Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013847 | Clostridium botulinum strain Af650 chromosome, complete genome | 5 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,WYL,cas3 | 2 | 9 | 8 | 4 |
| NZ_CP013848 | Clostridium botulinum strain Af650 plasmid pRSJ14_1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_CP013847
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013847_1 | 1179566-1179917 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP013847_1
|
5 spacers
spacers of NZ_CP013847_1
>1.1|1179594|39|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT CAAGGGTATTTAAAAGCAATATAGAAGTAATATTATAGA >1.2|1179661|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT ATATGATTTCTTAGTAGATATGCAAACGGGAGATGC >1.3|1179725|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT TAATCAAGATTTAACCATTCTTTAGCTTCTCGTAGT >1.4|1179789|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT TTGGAAAGCTTACTAGATTTCTTACCTATATCGGGT >1.5|1179853|37|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT AAGTTAATTCTTTTGAATTTAATATCATCTGTTACAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013847_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013847_1 >merge|NZ_CP013847|1|1179566-1179917|CRISPRCasFinder,CRT TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATCAAGGGTATTTAAAAGCAATATAGAAGTAATATTATAGATGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATATATGATTTCTTAGTAGATATGCAAACGGGAGATGCTGAACATTAACATGAGATGTATTTAAATTAATCAAGATTTAACCATTCTTTAGCTTCTCGTAGTTGAACATTAACATAGGATGTATTTAAATTTGGAAAGCTTACTAGATTTCTTACCTATATCGGGTTGAACAATAACATGAGATGCATTTAAATAAGTTAATTCTTTTGAATTTAATATCATCTGTTACACTGAACAATAACATAAGATGTATTATTAA >NZ_CP013847|1|1|1179566-1179917|CRISPRCasFinder TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CAAGGGTATTTAAAAGCAATATAGAAGTAATATTATAGA TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATATGATTTCTTAGTAGATATGCAAACGGGAGATGC TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAATCAAGATTTAACCATTCTTTAGCTTCTCGTAGT TGAACATTAACATAGGATGTATTTAAAT TTGGAAAGCTTACTAGATTTCTTACCTATATCGGGT TGAACAATAACATGAGATGCATTTAAAT AAGTTAATTCTTTTGAATTTAATATCATCTGTTACAC TGAACAATAACATAAGATGTATTATTAA >NZ_CP013847|1|1|1179566-1179917|CRT TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT CAAGGGTATTTAAAAGCAATATAGAAGTAATATTATAGA TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT ATATGATTTCTTAGTAGATATGCAAACGGGAGATGC TGAACATTAACATGAGATGTATTTAAAT TAATCAAGATTTAACCATTCTTTAGCTTCTCGTAGT TGAACATTAACATAGGATGTATTTAAAT TTGGAAAGCTTACTAGATTTCTTACCTATATCGGGT TGAACAATAACATGAGATGCATTTAAAT AAGTTAATTCTTTTGAATTTAATATCATCTGTTACAC TGAACAATAACATAAGATGTATTATTAA
>NZ_CP013847.1|WP_012704951.1|1177933_1178788_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFIYDTLENIGIETLHETFLNAFSDYQVKMDLPLFKFQHMLQRRGYVPKVSIGAFNDDILVGFVLNGVRNWDGKLTAYDTGTGIIEAYRKQGITSNMLLNVRRLFQQMGVEQYLLEVIQSNTSALQLYKKQGFKILRDFECFHLDKNKYNPITTYKVEHVDMINSNDWRELTEFWDFAPSWQNSIDSINAVSDSFIYSIVRFDDNIVGYGVIDKKTGDIPQIAVNKNYRCKGIARSILTDLIKNTESYNINVINVDGRSKSMKDFLLKLGFECGVSQYEMILKL >NZ_CP013847.1|WP_011948666.1|1177564_1177888_+|TfoX/Sxy-family-protein MASNIEFVEYVCDQISGAGDITYKKMFGDYGVYCNEKIIGLICDNQFFLKITKAGKDLLHEAIEAPAYKGAKPSFLIESLDNREYLAKIVSATYKELPMPKPKKTKK >NZ_CP013847.1|WP_012703775.1|1176617_1177463_+|aldo/keto-reductase MQDIKSYTILNNGVKMPWLGFGTYKVENGDTVIQSVKEALKIGYGHIDTASYYGNEEGVGTAIKESRIPREDIFLVSKVWNSEQGYDKTLKSFEDSIKKLGTDYLDLYLIHWPQPLSKETWKALEKLYKEGRVKAIGVSNFLVDHLKWLLEDAEIMPMVNQVEFHPQLIQKDLIEFCSKNNIQLEAWSPLMRGKVFEIQLLQDIARKYGKTISQIVLRWDLQMGVVTIPKSINPSRIKENADIFDFEISKEDMDKIQQLDKGLRVGSDPNKVYPCQSISNK >NZ_CP013847.1|WP_012705719.1|1176296_1176500_+|DUF3788-family-protein MYGKKEIEQFESRRDEFSDYMKGIFNETKHYHDGKWLLIRIQNDKYINELIEMIKIKKKSKKNILHK >NZ_CP013847.1|WP_003356862.1|1175639_1176233_+|DUF1349-domain-containing-protein MFRFNTKEAKWFFEPKNYLIKEDKVEIITEPNTDFWQRTYYGFRNDNAHVLYVTTDEKYFSFTVRTDFNSTALFDQCGLAIYQNSENWAKACIEFHDNNTSWLGSVVTNHGYSDWATMDIGSSVKSMWYRLSRRGSDYCFENSFDGVNFKQMRIFHLFEGAKEINFGLLACSPSKNSFKATFTEMKITDCLWEEHKA >NZ_CP013847.1|WP_012704500.1|1175043_1175487_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MEIKIIKDNKRSFLDLLLLADEQESMIDKYLNRGEMFALYDGDLKSICVVTNEEEGIYEIKNLATYEKYQGQGYGSRLIKFIFEYYKDNCKTMLVGTGDSPLTIPFYKHCGFKVSHRIKNFFTDNYDHPIYESGIQLIDMVYLKKHF >NZ_CP013847.1|WP_012704042.1|1174372_1174837_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MNIRMYQSEDCREIVELFYNTVHSINSRDYNNAQLDVWASKEIDIDSWDKSFSQHYSIVAEESDIIIGFGDLDATGYLDTLYVHKDYQGIGVATTIANELENYAQENHISIVTTNASITAKSFFKRQGYEVVKEQFIERNGQFLKNFIMKKILG >NZ_CP013847.1|WP_012704467.1|1172889_1173927_-|PocR-ligand-binding-domain-containing-protein MIKENLNLDKVIDFKKWIKLQESLALVTKAAIIIVDYKGNPVTEHSRCNRFCKAVRSNPNLVKYCQKCDSRGGLEAVRLNKPYIYLCHYNIVDIAIPIIIDGKYIGAIMAGQIKLSDNKDSDFLEQIVITPKNSMARHALEEFKEYYDEIPVLSLKEVQEIANMLFSLCNYLVEEALNKNLISEIYQKTVTPKSEIDLNILTGYTMKNIENAKKEMSNVLLDSYVKENLSSDSLDVSVSNTLKPAIEYIYNHKSENITAKKLAEVCHISPSYFSRLFSKETGKSFSSFISNLKIDWAKSLLEETDMHINEISDELGFNETGYFIKIFKKYEGVTPFVYRKYCKKN >NZ_CP013847.1|WP_003356404.1|1171238_1172369_-|glycerol-dehydrogenase MRKAFICPTKYVQGEDEILNLGYFVKSFGESALLIAHKDDIERVKDKLDSTAKKFGITFVESAFCGECSREEVARLQEIAKNNKCACTIGLGGGKAIDTAKCVAKGNSLIIVPTIAATDAPTSHSAVLYTPDGAFDDYAYFWQSPTVILIDTTVIANAPTRFLVSGMGDALSTYFEARATSNSFSNVNAGLPCGVREGLCAPAKGTNTALTLAKACYKTLLEDGVKAKIASDCNLVTQALENIIETNILLSGLGFESAGLAAAHAIHDGLTILEGTHKYFHGEKVAFGTIAQLVLENAPKEEIDEVINFCLEIGLPVCLEDIGVDSITDEELMEVAKKSCIEEESIHSMPFKVTPEAVAAAIITADTLGKKYKSNK >NZ_CP013847.1|WP_012703941.1|1169467_1171228_-|dihydroxyacetone-kinase-subunit-DhaK MKKIINRPETVVMEMCNGIAMAHPELEFVRKYKVMKKKNINKNKVSLISGGGSGHEPAHAGFIGKGMLDAAVCGDIFASPSQIQVYKAIKATASEKGTLLIIKNYSGDIMNFKNAAHLASEDGIKVDYVKVDDDIAVEDSLYTVGRRGVAGTVLVHKIAGAAAELGFSLEKVKSIAEKAVSNVRSLGFAFSSCTVPAKRTPTFQLAEDEMEFGVGIHGEPGIVREKVATADELAKKIVDSILKDMKIDGSNNEEVALLINGFGATPLQELYLFNNSVTAELAKKNIKINRTFVGNYMTSIDMEGASVSIMKLDDELKELLSKESDTPAFKVSGPVESVEYISLEDNNDIENEVSFDLETCDCHSEIKDKKITLDNMIYIIDKMSEVIIANEVHFCELDSHAGDGDFGMSVAKGFKQLKREWKHLLKEDNMNIGKFLNECSLVIMEHCGGASGPIWGSAFRAAGKQVGDKKELSVSDFAEMMQAAVKGIQSTGERSFGRGAVVGDKTLIDALVPCADLWSESANNNTSIHEAFQKGAAAAVKGAKMTEEIVARMGRAGTVGERSIGYPDAGAYGLGVIFTEISNSLK >NZ_CP013847.1|WP_012704767.1|1180530_1181499_+|C40-family-peptidase MKKKTTILSIFLAVFMALAMNVGQVKAAATGQDIVNYAKQFQGVPYVWGGTSPSGFDCSGFVQYVYRNAAGIELPRDTYGQITKGTPVSQSNLQPGDLVFPHTGHVGIYVGNGQIIHSPQTGDVVKISPIWKFYAARRIINKPQSYINIDGGGTLACNGTSGMNLIIRDYSSDVVRAFGWVDSDPSCSWAFDVTPPNSNYTKLYKGTNKVINLRNNGSPFTPGGNYKLTVKGYDKNGKVVCERSINLKVPNGIANSSAKPIFPGSYTVTAQTVAREYPRSNGAVTGNLKKGQEVGVFAEYGNWYLVARGTPQWVEKQYLTNK >NZ_CP013847.1|WP_012704336.1|1182503_1183511_-|adenosine-deaminase MNFKKLPKIELHCHLDGSLRVDTILDIAKKDNIPLPSYNKKELINYVSIMDDCNSLDEYLNKFFIPNKVMQTKENLKRIAFELLEDVAADNVKYIEVRFAPLLHVEKGLNIEEIIESVLEGIKEAEKLYDIKGNLILGCMRNMDIPSAFEVVKKGSKFIGKGVVAIDLCAGEEPHFPGKYIEVLKLAKECGYRITIHAGEAGVGENVLEAITLLNAERIGHGIYIKNCAEAYKLVKEKNIPLEVCPTSNLHTKAFESYETHPFMDFLKDGIKVTINTDNMTVSNTTITKELEMLNKFCGLSIEDYKILYLNAVEASFASPETKEILKSYANEITA >NZ_CP013847.1|WP_012704000.1|1184407_1186576_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MNRFKNIIKVYKRDIKSLNKNFIAIIIILGVCVLPSLYAWVNIKACWDPYENTSTVPIAVINNDKGTDFGGKELNVGNEMVKKLKSNDKIGWKFTNKKEADMGVIDGTYYASIEIPKDFSADIVSVLSDNPKHPEIIYKVDTKENPVAAKITGMAKNTLINEITTTFITTVNKTVFSSINEIGRNLEKNKNEIIKLKESIISMNRNMDLILAGLESVNTNSKNLNEYLSVVRTTFPEITKGLENINSKSSNTNETINQTNNIFNNSLNNINVILKQAISTNNRVQSVLDNLIVLNNESSNNEANSSIANLIMDIDSANKNIDSMIEFLEKINNTKPNTEVSKFIVSLNNVKGALNEEKQKLIKIQEIASNSSKVNENSINELKRNISNTNKQIESVMNVFNSNTRQELSTIINNFKNSIQDASKLIKAGNGLNTQIENLLATSTKGADLSAKLSKELIDKLTEYKGIIGQLSKKLELVSNDDLIQIISVLQNNPMLMSQTAAYPFNIKEEAVYTIPNYGSAMTPVYSVLALWVGTLILVSLLKTEVVDFEGSENITIRQKYFGKMLTFITLAAMQGFIVAVGNKAILGVYTVSFPLMLAFSVVSSIVFAIITYTLVAIFGKFGNALAIVFMILQLAGSGGTYPIQVDPLIFRILQPFFPFTYSIGGFREAIGGPLVSSVILDFIMLILMGGIFVLIGFFLKSPLHHKISKFDEDFKASGISE >NZ_CP013847.1|WP_012705171.1|1186601_1188761_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MKKVFRIFSRDLKNIVKHPAAIIVVLGLCFIPSLYAWINIEACWDPYANTGNLPIAIVNKDEGMMVRGKYTNVGNGIIESLKGNKKMGWVFVDEWQANYGLNEGKYYALIEIPSNFTSGLASLKTTDPQKPNIIYRVNEKSNAIATKITNAAKGSLAKEIQTNFVYTVNKEAFKLLNNTGGQLEKNKSKILGIKSTLELGNKSIGEVKNIIDDASKDSESLKQYFNDTKDKLPLITDQINNLQKATEASKNLVNETERDLNGIAKNINNDMIYRESTNSKINSILTNLKEYNNVSNNSEMIKLVDEASKLCDSINSNIDGTIKSLEIVNILKPNKIIEELINSLKNLQEKVNGEKNKLTELKNKISTSNNNKQNINQVVESILLLNDEINKNMRNTSNIFYNQTTMIIENTAKGLNNRLDTANDILDTTKLVIPQLKALGDFGVGTSDAALKDGKKINNKLAEFKKTINKLEEKTSSLTEDNLDKIINLTQKNPEQMASFISSPINIKEEEIYNTGIFGVGLTPFYTVLAIWVGVLLMSSLISVEAEEFEGEKKLTHLQVYFGKLLLFLSIAIIQGVIVTLGDVFILGIKPASMGLLMVFTIVTAITFTFIIYTLVSIFGNLGKAIAVVIMVFQIAGAGGIYPIQTNPKIFGVLQPLWPFTYAIAGFREAIAGPVRAAVIKNLGALFIFSIGSLLLVVLKKPLHKVTEYMNDKFIETGL >NZ_CP013847.1|WP_003356333.1|1189173_1189476_-|hypothetical-protein MKKKPSVKSSANLLAIVSLIMSIIVILPILNWLFKITPWQKLEGLPLFFGLLISPFGFLLGILSIKIQSNKLGKIGVIINTLLFLLPFIYMTLGVLIFGP >NZ_CP013847.1|WP_012705268.1|1189681_1190437_+|DUF4184-family-protein MPFTFSHPAIVLPLEKKWNKYFSFTALILGSMSPDFEYFIRFKPMATIGHGLIGFFLYNLPLCFILAYLFHKIIKKPLIAHGPKPIDSWYYNTALKPWRINSLTQVLVFSYSAIIGMITHVLWDSFTHKGGKFVILFEGLRKNIEILNYDIPVYKTLQHGSTLLGVIFIILYIYSKRNKHINWKTINRIPAINNKEKVSYFTTIFCTALIVLFVYISLLKVNFSIKNVGSFVVTFINGLFIGTIIASVKYR >NZ_CP013847.1|WP_012704784.1|1190680_1192810_+|DNA-helicase-RecQ MLEDAKDLLKKHFGYNEFRKAQEKVIESIIKKEDTVAIMPTGAGKSICYQIPALIFEGVTVVISPLISLMKDQVDSLKEVGIEATYINSSLNNLEIEKRIFNAREGIYKLIYIAPERLESDSFVRSLNNLNIALVAVDEAHCVSQWGHDFRPSYTKISNFIRKLSKRPIVTAFTATATETVRRDILNSLELQNPKVFVTGFDRENLSFSVIKGEDKEKFIFAYLGNNIGKVGIIYTSTRKEAESLYNKINKKGYKVGVYHAGLNDEERKKTQEDFSFDNIEIIVATNAFGMGIDKSNVRFVIHHNIPKNMEAYYQEAGRAGRDGEESECILLFSPNDIRLQKYFIDESFLSPERKNNEYNKLRAMVDYCYTSKCLRSYILEYFGEDALEEKCNNCSTCNDNREEKDITLEAQKIFSCVYRMKERFGVNMVADVLRGSKNKKLLSLDLDGISTYGIMEEFTQKDIVALMNKLIADDYMVTTDDKFPVVRLRPKSYDVLKGKETVSIKVSKIEKKVKVDNELFEILKQLRKAISQEESVPPFMIFPDATLKELSEYMPTKEEDLLKIKGIGERKAKVYGERFIEAITEYMNEKGIDINNMDNYESTKSNKESKIKTHILSYNLYKEGKTIKEIAEERNLKAITIQEHLFKCLSEGMEVDLDNFIKKDYEKLILDTIKKVGGTKLKPVKDELPPEVDYMCIKSVWYKYKDII >NZ_CP013847.1|WP_003356022.1|1192920_1193352_+|hypothetical-protein MDELDIINENQLGIAAENEKIKTDLEGQFRAETGEVGLYIAMARVAQRQGFPEIAEVLKVIAKEEAEHAARYAELNGKVSDCTKENLQKMLQGEIGSNKMKKSLAVKAKEENIDEVHDFIDEASRDEARHAKMLKGLLDRYFQ >NZ_CP013847.1|WP_003356810.1|1193635_1194181_-|phosphodiesterase MKLFFMSDIHGSAYYLEKALHIFEEEKADYLIILGDELYHGARNPLPKGYDPKKVTEILNSYKDKIIAVRGNCESEVDQMVLNYPIMSDYSIVLYNGKRLFLTHGHIFNKDNMPNISDGDALIYGHTHIPLAEKINNIFVINPGSITFPKENTPHCYGILSDNLFKIKTLEGNTFKEISLI >NZ_CP013847.1|WP_003355968.1|1194816_1195200_+|response-regulator MSSSQKNILVIDDSASIRSFVRNILEKANYKVYEACDGEEGIEVYKKCGNIDLVMTDIYMPKKSGLEVVVELQNKYKGTQIIVFSDGGKENFTNDSGVCEALGAAYFIRKDLIKDKLLDLVNIIFSK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013847_2 | 2456513-2456805 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP013847_2
|
