Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023544 | Campylobacter jejuni strain CFSAN032806 plasmid pCFSAN032806, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
NZ_CP023543 | Campylobacter jejuni strain CFSAN032806 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas2,cas1,cas9,csa3,DEDDh | 0 | 14 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023544_1 | 18083-18178 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023544_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP023544_1
>1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder TTGTTTTTTTAAAGTCCCTATTTTCCATATGTTATTTTCGTAAAAATGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023544_1
The CRISPR arrays of NZ_CP023544_1 >merge|NZ_CP023544|1|18083-18178|CRISPRCasFinder AGAAATCATTACATTTAAGTCAATTGTTTTTTTAAAGTCCCTATTTTCCATATGTTATTTTCGTAAAAATGTCAAAAATCATTACATTTAAGTCAA >NZ_CP023544|1|1|18083-18178|CRISPRCasFinder AGAAATCATTACATTTAAGTCAA TTGTTTTTTTAAAGTCCCTATTTTCCATATGTTATTTTCGTAAAAATGTC AAAAATCATTACATTTAAGTCAA
>NZ_CP023544.1|WP_002823273.1|17638_17914_-|hypothetical-protein MCKIIKYLDYARLNTLEKLYFDLTIMLIVTFLSFLFLVFEFFIYENIAVFFQDCFLMSVIFIIGMIGLFHTCKGLRKYKEILKSNKREEFI >NZ_CP023544.1|WP_021034322.1|17266_17560_+|EexN-family-lipoprotein MKNTIKLALLGAVITGVFSACSSEPKTVQYYEDPKNATELEAKIKECDKNANSAKTDTECANAYEARYSKSFDYKPQVSTKELMQKAREQNKNMELK >NZ_CP023544.1|WP_002823310.1|15922_17149_+|hypothetical-protein MPQKRIYLYVPFKDKEKAKSLGAMWDDKEKKWFAPKTLDKNIFSQWLYPHQKKEFSFDENEVLTAFKSALENQGLIIEGLPIMDGKIHRVKTTNDKGRELSGAYSGFLDDYPAGFVQNFKTGIKENWKMPIEKNQSNNIKNSQKLHEQIKKDQELREKEILTLQEKTALKLEDEYNNAKWANSNHAYLKKKGFDENFYLKQDKMGSLLIPLKDENGKLWSVQRIFPNGDKIIGVIKTQEEKDQGVEYLAKKQGCFHIIGAKTLHNLKEFYICEGFATAATIYKALNKPVIMGVDAGNLSKIVETLKNKFENTPITLIADNDKKRELKGLSNVGVETAKEIQQRFSDIKVIIPKISDQEAGQGVSDFNDIFLNKGLDEVKKQLNFIDFHNKLKAFKSMEKTQPEKEITR >NZ_CP023544.1|WP_021083573.1|15180_15840_+|hypothetical-protein MNNTINFNELFSQIRLYSYDNNIVKHYDNLKLVGKITPKIATLEIILRNKLDNKLSEQDSNWIKNSNDENIKKAKDEIEKREKNRILSHHQYLSRISLGTIIYLIKENRMQDSIMNLKNINFRNYNQYNRNFFLKNGKKRNFGNIYKVDIVLSLLQNLRNRSYHWENILKTTEKNSKHYPRLTTKIENVYIGINPQKIELFLDDLIKTFDERILKYCQD >NZ_CP023544.1|WP_021083574.1|14565_15177_+|hypothetical-protein MEKDYKIKVTDVSELNEQYKEAIQEGTYEGEDVNKFFNTIKTFDIAESLLKKDFSNQYIKFDIITDKEKIPLNIRLGDKNFEKGIEHLINIGSSKISKENINPEIKKDLNNQLGTYKPKVYDEMLDGTFKALKNLSEVANKDIGVMISEFANSYSETREKFEKKQINKKSFFKEKMNEFFKKKLNKILPDREISNEKTYSRSR >NZ_CP023544.1|WP_057036741.1|14256_14538_+|hypothetical-protein MLKESKLIEELKREYDEKLKKLLQKEKENKERIFKKFSSALFKDFEINEDFKNEFNLLVEKFDCKNTKNILDKINNLYDFNHRNDKIDTAKKQ >NZ_CP023544.1|WP_021034330.1|13511_14063_-|hypothetical-protein MNKNNNCVIKVSKDDKIILEYIKSETNASYSKIISILLKKFNSCDTDEKNKINDEICKNKFYTSDENKIIKLKLTENEVNILKEISKNTGFSSITKQAKFLLLNSIKNEKLFTNIEIDEFIKTRTEINAIGKNIYQLLKILRSGNSVKINENNLNKTMDNIRDKIDILSDQLGAIIEKNNERI >NZ_CP023544.1|WP_002801489.1|12123_13512_-|relaxase/mobilization-nuclease-domain-containing-protein MSRSIRIFDDEIIAKKVFTKIENASKLPLNYINKNRDKYTKDIKTGKLISKNMFRKNTEVVVKITSGSKNSQALSKHLDYISRDGNVELITNDFDRYAGEDEILEVKRIFKNEGSPIPLYKEGAKEKRHTINMVFSMKEHSTTPKEKLQQAVITTLKRMYPNNFFVVAFHNDTDNPHCHVCLKVADKNGKRINPKKADLANLRAEFAKALNELGVEAKATNKKQREVEINQEFSVKLNANNEINQAPKIKMHYYQVMDFGEANYQFSTDKNAKKSYYVSYKTKKGITTIWGQDLERVVRENKVLRGEYARFKIVGQEEYEIKRKAKINNKWQEVVKTLKKPIWEVSVIGREKDLKQINKAKTTKKYKIIQDKGVNNERDYTKQYRQRVLQELGNKSTIRRETAQERNSMRILSKQPMVHNTKRTQMLLHINALNQLQQGERGRSDNILRWTSARNNEIKRDG >NZ_CP023544.1|WP_031263757.1|10776_11388_+|NYN-domain-containing-protein MEAKELAKRLKDYVWETLRRNEDYLHRVYIYDCEPLDKNVPMPPIEKTDKSKNLSKTTTYKFRSELLNHLRKQPYFAVRLGEIDENSFQWKFRDYDKFRKILRKEIDICELTSEDFVLDIKQKGVDMKIGLDIATLANKHHAEKIILITADSDFIPAVKHARKEGIIVQLDPMRIPETQIKKGLLEHIDILSSVFINKNKNGN >NZ_CP023544.1|WP_079275893.1|4727_10523_+|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MSKKTKRQIEDEKDYGGRSLFDLIELEFSQGEENEQQNRELSEHREVTDNIERTSISSNTPSVDRQENSAIQFDNTREMGRVLSEHNQESRNVRSHDTSITTSSNGISNFGEQRSEQEERSGANRYGDTSGRADKSQSIHSNRTPNLFSFISRNDDERQGTGTRRDNQQSVLETATRNDGYERRSLKSGQKLDFVSDDEIYLGSLKDRFQKNLQAIKLSKTIEQENRYATKQEQEILNKFSGWGGIPQAFDHQNKEWEKEFKELISTLDYVEYEKAKTSTLDAFYTPKIIIDTIYQGLNQLGFNNDGHTKEIFEPSAGIGSFLSYAKNYSDKYHFTCVELDTISANILKHLHPNQTIYNKAFQHHLFDKPYDAFIGNPPFGQKKILDLNDTTLNKTSVHNYFIGNAIKNLKEDGIAAFVVSSYFLDSKNSTIRNYIAEQATFLGAVRLPNNAFKKRANTEVTTDIIFFKKGKDLNIDKSWLESVEYYDDRFDEAEKRGMHPDVFNDFRINEYFKNNPQNILGKMNIKSSQYGYSLECLDDGRDLKIALENFTKTLPKNIYKYQETKIKLSYYRIDRESPEYEKYSKTLSKLKDGNYFEYNNEIYMKIRSDDELVFSKPVLNEHDTRRIKKLIALRDQFNTLIEYEKNESSDLLVENQRKYLNKLYDEFVAKEGYLNRDANKKAFREDVEANKILALEKNYSSGISKSVALKEGIDPIAPSATKADIFFKRTINAQKEIKISTPKEALIASINEYGRIDLKFLETNLNQPLEETLKSLEQDKLIFKDHKNPANYVLAEKYLSGNVKAKHKEVKKLVEDGFNEFVNNLESLEQVLPKDLKAVDISISLGTTWIPIKYYKQFIEETLQITPKDYDLFLMEKTGEWSLKGFGHSLSPYIRSQYATEKIGCFDLFEHGLLRKPIRIYDKKLDPSGKEIRELNPKETAIANSKLENLKNEFIEWIYKDYDRRTDLENIYNERFNTNIEPQYNGEHLELPNFNANIKLKKHQKNAIYRAIQENSIIFDHQVGAGKTLVAICSVMEQKRMGLLNKPLIVVPNHLARQWNDEFYHAYTNANILVATNDDLKKDNREKFFSKITTNNFDAIIMTHSQFKLIPAPYEVIKKQYEEDINILEQTLEKKQNDDNVMRYSVKDLEKRIENFKVKLSDLQTTHKKSKAIDFSELGIDALIIDEAHEFKNLLITTSMGDISGLGNLKGSQKAYDLYSKTQYIHEQNKKLYFLTGTPISNSITELYTLQRYIQPNILKEKGIQAFDSWASTFGEVTNAWELDSSGINYKIVARFNKFKNVPELSTMYKSVADIVTNNDIMKYQKDFVPKLYNDKPINIVAPRSEEIAEFIGIQDENGRWNEGSIVWRMEHQQDDITRNNLLACTTDARKAGLDFRLINPHCDDYANSKINKLIENVFNEYNAWNDDKGTQLIFCDLSTPKQHSQKVALNGNIATPNLNKEEFVNINETIEQTEEENSKSLDELLAEQAKFDVYTDILKKLVAKGIPQNEIRFIHDAKTDLQKGQLFADMNSGKARILIGSTQKMGAGTNVQKRIVALHHLDCPWRPSDLEQRSGRVIRQGNELFMRDPQNFRVKEFRYATERTYDARMWQVIESKARSIEQFRKAGADVRTLEDVTSGAADAAEMKAEATGNPLILLQVQLNSDLRQEEMLYSGYKRQIHNNEESLITNLSKIELLKKDIAKMEILNSIIKENNSEHFQGKYYINDDEKDFIVFKNDTSDLNKSRQAELERNFEKIVKTIADDYQKEYKVLEFKGLLISGERTDLNTLNFYVSTTDGKTIIEPENLIYKRDEKTFFKLESYVNFGGFVKRLNNFYNDLEKFTQLNKNKIENLEKEIVELKSITGDNTPKYKRKDYLEALREDNRIIMDEIEKMSKQKNYKSDFVPKSAKILEDLNKHNKILKDRELLI >NZ_CP023544.1|WP_002801148.1|18405_18624_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MLLNIIIEKDQDGYFARILELEGCVSQGNTYEEALVNIKEAGELYLESLANEEKRIIENKTTSIIPMVLANA >NZ_CP023544.1|WP_002790340.1|18616_18820_+|addiction-module-toxin,-HicA-family MPELPRMTAKEAEKLLLQNDFSIDRQKGSHRIYKKGLYRMVIPHHSGEILHPKIIKQLFEIIEVAKD >NZ_CP023544.1|WP_057036742.1|18823_20617_+|AAA-family-ATPase MPKRNTIETITLGLFSDEDVSIICEDTIKLERGSVAVLSGNSEVGKSFLALKVCANAINDGLKPFFWSVEDKNKAILERIKNIESFYSFNTAELEFSNELPKINKEPINCLKEELNKLADCDLIVLDTFSAFFSTLGFKDQNNQNDVQNFFNILTDIAKSNNQAILLLHHLDKKGESLMGSSVIINAPRLVYKLSFEKGEDKNSTTYRLLEVLKDNNNINAGEFQKTIKVLQNSSIDEPSIVNLRANSIDSNTLEIINKKDISAVSVNELAKGYVTMNENRGVFYLSSRKLTDTNFYKVFKENDNKIDFKMTGANGSSYAISLKNSLLTQTHRNILDALFLYIKKNVDTSVIKKYQENFWDMEVRLEPYKFLKQYLNKNSNNYSWLKQKFTEISRFAYDLAFTQNVEDKDKKTITQRDKGILMFDSVERITKENGTIVSVFVLTVRREYIKKLETESTLSYDDDLSKILINLNSLVAQDLIRFLTSFPDKKILSYSEFCEIKAYKFYKENSIISRQKKEIIKLKDKLIEFGINIYGKGVEFADYDDEFFHNKYKNENDLFFIYQSNNKVKRYIKRDDPMNQLNTKDNRFLLQKSLFD >NZ_CP023544.1|WP_002803413.1|20746_21361_-|recombinase-family-protein MNIAYIRVSTNKQELDSQKLEIMEYCHKNNIILDEILEVKISSTKSQEKRKIKDLKQRLQSGDLLIATELSRLGRSMLEIINLVLEFNANNINFLFLRQRELSNFNNPSSKLILSIYAYLAENERDLISQRTKAGLENAKASGKKLGRPKGSLNSIYDKDIDKIQTLLDKDLSIRSIWKLFYKDSGKTYDGLLWFIKKRKLKQK >NZ_CP023544.1|WP_002801138.1|21357_21765_-|vapd MGINRKAINFDLSTKSLEKYFKDTREPYSLIKKFMLENGFEHRQYSGYTSKEPIDERRVARIVTKLAKKFTWFGECVKEFDITEIGEQYSLKDTIQNLCIKEINKQAGYNKDFHGKFKEFTQKTPKNQKLKDLER >NZ_CP023544.1|WP_002779624.1|21755_22079_-|hypothetical-protein MAYPLLGTRIVLDEEKILKEGKYNLEDMYKMIDEYAKESGMIKINKETYHCKGDKYDLGCMALFIYKYLIDSEWFTKNAKEWIWISEKEGNSDLISASKAEGEGIWE >NZ_CP023544.1|WP_002779625.1|22248_22512_+|TrbC/VirB2-family-protein MKIKLLSLILLSPIFVFAAGGIDKVNTFMENLSTALYALGAVLLTIAFMWGGSKIMFQGQTLREVAPIFIGGVIFGSASAIAGYIIT >NZ_CP023544.1|WP_021034332.1|22524_25293_+|VirB4-family-type-IV-secretion/conjugal-transfer-ATPase MEKNPLFKGLTRPPMIFGVPMTPFVIAMGSIILVAFYSQNIFLVGFSIPVFFIMKAMTKKDDFIFRLMFLKMRFFSNPASKNYYKAKTYSTNSYRQMPPNSNFPKISVFGLNAEPNFEKLIPFSSLINDSVVITKDYLLMTTWEIGGISFEAEDDDELDIKNDLLNMLFKSFANEPVSFYFHNCRYSIEDKLTSKFNNAFLEEIDRKYYESFKQGTLKKNSLYLTLIFNPLKVKIEKTTFMKSSFENKRKTISVFLAKFSEFADRLEANIKDFNPKRLKTYSKDDKTYSKQLEFYNYLLGGKFNPIRVLPNPIDQYLNGNLQNIQFGHDTIQFNQNDSTKRFARCIEIKDYTNETFAGILDILMYLDVEYTITQSFSPIPRVDAKSAISKQKKQLIATEDDGFSQVEQIDEALDQLTNGEISFGKYHFSILVYGNTIKECKDNTNEVVTKMNELGFGVTLATIALPATFFSQLPSNFAIRPRINLISSINFSSLIALHNFSMGKRDKNCWGDAVSILKTPNKQPYYFNFHQSSGVNKNDFGELFLANTLILGQSSGGKTVFMNFIVDQMMKYASKDTFPDDIPEENRKFTAIYLDKDKGALGNILCAGGRYISIENGKPTGFNPFMVENTQENIRQLQSLMKLLVTRNNEILTTREEEMLNNAVNSLMKGFEKEERKYPISLLLENLTENVDDDNSLKSRLALFKKGKQFGWVFDNEYDNLDFPDDINLFGIDGTEFLDDKDVSEILSYYILWRVMSLADGRRLCIDIDEAWKWLENEIVQEEVKNKFKTIRKQNGFLRLATQSVEDFLKLKNATTLIEQSATMVFLPNPKAKEEEYVKGVGLSYDEYMIIKGFNVAKRQFLIKRQDEKVICTLDLSSLGNENLKILSTGTAHIDTIEKIFSQENKSLDEKVLELKEFYKNS >NZ_CP023544.1|WP_002779627.1|25303_25861_+|Rha-family-transcriptional-regulator MSNKVIINKQEVQFGTQDNQIFCTSLDVAKVFGKEHKNILRDIENILNDLREIGTSNCLLNFELSFKVHKIQGFKGRERKYPYYNLTRDGFSLLAMGFTGKEALQWKILFIDAFNEMQKLLQKEIKSPNKYLTDLMELIYPNLPQNDYKVSVTITDNPYSKEAKNVFSLNYLVDNRTPKDPKKLQ >NZ_CP023544.1|WP_002779628.1|25857_26409_+|hypothetical-protein MSDKELEIFELCERLVDLLGDKEAVADLQTLLERHPEMFQNKEQVANLIKKVIHDPEIIINNPTPKSEKDYIAGKKLNEKKMGEVGIRKDENISKIFHANEKRIKNLELMAKKDVVVDGRNAHTSYTQAQSLDGRLVQKNISSATNKIIPQQNKSTNDFKAKLEEFSTKKTNAVKSINKEFKR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_KJ646012 | Campylobacter jejuni strain 11601MD plasmid p11601MD, complete sequence | 39947-39996 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP045793 | Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid p1CFSAN032805, complete sequence | 2492-2541 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NC_017282 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet, complete sequence | 33083-33132 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP013035 | Campylobacter coli strain HC2-48 plasmid pccdm1, complete sequence | 5473-5522 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP007752 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni D42a plasmid pTet-D42a, complete sequence | 6604-6653 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP014745 | Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence | 72201-72250 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP023546 | Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid pCFSAN032805_1, complete sequence | 3064-3113 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP017026 | Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence | 77864-77913 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP011017 | Campylobacter coli strain FB1 plasmid pFB1TET, complete sequence | 25209-25258 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP044168 | Campylobacter jejuni strain AR-0415 plasmid pAR-0415, complete sequence | 11714-11763 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP040609 | Campylobacter sp. CFSAN093226 plasmid unnamed, complete sequence | 4066-4115 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP017861 | Campylobacter jejuni strain TS1218 plasmid pCJDM218, complete sequence | 11000-11049 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP043764 | Campylobacter jejuni strain BfR-CA-14430 plasmid pBfR-CA-14430, complete sequence | 30424-30473 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP007750 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni M129 plasmid pTet-M129, complete sequence | 5167-5216 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP048762 | Campylobacter jejuni strain ZS004 plasmid pCJFEX, complete sequence | 17612-17661 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_MK541988 | Campylobacter coli strain CVM N61740F plasmid pN61740F, complete sequence | 9361-9410 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_MK541989 | Campylobacter coli strain CVM N61925F plasmid pN61925F, complete sequence | 33146-33195 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NC_022354 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid unnamed, complete sequence | 34776-34825 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_KX686749 | Campylobacter coli strain Tx40 plasmid unnamed, complete sequence | 16533-16582 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP007182 | Campylobacter coli RM4661 plasmid pRM4661_48kbp, complete sequence | 17073-17122 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NC_006134 | Campylobacter coli plasmid pCC31, complete sequence | 20905-20954 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP007180 | Campylobacter coli RM5611 plasmid pRM5611_48kb, complete sequence | 20269-20318 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP010073 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain 01-1512 plasmid pCj1, complete sequence | 8503-8552 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP023544 | Campylobacter jejuni strain CFSAN032806 plasmid pCFSAN032806, complete sequence | 18106-18155 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | CP002030 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet, complete sequence | 18942-18991 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP017418 | Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-1, complete sequence | 13094-13143 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP017419 | Campylobacter jejuni strain MTVDSCj16 plasmid pMTVDSCj16-1, complete sequence | 13120-13169 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP017866 | Campylobacter coli strain YF2105 plasmid pCCDM105L, complete sequence | 40967-41016 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP017879 | Campylobacter coli strain BG2108 plasmid pCCDM108L, complete sequence | 4231-4280 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP017416 | Campylobacter jejuni strain MTVDSCj07 plasmid pMTVDSCj07-1, complete sequence | 13533-13582 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP017872 | Campylobacter coli strain BP3183 plasmid pCCDM183, complete sequence | 6212-6261 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP020775 | Campylobacter jejuni strain YH002 plasmid pCJP002, complete sequence | 21028-21077 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NC_022355 | Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1, complete sequence | 18073-18122 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023544_1 | 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder | 18106-18155 | 50 | NZ_CP017869 | Campylobacter coli strain MG1116 plasmid pCCDM116L, complete sequence | 18541-18590 | 1 | 0.98 |
1. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_KJ646012 (Campylobacter jejuni strain 11601MD plasmid p11601MD, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045793 (Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid p1CFSAN032805, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NC_017282 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013035 (Campylobacter coli strain HC2-48 plasmid pccdm1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007752 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni D42a plasmid pTet-D42a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014745 (Campylobacter jejuni strain OD267 plasmid pCJDM67 L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023546 (Campylobacter coli strain CFSAN032805 plasmid pCFSAN032805_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017026 (Campylobacter coli plasmid pCC14983A-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011017 (Campylobacter coli strain FB1 plasmid pFB1TET, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044168 (Campylobacter jejuni strain AR-0415 plasmid pAR-0415, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040609 (Campylobacter sp. CFSAN093226 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017861 (Campylobacter jejuni strain TS1218 plasmid pCJDM218, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043764 (Campylobacter jejuni strain BfR-CA-14430 plasmid pBfR-CA-14430, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007750 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni M129 plasmid pTet-M129, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048762 (Campylobacter jejuni strain ZS004 plasmid pCJFEX, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK541988 (Campylobacter coli strain CVM N61740F plasmid pN61740F, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_MK541989 (Campylobacter coli strain CVM N61925F plasmid