Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017970 | Fusobacterium varium strain Fv113-g1 plasmid pFV113-g1-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_AP017968 | Fusobacterium varium strain Fv113-g1 | 13 crisprs | DEDDh,csm6,cas3,WYL,cas13c,DinG,cas4,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas2,csa3 | 0 | 16 | 7 | 0 |
NZ_AP017969 | Fusobacterium varium strain Fv113-g1 plasmid pFV113-g1-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP017968_2 | 136770-136867 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_2
|
1 spacers
spacers of NZ_AP017968_2
>2.1|136795|48|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder CAGAATTTGAAACTATTGATATAAATACAGATGTAACTTTTTTTGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_2
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_2 >merge|NZ_AP017968|2|136770-136867|CRISPRCasFinder AAAATATTAATTTTTAATGATATATCAGAATTTGAAACTATTGATATAAATACAGATGTAACTTTTTTTGAAAAAACTATTGATGATAGTGGAAAGTT >NZ_AP017968|2|2|136770-136867|CRISPRCasFinder AAAATATTAATTTTTAATGATATAT CAGAATTTGAAACTATTGATATAAATACAGATGTAACTTTTTTTGAAA AAACTATTGATGATAGTGGAAAGTT
>NZ_AP017968.1|WP_096401328.1|133130_134033_+|PHP-domain-containing-protein MSKNIDLHMHSLYSDDGEFSPEEIIKIGKREEMEIMALTDHNSVKGVDEMIKYGKEVGIKVISGVEIDCVYKGINLHMLGYGIDYKRKEFLEIEEEIFEKEMAIAKTKIERLKGNTDLIVDEEKIFEIAGGNIITGEIIGEVVLAEKKNRNNSLLEEYFNNGAKSDMPFVHFYWDFFSQGKIAYVPIEFRSMTEIVNLIKESGGLAVLAHPGNNFKNYLEIVEDIIEEGIDGIEVFSTYHSQEQIEYFYNKAEKNNLLMTFGSDFHGKNKPHIRLKGYPVPEKYEGMKEKLVRDFIERLK >NZ_AP017968.1|WP_096401327.1|132745_132928_-|YegP-family-protein MYFKILKAKNEQFYFNGYGNNHEIILTSEMYKTKQAAHNTIEVIKSQAEKAEIKDETEKK >NZ_AP017968.1|WP_096401326.1|130931_132398_-|efflux-transporter-outer-membrane-subunit 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP017968_1 | 136477-136628 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_1
|
2 spacers
spacers of NZ_AP017968_1
>1.1|136502|38|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder AAATATAATGAAAGGGAATAATGAAGTTACGATAAAAG >1.2|136565|38|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder AAGTCTAGGAACTGAAAGTGATACTTTAATATTAGATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_1
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_1 >merge|NZ_AP017968|1|136477-136628|CRISPRCasFinder AAAATAATATTATTAATGGTAATATAAATATAATGAAAGGGAATAATGAAGTTACGATAAAAGAAAATAATATTGTTAATGGAAATATAAGTCTAGGAACTGAAAGTGATACTTTAATATTAGATAAAAACAATATTGTTAATGGAAATATT >NZ_AP017968|1|1|136477-136628|CRISPRCasFinder AAAATAATATTATTAATGGTAATAT AAATATAATGAAAGGGAATAATGAAGTTACGATAAAAG AAAATAATATTGTTAATGGAAATAT AAGTCTAGGAACTGAAAGTGATACTTTAATATTAGATA AAAACAATATTGTTAATGGAAATATT
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MKTLTNEQTAMKVSFVSIVWNIILSVFKLFAGIVAHSGAMISDAVHSASDVLSTFIVIIGVKIANKESDKTHPYGHERMECVAAILLAAILFATGLGIGYKGILIISSNDYSHLTVPGVLALVAAVISIGVKEGMYWYTRAAAKKINSGALMADAWHHRSDALSSVGSFAGILGARLGYPIFDPIASVIICIFILKAAFEIFMDSINKMTDKACDDETIEIIRTLILKQEGVLGIDQIKTRLFGDRIYVDVEIQADGNISLKQAHDIAHYVHDAIENNIPKIKHCMVHVNPVNK >NZ_AP017968.1|WP_172426466.1|142065_142221_-|hypothetical-protein MKKELMNKEITNLDILEKLYNHSKSTENNDKLKEMKDELTMLDDYFLRYAK >NZ_AP017968.1|WP_096401335.1|142640_143027_+|polymer-forming-cytoskeletal-protein MGLFSKSNKDVEIDFSAKGMTAISKGSTVVGDITNECNLHIDGIITGNIVSNAVVTVGTSGRVKGKIRAYKIIISGICKGELEADIVEILTNSKVVGDIISSKLILEKDSYFEGRNQKKQPSEYIEMK >NZ_AP017968.1|WP_096401336.1|143296_143602_+|HU-family-DNA-binding-protein MGEKEFLKLYMKERGLKNLEEAKEKVDTFWKTVKESLEKGEKVKFKDWGNFEMKDVKPRRIIELKTKRDMTIPGSRKIKFSSGKGLIKFINDEIEKGKIDG >NZ_AP017968.1|WP_096401337.1|143594_143867_+|HU-family-DNA-binding-protein MDKLQFIKEYKENHEKRITNADAKKDVEAFLNLIENNIVDVGSIKFKGVGTFSLLRRRARVISNPKTRERMTIYPLAIVKFTPTKAKKEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017968_3 | 688696-689170 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_3
|
4 spacers
spacers of NZ_AP017968_3
>3.1|688748|47|NZ_AP017968|PILER-CR ACTACTGGCAGTGGAAATTATTCAGGAAATGGGATTTATTCTACGAC >3.2|688847|62|NZ_AP017968|PILER-CR ACTACTGGCAGTGGAAATTATTCAGGAAATGGGCTTTATTCTACGAATGGAGCTGGTACAAT >3.3|688961|57|NZ_AP017968|PILER-CR AGGAAACAGTACTGGCGGAGATAAATCAGGAAATGGAATATATTCTTATTCTGAGGC >3.4|689070|56|NZ_AP017968|PILER-CR ACTACTGGTAGTGGATCTAATTCAGGAAATGGAATATTTTCTTATTCTTATTCTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_3
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_3 >merge|NZ_AP017968|3|688696-689170|PILER-CR TGGAGCTAGTACAATAGGAGATATAACAAATAGTGGAACTATAAGTGGCAGTACTACTGGCAGTGGAAATTATTCAGGAAATGGGATTTATTCTACGACTGAAGCTAGTACAATAGGAGATATAACAAATAGTGGAACTATAAGTGGCAGTACTACTGGCAGTGGAAATTATTCAGGAAATGGGCTTTATTCTACGAATGGAGCTGGTACAATTGGAGCTAGTACAATAGGAGATATAACAAATAGTGGAAGTATAAGAGGAAACAGTACTGGCGGAGATAAATCAGGAAATGGAATATATTCTTATTCTGAGGCTGGAGCTAGTACAATAGGAAATATAACAAATAGTGGAACTATCAATGGTAGTACTACTGGTAGTGGATCTAATTCAGGAAATGGAATATTTTCTTATTCTTATTCTAATGGAGCTAGTACAATAGGGGATATAACAAATAGTGGAATTATAACTGGTAGT >NZ_AP017968|3|1|688696-689170|PILER-CR TGGAGCTAGTACAATAGGAGATATAACAAATAGTGGAACTATAAGTGGCAGT ACTACTGGCAGTGGAAATTATTCAGGAAATGGGATTTATTCTACGAC TGAAGCTAGTACAATAGGAGATATAACAAATAGTGGAACTATAAGTGGCAGT ACTACTGGCAGTGGAAATTATTCAGGAAATGGGCTTTATTCTACGAATGGAGCTGGTACAAT TGGAGCTAGTACAATAGGAGATATAACAAATAGTGGAAGTATAAGAGGAAAC AGTACTGGCGGAGATAAATCAGGAAATGGAATATATTCTTATTCTGAGGCTGGAGCT AGTACAATAGGAAATATAACAAATAGTGGAACTATCAATGGTAGTACTACTG GTAGTGGATCTAATTCAGGAAATGGAATATTTTCTTATTCTTATTCTAATGGAGCT AGTACAATAGGGGATATAACAAATAGTGGAATTATAACTGGTAGT
>NZ_AP017968.1|WP_096401822.1|687558_687804_+|hypothetical-protein MKSNTELFFKIITTTGTFLLAYHKYILSLFDKKLDKRDCEKERLYAEKFRIENIKTLTDGIKRIEERITRIEKQLMKQYKN >NZ_AP017968.1|WP_096401821.1|684477_685029_+|reverse-rubrerythrin MAKYRCKVCGEIITDESIDKCPVCKAGKDKWEEVVEGTEKVWATEHVIGEGLACGDEEIIMGLRANFEGECTEVGMYLAMSRAADREGYPEIAEAYKRIAFEEAEHAAKFAELLGECVSPSSKENLTKRVEAEYGATSGKFDLAKRAKMLGFDAIHDTVHEMAKDEARHGKAFVGLLNRYFGK >NZ_AP017968.1|WP_096401820.1|683678_684383_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MKSAVVTGATSGIGAAITNRLIDMGYTVYGIGRNFEKIMPNDRLKKIVCDLTKIFDIEKIVKEIKKETEIELLINCAGIGYFGPHEEINVNKIHNMVALNLEAPLVLVQLFLRDLKRSRGTIINISSITAKKSSTYGCAYSATKAGLSHFSKGLFDEVRKSGVKVVAIHPDITNTPFYDHLDFCQGDEENSYITPECVADAVEMVLTQREGTVLTDITLQPQRHLISKKNKKSY >NZ_AP017968.1|WP_096401819.1|682654_683665_+|DNA-repair-photolyase MKESEKKLLNSSFSHIYIEKEAFDYPLTKKILEKFPNSNIVELEIYKEIFSKGNQNFIIQKKSPKLILAVKKENYLYEGAKVCESFGNDNFYYTSSIMNCIYDCEYCYLQGVYTSANIVIFVNIEDCFKEIEKILQKKSMYICISYDTDLLALEGITELAEQWYHFVRKNKNLKIELRTKSSNIKVLRNLEPADNFILAWTLSPAEFAVQHENGAASLEQRLKAANEMLEKGWKVRICFDPVIYMKNFEGEYGELIKKTFKELSPDEILDVSIGTFRISKEYLKRMRKYRVTSEVLSYPFFCKDGVYSYYPQHINKMMDFMEKEVKKYVEDKKIFI >NZ_AP017968.1|WP_096401818.1|681852_682689_+|spore-photoproduct-lyase MIYIAVALTVEAKPLITYFKLKKDNEIKKYQVFKNEEIILIITGSGMLQGAIAVTYVLGRLDIGEEDIFVNLGICGAVKDTISIGDIILCNKIINNSSKKNFYPDMLFKHKFKEGALETFFHVVDKKMELDKIQGEIVDMEGAGICEAASLFFSQHQINVIKIVSDYLSTLEITPEKVMGLIENNIERTAEWLEERKKFYAGNKEIFTSEEKENIKKIEGNLKLTESMHYEFMELMKYYKIQNKSIENIILKYSDIKIKDKREGKINFERIRKEIIEL >NZ_AP017968.1|WP_096401817.1|681307_681802_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRKAEVKDLDRIMEIIKATIAEMKTYGNTQWDENYPQKNDFIGDVESGSLYVSEENGELYGFICANFVEPDEYKDIRWASDEKCLILHRMSINPKYRNQGTATKLIEFAEKTAKENGVNYIKTDTYSVNKKMNTLLLKLGYIHRGNMNFLGKEKEFYCYDKKI >NZ_AP017968.1|WP_096401816.1|680855_681311_+|MarR-family-transcriptional-regulator MKRLNSEILRKIGTLSRAIHSVSDIKYRELFLQKGQFIFLTRICENQGINFRELSRILAVDKSTTTKAVKKLIEAGYLNKEQDEKDKREYKLYPTKKALEVYELIIEEENRNIEICMEGLSKKEREIAENLLEKMSVNAEKDWLKVKGGKE >NZ_AP017968.1|WP_096401815.1|679166_680624_+|TrkH-family-potassium-uptake-protein MNNKMIRYVISYILKLEAAFMLAPLTLSFFYQEGFKLNRAYLITIIFLVISSFLLSKKIPENQKIYTQEGMIIVAVSWIALSFFGSLPFVFSGRIPSFVNAFFETVAGFTTTGASIIANIESIEKSLLFWIGFSHFIGGMGILVLALAILPKSSNQSLYIMKAEVPGPSVGKMVAKISYNSKILYVMYICITIIMIILLRAGGMPFFDSIIHAFGTVSTGGANIKNNSIGFYNNAYIDFVLGAGMLLCAVNFNLFYALFLKNYRQVFKNDELRAYLLIIAFSIIIICINIYPFYKNNFNMVRDVFFTVSSIITTTGYSTVDFNAWPVFSKTVLMMLTFIGGCAGSTTGGIKVSRIVIIFKKIVGEIKKIGTPNRVIAVKMDGKKIPDEMFSKISTYLITYIFIFLGIILIISIEFSDFTLAFSVVSATFNNIGTGIGTLGTTFDYSSLSNLSKIILSFSMLLGRLEIFPVLILFSPKIYKIKNKF >NZ_AP017968.1|WP_096401814.1|678133_678934_+|nitroreductase-family-protein MVSIDKEKCVGCGACVKDCFPENLFLENGKAEIKGRCMQCGHCIAVCPVDAVSITNYPQEGIEEYNKEDFDISPNKLLNFIKFRRSIRHYKNKPVEKEKLEKIIEAGRYTATGSNMQDVSYIVVQETLEEIKPIVWESLYEFALENINEKGVIGAYAPRWIKMYEDYKKDPEKDMLFFKAPVLLIVTALSPLNGGLASSNIELMANAEKLGVLFTGFIERALKNSEKAKKILGINKKEIISCMLIGYPDIKFKRTVPRKTAEISWK >NZ_AP017968.1|WP_096401813.1|677397_678045_+|GntR-family-transcriptional-regulator MKFIKLDDKKTLSEKVYDRLKELIMDGELERGTKITETSIAKMFDVSPTPVREAFRKLASDGLIEVASWKGVIVKGIEQKDLLEIYECREALEGMVGKLAVRNITEEDIKILEKILEKCNEAETPETLIELNTEFHNELLRIAKNERLSKLLNELMVVILYDRDISGRYSVRRKEIVQEHLDILEYLKKRDEKKVSELMEKHIRNGYEFIKNHNK >NZ_AP017968.1|WP_096401547.1|691692_693171_+|IS1182-family-transposase MQKPTNNNIFFQLNQPKLFNFLQYEISDNDPVRKLSSILEGLDFSSLMQVFSYKTKVHPIRMFSIIVYAYSRNLTSTRDIEMACHENIKFRFLLQDSKIPDHSTISRFLVKTEDILPDLFEQFVEKIFEMENISTETIYIDGTKIEAYANKYTFVWKKSIEKYRTRLDEKILELISNFNDDFNLQYDNFLEIYSYLSNLNFQIVKGRGKRKSKEQKYLELCAEYLEKYQKYSNHFKNLNGRNSYSKTDIDATFMRMKDDHMRNGQLKPGYNLQIGVISEYISSYEIFSNPSDSKTLIPFLEKISSQNLEIKNIVADAGYESISNYEYLEKMDYTSYIKPIYFEKSKIRKFKNDLNRVENLIYNHSENKLFRKDGLELEFLYSNKNNTVQYFWNPETNKKIKYNARFRILSNKSKENVSSNYGKQLRMNRSIQVEGAFAVLKEDMKLRKLKVRSKKSVLREICLFCIAYNFNRYLSRNINNRLGTTLHSLKVA >NZ_AP017968.1|WP_096401824.1|693362_693656_+|HU-family-DNA-binding-protein MTEGEFIRFYKKRNGLKNQQEVKEKIDLFWNTLLKVLNEGEKVTFKNWGTFEEKEVKPRKIMITKINKTGYTKAKKKIRFRAGAGLQDIVNGAGTDE >NZ_AP017968.1|WP_096401825.1|693648_693924_+|HU-family-DNA-binding-protein MNKRELAKVYSETSKGEISAREALKEIEVFLETMQEALEKSHSLIFRNIGIFEVKERKVRIIANPVNKEPMKIYPRKTVKFRESKNIFKIV >NZ_AP017968.1|WP_096404515.1|694006_694741_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MKENKYDDEIFFDKYSQMDRSKKGLAGAGEWHELKKMLPDFKGKRILDLGCGFGWHCIYAMEQGAVSAVGIDISSKMLEEAKKKTKFSNVEYIQMPIEDIHFEKNSFDIVISSLAFHYIESFENICRKVNECLVEDGDFVFSVEHPVFTAQGKEDWHYDENGNILHWPVDSYYLEGKRESVFLGEKVVKYHKTLTTYLNTLLKNNFNITGIVEAQPSSEMLESIPEMKDELRRPMMLLVSAKKR >NZ_AP017968.1|WP_096401826.1|694760_695132_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNKLEYINESEKSYDTIYNNKCPILYALKIIGQKWKLPILWHLSKFEMLHYNELKRCVAGITNTILTKCLRELESDGLVSRFQHRTIPPSVEYRLTERGKSLLPALNELYHWGKEQIELKDRK >NZ_AP017968.1|WP_096401827.1|695270_695930_+|flavodoxin-family-protein MKIIAINGSPRKKENTATMCNKFLEGAKSACSDVETEIINLFDLNYKGCISCFGCKRKEGNTYGKCIVKDELQPILEKVSTADGVVFGSPIYFGDITGQLRSFFERLLFPFSTYEEGYKKIAPKKMPTAMIYTMNVTEDLMKKFGYDVRLSNMELIIASIFRKPEIIYAFNTYQFSDYNKYKMEIFSEKVKAEHKRTQFPIDCQNAFDAGKRMVMQVQK >NZ_AP017968.1|WP_096401828.1|695979_697158_-|amidohydrolase MLIKELSEKYNDYIIDRRRYYHQYPELTLQEAETTKAIIKDLKEIGIEDIKTFKDFYGCVGILKGGKPGKTVLLRADIDALPVFEKTGLPFASKIEGKMHACGHDNHIAMLLGAAKILFDMKDKINGTVKFLFQPAEELAVGAKAVVEQGIMDDVDACYGIHIWSMVDSPKINMEIGERMASCDNFKITIKGFGSHGSAPHLGHDAIVAASAVIMGLQTIVSRINNPLNAAVITIGVVDAGQRFNIIADKAVLEGTVRTFNKKFRMEIEGLIRQISEDIAAGYRCTSETEYSYLTGAVINEDQHLVDLAQNAVKKLYGEDGLAELEKMTGSEDFSYLMEKAPGVYGFIGARSPKIPGSEKSNHHECFTVDEAALQRGAAVAAQFAFDFLTEK >NZ_AP017968.1|WP_096401829.1|697157_698354_-|amidohydrolase MDIKKLAEKYDDYIIEQRRYFHQHPELSFEEKETTQALKNQLEDMGIEVTTFDDYYGLVGIIHGGKKSGKTIMLRADIDALPIEEHADVPFASKNGKMHACGHDCHMAMLLGAVKILNEIKDELDGDVKILFQSAEESCYGAKYYVEKGILDDVDAVFGMHIWGTLDAPYFNLEAGGRMASCDNFKITVKGTSAHGSAPHLGHDAIVAAASMIMNLQTFVSRMNDPLNTLVLSIGTFKGGQRFNIIPNHVEMEGTIRTYSRELRKKMEANIKAIIENVANIFGCEVELEYDAFPNPVINEHKDLNRLAHDAAVKLYGEESLTTMPKLTGSEDFAYFMDKVPGFFGFLGCANEEIGACYSNHNDKFKVDETVLHRGSALYAQFAVDFLAEKSKNEGGNK >NZ_AP017968.1|WP_096401830.1|698392_699601_-|hypothetical-protein MVMNSLQAFIVLAIVYYAGEFIGTRTKAWIPSVFVTACLFLFGYWTFFPKNIVDIAGLGAPLGGLLAIMLCITHMGTIISIEQLKSQWKIICVTLAGLFGMVAFCWFICIPLIGRDYVIAGLPSLTGGIVAATMMNQAAAAKGLQVAAVLAIAMYAIQGFVGYPLTAIVLKKEGKILLERYHKGERGVLGNEGVDADTGNMAIKEETKKTLIPPMPEKYSTTAFILLKLMLVSYLSTVISGWTGGKLNAAVITLILGIVFTELGFLDKNSLQKSGSYGFLMYVLMIFVFSGLKDATPEMLLECIGPMFIIIVVGVIGMGILSVLVGKFLKVSWRMALATSLTALYGFPPNYILTEEAAKALAQTPEEKQFLMDNTLPQMIVGGFVTVTITSVIIAGIFVNLI >NZ_AP017968.1|WP_096401831.1|700027_701071_+|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MISFKNDYSEGALPYVMEALLKTNMEQTVGYGEDEYTAQAVEAIKKSIKCEDCYVRLLVGGTQTNLLTIAHSLRPHEAVIAADTGHISVHEGGAIEATGHKVIELKTSGDGKLNVELVRKSVELHEDTHMVQPKMVYISNPTEIGTLYSKQELIDLFEYCKSKDLYLYIDGARLASALASEKNDLKLEDYPKYSDVFYIGGTKCGLLFGEALVIVNKELRKSQFIRITKQKGATLAKGRLLGVQFAELFKGDNYYQVGKHSNEMAMTLKKAFLDKGFELKTDSYTNQQFPIFPVEMIEEIGKKYRYEFWEKVNDKYSAIRFVTSWATKKEHVDEFLKDFEELCKKYK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017968_4 | 973141-973372 | TypeVI-C |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_4
|
3 spacers
spacers of NZ_AP017968_4
>4.1|973175|32|NZ_AP017968|PILER-CR AATCAAGTTCATAATATTGTGAATCATCTTTA >4.2|973241|31|NZ_AP017968|PILER-CR TAAGAATTCTTCCATCTGGTTTCTCCAAGAT >4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR AGAATTTAATTCTAAATTAGCTCTTTCTAAAGT >4.4|973170|37|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT ATTTAAATCAAGTTCATAATATTGTGAATCATCTTTA >4.5|973236|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT TCTTCTAAGAATTCTTCCATCTGGTTTCTCCAAGAT >4.6|973301|38|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT GTTTCAGAATTTAATTCTAAATTAGCTCTTTCTAAAGT |
cas13c |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_4
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_4 >merge|NZ_AP017968|4|973141-973372|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAACATTTAAATCAAGTTCATAATATTGTGAATCATCTTTAGACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAACTCTTCTAAGAATTCTTCCATCTGGTTTCTCCAAGATGACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAACGTTTCAGAATTTAATTCTAAATTAGCTCTTTCTAAAGTGACTAAATCCATGTAAGTGAAATTTAAACTTTTC >NZ_AP017968|4|2|973141-973372|PILER-CR GACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAACATTTA AATCAAGTTCATAATATTGTGAATCATCTTTA GACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAACTCTTC TAAGAATTCTTCCATCTGGTTTCTCCAAGAT GACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAACGTTTC AGAATTTAATTCTAAATTAGCTCTTTCTAAAGT GACTAAATCCATGTAAGTGAAATTTAAACTTTTC >NZ_AP017968|4|3|973141-973367|CRISPRCasFinder GACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAAC ATTTAAATCAAGTTCATAATATTGTGAATCATCTTTA GACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAAC TCTTCTAAGAATTCTTCCATCTGGTTTCTCCAAGAT GACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAAC GTTTCAGAATTTAATTCTAAATTAGCTCTTTCTAAAGT GACTAAATCCATGTAAGTGAAATTTAAAC >NZ_AP017968|4|1|973141-973367|CRT GACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAAC ATTTAAATCAAGTTCATAATATTGTGAATCATCTTTA GACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAAC TCTTCTAAGAATTCTTCCATCTGGTTTCTCCAAGAT GACTAAATCCATGTAAGTGGAATTTAAAC GTTTCAGAATTTAATTCTAAATTAGCTCTTTCTAAAGT GACTAAATCCATGTAAGTGAAATTTAAAC
>NZ_AP017968.1|WP_096402050.1|969255_972732_+|hypothetical-protein MENKNKPNRGSIVRIIISNYDMKGIKELKVRYRKQAQLDTFILQTTLDKSNNSILINDFRVKAREKYRYSFTYDGKEKFSVPSNSIIVTKIDNAAPEKSKEIRKYKITLGIDEKCKTGSMITAAIEDLLEDDRVREGIRNPRRKASKTERKLITESICHNYAQITQCPVEEIDAVKIYKVKRFLSYRSNMLLFFALINDFLCKNLKNEKGEKINEIWEMENKGNNKKIDFDENYNILVAQIKEYFTKEIENYNNRIDNIIDKKELLKYSEEKEESEKNKKLEELNKLESQKLKILTDEEIKADVIKIIKIFSDLRHSLMHYEYKYFENLFENKKNEELAELLNLNLFKNLTLLRQMKIENKTNYLEGDEKFNILGKDVRAKNALGHYDLLVEQKNGFNNFINSFFVQDGTENLEFKKFIDENFIKAQKELEEDIKNCKESVKKLEKKLKENPKKSEDLEKKLEKKQKKLKELKKELEKMKQHYKRLNCAYVWDIHSSTVYKKLYNERKNLIEKYNKQLNGLQDKNAITGINAQLLRIKKEMEEITKSNSLFRLKYKMQIAYAFLEMEYEGNIAKFKNEFDCSKTEKIQEWLEKSEEYLNYCMEKEEDGKNYKFHFKEISEIKDTHNEEWLENTSENNLFKFYILTYLLLPMEFKGDFLGVVKKHYYDIKNVDFTDESEKELSQEQIDKMIGDSFFHKIRLFEKNTKRYEIIKYSILTSDEIKKYFELLELKVPYLEYKGIDEIGIFNKNIILPIFKYYQIIFRLYNDLEIHGLFNVSFDINKILSDLKSYGNENINFREFLYVIKQNNNSSTEEEYQKIWEKLESKYLKEPLLTPEKKEINKKTEKELKKLDGISFLRNKISHLEYEKIIEGVLKTAVNGENKKTSETNADKVFLNEKIKKIINFIKENELDKIELGFNFINDFFMKKEQFMFGQIKQVKEGNSDSITTERKRKEENNKRLKITYGLNYNNLSKIYEFSNTLREIVNSPLFLKDSTLLKKVDLSKVMLKEKPICSLQYENNTKLEDDIKRILLKDSSDIMGIYKAEVVKKLKEKLVLIFKYDEEKKIYVTVYDTSKAVPENISKEILVKRNNSKEEYFFEDNKKKYTTQYYTLEITKENELKVIPAKKLEGKEFKTEKKEENKLMLNNHYCFNVKIIY >NZ_AP017968.1|WP_096402049.1|967710_968523_+|MerR-family-transcriptional-regulator MYKIGLFSQITKTTIKALRYYDEVGLLKPSIINKENNYRYYTTEQLYTLHKILCLKQMGFSISEISTILNNDNIKQIINRKKINLEKEIACLVDQLTRLNNFSNENIKGDGFMNYQAAIKNTPECIVYYKKLSIANYNDYFKVIPQIGKEVIEANPDLKCMIPEYCFIQYLDDEYKEQNFSIEYCEAVIKFGKETESIKFKRLPSILVVSTLHKGDYNNLRDAYNYLFSWINKNNYECIDKAREVYIDGIWNKKNKEEWLTELQIPIKKL >NZ_AP017968.1|WP_096402048.1|966769_967477_+|GntR-family-transcriptional-regulator MPKESKYKIIENNIIKDIKEQKFKSGDRIPTEVELCEKFNTSRMTVNKAIVSLVSKGYIKRVSGRGSFVTGQIIEKPLKRIPRSFSEDMRSIGLEPGAILLEYRILRASELPQNIFQKLNVQSNEFVHFFSRLRTGNGMNVAISYDYVPCSTLPVIEAARLEGSFFEYVKECGLNLGSTDLVITATLPTSEQREKLKIENEALLKVSHITRLDDGRILEYIDTFYVGSMYAYRAV >NZ_AP017968.1|WP_096402047.1|965464_966589_+|SIS-domain-containing-protein MMKKDNLIMFDYICETPIALRKIIENRKEIADEFVKYYKDKEIEQIYVIGSGTSYHAGLAAKVFLEEIFGKKVFCMYPTQFARTEKVFCKKTLVIGMSQGGQSLSTVEGLESAKERELYTAAVSENPTALIFDYANTKTLIEVGNEKCGAKTKGFAGTTLTLMIMIMELLGTQNKLSEKQINEYLQRMEKVIANMDNVIDASVKWFEKIGKEFISAERVIVVGYDNNYADVLEGALKILETIRQGVSGYDIEEFFHGIYNSITDNAHIFYLASKSDYKPRTQKLIEILKEWTPHNYMISSPEGVENYSEKDLICNFTEDALFGQWEYILPLQIVACFGAEQLGIDPSIPKDPNFHKRIGSKKLDGIRDQYTVIK >NZ_AP017968.1|WP_096402046.1|964634_965465_+|PTS-system-mannose/fructose/sorbose-family-transporter-subunit-IID MEKIEKNEKRNSVTKSDLTKVFWRSFPLQACFNYERMQNVGFCYSLLPIFKKLYPKKEDMSAALKRHLEFFNTTPQTVTFITGACIALEEQNAKADGNFDMASIAALKAALMGPIAGIGDSFFWGTFRIIAAGIGCSLATHGSILGPILFLLIFNIPHYLARYYGLKIGYKGGIEFIANAQESGMIGILTNCAKVMGLCVVGAMIASMVKFTIPFTISITGATIKVQSIFDQILPSVLPLILTFIIYMLLKKGIKTTHVMFGLIIIGILGTYIGVL >NZ_AP017968.1|WP_096402045.1|963834_964632_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MLIKALLLGILAGFAIWDGRVFGQHMFDRPIVTGPIVGLILGDVHTGIVMGASLELVMMGIVGIGAATPPDVVAGGILSTAFAIMSGLSMDAAVALSLPIATLAQSVGILDRTINTTFLHWADKAAEEGNPDKVARAMWYGAFLFFFSEFIVVFLGVLLGSGTIASFINALPPFIISGLRVASGMLPALGIAILMQLIFDKANAAYLFVGFILTAVLGVSTVATAIVGAIIAYVIYQTSMNHKKEIDAIMAVMNSNSDDDLGGEL >NZ_AP017968.1|WP_096402044.1|963328_963814_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MIRLLRVDDRLIHGQVAVSWTSFIGADTLLVANEKATKDKVMQMAFNMAKPPQVLLSIKNIENAIAVINNPKYVDKKIFVVTGSLEDALSICEKCEGVKEICLGGIRKAEGKKMVERQVYLNNEEIEIMKKIKNLGKEVFLQAVPTEKKLSFEDVIKEYTK >NZ_AP017968.1|WP_096402043.1|962879_963320_+|hypothetical-protein MKNIVLVTHGSFAEGILTSLKLVYGNTENTASVTITASESIQEILSMIRKRIDEFKNDDPVVIITDIAGGSTTQAALEALSYKDNIYLLTGLSLGLLLEVVLADFTDSKAENIEILNEIIENSRQTINLITDLEENIDSVRDNCEL >NZ_AP017968.1|WP_096402042.1|960679_962389_-|hypothetical-protein