4 spacers
spacers of NZ_CP013847_2
>2.1|2456543|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT TACTTGTGATTTTAAAATAAAGAACATTAGGTAGT >2.2|2456608|37|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGGTTAAGTCAGTAATGATACCTTACTTAGAAGATTA >2.3|2456675|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TCAAGTATCGGGAATCTATAGTTAAGCCCTTCTATT >2.4|2456741|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAAAACAATAAGTAATTCATAATTCAAAAATGAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013847_2
The CRISPR arrays of NZ_CP013847_2 >merge|NZ_CP013847|2|2456513-2456805|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTTTAAATATATCTTATGTTAATGTTTAACTACTTGTGATTTTAAAATAAAGAACATTAGGTAGTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACAGGTTAAGTCAGTAATGATACCTTACTTAGAAGATTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTCAAGTATCGGGAATCTATAGTTAAGCCCTTCTATTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACCAAAACAATAAGTAATTCATAATTCAAAAATGAGGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC >NZ_CP013847|2|2|2456513-2456805|CRISPRCasFinder GTTTAAATATATCTTATGTTAATGTTTAAC TACTTGTGATTTTAAAATAAAGAACATTAGGTAGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AGGTTAAGTCAGTAATGATACCTTACTTAGAAGATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TCAAGTATCGGGAATCTATAGTTAAGCCCTTCTATT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC CAAAACAATAAGTAATTCATAATTCAAAAATGAGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC >NZ_CP013847|2|2|2456513-2456805|CRT GTTTAAATATATCTTATGTTAATGTTTAAC TACTTGTGATTTTAAAATAAAGAACATTAGGTAGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AGGTTAAGTCAGTAATGATACCTTACTTAGAAGATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TCAAGTATCGGGAATCTATAGTTAAGCCCTTCTATT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC CAAAACAATAAGTAATTCATAATTCAAAAATGAGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC >NZ_CP013847|2|1|2456578-2456805|PILER-CR ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC AGGTTAAGTCAGTAATGATACCTTACTTAGAAGATTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TCAAGTATCGGGAATCTATAGTTAAGCCCTTCTATT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC CAAAACAATAAGTAATTCATAATTCAAAAATGAGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
>NZ_CP013847.1|WP_012704223.1|2455700_2455892_-|hypothetical-protein MGKTLRFEIVSNIIKNKEVENDLNYNTYAYFYDNVRKAMYGKEYCIKKNKNTLIHKPILKFYI >NZ_CP013847.1|WP_012705753.1|2455253_2455547_-|hypothetical-protein MSFFTLNILIGAMAFIINKINNISQNIDSFEAFNDIQKSLEEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIVNYFNRAAG >NZ_CP013847.1|WP_012703796.1|2454407_2455205_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIKVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSIRRIEELLNKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLYTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >NZ_CP013847.1|WP_012704237.1|2452313_2454311_-|FAD-dependent-oxidoreductase MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERVHAYGSKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGVEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGGSLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLVVGGGVAGMEAARVAAIRGHKVTLIEKNGYLGGNIVPGGVPDFKDDDRALVKWYEGILKDLDVEIKLNVDASRENIKEFGADEVLLATGSSPRILTIEGADDVYSAEYVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETALWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLNDLIKFNKINVKTGSYISKKTDKGFVLNTNGQESIINADSAVVAIGYLSEKDLYNEVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >NZ_CP013847.1|WP_012704314.1|2451681_2452203_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKVLVPVIIILSLNLIGCGVNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANEYSAGFSLQTTKEPYEITVNYKTNENLGEENYNKFWKDKKVEELLEKNSVVLLYLIPNAKIIKFNVENIGEESYKYDRKNLEQKYGNLKSLFKDNDSLNKFLNN >NZ_CP013847.1|WP_012704753.1|2450490_2451381_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIEYIEEHIKEPLTVNQITKEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRKLSLSTIDLLEDQKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFGCSPTQYIKKMKSYYKSENNLILGKFMNDPYIVKKHGFKVAGYGIKTNAADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDVTYLLGVVVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVDSKDQREFAKIIKESWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRSDTVMDIYVPIKKLGR >NZ_CP013847.1|WP_012704151.1|2449743_2450484_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERSFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEEFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIPDREEYLENCHVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGGNLLDKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDKNSETFLYECYI >NZ_CP013847.1|WP_012704625.1|2448233_2449640_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPASKDKKTSTESVSTKSTEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGGFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTIGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NZ_CP013847.1|WP_021106877.1|2447549_2447903_+|aminopeptidase-P-family-N-terminal-domain-containing-protein MHLFINENKLNDEIKSNLKENGALFIHSYNKIYKEVKKFTNSDVVLVHPDRMNYALYNNIDKEVITEISSSNKLDTFPAEQGRFIRLSFKPISSFGEHATIVTCILLMENSFMIVTV >NZ_CP013847.1|WP_012705614.1|2446624_2447239_-|sugar-O-acetyltransferase MNQKDRMLAGLPYKACLDGLPEERMENKKKIYEYNHCFPDEHEKIHKLIRDILGEAGADVHIEAPFYCDYGKNIQVGDNFFANYNCTILDVGKVIIGNNVQFAPNVSLYTAGHPIHPDSRNSGYEYGIGITIGDNVWLGGNVVVNPGVHIGNNVVIGSGSVVTKDIPDNAIAIGNPCKVIREITEEDRKYYYKNYEFDVDDYKG >NZ_CP013847.1|WP_012705563.1|2457346_2458282_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNLSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGAVETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGQVFEDIRTAAELLSLDIADIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDAISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIAEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGLIELPTL >NZ_CP013847.1|WP_101526869.1|2458606_2460088_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MNIKIDKTSLITITQQLVHYFSDRIMSGFIKAGQKLPSIRSLAKELGISPMTIIKAYNNLEQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLGLIQNDIKLLSQYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMEAPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSKRKAELLDIARYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKTIKSIDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESRLIAAKANHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIESLNKQLVKRRDKVISLLKSHAPSGMKWAIPEGGINIWITLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII >NZ_CP013847.1|WP_012704637.1|2461137_2461590_+|hypothetical-protein MSKLNPEKLSVEFRDGVTNTEPILGGRYTLTHSDITAELFLTIGLTYAYDKIDAMRDEVLGEWIEKEKNCLFHVYLHVDGNNPIVTGVRNHIFRRELPLALEAIRYGDRKFFSFHPKLDNSPIIVHFISSYPSFNRIEKWGTFSDYFLKK >NZ_CP013847.1|WP_012705096.1|2461671_2462118_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSLGEKLLYLRKKAGLSQEDVAEKLSVSRQTVSKWETDQTVPELNKAKLLSELYNVSYDYLIGESHISGDVTGIEMIVDEIDWTGAWSKKYPILASYPGIKGINTYSEKISELYDSFKNDFGFNDTDTVLVLKDILYQKYKMGKKKTK >NZ_CP013847.1|WP_012704438.1|2462285_2463317_-|alpha/beta-hydrolase MKKVIKVGSVILIILVIAGFFIIKNLTETKDDKLNMYVAANLQLYKILNPKSLNSKSIEETRGALNKQSTRWSNKPIPFSNIKNLHIKMNNEKIPVRIYTPEKGSNFPIIIYSHGGFWIGGNVDTIDGVCRKLSQNTKAIVISVNYRLAPENPFPAGLNDVYNVLQWTYKNGKSINGDEKHIAVVGDSAGGNLSAAVSSMSRDKNGPPITCQVLIYPSTNISELNSKSWSYFSNSFNVSTEDMEKYISIYAPKKEDRKDPYGSPLLSKDLSKLPDTLVVTAEIDPLRDEGEAYANKLKESGVKAEVTRYKGITHGFITMDKITNKADEALNQISLYIQKEFQK >NZ_CP013847.1|WP_012705596.1|2463582_2464935_-|amidohydrolase MNQILIKNGYIITMDSSKKIFEKSDILVEDSKIITIGNVESELIKSSVEIIDANGKIIMPGLVNTHVHLSQQLARGLADDVDLLTWLRKRIWPYESNMDLEDSYISSLACCTELIRSGVTTFCEAGGQEVDGMGKAVEQAGLRGILCRSTMDCGDGLPLKWQETTEESLEKQVELLEKWNGKGDGRIKYWFGLRTIFNTTDKLITKTKELADKYKVGIHMHVAEIEEEVRYAEATRGETTVQHLAKLGVLDKNFLAVHTVWLTEQEIDLFKLHNVKVSHNPGAAMKVVLGFARIPEMLEKGINVSIGTDGAPSNNRMDMFDEMHLTSLIHKGRRLNPKVVPADEVLEMATMNGAKCALWEDEIGSLEVGKKADLIIINPKSIGSLPMHDPIGNIVYSMHSSDVESSMCNGKWLMKNKVLLTINEEDIIREVQERATALVKKAGIVLPKRF >NZ_CP013847.1|WP_012704006.1|2465010_2466354_-|purine-permease MKNTKDTNLIVGIDEKISLRYAFFLGLQHVFAMDLYIVPIILAGILSLDAQNTAYFIQMSFIAAGIATLIQTGLCMRLPIMQGPSYIPIGALAAIGSKLGLQAMVGSLIPGSLFLMILGYPLRFLSKIISKFIPHIVGGTVIVIVGISLMPVAMTNIFTAPGNLKINCILALISSALLVSCMMIGRKSNKFGKAVRLTSVMISLIGGTIAASLLGVVDFTPVTKAAWFSFPKLLPFGKPVFDLKAILTMLFIYAVILVETSGTWFAVSAVTGSELTDEGLNRGAVGEGIGCFVGALFGGTPMTGYSTNAGIIAVTGVGSRMAIIAGGIILVALGMLPKLMNVIACIPSAVVSGVFAVVCVIIAMNGFKSIQHEEFDERNMLLIGLPILLALGTTVLPKDILNSLPSLANYIFSSGITVGVLAAVILNILLPKAPVEVSKSQEYEEAV >NZ_CP013847.1|WP_012704678.1|2466791_2467691_+|hypothetical-protein MSNKRNLQSIRSFYLCILIFNIVYSSIFHLNNKGFNIKLFGDLTMRSVVLFTLNSILFLCVVIAVEKKININEEIKTQVSMKIRPLYLVDIFFITYILVCIFLLKNLDVILSSFVMEIIYIGILILTKKIMTLELTDRQLQWQNTCGYIDENCEKSSFLWRFKIWYSPHINVPFKNRWKDPSRLLYDLALVYGIFISKGTLFSLLLLILLFPDVLSWIEGLLGLQTSLTGMCTGITEHHSKNSHVIYHKVYVTDYKNKREITFYVDGPLFIHENSNMTVVHGTFSKRVLYVEGLNLDIR >NZ_CP013847.1|WP_012704772.1|2468030_2469353_+|APC-family-permease MLEKKYGLWTTVSMVIGIVIGSGVFFKADNILMASGGNVKTALLAWLVGAISMIFGALVFAECANRFERSNGIVDYAEGMLSEKFAYLIGWFNGIIYYPAIAAVLAWAAGNYTAILFNKDGNFVWIMAAIYMIGIYILNYISPILSGKFQIASTAIKLVPLMLIAILGTFQGLNNGILIENFSKVSTIGDSGSGFAAAVLGAAFAYEGWIIATTINGEIKDAKNTLPKALVFGSLVIVIIYILYFLGIVGMIPTETILKQGDNTVNVAARTVFGNFGASILTTFIIVSCLGTLNGLILGGSRSFYSLAIRGQGIKPEAFSKLDSKTNIPTNSTIANFILICIYLVVWYMNFKGIFPNKMFVDISELPIALIYGIYIIIYIAYMMKMKDLSFIKRFVIPSLALMGALIVVYGGLSKPSVIIDLGISVFVFLSGLLFYNKKK >NZ_CP013847.1|WP_012705326.1|2469420_2470155_-|protein-kinase-family-protein MVIKFFKRDTKYLPEQKIHGYTVLKILGEGRFGICYLVQSNNKQYILKQLKTKMLKKIGSKVIYEQEILKNINHNCIPKFIKTLQFKKFFGYVLEYKEGKTFEEIICEDEYVFKREEIYDICIQIIEILKYLHKSGIVHRDIRIPNTIYYKKKVNLVDFGLARWINNKRYIENVDFSYLGDFLLHLYYTSFQCKTFKGKPWYEELDLFSEEMNFLKRLLEIEKKYKNIEEVERDFLLLKSNYNK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013847_3 | 2460584-2460808 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP013847_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP013847_3
>3.1|2460614|35|NZ_CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder GCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAA >3.2|2460679|35|NZ_CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder GAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGC >3.3|2460744|35|NZ_CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder AGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCA >3.4|2460605|44|NZ_CP013847|CRT ATGTTCAACGCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAA >3.5|2460670|44|NZ_CP013847|CRT ATGTTCAACGAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGC >3.6|2460735|44|NZ_CP013847|CRT TTGTTCAACAGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013847_3