pN61925F, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NC_022354 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_KX686749 (Campylobacter coli strain Tx40 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007182 (Campylobacter coli RM4661 plasmid pRM4661_48kbp, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NC_006134 (Campylobacter coli plasmid pCC31, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007180 (Campylobacter coli RM5611 plasmid pRM5611_48kb, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010073 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain 01-1512 plasmid pCj1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023544 (Campylobacter jejuni strain CFSAN032806 plasmid pCFSAN032806, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to CP002030 (Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017418 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj13 plasmid pMTVDSCj13-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017419 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj16 plasmid pMTVDSCj16-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017866 (Campylobacter coli strain YF2105 plasmid pCCDM105L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017879 (Campylobacter coli strain BG2108 plasmid pCCDM108L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017416 (Campylobacter jejuni strain MTVDSCj07 plasmid pMTVDSCj07-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017872 (Campylobacter coli strain BP3183 plasmid pCCDM183, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020775 (Campylobacter jejuni strain YH002 plasmid pCJP002, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NC_022355 (Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttgtttttttaaagtccctattttccatatgttattttcgtaaaaatgtc CRISPR spacer ttgtttttttaaagtccctattttccatatgttattttcgtaaaaatgtc Protospacer **************************************************
34. spacer 1.1|18106|50|NZ_CP023544|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017869 (Campylobacter coli strain MG1116 plasmid pCCDM116L, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.98
ttgtttttttaaagtccctattttccatatgttattttcgtaaaaatgtc CRISPR spacer ttgtttttttaaagtccctattttccatatgttcttttcgtaaaaatgtc Protospacer ********************************* ****************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023543_1 | 1112873-1113372 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023543_1
|
7 spacers
spacers of NZ_CP023543_1
>1.1|1112910|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT GTGGTGTGCTTGGGTCTGTATTTATATCA >1.2|1112976|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT GATGCTTTAACAGTATGTTCTTTAGCAGG >1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT CTTTTTCACAATATGGTAAAGTAGTTGTA >1.4|1113108|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT TTTAATGTTGTGTAAAGTGATAATGGTAC >1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT TATCCATCTTTCATATCTTTGATTTTAAC >1.6|1113240|30|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT ACTGCTATAAGAGGAGCTACTGGTCAAGAA >1.7|1113307|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT CACCTGTTTTTGATTGAACGAAGCAACCA >1.8|1112910|30|NZ_CP023543|PILER-CR TGTGGTGTGCTTGGGTCTGTATTTATATCA >1.9|1112976|30|NZ_CP023543|PILER-CR AGATGCTTTAACAGTATGTTCTTTAGCAGG >1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR ACTTTTTCACAATATGGTAAAGTAGTTGTA >1.11|1113108|30|NZ_CP023543|PILER-CR ATTTAATGTTGTGTAAAGTGATAATGGTAC >1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR ATATCCATCTTTCATATCTTTGATTTTAAC >1.13|1113240|31|NZ_CP023543|PILER-CR AACTGCTATAAGAGGAGCTACTGGTCAAGAA >1.14|1113307|30|NZ_CP023543|PILER-CR GCACCTGTTTTTGATTGAACGAAGCAACCA |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023543_1
The CRISPR arrays of NZ_CP023543_1 >merge|NZ_CP023543|1|1112873-1113372|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTGTGGTGTGCTTGGGTCTGTATTTATATCAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAGATGCTTTAACAGTATGTTCTTTAGCAGGGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATACTTTTTCACAATATGGTAAAGTAGTTGTAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATATTTAATGTTGTGTAAAGTGATAATGGTACGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATATATCCATCTTTCATATCTTTGATTTTAACGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAACTGCTATAAGAGGAGCTACTGGTCAAGAAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATGCACCTGTTTTTGATTGAACGAAGCAACCAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA >NZ_CP023543|1|1|1112873-1113372|CRISPRCasFinder ATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATT GTGGTGTGCTTGGGTCTGTATTTATATCA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA GATGCTTTAACAGTATGTTCTTTAGCAGG GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA CTTTTTCACAATATGGTAAAGTAGTTGTA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA TTTAATGTTGTGTAAAGTGATAATGGTAC GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA TATCCATCTTTCATATCTTTGATTTTAAC GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA ACTGCTATAAGAGGAGCTACTGGTCAAGAA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATG CACCTGTTTTTGATTGAACGAAGCAACCA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA >NZ_CP023543|1|1|1112873-1113372|CRT ATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATT GTGGTGTGCTTGGGTCTGTATTTATATCA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA GATGCTTTAACAGTATGTTCTTTAGCAGG GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA CTTTTTCACAATATGGTAAAGTAGTTGTA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA TTTAATGTTGTGTAAAGTGATAATGGTAC GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA TATCCATCTTTCATATCTTTGATTTTAAC GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA ACTGCTATAAGAGGAGCTACTGGTCAAGAA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATG CACCTGTTTTTGATTGAACGAAGCAACCA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA >NZ_CP023543|1|1|1112874-1113371|PILER-CR TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATT GTGGTGTGCTTGGGTCTGTATTTATATCAG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA GATGCTTTAACAGTATGTTCTTTAGCAGGG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA CTTTTTCACAATATGGTAAAGTAGTTGTAG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA TTTAATGTTGTGTAAAGTGATAATGGTACG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA TATCCATCTTTCATATCTTTGATTTTAACG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATA ACTGCTATAAGAGGAGCTACTGGTCAAGAAG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATG CACCTGTTTTTGATTGAACGAAGCAACCAG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
>NZ_CP023543.1|WP_057036707.1|1111562_1112753_+|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MLMSYEESLKILHSHIKTYEKIEKIALTECLGRILAQDIKAPKNQPEFPTSAMDGYAIKFEDQDKPLKILGLTPAGTMPQFSVQNGTCVKTFTGSLMSEGSDTLVPVENIRIENNTLFIEKKVPQAFAVRAVGENYKKDEILLKKGTRLNYSEIALLAELGFFHISVFIKPIVGVLSSGSEIKDLGEALENPAQIRSSNHIAIANLAKNLNCDTRVFPLLKDDEKATFSTLESALQSCDILVTTGGVSMGDFDFLKKAIKEYEIIIDKADIKPGRHIKIAKANEKFIIALPGFPYSAMVMFNLYTREILNSWLLQPKDYICKAFLQGSYKKKTPYLEFVACNIEFKNGRILANLEGKKEGSSAIINNLNNKAALMVVPKECGMLENESLVDIIFMP >NZ_CP023543.1|WP_002781229.1|1111112_1111559_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKHFTLYQGSLDIPKIYSQWYEFSKDKNCGALLTFCGIVREEGGIEALSFDIYESLLKKWFDEWQKRVDFDGISLLFAHSIGDVAIHESSYFAGILSKQRKLGLKLLNEFVEDFKASAPIWKYDVINKERIYAKERSTKLCGAGLLKG >NZ_CP023543.1|WP_002779488.1|1110890_1111112_+|MoaD/ThiS-family-protein MVKVEFLGPINKENLELEVKNLKELKEILQKDESLKEWLELCAVSLNDEIIFDENTKLKDGDKIALLPPVCGG >NZ_CP023543.1|WP_057036708.1|1109347_1110889_+|multicopper-oxidase-CueO MNRRNFLKFNALTLASMGVAYANPMHDMHSMHKNHSINHDLDTSFINFAPKNLKLLDPKQFPQGEILKALPLLKNESKEKNIFRATIEIKENHIELIKGKKTLFYTYNGLVPAPKIEVFEGDKLEILVKNKLKEATTIHWHGVPVPPDQDGSPHDPILAGEERIYRFEIPQDSAGTYWYHPHPHFTTSKQVFMGLAGAFVIKAKKDALSHLKERDLMISDLRLDENAQIPNNNLNDWLNGREGEFVLINGQFKPKIKLATNERIRIYNATAARYLNLRIQGAKFILVGTDGGLIEKAIYKEELFLSPASRVEVLIDAPKDGEFRLESAYYDRDKMMVEEEPNTLFLASISLKKENLELPKNLKIFKPLEEPKEFKEIIMSEDHMQMHGMMGKSENELKIALASMFLINGKSYDLKRIDLSSKLGVVEDWIVINKSHMDHPFHVHGTQFELISSKLNGKVQKAEFRAFRDTINVRPNEELRLRMKQDFKGLRMYHCHILEHEDLGMMGNLEVKE >NZ_CP023543.1|WP_057036709.1|1108086_1109235_-|carboxynorspermidine-decarboxylase MFYENIQTPAYILEEDKLRKNCELLASVGEKSGAKVLLALKGFAFSGAMKIVGEYLKGCTCSGLWEAKFAKQYMDKEIHTYSPAFKEDEIGEIASLSHHIVFNSLAQFHKFQAKTQKNSLGLRCNVEFSLAPKELYNPCGRYSRLGIRAKDFENVDLSTIEGLHFHALCEESAGALEAVLKVFEEKFGKWIGQMKWVNFGGGHHITKKGYDVEKLIALCKNFSDKYGVQVYLEPGEAVGWQTGNLVASVVDIIENEKQIAILDTSSEAHMPDTIIMPYTSEVLNARILATRENEKISDLKESEFSYLLTGNTCLAGDVMGEYAFDKKLKIGDKIVFLDQIHYTIVKNTTFNGIRLPNLMLLNAKNELQMIREFSYKDYSLRN >NZ_CP023543.1|WP_024088174.1|1107069_1107783_-|hypothetical-protein MGALMDLEKLRLARSLYYQCLGELFVFSFSEERLSKLQEYLKTMQECLFDENLKSNFDILLKHLDDENSIQAFFKEYDLLFLSLKNSIPTTFSYIEEGFENSNPLLCVRQILVKSKIRRNEKFFKESEDSVGFCLLLMSEFLRQNEDDLAKELFEKVINKSIDEFLGDVFMNKNANLYKEIASIALAFMEFERLCFEVEKPAKINSKKVQNDLSRSEFLRREANKQRRTREKSQGIS >NZ_CP023543.1|WP_002851537.1|1106903_1107095_-|twin-arginine-translocation-signal-domain-containing-protein MKNRREFLKKSAFALGAAGVLGSTTLALAKDEERKDLVKGKSKKKEVLFQRSANWENYYIKAE >NZ_CP023543.1|WP_079264288.1|1104099_1106904_-|formate-dehydrogenase-subunit-alpha MSSVGENIKLTRRSFLKMAALSSLATPLLARSETLREASADELKEAYEGSKKVKTVCTACSVGCGIIAEVQNGVWVRQEIAQDHPVSSGGHCCKGSDMIDMVRSHVRLKYPMKKENGEWKRISYEQALSEIGEKLAAYRKENPESVMFLGSAKLNNEQAYYIRKFAAFFGTNNVDHQARIUHSATVAGVANTFGYGAMTNHLGDIQRSKCIIIIGANPAVNHPVGFRHFLKAKEKGAKLIVVDPRFTKSAAKADIYARIRPGTDIAFMYGMLKIIFDEGLEDTKYLDERVFGIDKIREEAAKWTAEEVENVTGISKELLVQITHEVAKNKPTTLIWAMGLTQHTVGTSNTRLAPIVQMVLGNIGKFGGGVNILRGHDNVQGASDMACLSENLPGYYPLNEATWRYYAKIWGVDYEWLLGNFVSKDWMHKTGLSLARWWAAALNGKDGNDAIDNAGTPLKALVVMGNGITSTAQQVKVKEGLEALELLVLADPFVNEAGIIAERKDGIYLLPAATQFETSGSVTATNRSGQWRFKVVDPLYESMEDQEILFELAKKLGFYEDFTKTLRDEKGEIVWPENATREIAKAVRSIGLNGWSPERLKKHTLYWDKFDEVTLEGKDEVAGEYYGLPWPCWSDKHPGSPVLYNTDIEVAKGGMGFRNNFGLEYEGESLLAKNAPLNSPINTGYPQITKDNIEKVLGITLSAQEKEKMGSTWSYDDSNIIATKCIEKGIVPYGNAKARAVVWTFKDKIPLHREPLHSPRNDLVQKYPSFEDQKALYRVDTKFVSVQQAKDYSKEFPLNLVTARLVNLNGAGMENRASMYLTRLTPEMFCEINPELAKEQDIKAGDMIWVHSPEGTKIHVRVKVNPGVAKDMIFLPFHFTGVMQGVDLTHNFPEGTKPYASGESANTVTNYGYDIMCQIPETKGGLCRISKDGK >NZ_CP023543.1|WP_002851264.1|1103461_1104103_-|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MSKVNFANLEKERLKFFCDNERCIDCNGCAVACDEAHELPIHIRRRRVITLNEGIQGKEVSTSISCMHCDDAPCSIVCPVDCFYIRADGIVLHDKEICIGCGYCLYACPFGAPQFPKDSVFGNKGIMDKCTMCAGGPEATNSEKERELYGQNRIAEGKVPVCAAMCSTKALLVGESSKIEEIYHNRLMNRNYGIPNPSESLEWKIAYTGKERL >NZ_CP023543.1|WP_002851174.1|1102532_1103465_-|formate-dehydrogenase-subunit-gamma MRKVFVTLLLSVVSLFAYGSERMGQDTQIWDFHRITNIPNYDTFGKLWTTLQGEYIATIALIAVIAVLSAFALHYMVIGPKQFSHDGKKIYAFTLFERLFHFIAAISWVILVPTGFVMMFGEVFGGGVFVRVCKNLHAFATILFIISIIPMFLCWIKRMLPASYDIRWMMIVGGYLSKIKRPVPAGKFNFGQKSWYYIAVFGGFLMIITGGFMYFLDFNSTAIQGLFGLTQIELLRISAIVHNFLGIVCAVFFGVHIYMAVFAIKGSIHSMISGYKEEEEVYILHSYWYKELSNKKQIEPSFSYDPNVKI >NZ_CP023543.1|WP_002797817.1|1113515_1113947_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MIEDKFMRVLLMFDVPTKSKKEQKLASKFRNNLIKLGYFMLQFSVYMRICKGLSSAKSSIENVKKILPPYGNVRALIITEKQFDKMELLLGGIVFNEKVNNETNLTLFDIDSHGEFKYKNSNNEEIQINKKQEKYHQQNLFEF >NZ_CP023543.1|WP_002797819.1|1113939_1114830_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSYDEAFKTLLISSNAKLNLELNHLVIKQDENIAKLFLKDINIIVLESLQISISSALFNAFAKYKIILLTCDETHSINGVFTPFLGHFQSAKIAKEQMNVSAQKKAILWQKIIKNKILNQAFILKKHNKIEQSNELINLAKKVSLNDSKNIEAVAAALYFKTLFGTSFSRDELCFENSALNYGYAIIRACIIRAVCISGLLPWLGIKHDNIYNSFALCDDLIEVFRASVDDCVLKLKGESEFLSKDDKRALIGNLQSKINFDGQNYPLNRAINHYVANFKNALLYEDELKIVKFDD >NZ_CP023543.1|WP_002895475.1|1114826_1117781_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MARILAFDIGISSIGWAFSENDELKDCGVRIFTKVENPKTGESLALPRRLARSARKRLARRKARLNHLKHLIANEFKLNYEDYQSFDESLAKAYKGSLISPYELRFRALNELLSKQDFARVILHIAKRRGYDDIKNSDDKEKGAILKAIKQNEEKLANYQSVGEYLYKEYFQKFKENSKEFTNVRNKKESYERCIAQSFLKDELKLIFKKQREFGFSFSKKFEEEVLSVAFYKRALKDFSHLVGNCSFFTDEKRAPKNSPLAFMFVALTRIINLLNNLKNTEGILYTKDDLNALLNEVLKNGTLTYKQTKKLLGLSDDYEFKGEKGTYFIEFKKYKEFIKALGEHNLSQDDLNEIAKDITLIKDEIKLKKALAKYDLNQNQIDSLSKLEFKDHLNISFKALKLITPLMLEGKKYDEACNELNLKVAINEDKKDFLPAFNETYYKDEVTNPVVLRAIKEYRKVLNALLKKYGKVHKINIELAREVGKNHSQRAKIEKEQNENYKAKKDAELECEKLGLKINSKNILKLRLFKEQKEFCAYSGEKIKISDLQDEKMLEIDHIYPYSRSFDDSYMNKVLVFTKQNQEKLNKTPFEAFGNDSAKWQKIEVLAKNLPTKKQKRILDKNYKDKEQKDFKDRNLNDTRYIARLVLNYTKDYLDFLPLSDDENTKLNDTQKGSKVHVEAKSGMLTSALRHTWGFSTKDRNNHLHHAIDAVIIAYANNSIVKAFSDFKKEQESNSAELYAKKISELDYKNKRKFFEPFSGFRQKVLDKIDEIFVSKPERKKPSGALHEETFRKEEEFYQSYGGKEGVLKALELGKIRKVNGKIVKNGDMFRVDIFKHKKTNKFYAVPIYTMDFALKVLPNKAVARSKKGEIKDWILMDENYEFCFSLYKDSLILIQTKDMQEPEFVYYNAFTSSTVSLIVSKHDNKFETLSKNQKILFKNANEKEVIAKSIGIQNLKVFEKYIVSALGEVTKAEFRQREDFKK >NZ_CP023543.1|WP_002851320.1|1119449_1120439_-|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MKISYEDAGVSIDNGNTFVEAIKPLVKETFNDNVVGGIGSFAGAFRMPSGFKKPVILGATDGVGTKLRLAIDAKKYDTIGQDLVAMCVNDLICNFATPLFFLDYYATAKLEVEVAKAVVSGIAKGCKMANCALIGGETAEMPGMYAKDDFDLAGFAVGMAEEDEIDRSKFVKNGDILLALSSSGLHSNGYSLARKVLFESLKLKFDDKIEGKNLIDILLEPTRIYVRDFLTLKPYISALAHITGGGLVENLPRVLPRGMGATIRKHHLKTPEIFYTIGQAVEESEMYRSFNMGVGLVMVVDPSNVSKILENSDAFIIGEICINEGIVLE >NZ_CP023543.1|WP_002872138.1|1120499_1121105_+|dephospho-CoA-kinase MKNAFFVTASIACGKSTFIEIANSLDFKSISADKIAHKILDENALELEKIFSPFNLKNLLTKEKKIDRKILGEIVFNNKEAKKILENFTHPKIRAKILEQMQILDKENKAFFVEIPLFFESGAYENLGKVIVIYTPKELSLKRIMQRDKLSLEAAKTRLDSQIDIEEKLKKADFIIKNTNSYADFRQECVKVIQEISKGKM >NZ_CP023543.1|WP_002872139.1|1121101_1121851_+|diaminopimelate-epimerase MKFYKYCASGNDFVITNADRKEDRSALAKELCNRYEGIGGDGFIVILPHEKYDFEWEFYNNDGSRAAMCGNGSRAAAHFAHHINKINPNMSFLTGAEIIKAKVNQDKVEVSLGKIKSVQNTFEELGKTWQLCDTGVPHLVHFCQNLDEFDTILCQKMRQKYNANVNFVKILDENHLKVRTYERGVEDETLACGTGMGACFYLAFLNKKVQNKVKITPKSGEEVGFTYKNEELFFEGKVKYCFEANYNFS >NZ_CP023543.1|WP_002872140.1|1121825_1122557_+|mannosyl-glycoprotein-endo-beta-N-acetylglucosamidase MKPIIIFLSLFLIPLFADDLKNGFGEEYYKLDIDQKRQIFFIKMNEMFDQSFKKIEQERAFIEAFFKDAYKTGFRTSNQINLEKLITIKNKYRIENLYDFAEYKKRIQKIPKSMGIAQALVESATGTSRFAREANNLFGEWTWGEKGLIPDLRHPDKKHKIKIFDSLQDSVDSYVLNLNRHFAYEKFRDARAKFESEGKEITGLEAIKTLDSYSERKGYYINLITKIIKRYNLEKYDTNSNNT >NZ_CP023543.1|WP_002851155.1|1122553_1123591_-|ATP-binding-protein MKVLNFFYENHPKFEVSYERKNQISKPNIIIKGPRFCGKKTLIFNFLSQFKASEILFLDLYDTRFEKQSLERLADFLNENLQIKILCLYNLDFIPNLEKINIPIILSTNIKDLNVNGFEELELDYFDFEEFISVSKKNLPINNLVGLFLQSGRSKFGEKNILLRQSFTLLELEILKYLALNLGQQISISKIFIELKKRLKTSKDSVYQAIKKLENTYVIYTLKHDEKKLQKIYFKDFGLRNNLCISKDFSHLFENLVLSELFKFKEEFFYNKYFNFYSQISKIAYISSPTLDIDLIKLRAKKILPKALELGIFHVIFITLSSEDNFFEQGVKFEVISFDKFSLGF >NZ_CP023543.1|WP_002851546.1|1123655_1124105_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSVTKQLLQMQADAHHLWVKFHNYHWNVKGLQFFSIHEYTEKAYEEMAELFDSCAERVLQLGEKAITCQKVLMENAKSPKVAKDCFTPLEVIELIKQDYEYLLAEFKKLNEAAEKESDTTTAAFAQENIAKYEKSLWMIGATLQGACKM >NZ_CP023543.1|WP_002855462.1|1124234_1125455_-|glucose-6-phosphate-isomerase MLNNTLFFKQSEIHTISSYANRINDEVKSGDIGYYHLIDTSLNLIDESLQFIQDKEYVKNIVLVGMGGSSCGVKALRDMLFNEKSNQRELFILDNTSSHSFNKTLEKIKLEESLFLIISKTGSTIEVVSLFKLLIEHFKLDMQELKKYFVFITDKDSKLHQEGENLGIKCFFIPANVGGRFSILSAVGIVPLCFCGYNAKALLEGAKACFEDFFTHKKDEILQKAYHYCTHKNANINVLFSYSDAFKGFNEWYIQLIAESLGKKQGYKRIGLTPIALIGARDQHSFLQLIMDGPKNKTVTFLKIKDAQKAPIIPDIHFKFLDSLSNKVNLHELLNAQCDATMHALIAENLSVDVIELEKLDAWHAGYLMYYYELFTSTCGVMLGINTYDQPGVEVGKLILKNILNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP023543_1 | 1.1|1112910|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1112910-1112938 | 29 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 3258-3286 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023543_1 | 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113174-1113202 | 29 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 24735-24763 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023543_1 | 1.6|1113240|30|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113240-1113269 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 9916-9945 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023543_1 | 1.7|1113307|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113307-1113335 | 29 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 13944-13972 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023543_1 | 1.8|1112910|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1112910-1112939 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 3257-3286 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 24734-24763 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023543_1 | 1.13|1113240|31|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113240-1113270 | 31 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 9916-9946 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023543_1 | 1.14|1113307|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113307-1113336 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 13943-13972 | 0 | 1.0 |
