Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017971 | Streptococcus pneumoniae strain KK0981 | 1 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,RT | 0 | 0 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP017971_1 | 105426-105521 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017971_1
|
1 spacers
spacers of NZ_AP017971_1
>1.1|105450|48|NZ_AP017971|CRISPRCasFinder TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017971_1
The CRISPR arrays of NZ_AP017971_1 >merge|NZ_AP017971|1|105426-105521|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAATTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGAAATGTGTAAAATTTTTATATATAA >NZ_AP017971|1|1|105426-105521|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAA TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA AATGTGTAAAATTTTTATATATAA
>NZ_AP017971.1|WP_050201523.1|105081_105408_-|PadR-family-transcriptional-regulator MYFPTSSALIEFLILAILEQGDSYGYEISQTIKLIANIKESTLYPILKKLEGNSFLTTYSREFQGRMRKYYSLTNGGIEQLLTLKDEWTLYTDTINGIIEGSIRHDKN >NZ_AP017971.1|WP_050201524.1|104501_105095_-|DUF1700-domain-containing-protein MTRTEYLTQLELYLKKLPEADRIEAMDYFRELFDDAGVEGEEELIASLGTPKEAAHEVLSNLLDKKINEAPAQKNNRQILHIALLALLAAPIGIPLGIAILVTLFAILVAALTVILAFFAVSILGIIGGFLFLVESFTVLAQAKSAFILIFGSGLLAIGASSLVLLGISYVTRFFGLLIVRLVQFVLKKRKRGNQHA >NZ_AP017971.1|WP_050201525.1|103597_104509_-|DUF4097-domain-containing-protein MRKWTKGFLIFGVVTTVIGFILLFVGIQSDGIKSLLSMSKEPVYDSRTEKLTFGKEVENLEITLHQHTLTITDSFDDQIHISYHPSLSAHHDLITNQNDRTLSLTDKKLSETPFLSSGIGGILHIASSYSSRFEEVILRLPKGRTLKGINISANRGQTTIINASLENATLNTNSYILRIEGSRIKNSKLTTPNIVNIFDTVLTDSQLESTENHFHAENIQVHGKVELTAKDYLRIILDQKENQRINWDISSNYGSIFQFTREKPESRGTELSNPYKTEKTDVKDQLIARSDDNIDLISTPSRR >NZ_AP017971.1|WP_000808444.1|102470_103535_-|membrane-protein MKQEWFESNDFVKTTSKNKPEEQAQEVADKAEETIADLDTPIEKNTQLEEEVSQAEVELESQQEEKIEAPEDSEARTEIEEKKASNSTEEEPDLSKETEKVTIAEESQEALPQQKATTKEPLLISKSLESPYIPDQAPKSRDKWKEQVLDFWSWLVEAIKSPTSKLETSITHSYTAFLLLILFSASSFFFSIYHIKHAYYGHIASINSRFPEQLAPLTLFSIISILVATTLFFFSFLLGSFVVRRFIHQEKDWTLDKVLQQYSQLLAIPIFLTAIASFFAFFDSLRFTALLCVISIGIILLASLHIITRPSQASETDSFYQLFLSVLVNGVIILLFFVAEVALIGDYLRILAFL >NZ_AP017971.1|WP_050201526.1|101538_102399_+|DUF4299-domain-containing-protein MAKTFFIPNKQSILGEQEILNAKSILALLDGLESHSYDVVYLRQPLNRLEYIECAIVGQSQFLFKVSYADGQKAYRVDLPDLLTKTDWQIIKSFLDALLAYTGTDIEGLDGFDFEAYFQASIQAYLADPVARFTICQGIFNPIFFSRENLKSFLEADGLAQFEARVRAVQETDAYFARVSFYQDGEGKVHGVYHLAQGVKTVLPREPFVPAAYIEQLVDKEVQWEIYLVQITGDGSKPEDYESIARLDYAKFLKVLPPSFYHQLDANQLEIQPILGQDFKTLAQEK >NZ_AP017971.1|WP_001030031.1|100430_101417_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MAKDIRVLLYYLYTPIENAEQFAADHLAFCKSIGLKGRILVADEGINGTVSGDYETTQKYMDYVHSLPGMEELWFKIDEENEQAFKKMFVRYKKEIVHLGLEDNDFDNDINPLETTGAYLSPKEFKEALLDKDTVVLDTRNDYEYDLGHFRGAIRPDIRNFRELPQWVRDNKEKFMDKRVVVYCTGGVRCEKFSGWMVREGYKDVGQLHGGIATYGKDPEVQGELWDGKMYVFDERIAVDVNHVNPTIVGKDWFDGTPCERYVNCGNPFCNRRILTSEENEDKYLRGCSHECRVHPRNRYVSKNELTQAEVIERLAAIGESLDQAATV >NZ_AP017971.1|WP_000800407.1|98683_100159_+|DUF3502-domain-containing-protein MKNWKKYAFASASVVALAAGLAACGNLTGNSKKAADSGDKPVIKMYQIGDKPDNLDELLANANKIIEEKVGAKLDIQYLGWGDYGKKMSVITSSGENYDIAFADNYIVNAQKGAYADLTELYKKEGKDLYKALDPAYIKGNTVNGKIYAVPVAANVASSQNFAFNGTLLAKYGIDISGVTSYETLEPVLKQIKEKAPDVVPFAIGKVFIPSDNFDYPVANGLPFVIDLEGDTTKVVNRYEVPRFKEHLKTLHKFYEAGYIPKDVATSDTSFDLQQDTWFVREETVGPADYGNSLLSRVANKDIQIKPITNFIKKNQTTQVANFVISNNSKNKEKSMEILNLLNTNPELLNGLVYGPEGKNWEKIEGKENRVRVLDGYKGNTHMGGWNTGNNWILYINENVTDQQIENSKKELAEAKESPALGFIFNTDNVKSEISAIANTMQQFDTAINTGTVDPDKAIPELMEKLKSEGAYEKVLNEMQKQYDEFLKNKK >NZ_AP017971.1|WP_001075102.1|97657_98581_+|carbohydrate-ABC-transporter-permease MAKKKIKKEKIDNVGIHSFSKKADIFFSIISGLIALSCILPFVFVIIISVTDEKSLLQYGYSFFPSQFGLDGFEFLAQFKDKILQALFISVFVTVVGTLTNVFITTTYAYAISRTTFKYRRFFTIFVLLSMLFNAGLVPGYIMVTRVLQLGDTVWALIVPMLLSPFNIILMRSFFKKTIPEAILESARIDGASEARIFFQICLPLSLPGIATITLLTALGFWNDWFNALLYIKSDNLYPLQYLLMQIQQNMDYIAKAVGLTGQLGVALPKETGRMAMVVVATLPIAILYPFFQRYFVKGLTIGGVKE >NZ_AP017971.1|WP_000714582.1|96714_97644_+|sugar-ABC-transporter-permease MKKFSKTLRDNWIFLLMVLPGALWLILFFYIPVFGNVVAFKDYHMTSNGFIDSIINSKWVGLDNFRFLFSSRDAFIITRNTVLYNLGFIFLGLVVSVGIAIILSELRSKRMVKIFQTSMLFPYFLSWVIISFFTDAFLNIDKGVFNHLLESLGLKEVNFYADLGIWPYLLLFLGIWKGFGYSSVMYYATIMGIDPTYYEAATVDGASKWQRIRNVTIPQLTPLVTVLTILAVGNIFRADFGLFYQIPHNAGQLYNVTNVLDVYVFNGLTQTADIGMAAAAGLYQSVVGLILVILSNLLARRVDPNSALF >NZ_AP017971.1|WP_001809441.1|96174_96396_+|hypothetical-protein MSLQIKLKKLAKELSKLLKDSNLETVDKDVLENSQKELQKAVLFLADEKGSEHTEAEVIDNLKEVIAKLKANA >NZ_AP017971.1|WP_050201522.1|105546_106713_-|CynX/NimT-family-MFS-transporter MKKQSLFFVPGIILIGVSLRTPFTVLPIILGNISQGLEVEVSSLGVLTSLPLLMFTLFSPLSTQLAQKIGLEHLFTYSLFFLTIGSLIRLINLPLLYLGTLMVGASVAVINVLLPSLIQANQPKKIGFLTTLYVTSMGIATALASYLAVPITQASSWKGLILLLTLLCLATFLVWLPNHRYNHRLAPQTKQKSQIKVMRNKQVWAIIIFSGFQSLIFYTVMTWLPTMSIHAGLSSHEAGLLTSILSLISIPFSMTIPSLTTSLSTRNRQLMLTLVSLAGVVGISMLFFPINNFIYWLTIHLLIGTATSALFPYLMVNFSLKTSAPEKTAQLSGLSQTGGYILAAFGPTLFGYSFDLFHSWVPSVAALLLIYILMTVALFTVDRADKIL >NZ_AP017971.1|WP_000096190.1|106770_107931_+|glycosyltransferase-family-2-protein MSSKVSGFQDKNGKVLKIMIEWWKEKFRRVVVTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTYPKENIEILFINAMSTDGTTAIIQQFIKEDTEFNSIRLYNNPKKNQASGFNLGVKHSVGDLILKIDAHSKVTESFVMNNVAIIQQGEFVCGGPRPTIVEGKGKWAETLHLVEENMFGSSIANYRNSSEDRYVSSIFHGMYKREVFQKVGLVNEQLGRTEDNDIHYRIREHGYKIRYSPSILSYQYIRPTFKKMLHQKYSNGLWIGLTSHVQFKCLSLFHYVPCLFVLSLVFSLALLPITFVFITLLLGAYFLLLSLLTLLTLLKHKNGFLIVMPFLLFSIHFAYGFGTIVGLIRGFKWKKEYKGTIIYLDKISQINQNMLQ >NZ_AP017971.1|WP_001035702.1|107969_109820_+|polysaccharide-biosynthesis-protein