Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017706 | Lactobacillus amylovorus DSM 20531 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DEDDh,cas14j,cas3,c2c9_V-U4,Cas14u_CAS-V,csa3,RT | 0 | 0 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017706_1 | 1150460-1150555 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017706_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017706_1
>1.1|1150490|36|NZ_CP017706|CRISPRCasFinder GGGTTTGCGGGGTGTCGTCAACGGTCTCCCGCGAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017706_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017706_1 >merge|NZ_CP017706|1|1150460-1150555|CRISPRCasFinder GTCTATTTTTTAGACTTCCGCTCGTAGCAAGGGTTTGCGGGGTGTCGTCAACGGTCTCCCGCGAAGGTCTATTTTTTAGACTTTCGCTCGTAGCAA >NZ_CP017706|1|1|1150460-1150555|CRISPRCasFinder GTCTATTTTTTAGACTTCCGCTCGTAGCAA GGGTTTGCGGGGTGTCGTCAACGGTCTCCCGCGAAG GTCTATTTTTTAGACTTTCGCTCGTAGCAA
>NZ_CP017706.1|WP_003660204.1|1149443_1149725_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelB/DinJ-family-antitoxin MAVKEKKRVQVQIDKELADNTEAVLSQLGLNPTTAINMFYKRIVANGALPFNVSLSEEERANLRFLKATKETPVTEFKDAKEVADWLNDPDED >NZ_CP017706.1|WP_010620892.1|1149211_1149397_-|hypothetical-protein MKDTITINDFFEIAKETDLKDLLDKSLHEPDPEKRKVYDALYTYFLDKRQDEVIKRKDFVR >NZ_CP017706.1|WP_082589030.1|1148803_1149160_+|transposase MNSGFKKIVADRRLRQGRSARTSFVILDAQSIKNTATAENKGYDGGKKISGIKRHLAVDINGFPQAIHITRANITDRDGAIALVTLNLEQFKLVRTMMVDSGYTGQNFVTAFAPFLDK >NZ_CP017706.1|WP_003681033.1|1148546_1148846_+|IS5-family-transposase MQHFSHHYQSDISRQQFDLIRQDLEASRKRTHPKHIDPYDIFCAMLYVLKNGCTWRDLPADFPKWSTVYYYWMNWSKAPTPDKPALLTQVLKKLSLIED >NZ_CP017706.1|WP_099202294.1|1145347_1148263_-|starch-binding-protein MKKKKSFWLVSFLVIVASVFFISFGFSNHSKQVAQAASDTTSTDHSSNDTADSVSDGVILHAWCWSFNTIKNNLKQIHDAGYTAVQTSPVNEVKVGNSGSKSLNNWYWLYQPTKYSIGNYYLGTEAEFKSMCAAAKEYNIRIIVDATLNDTTSDYSAISDEIKSIPNWTHGNKQISNWSDREDVTQNSLLGLYDWNTQNSQVQTYLKNYLERLISDGASGFRYDAAKHIELPSQYDGSYGSNFWPNITDNGSEFQYGEVLQDSISKESDYANYMSVTASNYGNTIRNALKNRDFTASTLQNFNISVPASKLVTWVESHDNYANDDQVSTWMNNSDIKLGWAVVASRSGSVPLFFDRPVDGGNGTRFPGSSEIGDAGSSLYYDKAVVAVNKFHNAMAGQSEYISNPNGNTKIFENERGSKGVVFANASDSSYSLNVKTSLADGTYENKAGSDEFTVKNGYLTGTIQGREVVVLYGDPTSSSSTTTETKKVYFEKPSSWGSRVYAYVYNKNTNKAITSAWPGKKMTALGNDEYELDLDTDEDDSDLAVIFTDGTKQTPAANEAGFTFTADATYDQNGVVRTSDSSSTSKKVYFEKPSSWGSRVYAYVYNKNTNKAITSAWPGKKMTALGNDEYELDLDTDEDDSDLAVIFTDGTKQTPAANEAGFTFTADATYDQNGVVKKVYFEKPSSWGSRVYAYVYNKNTNKAITSAWPGKKMTALGNDKYELDLDTDEDDSDLAVIFTDGTKQTPAANEAGFTFTADATYDQNGVVRTSDSSSTSKKVYFEKPSSWGSRVYAYVYNKNTNKAITSAWPGKKMTALGNDEYELDLDTDEDDSDLAVIFTDGTKQTPAANEAGFTFTADATYDQNGVVKKVYFEKPSSWGSRVYAYVYNKNTNKAITSAWPGKKMTALGNDKYELDLDTDEDDSDLAVIFTDGTKQTPAANEAGFTFTADATYDQNGVVRTSDSSSTSSNS >NZ_CP017706.1|WP_056940758.1|1144498_1145086_-|recombinase-family-protein MAKIGYARVSSKEQHLDRQLAALKDVDKLFTDKLSGANTNRPELQKMLAYIREGDIVMVTELDRLGRNNHDLTKIMNSIQNKGATLDVLNLPSMTGIADPNLRQLMTNLIIELYKYQAESERKRIIERQQQGIALAKQQGKYHGRKPQYTQDDLHLQHAFKLYQGGMSDVDVARNTGIKRTTFIRYRKKYKIKRK >NZ_CP017706.1|WP_056940633.1|1140545_1141778_+|DUF2974-domain-containing-protein MAGTLDYLRWRGDLSFKEKPFNSVDASLFASFIYLPVDKSAKGHTLSEVAEKLRVLPSFQVQMHDENGTQIWLLPKSPRLGNVEILNWTNRMEKDPYPLQFTAATFQLDKKTILIVYRGTDSSIIGWNEDMNMNYMPKVYGQDVAANYLKEIAAKYPDDKIYLAGHSKGGNYAEYALSVAEPTLQKRIIRALSFDGPGFFHQVWRSPGFVRALPKMKTYLPEASIIGTMLDHPERVLIVKSTAPMIQQHDPRRWSVGRDSFVLAKGLTSGARSLRHSLIDFNHTIPDEQRGELWDALFQAFDELNITDMFQITANKLLGTVRFSRVIMALTPETRKYVLHMVGEILNAIRGNISLPFNETDFALYPKSNDSNKAPIFFEFYDKTVPSILPEKIKQRFKDDKEREQKNENK >NZ_CP017706.1|WP_056940632.1|1139783_1140485_+|methyltransferase