Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_AP018046 | Photobacterium damselae subsp. piscicida strain 91-197 chromosome 2 | 0 crisprs | RT,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 12 | 0 |
| NZ_AP018048 | Photobacterium damselae subsp. piscicida strain 91-197 plasmid p91-197-2 | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_AP018047 | Photobacterium damselae subsp. piscicida strain 91-197 plasmid p91-197-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
| NZ_AP018045 | Photobacterium damselae subsp. piscicida strain 91-197 chromosome 1 | 1 crisprs | RT,DEDDh,cas3,csa3,DinG,csx1 | 0 | 0 | 21 | 0 |
1. NZ_AP018046
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
3858 : 71811
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP018046|3858:71811|DBSCAN-SWA ATTAATGGTAAAATTCACGTTCTATAAACGTTCCAATAACCTTATCGTGCATCTCTTCGCTTTTCGAAAAACCAATGGTTTTTCTTACTAATCTTTTTAGTCGAGATCGTAATGTTAAATTTGTTCTTTCAATTCGTTGCGTGTATCGCTTACCTATGATGTGATTTTCTCTTGGTAAATAGCTTGAATACACCTTAAAATCATCTGTGCAATAAATAGGAATAGTAAACGGCAAAAGAAGACGTTGGAGTTTATGGAATGTTTCTGAGTCCCGTTTCCCAAATACATGAGCAATGACTCGCTTATATCTAGGTTCCCACGCATACCATAACCAGCGCTGATTCTTTTTTTTACCGACAAACGACCATTGCTCATCAACTTCACATATCAGTTCAATGTGGGCTATATCAAAGGGAATTGTTGTTACTTGCTTCGGTGTGAGTTTTTTAAAGTGCGTAGTACTGTATTATAGCCGACTTTCAAAACTCGACCCGTCTCTCTTACTCCTGAACTATTCATCGCCATATCAACAATCTTTTCCTTAACGCCAGGTTTACAAGCTTCATAAGCGTAATCAAGAAGAAATGTTCGATTGCAATCAAAGCAGCGATATCGCTGAGCTCTTCGTGGATTAGTCCCATATTTGCGGACTTGCTCCGCTTGATTACAAAAACGACATTTCACATCAATAGTAGCCATGAATAATCCATCCTTAAAAAGGATGATTATATACTAAATAAATCAATTGGGGTCACTACCGGGAAATGGGCAACCTGCTACGCTAATGCTTGGTCTGCTGCTCGCGATCAGTTCCTTGGTGAGAAATATTAAAGATTATTATCAAACATTAAGCTGATATAAAACAAAAGGCACCGCGGGGTGCCTTTTTTAAATCATTATCTAAAACGATAACATCAGATTATTTATTGTCGCGCTTGTATAGCTCAGAGAAAGAACGCTGATATGCTACTGCAATTTTATTGATGATTTTCTTAGTCATGGCGCTAAACCTAATGTATTCCTAGTATCGTTAATGATTTAAAAAAGTTTAAGGACTTACTTATCCTCTGGAAGTGCGGGCATTATATGGATTTTATAACGATAAAAAAGTGAGAAAAAATTCAAATAAAGATTAGAAAAACTAATATTACTATTTCTAATGAATGGCGATAAAAAATACTAATTTATTTCATGAAAATATTTTATGGTTTTGCTTTTTTCAGCCCTTAAATATTCGCTAAAGTTACCTTTGGTATGAGATGAATTGAAGTTACTGCGAAAGAATAGACAAAGCGCTTTGAGATATAAAACCGTATCCTTATAGTGGTTTAATTGCTCTTAACCAAATGAAATATAAAACGAAAAATTTGAAAAATAACGGAGTAAGTCACTTAATTATCATACGTTTATGTTTACACTGAAGACATGATGTCATATATGAGAGGGATCGATTATGTCAGTACAACCTCTAAGCAGTGACAAACTGTATCGAGAATCAGAGCTAAATGGATTAGCTAAAGAAATTAAATCAACCAAACAGTTAGCACCGATTGATGAGATCGTAGGGCAAGAGCGTGCTCAAAGAGCGGTTGAGTTCGCAATGTCGATCAATGAGAAAGGCTATAATATTTATGCGATTGGACGTAATGGCCTAGGCAAACGTACTATGGTGCTGCGTTATTTAAATCGTCATGATCCTAATGGCAATGGTCATACTTTATATGATTGGTGTTATGTCTCAAATTTTGATAACTCCCGCAGTCCGAAAGTACTAAAGCTTCCTGCTGGTAGTGGCTTACCTTTTAAAAAAGACATTGAGCAATTGATGAAGCGGCTTGTTAAATCATTACCGCTCGCTTTTGATAACGAAATGTACTATTCCCGTGCTGATAAGCTCAAGCAACAATTAGCAGAGAAACAGGGCGAAATTCTTCAAGCGATTTCAAGCCAAGCTCAAGCTAATAATATTAGTGTGACGGTAACCGCTCAAGGTGAATACCAAATGGTTGCGATGAATGGTGAGCAACCTCATACTGAAGAGAGCTTTCAAGCACTTTCTGAACAAGAGCAAAATCATTTTGAACAGGTAATTAATGCTTTAGAAGCTGAGTTGCGCGGTATGATCCGTCAATTTACTGAGTTTGAAGAAGCATTTAGTGACAAGCTGCAAAAATTAGATGAAGAAGTTGCTCAAGAAGTGGTTTCTCACGTATTAAAACCACTCAAAATCCAATATGGAAAGATTTCAGAAGCTAAACATTACTTAACCGCACTACAAAAAGATATTCTGGAAAATCTGGATATTTTCTTAGAAGACAATGAAGAGCAACTGGCTTTAGCGTATGCCTCTCTCGATAAAAAAATGCCAAGACGTTATCAAATTAACGTATTGGTTGCGCAAGATGAACATGCGTTTCCAATCGTGGTAGAAGAGAGCCCAACGTATCATAATCTGTTTGGCTATATTGAAAATGCCACTTTCAAAGGGACTGTTTTTACCGACTATTCATTAATTCGACCAGGCAGCTTACACCGAGCAAATGGTGGGGTGTTGTTAATGGATGCGGTGAAGGTGCTGGAGCGCCCTTATGTTTGGGATGGCTTGAAGCGAGCATTGCGTGCCCGTGAGCTGAACTTAAACTCCCTAGAGCGAGAAGTCACCTTATCTGGTGTTGTTTCTTTAGAGCCAGAAGCCATTCCTCTGGATGTAAAAATTATCTTATTTGGTGACTATCAAACTTATCAGTTGCTACAGCATTATGATCCTGAATTTGGTGAACTATTTAGAGTCACCGCCGATTTTGAAGATGATATGCCAAGAACAGAGCAGTCAGAAGATCAGTACGCCAAGTTTATCGCCAGTATTATTCAAGACAATAATATGCTCCATTGTGATCGAAAAGCGATTGCTCGTATTATTGAATACAGTTCACGTCGGGCTGATGATCAAAATAAGTTGTCATTGCATTCGGCTGATATTGCCAACTTACTGCGAGAAACTAATTACTGCGCGAAATCTTCCAATGCCAATATGATTCGCTCTCATCATGTAGAGCAAGCTTTAGCTAATCAGATTCAACGGGTCAGTCGTTTACAAGATATGGTCAAACAAGGATTTGTAAATGGTACAACTCTCATTGATGTAACAGGTGAGCGCATTGGTCAAGTAAACGCTCTTTCTGTACTGACAACAACGGATCATCAATTTGGCTCTGCCAGTCGAATTACGGCCACAACAGCGTATGGCTCTGGTGAGATTTTTGATATTGAACGAACGGTTGATCTTGGCGGTAGCATACATTCAAAAGGGGTTATGATTCTTTCTGCCTATCTTGCTTCTGTTTTCGGCAAAACCGCTCGAATTCCATTAAGTACTCATATTACCTTTGAGCAATCATATGGTGGTGTTGATGGTGACAGTGCTTCAATGGCAGAGCTGTGTGCGATTGTTTCGGCTTATTCACAACAGCCATTACGACAAGATGTTGCTATTACTGGCTCTATGAATCAGTTTGGTGAAGCGCAACCTATTGGCGGTGTTAATGAGAAAATCGAGGGCTTTTTTGATGTTTGTACCATCAAAGGCAGAACTTCTCAGCAAGGCGTTATTATTCCCCAGTCTAATGTACATAACCTGATGCTACGTAAAGACATTGTCGAAGCGGTCGAAAAAGGGGAGTTTCATATTTGGGCGATTAACCATGTAACTGAAGCCATTGAAATCTTAATGAAGATACCTGCGGGTATATGGCACGACAGCACTGGATATGATGCTAATACTCTTTATGGTATGGCTCAAATAAGATTGAATGCTTTAAAACGTTAGTAATACATAAGCGGCTATTTCGGTAGCCGCTTATATTTATTAGCTCATATTTATTTGTTTATATTTTCGGTGGTGACTCCAATTGATTTATTAATGGTAAAATTCACGTTCTATAAACGTTCCAATAACCTTATCGTGCATCTCTTCGCTTTTCGAAAAACCAATGGTTTTTCTTATTAATCTTTTTAGTCGAGATCGTAATGTTAAATTTGTTCTTTCAATTCGTTGCGTGTATCGCTTACCTATGATGTGATTTTCTCTTGGTAAATAGCTTGAATACACCTTAAAATCATCTGTGCAATAAATAGGAATAGTAAACGGCAAAAGAAGACGTTGGAGTTTATGGAATGTTTCTGAGTCCCGTTTCCCAAATACATGAGCAATGACTCGCTTATATCTAGGTTCCCACGCATACCATAACCAGCGCTGATTCTTTTTTTTACCGACAAACGACCATTGCTCATCAACTTCACATATCAGTTCAATGTGGGCTATATCAAAGGGAATTGTTGTTACTTGCTTCGGTGTGAGTTTTTTAAAGTGCGTAGTACTGTATTATAGCCGACTTTCAAAACTCGACCCGTCTCTCTTACTCCTGAACTATTCATCGCCATATCAACAATCTTTTCCTTAACGCCAGGTTTACAAGCTTCATAAGCGTAATCAAGAAGAAATGTTCGATTGCAATCAAAGCAGCGATATCGCTGAGCTCCTCGTGGATTAGTCCCATATTTGCGGACTTGCTCCGCTTGATTACAAAAACGACATTTCACATCAATAGTAGCCATGAATAATCCATCCTTAAAAAGGATGATTATATACTAAATAAATCAATTGGGGTCACTACCATATTTTCAATGCTATTACTGAGGAAAGCACACGCCTAATCCTCCTAATCCGCAATACCCATCTGGATTTTTAGCCAAATATTGTTGATGGTACTCTTCGGCAAAATAAAACGTTGATGCGGGTTCAATTTCTGTTGTGATGAGATGATCATCTCCCATCTTTGTGAGTGCCTGTTGATAACGATTACGGCTACTGATTGCCGCTAACTCTTGTTCTGATGAATGAGTATAAATCACCGAACGGTATTGAGGACCGATATCATTACCTTGGCGCATGCCTTGGGTTGGATTGTGTTTTTCCCAAAATAAAGATAAAAGTTGCTCTA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56 | Escherichia_phage(56.25%) | transposase,integrase | attL 31319:31378|attR 71775:72554 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
80082 : 133732
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP018046|80082:133732|DBSCAN-SWA ATTAATGGTAAAATTCACGTTCTATAAACGTTCCAATAACCTTATCGTGCATCTCTTCGCTTTTCGAAAAACCAATGGTTTTTCTTACTAATCTTTTTAGTCGAGATCGTAATGTTAAATTTGTTCTTTCAATTCGTTGCGTGTATCGCTTACCTATGATGTGATTTTCTCTTGGTAAATAGCTTGAATACACCTTAAAATCATCTGTGCAATAAATAGGAATAGTAAACGGCAAAAGAAGACGTTGGAGTTTATGGAATGTTTCTGAGTCCCGTTTCCCAAATACATGAGCAATGACTCGCTTATATCTAGGTTCCCACGCATACCATAACCAGCGCTGATTCTTTTTTTTACCGACAAACGACCATTGCTCATCAACTTCACATATCAGTTCAATGTGGGCTATATCAAAGGGAATTGTTGTTACTTGCTTCGGTGTGAGTTTTTTAAAGTGCGTAGTACTGTATTATAGCCGACTTTCAAAACTCGACCCGTCTCTCTTACTCCTGAACTATTCATCGCCATATCAACAATCTTTTCCTTAACGCCAGGTTTACAAGCTTCATAAGCGTAATCAAGAAGAAATGTTCGATTGCAATCAAAGCAGCGATATCGCTGAGCTCCTCGTGGATTAGTCCCATATTTGCGGACTTGCTCCGCTTGATTACAAAAACGACATTTCACATCAATAGTAGCCATGAATAATCCATCCTTAAAAAGGATGATTATATACTAAATAAATCAATTGGGGTCACTACCAGATTGGCCTATTCTGTGTAGTCCATACATTTGGTCGTCAACTTAATTGGAATGTCCATTTCCATCTATCAGTCACACGTGGAGGCGTAAATCTCAAAACTAAGCGATGGGGAAATATCTACTTTAATGCTGCGATGGTAGAGCAGCATTGGAAGCAGCAAGTGGTCTCGTTCTTACGAGACCACTATAATGCCTTGAATACTAAACATGATAACTATCAACATATTAGAGACTTTCGTGGATGGAGTCAGTTTCTCTCTAGTCAATACAGTCGAAAGTGGCGTATTCACTTAGCCAAAAAGACAGAAGATGTCGGTCCAACCGTTAGATACCTAGGCCGCTATTTTAAGCGGCCGCCAATAGCGGCTTCTCGCCTACGTCATTACCAGGGTGGTGATGTTCACTTTGTCTATAAAGATCATAGAGATAATTGCTATAAGACATTGGTCCTTAGTCAAATAGAGATGATCGATCGGTTAGTCTCGCATATCCCCGCAGAAAAGAATTTTAGAGCCATCAGGTATTACGGTTTTCTGTCAAACAGAAAACGGGGAGAAGCCTTACCGTTAGTTTATGACTTACTGGATCAGGAAGAGCCGGTAGAGCCAAAACCATTGAATTACGCGCAAATGATGCATCACCTGGTAGGCATAGACCCGTACAAATGTATTCTATGTAGTGGTCGCATGTGCTTTGTGAAGATGGAAATGGGGCTGAAAGGGCATGAGTTAGTTACTTTGAGAAAAGCAACGATACGGGAAAAACGACGACTTCGTTACAGTCTTTAGGGATGATCTGCCTGAAATATGGCAAAAAGCCAAAAACAGTATAGAAAACACTCAAAAGTAACCTATTTTAGTCGGCTAAGTCATAAGAAAGACGATTACTGATTGATTTTTCAGTATTGCTGTCAGAGTGGTTAGGAATTGAAATTCATTAAAAAATATAGGTAAAGAATAATTCTTACCTGTATTTTTACTGTGAATAAGATGATTGTTCGAGAGATCGCAGCTAAGTAAATCGACCTCCAATTTACCTAGTAATAGAAGCTCAATCACAGACTGAGTAAGCACACTTAAAGATATATCTAATAATTCATTTAAATCATTGATAAAAATAGAATTATTTTTATCTACAGCGATGAGGATCGCATCATGTACGGATGTGAGATGAGAGGGAGAATTGTAACGCTGTAACAGTTTTAGGTTGTCAAAAATGGGTTGAGTATGGATTTGTTTTTCGGTCACTAAGTAAAGAGGAATATTGAGTTGATCGGCTTTTTCTTGTTTAGCTTTGAATCGGAAAATAAAATCTTCTGATTGTGCCTTCTTCGTAGGCTTTATCTCAATATACCGGTCTTGACCTTGATAACAGATGAGAAAATCAGGGGTATAGGGACACTGCGTGTCTTGATATGAATAATAGAACCCTTCGGGTTGAGCGATGAATGAGGAGACATCGTTTGAATATTCAAAATAAAAGCATGCATCAAATTCAAGCTTTGACTCAACAGTCAAAGCTTGATTCATTTTTGTACTAACAAATTTATGAATATGTTTAACGCTAGATTTTTTGATCTTTCGTCGATACATAGTTCTAACATTTTGTAGGAAATTTACTAAAAAAGTAGACTATGTAAACTTATAGTGCAAATTATGCAAACCTAAAATAGAATTATGCAAATCTATGGTGCAAACTACAATCTCGTGTTCCAAGCGAGATATTAGTCTATTAAGCGTGTAGTAGCGCCATAGACTCGTTCGCAATTACCCATTCTTCGTTGGTTGGAATTACCATTGCAAGAGGAGTATTTGCTTGCGTGATCACGCCTGAATTACCAAAGCGTGCATCTGCGTTTGCTTGTTCATCTTCACGGTAGCCAAGGATCTTCAATAAACGAAGGATCTCGCTACGAACAGGCATTGAGTTTTCGCCAATACCACCTGTGAAGATAATACCGTCAAGTTCATCTAGAGCTACCATGTAAGATGCGATGTATTTCGCAGCACGGTAAGTAAACACCTCAAATGCAAGCTTAGCATCGTGGTTACCTTGCTCCATTGCTTCAATGATTCCACGGCAGTCACTTGTAATGCCAGAAATACCAAGGAAGCCAGACTTCTTAACTAGAAGATCGTGAAGTTGCTCAGGAGTCCAACCTTTCTTAAGAAGGTACTCAAGAACACTTGGGTCGATATCACCACAACGAGTGCCCATCATAAGGCCCGCAAGTGGTGTAAAGCCCATTGAGGTATCAATACTTTCTCCGTTCTTAACCACACAAACTGATGCACCATTACCTAGGTGAACAGAAATAAAGCTTGATGCTTCTACTGGTTTATTAACCACTTTTGCAGCTTCACGAGTTACATAATAGTGGCTTGTACCATGTGCGCCATAACGACGAATGTCATATTCTTTACTAACTTCTTTAGAAATTGCGTAAGTAAACGCTTTTTCTGGCATAGTTTGATGGAAAGCAGTATCAAACACAGCGTATTGAGATAGCGTAGGGAAAGCTTTAGCTGTAGCACGCATACCAATAACGTGAGCTGGGTTATGAAGAGGAGCTAAATCGCTCAACGCTTCGATATCCGCCATAACTTGCTCATCAACTTTCACGGTATGTGAGAACTTAGTTCCACCATGAACAACACGGTGACCAATAGCTACGATGTCTTCTTTCAGATCTAATTCGTCAACCAGAGCAACGATACGATCAATCGCTTGCTGGTGGTGGTTTTCTAGGCCACTGAGTTTGTACTCGTGTTTTTCACCGTTAACTTTCCAGCTAACTACTGCCTCAGGTAAGAAGAAACACTCACCAAGACCATTTAACATCGCATCACCGGTAACAGTGTCGATTAGGGCAAATTTAAGTGAAGAACTACCAGAATTGATTACTAGAACTAAAGAGTTGCTCATGGTTATCTCATCAACGTTTCAAGGACTAAAAGGATACAAAGTTCCCATTTATTATCACTTAGCAAAATATGTGGAGCATTATTCACTAAGTCATCGCTTTCTAACGACCATCTTACTCAATTTTTTTTGAAAGTCTCAACTTTTGTTTTAAAAAATATTAAAAAATTGGAATTTAACTGGTTTAGATCAAATTTTTATCAAGAAATCGATTTCATCAGTTTAAAAATTCAGCAAACACTCAACTTTTGTTGAAAATAAATGGAATACATTGTTATTTGTAACACAAAAAAAAAGGACCTATCTATGATCATTACGCCAATCATTGATTCTAATGTCGCCCGTTCGTGTCATCCCTTAGGTTGCCATGAAATGATGAACAGTAGCCAGCCTTCGGCTGGAGCCAGATATCTCAACCTGAAATAGAAAACTGCGGCCTAGAACCTCACTTTTGGTAGTGACCCCAATTGATTTATTTAGTATATAATCATCCTTTTTAAGGATGGATTATTCATGGCTACTATTGATGTGAAATGTCGTTTTTGTAATCAAGCGGAGCAAGTCCGCAAATATGGGACTAATCCACGAGGAGCTCAGCGATATCGCTGCTTTGATTGCAATCGAACATTTCTTCTTGATTACGCTTATGAAGCTTGTAAACCTGGCGTTAAGGAAAAGATTGTTGATATGGCGATGAATAGTTCAGGAGTAAGAGAGACGGGTCGAGTTTTGAAAGTCGGCTATAATACAGTACTACGCACTTTAAAAAACTCACACCGAAGCAAGTAACAACAATTCCCTTTGATATAGCCCACATTGAACTGATATGTGAAGTTGATGAGCAATGGTCGTTTGTCGGTAAAAAAAAGAATCAGCGCTGGTTATGGTATGCGTGGGAACCTAGATATAAGCGAGTCATTGCTCATGTATTTGGGAAACGGGACTCAGAAACATTCCATAAACTCCAACGTCTTCTTTTGCCGTTTACTATTCCTATTTATTGCACAGATGATTTTAAGGTGTATTCAAGCTATTTACCAAGAGAAGATCACATCATAGGTAAGCGATACACGCAACGAATTGAAAGAACAAATTTAACATTACGATCTCGACTAAAAAGATTAGTAAGAAAAACCATTGGTTTTTCGAAAAGCGAAGAGATGCACGATAAGGTTATTGGAACGTTTATAGAACGTGAATTTTACCATTAATAAATCAATTGGAGTCACCATCCCCTATTAAGTCAAATGGGTCTTGATGGTATGGCGCTAGGTAACCACGAGTTTGATTTAAGTAATAAGAAACTGAATCAATTTATC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47 | Escherichia_phage(62.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
145839 : 200679
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP018046|145839:200679|DBSCAN-SWA 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55 | Escherichia_phage(69.23%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
211551 : 269282
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP018046|211551:269282|DBSCAN-SWA 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53 | Escherichia_phage(55.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
281492 : 339320
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP018046|281492:339320|DBSCAN-SWA 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44 | Escherichia_phage(44.44%) | transposase,integrase | attL 281668:281682|attR 312011:312025 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
358035 : 428645
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_AP018046|358035:428645|DBSCAN-SWA 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53 | Escherichia_phage(38.89%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
432239 : 536728
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP018046|432239:536728|DBSCAN-SWA 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97 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase,tRNA,integrase | attL 439167:439226|attR 535971:536752 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
560025 : 620874
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP018046|560025:620874|DBSCAN-SWA 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57 | Escherichia_phage(56.52%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
642447 : 696513
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_AP018046|642447:696513|DBSCAN-SWA 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>NZ_AP018046|642447:696513|681621_682347_-|WP_065171419.1|DBSCAN-SWA MNKSFLSLVLGTVLASSFVIGSAYADPKLAGTETGYSSTQLMQMGEQQAKLHWVSVADIEKSLEGKPPMAVGFDIDDTVLFSSPGFYHGQQVFSPNGYSYLKNQKFWNKMNCEWDVFSLPKDIGKELIAMHQKRGDSIYFITGRDPSTCKEITSDYLQKVFNIKHMNPVIFAGSSKTEYTKTKYIKDNHIKLYYGDSDGDIISARHAGAEGIRIIRASNSSYKPIAQNGVYGEKVVENSQY |
41 | Escherichia_phage(76.47%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
718439 : 766070
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_AP018046|718439:766070|DBSCAN-SWA 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39 | Escherichia_phage(54.55%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
777611 : 844701
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_AP018046|777611:844701|DBSCAN-SWA 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54 | Escherichia_phage(63.64%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
849451 : 990445
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_AP018046|849451:990445|DBSCAN-SWA 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MELSILKQVRKPTLDLPVSERKKMWFGPFIRSYLVVFVSYMVMYFIRKNFNIAQNDLISDYGMTMTQLGTIGLGFSITYGIGKTALNYWCDGKNSKNILPLGLLLSGLCMLGFGLVMGPSMGSFYMMIGLYALSGLFQSVGGSNSYSTITKWTSKKNRGTFLGMWNISHNIGGAGAAGVALFGANYFFDGNVAGMFIVPAIIAIVVAFIGFFMGSDSPEAYGLGTAEELFEEPVSEEDKAVSENQMSKLEIFKKYVLFNKVIWLLCFANVFLYVVRIGIDQWSTVYGYEVLGFDKETAISGFTMFETGALIGTCLWGFFSDLINGRRGLVACIALLGVIATLGFYQHADTIFAYQASLFALGFLVFGPQLLIGVAAVGFVPKQGIAVADGIKGTFAYLIGDSFAKLGLGLIADGTPIFGQTGWSGTFVALDTAAIICCSIMAIVAILEERKIHREKKEKKLAEANA >NZ_AP018046|849451:990445|893798_894533_+|WP_086959321.1|DBSCAN-SWA MVGQADKLRTLLSNTHRLAQNYHHEPRGTLRVTSSIMFGRQYVQDAISQFQKEYPEVSCELRLEDRLVDIVKEGFDIGFRLGKPKDSGLICKKITKSRLLIVATPEFIKQFGPIDNIEQLEAAPATVYSAPGLLLNKFTYQDDSGIEQTFQLNPVYKVNDTEMIVKSALAGNTLAVVTTQMIHNEIQEGLLNPILPQLNLDDYGIFYAVYPHRDAPIKTKLFIETLKSIIEKDSQTVTNSLSQQ >NZ_AP018046|849451:990445|895588_895789_-|WP_005305940.1|DBSCAN-SWA