MESKVKAVTDKMIEIFEFYEKEIREAIEKKETLPEDRFMPGWAKGIHFSWYHHKAQPEYDTKENNEITCFFEFNGIHVSYNRMKEQTDIDLKFLTSEIFKNEIVPTIQKWLQNKVDNEPYGELYNAAFGITMTLSVSRDPLPTDAPHMQGQVWEQTRITAKDEKRLNKRKELIYNFIKNKEYKTTDISEIDNSLVPICSAAVQDFLEEFGRNYLIEFFTALIEQAKKTRFSSTMTDLIYGFANGAAILTQVNESHTPNEEELALACWLSMMMLIHGTDKYERQYGRDYLKKAGELGYKEAKNILKFGTGQIPADIVQYKDKYVTCLGNDIDKIIDLKIKEECEEAYKAMIEFIICLIKAGFPNEYSIKFNSKVKEFLPIPDLKKTKANVFWNNCAKYPALHPLMKEYVNTIMDSYDYYSDADSEEAVPVGGYAVFALGLADISNGDIVQKFMEQNDSEHSISPSWFVGEYIDKFGITSENIPVVIACLINSNNHGYKGSNFDGLNNPDILSKFVEELENSEISSYSIYEIIESIWGGEDELKEAIDEASKVNQEYLQKILTLSEDNEEE >NZ_AP017968.1|WP_096402041.1|960037_960655_-|hypothetical-protein MKNVIKYLSLFLVWGIFLGIEIIFAVLFYKEATRFPVELVGPSRKEDAILAVIIITIVVFFACLVWFFVWKAIWKNQDIFESLLTAEEKENLSLNFAVYSLPLLLRENLLIINRGFSLERVNINSVIWIHTHKVIQKYRNSLMIYLYKTDGKKVKILLEYNKISLFETLLRKILSDYPQIKVTKGFFSKEYKKQKEIYKDLTRYN >NZ_AP017968.1|WP_096402051.1|974752_975559_+|ATP-binding-protein MVKCQFCGKDYVKNKNKYFKMLPEGIKKNLEYIPACSCLEDSKEREMEELEKKRMQECIKNRLKKCRDISVMDKKFLNSRFENADMSSNHMQLAKKYVESFLKKDKKEGLLFYGGIGTGKTFASACIANYLMERGKTVIVINLGLYFNKLSIEWGEGEKIILEQAEKCDLMIIDDFGAEKGLDKNQTGWRAEKIYNLIDGRYRSEKPLIISTNLNFSENENKCEITEKFSTQGHNRIRDRIIDMCFPVQIAGKSRRGMTQERFSEFIS >NZ_AP017968.1|WP_096402052.1|975969_976287_+|hypothetical-protein MAAGENQVILTVVQKEIVKVENAIKREKAILKNIDDITATLEHIAEQVEAGTAFPENSAYESYQEWQTSAEKEVKSYNTSLETIDKYRSLLGAYEFYVKNNTPEA >NZ_AP017968.1|WP_096402053.1|976359_976605_+|hypothetical-protein MKSNTELFFKIITTTGTFLLAYHKYILSLFDKKLDKRDCEKERLYAEKFRIENIKTLTDGIKRIEERMTGIEKELMKQYKN >NZ_AP017968.1|WP_096402054.1|976912_980746_+|autotransporter-outer-membrane-beta-barrel-domain-containing-protein MIKEMEKALKRYLKGKNRITMGVVVAFLLGSSFAFGDVTVKYEDSTIKILDNSGTITEIGTVTKNSDDEFTWTLPEGANITETVKIDDTVNTNNIKVNIVNSGTISSSGNGNYIGNGISSYSNSDSNTIGDITNSGSIRGNSTGGGKSGNGIFSDSDTLNSIIGNITNSGSISGNSTVEAHSGNGIYSYSDTSNSIIGNIKNNGNINGSTTGSGNKSGNGIYSYSDSASTIGDITNSGSIRGNSTGGDSSGNGIYSYSDSDGSTIGDITNSGSIRGNSTGGDKSGNGIYSYSETGASTIEDITNRGSISGNSTGGNDSGNGIYSYSKPSSTIGNITNSGTISGSTTGNGDKSGNGIFSYSKTGASTIGDIINSGTISGSTTGIGNYSGNGIYSTSSESIIGNIINYGIISGKSTSGSESENGIYSYSFRDDSISKSKIGNITNYGTISGNGRNVYSGNGIYSSSSTNLSSTSSKIGKITNYGIISGSTTGSGNYSGNGVFSSSSSGSSIIESISNTGVIMGSNNGIYIKGDSSSKIDKYSNYGLVIGQTPVKIEGGGTVNTLKEQGMAITLDGSGDITSIASGTGGSTGIYSIVNTQLRDNSGSAVSSGAVDSYDVYTSDQSISDTIINGAGVNSGTVTIEADKNFSLNGGVVNAYKTAVTVKDGASFTGTDVTINGGGLDGNTVVISGSAGANTVNISGNSFINGKVDLGDGDDILFIGNSTQINGDIDGGTGNGDILNFGSAVSRAVGNDNINLFHKISNMENININQKVTAFETSEITGAKDINIGKNGEFVLRIDTSKVDNTSGTDKITGHALYGNIGTISSTGGKLLLALNGVGNESIISFGNTQLDSSLVTGDEGKYQEDITLDTTSLLHSVGKIDLSNNEIKITAKSNLPTKPINPDNITYEKLNKIYHGILSVDKLENFNVDTDEKLSSFMGYLNDIYAGNPYSYSSELSRKSMGMFRDIVTENLFKADTGKWMIYGGLTHIDGGTKDTYYGKGYYTYDIGSSDIDADTKITGAYMLGEYGVSDTLTSGVIIGGNKLKSDLSNGSKVDGSAMYLGAYAKKYIGNLKVTAGLGFQYGDYDADRTAAGREITETRSYSSSYSDLTYDIYLNGRYSHNIRENLFLEPYGTLSYTYVDQDGADEGNKTLAIETDSKSFDYTSAKVGLDLKKVIPHEKGKSTLSVGASYTRLLNGADEEYITGRFKGGSNFDILVAHKNEHSLGLNAKYTLELENGILFDVKGTYSVERDSHNQSGKNKTKGEWIVGTGLGYKF >NZ_AP017968.1|WP_096402055.1|980767_981061_+|HU-family-DNA-binding-protein MTEGEFIRFYKKRNGLKNQQEVKEKIDLFWNTLLKVLDKGEKVTFKNWGTFEEKEVKPRKIMITKINKSGYTKSKKKIRFRAGAGLQDIVNGAGTDE >NZ_AP017968.1|WP_096402056.1|981053_981326_+|HU-family-DNA-binding-protein MNKRELAKVYSETSKGEISARKALKEIEVFLETMQEALQKSHSLIFRNIGIFEVKERKPRIIANPVTKEPMKIYPKKTVKFRESKNIQDK >NZ_AP017968.1|WP_096402057.1|981461_982613_-|aminotransferase-class-I/II-fold-pyridoxal-phosphate-dependent-enzyme MEINREVSKLQYSLIRTLNEESRKYSDAIDLTIGEPDIPSPKELITEALKYGAEHQLRYSPTGGGEKIRTLTADYYNRKYGSSYAADNVIINVGASEALSSCLKTILNSGDEVMVPVPFYPGYPPMISLCCAETVFVDITKTGFKITAELLEENYSSKTKALLLSNPCNPTGNVLTLEEMNTIADFIKKRDIFLISDEIYSELSFYNFHSFSSFDRIKDKLIIINGFSKSHSMTGWRIGYTIFPLEYRRYFLNTTLYTLSSPVTLSIAAAETALKKFEDRSELMNIYKERALYMKNSLIKLGFKVVEPKGAFYIFADYSEVSELNSFDFAMDILRKVQVAVVPGISFGTEKYFRISLTADIFKLKEAVERIEKYVKKIIQPIK >NZ_AP017968.1|WP_096402058.1|982622_983327_-|2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate-N-acetyltransferase MTNLNTAEELIAFIKNSQKRTPVKAYINGDINDIETSAQVFRGKGSYILIGESDEINRVLKKYRDNITDYYIENDRRNSGVPTLDYRNINARIEPGAVIRDKVTIGNNAVIMMGAVINIGAVIGDNTMIDMGAVLGGRATVGKNCHIGAGAVLAGVVEPPSAKPVIVEDGVLVGANAVIIEGVRIGTGAVVGAGAVVLEDVPAGAVVTGNPARIIKNVDEKTLGKTQLVDDLRK >NZ_AP017968.1|WP_096402059.1|983323_984037_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-reductase MEIIIHGTGAMGRLIKETAENNENIRITGFTDELATETGDVIIDFSHYSRLNSLLDYSKEKRIPLVIATTGYSNEILKKIKEAAREIPVLLSSNMSLGVSLLNDILERIVPVLYGNYDIEVIEKHHNKKVDSPSGTAKNLIETIKKSCSETMREQYGREGNRKREKNEIGIHSLRGGTIIGEHSVLFCGEDEVIEIKHTAMSKKIFAAGALKAAEFLIGKEAGIYTMKNIFENQEER >NZ_AP017968.1|WP_096402060.1|984027_984915_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MELFTGSGVALITPFDENGEVNYLRLRDILEFHLLNHTDAIIVTGTTGEGSTLTDEEKLSVIKFTVEVINNRIPVIAGTGSNDTRHAAEFSKSAEKAGADGLLVVTPYYNKGNENGIYEHYKTIAEGVKIPVILYNVPSRTGVNLSISLLKKLVQIENITALKEASGNISYVAEAAREVPELDIYSGNDDMIVPVLSLGGKGVISVAANIIPDISHEMVISFLNGEVEKARELQLKYNDLVNALFLETNPVPIKEAMNFLGYKTGNCRLPLGAMEESNRIKLIDILTAHEVARWK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017968_5 | 1741003-1741253 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_5
|
2 spacers
spacers of NZ_AP017968_5
>5.1|1741051|60|NZ_AP017968|PILER-CR GGGAAAGAAGCTAGTACAATAGGAAATATAACAAATAGTGGAACTATCAATGGTAGTACT >5.2|1741159|60|NZ_AP017968|PILER-CR TCTAATGGAGCTAGTACAATAGGGGATATAACAAATAGTGGAATTATAACTGGTAGTACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_5
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_5 >merge|NZ_AP017968|5|1741003-1741253|PILER-CR GTGGAAATGAATCAGGAAATGGAATATATTCTTATTCTGGGAAAGAAGCTAGTACAATAGGAAATATAACAAATAGTGGAACTATCAATGGTAGTACTACTGGTAGTGGAGCTAATTCAGGAAATGGAATATATTCTTATTCTTCTTCTAATGGAGCTAGTACAATAGGGGATATAACAAATAGTGGAATTATAACTGGTAGTACTACTAGTAGTGGACATTATTCAGGAAATGGAATTTATTCTTATTCT >NZ_AP017968|5|3|1741003-1741253|PILER-CR GTGGAAATGAATCAGGAAATGGAATATATTCTTATTCTGGGAAAGAAG CTAGTACAATAGGAAATATAACAAATAGTGGAACTATCAATGGTAGTACTACTGGTAGTG GAGCTAATTCAGGAAATGGAATATATTCTTATTCTTCTTCTAATGGAG CTAGTACAATAGGGGATATAACAAATAGTGGAATTATAACTGGTAGTACTACTAGTAGTG GACATTATTCAGGAAATGGAATTTATTCTTATTCT
>NZ_AP017968.1|WP_096402687.1|1739602_1739848_+|hypothetical-protein MKSNTELFFKIMTTTGTFLLAYHKYILSLFDKKLDMRDCEKERLYAEKFRIENIKTLTDGIKRIEERMTRIEKELMKQYKN >NZ_AP017968.1|WP_096402686.1|1739433_1739613_+|hypothetical-protein MKIIINFLKYFISKWLGTKAIEKVLIVVLKELVKRTESKIDDRIYEAVFGKLEGEKNEK >NZ_AP017968.1|WP_096402685.1|1739045_1739363_+|hypothetical-protein MAAGENQVILTVVQKEIVKVENAIKREKAILKNIDDITATLEHIAEQVEAGTAFPENSAYESYQEWQTSAEKEIKSYNTSLETIDKYRSLLGAYEFYVKNNTPEA >NZ_AP017968.1|WP_096402308.1|1738698_1738938_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MDREEYIYRKLEGLSSLNKALSQEMVASLGEWATIEEVAKYLKRHKNTIYDKVDGGDLLYRRIGPSILIYTRSIIFLLE >NZ_AP017968.1|WP_096402684.1|1737830_1738637_+|ATP-binding-protein MKKCKYCGKRYKENSIEHIEKLPDFIKEKIKFIPDCSCLEEMFKREMEKLEKERVYECMKNRVKKYKDISVVDNKFLESRFENADMSEKYMILAKRYADNFLVKNKKTGMLLYGDVGTGKTFASACIGNYLMEKGKTVMMINLGLYLNKLSREFGEAEKDILEQIEKCDLVIIDDFGTEKNLDDNSTGWRAEKIYNLIDTRYRSGKPLIISTNLIFNDDEEKCEITEKFSIQGKNRIRDRIIDMCFPVRVTGKSRRGITKDKFLEFMA >NZ_AP017968.1|WP_096402683.1|1736965_1737844_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNLSTEKNEKITDAIKVRGIYREGYGFIAKKIMKDRNLNIISKAIYAYICSYAGKGHNAFPSQKLISIDLGINKGTLVKYIKELKDSGYITVIQHKEKGKFSKNLYTVNILPQVVSPYRAGTDTEAVRHGQRDTNNNNINNNIKINNNSVNNNTHTEEQEEVIEKIEYKKEKIENAPVEIQQIIKKYIDLELPNFDYRPDNYILLGVYRELGAVKLFEALTLMSQSEFVKNNMSINTIFKIENLKKALNGSFKNKVKDIKKEFKKPEYEDFTEELIDEILSAETGGLESEKM >NZ_AP017968.1|WP_096402682.1|1736247_1736607_+|hypothetical-protein MEDHIILEFIDYTDDHWKYFIKFEEGEEEYNWHITCKFPNNRKHLIKVDLRDEKNLKKCMEQIFSDNSRYYEIEWLNGVEIVKKLLKKRSRRAITFEELKNEMKILEEIINKHNENEIE >NZ_AP017968.1|WP_096402681.1|1735180_1736044_+|5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine-nucleosidase MKNLFKKILLLMVFSASIAYAQVKSVTVPSHSVPKQPIIIQGPMPIEAQNLAARLENVREERTGNYIFYIGTLNDYPVIVAKTSKGMENTAAATAIAIERFKPAAVINQGTSGGHDKSLNVGDIVLGKRTFNAGNFKTLTKNEKEGSNPFEWLPMDVMASEGSAGENTDAEKVRYYEGNPMLLKAANAVKNQYKRGKVVEGTVASANFWNNEIDRINWLHEEFGSSVEEMEAASAALICEAYKVPFLTIRVLSNNKTNGGKYDPSTAKDCQDYVEKVVKEYIKMLEK >NZ_AP017968.1|WP_096402680.1|1733575_1734985_-|pyruvate-kinase-PykF MKKTKIICTIGPSSETKETLKELLKSGMNMMRLNFSHGNYEEHKEKIDNFRAAQAETGIRAALMLDIKGPKIRTTKLKDGKNVNIVSGQEFIITTDKSIIGDEKMVAVTYEDIIQDVKIGEKLLIDDGLLQFSIKEIVGNKIICIALNNGELGENKGVNLPKAKVSLPAISEKDRNDLIFGCQQGVDYVAASFIRKADDVKDVRKVLDENNGKNILIISKIETQEGIDNFDEILKVSDGIMVARGDLGVEIPIEDVPIAQKMMIEKCNAAGKVVITATQMLDSMIKNPRPTRAEVNDVANAILDGTDCIMLSGESANGKYPVEAVRVMTRISEKIDPLVSKKNYFAEDMTITTAVTKGTAEISESLDTKVIVVATQSGRAARDMRRYFPKAEIVAITNNEKTANQLLIVRGITPFIDGQPENLDSFFQLAEKVSVDLKLAKKDDIIIANCGESIFKVGTTNSIKLIKIS >NZ_AP017968.1|WP_096402679.1|1732741_1733488_+|MipA/OmpV-family-protein MKKVLIGLAAILASTTVFAENRYGVGIGAGVSNNIYKGDKTQAYPIPLFDVDYGNFYLKAATLGYRFYKNDKLSTSIYIDPLAGFPIKGKDMKNGYKNIDDRDFQVMGGIRLDAETGIYGIRTGLNAQFGEHGAEGRASLYKMYFANNKLTIIPGIHFRGFSKHYTDYYFGVTSKEAERSSRDNLKNEYKGGTAYSYGAVITLDYKLTENVSLDSFFGIEKFSSDISDSPIVERDWMYMIGGGIKYFF >NZ_AP017968.1|WP_096402689.1|1744002_1744296_+|HU-family-DNA-binding-protein MTEGEFIRFYKKRNGLKNQQEVKEKIDLFWNTLLKVLNEGEKVTFKNWGTFEEKEVKPRKIMIARINKTGYTKAKKKIRFRVGTGLQDIVNGAGTNE >NZ_AP017968.1|WP_096402690.1|1744288_1744558_+|HU-family-DNA-binding-protein MNKRELAKVYSEVSKGEISARKALKEIEVFLETMQEALQKSHSLIFINIGIFEVKERKPRVIANPVTKEPMKIYPRKTVKFRVSKKIER >NZ_AP017968.1|WP_096402691.1|1744929_1748616_+|hypothetical-protein MVEKILGRAKSSNQKRGINVAIGVVIGCFLIGGIGYSQEEVINKKTVYDEEIKWLWPFEKGSSKKKLEGNTGGEVLPPEPEIIPPKKDEIPWQHDPDGVIEDGLEQDSTDIYTGILKREWNKEKEKWEVVGLQDENKDGIADIYDPDGDFDGDGIKNKDDKNWALNAGKQNDLFISSNGLGYVDSGSIVRVLKENDWNADKIKNYLYSKGQLDLYKNGIKNLEDTDIKTITKLNKYNEKYNKENKIINSNDGTGEFENKLKEIEQNKLDEYNNFTGGTNNLLYNDIATEITGQNIREKDNIQVVNKGKINFTRVNPGQLGAKSNSFKAYNYGEIIGRIDLNGSGEPVSNDSIGQKGMAESNHLYNYGVIDVEIKIEGGYIGSVGQRIDNNMSYSKSVDNEIINYGYIKSINTGGGAAAGQDALATGGLKIELINSGKIYAEVNGAKSGNNGPEIVGQRIHGSNTQSSFLDINADIYNYNDIKLVLKQGDDGINQAHYLYGQKATIALVPPSTETAYLNSQLYNYGNIKIEDLDGKLGETGFLYGQYAETLNQGTDAENKTAQNNVYNYGNIDIISKGTTTSYGQRAAIKYNSINIRENQLYNYGKINISSENKNYGQFLTTWSTKEFFKSDIYNYGIIISEGKGTIGQSIEGYKGTANNYGQIRVKGGTKDTAGIKVIDGAIGFNYGMIEVDNKGIAPENMGTGMWADGKDSEAFNYGSIIVTGLTGTVENGMDTAYMRATNGGKVYNYGWLELKDSLDALTIGEGVSSSTRAGYRSAGDFDLKGEMKIMAETGKGDIYSKENFITAGGNGKEGNISGLENLTSSGVYEIFTTERKGDNGENIVDLVMNKTKNIEDLEKDSNTGRMVKELQLDNAVYGKDSEFARNNKEFSEMISRKVSEGESLENLLGLEYANLNGQIIESGKVLLENQEKVMSTDRTYLSGQFNKENNFDAVVINPQNESKIGIFHLNSDKDLDSQVSGTYRYELESTTLILQNNKNYMIGMNYSKLDYKNRNSDMKKTSVFAGHNYIKSLSDISEYRNYINGTLTFNTMDRNGKRDDFKSYDLNMRNEYVRELDIEGLTYSEFTAGVKTTVFGHEKIKEHGADLTSDRNIEVKKKIGISNEINLGFLMNKSYEIGENKRKNNFGISTYLGYKKELMPINDWRDEFTIGTGNYAKYNKPVKEHDLGVGLGVVSARYEIKDELSGTLSFSADTLGDTMTTFKIEYKF >NZ_AP017968.1|WP_096402692.1|1748633_1748921_+|HU-family-DNA-binding-protein MKENDFIKLYRNNRGLKNQKEAKEKIDAFWNTLFKAVETGEKVIFKGWGKFEKKDMKSRKIKIPKKDQLICTQPKSIIKFRAGKVFRKRLVGAYE >NZ_AP017968.1|WP_096402693.1|1748913_1749186_+|HU-family-DNA-binding-protein MNKKEFIKLYRSVYGENITVKESLEDIDIFLKTVEQVLKENGKVKFTKRGVFEVIDRKPRNISNPSTREIMTIYPQKTIRFRITKNIAKY >NZ_AP017968.1|WP_096404534.1|1749445_1750207_-|4,5-DOPA-dioxygenase-extradiol MPVIFVGHGSPMNAINSSKASVIWKKIGTILEKPKAILVISAHWYVNGTFIQSSNNPTQIYDMYGFPDELYKIKYPVKGNIELTKRILDLLDQDITLNDEWGIDHGTWSVLVHMYPNADIPVVQLSIDKTKSLKEHYALGKKLRQLRDEGILILASGNIVHNLRELNPYTETRKETAEFDNWIKENILNFNINNLINHSQHPYSVFAVPTPDHYIPLIYAVGASNNSDKIDIFNNYYELGSISMTSYLFDPAD >NZ_AP017968.1|WP_096402694.1|1750386_1751082_-|MmcQ/YjbR-family-DNA-binding-protein MLYQGKIFNNRKFIIKNLLSYGFIQKEKQYIYSKNLMNDTFNLIINIKETNEIDIKVLDIKLNEEYTPIYIQNISGGFVGKIRKEYETILSDIADKCTAKEIFKSDYAKKIVKYIAEKYKDEPEYLWDKTPNNAVFREKASEKWYAALLEVEKKKVGINEEGTIEIIDLKAAPDKILSIVDNINYLPGYHMNKKHWFTIKLDGSVSLKTIYSLIDDSFNIVKKKGLRTLKK >NZ_AP017968.1|WP_096402695.1|1751459_1751834_-|hypothetical-protein MKKFLFISILSFLFLFNFSLSEEIEKEEISQETVSVASALPEEGETKYNMPFSALFEKRGEYYYNKDNVCLSLGGFFTLTLGNTNKSIGNNIHINGKNIDEIAKGTFTITKIKNLYIMTEEYEK >NZ_AP017968.1|WP_096402696.1|1752629_1753211_+|hypothetical-protein MKKLLGIFLLLSCLTTALYSQEVSEKEGRKVLEQIRREIQAEEKAKQKAIEDAEKAKEAEEKARIAAEKAEEKKGKKIIEDIRRDMNESLEEKVFRSENTPEGRIAAAGAAFEIGRERMAFLKIEEEEIMKLEEVLGMEADENRVFLSQKFDEVYDKFKTNNNEIELLLLENEKLNEYLSRLDKMEQKVRAGN >NZ_AP017968.1|WP_096402697.1|1753227_1763517_+|autotransporter-associated-N-terminal-domain-containing-protein 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|
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017968_6 | 1759899-1760000 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_6
|
1 spacers
spacers of NZ_AP017968_6
>6.1|1759923|54|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder CTCTAGCTATAATGGAGTTATGACATCAGTACAAAATGATGATATGACTATGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_6
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_6 >merge|NZ_AP017968|6|1759899-1760000|CRISPRCasFinder AGGAACAGATGGAATAGGAATATACTCTAGCTATAATGGAGTTATGACATCAGTACAAAATGATGATATGACTATGACAGGAACAGATGGAATAGGAGTATA >NZ_AP017968|6|4|1759899-1760000|CRISPRCasFinder AGGAACAGATGGAATAGGAATATA CTCTAGCTATAATGGAGTTATGACATCAGTACAAAATGATGATATGACTATGAC AGGAACAGATGGAATAGGAGTATA
>NZ_AP017968.1|WP_096402696.1|1752629_1753211_+|hypothetical-protein MKKLLGIFLLLSCLTTALYSQEVSEKEGRKVLEQIRREIQAEEKAKQKAIEDAEKAKEAEEKARIAAEKAEEKKGKKIIEDIRRDMNESLEEKVFRSENTPEGRIAAAGAAFEIGRERMAFLKIEEEEIMKLEEVLGMEADENRVFLSQKFDEVYDKFKTNNNEIELLLLENEKLNEYLSRLDKMEQKVRAGN >NZ_AP017968.1|WP_096402695.1|1751459_1751834_-|hypothetical-protein MKKFLFISILSFLFLFNFSLSEEIEKEEISQETVSVASALPEEGETKYNMPFSALFEKRGEYYYNKDNVCLSLGGFFTLTLGNTNKSIGNNIHINGKNIDEIAKGTFTITKIKNLYIMTEEYEK >NZ_AP017968.1|WP_096402694.1|1750386_1751082_-|MmcQ/YjbR-family-DNA-binding-protein MLYQGKIFNNRKFIIKNLLSYGFIQKEKQYIYSKNLMNDTFNLIINIKETNEIDIKVLDIKLNEEYTPIYIQNISGGFVGKIRKEYETILSDIADKCTAKEIFKSDYAKKIVKYIAEKYKDEPEYLWDKTPNNAVFREKASEKWYAALLEVEKKKVGINEEGTIEIIDLKAAPDKILSIVDNINYLPGYHMNKKHWFTIKLDGSVSLKTIYSLIDDSFNIVKKKGLRTLKK >NZ_AP017968.1|WP_096404534.1|1749445_1750207_-|4,5-DOPA-dioxygenase-extradiol 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MVEKILGRAKSSNQKRGINVAIGVVIGCFLIGGIGYSQEEVINKKTVYDEEIKWLWPFEKGSSKKKLEGNTGGEVLPPEPEIIPPKKDEIPWQHDPDGVIEDGLEQDSTDIYTGILKREWNKEKEKWEVVGLQDENKDGIADIYDPDGDFDGDGIKNKDDKNWALNAGKQNDLFISSNGLGYVDSGSIVRVLKENDWNADKIKNYLYSKGQLDLYKNGIKNLEDTDIKTITKLNKYNEKYNKENKIINSNDGTGEFENKLKEIEQNKLDEYNNFTGGTNNLLYNDIATEITGQNIREKDNIQVVNKGKINFTRVNPGQLGAKSNSFKAYNYGEIIGRIDLNGSGEPVSNDSIGQKGMAESNHLYNYGVIDVEIKIEGGYIGSVGQRIDNNMSYSKSVDNEIINYGYIKSINTGGGAAAGQDALATGGLKIELINSGKIYAEVNGAKSGNNGPEIVGQRIHGSNTQSSFLDINADIYNYNDIKLVLKQGDDGINQAHYLYGQKATIALVPPSTETAYLNSQLYNYGNIKIEDLDGKLGETGFLYGQYAETLNQGTDAENKTAQNNVYNYGNIDIISKGTTTSYGQRAAIKYNSINIRENQLYNYGKINISSENKNYGQFLTTWSTKEFFKSDIYNYGIIISEGKGTIGQSIEGYKGTANNYGQIRVKGGTKDTAGIKVIDGAIGFNYGMIEVDNKGIAPENMGTGMWADGKDSEAFNYGSIIVTGLTGTVENGMDTAYMRATNGGKVYNYGWLELKDSLDALTIGEGVSSSTRAGYRSAGDFDLKGEMKIMAETGKGDIYSKENFITAGGNGKEGNISGLENLTSSGVYEIFTTERKGDNGENIVDLVMNKTKNIEDLEKDSNTGRMVKELQLDNAVYGKDSEFARNNKEFSEMISRKVSEGESLENLLGLEYANLNGQIIESGKVLLENQEKVMSTDRTYLSGQFNKENNFDAVVINPQNESKIGIFHLNSDKDLDSQVSGTYRYELESTTLILQNNKNYMIGMNYSKLDYKNRNSDMKKTSVFAGHNYIKSLSDISEYRNYINGTLTFNTMDRNGKRDDFKSYDLNMRNEYVRELDIEGLTYSEFTAGVKTTVFGHEKIKEHGADLTSDRNIEVKKKIGISNEINLGFLMNKSYEIGENKRKNNFGISTYLGYKKELMPINDWRDEFTIGTGNYAKYNKPVKEHDLGVGLGVVSARYEIKDELSGTLSFSADTLGDTMTTFKIEYKF 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MIKEMEKALKRYLKGKNRITMGVVVAFLLGSSFAFGDVTVKYEDSTIKILDNSGTITEIGTVTKNSDDEFTWTLPEGTNITETVKIDDTVNTNNIKVNIVNSGTISGSSTGGDKSGNGIYSYGASTIGNITNGGTINGSTTGSGTNSGNGIYSDGTSNGTIGNITNSGTISGSTTGSGSHSGNGIYSYSMNGASTSTIGNITNSGSISGSTTGSGSYSGNGIYSSSFSNSKIENITNSGTISGNSTGGNDSGNGIFSYSYSATSSNIIGNITNSGTISGNGTGGNESGNGIYSYSGKEASTIGNITNSGTINGSTTGSGANSGNGIYSYSSSNGASTIGDITNSGIITGSTTSSGHYSGNGIYSYSEPCSTIGNITNSGTISGKNGDGYYSGNGIYSSSSPNNSSDSSSSTIGNIVNSGTISGSSTSSGNIPGSGVESGNGIFSYSSTHAILSESKIGNITNYGTISGNNTGSGTNSGNGIYSFSSNGPAIIESISNYGVIMGSQNGIYIRGDSSSKINGYSNYGLVIGQTPVLVEKNWSGPNTFSVPEGKGMAITLESDGSIKTNGITSGNGDSTGIYSIINTTSQNGGVDAYNEYTNGENILDSIINGAGVSSGTVTINAGNFSLTNGIINAYKTAVTVKDGASFTGTDVTINGGGLDRTTPVISGDSGANTVNISGNSFINGKVDLGDGDDILFIGNSTQINGDIDGGTGNGDILNFGSAVSRAVGNDNINLFHKISNVEEININQKVTAFETSEITGAGNINIGKNGEFVLRIDTSKVDNTSGTDKITGHALYGNIGTISSTGGKLLLALNGVGNESIISFGNTQLDSSLVTGDEGKYQEDITLDTTSLLHSVGKIDLSNNEIKITAKFDLPTKPINPDNITYEKLNKIYHGILSVDKLENFNVDTDEKFSSFIGYLNDIYAGNPYSYSSELSRKSMEMFRDIVTENSFKADTGKWMIYGGLTHIDGGTKDTYYGKGYYTYDIGSSDIDSDTKITGAYMLGEYGVSDDFKAGVAVGGNKLKSDLSNDSKVDGDALYIGGYAKKYLGNLKVTAGAGFQYGDYDADRTAAGREITETRSYSSSYNDLTYDIYLNGRYSYNIGENLFLEPYATLSYTYVDQDGADEGNKTLAIETDSKSFDYTSAKVGLDLKKVIPHEKGKSTLSVGASYTRLLNGADEEHITGRFKGGSDFDILVAHKNEHSLGLNAKYTLELENGILFDVKGSYAVERDSHNNSGKNKTKGEWIVGTGLGYKF 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017968_7 | 1839000-1839481 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_7
|
7 spacers
spacers of NZ_AP017968_7
>7.1|1839029|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT CCAATTATAGATGAAACTACATATAATTTAGTTCAA >7.2|1839094|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT GCTTTATTTCCTGTTTTTGCATTTTCAAAGATATC >7.3|1839158|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT CTATTCCTAGTTTTAACTTGATAATTTTCCTCCT >7.4|1839221|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT ATTTTCCTCCTTACCAAGTTTCTTTATTGAATTCAT >7.5|1839286|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT AAGGATTAAACATGCTAGAGAGGTTGTGCCAAATA >7.6|1839350|38|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT TTTAGTAGATTCAGCAGAAAATGGGGTTGTGCCAAATA >7.7|1839417|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT ATATAAATTTGATAAATATTGTGTGGAAGATAGATA |
cas4,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_7