METFAPITTELDWLLRILVAAFCGALIGYERAIQRKTAGVRTHIVVAIASALFMIVSKYGFTDLLNMHDLSLDPSRIAAQIVTGISFIGAGTILVRKEQISGLTTAAGVWATAAIGMAAGAGMYFIGILSTALLFIIQLFFHDDEIVDKLTPHIRFDILIDAINKPDVLPQIKQELENNKVENISIKILDVSDKKIVLYVDGVINNKIDENQIIMTLRKYPDIRKISYTRGGL >NZ_CP017706.1|WP_007125838.1|1138536_1139343_+|hypothetical-protein MNQLKYNFSDYNLNIATFISKEQFKIYSQFINKLSPLKNIIQTYKMTQNQYIELQAVPRIIENLPILSEQGYDLAIQKTTIYIILNRMFIDNCKNLAIQLNDLNLNDPINSCDKTKCEENLHVLRNYANHATIPISGLTTESSSNGEAKIRPTIKRQDLKGKFNKHDRLIINTWPKNGIEIMPEITKSNTIIQKLLKAIIQKFIKTRINEEEIEQIKADKEIWKNILIPQKTRGVFPLPLSNELKVAYTDSLLLKMVVSLIIDNVEYN >NZ_CP017706.1|WP_056940631.1|1136971_1138333_+|IS4-family-transposase MNIHINILKCLDNIINDTAMHIHDYIKNPHAFTRKRKLDAFTTIKTTINMQNNCLTKEIDDAFDDGSFAGNNNISVSAYIQQKSKLSPKCFEHIFHAFTRQLPTKAQLDHKYRLFAFDGSDFNQVWNSKSKNIVDSSKGKSYCQIHVNAMYDLLNNTYQDCVFQPKSQIDERGAALDMLRQLDYSQPYIVMMDRGYESFNMIENCNRLKNCYYVIRTKIGQGGIKEIKNLPDEFCDKNISCRITISNHYYTLHHKTENLHIVFHPKHHYKKKFAKGTQDARWDFEDFCNVNFRACKIRINDPDTNKEEWEVLVTNLDRQEFPLERMKELYHLRWGIESSFRKLKYDLGSVQFHSKQDHFIEMELYAHMIMFNAVSQTTVQAYVPQRHCKYHYIINFKIACLIVQKRYKVSSNDQNFAGILVRISRHTIPIRPGRKDKRNLKVKSSVSFMYRVA >NZ_CP017706.1|WP_056940277.1|1150829_1151021_-|CsbD-family-protein MSNMDSGLKDKIIGKAKEVEGKLTGDKLREVEGKAQKTKGKVKAKAKKVKDDIEADHQIDEDC >NZ_CP017706.1|WP_056940278.1|1151166_1152045_-|ROK-family-protein MAEKKYVGSIEAGGTKFIVAVQDVETGKEVARDRIPTTTNKETLQKTADFFKKHPVDALGIGIFGPIDINPKSRTYGYILDTPKPGWSGTNVKGFFEKELGIPVAMTTDVNASCYGEYVARGRDDSKSYFYATVGTGVGAGIVQAGKLLGLNNHPEMGHMLVRRYPGDDYKGHCPFHNDACVEGMAAGPSLEGRTGIPGEKLSRDNKVFTYSVYYIAQMLFNVYMTARPDVMVVGGSVLNEDDLVKVRKFFNEFNNNYVATPDLDKLIVRPAVANNGSATLGDFELAKNLLK >NZ_CP017706.1|WP_056940279.1|1152163_1153093_-|DegV-family-protein MKIAVLTDSSAYLTKEQQEKYHIDVLPIPIIWGDKTYRDMIDIGYGEFYKKLADESELPSTSQPSPGDLQKRIDEYVEQGYTDVIVITLSSGISGYYSTVKSIANSETRIKIHPFDSKITCAGEADYAMLAGSLVEAGADVDLIMHDLSDLQKTMDVRFMVDNLSHLKRTGRLSNAASFVGTLFKIKPILSMDVQDEGKISAIAKERQTKRAYKHVQNDFDNLTKNMPYNIQCTIFDSLDPDKKEEWIEDYRAKFPRYKFDESIIGPVVGVHVGQGTMAMIWCRDLDDYFDKNGKPIEEINSEEVVDKA >NZ_CP017706.1|WP_056940280.1|1153196_1154144_-|phosphate/phosphite/phosphonate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKFKKVLVGALAVLATVSLAACSNNQKSSSSSSNEPKELNVEFVPSTQANKMEAKAKPLGTLLQKQLHIPVHVTVSTDYSGLVEAMSSKKVDVGFMPPYSYILAHKRGIADVLLQAERYGYDEPSGKMNHTLMHKYRGMIVVKKGSKIKSWKDLKGKKIAIGDPSSASGYVYPVAELYKKGLNVTKECKLVNIKGDDQEVLSVLNGDVDAAFVFSDARNIAAQDDKKAMTDVVPIYFTKWISNDTIAVRKDMPKKFRAKLSKAFKNIAKSKKGRKIIESIYNHYGYVDAKDSDFDVLRQYQKIVNKATGGSSNNN >NZ_CP017706.1|WP_056940281.1|1154369_1155764_-|replicative-DNA-helicase MDNIVSQQIPHDSDAEKAVLGAIFIDPEAIADASAVVQPEDFYERANQIIFQAMLDLSDRRDAIDPLTLQDELNKRNQLDDIGGIGYVSELAMSTPTAAHVNFYAQIVHRKALLRRLISASQNIITNAINGSDDVTDILDDAESEIMNVSSENNTGGFRSIKEVVNSTINDINNLPEDNNMVTGLPTGFYELDKMTTGFHDDELIIIAARPGVGKTSFALNVAQYVGLHTDKSVAMFSLEMSGEQLVQRMLASEGLIDSQHLRTGQLDQEEWHNLVMAAGSLAGTDIFIDDTPGIKMSEIRAKSRRLAKEKGNLGLVVVDYLQLIEGPRSESRQQEVSAISRQLKKLAKELHVPVIALSQLSRSVEQRQDKRPVLSDIRESGSIEQDADIVSFLYRDDYYRDESEDGENSGSSSEVGAEDDNGEVEVIIEKNRSGSRGTVKLMFSKPYNRFSNLDYAHDDPDGN >NZ_CP017706.1|WP_056940282.1|1155793_1156249_-|50S-ribosomal-protein-L9 MKVIFTQDVRGRGKRGQVKEVPDGYAQNYLIKRGLAKAATKGNMNTLKRVEANEKAAYEAEKAEAEKIKAELEKDSTIVNFKSKAGNDSRLFGSISSKRIVEGLEKQYGIKIDKRKLNLPEPIKTLGYTNVHVKLFKGVEGTIRVHVTEQD >NZ_CP017706.1|WP_056940283.1|1156263_1158285_-|DHH-family-phosphoesterase