CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP017713	Lactobacillus coryniformis subsp. coryniformis KCTC 3167 = DSM 20001 chromosome, complete genome	4 crisprs	RT,WYL,cas3,csa3,DEDDh,DinG,cas12j,csn2,cas2,cas1,cas9	0	15	23	0

1. NZ_CP017713

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP017713_1

• CRISPR_ID: NZ_CP017713_1
• CRISPR_location: 670598-670749
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers
• Cas_protein_info: cas3

Consensus repeat of NZ_CP017713_1

Consensus_repeat	Method
CCGTAACATCAGAGATTTTTTGGTACAAAAAATAACCACGTTTGTGGGGTAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP017713_1

>1.1|670651|46|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder
ACCATGTTTCTTGCGGTACGGTCTTTGCCACAAGAATGGCTATCGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017713_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP017713_1

>merge|NZ_CP017713|1|670598-670749|CRISPRCasFinder
CCGTAACATCAGAGATTTTTTGGTACAAAAAATAACCACGTTTGTGGGGTAGAACCATGTTTCTTGCGGTACGGTCTTTGCCACAAGAATGGCTATCGCCCGTAACATCAGAGATTTTTTGGTACAAAAAATAACCACGTTTGTGGAGTAGA

>NZ_CP017713|1|1|670598-670749|CRISPRCasFinder
CCGTAACATCAGAGATTTTTTGGTACAAAAAATAACCACGTTTGTGGGGTAGA	ACCATGTTTCTTGCGGTACGGTCTTTGCCACAAGAATGGCTATCGC
CCGTAACATCAGAGATTTTTTGGTACAAAAAATAACCACGTTTGTGGAGTAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP017713.1|WP_010010891.1|666309_667155_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224651
NZ_CP017713.1|WP_010010903.1|672276_673527_-|aminopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|376723
NZ_CP017713.1|WP_010010900.1|671740_671902_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017713.1|WP_010010908.1|677672_678557_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU	unknown	unknown	gnl|CDD|224131
NZ_CP017713.1|WP_010010898.1|670760_671174_+|DUF3284-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378692
NZ_CP017713.1|WP_010010894.1|667191_667551_-|DUF4828-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|374370
NZ_CP017713.1|WP_010010910.1|678993_680391_-|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD	unknown	unknown	gnl|CDD|225174
NZ_CP017713.1|WP_003677187.1|678613_678937_-|heavy-metal-binding-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|179188
NZ_CP017713.1|WP_010010897.1|670108_670447_+|PTS-lactose/cellobiose-transporter-subunit-IIA	unknown	unknown	gnl|CDD|376749
NZ_CP017713.1|WP_010010904.1|673743_674358_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP017713.1|WP_010010885.1|660071_661757_+|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|236020
NZ_CP017713.1|WP_010010896.1|668856_670116_+|DEAD/DEAH-box-helicase	cas3	mkCas0139_cas3_CAS-I	gnl|CDD|223587
NZ_CP017713.1|WP_010010895.1|667855_668857_+|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|223745
NZ_CP017713.1|WP_141707555.1|665164_666130_-|decarboxylating-6-phosphogluconate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|236582
NZ_CP017713.1|WP_003677192.1|675971_676424_-|flavodoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|180922
NZ_CP017713.1|WP_035457969.1|674541_675891_+|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP017713.1|WP_010010888.1|662558_663671_+|o-succinylbenzoate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|239433
NZ_CP017713.1|WP_010010887.1|661749_662559_+|2-succinyl-6-hydroxy-2,-4-cyclohexadiene-1-carboxylate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|274729
NZ_CP017713.1|WP_010010889.1|663684_665013_-|amino-acid-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|273332
NZ_CP017713.1|WP_010010902.1|671947_672163_-|CsbD-family-protein	unknown	unknown	unknown

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP017713.1|WP_010010896.1|668856_670116_+|DEAD/DEAH-box-helicase	cas3	mkCas0139_cas3_CAS-I	3.8e-14	46.4	0.5

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP017713.1|WP_010010891.1|666309_667155_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224651	COG1737, RpiR, Transcriptional regulators [Transcription].	2.21863e-65
NZ_CP017713.1|WP_010010903.1|672276_673527_-|aminopeptidase	gnl|CDD|376723	pfam02073, Peptidase_M29, Thermophilic metalloprotease (M29).	0
NZ_CP017713.1|WP_010010908.1|677672_678557_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU	gnl|CDD|224131	COG1210, GalU, UDP-glucose pyrophosphorylase [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	1.96711e-161
NZ_CP017713.1|WP_010010898.1|670760_671174_+|DUF3284-domain-containing-protein	gnl|CDD|378692	pfam11687, DUF3284, Domain of unknown function (DUF3284). This family of proteins with unknown function appears to be restricted to Firmicutes.	1.722e-26
NZ_CP017713.1|WP_010010894.1|667191_667551_-|DUF4828-domain-containing-protein	gnl|CDD|374370	pfam16110, DUF4828, Domain of unknown function (DUF4828). This family consists of uncharacterized proteins around 120 residues in length and is mainly found in various Enterococcus and Lactobacillus species. The function of this family is unknown.	4.42225e-28
NZ_CP017713.1|WP_010010910.1|678993_680391_-|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD	gnl|CDD|225174	COG2265, TrmA, SAM-dependent methyltransferases related to tRNA (uracil-5-)-methyltransferase [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	2.05353e-159
NZ_CP017713.1|WP_003677187.1|678613_678937_-|heavy-metal-binding-domain-containing-protein	gnl|CDD|179188	PRK00967, PRK00967, hypothetical protein; Provisional.	8.25984e-51
NZ_CP017713.1|WP_010010897.1|670108_670447_+|PTS-lactose/cellobiose-transporter-subunit-IIA	gnl|CDD|376749	pfam02255, PTS_IIA, PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIA subunit. The bacterial phosphoenolpyruvate: sugar phosphotransferase system (PTS) is a multi-protein system involved in the regulation of a variety of metabolic and transcriptional processes. The lactose/cellobiose-specific family are one of four structurally and functionally distinct group IIA PTS system enzymes. This family of proteins normally function as a homotrimer, stabilized by a centrally located metal ion. Separation into subunits is thought to occur after phosphorylation.	7.90452e-26
NZ_CP017713.1|WP_010010904.1|673743_674358_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	7.76071e-06
NZ_CP017713.1|WP_010010885.1|660071_661757_+|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase	gnl|CDD|236020	PRK07449, PRK07449, 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase; Validated.	1.17394e-155
NZ_CP017713.1|WP_010010896.1|668856_670116_+|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|223587	COG0513, SrmB, Superfamily II DNA and RNA helicases [DNA replication, recombination, and repair / Transcription / Translation, ribosomal structure and biogenesis].	6.44993e-86
NZ_CP017713.1|WP_010010895.1|667855_668857_+|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase	gnl|CDD|223745	COG0673, MviM, Predicted dehydrogenases and related proteins [General function prediction only].	7.82392e-44
NZ_CP017713.1|WP_141707555.1|665164_666130_-|decarboxylating-6-phosphogluconate-dehydrogenase	gnl|CDD|236582	PRK09599, PRK09599, NADP-dependent phosphogluconate dehydrogenase.	0
NZ_CP017713.1|WP_003677192.1|675971_676424_-|flavodoxin	gnl|CDD|180922	PRK07308, PRK07308, flavodoxin; Validated.	8.17316e-64
NZ_CP017713.1|WP_035457969.1|674541_675891_+|transposase	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.97979e-13
NZ_CP017713.1|WP_010010888.1|662558_663671_+|o-succinylbenzoate-synthase	gnl|CDD|239433	cd03317, NAAAR, N-acylamino acid racemase (NAAAR), an octameric enzyme that catalyzes the racemization of N-acylamino acids. NAAARs act on a broad range of N-acylamino acids rather than amino acids. Enantiopure amino acids are of industrial interest as chiral building blocks for antibiotics, herbicides, and drugs. NAAAR is a member of the enolase superfamily, characterized by the presence of an enolate anion intermediate which is generated by abstraction of the alpha-proton of the carboxylate substrate by an active site residue and is stabilized by coordination to the essential Mg2+ ion.	1.09296e-150
NZ_CP017713.1|WP_010010887.1|661749_662559_+|2-succinyl-6-hydroxy-2,-4-cyclohexadiene-1-carboxylate-synthase	gnl|CDD|274729	TIGR03695, menH_SHCHC, 2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase. This protein catalyzes the formation of SHCHC, or (1 R,6 R)-2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate, by elmination of pyruvate from 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate (SEPHCHC). Note that SHCHC synthase activity previously was attributed to MenD, which in fact is SEPHCHC synthase. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Menaquinone and ubiquinone].	5.40449e-84
NZ_CP017713.1|WP_010010889.1|663684_665013_-|amino-acid-permease	gnl|CDD|273332	TIGR00911, High-affinity_methionine_permease, L-type amino acid transporter. [Transport and binding proteins, Amino acids, peptides and amines].	1.70043e-61

Protein sequences

>NZ_CP017713.1|WP_010010897.1|670108_670447_+|PTS-lactose/cellobiose-transporter-subunit-IIA
MIEHNVAEVMTIMTSSTQAHSLLEAALTAAKTNDFVLARHKLQAADDALTEARNAQTTLLTREARGQTVPMTLLLIHAQDHLMSTVTYRDAVSEMITLYQKIAGLLAEKTSD
>NZ_CP017713.1|WP_010010896.1|668856_670116_+|DEAD/DEAH-box-helicase
MVSKIFEPVWQELGFDAPTAIQNAVYEPLKTDDSILGLAPTGSGKTLAFALPLMEKIVPGDGLQLLILAPAQELAMQERTAIQPFAQAAGLKIQAVAGGANIRRQIERLKQKPEVLVATPGRLLELIDQRKVKMHKLQTIVIDEADKLLTDESREMTRDVVRRAPGETQLAFFSATKIPVLDELPKWFGVPVTLFDVRAEDNSAGEVQHLFLEAPIRKRVDLLRRLSHIDDFYGLVFFATLAELEKVAKVLQHQHVPVAILDSDLRQTEREKALTGLRKRQIKLLLTTDVSGRGLDIAALPAVVNYDLPIDLITYIHRAGRTGRMGHAGMVVTLGNERQFRDLKQLVRSRYQVAQGYLYQGTLTTTKPAHEQHPLKKKKPAPMAAKPVTPVKPKKKKQRQRNRLNKGKRRKTNEGDKND
>NZ_CP017713.1|WP_010010895.1|667855_668857_+|Gfo/Idh/MocA-family-oxidoreductase
MLKLGIIGTNFITDQFIEAALATGNYQLTTVYSRSQEKAQAVADKYQASETFTDIDRFFAEGAFEVVYIASPNSLHFQQAKLAIAADKHVIVEKPAFSNPTEMANITALLSNKPHLFLFEAARHIHEPNFKVVQTAIKQLDKLQGAVLTYMKYSSRYDKFLAGEEPNIFSPSFSGGALQDLGVYVVYDAIAWFGVPEATHYYASLLPNGIDGRGTAVLRYADFDLTLMVGKNATSYLPSEIYGLKETLELGNNAADLQSVKLHRGAETKVLSTPPETNPMIAEAQDFYRIITENDRAAAAENAQLSRQVNQLLYDLRRSAGIVFAADIEEQKK
>NZ_CP017713.1|WP_010010894.1|667191_667551_-|DUF4828-domain-containing-protein
MFRNVFDRSQSLLQRLQQFKFKLPAKAAQKNDPTAIYVGTWLFYDIKQARHHQLKISPQLTISIDDHPLAGTVTTLTAHQLLFLDQYGYELQITAAYERPFEIYDEADHRTYPIQQNKH
>NZ_CP017713.1|WP_010010891.1|666309_667155_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator
MNEISQRVQQFAAELSSAEKKLATFLQQSQNLPDNLTISSLAQASKVSTATVSRFAKSLGYANFAALRVALISEVQRNGALFEEVEANDDALTVAHKVFAANQHSLSSTLALLDQSDLEQAVKLLTAARKVSFFGLGGSNVVAADAYHKFMRTPLDVNFNTDFHLQLMQAARLQAQDCAVVISHTGRDEQVLQLVHQLQAHQVPLIVLTSFAKSPLAQKSTVTFISMADESKYRSEALSSMLAQISIMDTLFLLVSLALPAKTQVTFNQIRQVIGQTRRGK
>NZ_CP017713.1|WP_141707555.1|665164_666130_-|decarboxylating-6-phosphogluconate-dehydrogenase
MHLILEKYFRILQSITFTKEGRNMKLGMIGLGKMGLNLVTNLQNHDHQVIAYDLDETARAQAAKVGAQPASDTTELIAQLATPRIIWVMVPAGKITQSVITELSQQLSAGDIVIDGGNSFYRDSIAHSELLATKGINFFDVGTSGGMAGALNGGNFMIGGDQDLFKTIEPIFQSIAAPAGYLYTGAVGSGHYLKMIHNGIEYGMMQAIAEGFDVLEHSEYKYDHAAVADMWNHGSVIRSWLMELAAAAFKEDPGLKHLQGKMYSSGEGKWTLEEAIRLQVPTPVIAASLMNRYRSLEDDTYTGKVVAALRNQFGGHAVDKK
>NZ_CP017713.1|WP_010010889.1|663684_665013_-|amino-acid-permease
MEQNGLKREMGLASALATVMGTVIGGGVFFKVASVTTEAGTANLTLFVWLLGGLLTICAGLTVAELATAIPQTGGAIKYIEYTYGKPWAFLLGWAQMLIYFPANVAALSIVFSTQLINLFHLTAGLLIPLAILCAVSLTLINFLGARVGGALQVVTLIFKLIPIALIVIFGLLAPAPVHFSLLPLTAAPEHNFWTALGSGLLATMFAYDGWLNVGSIAGELKRPKRDLPLAIVLGLALITLIYVVINFVFLRTLPLTALQGNLNAAADAAFQIFGNLGGKLVTIGILISVYGAINGYTLTGMRIPFALAYENQLPFSQYLRRLTTHTKVPYLAGLFELAVAIIMMLLGSFDLLTDMLVFVIWIFSCLIFIAVFILRRREPEMVRPYKVPGYPVIPLLALAGGLFILVATFLTQPSLAFTGLGLTAIGLPLYYWHQYMQKRTH
>NZ_CP017713.1|WP_010010888.1|662558_663671_+|o-succinylbenzoate-synthase
MQITQIQLQQIGLPLQTPFVTAHGTTKLRITTLVTVYLDNGYSGVGELTAFTDSRYLPETQASAWTVLQHEIAPLLRGFEFTRPSELATYLQQQLRGNQLACAAVETAVWAAYAKRQQQPLAHLLGGNVRPIPVGISLGHFATTTELLAQVTASVAAGYQRVKLKLTGPADVAQVAAVRARYPQLTLIVDANSAFTPADLPALQQLDQLDLALIEQPFANDDFVQHAWLQQQLHTAICLDENILTLADAQTAVALKSCRAINLKITRVGGLTTALAIVAFCRQQQIQVWCGGMLASGVSRAFDLALASRMEFTLPGDISASARYFKQDVLQQPLELRHGCLQLAATPGLGVTVDQQVVQQHLLKEKWLRL
>NZ_CP017713.1|WP_010010887.1|661749_662559_+|2-succinyl-6-hydroxy-2,-4-cyclohexadiene-1-carboxylate-synthase
MIKRTCNIRGQIYRLTTWGQPQAQAWLFLHGFMGSAADFAPIAAELNGYRICLDLIGFGPQAPTVPARRLSMAAQITDLTLILAELGVTQVKLVGYSMGGRLALGFTLAQPQLVPHLYLESSTAGLAGPQQREQRQRHDHELAVQLRTTGLPAFVAAWEQLPLFVSQRQMPPIQQHRMRQQRLQQNPENLAASLEQMGTGSQPNFWPLLPQMTTPTTLIVGGQDQKFYQIAQRLRRLIPKAKLVVLTDAGHNTHFEAPEQFINLLKDGC
>NZ_CP017713.1|WP_010010885.1|660071_661757_+|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase
MQNETLTLNTHRLISGLIAQGVHQFVISPGSRSTPVALLIAERVQQQPALRIFVDVDERSAAFFALGMAKTQQVPVALVCTSGTAAAEYLPALAEARLLHIPLIVLTTDRPLELTNIGAPQAIDQTELYGKQVKQSQRLELQQPGTTNADFIAFQSQRSVLTAMALPRGPIQLNLPLRKPLLPDLGVTPPQIKTVTVPQATVALAPTALTELAGQLQGKRVLLIAGPEEDSAYRATLLALSQKCHWPLLADSLANLRGRGAVISNFDLLFQARTTLPAALQPDVIIRFGSTPVSAPLMTWLEQQTVPLYLVGAQRQMADYSRATTHVLAADEQLLLAELLAVMPAQDATYLANWQQYAQRLQTKLTVPTELNEVTSVQVLDRLLPATSRLFISNSMPIRDVEDFYSGQAVRELYCNRGANGIDGVVSTAAGMATLGGANYLLIGDLALFHDMNGLMMLRRYQLPLTIVVINNNGGGIFSFLPQAAATDYFEDLFGTPQALDLAQVAALYQRSYQKVTTLVEFEQALQMQVQFIEVISQRADNLQLHRRLVSCLKQELSGDD
>NZ_CP017713.1|WP_010010898.1|670760_671174_+|DUF3284-domain-containing-protein
MRIEQLLNVPAAFLYHQIIDAELFEIHAHTGRQLTAAQLEGFTYQKQLDDATRAQVTITKNVLNRSYHYQTVTEFNRYEVKYDMLPIETDKSKIVYEEKVIARAWQQRLLDFVSNTLLGGLRRHNFRKMFQQIEKSY
>NZ_CP017713.1|WP_010010900.1|671740_671902_-|hypothetical-protein
MTKPAKKSFGRRLREWPKNFADSIQRPQPRFLPLALEEINERKLNGGPLYKWE
>NZ_CP017713.1|WP_010010902.1|671947_672163_-|CsbD-family-protein
MTKEERLDSAKTQAEGKLNKAAGKATGDKKQETKGKAQDLLGKAKKKVADAKDTAEASFEDAKEKLDRKHK
>NZ_CP017713.1|WP_010010903.1|672276_673527_-|aminopeptidase
MSHFKQQLQQYAELIVAVGGNVQPGQTVMLQIEVEQSELAHLITTAAYQRGAAEVIVNWQDTATQQAFIAHAATERLTTVDQVATAQVNDWLDKAATRIVVMSADPSSLSGLPAERIAAYQQTQAQIKQPLMQALQANRFSWTVVAAAGVDWAHHVFPDLPPNVAVTKLWQLIFKITRIDQPDPIAAWQQHAAELKAYATKLNQLPLDRLHYYSAKTDLTIGLPKNYNWSGATSENSHGQTFMPNMPTEEIFTAPDRYRVDGTVTATKPLSYAGTIIDGMVFTFTNGRITAAHADHGQSALDHLLATDAGAQHLGELALVPEATPIARSGLIFYNTLFDENAANHLAFGSAYPFSIKDGTSMIDAQLKAAALNTSQLHVDFMVGAPDMAIDAYTKDDRLIPIFRNGNWVPGLLDQY
>NZ_CP017713.1|WP_010010904.1|673743_674358_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
MVRKKQITRERILTGAYQLVVAQGFTHFTARNVAHAIHCSTQPLYQEFGSMANLKQAILLKLQHYLVNEVYNRQVTGDRMLDMALDYIKFAQDNPELYHVIFVEDHFGTNAMHDFTYCYGQRLLAHYKPAKQLSAAASENVITGMWIIAQGIASLVSSSFITISEKQAINLLRAALYDFIHNNRLEDGQITVNSLQQLDQLTKI
>NZ_CP017713.1|WP_035457969.1|674541_675891_+|transposase
MSTIQHSTPNIHLAMQHFSKLVQLPDVLRRANIHKTRGIQVPVLFEWLITTIFTRYSIFRAESDPHFTKKTARNCLNNRHTNWQRLVILLAVRLIQYVKHFTDTRRAQALILDDSLFKREFSRKTELLARVFDHNHQRYYHGFRTLTLGWSDGNTFLPVDFALMSSGKAKNQLGPINQFDPRTLAAQRRAQAKRKMNEVALELVDSALSAGIKTKYVLFDSWFASPRLFFELLQRGQFGVGMLKRSEKVYFRYRGRQMDVKSLYERLRRSKWPQHQNYHYSPIVTFEVGGQPMKVKLVFVPNRTDHSQYLVLGTTKTTLEPDQIIQLYGRRWQIEGYFKVAKQYLRFDQTQVQSYDGLCGHMAMVMMSYDILALHQREQVDERTLGDLFYNFGRPLPDIEIAVALAWLMRQLTGLGEKLGLTTTIIDELFDQFIRTLPNNLAQLLGNGV
>NZ_CP017713.1|WP_003677192.1|675971_676424_-|flavodoxin
MASAKIIYASMTGNNEEIADIVSEALENLGVDVDVSEISQADTEDFADVDICIVATYTYGDGELPDEAVDFYEDLQDEDLSGKVYGVCGSGDTFYDDSFGKSVDDFAAAFEKTGATKGADIVKVDLEAEEDDIEHLEAFAKSLAEKAADM
>NZ_CP017713.1|WP_010010908.1|677672_678557_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU
MKVRKAIIPAAGLGTRLLPATKAMAKEMLPIVDVPTIQFLVEEAKAAGIEDILIITGKGKRPIEDHFDSVPELEMVLKNRHKDKLLKLVESTTDIGVRLFFIRQSYPKGLGDAVRLAQDFVADEPFVVMLGDDITQSKVPLTKQLMNDYDKTHASTLAVIKVPHDEVSKYGVIKPVAETEKGLYNVQSFVEKPKPEQAPSDLAIIGRYLFTPEIFDSLNIQKPDAGGEIQLTDAIDHMNKTQRVFAREFTGKRYDTGNKLGYLTTNIEFGLQHPEIKDELCDYIIKLGHKLSQK
>NZ_CP017713.1|WP_003677187.1|678613_678937_-|heavy-metal-binding-domain-containing-protein
MADKILVTTTEHIPGHEYEIISEVFGLTTQSKNIARNIGAGLKSLAGGEIHAYTDLLTEARDVAIERLRENAVALGADAVVMMRFDSDSITDGMETIAAYGTAVKFK
>NZ_CP017713.1|WP_010010910.1|678993_680391_-|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD
MPEITYFHDIQVGQRFPLTIKRLGINGEGIGYYKRTIVFVKGALPDEVIVVEVTATAPKYVNAKIHTLRKKSPQRVEPRDADYYGHVGGIELEHLSYPAQLAFKVDVIRQSLEKFKPRGYQHYKLLPTIGMAEPYEYRNKAQFQVRELNGHVAAGLYQEHSHQLVDLKTFSTQRPATMQVIRYVVALLEELKVPIYNEEQNSGIVKTLVVRESFSTGHLQLTFITNSRKLPHKRELLSRIHTKMPQITSIMQNLNQGRTSLIWGEETFNLAGDDYITETLSGLTFKLSARAFFQLNPAQTAKMYALAREALQLAPHESLVDAYCGVGTIGLSLADTASEVRGMDIVPAAIADAQENANLNHIDNAKYEVGKAEELLPQWLAAGFAPDALVVDPPRTGLDQALLHAILDSRPQKFVYISCNPSTLARDLVRLSEVYAVDYIQSIDMFPQTARVEAVVRLEKRNIYR

Crispr_ID: NZ_CP017713_2

• CRISPR_ID: NZ_CP017713_2
• CRISPR_location: 724334-724445
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP017713_2

Consensus_repeat	Method
CGGACGAAGTATCGAAGAGCGACCTAAAAGTATTGATCAG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP017713_2

>2.1|724374|32|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder
GTGGTTCGCTGACAAGACTATCTCCATAATTG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017713_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP017713_2

>merge|NZ_CP017713|2|724334-724445|CRISPRCasFinder
CGGACGAAGTATCGAAGAGCGACCTAAAAGTATTGATCAGGTGGTTCGCTGACAAGACTATCTCCATAATTGCGGACGAAGTATCGAAGAGCGACCTAAAAGTATTGATCAG

>NZ_CP017713|2|2|724334-724445|CRISPRCasFinder
CGGACGAAGTATCGAAGAGCGACCTAAAAGTATTGATCAG	GTGGTTCGCTGACAAGACTATCTCCATAATTG
CGGACGAAGTATCGAAGAGCGACCTAAAAGTATTGATCAG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP017713.1|WP_069700473.1|725862_726306_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017713.1|WP_010011772.1|732586_733264_-|A24-family-peptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|377700
NZ_CP017713.1|WP_010011778.1|727606_727945_+|PTS-lactose/cellobiose-transporter-subunit-IIA	unknown	unknown	gnl|CDD|376749
NZ_CP017713.1|WP_010011787.1|709066_709537_+|CtsR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|226869
NZ_CP017713.1|WP_191976508.1|727996_729442_+|6-phospho-beta-glucosidase	unknown	unknown	gnl|CDD|181973
NZ_CP017713.1|WP_003680374.1|734061_734532_+|30S-ribosomal-protein-S7	unknown	unknown	gnl|CDD|235398
NZ_CP017713.1|WP_056943314.1|700228_702298_+|LTA-synthase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224287
NZ_CP017713.1|WP_010011779.1|726596_727304_-|GntR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|225099
NZ_CP017713.1|WP_010011785.1|712192_713116_+|U32-family-peptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|223896
NZ_CP017713.1|WP_003679858.1|718314_721962_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta'	unknown	unknown	gnl|CDD|234794
NZ_CP017713.1|WP_010011781.1|725031_725859_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|369792
NZ_CP017713.1|WP_010010930.1|699621_699858_+|YkuJ-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|370128
NZ_CP017713.1|WP_010011782.1|714711_718302_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta	unknown	unknown	gnl|CDD|234749
NZ_CP017713.1|WP_010010929.1|698434_699451_+|flippase-like-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377103
NZ_CP017713.1|WP_099235908.1|722147_723515_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP017713.1|WP_010011786.1|709557_712047_+|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|223616
NZ_CP017713.1|WP_003680373.1|733575_733989_+|30S-ribosomal-protein-S12	unknown	unknown	gnl|CDD|235355
NZ_CP017713.1|WP_010011784.1|713117_714341_+|U32-family-peptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|223896
NZ_CP017713.1|WP_010011773.1|732097_732556_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017713.1|WP_010011774.1|729660_730407_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224651

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP017713.1|WP_010011772.1|732586_733264_-|A24-family-peptidase	gnl|CDD|377700	pfam06750, DiS_P_DiS, Bacterial Peptidase A24 N-terminal domain. This family is found at the N-terminus of the pre-pilin peptidases (pfam01478). It's function has not been specifically determined; however some of the family have been characterized as bifunctional, and this domain may contain the N-methylation activity (EC:2.1.1.-). It consists of an intracellular region between a pair of transmembrane. This region contains an invariant proline and two almost fully conserved disulphide bridges - hence the name DiS-P-DiS. The cysteines have been shown to be essential to the overall function of the enzyme in, but their role was incorrectly ascribed.	4.86641e-20
NZ_CP017713.1|WP_010011778.1|727606_727945_+|PTS-lactose/cellobiose-transporter-subunit-IIA	gnl|CDD|376749	pfam02255, PTS_IIA, PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIA subunit. The bacterial phosphoenolpyruvate: sugar phosphotransferase system (PTS) is a multi-protein system involved in the regulation of a variety of metabolic and transcriptional processes. The lactose/cellobiose-specific family are one of four structurally and functionally distinct group IIA PTS system enzymes. This family of proteins normally function as a homotrimer, stabilized by a centrally located metal ion. Separation into subunits is thought to occur after phosphorylation.	3.35381e-41
NZ_CP017713.1|WP_010011787.1|709066_709537_+|CtsR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|226869	COG4463, CtsR, Transcriptional repressor of class III stress genes [Transcription].	8.58559e-51
NZ_CP017713.1|WP_191976508.1|727996_729442_+|6-phospho-beta-glucosidase	gnl|CDD|181973	PRK09589, celA, 6-phospho-beta-glucosidase; Reviewed.	0
NZ_CP017713.1|WP_003680374.1|734061_734532_+|30S-ribosomal-protein-S7	gnl|CDD|235398	PRK05302, PRK05302, 30S ribosomal protein S7; Validated.	1.57952e-108
NZ_CP017713.1|WP_056943314.1|700228_702298_+|LTA-synthase-family-protein	gnl|CDD|224287	COG1368, MdoB, Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	3.39647e-153
NZ_CP017713.1|WP_010011779.1|726596_727304_-|GntR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|225099	COG2188, PhnF, Transcriptional regulators [Transcription].	1.38274e-47
NZ_CP017713.1|WP_010011785.1|712192_713116_+|U32-family-peptidase	gnl|CDD|223896	COG0826, COG0826, Collagenase and related proteases [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	1.31914e-75
NZ_CP017713.1|WP_003679858.1|718314_721962_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta'	gnl|CDD|234794	PRK00566, PRK00566, DNA-directed RNA polymerase subunit beta'; Provisional.	0
NZ_CP017713.1|WP_010011781.1|725031_725859_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase	gnl|CDD|369792	pfam08282, Hydrolase_3, haloacid dehalogenase-like hydrolase. This family contains haloacid dehalogenase-like hydrolase enzymes.	7.39395e-58
NZ_CP017713.1|WP_010010930.1|699621_699858_+|YkuJ-family-protein	gnl|CDD|370128	pfam08796, DUF1797, Protein of unknown function (DUF1797). This is a domain of unknown function. It forms a central anti-parallel beta sheet with flanking alpha helical regions.	1.15574e-29
NZ_CP017713.1|WP_010011782.1|714711_718302_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta	gnl|CDD|234749	PRK00405, rpoB, DNA-directed RNA polymerase subunit beta; Reviewed.	0
NZ_CP017713.1|WP_010010929.1|698434_699451_+|flippase-like-domain-containing-protein	gnl|CDD|377103	pfam03706, LPG_synthase_TM, Lysylphosphatidylglycerol synthase TM region. LPG_synthase_TM is the N-terminal region of this family of bacterial phosphatidylglycerol lysyltransferases. The function of the family is to add lysyl groups to membrane lipids, and this region is the transmembrane domain of 7xTMs. In order to counteract attack by membrane-damaging external cationic antimicrobial molecules - from host immune systems, bacteriocins, defencins, etc - bacteria modify their anionic membrane phosphatidylglycerol with positively-charged L-lysine; this results in repulsion of the foreign cationic peptides.	1.63044e-29
NZ_CP017713.1|WP_099235908.1|722147_723515_-|transposase	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.21403e-14
NZ_CP017713.1|WP_010011786.1|709557_712047_+|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit	gnl|CDD|223616	COG0542, clpA, ATP-binding subunits of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	0
NZ_CP017713.1|WP_010011784.1|713117_714341_+|U32-family-peptidase	gnl|CDD|223896	COG0826, COG0826, Collagenase and related proteases [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	3.26641e-150
NZ_CP017713.1|WP_003680373.1|733575_733989_+|30S-ribosomal-protein-S12	gnl|CDD|235355	PRK05163, rpsL, 30S ribosomal protein S12; Validated.	2.16939e-85
NZ_CP017713.1|WP_010011774.1|729660_730407_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224651	COG1737, RpiR, Transcriptional regulators [Transcription].	2.86959e-50

