Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018889 | Beggiatoa leptomitoformis strain D-401 chromosome, complete genome | 7 crisprs | DEDDh,cas3,cas10,csa3,RT | 0 | 15 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018889_1 | 551124-551360 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018889_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP018889_1
>1.1|551160|30|NZ_CP018889|CRT TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGC >1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCAT >1.3|551294|31|NZ_CP018889|CRT AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCG >1.4|551161|30|NZ_CP018889|PILER-CR TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGC >1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCAT >1.6|551295|31|NZ_CP018889|PILER-CR AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCG >1.7|551160|31|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCG >1.8|551226|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATG >1.9|551294|32|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018889_1
The CRISPR arrays of NZ_CP018889_1 >merge|NZ_CP018889|1|551124-551360|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACTACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACAAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC >NZ_CP018889|1|1|551124-551360|CRT ATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGC GTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCAT GTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCG GTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC >NZ_CP018889|1|1|551125-551360|PILER-CR TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACT ACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACA TGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACA AGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC >NZ_CP018889|1|1|551125-551360|CRISPRCasFinder TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC
>NZ_CP018889.2|WP_062148489.1|550613_550832_-|hypothetical-protein MLGTIRDASSLDIPNIVPGECSLLPKFSIPLGSSTYTPDFSEQSYCDFFTALASFFIFMVVLSAIFITLTKG >NZ_CP018889.2|WP_062148485.1|549797_550016_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MPPVPALSASEVIKKFQRLGWIIRRQTGSHIMMNKEGHPALLVVPNHPEVARGTLRGLIRVADITVDEFIKA >NZ_CP018889.2|WP_062148482.1|549594_549798_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MYYTVVFEPDEDGIWVAECLELLGCFSQGKTQEEALNNIKDAIKLYLEVKQELNMHSQRKVCQVEVA >NZ_CP018889.2|WP_062148479.1|549200_549560_+|bacteriophage-CI-repressor MSDTTEVLERLYQLHNVKNDAELARKLNIGTSTISNWRTRDTVPYKICVEISKRDNVSLDWLLTGKELTNVNKPKTQAIIEMIENLDDSQKQKVYAVIEDEKRFAEMKKRIDQLERKTA >NZ_CP018889.2|WP_062148476.1|548720_548957_-|hypothetical-protein MNKESMLEQLRDEFGTIQEAAEYFHTSRVLLYQSIDGKGARAVRVALAKYFNAYPSDIWQDGTDTRVLDDYQMTETRQ >NZ_CP018889.2|WP_101539114.1|547895_548644_-|IS5-family-transposase MSRRYALTDEQWSKLEPLLPGRKGHVGMTAKDNRLFIDAVLFRYRSGIPWRDLPERFGDFRVVHTRFSRWSQKGVWERVFKILSADADNEYAMIDSTIVRAHQHSSGGGADEAIGRSAGGLSTKINSVVDALGNPTPFFLTAGQASDLEGADALIPQIKANALLADKAYDADERVRDVLKQKSIEPVIPYRKNRLNPPDYDKALYKARYLIEHFFGKLKQYRAIATRYDKRARNFLSGVYLASTLILLA >NZ_CP018889.2|WP_062148474.1|547365_547842_-|hypothetical-protein MFNPQTGEIVADGQYLLGELRKVIAKEDFTDRETKEVRPGGYEIEILCEVPNARDLLIIAKCPNPEDFTPLLKRRVLVSVKASAFQFGDRDAQVSYTVQASVKPIALDTLIGSSIHAHQHATPAVVPEKIPTVTEKPVETTEKVDSVVPKKTFMGSTV >NZ_CP018889.2|WP_062148470.1|547151_547337_-|hypothetical-protein MTYSTDFRKKVLLVTKLCLVMPIRQALLGGYLNAPRLSPLVLGKRSLQGRHYQAELGNEQI >NZ_CP018889.2|WP_062148467.1|546485_546968_-|hypothetical-protein MATDANANTAPMTYAQGEAIIGGVKGVGDAVKGVSDGIKGVGDAIKGVSDGIKDVGDKLDGIGNKLSANAPAINLKIPEGNPRQELTDLLGTIRNASSLDIPNIVPGQCSLLPKFSIPLGSSTYTLDFSEQTYCDFFTVLASFFIFMVVLSAIFITLTKG >NZ_CP018889.2|WP_062148464.1|546191_546482_-|hypothetical-protein MQELIDFLYAGLVAIFAGIGDLLLYVYFSLMLFLVDIFWKMGQDIIAFYDVMGKIDTLFSNLNPGLVNAFAFFKVKECVHLLATARITRYLFSFIS >NZ_CP018889.2|WP_101539228.1|552148_553354_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MQNLTDLNFTVTNATLLSETAPRNIQVGVRPFYLIEDMEASALKIKLQQCNETPLKKTEFSIGHRGAAMQFPEHTKESYVAAARMGAGIIECDATFTKDKQLVCRHSQCDLHTTTNILATPLAAKCSVPFTPADVANGTPASATCCTSDITLEEFKSLCGKMDASNPKATTVAEYLGGTPDWRTDSYATCGTVMTHAESIALFKQLGVKMTPELKSASVTMPFEGTYTQSQYAQQLIDEYKAAGVPASQVFPQSFNLADILYWIKNEPDFGQQAVFLDELETMDGVDASTARLPELVAQGVKIVAPPTWMLVTTDSNQQIIPSDYAKKAKALGLDIITWTLERSGPLKTGGGWYYQSINNVINNDGDMMVFLDVLAKQVGIRGIFSDWPATVTYYANCMGL >NZ_CP018889.2|WP_062148493.1|553551_554703_+|lipid-A-disaccharide-synthase MRIAMVAGEMSGDILGAGLIRALQVHYPDAQFEGIGGEQMISAGLHSYFPLETLSVMGLVEVLKHYRSIKRCYNQLRETWLNNPPDVFIGIDAPDFNLRLEYDLKQARIPTVHYVSPTVWAWRRYRVKKVIKSCDLVLSIFPFEVDFYRPYPVNVQFVGHPLADEMPLKVNQQAAREWLKLPKASAYIALLPGSRQGEVQKLGTIFLQTAQWLQQYYPDLHFILPIANAHLQQLVMTQITQTAPHLSITLIDGNAREAMAAADVVLTASGTATLETLLSKRPMVVAYKVAFLTYFLFKPLVKVPYFAMANLLADEALAPEFLQYAVTPANLGQAVSGWLEHPAEVYALQQRYTQIHQQLRCNASEQAAQAIVNLLCNLYVNET >NZ_CP018889.2|WP_062148496.1|554686_555244_+|flavoprotein MSTKPEKPRFAWAFTGSGHYLTECLTLANQLQNVDFFFSKAAYEVFRIYELEHHIHAWQEQQGVRIFRDTAASAPPVGLFYRGDYHTLIIAPATSNTVAKCVVGISDTLVTNIFAQAGKCLIPSIVFACDTEPVMETPAPDRIVKVYPRKIDLENTERLCEFERTTVVKSLADLERVIKVREGEL >NZ_CP018889.2|WP_062148505.1|555325_555673_-|hypothetical-protein MLAERVAIWYEEGVQKGMQAGMQAGMQEGLLKGIQQGREEGREQGREQGLMEGQATGIKNAMLAVLTMRFGKVSPVLQQAINDIHEITQLEDLMRQAVIIDSLTTFQQLIHSTNH >NZ_CP018889.2|WP_062148508.1|555729_556797_-|transposase MPDHDPSYKRFFSHPEMVKDLLQGFVHETWVAELDFTTLEKVSGQFISDDLRSRDNDVIWRIRWQNKWLYVYILLEFQSSVDNYMAIRLMVYIGLLYQDLIKAGLTTDKLPPVLPIVLYNGNRRWTAPVNVQDLIEPSPLQNYQPQLHYLLIDEGAYSTTELSRLHNLVAALFRIEKARNKEEVIAVLEALLQWLKEPEQMGIRQAFAVWLNRVYLPHHLPNTELPKLIDLQEINVMLAERVAIWYEEGVQKGMQAGMQEGLLKGIQQGREEGREQGREEGREQGREQGLMEGQATGIKNAMLAVLTMRFGKVSPVLQQAINDVHEITQLEDLMRQAVIIDSLTTFQQLIHSTNH >NZ_CP018889.2|WP_062148511.1|556864_557335_-|6,7-dimethyl-8-ribityllumazine-synthase MTAYTLLEGDFTACNARYAIAVGRFNAFIVDSLLEGALDVLKRHGVDATNITVAKVPGAYEIPLIVQRLAASKKYDAIIALGAVIRGGTPHFDYVAGECTKGIATVALQHDIPIAFGVLTVDSIEQAIERAGTKAGNKGAEAALSALEMVSLLKQL >NZ_CP018889.2|WP_062148514.1|557331_558459_-|bifunctional-3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate-synthase/GTP-cyclohydrolase-II MSLNTIEELIDDIRQGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEKVRAEDINFMARYGRGLICLPLTEERCKQLQLPLMVSDNRTPHGTNFTVSIEAAHGVTTGISAADRAVTIQAAVAPHATPTDLVQPGHIFPLMAQPGGVLRRAGHTEAGCDLARLAGLEPASVLVEILNEDGSMARRPDLELFAKQHNLKIGTVAALIQFRLANEKTVEKVAHCRLPTEFGEFQLEAYQDSIDGTLHFALVKGTPKAEEPTLVRVHITNILCDLTFSTQKECGWPLRDALQRIAAEETGIVVILQQTTNAKSIIKAIQDNHKRELGENLPAQPSTDDLRTYGLGAQILADLGVRKMRVLSAPKKMHGISGFGLQIVDYINQEGTSHS >NZ_CP018889.2|WP_062148520.1|558832_561880_+|PAS-domain-S-box-protein MPNKEFHHANFFTTCKTLLCVIGFDGGLRQFNLAWETELHYSTKELSEFLYLDLIHPEDKSITKNYIDKLITGAESAVFTNRILQKSGYYRAYLWHITACLKEFSFYAVGIETTEEVARQEIAQPMSATNTIDNQYASLFDVAPLLIVHKDKENRIIRANQQAARFWKTTTDKLSGISMDTLMPEDVDHHHADDLDIVVSGQAKRGILQETLNGTLQIDKFPYRNANGNIDGVVWFAVDITERLKVEQALRENQSLLTAIFEVAEIGIGLTDKNGRFVRVNPAYCEMFGYHPNELLGQSLLAVFPNSLHKEVQKLYQDAVSGSQFLAHDEWEGRHKDGHHFDMEITVSRLTQYNKPFVVTLTSDITQRKQMVRSLQNSEAHLRMIVENLPIMVDAMDEKYNFVLWNRECERITGYTANEMLHNPQALEKIYPNVDDRQKLVEALSNVLHTNPGYRRREWQMTCKDGTQKIIAWSINSKIKIPGFAVWGIGEDVTEREKALQQLQRSEESLRESEAHLKFVIENLPIMVNAVNAENQFVLWNRECERITGYSAAEIIGNPDALTLLYPDADYRQKMLAHFQFILEQNPGIHYSEWTVVCHDGIQKTISWAVNSKIKIPGFAVWSIGEDVSEREEALHILKTSEERLKQSEVHLKFVIEHLPTMVDALDTKGNFLLWNQECEQVTGYSAKEMIGNARGLEKLYPDPQYRQKMLDAVQRVAKEDPGYRRGEWVVRCKDGSDKNIVWSVNSKIKIPGFPVWGTGEDVTERQKILKQLADNESRLRSLVENIPIMLMAFDEKGQIVLWNRQCEQVTGFPAEDIVGNPSALAMLYPQPEYRSYRTKPLQYISPYWQNDMTCKDSKLKTIAWKDVSNQFPMSGWAKWITGEDVTFRKKIEQSMGINDGLLIAALNSIDSAVCATNSLEKIVYVNQGFCDLFGYTTEELLKMSIKQIMPSDSRGSFVARHYFSFYTGAHGSFYEETHHAFHHDGHIFKVKLNAHRVKQEKEVHILWIVNYLDG >NZ_CP018889.2|WP_062148523.1|561935_562592_+|thiopurine-S-methyltransferase MNAEFWHKRWERNQIGFHQTEINTHLQTYWQALNLPKGASVFVPLCGKSLDMLWLLEQGYRVLGIELSKVAVRDFFTENNLTPTVTTYKTFNRWAMDEIEILCGDFFHLTPTELQTCTAIYDRASLVALPPEMRNDYAQQLATLFPTNTQILLVTFEYSQAEMQGPPFAVHADEVTQLYQQHFTIEQVAHTDILNENPRFQKLGVTQMQESVYLLRKK >NZ_CP018889.2|WP_062148526.1|562755_563139_+|Co2+/Mg2+-efflux-protein-ApaG MLTSQLHNIIIDVETHYIDEQSDPEIARYVFAYTVTIRNMGKVPARLVTRHWVITDANGKVQDVRGEGVVGEQPYLRPGEGFRYTSAAMIETPVGSMEGSYQMVADSGEQFDAPINPFSLAQPRTLH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018889_2 | 945465-945833 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018889_2
|
5 spacers
spacers of NZ_CP018889_2
>2.1|945489|45|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder AATAGTTGACGGTCAACGCACAGGCAGAGGCATTTATACATGGAA >2.2|945558|45|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder CTTCACCAATGGTATTCGTGAAGGAGAAGGCATTTACCTCTGGAA >2.3|945627|45|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder TTTTGCAGCTAACCGTCGCGAAGGTAAAGGCACTTACCTGTGGAC >2.4|945696|45|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder CTTTATTAACGGCACACGTCATGGCAAAGGCATTTTAACTTGGGC >2.5|945765|45|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder ATTTTCCAAAGGAAAGCGCACAGGACAAGGCATTTACACCTCATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018889_2
The CRISPR arrays of NZ_CP018889_2 >merge|NZ_CP018889|2|945465-945833|CRISPRCasFinder CAATGGCGACAGCTACGAAGGTGAAATAGTTGACGGTCAACGCACAGGCAGAGGCATTTATACATGGAAAAACGGAGATAGCTATCAAGGCGACTTCACCAATGGTATTCGTGAAGGAGAAGGCATTTACCTCTGGAAAAATGGCGACCGCTACGAAGGCGATTTTGCAGCTAACCGTCGCGAAGGTAAAGGCACTTACCTGTGGACAAACGGCGACCGCTACGAAGGCGACTTTATTAACGGCACACGTCATGGCAAAGGCATTTTAACTTGGGCAGATGGCGACCGCTATGAAGGCGAATTTTCCAAAGGAAAGCGCACAGGACAAGGCATTTACACCTCATCAACAGGTGACCGTTATGAAGGGGG >NZ_CP018889|2|2|945465-945833|CRISPRCasFinder CAATGGCGACAGCTACGAAGGTGA AATAGTTGACGGTCAACGCACAGGCAGAGGCATTTATACATGGAA AAACGGAGATAGCTATCAAGGCGA CTTCACCAATGGTATTCGTGAAGGAGAAGGCATTTACCTCTGGAA AAATGGCGACCGCTACGAAGGCGA TTTTGCAGCTAACCGTCGCGAAGGTAAAGGCACTTACCTGTGGAC AAACGGCGACCGCTACGAAGGCGA CTTTATTAACGGCACACGTCATGGCAAAGGCATTTTAACTTGGGC AGATGGCGACCGCTATGAAGGCGA ATTTTCCAAAGGAAAGCGCACAGGACAAGGCATTTACACCTCATC AACAGGTGACCGTTATGAAGGGGG
>NZ_CP018889.2|WP_062149369.1|944093_944714_+|phosphoserine-phosphatase-SerB MKLCVFDFDSTLMDGETIDEIAAACGKKNAVAHITEQAMQGKLDFFEALTQRVAMLAGTSYTKVIDVCQHLPLMNGALETVQGLQQQGYKVVILSGGFHEATAYLGKQLGVDGEFANFLHHKENVLTGKVGGEMMQSTSKGDMLARLQKLLGAEKANTIVVGDGANDASMFPYADKKVAFCAKPILKQQANIIIDHKDLRELLQHI >NZ_CP018889.2|WP_062149366.1|943247_944009_+|adenine-nucleotide-alpha-hydrolase MNQLIKPPKSLLRCVGRAIGDYAMIKANDRVLLGLSGGKDSLSLLHILAHLKRHAPIHFNLGVITVDPLISGFDPSPLKTYLADLNIPYFYQQQPIMEEALRHIRGDSFCAYCSRMKRGIMYSTARKEGYNVLALAQHLDDLAESFLMSAFHGGRLQTMKAHYTNDAGDIRVIRPLIYARERQTADFAKATQLPVIFDNCPACFSKPTQRHHIKQLLATEELAYKQIFRNLLHAMRPLMQGNQPALQETDDDS >NZ_CP018889.2|WP_062155336.1|942043_942940_-|SPFH/Band-7/PHB-domain-protein MSIKSVPQGSNWTVERFGKYIRTLSPGLNFIIPIIENVSKKLSMMEQVMDVPSQEIITKDNAMVRVDGVAFFQIMNASEAAYQVQNLMDAILNLTMTNIRTVMGSMDLDELLSKRDEINHQLLRVVDEATTPWGIKILRIEIKDIAPPKDLIDSMARQMKAERDKRASILEAEGERQADILKAEGEKQSIILAAEGRKEAAFRDAEAREREAEAEAKATMMLSQAISKGNVQAINYFIAQDYVKALGQIASADNQKVIMMPLEAASVIGSIAGIGELAKEAISKRNPSPTIPPAGTSS >NZ_CP018889.2|WP_062149363.1|941584_942040_-|NfeD-family-protein MMSSLYVNFWYWWILAILLSIIELVVPTTLFIWSAAAAVVTGFVVLVFPQMGIEIQLILFSLLSIFIVWLGRSLQAKYPTKTDQPLLNQRGSEYIGRIFSVTEAINDGVGKVRIGDGYWRVEGSDCPVGTKVKVISVDGVRLKVEPLVEEN >NZ_CP018889.2|WP_062149360.1|940959_941400_-|rhodanese-like-domain-containing-protein MTEIVHSIAPREAWRLLEENPKAILIDVRAEMEYLWIGHPKGAIHIPWIDEPDWTVNPHFAAEVRKLLLGGVITDHDDVEHPIDSIPILLICRSGNRSLEAGKELVRKGFSNVYNVIEGFEGPLDHEHHRSTISGWRFHGLPWEQI >NZ_CP018889.2|WP_062149357.1|939663_940671_-|porphobilinogen-synthase MPLTNAPFPALRMRRMRRDEFSRRLMREHHLTTDDLIYPLFIMEGQQQRVAIPSMPEQYRLSIDELLKEAEQLVQLNIPAIALFPVITPDKKSLNAAESYNPDGLVPRAVRCLKQAFPQLGIITDIALDPYTTHGQDGLIDASGYVMNDETTHVLIQQALSHAEAGVDIVAPSDMMDGRIGEIRYAFESSEFKHTRIMAYSAKYASSFYGPFRDAVGSSGALGKGNKHTYQMDIANSDEALREVALDIQEGADMVMVKPAMPYLDIVRRVKTELRVPTFAYQVSGEYAMLKAAAQNGWLDEQSVMLESLIACKRAGADGILTYFAKQAALYLQQK >NZ_CP018889.2|WP_062149354.1|938841_939540_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MLATQEIMLREHALFRHLNKKLVERILSISSIRHLKKGEVLFVKDEAGDALYGVLAGRIRISNRSLEGQELILKIMEKSDIFGEIALLDGSPRTADAVASEDSQLLMIRHRDFTLLLQQEPMLALQMIRLLCERVRQSNEYIEDLTFLDISRRLAKHLLNASREGEKMDEGIRLPLLSHDELAQRLGTTRTEVTKQLHYWRDNGWLLLEKGQITLCDARALQKFINSRADMW >NZ_CP018889.2|WP_062149351.1|937314_938541_+|exo-alpha-sialidase MLRFGVKYLISSYCLCFSLIVSAECLFTTTTGVTVDGHYPRFAELSDGSVLMSADRYIVNEQGQGGQAIVIFRGDKNLLVWEEVVIAAYNPPANFSNAYLTVLKAKGSRPETILLALRAWEGINSHIDVIQSTDKGKTWQFRSQAFGENMGNLTNGESDDGSTVSDVGVYEPSLWVSHDGYNASGNETLFITYASEVSATADHAYENEQVILLQRSDDLGLSWSAPVVVTENEPYQRFGMPAIIAVDNLMAVFYEQVDLTPERVYSWWDFKTRPAWKWSIRSALSVDGGHSWNSGYMMFDSRLGYVDNEGKSINYSGAPVVRFLRFPNSSVDTIGLIFQVANIPTYADRNTAKVSPYYIGLTKEGIEFYRGPLPEPLSAWWASSFQHSISGKIILAGDKEGCMQAGFY >NZ_CP018889.2|WP_062149348.1|936560_937046_-|hypothetical-protein MQRLIQTFNDGSTVAFDSGRFDDWCVYLHRPAQRRYAPSDTYYFARLQILGKLYGFQSLYDDYIAIYEKTNAQINPDVLSLILQLTEKYQVDSLEIAIWFTVIYAGMVAEENKQGAILKKRIKRLGMHQTLIEQIAPNIAANYSRGKKWRELDVLCKEKGF >NZ_CP018889.2|WP_062149345.1|935620_936559_-|hypothetical-protein