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NZ_CP023184 | Yersinia ruckeri strain NHV_3758 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,c2c9_V-U4,cas3,WYL | 0 | 0 | 3 | 0 |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1481885 : 1491439
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023184|1481885:1491439|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023184|1481885:1491439|1485990_1488267_+|WP_038275712.1|protease|DBSCAN-SWA MLNQELELSLNMAFARAREHRHEFMTVEHLLLALLSNPAAREALEACSVDLVALRQELEAFIEQTTPTLPATEEERDTQPTLSFQRVLQRAVFHVQSSGRNEVSGANVLVAIFSEQESQAAYLLRKHDVSRLDVVNFISHGARKDEPGQAPNAENPVNEEPAGGEDRMENFTTNLNQLARVGGIDPLIGREKELERAIQVLCRRRKNNPLLVGESGVGKTAIAEGLAWRIVQGDVPEVMAECTLYSLDIGSLLAGTKYRGDFEKRFKALLKQLEQDKDSILFIDEIHTIIGAGAASGGQVDAANLIKPLLSSGKIRVIGSTTYQEFSNIFEKDRALARRFQKIDIVEPTPEETVQIINGLKPKYEAHHDVRYTAKAIRAAVELSVKYINDRHLPDKAIDVIDEAGARSRLMPASKRKKTVNVSDIESVVARIARIPEKTVSASDRDVLRNLSSRLNMLVFGQDRAIEALTEAIKMSRAGLGHENKPVGSFLFAGPTGVGKTEVTVQLAKALDIELLRFDMSEYMERHTVSRLIGAPPGYVGYDQGGLLTDAVIKHPHAVLLLDEIEKAHPDVFNLLLQVMDNGTLTDNNGRKADFRNVILVMTTNAGVRETQRTSIGFQRQDNSTDAMEEIKKVFTPEFRNRLDNIIWFNHLSTQVIQQVVDKFIVELQAQLDAKGVSLEVSDEARNWLSEKGYDRAMGARPMTRVIQENLKKPLANELLFGSLVDGGSVSVGLDKDKQQLAYEFQSAQKRKTEGAVH >NZ_CP023184|1481885:1491439|1485061_1485283_-|WP_004717324.1|DBSCAN-SWA METGTVKWFNNAKGFGFICPENGGEDIFAHYSTIQMDGYRTLKAGQQVNFDIHQGPKGNHASLIVPLDMIAIA >NZ_CP023184|1481885:1491439|1488522_1488741_-|WP_002211347.1|DBSCAN-SWA MAKEDNIEMQGTVLDTLPNTMFRVELENGHVVTAHISGKMRKNYIRILTGDKVTVELTPYDLSKGRIVFRSR >NZ_CP023184|1481885:1491439|1481885_1483001_+|WP_038241510.1|DBSCAN-SWA MTWFDGRKRRWILIILILAIGGFFAIKGGMAPTPIQYQTVKVTHRDLQQNVLATGKLDAVRKVDVGAQVSGQLERLYVAIGDKVKQGQLLAMIDPQQAQNQIKEVEATLQDLNAQLLQAKAEQQLAEVTLRRQQALAKLQAVSRQELDQAATTLTVKKANVSAIDAQINKAKASLATANINLDYTKISAPMDGDVVQITTLQGQTVIAAQQAPNILTLADMSTMLVNAQVSEADVIHLKPGLKASFTVLGDPSKSFDGVLKDIQPTPEKVNDAIFYSARFEVPNPNGVLRLQMTAQVSIQLAKVENAKVIPLSALGNELGVNRYEVAILKEGKEQPREVTIGIRNNVDAQILSGLEVGDEVITSRGVAEKT >NZ_CP023184|1481885:1491439|1489714_1491439_-|WP_004717331.1|DBSCAN-SWA MRVLLPFLAQYRRHWFLISLGILLAIITLLASIGLLTLSGWFLAGTALAGPAGLYTFNYLLPAAGVRGAAILRTAGRYAERVVSHDATFRVLAHLRVFAFQRILPLSPAGIARFRQSEVLNRLVADVDTLDHLYLRVISPLIAAIAIIAAVTFGLSFLDVDLALTLGVILLGLLLILPLIFYRAGQPIGVDLTRFRSQYRSQLTCWLQGQAELLVFGALGRFRQTLEEIEQRWLARQQQQASLAGLAQALMILASGLTVTLILWLAAAGVGGDTQPGALIALFVFSSLAAFEALLPVAGAFQHLGQVIASAERVAQLIAQKPEVTFPLSGPDATTQVTLSVSQVSFTYPGQPLPVLQDISLSLAAGEHIALLGRTGCGKSTLLQLLTRAWDADQGQILLNGQPLARYDEATLRQMMTVVSQRVHVFSSTLRQNLLLACPNASDQQLVTALQQVGLDNLLENEEGLNAWMGDGGRPLSGGEQRRLGIARALLHPAPLWLLDEPTEGLDAETEQQILMLLRQHCQHKSLILVTHRLYGLEYMDRICVMDGGHIVEQGNHQTLLKNKGRYYQFRQRR >NZ_CP023184|1481885:1491439|1483000_1484950_+|WP_004717322.1|DBSCAN-SWA MAALLELNSIRRSYQSGEQTVDVLQDVSLEINAGELVAIIGASGSGKSTLMNILGCLDKPSAGIYRVAGQDVGQMDNDALAALRREHFGFIFQRYHLLPHLSAAHNVEVPAVYAGVGKNERRERAKMLLTRLGLGDRVSYRPSQLSGGQQQRVSIARALMNGGQVILADEPTGALDSHSSVEVMAILKQLQQQGHTVIIVTHDPTVAAQADRIIEIKDGHIMADSGSKAPEKPIVSEPLSLSPPAPSWQQLGGRFREALLMAWRAMASNKMRTALTMLGIIIGIASVVSILVVGDAAKQMVLADIRAIGTNTIDIYPGKDFGDDDPSNRQALVYGDMAALKAQSYVNAVSPVISGSMRLRFGNTDVAGSVSGVSSQYFRVYGIKIDQGTAITPDQVERQVQVVVIDRNTQRRLFPHMNDVIGQVMLIGNMPATIIGVVEEKQSMFGSSKALRVWIPYTTMANRLMGKSYFDSITVRINDGYNSKEAEQQLVRLLTLRHGKKDIFTYNMDSLLQTAEKTTRTMQLFLTLVAVISLVVGGIGVMNIMLVSVTERTREIGIRMAVGARSSDVMQQFLIEAVLVCLVGGALGITLSFAIGMAVQLVLPSWEVTFSTTALISAFLCSTVIGVVFGYLPARSAARLNPIDALARE >NZ_CP023184|1481885:1491439|1488904_1489615_-|WP_004717329.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRLTHLSSHSYAFPAPELALREPNGLLALGGDLSAPRLLAAYQRGIFPWFNPSEMILWWSPDPRAVLYPAELHISRSMRRFHRRCPYRFTLNQAFADVVAACADRPDDGTWIGHEVQQAYCQLHGMGHAHSLEVWQDDELVGGLYGIAMGALFCGESMFSRAENASKSGLMAFCHHFTHHGGELIDCQVLNAHTASLGAREIPRSHFLQHLSQLQFSPLPAECWLPQSLDIEIAMQ >NZ_CP023184|1481885:1491439|1485642_1485963_+|WP_004717325.1|protease|DBSCAN-SWA MGNNNDWLNFEHLVKDKQIDALKPPSMYKVILNNDDYTPMEFVIDVLQKFFSYDIERATQLMLNVHYKGKAICGVFTAEVAETKVAHVNQYARENEHPLLCTLEKA |
8 | Dickeya_phage(16.67%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2118682 : 2227014
