Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041924 | Wolbachia pipientis strain wAlbB-HN2016 chromosome, complete genome | 6 crisprs | RT,DEDDh,cas3 | 0 | 1 | 15 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041924_1 | 158799-159047 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041924_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP041924_1
>1.1|158850|52|NZ_CP041924|PILER-CR ACCACATTCTCATGGCCTCCCTGAACAGCTAAATATAAAGGAGTAGCACCGA >1.2|158953|48|NZ_CP041924|PILER-CR CCTCTTTACAATTTATGGAAGCAGCATAATGTAAAGGAGTAAAACCAT |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041924_1
The CRISPR arrays of NZ_CP041924_1 >merge|NZ_CP041924|1|158799-159047|PILER-CR AATTATCTGTTATATTAATATTTGCTCCGTTTTTAAGCAATAATTTTACCACATTCTCATGGCCTCCCTGAACAGCTAAATATAAAGGAGTAGCACCGAAATGATTTTTTACATCAATATCTGCTCCGTTTTTAAGCAATAATTCCACCTCCTCTTTACAATTTATGGAAGCAGCATAATGTAAAGGAGTAAAACCATAATTATCCACTGCATTAACATTTGCTCCGTTTTTAAGCAATAATTTCACTT >NZ_CP041924|1|1|158799-159047|PILER-CR AATTATCTGTTATATTAATATTTGCTCCGTTTTTAAGCAATAATTTTACCA CATTCTCATGGCCTCCCTGAACAGCTAAATATAAAGGAGTAGCACCGAAATG ATTTTTTACATCAATATCTGCTCCGTTTTTAAGCAATAATTCCACCTCCTC TTTACAATTTATGGAAGCAGCATAATGTAAAGGAGTAAAACCATAATT ATCCACTGCATTAACATTTGCTCCGTTTTTAAGCAATAATTTCACTT
>NZ_CP041924.1|WP_096616077.1|157534_158623_+|IS481-family-transposase MSTIQTKILKPKLGLLELAKQLGNVSQACKVMGYSRDTFYRFKELYENGGEEALHEISKKKPLMANRVSEDMERAVVNIATEFPAYGQQRAANELRKRGIIISEGGVRSVWLRNDLETFKKRLRALEAKVMQDGIILTEEQLAALEKVKEQREAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGNIKGIGRIYQQTFIDTYSRVAFAKLYTDKTAITAADLLNDRVIPFFDVQSVPLLRILTDRGTEYCGKPENHAYQLYLGIENIDHSRTKANSPQTNGICERFHKTMQDECYNIIFRKKIYNSLEDLQIDVDHWLRSYNETRPHSGKYCYGKTPTQTFLNSKHIAFQKNISSMKQETDISFNYLNSSVS >NZ_CP041924.1|WP_129827239.1|156035_157355_+|IS66-family-transposase MIEVLQEKIVVLESENANLKAEIENLRKEVIELQDKLGLNSKNSSLPPSQDVYRKKTKKKSNRNPGGQPGHEAHKRELMEADEIVKCAIDSICVCGGQVILEEDTIHQKVELPEIKPIVTEYRLQKGYSASLPEGVGWNLLRSNAEAIISSFTGFFINSKREVQQILSSIFNLNISLGLISKTEGKVSEKCISEYEKIREELKESKYLHIDETSHRNQGKKGWGWVVTNKTATLMKLVGSRGKKVLKGLLPEYEGIVVSDRYAAYNYFSRENRQICWAHLARDFERFFFSKNVEVSQIGAALKSLSNRVFVIDRARKQNLIDNLRFCRLMRKIRKRVKYFLQKITRVAKGTQASRMAANILRSEDMMWKFVQSPDLIETTNNLAERQGRRYVIYRKNSFFTWSKRGEKFVERMLSIFLTSRLNNQNPVQKLQNLVAIPS >NZ_CP041924.1|WP_006013182.1|155522_155750_+|hypothetical-protein MANLAFSKETLQHLAELSELTKQPAQALAEKLLKEAIDSEMEDFLLSVVADQYDIESAETVDYKDVKWRSSGLQD >NZ_CP041924.1|WP_006013179.1|155083_155386_-|hypothetical-protein MKNIKEKGLSSAKVKYSVEPTVSENAEVNTFEECFGACYNKYQHDEKLMGSCIRGCQYRFGHNWDLDAPESKESEPIYTSEVLKNIGDNFHALADSVSIL >NZ_CP041924.1|WP_129827238.1|154792_155014_-|hypothetical-protein MSIHEFADAREKLHRLSIVLQDIIRNREGMLATGSYFYDNNYSSSSKIKKALQLDEHQLYSFIDVDDSEKLRS >NZ_CP041924.1|WP_129827232.1|153652_154525_+|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIQTVFGYLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_006014663.1|151723_152920_-|MFS-transporter MKSRAWFIWLISNLIVIFSNMQIIYTFISVDLKKELGITIAQVALVNSAYTWTFAISQFFSGAMFNVFSSKKIYFLSLSIMIFGFFILISSDSFVHLILSQFLIAIGASFGFVGAAHISSTYFPITQFGLMFSLVQTISSLSALMIQMLFSSFLAEGMDWKNLIVYVILFGVSIFVLMFFYPKGLSKKSLEKCTIKSSIKTVICSILTVLKLRDIWITSVVGAITFGTFLALNMLWAPRLLSNLELNTMELGVATAILWLGLAVGAPIADLISNLFKNRRHVISAFAILQGISVIILLYGNLTVHIIYFCMLMFGFFAGGHMLNFTVGSEIVEQKYISTSSSIINGFMFVMSGILVSILALFSDHQMALFTIFAMLTFASIFNYATKETYYKNKVAES >NZ_CP041924.1|WP_006014658.1|151388_151685_-|integration-host-factor-subunit-alpha MTTKDTTVTKATIAECINQKIGLSKEDSIAIIDDILDEIKTSLAKDGIVKISSFGTFLVKNKKERPGNIPRTLERVVIQARKSISFRPSKMMKKLINN >NZ_CP041924.1|WP_006014656.1|151062_151389_-|MerR-family-transcriptional-regulator MNKEKLFYTIGEVAEGLHLEQHVLRFWESQFHQIKPIKRKGRRLYDHKCIEAIKKIKYMLYDKGYTIKGVQKEFGNDVRIDHYSRNLLKELTDLRDYLTDKINEESNK >NZ_CP041924.1|WP_006014654.1|150419_151010_-|M23-family-metallopeptidase MCRIALFFILSAILISCGLQKPAPVLLKGEEFYGKRDLEYTREYHLIKENVDSSLQKESRKAFVDKVYNNDAQSMCKFVIPVKGAVISSDKICQDGIKITAQSGTKVIASAPGKVIYVGKGLRWYGNLIIVEHKDNYMTMYSYLKNIQVEIGDKVKQGQVIGSAGKSSTQDKDPQMCFTIRHNGQAVDPLVHINCD >NZ_CP041924.1|WP_006014667.1|159325_160330_-|PRANC-domain-containing-protein MNEREQRELDELLMNSSKGENIQQITELIEAGANINAVTTGGKETPLHIAVRYGHKEVAELMLNEGANVNAIERRKWTPLHVAVRCSSHKELVELLLEKGANVNAVDNIDMTPLHFAVKYVQEELVKLLLEKGASVNAVEKKGRTPLSIVATGCYQGYCDKPMLVRTIIVYAVLHSGITMKPECIVNNSELSEFWDLCKNEVSGRLSNSTISLYQFLRENDKNKLAGYLFDQNYDVKRYLEEKQYEKDFPIYANIITGQLHKAMKRKDLLYRSDIVMNHSVDLKDFPQEVKSKITNCLTNEELRNVIRAPFSIPSRNLDNPSAEQLQAAAQAHN >NZ_CP041924.1|WP_145510623.1|161133_162006_-|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIQTVFGYLKNRLDLEHLRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_006013222.1|163022_163379_-|hypothetical-protein MSDYFKQNLEAQVGMVRNLAKLLKKLNRVDKICSYIIADKVHSYITKPSFCLFVPTLIAAIFTSGTLGTAFTVAAAVTGMCMIIGIVTSICLSVYAYNSCNSKINDPKVEGFQGELQL >NZ_CP041924.1|WP_129827241.1|163510_164782_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MNKTKSFDIPKQLIWRAYKQVSKNRGAAGVDGVSITKFEENLKDNLYKLWNRMSSGSYFPEPVKAVAIPKDMGGGQRILCVPSVFDRIGQTAAAMYLEPLVEPKFHEDSYGYRPNKSALDAVDTVRKRCWRYDWTIDLDISGFFDNLDHELVLRAIKKHTDCKWVILYVERWMEAPIQQADGRRVARDKGVPQGGSVSPIISNIFMHHVIDIWMKKNYPTVPFERYVDDAIVHCRTEKQTGFMKVMIEERLAEYRLKLHPKKTQIVYCKDDNRRDEFPKQSFDFLGYTFRPRLARNKIGKHFVSFLPAISNKAKKKITTTIRSWKMLRNTHITLEEISGKVNPIVRGWYQYYGKFYRTEVYKSLKNVERHLEKWVKRKYKRLRSHGRLARQFLGKVRDRSPNIFYHWTLGLGSKRLNNGSCIS >NZ_CP041924.1|WP_129827232.1|165368_166241_+|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIQTVFGYLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_006015237.1|166522_167569_-|hypothetical-protein MLGTTQESQNELGKFSQEQWDQFVKDSIKKDLEAVKEQSKKNKKENIETLEKHFHDRTIQPISEFKKVGEKEAGYSSGFQAEHEYSDNEGDKAHFMIKSVLNHTLTKEEEQSKLVQFKKSFYEGSRKATKLHNPYLPDSIINNRIDPLWQQVESNICYDDLNIADFIREYVAGDLYKLFLYDRAPIVELVTNNNLPEKRFVKSDTQKGKDYKPGEYDLERDGKEREGYVKGKHIFKDQFKERIEQEKSQDKLHLRSKFLDKFTTLMDLKEKGQDAKGFEKILAAQILLGEADIAQPENFGVIEKEYENAEGKKVKEKLWAKIDHGRSFYLSCSSTKGYLQNFSFFCSN >NZ_CP041924.1|WP_006015235.1|167821_168439_+|lipoyl(octanoyl)-transferase-LipB MTEWLISNQLVDYNHAVEFMEAKIQQIYNNLSDELVWLLQHPPLYTAGIGATDDDIIEKLFPIYKTGRGGKYTYHGPGQRIIYLMLNLKKRNKCDIKLYIRDLSNWIINVLKHFNILGEFKEDRIGIWVNNNGVEEKIAAFGIRLRKWVTYHGIALNVSPNLSHYEGIIPCGLKDYGVTSMEKLGVKVSLCELDDILKQEFHKIF >NZ_CP041924.1|WP_006015234.1|168438_169407_+|LD-carboxypeptidase MYSFILYFLCLLLTNPAHTINQVDIIAPSSKGKESDLPTIREYVKTLGFNPHISEKIYSNDNPFYSNSDEFRANDLVNALTDDSKIIWCIRGGEGASRLIPYLEKLPNDKKERIAQNKKILIGYSDITALHIYLQIKYDWQTLHGTMLEMIVNNSVAETSVEKLKELILKQRNSIRFDNLKMIDNGIRLKNGKLESKIIGGNMTLVENSIGTAWQINAKNKILFLEDIRVYPYSIERSLDHLKQAHIFDGVDAVIFGDFVNCYNDNLVEIVKERFAKSVNFPVFTIKGVGHGHTNDPLPFNTHATISVQDEKEFMDVQQLYK >NZ_CP041924.1|WP_096641427.1|169589_170516_-|hypothetical-protein MTSKYELLKKVLSTIEVKEGLNKDNIIEEIQEELKEQDQDLYQEWEKGEFDVNHGFYISSYKVTLLMVAALNGHANIVEVLLEKGAHVNEKDWRDTTPLHLAALNGHANILEVLLEKGAHVNEKGWRDTTPLHLAAFYGHASVVEVLLEKGANVNAVDSEGFTPLHLAALNGHANIVEVLLEKGANVNAVDNEGWTPLDRAEDYAKSKNAVEVLLKAGGGSFVKARNKAKIAGGVTTLLGTAIAVALFTTGIIAAQLIPIVIAVVAVTAAALVVGCATYEWSKPSTKVDGAEKPSAVLTTNEQRGAAI >NZ_CP041924.1|WP_006015230.1|170716_174037_+|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MFIHLRVHSVYSLLESSVKIEELIGLCLQNKMPAVAVTDSGNLFGSLEFAEYAASRGIQLIIGCNIIVRHLEQNLSILLLAKNEQGYTNLVTLVSESFKKRKNNSDIPYVDFDELLSFNTGLIALTGGCLAQLLLEQDKETVEKLLSAFDGHLYVELQRHGLNKELELEEALIDFAYQRNIPLVATNDVFFSNRSDYEAYDILTCISEGSYALENNRKKLITEHYFKSVEEMEELFSDIPEAIYNTLVIAKRCSYMPRSRQPILPKFPCRENKTENEELREQAVAGLEFRIANETDINLKQYYDRLNYELSVITSMNYAGYFLIVSDFIRWSKANGIPVGPGRGSGAGSIVAWSLQITDLDPIKFGLIFERFLNPDRISMPDFDIDFCQEKRDLVIDYVQKKYGYVAQIITFGKLQARAVLRDVGRVLQMPYSQVDKISKMVPFNPVNPVTLSQAIEFDHNLQKERDSDEVIAKLLDISLKLEGIYRHVSTHAAGIVICDQKLENFVPVYYDPNSALPITQYSMKYVEKAGLIKFDFLGLGTLTLIDHVCRLINRDEKKFDISSVSLIDQRTYEMLSRGDSIGVFQLESSGMREALIKLKPDCIEDIIALISLYRPGPMDNIPTYVARKHGLEKPDYIHPLLEKVLKETFGVIIYQEQVMEIARILSGYSLAEADLLRRAMGKKIKEEMDKQRELFVQGATKNGVDYDRASYIFDLVAKFAGYGFNKSHAAAYAIISYQTAYLKANYPLEFFTALMNLNIDDRDKLNLFYHAAKFSGVAVLSPDISKSKAEFSIEGEHIRYGIAALRNVGFAIAEGIVNARSSSYKDIWEFIQNLGHIINKRALESLIKSGTFDSVHKNRKQLYESIDTLIYFANKNRQSNQAALFGNLDILKPKLENVEDFNEEEKLEHELFSLGFYLTNHPLEKFRTLLKKLNIGFIGESKTIKTAGVILNVRMRTSERGRFVILTLSDPHNVSEIAFYNNEIIEEKRNLFSPGAFVIIDLEISENTTRLSGKDISEFTEKVTSLMKGLVLTAVCADSQKVAEELNSVLKNGGKTKIMLKFLLEKHKVSILLPGAYSITPQAIYEISHLSWIEGVEINTNNLLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP041924_2 | 379514-379760 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041924_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP041924_2