MTSQTGIIRSFNPAEKKGLITCDLGGDISFDASQISCTSYPTMGSMVEFTLDESNSKLKAVKIRYL >NZ_AP018046|849451:990445|913833_914274_-|WP_044173652.1|DBSCAN-SWA 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MHVPRATKLIFNKDEAWEKYLTHCGDNITTNQIECIEKMLACGTSKVGSKHYECENPYCEHRKVIYNSCKSKACSSCGVMLTEKWIAKQLSILPKCEYQHMTLTMPDKLWPIFRLNPWLINLLYRCAVSAFLSFAKKRGIEIGLFCVVHTFGRQLNWNVHFHLSVTRGGVNLKTKRWGNIYFNAAMVEQHWKQQVVSFLRDHYNALNTKHDNYQHIRDFRGWSQFLSSQYSRKWRIHLAKKTEDVGLTVRYLGRYFKRPPIAASRLRHYQGGDVHFVYKDHRDNCYKTLVLSQIEMIERLVSHIPAEKNFRAIRYYGFLSNRKQGEALPLVYDLLDQEEPVEPKPLNYAQMMHIDPYKCILCGGRMCFVKMEMGLKGHELVALRKATIREKRRLRYSL >NZ_AP018046|849451:990445|910070_910367_-|WP_069107415.1|transposase|DBSCAN-SWA MPRRITPEFKRECAELVITLGYSHKDAAAAMNVGLSSIQRWVTQYQQELSGITPKATALTPDQLRIQELEKQLKQLQSDNELLKKASAFFAIEMNKNR >NZ_AP018046|849451:990445|898741_899962_+|WP_086958576.1|DBSCAN-SWA MLLNLNIGDAYLLLNDFKQGERYCRKADKLALELDDLNCISLAKMNVALALAHQGDLIDSEAWIQEAIHYAQKTLCQRTLGYAWSYQGRISAIQNNYSKAKHSYITSDYFFSQSYEYFGRSENQYFYALLLLKKNKLKAALNHCLQAEKLISNEDHYQDKNRLYHLQVQIYQQQGDFDKANNILALQAKEANDEITRSAGRETRYMDYILTLGEQKRQFDNLQQLHNNLSVITKIGQQIATANNLRAHLPEIYQQLNLIIPIHVFGIALYDQAQHQLNYDYFIEDGAVIPPIIIRCEDDSSLGAYSVAHQQQLHLNTSSEQDLAVYVDPQKMDRQLFQGNDEKTQSIIITPITLNESTIGVLFLEHHTPYLYQQHHCDLAKQLAGYIAVSLENLRQTNILKQQQEQ >NZ_AP018046|849451:990445|853539_853734_+|WP_075985093.1|DBSCAN-SWA MDNVIQLLNTQYDIAPPKDHDEEIALIYQYLIDKFGDTSTTTFKLHEVLISLAHIAERDGATPY >NZ_AP018046|849451:990445|871344_871923_-|WP_044178072.1|DBSCAN-SWA MSETKRVAVLLADGFEEGEAVVFIDIMRRLDIEVDVLSCMETTALNTYFKTKITADYTLIDKFDETYDAVMMPGGPQGTDNLTANTSVIAFLKRHIDANKYICALCSSGAKVLAAHHLLQGRPYTTGDKLADKFDDGDFRIQKVVVADNFITGRGLGVSFEFAFTVAKYLLSDNQEKVDWQANHIYFEHWPL >NZ_AP018046|849451:990445|928722_929649_-|WP_044179558.1|DBSCAN-SWA MYQRAVAQTAKFLMFDMQKLEETQHLIFGADYILIHPNSPGCILHLATHHLKLQPNQIVLLAPFNPFRLSLEKSSCSRRASVNDCDVLHFRLNALGQTFVDSVQFANIRSMLEQAKSGLLFSGEQLSLFNEYFQKMENTFEFKQVLNLLALLDELAAITPERYLINNCIEISNSKRAEDRVQMALKYIENNLAEPLTVTVVAEQLCMAESTFSRFFHANLGVTFRQYLIEQRVKQAARYLVSTDWSVAHIGAEVGFSSLSNFNAKFKSILRVTPREYRTNHLDMRQGIEQTASVQGQVQKQMLELVNS >NZ_AP018046|849451:990445|859604_860711_+|WP_044178087.1|DBSCAN-SWA MKTTTHISALTNLKVSVLAVSLALSSFVITGCGSEESTTVLPTAVKPALSEVVKAHANDELSFNGVVRSAQRADLAFRIGGRLTYIFVKEGDQVKQGQLLAKLDDRDAQTAFESAQLELKNARAEYQRGKAIFEKSQAIAKSDLDTLTTRFNLAQNRLEEAKRQLEYTQLKAPFDGIVGRKMVDNHVQVQANMPIIAIHDVQNLEVVINIPDTVMLYGLKETKAKAELSSIPGKDFALKLRTFATQADPVTQTYAVVLGFEDLKGFRVLPGMAVKVSPADPEIKLPIETTITVPLTAVVPDNQGKQFVWVVNDKNHVEKRYVKVGALSSSRIEITECLVPGERIIIAGVASLKDGMQVRPYTDDNSGA >NZ_AP018046|849451:990445|857739_858436_+|WP_086956953.1|transposase|DBSCAN-SWA MATIDVKCRFCNQAEQVRKYGTNPRGAQRYRCFDCNRTFLLDYAYEACKPGVKEKIVDMAMNSSGVRETGRVLKVGYNTVLRTFKKLTPKQVTTIPFDIAHIELICEVDEQWSFVGKKKNQRWLWYAWEPRYKRVIAHVFGKRDSETFHKLQRLLLPFTIPIYCTDDFKVYSSYLPRENHIIGKRYTQRIERTNLTLRSRLKRLVRKTIGFSKSEEMHDKVIGTFIEREFYH |
114 | Escherichia_phage(60.0%) | transposase,integrase | attL 930043:930102|attR 994198:994978 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
2. NZ_AP018047
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
0 : 9492
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP018047|0:9492|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP018047|0:9492|7734_8432_-|WP_086956953.1|transposase|DBSCAN-SWA MATIDVKCRFCNQAEQVRKYGTNPRGAQRYRCFDCNRTFLLDYAYEACKPGVKEKIVDMAMNSSGVRETGRVLKVGYNTVLRTFKKLTPKQVTTIPFDIAHIELICEVDEQWSFVGKKKNQRWLWYAWEPRYKRVIAHVFGKRDSETFHKLQRLLLPFTIPIYCTDDFKVYSSYLPRENHIIGKRYTQRIERTNLTLRSRLKRLVRKTIGFSKSEEMHDKVIGTFIEREFYH >NZ_AP018047|0:9492|8536_8728_-|WP_125653105.1|DBSCAN-SWA MVAKQDNEKLTNVNILVGEQGNNLLTNAAHANHRSKRKEAAARLEHHLRTFGSDWTESVTQKR >NZ_AP018047|0:9492|3220_3667_-|WP_086959645.1|transposase|DBSCAN-SWA MSRYDSSSHVFYRCQCHIVWTPKYRFKILKGNVAHEVYRSIHVFCSMKKCRIVELNVQIDHVHLVVRTPPSLSVSELVGFIKGRTAIKLFAKFPYLRKKKLWGNHFWQRGYFVDSVGANEAIIRRYVRHQDKVAKEDELRQMELNIQC >NZ_AP018047|0:9492|8874_9492_+|WP_086959636.1|DBSCAN-SWA MKEISSRIKAQRKELKLSQKKLANLVGVTTSAISQWEREETTPKGENLLNLASALSCSAEWLVGKKQQITVCEYIEIPFFDDIKASAGFGCICGQEYSYSISLPKKIFRYYNIDDLVAITSHGNSMEPVLSSESLLVIDTNVERINDGSMYVVRQDDLIRVKLISIGIKGLVLQSYNKNYPDEVYEKYDDIEILGKVIWYSSRCF >NZ_AP018047|0:9492|3911_5384_+|WP_086959643.1|DBSCAN-SWA MLIRNITNSLSVMDGINNNDSIKYLLERWKLNCSSSEALDCDVFLSEIEASNETGVLSLQYLSNLSSIPYIPEKITKLEIMFCDNLEEIPQLPDTIKNITISDCPKLNISRFPKDIESISIDMSNYSGWNKSLPDIPSGLISFSAKNGSYLPQLPSNLSSLSLIDFVTIPPLDLPCNLQKIEIHNSQLLPLINSLPLGLKELELGNVLLDEKISIDDYLPENLERLSLIICENIILPKKLPSNLQYILLSSMKEIKWDIKPENIPKGLDITTDLVKISHELLKREDIKFSGKSTGEASLFTEGDVVYGLTEERVRITSLLKSIYDITNKDIIIQNSLTNAVWNPRVKDKYNSDEFIRHSLNDYSRGEDFKKFLTNHKNYNVTDERFFDLSKEDLWMKTSKAGLEFQTKIRHRNVIFTLDTLFNSIDEIAGKEGKHGDAITAHELRWIYRHRNNEDVKENVKFFLHGEAISHEDVFSLPAWERYNPKNSHE >NZ_AP018047|0:9492|2672_2963_-|WP_086959647.1|DBSCAN-SWA MRKIELPGTNTVSIPLNFDTAPNADGVVEFGGIDSESMEALEVSKANVSTIVWATLCLERKIDRVLTNFFFGKFSGFDPKREQNYWENEFIGFHLN >NZ_AP018047|0:9492|878_1982_-|WP_086959685.1|DBSCAN-SWA