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_7 >merge|NZ_AP017968|7|1839000-1839481|CRISPRCasFinder,CRT ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAATCCAATTATAGATGAAACTACATATAATTTAGTTCAAATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAATGCTTTATTTCCTGTTTTTGCATTTTCAAAGATATCATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAATCTATTCCTAGTTTTAACTTGATAATTTTCCTCCTATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAATATTTTCCTCCTTACCAAGTTTCTTTATTGAATTCATATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAATAAGGATTAAACATGCTAGAGAGGTTGTGCCAAATAATAGAATATTAACTGAGAATGCAGGGAATTTTAGTAGATTCAGCAGAAAATGGGGTTGTGCCAAATAATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAATATATAAATTTGATAAATATTGTGTGGAAGATAGATAATAGAATAATAACTTATTAGTCTTTAAAT >NZ_AP017968|7|5|1839000-1839481|CRISPRCasFinder ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT CCAATTATAGATGAAACTACATATAATTTAGTTCAA ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT GCTTTATTTCCTGTTTTTGCATTTTCAAAGATATC ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT CTATTCCTAGTTTTAACTTGATAATTTTCCTCCT ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATTTTCCTCCTTACCAAGTTTCTTTATTGAATTCAT ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT AAGGATTAAACATGCTAGAGAGGTTGTGCCAAATA ATAGAATATTAACTGAGAATGCAGGGAAT TTTAGTAGATTCAGCAGAAAATGGGGTTGTGCCAAATA ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATATAAATTTGATAAATATTGTGTGGAAGATAGATA ATAGAATAATAACTTATTAGTCTTTAAAT >NZ_AP017968|7|2|1839000-1839481|CRT ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT CCAATTATAGATGAAACTACATATAATTTAGTTCAA ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT GCTTTATTTCCTGTTTTTGCATTTTCAAAGATATC ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT CTATTCCTAGTTTTAACTTGATAATTTTCCTCCT ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATTTTCCTCCTTACCAAGTTTCTTTATTGAATTCAT ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT AAGGATTAAACATGCTAGAGAGGTTGTGCCAAATA ATAGAATATTAACTGAGAATGCAGGGAAT TTTAGTAGATTCAGCAGAAAATGGGGTTGTGCCAAATA ATAGAATATTAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATATAAATTTGATAAATATTGTGTGGAAGATAGATA ATAGAATAATAACTTATTAGTCTTTAAAT
>NZ_AP017968.1|WP_096402759.1|1838203_1838842_+|hypothetical-protein MKNFSEKTVKNISICFLLLFLLLGLNHHYYFALMIIPIMIYFSTWKVVMFEDRIGRFSPIVIGLLLSAFIFYCQYYLQGEVVSTKEVIALKGTISLCIGLWLGNFIAKYIYMRIKFFLNRIGSKGEQKEYKIIKMIIDQKKYFKKPGSKYYINFYYLIADINGEEVKFLIEKDFYDKYLGKKSMNIKIKKGSFGIFYGINLIGLETEENFPS >NZ_AP017968.1|WP_096402758.1|1837553_1838207_+|epoxyqueuosine-reductase-QueH MKINYDLVMEKQLKEIEKNKIKPRLLLHSCCAPCSSAILEFLQEYFEITIYFFNPNITFQEEYLKRLEEQKEYHKKRGYQINVIEGRYNPEIDFFQNIKGLENEKEGGRRCHQCYRIRLEETVKKAKEDGYEYFTTVLSISPMKNAQWINEIGEELEKKYEVKFLNGDFKKKSRYLRSIEVSKEYELYRQDYCGCIFSKLEREKIEKEKREKNGGER >NZ_AP017968.1|WP_096402757.1|1837043_1837472_+|N-acetyltransferase MIRNLKNEDINTVMELWKNSTMEAQNFIPDSYWLENYDNVKNNYLPNSTTCVYEEGGEIKGFVSLIDEIFIGGLFIEVGSQRKGIGNRMLNFLKERYDKLQLAVYDKNIRAMNFYLKSGFKILNTEIDEKTKEKEHLMEWRR >NZ_AP017968.1|WP_172426502.1|1836883_1837051_+|hypothetical-protein MSIGEIEKLEKMIDELKEELHECDYEPERNALLKKYRTLAAQMEELKNLKRKKND >NZ_AP017968.1|WP_096402756.1|1836456_1836801_+|ArsC-family-transcriptional-regulator MIIQIFGKKNCNDSKKAERFFKERGVKIQFIDLKEKAPSKGELKSICSKYPLEELIDTDGIEYKKRNLQYMVFNLEETLLENPVLFKSPIGRFKNEITLGYQPEIWKNWTEKLK >NZ_AP017968.1|WP_096402755.1|1833645_1836444_+|AAA-family-ATPase MKINRIHLENYRIHDKLDVEFDSGINLLLGENGKGKSSILEAIGYALFDSELRGGNQREAIKYGKKSAKIEIEFTGIDGEDYIVTRKIPGSTSIYKKDNPELQLIGKEDRIRELCGIKGDLKGIYDNVIVAKQNEFISSFKEKDNEREKIFNKVFNTDIYKKIYEGYSREAVNRYEKDIEIEKNSMENIAEIMEDPADIKEKLEFEKGKAKEYNLSLTLLNDEKSKVKEFLNSYNSLNIEIEKLTGEINALSENIRNKNEELIKVSNSIKESEISEKIVKENRDKYEEYQKYSQEINILKVRKKELEKIKEECLLHEKEINLLEKLNSEIDGEIKVFKNKKENNESLLLERKNKLLEIEKEIEDKNVKSVEYKSELNKITPLLVKLEEFEKKLESGENNIKNFEIKLEEKLEEINKEKEKRKYLMSENLESQLSELEEYEKKKKLLEDEILKKDLLLKENEEAFEMLKTSYCPYLKEQCKNLDGKNIDEYFKDKREKYIKEIEDKKNTVKEINHKLINKNEIMEKIIKLDTLSKEINEKEAEFIQEKLKLETGKSKIENEKLKLKNFKLENNIESKEKLSEIRITLKTKIDSLDLLKSEDIKGGLEKEIENLNKNINIELKNIEAKKILIKENIKTLEEKRNFLGENKIFSNELITVNENIDKLEKKTDSLEKSSNLYLENYKKAMEKNQLEKNLENIKLIIENNEIKFKEKSALLELKRRDIESMDLEKFQEKDNKITSDIEEIREKLGAVNSEVETLKKKLEEIKKYENLLKNKRKYLEKLNMKLELTKIFREKIKSMGKEVSKNMLKEIEILATENFRKITGRGEKIIWSNEDKNKYVVFLDGDRGELKFEQLSGGEQVAVAISIRGAMSELFTESKFSIFDEPTNNLDTERRRSLADSIGEILKNLEQSIIVTHDDTFREMAQKVIEL >NZ_AP017968.1|WP_096402754.1|1832477_1833659_+|exonuclease-SbcCD-subunit-D MKILHCSDIHLGKKPFGTKEFSQKRYLDFFNAFEQAADRGIEKEIDIFLITGDLFDKKELSPDTLDRCEKVFLKLKNNNIQVLLIEGNHDNISGYDEINSWLGYLERKGYVRRGKYRASNEGYEFEKITIRDVNFYGVGYPGFAVDEVLEKLSEYLNENEKNIVMVHTALGGSEFLPGLVNTDIIKRFKDKVIYMAGGHLHSFISYPKDKPYFFIPGSTEFWNVLNEKNNSKGVIIFDTDTLEYEFSELSPRTRIEKEFTYENDIIGEFEEFSKNLGLTGEELVIVNIKLKDSGYVNVNELEKILESNGALKGYIKLRYPNSIFDRNLGEEGYYSVRDVEREIINYWEEFSDAEKITSYLQKFKEYQEENDREKDFFELFDTMLEEEIGNENK >NZ_AP017968.1|WP_096402753.1|1829637_1832475_+|ATP-dependent-helicase MENKEINLNKEQREAVTYTEGPLLVIAGPGSGKTRTLVERVVHMLIEKKISPEKIMVSTFTDRASKELIGRISERIKDYDSKININDIYMGTLHSICLRLIDEYIEYSDFSEGYQVLDELEQHFFIFSKIKEFKEIDGYNEFFKEIPAANNWGKAGKIQKWVNRINEEGRSLDYVKEEQDKKIGFLKEAHELYQKLLIEDNVIDFASIQREIYRILLNNNFVLEEIRKKIQYIMIDEYQDTNSIQEKIIFELGGNRKNICVVGDDDQGIYRFRGASVKNILEFPNKFDENECKIVTLDINYRSHKDIITFCNRWVSLINWKNFRYQKDIQPPADKEFVDNPGVIRIGGSSENQWKENIYKFIKNLKTMGKIEDYSQIAFLFKSVRFSRVKELIDYLEERDIPAYSPRSKNFFYRKEVKLVLGALLVLFPQSKPLVLDDVYIRKTAAYYNDCITALKKYLAKDKELYDWILKNREKNLDLGEEKGENISRIFYSLFAFKTFKELIDLNKNGAKEGREIYNLGILSQIFDKFENLSRIEYITKENIEKVVRYLFVTHIRLLFEKGIDEYENKETLLGAVSFMTIHQAKGLEFPVVIVGSLESEPDNRELTEEDRLEDVITLGNDFEPGDRKNIFDFWRVFYTAFSRAQNLLVLTSIENRAGGKELPSKIFKPVYETIPYWNDENFHFEKLQISKLKESETKEFLSYTGHILIYEDCPLRYRFYKEFEFKPLKTNKTSFGILVHKTIENIHKEVKSDVEKIYSDEELKELVEKNYNMLKKNVRVFLGENIRERAFEQIKRYVDSVKNNWNNIISSEEKEYSVENNYILEGTIDLLRKQGDYIELLDFKTGRFSGYNDSRYTSYERQIEIYSYMLREKYNPENLRAYLYYTGNKEEPMVEIKLEKNKIEQTISNFEDTVKKILNREFNRREFSEEKCRECEFKDYCRGE >NZ_AP017968.1|WP_096402752.1|1829291_1829483_-|hypothetical-protein MKEHKYVNFSQEYDVHYIINKYPKKEHEAVKEYLETLKTQKNLTHEDVFNLIEKNLKFKKIAK >NZ_AP017968.1|WP_005948307.1|1828400_1829045_-|DUF1275-domain-containing-protein MLCFLGGYINAICIVKYSYTVSHFTGNISKTAINISQGNFSEVFKVFTIIAAFVIGTTISGSLVDGREFNLKRRYGYASITLGSGLLILYSFLYDTLPFFYYLPFMIGVENGLFISYKGVVVRTSHITGSLTDMGVYIGHCIKGKTEDKWKVFFCLFTILSFMAGGFFGIEAFYVFKKEAFLIAAFLYIGVGLTYFSIRQRYQKILGYSDLKLY >NZ_AP017968.1|WP_096402760.1|1839701_1840397_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKSWVLELKVFLLEDIESHSAIEKIAAFIDSTFDKDEHWKEYHTDKKVKEYCFNSFYPVKVNTKKYNAGEIYTVQIRTISKELKEHFMKYLKDNITKELKGLIIKEREMEYRYIDKLVSVTPTILKTENGYWKKNISLVEYENRLKLNIIKKYNSIFNENLDENVDLFNFIEFKNKVPVKVKYKNINLLGDKLVLGIAKNETAQKLAFLCLSVGLGEMNARGFSYMNPRWV >NZ_AP017968.1|WP_096402761.1|1840415_1842209_+|hypothetical-protein MLRECVEIFTEIYNKKGERFITDSYELEPGDYFIVKSDRSYSHIKIERTKKIEENSNRRIIEDYEYLAERDYLSRLLDMNKPIDGKKQIHSNNYLSFFVKNNVLSEKKKELEESIEKYYEILKNPFLKYDKGEKKRVYTQLEEKLGKPSEEKIQKNYEWIKENLYKIKEEIKDGKEYIKIFFDEDIEEYKKENERYVIPNIYNSVDYNVIINDETYGLPNNNLNLNSKKPYLENKTRKEKYTVPYLLNEEEVFKQKKFFDYIYNMANSGKRNIYISSDKKEIIPLGNRESLSDDFTGYYLRIRKDKSESAIERYDIIPNYKAEIYPEIKILDCLGNGDKGKLEYGSSINKNSELAAVLNNLLFNGKLYGIIFENLKDLKIFDERIKNIANQYKEVFFELVYKGDMKKFADNYKKIFLELIKNSLCKKDYITEAYDMFNLMASIGDSIKNERGMTVNKHQEIKEKFRNIFETGVGEIENDEEYFFALGQLAKFLISRNRITVKTHELVVRVIESRDIEGLKREIYKLFRKYAYDIGFYSTKFNTLYERILGYEAESEEINMDRLLGGYLADSLIYEKSAKEENETNNGAKEINGKENE >NZ_AP017968.1|WP_096402762.1|1842211_1843156_+|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MKNRIYGVIGIRSMMANWNADFTGFPKTTSSGEVFGSDKALKYPMKKKWENEGEKVLYVKSLKVDSGEGKKGEIAVRPKSLRERYDEIFEANLKEEKDKTNVMKNLFKAIDVKNFGATFAEEKNNISITGAVQIGQGFNKYANTYVEEQQILSPFRDSSKDEKEGEASQSTLGTKIVSNEAHYFYPFVINPQVYRDFVKMGMTEGYTEEDYKKFKDAALTSATFFNSNSKLGCENEFALFIEVKEGYYLPELAQYIKFSKEKDCDVIELGFDELINQFKDNILSVEIYYNTLNVKVKHDIKGAKEYNIFTRKEV >NZ_AP017968.1|WP_096402763.1|1843158_1843914_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MEILKFTLSGRTAFFKIPEVNSYVYFSYGHIHKVSLLGLLGAVMGYGGYNSQEEKEYPEFYEKLKDIKISIMPKNTNGSFSKKIQFFNNSVGYASNEEGGNLIVKEQWLEDVEWDIFIKIEDTDIHKELKERMQNYNFEYTVYLGKNDHLATINNVEILQGENFLEDESEINSLFMKKSIEGFSEEKEFDFLAPEEDEIKYDYKYEEKLPLSLHNISNQYVVESLIFTNKKCILKNKSNFVQINNQIIEFY >NZ_AP017968.1|WP_096402764.1|1843921_1846507_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFEEELFSIEKYVKDEDKILAHISDRKNSETLLEHSILVVKYNKKIYEDKNLKIVFDKLAEKFFDQNEILKKFWNEMIINVSCMHDIGKLNINFQIDKMKNEIFERVPLCQSKRHSELSARIYVDYFSNKLIKLCSENKLNNDAIFKCFIFIILNSYVISRHHSSTKNLNEDFFCEITTNYERYKELFDEINNYCPNLKLSIKASKKFSQIFEKLKTTGEKWNKYVENKDWDSIDYYIYTKLLYSLLVSSDFYATSEYSSGKSIDNLNLLTNIDEYRSAFNSTEIYKGIKLHQKTGRYFKKDNINCYRSEMFIEAEKNLEMVNKENIVFLEAPTGSGKTVTSVNLALRLLEKNRELNKIFYIFPFNTLVEQTNSSLREIFQNSPLEESISVINSITPIKEVESEEEYKKDNIDYERSLLNRQFIHSPIVLTTHVHFFETLFGIDRESSFALPHLANSVVIMDEIQSYKNKIWKEIIIFLKKYAEILNIKIIIMSATLPNLSFLLDQEAKIPSLITDREKYYSNSIFRERVSLDFSLLEKEYGREELLKKIEKIIFEKHKNQKVVVEFIKKASAFEFYKKLLESDEVCKEDIFLITGDDNKAERKRIIKEAKNKERKSMILVATQVIEAGVDIDMDIGFKNISILDADEQFLGRINRSCKKKKCKAYFFQLDDGRNIYKGDVRIQDRFTLMNEEMREILKNKNFNEYYTIILEALEKFSKDENKEENIDDFRKDKVVQLNFEEIYKRLKLIADDRITKMIFFSRNIDIEGEKIAGNKVWNDFKEILLNNEMGYAERRVKLSKVMEKVDLFSYNIPVEMTYKLSYQSKIGDNILYIEDGEKYFVNGKFDRKKLQSDKDYEIIL >NZ_AP017968.1|WP_096402765.1|1846520_1847003_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MPINGTIINYFIHCKRQCYMHYNRINMEDESELVKMGKAMHEEKKTDEITIENIKVDKIKKDYLIEIKKSDADIEAAKMQVLYYLLKLKEKGIEKKGKIEVIEKNKSLRKSYEIELTAENEAYIKNIIEEIEKLVEQDELPPVEKNNKCKKCAYYSYCCI >NZ_AP017968.1|WP_096402766.1|1848014_1848299_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKGKNYNYIFLFYDINEKRVNKVFKICKKYLSHHQRSVFRGEITPSNLIKLRLELKDIIDKKEDFISIVKLVSEHYFDEEIIGTPWKDDENIFI >NZ_AP017968.1|WP_096402767.1|1849380_1850499_-|Mu-transposase-C-terminal-domain-containing-protein METEKELQLQRFKIIEPFLRKEKKLKEIEEETGISYATLKRWVNAYKKNGILGLDKKQRNDKDSYRAIDEDGVEYIEQICRESKETKISKLYSFCKEKLSNKYNISYPTFYRIVSNLDGFFNKSSNFHMKKIKKENQVYLILEIPLYILVSEEENEHKIVPQLLISIDTATLKPINHALNYNTSSIYTLLSFIRESILKVSYKSGKSVKPQEILVSSENINNKKILKEIYDNTSIKISEYFTENEETKKFISFLEEDIEKFYYQNNKILSYQNLKNFLDSYIYLDNKKYDFSLKYEMIQDIPYVREFDIFLQEASRKINKSSLRFNNFIYTNNFLTSLEGKKVIVKYNPLDTDILYLFFKNQFLGTANIATG >NZ_AP017968.1|WP_096402768.1|1850705_1852202_+|PTS-transporter-subunit-EIIC MKIFAEVQKIGKALMTPVAILPAAGLFLAFGNKLQFTLMEQAGQVIFSNLPLLFAIGAAIGLVGGDGVAALSAVVAILIMNTTMGIVSGAAEGIAAGDMSYAMVLGIPTLQTGVFGGLIAGIIAAVCYKKFYKTELPAFLGFFAGKRLVPIVTAVAAFIIGLAMPVIWQPVQVGLAKLSYLANETNTNVSTFIFGVIERSLIPFGLHHIFYAPFWYQFGEYTNAAGQVVNGDQAIWFAMLKDGVVNFSSDTYQGAGKFLTGKFVFMMFGLPAAALAMYQEAKPANKKLVGGILFSAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPILYGIHCIFAGLSFMLMNMLNVRIGMTFSGGLIDYIAFGVLPGTSGFQNNWYLVIVVGLCLSVVYYFGFRFAIRKFNLMTPGREETIAETVSASSGSEVKSDELAVGVLEALGGKDNLVSLDSCITRLRVEVKDTKIVSDQELKKLGASGILKVGTNGVQAIFGSKAQFICNDLKKMTGI >NZ_AP017968.1|WP_096402769.1|1852516_1852954_-|ACT-domain-containing-protein MKEKYLIVNKKILPDYFEKVVEARNLLTEGKVKGISDAAKIVGISRSTYYKYKDYVFLPSDNSIGRKALVSMMLEHKKGVLSEVLNYLSFVNGNIITINQNIPINNVASVVISLDISDITIPIEDIIIGIEQINYVSSTKLLSLE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017968_8 | 1848470-1849342 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_8
|
13 spacers
spacers of NZ_AP017968_8
>8.1|1848499|35|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAGAAGTAACATATCAGCAAGGTCTTGACAGAAA >8.2|1848563|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCCTCTAATCTCTAGTAACTGATCTATCTGATCCA >8.3|1848628|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTGTAGTAAAGTCAGCTAATTCTTTACTTTTTTGG >8.4|1848693|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAAATCCAGACAGAGCAATTCATGTTAATGAAGTA >8.5|1848758|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATCAGTAACCTTTTGGTCGAATTGCTGGAATGCG >8.6|1848823|37|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTATCTTAATACTTCCATCTTCATTATAATGTAA >8.7|1848889|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAGACTTCCCTGTTTTATAGTTCCATCTTCATTC >8.8|1848954|37|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTGCTTTAGTGTTCCAGTTGTTACCCTTTTACCAG >8.9|1849020|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATATATGTTAATTGATAATTTTAAAGATTTTTTT >8.10|1849085|35|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCGCTCCCTTACTAATACCCTTTCCTAAACCAG >8.11|1849149|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAATTTAAAGCAGCAGGAATAGATACTGAGGGAGA >8.12|1849214|33|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT GCAGATGACTATGTCGATCCTGACGACAGGCAG >8.13|1849276|38|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT GAAGATTTTCAATTGTATATGTATAAATAATCATTAAA |
cas2,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_8
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_8 >merge|NZ_AP017968|8|1848470-1849342|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATGGAGAAGTAACATATCAGCAAGGTCTTGACAGAAAGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATTGCCTCTAATCTCTAGTAACTGATCTATCTGATCCAGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATGCTGTAGTAAAGTCAGCTAATTCTTTACTTTTTTGGGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATATAAATCCAGACAGAGCAATTCATGTTAATGAAGTAGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATCTATCAGTAACCTTTTGGTCGAATTGCTGGAATGCGGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATTTGTTATCTTAATACTTCCATCTTCATTATAATGTAAGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATTAAAGACTTCCCTGTTTTATAGTTCCATCTTCATTCGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATATCTGCTTTAGTGTTCCAGTTGTTACCCTTTTACCAGGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATATATATATGTTAATTGATAATTTTAAAGATTTTTTTGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATTTCCGCTCCCTTACTAATACCCTTTCCTAAACCAGGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATTAAATTTAAAGCAGCAGGAATAGATACTGAGGGAGAGTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAATGCAGATGACTATGTCGATCCTGACGACAGGCAGGTAGAATATCAACTTATTAGTTTTTAAATGAAGATTTTCAATTGTATATGTATAAATAATCATTAAAGTAGAATATCAACTTATTAGTTTTAAATA >NZ_AP017968|8|4|1848470-1849213|PILER-CR GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT GGAGAAGTAACATATCAGCAAGGTCTTGACAGAAA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TGCCTCTAATCTCTAGTAACTGATCTATCTGATCCA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT GCTGTAGTAAAGTCAGCTAATTCTTTACTTTTTTGG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATAAATCCAGACAGAGCAATTCATGTTAATGAAGTA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT CTATCAGTAACCTTTTGGTCGAATTGCTGGAATGCG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TTGTTATCTTAATACTTCCATCTTCATTATAATGTAA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TAAAGACTTCCCTGTTTTATAGTTCCATCTTCATTC GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATCTGCTTTAGTGTTCCAGTTGTTACCCTTTTACCAG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATATATATGTTAATTGATAATTTTAAAGATTTTTTT GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TTCCGCTCCCTTACTAATACCCTTTCCTAAACCAG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TAAATTTAAAGCAGCAGGAATAGATACTGAGGGAGA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT >NZ_AP017968|8|6|1848470-1849342|CRISPRCasFinder GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT GGAGAAGTAACATATCAGCAAGGTCTTGACAGAAA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TGCCTCTAATCTCTAGTAACTGATCTATCTGATCCA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT GCTGTAGTAAAGTCAGCTAATTCTTTACTTTTTTGG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATAAATCCAGACAGAGCAATTCATGTTAATGAAGTA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT CTATCAGTAACCTTTTGGTCGAATTGCTGGAATGCG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TTGTTATCTTAATACTTCCATCTTCATTATAATGTAA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TAAAGACTTCCCTGTTTTATAGTTCCATCTTCATTC GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATCTGCTTTAGTGTTCCAGTTGTTACCCTTTTACCAG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATATATATGTTAATTGATAATTTTAAAGATTTTTTT GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TTCCGCTCCCTTACTAATACCCTTTCCTAAACCAG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TAAATTTAAAGCAGCAGGAATAGATACTGAGGGAGA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT GCAGATGACTATGTCGATCCTGACGACAGGCAG GTAGAATATCAACTTATTAGTTTTTAAAT GAAGATTTTCAATTGTATATGTATAAATAATCATTAAA GTAGAATATCAACTTATTAGTTTTAAATA >NZ_AP017968|8|3|1848470-1849342|CRT GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT GGAGAAGTAACATATCAGCAAGGTCTTGACAGAAA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TGCCTCTAATCTCTAGTAACTGATCTATCTGATCCA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT GCTGTAGTAAAGTCAGCTAATTCTTTACTTTTTTGG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATAAATCCAGACAGAGCAATTCATGTTAATGAAGTA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT CTATCAGTAACCTTTTGGTCGAATTGCTGGAATGCG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TTGTTATCTTAATACTTCCATCTTCATTATAATGTAA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TAAAGACTTCCCTGTTTTATAGTTCCATCTTCATTC GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATCTGCTTTAGTGTTCCAGTTGTTACCCTTTTACCAG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT ATATATATGTTAATTGATAATTTTAAAGATTTTTTT GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TTCCGCTCCCTTACTAATACCCTTTCCTAAACCAG GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT TAAATTTAAAGCAGCAGGAATAGATACTGAGGGAGA GTAGAATATCAACTGAGTAGTTTTTAAAT GCAGATGACTATGTCGATCCTGACGACAGGCAG GTAGAATATCAACTTATTAGTTTTTAAAT GAAGATTTTCAATTGTATATGTATAAATAATCATTAAA GTAGAATATCAACTTATTAGTTTTAAATA
