Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP024124 | Acinetobacter baumannii strain AYP-A2 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,RT,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 10 | 0 |
NZ_CP024125 | Acinetobacter baumannii strain AYP-A2 plasmid pAYP-A2, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 4 | 0 |
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---|
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
225181 : 246864
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP024124|225181:246864|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP024124|225181:246864|230309_230612_+|WP_000251875.1|DBSCAN-SWA MVRKYFGTDGIRGKANEGAMTAETALRVGMAAGRVFRRGDHRHRVVIGKDTRLSGYMLEPALTAGFTSMGMDVFLFGPLPTTYRKNKRPFHPSPTALDRS >NZ_CP024124|225181:246864|237936_238236_-|WP_001095006.1|DBSCAN-SWA MNTMLISPTLNVSCSENVLLKISSYFGVSHEQAYRKGVDSLLKLTEMVIANNEHSEIIKLFLCDCHLRTSINLDDISDMPTQLIGDCLNVIVLRYAFVV >NZ_CP024124|225181:246864|229407_230223_+|WP_001043260.1|DBSCAN-SWA MNKSLIIFGIVNITSDSFSDGGRYLAPDAAIAQARKLMAEGADVIDLGPASSNPDAAPVSSDTEIARIAPVLDALKADGIPVSLDSYQPATQAYALSRGVAYLNDIRGFPDAAFYPQLAKSSAKLVVMHSVQDGQADRREAPAGDIMDHIAAFFDARIAALTGAGIKRNRLVLDPGMGFFLGAAPETSLSVLARFDELRLRFDLPVLLSVSRKSFLRALTGRGPGDVGAATLAAELAAAAGGADFIRTHEPRPLRDGLAVLAALKETARIR >NZ_CP024124|225181:246864|225892_227803_+|WP_031986851.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP024124|225181:246864|233629_234550_+|WP_000417085.1|DBSCAN-SWA MEKYEHLAEHVLEIMQLSDSERIETLFTDRWIGYKKAITIMNTLTDILNRPRKLRPECLLIVGDSNMGKTTIIHEFARQYYTKTVSDADMDLLSVTKPVLPILAPAKANVKELYINILNHFFVPFRASDPEAKLRNQAVHLMRKYETKMLIIDEIHNCLTGSAKLLPEVMNTLKNLSNELSLNIVGVGTREAITILHTDPQYASRFDVVNLPKWELNQDFLRLLVSYVRLLPLKKQSNLASKEIATLIFEVSGGNLGDLNRLLVECAKEAILQGDEEITYDIVHKFKWLKPTEGLRNIRNINLSLS >NZ_CP024124|225181:246864|231003_231714_+|WP_000736396.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKLSDEYLPVRKAQTVYGSISGNYAFRGEKTIWFESTLERDFILKQEFNNNVIDVIGQPVVIPYITELGNQSTYTPDFLVQFSSSNCDDFEDFPVPMLIEIKPKKKLVEDWDKLKPKFRAAHRFAADKGWKFKIISETRLYDQYWENINFLKKFRRSHVGAVDQQLLLDTLQELGQSTINQLPAHIFKDKTNVLKGIHQVWALVAKRMIACDLYCPLTAETVIWVNQNDAFARNI >NZ_CP024124|225181:246864|234579_235695_+|WP_000081835.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP024124|225181:246864|244728_245133_-|WP_000512977.1|DBSCAN-SWA MGISLNHGVHAKVSTPVHLRKARTCYDHLAGEVAVKIYDSLCQQQWITENGSMITLSGIQYFHEMGIDVPSKHSRKICCACLDWSERRFHLGGYVGAALFSLYESKGWLTRHLGYREVTITEKGYAAFKTHFHI >NZ_CP024124|225181:246864|238303_239155_-|WP_000034564.1|DBSCAN-SWA MSKIIACIDGSLVTNTVCDYAAWFSDKLNSPIKLLHVIDKPKAKAPQDLSGAIGLGSRETLLKELVELEERKGKIELEHGQILLREAKNYLLEKFSIDAQSFQRHGSVLETIMGMEDDIRVLVMGKHGNETEHDSSKIGTHIENVVRALHKPVLITSAPFSPPKSFLIAFDGSQTARKCVERIASSPLLKGLAVHLVYVGNPNSEMQNQLSWAKEQLESQGFNITSNTLDGEVDKAIINYAEQHQIDLIVVGAYGHSKIRQFFIGSTTTKVITSANKPVLLLR |
20 | Vibriophage(40.0%) | transposase,integrase | attL 230551:230610|attR 245134:245330 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1095544 : 1107892
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP024124|1095544:1107892|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP024124|1095544:1107892|1101325_1102333_-|WP_000048052.1|DBSCAN-SWA MSKTVVKDKTVHYKKVDFLKGANLGQLLKAQLLDKDSFYYKAINRQQFVSATKDDFILINHASSHQSMFFGELIIVESGKAQAVLKIDSDDATEFPIKTYLTDDLPDDEDGVDATEVVRKEFIDSVLYFGVIDNHVAIIQSRSLTARTLESYLGWLLGEAAKALPENSALILKDAPNPTVKQKLESTPAKTISISSGIGSTELQPVHTVESSIPAKIDYKIEDNVVDVLKSAFGVDLENLKLEDGLDDANLKLKLTLTYNRKTSKSGQKVIDTVASSMRHNDDYVITLEDGTKVTADNLKMSGKISVETINNKVYNDGLKVQLYNWMTTNINFGD >NZ_CP024124|1095544:1107892|1104052_1104325_+|WP_001180660.1|DBSCAN-SWA MQNNLSNQTTERNQPEFLVGDVVVLTKECRTFKSNDLFEVKNKTLTRLWTIKSENHLILVSSKEIRTATVAELNAKRRLTSAEQALAEVS >NZ_CP024124|1095544:1107892|1103471_1103660_+|WP_000703023.1|DBSCAN-SWA MKISDLMTYHGCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA >NZ_CP024124|1095544:1107892|1096924_1097857_-|WP_000698529.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1111850 : 1140524