MKDFLHKLELPEFIKDSRLTASMIIILSLSLLGSVITMIMNPLFGLAMVLIFILTVAFAIYGTYILAGNANNFAVNLSYRIKRSEQEAMIKMPLGILLYDSDHQIQWVNPYLQLYLKDTDLVGHTIEAVDPDLNKLLNEAIEAKTSENHIVDWDGHRFEMVVQDNLGVIYLLDITRYAKIEDKYKAERLAIGQIFIDNYDELSETMHDQELTSMSSYVQNTLSNYAKKFKAYLKRIDEDHFLLLVHMQDLAEMEKDKFSVLDKVRQETSRNNTPLTLSMGIAFGSDSLSEIANQAQSNLDLALGRGGDQVVLRQPGKDARFYGGKSNPMEKRTRVRARMVSQAISELFKDADRVFVVGHQRPDMDSVGSGIGVVKLARLHGVKANFVLDTNKTNYDVGRLVTRMQQKNQDKDIFISPEEALSKVTDKSMLVMVDHSKYSITYSQPLYDRLKNRIIVIDHHRRGEEFPENPMLTYVEPYASSACELVTEMIEYQQPANGKRVLTDLEATAMLAGIVVDSKEFSLRTGTRTFDAASYLRSIGADSAVVSMLLKEDIDSFLERTHLVATLKMVKPHMAVLCGPDDKIIDPIITAQAADTALDLENVGASFAITRRSSDTIGISARSMGKINVQIIMEKLGGGGHLSNAATQIKGVTIEEAKQKFLKAIDEYEEEND >NZ_CP017706.1|WP_003549366.1|1158453_1158690_-|30S-ribosomal-protein-S18 MAQQRRGGRRRRKVDYIAANHIDYVDYKDVDLLKRFISERGKILPRRVTGTSAKNQRKVANAIKRARIMGLLPFVAED >NZ_CP017706.1|WP_013436847.1|1158718_1159240_-|single-stranded-DNA-binding-protein MINRVVLVGRLTRDPELRTTGSGISVATFTLAVDRQFTNSQGERGADFISCVIWRKSAENFCNFTSKGSLVGVDGRIQTRSYDNKDGQRVYVTEVVVDNFALLESRKDREARGQNGGYTPNNGNNSTPSTNNFQNNGGSQNNNPQNNNNQNNAQDPFAGSGDTIDISDDDLPF >NZ_CP017706.1|WP_005723612.1|1159285_1159582_-|30S-ribosomal-protein-S6 MATTKYEVTYIIKPDVDEDNKKALVENYDKVIADNGGTMVESKDWGKRRFAYEIDKYREGTYHIMTFTADNADAVNEFSRLSKIDNAILRSMTVKLDK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017706_2 | 1644924-1645106 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017706_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP017706_2
>2.1|1644948|60|NZ_CP017706|PILER-CR CCTCCTCTGATTGGTCCATTGGAGCAGTGGCTTATCTCGCCTCCCTGTCACGGAGGAGAT >2.2|1645032|55|NZ_CP017706|PILER-CR GGACCGTTTATGGCGGAATTGGTGAAGGGGTTAACACACTGGTTTGTGGATCCAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017706_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017706_2 >merge|NZ_CP017706|2|1644924-1645106|PILER-CR CGCGCGTGGGTTCAAATCCCACATCCTCCTCTGATTGGTCCATTGGAGCAGTGGCTTATCTCGCCTCCCTGTCACGGAGGAGATCGTGGGTTCAAATCCCACATGGACCGTTTATGGCGGAATTGGTGAAGGGGTTAACACACTGGTTTGTGGATCCAGCATGCGTGGGTTCGAATCCCACAT >NZ_CP017706|2|1|1644924-1645106|PILER-CR CGCGCGTGGGTTCAAATCCCACAT CCTCCTCTGATTGGTCCATTGGAGCAGTGGCTTATCTCGCCTCCCTGTCACGGAGGAGAT CGTGGGTTCAAATCCCACATGGAC CGTTTATGGCGGAATTGGTGAAGGGGTTAACACACTGGTTTGTGGATCCAGCATG CGTGGGTTCGAATCCCACAT
>NZ_CP017706.1|WP_056939922.1|1644257_1644758_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIIKPLISEDEAKETSRLFQKCWQNTYKDILPDVFLDNITENAWVKRLNESGRHNLIFIDDDNKIRAAVSYGRPRDTRMLGCGELMALYVEPDFQAFNIGKTLLNAAENELKKMGYGKIYLWCIDGDENARQFFEHFGWVNNATEKFVEIAGKEYKYLLYQKNLHD >NZ_CP017706.1|WP_056939924.1|1642226_1642673_+|hypothetical-protein MINNWVSSSKELQLLVDDYLLTVNYRSVIENDLVNYTQGIESYFRNERLTLRDKINKFIEELPESYRELLSEHVGNTDDWIGKLVSTRVFLTHGDRENMAVSNPYKLVQMTKIFGFMVIIFILQKLGITIDKPKILNKFKNVLTTHYY >NZ_CP017706.1|WP_056939925.1|1641814_1642015_-|cold-shock-protein MQTGTVKWFNADKGFGFITGSDGKDAFVHFSSIKTDGFKSLEEGQKVRYDVEQGKRGPQATNVVPQ >NZ_CP017706.1|WP_056939926.1|1638992_1640345_+|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD MKKNQIVDLEITDLSYEAMGVAHYEGLTVFVTNALPGEIVSAKILKVKKNFAFAKIEKIKKESPDRVKIKLNQWVQTGLASLAHIKYDKQLEFKRNQVVNLLKKAHLDDIEVGQTLPSPEQTGYRNKAQVPVREINGQLEIGFFRRHSHDLVPLTNFFTTDPEIDRVLVTVRDILRKYRVPAYDEINHKGEVRYLDVRRSKATGEIMVILVCLHNDFPQLLGVAAEVSQIPGVTGLILNHNPKKTNVILGKKDYLVFGNDQITDQIGDLKFRISPQSFFQINSLQTPRLYDLAIKKADLKPSDVVIDAYSGIGTIGLSVAKHVKAVRGIEVVRDAIKDAKDNAKLNDIDNAKYYLGKAEEIMPRWAKQGLKTDVVFVDPPRKGLTPEFIDATAKTGPEKVIYISCNPATMVRDLQLFQEKSYEFNRIDPVDMFPQTPHVEAVTVLERTEK >NZ_CP017706.1|WP_056939927.1|1637247_1638624_-|Na+/H+-antiporter-NhaC