MVCEKKEEENDTQQEESETKKRRVVKTIYVFNKEQTQQSEDEITERQSATKGSKAKSLATFGDVTKALAEGYISPLNHDQKRPEPTPPTDETKSRKAASLGDYQERIESKKARLAARAEKAQHESNSRFENAHQLGNVLPFGQPILVGHHSENKHRRLIEKIDTNMRKSIDAQKKADYLESKAQSVGSAGIASDDPDAIEKLKAKLVRLERSQETMKAINKVIRSAHMSHEDKIEYITQTHKLTEKHAKELLAGDFCGRVGFPLYALQNNNATIRQTKARINALEKLHSQAALADEGCAEGAAWTLDEEDGRIQFHFDAIPSETVRALLKQNGFNWSRTRGAWVRKITVNAVNTTRYLLTRLEEMEA >NZ_AP018047|0:9492|5865_7074_+|WP_086959641.1|transposase|DBSCAN-SWA MHVPRATRLIFNKDEAWEKYLTHCGDNITTNQIECIEKMLACGTSKVGSKHYECENPACEHRKIIYNSCKSKACSSCGVMLTEKWIAKQLSILPKCEYQHMTLTMPDKLWPIFRLNPWLINLLYRCAVSAFLSFAKKRGIEIGLFCVVHTFGRQLNWNVHFHLSVTRGGINLKTKRWGNIYFNAAMVEQHWKQHVVSFLRDHYHNLNTKHDNYQHIRDFRGWSQFLSSQYSRKWRIHLAKKTEDVGPTVRYLGRYFKRPPIAASRLRHYQGSDVHFVYKDHRDNCYKTLVLSQIEMIERLVSHIPAEKNFRAIRYYGFLSNRKRGEALPLVYDLLDQEEPVEPKPLNYAQMMHHLVGIDPYKCILCSGRMCFVKMEMGLKGHELVALRKATIREKRRLRYSL >NZ_AP018047|0:9492|5662_5857_+|WP_086959583.1|DBSCAN-SWA MDNVIQLLNAQYDTAPPKDHDEEIALIYQYLIDKFGDTSTTTFKLHEVLISLAHIAERDGATPY >NZ_AP018047|0:9492|379_679_-|WP_086959649.1|DBSCAN-SWA MRIVSRAALREFWENPSYQDAEQALKSWYDEAKNAGWRTPQDIKALYRNASFVGNNRVVFNIHGNKYRLIVAVNYTFSMVYIRFVGTHAQYDKVDATTI |
10 | Stx2-converting_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
18672 : 19370
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP018047|18672:19370|DBSCAN-SWA ATTAATGGTAAAATTCACGTTCTATAAACGTTCCAATAACCTTATCGTGCATCTCTTCGCTTTTCGAAAAACCAATGGTTTTTCTTACTAATCTTTTTAGTCGAGATCGTAATGTTAAATTTGTTCTTTCAATTCGTTGCGTGTATCGCTTACCTATGATGTGATTTTCTCTTGGTAAATAGCTTGAATACACCTTAAAATCATCTGTGCAATAAATAGGAATAGTAAACGGCAAAAGAAGACGTTGGAGTTTATGGAATGTTTCTGAGTCCCGTTTCCCAAATACATGAGCAATGACTCGCTTATATCTAGGTTCCCACGCATACCATAACCAGCGCTGATTCTTTTTTTTACCGACAAACGACCATTGCTCATCAACTTCACATATCAGTTCAATGTGGGCTATATCAAAGGGAATTGTTGTTACTTGCTTCGGTGTGAGTTTTTTAAAGTGCGTAGTACTGTATTATAGCCGACTTTCAAAACTCGACCCGTCTCTCTTACTCCTGAACTATTCATCGCCATATCAACAATCTTTTCCTTAACGCCAGGTTTACAAGCTTCATAAGCGTAATCAAGAAGAAATGTTCGATTGCAATCAAAGCAGCGATATCGCTGAGCTCCTCGTGGATTAGTCCCATATTTGCGGACTTGCTCCGCTTGATTACAAAAACGACATTTCACATCAATAGTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP018047|18672:19370|18672_19370_-|WP_086956953.1|transposase|DBSCAN-SWA MATIDVKCRFCNQAEQVRKYGTNPRGAQRYRCFDCNRTFLLDYAYEACKPGVKEKIVDMAMNSSGVRETGRVLKVGYNTVLRTFKKLTPKQVTTIPFDIAHIELICEVDEQWSFVGKKKNQRWLWYAWEPRYKRVIAHVFGKRDSETFHKLQRLLLPFTIPIYCTDDFKVYSSYLPRENHIIGKRYTQRIERTNLTLRSRLKRLVRKTIGFSKSEEMHDKVIGTFIEREFYH |
1 | Escherichia_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_3 |
29592 : 31218
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP018047|29592:31218|DBSCAN-SWA CATGAAAATAGTTAGCGTATGGAATGAGAAAGGTGGAGTTGGTAAATCAACTATTGCTTGGAATCTATGTGGTGCTGCGGCTGCAAGAGGTTTATCTGTATTATTAGTAGATGATGATCCTCAAGGTAGTTGTACTTGGCTTGGATCTGATGGTTTTGCTTCTTTCCAAGTAACACAAGAATTTCCAAAGAATGAACCTGATATTGACCTATTGATAATTGATATGACCCCAACGACCACTGATCGTCCATATGGTATTGTTTTAATTCCATATCAACCAAGCCGATTAGCGTATGGAGTAGTTAATAAACATTTGCCAAGGCTCCATGAATTAGGTTGTCGAGTTATTGAAATTATCAGTATGGTTGATACACGAAAAAGTGATCATCGAGATTTTGTTAAGGCCAAGCGTAAACAGTTGCCTAATGTGCAAGTTGTCCCCTCTCGTAGCATATATGAAAGAGTCATTGGTTTAGGTCGTACTGTTTTTGATCCAGCTTTGAAAGGACTATACGGGTTAAGTGATGCTCAGAAAGATATAAACAAAATATTAGACGAGGTTTTAAATGACTAATATTCCAAGCTGGATGAACAGCGCACATGAGAATAAACAAGGCAATATTGTTAGTGATAAGAAGAAGTCTAAACCTGGACCTCAGAAATCAGACATTAAACGTAAGAATGTTGGGTTTAAAATCTCAGAAGAACGTAATAAAGAAATAGATAAATTAAAAAAATTATTAGAGCAAGAATCACTTCAAATTACGAGAGGTCGAAGTGAAGCTGTTGAATTGGCTGTATCTGTTGTCATTGATTTATTACATGAGAGCGAAAATAAACTGAAAATAATAGCTTTACTTGAGAAGGAAATAGCTCAACCTAGATAACCTAGAAGGTTAGGAATTTCGGTGTTGACTCCAATTGATTTATTAATGGTAAAATTCACGTTCTATAAACGTTCCAATAACCTTATCGTGCATCTCTTCGCTTTTCGAAAAACCAATGGTTTTTCTTACTAATCTTTTTAGTCGAGATCGTAATGTTAAATTTGTTCTTTCAATTCGTTGCGTGTATCGCTTACCTATGATGTGATTTTCTCTTGGTAAATAGCTTGAATACACCTTAAAATCATCTGTGCAATAAATAGGAATAGTAAACGGCAAAAGAAGACGTTGGAGTTTATGGAATGTTTCTGAGTCCCGTTTCCCAAATACATGAGCAATGACTCGCTTATATCTAGGTTCCCACGCATACCATAACCAGCGCTGATTCTTTTTTTTACCGACAAACGACCATTGCTCATCAACTTCACATATCAGTTCAATGTGGGCTATATCAAAGGGAATTGTTGTTACTTGCTTCGGTGTGAGTTTTTTAAAGTGCGTAGTACTGTATTATAGCCGACTTTCAAAACTCGACCCGTCTCTCTTACTCCTGAACTATTCATCGCCATATCAACAATCTTTTCCTTAACGCCAGGTTTACAAGCTTCATAAGCGTAATCAAGAAGAAATGTTCGATTGCAATCAAAGCAGCGATATCGCTGAGCTCCTCGTGGATTAGTCCCATATTTGCGGACTTGCTCCGCTTGATTACAAAAACGACATTTCACATTAATAGTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP018047|29592:31218|30157_30478_+|WP_086959667.1|DBSCAN-SWA MTNIPSWMNSAHENKQGNIVSDKKKSKPGPQKSDIKRKNVGFKISEERNKEIDKLKKLLEQESLQITRGRSEAVELAVSVVIDLLHESENKLKIIALLEKEIAQPR >NZ_AP018047|29592:31218|29592_30165_+|WP_086959669.1|DBSCAN-SWA MKIVSVWNEKGGVGKSTIAWNLCGAAAARGLSVLLVDDDPQGSCTWLGSDGFASFQVTQEFPKNEPDIDLLIIDMTPTTTDRPYGIVLIPYQPSRLAYGVVNKHLPRLHELGCRVIEIISMVDTRKSDHRDFVKAKRKQLPNVQVVPSRSIYERVIGLGRTVFDPALKGLYGLSDAQKDINKILDEVLND >NZ_AP018047|29592:31218|30520_31218_-|WP_086958578.1|transposase|DBSCAN-SWA MATINVKCRFCNQAEQVRKYGTNPRGAQRYRCFDCNRTFLLDYAYEACKPGVKEKIVDMAMNSSGVRETGRVLKVGYNTVLRTFKKLTPKQVTTIPFDIAHIELICEVDEQWSFVGKKKNQRWLWYAWEPRYKRVIAHVFGKRDSETFHKLQRLLLPFTIPIYCTDDFKVYSSYLPRENHIIGKRYTQRIERTNLTLRSRLKRLVRKTIGFSKSEEMHDKVIGTFIEREFYH |
3 | Mycobacterium_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
|---|
3. NZ_AP018045