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP024124|1111850:1140524|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1146140 : 1268233
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP024124|1146140:1268233|DBSCAN-SWA 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112 | Escherichia_phage(30.3%) | transposase,integrase,tRNA | attL 1141968:1141982|attR 1221842:1224362 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1314211 : 1338825
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP024124|1314211:1338825|DBSCAN-SWA 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30 | Bordetella_phage(40.0%) | tail,head,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1342706 : 1359985
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP024124|1342706:1359985|DBSCAN-SWA 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13 | Acinetobacter_phage(40.0%) | tail,tRNA,integrase | attL 1348918:1348932|attR 1364358:1364372 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2317783 : 2359590
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP024124|2317783:2359590|DBSCAN-SWA 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60 | Acinetobacter_phage(100.0%) | transposase,integrase,capsid,plate | attL 2317259:2317276|attR 2359751:2359768 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2702966 : 2715681
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP024124|2702966:2715681|DBSCAN-SWA ATTATTTCAATGAGTTATCTATTTTTATCGTGTACAGAGCACGCGGGTTTAAAATCAACTGACGTGCTTGTTGGCGCGTTGCTTCTTGATTTGCTGAACCCAAGGCTGTAAGTATTGCAAGACGTTGTGTCGGTTGAGTCACGCGTTGTAACTCTCCAGACAATCGGTCAAAAGCTGGTTGACCTTTTTCTTGTACACGTACAGCTAAAATGGTTGGCAATAATTCAGGTGTTACTTGCGCAAAATTAAGCTGCTTTTGAGCAAATAGAGCATCTGACTGTTTTAACAGTTGGGTACGAACTTCAGGAACTTGAATATCTAGAGCAAGAAATCTAACCAACTCACTACGCCATAAACTGTCTTCAGCTGATTCGTCTGTTTTGCTGACATAACCCAACTGATTTAATTTAGGTAAATATAAATTAGCTAAGACTTTTCTAAAACGTTCACGTTCAGCTTCTGTTTTCAATACATGACGATGAATGGTACTTAACTGGGAAAACAGCGCTGTACTAATTTGTCGGCTATTCGAATTGGCAAATTTCTTCGCAGCATCTACGACAGCCAATAAATTAATATCACCGTGGTTAAATGCAGCTGAAATTGCATAGGCATAAGCCAACTGTTCAGTGTTAGAAAGCTTTTCTGTAGCAGCAGTCAGACGAGTAAATTCTTTCTGTGGCAAACTAAATTGATAGTATCCTGCCGCATCTGCATTTGGAATATACCAACTGCCAAGGCTGGCACCTTTGAGTTCAATCTTGGCTTCTGCTTGGTCTACCAATTCACATTGCACTTTACTACCTGCATTTGGAACTTCATAACGTACACATAACGGTACACCCCAGAGGCTTCTTGCATCACCTTTTGAGCCCACAGGTAAATAACGGCTTTGCTTCACATTTAAAAAGACTTTATTGCCTTCTTGCTGTAATGCGGTGTTAATTAAAGGCACACCTGGTTGATCAAGAAAACTTTTCATCGCTCTAGTAAAGCGCTCACCTTGTCCAGACTGCTCTGCTAAAGCGCTAATTAAATCATTAGCTGTCGCATTACCATATTGGTGCTTATTAATATAATTACGCACTCCTTGTTTGAATTTTTCTTCGCCTAAATAGCTTTCAAACATATTTAAAACAGCCGCACCTTTTTGATACGTGATGCCATCAAAAGCCGTTTGAATATCGGCATTGCTTAAAATAGGTTGACGAATACGGCGCACACTCACTAAGCTGTCACTTTTCATCGCATCTGCGGTGTCTGTAATACGTTCTAGGTCAGCATTAAATTCGGGATGTAATTTTTGAGTAATTTTACTTTGCATCCATGTGGCAAAAGATTCATTTAGCCACAAATCATCCCACCACGGCATCGTGACGACATCACCGAACCATTGATGCGCCAACTCATGTGCATTGACATTAAATGAATTCTGTACAAAAAAAACTGGCGAGTCCTTATCTAATAACATCAAGTAGTCTCTAAAAGTAATTAACCCCGGGTTCTCCATTGCCCCAGCAGCAAAGTCTGGTGCTGCAAGTAAGTCGAGCTTGTCAAATGGATAACCAAAGGCAAAATAATCTTCTAAAGTTTTTAAAATGGCTGGCGTTTCAGATAAGGCTTGCTGCATTTTTTCAGCTTTAGTATCAGGTGCAATACCACGTAACTGGATCGGCTGCTTACGCCATGAAGTTGCTCCAATATCAGGCCCTTTTTGTAATTGCCACGGTCCGACAGCCAATGCAAGTAAATATGTTGGTAGTGGTTTGGTTTGTGCAAAACTGAGTGTTTTCCACCCTGACTTCTCTATTTGCTCAGATGTTTGTTGGGTATTGGCAAAACCTGAATATTTGCTTGGAATCGTCAAACGAATATTAAACGGCGTTTTAAAACGTGGTTCATCAAATGATGGGAATGACTGGCGTGCACTAATTGCTTCCATTTGCGTCATCACATAAGGTTTACCCTCAAACTCGATTTTATAAATACCATCGAGCTGCTGGTCATACGCTGCATTAAAATCTAGAACGAGTTGATACTGTCCTGCGGGCAAGGTTTTGGCAAATTTAATTTTACTCACCCCATCTATTTCAGAGGCTTGCTCATATTTTGCCTTGGTTTTGACGCCCTCTGCCGATGTAATATTCACATCTTTAACCGTTAAAGATTTACCATGAATCCAGATGTGATCTGTGGCTTGAGCCAGCTTTAAATGAATCGTAGTTTTACCGGTATAGCCTTTTTGTGCGGGATCAATCTTAAAATCTAAATCATAAGATTCGGGTACGACCCACTCGGGTAATTTACCAATCGGGATTTGTTCACTGTTATTCGATGCAAAAATCTGTGTTGCCGATAAAGATAATAATGTTGTAAGTAACAATCTTTTTTTAAATGAAGGCTTGACCAGCATAAGGGGTTTTATCCTCTGTAGTTTTAAATAAAAAGATGCAGCAAATGCTGTACCACTTCACTGCATCCATACATCATTCTTAGAATTTATAGTTAAACTCCAACCAACCTTGACGGCCGAATGGTGAATATGATCCTATCGGATAATACGGCCAACCGCCTGTGTCATCTCGTTTCACTTTGTCAAACAAGTTATTAATAATGATTGAAGCAGAAGCTTTTGGAGAGATTTGATAAGTACCGCTCCAGTTCACCAAATACGTTGGGCTTAAATAGGCAGTTTGGTTACCATTTGGAATTTTGCCATAACGATTAACTAATACTGTTGATGCCCAATCACCAAAGCTCCAGCTGAGACTGGTATTAAAACGGTCACGCCAATCCAGACTACTTAAATCTTTTAAATAGTCATCTTTCTCGTGATCTTTTGATTGTTGATATTCATGTTCTAGTACACGGCTATAATTGATCGTCCAGAGAAAGTTACCAAAGCTGTCTGTTTTCCAGCGCCATCTGCTAGTGAAATCAATCCCGCGGGTATGGTCGGATGCAGCATTAATCGGAACGATATTTATATTCTTAATCACATTTGGGTCGACAACTGCATTTGCAGGGTTACGCTCCACACGTGCTAATGCATCAATACAGGCTGCAGAGTTAATATCTTGGTTGCCTAAACGACAATCTGCTTCCAAACGTAGAATTTTGTCCGCACTTAAGTTGGTCACAAGATTATCAATTTTGATATCCCAGTAATCGACGCTGATATCAAATTTATTGGTTGGCGACCAAACAAACCCTGCACCATAAGATTTACCCTCTTCAGGTTTCAGCTCTTTGTTTCCGGTTAAAGTGTAGTTCGCCCCAGGTGCGTAATCTTTAAAGCTACATTTATCTAAAGGTTGTCCCGTTTGGCTACAACGTAAATAGTCAGTCGTACTTGCGAAATAACCTTTTTGCTTATTTAAGAACAGATAGTTCATATCTGGTGCACGAAAACTAGTTGCGTAGTTACCGCGCACCAATAAAGTCGGATGTGGCCTAAACTCAAGGCCTGAACCGAAAGTTAGCTTATCAATACTGTTATCTGACAAAGCATAACGGTCATAACGTCCGGACAAGGTTAAATTTAATGGCTTTGCTAAAGGTAAGAATAATTCTGCACCAAGTGCTTGGCGTGTACGAGTACCACTATATTCTCCACTAGAACTCGTATTATAAAACTCACCATTTTCGATCGCCTCATCTGGCTTAATCGAAAAACCTTGACGCCCAATTTCGGCCACAGTCGCAAGTTTGGCCGTTCCTGCAGGTAACTTAAATACATCACCATTCGCACTTAAGGTTAAACTTTGTGCCCACGATTTATCTTTTTCTTTTGTTGTGCCCGAAATACTTTCAAATTCACTTGCTGTTAGTGGTCGACTTAAACGATCTAAGTGAGGTGAATAAATAGGAATACCATCTGCATCTGTACCAAGTTGCTGACCTAAGAAATATTCATCAACATTCGAACGTAATAAGCCTTGGCGGTTTAGCTGACTAGTATAAATGGAACCATTATAGACTGCTTCATAACTCCAGCTCGTCTCTCCAATATCGCCTCGAATTCCAAAATTTAAGTTAGAAGAAATTTCTTTCCATTTTTTATTTATTCGTTCTACCCCACCTAATTCTTCAGGTGCAAAACGGCGATTCCAAATTTCATAATTTCCCGAATCTTGATTTAGGAAATAACCACTCGTTGCAGCTAAAGAAGTCCATATCGGACTACGGGTATTATTTTCAATTTGGTTTGCCCCAATCAAAAAATCTGCAAATAATTGAGTTTTATCATTTAACTCATAATCTAAACCGAGATAACCATTTTGGCTGCGGTTTTGGGTCTGAACCGTCCAATAAGTTGGCCGTGCCAAACCACTGGCACAATTGTCCGCCCCTGCTTGTCCAATATTATTGACTGATCCGTTAAATAAACCATTAAAGGCCTGACATCCACCAATTGAAAGATATTTACCAGTATCAGCATTTTTACGACCCACAATCGTGTCTGGTTTTTCTCCTAAACGAGTTCGGCTCTTCATAAAATCTCGATCGGCTGCCCATATCGGTTCACGGCCGCTGAGTTCAATCCCATAGACGAGACTAAGCTTGTCTAAAGTTTTACTACCACTCAGTTGTAAACGTAAATTTTCGCCACCTTCTTTAGTTCCGCCTGCCTTGATATTAAATTGTGTGCCGTCTGTTTTCTTTTTCAGAATAATATTCACCACGCCTGCAATTGCATCTGAACCATAAATTGCAGAAGCGCCACCGTTTAATATTTCAATACGGTCAATAATAGCAGTTGGAATATTGGCTAAATTTACGAAATTGACAGAGCCATCATAAGGTACAGGATAGTCTGCAACCCGATGTCCATTAATTAAAGTTAAAGTATGATTCGGTCCCAAGCCTCGCAAGCTAATGGCATTAGCCGCAGGTGTAAAAGTATTTCCATAATCGGCGCCTTGTACAAAACCCGTGTTCTGCGTCAAGTTATTAAGTGCATCAAATGCATTACTAAACCCTTGTTTTTCAATATCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP024124|2702966:2715681|2711126_2712110_-|WP_001164226.1|DBSCAN-SWA