NZ_CP023543_1 | 1.2|1112976|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1112976-1113004 | 29 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 30207-30235 | 1 | 0.966 |
NZ_CP023543_1 | 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113042-1113070 | 29 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 1772-1800 | 1 | 0.966 |
NZ_CP023543_1 | 1.4|1113108|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113108-1113136 | 29 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 4022-4050 | 1 | 0.966 |
NZ_CP023543_1 | 1.9|1112976|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1112976-1113005 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 30207-30236 | 1 | 0.967 |
NZ_CP023543_1 | 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113042-1113071 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 1772-1801 | 1 | 0.967 |
NZ_CP023543_1 | 1.11|1113108|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113108-1113137 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 4021-4050 | 1 | 0.967 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | NZ_CP013615 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence | 245985-246014 | 4 | 0.867 |
NZ_CP023543_1 | 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113042-1113070 | 29 | LC519601 | Cronobacter phage vB_CsaP_009 DNA, complete genome | 63756-63784 | 5 | 0.828 |
NZ_CP023543_1 | 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113042-1113070 | 29 | MN812223 | Flavobacterium phage vB_FspS_mumin6-4, complete genome | 18716-18744 | 5 | 0.828 |
NZ_CP023543_1 | 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113042-1113070 | 29 | MN812227 | Flavobacterium phage vB_FspS_mymlan6-1, complete genome | 19196-19224 | 5 | 0.828 |
NZ_CP023543_1 | 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113042-1113070 | 29 | MN812222 | Flavobacterium phage vB_FspS_mumin6-3, complete genome | 18716-18744 | 5 | 0.828 |
NZ_CP023543_1 | 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113174-1113202 | 29 | NC_017296 | Clostridium acetobutylicum EA 2018 plasmid pEA2018, complete sequence | 42290-42318 | 5 | 0.828 |
NZ_CP023543_1 | 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113174-1113202 | 29 | NC_015686 | Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa, complete sequence | 42290-42318 | 5 | 0.828 |
NZ_CP023543_1 | 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113174-1113202 | 29 | NC_001988 | Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1, complete sequence | 42290-42318 | 5 | 0.828 |
NZ_CP023543_1 | 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113042-1113071 | 30 | MN812223 | Flavobacterium phage vB_FspS_mumin6-4, complete genome | 18716-18745 | 5 | 0.833 |
NZ_CP023543_1 | 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113042-1113071 | 30 | MN812227 | Flavobacterium phage vB_FspS_mymlan6-1, complete genome | 19196-19225 | 5 | 0.833 |
NZ_CP023543_1 | 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113042-1113071 | 30 | MN812222 | Flavobacterium phage vB_FspS_mumin6-3, complete genome | 18716-18745 | 5 | 0.833 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | JN638751 | Bacillus phage G, complete genome | 262323-262352 | 5 | 0.833 |
NZ_CP023543_1 | 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113042-1113070 | 29 | MT740244 | Proteus phage 3H10_20, partial genome | 21109-21137 | 6 | 0.793 |
NZ_CP023543_1 | 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113174-1113202 | 29 | NZ_CP036551 | Bacteroides fragilis strain DCMOUH0042B plasmid pBFO42_1, complete sequence | 5720-5748 | 6 | 0.793 |
NZ_CP023543_1 | 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113174-1113202 | 29 | NZ_KJ830768 | Bacteroides fragilis strain 69566 plasmid pBF69566b, complete sequence | 1055-1083 | 6 | 0.793 |
NZ_CP023543_1 | 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113174-1113202 | 29 | MF417868 | Uncultured Caudovirales phage clone 7AX_1, partial genome | 82443-82471 | 6 | 0.793 |
NZ_CP023543_1 | 1.7|1113307|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113307-1113335 | 29 | MW117965 | Synechococcus phage S-H38, complete genome | 9860-9888 | 6 | 0.793 |
NZ_CP023543_1 | 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113042-1113071 | 30 | LC519601 | Cronobacter phage vB_CsaP_009 DNA, complete genome | 63755-63784 | 6 | 0.8 |
NZ_CP023543_1 | 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113042-1113071 | 30 | NZ_CP053469 | Fusobacterium nucleatum strain Fn12230 plasmid unnamed, complete sequence | 5846-5875 | 6 | 0.8 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | AP012341 | Staphylococcus phage phi7401PVL DNA, complete genome | 31811-31840 | 6 | 0.8 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MG029515 | Staphylococcus phage phiSa2wa_st80, complete genome | 30237-30266 | 6 | 0.8 |
NZ_CP023543_1 | 1.1|1112910|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1112910-1112938 | 29 | NC_009928 | Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3, complete sequence | 40433-40461 | 7 | 0.759 |
NZ_CP023543_1 | 1.2|1112976|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1112976-1113004 | 29 | MH542234 | Staphylococcus phage Terranova, complete genome | 102573-102601 | 7 | 0.759 |
NZ_CP023543_1 | 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113042-1113070 | 29 | MT028297 | Proteus phage Privateer, complete genome | 20196-20224 | 7 | 0.759 |
NZ_CP023543_1 | 1.4|1113108|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113108-1113136 | 29 | MN694358 | Marine virus AFVG_250M310, complete genome | 19568-19596 | 7 | 0.759 |
NZ_CP023543_1 | 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113174-1113202 | 29 | NC_014824 | Ruminococcus albus 7 = DSM 20455 plasmid pRUMAL01, complete sequence | 118960-118988 | 7 | 0.759 |
NZ_CP023543_1 | 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113174-1113202 | 29 | JN638751 | Bacillus phage G, complete genome | 262323-262351 | 7 | 0.759 |
NZ_CP023543_1 | 1.7|1113307|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113307-1113335 | 29 | CP006878 | Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 plasmid pRgalR602a, complete sequence | 31817-31845 | 7 | 0.759 |
NZ_CP023543_1 | 1.8|1112910|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1112910-1112939 | 30 | NC_009928 | Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3, complete sequence | 40432-40461 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113042-1113071 | 30 | MT740244 | Proteus phage 3H10_20, partial genome | 21108-21137 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113042-1113071 | 30 | NZ_CP018299 | Photobacterium damselae strain Phdp Wu-1 plasmid plas1, complete sequence | 267044-267073 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MG770897 | Staphylococcus phage SH-St 15644, complete genome | 10956-10985 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MG029513 | Staphylococcus phage phiSa2wa_st72, complete genome | 32262-32291 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | AB045978 | Staphylococcus phage phiSLT DNA, complete genome | 27848-27877 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | KY056620 | Staphylococcus phage P240, complete genome | 11106-11135 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MT366568 | Staphylococcus phage R4, complete genome | 11106-11135 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | JQ957932 | Staphylococcus phage StauST398-2, complete genome | 30689-30718 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | NC_002661 | Staphylococcus phage phiSLT, complete genome | 27848-27877 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MK940809 | Staphylococcus phage Sa2wa_st8, complete genome | 30963-30992 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | EU861005 | Staphylococcus phage phiSauS-IPLA35, complete genome | 31057-31086 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MG029509 | Staphylococcus phage phiSa2wa_st5, complete genome | 29872-29901 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MG029517 | Staphylococcus phage phiSa2wa_st93, complete genome | 30962-30991 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MG029516 | Staphylococcus phage phiSa2wa_st93mssa, complete genome | 30962-30991 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MK801680 | Staphylococcus phage SAP8, complete genome | 11117-11146 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MK801681 | Staphylococcus phage SAP11, complete genome | 9608-9637 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MF417868 | Uncultured Caudovirales phage clone 7AX_1, partial genome | 82442-82471 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | JQ779023 | Staphylococcus phage SMSAP5, complete genome | 34389-34418 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.14|1113307|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113307-1113336 | 30 | MW117965 | Synechococcus phage S-H38, complete genome | 9860-9889 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.14|1113307|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113307-1113336 | 30 | CP006878 | Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 plasmid pRgalR602a, complete sequence | 31816-31845 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.14|1113307|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113307-1113336 | 30 | MT334653 | Buttiauxella phage vB_ButM_GuL6, complete genome | 59359-59388 | 7 | 0.767 |
NZ_CP023543_1 | 1.2|1112976|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1112976-1113004 | 29 | NC_014389 | Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360, complete sequence | 340622-340650 | 8 | 0.724 |
NZ_CP023543_1 | 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113174-1113202 | 29 | MT773554 | Myoviridae sp. isolate BML_2 genomic sequence | 84750-84778 | 8 | 0.724 |
NZ_CP023543_1 | 1.7|1113307|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113307-1113335 | 29 | NZ_LR134418 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9 | 350898-350926 | 8 | 0.724 |
NZ_CP023543_1 | 1.7|1113307|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT | 1113307-1113335 | 29 | MT334653 | Buttiauxella phage vB_ButM_GuL6, complete genome | 59359-59387 | 8 | 0.724 |
NZ_CP023543_1 | 1.9|1112976|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1112976-1113005 | 30 | MH542234 | Staphylococcus phage Terranova, complete genome | 102573-102602 | 8 | 0.733 |
NZ_CP023543_1 | 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113042-1113071 | 30 | MT028297 | Proteus phage Privateer, complete genome | 20195-20224 | 8 | 0.733 |
NZ_CP023543_1 | 1.11|1113108|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113108-1113137 | 30 | MN694358 | Marine virus AFVG_250M310, complete genome | 19568-19597 | 8 | 0.733 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | NC_014824 | Ruminococcus albus 7 = DSM 20455 plasmid pRUMAL01, complete sequence | 118960-118989 | 8 | 0.733 |
NZ_CP023543_1 | 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113174-1113203 | 30 | MT773554 | Myoviridae sp. isolate BML_2 genomic sequence | 84749-84778 | 8 | 0.733 |
NZ_CP023543_1 | 1.9|1112976|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1112976-1113005 | 30 | NC_014389 | Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360, complete sequence | 340622-340651 | 9 | 0.7 |
NZ_CP023543_1 | 1.14|1113307|30|NZ_CP023543|PILER-CR | 1113307-1113336 | 30 | NZ_LR134418 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9 | 350898-350927 | 9 | 0.7 |
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tatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer tatccatctttcatatctttgattttaac Protospacer *****************************
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actgctataagaggagctactggtcaagaa CRISPR spacer actgctataagaggagctactggtcaagaa Protospacer ******************************
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tgtggtgtgcttgggtctgtatttatatca CRISPR spacer tgtggtgtgcttgggtctgtatttatatca Protospacer ******************************
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agatgctttaacagtatgttctttagcagg CRISPR spacer agatgctttaacagtatgttctttagcggg Protospacer ***************************.**
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actttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer actttttcacaatatggtaaagtagtggta Protospacer ************************** ***
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atatccatctttcatatctttgattttaac-- CRISPR spacer atattcatctttcatatcttt--tttcaacca Protospacer ****.**************** ***.***
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ctttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer ctttttcagaatatggtaaagcagtttct Protospacer ******** ************.**** .
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ctttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer ctttttcattatatggtaaagtaggtaaa Protospacer ********. ************** *. *
18. spacer 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN812227 (Flavobacterium phage vB_FspS_mymlan6-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
ctttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer ctttttcattatatggtaaagtaggtaaa Protospacer ********. ************** *. *
19. spacer 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN812222 (Flavobacterium phage vB_FspS_mumin6-3, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
ctttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer ctttttcattatatggtaaagtaggtaaa Protospacer ********. ************** *. *
20. spacer 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017296 (Clostridium acetobutylicum EA 2018 plasmid pEA2018, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer tgttcataattcatatctttgattttaaa Protospacer *.*.*** *******************
21. spacer 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015686 (Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer tgttcataattcatatctttgattttaaa Protospacer *.*.*** *******************
22. spacer 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_001988 (Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
tatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer tgttcataattcatatctttgattttaaa Protospacer *.*.*** *******************
23. spacer 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MN812223 (Flavobacterium phage vB_FspS_mumin6-4, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
actttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer actttttcattatatggtaaagtaggtaaa Protospacer *********. ************** *. *
24. spacer 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MN812227 (Flavobacterium phage vB_FspS_mymlan6-1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
actttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer actttttcattatatggtaaagtaggtaaa Protospacer *********. ************** *. *
25. spacer 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MN812222 (Flavobacterium phage vB_FspS_mumin6-3, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
actttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer actttttcattatatggtaaagtaggtaaa Protospacer *********. ************** *. *
26. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to JN638751 (Bacillus phage G, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
-atatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer gatgt-catttttcatatcttttattttatc Protospacer **.* ***.************ ****** *
27. spacer 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT740244 (Proteus phage 3H10_20, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
ctttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer ctttttcagaatatggtaaagcagtatct Protospacer ******** ************.*** .