MIDITQLRFFTTCLLLAILSVAKASEISIDDTYTEIYNVQQELNIIKQYLKIDKEIIPPQVTLQVVPRLTWQKTYQILFKLDHIHEKYNLPRLNIPSREPEKDVSTAVIYEQVCRIRTELFLLKRVFDIKTEIPPPPVFTKKTQLDNYNALNQILYELDAFTGTSFLPSHVFGQAMRIHYDIDALLYALELTDSTLPPPKKDNVLPVDVFNAGLTLIKEMQEIQTHLNINKINLNINVYQRNSIQQITPTETFGMTGFVLAELQVIKAYLGLTNVITPVAQIYQGKIPADTLQILEWNIARIRLISKAIKQL >NZ_CP018889.2|WP_062149375.1|945946_946894_+|4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl-diphosphate-reductase MNVILAQPRGFCAGVVRAIEIVEQALMVYPSPVYVLHEIVHNRYVVDDLRQRGAVFVETLDEVPLGAVCIFSAHGVAQAVVKNAELRQLEVIDATCPLVTKVHQQAQRYVQQGAEIVIIGHAGHPEVEGTRGRIDGIVHILSTVAEAQALQVRDPEKLAYVTQTTLSVDDTKDVIAVLSQRFPTIQGPQLSDICYATQNRQNAVRELATKVNLLLVVGAQNSSNSNRLREAGEQAGVTSYLIQDAHDLNPEWFTGDQQIGVTAGASAPEILIQGVLDRLKTFGVQTISIMDGQPENTTFKLPLALLEKVKQKEVV >NZ_CP018889.2|WP_062149378.1|947200_952195_+|NAD-nucleotidase MTQGIMRKQAWQWLITSGLLAFAPVSLAEMTITEVGRYQSNLFAQGGAEIVAFDSVNKQVFVVNSGLAQIDVLSLNTIATPQKISTIDAKALGAGANSVAVKNGIVAVAIENVDKQANGLVAFYDSTTLKLLKTVTVGALPDMVTFSPDGKTVLVANEGEPNADYTVDPEGSVSIIDISHGVENAVAKIADFSAFNTQKQRLLNKGVRIFGKGANVAQDLEPEYITVTADSKTAYVSLQEANALAIIDIANAKVLDVVPLGYKDHNQGAPSLQTFNFPEMPDLNTSAMGETVKLGGFSGLHFEGVDSATGNYKFVTIPDRGPDAGLVDVDGDGVQERIFTIPQYQIRVVRFEVNPQTGVVQITQQIPLTRQDGTTPITGLPNIAGADESPAEQVPSNGQFTIEGKQYNKLDYDIFGADLEGIVINPVDNSFWMVDEQRPAIYHFLADGKLANRFVPQGTDPEGQARYGAETLPAVYRKRVNNRGFEAVALDTEQNILYAFIQTPLANPNMAASNASTVIRMLGINPDTGETVAEYVYLLEKPVVRGSVVDKIGDATYAGNGQFYVVERDSDLTANSIKPVYKIDLKGATNLLTSNINLLPDLTLEQHTPDQLSSVGIQAVHKRKILNLPSIGYLPSDKSEGLTVLPDGKLAVLSDNDFAANPETAQIQMGLISFGTNYGLDASDKDGMINIRNWPVLGSYMPDSLANIVINGNTYIVTANEGDSRDYAGFSEEVRIGSSKVVLDPIVFPNASDLKTDEQLGRLKITNTQGDIDGDGDYDELYAFGARSFSVWDNRGNLVYDSGDQFERFTAELLPDFFNTSHDNNKFDDRSDDKGVEPEAIAVGEVNGQPYAFIGFERLGGVAVYNLSNPHAPQFVDYVNNRHFAVTPEAGADTGDLGPEGFSFVHASQSPTGQALLIIGNEISGSTTLYQLGDSATAVTLPNLNTGVATDAQGQHVDKQTSFAGGISVKQTAFDKAVGQKLADKATVRGRIYVDPADVGKVADIVVYAAYKPILAANSPTVPANYFMLNAQNQIVTWDGKLSTLSAYQTNLTLSAQQDVLLYDANWLVSGYLELSFGYRLQDGTLVLSGTPITTTINDTPVVALRTSLIHINDSHSHLTEETIDLNLNGKTTRVNMGGFARVATKINALRKTAENPLVLHIGDAVVGTLYYSLFKGAADAAALNTIKFDALTLGNHEFDDGNANLAQFLKQLDNIPALSANIDVSQSADLKDLVKPYLIKEINGQKVALVGITTLKTLVSSSPGADITFSNEVEAAKQVVAELEGMGINKIIFMTHYGYTQDIELAKQVSGIDVILGGDSHTLLGNFSNIGLSSEGAYPTIARTPAGEKVCIGQAWQYAYVVGFMTVDFDDAGNVLYCDGNPTLLLGDNFLQADAAGTFVAVSDAMKTQLSQLINTQYTAEIVPENSDMAGVLSLFSEQVNVLKQSVIGKATDSLLHIRIPGKHTSGVELSHGSMIAPVVAEGFYQQLKTRNYNPDLILQNAGGVRVDLPQGDITVATAYTLLPFGNTIYVLDMTGAEVKQAIEDGLSNYFDNAGSSGSFPYAYGIHYTVDMNKANGERVTSLEVMSKTDGTYSVINPESLYRVGVNSFMATGGDGYTTLKKVAADRRTDTYFDYAESFVNYMKAVGTISAPTSYNLTYIPKQ >NZ_CP018889.2|WP_062149381.1|952330_953677_-|glutamine-synthetase MSFDYLKEWLETRHITEVECLVPDISGVARGKIIPASKFCKEEGMRLPEIIFIQTITGDYPEDESAIDPAEIDMILQPDPSTIRLVPWATEPTAQVIHDCFYRDGSEVDLAPRTVLKRVLKRYDEQGWKPIIAPELEFFLVKKNIDPDYSLEPPIGRSGRPERARQAYGIDAVNEFDPLFEEIYDFCEAQELNIDTLIHEAGAAQMEINFLHGDPLELADQVFLFKRTVREAAMRHDIYATFMAKPMEKEAGSAMHIHQSLVDKETGVNLFSNDKPEMTDLFLSHIAGLQTYLPSAMSFLAPNVNSYRRIARYNSAPINVQWGYDNRTVGLRVPYSDPKSRRIENRVAGADTNPYIVFAASLACGYLGMMQGLKPRPAIEGSAYDMPYELPRNLEESLRFLSEPESIPLREILGERFVKAYRAIKLKEYETFLAVISSWERDFLLLNV >NZ_CP018889.2|WP_062149384.1|954004_954370_+|hypothetical-protein MSQSVAQRLSDILITLPEAEQKNVLAFAEFLHARVRAEHPLTLPLPELLEPPQGESVVAAIKRLSRSYAMLDKTKMLGQTAELMTQHVVYGRTAEEIIPLLETLFMQHYQSFVEHYNKQIG >NZ_CP018889.2|WP_062149386.1|954374_955463_+|AI-2E-family-transporter MVQVLSRWFHRYFSDPQAVFLAILLVGSLTVLMTMGEILAPLLASIVIAYLLEGLVKNLQQWRVARLPAVIIVYSCFLAFLIFVLVILLPLLSNQLSQLFQELPNKLTKWQELLMALPQRYPGFISNEQVDSLLNSIRVGLRSIGQIALSYSIASLGVVIMLMVYSVLVPFLVFFLLKDKEVIIRWALSFLPQNRHAASQLWVEMDAQIGNYVRGKVYEIFIVGIATYIPLAILGMNYASLLAVLVGLSVIVPYIGAVVVTIPVVMVAYIQWGFNSDFIWAMSAYTVIQFIDGNIIVPLLFSEAVNLHPVAIIVSVLVFGGLWGFWGVFFAIPLATLVKALLVAWPRMPDHDMEKRQMDSLY >NZ_CP018889.2|WP_062149388.1|955487_956261_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKVFSAVCLILCLLGTQASYAEKLRFGVEGAYPPFSLIDTQGELQGFDIDIAKALCHAINVECVLVQNDFDGLIPALLAKKFDAIIASVSITEERKKSVDFTKKYYNTPARFVRKKDSGIEATAEGIKGKVVGVQRATTHDKYLTDNYDTTIDIKRYVTLDDAYLDLQAGRIDLLLADSIPLADGFLNKPDGKAYEFTGEPITDPKWFGEGVGIAVRKGDNELREKLNQAIAKIRADGTYKTIQDKYFQFDVYGDE >NZ_CP018889.2|WP_062155338.1|956474_957842_+|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine--D-glutamate-ligase MSNPTSSIPTQTNSYTAIMGMGKTGVSCVHFLVKQGIQLYIMDNRAEPPYFNTLQQTYPQLTYLTGHFDPDILANAQEIIISPGISLENEALQLARQAGVPIIGDIELFARHVTAPVVGITGSNGKSTVTTMLGEMAKQAGRAVQVGGNLGQPALDLLSTAADLYVLELSSFQLETTHSLRPKVAVVLNVCADHLDRYADMQAYAVAKQRIYQYAETCVLNADDPIVMAMAPTDKPIITFSLQADKGDFRVATYQGQAHLVRVKQGQIIPLIATAELALKSAFMRANALAALALGEVLGLPLDSMILILKTFKGLHHRCELVTTINQVEWFNDSKGTNIGASIAAIQGLENPKKIILIAGGDGKGADFSPLAAVAHEHLKACVLIGRDAPLIEIALQGIIPLSHAHSLEAAVKQCAELADAGDIVLLSPACASLDMFKNYEHRGQVFTDAVHGLV >NZ_CP018889.2|WP_062149391.1|958028_963095_-|hypothetical-protein MQWLCKFIFIFLYFSLLPIQIAIPLGLITFFWQSSTKSGVNEKPKTAPERRELFDLLTFYFELRSNHKQWRVTPAEYQDLLTKIEARCKSLVHYHYIDEIEKNRRLTDAWQLLRPQQTPCWEQQATLETESPQTNTQHIDDLIKELDNTLAPVTLPPAVTLPASVVIPKPRVNPVVIKQTVATVKPRIVKPLPSPKTTPTTPSLINRLQVFTRQILLPFIWQNIGWFVGGFCFVSGSGLLVAYTDGFANGLAVLFCLALYTLLILWGAYQIRRQRPELLISHQVLNFLGIFLIPLNFAAAVRLFMTSDGNFALLAVATLCAVGLWGGFLFALKIASGSLERQSLKEYPRLFLFLAGLQFALPLVSSMNSWYFLAVLHILLLAGLSYAFLRFTQGWLKALFLDADLLTYFTVGSLLYAALISFVHLTVSSGLTLPVGYAGGLLMLVCVLLFYVDSCANRDEFKQTIINYFTFLIYALSVTAIVLSYSSAWFIPTLSLAIGLYAAMVWRYLTLSPLYLLLAASVVWYWQVVLVHFTPDEHFLASVPLFVALWQLYRLACRRESPRFIVITYRTLLVLLFSVLAWSLYYAHPSVIGLITSLSASLLIFLLSKGRNTSPYMKTLGFIGAVTLNGIYFPLLPTLTVSVQFTLLFLLLSLIWTVISLSKWLKPAYAPVWFMQAGILSGLISIFISLNTHDILLSLAVTSGFASLLLSIGWIVRVRAFFYSGLLFITGVVVVSKLLFFPQTNLLALLLVTLVLWWVTWGLQRLQQRLLVHDIHLEPLLFLGMPLARTADRFTLLIPPCQISTIILWGVGIFGLLHYLLLPLSILSTGSLLLVLEAVITLLMAGQTRQLWLLPAVLFWLGLVLVPIFSDVQPLVFCFFLACYALGAWLTALIGLQFFHPRLTQLLCWQGGYGQRGGYTRAMQWVFYSTLFLLIGVQGASLSYALLFPHLGDGVLTAIFILSTLYFVILGRYYRYIALSYAALLTITISLLSFIGLPTLFALDLAQVLTILLGIAVALVGVTYPLRLSPVFSDLYYKPLYYTATLLYAYVLLHALSLLVWQFPMTSIWLAYVFGGLVVAQLPIFQWLAKDALHWRGIFLPLQLLAIVLVLFPQGNEFAWLILPFVLLGLAYYGLPWFNRLFALWAIDPTITFMLSFFVLFALPVVNFLQTGQIAWQIMLTVAAYFWLLQQQSHAENNRSLFTHLLFLALFGTFYSLSVTLFVLTAPSIFALWALLLFGLLQLGYRIKECEVWLFLTLIMAIISLFLLAVSLPQQLITFSIISGIALTIGGQQRDTTWFNVGILGGLVALHLLWFFLPATTLWAVLPYYALQNAVLLCVLLTLFPMLKATEDNWFNQLKLEWLIPFITASTLVLWAVGLVANLLVNQPLFGVVDSGILFLTGGIFIALWQAYRVEPTEKFIGIVFLITILAIYSRMSLFGFSSLTLWDSVALMLAAYGSLFSRYFIQLKVLDRLNLLLPCIALVPLLTVSDSTAITLLLFTGAVYYFFLQNQMKTVLPLYLAMILLNIALYLWIPALAQQQHLVQLYVLPAAITVLIMTYIHTQELRTTINHNLRLLALTVLYTSATTDVFLRPELSFFILALGLSMGGIILGIALRTRAFLYAGIVFLMINVLGQLVQFYPEDRLSKAIILILLGGGITVSMIFFNLKREMLLQKIRIMRADLAEWR >NZ_CP018889.2|WP_062149394.1|963304_963979_-|phage-shock-protein-A MFSIFRRVNDILNANVNDLLDKVEDPERMIKQLIREMEEQIASAKDGVVHAIASEKQLLRELEQQKAQSAEWQNKAETALRAYKEDLARSALQRKTEIDNVIRNLEPAWQTAKTTSERLKNQLRQLENKVEETKRKQGALVARQRAAQARQQMGKTLDRFQQGLDTQSRFDRLEDRIGEMEAYSEAMAEVDDTQSELDKEFAKLESTQEVDTLMAELKIKIQQK >NZ_CP018889.2|WP_062149397.1|964444_965383_+|nucleoside-recognition-family-protein MEEIAALILKSGRAGVELALFVLLPVMVVMLTLMRLLEAENILDRIVNWITPIFRPLGIPGLGIFALIQTLFVSFAAPLATLAMMDKSGTSRRHIAATLAMVFTVAQANVTFPMATLGLHVGTTILVSLIAGLLSATVTYHVFARHLPNESEPPEPALNHPQAANVKGVLHVINRAGREAFEIAIASIPMLILALLLVNSLQAIGIMGWLETLLAPVFAWFNYPSASVLLIITKYIAGGTAMMGVSADALQHGTITIVEFNRMAGLLISPFDVAGVAILISAGPHVASVLKPAAYGAIVGTLIKMILHGLLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018889_3 | 1967713-1967895 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018889_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP018889_3
>3.1|1967751|30|NZ_CP018889|PILER-CR GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGA >3.2|1967819|39|NZ_CP018889|PILER-CR AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGC >3.3|1967751|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGAGGG >3.4|1967819|42|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGCTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018889_3
The CRISPR arrays of NZ_CP018889_3 >merge|NZ_CP018889|3|1967713-1967895|PILER-CR,CRISPRCasFinder TCATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAACGTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGAGGGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAACAAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGCTTGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC >NZ_CP018889|3|2|1967713-1967895|PILER-CR TCATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGA GGGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGC TTGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC >NZ_CP018889|3|3|1967716-1967895|CRISPRCasFinder TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGAGGG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGCTTG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC
>NZ_CP018889.2|WP_062151614.1|1966271_1967579_+|DUF58-domain-containing-protein MRPAPLLLWLLFGWLLFAICTSIFPRLLMLWAIMGGMLLIIALYDLLQLWMQTFPHVTRKAAGSLALGVWCDVELTIFSRYKADQQIEIIDDYPPQADIENLPQTLYLQANTGVATQYQFCPQQRGNLHFNGVHLLLHSSLHLWKRYYYQAIPQAIKVYPNFAAVTKYALFAIENRLGQLGIRKRPRRGEGLEFHQLREYRAGDSLRQINWNATSRLKKLISKEYQDERDQQIIFLIDCGRRMATQDGALSHFDHTLNAVLLLSYVALRQGDALGLLTFSGTESRWIAPRKGMNTVNLVLNTLYDLQPTLRTSDYLNAVEQLLKHHQKRALIILISNLRDEDNEELTIALKLLRAKHLVLLASLREKILNEVLDAPVMQFNDALRYAAIHEYLGHRSQSQENFKNKGVIFVDTEPEQLAIHIVNRYLDIKRGGIL >NZ_CP018889.2|WP_062151612.1|1965560_1966268_+|DUF3108-domain-containing-protein MFRFFILVLHLGCIAPLWADDAFPPPFTAHYTVYAKGVTVGEGTRRLYRQADGRYVFEAKSNTVGVAALFRDDVIEEKSIFDLINNNARPLEYIYSQQGSKKQKFIHIIFDWEKHTAQNIAPEKPWDIHIEDGVVDMMLYQIILMQELQAGKRDLQYAIVDKGEVKTYIPKYLGDDIIDTGLGELNALKYERLSENGKRKTTIWSAPKLHYLPVRVEHEERGDTFSLVLESVEGL >NZ_CP018889.2|WP_062151610.1|1964392_1965424_-|RNA-3'-terminal-phosphate-cyclase MLQTRYLSIDGSQGEGGGQVLRSSLALSIYTQQAFHIHHIRAKRKNPGLQAQHLTAVRAAKMVSNAHVEGDVIGSGELWFTPNLAQGGRYRFNIGTAGSTTLVLQTVLYPLLLAEHPSHLVLSGGTHNTAAPPFEYLTTVLFPLLQKMGCQVTATLDNYGFYPKGGGQITVDIQPTRVLQGLTLLQRGELLQQEAQALITGIPAHVAERELAQVKKKLRWADSCLKFMPVASGYGTGNILLLFLHYAQVSELFSGVAQRGLKAEAVAEHAIVALQAYQAADVPVGEHLADQLLLPLAFAGKGQFLTVAPSQHTLTHCEIIQQFLGLKIQIEQVTSSQYLITVG >NZ_CP018889.2|WP_062151607.1|1957848_1964316_+|ExeM/NucH-family-extracellular-endonuclease MRRTQYPDSWVIKIRQYITSFSIYTLIIFGFLAQSAMAAPKLLISGYLANPQSTDSPYEYVQLIAVENIDFSVTPHAVVFTNNGTATSNGWVAGGALTYGFNLTTGTLNAGDIVYVGGSGKLINGSGSTDISSATWLNAINTATTAGNSFGTAASSGVLGNGGGNADGIAIFDVAVSSITASTVPVDAVFFGTGVGSAKPATGGYTLPTNDLYDNAQGTFGNGTNTFIFSDPAGSGFTKLTGVYNTNTATWTTARTGSSITLSTSSVLSDITTAITLATTDTAPTVISSVPSDSATNVATSSTITLNFDEPVDLTAAAVTVECPTATAQSFTGLPANNVSTVILTPSTTLPNTTSCTVTVIAGQVTDKDGTADNMATNQIISFTTIAAPVGTAPSISFGTNTDDYIDGGVSIAPASPFAITAALNDSTDAVKNAGIDFIIADSDGIATTSVTASSSNSSVVPNTNLTIAGSGTAAVNVKINPVGVGYSTITVTVSDGTNMADYVLNYAVSAASTTPTTTRFHSGKADASSAIAIDTDYMLVADDEDQTIRLYNRANSGLPVASFDFTSSLGLSGSSEVDIEASTRVGNSLYWLGSHSNNSSGNDKPNRERLFTTTLSGTGTTATLTFEHYYKYLEDDLIAWDSSNAHGLGANFFGLSASAAAGVIPETTGGFNIEGFSIAPNSTDTVYLAFRAPIVPTNTRTKALIIPVTNFTTLGDASGGVSGSATFGAPIQLELGGRGIRSMECNTAGCLLIAGSADGTGNFKLYTWSGNALDTPDERSTNLPIITDGSYETIVALPTGATLTAWDNQDVQFLIDTGDMIYYADGTIAKDLPNSNHKKFRSEIVNLGTPPVISKIHTLQGNGAATSLTGTQVIEGIVVGDFQGSTEGKGFYVQEEDADIDADVTTSEGIFVYCNTCTTAVSVGDKVRVTGTISEYSNQTQLGGTLSINVLSTGNSLPSASTVTLPVPSAIAGVDYLERFEGMLVIFSQTLYVSSNYTLGRYGEILLSANGRLSQPTNVTTPGVNASTLQAQNLLNQITLDDGLTSQNPDPAPHGLSASHSIRGGDTVTGLSGILNYNYNLYRVQPTASVSFIASNPRTATPTSVGGTVKVASFNVLNYFNTFTACTLGVGGTANNDNCRGATDATEFARQRAKTIAAIQAINADIVGIMEMENDGYDASSALQDLVNGLNSAMGADTYSFIDPDTALSTVNVMGTDAIKVALIYKSAVVTPAGAAMTSTDAIFDRRPLAQTFQVGIEKFTVIVNHFKSKGSCPTTGTDTANEDSGDGQSCWNAKRQTQATTLLNFIDNTVKVNSGDDDILIIGDLNSYAEEDPITLIKAAGYTNLVTEHSGVNAYGYQYDGLWGYLDHALSSASLTPQINGVTDWHINADEPISLDYNTEYKSAGQLTSLYAADGYRSSDHDPVVIGLTPTVAYQLSLTTTGTGTGTISSSGTPAGTSCGTNCLTYVSTSTVNLQATPTGGASFSGWSCTPTFVSGNTLTANTICAATFTAAVVTPVTPPTSGDYSLAIKVVGTGSGTISGTSAGNYPSGTRISLTALANADSDFIGWSPSTCAATFVLDVNTTCTATFDLKVIPQQYTLSLTTTGTGSGVISGANAGTYPSGTLINLSAIANSDSQFIAWNNALCASPFNLTADTVCIAQFESNPVTPPPPTTLSYTLYLQTTGTGTGMINGTGAGMYPNETLINLNAIANSDSQFITWNNALCASPFTLTADTNCIAQFDKLLPTTPLTYTLTVTPSPFGTVQMASVTCPDDCSVIVDSGTILSLNAIANTGYQFIHWTGDASCGQTVNMTTNIHCEAVFMPITTTTATTPLCPLTGTVNTLCNAQLREITQALTVLPQGNISNLVIATTVLNQGWLSNILVKTTGRITGGILTGYVHNQGILTDIDFKGGYLQGGILAGVILNSSLVDGYIANVRFMENATLTGGILQGRIYGNPNAPAMLNNVRIKTGSHLSGVILGENVIVEDNVIIDKNIILPRLDTLTAYDATGKVITVDSQFVGGISVLNQAYVIKTTQKLADTVNIRGRIFVAPEHVGKTADLFVYSPYWYADNRFISYFMTDSKGQIFAWDEKPLNLIPFKQSVVLEPIQEMDLYTGHFVAIGTLKVVFGYRLSDGTLVMHNEPSTIHIEIQP >NZ_CP018889.2|WP_083991470.1|1957018_1957642_+|GTP-cyclohydrolase-I-FolE MSQETPENKKSQYIVGENAVENLTTMYRNIIVNVGENVERDGLLKTPERAAKAILRLTSGYQQNLNAIVNDALFESDSDQVVLVRDIEFYSLCEHHLLPFFGKCHVGYLPCGKVLGLSKVARIVDMFSRRLQIQEQLTHQVALAIQECTGAYGVGVVMDARHMCMIMRGVEKQSSSTTTSAMLGTFRQNPAARAEFLSLIASSNSSL >NZ_CP018889.2|WP_062151604.1|1956210_1956825_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MEKLAIVVLISGRGSNLQAIIDAADPLVDIRAVISNRPHAQGLHIATQAGIPCEIIDHTQFANRDTFDTALQNCIDHYQAQLVVLAGFMRILTPDFIQHYAGRLINIHPSLLPAFKGLHTHRQALQAGVTEHGATVHFVTPELDSGAPILQGRVPVYPDDTEEQLAQRVLDIEHQIYPQVIHWFAEQRLYLQAQTAYLDNKPIN >NZ_CP018889.2|WP_062151601.1|1955167_1956211_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MKNQTSLTYRDAGVDIDNGDALVERIKPIARRTHRPEMLGGLGGFGALFEIPLDRYRQPVLVSGTDGVGTKLKLAMQLGKHDTIGIDLVAMCVNDVLTSGAEPLFFLDYYATGALDVETATHVISGIGKGCELAGAALVGGETAEMPGMYHGEDYDLAGFCVAVVEKAKIIDGSQVQAGDALIGLASSGVHSNGYSLVRKLLALSNADVHQDFYGRTLGATLLEPTRIYVKPLLQLIRTLPVHALAHITGGGLTGNVPRVIPEGLCARINTNSWHRPPIFDWLQTQGNITDEEMYRTFNCGIGMIVCVAQTDLDATMQCLHDAGETVWHIGEIVTDPQQTIVLHAGT >NZ_CP018889.2|WP_062151598.1|1953323_1954643_-|hypothetical-protein MTHKKHSAVLSIAGILLFSMICLSTIHGLTGFVSPLGAGICAWLAGILLFKRVSRQQKYQVWIILTIGFICMFFSLSQGKTAVLVAAVSINQAVLAMLAAVGFLRLVTQPRLHKHETLPTGKAALLRTLYGVHLFGFFINMSVLVIMGDRLAAHQTGLSRQQAIILSRAFAMAVLWSPFFAAMAVIYLYIPHINFLLLMAMGLPLALCGLWLTGHELVSEAESQHFVGYPMHFASLWVPSLLAVCVVLVHFLFPQLPVLTLITLLPIVLVVIVLSLQQGLPATFHQIFMHITHNLPTMSGELLLFLAAGVMAAGISSVLQITMIQLPLSHFGLLEATLLLFVILLIALIGVHPLISITTLSSLFLPIPHDPNLLGMTFLMGWGLGVSGTPFSAMHLMMQGRFHLSSYLITRWNIRFTLKMIALSLVVLYCYDLVSYYFI >NZ_CP018889.2|WP_062151595.1|1952380_1953301_+|hydroxymethylglutaryl-CoA-lyase MSLPTFVKLVEVGARDGLQNESQFVPTAQKIEFINRLSATGLSVIEVTSFVSPKWVPQMRDNTAVLTGITHQQGISYPVLTPNLQGFDMAVAAGATDVAIFAAASESFSQKNINCSIQESLARFNPLCQRAQQENIRVRGYVSCVLGCPYEGTISPQAVAEVATRLYDMGCYEISLGDTIGTGTPTKACQMLEAVATQIPLSQLAAHFHDTYGQALANLYAALTMGISVIDSSVAGLGGCPYAKGASGNVATEDVLYMLNGLGIETGVNLTALCQAGQFISHYLQRPSRAKVATALCITDYPNQNA >NZ_CP018889.2|WP_062151592.1|1948581_1952370_+|PAS-domain-S-box-protein MSFFTVFTSPPTRRHLLAFQTLLFLLLSTSWLLSFIHWEQPYQWLMITCLSSVIALHLLLGYWIRQEHGNTHILKLIQQDTLDTLFESENRFQAIFENAPIGVTLVDNKTHHFLQANNAICQMLGYSREELLSKTIFDITHPEDIELNRQLFETISPPHPIIIGEKRYLHKTGHTIWAAISSSLPPNSSYRITHIQDITERKQAEVALRESENRFRKAFENAPIGMTLTGLDRLIQQANNSFCMMLGYPANRVIGKNEADFTHAEDNNGGQQWVMQVLEYSISPHPLEKRYVHRDGHIVWAAISSTLQRDINGKPVYLITQVVNITEQKKAEAEIKRLNIELEQRVARRTAELSLISQILSLFIRSNESPLVFETMLQRILELTESEFGFIADVVYDTIGQPYLKCHAIGYLIKQNELSAHFQPLALAGHQIRKLDNPLGLVIQQGERMIINEYATEADEFPRHYPPVHNFLGLPLYRGEHLIGMLGLHNRITNYSEELADSLEPIISTFSQLIEAFHNEQKRQRAEEALRKNQQFLQTLIDSLPVAVFVRDIRDCGFEFVAWNKACEQFFGFNAETVLGKMAHDCMPITLANKLTQSDEIVLDYGQALEIAETQIDSPNLGHRILQPVKVPIFDEQHNPLYILCIAEDITIRKHAEESIAQKTAILEATLENMGQGILMVDKQWRLVAYNQRVIELLKFPAEFLKHRPNFAEIVRNWNEHHGIKEHLLQDTELNTQQMDSFTIEMPIIGDRVIEMGHFPIVDGGFVRTFTDITEHKQIEESLRQAKNQAEAANRAKSAFLANMSHELRTPMNAILGFSQLMQRDPHITPNLQENLEIINRSGEHLLALINDVLAMSKIEAGRMMLNEQNFDLYHLLDGLHDLFHLQAINKDLNVIFQIADNIPHYIRTDENKLRQVLINLLGNAIKFTNQGDITLTVSHVNAPATNNKARLHFQVKDTGPGIAKHEITHLFKAFGQTSTGQQAQEGTGLGLRISQEFVRLMEGEITVESWLGQGTIFSFEINVTLIDASDVPFKETTRRIIGLAPEQPVYRLLVVEDRWENRELICRLLEPLGFAVQKAANGQEAVAIWAKWQPHLIWMDIRMPVMDGVAATRSIKARKTAQQTIIIALTAGAFEEERAAMLEAGCDDFVTKPFREEIIFEKLAQYLGVKYRYAEQGVTPSRDNQATTAQLGTLYDLPVMMQAALQDALYSVDLDQLDTLLTTLNDTHPQLSTVLRECIDNFEYERVLAVLKTPLPDSLPR >NZ_CP018889.2|WP_062151616.1|1968328_1969624_-|adenylosuccinate-synthase MGKNVVVIGTQWGDEGKGKIVDLLTDRAAAVIRFQGGHNAGHTLVIDGKKTVLHLIPSGILRDKVLCLIGNGVVLSLQALMEEVEFLEKSGIPVRERLRISDAAPLLMPYHVALDQAREKARGESKIGTTGRGIGPAYEDKVARRALRVSDLFHRERFAAKLGEVLDYHNFALQHYYKVPVIDFQKTLDETLALADKIAPMVMDVTSLVGQLQKDGKNIMLEGAQGTMLDIDQGTYPFVTSSNTTAGGAATGSGIGPKDLHYILGITKAYSTRVGAGPFPTELFDEIGEYLTKQGNEFGATTGRRRRCGWFDATALRRAKLINSLTGVCITKLDVLDGLDSVRIGIGYRCNGQELYLAPTGADAIANCEPIYIDMPGWKESTIGIRRYEDLPANAKAYLEKLEELIEVPIAMISTGAERNDTIIKQHPFDL >NZ_CP018889.2|WP_062151618.1|1969821_1970994_-|ATP-phosphoribosyltransferase-regulatory-subunit MNHQDRWLLPAGITDALPEEAAHLEHLRRTLLDLYTTWGYELIIPPMIEYLDSLLVGAGHDLDLQTFKLIDQLNGRLMGIRADMTPQAARIDAHRLKREIPSRLCYLGTVLHTRPTGFTGTRSLLQVGVELYGHAGIESDAEILSLLLTTLKTTGVQAFHVDVGHVGIYRALVEQAHLNSEQESQLFAAIQRKSRTEIHDLLTIWQVSPLLQQQLTALIELNGDVSILAEARQALAPAPAEVLEALNSLEQLNKHLSNFTLHFDLAELRGYNYYTGLVFAAYVPEHGQAIALGGRYDNIGKAFGNARPATGFSTDLRILAELTTIPPIRKTAIFAPAGLDAALQTHIQQLRQVGENVIQALPNQQGDALAMGCNRELCWQAGQWQVRNID >NZ_CP018889.2|WP_062155421.1|1970993_1971179_-|DUF2065-domain-containing-protein MWTEFGIAFALLMVIEGMTPFLNPSRFRQTLRAVAELNDKTLRMMGFVSMLFGLLLLYLIH >NZ_CP018889.2|WP_062151620.1|1971312_1972197_-|protease-modulator-HflC MLQNKMVLGVISIVVLLIMMMSLFYVQETEKALKLQFGRVVKADYSPGLHFKIPFFQTIRKFDGRIQSFDSNPQHFLTGEQKNLIVDSFIKWRITDTEAYLKSVGGNPINAGRRLSEFIADGLRSEFGKRTIQEVVSGDRAKIMDIITAEANRRGSEFGIEVVDVRIKQINLPDDVSTSVYQRMDAAREQVAKELRSRGEAAAVRIRAEADRENMEIISKAERDAEQIRGEGDATATEIYARAFNRNVDFYTLTRSLNAYREVFNSKDDVLVIEPNSDFFKFFKGLDPIIAPKE >NZ_CP018889.2|WP_062151621.1|1972196_1973399_-|FtsH-protease-activity-modulator-HflK MAWNEPGNNGNKDPWGHRKNEQGPPDLDEILKKIQDKLNSLFGGGSGGSGMGNMGDMGKGLSWSLLAMIAVGLLFLWSMFGWYVVQPAEQGVETRFGRYINTTTQGLNWHFPYPIESVQKVNVEQVRAITHRALMLTQDENIVDIELVVQYRVANARDYLFNVNDPDGTLQQATESSLREVVGTSEMEKVLTSERDKVTLKTKDLIQVIIDRYKTGLVVISVNMQNAQPPTAVQAAFADVIKAREDEERDKNRAQAYANGVLQRATGQSELLRQEAQAYKAVVIARAEGQTQRFLSILTEYEKAPEITRKRLYIETIESVLSNSTKVMVDVKGGNNVMLLPLDKLFAGRTVTTVPTDTTQPAVPSATALPPFTVFPQSSTLQPIERPSRDDNRTTTRGNP >NZ_CP018889.2|WP_145917075.1|1973550_1973856_-|hypothetical-protein MGRFRKAINTIFGIAILGGISYYTYNFASAESRIRAVCAEIQQGMTTKELQAFALTHGLSSFKLKESGINYVVETKTYGRFGCKVITESGFIKESEYNFAD >NZ_CP018889.2|WP_062151631.1|1973969_1974185_-|hypothetical-protein MKDKYDFSNAEQGKFYRPLEELDIPIYLDNEVKAFFIQKLRARAKDQSFSLNEMINALLKKDIEISIQLIS >NZ_CP018889.2|WP_062151634.1|1974513_1975818_-|GTPase-HflX MFERPRTGERALLVHITIHQFTEQASLEEFTELASSAGAIPILQITGTRPMPDPALFVGKGKLQEILDAIKANDIEIVLFNHSLSPIQERNLEKALQCRVLDRTGLILDIFAQRARSFEGKLQVELAQLQHLSTRLIRGWTHLERQKGGIGLRGPGETQLELDRRLIAGRIKNIHKRLEKVNQQREISRRARQRAEIPVISLVGYTNAGKSTLFNRLTNANVYAANQLFATLDATLRRIDLPDKTPLILADTVGFIQQLPHDLVAAFRATLDETRLATLLLHVVDASDPERQDRISQVNQVLTDIEARHVSQILVYNKVDKLGDEQPHVERDESGRICKVWLSAVTGAGIDLLFMALSEQLHEINIQQWVCVPANNGQLRSRLYQISTVLEEEHAENGDSLLKIQLLPKTLTQLLESEKDLQVVDEPTGLPKAS >NZ_CP018889.2|WP_002683997.1|1975904_1976150_-|RNA-chaperone-Hfq MSKGQSLQDPFLNALRKERVPVSIYLVNGIKLQGQIESFDQFVVLLKNAVSQMVYKHAISTIVPARNVKIPHEDLMQDENG >NZ_CP018889.2|WP_062151637.1|1976222_1977182_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MNEIPCIFLMGPTAAGKTDLAVAIIQQFPCEIISVDSALVYRGMDIGTAKPTADILSIAPHHLIDICDPLEAYSTARFCKEALAHIQHIQAKGKIPLLVGGTGLYFRSLQQGLSDLPPADACVRERLNQELETFGLAALHARLAQVDPVAAQRIHPNDPQRIQRALEVYEISGVSMTEWYANTEKAWSLPHVLKFVIAPAQREVLHAKIAKRFKLMLEQGLVNEVETLFKRGDLHLSLPAMRAVGYRQVWQYLAGELDYAGMVEQSITATRQLAKRQLTWLRAEADATWFDSQQTDMTEHVLKRLVKIPMLSQSTSIIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018889_4 | 2233229-2233384 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018889_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP018889_4
>4.1|2233259|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder GACAAGGTCAGCTTGGGCAATGGCAAGGTCTGC >4.2|2233322|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder AGTTAGTTCGGCTTGAACAGTAGTCAATTCGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018889_4
The CRISPR arrays of NZ_CP018889_4 >merge|NZ_CP018889|4|2233229-2233384|CRISPRCasFinder TTGAGCGGTTGTTAGTTCGGCTTGAACAGTGACAAGGTCAGCTTGGGCAATGGCAAGGTCTGCCTGAGCCGTTGCAAGGTCTGCTTGAGCGGTAGTTAGTTCGGCTTGAACAGTAGTCAATTCGGCTTGGACTGTTGCGAGTTCCGCTTGAACCGT >NZ_CP018889|4|4|2233229-2233384|CRISPRCasFinder TTGAGCGGTTGTTAGTTCGGCTTGAACAGT GACAAGGTCAGCTTGGGCAATGGCAAGGTCTGC CTGAGCCGTTGCAAGGTCTGCTTGAGCGGT AGTTAGTTCGGCTTGAACAGTAGTCAATTCGGC TTGGACTGTTGCGAGTTCCGCTTGAACCGT
>NZ_CP018889.2|WP_062152166.1|2232152_2232818_-|formylglycine-generating-enzyme-family-protein MGKFLAGDLLGGGDPDEKPVHSVTITSDFYMSQYEITFAQYDLFCDATGREKPSDEGWGRDNRPVINVSWQDATDYSRWLSELTGKRYRLPTEAEWEYAARGGTKTAYWWGDEVKPNMANCIDCGDEFVNQTAPVGSFPANPYGLYDMTGNVWEWTRDWYASYSREPKTDPYGPIIGSHRVIRGNSWEDNARRSRSSFRGYHEPEKKTAYLGFRLIIEMEQ >NZ_CP018889.2|WP_062152164.1|2231438_2231981_+|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MEQFDGTTILSVRRNGQVVIGGDGQVTFGNTKLKGNARKVRRLYQNKIIAGFAGGTADAFTLFERFEAKLEKHQGNLTRSAVELAKDWRTDRMLRRLEAMLAVADHTASLIISGNGDVVEPEMGLMSIGSGSMFAQSAARALLENTELSAAEIVEKSLHIAADICIYTNHNLTIEILNAV >NZ_CP018889.2|WP_062152162.1|2229468_2231376_+|M48-family-metallopeptidase MLKVDFFGQQDQAQQKTRWLILYFIIALFVIIGFINLTFFLVGKFISLHHYQLSQWLQSPASHWVIGITLMVILGGTIRRLYQLREGGEALAIMIGATPIEPDTYREEERRLMNVVEEMAIAAGIPVPALYVLQMEHGINSFVAGYHASDVTLVVTRGALEQLDRRELQGVIGHEFSHILQGDMRLNLHLIGILAGILAIGQMGFYLLTGGTYQYEDRLNRNLRDLNIFPFALPFSILLISLGYIGLFCGRVIKSAISRQREFLADAAAVQYTRDPACLVGALLKIKGHRIGSKLYNYRAEEVSHLCFGSAFNLSRLLATHPTLDERITRIDRAYPYRLKYGKLGEQTASQQTAPLSEEYLSFQSTPTVRPPTTKTTVVASIGNPTPEHLAYATKIYQQIPKNILTLVHQQTGAKIITYALLFQGKVADKQAREIVLNTAESTEITQQVIALRQQLDTLGNQVRVPLLDLALPALKKLPYVERTTYLTIINDLIKADGKVSLFEYVLETILRHHLDTHTMRTSTVSYKNLAEALPDISLILSLLAHVGSGQSAYTIALKTLTTQPLPFASIVACKPEKLNGAINRLKYLTPQLKKSVIDACVTCVLADKQVETAELEVLRAVVESLDCPMPPLIG >NZ_CP018889.2|WP_062152160.1|2226646_2229265_+|hypothetical-protein MCVFKQHSNSCVWTDYAFYLLFFIGLSFTFPAQAADTTLPQLEGASGLDTTGESFSPNVIFSGGNAVAGQSYQTTVTQSLNAVADVKATIQVDPTHIGEKADIFVFAVTTLSVSTDVYYFMLGEGLYIDLWDQYTNTIVPFIPNVTLTATQSLSLYQGKFFYPGKLDIYFGYRLLDGTFIYNYQPISITITDTTTEPTPDPDPSTDAINGIPALTSYAFKSEQSKTIQGTSTENATGFNCSGTIKATDQIGRLALVSLFYQNGCYTDGTYNNNNYLVEKGTLNSSTQQQFEAYQIHEPSSKAQAFLASEHAIYYQFPTQEDYTVYSFNNNGLVKVADIAASAITLNEFTPIKSLTVSKVSGSVIYVFIPATQRISPFTALSTNVEAAHLTTTALGTPFKYRYNVNGLPFDTKQGFPYSPSDHANIYAQPRQFFFVRKTNGQIGIVWQNQADHSIQLTWLSNDLQSYTTITLNNNGMDLAVATGDDEGFIYYLTIQSGNGAQTDSSRVATLYKSNENGVLSTSLALDTAKTGLNIVSFDTDNVASLRYAQGKLGLIIGRLMHTSNDGLNHQGAIAVTFDANTLALLKNFGQTSGHSFENILTTNSQNEFVGVDLGDNYPRGINLHKFTDSRIDSRVIYTFKTQHGTTATSPAGKSYPLYSEISDSSHTYYKWSNDNNTYSELGGVIEGQQGYTVIFAGEKSPTGVSLDNSRVGSYLNDPRNLGIVQVIHDFASITPNTDNEVPEGLILTDGLTETGGFYTFNGTWSPQRNTGVVWLTNYQDKTQANVSRLKSVKLNDGNILLLWELWTDSQYVNTYMLKISEQGQKRSDIIALGTEVRLNRTDDILVNDNTVYIVNGNKSEKKLELIALPLTN >NZ_CP018889.2|WP_062152158.1|2222754_2225466_-|response-regulator MSNIIHFAQQTTNRILAVFPLRVVLIVPFLAQLIITVGLVAWLSFANGQKAVQELSQALRSEITQKIQQNLADYLSVPFYVVKNNLALLNQHFLTASDLTKWEKLFREQIYTYKTINSIALANEQKEFVAIRRIEASKLSFALSNEKTNFNLINYDYYTNQEIARSDNFDPRSRSWYKNPVKYNGLRWSDIFIALDTTALQLTVGVPITNVQAQLSGVIASTLRLTYISDFLKNLKIGKTGQTFIIERNGMLVASSTGENLFKKEDNTTKRMAVTESTNALTRYIADVLLQRFTQLSTIQTEQQIDFVWSDARYFLQVTPYQDDYGLDWLIVVLIPEADFMAQIHTNTRVTFVLSLLALIIAIFVGLLTARWVIKPILELNHAAQNLANGQWQAQSLLQTQRQDELGQLANSFQRMADQLYISFKNLENEVVARTQAQASAEAANRAKSTFLATMSHELRTPLNGILGYTQILEDDENLTLEQQEGIKTIQRSGEYLLTLINDILDLTKIEANRLELYPSSFKLKQFLEELVIFFKTNAQQKNVTFLYEALTLLPRFICTDEKRLRQVLINLLSNAVKFTARGGITFRVSYLDEKLCFQIEDTGVGISPEDLIHICESFKQVGDPKYRPDGTGLGLSITKRLLALLGGELLINSELGKGSCFSFCLHLSEIVELEKPTETPLAIGYTGTPRKILVIDDHWENRALLNSLLKPLGFEMIEAVNGADGLEKAKYYIPDLIVTDFVMPVMDGFEVVRQLRKIPALKNIPIIADSMSLLDYPQNTVSNIEINAFLPKPIKIEILLAILEKQLALTWIYKKPQGILSENVEQNATQYIDKTIILPSPTMLRSLHELATMGHINGIFKQLNHLETMDKQFSPFVKQIHVLAKGFQLDEICALIEQYLQQ >NZ_CP018889.2|WP_062152156.1|2221859_2222675_-|hypothetical-protein MQVERKKSFVEKLLTFLSRLKGYKSPLFIVYQPHSFLIKGKDTQEVMHLIKPGDILLRTYNNYLDKYFVKGTFTHAGLYLGEVTENHLRQIAKVDKPERYATGTQMVIHALADTVILEDLIQFCRCDALAILRFPQQLVLQKGRIPPDTVLNYLTEYAKVEAKSHQAAVLKAEIDIMTRLAQGDSLHFDTLFKIIYRVALSELITPHPADFGFDNFSPLSCTELIYFATKSICWNYDIEPTKQKIFFQQRRVIEADTFTNTDLEEVWKKVG >NZ_CP018889.2|WP_062152154.1|2221043_2221856_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MTETANDSLVKVRGLRFSRGKHLIFDNVDMDIPRGKITAIMGPSGTGKTTLLSLIGRQLRPQAGTIEVNGLDINKLSLNELYKIRKQMGMLFQSGALLTDLTVFENVAFPLREHTQLSEALIRNLVLMKLQAVGLRNARALMPSQLSGGMARRVALARALVLDPTMIMYDEPFTGQDPISMGVLVRLISSINKSLGVTSLIVSHDIHETASIADKIYIIANGKVVGEGHPDELRQSSSAWVRQFINAEPDGPVPFHYQGMDYETDLLGDK >NZ_CP018889.2|WP_062152152.1|2220243_2221026_-|lipid-asymmetry-maintenance-ABC-transporter-permease-subunit-MlaE MLDQFQQIGSQTLALFERLGRSVLFMLHLLSGLPSLLLRPRLVVMQLYSVGVLSLSLILVSGLFVGMVLGLQGYNILVNFNATEMLGVMVSLSLLRELGSVLTAILFAGRAGSALTAEIGLMKATEQLAAMEMMAVNPYHRVMAPRFVAGVLAMPLLAAMFNMIGIFGGHLVVVNLLGVDSGSYWSQMQSTVELYDDIFNGLLKSFVFGIAVTWIAVFEGYDCLPTSEGVSRATTRTVVYSALATLALDFMLTAIMFSDV >NZ_CP018889.2|WP_062152148.1|2219851_2220244_-|hypothetical-protein MAKKTIITTCPCGSGQVLQRCCEPYLQRQDYPLTAEALMRSRYTAYVLGNVDYLQTTWHPNTRPATLILDDSCRWVALEVVKTQAGKATDIQGTVHFRAYYKLATGRGGRLEEISQFERIDQQWFYLMGE >NZ_CP018889.2|WP_062152146.1|2215961_2219642_-|PAS-domain-S-box-protein MAVNNPRHSRFFWRSSAMFGILDMECQFKEVNAAWEKTLGLSTGQLLAKTFFAFVHQEDQPSTKYYFEQLEKGMASVSFACRFRHHDGTYRQILWEINGAASQEYAYHAVGMDITGREQPMIADEILSVLQEGVVLQYANGTIGACNPSAEQIIGLPAEQMMGWTLIDPDWRAIHEDGSPFPTETHPAICTLRTGQAYSDVVMGVVKSDESIFWLRVNSYPLWRDDVTTPYAVVISFSDISHYKENELTIRKEIQKRSSSPETVTDNNYELWDWNLDSNEVYFSSRWKKMLGFEEAELPNHIDTWHQRIHPSDYKKVMADIQNHLEGVTPVCENTHRLQHKDGSYRWILSRAVLVRDANGKPQRMVGTHIDVTETRRVEEELQETEKKYRQLLEVENNAVFMIDAESTGILELNKAAVQMYGYGRNDLLKMKTLDLSAQPEKTAKSIKKGLKYTSQQYHKKEDGTVFPVEVTANPFIWRGKQVLMLIVHDISERQKIETALWESESKYRQLFEASSNPTIVFDANTQQIFDVNHAAVDLYGFSKEDWLRLKTEEVSAESMKQRSAFGGGTTKKVQTIPLRWHRKKDGTVFPVEISTGNTYLFQGRSLICATVRDITERKAAEEALRKERDFINMLVQASPAFFFALEPDGKIRLMNKAMLNALGYVLDEVAGKEYLTFVPESERGIVATEFDTLRKSMQPSLLESHVISKSGVPLLVEWHSRAIVKANGALDYIFGVGIDVTERKKAQGHLRLFKSIIESSAEAIFVSNPEGQVVYVNPAHEKLLGYSTKDSRQMNYRTYYSDSSLMVWESDVVPALEEGGSWEGELEVHTQEGQLFPVWERVDAVRDTGGNILFSFGLLHDISEQQRTRDTLYKQAEENHVILNTIPAFIWYRDRENQLVRQNLLADTTFGTGNPLVMQLTDGKDVLRNGLAQFGIIQTYPTKTGDAVRLKIDKLPYHDGLGRVSGVIVYAIQLQDNMSLSANKPTDESVYEALQKLPFMLMAFDKERTLMVWNEMCTTITGYSGEEMVGDPAALKQLYPSIDQLEDILFSTSNQASFHWESLLTAKDGQLKNVVWYDLAKYFALPKWFTWYLGYEIPLDSYDDDALHDDDVMLSAVFDASKLGLCLTDDRGRFLRVNRTYAEFYGYRQDELLGQPFTLVLPSNTHSEAVREYYSLLMTNEQAIMYRQRNEQHRTGAIFETNVMASRVILNDKRRLLLSVVNKVI >NZ_CP018889.2|WP_062152170.1|2234340_2236062_-|hypothetical-protein