MEKKKVSFAESIIILIVLLAILGVSVIKFGLSPEVPVLFTVLLLTFGARLRGFSWQDVQNGIKEGIGVAIIPIFIFMLIGALIGVWIKAGIIPSIMVLGFNMISGSFFVPSVFIVCSIVGVAIGSGFTTISTVGIALFGIGSSMGANPALVAGAIISGAVFGDKMSPLSDSTNLSSAVAESELFSHIKNMMWSTIPSFVVSLILFWILGNSGHMDPTKIERTSQVLQNNFTISWWALLPIVLMLICAWRKIPAIPTLFMNIAITVVMIFIQSPHESAQSLNNLIMNGFVAKTSDASVNALLTRGGISSMMATVALIISTLSLGGMLMKFNIVQSAMEPLVKHLNKPGRLITVTILSGICINLFVGEQYLSVILPGRAFKPAFDKIGLSPLALSRVLEDGGSVINYLIPWGVAGSFAASALGVPVLQFLPFVFFSLLSPVFSIFSGVTGIGLKRAKKDK >NZ_CP017706.1|WP_056939928.1|1636848_1637196_+|hypothetical-protein MDKKYTDSEVRGERSDHPDKSYAADEVRKLFFTENAKKKYDILTGSQKTFIDRELDDLRLSRSSSVSRKDNSELQQEIVFEEQNNQVIVTDILYDDYRNSKEYKKAQVRMYDMNN >NZ_CP017706.1|WP_056939929.1|1635998_1636709_-|Bax-inhibitor-1/YccA-family-protein MDNMNFSSPERRQVHDVSEVNGFLSKMYGYMGLAVLVSAITAFLTMTVFRAAVMQMPTALMWIILIVPLGLSMGISFRATRNPVAGFVMLMILAVIYGFEFALLAGFYTGAQISTAFLSSAAVFGAMAIFGTFTKRDLNNLGSYMGAALIGLLVAMIVNIFLRNSVASFVFSIIGVIIFTGLTAYDAQKMKSIYNNYGSQVPTNGLAVLGALQLYLDFINIFLFLLQIFGMGNDRN >NZ_CP017706.1|WP_056939930.1|1634744_1635149_-|hypothetical-protein MTKSQNIIRIHEVMTPLSLSEKDETILDQFENVLLSDNVYYPFQPVKHINQVFIENINEQLLKDFAFKNKSRKLILDRLISISYKYLAKNRRDDISYSQIKKNWLNLIQICFNTYHYQYHPERLLNKIKEANQM >NZ_CP017706.1|WP_052542872.1|1633657_1634578_+|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MTSKARLIYNPVSGHEQMPKNVADILDVLEQAGYEASAFRTTPEQNSARNEATRAAKEGFDLIVAAGGDGTINEVVNGIAFLDKRPKMAIIPAGTTNDYARALAIPRDNIPDAAKVILKNKTRKMDIGKAVFGDQTQYFVNIAASGSLTELTYGVPSEVKSALGYAAYLIKGAEMLPHLTENEMRLTYDDGVYEGKLSMFLLGMTNSIGGFEQVMPDAQLSDGLFQLIVVKPSDPVSMMKLMALALNGKHVDDPNIIYTKTRSLKAELIGKNAGRDLPVNLDGEIGGYCPVEFHNLQQRIEFYVGK >NZ_CP017706.1|WP_056939931.1|1632201_1633632_+|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatB MNFKSTIGLEVHFELKTKSKIFSPSPVTYGAEQNTETNVIDWAMPGTLPMVNKNVYRLGIMVALATHAHILPTTHFDRKNYFYPDNPKAYQITQFFQPLARDGYIEVEVRGKKKRIGIHEMHIEEDAGKNTHGTNGFSYVDLNRQGVPLLEVVSEPDMEDPEEAYAYLEKLRKIVQFTGASDVKMEEGSMRVDTNISIRPAGQKELGTKVEMKNLNSFDHVRRSLAYEEKRQEQVLLAGGHIQLSTRRFDEATGKTVLERVKEGASDYRYFPEPDIAPDHISQEWIDQIAKELPKSPFDRYDDYVNKYGLKPYDANVLLQTKESSDFFDAAVAAGADPTLAANWMNTQVNGYLNDHRVSLNDIKLTPEHLAEMIKLIKDGTISSKIAKKVFAETIANGTDPKKYVEDNGMVQLSDTSVLAPMVKKVVDDNPQSVEDFKNGKDRAIGFLVGQIMKQTRGKANPKMVNKLLNQELQSR >NZ_CP017706.1|WP_056939921.1|1645254_1646721_+|MFS-transporter MNKKQITMVTIALMLGNVMSGLDGTIINTAIPTIVAALHGIQFMGWIVAIFLLGMSISIPIWTKIGEKITNKKAFEISLVLFVLGAALQGIVPNIIFFLCSRFIMGIGAGGMGSLPYIIAGYVFKNIKTRTKVLGYLIASWNGAAILGPLVGGWLIDAFSWHWVFYINIPIGLIALIICLIYYKPVTPEKTPVFDIPGAGLLVIGLLLFLMGIQLVGLTANWIVISLIIISLVFIVLFFIRENHAANPIIPVSLFKNKDLDGDFLLFAFTWGAFIAVNTYMPMWAQALLGLSALLGGMTLIPNSIVEIIASQSVAAIQEHMSTFKLALIGIIAMMISSAGLFLADIHTPVQMLTFIGAFSGIGVGFIFVAMQLKVQLDAGLKNMATATSTSYLIRILAQTVMAAVYGVIMNLNLASGVHTYKGITMAMMNKLSDAKSAKLLPQELVPTMRTIFHAGIKEIMLVSLILLIIAFVLNFYFNFGKKRKKLQ >NZ_CP017706.1|WP_056939920.1|1646728_1647241_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MNMKSLHTQQHIEKALFYLLQKKPYAEISIAEITRKAHVSRTSFYRNYSQKNDVLMLFLANQYKKFIVDINEHKLKTLTKQLVAYLTFFKGNPKVMKILLDAGFEGSLLNFQTRYLKKLLNVYHPDLNLPDYAIAYQSGGIYMLLIWWVKQDYATPLEDLINYAEKHIML >NZ_CP017706.1|WP_056939919.1|1647350_1649123_+|oleate-hydratase MHYSNGNYEAFVKAEKPKDVDQKSAYIVGSGLAALASAVFLIRDGQMKGNRIHIFEELSLPGGSMDGIYSKEKESYIIRGGREMEPHFECLWDLFRSIPSTEHEGESILDEFYRLNRKDPSYAKTRVIINRGEALPTDGQLLLTPKAVKEIVDLCLTPEKDLQNKKINEVFTKEFFQSNFWLYWSTMFAFEPWASAMEMRRYLMRFVQHVATLKNLSSLRFTKYNQYESLILPMVKYLKSHGVQFHYDTVVDNIFVNRSNGEKVAKQIILTEKGERKTIDLTENDLVFVTNGSITESTTYGDNFHPAPEEHELGASWQLWKNLAAQDSDFGHPDVFCKDIPKANWRMSATITFKNDDIVPFIEAVNKKDPHSGSIVTSGPTTIKDSNWLLGYSISRQPHFKAQKPNELIVWLYGLFSDTKGNYVEKTMPDCNGIELCEEWLYHMGVPEERIPEMAAAAATIPAHMPYITSYFMPRALGDRPKVVPDHSKNLAFIGNFAETPRDTVFTTEYSVRTAMEAVYTLLDIDRGVPEVFASAFDVRMLMNAMYYLNDQKKLEDLDLPMGEKLAIKGMLKKVKGTYVEELLKKYKLI >NZ_CP017706.1|WP_082589015.1|1649311_1649788_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MYMKAFPAWERFSMFSLLAMSLHRNVKFHAIYDDGKFCGITYYAENDNTVYLTYLAVSEKLRGQGYGSKILTMLEDNFPDKQIVIDIEPVTKKVKNYKQRVSRLKFYERNGFHRTDQKLKDPDGEFEALTTGERLDKNSFIKTLRQMSFGFYQARVEK >NZ_CP017706.1|WP_056939943.1|1650383_1651199_-|PTS-system-mannose/fructose/sorbose-family-transporter-subunit-IID 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1439 : 73642