>NZ_AP017968.1|WP_096402766.1|1848014_1848299_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKGKNYNYIFLFYDINEKRVNKVFKICKKYLSHHQRSVFRGEITPSNLIKLRLELKDIIDKKEDFISIVKLVSEHYFDEEIIGTPWKDDENIFI >NZ_AP017968.1|WP_096402765.1|1846520_1847003_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MPINGTIINYFIHCKRQCYMHYNRINMEDESELVKMGKAMHEEKKTDEITIENIKVDKIKKDYLIEIKKSDADIEAAKMQVLYYLLKLKEKGIEKKGKIEVIEKNKSLRKSYEIELTAENEAYIKNIIEEIEKLVEQDELPPVEKNNKCKKCAYYSYCCI >NZ_AP017968.1|WP_096402764.1|1843921_1846507_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MFEEELFSIEKYVKDEDKILAHISDRKNSETLLEHSILVVKYNKKIYEDKNLKIVFDKLAEKFFDQNEILKKFWNEMIINVSCMHDIGKLNINFQIDKMKNEIFERVPLCQSKRHSELSARIYVDYFSNKLIKLCSENKLNNDAIFKCFIFIILNSYVISRHHSSTKNLNEDFFCEITTNYERYKELFDEINNYCPNLKLSIKASKKFSQIFEKLKTTGEKWNKYVENKDWDSIDYYIYTKLLYSLLVSSDFYATSEYSSGKSIDNLNLLTNIDEYRSAFNSTEIYKGIKLHQKTGRYFKKDNINCYRSEMFIEAEKNLEMVNKENIVFLEAPTGSGKTVTSVNLALRLLEKNRELNKIFYIFPFNTLVEQTNSSLREIFQNSPLEESISVINSITPIKEVESEEEYKKDNIDYERSLLNRQFIHSPIVLTTHVHFFETLFGIDRESSFALPHLANSVVIMDEIQSYKNKIWKEIIIFLKKYAEILNIKIIIMSATLPNLSFLLDQEAKIPSLITDREKYYSNSIFRERVSLDFSLLEKEYGREELLKKIEKIIFEKHKNQKVVVEFIKKASAFEFYKKLLESDEVCKEDIFLITGDDNKAERKRIIKEAKNKERKSMILVATQVIEAGVDIDMDIGFKNISILDADEQFLGRINRSCKKKKCKAYFFQLDDGRNIYKGDVRIQDRFTLMNEEMREILKNKNFNEYYTIILEALEKFSKDENKEENIDDFRKDKVVQLNFEEIYKRLKLIADDRITKMIFFSRNIDIEGEKIAGNKVWNDFKEILLNNEMGYAERRVKLSKVMEKVDLFSYNIPVEMTYKLSYQSKIGDNILYIEDGEKYFVNGKFDRKKLQSDKDYEIIL >NZ_AP017968.1|WP_096402763.1|1843158_1843914_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MEILKFTLSGRTAFFKIPEVNSYVYFSYGHIHKVSLLGLLGAVMGYGGYNSQEEKEYPEFYEKLKDIKISIMPKNTNGSFSKKIQFFNNSVGYASNEEGGNLIVKEQWLEDVEWDIFIKIEDTDIHKELKERMQNYNFEYTVYLGKNDHLATINNVEILQGENFLEDESEINSLFMKKSIEGFSEEKEFDFLAPEEDEIKYDYKYEEKLPLSLHNISNQYVVESLIFTNKKCILKNKSNFVQINNQIIEFY >NZ_AP017968.1|WP_096402762.1|1842211_1843156_+|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MKNRIYGVIGIRSMMANWNADFTGFPKTTSSGEVFGSDKALKYPMKKKWENEGEKVLYVKSLKVDSGEGKKGEIAVRPKSLRERYDEIFEANLKEEKDKTNVMKNLFKAIDVKNFGATFAEEKNNISITGAVQIGQGFNKYANTYVEEQQILSPFRDSSKDEKEGEASQSTLGTKIVSNEAHYFYPFVINPQVYRDFVKMGMTEGYTEEDYKKFKDAALTSATFFNSNSKLGCENEFALFIEVKEGYYLPELAQYIKFSKEKDCDVIELGFDELINQFKDNILSVEIYYNTLNVKVKHDIKGAKEYNIFTRKEV >NZ_AP017968.1|WP_096402761.1|1840415_1842209_+|hypothetical-protein MLRECVEIFTEIYNKKGERFITDSYELEPGDYFIVKSDRSYSHIKIERTKKIEENSNRRIIEDYEYLAERDYLSRLLDMNKPIDGKKQIHSNNYLSFFVKNNVLSEKKKELEESIEKYYEILKNPFLKYDKGEKKRVYTQLEEKLGKPSEEKIQKNYEWIKENLYKIKEEIKDGKEYIKIFFDEDIEEYKKENERYVIPNIYNSVDYNVIINDETYGLPNNNLNLNSKKPYLENKTRKEKYTVPYLLNEEEVFKQKKFFDYIYNMANSGKRNIYISSDKKEIIPLGNRESLSDDFTGYYLRIRKDKSESAIERYDIIPNYKAEIYPEIKILDCLGNGDKGKLEYGSSINKNSELAAVLNNLLFNGKLYGIIFENLKDLKIFDERIKNIANQYKEVFFELVYKGDMKKFADNYKKIFLELIKNSLCKKDYITEAYDMFNLMASIGDSIKNERGMTVNKHQEIKEKFRNIFETGVGEIENDEEYFFALGQLAKFLISRNRITVKTHELVVRVIESRDIEGLKREIYKLFRKYAYDIGFYSTKFNTLYERILGYEAESEEINMDRLLGGYLADSLIYEKSAKEENETNNGAKEINGKENE >NZ_AP017968.1|WP_096402760.1|1839701_1840397_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKSWVLELKVFLLEDIESHSAIEKIAAFIDSTFDKDEHWKEYHTDKKVKEYCFNSFYPVKVNTKKYNAGEIYTVQIRTISKELKEHFMKYLKDNITKELKGLIIKEREMEYRYIDKLVSVTPTILKTENGYWKKNISLVEYENRLKLNIIKKYNSIFNENLDENVDLFNFIEFKNKVPVKVKYKNINLLGDKLVLGIAKNETAQKLAFLCLSVGLGEMNARGFSYMNPRWV >NZ_AP017968.1|WP_096402759.1|1838203_1838842_+|hypothetical-protein MKNFSEKTVKNISICFLLLFLLLGLNHHYYFALMIIPIMIYFSTWKVVMFEDRIGRFSPIVIGLLLSAFIFYCQYYLQGEVVSTKEVIALKGTISLCIGLWLGNFIAKYIYMRIKFFLNRIGSKGEQKEYKIIKMIIDQKKYFKKPGSKYYINFYYLIADINGEEVKFLIEKDFYDKYLGKKSMNIKIKKGSFGIFYGINLIGLETEENFPS >NZ_AP017968.1|WP_096402758.1|1837553_1838207_+|epoxyqueuosine-reductase-QueH MKINYDLVMEKQLKEIEKNKIKPRLLLHSCCAPCSSAILEFLQEYFEITIYFFNPNITFQEEYLKRLEEQKEYHKKRGYQINVIEGRYNPEIDFFQNIKGLENEKEGGRRCHQCYRIRLEETVKKAKEDGYEYFTTVLSISPMKNAQWINEIGEELEKKYEVKFLNGDFKKKSRYLRSIEVSKEYELYRQDYCGCIFSKLEREKIEKEKREKNGGER >NZ_AP017968.1|WP_096402757.1|1837043_1837472_+|N-acetyltransferase MIRNLKNEDINTVMELWKNSTMEAQNFIPDSYWLENYDNVKNNYLPNSTTCVYEEGGEIKGFVSLIDEIFIGGLFIEVGSQRKGIGNRMLNFLKERYDKLQLAVYDKNIRAMNFYLKSGFKILNTEIDEKTKEKEHLMEWRR >NZ_AP017968.1|WP_096402767.1|1849380_1850499_-|Mu-transposase-C-terminal-domain-containing-protein METEKELQLQRFKIIEPFLRKEKKLKEIEEETGISYATLKRWVNAYKKNGILGLDKKQRNDKDSYRAIDEDGVEYIEQICRESKETKISKLYSFCKEKLSNKYNISYPTFYRIVSNLDGFFNKSSNFHMKKIKKENQVYLILEIPLYILVSEEENEHKIVPQLLISIDTATLKPINHALNYNTSSIYTLLSFIRESILKVSYKSGKSVKPQEILVSSENINNKKILKEIYDNTSIKISEYFTENEETKKFISFLEEDIEKFYYQNNKILSYQNLKNFLDSYIYLDNKKYDFSLKYEMIQDIPYVREFDIFLQEASRKINKSSLRFNNFIYTNNFLTSLEGKKVIVKYNPLDTDILYLFFKNQFLGTANIATG >NZ_AP017968.1|WP_096402768.1|1850705_1852202_+|PTS-transporter-subunit-EIIC MKIFAEVQKIGKALMTPVAILPAAGLFLAFGNKLQFTLMEQAGQVIFSNLPLLFAIGAAIGLVGGDGVAALSAVVAILIMNTTMGIVSGAAEGIAAGDMSYAMVLGIPTLQTGVFGGLIAGIIAAVCYKKFYKTELPAFLGFFAGKRLVPIVTAVAAFIIGLAMPVIWQPVQVGLAKLSYLANETNTNVSTFIFGVIERSLIPFGLHHIFYAPFWYQFGEYTNAAGQVVNGDQAIWFAMLKDGVVNFSSDTYQGAGKFLTGKFVFMMFGLPAAALAMYQEAKPANKKLVGGILFSAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPILYGIHCIFAGLSFMLMNMLNVRIGMTFSGGLIDYIAFGVLPGTSGFQNNWYLVIVVGLCLSVVYYFGFRFAIRKFNLMTPGREETIAETVSASSGSEVKSDELAVGVLEALGGKDNLVSLDSCITRLRVEVKDTKIVSDQELKKLGASGILKVGTNGVQAIFGSKAQFICNDLKKMTGI >NZ_AP017968.1|WP_096402769.1|1852516_1852954_-|ACT-domain-containing-protein MKEKYLIVNKKILPDYFEKVVEARNLLTEGKVKGISDAAKIVGISRSTYYKYKDYVFLPSDNSIGRKALVSMMLEHKKGVLSEVLNYLSFVNGNIITINQNIPINNVASVVISLDISDITIPIEDIIIGIEQINYVSSTKLLSLE >NZ_AP017968.1|WP_096402770.1|1852963_1853839_-|homoserine-kinase MITVKVPATTANIGPGFDTLGLAFKLYSYFTFKRIEYGLRIVGCEEKYQNDSNLVYTSFKKTLEILNYPVTGIEISIKSDIPVSRGLGSSAACIVGGVMGANIIAGNPLSKDEIFKICNDIEGHPDNIAPALFGGLTASLVEDGIPYTVQYNISENLYFCALVPDFRLSTVEARKVLPSEIPYQDAIYNVSRIAVLLKALENGDEILIKKALSDKLHEKYRNVLINEYEEVKEICEKNGNTALFISGSGPTLMNIAKTKDFQWKIEYEIKNLKNSWIIRTLDIDMKGAVVL >NZ_AP017968.1|WP_096402771.1|1853835_1855314_-|threonine-synthase MNSKFESTREQNIACSASQAVIKGIASDGGLFVRRDMENLKINISELKGKKYTEIAEIILSKILDDYPEKSIKYCVESAYDKKFSSNDITPLVKVGNDYILELFHGPTSAFKDVALSVLPYLSTEALKLNKIKEKILILTATSGDTGKAALEGFKNIEGIKILVFFPNDGVSKVQEKQMISQDGNNTYVYAINGNFDDAQSEVKKIFTDEEVKKKLKNKNYSLSSANSINIGRLVPQIVYYFYSYMKLAESNEISLGEKVNFTVPTGNFGDILAGYYAELMGLPVNKLICASNENNVLYDFIQTGTYDRNRPFYKTLSPSMDILISSNLERLIYHLSGNDNKYIKSLMDELKSDGKYTVTQEIKSCIDNLFYAGYTNDLQTSETIKNVYNEYNYLLDTHTAVAYNVMKEFKEKDSNHKNIVLATASPYKFSKAVYESLFGENNSDEFKIMELLSEKTGVPIPENLKNLKNKKDIHTSIINKEDMKNCFEVIL >NZ_AP017968.1|WP_096402772.1|1855428_1856601_+|homoserine-dehydrogenase MKIGLLGFGTVGSGVYEIVKSSPTCFFNDIEVKKILVKDEKDKIMDIITTDAEEILNDKDIDLVVEVMGGIHPAYEYIIKSLKNKKNVVTANKAVVAAYLKEFTKTAYENGVSFEYEASVCGGIPWIKSLEKAKRIDEISEVYGIFNGTSNFILDNMTKKGYEFQEILKKAQEKGYAESDPSADIDGIDIMRKLLITSSLAFECEIPEKEIDVFGIRNIKKEDIEYFNNIGYTVKLIAKGKKAENRYCAVVEPVLFKNERIEAAVPQNFNIGTICGKTIGELKFYGQGAGKLPTGNAIVQDIIDIMEAKGNLIERKFEKSLIKDSSLIIGKYYVRINDEQFAEDNSDIIEKKLEYSGNIIYITKEIDCSAMKKAAEKYLEKEIFYARFEN >NZ_AP017968.1|WP_096402773.1|1856619_1857942_+|aspartate-kinase MIKVAKFGGSSLADAEQFKKVKNIIENDENRRIVVVSAAGKRFKEDNKITDLLYLCYAHIKYSVSYESMFSIIENRYLEIRDELGLKCNLESEFRIIKSRMKKGMNRDYLVSRGEYLAGMLMAEYLGYDFIDAENVIFFDYNGKVDTEKTREAMEKAVERSPKGVIPGFYGTLPNGEIKLFSRGGSDITGAIVSDCIKAAIYENWTDVSGILMADPNVVKDPKRIEIITYSELRELSYMGANVLHTDAVAPVKKANIPINIRNTNAPENPGTIIVDENNELLKNAKNYFITGIAGKKDFSVISIYKDHMSGEVGAIRKALEIFEKYKVSIEHIPTGIDTFSIVAATENIKKYLYEIVADLKRECEPSEVKVIDNISLIATVGRNMADRPGMSGKLFAAIGNSGVNIRMISQGSDEINIIVGVENEDFEKAINVIYNNFVI >NZ_AP017968.1|WP_096402774.1|1857954_1858974_+|aspartate-semialdehyde-dehydrogenase MRKYNIGILGATGAVGKEMLKVLEERNFPVENIRLFASSRSAGKKVFFKGKEYEIEEAKKGIYEGIDILLGAVENEQAKEFIPTAIENGAIVIDNSSAYRMADDVPLIVPEVNPEAVEVHKGLIANPNCATIIGLVAVNELNKYSKIERMIVSTYQAVSGAGSGGITELDAEIKAIAEGKDFTMETFPYQIAYNLIPQIGGFDEKGYSSEEMKFQNEGRKILNNPKLKVNCTCIRVPVYRSHSESITIEFKDRIDAEKAREILRKADGVKLVDDPQNKKYPMPLDTSDQDLVYVGRIREDISNDEGKGLTLWCCGDQVRKGAATNAVQIAELLIKKEIK >NZ_AP017968.1|WP_096402775.1|1859182_1860265_+|HDOD-domain-containing-protein MALEKIVMLGDSIIDWNYSSKYINYGHAGFKTRDVLWLLEEKPEIKGDIGILLVGVNDILCGFQEEYTLDYYNKTVEILRQRFKKLIILSMLPSDTPRINAKSKMLNTKLKNLYNEYFFDIYNLFLDVRELLADKYTVDGIHLNNDGYDIFNKALTEIAEKVKYEEIGYPDRETAERELEEAGELNPGQWISHSKYTALACEKIAEYCPHMNSEKAYIIGLLHDIGRRVGIVQERHMLEGYKYCMSKGWKEVAQICITHSFMLKDITTSIGKWDMTKEDYEFMKKFITEAVYDDYDKLVQMCDSLALPNGFCFLEKRFVDVAMRYGVNEYTTKRWGAIYDIKKYFEDIIGKPIEDILEIS >NZ_AP017968.1|WP_096402776.1|1860320_1863374_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MNIIDYSIKNRTVTLFLTFVIIAGGIFSYVNLGKLEDPEFRVKEAIVVTLYPGADPHQVELQVTDEIESALQQIANVEYIESVSKAGYSEVKIKLNESLKAEVIDQYWDNVRKKINDVQKNLPTGAISSVVLDDYGDVYGMFFAVTSEGYSKEELNRYVNYIKRELHSIPGVSKTAVYGKVDSAVEVVIDREKIDALGINEKLILTSFISQNLPAYSNSIEHGDMKIRVDINEAFNSLEDIENLVIFSKDNLRGGEETVFLKDIAVVKKSFSTPVKSKMRYNMKEAMGLMLSPEVGTNVINTGKAIDKKLDEIKKNLPMGIEIEKVYYQPELVTNAIGQFVNNLVASVVVVVGVLLFTMGMRSGLIIGSGLILSILGTLIYMLAVKMDMQRVSLGSFIIAMGMLVDNAIVVVDGTLTSLEKGENRYEALTKPAKKTAVPLLGATAIAVIAFLPMYLMPTDAGEYISTLFWIMAVSLGLSWILALTQIPVFCDIFLKIDKEKDKNGRKEKFYDLCHKFLEKVLAHKFLSLGIVIGAFLFSMLLFTRLPITFFPDSDKKGFVVNLWLPEGTSLDKTDKVSQIVEKELLKDKDIINVTAAVGSSPSRYYVATIPELQNSSFSQLIISVNKLESVNRIGENIKKFVKENIPDTKIEVRKYVNGIPTKYPVEVRILGPDPYVLRELSKEVMNIMRTVPNAENIQTDWKNKVLTWSPVLSQNIERKNLISPLDVANSLNRATEGMTLGKYKEGTEIMPIVLREKSGGQQLEINNIGQTPVWGLGIKSLPLNRIIEKESLKWEDPEIWRRNRVRAIKVQCDISGGVTAESIRKAVETEVNKLSLPENYKIEWGGEYYEQNKNVAAVFSSLPLQGTIMFSICVLLFATLKDPFIIFAILPLSFIGIAPGLFFTGRSFGFMSIIGAISLSGMMIKNSIVLIDEIKYEINVDKKDPYTAVIDSAVSRIRPVSMASVTTIFGMLPLVFDPLYGDMAITIVFGLTASTMLTLFVVPLLYSLLYKIEKKQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP017968_9 | 2764201-2764941 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_9
|
11 spacers
spacers of NZ_AP017968_9
>9.1|2764230|33|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT GGGTTATCCTTAGATACTGGTAGCCCTCTTGGA >9.2|2764292|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT CCATAAAGTACCTCCTAAAATATTTTTACTAGTTTT >9.3|2764357|37|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT ATGGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTG >9.4|2764423|37|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT ATGGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTG >9.5|2764489|37|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT ATGGCTGGGTAGTTCTAAAAAATTCTAATGGACTACT >9.6|2764555|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT GTATCAATAAATAATATCCATAGACTTTATAATGTT >9.7|2764620|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT TACAGAAATATCAAAATTTTGTAATTTATTTCTTTT >9.8|2764685|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT ATAACAGAAGTTACAGGAGGGCGTGATGAAGAGGA >9.9|2764749|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT TAAATATTTTTTTATGTTTTTTGTAAGTAGTTCCT >9.10|2764813|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT AGAGACTTGTCTACAGAGTGTAAGAGAAGAGCTTA >9.11|2764877|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT TAGGGTTTAACACTATACCGTTGTTGTATATCTCTT >9.12|2764294|36|NZ_AP017968|PILER-CR CCATAAAGTACCTCCTAAAATATTTTTACTAGTTTT >9.13|2764359|37|NZ_AP017968|PILER-CR ATGGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTG >9.14|2764425|37|NZ_AP017968|PILER-CR ATGGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTG >9.15|2764491|37|NZ_AP017968|PILER-CR ATGGCTGGGTAGTTCTAAAAAATTCTAATGGACTACT >9.16|2764557|36|NZ_AP017968|PILER-CR GTATCAATAAATAATATCCATAGACTTTATAATGTT >9.17|2764622|36|NZ_AP017968|PILER-CR TACAGAAATATCAAAATTTTGTAATTTATTTCTTTT >9.18|2764687|35|NZ_AP017968|PILER-CR ATAACAGAAGTTACAGGAGGGCGTGATGAAGAGGA >9.19|2764751|35|NZ_AP017968|PILER-CR TAAATATTTTTTTATGTTTTTTGTAAGTAGTTCCT >9.20|2764815|35|NZ_AP017968|PILER-CR AGAGACTTGTCTACAGAGTGTAAGAGAAGAGCTTA >9.21|2764879|36|NZ_AP017968|PILER-CR TAGGGTTTAACACTATACCGTTGTTGTATATCTCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_9
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_9 >merge|NZ_AP017968|9|2764201-2764941|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTAAAAACTTTTAAGTTATTATCAAGAGGGTTATCCTTAGATACTGGTAGCCCTCTTGGATATTTAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATCCATAAAGTACCTCCTAAAATATTTTTACTAGTTTTATTTAAAAACTTCCAAGTTACTATTCAATATGGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTGATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATATGGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTGATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATATGGCTGGGTAGTTCTAAAAAATTCTAATGGACTACTATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATGTATCAATAAATAATATCCATAGACTTTATAATGTTATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATTACAGAAATATCAAAATTTTGTAATTTATTTCTTTTATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATATAACAGAAGTTACAGGAGGGCGTGATGAAGAGGAATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATTAAATATTTTTTTATGTTTTTTGTAAGTAGTTCCTATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATAGAGACTTGTCTACAGAGTGTAAGAGAAGAGCTTAATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATTAGGGTTTAACACTATACCGTTGTTGTATATCTCTTATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT >NZ_AP017968|9|7|2764201-2764941|CRISPRCasFinder AATTAAAAACTTTTAAGTTATTATCAAGA GGGTTATCCTTAGATACTGGTAGCCCTCTTGGA TATTTAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT CCATAAAGTACCTCCTAAAATATTTTTACTAGTTTT ATTTAAAAACTTCCAAGTTACTATTCAAT ATGGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTG ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT ATGGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTG ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT ATGGCTGGGTAGTTCTAAAAAATTCTAATGGACTACT ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT GTATCAATAAATAATATCCATAGACTTTATAATGTT ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT TACAGAAATATCAAAATTTTGTAATTTATTTCTTTT ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT ATAACAGAAGTTACAGGAGGGCGTGATGAAGAGGA ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT TAAATATTTTTTTATGTTTTTTGTAAGTAGTTCCT ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT AGAGACTTGTCTACAGAGTGTAAGAGAAGAGCTTA ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT TAGGGTTTAACACTATACCGTTGTTGTATATCTCTT ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT >NZ_AP017968|9|4|2764201-2764941|CRT AATTAAAAACTTTTAAGTTATTATCAAGA GGGTTATCCTTAGATACTGGTAGCCCTCTTGGA TATTTAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT CCATAAAGTACCTCCTAAAATATTTTTACTAGTTTT ATTTAAAAACTTCCAAGTTACTATTCAAT ATGGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTG ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT ATGGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTG ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT ATGGCTGGGTAGTTCTAAAAAATTCTAATGGACTACT ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT GTATCAATAAATAATATCCATAGACTTTATAATGTT ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT TACAGAAATATCAAAATTTTGTAATTTATTTCTTTT ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT ATAACAGAAGTTACAGGAGGGCGTGATGAAGAGGA ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT TAAATATTTTTTTATGTTTTTTGTAAGTAGTTCCT ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT AGAGACTTGTCTACAGAGTGTAAGAGAAGAGCTTA ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT TAGGGTTTAACACTATACCGTTGTTGTATATCTCTT ATTTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT >NZ_AP017968|9|5|2764265-2764941|PILER-CR TTTAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATCC ATAAAGTACCTCCTAAAATATTTTTACTAGTTTTAT TTAAAAACTTCCAAGTTACTATTCAATAT GGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTGAT TTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATAT GGAATAGATAATGTACATGTACATTGTATGTTTTGAT TTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATAT GGCTGGGTAGTTCTAAAAAATTCTAATGGACTACTAT TTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATGT ATCAATAAATAATATCCATAGACTTTATAATGTTAT TTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATTA CAGAAATATCAAAATTTTGTAATTTATTTCTTTTAT TTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATAT AACAGAAGTTACAGGAGGGCGTGATGAAGAGGAAT TTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATTA AATATTTTTTTATGTTTTTTGTAAGTAGTTCCTAT TTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATAG AGACTTGTCTACAGAGTGTAAGAGAAGAGCTTAAT TTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAATTA GGGTTTAACACTATACCGTTGTTGTATATCTCTTAT TTAAAAACTTCTAAGTTACTATTCAAT
>NZ_AP017968.1|WP_096403544.1|2762974_2764174_+|glycine-betaine/L-proline-ABC-transporter-ATP-binding-protein MNKNIENNIDEKHILSVKNLTKLYGLNKNEAVKMLKAGAEKNEVFKKTGVTSAIWDMSFDVKQGEIFVIIGLSGSGKSTVIRCLNRLHNPTSGTILFDGKDIGKFSQKELTDFRRNKISMVFQNFGLMSHRDVISNIEYGLEIKGISKEEREKKAMEVLKMVGLEGLEHTNINSLSGGMKQRVGIARALANDPEILLMDEPFSALDPLVRSDMQFELLSIQKKLKKTIVFITHDINEAFKLGDKVAIMKDSRLIQLDTPENMSANPADDYVRQFIDSADKTKVISVKQIMFNPSCIIRLKEGAGIAIREMKSNRVSSAYVIDNHMKFLGIITIDNALKCRNENGFLSDYIFNEIPTTSSDALINDILPIAVNTKFPIAVIDNGELMGIVSKASILSTLI >NZ_AP017968.1|WP_096403543.1|2762111_2762975_+|ABC-transporter-permease-subunit MNWIFNFPFKLNIDVALIDRTVKNFSIQFGGFFNVIKNILNGLIGGILTILNFIPWWVLVLLVFLAGWRLTGKLRNGILYSCMLFFIGVIGLWDLMNDTLSIVLAAVFISLLLGFPIGILISGNERINSFVRPILDTMQTMPVFVYLIPAVLFFGLGKAPAVIATTIYAIVPVIRLTSHGIRQVDKEVVEAARAFGSTKFQTLWKVQIPQALPTIMTGVNQTLMMAMAMVVTCSMIGASGLGMEVLIGVNRIEIGRGLVAGTAVVIVAILMDRITQAWINRSEVKKK >NZ_AP017968.1|WP_096403542.1|2761136_2762096_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKKIFTFIITGFLTLAFLGCGGNDKKEVRFADAGWDSNKVHNAVAGFIIENAFGYTWSEVPGSTPILHEAIKSGEIDVHMEEWTDNIPSYYPDLKSGLFQELGTNFDDNRQGIYVPKYVIETMAPDLKSVKDLPKYKELFKDSENPEKGRIYGAIPGWEIDNIMYKKYEAYGLDKDFVYFRPGSDAALSAAFTAAYEKKEPIVGYYWEPTWLLGKYDFVLLEDEPYDAEKYFEGKTACPSVKVTIGASNKFKEKAPEIAAFLSKYHTSSKLTSEALAHMQETGDNYNATAKWLLKNNDNLIDQWLDADKAAAVRKALN >NZ_AP017968.1|WP_147385295.1|2758971_2760798_-|oligoendopeptidase-F MLKREDIDKKYKWNLEEYYPNWEAWDRELEQTKELMKKVPEYKGKIKYSSEKFTEMIQLEEKIGRTIEKLYIYPYMLKDINSKDETASIKLQEIMAILTEYSVSTSWMTPEILEIPKETMEKWIEKNPILQEHKFSLMEIYRLQGHVLDEGKEKLLSYYGQYMGAPDDIYGELSISDIKWNEVELSDGYKGPVTNGIYSKVLSTNRNQEDRKKAFEALYGSYDANKNTYGAIYRSLLQRDAATSKARNYNSTLDKALEPKNVPTEVFETLLKSAIDNNAPLQRYVKLREKALGLGSYHYYDNSINIVDYNKEFSYDTAKEMVLNSVVPLGKDYSEKMNKALSEGWIDVYETENKRSGAYSIGIYDVHPYMLLNYQSTMDDVFTLAHELGHTMHTILSNENQPYASSNYTIFVAEVASTFNERLMLDYMINNSNDSKEKIALLEQALGNIVGTFYIQTLFANYEYQAHKLVEEGKAVTPDVLSGIMENLFKQYFGETLTMDELQKIVWARIPHFYNSPYYVYQYATSFASSANLYDRITNEKYGIEERGAAASAYLELLKSGGNDHPMNQLKKAGVDLEKEESFHAVAKEFDKLLDQLEKELENLENNK >NZ_AP017968.1|WP_096403540.1|2757997_2758924_+|multidrug-resistance-efflux-transporter-family-protein MKKALLFGIGASFFFSFTFVLNRQMNIGGGSWYWSSSLRYIFMLPILFFIVTAKKQLFPVIEDIKKNPAAWFIWSTVGFGFFYAPLSFASVYGASWLVAGTWQLTIIAGALMSPFFYTIVDGKKIRNHIPKKFLFVSLIILIGIFLMLSEEAKKISILDSFLVVIPVLFAAFSYPLGNRKMMELCSSRLNTLQRVFGMTLCSIPFWIIIVILGVVQTGIPSHNQIIQSFIVAVSSGVIATIMFFKATDIVKGDSHKLAVVESTQVGELIFTLLGGVLVFHDTIPTVLGIIGIILVAIGMMINSFIQEK >NZ_AP017968.1|WP_096403539.1|2756663_2757977_+|HlyC/CorC-family-transporter MDELPGTTNVVSQLLFLLILTIANAFFAGAEMATVSVNKNKVKMLAEDGNKNALLLQELLKEPTKFLSTIQVAITLSGFLASASAATSFSHPLNVIMTKLGIPYGETIAIVLVTIILSFFTLVFGELVPKRIALQKAEAISLFTVKPVLFISKLTSPFIKLLSFSTNFILQILGMKAENLEENISKEEIKSMVEAGQANGVFNETEKEMINSIFKFDDILASEIMIPRTDVYSIDIDIPINEYLDELLATKHSRIPVYEEDIDNIIGVLYIKDLILEARNKGFENVDIRSILRKPYLVPESKNIDALFKEMQKSKKYIAILIDEYGGFSGIVTMEDLVEEVMGNIDDEYDDNEPKLEKIDNHTYSVDGLYSIDDLIDSLDIDIISKNHNTISGYLIDILGEIPDDTYLDKEIEVNDIIFKIKSIKENRIDKIELILN >NZ_AP017968.1|WP_096403538.1|2756213_2756579_+|ACT-domain-containing-protein MNLKILPNNFSICKIKNLNDINYEDEFIFIGKTDEELSLVCSTKYVPQEYIECDNNWKGFRIEGVLDFSLIGILAKISSVLAENGISIFAVSTYNTDYILLKSDKFDKAIEILKNSNYIFK >NZ_AP017968.1|WP_096403537.1|2755319_2756204_+|DMT-family-transporter MNYLGELYALITAFGWAFSSIFFEAASKKADSITVNVIRLIMGIIMLGSATFFTRGVFFPTDSTIHNWTFLSISGIIGLFLGDMFLYESYILIGARICMLFMTMTPLIVGLFGFLFLGESLTFTQTLAMFITCSGVLMVVLKPKSENPEDKKLSPKGIAFITIAVILEALGNIFTKIGAKGYDPSSSTQIRMICAMGVFLFYLTFKKKWGKIFFSFTDKKLMGLILLGTITATVGITFLISAFNLINAGVASTFSSISPIIVIPISIIVFKEKVKMREILGAFVSVFGIALFFL >NZ_AP017968.1|WP_096403536.1|2753651_2755205_+|AbgT-family-transporter MSQIKQEKKGFFNKFLDFIEVGGNKLPHPVTLFVLFCLTIIIVSGITEKMGVSATYNALNKKTGNFEEITVTVKSLTNAAGIRYIFNSMVKNFTGFAPLGTVLVGIIGIGVCEGSGLMSSTIKKVVMGTPRRAITAIVVFAGVMSNVASDAGYVVLVPLGAVIFLSFGRHPLAGLAAAFAGVSGGFSANLLLGTTDPLLGGITTEAAKLIRPDYFVAATANYYFMFVSTFIITALGTIITEKIVEPRLGPYHGDVDHDMKELTDLERKGLRAAGIVVLAYIAVMLVLTLPANAVLKIDGSLKAWTSSGLIPAMMFFFLLPGLAYGFTAKTLKSDKDVAKLMGKALAGMGGYMALAFTASQFIAYFGYTNLGTILAVKGADTLKSIGFTGLPLILGFVLFTAFINLFMGSASAKWAIMAPVFVPMLMELNYSPEFTQAAYRIGDSSTNIISPLMSYFAMIVAFMQKYDKDSGMGTLISMMLPFSICFLIGWTILLAIWFVFGLPIGPGVFIEFSKMIG >NZ_AP017968.1|WP_096403535.1|2751309_2753058_-|signal-peptide-peptidase-SppA