Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP024635 | Lactobacillus brevis strain BDGP6 chromosome, complete genome | 4 crisprs | DinG,cas3,csa3,DEDDh,RT,cas1,cas2,csn2 | 1 | 7 | 8 | 4 |
1. NZ_CP024635
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP024635_1 | 523857-524004 | Orphan |
I-E,II-B
Consensus repeat of NZ_CP024635_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP024635_1
>1.1|523883|35|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder TAACACCCGAGCGCAATTCAACATCATTGGCCGGA >1.2|523944|35|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder TAGATTCCTGCCGGCAATTTGATACTTTCGTTAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP024635_1
The CRISPR arrays of NZ_CP024635_1 >merge|NZ_CP024635|1|523857-524004|CRISPRCasFinder AGTGCCCACACACATGTGGGGAAAACTAACACCCGAGCGCAATTCAACATCATTGGCCGGAATCACCCCCACACCCGTGGGGAATACTAGATTCCTGCCGGCAATTTGATACTTTCGTTAGGATCACCCCCACACCCGTGGGGAATAC >NZ_CP024635|1|1|523857-524004|CRISPRCasFinder AGTGCCCACACACATGTGGGGAAAAC TAACACCCGAGCGCAATTCAACATCATTGGCCGGA ATCACCCCCACACCCGTGGGGAATAC TAGATTCCTGCCGGCAATTTGATACTTTCGTTAGG ATCACCCCCACACCCGTGGGGAATAC
>NZ_CP024635.1|WP_024525305.1|523422_523776_+|MerR-family-transcriptional-regulator MKIETVAQRYHISTSAIRYYEQQGLIGPINRINGIRDFNTTDLERMDFILCVKQCGMTIKQMKRFIATYEQGDSTLRERLAILQAQLSASEEQRTTLTRSINRLKQKIGDIRIRLAE >NZ_CP024635.1|WP_024525304.1|522293_523301_-|aldo/keto-reductase MQYTKLGHTEIMASKICVGAMSFGQPGTMHDWTLDYPASERVIGHALSLGINFFDTANGYSAGTSETYLGRALKAQRVARDQVVLASKVYFNPGRLSAKAIHHEIDGTLKRLGTDYLDLYIIHRFDYDTPIEETMAALNELVTAGKVRAIGASAMYGYQFNNMQQVAKDRGWAQFQTMENHYNLLYREDERELIPICQQQGVSLMPYSPLAAGHLSHSAWQVDTLRSQTDRVAMGKYDRTETEDQRIVARVAELAHKYQVSMTQISLAWQWAKGVAAPIVGSTKTSHLDEAVAALSVKLTTADIDYLEDLYRPHPIVGALDHNPAAGTILIDQKK >NZ_CP024635.1|WP_024525303.1|521509_522160_-|nitroreductase MDVLEAIKDRHATRAFDDKAIDDQNLTAIVTDAQRTPSWGNSQPWEVYIATGKSLEQIKSRYAAAAQAGVTEAADLAKAHRGDFSTMANQNMGHWVGTFRPIIEADPTTYWDSRENLYRAPAIAYLVLGQNPNSWSIYDLGAFSQTLSLAATARGVQSLSSYELVKYPDILRQELAVPTDRTIAMGIALGYEKPDKVLNQFRTDRVATQQILHIQH >NZ_CP024635.1|WP_024525302.1|520935_521421_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MEITDATLADLPEILRIEQLGFTAEEAGTAEQYQDRLARLAGTFLVAKEKHKLVGFVVGAATQEPYVADWMFEHTPTNLPTGGHQLIYTIAIDPAYRGHGLGSRLLVALQERAQNAHRETLSLTSLERNVPFYLKNGFENHGVANSTHAGEVWFNLVKPLY >NZ_CP024635.1|WP_011667631.1|519103_520570_-|catalase MREDLKNSAGQPWGDNEHSLTAGQRGPVLIQDYNLLEKLAHFNRERIPERVVHAKGAGAEGTFRLTKDMHQYTKAKIFTEMGKSVPMRIRFSQVAGEMGSADTVRDVRGFALRFYTDDGNYDIVGNNTPVFFVNDPLKFPDFIHSQKRDPRTHERSQDMQWDFWAHSPESVHQVTILMSDRGIPASYRKMHGYGSHTFKWVNEAGEVFWVKYHFRTAQGIQNLSNDVAQRLAGENPDYLQADLYHAIEAGDFPTWKVCVQVIPEQAGLDYPADIFDVTQVVSQKDYPLIEIGEFTLNKNPDNYFEGVEEAAFSPANLVPGIEPSPDKLLQGRLFAYKDAARYRLGVNYEQLPANRPLNHPNNYERDGFMQTDNHGDQVNYEPNSQGGPQEDPAGRLTPYTVSGKAGNYAYQTDYGRAAGKLYRLLPADERQRLIETIVMNLGQVKSHDVKRLETAQFYEADHDYGLAVAKGLGLKLDEIKDYPFDTTH >NZ_CP024635.1|WP_024525301.1|518464_519010_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MENLHLTDHLALVAPISPLAADLYALIAADRANLSRWLPWANTMHEVADEAAFLTYAQGQIAAHQLWLAIITVNGKPTGMIDLHDKKDGHADVGYWLGRPYRGHGYISQSLQALEKLAFNDWQLNKLQILTVPDNIASQAVAKSNHYHREARLPKHIPTLAGDYQDAIIFSKLRQDWLTQI >NZ_CP024635.1|WP_024525300.1|517837_518260_+|SRPBCC-family-protein MTDQKLFTNTVLIPADATRVHATLTNPQNLLKWVPEITAVDPKTNVFVITRTRAAINQHEVLTVTSNATTVTYTSREGRLPYQLVFTIVGQASQTLLQETLFVPRNTGLPLTLLSPIAKQALKQNLEMLAILLRRPAMPD >NZ_CP024635.1|WP_024525299.1|517213_517759_+|hypothetical-protein MQTSATDVFAVGDAIAVTYLPQHQSRSIALASNAQRQGELAALNLQTPVLPYTGVVGTSQWQAGHLQFGVTGLTDTAAQRANISHTSVTLTQDQRQSPNPAIPTKHVQLGLTYDPQTKQLLGAQVLADGNIDELINLLALALQAQQTLADLAVADFYMSPGKNDLPHLINAAAMTAYRQEK >NZ_CP024635.1|WP_024525298.1|516495_517200_+|FAD-dependent-oxidoreductase MKLLVVGSSHGGRAAITAALAQDATIEIDLIEAGPVTTVYPTQVKVHANTRAIQLLATQHQLLISHAGQKQRLSYDKLILAPGAQATIPAVLSTTSQNVLPMRTRAQINHLKAAATDATIHHVIVIGGGYIGVGAADLFSQHGKQVTLIEHGPQLLGSYLDNDFSMPIQQALQQQGVTVHVNELVTGLTGAPDVTGVTTNQTTLSADLVVVATGTTPNTDWLKDTLDCLTQWSH >NZ_CP024635.1|WP_024525297.1|515767_516364_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MGTRRRGDELETAIYQVTYQLLATNNGTALTFSQVAKAAHTSRTVLYRYWESPFDLVLATLTHYRQQDPQSMQLEHIDQGSLRADLIYVGTSFAQAATAGVSQYFRQLFSLAVDEQDQRQLAKILSLSTTANLTLMQQVVENARRRHELLRTPPQATLLAMFNQIRYVTMIGGAVPGEIEITRLVDDLILPAMQQLGR >NZ_CP024635.1|WP_024525306.1|524214_524526_-|HicB-family-protein MTKANIVTYPAVFHDNEAGGYIVTFPDIEEAMTSGQTLGESLVNATIVLGQTLHHHPMVLPTATTITELMHQYPMAFIQFVAVDLDQVIEHAVPTDQADLQLT >NZ_CP024635.1|WP_024525307.1|524655_526095_-|multidrug-efflux-MFS-transporter MTTDITGKPYNRAMMVTILLIGTFLNVLNQTVLATAFPDLMKAFSINATTVQWLTTGFLLVNGIMIPLSAWLSTQFNSKWLWISAMTIFAGGTILCWAAPSFAMLLSGRLIQAVGVGVAMPLLQTIMFSIFPPEQRGSAMGLVGIAVGVGPAIGPTLAGFVVDNGSWRNIFGIMIPIAFVIILLSFFFMRPVIENRRTHLDVLSLILSSIGFGSVLYGFSTVGQNGWTDSTVITALAVGVIFVAVFAVRQLTISEPFLELRVFARGQFTVATILGAIANTAMTGAELVLPMYLQIVRGQSALISGLTLLPGAIVIALMNPITGRIVDRIGGRELSIIGLACLTLGTLPLCFLQSDTALWWIILVYAVRMLGVSMVLMPITTVGMNALDRSLIAHGTAVNNTVKQIFSSIGTALVVSIMANVTKENMPNVRLYIKQPTLLHHLIMNANLDGYTAAFIVTAAMSFLGFLMAFLVKRSTKKA >NZ_CP024635.1|WP_021742597.1|526216_526669_+|MerR-family-transcriptional-regulator MTVTDNFSNWLNLIQQVSQPEGITLGTSDLVKATGVPASQLRYWVEQGYIKPIDVPNERSRKFSYRVVFRVRAIKYFLDHGYTLSAAMDNVNQFRNLDIQLQRILTDHLTDLQLHEDGQIDISLGTVQDGQELLGLTIKDGSSQFWTKKV >NZ_CP024635.1|WP_024525308.1|526830_527277_+|LytTR-family-transcriptional-regulator MHVTFNLKASFIPPFITINAPAETPELQHLAANISQLTNSQLIAGISPRGTRELVPVNQIIRIHTDAKHVVMETKATTYTLPQRIYQLKQLLPSDLFLQLSSGELVNRQHIRHFSLTPSGLYQVLLSTGATTFVSRRCMQQIRKEFLK >NZ_CP024635.1|WP_024525309.1|527273_527720_+|DUF3021-domain-containing-protein MKRLGILTSGAFLGLSIGFLCALFFSLTNHATTFMPSSPDFVAHFSSNTMATLAAAGLWATIGLLFGLTSLIFFNEHWSIARQTIWHFGLSYLGFTPLAILAGWFPLNVTWLLLYTLIFIEIYLVIWTYSMLRARKTVQHLNDTLSHH >NZ_CP024635.1|WP_024525310.1|527779_528385_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MMQINLVLGSSREKSLGRRVFNYLKNHRHDFEQQNAVHLNFLAVGDYQLPFFYEDVAPMNNQDRHLPAQQQAWLDDMEQASGYIFITPEYNHSFPAVLKNGLDYLAFQTAKKPALIMSYSDNARAGQFGGVDLTPVLTRLGMTVLPPLVGIGNVQKNFNEAGEFLENAPSKDFYHQKLQQTVEKIAFYSRLFADNPFTPQS >NZ_CP024635.1|WP_024525311.1|528371_529805_-|MFS-transporter MKTQAIRWWVLACIGIMTFMDDLDASIVNVALPVINRALAINMGVAELIVSVYLITICVFLLPFGRLGDTFGKVRVFKWGMWLFVLGSLGCGLSPNIISLLLCRLIQGLGAAMTMSTNNGIITESFPINERGRALGWIGSFVALGMIAGPGIGGLLLSFLPWESIFWINVPIGLLLMGLGHAVLTTETGSDDRPVFDWLGSGLIGIGISGFFGYLYAGQQLGYGQPLLMGLLAVAIIATLVFILYEIKCQQPLLDLKIFRKTDFTVGVGTALLVFVANNFYMVLTPFYLENAKVIGASVAGLIMMILPVVQVLMAPIAGRIADNQGPFKLCLTGLLIILSAQVGFVLINQQTPLTLVGGLIGLLGLGNALFQSPNNALIMGAVEQTQLGVAGSVNALSRNIGMVLGNALATSLLFVIMSALTRSKVTNFDGHFKRAFITGQSWVYLLGSLLVLLAIGLVSFNTWKNKKMEALSDDAN >NZ_CP024635.1|WP_024525312.1|529913_530399_+|MarR-family-transcriptional-regulator MISSANAKNLMACISQLLTQDTTVDQEKKWMLSQVATDTALTATIKALRTADFHTIATISTLTPAYLKTLPEKTGLSQPTISRMMTRLSHHDLVEKYRTVTNSKDILVRLTPKGTQIAEIHAQLDQRILNNVAQVLEPYSQTEVTTTIQILQEIAKIDINR >NZ_CP024635.1|WP_021742591.1|530488_530893_+|MerR-family-transcriptional-regulator MEYTMSDVCQKFNLSEYTLRYYDKINLIPGVYRNEQNRRVFTEDAVGWLQFVIALRSTGMPIADVKKYIALTTTTDDSTIQARLTMLQKQAAKVDSQIADMHKQRQIIADKINHYQQAMKTAPDPTKKSYQRWV >NZ_CP024635.1|WP_024525313.1|530901_531738_-|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase MTKTWFVTGSSRGLGRAIVENSLSNGDNVVATARNTASLADLAAEYGEHIYPLSLDVTDVDAVDAAIQMAIQHFGTIDVLVNNAGFADMDSVEEMPLATFKAQMDTDFYGTLYTIRAVLPTMREAKAGRIINISSIGGRIGGAGLSAYQSAKFAVNGLSEVLAHEVQSFGIQVTTVEPGGMRTEWGGDSMKAASSDLYKDSVGQAISMIHDQWHHAGDRYVSEPDKVAAAIHTLSEMPQAPVHLLIGKDAEQAAQQNAETLAKNDMANRSLTESTGNR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP024635_2 | 1633707-1633856 | Orphan |
I-E,II-B
Consensus repeat of NZ_CP024635_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP024635_2
>2.1|1633735|33|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder GCTGCATAATGGATAGGCTTAAGCACTGACTTA >2.2|1633796|33|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder CGCCAAACAATCAATGTGCTAACACTTGTCATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP024635_2
The CRISPR arrays of NZ_CP024635_2 >merge|NZ_CP024635|2|1633707-1633856|CRISPRCasFinder CGTTCACCCTCACATATGTGGGGAATACGCTGCATAATGGATAGGCTTAAGCACTGACTTAGGATCACCCCCACACATGTGGGGAATACCGCCAAACAATCAATGTGCTAACACTTGTCATGGGATCACCCCCACACATGTGGGGAATAC >NZ_CP024635|2|2|1633707-1633856|CRISPRCasFinder CGTTCACCCTCACATATGTGGGGAATAC GCTGCATAATGGATAGGCTTAAGCACTGACTTA GGATCACCCCCACACATGTGGGGAATAC CGCCAAACAATCAATGTGCTAACACTTGTCATG GGATCACCCCCACACATGTGGGGAATAC
>NZ_CP024635.1|WP_021741894.1|1632812_1633388_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MREKDTAKQTSIIDEVSNIILNEGIAAVSMSKIAKASGISSSTIYVYFTDKEDVLKQVYLAKKEMLATFLLKNIEATTDNPVIFAQQFMRALYEFGMQHYEALMIIEQFNSSPVRNNLQISQAESYRGFERLFEATSHAPQFVTDSAAVILGFAYAPIVLYVKARKTNQLAAQTISIEQVIDMCMHALLKE >NZ_CP024635.1|WP_021741893.1|1631315_1632743_-|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MTTNVEMTKIFEDQRQQYNRAQPMSLATRLTTLDQLERLLRENLNAFVEALQADFDQRDPLQIIGADLTGPLTTIAYTRKHLRKWMKPDKKRLGLMGLSGGREYVYNEPLGVVGIMSPFNAPIDLALDPAIEAIAAGNRVMVKISEYTPKAAALLQKLAKKYVSETTFAVITGEADVSVHFSALNWDKFVFTGGSETGKKILAAAAPNLTPVVLELGGKNPAVVLPDANQQLAAEKIARGRSGNSGQICLDVDYAMVPANQLTDYIHLIVEQLEQAFPTYSDNPEYSAIINDAAYKRITGMLAEAQQRGTQLLTINPNHDAVPDATKRLIPLTLAINPDPDLQIAKNEIFGPILSIFTYETLDEAIAFINTHEKSLAMYVFGKNKAQLDRVIRHTSSGGVDINELALHAGSHEMGFGGVGYSGMGRYKGGKVGFETFSNPKSIYKQGILAKYTTRFMVPIHSQRNEKRFKKMLGL >NZ_CP024635.1|WP_021741892.1|1630371_1631214_+|aldo/keto-reductase MEKTFTFDSDLTVNRLGYGTMQLTGDGVWGPVADPDNAVKVIETAIDHGVNFIDTADAYGPFYANLYLRDALKNRPDNHVMVATKVGNTRQGPDVWTPVGVPAYLRQQVEMNLFTLGLDHIDLLQLHRVDPNVPLADQIGVLKDMQDEGKIKHIGLSQVSVDQLKEATAIAPIVSVQNMYNLSNRQDEDVLDYADAHHIAFIPWFPLATGELIKDATLTNIAQKYNASPAQIALAWLLKRSDVILPIPGTKSSDHELQNIQAQDIDLSQADFDALKALAK >NZ_CP024635.1|WP_021741891.1|1629316_1630132_-|hypothetical-protein MKKFMVALTGLVTLATVGATVPATAVTTAHAATKSTYVSPSLKVNAIYTTSTKVAGTATKGSKITVKATKNAKTNLASGTASKTTGKYSIKLSKKLKKNANVYVYATNSKTKAYFYRIIRVQAASTKAATTKSTSTKKTTTKKTTTKKSTTSSKTSAASFSVKTPTGTWTSNTANKYSQKWVFSQKTGLNEYLYKNGKKVKTLVSYAKYSVSAKTPTFWKITYTPKGSKTKQTMYLRFTSAKKFKVVNSKNQVISTKAGVAPAAKWAFTKA >NZ_CP024635.1|WP_021741890.1|1627900_1629067_-|MFS-transporter MWKTKKEVSLVGILSATLLLNAAAACMWPLTTVYMHNQLHQTLALAGVALLGMSLCMIVGNWLGGWLFDNWSPFKSALVGTLCSFIPMLTLIVFHGWPIFGIMLLFIGLGDGIVMTVVNSFAANIKEISSRRVFNWLYIGMNLGVVVGTLMVGMLMDHGVQLVFMVASLSYAALLVIFVVDFRMDIQTKTHQHVKGPAKPAQLQLIWLIAAMVFCLYLSYSLWESVISVHMTNLGISFEKYSLLWTLNGLLIVFGQPLANRIGTYFKMSSQIAVGTLIFILSFLLLVFARDYTMFVVTMVILTVGEMTGFPGIPAWIDGLAGDNDKGKFQGIYNMAISFGRAVGPLYGGLIIEYGSYQLLFWSVTGLMLAALAAVMLRNHHNLTRVKK >NZ_CP024635.1|WP_024525962.1|1626396_1627743_-|MFS-transporter MFSFLKPAPDAKVKVPAEKVVGTYRLRQTGVLLSICIGYIGYYIIRLIFTTEQNDIMKAYGFTTADIGLVMSCFGIGYGISKLFMGALSDKSNPKWYLATGLFISAILNFGLGSTRNLYVMMLLMLVMSVAQGMGAAACQRTVQLWWGKKWRGTVYAVWSSAHNAGAFACVAVVQIATLMFTHSIAAVFYTASVVSIVIAIFIVLAGADRPATVGLPSIGEYTGDEVVLDDGQATRAELTDLSLWQIFVRYILTNKVVWAITLTSMSLYLVRYGIMSWIPSYLTQFKGFDPGTAKWLVGIFELAAVPGVILMGAISDLLKDRRAIVCIGCVIGLLICLTTYFFSTSHLAIIIVLLIMGSLIYAPLTLVGLMVNESVPKFAVGSSTGFMGFFQYIFGETLATALIGILVAKFGWIASNTVLYTAAGLALLLLCYIAIHEHHVAKIAAGE >NZ_CP024635.1|WP_021742824.1|1625691_1626306_+|NAD(P)H-binding-protein MKLAIIGATGKTGNAVLEVARTRKITVTAVVRNAAKLTEPVSVIEKDIFALTPADLQGFDVVICAFASSKKSDYPRVNQHLVEILTGTDTRLIVVGSGATLFTDETRQKTVGDELPLIMRNSSRKHLQARQILQASRLNWTYMAPPMNYVPDGNATGSYQVGHDVLLYDRHGDSTISYADMALALVDEVEHPQNERQLMTVAWK >NZ_CP024635.1|WP_024525961.1|1624118_1625588_+|MFS-transporter MTETRRRIITFGLLLANIMAGFEGTIISTAMPTIVADLHGLSLMNWGFTIYFLFNAIGTPIWGRVADIIGRKRSFLFGIAIFVIGSLLEGLATNMIWLIIARGIMGIGAGGMLAIPFIIFSEIYPVDQRASVFGFTAAFGGISAVCGPLLGGWIIDVLNWHWVFFINIPIGIISILIVYFAFREESKERHAKIDVWGSLSLSIVILAFLLGVQLIGQAHTPAIWAIVFLLIAIVFGFLFVRIERNTHDPLIPLHLFKNKDMLLWDLMAFVGMGFYISFSVYIPMWAQGILLTSALAGGATQIPTAGLWYSGSRFGSYLSKKRNHHLTAVLALSFALIGTLVLLALGMTPNYAFFIIVGALLGIALGMLLTTSQVGVSEAVTSNDLAVATTLNRLFNTLGQTIMTAIYGLVFNIVVNHQATKLGLPSAKISGLTNSAVTSDSKAQLLIMHHVLFAGIKSVLIVAFVLLLVALVLEIGNIHLTRIKKQSVQ >NZ_CP024635.1|WP_021742822.1|1623294_1623954_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MATENERRQQMIRRITQTIVQNGFADLKMEKIAKLMGVSRTKMYQYYSSKTAIMTDVVARYLEFMATRSVPQSVDAKTSVTNFPQVILNLANLIASSSQKFRRDLAQADEELSEQFEESYASWCHQVRDFLTNGVTNGAFNSSLQPELFLIQMEATVAALMQPRVLTQHKVVTQNVLREYLQMVITQVVAPKYRAQINLDAVEPDLEHLTLKYQQTLTK >NZ_CP024635.1|WP_021742821.1|1622399_1623146_+|nitroreductase-family-protein MNPTLTTLFNHRSIRQFTPEKLTTDEVATLITAAQHAATSTFSQQYSVISVTDPAKLAVLGDITGHHWLEKAGHYFVMVADQYRNQQLVPPTATTTTNLHSLDKLLAGVFDAAIATEAIVTAGESLNLGSTIMGSILNDAARVIDLLDLPKLTFPVLGLAIGHPTEHPEQKPRLPQDLMHFTNGYQALTADNARLAAYDQVIHDYYQQRGTHQRDETFSHHIVSEMSRDPQQRAGILQALQQQGFLTK >NZ_CP024635.1|WP_024525963.1|1634192_1635014_-|AAC(3)-family-N-acetyltransferase