Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP025426 | Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,cas14j,RT | 0 | 1 | 1 | 0 |
NZ_CP025425 | Enterococcus faecium strain SC4 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas2,cas14j,DinG,cas3,csa3,RT | 0 | 0 | 10 | 0 |
NZ_CP025427 | Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p2, complete sequence | 0 crisprs | csa3,cas14j,c2c10_CAS-V-U3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP025426_1 | 221150-221278 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP025426_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP025426_1
>1.1|221174|18|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder TTATCAACGTTTTGGCAC >1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder GCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTG |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP025426_1
The CRISPR arrays of NZ_CP025426_1 >merge|NZ_CP025426|1|221150-221278|CRISPRCasFinder GGTATGATTTTCATACCCTCTGATTTATCAACGTTTTGGCACGGTATGATTTTCATACCCTCTTGAGCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTGGGTATGATTTTCATACCCTCTGAT >NZ_CP025426|1|1|221150-221278|CRISPRCasFinder GGTATGATTTTCATACCCTCTGAT TTATCAACGTTTTGGCAC GGTATGATTTTCATACCCTCTTGA GCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTG GGTATGATTTTCATACCCTCTGAT
>NZ_CP025426.1|WP_002323647.1|219509_219842_-|hypothetical-protein MSYTGILSLKDICHYGKRCTATEKITKKLSTGQSKTVVQCKKYIIQKDKVSEEMIYYIGKQKQIILKDPIPLKELYPTIKHVYDQNGVLIGRRKNGVLRCTAKGMGRLIG >NZ_CP025426.1|WP_002295674.1|218549_218891_-|DUF5406-domain-containing-protein MKNYDPNIRLGTHTIKVSFQRWDYKGFVTFRRGGNCKGLDVLALDEDDLYDQTLTDNPIGFGLLPEDDEGNEWFKMTLMNDNGDELSVEDTWSYLSDYIVSFEIIEFVADKEE >NZ_CP025426.1|WP_002287107.1|217062_218313_+|IS110-family-transposase MKLFVGIDVSSEKLDVCFLTDDNQLSILSEISVANDIEGASFIRETILEFNNSYHFDQIVIGMESTSMYSFHPSMFFHEDEKLKKLNTLVTIENPFRVKQFSRMFDENKTDRNDALRIADFLRIQRFTTSPIKEEKYMALQRLTRTRYQLIKQLIRTKQHFLENLTYKCNTLAREMRDESTSLFSATLISLMTEDFTLDELAELPLEAFCDLLQEKGKGRFKQPEKIAKAIQRAITMSYRLGALAQESINVVLSVLVREIRALEKNIKELDKAIEQVIVVIPEYQCLTSIPGVGKVYAAGLIAEIGQIERFEDQTKLAKYAGLSWKVNQSGNYQSQNTPLTKQGNRYFRYYLVEAANSVKNYLPEYKAFYQSKYKEVPKHQHKRALVLTARKFTRLVDTLLRKHQLYTPPRSVIEK >NZ_CP025426.1|WP_002295673.1|216413_216653_-|hypothetical-protein MARPVLEAMDMDTLTKGRYVQLLARGYSPKEVFKALSKGTDMEKERLRKEFDYWRTHNGIKDLKPARPVIKRKKKITQD >NZ_CP025426.1|WP_002295672.1|216137_216347_-|hypothetical-protein MNYEEIENRKKVSKEMEEKLLKTMKQKHLKRLSVAQYINDMQLTGKEKACLLGSMKNFEQLRRTYRIHF >NZ_CP025426.1|WP_002336710.1|215406_216078_-|class-A-sortase MKKWLFGFLGVTLIVFCSVFGYVSYQKHEGEVFKQNIEKKMPVDQINAHAKSYKEDATNVNNDMSLGQMLSIQKEAIEMGVNKQVFAQIQIPALGLALPIFKGANQYTLSLGAATYFYEDAEMGKGNYVLAGHNMEMPGVLFSDIQKLSLGEVMDLVSNDGVYRYKVTRKFIVPGYFKLIDGVPEENSFLSLPKKGEKPLLTLFTCVYTSQGKERYVVQGELQ >NZ_CP025426.1|WP_010729784.1|213377_215354_-|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein MAINRYVKKAGMLVGMLGIIAGCFQGYQVHAEDVTQKTPPEKVNITVHKLMYDQGTQLNVDIDGIKNDGYTHDQYPTGVTKYNKADYGDVEFTLGNITDQVLPREDSDLTNAKVDEIVQDVEDKGSNSEYVKNATNKITSAVDENGEITFTDQPAYVNSKGNVYVVYESKSAAGLVTQKAKPMVVIAPMTDKTGSGFLKNIHLYPKNIVSKLSFELTKFGDDGADQSKQTLLKGAKFELYKGEPGKGTKLGDLVSDDQGKLTATDLTLGKYYFVEVPSEVVVGSDQEPTADQYLLGADARNDAHNKLTFEITNDGVTSDLKASYVNYKAPVIDKTVTNGTGQEHSFQIGDAVNYQGTIHIPTDIAGGADGITVNGVKSETSPYSVFKWGDTAGKGLSYVAEKADIKVTNNDGSVVLKENTDYKIENSDSGFVIDFIVNNGQVSDTVANLHGQDLKMTYNMFVNDSAEIANPLTNSVDFVYNNNPFNQEEHHEKTKADVVTYGAKFLKVDSGLFGTGIKATPLEGAEFAAKNAEGKYYGGLTDTDKDGVKEAVWVDDVANAAILKSDKEGHFEITGLTEGDYSLEETKAPENYQKLTKEISFKVDKDSYKEENRITIKNNQKASVPMTGSNGFQSYVLISCLLLGAGGLSAVVYFKKKA >NZ_CP025426.1|WP_010729785.1|212609_213365_-|class-C-sortase MIIRKPPKRRVMHKLMIFFWLLSAVAVYLIPVVETNVAKFQQQQRILAIENLEKTDSSLDVAKIELGDPVGVLTIPSISLKLPIYDGTSDKILENGVGITEGTGDITGGNGKNPLIAGHSGLYKDNLFDDLPSVKKGQKFFIKVNEEQHAYQIYRIEEVKAEELQKNYLDYLMPEKDQDRITLMTCTPKGVNSHRFLVYGERVSFSKEDLKLQKKAKNRKSISLDWRLALLFAFFCVPIIFIYKKIRRRSE >NZ_CP025426.1|WP_002350398.1|211788_212613_-|hypothetical-protein MNKRKWLFVCVAALFSTVAYSQLSFADSSDSSTTQTIDNSITAPSETDSSENTTEETADSNISFTESTNPTSESSSETSEKPQDVEDTQVIKQAIHIQKIISSNQINNQGSQVAQQEGINGAKFIVYDITNILEEMSQDDNEKNQSVEIIESKLKDRAKKLSYDQLKKVAEGETKTIDDQEGVIEFSIEVPANKKQAYYIVNESSPENISNSEDIVLLTPVSNEKGEFLTDVWLYPKSEKSEPKEEIKKVVSTGVKKNFFENCWEFFAQLFFDN >NZ_CP025426.1|WP_025481135.1|209388_211500_-|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein MEGIMENKIHCTTGRVITLVLFLFLLLFARGTAVQALEKVDPSQIKENNNLVLYHDSDSLRNIEVTGINGFKILDEYSTKKQKVLAWPKVKDLKSTSKIVAHYQKVGTYLGKEIDCDVTFSNFVAHAGVNQDGLAKTINGKKYYNYLLFDKNIYRGFFMQSINVMNAKLEFKYAGTKTKVALSEPQPEIQSKMRSMRAAGIDLNDTFLSIYSLNGQYQQRVSWYNDNNESVGERNIDMREFVGYEKMGSLPYFVTTDTACAEYKAPALSTNNLTSKVVGGRAEKAYSSNDHFTDVVGADTYHRSGVTYTLQGASPTFMIGANTNSMMFSFDTALLWTPQPSKPTKEVFNKANTEEAAHNIDKKVIPQGSDVYYHIHQKFDALTVNTMNKYKSFKITDTFDSKNFDMVSDGKNYDGALWYVEANGTWKKADTGGKLTVSGNTVTYTASDSFLANAANYGRDYILQLHMRAKNDAKGIAPNVATVTFNNDPNKGTQKTNTVENYFSLKPNKKVEQDGKDVDGRNDGKKGTPTAPLNAGSEVQYLVTQKWHTKGVDIASDHYKQFSIQDPVEDRLTYKEGSARVIDMSTGKDITSEGTLTYDSNSRTLKWEASADFLSKNLLDGREIQLIFTAKTPLNEELDIDNQAKVSVESIEKATNVVTIGVKPNLPQIIVPKTGSNHLVLTVIGSILFLTLASLGYVVLKLK >NZ_CP025426.1|WP_002348857.1|223057_223252_+|hypothetical-protein MMGFFLRFYIIELTGRLTVFFGNFAIKPFAEVTAHYICKWLDCKNKIKKVFHYISSSPCQIRPG >NZ_CP025426.1|WP_002323589.1|223958_225107_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MEQLKAYKFRIYPTEEQEIFFAKSFGCVRKVYNLMLDDRKKAYEEVKNDSSKKMTFPTPAKYKKEFPFLKEIDSLALANAQLNLDKAYKNFFRDKSVGFPRFKSKKNPVQSYTTNNQNGTIALIDSKFIKVPKLKSLVRIKLHRQPKGIIKSATISRHSSGKYYISLLCKEEIIELPKTNSTIGIDLGIMDFAILSDGQKIDNNKFTSKMEKKLKREQRKLSRRALLAKNKGTNLFEAKNYQKQKRKVARLHEKVMNQRTDFLNKLSTEMIKNHDIICIEDLNTKGMLRNHKLAKSISDVSWSKFVTKLQYKADWYGRKIIKVDKWFPSSQICSECGHKDGKKSLEIREWTCPVCHTHHDRDINASINILTEGLRLHSMGLA >NZ_CP025426.1|WP_002287522.1|225123_225528_-|IS200/IS605-like-element-ISEfa4-family-transposase MELDTNNHSVFLLYYHLVLVTKYRRQVIDDEISDYAKTTFERISESYHITLVEWNHDKDHVHIMFKAQPKTELTKFINAYKSASSRLIKRDFPRVKQFLWKEMFWSKSFCLLTTGGAPIDVIKKYIQNQGNNHK >NZ_CP025426.1|WP_002323399.1|225886_226141_+|hypothetical-protein MGKELKVRKIGNSVGVILPSSLGLKSGDIIQAKQEGNLFILDTTQIAKEHDRKLIEESFQDFEKGLTVSEIEMVKAFGKYGWSE >NZ_CP025426.1|WP_002290394.1|226141_226459_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MKEYTLVYSKSFQTSLETIIEEWENELALSPASIKRFVGAIQKALELTKNFPTMHEEVSEIYGMDIPTYRIVIGKSYALFYRIDHEKKEILVGRIFQSKQMKLGF >NZ_CP025426.1|WP_002323400.1|227017_227953_+|hypothetical-protein MNILNEKRYVWFAGKKYITTFKRLSELMQQTVKSAMPEGYKFNFVQSSVSTESIYFSILSESRLFHFRISSHVKKTDVDIYTFRTNNYKNLNDLSRSISEYLKGNSYLKIRFSHILILLPYLNENFTLIQVDKSFIASGNQGNMNITSNKTSRVLLALMGYGILYRDDQNGQILINRAGRSLLMKYRKFIPEDFQNLQLENMRLEDLFRLAEDDKYRFEVLKIQKNELLNKLYPENAIKAHFGDANHMYSWFIPKRFRGKINAGDQVKVLNRNSTDVVMITDIYVEDEDIIKYMKPVIKLVNKNKGTRGAS >NZ_CP025426.1|WP_002338109.1|229036_229891_+|AraC-family-transcriptional-regulator MENSIYLVTEPNTQLKDCYFNFCGYSKTEPRHSFGPAIREQYLIHIVLEGEGYYSINDQKYFLKKGQGFVIPPGVSTFYQADEKNPWSYVWLGLSGNLVEYYLKEIGVGKNHLTFKVENLNSFKGLIFETLSYDQDNLVSELSRQKQVYKFLELLLNSASYLNEGIITKKMNPFVRQTIEIIRENAYQKLSVKDIAVSLSIHENYLSRLFKNDMGISIKEYISEIKISIANDLLSSTEYSIQQISDKIGFSTVQSFSKAFKKANGVSPGVYRKRRLGLGIINGE >NZ_CP025426.1|WP_002314387.1|229987_232237_+|alpha-galactosidase MYKDNEMNIIYRSENQQFHLFNQEISYIFKISEDGKLLHLYYGENLPDNDYSHLIEMHHRPMTTYRNENDLLYSLEHLKQEFPEYGTTDFRHPAISLLQKNGSRLSDFVYQGYEVEEGKPKLEGLPATYVDNNDESKTLKVYILDSVTNVQVELLYTIYRDYPVITRSARVMNKGKDIQIIENISSLSLDLPDANYEWQQLSGAWGRERTIKSRTLQQGIQSIESTRGISSHQHNPFVTLKRKNTDENQGEAIGAALVYSGNFLIQAEVDTWDVTRLQVGINPFGFNWKLNPGEIFTAPEAILVYSSKGLNAMSQTFHQLFRKRLARGKWREKDRPVLINNWEATYFDFDEEKLVNIAKKAFDVGIELFVLDDGWFGERENDCAGLGDWHVNPKRLPRGIGSLSEKIRSFGMKFGLWFEPEMVNKDSELYRTHPNWIISTPNRKPNHGRNQYVLNFGLDEVVENIFDQMCKIIDESNLDYIKWDMNRPLTDVFDSHLSADQQGEVFHRYVLGVYRLYEKLITKYPNILFESCSSGGGRFDPGMLHYAPQAWASDDSDAIERLKIQYGTSMLYPLSSIGAHVSIVPNHQTNRITPIKTRGNVAFFGAFGYELDLNELSEGDLRIVKEQIAFYKKYRTIIHNGTFYRLLSPFDDDNQTAWMVVSHDKKTAIVAHYKTLNEVNAPYRRLKLKGLDNDGLYNVGQNSLRSGMELMRAGLVCSDASSGQINDQNRRPETFDFDSKIWVITQEEK >NZ_CP025426.1|WP_002336205.1|232239_233415_+|MFS-transporter MNNQKSLLQKGAILSISLMLTSSQAINGVIPQMKQSLGISQSQSELLGTAPSITVILFILLSSYFAKRIGMKKTIILGLLLAGIGGIIPVFTATFQTVLISRVILGAGLGVYNSLAVTYISSLYSGNTRATLLGIRNSMEALGQTILIFLAGVLVNINWTASFLVYAIAFPVALLFALKVPEIRDENSDIPENHVKEKMNPMVFALVLFAILLVMNSIAISVRFASIATEIKGVNFNASNYLALMPILGILAGFMFGPINKWIGKGTLYLGIIFFIISNLLIAVSNGNMTFLLTGLFLSSITGSWCFPFIFSNLDKVTTKNTINFATSLIFIGCNIGNFIAPIAMQLAQFLTRSTNLTAPFFVFAGIFIVILFVTFFATNKKNTRVTRGAS >NZ_CP025426.1|WP_002297422.1|234559_234823_+|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MAKTVLNPSSARKNFYKLLKDVNENHTEIEIISERSENNAVLIGLDDWKAIKETLLLEQIGTLGVVRKREKDDSGFTNVDEIDWDNL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP011282 | Enterococcus faecium strain E39 plasmid p1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP025426 | Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence | 221216-221254 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | LT603679 | Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 2 | 452-490 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP018832 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence | 244126-244164 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP040369 | Enterococcus faecium strain VB3240 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP043485 | Enterococcus faecium strain DMEA02 plasmid pDMEA1, complete sequence | 27883-27921 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP020485 | Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed1, complete sequence | 96547-96585 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP041262 | Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence | 454-492 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP012385 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 1, complete sequence | 95092-95130 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP013995 | Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence | 358205-358243 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP014450 | Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence | 119937-119975 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP018073 | Enterococcus faecium strain VRE001 plasmid unnamed3, complete sequence | 111370-111408 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP027518 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP027498 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP027507 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004055 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP027502 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135298 | Enterococcus faecium isolate E7429 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135288 | Enterococcus faecium isolate E7199 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135333 | Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 3 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135340 | Enterococcus faecium isolate E7356 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP046076 | Enterococcus faecium strain VRE plasmid p5_03A17012, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | MT074686 | Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP025756 | Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence | 126934-126972 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP027513 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004028 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135244 | Enterococcus faecium isolate E6988 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135279 | Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135783 | Enterococcus faecium isolate E4239 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135294 | Enterococcus faecium isolate E7237 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135255 | Enterococcus faecium isolate E7098 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135236 | Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135198 | Enterococcus faecium isolate E6055 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP040905 | Enterococcus faecium strain N56454 plasmid unnamed, complete sequence | 153621-153659 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP023805 | Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04619.3A isolate isolate plasmid pER04619.3A.1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP035221 | Enterococcus faecium strain SRCM103470 plasmid unnamed1 | 86167-86205 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_AP019409 | Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NC_020208 | Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence | 61653-61691 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP034948 | Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence | 5084-5122 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP016164 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_11 plasmid ISMMS_VRE11_p1, complete sequence | 177278-177316 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP018827 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence | 244126-244164 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | LR135186 | Enterococcus faecium isolate E4413 genome assembly, plasmid: 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP012461 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence | 192113-192151 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP023795 | Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04484.3A plasmid pER04484.3A.1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_MG674581 | Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP023781 | Enterococcus faecium strain Efaecium_ER03933.3A isolate isolate plasmid pER93933.3A.1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LT598664 | Enterococcus faecium isolate Ef_aus00233 plasmid 2 | 168263-168301 | 0 | 1.0 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP027401 | Enterococcus faecium strain FDAARGOS_323 plasmid unnamed, complete sequence | 109448-109486 | 1 | 0.974 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR135175 | Enterococcus faecium isolate E4402 plasmid 2 | 453-491 | 1 | 0.974 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_LR134096 | Enterococcus faecium isolate E1334 plasmid 2 | 453-491 | 1 | 0.974 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP042833 | Enterococcus faecium strain FA3 plasmid unnamed1 | 47629-47667 | 1 | 0.974 |
NZ_CP025426_1 | 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder | 221216-221254 | 39 | NZ_CP012367 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0933 plasmid unnamed 1, complete sequence | 3358-3396 | 4 | 0.897 |
1. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011282 (Enterococcus faecium strain E39 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025426 (Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to LT603679 (Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018832 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040369 (Enterococcus faecium strain VB3240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043485 (Enterococcus faecium strain DMEA02 plasmid pDMEA1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020485 (Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041262 (Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012385 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013995 (Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014450 (Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018073 (Enterococcus faecium strain VRE001 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027518 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027498 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027507 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004055 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027502 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135298 (Enterococcus faecium isolate E7429 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135288 (Enterococcus faecium isolate E7199 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135333 (Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 3) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135340 (Enterococcus faecium isolate E7356 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046076 (Enterococcus faecium strain VRE plasmid p5_03A17012, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to MT074686 (Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025756 (Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027513 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135244 (Enterococcus faecium isolate E6988 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135279 (Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135783 (Enterococcus faecium isolate E4239 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135294 (Enterococcus faecium isolate E7237 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135255 (Enterococcus faecium isolate E7098 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135236 (Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135198 (Enterococcus faecium isolate E6055 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135259 (Enterococcus faecium isolate E4457 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135182 (Enterococcus faecium isolate E1774 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040905 (Enterococcus faecium strain N56454 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041256 (Enterococcus faecium strain 515 plasmid p26, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019209 (Enterococcus faecium strain 2014-VREF-41 plasmid p41-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017798 (Enterococcus faecium strain E243 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135429 (Enterococcus faecium isolate E8927 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135436 (Enterococcus faecium isolate E8691 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135483 (Enterococcus faecium isolate E4456 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135204 (Enterococcus faecium isolate E7171 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135180 (Enterococcus faecium isolate E0595 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135227 (Enterococcus faecium isolate E7025 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135489 (Enterococcus faecium isolate E8414 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135365 (Enterococcus faecium isolate E8195 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135220 (Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
49. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135415 (Enterococcus faecium isolate E8328 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
50. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135395 (Enterococcus faecium isolate E8290 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
51. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NC_021987 (Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135345 (Enterococcus faecium isolate E8202 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135325 (Enterococcus faecium isolate E7654 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135358 (Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135409 (Enterococcus faecium isolate E8284 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135352 (Enterococcus faecium isolate E8014 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050649 (Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 ALE plasmid pBIOPOP-3_ALE) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050651 (Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 WT plasmid pBIOPOP-3_WT) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135385 (Enterococcus faecium isolate E7933 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044265 (Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135318 (Enterococcus faecium isolate E7663 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134106 (Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135373 (Enterococcus faecium isolate E8172 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006031 (Enterococcus faecium T110 plasmid pEFT110, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011829 (Enterococcus faecium strain UW8175 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR132068 (Enterococcus faecium isolate E0139 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019395 (Enterococcus faecium strain QU 50 plasmid pQL50, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LN999988 (Enterococcus faecium isolate EFE11651 plasmid II, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033042 (Enterococcus faecium strain Enterococcus faecium JE1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025687 (Enterococcus faecium strain CBA7134 plasmid pCBA710401, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040741 (Enterococcus faecium strain VRE1 plasmid pVRE1-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014530 (Enterococcus faecium strain E745 plasmid pl1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023424 (Enterococcus faecium strain K60-39 plasmid pTT39_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022342 (Enterococcus faecium strain KUHS13 plasmid pKO1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040877 (Enterococcus faecium strain HB-1 plasmid punnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032307 (Enterococcus faecium strain HY07 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040704 (Enterococcus faecium strain HOU503 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044275 (Enterococcus faecium strain V2937 plasmid pHVH-V2937-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017793 (Enterococcus faecium strain E240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019993 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-268 plasmid p268-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035655 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023790 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04462.3A plasmid pER04462.