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_AP018045_1 | 1852302-1852466 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP018045_1
|
2 spacers
spacers of NZ_AP018045_1
>1.1|1852336|50|NZ_AP018045|PILER-CR CAAGCCTGACTACCATCTGGCATCGTTGCGCGAATGAGTCGATGCTGACA >1.2|1852420|34|NZ_AP018045|PILER-CR TAACAAGTGTTTGATTTTTCCACGACGTTCGGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP018045_1
The CRISPR arrays of NZ_AP018045_1 >merge|NZ_AP018045|1|1852302-1852466|PILER-CR ATTCGACGACCAAACGCATCATACACATAACAAGCCTGACTACCATCTGGCATCGTTGCGCGAATGAGTCGATGCTGACAATCATATTCATAATGAGTAACAAGTGTTTGATTTTTCCACGACGTTCGGTGATTAAACGACCAAACTCATCATATTCAAAATGAG >NZ_AP018045|1|1|1852302-1852466|PILER-CR ATTCGACGACCAAACGCATCATACACATAACAAG CCTGACTACCATCTGGCATCGTTGCGCGAATGAGTCGATGCTGACAATCA TATTCATAATGAGTAACAAGTGTTTGATTTTTCC ACGACGTTCGGTGATTAAACGACCAAACTCATCA TATTCAAAATGAG
>NZ_AP018045.1|WP_086957414.1|1850686_1851384_-|IS1-family-transposase MATIDVKCRFCNQAEQVRKYGTNPRGAQRYRCFDCNRTFLLDYAYEACKPGVKEKIVDMAMNSSGVRETGRVLKVGYNTVLRTFKKLTPKQVTTIPFDIAHIELICEVDEQWSFVGKKKNQCWLWYVWEPRYKRVIAHVFGKWDSETFHKLQRLLLPFTIPIYCTDDFKVYSSYLPRENHIIGKRYTQRIERTNLTLRSRLKRLVRKTIGFSKSEEMHDKVIGTFIEREFYH >NZ_AP018045.1|WP_065171447.1|1850155_1850407_-|hypothetical-protein MKLANIAITAMLMTLNTHAVASINNAGEIRFIGRVVAPAECIISSKMICQKAAHYDNHLISENTDIKEEIGHNESKTLVITYL >NZ_AP018045.1|WP_107208937.1|1849556_1850135_+|fimbrial-protein MTNLAADTGAKDKIDIRIKKQIIGSTQFHGLVSTLYASLKNSVSSPDPIAQTYLDLTVNTPAFCSIDEGSTINIDLGEVVSSDLNYGKEPTGYTKRDLNLTFRCNFDGQLDLTLLGKSSSLPEFFATSNSEIGIAIERNGSLVKPNEKGNSVPLDGSHVGHFDAKTYPVKTNNSAVLPDNYTGSINVLVEVL >NZ_AP018045.1|WP_086956953.1|1848812_1849510_+|IS1-like-element-ISPda1-family-transposase MATIDVKCRFCNQAEQVRKYGTNPRGAQRYRCFDCNRTFLLDYAYEACKPGVKEKIVDMAMNSSGVRETGRVLKVGYNTVLRTFKKLTPKQVTTIPFDIAHIELICEVDEQWSFVGKKKNQRWLWYAWEPRYKRVIAHVFGKRDSETFHKLQRLLLPFTIPIYCTDDFKVYSSYLPRENHIIGKRYTQRIERTNLTLRSRLKRLVRKTIGFSKSEEMHDKVIGTFIEREFYH >NZ_AP018045.1|WP_044175494.1|1846980_1848576_-|ABC-F-family-ATPase MISTANITMQFGEKPLFENISVKFGEGNRYGLIGANGCGKSTFMKILGSELEPSSGTVSKDPNERMAKLGQDQFAFEEYTVVDTVIMGHKELWKVKEERDRIYAMPEMSEDDGMRVADLEVEFAEMDGYSAEARAGELLLGLGIPEDLHFGLMSAVAPGLKVRVLLAQVLFANPEIMLLDEPTNNLDIHTIAWLEQVLLERNCTMIIISHDRHFLNSVCTHMADLDYGELRLFPGNYDEYMIAAESARERLLADNAKKKAQMAELQTFVSRFSANASKAKQATSRQKQLDKIQLDEVKASSRQSPFIRFEQEKELFRNALEVEGLKQGYGDSILINGVRLLVEVGERIAIIGENGIGKSTFLNTLAGAMEPMEGMVKWSENSNIGFYAQDHGADFEEDLNLMDWMSQWKKEGDDEQVVRGILGRMLFSQHDIKKSVKVLSGGEQGRMLFGKLIMQKPNILLMDEPTNHMDMESIEALNLALEHFKGTLMFVSHDRQFVSSIATRIIEITKDGVEDFHGTYDEYLAKKGLEG >NZ_AP018045.1|WP_086956953.1|1846074_1846772_-|IS1-like-element-ISPda1-family-transposase MATIDVKCRFCNQAEQVRKYGTNPRGAQRYRCFDCNRTFLLDYAYEACKPGVKEKIVDMAMNSSGVRETGRVLKVGYNTVLRTFKKLTPKQVTTIPFDIAHIELICEVDEQWSFVGKKKNQRWLWYAWEPRYKRVIAHVFGKRDSETFHKLQRLLLPFTIPIYCTDDFKVYSSYLPRENHIIGKRYTQRIERTNLTLRSRLKRLVRKTIGFSKSEEMHDKVIGTFIEREFYH >NZ_AP018045.1|WP_086958319.1|1845299_1846091_-|sulfatase-like-hydrolase/transferase MNFTINKSIGVTTEKKRVQISSLQTTNLNYPLHPVKVSQGENRPNVFFIMIDAWRESDATKTVMPHINQFSQKTYNFKQHRSGGNSTQAGMFSLFYSLPPTYWDSFYASQKSPVFINKIIASGYQTKVLGSASLSSPPLARTIFKDIQSLRLHTPGETPVERDEKITDDFIDFLKHKTDQPYFGFLFYDSAHGEAFPENGDKFKPYWNRVDRMLLNNAFDANLYHNRVVTPIDLLMVKFTFYKRSNNLIVHLFAFRKTNGFSY >NZ_AP018045.1|WP_086956953.1|1844691_1845389_+|IS1-like-element-ISPda1-family-transposase MATIDVKCRFCNQAEQVRKYGTNPRGAQRYRCFDCNRTFLLDYAYEACKPGVKEKIVDMAMNSSGVRETGRVLKVGYNTVLRTFKKLTPKQVTTIPFDIAHIELICEVDEQWSFVGKKKNQRWLWYAWEPRYKRVIAHVFGKRDSETFHKLQRLLLPFTIPIYCTDDFKVYSSYLPRENHIIGKRYTQRIERTNLTLRSRLKRLVRKTIGFSKSEEMHDKVIGTFIEREFYH >NZ_AP018045.1|WP_086958317.1|1843530_1843983_-|YaiI/YqxD-family-protein 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>NZ_AP018045.1|WP_075984991.1|1865510_1867364_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MSEEALEDKGFDSKSFLKTVTHQPGVYRMYNASDEVIYVGKAKDLKKRLSSYFRTNVAGEKTRALVKNIHKVDVTVTHTETEALILEHNYIKQYLPKYNVLLRDDKSYPYIFLSHHQHPRLSMHRGVKRRKGEYFGPYPDAGAVRESLHLMQKIFPVRQCEDSVYANRSRPCLMYQIGRCSAPCVKGYISDEDYQGQVQLARLFLQGKDRQVIAMLVEKMEIASQNLDFEKAAVYRDQIQALRRVQEQQFVSHDTEDDLDVVGIAHENGMACIHALYIRQGKILGSRSYFPKMPADVELTEVLSSFVTQFYLNQAEGRVIPTNIILSEDLGDETAVISDTLSQLAERKVVFKYHPRGNRARYLKLAQTNAKTALTSKLNHKMTIQERFFELQQALSLKPISRMECFDISHTMGEKTVASCVVFNQDGPYKPDYRRYNITGITGGDDYAAMAQVLERRYGKQMELDKIPDIIFIDGGRGQLSRAYDVVKPYMEDWPKRPLMIGVAKGTTRKPGLETLIFITGEEFSLPSDSPALHLIQHIRDESHNHAISGHRAQRAKVRKRSALEDIEGVGPKRRQALLKYMGGLQELNRASKEEIAKVPGISLALAEKIVDALHHS >NZ_AP018045.1|WP_005299769.1|1867363_1868008_-|UvrY/SirA/GacA-family-response-regulator-transcription-factor 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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
18443 : 146019