>2.1|379563|50|NZ_CP041924|PILER-CR ATGGTTTTACTCCTTTACATTATGCTGCTTCCATAAATTGTAAAGAGGAG >2.2|379662|50|NZ_CP041924|PILER-CR TCGGTGCTACTCCTTTATATTTAGCTGTTCAGGGAGGCCATGAGAATGTG |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041924_2
The CRISPR arrays of NZ_CP041924_2 >merge|NZ_CP041924|2|379514-379760|PILER-CR GTGAAATTATTGCTTAAAAACGGAGCAAATGTTAATGCAGTGGATAATTATGGTTTTACTCCTTTACATTATGCTGCTTCCATAAATTGTAAAGAGGAGGTGGAATTATTGCTTAAAAACGGAGCAGATATTGATGTAAAAAATCATTTCGGTGCTACTCCTTTATATTTAGCTGTTCAGGGAGGCCATGAGAATGTGGTAAAATTATTGCTTAAAAACGGAGCAAATATTAATATAACAGATAATT >NZ_CP041924|2|2|379514-379760|PILER-CR GTGAAATTATTGCTTAAAAACGGAGCAAATGTTAATGCAGTGGATAATT ATGGTTTTACTCCTTTACATTATGCTGCTTCCATAAATTGTAAAGAGGAG GTGGAATTATTGCTTAAAAACGGAGCAGATATTGATGTAAAAAATCATT TCGGTGCTACTCCTTTATATTTAGCTGTTCAGGGAGGCCATGAGAATGTG GTAAAATTATTGCTTAAAAACGGAGCAAATATTAATATAACAGATAATT
>NZ_CP041924.1|WP_006014667.1|378228_379233_+|PRANC-domain-containing-protein MNEREQRELDELLMNSSKGENIQQITELIEAGANINAVTTGGKETPLHIAVRYGHKEVAELMLNEGANVNAIERRKWTPLHVAVRCSSHKELVELLLEKGANVNAVDNIDMTPLHFAVKYVQEELVKLLLEKGASVNAVEKKGRTPLSIVATGCYQGYCDKPMLVRTIIVYAVLHSGITMKPECIVNNSELSEFWDLCKNEVSGRLSNSTISLYQFLRENDKNKLAGYLFDQNYDVKRYLEEKQYEKDFPIYANIITGQLHKAMKRKDLLYRSDIVMNHSVDLKDFPQEVKSKITNCLTNEELRNVIRAPFSIPSRNLDNPSAEQLQAAAQAHN >NZ_CP041924.1|WP_096676677.1|376816_377689_+|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIQTGFGYLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_129827231.1|376410_376710_+|transposase MASRREYTTEFKLEAIKLVKETGQSSAKIARDLGINGDSLSRWVKKYNDKMSGTDAFPGKGKLAPYDKERFDLKKELARVTRERDILKKALGYFANQKE >NZ_CP041924.1|WP_006014682.1|374247_375675_+|isocitrate-dehydrogenase MSTSVTVAYGDGIGPEIMEAVLSILREAKAEISIDIIEIGERVYSKEWSHGISPSGWESIERTKILLKSPTTTPQGKGHKSLNVALRKNLGLYANIRPCISYHPVIENKFDKFDVVVIRENEEDVYTGIEHRLTGDSYQCTKIITRSGSEKICRYAFEYAKKHNRKKVTCLTKDNIMKMTDGAFHAAFDRIAKEYPNIKIEHYIVDIGMAKVATEPEDFDVIVTENLYGDILSDIVAQTSGSVGLAGSSNIGNEYAMFEAVHGSAPDIAGKNMANPSGLLNAAVHMLVYIGQVSTAKLIYDAWLKTLEDGIHTADLYKKKRSKQKVGTKEFAKAVIDNLGKKPTTLSELIISSDSDSKINKVQDNYEQDYKAKKLVGSDITLAWDKSNNFDQIVGLFESSDPKIIAIYSKGLAIWPGNSEFSSDQITCRFIANNEKKTITNSDINNLLIKLEEHNFDVVRMDKLYLYDGKESFFS >NZ_CP041924.1|WP_039950729.1|373642_374113_-|transporter MDTKISYAGILRRVLACVVDGVLWMIIAFVSLLFDLDNVDKNMTILMATLLITYIIFNILTITKYGCTPGRLLCSVRIKDANTFKNVTLMQSTIRYIFREGIWVIYSFLSYLLPGYVSGCLFIILTLVLMFAIFDQRKQTFYDKIAKTVVIDYKPS >NZ_CP041924.1|WP_006014685.1|372140_373412_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MKVLVIGSGGREHALLWALKKSPILTKLYVTLGRPAMENFGVLVNINIQDSVDVTQFCKKENIELVIIGPEQPIINGLADDLTAEGINVFAPSQAAAKLEASKSFTKELCKQYGIPTAKYERFIDERLAKNFVRSNKIKLPLVIKANGIAAGKGVIICHTENEAFSAIDSMLVEKNLGESGEEIIIEEFLIGEEVSFFALVDGLKVVILGCAKDYKRVGENNEGQNTGGMGSYSSPSIISKDMEQKIIQKIIYPTIQALTNMGTSYKGVLFAGLMICKDSPKLLEYNVRFGDPEIQSILPRLDPNCDLLKLMLSVAEGKLNTKMVEFNHKTTVCVVVASKGYPGDYQKGEVIKGLDKIENIPGVLVFHAGTKLDENGNWISDGGRVLNIVGEGNTVEEAKSKVYSALNFLGWPGGFFRYDIGS >NZ_CP041924.1|WP_039950731.1|370826_372107_+|serine--tRNA-ligase MHDIEHIRKNPKGFEKAIKSRGVKEFTTEEILEIDHKKRSLTTKLQALNKRRNEVTEEIKRLKMNKSPCEEQVKLSKSITSEIETISLKEQTEKNKLVDILSNLPNISAQNVPTGEDESSNVEIRKYGKRRKFDFTPKFHYELGERLGLMDFEQAAKISGSRFTILKGQLAKLGRALINFMLETHVNEFAYTEVYHPALVKNEAMYNVGQLPKFSDDSYLTTDKLRLIPTSEVVLTNLVADKIIEEKELPIHFTAYSECFRKEAGSAGRDTRGMIRQHQFGKVELVSITTEDQSKDELERMTSVAEEILKKLELPYRVMLLCSGDMGFAAQKTYDIEVWLPEQNKYREISSCSNCGTFQARRMNTKYFLENDRKTKKYVHTLNGSALAIGRTIVAIMENYQNSDGSVTIPNVLQRYMSNDTVISKQ >NZ_CP041924.1|WP_006014688.1|368447_369398_-|tRNA-dihydrouridine-synthase-DusB MSLQVGNLTIDYPVILAPMSGVTDYPFRSIVKKLGASLLVSEMIASRAMIMQTRQSMQKAKVDELTAVQLAGCEPDVMAEAAKLNEGMGAKIIDINFGCPVKKVVNGYAGSALMRDEKKAAEIIEAVVKAVSVPVTVKMRTGWNDENRNAPRLAKIAEDLGAKMITVHGRTRAQLYNGQADWKFVRNVKEQVKIPVIVNGDIKSLDDVQSALKESGADGVMIGRGAYGKPWLINQAINFLSGNKVSEPTASERLSIILKHYDSILEYYGSDIGIKMARKHIGWYSSGLQNSSEFRVRVNNIIDSTEVKENIIDFFS >NZ_CP041924.1|WP_006014690.1|359893_368413_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta/beta' MVDSSYMCASSAFVPRVSYSRSIDLKDSLLDLVKVQKGSYNSFTPNNESNERLEAIFHTIFPISDPLHRATIEFLNCRVDDLKYSESECIKRGITFSAQVIASIRLVIMQDGVSLEKYQEIKEYDDHSKLATVIKSAEEQEVRFCELPMMTDKGTFIINGVEKVIVSQMHRSPGVFFDSDKGKTYNSGKLIYSARVIPYRGSWLDIEFDVKDHLYFRIDRKRKLPISVLLKALGLSNNDILNKFYEKIEYIKHKSGWKVPFFPDKFKGVRLPFDLKNVEGNVLLKANVRITSKLAKNLYDNGLKEYLIPYDSICGLFLAEDLIDSASSTKILSAGESIKLEDIKKLELLSIDKISVLNIDNVSVGPYILNTLFLDENMSYENALYEIYKVLRPGEVPVLKIVEEFFRNLFFSPEYYDLSNIGRLKLNSCLGLNYEENLTTLTHEDIIEIIRKIVLLRDGQGSVDDIDHLANRRVRSVGEFIENQFRTGLLKLGRAVVDSMSTSSLDKVSPSDFINPKVLTNVLRDFFNSSQLSQFMDQTNPLSEITHKRRLSALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRICPIETPEGQNIGLINSLAIYARINKYGFIESPYRKVVNKVVTDQIEYLSAIDEGLYYIADTSAKLDENNCFVDDMLYCRYAGTFVMVNSNQVSYIDLSPKQVISVAASLIPFLENDDANRALMGSNMQRQAVPLLKPTAPLVATGMESFVASGSGAVVLAKRGGIVDSSDSNSIVIRAFDKGGINYLDVDIYHLRKFQRSNHNTCINQKPLVHVGDCVKEGDVIADGPAINNGELALGQNLLVAFMSWQGYNFEDSIIISSEVVKKDLFTSIHIEEFECVVHDTPLGSEKITRAIPGVNEENLYHLDDSGIVKVGTRVGPGYILVGKVTPRHSLSLPPETKLLMTIFGEKSFDCVDSSLYTSPDIEGIVIDVQVFTRRGEEENERAFLIKQKEANDFEKERDHIINVINQYFYDELRKILINSGSQDRESINFIEREGWWDIGLKNQSISKQVESLKKDFDEKVSHAITNFKRKVEKLHEGYDLPQGVSMSVKVFIAVKHSLQPGDKMAGRHGNKGVISRVVPVEDMPYLEDGTPIDIILNPLGVPSRMNVGQILETHVGWACKKLGEKVGNILDEINKIKRAFCEAIRSLSDDDFEKFAALYLDNKKFEDINDDEITASILDTPNKDELNNELTTLVENYFNSCKDAHSSLRHFLIEVYSCGSNLSICNNIRDINDNHLIEFAYKLRDGIPVTAPVFEGPKDEQIVKLFELAGLDNSGQVVLYDGCSGEKFDRKVTVGYMYMLKLHHLVDGKIHARSVGPYSLVTQQPLGGKSHFGGQRFGEMECWALQAYGAAYTLQEMLTVKSDDINGRVKIYESVIKGDSNFECGIPESFNVMIKELRSLCFNVDLKQNDIVIEDISHTNIAQSFNEVSISIASPESIKRMSYGEITDVSTANYRTFKVEKGGLFCPKIFGPVNDDECLCGKYKKRRHRGRICEKCGVEVTSSKVRRERMGHIELASPVAHIWFLKSLPSRIGALLDMSLRDIESILYSDNYVVIDPLVSSFEKGEIISEKAYNEAKDSYGVDSFIAMQGVEAIRELLIRLDLHEIRKNLRQELESVASEMRRKKIIKRLRIVENFIKSGNRPEWMILTAIPILPPDLRPLVSLESGRPAVSDLNHHYRTIINRNNRLRKLLSLNPPEIMIRNEKRMLQEAVDSLFDNSRRNALVNKAGAAGYKKSISDMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPTLKLNQCGLPKRMALELFKPFVYSRLKIYGMAPTIKFASKLIRAEKPEVWDMLEEVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPVLIEGKAIQLHPLVCTAFNADFDGDQMAVHVPISLEAQLEARVLMMSINNVLSPSNGRPIIVPSKDIVLGIYYLTLQQLKEDDLPLFCAFCEVEHSLNNGTLHIHSHIKYKMEYINSDGNIQYKTIFTTPGRLILWQIFPKHKNLSFDLINQVLTVKEITSIVDLVYRSCGQSATVVFSDKLMTLGFEYATFSGTSFSRCDMVIPETKATHVDYTRGEIKKFSAQYQDGLITKSERYNKVIDEWSKCTDIIANDMLKAISLYDENSKYNSIYMMVSSGARGSTSQMKQLAGMRGLMTKPSGEIIETPIISNFREGLNVFEYFNSTHGARKGLADTALKTANSGYLTRRLVDVSQNCIVTKHDCKTKNGLIVRAIVEGSTIVASLESVVLGRTAANDIYNPVTKELLLKAGELIDEDKVKQINIAGLDAIKIRSPLTCEISPGVCSLCYGRDLATGKIVSIGEAVGVIAAQSVGEPGTQLTMRTFHIGGVMTRGIESSNIIASINARIKLNNSNIIIDKNGNKIVISRSCEVVLIDSLGSEKLKHSVPYGAKLYVNEGELVKIGDKVAEWDPYTLPIITEKSGTISYQDLKDGISITEVMDESTGISNRVVKDWKLHSGVANLRPRIALLDDNEKVITLSSGVEACYFIPVGAVLNVQDGQKVHAGDVITRTPRESVRTRDITGGLPKVIELFEARRPKEHAIVSEIDGYVTFSEKDRRGKRSIVIKPVDEQASPVEYLVSRSKHVIVNEGDFVRKGDLLMDGDPDLHDILRVLGLEALAHYMISEIQQVYRLQGVRIDNKHLEVILKQMLQKVEITDPGDTMYLIGENIDRLEIDRENDAMNNSGKRPTHYLPILQGITRASLETNSFISAASFQETTKVLTEAAFCGKSDPLNGLKENVIVGRLIPAGTGLVMNKVKALSLCENIDKYEKYFDIETYDEKLLSDNSYQLHSDEEESVVASHYDQSS >NZ_CP041924.1|WP_006014691.1|359435_359837_+|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MNNVTSDLVDKILSLNLLEASELVKVLEEKIGLPGGSFLGGAVGAGVPISDNATAPVAQEKAEYKVVIKEIDASKKIGVIKAIREVNSTLNLKEAKELVESLPKDLTANVSKDEAEKIKQKLIEAGATKVELE >NZ_CP041924.1|WP_096676677.1|380754_381627_-|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIQTGFGYLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_096560603.1|382213_383485_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MNKTKSFDIPKQLIWRAYKQVSKNRGAAGVDGVSITKFEENLKDNLYKLWNRMSSGSYFPEPVKAVAIPKDMGGGQRILCVPSVFDRIGQTAAAMYLEPLVEPKFHEDSYGYRPNKSALDAVDTARKRCWRYDWTIDLDISGFFDNLDHELVLRAIKKHTDCKWVILYVERWMEAPIQQADGRRVARDKGVPQGGSVSPIISNIFMHHVIDIWMKKNYPTVPFERYVDDAIVHCRTEKQTGFMKVMIEERLAEYRLKLHPKKTQIVYCKDDNRRDEFPKQSFDFLGYTFRPRLARNKIGKHFVSFLPAISNKAKKKITTTIRSWKMLRNTHITLEEISGKVNPIVRGWYQYYGKFYRTEVYKSLKNVERHLEKWVKRKYKRLRSHGRLARQFLGKVRDRSPNIFYHWTLGLGSKRLNNGSCIS >NZ_CP041924.1|WP_006013634.1|383791_385132_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MACEEDIHQLVESGFDINSKDVSGVTLLHKFTKEGDLVGVKSLLEHEADFNVVDNENRNPLHYAIMHGHKKIAKLLVNQLTINSRDKNGFTPLHLATLQDDTELMDFLIAKGAKINEKDAEEGYTPLHIASLYGSKKSVQILIDSGANLECEDNNFRTPLFLTIYQCTTHYESRAEIIEYLIKKGANIEAKDAENNTTLFLAAYNNKMQLVKLIVKQAKARLKEFICTKNKHGFDALDCAIENNNRKMVTFLVSKGIEADDQDCNGNTRLHKASYNGDTKAVKFLLELKVNVNAVTRCNRTPLLLAAKKGHVEIVKMLLAVKVNMNICDQQGLTPLHLSIQKNYFDIAQLLIEKGAINCSNDYTAIDMFIDKAHSKKNIEENYKKFCRFLILYLKELNSKHRAFCVLSILALSLTIIGLPFIFKPIIKYRERSKIYKKIRAMLIYI >NZ_CP041924.1|WP_096676677.1|385800_386673_-|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIQTGFGYLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_129827249.1|387859_388732_+|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIQTVFGCLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_129827250.1|388758_389505_+|hypothetical-protein MEAPIQQADGRRVARDKGVPQGGSVSPIISNIFMHHVIDIWMKKNYPTVPFERYVDDAIVHCRTEKQTGFMKVMIEERLAEYRLKLHPKKTQIVYCKDDNRRDEFPKQSFDFLGYTFRPRLARNKIGKHFVSFLPAISNKAKKKITTTIRSWKMLRNTHITLEEISGKVNPIVRGWYQYYGKFYRTEVYKSLKNVERHLEKWVKRKYKRLRSHGRLARQFLGKVRDRSPNIFYHWTLGLGSKRLNNVY >NZ_CP041924.1|WP_096616077.1|389531_390620_-|IS481-family-transposase MSTIQTKILKPKLGLLELAKQLGNVSQACKVMGYSRDTFYRFKELYENGGEEALHEISKKKPLMANRVSEDMERAVVNIATEFPAYGQQRAANELRKRGIIISEGGVRSVWLRNDLETFKKRLRALEAKVMQDGIILTEEQLAALEKVKEQREAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGNIKGIGRIYQQTFIDTYSRVAFAKLYTDKTAITAADLLNDRVIPFFDVQSVPLLRILTDRGTEYCGKPENHAYQLYLGIENIDHSRTKANSPQTNGICERFHKTMQDECYNIIFRKKIYNSLEDLQIDVDHWLRSYNETRPHSGKYCYGKTPTQTFLNSKHIAFQKNISSMKQETDISFNYLNSSVS >NZ_CP041924.1|WP_006013625.1|391245_392259_-|hypothetical-protein MLTYIHKLIDKRQGSISISDFMNAALYHKEYGYYMSKLPLGKDGDFITAPEISQLFGETIAVWIMNTWEKLGKPSKFSLVELGPGKGTLIHDVIRVTKKYSCFFSSMDIHLVEIGPILQKIQKEKLKGLDINWHTDVDNLPNQPTIFFANELFDALPIDQFVYLDGQWYENRVTKQDNGSLSLLLQCSVPITGKGKLFNGAVVEVCLAGTEILKKLENKIVNNGGAALIIDYGYVYPSYKSTLQSIRQHKYTNFLENIGNSDITALVNFQALKDSLKHVDCETLTQREFLYLLGIKERAQALMENASNEQKNRIFSEFLRLTENMGTLFKVMLIHHL >NZ_CP041924.1|WP_006013621.1|392354_392726_+|hypothetical-protein MNSQDTDYVTLIPQDDGIEYKFKEAINFVENKVVDADGLTLAEIFQVLVRMLNGDLELVKKVLAYANIMVKHGMRLAQESQLSRADVRRALEGKESVFNRQDFIKKPPLVPSIKSVKKKSRGL >NZ_CP041924.1|WP_006013619.1|392726_392999_+|DUF2610-domain-containing-protein MVESIKKFTVQCDFKGQSSPFAIYIGDPKGDTHPIHHQDSWLAKERGGNIPNKVKESLQKLYKLSKENGVSFSELCAYAITVVSNNDKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041924_3 | 605924-606159 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041924_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP041924_3
>3.1|605963|60|NZ_CP041924|PILER-CR AATAATCATGGCGCTACTCCTCTGCACTGGGCTGCTCTTAATCAGAATATCAATATAGTA >3.2|606062|65|NZ_CP041924|PILER-CR AGAAGAATAAATATGACAATGTCCCTCTGCACTATGCTGCAGGTTATGGTAGCTTAAGTGTAATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041924_3
The CRISPR arrays of NZ_CP041924_3 >merge|NZ_CP041924|3|605924-606159|PILER-CR AAAAGCTTATAGAGGGAGGGGCTGATGTTAATGCTAAGAATAATCATGGCGCTACTCCTCTGCACTGGGCTGCTCTTAATCAGAATATCAATATAGTAGAAAAGCTTATAGAGAAAGGGGCTAATGTTAATGAGAAGAATAAATATGACAATGTCCCTCTGCACTATGCTGCAGGTTATGGTAGCTTAAGTGTAATAGAAAAGCTTATAGAGAAAGGGGCTGATATTAATGCTAAG >NZ_CP041924|3|3|605924-606159|PILER-CR AAAAGCTTATAGAGGGAGGGGCTGATGTTAATGCTAAGA ATAATCATGGCGCTACTCCTCTGCACTGGGCTGCTCTTAATCAGAATATCAATATAGTAG AAAAGCTTATAGAGAAAGGGGCTAATGTTAATGAGAAGA ATAAATATGACAATGTCCCTCTGCACTATGCTGCAGGTTATGGTAGCTTAAGTGTAATAGAAAAG CTTATAGAGAAAGGGGCTGATATTAATGCTAAG
>NZ_CP041924.1|WP_129827261.1|604702_605575_+|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIETVFGYLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_129827260.1|603124_603352_-|hypothetical-protein MRDLPSSIVQLKHLVCSFLIFLCVSTTHPIVALSQISRRVEERQNKRPQLADLRESGSIEQDADIVFTTLQRQLL >NZ_CP041924.1|WP_129827259.1|601943_602951_-|IS481-family-transposase MSTIQTKILKPKLGLLELAKQLGNVSQACKVMGYSRDTFYRFKELYENGGEEALHEISKKKPLMANRVSEDMERAVVNIATEFPAYGQQRAANELRKRGIIISEGGVRSVWLRNDLETFKKRLRALEAKVMQDGIILTEEQLAALEKVKEQREAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGNIKGIGRIYQQTFIDTYSRVAFAKLYTDKTAITAADLLNDRVIPFFDVQSVPLLRILTDRGTEYCGKPENHAYQLYLGIKNIDHSRTKANSPQTNGICERFHKTMQDECYNIIFRKKIYNSLEDLQIDVDHWLRSYNETRPHSGKYCYGKTPTQTFLNMY >NZ_CP041924.1|WP_096616077.1|600789_601878_-|IS481-family-transposase MSTIQTKILKPKLGLLELAKQLGNVSQACKVMGYSRDTFYRFKELYENGGEEALHEISKKKPLMANRVSEDMERAVVNIATEFPAYGQQRAANELRKRGIIISEGGVRSVWLRNDLETFKKRLRALEAKVMQDGIILTEEQLAALEKVKEQREAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGNIKGIGRIYQQTFIDTYSRVAFAKLYTDKTAITAADLLNDRVIPFFDVQSVPLLRILTDRGTEYCGKPENHAYQLYLGIENIDHSRTKANSPQTNGICERFHKTMQDECYNIIFRKKIYNSLEDLQIDVDHWLRSYNETRPHSGKYCYGKTPTQTFLNSKHIAFQKNISSMKQETDISFNYLNSSVS >NZ_CP041924.1|WP_006011986.1|600384_600603_+|hypothetical-protein MADSGINVTFNSEISECLAGLAKIRNKPVKKLVEELMQEAIENEEDKILIERAAELNVPGAETVDLKDVKWD >NZ_CP041924.1|WP_006011989.1|599221_600289_+|hypothetical-protein MLSALKNLKSKAKELVSTITHGQGVSKNIDKENCLPEKNALNPSYPYVNFGYMENGVFYQSQLAIKDKANLNISGVSGLPDEESWKIFQKHKVGKSHGEGDDYKSHINTLLEGEVSRKVVEELYNIKSDKIKFAALEEFLDEENRSFPVARLAIAGKDPICLMDFLEASKSKEYGIDAITMCKSDKNKTRGVRLSTCYDEDEQEIRSYEILDGTYDMDLAWEVEGKKCQMKISVSSDGSAKILKRNGVTDEEIYAHTEVMVGKQHETKSLYEALGLQQTQGKSMEKIQPKLYKRSQPKDSSSKAAIKQLVEKNPEVKSALKEFASEVKEESSESIKPLTDMTKANVKEADSSMQR >NZ_CP041924.1|WP_006011994.1|598193_598742_+|hypothetical-protein MKAQTDDSSVITIPQRKKELVELVQPRQIIEIQEIDEGIPIPKRKKGIERKLREDIKEVKNEIRDKKNIENKDNELAITEIINSIRDKLTECWSIPEGIVYKENFSIKINLLLSSKGEIVVATVADSSSYQNNPLFRSAADNAMRAVYKCSPLIGLPAEQHHIWREVTLDFIVPNLGEKPWT >NZ_CP041924.1|WP_006011997.1|597268_597997_-|DNA-repair-protein-RecO MRWKDEGVIIAVKKYGDKNLILSLFTKNHGKCRGLTRLTNNSNYKFQISNLLHAEWSAKLPENLGFLKCELIESPFHHFFQDRLKSIAIVSFSSILEKVLPESESCIKLYDNFRHFIDVIKHNSQFWQSHYLNLELLLLTQLGFKLDLSKCAVTGVKENLQFISPKTGRAVSKKVGDCYEDKLLPFPQMLHDVYNNNLQNSYSYQEFRLGLKITGYFLNKYLFLQLNAKFPELRNFMLSFES >NZ_CP041924.1|WP_006012001.1|595869_597246_+|PleD-family-two-component-system-response-regulator MTAKILVVDDIPSNVKLLEAQLKAEYYTVIVAYDGEEAIDLVAEQQPDIILLDVMMPKMSGFEVCKKLKNDPLTTYIPIIMVTALHDTHDRVEGINAGADDFLTKPIDETALSARIKSLVRLKMIIDELCLRGETNAEIGGVAESSIMDYSNQIFDANILVVDEDTFQAEQIHNVLKQRFRSIKILHDPKEALKVGIKDNYDLIISYMQFSKTDGLRLCSKFRSKVETRYTPILILSEDYDKSNLVKALDVGANDYLTVPLDESELIARVNLQVKRKRYQDALRMNLFNNMEMSIKDPLTNCYNRRYFDAHLRNIVKDSVEKDRSLSLMILDIDYFKMVNDNFGHNAGDELLKEIQKRISENIRVTDLLARFGGEEFVVVMPDTNVSDAYTIAERIRKIIAKEPFILVDKNTTHNVTVSIGISAMQRSDLGDVKKFIVRADKYLYKAKNSGRNRVVTG >NZ_CP041924.1|WP_006012003.1|595607_595898_+|hypothetical-protein MFNIGLSEILVVALVSIIVLDKSKVPVFLNLIKNIYRYFWVVKSRVRKLLKDTGIKELYEEHNVEKVNYIIGEDGKLYPTYNVDSTKNDSKNPSSR >NZ_CP041924.1|WP_129827263.1|607668_608541_+|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRRIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIETVFGYLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_039950809.1|608903_609791_-|4-hydroxybenzoate-octaprenyltransferase MYFNHYFSLMRIHSLTGLWLVLFSSLSGILLASTSLSYQALFLLVLFTIGAFLMRPAGCIINDIFDREIDAHVERTKYRPLASGALNIKQALALLSLLLSIALLILLLTNKTTLILGIISMCMIVIYPLLKRYVWWPQLFLGFTFNMGSLMGSAAITNQISIESLLFYIGCVFWTLSYDTIYAHQDKKDDEKLGMKSTALYFGNTTKSWLKRFYLISLMAWLYAGILSSLNNIFYIALLAIGFIFHHQHKNFNPDDSNQCMSIFKNNSQIGLLLFFGILLDRIVNSTFVSVQMHG >NZ_CP041924.1|WP_006015187.1|609794_610145_-|ribosome-binding-factor-A MKKEIRNLKVASVLHRAISKVLMEGNVLNEKVVVSDVKLSKDLKKADVYIVLSSLNIQNDNDDISTVVNEMNQSAWSIRKSILCYVDLRFIPELVFKPDLAFDNFVNVSKILHNHT >NZ_CP041924.1|WP_006015184.1|610154_612476_-|translation-initiation-factor-IF-2 