Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP017938 | Leuconostoc mesenteroides strain LK-151 plasmid pLm151-b, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_AP017937 | Leuconostoc mesenteroides strain LK-151 plasmid pLm151-a, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_AP017936 | Leuconostoc mesenteroides strain LK-151 | 1 crisprs | csa3,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 8 | 0 |
NZ_AP017939 | Leuconostoc mesenteroides strain LK-151 plasmid pLm151-c, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_AP017936_1 | 597876-597978 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_AP017936_1
|
1 spacers
spacers of NZ_AP017936_1
>1.1|597902|51|NZ_AP017936|CRISPRCasFinder CTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCG |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP017936_1
The CRISPR arrays of NZ_AP017936_1 >merge|NZ_AP017936|1|597876-597978|CRISPRCasFinder CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCACCTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCGCCGACGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC >NZ_AP017936|1|1|597876-597978|CRISPRCasFinder CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC CTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCG CCGACGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC
>NZ_AP017936.1|WP_011679264.1|596145_597633_+|lysine--tRNA-ligase MAEEKALNDQMLARRQKLATIVSDLHLDPFGKRFERTAKAQELHNLYDASSLEELENAKHEVVIAGRMVAKRGAGKVIFADFRDVSGKIQVYARRDDLADNYPIIKRADLGDFLGIKGIMMKTEAGELTVLATELTHLSKALRPMPDKFHGISDVETRYRKRYLDLIANEDSFKKFQERSHIISAIRAYMDRNDFLEVETPILQTEAGGAAARPFITHHNALNIDMYMRIATELYLKRLVVGGMERVYEIGRIFRNEGMDPKHNPEFTTMESYAAYMDFTDVMDETEGIFKAAASVVSDDLKITYQGTEIDLGTKFARKHLVDLIKEQTGIDFWQEMSVEEAQKLADDNHVKYEKYWGVGHIINAFFEEFVEDTLVQPTFVYGHPVEVSPLAKKNTDDPRFTDRFELFIMGSEYANAFTELNDPIDQRARFEAQAAERENGNDEAEGIDEDFIEALEYGMPPTGGLGVGIDRLVMLLTDSDTIRDVVLFPTMRPE >NZ_AP017936.1|WP_096638935.1|595165_596059_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO MADQFIKAITKNKYFRTFAVNGTNLVHQAAQIHETSRIAAVVLGRSLLATTLTAQAVLKGEETLSTKINGRGPIGNVVVESDAKGSVRGYVTNPNLETLINEAGQLDVAKAVGKNGFLQVTKFAPYSDPYIGQSQLVSGEIGDDFTYYLAQSEQTPSVIGVSVYLNSDDTVAGAGGFLVQALPDATDEAINQLEVALKNMKPLSEMIQERYTPLEVLEEIFGKGEVDILQTAGIGLAAEPSKDAYAKMLLTLPASEIQAMIKEDHGAEIVGKFSGKCYFFTEEQLSEILKQIEKNNE >NZ_AP017936.1|WP_096638934.1|592955_595058_+|ATP-dependent-metallopeptidase-FtsH/Yme1/Tma-family-protein MNNNKGGFLRSSVFYIFIFLAVVGMVYGLFGNDKTTTKTITSSEFIKALNDKELKSVTVQPGNSIYNVTGTYKKAQTATKDKGLSLFQPTQKVTKFTSTLLPNDASLKSVTDAATKTKTELVTKQAENSGFWLNLLVSLVPVLLIVAVFYLMMNQAGGGKGGQGGMMSFGKSKAKPSDPKDNKVRFADVAGAEEEKQELVEVVEFLKAPKKFVNLGARIPKGVLLEGPPGTGKTLLAKAVAGEASVPFFSMSGSDFVEMFVGVGASRVRDLFENAKKSAPAIIFIDEIDAVGRRRGTGMGGGNDEREQTLNQILIEMDGFEGSEGVIILASTNRSDVLDPALLRSGRFDRKILVGAPDVKGREAILNVHAKNKPLADNVDLKAIAQQTPGYVGADLENLLNEAALLAARRNKSKVDAADIDEAEDRIFQGPAKTNHNMSESERRTTAYHEAGHALVGLVRSEASVVRKVTIVPRGRIGGYALMTPKNDRYNLKYSEAKEQLAGLMGGRASEIFMFNEASSGASNDFQQATGLARQMVTAFGMSDKLGMVQLEGNASVGYADQAGNRAYSEETARLIDEEVRRLAREAFDDAIAILRDNKDKLTAIAEALLEVETLDEKQIKDIYLTGTFTRKDIQDDTELAKAKSFEEAKAAADAKDSQAEQRFEKQDEEKSSDNHSESKNEDTDSTDKSETDDNNTENK >NZ_AP017936.1|WP_096638933.1|592388_592928_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MDNDIQEVLYDQESIQKAAERLGKQITQDYAGSTPLFLSVLKGAYLWTADLLREVDLYAELEFIKISSYHGGVSSSDEITLVTDVRSDVRGRDVIILEDIVDTGQSLLFLKELLAKRGAKSIKVATLLDKIEGRKVEVDADYAGFNVRNEFVVGYGLDYEERYRNLPYVGILKKEVYTK >NZ_AP017936.1|WP_050884233.1|591095_592388_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS MTEKILQTIQQYNWPETVIVAVSGGVDSVVLVHALSKTKANLVIAHVNYRLREESDDDADFVRQLATQTGAIFEEQVWQHIPDHAVEKAARQFRYDFFEELAQKYHTNTIAVAHHADDQAETVLLKMIRGGRLQQMGGMQTKNHKVIRPFLSITKQELITYAQDNQLGWRQDKTNFDVDYTPRNLLRNDVLPKLTTINQRAVRHINNMAAQILQQQRLIDNQAKIYANDIQDWQKIPTLWQLPTLKYWLQKNKLFNIKENQLQQMIQLLSNTHKPNGKIALADNFEFIKNYQKISIQKQQNMAQVLTPVMLKLNQWHSFAKTTFMWTDNVPMNGQSFIKFQLTRSLPYLSLRPAKASDKIALINGHKNLRRLAIDEKLTPQERTMMWVLATADDEVIAVHLRSNQWRVNADFAVKENTQPYWLVCQIEET >NZ_AP017936.1|WP_011679260.1|590666_591065_+|septum-formation-initiator-family-protein MAGNFKRRQSNITPLNPAIAREIKKSERANSEAAKHYRKAHARREKKILLFGGLIAIIFVVQLLIGQVKLHAANQELTNTQDRLEKVQKTNTDLTADTKRLKDATYLQQLLRDKYGYSKQGELVYNLPSDNN >NZ_AP017936.1|WP_004164715.1|590303_590585_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein MRLDKYLKISRLIKRRTVAKEIADQGRISINGKVAKSSSDVSTNDELEVRFGNKTLTVKVLKIVETTKKEESADMYEVISEKFQQDFRKIGDE >NZ_AP017936.1|WP_096638932.1|586748_590288_+|transcription-repair-coupling-factor MTLIDFLSDTVTIKKLNEQATVGSAQLLLGVNGTARAASIAALYRKNPRPMLIISDTQVHADQFFDDLSSLLEDLVYNFPAEESIATEMAISSSELRLQRVQTLLALKTEKPIIVVTSLAGAERLVPKKQSLEQAHLHVKVGDAYNLNVIKNTLMMMGYTPTKLVQTPGEFAHRGSIVDVYPITFDDPIRLDFFDDELDQLKSFDVATQKSTTSFDEINIDPATDFIVSEHQYDQAKLAIETAFSDYRTNLSGVDKKHATDGFAPTQYMLNERERGSALVPYAPFFFDGQTTLLDYFPTDSLIIIDEYTRLMETRLQQMTRDQEWIEQQIEAYQLLPKQTWRTEITDLLASNQHATIYLANFQRGLNRIKFTNVEEVTTRPANQYYGQIPALKNDLIYAQESGITMVLLIPDAKRRANFSRSLSELEVPVTETRDIVKNQVQIMPGELSAGFEWPKLHLTVLTTHELFTQAKHSAPRTRKIANSERLKSYNELNVGDYVVHINHGIGRYEGLQTIEADGGKQDYLTIAYQQNAKIFIPVTQLNLIQKYVGASDVAKKPKLNKLGGSEWAKTKRQVAAKIEDIADDLLELYAKREAQQGYVFPPDDHAQIKFDDSFGYPETPDQIRSIEEIKIDMQKLRPMDRLLVGDVGFGKTEVALRAVFKAAHSGKQVAFLAPTTILVQQHYETMLARFSDFPEIKIGVLSRFQTPTQNKMIIEQLQNHEIDVVVGTHRLLSKDVDFSDLGLLIIDEEQRFGVKHKERLKQLRTSVDVLTLTATPIPRTLNMAMVGARDLSVIETPPANRYPIQTYVLAMDWKIVRDAIEKEIARNGQVFYLHNRVADLDRIVSQIEELIPSARVAAIHGQMSETQLESILYDFLNGQYDVLVTTTIIETGVDIPNANTLIVENADHMGLAQLYQLRGRVGRSTRLAYAYFTYPFTRTPSEEAEKRLEAIRDFTELGSGFRIAMRDLSIRGAGDLLGKQQHGFIDSVGYDMYTQMLKDTVAQKQGKQVTTSQPETDAELILGVLAYLPDEYVSDNAQKIELYSRIRQARTDAEFEDIESDMLDRFGEMPDEVARLLLVGQIKQLADQSQITNIRRQRKQLIMTFNETATKNLAGEAIFETMVDVPLKAAVRTEEGNLQVIFTVNDVAESSIWLNILRNFLLVIIDKLSAKTLNELHH >NZ_AP017936.1|WP_010291225.1|586181_586748_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase MKFIFGLGNIGAEYDQTRHNIGFMAVDAFATANHMSFSPSKQFALVAKTIIGGESVMLVKPTTYMNDSGKAVRAILDYYDGDVDDVLVLVDDMDLPFGKMRFRAKGSAGGHNGLKSIMTHTGSQTFLRLKFGLGHPVHEQNVVVNYVLGKFTAAEKPDIDAMLDRSTQAIADWIQGATAPELSNRYNG >NZ_AP017936.1|WP_011679258.1|585411_586056_-|CBS-domain-containing-protein MFQKSLVIPKSELTTVTENATIQEVYDIFNDPENAHTRTMPILDESGKLFRGNVYKQHVFEHVAKNGNMNLPATAIMRNSTKFIYTNSKFYEVFFAIRDLPFIAVLDENHQFYGIFTHDALMDLLSQSWSVRSGGVAIAISTHNTQGDLSKISKIITRYSNIESLLTIQSELKPLTVLFTLPLQEDSEQLEKLIKRLEKKGYHVSSVENLNRFR >NZ_AP017936.1|WP_011679265.1|598102_598636_+|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E MIVLFNKPYNVLTKFTDAEGRPTLADYIDIPRVYAAGRLDMDSEGLLLLTDSGKLNHELTDPDNKAYKTYVVQVEGVPTKSQLKQLEQGVALKDGLTLPAKVKRIPYPKWLWEREKPIRIRKNQPTSFIQLKIKEGRNRQVRRMTAAVGIPTLRLIRTHIGEYHIADLKPGQYRIVK >NZ_AP017936.1|WP_004164706.1|598706_599423_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWENIKMKKAQTDGAAAKVNSKYGIEIYAAAKQGGSPDPEANSTLKFVIERAKQAQVPKHVIERAIEKAKGSGDETFIEGRYEGFGPNGSLIIVDTLTSNVNRTATNVRTAFNKNGGTYGAAGSVSYLFDETGVIVFEGEDADATLETLLDAEVDVRDAEQQDDHIVVYTEPTALHQAIAALRESGVSDFSTTEISMLPQSEMTLAGEDLEIFEKLIDVLESDDDVQKVYHNVEL >NZ_AP017936.1|WP_011679266.1|599471_600419_-|ferrochelatase MNKKGLLLVNLGTPDSPHPDDVKAYLKEFLSDTNVIQMPRLLWQPILRGKILPKRSFKSAELYQKIWRKDGSPLMVYAKKQVEQVQQLQPNWIVRCAMTYRKPNIAETLKEMRLAGADDIVVLPLFPQYSVTSTQSVIDQVRKADKNINIVKSFYNDEAYLDLLARDIREAWAKNDYDRLIISYHGVPESYVRRGDPYVDHCTATTQGVLERVGPLTPDNTHQVFQSRFGPTEWVKPYLSDTLRSLPSQGIKRVLVATPAFVADCLETIEEIHVENHDIFKQAGGEVFDVVQPFNEHIDFSKYIASLANRHFAQN >NZ_AP017936.1|WP_096638936.1|601231_602680_+|NCS2-family-permease MEKLFQLKENKTTVRREIIAGITTFVSMAYIFFLNPQILGQAGVPTQAVFLAAILVAVFGTLFMGLFANVPFALAPGIGMQAYFTYTIVFGFGFTWQQALAIVFLVGVVDIVITLTHGRRTIVKGIPTELKAAIGGGIGLFVTYIGLKNAGFINFIVDPSNIMTLNGKPFTGEVHGAVNSILANGGVTPELTKFNNASTLLALIGFVILVVLVMRKVPGAFLISLIVTTLIGIPMGVTNTHIGAGTSVSHAFGELGQVFGQSLGAQGLGSLFNNWHHASLALVTIFAMGLTGLFDAIGTLIGIGNQTGIFSKEDQKSFESSNGFNSKMDRALVVDTFTTAFAGIVGTSNTTTFIESASGVAAGARTGLANVVTAAGFALMILFAPLVGVVPTAATSPLLILVGIMMMGEFKKISWESLEVALPAFFTSVFMAFSYSISYGIAAGFIFFIIVKFALGKFKEVSPVLLIVSAFFLLNFAVLAFM >NZ_AP017936.1|WP_096638937.1|602799_603600_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLNIKNLSVSYGRKVALTVPKLSINKGEIIGVMGKSGSGKSTLVNSCLGLIPFKGQVRIDTDDVGILMQEQHYVDTMTNQKMIEGMLNTRIKRDKKLTELIDFFDFSDQLSLHFKNLSGGQKQRMSLIMVLYQEPELIFLDEMTTGLDFESRQALISQLKIYFKQHQTTVLMVTHYAQEIEALADKLLVIHDGQVKAFDEPKNLFKQYIGYSAFIVDNHTEKSIKVQQPEDEYKVARRLIDDGDDFRRTQSDIELVYTEVMKGQRA >NZ_AP017936.1|WP_011679269.1|603596_604325_+|membrane-protein MIKKRKLVFEFQNLLGNIITLFFGFAFAPMMALVFGNSYANVPQALNQLYLGFFCTIPLSMVFVGFSSLFSQEVEQGFTLRAELFGYSRVSQALHKFMALTVFVLLSSIIYSWIFLSHFNLPLPNAVIIGQMAIFQILNTAVYFIIVFILTTILKKFSRVYGISMISYFAIMIISGIMGNMDVGKLGDYLPIKLFVTNYTNHLNDTDYISGKIGLYLLILLGILGVILKVIVRNKNGNKHQY >NZ_AP017936.1|WP_096638938.1|604302_604770_+|LytTR-family-transcriptional-regulator MEININIDDKLKDVQVVISGSDIEQLADIAQYLKSRNTPSRQLAIKTADNIRVVDKEDIILVESYGNDLTFTLKNNHKITTRKTLKRFLEENQKSDFVQISKSEVMNLSYLSKMESAFSGNYYAFLTNQARVTVSRRFIKGILKRLEGSAEDESF >NZ_AP017936.1|WP_096638939.1|604756_605167_+|DUF3021-family-protein MNHFKEAIVYLLVGIGVGSFISLLSFTLNHATPSMKQFGLLMTMSAIMGLLSLIFEYDKITFITQLISHFILEMLTYGFFIWLTFGSAVITFGNIPTFVITYVIIFIYFRKQGRDNARRINEQLQKNKPIKSDSTN >NZ_AP017936.1|WP_096638940.1|605300_607391_+|DNA-topoisomerase-III MPNYLILTEKPSAAANFTKALGGKTGVFSDFTYKITNLRGHVMTLKDPEEMVAEDLKKQYKSWLVKHLPWNLEDFSWARTYIRQRNIRTGKIESTKKLIDELKKESKSGYDAIVIATDTDPSGEGELLAWEALDAIGWRGQVLRANFMDESVSGIQKAMHQLRNVSDKMADGEYVKGESRNRWDFASMQLTRIATTAAKKEGFKVVAREGRLKSVIVWRIYQQLAAIKNYIKTPYFEVKFKDPAGHIFGRVTPQGEVIPWRFATKEQAKVDFNNYHETEVINEKHQTRTQAPGKLLDLAGLASILAPRGFSSKEVLSTYQKMYEAQIVSYPRTEDKTVTPEQFNELLPLIDQIAGVVGVDKNLLTHRSPRKTHVKSQGAHGANRPGENVPQTTQSLAKFGSSGPAIYEVLAKNYLAMLAEDYVYDHVTANLKDYPEFKTAFNIPIKLNFKLVYDSQKAIKVEEGEEEESISGQLGPQAMPYLHEGANPKPQVPTTKWIMAFLEKHNVGTGATRVSTLSEMSRGTKAMLTEKRGKLGLTETGNVSAIMVKDTWIASPKITKRLFEMMDQVGRFEMTMVQVLDSATKVVEHDMPIMLDNAQTLETLLGKPKPSIKKPRKTSEKMTGIWQGQEITFAREWSGHVFTDEALQKLLTGSEVSFPAKSKRGKSYTAVGKMAKQTFKGNTFYGFKLNPKTKKA >NZ_AP017936.1|WP_171030157.1|609565_610021_+|TetR-family-transcriptional-regulator MSDISKRSGISRRTFYRYYASKEDILTEYIDILIEQYGNDLRSKKLANFKEFIVYFFNYWGQYDHELFILQKNGLFTYVLSEFNKMIPELYATISAPWHIQKEVNSREIIYTTRYGVGGLWNVYGEWLEFDREKIEITEVAKILIQSFNSL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
291535 : 309215
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP017936|291535:309215|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP017936|291535:309215|298329_299085_-|WP_096638833.1|DBSCAN-SWA MTKPVFSLKDVIVTVGYSIQILKSINFDIYDGDFITVLGTNGAGKSTLFNTIAGNLSVASGKILHNGNNIAHETAVKRTNYIARVFQDPKMGTAPRMTVAENLLLAEKRGSKRTLRSRGLTQKKLTEYAALTKVMGNNLDRRLNTATGDLSGGQRQALSFLMATRVKPELLLLDEHTAALDPKTSEQLMLATNEQVTANNLTALMITHNLADALKYGNRLIILNAGNIVLDVRDDEKKALDETQILKYFVS >NZ_AP017936|291535:309215|303919_305233_-|WP_096638836.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MFNERLLESSEFYTKRYQNFTTLIIFPTLILLVLLILLACLTHKETVIKSTGEIAPIKILRTIQSTSNNPIIKNELLTKKEITAGDILIQYQNTESDTNLQLQKSSLKNLQEHVQALIIYKDSIKQNQNLFTDDDNFGCSTSYQSYLSQRRSLSTDHQQQVNDQDRVKQQKIIISEAINKKNSELSQYQDLINAIIKNTSLSPKNAYYSTFLDYQHQTKELPISQVDKLKKETVTSIQQQIDSINDALTSYKTQYAGFSSTNLAEDALTNKLNELKSQQLASITKELETLNQEIEQTKIQHAATETSGKNTIIATESGTVNLLINKTKLTSIPQGTNIAQIYPNLKKTPDLKVSFYISANEISEIVENQSIRYHLTEKNSKHMVIPGNITSIPANPITTKDGNFYQVSAILNLRPKDYQNIHYGQTGTVSIITGKST >NZ_AP017936|291535:309215|302089_302827_+|WP_002815471.1|DBSCAN-SWA 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MRKIGVVGIGHVGVTVAHIIIAQGLADEIVLVDKNPEKLASEELDFRDAASLLDHHVEVHAGTVTDLANAEVVISALGHIELIKPGGDRFTELKANTPEVQQVGSDLKQAGFNGVLIVISNPVDVITGIYQKATGLPANQVFGTGTYLDTARLKRALGDTLAIDPRGISGYMLGEHGDSQFAAWSTVNALGKNADELVKLYDINLDKVAEAARVGGFTVFAGKKYTNFAIAHAAVSLAKLVLSNARREAIVSHYDERFEGYISTPAIIGRDGVTAEFDLQLTDEEKVLLQKSANAIAEKTAAYL >NZ_AP017936|291535:309215|291535_291706_+|WP_010288466.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MEKLSEQELAKVSGGFPLLPIVVPIIAGGATYVAKDAWNHLDQIRSGWRKAGNSKW >NZ_AP017936|291535:309215|302942_303068_+|WP_011679061.1|DBSCAN-SWA MAEKNDLSSAYRRLKSPNAKTRDRALKLLKEIKAKKSQKSK |