The CRISPR arrays of NZ_CP013847_3 >merge|NZ_CP013847|3|2460584-2460808|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTGAATACATCTCATGTTAATGTTCAACGCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAACGAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGCATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAACAGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCAATTTAAATACATCTCATCTTATTGTTCAAC >NZ_CP013847|3|2|2460584-2460808|PILER-CR ATTTGAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC GCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC GAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGC ATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAAC AGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCA ATTTAAATACATCTCATCTTATTGTTCAAC >NZ_CP013847|3|3|2460584-2460808|CRISPRCasFinder ATTTGAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC GCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC GAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGC ATTTAAATACATCTCATGTTATTGTTCAAC AGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCA ATTTAAATACATCTCATCTTATTGTTCAAC >NZ_CP013847|3|3|2460584-2460799|CRT ATTTGAATACATCTCATGTTA ATGTTCAACGCAGATACTCTTAAACAAATAAAATCATATCATAA ATTTAAATACATCTCATGTTA ATGTTCAACGAGGACAGATGGCGTGGTTCTTATGAGAATTTAGC ATTTAAATACATCTCATGTTA TTGTTCAACAGAAACCCTTGTGGATGTGGTTCTAATGTTTTTCA ATTTAAATACATCTCATCTTA
>NZ_CP013847.1|WP_101526869.1|2458606_2460088_+|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MNIKIDKTSLITITQQLVHYFSDRIMSGFIKAGQKLPSIRSLAKELGISPMTIIKAYNNLEQNGLVTTIQGKGTYVNERNSTVKSNNITEKDSFQWQMSVPDYLSRSQFRYNPNLSYSNDYYNLSVASLNHKLLPTKTILKDSLGLIQNDIKLLSQYPPAQGDYEFRNIMSQYLRSKEIATSPENILVTSGSQQGISLIASTFIGPGDIVVMEAPTYPGAIDLFKCRGAVILTVPVDSEGMRTDILMNLCDKHSPKLIYTIPNFHNPTGYSMSSKRKAELLDIARYNDILIVEDDPWNEISYKREKIKTIKSIDTDGHVVYIKSLSKILGPSYRLAVIISESRLIAAKANHDLGTSVLIQKTIINFIQSNKITYYIESLNKQLVKRRDKVISLLKSHAPSGMKWAIPEGGINIWITLPKNFNVEKLLSYSITTKNISFLPGTICYPNEVEFNNLRICFTYLDEEFIEDTIIELCNLIKLLYTTKNITDYRPII >NZ_CP013847.1|WP_012705563.1|2457346_2458282_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MRKFEYTLVDVFTNQVFGGNQLAVFKDAEKLSSEEMQSIARELNLSETTFVTDIGPNHKKLRIFTPKTELPMAGHPTIGTAFVLADEGAVETREGINKLIFEEGVGEIAVSIHVEGGRIRSIEMEQPMPVFGQVFEDIRTAAELLSLDIADIDTTSPIQTVSTGVPFLYIPLKSLDAISKIKLRLDTWEKFFSASEDTKHIFAFTRETLHAGSTIHSRMFAPAMGIAEDPATGGASGPLGAYLVEHGLVAHGLVAHGYDGKYMIINEQGIEMGRPSFINITVSKTYNNFSEIKIGGTCVKFGAGLIELPTL >NZ_CP013847.1|WP_012704223.1|2455700_2455892_-|hypothetical-protein MGKTLRFEIVSNIIKNKEVENDLNYNTYAYFYDNVRKAMYGKEYCIKKNKNTLIHKPILKFYI >NZ_CP013847.1|WP_012705753.1|2455253_2455547_-|hypothetical-protein MSFFTLNILIGAMAFIINKINNISQNIDSFEAFNDIQKSLEEIDNEKVTNFVNGLINASMSNPSIGYFFMFLVYMTPVLNLLLLIKGIVNYFNRAAG >NZ_CP013847.1|WP_012703796.1|2454407_2455205_-|MerR-family-transcriptional-regulator MRYSITDLAEILGCTTSAIHYFEKEHLIKVEKGKNGHRYYNVVDVFRLLSYTKYRSMEIPMKTIIAQFGGEENNYKLIEEREAMYQLEALKRAQYYMNLADAIGEHLVSIRRIEELLNKYEFAKSPEVTIMCDDECGWLSKKRSSQRIIHEWVKAMPTVQLGVFDSRMGISNFGYLVKTKKREELELPLGLYTKQLKSTSCIHTIVMADEDFTQHPQKVFKKASEFAIKKGLEIGEIAWGKILLVEVEKGAKLHPYIELWISIKI >NZ_CP013847.1|WP_012704237.1|2452313_2454311_-|FAD-dependent-oxidoreductase MKDKYKVLYDPIKIGKLEIKNRYVLAPMGPGGMCNADGSFNKRGIEFYVERAKGGTGLIMTGVTMVENNIEKCALPSMPCPTINPLNFITTGNEMTERVHAYGSKIFLQLSAGFGRVSIPSIVGKVAVAPSKIPHRFLPGVTCRELTTEEVKEYVKAFGESAEIAKKAGFDGVEIHAVHEGYLLDQFAISFFNHRTDEYGGSLENRLRFACEVVQEIKKRCGQDFPVSLRYSIKSFIKDWCKGGLPDEEFEEKGRDIPEGIEAAKILVAAGYDALNGDVGSYDSWYWSHPPMYQKKGLYLPYNEILKKVVDVPIITAGRMEDPELSSDAILSGKTDMIALGRPLLADAEIPNKIFEDKYDKVRPCLSCQEGCMGRLQNFATVSCAVNPACGREKEYGLKKAEQIKKVLVVGGGVAGMEAARVAAIRGHKVTLIEKNGYLGGNIVPGGVPDFKDDDRALVKWYEGILKDLDVEIKLNVDASRENIKEFGADEVLLATGSSPRILTIEGADDVYSAEYVLMERKNVGEKVIVIGGGLVGCETALWLKQQGKEVTIVEMQNDILQVGGPLCHANHDMLNDLIKFNKINVKTGSYISKKTDKGFVLNTNGQESIINADSAVVAIGYLSEKDLYNEVRFDIPNARLIGDANKVQNIMYAIWSAYEVAKNI >NZ_CP013847.1|WP_012704314.1|2451681_2452203_+|DUF4825-domain-containing-protein MKNKLKVLVPVIIILSLNLIGCGVNSEKKSKENIKNSSKVETYDLIKYKGTYVGDNSSVGSIIKNLPANEYSAGFSLQTTKEPYEITVNYKTNENLGEENYNKFWKDKKVEELLEKNSVVLLYLIPNAKIIKFNVENIGEESYKYDRKNLEQKYGNLKSLFKDNDSLNKFLNN >NZ_CP013847.1|WP_012704753.1|2450490_2451381_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNYRKDIENCIEYIEEHIKEPLTVNQITKEIGYSSYHFCRVFSFLKGMPLMEYVRKRKLSLSTIDLLEDQKIIDVAFKWGFETPSSFARAFRKEFGCSPTQYIKKMKSYYKSENNLILGKFMNDPYIVKKHGFKVAGYGIKTNAADSKYTKDVASFWSNYNGENLESKLYKILSPLKHGEVGLCIPCSDSGDVTYLLGVVVEDFSKVTSDMITVEVPKAQYAVFTTNPVNTVDSKDQREFAKIIKESWKYIFDEWFKNNDYEYDEEKLDFEFYDERCHLRSDTVMDIYVPIKKLGR >NZ_CP013847.1|WP_012704151.1|2449743_2450484_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MINYYGSLCTVMYELLHPHAPEDELQFYLQYAKKEMKILEPLCGSGRFLVPFLERSFNITGFDMSEEMLKELYKKAPKAKVFQSSIEEFSPKEKYDYIFITSGSFSLFLDEDIAFNVLVKMKEALAPKGKFVFAAETTANIIPDREEYLENCHVKTKEGYDIIFKSKSFYDKHKKILSTPSLYELYDGGNLLDKEEMDFRIKLYDFGELDKLILKAGFKGSHVFSDFNRRESIDKNSETFLYECYI >NZ_CP013847.1|WP_012704625.1|2448233_2449640_+|peptide-MFS-transporter MSEKKQKHPIGLWLVNISIALQSYAAYAVVSILILFLTADVSKNGLGLSVPKAAAIIGLYQGINYMGSLVGGYITDKWLGIQKSLILGCFLTACGYLALFFAKPNIGSVWLGLIILIVAGAFFKAQISSLVGELYGKNELSKKDAAYSIFYMFINIGAFFGPIIAGLISDKWFAKVAADGEIAAYGYKYIFLMCTLIMIFIGIFIWIVSPKWLGEIGKYPASKDKKTSTESVSTKSTEKAKAQPLTQLEKNRIKAMIVMFVFVIIFWSAWDQTATSFSLLANKLVNRTIGGFTMPVPWLTSINAIFCVVLSPIIANIWLKLGNSKKGDLSVPTKMGLGMILTGIAFLTLILGISTLGGVLDGSKQMNILFIIVAYFLLTIGELCLSPIGMAMFNKLAPAKYGSLAMGAWYLSFFFSSIISGKLAGFTDTLGYTQIFGLISGIVIVFGVILILLRNGLLKLMSLDELDK >NZ_CP013847.1|WP_012704637.1|2461137_2461590_+|hypothetical-protein MSKLNPEKLSVEFRDGVTNTEPILGGRYTLTHSDITAELFLTIGLTYAYDKIDAMRDEVLGEWIEKEKNCLFHVYLHVDGNNPIVTGVRNHIFRRELPLALEAIRYGDRKFFSFHPKLDNSPIIVHFISSYPSFNRIEKWGTFSDYFLKK >NZ_CP013847.1|WP_012705096.1|2461671_2462118_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MSLGEKLLYLRKKAGLSQEDVAEKLSVSRQTVSKWETDQTVPELNKAKLLSELYNVSYDYLIGESHISGDVTGIEMIVDEIDWTGAWSKKYPILASYPGIKGINTYSEKISELYDSFKNDFGFNDTDTVLVLKDILYQKYKMGKKKTK >NZ_CP013847.1|WP_012704438.1|2462285_2463317_-|alpha/beta-hydrolase MKKVIKVGSVILIILVIAGFFIIKNLTETKDDKLNMYVAANLQLYKILNPKSLNSKSIEETRGALNKQSTRWSNKPIPFSNIKNLHIKMNNEKIPVRIYTPEKGSNFPIIIYSHGGFWIGGNVDTIDGVCRKLSQNTKAIVISVNYRLAPENPFPAGLNDVYNVLQWTYKNGKSINGDEKHIAVVGDSAGGNLSAAVSSMSRDKNGPPITCQVLIYPSTNISELNSKSWSYFSNSFNVSTEDMEKYISIYAPKKEDRKDPYGSPLLSKDLSKLPDTLVVTAEIDPLRDEGEAYANKLKESGVKAEVTRYKGITHGFITMDKITNKADEALNQISLYIQKEFQK >NZ_CP013847.1|WP_012705596.1|2463582_2464935_-|amidohydrolase MNQILIKNGYIITMDSSKKIFEKSDILVEDSKIITIGNVESELIKSSVEIIDANGKIIMPGLVNTHVHLSQQLARGLADDVDLLTWLRKRIWPYESNMDLEDSYISSLACCTELIRSGVTTFCEAGGQEVDGMGKAVEQAGLRGILCRSTMDCGDGLPLKWQETTEESLEKQVELLEKWNGKGDGRIKYWFGLRTIFNTTDKLITKTKELADKYKVGIHMHVAEIEEEVRYAEATRGETTVQHLAKLGVLDKNFLAVHTVWLTEQEIDLFKLHNVKVSHNPGAAMKVVLGFARIPEMLEKGINVSIGTDGAPSNNRMDMFDEMHLTSLIHKGRRLNPKVVPADEVLEMATMNGAKCALWEDEIGSLEVGKKADLIIINPKSIGSLPMHDPIGNIVYSMHSSDVESSMCNGKWLMKNKVLLTINEEDIIREVQERATALVKKAGIVLPKRF >NZ_CP013847.1|WP_012704006.1|2465010_2466354_-|purine-permease MKNTKDTNLIVGIDEKISLRYAFFLGLQHVFAMDLYIVPIILAGILSLDAQNTAYFIQMSFIAAGIATLIQTGLCMRLPIMQGPSYIPIGALAAIGSKLGLQAMVGSLIPGSLFLMILGYPLRFLSKIISKFIPHIVGGTVIVIVGISLMPVAMTNIFTAPGNLKINCILALISSALLVSCMMIGRKSNKFGKAVRLTSVMISLIGGTIAASLLGVVDFTPVTKAAWFSFPKLLPFGKPVFDLKAILTMLFIYAVILVETSGTWFAVSAVTGSELTDEGLNRGAVGEGIGCFVGALFGGTPMTGYSTNAGIIAVTGVGSRMAIIAGGIILVALGMLPKLMNVIACIPSAVVSGVFAVVCVIIAMNGFKSIQHEEFDERNMLLIGLPILLALGTTVLPKDILNSLPSLANYIFSSGITVGVLAAVILNILLPKAPVEVSKSQEYEEAV >NZ_CP013847.1|WP_012704678.1|2466791_2467691_+|hypothetical-protein MSNKRNLQSIRSFYLCILIFNIVYSSIFHLNNKGFNIKLFGDLTMRSVVLFTLNSILFLCVVIAVEKKININEEIKTQVSMKIRPLYLVDIFFITYILVCIFLLKNLDVILSSFVMEIIYIGILILTKKIMTLELTDRQLQWQNTCGYIDENCEKSSFLWRFKIWYSPHINVPFKNRWKDPSRLLYDLALVYGIFISKGTLFSLLLLILLFPDVLSWIEGLLGLQTSLTGMCTGITEHHSKNSHVIYHKVYVTDYKNKREITFYVDGPLFIHENSNMTVVHGTFSKRVLYVEGLNLDIR >NZ_CP013847.1|WP_012704772.1|2468030_2469353_+|APC-family-permease 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| NZ_CP013847_4 | 2564260-2564746 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of NZ_CP013847_4
|
7 spacers
spacers of NZ_CP013847_4
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013847_4
The CRISPR arrays of NZ_CP013847_4 >merge|NZ_CP013847|4|2564260-2564746|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAATAATACATCTCATGTTAATGTTCAACTAACATTATAGTTTTAGAAGATTTTCAAGGTTTTAAATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAACATATTGTAGTAAATGCACAAGTAAAATAAGCAAAAATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACTTTAATGAATTATTACTACAATACTATAAAGAATATTTAAATACGTCTTATGTTAATGTTCAACTGACTTCTCTATTTAGGGAATTAATGATTAAGTATAATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAACTCACAAAAGAGTAATACTAATGTTCAACAATTAGGATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAACGAATTTTTGGTTAAGAACTCTCGAGGATATTAACTAATTTAAATACATCATATGTTATTGTTCAACAAAATAGGTGTAGAATATGAACCAATTTTAACTACATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC >NZ_CP013847|4|4|2564260-2564746|CRISPRCasFinder TTAATAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TAACATTATAGTTTTAGAAGATTTTCAAGGTTTTAA ATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC ATATTGTAGTAAATGCACAAGTAAAATAAGCAAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC TTTAATGAATTATTACTACAATACTATAAAGAAT ATTTAAATACGTCTTATGTTAATGTTCAAC TGACTTCTCTATTTAGGGAATTAATGATTAAGTATA ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC TCACAAAAGAGTAATACTAATGTTCAACAATTAGG ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC GAATTTTTGGTTAAGAACTCTCGAGGATATTAACTA ATTTAAATACATCATATGTTATTGTTCAAC AAAATAGGTGTAGAATATGAACCAATTTTAACTAC ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC >NZ_CP013847|4|4|2564260-2564746|CRT TTAATAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC TAACATTATAGTTTTAGAAGATTTTCAAGGTTTTAA ATTTAAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC ATATTGTAGTAAATGCACAAGTAAAATAAGCAAAA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC TTTAATGAATTATTACTACAATACTATAAAGAAT ATTTAAATACGTCTTATGTTAATGTTCAAC TGACTTCTCTATTTAGGGAATTAATGATTAAGTATA ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC TCACAAAAGAGTAATACTAATGTTCAACAATTAGG ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC GAATTTTTGGTTAAGAACTCTCGAGGATATTAACTA ATTTAAATACATCATATGTTATTGTTCAAC AAAATAGGTGTAGAATATGAACCAATTTTAACTAC ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC >NZ_CP013847|4|3|2564521-2564746|PILER-CR ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC TCACAAAAGAGTAATACTAATGTTCAACAATTAGG ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC GAATTTTTGGTTAAGAACTCTCGAGGATATTAACTA ATTTAAATACATCATATGTTATTGTTCAAC AAAATAGGTGTAGAATATGAACCAATTTTAACTAC ATTTAAATACATCATATGTTACTGTTCAAC