MNKKLTDYVIDLVEILNKQQKQVFWGIFDIFSMVVSIIVSYILFYGLINPAPVDYIIYTSLAFLFYQLMIGFWGLNASISRYSKITDFMKIFFGVTASSVLSYSICYAFLPLFSIRFIILFILLSTFLILLPRITWQLIYSRRKKGSGDGEHRRTFLIGAGDGGALFMDSYQHPTSELELVGILDKDSKKKGQKLGGIPVLGSYDNLPELAKRHQIERVIVAIPSLDPSEYERILQMCNKLGVKCYKMPKVETVVQGLHQAGTGFQKIDITDLLGRQEIRLDESRLGAELTGKTILVTGAGGSIGSEICRQVSRFNPERIVLLGHGENSIYLVYHELIRKFQGIDYVPVIADIQDYDRLLQVFEQYKPAIVYHAAAHKHVPMMERNPKEAFKNNIRGTYNVARAVDEAKVPKMVMISTDKAVNPPNVMGATKRVAELIVTGFNQRSQSTYCAVRFGNVLGSRGSVIPVFERQIAEGGPVTVTDFRMTRYFMTIPEASRLVIHAGAYAKDGEVFILDMGKPVKIYDLAKKMVLLSGHTESEIPIVEVGIRPGEKLYEELLVSTELVDNQVMDKIFVGKVNVMPLESINQKIGEFRTLSGDELKQAIIAFANQTTHIE >NZ_AP017971.1|WP_000200892.1|110214_110847_-|HAD-family-hydrolase MTSITAIFFDLDGTLVDSSIGIHNAFTYTFKELGVPSPDAKTIRGFMGPPLESSFATCLSKDQISEAVQIYRSYYKAKGIYEAQLFPQIIDLLEELSSSYPLYITTTKDTSTAQDMAKNLEIHHFFDGIYGSSPEAPHKADVIHQALQTHQLAPEQAIIIGDTKFDMLGARETGIQKLAITWGFGEQADLLNYQPDYIAHKPLEVLAYFQ >NZ_AP017971.1|WP_000500040.1|110868_111741_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFYSIKELVEQADLDFQGNVAELMITTEFELTGREREEVFLLMERNLEVMKASVQLGLNENKSRSGLTGGDAAKLDHYIKNEKTLSDYTILSAARNAIAVNEHNAKMGLVCATPTAGSAGCLPSVLTAAIEKLDLSHEQQLDFLFAAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMSAAALTLAAGGTPYQASQAIAFVIKNMLGLICDPVAGLVEVPCVKRNAMGASFAFIAADMALAGIESKIPVDEVIDAMYQVGASMPTAFRETAEGGLATTPTGRRLQKEIFGE >NZ_AP017971.1|WP_000838912.1|111749_112421_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKSLRFQSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAVRIGKIVSSIFDDTPTEVEFQLFNSFAKTYRGHGTDLALVAGILGMDTDDPEIPNSLEIAHKRGIKIVWTIQKDSNAPHPNTTKITVKNAHKTISVTGISIGGGNIQVTELNGFAVSLNMNTPTIIIVHQDIPGMIALVTEALSRYGINIAQMNVTREKAGEKAIMIIEVDSRNCDEAIEEIRKIPHLHNVNFFK >NZ_AP017971.1|WP_000836442.1|112662_113250_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKSITKKIKATLAGVAALFAVFAPSFVSAQESSTYTVKEGDTLSEIAETHNTTVEKLAENNHIDNIHLIYVDQELVIDGPVAPVATPAPATYAAPAAQDETVSAPVAETPVVSETVVSTVSGSEAEAKEWIAQKESGGSYTATNGRYIGRYQLTDSYLNGDYSAENQERVADAYVAGRYGSWTAAKNFWLNNGWY >NZ_AP017971.1|WP_001189291.1|113301_113622_-|hypothetical-protein MQRLEVYKNYQRLYDLRIAILLNLSTLYLYNQDKNMCKQICYTLLEDAKNKKSYDRLAICYVRIGICTDDSKLIQKGFSLLELTEETSMLSHLKKEVEIYYQAKER >NZ_AP017971.1|WP_073077611.1|114033_114327_+|lactococcin-972-family-bacteriocin MIGEINHEKIGVASLMVCSILASTSVLAVWVDGGQWNYGVGWSGNFGYSDYLHSTRSHTATVKDGNKFSKDRAEAEAWARASIFKFPPTGMEYFYGF >NZ_AP017971.1|WP_000723961.1|114381_116490_+|bacteriocin-associated-integral-membrane-family-protein MKKISHLCMLLLLLCTTFFVFNVNYTREVVRIQEMGKTVDSLDLYLKDINEPAASVLRFFEDVSKEYKVSIIKTDSGDEVVKSGVFDKDTFPYQEFGISSLDFTTDGEGVYSNKEISNKLGTIPTFLKAKPIQLMTFQTYIKDTSRSLNGRYTITSTQEMDKDRIVQKWSDFFKIDQATLLEPTYKSAVEVINRDLLLSAIVFVLAILLLVLVTVYQPMMEMKRVGVQKLLGFQDRAVLADVVKGNLYLLLGGALVINLGVFFLLDYKPKDLFPMLWLSHFLLLQLYLFISWLTYLLIQKMTISSLLKGFSSFKFGLLFNYLMKIGTTILLTVLLVGVGKSLEQENKELDYQKQWISQGNYLTLETFQLNDNLWQEQLAGSGKALDYFYRFYQDLVEKTQAGYVQSSSLPVKNFVQSEQIQQYQLTDTVDVYYANRNFLKSKGFKLPDTGIKKVILMPASTKGEEDKNQLLGKLIAFHSMKYEEQQKRTIEEMDVEIAYYEGDWSFFPYSDKRKENLSNPIISLVNDSDMMWDEKASLSTTGLNNPIKIENTVQHQKEITELVEKLSDGNYLKFSSIQAIQQEKVDSYRDAVRNFNLLFALFGLLSMMISYFLLVTTFLLKRRDIITKKFMGWKLVDRYRPLLVLLLLGYSFPLLVLIFFAHAFLPLLLFAGFTCLDILFVLGLASRMEKRSLVELLKGGIL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4185 : 76353
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP017971|4185:76353|DBSCAN-SWA AATGACCAAATTACTTGTAGGTTTGGGAAATCCAGGGGATAAATATTTTGAAACAAAACACAATGTTGGTTTTATGTTGATTGATCAACTAGCGAAGAAACAGAATGTCACTTTTACACACGATAAGATATTTCAAGCTGACCTAGCATCCTTTTTCCTAAATGGAGAAAAAATTTATCTGGTTAAACCAACGACCTTTATGAATGAAAGTGGAAAAGCAGTTCATGCTTTATTAACTTACTATGGTTTGGATATTGACGATTTACTTATCATTTACGATGATCTTGACATGGAAGTTGGGAAAATTCGTTTAAGAGCAAAAGGCTCAGCAGGTGGTCATAATGGTATCAAGTCTATTATTCAACATATAGGAACTCATGTCTTTAACCGTGTTAAGATTGGAATTGGAAGACCTAAAAATGGTATGTCAGTTGTTCATCATGTTTTGAGTAAGTTTGACAGGGATGATTATATCGGTATTTTACAGTCTGTTGACAAAGTTGACGATTCTGTAAACTACTATTTACAAGAGAAAAATTTTGAGAAAACAATGCAGAGGTATAACGGATAAATGGTGACCTTATTAGATTTATTCTCAGAAAATGATCAGATTAAAAAATGGCATCAAAATTTAACAGATAAGAAAAGACAACTAATACTTGGTTTATCAACATCTACTAAGGCTCTTGCAATTGCAAGCAGTTTAGAAAAAGAAGATAGGATTGTGTTATTGATGTCAACTTATGGAGAAGCAGAAGGACTTGTTAGTGATCTTATATCTATCTTGGGTGAGGAACTCGTCTATCCATTTTTGGTAGATGATGCTCCTATGGTGGAGTTTTTGATGTCTTCACAGGAAAAAATTATTTCACGGGTTGAAGCCTTGCGTTTTTTGACTGATTCATCTAAGAAAGGGATTTTAGTTTGTAATATCGCAGCAAGTCGATTGATTTTACCGTCTCCCAATGCATTCAAAGATAGTATTGTAAAAATCTCAGTTGGTGAAGAATATGATCAACACGCGTTTATCCATCAGTTAAAGGAAAATGGCTATCGAAAAGTTACTCAAGTACAAACTCAGGGCGAATTTAGTCTTCGAGGAGATATTTTAGATATTTTTGAAATATCCCAGTTAGAACCTTGTCGAATTGAGTTTTTTGGTGATGAAATTGATGGTATCAGGTCATTTGAAGTAGAAACACAATTATCGAAAGAAAATAAGACAGAACTCACTATCTTTCCAGCTAGTGATATGCTTTTGAGAGAAAAGGATTATCAACGAGGACAGTCAGCTTTAGAAAAACAAATTTCAAAAACTTTATCACCTATTTTGAAATCATACCTAGAAGAAATTCTTTCAAGTTTTCACCAAAAACAAAGTCATGCAGACTCTCGGAAGTTTTTATCTTTGTGCTATGATAAGACATGGACTGTCTTTGATTATATTGAAAAAGATACTCCAATATTCTTTGATGATTATCAAAAATTGATGAATCAGTATGAAGTCTTTGAAAGAGAATTAGCGCAGTACTTTACAGAAGAATTACAGAATAGTAAAGCATTTTCTGATATGCAGTATTTTTCTGATATTGAACAAATCTATAAAAAACAAAGTCCAGTGACCTTTTTTTCTAATCTTCAAAAGGGTTTAGGAAATCTCAAATTTGACAAAATTTATCAATTCAATCAATATCCTATGCAGGAATTTTTCAATCAGTTTTCTTTTCTAAAAGAAGAAATTGAACGATATAAAAAAATGGATTACACCATTATTCTGCAGTCTAGCAATTCAATGGGAAGTAAAACATTGGAGGATATGTTAGAGGAATATCAGATTAAATTGGATTCTAGAGATAAGACAAATATCTGTAAAGAATCTGTAAACTTAATAGAGGGTAATCTCAGACATGGTTTTCATTTTGTAGATGAAAAGATTTTATTGATAACTGAACATGAGATTTTTCAAAAGAAATTAAAGCGTCGTTTTCGAAGACAACATGTTTCAAATGCAGAGAGATTAAAAGATTACAATGAACTTGAAAAAGGGGACTATGTTGTCCATCATATCCATGGGATTGGTCAATATCTAGGAATTGAAACCATTGAAATCAAGGGAATTCATCGTGATTATGTCAGTGTCCAATACCAAAATGGTGATCAAATTTCTATTCCCGTGGAACAGATTCATCTACTGTCCAAATATATTTCAAGTGATGGTAAAGCTCCAAAACTCAATAAATTAAATGACGGTCATTTTAAAAAGGCCAAGCAAAAGGTTAAGAACCAGGTAGAGGATATAGCTGATGATTTAATCAAACTCTACTCTGAACGTAGTCAGTTGAAGGGTTTTGCTTTCTCAGCTGATGATGATGATCAAGATGCCTTTGATGATGCTTTCCCTTATGTTGAAACGGATGATCAACTTCGTAGTATTGAGGAAATCAAGAGGGATATGCAGGCTTCTCAGCCAATGGATCGACTTTTAGTTGGGGATGTTGGTTTTGGAAAGACTGAAGTTGCTATGCGTGCAGCCTTTAAAGCAGTCAATGATCACAAACAGGTTGTCATTCTAGTTCCGACGACGGTTTTAGCGCAACAGCACTATACGAATTTTAAGGAACGATTCCAAAATTTTGCAGTTAATATTGATGTGTTGAGTCGCTTTAGAAGTAAAAAAGAGCAGACTGCAACACTTGAAAAATTGAAAAACGGTCAAGTCGATATTTTGATTGGAACACATCGTGTTTTGTCAAAAGATGTTGTGTTTGCTGATTTGGGCTTGATGATTATTGATGAGGAACAGCGATTTGGTGTCAAGCATAAGGAAACTTTGAAAGAACTGAAGAAACAAGTGGATGTCCTAACCTTGACCGCTACGCCAATCCCTCGTACCCTCCATATGTCTATGCTGGGAATCAGAGATTTATCTGTTATTGAAACTCCGCCGACTAATCGCTATCCTGTTCAGACCTATGTTTTGGAAAAGAATGATAGTGTCATTCGTGATGCTGTCTTGCGTGAAATGGAGCGTGGAGGTCAAGTTTATTATCTTTACAACAAAGTTGACACAATTGTTCAGAAGGTTTCAGAATTACAGGAGTTGATTCCGGAGGCTTCGATTGGATATGTTCATGGTCGAATGAGTGAAGTCCAGTTGGAAAATACTCTATTAGACTTTATTGAGGGACAATACGATATCTTGGTGACGACTACTATTATTGAGACAGGGGTGGACATTCCAAATACTAATACTTTATTTATTGAAAATGCGGACCATATGGGCTTGTCAACCTTATATCAGTTAAGAGGAAGAGTCGGTCGTAGTAATCGTATTGCTTATGCTTATCTCATGTATCGTCCAGAAAAATCAATCAGTGAAGTCTCTGAAAAGAGATTAGAAGCGATTAAAGGATTTACAGAATTGGGCTCTGGCTTTAAGATTGCAATGCGAGATCTTTCGATTCGTGGAGCAGGAAATCTTTTAGGAAAATCCCAGTCTGGTTTCATTGATTCTGTTGGTTTTGAATTGTATTCGCAGTTATTAGAGGAAGCTATTGCTAAACGAAACGGTAATGCTAACGCTAACACTAACACAAGAACCAAAGGGAATGCTGAGTTGATTTTGCAAATTGATGCCTATCTTCCTGATACTTATATTTCTGATCAACGACATAAGATTGAAATTTACAAGAAAATTCGTCAAATTGACAACCGTGTCAATTATGAAGAGTTACAAGAGGAGTTGATAGACCGTTTTGGAGAATACCCAGATGTAGTAGCCTATCTGTTAGAGATTGGTTTGGTCAAATCATGCTTGGACAAGGTCTTTGTTCAACGTGTGGAAAGAAAAGATAATAAAATTACAATTCAATTTGAAAAAGTCACTCAACGACTGTTTTTAGCTCAAGATTATTTTAAAGCTTTATCCGTAACGAACTTAAAAGCAGGCATCACTGAGAATAAGGAATTAATGGAGCTTGTATTTGATGTTCAAAATAAGAAAGATTATGAAATTTTAGAAGGTCTGCTGATTTTTGGAGAAAGTTTATTAGAGATAAAAGAGTCTAAGGAAGAAAATTCCATTTGATATTTTTCTTCTATAAAATAGATAAAAATGGTACAATAATAAATTGAGGTAATAAGGATGAGATTAGATAAATATTTAAAAGTATCGCGAATTATCAAGCGTCGTACAGTCGCAAAGGAAGTAGCAGATAAAGGTAGAATCAAGGTTAATGGAATCTTGGCCAAAAGTTCAACGGACTTGAAAGTTAATGACCAAGTTGAAATTCGCTTTGGCAATAAGTTGCTGCTTGTAAAAGTACTAGAGATGAAAGATAGTACAAAAAAAGAAGATGCAGCAGGAATGTATGAAATTATCAGTGAAACACGGGTAGAAGAAAATGTCTAAAAATATTGTACAATTGAATAATTCTTTTATTCAAAATGAATACCAACGTCGTCGCTACCTGATGAAAGAACGACAAAAACGGAATCGTTTTATGGGAGGGGTATTGATTTTGATTATGCTATTATTTATCTTGCCAACTTTTAATTTAGCGCAGAGTTATCAGCAATTACTCCAAAGACGTCAGCAATTAGCAGACTTGCAAACTCAGTATCAAACTTTGAGTGATGAAAAGGATAAGGAGACAGCATTTGCTACCAAGTTGAAAGATGAAGATTATGCTGCTAAATATACACGAGCGAAGTACTATTATTCTAAGTCGAGGGAAAAAGTTTATACGATTCCTGACTTGCTTCAAAGGTGATAAAATGGAAAATTTATTAGACGTAATAGAGCAATTTTTGAGTTTGTCAGATGAAAAGCTGGAAGAATTGGCTGATAAAAATCAATTATTGCGTTTACAAGAAGAAAAGGAAAGGAAGAATGCGTAAATTCTTAATTATTTTGTTGCTACCAAGTTTTTTGACCATTTCAAAAGTCGTTAGCACAGAAAAAGAAGTCGTCTATACTTCGAAAGAAATTTATTACCTTT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57 | Streptococcus_phage(33.33%) | bacteriocin,transposase,integrase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
114033 : 144252
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP017971|114033:144252|DBSCAN-SWA 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28 | Planktothrix_phage(50.0%) | bacteriocin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
313919 : 360758
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP017971|313919:360758|DBSCAN-SWA 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35 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase,integrase,holin,protease | attL 358672:358687|attR 366001:366016 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
452053 : 499381
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP017971|452053:499381|DBSCAN-SWA 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48 | Klosneuvirus(20.0%) | bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
802868 : 863870
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP017971|802868:863870|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(42.11%) | bacteriocin,transposase,integrase,protease,tRNA,holin | attL 807237:807279|attR 825822:825864 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
976778 : 1037205
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_AP017971|976778:1037205|DBSCAN-SWA 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47 | Streptococcus_phage(38.46%) | transposase,integrase,protease | attL 969885:969916|attR 1035884:1035915 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1060377 : 1087208
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP017971|1060377:1087208|DBSCAN-SWA 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>NZ_AP017971|1060377:1087208|1068978_1070196_+|WP_000417519.1|DBSCAN-SWA MEKYNNWKRKFYAIWAGQAVSLITSAILQMAIIFYLTEKTGSAMVLSMASLVGFLPYAILGPAIGVLVDRHDRKKIMIGADLIIAAAGAVLAIVAFCMELPVWMIMIVLFIRSIGTAFHTPALNAVTPLLVPEEQLTKCAGYSQSLQSISYIVSPAVAALLYSVWDLNAIIAIDVLGAVIASITVAIVRIPKLGNQVQSLEPNFIREMKEGVVVLRQNKGLFALLLLGTLYTFVYMPINALFPLISMEHFNGTPVHISITEISFAFGMLAGGLLLGRLGGFEKHVLLITSSFFIMGTSLAVSGILPPNGFVIFVVCCAIMGLSVPFYSGVQTALFQEKIKPEYLGRVFSLIGSIMSLAMPIGLILSGFFADKIGVNHWFLLSGILIIGIAIVCQMITEVRKLDLK |
29 | Streptococcus_phage(88.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1220834 : 1278374
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP017971|1220834:1278374|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_phage(33.33%) | transposase,holin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1330559 : 1393458
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_AP017971|1330559:1393458|DBSCAN-SWA 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60 | Streptococcus_phage(17.39%) | transposase,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1458576 : 1465330