MSITPAPPTNSSVNNAYYWHFTSDGEMVEAVSLPLFLSLTTTPTGYALSGTPYQVGSHVIELLVGGIAYSYTLLVEMPSSEQALVTIPATDTAVLLVQLNYFNPQTSVVERHFIATAPYISKPTDARANTSFYECIVNKPTVSRELSGAFDGIIKTNTDALTVKNFANERDDWLMQSFGMRRYRMWVGSKNQALDTLTQIAYGYIAREGITTSGETQLSIPFRDATEILDNPLQTNTYTQTHIKNQIYPDVFGTVFNIEPICIDTALLIYQFHSGSSNALTAVRDGGIGLTLGIDYTDVDLQNSTFRLIQPVKYRLTCDVQGATWNGQFVQTVGDIINYVLVNRLPELELVNLAEFNYLCPQPVGIYIKEKMTFKTLFNKLLSSIGAFAITDNEGRLSLKRFGDVTGNPVINIPKNDIVQGSMELAKRIPPVASLRLGYKKNYTVQADSFAEDLTEAERQPFKQEWLIAQTSNTGIEEQWREATLLESTGDITETCLVNELDAFAEASRRTVMYSRMRDVFKFKVYFNASLLPIGSEITIAYNRFGLAVATNVIVLSISAPLIGGSSEIGVLR >NZ_CP018889.2|WP_062152172.1|2236063_2236972_-|hypothetical-protein MRTKYTYSASATLAHVHADIIAILTGETDVNNLSASCNKASSSILTTISTAGWSVHDSSTGTTNKTIIKAPHADNASNYKYVEIYSQTSSLTVTLWEAWNETTNAGTNQSTAVTQPLNLTSGGSVYIWANPRYLVMASEIGASWGNSQNSGVVPIFELSRGQPWNTTSYPSFCLVNFYYTIYSNTAATYIPKAVDNNGNTVTGTNANCYIGSIAALIYLNVPSGATARVPDGSGGFTTPFYPLYLHNPSKYAAPVGQITSICDIWLAPSSLFSNLATIDKEGVTYEAVLIYSTGYHLLIPKG >NZ_CP018889.2|WP_062152174.1|2236971_2237763_-|hypothetical-protein MYLSLSLSSTATNATVLDAIRLALTGTTTLIGLGSACDMANSELLTDVSAGWTLVDSGTGFIVLSAPQETGTAIKFVRIRLISNSLSIDGMEAWNSTTVSGTNVTTAASISLAMPTVNQLNKLVLFSSNRFVAMQSTQNGVVSTLIYACEYTPIYPASLDKVRLLVSGRCVTQFNQDTQILLYNYSATVQTLDADFATTSTGQDTSGNLYAPAYPQFVNPASGGFVLGKLFGLLKTIALSQMEVTLNADSYAVIDTTTLIRKG >NZ_CP018889.2|WP_062152176.1|2237762_2246198_-|tape-measure-protein MSTVTVTVKILADGSALVGTTRLTREELAKLSGGMDYAKTAAGSLDNSFSRLANTLKGVVAAAVGLSVIKQVGSDFVQTIAETQQLNSRLLSLTGTLEGLAEAQDYASNAANKLNTDLQAFKASYASTLVLQQAGLMTTREARALIEGISQVAANIGASSDQVKTAMYGIAQSLGSGVLQMQELMQVAEPLPGILNSVARAAGVTVGQFRQMVSDGKITSEMYKNYLLKAVKEYDGAAQASAKNLIPAYTRLNNAYTEFKNAFEKPISDTLTPLMQNATSALKTMTGYAPQIIGAFSPVVNILGVGGGLYLGMKGLPVVVGGATTAFTTLSRAMYVLTVATSTAIVPTSRLDMALLALRANLAAQTTLLGKTSVLWGTLNTSLYGTAVAAQFASGWMGKLQVAGGLLFAAYAGWEIGSYLYEQFDIAKTGGMFFVSTTLQGWEYLKQGGDNLVGRLSKGWGIMGEAFKSPIQAIQTMFFTTIGAMTDTFIGFIQTVVSIGEYIPAVGDQFTQLNGYLESIKTSSNTTFAELSTTDFATNITKNNAEIDASLADLNKGYADNITQIQKLADEQAVSVVVGNQKVTQLDEEKRNLAEITKMETERTEGHKKQLEAIKTSMAEQLRLSTLNEKQAGAEQTVTELLKNQKFQATEEEKQSLISLQLQIEGNKETRKKAAQVEEQAIKQQADTLKKYVDTAKEAYAEIAQAGLNAQQKTQYEATDKYGNDLGLLVSQAQQAGEAITLLRDKRLELQKVGLSETQQKELDLTQQYNSELAKQVIEIDRLVVSQTALIEAQQGYDASGLTKQAREYLDLMKQVGEETAKQVITLNNQATAKSTGVDRIASLQEEITLLQLTEKERAQYNALVDIAPDQRDAVKSLLEQKAVLENTQKQWETMTNSAADYAEKVATGELKIGDAVKGFIVDINKQNIKDQLTKLKEQITSFFNGDSGKVTLEGALGIADAQTAKDVSAASKIFETYQESLKTGTDDSVKRMIDGVNTGIANLQKGIEESLLKVNIGLNDATANLTKAVEKSNVVSASNTSQTYTAKGNNQSIEAIIQAAVKNGISQTDFLKFASIETGGKFNADAYNSGSGASGLFQFVKSTAKQYGLDSSNVFDPFANANAAAKLYIDNLKQIQKYTNDISATDMYLAHQQGMGGYASIKSAQDTGSFTRSDTRKNILSNVSSADIKKILGIDLNQFKSLNDKEMAENFEKYWKTKVDAIDISKFVTANNTLTQAQQQQAQALTQSTVQKTVTDQQQIVAGQTLATANMQQVDALGLAGQGVQGFANATALSAQAIVDTAKGFASGAGDLVKQVANKIQTTQPSTSKESDKGLLSSITGIFDSDGMLSGVGDLFKTGGALESVGSAVSGLTDKLGKAGGSLGGFSTSIMSLFSGDIKGALTSGISAGLSVALPGVGTALGFAVTPVMNKLFGSWEVESQHLTASFKDLSASFAVKTVEVNKGLIGGGKKTTYSEVDSETNQQLQESIDATVKLIEDAGQKIGKALTDNFNFKSVIDMVHEGTDDFETQFARMQSIMVKNAFTEANIAGVDTSITAVMADKVQNVLKQASDGLYDKATQEFMWKPDTQKYAVQITGTVQDGLNSLIASTDWSGLTFDESQSKLQTYLTDAFNAIGVDVPQETFINMANDFATQIQDGMSWLNDTQDIVDPDAQFFKNMREIVNNFNEWDAQPEEVSAFINSLLGLKDAFKLVGYDAGLISQSLIDASGDIGTLSSNLDTFYSNFLSEEEQRTNKMTVLNDSLTSSFTQLGLEMPKSKDAFRALIDGMASDMSDPALFADAIALSEQVAEYFNLQAESVNDGITNVANGFDILIEQIDALATSLTAQDVGGWLKDSVLNATNAEDAGLRFSNAFANAFQEQMLSTVLSTVSNMVYTGLVEPMLQASSISASNTVSASTLSANQDITASNNSAVSLTAGGSTAATALAAGGQIAAEYIAGVVSEVKNVIAVMTTVMQDESIKAMLADLQPALQDIGSATFSAVSTPTSITAPYVQSQQASAVSDKADTATSNTTQEVEKEVESLDSLRQSLREFGTGLDDTDLKLYQLSDVFKNADLSMINFSGSAEDIANSINGLDDTQLRKIASETGISIDELEGYAVDYLSILREQATAEKERLAEFTAWQTGLLDYTANGSQVAQVTQWLTDSVNRLGMNADSAVGFLQGLNQADIAGYAQDLGITDDELQELIPDVISGLNDFAKSIESFHTSLNDFLTLSDPLNEFAKQTLELGVGSAQAAEWAKSQNPETLAKWAEELGISTDELMQNAVKVVTYMQTAETDARAMADGWISVFTELMDSLDSLNQGIGDDINSLNGLSVDSVARLKEQVYGDYTGNADSILQDPDELKKRISLAGDLRQAIMTQYEEQKSLLEEKHQTELDNANELLDIAQSLKDRVMSIQLNKTYFSAQDRFSTAQTQYQDLLGKAQGGDAEAAKKVGEAFSSYLDVASEMYASSAQFKAIRDAGLKDLTSLGVDLTTKGNSVSQSFQDSTYAGELKGLQESALSELQTLSNVVETTQAQGTNQLVASLKDLGTQFGIDINNVGQVIKDLFPQLGTRTDSVANAVTTPAVSDKQIADYVSQAVQASGGVNQQSVSQIVNTASQYGIAPDRLAGAIGVDKQTVSQTAAQYGQTYNAVSKKDITDYVGAVVAQKGITQESMTEIYNMAKQSGVTSGQLADALGYTREDVLAIAAQYGLPAFAEGGIVTKPTIGLIGEAGREAIIPLNQLPQMTQQGASPELLALIARLIEAQQRTQAILEQLLSSSDRVSSTVKETGDKQAKALEKAGSNGRFS >NZ_CP018889.2|WP_145917083.1|2246204_2246564_-|hypothetical-protein MDKNLSNIGEHWAMLQTRPRAVNIRKDYGYLPDEVIEALEGEQIQTDNVVCQVYACNVPAFNLFLDVCHLWRYLPMGGLIGLDWVQVQAWLALTQQVISPIVIRAVQVIESSAVRTLNK >NZ_CP018889.2|WP_062152180.1|2246544_2246868_-|hypothetical-protein MSFDIAEKIIIPTDVNVITADPKKPIKLRVHYAIVPQDEIDEAVETDGDKGFISAVVEKVEGIVKSGVAVDPVEAVQLIANHPLLSTAVMGAYAELRNRNFRGQKSK >NZ_CP018889.2|WP_062152183.1|2246902_2248051_-|hypothetical-protein MAYEIKFTKRAVVEAALEATAGVNPNSGFTAILANVGAKVDKNSTPIDRNVLDREFGAFGSAITASMFKESIEVEMKALGREAGNILVPEWTVPLQACATVKNDAYVLALSGVTGTFEVGEEVSVTSTVVGVIIDIAGTTLYVRKVGLTTVTPSDVVDGESSSASGTVSTVTTGLLFEPTSDESLMKSMTARFNQDGILKISTYMRGTAVITGAAKALPKIAFDLTGIYNAPTDTAMPDVTTSGVKPIPFQNVTLTWGDLDVSKIMFSEFSLDLGNVVVESEDSKKANSIGGVFITDGLPKLKLIFSQSTLAEYNPFAEHETPVERDFAVTYGVTDKFIRVGARKVQITTIAEQEKNNINFYTLDCTCNKGGLTPKWYIAIY >NZ_CP018889.2|WP_062152185.1|2248053_2248944_-|hypothetical-protein MNNCSRLNLPRQALFPTTFESGFQPAAHNFWFGLPRLRGDIALVGSVTTQDTTALVDSGIVALVGSVTAEQTNLVFTGNIQLVGDVTPTAVIAEQIDAGIVRLVGSVTLIEPTYVDSGVIALTGSVSTQDTTALVDSGAVALVGGVTTGSIIAEDSIVRQQIVLKLKEITDFLEVSGVANLKAGADNVDNMPSAYVFESGVTATDNQAATGVLQTVSTLFVIILMIENNTDDFGSDSSDQMNQLRAQVMSKLLGFKPIGQVQRLEYRGGRVYDFTDDILVWQEHYLLPYTVISDRS >NZ_CP018889.2|WP_062152187.1|2248912_2249266_-|hypothetical-protein MHLLLLIIPFLLLGCAEHPTRLSNGFGLIIHQVDEDRVPTDCATLTGVSYPYVGCTRIFNEENLCIVVAPTDAFPYFNQREQAIVDHEIRHCTEGNYHEPDLRDEQLYEQLLPIKPT >NZ_CP018889.2|WP_062152189.1|2249269_2250067_-|hypothetical-protein MIQNWDSVIAACNAQQVLNFYAPSTTTKGAGTFFNYWGTTWTYGAGVTPSTGAGQTFNKDSVGAIRFTAPPSGEKLYLGKWFMSSSVASSFFLYDFLWGNSGLVGNSLTLQAINSVALPTRASNGEGVQLWVNFYQGTDNAAPSITIKYTNSEGVANRTATATIPATNPVVGQAFPVLLQAGDKGVQSIQSFQMATVTPSAGDIGLMLVKQVSEMSLQQANVAESRDPIALLLPQIDENAAISIMQMCTTTVSGIQQGTFRLLAG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018889_5 | 3243864-3244047 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018889_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP018889_5
>5.1|3243889|53|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder TAGTTATAGCGGACAAACTTATGCACAGGGAATGGGATTATGGGGTTATGGTT >5.2|3243967|56|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder GCATTATAACGCGACTTTGTACGGGCAGGGCGTTGGGGGTGCAAAAGGCTTAGGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018889_5
The CRISPR arrays of NZ_CP018889_5 >merge|NZ_CP018889|5|3243864-3244047|CRISPRCasFinder TATTATTAGATTTACAAGGAAATGATAGTTATAGCGGACAAACTTATGCACAGGGAATGGGATTATGGGGTTATGGTTTATTATTTGATTTACAAGGAAATGAGCATTATAACGCGACTTTGTACGGGCAGGGCGTTGGGGGTGCAAAAGGCTTAGGTTTGTTGTTGGACATGCAGGGTAATGA >NZ_CP018889|5|5|3243864-3244047|CRISPRCasFinder TATTATTAGATTTACAAGGAAATGA TAGTTATAGCGGACAAACTTATGCACAGGGAATGGGATTATGGGGTTATGGTT TATTATTTGATTTACAAGGAAATGA GCATTATAACGCGACTTTGTACGGGCAGGGCGTTGGGGGTGCAAAAGGCTTAGGTT TGTTGTTGGACATGCAGGGTAATGA
>NZ_CP018889.2|WP_145917111.1|3241064_3242291_+|hypothetical-protein MPSHLNWTLIDQAMVSLVNFLTGVLVARLLGLDAFGFFALLWTILFFFSGLQIAFILSPLLSLGTQQTPEQADSYYSIVLIQQLIFAGLSSVFILLGLYLSDIFFPTWHTAPYALLLALTSFTYQLQDFIRRYFFTTGNTHSAFTNDVISYLGQLAGLLGLFYWQIISISAVLWVTMLSSLFAVGVGLCQFRWRAWNKTFFYQITQRHWQYARWLFASVLLERLHDAIMKAVITAVLGVQAVGVFRACQNVIGMSHVLLLALENFAPPQAGREYLQHGIVGLRRYLSRITFNGGVVMAGIALLLGCFPTTWLYLFYGDEFSDYGYVLTSYVVVYFIVFFLSPVKIGLRVLEKTRPLFHALLWAVLISLVVIYPFTVWFGLQGTLLQLMLFNLIQVVYLFWVLRLQLRH >NZ_CP018889.2|WP_062153681.1|3236223_3241035_+|tetratricopeptide-repeat-protein MNITLITITEKSFINNGFSAELAFNHQRRYQITITPPFDEKQEHNLAWYFEKYLAFPFTDNVRFNETALSIKTYGEQLFKQVFHEPDAYSDYRDALKTGFTLEIIGSPAFHALHWESLHDEKRPAPFALQFEIVRKPLHFNSPYQAITPQVSPTLNVLLVVARPNGRNDVAYRTISRPLVEMVRNSADLHVHFDILRPATFQALTQHLEDVKKKKGAGFYQIVHFDVHGAVLDYTTAQTAETAGRISFDYGRGELQPFEGKKAFIFLNHEQTGKAAPISAESLTDLLFQHGVPVVLLNACQSAKQENTSTETSLASYLMQAGTQAVVGMAYSVTVSAATLFMQTLYEQLFEGASLAVAIQRGRFELDKQKERQVYYNQLIKLEDWLLPVVYQNVPQVQFALRAFSVEEERTFYEQDALRFSEPKTAYGFFGRDLDILEIETAVLKRNSLLIQGMGGAGKTTLLKHLGAWWQTTHFVDKVFYFGYDEKAWTRQQIMRDIAIQLWGKLEYEQRFQAFSEDAQQKKLAKALRSERHLLILDNLESVTGSALAIQHVLTVTERENLQHFLQELVGGASLVLLGSRGAETWLKTGTFEINQFILNGLDSEAASQLVNEILNRHQIKTEYKQQDDFKKLLKLLAGYPLALQVVLQNLTTKTPTDILTALTAGDSAIDLNSTDKTQSILRCIEYSHSNLSPDAQQLLLCLAPFVGVINTNGLAVYTELLKQQPALAHLPFEKWETVLQEAKNWGLLGQHESHIYLTIQPTLPYFLQTQLQNKVEVKTAIETAFRLYYEKMAAGIYQLQKSKDPKQKQLGQLFASIEFENLQQSVQFALTAQVSIFYPYIALSNYFDATQNLQQGLVFGQQVLTQLEQYSPEKLAGQLGAELVGVIDNIANCFLQSQEYALAEQTYQKALKIWKNLTFFEKTERAKLNANTYHQLGMVAQAQRQWSQAQDYYQQALAILIEFNDRYSQASTYNQLGMVVEEQRQWSQAQDYYQQALAIWIEFNDRYAQAGTYHQLGNVAYEQRQWSQAQDYYQQALAILIEFNDRYSQASTYNQLGMVVEEQRQWSQAQDYYQQALAIWIEFNDRYAQAGTYHQLGNVAYEQRQWSQAQDYYQQALAILIEFNDRYSQASTYNQLGRVAEEQRQWVQAQDYYQQALAIWIEFNDRYSQAGTYHQLGRVAEEQRQWSQAEDYYQQALAIWIEFNDRYSQARTYHQLGRVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIKIEFNDRYSQAYTYHQLGRVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIKIEFNDRYSQASTYHQLGMVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIFIEFNDRYSQASTYHQLGMVAQEQRQWSQAQDYYQQALAIKIEFNDRYSQASTYHNLGMVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIKIEFNDRYSQASTYHSFGSVAQEQRQWSEAQDYYQQALAIYIEFNDRYSQARTYHSFGSVAQEQRQWSQAQDYYQQALAIYIEFNDSYSQAGTYHQLGRVAEEQRQWSQAKDYYQQALAIWIKFNDSYSQASTYHQLGLLAEAQEDWEQAIEYLLQAYIIFAEYQDEHNLQITLENLARIYQQHPNLVEQKYKALGISMNGNS >NZ_CP018889.2|WP_062153679.1|3235865_3236213_+|hypothetical-protein MTEYTVIFSPELDIQPAEFATFWNAQSQLQQQAVAQVQDAQKTAHYEMDGLTMMALIFIGNFALDIFKDVTKDAIKDFLKKRWLNKPEQKATEFDLIEKKTEDGKTLIIVLPKQN >NZ_CP018889.2|WP_062153677.1|3234678_3235824_+|OpgC-domain-containing-protein MSLISTSSPHSTITQRELKLDFFRGLALCIIFVAHIPDNWLANYTHGRFGFSDSAELFIFVSGYTAARAFGRTFSQLGFWVGTVRVLHRCWQLYIAHLALFFLLAAICAAGNKLQYIDYIGRLNIYFFFEHTPEAIVGLFSLSYVPNYFDILPMYIAILASVPLIMLLARVRPVLVPIACLGIYLGMWWFNLALPAEIDSDRPWFFNPFGWQLLFFTGFMLGAGWIKSPHLTSVLAFVCLLFILLSIPLSNYPIYSQSEWLNQLRTNIDPLVIKTNFGILRWIHFLALTGLTLYLLKYWKNFFYTLFAQCLIKIGQQGLALFLCSMILSYLAGMLMDYTGRHIIDTVVINGIGIGGLIGIAYMVAWFKTVPWKNKAVMCFG >NZ_CP018889.2|WP_062153675.1|3232362_3234162_-|aspartate--tRNA-ligase MRSHYCGQINEAFIDQIVTLCGWVHRRRDHGGVIFIDLRDREGLVQIVFDPDTQDAFNIAERLRNEFVVQIQGLVRRRPEGTENPDLSTGHIEILGRQVEILNASEALPFQMDENNVNEETRLRYRYLDLRRPIMQERMKLRTRVSRLVRNYMDSNGFMDIETPFLTKATPEGARDYLVPSRTHNGEFFALPQSPQLFKQLLMMSGMDRYYQIVRCFRDEDLRADRQPEFTQIDVEMSFVDETIVRDTMEKMIRGIFKEELNVEFPEPLQCMTYHEAVSRFGSDRPDLRNPLELVDVGDLMQGVEFKVFAQPAKDPNGRVAALLVPGGGHELSRGQIDGYTDFVTIYGAKGLAYIKVNDIMTGRDGLQSPILKFLPDDVVKQLLERTKANTGDLIFFGADKAKIVNESLGALRLKIGDDLKLTQQAWKALWVVDFPMFEWDDKENRWMSLHHPFTAPKVNDIAEMEANPGACLSRAYDLVLNGSEIGGGSIRIHRPDLQSAVFRLLGIGEEEARAKFGFLLDALKFGCPPHGGLAFGLDRLVMLMTGASSIRDVIAFPKTQTASCPLTSAPSPASEMQLRELHIRLRTPATKETVVAKD >NZ_CP018889.2|WP_062153673.1|3231975_3232233_-|hypothetical-protein MPTYDYHCSANGQTLEAKHSMNEELNTWGELCANTGLALGATPADAPIMRLITGGQIVSSRALKNPEMPACASGGCGGGMCGLMN >NZ_CP018889.2|WP_062153671.1|3231209_3231932_+|glutamine-amidotransferase MKKLFLVKTGKTFPALIKRRGDFDQWFIQCLGFSPDHIEIVEVFEGEPLPDELDDVAGVLVTGSPAMVTDRERWSELTAKWLCQVHQSSIPLLGICYGHQLIAHALGGKVANNPNGFEAGIVEIHLNEACDTDILLKELPKTLSVHAMHRQVVVTLPPETVILASNPHTDYQAYKIGETTWGLQFHPEFDADIMRTYLAEREAVFIKEGIDVETARQNAADTPYGDMLLKRFATLVQTRI >NZ_CP018889.2|WP_062153669.1|3230299_3231085_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MNTSSTIVRGVYDKQKCYVSITTDKTEVRQAQALRYQVFSEEMGATLNTSLSGYDIDIFDDYCQHVLVRESDTHQVVGCTRILTSEQARLAGGFYSESEFDLSRVLQREGRFMEIGRTCVHPDYRTGGVITLLWSGLARFMVEEGFDYLMGCASIPMPTADHHSLFDRFRERYFSDDQLRVTPKIPLRKTVEDTFNLDIPSLLKAYLRLGAQICGEPYWDADFKVADVFIFLDLDNLQDRYMKHFVDRARPTPHTLHSVAA >NZ_CP018889.2|WP_062153667.1|3228746_3230048_+|CHRD-domain-containing-protein MKKVIHSFLLLTTSLFLWTSAVFSQQAVFGVNTFTEYEAFLSAEQELGEENNSPAQGYGRLSFADDLSTAKLDVFIKDVDVNQITAFHIHCGSPNVLGPIIADLSVFGNFTDTIVNGHFAATLTNEHIVFVTMPPPAPNAGESFTLPLPEGCPNDYGQLGQVYTIAGLEALAKKGLLYFNLHTVTNPFYGEMRGQLYPLTQYKSAPTASSISFGTDSFTHYTANLSPKQELGEANGSQASGQGTVSFVQNLSYAQVELTINNLDASQLTAIHIHCGSPNVLGPYIIHFGDVATKVVNGKLSMKLTNKDIVFVTQAPPPPELGQSFTLPLPEGCPNDIGQVGQVYTIAGLEALARKGLLYFNVHTVTNAFYGEIRGQLGSEHPRADRAVYDNNYLMIPAVDVLDQDGKTVTYKADMMRLNTDNWLFELTSATEK >NZ_CP018889.2|WP_062153665.1|3227617_3228595_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MSFFLSPISEEVKSSSLFNPYLYTFAFASLYLLYCLLYIWLSSEIASHFAFSIQELTSIEQWKGTVFVFVTTLFISVILLLTLKRIEEYQNQILHQQNLLIQSERRATAGIFAASVAHDMNNYLFSMSGAIELIKESPSLNITDKQQQLLNSVEVGLQALMNLSTSLVSVEQETLQRDVTLIDINNFIEEIIGLTKHHQRVKKCTVRLEPMQLPQVLVDVNLIKQALINLIINAADAIQHPEGVILFKTALTHQQLLIEVHDNGTGIPENLRQKVFEPFFTTKNNGSGLGLLSVKVCMDKHHGNIKITNSASLGGCCIQLAFPLN >NZ_CP018889.2|WP_062153686.1|3244807_3246772_-|hypothetical-protein