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP018045|18443:146019|DBSCAN-SWA AATGCATAAATACGACATTAAAACCTTTCAGGGCATGATCCTCGCGCTGCAGGATTACTGGGGCCAACAAGGTTGTACCATCGTACAACCATTAGATATGGAAGTCGGTGCAGGTACCTCTCACCCAATGACATGTCTACGAGCTCTAGGTCCAGAGCCTATTGCAACAGCGTACGTTCAACCATCTCGTCGTCCAACTGACGGCCGTTATGGTGAAAACCCAAACCGTCTTCAGCACTACTACCAATTTCAGGTAATGCTAAAGCCTTCTCCAGATAATATTCAAGAGCTATACCTTGGCTCTCTAGAAGCACTTGGTATCGATACTCAAATTCACGATATCCGCTTTGTTGAAGATAACTGGGAAAACCCAACACTTGGTGCTTGGGGTCTTGGCTGGGAAGTATGGCTAAACGGTATGGAAGTAACTCAGTTTACTTACTTCCAGCAGGTTGGTGGCCTAGAGTGTAAACCAGTAACTGGTGAGATCACTTACGGTATCGAACGTCTTGCAATGTACATTCAAGGTGTTGACTCAGTATACGACCTAGTATGGACAGATGGCCCGTTAGGTAAAGTAACTTACGGTGATATCTTCCACCAAAACGAAGTTGAGCAATCTACTTACAACTTCGAACATGCCGATGTTGATTTCCTATTTACTTTCTTCGATCAAAACGAGAAAGAGTGTCAACAACTGCTTGAGTTGGAAACGCCACTACCACTTCCTGCTTACGAGCGCATCCTAAAAGCCGCTCACGCATTTAACCTATTAGATGCACGTAAAGCAATTTCGGTAACTGAGCGTCAACGCTACATTCTGCGTATCCGTAACCTAACTAAGCAGGTTGCAGAAGCTTATTACGCATCACGTGAAGCTCTTGGCTTCCCTATGTGCAAAAAAGATAAGTAAGGGATAGTCATGACAGAACGTAATTTCCTAATTGAGCTAGGTACAGAAGAGCTACCACCAAAAGCACTTCGTACTCTGGCTGAAGCTTTTGCTGCTAACTTTGAGGCAGAACTAAAAGCTGCAGATCTAGCGCACAATGGCATTGAGTGGTTTGCGGCTCCTCGCCGTTTAGCACTTAAAGTTAATGCGCTGGCTGAAAACCAACCAGACAAAATTGTAGAAAAGCGTGGTCCGGCTATCGCTTCTGCTTTTGATGCTGACGGTAACCCAACAAAAGCAGCACAAGGCTGGGCTCGTGGTAATGGTATTACTGTAGAGCAAGCTGAACGTCTGGTAACAGACAAAGGCGAATGGCTACTGTTCAAGCAAGAAGTTAAAGGCCAAGAAGCAAAAGCGCTACTTCCTGAACTTGCTGCAAATGCACTAGCTAAGCTACCAATTCCAAAACCAATGCGTTGGGGCGATAAAGAAACACAATTTATTCGTCCAGTGAAAACTCTAACCATGCTGCTTGGTGATGAGCTTGTTGAAGGCACTATTCTTGGTGTGGATTCAGCTCGCACTATTCGTGGTCACCGTTTTATGGGTGAAAGCGAGTTCACTATCGATAATGCTGATCAGTACCCTGCAATTCTAGAAGAGCGCGGTAAAGTGATGGCTGATTACGAAGCTCGTAAAGCTATCATTGTTGCCGATGCACAAAAAGCGGCTCAAGAAGTAGGTGGTATCGCAGACCTTGATGATGAACTAGTAGAAGAAGTAACCTCTCTTGTTGAATGGCCTGTGGTTCTAACCGCTTCTTTTGAAGAGAAGTTCCTAGCTGTTCCTGCTGAAGCTCTGGTTTACACCATGAAAGGTGACCAGAAGTACTTCCCTGTTTATGATGCTGAAGGCAACCTGGTTCCTAAGTTTATCTTTGTATCAAACTTAATCTCGAAAGATCCAAGCCAAATCATCGCAGGTAACGAGAAAGTGGTTCGCCCACGTCTTGCTGATGCTGAGTTCTTCTTTAATACTGACCGCAAGCGTCCACTGATTGATCGTCTACCTCAACTAGAGACAGCAATCTTCCAGCAAAAACTAGGTACTATTAAAGATAAAACAGATCGCATCACCGAACTTGCTGGCTTTATTGCAGCAAAAATCGACGCTGATGTTGATAACGCAAAACGTGCCGGTCTGCTATCTAAATGTGACCTAATGACATCAATGGTATTTGAATTTACCGATACTCAAGGTGTTATGGGTATGCACTATGCTCGCCACGATGGTGAAGCAGAAGAAGTAGCATTAGCTCTTAATGAACAATACATGCCTCGCTTTGCCGGTGATGAGTTACCAAGTACAGGTGTGTCTGCTGCAGTAGCAATGGCAGATAAGCTAGATACATTAGTAGGTATCTTCGGTATTGGTCAGGCACCAAAAGGCAGTGACCCATTTGCACTACGTCGTGCAGCACTAGGTGTATTGCGCATTATCGTTGAAAAAGGCTATAACTTAGATCTTGTCGAGCTTGTTGCAAAAGCACATGAGCTATACGGTGATAAGCTAAGCAACGATAATGTTGAGTCGGATGTTATCGAGTTTATGCTTGGTCGTTTCCGCGCTTGGTATCAAGATGAAGGCTTCAGCGTTGATGTTATTCAAGCAGTATTGGCTCTACATCCAACCAAGCCTGCTGACTTTGACCAACGAGTGAAAGCGGTATCTCACTTCCGTGAATTGGATGCAGCTGAATCACTAGCAGCAGCCAACAAGCGTGTAGGTAATATCTTAGCGAAATTTGACGGTGAGCTTCCTGCACAATGGGATAATGCTCTACTGGTTGAAGATGCAGAGAAAACACTTGCCGCTGATATTGCAGCAATGCAAGCAACTCTAGAGCCAGCTTTCGCTGCGGGTAACTACCAGCAAGCACTGACTGAACTAGCAAGCCTACGTGAACCTGTTGATGCGTTCTTTGATAACGTAATGGTTATGGCAGATGACGAGAAACTAAAAGTAAATCGTCTAACTATGCTTAATGCCCTTCGCAATATGTTCCTACAAGTTGCAGATATTTCTCTACTACAGAAATAATCTCAATTGATATAACAAAGCCCGCCACTGTGCGGGCTTTTTTTATCATCAAAATACTCTAATCTTTGATCATCTCTGTTTCACGTGAAACAATGTTATTGATGTTTTTCTGCTCTCTTTTCACACTCGCCGCAATAAGGTATGTTGAGCAAACACAACATCATAAATCCCCCAGCACTAGATTGGATGGGTTATAAAACATTGAGGTTTGCAAAGACACATGGAGTTCTCAACCTTTGGCGACAAGTTCGCTCGCTATTCCAGTATTGCTCAGTTAATGGATGACTTAAATGATGGCCTGCAAGACCCCAATGCCATCATGTTAGGCGGCGGTAACCCAGCTCAAATACCAACAATAAATACCTATTTCACTCAATTACTCAGTGAAATGGCCGCATCGGGTGAGTTAACGCAAGCGATGAGTAATTACGATGGGCCACAAGGAAAAAATCGATTTTTGATCGCACTGGCAGCTATGCTCAAGCAGCAGTATGGTTGGGAGATCAGCGAACGTAATATTGTGCTAACTAATGGCAGTCAGAGTGCTTTTTTCAGCTTATTTAATTTATTAGCAGGAAAGTATCAAGATGGTAGCCATAAGAAGATTCTATTACCCCTATCTCCTGAATACATAGGCTATAGTGATGCGGGTGTTCATGATGATATGTTTATCTCTTATCGTCCTGAGATCACTTTGTTAGATAATGGGCTATTTAAGTATCATATCGACTTTTCAACCTTAACAATAACCCCCTATATCGGTGCTATTTGTGTCTCAAGGCCAACTAACCCAACAGGTAATGTGTTAACCGATGAAGAGATCGCAAAACTTGATACTCTTGCTCAACAACACCACATTTCCTTAATTATTGATAACGCTTACGGCATGCCCTTCCCTGACATCATTTTTGCTGATGTAACCCCCTTTTGGAACCCCAATACCATTTTGTGTATGAGCCTATCAAAATTAGGCTTGCCAGGCGTACGTTGTGGCATTGTGATAGCAAATGAAACTATCGTTCAAGCACTCGCGAATATGAATGGCGTACTCAACTTAGCCCCTGGCAGCGTGGGGCCTGCGGTGGCACACAAATTAATTGAACGCAATGAACTGCTATCGCTAAGTCATCAGGTCATAAAGCCTTTCTATGAACGTAAAGCAACGCAAGCCGTCAGTTGGTTACAGCAAGCCATTCCAGATCCCAGGTTTCGAATCCATAAGCCTGAAGGTGCGATTTTCTTATGGTTATGGTTTGATGAGCTACCGATTACCACAACAGAGCTGTATCGTCGTTTAAAACAAAGAGGCGTACTTATTGTTCCCGGAGAGTATTTTTTTATTCGTTTAGAAGACTCTTGGCAACACCAGCATCAGTGTCTGCGGATGAACTATGTCCAAGATGATGAAGTGATGAAACAAGGTATTGATATCATTGCGCAGGAAGTTAAAAAAGCCTATTTAGAACAATAAAAAAACGCTGCCTTTTGGCAGCGTTTTTTATGATAAAAGCAAAAACTTATACGTCTAGATTTGCATTTAGAGCATTCGCTTCGATGAAGTTACGACGCGGTTCAACCTGATCGCCCATCAAAGTGGTAAACAACTCATCGGCAGCAACAGCATCGTTGATGGTCACGCGCATCATACGACGAGATTCAGGATCCATTGTTGTTTCCCACAGCTGATCTGGATTCATCTCACCTAGACCTTTGTAGCGCTGTAGCGATAGACCACGACGAGACTCTTTATTTAACCACTCTAGAACTTCTTTAAAGCTTGCTACTGGTTGCTTGCGCTCGCCACGTTGAACGTAAGCCGAATCATCAAGTAGACCATTTAGCTCTTCAGAAAGATCAGCCAACTTGCTGTACTCTTTAGAGCAAATTAGCTCAAAGCTTAATGGATACTCATGATCAACACCGTGAGTACGTACCACAACCTTAGGTAAGAAGTGATTGTTCTCGCTATCAACAACAATATCAAATGTGTAGTGGCTTTCACCTGATT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107 | Shigella_phage(30.0%) | integrase,transposase,tRNA | attL 80654:80713|attR 145263:146044 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
150200 : 215446