>NZ_CP013847.1|WP_012704359.1|2563468_2564017_+|hypothetical-protein MIDNIINSQRYLNINNKKNTIEQNDQPEDNKFEKYLSDYIPKYTGDEGISKKCNYKEMTVFEKRIFDHYMQTDFLYGVSYEDFKKTLCGFPPVDAPKSIIEAYQNTISKYPENQRKKIMGELSYLESPNDNLDMGTIIKNAIEHCKLVEIITGQSQKHRENLYEDFLNEFNKVNTIDDSHNA >NZ_CP013847.1|WP_041173666.1|2562857_2563028_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MREYLMDQKAFAEMLGIKKSTYNTIELNKVQGNAETLLTIAKALNRKVEDIWYLED >NZ_CP013847.1|WP_012704190.1|2562500_2562668_-|hypothetical-protein MAERLRVVLEFKKSDLDELQLYGKLLKFSNPAAVVKDILKGTLPIKILYEEELKK >NZ_CP013847.1|WP_012704064.1|2561736_2562141_-|hypothetical-protein MKICVIYSNTKVEDFKNKQRIKYNSNMELVAKHINTDNKLKRQAVFVLGSLFYVQDVVSAASDLGKIDKAGNTILGIVRKIGYWICIVGCIIDIIKSLMQGDTKSIAKIMMKYALAFAALYIFPWMLDLIKGIF >NZ_CP013847.1|WP_012704661.1|2561487_2561724_-|hypothetical-protein MEWVQKFIERGQYNAPQDTFVFRSKLLDVLSTNAYWICMFVGIGGILAYLCGYKKGGKLTKFSVVIYWVVAAICSTGK >NZ_CP013847.1|WP_061315794.1|2559151_2561506_-|hypothetical-protein MFNRKIKSMPLKDYFQIQKPTYKILKLTPDTSIRNYNSSNIAKAIQYMYKSITQRIHREEKKFIIQTPVKCSYMIDIQKNNVDFYFIVPERYLGLIREKITETWPKVTIEEVTQVKQFSQQAIKYQLNYSKEDALSLNINKKSNEPLNSILNVLDIMQEGDRVGIFYNFIPVVQKGWRKEYKDTIDKIKENKLIDREKFNVKYIIKEGIILLVNLAQDLFDTIGEFVGAEKKKEASTLAEIAVSSLMLEDKKKLSRNTVNKKDAIVLNTQMLILSESKDIKRQENNAVAVLEGYNTVSEDNELIYKKISKKNTFYVTDFKIAGVEENKLSTEECQNLLQLPGRDLLQQHKTIEKINTLETEVPEELRNGTKLIGINEYKGSKQNAYLTIDKDYKNLAVTVVGPTRSGKTSFMGNVARNSIDAGECVIVLDYIENCSLSDDIKACIPSNKVLEINLYNHDKLQGLGYNEAISASDNTFIQYESAKKQTSQLITLINSINVSNSDFTPKMERYLTAASLVSFINNGAIKDVFKILQNHKFRKECIDTIPENQSENLEEYAEYLRELDEWSKGTKDNPSQIIGTHSSYITGIIDRVQKLKSNTYMELMLKKDCSENINLLEEMEKNQAIFIKMPENMFGTPEERDIMTTYWLTKIWMCAQARAWKIKDRYARKTVTVFTDEIAQLKSSEQFIGNKLDQTAKFGVKFILSTMYINQLRIREKLRTANTSYILISGSDKVNYMELKDELNQFGYELEDLMNLKRFHSLNYIKYENGYWAGITKLPPPIK >NZ_CP013847.1|WP_012704654.1|2558793_2559144_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDLALKLGLNEKQGRYIIKDYETRGLYPPPELSIKLAKIFNLNTKYFYDEYYGFLDMDYPNIIKNYRLENNLSKTKLAKLLSTTYETIIRWEKGENISRQYYKKLNKLMQLTTKEP >NZ_CP013847.1|WP_012705016.1|2557963_2558152_+|hypothetical-protein MSNCEKMQTHVHEFLDSTRLAEIQTEPHNHRFAGVSGQAIRRGSSHEFIFATLINSPISQEA >NZ_CP013847.1|WP_003384483.1|2556947_2557151_-|hypothetical-protein MGVENPTCHVRILNDETKESVYHWRKEINIVEIEAIKISKKVYCNNQYYDIKTLVFNYDNLTLEIII >NZ_CP013847.1|WP_012705041.1|2556390_2556588_-|hypothetical-protein MIEKEIAIEIAKEDAEEDAEESAKENAKEDAEENAKEDVEENAKEDAEENVKEDAEEDVVEEKSV >NZ_CP013847.1|WP_012703837.1|2565200_2565431_-|hypothetical-protein MKKIVISLLTALILGVNVSSAYAAESCPRCGATVGRGENHKCCDYLGHDFKPLHDFHGKLVCMACRNCGYTIPYNN >NZ_CP013847.1|WP_041173633.1|2565788_2566337_-|hypothetical-protein MTGKKEVLINFLERWGVLISVILTLIVTLYFKFEINKLKHYEQLFSNTITFVSILIGVLMSLMGFLLGFSDEKVVIRIKENNGDKILIKYFIKPIIAGIIIVIMSLVLEMIYGQNISNISQRVYILISVIWSVLCVLFLSSTFRVSLLMYLILTKIFDEADNKGINTNEKGNVTFDNPEDIY >NZ_CP013847.1|WP_012705094.1|2566348_2567338_-|hypothetical-protein MVNKKPKFKQRFFNVDFLRLYIKKNNHDESEPYNLSKQLSEIEKIDTKERVIFYNGDTVRLQSIERLTETFDNLENCKDLWKLTFIRLKDSELLGVADEEGNYDEEKLKDALEDKQHLASPTPCIYDGEKNIFIIARNREGVFPTAILQFLSKMLKDILGDNGLHFAIIPNEKGLKVDDTIIYKNVEITIDNIKKYTDEQNKLLKKHAGTIYSMINSGKGFGINKVKVRLSASLKKEDSMDKLLVSNELTGLNELRDTPGLGFENIKNLEVDVKESSGTKIETIDLINNKIRDNFSIKFEKGDTIKVREVYTRLLGSYSNKFKIISAKI >NZ_CP013847.1|WP_012704593.1|2567585_2568347_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKIGIDCGHTMSGADYGAVGIKAESNLTREVGTKVISKLQALGHTVIKCYKDSCSGLNDSLSYRTNAANNNNVDLYVSIHFNCFNGSAYGTEVFTYGGKELLEARRVLNNICALGYTNRGLKDGSSLYVLKHTKAKAMLIECCFCDNAGDMNRYNAENMANAIVKGLVGKTTSNSTPSKPTSNNDSWINLDGKTGTINTPSGVNIREKKSTSSRILGALPNGAKVNLYRKEGDWMHIYYPPHGGYVYAKYIRY >NZ_CP013847.1|WP_012705426.1|2568384_2568579_-|hypothetical-protein MKFLEQFLQIKKIIALLTTIVFCILSAKGNLSSTEFLSVFTLIIGFYFGQSSARQAVKESKEQE >NZ_CP013847.1|WP_012705558.1|2568595_2568850_-|hemolysin-XhlA-family-protein MELKICEEKHKRIEEKINVHDIRLNDHSKRIDKIEQSQSRTDAKIENLCDQLKQLVGIMKWYVGLTVGGLVSFFLYAIQHNIFK >NZ_CP013847.1|WP_012704381.1|2568956_2569118_-|hypothetical-protein MEINMVIVRICAERIVNNGLNPKTSKTYIIDDVTNTDYREAIEDYILQNTPEV >NZ_CP013847.1|WP_012703739.1|2569117_2569414_-|hypothetical-protein MKRGSLIIYDNTGKIWINTGDAEGDVLPHTLPDGLPYIITEFGELNNKIVKGIDVETKELITEDIPHIETQEERLKREKQELENQLMLQADNNIGGIL >NZ_CP013847.1|WP_012705275.1|2569429_2570596_-|phage-tail-protein MAEKFYTLLTEIGKAKIANSAGFGSKINFVKMKVGDGGGSYYNPREDQEDLINTVWEGNITHVAIDEKNPNWINVEMMIPANVGGFMIREYGVFDEDNNMLAIAKCAESYKPLAEDGSTKELIMKMVLTVSNTENITLKIDPTIIFAKKSEIEILENKIKNIKIPVTSVNSKTGAIELKASDIKTEDGKTIESQLDDITTDNKRLTKDKTITGAINELFTSANNGKKLISDVVGNPLLATDTFQQQHDKIQILKNTFVTNLSKKEQGASSTENLQDLINKINNINVGKKWAEGTGKARESSNKEVCMSVTDLDFSPKTVIINTRSDTYREPYIAIDCTLFKYKTQGWYSGGYIILDDGYVHKNNRGFDFYASNGHISKDTTFQWIAFE >NZ_CP013847.1|WP_012705217.1|2570598_2571234_-|YmfQ-family-protein MIKSKKGKEMITYVSPIYEQSKVIQSIFEAIGYEWDTAGLLANDILKQFFPQTATWGLIYWEEAVNVVNNPTEEIERRRRKVIAKLQSRYAINPKRMALILKNYTGADILITEDIAPYTFEVKLTGREGFPKSLEDLYKEVKKIKPSHLSVKYKLISLTESNLYIGATSFSGETITVYPWTPNNIETTGNIEIALAQNAGLETITTYPKEG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
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III-B
Consensus repeat of NZ_CP013847_5
|
5 spacers
spacers of NZ_CP013847_5
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013847_5
The CRISPR arrays of NZ_CP013847_5 >merge|NZ_CP013847|5|2656926-2657285|CRISPRCasFinder,CRT TTAATAATACATCTTATGTTATTGTTCAACAGCCTTACACAGAAAATGCTGTTATAATAATTAGACTATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAACAATTATGGCTAATGGATTTGATACTACACAATTAGAATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAATAGAAGCTCATAACGATACAAGACCACTAAAAAAGAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATTAACAGTGAAAGTTCTATAACATCAAATGTAAAGAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAATTAATACATTAAAAAAATACAAAGCATATCTAAATGGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT >NZ_CP013847|5|5|2656926-2657285|CRISPRCasFinder TTAATAATACATCTTATGTTATTGTTCAAC AGCCTTACACAGAAAATGCTGTTATAATAATTAGACT ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAC AATTATGGCTAATGGATTTGATACTACACAATTAGA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAAT AGAAGCTCATAACGATACAAGACCACTAAAAAAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TAACAGTGAAAGTTCTATAACATCAAATGTAAAGAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT TAATACATTAAAAAAATACAAAGCATATCTAAATGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAT >NZ_CP013847|5|5|2656926-2657284|CRT TTAATAATACATCTTATGTTATTGTTCAA CAGCCTTACACAGAAAATGCTGTTATAATAATTAGACT ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA CAATTATGGCTAATGGATTTGATACTACACAATTAGA ATTTAAATACATCCTATGTTAATGTTCAA TAGAAGCTCATAACGATACAAGACCACTAAAAAAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA TTAACAGTGAAAGTTCTATAACATCAAATGTAAAGAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA TTAATACATTAAAAAAATACAAAGCATATCTAAATGG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAA
>NZ_CP013847.1|WP_012705030.1|2656147_2656561_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MYKENYIFPAIITKLAETDYNVSFPDFDEIITYGESVEEAYIMAEDALSLELFDLWEDKKEISEPTNVDNLTLENNETLILVKLNLKDVLKKYDNKAVKKTLTIPSWLNKMAEENKVNFSQILQAGLMEYLNINEKR >NZ_CP013847.1|WP_012703909.1|2655909_2656089_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MNAKDVIKQAQNIGWEIKTQRGSHVKLVKDNSTVIIPHHGSKDIPIGTLNKILKQLGLK >NZ_CP013847.1|WP_012704367.1|2655262_2655511_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MVFKDRLKGLREDRDLTQDQIANILKITRSAVANYENGIREPDISLLVKIADYFNISLDYLLCRTNKMEPFYKSHSNNLKIK >NZ_CP013847.1|WP_004440762.1|2653717_2654527_-|ATP-binding-protein MTLKTSINRIMEEIKNQRENGLGINHQNLNYKEIENVRDSYKEVCNKCGGSTWITNIDKEGRIYCRRCSCYEMQRAKDMWNLAGINTEQSKHTFSNYKPYNETTELAKNTAIQYYKNFDEIKNTRQNSIAFIGQVGSGKTHLSIALAVNFLRNKQISVIYMPYRNTITKIKQNMIDEKYYSKVLSKYQKAKILLIDDLFKGKINESDTNIMFEIINYRYINYLPMIVSSEFTVERLLDFDEAIGSRIIEMAKDYTVEIVGKENNYRLKI >NZ_CP013847.1|WP_033049616.1|2653600_2653711_-|YvrJ-family-protein MSIVGFPVTISVYLLARIEKKFDDLIKAFNDYTKES >NZ_CP013847.1|WP_004440579.1|2652816_2653359_-|DUF4342-domain-containing-protein MERNEMIEIIIEKANITREEAIEVLEKCNWDIIDSIIYLEKNGKIGNNQTTTIIEVKEEEQQQDKKKNSKKHEEKYGGIGEMVGRMFKFIGKLIRKGNENYFEIKKENEKPMRISLTISILLLIFLSVPTIVLLIIGLFCGYKYSLSGAHNNYDDVNNVFEKASESADNVKNDFKKGCAK >NZ_CP013847.1|WP_004440641.1|2652126_2652666_-|hypothetical-protein MDKLKLVDKLREKANVSYEEAKTALENSDWDMLDAVLYLEENEKVKRPSVNIFYTNEARYSGKSEESGKNQENKYEKSNKFQGIFEVICKYIDTCNNIFLEIKKKDKMFVKIPLTVIIIFSFFAFWMIIPLMVTSLFFDIELYIYSKSVDTGKANKILQSISNHVKIIKEKFKKADKNG >NZ_CP013847.1|WP_003396522.1|2651453_2652134_-|response-regulator-transcription-factor MVKILIVEDEEKLSRFIELELKHEGYEIVKANNGRTGLEIAEKGEADLVLLDIMLPEINGLEVLRRLRRTSDIPIIMLTARDAVMDKVSGLDAGADDYITKPFAIEELLARIRTALKKRIVTVKKDEDIIRCGLLSLDKMRRKVMYDSTEIELTNREFNLLQILMENKNIVLTRSILMEKVCGYDYLGETNVIDVYIRFLRTKIDDAFKVKIITTVRGVGYVIKDE >NZ_CP013847.1|WP_012705224.1|2650210_2651461_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MSRKNKTKNVISIAIKLNSVFVRSLFLKFLILDICIIAGFIGVWCIENEINFYGEIVRNAQRSFEFYPIETANYKVIWDNGKVMIKEASTFLNIFIKVISAIGIIEGIMLLMQMIFGTAKNRRILKPLNEIAEAASRLSDIAFDEQKFQSLEDAISKISPATSDERIHIKDSELQGLEEAINNLLDRMRDSYRQQARFVSDASHELRTPISVIQGYANMLDRWGKDDEEVLEESIAAIKSESENMKNLIEQLLFLARGINGKTQLKVMEFSLNDMMKEVLEESKMIDKDHIYRYIDSENINVYGDISLLKQTARILIENAAKYTDKGEDIILRTGKNNKNEPYFSIQDNGIGMDENDVLHMFERFFRADTARVRKNGGTGLGLSIAKWIIDSHKGYFSVLSRKEIGTRITVFLPKR >NZ_CP013847.1|WP_004440291.1|2648892_2649057_-|hypothetical-protein MPVTVGEYPNSQNTVRLEKGDTVEDIEDIGDGWIKFKSNGKTLTCPKDKLERSY >NZ_CP013847.1|WP_012704557.1|2657500_2658262_-|N-acetylmuramoyl-L-alanine-amidase MKVGIDCGHTLSGDDYGAVGIKAESNLTREVGTRVISKLQALGHTVIKCYKDSCSSLNDSLSYRTNTANNNNVDLYVSIHFNCYNGSAYGTEVFTYGGKELQQARVVLNNICSLGYTNRGLKDGSNLYVLRHTKAKAMLIECCFCDNAGDMNRYNAENMANAIVKGLVGKTTSNSTPSEPTNNNNSWINLDGRTGTINTPSGVNVREKKSTSSRILGALPNSSKVNLYRKEGDWIHIYYPPHGGYVYAKYVRY >NZ_CP013847.1|WP_003399453.1|2658303_2658498_-|hypothetical-protein MKFLEQFLQIKKIIALLTTIVFCILALKTNISSTEFLSVFTLIIGFYFGQSSARQAVKESKEQD >NZ_CP013847.1|WP_012705552.1|2658514_2658769_-|hemolysin-XhlA-family-protein MELKVCEEKHKRIEEKINVHDIRLNDHSKRIDKIEQNQSRTDAKMENLCDQLKQLVSVLKWYVGLTVGALVSFFFYTIQHNLFK >NZ_CP013847.1|WP_012705470.1|2658872_2659583_-|hypothetical-protein MKILNKYFELIFVGAITAILYFLTYTYQLGYFSYYNIPSIFIEISPSIIVDKLAWFFLIAIFSITTLRGIFIFIGENRSEQVQDEIKGVLLLLSMSYYFWVINPIFCYISIAFLILVGIDIIRISLDKLRKKEFKNFISYNKINMFYIGMSLELHDILRYLFITVLMASIAYSIGIYKAANDPEKTEIAINNRKAIVVSEYKSKLIIKYKKDKYDKLEDGFSIVDINGDYKIISKK >NZ_CP013847.1|WP_012704845.1|2659806_2660274_-|hypothetical-protein MKIFKKVSTMVMALTMCLMIFGGDVVFAKTNWGDKFEDPVTIYRHGGGSANVMVPIDNVNDNDWYLIDNSSGSTFSFGVFLTPPPGINYDMQIVRVDENGAITRSTYVDDNGPGNLDGFGTGIEAGCKIYVRVMSHGRNDYDRNRPYELKFIKYD >NZ_CP013847.1|WP_012704282.1|2660938_2661328_-|hypothetical-protein MRKKKIIFLLSACIISNLALGSIVSAKTVQAEESSVKTVQVKENTTVLNEDEYRSTRAAMGPMLEFLAGYIASKAIDGFIANYQDLYRWSQRDPSGYNRWVNAVNAGKNHCYNMCPIHSKFIDPRDYGY >NZ_CP013847.1|WP_012705342.1|2661449_2661659_-|hypothetical-protein MILYDLLKNLINNNYYEKEDMNNKLNVFYTFNQINLEQYSELMAKVTPVNKEEEKDLNKEDTKEKVVIQ >NZ_CP013847.1|WP_012704076.1|2661674_2661980_-|hypothetical-protein MKRGSLIIYDNSGKVWVNTGDAEGCIPPHTPPDGLPYIITEFGEFNDKIIKGIDVTVTPHKLITEDIPHIETEEEKLKKELLKAQSEVVNLKYKEVLNNIK >NZ_CP013847.1|WP_012704615.1|2661995_2663240_-|phage-tail-protein MAEKFYTILTKVGKAKIANATALGNKVNFTTLKVGDGGGKYYNPTEEQEDLVNEVWQGNINSIRVDENNPNWVVIEVIIPSSVGGFMVREAGVFDDENNMLAIGKYPETYKPQAQDGSTKDLVIRTNLEISNTSSVTLKVDPTVILATQKDIQILDDKIKNIKVPVTKVNEKIGDIVLTASDIKTENGQTIDEQLADITTLTGNKDNLKTTNKTNLVSAINEVFTSGNNVKINTVDALLQLDKSLQITKESKWEDIIKNISKISTGKKWAQGTANVNYYGPEVGIFMESNYPLSSASVNTNCGFKPSIVILTTIGITPRKNPDDYFRSDDRYSEPRIELYIYNELLQVKITFKTKSGYSSDIAYDREYSIEKINSIGNTIYTSLHIMRYSVRVEKGTSTAERYMFDKVNWYAYE >NZ_CP013847.1|WP_012704050.1|2663243_2663870_-|DUF2313-domain-containing-protein MKKKLIDFLPPQISDIEEFKNIMATENIELELIEKGQERILKENFIDTATDYGIKHKEQLFKIRADLVNDTLEFRKLRIKNRKMDKMPITHRSLEYKLKTLFGEGNYKVEVLNDEYVLKVEINTFDWSMFNEIIDNFRYIIPCNMMLSSTLVQKINTNIYFASAITSGEEITVYPWMPKDIASNGKVNIAMGSNTGVENITVYPRKEA |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013847_2 | 2.2|2456608|37|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2456608-2456644 | 37 | NZ_CP013847.1 | 1695148-1695184 | 1 | 0.973 |
