Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP023970 | Staphylococcus lugdunensis strain FDAARGOS_381 chromosome, complete genome | 5 crisprs | DinG,DEDDh,cas3,csa3,WYL | 1 | 0 | 8 | 0 |
| NZ_CP023971 | Staphylococcus lugdunensis strain FDAARGOS_381 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
1. NZ_CP023970
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP023970_1 | 122407-122497 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023970_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP023970_1
>1.1|122431|43|NZ_CP023970|CRISPRCasFinder AATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023970_1
The CRISPR arrays of NZ_CP023970_1 >merge|NZ_CP023970|1|122407-122497|CRISPRCasFinder AAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGCAATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACTAAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC >NZ_CP023970|1|1|122407-122497|CRISPRCasFinder AAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC AATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACT AAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC
>NZ_CP023970.1|WP_002458881.1|120515_122225_+|PAS-domain-containing-protein MLKFHQRLLLLLCTITIISFIGLGAIMHHSIYQTLTDKKVADLTKKTENYSKLEEQGKTEEIKNIAKNENISVKITEGNKIIFETKSHYDINPAIDNAANPSNIIYDRADEGYHYTFKNKFSNEAIYISGIDDEMVNLQKELWKYIALIGVVVLIAIYLAVRSIKRTYIRPINEVTYATSLLADGYYHVRVPESNVKETKALFVTTNELARRLQKLNNKQKIQSNRLKTTLENIPSSVLMIDKYGEIVVANHSYYEVFGLEEKVENKDYNDFIDDKIKQLILEAFKTEKSMYNQVEVNINNVHHKYFDVSCVPILSKSKKHLQGMVVVLHDITNLKKLENLRREFVANVSHELKTPITSIKGFAETLIEGAKDDVASLDMFLNIILKESNRIESLVMDLLDLSHIEQQRELETAYVNLSELAHNTVDNLQNQAKDKNIEIIDEISPDIIFKANKNKIAQVITNLLSNAINYSLENNRVIVRVYRQQSKVYLEIQDFGIGISKEEQKHIFERFYRVDKARSRDSGGTGLGLSITKHIVEAHHGVISVKSEPNKGSTFKVTFTDNYSNNEV >NZ_CP023970.1|WP_037540804.1|119805_120516_+|response-regulator-transcription-factor MSQKILVVDDEQSIVTLLKYNLETAGYIVEVAYDGEEALEKVEKVQPDLIVLDVMLPKKDGIEVCKTIRSDKNLVPILMLTAKDDEFDRVLGLELGADDYMTKPFSPREVVARVKAILRRSQFVNESANDAANEEDILIENIRIRPEFFEVYKDDELLELTPKEFELLLYLIERQGRVITREHMLNSVWNYEFAGDSRIVDVHISHLRDKLEENPKQPKLIKTVRGLGYKLERPKA >NZ_CP023970.1|WP_002478051.1|118333_119602_+|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MSAEKIVKTQDGLQVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKQIVWKEVLAGQKAYDETGEWLPSETLKTIEEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQQLDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTEEVKKVIDFLQNEMGASNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNGRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLAHNEFADKVFTWQQYDEIVENDGKEAANKAQERAEQQGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSELLSSVLMLEHLGWQEAADKITDAIESTIASKIVTYDFARLMDGATEVSTSEFADELIKNLK >NZ_CP023970.1|WP_002458878.1|117167_118286_+|citrate-synthase MAELKKGLEGVIAAETKISSIIGSQLTYAGYDIDDLAENAEFEEIVFLLKNYRLPTEEELADLKKKLNYYMTLNPRVYKHFEEYVTDNVHPMTALRTSVSYIAHFDPNAEGESEEKILERSIRIQAKVASLVTAFARVRDGKEPLKPKAELNYAGNFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALVLHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANERVMNMLSEVKSVDQVDDYLDEKFANKEKIMGFGHRVYKEGDPRAKYLREMSRKITSETGRSELYDISIAIEKRMKEEKGLIPNVDFFSATVYHSMDIPHDLFTPIFAVSRTAGWTAHILEQYRDNRIMRPRAKYIGEKDRKYIPIEER >NZ_CP023970.1|WP_002458877.1|115467_116826_-|amino-acid-permease MEDKLQRELSNRHVQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIAMTGPSILLTYILIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNKYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPQIPNWVSALFCVLILMTFNLLSARLFGELEFWFAIIKIATIVGLIVVGLVMILMAYKTQFGSASFANLYQNGIFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPQKTIPKAINSVPLRILVFYVGALAVIMSIIPWDKVSPDDSPFVRLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLADQQQAPPIFRSTNKQGVPHIAIIGSSVFLLVAALLNYIFPDATLVFTYVTTISTVLFLVVWGLILWAYINYSRRNPELHKQSTYKLPGGKYMGYIILLFFVFVFALLFVNVETRRAIYFTPVWFIILGLMYYRYKQMAKKTK >NZ_CP023970.1|WP_062248820.1|114477_114960_+|IS200/IS605-family-transposase MSSDTNSLAHTKWNCKYHIVFAPKYRRQVIYGKIKKDIGMILRQLCERKGVEIIEAEACKDHIHMLVSIPPKIGVSSFVGYLKGKSSLMIFDRHANLKYRYGNRKFWCKGYYVDTVGRNKKVIENYIRNQLQEDIVADQISMEEYLNPFTGEEIKKRKKK >NZ_CP023970.1|WP_002478049.1|112415_114176_+|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMLEKLMKAGMNVARLNFSHGSHEEHKARIDTIRKVAKKLGKTIGILLDTKGPEIRTHDMKDGLIMLEKGKEVIVSMTQVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLVELEVKEIDKANGEVRCEILNTGELKNKKGVNLPGVRVNLPGITDKDADDILFGIKEDVDYIAASFVRRPSDVLDIREILERENNHNITIFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPESVPIVQKDLIRKCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSFVNAIGVSVAHTALNLNVKAIVAATESGSTAVTISKYRPHSDIIAVTPSAHTARQLALVWGAYPVIKKGRKTTDDLLNNSVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGEKGTTNMMKLHLVGDEIAKGQGVGRESVVGQSVVADDASDLEGKDLSNSIIITTSVDETLVPYIEKAAGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTIVGVEHATKEIKDGILITVDAAQGKIFEGYANVL >NZ_CP023970.1|WP_002458875.1|111429_112398_+|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNNIEVYGIYQGYQGLLDDNIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPQFKEAEHRKVGIDNLRKRGIEGLVVVGGDGSYRGAQRISEECPEIQTIGVPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIECVDKIRDTASSHARTFIVEVMGRDCGDLALWAGLSVGAETIMVPEVKTEIKDVAEKIESGIKRGKKHSIVMVAEGCMSGQECADELMKYINVDTRVSVLGHIQRGGSPSGTDRVLASRLGGHAVDLLIQGKSGLGVGITHNQLTATPFDEIFKISDHKFNNDIYELAKKLSI >NZ_CP023970.1|WP_002492588.1|110322_111267_+|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLYDIKNKIESLKESQQKNDVDLQDEIDLLEASLKRETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTLLDYIPHIFDAFIEFHGDRNFRDDPAMVGGIAYLNEMPVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIAKNLIEMASLSVPVIAIVIGEGGSGGALGIGVANRILMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSSLAKMAAETMKITANDLLQLKIIDNVIEEPLGGAHRDIEIQAQHIKAAFENELAELSKLNKKQLAEDRYNKFRHIGSFVD >NZ_CP023970.1|WP_002458873.1|109463_110321_+|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRSSKKKKYLTVQDSKQNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAVSDEGSFQEFDKGMTSANPLDFPGYEEKIEKDQQKTDLQEAVVTGIATLENLPFGIAVMDSRFRMGSMGSVVGEKICRIIDYCTEHRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPEDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRKDMKETLAQILKMHQEVN >NZ_CP023970.1|WP_002493149.1|122544_125178_+|DNA-polymerase-I MNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAIYGFAMLLEKILKEEQPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQSTPPELSEQFPYIRQLLDAYHIKYYELENYEADDIIGTLSKQAEASGLETIIITGDRDLTQLATDHVTIYYTKKGVTDVDHYTPEFIAEKYNGLLPKQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFHSVEGVYNHLDEVSGKKLKENLENSKADAFMSKDLATINCDSPIKVNLKDTIMGDLNDNKDKIELFQKLEFKQLLNDIDSSASENNSETEHNFEVIHHFDNINFKKLDNAIIHFEIYGSNYLKDKILKFGLYAQNQYIVISAEDIHQYTELIEWLENDHNNKIVFDAKKTYVAAHRLEINLQHIDFDVMLASYIIDPSRTIEDVQSVVSYYNQNFVKSDIAVYGKGKKRQVPLDDVLEVHIAAIMQAIYNCKPLMSDILSDHNQMDLLNNLELPLARILADMEETGIYTDVNDLKEMQNELQEKLDNLVSEIYEAAGESFNINSPKQLGIVLFETLKLPIIKKTKTGYSTAVDVLEQLQGKHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSIDPNLQNIPIRLEEGRKIRKAFKPTSDDYVILSADYSQIELRVLAHMTQDESLKEAFIHGDDIHAATAMKVFGVEKNQVNDLMRRQAKAVNFGIVYGISDYGLSQNLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMTDIVKDAKANGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRSFAERTAMNTPIQGSAADIIKLAMVQFDKNVRETNYHAKLLLQVHDELIFEVPKSEVQDFSEFVEEIMDNALTLAVPLLVDSSYGATWYDAK >NZ_CP023970.1|WP_002493150.1|125194_126067_+|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVEHVKRGIEPFIINTIIKSVTFSSKVIDGKSDGKETIIKGINLDGFRQFTEGYKIYKVERRSKYINIYIEKNQERRVLISHLGMAGGFFIVNHLDEIYAPNYRKHWHVIFHLSNGKLLVYSDIRRFGEIRNVQALNNYASFKNMAPEPFDESALDHYLTYLNQPKVKHKPIKQLILDHKVIAGCGNIYACEALYRAAIHPATEVQSLNQQARQNLFLEVQAVLNEGIKYGGTSISDYRHADGKTGTMQLRLNVYKQQQCKKCGHKIEQQVIATRNSHFCPVCQK >NZ_CP023970.1|WP_002493142.1|126082_126688_+|dephospho-CoA-kinase MPKVIGLTGGIATGKSTVSELLTAYGFKVVDADIAAREAVKKGSAGLEQIRQTFGNEAINDDGEMNRQYMGQLVFNHPDKRTELNEIVHPIVHQLMDKEKSHYLNQGYNVVMDIPLLFENELEDTVDEVWLVYTSESIQIERLMERNNLSLEEAKARVYSQISIDKKSRMADIVIDNLGDKLELKQNVERILTDQGYINQE >NZ_CP023970.1|WP_002458885.1|126834_127836_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MSTNIAINGMGRIGRMVLRIALKNEALNVVAINASYPPETIAHLINYDTTHGRYDKRVEPIESGIRVEGHDIKLVSDRNPENLPWKDLEIDIVIEATGKFNHGDKAKAHIQAGAKKVLLTGPSKGGKVQMVVKGVNDQDLDTDTYDIFSNASCTTNCIGPVAKVLNDSFGIENGLMTTVHAITNDQNNIDNPHKDLRRARSCGESIIPTSTGAAKALKEVMPELNGKLHGIALRVPTQNVSLVDLVVDLKQKVTVDEVNHAFRDANLQGIIDVEEAPLVSKDYNTNPHSAVIDAKNTMVMGDNKVKVIAWYDNEWGYSNRVVEVANQLGELIK >NZ_CP023970.1|WP_002493146.1|128008_129016_+|biotin-synthase-BioB MNLANQIINGKYLTQAECLKIYRDASLATLDLVHEAYLIRRHYFGHKVKLNMILNAKSGICSEDCGYCGQSREMKHKQRYALVSNETICKGADVASNNKIGTYCIVMSGRGPSDKEVEHITKTVKDIKKDHPQLKICACLGLANEEQAEKLKAAGVDRYNHNINTSESYHGQVVSTHTYDERIQTLSYMKEHHISPCSGVICGMGESDEDIIDMAFALKKIDADSIPVNFLHPIQGTKFGSMDDLTPMKCLRILSIFRLINPTKEIRVAGGREVNLRSLQPLALQIANSIFVGDYLITGGQPNELDYQMLEDLGFEIDYGNDDEITFSHPQFKSK >NZ_CP023970.1|WP_002458887.1|129332_129803_+|transcriptional-repressor-NrdR MKCPKCSSTHSKVVDSRHADEANAIRRRRECEKCGTRFTTFEHIEVSPLIVVKKDGTREQFLREKILNGLVRSCEKRPVRYQQLEDITNKVEWQLRDEGHTEISSRDIGEHVMNLLMHVDQVSYVRFASVYKEFKDVDQLLASMQGILNDNKRSDS >NZ_CP023970.1|WP_002478057.1|129803_131180_+|DnaD-domain-protein MTMQAYQFDLRPRDSFEVIRHFELSQAHLEILNRLYAPLIGTHAIGLYHYLNQFVSENNQELLTHYTIMNELKVNLLDFRKTMDYLEGIGLLKSFVRHQSDNSNFIYELIQPPTAYQFFNDPMLSVFLFSEVDKKRFVQLKQYFEQDRKDLTNYQNITHKFTEVFKMPNKDIKIDSQNIKSSQYYKGLDLSNEHFDFELLKELLQHHFISSEIVTDEAKALILQLATLYGLTVEAMKRMILNSITSAQTLSFEELRKQARSYYLIEHEQQLPKLAINADKYYDSESQHTRDNSTNTKQDEWLSSLDNISPVDMLSSWSGSEPTHQQKLMIEELVSREKLPLGVINILLQFVMLKNEMMLPKKYIFEVASNWKKLGISNAKEAYERALKMNEPKQVERKPQNAKNRYYGKQIVSREKTPKWLENRDTAKRQEKIKKKDDNLEKDRQQFLEQLKKDWGDD >NZ_CP023970.1|WP_002458889.1|131179_132100_+|primosomal-protein-DnaI MKSFKNIMGSDSNLEQRISQIKQQVINDPDVKQFLTMHQSELTNAMIDRDLNVLQEFKDQQKHYDGHDYHSCPNFVKGHIPELYVEDERIKIKYLPCPCKIKYDEARFDSQLVTSHHMQRDTLNAKLNDIFTEDRDRLEIAIKANHICKSIINGESVKGLYIYGPFGTGKSFILGAMANQLKSQKVASTIVYLPEYIRSLKNGFKDGSYEQRLARIREAGILMLDDIGAEEVTPWVRDEIIGPLLHYRMVQELPTFFSSNLSFEELEHHLSITREGAEKTKAARIIERIKSLADDVYLEGKNYRNN >NZ_CP023970.1|WP_002493141.1|132459_134397_+|threonine--tRNA-ligase MTKINIQFPDGNKKAFDKGITTEEIAQSISPGLRKKAVAGKFNQQLIDLARPLEEDGEIEIVTPGSEEALEVLRHSTAHLMANALKRLYGNVQFGVGPVIEGGFYYDFDMENKISSDDFEKIEKMMKQIVNENHKIERKVVSREEAKEFFKDDPYKLELIDAIPQDEMVTLYSQGDFTDLCRGVHVPSTAKIKEFKLLSTAGAYWRGDSNNKMLQRIYGTAFFDKKDLKAHLQLLEERRERDHRKIGKDLELFTNNQLVGAGLPLWLPNGATIRREIERYIVDKEVSMGYDHVYTPVLANVDLYRTSGHWAHYRYDMFPPMKLDENEEMVLRPMNCPHHMMIYKNKPHSYRELPIRLAELGTMHRYEASGAVSGLQRVRGMTLNDSHIFVRPDQIKDEFKRVVHMIQDVYKDFGFEDYTFRLSYRDPEDKEKYMDDDDMWNKAESMLKEAVDELGLPYVEAIGEAAFYGPKLDVQVKTAMGKEETLSTAQLDFLLPERFELTYIGSDGEYHRPVVIHRGVVSTMERFVAFLTEETKGAFPTWLAPKQVEIIPVNVDLHYDYARNLQDELKSQGVRVEIDDRNEKMGYKIREAQMQKIPYQIVVGDKEVENNQVNVRQYGSQDQQTLERDEFIWNLVDEIRLKKHR >NZ_CP023970.1|WP_002493144.1|134860_136354_+|amino-acid-permease MSKIESQNGGIIRGLKDRHISMIAMGGCIGTGLFMTSGGAIHDAGALGALIAYAIIGIMVFFLMTSLGEMATYLPVSGSFSTYATRFVDPSLGFALGWNYWFNWVITVAADVTIAAQVIQYWTPMAGIPAWLWSCIFLVIIFSLNSLSVRIYGESEYWFALIKVVTVIIFIAIGLLTIIGIMGGKFVGFETFTKGEGPILGGNFGGSLLSILGVFLVAGFSFQGTELIGITAGESENPERAVPKAIKQVFWRILLFYILAIFVIGMLIPYDSNALMGGDNSISTSPFTLVFKNAGLAFAASFMNAVILTSVLSAGNSGMYASTRMLYSMSKDKLAFPIFGKTNKYGVPYLSLLLTAILVIIIFLVQKVSGNAYEYIVAASGMTGFIAWVGIAVSHYRFRRAFQRQHHNKKELKYKAKWFPFGPIFAGILCVIVIIGQDVDFIKTGEFDLNRFVITYMGIPVFLVFFIYHKLRYKTKKIPLEEVDLRQDVHMNEIKHH |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP023970_2 | 552829-552915 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023970_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP023970_2
>2.1|552859|27|NZ_CP023970|CRISPRCasFinder GGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023970_2
The CRISPR arrays of NZ_CP023970_2 >merge|NZ_CP023970|2|552829-552915|CRISPRCasFinder GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAATGAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGTG >NZ_CP023970|2|2|552829-552915|CRISPRCasFinder GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGTG GGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAT GAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGTG
>NZ_CP023970.1|WP_002491838.1|551552_552425_-|DNA-protecting-protein-DprA MDDIVLLKLRYSGIQAPQFQRLIHAYPNFLSFSEDDLLNLLSKTEIKKWFGDIAAQYKRISEDYILTSLYDASVKFITINSQCYSTLLKEIYDFPPILFYRGDISLLNSNTTLAVVGSRKATSYSYKALDFLFSQFNRRFTIVSGLAKGADSMAHELAIQHHHATIAVLGFGHLTHYPKETYILRQKIEAHHLSISEYLPFEPVTKYHFPQRNRLISGISKGVLITEAEKRSGSQITIAHALDQNRNVYVLPGDLFNPLTQGNLYRAREGACIVTGAEDILMDYDINKVF >NZ_CP023970.1|WP_172412355.1|549311_551387_-|type-I-DNA-topoisomerase MTLADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKKYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDVDDNFEPKYITIRGKGPVVKELKKYAKKAKKVFLASDPDREGEAIAWHLSNILELEDSKENRVVFNEITKDAVKESFKHPRDIEMDLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWTIEGEFRYQKSKFTAKFLHYKNKPFKLQNKDDVNKVTAKLDGDQFEITNVNKKEKTRNPAQPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMIAQQLYEGIDLKRQGTVGLITYMRTDSTRISDAAKNEAKSYITENYGSNYVSKRQAKGKQGDQDAHEAIRPTSAMRTPNEMKSYLSRDQHRLYKLIWERFVASQMAPAILDTVALDVTQNDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVEAKDDKENDKENKLPNLKEGDKVTATQIEPAQHFTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLDSKRFVPTELGEIVYEQVKEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDMKWRKVIDDFYNSFKLDVARAEKEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKTIGVTCPTCKKGDVVERKSKKNRIFYGCSNYPECDFISWDKPIGRDCPKCEHYLVEKKKGRSSQVVCSNCDYQEEAQK >NZ_CP023970.1|WP_002459294.1|547952_549260_-|FADH(2)-oxidizing-methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)-C(5))--methyltransferase-TrmFO MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAQRGINVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNALTNAVGVLKEEMRRLDSLIIKAADQAKVPAGGALAVDRHDFAGYVTDALRSHPNVTVLNEEITQIPDGHSIIATGPLTTSSLAQEIVNITGKDQLYFYDAAAPIIEKDSIDMDKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEEEFNRFYDAVLAAEVAPVNEFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGKRPFAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIQLIPGLENVEIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELIGNEHIQFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGVNLAHKLLAKGEVIFPRETMIGSMAYYISHAKNDKNFQPMNANFGLLPVLEKRIKDKKERYETLANRALEYLEKYKKTL >NZ_CP023970.1|WP_002491833.1|546927_547821_-|tyrosine-recombinase-XerC MNEIQKAFLYMLKVERNFSDHTIKSYHDDLMQFNEFLAQEMLTLSAFEYKDARNYLSYLYNKNLKRTTVSRKISTLRSFYEYWMTQDETVINPFVQLVHPKKEQYLPQFFYEAEMDALFETVLHDAKKGLRDRVILELLYSTGMRVSELVHIKKMDIDLTLPGVKVLGKGSKERFLPFGEFCKQSIEQYLLEFGPVKQNDHPFLLVNMNGQPITERGVRYVLNDIVKRTAGVTDIHPHKLRHTFATHLLNQGADLRTVQSLLGHVNLSTTGRYTHVSKDQLRKVYLNAHPRAKKERN >NZ_CP023970.1|WP_002459292.1|546384_546927_-|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MSTSIHATTIYAVRHNGEAAMAGDGQVTLGQQVIMKQTARKVRRLYDDKVLAGFAGSVADAFTLFEKFETKLQQFSGNLERAAVELAQEWRGDKQLRQLEAMLIVMDKSGILVVSGTGEVIAPDDDIIAIGSGGNYALSAGRALKRHAAHLSAKEMAYESLKVASDICVFTNDNIIVETL >NZ_CP023970.1|WP_002478282.1|544934_546338_-|ATP-dependent-protease-ATPase-subunit-HslU MDTNGIKLTPKDIVSQLNEYIVGQDDAKRKVAIALRNRYRRSLLDEETKQEIAPKNILMIGPTGVGKTEIARRMAKIVGAPFIKVEATKFTEVGYVGRDVESMVRDLVDVAVRLVKNQKKAMVKDEAVAKANDKLVKLLVPSMKKKAAQGNNPLENLFGGAIPNFGNNQEDEEEPPTEEIKTKRSEIRQQLLAGKLEDEKVRIKVEQDPGALGMLGTNQNQQMQDMMNQLMPKKKVEREVPVKTARNILADDFADELIDQETANQEAIELAEQMGIIFIDEIDKVATNNQSSGQDVSRQGVQRDILPILEGSMIQTKYGTVNTEHMLFIGAGAFHVSKPSDLIPELQGRFPIRVELESLTVNDFYRILTEPKLSLVKQYEALLKTEEVTVNFTDGAITKLAEIAYQVNQDTDNIGARRLHTILEKMLEDLSFEAPNMPNAVVDITPQYVDEKLKSISTNKDLSAFIL >NZ_CP023970.1|WP_002459290.1|544139_544913_-|GTP-sensing-pleiotropic-transcriptional-regulator-CodY MSLLSKTRELNTLLQKHKGIAVDFKDVAQTISNVTVTNVFIVSRRGKILGSSLNELLKSERINQMLESKHIPEEYTEQLMEVKQTQSNIDIDNVLTVFPPEDRETFINSRTTVFPILGGGERFGTLVLGRVKDDFNENDLVLGEYAATVIGMEILREKHNEVEKEARDKAAINMAINSLSYSEKEAIEHIFEELGGNEGLLIASKVADRVGITRSVIVNALRKLESAGVIESRSLGMKGTFIKVKKEKFLDELERNK >NZ_CP023970.1|WP_002459289.1|543132_543921_-|30S-ribosomal-protein-S2 MAVISMKQLLEAGVHFGHQTRRWNPKMKKYIFTERNGIYIIDLQKTVKKVEEAYNFIKQVSEDGGKVLFVGTKKQAQESVKAEAERAGQFYVNQRWLGGILTNYKTISKRIKRISEIEKMEEDGLFDVLPKKEVVELKKEYDRLIKFLGGIRDMKSMPQALFVVDPRKERNAIAEARKLNIPIVGIVDTNCDPDEIDYVIPANDDAIRAVKLLTGKMADAVLEGQQGVSNEEVAAEQNIDLDEKEEAKDAETTEENTSVESN >NZ_CP023970.1|WP_002459288.1|542070_542949_-|elongation-factor-Ts MAISAKLVKQLRERTGAGMMDCKKALTETDGDIDKAIDYLREKGIAKAAKKADRIAAEGLVHVEVKGNEAAIVEINSETDFVARNEGFQELVKEIANQILDTKPESVDALMETKLPNGQSVDEKMKEAISTIGEKLSIRRFAVKSKSDNDAFGAYLHMGGRIGVLSVVEGSTDEEAAKDVAMHIAAINPKYVSSEQVSEDEINHEREVLKQQALNEGKPANIVEKMVEGRLRKYLQEICAVDQNFVKDPDQTVEAFLKSKGGKLVDFVRYEVGEGMEKREENFADEVKGQMK >NZ_CP023970.1|WP_098903138.1|541211_541934_-|UMP-kinase MTQTSKYKRVVLKLSGEALAGEKGFGINPIIIKSVAEQVAEVAKRDCEIAVIVGGGNIWRGKTGSDLGMDRGTADYMGMLATVMNALALQDSLEQLDCDTRVLTSIEMKQVAEPYIRRRAIRHLEKKRVVIFAAGIGNPYFSTDTTAALRAAEVEADVILMGKNNVDGVYSADPKVDPNAVKYEHLTHIQMLQEGLQVMDSTASSFCMDNNIPLNVFSIMEEGNIKRAVMGEKIGTLITK >NZ_CP023970.1|WP_002491837.1|553083_554319_-|aminoacyltransferase MNFTTLTCEEFNTYVSKHFSHYTQSIQLYEYRKQQHKGVHLVGVKNIYGEVIAACLLTEARVLKIFKYFYSHRGPVMDYNDLSLVKFFFKHLTRYLKKQRGLFVLIDPYILENIRNAEGEIIHTYNNEKLIDTMHRLGYEHQGFSVGYSDMSQIRWHSVLNLQQKSEDQLLKEMSYQTRRNINKTFEMGVEVITLPIEETDRFYRLFKMAEEKHGFNFREESYFEEMQKIYHDNGYIKLAYINLADYLTRLEKQRQKLIVLLNDVKETLEINPNSKKSKTKYQQLTQQLASIDKNIAKTQDLQQEDGNILDLAAALYVYNNHEMYYLSSGSNPKYIQYMGAYRLQWDMICFAKSHHIHRYNFYGITGDFSSQAEDYGVQQFKKGFNAFVEEYIGDFIKPLRPWLYKFYSRK >NZ_CP023970.1|WP_002478289.1|554479_555388_-|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTQIVAGVTPGKGGQVVEGVPVYNTVAEAKQETGANVSVVYVPAPFAADSILEAADADLDMVICITEHIPVVDMVKVKRYLEGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNDDEETKAVVMIGEIGGTAEEEAAEWIKANMTKPVVGFVGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTAAEKIKTLNSCGVKTADTPSEIGTTLIAAAKEAGIYEQLLTIDK >NZ_CP023970.1|WP_002493081.1|555409_556576_-|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAKEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYANELLGKQLVTHQTGPEGKEVKRLYIEQGCDIQKEYYVGFVIDRATDRITLMASEEGGTEIEEVAATTPEKIFKETIDPVVGLSPYQARRIAFNINIPKESINKAAKFLISLYNVFVEKDCSIVEINPLVTTGDGEVLALDAKINFDDNALFRHKDIQELRDLEEEDPKEIEASKYDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDVGGGATKEKVTEAFKIILGDDNVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVAAVKEVELTLPLVVRLEGTNVKRGKEILNDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >NZ_CP023970.1|WP_002493079.1|556686_557454_-|ribonuclease-HII MKITIKEAKAQLNKVTTLEALSNHALHLDERKGIQQAIRVRQRQLEKELKLEQDYQRMMKYEQEILQQQPDAIICGIDEVGRGPLAGPVVACAVILNANHHYLGLNDSKKVSAVNRAQLNQDLMANVRGYAYGIASAAEIDQLNIYRATQVAMQRAINQLQVRPTHLLIDAMSIDSTISQTAIIKGDAKSVSIAAASIMAKEYRDHLMRDYAQVYPHYGFDKNVGYGTKAHLAGLEQYGVTPIHRRTFEPVKSML >NZ_CP023970.1|WP_002493074.1|557437_558322_-|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MAIQWYPGHMAKAKREVTEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDDVIKQKPRVVILNKKDMTNLKEMSKWEHYFVEQGFYPVAVDAKHGKNLKGVEAAAIEATKDKFAKEQAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLARKNIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGKVLQLLDTPGILWPKFEDELVGKKLSLTGAIKDSIVHLDDVAIFGLNFLIQHDIETLRQHYHISVEEDAAILEWFDAIGRRRGLLQKGNEVDYEAVIELLINDLRNAKMGTYCFDLYSEMKRDIAHENND >NZ_CP023970.1|WP_002493075.1|558578_561170_+|YfhO-family-protein MTKKLLMIMLFLTLAIIGHTYILYRFIHDGILFTGPNDGIEQMIPMQMYLYDKWSQGQFFYATDFGLGGDFFSDLSYYFSTNLLFIINAIIIYITNLIVSLPTGNVTFWTINAIVISIVKATIAMLVTYLFSMRIVKHRVNSSLIAFLFVMSPLYYRFTVYWPFFSDVFIGLHLLLYAIEHMLQQKKIGLLILAITIIMINNFYFAYYFLLIGAGYLLIRITFPHKDDRMKRITALWLSVLCAFLGLANALFMFYYSAQSYINNRRIPYKDHVPVFESLNINNNIFIDNYLIILLFITIQALLTFKLYKHYYFRLFAFLTCITILFNFMPIVDQIFNGFSAPQKRWHFLLAFNSAMVIGLFIKYFSTIRLKTYIWTNIVAQSAVFISVIVYHQYVPWLVLVPIVSLIGLFTLIIKDATSRLIIKQIYVFSIISLSILVSAVFIKNQIYFKDHEQRANNMYIHSSLYNSELQRQLLSYMTHTKEPWERIDWRVNEQDNTPMYQKFKGLSLYSSIFHHNILDLYYDDLKINLAEESLSRYQSTNGRQNIASLFSVRYMMLKDYQNNLPAYFQKIKSSGQYAIYENKLNLPAVKVTNHLYNDQSIKTSIDREHAMLDGVIVHNGGNNYRKHSKNLLNKVSQSSQHIQCLSNKHIKVNSQQGGMIKLHVPKSIRQHYTDFYLTMYIKRGQPDSNYSVAINGYVNHRLYNQSTYRTGVNTQLYRTQPDENGNISIQLTPSGTFDMKLISLHGENYHKLVQTHRQANFDHRYQDIHDGVRITLAPHSQGMAVVNIPYRKGMMAYVDGKRINPIRVNTMMTGIPVKKSTTSIIIKYLPPHWIVMLLLSSISILCSIMITRIFTKKRKDEE >NZ_CP023970.1|WP_002493078.1|561174_563781_+|YfhO-family-protein MQKRTVQAMKTFVMITLISFIATLIIYFPFIKDWISKGYVFSGVGDGFRQMMPFQMYLYEHYTQLKGFYDHSFGLGGDYVKSLAYYYSLSPTMWCNFIMIWLGERLLHWNPHVIGFWPFNQLIVALGRSLLTFICAFYYFRYLKLKQAPLMIATILYGASTVGLYYNFTWSFYGDLLIFLPLSLWGMERFFQRGKIGVFIVAIAITLFSNFYFSYYQAIVLGIYFLLRIIFEYRYDIVTRWQKFYLLMFGTILALFSSIIGFYTGVSSFLNNDRQQNSDFKISLFTDLTQDNYYIFSNGFYITISIIALVALLSFKLYKHYYYKLFAIITWFLLIGSLTQYFDSAFNGFSLPQRRWVYFLVLSTSALMALYIQHISELSIKQYCFTAIPVFIFGLCRYLFAEHFVNWMLISLILIIILALLVWRKKWLYHPLVLLGIVVIFFVQQVVMTIESSKRTIGPYSTTMSTITDPSYYNTKLAKVIQQINHKNNNPLHRIDYMSFYALNSPFIYHYNGISLYSSIFDGSILNYYDHLMQINMPVDKNSTYRYLSNRANLEALWNVQDRFRHPNDLNIPYGFKKIDTIKNGNDTLIHSKNTINYPATHVTNKVFNASDLKSPLDREQAMLQGIVPSDGSIKANTAFKANQNLIDEAKRSTHNATWQNHSHLKVDKNNGGVTYTLPKNVAKKYKDLYVEMDVELLTPDKNHEVGVNEYAQDRNELTYKYRRFVTPVTMRVKASDKLNIHLSQGTYRLSVKGIYGEDYSSLQQSAKDLKAVSVKENKNGYTISKSKSTSGYVVLPMVYADGMKATVNGRHEDVKKVNGIMTAIPVNKGDTHIRLTYTPPHWHLLFIMSILGIILSIAFRFWVKRKV >NZ_CP023970.1|WP_002459304.1|564027_564378_-|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRTGDTLRVHVRIIEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRNLRGKAARIQEIR >NZ_CP023970.1|WP_002459305.1|564483_565221_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKGIINVNTINFRDYAVNKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMKDIQHNDETRVILMCPQGRPFTQKIAQELSSTEHIVFICGHYEGYDERIREHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNQQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFQGMTVPDVLLSGNHAHIEKWRHKQKLIRTYLKRPDLLMAYPLSEQDKEIIESFKKQLKKG >NZ_CP023970.1|WP_037540673.1|565220_565721_-|ribosome-maturation-factor-RimM MQVEVGQIVNTHGIKGEVKVKSHSDFTDTRFQPGEVLTLKHNNDNVELTVTSYRIHKGFHMLKFEGFDNINDVESFKGDYLYQERDHEGIELAEHEFYYSDIIGCTVFNGEIPIGRVTNIIETGANDVWVVKGDKEYMIPYIADVVKDVDIENKTIMITPLEGLLD |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP023970_3 | 1069060-1069140 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023970_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP023970_3
>3.1|1069083|35|NZ_CP023970|CRISPRCasFinder ACCAAGCATTTCTACGTGCAACGCAAGCTGGGGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023970_3
The CRISPR arrays of NZ_CP023970_3 >merge|NZ_CP023970|3|1069060-1069140|CRISPRCasFinder GGGGCCCCAGCACAAAGAAATGCACCAAGCATTTCTACGTGCAACGCAAGCTGGGGGTGGGGCCCCAGCACAAAGAAATGC >NZ_CP023970|3|3|1069060-1069140|CRISPRCasFinder GGGGCCCCAGCACAAAGAAATGC ACCAAGCATTTCTACGTGCAACGCAAGCTGGGGGT GGGGCCCCAGCACAAAGAAATGC
>NZ_CP023970.1|WP_002492952.1|1067707_1068160_-|hypothetical-protein MKKGLVLLLAAIFLLTACGKGNDEKQSLEQDIQKLEKEKKDLEKQEEKLKSDKEKYKSQRETLEKEVEEMQSNSSDDDKDNKEKTSDKSKEKSSQHQTTHDQNKDQQNQHQNSNNTDNTQTDKDKTNKQQSSQSTKNDTQKQSKQPKQQQ >NZ_CP023970.1|WP_002459790.1|1067285_1067582_-|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELETLTGRTIVDSTGEINRVVAHLPNFDSDFDTFVATYKLNHQNDFIDAIFTAPKAQRNRLKEIPVHIELISYISKA >NZ_CP023970.1|WP_002492957.1|1066629_1067172_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MTVYIETERLKLRDWEENDLLPFQKLNANPQVRRYFPSLLSYRRSALDMKQMQKNITATGIGLFAVELKETNEWIGFIGLNYIPKDSQYPFNNLPFYEIGWRLIPEVWGNGIATEGAEAVLKYAQKKGVYDIYSLTAETNLSSRKVMEKIGMKVFDRFEFPELNKYHPLKMQVRYYKNLK >NZ_CP023970.1|WP_002479382.1|1066031_1066598_+|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKKIAVFCGASKGSNPTYVNEAYNLGKYMAQKGYELIFGAGSVGIMGAIQNGVLDHNGTVIGVMPKELDTKEITSQRVSELILVDSLHQRKEKMAELADAFILAPGGAGSLEEFFEIYSWTQIGIYQKPIGIYNLNGFFEPLHQLIIHMIQEGFIDEKYKALAPLYHTKEDLLHGLQNAKPLGERSYD >NZ_CP023970.1|WP_002492972.1|1065569_1066016_+|YaiI/YqxD-family-protein MTSIIIDGDACPVIQSVIELTSGTGIFVIIVRSFSHYTTQTYPEHVKTIYVDDGPDAVDYKIVQLAQSKDIVITQDYGLASLLLNKVKTVLHHKGYIYNSTNIDMLIQQRYNHAQLRKQGGRHKGPTPFSNKDQQHFEHIFRRVLSQI >NZ_CP023970.1|WP_002459786.1|1064884_1065565_+|hypothetical-protein MDQKKRHLIKTLINVLPIFIVPLVTERKHIKNHSEVKKVTAATSRASKTVANKATDVKEFVIDKKQEHDNKRELKKIAKENDPEYIEKKGEKLAKKNRKEADKMDKKLQKNIEQRHKEEAKAREKNEKQRIKDLKKTQKYQEKVGLTPGALDDETEKKGEKLAKDNKHDIKKLAKKLQKNIEQRHHDEEKNRDKNKKARIKEIKKYEEHDAQSVTKQNNKETHHES >NZ_CP023970.1|WP_002459785.1|1063695_1064568_+|undecaprenyl-diphosphate-phosphatase MFLLELIKGIILGIVEGLTEFAPVSSTGHMILMDDMWLKSTDFLGSESAFTFKVVIQLGSVFAAAWVFRERFFELLHIGKQHQAPISEEFRSKPRRLNLLHVLVGMIPAGILGLMFDDLIEKYLFSVPTVMIGLFLGAIYMIIADKYSEKVKHPQNVDQINYFQAFVIGISQAIAMWPGFSRSGSTISTGVLMKMNHKAASDFTFIMSVPIMLAASGLSLIKHYEYIHLAHIPFYLLGFLAAFIVGLIAIKTFLHLINKIKLVPFAIYRIILVVIIAILYFGFGIGKGIY >NZ_CP023970.1|WP_002459784.1|1062873_1063314_+|MarR-family-transcriptional-regulator MSEHHNLKEQLCFSLYNAQRQVNRYYSNKVFKKYNLTYPQFLVLSILWDESPVNVKKVVTELALDTGTVSPLLKRMEHVDLIKRERSEVDQREVFIHLTEKSEGIKPDLKDASSKVATASSLSADEAQELNRLLGKVINAFTENKE >NZ_CP023970.1|WP_037540845.1|1061716_1062649_-|GTP-binding-protein MKKHNCRNTYISIVSGFLGSGKTTFLQEYMQYLLKTDEKITIIMNEFGTFDVDSLTFNNEVAINALVNGCVCCDLKADLVAQLKNIIADGQTTHIIIEATGIAHPLEIMMACQDPEVIHLISEVKMIGILDASRFLHRHRYSLTTVELMEEQLAYSSTIIINKMDLINDQEQKKLSAELTQINLQATTCYTTFGQLDITTFNNIKHVDNIKSPAKHAHHHGIKSMQYTFSGPIDRQLFYQFILKLPQNVFRLKGFVRFRDCADVIYEFQYAHGLPSYGEVDKEVPLTIVIIGEHIDVERLRNNLDMLQFT >NZ_CP023970.1|WP_014533356.1|1061507_1061609_-|type-I-toxin-antitoxin-system-Fst-family-toxin MMEILVHITTTVISGCIVALFTYWLRTRNNKKK >NZ_CP023970.1|WP_002492997.1|1069509_1069995_-|DUF456-domain-containing-protein MTVLLWLLIIFAFILAFVGLIKPVIPSVLMLWVGFLIYQFAFNNGELSWIFYVSMIVLTVLMFISDFAMNKYFVNKYGGSKISEYVALIGVLVGCFVFPPFGIIIIPFVAVFAVELMQDFDVNKAFKASLGSIVAFLTSNIAKAIIMFIMIVCFFIDVFVI >NZ_CP023970.1|WP_002492949.1|1069996_1071214_-|sugar-efflux-transporter MFKALLHIKNYKLFVVNMMLLGMGIAITVPYFVLFATNELGMTTNQFGILLALAAVSQFTINSIVARFSDTHNINRKFLIITALFMGAVSFSIYFYIHDIWLFIITYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINISSSRKNAKFANTVLRSMFSFGFLFGPLIGSRLIHFNGYAGLFGGTVAIILFTLLLQVFFYQDLKLTGDQQVGGTAHIETTAPNMLKDVTLFLPFVAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTKQLHISEDYVGTLASLCAGLEVPFMVILGMLATKLQTRTLLIVGALSGGAFYFSIGIFNNIYMMMLGQVFLAFFLAILLGLGISYFQDILPDFPGYASTLFANAMVIGQLCGNLLGGAMSQWVGLENVFFVSASSIFIGMVLIFFTKDQKFTEEKVIS >NZ_CP023970.1|WP_002459796.1|1071299_1072154_-|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAELLYISQPAVTQRLKAIENNFGVDIFIRTKKQLITTTEGAMIIEHARDMLKRERLFYDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPDVLSLYNTQFPNVEIQVQVGSTEHIKAHHRDYHVMITRGNKVMNLTNTHLFNDEHYFIYPKDKRAEVDKLPFIEFQADPIYINQIKEWYNDNLGQDFHATITVDQVGTCKEMLLSGVGVTILPEVMMKYIDKNQFECEKVLIEGQPLIRSTFMSYEANMLQLPQVDSFVNLMYNFIR >NZ_CP023970.1|WP_002493006.1|1072661_1073276_-|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLIEREYIEVKVNNKRFKGIIGLVTMNKVREPLEVTVVGKHMVVADDHYQWLQILPEKKRYSITAMFDDKGQPLEYYFDINIKNITQKGNARTLDLFLDVLVLPTGKYELVDEDDLMNALVNEQITKRQYHEAYMIAHQLMIEINDNFDELERRIMHCYRKMNQKKHKAKRHHHQAPQPQQRHKRKKRFTED >NZ_CP023970.1|WP_002459798.1|1073659_1074127_-|cupin-domain-containing-protein MISAEEWINRLELMPHPEGGYYKETLRPDDKKRASYSSIYFLLKDADVSHFHRIDADEVWYHHSGETLLIHMITTEGKYYVEQLGQNVADGDVLQCVVPKGTIFASSLKHSKGYGIVGCMCQPAFEFEHFELLAQAILLEKYPQHQEIIKAYAVE >NZ_CP023970.1|WP_002493004.1|1074126_1074843_-|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPDPNSNQALRLVLERAKTYSVPNHIIDKAIDKAKGAGEENFDHLRYEGFGPSGSMIIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDDTATFAIEGKSADDVLEALMEQDVDVRDVIDEDGLTVVYAEPDQFAQVQDALRAIGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSAEDQETFEKLVDALEELEDVQNVFHNVDLK >NZ_CP023970.1|WP_002492965.1|1075076_1075436_-|MarR-family-transcriptional-regulator MSKDKLNQLLNLYKKHKLLSEYIDKKYKLTLNDLAVLKLAKDYTSEKKVLMQSFLKLAIEELDLSRTKLLVSIRRLIDKEKLSKQRSEEDERKIFIYMNDDNIESFNDLFKDVEELLEI >NZ_CP023970.1|WP_002493010.1|1075579_1077724_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTNTFFRILTKEEYQPTRCIDGIIVILPIQGDLTIQHFANSTTISDEIYIINNKDIFTIKQNHKSLMLYITSDWFKNHDYVFFDYKYSVNLIKSINKLKQLMLKIAINYINQMPITSNENYIKQMVEVIATEGSVDLETAENQYKFLFYGELSQILEYINKHSHEKLTLNALSQNLFTSKSNISAQFHQNLNMGFKQYVDSLKIAESIEYLLTENSTISHISDKLGFSNSASYTKMFKSYIGITPNDYRSLNIKDKYLLMNYEVLSEDNEQHLKTVLRQQINYYQENIERKIFIDNNKVKTKQNFELVTQINTVEEFKELFFIKIKGKANINTENLIIYVNFGTGTLINNLSDAEIGDMFKKIAANNLHIAFKIQSLEIMDYIERIYVQVVERLNYKKSLANGDRGIIMLVFDMEVIELKEIYRLILKIQNKQFGLRFGLAISCLLNETVMFKTLESQIKRIGFDYLFIDNAHLEQPYLLEDSQHLLLKNILEYQNIEKILTQIDLSYSKVIFLNIENHQFLNNENDLSNSAPLIIETFLKTAELFDGMGVNLYFSRNSFNAIHIFDENGFKTVLGIIIGQIKWMMNQSRTIKDNYIVVENEAQYTLFLYDWRVFESEASITYFGDTEVLIHFEEVAEQSIRLIKSEKVDEKNGNINHIINRHIREKYNWTQELLKEIEDHLHTTMRIIEHDFRKDYFKVNLGYDSLRIIKIFK >NZ_CP023970.1|WP_002459802.1|1078032_1078686_-|Bax-inhibitor-1-family-protein MNDFSKKQRHMTDHSQSKSWAYSQVWLYFMYYWLIFGIGCYFGQYLPDEWRMPLSIGLLVLIFSTLIFKRARKYGLIISHIYAIIVGLLSYAMFTTYLQNLGADVFYKNIVLAIGAFVIFGVIGFFFIKDASSIGRYLFVTLLALIVASLIGLFIHNPVFYTVITVVSLFLFLLYTLYDFNRMKRGQFSPREMGFNLFINLLNIILDILSLANRFRN >NZ_CP023970.1|WP_002479388.1|1079053_1079857_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITAASGAAAALTHQHAEAATQHTVKSGESLWSIAQQHNTTVNDIKQSNNLSNNFVFPGQVLSVGGNNTNSSQYSGQNSSATSHTVQAGESLNLIANQYGVSVNDLMRANNLNGYLIMPNQTLNIPSGSGNGAGSGGTTVTPSNTNTTPTFNHSNLYTSGQCTWYVFDRRSQAGKPISTYWSDAKYWAGNAANDGYRVDNSPEVGAIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNTNTRTIPASEVSSYAFIH |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP023970_4 | 1653199-1653289 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023970_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP023970_4
>4.1|1653232|25|NZ_CP023970|CRISPRCasFinder AGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023970_4
The CRISPR arrays of NZ_CP023970_4 >merge|NZ_CP023970|4|1653199-1653289|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCTTTGCTTGATGAATTTCTTTTTAGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCGCCCCAACTTGCTTTGCTTGGTGAATTTCTTTTT >NZ_CP023970|4|4|1653199-1653289|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCTTTGCTTGATGAATTTCTTTTT AGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCG CCCCAACTTGCTTTGCTTGGTGAATTTCTTTTT
>NZ_CP023970.1|WP_002492523.1|1652353_1652926_+|ECF-transporter-S-component MKRLTLADILVTVLISFIFGIIYKMVGLTVAALKPLGLHLDQIAYGLWFIAAIVAFLIIRKPGVAILAELAAGAGETILSGELNMSIIMHSLAQGLACELIFLIFKYKSTKASVAMLAGATAGIFTVPVDWFFNYLGNMPWWNVILLYAIRILSGTILSGLFGYYIVLSLEKTGVTRLYQSSTKKDIDSL >NZ_CP023970.1|WP_002460757.1|1650784_1651852_-|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase MDITQIKQQMTNFITDGKSEDFPQMALTLFNFQFNHNLDYQKFCIAQGKTPQTVRQWQDIPAVPIDAFKQATFSAIPPEDAAYVFMTSGTTRGIKGKNYHLDLDVYDLAMTKFFKQKVMPQIERIDMGILFPSPNDMPHSSLAHYLEVVKQQFGTSLSDTFINQQGIQFESVVQSLRHAEAQGTPYALLGASYSLVHFLDYLADHGLYFKLPKDSFIFDTGGYKNQSRDVPQSEFYSTLEKRFGVPKDKCINMYGVTELSTQFYDDGNAVSPSIKHGPHWCRSRIVNPLTLEPVPNGEKGVLIHYDLANYNSVAAIMMEDIGEARNDGFILHGRTEGALAKGCSLAVESFLNTMK >NZ_CP023970.1|WP_002492392.1|1649338_1650772_-|acyl-CoA-reductase MTIQLGYVPFLKAEDIHYQTIQVGNYTVKVPDLTQSQLTNVCHQIKSARYHLQAYTINDIIDVIDHAIQILLDRTSKWRQLAEEILPQSTGYPFDKIKVGLTRYLMTFRKHQLHRFIAEDLPNPQILNQFIPNHKGGYTKAVSPALITHLWSGNIPGLPLWSFISSLLVKSGSICKLPHAEPFLASWFAEIIAEIDPVIAQCFAVIYWPGGEIQLESIAIEQSDVILGYGNNDVLSAIAQRIPVTKRFLAYGEKVSLALIGNETLSPNKVEQVTRNIAREIANYDQQGCYSPQMIFIQQGGNYHPLQVAQMIAHQLQQIEQLFPVQSFNLQDSMTRSHWLQQAETQALLTDDIHVFKGAHASWIVTFHKQLTFLPSPLNRFVRIMPFTNITQLTQLLTPYRSYLQTVGIAAATEKMFQWSEALAQVGVCRFSSLETMTLPEAGWHHDGGFNLRDLLSFVDIEQPLLSSSEHFVDYEI >NZ_CP023970.1|WP_002460759.1|1648547_1649318_-|SDR-family-oxidoreductase MMTTLQDQVILITGASRGIGSAIAEACAQSGAHVIINYKSNTQAAQKTVSRCQAHGGIAEAIQADINQRQQVDEMMHYIQNNYGKLSCVVNNAFRPFEFNAETRQVADEMNWQDYATQFEGALLYTHNVIQAALPYLKQQQAASIINMTTNLIKRPIVPYHSYNVAKSALEAYTKNLAIDLGKYGIRVNCVAPGLVYPTNNTLATKEQLKQQLIQQTPLGRYTVPDDIAGPVMFLASDWSRFMTGQVLYVDGGLTI >NZ_CP023970.1|WP_002492409.1|1646806_1648342_+|PTS-transporter-subunit-EIIC MNKVFEKAQQFGKSFMLPIAILPAVGLLLGIGGALSNPNTVKTYPVLDVAILQNIFTLMSSAGNIVFQNLPVIFAIGVAIGLARSDKGTAGLAALIGFLIMNATMNGMLVITDGLAKTTELAKHGQSMVLGIQTIETGVFGGIVTGILTAYLHNKYNKITLPAYLGFFSGSRFVPIVTAISAIFLGVILFYIWPTVQSGIFNAGGLVEKTGVIGTFFFGFILRLLGPFGLHHIFYLPFWQTGLGGSLEVGGHMVRGTQNIFLAQLGDPHVTHYFSGISRYMSGRFITMMFGLCGAALAIYHTAKPQHKKVVGGLMLSAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPVLYLIHAFLDGLAFMMADIFNITVGQTFSGGFIDYILFGVLQGNDKTNYLWVIPIGIVWFVLYYVIFRTLITVFNFKTPGREDKEAQHTVAATERAETIVQGLGGKENIEIVDCCATRLRVTLKDGDLLDKSTLLKTDAKGVIVRGNGAQIVYGPHVTTIKNEVEELLEQS >NZ_CP023970.1|WP_002492576.1|1645980_1646559_-|hypothetical-protein MEEVLTNDSFSNLTYTKLKRFNKDYWKFVLIMFPTIPISAILPYLGNIYLKNNKDNIFVHGTIFPDNWTIIAGLIFALLFFYLIVLSPLLSFKNDVQTEIDIVNSVFINNQGELHSFIHLIKCDHFETEYYEHLITFISREYTRVTKQDLSHEQQTRYDEVQPHLSLDEAHRYVRELYLTLEKRYNNINLPE >NZ_CP023970.1|WP_002492541.1|1645121_1645877_-|SDR-family-oxidoreductase MFKLTNQIALVTGGANGIGKGIAAALAQAGAKVIIGDIDDTRGKETARELNGDFIELDVKQHDQVKDVVDQIVAKYERIDILASNTGVYPQIDIESLTEADWDYIQNINLKGMFFVTQAVLKVMKAQRYGRVIITSSVTGPITGYPGWAHYGASKAGQLGFMRSAALEYAKYGITVNAVQPGNVLTDGLKAQGEAYLEGTRKIIPTHELGEPLDIGYAVTFFASQEAKFITGQSLVIDGGQLLPEEPDGVL >NZ_CP023970.1|WP_002492472.1|1644186_1644984_-|arylamine-N-acetyltransferase MMNIRAFEHYMSIDSERYSEPSLEALNDYATRFMYTVPFENINVQNGIPISVDINDLYHKIVDNHRGGFCYELNTLFQAYLKAKGFDAQMMSATVHTANGGHRLEGSHVSLVVPLQGTYYVTDVGFGDLPLHAMPITLEQDSQPVQDISGTFRAIFENENKTRFFVQKWESDTWKTKYDAILKASSIDAFKDKINYNETHPDSIFVQNLLITQPKSYGRVTMSQQHLTVTEQNRKVQYDVTPQNYRQLLQDYFNLNVTIDRLELS >NZ_CP023970.1|WP_002479052.1|1643543_1643813_+|hypothetical-protein MSERRRSIISSLLLILAVIIISAVVLCDIINFIAGISVNHHIINTQYNMYFVFVSMLLWIISEVFDKQYVKAVIIALVVGVLTIIALII >NZ_CP023970.1|WP_002492383.1|1643159_1643480_+|hypothetical-protein MVNHCSDVKNILKKGDIIFNKEQHPKLLTVLHIIMIVFVGLAVLTLLISIIAHFIVGGRPFYHFAYVLFIIGMLAEVSINIIQRQTQAAVLSIIMIVLAIIIIFAD >NZ_CP023970.1|WP_037540733.1|1653355_1654732_-|MFS-transporter MSNSYQKGKQLIIGIILGILTYWLFAQSLLNIAPHVQHDYKIDMSVVNIAVSLTSLLTGVFIVVAGGLSDKLGRVKMTNIGLILSIIGSLALIISNMPILLLTGRVLQGLSAACLLPSTIALINQFFTGEERQKALSFWSFGSYGGTGLASLFAGTIATYVGWRWIFILSIIFAFIAIILLRGTPESKDRSSDGKRFDVIGIIVFVIMMVSVNVVITQGSKIGWLSPIILTLMIIFVLTLFIFYFYEQRQRHPFIDFSLFSNKVYIGTTIANLLVNTVIGSLALFNIFAQAGLGLTGAQAGLITIPYMLGSLLMIRIGERFMQKKGPQIPLMAGPISISVGILLLALNFLPHILYYIIALIGFSFIGLGLGFFATPALSTAVSNAPESKVGMASGIIKMTSTLGAAFGIAVVTTVYSTLEINHTPHMAATIALIVGACMVISAFIVAFLVIPKQHVKA >NZ_CP023970.1|WP_002492376.1|1654744_1657777_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MDKHITDQLTLHCGATLKNRVLMAPMTIQAGYFDGSVTREMIDYYQFRAGSASAIIVESCFVEDHGRGFPGAIGIDTDEKIPGLTRLADAIKSKGSKAILQLYHAGRMANPKLNAGETPISASPVAALRPDASVPREMTHNQILNMIERFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANTYLLQQFFSPHSNRRQDDWGGSREKRTNFPVEVLKKVQQVASEHHAQNFIIGYRFSPEEIEEPGIRFEDTMFLLNTLAQYHPDYFHISANSYKRTSIVNQDDTEPLINKYLSLQNETLAEIPIMGVGSIAQRADAEEALTLGYDLMSVGKAYLVEPNWLEKILNDETVEDFADIHDQQTLHIPSPLWKVMDFMILDKAEEHRKYEKLKALQNKKVAFKAGVYNVYAKGHNGNLPMQVELSKDKIISVHVDDSGESEGIANPVFERLPRDIIDGQTLNVDVISGATVTSQGIIDGIADAITQAGEDPDILRARPKPVVQWSNETIEETTDIVVIGTGGAGLSAAATALDNNKEVIMLEKFPAIGGNTIRTGGQVNAPEPQWQNRFPALAGERDTLRELLSLDEANIAEDYLEDFHKVKDQIKDYLNATEEEKPYLFDSIELHRIQTYLGGKRTDKYGEEISGQYDLVKTLTDNVLTSVKWLTDKGVHFDRSFVDMPVGALWRRGHKPMKAQGLEYIETLSNYVKTNGGRIFTETTAEKLIVEDHKVVGVEARKANGAKVHIRARYGVILATGGFGANTKMLQQYNTYWDNIPDDIKTTNSPAITGDGIRLGAQAGAQLVGMGFTQMMPISDPKTGALFTGLIVTPSNFIFVNKDGKRFVNEFESRDVLSKAALEQPDGLFYIIADANIKELAMNTSEDKINHELEDGTLVKADTLVALAEKLNINPDTFINTIERYNAAVDKGHDDDFGKNAFDLKIEKAPFYATPRKPAVHHTMGGLSINTGAQVLDINGQVIQGLYASGEVAGGIHAGNRLGGNALADIFTFGRIAAQTASEHQVIKE >NZ_CP023970.1|WP_172412347.1|1657854_1658751_-|FAD:protein-FMN-transferase MGTLIQLSINHDDAEYLFDLAEAKIRAWEQRFSANNTQSELMAINQQAGIRPVQVHPELFHLIKKAHQASMSSNLKLNILIGPLVKLWRIGFEDAQLPTNTEIQQRLRRIQPHHLYLNDAKHEIFLAQRGMEIDLGAIAKGYFADELQAFFLQNGVTSGIINLGGNVITIGSPATHKTWHVGIRDPFHHDGLPLLTVEIQQQSVVTSGIYERYFYQDGQLYHHILDSTTGYPVNNDIASVTIISNHSIDGEIWSTLCSFGYAQQNIDLLNQIDRVEGVIIRKNHDILFTHQLRTKLHL >NZ_CP023970.1|WP_002492417.1|1659070_1659583_+|DUF308-domain-containing-protein MMRKQNDKLKWSSLIMGTLLLITAIIIFSHPVKNFYALTWLIGVFIVINGILGLFFRRAAKAMTGSGTLTTFMAVIDIIFGLLVMFNIGVGSAFFIYMFAVWFVISSVIGLMTLSGQGRFKGLSILINMLGLLFGIILLFNPMMGMVIVSMMIGISFTIIGVMYIVDGLA >NZ_CP023970.1|WP_002492387.1|1660095_1661295_+|putative-C-S-lyase MTYNFDEIIDRRSTNAMNVEGYLPYLFGNADVSDLQHADDLIRLWIADMDFATPDVVLNAIRRRLDQKILGYTQVFHVDYYNAFVKWTQSRYGYHFPQEQLVFSHGIVAGLIELVSYICNNDDHALILTPSYGPFKMACDENQVEVHYSPLINEEEYYRIDFDDVERQIVQHNIKLCIFCNPHNPSGRVWSREELERFGNIMKAHDVWLISDEIHCDIMRKGMQHLPFATVLPDYDKVITAMSQSKAFNIAGLMFSNLIIRHKGLLNTWKQQHFGSENPLSIAATQAAYEQGEDWLQAMNTYLDGNFEWLKQFLQQELPNAKFKIPEATYLAWVDLSDYITQQHISEPMAKYFIKRAGVIIEGQEQFVHNADGHIRINLAVPRTVLQQGLTKIKAALMS >NZ_CP023970.1|WP_002492531.1|1661800_1662103_+|hypothetical-protein MLGTFMEILKIITPVLLASAVIATQYLLSRTGKKRFGLIIPIITLAVIVYMHITGILGLKLIGTILLTIIAELFLLGQWVSAQEDRKKKHAENESKDLKL >NZ_CP023970.1|WP_002492524.1|1662607_1663960_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MTEKYDVIIIGAGPGGYVSAIRAAQLGKTVAIIEKNNAGGTCLNVGCIPSKTLLEHGKKVHDIQSADEWGIHTSNLTIDAAQLTSRKVQVVQTLTSGVTHLLKKNKVSYYKGEAKINSDLTVTVNDETLSSQDVVLATGSRPFVPSIPGLENVDYETTDTFFDMEALPKSLVVIGGGVIATELASSMADLGVKVTIVEVADDILLTEIDEVRALLREHLESQGIEIITSADIEKVEKKSLHLKGQDKISFDRLLVATGRQPNIEIVNDLELSRDGKYLQVDVHYQTSKAHLYAIGDLTSGYQLAHAASAHGIHVAEHLAGMQPKTIKQEDITRCIYTRLEAASVGLSAEQAEALGYEVKVTTSGFQGNAKAIIKGEGQGFVQLVIDEKYKEILGAFIVGPHATDLIGELLGVKASEGTIAELSEIIQPHPALLEAIGEGADAYYNQAIHM >NZ_CP023970.1|WP_002479037.1|1664048_1664996_+|thiamine-pyrophosphate-dependent-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MEKEQARWIYKTMNEIRYFEEKVHKIFSDGKIPGFVHLYVGEEAVATGVMSQLEDDDYITSTHRGHGHAIAKGCDLNGMMAEIMGKKTGLGHGKGGSMHVAEIDKGMLGANGIVSGGFGLAIGAGISIRNQQKENVAVCFFGDGAANEGNFHEGLNFASILNLPVIFVCENNQFGEGTTHDYASASETIAERASAYNMPGVRVDGMDVMAVLEATEEAVARAKKGEGPTLIECDTYRKYGHFEGDEQKVKSPDDRNADKNATEEFRKQAIEEGWLTEDEADDIEKAAEQAVEDAVKYADDSDLPDVESLYKDVFA >NZ_CP023970.1|WP_098903151.1|1665011_1666052_+|alpha-ketoacid-dehydrogenase-subunit-beta MTETRKLTFMGAINEAIDQSMEQDENVILIGTDVSGGAGVKHIKDDDTFGGVFGVTKGLAKKYSRNRVIDTPIAEHITLSAGVGAAATGLRPIAELMFNDFLGFGLDLILNQGAKMRYMFGGKAKIPLVVRTVHGAGAGAAAQHSQSLYNVFAAIPGVKVVVPSNPYDAKGLLMAAVQDDNLVVFSEDKTLLGQKGNVPEEPYTVDIGKARVVREGEDLSIVAIGKMVAVAEETADRLKDDNISVEVIDLRTVSPWDEETVLTSVKKTGRLIVIDESNPQCNVAGDIASVMGDRAFDYLDGPIKKVTAPDTPVPFAANLEQAYIPNADKVLDVAAELVDDLRKVKS >NZ_CP023970.1|WP_002492516.1|1666069_1667362_+|2-oxo-acid-dehydrogenase-subunit-E2 MSQNIIMPKLGMTMTEGTVEEWFVAEGDDVNEGDSIATISSEKLTQDIEAPATGTLLKIEVQAGEDAKVKGVLGIIGDADEATDNSSSSTESTNETADTSEHDQHETSTETAKDDAQSYSTEKSTADVEKSPQQHTRIFISPLARNMAEDKALDINRIKGTGGNARITKLDIQRVEAQGYDYDDSKATETSVQTSKNVDVTNIGEGLNPMRKRIAQNMRESLANTAQLTLHRKVDADRLLDFKDKLTVELNQADKDVKLTVTALLAKAVVLALKDYGAMNARYDNGELLEYEDVHLGIATSLEEGLMVPVINEADTKSIGALAEEIKKTSQAVRDGHTDDVQLSGATFTITNMGTSGIEYFTPILNLGETGILGVGALMKEVTLDGDSLRQVSRIPLSLTFDHQILDGAGAAEFLKVLAKYIENPYLLIL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP023970_5 | 2446968-2447057 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP023970_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP023970_5
>5.1|2446992|42|NZ_CP023970|CRISPRCasFinder TATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP023970_5