18 | Staphylococcus_phage(50.0%) | bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
785334 : 794338
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP017936|785334:794338|DBSCAN-SWA AATGGTAGTAAAGAAAACGACTAAAAAAGACGATCAAGCAAAGAAAGATGGTCGTCGAGCCGCGCTAGATGAAGCGCTAAAGAAAATTGAAAAGAACTTTGGGAAAGGTTCAGTGATGACGTTAGGAGATAACGCGCTAACGCAGATCGAAACGATCCCTTCTGGTTCTGTTAAAATTGATGTTGCTTTGGGTGTTGGTGGCTATCCCAAGGGGCGTATTATTGAAGTATACGGTCCAGAATCATCAGGTAAAACAACCATCGCACTTCATGCAGTTGCTGAAGTTCAAAAGCAAGGCGGAACGGCTGCCTATATTGATGCTGAAAATGCTTTGGACGTTAAATATGCTGAAGCCCTCGGCGTTAAAAAAGACGAATTACTTTTGTCACAACCGGATACAGGCGAACAGGGATTAGAAATTGCTGATGCTTTGGTACAATCAGGTGCCGTAGATATGATTGTTGTTGACTCAGTTGCTGCATTAGTACCTCGTGCCGAAATCGAAGGTGAAATGGGTGATGCGCACGTTGGATTGCAAGCTCGTTTAATGAGTCAAGCACTACGTAAGTTAGCAGGAACCCTGAACCGAACGGGAACAATTGCTATTTTCATCAATCAAATTCGTGAAAAAGTCGGCGTAATGTTTGGAAACCCAGAAACTACACCCGGTGGTCGTGCACTAAAGTTTTATTCGACAGTACGTTTAGAAGTCAGACGTTCAACACAAATTAAAGACGGTACTGATGTCACTGGTAATTTGACAAAAGTTAAAATTGTTAAAAACAAGGTGGCTCCACCATTCAAAGTTGCTGAAGTTGATATTATGTATGGCCATGGTATTTCACAAACTGGTGAAATTCTTGATCTCGCTGTTGATCAAGATATTATCGACAAAGCAGGTGCATGGTATGCTTACGAAGGTGAACGAATTGGTCAAGGGCGTGAGAAAGCTAAAGACTATTTGGATGATCCTGAGCATGCCGCATTGCGACAAGAACTATATGTCAAGGTGCGTCAAGCATATGGTATTGATTCTAATGCGAATGGTACTGCCGTTTCAAATACGGAGGCTCAAGCAGAAAAATCTGATGAGCAAACTAATCTGCCGGATTTGGATACAACGACTGATGATTCTTTAACGGACGAACCAATTGTATAAATTACGTAAATATTGAGAAAAACGTTAGGTCGTTTTTCTTTTTTTGTTACAATGCAAGTATAGAAACGCATGGAGATAGACATGACTAAGATACTTGTTGTTGATGATGAAACGGCAATTGCAACGCTGCTGCAATACAATTTGCAACAGAATGGTTACGAAGTAACAGTTGCATCGGATGGTTTATCCGCTTATCAAAAGGCAAAAGAGCAACAATTCAATGCAATATTGTTGGATCTAATGCTGCCAGAAATGGATGGCATGACCGTTTTAAAGCAGTTACGTCAAGATAAAGTTAGCACACCAATAATTTTGGTGACTGCAAAAGGGGATGAGTTTGATCGTGTGCTTGGCTTAGAATTAGGTGCAGATGATTATATCACTAAGCCTTTCAGCCCTCGAGAAGTTGTAGCAAGACTAAAAGCTGTATTACGTCGTTCACAAGTTAGTACAGATACCAACAAAACGGACGAAATGGTTATTTCTATACAAGATTTGCTCATCAATGATAGCAAAAAAACAGTTATGAAAGAAAATATTGTTTTGTCCTTAACGCCACGGGAATATGATTTATTATTATATTTTGCACAGCGATTGGGACGTGTAATTGATCGTGAAACAATTTTGACGGCTGTGTGGGGATATGAATATACTGGCGAAAGCCGTATGGTAGATATGCATATCAGTAACTTACGAGATAAGATTGAGTCAAATCCAAAGGCGCCTAAAATATTGAAAACAGTTCGCGGATTTGGATATACTATGACGAATTAGTGTTTTCATAAGACATATGTGGCGTTATTATAGTAAATGGCAAACTGTAGACATAGCGTCGAAGGTGAGCCATTTTTGTTTTGTAAATTTTTCTTTACACGCATTTACAAGAATGCGACCAAATTGTGGCGTGTTTCATAACATAACTCCCGTAATATATAAGTTGTAAACAAGGAGCGGCACCCAAGAGCCTCTACTACAACCTTGTTTCACTACATATTTCTAAGGGAGAAATCTTCATGAACAAAAAGATTGTAGGAATTATTGGTGGTATAGTGGTCATTGCGGCTGGAATAGCCTTGTATACTTCTGCTAATGATAAGTCCAGCGATAATAAAACAAGTACGACGTCATCTTCTAATGTTAGTGGAAAAGTGTTATCGTTAGGATCAACAGCATTACAGCCTTTAGCAGAGCAAGTTGCTAAGTCATTCCAAGAGAAAAATCCTAATGTAACAATTACAGTGCAAGGTGGTGGATCGGGTGCCGGGTTAAGTCAAGTATCTGATGGATCAGCACAAATTGGTAACTCAGATGTGTTTGCTGAAGAAAAAGATGGTATTGACGCCACTAAACTAGTGGATCATAAAGTAGCTGTGGTTGGTATTGCGCCAGTTGTGAATAGTGATGTGCAGATCACGAGTTTAACAAAAGAACAGTTGCGTAATATTTTTACTGGTAAGGTAACAAATTGGAAAGAAGTTGGTGGTAACGATGAAAAAATTGTCGTTATCAATCGTGCAACTGGGTCAGGAACACGGGCTGTTTTTGAAAAAAATATCTTGGACGGTCAGGATGCTGTACAAGCGACCGAACAAGATTCCAATGGCACGGTGCAAAAGATTGTCAAAACAACACCAGGATCGATTTCGTACCTGGCATTTGCTTACCTCGACTCTGACGGTATTAAGGCACTGGACTTAAATAAAGTTCATCCTAATAAAAAAAATGTTGAAGATAATTCATGGCCAATTTGGGCTTACGAACACATGTACACTAAGGGGAAGCCAACTGGGGCTACTAAGTCATTCTTAGAGTACTTCACGACCAAAGAGGTTCAAAAAAATATTGTACCTAAGCTAGGATACATTGGATTAACAGATATGAAAGTCACTCGCAATGCAAGTGGTAAAGTGACAGATAAATAAGTATATTTGATAAGGACAAGCAGAGTGCTTGTTTTTTTGTGCGTTACCGTTATGCAAATTCAAAACCATGATAGAATAAACTTATGAAGAAAAGAATTGGCAAAATAACCAGTATATATAGTCTAAATATTTTATTATTATTTATAGTAACTCGAGTGATCCACGTGTCTCATAATCAGCTCTACATATTAGTTATTATATTTTTTGTTGTAGCTAATTTTGAAGTATGGTTTTTAAATTTTTGGCAAAACAAAGAAACAGCAGAATTAACAATTATGAAGAATAGAATGATTGCTACTTCAGCTGGAGAAACACCACGGGGTGTTTTAGCAGAACCAACATCTCCATACTACGAATTATTAGAACAATTCAATGAATTACAAAGTTATGTTCGCCATTCGCAATATAGTGCCAATCGTGAAATAAATAATTATCAGACATTATTGGCCAGCTTACCAGTTGGGGTCATTAATGTTAGTCGTCATCATATGATAGATGTTTTCAATCAAACCGCTGCCGATATGCTTGGTGTAGAGATGCCAGAAGTACCAATTTTAGACAGTTTAGTGATTCGTCAGTTTACTTTGTCAGAAATCATTAATCATACCTTTAATACCAATCAAAGGCAGCACTCCATTTTGAACTTGATGATTGATGGCGAGGCGCGACAATATGATGTTAGCACATTATTTCATCAATCTGGATCAAATGCAGAAGTGATGGTTATGTTGTATGATTTGACAGAGGTATTGAAATTAGAGCGCATGCAAGCCGATTTTTTGGCAAATGCTTCGCATGAGTTTAAAACACCGTTGACTGCAATAACAGGATTTGTTGAGACGTTACAGGGTGACGCAGGGGCGGACGAAGGAACGAGGACCCAATTTTTGCAAATTGTGGCGGATGAGGCAAAACGTTTGTCAGCACTGGTTAATGACATATTGTCTTTGTCACGTATGCAACACAAAGTGGATGAAAAAATATCTAATTTGCAAATTTCAGCCATTGTTGAACAACAATTAGAAAAAATTGATACTAAAACGGTTACGGTACACAATGATATTGCACCGGACTTCAGTGTGTCAGGTATTGCTAGTGACGTGTCTACTATCGTCCAAAATTTATTAACTAATTCGGTTAAGTATAATAAAATAGACGGTGAAGTTTGGATATCAGCATATAAAGACACGCAACAATGGCAAATAAAAGTTAGTGATTCGGGTATTGGTATTCCGTTAAACCAGCAGTCTCGTATATTTGAGCGCTTCTATCGTGGTGACGAATCAAGACAACGTAAAATAGCAAGTGGTACTGGATTGGGGCTCGCTATTGTCAATGAGATTGTGAACCAACATAATGGGGAAATCAATATTAAATCACAAGTAGGTGTCGGTACGACAATCAGTGTTATTCTACCCTTGTAGAAACGCGTCAAAACATTAAAATTGATGTTTTTTTGTATGAAAACATCATGCTCTTTACACAATCTTTACATAAAAGCGTTTTGACATTTACATAAGTTTAAGATAATAAATATGTAGTAGTAAATCTTGGGAGGCATTAACATGTCGAAATCATATCGCGGTTCAATCGTATTCACGATTGTAGCCGTGGCAGTTGCTGCAGCGCTTGGAACAGCGTATGCAATGCGCGATAAAAGTGCGTCAAATACGTCGATCACTGCAGTTGGGTCAACGGCCTTACAACCGCTGGTTGAAGCTGCTGGCGAGGAATACGCTAAAGACAATATTGGTACCTTCATCAATGTTCAAGGCGGTGGAACAGGTACAGGGTTAAGTCAGGTGTCGCAAGGCGCTGTTGACATTGGTAATTCTGATGTATTTGCTGAAGAAAAAGACGGTATTGATGCCAAAGAGTTAGTAGATCATCAAGTCGCAGTTGTCGGCATTGCGCCACTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP017936|785334:794338|786573_787266_+|WP_011679406.1|DBSCAN-SWA MTKILVVDDETAIATLLQYNLQQNGYEVTVASDGLSAYQKAKEQQFNAILLDLMLPEMDGMTVLKQLRQDKVSTPIILVTAKGDEFDRVLGLELGADDYITKPFSPREVVARLKAVLRRSQVSTDTNKTDEMVISIQDLLINDSKKTVMKENIVLSLTPREYDLLLYFAQRLGRVIDRETILTAVWGYEYTGESRMVDMHISNLRDKIESNPKAPKILKTVRGFGYTMTN >NZ_AP017936|785334:794338|791836_792721_+|WP_010291776.1|DBSCAN-SWA MNAKTADKIATGVIYAISGIVALILFAMLAFILVQGVPHLSWHFLTSPARAFEAGGGIGIQLFNSFYLLILAMLISFPIALGAAIYLNEYAQKNHFTAIIRTAIEILSSLPSVVVGLFGFLLFVVQFKLGFSILSGAIALTLFNLPLLTRSIETSLAQIPDLQREAGAALGLSRWETVLHVILPAAVPSIVTGVVLSAGRVFGEAAALIYTAGQSAPALNFADWNPFNISSPLNPMRPAETLAVHIWKINSEGIMPDVSAVSAGASAVLIIVVLLFNFSARKLGMKLYKKLTSA >NZ_AP017936|785334:794338|787505_788414_+|WP_042252799.1|DBSCAN-SWA MNKKIVGIIGGIVVIAAGIALYTSANDKSSDNKTSTTSSSNVSGKVLSLGSTALQPLAEQVAKSFQEKNPNVTITVQGGGSGAGLSQVSDGSAQIGNSDVFAEEKDGIDATKLVDHKVAVVGIAPVVNSDVQITSLTKEQLRNIFTGKVTNWKEVGGNDEKIVVINRATGSGTRAVFEKNILDGQDAVQATEQDSNGTVQKIVKTTPGSISYLAFAYLDSDGIKALDLNKVHPNKKNVEDNSWPIWAYEHMYTKGKPTGATKSFLEYFTTKEVQKNIVPKLGYIGLTDMKVTRNASGKVTDK >NZ_AP017936|785334:794338|793567_794338_+|WP_011679413.1|DBSCAN-SWA MTDNKEKTILSTRDVHLWYGKKEALHGIDLDFPEKGITALIGPSGSGKSTYLRAINRMHDLEDNVTVTGSFKFKDTDIYAPTTDTVDLRKRIGMVFQQPNPFPFSTYENVAFGLRLAGVKDKAVLDEAVEKALKQSSVWDEVKDNLHKSALGLSGGQQQRVSIARVLATSPELLLLDEPTSALDPVSSHNIEETLLKLRDDYAMIIVTHSMSQASRISDRTAFFLSGDLIEVDETKHIFLDPAKKETQDYVSGRFG >NZ_AP017936|785334:794338|788497_789838_+|WP_060461304.1|DBSCAN-SWA MKKRIGKITSIYSLNILLLFIVTRVIHVSHNQLYILVIIFFVVANFEVWFLNFWQNKETAELTIMKNRMIATSAGETPRGVLAEPTSPYYELLEQFNELQSYVRHSQYSANREINNYQTLLASLPVGVINVSRHHMIDVFNQTAADMLGVEMPEVPILDSLVIRQFTLSEIINHTFNTNQRQHSILNLMIDGEARQYDVSTLFHQSGSNAEVMVMLYDLTEVLKLERMQADFLANASHEFKTPLTAITGFVETLQGDAGADEGTRTQFLQIVADEAKRLSALVNDILSLSRMQHKVDEKISNLQISAIVEQQLEKIDTKTVTVHNDIAPDFSVSGIASDVSTIVQNLLTNSVKYNKIDGEVWISAYKDTQQWQIKVSDSGIGIPLNQQSRIFERFYRGDESRQRKIASGTGLGLAIVNEIVNQHNGEINIKSQVGVGTTISVILPL >NZ_AP017936|785334:794338|792728_793571_+|WP_011679412.1|DBSCAN-SWA MINSNTDLKPASEFIRENAPERFIYKMDTEKHEIALSTHDLQVFYGDNLALSEGDLQFERYKITSLVGASGSGKSTFLRSLNRMNDGVATVNGNIMYRGLDINTKKIDVYEMRRHIGMVFQRPNPFAKSIYDNITFALTSRGNYTKQQLDEVVETSLKQAALWDQVKDELNKSALALSGGQAQRLVIARALALKPDILLLDEPSSALDPISSAQVEDTLLKLKDQYTIIIVTHNMQQAARISDYTAFFHMGKVIEYDLTRKIFTRPKVALTNDYISGNFG >NZ_AP017936|785334:794338|790913_791837_+|WP_011679411.1|DBSCAN-SWA MDNITKKLMQRSESTHKDTFGRAVSLTALALIGIVVVAIFAFVLSRGLSTFFRDGVNVKDFLFGTTWNPSVTNPATKQPYIGALPMIIGSFLVTFLAAVVATPFAIGTSLFMTEIAQKRGAKIMQPIIELLVGIPSVVYGFIGLTVVVPFIRNITGGSGFGILSGTIVLFVMILPTITSMTVDTLKSVPRYYRESALAIGATRWQMIYKVVLRSATPGIMTAIVFGMARAFGEALAVQMVIGNAALMPTGLTTPASTLTSVLTMGIGNTVMGSLQNDVLWTLAMILLLMSLVFNLIVRAIGRRGAMK >NZ_AP017936|785334:794338|785334_786492_+|WP_096638989.1|DBSCAN-SWA MVVKKTTKKDDQAKKDGRRAALDEALKKIEKNFGKGSVMTLGDNALTQIETIPSGSVKIDVALGVGGYPKGRIIEVYGPESSGKTTIALHAVAEVQKQGGTAAYIDAENALDVKYAEALGVKKDELLLSQPDTGEQGLEIADALVQSGAVDMIVVDSVAALVPRAEIEGEMGDAHVGLQARLMSQALRKLAGTLNRTGTIAIFINQIREKVGVMFGNPETTPGGRALKFYSTVRLEVRRSTQIKDGTDVTGNLTKVKIVKNKVAPPFKVAEVDIMYGHGISQTGEILDLAVDQDIIDKAGAWYAYEGERIGQGREKAKDYLDDPEHAALRQELYVKVRQAYGIDSNANGTAVSNTEAQAEKSDEQTNLPDLDTTTDDSLTDEPIV >NZ_AP017936|785334:794338|789979_790861_+|WP_011679410.1|DBSCAN-SWA MSKSYRGSIVFTIVAVAVAAALGTAYAMRDKSASNTSITAVGSTALQPLVEAAGEEYAKDNIGTFINVQGGGTGTGLSQVSQGAVDIGNSDVFAEEKDGIDAKELVDHQVAVVGIAPLLNKHNGVKNLTTKQLIAVFTGKVTNWKEVGGNDQKIVIINRAAGSGTRATFEQWGLNGAQSTEAQEQDSSGMVRSIVSTTPGAISYAAFGYIDDSVVAAKVNGVKPTKQNVVSGKYAIWSYEHVYTKGKPSEPVAKFLKYLTSKKVQSTLVSKLGYISIHDMKISRDVNGQVTRK |
9 | Bacillus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
926544 : 935233
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP017936|926544:935233|DBSCAN-SWA TATGCCTCAAGTTGCAGTTGTCATGGGATCAACTAGTGATTGGTCCAGCATGAAAAAAACGACAGAAATTTTGGATATATTAGGTGTTACTTACGAAAAACACGTCATTTCAGCGCATCGCATGCCTCAAGAATTACAATCATTTGGCACACAAGCAAGAAACAATAAGCTTCAAGTAATTATTGCTGGTGCCGGCGGCGCGGCTCATTTGCCTGGTATGCTGGCAGCTAATACAACGCTACCAGTCATCGGCGTGCCGATGCAATCACGGGCACTAAATGGACTGGATTCTTTACTCTCTATTGTTCAAATGCCAGCGGGGGTTCCCGTTGCAACAGTTGCAATAGGTGATGCAGGTGCAAAAAATGCGGCAATTCTAGCCGCACAAATTATTGCTTTAAATGATAATGACGTATTGCAGGCCTTGAATGAATATCGAGAACGCCAAACAAAGACTTCTATTGAAAGCGAGGCAGAATTGATATGACGGGAGTAATTTTACCGCCGGCAACGATTGGTATTATTGGTGGTGGCCAACTTGGTCAAATGATGGCTCTTTCTGCAAAAGAAATGGGGTACCGTGTCGGAATTTTGGATCCCACGAAAGGCTCTCCAGCTGGGCAAGTATCAGATTTTCAGATAGTTGCTGATTATGATGATGTCGAAGCATTAAATGAATTATCACGACGAAGTGAAGTGTTAACATATGAATTTGAAAATGTTGATCGAGATGCATTGAATAAGCAAAGCGATGCAGAATTGCCGCAAGGTACAGAACTACTAAGAATTACAAGCGATCGCATTACTGAAAAAAAGTTTATTCGGGATGATGCTAAAGTACCAGTCACAAATTTCATTGAAGTAAATTCACCCGAAGATTTACGAAAGGTAACTTTACCAGCTATCTTAAAAACAGTGAGTGGAGGATATGATGGCCATGGTCAGTGGTCAATTAATACAGTGCAAGATATTGTTAATCTTGAAAAAGATTTTCCAGATACGCAATTAATTTTAGAACAAGTTGTGAATTTTAAACAAGAGCTAAGTATTATGGTTTCACGTTCCCAAGATGGGCAAATTGTGACCTGGCCGATTGTCGAAAATGTTCATGAAAATCACATTTTAAAAACGACAACAGCACCTGCCGACATCTCATTAACACTCAAGAATAAAATTGAAGCAATTGCTGAGAATATCGCTGAGTCACTTAAATTGCGTGGCGTACTTGGTATTGAGTTATTTGTCGCTGACGAGGAAGTATGGGTTAACGAATTAGCACCGCGACCACATAATTCTGGACATTATAGTATTGAAGCGACAAATGTATCACAGTTTGAAGGACATATTAGAAGTATTGTCGGTCTACCTATACCAAAAATTGAGTTGCAAAGCCCTGCTACAATGTTGAATTTGTTGGGCGATGAGTTAACACAAGCTAGAGAAGATTTAATTCATCATCCTGAGTGGCATTTTCACGATTATGGTAAATTGGCTGTTAAACCTAATCGTAAAATGGGACATATTACGGTATTAGGAACAGAAAATGGTCGAAAATTAAAAGAATGGGGTGACTTGCATGAGCAGCGCAACTGAATACGAAGACAAAACAGTGACTCGCGGAGAACTGAAATATCAAGGCAAGGCGAAACAAGTTTATTTCACAGATAATCCTACAATTTTGTGGGTTCATTATATGGATCAAGCAACAGCTTTAAATGGTAAGGTACATGAAAATATACCAGAAAAAGGCCAATTGAATAGTGCAATTTCGCATATATTATTTGAACATTTAACACGTCAGGGCATTGAAAATCATTATCTTTCTTCGGTTTCTGAAACAGACGAATTGGACTTAGCCCTTGAGATTTTGCCCATTGAAGTGGTTACGCGAAACTACGCATCAGGGCATTTTGTAAGTAAATTTAACGCAACGCCAATGCAAAAATTAACACCAGTTGTTCAAGAATTTTACTATAAATCAGACGAGCTGGATGATCCCTTCATGAATGATTCTCAAATTTTAGCTCTTGGTTTTGCCACATTATCTGAACTCACAAAATTACGTGCATATGCCCAAGAAGTTAATCAAGCGCTCACAGAAATATTTGATGAAATTAATATTAACTTAGTCGACTTTAAATTAGAATATGGTCGTGATAGTGAGGGAAAGTTAATCTTGGCTGATGAATTGTCACCAGATAATATGCGTTTGGTCGACCAAAAAACAGGTAAGTCACTTGATAAAGATGTATTTCGGAAACATGCTGGTGATGTTACTGTTGGTTATCGTGATGTTCTATCACGTTTAGAAAATTTGGAGAAATAATATGTACTTAGCAAAAATATATGTCACATACAAGCCATCAATCCTTGATCCACAAGGTGAAGTGATTAAAGCTGCGTTAAATCGTATGGATTATAGCGGAATCGAGCAAGTATCACAAGGAAAATATTTTGAAATTAAGCTGAAAGCGACCGATGTTGATGCTGCTACTTCAGAAGTTGAAAGTTTCACTGATGCCCTATTAATCAATCAAAATACCGAAACCTACCGCTTTGATTTATCTTTGGTAGATGAGGACGAGGTACTATCATGAAAGCTGCGGTTATTAGTTTTCCAGGATCAAATTGTGATTTTGACATGTTACATGCATTGCAAGAATTTGGTGTTGATGCAGAAATTGTTTCTGCAAAACATAATAATTTGAAAGAATATGATGCAATCTTTTTACCAGGTGGTTTTTCATACGGAGATTATTTGCGTACAGGAGCGATTGCCCGTTTTTCACCAATCATGAGTGCTGTGACACAGGCGGCTAATGATGGCAAGCTTATTGTTGGCATTTGTAATGGATTTCAAATTTTGACAGAAGCTGGTTTGCTACCTGGACAACTATTAACAAATAAAAAACCAGGATTTATTTGCGATGAGATAGCACTTTCAATTGCAAATCCAAACACTGCTTATACAAATACTTATGATTCTGAAGAAATAATTAATATTCCTGTGGCACATGCAGAAGGAAATTATTATGCCGATGCAGAAACATTGACGAAACTTGAAGAGGATAATCTGATTGTTTTCCGATATGTGGATAATCCCAATGGATCAGCACATGATATAGCGGGGATTATGAATGAAAATGGTAACGTCTTTGGTATGATGCCACACCCAGAGCGTGCAGTTGATGCAGTGACTGGTAACGAAGATGGTAAGAACTTTTTCAAAAGTATTTTGAGCGGCATTCTAGCAGGAGCCTAATATAATGACAACAAATGAATTATCACCCGAAGAAGTACGTGACAGTAAAATTTATATAGAGTGGGGGCTTACAGAACAAGAATATGATTTGATTGTTAAGGAGTTAAAGCGTCTACCTAATTTTACTGAAACAGGCATTTTTTCAGGAATGTGGTCGGAACACGTTTCTTATAAGAAATCAAAGCCAATTTTGCGCAAATTCTGGTCATCCAACGAACGGGTTTTACAGGGACCAGGTGAAGGTGCTGGAATTTTAGACATTGGTGACAATCAAGCAGTTGTTTTTAAGGCTGAAAGTCATAATCATCCTTCATTTGTTGAACCGTATGAGGGGGCAGCAACCGGAGTTGGCGGTATCTTACGTGATATTTTTTCAATGGGTGCCCAACCTATTGCTGTACTGGATTCGCTACGTTTTGGTGAATTGGACAATGCGCATACAAAACATATTGTTGACGGTGTCATAGCAGGAATTGCGGGATACGGTAATGCGATTGGTATTCCCACAGTGGGAGGCGAAATTGGTTTCGATGGCGTTTACGCTGGCAATCCATTGGTAAATGTTATGGCTGTTGGCTTGATGGACCAAAATGCTATGCAAGTTGGACAAGCTAAAGGCATAGGAAATTCAATTATCTATGTTGGTGCTAAAACTGGTCGTGATGGTATTAATGGCGCTTCATTTGCCTCTGCTGAGTTTTCAAGTGCAGAAAAATCTGATCGTTCGGCTGTTCAAGTTGGCGATCCATTCTTGGAAAAGTTGGTGATGGACGCAACGCTCCAAGCAATTCGTGAACATTCTGATATTATTGTTGGCATTCAAGATATGGGTGCAGCTGGACTCCTATCTTCGAGTTCTGAAATGGCTGCTAAAGCAGGCATGGGTATTCACTTGAACTTGGATATGGTCCCTCAACGTGAAACAGGAATGACGCCATATGAACTAATGTTGTCAGAGTCGCAAGAACGCATGGTGCTGGTTGTTAAAAAGGGTGAAGAACAAGCTATTATTGATTTGTTCCAATCGGCTGATTTAGATGCTGTAATCATTGGTCAAGTTACCGATGATGGTCGTTATCGATTAAACTTCAAAAATGAAGTTGTTGCAGATGTGCCTGTTGATTTCTTAACGCATGCGCCAGAGCAAGACTTACCAATGATTGAACCGGCAAGATTGGCGAACTTTACAGATGAACAATTTGAGCCAGACATGGGTAACGTCAAAGAAACAATATTAACATTACTCGCACAACCAACAATTGCTTCTAAAGCATCGTTGTTCCGACACTTTGATTCTCAAGTGCGCGCTGATACGGCTATTAAGCCTGGTGGAGATGCGGCGTTGATTCGTATTCGTGATACGCAAAAGGCATTAGCGATGACAACAGATGTCAATGCTCGTTATTTATATCTCAATCCACGTGTGGGTGCCAAAATGGCAGTTGCTGAAGCGGCTAGAAACATTGTATCCACAGGGGCAAAGCCAATTGGCATCACAGATGGCTTGAACTTTGGTTCACCGGATAATCCAGAAGTTTATTATGAGTTGGATCAAGCTGTTGCTGGGATTAATGACGTGGCTAAACAGCTTGACACACCAATTATTTCTGGAAACGTGTCTCTTTACAACGAAACAGATGGGCAAGCAATTTATCCCACACCAATGATTGGCATGGTTGGTTTGCTTGAAGATATTACAAAAGCAACACGAACGGCATTTCAAAAAGCAGGCGATAACATTTATCTTGTAGGGCGAACGAAAGATAGCTTTAACGGTTCAGAAATTCAAAAGATGCAAACAGGACATATTGCCGGTCAATTATTTGATTTTAATGATGAGGACGAGTTAGCAGCGCAACAGTTCATTCTAGATGTCACTGATCAACGTCTGCTTAATAGTGCGCATGATTTATCTGAAGGTGGATTAGTCGTTGGTCTTCTTGAGAGCGCCTTTGCTGGAAATCTTGGTTTTGATATCTCGGTAGACTTAGCCGATAAGTATTTATTTTCGGAAACACCAAGTCGTTTTGTAGTCAGTGTGTCACCTGAAAATAGGACAACATTTGAATCACTAGCCGGTGACCGAGTAATAAAATTAGGTGTGGTTACTGCAGATGATACGATTAATATTACAACGACAACAAGCGATATTCAATTGTCATTAAGCGAAACGAAGAAAATCTACCAGGAGAGTATCGCATGGAAACTAAACGCGGAGTAACGATGATGAACGAACAAAAAAATGAAACATCACGTCTTAATGTGCGTAGTTTGAATGAAGAATGTGGCATTTTTGGCGTCTGGGGTCGATCCGATGCGGCGCAATTAACATACTATGGACTACATGCATTACAACATCGTGGTCAAGAGGGTGCTGGTATTGTTGCTAACAATAATGGTCATTTGTGGCAAGAACGTGGTTTAGGTCTACTGAGTGATGTTTTTCGAGATACATCTCGCATTGAAGCATTATCTGGGAAAAGTGCTATTGGTCATGTGCGTTATGCTACAGCTGGATCTAATGGGTTAGAAAATATCCAACCTTTGATGGTGAATTTTCATGACATGCAAATCTCATTAGCGCACAATGGTAATTTGACAAATGCCCTTACATTACGTGAAAATTTGGAAGAAGAAGGGGCCATTTTTCAATCATCTTCTGATTCTGAAATTTTATTGCATTTAATTCGCCGATCTAAAGCAGACAAATTTATTGATAAACTAAAAGAAGCTTTAAACATTGTACATGGTGGATTTGCGTTCTTGCTATTGACGCCACATGGAATGTTTGCTGCGTTGGATCCACACGCGTTTCGACCTTTTGTCATTGGTCAAATGCCGGATGGCCACTACATTGTTACATCTGAAACAGCTGCTATTGAAGTTGTTGGTGCCAAGTTCGTACGCGATGTACAACCTGGCGAACTAATCGCGATCGACGACAATGGTTTAACCATCGATACATATACTGATAAAACCACTTTAAATATTGACTCGATGGAATATATCTATTTTGCTCGCCCTGATTCAATGATTTATGGTGTGAATGTACACAAGGCACGTAAGCGGATGGGGGCAGCTTTAGCAGCAGAACAGCCGGTTCCGGAAGCAGACATTGTTGTTGGCATTCCGAACTCTAGTTTGAGTGCAGCCGCTGGGTTTGCTGAAGCCAGTGGTTTACCAAATGAGATGGGGTTAGTAAAAAATCAATACATTGCGCGTACATTTATTGAACCAACACAAGATAAAAGAGAACGAGCCGTTCGTATGAAATTAAGCGCTGTCCGTGACGTTGTTGTTGGAAAAAATGTCGTTTTGATAGATGACTCAATTGTTCGTGGAACAACCTCTATGTTTATCGTGCGAATGCTGAAAGAAGCTGGTGCTAAATCAGTTCATGTAAGAATTGCGAGTCCTATATTTAAATTTCCGTCATTTTATGGTATTGATATGCAAACAACAGAAGAACTGATGGGCGCAAATCATTCATTGCTTGAAATGACAAAAATGATTGAAGCTGATTCACTTGGATTTTTGTCAGTTGATGCACTGGTTAAGGCAATTGACTTACCATATGATGGAGAAGGAACTGGGCTAACGACCGCTTACTTTGATGGGCATTATCCAAGTCCAATTTATGATTATAAAGCCAGTTTAGACCGATTTGTTCGTTCTGGAGAAGTTGATTTCGTTCCTGAACCAGTAACCACTTATCATCCCCGTCAAGTGGCTTCACTGCGACATCAGGAGCTTTTGTCAGATGGCACTATCCATTTAGATTCACAAACAATTCAGGGGGTGGAAATATGAGTGAGAAAAATGCGTATCAGAAAGCTGGCGTCGATATCAAGGCTGGAGAACGTGCTGTTGATTTAATGAAAGATGCAGTTGCAGATACATATAATGACCAAGTGCTTGACGGTATTGGTGGTTTTGGCGCTGCATTTGCTTTAGGAAAAGGATACACTGATCCGGTTTTGATTTCAGGCGCTGATGGGGTAGGAACAAAACTACTGTTGGCTATCGCTGCGGATAAACATGATACAATTGGACAAGATTTAGTAGCGATGGTGGCTAATGATATCTTAGCTCAGGGCGCAAAGCCAGCTTTCTTACTGGATTATTTAGCTGTGGACAAGATGAGACCAGAAGTTGTTGCTGAAATTGTCACTGGCATTGCCAAAGCCGCCAAAGCATCAAATATGTCTCTAATTGGTGGTGAAAGTGCTGAACTACCAGGATTGTACGCGGAAAAACATTATGACTTAGCAGCTTTTGCTGTTGGTATTGCAGAGCGGCAACAATTATTGTCTGCAAAAAATGTCTCTGAAGGAGATGTTTTGATTGGTTTGCCATCTTCTGGAATTCACTCTAACGGCTATTCGCTAGTACGTCAGGTTTTTGGTGTTCAGTCGGATGACGACTTTAATCAATTATCTCCTGAGACAAAGGCAACCTTACTGACTCCAACAGCTTTATATGCTCAATCTGTTTGGCCGGTTGTTGCAGCCAACCTTGTGCAGTCCATGGCGCATATTACTGGTGGAGGAATCATAGAGAATTTACCTCGAGCATTGCCCGATAATGTTTCTGCTGAAATAAGCTGGGGTTCATGGCCAATTTTGCCTATTTTCCACGAACTACAAGCTAAAGGACATTTATCTTTAGAAGATATGCTATTGACGTTCAATAATGGATTAGGTATGATTCTGATTGTAAAGCCACAACAATTAGCAGATGCAATGACCTTATTAACTCATCAAAATCAAACAGCCTACGTGCTTGGTAAAATAACGCCTGCTCAGAACGATCGAGTTGTCTTTACAGGTAATGAACCATGGTGAGAAAAGTAAAGTTAGCAGTTTTTGCGTCTGGTACGGGGACCAACTTTCAAGCATTAAATGATGCTATTTTACAACGAAATCTGAATGCTGAAATCGTACGTTTGATTGTTGATAAATCAACTGCTGGTGCCCTGAATTTAGCAAAATTATTCGGTATTCCTGCTACAGCAATCAAATATTCTAATTATGAAACGAAGATCGAAGCGGAACAGGTCATTATTAATCAACTTAAAACAGATCAAGTTGATGGTATTTTATTGGCTGGTTATATGCGTATTTTGACGCCAAAGTTAATCGATGCCTATTCAGGGAAGATTATTAACCTCCATCCGGCCATGCTGCCTAAATTCCCGGGACGACACAGCATCCTAGATGCCTTTGAAGCCGGTGTTTCAGAGACCGGTGTAACCGTTCATTTTGTGGATAATGGCATTGATACCGGTGAGATAATTGCTCAAGAAGCTGTCCCAATTTTGGTGAATGATACCATTGATTTACTTGAGACACGTATTCATAATGTTGAACATGTGCTGTATCCCAACACACTTGCAAAGTTAATAGATGAAGGAGTATTTTTAAAATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP017936|926544:935233|927026_928136_+|WP_042252909.1|DBSCAN-SWA