28. spacer 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP036551 (Bacteroides fragilis strain DCMOUH0042B plasmid pBFO42_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer tctccttctttcatatctttggttttttt Protospacer * *** ***************.**** .
29. spacer 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KJ830768 (Bacteroides fragilis strain 69566 plasmid pBF69566b, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer tctccttctttcatatctttggttttttt Protospacer * *** ***************.**** .
30. spacer 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF417868 (Uncultured Caudovirales phage clone 7AX_1, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
tatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer tcttcatctttaatatctttgatattagt Protospacer * *.******* *********** ***..
31. spacer 1.7|1113307|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to MW117965 (Synechococcus phage S-H38, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cacctgtttttgattgaacgaagcaacca CRISPR spacer tagaagtttttgattgaaggaaacaacca Protospacer .* ************* ***.******
32. spacer 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to LC519601 (Cronobacter phage vB_CsaP_009 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
actttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer gctttttcagaatatggtaaagcagtttct Protospacer .******** ************.**** .
33. spacer 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to NZ_CP053469 (Fusobacterium nucleatum strain Fn12230 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
actttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer actttttcacaatatgataaacaaactgtt Protospacer ****************.**** *..***
34. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to AP012341 (Staphylococcus phage phi7401PVL DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer atagccatctttcatatcttttgaaaattt---- Protospacer *** ***************** .****
35. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MG029515 (Staphylococcus phage phiSa2wa_st80, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer atagccatctttcatatcttttgaaaattt---- Protospacer *** ***************** .****
36. spacer 1.1|1112910|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009928 (Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gtggtgtgcttgggtctgtatttatatca CRISPR spacer ctcaattgcttgggtctgtttttatagca Protospacer * . ************* ****** **
37. spacer 1.2|1112976|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH542234 (Staphylococcus phage Terranova, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
gatgctttaacagtatgttctttagcagg CRISPR spacer gttgctttaacattatgttctttttttgc Protospacer * ********** ********** . *
38. spacer 1.3|1113042|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT028297 (Proteus phage Privateer, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
ctttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer ctttttcagaatatggtaaagctgtatct Protospacer ******** ************. ** .
39. spacer 1.4|1113108|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694358 (Marine virus AFVG_250M310, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tttaatgttgtgtaaagtgataatggtac CRISPR spacer gaaactgttgtgcaaattgataatggtag Protospacer * *******.*** ***********
40. spacer 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014824 (Ruminococcus albus 7 = DSM 20455 plasmid pRUMAL01, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer aacacttctttcatatctgtgattttagt Protospacer *. * ************ ********..
41. spacer 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to JN638751 (Bacillus phage G, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer atgtcatttttcatatcttttattttatc Protospacer .***.************ ****** *
42. spacer 1.7|1113307|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP006878 (Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 plasmid pRgalR602a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cacctgtttttgattgaacgaagcaacca CRISPR spacer ggtccgtttccgattgaacgaagcaaccg Protospacer ..*.****..*****************.
43. spacer 1.8|1112910|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to NC_009928 (Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgtggtgtgcttgggtctgtatttatatca CRISPR spacer tctcaattgcttgggtctgtttttatagca Protospacer * * . ************* ****** **
44. spacer 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MT740244 (Proteus phage 3H10_20, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
actttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer gctttttcagaatatggtaaagcagtatct Protospacer .******** ************.*** .
45. spacer 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to NZ_CP018299 (Photobacterium damselae strain Phdp Wu-1 plasmid plas1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
actttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer acttgttcacaataaggtaaagttcattaa Protospacer **** ********* ******** * *
46. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MG770897 (Staphylococcus phage SH-St 15644, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
47. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MG029513 (Staphylococcus phage phiSa2wa_st72, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
48. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to AB045978 (Staphylococcus phage phiSLT DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
49. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to KY056620 (Staphylococcus phage P240, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
50. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MT366568 (Staphylococcus phage R4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
51. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to JQ957932 (Staphylococcus phage StauST398-2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
52. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to NC_002661 (Staphylococcus phage phiSLT, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
53. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MK940809 (Staphylococcus phage Sa2wa_st8, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
54. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to EU861005 (Staphylococcus phage phiSauS-IPLA35, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
55. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MG029509 (Staphylococcus phage phiSa2wa_st5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
56. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MG029517 (Staphylococcus phage phiSa2wa_st93, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
57. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MG029516 (Staphylococcus phage phiSa2wa_st93mssa, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
58. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MK801680 (Staphylococcus phage SAP8, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
59. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MK801681 (Staphylococcus phage SAP11, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
60. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MF417868 (Uncultured Caudovirales phage clone 7AX_1, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer gtcttcatctttaatatctttgatattagt Protospacer .* *.******* *********** ***..
61. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to JQ779023 (Staphylococcus phage SMSAP5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atatccatctttcatatcttt----gattttaac CRISPR spacer ataaccatctttcatatcttttgaaaactt---- Protospacer *** ***************** .*.**
62. spacer 1.14|1113307|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MW117965 (Synechococcus phage S-H38, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gcacctgtttttgattgaacgaagcaacca CRISPR spacer atagaagtttttgattgaaggaaacaacca Protospacer ..* ************* ***.******
63. spacer 1.14|1113307|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to CP006878 (Rhizobium gallicum bv. gallicum R602 plasmid pRgalR602a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gcacctgtttttgattgaacgaagcaacca CRISPR spacer gggtccgtttccgattgaacgaagcaaccg Protospacer * ..*.****..*****************.
64. spacer 1.14|1113307|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MT334653 (Buttiauxella phage vB_ButM_GuL6, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
-gcacctgtttttgattgaacgaagcaacca CRISPR spacer tgta-ttgtttttgattgaatcaagcaacgc Protospacer *.* .**************. *******
65. spacer 1.2|1112976|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014389 (Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
gatgctttaacagtatgttctttagcagg CRISPR spacer agtgctttaacaatatcttctttagttat Protospacer ..**********.*** ********. .
66. spacer 1.5|1113174|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT773554 (Myoviridae sp. isolate BML_2 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
tatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer atagaatctttaatatctttaattttaat Protospacer ****** ********.*******.
67. spacer 1.7|1113307|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR134418 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
cacctgtttttgattgaacgaagcaacca CRISPR spacer gacctgtttatgatagaacgaagcttgtg Protospacer ******** **** ********* ..
68. spacer 1.7|1113307|29|NZ_CP023543|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT334653 (Buttiauxella phage vB_ButM_GuL6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
cacctgtttttgattgaacgaagcaacca CRISPR spacer gtattgtttttgattgaatcaagcaacgc Protospacer .**************. *******
69. spacer 1.9|1112976|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MH542234 (Staphylococcus phage Terranova, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agatgctttaacagtatgttctttagcagg CRISPR spacer tgttgctttaacattatgttctttttttgc Protospacer * ********** ********** . *
70. spacer 1.10|1113042|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MT028297 (Proteus phage Privateer, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
actttttcacaatatggtaaagtagttgta CRISPR spacer gctttttcagaatatggtaaagctgtatct Protospacer .******** ************. ** .
71. spacer 1.11|1113108|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MN694358 (Marine virus AFVG_250M310, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atttaatgttgtgtaaagtgataatggtac CRISPR spacer tgaaactgttgtgcaaattgataatggtag Protospacer * *******.*** ***********
72. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to NC_014824 (Ruminococcus albus 7 = DSM 20455 plasmid pRUMAL01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer gaacacttctttcatatctgtgattttagt Protospacer . *. * ************ ********..
73. spacer 1.12|1113174|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to MT773554 (Myoviridae sp. isolate BML_2 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atatccatctttcatatctttgattttaac CRISPR spacer aatagaatctttaatatctttaattttaat Protospacer * ****** ********.*******.
74. spacer 1.9|1112976|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to NC_014389 (Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY360, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
agatgctttaacagtatgttctttagcagg CRISPR spacer cagtgctttaacaatatcttctttagttat Protospacer ..**********.*** ********. .
