Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP024576 | Acinetobacter baumannii strain AbPK1 chromosome, complete genome | 3 crisprs | csa3,cas3,DEDDh,WYL,RT | 1 | 0 | 9 | 0 |
NZ_CP024577 | Acinetobacter baumannii strain AbPK1 plasmid pAbPK1a, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP024578 | Acinetobacter baumannii strain AbPK1 plasmid pAbPK1b, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP024576_1 | 460711-460905 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP024576_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP024576_1
>1.1|460729|45|NZ_CP024576|CRT AGCTTCGATGATAAGCCTCGTGGTGAGCGTCCTGCTTTCGGTGGC >1.2|460792|39|NZ_CP024576|CRT GAGTTCAACTCAGATCGTCCACGTCGTGAAGGTGGTTTT >1.3|460849|39|NZ_CP024576|CRT AGCTTCGGTGGTGAAGATCGTCCACGTCGCGAGTTCAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP024576_1
The CRISPR arrays of NZ_CP024576_1 >merge|NZ_CP024576|1|460711-460905|CRT GATGATCGTCCACGTCGTAGCTTCGATGATAAGCCTCGTGGTGAGCGTCCTGCTTTCGGTGGCGAAGATCGTCCACGTCGCGAGTTCAACTCAGATCGTCCACGTCGTGAAGGTGGTTTTGAAGACCGTCCACGTCGTAGCTTCGGTGGTGAAGATCGTCCACGTCGCGAGTTCAACTCAGATCGTCCACGCCGT >NZ_CP024576|1|1|460711-460905|CRT GATGATCGTCCACGTCGT AGCTTCGATGATAAGCCTCGTGGTGAGCGTCCTGCTTTCGGTGGC GAAGATCGTCCACGTCGC GAGTTCAACTCAGATCGTCCACGTCGTGAAGGTGGTTTT GAAGACCGTCCACGTCGT AGCTTCGGTGGTGAAGATCGTCCACGTCGCGAGTTCAAC TCAGATCGTCCACGCCGT
>NZ_CP024576.1|WP_000433619.1|458171_459002_+|inositol-monophosphatase MEPMVVMAARAAQTVGQELLKAHQNRHKLDLQVEEKGIDGPVTRVDRYLEQLTIDTLRKSYKNHSFLGEEFGLQEGKGHDADWCWVIDPLDGTQNFINGFPHFCISIAVQHKGVTQHGVIYDPVRDELFSASRGRGAVMNQRRIRVNVKDSLENTFLAVGHPYRAKRAGEIVSYAEQHFASLLAVTQAGAQIRRGGSAALDLAYVAAGRFDGFFELGLKPWDIAAGELIIKEAGGVVVDARGGNDSLENGQVIACSLKMLKTLMQTVVPAWDKAAK >NZ_CP024576.1|WP_000967375.1|456144_458049_+|1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate-synthase MLYTEIPTQRPVTPLLDAIDHPQQLRQLEHSQLLQVADELRQYILYAAGQSGGHFGANLGVVELTVALHYCFNTPNDRLVWDVGHQAYPHKILTGRREQITTIRAKNGLAAFPAREESVFDTFGVGHSSTAISAGLGMSLARRYQKDPCEVVCIVGDGAMTAGMAFEAMNDAVAHDADLIVVLNDNDMSISCSTGGFAKHLAAIWEKGHLVNVNEHGEAYIQPHPKWTYNSRLHQSATDAADNLFKAIGFDYFGPFDGHDVTQLVQVFNALKKRKGPRLVHVYTKKGKGFAPAEADPITYHAIGKINAASGGKTPPKYSDVFGEWLCDEAAQDERLLAITPAMCEGSGMVKFAKQFPQRFFDVAIAEQHAVTLAAGMACEGLKPVVAIYSTFLQRGYDQLIHDVALQNLDVTFGIDRAGLVGEDGPTHAGAYDYAYMRTVPNMVIMAPKDENECRQMLHTAYAYNGPAAVRYPRGAGVGVEIQKEMTVLELGKAEIVAEIKANSDEQITVLAFGSRVMVALEAAEQFAQKHDVSVCVVNMRFVKPLDEQMIRDLAEHTHLFVTVEEHAIMGGAGSAVNEFMAQEQIVKPIINLGLPDSFLHQATHNQMLQDCGLDAKGILNSIERAWLKVNQVV >NZ_CP024576.1|WP_001121174.1|455238_455841_-|GTP-cyclohydrolase-II MPIEFIATSKLPTAFGEFNISVFQDPVTGEEHVALSKGLENPPTGPVLVRVHSECLTGDAFASLKCDCGPQLQATQKLINEAGQGVILYLRQEGRGIGLTNKIRAYALQDQGHDTVDANLLLNLPADARRYDMCSIMLDHLKVKEVKLITNNPLKIQALKDQGINVVDRVPLTVGRNPFNEQYLKTKRERMDHLYQKDDF >NZ_CP024576.1|WP_001164613.1|454160_455111_-|oxygen-dependent-coproporphyrinogen-oxidase MQHPTSTDIQRVREFLLDLQARICAGLEQQEKAGGGTAEFIIDDWERPEGGGGHSRVLQNGTVIEKGGVMFSHINISKLPASATERHPQIAGAKAQALGVSLVIHPKNPNIPTSHANVRLFVAEREGQDPIWWFGGGFDLTPFYPDDQDVLNWHQAAYDLCKPFGDNVYAEHKKWCDDYFYLKHRDEQRGVGGLFFDDLNCWDFETCFKYIQAVGNGYLNAILPIFEKHREQPYTEAQREFQLYRRGRYVEYNLVYDRGTLFGLQTGGRIESILVSLPNLAAWSYRPEWDEDSPEKRLTDYYLKPRDWLGLEEKVA >NZ_CP024576.1|WP_000166019.1|453198_453987_-|shikimate-dehydrogenase MTKQFAVIGNPIEQSRSPELHHAFAEKTGVDLNYQKRLAPLDGFESSMRSFFAKGGSGMNVTVPFKEQAFALCDVLTERAQIAKAVNTLWMENGKLHGDNTDGQGLVAAIQALEWNLENTTILILGAGGATRGVIYPLVQAGAKKIVIANRTLARAEQLVDDLKTAVPQAQLQAISLNDLEGDFDIVINATSASLSGDALQLPEKLKFKYAYEMAYGKPSSFLDQAKQRNVPYAEGFGMLVGQAIEAFSIWNNVRPQLKDFL >NZ_CP024576.1|WP_000550356.1|450849_453153_+|hypothetical-protein MHLKYLSLCLFSLGLTACAQHGVRPQVASASLEQKAIQSVNAMYEYPSYDYRGNFKITVDPSQIKQNVKAENTAKLDAELQKKVDQYLREQKVALSKAQKQTLYTAIANEQGDLGLTSSARSEKINTVLFNLLNDLQFSYDGSIHYRQKMGSFNLTARYEKPTLLVQAKLPMVLDLENYKFYINYFGLMPYLVNKDNQNNLAYVDFSKYKAFFKNVDKKKFIEYLKASSAVSYRLAEPQNLQRVSLTEADRKAGAVEKIRLKTTVEQLLLEVDLFGQVNEKYLQKSVLGLDEEKLAETLAAEIAASDAKKGTAGKEEQKVSSDDAAAVSQQLYSLVNAHLGNTSTSEDEEIESASSEEASDVAVAEAEQTSENEEVVALTEDQCIELKSLKKPVALGDINYCQIYGIDVLDQSDTSIQKAQIKSRQDALKQTFEAYNQNQFINDEAFKALWLKHKDEIEQALPKQRNPITIDVALDDKGRAVNMDYDVDYTPAEFKHRFNIKADMQILNYGKATSIDQQQLKQAKSVAEASKGSMLENFIKGFSEKLGQSDVSEHPVGTHSDVQDLDANLAVLADKTYDATHAYDKTYKAVFIAKLTAEKPSYIKYYSVQQLQEIAEVYAYWFSDEDTYNPQGKALERITALQKKHHLEQDDQFDHELGRAVDHIVLTTIQGKTGREAWQKLQKQYKQPAQLFSKQYQLEFEKQNGVSAEEKHLLSETADILGNVYVAARKKQLSEKTIQNLKPEHNEFIDYEIFREVYKQMVAARK >NZ_CP024576.1|WP_001112081.1|448768_450592_-|acyl-CoA-dehydrogenase-C-terminal-domain-containing-protein MPAYKAPLHDIRFLMNEVLDYPAHYKTLSNGESADPDTVDMILEGAADYCENVLSPLNQSGDEEGCHFDNGEVKTPKGFKEAYDQFVMGGWQGLSYPEEFGGQGLPMSLNLIKSEMMGTANWSFTMYPGLSSGCMNTILQFGTDEQKQTYMPKLVEGTWSGTMCLTEPQCGTDLGQVKTKAEPQADGTYKISGTKIFISAGEHDLTENIIHIVLARLPDAPAGTRGISLFIVPKFIPTAEGGVGERNTVSCGSIEHKMGIRASATAVLNFDNATGYLIGEVNKGLHAMFTFMNTARIGTAVQGIAHAELSFQGALPYAKERMSMRALSGKKDPDKVADAIIHHADVRRMLLTQKAIAEGGRSMIYYAAQLADKMTDALTRGDQAAFEDYDDKLGFYTPILKGFLTELGLEAANHGMQVYGGHGYIKEWGMEQIVRDARISTLYEGTTGVQALDLIGRKVLLSSKGKVVREYTAEILKFCAAHARNKYLRRFAWDLTKLCAQWNTLTVRIMLAARKDRDIVSSASVDFLMFSGYVMMAYFWAQQAVVASEKLEAGNGQETPEFYKAKIKVADFYFDRLLPRAQGHAESMVTTSRTLTSLPAEHFSFDY >NZ_CP024576.1|WP_000054114.1|448048_448696_+|hypothetical-protein MSLKSSGLLMKHLGVAAILCMGLSACDVNHADSKDHSAVATTSRHEDSLIKSTTKVKTLDDAAGRTFLPEGVPDQTSKLSEADQQYAGRYHTRISCEDNFADCETGEAEYILNLLPDGTAYWNVVHFGRVGSKDGSKSAVINQLCPSLKWKVEPAVHELTIQCPLSDVNFYFDIDAKQRLVVNLEKLFYSDFGKNREFLEQNYFVPTKAYVLDKE >NZ_CP024576.1|WP_000013717.1|447540_447795_-|PspC-domain-containing-protein MANSGLYRSNRQSMIAGVMGGIAERFGWNANLLRIIFVLVSIMSAAFPGILVYLVLWLVIPKKQPEQVQGYQQPVRTVREEQIH >NZ_CP024576.1|WP_000111462.1|446370_447471_+|HPP-family-protein MSVIQPEWLQILKPNFKVLPLKERLLCGVGALCGLAISSLISWYVLGGINAWYIAPMGASSVLLFAVPTSPLAQPWNVIVGNTLAGIIGVACAQWIPDLTTAFSVAVGFAIFLMMTTDSLHPPSGAVAITAVLGGAAIHKLGFYFVFYPVLLNSLLLLGFAVFFNRLIGRHYPVTAHLNERSKDPTPTQKVSIQPKDIEYALEHHTELLDISQYDLEKIILEAQEHANERMVNQYTCQDIMSRDVIKLHENDDIHQALDKFKQENLMSLPVVNADNHLVGTLALYEVVEWFKGATDPRNSWQHYVRQIMSRRVVTVLPTQPIQDLVPYFVEKSFNYIPVVEERKLIGIISRADMIAALQQQLNRKL >NZ_CP024576.1|WP_157774845.1|461263_461449_+|hypothetical-protein MFIVIMHKSKRKESPLAWLSKFLFQRGLPYLFIALALCNGIYFAYALLTGHFVDQFQVLDQ >NZ_CP024576.1|WP_002019647.1|461575_462394_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNNKTPLSTQSLIEVKNLSFNRGERVIYDNISLNIRRGQITAIMGPSGTGKTTLLRLIGGQLVPDQGEVLLDGKDIAQMSRQELFAARARMGMLFQSGALFTDMSVYENVAFPIRAHTKLSENLIAELVALKLESVGLRGTEQLMPTELSGGMNRRVALARAIALDPDLIMYDEPFAGQDPIVKGVLTRLIRSLREALDLTTIIVSHDVPETLSIADYIYVVAEGKIQGEGTPEELQAYASPFVKQFLTGSAEGPVEYQFSHQAYLDNEVRP >NZ_CP024576.1|WP_001091950.1|462390_463167_+|lipid-asymmetry-maintenance-ABC-transporter-permease-subunit-MlaE MNTIAWLGRLVIERIRGIGVAALMLLQIIFSLPSAGGFGRFVYQMHRVGVMSLLIITVSGLFIGLVLGLQGYSILVNVGSESMLGTMVSLTLLRELAPVVAALLFAGRAGSALTAEIGSMKQSEQLASMEMIGVDPLKQIVSPRLWAGIVSLPMLTVIFAAIGIVGGKLVGVDFLGVDEGSFWSGMQNNVQFGHDVVNGIIKSIVFALLCTWIAVFQGYACEPTPEGIATAMTRTVVYSSLCVLGFDFVLTAVMFGGI >NZ_CP024576.1|WP_000842362.1|463166_463847_+|outer-membrane-lipid-asymmetry-maintenance-protein-MlaD MKSRTSELAVGIFVIIFGIALFFLAMKVSGLVGTNLSDGYTMKAQFDNVNGLKPRAKVTMSGVTIGRVDSITLDPVTRLATVTFDLDGKLTSFNAEQLKEVQKNALDELRYSSDYTQATPAQQKTMEQQLISNMNSITSIDEDAYIMVATNGLLGEKYLKIVPGGGLNYLKRGDTISNTQGTMDLEDLISKFITGGGAGKVAAGSSSAEEKAPASTDSSAQPSFVE >NZ_CP024576.1|WP_000560118.1|463921_464515_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MIAGTAFAAPSEAPPDFIKRVADGLISRLKADHAKLQNNPALVKTIVRQNLDPYVDSQAFTRIVMGTYATNQYSTAAQRAQFETNFRNTLIENYGSAFAKYTNQTYTMRPYKATAGKNPVVTLDFNHNGEKIPVSFQLADKGSQWKIRNINVSGIDLGLQFRNQFAATVKRNGGDLNKAIATFQPDADAAVNQNKQK >NZ_CP024576.1|WP_000250997.1|464526_464814_+|STAS-domain-containing-protein MVQYLNQELVVSGKIDFENAEQQYQAGLAIIKKQTSFPLIVDLKQLEHGNTLALAVLVQWLRQTPQKSGLHFKNVPEKMLKIIQACHLQEDLHLV >NZ_CP024576.1|WP_000888321.1|464883_465897_-|magnesium-transporter MLEAFYATERGSLEDATINGGFDLHPELVWLDLIAPSQEEQQWVLDAYNQNLPTLKSLEDISSSARFYRDDDGILHISTYFLTKNKNYQVDGDAEDSSHMLAMVQTVAFILHKDRLFTLRGEKLVAFRAFRARARRNDYEMDYKDPTWILLGLLEAKLDELADILEDIHKDLEKYSTEVLNNHQREQILDLDDMITRLAQQEDMLGKAQLCLIDLRRVLTFLSRPRALGSHIYDADIRELSEDVRSLVEHDAFLFQKVRFLLDTTSGFINTEQNDTIRRFSILPSMLAPPMLIASIYGMNTDVLPFAHGTTSFIIVLLIIIGFFIGPIIYFRWKKWI >NZ_CP024576.1|WP_001084310.1|466054_466636_+|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MNSICIFCGSSLGSNPIFQQIAQLTGEAIAKQGKTLVYGGGRSGLMGVVADSALQAGGQVIGVIPRALVDRELAHPGLTKLYVVENMHERKTKMADLSDGFIALPGGAGTLEEIFEQWTWAQLGIHQKPCAFLNVAGFYEDLLKMIQGTVDNGFSQARFVDKLIASDKIEDILQQFEQYQAPAPKWTNADVQP >NZ_CP024576.1|WP_000849701.1|466650_467052_+|NUDIX-domain-containing-protein MKTITVAAAVILNEQNELLLVRKRNTQAFMQVGGKLEPNEAPESAIQREILEEIGSPCVIEQFIGRFETAAANEPDHKLISHLYLVRLKQSPQIAAEIAEMKWVKFNDSETKLAPLTKEIVIPWCEQNLSITL >NZ_CP024576.1|WP_000472273.1|467054_467690_-|ComF-family-protein MFKFLNPQYLFQLLSPCLLCEIGTREKYSLCKECWEQLPWLKQTIQRNDQSVLVACHYAYPINRIIQQFKYEQKLHYQTLLAEVLQQLKFPKVQAIVPMPISKQRLTERGFNQSLLLANLLSKQLKIPVWQPVQRLNEHSQKGLSRLERFENIEQQFVALTQEKRRYRRVLIIDDVITTGSSIHALSQALKQLGCTSIHASCLAAASSTSY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP024576_2 | 2564680-2564877 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP024576_2
|
3 spacers
spacers of NZ_CP024576_2
>2.1|2564716|18|NZ_CP024576|CRT GCTCTGCTACTGGCTACA >2.2|2564770|18|NZ_CP024576|CRT GCTTAACAACTGGACACT >2.3|2564824|18|NZ_CP024576|CRT GCTCTGCTACTGGCGACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP024576_2
The CRISPR arrays of NZ_CP024576_2 >merge|NZ_CP024576|2|2564680-2564877|CRT ACTCAGCAAGCTCTGCTACTGGCGACAACTCAGCAAGCTCTGCTACTGGCTACAACTCAGCAAGCTCTGCTACTGGCGACAACTCAGCAAGCTTAACAACTGGACACTACTCAGCAAGCTCTGCTACTGGCGACAACTCAGCAAGCTCTGCTACTGGCGACAACTCAGCAAGCTCTGCTACTGGCGACAACTCAGCAA >NZ_CP024576|2|2|2564680-2564877|CRT ACTCAGCAAGCTCTGCTACTGGCGACAACTCAGCAA GCTCTGCTACTGGCTACA ACTCAGCAAGCTCTGCTACTGGCGACAACTCAGCAA GCTTAACAACTGGACACT ACTCAGCAAGCTCTGCTACTGGCGACAACTCAGCAA GCTCTGCTACTGGCGACA ACTCAGCAAGCTCTGCTACTGGCGACAACTCAGCAA
>NZ_CP024576.1|WP_099714986.1|2563318_2563954_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MRTSSQLFPENKDTSVTNDMADIHSLAEDDLRDTELLIRMAIKNLKQVIEVEKLFEPVFADVFRTLRLAEEKACESAYWHGAEASQLTGGGKYQRTAVKASKSLDTKPDGKPAKELKDRLKLSRKNAGITQEVLALSSGTNQSTISQLESGLMRSSTHIPAIAKVLGVDAHWLQTGREDSASVKINQLCLAPANAAISKTLTEGFKNDGRR >NZ_CP024576.1|WP_099714981.1|2563025_2563316_+|hypothetical-protein MNQITNLSQLKVDLTDYFDAVCLAKNDLDWTLYTLHEIKEKVKALKEEAAKHGMHEAYFHSLEQFTGILEYTMTLRFGYWEDEEMRIQKQLDGNGE >NZ_CP024576.1|WP_088741767.1|2562082_2562775_+|LexA-family-transcriptional-regulator MEKKQIHPTMQRVYQATNLTSSELANALGKPPQIIYNWENRGISKIGAFNISTKLKVDLGWILTGEGSPSIDSARNKTVSTVTKRGGWVPVKSYSKMGMDGYYTEMGYLGNGGDGYVPSLTAGPNAYAVRGTGDSMYPAIRNGWYVVCDPDAEPTPTEFVEVQLKDGRRTIKEFIGIVNDVLHLLAVNGGARMTIDMDEVAAIVAVSDIIPPSKHVHEYPVQPMQNIYLD >NZ_CP024576.1|WP_171266114.1|2561768_2562011_-|hypothetical-protein MIFLFVYTESIKMIYFEVLMSSIQKDAELIDKHGGATALAQTLGYKVQRVQNWKIRGIPAKERFKHPELLLVDFIPTPKK >NZ_CP024576.1|WP_060454564.1|2561413_2561710_-|hypothetical-protein MNEQILAQNSDCASPYDDEDQVLTQWQVDHDAYVETLDAYRKAHTDLEKALGIEKDFDKTSHSAKEIIEDLRKNWHLYALINRFESAVINRLRAKDKL >NZ_CP024576.1|WP_088741765.1|2560529_2561414_-|YdaU-family-protein MHYYERNIGDYYRKAGRLNILQHGVYNLLMDACYDRESFPTLEEAIEWVWAETEEEIDAVKFVLKKFFKLNEDGVYIQNHIKEELEKYRAFLAKQAENGKKGGRPKKNPKNDSGNNGNDFDNSGFKNESQDNPNESELNPEKPKETQIKPKPSNHLTNEPSNQENNICPPNGEPVPAEKPKENFKNEIQEVFEFWKVTFNKNNRTILDNPRKSKIQARLKEGYTVEDIKTAIVGCSKSQFHIEGNHTDLTLICRDATKLDHFLAMSNPAQVAIQPQIEDVQTIPAQYKVIEGDW >NZ_CP024576.1|WP_088741764.1|2559198_2560530_-|AAA-family-ATPase MSFNSNIHDVNMEQCVLAALMTTSLSLESIGQELDAECFYSDRHQQIYKAIVELSESNHPYDVVMVSNYLKGKNVLHLMGGEDYLIQLMQDAPSSFYNAESYVTQLKKLKTHRKIEQIGFRIAAMAKDTTVPDAFIEAENLLSQIDKTEDGDMGASFGDALTSALAQMIEKSEKKTKNQLSGVRFNLVTLDKMLGTVQNGHFCVVGGRPGSGKSTLAQMMAIDTAMVKKEGVLFISAEMDKETLSNRMFSSLSSIPYDNLHNATLYDGLLKEYARYREVYSGLPIWIEPKQKPSISEVRAYARRAKRRFAKAGIKLGCIIVDYLQLVRDPSKKDRFQEVGSISRELKSMAKEFECPVVALVQLNRESEKGKKPKASDIKESGQIEQDADQIILVNPLTDDKTLQPLGVTELIIAKNRHGKRGAVRVQEHLDMCRFKAIQELEE >NZ_CP024576.1|WP_088741763.1|2558923_2559202_-|hypothetical-protein MKTFLIIMTVICIATFMGLVVAAIAAKLHQFSGSLAKFRFSLAFMDITFFFLCVSALTVFDGGKYLAFAHLTQFLLALYLIFYRSNKWERSQ >NZ_CP024576.1|WP_088741766.1|2558453_2558765_-|hypothetical-protein MTRPQYDTLENMNPACVPCNTNKSSMSLEGWRKMLTHYRDVQLLRDSTHARHLLRFGLIEIKSKPVKFFFETYVPCDHVFSDWEKLEPEPNLRFRCMDCGKEI >NZ_CP024576.1|WP_088741762.1|2557895_2558453_-|hypothetical-protein MDKFEQWYLDTYYKPHGVVPPTNLFKRYEGTYLIDDVYRQNLVWQHQQAKVEELKATIKGNHGRIAELERLNRVKAQTILDLHQEIKELKASHHGEVIGHEVHLKKIKQERDEMQKRVQFLEQELGAWKGKSIAAMVNGMCKQCGGEPLQAIVSDKDGYALLHCFGCGANKYELIGEQALKGGEA >NZ_CP024576.1|WP_000141159.1|2565890_2566142_+|hypothetical-protein MTEVKFVSMPASELAQVIEKACENAVTKVLAAQGDELLNITQLCERIPGLSYHSFKKLAKEHRFKDIKGRYSLTAVKAALQSH >NZ_CP024576.1|WP_000190203.1|2566107_2567067_-|tyrosine-type-recombinase/integrase MATFQKRNGRVTATVRIKPHPAKSKTFDTLRDAKKWAQETEVRLKNEKLEIFDHIIFKDALIEYRDTVSINKRGYEKERRKINFLLKAMYVDQPLIQVNKDFLTEWREQRLLNVKGATIRREFILLSAFFTWCIEVKRWLSVNPLREIKFPSESPHRERVISDEEIEILLPFLSTEMRYIFLIALQTGMRLSEICNLKWEKIRLSKSYLILDLTKNGRAREVPLSSQAVEIFKSIGPKKQGYVFSITSDDATDEFRDAKLEAGLEGFTFHDSRHTAATKIALKIPLLDLCKMFGWSNPRRAMIYYNPTSSEIAARLSQP >NZ_CP024576.1|WP_000933387.1|2567243_2568386_-|cell-division-protein-ZapE