Protein sequences

>NZ_CP017713.1|WP_099235908.1|722147_723515_-|transposase
MASIPQNKIEKSSFKIITQFCALAHLPALVRLLNDHRHSNVSLTAILIWLLKVIFQRRTLYRAEAPGMCTKRTVYNILNDGRINWQRLSCLLAQRVITGLAQWLDARKSGALIIDDTLISRLNAKQTELLANTFDHDRQRYLKGYRGLTLAWSNGQLVLPVTTAVLSSQKARNRVGTPAKTLDQRTLAGQRRAQAMRPMPAVALELIKQARANGLKAKYVLFDSWFTSPKMFAALNDQKLIGIGMLKRTKKIYYRYRGRQYTVKTLYQYLRQSHRQPRADYLYSCVVQTATAKLPLRLVFVAKRHCANDYLVLATTKTNLTPAAIIQLYSRRWQIENYFKAAKQYLRLDQTQIQDYDGLCAHMAVTMMTYDLLAWQQRRQPGDPTIGDIFYQLDTLLPIIDLATAIGQLLGELTNLKVTKSPAKMTAQIKTLIDQFLNGLSIQTSALITLSMSNS
>NZ_CP017713.1|WP_003679858.1|718314_721962_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta'
MIDVNKFESMQIGLASPDKIRSWSYGEVKKPETINYRTLKPERDGLFDERIFGPTKDWECACGKYKRIRYKGIVCDRCGVEVTRSKVRRERMGHIELAAPVSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEIIYFASYVVIDPGDTVLEKKQLLTEREYREKYDQYGKGFKAAMGAEAIKELLNDVDLEKEVGELKEDLKTAQGQKRTRAVRRLDILEAFRQSGNEPSWMVMDAIPVIPPDLRPMVQLEGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLNAPNIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGRRGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIDVGPTLKFYQCGLPREMALELFKPFVMRELVKRELASNIKNAKRKIDRRDDDIWDVLEDVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPVLVDGKSIRLHPLACEAYNADFDGDQMAIHVPLSDEAQAEARLLMLAAHHILAPKDGKPIATPSQDVVLGNYFLTSEEAGVIGEGMIFKDSNEVLMALQNGYVQLHTRIGLATNSLPDKPFTPEQRQKVMLTSVGKVMFNEILPKDLVYLNEPTNGNLMEGIDDKFFVEPGTDVKALLADRDLIAPFGKGFLADIIAQVFNVYRVTETSELLDRMKTLGYTQATNSGITVGVADVKDLPEKPALVADAHKQVATITKQFRRGLITDEERYQRVIGVWNGVKDQIQKRLMDNMPANNPIFMMSDSGARGNVSNFTQLAGMRGLMAAPNGQIMELPVISNFREGLSVMEMFISTHGARKGMTDTALKTANSGYLTRRLVDVAQDVIIRDEDCGTDRGLDVSAITEGNEVIEPLYDRLLGRYTMKSVFNPETGAEIVGKNVMIDEVIAQQIIDAGVKTVTIRSVFTCNTEHGVCKYCYGRNLATGETVEVGEAVGTVAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGGDITQGLPRVQEIMEARNPKGLATITEVTGEITAIDENPADHTKEITVQGETDTRTYSVPFTARVRVQEGDYIHRGEALTGGSIDPKQLLQVRDRLSTEIYMLREIQRVYRSQGVEVSDKHMEVMVRQMLRKVRIMDPGDTDILPGTLMDIADFKRQNYKTLISGGIPATSRPVLLGITKAALETNSFLSAASFQETTRVLTDAAIRGKNDPLLGLKENVIIGKIIPAGTGMAKYRHMEPKGVGAVSQNVYSISDLEEKMASDNKDQSK
>NZ_CP017713.1|WP_010011782.1|714711_718302_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-beta
MAGHLVKYGKHRTRRSYSRIKEVLDLPNLIEIQSNSYNWFLDEGLKEMFNDIMPIDDFAGNLSLEFVDYELLEPKYTVEEARQHDANYSAPLHVTLRLTNHETGEIKSQNVFFGDFPLMTDQGTFIINGAERVIVSQLVRSPGVYYNSEVDKNGRTIYGTTVIPNRGAWLELETDAKDISYVRIDRTRKIPMSELIRALGFGSDDDIIGMLGNNESLMLTMEKDVHKNADDSRVEEALKDIYERLRPGEPKTADSSRSLLNARFFDPKRYDLAAVGRYKINKKLSLKTRLLNQTLAETLADPDTGEVIAQKGDVVDRQVMEKLSPYLDREDFMTTTYTPSDEGAVTDPMTLQTIKVESKRNPETVVPIIGNGHIELSWKHIRPADIIASMNYFLNLQEGIGSTDDIDHLGNRRIRSVGELLQNQFRIGLSRMERVVRERMSIQDTSTVTPQQLINIRPVVASIKEFFGSSQLSQFMDQTNPLGELTHKRRLSALGPGGLTRDRASYEVRDVHYTHYGRMCPIETPEGPNIGLINSLASYAVVNKYGFIETPYRRVDWNTHKVTDKIDYLTADEEDNYVVAQANSLLNEDGSFVDDTVLARREEDNLEISVDRVDYMDVSPKQVVAVATACIPFLENDDSNRALMGANMQRQAVPLINPHAPLVGTGMEYKAAHDSGTAVVAKNAGTVEYVDAKQVRVRREDGSLDKYDLMKYRRSNSGKSYNQRPIVKLGDHIDVSEILADGPAMENGELALGQNPIIAFMTWNMYNYEDAIVLSEKLVREDAYTSIHIEEYESEARDTKLGPEEITREIPNVGEDALKDLDEFGIVRIGAEVKDGDLLVGKVTPKGVTELSAEERLLHAIFGEKAREVRDTSLRVPHGGGGIIQDVKIFTREAGDELSPGVNMMVRVYIAQKRKIQVGDKMAGRHGNKGTVSIVVPEEDMPFLPDGTPVDICLSPMGVPSRMNIGQVIELHLGMAARNLGIHVATPVFDGAQDQDIWAAVKEAGMDDDAKSVLYDGRTGEPFANRVSVGVMYYMKLAHMVDDKMHARSIGPYSLVTQQPLGGKAQFGGQRFGEMEVWALEAYGAAYTLQEILTYKSDDVVGRVKTYEAIVKGEPIPKPGVPESFRVLVKELQSLGLDMKVLDADKQEIELRDMDDEDDEVVSVDALSKFAKEQEAQKAKKAAEEAANASGDSDNK
>NZ_CP017713.1|WP_010011784.1|713117_714341_+|U32-family-peptidase
MRVITDKPEVLAPAGTLEKLKVAINYGADAVYIGGDAYGLRSRAGNFSFDQMREGVAYAQAHNAKVYVAANIVAHEGDTAGAGQFFRTLRDIGISAVIVSDPSLIEIAITEAPGLPVHLSTQASATNYETLNFWQAEGLERVVLAREVGIEEIKEMRRHTDVQIEAFIHGAMCIGYSGRCVLSNHMSMRDANRGGCAQNCRWKYDLFEMSGGEKQSQLENGEAFSMSAVDMAMIEHIPDLVEAGVNSFKIEGRMKSIHYVSTVANVYRQAVDSYCADPDHYVLKREWVDELWKVAQREMSTGFYYGTPTADDELFGKRRKRPQYGFVGEVLDYDAERKVAIVQQRNNFGVGDKIEFYGPHFTHTEQVVERLWDQDNDILYRAPDAMMICQLPVKQPVKAGDMIRKQR
>NZ_CP017713.1|WP_010011785.1|712192_713116_+|U32-family-peptidase
MINLIATAASRKQASQLLAAGIDTLYVGEDYFGLRLPHSFERAELTELVDLVHQAGKKVTVAVNALMHNDRINKVGDYLYFLAELKVDQITVGDPGVVYLLQQEKLPLQFIYDSEVLMTSSRQINFWARHGAIGAVLAREVPYGELVKLAPELKIPAEVQVYGATCIHQSGRPLVHNYFSFVQEHQDRADRQRGLFVSAPHKPETHYSIYEDINGTHLFANNDLNLMGKLPQLQTLGLTNWKLDGLFAGEAEFVTIARQFVQAKQALSAGEWTPDLAATLSAAVVAQQPAERGLDTGFYDIDPSEVQ
>NZ_CP017713.1|WP_010011786.1|709557_712047_+|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit
MDNLFTPSAKNVLVLAQEQAKYFRHHAVGTEHLLLALVIETDGIAGKTLRQLSITDDDIREEIERFTGYGASAETQSDTYLPYAPKAKQILSYAGDEAKRMGAMKIGTEHILLGLLREDDILAARILTNLGLSLSKTRQIILKKLGVTDTAAKRRNAPRGRQAQGNSSEGTPTLDSLARDLTQLARENQMDPVVGRSKEVRRLIQVLSRRTKNNPVLIGEPGVGKTAIAEGLAQKIIAGDVPDDMAKKRLMMLDMGSLVAGTKYRGEFEDRLKKVIDEIYKDGHVILFIDELHTLIGAGGAEGAIDASNILKPALARGEMQVIGATTLDEYQKYIEKDAALERRFATIQVNEPTQAEAEEILLGLRSRYEEHHGVTITDEAVHEAVVLSSRYISDRFLPDKAIDLIDESAASVRLDAASKKTPESKLETELNQLVKDKEAAIEAQDFEKAASIRENEMALKDKLATEQAAAPTNGVRKDVKVTPDDIATVVSQWTGVPLTQLQKSETERLINLEKVLHKRVIGQEEAVSAVSRAIRRARSGLKDPQRPIGSFMFLGPTGVGKTELAKALAEAMFGSEDNMIRVDMSEYMEKYSTSRLVGAPPGYVGYEEGGQLTEKVRQKPYSVVLLDEVEKAHPDVFNILLQVLDDGYLTDSKGRRVDFRNTILIMTSNLGATALRDEKSVGFGAQKVQQDYKAMRSRILEELKKSFRPEFINRIDEVVVFHSLTKPELHQIVKIMAKNVLKRLHDQNIDVKITPAAIDVIAKAGFDPEYGARPIRRAIQQQVEDRLSEELLSGHIKVGESVTIGARKGEITVNVRDSETDTTPTVKA
>NZ_CP017713.1|WP_010011787.1|709066_709537_+|CtsR-family-transcriptional-regulator
MQGRNISDIIEAYLKEILAESARVEIKRSEIAELFNCVPSQINYVIKTRFTIQRGYLVQSKRGGGGYIRIEKVKLLDDRDMLDTMIQLIGEQINQRDALSLVQKLYDDQVIERKEANLILAATSRETLAVADRQLEERLRARILIGILNHLRYERE
>NZ_CP017713.1|WP_056943314.1|700228_702298_+|LTA-synthase-family-protein
MGQALKKVRSGLNTRLGFFILAVLLFSIKSYFAYKTKFSLGVSGGMQELLLAFNPLPFAVLLLGLALYMRGRKSYWFMLLIDAIMATWLFANILYYREFSDFLTFNLMKGSSAVSNNLNQSIAGIIHPTDFLVFADVIFLIILLAFKVIRMDTRVFKLRYAALVSSLAVLLFGANLSLAETDRSGLLTRTFDNNYIVKYLGLEAYTVYDGVKTTQNNATKANADSSDLTSVQNFLSKNRVSPNVEYSGVAKGKNVFIIHLESLQQFMIDYKWDGQEVMPNIDKLYHSSDTLSFDNFYNQVGQGKTADAEMMLENSLYGLPEGSAMVMDGTTNTFQAAPAILGQNGYTTAAFHGDVPSFWNRDNTYKSWGYDYYFSKSFFPNADKSSYNLGYGMKDKIFLRDSAQYIQQLPQPFYAKLITVTNHYPYLIDSQNESIKPFNTGDSTVDSYVQTARYLDQAVGELMTWLQKTGLDKNSMVVLYGDHYGISNNHKPAIAKLLGKKKVTNYDLANFQKVPFMIHMPGLKGGINHTYGGEIDVLPTLLNLLGVKNSDTIQFGTDLLATNRKQTVAFRNGDFASPTYTKYNGDYYDSTGKQLKNLTTAQKKSIDDMQNYVTNTLSASDKVINGDLLRFYQPEGFKKVIKGAYNYKKSAALKQLKKANKKQSTSLVSKNGGKSTMSEYQTDAPELKK
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MKSSQLVAIISRLEAMQQGSADDEVRTRRFEKNGAERGLVSFDPQTETYELEELTNHQKFEFDDIDLIAMEIYDLLDD
>NZ_CP017713.1|WP_010010929.1|698434_699451_+|flippase-like-domain-containing-protein
MSRKNIAVLIGMLLLGGGIFAYELRTVRLSQLLREIAQLNWWWLLVAAGCMGLYWLMEAFVVKLLLKGRVDHFSFKNALRIPLVEQLFNSLTPFSSGGQPAQLMALMQSGVDGGRASSLLLMKFIVFQAMVLINFILTLVFGFKLVAAKFTYLAWLVVFGFLIHLAVITGLLLVMYWYNFTKGLVRLLLRPLHWVMAESRVNKLEATLNLKIDNFYRESLRIKNQTGMLIKASILTFIQLIFYYSVPYFVLLALGLQPSFMEVLVMHIMIVMIISLFPIPGGSGGAEISFRALFATFVVVNSKLVLAMILWRFMTYYLGMFIGIFALVVKPDKVKEID
>NZ_CP017713.1|WP_010011781.1|725031_725859_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase
MISLVGTDLDGTLFNEHSQVSVANRQAIQQMSAQGAKIAICSGRTLPTVDALLRDTLQVPGYRVCLNGAVVYDPNNQPLAAIPVANELLIAAFKIAQHWQVRLCICSLDQMLVFEPKELKPLATRDQPDGQNQQITSLTELEQALTQPNAKFYKFTINMTHHNVLGVRQAAKAIQQLPLHFVRSGRFFYEATAPGVDKSAGLAIVAAHANLEMADFMCFGDYENDLEMIRDVGYGVAMANAIPSVKQVAWRETADHDRDGVAQVLQQVVAQHLAI
>NZ_CP017713.1|WP_069700473.1|725862_726306_-|hypothetical-protein
MISNGKNHNVTLDFQPTQIDLYTDQAEQFGSIFPGYINGIQLGVLRSSSPGIGNPLTNMNFWLFLLFSTTNHDFYCVNQDIRVVPAVIKWATNNQVTYEDPFGLEQRLQAAPTYQKLLEMIATDYNELAAKNQYPTLVSDLAAIYWE
>NZ_CP017713.1|WP_010011779.1|726596_727304_-|GntR-family-transcriptional-regulator
MYHDIADDITKSINEGLFDKKLPTEVQLMARYNVSRNTIRKAIDLVYQKGLLRRVQGSGYFINDISLSEKTVINLSVGAGQPLHLADGKLVSKVITFDKINADVALANRMSIKNGSELYRVIRLRYLNNELYCLEQAYYVRAEVPFLSVESVNQSIFTFLRENYGISANNSEDYISLEKLTEEDAALLELPTGTPALTMNQLNFYGNNIIFNFSTTIYVYPGLNFYFHSANLTSN
>NZ_CP017713.1|WP_010011778.1|727606_727945_+|PTS-lactose/cellobiose-transporter-subunit-IIA
MIETETENSNLQAVMGLILNGGNAKSSAFEAINAAKTGDFTTADAKLAEADKFLVDAHNAQTGMLTAEANGEHANVSLLMVHSQDHIMTAITFRDLAGEIVDLYKRLAQAGK
>NZ_CP017713.1|WP_191976508.1|727996_729442_+|6-phospho-beta-glucosidase
MAMPKGFLWGGAVAAHQLEGGWQEGGKGVSIADVMTAGANGVPRRVTDGVKKGEIYPNHWGIDFYHRYPADLKLFAEMGMTCFRTSIAWTRIFPNGDETEPNEAGLKFYDDLFAECLKNGIQPVVTLSHFEMPYHLVKAYGGWGNRKLIDFFLNFAEVCFKRYKGQVKYWMTFNEINNQTDWRDPHPLLQNSGLQLDENDNWEEAMYQAAHYEMVASALAVKLGHEIDPDFQIGAMVAMCPIYPLTAKPADIMMAERAMQTRYYYGDVQALGSYPAWLTKYWQRHNYQIDITAADKAALQAGTVDYVGFSYYMSFVTEATKDDPDFVYDEANDLVSNPYVQKSDWGWQIDPIGLRYGMNWMTDRWHKPLFIVENGFGAHDKVEVDGSIHDDYRIKYFHDHILQMEKAVVDDGVDLIGYTPWGHIDLISASTGEMAKRYGFIYVDQDDLGKGTLNRSRKDSFYWFKQVVASNGADLSMKPQY
>NZ_CP017713.1|WP_010011774.1|729660_730407_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator
MFSYQQIRSLNQLEMTVYKFIISHPNDVERLTIRQMAEQSHVSATTILRFLKKVGYSGFSEFKFALKQQRQQEAVQPKLQDLALIKQFFDQLSDHHFNDQIAHAASMVAAAKTTIFFGLGTSGSLAQYGGRLFANYGIYTLMISDPFRTPPVVEHDFYDSLLILLSVSGETEEVLRQARFYKENGANILAITADAYSTLAQLADFNIAYNIPQTQDVQGHLSTQLPVVFLLEQIAQHAYQEVAEHLVL
>NZ_CP017713.1|WP_010011773.1|732097_732556_+|hypothetical-protein
MSKHKRVASVQAEAAAQKNVDTILQNMHKGQKTIASLPKWSQELAHHRFGWSELISFLPLIIITLTSPLLSSQVSMGQGLVVNKNALFIIPFASLLISAGCYLNVKIRRKGERITDIDHFAMNEIFTLLSNVVVVALCSGVLIYQLIRVFTA
>NZ_CP017713.1|WP_010011772.1|732586_733264_-|A24-family-peptidase
MLLLLYTLIIYFGASLASGLFLCAERLTAGQSLIKPKSHCTVCQHPLCWWQLLPLISYPLLRGHCYYCATPIPLAAWVSEIIGGFLGLFIWLTAAAPSFTGLLFAGLFLFSWIDIKQRILLPVLFWPWLITLLLLPHEPLHLTAMLLLVSGLGLFAHFSRGLGSGDVQLLAGIGLLYGFNSTIQMLLFACLLAIGGHAFYQHKTIPFIPYLSLGIWLQQLFTFLH
>NZ_CP017713.1|WP_003680373.1|733575_733989_+|30S-ribosomal-protein-S12
MPTINQLVRKGRKSRTTKSDAPALNFGYNSMKKIQTNNPAPQKRGVATRVGTMTPKKPNSALRKYARVRLSNLIEVTAYIPGIGHNLQEHSVVLIRGGRVKDLPGVRYHIVRGALDTAGVTDRMQSRSKYGTKRPKK
>NZ_CP017713.1|WP_003680374.1|734061_734532_+|30S-ribosomal-protein-S7
MPRKGAAAKRDVLPDPIYNSKLVTRLINRLMVDGKRGTASTILYKSFDNIKESTGNDPLEVFEQAMKNIMPVLEVKARRVGGSNYQVPIEVRPDRRTTLGLRWLVQYSRQRGEHTMDERLAREIMDAANNTGAAVKKREDTHKMADANRAFAHYRW

Crispr_ID: NZ_CP017713_3

• CRISPR_ID: NZ_CP017713_3
• CRISPR_location: 2185058-2185216
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP017713_3

Consensus_repeat	Method
CGATGTCCATTCAACTAAAGCAAAGTCCGCTAAGTTGAAACATGGCTCTACT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP017713_3

>3.1|2185110|55|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder
CCACAATTAAGGTAAATAATTAGCAAAGACCACTAATTATTCCCAATGTTCCGGA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017713_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP017713_3

>merge|NZ_CP017713|3|2185058-2185216|CRISPRCasFinder
CGATGTCCATTCAACTAAAGCAAAGTCCGCTAAGTTGAAACATGGCTCTACTCCACAATTAAGGTAAATAATTAGCAAAGACCACTAATTATTCCCAATGTTCCGGACGATGTCCATTCAACTAAAGCAAAGTCCGCTAAGTTGAAGCATGGCTCTACT

>NZ_CP017713|3|3|2185058-2185216|CRISPRCasFinder
CGATGTCCATTCAACTAAAGCAAAGTCCGCTAAGTTGAAACATGGCTCTACT	CCACAATTAAGGTAAATAATTAGCAAAGACCACTAATTATTCCCAATGTTCCGGA
CGATGTCCATTCAACTAAAGCAAAGTCCGCTAAGTTGAAGCATGGCTCTACT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP017713.1|WP_010009016.1|2190500_2190947_-|MarR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|378956
NZ_CP017713.1|WP_010009017.1|2189323_2190508_-|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|340913
NZ_CP017713.1|WP_003679023.1|2188007_2189042_-|HPr-kinase/phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|235459
NZ_CP017713.1|WP_010009026.1|2174641_2175862_-|argininosuccinate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234785
NZ_CP017713.1|WP_010009015.1|2191072_2191420_-|phage-holin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224861
NZ_CP017713.1|WP_010009027.1|2173255_2174638_-|argininosuccinate-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|179143
NZ_CP017713.1|WP_010009008.1|2192054_2193527_-|daptomycin-sensing-surface-protein-LiaX	unknown	unknown	gnl|CDD|226123
NZ_CP017713.1|WP_003679009.1|2179014_2181021_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	unknown	unknown	gnl|CDD|235395
NZ_CP017713.1|WP_010009024.1|2181269_2181905_-|HD-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378993
NZ_CP017713.1|WP_003679021.1|2187150_2188008_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|183527
NZ_CP017713.1|WP_003679017.1|2185380_2185788_-|tetratricopeptide-repeat-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|276809
NZ_CP017713.1|WP_010009023.1|2182068_2183793_-|phospho-sugar-mutase	unknown	unknown	gnl|CDD|100092
NZ_CP017713.1|WP_003679000.1|2171517_2172402_-|RNase-adapter-RapZ	unknown	unknown	gnl|CDD|235450
NZ_CP017713.1|WP_010009028.1|2172708_2173095_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017713.1|WP_003679007.1|2176072_2178928_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	unknown	unknown	gnl|CDD|234734
NZ_CP017713.1|WP_003678997.1|2170519_2171521_-|YvcK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|211689
NZ_CP017713.1|WP_010009020.1|2186097_2187111_-|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|234629
NZ_CP017713.1|WP_010009022.1|2184027_2184981_-|thioredoxin-disulfide-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|273540
NZ_CP017713.1|WP_010009014.1|2191419_2191704_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226404
NZ_CP017713.1|WP_010009009.1|2191703_2191967_-|PspC-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377200

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP017713.1|WP_010009016.1|2190500_2190947_-|MarR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|378956	pfam12802, MarR_2, MarR family. The Mar proteins are involved in the multiple antibiotic resistance, a non-specific resistance system. The expression of the mar operon is controlled by a repressor, MarR. A large number of compounds induce transcription of the mar operon. This is thought to be due to the compound binding to MarR, and the resulting complex stops MarR binding to the DNA. With the MarR repression lost, transcription of the operon proceeds. The structure of MarR is known and shows MarR as a dimer with each subunit containing a winged-helix DNA binding motif.	2.13343e-06
NZ_CP017713.1|WP_003679023.1|2188007_2189042_-|HPr-kinase/phosphorylase	gnl|CDD|235459	PRK05428, PRK05428, HPr kinase/phosphorylase; Provisional.	7.08283e-172
NZ_CP017713.1|WP_010009026.1|2174641_2175862_-|argininosuccinate-synthase	gnl|CDD|234785	PRK00509, PRK00509, argininosuccinate synthase; Provisional.	0
NZ_CP017713.1|WP_010009015.1|2191072_2191420_-|phage-holin-family-protein	gnl|CDD|224861	COG1950, COG1950, Predicted membrane protein [Function unknown].	1.26063e-18
NZ_CP017713.1|WP_010009027.1|2173255_2174638_-|argininosuccinate-lyase	gnl|CDD|179143	PRK00855, PRK00855, argininosuccinate lyase; Provisional.	0
NZ_CP017713.1|WP_010009008.1|2192054_2193527_-|daptomycin-sensing-surface-protein-LiaX	gnl|CDD|226123	COG3595, COG3595, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	7.66866e-17
NZ_CP017713.1|WP_003679009.1|2179014_2181021_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	gnl|CDD|235395	PRK05298, PRK05298, excinuclease ABC subunit UvrB.	0
NZ_CP017713.1|WP_010009024.1|2181269_2181905_-|HD-domain-containing-protein	gnl|CDD|378993	pfam12917, HD_2, HD containing hydrolase-like enzyme. This is a family of bacterial and archaeal hydrolases.	6.04745e-64
NZ_CP017713.1|WP_003679021.1|2187150_2188008_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	gnl|CDD|183527	PRK12437, PRK12437, prolipoprotein diacylglyceryl transferase; Reviewed.	7.25446e-111
NZ_CP017713.1|WP_003679017.1|2185380_2185788_-|tetratricopeptide-repeat-protein	gnl|CDD|276809	sd00006, TPR, Tetratricopeptide repeat. The Tetratricopeptide repeat (TPR) typically contains 34 amino acids and is found in a variety of organisms including bacteria, cyanobacteria, yeast, fungi, plants, and humans. It is present in a variety of proteins including those involved in chaperone, cell-cycle, transcription, and protein transport complexes. The number of TPR motifs varies among proteins. Those containing 5-6 tandem repeats generate a right-handed helical structure with an amphipathic channel that is thought to accommodate an alpha-helix of a target protein. It has been proposed that TPR proteins preferentially interact with WD-40 repeat proteins, but in many instances several TPR-proteins seem to aggregate to multi-protein complexes.	2.10849e-09
NZ_CP017713.1|WP_010009023.1|2182068_2183793_-|phospho-sugar-mutase	gnl|CDD|100092	cd05799, PGM2, This CD includes PGM2 (phosphoglucomutase 2) and PGM2L1 (phosphoglucomutase 2-like 1). The mammalian PGM2 is thought to be a phosphopentomutase that catalyzes the conversion of the nucleoside breakdown products, ribose-1-phosphate and deoxyribose-1-phosphate to the corresponding 5-phosphopentoses. PGM2L1 is thought to catalyze the 1,3-bisphosphoglycerate-dependent synthesis of glucose 1,6-bisphosphate and other aldose-bisphosphates that serve as cofactors for several sugar phosphomutases and possibly also as regulators of glycolytic enzymes. PGM2 and PGM2L1 belong to the alpha-D-phosphohexomutase superfamily which includes several related enzymes that catalyze a reversible intramolecular phosphoryl transfer on their sugar substrates. Other members of this superfamily include phosphoglucosamine mutase (PNGM), phosphoacetylglucosamine mutase (PAGM), the bacterial phosphomannomutase ManB, the bacterial phosphoglucosamine mutase GlmM, and the bifunctional phosphomannomutase/phosphoglucomutase (PMM/PGM). Each of these enzymes has four domains with a centrally located active site formed by four loops, one from each domain. All four domains are included in this alignment model.	0
NZ_CP017713.1|WP_003679000.1|2171517_2172402_-|RNase-adapter-RapZ	gnl|CDD|235450	PRK05416, PRK05416, RNase adapter RapZ.	4.98969e-177
NZ_CP017713.1|WP_010009017.1|2189323_2190508_-|MFS-transporter	gnl|CDD|340913	cd17355, MFS_YcxA_like, MFS-type transporter YcxA and similar proteins of the Major Facilitator Superfamily of transporters. This group is composed of uncharacterized bacterial MFS-type transporters including Bacillus subtilis YcxA and YbfB. YcxA has been shown to facilitate the export of surfactin in B. subtilis. The YcxA-like group belongs to the Monocarboxylate transporter -like (MCT-like) family of the Major Facilitator Superfamily (MFS) of membrane transport proteins. MFS proteins are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	6.78637e-70
NZ_CP017713.1|WP_003679007.1|2176072_2178928_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	gnl|CDD|234734	PRK00349, uvrA, excinuclease ABC subunit UvrA.	0
NZ_CP017713.1|WP_003678997.1|2170519_2171521_-|YvcK-family-protein	gnl|CDD|211689	TIGR01826, Putative_gluconeogenesis_factor, conserved hypothetical protein, cofD-related. This model represents a subfamily of conserved hypothetical proteins that forms a sister group to the family of CofD, (TIGR01819), LPPG:Fo 2-phospho-L-lactate transferase, an enzyme of cytochrome F420 biosynthesis. Both this family and TIGR01819 are within the scope of the pfam01933. [Hypothetical proteins, Conserved].	2.74207e-131
NZ_CP017713.1|WP_010009020.1|2186097_2187111_-|NAD(P)H-dependent-glycerol-3-phosphate-dehydrogenase	gnl|CDD|234629	PRK00094, gpsA, NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase.	0
NZ_CP017713.1|WP_010009022.1|2184027_2184981_-|thioredoxin-disulfide-reductase	gnl|CDD|273540	TIGR01292, Thioredoxin_reductase, thioredoxin-disulfide reductase. This model describes thioredoxin-disulfide reductase, a member of the pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases (pfam00070). [Energy metabolism, Electron transport].	2.05683e-137
NZ_CP017713.1|WP_010009014.1|2191419_2191704_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226404	COG3887, COG3887, Predicted signaling protein consisting of a modified GGDEF domain and a DHH domain [Signal transduction mechanisms].	0.00526919
NZ_CP017713.1|WP_010009009.1|2191703_2191967_-|PspC-domain-containing-protein	gnl|CDD|377200	pfam04024, PspC, PspC domain. This family includes Phage shock protein C (PspC) that is thought to be a transcriptional regulator. The presumed domain is 60 amino acid residues in length.	1.44109e-21

Protein sequences

>NZ_CP017713.1|WP_010009022.1|2184027_2184981_-|thioredoxin-disulfide-reductase
MTKQADVVVIGAGPGGLTAALYASRSNLSVIILDRGIYGGQMNNTAEIENYPGFKSILGPDLAQNMYDGATQFGAEYVYGNVTNVEDQGEYKLIHTDDGDYQAKAVVIATGADHRKLGVPGEQEYSGRGVSYCAVCDGAFFKNREVAVIGGGDSAVEEGLYLAQLASKVTIIHRRDQLRAQKIIQQRAFDNDKIEFVWNANTEEVLGDEQKVTGVRYTDKVTGEEHVLPASGAFIYVGIDALTDGFQNLNILDEKGWVVTDEHMRTAVPGIFAIGDVRQKDLRQITTAVGDGGVAGQQAFNYIQELDDKVKHEASVK
>NZ_CP017713.1|WP_010009023.1|2182068_2183793_-|phospho-sugar-mutase
MAWQDTYQTWVAYPELDADLKKELTGTTDQEQLEDAFYAPMEFGTAGMRGVMGPGINRMNIYTIRQATEGLALFMDTLDAATKQRGVAISFDSRYNSELFAHEAARVLGAHKIPSFVFDGLRPTPELSFAVRHLETYAGIMITASHNPKQYNGYKIYGPDGGQMPPKEADLITSYVRKAADLFGIAVVDEHDLRTAKLMTMIGEDVDEAYLANIKKVTINQDLVDEIGPKLKLVYSPLHGTGKMLGAQALRNAGFTQFKLVAKQAIADPEFPTVPFPNPEFPQAFDMAIELGKRENADILVATDPDADRLGTAVRQPDGEYRLLNGNQIAALMLDYILRANQNAGTLPANAVAIKSIVSTELATQIAHNYNVEMLDVLTGFKFIGEKIKQYEQDHSHTYMFGFEESYGSLIRPFVRDKDAIQGLLLLAEIAAYYQKQGKTLYDGLQDLFKKYGYYAEKTVSQTFDGISGADKMAKLMTKFREEQPAEFNGVKISAVEDFAQQTKTYADGHQEKMALPTSNVLKYLLADETWIAIRPSGTEPKIKFYVGTIGTSEADVATKLDAFENALNEFAAE
>NZ_CP017713.1|WP_010009024.1|2181269_2181905_-|HD-domain-containing-protein
MGMHQYLQSLSNLETIHRAPGYFKYEEHSVAAHSFKVTQIAQILGDIEENAGQTVNWRALYEKALNHDYTERFIGDIKTPVKYATPTLRQMLADVDANLTETFIQNELPAEFQAAYRRRLSEGKDDTLEGRILSVADKVDLLYESFGEIQKGNPESVYTEIYRESLRTIVAFADMVSVQYFFKEILPDLLAENFTNQEELRRITQQITAEK
>NZ_CP017713.1|WP_003679009.1|2179014_2181021_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB
MIQREAHRDFDLVSPYQPAGDQPTAIAQLTKGIEAGTKAQILLGATGTGKTFTMSEVIKNVNKPTLILAHNKTLAGQLYGEFKQFFPHNAVEYFVSYYDYYQPEAYVPSSDTYIEKDSSINDEIDKLRHSATSSLLERDDVIVVASVSSIFGLGDPKEYADHVLSIRVGQELERNELLRQLVSIQFERNDIDFQRGRFRVRGDVIEIFPASRDERALRVEFFGDEIDRIREVDALTGEVLGDRDHVAIFPATHFMTNEDQMDHAIDGIAAELKTRLAELKDQHKLLEAQRLEQRTNYDIEMMREMGYTSGIENYSRHMDGRKPGEPPYTLIDFFPKDFLIMVDESHVTMPQVRGMYNGDRARKQMLVDYGFRLPSALDNRPLTLQEFEQHVNQIVYVSATPGPYEYEQTDQVAEQIIRPTGLLDPKIEVRPIMGQIDDLVGEINLRIERHERTFITTLTKKMAEDLTDYLKELGIKVRYLHSDIKTLERTQIIRDLRLGKFDVLVGINLLREGIDVPEVSLIAILDADKEGFLRSERSLIQTIGRASRNVDGTVIMYADNVTDSMQGAIDETARRRSIQEAYNEKHHITPRTIKKEIRDLISPVKSVPVDEHNSEAIAETDFADMTKKEQKAMIGRLEEQMRTAAKSLEFEQAATLRDTILELKAEIE
>NZ_CP017713.1|WP_003679007.1|2176072_2178928_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA
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Crispr_ID: NZ_CP017713_4

• CRISPR_ID: NZ_CP017713_4
• CRISPR_location: 2699624-2701639
• CRISPR_type: TypeII
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 30 spacers
• Cas_protein_info: RT,csn2,cas2,cas1,cas9