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023800 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.5A plasmid pER04526.5A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035137 (Enterococcus faecium strain SRCM103341 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035661 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035667 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NC_017963 (Enterococcus faecium DO plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035649 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040850 (Enterococcus faecium strain F17E0263 plasmid p_unnamned1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042840 (Enterococcus sp. DA9 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135171 (Enterococcus faecium isolate E4227 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135192 (Enterococcus faecium isolate E4438 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041271 (Enterococcus faecium strain VVEswe-S plasmid pVVEswe-S1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037956 (Enterococcus hirae strain CQP3-9 plasmid pCQP3-9_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135308 (Enterococcus faecium isolate E7240 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040237 (Enterococcus faecium strain VB3025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018066 (Enterococcus faecium strain E1 plasmid pE1_230, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023809 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.3A plasmid pER04562.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033207 (Enterococcus faecium strain RBWH1 plasmid pRBWH1.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018129 (Enterococcus faecium strain A_020709_82 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023805 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04619.3A isolate isolate plasmid pER04619.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035221 (Enterococcus faecium strain SRCM103470 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019409 (Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NC_020208 (Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034948 (Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016164 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_11 plasmid ISMMS_VRE11_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018827 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to LR135186 (Enterococcus faecium isolate E4413 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012461 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023795 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04484.3A plasmid pER04484.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG674581 (Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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112. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023781 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER03933.3A isolate isolate plasmid pER93933.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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113. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LT598664 (Enterococcus faecium isolate Ef_aus00233 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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115. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135175 (Enterococcus faecium isolate E4402 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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116. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134096 (Enterococcus faecium isolate E1334 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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117. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042833 (Enterococcus faecium strain FA3 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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118. spacer 1.2|221216|39|NZ_CP025426|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012367 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0933 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
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DBSCAN-SWA_1 |
7031 : 173578
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP025426|7031:173578|DBSCAN-SWA 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149 | Streptococcus_phage(25.0%) | holin,transposase,integrase | attL 131028:131044|attR 139809:139825 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP025425_1 | 2327691-2327800 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP025425_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP025425_1
>1.1|2327717|58|NZ_CP025425|CRISPRCasFinder CCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP025425_1
The CRISPR arrays of NZ_CP025425_1 >merge|NZ_CP025425|1|2327691-2327800|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTATTCATCACCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCGCTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCA >NZ_CP025425|1|1|2327691-2327800|CRISPRCasFinder CTTTGCTCAACCAGTATTATTCATCA CCTATTCACTTCGTTCATAGTGATTCTACTCGCTTTGCTCGAAAGGAAACTCCTTTCG CTTTGCTCAACCAGTATTGTTCATCA
>NZ_CP025425.1|WP_002291634.1|2327114_2327618_-|50S-ribosomal-protein-L10 MSEAIIAKKAAIVDEVSEKFTAAASVVVVDYRGLTVDEVTRLRKQLRDANVEMKVIKNSILSRAAKKAGLEGMDEVFTGPTAVAFSNEDVVAPAKIMDEFAKEAKALEIKGGIIEGKVSSLEEITALAKLPNREGLLSMLLSVLQAPVRNVAYAVKAVADKEDGDAA >NZ_CP025425.1|WP_002294588.1|2326693_2327062_-|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MALNIENIVAELKEATILELNDLVKAIEEEFGVSAAAPVAVAAAGGAAAAEEQTEFTVELTAAGDQKVKVIKAVREATGLGLKEAKAVVDGAPAPVKEGVSKEEAEELKAKLEEVGASVTVK >NZ_CP025425.1|WP_002294589.1|2325898_2326588_-|TVP38/TMEM64-family-protein MKKKIIRLILISLGIILILVVGYRLYLEYQTDIQLFLNPRASKAELLAHIRSHGTFASILLIVLTAVMCAVPGIPTSVVGVIAGLSFGPLTGAIINILGNALGNITAIFLMHRLKFLDKKTETNHWVQAIRQMKHPKIGVMLGYMIPVIPSSMVNFAADAMKLPLQQIILSIVIGVIPSSVLYACGGEALFHGYNKTAVTLVASVTVLVGLVVFIYKDRKKKQGKQKHK >NZ_CP025425.1|WP_002303471.1|2324614_2325817_-|MFS-transporter MKSNEKKPLTTSLILLLSITCGVVVANMYYIQPIGTKVAASLSVSTSAVGILTMLTQLGYALGLLFLVPLGDVVDRPKLIIRMAALSAVSLLAAFFAPSFTLFACASFLIGLLSIVPQIIIPYGAVLAGPKARGKVMGTLLSGLLVGILLSRTVSGIVASLFSWRMIYLFALCAVGILTLLLYWKMPRSVQQSSTAVSYLDSLKSLPHLVASQRLLREAAVSGFFMFGTFSIFWSTLIFYISSPAYNWGTFEAGILAIFGLSGAVAAPIVGRLADSYSERKIVYMGLVMQTISFIALLVGGSHLAILLLAIILLDVGNQFGQVANQTRVQGLGEAASNRNNTVFMFMYFIGGAAGSLLGTTMWQQYGWLGVTVSGLVFQGCAFFFQTVVFKGKRNLENKK >NZ_CP025425.1|WP_101699741.1|2322891_2324424_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MSILTLNNITQQFGDKILYEGVDLQLNAGEHLGLIGQNGAGKSTLIKIITGEILPDDGQIHWQKNIHKGYLDQYVEVDETLTIEEFLKTAYAKEYEKEEKIAFLYQTYSETFDDSLLEKAGKLQTELDQGVFYQIDTLVAEMISGLGIDVLGLDSLLKNLSGGQRSKVILAKLLLENPDVLILDEPTNHLDDQHIQWLTQFLQDFDGAYIVISHDQEFLDQITTHIADIEFGKITKYTGHLKQALKQKEQNRESYLRQYHAQQKQIEKTEAYIRKYKAGSRSTMAKSRQKQLDKIERLTPPASASKAVFDFPFSPIVTTLAVETTDLVIGYDRPLLAPINLTIRFGENIAIRGFNGIGKSTLLKTLIGEIEKISGDFHFPDNTKINYFSQDLYWENPLETPLQYLSSQFPKATIKELRRQLAKAGLVNQLASEPLTTLSGGEQTKVKLAQLTMNQGNLLILDEPTNHIDQETKESLQDGIQKFPGTVIIVSHEQEFYQDLVQRVIEIEPK >NZ_CP025425.1|WP_002287787.1|2321956_2322658_-|glucosamine-6-phosphate-deaminase MEIIRVKNAEEGGKKAFEIIKEGMNKGAKVLGLATGSTPVTLYKEMTSSDLDFSEMTSVNLDEYVGLGGSDEQSYRHFMDVQLFDKKPFKETFVPDGKAEDLEAACKKYDQIIDAHPIDIQILGIGQNGHIGFNEPGASFDGTTSVVDLTESTINANKRFFDKAEDVPTKAVSMGIGSIMKSKEIVLMAFGESKADAIKGMIEGPVTNHLPASVLQNHDNVVVIIDEEAASKL >NZ_CP025425.1|WP_002294593.1|2319540_2320680_-|AI-2E-family-transporter MQSRFKQSKLFFWTVELVLTIIGVYFILQMPNIFSPILKMLSAVFLPLLVAGFIYYMFDPIVVFLEKHRIPRVFGFLLTFLVVIILVVLTVMNVVPQLMEQTIQLTQSLPMYADETSKWLNELAQREEFKNFNLEEQLASANLSLSNLFNIILVSLSASVSKIISFMMQFFILLFTVPFILLFMFKDGHKFIDALSHFFPKAIRKELRQTVKELNETLSAYISSTILDALIIGVMSFLAMRIFDQPYSLLLAVICGITNIIPYVGPFIGAVPAIIVGLFISPFQALYMALSILVIQQLDGNLIKPLLFGKSMNIHPLTIILVLIGAGSVAGILGMLICIPVYAVIKTIILNIRKIYLLRRMEHVSEKLDSPKVLEETSE >NZ_CP025425.1|WP_002287792.1|2318486_2319452_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MSETYYEAINWNEIEDIIDKSTWEKLTEQFWLDTRIPLSNDLDDWRTLSQLEKDTVGHVFGGLTLLDTVQSESGMDQLRKDVRTPHEEAVLNNIQFMESVHAKSYSSIFSTLNTKKEIEEIFDWTNTNPYLQKKAERINEIYKHGTPLEKKIASVFLETFLFYSGFYTPLYYLGNNKLANVAEIIKLIIRDESVHGTYIGYKFQLGFNELPEAEQETLKDWMYNLLYELYENEERYTEELYDPIGWTEEVKTFLRYNANKALMNLGMDPLFPDTANDVNPIVMNGISTGTSNHDFFSQVGNGYLLGHVEAMKDDDYLIGLE >NZ_CP025425.1|WP_002303469.1|2316277_2318437_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MSLKNLQDVSYFKLNNEINRPVNGQIPLNKDKEALVAFFEENVKPNTMTFLSIMEKINYLIDQEYIEAEFIQLYSPSFIEKLYQFLDEQHFSFKSFMAAYKFYSQYALKTNDGSAYLETYEDRVAFNALYFANGDEELALALADEMIHQRYQPATPSFLNAGRKRRGELVSCFLTQVTDDMNSIGRSINSALQLSRIGGGVGITLSNLREAGAPIKGYEGAASGVVPVMKLFEDSFSYSNQLGQRQGAGVVYLNVFHPDIIAFLSAKKENADEKIRVKTLSLGVIVPDKFYELTRKNEDMYLFSPYSVEKEYGVPFSYVNITAEYDHLVANPNIRKQKIKARDLENEISKLQQESGYPYVINIDTANRENPIDGKIIMSNLCSEILQVQTPSVINGKQEYEVLGTDISCNLGSTNIVNLMQSPNFGQSVRTMTRALTFITDASDIDVVPPIQNGNKLNHTIGLGAMGLHTYLAKEQMEYGSEDSLDFTNIYFMLLNYWTLVESNNIARERKQVFHNFEKSAYADGTYFEKYVTGEFQPKSEKVKALFEGIFIPTAEDWNALKQAVMKDGLYHQNRLAVAPNGSISYINDTSASIHPITRMIEERQEKKIGKIYYPAPYLSNETIPYYTSAYDMDMRKVIDVYAMAQQHVDQGMSLTLFMRSEIPEGIYEWKTTTKQTTRDLNILRHYAFHKGIKSIYYVRTFTDDAEEIGSNQCESCVI >NZ_CP025425.1|WP_002287795.1|2315894_2316119_+|glutaredoxin-like-protein-NrdH MNVKIFSKNNCMQCKMVKRFLTENQIAFEEVNIDEQPEAVDWLKAQGFQSVPVITSDAETVIGFRPDQLRKLAS >NZ_CP025425.1|WP_002294587.1|2328027_2328717_-|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKSKKMQDALKKVDSSKVYPVAEAVALAKETNIAKFDATVEVAYRLNVDPKKADQQIRGAVVLPNGTGKTQTVLVFAKGDKAKEAEAAGADFVGDDDMVQKIQNGWFDFDVVVATPDMMATVGRLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVTKAVNEVKAGKVTYRVDKAGNIHVPIGKVSFDDEKLVENFAAIHDVLLKAKPSAAKGQYMKNVTITTTFGPGIHVDQASF >NZ_CP025425.1|WP_002291638.1|2328820_2329243_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKIVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGLIIPVVISVYEDRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAKIEKGSGEPNKNKVAKVSSDQVREIAELKMEDLNAANVEAAMRMVEGTARSMGITVE >NZ_CP025425.1|WP_002294585.1|2329585_2330254_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKDLRYRSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAARIGKIIRSIFGEQPDSVDIYLYESFAKTYRGHGTDIALVGGLLGMEPDDERLADSLKLAYEAGMEVLFVPKSEKAEHPNSVKMLLKKGTRKLSVTGISIGGGNIQISELNGFKISLSMGTPTLIVVHQDVPGMIAKVTSILSETNTNIGTMTVTRESKGENAIMIIEVDDPQVEETVKRLKQLPNIDSVNYFD >NZ_CP025425.1|WP_002294584.1|2330266_2331139_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFLSIEELVDQAKAYPSVAELMIAVEMEMSGRSRSHIIEIMEKNLSVMEQSINEGKEGVTSVTGITGGDAKKLDDYLNEADFLSGETILKAVRNAVAVNEVNAKMGLICATPTAGSAGVVPGVLMAVRDRLDLTHEQQLEFLFTAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMAAAALVCAKNGTPHQAAQAVAITLKNMMGLICDPVAGLVEVPCVKRNALGSSQAFISADMALAGIESVIPPDEVVAAMYQVGRQMPSIFKETAEGGLAVTPTAKRLAEEILNKRA >NZ_CP025425.1|WP_002294583.1|2331229_2332249_-|L-lactate-oxidase MEAGAFGYIRGGSEDEWTMKENTTSFNTKKIMPRILRGIDSADLHTSVFGIELDTPIIQAPSAAQGLAHEKGEADTAKGVAAAGSIFSISTYANTTIKDAADAAPGAPQFFQLYMSKDDRFNEFILNKAVEAGAKAIILTADSTLGGYREEDVINQFQFPLPMPNLAAYSEQSASGNGEGKGIAEIYAAAKQGLTPDDIKTIKEITHLPVIVKGIQSPEDAVIAISAGADGIWVSNHGGRQLDGGPASFEVLPKIAEVVNKRVPVIFDSGVRRGEHVFKALASGADLVAIGRPVIYGLNLGGAEGVTSVFEHLNKELSITMQLAGTKTIDEVKNTKLMD >NZ_CP025425.1|WP_002294581.1|2332421_2333309_-|alpha/beta-fold-hydrolase MTEPIKNLCKRATAAALVLISLFALSGCQTTKINTTEVSDKEKTAESSKVIEKTTIPTLFFHGYSGTENSFKGMLRRLEKNQQAVKELVLTVGTDGQIQATGDLSGKADNPMVQVLFEDNKNNEWNQAEWIKTCLLYLKENYGIDKVNIVGHSMGGVSALRYLGTYGQDTSLPQVQTLTAIGAPFNDFVDDSAQSLTDELAKGPAVVSNRYQDYQQMIGNIPITTRFFLIAGQLDETDLSDGTVPLNSALAVYALLKQRGNEIEEKVVTGENASHSMLHENQEVDQLVSRFIWKE >NZ_CP025425.1|WP_002294580.1|2333385_2333931_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusG MESFEKNWYVLHTYSGYENKVKANIESRAQSMKMADFIFRVVVPEEKETEVKNGKEKEIVHKTFPGYVLVEMIMTDASWYVVRNTPGVTGFVGSHGAGSKPAPLLPEEVNHILRSIGMSLRQNDLEVEVGEVVKIIEGAFAGLEGQVTEVDGEKEKLKVNIDMFGRETSTELDFDQVDKID >NZ_CP025425.1|WP_002294579.1|2334031_2334202_-|preprotein-translocase-subunit-SecE MKFLKSVKDEIKQVTWPSRKQLRKDTLVVIETSIIFGLMFYVMDTAIQSLFGWILK >NZ_CP025425.1|WP_002294578.1|2334225_2334378_-|50S-ribosomal-protein-L33 MAKKKAALACSVCGSRNYTKSVSEGKSGERLEINKFCKYCNQYTLHKETK >NZ_CP025425.1|WP_002294577.1|2334539_2335184_+|CBS-domain-containing-protein MLLKTLVYKKKDLTTVTETSTLEEALKILETSGYRCVPILDSSGNIFRGNIYKMHIYRHKANGGDMTLPVTHLLKNATKFIYLDTSFFKVFFTIKELPYIAVLDSENHFYGILTHSTLLNMLSQSWSVEQGSYVLTIASTGKQGDLAAIAKIISKHSSIASCITLDIEKDEYIRRTLITLPANTEAKVCETIVNHLEKKNYKVVEIENLQNQEA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
228386 : 276979
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP025425|228386:276979|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
563639 : 611729
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP025425|563639:611729|DBSCAN-SWA 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43 | Streptococcus_phage(25.0%) | integrase,transposase | attL 570384:570406|attR 603999:604021 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
743693 : 752165
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP025425|743693:752165|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP025425|743693:752165|747883_749005_+|WP_002294035.1|DBSCAN-SWA MMELQFPLHNDTSRKIIHIDMDAFFASVEERDHPEFRGHPLVIARHPSDTGGRGVVTTANYEARKFGIHSAMSAQKAYELCPQAIFKPGDHHKYSDISKQVREVFYRYTDIVEPVSIDEAYLDVTENKINCKSAIKIARMIQADIWESVQLTCSAGVSYNKFLAKLASDYQKPRGITVVAPQDAVPFLKALPIEKFHGVGKKTVPRMHELGIYTGKDLYECTEMMLIRNFGKMGYSLYRKVRGIHDSPVNVTRERKSVGKEHTYGQPLQTEEAVLTQLRQLAEKVEEALRRVQKHGKTVVLKVRYTDYSTVTKRVTLPEYIYKKEALFYQASLIWEEILGVEKGIRLLGITLTNLDPMTYENIVLPLWENQEI >NZ_CP025425|743693:752165|749975_752165_-|WP_002288083.1|DBSCAN-SWA MKVNYEEKTVVTQQPETSQMKVIKRDGRHVDFDEQKINEALIKAEKKIHGSLSPLTYEKIQMIADLVVQEIKSRFAENVKIYEIQNIVEHILLEKNEYELAEEYINYRTKRDFARSKATDINFSIEKLINKDQTVVNENANKDSNVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKMLPPHIANAHQKGDIHYHDLDYHPYTPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNAEVESPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRTDELLAPFAELNYKKHLKDAEEWIDSPERQKEYAKAKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSLGFGLGENWFEREIQKAILQIRINGLGSEKRTAIFPKLIFTLKKGVNLNPEDPNYDIKQLALECATKRMYPDILNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKDENGQEVNVGRMNLGVVTLNLPRIAIESKGDQNKFWQLLSDRLEIMKDALLYRVERCKEAIPANAPILYMYGAFGKRLSRTDSVNELFKNRRATVSLGYIGLYEVASAFFGGEWETNPEAKAFTLDIVKELKANADAWGDEYGYHFSVYSTPSESLTDRFCRLDTEKFGIIENITDKEYYTNSFHYDVRKNPTPFEKLEFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPMLQQNPKALEAVWDFAYDKIGYLGTNTPIDHCYQCGFEGDFKPTERGFECPECGNHDPKTCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEISSRVKHMK >NZ_CP025425|743693:752165|745669_746494_+|WP_002288073.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRYRDAGHIYYFAPGDSEYVYSDKVLVESQQSLHIATVVLPKKEIDPNDLPEAIRPILHKASQAELEKDKKNKKDAYDALKIAKEKVQLRELEMKMVKAEYTFDRNKLIFSFTADGRIDFRELVKDLAAVFRTRIELRQIGVRDEAKIIGGIGPCGRPLCCSSFLGDFVPVSIKMAKDQSLSLNPTKISGLCGRLMCCLQYESEEYETAKKELPDFGKVIATPDGKGKVVGLNLLSRIVSIRLTGRENPVEYEWDELKEFIQVGEMNG >NZ_CP025425|743693:752165|746486_746834_+|WP_002288076.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNQLESELRNTLTELVEMKHALHEIVEKNTTLEMENQRLREHLRELNQVAQAPAENVKQELSKSRMNLEKIYEEGFHVCYDLYGSRRDNDEPCAFCLEVIYRESGR >NZ_CP025425|743693:752165|746902_747775_+|WP_002288078.1|DBSCAN-SWA MYNQKSFKGNPVYGDLYLVPTPIGNLEDMSYRSVRMLQESDLIASEDTRNTQKLLNHFEIHTPQKSLHEHNYKERVPQLIALLKEGKTIAQVSDAGMPSISDPGHELVLACIKEGISVISIPGPTAGMTALIASGLVPQPFLFYGFLPRKKKEQKETLKKLKEQTVTLIFYESPYRITATLTNFLEIFGNRQVVLCRELTKVHEEYLRGSTEELLAYIEEHPVKGECCLLVEGNLFEMPVTEVDEELGTLKEQVEAKIASGEKPNAAIKAVALKNGLKKQEVYRQYHELD >NZ_CP025425|743693:752165|744352_744682_+|WP_002292340.1|DBSCAN-SWA MKIILAIIQDKDSNRLSNELIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIVGIEDDRVEEALEIIKKTCESRKQFVSTPVTLDISMDGGVPYPVEVEVGGATVFVLPVEGFHQF >NZ_CP025425|743693:752165|744695_745634_+|WP_002288071.1|DBSCAN-SWA MNQEINLAQMQPIVYQQLQRSFEHGRIAHAYLFEGEKGTGKHEVGIWLAQHLFCTQMKDNLPCGKCNNCQRIEKKEHPDVLVIEPEGQTIKVDQIRRLQTEFSRSGYESRKKVFLIKEAEKMNSSAANSLLKFLEEPPGDFLAVLETDAVGRILPTIQSRCQVLHFQELSKEALIHRLQEEQIPLEKAKLLAFLTNSLGKAVEISQDEWFNDAKDLIYQWFVYLQKQDTQAFIYVQKKLVKSFKEKTQQFTGLSVLMFYYQEAQRQAVANGEYGKVKQINQIIERILIAEQKLRSNVSFQAVAEQFVLHTIF >NZ_CP025425|743693:752165|743693_744338_+|WP_002294039.1|DBSCAN-SWA MNGLFITIEGPDGAGKTSILNELYPLLKEVAKTEIIQTREPGGIPIAEEIRAVILDPKNDRMDERTEALLYAAARRQHLVEKVLPALAKGKIVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGVTEIARLNEFATEGTTPDFTLYLDVDSDTGLRRIKKNRQNQIDRLDSEGLEFHQRVRHAYLKLAEENPERIHKVDARKSFEEVLQTSYHTIIEQYPQFFEN >NZ_CP025425|743693:752165|749058_749661_-|WP_002288081.1|DBSCAN-SWA MRNPKPKEWLAKDYSQNYIADYKPFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAAQNFRYGKPFTPELEEQIIADLRNDYVQGLTLLGGEPFLNTDVCLQVVRRIRKEFGTTKDIWSWTGYTFDELLQDSEDKLELLSQIDILVDGRFELSKRDLKLQFRGSSNQRIIDVQKSLESNQVVIWEKCTDATETYEQIKKQDLI |
