Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018062 | Enterococcus mundtii strain DSM 4838 plasmid pLDW-8, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP018061 | Enterococcus mundtii strain DSM 4838 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas14j,DinG,cas3,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
55668 : 61464
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP018062|55668:61464|DBSCAN-SWA ACTACTTAGGTGTTTCCTTTTCCATTATTTTACTAAGATAACGATAAATAGTTGTTCGAGAAACATTCCAACGTTCGGCAATCGTCTTAATAGGCGTACCGTTATCTACTAGAGTCTTCAGTAATTCCAAGTCCTGAGAAGTTAGCTTTTCAGGACGGCCACCAAACCTTCCTCTTGCACGTGCAGCTTCTCTTCCAGCAGCCGAGCGTTCCAAAATCAAATTGCGTTCAAATTCGGCAAAAGCCGCAAACAAATGAAACATAAGTTGTCCGGTAGAGCTAGATTTGTCCATTGTGATATTTTCTTGAAGACTATGAAAACTCACACCACGTTCATTCAAACGATTGACGATCGAAATCAGATCTTCCATATTTCTTCCCAGCCGATCCAAACGCCAAACTACGAGAGTATCTCCAGAACGAACAAAATCGATGGCCATGTCCAATCCTGGTCGATTACTTTTTGCTCCACTCATATGATCGGTGAAAATCTTCTCACAACCAAATTTGTTTAAACTATCTTTTTGTAAATCTAAATTTTGTAATCCAGTGGATACTCGGGCATATCCTATTTTCAAAAAAATCACTCCTAACTAAAATCTATTGTAACATAACTTTCTCCATATAGATTAATTGAACATAGATTTTGATATGGGTTTATGAACACTAAAAGTATAGAGAAATTTAAATTTAAGGTAAAAAAATAAAATGTCCAGAAACGGACCATTTTCTGGACACGATATTCTTATTTTATTTATACGTTCAACATTAATGCAATGCTTACGTTCATACTACGTTTTACTTTTTTAGGTTGACACATTTGAGATTTAAGAATATACTCTAAACGAATTAAATATTTCTTCGGGGCAGGGTGTAATTCCCGACCGACGGTGACGAGTTTACTCGAAGTCCGTGACCCACATTTTTGTGGTTGAGCTAGTGAAAATCTGGCACCGACAGTTAAAGTCTGGATGGGAGAAGAAAAATCGACTGAAGATCGGTTTTATTTGTATTAAAATCGATTATCTTTAGGTTTATTTAGTTATGCCCTGTGATTAATTTCGCAGGGCATTTTTTGTTGAAAGGGGGAATTGATATGCACCAGTCTTTCATGCTAGCTGCGATTGAAGAGGCAAAAAAAGGAAAGGGAAACACCTTTACCAATCCATTAGTTGGCGCTGCGATTGTCAAAGAAGGAAAGCTAATTTCACTAGGTGCGCATTTACATTATGGCGAGGCTCACGCTGAAGTAAATGCTATTCAAAATTGTGGTTCCCCCGAAGAACTGTTTGATTCAACTTTATATGTTACTTTAGAACCTTGTAACCACCAAGGAAAGCAGTCACCTTGTACGCAAGCCATTGTCCAGTCTGGTATCACAACGGTAGTCATAGGGCAACTTGATCCAAATCCTTTAGTAGCAGGAAAAGGCAGAAAATTTTTACAAAAGCATGGAATCAAAGTAATTGTAGGTGTCGAAGAAGAGACATGTAAAGGACTGAATCCTTTTTATAACCATTTTTTTGAAATGGATCGTCCCTATATCATATTGAAACAAGCCGTTACACTAGATGGGAAAATTTCTATAAAGAAAGATTCTCGGTACTCAATCACGGGCTCAGAGTCAATCTCAAGAGTACGCAAAGAGCGAGGAGAATATCAAGGAATCGTTGTGGGGAGCGAAACCGTTCTAGTTGATGACCCTCGTTTGTTACCTGATGCCGAAACTAGCTTTTCACCAGTGCGCATTGTTTTGGATCGTAGAGGACGGATCCTTAAAAATCCTAAACTCGATCTTTTTCAAACGACAACAAGTCCGGTCTGGATATTTACGGAAAATTCTAAGCTAAAGGAACGATTTCCTCATGTAACCATTTTTTATACACCTAAGTTTTCTTTTACGTTCTTTATTGAGACCATGAGAAAGAAAGGTATTCAGTCGTTGTATGTAGAAGGTGGAGCGAAAATCCATGATGCTTTTTTAGCAGAAAGTCTCTGGGATGAAGTCATCAGTTATATCGCACCCAAACTTTTTGGTGGAAAAAGTCCGATGTCCTTTCATAGTGAACGTTTAGTTTCTAAAGAACAACAATTAGCATTTTTGGAAGTTGAACAGCTTGGAGAAGACATTCGAGTTAGGGGGAAACGAAAGCAATGTTCACAGGATTAATCATTGAACAAGGAACAGTCAAAGAAATTAGACGAAGCCAACAAATGATCCAACTTACTTTTCAAGCTTCCAACAGTGTCCTACGTGATTACAAAATTGGAGATAGTATGGCAGTTAATGGGGTATGTTTAACTGCTATTGAGACTTCAAGTACTTTTTTTAGAGCTGAAATAATGCCTGAAACCTTTAAACGGACCACTATCTCCACCTTAAAAGTTGGAGATAGGGTAAATTTAGAACGAGCAGTTTCCATGATGCAACGCTTTGAAGGTCATTTTGTTGCGGGACATATTGATACTGTTACAAGGTTGATCAAGAAAATAGAGAATCAAAACGCATTAGTTTTGACATTTGCTTACCCAACTAAATATGCAGGTGAAATCATTCCACAAGGATCAATTGCAATTAATGGAGTAAGTTTAACCGTTACGGATACAACAATAGCAAGCTTTTCAGTTAGTCTGATTCCACATTCCAAATCTTTGACAAATCTGGGGAATTTAGGTGTGGGACATCTTGTGAATATAGAAACGGATATCATTGGAAAATATGTAAAGGCACAGAGAAATAAATTTGAGATGTACAAGGAGAAGGACTTACTATGAGTAATATTACTGAGGCAATAAAGACTTTGAAAAAGGGGGGGCTAATCATTGTAGCTGATGATGAAGATAGAGAATCAGAAGGAGATTTGGTTGGTTTAGCCGAATATGTCACACCTGAGGCGGTTAATTTCATGACCAAATTTGGTCGAGGATTAATCTGTGCGCCAATATCGAAGAAGATTGCGCAACACTTATCTTTAGAAGAAATGACAACTCATAATACGGATGCGTTTGGTACAGCTTTTACGATTAGTGTGGATCATAAACATACAAAGACGGGTATTTCAGCATTTGATCGAGCTACTTCCATTAAAGCATTGGCTGATCCTCATTCGAAATCAAGTGATTTTCTTAGACCAGGTCATATTTTTCCTTTGATTAGTGTAGAGGGTGGAACGCTTATACGTCGAGGACACACCGAAGCTGCAATTGATTTAGCCAAATTAGCTAATAGTATAGAGGCCGCTTATATTTGTGAGATCCTGAAAGAGGACGGCACGATGGCAAGGATGAAAGATCTGATACGTTTATCTGAAGAATGGCAATTACCCTTGATCACTATTGATGAGTTGGTAAATTTTTTAGAAGAAAGTAGTCATATAACAGTAAATTTACCGACAGATTATGGTGATTTCAAATTGACTATTTATGAAGATGGAGACAAAATGGAGCATTTATTGCTAACAAAAGGAGATATTCAAAATAGTCAGTCACCTACATTAGTCCGTGTTCATTCAGAATGTTTAACTGGTGATGTCTTTGGTTCTCATCGTTGCGATTGTGGTGAACAGTTACATGAAGCAATGAGAATGATTGCAGAAGAGGGTACTGGAGCTATTCTTTATCTTCGTCAAGAAGGTCGTGGGATCGGATTGAGAAATAAGTTAAAAGCTTATCAATTGCAAGAACAAGGATTTGATACTTATGAAGCAAATATTGAATTGGGCTTTGCTCCGGATGAACGGGATTATCATTTTGCAGCAGACATTTTAAAATCAATTGGTACAACTTCTATTCGGTTACTTACAAACAATCCCGATAAAGTAACAGAGTTACAACGAGATGGAATTACGATTGTAGAAAGAGTATCAATTGAAACCTTTCCACAAAAGGAAAACCAAGCCTATTTAAAAACAAAAAAAGATAAGTTTAATCATTATTTATCAGTATAAAAATAAAGGAGTAAAGACATGACGATTTATGAGGGAAATTATTCTACAAAGGATCTTCGAATAGGAATAGTAGTCGCGCGATTTAATGAATTTATCAATCAAAAATTGTTGCAAGGAGCATTGGACAATTTAAAAAGACATGGTGTGAAAGAAGAGCAAATTGATATTTATTGGGTACCGGGAGCTTTTGAAATTCCCTTTATCACCAAAAAACTTAGCAAAAAGGATAGTTATGATGGATTGATTACGTTAGGGACGGTTATCAGAGGAGCAACTACTCATTATGAATTGGTTTCCAATGAGGTAGCCAAAGGAGTCGCACATATTAACCTAGAGTCCAATATTCCAGTGATGTTTGGTGTATTAACCACAGAAACTATTGAGCAAGCAATTGAAAGAGCAGGTACGAAAGCAGGGAATAAAGGTAGTGAAGCTGCTCAAGGGTTAATTGAGATGATCTCTCTTTCACAACAAATTTAAGAATTATTATTTTTTGAATATGATGATTTTACTGCGGATCTACTAACTTTCAGTTTACTAAATATATTAAAAGCGGTTGTTGCTATCAAAAATACCTGTCAGGATAACTCTTGTCAGGTATTTTTGATAAGTAAAATGGTTACGTAGGTAATAATAATTTGTGTAATATTTTGCCTCTAAAAAAATGACATCTAGATTTTTTTGCGATACGCTTTTGTCTATTTAGGGTACACCGTAAAAAGACACTCTTGGGAAAAGCAAAATTGATAGCATTTTTCTATTTATTTAGCATATATTTATATCATTAAGTGGCAAAAATTTTAAATAACTTAACATTTGTAAACTCAGATCAAGTTACATTAAAATATATTGATCTAGCGAAGACGAAATTTGGGTTGTCTATTAGTCCTAGTTAGATAATCTATATAGAAAATGACATGGTATTAGGGTATATGGAATATAGAAACTAAAACACAAGATAGCGAAATTAAAAAAGCACAAGAACCATTGATGAATTCCATTGAAATAATTTCACCGTTAATCAATCCAAGCAGAAGTAAGTTTCGATTGATTATTTTCTGTTCTGAATTGATTTTGGCAAACTAAGTTCTGAATCAATCAAAAATATTCACGGAAATTTAGAAAGTTACGTTATCCATAAGCGACTCGTTGGATTTTTTTTATTACAGTAGTAATTTTTACAGTTAAGTCATTGTATAATTGTCTCTACTCATACCAATCCTATAAATATATTATTGATAATTATAAGTTTTTTATTAGATAACTTATTGGAGGAATTATATGACTAGAAAAATTTACGGCTATGCTCGGGTCTCAACTAAACAACAAGATCTTTCGCGACAATTAGATTTATTAGAAACTTATCATTGCAAAAAAATCTATACTGAAAAAATTAGTGGTGTCCGTGCAAGTCGTCCAGAACTAAATAAACTAAAAAAACGTGTAAAGACAGATTATCAAATTGTCATTGAAAGCTTCTCACGGTTTGGACGTAGCACAAAAGATTTAATTAACCTTGTTTATTTTTTTGAGAAAAAAGGAGTTAAAATAATCAGTATCAAAGAAAATTTTGATACTCAAACTCCCCAGGGAAAATTAATGATCACTGTTTTCCAAGCTTTTAGTCAATTTGAACGAGATATTATTGTTGAAAGGACCCTTGAAGGATTAAACTCTGCACGTGCAAGAGGTAAGGTTGGTGGTCGGCCAAAGGTAGATCAAGAGGTTCTTCAAGAATCACTCACATTACACCTTACAAAAGGATTATCTGTCTCAGAAGTTTGTAAAAAAACTGGGATAAAGCAATCAACTTTTTATCGCTATTTAAAACTAGAGAGGAATCTTTCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP018062|55668:61464|55668_56244_-|WP_071868067.1|DBSCAN-SWA MKIGYARVSTGLQNLDLQKDSLNKFGCEKIFTDHMSGAKSNRPGLDMAIDFVRSGDTLVVWRLDRLGRNMEDLISIVNRLNERGVSFHSLQENITMDKSSSTGQLMFHLFAAFAEFERNLILERSAAGREAARARGRFGGRPEKLTSQDLELLKTLVDNGTPIKTIAERWNVSRTTIYRYLSKIMEKETPK >NZ_CP018062|55668:61464|57820_58441_+|WP_071868069.1|DBSCAN-SWA MFTGLIIEQGTVKEIRRSQQMIQLTFQASNSVLRDYKIGDSMAVNGVCLTAIETSSTFFRAEIMPETFKRTTISTLKVGDRVNLERAVSMMQRFEGHFVAGHIDTVTRLIKKIENQNALVLTFAYPTKYAGEIIPQGSIAINGVSLTVTDTTIASFSVSLIPHSKSLTNLGNLGVGHLVNIETDIIGKYVKAQRNKFEMYKEKDLL >NZ_CP018062|55668:61464|60894_61464_+|WP_100917310.1|DBSCAN-SWA MTRKIYGYARVSTKQQDLSRQLDLLETYHCKKIYTEKISGVRASRPELNKLKKRVKTDYQIVIESFSRFGRSTKDLINLVYFFEKKGVKIISIKENFDTQTPQGKLMITVFQAFSQFERDIIVERTLEGLNSARARGKVGGRPKVDQEVLQESLTLHLTKGLSVSEVCKKTGIKQSTFYRYLKLERNLS >NZ_CP018062|55668:61464|58437_59613_+|WP_071868070.1|DBSCAN-SWA MSNITEAIKTLKKGGLIIVADDEDRESEGDLVGLAEYVTPEAVNFMTKFGRGLICAPISKKIAQHLSLEEMTTHNTDAFGTAFTISVDHKHTKTGISAFDRATSIKALADPHSKSSDFLRPGHIFPLISVEGGTLIRRGHTEAAIDLAKLANSIEAAYICEILKEDGTMARMKDLIRLSEEWQLPLITIDELVNFLEESSHITVNLPTDYGDFKLTIYEDGDKMEHLLLTKGDIQNSQSPTLVRVHSECLTGDVFGSHRCDCGEQLHEAMRMIAEEGTGAILYLRQEGRGIGLRNKLKAYQLQEQGFDTYEANIELGFAPDERDYHFAADILKSIGTTSIRLLTNNPDKVTELQRDGITIVERVSIETFPQKENQAYLKTKKDKFNHYLSV >NZ_CP018062|55668:61464|56762_57836_+|WP_071868068.1|DBSCAN-SWA MHQSFMLAAIEEAKKGKGNTFTNPLVGAAIVKEGKLISLGAHLHYGEAHAEVNAIQNCGSPEELFDSTLYVTLEPCNHQGKQSPCTQAIVQSGITTVVIGQLDPNPLVAGKGRKFLQKHGIKVIVGVEEETCKGLNPFYNHFFEMDRPYIILKQAVTLDGKISIKKDSRYSITGSESISRVRKERGEYQGIVVGSETVLVDDPRLLPDAETSFSPVRIVLDRRGRILKNPKLDLFQTTTSPVWIFTENSKLKERFPHVTIFYTPKFSFTFFIETMRKKGIQSLYVEGGAKIHDAFLAESLWDEVISYIAPKLFGGKSPMSFHSERLVSKEQQLAFLEVEQLGEDIRVRGKRKQCSQD >NZ_CP018062|55668:61464|59631_60093_+|WP_071868071.1|DBSCAN-SWA MTIYEGNYSTKDLRIGIVVARFNEFINQKLLQGALDNLKRHGVKEEQIDIYWVPGAFEIPFITKKLSKKDSYDGLITLGTVIRGATTHYELVSNEVAKGVAHINLESNIPVMFGVLTTETIEQAIERAGTKAGNKGSEAAQGLIEMISLSQQI |
6 | Staphylococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018061_1 | 2598510-2598623 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018061_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018061_1
>1.1|2598539|56|NZ_CP018061|CRISPRCasFinder TACTCGCTTGCGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCGCTCAACTCAACGAGTATTGTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018061_1
The CRISPR arrays of NZ_CP018061_1 >merge|NZ_CP018061|1|2598510-2598623|CRISPRCasFinder TCATCTAATCACTGCGTTCTTAGTGATTCTACTCGCTTGCGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCGCTCAACTCAACGAGTATTGTTCATCATCTAATCACTTCGTTCTTAGTGATTC >NZ_CP018061|1|1|2598510-2598623|CRISPRCasFinder TCATCTAATCACTGCGTTCTTAGTGATTC TACTCGCTTGCGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCGCTCAACTCAACGAGTATTGTTCA TCATCTAATCACTTCGTTCTTAGTGATTC
>NZ_CP018061.1|WP_071866450.1|2597944_2598448_-|50S-ribosomal-protein-L10 MSEAIIAKKAAIVDEVSAKFTEAASVVVVDYRGLTVDEVTRLRKQLREANVEMKVIKNSILSRAAKKAGLDGMDEVFTGPTAVAFSNEDVVAPAKIMDEFAKDAKALEIKGGIIEGKVSTLEEITALAKLPNREGLLSMLLSVLQAPVRNVAYAVKAVADKEDGDAA >NZ_CP018061.1|WP_010734285.1|2597517_2597886_-|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MALNIENIVAELKEATILELNDLVKAIEEEFGVSAAAPVAAVAAGGGAAAEEQTEFTVELTAAGDQKVKVIKAVREATGLGLKEAKAVVDGAPAPVKEGVSKEEAEELKAKLEEVGASVTVK >NZ_CP018061.1|WP_010734286.1|2596927_2597185_+|hypothetical-protein MSDLEHKEEKALDKIVATVNKLDKELNELDTLSENPEKKHNLKKWLVERKAIHEIKKILHEADKYEKYDEKELDKEFKEINDLLQ >NZ_CP018061.1|WP_081367414.1|2594773_2596297_-|putative-DNA-binding-domain-containing-protein MKFIELKDEIFTEPKENFQLEFKKSQTKLSNDVWSTYSAFANTNGGIIILGIEELVSKKEYQVVGVDNPEKVITEFWNCIHDKQKVSVNLLTNEDVQTFKVSGKSIIEINVPKAPYERRPVYINNNKSKTYIRTDDGDRIADDAQFKYLIVDSQNDIDSELLQNYDIDDLNLETVNEYRNLLYKNTNNSKYFELSHEELLKNIGVLKKDRQDSKSPYRLTIGGLLFLGKYNSITDRFKKFQLDYFKKQSFLDTDWRDRVSSGDMNYPEMNLFSFYNLVIQKLELSVPDSYRQEENMTRGSYRTDLLLALKEALVNTLMHAYYVSDKVIKIINCDDYVSFYNPGEMKVSKDEFINGSFSVTRNSIISTLFRRVGIAEKGGSGGPRIFEVATKNSLRTPEVDTNFDSTEVRIWKINMLESLSGLNEVETSIIKYAMEKPAFKIKDIVNSTSYKDHTVRKNVNNLVEKEMLQKIGNGKATMFVLSSSEETGVMTFKRLLKEIEVGFMKSK >NZ_CP018061.1|WP_019722298.1|2594192_2594387_-|hypothetical-protein