MQHLQWWTDFVAWQADALPMVLVTVVRADGSTPREVGATMLLRFNLQQQWQQSDTIGGGHLEFQAIDIAKAMLKESETCVRRIERFNLSARLGQCCGGVMWLLFEKILPAEIASDLSGSLQAWRAGKHIWRNASYQYASTWQTMDMEQQPSFEFHSGSSEEWQFSQQIQPNTMQVLICGAGHVAEAIVRCLLPIGVRVKWIDPRDDIFPSDLLEQAYCITTDTLDAEIEHFDRSGAVLILTHDHQLDLQLCFTALKPTAKPFAYVGMIGSKSKRAIFEKRMQVRGYTSETLQRLVCPIGIEGISSKQPAMIAIAVVAQLLQVFDVKK >NZ_CP024124|2702966:2715681|2709604_2710411_+|WP_000608304.1|DBSCAN-SWA MINIQNTILGKIVDRKHEELAARLKQRNLQDVEELAKAATPVRGFANALQHKRPGVIAEIKKASPSKGIIRADFNPAEIAEQYEQAGAACLSVLTDVDFFQGADENIAIARNHCALPALRKDFLVDPYNVVEARALHADCILLIVACLSDQQLEEMSKTAFEHQLDVLVEVHDEEELERALKLSEQCLLGVNNRNLKTFDVDLNTTIRLKKLLPASRLLITESGIATPDDVRMMQEHDIHSFLVGESFMKQPRPDQAFTALFGQPQTV >NZ_CP024124|2702966:2715681|2713842_2715681_-|WP_001076814.1|DBSCAN-SWA MNQTIDLNISKKSAKAGDSIPHESAHLHVTGQATYIDDLPELENTMHLAVGFSNCAKGKISKFDLDAVRQADGVHAVFSAKDIEVENNWGPIVKDDPIFAEEQVEFYGQALFVVVAESYQQARQAVRLAKIEYVPETPILTIQDAIKKESWVLPPVEFSHGEVEQAFQNAAHQLSGAIELGGQEHFYLEGQISYAIPQENQSLKVYCSTQHPTEMQLLICHALGMNMHQVSVESRRMGGGFGGKESQSAQWACIASLAAKKTGRPCKLRLDRDDDMSATGKRHGFAYEWSVAFDDTGILQGLKVQLASNCGFSADLSGPVNERAICHIGNAYYLNAVELRNLRCKTNTVSNTAYRGFGGPQGMFVIENIIDDIARYLGCDPVEIRQRNFFAEQPGGGRDRMHYGAEVRDNVAPKLVAELLQSSDYAKRRQTIHAFNQNNDIIKRGIALTPLMFGISFNAVHYNQAGALVYVYMDGTVAITHGGTEMGQGLYTKVRQVAAHELGLPIDSVRLIATDTSRVPNTSATAASSGADLNGKAVQNACIKIRERLAKLAAEISQSEADQVQFEDSMVSTANGHSWTFPDLVQRAYMARVQLWDSGFSLYTIKIDNSLK >NZ_CP024124|2702966:2715681|2702966_2705378_-|WP_000960547.1|DBSCAN-SWA MLVKPSFKKRLLLTTLLSLSATQIFASNNSEQIPIGKLPEWVVPESYDLDFKIDPAQKGYTGKTTIHLKLAQATDHIWIHGKSLTVKDVNITSAEGVKTKAKYEQASEIDGVSKIKFAKTLPAGQYQLVLDFNAAYDQQLDGIYKIEFEGKPYVMTQMEAISARQSFPSFDEPRFKTPFNIRLTIPSKYSGFANTQQTSEQIEKSGWKTLSFAQTKPLPTYLLALAVGPWQLQKGPDIGATSWRKQPIQLRGIAPDTKAEKMQQALSETPAILKTLEDYFAFGYPFDKLDLLAAPDFAAGAMENPGLITFRDYLMLLDKDSPVFFVQNSFNVNAHELAHQWFGDVVTMPWWDDLWLNESFATWMQSKITQKLHPEFNADLERITDTADAMKSDSLVSVRRIRQPILSNADIQTAFDGITYQKGAAVLNMFESYLGEEKFKQGVRNYINKHQYGNATANDLISALAEQSGQGERFTRAMKSFLDQPGVPLINTALQQEGNKVFLNVKQSRYLPVGSKGDARSLWGVPLCVRYEVPNAGSKVQCELVDQAEAKIELKGASLGSWYIPNADAAGYYQFSLPQKEFTRLTAATEKLSNTEQLAYAYAISAAFNHGDINLLAVVDAAKKFANSNSRQISTALFSQLSTIHRHVLKTEAERERFRKVLANLYLPKLNQLGYVSKTDESAEDSLWRSELVRFLALDIQVPEVRTQLLKQSDALFAQKQLNFAQVTPELLPTILAVRVQEKGQPAFDRLSGELQRVTQPTQRLAILTALGSANQEATRQQARQLILNPRALYTIKIDNSLK >NZ_CP024124|2702966:2715681|2710420_2711116_+|WP_000066126.1|DBSCAN-SWA MSNKDSSLSKEQQKLLKQFKKQISNPHSSKIANQPESKKSQAESEELEDTHLFKQAVAGVKPINNSNIADVKTPRAKKVDAQTLAKRAAAEGGRDTEHAELSDTQAALNPVASQATLSYRIATLQHKVFEDLKAGKMRWFEAVDLHGCTIEQARDAVLQIIQMAKDENQNVIKIVHGKGPEAVLKTYVNGWLRQHRDVLAFVSAPENQGGTGAVLVLLKRAEKNPKFEQKK >NZ_CP024124|2702966:2715681|2712718_2713809_-|WP_085940413.1|transposase|DBSCAN-SWA MTHLNELYLILNKYLKWNKSHLKCFALIMLVIILKQTCNLSSASKALPIKCLPQSFYRRMQRFFAGQYFDYRQISQLIFNMFSFDQVQLTLDRTNWKWGKRNINILMLAIVYRGIAIPILWTLLNKRGNSDTKERIALIQRFIAIFGKDRIVNVFADREFIGEQWFTWLIEQDINFCIRVKKNFIVTNHLGKNHKISDLFRHLKVGQIECRKRRILVGRVKLYISALQLENGELLLVVSPQFNANAIQDYALRWEIETLFSCLKGRGFNLENTRLTDPRRVKKLIAVLAISFCWCYLTGEWQHDQKKAIKIKKHGRLSMSLFRYGLDYVQMAIQRLIGFGKKEEFKEILAILRRQNPDRIRVL >NZ_CP024124|2702966:2715681|2708545_2709595_+|WP_001982145.1|DBSCAN-SWA MNIQQALNHITKNIHLTQPQMEEIMRSIMQGEATEAQIGALMMGLRMKGESIDEMTAAARVMREFAIKIDVSDIKHLVDIVGTGGDGQNLFNVSTASSFVIAAAGATIAKHGNRGVSSKSGSSDLLEQAGIHLDLDMQQTERCIREMGVGFLFAPNHHKAMKYAAGPRRELGIRSIFNLLGPLTNPAGVKRFVIGVFSDELCRPIAEVMKQLGAEHVMVVHSKDGLDEISLAAPTTIAELKDGEITEWTLNPEDVGIESQTLNGLVVADATASLKLIKDALSKNKSDIGEKAANMIALNAGAGIYVAGITKTYAQAVAFAQDIIYGGQALEKMSVLAEFTKTLKQSQAD >NZ_CP024124|2702966:2715681|2705457_2708190_-|WP_000281127.1|DBSCAN-SWA