9 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
805175 : 884720
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP025425|805175:884720|DBSCAN-SWA AATGAAAATGAAAGAAACCTTGCAATTAGGAAAAACAAAATTCCCTATGCGTGGTAATTTGCCAAACCGAGAAGGCGAGTGGCAAAAAGAATGGGAAGAAAATCGAATCTACCAAAAAAGACAAGAGTTGAACGAAGGAAAACCTAGCTTTGTTCTTCATGATGGACCTCCATATGCCAATGGTAATATCCATTTAGGACATTCATTGAATAAAATCAGTAAAGACATTATCATTCGTTCAAAATCAATGTCTGGCTATCGTGCACCATATGTTCCAGGATGGGATACACATGGATTGCCGATTGAACAAGTATTGGCTAATAAAGGCGTGAAACGTAAAGAAATGTCCATGGCAGAATACTTGGAAAAATGTCGTGAATATGCACTTTCCCAAGTAGATAAGCAACGAGCAGATTTCAAACGCCTAGGAGTTGCAGGAGATTGGGAACATCCTTATGTTACATTAGATCCTTCTTATGAAGCTGCACAAGTACGCGTATTTGGTAAAATGGCTGAAAAAAGCTATATTTACAAAGGATTGAAACCAATTTACTGGTCTCCGTCAAGTGAGTCTTCTTTAGCGGAAGCTGAAATTGAATATAAAGATGTAAAATCTCCATCTATTTTTGTAGCTTTCAATGTCAAAGACGGCAAAGATATTCTTGATGAAGATACAGCTTTTGTCATTTGGACGACAACACCATGGACATTGCCAGCAAACCAAGGTATTGCTGTAAATCCAAAATTTACGTATGTATTGGTGGAAGCCGATGGCCGTAAGTTTGTCGTAGCGAAAGATTTGCTAGAAACAGTCCAATCAGAAATCGGTTGGGAAAATGTAACAGTTCTAAAAGAATTTGCTGGACAAGAAATGGAATATATGACTGCAAGTCATCCATTCTATGAACGTGAATCACTTGTGATTTTAGGCGATCATGTTACTTTAGACGCTGGTACTGGATTAGTCCATACTGCTCCAGGACATGGGGAAGATGACTATATCGCTGGTAGCAAATATAAACTATCTGTAGTGTCACCTGTAGACTCAAAAGGATTGTTTACAGAAGAAGCACCTGGATTTGAAGGTATCTTTTATGACAAAGCAAATCCTATGATCACTGATCTATTAAAAGAAAAAGGAGCTTTGCTGAAGCTAGATTTCTTTACTCATAGTTATCCTCACGATTGGCGGACGAAAAAGCCTGTGATCTATCGGGCAACTCCACAATGGTTTGCATCTATCGATAAATTCCGTCAGAATATTTTGGATGAAGTAGAAAAAGTAGAGTGGGTTATCCCATGGGGTAAAACACGTTTGTATAATATGATCCGTGACCGCGGCGATTGGGTAATTTCCCGTCAGCGTGCATGGGGAGTACCACTTCCGATTTTCTATGCTGAAAATGGAGAAGCAATCATCACACCAGAAACAATCGAACATGTGGCAAAATTATTTGCTGAACATGGATCAATTATCTGGTTTGAAAAAGAAGCGAAAGAACTTCTTCCTGAAGGATTTACCCACCCAGGTTCTCCTAATGGCGAATTTACAAAAGAAAAAGATATCATGGATGTCTGGTTTGATTCTGGTTCTTCTCATGAAGCTGTTTTACGTCAGCGACCAGAATTATCATTCCCAGCAGATATGTATTTAGAAGGATCAGACCAATATCGTGGCTGGTTCAACTCAAGTATCACGACTAGTGTGGCTATCAATGGTGTAGCACCATACAAATCAGTTATTTCTCAAGGATTTGCTTTAGATGGTGAAGGCCGTAAGATGAGTAAATCTTTAGGAAACATCATTGCACCAGAAAAAGTGATCAAACAATTTGGTGCAGATATCCTTCGCTTATGGGTATCTAGTGTAGATTATGAAGCAGATGTTCGTGTTTCTATGGATATCTTAAGTCAAGTGGCAGAAGTATATCGTAAAATCAGAAATACGATGCGTTTCTTATTAGCGAATACAGAAGATTTCGATCCTAAAAAAGATACTGTTTCGTACAATGATTTACGTTCTGTAGACAAATATATGACCGTTCGATTGAACCAAGTAATCAAAGAAATCCGAGAAGAAGGGTACGACAAATATAACTTCATGCATATTTACCGTACAGTTATGAACTTCTTGACGGTTGATCTATCGTCATTCTACCTGGATTTTGCTAAAGATGTAGTTTATATTGAAGCAGAAGATGATTATCAACGTCGTTGCATGCAAACTGTTTTCTATCAAACAGCTGTAGCTTTGACAAAATTATTGACTCCTATCATTCCGCATACAGCAGAAGAAATCTGGTCATTCCTGAAAGAAGAAGAGGAGTACGTTCAGTTAAGCGAGTTTCCTGGTTATGAAGAGTTTGCAAACCAAGAAGAATTGATGGATACCTGGACTGCTTTCATGGACTTCCGTGATAATGTCTTAAAAGCATTGGAAGAAGCAAGAAACAGCAAATTGATTGGTAAATCTTTGGAAGCAAAACTAACTGTTTATCCAAAACAACAAGTTCGTGAAATGTTAAAAGCTTTGGATGCAGATATTGCACAATTATTGATCGTTTCACCAGACTACTTTGAAGTTATGGCAGCAGATGAACAAGTGCCAGATAACGCTATGGTATTTGATGATGTTGCTATTACAGTGGAAAAAGCAGACGGGGAAACTTGCGATCGCTGTCGCCAAGTTCGTAAAGATGTAGGAGTAGATGAAAAACTTCCTCATCTATGCGGTCGTTGTGCAAAAATCGTTGAAGACTTCTATCCTGAAGCTGTAGCTGAAGGATTCGAAGAAAAGTAAAAGGGAAAAGGGGGTGTGACATGTTCTTTGTCACACCCCCTTTTGTTATCAATCGTTTAATTTTCCACGTTCACGATACCAGTTATCTGGTTGCCAGATCCATTCGAATCCGTCTTTTTCAAGTAGTTCGAAAGCTGCTTTAGGTCCCATTGATCCAGCTTTGTAGTTGGGAAAATCCGGTTGTGTTTGGTCCCAAGCTTTTCGAATGACATCCACGATATGCCAAGATTGAGCGACTTCTTCCCAATGAGAGAAGTTCGTTCCATCACCATTCAACGCATCTAATAGTAATTTTTCGTAAGCTTCTGGGCTATTTTCAACCATTTCTGCACTATTTCTAAATTCCAATTTGATTGGTTCCGTTTCAAATCCTTGCCCTACTTCTTTCCCATTCAAGGATAAAGAAAATCCTTCAGTTGGCTGAATATAGATCGTTAGAACATTAGGTGGAAGTGTCGTATCGTCACATGGTTCATCGACAGATGTTTTGAATACATTAACAGGAACTTGTTTGAATACGATGTTGATCCGAGTCCCTTTTTCAGTCAAACGTTTGCCTGTACGTACATAGAAAGGAACACCTGACCAACGGAAGTTATCGATAGTGAATTTGCCTGCGACGAATGTTTCAGTCTCTGATTGAGCATCCACTTTGTCTTCTTCGCGATAGCCCTTGAATTGTACACCATCCAATTCACCTTGAGCATATTGCCCGCGAACGAAGTTTTCTAACACTTCTTCTTCGTTATAAATGCGGATAGCTTTCAATGCTTTGATCTTTTCTGTACGGATTTCTTTTTCGGAAAATGCTACTGGCGGTTCCATTGCAAGTAATGCTACAACCTGTAAAATATGATTTTGCACCATGTCTTTAAGTGCGCCACTATGATCGTAGTAGCCCCCGCGATCTTCTACACCGAGGTTTTCGCCAAAAGTAATTTGGATATTGTCGATATAGCGATTGTTCCATTGAGCCTCAAAAATATTATTGGCAAAACGGATAGCTGAGATGTTTTGGATCATTTCTTTTCCTAAATAATGATCAATCCTGAAAATATCTTGTTCTGGGAATACTTCTCTGATTTGCTGGTTCAATTCAAAAGCAGACTGGTAATCAGAACCGAACGGTTTTTCTATGATCAAACGATTGAAGCCATTTTTTGTCATAATATTTTGTGATTTCAAATGAGAAACGATCGTTCCAAAAAATTGAGGTGCCATAGCCAAATAATAGACACGGTTACCGTTTAATTGATAGTGTCCATCTAATCGGTCAGACAATTCTTTTAATGTCTGATAATGCGTTGAATCATTTACATCATGGGATTGATAGTAAAAATGGCTTGCAAAGGTAGTTGCTTCTTCATCTGAAGGATTCAATGCACGGATTGTTTCTTTGACAACTTCACGGTAGTGCTCATCGCTCCAGGGACGGCGAGCGGTTCCGATTACAGCAAAATGCTCGCCTAAATTTCCTTTTCTGTAAAGGCGGAACAAAGACGGGTACAATTTACGCTGGGCTAGGTCACCTGTACCGCCGAATATCGTAAACAATACATTTTTTTCATTAGACATGTGGATACACTCCTTTATATTTTATCGACAAAAATCGTGCTGGCCGCCTTAAAGCTGACGGGGATTTTCTTTCTATCATTTTGGATAGTGATCGGTCCTTCATAAGCTGCGATGTCAACGATCTCATATTCTTCGTTGATATTCAGGTCAATAGTGACTAAGTAATCCAACAATTCTTTTTCATCAAGCACTCGTGCGATACGCACTTTTGTACCGACAGGATAGGACTCCAATGTTTGTCGGCGTTCTTCATGGACAACTTCCTCTTTTTTAGGAATCGATCCTCCATGAGGACAATGTTCAGGATGATTCAAATAGTTTTCTAAATGATCTGCAAGATGTTCCGAAGTCACATGTTCCAATACTTCAGCATCATCATGGACTTCATTCCAGCTATAGTCTAAATGTTCAACTAAAAAAACTTCCCATAAGCGATGTTTGCGAATCAGACTGCTAGCTTTTTGCAGTCCGCTTGCAGTCAATTGTACACCTTGATAAGGGGAATGTTCTACAAGCTCTTCTTTCACAAGTTTAGAAATCATTTCACTGACAGATGCAGCTGAGACATCTAGACTAGATACGATTTGTTTATTGTTGACTTTCGTTGTATCTCCACCTAGTTCTA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94 | Enterococcus_phage(26.32%) | integrase,protease,tRNA,holin,portal,transposase,head,terminase,capsid,tail | attL 860759:860774|attR 864112:864127 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1177327 : 1186388
