Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017974 | Lactobacillus fermentum strain MTCC 25067 plasmid pLF25067 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_AP017973 | Lactobacillus fermentum strain MTCC 25067 | 1 crisprs | cas14j,cas3,DEDDh,WYL,DinG,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,csa3 | 0 | 3 | 16 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP017973_1 | 1246898-1247976 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017973_1
|
15 spacers
spacers of NZ_AP017973_1
>1.1|1246933|36|NZ_AP017973|CRT GTGATAGTTGAATGCCTGTACTGCCGTTAGTTACTT >1.2|1247004|35|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAAGCCTTAACCGGCAATTCAACGTCACCATATTT >1.3|1247074|34|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAATGGCTACAAAGACGGTAATGCTCAAAAGCC >1.4|1247143|35|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCAAGGTTACACAATTTACAATCCATACGTCAGGC >1.5|1247213|34|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACTAATCGGCTAGTGGTCCACCCTCCCCTGACG >1.6|1247282|33|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAAGGTAAGATTCAATCGAACCGAATACGTTA >1.7|1247350|34|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGACCGTATAATCCTCACGGCCAACCTTATAATC >1.8|1247419|34|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCCGGTGTGATTACCGGTTCGTCCCGCCAATCTA >1.9|1247488|34|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGAATTAACAAGGCGAATTAAAAATTTGGAGGA >1.10|1247557|35|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTGTCGCCAAGAGCTACTACCGAGATGACTTAGGA >1.11|1247627|33|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACACCACCACCGAAAACAGCACCGAATGAAGAT >1.12|1247695|36|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACCCAGAGGTACTTCATGACACGCTAGACGCCATTA >1.13|1247766|35|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATCTTAACACTTAACCATTGACTGACGGTTAGGTT >1.14|1247836|35|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCGTCATCGTCTTGTAACCATGAAGAATTGGTACT >1.15|1247906|36|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCATAACCCCTTTTTAGATTTGCATATAATAGGAAG |
cas14j,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017973_1
The CRISPR arrays of NZ_AP017973_1 >merge|NZ_AP017973|1|1246898-1247976|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGACAGGGGACCACACCCCCGCGAAGGAGTGCGACGTGATAGTTGAATGCCTGTACTGCCGTTAGTTACTTATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACTAAGCCTTAACCGGCAATTCAACGTCACCATATTTATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACAAAATGGCTACAAAGACGGTAATGCTCAAAAGCCATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACTCAAGGTTACACAATTTACAATCCATACGTCAGGCATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACTACTAATCGGCTAGTGGTCCACCCTCCCCTGACGATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACTTAAGGTAAGATTCAATCGAACCGAATACGTTAATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACGGACCGTATAATCCTCACGGCCAACCTTATAATCATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACTCCGGTGTGATTACCGGTTCGTCCCGCCAATCTAATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACAAGAATTAACAAGGCGAATTAAAAATTTGGAGGAATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACCTGTCGCCAAGAGCTACTACCGAGATGACTTAGGAATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACACACCACCACCGAAAACAGCACCGAATGAAGATATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACACCCAGAGGTACTTCATGACACGCTAGACGCCATTAATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACATCTTAACACTTAACCATTGACTGACGGTTAGGTTATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACTCGTCATCGTCTTGTAACCATGAAGAATTGGTACTATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGACCCATAACCCCTTTTTAGATTTGCATATAATAGGAAGATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC >NZ_AP017973|1|1|1246898-1247976|CRT TGACAGGGGACCACACCCCCGCGAAGGAGTGCGAC GTGATAGTTGAATGCCTGTACTGCCGTTAGTTACTT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TAAGCCTTAACCGGCAATTCAACGTCACCATATTT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC AAAATGGCTACAAAGACGGTAATGCTCAAAAGCC ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TCAAGGTTACACAATTTACAATCCATACGTCAGGC ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TACTAATCGGCTAGTGGTCCACCCTCCCCTGACG ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TTAAGGTAAGATTCAATCGAACCGAATACGTTA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC GGACCGTATAATCCTCACGGCCAACCTTATAATC ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TCCGGTGTGATTACCGGTTCGTCCCGCCAATCTA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC AAGAATTAACAAGGCGAATTAAAAATTTGGAGGA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC CTGTCGCCAAGAGCTACTACCGAGATGACTTAGGA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC ACACCACCACCGAAAACAGCACCGAATGAAGAT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC ACCCAGAGGTACTTCATGACACGCTAGACGCCATTA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC ATCTTAACACTTAACCATTGACTGACGGTTAGGTT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TCGTCATCGTCTTGTAACCATGAAGAATTGGTACT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC CCATAACCCCTTTTTAGATTTGCATATAATAGGAAG ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC >NZ_AP017973|1|1|1246969-1247976|PILER-CR ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TAAGCCTTAACCGGCAATTCAACGTCACCATATTT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC AAAATGGCTACAAAGACGGTAATGCTCAAAAGCC ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TCAAGGTTACACAATTTACAATCCATACGTCAGGC ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TACTAATCGGCTAGTGGTCCACCCTCCCCTGACG ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TTAAGGTAAGATTCAATCGAACCGAATACGTTA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC GGACCGTATAATCCTCACGGCCAACCTTATAATC ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TCCGGTGTGATTACCGGTTCGTCCCGCCAATCTA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC AAGAATTAACAAGGCGAATTAAAAATTTGGAGGA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC CTGTCGCCAAGAGCTACTACCGAGATGACTTAGGA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC ACACCACCACCGAAAACAGCACCGAATGAAGAT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC ACCCAGAGGTACTTCATGACACGCTAGACGCCATTA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC ATCTTAACACTTAACCATTGACTGACGGTTAGGTT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TCGTCATCGTCTTGTAACCATGAAGAATTGGTACT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC CCATAACCCCTTTTTAGATTTGCATATAATAGGAAG ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC >NZ_AP017973|1|1|1246969-1247976|CRISPRCasFinder ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TAAGCCTTAACCGGCAATTCAACGTCACCATATTT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC AAAATGGCTACAAAGACGGTAATGCTCAAAAGCC ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TCAAGGTTACACAATTTACAATCCATACGTCAGGC ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TACTAATCGGCTAGTGGTCCACCCTCCCCTGACG ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TTAAGGTAAGATTCAATCGAACCGAATACGTTA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC GGACCGTATAATCCTCACGGCCAACCTTATAATC ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TCCGGTGTGATTACCGGTTCGTCCCGCCAATCTA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC AAGAATTAACAAGGCGAATTAAAAATTTGGAGGA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC CTGTCGCCAAGAGCTACTACCGAGATGACTTAGGA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC ACACCACCACCGAAAACAGCACCGAATGAAGAT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC ACCCAGAGGTACTTCATGACACGCTAGACGCCATTA ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC ATCTTAACACTTAACCATTGACTGACGGTTAGGTT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC TCGTCATCGTCTTGTAACCATGAAGAATTGGTACT ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC CCATAACCCCTTTTTAGATTTGCATATAATAGGAAG ATTTCAATCCACGCACCCCCACGAAGGAGTGCGAC
>NZ_AP017973.1|WP_096494227.1|1245983_1246862_+|IS3-family-transposase MDVQHALESHPSINGMCDYVGISRSGYYQREKRHNHQSPRKLRKKFIQGEIKAIWLKSLCIYGAGKITQELRSKGYKIAERTVGKYMRELGIHAVYLTPWTTTTRNSKFDKQLINILDEQFNPLRPNAVWCIDTTYIPVHDGFVYLTSIMDLYSRWIIGWDLSETLEVSNVIPLIEKTKHSRHISKPLIMHSDRGSQFTSEAYNQVTANMTLSYSKKAYPWDNACIESFHALIKREWINRFKIHSYSEAKRLVFQYIETFYNTVRIHSHCGFKSPKQLEDEYQTQIQNLVVA >NZ_AP017973.1|WP_075667795.1|1245672_1245960_+|transposase MTKHSYDNEFKEQAVQYYLDNKDHMTMNEISKNLGIGASTLHKWIKLFTETGEFGRGSGNFASDKDKEIARLKRQLRDAEGAIEVLKKSIGILSK >NZ_AP017973.1|WP_096494225.1|1244008_1244974_-|aspartate-carbamoyltransferase-catalytic-subunit MTTQLVEQLVSLPHFVSVEDLTTDQVNALIARAEEFKNGAPAPELSRPVYVTNMFFENSTRTHTSFAMAEKKLGLTEIPFDASHSSIKKGETLYDTCLTLDALGVDLTVVRASENDYYLPLINPGAGHYLDLGIVNGGDGSGQHPSQCMLDIMTIHEHFGHFKGLKVAIVGDITHSRVARSNMEILNKLGAEVYFSGPEYWYDHAFDKYGKFLPIDELVEEVDVMMLLRVQHERHAGDAHEGDFSAADYHKQYGINEERYALLKPDTIIMHPGPINRGVELADSLVEAPKSAFVTQMKNGVFMRMAMLEAVLRGRKLGGLE >NZ_AP017973.1|WP_096494223.1|1242719_1244009_-|dihydroorotase MKTLIKNGTVYNDGRLVKEDVLVEDGIIRAIGKDLHEYLDDDYDELDAGNLLVSPGLVDVHVHYREPGQTEKETIRTGSAAAAHGGFTTVGAMPNVDPVPDTPAKVAQMVAKNKQDGLVHIAQYSAITTDRTSDEVVDMAGVKRAGAFAVSNDGNGVQAAGTMYRAMQAAKAVGLPLAAHVEDESLLFGGVMTEGDRSRYLGLPGAPEVVESAQVARDLALAKATGVHYHVCHVSTKDSLAMIHFAKQNGVRVTCEATPHHLLLSDQCIDGHDSNYKMNPPLRHEADRRALVAALNDGTVDMIATDHAPHTEEDKGRDFCCAANGITGSETAFALLYTKLVKTGLLKLERLLDLMATNPAEAFNLTEAGHLEVGKPADIAVFDLNHPYVIDQRDYLSKGINSPFTGMTVYGQTVMTMVDGQVVYQRKEN >NZ_AP017973.1|WP_096494221.1|1241635_1242718_-|glutamine-hydrolyzing-carbamoyl-phosphate-synthase-small-subunit MQRYLVLEDGTTYYGTAFGADQAKTGEVVFTTGMTGYQEAITDQSFANQILVFTNPLIGNYGVNLDDDESLLPEIKGVVCRKLARVATNWRMQDDLANFLAQRGIPGLEGIDTRALVKKLRQHGTLRGRLVDDLTDLDQVVAALKQATPMKNIIPLVSTKSPYPNPGTKRNIVVVDFGIKHSILRELAKRDCNVIVLPHTATATQVLNLHADGVLLSNGPGDPLEMTAAAEMVKEVEQHLPVFGICMGHQILALANGAKTVKMKFGHRGFNHPVKNVATGEVNFTSQNHGYAVDATSIDPDRLLITHVEINDGTVEGLRHKHYPAFSVQFHPDAAPGPHDAEQLFDDFINLVDQRKKGRN >NZ_AP017973.1|WP_096494219.1|1238456_1241636_-|carbamoyl-phosphate-synthase-large-subunit