MNNEDISNKKLTLQGLSKLKLDINLNSLDSQSTGTTIVKKRRKIHSAEEYSLFDESKLGSLTEKEQISRINAVQNATLLKERNQREQKEKIKKEESNQEAEDKNESHSLPKEINKEVLSNTNSVEQKEDSIEYENNDKKSFKASKDIYSKHSKLVITQAIDERNEHLPVFKQKFGIRSKQSKFTKGKNIAREVIIPDKITIRELSIRMAEDSKSVLKMFKEEVGENYRVDDTVDPDIACEIAKKFNHTAKRVSDADKEKNLLFISNRENLPKRLKPPIVTFMGHVDHGKTSLLDAFRESNVAERESGGITQHIGAYQLTTKNKQKITFIDTPGHEAFTAMRARGANITNIVVIVVAADDGIMKQTIEAINHAKAANVSIIVAINKIDKSQPGDVERIINSLPQYDLIPEELGGDVIIVPVSAKKKINLDKLEEAILLIAELMTLEGIEDCRALGWVIESKIDKAKGISATLIVEEGTLKIGDILVVGTTYSKVRSMVNHLGQREKAALPSTPVEVTGLNGVPNAGDKFVVVNSERQAREIVEYRLELIKKKQEDLDDSNLDIFSRNDSKTEELSVVLKCDVTGSIEAISSSIDKLGKDQVKLNILHKAVGGVTDSDMLLAEASSAVILAFNVKVDSKIRELAKQKGIEIHTYNIIYELIEDMRMYLTKMLKPVTREVRVGSASVRQIFNSSKAGNIIGCYVTDGVIKKDSLIKVVRGSKLVHEGKLKALRRFKDDVKEVGVNFECGISLEGNIDIKVGDILEAYQLVQEERTL >NZ_CP041924.1|WP_096560606.1|612483_614037_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusA MIANRKSSVKQKSNKNNIVGSLDVIKTAGELSLQKGLDFNIIINALKSAIEAVAQQKYGSKSKIVVNIDKNTGKVTSYRQLKVINDESNENECDLIKLTQAKLIKEDAKVGDTISELISLNTDLVSARIAQQKISEIIKDEELKKQYEEFKDKVGEMRYGIVKQVEYSDLIIDINGIGAYLPLRNLIGGESFREGDKVKAYIQAVKRSDDGRQIILSRAHEGFLEALLNQEVPEVADGLITIKGIARDAGSRSKVAVFSSDKNIDPVGACVGVKGDRIKTIIYELNGEKIDVIHYSSDLGQFVIKAITPAEVSKVIIDENENCIELIVAEDQLSLAIGKKGQNVRLASELVGWKIEILSIQQESERRNKEFSQCSVLFAEALNLEEIMGQLLVTEGFSSVEDISNTSIKELASIEGFNEDIANELHNRANNYLKAENDRKIEELKNLGMEDDVINLALSIDNKIALSKHNIKTLEDIADLSNYEFCSILSSSTNNKDNLKDTADLIIIEARKKLGLI >NZ_CP041924.1|WP_096616077.1|616708_617797_-|IS481-family-transposase MSTIQTKILKPKLGLLELAKQLGNVSQACKVMGYSRDTFYRFKELYENGGEEALHEISKKKPLMANRVSEDMERAVVNIATEFPAYGQQRAANELRKRGIIISEGGVRSVWLRNDLETFKKRLRALEAKVMQDGIILTEEQLAALEKVKEQREAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGNIKGIGRIYQQTFIDTYSRVAFAKLYTDKTAITAADLLNDRVIPFFDVQSVPLLRILTDRGTEYCGKPENHAYQLYLGIENIDHSRTKANSPQTNGICERFHKTMQDECYNIIFRKKIYNSLEDLQIDVDHWLRSYNETRPHSGKYCYGKTPTQTFLNSKHIAFQKNISSMKQETDISFNYLNSSVS >NZ_CP041924.1|WP_006014820.1|618563_619268_+|hypothetical-protein MVAVLSVTEGKNKVIVSGLVGVSSTLVFLTVIHIAAKIAIIVTAAAVTYALLSLLNKARPKSVKTDDMSEDEGYSSVDEGEEKDTEISEKEPERTETELEEEIIRKRAQERMEKGSLGGPIDAENSNPVDYTKTMVVPEKIILGMPDDKTLTQNSSSSIKNQMKSLPEHMDVSGNPLPEQLPSNLPNIGPKSKSTQKLSAADLLLRYGNVNNDVRKVLEWPITSKEFNGLGFNR >NZ_CP041924.1|WP_006014818.1|619271_620009_-|glutamine-synthetase MIILSNLSHNTVFGIELEFYTEGIKKEYLFLNSIKNKIASLGFFCEKESSLNQYEIKSDCYTSSDNLIMHFELAKQLLVGTAQEFDGNVSFKAKPYLDRAGSALNVHVSLMDSNNNNLFYGKKQKYSDHLIHSIGGLCAMMKKHMLFFAPNDDSYLRFQYPDIHTPTTISWGVNNRTAAIRIPYFGNDSKRCRLEHRVPGADCNLEKVLTAIIEGIVFGIENKIAPPNRVYGIASDPQYKMESLI >NZ_CP041924.1|WP_006014815.1|620335_621718_+|chromosomal-replication-initiator-protein-DnaA MNLTNHKVSTMFFDQMITVTDHNVTWEKIQNYLHNLYGEATYNSWLSSLRFISNRNGEVLLSVPTRFIKEWITVHYMEKILSLWQSEDQSVCSIDIQLIEERNSNSNTILKNREENNHNLGSPLDTRFTFDNFVVGKSNELAFTAAKRVAESIDPISGSNPLFLYGGVGLGKTHLMHAIAWDIVNSPSAKRKVVYLSAEKFMYQYITALRSKDIMLFKEQFRSVDVLMVDDVQFISGKDSTQEEFFHTFNALIDQNKQLVISADRSPSDLDGVEERIKSRLGWGLVADINETTFELRLGILQAKVERMNMYVPKDVLEFLARNIKSNIRELEGALNKVAHTSLIGRSMTVESASETLIDLLRSNHRSITIEEIQKKIAEFFNIKIADMQSNRRLRSLARPRQIAMYFAKKFTQKSLPDIGRNFGGRDHATVIHAVKQVENFIRTDPKFADEINRLKKMFK >NZ_CP041924.1|WP_006014812.1|621875_622748_+|protein-translocase-subunit-SecF MAIRLIPDNLDIKFSKYRNLTALVSVILIIFSMLTFILRGMNLGIDFTGGILIEIKSSSKDDAILDILKESGFTIQSSKAGDNLVVRFKDEGDEDKIKKVKSILESKLGNLVTYRKVDYVGPQIGSTQIFEGISAMLIAIIGIFFYVWLRFNWQCGLGGIMALIHDVILTLGFISLTSIEFNISSVAALLTVIGYSINNSVVIYDRIREYQKNRKDVEMDEIVDASINSTLFRTMLTSGTTLLASLPLVLICTGMVRDFSLIISFGIAVGTCSAIFISAPILTCRALISR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041924_4 | 755940-756041 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041924_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041924_4
>4.1|755970|42|NZ_CP041924|CRISPRCasFinder GATTTCTCAGGAGCAATATTTTCTAGTACTTTTATAATATCT |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041924_4
The CRISPR arrays of NZ_CP041924_4 >merge|NZ_CP041924|4|755940-756041|CRISPRCasFinder TGAAGACTAAACTTCTCAAATATGAGTTCTGATTTCTCAGGAGCAATATTTTCTAGTACTTTTATAATATCTTGAAGACTAAACTTCCCAAATATGAGTTCT >NZ_CP041924|4|1|755940-756041|CRISPRCasFinder TGAAGACTAAACTTCTCAAATATGAGTTCT GATTTCTCAGGAGCAATATTTTCTAGTACTTTTATAATATCT TGAAGACTAAACTTCCCAAATATGAGTTCT
>NZ_CP041924.1|WP_096641457.1|754533_755229_-|di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase MLNLESLPKHLAIIMDGNGRWAKNQGMVRIDGYRKGSEVAFDIAKHCTTLAISYLTLYAFSMENWLRPKNEADYLFDLFYSALTNEDKINFICNCNIKLNFIGNLSLLPSKIFDQIKKAEEVTHKNDGLLLTVAVSYGAKQEIIHAINNIIKGNIDCVLEDEFEKFLYTKDLPKLDLLIRTGGEKRLSNFLLWQSAYAELYFCDTLWPDFSCQDLSRALADYTKREKKYGR >NZ_CP041924.1|WP_006013769.1|753917_754544_-|phosphatidate-cytidylyltransferase MVDNNFMVRTLSSIVILLIFSFATYFSDLSFYLLIFSIAVLSSFEWYNLTKGNSILYIFALLLIALPNASLIYLYNLPQGKYELIWLILTIWSIDITAYLFGKNFGGAKICPIISPGKTWSGLLGAVLAGVFCTIFGSIFLSLFPIFYSPIIGVTIAILAQLGDFTESLIKRVYNVKDSGGIIPGHGGVLDRMDSFIFTAPFIAIYIS >NZ_CP041924.1|WP_006013766.1|753693_753903_+|zinc-finger-domain-containing-protein MSEVRDNNLIVCCRGDENDDGSGHPVVYLHKEGEMYCPYCSKPMSEIVNSEEFQFVEVKAVNKKERTKG >NZ_CP041924.1|WP_006013763.1|753115_753622_+|pantetheine-phosphate-adenylyltransferase MNINNKIGIYPGTFDPITLGHLDIIKRACKLVDKLVIGVAENVNKRTAFDIKLRTSMAENEVKGVGIDADVISFNGLLMKFAKEQNASVIIRGLRAVSDFDYEFQMSWVNYKLLPEIETVFLPASEDTQFISSSFVKEIARLGGDVSSFVSQNVQTELINLNRVKNGE >NZ_CP041924.1|WP_006013759.1|751987_752908_-|hypothetical-protein MYKCYNRIFNILLITFLLLSNIAYSEKVNKELSALTAENAVSYNIIVGLLQTDESQNIYEIFNNFGVKTIFIDYDKIINLKEIQEEFAKQDEILAKKLILDRIKVEVAKFIKEQKINRIFISDNFHSALNPYRQLVNEAIVKIVDGNPTIHLLAICGGSQGIMHVKGIEVVNDEKNHLKSAQKENIPLQQIKIVPGSRLEEVVAKFLLPNQNGWFSTYFPNAHSGKVSNTTGNRRRLELLGYKIAAFANDGVIEAIEDKHGNIYFQSHLEDLVVKSDKNSRLSSQKARQVSTLVAIAIINDFLHRV >NZ_CP041924.1|WP_006013756.1|750598_751756_+|2-octaprenyl-6-methoxyphenyl-hydroxylase MNYDVIISGSGLIGLITAIGLSNDSISVAVIEKNSLPRAVDDNRAFAISQGSKKILEKLAIWKFLESEAEPILDICILDGDSPFTVHYDHKMVGEEPMGYVIKSAIIWNAINNNFLHKLNIYSPRSYKTIACDEGYVEVTLDNDQKLISSLFICAEGKNSKLPELFSIPMIKFDYKQNSMVFNVKHELHHQNLAVERFFPGGPFAILPMKGGYTSSIVWTEKCEISKMLMSLSEEEFVIELKKRFGSYLGEIELEGERRFYPLSFSFARKLHKSRILLIGDAAHSIHPVAGQGLNLGMRDVESVIRQITNAKVSGIDVGSNYLLKKISRDRYFDNLTMALATDGLNRIFSNRILCAQVLRNLGLMVVENSDFLKKSFVRHAMGFI >NZ_CP041924.1|WP_006013753.1|749801_750437_-|hypothetical-protein MTTDCKKELLNCISKYREELAENKAAIRQTLTSDKINISDYFYKGDKICNKELFNIGSECQDTKYGSRQEYTYDEWKEKIEKPHAKDLLKMLQNEIKGKILKSFEDYEKYHKNATEAIKRELDMDSKLKAILKEKQQPETDETRAYYDVIRGLYENGDMRSQLKCNDLDCFNRTIEDNLSQKQSELAAIKDDFLDNTQNIFQHIQVEDSIF >NZ_CP041924.1|WP_039950541.1|748908_749577_+|septal-ring-lytic-transglycosylase-RlpA-family-protein MIKKLAFICLIFVLMSSCSFSNRCNHTAGHYKIGNSYTINGITYHPKYCSCYEEVGIASWYGIEDHGTITANGEVFNRHLISAAHKTLPLPCFVRVTNLENGRKLVIRVNDRGPFVEGRIIDLSEKAAQVLGLHKSGLAKVKVEYLRKRSEQLIQNTPHYKRQYEKEMQKRHPKQNNAESKGYVAFFVNAQVAKSAASKLRNQGIENVRLLFKNDQYCVKVS >NZ_CP041924.1|WP_096560683.1|747859_748882_-|UDP-N-acetylmuramate--alanine-ligase MRILNYTIINLVISKRLLPNMHSTKKEVIHIIGIGGIGMSAIAEILHNSSYKVQGSDTRSNDNIDRLQKLGIEVYIGHDASSIRQAQIVVHSSAIKPDNVELVAARDNNKTVLHRSDMLAKIMKGKYVIAVSGSSGKTTTTAMIASIFDHSGADATVIVGGILNSYQSNAKLGKSDIFLIEADESDGTMLKIPADIAVVTSINDDHIDHYGTFNDIKNAFSRFVNNANFAILPDSADINHDASNSIKFWFGNGKIRASNIKQHNNSIEFDVLISINESNRIPLSTTRVVERGGIKAALSSSPQCLKLDYRFNVKQDTIEFKRTIPRKSLHSKKVNRTNAI >NZ_CP041924.1|WP_096616077.1|745697_746786_+|IS481-family-transposase MSTIQTKILKPKLGLLELAKQLGNVSQACKVMGYSRDTFYRFKELYENGGEEALHEISKKKPLMANRVSEDMERAVVNIATEFPAYGQQRAANELRKRGIIISEGGVRSVWLRNDLETFKKRLRALEAKVMQDGIILTEEQLAALEKVKEQREAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGNIKGIGRIYQQTFIDTYSRVAFAKLYTDKTAITAADLLNDRVIPFFDVQSVPLLRILTDRGTEYCGKPENHAYQLYLGIENIDHSRTKANSPQTNGICERFHKTMQDECYNIIFRKKIYNSLEDLQIDVDHWLRSYNETRPHSGKYCYGKTPTQTFLNSKHIAFQKNISSMKQETDISFNYLNSSVS >NZ_CP041924.1|WP_096560682.1|757289_758462_+|2-oxoglutarate-dehydrogenase-complex-dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MSKIIEIRAPKTLGGESVTEGIVKIKKNIGEAIKVDDLIFEIETDKTALELTAEASGQITEFLVKEDDVISPDQLLAKLAVGEVKEEVKKEDKGESPDKKDAPSARKIMEENAISAENVKGTGMGGRITKADVIDHMSKAEQPAVKQYESPKSVASGERREERVKMSKIRQVIAARLKASQNTAAILTTFNEIDMKNVMDLRAKYKETFEKKYGIKLGFMSFFIKAAVQALKEIREINAEISGDEIVYKNYYDIGVAVGTDKGLVVPVIRDADQMSFAEIELTLVALGKKAREGKLQVSEMEGATFTISNGGVYGSLLSTPIINPLQSGILGMHSIQNRPVAVSSSIEIRPMMYIALSYDHRIVDGKGAVTFLVKIKNYIEDPNRLVLEI >NZ_CP041924.1|WP_096560603.1|759151_760423_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MNKTKSFDIPKQLIWRAYKQVSKNRGAAGVDGVSITKFEENLKDNLYKLWNRMSSGSYFPEPVKAVAIPKDMGGGQRILCVPSVFDRIGQTAAAMYLEPLVEPKFHEDSYGYRPNKSALDAVDTARKRCWRYDWTIDLDISGFFDNLDHELVLRAIKKHTDCKWVILYVERWMEAPIQQADGRRVARDKGVPQGGSVSPIISNIFMHHVIDIWMKKNYPTVPFERYVDDAIVHCRTEKQTGFMKVMIEERLAEYRLKLHPKKTQIVYCKDDNRRDEFPKQSFDFLGYTFRPRLARNKIGKHFVSFLPAISNKAKKKITTTIRSWKMLRNTHITLEEISGKVNPIVRGWYQYYGKFYRTEVYKSLKNVERHLEKWVKRKYKRLRSHGRLARQFLGKVRDRSPNIFYHWTLGLGSKRLNNGSCIS >NZ_CP041924.1|WP_129827232.1|761009_761882_+|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIQTVFGYLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_006013790.1|762901_763687_+|SDR-family-oxidoreductase MATSLLQGKKGLITGITNKRSIAYGIAKTLSEHGAELAITYQNETIKEKLLPIASELNVELILHCNVSNEETIDNAFEEIKKEWNTLDFLVHAIAFSDKNELNGKYVNTSLNNFINAMHISCYSFTALAQRAEKMMLNGGSLLTLSYYGAEKVMPNYNVMGLCKAALEASVKYIACDLGPQNIRVNAISAGPIRTLASSGISDFHSISEWNRSNSPLRRNVTIEDVGKAALYLLSDLSSGTTGEILHVDSGYNVVGMKIVD >NZ_CP041924.1|WP_129827232.1|763929_764802_-|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIQTVFGYLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFSTLVSYSMKPKKPSISRFYCID >NZ_CP041924.1|WP_006013808.1|766363_767458_+|redox-regulated-ATPase-YchF MSFNCGIVGLPNIGKSTLFNALTESSAAEAANYPFCTIEPNVGKVPIRDQRLKQIASIAHSGKIIYNQLEVVDIAGLVKGASKGEGLGNKFLSHIREVDAIVHLLRCFTDDDISHVNSKIDPISDAEIVEMELILADIDSIEKRLPQLEKKAKQGDKELKRQLELMQEVLATLKLGKPARSLENIDEDEMKLLQLLTTKPVMYVCNVEDTHIITGNELSKRVEKMAKENKSKFYCISAKLEADIANLDSEEEKQNFLSEFGLQESGLDGVARIMYEVLSMITFFTVGPKEARAWPIKIGSTADKAAGVIHTDFEKGFIKAETISFEDYIKYGSELACKDAGKIRFEGRDYIVQDGDIMHFRFNV >NZ_CP041924.1|WP_006013816.1|769041_769965_-|class-II-fructose-bisphosphatase MEDLAYKLVKVTEAAALAAYKLAGLGNEKKADQVAVDAMRTVLNSMEINGTIVIGEGERDEAPMLYIGEKVGTGSGPEIDIAVDPLEGTTICAHYKQGAMSVLAATKKGNFLHAPDVYMEKIAVGKNLPEGVVSLKNRIEKNLDNLAKAKGCKASDLIVTVLKRERHDELIAKIRKLGAKVKLIDDGDVAAIVSLINGNHDMYIGTGGAPEGVLAAAALSSIGGQIEGRLIFDTDQLKERAKNLNITDPEKIYTVKDMARSESVFIATGVTNGEFVDGVKFDQDICLTHSLIILPGKVIKIQTKSIS >NZ_CP041924.1|WP_006013819.1|770083_771883_+|ankyrin-repeat-domain-containing-protein MVGNLTYEDVKKFVTDNPNIAAQEFGEKLKQSGLTDAKICDLFMDILRSGKSSILNDYDTFLKIAELLAKSNIKIDIGDTTSKTVLDYAVVGGQPKVIKVFLDSGKFDQEKKLNALSAAVNGGNVQEFEIFLDYIDHTKILDVLNTAPYNEGNEVMKILLNNKRFTGEEKVQDLSNASIDGDLPKVKLLLKYMTGIPEDGIRNLLKIIEEGKLPLRKQLQIDFEFKVDFSNSDHNKYLSSCVIIALLRSALSNTPNLGGNRAESSSSGETAVLNSNDVKKWYARIARTINSISFEDLQGDLNKQETSFQSKCEQGTVLGNALLERAIQNENFNVIKFLLENRVTVINAISQEDRYYVSKIEGDKSILCSVVSYTDDDAEILSMLLQSVNAEQLKLDPESELYRLYQQLKDDAFCIAFSKKNSVAAATLIQNDRAIIVPHGSATNKEQETSHIETNSVSNSNRNVISRPVAIVPPVSISGNNNKNETPISTRADPTVTPNNDKKANGFIDAQFSSPHKKETKYKESFYTSLRSDVIGVVITGLFVATAVIVPSVAGAVICGVVAVLVTIVTGLHVKNSTLPSYREMKENKVEPAKLIKSV >NZ_CP041924.1|WP_006013822.1|772157_772895_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLVNNISYFYSNQDGFALSNINIQVKKGGVACLLGHSGCGKSTILKLIAGIENPKSGTIVINDKLVASNKVSIAIERRNIGLIFQHSALFPHKTVIENITFAICSTSKKEKYLTALEILKLFNIEKYENMYPHALSGGQQQLVAIARVMAQNPDVVLLDEPFSNLDILLKYRIRHHILSLFRSKNIPVLMVTHDPQEALKVADFIYVMKNGKIIQSGVPSYIYHRPKDDTLAKFFSELPFTPQLN >NZ_CP041924.1|WP_006013840.1|773035_773203_+|twin-arginine-translocase-TatA/TatE-family-subunit MSLGPWQLFLVLIIILVLFGAGRLPQVMGDLGKGIKNLKQELKDSEKLSSNEPDR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041924_5 | 921891-922129 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041924_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP041924_5
>5.1|921941|56|NZ_CP041924|PILER-CR TCATCTTTTACATTAATATCTGCACCTCTTTTTAGTAGAACATTTACTACATCTAT >5.2|922047|49|NZ_CP041924|PILER-CR TTACATTAACATCCGCACCTTTTTTTAGTAGAGCATTTACTACATCTAT |
RT,DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041924_5
The CRISPR arrays of NZ_CP041924_5 >merge|NZ_CP041924|5|921891-922129|PILER-CR TAAAGTAGCATAATGCAAAGGAGTATTACCATTTTCATCTTTTACATTAATATCTGCACCTCTTTTTAGTAGAACATTTACTACATCTATGAATTTATATATAGTAGCATAATGCAAAGGAGTACTACCACTTCTGTCTTTTACATTAACATCCGCACCTTTTTTTAGTAGAGCATTTACTACATCTATGAGTTCATATATAGTAGCATAATGCAAAGGAGTACTACCATTTCTGTCTT >NZ_CP041924|5|4|921891-922129|PILER-CR TAAAGTAGCATAATGCAAAGGAGTATTACCATTTTCATCTTTTACATTAA TATCTGCACCTCTTTTTAGTAGAACATTTACTACATCTATGAATTTATATATAGTA GCATAATGCAAAGGAGTACTACCACTTCTGTCTTTTACATTAACATCCGC ACCTTTTTTTAGTAGAGCATTTACTACATCTATGAGTTCATATATAGTA GCATAATGCAAAGGAGTACTACCATTTCTGTCTT
>NZ_CP041924.1|WP_006012653.1|919698_921036_-|AAA-family-ATPase MSSRANIPFFIAGAIASLTLITSGVFAVAPYVAFLSSVAALNIAPPVIFILFALSAVVIVFSYKMIKQSKKSQENSKAEVKELNKESSKEENKLTPIKEELEDGKDKENKYGFSGLEEKVHRILENFVTKDEVNGLKKEVSDLSARLINSPTTKNEVEAKLNMEFYVKGEARGWNTTFDNIILPSDIKEKLRGICESKSGGYLLYGPPGTGKTSISKAIANQTKSLFAFMSVSASCLSSQRNIDQIFEKAETNSPCMIFIDEIDGVGKKRTVHEDAGPLTYLLTKLDKEFLSSKNITVVAAINHKNHLDPALIRDGRLECIEVPGLDKDDTRQKILQERLEKLKDSDMKILVQASKGFSMANLICLIDKISETTEKEGEIKYLRTFCKNFKKKHNIKDEPDKKHSNGKTKNKDIRLSSGSLSRSSSVSSSLSDVSSRGSNRQIEG >NZ_CP041924.1|WP_006012656.1|917867_919058_-|hypothetical-protein MTNSVNELSNKAPIILTWVPRVRGTSLPNGKNSTLNYLEIIKNHKLKNKEKRDIYLVINGPGFEENQIDNLKRELKEIKGVHVVDLHQYDWSEIDEGWKIDGKDISIKDFFKNMYNMSEEQRMYFAIEIDTFRLIALALSEKMTGEKGAIYIDFDSLKAIDTHIGKDITIPEGILLGNVIACFLDQEGNTNYTSAVDIKNSNHYDEYKNLMIFTNNDCIAVNNSSVAVSILSNYKDRILSQKEACNEVKKRLSLALEQEEELDRGVSLFIKDEELKNETIKQAKEKIKKCISDFESNGIQELYNIENFHYINTGLGEFSLNSAQMSTIKPLLVQLNGEKVSKCPSFSFNCNNGNYVSVLGSDLSWMKGESLYCQQVDKKLEGAEVDQVAMEKLSLA >NZ_CP041924.1|WP_006012658.1|916938_917748_-|hypothetical-protein MSKKIVNALKAKVKELKYQDLKARESNYHLTYIDLARINNIVINGTVVTNEVIRQLLGGMRGESTIFHEMFRYAGATVPNDLIIKELAANYNQSGYVKFLYESYSSIEDWEKTGLKLLTNCNGERTFRMDCYDPNRLKFSFSMERIPVTDTEIEYFGHFHELCNLSGSVEFKLKYKDGNVTYEDGKVLLTIPKELEDYKAGDDSLLDKLTDIINKIAEYLKKLCEKLGFKFDTKIEYNSERNINIEHNLGRPLKVIDEPDIYAVNGLEL >NZ_CP041924.1|WP_096560603.1|914666_915938_+|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MNKTKSFDIPKQLIWRAYKQVSKNRGAAGVDGVSITKFEENLKDNLYKLWNRMSSGSYFPEPVKAVAIPKDMGGGQRILCVPSVFDRIGQTAAAMYLEPLVEPKFHEDSYGYRPNKSALDAVDTARKRCWRYDWTIDLDISGFFDNLDHELVLRAIKKHTDCKWVILYVERWMEAPIQQADGRRVARDKGVPQGGSVSPIISNIFMHHVIDIWMKKNYPTVPFERYVDDAIVHCRTEKQTGFMKVMIEERLAEYRLKLHPKKTQIVYCKDDNRRDEFPKQSFDFLGYTFRPRLARNKIGKHFVSFLPAISNKAKKKITTTIRSWKMLRNTHITLEEISGKVNPIVRGWYQYYGKFYRTEVYKSLKNVERHLEKWVKRKYKRLRSHGRLARQFLGKVRDRSPNIFYHWTLGLGSKRLNNGSCIS >NZ_CP041924.1|WP_129827276.1|913267_914080_-|IS982-family-transposase MNKNVTELFCFVDDFCKAINKNFAEKLLPNSKKPTRTPGITHSEILTIILLYQQSRCEDFKSFYTYYLKALHGSEFQNLPTYSRFIRLKSRVLWYLVLLLKWLCEQSKMTGISYIDATSIAVCHPKRISRNKVFKGLAKLGKTTYGWFLGFKLHMVINEKGEIQGVTMTKGNVDDRKPVPKLTEKLTGLLFGDKGYIKKELFAKLFDRGIKLVTKVKKGMKNTLMLLEEKIFLRKRSIIQTVFGYLKNRLDLEHSRHRSPINFLVHIFPH >NZ_CP041924.1|WP_006012667.1|912773_913184_-|hypothetical-protein MGEKQLLDDEAKKKGKSVIEELDKIEHKIVDLRNGKIRELYEPLVCHYSRYREIGLNLGQFYTVEVVRNGLIGQDESKIGLFFFEKNNGNYVCTINGDLSWARGANLYHKQLKSELEKVQVDQMELEKLSLKQSQI >NZ_CP041924.1|WP_039950273.1|911874_912672_-|hypothetical-protein MKDKARERRYADLKSTESSDYRTYKDLDMDFNSEYEFVCDLVINGKAITNDFIKNLYLKHKNLITEDKDKKGSYRLFLKQIFTEVFVNAGAAVPNDPIMEELITYYNRSGYKQFFSSQSQALRSFGLCMYSFRYLIPSYRERTYISCEDPNCLKFSFSVNDGIYHDNKILVCDLQNSVEFKLKCEGENVKYEEGKVSLTIPKELKNYKANDKNLFDVIIEYFQKFCEKFGFHFETKIEHILDNPLGVLSDINTSQDKNLNLKNLK >NZ_CP041924.1|WP_039950275.1|910210_910846_+|DNA-polymerase-III-subunit-epsilon MREIVLDTETTGLDVNSHRIIEIGCVELINHIPTGKVFHRYINPERSIDKGAFKVHGISEEFLKDKPLFSEIASEFLNFISSDTLVIHNAGFDIKFLNMELGKLNAKLISSDRVLDTLPLARKKFGPPASLSALCERFGISLESRELHGALIDAELLAKVYVERLQTPLDRCQHAVRNLSLRGHLPSNEEVSEQLDEINVSVHEGVVDRRL >NZ_CP041924.1|WP_006012681.1|908882_909401_+|hypothetical-protein MGGSNEKVDYTELSKSSISDKIKPKKKVTFCQQVQVKEIPLEGKKGKCKRHKEKKQSKKKNWTRGQYSAPPPYFLLIREQVQKTQLWERGAAIIVPPVIGLLGGLITLILITEEIRSPFLIAALAATVITAAIYELEYLLKPELLEKPGKTLKDLVTDSFVKEEKNSRTVSQ >NZ_CP041924.1|WP_006012683.1|907920_908784_+|lipoyl-synthase