Consensus repeat of NZ_CP017713_4

Consensus_repeat	Method
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	CRISPRCasFinder
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	CRT
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	PILER-CR

spacers of NZ_CP017713_4

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AAAAATCAACAGCTACTAATCGCTTATTGA
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GTACGCTCAATTCTTGGCCGAATATAACCG
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AGGACTTTTACGATTACGACACGCAAAGTG
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TATATACTAGGCTCATAAGATAAGGAAAGG
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TATATAATAAGTCTTGTAAGGTAAAGGAAA
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ACGCCAGGTTGACTAACGCCATAATTTGCC
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GGACAATTATTTATTGCAACAGCAATCCGG
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TAGACAAGCCTTAAGCACGCTTAAGCAGCC
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ACGACTGATATGGGTGGTTATGATACTCCC
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TGATGACGATACCGCTATTATTAATCTGCC
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AGGAAGGTGAAACTTATGTGGGTACGACAA
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TACCCTTGGGGTGTTTTTGTGACCGCGTAT
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AGCGTCTCCAGGACTGACGGATCTACCGGA
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ACTGGTAATGTAATCGTGCTTTCATACGTA
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CAGTCAGGGCGCCTTCAAGCGGCCGTTTAC
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AGTTGCTAAGTCCGATGGGATCAATCCATT
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AGCTACTGTTTCAGGCGGCTTAGTGACGGT
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GCCAAGTTATAGATTCCCATTTTGAAATAA
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ACGATTGCCAGAAAATTTTAGAAAATTATG
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ATGGCTTTCCAAAACCAGAATTGATTTTTA
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AACAGTTCAAAGCTAAAAACCCTAACGTAA
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TGGCACTCATACTTAATTGTCATTTCTTTT
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TAGAGGGTGGCGGTTACGATCACGTTCGGT
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ACAAAGATCATGAGCATCGGCTTAATGATC
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ATTAAACATCGATCAACAGCATTTCAAAAA
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AAATACGATTTAAGAATTTCTGACGAATCA
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TGACCGATAGGAGCAATTTCCAGCGCTTCG
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TTGCTGGCAGCCACTGGAATTTTAACCGAC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017713_4

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP017713_4

>merge|NZ_CP017713|4|2699624-2701639|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
ATTTTACAAACGATTGATTTAAGACTCTTCTAAAACAGGTCGCCGACGATTTTTCGAAGGGTGCCTGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACGGAAACAGTCGTTGATAGCCATGATATTCTGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACAAAAATCAACAGCTACTAATCGCTTATTGAGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACGTACGCTCAATTCTTGGCCGAATATAACCGGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACAGGACTTTTACGATTACGACACGCAAAGTGGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACTATATACTAGGCTCATAAGATAAGGAAAGGGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACTATATAATAAGTCTTGTAAGGTAAAGGAAAGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACACGCCAGGTTGACTAACGCCATAATTTGCCGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACGGACAATTATTTATTGCAACAGCAATCCGGGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACTAGACAAGCCTTAAGCACGCTTAAGCAGCCGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACACGACTGATATGGGTGGTTATGATACTCCCGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACTGATGACGATACCGCTATTATTAATCTGCCGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACAGGAAGGTGAAACTTATGTGGGTACGACAAGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACTACCCTTGGGGTGTTTTTGTGACCGCGTATGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACAGCGTCTCCAGGACTGACGGATCTACCGGAGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACACTGGTAATGTAATCGTGCTTTCATACGTAGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACCAGTCAGGGCGCCTTCAAGCGGCCGTTTACGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACAGTTGCTAAGTCCGATGGGATCAATCCATTGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACAGCTACTGTTTCAGGCGGCTTAGTGACGGTGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACGCCAAGTTATAGATTCCCATTTTGAAATAAGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACACGATTGCCAGAAAATTTTAGAAAATTATGGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACATGGCTTTCCAAAACCAGAATTGATTTTTAGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACAACAGTTCAAAGCTAAAAACCCTAACGTAAGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACTGGCACTCATACTTAATTGTCATTTCTTTTGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACTAGAGGGTGGCGGTTACGATCACGTTCGGTGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACACAAAGATCATGAGCATCGGCTTAATGATCGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACATTAAACATCGATCAACAGCATTTCAAAAAGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACAAATACGATTTAAGAATTTCTGACGAATCAGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACTGACCGATAGGAGCAATTTCCAGCGCTTCGGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAACTTGCTGGCAGCCACTGGAATTTTAACCGACGGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC

>NZ_CP017713|4|4|2699624-2701639|CRISPRCasFinder
ATTTTACAAACGATTGATTTAAGACTCTTCTAAAAC	AGGTCGCCGACGATTTTTCGAAGGGTGCCT
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GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	AGCGTCTCCAGGACTGACGGATCTACCGGA
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GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	CAGTCAGGGCGCCTTCAAGCGGCCGTTTAC
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	AGTTGCTAAGTCCGATGGGATCAATCCATT
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	AGCTACTGTTTCAGGCGGCTTAGTGACGGT
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	GCCAAGTTATAGATTCCCATTTTGAAATAA
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	ACGATTGCCAGAAAATTTTAGAAAATTATG
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	ATGGCTTTCCAAAACCAGAATTGATTTTTA
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	AACAGTTCAAAGCTAAAAACCCTAACGTAA
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	TGGCACTCATACTTAATTGTCATTTCTTTT
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	TAGAGGGTGGCGGTTACGATCACGTTCGGT
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	ACAAAGATCATGAGCATCGGCTTAATGATC
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	ATTAAACATCGATCAACAGCATTTCAAAAA
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	AAATACGATTTAAGAATTTCTGACGAATCA
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	TGACCGATAGGAGCAATTTCCAGCGCTTCG
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	TTGCTGGCAGCCACTGGAATTTTAACCGAC
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC

>NZ_CP017713|4|1|2699624-2701639|CRT
ATTTTACAAACGATTGATTTAAGACTCTTCTAAAAC	AGGTCGCCGACGATTTTTCGAAGGGTGCCT
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	GGAAACAGTCGTTGATAGCCATGATATTCT
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	AAAAATCAACAGCTACTAATCGCTTATTGA
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	GTACGCTCAATTCTTGGCCGAATATAACCG
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	AGGACTTTTACGATTACGACACGCAAAGTG
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	TATATACTAGGCTCATAAGATAAGGAAAGG
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	TATATAATAAGTCTTGTAAGGTAAAGGAAA
GGTTCTAAACTCATTGATTTAACACTCTTCTAAAAC	ACGCCAGGTTGACTAACGCCATAATTTGCC
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Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP017713.1|WP_010009267.1|2701666_2702341_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2	csn2	cd12218_csn2_CAS-II-A	gnl|CDD|213411
NZ_CP017713.1|WP_010009261.1|2689664_2690366_-|GntR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|225099
NZ_CP017713.1|WP_010009260.1|2689155_2689302_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017713.1|WP_010009269.1|2702620_2703526_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09720_cas1_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	gnl|CDD|187851
NZ_CP017713.1|WP_069700543.1|2692906_2694289_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	gnl|CDD|275209
NZ_CP017713.1|WP_169925060.1|2709959_2710988_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP017713.1|WP_010009264.1|2695953_2697414_-|peptide-MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|225646
NZ_CP017713.1|WP_010009266.1|2698685_2699522_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase-MsrA	unknown	unknown	gnl|CDD|376578
NZ_CP017713.1|WP_010009275.1|2711865_2713626_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224055
NZ_CP017713.1|WP_003679539.1|2690505_2691654_-|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase	unknown	unknown	gnl|CDD|238434
NZ_CP017713.1|WP_010009270.1|2703716_2707781_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9	cas9	mkCas0193_cas9_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	gnl|CDD|374653
NZ_CP017713.1|WP_004562648.1|2713683_2714109_-|universal-stress-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366180
NZ_CP017713.1|WP_154646675.1|2689285_2689432_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017713.1|WP_010009277.1|2716313_2717453_-|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|378925
NZ_CP017713.1|WP_081455883.1|2702337_2702658_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	mkCas0206_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	gnl|CDD|226043
NZ_CP017713.1|WP_010009276.1|2714127_2715702_-|Nramp-family-divalent-metal-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|234815
NZ_CP017713.1|WP_010009263.1|2695015_2695843_-|metallophosphoesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|163441
NZ_CP017713.1|WP_010009262.1|2691807_2692608_-|pyrroline-5-carboxylate-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|237008
NZ_CP017713.1|WP_010009265.1|2697955_2698597_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187577
NZ_CP017713.1|WP_010009271.1|2707885_2709103_-|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224582

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP017713.1|WP_010009270.1|2703716_2707781_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9	cas9	mkCas0193_cas9_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	0	1819.9	43.9
NZ_CP017713.1|WP_010009267.1|2701666_2702341_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2	csn2	cd12218_csn2_CAS-II-A	5.9e-79	259.4	11.8
NZ_CP017713.1|WP_081455883.1|2702337_2702658_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	mkCas0206_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	5.3e-56	181.9	2.3
NZ_CP017713.1|WP_069700543.1|2692906_2694289_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	7.4e-59	193.6	0.0
NZ_CP017713.1|WP_010009269.1|2702620_2703526_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09720_cas1_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	2e-83	274.4	0.2

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP017713.1|WP_010009267.1|2701666_2702341_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2	gnl|CDD|213411	cd12218, Csn2, CRISPR/Cas system-associated protein Csn2. Csn2 is a Nmeni subtype-specific Cas protein, which may function in the adaptation process which mediates the incorporation of foreign nucleic acids into the microbial host genome. Csn 2 may interact directly with double-stranded DNA. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA. Csn2 has been predicted to be a functional analog of Cas4 based on anti-correlated phyletic patterns; also known as SPy1049 family.	1.35594e-85
NZ_CP017713.1|WP_010009261.1|2689664_2690366_-|GntR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|225099	COG2188, PhnF, Transcriptional regulators [Transcription].	2.33637e-81
NZ_CP017713.1|WP_010009269.1|2702620_2703526_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	gnl|CDD|187851	cd09720, Cas1_II, CRISPR/Cas system-associated protein Cas1. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Cas1 is the most universal CRISPR system protein thought to be involved in spacer intergration. Cas1 is metal-dependent deoxyribonuclease, also binds RNA; Shown to possess a unique fold consisting of a N-terminal beta-strand domain and a C-terminal alpha-helical domain.	3.79393e-91
NZ_CP017713.1|WP_010009271.1|2707885_2709103_-|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224582	COG1668, NatB, ABC-type Na+ efflux pump, permease component [Energy production and conversion / Inorganic ion transport and metabolism].	1.03982e-33
NZ_CP017713.1|WP_069700543.1|2692906_2694289_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase	gnl|CDD|275209	TIGR04416, hypothetical_protein, group II intron reverse transcriptase/maturase. Members of this protein family are multifunctional proteins encoded in most examples of bacterial group II introns. These group II introns are mobile selfish genetic elements, often with multiple highly identical copies per genome. Member proteins have an N-terminal reverse transcriptase (RNA-directed DNA polymerase) domain (pfam00078) followed by an RNA-binding maturase domain (pfam08388). Some members of this family may have an additional C-terminal DNA endonuclease domain that this model does not cover. A region of the group II intron ribozyme structure should be detectable nearby on the genome by Rfam model RF00029. [Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	8.50026e-177
NZ_CP017713.1|WP_169925060.1|2709959_2710988_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	5.2836e-75
NZ_CP017713.1|WP_010009264.1|2695953_2697414_-|peptide-MFS-transporter	gnl|CDD|225646	COG3104, PTR2, Dipeptide/tripeptide permease [Amino acid transport and metabolism].	2.31715e-154
NZ_CP017713.1|WP_010009266.1|2698685_2699522_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase-MsrA	gnl|CDD|376578	pfam01625, PMSR, Peptide methionine sulfoxide reductase. This enzyme repairs damaged proteins. Methionine sulfoxide in proteins is reduced to methionine.	1.02874e-82
NZ_CP017713.1|WP_003679539.1|2690505_2691654_-|N-acetylglucosamine-6-phosphate-deacetylase	gnl|CDD|238434	cd00854, NagA, N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase, NagA, catalyzes the hydrolysis of the N-acetyl group of N-acetyl-glucosamine-6-phosphate (GlcNAc-6-P) to glucosamine 6-phosphate and acetate. This is the first committed step in the biosynthetic pathway to amino-sugar-nucleotides, which is needed for cell wall peptidoglycan and teichoic acid biosynthesis. Deacetylation of N-acetylglucosamine is also important in lipopolysaccharide synthesis and cell wall recycling.	3.14713e-147
NZ_CP017713.1|WP_010009270.1|2703716_2707781_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9	gnl|CDD|374653	pfam16592, Cas9_REC, REC lobe of CRISPR-associated endonuclease Cas9. The REC lobe of Cas9 - the CRISPR-associated endonuclease Cas9 - includes the REC1 and REC2 domains. REC1 forms an elongated, alpha-helical structure consisting of 25 alpha helices and two beta-sheets, whereas REC2 inserted within REC1 adopts a six-helix bundle structure. The REC lobe and the NUC lobe of Cas9 fold to present a positively charged groove at their interface which accommodates the negatively charged sgRNA:target DNA heteroduplex. CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat)-Cas system occurs naturally in bacteria as a defense against invasion by phages or other mobile genetic elements. Cas9 is targeted to specific genomic locations by sgRNAs or single guide RNAs, in order to complex with invading DNA in order to cleave it and render it inactive.	1.42496e-143
NZ_CP017713.1|WP_004562648.1|2713683_2714109_-|universal-stress-protein	gnl|CDD|366180	pfam00582, Usp, Universal stress protein family. The universal stress protein UspA is a small cytoplasmic bacterial protein whose expression is enhanced when the cell is exposed to stress agents. UspA enhances the rate of cell survival during prolonged exposure to such conditions, and may provide a general "stress endurance" activity. The crystal structure of Haemophilus influenzae UspA reveals an alpha/beta fold similar to that of the Methanococcus jannaschii MJ0577 protein, which binds ATP, though UspA lacks ATP-binding activity.	2.32236e-22
NZ_CP017713.1|WP_081455883.1|2702337_2702658_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	gnl|CDD|226043	COG3512, COG3512, CRISPR-associated protein, Cas2 homolog [Defense mechanisms].	3.69732e-24
NZ_CP017713.1|WP_010009277.1|2716313_2717453_-|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|378925	pfam12698, ABC2_membrane_3, ABC-2 family transporter protein. This family is related to the ABC-2 membrane transporter family pfam01061.	1.86099e-32
NZ_CP017713.1|WP_010009276.1|2714127_2715702_-|Nramp-family-divalent-metal-transporter	gnl|CDD|234815	PRK00701, PRK00701, divalent metal cation transporter MntH.	6.65948e-175
NZ_CP017713.1|WP_010009263.1|2695015_2695843_-|metallophosphoesterase	gnl|CDD|163441	TIGR03729, acc_ester, putative phosphoesterase. Members of this protein family belong to the larger family pfam00149 (calcineurin-like phosphoesterase), a family largely defined by small motifs of metal-chelating residues. The subfamily in this model shows a good but imperfect co-occurrence in species with domain TIGR03715 that defines a novel class of signal peptide typical of the accessory secretory system.	7.16735e-98
NZ_CP017713.1|WP_010009262.1|2691807_2692608_-|pyrroline-5-carboxylate-reductase	gnl|CDD|237008	PRK11880, PRK11880, pyrroline-5-carboxylate reductase; Reviewed.	2.18581e-76
NZ_CP017713.1|WP_010009265.1|2697955_2698597_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|187577	cd05267, SDR_a6, atypical (a) SDRs, subgroup 6. These atypical SDR family members of unknown function have only a partial match to a prototypical glycine-rich NAD(P)-binding motif consensus, GXXG, which conserves part of the motif of extended SDR. Furthermore, they lack the characteristic active site residues of the SDRs. This subgroup is related to phenylcoumaran benzylic ether reductase, an NADPH-dependent aromatic alcohol reductase. One member is identified as a putative NAD-dependent epimerase/dehydratase. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	6.16387e-90
NZ_CP017713.1|WP_010009275.1|2711865_2713626_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224055	COG1132, MdlB, ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components [Defense mechanisms].	3.54043e-171

Protein sequences

>NZ_CP017713.1|WP_010009266.1|2698685_2699522_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase-MsrA
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>NZ_CP017713.1|WP_010009265.1|2697955_2698597_-|SDR-family-oxidoreductase
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>NZ_CP017713.1|WP_010009263.1|2695015_2695843_-|metallophosphoesterase
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>NZ_CP017713.1|WP_069700543.1|2692906_2694289_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase
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>NZ_CP017713.1|WP_081455883.1|2702337_2702658_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2
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>NZ_CP017713.1|WP_010009270.1|2703716_2707781_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9
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MGE targeting detection<

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NZ_CP017713_4	4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701112-2701141	30	NC_042038	Enterobacteriophage phiKP26, complete genome	18584-18613	6	0.8
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NZ_CP017713_4	4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700320-2700349	30	LC375533	Pectobacterium phage PPWS2 DNA, complete genome	34326-34355	7	0.767
NZ_CP017713_4	4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700320-2700349	30	MK095210	Pectobacterium phage Zenivior, complete genome	1378-1407	7	0.767
NZ_CP017713_4	4.12|2700386|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700386-2700415	30	NZ_AP014817	Geminocystis sp. NIES-3708 plasmid pGM02, complete sequence	22025-22054	7	0.767
NZ_CP017713_4	4.24|2701178|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701178-2701207	30	NZ_CP048925	Lactobacillus plantarum strain X7022 plasmid unnamed4, complete sequence	8665-8694	7	0.767
NZ_CP017713_4	4.1|2699660|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2699660-2699689	30	NZ_CP013515	Rhizobium sp. N1314 plasmid pRspN1314d, complete sequence	69500-69529	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.1|2699660|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2699660-2699689	30	NZ_CP013605	Rhizobium sp. N731 plasmid pRspN731d, complete sequence	69494-69523	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.9|2700188|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700188-2700217	30	MG922974	Klebsiella phage KP8, complete genome	10806-10835	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700320-2700349	30	KF554508	Bacillus phage CP-51, complete genome	77697-77726	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700716-2700745	30	NZ_CP013600	Rhizobium sp. N741 plasmid pRspN741e, complete sequence	601698-601727	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700716-2700745	30	NZ_CP013504	Rhizobium esperanzae strain N561 plasmid pRspN561d, complete sequence	601699-601728	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700716-2700745	30	NZ_CP013510	Rhizobium sp. N1341 plasmid pRspN1341e, complete sequence	600139-600168	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700716-2700745	30	NZ_CP013521	Rhizobium sp. N113 plasmid pRspN113d, complete sequence	604386-604415	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700716-2700745	30	NZ_CP013494	Rhizobium sp. N6212 plasmid pRspN6212d, complete sequence	598505-598534	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700716-2700745	30	NZ_CP013515	Rhizobium sp. N1314 plasmid pRspN1314d, complete sequence	462006-462035	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700716-2700745	30	NZ_CP013594	Rhizobium sp. N871 plasmid pRspN871d, complete sequence	601699-601728	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700716-2700745	30	NZ_CP013605	Rhizobium sp. N731 plasmid pRspN731d, complete sequence	462000-462029	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.21|2700980|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2700980-2701009	30	AP011616	Thermus phage phiYS40 DNA, complete genome	90851-90880	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.21|2700980|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2700980-2701009	30	DQ997624	Thermus thermophilus phage YS40, complete genome	90852-90881	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.21|2700980|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2700980-2701009	30	NC_008584	Thermus phage phiYS40, complete genome	90852-90881	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701112-2701141	30	MN694098	Marine virus AFVG_250M415, complete genome	15063-15092	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	CP054927	Streptomyces fulvissimus strain NA06532 plasmid unnamed1, complete sequence	40214-40243	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	NZ_CP023068	Ensifer sojae CCBAU 05684 plasmid pSJ05684b, complete sequence	796665-796694	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	KC691254	Mycobacterium phage Breezona, complete genome	38947-38976	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	MN586030	Mycobacterium phage BobsGarage, complete genome	38947-38976	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	MH834600	Mycobacterium phage BigCheese, complete genome	38947-38976	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	KC661276	Mycobacterium phage Winky, complete genome	38947-38976	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	MF185730	Mycobacterium phage Miley16, complete genome	38947-38976	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	MF185728	Mycobacterium phage Finemlucis, complete genome	39233-39262	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	MN703410	Mycobacterium phage Itos, complete genome	37853-37882	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	MH779511	Mycobacterium phage LilDestine, complete genome	38945-38974	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701244-2701273	30	NC_015584	Mycobacterium virus Faith1, complete genome	38947-38976	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.27|2701376|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701376-2701405	30	NZ_CP037428	Myroides odoratimimus strain G13 plasmid pFM-G13, complete sequence	17453-17482	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.27|2701376|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701376-2701405	30	MK240351	Acinetobacter phage Henu6, complete genome	118610-118639	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.29|2701508|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	2701508-2701537	30	KC139516	Salmonella phage FSL SP-016, partial genome	28734-28763	8	0.733
NZ_CP017713_4	4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700320-2700349	30	HM144387	Bacillus phage W.Ph., complete genome	78909-78938	9	0.7
NZ_CP017713_4	4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700320-2700349	30	KC595513	Bacillus phage Shanette, complete genome	110787-110816	10	0.667
NZ_CP017713_4	4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT	2700320-2700349	30	NC_028982	Bacillus phage JL, complete genome	110075-110104	10	0.667

1. spacer 4.18|2700782|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012653 (Lactobacillus plantarum strain HFC8 isolate Lactobacillus plantarum plasmid pMK07, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

agttgctaagtccgatgggatcaatccatt	CRISPR spacer
agttgccaagtccgatggaatcaatccatt	Protospacer
******.***********.***********

2. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC699836 (Bacillus phage SIOphi, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgactgatatgggtggttatgataagccg	Protospacer
*.***********************  ** 

3. spacer 4.22|2701046|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047926 (Lactobacillus phage Semele, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867

atggctttccaaaaccagaattgattttta	CRISPR spacer
aatgctttccaaaaccaaaattggttttta	Protospacer
*  **************.*****.******

4. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to M84415 (Bacteriophage SPO1 DNA polymerase gene 31, complete cds) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
gagactgatatgggtggttatgatgatgcc	Protospacer
. **********************. * **

5. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY368639 (Bacillus phage vB_BsuM-Goe2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
gagactgatatgggtggttatgatgatgcc	Protospacer
. **********************. * **

6. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to KF669649 (Bacillus phage CampHawk, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
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. **********************. * **

7. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011421 (Bacillus phage SPO1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
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. **********************. * **

8. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY549443 (Enterococcus phage EFP01, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
ttaactgatatgggtggttatgataacccg	Protospacer
 ..********************** .** 

9. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH719082 (Escherichia phage vB_EcoM_IME392, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
agtattgataggggtagttatgatactcct	Protospacer
*  *.***** ****.*************.

10. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ668715 (Listeria phage LMTA-34, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgacagatatgggtggttatgacaaaccg	Protospacer
*.*** *****************.*  ** 

11. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK792752 (UNVERIFIED: Listera phage vB-LmoM-SH3-3, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgacagatatgggtggttatgacaaacca	Protospacer
*.*** *****************.*  ** 

12. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ535721 (Listeria phage List-36, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgacagatatgggtggttatgacaaacca	Protospacer
*.*** *****************.*  ** 

13. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN172529 (Listeria phage LP-039, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgacagatatgggtggttatgacaaacca	Protospacer
*.*** *****************.*  ** 

14. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT438761 (Listeria virus P61, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgacagatatgggtggttatgacaaacca	Protospacer
*.*** *****************.*  ** 

15. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT668624 (Listeria phage LP-Mix_6.2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgacagatatgggtggttatgacaaacca	Protospacer
*.*** *****************.*  ** 

16. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to DQ003638 (Listeria phage A511, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgacagatatgggtggttatgacaaaccg	Protospacer
*.*** *****************.*  ** 

17. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ591604 (Listeria phage LMTA-148, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgacagatatgggtggttatgacaaacca	Protospacer
*.*** *****************.*  ** 

18. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ094033 (Listeria phage LP-048, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgacagatatgggtggttatgacaaacca	Protospacer
*.*** *****************.*  ** 

19. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to JQ797329 (Listeria phage vB_LmoM_AG20, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
atgacagatatgggtggttatgacaaacca	Protospacer
*.*** *****************.*  ** 

20. spacer 4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014723 (Paraburkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

cagtcagggcgccttcaagcggccgtttac	CRISPR spacer
ctcccacggcgccgtcaagcggccgttttc	Protospacer
*  .** ****** ************** *

21. spacer 4.22|2701046|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP009691 (Bacillus mycoides strain ATCC 6462 plasmid pBMX_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

atggctttccaaaaccagaattgattttta	CRISPR spacer
aagtctgtccaaaaccagaaatgatttatt	Protospacer
* * ** ************* ****** * 

22. spacer 4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_007291 (Enterobacteria phage JK06, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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  * .**  ********* *********** *

23. spacer 4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ121662 (Escherichia virus Jk06, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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  * .**  ********* *********** *

24. spacer 4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_042038 (Enterobacteriophage phiKP26, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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  * .**  ********* *********** *

25. spacer 4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF771238 (Escherichia phage bV_EcoS_AHS24, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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  * .**  ********* *********** *

26. spacer 4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF771237 (Escherichia phage bV_EcoS_AHP42, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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  * .**  ********* *********** *

27. spacer 4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT825490 (Escherichia phage C119, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

aacagtt--caaagctaaaaaccctaacgtaa	CRISPR spacer
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  * .**  ********* *********** *

28. spacer 4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF771236 (Escherichia phage bV_EcoS_AHP24, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

aacagtt--caaagctaaaaaccctaacgtaa	CRISPR spacer
--ccattaccaaagctaacaaccctaacgtta	Protospacer
  * .**  ********* *********** *

29. spacer 4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047740 (Enterobacteria phage phiJLA23, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

aacagtt--caaagctaaaaaccctaacgtaa	CRISPR spacer
--ccattgccaaagctaacaaccctaacgtta	Protospacer
  * .**  ********* *********** *

30. spacer 4.4|2699858|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP019525 (Tenacibaculum phage PTm5 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

gtacgctcaattcttggccgaatataaccg	CRISPR spacer
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 ************** ***.****** ...

31. spacer 4.4|2699858|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP019524 (Tenacibaculum phage PTm1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

gtacgctcaattcttggccgaatataaccg	CRISPR spacer
ttacgctcaattctttgccaaatatattta	Protospacer
 ************** ***.****** ...

32. spacer 4.7|2700056|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007581 (Clostridium phage c-st, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

tatataataagtcttgtaaggtaaaggaaa	CRISPR spacer
attataataatacttgtaaggtaaataaat	Protospacer
  ********  ************* .** 

33. spacer 4.7|2700056|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP008983 (Clostridium phage c-st genomic DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

tatataataagtcttgtaaggtaaaggaaa	CRISPR spacer
attataataatacttgtaaggtaaataaat	Protospacer
  ********  ************* .** 

34. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN241318 (Enterococcus phage PEf771, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
ctaactgatatgggcggttatgataaccca	Protospacer
 ..***********.********** .** 

35. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN027503 (Enterococcus phage vB_OCPT_Ben, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
ctaactgatatgggcggttatgataaccca	Protospacer
 ..***********.********** .** 

36. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH542234 (Staphylococcus phage Terranova, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
gttacagatatgggtggttatgataaacct	Protospacer
.. ** *******************  **.

37. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT601270 (Bacillus phage vB_BsuM-Goe9, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
gagactgatatgggtggatatgatgatgct	Protospacer
. *************** ******. * *.

38. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MW004544 (Enterococcus phage EFGrKN, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
ctaactgatatgggcggttatgataaccca	Protospacer
 ..***********.********** .** 

39. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT416612 (Bacillus phage YungSlug, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
cataccgatatgggtggttatgataatgac	Protospacer
   **.******************* *  *

40. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_029009 (Enterococcus phage EFDG1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
ctaactgatatgggcggttatgataaccca	Protospacer
 ..***********.********** .** 

41. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT601271 (Bacillus phage vB_BsuM-Goe10, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
gagactgatatgggtggatatgatgatgct	Protospacer
. *************** ******. * *.

42. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH884511 (Exiguobacterium phage vB_EalM-132, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
tatacagatatgggtggttatgattctgca	Protospacer
   ** ****************** ** * 

43. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to LC557520 (Staphylococcus phage vB_SsapH-Golestan101-M DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
gccactgacatgggtggttatgatgaacca	Protospacer
.* *****.***************.  ** 

44. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048117 (Pectobacterium phage Khlen, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
aatccggatgtgggtggttatgttactcca	Protospacer
*   * ***.************ ****** 

45. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK095211 (Pectobacterium phage Zenivior_B1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
aatccggatgtgggtggttatgttactcct	Protospacer
*   * ***.************ ******.

46. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047758 (Pectobacterium phage PPWS1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
aatccggatgtgggtggttatgttactccg	Protospacer
*   * ***.************ ****** 

47. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048058 (Pectobacterium phage Lelidair, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
aatccggatgtgggtggttatgttactcca	Protospacer
*   * ***.************ ****** 

48. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to LC375533 (Pectobacterium phage PPWS2 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
aatccggatgtgggtggttatgttactccg	Protospacer
*   * ***.************ ****** 

49. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK095210 (Pectobacterium phage Zenivior, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
aatccggatgtgggtggttatgttactcct	Protospacer
*   * ***.************ ******.

50. spacer 4.12|2700386|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014817 (Geminocystis sp. NIES-3708 plasmid pGM02, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

tgatgacgataccgctattattaatctgcc	CRISPR spacer
agattacgatactgctattattaattacca	Protospacer
 *** *******.************.  * 

51. spacer 4.24|2701178|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP048925 (Lactobacillus plantarum strain X7022 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

tggcactcatacttaattgtcatttctttt	CRISPR spacer
agttgatcaaacttaattctcatttctttt	Protospacer
 * .. *** ******** ***********

52. spacer 4.1|2699660|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013515 (Rhizobium sp. N1314 plasmid pRspN1314d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

aggtcgccgacgatttttcgaagggtgcct	CRISPR spacer
tggtcgcggacgatttttagaaggccgtag	Protospacer
 ****** ********** ***** .*.  

53. spacer 4.1|2699660|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013605 (Rhizobium sp. N731 plasmid pRspN731d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

aggtcgccgacgatttttcgaagggtgcct	CRISPR spacer
tggtcgcggacgatttttagaaggccgtag	Protospacer
 ****** ********** ***** .*.  

54. spacer 4.9|2700188|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG922974 (Klebsiella phage KP8, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

ggacaattatttattgcaacagcaatccgg	CRISPR spacer
aaaaagttatttattgcatcagcaatctta	Protospacer
..* *.************ ********. .

55. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to KF554508 (Bacillus phage CP-51, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
gaaactgatatgggtggttatgatgatgag	Protospacer
. .*********************. *   

56. spacer 4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013600 (Rhizobium sp. N741 plasmid pRspN741e, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

cagtcagggcgccttcaagcggccgtttac	CRISPR spacer
tttcgagggcgccttcaagcggccgattgt	Protospacer
.  . ******************** **..

57. spacer 4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013504 (Rhizobium esperanzae strain N561 plasmid pRspN561d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

cagtcagggcgccttcaagcggccgtttac	CRISPR spacer
tttcgagggcgccttcaagcggccgattgt	Protospacer
.  . ******************** **..

58. spacer 4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013510 (Rhizobium sp. N1341 plasmid pRspN1341e, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

cagtcagggcgccttcaagcggccgtttac	CRISPR spacer
tttcgagggcgccttcaagcggccgattgt	Protospacer
.  . ******************** **..

59. spacer 4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013521 (Rhizobium sp. N113 plasmid pRspN113d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

cagtcagggcgccttcaagcggccgtttac	CRISPR spacer
tttcgagggcgccttcaagcggccgattgt	Protospacer
.  . ******************** **..

60. spacer 4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013494 (Rhizobium sp. N6212 plasmid pRspN6212d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

cagtcagggcgccttcaagcggccgtttac	CRISPR spacer
tttcgagggcgccttcaagcggccgattgt	Protospacer
.  . ******************** **..

61. spacer 4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013515 (Rhizobium sp. N1314 plasmid pRspN1314d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

cagtcagggcgccttcaagcggccgtttac	CRISPR spacer
tttcgagggcgccttcaagcggccgattgt	Protospacer
.  . ******************** **..

62. spacer 4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013594 (Rhizobium sp. N871 plasmid pRspN871d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

cagtcagggcgccttcaagcggccgtttac	CRISPR spacer
tttcgagggcgccttcaagcggccgattgt	Protospacer
.  . ******************** **..

63. spacer 4.17|2700716|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013605 (Rhizobium sp. N731 plasmid pRspN731d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

cagtcagggcgccttcaagcggccgtttac	CRISPR spacer
tttcgagggcgccttcaagcggccgattgt	Protospacer
.  . ******************** **..

64. spacer 4.21|2700980|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to AP011616 (Thermus phage phiYS40 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

acgattgccagaaaattttagaaaattatg	CRISPR spacer
cgcactttaagaaaattttagaaaagtatg	Protospacer
   *.* . **************** ****

65. spacer 4.21|2700980|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to DQ997624 (Thermus thermophilus phage YS40, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

acgattgccagaaaattttagaaaattatg	CRISPR spacer
cgcactttaagaaaattttagaaaagtatg	Protospacer
   *.* . **************** ****

66. spacer 4.21|2700980|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_008584 (Thermus phage phiYS40, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

acgattgccagaaaattttagaaaattatg	CRISPR spacer
cgcactttaagaaaattttagaaaagtatg	Protospacer
   *.* . **************** ****

67. spacer 4.23|2701112|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN694098 (Marine virus AFVG_250M415, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

aacagttcaaagctaaaaaccctaacgtaa	CRISPR spacer
aacagttaaaagctaaaaacccagtgtttg	Protospacer
******* ************** .   * .

68. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP054927 (Streptomyces fulvissimus strain NA06532 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
ctgtcggtggcggtgacggtcacgttcgag	Protospacer
. *  ********* ***.*********. 

69. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023068 (Ensifer sojae CCBAU 05684 plasmid pSJ05684b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
gagttcgtggcggtcacgatcacgttctcg	Protospacer
 **   ********.************   

70. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC691254 (Mycobacterium phage Breezona, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
cttaaggtgccggttacggtcacgttcgac	Protospacer
.  *.**** ********.*********..

71. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN586030 (Mycobacterium phage BobsGarage, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
cttaaggtgccggttacggtcacgttcgac	Protospacer
.  *.**** ********.*********..

72. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH834600 (Mycobacterium phage BigCheese, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
cttaaggtgccggttacggtcacgttcgac	Protospacer
.  *.**** ********.*********..

73. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC661276 (Mycobacterium phage Winky, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
cttaaggtgccggttacggtcacgttcgac	Protospacer
.  *.**** ********.*********..

74. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF185730 (Mycobacterium phage Miley16, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
cttaaggtgccggttacggtcacgttcgac	Protospacer
.  *.**** ********.*********..

75. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF185728 (Mycobacterium phage Finemlucis, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
cttaaggtgccggttacggtcacgttcgac	Protospacer
.  *.**** ********.*********..

76. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN703410 (Mycobacterium phage Itos, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
cttaaggtgccggttacggtcacgttcgac	Protospacer
.  *.**** ********.*********..

77. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH779511 (Mycobacterium phage LilDestine, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
cttaaggtgccggttacggtcacgttcgac	Protospacer
.  *.**** ********.*********..

78. spacer 4.25|2701244|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_015584 (Mycobacterium virus Faith1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tagagggtggcggttacgatcacgttcggt	CRISPR spacer
cttaaggtgccggttacggtcacgttcgac	Protospacer
.  *.**** ********.*********..

79. spacer 4.27|2701376|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP037428 (Myroides odoratimimus strain G13 plasmid pFM-G13, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

attaaacatcgatcaacagcatttcaaaaa	CRISPR spacer
attaaagatcgatctacagcattattatct	Protospacer
****** ******* ******** . *   

80. spacer 4.27|2701376|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK240351 (Acinetobacter phage Henu6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

attaaacatcgatcaacagcatttcaaaaa	CRISPR spacer
gtacaacatcgatcaacagaatatcaacgc	Protospacer
.*  *************** ** **** . 

81. spacer 4.29|2701508|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KC139516 (Salmonella phage FSL SP-016, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tgaccgataggagcaatttccagcgcttcg	CRISPR spacer
tactgcttacgtgcaatttccagcgcttcg	Protospacer
*. .   ** * ******************

82. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to HM144387 (Bacillus phage W.Ph., complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
ttcactgatatgggcggttatgatagggag	Protospacer
 . ***********.**********     

83. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC595513 (Bacillus phage Shanette, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
gaaactgacatgggtggttatgatgacgag	Protospacer
. .*****.***************. .   

84. spacer 4.11|2700320|30|NZ_CP017713|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028982 (Bacillus phage JL, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667

acgactgatatgggtggttatgatactccc	CRISPR spacer
gaaactgacatgggtggttatgatgacgag	Protospacer
. .*****.***************. .   

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4628 : 63068	55	Bacillus_phage(23.81%)	transposase,integrase	NA
DBSCAN-SWA_2	72201 : 130340	48	Paenibacillus_phage(30.0%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_3	392374 : 456313	55	Streptococcus_phage(15.79%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	461102 : 515736	52	unidentified_phage(13.33%)	transposase,tRNA,integrase	attL 488443:488457|attR 502469:502483
DBSCAN-SWA_5	524592 : 571332	41	Pseudomonas_phage(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	650504 : 723515	55	Streptococcus_phage(26.67%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_7	755186 : 812842	59	Streptococcus_phage(56.52%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	889602 : 940395	40	unidentified_phage(20.0%)	transposase,tRNA,integrase	attL 924248:924265|attR 940530:940547
DBSCAN-SWA_9	1075172 : 1136857	60	Streptococcus_phage(22.73%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_10	1273854 : 1320855	41	Orpheovirus(11.11%)	transposase,lysis,tRNA,integrase	attL 1289109:1289126|attR 1330037:1330054
DBSCAN-SWA_11	1337578 : 1346150	9	Synechococcus_phage(50.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_12	1349817 : 1407814	59	Bacillus_phage(21.43%)	transposase,tRNA,protease,integrase	attL 1352571:1352587|attR 1390808:1390824
DBSCAN-SWA_13	1521629 : 1529213	7	Staphylococcus_phage(33.33%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_14	1823765 : 1891022	60	Staphylococcus_phage(18.18%)	bacteriocin,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_15	1954732 : 2008407	47	Lactobacillus_phage(42.11%)	tRNA,tail,plate,protease,integrase,transposase	attL 1954334:1954349|attR 2012822:2012837
DBSCAN-SWA_16	2027146 : 2084958	42	unidentified_phage(30.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_17	2165580 : 2172402	8	Streptococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_18	2244342 : 2298787	53	Streptococcus_phage(20.0%)	transposase,integrase	attL 2245762:2245777|attR 2291396:2291411
DBSCAN-SWA_19	2376352 : 2452301	58	unidentified_phage(25.0%)	transposase	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

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MKIEEGYMPFRGYKTYYRIVGEPSKDKAPLLLIHGGPGSSHNYFELMDDYAETGRQLIMYDQVGCGKSSLPEDESVYIKETWAEELVALRRYLHLDELHMLGQSWGGMLEMLYLTQYDQTGIKSVMIDGSPASIKLWTQEQHRLISYLSYEDREAIAEAERTGDFSGPKYLAANDRYMERYCWDDPDENSPEPLRRPTNGKRASLIAEGPNEFTENGTISDFEITDQLKKIHVPVLVTNGTDDLCTPLIAKSVYDHIPGAKWHLFANSRHLALLDQHDEFISVLDQWLAAND
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MTGDLIIHTDLGSQYTSDDYNQRLTELHIRHSYSRKGCPYDNAPMESFHASLKKECVYPVPVFEDYETAAAVLFEYVHAFYNRKRIHSSLGYQTPLQVEIATLTSQMAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_056943259.1|4628_6581_+	DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	9.8e-143	45.0
WP_003677393.1|6709_9271_+	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	9.6e-114	34.9
WP_003680796.1|9594_9894_+	30S ribosomal protein S6	NA	NA	NA	NA
WP_003680798.1|9933_10488_+	single-stranded DNA-binding protein	U5U726	Lactobacillus_phage	1.4e-41	61.4
WP_003680800.1|10517_10763_+	30S ribosomal protein S18	NA	NA	NA	NA
WP_069700454.1|10898_11318_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	H7BW99	unidentified_phage	1.1e-11	50.0
WP_141707630.1|11306_11591_+|transposase	transposase	Q6J1X3	Lactobacillus_phage	9.2e-26	98.4
WP_191982320.1|11631_12141_+|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X2	Lactobacillus_phage	1.2e-89	98.8
WP_080595765.1|12144_12474_+|transposase	transposase	Q6J1X2	Lactobacillus_phage	4.0e-57	99.1
WP_010010464.1|12867_14880_+	DHH family phosphoesterase	NA	NA	NA	NA
WP_169925054.1|15120_16566_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A1X9I6E7	Streptococcus_phage	1.5e-07	27.7
WP_003680229.1|16710_17163_+	50S ribosomal protein L9	NA	NA	NA	NA
WP_003680228.1|17358_18765_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	3.0e-125	53.1
WP_141707574.1|18910_19057_+	DUF1211 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010467.1|19063_19321_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010468.1|19775_21068_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010469.1|21116_21584_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010471.1|21717_22260_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010472.1|22314_23262_-	TDT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_003680679.1|23494_24787_+	adenylosuccinate synthase	L7Y4J5	Megavirus	1.4e-65	34.6
WP_010010473.1|25046_25844_-	gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010474.1|26518_27229_+	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	6.0e-42	40.4
WP_010010475.1|27465_29346_+	cell wall metabolism sensor histidine kinase WalK	W8CYF6	Bacillus_phage	3.2e-34	33.7
WP_010010476.1|29335_30658_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010477.1|30657_31482_+	two-component system regulatory protein YycI	NA	NA	NA	NA
WP_010010479.1|31617_32430_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_010010480.1|32528_33788_+	trypsin-like peptidase domain-containing protein	A0A1B1IT49	uncultured_Mediterranean_phage	4.0e-20	30.6
WP_029507996.1|34423_34903_+	23S rRNA (pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase RlmH	NA	NA	NA	NA
WP_010010482.1|35045_35621_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0S2MVM8	Bacillus_phage	3.3e-06	45.0
WP_003678159.1|36121_37000_+	proline iminopeptidase-family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_010010483.1|37390_39358_+	TetM/TetW/TetO/TetS family tetracycline resistance ribosomal protection protein	E4ZFJ7	Streptococcus_phage	1.1e-72	32.9
WP_029508001.1|39347_39893_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010486.1|39889_40222_+	aminoglycoside 6-adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_029507997.1|40276_40729_+	aminoglycoside 6-adenylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_010010488.1|40811_42248_-	multidrug efflux MFS transporter	A0A0M3UL24	Mycobacterium_phage	7.2e-18	23.7
WP_010010489.1|42247_42685_-	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_010010490.1|42851_43505_+	DNA alkylation repair protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010492.1|44044_44839_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_169925055.1|45036_46482_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.5e-07	28.3
WP_029507998.1|46625_47207_+	uracil-DNA glycosylase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_029507999.1|47323_48877_+	gluconokinase	NA	NA	NA	NA
WP_010010495.1|48922_52858_-	MMPL family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010010496.1|53167_53761_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_010010497.1|53838_54579_-	peroxide stress protein YaaA	NA	NA	NA	NA
WP_010010498.1|54706_55099_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0S2MVM8	Bacillus_phage	2.9e-06	43.3
WP_010010499.1|55109_55433_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_056943304.1|55749_56475_+	carboxymethylenebutenolidase	NA	NA	NA	NA
WP_056943305.1|56655_57105_-	DUF2188 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677733.1|57353_58484_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677731.1|58476_59172_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.6e-37	38.5
WP_003677729.1|59158_60373_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_010010503.1|60409_60943_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010504.1|61051_61825_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0S2MVM8	Bacillus_phage	5.6e-09	44.3
WP_056943306.1|61821_62289_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_086989537.1|62292_63068_-|transposase	IS5-like element ISLpl3 family transposase	A0A0N9SHJ4	Paenibacillus_phage	2.1e-27	53.2

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP017713|72201:130340|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003677697.1|87957_88617_-	amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
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WP_003677693.1|91489_92407_+	YafY family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_010010541.1|92523_94509_+	sodium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_010010542.1|94701_97413_+	HAD-IC family P-type ATPase	M1HN09	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.2e-66	26.5
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WP_003677690.1|98324_99005_-	EAL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010544.1|100577_101324_-	nitroreductase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_099267083.1|109089_109877_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_099267086.1|121340_122711_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_003567312.1|122845_123403_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010814.1|123497_124367_-	DUF2075 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_015473476.1|124466_125396_+|transposase	IS30-like element ISLpl1 family transposase	H7BW61	unidentified_phage	8.5e-20	29.9
WP_099267087.1|125612_127727_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit	K4FB40	Cronobacter_phage	2.4e-118	39.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP017713|392374:456313|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MDQFTKNLTKTLLSNGDVKELFRQQLETAINHILQAELTALLGYDPYDRSGFNTGNSRNGQYYRLIDSEYGKLKIAVPRDRKGHFHNHLLPAYSRRQDALETTIIQLYSKGVTTREITDLIEKMYGAYYSPTTVSNITAQVTKQIEAFHQRTIKANYVCLFLDATYLPLRRDSVQREAVYIALGITSVGIKEVLDYRIAPSENAGVWSEMAEDLKKRGLEQVQLIIADGMVGLQPALLHAFPKAKFQRCLVHVMRNIGSHVRLKDREAILNDFKELHSATDVTAAHKILNDFYGAWGKSYSNLIQQLKSIENELLAFLSFPPAIRPTIYSTNILESLNKRIKRKTKPKE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_099267096.1|392374_393685_-|transposase	IS1380 family transposase	A0A1X9I6F6	Streptococcus_phage	4.6e-128	54.3
WP_056943319.1|393833_394898_+	Ldh family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_010011488.1|395345_395957_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	A0A249XZV3	Enterococcus_phage	7.1e-23	75.8
WP_010011490.1|396100_396931_+	YitT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011491.1|397101_399093_+	KUP/HAK/KT family potassium transporter	M1HZV6	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	4.8e-60	32.8
WP_056943320.1|399146_399668_-	DUF308 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003678599.1|399880_400759_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_176720015.1|400938_401646_-	MIP family channel protein	M1HWZ0	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.9e-32	35.0
WP_010011496.1|401717_403550_-	type 1 glycerol-3-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_010011498.1|403718_405230_-	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
WP_164512712.1|405505_406534_+|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	1.1e-41	33.5
WP_099267097.1|406715_407789_-|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	5.7e-44	35.2
WP_099267098.1|408129_409440_-|transposase	IS1380 family transposase	A0A1X9I6F6	Streptococcus_phage	1.0e-127	54.1
WP_003678595.1|409800_410556_+	DeoR/GlpR transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003678594.1|410685_411678_+	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	9.3e-49	35.3
WP_010011499.1|411723_412524_-	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003678592.1|412614_413676_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011500.1|413668_414544_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011501.1|414717_415734_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011502.1|415903_416764_-	aldo/keto reductase	A0A1V0SKP9	Klosneuvirus	1.3e-33	31.6
WP_003678588.1|416979_418332_-	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_029507699.1|419033_420434_+	sodium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_056943290.1|420514_421078_+	NUDIX hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_010011508.1|421193_421853_+	nitroreductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_056943289.1|422264_423089_+	metal ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011511.1|424420_425566_+	ArgE/DapE family deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_003679769.1|425711_426263_+	sugar O-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_035457528.1|426766_428329_+	BCCT family transporter	A0A2I7QNT1	Vibrio_phage	1.8e-06	22.5
WP_035457526.1|428580_428958_-	YbaN family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003679762.1|428997_430311_-	HlyC/CorC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010011514.1|430582_430744_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003679760.1|430865_431306_-	Hsp20/alpha crystallin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003679758.1|431687_432854_+	ABC transporter ATP-binding protein	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	1.7e-17	49.5
WP_003679756.1|432850_433486_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_010011515.1|433485_434415_+	osmoprotectant ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_176720025.1|434423_435083_+	ABC transporter permease	G3M9Y4	Bacillus_virus	1.0e-06	29.1
WP_099235711.1|435861_437244_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	4.2e-31	29.6
WP_010011516.1|437620_438160_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_010011517.1|438360_439071_+	5-oxoprolinase subunit PxpB	NA	NA	NA	NA
WP_010011519.1|439082_440087_+	biotin-dependent carboxyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011520.1|440118_440529_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit	NA	NA	NA	NA
WP_010011521.1|440545_441859_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
WP_029508041.1|441996_442746_+	LamB/YcsF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003680334.1|442778_443984_+	divalent metal cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_099235711.1|444472_445855_+	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	4.2e-31	29.6
WP_035456850.1|446156_447347_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_035456844.1|447753_448632_+	branched-chain amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_029508042.1|448641_449595_+	branched-chain amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_010011528.1|449597_450374_+	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2R8FG22	Brazilian_cedratvirus	3.7e-16	27.8
WP_010011529.1|450373_451084_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	1.3e-15	31.4
WP_010011530.1|451089_451713_+	CBS domain-containing protein	M1NSC5	Streptococcus_phage	1.3e-45	49.5
WP_169925044.1|452090_453140_-|transposase	IS256 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_050781705.1|453254_454298_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011532.1|454341_455088_-	ATP-binding protein	A0A059NT77	Lactococcus_phage	2.8e-58	49.2
WP_029508043.1|455089_456313_-|transposase	IS21 family transposase	A0A059NT83	Lactococcus_phage	1.7e-100	49.0

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP017713|461102:515736|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010011547.1|464690_465836_-	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010011548.1|465990_467175_-	amidohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_010011549.1|467244_467646_+	arsenate reductase (thioredoxin)	A0A2H4PQT9	Staphylococcus_phage	2.4e-32	54.3
WP_010011550.1|467722_468403_-	fructose-6-phosphate aldolase	I3ULK3	Synechococcus_phage	3.7e-20	30.7
WP_010011553.1|468420_470850_-	glycyl radical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011554.1|471242_471989_-	DeoR/GlpR transcriptional regulator	A0A077SK06	Escherichia_phage	7.8e-16	27.6
WP_010011555.1|472124_472928_+	glycyl-radical enzyme activating protein	NA	NA	NA	NA
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WP_004562524.1|476686_477871_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010011562.1|477919_480943_-	carbamoyl-phosphate synthase large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_010011563.1|480990_482067_-	carbamoyl phosphate synthase small subunit	R4TGJ8	Halovirus	1.4e-53	35.4
WP_010011565.1|482468_483494_+	N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase	NA	NA	NA	NA
WP_010011566.1|483641_484838_+	bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase ArgJ	NA	NA	NA	NA
WP_010011567.1|484896_485652_+	acetylglutamate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_010011568.1|485648_486785_+	acetylornithine transaminase	A0A1V0SKB7	Klosneuvirus	1.0e-14	26.2
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WP_010011570.1|488020_488329_-	DUF960 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
488443:488457	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_004562511.1|495630_496218_+	dihydroxyacetone kinase subunit L	NA	NA	NA	NA
WP_010011578.1|496214_496583_+	PTS-dependent dihydroxyacetone kinase phosphotransferase subunit DhaM	NA	NA	NA	NA
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WP_056943352.1|500214_500778_+	TIGR01440 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_056943369.1|502575_503442_+	SPFH domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
502469:502483	attR	NA	NA	NA	NA
WP_086989537.1|503456_504232_-|transposase	IS5-like element ISLpl3 family transposase	A0A0N9SHJ4	Paenibacillus_phage	2.1e-27	53.2
WP_056943377.1|504323_504683_-	AP2 domain-containing protein	A8ATW6	Listeria_phage	6.4e-08	33.1
WP_099267102.1|505021_506344_+|transposase	IS1380 family transposase	A0A1X9I6F6	Streptococcus_phage	3.8e-74	38.0
WP_010011865.1|506659_507286_+	recombinase family protein	A0A1B0VBM1	Salmonella_phage	8.0e-14	35.6
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WP_010011861.1|510203_510491_+	chorismate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_010013330.1|510524_511007_+	NUDIX domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011858.1|511298_511766_+	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_010011857.1|511833_512157_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011855.1|512178_513021_+	DUF72 domain-containing protein	A0A1D6Y809	Golden_Marseillevirus	2.3e-11	26.2
WP_010011853.1|513039_513594_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_010011852.1|513705_515736_+|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0SHR2	Klosneuvirus	3.7e-92	37.8

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP017713|524592:571332|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010011830.1|529298_529634_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_056943324.1|531394_532090_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_010011827.1|532429_533341_+	citrate (pro-3S)-lyase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_010011826.1|533333_534872_+	citrate lyase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
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WP_010011823.1|535508_536378_+	triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase CitG	NA	NA	NA	NA
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WP_099267105.1|540654_541548_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.9e-25	30.1
WP_056943364.1|541625_542651_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.4e-41	32.4
WP_099267184.1|542822_543326_+	PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IID	NA	NA	NA	NA
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WP_056943371.1|546196_546769_+	HTH domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_040473047.1|548210_549536_+	PRD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_056943322.1|549557_551474_+	PTS sugar transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
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WP_010009386.1|554075_554741_+	hypothetical protein	A0A0E3G348	Synechococcus_phage	5.9e-39	42.2
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WP_035457925.1|567826_569380_+|transposase	IS66 family transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	5.2e-54	31.4
WP_099267108.1|569769_571332_+|transposase	IS21 family transposase	K4I413	Acidithiobacillus_phage	1.4e-70	34.7

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP017713|650504:723515|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_099267111.1|650504_651776_+|transposase	ISL3 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	7.0e-49	31.7
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WP_010010879.1|652605_653292_-	amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_010010880.1|653398_654199_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010881.1|654461_655721_+	hydroxymethylglutaryl-CoA reductase, degradative	NA	NA	NA	NA
WP_010010882.1|656113_656485_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010883.1|656668_658495_+	cadmium-translocating P-type ATPase	E4ZFI9	Streptococcus_phage	3.1e-58	28.3
WP_029508015.1|658678_660082_+	isochorismate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_010010885.1|660071_661757_+	2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3- cyclohexene-1-carboxylic-acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_010010887.1|661749_662559_+	2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_010010888.1|662558_663671_+	o-succinylbenzoate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_010010889.1|663684_665013_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_141707555.1|665164_666130_-	decarboxylating 6-phosphogluconate dehydrogenase	M4SJX8	Cyanophage	4.4e-51	35.7
WP_010010891.1|666309_667155_+	MurR/RpiR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_010010894.1|667191_667551_-	DUF4828 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010895.1|667855_668857_+	Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_010010896.1|668856_670116_+	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	5.7e-35	28.7
WP_010010897.1|670108_670447_+	PTS lactose/cellobiose transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_010010898.1|670760_671174_+	DUF3284 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010900.1|671740_671902_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010902.1|671947_672163_-	CsbD family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010903.1|672276_673527_-	aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_010010904.1|673743_674358_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_035457969.1|674541_675891_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_003677192.1|675971_676424_-	flavodoxin	NA	NA	NA	NA
WP_010010908.1|677672_678557_+	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	8.0e-68	48.1
WP_003677187.1|678613_678937_-	heavy metal-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010910.1|678993_680391_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	A0A2K5B251	Erysipelothrix_phage	2.8e-83	36.7
WP_010010911.1|680718_681519_+	recombination regulator RecX	NA	NA	NA	NA
WP_010010912.1|681644_682178_+	DUF402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010913.1|682232_682556_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010915.1|682591_683023_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_010010916.1|683316_684444_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010010917.1|684530_685862_+	HlyC/CorC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010010918.1|685914_687513_+	peptide chain release factor 3	A0A1B0RXH7	Streptococcus_phage	1.2e-32	27.2
WP_035456673.1|687599_688274_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_035456720.1|688270_689164_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.9e-25	30.1
WP_010010921.1|689238_690348_-	MucBP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010922.1|690445_690721_-	DUF1827 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_029507742.1|691091_693326_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit	H6X3M6	Enterobacteria_phage	2.2e-122	40.9
WP_010010924.1|693555_693744_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677166.1|693932_694199_+	phosphocarrier protein HPr	NA	NA	NA	NA
WP_010010925.1|694198_695923_+	phosphoenolpyruvate--protein phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_010010927.1|696197_697376_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010928.1|697409_698432_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010929.1|698434_699451_+	flippase-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010930.1|699621_699858_+	YkuJ family protein	NA	NA	NA	NA
WP_056943314.1|700228_702298_+	LTA synthase family protein	W6LM83	Streptococcus_phage	5.9e-146	45.2
WP_010011787.1|709066_709537_+	CtsR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_010011786.1|709557_712047_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit	H6X3M6	Enterobacteria_phage	3.3e-127	41.1
WP_010011785.1|712192_713116_+	U32 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_010011784.1|713117_714341_+	U32 family peptidase	Q6DW11	Phage_TP	8.8e-41	32.6
WP_010011782.1|714711_718302_+	DNA-directed RNA polymerase subunit beta	A0A1B1ISA9	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-49	25.0
WP_003679858.1|718314_721962_+	DNA-directed RNA polymerase subunit beta'	R4TQM7	Phaeocystis_globosa_virus	4.3e-67	25.3
WP_099235908.1|722147_723515_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP017713|755186:812842|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_137601667.1|758399_758621_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011744.1|759125_759323_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010011741.1|760078_761503_-	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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WP_010011732.1|766972_767323_-	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2H4PQT4	Staphylococcus_phage	4.6e-19	42.3
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WP_010011728.1|770888_771194_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_056943271.1|771195_772191_-	lysozyme family protein	A0A1S5SEZ8	Streptococcus_phage	7.8e-104	58.7
WP_056943272.1|772187_774227_-	hypothetical protein	A0A1S5SF30	Streptococcus_phage	7.3e-149	51.5
WP_010011725.1|774227_776681_-	ATP-binding protein	A0A1S5SF64	Streptococcus_phage	0.0e+00	66.5
WP_010011724.1|776677_777058_-	conjugal transfer protein	A0A1S5SEX7	Streptococcus_phage	2.7e-41	67.2
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WP_003678268.1|777654_777876_-	hypothetical protein	A0A1S5SEY0	Streptococcus_phage	4.9e-27	83.6
WP_003678263.1|777899_778622_-	site-specific DNA-methyltransferase	A0A2K8IKC3	Lactococcus_phage	2.0e-69	54.3
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WP_010011721.1|779049_779370_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011720.1|779366_780566_-	replication initiation factor domain-containing protein	A0A1S5SEX3	Streptococcus_phage	1.5e-93	45.2
WP_056943273.1|780877_782707_+	RNA-directed DNA polymerase	NA	NA	NA	NA
WP_010011717.1|782758_783019_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011716.1|783058_784426_-	DNA translocase FtsK	A0A1S5SFB5	Streptococcus_phage	2.3e-146	61.0
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WP_010011713.1|784801_785644_-	nucleotidyl transferase AbiEii/AbiGii toxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003678254.1|785640_786234_-	abortive infection protein	NA	NA	NA	NA
WP_056943274.1|786394_786763_-	YdcP family protein	A0A1S5SF96	Streptococcus_phage	5.9e-25	48.4
WP_056943275.1|786781_787114_-	YdcP family protein	A0A1S5SF38	Streptococcus_phage	5.0e-15	41.7
WP_056943276.1|787146_787413_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_056943277.1|787409_791318_-	LPXTG cell wall anchor domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267113.1|791908_793201_-|transposase	ISL3 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	9.3e-49	31.7
WP_099267114.1|793287_794211_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	8.2e-31	30.9
WP_169925062.1|794317_795349_+|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	8.8e-42	34.4
WP_010011708.1|795500_795965_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011707.1|796054_796390_+	thiol reductase thioredoxin	A0A1X9I9P5	Staphylococcus_phage	9.2e-09	33.7
WP_010011706.1|796382_796901_+	transcription repressor NadR	NA	NA	NA	NA
WP_003677967.1|796951_797221_-	30S ribosomal protein S14	NA	NA	NA	NA
WP_010011705.1|797428_798616_+	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	9.6e-08	24.7
WP_010011703.1|798716_799097_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_010011702.1|799099_800233_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011701.1|800242_800455_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_141707562.1|800491_801445_-	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_010011699.1|801383_801752_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677962.1|802016_802550_-	serine O-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_010011695.1|802585_803725_-	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_010011694.1|803743_804652_-	cysteine synthase family protein	A0A1X9I5K7	Streptococcus_phage	1.3e-65	43.8
WP_010011693.1|805034_805907_-	bifunctional hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_010011692.1|805906_806398_-	ECF transporter S component	NA	NA	NA	NA
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WP_010011687.1|808501_809494_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_010011686.1|809546_810821_-	O-acetylhomoserine aminocarboxypropyltransferase/cysteine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_099267116.1|811519_812842_+|transposase	IS1380 family transposase	A0A1X9I6F6	Streptococcus_phage	2.9e-74	38.0

