Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP024611 | Acinetobacter baumannii strain Ab4977 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP024611_1 | 2341610-2341695 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP024611_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP024611_1
>1.1|2341633|40|NZ_CP024611|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP024611_1
The CRISPR arrays of NZ_CP024611_1 >merge|NZ_CP024611|1|2341610-2341695|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP024611|1|1|2341610-2341695|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP024611.1|WP_000795915.1|2340372_2340609_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP024611.1|WP_001124846.1|2339478_2340090_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP024611.1|WP_000885229.1|2338796_2339408_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP024611.1|WP_000376215.1|2338184_2338640_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP024611.1|WP_001990047.1|2336479_2338126_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP024611.1|WP_000115408.1|2332849_2336314_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP024611.1|WP_000107128.1|2331893_2332853_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP024611.1|WP_001025680.1|2331465_2331750_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP024611.1|WP_002017921.1|2331242_2331356_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP024611.1|WP_000937460.1|2330518_2331154_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP024611.1|WP_000983628.1|2342326_2342740_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP024611.1|WP_000432330.1|2342881_2343760_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP024611.1|WP_001990041.1|2343816_2345961_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP024611.1|WP_001145693.1|2346015_2347425_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP024611.1|WP_000482091.1|2347740_2348220_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP024611.1|WP_000108365.1|2348504_2348726_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP024611.1|WP_000132044.1|2348831_2349149_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP024611.1|WP_000498477.1|2349233_2349455_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP024611.1|WP_001136759.1|2349542_2349971_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP024611.1|WP_000251637.1|2350240_2350384_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
992019 : 1037379
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP024611|992019:1037379|DBSCAN-SWA CATGTCTACTGTATCAAATCAGATGAATAAAGACAAATTGTTAGAGTTAAAGCGCCAGCAAAGTTACCAGTCCTGGCATGGGCCAGCTTTAAAAACGCTTGCCGATTTATTGAAAGAACGCAAAGCGAACTTAAAGAAACGTAACCATGATGAAAACCAAGCAGCGGTAACACGTGATGAGTTTATGCAAGGCCTAGTTAATGATCATGGTGTACACGGCATAAATCTTTATCACGCGGGTGTAATTATCTCGAGTCTGTATAGGGCTAAAAAAATTCGATATTTGGGTAGCTTCATCCAAATTATTGAAGGGGATGGTGGCGCGTGATCCCACAAGAACTAATTAATGAAATTAGGCAAAATGCCCTTTTTGTTATAAATCATAGCGGTGGAAAAGATAGCCAAGCCATGATGATAAAACTACTTGAGTTTGTTCCTAAGGAGCAAATTCTTGTAGTTCATGCAAGTCTTGGTTTTATGGAATGGCCAGGAGCATTAGAGCTTGCACAGAGTCAAGCTGCTGCAGCTGGCGTTGATTTTATTGTGGCCAAAGCAAGTAAAACATTTCTTGATATGGTTCTGAAACGATTTTCTGAACGCCCTGAGGTTCCTTCATTTCCTTCACCTAAGTACCGCCAATGCACCAGTGACTTAAAAAGAGATCCTATCAAGCGAGAGGTACGCCGTTACGCAAAGGCTAATGATTTCAATCGAATAGTAAATTGTGTTGGTTTGCGTGCTGAGGAATCTAGCCATCGTGCAAAGCAAATGATCTTTAAACCTGCAGCTGAGAATGGTAAAGCAGGTCGCACCTGGCATGACTATCTTCCGATACATTCTCTTACAACCAATGAGGTTTTTCAGACCATTAAAAATGCTGGTCAATCACCTCATTGGGCGTACCAGGATAATGATCGTTTAAGTTGTATCACTTGCATTATGGCAAGCGCGAGAGACTTAATTAATGGTGCAACAAAAAATCCTGAATTCTATGCATTGATGTGTCTGGTAGAACAAATTACTGGATATGCAATGCACGCTAGTTTGCGGTTCCTTCCTGATCTAACCGGTATACATCCTAATTATTCACTTTTAAGCGAATACCAAGATCTAGTTTCAAAGTTTTCAAATACGCGCTCTAACAGAAAACGTATACAAATGCTGGAGGTTGCAGCATGAGTAAGTATGTCCCTAATTCATTCCAAGTTGCGAACGCTTTTGTAGATGAAGCAATGAGTAAAATCTCTGATGCTTCAGTAAAAATCTATTTGATTATTAACCGTAAAACACGTGGCTGGGCAAAAGAATGTGATGCGCTTTCACTTACGCAACTAGAAGAACTGTCAGGGAAAAGTCATCCAACAGTCGTTAGATGTACAAAAGAGCTTGTTAAAGTTGGTTTAGTAAGAAAACATGAGCAATCTGTATATGGGAATGTTTACTCATTAATAGACAATTATTTTGTTGGTGAGCATGTAAACTTCCCAAACAAGAGTTCAGTACTTGTTCAGTCTTTTAGCTTATTTAATGGGCAGCTAGTTAAAATTTTTAACTACCAAAAGCCTGTGTCTAAAAAATCAGTTAAGAGCAAAAAGAGTAAAAATCTGTGTTTAAATTTTCCACAAAAATCTCGGTTGCTAGTTAAAAATTTTAACTACCTTGAAAATACTAGCCAGTTAAATTTTTTAACTACTGCTAGTAAAAATTTTTTACCCCTACTAGTTAAAATTTTTAACACACAAAACACACTATCAAAACCAACTTATCAAAATAAAAAAAATACATGGTTTGTTTTAGAAAATTTGAAGTTTGAAATTTGTTCTATCAATCCGTCAATTGATACGGATGAGATTTTCAAGGCCTCTTGGTTTGAGAGAGAGTTAAAAGCATTCAAAGGTTTTAACGAAGGTCGCAATCACTCTGATTACGATATGGTTCGATTCTTTGCTGAGTGGATGCTTAAAGCACGCGCTAAATACGCCAAGATGAAAACACCGGCACCTCGCCAAAACAATTATTCAAATGGTCAGTCAGCTAAACCAGCTAATCAAATTCCTGAAGTAATTACTTTCGCATCTGAAAAACAACTATTCGCGTTCGCACGCCGTTTAGTAAACCATCCTGATTTCAAAGATACATTTTGCCATACCGGTGAATCATGGATGGATGCTGGAAAGCGTATGGCTCAAAAGTTGGTAGATCCTCAGGAACAAAAACCATTTATTCCGTATTTGATCGAGATGGGTTTTAAAAACTCATCCAAGGAGACGGCTGCATGATTACTCTAAATAAAACTACCGGCATTCAAAAATTAAAAGAGATTCTTCAAGAATTTGATTCTTGTATGTACATCGAACGTGACAATTTTTTTGACAAGCATTATGACCTAGTTAAAAGCGAAAGTGATATTGAGCAAATTCGTATTGCAGTCAAAGCAGCTGAATTAAAGAGGGGTACACGTGTCAAAGTAAATTTCACACATGTACCAGACAAGGGTCAAAACAAAATTCATTTTGTTGGCAATGGTACTGTCGATCTGTTTGAAGATAACCGGGTATTTGGTCGTTTAGATGATGGCCGACCTTTTTGCTGTTTAGTCTCAGATATAGAAATTTTGGTTTCAGAAAAATTAGAAAAGGAAGATGGCTACGAAGAATCTAAGGCAGTCAATAAAGTCTATTTTTTTCTTTGTTTGGTCTTGGGCTGTGCAGTAGTTAAGGGGTGTGGCCTATGAAAAAGGTTATCAGTTTTAGTGGTGGACGTACTTCAGGGTATGCAGTCAATCTCTTTAAAAATGATCCTGATGCTTATTTTATTTTTATGGATACTGGCGCAGAGCATCCAGCTACTTACCAATTTATTAAAGATATTGTTAAACATTGGAAAATAAATCTTGTATGTCTTCGTGTAGTCGTTAATCCACAAATGAAAAAGGGTGTGGGCTACAAAATTATACCCCTTGATGAGCTCAAACAAGACTTGGAACCTTGGAGAGATATGCTCAAAAAGTATGGAAGTCCTTATTACGATATGCCGTTTTGTACAGCTCGTATGAAAACTGAACCTTTTGAAAAATATTGCAATGATGTGTTTGGGAAAAACAACTATGAACGATGGATTGGTATTAGATCTGATGAGCCAAAACGGTTGCCAATTGAGGTTTTAGAAAAGCTTGGTTTACCTATTCATAAAGACGCAAAGAAGCAGAAAGCCGGGTTTAGATATTTAGCTGAAATTAGTGATTTCACTAAAGAAGATGTTTTGGACTGGTGGGAACAACAACCTTTTGATTTAGCAATTACAGAACATCTAGGTAATTGTGTTTTTTGTATTAAAAAACACTTAAACAAAGTTGCACTAGCTGCCAAAGACGAACCTGAACAAGCAGTGAAATGGATAGCGGTTACTGAAGGCGAAAACGTCAGATCTGAAGGTAGAAAATACAACCATCATCGGATGTATCGAACGCGGTTACATTTGAGCGATGTTATAGAGGCTTTCAAAAATCATGACAGAGATGAGCTTTACAACGCTCTTAGAAGTAGCAAGCGCTATGAAACAGGCTCTTGTACTGAATCATGCGAAGCCATTATTTGAGGGAATGGTGGATGAAGTTAACTAAACAACAACGGGCAGAGTTAAAACAAAAATTTGGCGGCCATTGTGCGTATTGCGGTGAAATGCTCGGTGATAAATGGCATGCGGATCATATCGAAGCTGTGAAACGAGATTTAATTCATGTTGGCGGTGGCAAGTTGATTACTGGAGAAATGACTAGACCGCAAAACGACACTTTGGAAAACATGAATCCAGCGTGTGTTCCTTGTAATACAAACAAGTCGTCTATGCCCTTGGAAGGGTGGCGGAGGATGCTCACACATTATCGTGATGTTCAGTTGTTACGAGATAGCACACATGCTCGTCATTTACTACGTTTTGGGCTGATTGAAATCAAATCTGAGCCTGTGAAGTTTTTCTTTGAGAGTTATAAAGAGGGCCAGTCATGAATAAACCATTAGAAACTTTTGATATAGACGCAGCAAAGGCTCGCTACGAAAAATTACGAGGCCGATATAACCGGAGTGGGCTATCTAATACTGATTACAACGAGCTACTTCAATTAGAAAAGGCAATCGAGCAAGCAAAGAAAGTTAATGAAGGAGCGCCGATTGATGAGCGAAAATAAGTTATCACCAAGACAGTTGGTACTCATTCGACGGGCAGCTGAAGATGCTATACATGCTTGCAATAGACATTACGGCCCATTTGTTGACTATGTTGCTCACCCATTAAATATCATTTCATTGGTTGATATGGCGCAAGAAAGCCTACACCAGCAAGAGCTAATAAAACAAAAGGATACAGTAATAAAATTTGCTAACAGTATGGCGAATTTAGATCAACAGAAGTTCAAGGAATTACAAGAACGGATAAATCTTGCCCTGCAACAAATACAAGGCAATTTGCAATATGTTGAGCAGGATAAGAGAGAAAACTTTGAATTTCTGCAAATGGCTATGATTCGAGCATTTAAAGAATTAGAGAAAGTGCTCAATGGTGGTGAGCCTAAATGACATCGATGAGTTTAGCGGATTATCACTCTAAATTTCCAAACGGCCATAAAGCTAAAAAGGGCCGTAATAAATTTAATGCTTCAAAAGTCACATTAGATGGGATGACTTTCGACAGCAAAAAAGAACTCAAGCGATATATCGAACTTAAAGCCATGCAGCAACGCGGTGAAATCTTTGGATTAGAGCACCATGCAAAATTTGAATTGGCTCCTAAAACTAAGATAGAGGGGGAAAAGAGAACAAAGCCGGCACTTAGATATTTTGCTGATTTTACTTACTACCTCATCAATGGCGAGTACATCGTTGAGGACGTTAAGTCTATTGCTACTAGGAAATTACCTAGTTATCGCAATAAGAAACATTTAATGAAAACTGTACACGGTATTGATATTAGAGAGGTTTGAGAAAAGTTTATGAGCGACATTG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54 | Acinetobacter_phage(66.67%) | capsid,terminase,tail,holin,integrase | attL 1021699:1021713|attR 1047244:1047258 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1201719 : 1216516
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP024611|1201719:1216516|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1551759 : 1598830
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP024611|1551759:1598830|DBSCAN-SWA 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66 | Acinetobacter_phage(100.0%) | integrase,terminase,capsid,transposase | attL 1551582:1551599|attR 1599338:1599355 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2572708 : 2620437
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP024611|2572708:2620437|DBSCAN-SWA 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45 | Escherichia_phage(26.67%) | integrase,tRNA,transposase | attL 2604324:2604383|attR 2617283:2618103 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2695120 : 2772843
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP024611|2695120:2772843|DBSCAN-SWA 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115 | Acinetobacter_phage(76.19%) | protease,capsid,terminase,tail,head,integrase,portal | attL 2687926:2687985|attR 2776680:2776743 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2996193 : 3008977
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP024611|2996193:3008977|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP024611|2996193:3008977|2999515_3000586_-|WP_002052057.1|DBSCAN-SWA MNKILFGDCRTLMAQMIQEGLKAQTCVTSPPYFGLRDYGVDGQLGLESTVDEYVQNMVEVFRLVRELLHEDGTLWLNLGDSYAGSGRGITRTGLNDGKNPKTKGLILPKQNAAQSNLKPKDLIGIPWKVAFALQADGWYLRQDIIWHKPNPMPESITDRCTKAHEYIFLFSKSRRYYFDHVAIKEPVAESSIKRLSQNLDDQQGSDRVVNKHNGPMKAVYSRSSRDSFKRSNSKRAVAHPNQSMGTHRADRKESNYDLLTRNKRSVWQVSTKPYKGAHFATFPMDLIEPCILAGSRVNDVVFDPFMGSGTTAAVAKKLKRQYLGCELNPKYEHLQKERLSQIHTNMELQFEGGCHV >NZ_CP024611|2996193:3008977|3007104_3007290_-|WP_000200037.1|DBSCAN-SWA MTSEKKVWPLGTNHTDSEGTPWKRDEQNNWWFWQENFGWSRYVGPVNQAFLDLRFEVGTEQ >NZ_CP024611|2996193:3008977|3006652_3007108_-|WP_000575725.1|DBSCAN-SWA MIFELINPSDKCTFEAPNLKIAALVTCVLGNGQYSAKGIENDLDVPFFIFGGHDEWFVSNFGLNFKETYIQVRNEEKFDLVNSFNSVLLGSYLDRTAFYKAYDLIQDPAEKNKWREQWLDERRSSLNNICKRAWNFAEQVSLYKPAQEGAA >NZ_CP024611|2996193:3008977|3001069_3001492_-|WP_000648413.1|DBSCAN-SWA 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19 | Acinetobacter_phage(53.85%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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