MKFLNFLKKFILGTILFVIKEIFSFFIKAFLFLLVIFSIGAFFAKTTLEKDKIIIEKGSYIEVDLSKDYKEKGKNLPEFLRGQDTNFFSMLKTFDYIERDNDIKGVVLKLDNLSLDSAQVEELGKKLDNLKKSKKEVYSYMTMADNKNYSLAIKSNHIFMPPTMSAPVNITGYYGELMYYKLLADKLGIEFNVIHVGDYKAYGENLTKEHISKEYKENIERMYNRKYANFIKNIAAERKVNHDFINEKILNGDLMASEPNQMKKLNLVDEFMYFDQLKQVIGDKKLLSYENYNAFLSKNSLLGINGNKRKDKIAVIYAEGTMFMDSSSGGISGSITPNTLIEEINKALKDNTVKGIVLRINSPGGSALAANIISNKIIEVNEIKPIYVSIGGVGASGGYYIAAVAEKIYADKDSLTGSIGVVSIIPNIKKMLGNISINVDEVKKGEYSDIYSMVKDFNADKRDKLYASNLKVYNEFLDTVSFGRKLNRQHVERIAQGKVWLGEEALELGLVDEIGGLESAVKGLADDLKLVEYDTIEIINAPNYDSILKRYVPAVKMLEEYDSFILDKELYFKPIYYFPYDI >NZ_AP017968.1|WP_172426563.1|2765162_2766413_-|uracil-xanthine-permease MEKIGSKTKLLLGAQHVLAMFGATVLVPFLTGLNPSIALIAAGAGTLIFHFCTKRIVPVFLGSSFAFIGALSLVLKEEGIGAVKGGVIAAGFIYLIMAYLVKVFGVEKIKSFFPPVVTGPIIMVIGLRMSPVALNMAGYANGKFEPKSLIIALIVIISMISITIMKKSFFRLVPILISVTLGYIVAMCMGLVSFEPIARANWLGLSTEAAADLFTLPVFSLSAILAIAPIALVVFIEHIGDITTNGAVVGKDFFKDPGIHRTLMGDGVATIVAGLLGGPANTTYGENTGVLAVTKVYDPSILRIAACYAIILGLLGKFGVILQTIPAPVMGGVSIILFGMISAVGARTLVDAGLDFSNSRNLIIASLIFVFGIAVDNIVIWKTVSLSGLALAALAGVVLNKVLPLDREVTINKKID >NZ_AP017968.1|WP_096403546.1|2766491_2766869_-|thioesterase-family-protein MLKEGMSLTLEKIVNENETAAKIASGALNVFATPILMAFMENTSFELVQKELPAGETTVGISVNIKHLKANLVGDKIRCVSILEKVDGKKLEFSVKVYHKDTLVGEGKHERFIVNEEKFLNKLKG >NZ_AP017968.1|WP_096403547.1|2766932_2767190_-|hypothetical-protein MLKVWIVIGVSLLIIAAYFGVLLASSTKESDDKYVVGVLRTGYKIFEYFNRKKNNLGVYFSYIILWIGYMALNGRKPKLKKDTLK >NZ_AP017968.1|WP_096403548.1|2767211_2767844_-|thiamine-diphosphokinase MKIAYVFFNGQLEGSKEFYTKLINEKKGDIYCADGGAIHLETLGILPLEIWGDLDSVTKEIIEKYRNNKVRIKKFSKDKDYTDGELILQHISKLNYDEIIVIGGLGGRIDHLLTNLNLIFKFKNLKFVTEKEKIFSIEKKAELIELKGKTISFVPFSEKVEGLTLEGFKYSLNKYTLHQGDSICMSNIAIEDTCKVTFDTGKLMGIVLSE >NZ_AP017968.1|WP_096403549.1|2767859_2768684_-|endonuclease/exonuclease/phosphatase-family-protein MKKIKLIFIYFLLTVVIFAQEGYIASFNTLRLGKSQKDYTLTAQTLEMFDIAGLIEVMDVEGVEKLVNALNKVSGEKWDYHISPYPVGKNSYKEYFAYIWKRDKVEFLKERGFYKDAEEKFARPPYGADFKIGEFDFTFVLVHSVFGKNESARRAETFKMNEVYDYFQNMDSEENDIIIAGDFNLSGFDESFEKLLSHPDKITYALSPVIKTTLGKKNLANSYDNMFLSTIYTKEFTGKSGALDFTQGQYRLMKDKISDHLPIFIVVEISEDDD >NZ_AP017968.1|WP_096403550.1|2768839_2769556_+|HAD-family-hydrolase MIAAFFDIDGTIYRNSLLTEHFKKLIKYELLDFREYDTRVKEAFKLWDERVGDYDKYLLGLTQTYVDAIKGLSTKYNDFVADQVVELKGNRVYSYTRSMIKWHKEQGHKVIFISGSPDFLVSRMAKKWNADDFCGSIYHVENGILSGKISPMWDSENKMKSIDMFCKKYGIDLMKSYAYGDTHGDYSMLLSVGHPRAINPSLELLNSIKESDYLKKNTEIIIERKDVIYKVHSNVETL >NZ_AP017968.1|WP_096403551.1|2769583_2769922_+|hypothetical-protein MTMRLFYFVISFMFMFFTSNFDIQEKHSAFKDLPQNILLLGKIESTREYSFIKIDKIELADRETLKNPIPAFLEMTEIVTEEPCINTVIYPQKDILTFYTILERYDSRILLI >NZ_AP017968.1|WP_096403552.1|2769978_2774208_+|2-hydroxyacyl-CoA-dehydratase MREFHIGMDVGSTTIKIVCLDEKDNIIYSIYQRHLSNVRETTKKMFDDFLEHMKNNFGEDIKYKISITGSSGMGISSWVGIDFVQEVIACIKSIETLIPETDVAIELGGEDAKITFLKNDMDQRMNGSCAGGTGAFIDQIATLLDTDASGLNELAKGFDSIYPIAARCGVFAKTDIQPLINEGVRKENIAVSVFQAVVNQTITGLACGKKITGKVAFLGGPLFFLSELRNRFIDTLKLTPEDVVFPENSQLFVAQGAAFLSKENEAVFSYEELKTKVERLNEKDTSDTSRLQPLFETEDELNEFLKRHEKEKIETRDLNTYEGNAYLGIDAGSTTIKVVLISEEKEILFSHYSHNKGNPLDNIIATLKELYSKMNKNIIIKGSCVTGYGETLIKAALRVDIGIVETMAHYKGSQFFQPDVDFILDIGGQDMKCLKIQDGIITSILLNEACSSGCGSFLETFAHSLGMDILEFSRLGMESKSPADLGTRCTVFMNSKVKQAQKDGVEVADISAGLSYSVVKNTLFKVIKIKNKDELGKNIVVQGGTFLNNSVLRAFELVSERNVIRPNVAGLMGAFGAALIAMEQAGESSSIMTLDELNNFSCTTNLTRCKLCNNHCLLTIHKFKNGENFISGNRCDNPLGKMKKNTAPNMFDYKYNRIFNYTPLEPSKATRGEIGIPRVLNFYDSYPFWFTLLTNLGFRVIISDDSSKKLYEKGIDTISSDSICYPAKLVHGHIVDLIEKGVKRIFYPCVIFEEKEDEKSSNQFNCPIVMSYPEVINNNMDILKEKHIDLILPFFSFESKEVLYKTVFEEFERFGISKSEAKMAVDAAWEEKYNFRKDMRNKALEIIADLEKTGKTGVVLCGRPYHCDKEIHHGIPNIINSFGIAVLTGDAVASLASLDEELRVIDQWTYHSRLYRAAAYVGKSKCLELIELNSFSCGIDAVTTDQVEEILANYGKVHTLLKIDEISNLGAVKIRIRSLLAALDYKKNALRSSIKKKIEYKRAQFTKKMKKEYTILAPQMAPMHFKLLKTAFKAEGYNLEVLDETQEALDCGLQYVNNDACYPSILVIGELIAALKSGKYDLDKTAVMISQTGGSCRATNYLGFLKKAIKDSGFEKIPILSLNASGFEKQEGFSITLPFAHKCLIAVSYGDILMKLLYHVRPYEKIKGSAFELYEKWNEKVKENIYNGKFSQFKNNINAIVNDFSKIEVSDEKKIKVGIVGEILVKFSPFANNNLAEFIEAEGGEVYTSSLMSFVKYCIYSDIFITERFKGKIAAMKLKAALWIIEQYTKVLNNALQKNSRFGHEDSIQDLAQKTSQYISIGNQSGEGWFLMGEMIEFIEKDVPNIVCVQPFGCLPNHITGKGMIKKLRSEYKNVNIAPIDYDPAYSEVNQLNRIKLMLSVARKNLKNS >NZ_AP017968.1|WP_096403553.1|2774274_2775381_+|alanine--glyoxylate-aminotransferase-family-protein MYKANYLMMTPGPTMVRENVLKARCSFFGNPDLDPNFFAFYDKLCKKTGKLFGAKKAQTVIMNGEGMLGLDTACASLTEPGDKVLVISNGIFGEGFKGLVETYGGEVTLFETDVKSTLDIDKLRIFLEKNKDFKYATVVHCDTPSGVLNNVEIICKILKSEGIMTVVDSVAAVGGVQLDVDGWGIDIALGGSQKVFSAPSGITIMTVSNDAWEAIENRKTPIASFYCNLSLWKNCVKEQLFPYTMPASDLIAFDVAIDNIYKEGIEKVRERHHTAAEYVRTRLMDIGVELYLKNGYSPTVTAFCLPEGYDCKEVSDYLLHNFEVMIADSYSYLSNKVLRIGHMGENARFYRLDYTLKAIEKTLRILKK >NZ_AP017968.1|WP_096403554.1|2775527_2776256_+|GntR-family-transcriptional-regulator MCDFDKNNKMPLYGQLMNFLLSEIECDKFKEHEKLPSERELCERFCVSRDTVRQAIFQLEKMGYIYKKHGKGTFVAPKQLKPDLYKFYDFTEEMKKLGKEALSKVLSFEIVPADKYIAKFLKIKENSNVHRIIRLRLVDSIPLIFEKTYLPMEKFNCFYIDELNNSSLCNILKNRFSIKFSKGEETFYPITPDEEIIRYLNLMKFQPVIKIERITFEDESPIMFTERIVRGDKFKYTVTTLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP017968_10 | 3513546-3513685 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_10
|
2 spacers
spacers of NZ_AP017968_10
>10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder ATCAGGAAAATATATAACTATAAATGCCTTAAAC >10.2|3513626|37|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder TGCTTCAGATAATAATTTGAATATCAGCACTTTAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_10
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_10 >merge|NZ_AP017968|10|3513546-3513685|CRISPRCasFinder GAGATAATTAATATAGGTTTAATATCAGGAAAATATATAACTATAAATGCCTTAAACAATATAGAGAATAAAGGATTAATTGCTTCAGATAATAATTTGAATATCAGCACTTTAAATAATGTAGAGAATAAAGGATTAAT >NZ_AP017968|10|8|3513546-3513685|CRISPRCasFinder GAGATAATTAATATAGGTTTAAT ATCAGGAAAATATATAACTATAAATGCCTTAAAC AATATAGAGAATAAAGGATTAAT TGCTTCAGATAATAATTTGAATATCAGCACTTTAAAT AATGTAGAGAATAAAGGATTAAT
>NZ_AP017968.1|WP_096404163.1|3511590_3511977_+|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKINKESEYAIRIVKYLSEIPENKLIGSKEISKKEEISINMTTKILRFLVNYGIIESYRGTLGGYRLKRDKVSYYEIIKAIQGELYILNDFKSLEQKENEVKKNLWKIQKICKNKLYSLEIKKNFFDS >NZ_AP017968.1|WP_096404162.1|3511077_3511506_+|hypothetical-protein MNIKLRMIGNKMDSSKILFNLEKMQLGTRLLVEKFPITRDIGILTVINSFNELENEFQIVVKDSHGKELGKGEVFRLRIMTREKEAIIIYNINKAYFEKKEDFYTIELLNKGNIIDRFDLSCETNIYNIYNNLDDKGTINLS >NZ_AP017968.1|WP_096404161.1|3509890_3511063_+|hypothetical-protein MEIRDYKYILIPNILAKYQCSASGECCKDKWRIDIDEDSYLKTKTNLDNLNEDINTCIEKIDNSYITKFSRGYCKFITEEKLCRIHRDFGWECLSNTCKVYPRNLKLTSRGLEISLVFSCSSAAKLLLSKEKFEIIKIKKEEFFLMKPNNISFLIPENNIKTNISSKYYELENLLINILNSEENLGKKLQYIDITLKTILSTEIKEFDFKKSNKDFLDFKEKDYSSSGVADLVVKTILAKRERSKAVASEYINLLKLIRLTGTLEKDRDILRDESFILNDEDIDMLKKLWPKDYDNILKNYLLCSVFNKDFYYNITYGFMKLVISGALLKFKILLNIKYLKRALSEEELIYTIKSHDNDLVHDGEFFNEFYKKNEIDINEYNKKILTILY >NZ_AP017968.1|WP_096404160.1|3508569_3509901_+|WG-repeat-containing-protein 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>NZ_AP017968.1|WP_096404158.1|3497414_3499121_+|ShlB/FhaC/HecB-family-hemolysin-secretion/activation-protein MKIKMSWSLILLLTTINGIVYSRQESPIRDPFKDIEMTQRLLELRRQQEYRDEQLKYPLRNEEKKEDKLEFKIEDGQKYLFKNIKVEGSNLYEKEVKKIVDQYVNTEMGKGEIYELLTKLSNIYLNHGYVTTLVTLKSGNINTGELVYEVKEGKLREIKFMNRESSFKDRLKLKLAFPIKKGELLTTQAMDQGLENINIGGYNNVTEVSPTEEYGYSDILIEENYRATGFSMGMDNSGYKDKGRHKLNFSFSQDNVLGINDRLTLNYIERLTKKRDLDKESNYDIGYSIPIGYWKIAYNYNLGDNYNTIISDLGKYKTESKSQKHKLKISRIISRGQYQKTTVHGGIVYRDNYNTMNGLVLDVSTKKYMNTVLGIDHIDKLFGGTIFGMFEYERGVPWFGAEGDPSILRAGDYKVEYDKLNFNLDWMKSFAIKNHGFQYRMGIGGSYSDDRLLSANQFTMGDEFTVRGFKESSVAGNKGIYINNTLSYMGTPDMNKYLSMITPFIGLDGGLSRDKDLENSDKIVGFAIGFKINIKGLYAGLTYGIPLRRAKGMPKEENPIYFNMSYNL >NZ_AP017968.1|WP_096404157.1|3494893_3497464_+|hypothetical-protein 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>NZ_AP017968.1|WP_096404166.1|3527979_3528270_-|HU-family-DNA-binding-protein MNKRELSKLYKKTYKEMTKNEITEKEALNEINEFLEILEKAILSAEILKFYKKGTFKILSKKSRKISNPVTREIMKIYPKKDISFKLSNNLNFYYD >NZ_AP017968.1|WP_096404167.1|3528262_3528556_-|HU-family-DNA-binding-protein MCEKEFLKFYKKEKKLKNIEAAKEKLELFWATLMLALEEDNKVVLKNWGKFEKKEFKPRKVSVPTLKSSFYTEFKTKIKFKTGIRLRQLVDEGDDYE >NZ_AP017968.1|WP_096404168.1|3529126_3530488_+|sugar-transferase MKRQIPKILMIALQFIFYLFINKIFKVSDRVMYNTFFIYLALNFTKNMYSFRTILIWEELKKQLLVHIEYLIIMLINDLAFWGKQYALVHLTLGITFTFFNLVVIKLIRCIFKNSLEKRLLIIGVGSIARELGYIIKENPFTMYNLLGYISVNLLDRANQDISIEKEKILGNCNDIEKIIKEKQVSEIIIALPLTYNKQMSKIIDRLDGKVEKIKFIPELNGIYTFNSTIEDYDGIILISSYNRINKKINKLLKRTFDLIVSIIGYIIFIFLYLIYGPKIKKDGGKIFFHHIRIGKDLKPFKMYKFRSMHVDAEKKLDEIFLKDEQLKEKFYQNFKLKNDPRITQIGKFLRKTSLDEFPQFINVIKGEMSFIGPRPVVQKEVDMYYGKENSKKIFMIKPGITGMWQANGRSDIEDYNERIKLDLYYIRNWSLWLDIVITIKTLRNVLIKKGAY >NZ_AP017968.1|WP_172426575.1|3530487_3531234_+|glycosyltransferase-family-2-protein 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MTLDKNIIKNIAWMIFDKIFILILEFLVGIKVANFYGSFFYGSYSFAVSISIFSAIFFELINSRIIKKYYNKKNYYLIIFNVTFFKRSVAIFLFIIIFIVGNIIQLERSLYIFLLLLFLDNILATSTVGIENYFEFKLQSKKIVVSNNIVKLVSYTLQYIGMILNYPIIIVPIIRCIGSLVRVFILKNIYKKNYYQGKKGKIIQKLIYNMIKKSFYLWLSFISFIIYTQLDKIMLGVLLGKKQVGIYTLGIQLINVLSTLIIPIQVSLFPKMLELYKKNYNEYLEFYLNCNILITQIYIFLILFSIPIVKIIFPYVFISEYSKAVSIYNILIIAVLMKVNGALQSSHMTLKDITKKSFYKTTVGLLLNGILNYILIKKQGIIGAAIATTITQIFTVFIMDFFIKEYKEQAKIQLKSFNPFYLVNLIKVFKWRYKK >NZ_AP017968.1|WP_096404174.1|3535700_3536330_+|acetyltransferase MKKKLILIGAGGFVKSVIDSIDEKKYNIEGFIDNIKSGSHLGYKILANNLEELENSGQYCYFIAIGDNKKRTYWYKKVAKRNLEIINVIDKTAILSENITFGRGIFIGKLAIINSDARIGENVIINTKALVEHGNRIGNNVNISTGTILNGDVKIRDNCFIGSSAVVNGQITIGENSIVGSGTVVINNIDKDVIVAGIPGKVIRRLNNE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017968_11 | 3681938-3682018 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_11
|
1 spacers
spacers of NZ_AP017968_11
>11.1|3681961|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder AGAAAGAGTTCCTCCAATTGAAGTATAGTTTCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_11
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_11 >merge|NZ_AP017968|11|3681938-3682018|CRISPRCasFinder TCTACTATTATATTTCCAGCAGTAGAAAGAGTTCCTCCAATTGAAGTATAGTTTCCATTAATTTTAATAGTTCCATCTGGT >NZ_AP017968|11|9|3681938-3682018|CRISPRCasFinder TCTACTATTATATTTCCAGCAGT AGAAAGAGTTCCTCCAATTGAAGTATAGTTTCCA TTAATTTTAATAGTTCCATCTGGT
>NZ_AP017968.1|WP_096404296.1|3680223_3680493_-|hypothetical-protein MVERKKRGRPLGSGVKNYCALGCRFTEKEYLLIQESLKKLKEEYGSNNKIILNLFKKYGNNVEKKKRNTILEEDNDKTNKKGIGSFRRE >NZ_AP017968.1|WP_096404295.1|3679838_3680270_-|hypothetical-protein MIKLTKKELEALGENKDAVAQLLVRKAILAEMENREYTEEEKKYLEEMKLNIEIEFYLNSIAQKTVQVYDYELLEVYKNNTELLKDKNTVEVYPQLQQALFNQKLGEEKVKVINGLVEKYKINDILKEYIKVEEPEIKEEESK >NZ_AP017968.1|WP_096404294.1|3679455_3679818_-|adhesin MKKILIGCILAVSAVSYSATDVMSTLEQLELNLQQLEAEERAMYNQRKAEAEEAERTLEAQRKMYAEISEKEKRILSVKDNKFYKGQYQELAKKYGEAKKELESDMKKQEEIISIFEAIK >NZ_AP017968.1|WP_096404293.1|3679261_3679444_-|hypothetical-protein MKKDEKEAEKTYRLFGCRFIEEDFKYINKKLKKLKKKQDISNSVILLELFKIYNRENKNK >NZ_AP017968.1|WP_096404292.1|3678574_3679210_+|hypothetical-protein MIEKWEYGGSYINYPLKPAVPYAIDKNIIMVHDLTDELPDFMKKADVLFIDPPWNLRNLNTFYMKARLMPKVQSYEEFYEILFKRIGEIKANLCFLEIGKEYLADFIKEMKKLYKHVTFYNSTYYNNSKNLCYIVQGSEKRLNLKLDGMDEEKIIEFICKNLQYECIGDMCMGRGLVGFNSYLNNKNFVGIELNHKRLSVLLENISKTKYI >NZ_AP017968.1|WP_096404291.1|3678045_3678582_+|ParB-N-terminal-domain-containing-protein MKYIKTKKGNIALPVMNPIIVPIYKVEPNKYNPNKVAINNMDLLERSILDNGFCFAVVTIYDKSRDKYIIVDGFHRYEIFKKHFKAKEIPIIVLDHNIEKRMAATVQFNRARGVHQVELMGELVRELYEKGLEDEMIAQSLGMEEEEVFRLKQITGIAEIFKNKSYSKSWEMVEVNDD >NZ_AP017968.1|WP_096404290.1|3676933_3678049_+|phosphoadenosine-phosphosulfate-reductase-family-protein MYSNKNVLEVSKERISFLFDNFQNICVSISGGKDSTVLAHLTLKEAVKRNRKVGLFFLDEEVVYSSTVKQIKYLMNLFPENTINYWLQIEFNLTNATSIVEGQLKCWEKNKSYLWMRPKEKNSIQNKPWDIETETIRDKNKGFGFYDVIENFQRLKKDTIFLVGLRATESPNRWGAVVKNPVDINGSFVYWGTKLKYGNFSFYPIYDWNFHDVWKYIYDEKLKYSKIYDYQYKKGTGLREIRVSSLIHEKSFKALVDLPEFEPKTYDKLLKRIAGISIGNLYGKDSKMLRCTKLPKNYDSWIEYRDFLLETYPNENKKWIFQKRFQKHLENEYVARQQCKQLILNDYENNLPVDNRKDPRLEKLKKWRTIL >NZ_AP017968.1|WP_096404289.1|3676059_3676947_+|hypothetical-protein 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NA
Consensus repeat of NZ_AP017968_13
|
1 spacers
spacers of NZ_AP017968_13
>13.1|3682396|52|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder TGTGAAGTTTGTCCCTGTTCCACTTGCATAAACTCCTACTGAATGATCATAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_13
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_13 >merge|NZ_AP017968|13|3682373-3682470|CRISPRCasFinder TCTATATTCATAGTTCCAGTATTTGTGAAGTTTGTCCCTGTTCCACTTGCATAAACTCCTACTGAATGATCATAGTTTACTGTGATAGTTCCAGAACT >NZ_AP017968|13|11|3682373-3682470|CRISPRCasFinder TCTATATTCATAGTTCCAGTATT TGTGAAGTTTGTCCCTGTTCCACTTGCATAAACTCCTACTGAATGATCATAG TTTACTGTGATAGTTCCAGAACT
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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP017968_12 | 3682082-3682231 | Orphan |
NA
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|
2 spacers
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017968_12
The CRISPR arrays of NZ_AP017968_12 >merge|NZ_AP017968|12|3682082-3682231|CRISPRCasFinder TTTACTATTATGTGTCCAGCATTTACTGTACTTCCAATTCCTTCTATTCCTATTCCATTGTTTACTATAATAGTTCCATTATTTTCAAATGTTGCTCCAGTTACTACGAGCATTCCTACTCCTTGATTTACTGTAATAGTTCCATTATTA >NZ_AP017968|12|10|3682082-3682231|CRISPRCasFinder TTTACTATTATGTGTCCAGCATT TACTGTACTTCCAATTCCTTCTATTCCTATTCCATTG TTTACTATAATAGTTCCATTATT TTCAAATGTTGCTCCAGTTACTACGAGCATTCCTACTCCTTGA TTTACTGTAATAGTTCCATTATTA
>NZ_AP017968.1|WP_096404296.1|3680223_3680493_-|hypothetical-protein MVERKKRGRPLGSGVKNYCALGCRFTEKEYLLIQESLKKLKEEYGSNNKIILNLFKKYGNNVEKKKRNTILEEDNDKTNKKGIGSFRRE >NZ_AP017968.1|WP_096404295.1|3679838_3680270_-|hypothetical-protein MIKLTKKELEALGENKDAVAQLLVRKAILAEMENREYTEEEKKYLEEMKLNIEIEFYLNSIAQKTVQVYDYELLEVYKNNTELLKDKNTVEVYPQLQQALFNQKLGEEKVKVINGLVEKYKINDILKEYIKVEEPEIKEEESK >NZ_AP017968.1|WP_096404294.1|3679455_3679818_-|adhesin MKKILIGCILAVSAVSYSATDVMSTLEQLELNLQQLEAEERAMYNQRKAEAEEAERTLEAQRKMYAEISEKEKRILSVKDNKFYKGQYQELAKKYGEAKKELESDMKKQEEIISIFEAIK >NZ_AP017968.1|WP_096404293.1|3679261_3679444_-|hypothetical-protein MKKDEKEAEKTYRLFGCRFIEEDFKYINKKLKKLKKKQDISNSVILLELFKIYNRENKNK >NZ_AP017968.1|WP_096404292.1|3678574_3679210_+|hypothetical-protein MIEKWEYGGSYINYPLKPAVPYAIDKNIIMVHDLTDELPDFMKKADVLFIDPPWNLRNLNTFYMKARLMPKVQSYEEFYEILFKRIGEIKANLCFLEIGKEYLADFIKEMKKLYKHVTFYNSTYYNNSKNLCYIVQGSEKRLNLKLDGMDEEKIIEFICKNLQYECIGDMCMGRGLVGFNSYLNNKNFVGIELNHKRLSVLLENISKTKYI >NZ_AP017968.1|WP_096404291.1|3678045_3678582_+|ParB-N-terminal-domain-containing-protein MKYIKTKKGNIALPVMNPIIVPIYKVEPNKYNPNKVAINNMDLLERSILDNGFCFAVVTIYDKSRDKYIIVDGFHRYEIFKKHFKAKEIPIIVLDHNIEKRMAATVQFNRARGVHQVELMGELVRELYEKGLEDEMIAQSLGMEEEEVFRLKQITGIAEIFKNKSYSKSWEMVEVNDD >NZ_AP017968.1|WP_096404290.1|3676933_3678049_+|phosphoadenosine-phosphosulfate-reductase-family-protein MYSNKNVLEVSKERISFLFDNFQNICVSISGGKDSTVLAHLTLKEAVKRNRKVGLFFLDEEVVYSSTVKQIKYLMNLFPENTINYWLQIEFNLTNATSIVEGQLKCWEKNKSYLWMRPKEKNSIQNKPWDIETETIRDKNKGFGFYDVIENFQRLKKDTIFLVGLRATESPNRWGAVVKNPVDINGSFVYWGTKLKYGNFSFYPIYDWNFHDVWKYIYDEKLKYSKIYDYQYKKGTGLREIRVSSLIHEKSFKALVDLPEFEPKTYDKLLKRIAGISIGNLYGKDSKMLRCTKLPKNYDSWIEYRDFLLETYPNENKKWIFQKRFQKHLENEYVARQQCKQLILNDYENNLPVDNRKDPRLEKLKKWRTIL >NZ_AP017968.1|WP_096404289.1|3676059_3676947_+|hypothetical-protein MIRIGLNKKQKEQEIINYLNSNCIEKIYCFFFKKFHINYDIGSANIEYIEYSDIEKYKYFYRLLEEINENSLIIIDECMRTSNRNKLIYNCAHHYLNQTSHKIIFEYFPIIENYDDFMILLNFENKGKYKGKGFDSNYLKNEDIKMIKRTIPIKINTIRTTRFMRERYEREKNLLFKLLGNQDPDTLPRNLHLLTGDFKKEYIKEKISVARNNRFRLKNVVSYNNINLISEEPEVLVVDFHYRRLNFNDFLKTMKNIKEFEFLSTSLPVDKFYIKSYIEWKDKCETIYDKADVFQ >NZ_AP017968.1|WP_096404288.1|3674703_3675477_-|uridine-phosphorylase MKYAEEGVQYHIGIKKGDVGKYVILPGDPKRCEKIAKYFEDAKLIADNREYITYTGYLDGIKVSVTSTGIGGPSAAIALEELVKSGADTFLRVGTCGGMQTEIMGGDIVIATGAIRMEGTSREYAPIEFPAVANIEIVNAFIQAAKDLGEKYHTGIVQCKDSFYGQHEPETKPVSYELMNKWEAWIRLGCKASEMESAALFVAGDYLKVRVGSAFLVVANQEREKAGLENPVVHDTDAAIRLAVEAIRNLIKTDVPY >NZ_AP017968.1|WP_096404287.1|3674293_3674692_-|cytidine-deaminase MEKYRDILDRAFMAVDNAYAPYSNYYVGACVKTKDGRYFIGANVENASYGLTNCAERNAIFQAYSQGCRKEDIEAIAIVSRGKTLATPCGACRQVLVELLNRNTPIVLSNSLKEMVTNIEELLPMSFTSDDL >NZ_AP017968.1|WP_096404298.1|3690730_3691312_-|hypothetical-protein MKKILGMFLLLSCLTTTLYSQEVSEKEGRKVLEQIRREIQAEEKAKQKAIEDAEKAKEAEEKARIAAEKAEEKKGKKIIEDIRRDMNESLEEKVFRSENTPEGRIAAAGSAFEIGRERMAFLKMEEEEIMKLEEVLGMETDENRVFLSQKFDEVYDKFKTNNNEIELLLLENEKLNEYLSRLDRMEQKVRAGN >NZ_AP017968.1|WP_096404299.1|3691893_3693333_-|carbon-starvation-protein-A MFSFIISIIALIAGYIIYGKIVERIFGIEASRVTPAKKLNDGVDYVEMGWKKAFLIQFLNIAGTGPIFGAVAGAMWGPAAFLWIVFGCIFAGAVHDFLIGMMSLRKDGASVAELVGENLGNGARKLMVVFSIILLVLVGVVFITSPAAILNDLTGINKMLLIGIIIIYYLAATVLPIDKIIGRIYPIFGIALLVMAVGIGVGIVIQGYNIPEISLHNFHPAKQSIFPYLFITIACGAISGFHATQSPMMARCLENESEGRKVFYGAMISEGVVALVWAAAAMSFFGGTPGLGEALGHGGAAVVVNRISNTVLGKVGGALALLGVVACPITSGDTAFRSARLTIADAIGYKQGPVANRFIVAIPLFIVGISLCFIDFNILWRYFSWSNQTLATIALWAAAKYLNNHGKNYYIALIPAMFMTVVVTDYIVIAPEGFVRFFQGTPVATIEMIGLVCGLVLSAVCTLGFLKSLKKEKIAEAQA >NZ_AP017968.1|WP_096404300.1|3693540_3695196_+|sensor-histidine-kinase MLKLTSHLLNNLGYIIAIAFFFTKFKSAKNIFTRKKYSQKDILLLSAFFSGLAIIGTYTGVDYRGAIVNVRNIGVVVGGILAGPEVGIMVGLIAGIHRLFVDASSITTIPCAIATMSGGFITAHLYKKTNEKNCYLYGFLGGFIVENLSMILILVLGSDFELAKDIVSKIYFPMILANAVGVSIVILIIQDIISEKEIIAGKQAKLALEIANKTLPYFRKGESMNEICKIILNSLEAKAVVITNDKYIIASYAESDEFKIDHTDIRSEVTKQVLKTGKVLVLGEENGIKDFHCISGKIKSCIISPLFQGEKIVSGTLKIYFDKAENVTARNQYLAEGLSLLISTQLEISTVENFKAMARDAELKALQTQINPHFLFNALHTTAFFVRMDPAKAKEVIIDLSTYLRYNLENASKVVSLDMEFTQVKAYVNIEKARFGDKISVEYDVEDGLENIKIPSLTIQPLVENSIKHGLLKQRGGGHVHITAKKKDKGCIVTIEDDGVGIDPKIIEELDERMEKSIGLKNVHNRIKLMYGKGLVIECLKKGTKISFYIE >NZ_AP017968.1|WP_096404301.1|3695205_3695928_+|response-regulator-transcription-factor MLKCVIIEDEFPAREELKFFIEKYEGIELEKEFDSPLDALKYLQANKTDIVFLDINMPELDGMSLGKILSKLNENLKIVFITAYKEYAAEAFEIKAFDYLLKPYSEKRINEVLSNLTKEKEIDHIKDINKINKVTVTSDEKMYVISIDDIYYIEAGEKESMIYTKDNSYSSKIKISKWEEILPKNKFYRTHRSYMVNLDKITEVEPWFNGTYVLKIQDLKFKIPVSRNNIKEFKEILVIK >NZ_AP017968.1|WP_096404302.1|3695989_3697504_-|flotillin-family-protein MFLGVGLTLVIFLVVILIGGAVLIYRKCPNDVILVKYGLGGNKIITSNGTFILPIVQGCKKLNLKPMNIDIDLREDSNVVSNDKIRVVVEADATFAISSSPEERVIASHRLLSFNDSEICALAKEILTGQTRTIISEMEFEDLLQDRVLLMTKVSENAEKELSKLGLDLINYNIKMIKDMDGITEMLGKKASALATSDAQIAVAEQQRKSDVGVAEANAQRDIAVTEQDKVRQIQVSKTKAVITEETIKAELIQTNATQNKLAEEKRMESESQKAQNLYRIETEKSINLKELDKEKEIKLQEENLKQEIADKSKETVKKQAEVALETQRAKEIVETKVYNEKLEIEKITELKLKKLEADNQLEIAKIKADAILIEARAEADKLKALAEADAIKVALPIEKKAEAEKKLLEVYGQSGIMGLKLIEILPELARAQADAVANIDINSLNIISGDGGSGDGNSGAGNQIAGIVTDITRAIPAFKMANDIAKSINMPELSITGDTKTEK >NZ_AP017968.1|WP_096404303.1|3698076_3699444_-|MATE-family-efflux-transporter 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>NZ_AP017968.1|WP_096404306.1|3705911_3707048_-|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase MKKIVNVLLLTIILASSTVFAKEAENEVAVKEEKPSYKAILLGDEKGKIYYSENIDEKYPLASLTKMMTLMVTFDQLEKGSIRMKDKIKISKKSAQIGGSRIPMKEGDVFTLEDLIKATAIYSANNAAYAIAEHIGKGDVDKFVKMMNKKSTDLGLEKELEFYTPAGLPSDMTKKGMDAGTTRGIYKLSLEAAKYSKYMEIASIKETTIHDGKLKIKNRNLLLGEEGIYGIKTGHHSKVGYNISVLSDKEGMQIFTVVVGGPTYKKRDESVLNQMEEFYEHYQFRKLTDENISIAKVPVFSGEKEYADLYPDKNFTDILNKDSDIKISIKRNKGAIAPVEAGKVLGEYKVVIDGNIVESGNLVTKEEVKLSISLKNIF >NZ_AP017968.1|WP_147385290.1|3707144_3707531_-|Fe-S-cluster-assembly-scaffold-protein-NifU MQYTEKVMEHFMNPHNVGVIENPSGYGKVGNPSCGDIMEIFIKVEDNIITDVKFRTFGCASAIASSSVSTELIMGKTVNEALALTNKKVVEALGGLPPVKMHCSVLAEEAIKLAIEDYLSKKDKKEEK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017968_4 | 4.1|973175|32|NZ_AP017968|PILER-CR | 973175-973206 | 32 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 558849-558880 | 6 | 0.812 |