| NZ_CP013847_5 | 5.5|2657220|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder | 2657220-2657255 | 36 | NZ_CP013847.1 | 1696708-1696743 | 1 | 0.972 |
1. spacer 2.2|2456608|37|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to position: 1695148-1695184, mismatch: 1, identity: 0.973
aggttaagtcagtaatgataccttacttagaagatta CRISPR spacer aggttaaatcagtaatgataccttacttagaagatta Protospacer *******.*****************************
2. spacer 5.5|2657220|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder matches to position: 1696708-1696743, mismatch: 1, identity: 0.972
taatacattaaaaaaatacaaagcatatctaaatgg CRISPR spacer taatacattgaaaaaatacaaagcatatctaaatgg Protospacer *********.**************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013847_3 | 3.3|2460744|35|NZ_CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2460744-2460778 | 35 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 121453-121487 | 1 | 0.971 |
| NZ_CP013847_3 | 3.3|2460744|35|NZ_CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2460744-2460778 | 35 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 164047-164081 | 1 | 0.971 |
| NZ_CP013847_3 | 3.3|2460744|35|NZ_CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2460744-2460778 | 35 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 52651-52685 | 1 | 0.971 |
| NZ_CP013847_4 | 4.5|2564551|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564551-2564585 | 35 | NZ_CP031100 | Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence | 1221-1255 | 1 | 0.971 |
| NZ_CP013847_4 | 4.5|2564551|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564551-2564585 | 35 | NZ_CP014173 | Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence | 21192-21226 | 1 | 0.971 |
| NZ_CP013847_4 | 4.5|2564551|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564551-2564585 | 35 | NZ_CP014218 | Clostridium botulinum strain B515 plasmid pRSJ21_3, complete sequence | 30043-30077 | 1 | 0.971 |
| NZ_CP013847_1 | 1.1|1179594|39|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 1179594-1179632 | 39 | NZ_CP014218 | Clostridium botulinum strain B515 plasmid pRSJ21_3, complete sequence | 44654-44692 | 2 | 0.949 |
| NZ_CP013847_4 | 4.5|2564551|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564551-2564585 | 35 | NZ_CP014147 | Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence | 35933-35967 | 2 | 0.943 |
| NZ_CP013847_1 | 1.1|1179594|39|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 1179594-1179632 | 39 | NZ_CP014173 | Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence | 6458-6496 | 3 | 0.923 |
| NZ_CP013847_1 | 1.1|1179594|39|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 1179594-1179632 | 39 | NZ_CP014147 | Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence | 48962-49000 | 3 | 0.923 |
| NZ_CP013847_1 | 1.1|1179594|39|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 1179594-1179632 | 39 | NZ_CP031100 | Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence | 45867-45905 | 3 | 0.923 |
| NZ_CP013847_2 | 2.1|2456543|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2456543-2456577 | 35 | NZ_CP013709 | Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence | 138413-138447 | 3 | 0.914 |
| NZ_CP013847_2 | 2.1|2456543|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2456543-2456577 | 35 | NZ_CP013682 | Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence | 141490-141524 | 3 | 0.914 |
| NZ_CP013847_2 | 2.1|2456543|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2456543-2456577 | 35 | NZ_CP013295 | Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence | 152206-152240 | 3 | 0.914 |
| NZ_CP013847_2 | 2.1|2456543|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2456543-2456577 | 35 | NZ_CP013844 | Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence | 183850-183884 | 3 | 0.914 |
| NZ_CP013847_4 | 4.4|2564485|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2564485-2564520 | 36 | KM983327 | Clostridium phage phiCT453A, complete genome | 27142-27177 | 5 | 0.861 |
| NZ_CP013847_4 | 4.5|2564551|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564551-2564585 | 35 | MH319752 | Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_14 genomic sequence | 2573-2607 | 6 | 0.829 |
| NZ_CP013847_3 | 3.6|2460735|44|NZ_CP013847|CRT | 2460735-2460778 | 44 | NZ_CP006909 | Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence | 164038-164081 | 8 | 0.818 |
| NZ_CP013847_3 | 3.6|2460735|44|NZ_CP013847|CRT | 2460735-2460778 | 44 | NZ_CP013684 | Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence | 52642-52685 | 8 | 0.818 |
| NZ_CP013847_3 | 3.6|2460735|44|NZ_CP013847|CRT | 2460735-2460778 | 44 | NZ_CP013700 | Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence | 121453-121496 | 8 | 0.818 |
| NZ_CP013847_4 | 4.1|2564290|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT | 2564290-2564325 | 36 | NC_010180 | Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence | 393605-393640 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP013847_2 | 2.4|2456741|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2456741-2456775 | 35 | MN693317 | Marine virus AFVG_25M47, complete genome | 27582-27616 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP013847_4 | 4.7|2564682|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2564682-2564716 | 35 | NC_041878 | Pectobacterium phage CBB, complete genome | 110155-110189 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP013847_2 | 2.4|2456741|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2456741-2456775 | 35 | MH586730 | Salmonella phage Solent, complete genome | 12186-12220 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP013847_2 | 2.4|2456741|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2456741-2456775 | 35 | NC_047786 | Salmonella phage vB_SenS_Sasha, complete genome | 9067-9101 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP013847_2 | 2.4|2456741|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2456741-2456775 | 35 | KY002061 | Salmonella phage vB_SenS_Sergei, complete genome | 11999-12033 | 10 | 0.714 |
1. spacer 3.3|2460744|35|NZ_CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
agaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer agaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer ***************************.*******
2. spacer 3.3|2460744|35|NZ_CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
agaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer agaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer ***************************.*******
3. spacer 3.3|2460744|35|NZ_CP013847|PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
agaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer agaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer ***************************.*******
4. spacer 4.5|2564551|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031100 (Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaattagg CRISPR spacer tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaactagg Protospacer ******************************.****
5. spacer 4.5|2564551|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014173 (Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaattagg CRISPR spacer tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaactagg Protospacer ******************************.****
6. spacer 4.5|2564551|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014218 (Clostridium botulinum strain B515 plasmid pRSJ21_3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaattagg CRISPR spacer tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaactagg Protospacer ******************************.****
7. spacer 1.1|1179594|39|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014218 (Clostridium botulinum strain B515 plasmid pRSJ21_3, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.949
caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattataga CRISPR spacer caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattataat Protospacer *************************************.
8. spacer 4.5|2564551|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014147 (Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaattagg CRISPR spacer tctcaaaagagtaacactaatgttcaacaattagg Protospacer ** ***********.********************
9. spacer 1.1|1179594|39|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014173 (Clostridium botulinum strain B609 plasmid pRSJ22_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattataga CRISPR spacer caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattattat Protospacer ************************************ .
10. spacer 1.1|1179594|39|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014147 (Clostridium botulinum strain CDC_67190 plasmid pNPD12_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattataga CRISPR spacer caagggtatttaaaaacaatatagaagtaatattataat Protospacer ***************.*********************.
11. spacer 1.1|1179594|39|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031100 (Clostridium botulinum strain CFSAN034202 plasmid p1_CFSAN034202, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.923
caagggtatttaaaagcaatatagaagtaatattataga CRISPR spacer caagggtatttaaaaacaatatagaagtaatattataat Protospacer ***************.*********************.