MTNWQEREITRVTTAIDLYDLFDRLGLRATDSCLVHTSLSAFGYIPGGEQTLVTALKTTLSQGNIVMPAQSADYTDPREWLYPPVRQDLQAKVMAGMPAYDRTLTPCHFIGITPEYFRTLPDTQRSGHPTCSMTAWGRNAAQICATPTLDLPFGAQGPLQKLYDLNAKVVCLGTDFETATAIHLAESTIGRPVFEEQAPISVAGKPQWRSYQMVELEPYDDFNVMGAAFCQAHPEQVVQQPLGQHHQARAIGMRTLVDFAREYYREKDRREMS >NZ_CP024635.1|WP_024525964.1|1635474_1636962_+|glucose-6-phosphate-dehydrogenase MATERTALFMFFGGTGDLAYRKLYPSLFNLYRKGNLRTHFAVIGTSRQSIDDDKFRAAVKKSLADSGNRADSKEASDFISHFYYQSHDVTDTAHYSVLKELAEKLDKKYKLQGNRIFYLSMAPQFFGTIAQDLKTQGLMSTDKDAFNRLVIEKPFGRDFDSAKQLNDALSKSFEEEQIFRIDHYLGKEMIQNIEALRFGNTLVESLWNNRYIDNIQVTLSEKLGVEERASYYDNSGALRDMVQNHIMQIVSLLAMEQPVAFTDTDIRAEKVKALRSLRVYNVADAATNFVRGQYGSVNDQPDYRHEDNVPVDSTTETFVAGKLLFDNYRWSGTPFYVRTGKMLADKFTRVDVVFKRPLVDIFAFPQSQNTPLAANVLTIFVEPHAGFSLQLNAKTNDTGFQTEPIKLDYIVGAEKSKDTPEPYERLIHDVLKGDGTNFSSWPEVSYAWKFVDQIRRVWDLQEPNFPNYTPHSMGPAAAEELIQRDHREWIYRLNN >NZ_CP024635.1|WP_024525965.1|1637139_1638825_+|hypothetical-protein MTFSPLNVPILLLSTSLLTLTLANVQPVTAHATATSVSLAEKTTTSTATAQLFTSPVNQPLTLTADTYPLYNDEGQETTDTLPGKQQLTTTKILVDPLAGTTYYRVQENPDRFIKYDATTVNLKHTLTLNFSDPDGSTIKGPLMFRMTQGNDFEAIASDLKDQYAAVIDGYVFNRTTVDTANPYNTQFNSFYDKAGGSSADESHASIPSSPLPSLSTLTNEKIRLTSPNDYSLYDNGGNNLTTGKTTVAGNSYYSATGLYLFHQDSTNADNVFYQISPDAFIKGDDTTALTSPITFKYETSDGQSIKTDSMLDTGLVTGDDLNNLIKELQTWQPTIDGYTYQSVNPTADTLTFKYTPTSASSSSDTSSSTSSSSQTSSSTSTDSTASSDTHNSVVTSASSTRPDKSIVPKGAAVTAIRKIGVYRDVQFTKQNRRHWYQRQPQTKRPQFVVTGYARTKAGTLRYQIRDVNHHSATDGQRGYITANSKFVMPTYYQAAPKRIKVISPHGVNAYRQINLTQKKRHYRVGTTITVKAIKSYHLTTRLVLSNGTYVTANKILVAKK >NZ_CP024635.1|WP_024525966.1|1638908_1639346_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MEWQAKSFDELSREEFFDIAYERIRTFVMAQHRPYQEIDATDKVARHILGYQAGQLVAYARVFREAGHVTFGRVLTIPEQRGTGHGRQLMVQIEAEIRRNFAGEAISIEAQIDKQHFYEKFGYAAIGAVFDFNGTPHIRMDKAGL >NZ_CP024635.1|WP_024525967.1|1639430_1639859_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MPNAFRSIGLIARATAAMGNQLFQADDLNNNQFIFLMRIVETPGITQAELATQLHVDPSTCLRAVRKLIATQYVTRGTDAHDKKRRPLLATAKGQAMYPALEDYEQQILSVGTQGLSTGETALLEELLAKVARNVRDYQNQH >NZ_CP024635.1|WP_024525968.1|1640003_1641446_+|NADP-dependent-phosphogluconate-dehydrogenase MADQKANIGVVGMAVMGKNLALNIESRGYTVGIYNRSANKTEQVMKDHSEKKLVPSYTVEDFVKSLETPRRILLMVKAGKPTDAVIHELLPLLDKGDVLIDGGNTNFHDTMARNAELDKSGINFIGMGVSGGELGALQGPSLMPGGQKEAYDLVAPILEKIAAKAPQDGKPCVTYIGPNGAGHYVKMVHNGIEYGDEELIDESYNIMRNVAGISVDDMADIFKEWNKGELDSYLIEITADILTRKDDLGDDKNLPIVDAIKDRGNNKGTGKWSSEDALDVQVPQSVITESVYARYISMLKDERVKASKVLPAAEKQGKADIADKDKFVEEVRQALFFGKLMSYAQGFEQLRFASEANDWDLKFGELAQIWRGGCIIRAQFLQNITDAFDKDPKLSNLLFDDYFKDIAGKYQQSIRDVVAMAVQAGIPVPSLSAAITYYDSFRAEVLPANLLQAQRDYFGAHTYERNDREGNFHYSWYEEQ >NZ_CP024635.1|WP_024525970.1|1642465_1642729_-|hypothetical-protein MTENVVLAPPEALELAKHLDEWAKWRQTHDRTTADMDWDQFIAKSREKAQWQAGLATEIDHWESLHAIQLALTDNLMGTAHGGHTRQ >NZ_CP024635.1|WP_021741903.1|1642861_1643455_-|hypothetical-protein MSRGEDIAEISELVARERLFRARHNPAIADCYYPDATVATSWQQGPLSTFLNAESTEVDPRFAIVGNNSGAVVHLNGRRAYVELPTCTHMRMMVNGTLAQIESYRRLLYRVEKRTTDWKISQMTSINENDDLRPVIAGQDLHINPQDLVGLRPSYQFLAYVRQAAGGKISANLLGTDRPADVDQLYAEAENWLRQTK >NZ_CP024635.1|WP_024525971.1|1643469_1643781_-|DUF2316-family-protein MSLNAQQLVATRQELHANFILTGLTKEQVAADLQISLTKLDHLFTLTQQSLNDPWILRNYLLERVAATGQAPVPFSALSGDWHRHWFLDSEVIDRREMSAGDR >NZ_CP024635.1|WP_024525972.1|1643797_1644799_-|amidohydrolase MRLIATEEHIESAVVTAQIAAATGKSALPPLSAGLLGYMRDNLPTPAEMQDTTTDRLAYMDAQGIDLAVLSYGNSSPQNLTPEVAIRLCQLANDALAKQVASQPTRYAGLAVLPVGDPQAAAMELSRAVNELGLRGVLLKGNYQGKFFDDPFFFPIFEQAATLDVPIYFHPSFIPQTVTDHYFASDNWSDVVTGILSSAGYGWHMDVGIQVIRLIVSGIFDRLPELKIISGHWGELVPLFLERLDDELTAYTDLKHSFSDYYRHNVYVTPSGILSEPQLQFMLAEMGADHLMFSVDYPYKQPQTAGSFLSHAKLSPTQREQIAHGTAEQLFKL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP024635_3 | 1807598-1807683 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP024635_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP024635_3
>3.1|1807623|36|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder TGATCCTAACCAATCCCCCTTCTCCTTGATCCGTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP024635_3
The CRISPR arrays of NZ_CP024635_3 >merge|NZ_CP024635|3|1807598-1807683|CRISPRCasFinder AGTGTATTCCCCACAGGTGTGGGGGTGATCCTAACCAATCCCCCTTCTCCTTGATCCGTGTCAGGTATTCCCCACAGGTGTGGGGG >NZ_CP024635|3|3|1807598-1807683|CRISPRCasFinder AGTGTATTCCCCACAGGTGTGGGGG TGATCCTAACCAATCCCCCTTCTCCTTGATCCGTGT CAGGTATTCCCCACAGGTGTGGGGG
>NZ_CP024635.1|WP_011668940.1|1806932_1807463_+|MarR-family-transcriptional-regulator MSDLFKQETTASKLIEFGMLRHVADDIADRDDDHPERQMIFQGQGKILLALMQEDHLAQKELAERLNLTAQSTAEFVRKLEKKGFVTRMKSPTDQRVTVVSITDAGRKETTKNVQQIPPFLTILDDTELDQLAHILDKVNQHMYEEVNAANPTWFNKFHQVIMNRMLSQLHSGEDR >NZ_CP024635.1|WP_024526071.1|1805851_1806787_-|daunorubicin-resistance-protein-DrrA-family-ABC-transporter-ATP-binding-protein MQPSTAITVSHLTKTFGAKTVVDDLSFAVKPGEVFGLLGPNGAGKTTTLRMMTTLLKATSGTVTIFGHDVRQESRLARAMFGLTGQYASIDEDISARENLMIFSRLNGLSRTAAKQRTTELLEEFSLTASADRALSDFSGGMRRRLDLAVSLITRPGLIFLDEPTTGLDPRTRSQMWTTIRQLVAHGSTIVLTTQYLDEADALADRVAVIDHGKLIKLGTPTALKQQIGGATLTLSLAKATQGPLAQRLLAQALHAQPTLHGAQLTAHLENPNKITDLLVQLQAADISLANIAVQEPSLDDVFFALTTGKN >NZ_CP024635.1|WP_051345740.1|1805060_1805789_-|ABC-transporter-permease MAYRNLLKTLHNPDRFMDVIIQPVMFMLLFGYLFGGAIAGGVQAYLPTIVPGILIQTLLSAASGSGAQIREDLDSGVFDRFKSLPMAHIAPLAGQLFADILRLLVATVVSLLTGYAMGWRPTVGFGWIIVIAALAIFIGWTISWVFALFGLLAKSSSMVQSVSMMVMMLLSFLSNAFIPLKTLPHFMRVIADANPITYVITAIRQILAQGAWNNNAWIVLIFGIGIVVLFAPLTVWAYNHNN >NZ_CP024635.1|WP_024526069.1|1803988_1804903_+|prenyltransferase MPKWLNWSVFYELTEIYTAPLNVMWFILGAAIAQYHVHTVDWINVGLCLAVVFIFDLAVNVADNYYDYLHAHDREDYAQKTNPIGRLHLPAKGVFWLAWVLYAVAAIPGIVLVMRTGWPVAVFGVVGYLIGIFYTAGPHPINATPVSAAVVALAIAFWIQLTCVYVSIYGQQPLSWSIVGTTFLLCMPLTLIFFTVQLANDTSDRDEDIANHRYTLAVYLGKRRSVRLIQLFLIIGTLWTLVNVGLGLAPLVTALAVILLPVMWRGMRPFFAIQDKRKTFMAMVKSASLFFIAYPVLFALGTWL >NZ_CP024635.1|WP_024526068.1|1800770_1803887_+|YfhO-family-protein MRIAHHRWPLWVLYTLAFAVIAAISFGIFGVANRTLIWNMDGITQHYPLIREFHQLLMKSGLAGVTGWSWTFGLGADKLTTLAYYVLGDPFAYALALLPTRLLEVGYGWAIVLRLYAAGLAFLVLAKRYAFKPGSQLVGAVTYAFTGYSLMVGVHHPFFLLPMIWLPLLFVGVDRILQGKGWGFLAAVTGITILSNFYFAYILGLGSLIYAIIRYFSCRERGQLAVSWLVATARFLAAAVTGLLISGVLLLPSLLMMLKSTRTVSIFANGLWLYPLNYYLTLSNTILTTGNTLNYWAVLGITGFGFLGCVYTLVHWRQHRWLAITLLAVIVGLLFPAVAAFFNVLSTPSNRWILLAAVPFGLALMTLMDHLTALSLPDRWWLLGSSLGLLGVIYLSNGFTFSNPARDLLTYGLLLATTLLVVVALPRRWTFGGVGILIGLNLINNAWGYYDPNLSNQATQQLRASDATRYIQDYFDGAQSAVQSDHAFSRVSATRNYNLFRTVGNNMTMSHGLHGIMSYFSVQNGYVGQFSRDLGNAEYAMNAPMGQADGRTTLTQLLGVKYLFARTDQVTNHAALPYGYQAAEKIYPEQPVYGLSNGVGTQVLTTNLAFPLVYTQPQVLTIKAWHRLSLVDRERSLTQAAVTSQPVAGVKAAHYQSPKRTLAYTVTPDTIPVIDSTNKVIQYRLKQAAAGQKTGLNDKQLATYGTTIQTPQLTVDKNGLLSKQEVQQYGPMVQLSRNQAALQRVLTHNQQIIQRTTQVNQTGLHQLTSDAQGQPIKYTVTLKHPQQAQGTELYLELDGISSQQLTTKDQLQTADNTSVLGNTPRSNLTKLNAWRTAISNPDLGDYWVTAKTRNATKTFSQFGLDNLSDYEPKHQVLLNLGYSQQLRKTIDVTFNATKQLNIKSAKLIAVPFGASYDQQVHAVQRRGLQHTQIRDNSVTGELTTPQASVMTTSIPYSSGWRLTVDGRPAATTVVNEGFVGARLAAGTHRIRLTYRTPGLIGGLILTIFGLVVWLGEMGWWHWRHPQAKTRATKSKSDA >NZ_CP024635.1|WP_011668945.1|1799988_1800510_-|QueT-transporter-family-protein MNSKKRVSGVSDTRSMVLAALIAALYVVLTTVLSALSFGPFQIRLSEMFNHLVVFNKRYIAAVTLGVFIANIIASPFGFLDIATGTIQTLLALLVMYWLSKFVHNRIAQMAINTVVAVFFMCMIAWEIAIVSKTAFWPTFWANWLSIGWGELVSMIFGGVVIYLLSLKIDFTK >NZ_CP024635.1|WP_051345739.1|1798633_1799287_+|hypothetical-protein MLQSAIKKNKLLSISAMNICGKYPYFKTYVAVTLGDIHYAKINKVVYMKKFIRYTTANFTPVKTLRAPIRTQLLRQGTGFVMSSTHINQPTYSSALFVTLDNYIQTYSQARMTEINDKWMNADVDSDFAKLKPTDSVKVTKLVKTGTAYKIDYARPLKSFSDKKIGPHHYRLTIKQLGRQYQNYTPIDDTYDTAASWTNFTINTKPYFSGFADWGLD >NZ_CP024635.1|WP_024526065.1|1797624_1798548_-|IS30-family-transposase MSTTILSFQNRVVIETLHNEGRSLRYIANYLGFSKTTIFNELHRLNSEYQAGLAQTDFERKVSQRGRKSSLTKKLKHLIEGKIQVQKWSPEQVAHVVGIAYKTVYNWIDQGWLDIQLTDLPDHGIRRHRAKEKRGTFNHGRSIEERPHKVETRQEFGHFEADTVLSGKRKGQAVATFVERKSRLTIVKRLHGRDSQSMTQAVLELASQLQDKLKTLTVDHGKEFANYQTIERRTGTQVYFAHAYSPHERGSNENRNRVLRRFIPKGQAIEELSDHQLVQINWYLNSRPLKCLNWHTPIEIFLLNLRH >NZ_CP024635.1|WP_024526064.1|1797404_1797641_+|hypothetical-protein MKKVYQWGLVVFVALVGWGSGLTAPAAAKVRELPESVSYVRTKHAMDIGAREKTKSGYKPIYIRQIARNNLNEFNDVN >NZ_CP024635.1|WP_024526063.1|1795386_1797207_+|DUF2207-domain-containing-protein MRYRQGVWWLLGLILALIGGCQMTTINAAASYTIKPFRMNVDVTRRGDANVTETMTYHFDDDYHGVYNVQDLRGIQGGRLTGVSTRLNDGGMRPARAVDSGDSRYQVSQSNQRLKVKVYRAVSAGDRLQVTYRFHLTGVVTNYADTAELNWKLIGAGWDEPLHNVRLTIQLPTQPVKQLQAWTHGPLTGHTAVQSKTGRVVMTIPENPANTFVESHLLFPTQVTAANPNTRAQKRRATAQKQEAKLAADANAKRQQQRWLVVGGYVVLTVGLVALLAGSYHWMRHHPANRYPHPIPVDHFFDVPGVAPAVAVALLNFRSSDTDALSGELMMAASRHEIKLEPVREKKHDTVRLTKTGTVTNIFLQRAFERLGSLDSFTLRDLKQFAKKDKGSRVSHWFKEWQDQVDEAAEVYQDGDNIAIRQRLLGIAWGLTLVIAAWIGVSALVDPLVFKLSAGLGLVVLFGSWTYISRQRRQIDRNTAEGLVLRNEIGGFRRMLKDIGHFNTAKIGDLILWEQILPYAAAFGLAKQVADKLAIDFGKDVVAGALVAYPLYYPGAFNLSLGDMVQTSIAGAIDTSANFSSPSGGSGGFSGGSSGGFGGGSGGGAF >NZ_CP024635.1|WP_011668939.1|1807853_1809164_-|NCS2-family-permease MQRIANFFHFEELGTNYKTEILAGLTTFVSMAYILFVNPQVLGASGISQGAVFTATAFASAFGCMLMGILANYPIAISASLGINAFFAYSVVIGMKVPWQTALAGVFVASILFMILTAFKLREKVVDAIPRDLKMAISAGIGLFIAFIGLSQGGLVAADKSTIVSLGSLQVGSTWLTIFGLLVTVLLMSARVPGAIFIGMVANSILGLVTGLIPMPSHIVAAVPSISSTFMVGLTHVGSINSLQMIVVVLTFLLVTFFDTTGTLVGLAEQAGLVKNNKLPRIGKALMADSSTMVVGSLLGTSPMGAFVESSAGIAVGGRTGFTAIVTGILFIFGAFFSPLLAVVTDQVTAPALIIVGVLMAQSLKNIHWEKFEVAAPAFLIVLGMPLTYSISDGIALGFITYPLTMLAAKRGKEVGAMMYGLAVVFVLFLWILNAA >NZ_CP024635.1|WP_024526072.1|1809444_1810428_-|aldo/keto-reductase MTHELVTIGKTDVRTTPLGLGTNAVGGYNLFPNLKDDDGLNLVKAGLNRGIQLLDTAFVYGLGHSEELVGQAMHDFDRHSFTLATKGAQDFSSGEQVINNDPAFLTAQVDASLKRLNTDYLDIYYIHFPDKQTPKAEAVGALQRLREQGKIRAIGLSNFSLAQVKEANADGYVDVVEDEFSLLHRDHETDLMPYLADHQISFVPYFPLASGLLTGKYDQSVQFPADDIRSQISDFQEPRYSQALTAIDQVRPIAQAHQATVAQTILAWYMQNPLVSVVIPGAKRAAQVEANAQALEVTLTAAEYQTIDTAFAGFKATANGKSLADPD >NZ_CP024635.1|WP_024526073.1|1810570_1811170_+|SDR-family-oxidoreductase MTTYLIIGANRVGQLVARQLATESATVRLLHDGKETLPSDLATQVTELTGDLTQEATYTAALQDQPIIFSALTGMDVDLAFEALFDAQYHQRLTFQRFVMLSTAGVDQEVTGDLAYPGITNVAEYLKQQRYAAKLVDEAEFPYTILRPVTLADSPRRDPQIIKEGTAVPAGTVSRETVAQVAVSLLQAGGADYQSLAIC >NZ_CP024635.1|WP_011668936.1|1811246_1811612_+|hypothetical-protein MALQIDEQQLQAIRERMDEANQRAHFVIFQSVERESGKVLRLITDIDSFRAIQEQHQDDSDMVIIQDIVPITDTLARWAVAENMAAQQGDNAEVLADLERYTNEVLKENHQTVNPPESTDD >NZ_CP024635.1|WP_024526074.1|1811743_1812757_+|polysaccharide-deacetylase-family-protein MIKIGKVLGVLVATVALGVESVPVTGQAKSTNKTVTFGQLTNKNTHRLAAIRQAARQEILTTTKAKSSRVAAVYQVKLPTHMTKTATLTKSGLRMNLLKNSFKVKQITIPYAQLKGKVLNRYLPKANRTSTIKTSKLVALTFDDGPDPTLTPRLLKTLKKYHAHATFFEVGQSVSRYPKISRAVLAGGNEIGNHSWNHPNFNSIGTAQTVSQVTRTNRAIYQATGTLPQYVRPPYGNITAAEGRAIEQPIIRWSVDSRDWAYLNSTKDINEVMHDTHGGDIILMHDIHAQSVAAAPTIIKRLQAKGYKLVTVSQLLNSQALPGLQYFGAHDYRTVGK >NZ_CP024635.1|WP_024526075.1|1812859_1814002_-|ArgE/DapE-family-deacylase MEDSEQIQILQHLISINSVNDHEADVAAYIQQLFADHGITSQIIPYADGRANIIAEIGDTTSDQVFALAGHLDTVATGDVADWKFDPFSAHIVDNQLYGRGAADMKSGLAAMVITLINLADQQTPLTGRLRFIGTVGEENGAMGSRMLTEKGVADDLTAMVIGEPTGGNLVYAHNGSLNYHVYSRGVGAHSSMPEKGINAITNLIKYVTAEATAFDDAPVSPELGPLVHSVTVFNGGEQVNSIPAKAELQGNIRPIPEFDNTAVIHRLHETVDRLNQEPGVDLALHVDYSFKPIISAKDSPLVQTTKAIADQEFGHAIDLQVIHGATDASEFTKSSHDFPVIVYGAGKWDAAHALNESVDLDEFRHVQHVYQQLVEKFLS >NZ_CP024635.1|WP_024526076.1|1814296_1817902_+|PD-(D/E)XK-nuclease-family-protein MSLQFILGSAGQDHRTPMVTALAQQVTAHPTDQSYYLVPNHIKFETEVDVLSALKEQIAPEQALFAQTQVQVFSFTRLAWFFMKNEPIYQLPRISPAGLNMLIYQIIQTHADELTIFRGEVDRPGFVSQLATQLAEFKVGQVTAADLMSAIEQLDTTNTDLQAKLHDLMIIYEAFETQMMGKFVENTDLLNQLATYLEQQVDLQHAHFYLEGFSQLSAQERQLVAILIQRSASVTVALNLDHGYPQKLPDKTTLFFQSAKLYQQLYMVAQANRVPVLIDQQAKTARVSADLQALDTYWQASQTLSPQPSAVEKPTHIQIVQAANRYVEVSRVATQIRQLVATGNYRYRDFLVLTRHLDAYQTVIDPIFQAQAVPYFDDADIRMADHPFVELLNALFDVQRRNYRYADVFRVLKSELLLPRDADGELMAVPAYRQALALTENFVLKNGLEGQHWWTQDKDWVYNRFAVGDGGVQTTRDDQISAQINRIRQFVKQILPPFFARLKAAATYTEAAAVLYQFVTNAGVSERLIAWRDQAIAAGDLTKAGQPEQTWAAFCDILDEFHTILGDLPTVLPDFQALLQAGFAGAKFSQIPSTLDQVVISESGIVQANNRKITFIMGATADTMPDNQIPTTLLADNDRQDLSARLQQVDDGTYLRDDAATQLAGEPYLNYLAFMSGSERLIFSYPAMSDDARSGLQLSPYVARIKDYFGLSIDIAAASPVAENEAILPFVGTRRTTLRHLVQASHDSQLREVPLSRSWLYVLNLLRTDPTYGELTTKLLGSLSYRNVPTQLTPDIVTQLYGTKINTSISKLEEYYANPYAYFLKYGLNLQERDVFALSPASTGEFFHATLDGLMKLVNDQKLNLAALDDQQLREMTDEVMAKLLDTTENPQFAILESSHRMGYIRQQLMKTMRQMAKTLQEQSKRTKLRPKRTEVQFGLGDERGLAALSFDVGKRRQVTVRGRIDRLDAVQVKDKTYLGIVDYKSSEHKFSYQEAYYGRAMQMLTYLDAVKQNLPTLLDTPTAKDAELAGAVYLHLQNPILKAAEVLGEDPLTSLLKAEQYQGLLLDDPDLLTNLDTLFGTPDYSGSSLLFRGLRRTKTGKITSYGKLLVNPNELDLLLTHTERLIKRAATDIFDGRVDLAPFREQNRTALQYSPYKSVMQFDPLLKENNYRDLPSLNKDDVMTRIAAEQEQEATDEHEI >NZ_CP024635.1|WP_024526077.1|1817885_1821674_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MSTKFSFTPSQDQAIHQTGNNLLVSASAGSGKTRVLVQRVIERLKTGVGIDQILIVTFTKAAAAEMRERIQTALRQELAVSQGDSVQQQFYLRQLNQLPVADISTLDAFCLRLLQRYYYVIDLDPVFRLLADETENGLLRDEVWADLREDLYANDDSGLFARLTENFSGDRNDQGLADLVQQTYTFANATPNPTAWLAELPQPYQLDSDQLMTTSFYQQRLRPFFQSQLRQLQADLTSAQALANQAGLDKQAAHVTAVLENVAAVQQLVTGDSWNALRAAIQDFAWGRMPAVRKTNEDYPIYNELKTTYYDPARKQLDSLKKTYLIQDEQQAMTTIRRSGELVGELSRVVTAFRTAYRQEKQRRHVLDFADVEHAALAILTQDSDQSRQVAAQLRHQFAEIMVDEYQDTNGLQEAILTAIAEPAPQGNLFMVGDVKQSIYRFRQADPTLFMTKTDQYAADAAAGELIVLAENFRSMKNVDDFTNLIFKQLMDRELGEIDYTGAAQLKFGASYYPDTVTSTAELLVYLTEDAPESAGDADSEAMDATFQVDNKHQGEVLMVGQKIQQLIADQTPIYDREAKQVRPMTYGDITLLTPTRTNNLIITDELRRLGIPVIVNDAQNYFKTTEIQIMMALLQIIDNPYQDIPLAAVLRSPIVGLNENELALLRINQRTGDYYQAVLHFQRSFVPNQASDFQQAVYQKVSHFLEQLQEFRDIAQQDELVTLIWRIYQETGFLDYVGGMPAGEQRQANLHALYERAKSYEQSSFKGLFQFVRFVERLQERDDDLAGAPVQAADDAVSVMTIHGSKGLEFPVVFIMDASRQFNKQDQQGNYVMSGKTGIGIDYLDPDSRVKAPSLQKLVTAQAISRASLAEEMRKLYVALTRAESRVYIVGSHKTQEAAISAWEQAYQSPDLVLNATLREKNTLANYLDWIGMCLVRDPKFAAELRQGTTTFSGLAGDPATFAVHFVTAHDLGPTQGVNETAVDWLQAASETAAKVTTPPVDTEQLHQIMDFRYPHQAATATTAYQSVSEAKRLFEDPDNATIGEYQASATGQVGGHRFVTHDFARPDFLQTVREPLATEIGSATHLVLQQLDVTVTPTLDRVQGVIDQLVADQVLTAEVAQRIQPELILRFFSSSVGQQVLAAPDQLHREVPFSLLMPARSLFQDFQETDSQVLVHGIIDGYLTTPAGVILFDYKTDHVNAQNQAASIEKIVERYGGQVNLYAAALKQMTGQPIVGQYLYLLAIGELVAVPEQQVRRLSE >NZ_CP024635.1|WP_035465953.1|1821765_1822671_-|hypothetical-protein MTIITRIIKGCLCLLALGTVTVGSLSGRAQTEKPSALVKVGDYRASTDFLNLSAYYQTTRPVTVKVAYVSTYKSQHTIMQKLTLPAGLTVAGNLTTTKHGSYLVPSLQLYLARLSYPALQNSAKANYTLDPGTSAYSPQATISDTTKLRAFKRVAAPDYMPGYSHGDLYIGGAKAALSPVEPTTKSIRITPDGYVEVLKYDTKANAGLGFYQKPVSLAKIVKTRFHDPNRTLYLNHPLASVKTKAITQNGQTRYRLTLKNLHTPQHIAGDPETGTAGTFDSLYSIGGTTYYTFIGYDGVSN >NZ_CP024635.1|WP_011668833.1|1823085_1823847_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MGWDLQFTHYLDDMQTYRSRDQTAKALILLGYVERDFIRFYRAGRIAEGIQFAKENLARSRLLLNELPPQQKRAQLHGLVDILAFEGVQNHAFIYEFIQLRDDYHRQIKTLPVTTARYVPWIIEIVQDFGNLAAKDGLPYDDHLESTLDIIYYVSAHLRDKLTVKQVVDHVNQRCNPVGVQRAFSDEMQMSIRDYINVKKIREAQRALLTTTVSVKQIAQELGFYDTSDFSKRFKREIGQTPLEYRQINSQKD |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP024635_4 | 1947099-1947662 | TypeII-A |
NA
Consensus repeat of NZ_CP024635_4
|
8 spacers
spacers of NZ_CP024635_4
>4.1|1947135|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGGGCTGGCTGGATGTTACTAAGTTGCAT >4.2|1947201|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACCGAGGCCGAAATTTCGGATGAATTGT >4.3|1947267|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCACTATCGGAACCTTCGCCCCTAAGAG >4.4|1947333|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAAGCCGGTATTAAGCTTCGGCGCAGTTC >4.5|1947399|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAGGTGAATTTTTAGGCGCTCAGGGGTA >4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATAGATGTTGATGATTTGCCGGAAATTTT >4.7|1947531|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCAGCCGGGACAGTCTCGGTTGCTCAGCT >4.8|1947597|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGGCAAGCCATTCATTGCGGTGGTCGCCA |
csn2,cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP024635_4
The CRISPR arrays of NZ_CP024635_4 >merge|NZ_CP024635|4|1947099-1947662|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAACAAGGGCTGGCTGGATGTTACTAAGTTGCATGCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAACTAACCGAGGCCGAAATTTCGGATGAATTGTGCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAACAAGCACTATCGGAACCTTCGCCCCTAAGAGGCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAACTAAAGCCGGTATTAAGCTTCGGCGCAGTTCGCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAACAAAAGGTGAATTTTTAGGCGCTCAGGGGTAGCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAACGATAGATGTTGATGATTTGCCGGAAATTTTGCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAACGCCAGCCGGGACAGTCTCGGTTGCTCAGCTGCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAACTAGGCAAGCCATTCATTGCGGTGGTCGCCAGCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGATCAAGAAT >NZ_CP024635|4|1|1947099-1947662|PILER-CR GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC AAGGGCTGGCTGGATGTTACTAAGTTGCAT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC TAACCGAGGCCGAAATTTCGGATGAATTGT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC AAGCACTATCGGAACCTTCGCCCCTAAGAG GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC TAAAGCCGGTATTAAGCTTCGGCGCAGTTC GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC AAAAGGTGAATTTTTAGGCGCTCAGGGGTA GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC GATAGATGTTGATGATTTGCCGGAAATTTT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC GCCAGCCGGGACAGTCTCGGTTGCTCAGCT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC TAGGCAAGCCATTCATTGCGGTGGTCGCCA GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGATCAAGAAT >NZ_CP024635|4|4|1947099-1947662|CRISPRCasFinder GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC AAGGGCTGGCTGGATGTTACTAAGTTGCAT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC TAACCGAGGCCGAAATTTCGGATGAATTGT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC AAGCACTATCGGAACCTTCGCCCCTAAGAG GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC TAAAGCCGGTATTAAGCTTCGGCGCAGTTC GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC AAAAGGTGAATTTTTAGGCGCTCAGGGGTA GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC GATAGATGTTGATGATTTGCCGGAAATTTT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC GCCAGCCGGGACAGTCTCGGTTGCTCAGCT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC TAGGCAAGCCATTCATTGCGGTGGTCGCCA GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGATCAAGAAT >NZ_CP024635|4|1|1947099-1947662|CRT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC AAGGGCTGGCTGGATGTTACTAAGTTGCAT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC TAACCGAGGCCGAAATTTCGGATGAATTGT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC AAGCACTATCGGAACCTTCGCCCCTAAGAG GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC TAAAGCCGGTATTAAGCTTCGGCGCAGTTC GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC AAAAGGTGAATTTTTAGGCGCTCAGGGGTA GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC GATAGATGTTGATGATTTGCCGGAAATTTT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC GCCAGCCGGGACAGTCTCGGTTGCTCAGCT GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGGTTAAGAAC TAGGCAAGCCATTCATTGCGGTGGTCGCCA GCTTTAGAATCTTGGTAAATCAATAGGATCAAGAAT
>NZ_CP024635.1|WP_024526167.1|1946398_1947064_+|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNLTYYGFQPFKITPGKVVVLATGSPHIYQEIILGLQDRTDTVKLSDDNFTTVTVGKGAQWYGDPLLNVDLNALFQRKLQTRLLKVLADDQTVGLVDGLQSLLSQLLADSYLMDVPLELPETPELAKLIKFSGIQLVPDLRDDVYGILETLVKTLIELNDHRMVVLTNVGHYLQVGQLQSLVRFMANIDLPILLIEFSSTKQSDYFRNCDYHYIDSDFVLW >NZ_CP024635.1|WP_024526166.1|1946096_1946402_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPMETSQDRRHYRHFRKVLLQEGFFMMQYSVYVRVCPNSAGAAAIEKRIAALAPANGLVQSVMLTEKQYQAMHFIAGQPNQELLNSAERTVMI >NZ_CP024635.1|WP_024526165.1|1945213_1946119_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRTLLISQHAKISLTSGNLVIQTDSDRYHTPIRDINVLLIQSLQVVITTAAVAALAEAHAKIIFTGRDGQPICETAECYPHARTAALVRQQVGWSEGRIENLWTRVVAAKIQNQIAVGNLLEVSTMDLSSELEKLELNDATNREAVVARQYFPLIFGKDFSRSDLVPINAALNYGYSILLSLVNRIIVSRGYLTCFGIHHDNAGNAFNLASDLMEPFRPIIDYWVAQQKILDLTPDVKFGLARLFELEMRYNGKKEVLSNVVEKVIVQCLKYLSEETETIRIEVDVPDEVSNYAINDYV >NZ_CP024635.1|WP_024526163.1|1938725_1940369_-|peptide-ABC-transporter-substrate-binding-protein MQRKGTILTVAALSLLTLAGCGSQSSSSNNSGKYAAKQVLNWTESSELATTDLAQATDTLSFNVLQNTQEGLYRLNSKGTPAKALATSTKVTNGGKTYTFNLRHGVKWSNGDPVTAKDFVYSWQRTVSPKTASQDAFYLYQVKNAEAVNKGKKSLSALGIKATGKYTLTVNLTKPVSYFKKLLAWPLFYPVNQNAVNKYGKKYGTSSSTTVYNGPYRLTKWNGTSKSWTLAKNKTYWDKKAVHLTKINEQVTESTTTSYNLYNAKKVDETLLSGQQIKNNKNSKDFVKRLPTGSQRLDLNEKKVSAFKNVNIRKALSLAINRTQLVNDVLQDGSVASKGFVPSGMGNNPKTGEAFNQEASVKSAVSYNVKQAKTLLAKGLKQAGDKKLNVTLSVSDTDSSKQTAEFIQSSLEKLPNVTVTIKTVPYVQLITQQNNGNYELTLAGWQSVFADPINFLDVFEADSSYNTTGWKNSTYDKLLDEAENVYGNQPEKRWGKLVAAEQVLMKNQGTIPLYQAAKSQLLRSNVKSVVYNPAGVPYDWKTTYIAK >NZ_CP024635.1|WP_035465971.1|1938005_1938536_+|hypothetical-protein MSCIKRSGDTMKKGLKGIVLAAASLGVFAMASSTTANAASKTTLPKSYRGTWYIYGGSDTEDKVTAYAVAKLNLTNKKMGYKVYTTTKKQLTSLKWQLSAAFPTIYSKKVNNKKKVTYRVKARIDDSVTLMTLGKTKVNVKVLGKKVTALRLRVDGTNVYAFRKPLRTHALSDITY >NZ_CP024635.1|WP_024526161.1|1937530_1938019_+|hypothetical-protein MRKQLLVGVITGLAAFTLAGMGHETAQAATLPADYQGDWVAYVGKTKHHHVNYYYTARLTLADTSLATQLNVTKNANLSDLTTQVTLQSAVTYQLKTTKKHQVSYKVRTATDNASLGKFSLTKVKVKGQKTTALAFDDGEDDVVYAFRSLSKTHAWGDDVLY >NZ_CP024635.1|WP_099963079.1|1936297_1937296_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MAATIKDIAKLAGVSPATVSRVLANKTAFFSADTAAKVQTAATTLGYQKNTAAAELVTQQSHVIAAIVNSTKTNFANHIIEGIQDAAYRQGLNVIILYAGDADPEQQRRALTTVIERPVRGILLLSVDLSADNLTYLQAAQIPYCFLSISFEEDQLPFITSDDWQVGYQGTQALLAQGHRQIGLAAVDSVHAHTGKLRLAGYTQALTEAGITPDPAWIQPGDYSYVAGQAAMRAYGQAPQVTAVLAGSDMAAIGVLNQARDFGLTVPHDLSIMAIDGTELCELVQPQLSSVSQSFYDMGVAGVEQLTMAQQQPPKITPITVVTRESVRFIES >NZ_CP024635.1|WP_024526159.1|1934720_1936103_-|SLC45-family-MFS-transporter MAQTTPIESTDATPAATSHNALPKISLKTIFAMTFGFFGVNMAFSLQSSQMGRIFQTIGADPTKLGFFFLLPPLAGMIVQPLVGKYSDMTWNRFGRRMPYLLIGAPIAALVMILLPNAGSFGFGYASLAALWFGAVAILFMDLSSNVCMQPFKMIIGDMVNEDQKDLAWSWQQSFSNLGGVLATIFPFVLTWFGVSNVAPKGTVPMSVRLAFYIGAGILLLTSLYTIISVKEYDPETYNRYHHVKTQAKQKSASLWHLVKTAPRAFWEVSFVQLFDWFAFQYLWTYGTGAIAANVWHTADASSAGYQAAGNWFGILSCIQALAAVVWGFAVLSRTKPAQRKLWFRISLIMGGAGFIWIFFIHSQYLLILPFCLIGICYLTMQTQALSLFTESLNGENEGAYLGLFNCGICLPQIIASLLSFAIFPAIGQSMPGMLVIAGVALLLGAVAVSVIHPKLSANL >NZ_CP024635.1|WP_024526158.1|1933026_1934700_-|alpha-glucosidase MTKKWWQNAVVYQVYPRSYQDSNGDGIGDLAGLTQRLPYIKRLGADVIWLNPIYKSPDKDNGYDISDYQSIQPAYGTMADFDHLLDSAHRQGLKLLMDLVVNHTSDQHDWFQQSRQSKDNPYADYYIWRDPVDGHEPNNWGSYFSGSAWTFEPKRNQYYLHLFAPGQPDLNWENPQVRQEVWNLMRFWLDKGVDGFRMDVINLISKPAGLPDAPQAPGAAYGDSQPIVSDGPKLNDYLREMNDEVLSHYDVMTVGEMPGSTPKDAITYTGLNANELNMVFQFEHVGLSPNPDARLGKWNAVPVKLTELKDSLSRWQTALDGKGWNSLYWNNHDQPRAVSRFGNDTPEFRERSAKMLATTLHMMQGTPYVYEGEELGMTNVHYTQLDQYEDLESLNAYHELVDDQHIVDQPTMLTYLSHISRDNARTPMHWDDSTNAGFTTGQPWFALNPNYPTINAADQLDQDDSVFNYYRRLIALRHSSDLIVLGSYEELDPEDDQVFAYKRHYQGQTLLVMSNFTDQTVTRDYGQAEASERLIGNYADDQGTTLRPYETKVYVFK >NZ_CP024635.1|WP_024526157.1|1931923_1932868_-|NADP-dependent-oxidoreductase MKTIAIDKYGTAKEFYAAEMPQPVPQADEVLVKVHAFSINPMDIAGRMGALGAPFTDLWSFPLVLGWDFAGTVAQVGDQVTGFAVGDAVFGSVASAHAANNGTYGEYVAAGTKELAHIPAGLSFDQAAALPIAGMTAYYGMKHNLNLQAGQKILIQGGAGGVGLFAVQIAKAFGAHVATTASENHREMLEQLGADEVIDYHQTSPAEVLHDYDAVFDTVGDIETGLKVLKADGQLATIAGQPTPEQQHDQQKKVAFQFTNGSSADLTALADLVTSGKIKLTLDVHDFTVENVIAAHETIEAHHTTGKIVIHVTD >NZ_CP024635.1|WP_024526168.1|1948317_1949697_+|MFS-transporter MSKMQLWKQRFFYGATDMAGNLIWQIVGLYLLFYYTTVMGISPAFAGTLFFVVRIIDAFDGVVYGFLIDHTHSKFGKARPYFLWFGIPLGILTMLLFFNPSFGGNKVIQLAWVSVVYTLFSLVYSGANTPITAILPSLTKDPDERTNLASARMVMTNIGTAVIGAITLPMVAQLGGKNAEKGWMIWGVIIGIAIIALFLGAFANLREKDDIVAETEDAPEIKGHLSVKDSLKGAAKNKPWLILSASFILLQTFWMMRLQTAVYYLTYVSHQPALVGAFNGLVIVAVIGNVSVPFLSKFMKHRNVMILAMMTFAFGELLMAFKNIPLLFIGNIIALVAMGAAFSIAFVMIADTVEYSRSELHIDEPGILSAVPMVGAKLGMGLAGLISGWLLSWGGFNAAAKVQGAKAVTAIATNFIWVPVVLALVIGGILYLWYQLDESKIASAKAAKEAEKKLSEEDA >NZ_CP024635.1|WP_024526169.1|1949759_1950812_+|alpha/beta-hydrolase-fold-domain-containing-protein MLNDTTTKQSLGYSDELRRLQGIGVTDIADGVTSWVKERDPLHTFEPLVWETVAGIEANPQLPTDLFSLRQGTETSGQRDLTTTAMKVEMQQIVAMNRRVRVIRIAREDHLNTDKAYIYFHGGAYYGGTPEDVLLALKFVAEQANCVVYNVDYALAPEQPYPAGILDGLAVVAAMTAEYAHISLGGDSAGASIALGVSQLCKSMGICEIASHVLFYPTVIQGSELPGPLWDDNQITIVSEQRAALHRSYQLFEQLDAIMSGYYVADQAVDLTAPLLSPLLADPTTFHNVTLLVGEYDPFRLQGEAFIKRVGHANGDANYFRYGGISHAFLNFTGNVPAVEDALMTAAKFI >NZ_CP024635.1|WP_024526170.1|1950844_1953055_+|glycoside-hydrolase-family-65-protein MLTLQDYHLTLHDVANHQPAYLETVFSLANGHFGVRANDPITGNPIAGTLINGFYETAPITYGEAGVGYAKAHQTILNLPDFRHINVATTTGHSFTSSERTKVDLDLATGELTEHYTLQTRQGETIAMSVQSVIGQTQTAFWAVNYGFLAGNYAGGLVVNKTIAVPAEAESLPSADPRKTRLAGLPICETTFMAKDLQQYHVKTRQTKQSVTIYLGMLTTPGSLLRQPVDLSDHTTHHLSYEVYVGEMGQQNTIDPALPFPATALTALMTDSRDFWQDVWQRSEVTVGGNDELDLAIHYNLFQLNQAAGRDGRTNIAAKGLSGSGYEGHYFWDTEMYMLPYFIYTNQPMARQLLVYRYQTLPQARQRARALGVDQGALFAWRTINGEEASAYFPAGTAQYHIDADIAYAVGKYYEITRDIDFVKQCGFEMVLETAHFWEAFGSWHQVGTSQWFEFHTVTGPDEYTALVNNNYYTNRLAKHNFELVTYLAQEILKVDPNGLTKFGIDATDIDAFQNLAEHVYLPYSAEQQINAQDDSFLSKPRWPVAQSTPENFPLLLHYHPLTIYRYQVAKQADTLLADYLFPEDLSPEQLQREYHYYEGVTTHDSSLSRSIFSILAARMGDVEKGYRYFMDTAQMDLVNLQKNTADGLHLANLGGSWLALVAGFSGFYVQDEVVHFTNHLPSELTQLTYRMKIAESVLEIKLTATETTVVVISGPIPTYGVSVNGQLISLAKKVR >NZ_CP024635.1|WP_024526171.1|1953940_1954774_+|histidine-phosphatase-family-protein MKLTKVVSLLAVTAGALALVAVPSNAQAKTKKKAAVKPVTIYLTRHGETTGNVMGRVQGWSDFPLTSNGIAVANNLGRGLKGKTFKVAYAGNLTRQQVTAKQALKYSGNKKVKVNVSKYLREGGYGSFEGDSIAADNALIAGVYGFKSGDEMMAKQGKDYWNLLQDAYYKLDQENSQKTNLVASDRAESSKQVQKRMAKELLTIAKATQKRGGGNALVVSSGMSINEYLSTMAGSKYTGAPLKNAAVTKLVYKHGKLTVSGPIGSMTYVDKGAKLAK >NZ_CP024635.1|WP_024526172.1|1954847_1955378_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MAVMLKLLASEEVAAFWQLAFRDPQAAWTQWNGPYFHDHVPTYAEFVTGPGHEAYVDRPWRQVIWVDDQMVGMVFAYYDDAPLNRWLDVGISIYDQHRWQRGIGRTALSQWIDWLWTQTPLPHIGLTTWSGNQRMCHLAESLGLREEARVRQVRYWQGRYWDSVKYGVLREEWHRR >NZ_CP024635.1|WP_024526173.1|1955382_1955697_-|multidrug-efflux-SMR-transporter MAWLFLIGAGLSEMLGVTFMNWALHRKTWWLWVLMILAFTLSFGGLELALKTLPMGTAYAIWTGIGAAGGVLTGMLFFGESKDWRKLVWVAVILGATLGLKLIS >NZ_CP024635.1|WP_024526174.1|1955698_1956025_-|multidrug-resistance-protein-SMR MWKHWLTVVLGAVFEVSWVVGFKHATTLWAWLITGVAVYLSFYFLIRASRSIPAGTAYAVFVGLGTLGTTSVGMFVFGEPISWLKIALILLLLAGIGGLQWTTTKEAN >NZ_CP024635.1|WP_024526175.1|1956335_1957457_+|glycerol-dehydrogenase MTQMFGSPASYVQGKDVLFDSIAYLEKFGHKALLMADSVVYQIIGDRFKAYLDDHHIEVHKVIFRGEASPEEIDRITGIGREFGADVIIGLGGGKTLDSAKAIADNLQLPVAILPSLASTDAPCSRLSVIYHADGSFKEYRFYDKNPDLVLVDTRLVAGAPARLLASGIADALATNVEAQAVAKGDNATMLGAKQTLVGNAIAQKCEDTLFAYGHLALESVKQHAVTPALNKIVEANTLMSGVGFESGGLAAAHAIHDGLTALDGPIHELTHGEKVAYGTLTQLFLEGRSEAEFDRYLAFDLSLGLPTTLADLKIPDVTDEDLLKVGQQATAPADTMDRMPFKVTPDGVAQAMRGVDAYSRAYQARHAKQLKD >NZ_CP024635.1|WP_024526176.1|1957512_1957935_-|hypothetical-protein MQRKYRDYFAYLKTINPDPNASFIAVSPANVQKTDPDKFATLTARAGRRWGVILFHALYGNKTTKKTNVPYAVVHEDSFARDWDGIDRAEFDEDVAILVQCQMLQVKEVQGLTRLIMRYPEPLASLADLRIKGIDQINPG >NZ_CP024635.1|WP_024526177.1|1958293_1959169_+|ROK-family-protein MQLGSIEAGGTKFVCAIGNEDYRTQDKVRIPTTTPEETLSQTIAYFKQFPDLKAIAISSFGPIELRHNSPKYGYITNTPKVGWANTDFVGRLKQELDVPMYWTSDVNGSAYGEYVMSTLFNENINSLVYFTIGTGVGAGAIIDGHFVGSLGHPEMGHVRLKRHPDDLDFPGICPFHGDCLEGLVSGPTFDARLGKPGKDVPLTDHVWDILAYYVAQAALQVTLMMRPDKIVFGGGVVSEAFLDKVRHEFDQLLNHYVDVGKLTDYIVMPAVKDNGSATLGDFALALNEYNK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP024635_2 | 2.2|1633796|33|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder | 1633796-1633828 | 33 | NZ_CP024635.1 | 271410-271442 | 2 | 0.939 |
| NZ_CP024635_2 | 2.2|1633796|33|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder | 1633796-1633828 | 33 | NZ_CP024635.1 | 2461137-2461169 | 2 | 0.939 |
1. spacer 2.2|1633796|33|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder matches to position: 271410-271442, mismatch: 2, identity: 0.939
cgccaaacaatcaatgtgctaacacttgtcatg CRISPR spacer cgccagacaatcaatgtgctaacgcttgtcatg Protospacer *****.*****************.*********
2. spacer 2.2|1633796|33|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder matches to position: 2461137-2461169, mismatch: 2, identity: 0.939
cgccaaacaatcaatgtgctaacacttgtcatg CRISPR spacer cgccagacaatcaatgtgctaacgcttgtcatg Protospacer *****.*****************.*********
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP024635_4 | 4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947465-1947494 | 30 | NC_027990 | Lactobacillus phage LBR48, complete genome | 41893-41922 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP024635_1 | 1.2|523944|35|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder | 523944-523978 | 35 | MN830254 | Lactobacillus phage JNU_P2, complete genome | 28930-28964 | 2 | 0.943 |
| NZ_CP024635_1 | 1.2|523944|35|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder | 523944-523978 | 35 | MN830255 | Lactobacillus phage JNU_P4, complete genome | 15453-15487 | 2 | 0.943 |
| NZ_CP024635_4 | 4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947465-1947494 | 30 | MN855976 | Siphoviridae sp. isolate 68, complete genome | 21283-21312 | 6 | 0.8 |
| NZ_CP024635_4 | 4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947465-1947494 | 30 | MN855636 | Bacteriophage sp. isolate 140, complete genome | 40739-40768 | 6 | 0.8 |
| NZ_CP024635_4 | 4.7|1947531|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947531-1947560 | 30 | NZ_CP018231 | Rhizobium leguminosarum strain Vaf-108 plasmid unnamed3 | 297031-297060 | 6 | 0.8 |
| NZ_CP024635_4 | 4.7|1947531|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947531-1947560 | 30 | NZ_CP016292 | Rhizobium leguminosarum strain Vaf10 plasmid unnamed4, complete sequence | 32502-32531 | 6 | 0.8 |
| NZ_CP024635_4 | 4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947465-1947494 | 30 | NC_047764 | Lactobacillus phage P1, complete genome | 56694-56723 | 7 | 0.767 |
| NZ_CP024635_4 | 4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947465-1947494 | 30 | KY381600 | Lactobacillus phage P2, complete genome | 60266-60295 | 7 | 0.767 |
| NZ_CP024635_4 | 4.2|1947201|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947201-1947230 | 30 | NZ_CP034939 | Pectobacterium odoriferum strain JK2.1 plasmid p.Jk2_1, complete sequence | 10058-10087 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP024635_4 | 4.3|1947267|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947267-1947296 | 30 | NZ_MF600313 | Mycolicibacterium sp. CBMA 213 plasmid pCBMA213_1, complete sequence | 218144-218173 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP024635_4 | 4.4|1947333|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947333-1947362 | 30 | NC_017963 | Enterococcus faecium DO plasmid 3, complete sequence | 222879-222908 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP024635_4 | 4.5|1947399|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1947399-1947428 | 30 | MN694651 | Marine virus AFVG_250M473, complete genome | 13078-13107 | 9 | 0.7 |
1. spacer 4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_027990 (Lactobacillus phage LBR48, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatagatgttgatgatttgccggaaatttt CRISPR spacer gatagatgttgatgatttgccggaaatttt Protospacer ******************************
2. spacer 1.2|523944|35|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder matches to MN830254 (Lactobacillus phage JNU_P2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tagattcctgccggcaatttgatactttcgttagg CRISPR spacer tagattcctgccggcaatttgatactttcgttatt Protospacer *********************************
3. spacer 1.2|523944|35|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder matches to MN830255 (Lactobacillus phage JNU_P4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tagattcctgccggcaatttgatactttcgttagg CRISPR spacer tagattcctgccggcaatttgatactttcgttatt Protospacer *********************************
4. spacer 4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855976 (Siphoviridae sp. isolate 68, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gatagatgttgatgatttgccggaaatttt CRISPR spacer aattgatgttgaggatttgccggaagtgat Protospacer .** ******** ************.* *
5. spacer 4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855636 (Bacteriophage sp. isolate 140, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gatagatgttgatgatttgccggaaatttt CRISPR spacer ggttaacgttgatgatttaccggatatttt Protospacer *.* .*.***********.***** *****
6. spacer 4.7|1947531|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018231 (Rhizobium leguminosarum strain Vaf-108 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
-gccagccgggacagtctcggttgctcagct CRISPR spacer cacccg-cgggacagtctcggttacacagcc Protospacer .** * ****************.* ****.
7. spacer 4.7|1947531|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016292 (Rhizobium leguminosarum strain Vaf10 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
-gccagccgggacagtctcggttgctcagct CRISPR spacer cacccg-cgggacagtctcggttacacagcc Protospacer .** * ****************.* ****.
8. spacer 4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047764 (Lactobacillus phage P1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatagatgttgatgatttgccggaaatttt CRISPR spacer tattgatgttgatgatttgccgtataagtc Protospacer ** ****************** * * *.
9. spacer 4.6|1947465|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY381600 (Lactobacillus phage P2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatagatgttgatgatttgccggaaatttt CRISPR spacer tattgatgttgatgatttgccgtataagtc Protospacer ** ****************** * * *.
10. spacer 4.2|1947201|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034939 (Pectobacterium odoriferum strain JK2.1 plasmid p.Jk2_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taaccgaggccgaaatttcggatgaattgt CRISPR spacer tgtaccgtgccgaaatttcggaggaattgc Protospacer *. * . ************** ******.
11. spacer 4.3|1947267|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MF600313 (Mycolicibacterium sp. CBMA 213 plasmid pCBMA213_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aagcactatcggaaccttcgcccctaagag CRISPR spacer gagcaatatcggaatcttcgccccgactgc Protospacer .**** ********.********* * .
12. spacer 4.4|1947333|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017963 (Enterococcus faecium DO plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
taaagccggtattaagcttcggcgcagttc CRISPR spacer ataagccggtattaagctttggtgccgaaa Protospacer *****************.**.** *
13. spacer 4.5|1947399|30|NZ_CP024635|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694651 (Marine virus AFVG_250M473, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
aaaaggtgaatttttaggcgctcaggggta CRISPR spacer gttcggtgaatttttagccgctcacggaag Protospacer . ************* ****** **. .
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| DBSCAN-SWA_1 |
149542 : 241199
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP024635|149542:241199|DBSCAN-SWA ATTGTTTGAAAACACCGAAACAGAAGGACCAGTGACCTGCTCGTTTTGTGGCAAGACACAGGATCAGGTGCAAAAGATCGTTGCTGGGCCAGGTGTTTACATCTGTAATGAATGTATTGACCTTTGCAAAGAGATTATTGATGAAGAATTCAATCAAACTGCTGCACAAGAAACGTTGGAAGTTCCAACGCCAGCCGATATTGTCAAGACGTTAAACCAATACGTGATTGGTCAAACAGAGGCTAAGCGGACCTTGTCAGTAGCCGTCTATAATCACTACAAACGGGTTAACGAAATGGCTCAGGAAACTGATGACGATGGTCCAGAATTGCAAAAGAGTAATATTGCCGTGATTGGACCCACTGGTTCAGGGAAGACGTATTTGGCGCAAAGTTTGGCCAAGATTCTTAACGTTCCTTTTGCTATCGCTGATGCGACGACCTTAACGGAAGCCGGTTACGTTGGTGAAGACGTTGAAAATATTTTGCTGAAGTTGTTGCAAAATGCCGATTACGATGTTGGTCGGGCCGAAAAGGGCATCATCTACATCGATGAAATTGATAAGATTGCCAAGAAGGCTGAAAATGTCTCCATTACGCGAGATGTTTCTGGTGAAGGGGTCCAACAGGCCTTATTGAAGATCTTAGAAGGGACAATTGCTAATGTGCCACCACAGGGTGGACGAAAGCATCCTCAACAAGAATTCATCCAAATTGACACGACCAACATCCTCTTTATCGTGGGTGGTGCGTTTGATGGGATCGAAGGCATTGTTAAGCGTCGTTTAGGGGATCAGACCATTGGCTTTGGTGCTGATAGTCAGGAACAGCATGTCCTGTCTTCCGGTGATAGTCTGATGCAACATGTTATTCCTGAAGACCTATTAGAATTTGGGTTAATTCCTGAATTCATTGGCCGGTTGCCGATTTTGACGGCACTTGAAAAATTGGACGAAAATGATTTGGTCCGGATTTTGACGGAGCCTAAGAATGCACTGGTTAAGCAGTATGAAAAGCTTTTGGCCTTGGATAATGTCGACTTACAATTCCAACCAGCGGCTCTGCGTGAGATGGCAAAGCTAGCAATTGCTCGTAATACTGGGGCCCGGGGATTGCGGTCTATCATTGAAGATGTGATGCGTGACATCATGTTTGACTTGCCAAGCCGTACTGATGTGGCTAAAGTCGTGATTACGCCAGAAACAGTGACGGAACACGCTGAACCAGAATTAGTTTTAAAGGATCAAAAGGCATCATAGAAATGCATTTACACGGAGAGTGACTAGCTGATAGGTTAGTCACTTTTTTGATGCACGCAAAGTAGGGCCAGACGGGCTTTATTCGATGATCCCACATAAAAAGCCAAGAGATTCATGCCAGTCAGCTCACGTTCTGTGTTAAAATGATGAAAGAGATTTTGGAGAGGATGGCATGAACTAATGGAAGTCAATCATGTAGAATTAGTGATGAGCGCGGTTGATCCCGCTCAATACCCAACAACGGGGTATCCAGAAATTGCGTTGGTGGGGCGTTCGAATGTGGGAAAGTCCTCATTAACTAATGTGTTAATTAACCGTAATTCGTATGCCCGGACGTCCAGTCAACCAGGGAAAACCCAGACGCTGAACTTTTATAACGTTGAGGACCAGCTTTACTTTGTGGATGTTCCCGGTTATGGTTATGCAAAGGTCTCCAAAACAGAACGAGAAAAGTGGGGGCAAATGATCGAAACCTACCTGACTCAACGCGATCAATTACGCGGTGTGATTTCGTTAGTTGACGCCCGGCATGCGCCAACGGAGGATGACATTCAGATGTATCGCTGGTTGGCTTATTATGAGTTACCAACGCTGATTGTGGCGACGAAGAGTGACAAGATTGCTCGCGGAAAGTGGAATCAGGCAGTTAGCCAAATTAAGAAGTCACTGGAGTTGCCTAATACAGATAATATTGTAATGTTTTCGGCGCCAAAGAAAATGGGTAAGGATGCCGTGTGGAACTGGATCGAAGCCCAAGCATTTGGAGGCGAATAAACATGGAATTTAATGAGTATCAACAAGCCGCTAATCGAACCTTGTATGGCAACGAACAGGTCTTAACGAACTGTGCACTCGGCTTAGCCGGAGAAACCGGACAAGTGGTAGACTTGGTTAAGAAGTATACGTTTCACGGCAAAGATCTCGACCACGATGCCATCGTGAAAGAAATGGGCGATGTGTTGTGGTACCTGAGTCAAATTGCCCAGTGGGCTGATATTGATTTTGACGAAGTGGCACAGGCTAATATTAAACGTCTGAATGCCCGTTATCCACATGGTTACCAACCAAATCGGTAACAAAAAAGGACGACCATTGTGGTCGTCCTTTTCGATTGATTTAATCGTTGGCGTGTTTCTGGTCATGTTTGAGTTGATCGTCTTTGATCAACGCTTTACCCTTCTTGTCACCCTTGTGATCGTCTTGACGCTTTAAGAACTTATCCCGCTTAACGTCAGTAGGGTCCATTTGGGCGAATTTGCCAAACATGGAATCAAGGTCATCTTGTCGTTTAACTTTTAATGCCAAATTGAGGCACCTCCTTGCTTTTCCGTTATCATAGCAGAATTTGACGCGTTTGTCATTTTTGACTCATGTTGGTCAAAAGGGATTTCACTTGCACCAAACAAACATTCGGCATATACTTTATTAGCTTATTAACACGCTTGAACGGGAGGGATTATCCTTGGCATCAGAATACTTGGAGCATAAGCTTGCGTTACTGCCGGGCCTTCCCGGCTGTTACCTCATGAAGAATATTAATAGTCAAATCATTTATGTTGGCAAGGCTAAGAACCTAAAAAATCGGGTGCGGTCGTACTTTAAGAGTAGTCACACTGGGAAAACGGCACAGCTAGTCAGCGAGATTGTTGACTTTGAAACAATTATTACGTCTACAGATAAAGAAGCTTTCTTACTAGAAATTACGTTGATTCAAAAACATCAACCTTACTTTAACATTAAGTTGAAGCGGGGAACGGGATATCCTTACATTAAAATTACTAATGAACGGGATCCCCAACTGCTTTTAGTGAGTGATATTCGGAAAGATGGCGCTTATTATTTTGGACCATATCCGAATGTTTACGCGGCAGAAGAAACAATGCACTTCTTGCAAAAGGTTTATCCGTTACGTCGGTGTCCTGGACATCAAGGCCGACCGTGTCTCTATTATCATATGGGGCAGTGCTTGGGTGCCTGTTTTAAAGAGGTGCCAGAAGCGGAGTATGACCAGCAGATTCGCAAAATTAAGTCGTTTTTAAATGGCAACGTGGGACATGCGAAAAAGGATCTAACGCAACGCATGGAAAAAGCAGCGGCGGATATGGCCTATGAACGTGCTGGTGATCTGCGTGACCAGATTCGCTACATTGAAGCGACAGTTGAAAAGCAAAAGATCATTTCTAATGACAGTACACCACGAGATATTTTTAATTTTTATCTGGATAAGGGCTGGTTATCCATTCAAGTATTCTTTATTCGCCAAGCCCGCCTAATGAAACGCGAAAAGCGACTCTTTCCTGTGGTCAATTCAGCGGAAGAAGAACTGGCCAGCTTTATTGTCCAATTTTATCAGCGCAAAAATACAGTCTTACCGCGTGAAATTTTAGTTCCGGCCAGTATCGACCATGACGTTATCGAAGAGCTGCTAAAGGTGCCCGTTAGAACGCCTCAGCGGGGGACTAAACGAGATTTGCTAGAGATGGCTGGGAAGAACGCCAAACTGGTCTTAGAAGAGAAATTTCGGTTACTGGAGCTGGATGAAGGCAAGACAACCGGCGCGATGAAAGAAATTACAGATGCGTTGGGGATTGCGCCGGGGCACAAGATCGAGGCGTTTGACCACTCACATATCCAAGGAGCTGATTTGGTCTCGGCAATGGTGGTCTTTGTCGATGGTCAACCGAATAAAAAACTTTACCGCAAGTATAAATTACAAACGGTCGATCATGCTGACGAAACGGCTAGCACTTTAGAGGTTATCCGACGGCGGTACGGGCGACTGCTTAAAGAACATGCGCCAATGCCTGATCTAATCTTGATGGATGGTGGTGACATCCAGATGAATGCCGTTAAAGAAGTCCTTGAAGACGAGTTTGATTTGCATATTCCAGTCGCTGGGATGGTGAAAAATGATCATCATAAGACGGCCGATCTCTTATTTGGACCGGATGACCACCATGTCCATTTGGACCCTAAAAGTCAGGGCTTCTATCTGGTTCAGCGGATTCAAGACGAAGTCCATCGGTTTGCCATTAGCTTCCATCGGCAAGTGCACACCAAGCATTCCCTGAGTTCACGCTTAGATCGGATTCCGGGAGTTGGACCTAAAACTCGGAATAAATTATTGCGAAAATTTGGCTCGACTAAGAAGATTAGTGAGGCTAGCATGGCAGAAATCCGTGAATTGGGTGTCAGCGAAGCGGTGGCACGAACGATTCACGTTACCTTAGCTGCGGAAACGGCCGAGATTAAGAATCCTCGAACCCCAACGAATCTTTGACGTGACGGCCGTTTGCCGGTATACTGACTAGCAGGAGATTAACAGAGCAGACAGCACGGGCTGACTGAGAAAACGAGGAAATTAATTATGTTTGTAGATCAAGTTAAAATTAATGTGAAAGCCGGTAATGGTGGTAACGGAATGGTTGCCTTTCGCCGGGAAAAGTTTGTGCCCAATGGTGGGCCAGCCGGTGGTGATGGTGGCCGTGGTGGAAATGTCGTTTTCGTGGTCGACGAAGGTTTACGGACACTGATGGATTTTCGCTACCAGCGTAAATTCAAGGCGAAGAGCGGTGGCAACGGGGCGATCAAGTCGATGACCGGTCGGGGGGCAGAGGACACAATTATCAAGGTGCCCCAAGGAACCACGATTATGGATGCGGAAACTGACCAAGTCATTGGTGATTTGGTGGCACCCGATGATTCCGTCATTGTGGCGCACGGTGGTCGTGGTGGACGGGGA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115 | Lactobacillus_phage(52.17%) | portal,terminase,protease,capsid,integrase,head,tail,tRNA | attL 164125:164142|attR 206062:206079 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
254144 : 295651
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP024635|254144:295651|DBSCAN-SWA 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MAFIKTRVFGTGREILTNFSHALTLSCMVQDTNAVADSNGVKFIKAGTPLGATGFTVRDREKTVLSPVTDAAQAVGIAMHDINVTDGVVRDTVIFRGDVVFYNMDADVQKLFTADMEKALPQITLV |
55 | Lactobacillus_phage(61.11%) | portal,terminase,transposase,capsid,integrase,tail | attL 253849:253864|attR 296791:296806 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
375413 : 384668
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP024635|375413:384668|DBSCAN-SWA AATGGCAAACAAAGCACAATTGGTTAGCGATGTTGCAACTGCAACTGGCTTAACTAAAAAGGACGCAACGGCTGCAGTTGATGCAGTCTTCGATTCTGTCCAAGCAACGTTAGCAAAAGGCGAAAAGGTTCAATTGATCGGCTTTGGTAACTTTGAAGTTCGTGAACGTGCAGCTCGTAAGGGCCGTAACCCACAAACTGGACAAGAAATCCAAATTCCTGCAAGCAAAGTACCTGCATTCAAGCCAGGTAAAGCCTTAAAGGATGCTGTTAAGTAATTGGTATCAATTATTTAGCGGGTAGTAAAGGCCAGTACGGTGAATGCCGGGCTGGCTTTTTGCTACCCGTGAAAACTGACACAGATAAGCAACTGGAGGCGGGTTATGAGTTACGCACAAACAGCACTTGATCAATTAGAAAAGGGCCAGTTAGACGCATTTAAGAAGCAATATGCGTTAGCTCTGCGCCATGATGATGACGATACGCTCTTTAGCCTAGCAGAAGAATTGTATTCACTGGGATTTTTGAATCAGTCACGCCGAATTTATGAAAAATTACTCAAGAAGTATCCAGATGAAGATGAATTACGCACAAATCTAGCAGATATTGCGATTGATGAAGACAAAAATGATGAAGCACTGGACTATTTAAATCAAGTTCGGCCTGATTCGCCGGCTTATATTGAATCATTGATGGTTGCCGCCGATCTGTATCAGACCCAAGAACTCTTTGAGGTCAGCGAACAAAAGTTGTTAACCGCTCGCCGGTTAGCACCTGAGGAGCCCGTGATTACGTTTGCCCTCGCGGAATTGTATTTTACAATGCGTGAATTTCGTAAGGCAATTCCCCTCTATCTGGAACTAATCACGGCCGGGACGACTGATATGTCACGGGTCAACCTTGTTGAACGGTTAGGGGTTGCTTACGCCAACGCTGGGCGGTTCGAACAAGCCATTGGTTACTTGAAACAAATTCATTCGGGGGACATGACGCCGGATGTTAAGTTTGAAACGGCGTTCACTTACTTGCAGCTAAAGGAGCGCACTGAGGCCATTCGGTTGTTTAACGAATTGAAGGATAGTGACGAGCACTACACGTCTCTGTATCCTTATTTGGGACAAGCGCTGGAAGAGGAGAACCGTTTACCGGAAGCCTTAACAGCCTTGCAGGAAGGTCTAGGCGTTGACCAATATAACGAGAAGCTATGGTTACAGGCCGCCCATGTGGCGACGCGACTGGACGATGAGGCCTTAGCCGAGCAGTACCTAAAGCGGGGACATGAGCTAGACAGTGACGATCTGAGCGCGGTCATTCAGTTAAGTAACCTGTACGTTAAGCAGGAGCACTGGGCTGAAACGCAAGAACTGGCGACACCTTATGTTCAAAACGATGATGCTGACCCGCAACTGTACTGGAACTTAGCGGTGGCAGCAGAACATGAAGAAGACTATGCAACTGCCCGAAAGTATTATGATGCGGCAACGCCATTCTTTATGGATCAGGCTGATTTCTTACGGTCGGCCATTTACTTTTATCGTGAAGAGGGCGCCCGTGAAGAAGTTGTTCGGCTGTTACAAGCTTACTTAAAGCAAGTACCAGATGACAGCGAAATGGCGTTAATGTTAGAGGGTTATACTGATTAATGGGGAAAGGCACGCTTCAATTTTGAAGGGTGTTTTTTTATTAACCAAATAGCACAAAAATTACTTTAACTTATAACATTCAAAAAAAGCGACCGCCAAACCCGCGGTCGCAAAAAACTAGTGCCTAAACCGATTTAACCAACCCTTATCCGGCAGTCCAAATGAAAAGCCTTCACCCAATGCTTCGTTCACATTGATAACTGAGATGAATGCCCGTGAATCATTACGCTGAATAATCTGCCGCAACCGATACAACTCGCTGGGAGCCACTACTACGTAAATCATCTTGCGTTCTTGATGGGAGAAACCACCTTCACCATTGACGAGACTAACGCCACGTTCCAATTCCGTCATAATTTCATCCGTAATTTGTTGATAATTCTCGGAAACAACGATCACACCACGCGCGGCATAAGCGCCTTCTTGAGTGAAATTCACAATTCTTGCGAAGACGTAAGAATAGATTAAGGTGTAAGCCATATGTTGAATATCAATGTAAACCAGCGAGATTAATAAAACGACAACGTCTAAGTAAAGGAGGGTCCGTCCCATGGGCACTCCCCGAAACCGTTCAAAAATTCGGGCGATAATGTCAGTACCACCAGTAGTGCCACCATAGCGGTATAACAGACCGGAACCGAAACCACCAATAATACCAGCGCCCAGGGCAGATAGTAGTAAGTCACCGTGCAAAGCAATGGTCAATGGGACCCGCTGCCATACCCACAGACACAAAGACAGCATACCCGTTCCATAGATGGTATAGATTAATGATTGGCGGCCCAAAAATCGCCAGCCAATAATAATTAAGGGAACATTAATCAGAATGGTTGAATAGGCCGGATCGATATGGAAAAGGGCCCGAAAAATCAGTGTAATTCCTGAGATACCACCGTCTGCTAAATGATTGGCAATATTGAAAAAGACTAGTCCAAAGGCAAACATGGCACACCCAATTCCAATCATAAGTAAGTCAATAAAGCGAATTGATTCATCTGGCTGCTGTGTCACCATTATCACTCCCATCTGAAAAAATAACTTGATAAACTCAATCATAGCACAGTCCTCTAGAAAACTGGCGATTATCTATGGCGGAATTGCAGGAGTTTGAATTCAATTCTAGCGGGTAATCTGTTAGACTGACATAGTGAGACAATAACAGAAAGTAACTGGCAGAAGGGTGACAATTATGCAGCTAGAACACTTACCAGAAGAATTTGAAATGGCCCGGCCAGTCCTCCAAACGATCGAACAGGCCGGTTATGAGGCTTACTTTGTCGGTGGCAGTGTCCGGGATACCATTTTGGGTAAAGAGATTCATGACGTGGATATTGCGACAAGTGCCTATCCAGATGAGATTAAACACCTCTTCAAGCGAACGGTGGATACGGGGATTGAGCATGGTACCGTCATGATCCTCGATCATGGAACGGGATATGAAACAACGACATTTCGGTCTGAATCAACCTATACCGATTTTCGCCGGCCGGACCAAGTAACCTTTGTGCGCTCACTGGCTGAGGATTTAAAGCGACGGGATTTTACCATCAATGCCTTGGCAATGAAGGAAGATGGTACCGTCATTGATCTATTTGACGGTCTAGCTGATTTAAAGCATCGGCAGATCTGCGCCGTGGGTGATCCACAAGAACGGTTCCATGAGGATGCGCTACGGATGATGCGGGCGGTTCGATTTGCTAGTCAATTGAACTTTACAATTGTGCCAGAAACCTTGGCGGCCATGACCAGTCATGCTGAGTTACTGCGTAAAATTGCCGTTGAGCGAACGCAAGTCGAGCTACTCAAGCTATTAACGGGACAGGCGCCCCAACAAGGACTCACGGATCTGTTGACGACCGGACTGTGGCAGTACTGTCCTGACTTTGCCGACCACAAGGCTGACTTAGAGAGGCTAACAGCGCAACTACATCAAGGTGCTAGCACCGACTTGACCGCGTGGACATTGTTAACCACCAGTTTTGGCTTAGAAACTAACGCTATTACCACATTTCTAAAACACTGGAAAACGGCTAATCAGACGATTTCCGCCGTACAGATGACGACTAAGACGGCACAACACTTACTGCAAGGGCCCTTGTCTACTTGGCAGGTCTACCAATGTGGTGAAGATCAACTAATGATCGCTAATGAAGCGGCAGTCGTACTAGGTGCTACGGATCGATCACGTGAACTGATAGCGCAATGGCAAAATTTACCAATTCAAACGAAGAAAGCTTTGGCTGTCACTGGACGAGATCTTATGCAAGCCGGTGTGCAACCCGGTCCACAGTTAGGGGCTATTTTGGGCGACTTGGAGTATCAAGTTGTCACGGGTAAACTGCCCAATGAGAAATCGGCATTAGTGGCTGCTGTCACCGATTGAATTTGAAAAATAAGAGAGTGAAGATATTATGCAAACGTTACGAGCAGAAAATTTACATCGGACTTACGGTGAAAAAACACTGTTTGATAATCTGAATTTTATTATTAATGAGCATGACCGAATTGGCCTGATTGGGGTCAACGGTAGTGGTAAAACGTCGCTGTTGAATACTTTAGCGGGCATCAGTAACGAACAGACGGGGGAATTAGCAACGCCCAAGGACTACACCATTGGGTATTTGACTCAGAAGCCAGATCTGGATGAAAACTTAACCGTGATGGATGCGGTTTTCTCCGGTGATCAGAAGGTATTTGTCACGATCCGTCGGTATGAGGCCGCACTGGCAGCTTATGGTGCGCATCCTGACGACGAGCAGGCCCAAAAGCGGTATCTAGATGCGGAAGCACAAATGAACGAAGAGGATGCTTGGACAGCCGAAAGTGATGTTAAAACGATCCTGACACAGTTAAAAATTACGGATCTATCCCAAGAAATTAAAACCATGTCTGGGGGACAAGTCAAACGGGTCGGACTGGCCCAAGTGTTAATTCAGTCACCTGACTTACTTCTCTTAGACGAACCGACCAACCACTTGGACTTCGATTCAATTGCGTGGTTACAACAGTATTTGACGAGTTATAAAGGGGCCCTCCTAGTGGTAACCCATGATCGGTACTTCTTGGATCAAGTGGCTAATCAAATCTGGGAATTGGATTTCGGTAAACTTTATCAATACCCCGGTAACTATCAGGCTTACGTTCAAGAAAAAGCTGAACGGGTAAATTTGGAAGCCGAAGCCGAACAAAAACAACAACGGCTCTATCAACAAGAATTGGCTTGGATGAAGGCCGGGGCTAAAGCACGCTCCACTAAGCAACAAGCCCGAATCAATCGGTTCAACGATATTGCCAGCAATGTCGGCACCCGACAAGTCGAGCATCACGTGGCGATTTCCTTAGGTCAACAACGGCTGGGGAAAAAGGTTATCGAATTAAAGGATGCTAACCTCAGCTTGGGTGGTCATACCATTCTCAATGACTTTAGTGATTTGATTCAGGCCGGCGAACGGATTGGGATCAGTGGTGAAAATGGGGCCGGTAAATCCAGTTTGTTGAACGTCATCGCCCAACGACTGCCATTGGATTCAGGGATTGTAACGGTTGGTGAAACGGTCAAAATGGCCTACTATACTCAGCAAATTGAACCGATTCCAGAAGATAAGCGTATGATTAACTATCTATCGGAAGTTGGTCAGACGGTTACGGATAAGCAAGGGAATTCGGTGAGTGTGACTGAGTTGTTGGAACAGTTCCTCTTCCCACGGTTCATGCATGGTACATTGATTCGTAAACTGTCCGGTGGTGAAAAACGGCGCTTGTATCTGTTAAAGCTATTGATGGAACAACCTAATGTGTTACTTCTGGACGAACCAACTAACGATTTGGATATTAGTACGCTGACCGTATTGGAAGACTATATTTCCCAATTTTCTGGTACCGTCATTACAGTCTCCCATGATCGGTATTTCTTGGATAAAGTTGCCGATCGTCTGTTAATCTTTACGGGAAATGGTCAGATTGAACGTTACTCGGGCCAATTTAGTAGTTACTTGGCAGCACAACAGGCACAGACGAAGCAGGCAACTAAGGCGAAGTCAAAACCAGCAGCGCCAAAGGAATCGGCACCTGCTAAGCCCAAACAAAAGGTGAAGCTGACGTATGCTGAACAAAAGGAATGGGAAGGGATCGAGAGCGTCATTGACGATCTTGAATCGCAAAAATCAGCGGTTCAAGAGGCCATGAATGCCAATGGCGCCAATTATGATAAACTAGCCGACCTACAGGCCCAACTCGATGACTTAGACCACCAGTTGGATGACAAGATGGCGCGTTGGGAATATCTCAGTGAGTACGCAGAATAGGGGGAAAAACGGTGTTAGAAGAGGCATATTTAGATTTAGCTAAGACTGTCTTGACGACGGGTCACGAAAAAACGGACCGTACGGGAACCGGAACGATTAGCTTATTTGGCTACCAAATGCGGTTTAATTTGCAAGAGGGCTTCCCACTATTGACTACTAAAAAGGTGCCCTTTGGTCTCATTAAATCCGAACTCTTGTGGTTCCTTCGTGGGGATACTAATATTCGGTTTTTATTGCAACATCACAACCATATTTGGGACGAGTGGGCCTTTCAACGCTACGTTGATAGTCCCGAATATCACGGGCCAGATATGACCGACTTTGGTCGCCGTTCCTTGGTGGATGCAGACTTTAATCAGCAATATCAAGCAGAAAAAAAGGCATTTTGTGATCGAATCGTGACGGATCAAGCTTTTGGTGACCACTTTGGTGATCTGGGTCTAGTTTATGGTAGTCAGTGGCGGGCTTGGCAAGGTCATCAAGGTGAAACCATTGATCAACTGGCCAATGTGATTGAGACGTTGCGGACGCACCCAGACTCTCGGCGGATGATCGTTTCAGCGTGGAATCCGGCTGATGTGCCATCAATGGCTTTGCCACCTTGCCACACGCTCTTTCAATTTTACGTCAATGATGGCAAATTAAGCTGTCAGCTTTACCAGAGAAGTGCTGATATCTTCCTAGGTGTGCCCTTCAATATTGCCAGCTACGCATTGTTGACATCGTTGATTGCTAAGGAAGTGGGCTTAGAGGTGGGCGATTTCGTCCATACGCTGGGTGACGCGCACATCTACAGCAATCATATCGAGCAAATCAAAACCCAGTTAGCACGGACACCACATGCTGCGCCACAGTTGTGGTTAAATCCTGATAAGTCGAGTATCTTCGATTATGAGATGAGTGACATTAAGGTGACAGGATATGACCCTGAACCAGCAATTAAGGCCCCTGTGGCCGTTTAGAGAGGGCTAAGACGGATGCTAATCTTTTTATGGGCAGAGAGCCAGGGACGAGTTATCGGGCTGCACGGCGGCTTACCATGGCATTTACCGGCTGACATGCATTACTTCAAAACGGTGACGACGGGTCATACAATTGTGGCCGGAAGCAAAACCTTTGCTTCGTTTCCACGACCGCTACCTAACCGTAAAAATATCGTGGTTTCTCATCAACCAGCAACGGCCTTCCCAGAAAATGTCAGCGTGCTGCACTCATTGCCAGCGGTGCGGGCCTACGCAGCAGCTCGCCCACAAGAAAAAATATTTGTGGTCGGTGGGGCGCAATTATTTGCCGGCCTGCTGGATGACGTTGATTTCCTGTATCGAACCCGGATTGATGCTGGATTTGACGGCGATACATGGATGCCAGTGATCGATTACAGTCAATTTACGCTAATTGACCAACAACCAGGGATTCGTAATGAAAAAAATCCGTATGATTTTGTTTTTGAACAATATCAGCGGCATTAAAAACGAACGTGATTGGTGAGCTTTGACGACGCCAATCGCGTTTTTTAAGACGTATTAACTTATTGAGTCGTTGGTGGCTGACAACGTTAAAGATTAACCACTAGTGACCGGAAGTCGACGACAAAAAATGGTTCACCTTAGTCGCAATTGCAACTGAGGTGAACCATTTGACCCTAAGATTAGGCGTATAACAGGATTGAGAAGTACATCAATCCGGTCCCTAACATAACAAATAGGTGCCAGATAACGTGACCGAATGGGACACCCTTAAAGCTATATAGTACCGCACCCACGGTGAAAGACACGCCACCGAAAAATAACAGAGTAAACCCAATCGGTCCTAATCCATGATAGAGGGGTTTAATTCCTAGCAAACACATCCAACCCATGACGACGTAAATGACGGTCGACAGGGTTTGGTATTTGCCTAACCAGATGGCTTTATAAATAATGCCACAAATAGCCATCCCCCAGATAATGCCAAACATGGTCCAACCCAGTGCGCCACCAACGACTAGTAAACTGTAGGGCGTATAAGTCCCAGCAATCAATAAATAAATGGCACAATGATCAAATATTTGAAAGACGTGGCTCGCCCGGGTAAAGTACAAACTATGGAATAGTGTTGAGGCGAGGTAAAAAAGGACTAAGATAGCACCATAGATGGCAAAGGTTGTCATTCGCAATGTGCCACCCTTGGCGTGAGCTTGAAGTAGTAGAATGACGAGACCTGCGATACTTAATCCTGCACCGATTCCATGGGTCGCGGCGTTAAGCACCTCGTTAATGATTTGATATGCGCGGCTGTGTCCGTTTGTCAAATGAAACCCTCCCTTAATTTGTCGGTAATAGTCTTTGACTAACCGTTACCGGTGAGTTAGTAACAACTACTGAAAATTATCCATAACTCTGCTATACTATTACCGTATGTTTCATTACGCATATTGTAGCATAAACCAAAATTTCTGGTCAGAAAGTGTGGGATCCCCATGGCTAAAATCAAAATCGTCACAGACTCTTCTGCTGGCTTAACCGATCAACAGATTGCAGACTATGACATCACAATTATCCCGTTAACGGTAATGATTGATGACACAATTTACGTTGAACGAGAATCAATTACGAATAAAGAATTTATTGAAAAAATGAAAACGGCGAAAACGTTGCCGAAGACGAGTCAGCCACCATTAGGATCGTTTGTCGAAACCTTCGATAAGTTGGGTGAAGATGGCAGTAGTGTGATTTGCTTTAATATGCTGGCAGCCATTAGTGGTACGGTTCATACGGCAGAGCAGGCCGCGCAATTATCTAAGACCGATGTCACCGTAGTCGATAGTCAAACGACCGATCAGGCGTTGGCTTTCCAAGTCGTGGAAGCAGCTAAATTGGCAGCCGAAGGTGCTGACAAGGCGGCGATCTTGGCTCGAGCGGCAGCCGTACGGGACCATACCAAACTCTTCATGGGTGTGGTAACGTTAGAGAACATCTTGAAGGGTGGGCGTTTAAGCCGGGCTGCTGGGATGCTTACCTCACTGTTGAATATCAAGATTGTTTTGGAAGTCACTGGTGGCGAACTGAAGATTCGGGCTAAAGGTCGGGGAATGAAGACTATTGACCGGTATTTTGACAAAGTCTACGAACAGTTGAAACAGACACCGGACGTTGTTGCTATTGGGATTTCTCACGTTGAAGCTTTTGAATCCGTGGATAAGATCAAACAACACCTCAGTGAAGTCGTTCCAGGTAAGGATGTCTTAGTCAGAGAAACGGTGCCAATTATTGCCACGCATGGTGGCCCAGGTGCCTTTGCGTTAATGTACTACACCGATCCGACAAAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP024635|375413:384668|378243_379437_+|WP_021741844.