MPKRTDIHKIMVIGSGPIIIGQAAEFDYSGTQACLALKEEGYETVLVNSNPATIMTDKEIADHVYIEPLTVAALTRILRQEAPDALLPTLGGQIGLNLAVALSKTGILDELGIELLGTKLASIDQAEDREKFKELMQELGEPVPASLTVSTVEQARTFAKTIGYPVIVRPAFTMGGTGGGLANNEAELTEIAKNGLELSPATQCLIEKSIAGYKEIEFEVMRDAADNTMVVCCMENFDPVGIHTGDSIVFAPSQTLADREYQRLRDCALKLISALKIEGGCNVQLALDPNSYDYNVIEVNPRVSRSSALASKATGYPIAKLAAKIAVGLTLDEIKNPVTKTTYAEFEPALDYVVVKLPRWPFDKFTKADRRLGSQMKATGEVMAIGRTAEEALLKAVASLEIDQKDLLSKEAAAASDRQLEDKLVHAQDDRLFYIAEAFRRGYSLADLHELTRINHYFLDIVAGLVEEEGRIKAAGLDKEVIYEAKRDGFADTTLATLLGQNPAAIRAFRKANEIVPVYKMVDTCAAEFDSATPYFYSTYETENESRRSAKPSVLVIGSGPIRIGQGVEFDYATVHCVRALQKLGYEAIVINSNPETVSTDFSVSDKLYFEPLTLENILNVTDLEQPVGAIVQFGGQTAINLAAGLEENGVKILGTTVADLNAAEDRELFDQVIKDLNLRQPIGMTATTRQGVLDAAKEIGYPVLVRPSYVLGGKAMEIVYGQAELEDYLNQNADVTGSHPILVDAYLEGGECEVDAICDGERVLLPGIMEHIEHAGVHSGDSMAVYPPQSLSGAVKVQIEEATKKLAVALKCVGIMNIQFIIHDGQAYVLEVNPRASRTVPFLSKVTGIEMAQLATKVILGHSLAEQGYRSGLAPESQMIHVKAPVFSFSKLGDVDSYLGPEMKSTGEVMGSDTTYEKALYKAFAGAGMEVPDNGAVLLTIEDNDKAQILPLAKRFLAIGYRILATSGTAAFLEENGLHPTVVAKLHEQGQPAILDVIKDKHVDLVINTMGHDDEKNSDGFIIRQTAIEHHVPLLTALDTVDALLRSLEMTSFKTTEL >NZ_AP017973.1|WP_096494217.1|1237526_1238444_-|dihydroorotate-dehydrogenase MTNRLAVSLPGLNMTNPLMPASGTFGFGDAWGADQVNFNDLGALVIKTTTPEARTGNPQPQIAKLNDGVMNAVGLTNPGVDAVIKEKLPNLAKQYPDLPVVGSIGGSTETDYVLVAEKLAKSGLVSALELNVSCPNVAHGGMAFGTDAKVLESLTNQVKRVVGDVPLYVKLTPNVTDITEVARGAEAGGADGLSLINTVLGLHIDIRTGQPVLGNGMGGYSGTAVKPLAVRMVYQVAHATKLPIIGMGGIETAADVLEFMMAGASAVAVGAAHFKDIAACPHIAAQLPALMDELGIKTLAELKRI >NZ_AP017973.1|WP_096494215.1|1236610_1237417_+|HAD-family-phosphatase MDQHLIALDMDGTTLNNQSKLTDHTVNTLRRLANDGHLVVIVTGRPWLISAHHYDQIGLKSPIINFNGALAHLPYQNWKHEYAIKVTRELTLDMLESRRELGVQTLIAEDKHHVWADHPSNELPEFLPAQLSDDQILNERNLTDDPIALTIQFDPAKKDAIINRVNERYGDFVEPRVWGGGYSIMELIHRGTHKETALSYLAHHFQIDRQHIVAFGDEQNDLEMIDFAGHGVAMKNAIPELKAVAKDVTTLDNEHDGVADYLEKYFQL >NZ_AP017973.1|WP_096494936.1|1235108_1236482_-|RsmF-rRNA-methyltransferase-first-C-terminal-domain-containing-protein MQLPTAFIEKYQRLLKEEAPAFLAALASGTVQSGFRANPLKPGQPTATIEAAAGQSPYVTNGYLGKVDGHSLDHVTGWVYSQEPSAMLVGEFADPQPGERVLDLCAAPGGKSTHLIAKMNDEGLLVANEIFKNRAQVLAENLERWGAKHVVVANESPDQLEKQFPAFFDRILVDAPCSGEGMFRKEPAGIEYWNEDYPAECANRQRHILTSALKMLKPGGTLVYSTCTFAPEEDEQMAAWLLNNYDLTMVELEKAPGMDAGRPEWTDGNPELTKALRLFPHHFKGEGHFIAKFVKNGEEPVILTKKNKKKKGRGQRSKFAPTKEQQALWQDFQTKVLPNYEAGQLVVFGDYLYDLPVGMPAIDQMSLIRPGLQLGVFKKNRFEPALALALATKPAACTQVVEVDEPAWRTYVHGDTLTIQDAPKNGWYLVECDQHAAGWGKLVNGTLKNFFPKGLRF >NZ_AP017973.1|WP_096494213.1|1233307_1234471_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MTKLIKGVKLRLYPNKQQQAQLWQMFGNDRRVWNIMLDMAKQRYQNNPSSHFVNEYGMNYLLKQLKQEYPYLKDSDATSFLVVNHNLVQAFKMLFKHRGGYPRFKSRHAAKQSYTGRSVCTVIAKRRMKLPKLGSIRTSKTSQAVNGKIKRYTVSYGPTGRYYLSLQVETVAPEALPKTGKTVGLDVGIADLAISSDGEKFGTFNAKWLEKQATKWQSKYSRRKYQATVAVRQWNHNHKDVKMDLNDYQNWQRAQKQKARYQQRIANQRQDYLHKLTTALVKKYDVIVIEDLKAKNLQKNHHLAKAIANASWYQFRTMLEYKCDWYGKQLITVNPNYTSQICSTCGYHSGKKPLEIREWTCPKCGTHHDRDINAAVNILHRGLKAVG >NZ_AP017973.1|WP_021350245.1|1248134_1248425_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLVIVSYDVNTEDPAGRRRLRHVAKICKDYGQRIQKSVFECNVDSTKLTVLKQRLLAEYDEDTDSLCFFNLGNKYQNKVSHYGSNSVVNLDEPVIF >NZ_AP017973.1|WP_021350246.1|1248434_1249466_-|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRQLLNTLYVNTPNAYLASEGNNVKIIIDQDCVGQLPLQNFESIVTFGYAGASSGLMQKCLNQGIALSFMQPNGQIKGRVSGKPTGNVYLRRTQFRVADDDQAKLKLARNFILGKVFNQRWVIERFIRDHGMQVDQAKLKAVSVTLKDGLDKIQRAVDMESLRGIEGNLATEYFSVINDLIINQTEAFIFHDRSRRPPLDRVNALMSFAYSLLANECGGALIANGLDPYVGFMHVDRPGREGLALDLMEELRAVIADRFVLRMINLKILRSSDFKQSPDGAVLLTDEARKKFLTKWHENEQKTLQHPYLNEKIEWGLVPFAQSQLLARCLRGDLDEYPPFLWK >NZ_AP017973.1|WP_024501029.1|1249462_1250119_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MAYDNDDILQISGIQHFIFCRRQWALAYLENSWVENYLTLTGDELHKKVDNPFIKESRNAKFIERAMRINSRRLGLSGICDVVEFIENPDGVRIFGKSGEYLPIPVEYKRGKQKSDHSDELQLLAEAVCLEEMLYCHLDYGYLYYGQTKHRERVEFSKELRDELNKAVAEMHRYWEKKYTPRVKTSKKCRSCSLKDICLPELLKTEKVSDYIKRRLEG >NZ_AP017973.1|WP_096494229.1|1250122_1251001_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MAEVLNHRIDFKVVIAAAGANPNGDPLNGNRPRQTSDGYGEISDVAIKRKVRNRLQDLGNKVFVQSADRADDEAKSLKERVESNDELKKLMDAGDNEGFAEAADNTWIDVRSFGQVFAFKGKGKSKGVSVGVRGPVSITRARSIAPIAINDMQITKSVNGETTEGRGSDTMGMKYSVDFAVYEFSGSINVQLAEKTGFTDEDAGMIHQALETLFNNDESSARPAGSMEVLRVYWWEQEGKLGKVAPAKIFRTVKVTPKEGTFDVRDFDDVDFTSADQAATEIEGAMCDIYRG >NZ_AP017973.1|WP_096494231.1|1251022_1252936_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MNWMSELVDLYDRNQNKAGKVTNVKRRGKNGEMEPVFLLPINHVSNCVEIEIKLNLDGDFVGAEVINKEKTIMPVTIESAARTSGIRPRPVDDKFQYIARDYNQLQEVLEAKREPGEHKDKPYKQDGDFDEYLQQLTDFFEFTKEHSKTKEHSKTVAPLLMAIQKYVANNDLIIDLIHSGQFGELDSYEDIDEKSILANNPLCRFNVLTEGPVRWKNPECFKAWSDFYQFKLAKEGEIGFDYVAGNEHVPLGTNHPKGILPLASGAKLISSNDTQNFTFRGRFINSEEAVSIGYESSQKGHAMLKWLIDKQGFSIGGRYYITWGTTGENLTTINPQDNELFNDILSLDDEIEDTNSAFASQLRNLLLKGASVNGIPKQNPVYVMQLEGTTTGRFGIVYYQALDLTTYIERITDWYTKLYLKCDDNKYIYPSLKFIADRIYGDRNDETTQKLKKDVVTDLVQSILGGRKIPYSYLSKIFQKSIRPTSFDNQSVWKLTVTTAARLFKSYFSREEIEPMLNTDFKDRSYLYGRLLAIADVVEQGVLGANGQDRSTNARRYMSAFSQRPADTWKVIYVNLQPYLTKSNYRQKAQRLFDEINEKFDVTDSQLNSPLDGKFLIGYSQQRTDWYKSSKSKSEVE >NZ_AP017973.1|WP_096494233.1|1252932_1253673_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MSLKERTTFCFQVDGDFALFTDPITKIGGEKFTYPVPTYQALKGIAESIYWKPTFQIVIDKVRIMKPIITEARDIRLMKYNRTGASDLARYTYLRDVSYQVQAHLEWNEQRVDLMKDRNANKHYAIMKRSIARGGRRDIFLGTRECQGFVEECRFGKGSGYYDDSDDRLFGTMLHGFDYPDETGEDYLGLRLWNVVMKKGIIEFPPPTDLQLHRRKLHELEAKKFTLDDIQSVDDTYEELLGGEDE >NZ_AP017973.1|WP_021350250.1|1253685_1256124_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MDFISHTVEGSTDVQLLREHLINAKNLAEDYGTDIDIPKVTGLAALLHDLGKYRVAFQEYIQNGVGHHGSVDHSSFGAYFIHQFINEHSQAESEKDRLYLTWFGETIENAIMSHHNSLGLKDFVDAHVNSPFLKRLNKVEEDPELKDELQRVIQRFFQKVMGEKEISDYFDQAYKEFSLLIDKCYSQDKKTLLSNLFFIETYVYSCVLDADRTDTATFSLDQPVKRYDYSAVFEDYYQKLNRQLAGMNSEKEINQLRSAMSDECDDFAEKRDGIYQLSIPTGGGKTLAGMRYGLKRSILSHKKHIFGVLPFITIIEQNARVYRKTFNGDPLDNQNILEFHSNVAQELRSNKEKDDLLDLAEDSWNSPITVTTMVQFLNCIFASGTTNRRRFHNLCNSVIILDEVQKVPVKCLSLFNKAINFLKEVGHCSILLCTATQPALGDLKASLKIDGEIIQDLSQRQEDFKRVKFTDLTRQGIQEHPISSQELAELITYKFNDSQRILVILNTIGAVNQLAENLDSGQLNCKVYALTTRMCAAHRQKLIKEIKDRLAQKLPTICVSTPLIEAGVDISFETVYRSVCGLDSIVQAAGRCNRNGERDRGDVYLVLLNKDSEKLDKLREIKWGQKIVLNMLAQKDFDPDSLLQTKVINNYFDHFYQEIDQSELSGYPTSDEGRDIHLADYIEGKQASRDYLQQNSGSELKAFSGSETIAKHFEVIDQETVSVLVPYGKGSDFIALLNSQNYQDSLSEIFKEAQPYLVNVFKNMLRGLIEKEVVYPIEFPFSDREVYTVRDSYYQEESGLNYQIKNSESMIF >NZ_AP017973.1|WP_096494235.1|1256990_1258130_-|IS30-family-transposase MTHLNDITTDTNVSTRSKGSHLTIDDRVKISVLKELEYSNRMIAQYIGVAHGTIDREIKRGMVTKMSKQSNNGKVYCYYKEYYDPYTAQERYEKSRSNCGRTPIYQSSPEIINLLDDLMLGEFDFKDHDKFESLDSQKCSPYAALKIAESLVNDDVKLPASERSIYNWIDKGFLRTKNIDLLEKTRRTKAKHGRTPKREQLGKNISQRPKEVETRTTFGHWEMDTVQGKKSAEDPVILVLAERLTRYNLAFKITSKTPNAVSRVITKLKELTGDYFDEIFKTITPDNGSEFFDVANEVDQVYYADAYSPWQRGTNENNNRLLRRSITKGTSLQLFSEFDVEQANLRLNSYPRKILGGKSSLDRFEEEILKIIDPETLAV >NZ_AP017973.1|WP_003683897.1|1258299_1258659_-|50S-ribosomal-protein-L19 MRQNQLIEKVTAGQLRSDIPAFRAGDTVRVHALIVEGTRERVQIFEGVVIKRHGAGISATYTVRKISNGIGVERTFPLHSPRVEKIEVVRYGRVRRAKLYYLRERTGKSARIAERRRDK >NZ_AP017973.1|WP_003683895.1|1258779_1260207_-|amino-acid-permease MKKLIARLLKQEDPSVYQLKDGQLEPTLRTIDLIGLGTGMVVGTAIFTLPGIVAAEHTGPAVPLAFIVAAIGAGLSALAYAETASVLPFAGSAFSWMNVLFGEFFGWIAGWALLAEYFISVAFVASGWSAYMQGFLASFGIKLPTALTGGFNPASGSYVDIFAAIAILAVGWLLSHGVHQVARIENTIVAIKLLVIILFIVVGATAIHTQNYHPFIPAHRPGTTFGGWTGIMAGASQIFIAYVGFDAIAANTAETKNPQKTMPRGLIGTLVLGTGFFIVVSLVLVGMFKYSRYANNAEPAAWALRESGHYLTANLLSVVALIGIFSALIAILLASSRLIYAFGRDGLLPSFLGHVDAKRVPNRALWTITVLAMILGSIFPFTFLATLVSAGTLVAFIFVSLGIYALRRREGKDLPEAQFKMPGYPILPAVSVIFSAVIFWNLNVDAKWMMVGWFAIGLLVYFLYGIRHSTLAKKG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017973_1 | 1.1|1246933|36|NZ_AP017973|CRT | 1246933-1246968 | 36 | GU323708 | Lactobacillus phage phiPYB5, complete genome | 19909-19944 | 2 | 0.944 |
NZ_AP017973_1 | 1.8|1247419|34|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1247419-1247452 | 34 | MN830252 | Lactobacillus phage JNU_P1, complete genome | 23909-23942 | 2 | 0.941 |
NZ_AP017973_1 | 1.8|1247419|34|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1247419-1247452 | 34 | GU323708 | Lactobacillus phage phiPYB5, complete genome | 16600-16633 | 2 | 0.941 |
NZ_AP017973_1 | 1.11|1247627|33|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1247627-1247659 | 33 | MK483107 | Vibrio phage vB_VpP_BA6, complete genome | 31918-31950 | 7 | 0.788 |
NZ_AP017973_1 | 1.11|1247627|33|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1247627-1247659 | 33 | NZ_CP015231 | Epibacterium mobile F1926 plasmid unnamed1, complete sequence | 715498-715530 | 7 | 0.788 |
NZ_AP017973_1 | 1.11|1247627|33|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1247627-1247659 | 33 | KM067278 | Pseudomonas phage vB_PaeP_PPA-ABTNL, complete genome | 5049-5081 | 8 | 0.758 |
NZ_AP017973_1 | 1.11|1247627|33|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1247627-1247659 | 33 | NC_047953 | Pseudomonas phage vB_PaeP_130_113, complete genome | 5211-5243 | 8 | 0.758 |
1. spacer 1.1|1246933|36|NZ_AP017973|CRT matches to GU323708 (Lactobacillus phage phiPYB5, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
gtgatagttgaatgcctgtactgccgttagttactt CRISPR spacer gcgatagttgaatgcccgtactgccgttagttactt Protospacer *.**************.*******************
2. spacer 1.8|1247419|34|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN830252 (Lactobacillus phage JNU_P1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tccggtgtgattaccggttcgtcccgccaatcta CRISPR spacer tccggcgtgattaccgggtcgtcccgccaatcta Protospacer *****.*********** ****************
3. spacer 1.8|1247419|34|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to GU323708 (Lactobacillus phage phiPYB5, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
tccggtgtgattaccggttcgtcccgccaatcta CRISPR spacer tccggagtgattaccgggtcgtcccgccaatcta Protospacer ***** *********** ****************
4. spacer 1.11|1247627|33|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK483107 (Vibrio phage vB_VpP_BA6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
acaccaccaccgaaaacagcaccgaatgaagat---- CRISPR spacer gcaccaccaccaagaacagcacc----gaagatactg Protospacer .**********.*.********* ******
5. spacer 1.11|1247627|33|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015231 (Epibacterium mobile F1926 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
acaccaccaccgaaaacagcaccgaatgaagat CRISPR spacer acaccaccgccgacaacagcaccgtgtccagaa Protospacer ********.**** ********** .* ***
6. spacer 1.11|1247627|33|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KM067278 (Pseudomonas phage vB_PaeP_PPA-ABTNL, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
acaccaccaccgaaaacagcaccgaatgaagat- CRISPR spacer acaccaccaccgaaaccaccaccg-ctgctgtcc Protospacer *************** ** ***** ** * .