The CRISPR arrays of NZ_CP023970_5 >merge|NZ_CP023970|5|2446968-2447057|CRISPRCasFinder TGATTGAGAAGTCAGTCGAAAAACTATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAATTGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACG >NZ_CP023970|5|5|2446968-2447057|CRISPRCasFinder TGATTGAGAAGTCAGTCGAAAAAC TATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAAT TGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACG
>NZ_CP023970.1|WP_002445345.1|2446226_2446901_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MIRNRLSELLSERGLKISRVAKDVKIARSSLTSMTQNDSEMIRYDAIDKLCSYLHISPSEFFEHNPINFDFTFDEEPNYKINDVFEGFEVTANITHAFSIENFDFEILVDVELDNRQKLNFDLDVSYKETEKITNSQHRFIFTIKNEDENIGLKKYVDSLSAGLKNLLFKKINQKLSGYVSEIIVKNIDDIEELFPNKGEKCTTLHKEILQTDSRLSSDIFKEY >NZ_CP023970.1|WP_002492309.1|2445040_2446213_-|tyrosine-type-recombinase/integrase MASYEKRGNTWRYRISLGKDAKTGKYKYISNSGFKRKSDAKHHAEMVERQLRTGDYIAPSTSTFKQVANDWLKQYANEVKVSSVRAREKAIHHAIERFNNKPIQTINKHDYQRFVNDISAQYSKNYIDSIIASTNMIFKYAYDMKLIRIMPSEGIKRPKKKVSVEELEDTEIHKKFLEKDELFQFLEIAKNHHSPQNSFEVFCTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTINITKTYYNPNNNKKQYQILTPKTESSIGKIPVDPHVIKLLKNYKVDVQDTWKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSKLMENVSKDLF >NZ_CP023970.1|WP_002461409.1|2443349_2444972_+|chaperonin-GroEL MAKDLKFSEDARQAMLRGVDKLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEYAAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAIEALHDISQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGQYISEAMDKVGNDGVITIEESSGFNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMTAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSSRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLELKDATMDMLGSANKVEVTKDNTTIVDGDGDNNNIDARVSQIKAQIEETDSDFDKEKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYKKVSDIQAEGDVETGINIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSIIVERLKHADSGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVANIPEPESNNQPPMGGGMPGMM >NZ_CP023970.1|WP_002461410.1|2443005_2443290_+|co-chaperone-GroES MLKPIGNRVVIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVVIAVGLGRQLENGQRITPDVNEGDRVVFQEYAGTEIKQGNDTYLILNADDILAIIE >NZ_CP023970.1|WP_002461411.1|2442084_2442825_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MSRIWISFLTIVIYALAQYLPVFIIKLTSFQIKSPTQLLHVAIYIQVILFIIAAIIIILLQKVIKNPTKLESDYKEPKRYLVQYALLGFIVVMIYQMFAGLINTWIFGELKASPNTERLMDIARQAPIFIILISIVGPILEEYVFRKVIFGEILDRLKGNIVMRFLIASVVSSLLFALAHNDITFIIVYFGMGMIFSLAYVLTKRIAVSIMIHMMQNGFVVIMQVCFGDVLKHLQTQANAIFHLFF >NZ_CP023970.1|WP_062248909.1|2440157_2441666_+|hypothetical-protein MTRKKTKIKYLSASFAIAVSTQVISPHITHAQDNTLYNKVTNEKSTAHSDNLSQDNSNQKDSDNTNQPSNSSNSANNEGKDNRPNKPSDGTDNGGKDNRPNKPSDGTDNEGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNRPNKPSDGTDNEGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPSDGKDNGGTPSHPQPPTQNGGHGHKPTNQPNNKDNNNGQNNGNGNQGWNTSNGQQYPQNGEKTDHNVSDDFINQINGRGHDSGRNSSSYFPRNHYDEGPVANNQRQSIMKRFKSLAIGSFKYNPFIIEQVNKLGESGNQVSDQDLYALFRKQNFSGNSYLNSLQRGSNYFRFEYFNPTNSSKYYKNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPVDKKGEDNHTQRSEDKIISAEGEDHKQGMTDVKFNRLNITLIGSMCVIFVAVMVYWFINRQKEKEQ >NZ_CP023970.1|WP_002461413.1|2439340_2439964_-|nitroreductase-family-protein MGLFSKNSEKSFLNAIEGRRTVYNLKESISISDEELEQIMTQAIKHVPSAFNSQSTRIVLLLNNKNKQFWDNTKAVLKEKMGADRDFTATEQKIDNFKHSYGTILYFEDQSVVKGLQEQMPSYAENFAIWSTQANAMHQFAIWTALSTKGIGASLQHYNPLVDAVTHQDFDIPETWELMAQMPFGDVREEPNEKEIQPVDARFLVRK >NZ_CP023970.1|WP_002492308.1|2438420_2439206_-|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKLQLLQFNVAYADVNANEHKIKTWFSNSLQQDTDVVILPEMWNNGYALEQLEEKADFDLERSTDFIKNLALQYQVDIIAGSVSNKHHDHIFNTAFAIDKTGKVINQYDKMHLVPMLDEPAFLTAGKNVPETFKLSNGVKVTQMICYDLRFPELLRYPARSGAAIAFYVAQWPSARLNHWQVLLKARAIENNMYVIGCNGCGYDGKTQYAGHSVVINPNGEIIQELSTTEKELTVTIDIDAVEQQRKAIPVFDSLVPHLYK >NZ_CP023970.1|WP_037540641.1|2437226_2437793_-|accessory-gene-regulator-AgrB MKAIDKKIERFARYLQRQNNLDHIQFLKIRLGIQVALGNFFKTIVTYGVALLFHTFLYTLITHLTYFFVRRFAHGAHARSSLLCHIQNLVLFVALPWSIVHFQVSWTFMILLAFIAFIIIICYAPAATKKQPILPHLRKKKKRNAILISICFLVLMLFVSEPYMQLIALGMCLEAITLLPIFFSKEET >NZ_CP023970.1|WP_002461416.1|2437080_2437224_-|cyclic-lactone-autoinducer-peptide MNLLSGLFTKGISVIFEFIGNFSVQDMCNGYFDEPEVPQELIDLHRN >NZ_CP023970.1|WP_000153640.1|2447073_2447292_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTILANTRKFKEAMFLKGFNLSDLSRETGVGISYLSQIINGKKIPSPKLAKKMAEVLQVEVNELFEFEVKEA >NZ_CP023970.1|WP_002445364.1|2447296_2447614_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MFNINIDEDEARELLEQAINVRVDELAKEKYFMTYKELSNYLNLSKPTIEELLINNGMKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEQLTAHMNIQNNDFKQVNIKKLLEARQ >NZ_CP023970.1|WP_002445365.1|2447610_2447757_+|hypothetical-protein MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGCNLTGGLENE >NZ_CP023970.1|WP_001058489.1|2447749_2447959_+|hypothetical-protein MNNEQKEVIEHVVYQLELSVMNNLESYEHTEYVDGIEVVSEVSREKHLELIMKWCAQELKNNFQLEKGE >NZ_CP023970.1|WP_002445368.1|2447961_2448285_+|DUF1474-family-protein MNWEIKNLFSDLKLLKDSFEDLKDNHGWHFEELYPHEPNHNLNKDELIREGFSYHERRIHNNQMFDLFHLYIEQFDKIIQKFHELEKASSENFGEESDDAQKLKITE >NZ_CP023970.1|WP_002445370.1|2448348_2449218_+|primase-C-terminal-domain-containing-protein 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>NZ_CP023970.1|WP_002445372.1|2451288_2451654_+|hypothetical-protein MEKEQLKQYMYDYVKEYEEIPIYQLEDLFKELDHDYKGKTSVTHDQDKNIVFWSGWNKLTMYALIELVKGEHLDLVYRGSYVMRYLLDGRVPSLPLAITYPEYGQQTEVPSWVPMLLRVTK >NZ_CP023970.1|WP_002492310.1|2451667_2452309_+|pathogenicity-island-protein MNIEIIANQFETRAAALLRYYTGLLESSKKTPFGFKIYNDPFDMVYVVMEGNLYGHIYIKDCNVRKAFELASPKHTEGLIRSIEGHYAGYEIPDGTHDTISDMMASFMFDNDYFMYGLETFAESNNTDMFTYIEGGLNVEELEGVQSSNADVIGNIEILYQLATGINEPASELVEGLKLVTAFVQDENATLDDYKALERKLSELKSSYYSLSK >NZ_CP023970.1|WP_002445374.1|2452596_2452941_+|hypothetical-protein MQKLVEKEKTYNLPDEHRQVLNVIRNTSKKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRKVINSLVYDYAYPIGCSYKRNERGYYIITTEQEKQQAMISIKKLADGSMKRYEALKRIEV |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP023970_2 | 2.1|552859|27|NZ_CP023970|CRISPRCasFinder | 552859-552885 | 27 | NZ_CP023970.1 | 1110228-1110254 | 2 | 0.926 |
1. spacer 2.1|552859|27|NZ_CP023970|CRISPRCasFinder matches to position: 1110228-1110254, mismatch: 2, identity: 0.926
gggccccaacaaagagaatttcgaaat CRISPR spacer gggccccaacaaagagaaatgcgaaat Protospacer ****************** * ******
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
16233 : 46488
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP023970|16233:46488|DBSCAN-SWA 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32 | Staphylococcus_phage(96.15%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
163719 : 172750
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023970|163719:172750|DBSCAN-SWA 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ACATCTTTCGAAAGATGGAACTTTGTAAAACTAGCCAAACCGTTAATTGGTTTGAGTATTCTTATCTTAATCGTTGGTATTGTTATTCTAAGTATTTTCAAACTGAATTTAGGTATTGACTTCTCAAGTGGTTCTCGTGTTGATGTTGAATCGAATCATTCACTATCACAAGCTAAAGTTGAGAAGACAATGAAAGATGTTGGCTTAAAAGCCGATGAAATACAAATTAATGGTGATGGTAAAAAGCAAGCAACTATTATGTTTAAACATGATTTAGCTAAAAAAGACATTGCCAAATTAAATGATAAATTTAAAAATGAATTTGGACATAGTCCTTCTGTAAATACAGTGTCACCTGTCATAGGTCAAGAGTTAGCTAAAAATGCTTTGAAGGCTTTAATATATGCTTCAATCGGTATTATCATTTATGTATCATTGCGTTTTGAATGGCGAATGGGATTGTCCTCAGTACTCGCATTATTGCATGATGCATTTATGATTGTGGCAGTCTTTAGTTTATTCCGTATTGAAGTAGATATCACGTTTATAGCTGCCGTATTAACAATCATTGGTTATTCCATCAACGATACGATTGTAACGTTTGACCGCGTACGTGAAAACTTGCATAAGCTAAAAGTAATTACGTCGCCAGAACAAATTGATGATATCGTTAACCGATCAATTCGACAAACAATGACACGCTCAATCAATACTGTGCTTACCGTCATAGTTGTTGTAGTTGCCATATTACTATTCGGTGCACCAAGTATCTTTAACTTCTCGTTAGCTTTACTTGTAGGATTAATTTCTGGTGTATTCTCTTCAATCTTTATTGCTGTACCGCTTTGGGGTATTATGAAAAAACGACAATTGAAAAAATCTGATAAAGGTAAGTTGGTTGTCTATAAAGAGAAAAAATCAAATGACGAAAAAATTCTAGTTTAATCAACTGAAACATCATCGAATCATCTAATTAGTGGTTCGATGATGTTTTTTATTGCTATATTACTTAAGAACAACAGATTTTTTAAAGTGCTTGGCAAAATTATGATTTTCTTTACGCTTTCTACTAACTTTATAAAAAATCGGTAGTACTTCTACAAAGAAGATTTTTATTTTACTGTAGTCAAACATCATAAAACTTAAAAAAATATATGTTGAAGCTTTTTATTTAAACAGATTTTCGATATAATGGCTTTTGGAAATGAGGAAGGCTAATGATTAAATCAAAATATACTTGGAATCACAATGAACCAACTCAATATATAGATGAACAAATAGCAAAGAAATATAAACTTTCTCCAATTATAAAAAAAGTGTTAGAAAGTAAACATATCGTAAATGAAAAAGATATTGAAGGATTATTGAATGGGCAACAACAATTGCATGAGCCATGGCTATTAAGTGATATGACCAAAGCCATAGAACGCATTAATTTGGCAATTGATAAACACGAGCGCATTTTAATCTATGGTGATTATGACGCAGATGGTGTGACATCAACAACGATTATGGTAAAAACGCTTCAATCTTTAGGAGCAGAAGTAGGTTGGTATATTCCAAATCGTTTTTCTGAAGGTTACGGTCCGAATGAGTTAGCGTTTAAAAATGCTTATGATGAAGGTGTTTCACTTATCATTACAGTTGATAATGGTATTCAAGGACATCGTGAAATTGAAATGATTCAAGAATTAGGCGTAGATGTTATTGTTACAGATCATCACGAAATGGGAAGCACTTTACCAGATGCTTTTGCGATTGTTCACCCTATGCACCCAGAATTCGACTATCCATGTCCGAACCTTTGTGGTGCAGGGGTCGCTTATAAGGTTTCGCAAGCGCTACTAAAAAATAAAGTACCGCCATATTATATTGCTCTTGCTTCAATAGGTACCATTGCCGATTTAGTATCGTTAACAGATGAGAATAGAACCATTGTAAAAACGGGGTTATCTATATTAAACGATTATCAGCCTATTCAAATTGCAGCACTATTAAATGAAGCAAACTATAACGATCCCATTGATGAAGAAACAATTGGCTTTATCATCGGTCCGAGATTAAATGCTGTTGGACGATTAGAAGACGCATCATTAGCTGCTGAATTACTTATGACAGAAGATGCTGAAGAAGCAGCATTTTTAGCAGAGCAAGTTAATCATTTTAATAACGAACGAAAAGATATTGTATCAAAAATTACAGAAGAGGCTTTGTTACTTGCCAAAGAAGAGGTGGCTAAAGGGCGTCAATTTCTGCTGTTAGCAAAAGAAAATTGGCACGAAGGTGTGTTGGGAATTGTAGCGTCTAGAATTGTAGAAACATATGGATTGCCAACGCTCATTCTTAATATTGATGATGAACAACATTATGCAAAAGGATCAGCTCGTAGCATTGAACAAGTTTCAATGTTTGAAATCTTAAGTGACCATCAAAATTTAATATCTAAATTTGGTGGCCATCATATGGCTGCTGGGATGACAATGCCTATCGAAAACATATCTGAATTGCGAGAAGGCTTAAATACATGGATGGCAAATTTGGCTGAGACGACATCGTTTGATCAGAAAAAACAAATAGATGTGAAAATTACAGAAGACGAGATTACCGTTAATAACATTTACGATATAGAGCGATTAAAACCATTTGGAATCGACTTTAATAAACCATTATTTGAATTAGATGATGTCAATGTTAATTCATTGAAAGTGATTGGAAAAGATAAGAATCATTTAAAAATGACAATTGGTAACTCTAATTTGGCTACACTTTATTGGAATAGCGGAAGTTTAGTCGATGAGCTAGAGCTGAATCAACCAATTAACATGATAGGTCAGTTACAAATCAATGAATGGAATGGCAATCAATCACCACAATTTATCATTCAGGATATTGCTATCAATCAACAGCAAATTTTGGATTATAGAAGTAAACGGAAACAGCTATCAATCGATTTTCATGACGAGCAATTAGCCATATTAATTCATCCACAAAAAGAAAAATTAGATCATAATTATTATCATTATGGCGAAAGTATTGATGAACATGTAAGTCGTGTCGTATTACGTGATTTACCCCTTTCATTAGCACATTTATCAGAAAGTATGAATGGTCATCAATTTTCTCAAATATATGTTGTTTTACAACATCAACATTCAATTTATTTCGAAGGTATGCCTGATAAAAAAACATTCAAAGCTTGCTTTAAAATACTGATGTCAAAACAAAAAGTAAATTTAATCAGCGATGGAATGGCATTATCGAAATTTTTGGGGATTCAGCCTAACACATTAAAATTTATGTTAAAAGTTTTTCTTGAACTGGGCTTTATTATAGATAGCAATGGTATAATATCAGTAAATCAAAATCCTAATAAACAGGATATAGAAGCAAGTCAAGTTTATCAAACGAGAAAAGCAAGAATAGAAGTTGAAAAATTAATGCTGTATGATGATTTTCAGCATTTGAAACATTGGATTATCGAGCAAATGGGTTAACTATTAGGAGGAAACAAAGATGGATTTAAAGCAATATGTATCAGAAGTACAAGATTGGCCTAAGGCAGGGGTTAGTTTTAAAGATATTACAACAATCATGGATAATGGAGAAGCATATGGTTATGCAACTGACCAAATTGTTACTTATGCCAAAGAAAGAGAAGTAGATATTGTTGTAGGTCCTGAGGCAAGAGGATTTATTATTGGTTGCCCTGTTGCCTATTCAATGGGTATAGGTTTTGCACCAGTGAGAAAAGAAGGTAAATTACCACGTGAAGTTATTCGTTATGAATATGATTTAGAATATGGCACAAATGTATTGACTATGCATAAAGATGCTATTAAACCAGGACAGCGTGTTCTAATTACAGATGATTTGCTAGCTACAGGTGGAACTATTGAAGCCGCAATAAAGCTTGTCGAAGCGTTAGGCGGAATTGTTGTTGGCATCGCTTTTATTATTGAATTAAAATATTTAAATGGTATAGAGAAAATCAAAGACTATGACGTGATGAGTCTAATTTCATATGATGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP023970|163719:172750|165770_166910_+|WP_002458926.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELTDIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKQAGGLHKFMNWNGPILTDSGGFQVFSLSNLRKISEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMEIQNDLGSDIMMAFDECPPMPSEYKYVKDSIERTSRWAERCLKAHKRPDDQALFGIIQGGEYKDLREQSAKELVALDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYDMVKHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSIGRLVIKNAQFANDFRPLDENCDCYTCKNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEAFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP023970|163719:172750|167374_169663_+|WP_098903137.1|DBSCAN-SWA MKKGSRIVAFILLIVLLFAGMRLTYKNVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVKPLQKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPRIQVEDPDRIRVQLAGVKNQNQARDVLSSQANLTIRDANDNVKLTGKDIVQGSAKQEFKQQTNEPTVTFKLKDRDKFKKVTEEISKKKENMMVVWLDYEKGDSYHKELQKKNENDRKYVSVASVNQPINSDSVEISGGFHGQEGVKKAKQISELLNAGSLPVKLDELTSTSVGAQFGQDALDKTIFASFIGIAVIYLFMVGFYRLPGFVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYTKANRSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRGLLSLLVSSNYFKKKFWLFGVKKKQRHDINEGKDVHDLKTSFERWNFVKLAKPLIGLSILILIVGIVILSIFKLNLGIDFSSGSRVDVESNHSLSQAKVEKTMKDVGLKADEIQINGDGKKQATIMFKHDLAKKDIAKLNDKFKNEFGHSPSVNTVSPVIGQELAKNALKALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDAFMIVAVFSLFRIEVDITFIAAVLTIIGYSINDTIVTFDRVRENLHKLKVITSPEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILLFGAPSIFNFSLALLVGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSDKGKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP023970|163719:172750|164726_165752_+|WP_002492120.