NZ_AP017968_4 | 4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR | 973306-973338 | 33 | NZ_CP015798 | Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp32-1, complete sequence | 28770-28802 | 7 | 0.788 |
NZ_AP017968_8 | 8.6|1848823|37|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848823-1848859 | 37 | MT774399 | CrAssphage cr109_1, complete genome | 69616-69652 | 7 | 0.811 |
NZ_AP017968_4 | 4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR | 973306-973338 | 33 | MN693448 | Marine virus AFVG_25M325, complete genome | 6707-6739 | 8 | 0.758 |
NZ_AP017968_4 | 4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR | 973306-973338 | 33 | NC_015906 | Borreliella bissettii DN127 plasmid cp32-quad, complete sequence | 64579-64611 | 8 | 0.758 |
NZ_AP017968_4 | 4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR | 973306-973338 | 33 | NC_015908 | Borreliella bissettii DN127 plasmid cp32-3, complete sequence | 28884-28916 | 8 | 0.758 |
NZ_AP017968_4 | 4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR | 973306-973338 | 33 | NZ_CP015802 | Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp32-6, complete sequence | 15354-15386 | 8 | 0.758 |
NZ_AP017968_8 | 8.1|1848499|35|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848499-1848533 | 35 | MN379642 | Chicken microvirus mg7_16, complete genome | 1183-1217 | 8 | 0.771 |
NZ_AP017968_8 | 8.1|1848499|35|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848499-1848533 | 35 | MG945583 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 3973-1602, complete genome | 2927-2961 | 8 | 0.771 |
NZ_AP017968_8 | 8.7|1848889|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848889-1848924 | 36 | NC_007581 | Clostridium phage c-st, complete genome | 169085-169120 | 8 | 0.778 |
NZ_AP017968_8 | 8.7|1848889|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848889-1848924 | 36 | ACSJ01000017 | Clostridium phage D-1873 CLG.Contig173, whole genome shotgun sequence | 39556-39591 | 8 | 0.778 |
NZ_AP017968_8 | 8.7|1848889|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848889-1848924 | 36 | AP008983 | Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome | 169085-169120 | 8 | 0.778 |
NZ_AP017968_9 | 9.5|2764489|37|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT | 2764489-2764525 | 37 | NZ_CP053689 | Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence | 146409-146445 | 8 | 0.784 |
NZ_AP017968_9 | 9.9|2764749|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT | 2764749-2764783 | 35 | MK562505 | Shigella phage Silverhawkium, complete genome | 78180-78214 | 8 | 0.771 |
NZ_AP017968_9 | 9.9|2764749|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT | 2764749-2764783 | 35 | MK562504 | Enterobacteria phage CHB7, complete genome | 77956-77990 | 8 | 0.771 |
NZ_AP017968_9 | 9.9|2764749|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT | 2764749-2764783 | 35 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 401359-401393 | 8 | 0.771 |
NZ_AP017968_9 | 9.15|2764491|37|NZ_AP017968|PILER-CR | 2764491-2764527 | 37 | NZ_CP053689 | Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence | 146409-146445 | 8 | 0.784 |
NZ_AP017968_9 | 9.19|2764751|35|NZ_AP017968|PILER-CR | 2764751-2764785 | 35 | MK562505 | Shigella phage Silverhawkium, complete genome | 78180-78214 | 8 | 0.771 |
NZ_AP017968_9 | 9.19|2764751|35|NZ_AP017968|PILER-CR | 2764751-2764785 | 35 | MK562504 | Enterobacteria phage CHB7, complete genome | 77956-77990 | 8 | 0.771 |
NZ_AP017968_9 | 9.19|2764751|35|NZ_AP017968|PILER-CR | 2764751-2764785 | 35 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 401359-401393 | 8 | 0.771 |
NZ_AP017968_4 | 4.2|973241|31|NZ_AP017968|PILER-CR | 973241-973271 | 31 | MK493321 | Cyanophage S-RIM4 isolate RW_11_0999, complete genome | 97533-97563 | 9 | 0.71 |
NZ_AP017968_8 | 8.1|1848499|35|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1848499-1848533 | 35 | NZ_CP042965 | Bartonella krasnovii strain OE 1-1 plasmid pOE11-1, complete sequence | 23646-23680 | 9 | 0.743 |
NZ_AP017968_8 | 8.9|1849020|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1849020-1849055 | 36 | LR214964 | Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 10 | 25899-25934 | 9 | 0.75 |
NZ_AP017968_9 | 9.2|2764292|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT | 2764292-2764327 | 36 | NZ_KT897280 | Clostridium botulinum strain FI1111E1 plasmid pFI1111E1, complete sequence | 63170-63205 | 9 | 0.75 |
NZ_AP017968_9 | 9.2|2764292|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT | 2764292-2764327 | 36 | NZ_KT897278 | Clostridium botulinum strain FWSKR40E1 plasmid pFWSKR40E1, complete sequence | 63170-63205 | 9 | 0.75 |
NZ_AP017968_9 | 9.2|2764292|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT | 2764292-2764327 | 36 | NZ_KT897279 | Clostridium botulinum strain SWKR38E2 plasmid pSWKR38E2, complete sequence | 63170-63205 | 9 | 0.75 |
NZ_AP017968_9 | 9.9|2764749|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT | 2764749-2764783 | 35 | NZ_CP038863 | Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence | 62501-62535 | 9 | 0.743 |
NZ_AP017968_9 | 9.12|2764294|36|NZ_AP017968|PILER-CR | 2764294-2764329 | 36 | NZ_KT897280 | Clostridium botulinum strain FI1111E1 plasmid pFI1111E1, complete sequence | 63170-63205 | 9 | 0.75 |
NZ_AP017968_9 | 9.12|2764294|36|NZ_AP017968|PILER-CR | 2764294-2764329 | 36 | NZ_KT897278 | Clostridium botulinum strain FWSKR40E1 plasmid pFWSKR40E1, complete sequence | 63170-63205 | 9 | 0.75 |
NZ_AP017968_9 | 9.12|2764294|36|NZ_AP017968|PILER-CR | 2764294-2764329 | 36 | NZ_KT897279 | Clostridium botulinum strain SWKR38E2 plasmid pSWKR38E2, complete sequence | 63170-63205 | 9 | 0.75 |
NZ_AP017968_9 | 9.19|2764751|35|NZ_AP017968|PILER-CR | 2764751-2764785 | 35 | NZ_CP038863 | Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence | 62501-62535 | 9 | 0.743 |
NZ_AP017968_10 | 10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder | 3513569-3513602 | 34 | NC_042112 | Campylobacter phage CP81, complete genome | 25977-26010 | 9 | 0.735 |
NZ_AP017968_10 | 10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder | 3513569-3513602 | 34 | NC_015464 | Campylobacter phage NCTC12673, complete genome | 13724-13757 | 9 | 0.735 |
NZ_AP017968_10 | 10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder | 3513569-3513602 | 34 | KF148616 | Campylobacter phage CP8, complete genome | 102910-102943 | 9 | 0.735 |
NZ_AP017968_10 | 10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder | 3513569-3513602 | 34 | NC_016562 | Campylobacter phage CPX, complete genome | 102674-102707 | 9 | 0.735 |
NZ_AP017968_10 | 10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder | 3513569-3513602 | 34 | KX236333 | Campylobacter phage PC14, complete genome | 48720-48753 | 9 | 0.735 |
NZ_AP017968_4 | 4.4|973170|37|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT | 973170-973206 | 37 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 558849-558885 | 11 | 0.703 |
NZ_AP017968_4 | 4.6|973301|38|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT | 973301-973338 | 38 | MN693448 | Marine virus AFVG_25M325, complete genome | 6702-6739 | 12 | 0.684 |
1. spacer 4.1|973175|32|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
aatcaagttcataatattgtgaatcatcttta CRISPR spacer gatcaggttcataatatagtgaatcatagtga Protospacer .****.*********** ********* * *
2. spacer 4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NZ_CP015798 (Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp32-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
agaatttaattctaaattagctctttctaaagt CRISPR spacer aaatcctaattctaaattagccctctctaaagc Protospacer *.* ..***************.**.*******.
3. spacer 8.6|1848823|37|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774399 (CrAssphage cr109_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
--ttgttatcttaatacttccatcttcattataatgtaa CRISPR spacer aatcattg--ttgatacttccatcttcattataatgtat Protospacer *..**. **.*************************
4. spacer 4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR matches to MN693448 (Marine virus AFVG_25M325, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
agaatttaattctaaattagctctttctaaagt CRISPR spacer tctatctaattctaaattagctctatctaactc Protospacer **.****************** ***** .
5. spacer 4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NC_015906 (Borreliella bissettii DN127 plasmid cp32-quad, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
agaatttaattctaaattagctctttctaaagt CRISPR spacer aaaccctaattctaaattagcacgttctaaatc Protospacer *.* ..*************** * ******* .
6. spacer 4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NC_015908 (Borreliella bissettii DN127 plasmid cp32-3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
agaatttaattctaaattagctctttctaaagt CRISPR spacer aaaccctaattctaaattagcacgttctaaatc Protospacer *.* ..*************** * ******* .
7. spacer 4.3|973306|33|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NZ_CP015802 (Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid cp32-6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
agaatttaattctaaattagctctttctaaagt CRISPR spacer aaatcctaattctaaattagccctctctaaatc Protospacer *.* ..***************.**.****** .
8. spacer 8.1|1848499|35|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN379642 (Chicken microvirus mg7_16, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ggagaagtaacatatcagcaaggtcttgacagaaa CRISPR spacer gctgatttgacgtatcagcaaggtcttaacagaat Protospacer * ** *.**.***************.******
9. spacer 8.1|1848499|35|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG945583 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 3973-1602, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
ggagaagtaacatatcagcaaggtcttgacagaaa CRISPR spacer gcagatttaacatatcagcaaggtcttaatcgtat Protospacer * *** ********************.*. * *
10. spacer 8.7|1848889|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taaagacttccctgttttatagttccatcttcattc CRISPR spacer tctctatttccctttttaatagttccatcttcatta Protospacer * *.****** *** *****************
11. spacer 8.7|1848889|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to ACSJ01000017 (Clostridium phage D-1873 CLG.Contig173, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taaagacttccctgttttatagttccatcttcattc CRISPR spacer tctctatttccctttttaatagttccatcttcatta Protospacer * *.****** *** *****************
12. spacer 8.7|1848889|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taaagacttccctgttttatagttccatcttcattc CRISPR spacer tctctatttccctttttaatagttccatcttcatta Protospacer * *.****** *** *****************
13. spacer 9.5|2764489|37|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053689 (Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
---atggctgggtagttctaaaaaattctaatggactact CRISPR spacer cgcatg---cgttagttcaaaaaaattctaaaggactagt Protospacer *** * ****** ************ ****** *
14. spacer 9.9|2764749|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK562505 (Shigella phage Silverhawkium, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
taaatatttttttatgttttttgtaagtagttcct CRISPR spacer aagataatttttaatgttttttgtaagtcattgat Protospacer *.*** ***** *************** .** *
15. spacer 9.9|2764749|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK562504 (Enterobacteria phage CHB7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
taaatatttttttatgttttttgtaagtagttcct CRISPR spacer aagataatttttaatgttttttgtaagtcattgat Protospacer *.*** ***** *************** .** *
16. spacer 9.9|2764749|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
taaatatttttttatgttttttgtaagtagttcct-- CRISPR spacer aaaatatttttttatattttttctaacc--ttccagg Protospacer **************.****** *** . ****
17. spacer 9.15|2764491|37|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NZ_CP053689 (Arthrobacter citreus strain NEB 577 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.784
---atggctgggtagttctaaaaaattctaatggactact CRISPR spacer cgcatg---cgttagttcaaaaaaattctaaaggactagt Protospacer *** * ****** ************ ****** *
18. spacer 9.19|2764751|35|NZ_AP017968|PILER-CR matches to MK562505 (Shigella phage Silverhawkium, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
taaatatttttttatgttttttgtaagtagttcct CRISPR spacer aagataatttttaatgttttttgtaagtcattgat Protospacer *.*** ***** *************** .** *
19. spacer 9.19|2764751|35|NZ_AP017968|PILER-CR matches to MK562504 (Enterobacteria phage CHB7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
taaatatttttttatgttttttgtaagtagttcct CRISPR spacer aagataatttttaatgttttttgtaagtcattgat Protospacer *.*** ***** *************** .** *
20. spacer 9.19|2764751|35|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
taaatatttttttatgttttttgtaagtagttcct-- CRISPR spacer aaaatatttttttatattttttctaacc--ttccagg Protospacer **************.****** *** . ****
21. spacer 4.2|973241|31|NZ_AP017968|PILER-CR matches to MK493321 (Cyanophage S-RIM4 isolate RW_11_0999, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
taagaattcttccatctggtttctccaagat CRISPR spacer gaagaattctagcatctggtttcttctcatc Protospacer ********* ************.* . .
22. spacer 8.1|1848499|35|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP042965 (Bartonella krasnovii strain OE 1-1 plasmid pOE11-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ggagaagtaacatatcagcaaggtcttgacagaaa CRISPR spacer aaagaggtaacatatcagcaaggttttgagtatta Protospacer ..***.******************.**** . *
23. spacer 8.9|1849020|36|NZ_AP017968|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LR214964 (Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 10) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
atatatatgttaattgataattttaaagattttttt CRISPR spacer tttcaaaaattaattgatgattttaaaaatttttta Protospacer * .* * .*********.********.*******
24. spacer 9.2|2764292|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897280 (Clostridium botulinum strain FI1111E1 plasmid pFI1111E1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ccataaagtacctcctaaaatatttttactagtttt CRISPR spacer agataaagtacctcataaaatctttttacaaacatc Protospacer ************ ****** ******* *.. *.
25. spacer 9.2|2764292|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897278 (Clostridium botulinum strain FWSKR40E1 plasmid pFWSKR40E1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ccataaagtacctcctaaaatatttttactagtttt CRISPR spacer agataaagtacctcataaaatctttttacaaacatc Protospacer ************ ****** ******* *.. *.
26. spacer 9.2|2764292|36|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT897279 (Clostridium botulinum strain SWKR38E2 plasmid pSWKR38E2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ccataaagtacctcctaaaatatttttactagtttt CRISPR spacer agataaagtacctcataaaatctttttacaaacatc Protospacer ************ ****** ******* *.. *.
27. spacer 9.9|2764749|35|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038863 (Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
taaatatttttttatgttttttgtaagtagttcct CRISPR spacer caaatattttattattttttttgtaaaaaatagca Protospacer .********* **** **********. *.* *
28. spacer 9.12|2764294|36|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NZ_KT897280 (Clostridium botulinum strain FI1111E1 plasmid pFI1111E1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ccataaagtacctcctaaaatatttttactagtttt CRISPR spacer agataaagtacctcataaaatctttttacaaacatc Protospacer ************ ****** ******* *.. *.
29. spacer 9.12|2764294|36|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NZ_KT897278 (Clostridium botulinum strain FWSKR40E1 plasmid pFWSKR40E1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ccataaagtacctcctaaaatatttttactagtttt CRISPR spacer agataaagtacctcataaaatctttttacaaacatc Protospacer ************ ****** ******* *.. *.
30. spacer 9.12|2764294|36|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NZ_KT897279 (Clostridium botulinum strain SWKR38E2 plasmid pSWKR38E2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ccataaagtacctcctaaaatatttttactagtttt CRISPR spacer agataaagtacctcataaaatctttttacaaacatc Protospacer ************ ****** ******* *.. *.
31. spacer 9.19|2764751|35|NZ_AP017968|PILER-CR matches to NZ_CP038863 (Campylobacter jejuni strain SCJK2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
taaatatttttttatgttttttgtaagtagttcct CRISPR spacer caaatattttattattttttttgtaaaaaatagca Protospacer .********* **** **********. *.* *
32. spacer 10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder matches to NC_042112 (Campylobacter phage CP81, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atcaggaaaatatataactataaatgccttaaac CRISPR spacer gttaataaaagatataactataaatggcttatca Protospacer .*.*. **** *************** ****
33. spacer 10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder matches to NC_015464 (Campylobacter phage NCTC12673, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atcaggaaaatatataactataaatgccttaaac CRISPR spacer gttaataaaagatataactataaatggcttatca Protospacer .*.*. **** *************** ****
34. spacer 10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder matches to KF148616 (Campylobacter phage CP8, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atcaggaaaatatataactataaatgccttaaac CRISPR spacer gttaataaaagatataactataaatggcttatca Protospacer .*.*. **** *************** ****