MLQGMRAGIQGWLGWALIILISIPFALWGIQEYLSPSRGVAVAEVNGVEISSLNFEQAVDQQKRQLRSMTQQADLSFMEAQIRKETLNRLIEQEVLMQTAINHGMRIGDMMLAKQIHQFPMFQQGGMFSQPIYEQALRSQGMNPSGFEVEMRRSLLVSQLQDGITNSAFISSAELTQRTQLEKQQRSVSYLTIPANRFTAQVVVDDAEINKYYQDHPDAFKTPEKVSLEYIEFSQEELAAAQAITEEHLKEQYKERLASFTTPGQWQAKHILIEVPQDASPEKLADAEKQANDILAKIKAQEKTFDESAKAFSADTSNKDKGGDLGWFGEGFMVKPFEEAIKSMKVGDISDKPVKTQFGFHIIQLVDAKPTITKPFESVRDELLKKVQTEEAEQAFYTHAEQMADLAFENPNSLQAIADTLKHPIKTTALFAKTETGEKDTFLSNRKVIESAFSEQVLENRYNSEVLELDKPQHVAVIRLKEHQPAQLRPLADVKEEIIAKLKQEKSTAEAEKLGKTLLADLQKGEAPDALFKKQDLQPQPAQWIERQNSRLGYPEIVREAFKMGHPTETKALYQGVSLNNGDYAIVILLAVKAGEIPAVVVENGKETANPEADRSKTQIKRALGDAGFKQIVAEMKVGTDVMVYQDRITDKVQ >NZ_CP018889.2|WP_062153687.1|3246798_3247437_-|Vat-family-streptogramin-A-O-acetyltransferase MLGPDKNAIYPLKNYNRLCFLKNIITNPNILIGDYTYYDDFEDIHNFEKNVKYHFDFIGDKLIIGKFCMIASGATFIMGGANHRMDGITTYPFTIFGHGWETITPTLNDLSLKGDTIIGNDVWIGTNATIMPGVHIGDGAIIATNATVTKHVEPYAIVGGNPAREIRKRFSTQQIKELLEIQWWNWDIEKITANLHHLVNNNIDKLKTNSSV >NZ_CP018889.2|WP_062153688.1|3247817_3248090_-|HU-family-DNA-binding-protein MNKSELVQAVAESIDIPKTTAAKAVDAVLDSIKKALTEDDTVTLIGFGTFTVRERAARTGRNPRTGKPLDIKAAKVPVFKPGKALKDSVN >NZ_CP018889.2|WP_062153689.1|3248232_3250677_-|endopeptidase-La MAYDDKTSEVIEDTRLVLPVLPLRDVVVYPHMVIPLFVGRAKSIHALEQAMTTDKQILLVAQKNAAEDEPNIEDIYRIGTVSNILQLLKLPDGTIKVLVEGGQRAKIINFLSVDDMFSAQVMPLASSDGEEREVEVLSRSVTSHFDQYIKLNKKVPPEILSSLSSIEEPSRLADTIAAHMAIKIEEKQKILEITSIRDRLEHLIALMESEIDLLQIEKRIRKRVKGQMEKSQREYYLNEQMKAIQKELGELEEVPSEIDELTRKIEEAGMPKEAKAKAYSELNKLKLMSPMSAEATVVRNYIDVLVNVPWRKRSKISRDIAKAEQVLEADHYGLEKVKERILEYLAVQQRVNKLKGPILCLVGPPGVGKTSLGQSIARATNRKFIRMALGGVRDEAEIRGHRRTYIGSMPGKIIQNLVKVSTRNPLFLLDEVDKMAMDFRGDPASALLEVLDPEQNHTFNDHYLEIDYDLSDIMFVATANTMNIPAALLDRMEVIRLSGYTEEEKVNIAINYLVSKQIKSNGLKKEEININEAAIRDIVRFYTREAGVRNLEREIAKLCRKVVKEILLKPSLKKITITPRNLEKYLGVQRFRYGRAEEQDRIGQVTGLAWTEVGGDLLTIETAMMIGKGKLTYTGQLGDVMQESIQAAMSVVRSRASSLGITSDFYQKYDLHIHVPEGATPKDGPSAGISMCTAIASVLTNIPVRADVAMTGEITLRGEVLPIGGLKEKLLAALRGGIRTVIIPDENKRDLQEIPDNIKKSLSIRPVKWIDEVLEIALQHMPTPLEAREEAVGEEQTVVDQAANVQKKQSVQTH >NZ_CP018889.2|WP_062153690.1|3250807_3252091_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit-ClpX MSDDRKAKHGSDDRLLYCSFCGKSQHEVRKLIAGPSVFICDECVELCNDIIREEVQENADANARHKLPTPHEIHQHLDEYVIGQEHAKKVLSVAVYNHYKRIETQLNKKNEVEIAKSNILLIGPTGSGKTLLAETLARLLNVPFTMADATTLTEAGYVGEDVENIIQKLLQKCDYDVEKAQTGIIYIDEIDKISRKSDNPSITRDVSGEGVQQALLKLIEGTIASVPPQGGRKHPQQEFLQVDTTNMLFICGGAFAGLDKVIRARSEKGGIGFSAEVHSNDDKRNITELLHGVEPEDLIKYGLIPEFIGRLPIITTLEELTEEQLVQILIEPKNALTKQYIKLFEMEGAKLEFRDEVLKAISRKALARNTGARGLRSILENILLETMYDLPSMENVAKVIVDETVIEGESKPLILYKNTEKQRVASD >NZ_CP018889.2|WP_062153691.1|3252155_3252797_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MKDRLITDIQAAGNLVPIVVEQTARGERSYDIYSRLLKERVIFLVGQVEDYMANLIVAQLLFLESENPDKDIHLYINSPGGSVTAGMSIYDTIQFIKPNVSTLCIGQAASMGSLLLASGAPGKRFCLPHSRVMIHQPLGGFQGQATDIDIHAREILKVRDRLNNILAKHTGQPLENIARDTDRDNFMSGEEAVKYGLIDAVLTTRQALAAPKA >NZ_CP018889.2|WP_062153693.1|3252807_3254127_-|trigger-factor 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018889_6 | 3502031-3502610 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018889_6
|
8 spacers
spacers of NZ_CP018889_6
>6.1|3502067|32|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGT >6.2|3502135|30|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTG >6.3|3502201|31|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCAT >6.4|3502268|30|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCC >6.5|3502334|36|NZ_CP018889|PILER-CR GACCGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTT >6.6|3502406|34|NZ_CP018889|PILER-CR ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGAC >6.7|3502476|34|NZ_CP018889|PILER-CR TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTT >6.8|3502546|32|NZ_CP018889|PILER-CR TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTC >6.9|3502334|33|NZ_CP018889|CRT CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTT >6.10|3502403|34|NZ_CP018889|CRT ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGAC >6.11|3502473|34|NZ_CP018889|CRT TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTT >6.12|3502543|32|NZ_CP018889|CRT TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTC >6.13|3502067|45|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGTGTTGCAGCCTTAC >6.14|3502135|43|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTGGTTGCAGCTTTAT >6.15|3502201|44|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCATGTTGCAACCTTAC >6.16|3502268|43|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCCGTTGCAGCCTTAC >6.17|3502334|46|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTTGCAGCCTTAC >6.18|3502403|47|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTTGCAGCTTTAT >6.19|3502473|47|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTTGCAGCCTTAC >6.20|3502543|45|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTTGCAGCCTTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018889_6
The CRISPR arrays of NZ_CP018889_6 >merge|NZ_CP018889|6|3502031-3502610|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGTGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACAGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTGGTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCATGTTGCAACCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACCACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCCGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGGTTGAGACCGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTTGCAGCCTTACTCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC >NZ_CP018889|6|3|3502031-3502610|PILER-CR GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTG GTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCAT GTTGCAACCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCC GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGGTTGAGAC CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTT GCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACATA ATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTT GCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTCA TCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTT GCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTTG TCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTT GCAGCCTTACTCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC >NZ_CP018889|6|2|3502031-3502610|CRT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTG GTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCAT GTTGCAACCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCC GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGGTTGAGAC CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGAC GTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTC GTTGCAGCCTTACTCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC >NZ_CP018889|6|6|3502044-3502610|CRISPRCasFinder ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGTGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTGGTTGCAGCTTTAT ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCATGTTGCAACCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCCGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGGTTGAGAC CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTTGCAGCTTTAT ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTTGCAGCCTTAC TCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC
>NZ_CP018889.2|WP_062154083.1|3498460_3501736_+|methylmalonyl-CoA-mutase 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>NZ_CP018889.2|WP_062154081.1|3497392_3498193_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MHYDITLKDLFQQLPKQLFQTLWGALPVELLNLEFSQTKQRRPDIIAKLANGQIHHLELQSDNDADMQWRELEYYSLIYQAYQIEPIQQVLYVGNKPSRFTTTIQHKQLNFSYQLIDIRELDCLSLLESEEISDNILSLLGRLPDRREAVRRVLNKIAALTENHRNDVITRLAILSGLRPLELPNLLKEEVRTMSIRVNLMENPLFREGYEKRFEEGIQLGEQRGEQRGINKTTQQIARQMLAEGLPIALITKVTQLTAEEIQRLH >NZ_CP018889.2|WP_161575469.1|3497242_3497383_-|hypothetical-protein MNIKQYGYHHINGVIHLGISKTTQHIARQMLAEGLPIALMFGYKQK >NZ_CP018889.2|WP_062154079.1|3494307_3497169_+|filamentous-hemagglutinin-N-terminal-domain-containing-protein MTTTYFRYLFIGGMLITVSCVHADIVLDGSIGAVTETTRLEESSLTLPAVGEQRAFIISPDLGVQYGTNLFYSFKEFNLYAGEIANFALTSNSSNVQNIINRVTGGTASFIDGSIISDLQGGNLFFINPAGVIFGEHAQIGLFSAFHVSTADTLLLGNNEGEFNARYPEQSLLSSAPPSAYGFLTDTPAPISLKGATLVSVDNDISLTGGDITIDNSSLWAVSQEIALVSLASQGKIAFNLENTQKDNVAIVATKQGNIALNNSYLIVSGGQIQDNLLNINAITQKSGDIYIYAGDFYVKNSALISGGVLSVSIDGTDTYQVNANIINNEDSGDIFMQINSLKLEDGFIATFTNGSGNGGDIYVLANERVDIGGTRTDAINTNLLLTSQISANTLSTADDAGQAGLIYIETPELTLHDGGKLESSSSGSGNAGGIFIRAGNINILGSTQQDTNDSPYSGIFVNALDPSATAGDAGIISIEANNLRLVDGGLISSSTAGNGTGGVINLSLNGNLTIGNGNTVNPIITTHDLLDTVANKTGRIGVVSTTENTDTSSNIPTKQPITTSGILAASESRGNAGSIIIQAQNIDMNNGFITTITLGAGNAGMVDINADNLSMTNGANISSPTEDKGDGGMISLNIQDTLNVQGGELKEKFAYPTVIQTSTANTELDNAGQAGRIKINTDKLIIQDALITSATRGSGIGNRIEINANAIEISKDKDSNSDAMRAGIYASSESAQENAGQAGEIYMTTQILTLKNGGSINTSTQNADGGNIWVTLPNQLYLRDAGNITTSVSGGTGNGGNISVQSPQFVVVNHGQIVAQATEGNGGNITIATEQFLASADADSLIDASSQKGIAGQIVITSPIVDISGNVISLPSNFLNATAHLQAKCYDLNEQLESRFIVRNLQRIGKHPEELRTTGYLPKKSTQPNPTTALPDINGQLFVQVRCGKKTA >NZ_CP018889.2|WP_062154077.1|3493632_3494013_-|RidA-family-protein MQHQLISSGSPWEATIGYSRAVRVGNVVEVSGTVAAGDNGVVGKDDPYQQAQFILQKIEKALKDAGASLENVVRTRIYVTNISQWQAVGKAHGEVFSAIRPATTVLEVSKLVNDDYLVEIEATAVI >NZ_CP018889.2|WP_062154075.1|3492840_3493179_-|hypothetical-protein MITSYIIINILFLLPFILLLGLTIFAIFHAFLKKSYIWLLCIIFFPGIGAFLYLLPMFMRKKIEREYKEKQIIEKPVVGVVVREQPMLESPKPKITTSQDVLTRLQKQRANS >NZ_CP018889.2|WP_101539167.1|3490620_3491366_-|IS5-family-transposase MSRRYALTDEQWSKLEPLLPGRKGHVGMTAKDNRLFIDAVLFRYRSGIPWRDLPERFGDFRVVHTRFSRWSKKGVWERVFKILSADADNEYAMIDSTIVRAHQHSSGGADEAIGRSAGGLSTKINSVVDALGNPTPFFLTAGQASDLEGADALIPQIKANALLADKAYDADERVRDVLKQKSIEPVIPFRKNRLNPPDYDKVLYKARYLIEHFFGKLKQYRAIATRYDKRARNFLSGVYLASTLIFLA >NZ_CP018889.2|WP_101539168.1|3489767_3490516_-|IS5-family-transposase 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MSEIEGKYQKIKYLSLRWKFSIPLIALGLLGIISFTWLFSLFFINKIEMQVLKQTKQTMQIISYATERVFINTEQLQGFISLIANDDDIQDVLILSGEPLRVIATTNRQFIHKPLDAVFHDTLLYTHLVDAIKDNRPYYDQINQQELRFIMPLRFYEDFQSAEPISSNSAMLLIVNTSDIYTVQSETLWHIFSFSLGFVVLIGTAIYLLLNRLVLHPAKIIRDAISRQTNNNKIILMPRLAMDEIGLIAQTFNTMLLEQERNQNEIRKLALVVERTNNAVIITDAQQRIEWVNQGFTRMTGYRLHEVIGRVPGHFLQGVETDPNTVQYMRQKLAEGNAFQVELVNYSKIGRRYEVAIETQPVCDEQGRIVQFMAIESDITARKAAELEIRQTKDFLNTIVSHLPLALFAKEPENLRFILWNKYCEQLFGLNEADVLGKTDYDFFPVKEASLYQTYDRQVLNNGSLVDIPEEIIHSKTLGERIAHTRKVAVLGQDKKVVMLLVILEDITEQKNAAQALQASEERFRTLVEASSDWVWETNTHFINVYSSPKVADLLGYTPEEIQGRSLYSFMSSKETEQAIQTINPYLQTQKPFRFVQNQWLHKDGHLVILEMNGVPMLDTQGKYIGYRGIGRDVTARYEMEMAVRQQAQELSLLNQELLRASRLKDEFLANMSHELRTPLNSILALIEILQEQVYGVVNAQQQKYLSNIDTSGRHLLALINDILDLSKIAAGKMELEIQSTILEGVCQASMNFIREQALRKKIRVTTHYDHNVNKIEADERRLKQILINLLTNAVKFTPEKGEIGLEYKGIPDKKTLEIHIWDTGIGIDKNELSNLFKPFTQLNTTQHEGTGLGLALVRRLTALHGGDVQVNSEMGKGSRFIITLPWRPNDIDNTAPTTAPTAETATIELHKPDDNPLILIVDDNDANILSISDYLTLKGYRTTIAHNGIEAIESANKLHPDLILMDIQMPVMNGLDAITHLRADKTFKTVPIIAVTALAMSGDRERCLNVGANEYLAKPIGLRHLVSVIERLRQQVLDNSIIS >NZ_CP018889.2|WP_062154087.1|3506342_3507446_+|cell-division-protein-ZapE MPTPLARYQRDLQRPDFVSDEAQKRAVQHTQQLYEALIHANTPPTDSLLSVLRAKLSKRKKEPVKGLYFWGGVGRGKTYLIDNFYDCLPFSEKMRIHFHRFMRQVHEDLQKFKALQNPLTHVARHLAQQTQVLCLDEFHVADITDAMLLTGLLKALFDNGVTLVSTSNVAPDLLYKGGLQRDRFLPAIALLKQYTQVLNVDGGVDYRLRTLEQAEIYHYPLDAQADINMLNSFMALSPEEGFNNQALEINGRSIQTKRCADGIVWFDFEVLCNVPRAVSDYIEIAQCFNTVFLSNIPVLDVYKDDHALRLINLVDEFYDRNVKLIVSAATSVDKLYTGQRQAFQFQRTISRLLEMQSHDYLQRPHLP >NZ_CP018889.2|WP_062154088.1|3507561_3511659_+|PAS-domain-S-box-protein MSYLIILECLKIGMLAVVLASLSVINQQLKNTRKTGWYLLFGGFCLISLEKSFYLSAEIPLHSTDFIVTELISLCGFIGYLLFVSGIFYVLPYGSKLSRMVHRYLLKKQKKQVNIKANSELLAQETLARLNELIKTSPLAVMEWDEKGIIHRWSLSAEKIFGYSEAEILGRNIFEVNFIYEEDSEHVLKVKDRLLMGIEQNNICVNRNYSKDKRIIFCEWHNSVQPATDNYPLSVLSFAQDITEREEHHQALHNSEEKFRQVTEHLNEVCYVVDLQSQRIIYVNAAFEQVWGIPVQQLLTNPHVWLDAVHPEDKKYVKTLFFNDFFQEKNLTYHQAEYRLLKANGDIYWVRDKCYPVIDRNGHVYRLVGIAEDVTYYKNTENTLREQQELLSQRNIELSKTYENLQFHIDNSPFAIVEWDAEGQISYWSTTAEKMFGWYASEMLGKSLFEVDWVHQADIRVIKILIKRLICREMSTIMHISRHYTKEKQLLFCEWHVSVRLDEQGQILSLLSFALDVTLREQLRLTLQYSEEQFRQLAEHIEEVFYIFDIEQNKLLYISPSHEKIWGQSTKDLLQNPALWAEIIHPDDRNMVEKAFRRFQQGGEFIQEYRIIRVEDKEIRWIRDRSYPIYNATGQLYRVVGIAEDVSDYKYAEIALKQSKVELQQRNFEIRELYEFTQQLNYRLNMDEVLRIFYEYLYRLIPAITCSCFISNDTNSYQLFIASREKLSPTLIQNIREEVFATLTSLNPHHGITAEEIPIVWLKQYSLQNTFNNTTLLSSRLNIPLEKTTPTLQNKAKPSSILWLGTVMKDAFTHNQLRLCYIFINHLANTFKRIQEVFIKEQRDLQSIVMYLPIGVVLFDKKAKILFVNQQAQQYFPFLIDDNKDYLAEKIFNPLLYNTNSEQNYLNRQYINIENLFLELTTRQLDYGSYSTHYLMVIQDITEQKKIESALKAERVLLAQQVEKRTAALSDANLELAKANRLKDEFLASMSHELRTPLNAILGMSEALNEEVYGKLNEKQHKFLHHIHESGQHLLALINDILDLSKIEAGKVQLMLDTTNIAELCQSCLTLIKQQAENKKLHVHFHLDGQAQVIYADQRRLKQILLNLLSNAVKFTAEGGDIGLEVEHDAEKQAIHFIIWDKGIGIDNENMQQLFKPFTQLDSRLSRQYEGTGLGLVLVHRLTELHGGSIKVESQAGQGSRFTVSLPAVSEKWRAYIQSEDPQIVLKPPSTINATIAQQAPLILIAEDHLNNILVLIDYLMAHGYRVNTARTGTEALEQLHEETPHLILMDVQMPGMDGIEATRQIRLNAQFASLPIIAMTALTMPGDREQCLAAGMNDYISKPFALKQLLNLIQQYLGVKTEKT >NZ_CP018889.2|WP_062154090.1|3511778_3512426_+|cytochrome-c4 MKKLTLALYILLGSPFVYATEQATGNGAIVGTAEAGKAKATTVCVACHGADGNSINPEWPSLAGQHASYIEQQLHDFKAGVRENALMSSQAANLTEQEIADLAAYFADQTKKQGAASSAELATQGERIYRGGNQSTGLPACAGCHGPKGSGNGGAKYPALSGQHAKYVQKQLADYKSGARGSKSDQATKLMMRQIAQKLSTEEIAAVAEYISGLH >NZ_CP018889.2|WP_062154092.1|3512624_3512990_+|transposase MTYSIDFRKKVLKVKQEENLTLAAVAKRFQIAIASVVRWSKVLEAKGTRNRPTKIDMEALKQDVALYPDAYHYERAARFGITEGGIRHALKRLGISRKKNPQTSQSQPRSTASLSKQNEPL >NZ_CP018889.2|WP_106405021.1|3512976_3513447_+|IS630-family-transposase MNRYKQSDRQIVFIDESGFAHDMPRRFGYAPIGKRCSGTQDWNAKGRTNVIGALLNFCLLTVSLVSGAINSDVFFAWITQDLLPKLPQNSVIVMDNATFHKRSDIQQAILDAGHLLEYLPPYSPDLNPIEHKWAQAKTLRKQQHCSIDELFLLNSI >NZ_CP018889.2|WP_062154094.1|3513534_3516345_-|phosphoenolpyruvate-carboxylase MKNLVKDKPLRRRVKLFGKLVGKVLRARAHGQVYATVEELRKGYIQLRKTPDSVKQHKLERMITLLSPEVLSEVIRAFNIYFSLTNIADELFKHQSRREQVHKGGALWEESFDATFREFIKAGLSPQDIQSLFDNLLYTPVFTAHPTELRRRTLMLALRRVFLATEKLDQRGLSWVEHAELEAALEAELHILWKTDEVRLRQMHVEDEISNGLNYFRESLFTAVPLAYRAAERTIKRLYNDTNQTPVVVPSFLRFGSWIGGDRDGNPFVKPATTVKALRLQKVEILREYERQLYDLSDIITHSKSFCQPSQALLESIEQDAGLLARNNLYTYSEHIFEIYRRKLSMMRIRIKNNLEATEARLNNALTGMVIADKERIGYTNEAEFLADLQLIYQSLLSHDDQAVADGALKDLIRSVETFGFYLMKLDIRQESTRHTEAVTELLTAQNIDYNSLSENARLALLIQLLQTEQALLTNNTRWSELTAETLEVFQIVHDMRQEISPDAFGSYVISMTHSASHVLEVLLLAQQYKLVDKNGGYCYIGVSPLFETIDDLNHIEHVLSTLFTQPFYRQLLRASGNTQEVMLGYSDSCKDGGIITSSWLLHEAQKKITALAEANQLACRLFHGRGGAVGRGGGPTYEAIISQPAGTVHGQIKFTEQGEVLAYKYSNPETAMYELTVGAAGLLKASSVLMHKHKSVDSRYIEIMNYLAKQGEKQYRLLTDHTEGFMPFFYDATPVAEIGLMNIGSRPARRRSDNPSKYSIRAIPWVFGWSQARYTLPAWFGLGTALEKFCDKDVDNLAKLQKMYVEFPFFKSLLSNIQMSLFKTEMDIARRYADLCSDKRQAEKIFAMIEAEYVRSEQYLLQVANISELVADNPSLQLSIERRLPYIDPLNAIQVYLLGQYRQTTASGNAEEAKRWFDPLIRSINAISAGMRNTG >NZ_CP018889.2|WP_062154096.1|3516634_3517222_+|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MFDTFTPKSSQTYNGVFTLIIINLVMYVLDHILQLPLERLYLNHHNPALYQFVTSLFCHASWQHLSGNLFFLYLFGKLVEEEEGASGVIISYLVCGIGANLMSWLLQSGYFSSLGASGAVFGLFSVSVLIRLSWDWRRLLEVLILGQFVIMQVIQETQQLGQADGVNRIAHLGGAFVGVVFILGLLRLAKSKKTS >NZ_CP018889.2|WP_062154099.1|3517483_3519094_+|hydrogenase MRRFDWLAELLARFEDQTIQVGNGSKTTLQPAHLLHIPAPEWGRALAEVAQFACRFSALWVTETLPTAKDEYYGFFILSCCVEKRGDYVVFRTEIASDTPEIASITPFYPAANRVERHIQDLFGIRFIDHPDKRRWIRHQAWQEHEYPLRKAFSAQGAPPHLTPPDSDYPFLQAQGIGVYEIPVGPVHAGIIEPGHFRFQAVGEKILNLEEHLGYIHKGTEKIAEGRDPIALAKLAGRVSGDSTVAHTWAACMAMERAAQVTIPPRAQFLRAILCERERVANHLGDVGAICNDVAFSFAFYQFARLREEWQRLNVASFGHRFLMDCIIPCGVKTDLAANLIPEHKAQLHVFQQEVEELAGIIDRHTGIEDRLETTGILSLETASRLGCLGYVGRASGLTYDVRRACPYPPYDEIVVEVPVFKKGDVKARLQIRLAEIQATLTLLNQLLSFLPTGDIVGQWQIPLENAEGLGIIEGWRGEIVSYIRFGKAGLIDRFYPRDPSWLTWSALELMIRNDIVPDFPVCNKSVNGSYSGVDL >NZ_CP018889.2|WP_062154101.1|3519112_3520219_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MQKYHFIFLIFSYLLSNVTVTLAESPAKTLTVVSWGGKYTDSQIAAYYKPFADKFGVAIQANTYNGGLGQIRSQVKTHNIKWDVVDLSLADAVKGCNDGLLEPIDLTSFPPSSNGISPLNDFYDITILTSCAAPLVVWSTVVAYNETAFAKAKKKPNKIADLFDIETFAGKRGFRKTPQVTFEWALMADGVPSTEVYNVLATAEGVERVFTMLDKIKKQIIWWDTGAQALQLLNNNEVVMTTIYNGWVADAIVNNAKPYKIIWDGQLFDLDVLSIVKGTKQLDLAIEFIKFASDTQALAEQTRYIAYSPARKSALKYLPTIAQLGYDIRPLLPMTPANFTNAIRYDFTWWAKHQEVLTDKFNAWLARN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018889_7 | 3710746-3710840 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018889_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018889_7
>7.1|3710769|49|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder GGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAGGGTTTACAACTTGGAGAAGAGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018889_7
The CRISPR arrays of NZ_CP018889_7 >merge|NZ_CP018889|7|3710746-3710840|CRISPRCasFinder GGATTGGAAAAAGGCTTGCAAATGGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAGGGTTTACAACTTGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAAGGTTTACAACT >NZ_CP018889|7|7|3710746-3710840|CRISPRCasFinder GGATTGGAAAAAGGCTTGCAAAT GGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAGGGTTTACAACTTGGAGAAGAGCGC GGCGTTGAAAAAGGTTTACAACT
>NZ_CP018889.2|WP_062154420.1|3709505_3710027_+|co-chaperone-HscB MTSPNYFELFGLPVCFTIDSEVLAACYRDLQKMIHPDKFVDAPERERRLAMEKATLINEAFQTLKQPVNRARYLLELQGVSLNNDSDTFMDATFLMAQMELRETLAEIKNQINPLAALSQFLTTLNKQSQTLIDKLNQQFTQQDWQAARNSVRQLQFFNRLQEETLQLEETLL >NZ_CP018889.2|WP_062154418.1|3709178_3709502_+|iron-sulfur-cluster-assembly-protein-IscA MMISLTPKAATHIQKSIDKRGKGVGLRLGVRTSGCSGMAYIMEFADQVEEQDQIFESQGVKVIVDPKSLSYIDGTELDYVREGLNEGFKFNNPNIKDECGCGESFNV >NZ_CP018889.2|WP_101539113.1|3707938_3708687_-|IS5-family-transposase MSRRYALTDEQWSKLEPLLPGRKGHVGMTAKDNRLFIDAVLFRYRSGIPWRDLPERFGDFRVVHTRFSRWSKKGVWERVFKILSADADNEYAMIDSTIVRAHQHSSGGGADEAIGRSAGGLSTKINSVVDALGNPTPFFLTAGQASDLEGADALIPQIKANALLADKAYDADERVRDVLKQQGIEPVIPFRKNRLNPPYYDKVLYKARYLIEHFFGKLKQYRAIATRYDKRARNFLSGVYLASTLILLA >NZ_CP018889.2|WP_161575471.1|3706669_3707899_-|type-II-secretion-system-protein-GspL MRYFLLCRLGTDVDALISWVLYDHAGKRIDSANAVSLATLPPPASHVLSVLVPSTACLLTTAHVPTTQRQRLLQAVPYALEELFAEDVEALHFALGERLVSEQVAVAVTTHQKMQQWLALFTERGYKPQTIMPDVLAVPRPENTWGILFYNQVVLVRTGDYSGFGIELETLQTALQLALHQQAAPARLVVYYARVAPPSLTVLRGLGIPIEEQAHTEDSLGWLLQGITQKNKTINLLQGEYRPQDKIQTLWKPWRLTIGLLLVWGVILFIQQIVEYQDLSQQRTALNTEIEALYRQTFPDAKRIVNARVQMEQQLNTLKNQQSNPLKGESYLTTLAQLSPILKQAAGLHLKRLDYRQGRFDLELELANLQALEQIKQSLSQMGFTVELQSASSRDNVVEARLRLQKNPI >NZ_CP018889.2|WP_062154414.1|3705929_3706583_-|hypothetical-protein MGKEIDRISSDIACLNIEHFPATLVSTTGSHCEVWQAFRTSFDNAEKTTLNFVVKRHYQPCEFREVRNLCRDYYILKEKLTDIIPNALFVQTSIDNRANLIVIAETNTPWFNLANPINETEAIPTLRQNPKALSQLKRFLQAAKQWHDEKGWVIDLYGLDNLILNKNSEVRYIDSFSVFFYEDMLKFVTDDDSLQEKIDLSLKRRSYLEYIYAQATP >NZ_CP018889.2|WP_062154412.1|3705556_3705925_+|DUF1992-domain-containing-protein MVNIDKIAEAYILEAIEKGELDNLAGMGKPLELEDLSHVPEELRMAYKILKNAGCVPEEVQLRKDIMQLQTLLQTVDDEKTRTQAVKRLNLLFAKLGNQRAGSLQAMDTQYYQKTVDKLLSE >NZ_CP018889.2|WP_062154410.1|3704432_3705410_+|quinone-oxidoreductase MTVNAIQIHQTGGIDVLRWEKIEIGEPAAHQIRIRHTAIGLNYIDVYFRMGLYKPAAYPFIPGMEAAGVVEAVGAAVTDLHVGDRVAYGATLGAYTEARVIDAERVVKIPDGISDQTAAAMMLKGMTAQYLLRQTYPVKAGDTILFHAIAGGVGLIACQWAKKLGVTVIGTVGSAEKAELAKAYGCDYPIIYTKENFVTRVKELTNGKGVPVVYDSVGQDTFMQSLDCLQPMGTIVSFGQSSGSVPPLDIGILSAKGSLFLTRPTLMSYTASRQQLLTCTDDLFAVVQSGDVKIDVNQIFSLKDAGKAHAALETRQTTGSTVLLP >NZ_CP018889.2|WP_062154406.1|3703605_3704376_+|5'/3'-nucleotidase-SurE MKILVSNDDGYRAAGIVCLVNKLKTFADITVVAPDRNRSGASNSLTLEYPLRAHTADNGFLYVDGTPTDCVHLAITGLLEELPDIVVSGINEGANLGDDVIYSGTVAAAMEGRFLGLPAIAVSLAGYPNPTHYDTAARIVEILLNHLHEGNLPLPVDTILNVNVPNVPFAALQGIQVTRLGSRHRAAPVVKDQDPRGRDIYWVGAPGKEQDAGVGTDFHAIRNGFVSVTPLHVDLTRYSAMDVTRTWLKAFETLKP >NZ_CP018889.2|WP_062154404.1|3702804_3703458_+|endonuclease-III MNAAHRHALFARLQAQNPNPKTELVYHSTFELLISVILSAQATDISVNKATVKLYSVANTPQAILNLGADGLKGYIKTIGLYNAKAKNILQTCQVLVDKYNGEVPHERAALEALAGVGRKTANVVLNTAFGEATIAVDTHIFRVANRTGLASGKTVRAVEDNLLKAVPPEYQQHAHHWLILHGRYTCTARNPKCASCVIAEFCEFKEKNLVMPNKAG >NZ_CP018889.2|WP_145917119.1|3700237_3702451_-|LPS-assembly-protein-LptD MPKRHKLILFITLLITLPTNSHALEWGMCQAIAEITPLPPQLPPPPENNAVRLYADDGEMSEKEGKVTANGNVILQRGEQVLKTDLAIYLRDQETVDAEGNFTFWDKQFIVSGNRAKLLPNHQGEMHDVHYWLLNRRGRGQATFLQRESENNASLQQTTYTTCDPSAEVWRLDAANVHLNQETGRGTANNVFINVLNIPVFYSPYLSFPIDERRLSGFLAPSMGSSDEVGVEFSIPYYLNLAPNYDATITPRFMSKRGLLLGTEFRYLLANSGGKIEWEYLPSDRVADINRSLLKVRHSGMVVPSLYTDIVYDEVSDDLYFRELGDNLTVSSTTHLEQRGDLRYFGHGWNVLGRLQRYQSLDANPATRPYERLPQIILSSDVPERNKKINVQGQVELVNFERSYDEAPVGNRYDFKSTISFPWRTASGFFVPSAILRHTRYDLSQIPIAEADRFSETPTRSTYTLMADSGLFFDRELSLFNRNLLHTLEPRLFYRYTPYENQDDIPIFDTAEYDLSFGQLFRENRFIGADRVDDSNQLTAALTTRFIDQATGLENLRVSVGQIYYFADREVVLPSELFETNSSSNIVAEISSQFNSRLSGSATVLWNPYDSKAELSIWRLRYRPNPESLYNFAYRLRENRLEQTDVSWRFPLSSQWRTLGRWNYSLDEHKDLEVFLGLEYESCCWAMRGVARRYLNTVDGAYLNGFFFEVELKGLGGVGKKASAFLEDSIVGYDDRF >NZ_CP018889.2|WP_062154423.1|3711053_3712937_+|Fe-S-protein-assembly-chaperone-HscA MPLLQISEPGQSTAPHQHRLAAGIDLGTTNSLIATVRSGIAETLPDQQARHLLPSVVHYATDTQTVIGYEALAFASSDPLNTIASVKRLMGRGLHEVKTLGTQLPYDFIDQQGMPLLRTVKGELSPVQISADILRSLKQRAEATLGGELSGVVITVPAYFDDAQRQATKDAATLAGLQLLRLLNEPTAAAVAYGLDKKAEGIHAIYDLGGGTFDISILRLHKGVFEVMATAGDSALGGDDLDREIARWIMTQAGIADNSTQGHIRYLLDSAKTAKEALTIQDSVMLNLTLSNGQPWTGVLNRETLHSLVDTYIQKTLLPCRRALRDAGITIEDIHEVVMVGGSTRMPRIREKVADFFQRQPHVDIDPDKVVAIGAAIQADILVGNKPDDDMLLLDVIPLSLGLETMGGLVEKVIPRNTTLPVARAQEFTTFKDGQTAMAVHVVQGERDLVSDCRSLARFELRGIPPMVAGAARIRVTFQVDADGLLSVSAQEQTTKIKSEINVKPSYGLQDADIERMLKEAISYADLDAKKRTLREQQVEADRVINALRAALQADGQTLLKHQEFLAINVALDELLTVAQGNEPMVIKQAIEKLDNLTQEFAARRMDQAIKHAMQGHKINEFMEENK >NZ_CP018889.2|WP_062154424.1|3712936_3713275_+|ISC-system-2Fe-2S-type-ferredoxin MPKITFLPHPELCPDGITIEVSTGTSVLDAALDNHVALEHACDKSCACTTCHIIIREGFDSLTPATDEEEDLLDKAWGLESESRLGCQATIKMDDLVVEIPKYTINYARENH >NZ_CP018889.2|WP_062155576.1|3713297_3714284_-|NAD(P)H-quinone-oxidoreductase MNYIKLNPIDTPDALVLAHETIPAPKAGEVLIKVAAAGVNRPDVLQRQGLYPPPAGASTVLGLEVAGTIVAVGETVDENLLNQPVCALVNGGGYAEYCIADVELCLPIPQGLDFISAAAIPETYFTVWTNIFERAKLQAGETFLVHGGTSGIGTTAIQLAKAFGATVIATAGNEAKCQVCRELGAHHVINYHTHDFVEVVKKLTAGQGVNVVLDMVGGDYIAQNIKVLALEGRLVQIAFLTGSKVTLDFMPIMLKRLTLTGSTLRARSVAQKAQIAQALLQNVWTLLEKGQVKPVIYKTFPLSHAADAHRLMESNQHIGKIVLVMEGA >NZ_CP018889.2|WP_083991626.1|3714918_3715962_+|diguanylate-cyclase MLADANSQFKHINTLVEQILDYKSYLKTPRLSSHPNALNFHHNSQAVLGTDFFQGYKSNTQQAYPLTHQPLLRALQGERVYIDDLEIQLENSILPLEVWATPIFNEKQEVLYAIAVFQDISQRKQAEAERIRLAQEREAKDAALRMNALLAQEIQERRRAEAELAKANQELQRLASLDGLTQLANRRRFDEYLDQEWRRAVREDVPLSLILCDVDFFKRYNDTYGHQAGDDCLRQVAMAMSQAVKRPADLVARYGGEEFAVILPNTHTDGAKTVAQNIADAVKALCLEHRASTVQPIVTLSVGVAGIYPSRGQSSIFLIKTADEALYLAKNAGRNQVFTRAIQLENS >NZ_CP018889.2|WP_062154426.1|3715958_3716915_-|MoxR-family-ATPase MDVSVFNTLRQSLEQQIIGQHHLVNSMLIALLSDGHILVEGMPGLAKTTAVKSLATAIEGEFHRIQFTPDLLPADLVGTDIYQQETGEFTFRPGPLFHNVLLADEINRAPPKVQSALLEAMAERQITVGQTTYRLPNLFMVLATQNPVEHEGTYTLPEAQLDRFLLYVKVSYPSRAEELAIIELHEQNAPTTRSTPAYHLSQADVFAARDAVMQVYIDPRLKEYIVDIVRASREPLAYDKDLHRWQRFGASPRASIALVHCARACAWLAGEKYVTPAHIQTVLPDILRHRLLLSFEAEADAISTDMFIERLLRVVGVP >NZ_CP018889.2|WP_062154427.1|3717067_3717598_-|hypothetical-protein MQLKLLISSLLLAISTVAMAAKPITEEEVLAAQKTWGEAIVAIGKAYVAKEDYKAVATKTVETLYGYHEGEVLFKPTKASQQQFRLTKEEAISYFISGVIPEDHGFAIQPWTNVRFENKDIIIDSDSAIAMGNYYFTDAKTDKEAKVEFTFGYKRGVDDNLLINLHHSSFPYTPTY >NZ_CP018889.2|WP_062154429.1|3717808_3719437_+|VWA-domain-containing-protein MIKNLFFVLLGSLLLTACNQSTSSNNEISHIETAPKVGSVSVTESFNRGQPQPASIPADYRPPLEDREKYAHVSDNPIKSAKEQPVSTFSIDVDTGSYSNIRRFLNQGSLPNPDAVRVEEMLNYFTYNYPYPVSTTPPFKVTTEFAPAAWNPKTHILLIGIQGYDVPRAQLPPANLVFLIDVSGSMNSPDKLGLLKSALQLLAESLTAKDRVSIVVYAGASGVVLEPTAGNETATINAALQRLVAGGSTNGGEGIQLAYAMAQQAYIPNGINRILLATDGDFNVGTTDFEALKSLVSEKRKSGIALTTLGFGTGNYNDQLMEQLADAGNGHYAYIDTLNEARKVLVDEVSSTLQIIAKDVKIQIEFNPAQVAEYRLIGYENRVLAREDFSNDKVDAGEIGAGHRVTALYEVTLQGSGGERLESLRYNETKSQGAMSNAEIAFLRLRYKMPNAEKSELLEFPISSTLLNKNVSNTSENFRFASAVVAFGQLLRGGKYTEHFGYDDVLALAQAAKGLDEFGYRNEFINLVKLAKSLSTRSLEKE >NZ_CP018889.2|WP_062154431.1|3719557_3720598_+|glycosyltransferase-family-4-protein MVLVLMLLAFFVALVLTRQFTHPDTFLYVVNVPNQRSLHTRPTPITGGVAFLSGFAVAMFITYFFYTEISTDLLWIYFGALLIAFISFLDDCYELSALKRLIIHIIATILLLSQGGYWLTHLLLPNVAWLLPKSLQVVVSLFFVVWMINLYNFMDGMDGFAGGMAIVGFGAFAILGGLKGDMVFMLVNLLLISAIAGFLVFNFPPAKIFMGDTGSSTLGFLVAALSLWGQRYGIFPLWIAVLIFSPFIVDATVTLFKRLFRGEKIWQAHKSHYYQKLVQLGWGHKRTVLTEYGLMSACSISALIALYFPPTTQWILIIAWCVIYIFLMYLVFLLEKQAALKKLTGF >NZ_CP018889.2|WP_062154433.1|3720583_3721354_-|ParA-family-protein MLRVIFNQKGGVGKSTITCNLAAISATKGYRTLVIDLDAQANSSYYLLGKQLTEETQGITTFFEQLLTFTFQEKKITAFIHPTPYENLSVLPANANLSYLESKLESRHKIYKLRDALKTLLQEYDQIFIDTPPALNFYTQSALIAADRCLIPFDCDDFSRRALYSLSDNVREIQQDHNDRLRIEGIIVNQFQPRAKLPTQLVDELISEGQPVLNTRLISSVKVRESHQAAMPLIHFAHDHKITEAFKQLFAELETR >NZ_CP018889.2|WP_062154435.1|3721488_3721872_+|hypothetical-protein MKSNKQRRLEIKANRLKQAKKQQKKLIAIPVPLPKGAILANPQALAHNHTYGILPTYYLDRPFTCRDCGVVEVWTAKQQRWWYEIAKGNINSRAVRCSACRHKIREQKRLQREHMDEKSSNIKKQNC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018889_1 | 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT | 551226-551257 | 32 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 28579-28610 | 5 | 0.844 |
NZ_CP018889_1 | 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR | 551227-551258 | 32 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 28579-28610 | 5 | 0.844 |
NZ_CP018889_1 | 1.8|551226|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder | 551226-551258 | 33 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 28579-28611 | 5 | 0.848 |
NZ_CP018889_1 | 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT | 551226-551257 | 32 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 2374100-2374131 | 6 | 0.812 |
NZ_CP018889_1 | 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR | 551227-551258 | 32 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 2374100-2374131 | 6 | 0.812 |
NZ_CP018889_1 | 1.3|551294|31|NZ_CP018889|CRT | 551294-551324 | 31 | NZ_CP033050 | Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence | 179798-179828 | 7 | 0.774 |
NZ_CP018889_1 | 1.6|551295|31|NZ_CP018889|PILER-CR | 551295-551325 | 31 | NZ_CP033050 | Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence | 179798-179828 | 7 | 0.774 |
NZ_CP018889_3 | 3.1|1967751|30|NZ_CP018889|PILER-CR | 1967751-1967780 | 30 | NC_022050 | Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI8, complete sequence | 40999-41028 | 7 | 0.767 |