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017706|1439:73642|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase,integrase | attL 20809:20834|attR 23938:23963 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
204807 : 406849
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017706|204807:406849|DBSCAN-SWA 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200 | Lactobacillus_phage(48.31%) | plate,terminase,tail,capsid,portal,integrase,tRNA,transposase,protease | attL 303827:303886|attR 345942:346030 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
552179 : 618090
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017706|552179:618090|DBSCAN-SWA 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56 | Bacillus_virus(22.22%) | tRNA,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
638252 : 702136
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017706|638252:702136|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
841045 : 914865
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017706|841045:914865|DBSCAN-SWA 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59 | Chrysochromulina_ericina_virus(11.76%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1051168 : 1122444
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017706|1051168:1122444|DBSCAN-SWA 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50 | Lactobacillus_phage(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1125534 : 1179170
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017706|1125534:1179170|DBSCAN-SWA 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48 | Bacillus_virus(30.0%) | tRNA,transposase,integrase | attL 1125437:1125496|attR 1134996:1135963 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1281592 : 1386435
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017706|1281592:1386435|DBSCAN-SWA 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107 | Bacillus_phage(14.29%) | transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1400759 : 1456645
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017706|1400759:1456645|DBSCAN-SWA 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46 | unidentified_phage(30.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1471894 : 1549318
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017706|1471894:1549318|DBSCAN-SWA 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60 | Streptococcus_phage(23.08%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1566731 : 1612881