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023184|2118682:2227014|DBSCAN-SWA 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MANLHPIQAAIFDMDGLLIDSEPLWLQAELDIFNHLGLNTTSRDLLPNTLGLRIDQVVKLWHKTQPWSQPDEAEVCRQIIARAIQLIEKERPLLPGVEHALQLCRHQGLKIGLASASPLNMQNRVLEMFGLTDYFDCRMSAEYLPYSKPHPEVYLNAANALGVDPLHCITLEDSFNGMIATKAARMRSIVIPSAELRNDPRWSLADIQLNSLEELLAEHIS |
103 | Escherichia_phage(21.57%) | bacteriocin,plate,capsid,terminase,tRNA,portal,holin,protease,integrase,tail | attL 2106317:2106333|attR 2231147:2231163 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2547572 : 2592628
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023184|2547572:2592628|DBSCAN-SWA ATTACGGGTTCCCACCGCCCAGTCGACGTTGTAATTGATCGCGCAGATTAGGTGGTGTGCCTTTGATCGTTAAGGTGTCGGTAGTCGGATCCCAGAAAATACGTTCGCCTAACAGCAAGGCATCGAAGTTAATGCTCAACCCGCCGCCACTGCCGGAAAACTTGGTGAGCTGACGCAACGTACTACGATCGGCAGGAAACGTCTCTTCCAGTGCATAACCCTGCTCGGTGGAGAACGCTTTGAAATCTTTATCACCCAACGTCGGTAATTCCTGAGCCAGTTCTTGCAAGGCAATGTCTTCACCAGCTTGCAATTGTTCATTGCAATAGCTGTAAGCCTGCTGGCGGTAAGCTTGGCGCTCATTCTTATCCAGTTGCGCATCCGCACAGTAATCGTCCAGCGCCTGCAATAAGCCACGGTTCTGCGCCTTGGTATCCAGCCCCTCAGCTGCAGACAGAAAATCCATAAAGAAATCAGAAACTTTACGACCAACACGCCCTTTCAGGAACGTCAGGTAACGGCTGGATTCTGGGTTGGTTTCCCATTCGGTCAAATCAATGCGAGCCACAATATCAGCACGATTAATATCCAGATAACGGGTCGTGCTCAAATCGAGCTGTTCGTCTACACGCTGACTATTACAACTGCTGAGTACCGAAATCAGTAAGTACTCGACGGCCAGATAACGATATTGGCAAAACAGTACCACACCACCTTCAGCGAAGGGATATTTCGCCAGTTCATCACGCAAACGTACCGTGGCAGCGCGACTGAACGCGAGGAAATCCTCATCCCCCTTACGGCAACGTTTTAAAGCATCCGCCAGCTCGCTTTGCTCATTAAACAAACCATAAGCCTTGCTTTTGGCGCTATAGACACGGTGCAGTTCCGTCATCATTTCTTCTACTACCGCATTGGCCGGTAACAGTGAATCCCGTAACGTGACATCCAGAGTCTGTTCGTCACGTTTAATCAGTTGATGTAAAGCAATTTGGTCGATATCAAGGCTCATGATCAATACTCCTTTTAGCTAGGGGCGTATTCAAACACCGATGCCCTGAAGCCGCAACTCAAAAGCAGCGCGAAACCCGAAACACCTGCAATTGATTCTTAATGCTATAAAATAGCGGAAAACCGTCGCTCTATACGGTAAGATGTGGGACTTTGTCAGGCGCTGAGTACAATTTTTATGCCACAATCATCCCGTTACAGTGACGAACACGTCGAACAGTTGCTTTCAGAACTGGTTCAGGTGCTAGAGAAACACCGCACCCCAACCGATCTTTCCTTGATGGTTTTGGGGAATATGGTGACAAATTTGATCAATACCAGCATTGCCCCAGCGCAGCGCAAGGTATTAGCGAAATCTTTCGTTGAAGCACTTCAGGCTTCAATACGTGAAGATAAAGCCCATTAATTATTCGGCTAAGACTGCTATCTCTATATGGTGACAAATCGTCAGCGCTATCGTGAAAAAGTCTCCCAAATGATCAGTTGGGGGCACTGGTTCGCCTTATTTAACATTCTGTTCAGCCTGGTGCTGGGTAGCCGCTATCTGTTTGTCTCTGATTGGCCAACCTCTTTGGTTGGCCGTATCTATGCTCTGGTCAGTTGGCTTGGGCATTTCAGTTTTATCGTCTTCGCTGTTTATCTGTTGGTGATCTTCCCGCTGACCTTTGTGGTGATGTCCCAGCGCTTGCTACGATTCCTTTCTGCTGCAGTTGCCACTACCGGGTTAACCTTGTTACTGGTAGACACCGAAGTGTTTACCCGTTTTCATTTACACCTGAATCCAGTGGTCTGGGAACTGGTGATCAACCCTGATCAAAGTGAATTAGCCCGCGATTGGCAACTGATCTTCGTCTCCGTACCCATTATCTTTCTGGTCGAGATGCTATTTGGTACTTGGAGTTGGCAAAAACTTCGCAGCTTAAACCGTCAACGGTTTGTTAAGCCAGTCGTCGCAGTATTTATTTCGGCATTTTTCGCCTCACATCTGATTTATATCTGGGCGGATGCCAATTTCTATCGGCCGATTACCATGCAGCGCGCCAACCTGCCACTTTCTTATCCTATGACAGCTCGTAAGTTTCTGGAGAAACACGGTCTGCTGGATCAACAGGAATATCAGCGCCGCATTATTGAGCAAGGCAATCCTGAAGCCGTTACCGTCGAATATCCGCTCAATAGCATCACTTTTAGCGATAAAGGTAGCGGTTATAACCTGTTGCTGATTGTCGTAGACGGCATTCGGCTAGAAAGCCTACAGCAGGACATGCCAGCACTGAGCGATTTTGCCCAATATAATATCCAGTTCAACCACCATTACAGCTCGGGAAACCGTAAAGAAACCGGTTTATTTGGCCTGTTTTATGGTATTTCTCCAACGTATCTGGACAGTATTCTGGCGGCTCGTGAGCCTTCAACCTTTATTAACGCACTGGGTACACAAGGTTATCAATTCGGTTTATTCTCTTCCGATGGGTTTAAATCGGCTCTTTATCGTCAGGCATTATTGTCCGATTTTTCATTACCTGCGCCAGCCCGACAGAGTGATAGTGCGACGACAGCCCAATGGCAACAATGGTTGAACAGCTTGCCTAACCCGAATCCGTGGTTTTCCTACGTCAATCTCATTGGTTCACAAGAATCCCAAGATCCGGCTGAAGTATCCACGCCTGCGGTACCCAATGATTTTATCCGCCACTATCAGGCTGGAGCCAAGAATGTTGACCAGCAGATTGCGACCATTATCGACACACTGAAGCAGAAAGATCTGCTGGATAAAACCGTGGTGGTTATCACCGCATCTCACGGCGTCGAATTCGATGATAGTCACCAAGGTCTCTGGGGGGCAGGCAGCAGCTTTAACCGCCACCAATTGCAGGTGCCGCTGATTATTCACTGGCCAGGCACACCGGCGCAGAAAGTCAATAAACTGACCAATCATGAAGACGTGATGACCACGCTGATGCAGCGTTTATTACACGTACGCACAGCGCCAGAGGACTATTCGCAGGGTGAAGATTTGTTTGCCGCACAGCGCAATCATAATTGGCTTGCCACCGGCGAAAATGGCGTACTGGTGATCACCACGCCAACACAAACCATCGTGCTCGATAATAGCGGTAACTACCGAACCTTTGATCAGCAAGGGATCGAGGTAAAAGACGAAAAGCCGCAGTTGGCGTTGCTATTACAAGTATTGACCGATGTGAAACGCTTTATTGCCAACTAAAGTTGCTGCATTTAACTGCCTAAAAAACAAGCAAACATTCGCTATACTCTTGCAATCGTAAAGAGAAAAGGTAGTATTAATCCATTGCATCGGCATGTAGCGCAGCCTGGTAGCGCACCGTCATGGGGTGTCGGGGGTCGGAGGTTCAAATCCTCTCATGCCGACCAAATAATCTCTTAAAAACCAACCCATTGCGGTTGGTTTTTTTATGGGTGGGATTTAGCGATGGTAAAATGATGGTGAAATAATGGTAAAACCCCGACGATAATCTCATGAAATGTTGGGCGTTGCTCAAAGGGCAATTTAGAACCTACACCGACTTGATCTCGTAACGTAGAAAACGCCCGACTCAAATAATCAGGTGCCACTTGTGACGATGAGTTAGCTAGTCTGGCGAGACAATACCGTGATGCCTTTATTGTTGCGACAGATAACATGATGGTCAGCGATTATTCGATTGATGATATCCCGCTAACCAGCACCCAGCGTACCGCTCGTGGCCGACACTGGCAGGCTGGCCGTTGATAGAACTGCCGGTAATTGGCGAGTCGGATAAATCCCGCTGGCTACTGATCGAGGCGGTGAATAATGGCTACGTGGTACCGGAGTGGCCACCGGAGTTCCGTTAAATCTTGATAGGCCACATCGTTCGCGGCCTATAAGAAATCACTCAGGCTTTAGTGGCCACTCAATATCTGGCGCAGTTGAGGTATCAACGCGCATCAGCAAAATCCGATATTTTTTCCATTCAGCCAACGAGGCCGCTTCTTCTTTCGTCGCAATGCCAGTATCAACAGCATCCTGCCGCCACGCAATTTCTCCATCCGCTTCGCTTCGCAACTGCGTACGCTGAGTCTCTGCGTTTTCCTTCTGCTGCTCCGATGTTAGGGGTGGCAGGTCGATCCACACTGGACGCCCTTTAGCTGCCCCGAGCCTTTTTCCATCCGGTGGCGACACTCGCCAATATTTTTCTGTTTCTTCCTTTGTTGGCTCGAACAGATCCTTAGGAAGTGAATTCCCATAACTGCCGTCATCAACCATGTTTGCAGCGTAGAACAGAACCTGAGTGGGGCTAAAATAAGCATTCATATTAATATCCTATGGCAATCCAACGGCATGGCACTGATGAGGCTGCCGCATTGCGTAAAAAACCCTGTGCATTAAACGATAATGTCTGATGATAGATTAAACCGTGCGCCCCGGTGTCTGCCGATTGAGGGATCTGCAGCACCGTGAGACAGTCAACAGAAAATGGCGTAGGGAAGTTGACTCCCTGACCTGATGAGAAGTAGCCCCACTGAATCATCAACCCGCGAGGGACATCAGGGATACGGATGTAATCATTCGCGCTGTATGATCTCTTGGGAATAAGTGACGCGAGGCAGTCCATTGTTGCAAGAAGACTCGTACTGCCTGCTGGAATATCGTCTCGAGTCCCGACCCCCAGCAAGGCCGCTGCACCTAGCTGAAGTGCGAGTCTGAAAGCTGCCTTGTCAGGAATATCCGCACCATTTGACGCTTTAGACATTTTACTCTGGGCTTGACCAAAAGTGTATGTAACTGAATTTATAGTGGCCGCAAGTGTTGTATCTGTACTACCTACATTGTCACTCAGCCTTACTAATCCAGCATTTGTCAATGATGCTTCCTGAATACCAAGGTTTGCGAGAGTTTGTGCGACGGCGGCTTGTCCCGCATTTTTAATTTCAGACAGGTTATTACCAGATTGCAAAAATAGCTTTTTCAATGCCGCTAATAACTG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58 | Shigella_phage(28.89%) | plate,capsid,lysis,terminase,portal,holin,protease,head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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