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQLEHLPEEFEMARPVLQTIEQAGYEAYFVGGSVRDTILGKEIHDVDIATSAYPDEIKHLFKRTVDTGIEHGTVMILDHGTGYETTTFRSESTYTDFRRPDQVTFVRSLAEDLKRRDFTINALAMKEDGTVIDLFDGLADLKHRQICAVGDPQERFHEDALRMMRAVRFASQLNFTIVPETLAAMTSHAELLRKIAVERTQVELLKLLTGQAPQQGLTDLLTTGLWQYCPDFADHKADLERLTAQLHQGASTDLTAWTLLTTSFGLETNAITTFLKHWKTANQTISAVQMTTKTAQHLLQGPLSTWQVYQCGEDQLMIANEAAVVLGATDRSRELIAQWQNLPIQTKKALAVTGRDLMQAGVQPGPQLGAILGDLEYQVVTGKLPNEKSALVAAVTD >NZ_CP024635|375413:384668|382335_382827_+|WP_011667559.1|DBSCAN-SWA MLIFLWAESQGRVIGLHGGLPWHLPADMHYFKTVTTGHTIVAGSKTFASFPRPLPNRKNIVVSHQPATAFPENVSVLHSLPAVRAYAAARPQEKIFVVGGAQLFAGLLDDVDFLYRTRIDAGFDGDTWMPVIDYSQFTLIDQQPGIRNEKNPYDFVFEQYQRH >NZ_CP024635|375413:384668|383816_384668_+|WP_021741848.1|DBSCAN-SWA MAKIKIVTDSSAGLTDQQIADYDITIIPLTVMIDDTIYVERESITNKEFIEKMKTAKTLPKTSQPPLGSFVETFDKLGEDGSSVICFNMLAAISGTVHTAEQAAQLSKTDVTVVDSQTTDQALAFQVVEAAKLAAEGADKAAILARAAAVRDHTKLFMGVVTLENILKGGRLSRAAGMLTSLLNIKIVLEVTGGELKIRAKGRGMKTIDRYFDKVYEQLKQTPDVVAIGISHVEAFESVDKIKQHLSEVVPGKDVLVRETVPIIATHGGPGAFALMYYTDPTK >NZ_CP024635|375413:384668|381369_382320_+|WP_021741846.1|DBSCAN-SWA MLEEAYLDLAKTVLTTGHEKTDRTGTGTISLFGYQMRFNLQEGFPLLTTKKVPFGLIKSELLWFLRGDTNIRFLLQHHNHIWDEWAFQRYVDSPEYHGPDMTDFGRRSLVDADFNQQYQAEKKAFCDRIVTDQAFGDHFGDLGLVYGSQWRAWQGHQGETIDQLANVIETLRTHPDSRRMIVSAWNPADVPSMALPPCHTLFQFYVNDGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTSLIAKEVGLEVGDFVHTLGDAHIYSNHIEQIKTQLARTPHAAPQLWLNPDKSSIFDYEMSDIKVTGYDPEPAIKAPVAV >NZ_CP024635|375413:384668|383006_383648_-|WP_011667560.1|DBSCAN-SWA MTNGHSRAYQIINEVLNAATHGIGAGLSIAGLVILLLQAHAKGGTLRMTTFAIYGAILVLFYLASTLFHSLYFTRASHVFQIFDHCAIYLLIAGTYTPYSLLVVGGALGWTMFGIIWGMAICGIIYKAIWLGKYQTLSTVIYVVMGWMCLLGIKPLYHGLGPIGFTLLFFGGVSFTVGAVLYSFKGVPFGHVIWHLFVMLGTGLMYFSILLYA >NZ_CP024635|375413:384668|375794_377054_+|WP_024525208.1|DBSCAN-SWA MSYAQTALDQLEKGQLDAFKKQYALALRHDDDDTLFSLAEELYSLGFLNQSRRIYEKLLKKYPDEDELRTNLADIAIDEDKNDEALDYLNQVRPDSPAYIESLMVAADLYQTQELFEVSEQKLLTARRLAPEEPVITFALAELYFTMREFRKAIPLYLELITAGTTDMSRVNLVERLGVAYANAGRFEQAIGYLKQIHSGDMTPDVKFETAFTYLQLKERTEAIRLFNELKDSDEHYTSLYPYLGQALEEENRLPEALTALQEGLGVDQYNEKLWLQAAHVATRLDDEALAEQYLKRGHELDSDDLSAVIQLSNLYVKQEHWAETQELATPYVQNDDADPQLYWNLAVAAEHEEDYATARKYYDAATPFFMDQADFLRSAIYFYREEGAREEVVRLLQAYLKQVPDDSEMALMLEGYTD >NZ_CP024635|375413:384668|377171_378068_-|WP_042254316.1|DBSCAN-SWA MVTQQPDESIRFIDLLMIGIGCAMFAFGLVFFNIANHLADGGISGITLIFRALFHIDPAYSTILINVPLIIIGWRFLGRQSLIYTIYGTGMLSLCLWVWQRVPLTIALHGDLLLSALGAGIIGGFGSGLLYRYGGTTGGTDIIARIFERFRGVPMGRTLLYLDVVVLLISLVYIDIQHMAYTLIYSYVFARIVNFTQEGAYAARGVIVVSENYQQITDEIMTELERGVSLVNGEGGFSHQERKMIYVVVAPSELYRLRQIIQRNDSRAFISVINVNEALGEGFSFGLPDKGWLNRFRH >NZ_CP024635|375413:384668|375413_375689_+|WP_011667553.1|DBSCAN-SWA MANKAQLVSDVATATGLTKKDATAAVDAVFDSVQATLAKGEKVQLIGFGNFEVRERAARKGRNPQTGQEIQIPASKVPAFKPGKALKDAVK >NZ_CP024635|375413:384668|379465_381358_+|WP_021741845.1|DBSCAN-SWA MQTLRAENLHRTYGEKTLFDNLNFIINEHDRIGLIGVNGSGKTSLLNTLAGISNEQTGELATPKDYTIGYLTQKPDLDENLTVMDAVFSGDQKVFVTIRRYEAALAAYGAHPDDEQAQKRYLDAEAQMNEEDAWTAESDVKTILTQLKITDLSQEIKTMSGGQVKRVGLAQVLIQSPDLLLLDEPTNHLDFDSIAWLQQYLTSYKGALLVVTHDRYFLDQVANQIWELDFGKLYQYPGNYQAYVQEKAERVNLEAEAEQKQQRLYQQELAWMKAGAKARSTKQQARINRFNDIASNVGTRQVEHHVAISLGQQRLGKKVIELKDANLSLGGHTILNDFSDLIQAGERIGISGENGAGKSSLLNVIAQRLPLDSGIVTVGETVKMAYYTQQIEPIPEDKRMINYLSEVGQTVTDKQGNSVSVTELLEQFLFPRFMHGTLIRKLSGGEKRRLYLLKLLMEQPNVLLLDEPTNDLDISTLTVLEDYISQFSGTVITVSHDRYFLDKVADRLLIFTGNGQIERYSGQFSSYLAAQQAQTKQATKAKSKPAAPKESAPAKPKQKVKLTYAEQKEWEGIESVIDDLESQKSAVQEAMNANGANYDKLADLQAQLDDLDHQLDDKMARWEYLSEYAE |
9 | Staphylococcus_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
656513 : 707357
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP024635|656513:707357|DBSCAN-SWA CTTAAGCTTTAAAGATGGTTTGGCCTCGTTCAAAATCAAACGGTTCACCAACTTCATAATCGTCTGGCAAAATCAAAGCACCAGGCTTTTGTGGCGCATTAGCCAGGCCCAGTTCTCGTCCAGAACAAATCATCCCGTTGCTGGATACGCCCCGCAACTCGCCAGGCCAAATAATCAGGCCATTGGGCATCATCGCGCCAACCTTAGCAACAACCACCTTAATATCCGCTTGCATGTTCGGTGAGCCACTGACAATTTGCAAGGATTCATCATTGTCCACAACTGTTTCGGTCACTAATAAATGATCCGAATCTGGATGTGGTGTGGTCGACTTTACATACCCCACGACGAATCGTGACGCTGTTTCGGCCACTAGTTCACCAGAAAATCCGGCTGCTTCTAATGCGGCATTCAATGCAGCAACATCCGCAACGGACAATGCGACTTGCCCCTGACCCGTAATTTCTGGTAGGATTTCACTAATGGCCAAGAAATTATACCCCAGCGTTTTTTCCGTTTCTGGGTCATAAATCCGTGCGACATTGTCTCGGACTGTGTGTGCTTGGGTTGGTGCATCTGGTGCCACAACCACAATTAATGTATCCCCCAACTCTTGGGGGTTGTAACTAGCAATTAACATGTTTGAATCCTTTCCAACAGGTATTAGTTGGCGTTGGTTGTCAAAGAATTGATAAATTCTTCTACCTCTGCTTTTGTCTTACGATCTTTGTTTACCAACCGACCAATCTCTTGACCGTCGGCATAGGCAATAAAACTTGGAATGCCAAAGACATTGAGTTCTGCGGCCAAATCGATATTTTCATCGCGATCGACAGCAACAAACTTAAAATCAGGGTATTCCGCTTCAATTTCAGGCATGGCTGGCTTGATAAATGCGCAATCTGGGCACCAAGTTGCCGAGAAGAACAGCATCGTTTTACCAGATTTAACCACGTCGGTTAATTCAGTCGCTGACATTTTGGGTAATTGTTCCATGAAGATGCACTCCTTTATTTTAAGTTTGAAAATTATACAAGAACCATTATAGCAATCTACCAGAAAATTTACACGATTTTTGCCTTTTTACGGGAACTTCTTGGCAATCCTTGCTATACTAGGGGAAGAAGTGATGGAAAATGTGGCCCAGTAACACGTAACTTAAGGAGGCGGTAGTATGGCTGCTAAGAATGGACAATTGTATCAATTAAGCCTAACCGGAGTGTTGGGTGGATTAATGGGCGTTTTCATCACACGGTTTTTTGGCGGTACGTCACGATTAAACCCTGATGACATCTTGGAACAAGTCAAACGACAATTCCGTGAAGAGTCGCCAATTGAAGGCGCTTGGATTGAGAAACACGCAGTTCCTTTCCAAAAATTTGCCGTTAAATCTCGTGTTTATTACGGGGGTATCAATCGCTACGAAGACGATCAACTTGTCCAGTACCAATTCATCGCCGACGCCGCTACCGGAAGTATTTTGGATATTCACCGACTATAATTTAACTGACCTTGACGACACCATTTTAAGTAGTGTCGTCTTTTTTGCCAAAAAACTGACAGTGGTCGCATCATCCGACCACTGTCAGTTTTTGATTATTTCGCTTAGGTCCGTGACCGCTTCATTTGACGTCCTTTGATAAGATACAGACCACCTAACCACACGATTGATAAGCCTAACGCAATTGCTGTATCTAGTTGGAAAATCAAAATAATTGCGACCAGCATCAGTAACGCCAACACAAAATAGTCAGCCCACGGGAACCACGGTGCTTTGAACTTAATCTGCATGTCATCTGTCGTTCGCCGATATTTCAGGTGAGTCAAGATGATACTGCCCCAAATGAACAAGAAACAGGTCGTGGCCACACTGGAAACTAACGTAAAGACCATGTCTGGGAACAATAAGTTCAACACCACGGCCAACGTGATAACCAGCGCTGAGAAGTTCAAGGCATTTCCGGGAACTTGATGCTTCGACAACTGATTCAATTTCATTGTCAGCGGTCGCTTGGCATCTTTGGTCAACGAAGAAAGCATGCGCCCAGTCGTGAAGATGGAACTATTGCAGGCTGAAGCCGCTGCCGTGATAACAACAAAGTTAATGATATCCGCTGCCGCCTGAATCCCCACGTTTTTGAATACCATGACAAATGGACTTTGGTTTGGCAAAACCGTGTTCCACGGATAAATCGTCATGATGACAAATAAAGCGCCAACGTAGAATAAGATAATTCGCAAAGGAATATCATTAATGGCCCGTGGCAATACCCGATCCGGATTCTGCGTTTCCGCGGCTGTCATCCCCACCATTTCAATACCGATAAAACTAAAGACCACCATTTGTAGGGATAATAAGAAGCCAGATGCGCCTTTGGGAAAGAATCCGCCAAAGGCCACTAAATTTTGTAACGAGGCATGGCCCACCGGCGTCTTAAACCGCATGAAGAGCATACCGATTCCGACAATAATTAATCCCAAGATGGCGACAATCTTAATCAGTGCAAACCAAAATTCAACTTCACCAAACGCCCCCACCGTGATTAAGTTAATACATAATAGAACTGCCAAAACGACCAGTCCTGGTAACCATTGCGGCACGGCCGGAAACCAGAAACGGAAGTAAATCCCAATGGCCGTGATTTCCGCCATTGCGATCGTGATCCAGCAAATCCAGTACGTCCAGCCGACAACAAATCCAACGCGTTCGCCAAGATATTCTGTCACGAAATCCACAAACGATCGTTGATTTGTGTTTGATAATAATAATTCTCCGAGCGCTCGCATGAGTAAAAAACAAGCTACTCCAACACCGAGATAGGCCAGCAAAATGGATGGACCCGCTTGTTGAATCGACTTCCCCGAGCCTAAAAATAGTCCGGTACCAATCGTTCCACCAATCGCAATCAACTGAACGTGCCGATTCTTCAAATTACGCGCTGGAGCTGTCGGTTCTGTTGCCATATGACGTCCCCCCCTTTTGCCCATCTAGTTAACGTTTAAATAAGTGTGACTAAGTCCGTAGCGGAAACGCCCTGACTTGCGGCAACGGCTGCCTCCGTTAAGTGACCCGCATAAGTGTTAACCCCAGTTAAGATTGTCGCATTGTGTTTAGCTGCCGCTTCAATGCCCTCATTTGCAATCGTCACTGCATATGGAATGGTGACGTTGGTCAAGGCCGCAGTTGCCGTCTTAGGAACAGCACCTGGAATATTAGCCACTGCGTAATGAACAACGCCATCTTTTACAAACACCGGATCATCATGGGTCGTCGCGTGGTCGGTCGTTGCAAATATGCCACCTTGGTCAACCGGGATATCAACCACCACGGAGCCAGGTTCCATCGATTGAATCATCGCTTCACTAACCAATTTTGGTGCTGTATGACCCGGAATAAGGACTGCCCCAATCACTAGGTCAGCAGTTTTAATGGCTTGTGCCAAATTAAACGGATTGGAAATGAGCGTTTGAATGTTGCCGTTAAAAGCAGTCTCAATTTCTGCCAGTCGTGCCGCATTAATATCTAGTAACTTGACGTGAGCCCCCAAGCCTAAAGCAATCTTGGCAGCATTGAACCCCACTGTGCCCCCACCAATAATGACCACGTTTCCTTTGGCTACACCAGGAACGCCTGCCAGCAAGACACCTTTACCGCCATGATTTTCTTCTAAAAAGTGTGCCCCTACTTGAACGGCCATGCGCCCAGCAACCTCACTCATTGGCACTAGCAGTGGCAACCCCCCACGAGGTCCAACCATAGTTTCGTAAGCCACCCCAGTTACCTTAGCCGCGAGTAAGGCCTGCGTTAATTGAATATCCGGTGCCAAGTGAAGATACGTATACAAAATTAGTCCCTCATGGAAAAAGTGATATTCTTCTGGGACTGGTTCTTTTACTTTAATAACCAAGTCGCATGCCCAAGCCTCGGTTGCTGTCCCCAAGACCGCACCAGCCTGTTCGTAGTCACTATCTAGATACCCAGCACCCTCACCTGCATGATGTTCAACGATAACCTCATGACCGGCATGAACTAGACTAACCACGCCTGCTGGCGTAATCCCAACCCGGTTTTCGTTGTTCTTAGTCTCTTGCGGAATTCCAACTTTCATTTTCGTTACCCCCCTAATATTTGACTCTACCGCCAGTATAATGATTTTTGCCCACAACTACTGGCCTAACTACTCGTTGACGGCTGGTTAGTTCACTAACCTGAACAAAATCGTGGTCTAACCTTTAAGGCCCAGCTTGATGCTGACCATTCAAAAATAAAGACAACAAAAAAAGAGCTCGGGCAACCGCCACGAACTCCCTTGATAACCTTTATTTAGTTGGAACTTTTTTTAACCGCGTCACCTGGTTGTGTAGGTCCGTCCGTACGACCAGCACGTCACAAACCGCATTAGCCACCACGTAACTGGCTGTTGACCCTAGTAGCATGCGTTCAACCACATTCACACCCGTTGCGCCTAACATAATGAGGTCCGCCTGATACTCTTTGGGTAGCGACTTAGCCAAGTCAACTTTCGCATGTCCATAAAAGACAGACGTTACCACCCGCTCAACACCGGCTTCTTGAGCTTTTTGCCGGTATTGGTCAACTAATGCTTCTAGTGCTTGACGAGACTCGTCCATCACTTGCTGATCAACGTAACCAAAGCCGACCTGCGTATTATTTCCCAAGCCAACATAATCTCCACCACTCATAATCGTGACAATGATCAATTCCGCTTGGTTACGTAACGCAACAGCAATCGCCTTATCCAGCGCCCGTTTAGCCTGTCGCGAACCATCGACACCCACTAAAATGTGCTTATATTCTGCAACCATGTTCACCACTCCTTTGATCGGTTTATCTTAACCAACCTTATTTGGTGAGTTCAAAAATAGCTTGACCGTAAATCGCCATTGCTTTGAGTAAATCAGCTTCTGGCTGGAATTCATCAGCCTGATGCATGGTATCAGCCGTGCCGGGGAAGAGCGCACCAAAGGCAACGCCACGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP024635|656513:707357|688576_694174_-|WP_024525402.1|tail|DBSCAN-SWA 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56 | Lactobacillus_phage(38.1%) | portal,plate,terminase,capsid,integrase,tail,tRNA | attL 665180:665193|attR 712673:712686 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
710541 : 726126
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP024635|710541:726126|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP024635|710541:726126|712493_712769_-|WP_024525425.1|DBSCAN-SWA MAKVQELKIAPEFMEAQLNGLKNFEIRKNDRNFEVNDMLWLREWSNGEYTGRSASVSVTFITDYKQRPGYVVLSTRPVQLDTKKIVGKPIY >NZ_CP024635|710541:726126|719525_720269_-|WP_024525440.1|DBSCAN-SWA MAEAPSYYAIIPANVRYDQNLPGKAILLYGEITALCNQKGFCWASDDYFAKLYGVTKMTVQNWLKSLESENYISREVTYKKDTKEIEHRLIRIEMTPTKKNLGTPTQKNFRDNTTSINKNHSKAEKKDSIDYQKIIGYLNAEAGREYKNVGSNRKPIRARMNEGYSEHDFALVIAFKCKQWVDNNEMAKYLRPSTLFGEKHFDEYLNEAKQSLKKAKPAEPQSLSVGEGSARAANYLAKLEKQYEGD >NZ_CP024635|710541:726126|718280_719525_-|WP_024525439.1|DBSCAN-SWA MNDDIEKEIIAILLKNPKDIELINLNPEWLSDSDCRALYMAMKSTDDTSLMTIFGKAKTIFEQMTLGYSDLITLRSSAITDAHLSEMVKDLHRVYAENQLDQVIQMYQEAPYDDNLEKLSVAINSVNSIDERVDDGSIGAEAEELRYNLDHPVQAGIKSYSQLDTCLAGGFYGGMLFTLGARPGVGKTAYSVNLAAQMMSKNSKLHVDYFTLEMTKREMLNRFISRDTGVPSTVLRANANGLKPVLKQIVKQSSEKMERLNLAVYDQTKTLAQIASVIRRHASEAKQNEYIAFIDYIGLVTVPGFKERYLQVGEITRQLKVMANEYNVPIVALTQLNRGIESRQDKAPQLSDIRESGSVEQDSNVVAFLSRSSIQDDIINLDVRKNREGMLMQIKYQFNGQGMKFQELELDSSD >NZ_CP024635|710541:726126|711406_711658_-|WP_024525422.1|DBSCAN-SWA MIFKKGADKNGSLAEMRVGEMRGGKGIVAIITSINKIDYSFVDVIVEYEFESVEEWPKHKMDKAIKQNRISKFKVINGGIDND >NZ_CP024635|710541:726126|711090_711414_-|WP_024525421.1|DBSCAN-SWA MIDMRIGEYHITSEPRNYIVAFAKMFDDGTPKTITTKTGKVFNERILGYYNSISLALQAIAKDMMIRGDERIKTVDQYVQKTKSVDVALNHAVYEHGLELEKQSQNI >NZ_CP024635|710541:726126|716333_716717_-|WP_024525435.1|DBSCAN-SWA MAANEELMDKIRKAENEYGSSDDWPESVVKELNGLANRQPDGSEETIEAQELFRRGFTGNKVAEKMHRSSHWAATRKPIITDFEYTNEDLTELKRYEGKPIRWVAKRMGRNYLWVRGMREKIQEEEQ >NZ_CP024635|710541:726126|710541_710997_-|WP_024525420.1|DBSCAN-SWA MMEIDFNNVSMSDVFPKVDKQATCHKVASFLKWTLPRMVLIAGKSLTDLRSPNYDGMPKAPASGNSNDARIVQKLYAQEVIKRTVEAIGKCDKECRELLDMLYLQDYTDTMCYLDLGYSESTYSHSKKPKALLQFADVYLMEDLRVPAAES >NZ_CP024635|710541:726126|716738_717182_-|WP_024525436.1|DBSCAN-SWA MGYRHYENQSSRVQSISDTMVHFFQSQGIKVMRYNSYTTSSVYLKLDYGMLYTMRISDHLGKKYLNYRYNVTRGYQGVPRRQTDWGWDREFISFNRNRLNEMCLEIIRMRAKKISCLGLYGYQEEMDKRRKKNANQRGFWQKAKDLG >NZ_CP024635|710541:726126|715563_716337_-|WP_024525434.1|DBSCAN-SWA MNYLPKETLEYMREKTDEPILAVYLTGSYLNNLNVTGSDLDYYVVTFPPFEKLIFNRNEKVKQVNGDVDFKVMDLFHFISLVFKANPNVIELFYREPLYVNATYQTLGEWLKNNRKELPMLNSSGWERACIGLMIHSYQTFKRNKAYQGSGSDGKEAVNFFKAFQYFTYELNKGSLEGVVTFDDDLLRQWALEMKSYENVSDKEREQVANYMVRQIDAVKLNQGELERMPVPDQLMSNLIKTAKRTYFVGEQLLEDE >NZ_CP024635|710541:726126|722951_723230_-|WP_011667895.1|DBSCAN-SWA MELTLDDTKDSALIRGIIAVLLPALRKELSVKEELLTVQQLNEEYYHISNEAMAAIVRQKGYPSCDIPGNKNPKYSRRAVEKYIAEHQDYHN >NZ_CP024635|710541:726126|723318_723573_-|WP_024525445.1|DBSCAN-SWA MNPEYFAQEVAANAKKGMMDYDNIRFGAEVKSAASRGETKLSFDFRYKLSNEMLDALEGQGIELISLADDKYQFDISKLVNSLC >NZ_CP024635|710541:726126|712779_712953_-|WP_155278303.1|DBSCAN-SWA MKNESKIKIDVWSSPQLAGVEWHDTIELPANATQTEIDKAAKEVAFEHLEWGYDIVK >NZ_CP024635|710541:726126|711688_711880_-|WP_024525423.1|DBSCAN-SWA MTCLPMKVEKRGYDKSLSTGEIVDFKGKKYVIIFIQKMTSYNWLNSPVIEATVVGQEVGSPNP >NZ_CP024635|710541:726126|713191_713635_-|WP_024525427.1|DBSCAN-SWA MIKIYQKQPIQAEQFNGTTDSANRLGVEWEDGNGFIGDPSYTPESQPCWYIPEDKFTVFGYDENSIKPDDWIIECSGNIRLIMTNNEFKKDYAELPVIPKSWADTIEEYKANHYRMDEIFTEWSWNYDEQELIARAWLDGYQVEEDK >NZ_CP024635|710541:726126|714248_714500_-|WP_024525430.1|DBSCAN-SWA MTNEIKDNSITVKGSVLNSTEKTVNKGQVIELKVRIPADQFDGKRDAFAQVLEGHSIMTFTPNQTELDTDGEDNPDQTELDVD >NZ_CP024635|710541:726126|723801_723990_-|WP_143447255.1|DBSCAN-SWA MNFSQAERLITQLVEINKTLKVIASNQERSVDSKIDGKSINDTIYRQLTNELKDLEQEHPCI >NZ_CP024635|710541:726126|725316_726126_-|WP_024525449.1|DBSCAN-SWA MQEVALSNDLTKLTTEIKTYQSIGGQAIFEIGRRLKWVKENDLAHGEYDSWLKEINTSRSQAHKFIKVAKEYSNVPTSAHLGINVLYEIATMPPDERDKPQTLESGETKKPDEMTVRELRETKKKLKERDKDVADRDAKINELSDKEPEIVEKVPDDYGMLQGMVENQKATIDRYIKDNSELREEIDDLQDQLTDRQPEQTSSLNDLLAEFIGKAFPLADSNEFVKSMNHPSQAKSIQMNIESIDKWCLELKERFKSSTVIEGDFTNEK >NZ_CP024635|710541:726126|711876_712044_-|WP_155278302.1|DBSCAN-SWA MVSKRTIGTIICFLGGALALMFGKPVIKVDFDNMFAMVDISMVAFGTGLILGGGK >NZ_CP024635|710541:726126|715183_715564_-|WP_024525433.1|DBSCAN-SWA MVPKFRAWNMPFGPKGPMQEMVHGRAGSILTQAEMTPDDYIVEQYTGLKDANGKEIYEGDIVRMHVVLLSPDDKVGYVEYHKKYGYSLIMKDRRCRQEYWAADDKATYEVIGNIHENPELLEGKVE >NZ_CP024635|710541:726126|713645_713993_-|WP_024525428.1|DBSCAN-SWA MEKEAIAKLIGTLDGQLSSLPTVAKDMVHQYVVTNYVFSAIWAVLLIATVITVICVVRYVTRRRQEAKYWCSDDDMGVWIFSVIGLFIGFVFLGISLYCLWNALNPIISIISSVG >NZ_CP024635|710541:726126|712076_712460_-|WP_024525424.1|DBSCAN-SWA MKLSEVSVGQKLYLVYSNRGEYQTYDVNVTKVNTSSIYVKKPDNGYERRFTRKGKFPLRENDRFGGWLGINYLTDVPNQADIWEKRNERNKKLDDELERYMMKISSIGDPDEKESVIKAVASLVATK >NZ_CP024635|710541:726126|717184_717874_-|WP_024525437.1|DBSCAN-SWA MQLFLPVEKDPDGKLLINLSDVDPPTRRIIAGNVGQLAEIKFDDGRHISADQRKKVFALLHEIDRWSGNYVMDVTEHQMKYMFLRQRGLYEEFSLSNCSLEMASRFIEFLLGFCFAYNVPIATKVVDSIREQYGWDMYCLRYHCCMICGAHADIAHVHAVGIGRNRQTISHIGNYVMALCRKHHQEQHSKGIVTFMQDNQLKGVKVTSEVAKMLKLGNWRQEQGEDVEV >NZ_CP024635|710541:726126|722445_722625_-|WP_024525444.1|DBSCAN-SWA MNKVGKQDLIEAYESIEVSLQQRIALTPVSQFKQLLHDFTQLYRTKGKLARLKGVSANG >NZ_CP024635|710541:726126|723990_724479_-|WP_024525447.1|DBSCAN-SWA MLSEHKRKILQHQSDMILNRHSEGTPFNKTDLQRLIFSEVKLIDLDNYNYKINEMASANDARNLIAINDLIGQLSPREFSQIFPITKEYDGHKYGAKDYFSVTEYINSFGWDTMIGNGFEFVMEYLNEDVQDLCVATMMVVSHSTPELDIFSVLDHLEGGNK >NZ_CP024635|710541:726126|717874_718288_-|WP_024525438.1|DBSCAN-SWA MTSQYMSTQDFNEIMNSNGWHMSQAVKVYLVKASHCYKQYQLMTKAAKVHPQNKVLQAEYRHLDELRASYVWDALDTAEIEYLQQWRFLEDKGDFIQAMMLKYHGDLSKCTNEEKAKADYIEALESAKQQEIRNGVR >NZ_CP024635|710541:726126|714514_714712_-|WP_024525431.1|DBSCAN-SWA MNENQKVFRRFVLRSFEDHHEDMTQALGWCQLHFYSLLKVDRDAIQQLSSRERNAVISEILLANK >NZ_CP024635|710541:726126|714725_715187_-|WP_024525432.1|DBSCAN-SWA MKSPTALNKHGTKVHLDGYTFDSQKEADFYTRFVRDSGLQYTIHPKYVLTPLTELGKVKASQISYKPDFVIYKDGKISHVYDVKNSFGVYGIDGSVKLRFKLFLLTQGIPVEAVVVRKHDFKVIAQGITKQRKSTQPLVCTNLLYEWIEATNL >NZ_CP024635|710541:726126|713993_714248_-|WP_024525429.1|DBSCAN-SWA MASKSDFEKVTAYLFVLSVGVGLYPIQIIGEFMRDVNSRVEVDPSLDIGVPGDIKKIYEGWTDKEEAAFLIFFGRACMDELEDN >NZ_CP024635|710541:726126|720860_721559_-|WP_024525442.1|DBSCAN-SWA MKFYKDGAIQPIPNMYFVYGDGGTGKTSLVKQFKGHKLVFSFDMSSNVLIGDKDVDVAILEEKDAPTVQNLVSTMVTRAFSQDKYDVIVLDNVTALQNLVLENIDGASKDGRQNYQKLQLWFRKLGMALKESGKTIYTTAHQIDTGNGDGLSSKGRFAADMNEKTFNAFTSMFDLVGRIYLKDGQRFIDLDPENGNHAKNRLDNRKLIKADELLDVKKTETKKTTKKETDKK >NZ_CP024635|710541:726126|720282_720864_-|WP_024525441.1|DBSCAN-SWA MSLFTTDSSNVFGTGVQEAGSYNVKIVKAEAGKAKNSGRETLTLDYQVLDGKYAGGEIRYQTMTWIDDDSEKLKQSIRRFNTLVVALGVGDGVTIESIPQLAKSVLNKELTVDVDWGDPNNKGNVYLEVRGYHLLDPEGSKPNGIKRSDSQSNKQHNGGFNNASTGTPTPTADPFAGNGSGDTVDISDDDLPF >NZ_CP024635|710541:726126|724478_725327_-|WP_024525448.1|DBSCAN-SWA MKNNDLNIFSAQDMLQPNRGYKIGEVFKTDDYSLFKLSKFNRTVILRKAMIEQARQGLIAPIVVNENFVVIDGQHRLAASKAAKVPVEYIVKPGLGKNDIVRMNTIQRRWSLEDYVDAFANQGNPTYIQLATLINQKYADITTTIEVAVNLLTPHGAREKIENGKFEFFNYGKTIEFLHFYENFRKKTGTPKRTTVTTALYMLFKIKKFSQERIIKKVVSTGLNEDIKVKTFNHSDILKELIDSYNTQLSPKNPKYINYHVTSTGKIVIDEELSSWADMEES >NZ_CP024635|710541:726126|721559_722453_-|WP_024525443.1|DBSCAN-SWA MAENELVTFEPNIEVNPTPIVINNLEQLEMAVNGVVTKYGQDFVVTSDNVADTKKMRANINKIAKSINDKRLETDRQYKKPMADFDDLMKELGDKVKNLLDPLDSKIEEIETQERQARYDSVKAEIAEMAPNYGVSATDIEIQPGWLLKSLSHKKLLEQIAEAMTQLRKDRDQRATDIQTVRMYADQLELESSGWAALISKGEPVSDILAEMDAAAAKRDKERQKKAEKAKAAKEAQAAIDATHQVKQGDETIDTDTGEVVPQVITVKLTGTHKALGQVWAGAKQLGVRVELVDKED >NZ_CP024635|710541:726126|712949_713195_-|WP_024525426.1|DBSCAN-SWA MKYTVELQFKRFNLSTLREETLTMSLKEQSVGFRRMMETYFVTDDGWDQDNGYEITINDRKHQTNGKWWLDSVLRIPEVDK |
33 | Lactobacillus_phage(80.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
831267 : 885978
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP024635|831267:885978|DBSCAN-SWA ATTAAAGTAACTCTGCAAAGACATCTTCGTTTTGATTCAAATAGTTATCGTCCGGATGGATATCCGTGATAATCATCCCATCTAACGCTTCTTGCATCAAACCATCCACGTCAATATATTTTTCATATTTACGAGATTTCTCTAAATCTGGATGGGTTTTCGGTGCCGGTGGTGTAAAGATCGTACAGCAATCTTCGTATGGCAAGATCGATAGATCATAAGTGTCGATGCTTTCGGCAACCTTGATAATCTCCGTCTTATCCATCGACAATAGTGGCCGCAGGATTGGCATCGATGTGACATCATTAATAGCTGCCATACTTTCCAACGTTTGTGAGGCCACCTGTCCCAGAGACTCCCCATTAAAGATTCCTTTAGCGTGTCGGCGTTCAGCCACTGCCGCAGCTAGTCGCAACATTAACCGCCGTTGAATCGTCATCAGATAGCCTTCTGGTACCTTTTCTTTAATCGTCTCTTGAATCTTCGTGAACGGTACTTGAATAAACTGGATGCTCCCAGAGTAACCCGCTAGCCGAGCCGTTAATTCTTTGGCCTTGGCGAGTGCCTGTTCAGATGTATATGGCGGACTGAAGAAATGAACCATATCCAACTTAACGCCACGGCGCATGCCGTAATAGGCCGCTACTGGTGAATCAATTCCTCCAGATAGCATCATGACTGCCTTGCCGCCAGTTCCAACTGGTAATCCACCAGCACCTTGAATCGTCTGGCCGGACAAGAAGACCCCATTAAGACGGACTTCGACCCGTAAAGTTAAGTCTGGTTGCTTCATCTTAACCTGAATGCCAGGGACGTTCTCTAAAATATAACCGCCCAATAGGTCATTCAAATGGTTCGTATCATATTCAAACTGTTTATCTTGTCGCCGGGTATTAATCTTGAAAGTCATCCCCGGTGTAAAGATTTCCTGCACCATCGCTAAAGCCGTGGCTTTAATAGCCGCGATATCTTTCTCAACTTTCACGGAAGGTGAAAAGTTCTCGATACCAAAGACGCCCTTTAACCGATCCATCACTGCCGTTGAATCAGCACCATTTAAGGTCACATGTAATCGGTCATGCTGCGCTTTGACTTCAATCCCGTCAAACTGATGCAAGGCTTTGCGGGTATTTTGACCAAGTTGTTTGATAAAGTCTTTCTTGTTCTTTCCCTTTGTCGACAACTCGCCATACCGCACCATAATCTCGCTGTATTCCATTGTGCGACCCCTTTCGTCGTTTAGCGTAACTTGGCAAACCCACGATAGAGTTCGTCAAATACTTGATTAAATTGTTCAGCTTCAGCCAACGTGTTATGTTCATCCAACGATACGCGAACCGCACTGGTTGCAATGCCATCATCAATCTTCATGGCTTGTAATGTACTGGATTCAACGTGTTTTTTAGAGGAGCAGGCACTCGTGGTTGAGATATAAATCCCGTGTTCTTCAAAGGCATGGACGATAGTTTCGCCCCGAACACCTTCAATCGCAAAACACAGAATGTGTGGTGCAAATACCGGTAAATCTTTAGAAAAAATAGTGACATGTGAAAATGTCTTGATGTGGTTAAGAATTGTTAACCGCACCTCTTGTTGTCGCTGGACTTTTGCAGCTTCATCGTCTAACAACAGCCGTAGTGCTTTAGCCATTGCAGCAATTGCGGGTAAGTTCTCAGTTCCGGAACGTAGATCCCGTTCCTGACCACCACCTGTCAACAACGGGGCAATCGTCCGACCTTGGCGCTTATACATAAAGCCAATGCCACGTGGCGCATGGAATTTGTGTCCCGAGAACGTGATAAAGTCAACCCGATCATTAAAGATCAGATCGTGTAGTCCTTTACCAATCCCTTGAACGGCATCAATATGCCAGTGAATTTTAGGAAAGTCCCGCATCACATCCGCAATTTCAGCCAAGGGTTGTACGGCACCAATTTCGTTGTTGACGGCCATCGTTGACACTAAAATCGTGGTTGGCCGAATAGCAGATCGCAAATCGCCTGCCGAAACTCGGCCGTTCTCATCAACGGGCAAATAAGTCACCTCAAAGCCCAGTTGTTTCAACTGTTCCATGGAGTTGTGCACGGCGGGGTGCTCGACTTCGGTTGTAATCAAGTGATTACCAAATTCACGTTTTGCAATCGCCGTTCCTTTGATGGCCCAGTTATCGCCTTCGGTTCCCCCACTCGTGAAGAGAATCTCACTGAGTGAAACACCTAGTAAATCGGCAATCTGTTGGCGCGACTGTTCCAATAGATTAAATGCCTGTTCGCCAAAGTTATGCAAACTAGATGGGTTACCCCAATATCGTTCACTGACTTTCGCATAAGTATCCACAACCGCCGGTGCTGCCTTAGTTGTGGCACTATTATCAAAATAAATCATGCTGAACCCTCTTATCTCTTTTCTATTGGTTCGACTCCGATAGAAATTCTTTCTCATTATAAACACAAACGTCGTGAACCACAAGGGGGAGCCACATAATGTTAACGACACAAAAAAACGCGAACCCTCTAACGAGCGGTTCACGTTTTCATCAATCTTTAGTTGTGCGGTGCGGTTTATCCGTTCCTTTACGTTGATAATAGGCATCTTCTAGCCGCTTGTATGACCCAGGCTCAACTTCATCTAAAACTGTCGCGATTGTTTCTAGGGCCTGCGCATACTGGTACTGATGTTCAAACAAATCCGAGGCCTTTTGACTAGCTTCGGCCACATTGGCATGACTTGTTTGGTAGCGGTTGGCATACTGCAACAGTTGCTCCGCCAGTTGGGAACTGTCCACTAAGTCTTCAGTCTTCTCTCGTAAGGTGTCTAAATCGGTTTGAATGATCAATAGCTGTTTCGTAATACGTTCCATGTCAATTTGGGGCTGGTCCATATCCGTTGCTAATTGTGCCACCTCATCGCGAACCACGAAGAAATAATCCAAGTAAGATTGCGGAATGCCCGGCAAGTTCAAATTTTCCACCTGACGTCTTAAGCTATGTAGATCAAAATCAAATTGTTGCAAGGTGTCACGAGCCTGACGTTCTTCATCAGCGAGTCCCGCCACACTCTTCAAAATATCGGCTTGCTGTTTCTCAATTTGTTCCAAGTCTTTTTCTTGCTGCTGTTGATGCGCTAAAATCTGGGAGTACGTTGCCGTTTTTCCGGTTAGCGTTTGCACATCTTGTTGATAAATACCATCAATGTGTCGTAACTGCTCATTAAGCTCGCGAGCCGTTTCTAATTCATGATGATCTAACGTGTAGTTTTGTCCGAGACGATCCAGTTCATTTAATAGCATATGACTTTGATTCTGAGCATGCGCAATGAACTTAGCAATCCCATCTAAGTTTTTTTCAACGGGTTGTTTAGCGTCAATTTCTGTTTGCATCAGATCATAAATCTGGTCAATTTGTTTGGCAATTCGTTCGTTGACCACCTGTGCATCTGCCGGTCGAAGGTCACTAAGCGTTGCCAAGTTCTCTTGAATGTGCTGTTCAATTGCCGTGACTTGCGCCACAATGTCTTGATCGCCGAAGTGAAAGTGTTCAGCGCTCAATTGCTGATACCCGGCTTTTAACTCCTTCAATTGATCGGGGAACACCACAGTCAGGTCTTTATACAACGGTGGAATCGTGTCAATTAGGTCATCTAATTGTTTCGTATCATCTTGTAATTGGCTTAAAACATCAGCCGCTCGTTCATGGTCGCCTTCTTGGGTCAACTGGGTAAACGTGTCAAAGTTCCCTTCTAACTGACCCAAGCGTTCCTCTAAACCATCAATACTAGGGCCAAATGCAAAATTTTTGGCCAGCAAAGTCTTTCGTAAATCTTGATACTTATGCTCTAATTGCTGAACGGCCTCTCGGTGCTGCTTATCAACTTCTTGCAAACTAGCCAACTTTTCTTGGACGGATTGAACCAGCTCGTCTGTCTGGTTAACGAGTAAGGTCACCTTATCAAGGTTTTTCTTTAGTTGAAGCACATTTACCCCACGGGCATCCGCGAGCAATTGACTGAGCTGTTCATCAATTCGGGGAAACCGATTCGTGGTAATGTCCGCATAGTCGGTCTGTAAACTTTGATACCGTTCTAAGGACTGTCCGGTTAGACTTAATTGTCCAACTAATGCCAACTCGTCTTTTAACGGGATGGCTACCATGGATTCTTTTTTTGTCGTTAGCGCTGCCACTTGTCGTCGGATACGTTGCTGGTATACCAGCACGCCAACGTAAATGACAATCGCTAGTATCACGATTCCAATTAGCACACCTATCATAATTGACCCCATCCTTCATCGCTTTTCATCATTTATCCGAGTTGCAAAATCGCCCGGTTCAATTTACAATTTAATCTAACCTCGATTATAGCATAACTCACGCCTAGGCTTCACTAGGTTTTCACGATTCTCTATCCGTTTTTATGTGTAATTGAATGATTCAAACATTAAACTTTGGAGGTCTTTACAATGAGTGAGTCCCTAAATCCAATCATCACCAAACAGTTGGATGCCCTATTATATGGAGAAACAAACCTGGTGGCCAACTTATCTAATGCCGCAGCGTTGCTTAATCAAACCTTATCAGACATCAATTGGGCTGGCTTTTACCTCTATCAGCCCGAAACGGATGATTTAATTCTGGGACCGTTCCAAGGTAATGTCGCCTGTGTGCATATTGAAAATAACCACGGTGTCTGCGGCACAGCATTAGCCACGCAAACCACACAGCGGATCGCCGACGTTCATCAATTTCCTGGGCACATCGCTTGTGACTCGGCTAGCAATGCCGAAATTGTAGTTCCGTTGACCATTGGTGAAACGAAATTTGGCGTCTTAGACATTGACTCACCAACTAAAGACCGGTTTACAGCCGCTGACCAACAGGTCTTAGAAGAATTTGCTCGGGTTTTGCTGTCACACATTGACAAAGCCTAGCGTTTCCGGTTATACTGGTCGTTGTGTAAAATAATGCAGCGATAAGTGGTAAGCTCGTCAACAGATTGTTGCCGTT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59 | Bacillus_phage(30.77%) | portal,terminase,capsid,head,tail,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2443833 : 2518618
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP024635|2443833:2518618|DBSCAN-SWA ATTGCGTGATCCCATTAATTACAACGCGTTTACCCGTGAGCAGTGGCAACAATTCTCGGCGGACGCTACCTTGCCACTGACGCAAGAAAGCTTGCGGCAGATTAAGGCGTTTAACGACCGCATTTCGCTGCAAGATGTGCAGGATATTTATATTCCGCTAGTGCACTTGTTACACTTGGAATTTGATCATTATCGGCAGTTACAACGCGATAAAGCAACCTTTTTAAAGCAACCACAACAGCGAGTTCCATTTATTATTGGAATTGCCGGTAGCGTGGCGGTGGGCAAGAGTACGGCTGCACGGTTATTAGAAGTGTTGCTTAATCACTATTTTACGGATCAACGGATTCAGCTTATTACGACCGATGGTTTTTTATATAGCAATGAGGAACTTAAAAAACGTAATTTAATGGCACGTAAAGGGTTTCCAGAAAGCTATGATATGACGGCACTGATTCAATTTCTCAATGACGTTAAGGCGGGAAAGGAACTGATTAAGGCCCCAGTCTATTCGCACAAAGTGTATGACATCGTTCCCGATCAATTTGACTACATCATGCATCCAGATGTGCTGATCGTTGAAGGCATCAATACCTTACAGTTGCCGACTAACGAGCAAATTTATGTCAGTGATTTCACCGATTTTTCAATTTACGTAGATGCCGACCCAACGCTGATTGAAAGTTGGTTCTTGGAACGGTTTGAATTACTGCTAGCGACGGCTTTTCAGGACCCGACCAATTACTATTATCCTTACGCGATTGGCGATCATGATGAAGCCATTGCTAAGAGTAAACGGGTGTGGCGTGATATTGATTTAAAAAACCTGGAAGAGTATATTTTACCAACTCGCAACCGGGCCGATATGATTATTCATAAAACATTCGGCCACCGGATTGATCGATTGCTGTTACGGAAATATTAGGGGGCGATGGGAGTGCTACGTGATGCGACCATTGTTGATGCGGATGCGGTGAGCATGTTGGTCTTACACGAACTGGAACGCCGACAGTTACGCCGATTGCGGCGCCTTAGTAAAGAGCAATTATCGCAGCTATTGTTTGTCGGGTATCACCAGTCAGCGTTTCGATATGGTTTTCCACAAGCGCGCGTTTATCAAAATCAGGGCGTGGCCGTCGGGGTAGCTTACGGGTACCCAGCAGCCGTTGAAATGACATTGGATAATGAGTGGACGACCCTGTTTGAACGCTTGCAGGTGGCACCACCGCAGCAGTCAGTGGTCTCACCGCGCGCGTTGTCTGATGAGTGGTACTTGGACTTGCTCACGGTACGTAACCGTTCGCAACACAAGACTTATCAACAAAAGTGGTTTGACGAGTGGTTATTTGGGGATGCTATTCATCAGGCCCGTTTGAGTGGACAGGCCTTCCTGGGATTAGATGTGCGGTCTGGGAGTCGTTTGGCCCAGCTAGCGGCCATGTTTGGGTGTGTGACCACCGAACGCCGGCGCTTGGATCGGCAACCATACCTTCATCTGCGTTACCGGATAAACTAATTCGTGATAGATTGAACGTTGTTTTAGATTGACCCGCGTTTCAGAAATCGGTATGATATAAGCAATGTTGAAAAAGAAGAAAGGGTGAATGGCTTGGCAAACGTTGATATGTCTAAATTCGACAAGATCATCGTCTTAGACTTTGGGAGTCAATACAACCAATTGATCACCCGCCGGATTCGCGACCTCGGAGTTTACTCCGAATTAAAGGCCCATACGATGACTGCGGCTGAGATTAAGGCTTGGGGCCCCAAGGGAATTATCTTCTCTGGTGGACCAAATAGTGTCTACGACAGTAGTGCATTTAATGTGGACCCAGAGATTTTTAACCTCGGTATTCCAATTTTAGGAATTTGTTACGGGATGCAACTGATGGCCCACAGTTTGACGGGTGGTAAGGTTGAATCCGCTGATAACCGAGAATACGGTCGGGCCGATATTACGGTTCTGAGCGACGACGCAAAGCTATTCCACGACACCCCTAAGGAACAAACGGTGTGGATGAGCCATGGGGACTTAGTCACTCAAGTGCCTGATGGTTTTGAACGGGTAGCAACCAGTGAAAACTGTCCAATTTCAGCGATGCAGGATACGACCCGTAATTTCTACGGGATTCAATTCCATGCTGAAGTCCGGAACACGGAATACGGCAACGATATCTTAAAGCACTTTGCTTTTGATGTCTGCCAAGCACAGGCTAACTGGTCAATGGATGATTTCATTGATTTACAAATTGCTCAAATTCGGGAAACCGTTGGCGACAAGAAGGTCCTGTTGGGTCTGTCTGGTGGGGTTGATTCATCCGTTGTGGGCGTGTTGTTGCATAAAGCAATCGGCTCACAATTGACCAGTATTTTTGTCGATCATGGCCTATTACGTAAGGGTGAAGCCAAGCAAGTAATGGACAGCCTAGAAGGTAAATTTGGGTTGAACATCGTGCAGGTCAACGCGCAAGATCGCTTCTTGAGTAAGTTGGCAGGCGTTACGGAACCCGAAAAGAAACGTAAGATTATTGGAAATGAGTTTATTCAAGTCTTCAATGATGAGGCCCAAAAGCTGGATGGTATCGACTTCTTAGCCCAAGGAACGCTGTACACTGACGTGATTGAAAGTGGGACGGATACGGCCCAAACAATCAAGTCACACCATAACGTTGGTGGCTTGCCAGAAGATATGCATTTCCAATTGATTGAACCCTTACGTTCACTGTTCAAGGATGAAGCTCGTGAATTGGGTGAAAAGCTGGGAATGCCAAGCGAGTTAGTGTGGCGGCAACCATTCCCTGGTCCTGGTTTAGGGATTCGGGTATTGGGTGAAATTACACCAGAAAAGCTCCAAATTGTCCGTGATAGCGATTTGATTCTCCGTGAGGAAATCAAGAAGGCCGGCCTCGACCGAGACATTTGGCAATACTTTACGGTGTTGCCCAACATCAAGAGTGTCGGGGTAATGGGCGATGGCCGGACGTATGATTACGCCGTGGGTATTCGCGCTGTCACTTCGATTGATGGTATGACGGCTGACTTCGCGCATATTCCATGGGATGTCTTGCAAGATATTTCTGTGCGGATTGTTAATGAAGTGGAACATGTTAACCGCATCTTATATGATGTGACGAGTAAGCCGCCTTCGACTATTGAGTGGGAATAAGGCAGCTATAAATTAAAGGCATTGGGTGACAACCCATGATAGCGATAACGCGGTTTATCAGCGTTTTCTATTATAAGAGTTGTCACTCAATGCCTTTATTTTTCATCCATTTCTGACACCTGAGCTGACACCCAAGTGATTTTTGAGAATTTTTGGTCTTTTCCTGACACCCAATTTTAGATATCCTTTGAAATACCCTTAAATACGCCCATGGCACCCTCTGGGGTTTCTCGTGTATAAGAGTCGGTCATAGTGATGCTTGCGTGTCCAAGCCAATGCATGACATCAGTTTCGGGTAGTTTTTCTGTTCTCGCTTTTGTCGCAAAATAATGTCGTAGTAGATGGGGATGTATTGTGACCCCTGATTTTTGAGACACTCTTCTCATTATAGTATTTGTATACTGTACGTGATATGGTTTTCCAGTTTTAGGATTCAGCCACAAAAAGTGATCTTCTGGAGCCTCTATATTGTGGTCTTCAAGAATTCTGTTGGAATATGAGATTGCGTATTTTATTAGATCAACATACTCACCGGCAACCCAGATAGTCCGGTAAGATGACTCTGTTTTTAACCCGGTGCCTGTCGGTTCATTAGCAGTCCGGGCTACATAAAACTTAATGCCACAAATATCTTTTTTGTTGACTTCATCACGTCGGAAAGTGAAAGATGATTTAGTGCGCAGCCCCATCATCTCGCCTCGCCGTTGCCCCAATGTCATTAGCTTTATGAATGCATATTCGTATCTATTAAGCTGTTCTTTTGCAGTCTTCATGAACAGGTCAAAATCGCTCTTGGTTAGGTCTTGGCTTTTGGCTGGCTTGCCACCAGTGATAACTATATGTCGCAATTTGTTTTTTGTAATGACATCATTAATTTCAGCGTCATTCATAGTTTGCTGCATTAGAGAATCAACGCGATGAAGTGTGCCTTTCGTGTAGCTGCCGCTTAGAACAAGCTCGTCTATGAAGTGCTGATACTGCAGGCGGGTGATCTTTTGGATCTTTTGAGAGCCAAATGATTTGCGAAAATGGGTATTATAGTAGGTCTTATTCGTGCTGGCTGTTGAATTCTTCCAGACACCCATACGAATTTTACGTTCAGCCATTTGGTCAAAATAATTGTTGAGTGAAATCTGCTTACGCTCGGCAGTTGCAATTGAGCCATCGAACAGACGGGTTTCAAATTTCCTTAAGCCCTGTTCAGCATCTTGCCAATTCAAAAATCCACTCGTTGAATACCAATCATCTTTACCCATGGCGTTTCTATACTGCTTACGCACACTGTATCGCTTACCTCGTTTAGTTTCATACCAGTAAATATTGGGGTGTTTTTTCATTGCATACCGCTTAATTGCCATTGATATTCCTCCTAAATGGAAATTAGTTAGCTTGATTTTTCCAAACGTATGTTCTTTTCTGCTTCTAAATAAAAGCCCTGAACGGGCCTAATAAATATATTTATCTTTTAATGTCACCATCTTCGGGACTATGCTTCTCCCCGGAATCGAACAAAGGGGAGTCACCAGACAGAAGCTATCAAAACTATTTTTGTGGAACGTAGCGATTATTTTGTTGTTTTGAAGGCTGGCATAAAATAATTAGCATAATTAGTGATCCGATTGCTGGAACTAGGTTAATCAACCAAAATGCGCCATTATATCCCAGATCATGGAGTCTACGAATCTCGCCTGTTAGAGCAGCGATAAAAAGAATCACATAGATAGCTAACAGAATAATCAACATAATGAGGCTTGTGACCCCAGCAGGAGTTAGCTCACCGGCAATATCGGTTTCCATAAAGTTGTCACTACCACCAAGAAATACGGTTTGAATA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92 | Lactobacillus_phage(42.11%) | portal,plate,terminase,transposase,integrase | attL 2446977:2446997|attR 2493238:2493258 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2732774 : 2785111
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP024635|2732774:2785111|DBSCAN-SWA 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MERKDIVTIVANQDGGAHFDSELDQKYQNIKDGSTGIKVKAGSLTGYLTTGHIASEPTWITYQDMQLSLLREIVHETILSLIEWYKLDLPYNPDFDYNWHRKLNKLGINVSVH >NZ_CP024635|2732774:2785111|2760304_2760940_+|WP_024526669.1|DBSCAN-SWA MEKSESIKNLATSMAQFRKNLLKAQPSKDGKSHYGNYVTLEDLTAAVDGALPESLGYTQEATSDPNGVSITTMLFDASGEYIIYNPLSMPVQRKDAQAFGSAETYARRYSLSAAFGVSASKDDDGQQATKAAPSKTQNGTKRPADRVTTDQMTELTKLFKQTSEVTNGSLANVQKYYLGQFNVSNISQLTKLQADEIITVVKRKLNGGNKK >NZ_CP024635|2732774:2785111|2732774_2733344_-|WP_024526644.1|protease|DBSCAN-SWA MLAKITKWTILMIATIALTISTCGSTIFAAATAAKTPSWGSWDDTTITYKTENASSYYKNIWQDAVKRWNKVGVVKLKAATTGEKADITLTSSASLSTQGGKLAGYTNYSYYKKSGSDQIVSAKSTLNRSLLSKYNYTKSQRTNVATHEIGHALGLSHSASKSSVMYASDRYASIDHQDKVALDNAYNN >NZ_CP024635|2732774:2785111|2755177_2755390_+|WP_035466212.1|DBSCAN-SWA MYRVRKPDEVLALDETRYMSSAFLDEANITLDDLKFLLDGGILVDLSDGEYIHPFRLSSDALNYIQHRLK >NZ_CP024635|2732774:2785111|2733717_2734041_-|WP_024526645.1|DBSCAN-SWA MNNDLLVTTTEHIPGKEYEVIGEVFGLTTQSKNVLRNMGAALKNVVGGEIKDYTKMLDEARNISVDRLRKNARDMGADAVVMMRFDSGSIGTDMQSVAAYGTAVKYL >NZ_CP024635|2732774:2785111|2759809_2760295_+|WP_024526668.1|DBSCAN-SWA MNLYELEGNLLHVVELANSAKPEDQQLFADTIESLQDSIADKAIGYGKVINQLVADEKQLADKIKHDQERKRALSNNISRLKLALQHGMETAGKDKIKDIDLSIWIQNNPVSVAVTDDKLIPGEFTEVEKKLNKTAIKRALNEGEEVPGAKLVQTRSIRIK >NZ_CP024635|2732774:2785111|2750774_2751101_-|WP_024526655.1|DBSCAN-SWA MLISTLDQLPEEKNVETVTAIFSEYTAGINVFKDVTGGVKALLGKRTDNYEKDIIKARQTVLDDLVKQAEKHGANAILSLTFQYDQLTDSNITLITVYGSATAVRILK >NZ_CP024635|2732774:2785111|2772023_2773226_+|WP_096110518.1|portal|DBSCAN-SWA MFQLYQQKAGYKGQNFDFSNWQGHDFFGESNHALTTSEAVYSVILRLSNTVSSLPINLYHNYDVANMDVANLLKAAPNNSLHAFDFFSQLETSRDTKGNGYALIVRDQYLQPIELIPISADYVTPMINLDDQSLWYRITGRNKDATVFNSEVIHVKSLETIEGVKGISPIKVLKSTLEFDEAVQTFNLSEMNKTDSFVVQYDRTIDPEKRKAVLDDFRHFAQDNGGALFQEKGFSINQLSRDFQSSDMVNTEKITRSRIANVYNVPLSFLNESFSEGVSSNEELMTQFTQMTLLPIVKQYESEFNRKLLTDYQRQQGYYFKFNLNGLLRGNITARTAFYQMMIRNGIVTPNDVRALEDMPPDSDPMADTLFISGDLYPINMDPTQRKGVKSNDTTKVSDD >NZ_CP024635|2732774:2785111|2764866_2765223_+|WP_024526676.1|DBSCAN-SWA MLKIYNGWAFEEDENKKRDINANTFIKLIDRCKVGYGEDNGSAEYFVFNGEYLETKECELNELEVAFKHLPPTYNEIHAQVIVNKPRFNNDELLLLFDRGNLCFGGTVSNNILTVFTD >NZ_CP024635|2732774:2785111|2761375_2761933_+|WP_024526671.1|DBSCAN-SWA MSEYRQIPGYENLYEASSNGTIWTCEGKTTFRNIHGKRQKRVWKRRQIIPKREKRQSSTHYDLRVELWKNGSHQTKLVHRLIAMSFIPNPQNKPCINHIDGNSENNRPENLEWCTYKENQIHAFRTGLNKRCKRVELISTYDHKHHTFYSMAEASKFLKMNHGFVSGLVSRGIMNFGEYKILIKG >NZ_CP024635|2732774:2785111|2767881_2768262_+|WP_024526680.1|DBSCAN-SWA MRNYRLLASVLLISTVLLSGCTRTLEKIKNGKLPTDTYIIEKTNFGNEDVFSMIPIYISNGKTTTINWVPMWSQEKYLRVSYVYKGHIRKLSTDDYDVVKTHKHPFIKVKQGQVRSNNPSVVAYMR >NZ_CP024635|2732774:2785111|2748251_2748770_+|WP_024526653.1|DBSCAN-SWA MRWLFYIVVSLLWGSLIVRALFNRQYRRCWWWLGWWLLTTLTWTPVTLNFGSAVGGITTHWWAGGIWVTRPLQPASVDTSFWLNIVMTVPQGGLLAWNWPRLRWPQWVLAGILTGLTLEAGQALGNWLLGLGRWVDVNDVLTNATGIVIGAILFWCWRQWQQKMKGRGSKCL >NZ_CP024635|2732774:2785111|2775297_2775642_+|WP_024526689.1|head,tail|DBSCAN-SWA MNITVVSEDDLALLKNSLRIDSDSDDKLLANLVVAARKNIIGRIGNKIATFYDDNHEEFSLATILLASNYYNNRSAISDSEKYTVPLAFDDLIMSLKASYLLALSEVNDYGQEN >NZ_CP024635|2732774:2785111|2764214_2764829_+|WP_024526675.1|DBSCAN-SWA MENAMKVKISTGSITVSVKADHVLEFDDLFKIHQLATGGHDHLTIESDSQDDVKSDSDENIKDKFIHTDNVSQEMGEPRPDDVVKVAMACPFCGHTESTSALWKHSFTRCPNCHEKLFLRWATDVPGKPDEKGFYYKAETKFHSRYEDEKPDEFAEMFKHSDQEGVPDAYSTVEEIKKYLDSKGVDYSGCRLKGQFLELVKANN >NZ_CP024635|2732774:2785111|2783119_2785111_+|WP_080662579.1|tail|DBSCAN-SWA MAFNDVNTFDYAFNENGTGGFNSDKDLEVLVNHVSKPIAPTITESFQDVPGRFGGVFLGNSYGEKQIDIPITMYPTDRDDYNRILNNLSKALINTHDDADTQYPLRFNDQPDVVYYGHFTAIPTPTFISDGVQDCTTTLTFMLADPRGFLPQRDIKISSNEQIISPAGNTAVQPVIHIIPKTDLYYFGYTLGDQYVAVGYHVDDGSTTTDADGNVTSLTPHQELQVHDPCNSMSTWFQAGTDTQEIKVYRGENDGKATATATALMVAKDSKGHYNWGTTGKHKDFYGPVIIHQGIPKISNYWKVSMRFHHIKRMKNERAMGKVEGYLLDSNGNVCGRMGITDYAEGRYPRGYIQLGSSFNATKDKGNYLTLLYNEGGRKNNGQNNHDVKVHLTKTVKVKTTSKAKAKAKSARMYQATIQREAFKAAAKKKTTSKKKKKTTKKVTKKKSGGKSKSTKVSKPTVKTKSKTIKTYVMETTYMNSDAYSNFFGEFSLERQKKTIGGKVYDNWVAEINEFNPKTGVAYSINTEGKVHIHTEKLDKSGKFGFALANVAATFMKHDIKEDLVSPKVGYYSDFETLTDLKIYTSDGSDDPDDIPHVIAHAGEEIIIDSTDNTVTVAGRNVDKYVSWLSTFPSIEGDVSQEMHFTPDPANSDITLEYKPAIK >NZ_CP024635|2732774:2785111|2768930_2769248_+|WP_024526682.1|DBSCAN-SWA MTNKIEDIKLNIDIDATQAQHSMELLSKTLCNLIDKCEGAVKKQPHIRIEFDDIDDTPRVFVDGVEQQGLYHIELNWNSDSVISGRYRIDSMDNLGRLYGIGQGK >NZ_CP024635|2732774:2785111|2759558_2759807_+|WP_024526667.1|DBSCAN-SWA MALGGTTVEYDRKFATPVVTHINQTDEEKATLEYNAHVETLETLATDLQNCLEHATDEKYKRYLAVKLDRTNQRLEQLRTEE >NZ_CP024635|2732774:2785111|2739203_2739530_+|WP_011668242.1|DBSCAN-SWA MFESNHARYASYGTVAALPGEMIDAVWQIIDDDLQGLFPLANLLTFKLHNNQGQTTFEYVQTDDDQEVTLRAGFDTQFGYTPELPATVLAYDDGDSQIILLPSETAEH >NZ_CP024635|2732774:2785111|2777889_2778102_+|WP_024526695.1|DBSCAN-SWA MGRLNVLIHDLEDAQEDQAYFKQQLMANSGVLPSQLDGEDYYELIRINQAKPKDKRAEDPMAMVNRLRGK >NZ_CP024635|2732774:2785111|2751697_2752075_-|WP_024526657.1|DBSCAN-SWA MIKEFKEFIARGNVMDLAVGVIIGAAFTAIVKSLVDNLINPLIGIFLGQVDFSNLVFKVGNATFKYGSFINSIINFLIIAFVVFLLVKAINKIMPAQKEDSGETPVPTKEEKYLSEIVDLLKQDK >NZ_CP024635|2732774:2785111|2744822_2745785_-|WP_024526650.1|DBSCAN-SWA MTSVLVTAPIPQAALNILRQADLDVDCYNGHGLITKAELLKRVVGKDYLITPLSTQVDRDIIDADPQLKLIANYGAGFNNIDADYAQSRQIPVTNTPKVSTVSTAEVTAGLIIALTHRLVEGDRLMRDQGFDGWSPLFFLGHELAGKTLGILGMGQIGQAVAKRLAAFDMKIIYTQRHPLDATTAQALHAQQVPLTDLIAQSDILTIHCPFTPETHHLLGAAEFKAMKDSAYLINAARGPIIDEAALLTALQQEQLAGAALDVYEAEPHVDAGFKALDNVILTPHVGNATVEARDAMATIVAKNAVRVDQGQAPLYIVNP >NZ_CP024635|2732774:2785111|2740379_2741150_+|WP_021742218.1|DBSCAN-SWA MYQAIVFFDLDSTLFDDNKHVLPASVAAIHEMQQHHILPVIATGRNIFEIQYVLDGTGIDSVVGANGSYVQYQGQRLAAAVIAPELLTAVTSFAQRQHDPIAYYTSQGFRLSQANADTTENFQLLRLHPIVDPAWYATQQINFLNVFNRDHDQLYQEKFSGQLTFVRNNPRCLDTMVNGVTKQSGIRTLIQQAGLQGIKTYAFGDGYNDLQMFDEVDVPISMGNGVAAAKEKAAYVTTTNTTDGIVRGLRYFGLIQ >NZ_CP024635|2732774:2785111|2776389_2776776_+|WP_024526692.1|DBSCAN-SWA MKLPVTQVYEIIKANKSSWIDGLYPENIPNIVDKSGSKTLVLITSVSEPLSGYKNDTFSEFSASIQVQIFFSKTVAINVLDAQLELMNLLDDNGWIVATRYPNVVDPDTEQVTATFSVFKKIKIKRGN >NZ_CP024635|2732774:2785111|2734246_2734816_+|WP_024526646.1|DBSCAN-SWA MDKNDLSGSMSPESIGPKDRKLIDQFLELRQSYQAITQQIEHDLQTPLDHYQQKRLFYLDVGDLTHFRLNFFDTVGYFLRESLATTYHLEIWDRQTHQKRCYSLDELQRISRWEVEQGTAIETITYGRLGYRIRRTFDIYNRRLYVSKTEFFNANEQIPLIDGLMLLQQELNDHTLWIRGKLLRIKDFT >NZ_CP024635|2732774:2785111|2735310_2736018_-|WP_021742221.1|DBSCAN-SWA MTTLMAFLKNRTVQQLVIFTACQNSLWWLAGSTVNTGSPLTTLVKFYLLMYGGLLAAGVFLILNHHFQSRIGPVLVVAAATMGFLAAPNAHLVQFFALLICLFLVLVCLPQLGLQSVYGLVVFSCLAGCGIPVVLFFLRNHYLALQFLTLLLPLVASYLVFFEPYYLPAERDWRLTLISPLILIIIMSGVAFSWRILVVILIVAVHWWLQPRLNERYRLVTSGLLQLITGLFILL >NZ_CP024635|2732774:2785111|2763749_2764169_+|WP_024526674.1|DBSCAN-SWA MSSNKKMAAEIRAAYANYGEDPDDWPEDVKKEIRGQTEEEHTAENKILRHMILHGYTNKYIAQERSKTPQYIQQLRGRMQRRDELNYQATPDELTQLKYNVKHMNKPNNKGVASVMHRDKDWVRCMREKLREADDEARR >NZ_CP024635|2732774:2785111|2756488_2756698_+|WP_024526664.1|DBSCAN-SWA MPELLAGRELVNKYLDDNKISITSLGVTYGKGRMYMAEVLSGKKKNPAANQLILKIIDDFQIRPKEKED >NZ_CP024635|2732774:2785111|2755879_2756206_-|WP_024526663.1|DBSCAN-SWA MTLFDQIKFLAEKQKKSINDVEKELGYSKNTLYRLKKTNPSAKKLEELADYFHVSTDYLLGRVDNPTLDDKEKKVDLSDDDYIMTYQGKPIPEEDMEYIKRILNGGKD |
64 | Lactobacillus_phage(58.62%) | portal,terminase,protease,capsid,head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP024635.1|WP_042254721.1|2452531_2452729_+|hypothetical-protein |
2452531_2452729_+
Protein sequences of NZ_CP024635.1|WP_042254721.1|2452531_2452729_+|hypothetical-protein>NZ_CP024635.1|WP_042254721.1|2452531_2452729_+|hypothetical-protein MKKHEVIHFYKSGGFNHLVNVSVDDNLFAAVTFTDSEVKRIEQKYPLAKDNLFALVDGVEIKLKD |
65 aa aa | NA | NA | NA | 2443833-2518618 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.2|1633796|33|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024635 position: 2461169-2461137, mismatch: 2 cgccaaacaatcaatgtgctaacacttgtcatg CRISPR spacer cgccagacaatcaatgtgctaacgcttgtcatg Protospacer *****.*****************.********* |
||||||||||||||
| NZ_CP024635.1|WP_099963139.1|2492172_2492472_-|hypothetical-protein |
2492172_2492472_-
Protein sequences of NZ_CP024635.1|WP_099963139.1|2492172_2492472_-|hypothetical-protein>NZ_CP024635.1|WP_099963139.1|2492172_2492472_-|hypothetical-protein METKVYQVPTPDHRIWIICDQIGISVTTDPKTDMVPLTITDETVSGKGILTSMTLNGKSIEVLVDRANDQSVKLPSGIYQFHRNTPEAPAKAILQLAKK |
99 aa aa | NA | NA | NA | 2443833-2518618 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.2|1633796|33|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024635 position: 2461169-2461137, mismatch: 2 cgccaaacaatcaatgtgctaacacttgtcatg CRISPR spacer cgccagacaatcaatgtgctaacgcttgtcatg Protospacer *****.*****************.********* |
||||||||||||||
| NZ_CP024635.1|WP_099963158.1|2492846_2493104_-|hypothetical-protein |
2492846_2493104_-
Protein sequences of NZ_CP024635.1|WP_099963158.1|2492846_2493104_-|hypothetical-protein>NZ_CP024635.1|WP_099963158.1|2492846_2493104_-|hypothetical-protein MERQPLNGILESDPRTIKLSPLLLYVKIRDSKTNELINCLVHAHALDFLYRAEKGSPAALFGHYNSRKQFVITKYAFCATTVAIA |
85 aa aa | NA | NA | NA | 2443833-2518618 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.2|1633796|33|NZ_CP024635|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP024635 position: 2461169-2461137, mismatch: 2 cgccaaacaatcaatgtgctaacacttgtcatg CRISPR spacer cgccagacaatcaatgtgctaacgcttgtcatg Protospacer *****.*****************.********* |
||||||||||||||
| NZ_CP024635.1|WP_024526535.1|2519669_2519864_-|hypothetical-protein |
2519669_2519864_-
Protein sequences of NZ_CP024635.1|WP_024526535.1|2519669_2519864_-|hypothetical-protein>NZ_CP024635.1|WP_024526535.1|2519669_2519864_-|hypothetical-protein MKYLTKRFAGQSFISWGLQLLLIYLAWLVTDHKIQNNLWTIGTAAILVLLIYMSLAHDNHSRTK |
64 aa aa | NA | NA | NA | No | NA |