7. spacer 1.11|1247627|33|NZ_AP017973|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_047953 (Pseudomonas phage vB_PaeP_130_113, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
acaccaccaccgaaaacagcaccgaatgaagat- CRISPR spacer acaccaccaccgaaaccaccaccg-ctgctgtcc Protospacer *************** ** ***** ** * .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
14432 : 84636
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP017973|14432:84636|DBSCAN-SWA AATGGGCACCACTATTTTATCATTCCAGAACCGTGTTGTCATTGAAACGCTTCATAATGAAGGACGTTCCTTGCGATACATCGCTAACTACTTAGGCTTTAGTAAGACCACCGTCTTTAACGAACTTCACCGGCTCAACGGTGAGTATCAAGCTGAACTAGCGCAAACTGACTTTGAACGCAAGGTTAGTCAACGGGGGCGGAAGTCTTCACTCACTAAAGGCCTTAAGCACTTGATTGAGGAAAAGATTCAAGTCCAGAAGTGGTCCCCTGAACAAGTTGCCCATGTGGTGGGGATTGCCTACAAGACGGTCTATAACTGGATTGATCAAGGCTGGCTTGATATACAGTTGCCCGATTTACCTGATCATGGAATTCGTCGTCATCGTGCTAAAGAAAAGCGTGGTACGTTCAATCACGGCCGCTCCATTGAGGAGCGTCCTCATAAAGTCGAAACTCGCCAGGAATTCGGCCACTTTGAAGCTGATACCGTACTTTCTGGCAAACGTAAAGGTCAAGCTGTGGCTACTTTTGTGGAGCGTAAGAGTCGCCTGACAATTGTTAAACGGCTCCATGGTCGCGACAGTCAGTCCATGACTCAAGCCGTACTTGAACTAGCTAGTCAACTTCAAGACAAGCTCAAGACGCTTACCGTGGATCATGGGAAAGAGTTCGCTAACTATCAGGCAATTGAACAGCTAACGGGTACTCAGGTTTACTTTGCCCATGCCTATTCACCGCACGAACGCGGTAGTAATGAGAACCGTAATCGAGTTTTGCGACGGTTTATTCCCAAGGGACAAGCCATTGAAGAGCTGAGCGATCACCAGCTGGTTCAAATCAATTGGTATCTGAATTCACGGCCACTTAAATGTCTTAATTGGCATACACCAATCGAGATCTTCTTGCTTAATCTACGTCACTAAATTCGTTCAAGTTATTTCTTGCAATCTGCCATTGTCTAAAATTAAGGAAACTAGGTGAGGAAATGCAAACAGAAATTAAGTTTCGTTGGCTGCTGCTCGGTAGCTTTTTGGTTAACGTTGGGAACAGCTTTATTTGGCCGCTGACGACGGTCTACATCCACGATCAACTACACCAGTCACTGACGGTTTCTGGAATTGTGCTTCTCTTTTATTCCGGAACTAACGTGATCGGTTCCTACGTCGGTGGGCGGTTATTTGACAAGTACTCGCCCCAACGGCTAACCCTCGGGGGGATCGTGGCGGCGGTAATCTTCATGGGGGTGTTGGTCTTTAAAAACGACTGGCCGACCTACCCGATCATGCTCGCCCTGATTGGGATCGTCAACGGGTGGTTGATGACGATGCACAACTCCTACGGTGCTCGGATGCGCAGTCGGGATGGGCGCTTCGTTTTTAACATGCTCTACTTTGCCAATAACTTGGGGATGGTCTTTGGGACCACGATTGTCGGCCCGCTTTACCAGTATGCCCACGATAACGTGGGGCCACTGTTCTTGGTGACCGTGGTCATTTACGCCGCCTTTTCCTTAGTGGTGATCAAGTTCTACCAAATTGCCGTCATCAAACGGCCCCAGCACGAAGAAAAACTGGTTAAGTTGCCCCGGGCCAATTCCCAGCTGATTTGGACAATGAGCGGCGCCCTGTTGGTGATCTGGATGATGTACTCGCAATGGTCATCCAACATGTCGGTTTACATTACCGGTCACGGGGTTTCCATGACTAGCTACTCGCTGTTGTGGACGATCAACGGGCTCTTGATCGTGGTCTTGCAGATGGCGATTAACTGGTTAAACCGGCGGATGAACAACGATCACCTTTACTTGTACTTTGGCGCCGCCATGTTAGGGCTGTCCTTTTTGATCCTGCCCTTTGCCAAGGGCTACGGGGCCTTCGTCTTCTCAATGGTCGTGCTAACCCTGGGGGAGGCAACGGCGATTCCAACGATCCCGGCCCTGGTCAACCAGCTGTGCCCAATGGAAGATAAGGGGCGCTACCAAGGGATCGTCAATTCTTTTGGTTCGGCCGGCAAGGCGCTGGGCCCCTTATTTGGTGGCCTGGTGATCGAACGGTTTAGCTATCAGCCCCTCTTTTACGTCTGTACGTTAGCAATCCTTGGTGCCGGCTTAGTTTCCTGGTTGATGATGGAAAAGAATCACCGCCAGGCTGAATACTACTAGGGGGTGAGCGTGTGTTTTACCAAAATTACGATGAAGTTCGTGGCGAGGACCGCTGGGGGATGGTCGGCAAGGTCGGCGACCCCTTTAGGGAGGATTGCCTACTAGCGGCACCCTGTTACAAGTGTCACCGCCAGCCACTGGTGATCGCCGAGCGCAACTGGGAGGCCACCAACAACGACGACTCGCAACAGTACCAGATTCTAGTGGCCTGTACCCACTGCGGGGCGGTCGATGAGTTTACCGTCAACCAGGGAAGAGAAGGGGTGCTCAGTCAGCTCAAGTACAGCCACCAACGGGTGAGTGTTAACGACGTCAAAGCTGAATCGCAAGAGGGTGGGAAGTAACCTTCTCGGCAGGTCGTATGACTAAGCTAGGACGAACGGTTAGTGCAGAATGCACTGTTCTTCGGCCTGCTTAGGCACTAGGCCTGCGGTTATCTACCACGTTTTCTGTCTAACATTCGGGAATACAACAAGGGGCTGGGAGAAAACACAGTTTTCTCCCAGCCCCTTGTTTTTAGGTATAAAAAAACCGCCACCCAAACGGTGACGGAATGAAATGGGCAGTCAGGGGATCGAACCCTGGACACCCGGATTAAGAGTCCGGTGCTCTGCCAGCTGAGCTAACTGCCCATGTCTTAACAACATAAAATATACTACCAGTTGACCATCGTTTTGGCAAGCCCCTTTTTAAAAAAGATCGGGGACCCGGGAAAGTGGGCCCCACCGCCAATTGAGGATGGCCATTTTTATACAAAAAACCGCCACCCAAGCGGTGACGGAATGAAATGGGCAGTCAGGGGATCGAACCCTGGACACCCGGATTAAGAGTCCGGTGCTCTGCCAGCTGAGCTAACTGCCCATGTCATGTCTAACACAAAGTTATTAACTATATCAGATGTGGTCTAATTTGGCAAGACCTTTTTGTGAAAAAGTTGGAGGGCCGGGATCCACCCACCCGGTGTGGTATAATTAAGTTTACGATCAATTAACGAAGAATGAAAAAAGATGGATGCGGAGGGACCGACATGGCCAAGAAAGTTTTGGTTGTTGACGATGAAAAACCGATTTCGGATATCATTAAGTTTAACCTAGAAAAGGAGGGCTATGAAGTCGTCGTGGCTTACGACGGGGAAGAGGCCCTGCAAAAGGTCGAAAGCGAGTCACCGGATCTTATCGTCTTAGACCTGATGCTGCCCAAAATTGACGGCCTGGAAGTGGCTAAGCAGGTGCGGGCTAAGCGTTCGACGCCAATCATCATGGTAACGGCTAAGGATTCGGAACTCGATAAGGTTTTGGGCCTTGAGTTGGGAGCCGACGATTACGTTACCAAGCCGTTTTCTAACCGTGAGCTAGTGGCCCGGGTTAAGGCTAACCTGCGCCGCCAAGACGCCACCGTTTCACCGGCGAACGACGACCGGACCGCCGATATCAAGGTGGGGGATTTGACCATCCACCCGGACGCCTACACGGTCACCAAGCGGGGCGAAAACATCAACCTGACCCACCGGGAGTTCGAGCTCTTGCACTACCTCGCCCAACACATTGGCCAGGTCATCAACCGGGAGCACCTCTTGCAAACGGTGTGGGGCTACGATTACTTTGGTGACGTCCGGACCGTTGACGTAACGGTGCGCCGGTTGCGTGAAAAAATTGAAGATAACCCGAGTCACCCCCAGTGGCTGATCACGCGGCGGGGGGTCGGTTACTACCTAGCCAACCCGAATCAGGATTAAGGGCCTGGATCGTGAACAGCAAAATCAAATTCTACCAGTCGATCCACTTTAAAATCGCCCTTGTCTTTGCGCTGATGCTGATGCTGACGCTCGAAGTGGTGGGGGCGGTTTTTGTGCGTCAACTGGAACACCAAGAACTCGCCAACTTCAAGCAACAAATTGAGTTGCCGTCTTACATCGACAATTCCTTGGCCACCCAACTGACCAGCACCGATACCAAAACGGCCAACAAGGAAATTAAAACGATCCTCGCCCGGGTCAACAACACCAGTATCACCGAGATCCGGGTGGTCGATGCCAAGGGGATCATTCGCGGGACCAGTAGTTTGGGCAACCAGGGGATCGTCGGGCAAAAGACCACCGACACGGTAATTAAAAACACCCTGGTCAACAACCGCTCCCACACCGAAAACCTCTACGACAGCGCCAACCACAACCGCTACTACGTCAGTGTCGTGCCGCTGTTAGCCAGTGGCAACGCCAATAACGTGGTCGGGGTCGTTTACATGCGGGCCAACCTCGAGGGGGTCTATTCGACGATCAACTCGATCTCCTTGATCTACCTGTCGGCGGCTTTGATCACGATTGTCCTGGGGCTGGGGTTAGCGGTCCTAATTTCCCGGGAAATTACCCGGCCGATTGAAGAAATGCGCAAGCAGACCCTACGGATTGCCCGTGGGGACTTCTCCGGGCAGGTTAAGGTGATGGGCAACGACGAACTAGGCCAACTGGCCGGGGCAGTCAACAACCTCTCGGTGCGGGTGGAGGAGTCCCAAGAGTCCTCGGATGCCGAACGGCGCCGGTTGGATTCAGTCCTCTCCCACATGTCTGACGGGGTGTTGGCCACCGACCGCCGGGGTAACCTGACGATCGTTAATAACACCGCCCTCCAGTTTTTAAACATCGCTGACGAAGAGCAGGTGCTCGGCAAGTCGATTTTGGACGTTTTAAAGATTCGGCGCCAATTCTCGATTCGCCACCTAGTCGACGAAGACCAAGACCAGATTATCTTGGATGATTTAAACGAGGACCTAATTTTATCGGCCTACTTCTCGCCGATTAAGCGGGAATCGGGCTTTGTCTCGGGTCTAGTTTGCGTCTT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51 | Streptococcus_phage(17.39%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
89373 : 155484
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP017973|89373:155484|DBSCAN-SWA AATGTTAGACATCAAGCAAATTCGCCAACAACCGGACTGGTTCAAAGAAAAGCTGGCCACCCGGGGCGTTCAACCAGAAGAAATCGACGCCGTGCTGGAACTGGACGCCAAGCGGCGCGAACTCCTGCAACAAACCGAAACCCTGAAGGCCAAGCGTAACGAAGCCTCCAAGAAGATCGGGGAAGCTAAGCGGGCCAAGCAATCCGCTGACGAAGCAATTGCCGAGATGCGCCAAGTCGGCGAAGACATCAAGGCCTTAGACGAACAGGTGGAAGCAAACGACAAGGACCTCTTTGACAAGTTAGCCCACCTGCCGAACGTCCCTCACGAAGGGGTGCCGGTTAGCCTGACCGAAGATGGGGCCGAAGAACTGCGTAAAGTTGGGCAAGCCCGCCAATTTGACTTTGAACCAAAGCACCACTGGGAAATCGGCGAAAACCTCGGGATTTTGGACTTTGAACGGGCCGGTAAGGTTTCCGGCTCCCGCTTCGTCTACTACGTCGGCCTCGGGGCTCAATTAGAACGGGCGCTGTACAACTTCATGCTCGATGAACACATGAAGGAAGGCTACACCGAAGTCTTGCCGCCGTACATCGTCAACGCTCACGCGATGTACGGGACCGGTCAATTCCCGAAGTTCAAGCAGGACGTTTACCAAGTGAACGGCGAAGACATGACCCTGATCCCGACCGCCGAAGTTCCGTTGACCAACTACTTTGCCGGCGAAGTGATCCCCGCAGAAAAGCTGCCGGTTTACGTGACGGCCTTGACGCCTAGCTTCCGTTCCGAAGCTGGGTCAGCTGGTCGCGATACCCGCGGGTTGATCCGGATGCACCAATTCAACAAGGTCGAAATGGTTAAGTACACCAAGCAAGATCAATCCTGGGAAGAACTCGACAAGATGACGGCCAACGCCGAAAACATCCTCCAAAAGCTCGGCCTGCCGTACCACGTCATCACCCTGACGACTTCGGACATGAGCTTCACGGCCTCCGAAACCCACGACCTGGAACTGTGGATGCCGGCCCAAAACAAGTACCGGGAAGTTTCCTCTTGCTCCAACTGCTTGGACTTCCAAGCCCGGCGCCTGCACATGCAATACCGGGACGAAAACGGTAAGCTCCAATACGTGCACACCCTGAACGGTTCTGGTTTAGCCGTTGGGCGGACGTTGGCGGCCATCTTAGAAAACTACCAAAACGAAGACGGCTCCGTGACGATTCCAGAAGTGCTGGTACCGTACTTCCACGGCATCACCAAGATCACCAAGGAAAACGCCGTGCCGTTTAACAACAAGTAAAAAGAGAGTGGCAAACAACCGCAGGCCTGCTGGTTGTTTACAAAAAAGCGGGAACGTAACCATCAGGAAACGTCCCCGCTTTGGCTTTTAAAAGGGTAGCTAGTTGACCGCCCCGATCGCCGTGCCATAATGACAATATAAAAAGGAGGCTGTGAAGGGCCTCCCGAGTAGCGCCGTCAAAAACGGTGGCATGCAATTTGGTTAAATAACCGCTAGCTTTGCCGGGCTAAGGCGGTTATTTTTTAGATTAATTCGACCATTTTACTTGCCTTTTGGGCGAATAGTTGATAAGATCATATCCGTCCTTAAATGACCCGTTGGTCAAGTGGTTAAGACACCACCCTTTCACGGTGGTATCATGGGTTCGAATCCCGTACGGGTCACTTTTCAAAGCCATTCGCAGTTTGCGGGTGGTTTTTTTCGTACTGTGAACTACTCGGCCATAAATGACCGAGCTTCTGGGAACACGAAGTAGTATTTAGGATGTTGCTTCTGTATTCAGAATACCTAACTTACAGAACTCCGTTCTTTTACCACGGCTAGTCCCTAGCCAACGGCTTTTAATCCTCTATGGAGTATATTAACTGCCGCATTAATATCTCGATCGTGATGAGTACCACATTTAGGACAAGTCCATTCTCTAATTTCAAGTGGTTTCTTCCCACTATGGTAACCACACGTGCTACAGATCTGACTGGTGTAATTAGGATTAACAGTAATTAACTGTTTACCGTACCAATCACACTTGTATTCCAGCATGGTTCTAAATTGGTACCAACTGGCATTCGCAATAGCTTTAGCTAAATGGTGATTCTTTTGTAGATTCTTGGCTTTCAAATCTTCAATGACAATCACATCGTATTTTTTAACTAAGGCTGTTGTTAGTTTGTGTAAGTAATCTTGACGTTGGTTCGCTATCCGTTGTTGGTAGCGAGCCTTTTGTTTTTGAGCCCGTTGCCAATTCTGATAATCATTGAGATCCATTTTTACGTCTTTATGATTATGGTTCCATTGGCGAACAGCTACGGTTGCTTGATATTTTCGGCGACTATACTTGCTTTGCCACTTTGTGGCTTGCTTTTCCAACCACTTAGCATTGAAAGTACCAAACTTTTCACCGTCAGAACTAATCGCTAAGTCAGCGATCCCAACATCCAGGCCAACGGTCTTGCCTGTTTTTGGCAATGCTTCTGGAGCAACAGTCTCGACCTGCAAAGATAAGTAGTAGCGACCAGTTGGACCATAGCTGACGGTATAACGCTTAATTTTGCCATTTACAGCTTGAGAGGTCTTACTAGTTCGAATACTTCCTAACTTAGGTAGCTTCATTCTTCTCTTGGCAATCACTGTGCAGACCGACCGACCAGTATATGACTGTTCGGCGGCGTGCCTGCTTTTAAAGCGTGGATAGCCACCACGATGTTTAAGGGAGTGTAAAATATTTTGTGTAAATTGATACCTTGAGGGTATTGAAAAAGGGAAAGCCTTCCACGTATGATTGAAATCGCTAAAAACCAATCAGAATACGGAGGCTTTCCCCATGAACCAGTTTAACAAAGATATTATCGCAGCGCTATCTTCCGACAAAGATATTACCCTGAATGAAGTCTTACGTCGTCAAATTGAAGTGGCCGCTAATCAGTTCCTTCAAAATGAACTGACTGCGGTGCTAGGCTACGAACCACATACTCGGATCGACCAATCAAAAGACGACGTGAACTACCGGAACGGGACGTACACCCGCACGATCGACACTGAGTACGGTGAAATTAATCTGACGATCCCACGGGACCGGTTAAACAAGTTTCAAAACGCCCTCTTCCCTCCTTACGTGCGTCGGACTGATGGACTGGAGGAAATGGTCATCAAGATGTACTCCAAGGGCGTCACAACTCGTGAAATCGCTGATATGGTTGAGAGAATGTACGGCCACTACTACTCACCAACTACGGTTTCAAACATCACTAAGCGGACGGATCACCTGGTTGAAGAGTTCCACGAGCGCAGATTCAAGTACTCACAGTACGTCTGTGTGTTCCTCGATGCTACTTACATTCCGTTACGCCGTGGTACCGTTGAACGAGAAGCCGTTAACGTAGCGATCGGAATTCGAAGTGACGGCGGTAAGGAAGTTCTTGACTACCGTATCGCACCGACCGAGAACGGAGCCGCTTGGTCTGAACTACTCCAGGGATTACGCGCACGGGGGATTAAAGATATTCAGTTGTTCATCGCCGACGGTTTAGTTGGACTTCAATCTGCGATTGAGGCTAACTACCCGCAGGCGAAGTTTCAACGGTGCTGGGTCCACGCAGAGCGCAACCTTTTAGGGTACGTTCGCAAAAACGATCGCAGGGAGATTATCACCGACTTTAAGGCTATTCGGCAAGCAGAGAACCTACAAGCCGCCAAAAAACGATTGGCGGCTTTCAGTGCTAAGTGGGAGCCCAGTTATAAGCGTCGAATCAAGAATCTAGTCCAAATGGAGGAGCTATTCACGTTCTTCAGTTTTCCAACTGCGATCCGTCAGACCATCTACTTGACGAACCTAATTGAGTCGTTCAATAAGAGCCTGAAGAAGATGGTCCGACGTAAAGAGCAGTTCCCAAACGAAGGGGCCCTCGATCGCTTTATCATGACGCAAGTGATGGAGTACAACGATAAATTTGAGAATCGAGCACATCGGGGATTCAAGGACTGTCAGGACACGCTTGATTCGATGTTTTAGAATTGCCAATTCATGCGGGCGAAGTTTCCTTTTTTACACAACATCCTTGACACTCTCCCAAACCAGATCGTATTAGCCTTTGCGCCTGCCGTTGGTTTTGTGAACAGACTTATTCTTTCACACCAGCGTGGTAGAGTTGATCTGTTGCTCATCGTGGTTATTGTGTAAAGGTAGATCACAATGCTCAAAGATCTGGTAAACCCGGTCCTTTAGATTAAGGGCATTGTTAATCACATTGCGTAATAATTTTAACGGTGATTTCTTGATTGTTTCCTCGATTAACTAGTCGGCTTTGTTTTTCTAGGGCGTTAGCTTTTCACAACCGGGGTTTTAAAAAGATCATTCAAGGCTTCAGACATGGTTGGATGAGTATAGATCGTGTCGCGTAATCTTTCGTAAGGTAATTTGGCCTTCATTGCCAATGCAATTAGGTTGATGGTTTCATGGGCCTCAGCGGCATATAATGTTGCCCCTAAAATAAGGTGTGTTTTTTGATCAACGATTGCCTTATAAAGTCCGCGTTGATCCTCCAAGACACGGGCCTTTGGAATCGCCTTGACTGATAGCTTGAAGGTTTGTAAATCATAACCGGCACTCTTAGCTTGACGTTCATTTAAGCCAACGCTAGCCAGTGGTGGATTTAGGAACGAAGCAGTCGGTATCACCGTTCGATCGGCTGTTGAGCGATCTCCCTTACCAAACAATTGATCTACAATAATACGAAAATCATCCAATGAGATATAAGTGAACATAGGACCGCCATTAACGTCGCCCAAAGCCCAAACGTTTTGTACGGTGGTCTTTAAATGATCATCAACCTGAATAGCGCCACGACTGGTTAAAGCAATATCGGTATTTTCTAGTCCTAAACTATTTATATTAGGCCGTCGACCGACGGCAACCAATACCGCATCAAATTCCGCAGTGTTACTTTGATCACCTTGTTGATAATATAATGTAACCTTCTCACCA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54 | unidentified_phage(19.23%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
342908 : 351380
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP017973|342908:351380|DBSCAN-SWA CTTAAATTACGCAAGATTCACATTGGTTGGCGCCGACTTCTTCGTTATCATCCGTGAATGTCCGGATGTAGTAAATCGACTTAATGCCCTTTTGGTGGGCGTAGTGACGTAAGATGTTGAGGTCGCGGGTGGTCATCTTTTCCGTCCGCCCGTCCTTCCATTCATACATGCCGGCTGGAATGGTCGAGCGCATGAACAGGGTCATCGACAGGGACTGGTCGACGTGTTCTTGGGCGGCGGCGTAGGTATCAATGACGCTACGCATGTCCGTGTCGTAAGCGGAGCGGTAGTACGGCATCGTGTCGTTGGATAGGTATGGGGCCGGGTAGTAGACCTTACCAATCATCTTTTCTTGCCGTTCTTCGATCCGGTTGATGATGGGGTGTAGGCTAGACGTGGAGTCTCCAATGTAAGAGGTCGAGCCGTTCGGTGCCACGGCGAGGCGGTAGGCATTGTAGAGACCGGATTCTTGAATCCGTTGTTTGAGTTCCTGCCAGTCGTCTGGGGTTGGAATAAAGAAGCCGGCAAAGAGTTCCTTAACGGCGGCGGACTTTGGTCCCCAGTCCTTAGTCAGGTACTTGTCAAAGTAGGAACCGTCAGCGTAGGCAGACCGTTCGAAGTTGGCAAAGGTTTCACCCTTTTCCTGGGCGATTTCGTTAGAAGCCACTAGGGTCCAGTAGTTTAAAAGCATGAAGTAAACGCTGGTGAACTCAAGGGCAACCGGAGAACCGTACATGATGTGGTGCTTAGCTAAGAAGCCGTGTAGCCCCATCGCTCCTAACCCAACCGAGTGGGAAAGGTCGTTGCCGTGCTTGATGGATGGGACTACGGTTAAGCTTTCAGCATCGGAAATGTGGGTCAGACCACGCATCATCGCCCGAACGGAGCGTCCGAGGTCTGGTGTTTCCATCAGGTTAGCGATGTTTGTGGAACCGAGGTTACAAGAAACGTCGGTGCCGAGGGTTTCGTAGGTTTGGTCATCGTTGACCCGGGACGGAATCTGAACTTGGGCAATTTCGGAACAGAGGTTGGACATTACGATTGTTCCTTCGATTGGGTTGGCCTTGTTAACCGTATCGACGTTAACAATGTATGGGTAGCCAGATTCTTGTTGTAACTTGGAGATTTCGTCTTCCAACTCACGGGCGTTGACCTTCTTCTTGGTGATTTCAGGGTTAGCAACCAGGTTGTCGTATTCCTTGGTGATGTCAACGTAAGAGAAAGGCTTACCGTAGATTCGTTCCACGTCGTACGGGGAGAAGAGGTACATTGGGGCGTCTTCTTCCACTAACTGGTAGAACTTGTCCGGCACCGTTACCCCCAGGGAAAGGGTCTTTAAGCGAACCTTTTCGTCGGCGTTTTCCTTTTTGGCCCCCAAAAAGTCAATGATATCGGGGTGGAAGACGGAGAGGTAAACAACCCCCGCTCCTTGGCGCTGCCCCAGTTGGTTGGAGTATGAAAAAGCGTCTTCTAAGAGCTTCATGACCGGGACAACCCCGGAAGCGGCCCCCTTGATCTTCTTGATTGGGGCGCCGGCTTCGCGGAGGTTATTTAAGTTGATGCCGACCCCGCCACCGATCTTGGATAGTTGCAAAGCGGAGTTGATCGTCCGCCCGATCGTGTTCATGTCATCGGTAGCTTGGATTTCAAAGCAGGAAACGAATTCCCCACGCCGCTTGCGACCAACGTTTAAGAAGGTTGGCGTGGCCGGTTGGTAGCGTTGGTGGATTAACTCATCAGCCAGGTCCATGGCCAGTTGTTCGTCCCCGTTGGCTAGGTACAAGGCGTTCATAGCCACCCGGTCGATGTAGTTTTCCAGGTAGTATTCCTTGTCGTTGGTCCGCATGGCGTATTGGGCGTAAAATTTGTAGGCGGCCATAAAGGAGTGGAAGTGGAAGTCTTGTTCCTTTAAGTATTGGTAGAGTCGATCTAAAAAGGCGGGCGTATATTGGCGAATAAAGTCTTCTTCGAGGTAGTCGTTTTCGATTAACCAGTTTAGCCGTTCCATTACGGAGGAGAACTTCTTGGTGTTTGGTTCCACGTTTTCCTTAATAAAGTCGTCTAGGGCTTCTTGATCGAGGTTCAACTGGATTTGACCATCCTTGGGGATGTTGATCTCGTTGTTTAGGTCGAAGTACTTCACCTTGGTCATATCAATTTCTGAAAGAGCCATTGATCACGTTCCTACTTTCTTTTATACCTGAGTTAATAACAATAAAAAGGGCGGGCACCTAGAACAGGTGTCGCCGCCCGTAAAATTTTTGCAGCGCCCTTAGGCCAAGGCTGAAAGGCGATCCGGTCGAAAACCGGTGAAGGCGTTACCGTCGGGAAGTTTAACGACGGGGGTTGCCAAAAAGCCTTCTGCCTTTAAGTTTTCGATGAATTCAGGTTGTTCATCGATGTTGTGTTCAATGAACGCTACATTGTGTTCCTCTAAGAAACGCTTGGTCATTTTACATTGAATGCAATTATTCTTGGAAAAAACGGTTACCATGAGCATTTCCTCCCTTACCAATATTTGATGTTTTCTAGTATAGCCGATCAATCATAAAAAGGCCACCATATCTCGTGCTGGTCGAAAACGATAACACAAGATATGGTGGTTGATGGGACGTGGTTAGGACCGAATCAAAAAAAGTTGAAAAATTTTTAGCCGATGATTGAACAGTCATATCGACAGATTTGAAAGTAACTAAAATTATATTGTACACTGAAGAGCGATAAAAAACTAGCTAAAAGGGGGGCAAAGAATGGAAGAAAAAATAACGGAGCGTGGTTATATGAAGGAGGCCTTCAAGGAGGCTAACCAAGCGGCCTTGCTAGGCGAAGTTCCAATTGGGGCGGTCGTCGTTTATAAGGGGAAAATTATCGGACGAGGACACAACATGCGGGAAAAATTCCAAGATGCCACCTACCACGCCGAAGTATTAGCAATCATGGAGGCCTGCCAAGCGTTGGGTTCGTGGCGACTAGAAGAATGTGATCTTTACGTCACCCTTGAACCGTGCATCATGTGTTCTGGGGCGATCATCAATTCACGGATTAAACGAGTCTTTTTTGCGGCCCCGGATGAAAAGGCGGGGGCGGTATCCTCCCTTTACCACCTATTAGAAGATACCCGCTTGAACCACCAAGTTGAAGTTCACCAGGGTCTAATGCAAGAAGAAGCCAGTCAAATGCTCAAGGAGTTCTTTCGGGCGATCCGTAAGCGGCAAAAGACGGCGAAGAAAAAACGGCGCCAGGAAGAAAATGCGGCTCAAAAGGCTGGTCAGTGACCGAAAAATAGTGTATAATCATTTTTGCCGTTAGGCCTTAGGGCAAGGGCGTCCTTACGAACCGTGTCAGGCCTGGAAGGGAGCAGCACTAAGTTTGCGATTCCTTGTGCCCTAAGTTTGAATGAAATTAACCAGGAGGCTGGGAGAAACATTGTTTTCTCCCAGCCTCTTTGAATTTTGAGATATCTCTTTTGGTAGATGATTAAAAGCTAGTATAATGGATAAAGATATCTTCAAAAGCAGGGAGGAACAGAGATGAGTTATCAGGCGCTCTACCGGGTTTGGCGACCCCAGCGGTTTAGTGACCTCGTTGGTCAGCAGATCGTTTCGACCACCTTAAAAAACGCCATCATCACCAAAAAAATTAGTCACGCCTACCTCTTTGCCGGTCCACGGGGAACGGGGAAGACATCGGCGGCGAAAATTTTTGCCAAGGCGGTAAACTGCCACCACCAAACGGATGGGGAACCCTGCAACGAGTGCGAATTCTGCCAAGCAATCACGGCGGGGCAACTAAATGACGTAATTGAAATCGACGCCGCTTCCAATAACGGGGTTGAGCAGATCCGTGACATTAGAGATAAGGTCAAGTACGCCCCTACTCAGGCTGACTATAAGGTTTATATCATTGACGAAGTCCACATGTTATCGACCGGGGCCTTCAACGCCCTCTTGAAAACCTTGGAGGAACCGCCAGCCAACGTGATCTTTATTTTGGCTACTACGGAACCGCACAAGATCCCGCTGACGATCATTTCCCGGGTTCAGCGCTTTGATTTTAGACGAATTAGCGCAAAGGACGCCTTTGAGCGGATGAAATACATCCTGGATCAAAAAAAGGTCGCCTACCAAGAGGACGCCCTATGGGTGATTGCCAACGCCGCTGAGGGGGGGATGCGGGACGCCTTAAGTATTCTCGACCAGGCACTGTCCCTTGGCGATGAGCAGGTGACCATTGATGACGCCTTATTGGTGACCGGGAGTGTGACCAAGCAGCTGGTGCAGGAATATTTCCTGCAAGTAGCCAAGGGTGATAGCGCCCCGGCCTTAGAGACCCTTACTAAGATCACCGGGGCGGGCAAGGACGGTCAGCGTTTCATTGAGGACCTGATCTCCTTTATTCGCGACGTCCTCTTGTACCAGGAATCACCAAGTTTGATTGACCTGCCGGCGACGGGCCTGCGTAAGGAAGATTTTGATCAACTGAGCGGCGCCGCAAGTTCGACGGCTCTGTATCAAATGATTGATACCCTAAACGATATCCAACAGGAGATGCGCTTTACGACGCACCCGGACGTCTACCTAGAAGTGTTAACCGTCCGGTTGTGCCAGATTAGAGGGGACGAAAGAACCCAGCCAGGTGCTGACCAAGCGGAACTTACGCAGCTTCGCCAGGCGGTAGCTGCCTTACAACAAGAGGTTAATCAGCTACGCCAAACCCCACCAGCAGAGGTGAAAACACCGGCGCCAAGGCCGAGCCGGTCGACTAGCAATAAACAGGCGTTGCGGATTAACTTAGCCCAGGTTAACTTGATCTTGACCAACGCAACCCGGCCTGAGTTAGAGAATTTACAGGGCCTGTGGGGAGACATGCTTTCCTTATTAGATAACGCTCAGAGCTCGTTGATCAATAATTCTGAGCCGGTGGCTGCCAGTCCGGCGGGGGTCGTGGTATCCTTTGATAATAACTTCCTCTTTGAACAGGCCAACGGGGGCAACCTAGGTAACGCAATGGGGGCGGCCCTACAACAGTTGACCGGTAGCGAACGCCAAGTGGTCTTCGTGCCTAAGGACAAGTGGCCCCAAATGCGCCAAGACTTCTTAGTGGAAAATGGTTACTTAAAAAAGGGAACCGCTAAAAAGGAGGCCCCCAAGGCAACTGATCCGGTAGTCAGTCAGGCCGAAAAGTTGTTTGGCCCGGACGCAATTGAAGTAAAAAACGATTAACAATAAAGGATGGTAATGAATTATGATGCGCGGAATGAACATGCAAAAGATGATGAAGCAAGCCCAAAAAATGCAAAAGCAAATGATGGCCGAACAAGAAGAATTAGCGGCCATGGAATTTGTTGGCCAAGCGCCGGACGAAATGGTAACGGCGACTTTAACCGGGGACAAGAAGCTCAAGGATTTGAAGATTAACCCAGAGGCGGTGGACCCAGATGACGTGGATATGTTAAGCGACTTAATCGTAGCGGCGGTTAACGATGGCTTAGACAAGGTTGAACAGGCCACCCAAGCTAAGATGGGTAAGTATACCCGCGGGTTAGGAATGTAAGGTTTAGGTGAGCAAATGCAGTACCCAGAACCGATTGCCCGTTTAATCGATAGCTACATGAAGCTGCCGGGAATCGGGGAGAAATCTGCCACCCGGCTCGCCTTTTACACCTTGGGCATGTCCGATGCGGACGTGGATAACTTTGCCAAGTCGTTAAGGGCCGTTAAGCGCGACTTGCACTACTGTAGCGTGTGCGGGAACATTACCGAAGACGACCCGTGTCCCATTTGTAAGGATAAGACCCGTGACCAAAGCCGGGTCTTGGTGGTAGAACGGTCCAGAGACATTATGGCCATGGAACGGATGAAGGAATACCACGGCCTTTACCACGTCTTACACGGGACGATATCGCCAAGCGAAGGGACGGGCCCCCAAGACATTAACTTGGAGAGCCTCTTAAAGCGCCTTGAAGCGCATAAGGAAATCCAAGAGGTGATCGTGGCCACCAACGCTTCTTTAGACGGGGAAACCACCGCCCAGTACTTGGCCCACTTGATTAAGCCGGCCGGGATCAAAGTAACCCGCTTAGCCCATGGTTTATCAGCGGGGGCGGACATTGATTACACTGATGAAGTGACCCTCTTCCGGGCGGTTCAAGGGCGAACGGAGATGTAAGATGTTTTTCAAACGACCACAACATCAAGTTGAACAGGAAGGTAACCAACGCTTGTTAAACTTGATTTACCAAACCAAGGCCAGCTGGGATCACGCAAAGGAAACGGAGCAAGCCGTTTACGAAAGCCATGTTAATAACGAGCTCAAGGAGCGAACTAAGCTGCAAGAGCGCAAGTACTTATACTTGTACGAACGGGCACGTAAGCGAGGCTTGCACGGTAAGACCAACGCTGGTGTAATTATGCAATAAGATAGGGGCGCACCAAGAGATGAGCGGACGATTTATTAGTTTTGAGGGGCCAGACGGGGCCGGGAAGACAAGTGTCTTAACCGCGATCCGGACGGGCCTAGTTAACCAGTTGGGTGATCAAGTTGTCTATACCCGTGAACCCGGGGGAAACCCAATCGCCGAACAAGTACGGGCGGTCTTGTTAGATAAGCAAAACGGGGCGATGGATGACTGGACGGAGGCCTTATTATACGCGGCTTCCCGGCGCCAACACGTGGTTGAAACCCTTAAACCGGCACTTGAAGCGGGGAAGCTAATTTTGTGCGACCGCTACTTGGATAGTTCAATTGCCTACCAGGGTGGGGGACGTGAGTTAGGGATCGACCAAATCTGGGAGTTAAACCAGTACGCCATTGACGGTCTCTTGCCGGACCTAACCATTTTTTTGGACCTCCCCGTGGAAACCGGGTTAGCCCGGATTGAAAAGGGACGGGCGGAGACAATTAACCGCTTGGATGAGCAGACCACCAACTTCCACCGGCGGGTCCGTCAGGCCTACTTAACCCTGGCCGAGCGCTTCCCAGAACGAATTGTGAAGGTAAACGCCGATCAGGAATTTGCGCGGGTAATTGAAGATGTACAAAGCGCAATTCACGCACGTTACGCAGACCTATTTACCAACTAAGGAGGAACCGTCATGAAGATGATTATGGCCATTGTGCAACCAAAAGACAGCAACCGCCTTCGCGACGCCTTTAACGACGCCAAGATTGGTGCCACTAAACTTTCGAGTACCGGGGGTTTTTTGCGGGAAGGGAACACGACCTTTTTGATTGGGGTCGCCGACGATCGTGTTGACGATGTCTTAGAGATCATCAAGAAAAACGCCGAGTCCCGGGAGCAATACATGACGCCGCCTACCCAAATGGATAACGGGGCGGGCGCCATGCCAATTAACGTGCAAGTCGGGGGCGCGACCGTCTTCGTCTTACCGGTTGAGCAGTTCTTACACTTCTAGGACGGAGGGAAGAGAACATGGAGCGTGAGCTAACCGCCACCGCACTACAACCTGAAATCACGGCGCGCTTTGCCAGCCTAATTGAGCGGGGGGCGCTGGCTCACGCCTACCTCCTAGTGGGCAACGTCAACATGGGAACGGTCGCGTTAGCAACGGAGGTCGCACTACGCTTGTTTTGCCCCCATCAAGACGACCAGGGGCATCCCGATCGGACGTGCCCAGAGTGCCAGCGGATCCTTTCGGGGAACCACCCGGACGTGGTGGTCGCCCGTCCCGAGGGGCGTCAGATTAAGGTTGATCAGGTCCGCTATCTAAAGGCTGAATTTTCCAAAACCGGGGTTGAAGGGGAGAAAAAGGTGTTCATCATCGAGGGGGCTGAAACCTTAACCGGCTCGGCTGCTAACTCCTTATTGAAATTTATCGAAGAACCCGGACCGGGGGTCTATATCTTTTTGTTAACTCCTAACAAAAATGCCGTTTTGCAGACGGTTCAATCCCGGTGCCAAGTAATCGAATTACGCCCCCTGCCAAGCGAAATGGTTAAAGAGCAACTGCAAGAGGCGGGGGTACCAGAATACCTGGGCCCCCTGGCCGCGGGGCTGGGACTAAGCGCCAAGCAGGGGGCCTCTTTGATGGAAGACGACTGGCTCCCCACCAGCGTGAAACTAGTTTTCGACTGGTTTAAGGAGGTAGCTAGTGGCGATCCGCTCAGCTTTGTGGACGTCCAAACTGGTTTTTTAAAGCAGGGTAGCGACCGGGCAAAGCAACTAGTCTTGTTGGACCTAGTGACGATGGTTTGGCGCGACGCCCTCTTGTTAAAGAACCGGGTGACCGAACCAGAGCGGCTTCACTTTCGTCAGTGGCAAGCAGAAGTGGCCCAACTGATCATGCCAAGTTCGGCCCAGCAAGTTCTCGTGGCCAGTGAACTAACCTTAGAGGGGCGCCACTTGCTTGATCAAAACATAAGCTTTCAAAACGTGGTGGAGCAATTAACGCTCCGCCTCCTCTTGGTGATGAAGGGTGACTTTAGTGAGGAAAGGGGCAGCAACCGTGAGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP017973|342908:351380|342908_345080_-|WP_096493424.1|DBSCAN-SWA MALSEIDMTKVKYFDLNNEINIPKDGQIQLNLDQEALDDFIKENVEPNTKKFSSVMERLNWLIENDYLEEDFIRQYTPAFLDRLYQYLKEQDFHFHSFMAAYKFYAQYAMRTNDKEYYLENYIDRVAMNALYLANGDEQLAMDLADELIHQRYQPATPTFLNVGRKRRGEFVSCFEIQATDDMNTIGRTINSALQLSKIGGGVGINLNNLREAGAPIKKIKGAASGVVPVMKLLEDAFSYSNQLGQRQGAGVVYLSVFHPDIIDFLGAKKENADEKVRLKTLSLGVTVPDKFYQLVEEDAPMYLFSPYDVERIYGKPFSYVDITKEYDNLVANPEITKKKVNARELEDEISKLQQESGYPYIVNVDTVNKANPIEGTIVMSNLCSEIAQVQIPSRVNDDQTYETLGTDVSCNLGSTNIANLMETPDLGRSVRAMMRGLTHISDAESLTVVPSIKHGNDLSHSVGLGAMGLHGFLAKHHIMYGSPVALEFTSVYFMLLNYWTLVASNEIAQEKGETFANFERSAYADGSYFDKYLTKDWGPKSAAVKELFAGFFIPTPDDWQELKQRIQESGLYNAYRLAVAPNGSTSYIGDSTSSLHPIINRIEERQEKMIGKVYYPAPYLSNDTMPYYRSAYDTDMRSVIDTYAAAQEHVDQSLSMTLFMRSTIPAGMYEWKDGRTEKMTTRDLNILRHYAHQKGIKSIYYIRTFTDDNEEVGANQCESCVI >NZ_AP017973|342908:351380|350339_351380_+|WP_021815680.1|DBSCAN-SWA MERELTATALQPEITARFASLIERGALAHAYLLVGNVNMGTVALATEVALRLFCPHQDDQGHPDRTCPECQRILSGNHPDVVVARPEGRQIKVDQVRYLKAEFSKTGVEGEKKVFIIEGAETLTGSAANSLLKFIEEPGPGVYIFLLTPNKNAVLQTVQSRCQVIELRPLPSEMVKEQLQEAGVPEYLGPLAAGLGLSAKQGASLMEDDWLPTSVKLVFDWFKEVASGDPLSFVDVQTGFLKQGSDRAKQLVLLDLVTMVWRDALLLKNRVTEPERLHFRQWQAEVAQLIMPSSAQQVLVASELTLEGRHLLDQNISFQNVVEQLTLRLLLVMKGDFSEERGSNRE >NZ_AP017973|342908:351380|345657_346182_+|WP_004562759.1|DBSCAN-SWA MEEKITERGYMKEAFKEANQAALLGEVPIGAVVVYKGKIIGRGHNMREKFQDATYHAEVLAIMEACQALGSWRLEECDLYVTLEPCIMCSGAIINSRIKRVFFAAPDEKAGAVSSLYHLLEDTRLNHQVEVHQGLMQEEASQMLKEFFRAIRKRQKTAKKKRRQEENAAQKAGQ >NZ_AP017973|342908:351380|348151_348460_+|WP_004562761.1|DBSCAN-SWA MMRGMNMQKMMKQAQKMQKQMMAEQEELAAMEFVGQAPDEMVTATLTGDKKLKDLKINPEAVDPDDVDMLSDLIVAAVNDGLDKVEQATQAKMGKYTRGLGM >NZ_AP017973|342908:351380|350001_350322_+|WP_021815679.1|DBSCAN-SWA MKMIMAIVQPKDSNRLRDAFNDAKIGATKLSSTGGFLREGNTTFLIGVADDRVDDVLEIIKKNAESREQYMTPPTQMDNGAGAMPINVQVGGATVFVLPVEQFLHF >NZ_AP017973|342908:351380|349076_349325_+|WP_004562763.1|DBSCAN-SWA MFFKRPQHQVEQEGNQRLLNLIYQTKASWDHAKETEQAVYESHVNNELKERTKLQERKYLYLYERARKRGLHGKTNAGVIMQ >NZ_AP017973|342908:351380|345179_345401_-|WP_004563324.1|DBSCAN-SWA MVTVFSKNNCIQCKMTKRFLEEHNVAFIEHNIDEQPEFIENLKAEGFLATPVVKLPDGNAFTGFRPDRLSALA >NZ_AP017973|342908:351380|346437_348129_+|WP_096493426.1|DBSCAN-SWA MSYQALYRVWRPQRFSDLVGQQIVSTTLKNAIITKKISHAYLFAGPRGTGKTSAAKIFAKAVNCHHQTDGEPCNECEFCQAITAGQLNDVIEIDAASNNGVEQIRDIRDKVKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRVQRFDFRRISAKDAFERMKYILDQKKVAYQEDALWVIANAAEGGMRDALSILDQALSLGDEQVTIDDALLVTGSVTKQLVQEYFLQVAKGDSAPALETLTKITGAGKDGQRFIEDLISFIRDVLLYQESPSLIDLPATGLRKEDFDQLSGAASSTALYQMIDTLNDIQQEMRFTTHPDVYLEVLTVRLCQIRGDERTQPGADQAELTQLRQAVAALQQEVNQLRQTPPAEVKTPAPRPSRSTSNKQALRINLAQVNLILTNATRPELENLQGLWGDMLSLLDNAQSSLINNSEPVAASPAGVVVSFDNNFLFEQANGGNLGNAMGAALQQLTGSERQVVFVPKDKWPQMRQDFLVENGYLKKGTAKKEAPKATDPVVSQAEKLFGPDAIEVKND >NZ_AP017973|342908:351380|349344_349989_+|WP_096493428.1|DBSCAN-SWA MSGRFISFEGPDGAGKTSVLTAIRTGLVNQLGDQVVYTREPGGNPIAEQVRAVLLDKQNGAMDDWTEALLYAASRRQHVVETLKPALEAGKLILCDRYLDSSIAYQGGGRELGIDQIWELNQYAIDGLLPDLTIFLDLPVETGLARIEKGRAETINRLDEQTTNFHRRVRQAYLTLAERFPERIVKVNADQEFARVIEDVQSAIHARYADLFTN >NZ_AP017973|342908:351380|348475_349075_+|WP_004562762.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIARLIDSYMKLPGIGEKSATRLAFYTLGMSDADVDNFAKSLRAVKRDLHYCSVCGNITEDDPCPICKDKTRDQSRVLVVERSRDIMAMERMKEYHGLYHVLHGTISPSEGTGPQDINLESLLKRLEAHKEIQEVIVATNASLDGETTAQYLAHLIKPAGIKVTRLAHGLSAGADIDYTDEVTLFRAVQGRTEM |
10 | Enterococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
409556 : 477975
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP017973|409556:477975|DBSCAN-SWA TCTACTTACGTCCTTTAGGGCGTTTTTTTATTTCATTGTACTTTTGATTATTGATATATTGCTCAACGACCTCCTTGCTCATATTCCCTAAAGTACTCATGTAATAGCTAGGGGACCAGAGGTGGCCACCCCAATACTGCGACTGGCGGATTTCCGGGTGTCGCTTGAGGAAGATGAAGGCACTGCGTCCTTTGAGGGCTTTGATAGCGCTAGTTGGTGCTTTACTAGGTGGAAAACTAATCAACACATGGACGTGGTCAGGCATTACTTCCATGTGCTCAATCACGATTTCGTTATCTGCCGCAACCGTTGTAAGGATTTCTTTCATTTCATTCACTAACGCTTCACTAGTAAAAGTTGGATTACGATACTTGGTTACCCAAATCAAATGGTAGTGAAAGTTATAAATATAACGCCGTGTATAAATGGCATCTTCGATTTTGTCCTTCGACATGATTGCCACGCTCCTTAATTATTATTGTCATTGACATGTGGTATAATAACACTATATCAGTGAAGAAGGTGAAAACAAATGAAGTCAATGGCGCAGATGAAATATCATTACGGACTCAAGGTGCGGATTTATCCAAGCGACAGGCAAAAGAAAATTATCAAGATCAATAGTGATGCTAGTCGATTCATCTATAACGAAATGGTCGCTATTAACAAGGAACTTTGGCGGCTAAAACAGGTTAAACTCCCGATTGATACCATTCAGAACCGGATTGAGCAACTGGAGCTTCGCCAAAGCGCTAAACAAATGTCTAATCATTTCCAGTTCTTAGAAGATAAAAGGATCGATAGCTTGACTAAAGCCAATGCCATTCAAAACTACCATAAAGCTTGGAATGCTTTTCGCAAAGTTCATACCGCAGGTGTGCCTAGGTTTCACCGGAAAAGTTACGTTTGGCGTTATCAAACTAACTGCCAGTATTTGAAACAGAAGGCAGCATACTTAACTAACGGAACTGTACATTTTGAAGATAGTAAGCATGTTATAGTGCCTAAATTAGGTCGGCTCCGTGTTAAAGGTTCCCATCAACGAGTCTTAGCTCGCAGTGCTGAAACCCGTATTGGAACGGTAACCATCGTAAAGGACGCTAGCGGTCGTTTCTTTCTCTCAATGCAGTTAGCGTCGGATACTCCCTTTGTTAATTGGCCGCAAAATACAGGCAAGCAGATTGGGATTGATCTTAATACTGAAAACTTCTTAACTACTAGTAATGGCGATACTGTGGCTAATCCACGCTATTACCGCATAATTAAGGGTCGCTTAGCCAAAGCACAGCGCATCTTATCGCGACGGGCTCGTCGGGCCAAACAAGAACATCGGCCATTACGGACTAGTAAGAACTACCAAAAGCAACGCTTGTTGGTGGCTAAATTACACGCCCAAGTCTTTGAACGTCGACGTGACTTTCTCCACAATGTCTCGACTACACTAATCAAGAACCACGATTTCGTAGCCGCAGAGGAATTGCGGAGTAAAAATATGCTGAAGAATCATGCTTTAGCGATGAGTATTGCGGACGTAGGTTGGCGGACTTTCTTAGGAATGTTGGCTTATAAAGCAGAACTCTACCATCGCCAATTCCTTACGGTGGATCCTAAGAACACTACGCAGGCTTGCCATGAATGTGGTTTTGTGATGGGCACAGCAGGGACCGAAAAACTCACACTTGCAGACCGAGAATGGACATGCCCAAAGTGCCATGCTCACCACGTTCGTGACCATAACGCTGCGCAGAATATTCTAACTAAAGGAATTATTAAATTAGCCTAATTTGGCTCGTCCCTATGGCAACCTGGGGACGCTAAAGGCATTGGTAATTGCCGTGTAAGACGAAACGGTTCGTAGAACTGTTCGCAGTGGTGTATCTATGCAAATTGTGATTCAAACACTCATCAGAAGGGTGCTTGCTCACAAGCCACTGACTTTAGTCAGTGGTGGTTGACTCAATCAAAAAGAGGCTGAGGAAATCTGCTTTCCCAGCCTCTTATTTTATTCCTGAATGTTAGAAAGAAAACGTGGAAAATAACCGCAGGTCTAGTGCCTAAGCAGGCCGAAGAACGGTGCGTACCGCATCAACCGTTCGTCCGATCTTACATACGACCTGCCAAGGAGGTGATTTCCCACTCCATTGATTACTTAACGCGAGTGATCCAGCCGTGGGTATCTTCTAAGTCACCTTCTTGGATCCCGTAAAGGGCGTTGTAAAGCTTGGTCGTAACCGGTCCGACTTCTTTTTCGGAGTAGAAGACGTGCTTTTGGCCCTTGTAAGTTAAGGAGCCCACCGGTGAAATCACGGCGGCGGTCCCCATTGCGCCGGCTTCAGCAAAGTCATCGAGTTCCTTGTCAATTTCGATCTTACGTTCAACCGGGTTGAGGCCCAGGTCGTCAGCGAGAACTAGGAGCGACTTCTTGGTGATGGATGGCAGGATCGAGTCGGACTTTGGCGTTACGAACTGACCATCCTTAGTGATACCAAAGAAGTTGGCGCCAGAGAATTCATCGATGTACTTGTGTTCGCGTGGGTCGAGGTAGAGGCAGTCGGCAAAGCCAGCCTTCTTGGCCTCAATTTCTGGCAGGAGCGAGCTAGCGTAGTTCCCGGACGTCTTGGCTTGACCAGTTCCGGCACCGGCCGCCCGGTCGTAGTTGGAAACCGTGTACGGGGAAGGAGCGAGGCCGTTGATGTAGGCACCAACCGGGGTGGCGTAAATGTGGAAGGTGTAGGTGTCGGCCGGGGCAACCCCCACGATGGGTTGGGTCCCAATCAAAAATGGCCGGATGTAGAGGGAACCGCCCGTCCCGTACGGTGGGACAAATTCCTCGTTGGCGAGAACAACTTGCTTAACGGCCTCGACGAACTTGTCTTCCGGGTAGGGTTCCATCAGCATTCGCTTGGCAGAGTTAGCGAGCCGCTTGGCGTTTTCTTCGGGGCGGAATAAGTTAATGTGTCCATCCTTGGTCCGGTAGGCCTTGAGCCCTTCAAAAACTTCCTGGCCGTAGTGGAGTACTTCGGCGGCTTCCGAGAGGGTTAAAGTGGAGCTTTCGGTCAGCGTACCACCTTGCCATTGGCCATCCTTAAACTCTTCGTTGAAGCTGTACGGCAGGTCGTGGTATTCAAAGCCCAGGTGGTTCCAATCCAGGTTAGCGACGGTTTCTTTTGCCATAAATATGTTCCTCCTCAATGAACGGTTAGTCTTCTTGGTCAGCGGCTTCCAGCGACTCGGCAAACTTTTGCTTGATGAAGTCAGCGGAAACTTGAAGCTTTTGCAACTCTTCTGCGGTCAGGTCTAATTGGCACTGTTCGACGATTCCATCGCGCCCGACCACGGCCGGGTAGGAAAGGTAGACGCCGTATTCCTCGCGGTAGTTTGAAACCGGCAGTTCGGTTAGGGCGTTAGAGAGAATCGTGTTAACCAGGCGAACGGCGGCCGTGGCCACCCCGTAGCTGGTGTACTTCTTGCCCCGAAAGACAATGAAGCCACCTTCGCGGGCCGCCTTATCCAGGTCCACCAGGTCCAAGCCCTTTTGGTTGGCGATTTGCTCGATTGGCTTCCCCAAGACCCGGACGGTTGACCAAGCGGTGAACTGAGAGTTACCGTGTTCACCAAGGTTGTAGCCGGCCACGGAGCGGGGGTCGAGGTTGAGCTTCTTGGCAACGGCGCGCTTCATCCTGGCGGAGTCCAAAAGCGTCCCGGTTCCGATCACGTGGTTCTTTGGCAAGTCGGTAATTTCTTGGTATAAGGAGGTGATCACGTCGACCGGGTTAGTGATGGCGACGATGATCCCGTTGAAGCCAACTTCCTTAAGCTTTGTGGCGACCTTTTTGACCTGAACCCGGGTGTAGGGGAGTTCGGCAAAGCGGTCATCGTCGGGGTTATCTTGGAGCTTAATGTTACCAAGGGCGGAAACCACCACGTCAGCGTCGGCTAGGGCCTCGTAGTCGTTGACGAAGATATTAGTGTGATATTCCAGGTTAGCCATCGCATCTTCAAAGTCGACGGCATCGGCCACCACCTTTTCTTCGCGCGGATCAATTAGGACGAGGTCGTCGGTAAACCCGCCGGCGACTAAGTAGTGGGCGACGGTTGCACCAACGTTCCCCATCCCAACAACAGCAACTTTTCGTGCCATTTGAACATCTCCTTTACACTGTTGCCTAATTTTCTAATTATTTTTTAATATAGCGCGTTGAAAAGGAAAGTGCAACGATTATTTTAGCGAAGTGATGGTAAAATGTTTGGAAAAGGGGGACTTACCATGACCAATTACCTCGTTTCTGACCTTGATCACACCCTATTAAACGAACGGGGCGCCCTGAGTCCGGTCACCCAAGCGGCGGTTGCGGCCGTAGCCGATCGAGTGATGCTGGCGTCGGCCCGCCACCCCGGGCAGATGACGGTTTTGATTGACCAACTGGGCTTGACGGGTCCCCAGGCGGCCTTAAACGGCGCCCTGATTTTTGCGGGGGCCGGTGGGGAGACTTTGAGGGCGCAGCCAATCGATGACCGGGATGCCCAAGCGGTGGTGGAGTTGGTAGCCGAACGCTTCGGGGAGGTTAACTTCACCTGGATGGACGCGGCGGCTTGGCACGTTAGCTTTGTTGACGCGGCCGTCGAGTTCGATCAACGCCTAGTTCCCGTTCCCCTAGCAATGGATGGTTTAAAACCGGCCGGCGCCCTGATGTTATTGATGATCGTCAGCGACCCGGGGATGTTTCAAACGTTGGGGCAGTTGTTGAAAAGCGCCTTTCCTAAGCTGACGATCAGTCCGGCTGGTGACGGGTACCTAACGATCACGGCGCCGGGGGTTGATAAGGGACGGGCTGTTGACTACCTTGTTAGTACCGGAATTTCCCGGGCAAAGGTGGTGGCCGTTGGCGATGACGAAAACGACTTACCCTTATTAAACCGGGCCGGGCACGCCGCCGCGGTTGGCAATGCCGCTTCAGTGGTTAAACAACGGGCGCAGGTCCTGTTGCCAACTAATGAAG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56 | Streptococcus_phage(43.48%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
483058 : 542832
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP017973|483058:542832|DBSCAN-SWA 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58 | Lactobacillus_phage(25.0%) | transposase,tRNA,head,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
