGCTGTGTAAGAGTTCACCAAAAATATCTTTAGTTTCAAGACCATTTTTTGAGTTTTCTTTACCAAGTGGTGTGCCAGTAAAACCAATTAAAGCAGCATTAGGGAATGTTTCGTTGATATTTTTAATCATTTCACCTGATGTGCTTCTGTGTGCTTCGTCAAAAATAAAGACAATTTTTTGTGAAGCCGCTCTGTTTATTTCTCTTTCTGAAAAGTTTTTTGTATTTACTCTAGATTGTTTTTGGATTGAACCAACAATTATAGTGTTCATTAAATTTTCTTTTTTTATTAAAGAAATAAGGTCATCAGTTGATGAAGCTATTTCAACATTGACTTTTCCGCCTTTAAAACTGCTAAATTCGCTAAAACTTTGTGTCCCTAATTCGGTTCTGTCAACTACAAAAACAACTGTATCAGCAATATTTCATTCAAGTAATAATTGCGATAATTTAAAACTAGTTAGAGTTTTTCCAGAACCTGTTGAGTGTCAAATATGACCAACTTTTGCACATCCAGAACGATTTGGGTCAAAGAAAATTTTTTTATCCGTTCTAAACTTTCTTTCAATTTTATCAATTGCATGAAATTGATAGCTTCTTAAAATTAATGGATTAATCTCATTTTCTTGGCAAACTGTAAAGTCAGCAATAAGTCGGTGTGCCATTGGAATTGATAGAAAATGTTTGACAACATCTCTTCAATCTCTTAAAACATTGTTTCGGTCATCGTGTCAATAACTAAATGATTGTTCATTAATAAATTGACCAGAATGATCTGTTGGCATATATTTCATTTCTTCAGGATTCATAGCAACACTAACTTGAACTAGTTTTAAAATTTCGTCAAAACCACCTGAATTAATGTAGTTAGAAATTTGGGTTATTGATTTTGATATACTAATTCCTTTTGCCTTTAATTCAATATGGAATAAAGGCAAACCATTAATTAATAAAATAACATCAGCTCTATGCTTGCGGTTAACTGCTTTTCAAGGCAGCTCTACTTCTTTGGCAATTTGATAAATTGAATCACCAGCATTAATCTCTTTTCTACTGAAGATTTTTAAATATATTTCCTTGCCATATTTTTCTGTATCTTTTTTATTATCTCTTTTAATAGCAATTGTTTCGCTATTTATTAATTTATTAGCAGCTGCTGTGCTATTACATTGTTTAATTTTCTCTTTTAATTGCTCTTTTTCGCCATCTGTAAGGTCAATGTTATTTAATCTATCCTTATTATTGCGATAAACAATTTTAAAAAAGTTATTTCACAAATCTTCTATAGTGCATGATTCTAAAACTGGTTTAATTTCCCTGTTTATATTTCTTCAGCCGTTTTCTTGCAAGGCGTTGACTAAATCATTTTGAAATTTTCTTTCACTATCTTTATTTTCTATCATTTGTTTATTCTCCTTAGACAAACATTTTTATCAAGTTGCTGTTTAATGTTTTAAGATTTTTTAACTTATGCTGATGAAGGGTGATTGAGGTGTTTAAATTTAAAAATAAACTAGAGATTTTTTGTTGTTCATTAAAATCTGTTACCCAAAAATTCATGCTCATCAAATCATTGGAATTTAATTTTTTTCTATCAGAACCAACTAATATAGTTGATAAATCATTTGCGTTTATTAAGTACTTTAAAAACAATGTTGAATTATTTTTGTTAGATTTTAATACATGAGCATGATTATTAACTCAAATTTTGCCATTTACATATTGAACAGGATAGTTTTTTAAATCATTAGCGCCATCTTCAGCAACCAAAACGAACTCTCCATTATGTGTGTGTCCCTTTATATAGCCTTGAATTCCATTAGCTCCATAATATGGGGTGCTGCCCTTTTCCCTCATATGTTCACTAATTGGAACACGCAGATTATCGTATCTATCGGCAATATCTCCCAACCTTCTCTGTTCTCAAGCGTTAGTAAATTCTTTGAATCTAATTGCTGGTTTAAGTAGTTTATGCATTTACAAACATCTTTTCTAAAAGCATATTTTTAATGTTTTTTAGCTTTTCTAACTTACGCTGATGAAGGGTGATTAGGGAGTCTAAATTTAAGAATGTGTTAGAGATTTTTTGTTGTTCATTTTTCGATGAAATATTAAGGTTCAAACTGTTCAGCATATCTAAAACAATGTAAGGTATACCCGAACCTCTAACTTCTTCTTGTATCTTTTTATTTAATGCATTTTTAATTGCATAATTTAAAAATATTCTATTTTCCGAAAACGCCTGTAAAACATATGTTCTTTGATACGCGTTGAATTGTCCTTCTGCTAAATGCATATATCCAACATTTGCTCCATTACCAGCAATCGTTATTGCTTCACCTGAAAAAGCAAACCTATTTATTTTATAAATTTCAACACCAGAGGTATAAAAATTATATTTTCCGCCTTTATCCATTGCATTTGCATCGAGTTTACCAGTCGAAATAATGCACATATCTCCCAACCTTCTCTGTTCTCAATCGTTAGTAAATTCTTTGAATCTAATGGCTGGTTTAAGGTTTTTTTCGTCTGCAAACATCTTTTCTAAGAGCATATTTTTAATGTTTTTTAGCTTTTCTAACTTACGCTGATGAAGGGTGATTGAGCTAAAAATTGACTCTAATAATGAAGCAATTTTTGTTTGCTCTTTAAATGACGGAGCATTAAGTATTGAATAATTTAACTCATCAAGATTAATTGTTTTACCAACTCTTAATCCGTATGTGAATGGAACTAATGATTTTATAAATGCTTCAGTTCTAAAAAAGTGTTTTCAGTATTTTGGGTTATTAACATTTTGACCAATTAGCCTTAAAACTATGTATGCTGGTGAAGTAATACCATCAAAATCTGAGAATGCTAAACCACTTCTAAAAGATGAGAGGTGAAGTATGAAATCATTTTTTAAAACTCGAACATAGTTCATTAAACTTGCATTTGATACGCTTACAGTATACCCTGTATCGATTCTGCGAAATACATCTCCAGTTACAGAAGCGGTTAAAGTTGGCATATTTGGATGACCTTTATCAACTATTTTAATTAGTAATTCATTAAACTTGTGTTGTTCTCAATCGTTAGTAAATTCTTTGAATCTAATGGCTGGTTTAAGTAGTTTATGCATTTACAAACATCTTTTCTAAAAGAATATTTTTAATGTTTTTTAGCTTTTCTAACTTACGCTGATGAAGGGTGATTGAGGTGTTTAAATTTAAAAATAAACTAGAGATTTTTTGTTGTTCATTAAAATCTGTTACCCAAAAATTCATGCTCATCAAATCATTGGAATTTAATTTTTTTCTATCAGAACCAACTAATATAGTTGATAAATCATTTGCGTTTATTAAGTACTTTAAAAACAATGTTGAATTATTTTTGTTAGATTTTAATACATGAGCATGATTATTAACTCAAATTTTGCCATTTACATATTGAACAGGATAGTTTTTTAAATCATTAGCGCCATCTTCAGCAACCAAAACGAACTCTCCATTATGTGTGTGTCCCTTTATATAGCCTTGAATTCCATTAGCTCCATAATATGGGGTGCTGCCCTTTTCCCTCATATGTTCACTAATTGGAACACGCAGATTATCGTATCTATCGGCAATATCTCCCAACCTTCTCTGTTCTCAAGCGTTAGTAAATTCCTTGAATCTAATGGCTGGTTTTAGTGTTTTTTCGTCTGCAAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP017902|173482:181664|174044_175244_+|WP_096385645.1|DBSCAN-SWA MHKSLKPAIRFKEFTNDWEQRRLGDFLFDPPLEKVEVEDENDLITIGLNLTGIRIGGNRNKFSFGATQYYKRLAGQLIYGKQNFFNGSIALISPIYSGKCTSGDVPSFNIENINKYFLYQFIARPDYYKSKESYSIGTGSKRIHQSEIKKFQITSPISLIEQEKISDTFIELDSLITLHQRKLEKLKNIKNMLLEKMFADEKNLKPAIRFKEFTNDWEQHKFNELLIKIVDKGHPNMPTLTASVTGDVFRRIDTGYTVSVSNASLMNYVRVLKNDFILHLSSFRSGLAFSDFDGITSPAYIVLRLIGQNVNNPKYWKHFFRTEAFIKSLVPFTYGLRVGKTINLDELNYSILNAPSFKEQTKIASLLESIFSSITLHQRKHYYWFFSFLYIKKYLFIWV >NZ_AP017902|173482:181664|173482_174052_+|WP_096385643.1|DBSCAN-SWA MFADEKTLKPAIRFKEFTNAWEQRRLGDMCIISTGKLDANAMDKGGKYNFYTSGVEIYKINRFAFSGEAITIAGNGANVGYMHLAEGQFNAYQRTYVLQAFSENRIFLNYAIKNALNKKIQEEVRGSGIPYIVLDMLNSLNLNISSKNEQQKISNTFLNLDSLITLHQRKLEKLKNIKNMLLEKMFVNA >NZ_AP017902|173482:181664|176219_179372_-|WP_096385651.1|DBSCAN-SWA MIENKDSERKFQNDLVNALQENGWRNINREIKPVLESCTIEDLWNNFFKIVYRNNKDRLNNIDLTDGEKEQLKEKIKQCNSTAAANKLINSETIAIKRDNKKDTEKYGKEIYLKIFSRKEINAGDSIYQIAKEVELPWKAVNRKHRADVILLINGLPLFHIELKAKGISISKSITQISNYINSGGFDEILKLVQVSVAMNPEEMKYMPTDHSGQFINEQSFSYWHDDRNNVLRDWRDVVKHFLSIPMAHRLIADFTVCQENEINPLILRSYQFHAIDKIERKFRTDKKIFFDPNRSGCAKVGHIWHSTGSGKTLTSFKLSQLLLEWNIADTVVFVVDRTELGTQSFSEFSSFKGGKVNVEIASSTDDLISLIKKENLMNTIIVGSIQKQSRVNTKNFSEREINRAASQKIVFIFDEAHRSTSGEMIKNINETFPNAALIGFTGTPLGKENSKNGLETKDIFGELLHSYTLKNGIQDKKILDFNIEYNIFTKYIESAIKNIKESAIKFVKKGLYTDKISKIVDKLSHFRDLNNDDKKINRDYEDDLLRGGYYDDKRFKKLIVEDILNTQEYFLDDKRYSAIFAVKSIPDAIEYFELFAEACDNNEKYKDFKFTALFDQSLDREEELTKTEYKADAINNIINRYNNDFSKVINVNDSAQFKQDLSKRLSRKGNFNNIENKDKLQLLIVVNQMLTGFDSKYINTIYFDKVMTYEHLIQAISRTNRTLPGKDFGNVIFYRQPNTMNYNLDKALSKYADINIESILTTSFEDRLLSINNTFAEVKKFFLMYSKHTWFGSIYPEQHNNNLQYTENMRKANKLINKIINDVRAAKIMGFSWERAKNPNDICSTITYTEHDFDALVARNEDITRYLKEHQKENHASGTKDESDPLELQNLSTEYSPYREKIPLNLAKLNDIIKLDRTRERIVHAIASFTAEHQEILLRILEPYFNNQKNWDYLDINEEFTEAILNIESEILKEFCNEWNFDSKAINKIINSTEPINVNNRLHDLCEKSYTNEIREKFALKLNRKPKKALPADFISFVEKWIEEQKDKK >NZ_AP017902|173482:181664|179385_179946_-|WP_096385654.1|DBSCAN-SWA MHKLLKPAIRFKEFTNAWEQRRLGDIADRYDNLRVPISEHMREKGSTPYYGANGIQGYIKGHTHNGEFVLVAEDGANDLKNYPVQYVNGKIWVNNHAHVLKSNKNNSTLFLKYLINANDLSTILVGSDRKKLNSNDLMSMNFWVTDFNEQQKISSLFLNLNTSITLHQHKLKNLKTLNSNLIKMFV >NZ_AP017902|173482:181664|179938_180508_-|WP_096387385.1|DBSCAN-SWA MFADEKNLKPAIRFKEFTNDWEQRRLGDMCIISTGKLDANAMDKGGKYNFYTSGVEIYKINRFAFSGEAITIAGNGANVGYMHLAEGQFNAYQRTYVLQAFSENRIFLNYAIKNALNKKIQEEVRGSGIPYIVLDMLNSLNLNISSKNEQQKISNTFLNLDSLITLHQRKLEKLKNIKNMLLEKMFVNA >NZ_AP017902|173482:181664|181085_181664_-|WP_172412436.1|DBSCAN-SWA MFADEKTLKPAIRFKEFTNAWEQRRLGDIADRYDNLRVPISEHMREKGSTPYYGANGIQGYIKGHTHNGEFVLVAEDGANDLKNYPVQYVNGKIWVNNHAHVLKSNKNNSTLFLKYLINANDLSTILVGSDRKKLNSNDLMSMNFWVTDFNEQQKISSLFLNLNTSITLHQRKLEKLKNIKNILLEKMFVNA >NZ_AP017902|173482:181664|175253_176174_+|WP_096385648.1|integrase|DBSCAN-SWA MKKSEILLYKYFQNWIDVYKKGSIRKISFKKYQLTLDWIIKIARDVRLCDLDRTLYQRILNEYALTHERQTTMDFHHHLKSCLLDAFDDGYLTNDPTRKVVIKGKNPRKKKVKYLSQFELQLLVKNLKLKDFINMDWLILLIAKTGLRYSEALALTPQDFDFAKQTLNVSKTWDYKEQGGFLPTKNKSSIRKIQLDWMTVSQFSGIIKNMPENEPIFVTKERIYNSTINDVLMRRCNAAGIPVISVHGLRHTHASLLLYAGVSIASVAKRLGHASMNTTEKVYLHIINELENKDVDLVMRSISLLN |
7 | Cafeteria_roenbergensis_virus(33.33%) | integrase | attL 174657:174716|attR 182743:183270 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
216216 : 278209
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP017902|216216:278209|DBSCAN-SWA TATGGAAAAACAAGATTTGATGCTATTTAATGTTCATGGAAATAAAAAGGGCGTTTTATATAAATATGTTGGCTGGTCAAACGGATTCAATAAAAATCCAACAAGATGGTTTAGTTTAGGAAATGTAGAAAAACTACTTGAAATTAACGAAAACGCAATCGAGATAATAAAAAACAAACTTAAAAACTTCACTAGACAGGATAATCCAGATAAAGTTAAACATGCGCTTCTACACTCGATTGAAAAAGAAAAAATCCAACATACAAGTATTTGCGTTGGCAATGAATTAATAAGTGAATTTATTGAAAAACACAACATATTTAAACAATTAAAAGCCACAAGACATAAAAATATGAATGAAATATTTAATTTCTTAGTGGCGAAAAGAATTATTAATCCCACAAGTATATACAACTCATTTAATGAATCAGATGAATATTCAACAAATATCTTTTCTTCTAAGAATAGCTTTTATAGACTTTTAGACATTGTTCACGAAAACAAAGACCAATTGCTTTTTTCAATAAATAAATTAGTTGAATCGGAAACAAAAAGTAAATTAGATGAAATCTATTTTGATTCATCTACAGTGTATTTTGAAAGTTTTAGCCGCGAAGGACTTAGGGTTCCTGGGTATTCTAAAGATGCCAAATTCAAAGAAGATCAGATTGTGATTGGTCTTGCGTGCGACAAAAATGGTATTCCTATTTACATGAAAGTTTTCAAGGGAAATACAGGGGATTCAAGAACAATGATTCCATTTATATTAGAACTTGAAACTAAATTTGGCATAAAAAATATAACAATTATTGCTGATAGAGGGATGAGTACAAATGCAAATATCCGTTTTTTAGAACAAAGAGGACACAATTTTATAATCTCATATAGAGCAAAATCTGGTAGTCAGAATTTTAAAAATTGGATTTTAGATCGCGAAGGATACATTGGAGATTCTGAATTTAGATACAAAGAAACAGAATATGAATCTAATTGAAAAAATACAAGATTTAATGGTAAATTAAGAAGAAGAATTGTAACTTATTCAAAAACAAGAGCAAAAAAAGATAGAGAAGATCGCGGAATTTTGATTGATAATTTCCGTAAAAAACAAGACAAAAGCGGTTATGTTGATTCAACAAAAATGTTGGGTACAAAAAAATGCAAATTCTTTAAACAAATATCTAAGTTTAAATTTGAATTAGACTTTGAAAAAGTCACAAAAGATTCTGAATTTGATGGTATCTATGTTTATGAAACAAATATTTCAAATATTTCTGCTGAAAAAATCATTGAAAAGTACGCGAACCAATGAAAAATTGAAACAAATTTTAGAGCATTAAAAAGTTTTTTACAAATTAGACCGGTTTATGTGAGACTAGACGAACACATAATAGCACACTCAATATTATGTTTTATATCACTTGTTTTATTAAAACTTATTACTTATAAGATAAACAAGTTTTATGAGGATTATGGTGTAATTGACCATTTATCTGAACAAAAACTTATTAATATATTATCCAAACTAAGAGAAAGAGTTGATATCAACTCAAAAACAAAAGAAATCATTAAAAGACAAAGAGAAGATTCGAAAACAATAAAAGATATTTGAAGCGAATATGATCTTATTAAAAAAATTGTAATTAAAAAATAGCATAAAAATAACGAAAAGCACTATAAATAAGGCTTATTCGTTATTTTTATTATTTGAAACTGGGAAACTCGGGAAAACACGCAATATATGATTTTAATATTTTATTTGGTCAAGACATTAAATGATGGGGCTCATTAATTTATACAGGATCATGAACTCTATTGATGATAACATTAAACATTTCTTTATCTAACCTAAAAAGAAAATAAACGCAGTCAATTTTCCTGAGTTTCCCAATTTCATAGATTAAAATAACGAATACCCCTATTTTAAAGTGGTTTTCGTTATTTTTAATTAATTTTTAGTTACAATTTTTTTAATGAAATCATATTCCGTTATCCTTTTTTATCATAATTGTAATTAAATGAAATAAAAAAATACAAAAAAATTCATACTATATATAGTATGGGTTAATAAAATCTTTTTAAACTGCTAACTAACACTATAAAAGTGGGAAACACAGGAAATCGTGTCATTTATTTTTTGGGATCAAATACACCAATGAATGGTATTCCTCTAAATTTTTCTTGGTAATCTAGCCCGAATCCGACAATAAATTCGTTTGGAACTAAAAAACCTACTTTATCAGCTTCTAAATTAACTTTTCGATTATATGGTTTGTCAAGTAAAGTAATTATTTTTAGACTTTTTGGATTTCTTTGTAAAAGCATATTTTTTACTTTATCAAGTGTAATTCCAGAATCAATGATATCTTCTGCAATCAAAACATCTTTTCCTTCAATATCAACTTCAAGATCCATAATAATTTTGACATTCCCGCTTGATTGGCTTGCACCATGATAGCTCGAAGCAATCATAAAAGCAAGTTCATTTTCAATATCTACACCTTTTATTAATTGAGCAATGAAGGGAATAGCTCCTTTTAACAATCCAACAATAACTAAATCTTTAGAGTTATTGTATGTTTCGTTAACTCATTGCGAAAGCTCTTTAATACGTTGTTCAATTTCTGTTTGAGTGTATAAAATTTTTGTGAATCTTTTGTCCATATTTAGTCCTTTATATAATTTTATAATTTATTTTGAAAAGTCAAATTTTTCAATTATATTTATTGCTTCAGCTAAAATTTGATGTTCATTTTTATTATTTCCATCAATTATTGCGTATGGGATTTTGTACGTATTCATGAGTTTTTCATAAAGATGTCTGTATAGAGCGTGCAATTCTTTAAAATATTCTTCATTTTGCTCATAGTTTTTAATTTCACTTTCGCGACCACGTTTAAATAAGTGTTCCTTGAAATTATCAAAGTCAATATCAATAAAAATAGCTAGATTAGGATTTTGCTCTTTTTCAATCATTTTATTAAACAATTGGTCAAAAGCTTTAATAAATTTTGCTGGTTTGTTTTTCATTGAAATTAATGCAAAAATGTAATGTTCAATATTAAATCTATCAAGAAAAATATGGTTTGTTTGGCAAATTTTGCCGCTTTTTGAAAAATCAATTAGAGCACTTCTAAGAGTATTTGCTGAGGATTCCAAAATGTAAGCTTGAAATGCTAAATTGATATTTTTTACACCTTTATAAAATCATTCAATAAATTGGTTAAAAATTTTATCTTCAGATTGAAATTCTTCTAAATATATTGAATTATCATAGAATTTTGCTAAATTTTTTGCAAGAGTGCTTTTGCCGCTTGCGATCATTCCACTAATACCAATTATCATTTTTTAACCTTTCTTATTCACTAAATGATTATCTATTATCTTGATGGCTTGATGTAAAACTTGATTTTCAGATAAATTGTTTGTATCGATTATATAGAATGGCATTTTGTATAATTTCGCCAATTGTTCAAATTTTGATTTATATACAGAGTGCAATTTTGCAAAATATTCTGCATTTTGCTCATAGTTTTTAACTTCTACCTCGCGACCTCTTGCAAAAAGTCTCTTTTTAAATGTTTCATGTGTCATATCTAAAAAAATTGCAAAATGGGGAGTTTCTTCATTTGTTATCATTTGCTTAAACATTGAATCATAGGCTTGTTGATAACGTGGGTTTTTGTCTTGAAGAATAACGGAAGCGAATATGTAGTGTTCAATTGCAAAGCGGTCTAAAAATAGGTGGTCATTATAAATATTTTTTCCTTTTTCAATAAATAATTGTTTTATTTCGGAAAATTTATCAACATGCCGTTCAATCATATAAGATTGAAAGCTCATTGTTATATTTTCTTCATTTTTGTATAATCATTCTAAAAAAACATTAAACTCTTCGTCATTTTCTTCAAATTCATTCAATATCATTGAATCTTTATAATGGTTTAAAAGTTTTTTTGTAAGTGAACTTTTACCGCTACCAATCATTCCGCTTATGCCAATTATCATATTTGCTCCTTAAAATTCGTAAATAAAAAGTTTAAAAAAAGTAATTAAAATAATTTGCATTACTTAATTACTTAATAAATTATTTATATTCAACATCAAGAATTTTGATTGAGTATTTACTTGCAGCATCAACTTCAACAATCTGGCCAATTTTGCCATCGCTAAGCGCTAAAGCCAATGCAGAAACATTAGAGATTTTGCCATTTAAAGGGTCACTATCGTGAATACCCATTATAGTCACTGTTTTAATTTCGCCACTATCAATTTTTTCGTATTTAACAGTAGAACCTACACCGATTTTGGTCGAAGTTCTTGCTTCATTGGTGCTAATTACTTCAGCTTTTTCAATTATTGCTTCTAATTCTAGAATTCTGCCTTCAACAACTCCTTGTAAGTCTCTAGCCGCGTCATATTCCGCGTTTTCTGACAAGTCACCTTGTGCACGAGCTTCTTTTAGTGCTTGTTGAACTTCTTTACGTTTTACATTAACTAATTCATGATACTCAGCTTTATATTTATCTAGTGTTTCTTGGGCTAAATAAATTTTGTCTTGAATTTTTGACATAGAAATCTCCTTTGTAATTATTTTTTATTTTATCAACTTTGTTTATATTTTTAAGAAATATTTGCATTTTTTACAATGTAAATAAATTTACTTGCAACACTTGAAACTTCATATGTTACTTGGGCAAATTTTAAATCCGAAATCAATTCGCGTAATTTAGCTTTATTTGTGTCATCTTGACGGATAACTAACATACCATTATTATTCAATAAATTAAAGTAGTTTGCGAAAATATCAGTGTTATTTTCAATGATATTTGTTGCATAAATTAAATCAAATTTGGAATCTTTAATTTCGTTTTGGGATAAAACACTGATTTTTTTGTTGCTTAATTCAGTGTTTATTTCGCATGCTTGAGTATATTTACTTTCATCAAAAATATTTTTATTTATTGTAATTTTAGCTGGCGAAAGTAAATTCAAACAAA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56 | Lactobacillus_virus(10.0%) | tRNA,tail,terminase,transposase,portal,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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