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP017713|889602:940395|DBSCAN-SWA
AATGTTTATTATTTATGTCAATCTGGACTATCATCGTTTGCCGCTGGCACTTCGTGAGCAATTTTCATTTGCGGCGGAGCAACTGGCGCAAGCCGATCAAAAATTAAATCAGGAAAAAAGTATCCTGGAAAATGTCATTTTATCAACCTGTAATCGTACCGAAATTTATGCGGTCGTTGATCAGATCCACACGGGCCGTTATTATTTGAAGCGTTTCTTGGCCAACTGGTTTAATGTCGACTTAGCGACGATCAATACCTATGTTATGATTGAAGAACAGGACGCTGCAGTGACCCATTTATTCCGGGTTGCTAGTGGTTTGGAATCATTGATCGTTGGTGAACCACAAATCTTAGGTCAAGTTAAACGGGCTTTCTTTGCGGCTCAAGCCAATGCAACGACTGGCGCAATTTTCAATCATTTATTCCAAGAAGTGATTACTTTTGCCAAACGGATGCATACAGAATATAAGATCAGTGAACATTCAATTTCATCGAGTCAGGCCGGCTTACATCAGATTAAATCCCATCTACAAGCTTTACAGGGTAAACAATTGGCAATTGTTGGCTTAGGTGAAATTGGTCGCCAAGCGTTGGATAATGCCTACAATATGGGCTTTAGTCATATTGTTTTAGTCAACCGAACTTTAAGTAAAGCGCAACATTTAGCGGCTAATTTTGGTCAGCAAGTCAGCGCTGCGCCGTTGACTAACTTAACTGAGGTTTTAGCCGATTCTGATGCGGTGATCACTGCGGTGGCGGCACGTGAACCGGTGATTACTGAACAAACGTTGACAAAACGGCGGCCAAATTTGGTATTGATTGATCTGGGAGTTCCGCGCAATATTCGTTTAACCCCACAATTAGCGGATCAATTGCATTATTACAATATTGATCAACTGACAGAGATCGTTCAATCCAATAATGAATTACGCCAGCAGTTAGTCAAAAAGATTGCCGCGGAAATTCCCGTTGCGGTACAGGATTACTATACCTGGCAACGCCAATTACATATCGTTCCGGTGATCAAGGAATTACGTGAATCAGCTTTAGCGGTGCAGGGTACCGCCTTGACTAGTCTGCAGCGTAAGTTACCTGAGTTAGACGAACATGAGCTAAAAGTGATCCGTAAGCATATGAAGAGCATTGTGAATCAGTTGATCAAGCAACCGATCAAAACGATCAAAGAGTTATCGGTCACAACCGATGCAGAGGTCGACATTGATTTCTTTAAACAGATTTTCGGTTTAGATGAAGATGAAGCGACTGCTAAGAAGGAGGTTGCTAAATGAAAACAACGTTTATTATTGGCACACGTAAAAGTAAACTAGCTTTATGCCAATCCCAATTAGTGCAAAAACAATTACAAACACGATTTCCGCAACTGGAATTTAAGCTCCAGCCGATTGTAACTGAAGGCGACCGTAACTTACATGACAGTCTACAAAAAATCGGTGGTAAAGGTGTTTTTGTTAAAGAAATTGAACACGAACTATTATCCGCAAAAATTGATTTTGCAGTGCATAGTTTGAAAGATGTACCACCGGTTTTACCGCAGGGTTTAACGATTGGCGCAGTGCCAAAACGAGCTTCAGCATTTGATTGCCTGATCACGGTGGCACCCATCAAATCGTTAGCTGATTTACCCCAAAATGCGCGTATCGGCACCAATAGTTTACGTCGTGAAGGGCAGTTATTGCACGCACGGCCGGATTTAGTGATCGTACCAATTCGCGGTAATGTCGATACTCGCTTAGCTAAAATTGCTAGTGAAAACTTGGCCGGCATTGTTTTGGCTGAGGCTGGTTTAGATCGTTTGGCCGTTGATATTGCGCCTTATTATCGTTACTCCTTACAAGACGTAATTTTGCCAGCCACTGGTCAAGGTGCATTGGCAATCGAATGCCGGCAAGCGGATACCGATACTTTGGGACTATTAGCAGCGATTCATGATGCCCAAACTGCTAGCTGTGTCCAAATTGAGCGCGCCTTTTTAAAGGCACTAGGCGGAAGTTGTAATTTTCCAATTGGAGCTTACGCCACGCAAAATGCACTTGGGTATGAGTTTAAAGGTTTAGTCGCAGCGCAAGATGGGACCGCATGGTATCCAATTGAGAATCGCGGTCCCTTAACCGCTAAATTAGGTAAAACGGCGGCTGATACATTGATCGCTCAAGGTGCATTGGCAGCATTAGCAGTGGATTAGTAAGTGTTGTTTATTGTTAATTTAGCGGAAAATATTGTGCTTGCTTAACTAGGTATACGTCATAATTCAGGCGTTTTTTCAACGCAGGTTACAAAATTAATTTAAGGAAAGAAGTTAGATATTTATGATTCAATTTGATCGTCATCGTCGTTTACGCACAACTCCAGCATTACGGGACCTCGTTCGGGAAAATCGGGTGACTCGCGATGATTTGATCATGCCGGTTTTTGTCGTTGAGGATTTTAATGGCAAAAAAGAAATCAGCTCGATGCCAGGGGTTTATCAATTTGGCTTAGATACGATTTTGACTGAGATCAAGGCTATCACTGATTTAGGTATTAAAGCAATTATCTTATTTGGCCTACCTAGCCATAAGGATGATGTTGGTACTGGTGCTTGGTCAGACGATGGTATCGTGCAACAAGCAACACGCAAGATCAAAGCCGCTTATCCTGATTTGATCGTTATTGCGGATACTTGTTTGTGTGAGTATACGTCTACTGGTCATTGTGGTGTCGTGGATGAAAATGGCTACGTCTTAAATGATGAATCATTGAAGTTGTTGGCTAAAACTGCGGTCAGCCAGACTAAGGCGGGGGCTGATATTATTGCGCCATCTAATGCAATGGACGGCTTTGTTGCGGCAATCCGTCAGGGCTTGGATGAAGCGGGTTACGTTAATACACCGATCATGTCCTACGCCGTTAAATACGCTTCTAGCTTCTATGGCCCATTCCGCGATGCGGCCAATAGTGCACCAGCTTTTGGTGACCGTAAAACTTACCAAATGGACCCAGCTAACCGCTTAGATGCATTGCGCGAAGTTGCTAGTGATGAAAAAGAAGGCGCCGATATGGTGATGGTCAAACCGTCAATGGCTTTTGGGGACATTATGCGTGACGTTCGTGAACAAACATTGTTGCCATTAGTGGCCTACAATGTTTCTGGTGAATATTCAATGGTTAAAGCTGCCGCCGCTAATGGGTGGATCGATGAAGCCAAAATCGTGGATGAAATTTTAACTGGGATGAAGCGTGCTGGTGCCGACTTGATCATCACTTATTTTGCCAAGGATGTTGCGGCCCGGCTGGTCAAATAACGGAAAACTTTAATATTAAATTAACCACGATTGTGAAGTAGGGGGAATTAGGATAGTATGCGTGATTTTACAAAATCAAAACAGGCTTTTGCTGAATCTAGTCAATTAATGCCTGGCGGGGTCAATAGCCCAGTTCGTGCTTTTAAAAATGTCGGTGGTGATCCATTATTTATCGATCATGGTAAAGGATCACATATCTATGATATTGATGGTAATGATTATATCGATTACGTCATGTCATGGGGGCCATTGATTCTTGGACACGCTGATGATCAAGTGGTTGCTGATTTACAGGCAGCTGTGACTAAAGGAACCAGTTACGGTGCACCGACTTTGTTGGAAAGCCAATTGGCGAAAATGATTCAAAAAGTGGTGCCGTCGATCGAAATGATGCGGATGGTTTCTTCAGGGACGGAAGCCACGATGAGTGCGATTCGTTTGGCTCGTGGCTACACGAAACGTGATAAGATCGTTAAATTCATTGGGAACTATCATGGCCATAGTGATTCATTATTGGTCGATGCTGGTTCTGGATTGGCAACGTTTAATATTACCAAGTCTCCTGGTGTACCTGAAGCTTTAGCGTATGATACTTTAACTGTGGCTTATAATGATGAAGCGGCGATCAAAAAAGTCTTTGCGGCGCATGGTGATGAAATTGCCTGTGTGATCGTTGAACCCGTTGCCGGTAATATGGGCGTTATTCCAGCTAAGAAGTCATTTTTGCAGACGCTACGCCAAGTCACTAGTGATCATGGCGCTTTATTGATCTTTGATGAAGTTATGACTGGTTTCCGTGCAGCCTTCCATGGTGCTCAGGCTTTATATGGTATTACACCAGATCTAACGACTTTAGGTAAAGTTGTTGGTGGTGGCTTACCGGTTGGCGTCTTTGGTGGTCGGCGGGAGATCATGCATGAGATCACGCCTGATGGTCCAATCTATCATGCTGGGACTTTATCTGGTAATCCATTAGCGATGACGGGCGGTATTAGCACAATCAAGCAATTAAATGAAGACTTGTATACTGCGATGGATCAAAAAGTGACGCGCTTGATGGCTGGAATTGCGGCTGCTGCAAAGCAATATCAAGTGCCAATAGTCACGCATCATGTTGGCACGATGTGGAGTTACTTCTTTAATGAACATGAAGTTGAAAATTTTGCGGACGTTCAAAAAAGTGATCAGGCATACTTTGCCAAGTTCTATAAGGCGTTATTGCAAGAAGGTATTTACACTGCGCCATCGCAATTTGAAACGAATTTCATTTCCACTAAACACACTGATGCTGAGATCGACCAAACGATTGCAGCATTTGAACGTGCCTTTGCTGCCGTTAGTCAGGGGTGAGTGGCGATGAGTCAATTTCGTGATTTAACATTACTGCCATTATCGACAACTGAACAATTGGTAATTGCCTGTGACAGTAGTGCAGGAATTGGCGCTAAACAAGCAGACATGGTTTCGGTTCCCACCGAAGTTATGTCTGCTTATTGTTTACGCGTCCCATTATTAGAGCTGTTGTGCTTTGGTGCACAGCCATTAATGGTGATCGATACCGTTGGAAATGAAATGCAGCCTACTGGTGAAAAGGTGATCACCGGGTTGCGGCAAGAATTAGCTAAAGCTGATTTAGCGACGTTGCCATTAAATGGCAGTACCGAGGATAACATGACGACGATCACAACCTCAGTCG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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010009054.1|925813_927361_+	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase	NA	NA	NA	NA
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WP_010011936.1|933691_934885_-	class I SAM-dependent methyltransferase	A0A2K9L4K8	Tupanvirus	6.8e-46	34.3
WP_029508064.1|935425_936715_+	pyrimidine-nucleoside phosphorylase	A0A0H3UZD4	Geobacillus_virus	2.8e-45	31.6
WP_010011933.1|936850_937498_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.6e-20	35.4
WP_003678562.1|937494_938250_+	iron export ABC transporter permease subunit FetB	NA	NA	NA	NA
WP_056943358.1|938946_940395_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A1X9I6E7	Streptococcus_phage	2.4e-08	25.7
940530:940547	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP017713|1075172:1136857|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003678413.1|1090638_1091625_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A096XT60	Enterococcus_phage	1.6e-117	65.2
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WP_010009516.1|1099216_1099528_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_003678406.1|1099761_1100358_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
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WP_003678402.1|1101763_1102093_+	cyclic-di-AMP receptor	NA	NA	NA	NA
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WP_010009521.1|1103357_1104149_+	stage 0 sporulation family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_056943296.1|1104786_1105656_+	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	7.8e-76	54.2
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WP_176720060.1|1106803_1107436_+	sugar transferase	NA	NA	NA	NA
WP_010009525.1|1107506_1108271_+	DUF4422 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_169925064.1|1108453_1109482_+|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	8.8e-42	33.5
WP_029507962.1|1109672_1110743_+	CDP-glycerol--glycerophosphate glycerophosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_010009527.1|1110891_1111509_+	chain-length determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009529.1|1111544_1112924_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003678381.1|1113017_1113428_+	glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase	A0A1V0SGE7	Hokovirus	3.3e-16	40.3
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WP_010009532.1|1114600_1115491_+	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_156403532.1|1115905_1118614_+	sulfatase-like hydrolase/transferase	NA	NA	NA	NA
WP_010009602.1|1118685_1120767_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003681017.1|1120908_1121814_+	EpsIIB, glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_099267127.1|1122075_1123068_+|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	1.3e-39	34.3
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WP_003680852.1|1123363_1124122_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267128.1|1124108_1125671_-|transposase	IS21 family transposase	K4I413	Acidithiobacillus_phage	1.4e-70	34.0
WP_141707550.1|1125968_1126319_+	KxYKxGKxW signal peptide domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267129.1|1126496_1127807_-|transposase	IS1380 family transposase	A0A1X9I6F6	Streptococcus_phage	7.8e-128	54.1
WP_145955956.1|1128032_1130285_+	SH3-like domain-containing protein	F8J1A5	Lactobacillus_virus	2.8e-16	30.0
WP_081455889.1|1130517_1131999_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003679926.1|1132018_1133014_+	glycosyltransferase family 2 protein	A8CG95	Salmonella_phage	1.1e-49	38.0
WP_003679924.1|1133054_1134221_+	acyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009869.1|1134295_1134787_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_029507971.1|1134878_1135283_-	GtrA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009867.1|1135421_1136354_+	glycosyltransferase family 2 protein	V5USA4	Oenococcus_phage	3.3e-80	50.2
WP_081455888.1|1136632_1136857_-|transposase	transposase	A0A1X9I6F6	Streptococcus_phage	3.5e-12	47.9

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP017713|1273854:1320855|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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MSNNEKKDVTPDNAVLDDLLKDPFSTPNAPVVNDQQVTQTGQPEQMIDRLNPEQRADAEKLAQQIDVSDTQSVMTYGAQAQTKLSEFSQGMLSKVQSQDTGAIGDALSGLMFRLNEASPEDLQAGDSNFFKRMFGKVRKSIYEIQAKYQKIGAQIDTIAVKLDKEKNNLLNDNRLLEQLYQKNKDYFDALNIFIAAGELKRTELQTKLIPEANQKAQASGSQMDLQTVNDLNQFEERLDKRVYDLKLAREITIQQAPQIRLIQNTNQVLAEKIQASINTAIPLWKNQVAIALTLLRQKEAVTAQRQVSETTNDLLKKNSEMLKISSIETAKENERGVVDIETLQKTQSDLVETLQETLKIQQEGREKRQSAELELSHMENNLRDQLLALTQGHNK
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MTHTYLDNAATTPMDPAVIAVMTEQMQQNFGNASNIHYFGRQARQVLDASRKTLAQSINAKEAEIVFTSGGTEGDNTAIMQTALQRQKLGRHIITTAIEHEAVLKPLHFLETQGFEVTYLPVDERGLISLADFKAALRDDTILVSIMMGNNEVGSHMPIHEIGELLKDHQAWFHTDAVQAYGLLDIDVQRDHIDLLSVSAHKLNGPKFLGFLYRRQGINFPSFIKGGDQEDKRRAGTENIPAIAGFAKAVELDTPAEKAARQQKYAGFKHQLLAGLTANGIDFAVNGELNPDNLQHVLNIWIKGISTYVLQMNLDLAGFAISGGSACTAGSLEPSHVLTAMYGKDSPRIEESIRISFGKDNTAAEIDNFVAALTKIVQRVKKTVKI
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MRIISGEFGGRRLKAVPGQATRPTTDKVKEAIFNMIGPYFSGGRGLDLFAGSGGLGIEAISRGLDSMVLVDRQYAAIKVIKDNVATTKAADRFQVIKANADRAIQQFAAAGEQFDLVLLDPPYRAQQIAAELTTFAAQKLLAPGATIVCETSSETVLPEALAGFTHLRRQTYGTTAITIYQYGGIDIDS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010009722.1|1276883_1277861_+	diaminopimelate epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_029507967.1|1277930_1279373_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010009715.1|1279418_1280606_-	toxic anion resistance protein	A0A291I9K4	Lactobacillus_phage	4.1e-35	28.3
WP_010009714.1|1280595_1281303_-|lysis	5-bromo-4-chloroindolyl phosphate hydrolysis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009712.1|1281499_1282039_+	NUDIX hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_010009710.1|1282136_1282391_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677504.1|1282488_1283181_+	5'-methylthioadenosine/adenosylhomocysteine nucleosidase	NA	NA	NA	NA
WP_003677506.1|1283252_1284413_+	cysteine desulfurase	NA	NA	NA	NA
WP_003677507.1|1284531_1284873_+	DUF1831 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677509.1|1285188_1286313_+|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
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WP_003677513.1|1287090_1287747_+	tetratricopeptide repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009706.1|1287756_1290258_+	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A1P8DII4	Virus_Rctr197k	4.3e-42	30.5
1289109:1289126	attL	NA	NA	NA	NA
WP_003677517.1|1290284_1291247_-	diacylglycerol kinase family lipid kinase	NA	NA	NA	NA
WP_003677518.1|1291331_1293014_-	ribonuclease J	NA	NA	NA	NA
WP_010009705.1|1292988_1293228_-	DNA-dependent RNA polymerase auxiliary subunit epsilon family protein	NA	NA	NA	NA
WP_056943362.1|1293566_1294736_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_010009702.1|1295399_1295906_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677521.1|1295953_1296511_-	peptide deformylase	A0A2I7S809	Vibrio_phage	6.9e-09	37.0
WP_003677522.1|1296826_1297753_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009699.1|1297749_1298028_+	UPF0223 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677524.1|1298037_1298817_+	inositol monophosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267131.1|1299414_1301262_+	translational GTPase TypA	NA	NA	NA	NA
WP_010009696.1|1301443_1301809_+	DUF1507 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009695.1|1301827_1303048_+	FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009693.1|1303074_1306530_+	pyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_010009691.1|1306542_1306959_+	YlbF family regulator	NA	NA	NA	NA
WP_010009689.1|1307020_1307359_+	YlbG family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009687.1|1307362_1307932_+	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
WP_010009685.1|1307921_1308419_+	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	9.2e-21	35.4
WP_010009683.1|1308421_1309453_+	PDZ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267122.1|1309551_1310922_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_099267101.1|1311212_1312661_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A1X9I6E7	Streptococcus_phage	8.1e-09	26.3
WP_035456922.1|1312836_1313514_+	helix-hairpin-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009681.1|1313880_1314372_+	ComE operon protein 2	A7KUY9	Bacillus_phage	3.8e-35	58.3
WP_010009680.1|1314381_1316595_+	DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2	Q0H255	Geobacillus_phage	2.2e-29	35.2
WP_003680528.1|1316694_1317720_+	DNA polymerase III subunit delta	NA	NA	NA	NA
WP_010009676.1|1317770_1318025_-	30S ribosomal protein S20	NA	NA	NA	NA
WP_099267132.1|1318248_1319616_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_099267133.1|1319829_1320855_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.4e-41	32.4
1330037:1330054	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP017713|1337578:1346150|DBSCAN-SWA
TGTGAAGCAAGTTGCGATCGTGATGGGTTCAGTTTCAGATTGGCCGACAATGCAGGCGTCCGCCACTATTTTAAATGAGTTGCAGATTCCGTTTAGTAAGCACGTGATTTCGGCACATCGTATGCCGGCACAGCTGCAAGACTTCGGTCAGCAGGCGGTGACCCGGGGCATCGATATAATCATCGCTGGTGCTGGTGGTGCCGCACATTTACCGGGGATGCTGGCGGCGAATACCGTGCGGCCGGTGATCGGTGTCCCGATTGAAAGTCATGCGCTGCACGGGCTGGATTCCTTATTGTCGATCGTGCAAATGCCTGCCGGTGTGCCGGTGGCAACGATGGCGATCGGCGTGGCTGGCGCTAAAAATGCGGCGTTGCAGGCGGCTAGCATGCTGGCGTTGCAAGATGATCAGTTGCAACAGCGGCTACTAGATTACCGAGCGGCGCAGACCCAAAAGGCGATTGAAAGTGAGGCGCAACTTGATTAAGCAATTATTACCACCGGCCACGATCGGTATTGTCGGCGGCGGTCAATTAGGGCAGATGATGACGTTAGCCGCCAAGAGCATGGGTTACAAAGTTGGTGTGCTCGACCCAACCCCGGATTGTCCTGCGGCTCAGGTGGCTGATTTTCAAATCACTGCCGACTATCGTGATCAACCAGCCATGCTGGCGTTAGCCAAACGGGCTGATGTGTTAACTTATGAATTTGAAAATGTTGATCTGGCTAGTTTAAAGGCCGCTAAGCAATATGCTGAATTGCCACAGGGGACGCATTTGTTGGCGATCACCCGCAATCGACTGACGGAGAAAAACTTTCTTAAATCGCTGGGGGTGCCGGTGACTGAGTTTGCAGCGGTGACGACACCAACTGAATTAAAGGCAGCTTGTCAAACCGTGGGCGTGCCCAGTATTTTGAAAACTGCTACCGGTGGTTACGACGGTCATGGGCAGCATGACGTGAATACGCTGGCCAATTTGGCGACTGATCTCTTGCCAGGAGAGTGTATTCTAGAACGGCGCCAAGCATTTACCAAAGAATTAGCCATTATGGTCACCCGTGATCGTGATCAGCAAGTGCGCACATTTCCAGTGGTCGAAAATAGCCATCATCAGCATATTCTTCATGAAACGATCGCTCCAGCGCCGGTTTCAGCGGCAATTAAGGCTGAAGTCGTTGCGATCGCCACTAAAATTGCCCAGGGGTTGGAATTGTACGGCGTCTTAGGCATCGAATTTTTCTTATTGCCGAATGGTCGTTTGTTGGTTAATGAATTGGCGCCACGACCGCATAATTCTGGCCATTTTAGCATTGAGGCTTGTAATTTATCACAATTTGCCGCCCATATTCGTAGTATTTGCGGACTGCCGATCCCCGCGATCACCCAACAGCGACCAGCGGTGATGGTCAACATACTCGGCCAACAGTTACAGCCAGCGCGGCAACGCTGGTTACAACGGCCGCAGTGGTATCTCCATGACTATGGTAAAGCAGAAAGCCGTTACCAACGTAAAATGGGCCACATCACTATTTTGACTGATGATCCAGCGGCGACACAGGCTCAGTTAGAACAAGAAAATATTTGGGAGGATCAATAATGCGCAAACTTAAAGAATTGAAAACCGGCAAGGCCAAACGACTTTATACTACCGATGACCCAACCGTTTTGTGGGTCGAATACTTAGATCAAGCCACTGCACTTAATGGCAAACGCAAGGAACAAATTACTGCTAAAGGTGCGCTGAACAACCAGATCGACTGTTTAATTTTTGATTACTTAATGGCCAATCAGATTCCGACTGATTTTATTCGCCAAGTTTCGGCGACAGAACAATTGATCCATCCCGTTAAAATGATCCCCTTGGAAGTCGTTGTCCGCAATCTGGCTTCTGGTAGCTTCCAACGCAAGTTTGCCACCGACTATTTACAGCCGCTAACTAAGCCGCTGATTGAGTTCTTTTACAAATCGGATCAGCTGGACGATCCTTTCATGAATGATGCGCAAGCCGAAGTTTTAGGTATCGCGACCGCTGATGAACTAGCTGCGATTAAACAATTAGCTTTGCGAATCAATCAGTTGTTGCAAGCGCGGTTTGCGCAAGCTGAGTTGACCTTAGTTGATTTTAAGATCGAAGTCGGTTATTTAGAGGGTCAATTGGTGTTGGCAGATGAAATTTCACCGGATTCGTGTCGGCTAGTCGATGCGACAACGCAAGCCTCGTTGGATAAGGACGTTTTCCGCAAACACACGGGTGATTTGACCACGGTTTATCAAGAAGTGTTGACGCGTTTGCAAAACTCGGAGGTGGCTCATGTATCGCGCTAAAGTTTATGTGACCTATAAAGATTCGATCCTCGATCCTCAGGCCGAAGCAGTTAAAACCGCTTTGCACCAATTGGATTTTTCTGAATTGCAACAACTGACTTGTGGTAAATATTTTGAATTAGTTTTAGCTACATCGAAAGAAAAAGCAGCGGCCGCGGTGGAACAGATGTGTCAAAAGTTACTAGCTAATGTGAATATGGAAAGCTATCGTTACGAATTGGAGGCTTGCTAAAAATGAAGTTTGCCGTGGTTCAATTTCCGGGCTCAAATTGTGATCAAGACTTAGTAGCCGCTTTACGCGATGTCTTTCAGCAACAGGCCGTTTTAGTCGATTATCGAACCGTCGATCTAACTGATTATGCGGCAGTTTTGTTACCTGGTGGTTTTTCGTATGGCGACTATCTGCGTGGTGGGGCGATCGCCCGTTTTGCCCCAATCATGACTGCGGTGCGTGAGTTTGCCGCTGCTGGCGGGCTAGTGATCGGTATCTGCAATGGCTTCCAGATTTTGACCGAAGCTGGCTTATTGCCAGGCGTTTTGCAGCAAAATCACAGCGCCAACTTTATCTGTCAACCGGCGGCTTTAACCGTTGTCAACAATCAAACCAGCTTCACCAACGCTTACCAGCCGCAACAGCCGATCACTTTACCGATTGCTCACGGTGAAGGTAATTACTACTGTGATGCGGCAACGTTGGCGGCGCTCAAAGCACACCAGCAAATTGTGTTTACTTATCAGGACAATCCTAATGGCAGTGTCGCTGATATTGCCGGTATCACCAATCGCGCCGGCAATGTTTTAGGCATGATGCCCCATCCCGAACGGGCGGTGGAGGCACTTTTAGGTAGCGAAGACGGCCGCGGTGTTTTTCAAAGTATGTTGCAAACATTAACGAAAAAGGTGGTGCCAGCATGATCGAGCAAACAGCGACAGCAATTGAAGCTAGCGGGTTATACGAACAATGGGGCTTGACCAGTGCTGAATATCAACGGATCCAAGAATTGCTCGGCCGTTTGCCTAATTTCACTGAAACTGGCTTGTTTGCGGCAATGTGGAGTGAACATTGTGCCTATAAAAATTCTAAACCGTTACTGAAACAATTTCCGACTAGTGGGCAACGGATTTTGCAGGGCCCCGGTGAAGGTGCTGGCATCATCGATATTGGTGACGGTCAGGCAGTGGTTTTTAAAGCTGAAAGTCATAACCACCCCACAGCCGTTGAACCTTATCAGGGGGCAGCGACTGGTGTTGGCGGTATTATTCGCGATATTTTTTCAATGGGCGCACAGCCGATCGCGCTGCTAGACAGTCTGCGTTTTGGCGAATTAACTGATGCGCATACCCGCTTTTTACTACAGGAAACTGTCGCAGGTATTGGCGGTTATGGTAATTGTATCGGCATTCCGACGGTTGGCGGTGAGTTGGCGTTTGATGATGCTTATGCGGCCAATCCAGTTATGAACGCAATGTGCGTTGGGTTGTTGGACACCACGATGCAGCAAAAAGGTCAAGCCGCCGGCGCCAGTAACTTGATTTATTACGTTGGCGCTAAAACTGGCCGCGACGGCATTCAAGGGGCAATTTTTGCTTCGGCGGAATTTAATGATGCGGTTGAAGCTGATCGTTCCGCGGTTCAAGTTGGCGATCCCTTTATGGAAAAGCGATTAATGGACGCTTGTTTGGAATTGATCCGCGAACACCCGGAAGCAGTCGTCGGCATTCAAGATATGGGCGCTGCTGGCTTGGTCTCATCTTCAGCCGAAATGGGTGCCAAAGCGGACTACGGCATGACTTTGAATTTAGATGCGGTGCCGCAGCGGGAAACGGGTATGATTCCTTATGAATTAATGTTGTCGGAATCGCAAGAGCGGATGTTGCTCTGTGTTGCTAAAGATCAAGGGGCGGTGGTCGAAGCAGTGTTTGCCCGCTATGAACTGGATGCGGTACAGATCGGTGAAGTGACGGCAGCTAAACAATATCAGTTGTATGCTCATGGTGAAAAAGTGGCTGACGTACCGATCAAAGCGTTAGTCGATGAGGCGCCAGTTTATCAGCGGCCGCAACGAATCCCTGCACGGTTATTGACGGCTGACCCACAACAGTATCAGCCCCAGTTCACCAGCGCAACAGCCGTTTTGACAAAGCTGTTGCAACAACCAACGCTGGCTTCCAAGCAAGCCATTTATCGCAGTTACGATACTCAAGTTAAAACCAATACTGTCGTGGCACCAGGCTCGGATGCCGCCGTAATTAGAATTCGCGGTGGGCGTAAAGCTTTGGCAATGACTACTGACGGTAACGGACGCTACTTATATTTAAATCCAGAAATCGGCGGCCAAATTGCGGTTTGCGAGGCGGCGCGCAATATTGTGGCTAGTGGCGGTGTTCCGCTGGGTATCACCGACTGTCTTAATTTCGGTAGTCCCGAAGAACCGGAAAGTTTTTATGAATTGGCACAAGCCACTAAAGGGATGAGCACGGCCTGCAAAGCTTTAGCAACGCCGGTGATCTCTGGTAACGTGTCGTTGTACAACGAATCTAACGGCACAGCGATCTACCCAACGCCGATGGTCGGCATGGTTGGTTTGATCACAGACCTTGCTTTGATCACGACCCAAGATTTCAAGCAAGCGGGGGACGTGATTTTCTTAGTCGGCCAAACTCATTCTGATTTTAATGGCAGTGAATTACAAAAAATGCTGACTGGGAATATTAGTGGCGCGTTATTTGATTTTGATCTAGCCACGGAAATTGCCCATCAACAATTGGTTCAGCAAGCGATTCGGGCAGGTCTCGTTAGTGGTGCGCATGATCTAGCGGAAGGTGGCTTAGCGGTCGGTTTAGCGGAATGCTGCTTTGGTCAGCAATTAGGCGCCAGCGTTGACGTAGCCATGCCCGCTAGCTGGCTATTTGCCGAAACGCAGTCACGCTTTATTATCACCGTGCCCGCAGCGCAAGCAGCAGCTTTCAGTCAAATGGCCGGCGAACAGGCACAACAGATTGGCACGGTCACAGCAGCGACTGACCTAGTTATCAAAACAAATACAGAAACCTTGACATTGGATATCGTCACCAGCAAACAGCAGTGGGAAGGAGCATTAGCATGGTAAGTGAGGTCAAAAGTCTCAATGAAGAATGCGGAGTATTTGGTATTTGGGGCGATGCGCAAGCGGCCGAGCTCACTTATTTTGGCTTACATGCGTTGCAACATCGCGGTCAAGAAGGCGCCGGCATCGTCGCCAATGAGCAGGGACATTTAAGCGGTGAGAAAGGTTTAGGTTTGTTGACGGAAGTTTTTGACCATCCGGATAAATTAGCCCATTTAACTGGTAACGCGGCTATCGGCCATGTCCGTTACGCCACGGCGGGCAGTGCCGGGATCGAAAATATCCAGCCACTATTATTTAATTTTAACCAGCAACAAGTGGCCTTGGCGCACAATGGCAATTTGACTAACGCGGTCAGTTTGCGGGCGACGTTAGAGGCAGCCGGCGCCATTTTCCACGCTAACTCCGATACCGAAGTGTTGATGCATTTGATCCAGCGGCAAACCGCCGCGACGTTTGAACAGCGCTTAAAAGCCAGCCTGCGCCAAATCAAAGGTGGCTTTGCGTACTTAGTCCTGACCAACGATGCCTTGTACGCCGCACTAGATCCCAATGGCTTTCGACCGTTAGCGCTAGGCCAGTTAGCAACTGGAGCTTATGTGGTGGCGAGCGAAACTTGTGCTTTAGATACGGTCAATGCGCGCTTCATCCGCGACGTGCAACCAGGTGAATTGATCAAAATCGACGATCACGGTTACCACGTTAATTCCTATACCACCGACACACAGCTAGCCGTTTGTTCGATGGAATTCATCTATTTTGCCCGGCCTGATTCAACGATTTATGGTGTCAATGTGCATCAAGCGCGCGAACGTATGGGCCAACTTTTGGCTAAAGAACAGCCGGTGGACGCCGATATCGTCGTCGGGGTACCGAATTCTTCTTTGTCGGCGGCTAATGGTTACGCGGCGGCCAGTGGTATTCCTTACGAAATGGGTTTGATCAAAAATCAATACAGCCAACGTACCTTCATTCAGCCAACCCAGCGCTTACGTGAGCAAGGTGTGCGGATGAAGTTATCAGCGGTGACGGCAGTGGTCAAAGGTAAGAAAGTTGCCTTAGTCGATGATTCGCTAGTGCGGGGGACGACTAGTAATTATATTGTGCGCCTTTTAAAAGAAGCGGGCGCCACCGCGGTTCATTTGCTGATCGCCTCGCCGCCATTGCGCTATCCCTGCTTTTACGGTATCGACATTGAAAACACCCGTGAGTTGTTGGCGGCTAATCTGACCTTACCGCAAATGCAGGCGCAGATCGGTGCTGATTCACTACATTTTCTCAGCGTAGCCGGCTTGATCGCGGCGATTAATTTAAAAAGCAGCGCGCCGTATTCTGGTTTATGTGTAGCTTACTTTAATGGTGACTATCCGACCCCGCTGTATGATTACGCCGCAACTTTTGAATTGCCGCAAGTGATGGCTTGAAGTTTGGCGGCAAAATTAAACAGTGAGTGTATCGCTAAACGAAGGATACTACTGAGCTAAATTAGTTGTAAGAGCCAGCCAAATAATTTTCAAATACAGCTTAGGAGGAAACCAAATGAATGCTTACGAGAAGGCGGGCGTTAATATTGCTGCCGGGGAAGCGGTGGTCACTAATTTGCAGCAACAGATCAAAAAACTAAATTCGGCAAATGTGTTAGGGGGGTTAGGCGCGTTTGGTGGCTTGTATCAATTGCCACCGCGGCAGCAGCCGGTTTTAGTTGCGGGGACGGATGGTGTTGGCACCAAATTGTTGTTGGCAATCCAAAGTGGACGGCGGACAACGGTGGGCCAGGATCTAGTGGCAATGTGCGTCAACGATGTCGTTGCACAAGGGGCACAACCCTTATTTTTCCTGGATTATTTAGCGGTGGCGAAAACCCAACCGCAGGAAGTGGCTGAGCTGATGCAAGGAATCGTGGCCGGCTGCCAACAAAGCGGGATGGCCTTGTTAGGCGGCGAAACTGCGGAAATGCCAGATATGTACACTGCTGGTCATTATGATCTGGCTGGTTTTGCCGTTGGTATCGCTGAAAAGGCAGCGTTGCTGACGCCGGAGCAGGTGCAGGCCGGCGATATTTTGCTGGGCTTACCTGCCAGTGGTTTACATAGCAATGGCTTTTCGTTGGTGCGCCAATTGTTGTTCAAAACACACGATTATCGTTTTACTGATACCCCTGCTGAATTAGGGGGAGCCAACTTACTGGATACCTTGTTGACGCCGACGCAGATCTATGTTGACGCGTTGCTGCCATTGCTTAAGCAACAGTTGATCGCTGGTGCGGCGCATATTACTGGCGGTGGCTTGCTGGAAAATGTACCGCGGATGTTGCCGGCTGGATTAACGGCTCAAGTCAACTTAGGTAGTTGGCCGCGCCAGCCGATTTTTGATTGGTTGTGTGCATTAGGTCAGTTGCAGCAAAATGAGGCGTTCACGACTTTTAACATGGGTCTGGGCATGGTTTTAGCGATCCATCCAACTGATCTAGCTGCCGTGCAACAAATTCTGACCGCTCAGCAGCAAGCTTTTTATCAAATTGGTACGGTGCACGCGGGCGCAACTGGTGTGGTATTAGTGGAGGCCGACGCATGAAAAAGTTAGCGATCTTCGCTTCCGGCAATGGTAGTAACTTTGAAGCGTTGGTAACCGGCATTCAGCAGCAAAAATTAGCAGCACAAGTGGTGTTACTAGTGTGTGATCAGCCGACTGCGCCGGTTATTCAACGGGCGCAACGGTTAAAGATTCCCGTTTGGACCGCGGAATTTAAGCAATTTGCGGATAAAGCAGCTTTTGAAACGACGATCTTGGCTCAATTACGCCAACATGAGGTGGAATTGATTTTGCTGGCTGGTTATATGCGGATCATTGGTCCCACCTTGCTGCAGGCTTATCCGCAGCGGATCATCAATATTCATCCGGCTTTGTTGCCTAAATTTCCTGGCCGTCATGGAATCGAAGATGCGTTTGCCGCTGGCGTGACCGAAACTGGCGTGACGATTCATTACGTTGATGCTGGCGTTGACAGCGGGCCAATCATTCAGCAGGCTATGGTCCCAGTTAAATCGCAGGACACGCTGGCTAGCTTAAGTCGCCGCATTCATCGAACGGAGCATCGGCTTTATTTGCAAAGTCTAGTAAAAATATTAGAAGAGAAATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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MIEQTATAIEASGLYEQWGLTSAEYQRIQELLGRLPNFTETGLFAAMWSEHCAYKNSKPLLKQFPTSGQRILQGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPTAVEPYQGAATGVGGIIRDIFSMGAQPIALLDSLRFGELTDAHTRFLLQETVAGIGGYGNCIGIPTVGGELAFDDAYAANPVMNAMCVGLLDTTMQQKGQAAGASNLIYYVGAKTGRDGIQGAIFASAEFNDAVEADRSAVQVGDPFMEKRLMDACLELIREHPEAVVGIQDMGAAGLVSSSAEMGAKADYGMTLNLDAVPQRETGMIPYELMLSESQERMLLCVAKDQGAVVEAVFARYELDAVQIGEVTAAKQYQLYAHGEKVADVPIKALVDEAPVYQRPQRIPARLLTADPQQYQPQFTSATAVLTKLLQQPTLASKQAIYRSYDTQVKTNTVVAPGSDAAVIRIRGGRKALAMTTDGNGRYLYLNPEIGGQIAVCEAARNIVASGGVPLGITDCLNFGSPEEPESFYELAQATKGMSTACKALATPVISGNVSLYNESNGTAIYPTPMVGMVGLITDLALITTQDFKQAGDVIFLVGQTHSDFNGSELQKMLTGNISGALFDFDLATEIAHQQLVQQAIRAGLVSGAHDLAEGGLAVGLAECCFGQQLGASVDVAMPASWLFAETQSRFIITVPAAQAAAFSQMAGEQAQQIGTVTAATDLVIKTNTETLTLDIVTSKQQWEGALAW
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MIKQLLPPATIGIVGGGQLGQMMTLAAKSMGYKVGVLDPTPDCPAAQVADFQITADYRDQPAMLALAKRADVLTYEFENVDLASLKAAKQYAELPQGTHLLAITRNRLTEKNFLKSLGVPVTEFAAVTTPTELKAACQTVGVPSILKTATGGYDGHGQHDVNTLANLATDLLPGECILERRQAFTKELAIMVTRDRDQQVRTFPVVENSHHQHILHETIAPAPVSAAIKAEVVAIATKIAQGLELYGVLGIEFFLLPNGRLLVNELAPRPHNSGHFSIEACNLSQFAAHIRSICGLPIPAITQQRPAVMVNILGQQLQPARQRWLQRPQWYLHDYGKAESRYQRKMGHITILTDDPAATQAQLEQENIWEDQ
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MVSEVKSLNEECGVFGIWGDAQAAELTYFGLHALQHRGQEGAGIVANEQGHLSGEKGLGLLTEVFDHPDKLAHLTGNAAIGHVRYATAGSAGIENIQPLLFNFNQQQVALAHNGNLTNAVSLRATLEAAGAIFHANSDTEVLMHLIQRQTAATFEQRLKASLRQIKGGFAYLVLTNDALYAALDPNGFRPLALGQLATGAYVVASETCALDTVNARFIRDVQPGELIKIDDHGYHVNSYTTDTQLAVCSMEFIYFARPDSTIYGVNVHQARERMGQLLAKEQPVDADIVVGVPNSSLSAANGYAAASGIPYEMGLIKNQYSQRTFIQPTQRLREQGVRMKLSAVTAVVKGKKVALVDDSLVRGTTSNYIVRLLKEAGATAVHLLIASPPLRYPCFYGIDIENTRELLAANLTLPQMQAQIGADSLHFLSVAGLIAAINLKSSAPYSGLCVAYFNGDYPTPLYDYAATFELPQVMA
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MKQVAIVMGSVSDWPTMQASATILNELQIPFSKHVISAHRMPAQLQDFGQQAVTRGIDIIIAGAGGAAHLPGMLAANTVRPVIGVPIESHALHGLDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGVAGAKNAALQAASMLALQDDQLQQRLLDYRAAQTQKAIESEAQLD
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MYRAKVYVTYKDSILDPQAEAVKTALHQLDFSELQQLTCGKYFELVLATSKEKAAAAVEQMCQKLLANVNMESYRYELEAC
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MNAYEKAGVNIAAGEAVVTNLQQQIKKLNSANVLGGLGAFGGLYQLPPRQQPVLVAGTDGVGTKLLLAIQSGRRTTVGQDLVAMCVNDVVAQGAQPLFFLDYLAVAKTQPQEVAELMQGIVAGCQQSGMALLGGETAEMPDMYTAGHYDLAGFAVGIAEKAALLTPEQVQAGDILLGLPASGLHSNGFSLVRQLLFKTHDYRFTDTPAELGGANLLDTLLTPTQIYVDALLPLLKQQLIAGAAHITGGGLLENVPRMLPAGLTAQVNLGSWPRQPIFDWLCALGQLQQNEAFTTFNMGLGMVLAIHPTDLAAVQQILTAQQQAFYQIGTVHAGATGVVLVEADA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_010009660.1|1337578_1338064_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.1e-18	40.1
WP_010009658.1|1338056_1339175_+	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_010009657.1|1339174_1339903_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	A0A0E3FUQ7	Synechococcus_phage	7.8e-37	38.1
WP_010009656.1|1339889_1340135_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_010009655.1|1340137_1340818_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_010009654.1|1340814_1343013_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	6.7e-140	42.0
WP_010009652.1|1343006_1344434_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	2.6e-52	34.7
WP_010009651.1|1344549_1345584_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3FC27	Synechococcus_phage	3.8e-61	42.6
WP_010009649.1|1345580_1346150_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	3.7e-26	38.3