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_AP017971|1458576:1465330|DBSCAN-SWA CATGTCTCAACTATATGATATTACCATTGTAGGTGGTGGTCCCGTCGGTCTTTTTGCAGCCTTTTACGCCCACCTACGCCAAGCCAAGGTCCAAATCATCGACTCCCTTCCCCAGCTAGGTGGACAACCTGCTATTCTCTATCCTGAAAAGGAAATCCTAGACGTCCCAGGCTTCCCAAATCTAACTGGAGAAGAGTTGACTAATCGTCTAATCGAGCAATTAAATGGCTTTGATACTCCTATTCATCTCAATGAAACGGTTCTTGATATTGAAAAACAAGAAGAAGGATTTGTCATCACAACTTCTAAAGGTAGTCACCTGTCTAAAACAGTTATCATCGCTATGGGTGGTGGTGCCTTCAAACCACGTCCGCTGGAACTAGAAGGCGTTGAGGGCTATGAAAATATTCACTACCACGTTTCCAATATTCAGCAATACGCTGGTAAGAAAGTGACGATTCTTGGTGGGGGAGACTCAGCTGTGGATTGGGCTTTGGCTTTTGAAAAAATCGCACCAACTACGCTTGTCCACCGCAGAGATAATTTCCGCGCCTTGGAACACAGTGTCCAAGCCTTACAAGAATCATCTGTGACCATCAAGACACCATTCGTCCCTAGCCAACTCCTTGGAGATGGAAAAACGCTTGATAAACTTGAAATCACAAAAGTTAAATCTGATGAAACCGAAACGATTGACCTAGACCACCTCTTTGTCAACTATGGTTTCAAATCTTCTGTCGGTAACCTCAAAAACTGGGGTCTGGACCTCAACCGCCACAAGATTATTGTCAACAGCAAGCAAGAATCTAGCCAAGCAGGTATCTACGCTATCGGTGACTGTTGCTACTATGACGGAAAAATTGATCTGATTGCGACAGGGCTTGGAGAAGCACCAACTGCTGTCAACAATGCCATCAACTACATCGACCCTGAGCAAAAAGTACAACCAAAACACTCTACTAGTTTATAAAAAAGAACCACGAGTCACATAGGATTCGTGGTTTTATAGTTCATCGGCTAATTTATTTATCTTTCTGAGTCTGTGGTTGACGCCACTTTTGGTCAGAGGGGTGCTGAGGCTATCTGCTAACTGCTGGATAGAGTAGTCTGGGTGTTGAATCCGCAACTGCGCCACCTCCTGCAAATCCACTGGCAGATTTTCTAAGCCCATAATATCTTTGATTTTACTGATATTGTTGATGGTCTTCATGCTGGCAGAAACTGTCCGAGCGATATTAGCTGTCTCGGCATTATTGGCCCGATTGAGATCATTACGGGTTTCTCGCAAAATCTTAACCCGCTCAAAATCATCACGCGCCTGCATGGCTCCGATGACAATCAAGAAGTCCATAATGTCTTCAGCTCGCTGGAGGTAGGTCACTGCCCCCTTCTTACGCTCAAGCACCTTGGCATCCATTAAAAATTGCTGGAGAAGAGAGGCAATCCCTTGCGCGTGGTCCAAATAAACAGAACTGATTTCCAACTGGTACTTACCTGATTCAGGGTCTCGAATGCTCCCATTTGCCAAGAAAGCGCCACAGAGATAGGCACGACCTGCTTCCTCATCCGATAAAATCGCCTCATCAATACCTGTTTCCAGGCCAAAGAAAGAGTCTGCCAAGTGCAAATCACTTAACAAATCCTGCACCTTTTCATCTGTAAAAACGGTATAGACGCGATTCTTGCGAAGATTGCTACGTTGGTGGTGACGAATTTCAGATTTGATTTCATAGAAATGAAGAAAGGACTCATAGAGGTGACGGGCCAGTTTGGCATTTTCTGTCACAACTGACAAAGTCAAGCCCGAAGTCGAGAGACCGATGCTACCAGACATTTTGATAATGGCAGATAATTCATGCCAGCTCAGATGGTGTTGGCCCAGGATTTCTTCTTTTACTGCTACTGTGAAACTCATTTTTTCACCTGTATAATGCGCATCAACTCGTCCACAATCAAATCTCCATCGTGGAAGGCACCGCCATTTTCCAGACGAAGGAAGTTAGATGAAATCACGCGCGAAACTTGCTTACAAAGACCTACAAAATCGTGTTCCACTTGCACTAAGTATTCATCAAAACGGTTGGAATTCATGTATTCCTGAGGCACTTTTTCAATATTCACCAAGACAGTGTCGATAAAAGGGCGACCAAGGTGACGATGCAAGACTTCCACGTGGTCGCTATCTGTAAAGTGTTCCGTCTCCCCACGTTGGGTCATGATATTGCAGACATAGGCAATTTCTGCCTTGGTTTCCAAAAGAGCCCGCCCAATTTCCTTAATCACGATATTGGGCAAAATAGAGGTAAAGAGGGAACCTGGCCCTAGGACAATCATGTCACTTTCAAGGATGGTCTGCACTACTCGACGGCTGGCCAGAGGCGTATCATCGTTTAGAGCATTAGTCACATAGACATTGTCAACTATGCCTCGATGGTCTACAATATGACTCTCTCCAACCACTTCTGTCCCATCCTGAAAGACTGCATGAAGGGTCAAAGGATGGTCACTGGAAGGATAAATTTTCCCTGTTGTATGGAAAAATTTGCTCAATAACTGCATGGCATTATAGGTTGAACCCTGCATTTCTGACAAGCCAGCAATGATGAGATTTCCCAATGGATGGCCAGCAAAGGCTCCGGCATCCTCAGAGAACCGATACTGAAAGACCTTCTCATAAAACTTAGGCATATCCGACATGGCCACAAGGACATTACGAAGATCACCTGGCGGTGTCAACTGTTGCATATTTTTTCGGAGTTCACCTGAAGAACCACCATCATCTGCCACCGTCACGATAGCTGCGATTTCCACATCTTTTTCCCGCAGACTTTTTAGAATGACGGGAATTCCAGTCCCTCCACCAATCACCGTTATCTTTGGTTTTCTCATGAACGGTTTACCGTTTCCTTTCTGCGGTCTTTGTCGCGATGCCCTTCATTAACAGACCAATTCTTGGATAAGTCCTGCGCCAAGCATTTAGCAAATGCCACACTACGGTGTTGTCCACCCGTACATCCCATGGCAATGGTCAAAACGGACTTACCTTCCTTTTGGTAACTTGGCAGAATCGGCTCAATCAAGGCCAATAAATGTTGATAAAAGTCTTCTGACTCAGGATGGTTCATGACATAATCATAAACAGGTTCATCCACACCCGTTTGGTTTCTCAGTTCTGGTAAATAATAGGGATTTGGCAAGAAACGGACATCAAAGACCAAGTCCGCATCAATCGGGATTCCATACTTAAATCCGAAAGACATGACTTCGATACGGAAAGACTGAGCTTGTTCTTGGTCTGAAAACTGCTCTGCAAGGGTTTTGCGCAGCTCACGTGGAGTGAGTTCAGTCGTATCCACCACATTTTGGCTCATATTTTTCAAAGGTGCCAAGAGTTCACGTTCCAACTTGATTCCATCTAAAATACGACCGTCTGCTGCTAGTGGGTGACTCCGTCTGGTTTCCTTGTAACGAGCGACCAATTCCTTATCAGCCGCATCCAAAAAGAGGATTTTGAAATCCAAACCATCTTGATTTTCCAACTCATCCAAAACAGCTTGAATCTCTGAAAAGAAAGAACGGCTACGCATATCCACTACCAAGGCCAACTTAGGATTGTCTTCCTTAATTTCAACCAGCTGCAAAAACTTAGGCAAGAGAGCTGGCGGCATATTATCAATGGTGAAATAACCTAGATCCTCGAAGGACTGAATGGCTACAGTTTTCCCTGCGCCACTCATCCCTGTCACAATCACCAAGTGAAGTTGTTTCTTTGTCATCTTTTTCTCCTTATATCAAAAGAAGTTTGGCAACACCAAACTTCAACTAGCTTATCCAATCTCTGCGATGACTTCAATTTCGACTTTTACATCACGAGGAAGACGAGCTACCTCCACAGCTGAACGAGCTGGGAATTCCTCTTTGAAGGCCGTTTGGTAAACCTCATTAAAAGGAACAAAGTCGTTCATATCGCTCAAGAAACAAGTTGTTTTGACAACATGGTCAAAGTCTGTTCCTGCTTCTGCCAAAATAGCACCGATGTTTTTCAAGACTTGCTCTGTCTGTTCTTGGATATTCTCTCCTACAATTTCCCCAGTTTCAGGGGATAGGGGAACTTGACCGCTAGCAAACAAAAGGTTGCCAACGATTTTTCCTTGAACATAGGGTCCGATAGCCTTTGGGGCCTTATCTGTATGAATTGTTTTTGCCATTTTCTTTTCCTCACAATTTTTCTAAGATTGCATCCCAAGCCTCATCCATCCCTGCCTTGCTGACAGATGAAAAGAGGATGAAATCGTCACTTGGGTCAAAGTTTAATTTCTTTTTGATTGCTGATTCATGCTTGTTCCATTTACCACGAGGAATCTTGTCCGCCTTGGTCGCCACAATGATGACTGGAATCTCATAATACTTGAGAAATTCGTACATCTGCACATCATCTGCTGACGGGTCATGACGAAGGTCAACTAGACTGACAACCGCACGGAGATTTTCCCGAGTCGTTAAGTACTCCTCAATCATGCACCCCCACTTTTCACGTTCCTTTTTAGAAACACGGGCATAGCCATAACCAGGCACATCCACAAAGCGCATCTTGTCATCAATGTTAAAAAAGTTCAGGAGCTGGGTTTTACCAGGTTTTCCTGATGTACGGGCGAGATTCTTACGGTTCAACATAGTGTTGATAAAGCTGGATTTACCAACATTTGAACGCCCTGCTAGGGCAATCTCTGGCAGTTCATCCTGCGGATAGTGGGACTTATTAGCTGCACTGAGCAAGATTTCAGCATTGTGTGTATTAAGTTCCATAGTCACCTCTAGGCTGTTTCTAGGATCGGTTTATCCGTTCCATCGACAGTTTCTTTAGTGATGCGAACCAATTTCACATTTTCCTGACTCGGCACCTCAAACATAACATCTAGCATGGTTTCTTCGATAATGGAGCGAAGTCCACGCGCCCCTGTCTTCCGTTCGATTGCCTTATTAGCAATCTCTTGAAGGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_AP017971|1458576:1465330|1458576_1459545_+|WP_050201372.1|DBSCAN-SWA MSQLYDITIVGGGPVGLFAAFYAHLRQAKVQIIDSLPQLGGQPAILYPEKEILDVPGFPNLTGEELTNRLIEQLNGFDTPIHLNETVLDIEKQEEGFVITTSKGSHLSKTVIIAMGGGAFKPRPLELEGVEGYENIHYHVSNIQQYAGKKVTILGGGDSAVDWALAFEKIAPTTLVHRRDNFRALEHSVQALQESSVTIKTPFVPSQLLGDGKTLDKLEITKVKSDETETIDLDHLFVNYGFKSSVGNLKNWGLDLNRHKIIVNSKQESSQAGIYAIGDCCYYDGKIDLIATGLGEAPTAVNNAINYIDPEQKVQPKHSTSL >NZ_AP017971|1458576:1465330|1464823_1465330_-|WP_000162488.1|DBSCAN-SWA MTKKIVAIWAQDEEGVIGKENRLPWHLPAELQHFKETTLNHAILMGRVTFDGMGRRLLPKRETLILTRNPEEKIDGVATFQDVQSVLDWYQVQEKNLYIIGGKQIFQAFGPYLDEVIVTHIHARVEGDTYFPEELDLSLFETVSSKFYAKDEKNPYDFTIQYRKRKEV >NZ_AP017971|1458576:1465330|1462793_1463381_-|WP_000422599.1|DBSCAN-SWA MELNTHNAEILLSAANKSHYPQDELPEIALAGRSNVGKSSFINTMLNRKNLARTSGKPGKTQLLNFFNIDDKMRFVDVPGYGYARVSKKEREKWGCMIEEYLTTRENLRAVVSLVDLRHDPSADDVQMYEFLKYYEIPVIIVATKADKIPRGKWNKHESAIKKKLNFDPSDDFILFSSVSKAGMDEAWDAILEKL >NZ_AP017971|1458576:1465330|1464653_1464824_-|WP_000442275.1|DBSCAN-SWA MERSLFGLFTAFLCFICFLAGAQAFRKKRYGLSILLWLNAFTNLVNSIHAFYMTLF >NZ_AP017971|1458576:1465330|1461460_1462351_-|WP_000163031.1|DBSCAN-SWA MTKKQLHLVIVTGMSGAGKTVAIQSFEDLGYFTIDNMPPALLPKFLQLVEIKEDNPKLALVVDMRSRSFFSEIQAVLDELENQDGLDFKILFLDAADKELVARYKETRRSHPLAADGRILDGIKLERELLAPLKNMSQNVVDTTELTPRELRKTLAEQFSDQEQAQSFRIEVMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPYYLPELRNQTGVDEPVYDYVMNHPESEDFYQHLLALIEPILPSYQKEGKSVLTIAMGCTGGQHRSVAFAKCLAQDLSKNWSVNEGHRDKDRRKETVNRS >NZ_AP017971|1458576:1465330|1460486_1461464_-|WP_001231095.1|DBSCAN-SWA MRKPKITVIGGGTGIPVILKSLREKDVEIAAIVTVADDGGSSGELRKNMQQLTPPGDLRNVLVAMSDMPKFYEKVFQYRFSEDAGAFAGHPLGNLIIAGLSEMQGSTYNAMQLLSKFFHTTGKIYPSSDHPLTLHAVFQDGTEVVGESHIVDHRGIVDNVYVTNALNDDTPLASRRVVQTILESDMIVLGPGSLFTSILPNIVIKEIGRALLETKAEIAYVCNIMTQRGETEHFTDSDHVEVLHRHLGRPFIDTVLVNIEKVPQEYMNSNRFDEYLVQVEHDFVGLCKQVSRVISSNFLRLENGGAFHDGDLIVDELMRIIQVKK >NZ_AP017971|1458576:1465330|1462402_1462783_-|WP_001140412.1|DBSCAN-SWA MAKTIHTDKAPKAIGPYVQGKIVGNLLFASGQVPLSPETGEIVGENIQEQTEQVLKNIGAILAEAGTDFDHVVKTTCFLSDMNDFVPFNEVYQTAFKEEFPARSAVEVARLPRDVKVEIEVIAEIG >NZ_AP017971|1458576:1465330|1463389_1464622_-|WP_000106346.1|protease|DBSCAN-SWA MSTNRKNDMMVYCSFCGKNQEEVQKIIAGNNAFICNECVELAQEIIREELVEEVLADLSEVPKPIELLHILNHYVIGQDRAKRALAVAVYNHYKRINFHDTREESEDVDLQKSNILMIGPTGSGKTFLAQTLAKSLNVPFAIADATALTEAGYVGEDVENILLKLLQVADFNIERAERGIIYVDEIDKIAKKSENVSITRDVSGEGVQQALLKIIEGTVASVPPQGGRKHPQQEMIQVDTKNILFIVGGAFDGIEEIVKQRLGEKVIGFGQNNKAIDENSSYMQEIIAEDIQKFGIIPELIGRLPVFAALEQLTVDDLVRILKEPRNALVKQYQTLLSYDDVELEFDDEALQEIANKAIERKTGARGLRSIIEETMLDVMFEVPSQENVKLVRITKETVDGTDKPILETA >NZ_AP017971|1458576:1465330|1459578_1460490_-|WP_050201373.1|DBSCAN-SWA MSFTVAVKEEILGQHHLSWHELSAIIKMSGSIGLSTSGLTLSVVTENAKLARHLYESFLHFYEIKSEIRHHQRSNLRKNRVYTVFTDEKVQDLLSDLHLADSFFGLETGIDEAILSDEEAGRAYLCGAFLANGSIRDPESGKYQLEISSVYLDHAQGIASLLQQFLMDAKVLERKKGAVTYLQRAEDIMDFLIVIGAMQARDDFERVKILRETRNDLNRANNAETANIARTVSASMKTINNISKIKDIMGLENLPVDLQEVAQLRIQHPDYSIQQLADSLSTPLTKSGVNHRLRKINKLADEL |
9 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1760485 : 1767817
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_AP017971|1760485:1767817|DBSCAN-SWA CATGACCAAAACAATTCTTGTTACAGGTGGGACTAGCTACATTGGCTCCCATACCGTTAAAGCTCTTTTAAATGCTGGTTATAAGGTGCATGTCCTCGATAATCTCTCCACAGGAAATCGAGCGACTGTGGATAATCGTGCTAGCTTTAAAGAACTGGATGTTTATGATGCTAGCGCCTTAAAGGCTTACTTAGAAGAAAATCAGATTGATGCTGTCCTCCATTATGCAGGTGAAATTGTTGTGAGCGAAAGTATTGAAAATCCAAGTAAATACTTCACTGCCAACGTTGCTGGTAGGAACCAAGTTCTCAAAGTCTTATCTGAAGTTGGCACTCAAAAAATCATGTTCTCTTCGACTGCTTCTCTCTATGGAAATAACTGTATTGACAAGCCGGCGACTGAAGATACCCTGATCGACCCTGTCAACCCTTATACAGAGACAAAACTGATGGGCGAACGAATGATTTACTGGATGGCCAATCGCTACGACTGGAAATATGTTATTTTCCGTTACTTTAATGTTGCTGGGGCTGAAATGGATGCTTCAAACGGTCTGCGTGTGAAAAATCCAACTCACATCATTCCAAATATCAACAAGACCGCATTGGGACAAAATGATAGCTTAAAAATATTTGGAGATGACTACGATACACGTGACGGTTCATGTATTCGAGATTACATTTATGTCTTGGACCTTGCATAGGCTCATGTTAAAGGAATGAACTACCTATTTCAAGAAGACAGTTCTTCTCAAATCTTTAACTTAGGAACTAAAAAAGGCTATACTATCAAAGAAATCTTTAAAACTGCTGAAGAATTACTAAATTAAAAAATCCCACACGAGATTGTTGCTCGACGTGCTAGTGACCCAGCCAGTGTCCTAGCAGATGCTTCAAAAGCTAAACAATATCTTGATTGGACGGCTAGCTACTCCCTCGAAGATATTATTTTATCAGATTAAGGTAAAAACATTTTAGAATAGGATAACAAAGGAGAAAGTCTTGTTGCTCTCTCCTTGTTGTATTTATTAAATTGTCAGAAATTTTATTGACAGATTAGAAAAATAATGTTACATTTATATCCGCAGATATCTTTCGATACCAAATCTACATGAAAGGACGGGGTATGAAACTTTCTCATTATTTAATTGGCTTACTTCTACTCCTAGTCTTTCTCTCTATTAGCATTGGGACCAGTGATTTTTCATGGGGAAAGCTATTTGATTTCGACCAGCAGACCTGGCTCCTCTTTCAAGAGTCCCGTCTCCCAAGAACTATCAGTATTCTCCTGACTGCCTCTAGTATGAGTATGGCAGGCCTTCTCATGCAGACTATTACCCAAAATCAGTTTGCTGCACCGAGTACAGTTGGAACGACTGAAGCCGCCAAACTGGGAATGGTGCTGAGCCTTTTTGTCTTTCCATCGGCTAGTCTGACCCAAAAGATGCTCTTCGCTTTTGTTTCATCCATCGTATTCACCCTCTTCTTCCTAGCCTTTATGACCATTTTTACTGTAAAGGAAAGGTGGATGTTGCCTCTGATTGGGATCATCTATAGCGGGATTATCGGCTCAGTCACAGAAGTTATCGCCTATCGTTTCAATCTGGTTCAGAGTATGACTGCCTGGACCCAGGGCTCCTTCTCCATGATTCAGACCCATCAGTATGAGTGGCTCTTCTTAGGCCTCATCATCCTGATAACCGTTTGGAAATTATCCCAAACCTTCACCATCATGAATCTAGGGAAAGAAACCAGCGAGAGTTTGGGGATTTCCTACTCCCTACTTGAAAAACTGGCCCTCTTTCTGGTGGCGCTAACGACAAGCGTCACCATGATTACCGTGGGTGGCCTACCATTTCTCGGAGTTATCGTTCCCAATCTTGTTCGCAAGTGCTATGGAGATAATCTAAGTCAAACCAAACTCATGGTCGCACTGGTTGGTGCCAATCTAGTTCTGGCTTGCGATATCCTATCCCGAGTTCTGATTAGGCCCTATGAGTTGTCTGTCAGTCTCTTGCTAGGAATCATCGGTAGTCTCGTCTTTATCCTACTTCTCTGGAGAGGGGGACGAAAAGATGCAGACTAAAAGCAAACATACCAAGCTCTTCTGGATTCTCATTATTCTTGCCATCGGAGCTTGTCTTCTCTACTTTTGGCCCATCACTCACTTGTCAGCCTTTGCTTGGAAGTTGCGTTCCCAAAAGATCATCGTTTATCTCTTGGTAGCCATCGCGACTGGGATTTCGACCATTAGTTTTCAAACCCTGACGGAAAATCGCTTCCTGACGCCTAGTATTTTGGGAATTGAATCCTTCTACGTCCTACTACAAACCCTACTACTGGTTTTTGAAAGCAAGTTTCTTCAACTTGGCAAATCCCCTATCTTAGAATTCCTAGTCTTACTTCTTGTCCAGTCCCTCTTCTTTCTCGCCTTACAAGGTTACTTGAAGACACTGATGAAGCAAGACCTGGTCTTCATCCTGCTGATCTGTCTAGCGCTCAGAAGTCTCTTTCGAAATATCAGCACCTTCCTTCAAGTCCTAATGGATCCAAACGAATACGATAAACTGCAAAATAGTCTTTTTGCCTCCTTTCAACATCTTAACACTTCCATCCTAGCCATCGGTTCTCTGATCATCCTCGCTTTGACAATCTTTTTCTTTCGAAAAGCAGTCGTTCTAGATGTCTTGCACCTGCAAAGAGAAACGGCTCAGATATTGGGACTCGATGTTGAAAAAGAACAGAAAGAGCTCCTCTGGGGAATCGTGCTTTTGACCTCAACGGCCACTGCCTTGGTAGGACCTATGGCCTTCTTCGGCTTTATGCTGGCCAACCTCACCTACCTGATTGTCAAAGACTATCAGCACAAGTTACTCTTTATAGTGGCCATTCTGGTTGGATTTATTAGCTTAACCTTGGGGCAAGCCTTGATTGAACGAGTCTTTGCACTGGAAATTCGTATCAGTATGATCATTGAGAGTGTGGGTGGCTTCTTATTCTTTATCTTACTATATAGGAGGGCTCGTCAGTGAAACTGGAAAACATTGACAAATCCATTCAAAAACAGGATATTTTGCAAGGCATTTCGCTTGAAGTCAGTCCTCAAAAACTGACAGCCTTTATTGGTCCAAATGGTGCTGGAAAATCGACTCTCCTCTCCATCATGAGCAGACTAACCAAGAAAGATCAGGGAGTTCTCAGTATCAAAGGACGTGAAATCGAGAGCTGGAATTCGCAAGAACTGGCCCAAGAACTAACCATCCTAAAACAGAAAATCAATTACCAAGCCAAATTGACTGTTGAAGAACTGGTCAGTTTTGGACGTTTTCCCTACAGCCGAGGTCGACTTAGATCAGAAGACTGGGAAAAAATCCGAGAAACTCTGAACTATTTGGAACTGACCAACTTAAAAGACCGCTACATCAATAGCCTGTCAGGGGGGCAACTCCAGCGCGTCTTTATCGCTATGGTACTGGCCCAGGATACGGACTTTATCTTGCTGGACGAACCACTCAACAATCTCGATATCAAGCAAAGCGTCAGCATGATGCAAATTCTTCGACGACTGGTGGAGGAACTCGGCAAGACCATTATCATCGTCCTCCACGATATCAACATGGCCAGTCAGTATGCAGATGAAATTGTCGCCTTCAAGGACGGTCAGGTCTTTAGCAATGGAAGCACCGATCAAATCATGCAGGCTGACCTGCTCAGCCAACTTTATGAGATTCCCATCACGCTAGCTGATATCAATGACAAAAAGATCTGTATCTATAGCTAGTAACATAAAAGCTCAAGTTAGAGAACCTTCAGTCTCTTAATCAATAAGATCAAGAGACTCCCTAAATCGTTATCACATTTTAAAAAGGAGAAATTATGAAAACATCCCTTAAACTTTATTTCACTGCCCTAGTGGCCAGCTTCTTGCTCCTACTTGGTGCATGTAGTACAAACTCAAGCACTAGTCAGACAGAGACCAGTAGCTCTGCTCCAACAGAGGTAACCATTAAAAGTTCACTGGACGAGGTCAAACTTTCCAAAGTTCCTGAAAAGATTGTGACCTTTGACCTCGGCGCTGCGGATACTATTCGCGCTTTAGGATTTGAAAAAAATATCGTCGGAATGCCTACAAAAACTGTTCCGACTTATCTAAAAGACCTAGTGGGAACTGTCAAAAATGTTGGTTCTATGAAAGAACCTGATTTAGAAGCTATCGCCGCCCTTGAGCCTGATTTGATTATCGCTTCACCACGTACACAAAAATTCGTAGACAAATTCAAAGAAATCGCCCCAACCGTTCTCTTCCAAGCAAGCAAGGACGACTACTGGACTTCTACCAAGGCTAATATCGAATCCTTAGCAAGTGCCTTCGGCGAAACTGGTACACAGAAAGCCAAGGAAGAATTGGCCAAGCTAGACAAGAGCATCCAAGAAGTCGCTACTAAAAATGAAAGCTCTGACAAAAAAGCCCTTGCGATCCTCCTTAATGAAGGAAAAATGGCAGCCTTTGGTGCCAAATCTCGTTTCTCTTTCTTGTACCAAACCTTGAAATTCAAACCAACTGATACAAAATTTGAAGACTCACGCCACGGACAAGAAGTCAGCTTTGAAAGTGTCAAAGAAATCAACCCTGACATCCTCTTTGTCATCAACCGTACCCTTGCCATCGGTGGGGACAACTCTAGCAACGACGGTGTCCTAGAAAATGCCCTTATCGCTGAAACACCTGCTGCTAAAAATGGTAAGATTATCCAACTAACACCAGACCTCTGGTATCTAAGCGGAGGCGGACTTGAATCAACAAAACTCATGATTGAAGACATACAAAAAGCTTTGAAATAAGCCACTTCAAACTCAATTTAATACTCAATGAAAATCAAAGAGCAAACTAGGAAACTAGCCGCAGGTTGCTCAAAACACTGTTTTGAGGTTGCAGATGAAAGCTGACGCGGTTTGAAGGGATTTTCGAAGAGTATAAAATTTTGACATTCTAAAACGCATCCTATCAAGTTCACTCAAACCTGATAGGATGCGTTTTTATCATTTTGAAATCTATTTACCCCACCTCATTCCCCTTCTTGATTTCGTTTAAGGGAAAAGTGGTCTGGAACGGGGTCCTTACCTGTTTTCGACCAGGGATGACAACGTAAAATCCGAGCCAAGCCCATCAATACCCCCTTAAAACCATGTTTTTCAATAGCCTGAATCATGTAGTTGGAACAAGTCAGCTCAAAGCGACAAGAGGGTGGAAAGACTGGTGAGATAAAACGTTGGTAAAAGCGCACAGGCGCTATTAAAATTCGTTTCATTATTTCTTAGTTACAGCCATGGTGTGTAGTTGGCTGATTTCTTTTTTATTAAGACGACGGGATTCTCCTGGACGGAGTCCTGTCAAGTCTAGGTGTCCGAAACGAGTCCGAGACAACTTATCTACTTGGAGACCAACAGCTTCAAACATCTTTTTAACCTGATGGTTACGCCCTTCATGGATGGTCAACTGCACCACAGAGCGATTTTTGACTGGGTCCACTTTGAGAATTTCATAAACAGCTGGCTTGGTTTTCTTACCATCAATCTCAAGACCACGGGTCAAGGGGCGGAGATTGTCCTTATTGGCCACACCTTTAACACGCGCGACATAAACCTTGTCAATCTCATTACGAGGGTGAATCATCTCGTCTGTAAAGTCCCCATCATTGGTCAAAATCAAGACACCTGATGTATCCCAGTCCAAACGACCCACAGGGTAAATACGTTCTTTGACATTGGGCAAGAGGTCGACAACCGTCTTGCGACCCTTATCATCTGTCACACTGGAAATCACACCGCGTGGTTTGTTAAGCAGATAGTAGACCTTTTCTTCGTTGTAGATAGGTTGACCTTCAACTTCGACCTTGTCGCCTGACTTGATAGTGGTTGCTAGTTCACGCACCACTTGGCCGTTAACCGTCACCAAGCCTTGCTTAATCAGCTCTTCTGCTTTTCTCCTACTGGCCACACCTGCGTGGGCAATATACTTATTGATTCTCATCTTCTTCTATCCTTTCACCAAATAATTGGCTTTCTTGGGCTTGAATCTCAAGCTCATCAATCACTGGTAATTCTTCTAAATGGTTTATCCCCATGTAATCTAGGAAATAATCCGTAGTCACATAGAGGTTGGGGCGCCCCAATACTTCCTTTTTCCCGTCTTCCTTTATCAGGTCAAAAGCCTGCAACTTTGCCAAGGCTCCACTCGAGTTAACCCCACGGATGGCATCAATTTCTATCCGCGTAATCGGCTGTTTGTAGGCAATGATGGACAAGGTCTCAAGAGCAGCCCGAGACAAACTTTGGTTGATGGGTGCCTTGGAGTATTCCTTCAAAATCGCTGCAAATTGAGGCTTGGTGACCAATCTGTATGCACCACCTGTCTCGATCAGGGACAAGCTCGAATCTTGGTCTTTTTCATACTTCTGGGCTAATTTTTCTAAACTCTGTTGGATACCTGTCGGTGGTAGAGAGAGGAGTTCAGCTAACTGGCGGACTCTAATCCCATCTTCACCCGCTACAAACAAGAGCGCTTCTATTTTTGCTAAAGTACTCATCTTTCCTCTCTATCAAGTCTAGCTTTGGGCCACTTGACTTTCTTCCTTCTTTTCCATGAGATAGATATCTCCGAAACTCTCCTCTTGCACGAGGATCAGCTCCTGGGTTTTGATTAACTCTAGGGTTGCCAAAAAGAGGGTAATGACCTCTTGGACATTCTGAGCTTCCTTGAACAAATCCTGCAAGCGCAACTGGTCTCGTTCAGCCAAGGACTCTTTCACGATAACCATCATGTCCTCAATCTTATACTCATCCCGCAGGATAGTCGTGTGATTCTGTGCAAACTCCTCTTTTTTCTTGGCTAGGATATTTGAAAAAGCCAAAAAGAGATCAATGGTCGTCTTGTCATGCACAAGCTCCGCATCTTCGTAAATCAACTCTGTCGGCGCTTTGGAATAGTACTGGGCCCTTTCTTGGTGCTTGGCTTCCAAGTGCTCACCCAAGAGCTTGAACTTGCGGTATTCTTCGATTTGAGAGAGAAGATCCTGCTCCAGGTCATCCTCCAAGTCGGTCACTTCTGCTACCTTGGGAAGGAGTTTGCGGCTCTTGATCAGCATGAGCTGACTGGCCATAACCATGTACTCGCCCGTCACTTCCAGACGCATGGCCTGCAGGGTTGAGACATAGGCTAGATACTGCTCAATGACTTCTGTAATTGGAACATCGTAGATATCCATCTGGTACTTTGAGACCAGGTGCAAGAGTAAGTCCAGGGGCCCTTCAAAATCTTTTAATTTAATATCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_AP017971|1760485:1767817|1765549_1765792_-|WP_000821640.1|DBSCAN-SWA MKRILIAPVRFYQRFISPVFPPSCRFELTCSNYMIQAIEKHGFKGVLMGLARILRCHPWSKTGKDPVPDHFSLKRNQEGE >NZ_AP017971|1760485:1767817|1767088_1767817_-|WP_050201352.1|DBSCAN-SWA MDIKLKDFEGPLDLLLHLVSKYQMDIYDVPITEVIEQYLAYVSTLQAMRLEVTGEYMVMASQLMLIKSRKLLPKVAEVTDLEDDLEQDLLSQIEEYRKFKLLGEHLEAKHQERAQYYSKAPTELIYEDAELVHDKTTIDLFLAFSNILAKKKEEFAQNHTTILRDEYKIEDMMVIVKESLAERDQLRLQDLFKEAQNVQEVITLFLATLELIKTQELILVQEESFGDIYLMEKKEESQVAQS >NZ_AP017971|1760485:1767817|1765791_1766514_-|WP_001222228.1|DBSCAN-SWA MRINKYIAHAGVASRRKAEELIKQGLVTVNGQVVRELATTIKSGDKVEVEGQPIYNEEKVYYLLNKPRGVISSVTDDKGRKTVVDLLPNVKERIYPVGRLDWDTSGVLILTNDGDFTDEMIHPRNEIDKVYVARVKGVANKDNLRPLTRGLEIDGKKTKPAVYEILKVDPVKNRSVVQLTIHEGRNHQVKKMFEAVGLQVDKLSRTRFGHLDLTGLRPGESRRLNKKEISQLHTMAVTKK >NZ_AP017971|1760485:1767817|1761609_1762569_+|WP_000777246.1|DBSCAN-SWA MKLSHYLIGLLLLLVFLSISIGTSDFSWGKLFDFDQQTWLLFQESRLPRTISILLTASSMSMAGLLMQTITQNQFAAPSTVGTTEAAKLGMVLSLFVFPSASLTQKMLFAFVSSIVFTLFFLAFMTIFTVKERWMLPLIGIIYSGIIGSVTEVIAYRFNLVQSMTAWTQGSFSMIQTHQYEWLFLGLIILITVWKLSQTFTIMNLGKETSESLGISYSLLEKLALFLVALTTSVTMITVGGLPFLGVIVPNLVRKCYGDNLSQTKLMVALVGANLVLACDILSRVLIRPYELSVSLLLGIIGSLVFILLLWRGGRKDAD >NZ_AP017971|1760485:1767817|1766500_1767070_-|WP_050201353.1|DBSCAN-SWA MSTLAKIEALLFVAGEDGIRVRQLAELLSLPPTGIQQSLEKLAQKYEKDQDSSLSLIETGGAYRLVTKPQFAAILKEYSKAPINQSLSRAALETLSIIAYKQPITRIEIDAIRGVNSSGALAKLQAFDLIKEDGKKEVLGRPNLYVTTDYFLDYMGINHLEELPVIDELEIQAQESQLFGERIEEDENQ >NZ_AP017971|1760485:1767817|1763511_1764264_+|WP_000764307.1|DBSCAN-SWA MKLENIDKSIQKQDILQGISLEVSPQKLTAFIGPNGAGKSTLLSIMSRLTKKDQGVLSIKGREIESWNSQELAQELTILKQKINYQAKLTVEELVSFGRFPYSRGRLRSEDWEKIRETLNYLELTNLKDRYINSLSGGQLQRVFIAMVLAQDTDFILLDEPLNNLDIKQSVSMMQILRRLVEELGKTIIIVLHDINMASQYADEIVAFKDGQVFSNGSTDQIMQADLLSQLYEIPITLADINDKKICIYS >NZ_AP017971|1760485:1767817|1760485_1761187_+|WP_000167845.1|DBSCAN-SWA MTKTILVTGGTSYIGSHTVKALLNAGYKVHVLDNLSTGNRATVDNRASFKELDVYDASALKAYLEENQIDAVLHYAGEIVVSESIENPSKYFTANVAGRNQVLKVLSEVGTQKIMFSSTASLYGNNCIDKPATEDTLIDPVNPYTETKLMGERMIYWMANRYDWKYVIFRYFNVAGAEMDASNGLRVKNPTHIIPNINKTALGQNDSLKIFGDDYDTRDGSCIRDYIYVLDLA >NZ_AP017971|1760485:1767817|1762558_1763515_+|WP_001193668.1|DBSCAN-SWA MQTKSKHTKLFWILIILAIGACLLYFWPITHLSAFAWKLRSQKIIVYLLVAIATGISTISFQTLTENRFLTPSILGIESFYVLLQTLLLVFESKFLQLGKSPILEFLVLLLVQSLFFLALQGYLKTLMKQDLVFILLICLALRSLFRNISTFLQVLMDPNEYDKLQNSLFASFQHLNTSILAIGSLIILALTIFFFRKAVVLDVLHLQRETAQILGLDVEKEQKELLWGIVLLTSTATALVGPMAFFGFMLANLTYLIVKDYQHKLLFIVAILVGFISLTLGQALIERVFALEIRISMIIESVGGFLFFILLYRRARQ >NZ_AP017971|1760485:1767817|1764359_1765325_+|WP_000858259.1|DBSCAN-SWA MKTSLKLYFTALVASFLLLLGACSTNSSTSQTETSSSAPTEVTIKSSLDEVKLSKVPEKIVTFDLGAADTIRALGFEKNIVGMPTKTVPTYLKDLVGTVKNVGSMKEPDLEAIAALEPDLIIASPRTQKFVDKFKEIAPTVLFQASKDDYWTSTKANIESLASAFGETGTQKAKEELAKLDKSIQEVATKNESSDKKALAILLNEGKMAAFGAKSRFSFLYQTLKFKPTDTKFEDSRHGQEVSFESVKEINPDILFVINRTLAIGGDNSSNDGVLENALIAETPAAKNGKIIQLTPDLWYLSGGGLESTKLMIEDIQKALK |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2126134 : 2134888
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_AP017971|2126134:2134888|DBSCAN-SWA ACTATCCATTTAGCGACTCCTTGAACTCCTCTATCTTAATCGGTAATCGTTTAAATGACACGCCTCTATCAGCCAATCGTTTACAAAAGGCCGTAATTTTAGGTACTCCCAACTGAACTTCTTCCATAAAAACAACGTCTTGAAAGACATCACTTGGTTTGCCCCCCTTTACTAAACGTCCCTTTTCCATTACATAGACTTGATTCGCATATTCAGCAACATCATCCATCAAATGCGTTACCAAGACGATGGTCATCCCTGACTGGTGGAGTTTTTTGAACAGGGTCATCAACTCTTTTCTCCCTAGAGGATCTAGACCAGCTGTTGGCTCATCTAAGACTAATATAGCTGGCTCCATGGCAAGTATGCCTGCAATGGCAACACGTCTCATTTGTCCCCCTGACAGCTCAAACGGACTACGATCAAAAAGTGATTCATCAATTCCAACCAGAGCCAGTTTCTCACGCGCAGTCTTCACAGCATCTTCTTCAGAAACTCCAAAATTTTGCGGTCCAAAAGCAACGTCCTTCAAAACCGTTTCTTCAAAAATCTGATTTTCAGCAAACTGAAATACCAAGCCAACCTGTTTTCTAATTTGACGAATATCTTTATTTTTAGAAGTCGAGGTGATTAAGGTATCAAAAACCCTCACACTCCCTTGACTTGGCACCAATAAACCATTTAAGAGTTGTAAAATAGTTGATTTACCACTACCTGTGTGCCCAATTAAAGCTGTATAAGAGCCATCTTCAATCGTCAAAGAAACATCCGACAAAGCTGCTGAAGCTAAGGGAGTACCTTCTTGATATGTAAAATTCACATTTTCTAGAGCAATTCCCATAGCTTATCCTCTAGCTCACTTTCTGTCAAATAATTTTCAGGTAAATCATAGCCATTCTGGCTCAAAGATTTTTTTAATTGATTAGCAAAAGGATCGTCTAATCCAATTTGATCTAAATCATTTCGAGAGAAAAGCTCCCTTGGACTACTAGTTGATTCAATTTCCCCTTTTTTCATGACCAATACGCGATCACTCATGGCGACTTCTTCCAAATCATGGGTAATAGAAATGACCGTCATATCATAGTCTTTTCGAATTCCTTTTACTGTCCCAATAAGTTCTCTACGCCCCTCAGGATCCAACATACTCGTTGCTTCATCTAAGATTAAAATAGCTGGTCTTAGGGCTACAACACCTGCAATGGCCACACGTTGCTTTTGGCCACCTGATAGACGCGCTGGCTCTCTCTTTTTAAAGTCCAACATGCCAACTAAAGCCAGAGCTTCTTCCACTCTCTTTTTCATTTCTTGACGAGAAAGTCCCTGATTTTCCAAACCAAAAGCAACATCATCTTCAACAGTCGCTCCAACAAATTGATTGTCTGGATTTTGAAAAACCATACCGATTTTACGACGTATATTCCAAACATTTTCCTCAGTCAAACGTTGGCCATCAATTACAATCTCTCCGGATTCTGCTTCCAGTAAGCCATCAATTAATCGAACCGTCGTTGATTTACCACTACCATTATGCCCTACAATCGAAAGCCATTCTCCACGTTTCACGTGAAACGTAATATCCTTCACATCGTAGTAGTTCTGATTTTCTTTATAGCGAAAAGAAAGATTTTTTACATCAATTATTGATTTCATTTCGAACCAAATGTCCCTTTAAATACATAGGCACTACCCTTGAAATAGTCATAGCCAGAGTAGATAGTGAAAAATAAGGCTACATAAAGTAGAACTTGACCAAGCAAAGTCCAATGTAATAGCAAGAAAATAATGGCAAACATCTGACTAAAAGTTTTAATTTTTCCAGGCATTGCTGCTGCTAAAATTGTTCCACCAGTTTCAACCAATAAAAGCCTTAAACCTGTCACAGCTAACTCACGACAGATAATCACTGCAACAATCCAAGCCGGAGCCATACCTAACTCAATCAACACAATAAAAGCCGACATAACTAGTAACTTATCCGCCATAGGATCTGCAAATTTACCAAAATTACTGACCACATTCCATTTACGAGCTAAATATCCATCTAAATAGTCGGTAATACTGGCAACAGCAAAGATAATAGCTGCAACTATATGACTCTCTATCGAATTTCCTATCGTTAAAATAAAGATAAAAATAGGTATAAAGAGAATTCGACCTATTGTTAAGAGATTGGGAATTTGTTCTTTTTTCATTCGTTTTTCCTTAATTTTTAGTAAAGGTTACAGTGATTTGTCCAGTCTGAGCTGTTAATTTCGATAAATCAACAGTCTGATTATCTACTGTCAAATCAACACCTTTTACAACACCTAACGTAATTGTTACAGGACTTTTAGTTGCAACTGTTGCTTCTGCACTTTTCTTCTTTGGCGATAAGGTTACACCGCCCTCAAGTTCGCTTTCTGAAACACTGACCCAACTTGTAACATCTGAAACTGCCAATTGCAATTTAACTGTTTCCTTACTTGTCTTATAAGCGATTTCTACATGATTTCCTTCGCCTGATACACTTATAGCTGATTCTATACTAGAAGAACTACTACTTGAGGAGTGGGGAACAGAGCTAGTTGAACTTGTTGATTGAACCACACTGTAATTAGAAAGAGAAGGCTCCTCTGGTTGAGTTTGAATATAGTTCCAAACATAATAAGTCACAAAAATTAAAATCGATAAAGCAAAAAGGATAAAATAAAATAAAGGTAAAAATGATGTTTTTTTCTTCTTTTTCTTACTTGAACGTCTACGACCTGTCAACTCATCTTCATCAACATCTACTTCCTCATAAGTAATCATACTCCCAGAATCATAAGCATCCAAAACAATTTGGTCATCTAACTCAACAGCCCATGCATATTTTTTCAAGAAAGAACGCGTGTAAAAAGGACTTGGAAGTTGATCGAAATCGTCTGCTTCCATTGCTTCCAACATATCTAACTGGATTTCTGTCTTTTTCTGCAATTCATCTAAACTCAATCCCTGATTGATTCTAGCTAATCGTAAAACCTCTCCAATTGTTTTTTTTCTCATACTTGTCATCTCTTCTTTCTAGTGTCTATTATGATAGGTTACTACGATGGGAATATTGTAAAATCAACTATGTCACCATCATCTATTAAATGATGTCCAGCATCAAGGACATCCTCTAAAGTAATTTCCTGTAAAATTTTCGGCAAATCAAAAATTGTCTCACCATTTTCAAAAGCATCATATTGCGTTGCAATAAATTCAAGAGAGTTCATGCTACTGAAAAATTCGCCAAACATCTCTCTTTTGATAATATCTAAATGTTCCTCTGTAATATCTAAATCCTTTGTAAAATTACGAATAGCCTTCCTAAATTGATGAGACAAAGCAACTGGCTCTTTCGTATCCATTGTCAACATGACAAAATGAAAGCGACTTGTTATTTCAACTTCCAGAGATAAGGACGCATCAATTTTACCTGATTCATAACATTTTTGAAAACGATCCGAAGTCCAACCAAACATCATTGCAAACAATAATTTTAATAAAATATGATGTCGATAGCAATCCGCTTCAGAAACTTCTCGCTTACCTCTAACTCCAATCGCTAGTTTGGGAGAAGATACTTCCATTCTCATACTATCTGTTGGCTTTACAGGCTGTAAAAACAACTTTTCTCTTGCTACTTCCTGAAAATCTGAATCTTTCAGTTCTTTGCTTTCAAAATAGTCCTGTACTCGCTCCACATCAAAATTACCAACTAAAAACAGAGACATGTTTACAGGTTTGTAAAACTTTGTAAAATTTTCTTGCAAATTAGTTAGATTGATTTGGGAAATGGACTCCTCACTTCCAACTATATCAGTTGCTAAAGGTGTACCAGGATACAAATTCGCTAAAGTTGAAAAGAATAAACACGAATCTGGATCATCTTGGTACATTTCTCGTTCTTGCTGAATAATATCCTGCTCTGTCAGAATGGAAGCTTCAGTAAAGTGTGCTGATGTTACCAATTCATCAAGTAAATCTAAATTTTCTAAAAAATAATCCGTTGCTGAAAAAAGATAGTTTGTTTTTGTAAAGCTTGTAAAGGCATTACTATCTGCACCTAGACTCGTAAAAGCCGACATCAAATCACTAGAATCTTCTCTCTCAAATAATTTATGTTCAAGAAAATGAGCAATTCCTCCAGGATATTGTTTTACATCTCCGTCAACTTCTGTGACAAACGTATCTACCGAACCAAACTGTACAGTGACACTCCCGTAAACCTCTTTAAATTCCTTTTTAGGCAAAAGAGCAACTGTCAATCCGTTGGCCAAACGAGTTCGATAAACCATTTCTTTTACAGCTGGATAGTATTTTTCTTCAAAAACAACCTTTGTCATTCTATTCCTTCCATAAAGTAAATCGCTTGTAGTTTCACATTATTAGCTACTCTACAAATAGCATCTTTGTCAATTTGTTCAAGCTTTGCAATCCAACTTTTAAAGTCTGCTGAAGATTTTCCAAATAAGGCATTTTGATAAGCACGTTCAATCAATGAAGATTGATTATCTTGAGAAAGTAACAACGACCAACGAATCATTTCCTTGGTCTGATTTAACTCAAACTCTGTAAAATAACCTTTTTTTAAATCAAGCAGTTGATTATTCATCATTTTACGAGCCTGGTTACGATTTTCTCGATTGATACCAGCATACATCCTCAAGAATCCACTAAATAAATCAAGCTCACTTGAAATGGTATAAGCTAATCCAGCATTTTCACGGACATTTGTAAAGAGCTTAGAGTGAGCAAATCCACCAAGTAAACCATTCATTACAATCATGGGTAAATGTTGCTCATCACCATATTTAGAACGGTAATGATAACCTAATTCCAAAATGGATTGTCCCACATTTTTCCGAACCATACCTTCCTGAAGGATATTAGAATAAGGTTGACAATACTGAACCTTCACATCTCCTTTTCGACCTTTAAAGCCAAATGATTCTAATACATTTTGAATTTCAACCTCATTAAAATCACCTAGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_AP017971|2126134:2134888|2132261_2133359_+|WP_000266660.1|DBSCAN-SWA MWLQHLSLKTFRNYKETKIDFNPKLNVFLGRNAQGKTNMLEAIYFLALTRSHRTRTDKNLIHFDEEQLHLSGLVQKKTGSIPLEIELTQKGRVTKVNHLKQARLSDYVGHMNVVLFAPEDLQLIKGAPSIRRKFIDMELGQIKPIYLSDLTNYNHILKQRNTYLKSAQKIDETFLSVLDDQLVDYGCRVMNHRLDFIKKLESFGRKKHFELSNQIEELSISYQSSVNITDKQNLSESFKIALEKSRSRDLFKKNTGVGPHRDDISFYINGMDASFGSQGQHRSLVLSIKLAEIELMESITTESPILLLDDVMSELDNTRQLKLLETISQSIQTFITTTSLDHLQNLPENLSIFTIQDGKAAVNGN >NZ_AP017971|2126134:2134888|2130481_2131732_-|WP_000424275.1|DBSCAN-SWA MELVHGISTHFIQSKKFKTNKITVRFTAPLSLDTIAGHMLSASMLETANQMYPTSQDLRRHLASLYGTDMSTNCFRRGQSHIIELTFTYVRDEFLSRKNVLTSQILELVKETLFSPVVVDNGFDPALFEIEKKQLLASLAADMDDSFYFAHKELDKLFFHDERLQLEYSDLRNRILDETPQSSYSCFQEFLANDRIDFFFLGDFNEVEIQNVLESFGFKGRKGDVKVQYCQPYSNILQEGMVRKNVGQSILELGYHYRSKYGDEQHLPMIVMNGLLGGFAHSKLFTNVRENAGLAYTISSELDLFSGFLRMYAGINRENRNQARKMMNNQLLDLKKGYFTEFELNQTKEMIRWSLLLSQDNQSSLIERAYQNALFGKSSADFKSWIAKLEQIDKDAICRVANNVKLQAIYFMEGIE >NZ_AP017971|2126134:2134888|2129201_2130485_-|WP_000170215.1|DBSCAN-SWA MTKVVFEEKYYPAVKEMVYRTRLANGLTVALLPKKEFKEVYGSVTVQFGSVDTFVTEVDGDVKQYPGGIAHFLEHKLFEREDSSDLMSAFTSLGADSNAFTSFTKTNYLFSATDYFLENLDLLDELVTSAHFTEASILTEQDIIQQEREMYQDDPDSCLFFSTLANLYPGTPLATDIVGSEESISQINLTNLQENFTKFYKPVNMSLFLVGNFDVERVQDYFESKELKDSDFQEVAREKLFLQPVKPTDSMRMEVSSPKLAIGVRGKREVSEADCYRHHILLKLLFAMMFGWTSDRFQKCYESGKIDASLSLEVEITSRFHFVMLTMDTKEPVALSHQFRKAIRNFTKDLDITEEHLDIIKREMFGEFFSSMNSLEFIATQYDAFENGETIFDLPKILQEITLEDVLDAGHHLIDDGDIVDFTIFPS >NZ_AP017971|2126134:2134888|2126958_2127786_-|WP_000835710.1|DBSCAN-SWA MKSIIDVKNLSFRYKENQNYYDVKDITFHVKRGEWLSIVGHNGSGKSTTVRLIDGLLEAESGEIVIDGQRLTEENVWNIRRKIGMVFQNPDNQFVGATVEDDVAFGLENQGLSRQEMKKRVEEALALVGMLDFKKREPARLSGGQKQRVAIAGVVALRPAILILDEATSMLDPEGRRELIGTVKGIRKDYDMTVISITHDLEEVAMSDRVLVMKKGEIESTSSPRELFSRNDLDQIGLDDPFANQLKKSLSQNGYDLPENYLTESELEDKLWELL >NZ_AP017971|2126134:2134888|2127782_2128328_-|WP_000712136.1|DBSCAN-SWA MKKEQIPNLLTIGRILFIPIFIFILTIGNSIESHIVAAIIFAVASITDYLDGYLARKWNVVSNFGKFADPMADKLLVMSAFIVLIELGMAPAWIVAVIICRELAVTGLRLLLVETGGTILAAAMPGKIKTFSQMFAIIFLLLHWTLLGQVLLYVALFFTIYSGYDYFKGSAYVFKGTFGSK >NZ_AP017971|2126134:2134888|2126134_2126974_-|WP_000510412.1|DBSCAN-SWA MGIALENVNFTYQEGTPLASAALSDVSLTIEDGSYTALIGHTGSGKSTILQLLNGLLVPSQGSVRVFDTLITSTSKNKDIRQIRKQVGLVFQFAENQIFEETVLKDVAFGPQNFGVSEEDAVKTAREKLALVGIDESLFDRSPFELSGGQMRRVAIAGILAMEPAILVLDEPTAGLDPLGRKELMTLFKKLHQSGMTIVLVTHLMDDVAEYANQVYVMEKGRLVKGGKPSDVFQDVVFMEEVQLGVPKITAFCKRLADRGVSFKRLPIKIEEFKESLNG >NZ_AP017971|2126134:2134888|2131890_2132259_+|WP_000455903.1|DBSCAN-SWA MEYKLFEEFITLQALLKELGITHSGGAIKSFLSEHSVYFNRELESRRGKKLRIGDKVDIPDMNIDILLTQPTSEEQDEYQADKVEKERIAKLVKKMNKGVKKDKSKPASSPKSQQAPRFPGR >NZ_AP017971|2126134:2134888|2128338_2129160_-|WP_001227958.1|DBSCAN-SWA MRKKTIGEVLRLARINQGLSLDELQKKTEIQLDMLEAMEADDFDQLPSPFYTRSFLKKYAWAVELDDQIVLDAYDSGSMITYEEVDVDEDELTGRRRSSKKKKKKTSFLPLFYFILFALSILIFVTYYVWNYIQTQPEEPSLSNYSVVQSTSSTSSVPHSSSSSSSSIESAISVSGEGNHVEIAYKTSKETVKLQLAVSDVTSWVSVSESELEGGVTLSPKKKSAEATVATKSPVTITLGVVKGVDLTVDNQTVDLSKLTAQTGQITVTFTKN >NZ_AP017971|2126134:2134888|2133409_2134888_-|WP_000073428.1|DBSCAN-SWA MSNWDTKFLKKGFTFDDVLLIPAESHVLPNDADLTTKLADNLTLNIPIITAAMDTVTESQMAIAIARAGGLGVIHKNMSIAQQADEVRKVKRSENGVIIDPFFLTPEHTIAEADELMGRYRISGVPVVETLENRKLVGILTNRDLRFISDYNQPISNHMTSENLVTAPVGTDLATAESILQEHRIEKLPLVDEEGSLSGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEFGRLLVAGAVGVTSDTFERAEALFEAGADAIVIDTAHGHSAGVLRKIAEIRAHFPDRTLIAGNIATAEGARALYEAGVDVVKVGIGPGSICTTRVIAGVGVPQVTAIYDAAAVAREYGKTIIADGGIKYSGDIVKALAAGGNAVMLGSMFAGTDEAPGETEIFQGRKFKTYRGMGSIAAMKKGSSDRYFQGSVNEANKLVPEGIEGRVAYKGAAADIVFQMIGGIRSGMGYCGAANLKELHDNAQFIEMSGAGLKESHPHDVQITNEAPNYSM |
9 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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