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEDFDYHLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLNKETGDMKHQHFKDVINYLNPGDTLVLNDTRVMPARLFGVKEETGAKVEMLMLTQIENNDWEVLLKPAKRIKVGNQLSFGEGKIIAECIKELDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKARLDDPDRYQTVYAKENGSAAAPTAGLHFTDNLLKDIKAKGVNIAFITLHVGLGTFRPVSVENINEHEMHSEYYQMTENTAQLLNNTKLQGHRIIAVGTTSTRTLETIRRDHSQFIATSGWTDIFIYPGFEFKAIDALITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRQFILTAYRKAVELEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP023970|163719:172750|163719_164724_+|WP_002478078.1|DBSCAN-SWA MDDRMVDQSFHQEDSAFEYSLRPTYLKQYIGQTTIKSNLEVFIQAAKLREEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLIGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNEHELKEIIIRTADVLGTSIDDESAVELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNGDDQIYIETTKKALKLLQVDEQGLDYIDHKMMNCIINQYQGGPVGLDTIAVSIGEERVTIEDVYEPFLIQKGFIERTPRGRKATAFAYEHFMKSKEKRE >NZ_CP023970|163719:172750|169935_172212_+|WP_070858044.1|DBSCAN-SWA MIKSKYTWNHNEPTQYIDEQIAKKYKLSPIIKKVLESKHIVNEKDIEGLLNGQQQLHEPWLLSDMTKAIERINLAIDKHERILIYGDYDADGVTSTTIMVKTLQSLGAEVGWYIPNRFSEGYGPNELAFKNAYDEGVSLIITVDNGIQGHREIEMIQELGVDVIVTDHHEMGSTLPDAFAIVHPMHPEFDYPCPNLCGAGVAYKVSQALLKNKVPPYYIALASIGTIADLVSLTDENRTIVKTGLSILNDYQPIQIAALLNEANYNDPIDEETIGFIIGPRLNAVGRLEDASLAAELLMTEDAEEAAFLAEQVNHFNNERKDIVSKITEEALLLAKEEVAKGRQFLLLAKENWHEGVLGIVASRIVETYGLPTLILNIDDEQHYAKGSARSIEQVSMFEILSDHQNLISKFGGHHMAAGMTMPIENISELREGLNTWMANLAETTSFDQKKQIDVKITEDEITVNNIYDIERLKPFGIDFNKPLFELDDVNVNSLKVIGKDKNHLKMTIGNSNLATLYWNSGSLVDELELNQPINMIGQLQINEWNGNQSPQFIIQDIAINQQQILDYRSKRKQLSIDFHDEQLAILIHPQKEKLDHNYYHYGESIDEHVSRVVLRDLPLSLAHLSESMNGHQFSQIYVVLQHQHSIYFEGMPDKKTFKACFKILMSKQKVNLISDGMALSKFLGIQPNTLKFMLKVFLELGFIIDSNGIISVNQNPNKQDIEASQVYQTRKARIEVEKLMLYDDFQHLKHWIIEQMG >NZ_CP023970|163719:172750|172231_172750_+|WP_002458930.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKAGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVTYAKEREVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEALGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP023970|163719:172750|166928_167189_+|WP_002458927.1|DBSCAN-SWA MNLTAILIPVLFLLVFYFLIIRPQQKRAKEHREMVNRVEAGQKITTIGGLKGTVKAVDETTVVITVNGHGTEMTFEKPAIKQVDPS |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
299383 : 308078
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023970|299383:308078|DBSCAN-SWA AATGTATGAAGTAAAATTAGACGCTTTTAGCGGTCCACTCGATTTATTGCTCCATTTAATTCAGAAATATGAAATAGATGTTTATGACATTCCAATGAAAACATTAACTGAGCAATATATGCAATATGTACATACGATGAAGCGTCTAGAAATTAATATTGCTAGTGAATATCTCGTTATGGCGTCTGAACTCTTAATGATTAAAAGTAAATTACTTCTACCTCAATCAGATGATCATGTAGAATTTGAAGAAGATCCACGTGAAGATTTAGTAGGTAGACTAATTGAATATCAAAACTATAAAGAATATACAGAAATACTTGATAGTATGAAAGCAGAACGAGATCTCTACTTTACAAAACATCCGACAGATTTATCTCATTTAGAAACTAATGAAAGTTGGGATAAATCAAACACCATTGATTTGACAGAACTGATTGTTGCTTATCAAAGAGTGAAAAATCGCGTTGAGTATCACACACCAAAAACTGTAGAAATCAGTAAAGAAACATTCACTATTGAAGAAGCAACAGAAATTGTAACGACAAGATTACGTACACAAACAGCGTTTAATTTTTTCAGCTTATTTACTTTTCATGAACCAATTGAACAAGTCGTTACGCATTTTCTTGCTATTTTAGAAATGTCTAAGGCTGGCATAATAAACATAAGTCAAAAGCAAAATTTTGATGATATTGATATTGTAAGGGGAGTGAATTATCAAGTTGGATAAACAAGCAATCTTAGAGGCATTATTATATACAGCTGGCGATGAAGGTATTGACACAAAACAATTACTAGAGATACTGGACATTACTAAACCACAATTGATTGAATTAATCGATAATTATTCATCTCATGGACTAGAAATTCATCACTACGGTCAAACTTATGTATTAACTACAAAAAAAGATGCTGCTAATTATATTGAAAAACTCGTTCAACAAAAGTCAAATATGAAATTATCACAAGCTGCAATGGAAACGTTATCAATCGTTGCTTATAATCAACCTATTACACGTAGTGATATTGAATTAATACGAGGTATTAATTCAGATGGTGCTGTTAGAACATTAGTTGCTCGTGGTATGATTGAAGCTAAAGATGTTGAACATTCAAGAAGCCATCACTTGTATACAACTGAATTATTTTTAAATGTATTTGGATTAGAAACAATAGAAGATTTACCGACTACCGAAGAAGATGATGAAGAAATGGAAGATTTCTTTAGTCAATTAGTTAATCAAAAGGGAGAATGATTATGAGCAAAGAACTAGAGCGATTGCAAAAAAGAATTGCTAATAGTGGTTATACGTCTAGAAGAAAAGCTGAAACATTGATTACTGAAGGTAAAGTCAAAGTGAATGGAGAAGTTGTCACTGAACTTGGCACAAAAGTAAAACCATCAGATCAAGTTGAAGTAGAAGGAATCAAAATGGAACAAGAAGATAAAATATATATTCTGTTTCATAAACCAGCGCAAGTCATTACTAGTGTATCAGATGACCGTGGAAGAACAGTTGTGACTGACTATTTTAAAGACTTAGATACTAGAATATATCCTGTTGGTCGTTTAGATTACGATACATCCGGAGTATTACTACTAACAAATGATGGTGAGTTCACTAATCTTATGACCCATCCACGGTACCATATACCAAAAACATATGTTGCCAAACTCAAAGGTTACCTTATGCGCGAAGAAGTAAAAGCACTTGAAGCAGGAATAGAACTTGAAGATGGTTTAACTCAACCCGCTACTGTTAAAATTAAACGCCAAGATAAAGACAAAAATACAACGTTAGTTGAGATTACCATTAGTGAAGGAAGAAATCGACAAGTACGTCGTATGTTTGAGCATTTTGGCCATAGCGTTAATAAATTAACACGTATACAATTCGGTTCACTAAATTTAAAAGGTCTTAACGCTGGAGAAGGACGCGTATTAACACCTCATGAAGTAAAAGTATTACGTCATCAAGCAGAAAACGGTAATTAGTAAGCGGTTACATGTAGTTTGCTGAAGTTAATTTTATGGTTATAAAATCATTGCTAATTTTTTCACAATCAAATTTGAAATTAGAGATTTAACAATTACCATATGCTATAATAAACAAGAAAATAGCATGTGTAGGAGGTATATGAATTAATGAGTAAGGAAATACTTATCGTAGATGATGAAGACAGAATTAGAAGATTACTCAAATTATACTTAGAGAGAGAATCTTTTAACATTCATGAGGCTAGTGACGGCAAAGAAGCCTATGAATTAGCCATGGACCACAATTATGCATGCATACTTTTAGACTTAATGCTTCCTGAAATGGATGGAATCGAGGTCGCATCAAAACTACGGGAGCATAAAGATACACCTATCATTATGCTTACTGCTAAAGGCGAAGAAACTAACCGAGTTGAAGGATTCGAATCAGGTGCTGATGATTATATTGTTAAACCATTCTCTCCACGTGAAGTGGTCTTAAGAGTGAAAGCGCTATTAAGACGTACACAATCAACAAGCGCCGAACAAAGCGAGCCTCATGCGAGAGATATCATAGAATTTAATCATTTACTTATTGATAATGATGCGCATCGTGTATTAGCTGATAATCAACAAGTTAACTTAACACCCAAAGAATATGAACTACTAATATATTTAGCTAAAACACCAAACAAAGTATTTGATAGAGAACAATTACTTAAAGAAGTTTGGCATTATGAATTTTATGGTGACTTAAGAACTGTTGATACCCATGTTAAACGCTTAAGAGAAAAACTTAATCGTGTTTCAGAAGATGCAGCACAAATGATTCAAACAGTATGGGGTGTTGGCTACAAATTTGAAGTTAGAGCTAGCGATGAGCCGACTAAATAGTGTTGTAATAAAACTGTGGTTAACTATTATCTTTATAGTAACGACAGTTTTAATTTTATTAAGTGCTGCATTAATAACTTTTATTCAATACTATTATACTGAGCAAACAGAAAAATCAATTCGTGATGATGCCAGAAGAATCAGTCAAGTTGTTGAAACATCTAAAAATAAAAAGTTAGCTATTGAACATAGCCAAAAACTGATTAGTGGTTCTGGTGGCGTTATTATTATGAAAGACAAGTCAACACATCATAATGCTAAAGAGTCACAATTAAATAATCAAATGTTGGCTAAGATTAATCAAAACGAACACTTTTCTCCAGTGTTTAATAAAGGTCAATCTGCAACTCAAAATGTAACATTAAAACATAATGACCATTCTCGTTCTTATATCTTACTGGGTTATCCTATGAAAGCTCAAAAGGGAAGTCACAGTCATTATAGTGGCGTCTTTATTTATCAGGATTTAAAATCCATAGAAGATACCAATAACGCTATTACGATTATTATTCTGATAACTGCAATTATTTTCCTAGGTATTTCAACTGTCTTCGCCTTTTTCCTATCTAATAGAATTACTAAACCACTTAGAAAGCTTAGAAATCAGGCTAAAAGTGTTTCTAAAGGGGATTATTCTCAAATTTCATCTGTAACAACTAAAGATGAAATTGGTGAACTATCTCGCGCATTAAACGACATGAGTTTCGAAATTCAGGAAAATGTTCAAGCACTATCAACCTCAAAAAATATTCGTGATAGTTTAATTAATTCAATGGCTGAAGGTGTTGTAGGTATCAATGATCATCGCGACATTATATTATCAAATAAAATGGCAGATGAAATTTTACCAACTATTGATCAATCTATGTATGAACGAATTGAAGACCAAATCGAAGATACTTTTACAAGTAAAGGCACAGAATTTCGAGAATACGATTTTGACACACGCTATTATGTCTTCATTATGAGTTACATTCCTCAGATTCAAGAAGATGGTCGCAGTGGAATTGTCGTTATTATTCGTGATATGACTAATGAGCATAACTTAGATCAAATGAAAAAAGATTTCATTGCTAATGTTTCTCATGAATTGCGTACACCTATTTCATTATTACAAGGATATACAGAATCAATTGTTGACGGTATCGTTACGGAACCAGAAGAAATTAAAGAGTCATTATCAATTGTCTTAGATGAAACGAATAGGCTCAATCGTTTAGTTAATGAATTACTCAATGTTGCAAGAATGGATGCTGAAGGGTTATCTGTTAATAAAGAGATACAACCTATTGCACCATTATTAAACAAAATACAAACAAAGTATAGACAACAAGCTAGTGATTTATCATTAAATATGTACTTAACTCCAGAAACTAATGACGCATTGTGGTACTACGATTCTGATCGAATCGATCAAGTGCTCACAAATCTTATTGATAATGCTACAAGATATACTCAACCTGGTGATACAATTTCTATTACTAGCGAAGATACTGATAAGTACAATGTGCTTCACATAAATGATACAGGCAGTGGTATTGCTCCTGAACATTTAAATCTTGTTTTTGATCGCTTTTACAAGGTTGAAGCATCCAGAACACGTGGCAAACAAGGAACCGGCTTAGGATTATTCATTTGTAAAATGATTATAGAAGAACATGGAGGTACGATCACTGTATCAAGTGTCGTTGGAGAGGGAACAACATTTACAATCAAGTTACCGAAGCCTTAATCTTCAGGCTTATTTATAAAATTTATCAAAGATAATATCACTGAATTCAGACAGGGACATAAACCCGCAAATAATAGCACAAAGATGATTTAAAATTAAAAATCGTCTTTGTGCTTTTTTATATTCAATACTTTGTATGATTGACTCGCATGCTTAGGAGACTACTTCAGCTTGCTTTGTTAAAAAATGGTTTAGTCAGTTTTTTCTGTGCTGGACTTTGACTTAATATAAAAATAAGGACGAAGGCTATTTAAGCAGAGACGTTTATGAGCCGGCCTGACCTTATATATAGTTAATATCAGTTAAAACATATTGAGATTAACTATGCACGATATATTGGCAGTAGTTGACTGAATTGAAAATATCCTTATACCAAGCTTTTTCCATCCTAGTCAACCTTTCCGATACGGAACTACGAAATCATAATGAATTCTGTCCCGCTCTCAATCATCATCTCTTACCGGGCAACTTTATTGCTTTGCGGCTAGTGTTGTCGTATGATTAATGACGTAAAATATTTTAAAATTCATCTTCGGGGTAGGGTGTAATTCCCAACCGGCAGTAAATAAAGCCTGCGACCTGCTTGTGTTCAACAAGCGGCTGATCTAGTGCGAATCTAGAGCCGACAGTATAGTCTGGATGGGAGAAGATGGAGGTTTATTTGTTGTGAACAATTTTCCTCCAATTCTTTGCAAGATGAATGGAAGGAGAAAACTACATATGCAACAAAATAAACGTCTAATAACCATTAGCATGTTAAGTGCCATTGGCTTTGTTTTGACTTTTTTAAAGTTTCCACTACCTTTTTTTCCGCCATACTTAACATTAGATTTCAGTGATGTCCCTACATTGTTAGCAACTTTTTCAATGGGTCCTATAGCAGGTATTATAGTGGCATTTATTAAAAATTTGCTTAATTTTTTCTTTAATATGGGAGACCCAGTAGGTCCTGTGGCTAATTTCTTAGCCGGTATAAGTTTCTTACTTACAGCATATTATGTTAATAAAAGAGGACATGTTGCTAATAAAGCAATGATAACTGCATTAGTCATGGCTACATTAGTTATGACCATTGTACTTAGTATTTTAAATTATTTCGTATTGTTGCCACTATATGGCATGATTTTCAACTTAGCAGATATTGTAAAAAATATAAAAATCATTATCGTCTCTGGTATCATACCGTTTAATATTATCAAAGGGGCAATCATCTCAATCATATTTATACTTTTATATCGCAGAATTAAAAGCGTACTTAAATAATTAACAGGTAAATGAAACTTTTAAAGATACGCTTGTAAATACAAAGCAGGCAATGCTCCCATTTGAGAAACATTGCCTGCAATTATTATAATTAATATTTTGCTTTAACTACTAATCTACTATATATAAAATAGCTATGTGCTATTCGAATTTTAAAGCATCACCATCAAAAGGTTCTTCTTCTATTTTGATGGAATCAGTTGGACAACCTTCTAAGGCATCTTCCATATCTTCATATAACTCTTCTGGCACTTCGGCAGTACCTTGGTTATCATCAAGGATTACGAAAGCAATACCTTCATCGTCATAATCATAAATATCTGGAGCGGCCGCACCACATGCACCACATGCAATACACGTATCCATATCAACGATTGTATATTTAGCCATTTTCATTCGCCTCCTTTGATAAACATGCTACACTAGTATAACAAATACTCATGTATACATCGAAAAAACTTTTTATTAATTTATTAGTTTCATAAGAGCGAGGGTCGAGATTGAAAGATATTATACTTTATTCTAAACAACATTCATTCACTTATAAAACAAATAAAAGCATTTTTAATTTATTAACAGGCAAAAAAACACATCAAACCTTTTTTGACGCCTGCAGTCAACAACTTTTATCATTATATCACAGTTTACCCAATTTAAAATATCCGTCTTTCGAGCGATTTATGGCACAAAATGTTAACAATGACATGACGATAAAAGTTCATCCAAGATATACGTATGATAGTTTAGTACATACTTTCAATTGTATTCAATTACTTATTCAAACGTTGTCAAACACGCAACAAAAGGTCTATTCATTTATACCTATTTCACAGCATGGCCTTATCCAAAGAAAAGTTAAACAAATCTACTACTATATAAAAAAAGAAGATAAGGATAGCGCATTTATCACTGAGCTAAATCAATTATTTAAAGCTCTATATACAAATAATAACAATTATTGTTGTCTACATTATTATTTACAAGGCTATGAAGAACCAATGTATACCCGTCAACAAATCAGTTTGATTGAAAGTATACCTGAACAGCATTTATTTAACCTAGAAATGAACGAACTTGTAACACTAATGTATGAACTAGAAATAGAATATCGTTATCCAATACTTAGTCAATGTATCATTAAACCGTCATTATTACATAAAACACACATAACCCAACAACAATTAAAACAACGTTTTTCAATGACGCAAATTGCTCAAAAACAACACGTCAAACTGAATACAATCGAAGATCATATACTAGAGTTATTTATTAAAGGTTATATCACTCATTATTTTGATTTCATATCTGAAGACGGTTTCCATCAATTTAATGAATTTTATAACAAACATCGTGGAGAGCGATTAAAAGCATATAAACAGGCTTTCCCAAACTTGTCTTATTTTGAAATAAAACTAATGATTGTTGGAATTGAAAGAGGTGAGCTTATTGCTAGAGGATAAATTAAAATCCTGGTTTGGTTTTGATAACTTTAAAGCAGGACAAAAGGAAATTATTAAAAGTGTATTAGATTCAAATCATACATTGGGCATTTTACCGACTGGTAGCGGTAAAAGTCTATGTTATCAAATGGCTACTTATGAATTACAGCAATCAACTTTAATTATTTCCCCGCTTATTTCTTTGATGGACGATCAGGTTGCACAATTAAAAATGAGTGGAGAACAGTCTGTTGCATACATTCATTCAGGTATGGATGATAATGAAAAAAACTGGAATATGAAACGCTTAGCGAAGAGTCGCTTTATATTTTTAAGTCCTGAATTTATATTACAACCTCAAAACTTCAAACTAATTTCAACTATCGATTTTGGTCTTATTGTACTAGATGAAGCACATTGTATCTCTGAATGGGGATATGACTTCAGACCGCATTATGCGCTTATTAGTAAAATAACCAACTATTATAAAAATGCTACCATCCTTGCGCTAACTGCTACTGCTCCGCCACATTTGGAACAGGATTTAAATCAGCTGTTAAATGTGTCATTTCATGTTATCAAAACACATATGAATAGACCTAATATTAGTTTTCAGCACATTAACTTTAGAAATGATCAAGAAAAAATGAATTGGTTAATGCACTACATAGAACAATCTGGTCCAACAATTATTTATGTTTCGTCTAAAAAAATGTGTGTTGAATTAGCCAAGACTATATATAAACATGGGTATTTAACAGGGATATACCATGGTGATTTATCTTATCAAGAACGACAAACCGTCCAACAACAATTTATCAATAATGATATACCAGTCATTGTAGCAACTAGTGCATTTGGTATGGGAGTCAATAAAAAGGATATTCGCACGGTTATTCATTTTCATCTATCTACCAGTCCGTCTAGTTATCTCCAAGAAATAGGAAGAGCAGGGCGTGATCAGCAACCGAGCCAAGCAATTAGCCTATTTCAACCAGATGATCGCTATTTATTAGAAACCATCCTTTTTGCAGATATGATTTTACCTTATGATATTGACTGCTACGAACTTGGTGCAAACATTGAGCCATTGAAGCAAGATATATTAGAAATCTTACATTCTCATTTCACTTATGCACAACTTAAACAGATTTTCCAAATAGCACAAGAGAGAAAACAACTCGCACTTAATCGTATGCTTAGTTATAGCCAACTTGATCAATGTCGTCGAAAATACTTATTAGAATTTTTTGGAGAAGTCCCTGATATTCCATCTATATGTTGTGACCATGATACTGATATAAAACCGCTTAAAATTTATAATCGAAAAAAGGTCAAACGTCAAATGTCTTATGAAGATAAACTTAAAAATTTATTTCTTAGCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP023970|299383:308078|301531_302257_+|WP_002459064.1|DBSCAN-SWA MSKEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFNIHEASDGKEAYELAMDHNYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSTSAEQSEPHARDIIEFNHLLIDNDAHRVLADNQQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAQMIQTVWGVGYKFEVRASDEPTK >NZ_CP023970|299383:308078|304709_305252_+|WP_002478165.1|DBSCAN-SWA MQQNKRLITISMLSAIGFVLTFLKFPLPFFPPYLTLDFSDVPTLLATFSMGPIAGIIVAFIKNLLNFFFNMGDPVGPVANFLAGISFLLTAYYVNKRGHVANKAMITALVMATLVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIFNLADIVKNIKIIIVSGIIPFNIIKGAIISIIFILLYRRIKSVLK >NZ_CP023970|299383:308078|299383_300115_+|WP_002459061.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFSGPLDLLLHLIQKYEIDVYDIPMKTLTEQYMQYVHTMKRLEINIASEYLVMASELLMIKSKLLLPQSDDHVEFEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEILDSMKAERDLYFTKHPTDLSHLETNESWDKSNTIDLTELIVAYQRVKNRVEYHTPKTVEISKETFTIEEATEIVTTRLRTQTAFNFFSLFTFHEPIEQVVTHFLAILEMSKAGIINISQKQNFDDIDIVRGVNYQVG >NZ_CP023970|299383:308078|305393_305642_-|WP_002449743.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEEEPFDGDALKFE >NZ_CP023970|299383:308078|300643_301381_+|WP_002478163.1|DBSCAN-SWA MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGEVVTELGTKVKPSDQVEVEGIKMEQEDKIYILFHKPAQVITSVSDDRGRTVVTDYFKDLDTRIYPVGRLDYDTSGVLLLTNDGEFTNLMTHPRYHIPKTYVAKLKGYLMREEVKALEAGIELEDGLTQPATVKIKRQDKDKNTTLVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHSVNKLTRIQFGSLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKVLRHQAENGN >NZ_CP023970|299383:308078|302240_303989_+|WP_002492342.1|DBSCAN-SWA MSRLNSVVIKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQYYYTEQTEKSIRDDARRISQVVETSKNKKLAIEHSQKLISGSGGVIIMKDKSTHHNAKESQLNNQMLAKINQNEHFSPVFNKGQSATQNVTLKHNDHSRSYILLGYPMKAQKGSHSHYSGVFIYQDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFLGISTVFAFFLSNRITKPLRKLRNQAKSVSKGDYSQISSVTTKDEIGELSRALNDMSFEIQENVQALSTSKNIRDSLINSMAEGVVGINDHRDIILSNKMADEILPTIDQSMYERIEDQIEDTFTSKGTEFREYDFDTRYYVFIMSYIPQIQEDGRSGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPEEIKESLSIVLDETNRLNRLVNELLNVARMDAEGLSVNKEIQPIAPLLNKIQTKYRQQASDLSLNMYLTPETNDALWYYDSDRIDQVLTNLIDNATRYTQPGDTISITSEDTDKYNVLHINDTGSGIAPEHLNLVFDRFYKVEASRTRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGTITVSSVVGEGTTFTIKLPKP >NZ_CP023970|299383:308078|300107_300641_+|WP_002492337.1|DBSCAN-SWA MDKQAILEALLYTAGDEGIDTKQLLEILDITKPQLIELIDNYSSHGLEIHHYGQTYVLTTKKDAANYIEKLVQQKSNMKLSQAAMETLSIVAYNQPITRSDIELIRGINSDGAVRTLVARGMIEAKDVEHSRSHHLYTTELFLNVFGLETIEDLPTTEEDDEEMEDFFSQLVNQKGE >NZ_CP023970|299383:308078|305752_306712_+|WP_002492332.1|DBSCAN-SWA MKDIILYSKQHSFTYKTNKSIFNLLTGKKTHQTFFDACSQQLLSLYHSLPNLKYPSFERFMAQNVNNDMTIKVHPRYTYDSLVHTFNCIQLLIQTLSNTQQKVYSFIPISQHGLIQRKVKQIYYYIKKEDKDSAFITELNQLFKALYTNNNNYCCLHYYLQGYEEPMYTRQQISLIESIPEQHLFNLEMNELVTLMYELEIEYRYPILSQCIIKPSLLHKTHITQQQLKQRFSMTQIAQKQHVKLNTIEDHILELFIKGYITHYFDFISEDGFHQFNEFYNKHRGERLKAYKQAFPNLSYFEIKLMIVGIERGELIARG >NZ_CP023970|299383:308078|306698_308078_+|WP_002459069.1|DBSCAN-SWA MLEDKLKSWFGFDNFKAGQKEIIKSVLDSNHTLGILPTGSGKSLCYQMATYELQQSTLIISPLISLMDDQVAQLKMSGEQSVAYIHSGMDDNEKNWNMKRLAKSRFIFLSPEFILQPQNFKLISTIDFGLIVLDEAHCISEWGYDFRPHYALISKITNYYKNATILALTATAPPHLEQDLNQLLNVSFHVIKTHMNRPNISFQHINFRNDQEKMNWLMHYIEQSGPTIIYVSSKKMCVELAKTIYKHGYLTGIYHGDLSYQERQTVQQQFINNDIPVIVATSAFGMGVNKKDIRTVIHFHLSTSPSSYLQEIGRAGRDQQPSQAISLFQPDDRYLLETILFADMILPYDIDCYELGANIEPLKQDILEILHSHFTYAQLKQIFQIAQERKQLALNRMLSYSQLDQCRRKYLLEFFGEVPDIPSICCDHDTDIKPLKIYNRKKVKRQMSYEDKLKNLFLS |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