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP017713|1349817:1407814|DBSCAN-SWA
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MAQDPAIAEAQQKMVKAEEALQRELGQIRAGRANASILNRVTVDYYGAPTPVNQLATITIPEARVLMITPYDKSTLKEIERAILASDLGLSPANDGTVIRLVIPQLTQDRREELAKDVKKQTEEAKIAIRNIRRDAIENMRRREKNNELTEDDLHELEEETQKITNAATKKLDEIAATKEKEILTD
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MKFIVYGVRKDEEGYAHNWSKENKIDVKLVADLLNKETVKLAKGYDAIIAYQQLPYDKEIFTTMKEYGIKDLSIRNVGVDNIPTDAAKANGVRITNVPSYSPSAIAELAITGLMQLLRRTPEFNEKLAKGDFTWEPDIARELHTMTVGVVGTGRIGRAGINIYKGFGAKVIGYDVFRNPELEAEGMYVDTLDELYAQADVITLHVPAVKENHHMINKDSIAKMKDGVIIINTARGELIESKDLLAGYKSGKIGGAVLDVYENEVGIFNSDFTGKKVPDATLVELMKQRDILVTPHVAFYTETAVRNMVDVALDSAKSMIEKGESRNEVKF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_169925048.1|1349817_1351347_+|transposase	IS66 family transposase	S5VTD3	Leptospira_phage	1.9e-53	31.3
WP_035457969.1|1352473_1353823_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
1352571:1352587	attL	NA	NA	NA	NA
WP_003679950.1|1353956_1355903_-	PTS sugar transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_010010113.1|1355929_1356847_-	1-phosphofructokinase	NA	NA	NA	NA
WP_010010112.1|1356843_1357599_-	DeoR/GlpR transcriptional regulator	A0A077SK06	Escherichia_phage	1.1e-22	32.3
WP_003679956.1|1358190_1359486_+	GTPase ObgE	NA	NA	NA	NA
WP_010010111.1|1359518_1361411_+	acetyltransferase	A0A1R3Y5Q6	Salmonella_virus	1.9e-29	27.9
WP_010010110.1|1361560_1362247_+	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	7.2e-32	36.5
WP_099267194.1|1362252_1363563_+	histidine kinase	W8CYF6	Bacillus_phage	1.6e-27	33.2
WP_003680309.1|1364291_1365245_+	ribonuclease Z	NA	NA	NA	NA
WP_010010106.1|1365269_1366061_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_010010105.1|1366145_1366517_+	LapA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010103.1|1366579_1368916_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	3.0e-74	31.0
WP_003680303.1|1368905_1369424_+	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	4.9e-25	41.3
WP_010010102.1|1369801_1370968_-	hydroxymethylglutaryl-CoA synthase	NA	NA	NA	NA
WP_010010101.1|1371002_1371404_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_035457700.1|1371572_1371914_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_035457699.1|1372090_1372327_+	cytochrome b5	NA	NA	NA	NA
WP_099267134.1|1372474_1374028_+	flavocytochrome c	A0A2P0ZL82	Lactobacillus_phage	1.1e-51	30.2
WP_029507982.1|1374403_1375732_+	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010010095.1|1375832_1376777_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010010094.1|1376858_1377698_+	aldo/keto reductase	NA	NA	NA	NA
WP_056943291.1|1377780_1378287_+	O-acetyl-ADP-ribose deacetylase	A0A0K1L687	Scale_drop_disease_virus	1.4e-37	59.4
WP_010010092.1|1379352_1379616_+	type II toxin-antitoxin system RelB/DinJ family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_035457574.1|1380057_1380270_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010089.1|1380446_1380785_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_169925066.1|1380957_1382403_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A1X9I6E7	Streptococcus_phage	9.9e-07	27.2
WP_010010088.1|1382546_1383563_+	NADP-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_010010087.1|1383658_1384510_+	glycosyltransferase family 8 protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010086.1|1384484_1385006_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003679889.1|1385002_1385458_+	nucleoside 2-deoxyribosyltransferase	A0A2K9L7B8	Tupanvirus	4.0e-15	40.5
WP_029507980.1|1385487_1386069_+	TIGR00730 family Rossman fold protein	NA	NA	NA	NA
WP_004562637.1|1386230_1387091_+	sugar transporter	NA	NA	NA	NA
WP_004562639.1|1387117_1387996_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_010010082.1|1388287_1388536_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010081.1|1388685_1388868_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_157769840.1|1388942_1389278_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267136.1|1389571_1390921_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
1390808:1390824	attR	NA	NA	NA	NA
WP_010010079.1|1391454_1392528_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010078.1|1392541_1392913_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677044.1|1392958_1393396_-	PAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010077.1|1393581_1394361_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_010010075.1|1394367_1394991_+	hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_010010074.1|1395161_1395350_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677037.1|1395397_1396018_-	transcriptional repressor LexA	A0A0N9RTK0	Paenibacillus_phage	5.0e-08	34.6
WP_035456688.1|1396171_1396408_+	DUF896 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267122.1|1396506_1397877_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_010010068.1|1398066_1398285_+	YneF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010067.1|1398320_1398935_-	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_056943264.1|1399046_1399784_+|tRNA	tRNA1(Val) (adenine(37)-N6)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_010010064.1|1399770_1400055_+	GIY-YIG nuclease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677032.1|1400143_1401136_+	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1H9J0	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	7.9e-48	35.0
WP_003677030.1|1401372_1402197_+	30S ribosomal protein S2	NA	NA	NA	NA
WP_003677027.1|1402460_1403345_+	elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
WP_003677024.1|1403481_1404207_+	UMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_010010062.1|1404208_1404769_+	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
WP_003677021.1|1404907_1405672_+	isoprenyl transferase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	6.3e-21	42.0
WP_003677019.1|1405709_1406492_+	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003677017.1|1406539_1407814_+|protease	RIP metalloprotease RseP	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP017713|1521629:1529213|DBSCAN-SWA
ATCAAAAAATAGACCATCGTTTACGTTCATAAGTAAAGCCTTCACCAAGCACTTCGTGTACATTAATGATCGAGATAAAGGCTTTTTCATCATGTTGAGCGATAATGCGTTTTATCAGTGCAATTTCATTAGGCGCGACCACACAATAGATCACCCGTTTATCAGCGTGCTGGTAGCCACCTTCAGCATGGAACAAGCTAGTTCCACGATCTAAGTGTGTCATAATATCGTCGGCAATCGCTTGATAATCATCACTAATGATCAAAATACCACGTGCCGCATATGCACCTTCCTGAGTAAAATCAACCACTTGAGAAAAAATGAATGACGCGAGTAGCGTGTACATCATGTGACGAACATCTAGATAACTTAAGGATAAGGTGAGTACGATCACATCAAATCCAAGTAACGTGCGGCCCATAGAAATACCGCGTTGTCGTTCGATCACCCGGGCAACAACGTCACTGCCGCCAGTCGTGCCACCAGCGCGATAGATCAAGCCGCTACCAAACCCACCACATAATCCGGCCATTACACCGGCGATAAATAGATCATGATGTAAATTTAACTGTACTGGCAGCCGTTGCCATAACCACAGAAAAACGGATAACATTACTGTGCCATAAATGGTCAGCAGCAATGCATTACGGCCCAGAAACTTATAGCCCACGATAATCAGCGGAATGTTGAGCAATAAACTTGAATAGGCGGGATCAATCTGAAACCAAAAACGTAAGATCAAAGTGATCCCGGTGATACCGCCTTCGGCTAAATGATTATTGATATTAATACTTACTAAACCTAATGCGTATAAAGCACAGCCCAATGTAATCAAGAATAAATCACGTATTCGTATTTCTTGCTTCGTCATGGAATGCCACCACCTTATTATTTTAAAAAACGTTTTAACTGCATTATACCGAATTCATTAGCCAACTTGGCTGGAATGGGCAGATTCTAATTTTAGGATTATTTTTAGCGAGTAACCGATATTTTAATTACCGGCATAATTTGTTAGTATGGTAGGTAACGGATTAAATTAAATGAAAAAGGTGATCGTTTTGACAAAAATTCTTGTGGCGGGTTTTAAAGGTAGAATGGGCGCTACCGCAACCCATATGGTATTGAAGAACACTGATTTTGAATTAGTTGGTGTTTATGATCCAATTGCAACTGAAAAAGATTTAGCTGAGGTAGCAGAATTTGGCGGTCAACATGCACCAGTGTTTACTGACTTAGAAGCAACCCTTGCAGCAGAACCGGAAGTTTGGATCGATTTTACGATTCCTAAAGCAGCCGTTGCTAATACAAAATTTGCGTTGGAACATCAAATCTCACCAGTTGTGGGAACAACTGGGTTTACGCCAACCGATATTAAGGCGTTACAAGAATTAGCAGCTAAGAACCAAGTTGGTGGCTTGATCGCACCTAACTTCAGTCTAAGTGCTGTCTTAATGATGCAATTTTCTAAACAAGCAGCTAAGTATTTTCCTGATGTTGAGATCATTGAAATGCATCATGATAATAAATTAGACGCACCAAGTGGTACTGCCGTCAAAACAGCCGAGATGTTGGCCGAGGTTCGTGGCGATAAACCACAAGGTAACCCTAATGAGAAAGAAAGTATTCCTGGTGCTCGTGGTGCTAACTACGCGGGTATGCGGATCCATAGTGTTCGTTTACCCGGTTTAATCGCCCATCAGCAAGTTCAATTTGGTGGTGTCGGGGAAGGCTTGACCATCCGCCAGGATACGTACGATCGCGAATCATTTATGACTGGGGTCGCGTTAGCTTGCCGTAAAGTGCGCCAAGAAAAGCAACTTTATGATGGGCTTGAATATTTACTATGAAATTAACCCAATTACCAGACGAATTTGTCCAAGCGCTACCGGTATTGCAGACAATCACCCAGGCCGGTTTTGAAGCTTATTTTGTCGGTGGGAGTGTCCGTGATGCGCTTTTAGGTAAAAAGATCCATGATGTCGATATTGCAACCAGTGCTTATCCAGCAGAAATCAAGCAAATTTTTCGGCGCACGATCGATACTGGTATCCAGCATGGGACAGTGACCGTGATGCAACAAGAGACAGCTTATGAAGTTACCACGTTTCGTACTGAATCAGGTTATCAAGATTTTCGGCGGCCAGATCATGTCACTTTTGTGCGCTCACTGCGTGAAGACCTTAAGCGGCGTGATTTTACGATCAATGCACTAGCATTGCAACATGACGGCACGATCATCGATCTATTTGCTGGGTTAACGGATTTAGAAAATAAAGTGATCCGCGCAGTGGGCGATCCTAATGAGCGCTTCCATGAAGATGCTTTACGGATGATGCGTGCGGTTCGTTTTGAAAGTCAATTAGGTTTTACGATCGAAGCAAATACTGAAGTGGCGATCCGCGCCCAGCATCAATTGTTGAGTAAGATTGCGGTTGAACGAATTCATGATGAATTTGTCAAACTTATGCTGGGACAGGCGCGTTATAACGGGCTGGTCAGTTTTGTACAGACCGAGTTATATCAGCAATGTCCAGATTTTACGAATGCTGGGCCGGCGTTCAAAGCGCTACTGAAATTGCCCACAACACCGTTACGTAGTGAAGCTGCGGTCTGGTTGTTGATCGCGCAGCAGCTACAATTGGACAGTGAGCAGGTCAAACCATTTTTACGTCATTGGAAATCGGCTAATGATTTGATCTATGCAGTGAGTACCAGCTTACCTGTTTTACAAAAATTTTTAGCCCAGCAACCATTAAGTAACTGGGATTTTTATCAAGCAGGTTTAACTAATGTGCTAACGGCTAATCAGATCGCCTATTTTTATGGTGCTGACATGGCGGAAACTGCTTTACAATCTAAGTACCAGCAATTACCGATCAAACAGCGTAGCGAGCTTGCTGTCAACGGTGGCGACTTGTTACAAGCATTAGCACTAAAACCGGGACCAAAATTAGGTCAGTTGCTGGCACATTTGGAACGTGCAGTTGTGGCAGCACAGATTCCCAATCAAAAAGCAGCTTTGATCGCAGCCGCGACAAAGCTTTAATAAGTGAGTGCGCTGATAATTGATCAGTGACTCTCACTTTTATTTTGCGGATAAAGTTGATTGCTTTTTCGGAAGTAATCTTTTACGATGGGCGCAATAGAAACTGAGGTAGATAAGTCATGCAAACTTTAACTGCAGAGAATTTAACTAAAACTTACGGTGAAAAAACACTATTTGATCATATTTCCTTTTTCATTAAGGAAGGTGATCGCATTGGTTTGATCGGTACGAATGGTGCGGGTAAAACCACATTGCTAAATGCGTTAACCGGTAATGATACTTTTGATCAAGGTGATATCACCACGCCTAAACAGTATCGTATTGGGTATTTACAGCAAGTGCCACAATTACCGCAAGACTTAACGATCATGGAAGCTATTTTTACCGGCGATAATCCATTATTCAAAGTAATTGCGGCATATGAAAAAGCCTTGACTGCGCTAAGCCTTGACGGCAATAGTACAAAGGCACAGGCAGCCTATACCAAGGCTGAAGCGGCTATGAACCAAGGTGATGCTTGGAACGTTGATACGCAGATCAAATCGATTTTGTCCCAATTAAAGCTAACTGACTTAAATCAGCGCATCAGTGAATTATCTGGTGGTCAGCAAAAGCGGGTCGGTTTAGCGCAAGTTCTGATCGAATCTCCAGACTTGCTTATTTTAGACGAACCGACCAACCATTTAGATTTTGCATCAATTGCGTGGTTAGAAGAATACTTAGCTAGTTATAAAGGTGCATTGTTAGTGGTGACCCATGATCGGTATTTCTTGGATCGAGTTACTAATCAGATCTACGAGTTAGCCTTTGGTCAATTGACCGCTTATAGTGGTAATTTTGAAGACTATCTGCGGCAAAGTGCTGAGGCAGCCGAACAAGCCAGTGAACAAGCCGCTAAACAGGAAAAGCTTTATAAGAAAGAACTTGACTGGATGCGTGCTGGTGCTAAGGCACGGTCGACTAAACAACAGGCACGGATCAATCGATTTAACGATCTCAAGGCACAAGTTAATAAAGGGGTTGAGCAAGCTGCCACCGTAGCCATTAACTTAGGCCAGCAACGCTTAGGCAAAAAAGTTTTGGAACTAAAACAGGCCAGTCTAAGTTTCCATCAGCATCCCATTATCAAAGACCTTGATTTAATGGTCCAAAGCAACGCTCGTTTAGGTATAACCGGTGAAAATGGTGCTGGCAAGTCAACTTTCTTAAATGTTCTGGCTGGGCGCCTACCATTAGATTCTGGAACGATCACATTAGGCGAAACGGTTCGTTTAGGCTACTATACGCAAATGACTGAACCATTGGACCCAGATAAGCGAGTAATCAGTTATTTGCAAGAAGTTGGCGAGGCCGTCACTGAACGTAACGGTGATGTGGTCAGTGTGACTCAGTTGTTGGAACAATTTCTCTTTCCACGTTTTATGCACGGAACGCTGATCCGTAAATTATCTGGCGGTGAACAACGACGGCTGTACTTGTTAAAAATCTTGATGCAGCAGCCGAATGTTTTATTGCTTGATGAACCAACTAACGATTTAGATATTAGTACATTGACGGTGCTGGAGCATTATTTGGCTAACTTTAATGGTGCAGTGATCACCGTGTCCCATGATCGGTATTTCCTGGATCAAGTGGCGGATGAGCTCTTAGTTTTCAATGGTAACGCGCAAGTTACACGCTTTACTGGGGCTCTAAGTGATTATTTAGCGCAACAGCAAACTAGTGATACCACAAAAGTAGCTACACCAAAAGTGACGACAGAAACACCGACTAAGCCAGTGGTTAAAGAAAAGACTAAGCTCACCTATAACGAGCAAAAAGAATGGGATACATTGGAAGATGACATCGATCAGCTGGAACAGCAACTAGCTGCCACCCAAGCAGCCATGCAAAGTAACGGTGATGATTACGGCAAGTTAGCCCAACAACAAAAGGACGTTGACCAACTTAATCAACAAATCGAAACTAAAATGCAACGCTGGGACTATTTAAGTCAGTACGTGGAATAGTTTTTTGAAGGAGGAAATAGTGATCATGGAAGAAGCATACCTCGATTTAGCACGTCAGATCTTAGCCGAAGGTCATCAAAAAAATGATCGTACTCAGACTGGGACTTATAGTATTTTTGGTTATCAAATGCGCTTCGATCTTAGTAAAGGCTTCCCGTTATTAACCACTAAAAAAGTTCCTTTCGGCTTAATCAAAAGTGAACTATTATGGTTTTTAAAGGGCGATAGTAATATTCGCTATTTGTTGCAACATAATAATCATATTTGGGACGAATGGGCGTTTAAGCATTACGTTGAAAGTACTGATTACCATGGTCCAGACATGACTGACTTTGGTCATCGGCAATTGACTGATACGACCTTTGCGGCAGCCTATCAGGAACAAAAAAAGCTTTTTTGCGAGCAAATACTAAACGACGATGCTTTTGCGGCTAAATACGGCGAATTAGGCAATGTATACGGTAAACAATGGCGGGCATGGAAAACACGTAGTGGCGAAACAATCGATCAAATCAAAGATGTGATCGCAGCAATCAAAACTACCCCTGATTCACGACGCTTGATCGTAACTGCTTGGAATCCTGAAGATGTGCCCACCGCAGCATTACCACCTTGTCATACTTTGTTTCAATTCTATGTTGCGGACGGTAAACTAAGTTGCCAACTTTATCAGCGCAGTGGCGATGTTTTTCTTGGTGTTCCATTCAACATTGCCAGCTATGCATTGTTGACAGCTTTGATTGCCAAGGAAGTTGGTCTAGAAGTCGGGGAATTCGTACACACTTTAGGTGACGCGCATATTTATAGCAATCACGTCAAACAAATTGAGGAACAATTGACGCGGACACCACGGCCAGCGCCTACGCTTGAACTAAATCCGGCCAAACATAGTATATTTGATTATGATGTTACGGATATTAAGTTAGCTAATTATGATCCGTATCCAGCAATTAAGGCACCGGTTGCGGTTTAGTATAATATTAAGTCGTAGCTCACTTTAATTGTGAAATAGGAGGATTTTAAAATGACGATTGCGTTCATGTGGGCGGAGGCCCGCGACCATTTGATTGGGGCCAACGGACACTTGCCATGGCATTTGCCTGCCGATCTCCAACATTTTAAGCAAACTACATTGAATCAAATTGTAGTGATGGGTCGGAAAACTTATGCTGGTATGGGCAAGCCACTACCAGGGCGTACCAATATCGTACTAAGTCAACAAGTGGATTATCCAGTGGCACCCGGCGTCATTTTATTAAATAACGTCGCTGCTGTTTTGGATTATGCATCCGCGCACCCACAGCAGGAGACAATCATTATTGGCGGTGCACAAATTTTTGCTTTATTTAAAGAATATGTTACCCGCTTGTATGTTACTGAGATCGATGCTACTTTTAGCGGTGATACGTATATGCCAGCGCTAGATTGGTCAGCATTTAAACGGGTTGCTTTTCAAGCCGGTGAAATCGACACCAAAAATAAATATCCTTATTCATTTGCGACCTACCAACGCCGTGACGAATAATTTTTAGAGTGACAAGTGAAAAAGCAAGGTTAATCTGCTATACTAAATTAGTGTTTATTTGCTGGTCCAACGTTAATTTAGAAGGTTACTTTTGAGTTAGCGTTTTCCGACAATAGCAAGTTGAAAACAATTTGTAAGAAAGTGTGGCTGAAGTTCGTGGCAACTATAAAAATCGTAACCGATTCGTCGGTTCAACTAACCCCTGAAGAAGTTGAAAAATACAATATCACGGTCATTCCACTTTCAGTTATGATTGACGGTACCGTTTATATCGATGGCAAAACGATCACACGTCCACGTTTTGTTGAATTAATGAATCAATCGACCGCGTTACCTAAAACTAGTCAACCGCCGATCGGTGAATTCATTGAATTATTTGATCAACTGGGTGCTGACGGTAGTCAGGTGATTGCTTTGCATATGACGGATGCCATCAGTGGTACCGTTAATACTGCGCGTCAAGCAGCTAACTTAAGTAAAAGTGATGTTACGGTTATCGACACACGGGAAACTGATCGTGGCATGGCCTTTCAAGTCTTACGTGCAGCACAATTAGCACAATCTGGTGCCGATAAGGAAACTATTTTGAGCTCATTGGATCGTGTGCGCAACAGTACAAAGTTATACATGGCCGTCATGACCTTAGATAACATCGTTAAAGGTGGTCGAGTCAGCCGGGTTACTGGCTTGATCTCCAATATTTTGAACATGAAGGTTATTTTTGAAATGATCGATGGTGAGCTAAACGTCAGGACTAAGGGTCGCGGTACGAAAACCGTTAATAACTTTATGCGTGATTTGATTGCTGACCTAGCAAGCAAACCAAATATTAAGAGTATCGGTATTTCACATGTAGCAGCGAATGATGTTATGGAAAAATTCAGAGCAGACATTCATGCAGCATTGCCGAATGTACCTTTATTGATTCGTGATACTAGCCCAATTATTGCAACATATGCGGGTATGGGTGCTTTTGCGATTATGTATTACACTGAAGATTAG

Protein sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP017713|1521629:1529213|1528367_1529213_+|WP_003679736.1|DBSCAN-SWA
MATIKIVTDSSVQLTPEEVEKYNITVIPLSVMIDGTVYIDGKTITRPRFVELMNQSTALPKTSQPPIGEFIELFDQLGADGSQVIALHMTDAISGTVNTARQAANLSKSDVTVIDTRETDRGMAFQVLRAAQLAQSGADKETILSSLDRVRNSTKLYMAVMTLDNIVKGGRVSRVTGLISNILNMKVIFEMIDGELNVRTKGRGTKTVNNFMRDLIADLASKPNIKSIGISHVAANDVMEKFRADIHAALPNVPLLIRDTSPIIATYAGMGAFAIMYYTED
>NZ_CP017713|1521629:1529213|1522689_1523478_+|WP_029507975.1|DBSCAN-SWA
MTKILVAGFKGRMGATATHMVLKNTDFELVGVYDPIATEKDLAEVAEFGGQHAPVFTDLEATLAAEPEVWIDFTIPKAAVANTKFALEHQISPVVGTTGFTPTDIKALQELAAKNQVGGLIAPNFSLSAVLMMQFSKQAAKYFPDVEIIEMHHDNKLDAPSGTAVKTAEMLAEVRGDKPQGNPNEKESIPGARGANYAGMRIHSVRLPGLIAHQQVQFGGVGEGLTIRQDTYDRESFMTGVALACRKVRQEKQLYDGLEYLL
>NZ_CP017713|1521629:1529213|1526708_1527659_+|WP_029507974.1|DBSCAN-SWA
MMEEAYLDLARQILAEGHQKNDRTQTGTYSIFGYQMRFDLSKGFPLLTTKKVPFGLIKSELLWFLKGDSNIRYLLQHNNHIWDEWAFKHYVESTDYHGPDMTDFGHRQLTDTTFAAAYQEQKKLFCEQILNDDAFAAKYGELGNVYGKQWRAWKTRSGETIDQIKDVIAAIKTTPDSRRLIVTAWNPEDVPTAALPPCHTLFQFYVADGKLSCQLYQRSGDVFLGVPFNIASYALLTALIAKEVGLEVGEFVHTLGDAHIYSNHVKQIEEQLTRTPRPAPTLELNPAKHSIFDYDVTDIKLANYDPYPAIKAPVAV
>NZ_CP017713|1521629:1529213|1524796_1526686_+|WP_010009964.1|DBSCAN-SWA
MQTLTAENLTKTYGEKTLFDHISFFIKEGDRIGLIGTNGAGKTTLLNALTGNDTFDQGDITTPKQYRIGYLQQVPQLPQDLTIMEAIFTGDNPLFKVIAAYEKALTALSLDGNSTKAQAAYTKAEAAMNQGDAWNVDTQIKSILSQLKLTDLNQRISELSGGQQKRVGLAQVLIESPDLLILDEPTNHLDFASIAWLEEYLASYKGALLVVTHDRYFLDRVTNQIYELAFGQLTAYSGNFEDYLRQSAEAAEQASEQAAKQEKLYKKELDWMRAGAKARSTKQQARINRFNDLKAQVNKGVEQAATVAINLGQQRLGKKVLELKQASLSFHQHPIIKDLDLMVQSNARLGITGENGAGKSTFLNVLAGRLPLDSGTITLGETVRLGYYTQMTEPLDPDKRVISYLQEVGEAVTERNGDVVSVTQLLEQFLFPRFMHGTLIRKLSGGEQRRLYLLKILMQQPNVLLLDEPTNDLDISTLTVLEHYLANFNGAVITVSHDRYFLDQVADELLVFNGNAQVTRFTGALSDYLAQQQTSDTTKVATPKVTTETPTKPVVKEKTKLTYNEQKEWDTLEDDIDQLEQQLAATQAAMQSNGDDYGKLAQQQKDVDQLNQQIETKMQRWDYLSQYVE
>NZ_CP017713|1521629:1529213|1521629_1522499_-|WP_003680513.1|DBSCAN-SWA
MTKQEIRIRDLFLITLGCALYALGLVSININNHLAEGGITGITLILRFWFQIDPAYSSLLLNIPLIIVGYKFLGRNALLLTIYGTVMLSVFLWLWQRLPVQLNLHHDLFIAGVMAGLCGGFGSGLIYRAGGTTGGSDVVARVIERQRGISMGRTLLGFDVIVLTLSLSYLDVRHMMYTLLASFIFSQVVDFTQEGAYAARGILIISDDYQAIADDIMTHLDRGTSLFHAEGGYQHADKRVIYCVVAPNEIALIKRIIAQHDEKAFISIINVHEVLGEGFTYERKRWSIF
>NZ_CP017713|1521629:1529213|1523474_1524677_+|WP_010009965.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MKLTQLPDEFVQALPVLQTITQAGFEAYFVGGSVRDALLGKKIHDVDIATSAYPAEIKQIFRRTIDTGIQHGTVTVMQQETAYEVTTFRTESGYQDFRRPDHVTFVRSLREDLKRRDFTINALALQHDGTIIDLFAGLTDLENKVIRAVGDPNERFHEDALRMMRAVRFESQLGFTIEANTEVAIRAQHQLLSKIAVERIHDEFVKLMLGQARYNGLVSFVQTELYQQCPDFTNAGPAFKALLKLPTTPLRSEAAVWLLIAQQLQLDSEQVKPFLRHWKSANDLIYAVSTSLPVLQKFLAQQPLSNWDFYQAGLTNVLTANQIAYFYGADMAETALQSKYQQLPIKQRSELAVNGGDLLQALALKPGPKLGQLLAHLERAVVAAQIPNQKAALIAAATKL
>NZ_CP017713|1521629:1529213|1527710_1528211_+|WP_003679735.1|DBSCAN-SWA
MTIAFMWAEARDHLIGANGHLPWHLPADLQHFKQTTLNQIVVMGRKTYAGMGKPLPGRTNIVLSQQVDYPVAPGVILLNNVAAVLDYASAHPQQETIIIGGAQIFALFKEYVTRLYVTEIDATFSGDTYMPALDWSAFKRVAFQAGEIDTKNKYPYSFATYQRRDE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003680513.1|1521629_1522499_-	YitT family protein	M1Q1P6	Streptococcus_phage	4.0e-56	39.5
WP_029507975.1|1522689_1523478_+	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase	NA	NA	NA	NA
WP_010009965.1|1523474_1524677_+|tRNA	CCA tRNA nucleotidyltransferase	H7BUW3	unidentified_phage	1.6e-47	51.2
WP_010009964.1|1524796_1526686_+	ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	1.1e-50	29.7
WP_029507974.1|1526708_1527659_+	thymidylate synthase	A0A0N9SH48	Staphylococcus_phage	4.3e-120	64.6
WP_003679735.1|1527710_1528211_+	dihydrofolate reductase	A0A217ER00	Bacillus_phage	1.2e-23	33.7
WP_003679736.1|1528367_1529213_+	DegV family protein	A0A0N9SI50	Staphylococcus_phage	1.3e-19	40.6