MLNLKSSHSTAFTPSSPAERYAEALASGQFMADEAQAQAVQELDRVWKELLNRYKASKKAFRRFRRQTSPKGVYMWGGVGRGKTWLMDQFYESVPFRRKTRMHFHHFMQHVHKELNKLSGQRNPLDIVADQIYKDAVVICFDEFFVSNVTDAMILSDLFQKLFVRGVTLIATSNIAPDGLYKNGIHRDRFIPTIEMVKKNCVVLNVDAGVDYRLRVLKQAQLFKSPLGNEAQSWISERYTALTHTQTNSHEPIVINNRVVETLGHTEDVLWCEFSELCLKPRSPADFIEIANIYNTVLVSNVPHLTDFLSEGTRRFIYLVDEFYDRGVKLLLTSQDSIIDIYQGEKLAFEIERTRSRLLEMQSDEYLHSEHRHIDATKTS >NZ_CP024576.1|WP_085917006.1|2568469_2569447_-|AraC-family-transcriptional-regulator MRNAGIDVDSRLADIGIKVDSLDPSSTIHDSLEWDIQQIISENVDPEKGLFIGQHYALAGYGPLLMLLVTSHDIQTALEKGIQYQKLTHLFGTLSLQETENHIILNYLPVDLKTEIGLLRAQCEISGTYKFIQDIYTMMGLKMPDMRIDLPFPKPSDPDTVTQYYAYYGDDLHFNSTHAAFSLSKNVLEIKIPSADIITHRIYEAKCIKEIERLNEQDHQIPPIIQYVQDYLELQQGIIPSMAETAFALKMPERTLRHQLQQLNTSYKQIREQIIKNKALKLMEYKEYSIEVIAEALGYSEPAAFNHAFKRWFGQSPRQYGKEFY >NZ_CP024576.1|WP_014538345.1|2569610_2571158_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MPAILFTAYAGFPMLNAKQHAIQKTKIAIIGAGFGGLAMAIRLLQSQQSDFFILEKSNDVGGTWRENRYPGAACDVQSHMYSLSFAPKTDWSKRYAEAPEIFDYIQDITNQYQIKNYCKFNHEVTHVQYDEMRHVWSLDFANQPSLEAQFVVFASGPLHIPQIPHIQGIEKFKGKVFHSSQWEHDYSLEGKSVASIGTGGSAIQYVPEIAKDVKQLYVFQRTAAWVIPRDERKYSNLSKALFKKSNFYRQIHRSRLYWSNESRVVPIVQPQIMKYGQKLAEAFIRFQVKDKDLAKKLTPDFVMGCKRILISNKYFPTFNRKNVELVTEGIQEIKENSIITKDGKERPIDCLIYGTGFVTDPRIYLKHFTCIGRNQIELKQAWKNGAESYYGIMTKNFPNLFQLVGPNTVLGHNSIIFMIESQVNYILQLIDLVEKSGQHAIEIKPEVQDSFNERIQTQLQGTVWQAGGCSSWYQAADGKNFSLWPTYTWKYWLDTRKVNPKDYLLLNKCSQSYAA >NZ_CP024576.1|WP_001190746.1|2571207_2572119_+|lysine-exporter-LysO-family-protein MQSISLIIQIFLVLAFGYFLGPKLSLNIRHFIFKILPYFSYILLTSVALELTLALDQIDNPSTILPPALLIALTTSLGSFFTCLFAYTIFDKESVKGKISLQLFMNALKNIAKAFLALTIGVILGILLTQLHTHIPFNSWYLLLLFIFLIGIELAFTHFNRTWLSWKILIVPLAAFIGSCLAGLLNYSLLGHEFTLNEILALGQGYGWYSMSGILFTQLHSAELGGIALLTDLFREIVAILLMYTMGWRFPRPAISSAGATSMDVTLAMVKQSCGTHYVPHAMMSGLLLSLLAPLLITVFLNF >NZ_CP024576.1|WP_000392928.1|2572115_2572814_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase MEESLLSIIVALDAKSQYDALKIVEQLDPTLCRVKVGKELFTHEGPSVVKKLQEENFEVFLDLKFHDIPNTTAQAVCAAADLGVWMVNVHASGGRKMMETCVERLKAGNYQTQLIAVTVLTSMGREDLKDIGLDIEPVEQVKRLAKLTKESGLDGVVCSAQEAKILRELIGQDFSLVTPGIRPEGSNADDQKRIVTPKQAMLDGSTHLVIGRPITKAENPTEMLKSILASIA >NZ_CP024576.1|WP_001269278.1|2572979_2573345_-|DUF1049-domain-containing-protein MRYILIALLIIVFGYSLALVLQNPTELPVDLLFTQVPAMRLGLLLLLTLALGIVVGLLLGVQVFRVFQKSWEIKRLRKDIDHLRKEQIQSAQLAAAEAAANVRHEKTVVDIYPQDKNSTPL >NZ_CP024576.1|WP_000205997.1|2573369_2573672_-|integration-host-factor-subunit-beta MTTEALNKSDLIERIALKNPHLAEPLVEEAVKIMIDQMIEALSSDNRIEIRGFGSFALHHREPRVGRNPKTGKSVDVAAKAVPHFKPGKALRDAVNESGK >NZ_CP024576.1|WP_000140309.1|2573828_2575502_-|30S-ribosomal-protein-S1 MTESFAALFEESELNLNVEKGAVIQGVVVNIDSDWVTVDTGLKSEGIVDRAEFLNEQRELEVQVGDTVDVVVEALDNGMGQTVLSREKAKRAETWTKLEKIFEDGEIVTGVISGKVKGGFTVDIGPVRAFLPGSLVDTRPIRDTTHLEGKELEFKVIKLDAKRNNVVVSRRAVMEAESSADREALLAQLEEGQTVTGTIKNLTDYGAFVDLGGIDGLLHITDMAWKRIKHPSEVVEVGQEVTVKVLKFDRERNRVSLGLKQLGEDPWLAIMSRYPKGSIVKARVTNLTDYGCFAEIAEGVEGLVHVSEMDHTNKNIHPSKVVQIGDEVDVMVLEVDEERRRISLGIKQTRANPWEEFAKSHEKGEKVSGTIKSITDFGIFIGLNGGIDGLVHLSDISWNEQGEEAIRRYKKGDTVEAVILSVDAEGNRISLGIKQLNSDPFNDFLAANERGALVKGTVTAVDARGATVKLADEVEATLKASEINRDRVEDATKFLEVGQEVEAKIINVDRKSRSINLSIKAKDEAEEKEAVANLRTASASQDNGPKTIGDLIKAQMK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP024576_3 | 2765703-2765788 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP024576_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP024576_3
>3.1|2765726|40|NZ_CP024576|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP024576_3
The CRISPR arrays of NZ_CP024576_3 >merge|NZ_CP024576|3|2765703-2765788|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP024576|3|1|2765703-2765788|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP024576.1|WP_000795915.1|2764465_2764702_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP024576.1|WP_001124846.1|2763571_2764183_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP024576.1|WP_000885229.1|2762889_2763501_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP024576.1|WP_000376215.1|2762277_2762733_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP024576.1|WP_001990047.1|2760572_2762219_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP024576.1|WP_000115408.1|2756942_2760407_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP024576.1|WP_000107128.1|2755986_2756946_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP024576.1|WP_001025680.1|2755558_2755843_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP024576.1|WP_002017921.1|2755335_2755449_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP024576.1|WP_000937460.1|2754611_2755247_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP024576.1|WP_000983628.1|2766419_2766833_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP024576.1|WP_000432330.1|2766974_2767853_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP024576.1|WP_001990041.1|2767909_2770054_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP024576.1|WP_001145693.1|2770108_2771518_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP024576.1|WP_000482091.1|2771833_2772313_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP024576.1|WP_033839439.1|2772597_2772738_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP024576.1|WP_000132044.1|2772843_2773161_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP024576.1|WP_000498477.1|2773245_2773467_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP024576.1|WP_001136759.1|2773554_2773983_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP024576.1|WP_000251637.1|2774252_2774396_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP024576_1 | 1.2|460792|39|NZ_CP024576|CRT | 460792-460830 | 39 | NZ_CP024576.1 | 460879-460917 | 1 | 0.974 |
1. spacer 1.2|460792|39|NZ_CP024576|CRT matches to position: 460879-460917, mismatch: 1, identity: 0.974
gagttcaactcagatcgtccacgtcgtgaaggtggtttt CRISPR spacer gagttcaactcagatcgtccacgccgtgaaggtggtttt Protospacer ***********************.***************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1174727 : 1215505
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP024576|1174727:1215505|DBSCAN-SWA 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52 | Pseudomonas_phage(21.88%) | transposase,plate,capsid,head,integrase,tail | attL 1169278:1169294|attR 1218844:1218860 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1240688 : 1296039