MTGVILPPATIGIIGGGQLGQMMALSAKEMGYRVGILDPTKGSPAGQVSDFQIVADYDDVEALNELSRRSEVLTYEFENVDRDALNKQSDAELPQGTELLRITSDRITEKKFIRDDAKVPVTNFIEVNSPEDLRKVTLPAILKTVSGGYDGHGQWSINTVQDIVNLEKDFPDTQLILEQVVNFKQELSIMVSRSQDGQIVTWPIVENVHENHILKTTTAPADISLTLKNKIEAIAENIAESLKLRGVLGIELFVADEEVWVNELAPRPHNSGHYSIEATNVSQFEGHIRSIVGLPIPKIELQSPATMLNLLGDELTQAREDLIHHPEWHFHDYGKLAVKPNRKMGHITVLGTENGRKLKEWGDLHEQRN >NZ_AP017936|926544:935233|934642_935233_+|WP_011679516.1|DBSCAN-SWA MVRKVKLAVFASGTGTNFQALNDAILQRNLNAEIVRLIVDKSTAGALNLAKLFGIPATAIKYSNYETKIEAEQVIINQLKTDQVDGILLAGYMRILTPKLIDAYSGKIINLHPAMLPKFPGRHSILDAFEAGVSETGVTVHFVDNGIDTGEIIAQEAVPILVNDTIDLLETRIHNVEHVLYPNTLAKLIDEGVFLK >NZ_AP017936|926544:935233|926544_927030_+|WP_042252907.1|DBSCAN-SWA MPQVAVVMGSTSDWSSMKKTTEILDILGVTYEKHVISAHRMPQELQSFGTQARNNKLQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTTLPVIGVPMQSRALNGLDSLLSIVQMPAGVPVATVAIGDAGAKNAAILAAQIIALNDNDVLQALNEYRERQTKTSIESEAELI >NZ_AP017936|926544:935233|928119_928869_+|WP_038534119.1|DBSCAN-SWA MSSATEYEDKTVTRGELKYQGKAKQVYFTDNPTILWVHYMDQATALNGKVHENIPEKGQLNSAISHILFEHLTRQGIENHYLSSVSETDELDLALEILPIEVVTRNYASGHFVSKFNATPMQKLTPVVQEFYYKSDELDDPFMNDSQILALGFATLSELTKLRAYAQEVNQALTEIFDEININLVDFKLEYGRDSEGKLILADELSPDNMRLVDQKTGKSLDKDVFRKHAGDVTVGYRDVLSRLENLEK >NZ_AP017936|926544:935233|929136_929805_+|WP_042252914.1|DBSCAN-SWA MKAAVISFPGSNCDFDMLHALQEFGVDAEIVSAKHNNLKEYDAIFLPGGFSYGDYLRTGAIARFSPIMSAVTQAANDGKLIVGICNGFQILTEAGLLPGQLLTNKKPGFICDEIALSIANPNTAYTNTYDSEEIINIPVAHAEGNYYADAETLTKLEEDNLIVFRYVDNPNGSAHDIAGIMNENGNVFGMMPHPERAVDAVTGNEDGKNFFKSILSGILAGA >NZ_AP017936|926544:935233|929809_932026_+|WP_096639015.1|DBSCAN-SWA MTTNELSPEEVRDSKIYIEWGLTEQEYDLIVKELKRLPNFTETGIFSGMWSEHVSYKKSKPILRKFWSSNERVLQGPGEGAGILDIGDNQAVVFKAESHNHPSFVEPYEGAATGVGGILRDIFSMGAQPIAVLDSLRFGELDNAHTKHIVDGVIAGIAGYGNAIGIPTVGGEIGFDGVYAGNPLVNVMAVGLMDQNAMQVGQAKGIGNSIIYVGAKTGRDGINGASFASAEFSSAEKSDRSAVQVGDPFLEKLVMDATLQAIREHSDIIVGIQDMGAAGLLSSSSEMAAKAGMGIHLNLDMVPQRETGMTPYELMLSESQERMVLVVKKGEEQAIIDLFQSADLDAVIIGQVTDDGRYRLNFKNEVVADVPVDFLTHAPEQDLPMIEPARLANFTDEQFEPDMGNVKETILTLLAQPTIASKASLFRHFDSQVRADTAIKPGGDAALIRIRDTQKALAMTTDVNARYLYLNPRVGAKMAVAEAARNIVSTGAKPIGITDGLNFGSPDNPEVYYELDQAVAGINDVAKQLDTPIISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLLEDITKATRTAFQKAGDNIYLVGRTKDSFNGSEIQKMQTGHIAGQLFDFNDEDELAAQQFILDVTDQRLLNSAHDLSEGGLVVGLLESAFAGNLGFDISVDLADKYLFSETPSRFVVSVSPENRTTFESLAGDRVIKLGVVTADDTINITTTTSDIQLSLSETKKIYQESIAWKLNAE >NZ_AP017936|926544:935233|928870_929140_+|WP_004164272.1|DBSCAN-SWA MYLAKIYVTYKPSILDPQGEVIKAALNRMDYSGIEQVSQGKYFEIKLKATDVDAATSEVESFTDALLINQNTETYRFDLSLVDEDEVLS >NZ_AP017936|926544:935233|932004_933615_+|WP_042252917.1|DBSCAN-SWA METKRGVTMMNEQKNETSRLNVRSLNEECGIFGVWGRSDAAQLTYYGLHALQHRGQEGAGIVANNNGHLWQERGLGLLSDVFRDTSRIEALSGKSAIGHVRYATAGSNGLENIQPLMVNFHDMQISLAHNGNLTNALTLRENLEEEGAIFQSSSDSEILLHLIRRSKADKFIDKLKEALNIVHGGFAFLLLTPHGMFAALDPHAFRPFVIGQMPDGHYIVTSETAAIEVVGAKFVRDVQPGELIAIDDNGLTIDTYTDKTTLNIDSMEYIYFARPDSMIYGVNVHKARKRMGAALAAEQPVPEADIVVGIPNSSLSAAAGFAEASGLPNEMGLVKNQYIARTFIEPTQDKRERAVRMKLSAVRDVVVGKNVVLIDDSIVRGTTSMFIVRMLKEAGAKSVHVRIASPIFKFPSFYGIDMQTTEELMGANHSLLEMTKMIEADSLGFLSVDALVKAIDLPYDGEGTGLTTAYFDGHYPSPIYDYKASLDRFVRSGEVDFVPEPVTTYHPRQVASLRHQELLSDGTIHLDSQTIQGVEI >NZ_AP017936|926544:935233|933611_934649_+|WP_011679515.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYQKAGVDIKAGERAVDLMKDAVADTYNDQVLDGIGGFGAAFALGKGYTDPVLISGADGVGTKLLLAIAADKHDTIGQDLVAMVANDILAQGAKPAFLLDYLAVDKMRPEVVAEIVTGIAKAAKASNMSLIGGESAELPGLYAEKHYDLAAFAVGIAERQQLLSAKNVSEGDVLIGLPSSGIHSNGYSLVRQVFGVQSDDDFNQLSPETKATLLTPTALYAQSVWPVVAANLVQSMAHITGGGIIENLPRALPDNVSAEISWGSWPILPIFHELQAKGHLSLEDMLLTFNNGLGMILIVKPQQLADAMTLLTHQNQTAYVLGKITPAQNDRVVFTGNEPW |
9 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1239682 : 1264202
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP017936|1239682:1264202|DBSCAN-SWA TATCAGCTTTGAATATAGCTCGAAGCACTATCATCAATGGAAAAATTGGCATCCCAGCCAACAAGAGACGCGTCGCAACGCTCTAAAAACGGCAATCAAAGCCGTCTACAACACCAATCGTGGGATCTATGGCTACCGACGCATCGCCGTATTTTTACGGTTCATTTTGAACACTGAAGTTGGTGATCGTTTGGTTTGGGGGCTCATGAATGAGATGAGCCTTAAATCTCGCATGGTCAGGAAGTCATATAAGAAGCCGACGACGACCACTGACACACCACAAAAGCCCAATCTCATGAAGAATTTGGATGATTTGAGTGGCGTTCTAACGACTGACATCACGTACATCCAGTTGATGAATAGAAACTGGGTTTACCTGGCGACGGTCTATGACCCAGAAAAACACCGTGTTGTCTCATATGGACTGAGTTCAGAGATGACCAAAGAATTCGCAACATCTGTTGTCGTGAAGGCTCTAAGAGCCAACGGTAAACCAAAGATGATTCACAGCGACATGGGAAGCCAGTACACTTCAAGTCTGTTCGAAGGAACGTTGCAAAACGCTGGGATAGATCATTCTTACTCGCGTAAGGGGCATCCTTACGACAACGCACGTATCGAGAGCTTTCATTCGCTCATCAAGCGTGAGCTGATTTATCACGAAGAATACAGAACCATTGATGATGTCAGGTCATCTGTCGAATGGTATGTGAGCTGGTACAACAACGAACGTATTAATTCACGCACTGAATGGCTTCAAGCCGCCTAGACCAATGTTTGGTTTACTTAATCTCGGTTATCGGCACTAGCCGGCACGACGTCGTTTATAAGCCGTCACTTGTGAATTTCAAAAATTCGCCTTGTGAAGGCTTATTTGTTGCACGATACAACTTGTGAAATCCGGCTGGTTCACAATCTATACCACCCGTTTTCTCTCACCGGCAGGGCTAAGCCCTGTTCCACCTACAAAAACACCCAGAACTCACGCCGTTTTAAGCTGAAATCCGGGTTTTGAAAAATTTTCGGAGTCCGGCACCTCTCGGTGCCGAAAAAATCTGTCCATAATCTTGACATCAGCGCCCAAGCTCATTTACCCACACATCCAAAATTTCCAACGATAGCTTTTAATCGTTCTGAATATGCACGACTTGGTGGTAAGGATTTCTATTCAGTTGATGTGTTGCCACGTAGTTTGGGCAGTGAAGCGGTTCGATTATTGTTTAACGATCAGCGCTCTGTCCTGGAGCAAACTAAGGCAACAAGCGTGATTGTGCCGTACCGTTTACCTGAATTTTGTGATGAGACGTGGTGAATTAAAATAATATTGCACGAAAGGCGCATGTCTCAAAAATGACACTTAGCCATGTAATTAATCATCCAGATCAAGTATCACCTGAACTGATGGTGCGAGTACAACATGCAATAAAAAAAAGACCGTTGACTATCTGCCAAATCAAGTCGTACGGTCATTAGCCAACCAACGCCATTATGTCATTCGTTTCTTACTTTTAGAAGATGTTACAACAGTTGAACAGAATTATTGATTCGATTAGCTATAATTTACAACAAAAAGGTTAGACACTGAAAATTAGCTTAGATATTACGGCAGAGACACAATCTATTGACGTGAATAATCGAGCAGGCATTGAATAAACGACTGAATATATGTGCCGGCAGGGATATCGTGATATTTATTATATTGTTTTATCGTTAGATTAGTATTGAACTTAATGCACAATTTCTAATTGCCGACTACGATTATCCGTGCGAGCGATTAGGTTGCACTTGTTGTGCTAAGTGCGGTTCAGCCGAAATTAGACACCCATAAGGCAAGCGTTTGCCTTAATTATTGAAAAAATTGTTGCACAAATTATTTCTTAAATTGAATCAAAAAACGATAGAATTAGGAAATACCAGCATTTCAGCAGCTATAGCTGTTCGATAAACAATAAATTTGCATAATGTTATCGTTAACATTGTGCAAACGCTTCCATTAATTATCCAAATGTTCTATGCTATAAAATATAAACGGTTACATATATTGGTGTTCAGAACATGTTCCTGATTTCTAAAAAAACAGTTTCATCACGAATTGTTCATATAAATGGTGCATGATTAGAGCAAATCAGTTATGTTTCAAAAAAATTTTGGAGGAAGTAATTATGGTAGATAAGAAAAAAGGGCAGGGTTTGCCAAACCTGCCGCTAAGCACCATTTGGATGCTGAGTTTTGGATTTTTGGGCGTGCAGATGGCATTTTCATTGCAGAGTTCCCAAATGGGACGTATTTTTCAGACCTTGGGTGCTGATCCCACTAAGTTAGGATTTTTCTTCATCCTACCACCATTGGCAGGGTTGTTTGTTCAACCACTAGTTGGTTATTTTTCAGATCGCACTTGGACAAAACGCTTTGGTCGTCGAATGCCTTACCTATTGGTTGGCGCTCTTGTGTCAGTTATTGTGATGTTCTTGTTGCCTAATTCAGGTAGTTTTGGTTTTTCAACTACTGCTGGTTTGTGGTTTGGAGCAATCACAATTTTGTTCATGGATTTGAGTTCTAATGTTGCAATGCAACCCTTCAAGATGGTTGTGGGTGACATGGTTAATGAAGACCAAAAGTCATACGCATACTCAATTCAAAGTTTCTTATCTAATACAGGATCTGTGTTGGCAACCATTTTCCCATTCTTGCTGACAGCGATTGGTGTTGCTAACACAGCGCCTAAAGGTCAAGTGCCAGCATCTGTAATTATTTCATTCTATGTTGGTGCGTTAGTCTTAGTTGTCTTTTCACTGATTGCAGTCTTTAACGTGAAGGAATACGATGATGCCACTTATGAGCTATATCATGGCTATGCTTTGAATACACCAAATGATGGTGAAGGTGGCTTCTTGACTTTGTTAAAGCGCGCGCCAAAAACATTTTGGATGGTTACTTTGACTCAGTTCTTCTGCTGGATGGCATTCCAATATTTGTGGACCTACGGTACTGGTGCTGTGGCAGACAATATTTTCCATGCAACTGATCCAACAACGGCTGGTTACCAAAATGGTGGAAACTGGTTTGGTATCATGTCAGCGGTTTATGCTATTGCAGCCGTTGTGTGGTCGTTAGTATTATCAAAGATTCCAGCAAACAAAAACAAAACAGGTTATGCTTTGTCACTATTTTTGGGGGCAATTGGGTTCACATCAGTGTTCTTTATTCATTCACAGTATTTGTTGATTGGCTCATTTATTTTAATCGGTATTTCATGGGCAGGTATGATGGCATACCCATTCATTATGGTAACCAACGCATTACCCGGTGATCACATGGGGACTTATCTAGGATTGTTTAACGGTTCAATTTGCTTGCCACAAATTGTAGCCTCAGTTGCTAGTTTTGCACTATTCCCAGCACTTGGTTCACATTTCCCATCAATGATCTTAGTATCCGGAATCTTAATGTTAATTGGTGCTGTTAGTGTTGGGTTTATCAATGAAATTCACAGTAATCCAGTAGATGCACAATAATGGCTAACGCTTCGGCGTTAATATGTGCGATCGATCGTCGTAGATATTAGCGCTGAAGCTAAGCATTAGAAAAATTGAAGAGGTAGAAAGTCTTATGAAACGAATTTTTGAAGTTGATCCTTGGACAGTTACATCACATGATTTGAATCCCAAAGATAAACGTCTCCAAGAATCTATGACGAGTTTGGGCAACGAATACATGGGCATGCGTGGCATGTTCGAAGAAGTCTATTCCGGTGACACACATCAAGGAATTTACGTTGGTGGTGTTTGGTTCCCAGATAAAACACGTGTCGGTTGGTGGAAAAATGGTTATCCACTTTACTTTGGAAAAGCTATCAATGCGCTAAACTATGTCAAGGCAGACATTTACGTTGATGGCAATCAAGTTGATTTAGCTAAGAATGATGTGACTGATTTTGAAGTATCATTGGATATGAAAAATGGTGTTTTGAATCGAACATTTACTGTGTTTGGCGTGACGTTTAAAATCACGCGCTTAGTTTCAGCAGCATTGAATGAACTGGCAGATATTCACTATGAGTTGTCATCTGCTGATGGTCAAGCGCACAAAATTCGTTTTGATGCTAGTATTGATGCTGACGTTGTCAATGAAGATTCAAATTATGATGAAAAGTTTTGGCAAGTTTTGGACGCAGGTAATGACACTAATTCATCATTTATCGCTACGCAAACAATTGAAAATCCGTTTGGTGTGCCACAATTTACAGTTGTTGCCCGTCAGAGCTTTGTTGGCGGTGAAAAGCATGGTGTGAACCGCTCTGAAAAAGAAGTGACTGATAACTTTGACATTGAAGTACCAGCTAAAGGTTCAGTTAGTTTTGAAAAGCGCGTGATTGTGACAACTTCGCGTGATTATGATAGCCTAGCTCAAGTGATTAAAGCAGGTGAAACACTAACTGCGGATCTTGCCGCACAAACATACGACGACATATACACAGCACATGCACAAGAATGGGCTAATCGTTGGGAAAAAGCTGATGTTCAAATTGAAGGAGATGATGCGGCGCAGCAAGGTATTCGCTTCAACCTATTCCAGTTATTCTCAACTTACTATGGTAATGATCCACGCTTGAATATCGGACCAAAAGGTTTCACTGGCGAGAAGTACGGTGGTGCCACGTATTGGGACACCGAAGCATTTGCCATTCCTGTTTACCTTGGTGTTGCTGATCCGTCTGTGACCCGTTCATTGCTACAATATCGTTTTGATCAGTTGGATGGTGCATTCCACAATGCCAAAGAACAAGGCTTAAAAGGTGCTTTGTACCCAATGGTGACCTTTGATGGTATTGAGTCACACAACGAGTGGGAAATTACTTTTGAAGAAATTCACCGTAATTCGACAATTGCTTATGCGATTTATAATTATACCAACATCACGGGAGATCACTCATGGCTTGACGGTGATGGCGCACAAGTTTTGTATAATATCGCCCGCTTCTGGGCAGATCGTGTCCACTA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23 | Bacillus_phage(66.67%) | integrase,transposase,holin | attL 1247653:1247669|attR 1269362:1269378 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1441360 : 1494597
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP017936|1441360:1494597|DBSCAN-SWA 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>NZ_AP017936|1441360:1494597|1470928_1471162_+|WP_096639271.1|DBSCAN-SWA MTLTIYYKLERLPYGSIRRYVSTDKDIVQKGGYPVFFEIYGKERSDSYILADTKNDLIQKYGQDIKLVNLSLGGEAK |
52 | Staphylococcus_prophage(16.67%) | protease,transposase,holin,integrase | attL 1493565:1493582|attR 1494711:1494728 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1688178 : 1724114
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_AP017936|1688178:1724114|DBSCAN-SWA ATTATTCACCCACTTTCGTAATTTTGATGTCTGTAGTCTTATTCCAAAAATCATCAGTAACATTGCTAACAACTTCAGATAATCGACTGATTTTATATTGATCACTTTTTGTCAATAATAACAACGTATTGTGATTAAACGTTTTATAGTTTTTTGTTGTGGTTACAACTGAATTTTCTTGAATAAGCGAAGAGAGATTAACAATTTGATTATGCAGGTCAATCAGTTTATTTTCATCAGCAGCAACCGCATTCTGATAGTCCTCAAATTTCTTCTCAACTTCTTTTATTAAATCATCATATTCGCTAAGATAATCCGCGGAATTAATGTTAAATTCTACTAGATTTGGCAAAACTGATATGCCTACATCTAACGTCGCCTCGGTAATTACATTACCTTGATCGTCGGTTGAGGTGATTTTAAAAAAAGCTTGTTGGAATTTACCAGAAGCGGAAAATAACTGTTCGTTAAACGTGTATCTAAATATGCCTTTATTGCGGTCAATAATAATGAAACTATTGGTATCTATAAAGTGAGTACCATCTGGCTTTAACGCTTCAAAAACAAGTTGCCGATTAATCAAACCATACGGCTTTCCGTTACCGCTATCCCACAAAGAGACCGTTACAAACTTAAGCTGACCATCTCCTTGCCTAGCAGTGATGAGCTGCTGTTTTGGCGATACCTTACTAACATCGAAACTTAAATATTGATTAGACATCTAATGCTCCTCCGTTCCTGAGTAAGGCATGTTCAATATTATCCAATCGCCTTCCTAACGTTTTGTACTGTAGTCCGTTAATGTCTTGTCTGGCCAGTTGCACTTCAATTGATGAATCACCTTTATCACTTCCAATAACCATTGTTGAAATCATTTCTCTAAGCTCGTCTAATGTATTCCTTAATTGCAAAATATCATTATCATATTCTTTTTCGCTACTGGAGCTTGGAATATTTGTAATCACTCTTTCAACAATCGTAAAATTATCAATTAACTGTTTCCTTAACTCAGGACCCAATTCATTTGAAATGTTTAAATCAAGCATTATTTACCTCCTTTTCTGTTGTTAATTTACCGTCATCATCTACTTTGACATCGAACACCGTGCCATTAGGTGACAATAATTGTAGCCCACCTGACAGCTTGGTTTGACCTTCATAATTTTTGTTACCCTTTATGACTTCATCGTCTTGATTTGTTGGTGCTGTGTACTTAATACCATTGATTAGTAATGCACCATCATCATCAAATGACAGGTCATATTTGGTACCTTTTGTCGATTCAAAAGACAAGCTAGGTAAAACTAAGTCATCAAAGTCAGTAGGCTTAAAATGAAAACCGTCTGGAGTAATCAAGATTCGCAAACTATCAGTAGTTCCATCTGGCATTATTCCTATACCAAAATTACCAACTCCTGTTTTACCATTTGTAATCGTTGGTCTAACCTGTTGTGACATCTTTACCTCCATATTCGTACCAGATTCCATCTTGTGAGATAACGTTTATTTTTGCATTCGCATCTTTAATCGCCTTTGCTAACGCAGCACTGTTTTGTTTAGCTTCATTTAGCTGTTGCTTGTTACTTCGTTGAAAATCCAATACTGTTTTGGCATTACTATTCAAAGTAACCGATGGCTTCTGATTTAGGTCTAATGGATAGTAGCTATATGACAGCACCATCACATCTGTTGCAAAACCAGTATCAAGTATTTCTAAACGCCTGACTTCTCCTGGTATTGGTACATCGGTATCTAAATAATCTAGAGTAATTGATATTGATGGCTCTTTGACAAATGTAGCTTTAGCAGCATTATCTGCGGCAGTAACATCATGAAATCGCTCATCACTGAAATCGCCACCATCCCACACGCCATACTCACTAATCGAAGTGTCATCTTTAACAATATGCGGTTGAAAATAGACTGAACCATCATCTTTAGTCGTGCTAATAACCGTCAACTGATTAATAATGCTAGTAGAATCATAAGTGATTGCAACATTATCAGAGTTATAACCATACCCTAGTCGATTACCTAGATTAGTGGCAAAACTACTTTTGTCATAGACGACAATTTTTTTATTGTCTGGATATACATAAGCTTCTGGCCAAGTTGAAATTATTTGACTCAACCCATCAAAAGCATTATTGCTACCCAAATCAGTGATTTGCTGTTTAGCAAATGTACCTCTGACCTCGTACGAGTAGCCAAAATTATTTTTGTCAAAATAAAAAGATAGAACATCATTAACCGAATAAGTTAGTGTTCCATCTTTTTTATTATGTTGAAATATTTTTCGACAATCCAGATAGACGTGTGTTGCCGTTATCGTCACTGTATTGTACCTACCAGAATAATTAGGTACGCTTTGTTTAATCACAAACTGTTGCCCTTGATAAGTAATGATGTTTTCAGAAACCAACAGAGCATAGCCAACACTATTATCACTATAGGCTGTAAACGTAATTTGATAGGTACTATTATTTTCCCAGCTCACATTAAATGTTGGTTTGACAATGGATTGAAGCGGTTCGTTTAGGGTGCCATCACGCTTCATTACCGTCACTACCGAATTAGTCAAGATAAATAAACGGAAAACTAAAAGTAGTTGTATGACTAGTAGCACCCGATACCGTAATGTCATTCCAACCTTTTTCTAGTTTGATATACCCAAAGTCGGTATTTTGTGAAACCGGATTACCATTCAAAGTCGTTGCAAGACCATTTAGCACTAATTTGTCATTAGTACTAATTGCTTTATTATATTTGTAACTCGTACCGTTCGTTTTATTAGTAATTTGATAGGAACTACCAGTAAATTGTATCAGCAACATTGAATCATGTCTTTGATAATACGGGTCGATTGCTACATCGCTAGGATTATATATTCTAAAACTATTAGCCGTCTGTTGATAAACAGGCTTTTCATTTAGCTTGAAGTTCATTCCAAAAGAAGTATGATTCATATCTATTGCATCACTACGCACTAGTGAATATTTGTATCCTGTCGGTATTTCAAATTGAATTGAAAACAAAGAATCATCATATCCATCAGCAATGAATTTAATTTCAAACGTAGTTGGTCGCCCGTACATGACTTTTTGCAAATCAATATCAGTTCTAAATCTACATAATTCTCTATCGCCAAACAATTGATAAACTTCATGGCGTAACAATTTCTGATCATAATAATCTCTTGAATGTAATAAAAAATTAGCAGTGAAAACCAACTTGCCAAAAGTAGTTCCTGTAAAGCGACTACCATCTCTAGTTGCATCATCTTGGTAGTTATTATTGAACGTTGGCGTTGAATCACCACCCATATATTCAACATTGGGTAGTCTCGCCGTCAAGTCAAACTCATCTTGCCCTTTCAATTTTATTAAAAATGTTGGTTTGATAGTATCACCTCCTATGCAAGTGATTGATAACCACGTATATTTCCGTCTTGTGCTTGTTGCCTATATAGCTCGTTTTTATCAAGTGCTACGTTTACAGGAACTGGATTCCCTTGACCTTGAACAAGTTGAGTAAGCAATTCTACAGCTTGTTTGAGTTGGTTAATCACATCTGAATCAGAATTTATTGATGTACCCGTAGCGCCATCACGTTGTGCCATTGCAACTGCTGTTTTACCTAGAAGTTCAAAGCCTCTAGAACTCTTCATACCATCCAAAGGTATAATCATTTCTGGTTTATTACCTTCACCTATTTCGGCAATTTGATGTTGAGTAATCAAACCACCATTAGCATATCCATGACCTTGACCAAGGAATGATAAATTATTACCATAGGTGTGTTTAGCATAATTAAGACCTGCTAGAATGTTGTCATAACCATTCATGATATTGTTATGACCATGCAAAGCATAAGCTCTAAATGTACCGGGCTTAACCTGCATCAAACCTGTGGCATTACCATCAGCTAATCCATCATTACCACCAATAGCTTTAGCGTTTCCACTTGATTCAGTTTGAATCTGCTTTAATACCTTAGATACCATTGAACCTGAGGTACTTAACCCTAACTTACTCAAAGCTTTCTTAACATCACCGCTCCAACTTTGTACATCACTATCAGTACCTGTTGAGCTATCGTTAATTGGTGCAATGAACTTCTGAATCCATGCCATCATGCCACCAGTTTGCTTCTTGATTAACTTAGATAGTGGGTTGTTTGTAGCAATTTCTTTGGCTTTAGCTCCTGCACTTCTACCAAAGTCTAAGAATGTAGTAGCACCTGATGCCTTACGTCCGTTATAGGTGTGGTATTTACCATCACCGCTCCAGTTATATTCTTCACCACTTATCTTGCCACCTTGAACACCTGTAACCATGGAAACGTGATTACCGAACTCTGAACCTGCACCATAAACAGCAACATCTCCAGCTTTAGGTTTATTTGAATGAGGTACCTTAGCATTAACCCAATCAGCACCATTACCCAAGTGACTGAATAGACTTGCTGATACTCCCAAGTTCTTTAATCGACTAGCTACGAAACTGACACATTCACGATAGAAGTAACCCCAAGGGTCAACTCCAGAATCTTTGGACTTGTTCTTAAAGGCATAATCATCACCCTTAGAACCTGTACCACTTGATGAGCTTTCAGACGCCATGCTCCATAATGTAGACCACCAGTCTTTAGCTGTAGATGTTACCTTTTTATAAGCACCACCTGCTACGCCATCCATGACTGATGAAACACCACCACTTTTAAGGTTTAATACTTTCCCTAATGTTCCTGATGGGTCTGCTACAGCTCCTGTAATGTAACTAAACATCTTAGTGAACTTGTCTACACCGTTTTTTAAGCCACTCCATGCACTACCAGCAATGTTTGAAACAGCATTACCAGCACCTGATAGTAGCTTGCTCCAGAATCCTGTACCACCTGCAAAGTGCTTAACACCTTGTAGACCCATAAACATGGCTGTCTCACGTGCATTTAGAACTTCTGTTCCAGGTAATAATAGCCTTTCAGTATTTCTACCTTGA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53 | Lactobacillus_phage(48.15%) | portal,integrase,tail,plate,head,terminase,protease,transposase,capsid | attL 1690460:1690475|attR 1725369:1725384 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1913566 : 1938646
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_AP017936|1913566:1938646|DBSCAN-SWA 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25 | Lactobacillus_phage(56.25%) | portal,tail,plate,holin,head,terminase,protease,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1942700 : 1954522
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP017936|1942700:1954522|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_AP017936|1942700:1954522|1942700_1943123_-|WP_096639494.1|DBSCAN-SWA MADRIDRYLSDYYSGVIDMQIKLRKIELQTPEIVDENIGGGTAQNKENRILDNQLIIEESDYAFQSFIRDKWCMSNFLKILTEDERAMLSLRYDRRRKRSWSQVARILSKSESQCHRDLQNIKQIYRKSVFAYQPVDNSE >NZ_AP017936|1942700:1954522|1948529_1948712_-|WP_025268426.1|DBSCAN-SWA MVQDALAHFQPDVESSAWRKKQSRIEYLCKERDAALDEIQGCQDYVEELEQELTQLESGD >NZ_AP017936|1942700:1954522|1951855_1952287_+|WP_096639510.1|DBSCAN-SWA MNKTFCYDHVYPDIVNALESKAKNSGTVLVLADDLLSHVPDTALIKNKAIIMNMNFQVNVDYCYRLAHELSHILYGDHDAQAVYQFSEYGKRGEELLAHRNAIKILMKIKEPSNPINFMNYYRIPSWLEKDVIKTFREVTIVD >NZ_AP017936|1942700:1954522|1950355_1950598_-|WP_096639506.1|DBSCAN-SWA MVTQLLAKLDEIIKFFHKSQLPEIMDKTELAQFLGVGINNVNKYIYSDGFPYIEQPNMKDGYPKKAVQGWIDSHTKFYGR >NZ_AP017936|1942700:1954522|1948125_1948527_-|WP_096639503.1|DBSCAN-SWA MANEITIIDDFGQKFGLSIMTDDVQLKQLDNTTFEDLVYLIKYLKNGIKKTDAELKSRLDNGTQFKHISYGESNKQSLAQDDEALKKAFVKKYGWQAVEVKTPTKLKKEFGETIQEDLDKVVVHETQKRVKYE 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24 | Leuconostoc_phage(57.14%) | integrase | attL 1953327:1953343|attR 1963754:1963770 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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