MYYVEVQTRGVKNKQYVKTVRHNYPLLGSWEEAEPFSKECALQIKSILEQELTCGKANVTIIEK >NZ_CP018061.1|WP_071866449.1|2593718_2594069_-|hypothetical-protein MTYEVKVSKEILNIFSENQSKRYQEIILYKVNEYLTHNFYRIKLVDTPVKPSIYEMKIRLGKENFRIAFIIEDKEVQVFYISRTLKKELFDKEVNRFVHRFNKKHRITKSMKKVEA >NZ_CP018061.1|WP_071866447.1|2592428_2593106_-|TVP38/TMEM64-family-protein MKKQYIRNTLIGLGLLLILFVGYQLYLEYRPDIHLLLDPQASRKEWMREIRSHGVSAAFILTLLISLMCAVPGIPTSVIGVVVGLSYGPFLGTVINVTGNALGNILSIILMQHLSFMDHSKKENRWVKAIRRMKHPKIGVMIGYMVPVIPSSVVNFAATSLNLSVRELLLSILIGVVPSSLLYACGGEALFHGEHIKALVLVASVLVLTVLVVIIYRDRRKHLVK >NZ_CP018061.1|WP_071866446.1|2591154_2592348_-|MFS-transporter MEMNKQTPLSKSLILLLAITCGVVVANMYYIQPIGTKVAANLSVNTSAVGLLTMLTQLGYALGLLFLVPLGDVVDRPKLIIRMAGLSALSLLAAFFAPNFALFAVASFLIGLLSIVPQIIIPYGAVLAGPAARGKTMGILLSGLLMGILLSRTVSGLLASWFSWRSVYLFALCLVGALTVLLYLKLPRTQGTLEKESTVSYLASLKSLPKLVKEQRLLREAAINGFFMFGTFSLFWSTLIFYISSPAYGWGTFEAGILAIFGLSGAVAAPIVGRLADTYSERRIVGMGLVMQTISFLALFVAGDYVAVLLVAIILLDVGNQFGQVANQSRVQGLGEATSNRNNTIFMFMYFIGGATGSLLGSVMWQHYGWVGVTVTGLIFQLCAFFFQAIIYPDKRK >NZ_CP018061.1|WP_071866445.1|2589735_2590968_-|Fic-family-protein MSYKPLKITFYENRNEFEEEYNSRFNFFSTFKTGLKIHPFDREQRITTESYELFYIPLLEHENLKERIQKNSSEIERYISMLPPIIQRNIFNSQIIDEIKSTNDIEGIQSTRKEIGTAIKKRNSDEIVRFKGIVNMYMNLGESEFEEIHDIVKIRNIYDELFRKDIPEEDQPDGQLFRKEVVYIGSENKRVHQGNPNEETIIRDLNNLVLFMNRKDIPFLLKCVITHYYFEYIHPFYDGNGRMGRFLISNYLSRKLDFLTGITISNAITHDKKAYGKLFEEVSNPRNKADLTLFVQNMYQLIIDGQTKVIEELQIAKAKLDNAINNLKKLDLKDKDMVEVLFVLIQGHLYNEVNEYITDIELRKHLNISYPKLKQINQYLIAKKLIVQIKKKPSIHILSTEFQERLESFS >NZ_CP018061.1|WP_023520342.1|2588841_2589543_-|glucosamine-6-phosphate-deaminase MEIIRVKNAEEGGKKAFEIIKNGMENGAKVLGLATGSTPITLYKEMTSSDMDFSNMTSVNLDEYVGLGGSDDQSYRHFMNVELFDKKPFKETFVPDGKAADLDQACQSYDQIIEEHPIDIQILGIGQNGHIGFNEPGAPFDGKTSVVDLTESTINANKRFFDKVEDVPTKAVSMGIGSILNGKKIVLMAYGESKAEAIKGMINGPVTTDMPASALQNHDDVIVIVDEAAASKL >NZ_CP018061.1|WP_071866451.1|2598823_2599513_-|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKSKKMQEALKKVDSNKVYSVAEAVALAKETNIAKFDATVEVAYRLNVDPKKADQQIRGAVVLPNGTGKTQTVLVFAKGDKAKEAEAAGADFVGDDDMVQKIQNGWFDFDVVVATPDMMATVGRLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVTKAINEVKAGKVTYRVDKAGNIHVPIGKVSFDNEKLVENFAAIHDVLVKAKPSAAKGQYMKNITVTTTFGPGIHVDQASF >NZ_CP018061.1|WP_010734282.1|2599614_2600037_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKIVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGLIIPVVISVYEDRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAKIEKGSGEPNKNKVAKVSSDQVKEIAELKMEDLNAANVEAAMRMVEGTARSMGITVE >NZ_CP018061.1|WP_010734281.1|2600357_2601026_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKDLKYRSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAARIGKIVRSIFGDQPDSVDIYLYESFAKTYRGHGTDIALVGGLLGMEPDDSRLADSLRLAHEAGMEVLFVPKSEKADHPNSVKMLLKKGSRKLSVTGISIGGGNIQISELNGFKISLSMGTPTLIIVHQDVPGMIAKVTNILSETNTNIGTMTVTRESKGENAIMIMEVDDPQVEDTVKKLKQLPNIDSVNYFE >NZ_CP018061.1|WP_071866452.1|2601041_2601914_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFLSIEELVQQAQDYPSVAELMIAVEMEMSGRSREQIIKIMEKNLLVMEQSIAEGNAGVTSVTGITGGDAKKMDNYLSHADFLSGETILTAVRNAIAVNEVNAKMGLICATPTAGSAGVVPGVLMAVRDRLQLTHEQQLDFLFTAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEIGSASAMASAALVCAKNGTAHQAAQAVAITLKNMMGLICDPVAGLVEVPCVKRNALGSSQAFISADMALAGIESVIPPDEVVAAMYQVGRQMPSIFKETAEGGLAVTPTAKRLTKEILEKQT >NZ_CP018061.1|WP_071866453.1|2602027_2603338_-|amidohydrolase MSTLIKNVHVLTMDDQLTEYKNGYVRIEENRIIEIGEWRKGIASAEEVIDGAGGILLPGFVNTHTHAGMIPFRSLGDDVPDRLRRFLFPLEAFMTPELVAASTAYAISEMLLSGVTGFCDMYYFEDQVAQVCDQFKIRAILGETIIDMPVCDNVEPSGGLTYCETFLPKWKDHPLITPALAPHAPNTNTYEGLKRTVELSERYDVPITLHVAEMDYEMQELAKQYQQTPFELLKDLGFMNRPLIMAHCIHMTEADIALVATAGEQVGIAHCIGANTKSAKGVAPVKAMLSAGLTVGLGTDGPSSGNTLDLFAQMKLFANFHKTFEKDRALFPAKEIVRLATRGGAELLDFKETGQLVVGNKADFIIVETQSVNMFPIFDPYSALVYSANASNVAHVWVDGRQLVRDHQLVHHDLKQIKADLYEQMGQFVFEAKRRM >NZ_CP018061.1|WP_065096677.1|2603334_2605059_-|amidohydrolase-family-protein MKIDLLIRDAQVYNTAKQCFEKKHVTVSGEKFYYITTKDLSHLEILHEIDGRGKYMIPGLIDSHMHIESSMTTPSIFSKAVLPFGVTTVIADAHEMANVFGLEGLTEFMAAETELDIFHAIPSSVPSTTPELETTGGIIGLAETEKLLDNPKVICLGEAMNFHGIAHEPTSLIRQIIDLCKEKRPTMPLEGHCPKIYEEELAAFMYSGISSDHTHQFPESLAEKIENGMFIQFQNKSITPENMAVITENEYYDYACLITDDVMADDLLTGHLNENLRKAVEAGLPVEQAIYMTTYTPARRMGLNDRGLIGPGRMADFILLDDLSTFAISAVFKSGKEVYRQGEAITYPEKIEQFPASYSQTVHCKKLSLDDLRLPVKTDLASVRCNVIRKHEVGTFTERITKEIPVKDGYLDWENSDCALLLVMERYGKNGNVAYALMEEPISKPGSIATTWAHDHHNVMVMGNNCQDILLAQQKLLELQGGYVVVNEGKLTATCPLPIGGIVSQAPIEELGQDLKTVRREMQNLGYKNMNEIMSFSTLSLPVSPAIKMTDKGMMNTKTQEFYPLVFPSDGVLL >NZ_CP018061.1|WP_023520403.1|2605168_2606230_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
481564 : 489317