75. spacer 1.14|1113307|30|NZ_CP023543|PILER-CR matches to NZ_LR134418 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 9) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gcacctgtttttgattgaacgaagcaacca CRISPR spacer agacctgtttatgatagaacgaagcttgtg Protospacer . ******** **** ********* ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
181887 : 240953
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023543|181887:240953|DBSCAN-SWA 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69 | Campylobacter_phage(24.14%) | tail,head,integrase,tRNA,protease,plate,transposase,terminase | attL 230201:230218|attR 241119:241136 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
550371 : 654139
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023543|550371:654139|DBSCAN-SWA 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107 | Campylobacter_phage(22.86%) | tail,head,integrase,tRNA,protease,plate,transposase | attL 604958:604976|attR 643721:643739 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1012305 : 1029071
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023543|1012305:1029071|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023543|1012305:1029071|1014543_1014942_-|WP_002875574.1|DBSCAN-SWA MKTLLIDLDGTLTIDEEHVDYIDKKPNIILIKTLKEYKKQGFKINIFTSRNMRTFDGDLEKIKFHTLPTITTWLQKHDVPYDEIIIGKPWCGYDGFYVDDKAIRPSEFISLNYEQIKELLKKENSHKDGGNK >NZ_CP023543|1012305:1029071|1027916_1029071_-|WP_079459990.1|DBSCAN-SWA MQKDSKIYIAGHSGLVGSAILNELKQQGYKNIVFKTHFELDLTNQKAVADFFEREKPEYVILAAAKAGGILANNTYRADFIYQNLMIECNVIHNAYLHKVKKLLFIASTTVYPKNATLPTSEDQMLSGDLEYTNKPYAIAKISGLMLCESYNLQYNTNFIAITPTNLYGNNDKFDLEKSHVLPGILRKMHLAKLLNEKRYEDLLNDLKFDSIEEAKNYLKKFGVDENNVEIWGSGKPTREFLHSQDLANACLFIMNNIDFKDLKGGNTEIINTHLNIGPHKNITIKELAELIKNIVGFKGNLAFNLNRPDGAMQKFTDCSKIHSLGWKHKIDLEKGIQMMYEWYKNNNGGGVLNFEYSIFTNIKSLFANNIRSFANSTKRVCNA >NZ_CP023543|1012305:1029071|1018296_1019022_-|WP_002826457.1|DBSCAN-SWA 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MKTIRTQTPLRLGLAGGGTDINLYCDKYTGYVLNATISLYIHCTLIEREDGKIIFDSPDTNSYSEYESKEFLGDDGKLDIFKSIYNRIVKDFTKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGVIKAFAEWLNLPLGEYEIAKLAYEIEREDLGIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYNNKRVIVNPLRIKNWIASELEARIVLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDEKSLEAMHAIKQDAIKMKEALFKADFDTLAKILGKSWQSKKIISEIVSNDELERIYKLAIDNGAYSGKTSGAGAGGFMFFFVDPTKKYNLIKALSKEQGYVQDFSFTKEGVKSWRI >NZ_CP023543|1012305:1029071|1023084_1023690_-|WP_002875645.1|DBSCAN-SWA MENLNSYIKEHFTDSILVKEQILKDENLITLIKNASLEVIKAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALSTDTSILTAISNDYGYENLFARQVQAQGVKGDVFIGISTSGNSKNILKALELCKQKEIISIGLSGANGGAMNELCDYCIKVPSTCTPRIQETHILIGHIICAIVEEELFGKGFSCKQ >NZ_CP023543|1012305:1029071|1014981_1016898_-|WP_057036771.1|DBSCAN-SWA MLDINILIEKAVDNWSYEFIDKILNKENLSDEHLLLIYKLGQYDFYCKNFDYINKLSFLLDVDSKDLYDFMSCCLKEKIINESFLFGKYKISYIGFLSYHLNIIDFEDFSFFKKILNEVKNSQDLILQSLFLKNSIDFFYINSNDIFFKGGIYFIMLEIIYNNFLNTLGGRLYYDKLRFIAGRYFISKKSYSGSRIALCLNGQLRPGWRDSIKALIDSFSHLGNIDVFLYSWDTESLWPGVGGNGIGWIRRFFRPIVSKCPSELIMSNIEFSKKFPNVFNIISKEFNKKFLLKDVFILDDKIKKVTLESYSKVVNRLGDLKNDSKQFYGIYQVYNVMEEYEKQNNFKYDFIVRVRPDYIIEKNNIKIEDLHLLELNEIYSLRGSAGLDDSLEIGRRNAMEVFMKTWIYAKENKENPCFNVCLKKFPQTCMSPGNGFLSHYVLSQWMDFLKLRVIKLDIQSSYVNNFLFDNISFPDIKNELKKDIWYIKKNKIFNEVQIGKIVDFFDLIAKEYKIIAKNHGNLAKIKIQNHLAYKLGQAMIYNSKSILGYIRMPFVLFYIRYRHQKELQRRKTNPELVLPPLEDCSDYEEALKIKNYFLYKLGEALTQASKNWYKGGYVKFLFFDLFALNQNKIKSKKK >NZ_CP023543|1012305:1029071|1022422_1023097_-|WP_002826582.1|DBSCAN-SWA MQAIILCGGLGTRLKSVIKDIPKPMAPINDKPFLEFIFEYLKKQGIKEVILAVSYKYEVIQEYFKDEFLSIKIKYSIEKEPLGTGGAIKEALKFIKNEAYVLNGDTFFDIDLTKLKLNGNRICLALKQMNDFDRYGTVNVDKHGFVISFEEKVFKKQGLINGGIYLLTKDIFNEFDLEKKFSFEEFLRENYEKLKAKAHIFDDYFIDIGVPEDYYNFTTNQSHF >NZ_CP023543|1012305:1029071|1017968_1018304_-|WP_002826455.1|DBSCAN-SWA MLKKLTEKYISAFNKKDINEVTNLLNENFVLEDPVVKRIEGKEECLKAIENIFKNCNKLSFSAKNIFQDKNTTFIEFILILDDIRLEGVDIIEWHDEKIVELRAYLDIPKG >NZ_CP023543|1012305:1029071|1025733_1026795_-|WP_052784009.1|DBSCAN-SWA MLKDSKIYIAGHRGLTGSAIIKNLQNKGYSNLIFKTHSELDLTNQKAVADFFVREKPEYVFLSAAKVGGIGANNTYRADFIYQNLMIQNNVIHQSYLNGVKKLLFLGTACIYPRECPQPIKEEYLLTSKLEYTNEPYAIAKIAGLKMCESYNLQYKTNFISVMPCSLYGANDNFNLETSHVLPAFIRKMHLAKVLQEEGIAKVRYLLNFNDESEVKNCLNRFGITENSVEIWGSGKAMREFLHADDMADACVYVMEKVNFNDLYKNNEVEIRNTHINIGSGKDISIKDLAELVKRIVEYRGNLVFNTNKPDGTMKKLGSCKKINSLGWKAKIKLEDGIKMMYEWYLKEQNIRQ >NZ_CP023543|1012305:1029071|1012305_1013028_-|WP_002875658.1|DBSCAN-SWA MIIIFPMAGLSSRFAKAGYDKPKYMLDLKGNSVFFHAVNSFKKYFKDFKFLFIYREIENTSDFIKEECEKLGIKSYESVRLEQETLGQAHTVRLGLERANIKDDESILIFNIDTFRPNFSLPTTLDFCKIDGCLEVFEADGEQWSFVLTDENDNVIKTAEKERISNLCSSGLYYFKKTKDFKEIFDRMKAENDFTKGELYIAPMYNYLIKKGLHIKYHIISLDEIIFCGTPEDYERLISI >NZ_CP023543|1012305:1029071|1017636_1017966_-|WP_002875572.1|DBSCAN-SWA MKNYKLDEMIRGWFVGNFDPSVFKTNDVEVGVKEYKKGDTEEKHHHKIATEITVIISGKVRMNDKIYSKGDIVMIYPEEATDFEALEDTTNVVVKLPGVNNDKYLGECQ >NZ_CP023543|1012305:1029071|1016899_1017640_-|WP_002826453.1|DBSCAN-SWA MNIVIPMAGLGSRFAKAGFDKPKPFIDVLDKPMIVRVLENLKYKDARYILIARKEHLTKEKKLVDEIKNNFNVEFIPIDKLTEGTACTVLYARKYINNDMPLMIANSDQIVDINIADFINDSFKRGLDGSILTFIDKEKNPKWSFAKLNNDLVVEVKEKEAISEFATVGIYFFNKGKIFVESAIDMIIENDRVNNEFYTCPVYNYAIKSGAKIGIYNIDFSKMHGIGTPEDLEKYINHLYCKIDKA >NZ_CP023543|1012305:1029071|1020526_1022410_-|WP_096777909.1|DBSCAN-SWA MHNPNSAIERIKNHLAYKLGKVMIDFSHQRNNYKYGGGYIALFKKLYKIKKQHKKEQKIYQQTIQVFPQLKYPNLETCSDYEQALKYKFHLSYMLGEVLIQTFQNLHKGSMFKLAKNIKKANKEFKIFKEIFNNFAKLSPNIIKIISKNKQAFLKELPRIQNILKIHQDYQPILDNIFHNFNYFIQNFNLIEEWLLSNDFNEKYKKENHPYPSLLDPKKLNDEKEKINYKNIPAELAWEMNLPLPDNYEFVYMRNFGAGGSALNLFFQKCGFKVRFSQRIKAHEEYLEMFIFLISCYHEHAVLTLPGFPIDGREKLCYMIQKRVKCICIVRDPISIYKTLVNHRGYMPDRKIFFNQNESFKNIFTGIRYRFYDRKKNIVISYTYPTLDSLYSPVYIDKGHERFNLTTKINLLYSISDLVYIDMKKILPGEIKKTLPLLSEQFNINLPKDIYSYFEQPLNGGKFVYLLPKTLIIEKSFIKEKFHTIVKENVKILITQSQFLNSSESSMINITCLFDNIITLNNILIYIKHEEGLLKNLYFITFIRRYLGIVVKKLLIHSRFEELKLFKEKDVLNYLKENKELRVKLKNILDKELVHIKQHRPDIVASWKYYQEFEQMCKELDQELTLE >NZ_CP023543|1012305:1029071|1019015_1019654_-|WP_002826458.1|DBSCAN-SWA MTKIKAIIFDMDGVLIEAKDWHYEALNRALKLFGMEITRYEHLTTFDGLPTKDKLKMLSLERGLPKSLHSFINELKQQYTMEIVYSLCKPRFHHEYALSKLKFEGYKMAVCSNSIRNSIKVMMKKSALENYLDFYISNEDVKKGKPDPEMYIKAIERLKLNPKECMIVEDNENGIKAARASGANVMIVDEVSEVNYENIKNHICKFEEELKC |
15 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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