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP024576|1240688:1296039|DBSCAN-SWA 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74 | Acinetobacter_phage(90.32%) | tail,capsid,transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1300338 : 1308271
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP024576|1300338:1308271|DBSCAN-SWA GATGACAAAACCAAACTATACCCCCGAAATTAGAGAAAGAGCGGTTCAATTACTAATTGAATCTGAAAAAGATTATCCTTCTACTTGGGCAGCAATCACAGCTATTGCTCCTAAAATCGGTTGTACTCCTGAAACATTGCGTGTTTGGTATTTAAAGCATCTGGATCAACTAAATCCTGCCAAAGTACAACAGATATCTGACCAAGAAAAAATGAAGCAAATGGAACGTGAAATTAAAGAATTAAAACGTGCCAATGAAATTCTACGCAAAGCAGCCGCTTTTTTCGCCCAGGCGGAGCTCGACCGCCCACACAAATAATGGTGGATTTTATCCATAACAATAAAGATCGATATGGTGTTGAAGCGATTTGTAGAATTTTACCGATTGCACCTTCAACCTATTACCGAACTTTAGATCTCACTGACAATCCAGAACATCGAGCGAAACGAGATCTACATGATGAGTATCATGCTGAACAAATTAAACGAATTTGGAAAGAAAGTTCAGGTCGATATGGTGTACGTAAAGTTTGGCAAAAATTGAAACGTGAGGGTTATGTTATTGCACGTTGTACAGTTGCTCGATTGATGCAAAAGCTAGGTATACAAGGTGTTTGGCGTGGTAAGAATAAACAAACCACCCGTAACCGAGATGACCAAAAACGGGCAGATGATTTAGTGAAACGTAATTTTAATGCTGATCATCCAAACCAACTATGGGTGGGTGACTTTACGTATATTCAAACTCATTCAGGCTGGGTATATACCGCATTTGTTATTGATGTGTTCTCACGAGCAATTGTTGGATGGAAAGTATCTACACGGATGAATACAGATATGGTGCTTGATGCATTAGAGCAAGCATTGCATGATCGAGGCATGCCAAAGAATGTGATTCATCATTCCGACAGAGGTGTGCAATATCTTTCCATTCGCTATACCAATCGTTTAGAAGCAGCAAATTTACGAGCATCAGTCGGTACAACGGGTGATTCATACGATAATGCTCTGGCTGAAACGGTGAATGGCTTATACAAAACAGAGGTGATTGAATATTTAAAAGCAGATTGGCAAGGTTTAGCAGATGTACAACTTGCGACACTAAACTGGGTAGATTGGTTCAATAAAAAGCGTGTACACAGTGCACTGGGTTATGTATCGCCTTTTGAGTTTGAAGCAATGTACTATGATAAGATTAACCCGTTAGGTCAGGTGGCTTAACTTAAATAAAAAAGTCTCCGACAAACCCGGTACGGTTCAGACAGTTGAAGCCGAACAACTGGACGAGCAAACAGTCCGGATCATTGTTAAAGATGAACTGGATAAGCAGCTTCCAAGAACGGTACCTAAGCTTGTAAGTGATCAAATCGCAAATCCAAACTCAACCATTAGTCGGTCTTTGACTGAGAATACGACAGCGAGAAGAAATCGTACTTAATAATTTGAACCCTTTTCGGAGGGTTCATTTTCATAATATTTAAATTTCAAGGTGATAGAGTCTGTTGGCATTAAAATTGATGGTTAAGACATGAAAAAAATAATTGTAATTTCTACAACACTTTTAGGCCTTACGGGATGTGCCATTCCTGCGGTAAATAATCTCGTAAGATCCACAAATATGTATCAGGATGATGTTTCGGGAAATACTGCAAATTTAAGGGTTTATAGAAGTAATATTCCCATGGTGCAGTTCTATATTACTTATCAAAATAATGAGGGTGAAAAAATTTCAAAAAACCTAATAACTAAGCAGATTTCAAATAATTTAACAAAGTATGGCTCTATGCATGAGCCCAAAAAATTAAATATGCCTAAACCCACAATCAGTTTAAATAATGGTGAAGAGTTTTTTGAGTTTAAAGTACCCGCAAATAAGAAGTTAACTTTCAGGCTTACTTCTGTTATTGGGTCAACTACTATGTATAGTTGTGATGTAAAAATGGACTATCAGTTGGAAAGAAATGGAAATTATGAATTGATCCGTTTAAAACAGATCAAAGATTTTGTGAATCCAGCTTTACTGACTGAACCATCTCAAGATGAAGCCTACTGCAAGTTTGTAGTAAAAGAGATTTTTGAAGATGGTAAAGAAACTATTATTAAATCGATTTCTTAATGTTAAATCGTTTTTGTAATTAATTTAAATATCTAAACCTTATTTCATCAAACCACCTTTCGGGGTGGTTTTTTATTACCTGAAGGAAAGTTATGTACAAGTTAAAGCTAAATCCTCAGACCAGCGGCTATGGCGTAACACCGGGTGATGATGTGAAACGTCAGCAGATGGATGGCGGTCGTGGTCGCTATTACATCGATGTGAAACGTAACAGCCACATTGTTGATGTGAACTGGAACTTAAGTAAAACCGATTTCAATAAAATGATGGCTTTCTGGCGGGTCTACCAGAACAAACCAGCCTCATTTTATGCGGATTTGGTGATTGATCAGGGAACACGTCAGCAATATCTATGCAATTTCATTCCAAACTCGTTCAAGACCAATGAAGTCAACGGCAACTTATATCGTGTGAACGCGCAGCTCGAAGTTGTTCAAAACCAGCCTAACCTGAATGCCGATATAGCATTAATTAAAGATTGGGAGGTCTAATGGATAACGAATATGCCAAGTTCTTTTTCAATCGGAAAGTTGATGTCTATCAACTGGAGTGTATTGAGCTATCACATCCTTCTTTTATGAATACTTATCGGGTAGTCCGTAATGATGACCGAGGTGTCTATGTACAACATAAGGAAGGATCCGGTCAGGTCTATTATGAGTTCTTGCCAGTCTCTATACAAAGATCCGGAATGCTTGGTGATCTGGACCAGACATTAACCGTTTCTATCTCTGGTCTAGGTGATGTGATGCCTGATGAGTTTGAACGGGTAATCGAAGGGCAATATCCAGATGTAAAGCCAACCGTAAATTACCGGATTTACAGTTCAGACAATCTGAACTCTCCAATGTTTTATTTACTTGGACTGCAACTCTCAAGTGTCGCCATGAACCATAAAGCTGTGACATTCAAGGCTGAATCACCACGATTAAATACCACTAAAACTGGGGACATTTTTGCACTGGATCGCTTTAGTGGTTTGAAGGGGGCTATATGAAAAGTCATGATCATTTGCTCGATAGGCAATATGACGAGGATCACTACAACTGTGTTCACTTTGTTCATGAAGCTGCAATGGACCTATATGGCATAGATCGGGCTGAAGCGCTTGAACTCTTTATGCAGCCTAAGGGCAAAATTACTTTTTTATCTTCACGGTTAAAACTTTTAAATCCGCTACCCATGCCCAAGGAAGGCTGCATAGTCGCCTTCCATCCGAGACAAAGAAATAAGCCCCCGCATGTGGGGCTTTTTCGTGGGCAAAAGATTCTTCACCTCATGGAAAGCGGAGTCACTTATTTGCCTGAAGAGGTTGTGATGGGAATGGGGTTTAATCGGGTCAGTTATTATGATTAAAGTTATTTATAAAAAAGACGCTTTGTCTGAAGAAAAGACAATTGAGCAGGCTCAAACCATTGGGCAATGGCTCACTTCAAAATATGAACATATGCCTGAGCATGTCCGTATCTTTCATACCACAAGCAATATGGATCATGCGGAAATTTCATTTGCGAACGAAGTCACACCGAAGAATGCTTATGAGTTAAAGCAGCTTGATTTCTTACCGGGCACTTTTATCGTAGTTGAGAACCCTAAATGGGTCGCGGCTATTGTTTCGATTGTGATTAGTATTGCGATCGCATTTTTAATGCCAACGCCATCAATAGCACAAACGACTCAAAATACTAACCAGTCTTCTTCAGCAAACAATGAACTTTCTAACCGGGAAAACAAGATCCGGGTGAATGGTCGTATTGCTGATAACTATGGAGCTGGGTGGAATACTCCCGACCTAATCGCAGTACCTTACAAGGTATATGAAAACAACGTTGAAGTTGAGCATGTAGTGGGCTGTATTGGGCGTGGACACTATAAAATCAATAGAGCTTATGACGGTGAAACCAATATTGTCGATATTGCTGGCGCATCGGTAGAAGTCTTTCGACCAGGTGTAGATATTGTTTCAGGTGAGCCATATTTCTCGCTTGGTACCGAAATTACCACGCCGCCACTAACGGTTCAGCATCAAACTTCTGTTAATGGCCAAGTTTTACGTCCTGCTGATACACAATCTTTAGAAGGTACGAACTACCTTCATTTTGCATATCCAAACGAGATTCTTCGGGCAACGGCAAACAACACAGATTTAACCACTAAGTTTGTAAGTAATGACCGCGTAGAAATCACCAATGCCTCATTCACGTTTAATGGCCAGACTTTTGATTTAAATGGTACTTATAGCGTTCTATCGGTAGCTGATGACCGTATGACGTTATCAAATCCGGCGGCCGTTAATGCTAACTGGTTAAAGCTTAAAGAGTTAAATAACCAACAAACTGCAGCTTTGTCACCAAAGATCAGTTCAATAGGTGAAAAATGGATTGGTCCATTCATTCTGGACAATGTTGAACGTAGCCGGGTGCTGTGTAATTTTGTGGCCACCAATGGACTTTATACCGTTTCTTCAGGTGGGTATCAGGCCGCTGTTAATGTCACGATTGAAGTTGAAGTAACACCGGTAAATGAATCTGGTGCAGCGATTGGTAATCCGATGCTGAAGCAGATCATTTTGAAAGGTTCGGCAAAGTCACGTCAGACCGTTGGTGCAACACTTGATATGGTCACGTTTCAGGGGCGTTGTAGTGTCCGTGCACGCCGTTTAACTCCGACTCCGACAGTCACAACAGTTGTTGATGAAGTAAAGTGGCAGGCGCTTTACGGTGCTTATCCTTTACAAAGCACAGTGTATGAACATGAAACGGTTTTTCGTGCGCGTACTTATGCAACCACTGGAGCTTTATCTGTTAAGTCCCGCAAGATCAATTTTGATCTTCAGCGAATGTTGCCGACTTATAAAAACGGGGCAATGACAACAGAGCTATATCCAACGTCTAGCTTTGCTGATGCTTTGGTATCTATGGCACTCGATGACAAGATTGGCCGCCGTTCGATCGATGAGATTGATCTTGAAAACATCTATCGGACCTATAATGATGTAGTTGATTATTTTGGTACGCCGCTAGCGGCTGAGTTCTGTACTACCATTGATGATACGAATCTATCTTTTGAAGAGCTGGTTACCAATCTTTGTGATGCGGTGTTTTGTACTGCATATCGGCAAAACAATAAGCTCAAGCTTTATTTTGAACGGCCAACTGATAACTCGGTAATGCTGTTTAACTTCAGGAATATCATTCCGGATAGTTACAAGCATGACCTGACCTTTGGCGTGATGGATGACTACGACGGACTGATCTATGAATACACGGATCCGACCGACGATAGCCGTATCAATATCTATTTACCGGATAAAGGAGCCAAAAACCCAAAAGAGGTGAAATCTGTTGGTGTACGAAACAAGTGGCAAGCGCATTTCAATGCATACCGGATTTGGAACAAGATGCGCTTCCAGCGCAAATCCATTACCTTTGATGCGGCACCAGAATCAGAATTACTGGTTTTACGTGACCGGATTGCTGTAGCGGATTATCGCAATGGTATTCATCAAAGCGGTGAGGTGGTACAGCAAGAAGGTTTAGTCCTCACCTTAAGCCATGATGTAGATTTCATTGCAGGCAAGAGCTATGTGATTTATCTGCAAATGGCGGATGGCACAGTGGACCTGATTCCTGTTACACCGGGTTCAGCCAAAAATAAGGTGGTTTTAGGGCGGTTGCCGAACGGGGCCTTAAAGCTAAGTCCTGATGATTTTGTAAATACCATCTATACAGTAGTTAATGATGATACTAAAGGTTCATTGCCTTATCTGGTTGCAAAAAGAGAACCGGTTGACCAGTTCTCTAATACTATTACAGCAATTAATTACGATGAGCGCTATTACCTCAACGATAAAGACTTTATTGACGTGCCGGTTGATGATTCTCCAATTTACATTCGATATGACCAGCTGGATATTAATCTGGCGCGTTTATATCAGATGCAAAGAGGGGATTTGCCAACGACTGGCGAAATCAGTTTTGTAGTTGAATCTGGTGCACTAGTTTCTAGTTCGAGTTCTTATCGACCGGAAACCAGATTTGTCTATAAATTCGACTACAACTCCAGTCCGCCGAAACAGGAATTTATTGCCCCTGCAGCGACTGAACTACCCGCCATTGATACTGGTGAGTTCCCACCTGATCTGGTGGTAAATCTGACTATTAAAGGTGCTGTTGTTGGGCGTGGTGGTGATGGCGGTTTACCTCATTTGGCATTTGGCGCATGGGAGTCCGATCCGGATTACAACTTTACTAAAACCCGACGTGATGGGTTTCAGGGAGCACCCGGTTTATTGAACCGGCACAGCAAACTAAACCTGATTATTGATGGCGGCACTCTAGCTCGAGGTGGATCTGGTGGTGGAGCAACACCAAGCGGTATTTACACTGGGTTGTCTTATGGTGTTCAAGGTATTCCGGGTGGAGCTGGTGCACCATTTGGACGGGTCATGACAGGCCAGCCAATTTCAAGCGACTCACAAGATTGGCGCTGGTATTTTGGAAGTTACTTCAATGTCTTAAAAATTACTGATGCCGAAGCTTCGGTACCCGGAAAAGGCTACCGAACCCAAAATGACCGTTATGGATCCCCATTATCAGGTGATGGCGGAAACTGGGGCGAACGTGGTACCAAGTCTACTAATGATGGAACATGGAACTGGAAATACCATGGCACAACTGAAGGTCAGCCGGGGCCAGGTGGACCTGCAATTGTGGGAGTTGCACCACTGACAACTCAATTGATTAATGGAGGGAAAATCTTACAAACCCTTTAAACCTTATAAGAACTTTGAGCACCCAATTCGGGTGCTTTTTTATTACCTAAATTTTCTGGAGAAATTAATGGAACCAGTTTCCACTAGCGGTTTTACAGCACTTTTAAAATTATATGGGATTGCAATCATGGTGACTTTAGCAGTCGGTTTGGTTGCAGCAGTTGTATTAATGACTCGTATGCCACGCTCACCACAAGAGTGGGCAGTTGGTTTGATCTGTACGGTTGTATCAAGTTTGGCTGGCGGCTCATTCATTATTGTGAAGTGGGGACTTCATGAATGGGTTACTGATGTATGGGGGATGATTGCTCTAGGTGGGTTCTTCTTTGTTTGTGGTTTACCCGGTTGGGCTTTAGTCCGTTGGATTTTTAATTTTATAGATAAACAGGAAGGTAAAACGATCGTTGAAGTGATCAAAGAGTTTAAGAAAGCCAGAAAAGACATTGAAAACAGCTAATGCCGCCTTCGGGCGGTTTTTTACATCTGAAGGAAACCGAAATGAACATTGAACAATATCTGGACGAGTTAATTAAGCGTGAGGGCGGGTACGTAAACAACCCAGCAGATCGAGGCGGTGAAACAAAGTACGGTATTACTGAAGCAGTAGCACGTACTAACGGCTTTAAGGGCAACATGAAAGATTTACCGCTTGATGTGGCCAAAGCCATTTATAAAAAGCAGTATTGGACAGATCCGCGATTTGATCAAGTGAATGTAATTAGCTCGTTAGTTGCTGAAGAGCTTTTAGATACTGGGGTAAATTGCGGTACCGGATTTGCAAAACCACTCTTACAGCGTGCTTTAAATTTGCTGAATAACCAAGGTAAAGCAGGTTGGCCAGATTTAACAGTTGACGGAATTTATGGTCCAGCAACTCTTAATGCACTCAAAACTTATCTGGCCAAGCGTGGAAAAGACGGCGAAAAAGTCCTGGTGCGTGTTCTTAATATCATGCAAGGGCAACGTTACATTGAAATCTGTGAACGCAATCCTAGCCAGGAACAGTTTTTCTATGGTTGGATCGCCAATCGAGTTGTTATATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP024576|1300338:1308271|1307294_1307684_+|WP_000433907.1|DBSCAN-SWA MEPVSTSGFTALLKLYGIAIMVTLAVGLVAAVVLMTRMPRSPQEWAVGLICTVVSSLAGGSFIIVKWGLHEWVTDVWGMIALGGFFFVCGLPGWALVRWIFNFIDKQEGKTIVEVIKEFKKARKDIENS >NZ_CP024576|1300338:1308271|1303446_1303809_+|WP_000835161.1|DBSCAN-SWA MKSHDHLLDRQYDEDHYNCVHFVHEAAMDLYGIDRAEALELFMQPKGKITFLSSRLKLLNPLPMPKEGCIVAFHPRQRNKPPHVGLFRGQKILHLMESGVTYLPEEVVMGMGFNRVSYYD >NZ_CP024576|1300338:1308271|1300338_1301557_+|WP_087486619.1|transposase|DBSCAN-SWA MTKPNYTPEIRERAVQLLIESEKDYPSTWAAITAIAPKIGCTPETLRVWYLKHLDQLNPAKVQQISDQEKMKQMEREIKELKRANEILRKAAGFFRPGGARPPTQIMVDFIHNNKDRYGVEAICRILPIAPSTYYRTLDLTDNPEHRAKRDLHDEYHAEQIKRIWKESSGRYGVRKVWQKLKREGYVIARCTVARLMQKLGIQGVWRGKNKQTTRNRDDQKRADDLVKRNFNADHPNQLWVGDFTYIQTHSGWVYTAFVIDVFSRAIVGWKVSTRMNTDMVLDALEQALHDRGMPKNVIHHSDRGVQYLSIRYTNRLEAANLRASVGTTGDSYDNALAETVNGLYKTEVIEYLKADWQGLADVQLATLNWVDWFNKKRVHSALGYVSPFEFEAMYYDKINPLGQVA >NZ_CP024576|1300338:1308271|1303801_1307227_+|WP_099714914.1|DBSCAN-SWA MIKVIYKKDALSEEKTIEQAQTIGQWLTSKYEHMPEHVRIFHTTSNMDHAEISFANEVTPKNAYELKQLDFLPGTFIVVENPKWVAAIVSIVISIAIAFLMPTPSIAQTTQNTNQSSSANNELSNRENKIRVNGRIADNYGAGWNTPDLIAVPYKVYENNVEVEHVVGCIGRGHYKINRAYDGETNIVDIAGASVEVFRPGVDIVSGEPYFSLGTEITTPPLTVQHQTSVNGQVLRPADTQSLEGTNYLHFAYPNEILRATANNTDLTTKFVSNDRVEITNASFTFNGQTFDLNGTYSVLSVADDRMTLSNPAAVNANWLKLKELNNQQTAALSPKISSIGEKWIGPFILDNVERSRVLCNFVATNGLYTVSSGGYQAAVNVTIEVEVTPVNESGAAIGNPMLKQIILKGSAKSRQTVGATLDMVTFQGRCSVRARRLTPTPTVTTVVDEVKWQALYGAYPLQSTVYEHETVFRARTYATTGALSVKSRKINFDLQRMLPTYKNGAMTTELYPTSSFADALVSMALDDKIGRRSIDEIDLENIYRTYNDVVDYFGTPLAAEFCTTIDDTNLSFEELVTNLCDAVFCTAYRQNNKLKLYFERPTDNSVMLFNFRNIIPDSYKHDLTFGVMDDYDGLIYEYTDPTDDSRINIYLPDKGAKNPKEVKSVGVRNKWQAHFNAYRIWNKMRFQRKSITFDAAPESELLVLRDRIAVADYRNGIHQSGEVVQQEGLVLTLSHDVDFIAGKSYVIYLQMADGTVDLIPVTPGSAKNKVVLGRLPNGALKLSPDDFVNTIYTVVNDDTKGSLPYLVAKREPVDQFSNTITAINYDERYYLNDKDFIDVPVDDSPIYIRYDQLDINLARLYQMQRGDLPTTGEISFVVESGALVSSSSSYRPETRFVYKFDYNSSPPKQEFIAPAATELPAIDTGEFPPDLVVNLTIKGAVVGRGGDGGLPHLAFGAWESDPDYNFTKTRRDGFQGAPGLLNRHSKLNLIIDGGTLARGGSGGGATPSGIYTGLSYGVQGIPGGAGAPFGRVMTGQPISSDSQDWRWYFGSYFNVLKITDAEASVPGKGYRTQNDRYGSPLSGDGGNWGERGTKSTNDGTWNWKYHGTTEGQPGPGGPAIVGVAPLTTQLINGGKILQTL >NZ_CP024576|1300338:1308271|1302545_1302944_+|WP_000277448.1|DBSCAN-SWA MYKLKLNPQTSGYGVTPGDDVKRQQMDGGRGRYYIDVKRNSHIVDVNWNLSKTDFNKMMAFWRVYQNKPASFYADLVIDQGTRQQYLCNFIPNSFKTNEVNGNLYRVNAQLEVVQNQPNLNADIALIKDWEV >NZ_CP024576|1300338:1308271|1301865_1302453_+|WP_000721057.1|DBSCAN-SWA MKKIIVISTTLLGLTGCAIPAVNNLVRSTNMYQDDVSGNTANLRVYRSNIPMVQFYITYQNNEGEKISKNLITKQISNNLTKYGSMHEPKKLNMPKPTISLNNGEEFFEFKVPANKKLTFRLTSVIGSTTMYSCDVKMDYQLERNGNYELIRLKQIKDFVNPALLTEPSQDEAYCKFVVKEIFEDGKETIIKSIS >NZ_CP024576|1300338:1308271|1307725_1308271_+|WP_001019739.1|DBSCAN-SWA MNIEQYLDELIKREGGYVNNPADRGGETKYGITEAVARTNGFKGNMKDLPLDVAKAIYKKQYWTDPRFDQVNVISSLVAEELLDTGVNCGTGFAKPLLQRALNLLNNQGKAGWPDLTVDGIYGPATLNALKTYLAKRGKDGEKVLVRVLNIMQGQRYIEICERNPSQEQFFYGWIANRVVI >NZ_CP024576|1300338:1308271|1302943_1303450_+|WP_000368388.1|DBSCAN-SWA MDNEYAKFFFNRKVDVYQLECIELSHPSFMNTYRVVRNDDRGVYVQHKEGSGQVYYEFLPVSIQRSGMLGDLDQTLTVSISGLGDVMPDEFERVIEGQYPDVKPTVNYRIYSSDNLNSPMFYLLGLQLSSVAMNHKAVTFKAESPRLNTTKTGDIFALDRFSGLKGAI |
8 | Acinetobacter_phage(85.71%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1375151 : 1397802
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP024576|1375151:1397802|DBSCAN-SWA CATGTTTGTTGCAGGCGTAGATGAGGCAGGACGAGGCCCATTAGTGGGTTCGGTTGTTGCTGCAGCTGTTATTTTAGATCCGAATAATCCAATTTTAGGATTAAACGACTCTAAAAAATTAACTGAAAAGAAACGTGAAAAGTTGTTTATTGAAATTCAAGAAAAAGCTTTAGCATGGTCAATAGCAGAAGCTACACATGCAGAAATTGATGAGCTGAATATCTTGCAGGCAACTTTTTTGGCTATGCAACGTGCAGTGGAAGGTCTGAAAACACAACCTCAAAAGGTAATTGTAGACGGCAATCAAATCCCCAAAGGAATTATTATTCCTTGTGAGGCGATTGTAGGGGGAGATGCAAGCCATGCCGAAATTAGTGCGGCGAGTATCTTGGCTAAAGTTACGCGTGATCGTCAAATGGCAGAATTAGATCAACAATATCCATTATTTGGTTTTGCCAAGCATAAGGGGTATCCAACCAAAGCACACTTTGAAGCCATTGCTGCTCATGGCGTGATTGATCAACACCGTCGTAGTTATGCACCTGTAAAACGGGCATTAGGACTATAAATTTATATATTCCCAAAAAATTTAAAGCGACTATAAAGTCGCTTTAATTAGGGAGAGAACAACTTCATACTAACGATTGAAGTTTTTCTGTGCATAATTATCATCTTCATATGAAACTTGATAATCTTGATCAAGATGTTGAAGGTGTTCATGCATTGCACGTTCATGTTGAATACGTTGATAAATTTCTTCGCGATGAACAGAAACCTCTTTTGGTGCATTTACACCAATTCGAACTTGGTTTCCTTTGACGCCAAGCACAGTAACACTGACTTGATCCCCAATCATTAATGTTTCCCCGACACGGCGGGTCAGAATCAGCATGTTTATCTCCTTGCTAAACGCTTAAAACTGCAATATTGGTACCCAAATAAAAAGCTCAACCTCAGTTTTCAGTCAGATTCTAACAGAAATATGAGAACAAAGTCATATTTTGATAATCACTGCCAAAAAACTTTCCGTTTAATATAACAGAGCCGCTATAAAAAAAACTATAGCGGCTCTGTGTTTTCTTTGATTATTGTCGGACAAGTAAACATTTTTTAATGAATTCTTGACCGTTCGGTAAAATTAAGCGCGTGCGCTGCTTTCACCATGTTCACGATCTAAACCAAAAGCGGTATGTAAGCAACGAACTGCAAGCTCAAGGTATTTTTCATCAATAATGACAGAAACCTTAATTTCAGATGTTGAAATCATAAGGATGTTAATACCTTCGTCAGCAAGGGCAGTAAACATTTTGCTTGCTACACCCGCATGCGAGCGCATACCTACACCCACGATAGATACTTTAACGATGTCATCGCGTGTTGAAACTTCACGTGCACCAATATTTTTGGCAGTTTCATTTAAGATTTTTTCAGCTTTTGCTAAATCAACACGGTTTACAGTAAACGTGAAATCTGTTGTGCCATCTTCTTCAACATTTTGGACTATCATATCCACTTCAATGTTGGCATCACTTACTGGTGATAAAATTTTAGAAGCAATACCCGGTTCATCAGGTACACCTAAAATTGTTAATTTTGCTTCGTCACGGTTAAAAGCGATACCTGCAATGATTGGCTGTTCCATAGTGTCTTCTGCCTCAGTAGTAATGAGTGTACCTACATTTTCTTTAAATTCGTCGTCAAATGCGCCGTCGTCATCATTATCAAAACTTGATAATACGCGTAAAGGAACTTGATATTTTCCGGCAAATTCTACTGAGCGAATCTGTAAAACTTTAGAACCTAATGATGCCATTTCTAGCATTTCTTCAAAAGAAATGCGATCGATTTTCTTCGCTTTAGGGGCAACACGAGGGTCTGTAGTATAAACCCCATCAACGTCAGTATAAATTTGGCATTCATCTGCTTTTAGGGCAGCTGCAATGGCAACACCAGAAGTATCTGAACCACCACGTCCTAGAGTTGTAGTATTTCCGTTGGCATCGAAGCCTTGGAAGCCTGCAACTACAATAACACGGCCCGCATCTAGGTCATTGGTCATGACATCTGTGTCAATCGACTCAATACGCGCCTTAGTAAATGCACTGTCAGTTTTAATACCGACTTGACGTCCGGTATAGGATTTAGCTTCCACACCAATCGAATTAAGTGCCATAGCTAACATGGAAATCGTCACCTGTTCACCGGTTGAAACCATTTGGTCTAACTCACGTGGGTCAGGTGTTTCGGTAATGGCTTTAGCGAGGGCAAGTAAGCGGTTTGTTTCACCACTCATTGCAGATACGACCACAACAACTTTGTGACCGTGATCATGCCAACGCTTCACACGACGAGCAACATTTAAAATGCGCTCGGGGGTACCCATAGAAGTACCGCCATATTTTTGAACGATTAATGCCATATCGCCTAAACCCTTATAATTAAACGGGAAAAGTATATTCTTGCTTCCTTGGTTTCATTATATGTACACCATTATGTACATAAATGAAATTGCTGAGTTTATCTAGCAAGCCGTGATTCGGCGGACAGTATATAGTAACGTAAATATGCTAACAATCATTGATCTGGACTAATTTCATCAAGTTTGCTGATTGTTAGCTTCGGTACAACTTATATAGCTTTTTTTAGTTGCTTCTTTTGCTGGCATTCTTCCTCCCACTTCATTACATCAGTAGCGAGGTATCTTTTCATTGTCCCGCCTTCAGAACTTAAAGCTGGGGCTGGGAAGGGAATACCCCAAGGAGTATTAATTTCCCAACGATTAAGTGTGCGTTTAGTAATATGAAACATCTCACACACATTGTTAGATGTCAGATATTTATCCACCTTACCCCTCCTTACTTTCCGCTTTAACTTCTTCTAACATGGCCTCAACTCTCTTTAATTCAGATCTACTGTGAGCTATACCGCCACCATTAATATCTAAGTAAAACTTTAGTAAATCTGCCTTGTATTGAAAGTCATACATCTTCACCACAATCTGCAAATCTCTAAATATTTGCCTTTTAGGTAATTGATCAAACTTAAGACCAAAGACCTTTAATTCACCTGCAATAAACCTTCTGATAGCAGTTAATCTTTGCAAACCATCAATACACACCATTTGATCAAGAAGATCACAATCTTTTGCTCTCTCTTTTCTCCAAGAAGGGCAGTTGAATCGAATTGTTAATCCGCTTTCATCTACAATTAACCTCAAGACATTTTCTATATAGTTGGTTTGCTGTTTTTTAGTCCATACATGCCCACGTTGAAAATCGGGTACTAGTTCTACACCATGCGGAATATCTTCACTTTCACAATGCAACCATGTTTCAAGATAAGAAAAACTACAGTGCCAAGTTCTTGTGGGGCGTTCCAATGGATTAACAATCTGCCGGAACTCATCAGGTGTTAAACTCATCCCTCAGCTCCCGATTCAACATCCAACAACATGCTGCCTTCTTCTGGATATTCGGTCATCCAAAAGTAATAGCCTTTTCCACTGTGGCCATCTTCAAAGAATTTAATTGTTAGTTCAGTATCAAGTTGATCTAAATCTTTCTCACCATCTGGATTTACAAATTCGAGAAGGCTTTTTAGTTGATGACCGCTAAGTGTTATGCTCATTGTTCAGCTCCCGATACGTTTGGCACACTATGAAAATGCATCCAATGTGAAGGTGGATCATTTTGATAGTTTGCCCATACGCTATTTAAATCCTCATCAATAGTCATATAGTCTTGTTCTGGGGTGACATCAGGAGCATCTGCCCAACAAATAAGTACCATTATGTCAGTAGGTGGCAATTCATCAGTCACGCTAATCCAAGTTGGCAACACCTGAGCACTGGCGTCATTCCATGCGGCATCCCAAATCAACCAAGCTTCATGACGAGGACTAGTTGGTAAATATCTGTGTCCTGTTAGTGCCTCTTGTCTATCTAGTTGACGTTTTAAACTTTCATAACTGCAATTACATTCTTTGGCATGAAATCTTTCAAAAGCTTCTCTTTTTTTATTTAGATCAATCATTACCTAAGCCCTCAAATATTCTTCTTTAGTCCACTCAACAAACTCTTTATAAAGCTGCTGAGCGGGTTTATTTAACCGGTTGTTGTAGTCTATTGTTATGCGGCGCCAAGCTACTGGTACGGCATAATGTTTCGTTAAAAGCATTGCTTGGTTTAACCCTTGCTGGACTATTACAAAGCCCAGCAAGTGCAAGTAATTAGTAAAACCAAGTAAGTGCTTGTTATTCACTTTCTTGAATTGGTCTTTCATTCTAGTAACCGTCCACTAATAGATAATCAGGATCAGCTTCAGGTTGGGTAGGTGTAGGATTCTCTAATTCATAGCGGCGTTTTCTCACATACCCCATTAGCTTCGGTTGAATCTGCGGATCTCGTGCAGCCACATCTATTTCCAGCGCATCCAATGTTGTGAGATCTGGTGCGTTCTGGATCTGAACCATTAAAGAGGGTGGCTCATTCGCAGATGCCTTTTCTTTTTCTAGCTCTTCAAGACGTTTGTGAGTGGCGAGAAGGATAGGTTTCATTTGTTCGTCATCCCATGTGCGGGTATAACGATAAACCGCATTTACTTCTGCAGGTGTTTTTGACTCTTTTACACGCTGTAGAAGAGTATCTAGGGTTTGCTGATATTCTGGATCTACTTTAGGCTCGTTAGTTTCTGGAACTAATAGATCCTCGGATGATGAAACGTAAGGCCCCTCAGTAACAACAATTGCACTATCGAGATCCTCTTTTAAATCTTTAGTAGTCTCTTCAATTACTGTTTTTTCAGTATTAACCTGAGGTGATTTCTCAACTTCATTTTCTAAAGGCTTTTCTTCTTCAACTTCATCAGTTGGCTTGTTCAGAAGTTTGAGCATATCTTCAGCAAACTCACCACCACTGACTTTAATAATCGCGCAGCAATGAGCAAAAGCATTATCAAAACTTGAGTGGACTTGGCCATGCTGAAGCATGCGTAATTGTCCTT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MDKYLTSNNVCEMFHITKRTLNRWEINTPWGIPFPAPALSSEGGTMKRYLATDVMKWEEECQQKKQLKKAI |
36 | Acinetobacter_phage(70.97%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1406961 : 1419583
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP024576|1406961:1419583|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP024576|1406961:1419583|1410875_1413365_+|WP_000509186.1|DBSCAN-SWA MGGLFGSTTISTTDTRINSMRIQQSAYGLCQPLVYGKTRVAANMFWYGDFTATPHTTVQKSGGKGGGTKTSNTTFSYSASLMLGLCENQIKKIGLIWVDKEQYVPKQEGSIILDPIDQLKFELFDGNNNPPWGWLVSKHPEQAINYPYLGYVAVANYEMGNSASLSNHNFEVISTITLSDTIDDANPADVIEDFITHPRHGAAPNLNIADLEEFRTYCRAANLLISPAFTEQRPAYETINEIVEAVNCAVVPSPDGLKIRSFGDSAITGNGVTFTPDLTPVYHLTDDDFIGDDEPVRVRRSRDTDAYNHVQIEYINRYNQYNTETTEAKDQANIEMFGLRTEDPVECHYFCEPKIARHAAQLRLQRLLYVRNEYEFDLGWKYCRLEPMDILTLTESGLGLDKFPVRITRIEEDESGMLTVTAEELSIGSRSAIEYDSQVSNGYQGGNEEPGNVNAPSIFEPPLDLTDGKNQVWVAVSGGANWGGCNVWVSLDNTTYEMIGTIYGSARYGQLVTTIDADDTTLQVELNTASQIFSGTLEDAQADQTLCKVGDEYFNYQVATLNGSGLYTLSDVLRGRFDDAQSHNAGEPFVRLDKAIFKYPYNEGLVEKQIFLKFTSFNGLERKEQTLDEVTAYSYTLSGGRPAGVKGLSLQSPFVGTTFKVQWQSSTGADGYRVQVWSNGTMIRQVDTTNTDYSYSIEEAKQDGLGRAYTIRVASKNGDQVSTYAELSISNPVPPVLLNVYTAATVDSITVNWIPSEVPDLKDYAVWLSPTSNFDPTQMPPSWTGTETTTTFGGLQPTTPYYIRVAARDVWENTVWNYTNQITQSTSEA >NZ_CP024576|1406961:1419583|1418686_1419583_+|WP_001175125.1|DBSCAN-SWA MQLALVNNKRVEAFEGGRGTCPICGAVTIAKCGPKIINHWAHFRLKDCDPWWENETQWHRDWKNNFPSECREISHTAPDGEIHRADVITPTGIIVELQHSPMSDKERISREDFYRNLVWVIDGEEFKKNFKFCHILPDPNSALGKDLVWYKAKHDDLIPVNENGMFYRISETRESYPEIPEISKSNLEAIPRLVEGHSIRKIFKEVQDNHIGHYQFDWKRPRSTWLEAKCPVYIDFGGSFLAKLETYDETGLKCIRYISKSKFMYDVMHEDKVENIAKKWFNIKEWVEAQNFNFDKYG >NZ_CP024576|1406961:1419583|1413428_1413818_+|WP_000433918.1|DBSCAN-SWA MEPVSTSGLTAILKFYGAAIMVTLAVALVAAVVLMTRMPRSPQEWAVGLICTVVSSLAGGSFIIVKWGLHEWVTDVWGMIALGGFFFVCGLPGWALVRWIFNFIDKQEGKTIVEVIKEFKKARKDIENS >NZ_CP024576|1406961:1419583|1409681_1410452_+|WP_000008888.1|DBSCAN-SWA MSFLFFKTKDFSSAHSLPQLKDVSDLIPQYENNAYGHWLFGGGPSSLVDVVNGRILTLQNGATVQPVYGDKTITLSTAIGNALLTDLVDSSAQSMTLCSVVKCSTTSLAILLGNLVPSSSALSSGLAAFASAGKGYLTVKPATAGGPGGISSLTPPSSIVQTSNFFIATSVDKNTKKGIIYLQQLGVESSNESSYTAVSYESSANKIGIGNVAYTGSSNTATYSEAIIFDNALTLAEIQNVALRSKDRMANRNISF >NZ_CP024576|1406961:1419583|1417935_1418571_-|WP_000332610.1|DBSCAN-SWA MCANYEPISKDRVHLLDLLEPTFDYKADVYPGYDCPLIFSKDGHIEWRQVKFGMIPPWNHDLKFSKYTYNARTETVDKKPSFRHAWAKSQFALIPVEKIYEPRYVNGKAERWGIYREDGLPFTVAAIYDSTVIDGQQVRSMSMLTINADNHPFMSQFHKPEDEKRSIIVIPEEYREDWLNCKKEDADQFFFEMPIGEFTAEYFPKPRKSAN >NZ_CP024576|1406961:1419583|1406961_1407819_+|WP_001248150.1|DBSCAN-SWA MRQASPKLIALLDADQFIMADLYTITTIQGIEYRYTSYDVNLTVQGKEFRADGPIISREGTSLSLGIEVDNLSITIEATENTKFGDVPIAQAFHNGILDGARFKLERIFMDMNTPTDTSAGTLVLFEGRIVEPELNRYEINASVVSDVDNLKLQMPRNLYTPGCLNTLFDSACGLLSADFAVNTTIGTNSTPNRILCDLSQPQGWFTQGVVEFLEGANIGIKRTVRLHEAGSLILTLPLLKMPEIGEAIRVYPGCDKRLDTCTNRFNNRARFRGAPFVPVPETSI >NZ_CP024576|1406961:1419583|1415992_1417291_-|WP_000679994.1|DBSCAN-SWA MKHENKVFFLIDVNNMYVSCERVFDPSLNDRPVIVLSNNDGCAVARSNESKALNIKMGVPLFQIKDIVQQYNVLVLSSNYAMYAEMSRRFHTILASYVTDEEVEPYSIDECFVDFTAYEKNFDLEKVGQQMRQQIWKWLGLPVCVGIGRSKTEAKIANHIAKKNPGFNSVCDLVNMDPCNKEYYFAQIDVSEVWGVGRKHSKKLQSMGINTVLDLACAEPREMQKKFSIVMARTIYELQGISCIEIEHTPPSKKQIVASRSFGGRVTELTDLKEAISMYAQDACKRLRGEGLLCGCMIAFVQSNPFDPNVPFYNKSITGSFSEPTDCAVDFVKAATRMLNDIYKEGIKYKKCGVVLTCLEPKSGHTYDLLTDFKQIEKKECLMQAMDGIHSKFGKKKISVGPCFIPNRNWSMSRDKLSRNPFRWDELLVIRN >NZ_CP024576|1406961:1419583|1415331_1415952_-|WP_000362647.1|DBSCAN-SWA MDLEKRLELYKAEYLFQIDMKEKIYTRMAIFSVFITACITANFTMFDALLELSQTQLALVVGLWIFCLFYLVAIIINFYGISKHKYDKLVNSNIEMEQYRIVLENHFTTNSATPPSQQEIEKYVREQFNLYLIKQYAECSSAYYLNNVDRQTKLTKIASSSYSILVLTLIVSLFYVGHKLEGKFDESKSKHSTTTTTTACKSNKGR >NZ_CP024576|1406961:1419583|1414509_1414926_-|WP_001199182.1|DBSCAN-SWA MQYEKIHKITSSALKFFEDHLKSPMIWQVFPRNFCEEASSLLLMILQQEGINDFKIMKGTNMEEENHYWLESEEYVIDLTAHQFNGITSPFILIEKSKYPLNKIFSLDIHEIIDFQNWSGLNPYEPKIQSIFYVDYYK >NZ_CP024576|1406961:1419583|1407875_1409678_+|WP_001130838.1|DBSCAN-SWA MPLPNADQFVGQNVTESGFKQAQTQLIQFLGDEVPTNEKLVNTFATKAIADSKTTLMPIDYKITVTSDPDETKNGDYTWNGTELVKSPYDPVDKSRQFTSEEVGKVSADVKEKFEKIKLSTSSESTSVIPVLVDKDNKTLIGYDTEKDQIAAGRLQEQVLENLPNLKKSEDIGKIAVLTDSTHKILIGYDTEKDQAIIAGLELPNQRPLVKAVNHILFYGQSLSVGATATTILSTSQPYFNVTFDTGPRKDSAANSVIPLIEQFNNPSSDGYDNRGETCCSGAANYASRAMMLENGIDPKDHVIFASTAGHGGYRIDQLEKGTDWYNFFIEHVSEAKRLNGEDYKVQVVCWVQGENDAVSSVQTSYEVYRQKLLKLQSDASADIKAITGQTDEVKFITYQMSYAARTWEKQALVQLHLCQQSDKFLMATPMYHMPYAIDNIHLTNVGYKWLSAYFGRAYKQLVVDNRKPDFINPKVAQLIGDEIHINFDVPKVPLVLDTTTLALTTDHGFKVLVDGDATTIVSVTVQDDKVVLKLSEPPTGVVKVRYALDHLGAGISLTGGASGNLRDSTADEILIDGVLKPLYHVCPHFELTAFIDKGI >NZ_CP024576|1406961:1419583|1417294_1417789_-|WP_001290300.1|DBSCAN-SWA MSEIVPSIIQIKPYLTQGIVLSEALSIKQVVPSTHLLIPYALEKINAGFPSPAQDYIDKALDMNEHLIKNATSTFIVKVASLSMLNAGIDIDDELIVDRSLDAKHGDIVIALIDNEFTVKRLMIDEKGQWLKAENPDYKNIYLADGQELIIWGVVTHIIKMTRH >NZ_CP024576|1406961:1419583|1410452_1410875_+|WP_000792723.1|DBSCAN-SWA MKNLEAVKEALTWLGTPYHHQGRVKGVGVDCGTLICEVYEKVGLMDHLDPRPYPPDWHLHQMGQRYLELILGVCDPVEGPPQPGDIVLYHFGKCISHGAIVIEWPQVIHSYLHQGVIIQDGTKGSLARRIAGFFRMKRLK >NZ_CP024576|1406961:1419583|1413860_1414406_+|WP_001019705.1|DBSCAN-SWA MNIEQYLDELIKREGGYVNNPADRGGATKYGITEAVARANGFKGNMKDLPLDVAKAIYKKQYWTAPRFDQVNIISSAVAEELLDTGVNCGTGFAKPLLQRALNLLNNNGKAGWPDLSVDGIYGPATLNALKTYLTKRGKEGEKVLVRVLNIMQGQRYIEICERNKSQEQFFYGWIANRVVI |
13 | Acinetobacter_phage(30.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1566472 : 1648152
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP024576|1566472:1648152|DBSCAN-SWA 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117 | Acinetobacter_phage(90.62%) | integrase,capsid,transposase,terminase | attL 1559446:1559460|attR 1645831:1645845 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2527207 : 2567067
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP024576|2527207:2567067|DBSCAN-SWA 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52 | Acinetobacter_phage(40.0%) | transposase,terminase,head,capsid,integrase,tail,portal,protease | attL 2532246:2532267|attR 2567204:2567225 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3053010 : 3076384
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP024576|3053010:3076384|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP024576|3053010:3076384|3075232_3076384_-|WP_000947481.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPVMGCKEARQQARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPVNEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFRRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPADRMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYLFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKSTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVEGWLKD >NZ_CP024576|3053010:3076384|3060128_3060446_-|WP_099715013.1|DBSCAN-SWA MTQVETVTELTPYLEYWSSGIYMFKCPGCKYLHPFHVKEDAHHNGNTWDFNGDIDKPTFTPSLLVNDHFPASRCHLFMTDGKIQFLSDCHHELAGQTVDMVPIDV >NZ_CP024576|3053010:3076384|3068379_3068742_-|WP_000835159.1|DBSCAN-SWA MKSHDHLLDRQYDDEHYNCVHFVHEAAMDLYGIDRAEALELFMQPKGKITFLSSRLKLLNPLPMPKEGCIVAFHPRQRNKPPHVGLFRGQKILHLMESGVTYLPEEVVMGMGFNRVSYYD >NZ_CP024576|3053010:3076384|3069890_3071110_-|WP_087486619.1|transposase|DBSCAN-SWA 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29 | Acinetobacter_phage(66.67%) | integrase,transposase | attL 3047627:3047642|attR 3087185:3087200 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3749860 : 3799996
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP024576|3749860:3799996|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(16.67%) | integrase,tRNA,transposase | attL 3785975:3785989|attR 3802071:3802085 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
9069 : 17610
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP024578|9069:17610|DBSCAN-SWA GATGACAAAACCAAACTATACCCCCGAAATTAGAGAAAGAGCGGTTCAATTACTAATTGAATCTGAAAAAGATTATCCTTCTACTTGGGCAGCAATCACAGCTATTGCTCCTAAAATCGGTTGTACTCCTGAAACATTGCGTGTTTGGTATTTAAAGCATCTGGATCAACTAAATCCTGCCAAAGTACAACAGATATCTGACCAAGAAAAAATGAAGCAAATGGAACGTGAAATTAAAGAATTAAAACGTGCCAATGAAATTCTACGCAAAGCAGCCGCTTTTTTCGCCCAGGCGGAGCTCGACCGCCCACACAAATAATGGTGGATTTTATCCATAACAATAAAGATCGATATGGTGTTGAAGCGATTTGTAGAATTTTACCGATTGCACCTTCAACCTATTACCGAACTTTAGATCTCACTGACAATCCAGAACATCGAGCGAAACGAGATCTACATGATGAGTATCATGCTGAACAAATTAAACGAATTTGGAAAGAAAGTTCAGGTCGATATGGTGTACGTAAAGTTTGGCAAAAATTGAAACGTGAGGGTTATGTTATTGCACGTTGTACAGTTGCTCGATTGATGCAAAAGCTAGGTATACAAGGTGTTTGGCGTGGTAAGAATAAACAAACCACCCGTAACCGAGATGACCAAAAACGGGCAGATGATTTAGTGAAACGTAATTTTAATGCTGATCATCCAAACCAACTATGGGTGGGTGACTTTACGTATATTCAAACTCATTCAGGCTGGGTATATACCGCATTTGTTATTGATGTGTTCTCACGAGCAATTGTTGGATGGAAAGTATCTACACGGATGAATACAGATATGGTGCTTGATGCATTAGAGCAAGCATTGCATGATCGAGGCATGCCAAAGAATGTGATTCATCATTCCGACAGAGGTGTGCAATATCTTTCCATTCGCTATACCAATCGTTTAGAAGCAGCAAATTTACGAGCATCAGTCGGTACAACGGGTGATTCATACGATAATGCTCTGGCTGAAACGGTGAATGGCTTATACAAAACAGAGGTGATTGAATATTTAAAAGCAGATTGGCAAGGTTTAGCAGATGTACAACTTGCGACACTAAACTGGGTAGATTGGTTCAATAAAAAGCGTGTACACAGTGCACTGGGTTATGTATCGCCTTTTGAGTTTGAAGCAATGTACTATGATAAGATTAACCCGTTAGGTCAGGTGGCTTAACTTAAATAAAAAAGTCTCCGACAAACCCGGTACGGTTCAGTTGAACCAAATGTGTCTATTGCAACATATGCATATACTGTTTTACTCCCTATTTTGATTAAAAATAAACAAAGTTATTTAGCCACTTTACATGGAAATACTAAACTTAAATCTAAGAGACGTTTAGGCATAAGCTATCATAGAGGGTGGATTCTTGGAGTTGAAAAAAAGTGTAGGAACTTAAATCCAGATAAAGAGCTAAAGGAAAAACTGAGCGAATATGAGAAAACTCTTAATCTTATATATTGCGAAGTTAAAAGTGTTAAACATTATAATAAAGATATGCTTAATCAAGCACGAGTAAAAGGGTATTCGGACGGGAGTAAGGTGAACTTACATCATGCTATTGATCCTAATGAAACGAAAAAGATTTTCTTGAGTTGATTGAATGAGTAACGTTGATCCTCAACTTGAGCATGTTGATCCAGCTCATCCTGCTGCACCGGATGCTTACATGAGAGTTCTGAACTGTAAGAGTAATTATGTAAATATATTAGCTGGATGGTTTCTTAAAGATGGTAAGAAGAAATTTTATATTGCAGATGTAAGAGGCAATGAAGTTGAAGCCGGTTTTAACAGGCTTGATTGGTTGACAGAGTTTGACACAATTTATAAGGGCAAATAGGTTTTCTATTTGTCCTTATTTTTTTTATTCTTTTTGCGATTTTCAATAGTTTGTTGAACATCTTCAAAGCTAATTGTATTTATATATCTTTGAACCAATGTTTCAACAATATCTGAAGTTTTAACCATTTGACGTTGCTCTTGTTGCATATCTAATGCGGTATCCATAACAAGTTGAGCTGTTGGATCCCGGAGACGTACTGTAGATCCCATAACAAATCCTCCTTTCAGTAATTTATTATATGTGATTTATTTAATTTATATACAAAAAATATTACAAGTTTAATTTTGTTTTTGATCATATTTGTTAATTCTAGCCATGTTTTATTTCTTTGGTAGTTAGGCTACCTTGTTTCTATAAAATTGAATCTAGGAGCAAATAGAGCGATTTAGAGGGCTATTTGTCGCAACCCTGCGGGATTGCTTTGTTATTACCGGATAAGGTCCAATGGGGGAAGTTTCACTTCTTCGGTCGTCTAGTCAAAATCACAGATTTTGACTGACTCGCTCGAAGTTTGAAACGGTAATCAAGGAGGGGGATGCTCGCAAATTTCATCAGTTCGCAACGTGGACACGTTGCTCTGCAAATGTATTTTATAACACAAAAAGATTACACTAAATATATGTTTTTTCTTAATAAAAAAACATGAAAATGTAGTATAATTGAGGGGTGAAATCGGGTAGGCTGGTTTCTATATATGAGCTGAAAAGCTTAAGGTGAATTGAATGAAAAATAATGCTTTATATAAAGAGCTTGATAGACATGATGATGTGAATGTTATTCCTAATGTATTAAAAAATGCTATAGGACAGGCACTTGCATCTGAAGGTAAGTTGTTCTCTGTCTCAGAAATAGATTTAGATATTTATGATTTAATTATCGTCAGTATGAGTGGCGGAAAAGATAGTATTGCTTCTTTGCTCTATTTAATAGAGAAAGGCGTGGACATGTCAAAGGTTGAATTGTGGCATAACCTTGTTGACGGTAAGAGTGAGCCGTTTATGGATTGGCTGTTTATGGATAGCTACAACAAACAGCTTGCCAAAGCATTTAATTTACCAATTTATAATAGCTGGTTAATGCATGGCTTCGAGGGGGAGATGCTAAAAAATAATTCCATAAGCCATGAATATGAGATTGAAACACCGAGTGGGAATATCATTATTCCAAGAAAACGAGCAAAAGCTGGAACGAGATTGCGGTTTCCTCAACAATCAGCAGATCTCCGTATTAGATGGTGTTCTTCAGCTCTGAAGATCGAGGTAGGGCGTAGAGCTTTATCAAACCAGGAGCGTTTTAATAACTCTAAAGTTTTATTTGTTACTGGAGAGCGTCGAGAAGAAAGTCCTAATCGAGCAAAATACTTCCAATTAGAAACACATTTTTGTGATAATCGTAATGGGAAAAAAGGTCGTCTAATTGATGCATATCGACCAGTTCTTGATTTTACAGAACGTCAAGTGTGGGAAATTTTAGAGCGTCATAATGTCGCAGCGCCAGTACCATATCGCTTAGGATGGTCGAGATCAAGCTGTATGACTTGTATCTATAATAGCCCGAAAGTTTGGGCAACAATCAAACATTATTTTCCCAATCGTATTGATCGAATTTTTAAATACGAAGAACAATTTGCAACTACAATTAGTCGAAAAAAAATCAATGTCATAAATATAAGTGAGGGTATTCAGCCTTTTAATATCAATGATTTAGTAGCTTTGGATCAGGCAATGAGAAAAGAATATACCTTGCCTATATTTACAAAAAACTGGGAGCTACCTATGGGGGCCTTTAATAAAGAGGGATGCGGTTCAGATTAAAAATTATAAAAGGCTAAAACAATTGAGATTCGAGCAGAAATGCTTAAGGTGAAATTAATGAAATCATATTATCAAATTAGCTTTAGTGGTGGACGTACTTCAGCATATTTAACCTGGTACTTGCTTAATAACTATAGCCACCTTTATAACTTTATAGTCACATTTGCAAATACAGGCATTGAGCATGAGAAAACTTTAGAGTTTGTCGATAAATGTGATAAATATTTTAATTTCAATACAGTTTGGTTAGAAGCAGTTATTCACCCTAAAAAAAGAGTAGGTACGACGCATAAAGTTGTCAATTTTAAGACAGCTACCAGGGGGCCAGTACTTTTTGAACAGATGATTGAGAAATACGGAATTCCTAATAAAGTTTATAAGCATTGCACCCGTGAATTAAAAATAAGACCAATGGATTCATATATTCGTAGTATTGGGATGAAACCTAAAGATATCCCTACTGCAATCGGTATCCGGGCTGATGAATCTAAACGTTGTGCTAAGGATGCAGAAGCAAATAACTTTATTTATCCATTAGTCACAGAACATCCAGTGGATAAGCAATTCATATTAGATTGGTGGTCAAAGCAAGCGTTTGATCTAGAGCTAAATGAATGGGATGGAAATTGTAATATGTGTTTTGAGAAATCATTTCCAAAATTATTGAAGCAGCTTGAATCAAATCCGTTTGCTTTAGAGTTTCATTTACGAATGGAAAGGATCCACGGGCAAACTAACAATCAACCAGGCAGGCCTGATAGAGTTTTTTTTCGTCAAAATACTTCAGCAATTGATATCTTAAATATGTTTAACCAAGCGAATGTAGCTTAGACATGTGTTATGTGATTTTTAAAGTAGGTGTAGGTAAGTATATCTATACCTAACACACTAGAATATTAAAAAATGCTGTCAGTTCCATTAATTAACTAGAGTGGATGAACCTAAAATCAATTAGATTCGCAATTTAGAAGCGCAACCCTGCGGGATTGCTTTGTTACTCCCGGATAAGCTCCAATGGGAGAAGTTTCACTTCTTCGGTCGTCTAGTCAAAATCACAGATTTTGACTGACTCGCTCGAAGTTTGAAACGGTAATCAAGTAGGGAGATGCTCGCAAATTCCTTCAGTTCGCAACGTGGACACGTTGCTCTGTTAGTAATGTTTAATTCGAAAATATATTTCATTAAATTAATGTTTTTTAACAATATTAACGTTTAAAGATCTTGATTAAAATACATCATTGTATTACAATTTTGGTTAGAAATCGGATAGGCTGATTTCGTATTTTGAGCTGAAAAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP024578|9069:17610|14081_14579_+|WP_001067227.1|DBSCAN-SWA MNNYFNVLIITDLKIGRLKTPSHCACAVGHIDIKKPSFEYNTGLVALSTTMYDCKDFNVYTLSTKESFNKFISTLKVLEELIGIPCPFLTAIQETYEFYGDFIFECLTWFNNNADILFRPDHLGEFTKTADESLNFQLMYFKVLETFRKAGLNGFIQFNTLKTIN >NZ_CP024578|9069:17610|14607_15384_+|WP_001086346.1|DBSCAN-SWA MNSKVNIGKTYSVLKSEFIHTLKSIDQSKNIYEIFHDFVFCSAAALRNSIGHRYQNLFNHNIENEYLQRINRYDVSGRLKIKKLFYLLVDLCEAKGEPYDVLGSIYMELEIGNDHIGQYFTPSEVSNLCAQVVMTDLKKQLEEEGVISISDPACGAGSTLLSTVKLCLESKIQVQDHLYIEAADIDRNVALMCYIQLSLWAVPCRIFVGDTLKLKYRECWCSLMYYVKGWDIKLHSQKLKEIVHKAEDYVPNFILIND >NZ_CP024578|9069:17610|11678_12770_+|WP_000794252.1|DBSCAN-SWA MKNNALYKELDRHDDVNVIPNVLKNAIGQALASEGKLFSVSEIDLDIYDLIIVSMSGGKDSIASLLYLIEKGVDMSKVELWHNLVDGKSEPFMDWLFMDSYNKQLAKAFNLPIYNSWLMHGFEGEMLKNNSISHEYEIETPSGNIIIPRKRAKAGTRLRFPQQSADLRIRWCSSALKIEVGRRALSNQERFNNSKVLFVTGERREESPNRAKYFQLETHFCDNRNGKKGRLIDAYRPVLDFTERQVWEILERHNVAAPVPYRLGWSRSSCMTCIYNSPKVWATIKHYFPNRIDRIFKYEEQFATTISRKKINVINISEGIQPFNINDLVALDQAMRKEYTLPIFTKNWELPMGAFNKEGCGSD >NZ_CP024578|9069:17610|10958_11165_-|WP_000535991.1|DBSCAN-SWA MGSTVRLRDPTAQLVMDTALDMQQEQRQMVKTSDIVETLVQRYINTISFEDVQQTIENRKKNKKNKDK >NZ_CP024578|9069:17610|15576_16350_+|WP_000724905.1|DBSCAN-SWA MKKIVITNEKGGIGKTSVAVHLAHYCYERGMRVLFVDMDKQGNSGFSLSKVAVEIKDTHSLFADIQNFETLDKYFVLFKGNKSLKSLFDPTEQEFKLDKVEEYQRNFKSNIAKANEFFDICIFDTPPTDGPFQRLPLLVSEFALSPFLLDKYSILGLRGIIDTTQEIKEVNPKIQFLGLLPNMVSANSVTQKTTLNELQKQLSHLMLDKTAFIPNRSAIADASEQQVPVWKIDKTSAKDVGRKIKKINQLVLEKMGV >NZ_CP024578|9069:17610|16353_17610_+|WP_024437522.1|DBSCAN-SWA MSSLLGDLNAVDSSLTSANLNANNNSDRTILKLPLNRVKLDPQNVRLEYDQDYVKELANTILRDGLLQPISVRADSDNPGEYIINMGHYRYLAHKHLNLDTIEATIDNKLGSRRVKMSENLFRKDMSLLEVATNLKLMLEEGVAENPKYSYDDLANEINKSKTWVSRRLQLLESDDYLKSLMANKMVNDAETGTIIKNLLAEYPEEVKALVADHEGAISSKLARVWSKELKGEIITSSTSEVTQSSLELQNSPKAGEKNEDSKVDNTQELITETKETLQQPAKVQESVENTEAVKDEKSFTTTTQKQTKEIVKQANEKAFSELETAYFNGILESYVSILDLTESEDEDLVSVACGFLRSFNDENTANLFSWKSLIQYPVLVNELATILDSMAQLHVFVPSSNVEDSRMQVILNQQDLI >NZ_CP024578|9069:17610|9069_10288_+|WP_087486619.1|transposase|DBSCAN-SWA MTKPNYTPEIRERAVQLLIESEKDYPSTWAAITAIAPKIGCTPETLRVWYLKHLDQLNPAKVQQISDQEKMKQMEREIKELKRANEILRKAAGFFRPGGARPPTQIMVDFIHNNKDRYGVEAICRILPIAPSTYYRTLDLTDNPEHRAKRDLHDEYHAEQIKRIWKESSGRYGVRKVWQKLKREGYVIARCTVARLMQKLGIQGVWRGKNKQTTRNRDDQKRADDLVKRNFNADHPNQLWVGDFTYIQTHSGWVYTAFVIDVFSRAIVGWKVSTRMNTDMVLDALEQALHDRGMPKNVIHHSDRGVQYLSIRYTNRLEAANLRASVGTTGDSYDNALAETVNGLYKTEVIEYLKADWQGLADVQLATLNWVDWFNKKRVHSALGYVSPFEFEAMYYDKINPLGQVA >NZ_CP024578|9069:17610|12827_13601_+|WP_000844619.1|DBSCAN-SWA MKSYYQISFSGGRTSAYLTWYLLNNYSHLYNFIVTFANTGIEHEKTLEFVDKCDKYFNFNTVWLEAVIHPKKRVGTTHKVVNFKTATRGPVLFEQMIEKYGIPNKVYKHCTRELKIRPMDSYIRSIGMKPKDIPTAIGIRADESKRCAKDAEANNFIYPLVTEHPVDKQFILDWWSKQAFDLELNEWDGNCNMCFEKSFPKLLKQLESNPFALEFHLRMERIHGQTNNQPGRPDRVFFRQNTSAIDILNMFNQANVA >NZ_CP024578|9069:17610|10716_10953_+|WP_000072937.1|DBSCAN-SWA MSNVDPQLEHVDPAHPAAPDAYMRVLNCKSNYVNILAGWFLKDGKKKFYIADVRGNEVEAGFNRLDWLTEFDTIYKGK |
9 | Escherichia_phage(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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