712319 : 720789
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP023970|712319:720789|DBSCAN-SWA CTTATTTAATAACCTTAGCTATAACACTAGGATAAAGTTCATATTCTAATTGTTTGACTCGTTCTTCCAAATTTTCTTTGGTATCATCCGGTTTGATCTCGCATTGTCTTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATGCCACTATCAACATAATGAACTGTTGATCCTGTAACATTATCACCACTATTAAAAGCCTGACCAATAGCATCTTTCCCCTTATATTTTGGCAATAATGATGGATGAATATTTAAAATCTTACCTTCGTATGCGTCTAACAAATCAGGACCAATTAGCCTCATATAACCTGCGAGAATAATCCATTCAACTTCTTCACGCTCTAGTATACGAATCAAATGGTGTTCATAGGCAGATTTTGAGTCAAAATCTTTTGGTTCGTTGATATTAACTGCTACCTTTAACTGTTTTGCGCGTTCAATACAATACGCATCGTGATGATCAGTATAAAGTGAAGTAATTTCTATATTGTTGAGTTCTCCTTTATCCACTTTTAAAACAATATTTTCGAAATTACTTCCCGATCCAGAGGCAAAAATAGCTACCTTAGTCACTATTCTACCCCCTTGAGATAAATAGGCACATGTGCATCTTCTATAACATTGCCTATGTGATAAGCAGGGACATCGTGTTTTTTTAGGACATCTAGTGCTTTAGCAATGTCATCTTGACTAACGATGACCGTATACCCTATTCCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATCCGTAGAAATTTGTCCTTGTTGTTGTAACCAGTCAAAAATAGGAGGTGTTGGGAATGTATTCACATCAATTTGCGCAGCTAAACCATCAGGTAACACTCTAGGAATATTTTCATAAAATCCACCACCAGTGATATGATTCATCCCCATGATTGTTACTTTATCTTTTAAATCAAGTATCGGTTTCACATAGAGTCGCGTAGGTGTTAAGAATGTATCTAAATATGTTTGACCATTGAAGTCATCGTATAAATCAATGTCAGTCTGTTTAATTAATTTACGTACTAAGCTATAACCATTTGAATGTATCCCACTAGAAGCTAAACCAATAATTGCATGACCTGCTTTTATATTTGAGCCATCAATGTATTCTGCTTTTTCAACAGCACCGACAGCAAAGCCAGCTAAGTCATACTCACCTTCATGATACATTTCTCCCATCTCCGCGGTTTCACCACCAATCAGTGCGGTATTTGTTTGTTGACATCCTTCGCTGACTCCTTTTACAATCTGCTCAATAACTTCTGGAACAACTTTATTTGCTGCAATATAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCTCCAGTCGTAAGAATGTCATTCACACACATGGCTACGGCATCAATTCCAATGGTGTCATGTCTGTCATGATCGATAGCTAACTTTAACTTTGTTCCTACACCGTCTGTACCTGACACAAGCATAGGCGCTGTCATCTGCAATTGTGATAAGTCAAATGTCGCACCAAAACCACCTAAGCCACCTAAGACTTCTTTTCGTAGTGTTCGCTTTACATGTGCTGACATTCTTTCTACTGCTTCATATCCTGCTTCTATATCTACTCCAGATTGTTCATAAGCTTTAGACATTTTTATTTCCCTCTCGATCATAATAGTGTTGGTGATTCTCGATATATGCTTTTTGTCGTGGGCTCAAGTGCTTAAAATAATTTTCTTCATAATCATACAAACCAGCTGGATAATCACCTGTAAAACTTTCTAAACATAGACCACTATATGGCGCATCATAGTCTAAGCCAATAGCTTCTATTAAACCATCAACGCTTAAATAGGCTAATGAGTCGGCACCTATATGGTCACAAATTTCTTCAGGTGATTTACTCGCTGAAATCAACTCAGCAGTAGTTGAAACATCAATACCATAAAAGCTTGGAAACATAAATTCTGGTGATGCGATCCTTACATGTACTTCTTTAGCACCGGAATCTTTGAGCATTTTGACTATACGTTTAATAGTTGTGCCACGTACAATTGAGTCATCGACTAAAATAATTTTTTTACCTTCTACAATGTCTTTGACAGCTGATAGTTTGACACGTACACCTTGTTCTCTCAATTCTTGAGTTGGTTGGATGAACGTTCTAGCGACATATTGATTTTTAACTAATCCCATTTCATAAGGCAGCTGGCTTTCTTCAGCATAGCCACTAGCTGCTGATAATGATGAATTAGGTACACCAATAACCATATCTGCTTCTACAGGATTTTCTTGAGCTAATTTCTTTCCAGAAGCTTTACGAACTGCATGCACATTCTTACCAGCTATTGTAGAGTCTGGACGCGCAAAATAAATATATTCCATTGCTGAAATCGCAGTACTTGTGTGTTTTGTATATGATTTTATTTTTATACCTTCGTCATTGACAACGACATATTCTCCTGCGTGAACATCTTGGATAAATTCTCCACCTAAAACATCAATAGCGCATGTTTCACTTGCTAATATATAAGTTCCATCTTGCATTTTTCCGACCGCTAATGGTCTAATGGCATTAGGATCAACTGCACCATATAAAGCATCCTTCGTCAAAATCGTAAAGGTAAAACCACCTTTAATTTGGCGTAGACTTTCTTTTAGTGCTTCTTCAAATGTTGGTGCTTTACTTCTACGAATTAAATGCATAATCACTTCAGTATCTGACGACGAATGAAATATTGCCCCATGCTTTTCTAAGTATTGTCGTAATGATTGTGCGTTGATCAAATTTCCGTTATGACATACTGCAACGCTCATATCATAAAAATGATAGAGAAATGGTTGAATATTCTCGATACCTTTATTGCCTGATGTTGCATAACGTACATGACCTATAGCGTTACGACCTGTTTTTAATTGTTCCATTTGCACTTCTTTGATTGCTTCAGTTAACAGCCCTACACCACGTTCACCTTTTAATGTGTTACCATCTGTGACAACAATTCCAGCGCCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAATCCCATATATGTCAATTGAGCTGCCTCTGCATGGTTCCAAATTCCAAATACGCCACACTCTTCGTTTAATCCACTGTAGTTAAACATTGCGCAATAGCTCCTTCCCATTGTGCTTTTATATCAGAAGCTCTCTTAGAAATTGATGTATGAGCAGCTGCAACATTAAATTCATCCGTATCTGTAAGTTGACCTATTTCAATTGCATGCTCAATATTTAATTCTTGTCCTGCTTTAACAGCAATCACATAACGTCCTTGCGTTTCACTGAATAACTGTGCATCTGAAAGATTTACTTTAGCTTTTAATCCAAGACTATAATGCGCACTGATTCTAGCGAGAGTAATTAACAATCCACCTTTGCCAACAGTCTGTACGTGTGAAGCCACACCATTTCTAATTGCCTTTTTAACGGCTTCACCCTTTGTCACTTCATCGCTTAAATCAATCGCTTCAAATTCATGATTCACTTTGCCGTATAACAATTTTTCAATTTGACTGCCACCGAAATCATCCCTAGTATCTCCAACTAAGTACAATTTATGTCCTGCTTGAGGATGGAAATCATTTAAATATTCGATATTTTCAATTAGCCCTACCATACCAACAACTGGTGTTGGAAAAATAGATGTACCACGTGTTTCGTTATAAAGCGAAACATTACCAGATACTACTGGTGTTTTTAAAATTTCACATGCTTCTGACATCCCTTTTGTTGAATCTATTAATTGTTGATAGATTTCTTTTTTCTCAGGAGAACCATAATTTAAGCAATCTGTCATGGCAAGTGGTGTGGCACCAACAGCAATTAAATTGCGATAGGCTTCTGCCACTACCATTTTTCCACCTTCATATGGTTGATTAAAGACATAACGTGCTTCGCCATCAATGGTAGAAGCAATCGCTTTTTGGGTACCTTCAACACGAACAACTGAAGACTGTAAACCTGGTTTAATGATTGTATTGGCACCCACTTGTTGATCATATTGTTCATATAAATAATGTTTTGATGCAATTGTTGGATGTGTGAGTAACTGGTCAAATACCTCTTGAACATTGATAGAATTATAATCATTTTTAGAAGTATTATATGCCTTTTCTTCGCCTTCAAGCACATAAACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGATTGCACAGGAATATCTGCAAATACTTCATCCTCATATTTAAGTACAAAACGGTCTGTATTTGTTACTTCACCAATAACAGCACTATCTAATTCATGTTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCCGTACCCTTTTCAACAACAAGTAACATTCTTTCTTGTGTTTCAGAAAGCATCATTTCATAAGGAGATATGCCAGGTTCTCTAGTCGGCACTTGGTCTAAATTTAATATTAAGCCACTGCCACCTTTAGCTGCCATTTCAGACGATGACGATGTTAATCCGGCTGCTCCCATATCTTGAATACCTACGAGCTCTTTGTATGTAATTGCTTCTAGGGTAGCTTCCATTAATTTCTTACCTACAAAAGGGTCACCAATTTGAACTGAAGGACGTTTACTTTCACTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGACGCAAACGTTGCACCATGAATACCATCACGACCTGTTTTCAAACCAACATATATAACTGAATTTCCTTCGCCTTTAGCCGTCCCTTTTTGAATCATATCATGGTCAATAATACCTACACACATCGCATTAACTAATGGATTGCCATCATAACGATCATCAAATTCAATTTCACCTGCAGTAGTAGGAATACCGATACAGTTACCATAGCCACCTATACCGCGAACGACCCCTTTTAGTAGTCGTTGATTTTGTTTCACTGATAATTCACCAAAACGCAAACTGTTTAATAAATTAATAGGTCGTGCACCTATTGACACAATGTCACGAATAATCCCACCTACGCCAGTTGCTGCACCTTGATATGGTTCAATTGCTGAAGGGTGATTATGTGATTCAACTTTAAAAACGACCGCTTGGTTATCACCAATATCAACTACACCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP023970|712319:720789|713909_715394_-|WP_037540539.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHAEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVTDGNTLKGERGVGLLTEAIKEVQMEQLKTGRNAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAVCHNGNLINAQSLRQYLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRQIKGGFTFTILTKDALYGAVDPNAIRPLAVGKMQDGTYILASETCAIDVLGGEFIQDVHAGEYVVVNDEGIKIKSYTKHTSTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQENPVEADMVIGVPNSSLSAASGYAEESQLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVEGKKIILVDDSIVRGTTIKRIVKMLKDSGAKEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEICDHIGADSLAYLSVDGLIEAIGLDYDAPYSGLCLESFTGDYPAGLYDYEENYFKHLSPRQKAYIENHQHYYDREGNKNV >NZ_CP023970|712319:720789|718227_718488_-|WP_002459451.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYTQVNDIRVGKVLYMSVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKIVDEKENA >NZ_CP023970|712319:720789|712885_713917_-|WP_002478378.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVDIEAGYEAVERMSAHVKRTLRKEVLGGLGGFGATFDLSQLQMTAPMLVSGTDGVGTKLKLAIDHDRHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIAANKVVPEVIEQIVKGVSEGCQQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKAEYIDGSNIKAGHAIIGLASSGIHSNGYSLVRKLIKQTDIDLYDDFNGQTYLDTFLTPTRLYVKPILDLKDKVTIMGMNHITGGGFYENIPRVLPDGLAAQIDVNTFPTPPIFDWLQQQGQISTDEMYNIFNMGIGYTVIVSQDDIAKALDVLKKHDVPAYHIGNVIEDAHVPIYLKGVE >NZ_CP023970|712319:720789|718487_719192_-|WP_002478381.1|DBSCAN-SWA MALLYEGKAKRVFSTEVENQLRVEYKDEVTAGNGAKKDTMKGKGRLNNQITSIIFDYLSHKGIESHFIKQLSETEQLVKEVKIIPLEVVVRNVAAGSITKRLGLDKGYQFNEPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLNIANDEEIQTLKQMAKDINHVLIQLMDEMDLQLVDFKIEFGKTQDGKILLADEISPDTCRIWDKDSGTNFDKDVYRNETGSLIDTYQTFLNKLEEVK >NZ_CP023970|712319:720789|712319_712886_-|WP_002492152.1|DBSCAN-SWA MTKVAIFASGSGSNFENIVLKVDKGELNNIEITSLYTDHHDAYCIERAKQLKVAVNINEPKDFDSKSAYEHHLIRILEREEVEWIILAGYMRLIGPDLLDAYEGKILNIHPSLLPKYKGKDAIGQAFNSGDNVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCEIKPDDTKENLEERVKQLEYELYPSVIAKVIK >NZ_CP023970|712319:720789|717554_718226_-|WP_002478380.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKTGAEAEYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVIDEVKRLASEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLKIVNNQTPFTNLYENNDLVVYPVAHGEGHYYCTDDIYEELVTNNQIILTYQDNPNGSYKDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETILGTDSGVKLFEAMVNSWREQHV >NZ_CP023970|712319:720789|715372_717562_-|WP_002478379.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSIEEIKVEKLYQDMGLSDAEYTKVCDVLGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGERILMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSVKQNQRLLKGVVRGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMIQKGTAKGEGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYKELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLILNLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTNTDRFVLKYEDEVFADIPVQSLADEAPVYVLEGEEKAYNTSKNDYNSINVQEVFDQLLTHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQSSVVRVEGTQKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEILKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIENIEYLNDFHPQAGHKLYLVGDTRDDFGGSQIEKLLYGKVNHEFEAIDLSDEVTKGEAVKKAIRNGVASHVQTVGKGGLLITLARISAHYSLGLKAKVNLSDAQLFSETQGRYVIAVKAGQELNIEHAIEIGQLTDTDEFNVAAAHTSISKRASDIKAQWEGAIAQCLTTVD >NZ_CP023970|712319:720789|719192_720320_-|WP_002492672.1|DBSCAN-SWA MSFNKLKFGDTIGIIGGGQLGKMMTQSAQKMGFKVICLDPNTDCPCHHIANEFITAAYDDTQALQELGEKSDVITYEFENISAQQLRTLSEQFNIPQGYQAIELLQDRLTEKQTLERAGAHIVPFLSINNIDDLYNAIEELGYPFIIKTRFGGYDGKGQILVKDHTAIEEAKQLIAQQECVAEQYLDIEREVSLTVTIGNQKQTTYFPLQENEHRNQILFKTIVPARSDKEQLARIEVNKIIDTVHFVGTFTVEFFIDKQNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAITGQTLPQTIELLKPAVMMNLLGRDLDLLEDDFGQHPEWHVHIYGKAERKPDRKMGHMTILTDDVNATEATMLKQFEGREL >NZ_CP023970|712319:720789|720306_720789_-|WP_002478383.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCAMLEEFGIPFDKKVVSAHRTPKLMYDFANQARANDYDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARILSISHKSVLEKLENYEKTLVKKVGDMQHELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1011881 : 1024315