35. spacer 10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder matches to NC_016562 (Campylobacter phage CPX, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atcaggaaaatatataactataaatgccttaaac CRISPR spacer gttaataaaagatataactataaatggcttatca Protospacer .*.*. **** *************** ****
36. spacer 10.1|3513569|34|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder matches to KX236333 (Campylobacter phage PC14, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atcaggaaaatatataactataaatgccttaaac CRISPR spacer gttaataaaagatataactataaatggcttatca Protospacer .*.*. **** *************** ****
37. spacer 4.4|973170|37|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
atttaaatcaagttcataatattgtgaatcatcttta CRISPR spacer tgcctgatcaggttcataatatagtgaatcatagtga Protospacer .. .****.*********** ********* * *
38. spacer 4.6|973301|38|NZ_AP017968|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693448 (Marine virus AFVG_25M325, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.684
gtttcagaatttaattctaaattagctctttctaaagt CRISPR spacer ctcattctatctaattctaaattagctctatctaactc Protospacer *. . **.****************** ***** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1082276 : 1089386
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP017968|1082276:1089386|DBSCAN-SWA AATGATAATACGATCTAAAGCACCTTTAAGACTTGGGTTAGCTGGAGGAGGGACTGATGTATCACCATATTGTGATGAATATGGCGGAGTTGTACTTAATGTGACAGTAGATATGTATGCCTATTGTACTATTGAGCCTACTGCTGATAATAGGATAATTTTTAATTCAACTGATAGACATGAAATATTTGAAGGAGAGAGTAAGGATTATTTAGAAATAGATAATAATCTTTTGCTTCATAAAGGAGTCTACAATAAAATCGTTAAAAGGTACAATGATGGGAAACCATTATCTTTTAAAATGACAACTTATTCAGATGCTCCAGCAGGTTCAGGATTAGGTTCTTCTTCAACAATGGTAGTAGCTATAATAAAAGCATATATGGAATGGTTAAATTTACCATTAGGTGAATATGATATAGCTAATTTGGCATATGAGATAGAAAGAATAGATTTGAATTTAAGTGGAGGAAAGCAAGATCAATTTTCTGCTACATTTGGTGGATTTAACTTTATGGAGTTTTATTCAGAAAATAGAGTGATAGTAAATCCATTAAGGTTAAAAAAATGGATAAAAAATGAAATAGAAAGTTCACTTATTTTATATTATACAGGAACTTCAAGAGAATCTTCAAAAATAATTGATGAGCAAATCAAAAATGTAAAAGAAAAGTCTGAAAAAAGTTTAGAAGGAATGCATGAATTAAAAGAATCAGCTATTGAAATGAAAAATGCAATTCTAAGAGGAGATTTTAAAAAGTTTGCCAAGTGTCTAAAAGAGGGATGGATATCTAAAAAGAAAATGTCAAATGCAATTTCTAATGAGTTTATAAATGAAACTTATGATTTTATAATGAATAATGGAGGAAAAGCAGCTAAAGTATCAGGCGCTGGTGGCGGAGGTTTTATGATGATACTTTGTGACCCAAAAGAAAGATATAGCCTTATAGAAAAATTAAGAAAAAAAGAAGGGAAAGTTATGTTAGCACAATTTTCAGAAAAAGGAGCACAGGCTTGGACTTTATATGAATAAGAGGTGTATAAAATTGAAAAAATCTACAAATTTATTAATAGAAAATTTAATTATAAGATTTCCTAAATTAACTAATTGTAAGCAAGAAATAGAAAATTCAATATTAGAAATAGTAAATTGTTATAAAAATAAAGGGAAATTGCTAATTTGTGGCAATGGTGGAAGTGCTTCAGATTCTTTACATATAGTAGGAGAACTCATGAAAAGCTTTATTCTTCCAAGAAAATTAGAAAATAAATATATAGATAAAATTAAAAATACATTTCCACAAGAAGCAGAATATTTTATAAATAACTTACAGAGCTCATTACCTGCAATAGCTTTGGTAAGTGAAATTTCATTGATAACAGCTTACAGTAATGATAATAATTCTGAACTTGTTTTTGCTCAACAGGTATTAGGATATGGGAATGAAGGAGATATATTAATAGCTATAAGTACATCAGGAAATTCAAAAAATGTTATTTATGCTTCGCAAATATCTAAAATTAAAGGGATGAAAGTAATTTCGTTGACAGGAAAGTTTGGTGGAAAATTAAAAAATATATCAGATATAAATATAAATGTTGAAGAAAAAGAAACATATATTATTCAAGAATATCATTTACCAATTTACCATACTCTATGTTTAGGAGTAGAAAAAGAAATGTTTGGGGAGGAATAAAATTGGAAGCAATAGTACTAGCTGGAGGTTTTGGAACAAGATTAAAAGAAGTGGTATCAGATGTTCCTAAACCAATGGCTCCAGTAAATGGAAAACCTTTCTTAGAATATTTATTAAAAGATTTAAGTAAAAAAGGAATAAAGCATGCTATTTTAGCTGTTGGTTATAAAAAAGAAATAATAAAAGAATATTTTAAAAATAGATATGAAAATATTGAAATAACATATTCAGAAGAATTAACTCCTCTAGGAACAGGAGGAGCTATAAAAAAAGCTTTAAAGTTAGCTAAAGAAGAAGATGTTTTTATAGTTAATGGAGATACTTTCTTTGATATTGATTTAAAAGGAATGAAAGAATTTTACACTGAAAAAAAAAGCACCTTAACAGTTGCAGTAAAAGAAATGGAAAATTTTGATAGATATGGTTCTTTAGTAATAAAAGAAAATAGAATAATAGAATTTGAAGAAAAAAAGAAAAAAGATAGCGGAAAAATAAATGGAGGGATATATTTAATAAAAAAAGATTTATTGGATAGAATAGAGAAAGAAAATTTTTCATTTGAAAAAGAAATATTAGAAGCTAAAAAAGTAGAAAAGTATTCGTATGAAAGTAAGGGATACTTTATAGATATAGGAATACCTGAAGATTACTATTTATTTAAAGAAAAGAAATAAGAATAAAAAATAATATATGTATATGTAAAACACACTATCAAAAAATTTAAAAAGATACTTATTGAAAGGACAAGATAAAGTGCAAAAGATTATAGAAAGAGTTTTTATTTTTTTTGTTTTTTTTATAGTATATCTTCCAATGAGTGAGATAAGAAATATTTCATTTCATCAAATAATTTTATGGATTTTTATATTTTATTTTTACGTAAGAAATAAAACTAAAATAAAAAAAAAAGAATTTTTAATTTTTATATTTATAATCTTAGAAGCTATTTTAATATTTTTTTATTATGACTATAAATATGTTAATTTTTTAAATGATAATATTCCAGATATTTGGTTTGAAATGGGAAGTTGGGGAAGGTTTAGCTATTTTAAAGGTCAGTATGAATCAATTGCCCAATTAGTACATATTTTAGAAAATTTTTTAATTTATTTTATATTTGAATTTAAGGTAAGTGTTACAGAAGAACAATTGAAAAAAGTAGTGCTATTAAATTTTATTTTTCAATTTATTGTCATATTATATCAAAAGTTTATATTAAATACATTTTGGCAATCAGGGACATTAGGTCATTCCCAAGCAATTGGAACCTTTTGTGTAATGATTTTGATTTTATTTGGATTTTCAAATAAAAAAAACAAAATAATTTCAATACTATCTATAATTCTTGTTTTTATATCTAAAAAAAATAGTAGCATAGCTGTAATGATATTTATAATGATATTTTATAAATATAGCTTATTAGCATTATATCTAAGTGCTTTAGGAAATATAGTTTTGACAATTTTATTTTCTTGGATAGAGAAATTGAAAATAATATTTTTTTCTTTGATAAAATTTTTATTTAGTGAAGAAAGTTTATATACTTTAAAAATGAGATACATTATATGGGAAAATATATTTCTTTTAGTAATAAAAAAGAATTTTTTATTAGGCACAAATGGTATTATAGTATCATTTCCAGAGAATGTAATATGGTATTTTTTACAACCTTATGGAATAGTTGGAATAATTATTATTTTATATTTCTTTTTTTATAAATGTAAAGATAAAGCTCAAAAACATAATTTATTATTAAGTGCTTTTTTTCTTCAAGGAATAAGTTATTATGGTTTTTTAGTTCCACCTATGTCATATATGTTTTTTGCATTATTAGGATTATATTCAAAAGAAAAAATAGAAAATAAAAAGGAGAAAATTAAATGAAAGTTTCAGTAATTATTCCAAATTATCATAGATAGCACATTTTAAAAGAAATAATACCTACCTATTTTCAGGCTGAGGTAAAAGAAGTAATAGAAAAGTTAATGAAAGAATTTTTAAAATTGAAATATTATAAATTGAAAAAAATTCAAAACAAACAATGGCTAAAAATATAGGAATAGGAATGACTAATAAAGAAAATGAATATATTTATTTTTAAAATGATGATTTATATTGAAAGAAAATTCTATAAAGTATTTAATAAAAATATGATGCAGATTTAGTTAGAGTCAAAGCTTTATATTTATAAAATCAAAAAGAATTACAAAATTTAACTATAGAAAATTTAAATTTATTAAATTAATTTATAAAAAATTAGAATATGAAAATATTATATAAATATTATTTAAAAGATTGATAAACAAGGAGGGAAAAACTATGGAAATAGTAGCTCATAGAGGTTGTTGGTATTCAGAGGAAGAAAAAAATACAAAAGAAGCTTTAATAAGAGCATTTGAAAAAAGATTTGGAATTGAAACTGATATCAGAGATAGAAATGGACAATTGGTGATAAGTCATAATATTTCAAATACTTCTTCTATATTATTAGAAGAAATTCTTCAAAAATATAAAGAAATAAATTCAAATGTAGTTTTAGAATTAAATATAAAAGCAGATGGAATACAAGAAATGCTACAAGAAATAATGCATAAATATGAAATAAATAATTATTTTGTTTTTGATATGTCTATTCCAGAAATGGTAATAAGTAAAGCCATAGGAATTAATTTTTTCACAAGAAATAGTGACATTGAAGAACAATGCATTTTATATGAAGATGCAGAAGGAGTGTGGTTAGATAGTTTTTATATAGAAAATTGGTTAACTCCAGAAATTATACAAAATCATTTGAATAAGGGGAAAAAAATTAGTATTATATCTCCTGAAATACATGGTTTTAGTAATTTTTCTGTTTGGGAAATGTTAAAAAAGTATAAGTTTCATAAAAATAATAGAGTATATCTTTGTACAGATTTACCAATAAAAGCAAAGGAGTATTTTGAAAATGATTAAAGCAATATTATTTGATATGGATGGAGTTTTGATTGATGCAAAAGATTGGCATTATGAAGCTTTAAATAAAGCTTTAGGATTATTTGGTTTAGAAATTAGTAGATATGACCATTTGCACACTTTTGATGGAATACCAACGAAAGTAAAATTAAAAATGTTAGGAGAACAATATTATTTGCCAGAGGAGCTTCATCCATTTATAAATCAAATTAAACAAAAATACACTCAAGAATTAATAGAATTAAAATGTAAACCAATGTTTCATCATGAGTATGCTTTATCAAAGCTAAAACAACAAGGATATAAAATAGCAGTTTGTTCCAATTCTATAAAAGCAACAATTGAAATGATGATGAAAAAGGCAGAATTAATAGAATATATTGATTTAATTATAAGTAATGAAGATGTAAAAAAAGCTAAACCAGATCCTGAAATGTATAATATGGCAATAAAAAAATTTGCTTTAAATCCAATTGAATGTTTAGTAGTGGAAGACAATCCAAATGGAATAGCAGCAGCGAAAGCAAGTGGAGCTTTTGTATTACCTGTGGGAACTGTGTATGATGTTAATTATGCAAATATAATGAAAGCAATAAAAAGGAGTGAAGAAAGATAATTATGGTTAATATTTTAATCCCCTCTTTGGGAAATTCATTATTTTTTAAAGATAGTTATTTTCCAAAACCAGTAATAGAAATTTTAGGAAAAACAATGTTAGAAAAAGTAATTGAAAATTATAAAGAAATACAAGAAAAACATTATATTTTTATTTTTGATGAAAAAAATTGCAATGAATTCCATTTAGATGATTCTGTTAAAAATTTAATTCAGTCAGAAATAGATATATTAATTTTAAAAAATATTACTAAAGGAGCATTATGTAGTTGTTTAATGGCAATAGAGAAAATAAATAATGATACTCCATTGATCATTGCTAATTGTGATCAAGTAATAGATATTGATTATAAAGAAGTTATTAATAAATTTAAAAGAGAGAATATAGAAGTAGGAATGATAACTTTTGATAGCATTCATCCTCGTTGGAGTTATATAAGGATTGAAGAAAATCAAGTAATAGAAGCAGCAGAAAAAAGACCTTTAAGTAAACATGCAATAGCTGGTTTTTATTATTATGAAAAAGGAAGTATTTTTGTAGAAACTGCAAAGAAATCAATATTGAAAAATGAGAAATATAATGAAAACTTCTATATTTCTTCAACTATAAATCAAGCTATTTTATTAAGAAAAAAAGTTGGATATTATTCTATTCTAAGAGAAAAATATCACTCTTTCTATTCGCCAGAGAAAATTAAAGAATATGAAAAATGTATTAAGATAATAGATTGAGAAATTTACTATAAACAAATATTATATGGAGAAATGTATGAAAATAAATAGATTAGAAAATATGACTAGGGGATGGTTTATTGGAAATTTTGAACCAACTGTATTTAAAACAACTAATTGTGAAGTAGCTATAAAAAAATATAAAAATGGAAGTTATGAAGAAGAACATTTTCATAAAGTGGCAACTGAAATAACTGTTATTACAAAAGGAAAAGTAAAAATGTTTGGAGAAATTTTTAATGAAGGAACAATTATAGAAGTAGAACCTGGAGATATAACAGATTTTATGGCTATAGAAGATGCAGAAACTGTGGTAATTAAAATACCTGGAATAAATAATGATAAATATTTAGTAAAAGAATAAAGGAGAAAGGAAAATTATGTTAAATATAGTAATCCCTATGGCAGGAAGGGGAAATCGTTTTATACAAGCTGGATATGTAAACCCTAAGCCTCTAATAGATATATATGGTCATTTTATGATAGAGTATGTTATTAAAAATCTTAAACCAAATTGTGAACATAGATTTATTTATATTTGTCAAAAAGAACATGCAGAAAAATTTAATTTAAAAACAATATTAAAAAAAATATCTTCTAATTGTGAAATTGTAACAGTGGATTATATTACAGAAGGAGCTGCATGTACTGTGCTTTTAGCTCAAAAATATATAGATAATGAAAATCCTTTAATGATAGCTAATAGTGATCAGTTTGTAAATATAAATATAAATGATTATTTAGAAGCTCAAAAAGATTTGGATGGATTAATTATGACAATGCCAGCTAATCATCCTAAATGGAGTTATATTAAATATAATAAAGAAAAATATGTAAGTCTTGTAAGAGAAAAAGAAGTTATTTCTAATGAGGCAACAGTTGGAATATATAATTATAAACATGGGTCAGATTTTGTAAAATATGCATATAAAATGATAGAGAAAAATATAAGGGTAAATAATGAGTTTTATGTAGCGCCTGTTTATAATGAAATGATTGAAAATAGGAAAAAAATAGGATTTTATAATATTGGAGATAATATGTATGGAATAGGAGTGCCAGAAGATTTAGAAAAATTTATGGACTTGGATCTATGTAAAAAATTTTTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP017968|1082276:1089386|1085121_1085856_+|WP_147385273.1|DBSCAN-SWA MKKVVLLNFIFQFIVILYQKFILNTFWQSGTLGHSQAIGTFCVMILILFGFSNKKNKIISILSIILVFISKKNSSIAVMIFIMIFYKYSLLALYLSALGNIVLTILFSWIEKLKIIFFSLIKFLFSEESLYTLKMRYIIWENIFLLVIKKNFLLGTNGIIVSFPENVIWYFLQPYGIVGIIIILYFFFYKCKDKAQKHNLLLSAFFLQGISYYGFLVPPMSYMFFALLGLYSKEKIENKKEKIK >NZ_AP017968|1082276:1089386|1082276_1083308_+|WP_096402137.1|DBSCAN-SWA MIIRSKAPLRLGLAGGGTDVSPYCDEYGGVVLNVTVDMYAYCTIEPTADNRIIFNSTDRHEIFEGESKDYLEIDNNLLLHKGVYNKIVKRYNDGKPLSFKMTTYSDAPAGSGLGSSSTMVVAIIKAYMEWLNLPLGEYDIANLAYEIERIDLNLSGGKQDQFSATFGGFNFMEFYSENRVIVNPLRLKKWIKNEIESSLILYYTGTSRESSKIIDEQIKNVKEKSEKSLEGMHELKESAIEMKNAILRGDFKKFAKCLKEGWISKKKMSNAISNEFINETYDFIMNNGGKAAKVSGAGGGGFMMILCDPKERYSLIEKLRKKEGKVMLAQFSEKGAQAWTLYE >NZ_AP017968|1082276:1089386|1083300_1083972_+|WP_096402138.1|DBSCAN-SWA MNKRCIKLKKSTNLLIENLIIRFPKLTNCKQEIENSILEIVNCYKNKGKLLICGNGGSASDSLHIVGELMKSFILPRKLENKYIDKIKNTFPQEAEYFINNLQSSLPAIALVSEISLITAYSNDNNSELVFAQQVLGYGNEGDILIAISTSGNSKNVIYASQISKIKGMKVISLTGKFGGKLKNISDININVEEKETYIIQEYHLPIYHTLCLGVEKEMFGEE >NZ_AP017968|1082276:1089386|1088654_1089386_+|WP_096402145.1|DBSCAN-SWA MLNIVIPMAGRGNRFIQAGYVNPKPLIDIYGHFMIEYVIKNLKPNCEHRFIYICQKEHAEKFNLKTILKKISSNCEIVTVDYITEGAACTVLLAQKYIDNENPLMIANSDQFVNININDYLEAQKDLDGLIMTMPANHPKWSYIKYNKEKYVSLVREKEVISNEATVGIYNYKHGSDFVKYAYKMIEKNIRVNNEFYVAPVYNEMIENRKKIGFYNIGDNMYGIGVPEDLEKFMDLDLCKKFF >NZ_AP017968|1082276:1089386|1083974_1084646_+|WP_096402139.1|DBSCAN-SWA MEAIVLAGGFGTRLKEVVSDVPKPMAPVNGKPFLEYLLKDLSKKGIKHAILAVGYKKEIIKEYFKNRYENIEITYSEELTPLGTGGAIKKALKLAKEEDVFIVNGDTFFDIDLKGMKEFYTEKKSTLTVAVKEMENFDRYGSLVIKENRIIEFEEKKKKDSGKINGGIYLIKKDLLDRIEKENFSFEKEILEAKKVEKYSYESKGYFIDIGIPEDYYLFKEKK >NZ_AP017968|1082276:1089386|1087545_1088274_+|WP_096402143.1|DBSCAN-SWA MVNILIPSLGNSLFFKDSYFPKPVIEILGKTMLEKVIENYKEIQEKHYIFIFDEKNCNEFHLDDSVKNLIQSEIDILILKNITKGALCSCLMAIEKINNDTPLIIANCDQVIDIDYKEVINKFKRENIEVGMITFDSIHPRWSYIRIEENQVIEAAEKRPLSKHAIAGFYYYEKGSIFVETAKKSILKNEKYNENFYISSTINQAILLRKKVGYYSILREKYHSFYSPEKIKEYEKCIKIID >NZ_AP017968|1082276:1089386|1086919_1087543_+|WP_096402142.1|DBSCAN-SWA MIKAILFDMDGVLIDAKDWHYEALNKALGLFGLEISRYDHLHTFDGIPTKVKLKMLGEQYYLPEELHPFINQIKQKYTQELIELKCKPMFHHEYALSKLKQQGYKIAVCSNSIKATIEMMMKKAELIEYIDLIISNEDVKKAKPDPEMYNMAIKKFALNPIECLVVEDNPNGIAAAKASGAFVLPVGTVYDVNYANIMKAIKRSEER >NZ_AP017968|1082276:1089386|1086291_1086927_+|WP_096402141.1|DBSCAN-SWA MEIVAHRGCWYSEEEKNTKEALIRAFEKRFGIETDIRDRNGQLVISHNISNTSSILLEEILQKYKEINSNVVLELNIKADGIQEMLQEIMHKYEINNYFVFDMSIPEMVISKAIGINFFTRNSDIEEQCILYEDAEGVWLDSFYIENWLTPEIIQNHLNKGKKISIISPEIHGFSNFSVWEMLKKYKFHKNNRVYLCTDLPIKAKEYFEND >NZ_AP017968|1082276:1089386|1088311_1088638_+|WP_096402144.1|DBSCAN-SWA MKINRLENMTRGWFIGNFEPTVFKTTNCEVAIKKYKNGSYEEEHFHKVATEITVITKGKVKMFGEIFNEGTIIEVEPGDITDFMAIEDAETVVIKIPGINNDKYLVKE |
9 | Synechococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1483053 : 1527293
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP017968|1483053:1527293|DBSCAN-SWA 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60 | Clostridium_phage(26.67%) | terminase,portal,integrase,tail | attL 1489645:1489662|attR 1506652:1506669 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1898812 : 1948883
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP017968|1898812:1948883|DBSCAN-SWA 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50 | Clostridium_phage(25.0%) | protease,bacteriocin,integrase,transposase | attL 1906897:1906914|attR 1937363:1937380 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1998300 : 2004062
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP017968|1998300:2004062|DBSCAN-SWA ATTAGTGTTTGAAGTGTCTCATCCCAGTGAATACCATTGAAATTCCATGCTCATTACATGCATCAATAGATTCCTGATCTCTCATAGAACCACCTGGCTGAATGATAGCTCTTATTCCAGCTTTTGCACATTCATCAACAACATCTCTGAATGGAAAGAAAGCATCAGAAGCAAGAATAGCTCCTTCTATTTTATCTCCTGCTCTTTCTATTGCCTGTCTAGTTGGCCATATTCTGTTAGTTTCACCATTTCCAATTCCTACTGCCATCATATCTTTTACTACAACAATAGCATTTGACTTTACATGTTTTACCACTTTCATTCCAAAGATAAGGTTTTCCATTTCTTCAGCAGTTGGAGCTTTCTCAGTAACTGCTTCATAATCAGTAGTAAAGCTTAAATCTTCATCTTGAATAAGAAGTCCTCCATCTACTTTTACCATATTGATTTTATCCTGTGGTGTATGTTTGCATTTTATAACTCTAAGATTTTTCTTAGTTTTAAGTACTTCTAAAGCTTCATCAGTAAATGATGGTGCTATTACAATCTCTAAGAATATTTTTATCATTTCCCTAGCTGTATCTGCATCTACTTCTTTATTTAAAGCTACTATTCCACCAAAAATAGACACAGGATCACATTCATAAGCTTTTACATAAGCTTCATGAACATCTTTGCCAATAGCTGCTCCACAAGGAGTAGAGTGTTTCAAGCCACAGCATGCAGGCTCTATAAATTCACATACAGTTCTCCAAGCTACATCCATATCTCTTAGATTGTTAAATGAAAGTTCCTTCCCATTTAACTGTTCAAAGTCTTTCATAGCTCCTGTATCAGTAGTAGATACATAATATGCAGCCTTCTGATGTGGATTTTCTCCATATCTAAGATCCATTAATTTTTCATATGAAGCATTTAGATATTTAGGTATCTCATCTCCCAATAAGAATTGAGATATAGCCGCATCATAAGCTGATGTTAGATTAAATACTTTTCCAGCCAGTCTTTTTTTAGTTTCAAATGTAACCTCTCCAGTTTCCATTTCTTTCATTACTGTTTCATAATCAGCAGTGTCACTTATAACTACTACATCTTTAAATGATTTAGCAGCAGATCTCAGCATAGTAGGCCCACCAATATCTATAAATTCTACTTTTTCTTCAAAAGTAAGGTCTTCATTTACTTTCTTAAAGAAAGGATAAAGATTTACAACCACCATATCAATAGTAGATATTCCTCTTTCTTTAATAGTCGCCATATGTTCAGCATTATCTCTTATTGCAAGTATTCCCCCATGAATAACTGGATGAAGAGTTTTCACTCTTCCATCAAGCATTTCAGGAGCTCCAGTAACTTCAGCAACCTCTATTACAGGCACTCCATTTTCTTTTAAATGTTTATATGTTCCACCTGTTGAAATTATTTCTACTCCATGTTTAACTAAAAAGTTAGCAAATTCTAATATACCATTCTTATCAAAAACTGATATTAATGCTCTTTTCATCAACTTTTTCTCCTTTTTATCTCTCTGATATTATTTTAGAAATAGATTTTGGTAAAAGTTTGTGTTCTTCTACTAATATTCTTTTTTGAAGAATTTCAGCAGTATCCCCTTGCATTACAGGAACTTTTACTTGAAAGATTATCTCTCCGCTGTCCACTCCATTATCTACATAGTGAACTGTACACCCGCTTTCTTTTTCTCCTGCTGCAAGGACTGCTTCATGTACTTTTATTCCATACATTCCAGGTCCTCCAAATTTAGGAAGAAGTGATGGATGAATATTGATTATCTTCCCTTTCCATTTTTCCACAAATTCTTCATCAATTATAGATAAAAATCCTGCAAGAACTATAAGATCTACTTCTTTTTCAGAAACGACTCTGTCTATCTCCCTGCACAATTCTTTTTTAAAAACTTTTCTGTCAAGAACACAGCTTACTATCCCTTGTTCAGCTGCTCTCTCCACTCCATAACATTCTCTGTCTCCAATGACACAGGCTATTTCACAGGCCAGCTCTCTACTCTTCGACTTCTCTATTATAGATTGAAGATTGCTTCCTCCTCCTGATACTAATACTGCTATCTTAAACATAGACCTTTCTCTCCCTTTTGAACATATCCTATCTCAAAAGCTTCCTCTCCATGTTTTGCCAATTCTTCTATTACACCATTTTTATCTTTAGAATCTACTACCAAAACAAATCCTACACCCATATTGAATGTACCATACATTTCACTTTCAGGTATTTCTCCCTCTTTTTGAATATATTTGAATATATCAAGAACTCTTAATTTATCTTTGAAAACTACTGGCTGGTGTCCTTCACTTATAGTTCTAGGAAGATTTTCAGGAAGACCTCCTCCAGTTATGTGAGCCATTCCTTTTACATTATATTTTTCTAACACAGCTAATACAGGTTTAACATATATTTTTGTAGGTGTTAAAAGAGTTTCACTGATAGGCTTTCCATTAAAATCTTTAGTATAATCAGTTATTACTTTTCTTACTAATGAGAATCCATTGCTGTGTACTCCAGAAGAAGGTATAGCTATAAGGATATCTCCCTCAGAAGTAGTACTTCCATTTATTATTTTAGACTTTTCTACTGCCCCTACACAAAAACCAGCAATATCATAATCTCCCACTTTATAAAATCCTGGCATTTCAGCAGTTTCTCCACCAATAAGTGCTGCTCCTGCCTGATAACATCCCTCTGCTACTCCTGAAACAAGTTCAGCTGCTATTTCAGCATCTAGTTTTCCACAAGCTAGATAATCCAAGAAGAATATAGGTTTTGCTCCATGACAGAGTACATCATTTACACACATAGCCACAGCATCTATTCCTACTGTATCATATTTTTTCGATGTCAATGCTACTTCAAGTTTTGTTCCTACTCCATCAGTTCCAGAAACTAATACAGGATTTTCATATTTTCCCAATTCATACATAGCTCCAAAACTTCCAAGTCCATTAAGTACACTGCTGTTTTGAGTTTTAGCTACTGCTTTTTTCATAAGTTCCACTGCCTTGTAACCTTCTTCTTTATCTACTCCAGCTTCTTTATAAGAAATTGCCATTTTTTCCTCCCAAATAATTTTTTACTCTTCTGTTGGTGTACACATAGGATATTCCCCACTGAAACATCCCACACAATAATCTTTACAATTTAATGATTTTATCATATTATCCATTGATAAGTAATCCAATGTATCTGCATTTATCTCTTTTCTTATCTCATCAACTGTCATCCTAGCAGCTATAAGTTCTTCTCTGTGTGCAGTATCTATTCCATAGAAACAAGAATATTTAACTGCTGGAGAAGCTGATCTGAAGTGAACTTCCTTAGCTCCTGCTCTTCTTATTAAGTCAATAAGTATTTTACTTGTTGTTCCTCTTACTAGAGAGTCATCAATGATTACTACTCTTTTTCCTTCAAGCTGTACTCTTAAAGGATTAAGTTTTACCATTACAGCCTGTTCTCTTAAAGCTTGAGTTGGTTTGATAAATGTTCTTCCAATATATTTATTTTTGATAAGCCCCATAGCATATGGTATTCCACTTTCTTCAGCATATCCAATAGCTGCTGGTATTCCCGAATCTGGTACTCCAATAACAATATCAGCTTCAATTTTCATCTGTTTAGCCAGAAGTCTTCCAGCTTTTACTCTTGCTTCATATACATTTATTCCATCTATAATACTATCAGGCCTTGCAAAGTAAATATGCTCAAATGAACAAGGTGCTACTTTATTATTTTCAGCATATCTGATTGATTTAACTCCTGTTTCATCTATGATTACCATTTCTCCAGCTTCTACATCTCTTATCAGATGCCCCCCTATAGAATCTATAGCACATGATTCAGAAGCAAGGAAATAATCTCCCTCATCATTCATTCCAAGACATAGAGGCCTGATTCCATATGGATCTCTTACTCCTATAAGTTTGTTGTCTGCTAATATTACCAAAGCATAAGCTCCTTTTATAGCTCCAACTGTACTTCTGATAGCTTCTTCAAACCCGTTCATAGCTTTTCTGGCTACCATTTTTATTATTACTTCTGAGTCAGTAGTAGATGTAAAAGTAGCTCCTCCATCTTCTAATAATTCTCTGATTACTTTAGTATTTGTCAAATTTCCATTATGAGCAACTGCTATTTGTCCAAGTTTAAATCTGCTTTCCAAAGGCTGTGCATTTTCTATTTTGCTTTCACCAGTAGTTGAATATCTTACATGCCCTATGGCTGCATTTCCTTTTAAATTATTTAGAGTTTCCTGTGTAAATACATCAGCTGTAAGTCCCATACCTTTATATGTTATTAATTCTCCATTATTCGAAACAGTTATTCCTGCACTTTCCTGTCCTCTGTGTTGAAGAGCATATAGGGCATAGTAAGTTAATTGTGAAACTTCTTTTTGAGTTTTGCTGTATACTCCGAAAACTCCACATTCCTCTTCCATTTTGTCCTTTGCTAACATCATTTCTGTGCAGTTCATTATTCAGCCCCCAATCTTTTTAAGACTTCTATATATGCTTCTTCTATTCCGCCTAAATCTCTTCTAAATCTGTCTTTATCTAATTTCATACCAGTTTCTTTATCCCATAATCTGCAAGTATCTGGAGTGATTTCATCTGCAAGAAGGATTTCTCCTTTATTATTTTTACCAAACTCTATTTTGAAGTCAACTAAAGTAATTCCTATTTTATCAAAAGCATTTTTCAACAGGTCATTGATTTGCCCAGTTATTCTATAGATCTCAGCTAGCTCTTCATAAGTAGCAAGTCCTAGTGCAACTGCATGGTGATCATTTATTAATGGATCTCCATAAGCATCATTTTTATAGCAAATTTCAAATATAGTATTTACAGGTTTAGTTCCCTCTTCTACCCCTACTCTTTTAGCCATTGATCCAGCTATAACATTTCTCACTATTACTTCTAAAGGAAATATTTTTACTTTTTGACAAAGTTGATCTCTATCATTAAGTACTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP017968|1998300:2004062|2000382_2001384_-|WP_096402904.1|DBSCAN-SWA MAISYKEAGVDKEEGYKAVELMKKAVAKTQNSSVLNGLGSFGAMYELGKYENPVLVSGTDGVGTKLEVALTSKKYDTVGIDAVAMCVNDVLCHGAKPIFFLDYLACGKLDAEIAAELVSGVAEGCYQAGAALIGGETAEMPGFYKVGDYDIAGFCVGAVEKSKIINGSTTSEGDILIAIPSSGVHSNGFSLVRKVITDYTKDFNGKPISETLLTPTKIYVKPVLAVLEKYNVKGMAHITGGGLPENLPRTISEGHQPVVFKDKLRVLDIFKYIQKEGEIPESEMYGTFNMGVGFVLVVDSKDKNGVIEELAKHGEEAFEIGYVQKGEKGLCLR >NZ_AP017968|1998300:2004062|1999819_2000395_-|WP_096402903.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGSNLQSIIEKSKSRELACEIACVIGDRECYGVERAAEQGIVSCVLDRKVFKKELCREIDRVVSEKEVDLIVLAGFLSIIDEEFVEKWKGKIINIHPSLLPKFGGPGMYGIKVHEAVLAAGEKESGCTVHYVDNGVDSGEIIFQVKVPVMQGDTAEILQKRILVEEHKLLPKSISKIISER >NZ_AP017968|1998300:2004062|2002802_2003519_-|WP_096402906.1|DBSCAN-SWA MSAQKKEFIYEGKAKQVYSTDDENLVIIHYKDDATAGNGAKKGTIENKGIMNNKITAMLFEMLEKNGIKTHLVEVLNDRDQLCQKVKIFPLEVIVRNVIAGSMAKRVGVEEGTKPVNTIFEICYKNDAYGDPLINDHHAVALGLATYEELAEIYRITGQINDLLKNAFDKIGITLVDFKIEFGKNNKGEILLADEITPDTCRLWDKETGMKLDKDRFRRDLGGIEEAYIEVLKRLGAE >NZ_AP017968|1998300:2004062|2003582_2004062_-|WP_096402907.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKMKGAANCLKEFGIEYSAHVLSAHRVPEKLEETLEKLEKDGYEVIIAGAGLAAHLPGVIASKTVLPVIGVPIEAAFNGMDALLSIVQMPKSIPVATVGVNNSYNAGMLAVQMFSLKCPELKEKLVKFRKDMKAKFIADNETGVEL >NZ_AP017968|1998300:2004062|1998300_1999806_-|WP_172426505.1|DBSCAN-SWA MMKRALISVFDKNGILEFANFLVKHGVEIISTGGTYKHLKENGVPVIEVAEVTGAPEMLDGRVKTLHPVIHGGILAIRDNAEHMATIKERGISTIDMVVVNLYPFFKKVNEDLTFEEKVEFIDIGGPTMLRSAAKSFKDVVVISDTADYETVMKEMETGEVTFETKKRLAGKVFNLTSAYDAAISQFLLGDEIPKYLNASYEKLMDLRYGENPHQKAAYYVSTTDTGAMKDFEQLNGKELSFNNLRDMDVAWRTVCEFIEPACCGLKHSTPCGAAIGKDVHEAYVKAYECDPVSIFGGIVALNKEVDADTAREMIKIFLEIVIAPSFTDEALEVLKTKKNLRVIKCKHTPQDKINMVKVDGGLLIQDEDLSFTTDYEAVTEKAPTAEEMENLIFGMKVVKHVKSNAIVVVKDMMAVGIGNGETNRIWPTRQAIERAGDKIEGAILASDAFFPFRDVVDECAKAGIRAIIQPGGSMRDQESIDACNEHGISMVFTGMRHFKH >NZ_AP017968|1998300:2004062|2001405_2002803_-|WP_096402905.1|DBSCAN-SWA MNCTEMMLAKDKMEEECGVFGVYSKTQKEVSQLTYYALYALQHRGQESAGITVSNNGELITYKGMGLTADVFTQETLNNLKGNAAIGHVRYSTTGESKIENAQPLESRFKLGQIAVAHNGNLTNTKVIRELLEDGGATFTSTTDSEVIIKMVARKAMNGFEEAIRSTVGAIKGAYALVILADNKLIGVRDPYGIRPLCLGMNDEGDYFLASESCAIDSIGGHLIRDVEAGEMVIIDETGVKSIRYAENNKVAPCSFEHIYFARPDSIIDGINVYEARVKAGRLLAKQMKIEADIVIGVPDSGIPAAIGYAEESGIPYAMGLIKNKYIGRTFIKPTQALREQAVMVKLNPLRVQLEGKRVVIIDDSLVRGTTSKILIDLIRRAGAKEVHFRSASPAVKYSCFYGIDTAHREELIAARMTVDEIRKEINADTLDYLSMDNMIKSLNCKDYCVGCFSGEYPMCTPTEE |