655119 : 720426
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_AP017973|655119:720426|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(15.79%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
740545 : 792340
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP017973|740545:792340|DBSCAN-SWA 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42 | Faecalibacterium_phage(14.29%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
805093 : 866025
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP017973|805093:866025|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(26.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
917392 : 925663
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_AP017973|917392:925663|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_AP017973|917392:925663|917392_918595_+|WP_096493896.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKIETLPAEFEPARPILSRIEEVGFEAYFVGGCVRDTILNLPIHDIDIATSAYPAEIKQIFSRTVDTGIEHGTVMILDHGTGYETTTFRTESGYQDFRRPDSVTFVRSLKEDLQRRDFTINALALKEDGTVVDLFDGLGDLKRHLIKAVGDPAERFHEDALRMMRAARFAAKLGFQIEPGTLAGMSQNAALLEKIAVERIQVEFEKLLLGKAAQNGLATMLDTKLYLHCPGLKEGGQGLQYLAQQPLTLNNATQAWGTLAICLGLDKNQLRPFLKGWKLSNGLITAVSRAVPLVEKLTTKAAGASDLYQAGQQAVADAVVIANSLGGQVDPQVVQAAYQALPIKESGELALNGGDLIKAGFKPGPAMGKALTTLTKQVVEGQLANDYQTLLKAAGELLKA >NZ_AP017973|917392:925663|918607_920494_+|WP_003683172.1|DBSCAN-SWA MQTLRADNLTSRYGEKVLFEDVSFLINEGDRIGLIGTNGSGKTSLLNVIAGQTGADAGQITKPGDYTIGYLMQQPSFDPDLSITDAVFAGSQRVFQTIRSYEAALTEYTNHPEDAAAADRFAKLQASMDQEDAWDADSRIKTILTQLKITDMDQKMGELSGGQVKRVGLAQVLIQEPDLLMLDEPTNHLDLASIVWLQEYLASYKGAVLVVTHDRYFLDQVTNHIWELAYGVMHHYDGNYQAFVEKKAERLELSQASERKKQNLYRKELAWMRHGAKARSTKQKGRINRFNELKDSLGQVETDEDIAIDLGSQRLGKDVIELKGANLSLGEHHILQDFNLLVQGGDRIGITGENGAGKTSLLNVIAGRVPLASGVLKIGETVNLGYYTQQTEGVDDDKRVISYLTEIADNVVDKYGQRVDVTKLLERFLFPRFMHGTLIRKLSGGEKRRLYLLKILMQQPNVLLLDEPTNDLDIGTLTVLEDYLDDFSGTVITVSHDRYFLDRVADDLLIFKGQGQIERYTGRFTDYLANQVQTTVPAKKAPVEKKPVAKQAEKKEKTKLTYAEQLEWEKINEQIDQLASQQEEIETAMAANGDNYEKLAKLQAQLNQVTKELDDKTARWEYLSDYVD >NZ_AP017973|917392:925663|920559_921519_+|WP_096493898.1|DBSCAN-SWA MTVNHNEEQYLDLARHVLEFGDQKGDRTGTGTKSVFGYQMRFNLQEGFPILTTKKVAFGLVKSELLWFLRGDTNIRFLLEHKNHIWDEWAFKKWVESDEYTGPDMTDFGRRSLVDAAFNEEYKNEKRAFCQRILEDDDFAKQYGNLGLVYGSQWRSWQTPNGPVDQIKKVIEQIKTNPASRRLIVTAWNPADVDNMALPPCHTMFQFYVNNGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTHMIAHQCGLEVGEFVHTLGDAHIYLNHLDQIKEQLSRPVHQAPQLILPAEAKPIDEYQMEDIKLEGYEHEEAIKAPVAV >NZ_AP017973|917392:925663|925036_925663_+|WP_096493902.1|DBSCAN-SWA MHIEFPKLKRDEPTLGEGVQVNKTTFGQWVELGDRTLADNCTIGDYTYTGQNCYLQNSDLKRFISIAAQVRIGPTNHPYNRASQHVFAYNGTTFGFDQPDVEFLDNRKQVRTTIGNDVWIGHGAIIQAGLTVGDGAVIGSGAVVTHDVEPYTIVGGVSAKKIKDRFPDEIKADLEKIAWWDWSREQLEANYLDFRLPIEEFVQKHLHA >NZ_AP017973|917392:925663|921530_922034_+|WP_021816051.1|DBSCAN-SWA MVKIAFIWAEDEAGWIGKDNDMPWHLSADLKHFKHLTSGHPVIMGKNTYLSLGRPLPKRTNIVVTRQTTPIEGVTLVNGVNALTDLLANYGEDEEAFIIGGAHLFASTMSLATVLYRTVVEGDHHGDVKMAPIDYRTWQKVAERHLQATESDPACTFEKWVLNVKQN >NZ_AP017973|917392:925663|923788_924967_-|WP_096493900.1|DBSCAN-SWA MYQVKTIDKFELSDFAHDLLQISDTDAPNALLVRSSQVDDALINDQLLAITRAGIGTNTINVTACTENGTVVLNTPGANANAVKELIIQALFRCVRPIDRAIETVKDLTAEPGADLQVLAEATRKEFIGRELYGKTIGILGLGAIGQRVAEASYHLGMQVLGYNRSPKNLPHVVQLPTIEEVMSLADFVVVMLPLTEETTGLINRERLQQLKPDAYLLNFGRGEIVNNQDLLEALANGELAGYVSDFPASDLQNQPGVTLLPHIGGNTEEALTFSTDMALQNLLNFLENGSVRTSVNFPRVDLPFDTPHRITLFYKDRANLCLDFVQLLTDQGLTVKEMTSNAKNGYSYALINTDLSVLSQAEIANLRQLLQDHGDIIRFRFLTNPSMNPEL >NZ_AP017973|917392:925663|922811_923654_+|WP_021816053.1|DBSCAN-SWA MAKIKIVADSSAGLTEAEIKEHDITIIPLSVMIDGTVYVERETITNDQFSDMMEKASSLPKTSQPPIGKFTEAFDRLGEDGAEVLCVCMMESISGTVHAAEQAASLTKTPVRVIDCQTTDRAMAFQILEAAKVIEAGGTMDEAVAKMKEVFDHHKLYLAIDNLDNLVAGGRISRFAGTISSLLNIKVMLEVAGGQIHIAMKGRGIKAIHKEWDKILDQMANGPKVKGIGISHVKADKEVARLKGKLNELFPGIEVTVRETVPVIATHTGLGACCLIYYTE >NZ_AP017973|917392:925663|922013_922643_-|WP_021816052.1|DBSCAN-SWA MHRQQPNLLIEIGNAVTHGLGVGLSIVGMIALIITAVNAHSPLKLVAFIIYGTVLVLFYLASTLFHSLIFTRARHVFQVFDHSMIYLLIAGSYTPYCLVAIRGWLGISLLTVIWLMAIGGVIYKALWLNKKSLWSTVIYVIMGWMCLFAIIPLYHALGPVGFGLLLAGGITFTLGAVLYSFPTQYTHLIWHLFVLGGTILMYFSILLYV |
8 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
988496 : 1069647
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_AP017973|988496:1069647|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 1001202:1001225|attR 1005917:1005940 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1204153 : 1263200
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_AP017973|1204153:1263200|DBSCAN-SWA 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49 | Bacillus_phage(28.57%) | transposase,tRNA,integrase | attL 1256939:1256997|attR 1269222:1269280 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1313005 : 1321794
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_AP017973|1313005:1321794|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_AP017973|1313005:1321794|1317903_1318320_+|WP_148664340.1|DBSCAN-SWA MSRGILRKPSIKKSLAAKYKGAYTRKLKKSLIPGYGTKTAGWLHPKRKLYNKIYYRTSIDTRKVIADALTKKNERSTSSTSANVSQGKTSSGEKWILWGTTIICAIIGLSIDGFLGFILLAVIAYFTTKFALKKHKAR >NZ_AP017973|1313005:1321794|1316472_1316835_+|WP_096494293.1|DBSCAN-SWA MKTTKLVSGIIIIVLGVIIFFQSMLAGVGNALDNSNSHSGSAGVFVAILYIVIGIVYLATRKSPKMGGDIAGLVIAIIAWMLGAFNVGIYKDLQVWAWLILIIGVMFFIWHFITNRKNNN >NZ_AP017973|1313005:1321794|1319953_1321141_+|WP_070955490.1|transposase|DBSCAN-SWA MNQFNKDIIAALSSDKDITLNEVLRRQIEVAANQFLQNELTAVLGYEPHTRIDRSKDDVNYRNGAYTRTIDTEYGEINLTIPRDRLNKFQNALFPPYVRRTDGLEEMVIKMYSKGVTTREIADMVERMYGHYYSPTTVSNITKRTEHLVEEFHERRFKYSQYVCVFLDATYIPLRRGTVEREAVNVAIGIRSDGGKEVLDYRIAPTENGAAWSELLQGLRARGIKDIQLFIADGLVGLQSAIEANYPQAKFQRCWVHAERNLLGYVRKNDRREIITDFKAIRQAENLQAAKERLAAFSAKWESSYKRRIKNLVQMEELFTFFSFPTAIRQTIYSTNLIESFNKSLKKMVRRKEQFPNEGALDRFIMTQVMEYNDKFENRAHRGFKDCHDTLDSMF >NZ_AP017973|1313005:1321794|1318417_1318762_+|WP_096494938.1|DBSCAN-SWA MKGLGAKLSALREERHWSKTYVAKQLKMNLPTYANYEYGNREPDLETTSKLAELFGVSVDFLLGRPAKEKTASDEPLTENQKLVAYSIDPDISDEERQDIIELVKIAMKNRRRI >NZ_AP017973|1313005:1321794|1315264_1315561_-|WP_096494289.1|DBSCAN-SWA MKLNLKRIKAERIANGLTQADVAEALKITRSSYALRENGHTNWTIDNLTSFCKLIGLGPDEIGIFSWIIRSENRTKLGRRNKYGKPSSQASKRSGCYG >NZ_AP017973|1313005:1321794|1315723_1316341_+|WP_096494291.1|DBSCAN-SWA MKSNEEVIRHLNELRKQQKISISELARKVDMSKSTVSQYFNGKLQFPLNRAHDFARVLGVTTDDLLGLDLSKVNPVNRLTKIPLLGTIACGDPILADENISGYLLEPTDFLPSGKLFYLRAKGQSMEPTIKDESLVLIRQQPDVEDGEIAAVLFTDDNEATLKRIKRAGPTVILIPDNREYEPIIASNNNPVRILGKAVRVTTNL >NZ_AP017973|1313005:1321794|1316859_1317435_+|WP_096494295.1|DBSCAN-SWA MKKLTSFAIVCGLSLLGASTTLTQTTYAKATQTTLGAGAYKVGTDIKPGRYTITAQNGSGNVTGSNDLNIILGDTTDDDLSQVDSYTMNLKKGAKVKIDGIESTDFTPVTKRAYQTELKAGQWVVGKDIKPGRYTIKATSGSGNLTSNEGINEILGTESDSDLGQVTQTTQTLHRGEVLNSDLEGIQLIKK >NZ_AP017973|1313005:1321794|1319051_1319786_+|WP_096494299.1|DBSCAN-SWA MINNKYKNIIYIGYEITIATLSVASIFMIVLDYAKSIDITAYPYNVFDNLILTIFTIDYFGRLIASKNKRKFITDNIWDLLSIIPVNQVFYFFRAARIFRIFRLLKLLRLVRLVGLTGRLRKFINTNGLIYYIYISIAVLIIGASMYSISEKVDFATALWWSITTATTVGYGDISPTTPIGKLAAVMVMIIGIGFIGMLTSSISNFFISNDEVNLKEKLAKLHNENAQLNDKLDRLEQIIKKKN >NZ_AP017973|1313005:1321794|1321248_1321794_+|WP_096494301.1|DBSCAN-SWA MKKIGLICVAALMGMALTACGNSSAQKSTKISNSSSSTKSVQKHKAAKKNKQEKNKQGSISSTSSSSSQSQTAPQQNEQSSTQATQTAAQQNEQSSTQATQTSTTKSQGEINRERGYDPNGAPLLPGQDHAAGSNPDGTPDAWVQGQIDWEKQNGYLNSDGTETDKGRAADQEVEQNEQDW >NZ_AP017973|1313005:1321794|1318773_1319055_+|WP_096494297.1|DBSCAN-SWA MTDLEKLEDQYPELRFWSIDVPNPHFHGLIKGTDVYINANDDNLTQLMTALHEVFHHEIGCGDLSDIHRVEVIKEEGQAIRFATRLVKDFIQP >NZ_AP017973|1313005:1321794|1313005_1313512_-|WP_096494287.1|DBSCAN-SWA MATKEEHAKPVKGEQQNVDNVIDHVKRLPRDEQHQVMQKLEMFSGPIPAPHILEQYDKMDPGAAKQIIDNGVEESHHRRQMESKMLEMSRKKNIRRDWMGFVIGIVAIFVGAFLIYKDHYVVGTIFSGISILGLVGQFLGEAPTDSSEKGTDNQSEKGTDNQSEEKDE >NZ_AP017973|1313005:1321794|1313501_1313735_-|WP_021816827.1|DBSCAN-SWA MKFFDAIFIVTNMVTDNISKGTQTFFEGVSKLVTKNVSANFYRQANESDKEKIAGDFKRIGNDMYVALDKYEAKHGY |