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP023970|1011881:1024315|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP023970|1011881:1024315|1016503_1016902_-|WP_002459743.1|DBSCAN-SWA MKVIYFSFSGNVQRFIKRTELSDVMEITEDNCQEEVNEPYILVTGTIGFGEVPQEVQQFLQVNHQHLQAVAASGNRNWGQNFAKAGQTISEQYNVPLLMKFEVQGSNSDVKEFKDKVGQFNENYEREKIQSY >NZ_CP023970|1011881:1024315|1011881_1012859_-|WP_002459740.1|DBSCAN-SWA MKLLLKGYTLLICLVIMSIISLFVGVSQLSITDIFHLTKEQLNILLSSRIPRTVSILISGSTLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILISLVCFPQGHILLKLAFAVLCSLFGTFLFVKLIEMIRVKEVIFVPLLGIMLGGIVSSFTTFIALRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLIITYIFANHFTIAGMGKDFSHNLGVNYEQIVRIALFITASITALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISIYRGDHLKNALPHTMMLGACFVLFSDIIGRLIVYPFEINIGLTIGVFGTVIFLVLLMKGRKNYANDFE >NZ_CP023970|1011881:1024315|1021273_1022188_+|WP_002492138.1|DBSCAN-SWA MTDKYNHGVLFYHEHSGLKDIYNGLGEVTKALSSICKQLSIQLSENEGDIIKYCQKIKQGDYGQKIDILFILGGDGTVNEMVNGVMKHQLDLPIGIIPGGTFNDFTKTLNIHPNFKQASEQLKYAQIGQYDVIQVNKEFALNFVGLGLIVQNAENVQNGAKDIFGKLSYIGSTVKTLMDPSNFDFTLTIDGEKTTGNTSMLLIANGPNIGGSRIPLTDLSPQDGKLNTFIFDEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIDHISGKDIRIDTKPIMKVDIDGEIRLETPLDIKVLPKALKLLTIPT >NZ_CP023970|1011881:1024315|1014435_1016541_-|WP_002459742.1|DBSCAN-SWA MKIMNEKKYNHIELNNEVTKRKESGFFNLEKDQEALKVYLEEIHDKTIYFDDEIERLHYLVDHDFYFNVFDKYSEIDLREITDFAKSIEFNFASYMSASKFYKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVTIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEQYYDDMVANPNIIKKKKDAREMLNTIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIDDEIKRDISCNLGSLNIVNVMETGKFRDSVFTGMDALTVVSDEANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYFAKNKIGYESEEAKDFANVFFMMMNYYSLERSMQIAKERGQVYQDFEQSDYANGKYFSFYTAQDITPRFAKVQQLFEGIEIPTAEDWKALQQQVEAHGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >NZ_CP023970|1011881:1024315|1013227_1014196_-|WP_002459741.1|DBSCAN-SWA MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTDDERNTFKRALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKADKIIENYHKLWGKEASIYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGIDAQSLRNELSENEKQQADKEMYVLLEDLYSNEVSYTHMLYDDIGLTEDVLNYVKYNGNKALSNLGFDPYFEEKDFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEALRDEDFIFEN >NZ_CP023970|1011881:1024315|1019441_1020947_+|WP_002492139.1|DBSCAN-SWA MASHNSHELAVEKIPQKGFFGHPKGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLIFYMYYAINQGGLGIDKATAMSIMSVYGALIYMSSIPGAWIADRITGTRGATLIGAVLIIIGHVCLSLPFQMFGLFASMFFIIVGSGLMKPNISNIVGRLYPENDVRIDAGFVIFYMSVNLGALISPIILQNFLDVNNFHGGFLIAAIGMALGLVWYILFNRKTLGQVGMQPTNPLTAEEKKKYTFIIVAIVAVITAVLIVTYLTNTLSFNLVSNTVLVLGIVLPIIYFATMIYSKDVDDTERSRVKAFIPLFILGMIFWSIQEQGSNVLNIYGLEKSDMHLNIFGWTTRFGEAWFQSINPLFILLFAPLISLMWMKMGKKQPSLPVKFALGTFLAGLSYLIMGLIGVSYGSTTFSVNWVILSYVICVVGELCLSPTGNSAAVKLAPKSFNAQMMSVWLLTNASAQAINGTVVKYIDDLGQTTYFILLGSIAVVVTLIVLAFTSIIKKAMKGIH >NZ_CP023970|1011881:1024315|1023259_1024315_-|WP_002459751.1|DBSCAN-SWA MKKQLDQLSAYQPGLSPRALKQQFGIEGELYKLASNENLYGPSPKVKQAITDHLDELYYYPETGSPSLRKAISAHLHIDESRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDKIVTSEATFGQYYHNAIVESADVVQVPLKNGGFDLEGILNEVDEQTALVWLCNPNNPTGTYFTHEKLHDFLSRVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLKLQEEFDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVIATNEAIDKWNIIRPPFNVTRISEYAAIAALEDQDYLHDITQKNAQERQKFYAIPQSKHFLPSQTNFIFVVTDKVQELYQQLLQVGCITRPFPTGVRITIGFPEQNDKMIEVLQQFDY >NZ_CP023970|1011881:1024315|1018656_1019157_+|WP_002479355.1|DBSCAN-SWA MTQGRQEEEMKDITLLGNQNNNYQFDYRPDVLETFVNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPDTKYARMAEHRLMNHDMYPEKIDNR >NZ_CP023970|1011881:1024315|1022491_1023022_-|WP_002492147.1|DBSCAN-SWA MTRQKIAIDMDEVLADTLGAIIEAVNKQTNLGITMEGLNGKKLKHMIPEHDGLVREILNAPGFFRQLPVLPAAQEVVEKLAAQYDVYIATAAMDVPTSFHDKYKWLLQHFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLAIFEGEPIIYTAAHNVNETRFTRVNGWKEVEAYFLN >NZ_CP023970|1011881:1024315|1017774_1018644_+|WP_002492137.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNFVAMFIPLFFIYKYKQPMFGKLRNQPLLIGRSTLGLIGVLLNIFAIDHMVLSDADTLMKLNPFWTILLSLLFLHEKVRKYQISAMIIAIMGMLLIVKPEFSSEMLPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSRREQPYTIVFYFSLFSVIVLIPFSIATFEPMTTTQILYLLGAGLAAAVGQIGITLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTALFGFILFGETPDMYAIVGYIIIISASYYMFDQARRESNTQQSH |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_6 |
1039577 : 1046198
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP023970|1039577:1046198|DBSCAN-SWA TTTATAGCATCTCCAAAATTTTAGCTTTATCACGAAATTCTTGCACTTCATTTTCAGGATCAGAATCAATAGTAATACCCGCGCCGACACCGTATATCGCTTTATTATCACGATATTCAATTGTGCGAATAGGTACATTAAAAATCATCTTGTCATCTGGCATCAATATGCCAAGCGTACCACAGTAAATATAACGCGGTTGGTCTTCTAATTTGTGAATATATGACATCGTGTTTAATTTAGGTGCACCTGTTATGGAACCACAAGGAAATAGCGCATGAAATAACGTTGCTAATGGTAATGTTGCATTTGAGAGTTGACCTGCAACCATACTTGTCATTTGATATACAGTGGCATAAGTTTCAATAAAAAACGGACGATACACATGTACCGTACCTTTTCGTGCAATTCTAGCAATATCATTTCTCAATAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCTCTATCCTTTAATGATTGTTGTAAATATTTATAATTATATTGATCTTGCTGTTTGACATCTGACCTTGGCATGGTGCCTTTCATAGGCTTACTCACAACTACATTATCTTGACCATCAAATGGCCCTTTCTGAAAGAATAATTCGGGTGAAATAGAAGCGACTTGTACGTCTTCAGTATCCATTAACATGGTGTAATTGCCATTTTTAGTTTGCGTTAATTTATCATACAGGTCTTTAATTGGCATTTGTACTGGCGAACTCACTCTTGTTGTATAGTTTACCTGGTAAGTTTCGCCATCAATAATTGCTGCTTGTACTGCTTTGATATGTTGAATCATAGTTGCCTCTTTTACTTGAAAGGCAAACTGGTGTTGTGGCTTATTATTATAATGCTTTATTGACGTCTCTTGTTGTATGGGCTGTGCCGATTGATAACTATAAGCCGCTGCTAATATTGCATCGTCTGCAGTTGGATGCACAGCCATGTCAGGATTAAAGTATTGTGCCGCTTCATACGTCATATAAAGCGCCACATATTTCCCTTCTTTCTGCTGTTGTTCTGCAAAATTGATAACGTCTCCCACATCTTTCATCTCATATGCTAGATATTGCCCTAACCTTTCTGTGAGTTTAAGTTGGTGCGTTTCGTAGCGTGAATCGTCTAAATAATATCTATAATTAAATTGTATTGTCACACTGATTCACCCCCAAAGTTTTAATAAACAGCTCAATTTGTGCATGACCATGTTCACTGAGAATTGATTCAGGATGATATTGCACCGCATAAATAGGCCATTGTCGATGCTGAACTGCCATAATAATACCTTCATCATTTTCAGCACTAATTTCAAGTTGTGCCGGCAGTGATTGACGCTCTGCAATCAAAGAATGGTAACGCATCACTTCAAAATGTTGTGGCAGTTGAGCAAAAATCCCCTTATTATTATGATTAAGCTTTGTTGTGTGGCCGTGTACAGGTCGTTTACCATGAATAATACGGCCCCCAAAATAATCGTAAATGCATTGAAATCCTAAGCAAACACCTAATATGGGAATACGCTTTTTAAATGCTGCAATAATCTGTGCGATTATCGGATAATCACTAGGCTTACCCGGGCCTGGGGAAATAACTAGCGCTGACGGATTAAGCTGTTGTAATGATTGTATTGTGACTTGATTGATACGATAAACAATGATTTCTATATCAGTAACTGTTTTAAAATAATCTATCAAGTTATATGTAAATGAGTCGTTATTATCTATGACTAATATCATTTTATGCTTACCTTCTTTAGTTTCATTCGTAAAAATTACCACTTTATTATAATATATATGTAAGGGGTTACGTTTCTATTATCCCAAAATATTTCTTGATTTTACATAGTTTCTGTATTATTCTAGCTAGCGTATTCAAAATAAATAATCAGAGGTTCCTAGCCGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACACCGAATGTTTCAATCAATATTTAAAGTAACTTATCATCATATGCATTTACTTATTCTGTGGTCTATCTTTTTTATAGAGATAGCTTTTTTTATGTCTAAAAATAGGTTGCATTACCCTCAACGCACTTAAATTGGAGAGATGGACAATGACTGAAACAACTTTAAACAATAACAAAGCCATAGTCGTATTTAGCGGTGGTCAAGATAGTACTACATGCTTATTTTATGCTAAAAAGCACTTTGACGAAGTCGAACTTGTTACGTTCAATTATGGACAGCGTCATAATACTGAAATTGAAGTAGCCAAAAGCATAGCGCATGAACAAGGACTAGCACATCACATTCTTGATATGTCGCTATTATCACAATTAACGCCAAACGCATTAACGCAACACGATATGAAAATTGAAACCAACGAAGACGGTATGCCTAATACATTCGTACCTGCACGTAATCTATTGTTTTTATCATTTGCAGGTGCCCTTGCTTACCAACTCAACGCCAAACATATTATCACTGGTGTATGTGAAACAGATTTCTCTGGCTACCCAGATTGCAGAGATAACTTTATTAAATCAATGAATGTGACACTAAGTTTAGCTATGGATAAAGATTTTGTCATTCATACACCCCTCATGTGGCTAAACAAAGCTCAAACATGGGCGCTAAGTGATGAACTTGGTGTCTTAGACTATATCCGTCATCAAACATTAACATGCTATAACGGCATCATTGGTGATGGCTGCGGAGAATGTCCAGCTTGTCACTTAAGAGCACGTGGTTTACAACAATATCTTAATTCTAAAGGAGCGAAATAATATGTTACAACAAATTTACCCGTCTGTCTCACATCCTTACCAATTCGAACTCAATAAAGACTTTAATTTTTCTGCAGCACATTTTATACCATGTAAAGATGCTGGAAAATGCGTACGCACTCATGGACATACGTATTTCGTAAATTTAACAATTGCGGGTGACACGCTTGATCATAATGGTTTCCTTATCAATTTCCAAGAGTTAAAAGCATTGATTCACGATCAATTTGATCATTATTTATTGAATGATTTGCCCCACTTTAAAGACCAAAGCCCCTCTACTGAAATTGTGGCACAGACAATATATAACATGATTGAAAATCATCTGATGCAATATACAAATCGTCCACATTGTGTTCAAGTCTACTTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTTGTTTATCGTCCGAAGGTGCAACATTAATGGCTGCTAAAATACCTGTATTAGAAATTTTTGGCCCCACAATTCAAGGTGAAGGCCGTGTCATTGGACGTAAAACGATGTTTGTTCGAACTGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGTTGGTGCGATTCCGCATTTACCTGGGATGGCAGTGCAAAAGATCAAATTCAATTAATGAGCGCAACAGAAATTTATGAAAAGTTAATTGAAATTGGTGGTGATTGTTTTGATCATGTAACGATATCAGGAGGTAATCCTGCATTAATTAAAGGTATACAAGATCTTGTCGATTTATTTGAAACTGAGCATATCGCAACTGCTTTAGAAACACAAGGTAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAGATTAATGATTTGACGATAAGTCCTAAACCACCTAGCTCTTCAATGACACCTAATTTAGAAGTTTTAGATCAAGTCATTGCACAATGTGTGCCACAATCCTTAAATTTGAAAGTGGTTGTTTTTGATGATGAAGATTATGCTTTTGCCAAAATGATTCATCATCGTTATCCAGACATACCTTTCTATTTGCAAGTAGGCAACCCATACTTAGCAGATGACGTAGCAAATCACACTGAAAAACTATTGTCACGATATGAACAATTGGTTGAAAAAGTAATGCATAGCAATGATATGAATCGCGCTTATGTCTTACCACAACTTCATACATTATTATGGAGCAACAAAAAAGGTGTTTAAATTTATCGCTATAAAATGTTTTGTAAGTGTTATGAAATGATTAAGTTGTGTTAAATTGCTATAATATGGCAATGAAGTATTTGCGATAGGAGTTCATCATGATTATATACGTACTATTAAACATTGCTGTAGTTATGGCTATCGTTGGGTTTGATTTATATAGGCAGCAATATAAACAACTTAAATTTAGTTCTCTACTATTAGCGATTGTCATTAACACAACAATAAATATGTTTATTATTCAAAAGTATAATTTTATTTCAACTTATACCACTGCATTACTAATCATATGGTTATTACTGCAACTGTATGTTAATTATAAGGTACATCCTTTTGTAATTAATAACCAAAAATTTCTTGCCAGCATATTTGCGATTATTTTAAGCTTATCAGCATTTATTATGGATATTTCGAGCGACCAATCTGTCTATATGTCCATTCCTTATCTGTCACCAGCTATTTTTCTAATTGGGGCAATCATTTTATTTACGGGTACATTTAAATCAACCGAACGCAATCGCTTGCCATTATTCAAACGAATACAAGCCCCTATCATGATAGGAACAATTATTATTGCATTATCATTTGTTGTTATGATGATGTTAACACCATTCTGGTACATATTTTTAGGAATCTATGTATTATTTATAGCATTTATTATTTGGCAAAAAGTATTTCAACATTATTAAAATAACCGGAACACACTTGTCGGCGTGTTTCGGTTATTTATTATATATGCTCTTTTTCTTTATCTTTCACGGTATGCTCATGGTTTATATTACATTGATATGCATTGGGACTATGACCATTTTCATAGGTTAAATTCGAAGCTTGTACAATGTACTTAGGTCTTTGCTTCACTTCATAATAAATCCGTCCGATATATTCTCCGACAACACCTATAGAGATAAGTTGAATACCACCAAGTAACAAAATAGCAGCTATCGTCGTGAAATAACCTGGATTACTAATGCCATTTACGATAATGCCTATAGACAAATAAATAATATAGATAAGGCTAATTGCAAAAATAAATAATCCAAAATAAATCATTGTCCGTAATGGCTTACTATTAAATGAAATTAAACCATCAATACCATAATTAAATAACTTTCTAAAATTCCACTTTGATTGTCCCGCTTCACGTTCTACATTTTTATATGAAAAGACTTTTGTATTATAACCAATCCAAGCAAATAATCCTTTTGAAAAACGATTGTTCTCTTGCAACTCAGCAATTGCACACACAGCCCGTTGACTCAACAATCTAAAATCTCCTACCCCATCGACAAACTGGACATCTTCAACAAATGCATTAATCAATTTATAATACATCTTTGTCACTATTTTACGTGATAGCTGTTCGCCTTCTCTATCACGTTGGGCAATGACTTGATCATAACCCTCTAGATAACCATCAATCATATTGGGTATAAATTCAGGAGGATGCTGTAAATCACCATCTATCATAATGACAGCGTCTACATCAACACTATGGTGAAAACCTGCAATCATCGCTGATTCTTTACCAAAATTCCTACTAAATGAAATAAACTTTACGTGTTTATCTTCTAACGACAATTGCTGTATGTGTTGAATCGTACTATCTTTGCTACCATCATCAATAAATAATAAATCATAGTCATAATTTTTTTCGTTACTGTCTTTCAACATAATTTCAGTCAATCGCTCATATGTTTTTAATACGACTTCTCCTTCGTTATAACAGGGGACAATGACTCTGATTTTCATCCGATTACTTCCTTTACTTATTTCTTAATACTATTTTATCAATTTATTCATAAAACGCGCTAGTATCGTTCTTTAATTTTACAAAAAATTAATAAAGTTGCAAGCGAACTAGTTTTTAAAGCTATTTTATTTTTTTAAGTAGGCTTATCATTTGTACTATTTTAAATCGCCAATGCTAACATCATCAGGATCTTTCCCTTGTCTTGCATTGCGATTCAAACTATCAATTTCTGCAATTTCAGCTAATTCCAAATTAAAATTAAATAAATCGAAATTTTCTTTAATTCGTGAAGGTGTCTGAGACTTAGGTATAATGATACGATTATGTGCTAAGTGCCAACGCAACACGATTTGAGCCGGTGTCTTGTCGTGTTGTTGGGCAATATGTTGAATTGTTGAATCATCTAATAATCCGCGATTGCGCATTAATGGCATCCATGCCGTTACAGTAATATCGTGTTTATCGCAAAAGTCTTGAACATCCTGTTGATTAAAGTAAGGATGCACTTCAATTTGGTTAATTTGTGGAACGATATTGGTTTCTTGCATTAATTTTTCCAAGTGATGAATTTTAAAATTACATACGCCAATCGCTTTTACTTTACCTTCATGATATAAATCCTCTAGTGCTTTATATGTTTCAATATATCGTCCATTCTGTTCACATGGCCAATGAATCAAAAATAAATCAAAATAATCAAGGCCCATGTTATCTAAAGAACGTTGGAAATAGGCTTTCGTCTGTTCATAACCTTGATGATCATTCCATACCTTAGACGTGATAAACAATTCTTCACGTGGCAGACCACTATTCTTTAAAGCCTGTCCTAATGATGCCTCATTGCCATAAAAATATGCAGTATCAAATGCACGATAGCCGGTTTCTATAGCTTGTTGAATGACTTTCGGCATATCTTCATCAGTGATTTTATAAACACCAAAACCTACTTTGGGCATAGGATAGCCATTATTTAATAATTGCGTATCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP023970|1039577:1046198|1044182_1045205_-|WP_002459768.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCYNEGEVVLKTYERLTEIMLKDSNEKNYDYDLLFIDDGSKDSTIQHIQQLSLEDKHVKFISFSRNFGKESAMIAGFHHSVDVDAVIMIDGDLQHPPEFIPNMIDGYLEGYDQVIAQRDREGEQLSRKIVTKMYYKLINAFVEDVQFVDGVGDFRLLSQRAVCAIAELQENNRFSKGLFAWIGYNTKVFSYKNVEREAGQSKWNFRKLFNYGIDGLISFNSKPLRTMIYFGLFIFAISLIYIIYLSIGIIVNGISNPGYFTTIAAILLLGGIQLISIGVVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQASNLTYENGHSPNAYQCNINHEHTVKDKEKEHI >NZ_CP023970|1039577:1046198|1042736_1043453_+|WP_002459766.1|DBSCAN-SWA MAAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKDQIQLMSATEIYEKLIEIGGDCFDHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFETEHIATALETQGSKFQPWMTQINDLTISPKPPSSSMTPNLEVLDQVIAQCVPQSLNLKVVVFDDEDYAFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLADDVANHTEKLLSRYEQLVEKVMHSNDMNRAYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP023970|1039577:1046198|1045361_1046198_-|WP_002492999.1|DBSCAN-SWA MNDTQLLNNGYPMPKVGFGVYKITDEDMPKVIQQAIETGYRAFDTAYFYGNEASLGQALKNSGLPREELFITSKVWNDHQGYEQTKAYFQRSLDNMGLDYFDLFLIHWPCEQNGRYIETYKALEDLYHEGKVKAIGVCNFKIHHLEKLMQETNIVPQINQIEVHPYFNQQDVQDFCDKHDITVTAWMPLMRNRGLLDDSTIQHIAQQHDKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSQTPSRIKENFDLFNFNLELAEIAEIDSLNRNARQGKDPDDVSIGDLK >NZ_CP023970|1039577:1046198|1042317_1042737_+|WP_002459765.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSVSHPYQFELNKDFNFSAAHFIPCKDAGKCVRTHGHTYFVNLTIAGDTLDHNGFLINFQELKALIHDQFDHYLLNDLPHFKDQSPSTEIVAQTIYNMIENHLMQYTNRPHCVQVYLRETPTSYVVYRPKVQH >NZ_CP023970|1039577:1046198|1041644_1042316_+|WP_002492964.1|DBSCAN-SWA MTETTLNNNKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFDEVELVTFNYGQRHNTEIEVAKSIAHEQGLAHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMKIETNEDGMPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQLNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDNFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAQTWALSDELGVLDYIRHQTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRARGLQQYLNSKGAK >NZ_CP023970|1039577:1046198|1039577_1040729_-|WP_002459762.1|DBSCAN-SWA MTIQFNYRYYLDDSRYETHQLKLTERLGQYLAYEMKDVGDVINFAEQQQKEGKYVALYMTYEAAQYFNPDMAVHPTADDAILAAAYSYQSAQPIQQETSIKHYNNKPQHQFAFQVKEATMIQHIKAVQAAIIDGETYQVNYTTRVSSPVQMPIKDLYDKLTQTKNGNYTMLMDTEDVQVASISPELFFQKGPFDGQDNVVVSKPMKGTMPRSDVKQQDQYNYKYLQQSLKDRAENVMIVDLLRNDIARIARKGTVHVYRPFFIETYATVYQMTSMVAGQLSNATLPLATLFHALFPCGSITGAPKLNTMSYIHKLEDQPRYIYCGTLGILMPDDKMIFNVPIRTIEYRDNKAIYGVGAGITIDSDPENEVQEFRDKAKILEML >NZ_CP023970|1039577:1046198|1040712_1041309_-|WP_002479366.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYFKTVTDIEIIVYRINQVTIQSLQQLNPSALVISPGPGKPSDYPIIAQIIAAFKKRIPILGVCLGFQCIYDYFGGRIIHGKRPVHGHTTKLNHNNKGIFAQLPQHFEVMRYHSLIAERQSLPAQLEISAENDEGIIMAVQHRQWPIYAVQYHPESILSEHGHAQIELFIKTLGVNQCDNTI >NZ_CP023970|1039577:1046198|1043551_1044142_+|WP_002493007.1|DBSCAN-SWA MIIYVLLNIAVVMAIVGFDLYRQQYKQLKFSSLLLAIVINTTINMFIIQKYNFISTYTTALLIIWLLLQLYVNYKVHPFVINNQKFLASIFAIILSLSAFIMDISSDQSVYMSIPYLSPAIFLIGAIILFTGTFKSTERNRLPLFKRIQAPIMIGTIIIALSFVVMMMLTPFWYIFLGIYVLFIAFIIWQKVFQHY |