12. spacer 2.1|2456543|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013709 (Clostridium botulinum strain F634 plasmid pRSJ2_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
tacttgtgattttaaaataaagaacattaggtagt CRISPR spacer tacttgtgattttaaaataaaaaatattaggtaga Protospacer *********************.**.*********
13. spacer 2.1|2456543|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
tacttgtgattttaaaataaagaacattaggtagt CRISPR spacer tacttgtgattttaaaataaaaaatattaggtaga Protospacer *********************.**.*********
14. spacer 2.1|2456543|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
tacttgtgattttaaaataaagaacattaggtagt CRISPR spacer tacttgtgattttaaaataaaaaatattaggtaga Protospacer *********************.**.*********
15. spacer 2.1|2456543|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013844 (Clostridium botulinum strain A634 plasmid pRSJ19_2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.914
tacttgtgattttaaaataaagaacattaggtagt CRISPR spacer tacttgtgattttaaaataaaaaatattaggtaga Protospacer *********************.**.*********
16. spacer 4.4|2564485|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KM983327 (Clostridium phage phiCT453A, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.861
tgacttctctatttagggaattaatgattaagtata CRISPR spacer ctacttctctatttagggaattaatgcttaaataca Protospacer . ************************ ****.**.*
17. spacer 4.5|2564551|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH319752 (Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_14 genomic sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.829
tcacaaaagagtaatactaatgttcaacaattagg- CRISPR spacer tcacaaaatagtaatactaaggttcca-actcaggc Protospacer ******** *********** **** * * *.***
18. spacer 3.6|2460735|44|NZ_CP013847|CRT matches to NZ_CP006909 (Clostridium botulinum CDC_1436 plasmid pCBG, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.818
ttgttcaacagaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer aaagggaaaagaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer . ** ***************************.*******
19. spacer 3.6|2460735|44|NZ_CP013847|CRT matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.818
ttgttcaacagaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer aaagggaaaagaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer . ** ***************************.*******
20. spacer 3.6|2460735|44|NZ_CP013847|CRT matches to NZ_CP013700 (Clostridium botulinum strain AM1195 plasmid pRSJ11_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.818
ttgttcaacagaaacccttgtggatgtggttctaatgtttttca CRISPR spacer aaagggaaaagaaacccttgtggatgtggttctaatatttttca Protospacer . ** ***************************.*******
21. spacer 4.1|2564290|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010180 (Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
taacattatagttttagaagattttcaaggttttaa CRISPR spacer atagaagatagttttagaaggttttcaaggatttta Protospacer * * *************.********* *** *
22. spacer 2.4|2456741|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693317 (Marine virus AFVG_25M47, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caaaacaataagtaattcataattcaaaaatgagg CRISPR spacer caaaacaataagtaatttattattcccgcatgcaa Protospacer *****************.** **** . *** ..
23. spacer 4.7|2564682|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_041878 (Pectobacterium phage CBB, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
aaaataggtgtagaatatgaaccaattttaactac CRISPR spacer cagttaggtgtagaatatgaaccatgtttgccaag Protospacer *. ******************** ***. * *
24. spacer 2.4|2456741|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MH586730 (Salmonella phage Solent, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caaaacaataagtaattcataattcaaaaatgagg CRISPR spacer ttcaataataagttattcataattcaaaaacctct Protospacer . **.******* ****************.
25. spacer 2.4|2456741|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_047786 (Salmonella phage vB_SenS_Sasha, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caaaacaataagtaattcataattcaaaaatgagg CRISPR spacer ttcaataataagttattcataattcaaaaacctct Protospacer . **.******* ****************.
26. spacer 2.4|2456741|35|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY002061 (Salmonella phage vB_SenS_Sergei, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
caaaacaataagtaattcataattcaaaaatgagg CRISPR spacer ttcaataataagttattcataattcaaaaacctct Protospacer . **.******* ****************.
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1685572 : 1708298
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013847|1685572:1708298|DBSCAN-SWA ACTAATATAATTTATCTAATTCTTTAGCTACCTCAGTGTGTTTGTTTGGGTACAAGTGTGAATATGTATTTAATGTAGTTTCAATGTTTTCATGTCCAAGCCTTTCAGATATTAAAAGCGGAGTAAATCCTAATTCTATTAAAAGCGAAGCGTGGGAATGTCTTAAATCATGCAGACGTATTTTTTTAATACCACTTTTTTTACAAGTTCTATTAAGTTGTGCATTAATATTTTGTTTAGCTATGGTAAAAATTCTTTCGTTTTCATTTAAGTTGTATATCTTATTTTTATATTCTTTAATATCTTCACAAAGGAAATCAGATATAGTAACTTCTCTTTTACTCTTCAAAGTTTTAGGCGGGTTTATTATATCCTTTTTATTTATTCTTGCATAGTTCTTATTTATATTTATAATCTTTCTATCTAAATCTATATCTTTATATGTTAAGGCTAATAATTCACCACTTCTTATACCTGTCCAGAACAAAATTTTAAAAGCTAATTTATAAATTGGCTTCTTAACATATTCTATAAATGTTTTAAATTCTTCTACTGTCCAAAACTGCATTACGTCAGCGTTCTTTTTACCCATAGGACCAGCTTTAACCACTGGGTTGCTAGATAAATTATAATATCTAATAGCAAAGTTAAATATGGCACTAAGTTGATTATTAATAGTTCTTAAATATGTATCACTATAATCATTTTCCATTATTTTGTTTTGCCATTTCCTAATATGATTTGGGGTTATATTATTTAAATTTATATCTTTAAAGTAAGGGGCTATCTTTAAATCTACTATAAGCTTCTTTTGTCTAAATGTAGTAAATCTTATTTTATTTTTAATATCATCTAAATATATATTAACTAAATTCTCGAAATTAATACCTGGATCATTCTTTTGCTTATTTAAAAAATCTCTTTCATAGTCTTTAGCATCTTTTTGTCTTTTAAAACCTTCTTTCTTTTTTCTTTTCTTTTTACCTGTCCAATCAGTGTAATAAAAAGTACAAAAATAAGTTCCTCTTTCTTCATTTTTATAAACAGCCATTTCTTTTTCCTTTCCTTTCTTCTTTCAATAATATTTCTAAAAGCTTTACAGGATGAACTTGTAAAGCGCGAGATAATTTTTTTAATTTCCCTATTGTCATAAATTCTATTTCGCCATTTTCTAATCTGCTTATATAAGGTTGCTCTACTCCAATTCTTTCTCCTAGAGTTTCTTGCGTGTACCCTAGTTTCGTCCTTAGTTTCCTCAATTCGACATCACCCTTTATAATTGTACAATATTCAACAAAAAAGTAACGTGGAAAATGTCGGAAATATAACTACTGGTTATATTATTTGTGCTAACATTATCCATAGAGAGGGGGATTCAAATGGACGAAACTATGGGAAAAACTATAGAGGAAACTATACTAAAATTATTAGATTTACAAGGTGATTTATTTTTGTTCTGCCATCTTCAATTTTAAATTTATTTCTAGCTCTAAAGATGTCCATATAAGTTTTTTCACTTCATCACTTATAGGGGCATCTTCTTTTATTTGCCCTTTTTTTATTAAACTATCTATCACCATATTTGTAGTTTCTAGTGTAGATAGTTTTTGTATTTTCTCTTTCCCAATCAATTCACTTATAGGCTTTTTAAAATATTTGCTTAATTTTTTAGATGTATCTATAGAAGGTTCTCTACCTCTTTCCAAATGTGATAAAGTACCTCTAGTTATGCCAACTAATTCAGCATATTGTTCTTGTGTCATTTCTTTTTGCTTTCTATCGTTTTTTAAAATATCTTTTAATTCCATTGTTATTCCTCTCTTTCTTGTTACATGGTAGCACATTGGAGAACAAAGCGCAAATTATAATATATGGAATTACGAGTAAATATCTAAAATACCAAGTAATATGTAGCATAAGCTAGCTATTTCCCTTATTTACTACATTTTACTATTTTGCGCTTTTGCGCTATCATTCGCTTGCATATATAATTAAATCATAGCAAGGGCAAAACAAAGCGCCTTGAAGGTTCTTTGAAAATTGAATATAGAAAACCAAAGAGAAACTTACAAAAGAAGGGTGGAGAAGTTAAGCATTAAGCGAACCAAGCCCAAGTAATGTAGCCGCGAAAGTGACAGTCCCAAGCCTGTGTAAATACAGAGGGTAAAGAAATTTAAAGGGGGATATATATGGAAAAAATAATATCAATTTTGTTGGAAATAGAAAACAAAATAAAGGGAGGAGAATACAAAGATGACAATAAGTAAGACATTGAAGTATGAAAGACTTAAAAGAGGAATGACACAAAAACAATTTGCTGAATTATTAGAAACTGACAGGGGGTCAATCGCGCATTATGAAAATGGAAGAGTACCATTACCACCAACTTTAAAAAAATTTAGTGATAAATTAGATGTTGACTTAGCAAAAGCACTTATGGAAGGGGATATGTAAATGAAAGAATTGCAAGTATTAAACAATAAAAACTTAACTTTAGAAAGCATAGAAGTTACTAGGATGCTAGGAAAAGAACACAAACAATTATTAAGAGAAATTAGAGATATTTCAAATATTTTGGAGAGTGAAAATTTTTCACCATCAAAGTATTTTATAGAAAGTGAATATATAACTGCTCAAAATAAAAAGCACCCATGTTATTTAGTTACTAAAATGGGATGCGAATTATTAGGTAATAAATTACAAGGAGCAAAAGGAACAATATTTACAGCTGAGTATGTAGAAAGATTTAACCAAATGGAAAATATAAAAATACCAAAGCTTAGTAAAGAGGTACAAGCAATATTCACACTAGATAATAGAACAATGGAGATAGAAGAAAAGGTAACTAACTTAGAAAACAATATCCCACTTTTTAATGTGGAGTGTAAAGAGTTACAAGCTTTAGTAAGAAAAGTAGGAATTAAAACATTGGGAGGTTACAAAACATCAGCCTATAATGATAGATCATTACGTACCAAAGTATATTCAGATATTCAAGGACAACTTAGAAGAGAATTCGGCGTAACTAGATATGAAGCAATAAAAAGAAAACAATTAAATAAAGCCAAAGAAATATTAGAAAATTACACAGTCCCAGTTTATTTAAAAGAAGAAATATTTAGTACAAACAATCAAGAAGAATGGAGATGTATATAAATGTTTTATACAGTTGACCAAATAACAGAAATGTTACAAATAAGCAAATCTAAGGCTTATAAGATAACAGCCAGCCTTAATAAGGAATTAAAAAAAATGGGTTATATAACCATAGCTGGTAGAGTTCCTAAAAAATTCTTTGAAGAAAAATATTATATGTAAGGAGTGTCATGTATGAACAAAGAAAAATGTGTTTCCATAATAGGCTTAGCAGGTATAGGACTAATAGCTGGTACAGTTCCAGCGTGGATAATAAGTGGTTTAGGTATGGTTTGCATATTAACTATGAAAGAGAAAAAGGGAGAGGATAAATAATTATGATTAGTATAGCTAATTTAGATAAAAGGATATGCGACATTGAAGAATGTGAAAATACTCAAACTTATCGGGAATTTATTAGAGAAAGTGAAAAAGAATTTGGTATATATCCGTATCCTTTAGACCAAGAACATGTCACAGATGAAATATTAAAAGATTATGTATATTTTTTAGATGAATTATGGTGCAAATAAGGAGGAAAACAAATAATGAAAAAGTATAGAGTTAAAAAAGAATTTATATATGATAACACTCAATTAGAATACACAGATTTATATCAACAGGCTTGTAATCTAGGTTACGCATTTGTAAAGGATGGAAATGATTATAGAATGATTACAATTAATGAATATAAAACTAAGCCTAGCTTACTTCAAGTAGATTTAGTTAATTTAGAAATCATTTAGGGAGGTGAAGCAAATGACACCATATGAGCAACTTATAAAACAAATAGAAGAAAGCTTTAACTACAGTAATGCAGATGCAGAGGAATACGGTAAAAAGCTAAAACACTTATCCTTAGTAGCATTAGAAGAAATAGAAGAGGAATTTAAAAATGCTTAGGCTAGGCGAAATTATATTAGCCATATACAGCTTAGTAATACTTTTAGCTTTTATAGGTGTAGATATTAAGCAACTAAAAAAGATTAAGGATACTGGATGGATTACAGTAATATTTATACCTATAATAATATTCCTATTAAACATTATTTGGAGGTGTTAAAGATGGATAAAAACTGGTGTACGTTATTAATAGCGATATTGAGAGAAAAACCATGCACCAGAGAACATGCGGCAGAACTTTATGACAAGGGGACATTATTTAGAAATAAAAGACCTAAAGAGGATATAGAAGAAATGATTAGACTAAGAAAACAAGGTCTTAAATTTAAAGAAATAGCAGAAATATTTTGTTTGGATCCAAGCACAGTATGTACTTTAGTAAATAAAAAAAAAGCTTCCTGCAAGAAGCTAAAAATTTAATAAATTAAACATTAAATATATTTTATACAAGATTAGGAGATTTGTAAAGTGCGAGTTATTAAAGGGTGTAAAGGCTGTACACATTATGTATTACAAGTAGTGATAAGCAATACAGGGAATAGAACAAAATTATTATGGAAACCAGCTTGCATGGCAATTCAATGTATTAAAGGGGGGAAAATTAAAAATGAGCCAAAAGAAAATATTTGAACTAAACATTTTAAATACAATGGATATTACAACAATAAAAGAATGTGAGGGAATGAAGAAAGGTATTCACTCTAAAGAACAAGTACATCATTTAAAATTTTACAAGAATGGGAGAACCATAACTGCGGTAATGACTGATAAAACTGGAATGATTAAAGGAGTAGGTGTAGCTAAATGTAATCCAAAAGATACATTTGATATCAAAACAGGGTTGGTACTAGCTGAAATGAGGGCTAGAGAAGATTTTTATAAAAGTACAGCTAATCGTTTTTTATGGGAGGAATTTTAATGGCGAAGCAATTTGTAGAAGGTAATAAATATGTTTTTAGTGC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>NZ_CP013847|1685572:1708298|1694461_1694650_+|WP_012703931.1|DBSCAN-SWA