MYLNKLKYVGALKNKRSFIFVFVALFHPLESYAQETVEQTQNQAKPDKVVRVAVTGSRISKAQKDGPTSVTVITAADIEKQGFSNAFDALNNLTQNTGFVQGADYGNTFTPAANAISLRGLGPNHTLTLINGHRVADYPVPYDGSVNFVNLANIPTAIIDRIEILNGGASAIYGSDAIAGVVNIILKKKTDGTQFNIKAGGTKEGGENLRLQLSGSKTLDKLSLVYGIELSGREPIWAADRDFMKSRTRLGEKPDTIVGRKNADTGKYLSIGGCQAFNGLFNGSVNNIGQAGADNCASGLARPTYWTVQTQNRSQNGYLGLDYELNDKTQLFADFLIGANQIENNTRSPIWTSLAATSGYFLNQDSGNYEIWNRRFAPEELGGVERINKKWKEISSNLNFGIRGDIGETSWSYEAVYNGSIYTSQLNRQGLLRSNVDEYFLGQQLGTDADGIPIYSPHLDRLSRPLTASEFESISGTTKEKDKSWAQSLTLSANGDVFKLPAGTAKLATVAEIGRQGFSIKPDEAIENGEFYNTSSSGEYSGTRTRQALGAELFLPLAKPLNLTLSGRYDRYALSDNSIDKLTFGSGLEFRPHPTLLVRGNYATSFRAPDMNYLFLNKQKGYFASTTDYLRCSQTGQPLDKCSFKDYAPGANYTLTGNKELKPEEGKSYGAGFVWSPTNKFDISVDYWDIKIDNLVTNLSADKILRLEADCRLGNQDINSAACIDALARVERNPANAVVDPNVIKNINIVPINAASDHTRGIDFTSRWRWKTDSFGNFLWTINYSRVLEHEYQQSKDHEKDDYLKDLSSLDWRDRFNTSLSWSFGDWASTVLVNRYGKIPNGNQTAYLSPTYLVNWSGTYQISPKASASIIINNLFDKVKRDDTGGWPYYPIGSYSPFGRQGWLEFNYKF |
8 | Acinetobacter_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2881192 : 2927702
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP024124|2881192:2927702|DBSCAN-SWA 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55 | Acinetobacter_phage(66.67%) | capsid,integrase,terminase,tRNA,tail,holin | attL 2872464:2872478|attR 2898009:2898023 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3416924 : 3467273
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP024124|3416924:3467273|DBSCAN-SWA 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MKIIYTRIAAAAALETGIIANPDYYENPNLKAKEVIIYGNYPKIQKDYESLEVPVEVRKLEVPQKTTLATVNVAVGITPELQAVMDDAKAECEKVVEENTQLKQKIAILEQAGGNQSELLSENSRLKDAAVLADKALKDAEAQVVGIKTEFEAFKNDIPAMQARIAELEAGKAAENPATETAANDFENWSNDQLKEYLASKNIGYKPSATKAELLKLIPKE |
73 | Acinetobacter_phage(98.48%) | transposase,integrase,capsid,terminase | attL 3413463:3413478|attR 3475375:3475390 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 16619
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP024125|0:16619|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP024125|0:16619|4907_5786_-|WP_001131896.1|DBSCAN-SWA MPLWMQLLINGGVLRNPADGEGNDLGGGGEGGGNNDDVTDDDDQGKEADSEKDKDDADEQKDKQPNGGKNKLTDKEAELIKEVMKRKDREKKLLQEFDEFKRQFADIDPELARKAIAAQKEKETRELEEKGEYERVKQSMAQQHQAEVNRLQQQIKDLQQQLGSKDSQINELTIGSNFSRSAYIAEELTLTPNKARALYGAHFEIENGEVIGYDKPRGAANRTALVDSYGNPLSFDKAMQKIIEADPERDTLIRSKVNPGAGSKTKQENKGLQKEQPKTSLEKIMAGLRGES >NZ_CP024125|0:16619|12258_12915_-|WP_000312034.1|DBSCAN-SWA MAVYNIDVRYKTSVERTERVLEIAESFGLGLDAKEFVVFDNTPIEIEQGDIVYITGQSGGGKSTLLRKLAEQMEQSGLKVADLNAIEHDDRPIVDQIGETLKDALDVLTIAGITDAYIWLNKFDALSDGQRYRFKLAKLIESKADVWIADEFLAVLDRTVAKVVAYNIQKIARKLGTTVLVATTHDDMVEDLNPSLFIDKRYREKVVITKAPEGFKQV >NZ_CP024125|0:16619|11839_12262_-|WP_000184979.1|DBSCAN-SWA MTNRSKKVVTKDTVDAHEFASEASETVAEQIVQAEVVERSESEPAQTKRTLTLYSSTVCSPCKTIKPILEKQMLGRATEYHVLTIDPNNIEPEIKQQFEEAGVTQVPTLICKEDGKEVGRLSGYSGVRPLLDVLKAWEVI >NZ_CP024125|0:16619|9557_9959_-|WP_000084570.1|DBSCAN-SWA 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21 | Rhizobium_phage(35.71%) | portal,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
23434 : 31455
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP024125|23434:31455|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP024125|23434:31455|24496_24823_-|WP_000495140.1|DBSCAN-SWA MFTRTVQTLKNSTDLVQRFAMPEIHEDFELRRLSNKDRYKHYILIFKNVINQKKDWEDVKVVAEIQERNHNLRFNIKISKQYPELADYEKLLEAKINAIINNSSLVIS >NZ_CP024125|23434:31455|25056_25302_-|WP_000119273.1|DBSCAN-SWA MSYADRTPMAKFFDALAYEKNEVKVTHTKDKKGVHESIHVKLSSGFAKFEKNNQKYEFVFNHQHQEINEDCFTSVKEKLVK >NZ_CP024125|23434:31455|28690_29854_+|WP_085942965.1|transposase|DBSCAN-SWA