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP018061|481564:489317|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP018061|481564:489317|488555_489317_+|WP_071866639.1|DBSCAN-SWA MNVAELDLVTRFVLEKKANLHGGIYHLTQVEMAYNSNRIEGSRISEKQTALIFENNILPPAESGEATKLDDIKETENHFKGFDYVIDHIEEPLSNDFIKELHRILKRGTTDENNPLTPVGEFKLVQNMIGFGYDEVETTAPEEVTEKMTELLAHYENSKKQSLVEIADFHVKYERIHPFADGNGRTGRLIMFKECLRHNIMPFVIKDVHREFYYRGLSNWGTENGYLLDTLGMSQDMYEQFLKKMKFTGSVHQ >NZ_CP018061|481564:489317|484737_485559_-|WP_010736144.1|DBSCAN-SWA MEHFHSKEEEKTYYEQEASETDFLSWYQDQERPEYEKPSLTVDIVLLCYNKEEDQLKVLLIQRKSHPYRNSWALPGGFVQKNESTGASVLRETKEETGVIISEENIEQLHTFSTPNRDPRGWVVTVSYLAFIGEEPLIAGDDAKEVQWFSLERNANKLHLSSGDVAITLDLTTSESSGKDTLAFDHSEIIVKAFNRVVNKMEHEPQVLQVLGKDFTITEARKVFAKFLGIDFKMIDHSNFKKAMLQYFDEIGERPVGIGRPSKIYQLKPGHTE >NZ_CP018061|481564:489317|482621_483575_+|WP_071866641.1|DBSCAN-SWA MNKKLLEVKGLKQYFNVGKKNEVHAVNDISFHIYEGETFGLVGESGSGKSTTGRTIIRLNEPTGGEILFDGQDVTKLKGKEAMTKFRHEVQMIFQDPYASLNPRMKVRDIIAEGIDVNGLAKSPEERAEKVNELLKTVGLNPSHGTRYPHEFSGGQRQRIGIARALAVNPKFIICDEPISALDVSIQAQVVNLLQDLQKEQGLTYLFIAHDLSMVKHISDRIGVMHNGLLLEMGTSEEIYNHGVHPYTESLLSAIPLPDPDHERQRRRIKYQPEPDDGQIRTLREIAPEHFVYATEQEVAYYAKKLKRQKEALLVAN >NZ_CP018061|481564:489317|483587_484595_+|WP_071866640.1|DBSCAN-SWA MLKAFKFRIYPTDSQKQWLIQTFGCVRFTYNHLLKARQAYYLETQEIDYTLTPASLKKQYPFLKEVDSLALANAQLNLDRAFRNYFKGRASFPKLKNKKSIWQSYTTNNQKGTIYLEETYLKLPKLKEKIRIHAHRPIEGTIRSATISSRYNEIFYVSLLCEVPQKTMRASNKWIGIAYDPDRLVEMSTPLDITIPKFKQVDQQLLRAKRKLVIKGRSAQHRRTHVERVKNYQKQKRKIKDLYLKQKFQREDYLEQISGTVIRHYDYLFVESISADCPEGDFSIQDWHKLLAKLQYKSQWYSKKLVLIDMKEQTNPSTNKKSLELVEIGKQVLFE >NZ_CP018061|481564:489317|486206_488216_+|WP_010736142.1|tRNA|DBSCAN-SWA MAEKETFYITTPIYYPSGKLHIGNSYTTIACDAVARYKRLMGFDVFYLTGVDEHGQKIEKKAEELGVEPQEYVDKMAADVKKLWKTLDISYDKFIRTTDDYHKAAVQKIFDRLLEQGDIYLGEYEGWYSVSDEEFFTETQLAEVYKDEDGKVIGGKAPSGHEVELVKEESYFFRMSKYADRLLEYYEEHPEFIQPESRKNEMINNFIKPGLEDLAVSRTTFSWGINVKNDPKHVVYVWIDALSNYITALGYGSEDDQLFQKYWPADVHMVGKEIVRFHTIYWPIMLMALDIPLPKKVFGHGWLLMKDGKMSKSKGNVVYPEMLVERYGLDALRYYLLRAVPFGSDGVFTPEDFVSRVNYDLANDLGNLLNRTIAMINKYCDGMVPDYASLVTPFDSELSTTAANVVGRYHDAMEKMEFNTALAEIWVLISRANKYIDETEPWVLAKDEEKKKELESVMIHLAESLRITAILLQPIMTETPTKIFNQLGLDAETMNLEGLHFGEFPSGTKVVAKGTPIFPRLELEEEIAYIQAKMSEGTQTNEDSVKWDPEETELVSTKEKQIKFDVFEKVELKVAEVINCQKVEGADKLLQFRLDAGDDQDRQILSGIAEFYPDPSELIGKKLVIVANLKPRKMRGLISQGMILSAEAADGSLQVIEAPKGMPNGSEVG >NZ_CP018061|481564:489317|481564_482647_+|WP_019722498.1|DBSCAN-SWA MTKILEVKNLQISFDTYAGKVQAIRGVDFHLNKGETLAIVGESGSGKSVTTRSIMRLLSSNASIDSGEILFKGQNIVDKTEKEMQKIRGKEIAMIFQDPMTSLDPTMTIGKQVAESLRKHNKVSKKEGQKAALELLNLVGIPEAEKRIHSYPHQFSGGQRQRIVIAIALICYPEILIADEPTTALDVTIQAQILELLKKIQSKIDTSIIFITHDLGVVANVADRVAVMYGGKIIEVGTSEEIFYNPQHPYTWGLLGSMPTLESGNDRLYAIPGSPPDLLNPPKGDAFYPRNEFALKIDAEQAPPFFELSPTHQAATWLLAPQAPKVTPPEEIQRRWAIFQEKQKAHGQGGLNNEQKTARG |
6 | Planktothrix_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
609961 : 618674
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP018061|609961:618674|DBSCAN-SWA 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TGGTAAAATGGGGTATTCGTTGTATCGAAAAGTACGAGGTATCCATGATTCGCCGGTCAATGTCACCCGCGAGCGTAAGTCAGTCGGAAAAGAGCATACGTATGGACAACCACTAAGAACAGAAGAAGAAGTTTTAGGTCAATTACGTCAGCTAGCTGAGAAAGTAGAAGAGTCTCTCCGACGTGTTCAGAAACATGGAAAAACAGTTGTCTTGAAGGTCCGTTATACCGATTATTCTACAGTAACGAAGCGAGTGACATTACCAGAATATGTTTATAAAAAAGAAGCGCTGTTTTATCAAGCGAGTCTGATATGGGAAGAGATTTTAGGGATAGAGAAAGGGATTCGTTTATTAGGTATCACACTGACGAATTTAGATCCGATGACTTATGAGAATATTGTGTTGCCTTTGTGGGAAACGCAAGCGATAGAATCAGAAATAGAATAAAGAATGCTCCATCTTAGACTTTGAGACAAAAGCGAAATTCACTTCTGTCTTGGCCTTTTAGATGGAGCATTCTTTATTGTGTTCAATCAAAACTGAGTATAGTTAAATCAGTTCTTGTTTTTTTATTTGTTCATATGTTTGCGTAGCATCTGTACATTTTTCCCAGATGACGACTTGTTTTTCAGCAAGCGATCGTTGCACGTCAATGATGCGCTGATTACTACTTCCACGAAATTGTAATTTGAAATCTCTTTTTGACCATTCAAAACGGCCATCAACAAGAATATCGATTTTCGAGAGCAGTTCTAGTTTATCTTCCGAATCTTGTAATAATTCATCGAAGGTATAACCGGTCCAAGACCAGATGTCTTTGCTGTGACCAAATTCTTGCCGGATTCGATCGACTACACGTAGGCAAACATTCGTATTCAAAAAAGGTTCACCGCCTAAGAGTGTCAATCCTTGGACGTAATCATTGCGTAGATCAGCCATGATTTGTTCTTCCAGTTCAGCAGTGAATGGTTTGCCGTAACGGAAATTCTGAGCGGCTTTGTTAAAACAACCTTCACAGGCAAATAAACAGCCACTTACATATAAGCTATTACGAACACCTTCACCATCCACAAAGTTGAACGGTTTATAATCGGCAATATAGTCATGACTATAATCTTGAGCCAGCCATTCTTTAGGTTTAGGATTTCTCATAGTAAAACTTCTTTCATTATAAAATGGTATCCGTTATAAAAAATTCTTGAAGGTCGTAGGAGACATAAGAAAATAGCCAGAAGAAGGGGTGCTATCTCTCGTATGACTTGGAGTTGGACGCTTTTCTTACAACCTTATCTACAGTGTTCGAAAGCCAACTCCTACGATAATAAGTCAAAAGATGAAAAAATATAGAAAACTATTTTCCCATCTTCTGTCTTATTACTTGGAGCTGAACGACTTTCTCACAACCTTATCTACGGTGTTCGAAAAGCTGACCTTCAACATTAAGCTGAAAAATCAAAAAATATGAGAAGCTATTTTCTGATTTCCCATCTTACTGCTCAGGTCAGGACGCTTTTCTCACAACCTTACTTCATATGTTTCACGCGTGATGAGATTTCTTTGTGTCTGCCGTGGACCATTGGGCGGGCTTGTGGGTTTCCTAGATAGCCGCATGTTCGTTTGACTACGTCACATGATTTTGGATCGTGATTGCCGCATTCTGGGCATTCAAAGCCACGTTCAGTTGGTTGGAAATCTCCTTCAAAACCACATTGGTAGCAATGATCGATCGGCGTATTGGTTCCTAAATAGCCTACTTTGTCATAGGCAAAGTCCCAAACAGCTTCTAATGCCTTAGGGTTTTGTTGCAAGACTGGATATTCACAGTAATGGATAAAGCCACCAGAACAGTATTTTGGATAGTCTTTTTCAAATTCAAGTTTTTCAAATGGCGTTGGATTTTTACGCACATCATAGTGGAAACTATTAGTGTAATATTCTTTATCTGTGATATTTTCAACGATACCGAATTTCTCTGTATCTAAACGACAAAAACGATCAGTCAAGCTTTCACTTGGCGTGGAGTATACGCTGAAGTGATAGCCATATTCATTCCCCCAAGCGTCTGCATTGGCTTTTAGTTTTTTCACGATATCCAGAGTGAAGTCTTTAGCTTCAGCATTATTTTCCCACTCACCGCCAAAGAAAGAAGCAGCGACTTCATAAAGTCCAATGTAGCCTAATGAAACAGTTGCTCGACGATTTTTAAATAATTCGTCTACGGCGTCTGTACGAGATAGTCGTTTACCGAAGGCACCATACATATAAAGGATCGGTGCATTTGCAGGAATCGCTTCTTTACAACGTTCGACACGATAAACTAATGCATCTTTCATGATCGACAAGCGATCTGAAAGTAATTGCCAGAATTTTTCTTGGTCACCATCTGCTTCCATGGCGATCCGTGGCAAGTTCAATGTAACCACACCTAGATTCATTCTTCCGACATTCACTTCTTCACCGTTCTCGTCTTTCCAACCTTGTAAGAAGGAGCGACAGCCCATTGGTACTTTGAAGCTTCCTGTCAATTCAACGATCTTGTCATAGTTTAGAATATCTGGATACATTCTTTTTGTGGCACATTCTAATGCTAATTGTTTGATGTCGTAGTTTGGATCAGTGGGTTTCAGATTGATTCCGTCTTTTAGTGTAAATATCAATTTAGGGAAGATTGCTGTCCGTTTTTCACTTCCTAATCCATTGATCCGGATTTGTAAAATCGCTTTTTGGATTTCTCGTTCAAACCAATTTTTACCTAGACCGAAGCCAAGTGAAGTAAAAGGCGTTTGTCCGTTGGAAGTGAAAAGTGTATTGATCTCATATTCTAAACTTTGCATGGCATCAAAAATATCTTTTTTTGTTTTGGCTTTTGCATAGGCTTCTTGACGTTCGGGTGTGTCGATCCATTCTTTGGCATCAATTAAATGCTTTTTGTAATTTAATTGTGCAAAAGGAGCAAGCAATTCATCTGTACGATCGGCAGAACATCCGCCATATTGGCTAGATGCAACATTGGCAATGATCTGTGAGATCTGTGCCGTTGCTGTTTGGATCGATTTTGGTGATTCGACTTCTGCATTCCCAATTTTAAATCCGTTGTTCAACATACCTTTGAAGTCGATCAAACAGCAATTTGTCATTGGTGTATACGGATGATAATCGAGATCATGATAATGGATATCGCCTTTTTGATGTGCGTTGGCAATATGCGGTGGGAGTAATTTTAGCCCAATCGATTTCCCAACGATCCCAGCAGTCAAGTCACGCTGTGTATTGAACACATTACTATCCTTGTTCGCATTTTCATTGACAACACTTTGGTCTTTATTGATCAGTTTCTCAATCGAAAAGTTGATGTCTGTTGCCTTACTACGAGCAAAATCACGTTTTGTTCGATAGTGGATATATTCTTCTGCTAAGGCATATTCGTTTTTTTCTAACAAAATATGTTCAACGATATTTTGGATCTCATAGATTTTTACGTTATTTGCGAAGCGATCTTTGATTTCTTTGATCACAAGTTCTGCGATTGATTGGATCTTTTCGTACGTAATAGGAGATAAGGAACCGTGAATTTTCTTTTCTGCTTTGATCAGTGCGGCATTTATTTTCTGTTCATCAAATGGTACCTCGCGTCCGTCGCGTTTGATGACAGTCATTTTTTTAGTTTCAGGCTGTTTTTCTAGTACAGCCATTTCTTGATCTGTTCGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP018061|609961:618674|615510_616113_-|WP_071866994.1|DBSCAN-SWA MRNPKPKEWLAQDYSHDYIADYKPFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAAQNFRYGKPFTAELEEQIMADLRNDYVQGLTLLGGEPFLNTNVCLRVVDRIRQEFGHSKDIWSWTGYTFDELLQDSEDKLELLSKIDILVDGRFEWSKRDFKLQFRGSSNQRIIDVQRSLAEKQVVIWEKCTDATQTYEQIKKQELI >NZ_CP018061|609961:618674|610958_611897_+|WP_071866998.1|DBSCAN-SWA MAQENILAQMQPLVYQQLQRSFEHGRLAHAYLFEGEKGTGKHEVGIWLAQHLYCTKMNNQQPCGRCNNCQRIQNQEHPDVLVLAPDGQSIKVDQIRRLQTEFSRSGYESRKKVFLIQEAEKMNASAANSLLKFLEEPPGDFLAILETEAIGRILPTIQSRCQTLHFQELSKDSLIQKLQDQQISAEKAKLLSFLTNSLGKAVEISEDEWFNEAKDLIYQWFVYLDKRDTQAFIYVQKRLVKVFKEKNQQFTGFSILMYYYQEAQKQAITSGEYGKVKRLNQTIERLLLAEQKLRSNVSFQAVAEQFVLQTIF >NZ_CP018061|609961:618674|611936_612761_+|WP_071866997.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRYRDAGHVYYFTPGDSEYAYNDKVLVESQQTLHIATVAIPKRDIDLEDLPETINPILHKATTAELKKSNKNEEDAKKAFLIAKEKIRDRKLEMKIVQVEYTFDRSKLTFYFAADGRIDFRELVKDLAAVFRTRIELKQIGVRDEAKMIGSIGPCGRPLCCSSFLGDFVPVSIKMAKEQGLSLNPTKISGLCGRLMCCLQYESEAYEAAKKELPDFGKTLETPDGKGKVVGLNLLSRLVSVRLNGRENPVEYEWDELKNFIQVGEMNG >NZ_CP018061|609961:618674|612753_613101_+|WP_010736045.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNQLESELRNTLTELVEMKHALHEIVEKNTTLEMENQRLREHLRELNQVAQAPAENAKQELSKSRMNLEKIYEEGFHVCYDLYGSRRENDEPCAFCLEVIYRESGR >NZ_CP018061|609961:618674|610620_610950_+|WP_010736048.1|DBSCAN-SWA MKIILAIIQDKDSNRLSNELIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIVGIEDDRVEEALEIIKKTCESRKQFVSTPVTLDISMDGGVPYPVEVEVGGATVFVLPVEGFHHF >NZ_CP018061|609961:618674|613240_614110_+|WP_071866996.1|DBSCAN-SWA MYNQKSFKGNHVFGTLYLVPTPIGNLEDMTVRSVRTLQEADLIASEDTRNTQKLLNHFEIQTAQKSLHEHNYKERIPQLIDWLKEGKSIAQVSDAGMPSISDPGHELVVACIKEDIPVVALPGPTAGMTALIASGLVPQPFLFHGFLPRKKKEQKTMLESLRNQTATLIFYESPYRVAATLINMLEVFGNRQVVLCRELTKIHEEYLRGDIEELLAYLEKQPIKGECCLLVEGSNEEVVPSEQFQGTLKEQVQQLIEQGEKTNVAIKTIAVKNGIKKQEVYRQFHELDD >NZ_CP018061|609961:618674|614271_615408_+|WP_176285304.1|DBSCAN-SWA MMELQFPLHNDTSRKIIHIDMDAFFASVEERDHPELRGKPLVIARHPSDTGGRGVVTTANYEARKFGIHSAMSAQKAYELCPEAIFKPGDHQKYSAISKEVREIFYRYTDLVEPVSIDEAYLDVTNNKINCKSAIKIARMIQLDIWQTVHLTCSAGVSYNKFLAKLASDFQKPKGMTVVTPEEAVDFLKALSIEKFHGVGKKTVPKMHELGIFTGEDLYKCSEMMLIQQFGKMGYSLYRKVRGIHDSPVNVTRERKSVGKEHTYGQPLRTEEEVLGQLRQLAEKVEESLRRVQKHGKTVVLKVRYTDYSTVTKRVTLPEYVYKKEALFYQASLIWEEILGIEKGIRLLGITLTNLDPMTYENIVLPLWETQAIESEIE >NZ_CP018061|609961:618674|616484_618674_-|WP_071866993.1|DBSCAN-SWA MKRTDQEMAVLEKQPETKKMTVIKRDGREVPFDEQKINAALIKAEKKIHGSLSPITYEKIQSIAELVIKEIKDRFANNVKIYEIQNIVEHILLEKNEYALAEEYIHYRTKRDFARSKATDINFSIEKLINKDQSVVNENANKDSNVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKLLPPHIANAHQKGDIHYHDLDYHPYTPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNAEVESPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRTDELLAPFAQLNYKKHLIDAKEWIDTPERQEAYAKAKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSLGFGLGKNWFEREIQKAILQIRINGLGSEKRTAIFPKLIFTLKDGINLKPTDPNYDIKQLALECATKRMYPDILNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKDENGEEVNVGRMNLGVVTLNLPRIAMEADGDQEKFWQLLSDRLSIMKDALVYRVERCKEAIPANAPILYMYGAFGKRLSRTDAVDELFKNRRATVSLGYIGLYEVAASFFGGEWENNAEAKDFTLDIVKKLKANADAWGNEYGYHFSVYSTPSESLTDRFCRLDTEKFGIVENITDKEYYTNSFHYDVRKNPTPFEKLEFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPVLQQNPKALEAVWDFAYDKVGYLGTNTPIDHCYQCGFEGDFQPTERGFECPECGNHDPKSCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEISSRVKHMK >NZ_CP018061|609961:618674|609961_610624_+|WP_071866999.1|DBSCAN-SWA MNGLFITIEGPDGAGKTSIIKELFPLLQQVAKTEIIQTREPGGIPIAEQIRAVILDPKNDRMDERTESLLYAAARRQHLVEKVLPALSSGKIVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGVNEIAELNEFATEGTTPDFTLYLDVDSDTGLRRIAKNRQNQIDRLDSEGLEFHQRVRHAYLKLVEEHPDRIHKIDARNSFEEVLQLSYHAIINQFPQYFESQEGERK |
9 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
640520 : 718204