NZ_CP018889_3 | 3.1|1967751|30|NZ_CP018889|PILER-CR | 1967751-1967780 | 30 | NZ_CP050093 | Rhizobium leguminosarum bv. trifolii strain 22B plasmid pRL22b5, complete sequence | 147618-147647 | 7 | 0.767 |
NZ_CP018889_1 | 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT | 551226-551257 | 32 | NZ_CP007767 | Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence | 32674-32705 | 8 | 0.75 |
NZ_CP018889_1 | 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT | 551226-551257 | 32 | NZ_CP044261 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence | 31359-31390 | 8 | 0.75 |
NZ_CP018889_1 | 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT | 551226-551257 | 32 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 331988-332019 | 8 | 0.75 |
NZ_CP018889_1 | 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR | 551227-551258 | 32 | NZ_CP007767 | Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence | 32674-32705 | 8 | 0.75 |
NZ_CP018889_1 | 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR | 551227-551258 | 32 | NZ_CP044261 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence | 31359-31390 | 8 | 0.75 |
NZ_CP018889_1 | 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR | 551227-551258 | 32 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 331988-332019 | 8 | 0.75 |
NZ_CP018889_1 | 1.9|551294|32|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder | 551294-551325 | 32 | NZ_CP033050 | Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence | 179798-179829 | 8 | 0.75 |
NZ_CP018889_6 | 6.1|3502067|32|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT | 3502067-3502098 | 32 | MN417334 | Clostridium phage CPAS-15, complete genome | 23071-23102 | 8 | 0.75 |
NZ_CP018889_6 | 6.1|3502067|32|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT | 3502067-3502098 | 32 | MF001357 | Clostridium phage CP3, partial genome | 641-672 | 8 | 0.75 |
NZ_CP018889_6 | 6.2|3502135|30|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT | 3502135-3502164 | 30 | MN692957 | Marine virus AFVG_117M60, complete genome | 36488-36517 | 8 | 0.733 |
NZ_CP018889_6 | 6.4|3502268|30|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT | 3502268-3502297 | 30 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 20042-20071 | 8 | 0.733 |
NZ_CP018889_6 | 6.4|3502268|30|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT | 3502268-3502297 | 30 | JQ680349 | Unidentified phage clone 1013_scaffold24 genomic sequence | 29804-29833 | 8 | 0.733 |
NZ_CP018889_1 | 1.1|551160|30|NZ_CP018889|CRT | 551160-551189 | 30 | AP014207 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 2322-2351 | 9 | 0.7 |
NZ_CP018889_1 | 1.3|551294|31|NZ_CP018889|CRT | 551294-551324 | 31 | MN871444 | UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome | 49553-49583 | 9 | 0.71 |
NZ_CP018889_1 | 1.4|551161|30|NZ_CP018889|PILER-CR | 551161-551190 | 30 | AP014207 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 2322-2351 | 9 | 0.7 |
NZ_CP018889_1 | 1.6|551295|31|NZ_CP018889|PILER-CR | 551295-551325 | 31 | MN871444 | UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome | 49553-49583 | 9 | 0.71 |
NZ_CP018889_1 | 1.8|551226|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder | 551226-551258 | 33 | NZ_CP007767 | Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence | 32673-32705 | 9 | 0.727 |
NZ_CP018889_1 | 1.8|551226|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder | 551226-551258 | 33 | NZ_CP044261 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence | 31358-31390 | 9 | 0.727 |
NZ_CP018889_1 | 1.8|551226|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder | 551226-551258 | 33 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 331988-332020 | 9 | 0.727 |
NZ_CP018889_1 | 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT | 551226-551257 | 32 | MN693402 | Marine virus AFVG_25M260, complete genome | 22109-22140 | 10 | 0.688 |
NZ_CP018889_1 | 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR | 551227-551258 | 32 | MN693402 | Marine virus AFVG_25M260, complete genome | 22109-22140 | 10 | 0.688 |
NZ_CP018889_4 | 4.1|2233259|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder | 2233259-2233291 | 33 | AP013497 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S35-C79 | 4324-4356 | 10 | 0.697 |
NZ_CP018889_4 | 4.1|2233259|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder | 2233259-2233291 | 33 | AP013775 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C68A-MedDCM-OCT-S26-C73, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 8948-8980 | 10 | 0.697 |
NZ_CP018889_4 | 4.1|2233259|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder | 2233259-2233291 | 33 | AP013498 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S38-C76 | 24489-24521 | 10 | 0.697 |
NZ_CP018889_6 | 6.8|3502546|32|NZ_CP018889|PILER-CR | 3502546-3502577 | 32 | MN694562 | Marine virus AFVG_250M829, complete genome | 31480-31511 | 11 | 0.656 |
NZ_CP018889_6 | 6.12|3502543|32|NZ_CP018889|CRT | 3502543-3502574 | 32 | MN694562 | Marine virus AFVG_250M829, complete genome | 31480-31511 | 11 | 0.656 |
1. spacer 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
atggaacaattccttgaagaacaaaac-accat CRISPR spacer gtcgaacaattcgttgaagaacaaaactatca- Protospacer .* ********* ************** *.**
2. spacer 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
atggaacaattccttgaagaacaaaac-accat CRISPR spacer gtcgaacaattcgttgaagaacaaaactatca- Protospacer .* ********* ************** *.**
3. spacer 1.8|551226|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
atggaacaattccttgaagaacaaaac-accatg CRISPR spacer gtcgaacaattcgttgaagaacaaaactatcat- Protospacer .* ********* ************** *.***
4. spacer 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
atggaacaattccttgaagaaca-aaacaccat CRISPR spacer atggaacatttccttgaagcacacgaacaata- Protospacer ******** ********** *** .**** .*
5. spacer 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
atggaacaattccttgaagaaca-aaacaccat CRISPR spacer atggaacatttccttgaagcacacgaacaata- Protospacer ******** ********** *** .**** .*
6. spacer 1.3|551294|31|NZ_CP018889|CRT matches to NZ_CP033050 (Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer accatgctaatgtagcgggttttgtagttgg Protospacer * *****.******.********** * *
7. spacer 1.6|551295|31|NZ_CP018889|PILER-CR matches to NZ_CP033050 (Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer accatgctaatgtagcgggttttgtagttgg Protospacer * *****.******.********** * *
8. spacer 3.1|1967751|30|NZ_CP018889|PILER-CR matches to NC_022050 (Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI8, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gtacactcggtatattcagcgtctgctgga CRISPR spacer aagcgctcggtatattcagcgtctgcaaca Protospacer . .*.********************* . *
9. spacer 3.1|1967751|30|NZ_CP018889|PILER-CR matches to NZ_CP050093 (Rhizobium leguminosarum bv. trifolii strain 22B plasmid pRL22b5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gtacactcggtatattcagcgtctgctgga CRISPR spacer cgacactcggtatatgcagcgtcaccgcga Protospacer ************* ******* * **
10. spacer 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT matches to NZ_CP007767 (Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
11. spacer 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT matches to NZ_CP044261 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
12. spacer 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gtacaacaataccttcaagaacaaaacaaaaa Protospacer .*. ****** **** ************ *
13. spacer 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR matches to NZ_CP007767 (Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
14. spacer 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR matches to NZ_CP044261 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
15. spacer 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gtacaacaataccttcaagaacaaaacaaaaa Protospacer .*. ****** **** ************ *
16. spacer 1.9|551294|32|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033050 (Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcgg CRISPR spacer accatgctaatgtagcgggttttgtagttgga Protospacer * *****.******.********** * *.
17. spacer 6.1|3502067|32|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT matches to MN417334 (Clostridium phage CPAS-15, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
accataatccctaggtggactttgacatacgt CRISPR spacer actgatatgcctatgtggactttgacatattt Protospacer **.. ** **** ***************. *
18. spacer 6.1|3502067|32|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT matches to MF001357 (Clostridium phage CP3, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
accataatccctaggtggactttgacatacgt CRISPR spacer actgatatgcctatgtggactttgacatattt Protospacer **.. ** **** ***************. *
19. spacer 6.2|3502135|30|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT matches to MN692957 (Marine virus AFVG_117M60, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agaagcgacttgataacgctacgaattctg CRISPR spacer acgttgtacttgataacgctactcattctg Protospacer * . *************** ******
20. spacer 6.4|3502268|30|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cacaatggaattgatgagtatttgctcccc CRISPR spacer aacaatggaattgatgtgtatatgtcagct Protospacer *************** **** **.. *.
21. spacer 6.4|3502268|30|NZ_CP018889|PILER-CR,CRT matches to JQ680349 (Unidentified phage clone 1013_scaffold24 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cacaatggaattgatgagtatttgctcccc CRISPR spacer cttcatggaattgatgagtattggcatatc Protospacer * . ****************** ** . .*
22. spacer 1.1|551160|30|NZ_CP018889|CRT matches to AP014207 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tacccatcattgattgaagacttggggggc CRISPR spacer acgctctcattgattgaagtcttggggaaa Protospacer *. ************* *******..
23. spacer 1.3|551294|31|NZ_CP018889|CRT matches to MN871444 (UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer ctctacctgatgtagttggttttgtagattg Protospacer ********** ********* **.*
24. spacer 1.4|551161|30|NZ_CP018889|PILER-CR matches to AP014207 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tacccatcattgattgaagacttggggggc CRISPR spacer acgctctcattgattgaagtcttggggaaa Protospacer *. ************* *******..
25. spacer 1.6|551295|31|NZ_CP018889|PILER-CR matches to MN871444 (UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer ctctacctgatgtagttggttttgtagattg Protospacer ********** ********* **.*
26. spacer 1.8|551226|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007767 (Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccatg CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaagat Protospacer * .**** ************ ******* .
27. spacer 1.8|551226|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044261 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccatg CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaagat Protospacer * .**** ************ ******* .
28. spacer 1.8|551226|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccatg CRISPR spacer gtacaacaataccttcaagaacaaaacaaaaaa Protospacer .*. ****** **** ************ * .
29. spacer 1.2|551226|32|NZ_CP018889|CRT matches to MN693402 (Marine virus AFVG_25M260, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gctcaacaattacttgaagaacaaaacctttc Protospacer .. ******* *************** .. .
30. spacer 1.5|551227|32|NZ_CP018889|PILER-CR matches to MN693402 (Marine virus AFVG_25M260, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gctcaacaattacttgaagaacaaaacctttc Protospacer .. ******* *************** .. .
31. spacer 4.1|2233259|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder matches to AP013497 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S35-C79) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gacaaggtcagcttgggcaatggcaaggtctgc CRISPR spacer accaatgtcagcatgggcaatggcaagagtaaa Protospacer . *** ****** **************. . .
32. spacer 4.1|2233259|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder matches to AP013775 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C68A-MedDCM-OCT-S26-C73, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gacaaggtcagcttgggcaatggcaaggtctgc CRISPR spacer accaatgtcagcatgggcaatggcaagagtaaa Protospacer . *** ****** **************. . .
33. spacer 4.1|2233259|33|NZ_CP018889|CRISPRCasFinder matches to AP013498 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S38-C76) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gacaaggtcagcttgggcaatggcaaggtctgc CRISPR spacer accaatgtcagcatgggcaatggcaagagtaaa Protospacer . *** ****** **************. . .
34. spacer 6.8|3502546|32|NZ_CP018889|PILER-CR matches to MN694562 (Marine virus AFVG_250M829, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
ttgtcagtctctccaccatactgcattagttc CRISPR spacer agtacagtctctccaccttcctgcatttcccg Protospacer ************* * ******* ..