MSKKQKIYTAEFKAEAIKAIELNQGNVSETARQLGVSMQTLSNWYNKAKAGTLEGTQQYSPDLVALLEENKKLKQQLKTAEMEKEFLKKHSSVLCQGKSVRYAYMKEYKNTYPTTMMARLLKVSISRFYDWVKQGLSKRAIQRNQQTIFVKIAHQETKESYGHIRLTKYLQSQGTQISAYAVRCIKRLNQLYCKRHKRFKRTTNSDHSRSVYNNLLEQNFTATTPNIAWVSDITYIWTAEGWLYLAALKDLCTKQVVGYSLSERMTAQLVCNALNMAIRNRKPPQGLIVHSDRGSQYCSHEYRNMIEKYGFHGSMSKKGDCYDNAPIESFWGILKNELVHHRNYKTREEAKADITKYIELFYNQQRIQKGLDFKTPNQMAEDFYKLVA >NZ_CP024125|23434:31455|23434_23683_+|WP_000401859.1|DBSCAN-SWA MEIDQDTPRMTPEELRQAGEILYGTHWQSELARAIDVDPRRVRQWITRERPIPAGIRNEIILLLKEKSRKSVEYADYLDQQF >NZ_CP024125|23434:31455|23758_24481_-|WP_000075093.1|DBSCAN-SWA MSPSLLTQDNYQKLLDPLPLDFDYEKPIETRFFFNQVSDSIFKFVELKGNPGCDYSGCIEVHYCHYNEMAKGAMLAIAEDHCDPYEVAAEVFKAGLDYDYEKLIGRYTYKDFTFQDHEETKFGKQIRGAYIEKEFQQFKIATFIYQFLANKYSHLISDNQQTYQGHNLWVLSVLKWGKVKAYDCIEQKFISSFHPIDESKGFKPWSIPYNFPEENEKFLIMDFCVRTDVPLANVVLIAHG >NZ_CP024125|23434:31455|26725_27889_-|WP_001202407.1|DBSCAN-SWA MRALTYHGARDVRVESVPDPVIQEPDDVILRVTATAICGSDLHLYRGKIPATEDGDIFGHEFMGIVEEVGPEVTEVKKGDRVIIPFVIACGHCFFCEHELMAACENTNTGRGAILNKKQIPPGAALFGFSHLYGGIPGGQAEYVRIPKGNVGPFKVPGSLPDEKVLFLTDILPTAWQAVNNAQVGRGSSVAIYGAGPVGLLAAACARMLGAEQIFMVDHHPYRLRFAHQTYGVIPVNFDEVDAAEFIIQNTTGYRGVDAVIDAVGFEAKGSMLETVMTNLKLEGSSGSALRQCIAAVRRGGVVSVPGVYAGPIHGFLFGDAFDKGLTFKMGQTHVHNYLPQLLEHIENGDLSPDLIITHRMKLEDAAEGYRIFDKKEEDCRKVILTP >NZ_CP024125|23434:31455|30045_30321_+|WP_001133624.1|DBSCAN-SWA MPNQVEDKKKILLRVRKIKGQTQAIEKALEDNVECGAILQQICSVRGAINGLMNEMLEVHLKDTLVSGETTEQQRKEELAEIAKILKSYLK >NZ_CP024125|23434:31455|30342_31455_+|WP_000842147.1|DBSCAN-SWA MKSRAAVAFGPGQPLQIVEVDVAPPKKGEVLIKISHTGVCHTDAFTLSGDDPEGVFPAILGHEGAGVVVEVGEGVTSVKPGDHVIPLYTAECGECLFCKSGKSNLCISVRETQGRGVMPDGTTRFSYNGQPIYHYMGCSTFSEYTVVAEVSLAKINPEANHEHVCLLGCGVTTGIGAVHNTAKVQEGDSVAVFGLGGIGLAVVQAARQAKAGRIIVVDMNPDKFVLAKEFGATDFLNPKDYDKPIQQVIVEMTGWGVDHSFECIGNVNVMRAALESAHRGWGQSVIIGVAGAGQEISTRPFQLVTGRKWLGSAFGGVKGRTQLPGMVEDAMKGKIQLEPFVTHTMGLDQINEAFDLMHEGKSIRTVIHYE |
8 | Synechococcus_phage(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
38677 : 40834
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP024125|38677:40834|DBSCAN-SWA TTCAAGTGACAACTTGGGTATGAGGACGACCTAATTCTGTAAATTTATTTAATACTGCCACACGAGCATGAATCTCATTCACTTGGCTCTGAAAGTTTCTCGCACTGAGTTTATCCCCCAATAGTTTGATGCAATGCATCTTGGTTTCAACTAAACTTCGACGATGATAGCCTGCCCATTTTTTCCAAAGCGTTCTTCCTAAACGTTTAACTGTTTTCAGTAACTCATTCCGCTCTAAAGATCTCAATTTCTGATCTTTCCATGGTTTTGCATTTTTTCTTGGCGGAATGACCGCATGTGCATCTCGATCTAGAATGACTTGTCTGCAGTGCTTCGTGTCATAAGCACCATCGGTATAGACCGAATCAATCTGCTCATTCAACGGGATTTGATCAAGTAAATCACCGAGTACTTGCGAATCGCTCACATTATTTATAGTAAGCTGTACTGCACGTATTTGCAAGGTTTCAGCATCGATGCCAATATGAAGCTTACGCCATTGGCAACGATATTCAGGTTCATGTTTCTTACGTTTCCACTCGCCTTCACCTAGAAACTTTAAGCCAGTTGAGTCGACGAGTAGATGTAGCCCATCACTACTTTTTTGATAGCTAATCGCAATATTAATATGTTTTTGTCTTCGACAAAGCGTACTGTAATCTGGTGCGGTCCAATTTAATCCACAAAGTTTAATCAGACTTTGAACAAAACCTGTGACCATGCGTAAAGAGAGTCTAAATAAAGATTTGATCATTAAACAGCATTGAATAGCCTTATCGGAGTAAGTTTGATTTCGACCTTGCTTGTCTTGTGGTTGTGCATACCACTGAGTGTTTGGATCAAACCAAATGGAAATGTTACCCCGATTAATGAGAGCGCGATTATAGGAAGACCAGTTGGTTGTACGATAAGTTTTAGGAGTAGGTTTATTCATTTTGAAATATAGGACTGAATAAACCTTATAGGCTAGGTTTGTGCAACAAAGCCAGTGTTGAGTGAATAGTAAATGTAATTATCTGGAAATATATAGTAAGCGATAACTAATAATATGGATTCTATCTACTGTTTTATATTTTTAAAAGAGTATAACAATATTTATAAGTAAGCGCTTATATATAAGAAGTGCTATTTTGCGTTGTAAAGCGCTAGATTTAATTTTATTTTCAGCGTGAGTGTTTCTTTATAAAAATTTTTTTAACGTAATTAGCGCGCAAATTAGAAGCAGGAAAATAGTGTTTTTGACATAGGCAAAAATAAAGGGAGTTTGACACTCCCTTTTTACCGCTTTTTTCTATTACTTTTCACTTGGAAAGAGATCAGCTTTCATCTTGGCTAAAATTAGCGACTGCTCATTTGGAATTAGCTTATTTCCTTCTTTTGTTGCAATTTTCAATAGGGGGAACATTTGGAGCATCTGTCCCGCCTGCGCTCGCGCTGTACCTTCTGAGTAATGTGCATTCAACAGGTTGTTATATAGATTGCCACCTTTACCAGTTGTAATATAACCATCTGTAATAATCGTCTCAAATGCGATTCTCATGACCTTATTTAAGTTTCCACCGTTCTTGAAATAGGTGAACAAGATAATGACCTTCTCAGCTACTTTCTTTTGAACTGTCTCAACATTACCTCGTGTACCAATTACCGTCGGTTGGTTGTTCAGGATACGTAACAGGTTTTCTTGTTTTTCTTTAAGCTTGTCATTTGGTAAATCAATATCACTCGCTTCAAGAAGAATCATGTCTGCACTACCGCCTAGACGGTCTAGTAAAACTTCCGACTTCTTAGAGTTGTAGTGCGTTACACGTTGCTGTGTAGATTTAGGTACTTGTTTTTCAGTTACATTCTCAGTTTTTAACTTCTCAGGCTCTGTAACTTTCTTATCTGAAACAACAGAATTTTCAACTTCTTCTGCTTCAAGGCTTAAATCTAATTCTTCATCATTAATGAGTGTTTCAAGTTCAGTGTTATTTAAGTCGTCTAATAACTCAACATCATGCAACTCTTCATCGATTAGCTTTTCATCTTGAACAGCAGCAGATTCGGCTGTTGGCTCTAAAGCCATGTCGAGTTCTGATTCATCAATATCAAGTTGATCAAAAAGATTAGATATAAGTAATTCATCATCTTTTACTTGATTAGTAGCTTTTGCGTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP024125|38677:40834|39970_40834_-|WP_000991896.1|DBSCAN-SWA MNAKATNQVKDDELLISNLFDQLDIDESELDMALEPTAESAAVQDEKLIDEELHDVELLDDLNNTELETLINDEELDLSLEAEEVENSVVSDKKVTEPEKLKTENVTEKQVPKSTQQRVTHYNSKKSEVLLDRLGGSADMILLEASDIDLPNDKLKEKQENLLRILNNQPTVIGTRGNVETVQKKVAEKVIILFTYFKNGGNLNKVMRIAFETIITDGYITTGKGGNLYNNLLNAHYSEGTARAQAGQMLQMFPLLKIATKEGNKLIPNEQSLILAKMKADLFPSEK >NZ_CP024125|38677:40834|38677_39610_-|WP_001040034.1|transposase|DBSCAN-SWA MNKPTPKTYRTTNWSSYNRALINRGNISIWFDPNTQWYAQPQDKQGRNQTYSDKAIQCCLMIKSLFRLSLRMVTGFVQSLIKLCGLNWTAPDYSTLCRRQKHINIAISYQKSSDGLHLLVDSTGLKFLGEGEWKRKKHEPEYRCQWRKLHIGIDAETLQIRAVQLTINNVSDSQVLGDLLDQIPLNEQIDSVYTDGAYDTKHCRQVILDRDAHAVIPPRKNAKPWKDQKLRSLERNELLKTVKRLGRTLWKKWAGYHRRSLVETKMHCIKLLGDKLSARNFQSQVNEIHARVAVLNKFTELGRPHTQVVT |
2 | Vibrio_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
44061 : 110079
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP024125|44061:110079|DBSCAN-SWA TTCATACTTCCACCTGAAAGAAACCTCGCTCTCTTGCCTTAAAGAAGCACTGCATCATCACGTCTACGTCATACGATGCAGCGTGTGCTGCTAATGCGTCATATTCAACGCCTAACGAAAAACACAAATCTGCTAACTTTGGGTATTTGCCATCAAACGTTGCCCAACGGCCATATTCCATCGTGCAGAAAGAAGAAACTTTCTTAGGCGTCATGCCTGCACGTTTCAGTTCAGTTGCGATAAAAGGGCCATCAAATGCAAAGTTATGAGCCACTAACAAAGAGGCGTGATTTACGATTGAGGCAACTTCTTCTGCTATATCTACAAATTTTGGACAACCGATAAGGTCTGAATAGGAAATGCCATGCACCGCTTGAGCTTTTGGATCAATGTTTCGTTCAGGATCAATTCGCTGTACGAATTCCTCTAGCTTTGCGCCGTCCAAGTCATATTTAATGAGAGCGATTTCAATAATCTTGTCGCCATTATCTACTTCTAGCCCTGTCGTTTCAGTATCGACTCCAAGAATATATGGAATCATAGCTAACACTCCGAAATATAAGCAGTTATTTAACTTTCGTTTTGAAATATAGCATTGATAAATAAGGATATTTCAGGGATATATATTTATATTCCTGAAATATATTATAGTAAGCTATTACTAATAATCTTGATTCTTAAAAATTCATTTAATGCGGTCTAAATACGATGCGGTTTTCGCTCTTTCTTTGGTTTTTGAGTGAGTTTAATTACTGTCCAAATTGCAACGATAAAACCAAGTCCTAACATTGCTCCTGTCAGGAATTTATCGAATAGCATTAGCCAATGAATTTTTAATGGAAAAATAAAACAACTATTCATCGCATTATCCCTCTTTAGCTGTTAATACAAAATCTTTCGTTCCAATAATATTTTCTAAATCATCAACTGATTCTTTGAACCATTTGATAGCTTGCTCAATAATTCCGCCTTCTTCACTAGAAATCATTGCAGAACCAAAAGCTTTCATCATGAGAAAAAACTCATTTAAACTTTACTTACAAATAGATAGTAATGATTTTCTTTTGGAACAAAACTGTTCGTGAAATTTATCCAGTAAATGAAAGCCACCCGAAGGTGGCTCTCTCTGAGTAGGGCAACTCAATTAATTATAAGCACAATAATAAAGTAAGTGCTTACTAATAATATAGCCCCAAATAAAAATTATTGCGGGAGACTTGAAGGGGTGAAGTATGCATTAAAACCACTTTCCGAACTGTTCCAGTTAAAGACACGATCATTATCCATATTTCGTAACATTGAACGGGCCAATGCGTCTGAACATACGGCAACTCGACGTTTTAAATTGGTCACATTTCTTGGGATATAAAACATCGGTACTTCGTTTACTCGTTCATCATTAATCAGACCCAAAATAAGCGAATTTAGATGTTCAATAAACCCTAAAGCGGCGGGTGCAGATTTTTCATCCTCTTTAAGTTCGATGCCCGGCTGAACCAGCAAGATGCCGATACAGTGATCTCGTGCTACCTGCGCACAGCGGTCGATATAGCGCATAAGACGCTTAGACTGTTCCTCAGTAATATCAGGTCCAGCATGTATCAACGCATATGCCATAAGATCAATAGGGGAGCGATCCGCTACTGCATCGATGTGGTAATTGGCTTCATAAATGTCATTCAGGCGCTCAATGAGGTGTTCCTGAACTTTCATTCGCTCATCAAAGCTATAGCTCTGATTAGCTGAATTAAAGCCAATTTCCTTTTGCAATCTAGTAATCGACATAGGGATAAATTTTGCCCCTGAAACTCTGGCAAATTCTTGAGCCAAAGTAGTCTTGCCGGTTCTATGACTGCCACATAATGCAAAAATCATGCTTCCACCTTATCCGCACGAGCTTGGGCTTGCTCATTTGAATAAGTGCCTTTGCTATAGCGCTTACCCAATTTTGCCATATTCGCCGCAATCGTTTCCTCACGGCTTACCCCGATGATTTGGCGAATACGTTCCATGTAGAACTCTAAATCACCAAGTTCTTCAATCACGTTTTCACGATCTAGCGGTTTGCCGTAAATTGCATGTTTCTTGATTGCGTCAAGAAGTTCACCAGATTCACCTGAAACACCGACACCCATGTGAAGTAAATCGGCTTGCTCTGGTGTCATATCATTCAGGATGTCCTGACCTTTTTTCACCAAAGCCGTGACCATTTCGCTAAAAATGATTTGATCAGCCAACTTTGTTCTCCAAGTTAGTTACACGCGAATTCAAGCTATTGATTGAATTGCCTTGAGTGACATTCACTCCTTCTGCATTATTCATGCGGCTTGTCAAAGTTGAAATTGAGGTGCTTTGACTAGCGTTAGTGTTTTCAACATTTGTAACGCGATTAGCAAGAGTATTAACGGAAGCAACATCAGCCTTTTGAGTCAATTGGCTCTTAAGGTTGTTAATTTCCATTTCGATCTGTTCGTTAGTCATAGTCATGTGCTATCTCCTGTTAATGACATAGACGGTTTAGACTTTTATTTTCTTTTTGACCTCAAGGCCTTCATTACCTGCGGCTTGATAAGCTGCGGTCAAATGCTCAATTGCGGCATCAATGCGGCGATTAAATTCAGGATTGATGCGCTCTAGGTAATACTGATGCCTAGTCAGGTGGTCATTCACCATGCTTAAAAGGACATAAGATGTATGTAATGCCTCATGTCTGAACCACTTAGGATTTACCTTCGTTTTACTCATTACCCGTTCATCTCCTGAAAGACTTCCGTTAATGCTTTTCGTGTTTTGATAGCGCGCGCAATTTCGACATTGTTATCTTCAATGCGAGTTGTAGCGGATCGAATTAATTCATTTTGAACATCGTTGTCCTCTAACAGGCGCTCTTCTAAATCGAAAAGCTCACTCAGCTTTTGCTCAAGATCAGCCGTGATATGGCGAACTGTTTTAGGCTTGACTTGGCCCATGCCAACTTTTTCTTCAAGATGTTCGGTAGCTTTACTTTGTCCGATTCCAAAAATATTCATGACTTACTCCTTGTTTTTCGATAAGAAGATTTCTGCTTCAATGAATTTGCGATGTTGTAACCAGCCTTTTAGATTTCCGTGCATTGTTGGGTTGGCATACTTTTCCGTGCGGTGATCAAAGCTGTCAGGTGTTGCTTGGTGCTCAAAAGGTGAAGCATGCAAAGGTTCAGCTCCGACCAAGCGTTCGCAAAGTTTTAAATCTTCACCAACATTTGATTTATTGCCGTAATGGTTCATGAAAGAGACGCGGCAACAACGGGCACCAGATACCTTTTTTAATACCTCGATTTTGTGCTGCTTCCGTTCCTCGTCTGTGATATATGGCAAGTGCCATTCACCAAATTTGAGCTTTTTAGGTGTTGAAGTACGCATTGCTTTTTCAATGAGATAAGCAACAGCGAAGATTTCGAACTGTGCGTCCTCATGGATACGGAGATCGAAAAAGTTATCCATTTCCGTAGAGCTAAGAACCACATGCATAAATTGCCAAGGCATCAATAAGCGGTTGGCCGTTTGCTTGTGCAGTCCTAATTTCATTAAGGACCATACAACACCGCACATCAGGCGACCTGACCATTTCCATGCAAATCGGCACAAGCGAATCTTGCGTTTTGAAAACTGTTCATTCGCTTGCATGCCAGCCTTGTTTTTGCCCCAAAAGATTGGATATGCCGGATTGTTCCAGACTTGCTGAATGATCTTTGAAATAGGAATGGCGCGGTTAGATGCGGCATTACGGCTGAATACACGATGAGTCATCATTTCGGCATGTATTGGTAACCAATACATAAGCTCAAAGGTGACAAGGCGATCGCCGTATTCATTGATGCTGTCTGCCAAGATTTTTACTTTGATTTGACCTTCCTCAATTGCTTTATCAATGAGGTGTACGAGGTCGAAATTAGTAATTTGCAATTTAGTTCCTCCTTACCAAACCAAAGCACCGCCAACTTTGTAGTCAGTGACGCGGGTTTCGAAGAAGTTCTTTTCTGACGTATTAGGTTTAGAGAACTGCTCAACCCAAGGGAATGGATTTTTTACGCCTGGATATGGCACAAACGGCGCTTGAATTTGTTCAGCACGGAGGTTTGCAAGATGCTTGATGTAATCCTCAATAGCTTTAGGATTCGTTACGCCTTTAGTAATGTATTTCCCCCAACTGATTTCCATTTCTGATGAAGTCAGGAACACTTCAAGAGCTTTATTCCAGAAGGATTGGGTAAAGACGTCTTTATTTTCGTGACGAAGGGTGTCTAGCATATGTGCGAACAAATCTAGGTGCGTTCCTTCTTCATCACGTTGGATATAGCGAATCATGTCGGCTGAACCTAACATTTCACCCTTATCGGCAAGCAGATAGAACGAAAGGAAACCTGAGAAGAAATAAACACCTTCAAGCAAGACGTTTGATACACATGAAAGGGCAAAACCTTCAGCCGAGAATTTTTCACCGAGTAATCGCGACTGTTTGAGAATGAACTGGTTTTTTTGAGCCAATAACCCATCACGTTCAAATGTCATGTAAACGCTCATTGGATCAAGACTGACTGTCTCAATGATCGTGGCGTATGATTTGACGTGTAGCGCTTCTTCCCATGCTTGACGTGACAAACACATGGAAACTTCCGGAGAGGTTACGTGTTTTGCAATATTCTGGTTGATGTTGTTGAATTGAATGCCGTCTAGGTTTGACAAGAAAGCTAATGCTTTATCAAACATGAAACGATCTGCGGCATTTAAGCGGTTATAACTGGCAACATCATCTGCCATATTTACGACATGCGGAAACCACGTATTATTTTCCATGCGGTCGAGAATGCCTTTTGCCCATGTATGCTTCATCGGGCTAATTGCCATTAGGTCATCCTTGGGACCTAAAATTAGACGTCGGTCATTAATACGATTTGCGTAAGTCATAATTTCTTTAATACTCACAAATAAAATAGGGATGAACTTTTCATCCCTATAATT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>NZ_CP024125|44061:110079|46289_46547_-|WP_002017378.1|DBSCAN-SWA MTMTNEQIEMEINNLKSQLTQKADVASVNTLANRVTNVENTNASQSTSISTLTSRMNNAEGVNVTQGNSINSLNSRVTNLENKVG |
59 | Pseudomonas_phage(32.26%) | tail,integrase | attL 49063:49082|attR 104456:104475 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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