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP018045|150200:215446|DBSCAN-SWA 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53 | uncultured_Mediterranean_phage(14.29%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
234952 : 302208
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP018045|234952:302208|DBSCAN-SWA 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57 | Vibrio_phage(20.0%) | integrase,transposase,tRNA | attL 228195:228209|attR 300669:300683 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
424380 : 478502
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP018045|424380:478502|DBSCAN-SWA 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44 | Shigella_phage(22.22%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
536593 : 593489
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP018045|536593:593489|DBSCAN-SWA 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38 | Klosneuvirus(12.5%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
686398 : 756157
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_AP018045|686398:756157|DBSCAN-SWA 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55 | Ostreococcus_lucimarinus_virus(10.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
815354 : 876022
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP018045|815354:876022|DBSCAN-SWA 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56 | uncultured_Mediterranean_phage(15.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
980956 : 1047744
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP018045|980956:1047744|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_thuringiensis_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1123675 : 1241252
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_AP018045|1123675:1241252|DBSCAN-SWA 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103 | Bacillus_phage(16.67%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
1261614 : 1299296
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_AP018045|1261614:1299296|DBSCAN-SWA 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24 | Bacillus_virus(25.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
1323912 : 1379470
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_AP018045|1323912:1379470|DBSCAN-SWA 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45 | Powai_lake_megavirus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
1390342 : 1463531
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_AP018045|1390342:1463531|DBSCAN-SWA 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57 | Bodo_saltans_virus(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_13 |
1478769 : 1505303
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_AP018045|1478769:1505303|DBSCAN-SWA 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23 | Morganella_phage(33.33%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_14 |
1539718 : 1600231
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_AP018045|1539718:1600231|DBSCAN-SWA 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51 | Shigella_phage(25.0%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_15 |
1604329 : 1665177
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_AP018045|1604329:1665177|DBSCAN-SWA 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50 | Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus(50.0%) | lysis,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_16 |
1794333 : 1903612
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_AP018045|1794333:1903612|DBSCAN-SWA 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82 | Klosneuvirus(14.29%) | protease,holin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_17 |
2069469 : 2122841
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_AP018045|2069469:2122841|DBSCAN-SWA 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35 | Hokovirus(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_18 |
2160866 : 2226151
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_AP018045|2160866:2226151|DBSCAN-SWA 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50 | uncultured_Mediterranean_phage(15.38%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_19 |
2240890 : 2305776
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_AP018045|2240890:2305776|DBSCAN-SWA 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46 | Shigella_phage(33.33%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_20 |
2322037 : 2396336
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_AP018045|2322037:2396336|DBSCAN-SWA 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54 | Bacillus_phage(23.08%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_21 |
2818158 : 2869259
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_AP018045|2818158:2869259|DBSCAN-SWA 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49 | uncultured_Mediterranean_phage(20.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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