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP018061|640520:718204|DBSCAN-SWA AATGATCAAAGGGACATTTAAACGAAATGACGCTGGTCAAATCGTTTCATTTACTTTGACTGGGCACGCTGATGCCGGTCCTTACGGAAGTGATATCGTTTGTGCAGGTGTTTCTGCCTTAGCGATCAGCACTGTCAATGGGATTTCATCATTAGCTGGTTTTGAACCGATTGTTGACATGAATGAAGAAGAAGGCGGCTATTTGTACGTCGAAGTAATTTCACGATTGACACAAGAGCAAAACAATATTGCGGAAATCTTATTGGAGAATCTCCTATTAGGTTTACAATCGATCGAAGCTGAAAACCCAGAATATATCCAAACAAAAACAATTAATGATAAATAGGAGGTGCAGACCATGTTGTTAACAATGAATCTACAATTATTTGCCCACAAAAAAGGTGGCGGTTCTACATCTAACGGCCGTGACTCAGAATCAAAACGTCTAGGTGCAAAACGTGCTGACGGACAAACAGTTACAGGTGGATCAATTCTTTACCGCCAACGCGGAACAAAAATTTATCCAGGTGTGAACGTAGGTATTGGTGGAGATGACACTTTATTTGCTAAAGTTGACGGTGTTGTTCGTTTCGAACGTAAAGGCCGCGACAAAAAACAAGTGTCTGTTTATCCAGCTTAATTCTTGTCGAATGCTCAATCCCTTGAAGCTCATGGGATTGAGCTTTTTTTGTTTTTTTTTAAATCCATTTTGACTATCCTTTTGAATGTCTTTTTAGAAATTCATATAGTTTAGTAATTTCATTGTTGTTTCTTCTTTTTTACTATTAGTTATATGTGTGTAGGTATCCATGGTTGTTTTAATATTTGAATGGCCTAATCTTTCTTGCACTTCTTTGTGATCAGCACCAGCTTCATAGAGCATAGAAGCGTGTGTGTGTCTGAAACCATGTAAACCAATATAAGGTAAGTCTGCACGTTTGCGATAAATATTATACCTATCTGCAACAGCTTGATTAATAGTGAAAGTATTATCATCATTAGTAATGATATAATTTGCTTGATTAAAACCTAGTCTTAATAGATATTTTTTTTGTTCAAGTTTCCATTTTTTTAAGTGCATAATTGTTTTTTCATCTAGATAAATCACTCGATTTGATTTTTTTGTTTTAGGAGTTTCAGAAATATAATATTTATCTGATCGAGCAACTGTTTTGTTGATTGTTATTTCATTAGTATTAAAATTTACATCCTTCCAACTTAATGCAAGAATTTCCCCGATTCTACATCCAGTAAAAGCTAGCAATCTAAAAATAGTATAGTCTCTATTTTTTAGATACTGATTTTCTTCATTTAATATTTCCTTCAAAAATAACTCTAATTGTGTTTTAGTGTATAGTTTTAGTTTCTTTTCACTTGTGTTATTAGCTTTTGGTATAATTAGGTTTAAAGTAGGGTTGTTTGTGGTTAAACCTATATTAATAGCATATTTAAAAACTTTGTTCATGTAGTTAACAAAAAGTGGGAATTGCTTTGAAGTTCCGTTTTTGCTCCATTCTTGTACTACATTTTGACAGTAGGCTGTCGTAATTTTAGATAATTTCAATTTTCCAAATTTAGGATATATGTGTTTTCTGAAAATGATATTAGTTCTAGAATAAGAACTTTCTTTTACAGTTCTTCTATAATTTTCTAACCACATTTCTGCAACTTCTATAAACGTTACGTTTGTATTTATCGGTACTCCAGATTTCTGGATATCTAACTCTATTCTAGATAATTCTAACTTTGCTTCTTTTTGTGTCTTAAAACCTCGCCGTGTAGTATATCTTTTCTTTCCTGATAAAGGATCAACTCCTAAATAGATTTGAAACTTATACGCAGTTGTACCATCTTTCTTTATATATTTCTTTATTTCAGCCATAATTGTTCCACCTCGAATGTATGTTCTTTTTAGCGTAAAAGAAAAAGCTGTTAAGCTTTTTCAATAAAACTCTTTTATTTGCAAAATGTATCAATTTATTTAACTTGAAACTCTGCACTCCCGAATTCATCTCCCATAATACTTTGGGAGGTTAATGTTACAGGTGTTTCTGTATCGGATAATTCATATGCTACTGCGCTTGACAAAGTACCACCTGGTTTGATTTCTGCTGATTGGTTATCTAAGTATTGTTCGTCTGGTAATGACGCAACATTAAGTTCATTAACTTTATTAGGATCATTGTCTTGAGTAGCAGTAAAGTTTGAAATCCAAGCACTATTAGGAGAAATTGGCGCTGAATTATCATAATTTGGATTCACAAGTGTATCAAACCAAAATGCAATTACTGGTTTGGTGCCATACTCATTTCCTTTTTCACCAGGTTGTAAAATTTTATGGTCTGTAATTTTAATAGAATACGAGTTTCCTTTAAGTGTTGTTCCATCAAAATAAGAATCTTGTGCAGTGGCAACAAAATCTCCTGATTCCTTTGTAGATGATGATTCTGCTTTGCTAGATGCTGTTGTGGTGGCTGTTTGTTCACTCGTGTTACTTGTTGATGTTGCAGAATTATTATTACATGCTGACAAAGTTAGCAATAATAATAGTGAAGTTCCAAAAAAAATTGTTTTTTTCATTTATTAGTTCCTCATTTCTTGTTATAGTATATATGTGATCTCAAAAATGAGGTTAGAGTCCGTGTTACAGCACGGGCTTTTTTTATTTAAGATTAAATATACATAGTTATTTAAAATAATAAATTTTTTTTTAGATATTCACATATTAGTAATTGAATGCTGATTCTACACTGTCTAATTTTGTGTCTATGACAGCTAAAGAATCATTGTTAAAGATTAAAAGATAATCTTTATATAAATGAGTAGGACCAAACTTAGTGTAGTAATGCACAAGTACTTCTAATAAAAATTCTTCTGTAATACCTAAGAACTCAGCACATGCGTATTTTGTTGTACAGCCAGCAAATGAACATGCGATTAAATCATCAAGAGTGACAAGCCGTTCGATGGAATCTCGACGTGCTTGCCACTCCTGTTTTCTATTCTTCGCATCGTTGTAATTGATGATGTCGCCGATACTTGTTTTGTAATGTGAATATTCCTCAGATAGATTGACCTTCTTTTCAGCGGTACTTAGGTTTTTATCTATATAAATGAAATTGTCTTGATAAGCAGCCTTAAGACCAGTTTCACTTAACAGATCCATTTCGATAACCGGAATAGTACTTGAAATATTATCTAGTAGTGATTCATATTCATCCATTATCTACAACACCTACTTGCCTTTTTTATTTTCGTATTTTTGTCTTGCTTTATCTAAAACAGATTTAATATGATCAATTTCTTCTTGAGAATATTCCTTTTTAGGATCAGCGGCATGGGCGGCTATTGTGTGAATTTCTTCTGTATCATTTTTATTATCCATAGAAATAAGCTTAGTATTTTTGCTTTGTTCTGCAAGCTCATTTTTTGCATAATTAAATACCCTTTTTTGACGTTCTTCGGTTAATTTGTTGTATACAGAATTAATATCTTCAGAAAGGGGATAAGAATCACGTAGGTTATCAGGAACCCTATCTTTTGGAACATCAAAACCCATCAACCAAGGTTCGCTAACATCAAAGAATTTAGATAAAAGAAAGATTCTATCTTGATCAGGTGATTGTTTCCCATTTACATATTGTGACAAAGTACTTTTCCCCATCTTAATATTTAATTTTCTTTGTAGGGGGGCAGACTGATTCATAATATCTACTTGTTTCAAGTTTCTTTCACTCATAAGCTGTTTTAGTCTGGTAGCAGTGCTAACTTTCATAACTAACACTCCTTTCATTTTATAATTTTGATAAATACAGTATAGCAATCGTTGAATTTAAGTTCAATAAAAAAGTTCAATTATCATGAACTTTCTGGTTGACATGATTCAATAAAACGATTAACATAAACATATAAAGTTCATGTTTCGTGAACTAAAAAGGAGGGTGATTATTAATGAGTTATGATTATTCTTCACTGTCAGGTAAGATTGTAGAAAAATTTGGAACACAATACAATTTTGCAATTGCAATGGGAATGTCAGAAAGAAGTTTGTCTTTGAAAATTAATGGTAGGGTTTCTTGGAAAGATGATGATATCGTTAAGGCGTGCAGTTTATTAGATATCGAAATTAAAAATTTGCACGAATATTTTTTTAAACCAAAAGTTCACGTTTTGTGAACTTATCTATTTTTTAGTAAAGGAGGTCTAAGCATGCAAATCAATATCCCTGACCAAGTAATAATACCTGAATTAGTAAACCAAATAGTAAGCAGTGTCTTAAATTCACTTGAATCGAAGATATCACTATTGAACAAGTCTAGTGAATTACCACCTTATCCAAATAAAACACAAGTTAAACAAGTATTAGGGATTGGAGATAGAAAGTTAGATAGTTGGATTGCTAATGGTTTAAGAATTCAGATTTGGAGTAAACAAGACATACGTATAGATAGAAATGAATTACAAAGATTTTTGAAAGAGAACTTTGAAGCTTAATCTTGTTGTAAATAAAAATCGGAGTGGAGTTGGGACTGTGAAAAAGACAGATACACTTTTTATTGGATTTATATTAGGGCTATTGGTTTTAGTAGCACATCAAAATATTTTAGGAGGACTTATCTTCTCCTCATTAATGGTTTTGATAAACCTATTAGATTCGAAGGAAAGGAGAACGTATGAATCGAAGAGAAGCATTGAAGAAAGGAAAGGTGATTGCTGATAGATGGTGGTATGACAATAAGTCAACTATCTTAAGCCTACAGCTAATTGATAAACAAAAGGCATGGATAAAAATAAAAAAGTGACTCAGCCGACCAAAGCAATGAGTCACAAACAAAACATATCTAAGGAGATTTTAGCATATGAATAATGAACTTTCCACTTTAGATGAATATTTAACTAATCCTGACTGGGGTAAACCGACTATTAGTGAAGTGGAGGATGAAATAGATGAAGACTAGTGAAGAAACAAATGAGATTTATAAAGGGCTATATGTATTGAA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>NZ_CP018061|640520:718204|689445_690300_+|WP_071865922.1|DBSCAN-SWA MSELMNGKELAEKMQAELALKVKELNERQINPGLVVLLVGENPASQVYVRNKERVANQLGIYSKVERYSQTISEDELLNEIEKYNKDPRFHGILVQLPLPKHIDEEKVLLAIDPKKDVDGFHPLNLGRLFAGNPDKIPCTPYGIMKMFEAYDIDLTGKRAVVIGRSNIVGKPMAQLLLMADATVTIAHSKTKDLAALTREADILVVAIGRGHFVTKDFVKPGAVVVDVGMNRDENGKLIGDVKFDEVAPLASYITPVPKGVGPMTITMLMAQTVQSAEAERGEL |
99 | Enterococcus_phage(46.15%) | integrase,tRNA,terminase,tail,portal,plate,protease,capsid,holin | attL 641136:641154|attR 679275:679293 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