MNNMTDGKKDGLALVYVKDSVAYPVALNEEQLEILDITLGMSLKEIKLINKPIGKVINLLEK >NZ_CP013847|1685572:1708298|1700176_1700473_+|WP_021106471.1|DBSCAN-SWA MKQAVELNIKGIKCDNPNCDYRNDKVRFEDYKNWLNKPCPKCGTNLLTKEDLEMTKSLINIANIANRVLPKQNNEEERIKAIIEMNGTGRVDFKIKED >NZ_CP013847|1685572:1708298|1688025_1688727_+|WP_012704859.1|DBSCAN-SWA MKELQVLNNKNLTLESIEVTRMLGKEHKQLLREIRDISNILESENFSPSKYFIESEYITAQNKKHPCYLVTKMGCELLGNKLQGAKGTIFTAEYVERFNQMENIKIPKLSKEVQAIFTLDNRTMEIEEKVTNLENNIPLFNVECKELQALVRKVGIKTLGGYKTSAYNDRSLRTKVYSDIQGQLRREFGVTRYEAIKRKQLNKAKEILENYTVPVYLKEEIFSTNNQEEWRCI >NZ_CP013847|1685572:1708298|1687824_1688025_+|WP_012705054.1|DBSCAN-SWA MTISKTLKYERLKRGMTQKQFAELLETDRGSIAHYENGRVPLPPTLKKFSDKLDVDLAKALMEGDM >NZ_CP013847|1685572:1708298|1697992_1698151_+|WP_021106465.1|DBSCAN-SWA MEIGVLRAETKRYRSFKEKVMLVQKYENKYHVEDIGGWLSLIRRGERGTCTK >NZ_CP013847|1685572:1708298|1705067_1706234_+|WP_080309901.1|portal|DBSCAN-SWA 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MHEDIKEILEQHKKEQIMYNLDDLIDELKNKWNDDKYFYDEEEARRFYKFITKLELDKGKKGQKISPLKFQFRITSEILCVKERETGFRKHREALLDISRKNGKGSLVSWIAVYLYFTDPTFGAEYIIVANDKKQASNLFNTMVLMIKKNKTLKKYVKITESMRQMYRKSTNSYLRVLANDGANLDSYASYVVILDEPHEYKNSDAYTKLRTGMGLWDSPLLFATTTASSGQDPQNLELELYNYAKDIEKGKFEDDKFYYAIYEADKDCDLMDIKQQIKANPALGIFRKYDDLKDFMLKASRIKTFEAKARRLYLNQHVALDGENAINMRLWKECLQDIDLNDLKGAMCWCGLDMAYIQDIIAYVQCFYNGKEDKYIIYPHLFTPKETLIDRSERDNVRYDTWVRNKDLIGLNGTYVDNEELFNYIDHINSKYSFDIDEIVFDRWGAGDIRSRLEKHYTVAPFGQGYKSMSPVIRDFEIMLLDKRLIIANNPVLTWMASNVIATEDPAGNIKYDKSKCKNKIDGVIAMLMALGRAIFNTKQAVKLNKYASEEYINRLYGGDKD |
50 | Clostridium_phage(52.38%) | protease,terminase,capsid,integrase,portal | attL 1681021:1681036|attR 1692696:1692711 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1712736 : 1723376
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013847|1712736:1723376|DBSCAN-SWA TATGGCTTCCAAGACTATAGGTGTTGTTCTTTCCTTGCAGGATAAAATGAGTGGCGGTTTATTAAAAGTAAATAAAAATGTTCAAGGAGTTTCTAAAGAAGCAAAGAGAGCTTCACAACAAGTTGCGAATTTTGCTACCAAAGCGCAAAAGGGCTTTGAAAAAGCCGGAGATAAAGTTTTGAAGCTAGGTGCAGGTTTGGCAACTCTTGCGGGTGGTTTAATAGTAAAGACAGGTGTTGAAGGATTAGGGGAATTAGACCAAGGTGCTAGAAAAGTTAAATCAATAGCACAAGATAGTTTGCAATTAGATAACATTCAAAAAGGTTTGCTTAAAACTTCCAACGATACTGGAATTGTAATAAAAGAATTGGCTGACACCCAGTATGATGCAATATCTAGTGGTGTGGCGGCCAACGAAAGTATACAAGCAGCAGTTACATCAGCGAAACTGGCTAAAGCTGGATTTTCAGATTCAAACAGTTCGCTCAAAATACTAACTTCAACCATGAATGTCTACGGGTTAACAGGTCAAAAAGCAATGCAAAGCATATCGGATAAACTGTTAGTTACACAAAACCTAGGTGTAACAACTGTTGGGGAATTGGCGAATTCGATGGGATCATTAACACCTATTGCCAAATCTGCTGGTTCTTCTATAGATGAAATGTTAGCAGGAATGGCAAGCTTAACAAAGAATGGATTGAAAACAGAGGAAGCGGTAACATCTTTAAAATCTGTGTTTTCAAGTGTAATTAAACCAACCGAAGAAGCTTCTAAAACCGCTCAGCAATTAGGAATAGACTTTTCAGCGTCTGCGTTAAAAAGTAAAGGATTTGCCAAATTCTTAGAAGAGATAAAAGTTAAAACCGGCGGAAATACTGAAACTATGGGTAAGTTGTTCGGAAACGTTAACGCGTTATCCGGTGCTTTGGTACTTACAGGAAAAGGGTTCGGAGACTTTAATACAAGTCTAGACGCTATGCAAAATAGCGTTGGGCTGACTGACAAAGCTTTTGAAACAATGAATAATAGTTTAATAAGTAAATTTGGGAAAATGAAAAACAGATTAACAAATATGGCTACTGAAATGATGCAAGGAACAGGTGGACAATTAGGAGTTTTAATAGATAACATAACAGGTAAATTAAAACAATGGCAGGAAGATGGGACTATAGAACAGGTCGCTAATAAAGTGGCGACTGGATTTATGAAAATGTATGACATTATTAGTAAGGTTATAAGCTTTCTAGTAGAGCATAAAGATGCAATAGCAAATGTAGCTATTGTATTTGCATCCTTCTATATAGCCATTAAAATTTTCAAGGTACTTAAAGGGGTTATATTCGGAGTACAGATTGCAATAGGATTGCTTAATGGTACTTTAATGCTTACACCTTTGGGATGGGTCATGGTAGCGATAACTGCTGTAATAGCAATAGGATTATTACTATGGAAAAACTGGGATAAAATAAAGCAAGTTGCCCAAACTTTATGGACAGCAATTAAAACAGTATTTACTAATATATGGACAACAATAACAACTGTATTCACTAATATCTGGACCACTATAACAACAGTGGCTAGTAATATATGGACCAGCATAACAACTGTATTCACTAATATATGGACAACAATAACTACTATATTTACAGCTATCTGGACCACTATAACAACAATAGCCACCAATATATGGTCAAGTATAGTTTCTATTTTTACAACTATATGGAATGTTATTGTAACAATATTTACACCTATTAAGTTGTTTATAGAAGCGGTATGGAAAGGCATATTAGCTGTAATAATAATTGTAGGAGCGTTTATTTGGAACGCAATTGTAACAATGTGGACTAACGTATGGAACGTTATACAACCTATACTAACAGCTATATGGAATGTTATAACAACAGTATGGACAGCTATATGGACCACAATAACAACAATAGCAATGGCTATTTGGAACACTATAGTAAACGCATGGAATACTATAGCCGGAGTTGTATCAGCTGTAATGTCTGCAATTTGGGGTGTTATATCTAGTATATGGAGCAGTATTTATGGAACTGTAAGTGGAATTATGTCATCAATTTGGAGTACTATAACAGAGATATGGAACAATATCGTATCTACTGTTAGCGATATTGTTGGTAATATCGCTAGTACAATAAGTGATGGGTTTAATTCTTTAATCGGAACATGTTCCGATATATTCAACAATATAAAAAATACTGTAATGGATATTTTTCAAGGCATATGGCAAGGGATTAAAGATATAATTAACGGTGGAATAGGTATGCTAAATAATTTTATTGGTGGAGTAAATAAAGTTATTAGTAAAGCCAATAAAGTTCCAGGAGTTAATATAGGCGCTGTATCGGAAATACCTAAATTTGCAAAAGGCACTCAATATTCACCCGCAGGAATGGCACTAATTAACGAAGAAGGTGGAGAGTTAAGAAAGCTTTCTTCAGGGGAGACAATTATACCAGCCGATAAATCTCGCCAATTAATGAGCGGGAATTCAAGTCCAGAAATTAATATTTATATAACTGGCAATGTAGGAACAGAAGAGTTCTTTAATCAAGCAGGGGAACATATAACAAATCAAATTAAATTAGCATTGCAAAATATGTAAAGGTGTAGTTTTATAACTATGCCTTTTTTATTTAAGGGGGTGTAATATGGCAAATATATATTTTAGTACATTAGATAGAAAACAATTGTACGAACTTCCCATTTTACCAGAAGAAATGCCGGAACTTAGTAAGAGTAGTAAAAATGAAATATTTGAAACTTTTAACAATGGAGAATATAACTTCCTAGGAGAAGTTAGTTTAATCAGTTTTAGTTTAGAAAGTTGGTTGCCAGCATATCCCAATAAGTATAGATGGGCTAAGAGCCAAATTAATCCTTATTTATTAATAAATATGTGGAATACAGCACAAAACACTAAGAAGCCTCTTAGGATTGTTATAAATAGAAATAAAAATACTTTTTTACCACAAGAATTATTAAACTGGATGGTTTCTATAGAAAATATAAGTTGGCATGAGCTAACCAATGGAGATGTAGCTTATAAATTAGATTTAAAGCAATACAGGGAGATAAAATAATGTGGTACTTATATACTTCCTATATTGTAGGGAAAGGATATACAACTAAAGAAATAATAGGGCAATGCAATAATTTAAGTTGGAGCAATGACGTAGATACATTAGCTACTTCCTTGTCTTTTGATTCTATATTAGATTTAGCAGAGGGAAGAAGTAAAATAATATTAAGACAAGACAAGATAACAGTTTTCGAGGGCGTTGTAGTAAATAAAAATAACAAAGAAAATGTCCACAGCTATACAGCTATGGACTATGCATGGTATTTAAATAAAAATAAATATGTAATGCAATTTAGAAATATAAATGCGAAAAGTGCATTACAACAGATATGTGCTAAGGTAGGTATTAAAGTAAATATAAGAACTAGATTAACTACTAGAATAAATAAATTGTATTTCCAAGAAAGTTTAAGCGATATAATAAAAGACATATTAGAACAATGTAAAAGAGAAATAGGGGAACATTACATAATGGAAATGCAAGGTAAAACACTTTATATTAATAGAGTTATAGATTTAAAAATTAATTCAACTGTATTAATAGAAAAAGATTATAGTATTAGTAGAAGCATAGAAGATATGCAAAACAATATAATAGCGGTCAATAATGATGGCAGAGTTTTAGCCAGTGTAAAAGATAATAAAAATATTAAAATATTCGGAGAACTAACGGACATTATAAGTGTAGAAGATGAAAATACAAGCCGAGCTAACAATATAGCACGTAACGAATTAAAAGAAAAAAATAAGATAAAAAAAGAACTCTCTTTTAATACAATAGATACTGGCAAAGGAATTTATATAAATTGCAATAGATTAATTAGAGTTAATCTAGGCAAATATGGTGTAAATGGGTGGTATAGAATAAAAAGCACACAACATACTTTAAATAATAATATACATAAAATAGGTATAACAATAGATTTTAGCTAGGAGGTTATATATGGATTATGGAATAGAATTTGCCCAATGGCTAAAAAAAAGAAATAATAAAGATAGAATAGGGACAACAATAGGAGAAGTTGTAAGAGGAGGTTTGGATTATAGAATAAGTATTATGGATAATAAATTATATCTAGATCCGAGCAATTCTACTTTATGCAACTCTTTAAAAGATAGAGTAGAAGAAAGAACTATAGAATTAAATAACACTAGCTACAATGCTAAAATAACATATAGTAATATTTTAAAAAAATATGATAAAGTGTTGGTTATTGAAAATGAAAGCGGCCAGCACTTTTTTATTGTAGATAAAATATAGGAGGTGTGAATATGGCACTACTTCCAGAAGAAGATATAATAATTGAAGAAGTGGAACAAATAGAAGAGGAACAAACTTTGTCTAAGTTAGGCAAGGTTTTTTTATTTGATTTTAAAAAGAATAAATATGTAATTAAAGATGGGAAACTAGTTGAATGTACAGAACGACAAGCGTTAGAGCAATGGATACATTGGATATTGCTAACTTATAAAGATAAATACAATGTTTACAAGGGTACAGACTTCTATTGTAATATAGAAGATTTAGCAGGAAAGAAAAGAAATGCATTTATTCTCTCAGAACTACAAAGAGAAGTTGAAGAAGCAGTTATAAAGCATAGATATGTAGATCATATAGAAAACTTTGTAACAACACAAGAAAAATCAATATTGAATGTAAGCTTTGATGTTGTTACAAAAGATAATGAAGTTATTAATATAAGTGCCTAGGAGGTGAAGGGTTGAGTGTAAATGTAAAAACACAGGAAAAATTAATTAAAGATATGCTTAACAACATATCGAACACATATGAGAAAAGCGAAGGACACCTTACATATGATATAACTAAAACTAATGCCATAGAATTAGCTTTACTATATCAATATGCTTTATCTATAGCCAATCTAAGGTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013847|1712736:1723376|1720643_1720847_+|WP_012704941.