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017706|1566731:1612881|DBSCAN-SWA TTTAAAATACAGGATTAATAGAGGCTTGATTCCGATATTCTTTCGGAGTTAAGCCTTTTAATCTGCTCTTTATCCTTTCTTCGTTATAGTATTCGATATATTCTTCGATTGCTTGAGCTAATTCTTGAAGACTATGGTACTTGTATTCTTGATCATAGAACATCTCTGTTTTGAGCAAGCCAAAGAAGTTTTCCATTAGCCCATCATCCATGGAATTACCTTTTCTAGACATGCTTTGAGTAATACCATGAAGCTTTAAAGCACGCTGATATCTTGGACTTTGGTATTGACAGCCCTGATCAGTATGAAAGATGCAATTATTAAGAGCCGTTTCCTTGGCCAAAGCCTTATCAAGCATTGTCATTACTAACTCCATGTCTGGATGTTTGGAAATAGTGTAAGAGACTATATCGCCTCCACAACCATCCAAAATAGGTGATAGATAAAGCTTTTCATCATTGAGATGAAATTCAGTAATGTCAGTGTACCATTTCATGTTGGGCATTGGTGCAGAGAAATCACGACGAATTAAATTAGGGGCTATCTTGCCAATAGTTCCCTTGTAGCTTGAATATTTACGCTTGTTGCGTCTGATACCCTTAAGACCCAATTTATGCATCCAGTAACGGACTGTTTTCTCAGTAATATTCCAGCCTTCTTTTATTAACTGGAGTGCCACTCGACGATAGCCATAGCGTCCTTTCTGTTTGATAATGACATTATACCCGTTTTCCTTATATTCTCTAAGCCAAATACTGAGTGTGCCAATACTCTTAAGCCCCAGTTCTAGTGATACTTGTACATATGACTTGGTACTGAAAACAGCTTGCTCAATTGCTTGTTCTTTAAATTCCTTAGAATAAACCTGATAAGGCCTATCTAAAACATTGATTCTATACATATCAATTAATCTAAGCATGTAATCCAAATTAGCTACATTCGTTTTATATGTTTTAGACAACTGACTTATTGAAATCTTTTCATCTTCCCATTTACGATAAATTTCTATTTTCTGTTCTTTATTAAATTTAGACATAGAAAAAGACCTAAAAGTGTCTCACTTTTAGGTCTCACTTCATTTAGATGCTGATAAATCCACCTTTTTCTTTTTGAAATATAAAAACAATTAAAATAAATCCGGTTTTTCATATGTACAAATGCAGATTAACATCCAAATTGTTAGCGGTAACATACACATTCACTATTGTTAATGAAAGCGTTTTAATATACGCTTATTCTGAAATATTCAAATAGGAGGAAGCTATAATGTATAAAAATAAAAACCGTTACAGAGGAAGTAAATGCGTATTTGTTTGTGCATCAGCCATTTTGAGCCTTTGGCTTGGTGCAACTTGGACTAACAATGTTAAAGCCGCTGAAGTTGACGCAAATCAAGCAGCAAATAACACCGAACAAACACAGCAAAATACAAATCCTGCAACGGCTAATAACCAAGATAAAACAAAAGATGTAGATAATCAAGCTACACTTACTGCAAATGAGCAAAATAATGCGCAACCAGCAGCAAATGCAGAAGGTAGTAATTCGGCTTCTGCAACACCTCAATCTGATACAAAAACGGTAAAGAACACAACTAAAGTTGTTGTTCACTATCAAGGTGATGGTACTAAATGGGTACCTTATGTATGGGGCAAGAATCCAAACAGTACTGGTGTTCAATATAATTGGGACGGCCAGGATAATTATGGTTATTATGCCAACATTACAGCCGATAATGATGAACAAGAAGTAGGGGTTTTGATTAAAGGTACAGACTCCTGGGATAAAGATGGTACAGGTGCCGACCGTTCATTGACTGTTGACGATAATGGTAAGGCTGAAGTTTGGTACAAAGAAGGTTCTGATGATAGTCAGGATGTAACTCCAAGCTATAATTCAGCTAAAATAAAAGTTCATTATCATGGTAATACTGATGCAACAAGTCTTAATTACTGGACTGATACTGATCAAAGTAAAAAGACAGTGTCATTATCGAAGGAAGACGATGATGATGAAATTGGTGACTTTGATTTGACGGGCCAAACATTTAGCAAGATTTATGTTTCACCAATTGGTAGTGACACTGAGACTAGAGAATTTACTCCACTTCCAGGCGATGGAACTACTGATATTTATTTAGTAAATAAAGATACAACGGCTTACTACACACCAAGCTTTGCTTTAGCACCAGAAAGCTTAGCTTCAGCTTCAATGGAATCAACCAATATAGTAGATATAAAGACTGCTAAAAAGATGACCGCAGATGAAGCTAAAGCTATCTTACAAATGAATGATAATAAAGTTGTTGATATATCCGCAGTTGACGCTGATCAGGATGGCAAGAGTAAAGAATTTAAGATTACCACAGCTAAAGCTCTTGATATTTTAACTAATAATCAAATTGGAATTTACAACAACTTCAGGTCTATCGATATTGGCAAATACGTCAGATCTGATGAATTCGATGCCCAATATTACTATGGCGGCGATGATTTAGGTGCAACTTACACTCAAGCACAAACCCAAATTAAACTTTGGGCACCAACAGCTAAGAAAGTTGTTTTGAACTTATATAGCCCATCAGATAATGACTCAGCTGCAACTAAGACATTTGTCATGACTCGTGGTGATAAGGGCGTTTGGTCAGTATCTCTTCCAGGTGATTACAAGAATTGGGCATATGATTACAGCTTAACCTTCGGTGATGGTAGCGAGACTAAAAGTAATGATCCATACTCAAAGGCAGTAACCATCAATGGTGATCGTTCAGTTATTGAAGATTATGATGCAATTAAACCAGATGACTTTAATAGAATGCCTTCATTCTCAAGCCCAACTGATGCAATTATCTATGAAACCAGCATTCGTGACTTTACGAGTGATCCAAACTCAGGTATTAAAGATAAAGGTAAATATTTAGGCATGATTGAATCAGGCGTAACTCCTGATGGCCAGGTCACTGGTTTGGATTACTTGAAGTCATTAGGCATTACTCATGTTCAAATTATGCCAATGTTTGACTTCGCAAGTATTGATGAAACTAAGAATGATGGAACTTATAATTGGGGTTATGATCCTAAGAACTATAATGTTCCAGAAGGAAGCTATTCAAGCAATGCAGCTGATCCAACCGCAAGAATCGTGGAAATGAAAGAAATGATCAACGGTTTGCACAAGGCTGGTATTAGAGTAATCATGGATGTTGTTTACAACCATGTATACTCACCAAACGACCAGGCCTTGCAAAAGACAGTTCCAGGTTATTACTTCGAATACGATGATGATAACAATATGGTAGCTGATAGTGGTTGTGGTAATGATACTGCCAGTGAACGTCGGATGATGAGAAAGTATATCCTGGATTCAGTTAAATACTGGGCTGAAAACTACAACATTGATGGCTTCCGCTTTGATATTATGTCATTGCTTGATACTACTACCATGAATGATATTCGGGATGAATTAAATCAGATTGATCCTGGTATGCTTCTTTATGGTGAAGGCTGGGATATGCGAACCGCCAAGCGTGAGATCGGTGCTGGTCAATACAACGCAGATAAAATCCCTTCAATTGGCTTCTTCAGTGATGATATTAGAAACTCAGTAAAATCTGATGAACCAAATTACGCTCCAGGTTTGGTTATCGGTGATGGGAAAGAAGAAAAGTATGAAGCTGATGCTAAGAAGTTTATTGCCAGCTACTTGGGCGGTAAGGACTTAGCAATTCCTGGTGTTACTTGGCAGATTCACCCATACCAATCACCAAGTCAAACTATCAACTATGTTGCTTGTCACGATAACCGTACTTTGTATGACTTGTTGAAGTGGGCTTTACCTAAGGAATCTGAAGCTAATATTATTAAGCGTGATAAATTAGCAACGTCAATGATCATGTTAGCAGAAGGTGTGCCATTTGTTTATGGCGGCCAAGAAGCTTTAAGAACTAAAGATGGTAACAATAATAGTTACAATGCTCCAATTGAAGTCAACGAAATTAATTGGGAACGTGTCAAAGACAATCAAGATCTTGTTAACTACTTCAAAGAATTAGTTAATGTACGTAAGAGCCAACCTGCCTTAAGATTGAACAATTATGATGAAATCGCTAAGACAGTAAAGACAGTCAATGCTGGTGAAGGTGGTATCTTTACTTTCGCTTACAAAGAAGATGGCAAGACACTTTATGTAGTATTTAATGTTAACGATAGTAATGCTGAATTGAATGATGTTGATTTGTCTAAAGCTGATAAGTTGCTAGACAGCGATGGAAATGTTGTCTTAGGCAAGACTACAACATTGATGCCACTTAGCACGTTGATTGCTGTAGTTCCAGATGAAACTCCAGTAACCCCAGAAAACCCTAGTGATACTGGTAATACTGGCTCCATCACTAATACTGGTTCAGCTGATTCATCACAAATTCAAGGCAATGGTGATACTGATAAGCTTTTACCAGCTCTTGATATTGTTTTGCCTCATAATGCTTATATCTATCAAAATGATGGAATTACTACTCTTAAAGAAAATGGTAAGAACATTGTCCTTAAATTGGGTAAAACTATTCATGCTATGAACAATGGTCAAATCTTTACCTTCAACGGTAAGAAATTCTACCAAATTGGAGAAAATGAATACGTCAAAGTTAATAATACTTTGAAACGCAAAGTTTTGATCCATAACGCTTTTGTTTACACAAAGAGCGGTAAGGCCATTAAGAAAGGTCACAAGCATATTGTTCTGAAGAAGAAGAGCACAATCTTAGCACTGGATAATGATAAGATTGTTACTATCAAAGGTAAAAAGTTCTATCGCATTGGTAACAATAAATATGTCAAAGTTGCTAATGTTAAAAAGGATTAATTGCTATTCATAATCTTTTCTCCACATATTACAAAGCTCTGAATCTAATTAACCATTTACTTAATACATAAAATTGCTTTGGAACAAAAAGGTTTAATTACTGTTATGGAATTAAACCTTTTTTTATTTCTTGATTTTAA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36 | Bacillus_phage(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1793458 : 1836115
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP017706|1793458:1836115|DBSCAN-SWA TTTAAAATACAGGATTAATAGAGGCTTGATTCCGATATTCTTTCGGAGTTAAGCCTTTTAATCTGCTCTTTATCCTTTCTTCGTTATAGTATTCGATATATTCTTCGATTGCTTGAGCTAATTCTTGAAGACTATGGTACTTGTATTCTTGATCATAGAACATCTCTGTTTTGAGCAAGCCAAAGAAGTTTTCCATTAGCCCATCATCCATGGAATTACCTTTTCTAGACATGCTTTGAGTAATACCATGAAGCTTTAAAGCACGCTGATATCTTGGACTTTGGTATTGACAGCCCTGATCAGTATGAAAGATGCAATTATTAAGAGCCGTTTCCTTGGCAAAAGCCCTATCAAGCATTGTCATTACTAACTCCATGTCTGGATGTTTGGAAATAGTGTAAGAGACTATATCGCCTCCACAACCATCCAAAATAGGTGATAGATAAAGCTTTTCACCATTGAGGTGAAATTCAGTAATGTCAGTGTACCATTTCATGTTGGGCATTGGTGCAAAGAAATCACGACGAATTAAATTAGGGGCTATCTTGCCAATAGTTCCCTTGTAGCTTGAATACTTACGCTTGTTGCGTCTGATACCCTTAAGACCCAATTTATGCATCCAGTAACGGACTGTTTTCTCAGTAATATTCCAGCCTTCTTTTATTAACTGGAGTGCCACTCGACGATAGCCATAGCGTCCTTTGTGACGATTAAATATTTCCTTGATCCTTGCAATAAGTTTGGAACGCTTGGGCTTCTTAGGCTTTCGTTTAATTATTTTATAGTAAGAACTTCTGGCAATCGTAGGCAGCTCTGGATGCTCTGAAATTGCATCTAAGACATAGTTCAAGCTAACCTTAAATTCATGCCTTAGATCAGTAATTGCCTTAGCTATTTCTTTCGATCTTTGTCTTGATCCAAGGCCTTCAGTTTTTTTACGTATTCGTTCACAATACGCAATCGCAAGTTTTCTTCTTTCAGCTTTTGGATCTCTTTCTCCAATTCCTTGCGTGATTTTTGAGTCTCTTTGATCACGGGCAGGGCGTCCTTTCTGTTTGATAATGACATTATACCCGTTTTCCTTATATTCTCTAAGCCAAATACTAAGTGTGCCAATACTCTTAAGCCCCAGTTCTAGTGATACTTGTACATATGACTTGGTACTGAAAACAGCTTGCTCAATTGCTTGTTCTTTAAATTCCTTAGAATAAACCTGATAAGGCCTATCTAAAACATTGATTCCATACATATCAATTAATCTAAGCATGTAATCCAAATTAGCTACATTCGTTTTATATGTTTTAGACAACTGACTTATTGAAATCTTTTCATCTTTCCATTTACGATAAATTTCTATTTTCTGTTCTTTATTAAATTTAGACATAGTAAAGACCTAAAAGTGTCTCACTTTTAGGTCTCACTTCACTGCTAAATAGTAGTCTGATGCTTTTTCCTTAATAATGGCATCCTTTTCTTCTAGATCGATTCTGGTTACTAGATGATTGAAGTTAGCGTAACCGTAGGCAGTACGTTCAATCTGTTTAATCTTACGGTTGGTTCCTTCAAGGCAACCGTTTGATTCATCGAACTTAGCAGCGTTGAGAATATCATGTAGATTACGTTTGAAAGTATTTAAAGTGGTGTGCATCATATTGCCAACATGATCTTTGCTTTGAATTAGGCTTCGTAACTTCTTTGTATCTCTATCTTTTAAAGCTTTACTGATATCTTGCATAAGGTTATAAGTATTTTCAAGCTCATTGTTTAAAGAAAGCCCATCAGCCACGATTTGTTCTTGAGTTAGGGTATCTTTTAATCTGGATTGATAGCACGGCTTAACTTTTTCCAGGTCATCAAAAGGCTTAAGATAAAGCTTCCAGTAATATTTAAGCAGGTTGTATTCCCATGAACCTTTTTTGTGCTTCTTCATTTCTTGAATGCGACAGGAATTAAAGGAACGGTTAAGCATCTGAACGATATGGAAACGGTCGAGGATTACTTGAGCATTAGGAAAAAGCTCCTTAGCCATAATGTCATAATAGTAATTAAGATCCATAGTTACAGTCTTAACCTTGTTTCTTACGGTTATTGGGAAACGTTTAAAGTAATTGATAATATCTTTTTTTAATCTGGTAGGCAGTACCTTAACTATTTTGTGCGTGTGACCATCAATGGCAATAAAGTGCAGCTGCCTGCCAACGCCTCTGAATTCATCAAAAGCCAGGTATTCCGGCAGCCAGTCAGTATCTTCAAAGGAAGACGGACTATATTTCTCTAGTACGCGTTGCACGGTATTGGTTGAAGTTGAAGTTTGTCTGGCAATGCTCTTCATGGACCAGTCTTCGGTTAAAGAGCCAATAATTTTACGCTTGGTGGCATTAGAAATACAGCAGTATTTATCTACTAGTTCTGTTTGAGCCATCGAATTTGTCTGACAATCACGGCAGATAATTCTTTCTTTAGCTATTCTGATAAAGACGGGCAGACTAGCATCTAAAGCAGGATAACGCACATTAGAATACAAATGACCGTTATGTACGATGTTAGCGGAGCCACAGTTTAAGCAATGGTCTAAATGTACAATAGCGTGGTAGAACTTGGCTTTACGATTGCGGTATTTGCCAGTTGAGATATCAAAAAATTCTAACAAAGGGTCTTTAATATTCAGAGAAAATTTAATACAATCATTATAAGAGGACATAAGCAATTCACCTTAATTTCTAAAGAGTGGTATCAAAGGACATTATGCAGTGAGGCTTGTGCCTCTTTTTTAATGCAAAAAATCCTATTGATAGAATATCATAGAAATCTATCAACAGGATTTATCATAGAACCAAAGAAAATAGCTTCTGCCAGTGCAGAAGCTATTTTCTTGCGCCTTTAAATAACGGCTTACCATAGCAAAAATAGTAATCGATATAGAAATATAAACGCTTTTAATGACAAATAATAACGCTTTAGCACTTGTATTTTGACCAGGACCAAGTATAATAAGAGTTGGAAGTTATGATTGAACGGATTATAACTTCTGAATATTCAGTCTCTGCCTAATAATTCCTTATTACTTAATAAATACAAACTTTATAGCAGAAGATACATCTATATCTATATTACTTTCTAGAGAAGCAGTTATGAAAAATTTTCATAACTGCTTTTGTGTTAATTAGGATTAATTTCGAACTTTTGATTAATTGGTGGGAAGGTTGGAAGTTTAAGTGGCGTGACATGCCATTGAGTAAATAAAATAGAAGTTAAGAGGATAAAGGGAACATCCTCTGGCTTATTAATTTCGCACGTCAATACAACACCTTTATCACCCATCATGGTTTTAACATTGGCTACCTTTTTGATACCAGATCTAAAGGTATAAGTACCATGTTTGATACTACCAGTTACGACGTAGTTAAGCTGAGTGAGATAAAAAATATTAGTTCTAGGAGTGTTTAATTTTTTTACGCCAACAAGAGAGTGGTTTACCACATCAATGGTAAAAGAAGCTATCAGACCAGCACCGTCAGAAAAAAGACGGCCCACTTCCTTATTATTTATATCATTCAAATAAAGAGTATGATTGGGATTATCTAGGTTGCCTTGAATAAAGAATTTAACCTGACCATTAGAAGCAATGACAGGTATTTGGCCGTAATCCTTTTCTTGATTAAGCTCTAACCAAAACAACATATTTTTCACCTCTATTTTTGTTGATTATCTTTAATGAATTGATTAAGAATATAGGCTACTCCATCTTCATTATTATTCTTGGTGGTAACTTGAGCGATGTCTTTTATTAAAGGAATCGCATTGCCCATTGCTACGCCGACACCTGCTGCGCGAATCATGCTTTCATCATTTAGATTATCTCCAATAGCGGCGATTTCGTCTTTTTTAATATTTTTTAATTTGGCATAATCCAGCAATGCAAGCCCCTTTTGTGCCTCGTCCGCATTAATTTCAATATTTGAAGATGAGCTAGAGGTAATAACTAGGTCGCCTAATTCGGCGATTTCTTTTTTTACATCGGCAAAAGCTTCGTGTCCGCGTGAATCAAAAGCAATAAATTTCATCACTTCGATTTCGGGATCAGCCAGCAATTCCGTAAAACTAGGAACCTGCTTCATATTCATAATTGTTTTATTACCGGCAGAAATTGCGACAGCTTGACGGAAGTCGAGCAGAGGATTTAAATCAACCATCAAGTGCGCTACATTAGTAATTCGTTGCTCTAAGTTTTCACTATAAACTTGATTTTCGGTAACGACTTCAAAGTAAAATCCAGCCTTATAAAGGAGGTTAACAATTTGGATGGCCTTCTGAGTAGGGATACTGTGTTTGACCATTAATTGACCTGCTTCGTTAAATACTAGAGCACCATTTAGGTTGATAAAGCCAGTATGCAAATTTGCATCTCTTAAAATAGAACGTGATTCACGTGGGGCGCGACCCGTCGCAATCAGAAATTCAATTCCATTATTTTGTGCATTTTTCACAGCTTGAGTATTTGCTTCTGAAACGGTCATATTTGAATTAAAAAGAGTACCATCTAAATCGCAAGCAACTAATTTGATCATAAATTTCCTCCCAATTACTGTTAAATTAATGATACCATAAAGAGGATTAGAAAAGAGGGTGTAAGACTTGGCTAAAGAATTAATTGGCAATGATTGGGATCAAGTATTAGATCCAGTCTTTGCAAGTGAGAAATATCACGAACTTCATAACTTTCTAAGAGAAGAATACTCTACTAAGCAAATTTATCCTGACATGTATCATATATTCACAGCTTTCAAATTAACTCCCTTTGCTAAAACAAAGGTAGTCATTTTGGGACAAGATCCATACCATAATCCTGGACAGGCAAATGGGATGAGTTTTTCTGTCATGCCAGGTACACCACTTCCGCCATCACTTAAAAACATCTATAAAGAACTTTATGATGATGTTGGTGCACAGCCAGTTAACCATGGTTATTTGAAAAAATGGGCAGATCAAGGCGTATTGCT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41 | Bacillus_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2075374 : 2132181
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP017706|2075374:2132181|DBSCAN-SWA 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55 | Mycobacterium_phage(16.67%) | tRNA,transposase,integrase,protease | attL 2065841:2065857|attR 2098558:2098574 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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