833644 : 914235
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP018061|833644:914235|DBSCAN-SWA ATTAACCTTGCTCTTTTTCTTTTGCATTAAGTTTATCTATTAAATCTTGTTCTACCTTTTTGGTAACATGTGTGTATATCTTTAAAGTAGTTAAGGGATTAACTTGACCTACTCGTGACATAATTGCTTTTTGATTTATTCCCATTTCTGCTAGTAAGGAAATATGAGTGTGACGAAAAATATGTGTTGATAGTCTTTTGTTTAATTTACCTTGTTCTTTTAGCCTTGCAGACAGTCTTCGTAAGACTCTATTCATGCTAAAAGGTGGCACTGCATCTCCATTTGGAGCTGCCAAAATAAAGCCCATGTCATTATATTTTGAATTAATTGTTTTGTTTAATTTGTTTTGGTTAATCCATTTTTCAATAATTACTTTTGTTTCATTGCTTATTGGAATTTTTCTGTTTGAGAAGACATTCTTAGGACTCGTTGTCAATCCATCTTGCGCTCGTGCGTAGTTGTAGAAGAGTGTTTTGTTAACATCAAGTGCATTACCGTCATAATCTTCAATCTTGAGAGCAGCAAGCTCACCGTATCGCATACCTGTTTTAGACAAAACCTCAGCGATTTCAGCATATTGCGAAGCGCATGAACTATATTTTAAATTTCTTAATTCATCTATTACTAATTCGAGTTCATCAGGTTCTAAATATTTTTGAGTTACTCTTTCATGTTCTTCAATAGTGGCTTTTTTACGTTCTATCTTTACATCTTTAACTATATTATATTTTACAAAACCTACTTGTTTAGCATATTCATACATATTGCTAAATAGTGATCTAATAGCATCAGTATATGAATAAGAATAGTTTTCCTTATAATAGAAATCATTTAAAAAATTTTGTAGATAGCTTGAAGTAAGGTTGTTAACTAAAACAGATGTATCCATTCTTAGTTCAACTGCTTTGTATAAGCTAACATTTGTTAGGTAAGTTTGTTCTTTTACTTTTTGTCTATAAATTTGAATCCATTCATCATATAGATTTGCTAGGGTTACTTTCTGTTCATTTGGTTTGCTGATCTTAACATTAATTTTTTCTTGTAATTCAATCATAGCTTGTTTTTTTGCTTGATTGGATTTTGATGTTAGAGTGATAGATACACGTTTAAGTTTTTCCGTGTACGGATCTTTATACCTTTCAAAATACTTGTACTTTCCATTCGGTAATTCTTCCATCCACATGACTTTCACTCCTATTTCATGATAAAATAGGCATAATGAAAAAGCCTATTGTTTATTTTGTTTGAGCACGCTCTCGCTTTGGTCGGTAGGGCGTGTTTTTTTATTTTGTTTCAAACGTTGTATGACAATTAGTACAGAACCACTCATTTTTACCTTTTTTTCCAGCAAATCCTGCCAATGTACCTACCCCACCTGTAAGCGCGGCCCCACCAATTGCTTTTCCTACAGAAAAACCTTTTTTATTGTTCTGCATAAACTCTATCTCTCGTGATTGGCAAGTGGGGCACTTGATAATGTTTTTGTTTTGTTTGTTTGATGTTGCTTGCTTGTTCAATTCATCCAAATCTTTCTTAGCTTCTCCATGTAACTGCTCCCATTTATCGTAAAAGTTGTTACTTCTAGTTCCTAAAAATAAGGAGCCTAATGATAAAGTTAGTATAAAAAGTGACCCTAAATCTATCCAATCTCCAAAATAAAAACCAAAATAAAGATATATGACAAAAACTACTATAGATAGCCCACTGAAAATTTTTTTGTATTTTCTATAACCATTCATGTATTAACATCCTCCTAAAATATATTTTATTTAAGGTCAATCTCTTAGTTCAATTAAACCACCTCCTCAAACACACAAATATTATTTTTAAATAAAACATGTATTTATTTGTATGTTATATGAAATATAAGAATTAAAGCGCTTAAAATTATACGTATTATAAATACAAGCTTATGTTCTTTAATGAAGAACAATTGAATAACTCAATTGTTCTTCATTTATATGCTGAGTCATAAATTTTTTTACAATCGTTTCGTATCTGATATCCAAATCGTAGCTTTCTAAAAAATTAATGGTATTGAATGCTTCCGGTGAAAAATCGGGATCATGCAAACGGGTTTCGATCATTTGCTTTATCATAAATTCTTCCGCCTCTTGCTCCATTTTTGATCTTAAAGAAAAGGTTAAATTATATAATTCGTAATTCTTCATATGTTTAGCTGCGTGTCCTAGTTCATGCAAGAGAGTAACTTTTTCTTTTCTTTCCGACAACGATGAATCAAGGACTATGGTGTTGATGGCCGCAAGGTAATGACCATCAGCATCCATTTGCTCTGCTTTTTCCACATAAACTACAGAAACATTTAACTGTGAAATAATATCATTTATCTTCGCATCCATTTATCACACCTACTTAGCATCATTCTTATTTTCAATATATGCTTCGATAATTCCGGTTAAAATTCGCCTATCATTATCAGTGAGTGGTTTTCCATCGCTACTCATTACAGAAGCTAGCGCTTCTTCTACAGTTAGGCCTTTAGACTCCTCTGATAAGCCAAGAGGGGTATCGGTACCATCTAAAAGGTAATCTGTAGTAACATTAAAATATTTTGCTACTTTTTGTAAGGTGTCTGCCTTAGGACTACTAGTTCTCCATTGATAAATTGCGTTTCTACTTAATCCTAGATCTTCTGCAACTTCTTTTAAACTTTTTCCCCGTTTTTTAGCAAGTTCAGAAATCCTTTCAAATAAAGTCATTATAAACACTCCTTGATCACAAGGATGTTATATAAACAAAACTATGCACAAAACACTTTACATGCACAAAGTTTTGTAATATACTTCATCTTGTAAGTTAGTTTGATAGAAAAAAAGCAAATTAAAGACACTTCTTATCAAGCGTAAGTTTGGCGACCGACCGCAGATAAAAGGATATTTATGTGCTTATTTCTTTATGTTTATATAGTACGAAACTTTGTGCATGGTGTCAATAACTTTGCCAAAATCTTTTGAACTAGCTTACAAAAATTTCAGGGAAGGAGAGAGTCATAGTGCCAGATACAACAGTAAGTCGTCAAAAGATCCGTGATCATTTTAAAGAAAAAGGTATTTCACTAGCGAGCTTGGCTACATTGTTTAATGTTCCAAGACAAGATTTAATTGATTATCTTAATGGAAAGAATCAAAGCAAAAAAGCACATGAGATTCTTTTAGCTATTATTGATATTTATAAAATTAGATAGTTGGAGGGGAAGCAGGTGAGTAATATCCAAATTACAGTTGCAAAGACTATTGAAGTTCCTCAGGCATGGATGGCCAAAGATGAAGCGATTATCTACTTTGGCTATCAATTCCACAAACCTTTATTTCAAAAGCTCTTGAAAGAGTTTAAGGAACATGATGATTTCAAGGAGGGCTATCGGTTAGTTACGTATGGTTTGCCAATTATAAACATTAAAACGTTCGATAATTTTCTAGTTTGGCGAGACAAGAATAAGTTTAAGCGAAAAAGACAAGTTTAGGAGGCAACAGCATGAATCAAATGCAAATTATTGAATTTTACAATCAACGCTTATTAACTACGGAGCAATTAGCGGAATTCTATGAAGCGACACCGAAAAACATTCGTGATAATTTCCAAAACAATCGAAATAAATTTATTGAAGGTAAACATTATTTCAGGTTAGAAGGTGATGATTTAAGAGCGTTTAAGAACGACACCGAAAATATCGGTATCGTCGGAAGTCGAGTAAATCAACTTATTCTCTACACAAAACGAGGTGCGAGTCGTCATTCGAAAATGTTAGGCACGGATCGAGCGTGGGATATGTTTGATGAATTGGAAGAAAACTATTTCAATCCAAAGCAACAAATCAAAATCCCAACAACCCCTCGTGAATTAATTCAATTAGCTTTAGCAGGAAACGAAGCAACAAATCAACGTGTTGATGAAATTGAGGAACGTTTAGTAGACATTGAAGTAAATAAACTGATCAACACGGAAGATAAAGGGACAATCGATCGAGCGGTTCAAAAAAAAGTTTATCAAATCTGTAAGGATCAACATTTTGGGCAAGATGCCAAGAGCATGCTTTTTCAGGATCTGGGGTCAAGTATCAAACAATTATTTAATGTTCCGAATCGTGGACGAATTAAAGATAAGGATTTTCGAAAAGTATTGAACTTTATCAATAGCTGGGAGCCGTCTTCTGTGACAAAAGAACGTATCAATCAGATTCAAACAGAATTGGAAATGTAGGAGGAAGTTAAATGAAAATTAATAAAAAGTTAGAGCAAAAATGGCAATAGTGGGAAACAACGATGGAAGGCGCAGAGATGTATCTAAATGCTGCAAGAGATTTGGGTTCAACTGTCATAACCGAGGATGATGCTGTTTTTTGCCTAGCTAGTGAAAAAATCCAATTAACCATTGATCAGTTGGAAGAAGGCAAGAAATTAATTGAAAAGCTAGAATTTGCAGAAGAATTACTGGAATAGGCAAATACTTTTGAAAGTAGGTTGAGGTGAGACGTGAACATGCCTAGGAAAATGTGTCAAAAGAAAATGATAGCGACTGCTGGTCACTACACGTTTAAGCAGGAGGAATTGATTAAGAAGTCAATTGCAAAATCTATTCAAGACTTGCAGTACCTTGTCCATGATAAAAAAAGCGTGTTAAGCGCTAGGCAGCTTGATACTGCTAAACGTGAGTTGAAACAATATCAAGAACTGCAGTATCAAAATAGGCTTAATCGCCTTATAAATATGAAATGGAGATAAGACTATGAAAAAGACAGACACACTTTTTATCGGAGTCATCTTAGGTTTACTCGTACTAGTAGCACACTACAGCGTAGTGGGAGGAAGTATTTTCGCAAGTTTAATGGTTTTGATAAACCTATTAGATTCGAAGGAAAGGAGAACGTATGGATCGAAAAGAAGCTTTGAAGAAAGGAAAAATGATTGCTGATAGATGGTGGCGTGACAATAAGTCAACTTTCTTAAGTCAACAGGTGATCAATAAACAAAAGAAATGGC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84 | Enterococcus_phage(21.95%) | integrase,tRNA,terminase,tail,portal,plate,transposase,capsid | attL 833538:833559|attR 881706:881727 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1103340 : 1112374