6 | Prochlorococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2552174 : 2637351
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP017968|2552174:2637351|DBSCAN-SWA 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98 | Clostridium_phage(45.16%) | integrase,plate,transposase,holin,terminase,tail,tRNA,portal,capsid | attL 2597295:2597352|attR 2637524:2637581 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3188639 : 3254450
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_AP017968|3188639:3254450|DBSCAN-SWA ATTATCTTTCTTCTATCTGGTTAAGATCAGCCATTTTTATAAATAAATCAGCTAGAAATTTAAGTTGAGAAAGTCTGTTATTCTTAACATCTTCATCTTTATCCATTACCATTACTTCATCGAAATATCTGTTAATAATATCTTTGCCTGAAACTATAGCCTGAAGATATCTATTATAGTCTTTATTATTCAAAGCATCTATTACTTTTGAATTTAATTCCAATGAGAAATTATATAGTTCAGTTTCTACTGGTTCTTTAAATAAATCTTGATTTATAATACCTTTTTCATGATCTTTGGAAATATTTCCCACTCTTTTCAATACTGGAAGAAGTATTTCAAAGGCTTCTTCTTTAGCAAAAGATTCTAAAGTTTTTATTTTTTCTAAAGCTTCTACAGCATTGTCACTATCAGTGTTAAGAACAGCTGTAACTATATCTTTACTGTATTTCATTTCAGTAAATATATTCGTTTCTCTTTGCTTAAAAAACTCTAATACTTCTGTAAGTACAGTCTCTCTATCTCTTTTTAATACTCCACATCCTTGAAGTGCATCTAAAGCTTTTTCAATTAAAGCTTTTAAAGAAATATCCAATCTTGAATTAAGTATTACATTTACAATTCCAAGAGCTGCTCTTCTCAAAGCAAATGGATCTTTTGATCCGCTTGGAATAACTCCTACACCAAAGCACCCTACCAATGTATCTATTCTATCAGATATTCCAGCTACTATCCCTTCTAATTCTGTAGGAAGATTATCTCCTTGGAATCTTGGATAATAATGTTCTTTTATACCAAGAGAAACTTTTTCTCCCTCTCCAGATTTTAGTGCATAGTCTGCTCCCATAAATCCTTGAAGTTTAGTAAATTCCTTTTCTCCTATCATATTAGAAACGAGGTCAGCTTTAGCCAGTAATACAGTTCTTAATATACTGTCTTTTCTGTCATTATACCCAAGAGTATCTATTAAATATTTAGCTATTTCAGTTGCTCTTTCTATTTTAGAATAGATAGTTCCTAGATCTTTTTGGAATACTACTGTTTTTAATTTTTCTATATTATCAGCAAGAGGTGATTTTAAATCTTCCTGATAGAAGAATCTAGCATCAGCAAGTCTTGCAGATAATACTTTTTCATTTCCTTTTCTTACTTGTTCAGAAGTTTCTACACCATTTCTAACAACTACAAATTTAGGTAGAAGTTTTCCATTTGAATCAAGTATAGGGAAATATCTTTGATGTACTTCCATTGATATTATAAGTACTTCCTGTGGTACTTCCAAGAAATCTGAGTTGAAGCTTCCAACTATAGGACATGGATATTCTATAAGATTAGTTACCTCATCTAAAAGCTCATCTTCTACAAGTACTTGTTCTCCTGAATTTGTACAATTTTCATTAATAAGTTTTTTAATAAGAGTCTTTCTTTCTTCAATATCTATTATTACATTATTTTCTCTTATTTTTTCAAAATATTCATCTATGGTATTTACTTCAAACTCTTTCCCAAAGAATCTATGTCCTTTAGATTTATTTCCACTTTCCATTCCTTCAATTTCAAATTTTACCACTTCATTATCACAAAGTGCTAAGAACCATTGTACAGGTCTTGCAAATCTTAATTTTTTATCTGACCAAGTCATAGATTTTTGGAAGTTTAATTCTAATACAAGACTTTTTAATATTTCAGGAAGAAGCTCTTTAGTTTCTTTTCCTTTCATAAATTTTCTTGCAGCTATATATTCACCTTTTGGAGTGCTTACTATTTCAAGATCTTCTGCTTCTATTCCTTGTGATTTAGCAAATCCAAGTCCTGCTCTAGATATCTCTCCATTACTTCCATAAGCTACATTTTTAGCTGGTCCCATATTCAATATATTAAGATCTTCCTGCTGTTCTCCTAACTCACATACATCCAAAACCAATCTTCTTGGAGTCCCATAAGTTTTTATATCCTTAAAACTAATTCTTCCATCTTTAAGTTTTGCTTCTAAATTATTTTTTAAATCTTTCAATGCCTGATTTAGAAATCTTGCAGGCAGTTCTTCCATTCCAATTTCAAATAGTAATCTCAATGTTCTTCCTCCTCTTCCATTTCAATCCACTCTAATAAAATAATTTTTCAAAATCAACTATTTTTTTAAAAGAGGGTAACCTAGATCCTTTCTGTTTTGTACATAAACTTCAGCACATCTTCTTGCTAAATTTCTAACTCTTAAGATATAAGCCATTCTTTCAGTTGTAGATATAGCTCCTCTTGAATCTAAAACGTTAAATGTATGAGAGCATTTCAATACATAGTCATAAGCTGGCAGAACTAATCCTGCATCTAAAATTTTAGCTGCTTCTTTCTCATATTCATCAAACCATTTGAAATGACTTTCTAAGTCTGCTAATTCAAATGAATATTTTGAGTTTTCATATTCAAACTGAAATCTCATATCTCCATATTTTACACCAGGAGCCCATTCTAAATCATATACATTTTCTTTATTTTGAATATAAAGAGCAAGTCTTTCTAATCCATAAGTTATCTCAACAGGAATAGGATCTAATTCCAGTCCTCCTACCTGTTGAAAGTATGTAAATTGAGTAACTTCCATACCATCTAACCATACTTCCCAACCAAGTCCCCAAGCACCCAAAGTTGGAGATTCCCAGTCATCTTCAACAAAACGAATATCATGTTTTTCAGGGTCAATTCCCAATACTTTTAAACTTTCAAGATAAAGTTCCTGAATGTTTAATGGAGATGGTTTCATAATAACCTGAAATTGATGATGTTGATAAACCCTGTTAGGGTTTTCTCCATATCTTCCGTCTTTTGGTCTTCTTGATGGCTCTACATAAGCAACATTCCATGGTTCAGGTCCTAAAGACATTAAGAATGTGTTAGGGTTAAATGTTCCTGCACCTTTTTCGATGTCATAAGGATTCCCCAATACGCATCCTTTAGAACTCCAGTATTTTTGAAGAGCAAAAATTATCTCTTGAAATGTCATTTTTAATCCTCCTCTATTTTTTCTTCTTTTTTTCTGCAAAAAAGTAATCTAGAAGTATCAATACAACTCCTATATTTATCCATACATCAGCTAGATTGAAAACAAAAGACCAGATACCTCTAAAGTCTATCATATCAATGACAAATCCTCTCCATATTCTGTCTATCATGTTTCCTATTGCTCCAGCTAAAACAAAAGTAAATCCTAATTTTTCTAATAAGGGCATTTTATTTCTGCCCTTATACAAATAATATGCAATAGCTACAATTGCTATAACTGTAGCTATGCTTATTACATCAAGCTTCCCTTGAAACATCCCAAAGGCTATTCCTCTATTTTTTACATATGTAAAATGGAAAAAATCAGTCAGTACACCGATAGTATCTCCCTCAAAAAAGTTTTTATCAACGATGTATTTAGATATTTGGTCTAATAGAACCAGTATAAAGACTAAAATTATATAGATCATATTATCTCCTAGCTATTCTTTAATACACTTGCACATCTTGGACAAAGAGTTGGGTGTTCAGGGTCTTTTCCAAGTTCAGTAGAATATTTCCAGCATCTTTCACATTTCTCACCATCAGCATGAAGCACTTTGATATAAAGATCTTGAGTCTCTTCTCCCTTTACAAAAGTATCATCTGCATTTTCTGCAATCTCTACTTCTGAAACAATAAGGGCAAGTTCGAGTTTCTCTCTATTTTCAACTAAGAATTTTTGTATTTCTGTATCTGTTGAATGAAGTATTACTTTAGCATCAAGTGAGTTTCCAATTATTCTATTTTCTCCCTGTCTTGCTTTTTCAAGTATTTTATTAGCTTCTTTTCTTACTTTAATTATTTCTACCCATTTATTTTCTATATCTGGATTTAAATATTGATCATTTTCTTTATACCAGTCAGTCAGCAGAACTGATTCACTATCTCTCAATACTTCTGGCAGAGTTTCCCATATTTCTTCTGAAGTAAATGAAAGTATAGGAGTTATCATCTTAGTAAGAGTAACTAAAATTTCTGTCATAACAGTTTGAGCTGCTCTTCTTTCTATTGAATTAGTTCCCTCAGTATATAATCTATCTTTTATTATATCAAGATAAAATGCAGACATATCTATTCCAGCAAAATAATGAATATCTTGGAAAAGATTGTAGAATTCATATCTATCATAATTTTCTGTCACTTTTCTTTTCAGTATTTCTAATTTATTTAATGCCCATTTATCTATTTCCATCAATTGTTCATATGGAACTTTATCAGTATTAGGATCAAAATCATTACTATTTCCTAATATATATCTTGCTGTGTTTCTTACTCTTCTATATGCTTCTGCCATTTGTTTTAAAATATTATCTGATATTTTAACATCTTCTCTATAATCTACAGAAGCACACCACAATCTAAGGATATCTGCTCCATATAATTTTATTACATCAGATGGAACTACTGTATTTCCAACTGATTTAGACATTTTCTTACCTTCTCCATCATTTACAAATCCGTGAGTCAGTATCTTTTTGAATGGAGCATCATGTGTAGAACCTATAGAAGTCAGAAGTGATGTCTGAAACCAACCTCTATGCTGGTCCGATCCTTCCAAATACATATCAGCTGGTCTATGCAAAAGATCTCCTCTCGTTTCAAGCACTGCTCTATGAGATACCCCTGAATCAAACCAAACATCCATGATATTTGTTTCTTTTCTAAGTTCTAATCCTTTAAGTTCATATTTTTCCATCAGCTCATCGCCAATAAGTTCTTCAGCTGAATATTTAAGCCATGCTGCTGTTCCTTCTTTTTTGACTATTTCAACTACTCTTGCAAGTATTTCTTTATTGAATATCTCTTTTCCATTCGCTTCATTAAAGAATACTGGGATTGGCACTCCCCATACTCTTTGTCTTGATATACACCAGTCAGGTCTTGTTTCAAGCATAGATCCAATTCTATTTCTTCCCCATGCTGGTATAAATTCTACATTATCCAAAGCTTTTAAAGCT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54 | Staphylococcus_prophage(23.08%) | tRNA,integrase,transposase | attL 3215402:3215424|attR 3245614:3245636 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3383084 : 3390864
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP017968|3383084:3390864|DBSCAN-SWA TTTATTCTAATATTTTAGTAAGAAAACTTTTCCTATGTATTTCCAATACTCCATGTTCTTTTATTGCTTCTCTATGCTGTTTGGTTCCGTATCCTTTATGTTTTTCAAAACCATAAAGAGGATATTTCACAGCTTCTTCTCTCATCATTCTATCTCTTGTTACTTTTGCTATTATTGAAGCTGCTGCAATAGAAAGACTTTTTGCATCTCCTTTAATTATAGGTTCCTGCTTTCCTTTATATTCTCTTATTTTAAAGTTTCCATCTACTAATACAAGATATTCTCCCTTACACTCTTTTTTTAAGTTTTCCAAAGCCCTTCTCATTGCTAAAAATGTAGCATTAAGTATGTTTATTTCATCTATTTCCTTAGTATCAGCTATTCCAACACCTACATAGAAATGCTCCTTTATAACATCAAAAAGTTTTTCTCTTTTCTTTTCTGATATCTGCTTTGAATCATTTATTTCATCTAAATCTTTATCATAGTTCTTCAATTTTACAGCAGCAGCTACTACAGCTCCGGCTAAAGGTCCTCTTCCTGCTTCATCCACTCCTATTATTTCTTCACCTATATTAATATCAAATTCATGAAGAGATACAGTTTCTTTTTTCTCATTTAAAATATCTTGCTTTTTTTTGCTTTTTAGAACTTTTTTTTCCTCAACTGAAAAAAGTCCCAATTGACTTTCTGCCTTTTCTTCATTTTTTTTATTTTTCACAATCAATCCTTCTTTAAAATTTTATTTTATTTACATCTACTCCTGCAAATTTTGCTGCTTTTTTAAAGTCTTCTGGAATTTCTGCTGTAATTATCATCTCTTTTTCGGTTACAGGATGATTAAATTTTAACCTATAGGCATGGAGCATCTGTCTCATTGCTCCTTCACTGCTGCTCCCATATACAGTATCTCCTAATATTGGATGATTTAGATATTTCATATGAACTCTTATCTGATGTGTCCTTCCTGTTTCTATTCTCACCTTTACAAGAGAAAAATTTTTCCCTTCATCTAAAATTTCATAATTAGAAACAGCATATTTTCCATTAGTTTCTACTACTGCCATTTTTTTTCTATCTTTTATATCTCGTCCTATAAGAGTTTCTATTCTCCCATATTTATTCTTAAATATTCCCTTTGCTATACATACATATACTTTTTCTAAATTTTTTTCTTTAAACATATCTGAGAGAGTTGAATGGGCTTCATCATTCTTAGCTACTACTATAACACCACTTGTATCTTTATCCAGTCTGTGAACAATTCCTGGTCTTATTACTCCATTTATAGTAGAAAGATCCTTTATATGATATAATAAGGCATTTACAAGAGTACCATTATAATTACCATGGGCTGGATGTACTACCATATTAGGAGCTTTATTTATAATAACTATATCTTTATCTTCATATATTATATTAAGTGGAATATTTTCTGGTATCACATCAAGAATTTCATCTTCTGGAATATTTACTACTATTGTTTCTGTTCCTTTAAGTTTGTTCCCACTTTTAGTAACTTTTTTCCCAGTTATTTCCACATATCCATTATCAATTATTTTTTGAATGTATGATCTTGTTGCGTCGTCTATTACTTCATTCAAAAAACTATCTATTCTTTTTCCCTTATCATTTTCATTAGCAGATACAGTTATTGTTTCTTTAATATTTTCCATAATTTCTCCACATTTTTTATTTTTTTTTAATTATAGCATTTATTAGAAAAAAAAGAAATGAGTCCATTATTAAAATAATGAACTCATTCCCCAAAATACTTATTTTTTTTAATATTAGATGTGAAGTATATGACCCATCTTTTCTTTTTTAGTTTTCATATATCTTTCATTTGATGGATTAAAACCTGTTTCAATAGCTTCTCTCCCTGTTACTTTTATTCCATATTCTTCAAGTCCTTTTATTTTTTCAGGATTATTTGTCATAATTCTTACTGACTTTATTCCAAGTGCTTTTATCATTTGAGCTGCTATAGAATAATCTCTCATATCTGGATCAAATCCAAGTTTTACATTTGCTTCTACAGTATCTGCCCCATTATCCTGAAGAGTATAAGCTCTAAGTTTATTAAGAAGTCCAATTCCTCTTCCTTCCTGTCTTAAATAAAGAACTGCTCCCTCTCCCTCTTCATCTACTCTCTTCATAGCTCTTTTTAATTGAGAACCACAGTCACATCTTAATGATCCTAAAATATCTCCAGTGAAACATTCTGAATGGATTCTTATAAGAACATCTTCTTTTCCTTCTAAATCTCCTTTTATAAGGGCAATATGCTCTTTGTCATCAAGTTTATTATCAAAACCAACAATTTCAAATTCTCCCTGAGCAGTTGGCATTTTTGCTTTTACAGATATTTCCATAAGTTTTTCATTTTTTCTTCTGTATTTTTGAAGATCTTCTATTGATATCATTTTAAGATTAAATTTTTTGGCAAATTCTTGAAGATCATCCATTCTTGCCATCATTCCATCTTCTTTCATTATTTCACAACATAGTCCTACTGGTTTAAGCCCTGCAAGTATCATAAGATCAACTGTTGCCTCTGTATGTCCATTTCTTACAAGAACTCCCCCTTCTTTTGCTCTAAGAGGGAACATATGCCCTGGTCTTCTAAAATCTTTTGGTTTTGCACCTTCTTCTACTACTTTCATAGCTGTAATTCCACGCTCATATGCTGAAATTCCAGTTGTTGTATCCACATGATCAATAGACACTGTAAAAGCTGTACAATGATTATCAGTATTATCACTACACATTTGAGGTAGATCTAATTTTTCTATATATTCTTGTGACATAGGCATACAGATAAGTCCTCTTGCATGGGCAGCCATAAGATTTACATTTTCTAATGTTGCAAACTCTGCTGCACAGATTATATCTCCTTCATTTTCACGATTTTCATCATCTACTACAATTATTGATTTTCCAGCTCTTAAATCTTCCAGAGCGTCTTCTATTCTATCTAACATTATTAATTCACTCTCCTTTAAAATCCATTTTCCAAAAGAAACTCTCTTGTAAGTATTCCTTCTTTTTTATCTTCACCAGAAAAATTAAGCAGTCTTTCTACATATTTTCCTATGAGATCAGTTTCTATATTTATATGATCTCCTATATTTTTACTTCCTAATGTTATCATTTCCTGAGTATGGGGTATAAGAGATACACTTAAACTATTGTCTGTCATTCTCATAACTGTCAAACTTGCTCCATCTAAAGTTATTCTTCCTTTTTCCACTACATATTTCATATATTGTCTGTCTATCTCTATCTCGTATATCTTAGCTATTCCTTCAGAAGTTATTGAAACAATAGTTCCTTCACAGTCCACATCTCCCGTTACAAGATGTCCTCCAAGAGGAGTTGCCAATGTGATAGATTTTTCAAGATTTACCTTATCTCCTGCTTTAAGTCTTTTTAGATTAGTTCTTTTTACTGTTTCATACATGCAGTCAGCAGTGAAATAGTTCTCCCCTATCTCAACAGCAGTAAGACAAGTTCCATTTGTTGCTATACTATCTCCAATCTTACTTTTATCTAATACTTTTTTACATTTTATTTTTATCTTAAGGGATTTCTCACCATTTTCAATAGCAAGGACTTCTCCCATTTCTTCTACAAGTCCTGTAAAAATAGAACTCACTCTCCTCTCTATCTGTAAAATTCCATCGATACATTATTCCCATAATTATTTATTTTAACATTTTCCAGCTGAAATCCATCAGAAATATTTTCACAATTAAATCCCTTTATAAAAGGCATTGCCTCCCCATCTCCCAATATTTTTGGAGCAATAAATATCTCTCCGCCATCTATAGCATTTTCAGCAAAAGCTCTTGATATAAGGAAGCTTCCTCCTTCTAAAAGAACTCCATCTATTCCTATTTCTCCAACTTTTTTCAATATATCACATATTTTAAAATCTGTTCCCTCTAAAAAAATCACATTTATATTTCTATTTTTTAAAAAAGAGATTTTTTCTTTTTCTACATTATCATATGAAGTAACCAGAATACTTTTTCCATCTTCAAAATTTACAAATTTTGAATCTATAGGAATATCTAAAAATGGATCTATCACTATTCTATATGGATTTCTTCCATTTTTTATTCTAGCTGTAAGACTTGGGTCATCTGCAAGAACTGTATTTATTCCTACCATTATTCCCATATATTTATTTCTCAGTTTTTGTACTTTTTCTCTTGCAAGTTCATTAGTTATCCATTTTGAATTACCTGTTCTGCTCGCTATCTTCCCATCTAATGTTATTCCACATTTCAAAAAAAGATATGGTGTCTTTGTTGATATATATTTCATAAAAACTCTGTTGAGTTTTAAAGCTTCTTTTTCCATGATGCCAGTGATTACTTCAATACCAGCATCTGTCATCATTTTTATACCTCTTCCAGATACTAGTGGATTAGGGTCTAAAGATGCGATAACGCATCTTTTTATCCCCATATCTATTATCTTTTTGGCACATGGAGGAGTTTTTCCATAATGAGAACATGGTTCTAAAGTAACATAGATAGTTGCTCCTTCTGCTTTTTCTCCAGCTTCTTCCAGAGCGAAAACTTCAGCATGAGGTCCACCATATTTTTTATGATATCCTTCACCTACAATTTTTCCATCTTTTACTACTACTGCTCCTACCATAGGATTGGGCTTTACTTTCCCTTCCCCCAGAGCAGCAAGTTCCAATGCTTTCTCCATGTACTTTTTATCCATGATTACATCCCCTTTAGTAAGTTTACCATTTCAATAGCTGTAACTCCTGCATCAAATCCTTTATTTCCTGCTTTTGTTCCAGCTCTTTGGATAGCTTCTTCTATACTATTTGTAGTAAGTACACCAAATATTACTGGTATATCACTTTGAAGACTTACAGTAGCTACTCCTTTAGAAACTTCTGCACAAACGTAATCAAAATGCGGTGTTGATCCTTTAATTACTGCTCCTAGAGTGATTACAGCATCATATCTCCCTGATTCTGCCATTTTCTTTGCTGCTAAAGGAATTTCAAATGCTCCAGGTACCCAAGCTAATTCAATATCATCTTTTGCAACTTCATGTCTAACTAGTGCATCTTCTGCTCCACCTATTAATTTAGATGTGATGAACTCATTAAATCTTGCTGCTACTATTCCAATTCTTAACCCTCTACCTGCATAATTTCCTTCTAATACTTTCATTTTTCCTCCTTGTGATTCAGGACAAATAAAAAAACCCAGATAAACTCCGGGCTATAAAAGCATAAAAAAGACAATCAAAAAAGATTTCTTTTCTCTTCTTCCATCCAGACTATACTGTCGGTTTTGGAATTACACCAAATCAAGACCAAAGGTCTTCGCGGACTTTTACCGCCGGTCGGGAATTACAAAATGCTCACCCTGCCCTGAAGATAATTTTTATTTAATTTCTCTACATAAATAGTATAAAGCTGCTTTCTATTTTTGTCAACTATATATTTTTCTCTATTTTTAAAATTTACTCTTAAATTCTATTGAAATTTTTTATTTATAGTGTATGATATGTATTGTTCATATAAATTTTATCAATATTTGGAAGGGGAAAAAAATGAAACAGAATTTAAATCTAGAGTCAGGAAAGATATCAAAACTTTTTTTTAGTTTTGCTGTTCCTTCAACTATCAGTATGATAGTAACATCTCTTTACACCATTGCAGATGGTGTCTTTATTACAAGAGGAGTAGGAAGCGATGGAATTGCTGCTGTAAACATTGGATATCCCATCATTAATTTTACTGTTGCTCTTAGTTTAATGTTTGGAATAGGAGGAGCCACTCTTATTGCATTCAAAAAAGATGATATTAAATATCAAAATAAATGTTTCTCCCATATAATCCTTCTCAATATTTTTGTATATATAATAGTAGCAAGTATGATATTTTTATTTACCAAGCCTTTAATGATGGCTATGGGAGCAAATGAAAAACTGTTACCAATGATAAAAGGATATATGTATCCATGTACAGTATCTACTTTTTTTCTTATGATATCCATGTCATTAAATGCAGTAGTAAGAAATGATAATGCTCCTAGAAGAGCAATGGTTTCTACTCTTTTAGGAGCTGGATTGAATATCATATTAGATTACTTATTCATCTTTAAATTTAATTTAGGAATAGAGGGTGGTGCTTATGCTACAGCCATCAGTCAAATAATATCTGCTGTATATTTATGCAGACATTTTATTGGCTCTACCTTTAAGCTTGATCTTTCTTTAAAAAAAATAGATTTCTTTCTTTTAAAGAAACTTTTATCTATTGGATTTCCTTCATTTGTACTGGAATTTGCAGTAGCTGTTATTACAGTTCTTCTTAATATCGCATTTATGAATGCTGTCGGAGTTTTTGGAGCTTCTGCCTATGGAATAATATCTTATAGTTTTATGTTTTTCAGAATGCTTTTCACTGGACTTTCACAAGGAATTCAGCCAATAGTAAGTTTTAATTATGGTAGAAAAAATTTAGATAGAGTTAAAAAAATGCTTATTTTTGCTCATAAAGTAACTTTTGGAACTTCCATAGTCTCTCTTATAATAATATTTTTCCTTGCTACCCCAGTAGTAAGAATCTTTACTCATGATGCACCACTTGTCGTGGAATCAGCTAAAGGATTTATTCTTTATTCCATAGCTCTTTCATTTTTGGGATTTAATTTTGTAAATATTGCTTATCTTCAGGCAGTTGACAGACCCATGGTTTCTAATGTAATATGTATGTCTAGAAGTTTTCTTTTTGTATTTATAGGACTGATTTTCCTTCCAAAGTTAATAGGAGTAAATGGTATCTGGCTTGCCTTGCCTTTTGCAGATTTCATAACAGCTATACTCACTATTCCCTTTATGAAGAAAATTACTGTCAATTATGTAAAAGCTTCTGTCTAAAAACAACTAACAAGGAGAAATAAATGAAAAAATTAATATTACTGATATTTTTTACTTTAACTATTTCAATTTTTGCATTAGAAGATATAAAATTTTCAGGTAACGAAGTTAAACAAGGTGGATTTTTTTATGTTGAATATCCTATTAATAAAAACTATGAAATAATTTTTAAAAACTCTTTGACAAAAGTAAAAAGTTTTGAAGAAAATAATAAAAAAATTGCTCTTATCCCTGTACATTATTCAACTCCTGTAGGAGTATACACTGTAAAAATAATTGAAGAAAATAATGAGGTTTTTTCTAAAACTGTAAAAATTCTTGATGGGAATTTTAAAAAAAGTTATATAACAGTTTCAAAGACTATGTCAGAAAAGCGTTCTGATAAAAATATGAAAACAATGACTAATTTTGTAGCTGAAGCAAAAAAAAATCCTGTTAAAACAAAACTATGGAACAGTAATTTTATCCTTCCTGTAAAAAGCAAAATCAGCAGTCCTTTTGGAGCAATGCGATTTGTTAATGATAAGGTAGTTGGATATCATTCTGGTATTGATTTCCCAGTTCCTGTAGGAACTACTTTAAAAGCTGCCAACTCTGGAAAAATAGTTCTTGCTAGAGAACTTACTACTACTGGAAATACTATTGTTATTGATCATGGAATGAATGTATTTTCAAGTTATGCTCATATGAGTGTTTTAAATGTAAAAGAAGGAGATACAATAAAAAAAGGTGATATTATTGGAAAAAGTGGAAATACAGGTTTTACTACTGGTCCTCATCTTCATTTTACAATCAGTATTGGAACTACTTTTGTAAATCCACATATTTTCCTTGATTCTCCTATACTAGAAAACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP017968|3383084:3390864|3387828_3388290_-|WP_096404053.1|DBSCAN-SWA MKVLEGNYAGRGLRIGIVAARFNEFITSKLIGGAEDALVRHEVAKDDIELAWVPGAFEIPLAAKKMAESGRYDAVITLGAVIKGSTPHFDYVCAEVSKGVATVSLQSDIPVIFGVLTTNSIEEAIQRAGTKAGNKGFDAGVTAIEMVNLLKGM >NZ_AP017968|3383084:3390864|3390030_3390864_+|WP_096404056.1|DBSCAN-SWA MKKLILLIFFTLTISIFALEDIKFSGNEVKQGGFFYVEYPINKNYEIIFKNSLTKVKSFEENNKKIALIPVHYSTPVGVYTVKIIEENNEVFSKTVKILDGNFKKSYITVSKTMSEKRSDKNMKTMTNFVAEAKKNPVKTKLWNSNFILPVKSKISSPFGAMRFVNDKVVGYHSGIDFPVPVGTTLKAANSGKIVLARELTTTGNTIVIDHGMNVFSSYAHMSVLNVKEGDTIKKGDIIGKSGNTGFTTGPHLHFTISIGTTFVNPHIFLDSPILEN >NZ_AP017968|3383084:3390864|3386749_3387811_-|WP_096404557.1|DBSCAN-SWA MEKALELAALGEGKVKPNPMVGAVVVKDGKIVGEGYHKKYGGPHAEVFALEEAGEKAEGATIYVTLEPCSHYGKTPPCAKKIIDMGIKRCVIASLDPNPLVSGRGIKMMTDAGIEVITGIMEKEALKLNRVFMKYISTKTPYLFLKCGITLDGKIASRTGNSKWITNELAREKVQKLRNKYMGIMVGINTVLADDPSLTARIKNGRNPYRIVIDPFLDIPIDSKFVNFEDGKSILVTSYDNVEKEKISFLKNRNINVIFLEGTDFKICDILKKVGEIGIDGVLLEGGSFLISRAFAENAIDGGEIFIAPKILGDGEAMPFIKGFNCENISDGFQLENVKINNYGNNVSMEFYR >NZ_AP017968|3383084:3390864|3388675_3390007_+|WP_096404055.1|DBSCAN-SWA MKQNLNLESGKISKLFFSFAVPSTISMIVTSLYTIADGVFITRGVGSDGIAAVNIGYPIINFTVALSLMFGIGGATLIAFKKDDIKYQNKCFSHIILLNIFVYIIVASMIFLFTKPLMMAMGANEKLLPMIKGYMYPCTVSTFFLMISMSLNAVVRNDNAPRRAMVSTLLGAGLNIILDYLFIFKFNLGIEGGAYATAISQIISAVYLCRHFIGSTFKLDLSLKKIDFFLLKKLLSIGFPSFVLEFAVAVITVLLNIAFMNAVGVFGASAYGIISYSFMFFRMLFTGLSQGIQPIVSFNYGRKNLDRVKKMLIFAHKVTFGTSIVSLIIIFFLATPVVRIFTHDAPLVVESAKGFILYSIALSFLGFNFVNIAYLQAVDRPMVSNVICMSRSFLFVFIGLIFLPKLIGVNGIWLALPFADFITAILTIPFMKKITVNYVKASV >NZ_AP017968|3383084:3390864|3384873_3386067_-|WP_096404050.1|DBSCAN-SWA MLDRIEDALEDLRAGKSIIVVDDENRENEGDIICAAEFATLENVNLMAAHARGLICMPMSQEYIEKLDLPQMCSDNTDNHCTAFTVSIDHVDTTTGISAYERGITAMKVVEEGAKPKDFRRPGHMFPLRAKEGGVLVRNGHTEATVDLMILAGLKPVGLCCEIMKEDGMMARMDDLQEFAKKFNLKMISIEDLQKYRRKNEKLMEISVKAKMPTAQGEFEIVGFDNKLDDKEHIALIKGDLEGKEDVLIRIHSECFTGDILGSLRCDCGSQLKRAMKRVDEEGEGAVLYLRQEGRGIGLLNKLRAYTLQDNGADTVEANVKLGFDPDMRDYSIAAQMIKALGIKSVRIMTNNPEKIKGLEEYGIKVTGREAIETGFNPSNERYMKTKKEKMGHILHI >NZ_AP017968|3383084:3390864|3383084_3383804_-|WP_096404048.1|DBSCAN-SWA MKNKKNEEKAESQLGLFSVEEKKVLKSKKKQDILNEKKETVSLHEFDINIGEEIIGVDEAGRGPLAGAVVAAAVKLKNYDKDLDEINDSKQISEKKREKLFDVIKEHFYVGVGIADTKEIDEINILNATFLAMRRALENLKKECKGEYLVLVDGNFKIREYKGKQEPIIKGDAKSLSIAAASIIAKVTRDRMMREEAVKYPLYGFEKHKGYGTKQHREAIKEHGVLEIHRKSFLTKILE >NZ_AP017968|3383084:3390864|3386084_3386732_-|WP_172426574.1|DBSCAN-SWA MFTGLVEEMGEVLAIENGEKSLKIKIKCKKVLDKSKIGDSIATNGTCLTAVEIGENYFTADCMYETVKRTNLKRLKAGDKVNLEKSITLATPLGGHLVTGDVDCEGTIVSITSEGIAKIYEIEIDRQYMKYVVEKGRITLDGASLTVMRMTDNSLSVSLIPHTQEMITLGSKNIGDHINIETDLIGKYVERLLNFSGEDKKEGILTREFLLENGF >NZ_AP017968|3383084:3390864|3383817_3384759_-|WP_096404049.1|DBSCAN-SWA MENIKETITVSANENDKGKRIDSFLNEVIDDATRSYIQKIIDNGYVEITGKKVTKSGNKLKGTETIVVNIPEDEILDVIPENIPLNIIYEDKDIVIINKAPNMVVHPAHGNYNGTLVNALLYHIKDLSTINGVIRPGIVHRLDKDTSGVIVVAKNDEAHSTLSDMFKEKNLEKVYVCIAKGIFKNKYGRIETLIGRDIKDRKKMAVVETNGKYAVSNYEILDEGKNFSLVKVRIETGRTHQIRVHMKYLNHPILGDTVYGSSSEGAMRQMLHAYRLKFNHPVTEKEMIITAEIPEDFKKAAKFAGVDVNKIKF |
8 | Staphylococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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