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP017713|1823765:1891022|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010010982.1|1833639_1834449_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2R8FG22	Brazilian_cedratvirus	5.5e-07	24.0
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WP_004562607.1|1839698_1841075_+	branched-chain amino acid transport system II carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010970.1|1841182_1841716_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010969.1|1841762_1842074_-|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010968.1|1842094_1842241_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010967.1|1842263_1842548_-|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010965.1|1842706_1843549_-	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010010963.1|1844302_1844875_+	methylphosphotriester-DNA--protein-cysteine methyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010010958.1|1850776_1851370_+	TVP38/TMEM64 family protein	M1Q152	Streptococcus_phage	7.6e-30	35.1
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WP_010010953.1|1858772_1859330_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_035446519.1|1860002_1860215_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003680600.1|1860652_1861405_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010010942.1|1865059_1865278_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010941.1|1865331_1865919_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010010939.1|1866442_1867756_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010010937.1|1867819_1868341_-	GrpB family protein	A0A2K5B2B6	Erysipelothrix_phage	1.5e-13	31.7
WP_003680176.1|1868391_1869117_-	rRNA pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_003680178.1|1869126_1870758_-	oligosaccharide flippase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_099267146.1|1871621_1872959_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_010500113.1|1876010_1876889_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_056943298.1|1876960_1877623_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010011646.1|1888457_1888829_-	S1 RNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003678941.1|1889045_1889630_-	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0S9I2	Catovirus	1.2e-24	41.0
WP_099267088.1|1889843_1891022_+|transposase	IS256 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP017713|1954732:2008407|DBSCAN-SWA
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MVLTVKDFQGNIAPINNPTTASLVDTFGQVSQITVTFLRSLNPNVANMMQPRTLLINEDTQQQYRLQSVSATPSGGDYSIQAVFLGILHDWNDHYVDGTIKDTQSLDACMQLLTNGTSVTYTIHDSFPNFEFSTEFGKGKAYDLFLNTLVSDFGFEFSIDNQHIDIYKTIGQQDAFVWLDTLSFNTLNEQSDYTAIATHIKGTGKMDDNSKPLATAEYSSPHVKDYGVIDADFVSDERFTNNDALLAYLKTKLQDYPLIQRTITLNNDNTKSPFKLNKDAVAVGDHGYLRARNGVDVNTRITEITRDLTGHTATQITLGNQIKTFDRITADLQLARQQAAQQITDIKNEQSTIINNNVSTLDGGESVVRYADYAETLPTGQD
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MTDYSSKETDTSTMTLTLFDDGLPTGLVGDLSVIAANDDGDVKQLKYELADNRIIITPAAELPAGRYRLEVWLVNGAARAIYPSAGYLYFYVGYALNGVEGNMVKVISLTDLYQQMQKIADKAASNGVAGNFRIDDTGDLIYSTSTKETE
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MQKAELQQQIIAQIKAFETIIIHRHEKADPDALGSQVGLAEIIRASFPAKKVYVVGANTEGLDWLATMDQVTDETYRQALVIVTDTANTPRVDDQRFNQGQELIKIDHHPNDDAYGDIQLVDDQASSTSELIFDLQAASAELQLSATAAQLLYAGIVGDTGRFMFANTSTHTFNVAGELVKADFDPTVINRNLDTLTLEQARLSAYVLEHMTVLPSGAAYVTLTTETLNALNVSVAQAHAVVSLPGKIAAVQVWSVFVQQAPASYRVHLRSKGPIVNQLAKAHDGGGHPLASGARAYSEAEIKAIIAGVDQLAQNNK
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MANLGILQIPLTNDLSRKIIHVDMDAFYASIEEREHPEFIGKPLIIARDPSDNGGKGVVTTANYTARQFGVHSAMAAQKALELCPKAIFKKPDFTLYRSVSAQVHEIFKKYTDVIEYVALDEAYLDVTANKADLASAVLLARKIQTEIKQVTHLTSSTGISYNKFLAKMASDYRKPAGTTVIMPEQALRFLRDLPIEKFHGVGKKTVPKLHELDIYTGADLQQLSEFELIQRFGKMGDQLYRHVHGVDLRPVEYQRQRKSVGRESTFGQPLSTDTQVNTELRVLARGVANNLAKTQKHGKTIVLKWRNRDFETTTKRLTLSDYIADETAIAYYAQQLWDENGSLSKGIRLLGITITTLDPLAFEEISLPLFARSDPKV
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MKKLSSSQIRQMYLDFFKEKGHSIEPSASLVPVDDPSLLWINSGVATMKKYFEGRVVPENPRLTSSQKSIRTNDIENVGKTARHQTLFEMLGNFSVGDYFKKEAIPWAWEFMTSPKWMAFDPEKLYITVYPKDKVAKEVWLKTGVKPDHILEDEDNFWDIGEGPSGPDSEIFYDRGQKFNNVAEDDPENYPGGENERYLEIWNIVFSEFNHKPDGTYEPLPHKNIDTGMGLERLVSVVQETKTNFETDLFMPIIKATEQMSDGKRYGVDKTADISFKVIADHARAVTFAIGDGALPSNEGRGYVLRRLIRRATVHGKKLGINEAFLYKLVPIVGEIMESYYPEVLAQKDYIAKIIKSEEDRFNNTLTDGLKLLDKQIKAAKKANEQTLPGKTVFMLFDTFGFPFDLTKEYAADEGLQVDEAGFNAEMQQQKDRARAARSQDNGMGVQNGLLLDVKVPSKFIGWDHLEKDDAKLTLLVANDKIVEQVTTGEAQLIFDETPFYAEMGGQVADHGDIFDQAGHKVATVTDVQHAPNGQNLHTVDVLAPMTKDATYQLKVDPAFRQAVSRNHTATHLLDQALRDVLGEHVHQAGSLVEPDYLRFDFTHAGQTTPEELKQIEQIINEKIWAALPINWVVTDIESAKKMGAIAIFTEKYGKEVRVVSIGDYSREFDGGTHANNTAELGLFKFTGETGIGAGVRRVEAVTGKAAFDYMTQRENWLQATANLVKAPQLQNVVGKVEQLQEQLKQAEKQIESLQAKAAQQQAANIFQNVQTINDVTLVAEQVNVADMNQLRQLADDWKQKAVSDVLVLGTIVGEKVNLIAAVTKDGIAKGIKAGDLIKAIAPKVGGGGGGRPDMAQAGGKNPAGMADALQAAQTFLQGK
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MAKDDDIMIVTPTGEQILASSIGIHTESFSPPSPNYSHTYTSISSHRVTASTAQLQQRTIPWVFDINSNDKYDQSLQRLEVFRLLGGSEDFYVIDMRVPFIRWPVHVDGGFSVSPYQGSNVISDDVTVNLIVSEGYGETVTTSDNLNQMAAFGMALPTNNELDYTFKNQTTAKVYIAGVVPINADEHPMLIKFHGDVANALSIKNVTTNQTFSLTKPLNKNQELLIWGNVPAIDGTQVYGSSNHAYLDFQLGFNDIVISGATNFDVTFSTRFYY
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MAKELKFSEDARSAMLRGVDKLANTVKTTLGPKGRNVVLEKSYGSPTITNDGVTIAKDIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDNAGDGTTTATVLTQAIVREGMKNVTAGANPVGIRDGIEKATKAAVDELHKISHKVNGKGDIAQIAAVSSANQEVGKLIADAMEKVGNDGVITIEESKGIDTSLDVVEGMQFDRGYLSQYMVTDNDKMEADLDNPYILVTDKKISNIQEVLPLLQKIVEQGKALLIIADDVDGEALPTLVLNKIRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAQLEDIATLTGATVITADLGLELKDTDISQLGQAGKVTVTKDNTTIVEGAGNKDTIAQRVAEIKAQIADTTSDFDREKLQERLAKLAGGVAVVRVGAATETELKEQKYRIEDALNATRAAVEEGYVAGGGTALINVIKAVAKLEEEGDVQTGINIVLRALEEPVRQIAENAGVEGSVIVEHMKSLDPEVGYNAANGKWENMIDAGIIDPTKVTRSALQNAASVSSLLLTTEAVVADKPEPQSNDAGAGAPGAGMAPGMGGMM

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1954334:1954349	attL	NA	NA	NA	NA
WP_010010664.1|1954732_1957375_-|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	2.2e-60	33.6
WP_010010665.1|1957720_1958707_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003678647.1|1958732_1960082_-	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	1.1e-47	31.9
WP_003678649.1|1960309_1961263_-	bifunctional oligoribonuclease/PAP phosphatase NrnA	NA	NA	NA	NA
WP_010010666.1|1961265_1962579_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010667.1|1962666_1963803_-	DNA polymerase IV	NA	NA	NA	NA
WP_010010668.1|1963941_1965444_-	glucose-6-phosphate dehydrogenase	M4SP85	Cyanophage	4.4e-74	34.4
WP_010010669.1|1965572_1968194_-	bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_003678499.1|1970446_1970878_-	preprotein translocase subunit YajC	NA	NA	NA	NA
WP_003678498.1|1970954_1972097_-|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	6.7e-83	42.7
WP_029508007.1|1972504_1973539_-|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_010010673.1|1973593_1974613_-	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	A0A127AWE7	Bacillus_phage	1.8e-07	28.3
WP_010010674.1|1974646_1975258_-	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_010010675.1|1975467_1976037_-	septum formation protein Maf	NA	NA	NA	NA
WP_010010677.1|1976033_1977971_-	DNA mismatch repair endonuclease MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	4.3e-58	29.9
WP_010010678.1|1978094_1980740_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SGG8	Hokovirus	2.5e-32	22.8
WP_010010679.1|1980951_1981317_-	YlbF family regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003678490.1|1981337_1982147_-	TIGR00282 family metallophosphoesterase	NA	NA	NA	NA
WP_010010680.1|1982246_1984073_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_003678487.1|1984330_1985971_-	chaperonin GroEL	A0A240F766	uncultured_virus	3.2e-155	54.2
WP_010010682.1|1986152_1986437_-	co-chaperone GroES	A0A221S386	uncultured_virus	7.3e-15	46.2
WP_010010683.1|1986625_1987261_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_010010686.1|1988801_1989395_-	collagen-like protein	A0A2P0ZL67	Lactobacillus_phage	1.2e-14	42.3
WP_099267197.1|1989399_1989852_-	hypothetical protein	A0A075KL04	Lactobacillus_phage	4.1e-12	34.8
WP_010010691.1|1991846_1992209_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267198.1|1992201_1992555_-	hypothetical protein	D6PSR9	Lactobacillus_phage	1.2e-22	47.4
WP_010010693.1|1992674_1993298_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010694.1|1993331_1993511_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010696.1|1993513_1993744_-	XkdX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010698.1|1993743_1994118_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_029508008.1|1994130_1994562_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010700.1|1994605_1995058_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010701.1|1995197_1995665_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003677555.1|1995785_1996811_-|plate	BppU family phage baseplate upper protein	NA	NA	NA	NA
WP_035456932.1|1996811_1997255_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010705.1|1998679_1999030_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010706.1|1998980_2000129_-|tail	phage tail protein	O03938	Lactobacillus_phage	1.8e-67	43.8
WP_010010708.1|2000142_2000967_-|tail	phage tail family protein	D2KRB8	Lactobacillus_phage	4.1e-42	36.4
WP_056943312.1|2000966_2002283_-	hypothetical protein	A0A2I6PER7	Staphylococcus_phage	1.1e-28	42.8
WP_099267122.1|2002388_2003759_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_010010118.1|2004034_2004196_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010119.1|2004252_2004486_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	O03906	Lactobacillus_phage	8.4e-09	48.6
WP_010010122.1|2004676_2005066_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	O03970	Lactobacillus_phage	3.2e-21	45.5
WP_010010123.1|2005083_2005518_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_010010124.1|2005534_2006458_+	DUF4352 domain-containing protein	Q9AZW5	Lactococcus_phage	4.6e-26	42.1
WP_010010125.1|2006530_2007094_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010127.1|2007216_2008407_+|integrase	site-specific integrase	A0A0P0I3D2	Lactobacillus_phage	3.2e-112	54.5
2012822:2012837	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP017713|2027146:2084958|DBSCAN-SWA
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MAEQKKQSVLFQHGTLSLLVPGLFEGTMTVGELLQHGNYGIGTVQDFNGELVVLDGHAYQVVESGAVNELSAEQSVPFATVHFDDPLEQIELSNLNKTEVERYLLQNYPYRNVFFAVKITGEFAHMHTRVVEEQQKPYPSLTEATKTQPKFNQDNIHGTLIGYYAPELFQGVAVAGYHVHFLSDDHKTIGGHILDYRLQKGQVAIQPFATLEQHFPLDNHDFLHQNFNYDGMSQSINQAEK
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MSTVTSTVIAIGNHAIENEDPLVILFDQEATPELQDIAVIQEFSEPAAMKTLALAEGDTITIDENTYTIAYVGDVANQNLQTIGHITLLFAPLPASDRLGNGVYLTTTVKPAFHVGTKISYKTDD

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010010142.1|2028704_2030057_-	FAD-dependent oxidoreductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	6.9e-103	44.9
WP_010010144.1|2030390_2031236_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003678891.1|2031464_2032442_+	GMP reductase	G3MBI2	Bacillus_virus	1.4e-145	78.3
WP_010010146.1|2032631_2033684_+	nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_010010147.1|2033699_2034077_-	PTS glucitol/sorbitol transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_010010148.1|2034287_2035319_+	lactonase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_176720053.1|2035345_2035981_+	copper homeostasis protein CutC	NA	NA	NA	NA
WP_040473077.1|2036134_2036662_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_010010152.1|2036661_2037096_-	peptide-methionine (R)-S-oxide reductase MsrB	NA	NA	NA	NA
WP_176720052.1|2037237_2038596_-	magnesium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010010154.1|2038623_2039514_-	RluA family pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_010010155.1|2039510_2040326_-	NAD kinase	NA	NA	NA	NA
WP_010500113.1|2041702_2042581_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_099267150.1|2042787_2043501_-	GTP pyrophosphokinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010500113.1|2043650_2044529_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_010010156.1|2044761_2045379_+	CYTH domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010157.1|2045462_2046092_+	DsbA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267151.1|2046222_2047146_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	6.2e-31	30.9
WP_169925069.1|2047367_2048399_-|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	1.0e-42	33.8
WP_010010158.1|2048826_2050179_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_010010159.1|2050266_2052444_-	alpha-galactosidase	NA	NA	NA	NA
WP_010010160.1|2052558_2054238_-	alpha-glucosidase	NA	NA	NA	NA
WP_003678873.1|2054255_2055116_-	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003678871.1|2055128_2057090_-	PTS beta-glucoside transporter subunit IIBCA	NA	NA	NA	NA
WP_003678869.1|2057333_2058830_+	sucrose-6-phosphate hydrolase	S6ATV4	Bacillus_phage	6.6e-14	24.7
WP_010010162.1|2058843_2059824_+	LacI family DNA-binding transcriptional regulator	C6ZCU4	Enterobacteria_phage	3.2e-25	30.8
WP_056943348.1|2066753_2068031_-|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-92	50.7
WP_010009283.1|2068479_2069145_+	deoxynucleoside kinase	C1KFI3	Lactobacillus_virus	6.2e-49	45.9
WP_099267122.1|2070290_2071661_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_010010587.1|2072264_2073770_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010588.1|2073868_2075332_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_010010589.1|2075666_2076392_-	acetolactate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_056943321.1|2076486_2078166_-	acetolactate synthase AlsS	NA	NA	NA	NA
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WP_010010595.1|2079718_2080282_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010596.1|2080391_2080931_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003679147.1|2081084_2081873_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_010010597.1|2082006_2082285_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010598.1|2082262_2083156_-	RluA family pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_164512712.1|2083929_2084958_+|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	1.1e-41	33.5

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP017713|2165580:2172402|DBSCAN-SWA
TTTATCCAGGAAAGGTGCCGCCGTTGACATGAATAGTTTGACCAGTGATGAAACTACTGTCCACTGCAGCTAGGAATACGTAGCTTGGTGCCAATTCATAAGCTTTGCCACCGCGTCCCATTGGGGTTTTACCCCAATTTTCTAATTTATCTGGCGGAAAAGTTGCGGGAATTAATGGTGTCCAAATCGGTCCCGGTGCAACTGCATTAACTCGGATATCACGTTTTAATAGTTCTTCGTTTTGCGCTAAGGCACGGGTCCAAGAAACAATTGCACCTTTGGTCGATGAATAATCTAACAAAAGTGGATTTCCTTTGAAGGCCGTCACTGAGGTCGTATTGATGATTGCGCTATGATCCGCTAAATATGGTAGCGCTGCTTTGGTCAGATAAAACTGACCAAAAATATTCGTTCGAAAAGTACGCTCAAACTGACTATCAGTTAGTGCACCCACTTTTTCTTGGACATGCTGTTCCCCTGCATTATTGACCAAGATATCAATGTGTTGAAAAGTTTGCATCGTTTGATCCACCACTTGCTGGGCAAAAGTTGGTTCGCCAATATCGCCTTGGCAAACTAACACACGCCGCCCTAATGCAGTGATCTTATCCTTGATTGCTTGAGCATCGTCAGTTGATTCATAATACACGATCACGATATCTGCCCCTTCGCGCGCATACAATAATGCCACTGCGGCACCAATACCGCTATCACCACCAGTAACAATGGCAACTTTGTCTTTAAGTTTATCCGCTGGTCGATAAGTGGGATGGTCGATCTCAGGTGTTGGCGTCACATTTTTACTACTGTCATTGATCAAGTAATTTTCTTTGGGCTGCCGTTCTGTCATCTGTGAACCACCTCTTTATTAGGATTAAGTTCAAAATAACAAGTCCGGCGTAGCAAAACAATAAATACGCATGCGCTTATTTTCAGCGGAATTCCTGCTCAACGCGCCGATTAGGAATAAACCACAGAATCGAAACCACAATGCTAGCTACCAGGCCAGCTGGCGGCCAAACCAAGGTCAATAAGCAGCCGATGAAATAAATCAACAGCGATAACCAGCGTTTATGATCATGTTGTGAAATGACTGCCACCCGTGAATTTTGTCCATTGGCATGAATTAAGCAGCAATCAAGTAAATTATAGGTCAATCCGCACATAAACGAGACAATTGCATAGCTCAATTCGGGCAACATCGCAGTCAAATTTTCGCCGACCCAGGCAGTCGCAAATGGCAACAAACTAAGCCAAAATAATAAGGCGGTGTTAGCCCACAATACAATGCCATCAATCCTTTTGACGGTTTGATAGAGATGATGATGGTTATTCCAGTAGATAGCGATCGCGACAAAACTAACCACATACGCTAAAAAAGGTTCGATCAACTGATGTAACGCTGACCACGATACACCTTCTGGTGGCCGTAGATCTAACACTAAAATGGTGATCAAAATGGCGATTACGCCATCAGTAAAAGCTTCCACACGACTTTTAGACATTTAACCTCAACTCCTTGAATTTAATACTTACGATATTTTTTCAAACATAGAATAGCATGTTCACCATAAATGAGCTCAGGAGTTGTTTCGCTTACTTGTGCTATACTTTTAGTCAGTGATTAATTAGAAAGTAGTGTGATCAAAATGCAGGCACTGTATGTAAATTCAGCTACTGCCCATGAACTCAATGCGCTAACACTCGGGGAACAGCCTCAACCACAGCCCGCTGCAGATGAAGTTCTTGTCCGCGTCCACGCCGTTGGTTTAAATCCAGTGGACTACAAATTAGTGGAAGAAGGTAATACAAATTGGCAATTCCCGCATATTTTTGGCTTGGATGTTGCTGGTGAAGTCGTCACAACTGGTGCTGCCGTCACTGGCTTTAAAGCTGGCGAACGTGTTTTTTATCACGGTGACCTGACTAAAAATGGCGGCTTTGCCGAATACGCGGTGGTCAAAAGTTATGCCGTCGCCAAAATGCCCACCGGATTAAGTTATGAGCAAGCCGCCGCCCTACTTTGTGGCGCCATGACTGCCTATGCCGCTGTCTACCGTAAAGCTAATCTGACCAATCGGCATTCCGTTTTGATCCACGCCGGTGCTGGTGGTGTCGGCGGAATTGCCATTCAATTGGCCAAACAAATTGGTTTGACCGTTTATACCACGGTTTCGGCGCGTAAACGCGCTTTTGTACAAAGCTTACAGCCAGACCATATTATCGATTATCAAACCACTGATGTGACCGCAACGATCAAAGAATTGACTCAGGGACTCGGCGTTGATCTGATCATCAACACGATTGGTTCTACCGAGGCGACTGCTGATCTACAGCGGTTGGCTTACAATGGCGCGCTAGTCACGATCGTCGGTGAACCTGATCTAAGTCATTATGATCTCGGTCGTTATGGTCAAAGTGTCCTTAGTGTTAACTTAGGTGGTGCTCATCAAAGTCATAATCCACAGCAACAAGCGGATTTAGCAACAATGGCAACTGCTTTAGGTGAACTCGTTGTGACTAAAAAACTTGATCCAATGATCGATCATGTCTTGTCCTTCGAACAGATTCCCCAAGGCCTACAGGCGCTCAAACAACATTTAATCAGTGGCAAGCTTGTGGCAAGAATCGATTAATTTTTCAAATATTTAGCAACTAAATATTTGACCTTTTTTGACCAATAGTCTAAACTAGCATTACACTTAATTGAGTGCTAAAATTAATTTAAACTTGAAACTTTAGGAGGTCACACTATGTTAGTTCCTACAGTCATTGAACAATCTTCACGAGGCGAACGTGCTTATGATATTTATTCACGTCTGTTAAAAGACCGTATCATCATGTTATCTGGTGAAGTTAACGACCAAATGGCCAACTCGATCATCGCCCAACTACTATTCTTGGACGCCCAAGATTCTGAAAAAGATATTTCAATCTACATCAACTCTCCTGGTGGCTCAGTTTCAGCCGGCTTAGCAATCTACGATACAATGAATTTCGTTAAATCCGATATTCAAACGATTGCTATGGGGATGGCTGCTTCAATGGCCAGCGTTTTACTTACAGCTGGTACTAAAGGCAAGCGTTTTGCTTTACCTAACTCAACTGTCTTGATCCATCAACCTTTAGGTGGTGCTCAAGGTCAGCAAACTGAAATTGAGATCGCTGCACGCGAAATCTTGAAGACCCGTAATCGTTTAAATAAAATTTTGGCTGAATCCTCTGGTCAAGATCTTGAAACGATCCAAAAAGATACCGACCGTGACCATTACTTAACTGCGCAAGAAGCTAAGGATTATGGTTTGATCGACGATATCATGGTTAATCAAAAATAGTTTATTTCTGTACCCTACCGGCAATTGTTGGTAGGGTATTTTTAGTAGTAGACATTCAAAAATGGAGGTACTGATTATGGATACATCTGCGATCGATTTAACTAAGATCAGTCAGCGCGGGTTAGTTGTCGGCGATATTAATGCGCCGATCACTGTGATTGAATTTATCAATCTGCGCTGCCCCTATAGCAAAACCTGGTTTAAAAAGGCCGCCCCCATTTTAGAACCTGCAGTGGCCAGCGGCCGAATCAAACGAGTTTTCAAACTTTTCGACAAACCTAAAGTGACCCTAAGAAAAGGTAATCTAGCCCAACATCACTTACCCTATGACCAACCGGAACAAGCCTACGCCGCAATTAAAATTTTATTTGCACAACAAACCGAGTGGGGCGAACAATTAAACGACACCCAAATTGAAGCTTACATTAAACAACATTTTGGTTTTAAATTGCAGCCAAACCAAGCAATGATCGATTTAGTTTTAAATGAAGCCGCAGCCGCTAACATTCAATTTGTCCCAACTGTGATTATTGGAGAAGCGATTTTTGACGAACACATTACAACTGAAGAATTAGCCAAATTGATCTAATCAAAAAGCCGACCAAACTAATAAAATAGTTTGATCGGCTTTTTCAGCTTACGAAGTGACTTTACCCGCCCGTAAGTTATCGGCAATTTGCATTAATTTACGTAAGCGGTGGTTGATTCCTGACTTAGAGATTGCGCCACTAGGAACCCGCTCACCTAATTCTTTTAACGTAATATCAGGATTAGCTAAACGTAAAATAGCAATTTCTTGCAACTTTTGCGGCAGGCTATCTAAGCCCGCGACCTGTTCAATAAACTTAATATTCTCCACTTGATGCGTCGCCGCATCGATCGTTTTATTCAAATTGGCAGTTTCACAGTTAACTAAGCGATTCACCGAATTACGCATATCACGAACGATTCGGATATCTTCAAATTTCAGCATCGCACTAGTCGCACCGATCAGCTGTAGGAAATCAGCGATCTTCTCGCCTTCCTTTAAGTAAACGATATAGCCGCCACGACGTTCGGTCACCCGAGCATTCATTCCAAACTGGTTGATCATCGCGGCAATCTGTAGATTATGTTCCTCATATAATGAATAGATCTCCAAATGATAGCGACTCGTTTCAGGATTATTAACGGAACCACCAGCTAGAAAGGCCCCACGTAAATATGAACGCATTTTCTGGTCGGACTCCTTAACTTCTGTAGAAGGTAAGGTTGATAACGTCGATGCACCAGTTAAAATATGCAGATCATTGAGCACTAATGTACTGCCATGTTTTAAGCGGACAATGTAAAGATTATTCTTTTTTAATTTCATTTTACGCCGAACCAATAACTCAGCTTCAATTGAATAATTATCACGCAACAAGGCGTAAATGCGGCGAGCAATTGCTGGATTTTCTGTTTGCACGTTTAAAACAAATTGATGATTGGCAATACTTAATGAACCATTCATCCGAATTAAAGCTTCTAATTCAGCGCGTGCGTGTTCACGGTGGACCTCCAGCGTGGTGAGTTCTTTCTTAACTTCACTAGCATATGACCCCAAATCCGCCACCTACTTTCTAATTAATCGTGTGGTTGAAAGGCTAAATGCAATAATTCTTGTGCCACTTTATCGCCATCATGAAAGACACCACGATCGTGGAGCGACAAGAAATTATCTGAGATCACGCGACAACCAAGTTCGCGCAAGCCCTTAAAATCGTGTTCAACTTGAACTAAGTACTCATCATATTTTTGATGATCCATATAGTTAGGTGGAACTGGTTCAGTATTGACCAATACCGTATTAACGAATTGACTACCTAAATGTTTAGCCAAAACACGAACGTGATCAGCATCAGTAAAATGCTCCGTCTCACCTTTTTGCGTCATGATATTGCAGACATAAGTTACATCAGCCTTGGTTTGGCGCACTGCCTCCCCGACGTTACTGATCATTAAGTTGGGTAGAATGCTGGTGAACAAACTCCCCGGCCCTAACACCACTGTGTCGGCGTCCATAATCGCCGCAATGACTTCATCTACTGCTTGCGGCGCAGCATGAGTCGGATCTGCTGGGGTGACCCACACACGATCAATACTTTTACCGGCAGCTGTAATTTCTGCTTCTCCAGCAAGTTCAGTACCATCACTAAAATGCGCGTTTAATACCAATGGATCATCACTGGCCGGATAAACATGGCCATCGATCTCCATCATGTTTGACAACTCTTGGACCGCACCAAAAATACCTGAGCGCATTTCGGATAACGCCGCAATGATCAAATTACCGATCGCATGACCGGCTAAAAATGAATCATCACTATTGAAACGATATTGAAAAATATCCAAATAAAGTTGCGGTAAATTAGATAATGCCACCAAGACATTACGGATATCACCAGGTGGAACCACGTTAACGTAATTCCGAATGGCGCCTGACGAACCACCGTCATCAGCCACAGTCACCACAGCCGTAATATCAGTATTCTGCTTATGCAAACTTTTTAAAATAACCGGTAAGCCAGTGCCACCGCCGATGACAACCATCTTCGGCCGTCGATAATTTCTGGGCGATCTTGTCATGAGCGATTCACAGTCTCCTTCCGCTTATTCATATCGCGATGGGTCGTGTCAACCGGATAGTGTTGCCCCAGATCCTTACCTAATCGTTCCGCCAACGCAACTGAACGATGTTGCCCACCAGTACAGCCGATTGCGATCGTTAAACTCGTTTTACCTTCTTTTTCATAGCCAGGCATGATGAAATGTAGCATACTGCTAAACCGTTCATAGAAGTCTTCCGTAGCCGGTTGTTGCATAACGTAATCATAAACAGCCTGATTCAAGCCAGTTAACTTTTTAAATTCAGGCACATAATATGGATTAGGCAAGAAACGAACATCCATCACAATATCCGCATCGATCGGTACACCATATTTAAAGCCAAACGACATCACTTCAATATGGAACGTCGTGGTTTCTGCGGATTTAAAGTTATTAAAAATCTCCTCACGCAGTTGCCGTGGCGTCAATTCAGTCGTATCAATGATCAATTGTGACCGATTTTTGATCTCAGCCAACAAATTCCGTTCCTTGACGATACCATCTAATAAACGGCCTTCCATTGCTAATGGATGAGCGCGCCGTGTTTCTTTGTAACGCGAAACCAACTCTTCATTAGAAGCATCTAAAAAGAGGATCTTGGTTGTAACAAAATTAGTGTTATCCAAATTAGCCAGCATTTCATCTATTTCATCGTAAAACGCACGTGAACGTAAATCGATAACTAGTGCGATTTTGGTAACTTTACCTGATTCTTTGACTAATTCCCAAAACTTCGGTAACAAGCTAGGTGGCATGTTATCAACACAGAAATAGCCGAGATCTTCGAAGCTTTGCATGGCAACTGTTTTACCAGCGCCACTCATGCCAGTGATCACAACTAAATTTAAAGTATCTACCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_17

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>NZ_CP017713|2165580:2172402|2168990_2169503_+|WP_003678993.1|DBSCAN-SWA
MDTSAIDLTKISQRGLVVGDINAPITVIEFINLRCPYSKTWFKKAAPILEPAVASGRIKRVFKLFDKPKVTLRKGNLAQHHLPYDQPEQAYAAIKILFAQQTEWGEQLNDTQIEAYIKQHFGFKLQPNQAMIDLVLNEAAAANIQFVPTVIIGEAIFDEHITTEELAKLI
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MLVPTVIEQSSRGERAYDIYSRLLKDRIIMLSGEVNDQMANSIIAQLLFLDAQDSEKDISIYINSPGGSVSAGLAIYDTMNFVKSDIQTIAMGMAASMASVLLTAGTKGKRFALPNSTVLIHQPLGGAQGQQTEIEIAAREILKTRNRLNKILAESSGQDLETIQKDTDRDHYLTAQEAKDYGLIDDIMVNQK
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MTRSPRNYRRPKMVVIGGGTGLPVILKSLHKQNTDITAVVTVADDGGSSGAIRNYVNVVPPGDIRNVLVALSNLPQLYLDIFQYRFNSDDSFLAGHAIGNLIIAALSEMRSGIFGAVQELSNMMEIDGHVYPASDDPLVLNAHFSDGTELAGEAEITAAGKSIDRVWVTPADPTHAAPQAVDEVIAAIMDADTVVLGPGSLFTSILPNLMISNVGEAVRQTKADVTYVCNIMTQKGETEHFTDADHVRVLAKHLGSQFVNTVLVNTEPVPPNYMDHQKYDEYLVQVEHDFKGLRELGCRVISDNFLSLHDRGVFHDGDKVAQELLHLAFQPHD
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>NZ_CP017713|2165580:2172402|2171517_2172402_-|WP_003679000.1|DBSCAN-SWA
MVDTLNLVVITGMSGAGKTVAMQSFEDLGYFCVDNMPPSLLPKFWELVKESGKVTKIALVIDLRSRAFYDEIDEMLANLDNTNFVTTKILFLDASNEELVSRYKETRRAHPLAMEGRLLDGIVKERNLLAEIKNRSQLIIDTTELTPRQLREEIFNNFKSAETTTFHIEVMSFGFKYGVPIDADIVMDVRFLPNPYYVPEFKKLTGLNQAVYDYVMQQPATEDFYERFSSMLHFIMPGYEKEGKTSLTIAIGCTGGQHRSVALAERLGKDLGQHYPVDTTHRDMNKRKETVNRS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010009033.1|2166511_2167084_-	DUF1211 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010009031.1|2167228_2168215_+	zinc-binding dehydrogenase	K7Z7U2	Megavirus	1.7e-05	23.2
WP_003678991.1|2168332_2168914_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-50	52.3
WP_003678993.1|2168990_2169503_+	DsbA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003678995.1|2169551_2170499_-	DNA-binding protein WhiA	Q7AWZ3	Streptococcus_phage	9.8e-48	36.8
WP_003678997.1|2170519_2171521_-	YvcK family protein	A1IMD5	Streptococcus_phage	7.6e-99	56.8
WP_003679000.1|2171517_2172402_-	RNase adapter RapZ	A0A0R8VB27	Thermobifida_phage	4.2e-08	29.7