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP018061|1103340:1112374|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP018061|1103340:1112374|1107078_1109301_+|WP_071867135.1|DBSCAN-SWA MKTMMEPTALEIKEQKIYTQWGLTDEEYRMIEEDILGRMPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPILRKFPTSGPNVLQGPGEGAGIVDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGELDNPRTKYLLEEVVAGIGGYGNCIGVPTVGGEIAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIDHKDIQKGQASGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFSQEEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELIFDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGSGLVLTLDDVPQRESQMTPYEMMLSESQERMLICVKAGSEARVQELFQKYDLDAVTIGKVTDDGQYRLYHHGKEVANLPVDALAEDAPVYQKEMVEPERMAKFRELGQYQPVIDDPNNVLLDLLQQPTIASKRSIYETYDSRVQTNTVVAPGSDAAVLRIRGTKKALAMTTDCNARYIYLDPEIGGQIAVAEAARNIVASGGQPLAITDCLNYGSPDKPEVFWELAYSADGIAKACEMLETPVISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLIEAHEHITTQEFKQAGDLIYVIGQTFADFNGSELQKMQLGRIEGMVEHFDLTTEKENQTLVLEAIKAGLIQSAHDCAEGGLAVAIAESAFTNGFGVSTTIDLPVAHLFSETQSRFVVSVTRENKQAFEKLAGDRVTFLGHVTEEKQLVVQANDGRVDLAVASAKQSWEEAIECLMK >NZ_CP018061|1103340:1112374|1105412_1106144_+|WP_071867137.1|DBSCAN-SWA MEKQNLLYEGKAKRMFNTNDETVLWVEYLDQVTALNGGMKDQMQGKAELNNQITSAIFEYLSNQGIKNHFLEKLSKTEQLIKKRSIIPLEVVVRNISAGSFSKRLGVEEGQVLPSPIVEFYYKKDELDDPFINDSHIAFLKLATPEEIAELKKQALLINEQLIKLFKKIDLQLVDFKVEFGRTDIGEIELADEISPDTCRLWDIATNKHMDKDVYRRKIGNIIPVYQEVLDRLNQLSLENKGE >NZ_CP018061|1103340:1112374|1111795_1112374_+|WP_071867132.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQALVDYFKKNRLSATIEWLFCDQPHAYVLQRAKKAQVPSTCFSPKEFASKTEYEQAILEELANREIDLIVLAGYMRIVGEGLLSIYENKMINIHPSLLPNFPGLHGIRDAFEAGVEETGVTVHYIDRGVDTGPIIRQEKVVIEKEDTLATLEQKIHQIEHQIFPEVIAKIVNMGDVNK >NZ_CP018061|1103340:1112374|1110755_1111799_+|WP_071867133.1|DBSCAN-SWA MSNAYAKAGVDVEAGYEVVDRIKKHVKKTERIGVMGALGGFGGCFDLSGFQLKEPVLVSGTDGVGTKLAVAIAADRHETIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYLATGKNDPERLEKVVAGVAAGCVSANMALIGGETAEMPGMYQGDDYDLAGFAVGIAEKAQLITGQSITTGDILLGLPSSGIHSNGYSLVRKIFFDQHGFSLEETIEGLDSSLADVLLEPTKIYVSTLLPLVKEEKIKGAAHITGGGFIENIPRMLPENVAASIDLGTWPVLPVFDCLQKYGEIPAHEMYEIFNMGIGMVIAVAPEKASEIIDQIRKSGEEVYQIGQVVPFEEQKVVIAEGKK >NZ_CP018061|1103340:1112374|1103340_1104636_+|WP_034690182.1|DBSCAN-SWA MLERYTRPEMGNIWTEQNKYQAWLEVEILADEAWAELGEIPKEDVAKIREHASFDIARILEIEQSTRHDVVAFTRAVSETLGDESKWVHYGLTSTDVVDTAYGYQIKQANDILREDLKRFTAIIGEKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLATWYSEMKRNIERFEHAAKGVEAGKISGAVGTFANIPPFIEEYVCEKLGIRPQEVSTQVLPRDLHAEYFATMSLIATSIERFATEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMAGLARVIRGHMITAYENVSLWHERDISHSSAERIILPDTTILLDYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDATFGLIYSQRVMLKLIDKGMTREEAYDLVQPKTAYAWDNQVSFRPLLEEDEAITSVLTPEEIAEAFDYNHHMKNVDVIFERVGLA >NZ_CP018061|1103340:1112374|1109285_1110725_+|WP_071867134.1|DBSCAN-SWA MSYEVRSINEECGVFGVWGHPQAANVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDDGKLYGHRDLGLLSEVFKDPRKLAALSGQAAIGHVRYATAGNGSVDNIQPFLFKFYDQSIGLAHNGNLTNARSLRTSLEKDGAIFHSNSDTEILMHLIRRSNEETFLDRLKEALAEVKGGFAYLLLTEDAMVAALDPNGFRPLAIGQMKNGAYVITSETCALEGIGARFVRDVLPGEIVIINDDGYTIEQYTTDTQLAICSMEYIYFARPDSDIAGINVHTARKNMGRRLAAEAPIEADMVVGVPNSSLSAASGYAEASGIPYEIGLVKNQYVARTFIQPTPELREQGVRMKLSAVRGVVEGKKIIMVDDSIVRGTTSRRIVNLLKEAGAKEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHSIEEIRECIGADSLDFLSEEGLIGAIGLQKDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEKYQESLKEKVSFF >NZ_CP018061|1103340:1112374|1104778_1105156_-|WP_071867138.1|DBSCAN-SWA MEDPSMSAQRFLLDLSVEEKSRLYNDLLAIKDVDACMKDRSFYTFRKLRRAAKRQSECRKRTFHYLTQNNHELVIKQIHEQKLFKHHYRLLVTFDQQEFGYTFVETLLNLLHSQHFNLGHQMAYA >NZ_CP018061|1103340:1112374|1106147_1106402_+|WP_071867136.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKNAVHRLGYDNIEDIRIGKYFEIQVSASEEEVEATIEAICDRLLANINMETYRYEINKMEEV >NZ_CP018061|1103340:1112374|1106403_1107078_+|WP_019724081.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDADLLWAIRDVMGAEADYVRYDESSLEGYDGVLIPGGFSYGDYLRCGAIARFSTIMDEVIRFAEEGKPVFGTCNGFQVLTEAGLLPGVLRRNDSLRFICKSASLKVNNQTSFTSEYDKNEVIQLPVAHGEGNYFCDEETLQELIDNNQIVFTYEGENINGSVANIAGITNKAGNVLGMMPHPERAMEALLGSEDGKRFFASLLKNFGKVTA |
9 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1730298 : 1834201
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP018061|1730298:1834201|DBSCAN-SWA 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123 | Enterococcus_phage(17.86%) | head,integrase,tRNA,terminase,tail,portal,plate,protease,capsid,holin | attL 1784585:1784643|attR 1820671:1820729 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2173094 : 2223418
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP018061|2173094:2223418|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(18.18%) | transposase,integrase,protease,holin | attL 2180274:2180290|attR 2211326:2211342 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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