MHSKPTWLRAKAPAGKIFNETLNTVKLHNLHTVCEEAACPNIGECWNKRHATVMILGSVCTRACAFCNVATGIPDKLDPHEPENLAKAIKKLNLKHVVITSVDRDDLPDGGANQFIRCIEEIRKITSETTIEILTPDFVNKKGAFEAIAIASPDVYNHNIETVPRLYAKIRPRARYFHSLYLLKMVKQINSKLFTKSGLMVGLGETKEEIFQVMDDLRSAEVDFITIGQYLQPTPKHAKIDRYVTPEEFEHYKYIAYSKGFLVVASSPLTRSSYHAEEDFNRLKACS >NZ_CP041924.1|WP_006012648.1|922999_923704_-|ComF-family-protein MNLLLLKKATDLIFPNVCVSCERIIDKSYDLCSECNKKINFLTKHYCNVCGVVIPDNIYTCGKCISNPPPFKVLRSVFAYDEHSKNMIINFKFFDNLNYMKVYAKCMYKANKDMFQNAEVIIPIPLHKIRLFKRKYNQAALLAKELSKLSHLSYTPFAIKRIRHTVPQAGLSLKRREKNLRKAFKISNSEIIKNKIVILVDDVVTTGATARSCSQEILNSGAREVRVLSLARTI >NZ_CP041924.1|WP_006012646.1|923755_926569_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MIRVKGAREHNLQGIDVDIPKNKLVVITGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLNIQDKPDVELITGLSPAISINQKSISKNPRSTVGTVTEIYDYVRLIYARVGIPYSPVTGLPITKQAVSQIVDTIIALPLETKIYILAPIVRGRKGEHFKEILEIKKQGYVRLKIDGETYNIDDLPKLDKNKKHDIFVIADRISISDDIGNRLPSSVESALRLGHGLMYAEIVNLPDNHSSEYKNGQTLTFSENFACPESGFTLEEIEPRLFSFNSPYGACSSCNGLGKKLSVDAKLIVPDETLSISEGALKPIGSIFRQVHTNYGLLKNAILSLAENCKFSLDVPWKNIDQKVKDLILFGSREIKFQGLVSILERQMDYDASLIDRYCSVTDCKECVGYRLRKEALTVKIDEKHIGEISRLSIDESLKWFGNLSDRLTEQQRQISNKILNEIIKRLTFLKNVGLNYLTLDRESSTLSGGESQRIRLASQIGSGLTGVLYVLDEPSIGLHQCDNDRLITTLKNLRDMGNTVIVVEHDEDTIMAADYVIDIGPGAGVNGGKIVAEGTPDQVQKNSESITGQYLSGKKEISISKRRKQTTQFIKVVNACENNLKNINVEFPIGNFICVTGISGGGKSSLVIETLYKYSAHKINHSSARHGRCDKIEGLEYIDKIIEVDQSPIGRTPASNPATYVGMFTHIRNWFAGLPESKARGYNVGRFSFNTKGGRCEACKGDGHLKIEMHFLPDVYVKCEQCRGQRYNRETLEVTYKGKSISDVLGMTIDQACDFFADLPMIKEKLISLQEVGLGYITLGQSSTTLSGGEAQRIKLSKELSKRFTGKTLYILDEPTTGLHFEDVNNLLKILHRLVDLGNTVIVIEHNLHVIKTADHIIDIGPEGGVKGGKVVAVGTPEKVAQTPESVTGKYLKTYLLDQVSTIS >NZ_CP041924.1|WP_006012645.1|926894_928220_+|hypothetical-protein MAIEKEKFFEIINEVSESRDLDEDNLLEKIKNELKGKDAGEYNKFSKNFSKEHQFSIKISEEAAEDWTLLHLATACNNMLIVELLLKKKASVNARVKDGSKNDGLTALHIATFCGHESMVKQLLSDDRVNPSLKSKNKTPREVVGNTENKEAIVQMLEEAEENHSRKKKIKGFHIQVGEGSCDRSSQNDNITRVSSFVNGITELGNDRKKSIAVEIQMWNERRKENNDNIQSEQIASHSITGESVSNEDSGLEFEDTFDTSFCSEINNDGAANEVNDQILESLQPQIQLQDRQIRKLEKPGKELKHIEKALEKLKSDLAGHETRSEILDKLSEENQSLKQQIQDLKSKNTTLNSELSKTKANKVEKTQLCFLKIASVNFAIMLTVGVAFSIAFQLPILLMIATSVMSSLIVGGVTYALSPQPTELKEVSIKCSMQHDACKT >NZ_CP041924.1|WP_096641442.1|928280_929279_+|pyruvate-dehydrogenase-complex-E1-component-subunit-beta MAILSVREALCTAIREEMQNDPDIFIMGEEVAEYDGAYKVTKGLLKEFGENRVVDTPITEHGFAGLAVGAAFAGLRPIVEFMTFNFSMQAIDQIVNSAAKTNYMSGGQLGCPIVFRGPNGAAARVAAQHSQCFASWYSHVPGLKVIAPYFASDCRGLLKAAIRDPNPVIFLENEIAYGHEHEVPDSELSNKDYLLEIGKAVVIREGKDVTITAFSLKLMDALNAADLLSIEGIEAEVIDLRTLRPLDTETVINSIKKTNRLVSLEEGWPFGGIGAELSAVVMEQGFDYLDAPVVRVTGKDIPLPYAANLEKKALPQIEDIVEAVHQVCFRKK >NZ_CP041924.1|WP_006012640.1|929284_929638_-|TrbC/VirB2-family-protein MNPTIRKVFCILLIILFISFSHVGSAANSNDDTTAQVICNIIGYVWGIGGPLMTVVIIGAALLAIFGRMPWPALFALGVFCAVFFGAKTIVIKVMGGINSTNASFMEKCGTEETKNN >NZ_CP041924.1|WP_006012627.1|929837_930620_+|signal-peptidase-I MCYDKFKFIKKIKLKELRENRIARTRKFLSSLFFLLLIALSIRSFLFEPFHIPSGSMKSTLLEGDYIFTSKYSYGYSKHSFPFSPNIFSGRIFYTPPERGDVIVFRPTRNESVRYVKRVIGLPGDKVQVIKGELYLNDQKVERRQIKDFFDYESKRSIPRYIETLPGGKEHEILTYNIDDEPSNTPVYYVPDDQFFVMGDNRNNSRDSRFSDVGFVQMENIVGRVSMVGLSFKLGKVDWLPFNFRLPVALRFDRILHKVV >NZ_CP041924.1|WP_006012624.1|930623_932396_-|Fe-S-protein-assembly-chaperone-HscA MRPVQISEPSSNEVVFGIDLGTTNSLIAMVNKAGNVEIFKDEQGRELLPSVISYEKDVLKVGYDVGENAICSIKRLMGKSVKDLHKEGINCEIDNESEKVIRVKCSEEKYLTPIEISAEILKTLCKRVKKFTGMKVNKAVITVPAYFDDSARNATKYAAKLAGIDVLRLINEPTAAALSYSIEKNNNSGIYAVYDLGGGTFDISILKLHQGVFQVLAVGGDTKLGGDDFDHLLSLIVLEKYREQVGLSKSVIPASATCMAGPSLIESRIVKEYLSNNTSGTFEFSINGELFECEITKEEFEQAISPLVNKTINIVTRTISNIDLKIDNIKGVILVGGATRVPLVQNSLIKLFGNKVLNDVDPDKAVANGAALQAHYLTSNSKDRNILLDVLPLSLGIETMGGIVEKIIPRNTPLPVSEIKEFTTYANGQTAMKIHVCQGEREMIKDNKSLARFELKGIPKLPAGSAKVEIGFTVSIDGILTVTAREKTTGVEQTVEINSSSGLSEEDIQDMVNQSVSNFDEDMKARSLAEAKINGNKLIHLVENVSTEQKLKILLQNAKDALQENDLDNINNAISELENSALELCESSDR >NZ_CP041924.1|WP_006012616.1|932373_932832_-|molecular-chaperone-Hsc20 MSSNHFTLFGIEPAFNISFDELEKKYIELSKTDINERESKNMENINKAYQVLKSPLKRAEHLLDLFDVQSKKEHLDPEILNESMEIREYFLDCDDLQFASRMIDEKVKDCTKNLINAFATKNFDEAATQVFRLRYLYKSFEEIKENAASSNF >NZ_CP041924.1|WP_006012614.1|932824_933211_-|iron-sulfur-cluster-assembly-accessory-protein MSEFQGVNSVKKPITLTANAVERVRFLLDKKKHANLEEAIGIRVLIKQKGCSGLKYDIEYAYDVRPLESVIEESCSDDQKVKVLIDPKSIMFILGSEMDYVEEKFSSGFIFKNPNEKGKCGCGESFHV >NZ_CP041924.1|WP_006012607.1|933216_933600_-|Fe-S-cluster-assembly-scaffold-IscU MSYNEKILDHYENPRNVGSLDKNDPNVGTGLVGAPSCGDVMKLQIKVNDKGVIEDAKFKTFGCGSAIASSSLLTEMIKGKTIEDVTKIKNTQIVEELSLPPVKIHCSVLAEDAIKAAIHDYQNKQKH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041924_6 | 1302689-1302762 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP041924_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP041924_6
>6.1|1302712|28|NZ_CP041924|CRISPRCasFinder TGTTAATGTTGCTACGATTGAGGGTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP041924_6
The CRISPR arrays of NZ_CP041924_6 >merge|NZ_CP041924|6|1302689-1302762|CRISPRCasFinder TCTCCTTTACATATGGCAGCACATGTTAATGTTGCTACGATTGAGGGTTATTCTCCTTTACATATAGCAGCACA >NZ_CP041924|6|2|1302689-1302762|CRISPRCasFinder TCTCCTTTACATATGGCAGCACA TGTTAATGTTGCTACGATTGAGGGTTAT TCTCCTTTACATATAGCAGCACA
>NZ_CP041924.1|WP_096616077.1|1300722_1301811_-|IS481-family-transposase MSTIQTKILKPKLGLLELAKQLGNVSQACKVMGYSRDTFYRFKELYENGGEEALHEISKKKPLMANRVSEDMERAVVNIATEFPAYGQQRAANELRKRGIIISEGGVRSVWLRNDLETFKKRLRALEAKVMQDGIILTEEQLAALEKVKEQREAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGNIKGIGRIYQQTFIDTYSRVAFAKLYTDKTAITAADLLNDRVIPFFDVQSVPLLRILTDRGTEYCGKPENHAYQLYLGIENIDHSRTKANSPQTNGICERFHKTMQDECYNIIFRKKIYNSLEDLQIDVDHWLRSYNETRPHSGKYCYGKTPTQTFLNSKHIAFQKNISSMKQETDISFNYLNSSVS >NZ_CP041924.1|WP_129827301.1|1299760_1300702_-|hypothetical-protein MCLVHINKPDVSIVTNLYEHFTQKPTRNRREYPNSQFSIIREIYKNAFILVSNDIAKLNEKNFNQIISRKVGQIETILAIVSLIDNKRLIKKMLNLVEKNIKNNPEGQQVLLKSLVNILTYSIKNERLQTINYICTGQFSKKNFCSVIQEIYIKAFADSKVVEELENKIEKQEKSAKYEWWMELKKYLDFNQKLNDLQKLKEIVNKFIEASDYHNKLCQDENYPALSYYNTEIDLERLEQITRKFINDSGHISEKEVLKQKKLQIPLPGEKQLVENLRKLEKKYLLSFNLFMKKLHMISNTQALFSPLKRKTL >NZ_CP041924.1|WP_006015319.1|1297548_1299504_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MTDLEKMREKLQDQINYHNILYYQKSKPEISDAEYDELKKKLAEVEPEAYATQDSVGAPPDERFSKVEHQEPMLSLENAYDEQGVEKFLSKIKRFLIADEIEILCEPKIDGLSFSAIYEDGKFVKAATRGDGFVGEDVTHNVATIKGFPKFLQGVEGKLEVRGEIYISNSDFLKLNENNEFANPRNAAAGSLKQLNANITAKRPLRYFAYSLIGGIEKSQSDILEKLEKFGFCVNEHRSLTSSLNGMLKFYNEIYDYRYNLDYDIDGIVYKVNDLVLQSRLGSTHKAPRSALAYKFSAVYAKTKLNKIFIQVGRTGVLTPVADLVPVNIGGVLVSRASLHNQDEIKRKDIREGDVVTIKRAGDVIPQIVKVDEGSRHTNMPEFVFPDICPECGSKVQIEGVAVRCPKEFNCKAQIVEKLKHFVSKDAFDIVGLGEKQIKFFYDLELIRQIPDIFILEERLKEFSLKEHHGWGEKSIANLLSAIKSRRVISLDRFIFSLGIRFIGQVAAELLANYYVSYDNWYNSMSSNDVELVGIDGIGEKVAESLKSFFSQERNIKMLNDLTAYLQILPVGSNSNDSFLNNKIIVFTGKLRAMSRGEAKVRAKVLGAKISSSLSTKTDYLIAGEDPGSKYKKAMELGVEILDEEQWNKLC >NZ_CP041924.1|WP_096616077.1|1295833_1296922_+|IS481-family-transposase MSTIQTKILKPKLGLLELAKQLGNVSQACKVMGYSRDTFYRFKELYENGGEEALHEISKKKPLMANRVSEDMERAVVNIATEFPAYGQQRAANELRKRGIIISEGGVRSVWLRNDLETFKKRLRALEAKVMQDGIILTEEQLAALEKVKEQREAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGNIKGIGRIYQQTFIDTYSRVAFAKLYTDKTAITAADLLNDRVIPFFDVQSVPLLRILTDRGTEYCGKPENHAYQLYLGIENIDHSRTKANSPQTNGICERFHKTMQDECYNIIFRKKIYNSLEDLQIDVDHWLRSYNETRPHSGKYCYGKTPTQTFLNSKHIAFQKNISSMKQETDISFNYLNSSVS >NZ_CP041924.1|WP_006015331.1|1294238_1294829_+|orotate-phosphoribosyltransferase MILDNTIIKEFVEAGAILHGHFVLSSGLHSNTYIQCAKIFENPSRAMNVCELLANKIRKELIEPIDLILSPAIGGIIVGYEIGRQLGIRTIFCERVNGKFELRRGFEIKQGEKILLIEDVITTGKSSLEAVKCAEEKGGEVVAEASLIKRNSETKLPFPIISLIELNIENYSEKELPSELKQLPITKPGSREYLTK >NZ_CP041924.1|WP_006015333.1|1293057_1294242_+|dicarboxylate/amino-acid:cation-symporter MHKFAVFFSILFAIVAYYLNNEVIFEVARLLSDIFISLLKLISLPLVFLSIVSTISGLKDSIEIKVLLKKTLFYTLLTTIIAAFVALSFYLFIDPVRKNFISNTIESVSDSNHNYFSYLKSLIPSNFVQVFLENNVIGSILIAFLMGGAIISLSKEKQDILHQIFSALFDTLLRIAQGLLKFIPLAVWSFITCFLYELKGGSEFHSLFWYFACIMSANFVQAFVILPLLMWHKGISPIQTMKGVMPALTLAFFSKSSSATLPTTIECVQNQLKVPKKLSSFILPICTTVNMNACAAFILITVMFVAEMNGHTFSLSEMFIWIFLATGAAIGNAGVPMGCYFMATSYLVSMNVPLYIMGLILPIYTIIDMFETAINVWSDICITQIINKEFKTQE >NZ_CP041924.1|WP_096560746.1|1292105_1292990_+|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase MLISLPKVCGIYRYNVSMSKMTWLNVGGQADVLFKPRDVEDLMCLIKDTELPISIIGATSNIIVQDSGIRGITVKLGKEFAYIKCKDNSSIVAGGAALLSNLAYFAGEKQISGLEFLAGIPGTVGGGIEMNAGAYESDIASVVKFIRAVNLEDGNLYEFSSEEMGYFYRGHSLKGRWIFVEAEFKGVSSEYELILQRLKEVIDKKNKSQPVKGKTAGCIFKNPTGCKAWKLIDESGCRGLDNGVAKISKKHCNFLLNYNNATALDLESLGNRVKDAVKDKFNIELEWEIRVLGR >NZ_CP041924.1|WP_006015337.1|1291236_1292115_+|hydroxymethylbilane-synthase MLVKIGTRGSDLAIIQALETKQRLLESFPNLSVEIIKIKTSGDKYANVTLAEIGGKGLFLREIEAELLKNNIDMAVHSLKDVPAFFSKDLTIPCVLERLSPCDVFISHKYKSLKTLPQQATIATSSIRRKVQLLNLRPDLNVVPLRGNVTTRLQNQNFDGMILAEAGLIRLKKYHLITEVLPPKVMLSAVGQGAICIQCRKNDIKVIDLLEKINNNMSFIRAKSERSFMKTVNGSCFTPLAALAEYVSENMLHLYCMLAGERVIYFTERTSFVEDAEKMGMDAGLELKSKCL >NZ_CP041924.1|WP_006015339.1|1290743_1291118_-|hypothetical-protein MFDILKDSNGRFNKKNILPLVGATVAIILTALSAVVAIPRFFSHPSLSSPLGWKDPSYSEFLAIHIPATIVTFSILGLCIYLPIDSIRKNKQIENLKATSEPHSWIYNDILEKQTQTINYRSGL >NZ_CP041924.1|WP_006015341.1|1289165_1290671_-|protein-translocase-subunit-SecD MPNKIIVKSLSVLLIFLLSLYIILPNFIDNKFLASKKRINLGLDLKGGSSLLLNVDLDFYFKEKLSMLTDEIKEGLLTQNSIKNDKQVVVTLSNMDDYKKVSMLIHKINPNLELNRKDTSIFISYKPHYKNSLINEVVSESIINVQRRLDKLGTKEVSVQKQGQNKILVQVPGVEDTQQIKSLLGKTAKLAFHLANTNITKLQDMDHETTVMLKDSLGNSYPIFRKTEIGGDSLVNASVRFGNLGKPTVHFKFDSIASKKFAKITKENVGKPFAIVLDNTVLTVPTIREPILNGEGEISGNFTEKQASELAILLKSGALPAPLKIIEEKNIGPSLGEESIKAGEIAAIISIIAVGLSIIITYGKLGLLASVALVFNVISILLILTLLEATLTLPGIAGIALTVGMSVDANVLIFERIREEIRAGKRTARAIDEGFKNAIKTILDSNLTTLIASGIMFIIGSGAIRGFSITLSIGVLCSMFSAIIVTKLLIELCINPQKLVL >NZ_CP041924.1|WP_096616077.1|1303421_1304510_+|IS481-family-transposase MSTIQTKILKPKLGLLELAKQLGNVSQACKVMGYSRDTFYRFKELYENGGEEALHEISKKKPLMANRVSEDMERAVVNIATEFPAYGQQRAANELRKRGIIISEGGVRSVWLRNDLETFKKRLRALEAKVMQDGIILTEEQLAALEKVKEQREAHGEIETEHPGYLGSQDTYYVGNIKGIGRIYQQTFIDTYSRVAFAKLYTDKTAITAADLLNDRVIPFFDVQSVPLLRILTDRGTEYCGKPENHAYQLYLGIENIDHSRTKANSPQTNGICERFHKTMQDECYNIIFRKKIYNSLEDLQIDVDHWLRSYNETRPHSGKYCYGKTPTQTFLNSKHIAFQKNISSMKQETDISFNYLNSSVS >NZ_CP041924.1|WP_039950839.1|1304792_1305551_-|FtsQ-type-POTRA-domain-containing-protein MLNNVTRSQRSFLRKCAFMIITALFLTLVLYSSLDKITNRFNYYFTWCNDRLSSLLISNGFSIDKVTVTGNKFTNEQDILSLVDRTQPIMYVSLSKLTDNIQSVSEWIKYVRIYRILPNTLQIDIDEHTPFALWKDDNKTSVIDSEGKVIVDDYQIDNLVIIKGQNSLSSLKFIKYILERKTQLSDHISSCVYVGNRRWNIILDDSATVKLPEDNPYSAWDYLSHLQNTTDFTFSNWSIIDMRVADKIFVKK >NZ_CP041924.1|WP_006015304.1|1305531_1306485_-|D-alanine--D-alanine-ligase MLMVPTIAILSGGFSCEREISLMSGKAVKKALDSLLYNAIEIDVDSNISDKLKKTNPDLAFIALHGPYGEDGCIQGLLEILGIKYTHSGVMPSAVAMNKVMSKHIFHSLNIDTPRGYVISREDVLKNNIKVDYPYVLKPINEGSSIGVHMIFSHEDYLKLKDGNSAIMERMIIEEYIPGIELHTAVLLNEAIGTMEIRPKNKFYDYEAKYTDGFAEHIFPAEIPDNIYRMTLEHALKVHQFLGCKTVSRSDFRYNPQNNTLKMLEINTHPGFTELSLVPEIAKLTKGIDFNELIKIIVKDSLHHKNIRDQVDVEQCY >NZ_CP041924.1|WP_006015300.1|1307048_1307315_+|hypothetical-protein MVIPTQNSNSLTFQARNLSHICHKNCEEVFNETDKPLCKARCDVFFPVPEPRSQISEKLIDISNNLRFESAQLSSMADEIDAYNSMSI >NZ_CP041924.1|WP_039950835.1|1307344_1307722_-|ferredoxin-family-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP041924_6 | 6.1|1302712|28|NZ_CP041924|CRISPRCasFinder | 1302712-1302739 | 28 | NC_041878 | Pectobacterium phage CBB, complete genome | 170074-170101 | 6 | 0.786 |
1. spacer 6.1|1302712|28|NZ_CP041924|CRISPRCasFinder matches to NC_041878 (Pectobacterium phage CBB, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
tgttaatgttgctacgattgagggttat CRISPR spacer tgttaatgttactacgattgtggaagaa Protospacer **********.********* **. *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
13818 : 56914
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP041924|13818:56914|DBSCAN-SWA 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41 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
147910 : 194342
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP041924|147910:194342|DBSCAN-SWA 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45 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
205071 : 280600
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP041924|205071:280600|DBSCAN-SWA 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52 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(28.57%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
287407 : 352230
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP041924|287407:352230|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_virus(18.18%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
368447 : 426626
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP041924|368447:426626|DBSCAN-SWA 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48 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(36.36%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
430961 : 492508
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP041924|430961:492508|DBSCAN-SWA 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56 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(13.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
497474 : 661624
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP041924|497474:661624|DBSCAN-SWA 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116 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(21.21%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
669905 : 739358
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP041924|669905:739358|DBSCAN-SWA 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52 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(27.78%) | transposase,tRNA,head,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
742910 : 885810
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP041924|742910:885810|DBSCAN-SWA 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114 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(31.25%) | transposase,integrase,tRNA | attL 739120:739179|attR 804800:805072 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
895790 : 952931
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP041924|895790:952931|DBSCAN-SWA 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48 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
981534 : 1029884
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP041924|981534:1029884|DBSCAN-SWA 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44 | Wolbachia_phage(61.9%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1056296 : 1124252
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP041924|1056296:1124252|DBSCAN-SWA 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49 | Staphylococcus_phage(22.22%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1127700 : 1272956