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP017713|2244342:2298787|DBSCAN-SWA
CATGACTAACTTACACGAAACCCAACTGCGATTCAACCCTAAAATCAAAATTAAGACTGATGATGTTCAACTTTCAAATAACGCAGGCCTGTTGTTTTACGCCGAATTTAAGCACGCAGCTGGTCTTGACCAAACTATTGATCAAGCGGCGGCACAATTAAGCGAAAAACGTATTGGCCCTCATTATTCTAAAACTAGCTTACTCAATCAAATGCTGGAACTGAATATTGCCGGTTACGGCAATGATGTCGCGGCCGACGCGCTACAACACGACCCAGTCATGAAACAGGTCCATGGGACGACTGATTTAGCACCACAACCGACTATTTCTCGTTTTTTAAGTGCGCTAACTTGTGATGATGTTCTGCACTTGAACCGTTTGATTTTAACCTTGGCGCTCGATTATATCAGGACTAACCATATTGACACGGTCATGCTTGATGTTGATTCGACGCATTGTGATACCTTTGGTCATCAAGAAGCTGCTAGTTTCAATGCGCATTATGGGGTTACTGGTTTCCATCCGCTAGTGGCCTATATCGCGCAGCTGAATTTGCTTTTAGGAATCAAGCAACGTCCAGGCAATCAGTACACCAGCACTGGTGTCAAAGAATTCTTAGCCCCGATCTTTGCGGCTTTTTGCGAATTGCCGTTTGATGTTCAGTTGATTTTACGCGGTGATAGTGGTTTTGCGACGCCTGAGCTTTATACGCTCTGCGAATTTTATGATGTAAAATATGTGATCCGCCTGAAGCGAAACGCCGCTTTAGACCAACTAGCTGATGAATTCACACCAGTAGTGCCCAAGCATTTTGATCAGAATTCGGTCATCTATGGTGAATTCAACTACGCGGCCAAGAGCTGGTCGATTGATCGGCGCGTCCTAGTAAAATCGACGCATCAAGTAGGTGAACTATTCTTTGAACGGCAATATGTGGTCACTAATATGACTGAAGCCGGGGTCAAATTATTGTACTTAGCCTATCAAAAGCGTGGGGCCATGGAAAACCTGATCAAAGAAAGTAAAGCCGGCTTTTTTATGGATAAGACGAATAGCCACACCTTTACTGCCAATGCCGCGCGGGCAACTATCAGCGGCATTGCCTATAACTTGATTGCCTTGATGAAGTTAATGGCCTTACCAAAAGAGCAGCGCAACACGACCATTAGTACACTACGCTTTCAAATCTTTCATGTTGCTGGAAAACTAGCCCGTCACGCCGGAAAAATAATCATTCATCTGGCGCAAAGCAACGTCTTTAGCCAGCAGATCGAAGCCTTATTAGCTAACATTCACACGTTAAGCCCCTTAGTGACCAACTAAGAAAATAGCGCAGTTAATTTTAAAATTTTTTAAAATTATTGTGTTTGACCAAGGGATTAGTGGCTACTTTTTTGACGCGATCAAGTATGAAAACTAATCAAACTAACTAAATTAAGTCAAACTTGGCTAGTCATGACTAGCCCAAGTCGTGAATATAGAGAAATTACGTAAAACTGATAATTTGGCCAATCAATTTGATGCATATGCATAATTCAGGTAGAACATTACTCATCTAGTGGTGGCAAGATCACATTATTGTAGCGGAACGTTCGCAGAGCAGCAAAATAGTTACTGTTTTTAGCCTTACTTCTCGGCCGCTTCAGCTTTTTTCTGAGGCTTAGCCGGTGCCCGTTTATTCGTGGCATCACGGAGTAATTGATACAAAGTTGCTGTAATTGGTACTCCCAGTAACATGCCAATAATGCCAGCGACACCACTACCGACCGTGATCGCCGCCAACACCCAGATTCCAGGTAAGCCGATCGAAGTGCCGACCACTCGCGGATAAATCAGGTTATTTTCCAGTTGCTGCAACACTAAAATAAAAACAATGAACAGGAATGCCTTAAGTGGTGAATCAACAACAATCAGCAAGAAGCCAACTGCCGCGCCGATCCACGCACCAAAAATTGGAATCAACGCCATGATACCGATAAATGCCCCAATTGGCACCGCATTAGGAAATCTAAATAGCCACATTCCTAACATGCACAACGTTCCCAGTACAAATGCTTCGGTAACTTGACCCACAATAAAACTGCTGAACATTTTATTGGCTACCTGCAAAACATAATGAATTTTGTCTAGCGCGCGTTGTGGCACAAAAGCGTGACTAACGCGACGTACATTATTAGCCAACCGTTCCTTGCTACTAAGAATATAAATAGCAAAAGTTACTGCTAAGAAGAAATTAACGATTCCTTTAGTGATATTACCAAAAATCGTGAACGCCGAACCAAAAATTCCACTCACACCACTGGTGAAATATTGCATCACTTTTGATTGAATCGACTGCCAATCGATCTCCATTGATTCCAATTGTTTGGTAATCAATGGTAACTGATCAGTATCTTTAAGCCAATTGGCAGTATTGTTTGCGATCGTTGGTACAGAAGTGAAAAAATCACCGAGTGCAGTGGCAAACTTCGGGATCACCAACTGTAAGACACCTAAAATAACCGCGATAATGATCAGCAACGCCACCACGATCACCACTGGACGGCGACTTTTTTGTAACCAACGCTTCTTTGTGTGTGGAAAGTACCATTTTTCCAAACGGGCACATAGCAAATTCAACACATAAGCTAGCGCACCCCCAAGAATCAATGGTAAAATCACGCCGAGAATATTGGTGAATGCCCCATAAATCTGTTTTGGATAAATTAAAATAATTAGAAATAGGCCGCCAATGATTGCAGCTTGAATAATGCGTTTCCGGTTGATTTCCATAGAAAACTCCTCTACTTGATTTAATCAAAGCTGGTGCTTAAACTCCGGATGTTCTTATTACAATAACATATAACACTAATCAATTTCATCCGCCGTTGGAACCAAAATGATTTTATCCTTACTGCTACCAGCGGTCAATAATTGGTGAGCTTGAGCCGCATAGGCAAAAGCATTAACCGCCAATTTATCCTCCAGCAAACGACCACGACTGAATTCATGATTCAATGTTTTGGCCGCTTGCTGCAGCTGACTCAGTGTCGCATGGCTAATGACAAAGCCGGCAATATTTTTATCAGTCGTATAAAATTCGCGCACCCGGAAATCAAATTGATCAGTTGCTGGCGCAGTGATCAGCGCCACGGTTCCCCGTTGTGCTAATAGATCTAGATTGGCCTGTAACGCTACGCGGCCAGAAGTATCAACGATATAATCGATACCTTGAGGATATTTATCAGCAATTTCGACGGTAAAATCTGTCTGATAATCATACGGCGCTGCACTACCTAATTTGGTTAATTGCGCAAAGTCACACGGCTGCGAAGTTGTGATCACAGTCAAGCCCATATCGTGTGCCAATTGAATTAATTTACGACCAACATGGCCTGCTGCGCCCTCTACTAATAAAGTCGCACCAGGCCGCACCTGGAAAATATCGGCCAACAAAATAGCCGCCGTTGCTCCTGAATGGACAGCTGCCACTAGTTGCAGTGGATTAACGGCCGCAGGTACTTTGAAGACGCGCGCCACTGGGATCGCTGCATATTCGCTGGTTACACCTTGGCGTCCGGCATAGCCCATACTATTAGTCCAGACTAAATCGCCTTTTTTGAATTGATCAACCGCATTGCCCACTGCCACCACAGTTCCTACCGCGTCACGCCCGATAATAAACGGAAACGTCAGCTGAGTCTTAAAACTTCCCCCGCGAATAAAAGTATCCACATGATCGACGGCAACTGCTTTAACCTTGATCAAAACATCATGTGACGCTACATACGGCATCGGTAATTCGCCTAATTGAATTTCTGTTGGCGCGCCGGTCCGTTTAATATATGCCGCTTGCACAAAAATTCCTCCTCTACACCCACTCTAAAGTGGCTAATTTATTCCGTTCAATAATTTATAGCTGTGTTAAGCATATTATACTGCACTGACAGCGCTTAATTAAGCTATAATGAAAAGTAAGCAAAACTATTAAAAGGAAGTCCTATTTATGGCTGAGTTAGAAACAATTATTCACGAACGGCACAGTGTACGTCGCTATGAAACAAATCATCCCATTTCTACTACCGAACTTGATGACATGATTGCCACAGCTGCTTTAGCGCCCACTGCAATGAACAAACAGCCGTTGCGCTACTTAGTACTCGATTCACCAGAAGCACGTACTAAGTTACTACAACAGGCTAGCTTTAATCAAAGTCAAATCGAAACCGCCAGTAGTTTAGTGCTGATTGTCGCTGACTTAGTCAATGATGATGCGTCAGCTTTTAGCACTAGTCATGGCACACCGGCACCAGATGCGGGTACTTTAACCAACCATGCCTTAAATGCCGGTTTAGCTGGTATGCAATTAATGTTGATCGCGCAAAATCGCGGTTACGTCACCAACCCAATGACTGGTTTCAATCATAACGAAATCTTATCTGCATTTGGAATCGACAAGGAACGTTATGTGCCACTATTATTGATTGCTATTGGTAAAAGTAACGATCATGGTCAAGCTAGCGAACATAAGCCACTAAATCAGATCTTACTACGGAAATAACAGCTTAAATAAAAACAAGGCAGCGTGTTATGCTGACCTTGTTTTATTTAATTGCTTGAAATGCAGCGGTTACTGTAGGATGCACTGTACCTGAAGCAAACAGCTGAACGGTTTTGGTTGCCCGTGAAATTCCGGTATACAATAACTTATTCAGACGTTCTGGTGTTACTACGGCTAATTGTGCTTGGCTCACATCTAATAGTAATACGCGGTCAAATTCTAGACCTTTAGCTAAGGTCAGCGGCAAGATCACAGCTTGTTTGGTAGTCATACCACCATTTTTCACAAGCGCCAGCGTTGGTGTCAGCGCCTTTAAACCTGCGTAAACGGACTCGACCATTTCTGGTAATAACGTAACAATTGCTGTTGAACCGGAATTTTCTTGCTGCAACACTTGATTTAAATCAGCTAACATACTAGCAAAATCAGAACTTGACCGTAATTCAGGTCGTTGGCCGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_18

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MTIQEMKKGYEQEVTYQKHMLRNLGYWFQLWTIISGIGIVLTYFFYRQNLWLCILGITLFVIGTLGMLVFGYAGWKGQQNIHAIIDDFDKKIEYFQ
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MRIKSGIAYLEYLLSIVQSRYDLHLRPNDFAIEAMQLDRSELDLDSLSGVLVPHDFGTMETTDTLSFYLFSTEDQGNDYLGYAILSDTLEQAYLVGWVKNSQLVYWNDLQKGGNADGRID
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Homologous phage analysis in the prophage region

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2245762:2245777	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_010008956.1|2247189_2248179_-	zinc-binding dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
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WP_010012393.1|2254166_2254403_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267157.1|2254545_2255469_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	1.4e-30	30.6
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WP_003680883.1|2260676_2261378_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
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WP_156403526.1|2263133_2263283_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010008934.1|2263601_2264750_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	Q4ZD55	Staphylococcus_phage	1.2e-26	29.8
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WP_010008932.1|2265112_2266741_-	primase	A0A2I7QLM0	Vibrio_phage	3.8e-23	29.3
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WP_010008927.1|2267539_2268682_-	DNA-directed DNA polymerase	R4KLC5	uncultured_virus	1.7e-09	25.8
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WP_010008920.1|2271409_2271691_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010008919.1|2272016_2274827_+	class I SAM-dependent DNA methyltransferase	Q6NE04	Leptospira_phage	2.0e-144	35.4
WP_010008918.1|2275272_2275962_-	2,3-diphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_029507575.1|2276128_2276320_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010008916.1|2276285_2277506_-	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003677794.1|2277985_2279026_-	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010008914.1|2279150_2279813_-	type 1 glutamine amidotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_010008913.1|2279877_2280345_-	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	1.2e-11	32.0
WP_010008912.1|2280752_2281082_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010008911.1|2281144_2282266_-	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_003677785.1|2282292_2283108_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010008908.1|2283538_2283829_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010008907.1|2283862_2284708_-	PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IID	NA	NA	NA	NA
WP_029507942.1|2284710_2285562_-	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
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WP_010008902.1|2287123_2289649_+	PRD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267158.1|2289889_2290315_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267159.1|2290329_2291256_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_169925041.1|2291456_2291633_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
2291396:2291411	attR	NA	NA	NA	NA
WP_010011941.1|2291622_2291976_+	IS66 family insertion sequence element accessory protein TnpB	NA	NA	NA	NA
WP_169925051.1|2292040_2293570_+|transposase	IS66 family transposase	S5VTD3	Leptospira_phage	7.4e-53	31.1
WP_010011944.1|2294489_2294960_-	PTS glucose transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_056943338.1|2294961_2295720_-	DeoR/GlpR transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_010011946.1|2297557_2298787_+|transposase	IS110 family transposase	M1NSC9	Streptococcus_phage	1.1e-83	49.1

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP017713|2376352:2452301|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010012081.1|2415502_2416210_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_139026548.1|2416185_2417085_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_003677444.1|2422189_2422798_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator C-terminal domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010012088.1|2427776_2428922_-	ArgE/DapE family deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_099267109.1|2429114_2430038_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	6.2e-31	30.9
WP_010012090.1|2430344_2431202_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_003677437.1|2431211_2431643_+	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_099267163.1|2433327_2434755_-	DHA2 family efflux MFS transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_010012092.1|2434898_2435489_-	CvpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_176720061.1|2435841_2437194_+	DUF21 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010012094.1|2437363_2438512_+	LCP family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010012095.1|2438611_2439577_+	Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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WP_010012236.1|2440220_2440895_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_169925064.1|2451272_2452301_+|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	8.8e-42	33.5

Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_20

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010012147.1|2488683_2489574_-	2-hydroxy-3-oxopropionate reductase	NA	NA	NA	NA
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WP_056943316.1|2491338_2492394_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010500113.1|2492590_2493469_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_010012157.1|2498999_2499890_-	decarboxylating 6-phosphogluconate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_010012158.1|2499959_2501900_-	transcription antiterminator	NA	NA	NA	NA
WP_169925071.1|2502067_2503099_-|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	5.2e-42	34.4
WP_167578815.1|2504312_2505782_-|transposase	IS66 family transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.0e-51	31.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_21

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MSLSVFLELVEIKAKTASVFPFLLGTFFAWYHYHQLHPVYLLLFFVAMLMFNMAVDANDNYQDYHRATHNQALAFREKTNIIGVHKLNPSHIGWLIFWLIAVSAALGLFIVSRTGWPLFWLGLFSYAVGYFYAGGPRPISSTPFGEFFSGITMGFVIFLISVYINTYDVITFNWAFVWPVLLSSGLAVCSIANLLLANNIADEQEDRELGRTTIVYYLGKPAALKMFVILYVVGFVCLLASVWLGYLPKLTLLTFLTVPIVWRNTRGFLAKQIKKETFPLAIKNLFLITLAQVIFFGLGLLIQW
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MPELIKIASTANHTFVTPLMTLYVSILEHNPAVDFEFFIIDDALQPIDYRYLNTLCQYYPNCRRINFLRVDPAGYARAATSHRIIQSAYYRIDLPETLRNHERLLYLDCDMICRGKLLPLWHQNLHGRILGAVEDAGYVEARLDKMQIPHHEKCYFNSGLMLIDVAQWRRHKVSQRVKAFIAAHADQLRYHDQDALNAILADHWLRLHPKYNAQSRLLWREQQHREPAEEQRNEAARQAPVLLHYSGYRKPWNATDHHPAAAAFNAYQPLVQQLKLKTSEPTPFKMNSRTQK
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MNSFYQKSSLLTTLHAYFFDLKAAGLSKPMGLNYFWLCLALLVIGDRHSIRHLFEQFLGRVTKHSLNTFYRALAVIGDHLPQLEVRNLTYLLTLIPTTCQDLPLLLVLDDTVQPKFGHKFTGVKYLFDHAAHTGKRLVNAHDFVTLGLMIPTQRDQDDQPVYTFLPLATHLYQAEQATKYQQAAQMIKTTLKSIASDQQVFLLCDSWYPKAEINQLVMTQPNLAMIANVRKDTAMFGLPKRTGKRGRPRKYGDQIHLGNIALNLCSAGDQIGIVRCLTRLMPQPVYMIRVQRKTTCRLFMATSAPEELAAITTETLAVDPTQLTYRTPETSAPAPALRALAYYQKRWAIETYFYEMKTFWHFGDYAVRSVAKIEADHHLLNTAYTLMIVLPLTQPRLAFLATKSLRERKLWLSRQIQAALFLASLARQVQRRLKTTPAKVVIQWLASCWSGVSEKL
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MHTPLIAYLVLIIKLQRQIILILLAQLAEIFDHSRLPSADKPVFKRFNQFQVDEKVPLLQADIGSEALDYQQLIAESLEKNGKPILPVRRRKPISFAAQDCPRCSAPQDYLYANNGAGGQLRCKVCQFKFQDGHAEKNKTVALRCPYCQNRLSIHNRRTKFDVWCCYNDKCAFRLGAIAAMSPAEVADFNVHPTAHKVRYTWRTYNFELKGIAPESPIQAPVDLDRIQASPEVLGLVLTYHINYGLSARRTAAIMYDIHGVKISHQTIHNYEMAVAAVVRPFWANYPYALSDQIVGDETYVRVKDKWHYIFYFYDAKCKLILADYVTPNRTTESAVIAINQVLQKMPQIPEKLNFVVDANPIYQVAQIYFAQQGIKFGIHQVVGLENKDEISREYRFLKQTIERLNRSYKENYRSSTGFGSATGSASYTALYSAAYNFLRPHEALHYRIPVELPQLKPFERMPDKWLALIELAQSQLPTAA
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MQQKRFLRLSLGWRIVLGLILGLVVGALFYQNKMAIAILNPIGTIFINLIKMIVLPIVVSCLVVGIAKMGDIKKLGRVGGKTLIYFELMTTIAIALGLLVGNLTKPGDSINIQTLSKVSISQYTATAKTAGNNGLGDIIMNIVPTNFFEALGKGDMIPVIFFTVMFGLGIAAIGKRGHVLIDFFDATSEVMFKMTNWIMQLAPIGVFALIGVTIAQFGLSALKPLALFLLIAYMTMIIFVVVVMGLVARFFHLNIFDLLLVIKDELVLAFSTASSEAALPRIMEKMPRYGVSQGIASFVIPTGYTFNLDGSAIYQSLAALFLAQAYHIHLSLGQQITLLVVLMITSKGMAGVPGASFVVLLATITTIGVPASGLAFIAGIDRLVDMGRTAVNVVGNSLAALIIAKTEHEFDEEKQQNYLADVKKVTAEKVN
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MKRISAILALAVSVVLLTACGRLGSSGVGTTSSTKTKTSIQTTGQTSDDEYQGVIQNGRYKTSKARGLTKDQNTNGANLKSFENGLQTISQKQFATDDYIFQEGQYLKKATAQNWLDRKSKSNASGLNPEDNGQTDADKRNPDYLQAIEEQDYMTQDGNNLKLGGMTIGLAMNQVDYYQKEEYGATYETKISHDKMVSEGKSMADQVVSRMRKTEGVGNVPIVIALYEQATNDSLVGGTFFAYGISKDGGKTISEWHDVNEANYVLPVVGSAKSGNSSDADSFTNFKNNVQSFFPNLSGVTAQTHYKDGNLSGMNITINTQFYSETEIKSFTQYLVTAANKYLPSEAAIEITVQSTDGTQAFVARKAGEKSFYSHVFGSY
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MNFFDNDLTTIHNQLVNKELTSYELTKQTIDALKATDQKIDAFLALDEENALATAKAIDEKGIDAANLLAGIPIAIKDNIMTKGLRTTAASKILENFTPIYDATVMEKIHANDMVVIGKTNLDEFAMGGSTENSAFKITKNPWDTTKVPGGSSGGSAAAVSAGMVPFALGSDTGGSIRQPASFTGVVGMKPTYGRISRWGLIAFGSSLDQIGPFSRGVKDNAALLNILVGEDKRDATSVSGHEADFTAKIDAGVKGLRIGLPKEYLGEGVQAEVKEAILAAADKYRELGATVDEVSLPHSKYGVAAYYIISSSEASSNLQRFDGIRYGVRAQDAKDLNEVYVNSRTQGFGPEVKRRIMLGMYSLSAGYYDAYFKKAAQVRTLMRQDFADIFKDHDLILGPVAPTTAYGIGEDVTDPLTMYAGDVLSVPVNLAGLPGLSLPAGFANGLPIGMQLIGPSFAEATLYQAGYAFEQATDFHKQVPTLGGND
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MAQQNSSQQVVDANGQPYNRLLLVATLLVGTFSTFIMQTILTTAFPTLMRHFNITADTVQWLTTGFMLVMGIMIPVSAWLLSRFNSKYLYLTAIGLFWIGTFVCYMANSFGVLLAGRLIEAMGVGISAPVFQTIMLSIFPPQKRGTAMGLAGIVIGLAPAIGPTLSGWILLNYSWRMLFLVILPVNGAVFILALFTMHKVLPTAKTAIDVLSVIVSTIGFGSLLYAFSSVGSSSWGNPKVLIPLVIGLVFVALFVQRQLHMDKPLLELRVFGVKAFSLSAILTAVAYMAMMGAEMVLPLYIQTIRGESAFHSGLILLPGAVMMGIMSPITGRIFDRIGAKRLSITGMILLTVGTAFFVTMTAKTPIIYITVLYTMRMFGITMVTMPVTTTGMNALPLNLIGHGTAVNNTTRQVAASMGTAILISVLTNVTNAQSPAKSLLKQAPLAYQQHMINATLSGYHAAFVVSLLFCAVGLVLTFMLPNANHQKEAR
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MSTIQYNDTDIHHSFAHFSKLVHLSAILRRVNIHKSRGIKTERLFEWLLTTIFNRYSIFRAEKANDFSKRTVRNCLNDPHINWQRLVQLLAIHLIQYVQHFTDPRRRQALIIDDSLFKREFSRKTELLARVFDHDKQQYFKGFRTLTLGWSDGNTFLPLNFALMSSSHAKNRFGHLKSSDQRSLAAKRRTQATRKMTDVALELVDDAIKSGIKAKYVLFDSWYASPRMFAALLKRHCHGIGMLKKTKKVYFRYRGREMDIKTLYTNLRRSKWPIKDSYLYSPIVTFEVDGEKIPMKLVFVTKRGQADQYLVLATTMTDLRPEAIIQMYGRRWQIECYFKVAKQYLQFDQTQVQSYDGLCGHLAMVMLSYDVLALAQRENTDDRTLGDLFFDYGRPLPDIKLVSALNWLIQTITGLGEKLDMAVETLTIIFDEFIKALPNSLARLLGNAQ
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MFHLIWLLIVGAVIGALAGAITSRDLPLGWLGNIIAGLIGAWLGETLFGDWGPQIADLALLPAIAGAIIFVLIISWALTKIKHQK
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MAKFTPQETWLYLTINDNLLAQFANKFLMFVAMTILVAKFTPQETWLYLTINDNLLAQFANKFLMFVAMTILVAKFVPQETWLHHRNHDTASQPDLASFAPRWLRPRS
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MKFIAPVTKNEEITATIIDLTYEGMGVAKVSDYPLFIEDALPGEEVELVVTKVGKNYGYARVLKRHNDSPDRVELPNKTYMQSGIAPLGHLSYAAQLKFKQQQLRNVYQKNHLDIEVLPTIGMADPKGYRNKAQIPVRQVNGQLETGFYRKRSHQLIPLEDFYIQDPEIDRAIVVVRDLLRQYHVPAYDEARNRGIMRNIMVRRGHFTHEMMIVLITRTKDIPQLQNIISGIVTKLPKVVSIMQSVVPKPTNVVLGRTVKKLYGKTYIHDQILGHTFDVSALSFYQVNPLQTERLYQTAIDAAHLTGKETVIDAYSGIGTISLSLAKHAKYVYGVEVTEAAVADAKRNAKHNGIHNVKFQLGLAEKVMQEWREEGLEADVLVVDPPRKGLASTFVEAVGVMKPKRIVYVSCNPATLGRDIALLQEFGYHAEKTQPVDMFPLTQHIESVTVLTLD
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MTEFYFIRHGVTPLNQQHRFCGSGIDTPLATVGIAGARRAGRFLQNIKFTHAYTSPLQRAQATLENVLAVNQAPQVPTTILADLREINLGDWDGDVLADHQQEQQCQYYFKQPELFDATVVHAESYTDLEQRGRRALLQIFQENPQGNVLIASHGVLLMTLLQRVLGVPLSEIRRHGVLDNTSVTQLSSNDGSHFTKEMWNETSFL
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MDIQVGNTVRCKANGNMEADFSGVIEKVYENSALVNITDYDAKTDSMNIQDLQNKAVISFGKMKLVSAK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_010009632.1|2532516_2532735_+|transposase	IS3 family transposase	A0A2I6AZV9	Macacine_betaherpesvirus	5.6e-07	44.6
WP_176720049.1|2532804_2534103_-	NCS2 family permease	A0A0R6PHV4	Moraxella_phage	5.7e-46	33.2
WP_010009636.1|2534383_2535580_+	NAD-dependent formate dehydrogenase	A0A1V0SBV6	Catovirus	1.6e-18	30.3
WP_010009637.1|2535664_2536531_-	aldo/keto reductase	A0A1V0SKP9	Klosneuvirus	2.1e-28	31.2
2535944:2535960	attL	NA	NA	NA	NA
WP_010009638.1|2536562_2537312_-	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_169925066.1|2537999_2539445_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A1X9I6E7	Streptococcus_phage	9.9e-07	27.2
WP_003678974.1|2539769_2540645_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_099267168.1|2540835_2542173_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_164512712.1|2542407_2543436_+|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	1.1e-41	33.5
WP_003680217.1|2543807_2545172_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	A0A2K5B251	Erysipelothrix_phage	1.2e-131	51.7
WP_003680215.1|2545294_2546281_-	diacylglycerol kinase	A0A1V0SBJ0	Catovirus	2.3e-15	25.7
WP_010010820.1|2546293_2547724_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_010010821.1|2547723_2549187_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_010010822.1|2549183_2549498_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_010010823.1|2549677_2550973_-	cation:dicarboxylase symporter family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010010825.1|2551173_2552316_-	CamS family sex pheromone protein	NA	NA	NA	NA
WP_169925052.1|2552404_2552731_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010827.1|2552675_2554712_-	NAD-dependent DNA ligase LigA	A0A1W6DX16	Sphingobium_phage	7.9e-95	35.8
WP_010010828.1|2554783_2557057_-	DNA helicase PcrA	A7KV33	Bacillus_phage	3.4e-131	41.4
WP_010010829.1|2557341_2558640_-	adenylosuccinate lyase	A0A1B3B081	Gordonia_phage	1.9e-17	32.4
WP_003678537.1|2558722_2559859_-	ATP-grasp domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010831.1|2560014_2561343_-	purine permease	Q9KX94	Enterobacteria_phage	2.2e-29	28.6
WP_010010833.1|2561332_2561929_-	xanthine phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_010010834.1|2562385_2563021_-	glycoside hydrolase family 73 protein	Q9ZXE4	Bacillus_phage	4.5e-20	43.7
WP_010010835.1|2563126_2564089_-	aromatic acid exporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010836.1|2564214_2565408_-	phosphoglycerate dehydrogenase	M1NSB9	Streptococcus_phage	2.7e-95	44.4
WP_010010837.1|2565407_2566484_-	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	3.8e-104	54.5
WP_010010838.1|2566720_2567635_-	prenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_010010841.1|2567894_2569625_-	thiol reductant ABC exporter subunit CydC	W8CYL7	Bacillus_phage	1.1e-20	25.9
WP_010010842.1|2569621_2571352_-	thiol reductant ABC exporter subunit CydD	W8CYL7	Bacillus_phage	3.2e-20	24.7
2569798:2569814	attR	NA	NA	NA	NA
WP_010010843.1|2571348_2572365_-	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_010010844.1|2572357_2573797_-	cytochrome ubiquinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_010010845.1|2574190_2576506_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010846.1|2576544_2576802_-	GlsB/YeaQ/YmgE family stress response membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010848.1|2577018_2577897_+	glycosyltransferase family 8 protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010850.1|2577923_2578736_-	sugar-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_056943261.1|2578842_2579463_-	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010852.1|2579556_2581014_-	cardiolipin synthase	NA	NA	NA	NA
WP_010010854.1|2581183_2582656_+	multidrug efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010010856.1|2582655_2583174_+	DUF4811 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267136.1|2583309_2584659_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_010010857.1|2584816_2585137_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_029508013.1|2585301_2586651_+	ATP synthase subunit J	NA	NA	NA	NA
WP_010010859.1|2586678_2587344_+	TrkA family potassium uptake protein	NA	NA	NA	NA
WP_162253083.1|2587454_2588276_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_010010862.1|2588346_2588556_-	DUF2187 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267171.1|2588669_2590040_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP017713|2709959:2765551|DBSCAN-SWA
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MSTKTPQIPRSVMTIAWILVFGAMAPLLDSTMINIAIHNLVHDLNSSVTTVQWTITGYLLATGIAVPFSSWLLNKFNGKHVFLAGEVLFALGSILSALAPNIQWLISARVIQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAAMGQMMATVGLPMILGPLFGPVLGGIIIKSLSWHWIFWVNVPVGIISISLILWKMPDYPAQNKAAKMDFGGIILLAGATTSIIYGIVKASKLANFTNQTTLTFLGSGLLLLIGYLIWAALRKEKAVLPLNLFTHASFNGAGLGLLLAGTVLNGAMLLLPLFFQDVRGMTVMQAGLALIPQGAGMLVARTLTGRLTDSLGAKYVVLVSLVITFIGTLPFYWFDAHTAYWLIACVLIVRGIGAGGILMPLMADAYTGMKPQQVPAASIGSRIIQNIGSALGSALIATLVTAYTNTYVKSFQQQLANGRFHIPATQRATFAQQHLATIKLHAFQYGFLFTAIAALAIILPALLLTNKMNDHHA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_010009278.1|2717453_2718548_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_010009279.1|2718556_2719495_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	6.1e-26	34.0
WP_069700561.1|2719665_2720655_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	9.9e-59	40.1
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WP_010011795.1|2730401_2731055_-	serine dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_003679813.1|2731337_2732879_-	ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L0W2	Tupanvirus	3.9e-46	28.2
WP_010011797.1|2733427_2734303_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_010011798.1|2735449_2736226_-	PAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011799.1|2736248_2737169_-	FAD:protein FMN transferase	NA	NA	NA	NA
WP_003679818.1|2737259_2739020_-	pyruvate oxidase	A0A0P0CDR3	Ostreococcus_lucimarinus_virus	3.8e-29	26.8
WP_010011801.1|2739278_2740460_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
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WP_003679984.1|2744859_2745453_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_010011808.1|2748663_2749176_+	DUF1440 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010011812.1|2751332_2751950_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010011814.1|2752198_2752900_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267173.1|2753200_2754274_+|transposase	IS30 family transposase	H7BW47	unidentified_phage	5.6e-31	35.0
WP_010012694.1|2754798_2755038_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_099267174.1|2756337_2758452_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit	K4FB40	Cronobacter_phage	1.5e-117	38.9
WP_164512712.1|2758689_2759718_+|transposase	IS30 family transposase	H7BUM7	unidentified_phage	1.1e-41	33.5
WP_056943345.1|2759953_2761078_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_141707553.1|2761493_2761730_-	KxYKxGKxW signal peptide domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010009885.1|2762215_2763061_-	PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IID	NA	NA	NA	NA
WP_010009886.1|2763063_2763927_-	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
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WP_056943358.1|2764102_2765551_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A1X9I6E7	Streptococcus_phage	2.4e-08	25.7
WP_056943358.1|2764102_2765551_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A1X9I6E7	Streptococcus_phage	2.4e-08	25.7
2774435:2774585	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP017713|2771073:2824238|DBSCAN-SWA
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MDSNDELDDDTYGEVQKSVEQVAASAVGGVSGAALVSVFAALVPLAGTILGAMSALNWKKLLK

Homologous phage analysis in the prophage region

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2774435:2774586	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_145955961.1|2778550_2778823_+|transposase	transposase	Q6J1X3	Lactobacillus_phage	3.5e-30	98.6
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WP_010010305.1|2793772_2794459_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010307.1|2795055_2796201_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010308.1|2796357_2796969_-	DUF1211 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_010010309.1|2797116_2799213_-	ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	1.0e-44	30.2
WP_010010310.1|2799217_2800954_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2R8FG22	Brazilian_cedratvirus	7.2e-12	29.4
WP_010010311.1|2801150_2801810_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator C-terminal domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010010314.1|2803134_2803518_+	reactive intermediate/imine deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_010010315.1|2803556_2804339_-	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	3.7e-16	28.4
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WP_010010317.1|2807741_2809442_-	biosynthetic-type acetolactate synthase large subunit	A0A0P0CDR3	Ostreococcus_lucimarinus_virus	2.1e-64	31.5
WP_137636541.1|2809918_2810131_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_010010324.1|2816594_2817317_-	DNA/RNA nuclease SfsA	NA	NA	NA	NA
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WP_010010333.1|2822688_2822952_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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