12 | Lactobacillus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1429630 : 1499533
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_AP017973|1429630:1499533|DBSCAN-SWA TATGAGCTATAAACATCTTACTATAAAAGAACGTGAAATACTTATGTTTTTACGAGCTAAGGGGTTATCTATCCGGGCTGTTGCGTTACGGCTGGGGCGAAATCCAAGCACTATTTCACGGGAGTTAAAACGTTGTACCGGTAATTATTCCCCAAGCAAAGCAGATAATGACTATCATCAAAAGCGGCAGAATTGTCACAAGAAGCGGCTATTAGACAGCCATCCACAATTACGCCGTCAAATTGTTCATTACATCTTAGATCTGCACTGGTCACCAGAGCAGATTGCCGCTCGCTTTAATAAGGAACATCAATGGTGTGTTAGCTATAACACAATTTACCGTCATATCTATCAACACAATTTAGGCGAGAAGTACTCCTCACGTGGTGATACCGGTATTCAGCGCCATCTCAGACATAAACATCGGACCCGGCATTCAAAGAATACTAGACGACATCGAGAAGTACAGACCGACTATATCTCGATCCATGAGCGCCCTGGTTTTATCAACCAGCGTCAACGTATAGGTGACTGGGAAATTGATACTGTGATTGGTCGAACGGGTCACTCCATCCTTTTAACGGTTGTCGATCGGCTTAGTCGGCTTACGCTTATCAAAAAGATTGTGCAAAAGGACTCGCAGGAGATAAATAAAGGCTTAGTTGAACTGTTAGGGGCCATTCCTAAAGAATTTGTTCATTCTATTACACCAGATCATGGGACCGAATTTCTTCATCTTGATGAAATCAGCGAAAGGTTGGGTGTTACTGTCTATTGGCCCGATCCATATTCGCCTGAACAGCGTGGAACAAATGAGAATACAAATGGATTAATCCGGGAATATTTTCCCAAGCGAACAGATATTGATAATTATACAGAACAGGACGTTGAACACTGCCAAAAGCAGTTAAATCAACGTCCTCGCAAAGTGTTAAACTATGAAACCCCATATGAAGTATTTTTTGACAAACCGTTGCACTTAGTTTGACAATTCGCCGGACACAAAAAAAGACGCCCCGAAGGACGCCTTGGAACTGAATATTACACGAGATGCTTAAAGGCAATAAGCCATGGAATGCCTCCGGTGGGGGTCGAACCCACACTCCCAAACGGGAACTGGATTTTGAGTCCAGCGCGTCTGCCAATTCCGCCACAGAGGCAAGATAACAAAGGTGGTAACCGGATTCGAACCGGTGATGAAGGTTTTGCAGACCTGTGCCTTACCACTTGGCTATACCACCATTGAGCATCTACTATTCAATTCATACAATTAGACGGGCATTACCCCGTCTAATCAGAAGGGCGGTATGTGGGATTCGAACCCACGCATGTCGGACCCACAAACCGATGTGTTAACCAAACTTCACCAATACCGCCAAAATATTCAGTTGAGCAGGGATAGTAGGAATCGAACCCACAATGACGGTTTTGGAGACCGTAGTTATACCGTTTAACTATATCCCTATAATAAAGTGGAGGAGAGTGGATTCGAACCACCGAACCAAGAGGAACGGTTTTACAGACCGTCGCGTTTAACCAGACTTCGCTACTCCTCCATCAATGGCGCAGGACGGAATCGAACCGCCGACACATGGAGCTTCAATCCATTGCTCTACCAACTGAGCTACTGAGCCATCGTGGTGTAGGTTTGCAACCAAATGGTTGCGATGGAGGATACAGGGCTCGAACCTGTGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGACGCTCTCCCAACTGAGCTAATCCTCCAAAAAGTGACCCGTACGGGATTCGAACCCATGATACCACCGTGAAAGGGTGGTGTCTTAACCACTTGACCAACGGGTCATAAACGGAGAGTAAGGGATTCGAACCCTTGATACAGGCTTTAACCCGTATACAGCATTTCCAATGCTGCTCCTTCGGCCAGCTCGGACAACTCTCCAATTCGCGTGGCAACGTCCTATCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTTTTGGCGTGCTGAAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTATCCTTCAGGCCATCATCACCACACTTTGAAAGCTTGTGCTTTCAAAACTAAACAATATCTTTTCTTATCAAGAATCCTCACACCTGACTTGGTTAAGTCCTCGACCGATTAGTAATGGTCCGCTCCATGCGTCACCGCACTTCCACTTCCATCCTATCTACCACATCATCTCTGTGGGGTCTTACTTCCAAAGGAATGGGAAATCTCATCTTGAGGCGAGTTTCACACTTAGATGCTTTCAGCGTTTATCTCATCCATACATAGCTACCCAGCGATGCTCCTGGCGGAACAACTGGTACACCAGCGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGGTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCGCGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTACCGCTTTAATGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGGACCGACTACAGCCCCAGGATGCGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACCTCCCCGTCGATGTGGACTCTTGGGGGAGATAAGCCTGTTATCCCCAGGGTAGCTTTTATCCGTTGAGCGATGGCCCTTCCATGCGGAACCACCGGATCACTAAGCCCGACTTTCGTCCCTGCTCGACCTGTCTGTCTCGCAGTCAAGCTCGCTTGTGCCTTTACACTCTGCGAATGATTTCCAACCATTCTGAGCGAACCTTTGGGCGCCTCCGTTATCTTTTGGGAGGCGACCGCCCCAGTCAAACTGCCCACCTGACACTGTCTCCCACCACGATCAGTGGTGCGGGTTAGAGTGGTCATAATACAAGGGTAGTATCCCACCAATGCCTCCACCGAAACTAGCGTCCCGGCTTCTACGGCTCCTACCTATCCTGTACAAGTAGTACAAACACTCAATATCAAGCTACAGTAAAGCTCCATGGGGTCTTTCCGTCCTGTCGCGGGTAGCCTGCATCTTCACAGGCAATTCAATTTCACCGAGTCTCTCGTTGAGACAGTGCCCAGATCGTTACGCCTTTCGTGCGGGTCGGAACTTACCCGACAAGGAATTTCGCTACCTTAGGACCGTTATAGTTACGGCCGCCGTTTACTGGGGCTTCAATTCAGGGCTTCGCCGAAGCTAACTCTTCCTTTTAACCTTCCAGCACCGGGCAGGCGTCAGCCCCTATACTTCATCTTACGATTTTGCAGAAACCTGTGTTTTTGATAAACAGTCGCCTGGGCCTTTTCACTGCGGCTGGTCTTGCGACCAGCACCCCTTCTCCCGAAGTTACGGGGTCATTTTGCCGAGTTCCTTAACGAGAGTTCACTCGCTCACCTTAGGATTCTCTCCTCGACTACCTGTGTCGGTTTGCGGTACGGGCAGTTAAATGCTCACTAGAAGCTTTTCTCGGCAGTGTGACATCGGCAACTTCGCTACTTTAATTTCGCTCCCCATCACAGCTTGTCAACCCGGTTTAAAGCATTTGACTCTAAACCTGACTTACTGCTTGGCCAGACACTTCCAATCGTCTGGTTTGCTTAGCCTCCTGCGTCCCTCCATCATTCAAACGCATTTAACTGGTACAGGAATCTCAACCTGTTATCCATCGACTACGCCTCTCGGCCTCGCCTTAGGTCCCGACTTACCCTGGGAGGACGAGCCTTCCCCAGGAAACCTTAGTCATTCGGTGGACAGGATTCTCACCTGTCTTTCGCTACTCATACCGGCATTCTCACTTCTAAGCGCTCCACTAGTCCTCACGGTCTAACTTCGTCGCCCTTAGAACGCTCTCCTATCACGTGTCCAAAAGGACACATCCACAGTTTCGGTAATATGCTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGAATCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCTTTAAATGATGGCTGCTTCTGAGCCAACATCCTAGTTGTCTATGCAACTCCACATCCTTTTCCACTTAGCATATATTTAGGGACCTTAACTGGTGATCTGGGCTGTTCCCCTTTCGACGGTGGATCTTATCACTCATCGTCTGACTCCCGGACATAAATCATTGGCATTCGGAGTTTATCTGAAGTCGGTAACCCATGACGGGCCCCTCGTCCAAACAGTGCTCTACCTCCAAGATTCTCGATTCCGAGGCTCCCCCTAAAGAGATTTCGGAGAGAACCAGCTATCTCCAAGTTCGTTTGGAATTTCACCGCTACCCACACCTCATCCCAGCCTTTTTCAACAGACACGGGTTCGGGCCTCCAGTGCGTTTTACCGCACCTTCACCCTGGACATGGGTAGGTCACCTGGTTTCGGGTACATAACTACGTACTTCGTACGCCCATTTCAGACTCGCTTTCGCTGCGGCTCCGGTTTTTCCACCTTAACCTTGCACGTAATCATGACTCGCCGGTTCATTCTGCAAGAGGCACGCCGTCACCCATTAACGGGCTCCGACAGCTTGTAGGCACATGGTTTCAGGAACTATTTCACTCCCCTCCCGGGGTGCTTTTCACCTTTCCCTCACGGTACTGGTTCACTATCGGTCACTAGGGAGTATTTAGCCTTGCGAGATGGTCCTCGCGGATTCCGACGGGGTTTCACGTGTCCCGCCGTACTCAGGATCCTGAACGGAGAGAACCAGGTTTCGTCTACTGGACTATCACCATCTCTGGTGTGGCTTCCCAGCCACTTCGACTACCTGATTCTTTGGTAACTCCAAAGTTCAGTCCTACAACCCCACTGAGCAAGCTCAGTGGTTTGGGCTCTTCCCGTTTCGCTCGCCGCTACTCAGGGAATCGAATTTTCTTTCTCTTCCTACAGCTACTAAGATGTTTCAGTTCACTGCGTCTACCTCTTGGCAGCTATGAATTCACTGCTCAAGTAATCATCGACTAAGATGATTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCTCCGGATCAAAGCGTACTTACCGCTCCCCGAAGCATATCGGTGTTAGTCCCGTCCTTCATCGGCTCCTAGTACCAAGGCATTCA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46 | Streptococcus_phage(23.53%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1512451 : 1562976
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_AP017973|1512451:1562976|DBSCAN-SWA 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45 | Streptococcus_phage(15.0%) | holin,protease,tail,tRNA,head,transposase,integrase | attL 1553053:1553085|attR 1556685:1556717 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1619889 : 1745626
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_AP017973|1619889:1745626|DBSCAN-SWA 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105 | Lactobacillus_phage(16.67%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1752280 : 1825310
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_AP017973|1752280:1825310|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(23.81%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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