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP041924|1127700:1272956|DBSCAN-SWA CTTATATTGCCTGAGCATTTATCAATTGTTTAACCTGTATAAGGTTAAACTCTGCTACTAAATGAAAGGTAGAAACAACATTTGCAAGCAAAGATAACCTGTTTATTCTAAGCTCATTAGAATCACAGTTAATCTTTACACTGTCCATAAATTGATTGATAAATGGAGCAAAACGAGCAAGTGCATCAAGCGCTGTATTAAAGTCGTTATTTTCTATCGCTTGTTTTATGTTTTTACAAGCAGCTATAGCACAATTTGATAGCGCAATCTCCTCATCTTCAATCAAAAACTTCTTACTGTAAGATGCATTATAAGTAGTGCCATCACTTTTTCTCACTTTGCTCATCATGTTACTGGCTCTTTTATAAGTGCTTAGAACCTGTTCACCTTCTTTTGTACTAAGATAACGATCCAATATCACAGTTTGCTTTTCCGCTTTCAGCAGATCATTAATATCGACTTTATATAGTATTGAATCTACAACATCTTGCCTTATATTTCTATTTTTTAAAATAACCTTGAACCTTTCTAAGCAGAATTTAAATACTAGTTCTGAAATTTGTTTTTCACTTGGCTTATCAACTGGAGTTATATTTTTATTCAATAGAAGTCTTGAACATAAAGATACTGACTTATCTATCAGCAATCTAATTGGAATATGCAAATTATTTTCAAGTATTGTTCTAATTATACCAATTGTCATTCTCCGCAAACCAAACTGATCATACGAACCAGAGATTTTCTCACCTGCTGCAATTAAACCAACCAAACTATCCATCTTGTCTGCAATAGCTACAGCAATCGCAGTAGGAGATTTAGGACATTCTTGCTCCGATCCAATTGGCTTATAGTGCTCAGTTATAGCTTCTACTACTTCTTTATCTTCTTGAAAATAAGAAGCGTAGTATCCACTCATTACTCCTTGCAATCCCGGAAATTCTTTCACTATCAACGTTGCAAGATCTGCCTTTGCTAAATATGCAGCACGTTCAACTTTAATTAATGAAGCATGTGGAATAAATATCGCTATATACTTTGAAAGAGCGATAATACGCTTCACTTTTTCTTCTACGCTACCGAGCGAAGCATGAAATGAAATAGAGCTCAATTTTTTGACATAGTAATCTAGGTTTTCCTTCTTGTCTTGAGATATCAAAAACTGGGCATCAGCAAGACGTGCTTCTAATATTCTTTCATGGCCTTTGACAACTTCATTATTGTTAACATTTACAACAGTAACAAAATGTGAAATTTTCTGTCCATCACTTAAAGCAAGATACTTTTGCTGCGTATTAATTATACTAAGTATTACTTCCTTCGGTAATTCTGATGATTTTACTTTACCAAATAATACTATTGGCCACTCTATAAGCCCTGCCAATTCATTAAGTAAATAATCATTTTTTTCAAGTTGTAAGTTCTGCTCTTTTGTAAACTTATTAATCTGATCTAGTATAAATTGCTTTCTTTTGTCCAACTGGAGAATGACATTATTTTTTTCTAACAATTCAAAATAGTCTTTGGGTGTTTTAACAGTAAGTGCTGCATCACCCGAAAGAAACCTATGACCATACGTTACGTTGCATGCTGCAACCCCTGCAAAAGATACAGGTATTATTTCGTCATTAAAAATACATAGAATATTTTTAATTGGCCTAACCCATCTCTCTTTTCTTTCACCCCATCTCATGCTCTTTGGCCAAGAAAAGTTTTTTAGCATTTCCTCTAGTTGATTTTTGAGAAACCCGTTGATGTTAAATAAGCAGCTTTCTCTCTTAATGAAGTAAAAATCTTCATCGTTTACTTTGCGAATGAGTAAATCTTCTTCAACTTTGCGATTTTTTCTCAAAAAACCTTCGATAGCACTTTTCGGTGCATTAACTCTTGGTCCTTTAATCTCATTGTTAGAATCTTTTAGCTCCAAAGCACTTATGCCATCAATAAAAAGAGCAATGCGACGTGCAGTCACATAAACTTCTATAGATGCAAATTTCACATTATTTTTACTAAAAGCATTAGTGATATAGCTCTTAACCTGAGCTGCAGATGAATTCTGCATTCTTGATGGAATTTCTTCTGAAAGACATTCAAACAATAATTGTGACAACATATTCTACTTTGCTCTATATAATTCACAGCATTTTTTTGTTAACTCTCTCACTCTACCAATATAGGCTGTACGTTCATTCACACCAAGCACACCTCTTGCATCAAGTAGATTAAGTAGATGGCTCGTTTTAATACATTGGTCATAAGCTGCTATCGGCAATTCTTTTTCAACAAGGAATTTACACAGTTTTTCTGTATCCTCAAACTGCTGTTGTACTACTTTAGTATCATAATAATCAAGTGCCAGGTAAGAAAACTCTCGCTCTCTTTGTTTAAAAATATCTCCATAAGTTGCACCGCCACCGTTCCACATTATGTCGTAAACATTATCTACACCCTGTATGCACATTGCTAAACGCTCTAACCCATATGCTACTTCACCAGGAATTATTCTGCAGTCAATACCTCCCACTTGCTGTATATAAGTAAGTTGTGTTACTTCCATTCCGTTGCATGTAACCTCCCAACCAAGACCGGATGCACCAACACTTGGGTTTTCCCAATCATCTTCAATAAACTTAATATCATATTCTTTTGTCGATACACCAAGAGCTTTTAAGCTATTTAAGTAAACATCTTGCAAATTGCTGCCAGATGGTTTTATTATAATTTGGTATTGATGATGCTGATATAAGCGATTAGGGTTGTCGCCATAGCGTCCGTCTGCAGGTCTGATTACTGGTTGTAGATACGCAATTTTTGTTGATTTTTCGTCAATCGCTGACATGATTGTTGCGGGATGTAGTGTTCCAGCTCCAACTTCAGACGTATATGGATGAAGTATAGTACATCCTTCATCTGCCCAAAAATCTTGTAATCCCTTTATTATATCCTGTAGATTCACGCAGACTGTATATCTTTTAAACTGAATACATAAGCAAATAAGTACTATTCTATACTTATTTTTTTAATAGTGCCATGAAAATAGTCACTCAAGGCTATTGAACTTTCTTTTACATACTCAAATATGCTTTTGTTTAAAACAATCGCATCATGCATAGTCAGATCGCAGAATATAAATGCAGTCAAGTACAATAAAATCACTGCATAAAACACATGAAAAATCCCTTCAAATGTGATTGATATTGCATTGTTATAACTAAGCTGTATCGTACTTATCGGCCATGGTTTTATTACTTCTACAATATTAAAAAATAAATAAGGTATTATAAAGAAAAAGAACAAATGCATAAGATCATTAAACCAAAATGGACATTGAAGTATTGCTTTACATATACTTAGATAGAATTTACTTACAGTATAATAAATTGATATTATTGCCGGCATCGAAAGCGCAACAGTCAGCACCTGTCCTGATGCTATTTGTATTACTATATTCTCATCACTGCTGGCTGAAGGATCTTGAATGTGAAAAATGGATATTGCAACTAATTGCAGCACTAACATAACTATTGCTAGCTTGGTAAAAATGGCAGCTACAACTATGCCTGTATTCGGCATTTTATATAGTATAAAATCACCTCCGTATGTAAGCATTAATATAATGTCGGTAATAAATAATATTAGAAAAGAAGACCAATAATGCTGCCAACCCGGTAAATACCCTACTCCTAAAAAAGAGCTTACTATTTTGGCAGGAAAAACCTTGCCTAGCACCTTACCCAAAAATTGAAAAAAAATCCCCATGTCCTAACTAACACTTGACTTATATTTTTCACAATACTGAATTGTAATGGACTTATCAATACACTTCTTGCATAGAAAAAAGGCAAATAGTTAAAAACGATCTAAACCGTTGCCCCTTTATATTAACCCCAGTTGCGGATTAATCAATACAGTAAAATCTAGAAATAGAGGGCTTTTTAGGCTTCATAGAATATGAAACTAATGTGGAAAAGATGTGCACCAAGAAATTTATTGGAGACCTGTGTCTTGAATGCTCAAGATCAAGTCTGTTTTTGAGGTAACCAAAAACTGTTTGAATAATCGACCTTTTTCTTAAAAAAATCTTTTCTTCAAGAAGCATTAATGTGTTTTTCATACCTTTTTTTACTTTGGTAACGAGTTTTATTCCTCTATCGAAGAGTTTTGCAAAGAGCTCTTTCTTTATATAGCCCTTATCACCAAACAAAAGACCAGTCAGTTTTTCAGTTAATTTTGGTACTGGTTTTCTGTCGTCAACGTTGCCTTTAGTCATTGTAACTCCTTGAATTTCACCTTTTTCATTAATTACCATATGCAATTTAAAACCCAAAAACCAGCCATATGTAGTCTTTCCAAGCTTTGCCAATCCTTTGAAAACTTTGTTTCTTGAGATTCTTTTTGGATGGCAAACAGCGATAGAAGTTGCATCTATGTACGAAATTCCGGTCATTTTTGACTGCTCACAAAGCCACTTTAACAAGAGCACTAAATACCATAAAACCCTAGATTTTAGCCTAATAAATCTACTATATGTTGGCAAATTTTGAAACTCAGATCCATGTAGTGCTTTCAAATAATATGTATAGAAAGATTTAAAGTCCTCACATCTAGATTGTTGATAAAGTAAAATTATAGTAAGAATTTCAGAATGCGTAATCCCTGGCGTTCTGGTAGGTTTTTTACTGTTTGGCAGGAGTTTTTCTGCGAAATTTTTGTTTATAGCCTTGCAAAAATCGTCTACAAAGCAAAATAATTCTGTTACATTTTTATTCATGGGTAACCTCTCTATTTTTTGATAATATGTTTCCGGAGTTTACCCTATTTTCCTGGCTTTTTCACTGACTTCTAATCCGCAACTGGGGTTATATTAGTAGCCTCCTTTTTTGTCATCCCAGTGCTCCGACACTGGGATCCAGCCTTTCTTACCAATAAAAACTTAGAATAAGTCTCCTTTGTGCTCAAAAAATTCCTGGATTCCAGTGTCAGCTACTTGAATGACATCTTCA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117 | Wolbachia_phage(30.77%) | transposase,tRNA,protease,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1276635 : 1431088
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP041924|1276635:1431088|DBSCAN-SWA 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113 | Wolbachia_phage(28.21%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1439082 : 1447974
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP041924|1439082:1447974|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP041924|1439082:1447974|1446186_1447974_-|WP_006014134.1|DBSCAN-SWA MAIILLDTKTINRIAAGEVIERPASVVKELVENAIDAGSSEIEIKIESGGRNLITVTDDGNGIEKDDLELAFMRHATSKLSDSELIEIKHLGFRGEALPSIAAVSRMKLSSKASGAKEAWSIRYEGGEKIREITPCSLLQGTYIEVRDLFFATPNRLKFLKTERAETQSIVDIVNNLAMINYSIGFTLTSGNKKLLKYVKQTSLFNRLCEIEEEFQSNSLEVKEEEEGIKLKGHICKPNVNRGNSTQIYTFVNGRPIKDNLLVGAIRYAYHDFIPNNRYPFAVLHLEVPYDQVDVNVHPNKSEVRFQNKRLIYEIVRRGIIKTLSTRFAAGDQGIEEELIFNDSKSQEQVDSQEKKDQKEFYEKRPSLLENRLMKEFNAPDERRQSLPETFKYGESPPQKGTMVLERKQIDLVEDHPLGYARCQVHNTYIIAESGDRLIIVDQHAAYERLIYECLTSIKRQKLLPETVEIKNQAGMGMVKTYKDELFEMGFDIEIQSEDKVTIKEIPAILGTIDIKEMLVDIVDKLMEMEDTLPIEDKVNKISATIACHGAGRKMKLEEMNEILRQIEKTPYSGHERPTYIEMKLSDIEKLFERR >NZ_CP041924|1439082:1447974|1445179_1446118_-|WP_006014132.1|DBSCAN-SWA MKKENKCSNFLDYKVIGQEVRNRRLAKGYTQKDLAKKIDTTYQVILQYEKGTRRISIKKLYELAEALSTTARDLACGQEVSNEGRYEEEEILNLVRRHKEIKDQELRETFYLLTKFIRISEEESGKAVKVEVAKGLVKEGVSAHVISQTTSLSIDEYDNDEKKISIPYKVGQRIKEWRLRRGYTQEDLASKVGIINQRIYEYEQGRAGVSLEMLDEIAKVLSISITDLLPETTENENSEVELSRLIEEYKKIKSQELRHVLIKSLFESIQVCKEKVKRVEKMKIAKNLVKEGISINIILKTVGISLDEIQQI >NZ_CP041924|1439082:1447974|1444343_1445009_-|WP_006014130.1|DBSCAN-SWA MNNKKDRREEIEFRALESNGKALLDREVIETFLSAVHDREEARIIARKLIDNFGIGGVLGQEIDDLKTIEGITDSTVAVILCLKEAAKRVSREELKKGPVMDNLETIVKYLRVSIGYSEEEKMKIIYFDQKCRLKGEEVFTGTVDKVPFYIREVTRKALIRKATSIIISHNHPEGRLKPSDEDEAVTKDLAKACQTIGIRLLDHIIITSVGYFSFKEQGLL >NZ_CP041924|1439082:1447974|1440115_1441024_-|WP_006013992.1|DBSCAN-SWA MEKSLDCEVGQKVKNWRLERGYTQKDLAEKVGVKYWAILQYEKGSRKIPIKKLYAIAEALSVNVKGLVCGETLPNEKRYFEDEEILNLVKGYKDKELSEVFYLLTKFIRLSEERSRKAVKIEVARGLMKVGVSAHVISRTTNLSIGEYEENKIPVPYKVGQRIKEWRLIRGYTQKDLANKVGITNQGIYEYEQGRAAVSLEMLDEIAKVLSISIIDLLPESDEDSEAEEKLSKLIEEYKKIESRELRDMLIKSLFEGIHVYREKVREEKKIEVARNLVKEGISVDIILQTTGLSNYMIEKFL >NZ_CP041924|1439082:1447974|1441141_1442413_-|WP_129827233.1|DBSCAN-SWA MNKTKSFDIPKQLIWRAYKQVSKNRGAAGVDGVSITKFEENLKDNLYKLWNRMSSGSYFPEPVKAVAIPKDMGGGQRILCVPSVSDRIAQTAATMYLEPLVEPKFHEDSYGYRSNKSALDAVDTARKRCWKYDWVVDLDISGFFDNLDHELVLQAIKKHTDCKWVILYVERWMKSPIQLADGSKVVRDKGVPQGGSVSPIISNIFMHHVIDIWMKKNYPTVPFERYVDDAIVHCRTEKQTGFVKVMIEERLAEYRLKLHPKKTQIVYCKDDNRRDEFPKQSFDFLGYTFRPRLARNKIGKHFVSFLPAISNKAKKKITTTIRSWKMLRNTHITLEEISGKVNPIVRGWYQYYGKFYRTEVYKSLKNVERHLEKWVKRKYKRLRSHGRLARQFLGKVRDRSPNIFYHWTLGLGSKRLNNGSCIS >NZ_CP041924|1439082:1447974|1442985_1444113_-|WP_051008237.1|DBSCAN-SWA MDLDRLSKGEVLNAIVGIGRTNTFVSKINKAKKPEEIAPFPGREVRENKINYGKGFDYVYGTKPVSDQEDKNPFASALKKIKPSAEKLSWFKSAVVRAKSPNELHKVVDEALAAGARLNACNDGEWSLAEYVILGTHFHKFDKADRKKLIRKLMLNGAEFHDTLLENKLIGEIYNELQPEVQPHIDERLEELEKAGESAVQEGELIDVEIDNTTSYIEFSGDSKVEVAKILEAKRELGSNILKIGNDAVEVKSEKGGIRNYIDMSDGSSIILEFPTSIGKLDIILYHDVKKYDQVQVRVENKEMWSKLQERGEEIGKNCLFAGVKLKEAVEKGSFMRCGIWNSKQLMKEVDSPSEKLSSWVDKVRENSKETFRGL >NZ_CP041924|1439082:1447974|1439082_1440069_-|WP_006013990.1|DBSCAN-SWA MFASVGKTAFRGFIYDNSEHIGSVSYELGKKIEGCRIVQGYTQAKLASKIGLTHKEIHNFELGCKAITIKESYIIAGALSVNVIDLLPGPTVLRENSWYEDEDKEIVYLTKIHREIKDQELRKKLYPLVRFVYISEKISQEEAKIEVAKNLVKEGVSVDIISQVTRLSTYEYDDIEKEICTDSILYKVGKRIKEQRLIREYTQEDLANKIGSTPKEIHDYERGYTDIPIEILYKIAKTLSVNIKALGLTEYENEPVFGFIGKCEKIEDQELLDTVARSLSEGMQTGKEKVKKAEKIKIAKDLVKEGVAIDIIVRASGLTADELGECEN |
7 | Wolbachia_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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