35. spacer 6.12|3502543|32|NZ_CP018889|CRT matches to MN694562 (Marine virus AFVG_250M829, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
ttgtcagtctctccaccatactgcattagttc CRISPR spacer agtacagtctctccaccttcctgcatttcccg Protospacer ************* * ******* ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1480387 : 1530512
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP018889|1480387:1530512|DBSCAN-SWA 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40 | Hokovirus(30.77%) | transposase,tail,integrase,tRNA,protease | attL 1480598:1480613|attR 1525745:1525760 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2167560 : 2175065
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP018889|2167560:2175065|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP018889|2167560:2175065|2168852_2170331_-|WP_062152026.1|DBSCAN-SWA MTPYKRLVDGIKKILKSFEPSEVQPQTALSSIIDTQKPVPLRISRAEHALSRKNISKSALKVLYQLQSAGFQAYIVGGGVRDVLLGKQPKDFDIVTNALPEQVKNVFRNCRLIGRRFVLAHVYFGQEIVEVATFRASHGGKVNGNERVIEDGRIVRDNVYGTTVDEDANRRDFTFNALYYDINDFAILDYANGMADLQAGIVRLIGDPMLRYQEDPVRMLRAVRFAAKLGFTIENYTAEPIPQLGGLLADVPSARLHDEVLKLFLSGHGLKSFRYLRQYGLFEHLFRQTHECILENPNVLTMVEQVLKNTDERVAKQQSVNPAFLFAALLWSPILKVLPFHREEGASEQDCLINAMQRVMNKQVKQVAIPKRISVIMQEIWLMQPRLLQRKNKRKRLLLMEHPRFRAAYDFLLLRAFLDAEAREGAEWWTQALTTEVVARVPEENTPVIAEIEETLIISTPPTHPAIHKQPHHNRRKRRPYRRRNDASQSES >NZ_CP018889|2167560:2175065|2171113_2172244_-|WP_062152032.1|DBSCAN-SWA MNLLLINYEFPPIGGGAATATWNTAHELAKQGHQVTVLTSCFQELRGWSEEQGVFIYRCLAFRHQVSRSSLFEQFSFVLSAMMVLPRLLKKQNIQGIIVYFSIPCGPLGLWAKLLYKTPYIVSLRGGDVPGLEPRIMWIHRILQPLRRVILKQAIAIVANSIGLQQVAQKADPFQTQIIANGVDTHFFFPIPHENPIFQFLFVGRFQEQKNLFFLLKQLKKLRDTTTLAFCCHLVGDGYQKTALQAYAQQLQLDDVLIWHGWLDKTILRACYQQADCLLSFSLYEGMPNVLLEAMASGLAIVASQVTGHESVVRHGETGYLLALQNNDEIQTTLKYLITNRQQTKVLGDAGRQWVMEHFSWEQVAKQYVQLFVNKS >NZ_CP018889|2167560:2175065|2172249_2174103_-|WP_062152034.1|DBSCAN-SWA MCGIAGFIGTGTIADLRSLTHRLQHRGPDAEGLWHEQTVFLGHRRLAIVDLSGGQQPMLTSDKDLVIVFNGEIYNHIALRQQLQCKGHVFVTDHSDTEVLLHGYREWGTELPNKLNGMWSFVLYDRKQQVIFCSRDRFGEKPFFYTCQKDLFVFASELQAITAHPAVTPTLFPLALQKYFAYGYIPAPHTLYKNIYKLPAGHSLIYNLQTQHCNIQKYWDFVLEPFTTIPSNPDIVWAEQLRELLDNAVKIRLMADVPLGIFLSGGVDSSAVAAFARRHVDRDKLNTFSIGFTEADFDESKYAQQVASYLGTQHHLDVLSLDKAQTLLPSIIDKLDEPMGDSSLLPTYLLCRFARQTVTVALGGDGSDELFAGYDPFRALRWATLYQKFIPKPLHQGIRLLFARLPVSHRNMSVDFKIKRTLRGLSYPPSLWSPVWMATLDPQELNDLFQEPIDLENLYSEAIIQWDACQQDNLVDKTLQFYTKLYLQDDILVKLDRASMMVSLEGRCPFLDIDLVNFIRQIPSDYKFRHGQTKYLLKKALEGILPNEILYRSKKGFGVPIGKWLAQGKLTIPTTFPLLHSPFIQEKIHEHRCNTVDNRAFLWNLSLLSRWSESKSF >NZ_CP018889|2167560:2175065|2174105_2175065_-|WP_062152037.1|DBSCAN-SWA MHSLSLIIPVYNEAENIPLLQEKIAKTLAQLSYPYEIIYVDDGSQDQSFAVLTALAQNNAFIKVIQFTCNHGQTAAIAAGIDHATGDVIIFMDADLQNDPADIPMILNKLDEGYDLVSGWRANRQDAWLTRTLPSNMANWLISKVTGVRLHDYGCTLKAYRKEVLQGYRLYGEMHRFLPAYAAQVGARIAEIPVNHNPRRFGQSKYGLERIFKVILDLFTVKFLSKYGQKPIYLFGSIGAGFIVGSFLLLIYLLLDKFFYAQSLVTSPLLLMSAMFFIVGVQSIFFGLIGELLMRTYYESQDKPTYSIRTRFNITADKP >NZ_CP018889|2167560:2175065|2167560_2168355_-|WP_062152021.1|DBSCAN-SWA MPRLSLNHFRKLKRQGEKFASLTAYDASFAHLIEEAGIELVLVGDSLGMVIQGHESTLPVSIEEMIYHAQQVHRGSDNMLLMVDMPFMSYATPDTALHNAARLMREGYAQVVKLEGGNWLVDTVKLLTERGIPVCAHLGLMPQSVHQLGGYVVQGRANSDAERLRQDALALQAAGASMLLVECIPGKLAAEITQALHIPVIGIGAGAECDGQILVLYDMLGLTVKPPSFSKNFLTEQYSIQAAVQAYTQAVKSKAFPTIEQTFT >NZ_CP018889|2167560:2175065|2170502_2171117_+|WP_062152029.1|DBSCAN-SWA MASLQLYALIPQTHVLGPFTRFALWVQGCPFRCHDCMTPDALRVDGGTSVEITELAQQILNTPTIEGITLSGGEPFAQSAELLELIHQIKRVKSLGIIVYSGYTLEQLQKMAKKHPAVAGLLDQIDVLIDGLYIAEQNDGLSLRGSKNQQIHALTPRYAALIAEYYAQSQRAVEMHLLADTVMLVGIPGINLLSTWQTQIKKQS >NZ_CP018889|2167560:2175065|2168354_2168843_-|WP_062152023.1|DBSCAN-SWA MVNSIAYIGLGSNLAEPVKQIHQAFQSLATLPQTQLRKQSGLYQSKPLANMLQPDYINAVAVLETQLPPYILLEHLQAIENQQGRVRGERWGARTLDLDILLYDALQSTDPRLCLPHIGLTQRAFVLYPLYECEPALILPDGTPLEILLQHCPMDGLYRIEN |
7 | Ostreococcus_lucimarinus_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3032030 : 3097970
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP018889|3032030:3097970|DBSCAN-SWA 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57 | Mycobacterium_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3353286 : 3422923
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP018889|3353286:3422923|DBSCAN-SWA 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51 | Wolbachia_phage(30.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3436596 : 3513447
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP018889|3436596:3513447|DBSCAN-SWA 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56 | Tupanvirus(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3586763 : 3595711
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP018889|3586763:3595711|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP018889|3586763:3595711|3593688_3594045_+|WP_062154232.1|DBSCAN-SWA MDIIYLRDLRIDTVIGIYGWERQVKQTIVLDIEMATDICKAAATDHIEDTLNYKAVAKRIIDFVTHSEFELVETLAERITEIILSEFQVPWVRLQLNKQGAVRGARDVGIIIERGIKI >NZ_CP018889|3586763:3595711|3590785_3591649_-|WP_062154226.1|DBSCAN-SWA MIEVAPLKFGVVFKHAFSQVTVFKNFVKDVIDIDINIDKVHTEYEYPTQIGFVKSKYDLFAEDVEKRIIVEIQHIKEEDFFDRFLYYHLISLVEQIGTYQKYQFEKTVYTIVVLTSLPRDKSVQFSCAVSDMSPIDEHGKKHNIYPHRLIFLCPRLVNEDTPVNVKTWLELIEDSLDGKLEEDKFTAQKFKDILNAIHQQRIDPALLAQIKDEAAWEDVKREERKEGFEAGVQLGLQQGLQEGEKRGEKQGERRKALETAQKMLSKGFSLKEVVELTGLSETDLKES >NZ_CP018889|3586763:3595711|3589917_3590784_-|WP_062154224.1|transposase|DBSCAN-SWA MIEVAPLKFGVVFKHAFSQVTVFKNFVKDVIDIDINIDKVHTEYEYPTQIGFVKSKYDLFAEDIEKRIIVEIQHIKEEDFFDRFLYYHLISLVEQIGTYQKYQFEKTVYTIVVLTSLPRDKSVQFSCAVSDMSPIDEHGKKHNIYPHRLIFLCPRLVNEDTPVNVKTWLELIEDSLDGKLEENKFTAQKFKDILNAIHQQRIDPALLAQIKDEAAWEDVKREERKEGFEAGVQLGLQEGVQQGLQQGVQQAHLETARKMLKKGFDLENIAELTGLTVSELRSLSKEES >NZ_CP018889|3586763:3595711|3588223_3589063_-|WP_062154220.1|DBSCAN-SWA MIEVAPLKFGVVFKHAFSQVTVFKNFVKDVIDIDINIDKVHTEYEYPTQIGFVKSKYDLFAEDIEKRIIVEIQHIKEEDFFDRFLYYHLISLVEQIGTYQKYQFEKTVYTIVVLTSLPRNKSVQFSCAVSDMSPIDEHGKKHNIYPHRLIFLCPRLVNEDTPVNVKTWLELIEDSLDGKLEENKFTAQKFKDILNAIHQQRIDPALLAQIKDEAAWEDVKREERKEGFEAGVQLGLQEGVQQGERRKALETAQKMLSKGFSLKEVVELTGLSETDLKES >NZ_CP018889|3586763:3595711|3594590_3594809_-|WP_062154236.1|DBSCAN-SWA MTVSAESISKTIFNDIKEMEKKPSDEGKAINDRIRRAVEDKLNLKSIGLRRLVRGEWKLCSLVCKPKNVANR >NZ_CP018889|3586763:3595711|3587220_3587586_-|WP_062154092.1|transposase|DBSCAN-SWA MTYSIDFRKKVLKVKQEENLTLAAVAKRFQIAIASVVRWSKVLEAKGTRNRPTKIDMEALKQDVALYPDAYHYERAARFGITEGGIRHALKRLGISRKKNPQTSQSQPRSTASLSKQNEPL >NZ_CP018889|3586763:3595711|3591860_3592598_+|WP_062154228.1|DBSCAN-SWA MSTQLPLGIGLPESASFTNYIPGPNQAVFNILQQIIDGEWENCLYIYGGAGTGKSHLLQAACEQTAKRGGRPVYLPLALFYQSGPDILEGLDALDLVCLDDIHTVAGQPLWEEALFRLYNQLRASGIPQIITGNTIPNKLGLKLPDLVSRLNWGGAFALQPLDDASTLQALQKHAKGRGMELSDKVAQYLIHHCPRDMNTLLKWLRQLDYESLSNRRKLTLPFVRHLVQNTVVSLQDNASWHGNK >NZ_CP018889|3586763:3595711|3594046_3594553_+|WP_062154234.1|DBSCAN-SWA MARVYVSVGSNIEPLQHIRAGLTDLQQHYGTLQLSSVYESAAVGFTGENFYNLVLAFETKQTVQQVNQLLHDIEARHGRTRDGQRYSARTLDLDLILYDNLVLQDKANKVEVPRGEIEKYAFVLLPLAELIPTLKHPILGKTYAELWDNFQGKEKQALWKVDIALLAD >NZ_CP018889|3586763:3595711|3594888_3595359_-|WP_106405021.1|transposase|DBSCAN-SWA MNRYKQSDRQIVFIDESGFAHDMPRRFGYAPIGKRCSGTQDWNAKGRTNVIGALLNFCLLTVSLVSGAINSDVFFAWITQDLLPKLPQNSVIVMDNATFHKRSDIQQAILDAGHLLEYLPPYSPDLNPIEHKWAQAKTLRKQQHCSIDELFLLNSI >NZ_CP018889|3586763:3595711|3586763_3587234_-|WP_106405021.1|transposase|DBSCAN-SWA MNRYKQSDRQIVFIDESGFAHDMPRRFGYAPIGKRCSGTQDWNAKGRTNVIGALLNFCLLTVSLVSGAINSDVFFAWITQDLLPKLPQNSVIVMDNATFHKRSDIQQAILDAGHLLEYLPPYSPDLNPIEHKWAQAKTLRKQQHCSIDELFLLNSI >NZ_CP018889|3586763:3595711|3595345_3595711_-|WP_062154092.1|transposase|DBSCAN-SWA MTYSIDFRKKVLKVKQEENLTLAAVAKRFQIAIASVVRWSKVLEAKGTRNRPTKIDMEALKQDVALYPDAYHYERAARFGITEGGIRHALKRLGISRKKNPQTSQSQPRSTASLSKQNEPL >NZ_CP018889|3586763:3595711|3589064_3589916_-|WP_062154222.1|DBSCAN-SWA MIEVAPLKFGVVFKHAFSQVTVFKNFVKDVIDIDINIDKVHTEYEYPTQIGFVKSKYDLFAEDIEKRIIVEIQHIKEEDFFDRFLYYHLISLVEQIGTYQKYQFEKTVYTIVVLTSLPRDKSVQFSCAVSDMSPIDEHGKKHNIYPHRLIFLCPRLVNEDTPVNVKTWLELIEDSLDGKLEENKFTAQKFKDILNAIHQQRIDPALLAQIKDEAAWEDVKREERKEGFEAGVQLGLQEGEKRGVQQGIQLAHLETAQKMLSDGIPLETVLKYTGLSEIDLKES >NZ_CP018889|3586763:3595711|3592579_3593587_+|WP_062154230.1|tail|DBSCAN-SWA MAWKQITIAIGVSFLLTMLGSYLLFNNRLNTLAMQVDALETREFQQLDQQYARTQYVDKLNQELRATLAAAVNASTEQNLYLTAQVNNAYRLADTLLGKVNKQAEQHTAVLAQITSLKQTLTKLIDIVDGLKKNTAYNVPTGTIIGYAGNIDSEQQQILQQLGWLLCDGREVSRQQYPALFSAISTLYGVSTEQTFHLPDFRGVFLRGLDLGRQLDVERALGVLQEDDNKAHQHTGTTTTAGVHQHRGTTDLGGEHRHKLEAMGFWYTTKSWIERRAMTNEVDDGETYNTSLDGEHRHTFVTPIGGEHQHNLLTEMSGNIEARPKNYAVVYFIKY |
13 | Bdellovibrio_phage(100.0%) | transposase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3776603 : 3834435
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP018889|3776603:3834435|DBSCAN-SWA AATGCTAACTTGCCCTAGTTGTAAAGTGACACATATCGTGAAATATGGAAAACCCCACACAGGGACACAAAACTACAAATGTCGCGAATGCGGACGGAGATTTGTATAGTAACCGTCATTTGTGAAATACGATAAAAATTAATATTTTTTAATCAAAAGATTGGAAAATATAGTTGAAATATAGACAGGATAATACAGAAGGGAAGAGAAACAACGCGGTTTAAGGTGGGGGAAAATCAGCGATGTGGAGGAAGACATCGCTGAGTATTGTATGGCGGGATATAGCGGGCGGGAAATATTCGGGGTAAATTCATTACTTGTAAAAACAACATCATTATTCGTATTCTCCTTTTAACCAATCACATAAGGTGCGTTTTAACGATTGTTTATCGCTCATCCGTTTACCTGTTTTGGATTGTTCGTGTACGCCACCTTTACGCAAAATGGGGGCGCGAGCAATGGGGTTGTGGACAACTTGCCGTTGTTTGGACGGCATGGCTTTGTAATTGGGCATAGCTATTTTCCTTGTAAAAATAATACCATCGATAATCCAGTGTGTGCGTGTATGGTGATGACATAAAAACCTCCATTATAAAAAAAATGTTAAACATGACTTCCCGCTTGTCGTGTGACAACAAGCAGGAAGAGGACTCACTAGACTTATTTAATTCTTGCTTTCAGAGATACCAACTTCTTTTGCGAATTCCAATACCTTACCATCAGGTTTATCGGAGCAGGCTTTTGCCAAGTTGTTGACAAACTCACCTAATGACGCAGGGTCAAAAGAAGTGTCGTCTGTTACCCCTGATAAATAACCATCTAACCAAAACAACATCATAGATGCCGTTTCTTTATCCATGCCATCTAAATCCTTACAAGTCATGTTTTTTAAGTCCACTGCACCAGCGGCATTGACTAAAGGTGTTGCGCCTAAGCAAGCCAATAAAGCAATTGCACCGAACAACTTTTTCATAAACGACTCCGTTAAGATGGTAAATTAAGCATAAGTGATAAACAGATAACATGCCGTTATCCGTGCATTTACTCTAGCATAAAAAATGCCGAGTAATAGCGGTGTCCTCATAATTTTTAGTGGTGAACTATTAGCGATAACATTATGTATTTTGAATCTGAGATGTTTTTCACTCATAAGCACGTTAAAATCTATGGTAGTGAAAAGATTCCTTCGCAATTTCCTTGTTTACGTGCTTCTCTTTGCTGATAGAAAGGGGTGAAGAAGGAAAAATTCAGCCATTATTTAGCATTACTCAATCAATCTATTCTTTCATAACGCTTTAGGATTCATGGAATGCACTTGCTTTCGCGTTGGTATGTTCAAGTTTTTTTAATAATAATTGCCGTTATTGCTGTTTATGCGCAAACCGTAGATGTTCCGTTTTATTTAGATGATTTTTCATCGATTCAAGAAAACCCCGTTATTTATCAGTGGAAAGGCACGCTTGCTGAGTTATGGAATTTTTCGGCACTGCGTATTTTGGGGTATTACACCTTTGCCTTAAACTTTCAAACTCATCAGTTTGAACTTTTTGGCTATCATCTGGTCAATATTACGATACACGCATTAGCGGGCGTGGCTGTTTTCGCGTTTGTTCGCAGTTTGATGCAGACACCCACCATGCGCCATCATTTATCCGAACAAAGTATATTATGGTTACCCATTCTTGTTGCCTTGTTGTTTGTGTTACACCCGCTACAAACGCAAGCGGTTACTTATATTGTTCAACGTCTAGCGTCGCTCGCTGCGTTGTTTTATATCGCCGCATTAGCCTGTTATTTACAAACCCGTTTAGCAACAACCGTTACCAAACGAACAATATGGTTAATAGCTTGTTTAATCTTATGTGTTTGCGCTTTTTTTACCAAACAAAACACGGCAACGCTTCCCTTAGCCTTTCTCTTATTAGAATTACTCTGTTTCCCCTTACATATAAAACGCTTAAAAATAGCCGCAGGGGTTATGGTACTTGGATTAATAGCAGGGGCGGTGTTGATAACCATTATCTTGGGATACAACCCTTTTTCTTTAGAGGCAATGCAAGCACTTACCCAAGAAACACAAGAAATTTCGCGTCTAATTTATTTAGCAACACAATTCAGTGTGTTATGGGCGTATATCGGATTATTTTTCTTTCCTGTTGGACAACACATTGATTATTTTTATCCACTAGCCACCAGTTTTTGGAATGGACAAGTTTTGTTTGCTTTAGCAGGACATTTAATGGTAATCGGTTTTGCACTTTCTCAAGTAAGACGTTTACCCTTATTAGTTTTAGGCATTTTATTTTATTACCTTGCTCATCTGGTTGAATCTAGTGTTATACCCATTACCGACGTTGTTTTTGAACACCGCACATATTTGCCCAATTTAGGGCTATGTTTACTGAGTGGATGGTTTTTATTAGAAGTGGTCTTTCAATGGTTTGACCAACGACATACCGTTATTCTTATTAGTATCATACTAATAACATTAGGTATTACCACATGGCAACGTAATCAATTATGGCGTGACCCCATTGCATTATGGCAAGACAACACCACAAAATCGCCCAAAAAAGAACGGGGTTGGGTTATTTTGGGTAAACACCTTATTCAAGCAAATCGCCCAACCGAAGGATTACAAGCCTTACAAAATTCAGTAACACGGATTACCAACAGTGACGGCACCCAATCTGTGCGTATCACTGTAGAAACCATGCTGAATATGGTTGTAGCGCATCGCATGTTAAAACAATACGACCAAGCGAATAACTTAATCAATCAAGCCCTCAGTTCGCCGAGCTTGCGCCCATTTGACCGCGCTAAATTTCTTGTTAATCAAGGAAATATTTTTTACGAACAGCACTTATATGCAGAAACAGAAGCTGCTTATCGTCAAGCGATTGAATATTATCCTGAAGGCTTAACCGCGCGAGCCAATTTAGCCAGTATTTTGGCAGCAACTGGTCGCGAGGCAGAAGCGATTAAGATATATGAGGAAATTCTAAAAATAGACCCAAATAATGCGATTGTGTTGGAAAATCTCAAAACAATCCAATCGGAACAATACTCATCGGTAGGTACTACAAAATAACCGTAATACCTTGAGACTGAAAGAATATGGATAACACCGCTAGAGGCGATGATATCCGTATTCGCGGTAGGGTGGGTGTTGCCCTGCCACGTCTTTATTTAATAGTATTAAAATCATGTACTTAAGCTATTTTATAGCGACAAGCCAATTAATGAAATCCCAGAAAAATTAACGCAATTGTTTTTGCGTAATCCCACATGTTCCTAATCACCGCGCAATCCGCCCGACAAGGCTTTATATTTTTGATGTAATAGAGAGGAAATATAGAGCCTGTCATCAAATAAGAAGGGTTAAAGGTTCAAGCTAAAAGAATCAAGGTAGAAGCCAAATAGACCCCACTTAAGAAATTCCTAGCGCGTTTATCATATCGAGTAGCTATTGCACGGTATTGCTTTAATTTACCAAAGAAATGCTCGATTAAATAACGTGCCTTATAAAGGACTTTATCATAATAAGGTGGATTTAAACGATTTCTCTTGAACGGAATCACAGGTTCTATGCCTTGCTGTTTTAATACACTTCTAACTCGTTCATCTGCATCATAAGCCTTATCAGCCAATAAAGCGTTTGCCTTTATCTGTGGAATAAGGACATCAGCCCCTTCAAGGTCGCTTGCCTGTCCCGCAGTCAAAAAAAAAGGGTCGGATTGCCCAGTGCGTCAACAACGGAGTTAATCTTGGTACTTAACCCCCCTGCACTACGCCCAATGGCTTCATCCGCGCCACCGCCACTATAGTGCTGTCTATCATGGCATATTCGTTATCAGCATCGGCACTTAGTATCTTGAAAACACGTTCCCAGACACCTTTCTGAGACCAACGACTGAAGCGGGTATGGACAACACGGAAATCACCAAAGCGTTCGGGAAGGTCGCGCCAAGGAATGCCACTGCGATAACGGAATAGAACAGCATCAATAAACAAGCGGTTATCTTTAGCTGTCATTCCAACATGTCCTTTACGTCCAGGGAGTAGCGGTTCTAGTTTTGACCATTGTTCATCTGTTAAGGCATAACGACGACTCATTGTTTTATCCTTGGTGATATCTGGATATATACTTATAATATAACATTTTTTACTATTTAATGACACGCCCTAACTGTTGAAGGTATTAATATGACCGCTTGTGAGAGAATAATTGACGGTGTAGCCAAACTTTCAACTGTATTTACTCCCTAAAATAAATGATGGAGGTGCTTTCTTGAATATCGGTGAATTATCTAAATTAGAACATCATATTATGTTTCATATTTTAAGTAGTCATTTTGGTGAAACAATGGCAAATGTTGTACTTCACCAACTCATTGTTAAGGAACGCACATTTACTACTTCGTCCATAATGCCAAGTCTTTGTTCGGGTTCATTTACAGATTTTGAACCATTTGATAACTCACGTTTGGGAAAATTAGACTGCACATATTATGCTGATGCCGAACATCCCTTACTTCCAGGAACAGGTTGTAGCATTGTTTTATTTGCAACGGAAGATAGAACCTCATTTAATTTTTTAGAACTTAGTTTTTATGGGGAATCTTTACCTATTGATTTGGTAACTGCTGAGTTACATGGTTTTACAATAATTACTTATGACCCCCTGATTAGTCGGGATTTGTAACCCTAACTAACATTAACGCACCATAATACACAGATTTTTAAGTTATTTAAGCGTTTTTTAACCGCCTTTTTGGCGAACTAAGCGCGGAAACCGCACTTTGTGCCAATAATCCCCTGTATCAGGTTTATTACACTCGCGATAAAGCAGGACGAATTACCCAGAAATTAGAAACGATAGAAGGCATTACCCACAGTATTGATTACAGTTACGACCTCGCAGGACGCTTAATTGAAGTCAAACAAGACGGCACAGTCACAGAAACCTATCAATACGATGCCAATGGAAACCGCCTCAA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49 | Morganella_phage(58.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
4203862 : 4254691
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP018889|4203862:4254691|DBSCAN-SWA 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45 | Streptococcus_phage(12.5%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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