8 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1370517 : 1386943
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP023970|1370517:1386943|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP023970|1370517:1386943|1377896_1378118_-|WP_002492076.1|DBSCAN-SWA MIAKVNYLKRLIAFEGLSLKDFASEIEVNSNFLNSIVNGKRTTSPKTANKIAKRLNVDIKDIFIFIEEKEGVK >NZ_CP023970|1370517:1386943|1378888_1379581_+|WP_002459649.1|DBSCAN-SWA MKINKWIMWVILFSSLFGIANKGISIIAFILSIVALTKFVLVDKKSINTNAENNNTKVQQPKQTSNKEFKQNERLRKKEEKIKEKERAREQEKQIAIQRSHDYFGVDFIDANVTNSKATAYYNKIKTDTEHVIDVVNARATKNVKNYKRYGYHLETTDKGILILTTENIYFLTAQNGFAKTVYPIKNVNGINTSMANLYITYGRTKHIYNVEGWKRSDLFMKNYIKYFYS >NZ_CP023970|1370517:1386943|1386115_1386943_-|WP_002492025.1|DBSCAN-SWA MAIENDHRLQINEDEQIRWIAIEEIMPNPYQPRKNFDAERLNDLAESIKIHGILQPIVLRQTVQGYYIVVGERRYRASQLAGLTKLPSIIKELSDADMMELAIIENLQREDLNAIEEAESYQRLMDDLQLTQQEVAHRLGKSRPYIANMLRLLHLPPSLKDSVQRGELSGAHGRTLLGIKDKQRMIQVGRKAFKESWSVRYLEKYVNNIQEGSQPYPKVTKEPLKPKFIQKQERLLREQYGAKVDISTKKQVGAITFEFKSKEEFERLIKLLHDK >NZ_CP023970|1370517:1386943|1383695_1384793_-|WP_002479239.1|DBSCAN-SWA 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MSIIQLENDTQVSVVWYGNEKSTSFKNFSQPKWSELISRLSIPQNNGNKYARGTAVYGDVADGVDDEGNEYRKYRNNDNVLYRDVLVLDYDDEDDLNMLHKSIKSELEGFAWFWHTTFRHTNESPRIRLYVPLSERISANEYRAYVRTLAQKIACKIDEGSYQPSRAMALPVRKSNESPFEFQFNDAAILDKSILKEWAKLFDISTQENSTQNFKRRDASHWEEKAFGVSEGGRNSSLTSILGHLFQRRVNEHIIYSFAQMWGQSCTPPMNEREINTTFYSIMKKHYNN >NZ_CP023970|1370517:1386943|1381272_1381782_-|WP_002461102.1|DBSCAN-SWA MLNRVVLVGRLTKDPEYRTTPSGVSVATFTLAVNRTFTNAQGEREADFINCVVFRRQAENVNNYLNKGSLAGVDGRLQSRSYENQEGRRIFVTEVVCDSVQFLEPKNAQHGGQRSQNNEFQDYGQGFGGQQSGQNTSYNNNNASKSNQNDNPFANANGPIDISDDDLPF >NZ_CP023970|1370517:1386943|1373205_1373727_-|WP_002492062.1|DBSCAN-SWA MPTITEIGHQQFKMFINNDKFQQHVKKEQENMAKGLIISLLANPTGIHQTFIQEVIQLTKKCYLYCDGGDILLITKDFKALIKFNIRKPNPLFKQHFNTSWIIEIDNLNSLKKGHGKMLLKDVLAISTKLNLESCLWTESDNNTKYFERHNFKSIGKVGKDNENLMIRRKERV >NZ_CP023970|1370517:1386943|1384792_1385008_-|WP_002479238.1|DBSCAN-SWA MTSKYGINDIVEMKKQHACGANRFKIIRMGADIRIKCEKCNRSIMIPRQTFNKKMKKIVVSQQDTESKENE >NZ_CP023970|1370517:1386943|1374051_1375761_-|WP_002492057.1|DBSCAN-SWA MNFTNDEIMNEIKENMNKKTYTPNLIPDGYKVKPNSYGAALYQIIPSRKDGEPDKERFITTTIPEINTRYENIENGEVSYNMHFFDNRTPVNLNVTAEEITDNRQLLKLANRKLDVTSNTSSKLVDYINQSKRYSPPINIKVATRLGHVKDYFIYPYKDEMEHENIKFFNNDKGFQKLVNSFKSKGTIEDYSKKVFIKIKDLPMVMVMLYASLGSVLLYEFDIMPFIVELAGSTSTGKTFTLNLVASVWGTTDLTTTWSSTRNSIEAMAAFLNSFPMFKDDTRNISPNFIANAVYNYSSGESKSRSNKNLTIDEKKEWKNIMLSTGEASITNMAEDKAGVSARVVTLEEQPYPDNFDFISLDHEFRENYGTLGIEFIKQYQSKKDEYKESFESYLRYFNEKGINEVMQRIGKCFALLQLTGEILNDIDGFEHDYYKIINQAYENMLKNNKTIDKPKQMLEDMLQYLDAHRNNITGDGYSHVKNGEIKAVYKRGYLCILGDTVKDILGHEMYTTTKQWDKKGYLVKKEKDRLQIQVRHETKKHRGFAIKDEVIKEMGFDFSNSHNPHSKF >NZ_CP023970|1370517:1386943|1380983_1381226_-|WP_002461103.1|DBSCAN-SWA MAGGPRRGGRRRKKVCYFTANGITHIDYKDTELLKRFISERGKILPRRVTGTSAKYQRMLTTAIKRARHMALLPYVKEEN >NZ_CP023970|1370517:1386943|1371152_1371674_-|WP_002445376.1|DBSCAN-SWA MKTLDQIEKYKTNIEDYRKEIKNLDAEVKNDGKQLDDINQEYQDLVINGEVEKADKLYTKIEKLESDYRAKSKRLMVMKQSFKKVVIKNCENMQDVADELSDEYNETYQDDLKRYETLNQQLKDAKDKLLGYNDEYSAKQRTLTQYIDRLKRENNIQPVEFIGNVNIIQPFNI >NZ_CP023970|1370517:1386943|1382417_1383203_+|WP_002461100.1|DBSCAN-SWA MFIKISRSIITLLILLTTLCTTTALAEKPVYQYHKGTMGSGYKQYINSGAGGRGGMPTKPRANVSSSSKRILDISEWQGALTDAQVKALKKNYDFIIIRGQYGSEYVDKCLANNSALLDKYNMKFGVYSYSMYENADDARYEARTLHQRAPKADFYINDYEQQTVKSGDENAATQAWAAEMKKLAGNKKVLFYSYENFMLNHVANAINAYDGCWLAAYQQTEPQSEHVLWQYTDHYYASELKQNVDANYVSQNLNQNFFIN >NZ_CP023970|1370517:1386943|1379617_1380838_+|WP_002492008.1|integrase|DBSCAN-SWA MWHEKFTNKHGDVQYRFYEKYKDPLTAKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQKLLNKRIEAKLNDKTPTTLKSLTFHAACDEWLEYYKNHSGSKATTIKEKISNTNTVKNAIDKEVLINNITHTYLQDIINEWAKLHSKGHVQSLVIIIRSVFKYAFKYYDLQDISVLDKIDIPKKAKTRDELQAKRNNYLEDSEVKELLDCFDYLIKHKNHSSRKRNYNMVKAIVQFQIANGMRIGELLAIKKDNINFEHKTLEIDGTINWVTDKETGAFGVKETTKTSKSYRTIGLTTQSINLLKTLILENKKENQWNEDFIDRGYVFTNTAGSPIDLNKINNIIKEATDISSIKKRVTTHTLRHTHISTLAQLGINLKAIQDRVGHSDYKTTLEIYTHVTDQMTKDMMNKLETINIV >NZ_CP023970|1370517:1386943|1371932_1372277_-|WP_002445374.1|DBSCAN-SWA MQKLVEKEKTYNLPDEHRQVLNVIRNTSKKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRKVINSLVYDYAYPIGCSYKRNERGYYIITTEQEKQQAMISIKKLADGSMKRYEALKRIEV >NZ_CP023970|1370517:1386943|1385025_1385907_-|WP_002479237.1|DBSCAN-SWA MNQIKNVLASLFEPLTKVETYENLITKLALILIYILVAIIVISILNKIIAQAFKIQNKSKKGNKKRSKTLISLVQNVVKYIVWFIVITTVLSKFGISVEGIIASAGVVGLAVGFGAQTIVKDVITGFFIIFENQFDVGDYVKINSGGTTVAEGTVKSIGLRSTRINTITGELTILPNGSMGEITNFSITNGTAIVVIPVSVEENLDAVEKKLNKLFVSMRSKYYLFVTDPVVLGIDAIENNKVTFRISAETIPGEGAAGARILRKEIQKLFVQEGIKLPQPVFSQYESQQKSK >NZ_CP023970|1370517:1386943|1376737_1377040_-|WP_002492064.1|DBSCAN-SWA MNWELRNLFDDLEVVQEKINDVVTSFVWFDDEYFTHEPNHMLTKKEIYTHGWKYHEHRIKNTQVIDLMLMYMRDFDDIMKKIRDIEKTLPENFGEESDNA >NZ_CP023970|1370517:1386943|1377448_1377607_-|WP_002492040.1|DBSCAN-SWA MMKFTFNILVLSIISFLSGWLLGIHVAFAIYLLGSVIALLNYENLEVQPDEQ >NZ_CP023970|1370517:1386943|1377039_1377459_-|WP_002492019.1|DBSCAN-SWA MNNKQELNKQIKFREENEKMKNLTNQDFKTIKGKLNYEHMVNGKKHTSKMIKLLQKRHAKNVSVIKSEYPYLSDNEILEILADYREYEDLLSATETFIDFPNIYEGSNISKFLTLDDVAELKIAIEEMTIFVESLEDNE >NZ_CP023970|1370517:1386943|1371685_1371919_-|WP_002492317.1|DBSCAN-SWA MKANQYEELSEVLDLTESQKLKLYVYQERQNKNIKQDSKESKQNNEEANREKRQKILDIKDDVTRQNAIAKNRELFK >NZ_CP023970|1370517:1386943|1383264_1383456_+|WP_002479240.1|DBSCAN-SWA MQLNLDWSKDFQEFQDILNSGIHPDWLYCAKANLVLQPAYTGEGKQFFSTEDIVEASKVIPFF >NZ_CP023970|1370517:1386943|1370517_1371090_-|WP_002445377.1|terminase|DBSCAN-SWA MPKLTPKQERFVNEYIRTLNVTQSAITAGYSPKTAHVTGSRLLKKKHINEYIQEQKKKVIDESILSANELLHLLTNSAVGDETETKEVIVKRGEYKENPQNGKIQLVYNEYVELIEIPIKPSDRLRARDMLGKYHKLFTEKKEFTADTPVIINIGEWDEEDEEDKQRTLDKINDNYPNRTMIVDDIPLED >NZ_CP023970|1370517:1386943|1377623_1377896_-|WP_002492070.1|DBSCAN-SWA MPRTKLQDFPSKENTVTEPKQVVVKPIMAKPNAIAKLFGISYSSVNRILKEYDKDNKGVEDLYFSLSSTMTVISIDGFREYLSKRHKGWL >NZ_CP023970|1370517:1386943|1378289_1378862_+|WP_002459648.1|DBSCAN-SWA MQQNSLEDFSNILKKFRKEEDLTLDTLSKYLGVSDVYVSKLENGKRFPSKNILFWYVLFMDQSQMHDDIEKLLTIFSENKKISYEQLRTEYDQFVKKFQEEQKKHSSKIQRKEIKLTMNEFNQYQIEEIDEPYFDLKWLLNQSEYKLFYSGIDNKNSFGFNEVLSESDKKMLSEIVNSVIQRIYNDENQK |
25 | Staphylococcus_phage(50.0%) | integrase,terminase | attL 1367843:1367902|attR 1380925:1380998 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2443005 : 2456178
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP023970|2443005:2456178|DBSCAN-SWA CATGCTTAAACCAATAGGTAATCGTGTAGTAATTGAAAAAAAAGAACAAGAACAAACAACTAAAAGTGGCATTGTTTTAACTGATAGTGCTAAAGAAAAATCTAATGAAGGTGTAGTTATCGCGGTAGGTTTAGGTCGACAACTTGAAAATGGTCAACGTATCACTCCAGATGTTAACGAAGGGGATAGAGTTGTATTCCAAGAATATGCGGGAACTGAAATAAAACAAGGAAACGACACATATTTAATATTAAATGCTGATGATATTTTAGCAATTATAGAATAATAATATAATTTATAGAATTCAATTTTTACAGACACATATTTTAATGGAGGTTAAATAGAATGGCAAAAGATCTTAAATTTTCAGAAGACGCACGTCAAGCAATGTTACGTGGTGTGGATAAATTAGCAAATGCAGTTAAAGTAACAATAGGACCCAAAGGACGTAACGTTGTTTTAGATAAAGAATATGCTGCACCACTTATTACTAATGATGGTGTGACAATCGCAAAAGAAATTGAACTTGAAGATCCATATGAAAACATGGGGGCAAAATTAGTTCAAGAGGTAGCTAATAAAACAAATGAAATTGCTGGGGATGGAACAACAACTGCTACAGTGCTAGCACAAGCAATGATTCAAGAAGGACTTAAAAACGTAACGAGTGGTGCAAATCCAGTTGGCTTACGTCAAGGTATTGATAAAGCAGTTAAAGTAGCTATCGAAGCATTACATGATATATCACAAAAAGTTGAAAATAAAAATGAAATTGCACAAGTTGGGGCTATTTCTGCAGCAGATGAAGAGATTGGACAATATATTTCAGAAGCTATGGATAAAGTAGGTAATGATGGCGTAATAACTATTGAAGAATCTAGTGGTTTCAATACTGAACTTGAAGTTGTAGAAGGTATGCAATTTGATAGAGGTTACCAATCACCATATATGGTTACGGATTCAGATAAAATGACTGCAGAATTAGAACGTCCATATATATTAGTTACAGATAAAAAAATATCTTCATTCCAAGATATTTTACCTTTACTAGAACAAGTCGTTCAATCTAGTCGCCCAATATTAATTGTTGCTGATGAAGTAGAAGGTGATGCATTAACTAATATCGTTCTAAACCGCATGCGTGGAACATTCACTGCAGTTGCTGTTAAAGCACCAGGCTTTGGTGACCGTCGTAAAGCTATGTTAGAAGATTTAGCTATTTTGACAGGTGCACAAGTGATTACTGATGACTTAGGTTTAGAACTTAAAGATGCAACGATGGATATGTTAGGTAGTGCCAATAAAGTTGAAGTAACGAAAGATAATACAACGATTGTTGATGGTGATGGAGACAATAACAATATCGATGCACGTGTTAGTCAAATTAAAGCACAAATTGAAGAAACTGACTCAGACTTTGACAAAGAAAAATTACAAGAACGTCTTGCAAAATTAGCTGGGGGCGTTGCAGTAATTAAAGTTGGCGCAGCTTCTGAGACAGAATTAAAAGAGCGTAAATTGCGTATTGAAGATGCTTTAAACTCAACTCGCGCAGCTGTAGAAGAAGGTATTGTTGCTGGTGGTGGTACAGCACTAGTTAATATCTATAAAAAAGTGAGCGATATTCAAGCAGAAGGTGATGTAGAGACTGGTATCAATATCGTCTTAAAAGCATTAACAGCACCGGTTAGACAAATCGCAGAAAATGCAGGACTAGAAGGTTCAATCATCGTTGAACGTTTAAAACATGCGGACTCTGGTGTTGGATTTAACGCTGCTACTAACGAATGGGTAAATATGTTAGAAGCTGGTATTGTTGATCCAACAAAAGTAACGCGTTCAGCTTTACAACATGCAGCAAGTGTTGCAGCAATGTTCTTAACAACAGAAGCAGTTGTAGCTAATATTCCTGAACCTGAAAGCAATAACCAACCACCAATGGGCGGCGGCATGCCAGGTATGATGTAAAAAGACCGTTGAACACTGTTGTAGTAGCTTTTGAAATCTTCAATGGTCATAATTTGGGCATATAAATTTTAAAATAAATCTTTTGAGACGTTTTCCATGAGTTTACTAAACTTTTGGGAAGCGTCTTTTTTGTATGAGTTCGTAATCTTAGCGTAGATGTTCATAGTGGTATTTATATCTTTATGGCGCAAGCGTTCTTGTATTTCCTTAATATGCACACCAGCCTCTATAAGTAACGCACAATGAGTATGACGAAATGAATGAGTGCTTATTTGTTTATTAGTTATGTCAGTCTTTTTAAGTATAGCTTTTATCCATAATTGTAGTTTTTTAATTACAAGAGGGTAGCCGTTAACATCAGTAAAAACGAAATTATTATCTACATACAATTCGTTTTTCCATGTGTCCTGAACATCCACTTTATAGTTTTTAAGTAATTTAATCACATGAGGATCAACTGGAATTTTTCCGATTGAGCTTTCAGTTTTTGGTGTAAGTATTTGATATTGCTTTTTATTGTTATTTGGATTGTAATAAGTCTTTGTAATATTGATTGTGTTATTCTCAAAGTCTATATCAGACCACTTCAATGCCAATAATTCACCTGCACGCATGCCTGTATATGCTAATGTACAAAATACTTCAAAGCTATTTTGTGGTGAATGGTGATTTTTGGCAATTTCCAGGAATTGAAATAATTCATCTTTTTCAAGAAACTTTTTATGTATCTCAGTATCTTCTAATTCTTCCACACTAACTTTCTTTTTAGGTCGTTTAATACCCTCGCTAGGCATTATTCTTATTAATTTCATATCGTATGCGTACTTAAATATCATATTCGTAGAGGCTATAATGCTATCAATATAATTCTTGCTATACTGTGCGCTTATATCATTTACAAAGCGTTGATAATCATGTTTATTGATAGTTTGTATTGGTTTATTGTTAAAGCGTTCTATGGCGTGGTGTATGGCTTTCTCGCGTGCTCTGACACTACTTACTTTTACCTCGTTAGCATATTGTTTAAGCCAATCGTTAGCAACCTGTTTAAATGTAGATGTGGACGGTGCGATATAATCACCGGTTCTTAATTGACGTTCTACCATTTCAGCGTGGTGTTTAGCGTCTGATTTGCGTTTAAAACCTGAGTTTGAAATATATTTATATTTGCCCGTTTTTGCGTCTTTTCCTAGTGATATACGATAGCGCCATGTATTTCCGCGTTTTTCATAACTTGCCATTTGATCACCTCGATTAATATTCTTTAAAAATATCACTAGATAAACGGCTATCAGTTTGTAAAATTTCTTTATGTAGAGTCGTACATTTTTCGCCTTTATTTGGAAAAAGCTCTTCAATATCGTCTATATTTTTTACTATTATTTCAGAAACATACCCACTTAACTTTTGGTTAATTTTTTTAAATAACAAGTTTTTAAGGCCTGCAGATAAACTATCAACGTATTTTTTTAATCCGATATTTTCATCTTCATTTTTAATCGTGAAAATAAATCTATGTTGTGAATTAGTTATCTTTTCAGTTTCTTTATATGAGACGTCTAAGTCAAAATTTAATTTTTGCCTATTATCTAATTCGACGTCTACTAAAATTTCAAAGTCAAAATTTTCAATCGAAAAAGCGTGAGTAATGTTTGCAGTTACTTCAAATCCCTCGAAAACATCATTAATTTTATAATTCGGTTCTTCATCAAAAGTAAAGTCAAAATTGATCGGATTATGTTCAAAAAATTCTGAAGGAGATATGTGCAGATAACTACATAATTTATCTATAGCATCATATCTTATCATTTCAGAATCATTTTGTGTCATTGAAGTAAGTGAACTTCTTGCTATTTTTACATCTTTTGCAACACGAGATATTTTTAGTCCTCTTTCTGACAGTAGTTCAGACAATCTATTTCTAATCATTACAAACCTCCTAATTATGTTAATAATAGCATTTTTTTGGACGTTTATGTACAAAAAAATAAAAAATGATTGAGAAGTCAGTCGAAAAACTATTGCAAAAGAAAAACGATTATGTATAATAAAGTTATAAATTGATTGAGAAGTCAGTCAAAAACGAAGGAGGATTTTAATTATGACTATTTTAGCGAATACTAGAAAGTTTAAAGAAGCTATGTTCTTAAAAGGTTTTAATTTATCTGATTTATCTCGTGAAACAGGTGTTGGAATTTCTTATTTAAGCCAAATTATTAATGGTAAAAAGATTCCAAGCCCTAAATTAGCTAAGAAAATGGCAGAAGTTTTACAAGTTGAGGTAAATGAATTATTTGAATTTGAAGTAAAGGAGGCATAAACCAATGTTCAACATTAATATTGATGAAGATGAAGCACGTGAGTTACTTGAGCAGGCTATCAATGTACGTGTGGACGAATTAGCGAAAGAGAAATATTTTATGACTTACAAAGAGTTGTCTAACTATCTGAATTTAAGTAAGCCTACTATTGAAGAATTACTTATTAATAATGGCATGAAATATTATATGGTCGGATCTACGTACAGATTCAAAAAGTCTGATGTAGATGAATTCATGGAACAGCTTACTGCTCATATGAATATCCAGAATAACGACTTTAAACAAGTCAATATCAAAAAGTTATTGGAGGCAAGGCAATGAAAATGTACTTAACTTATATCTGCTTAGTTTCATTGTTAACAATTTTATTACTAGCAATATCTAACATGTATGTCGCTTTTAGTGTGTACGGCATGATGGTAACTTATGGATGTAATTTAACAGGAGGATTAGAAAATGAATAATGAACAAAAAGAAGTAATAGAACACGTGGTTTATCAACTTGAGTTAAGTGTCATGAATAACTTGGAAAGTTATGAACACACGGAATATGTTGATGGTATTGAAGTGGTTTCAGAGGTTAGTCGTGAAAAGCACTTAGAATTGATAATGAAATGGTGCGCACAAGAATTAAAGAATAATTTTCAATTAGAGAAAGGAGAATAAAAATGAATTGGGAAATTAAAAATTTATTTAGCGATTTAAAGTTGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP023970|2443005:2456178|2455137_2455746_+|WP_002445379.1|DBSCAN-SWA MPRFNSNVTSKKRKKNVHVEIVNKDFLPTRNEFETDKVEIELRNAEVKEVVFFNEEVKYSKQNNDLKFTNFISDFTQQNQINAITHFSENISIVKNNPDEATNINYDERMLSILSLYTQQDIRNIKGLMKTDIRGLLDVQEGLRVYWYYDLIDNEIKIVCIDPQHLVLPSQHGKMNKDKMMITTYQSVTNSKKHCISRYFIN >NZ_CP023970|2443005:2456178|2447961_2448285_+|WP_002445368.1|DBSCAN-SWA MNWEIKNLFSDLKLLKDSFEDLKDNHGWHFEELYPHEPNHNLNKDELIREGFSYHERRIHNNQMFDLFHLYIEQFDKIIQKFHELEKASSENFGEESDDAQKLKITE >NZ_CP023970|2443005:2456178|2451288_2451654_+|WP_002445372.1|DBSCAN-SWA MEKEQLKQYMYDYVKEYEEIPIYQLEDLFKELDHDYKGKTSVTHDQDKNIVFWSGWNKLTMYALIELVKGEHLDLVYRGSYVMRYLLDGRVPSLPLAITYPEYGQQTEVPSWVPMLLRVTK >NZ_CP023970|2443005:2456178|2454635_2455145_+|WP_002492698.1|DBSCAN-SWA MAEQKYLTTVENIIGLMKEEIKNISPLRLQKTLYFLFAYYGASYGQLSKSKEYEVTKSESLNLPEYLFDAQFEAWQYGPVIRDVYKNNKYSLGYNDIDFSMSNFEIEDKTMQQEITEYLREIIKSTLKISDFGLVERSHEDEEWKNKITQQEIMNNDLIIKEYIGLVNA 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20 | Staphylococcus_phage(62.5%) | integrase,terminase | attL 2444955:2444974|attR 2458784:2458803 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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