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP025425|1177327:1186388|DBSCAN-SWA CATGTTAGAACGTTATACACGCCCTGAAATGGGGAATATCTGGACGGAAGAGAACAAATACCGTGCGTGGCTCGAAGTCGAGATTTTAGCAGATGAAGCTTGGGCAGAACTTGGTGAAATCCCGCAAGAAGATGTGAAAAAAATTCGTGAGCATGCATCATTTGATATCGATCGGATCTTGGAAATCGAAAAATTAACACGCCATGATGTCGTTGCGTTTACACGAGCGGTTTCTGAAACATTGGGAGAAGAAAGAAAATGGGTCCATTATGGTCTAACAAGTACGGATGTCGTAGATACTGCTTATGGCTATCTCATCAAGCAAGCAAATGATATTTTACGGGAAGACTTGAAACGTTTTACGGAAATCATTGGCGAAAAAGCAAAAGAACACAAATATACAGTGATGATGGGTCGGACACACGGTGTCCATGCTGAACCAACTACTTTTGGATTGAAACTTGCCACATGGTATTCAGAAATGAAACGGAACATCGAACGATTTGAACATGCGGCAAAAGGAGTAGAAGCAGGAAAAATCTCAGGAGCAGTGGGGACGTTCGCAAATATCCCGCCATTTATTGAAGAGTATGTATGTAAACAATTGGGGATCCGTCCACAAGAAATCTCTACTCAAGTTCTCCCTCGGGATCTACATGCTGAATATTTCTCAGCGATGGCGCTTATTGCTACAAGTATTGAACGTTTTGCAACAGAGATACGCGGATTGCAAAAATCCGAAACACGTGAAGTAGAAGAATTTTTTGCGAAAGGTCAAAAAGGTTCTTCTGCTATGCCGCACAAAAGGAATCCGATCGGTTCAGAAAATATGGCTGGTCTAGCCAGAGTGGTGCGCGGACACATGGTCACTGCCTATGAAAATGTCACATTATGGCATGAAAGAGATATTTCTCATTCTTCAGCAGAACGAATCATCTTGCCTGATACCACGATTTTATTGAATTACATGTTAAATCGTTTTGGCAATATCGTTAAAAATCTAACGGTCTTTCCTGAAAACATGAAGCGGAATATGTCTGCAACATTTGGTTTGATTTATAGCCAGCGCGTTATGCTGAAATTGATCGATAAGGGAATGACAAGAGAAGAAGCTTATGATCTTGTTCAGCCAAAAACTGCGTACGCTTGGGACAACCAAGTGCAGTTCCGCCCGCTGTTAGAAGAAGATCCAACCATCACATCGGTATTATCTAAAGAAGAAATAGACGATGCCTTTGATTATCATCATCATTTGAAAAACGTTGACGTGATATTCAAACGAGTAGGTTTGGAATAAAGAAGAGTGAGTTGCAAAATTCAATTAAAATAGAATAGCAAAAATAACCAAAAAAGAAGCAGATCCGTTAGCGGTTCTGCTTCTTTTAGTTTATTATATTTTCTTATCAATAATAGGAACCTGATTTTAAAAGCGGCTACCTCTTTACCGTGCCTCTTTACATACAAAAAATAGAGGAATTAAGCGTAAATGGCTTGGCTATTATAACTAAAATGCTGGTTATGGAGATGTTGCAGCAAGTTTTCGAGAAAAGCGTATTCCATCTCTTGTCCATTGAATAAGATCTGGATACGATAATGATTTTTGAAACGCTTCTGTTCATGAATCTGACTGATTGAAAGTTCGCCTTTGTGTTCTGTCTGATAAAGAAAAGTCCTTTTACGGCATTCAGCACAGCGCTTGGTTGCTCGGCGGATTTTTCGGAATGTATAAAAACTAGTATCTTTATTGCATAAATAAACGTCTTTGATCGACAGCAAATCATTATATAGACAGGAACGTTCTTCAGCTGTTAATTCTGATAAAAAAAGCTGACCTTGTTTTATTGCATCTTCCATCGGCAAGTGCCTCCTCGAACCCATTATCCAAATTTTTAGTTAATTCTAATATACCATCATTAAGTATAAATGTAAACGCTTGTTGATGGTATAAGATTTTCGTTTCTGATAAAACACGAACATTAAAAGAATCTAATGTCTTAAATGTACATATTTTTGTTGATTTATAAAAAGATGATTGCTAAAATTTAAAGTGAAAACACGAACAAAAAACGATGTATTTGCTTTTAATGTAAATAAAAAGGAGAGACGTACATGGAGAAGAAAGAACTTTTGTATGAAGGAAAAGCCAAAAAAATATATCTTACTTCTGATGAGAACTTGATTTGGATAGAATATTTAGATCAAGCAACTGCGTTGAATGGCGCGAGGAAAGACCAGATAAGTGGAAAAGGAGAATTGAATAATCAAATCACAAGTGCAATTTTCCGTTATCTGACTCAAAGAGGAATAAAAAATCATTTTATTGAACAATTGTCTAAAACCGAACAATTAGCAAAAAAAGTACAAATTATCCCTCTGGAAGTGGTTATCCGAAATATTGCAGCAGGAAGTTTCTCAAAACGTCTAGGTGTTCCCGAAGGTAAAGAATTCATCAAACCAATCATTGAATTCTACTATAAGGATGACCAGTTGGATGATCCATTTATCAATGAAGAGCATATCTATTTCTTACAACTTGCAAAACCGGAAGAAATCAGTGAGCTGAAAGCCCAAGCGTTGGCTATTAATGAAATTTTGACCGAATTATTTGCTAAGGTCGGTTTGGTTTTAGTAGATTTCAAGCTAGAATTTGGCCGGTCGAATGGACAAATTTTGCTTGCGGATGAAGTAACACCGGATACTTGCCGATTATGGGATGAACGTACGAATGAACATATGGACAAAGACGTTTACCGCAGAGATCTAGGTGATTTGATCCCAGTCTATCAAGAAGTATATAACCGTCTATCGGAACTAACTGAAGAAAAGGAGCGAGTATGATGTATTTCGTAAAAGTATATGTAACCTATAAAGATTCAGTGTTAGATCCTCAAGGGGAGGCAGTAAAAAAAGCAGTCCATCGTATGGGATATGAAACAATCGAAGATATCCGAATAGGAAAATACTTTGAGATACAACTTGCTGATGCAGAAGAACCAATCGATACAGTGATTGAAACGATTTGTGACAAGCTGCTTGCAAATGTAAATATGGAAACATACCGATATGAAATCAAAAAAATGGAGGAAGTATAACATGAAATTTGCGGTCATCGTTTTTCCAGGTTCAAATTGTGACGCAGATATGTTATGGGCAGTTCGCGAGATCATGGGCGCTGATGCCGAATTTGTACGGCATGATGAGTCCTCTTTAGAAGGATTTGATGGGGTTTTACTGCCGGGAGGATTCTCCTATGGTGACTATTTGAGATGCGGTGCGATTGCTCGGTTTTCTACAATCATGGAAGAAGTGATTCGTTTTGCTGAAGAAGGGAAACCGGTATTCGGTACATGCAATGGATTCCAGATATTGACAGAAGCAGGACTTTTGCCAGGTGTACTGAGACGAAATGAGTCTTTGCATTTTATTTGCAAAACTGTACCATTGAAAGTCAACTCCAAGACGGCCTTTACTTCAGAGTATGAAGCCGACGAAATAATCTATCTTCCAGTTGCTCATGGGGAAGGAAATTATTTCTGTGACGAAGAAACACTTCAAGAACTAAAAAAAAATAATCAGATTGCCTTTACTTATAATGACAACATCAACGGCAGCGTGGAAAACATTGCAGGGATTACGAACAAAGCAGGGAATGTGTTAGGAATGATGCCTCATCCAGAACGTGCAGTAGAAGACTTGCTAGGATCAGAAGATGGGAAACGGTTCTTTGCTTCCATTTTAAAAAACTTCGGAAAGGTGACCGTATAGATGAAAACATTGAAAGAACCGACAGCTGAAGAGATCAAGAAAAAAAGAATCTATGCCGAATGGGGATTGACTGATGAAGAATATCGAATGATCGAAGAAGATATCTTAGGAAGAATGCCTAATTATACGGAAACTGGACTGTTCTCTGTTATGTGGAGCGAACATTGTTCCTATAAAAATTCTAAACCGGTTCTACGCAAATTTCCTACTAGTGGACCTCATGTGTTGCAAGGCCCTGGAGAAGGCGCAGGCATCGTCGACATCGGTGATGGACTAGCAGTTGTCTTCAAAGCAGAAAGTCACAATCATCCTTCAGCTGTGGAGCCTTATGAAGGAGCTGCGACAGGAGTTGGCGGAATCATCAGAGATATTTTCAGCATGGGGGCTCGTCCAATTGCGTTGCTAGATTCATTGAGGTTCGGCGAATTAGATAATCCAAGAACGAAATATTTACTAGAAGAAGTAGTTGCAGGTATCGGCGGATACGGCAATTGTATCGGCATACCGACTGTAGGCGGCGAAATTGCATTTGATCCTTGTTATGAAGGAAACCCATTAGTCAATGCAATGTGCGTAGGTTTGATTGAACACAAACATATCCAGAAAGGGCAAGCCGCTGGCGTCGGTAATTCGATCATGTATGTAGGCGCAAAAACAGGTCGCGACGGTATCCACGGAGCAACTTTTGCCTCAGAAGAATTTAATCAAGAAGAAGAACAGCAACGTTCTGCTGTACAAGTAGGCGATCCTTTTATGGAAAAGCTGCTGCTTGAAGCGTGTTTGGAATTAATCTTGCATCATTCGGATTCTCTAATAGGTATACAGGATATGGGAGCAGCAGGACTTGTTTCATCTAGTGCGGAAATGGCTTCAAAAGCTGGTTCAGGACTTATATTGACATTAGATGAAGTCCCACAAAGAGAAACTGGAATGACGCCTTATGAAATGATGCTATCGGAATCACAAGAACGGATGTTGATTTGTGTCAAATCAGGAGAGGAAGAAAAAATCCAAGAACTATTTCAGAAGTATGATCTAGATGCAGTCACTATCGGGAAAGTAACAGATGACGGGCAATATCGGCTATATCATCAAGGAGAAGAAGTAGCAAATCTGCCAGTCGATGCATTAGCTGAAGATGCACCAGTCTATCATAAAGAAATGAAAGAACCAGCTCGAATCGCAGAATTTCAGCAGTTAGCTCCTTATCAGCCAGTTATCGAAGAACCTGGACA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP025425|1177327:1186388|1185809_1186388_+|WP_002302314.1|DBSCAN-SWA MRIAVFASGNGSNFQALADYLSKKELEASIDWLFCDQPEAYVLKRATALSVPADCFSPKEFDSKKEYEEAILHKLKEKKIDLIVLAGYMRIIGPVLLENYDKRIINIHPSLLPAFPGLHGIRDAFEAGVKETGVTIHYIDQGVDTGPIIRQEKVRIEQEDTFDSLEGKIHRVEHRIYPEVISEIIENGGYLK >NZ_CP025425|1177327:1186388|1180163_1180418_+|WP_002295474.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKKAVHRMGYETIEDIRIGKYFEIQLADAEEPIDTVIETICDKLLANVNMETYRYEIKKMEEV >NZ_CP025425|1177327:1186388|1180419_1181091_+|WP_002302316.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDADMLWAVREIMGADAEFVRHDESSLEGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSTIMEEVIRFAEEGKPVFGTCNGFQILTEAGLLPGVLRRNESLHFICKTVPLKVNSKTAFTSEYEADEIIYLPVAHGEGNYFCDEETLQELKKNNQIAFTYNDNINGSVENIAGITNKAGNVLGMMPHPERAVEDLLGSEDGKRFFASILKNFGKVTV >NZ_CP025425|1177327:1186388|1178802_1179180_-|WP_002297115.1|DBSCAN-SWA MEDAIKQGQLFLSELTAEERSCLYNDLLSIKDVYLCNKDTSFYTFRKIRRATKRCAECRKRTFLYQTEHKGELSISQIHEQKRFKNHYRIQILFNGQEMEYAFLENLLQHLHNQHFSYNSQAIYA >NZ_CP025425|1177327:1186388|1181091_1183314_+|WP_002299012.1|DBSCAN-SWA MKTLKEPTAEEIKKKRIYAEWGLTDEEYRMIEEDILGRMPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTSGPHVLQGPGEGAGIVDIGDGLAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGELDNPRTKYLLEEVVAGIGGYGNCIGIPTVGGEIAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIEHKHIQKGQAAGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFNQEEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELILHHSDSLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLILTLDEVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLICVKSGEEEKIQELFQKYDLDAVTIGKVTDDGQYRLYHQGEEVANLPVDALAEDAPVYHKEMKEPARIAEFQQLAPYQPVIEEPGQVLLDLLQQPTIASKRSIYETYDSQVQTNTVVRPGSDAAVMRVRGTNKALAMTTDCNARYLYLDPKIGGQIAVAEAARNIIASGGKPLAITDCLNYGSPDKPEVFWELSTSADGIAAACETLGTPVISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLIEDHKHITTQEFKKSGDLIYILGKTFADFDGSELQKMQLGRIEGVIRNFDLSIEKRNQELVLTAIQNGLIESAHDCSEGGLAIALAESAFKHQLGISVQFELSSAQLFAETQSRFVLTVAPENKTRFEEMMGDAAVLAGKVTDEAIIEISATDGQIKIETAVARKCWEDAIVCLMK >NZ_CP025425|1177327:1186388|1184769_1185813_+|WP_002299008.1|DBSCAN-SWA MANAYAKAGVDVEAGYEVVERIKKHVKKTERLGMMGAIGGFGGCFDLSVFQLKEPVLVSGTDGVGTKLAVAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYLATGKNDPIRLENVVKGVADGCVQGNMALIGGETAEMPGMYSGNDYDLAGFAVGIAEKSQLLTGETINPGDVLLGIASSGIHSNGYSLVRKIFFEQQQFSLSSKLPELKKTLGEELLEPTKIYVSSLLPLIKEKKIKGAAHITGGGFVENIPRMLPESMAAQIKLGSWPILPIFGCLQKYGEIPEMEMYEIFNMGIGMVLAVEESKVKEIVHEIEQAGEKVYEIGKVIAKEKHRVVFIGEER >NZ_CP025425|1177327:1186388|1179435_1180164_+|WP_002288021.1|DBSCAN-SWA MEKKELLYEGKAKKIYLTSDENLIWIEYLDQATALNGARKDQISGKGELNNQITSAIFRYLTQRGIKNHFIEQLSKTEQLAKKVQIIPLEVVIRNIAAGSFSKRLGVPEGKEFIKPIIEFYYKDDQLDDPFINEEHIYFLQLAKPEEISELKAQALAINEILTELFAKVGLVLVDFKLEFGRSNGQILLADEVTPDTCRLWDERTNEHMDKDVYRRDLGDLIPVYQEVYNRLSELTEEKERV >NZ_CP025425|1177327:1186388|1177327_1178623_+|WP_002288023.1|DBSCAN-SWA MLERYTRPEMGNIWTEENKYRAWLEVEILADEAWAELGEIPQEDVKKIREHASFDIDRILEIEKLTRHDVVAFTRAVSETLGEERKWVHYGLTSTDVVDTAYGYLIKQANDILREDLKRFTEIIGEKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLATWYSEMKRNIERFEHAAKGVEAGKISGAVGTFANIPPFIEEYVCKQLGIRPQEISTQVLPRDLHAEYFSAMALIATSIERFATEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMAGLARVVRGHMVTAYENVTLWHERDISHSSAERIILPDTTILLNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMSATFGLIYSQRVMLKLIDKGMTREEAYDLVQPKTAYAWDNQVQFRPLLEEDPTITSVLSKEEIDDAFDYHHHLKNVDVIFKRVGLE >NZ_CP025425|1177327:1186388|1183298_1184738_+|WP_002299010.1|DBSCAN-SWA MSYEVKSLNEECGIFGVWGHPDAASVAYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDRGKLMGHRDLGLLSEVFKDQRKLQQLTGEAAIGHVRYATAGNGSVDNIQPFLFKFHDQSIGLAHNGNLINARSLRKELEENGAIFHSNSDTEILMHLIRRSEETDFLNKLKSALNEVKGGFAYLLMTETAMIAALDPNGFRPLAIGQMKNGAYVIASETCALEVIGARFIRDVQPGEIVIINDEGIQIDCFTKNTQLSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHTARKNMGRNLAKESPVKADMVVGVPNSSLSAASGYAEASGIPYEIGLVKNQYIARTFIQPTPELREQGVRMKLSAVRGVVEGKKVIMVDDSIVRGTTSRRIVHLLKEAGAKEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTIDEIKECIGADSLGFLSEEGLIESIGLKKDGPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEKYQESLKEKVSFF |
9 | Gordonia_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1462447 : 1502298
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP025425|1462447:1502298|DBSCAN-SWA TCTAAGCCAATCCCATAGAATGTAGTCTTAGACCTTCGGTCAGAATATTGATACTAGCATTGATATCACGATCATGATGAGTATGACAAACAGGACAAGTCCATTCTCGAATTTCAAGAGATTTCTTGCCATCTTTATGTCCGCACTCTGAACAAATCTGACTAGACGGAAACCATTTATCTACTTTGATGATTTTTCGTCCATACCAGTCAGCCTTGTATTGTAATTTAGTCACAAACTTTGACCAAGAAACATCAGAAATACTTTTAGCTAATTTATGATTTCGCAACATACCTTTTGTGTTTAAGTCTTCAATACAGATAATATCGTGATTTTTGATCATTTCTGTACTCAACTTATTCAGAAAATCAGTACGTTGATTCATTACTTTTTCATGCAATCGTGCTACTTTACGTTTTTGTGTTTGATAATTTCTAGCTTCAAACAGATTGATACCTTTTTGTTTAGCTAATAAGGCACGTCTTGACAACTTACGTTGTTCACGTTTGAGTTTCTTTTCCATTTTGGACGTAAATTTATTATTATCAAATTTTTGACCGGTAGAAAGAATTGCAAAGTCTATAATACCTAGGTCAATACCAACAGCAGAATTAGATTTAGGTAGTTCGCGAACTTCTTCTTTGCATAACAAAGAAATATAATATTTACCGCTAGAATGACGTGATATTGTAGCGGATTTGATAATCCCTTTTGGTTGTCTATGAAGCTTAATTCTTACTAATGACTTCAATTTAGGAACTTTGATGAATTTACTATCAATCAAAGCAACTGTACCATTTTGATTATTCGTTGTATAACTCTGAACAGGATTTTTCTTACTTTTGAAACGTGGAAATCCAACGGATTTATCCCGAAAAAAATTCTTGTATGCTTTATCTAAATTAAGTTGGGCATTGGCTAAAGCAAGGCTATCAATTTCTTTCAAAAACGGAAATTCTTTCTTGTATTTAGCTGGTGTCGGAAAAGTCATTTTTTTAGAAGAATCATTTTTAACTTCTTCATACGCCTTTTTTCGGTCATCAAGCATTAGATTGTAGACCTTACGGACACAACCAAAAGATTTGGCAAAGAAGATTTCTTGTTCCTCTGTTGGATAGATTCTGAATTTGTATGCTTTTAGTTGTTCCATAAAGTTCACCTACTTTCTATTTATGATTGTTTCCTTGATTTTGGATATACTTCTTAATCACATCAATTGGTGCGCCACCAGTTGTCAGAAGACAAAAACTTTTAGACCAGAACATTTCTTTCCAAAGAAATTGTTTGACTCTTGGAAAGTCACGTTTTATCAATCTTGAGCTGGCACTTTTATAGGCATTGATGAATTTTGTCAATTCTGTTTTAGGTTGAGCTTTGAACATAATATGAACGTGGTCTTTATCATGATTCCACTCCACTAAAGTAATGTGATACGATTCTGAAATTCTTTCAAAAGTAGTTTTGGCATAATCAGATATTTCATCATCAATCACTTGTCTACGATATTTCGTTACTAAAACAAGGTGGTAATAAAGAAGAAATACTGAATGATTATTTGTATCTAATTCCATGTTATATCAACTCATTTCTTGTATAGACTGATTGTAACATGGGACAAAATAAAAAGGCAATACGCCTTAGTTGTCGGTCTTCGAGTTACCAACGGTAACCCTCATACCGAACGGCATTCATCACCCACCTATAGAGGATGGGCGACTTCTGCCTAATTCTGTTAAATTTTTTCGGAGAATTAAAAAATACAATAAATAACTTTAGTTACTTTAATGCGTTCTTACTTTATTTTTATATTATCATTTTTCTTATTCACTTCTTTGGTTTATACTATTCTTATAAATAAAAACGAGGTATGTCCTATGATGAAAAGATTGTACTATTCATTGATCATAACGATTGGCTATTTGATTGTATCAAATCTAGGAAATATGGTATTTGGTATCAGTAAAGAATTCAGTTGGACTACTACATTATGGGAATCTCTATTCTTTTTCATCTTCGTATTTTTGTTACAAAATTATCGAAAAAAATAAACATGTGCCATCTATCTGTTGGCACATGTTTTAGGATTTATGGTACTTTTTATTCGGCAATCCATTTTATTTTTCTACTTCTTCTTAATACCTCTAACACTTTTGATTTATAAACTAATCCAATGCATCTACTTGCGCTTATTAAGCTATTTCAGCTAGATAGTACCACCCCATGCGTCAATGCTTGATTTTCCTTTTGTATAACATTGTATAAGCAATAAAGGACAAATAAGTGGTGATTACACCAAACCATTGAATAAGAAAAATTCTGATACGTAAATAAACATGAACTTGAAAAAATTAATGAATCGGTTAGCTACTACGTAGTTGTCTTTTTTCTCATACAGTTCTGTTAACTTACACTTCTCTTCGCTAGATAATAAAAAATCCTCCAACTGTATTGTCCAATATAATCCCAGGCATCTAAACTAGCATTATAGAAGAGACACACATAGAATCTAAAATAACTGGTTTTAAATGTTTCTTACAATCAAAAAAAGCTGTTAAATGCACTCCACACCTTCATACTCTATCATTTTTTATAAACGATATATTTTTATTGTTTTTCGATAAAAAATAGTTGTTTTACAATAATTATTCTGCTATATTTTAGCTATCAAAGATAAAAGAGGGATAAAAATGAAATTTAAAACATTGCTATTAAAATTTGTCGTTTTAGGTATAAGTGCCGTATTTATTTTGTTCGGCGTACTTTTTTATACTCAGATCGCTACAAGCGAAAAAGGATTCAATTTTGATTGGCAGACCACATTATTTGTTTCTGTCATTTACTTTGCCCTTCTCCTAGGGATCGTTATTGCTTATTTCTTATTGAAACTATTGAAAAAAATCGAAGATAACCAAGCTTTTTCCACTCAAAGCTTAAACATACTAAAAAAAATCGAACGAACCATTTTGTTTATTGGTTTCGCCTTTTTTGGCTTACTTCCTAAATTTATGAAAGTAGCGGATTTAGACGATGCTCCAGGTTTGATGTTGGTAGGAATCGCTGTCGTATTCATTCCTTTTGCAGTATACACATTAACAAGCGTGCTGGAAAAACTGCTTGAACATGCGATTTTACTTAAGACAGATCATGATTTGACAGTGTGAGGTGCGACATGGCAATTATCGTTAATTTAGATGTAGTATTAGCTCAAAAAAAAATGAGTGTGACTGAATTGAGTGAGAAAGTGGGCATTACGATGGCAAACATCTCTATTCTAAAAAATGGAAAAGCAAAAGCCATCCGTTTTTCCACTCTCGAAAAAATCTGCCAAGTTTTGGAGTGTCAACCAGGTGATTTGTTGACCTATAAAAATGACTCGAATACTATACCAGAAGAATAAAATAAAGTAGAACAAACAGTAAATAAAAAATAATCTGAATGATAGATGTGTGAGACTTTTAGAAGTTATTTACGTCTATTATTCAGATTTTTTATTTCGATTGAATACCGTTTTATCTATAAATAAGATATGTACTGACTCATACAAAGGGGGCCTTTTCTTCTCCATGTACTATCACTTTTCCTGATACAACTGGTTTCCTGTTACGTTGTAGTTGGATCTGCTTTTAGTATAATACTTTATTCATTCCACCAGACTGATAGCAGTTTGAGCAGTCTAAATAATCATGTAGTATTACAGGCCATTCTGTTTCATACCTTGAAGTGCTTAAAACTTCAGCTAATGGCCCATTGTGTTAACTCTTACTCCATTCTTTTTTAGTAAGCTCCCATATATACTGTAAAGCCTTCTATATATTATGTCATGTTGCTTTTTAACATTTACTATGTAGTTTTGATAAAATGATTTGAATAACAGTGATGGACAATTCTTTTTTATTTTTAACATTATTTTGATAATAATGACAGACTGTAGACAAAAGCTGTTCCAAACTCGTAACTCGAGCTTGGAACAGCTTTTTATCTACTTCGTTTCGAATTTTTGAACAAAAAAATAAAGGCTCCTTGCCTTTCCATAGCCAGGTGGCTAATTTCTTTAAATTCATTGCAGCAAACACTAGCATCGTATGCGTCGCGACTTTTTCCAAGCCTCGATACTTGGTCCAACGCATCCCATGCTTTTCTTTTGCATCCGCAAATATTCGTTCAATCGTTTGTTTCCGTTTTTTGTAAATTGATTTATTCAGATCTGTTAGGCGAAGATGTTCCACTTCATCCATCAGATCTCCCCAAACATGTCTCGTGATGACTCGTTGATGATTTTTACTTATGGTACATTGGTTTAGCAGAGGACAGTTCACACATTCTTTTGGATTGGATTTGTATTCTCGGTACCCTTCTCGAGTAACCGTTGAAAAAGCGAGCATTTGATCTTGCGGACAAATATAACAATCAAAATACTCGTCATAGAGAAACTCATTTTTTGATAATAGCCCCTTTTTCCCTTTGGGCCTTGAATAAGGCAAACAAGGTCGAAGGTTCAAATGAGTCAAAAAGTGAACAAACTTAGGTGTCTTATACCCAGCATCAGCGACAACACAATTGATTTCAGGAAAAAGTCTCTTCGATTGTTTGACGAGCTGAAAGGCGACTTGACTGTCATGAATATTTCCAGGAGTGATGATTGTGCTAAGAATAAATCCATTGTCGTCGCATGAAGTATGGGCAGAATAAGCAAATTGTTTTTCTCGTTCGCCTTTGACGTAGTAGCCGCTTTCCGGATCAGCTTTACTTATTTTTCTTTCTTTCAGCTTCACTTCCTTTTCTAAGTCCAAAGTAAAAGGGCGTTTTCCAGCCTCTATTCGTTGACGATTGATCTCATCTTCTAATTCATCCTGATAGGCTTTCGCTTCATCATGGGTCATTTCTTTCGTAAACTTATGTTTATTGGCGTTAGCTTTGATGTGGGTAGAATCCAGATACAAATTATCCTCTGTTACAAAACCTGCTTTAACTGCTTGTTCTAAAATATAGGCAAAAATATC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46 | Streptococcus_phage(25.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1647042 : 1704001
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP025425|1647042:1704001|DBSCAN-SWA 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52 | Paenibacillus_phage(10.0%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1725252 : 1807012
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP025425|1725252:1807012|DBSCAN-SWA 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99 | Enterococcus_phage(30.23%) | plate,integrase,protease,tRNA,holin,portal,transposase,head,terminase,capsid,tail | attL 1759046:1759105|attR 1805717:1805817 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1821874 : 1880043
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP025425|1821874:1880043|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(25.0%) | tRNA,integrase,transposase | attL 1812918:1812934|attR 1870129:1870145 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2640321 : 2657217
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP025425|2640321:2657217|DBSCAN-SWA 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18 | Streptococcus_phage(92.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
74126 : 113095
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP025427|74126:113095|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(58.62%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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