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MENEIIKLVATQGAFAVFFAYLLFYVLRENSRREGKYQDIIKELAEKLNVIEDVKKTVDKIEGKLEG >NZ_CP013847|1712736:1723376|1715413_1715845_+|WP_012705686.1|DBSCAN-SWA MANIYFSTLDRKQLYELPILPEEMPELSKSSKNEIFETFNNGEYNFLGEVSLISFSLESWLPAYPNKYRWAKSQINPYLLINMWNTAQNTKKPLRIVINRNKNTFLPQELLNWMVSIENISWHELTNGDVAYKLDLKQYREIK >NZ_CP013847|1712736:1723376|1722869_1723376_+|WP_012705355.1|DBSCAN-SWA MENKKNKKPFYKKWWVWILAIIILAGLGQGTGDKKKAQKTATQQEQKKEDAKRDAEKKAKKEKEKKAKEEAEKKPKKEDNEATLITTAQGVVKKNLKAPSTAKFPWSFKEYNIQESKSENKDMIIYTVTGYVDAENSFSAKIRNNFIVKMECTKDLSKYRVLDVNITE >NZ_CP013847|1712736:1723376|1716787_1717105_+|WP_012704547.1|DBSCAN-SWA MDYGIEFAQWLKKRNNKDRIGTTIGEVVRGGLDYRISIMDNKLYLDPSNSTLCNSLKDRVEERTIELNNTSYNAKITYSNILKKYDKVLVIENESGQHFFIVDKI >NZ_CP013847|1712736:1723376|1717565_1718675_+|WP_012705663.1|plate|DBSCAN-SWA MSVNVKTQEKLIKDMLNNISNTYEKSEGHLTYDITKTNAIELALLYQYALSIANLRLVKDLRGDDLTARVYDNKGIVRKVATRAKVILTLTGTGTIDKEDLFGTPNKIEFASLEKKQIEGTGTILAECTQVGNIGMVGANSIAEFPITIAGFTEVNNSNPSYDGFEEESDESLRQRYYESLKNPITSNNQAHFIYWAKSATGVGNAKVIPLWDGDLTVKVIIINSDMQPASVDLVNTVQEYIDPKGILDTNTNTWSLWGTGAGASAIGNYCTVVSATAKNIDLECSITKANGYSDEEIKQNISSKIAEYLKEIAFSATINYVSHAKIISLILSADGVLDATNVKVNGSLSENVIIGEEEVATMGAVTLI >NZ_CP013847|1712736:1723376|1712736_1715367_+|WP_061332124.1|tail|DBSCAN-SWA MASKTIGVVLSLQDKMSGGLLKVNKNVQGVSKEAKRASQQVANFATKAQKGFEKAGDKVLKLGAGLATLAGGLIVKTGVEGLGELDQGARKVKSIAQDSLQLDNIQKGLLKTSNDTGIVIKELADTQYDAISSGVAANESIQAAVTSAKLAKAGFSDSNSSLKILTSTMNVYGLTGQKAMQSISDKLLVTQNLGVTTVGELANSMGSLTPIAKSAGSSIDEMLAGMASLTKNGLKTEEAVTSLKSVFSSVIKPTEEASKTAQQLGIDFSASALKSKGFAKFLEEIKVKTGGNTETMGKLFGNVNALSGALVLTGKGFGDFNTSLDAMQNSVGLTDKAFETMNNSLISKFGKMKNRLTNMATEMMQGTGGQLGVLIDNITGKLKQWQEDGTIEQVANKVATGFMKMYDIISKVISFLVEHKDAIANVAIVFASFYIAIKIFKVLKGVIFGVQIAIGLLNGTLMLTPLGWVMVAITAVIAIGLLLWKNWDKIKQVAQTLWTAIKTVFTNIWTTITTVFTNIWTTITTVASNIWTSITTVFTNIWTTITTIFTAIWTTITTIATNIWSSIVSIFTTIWNVIVTIFTPIKLFIEAVWKGILAVIIIVGAFIWNAIVTMWTNVWNVIQPILTAIWNVITTVWTAIWTTITTIAMAIWNTIVNAWNTIAGVVSAVMSAIWGVISSIWSSIYGTVSGIMSSIWSTITEIWNNIVSTVSDIVGNIASTISDGFNSLIGTCSDIFNNIKNTVMDIFQGIWQGIKDIINGGIGMLNNFIGGVNKVISKANKVPGVNIGAVSEIPKFAKGTQYSPAGMALINEEGGELRKLSSGETIIPADKSRQLMSGNSSPEINIYITGNVGTEEFFNQAGEHITNQIKLALQNM >NZ_CP013847|1712736:1723376|1718686_1719217_+|WP_012705196.1|DBSCAN-SWA MNIEQQLIANLHKRVRQDSYVKNLCNASGIEMDTIEDVLEDIKKQFKFETMTWSADLLASEMGIKLDPSLKQDEKNSIIAARWKSEGKADLNLLQAICNSWKNGNVKVSFIDGKIVFKFVGEYGIPADLDSLKKQIDLSKPSHLAIDYLFAYLLLKDVEEITLTKLENTTLNKFAF >NZ_CP013847|1712736:1723376|1722479_1722725_+|WP_012703802.1|DBSCAN-SWA MKKEIRFLIIGLLLGACTRFIGIATAIEQAEDNCPSNGEYMYCTDQGKPLWISIYDVHQEEKFIYLRQPNSNKIIKLTQLK >NZ_CP013847|1712736:1723376|1722286_1722469_+|WP_012704407.1|DBSCAN-SWA MAKSKQTEANKKWYDKNKEHAKYLNKRSHTRSFIKNFAKLEDLEELQKLIEERKELLRQE >NZ_CP013847|1712736:1723376|1717116_1717554_+|WP_012705449.1|DBSCAN-SWA MALLPEEDIIIEEVEQIEEEQTLSKLGKVFLFDFKKNKYVIKDGKLVECTERQALEQWIHWILLTYKDKYNVYKGTDFYCNIEDLAGKKRNAFILSELQREVEEAVIKHRYVDHIENFVTTQEKSILNVSFDVVTKDNEVINISA >NZ_CP013847|1712736:1723376|1720848_1721022_+|WP_012704333.1|DBSCAN-SWA MDRVLRKITSARWLIAVIMTIVFAILAIKNTLNTEFITIYTMVVAFYFSKDRKEQDK >NZ_CP013847|1712736:1723376|1720049_1720355_+|WP_012704076.1|DBSCAN-SWA MKRGSLIIYDNSGKVWVNTGDAEGCIPPHTPPDGLPYIITEFGEFNDKIIKGIDVTVTPHKLITEDIPHIETEEEKLKKELLKAQSEVVNLKYKEVLNNIK >NZ_CP013847|1712736:1723376|1720370_1720556_+|WP_012705345.1|DBSCAN-SWA MILYDLLKNLIDNNYYEKEDMNNKLNVFYTFNQIDIEQYSELMAKVNPAAKENTIEKVVTQ >NZ_CP013847|1712736:1723376|1721971_1722112_+|WP_021106503.1|DBSCAN-SWA MIEDIGKLIALVISILTIRQLSLQNSKTELEIKKLRLEIKRLKEGD >NZ_CP013847|1712736:1723376|1721064_1721823_+|WP_012704505.1|DBSCAN-SWA MKIGIDCGHTLSGADYGAVGIKAESNLTREVGTKVIAKLKALGHTVINCYKDSCSSLNDSLSYRTNTANNNNVDLYVSIHFNCYNGSAYGTEVFTYGGKSFTEASRVLNNICALGYTNRGLKDGSGLYVLKHTKAKAMLIECCFCDNAGDMNRYNAENMANAIVKGLVGTTVATPNKPKEVVKVQKPKYDETIPTGESIFKIPGTTGYIEQATDGRLIIHKDRGNYIAIGKGFIDCYWNDNKGNGCNKRLSN >NZ_CP013847|1712736:1723376|1715844_1716777_+|WP_012703984.1|DBSCAN-SWA MWYLYTSYIVGKGYTTKEIIGQCNNLSWSNDVDTLATSLSFDSILDLAEGRSKIILRQDKITVFEGVVVNKNNKENVHSYTAMDYAWYLNKNKYVMQFRNINAKSALQQICAKVGIKVNIRTRLTTRINKLYFQESLSDIIKDILEQCKREIGEHYIMEMQGKTLYINRVIDLKINSTVLIEKDYSISRSIEDMQNNIIAVNNDGRVLASVKDNKNIKIFGELTDIISVEDENTSRANNIARNELKEKNKIKKELSFNTIDTGKGIYINCNRLIRVNLGKYGVNGWYRIKSTQHTLNNNIHKIGITIDFS |
16 | Clostridium_phage(62.5%) | bacteriocin,plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1824993 : 1833194
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013847|1824993:1833194|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013847|1824993:1833194|1832237_1833194_+|WP_012099663.1|DBSCAN-SWA MINIFSKKDSKKDNKNDTIEQEVIVEEKHEVETIDTMKFLKEMTIQIEGIIQQHNKVNGEHEVLEKLAKQIENHMVTVSNLTERTNESTDKLFSQGESLLEITKDTVNKSLEGKKSIEGMVKVIENLDIETKDTYENINALGEKLKEIGEIAQLISGIASKTNLLALNAAIEAARAGEQGKGFAVVADEVRKLAEMTGESSSNITNLISGIDSQTKNVLNSVEKSTLVVTEGVKSSKGALEKIEEVLDSFNRVEDDTDSLIKTINTQKEDISKIFNGINGVDKILTETNEQIIKHIDEAHKVDEKLEKSVYHIAQYVK >NZ_CP013847|1824993:1833194|1827664_1828426_+|WP_012704794.1|DBSCAN-SWA MRLLGIDLGSREVKIVLMENNIIVQKKKVSTMKFYRDYCSFHGKIVVDLEKLNIKGIDKAISTGYGKNNTDLEFFTPINEIKAHVYGGIYQSNLKDFILLDVGGQDVKVVKVEKGVATDLELNEKCAASCGRYLENMANVLEISLDEMSQYSENPVDLNSTCAVFSESELIGKIAEGVHIERLCAGVNYSLYKRLQPLLSKFRGKKLVITGGVANNHSIKKYLNNDYEEIVSVKDPQFNGAIGCCYYGSKFLK >NZ_CP013847|1824993:1833194|1828443_1828875_+|WP_011949100.1|DBSCAN-SWA MYTLKVEHNFDSAHFLAGYEGKCGNIHGHRWKVEIQVQAESLVQGGQLDGMIIDFGDLKKDVKSMVDYYDHALIIEKGTMRGQSLSSLKEDGFRIIEVNFRPTAENFAAFFYKIMKDRGYNVKSTTVYETPNNSATYEESGVI >NZ_CP013847|1824993:1833194|1828876_1829542_+|WP_011949101.1|DBSCAN-SWA MDFKVVERFVSINGEGRRCGQLAIFIRFAGCNLNCSYCDTLWANEKDVPYEVLSSKDIYEYIKSKEVKNVTLTGGEPLLQKGIMELLKLLSKDKELYVEIETNGSILLDEFLNIENSPSFTMDYKLPLSNMENKMALDNFKYLTKKDTVKFVSGSIEDLEKAREIINKYNLVDKTNVYISPVFGKINLDTIVEFMKNNRMNGVNLQLQLHKIIWEPSKRGV >NZ_CP013847|1824993:1833194|1826552_1827548_+|WP_012704832.1|DBSCAN-SWA MKKIGLTTTVPVEVLIAAGYTPVDLNNIFITSEDYLKYIDIAERDGFPKSLCAWIKGIYGACLENNIKEIVGVMEGDCSNTKALIEVFKLRGIKIYPFSFPHSHNLKDVEIEIRKFMDIFNVNEDKVEQVRKRLNRVRKLAKKIDEMTYIDNKVNGFENHLYQVSSSDFNGNIDEFEEHLKKVIEGMEKRESINKKLRLGYIGVPPMTGDIYEFSEKLNAHFVYNEVQREFAFPRGIEAANIFEQYYNYTYPYDNEFRIKELKKQIEKRKIDAIIHYTQAFCHRAVEDIVLKEELNIPMLNIEGDKLNTLDARTKLRLEAFLDMLLDLKHK >NZ_CP013847|1824993:1833194|1829545_1830136_+|WP_003358544.1|DBSCAN-SWA MAIDVKAIEEHIRGILIALGDDPEREGLKNTPKRVAKMYEEVFKGMCYSNDEIAEMFNVTFEDDLCINDNENDMVFMKEIEIFSHCEHHLALMYNMKVAIAYIPKKKIIGLSKIARIADMVGRRLQLQERIGSDIAEILQKITGSEDVAVIIEGEHGCMTTRGIKKPGTKTITTTLRGRFNTDPIVSNKLMMLYTK >NZ_CP013847|1824993:1833194|1831272_1832091_+|WP_012704400.1|protease|DBSCAN-SWA MEKFNENRGISIKESIKLFFEINIWLIIYGIPFTILAIYFKEHGLEVTYESIEQLGEIVAYIFIIKKIYKRFKSQENFRFKIKYKPTLKEGIFVIIATIAYIFVYDNTLGILLQKIPEADWVKNAFIEIESEPLLLQFSSLCLIAPIFEEIICRGIILEQLNKRCGATKAILISSLFFGIMHFNLHQGVNAFFIGVVMGVIYVKTDPLLLTILLHFVNNLYCLIAQYIPYLDQIESNFSVVRLICGVILLFLVYRFFNNSKIDLDRKLNLEA >NZ_CP013847|1824993:1833194|1830319_1830979_+|WP_012704981.1|DBSCAN-SWA MNKEKAIVVFSGGQDSTTCLFWAKKKYKEVIAVSFDYNQKHKLELDCAKDICKKYNIEHHILDLNLLNQLAPNSLTRQDITVDKSAPKEGVPNSFVDGRNLLFLSFVAVFAKQKGINTIITGVSQSDFSGYPDCRDVFIKSLNVTLNLAMDYEFEIITPLMWINKAETWKMAYDLGVLDIVKEETLTCYNGIKADGCGECPACKLRKKGYWEFEKYLMN >NZ_CP013847|1824993:1833194|1824993_1825938_-|WP_012705299.1|DBSCAN-SWA MKINRLLAIVVMLLNREKISASELAEKFEVSVRTIYRDIEAINLAGIPIVSQIGNNGGFYIIDNYKINHQLLTLEDMISIIDALKNMNKFLDNKNVEMAIEKVKNIVPKEKKEVFDLHFEQMCIDTLPWGFKKCEEENLKYKIIYDAVDNKNCIAFDYRNSKGEYNWRQVEPLTLVFKGFSWYLFSFCKLKNDYRFFKLSRMENLTVLHEKINENRISYKEYINISESEQVPTRVVLKFSERVRYRIDDCFDKDEIKFQEDGSVIVDTYLLEDDWIYSMILSYGECVEVLEPNHIREIIKDKCKKINDIYSNMT |
9 | uncultured_phage(33.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
2061053 : 2145100
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013847|2061053:2145100|DBSCAN-SWA ATTATTTAAAATATTTTCCTTTCTTTCTAATTATAGATATTAGTTCATCAGAAATTTTATTCATATTAACTTTAAGCTCTTTACTGATTTTCAAAGTGTAATCTATATTAGAAACTTCAATAGCTAGAATGTATCCCTTTATTTCATTATAATAAAGTTTAACTAAGTCTATAAAACTATAGCTATGTTGGGTATATCCATTTTTATGTGATGTATAAGTATCTAGAGGTAATATTGTTATATCTCCTATTTTTTTACCATAGTATCCCGCATCTAATATAAATAAGAAATCCTCCTTTTTTATTCTTGAAAGGCAATATTCAAAATCCGTTTCTCCTATTATAAGATCTATATGATTTTCTTTCAAAAATCCCTCAATATTTTTAGCTATTTTTATGGCTATACCATCATCACCCATTAAAATATTTCCTATAGAAATAACTTTAATAGCTATACTAATACTTCAACTTTAACTGGTTCATTATTATTACTTACTAAATGGGTGGCACAGGAAATGCAAGGATCAAAAGAACGAATTATTCTTCCTATTTCTACGGGTTTTTCTATATTATCTATTTTTGAGCCTATTAAGGATTTTTCTCCTACACCTCTTGTACCCTTTGAATCCTTAGGAGATATATTCCAAGCTGTAGGAGTTATAATATTATAGTACTTTATAGTTTTATTCTCTATTTTTATAAAGTGTGATAAGGCTCCCCTAGTAGTATCTATAAGACCTTCTCCAAAGGCGCCTTCTGGAATATTATATGCAGATTGATTATTAGATAGTAATTGAATCTTTTCTGATATATTATATAATATATTTATTATTTTTTTAGTTTCTAGAACACGGGCTATATTTCTATCCATAGAGGAATTGCCTCCGGTATATTCTCCTGCAATTTTTAATCGAGCTAGAGGACCTACTTCCATAGGTAAATCAGCATATCTAGGTGCTTTTACGAAACTATAAGCTCCTTCTTTTTTTAAATCTACAGTATATTCATTGTTCATAATCGGATTTTCTATTATAGTATCGCTTACATACCAAGCATAGCGAATGTTTTCTGTTATTTTATCTCTATCAAAATTTTCTAATTTATTATTTATTATTACTCCCGGTTTTACATAGCTTATATTTTTATCCTTATATTTATCAAATACACCAAAACTCATAAAATTCCCATAAGTGTTTCCAAGATTAAAATATTCAGGGTAATACTGAGCAATTATATTCATATCCTCTAACATATAGATATTTACAAACTTTTTTATTGCCTTTAATATGGATTGTATTTTTGTTAATTTGTAAGAATCTATATTTACAGTAACTCCTCCTACGAAAATACCATGACTATGAGGTGCTTTACCTCCCAATACAGCTAAGGCTTCATGGGCTAACCTACTATATTTTATGCCCTCTTCATAATGGGAACTTATTCTTTCATTTAGCTTTTTAGGCAATCTAAAATCACTATATTCCTGAGGGTATATAGGTCTTATATTAGGTAGGTTTACATAGCTTGGCACAGTAAAACAATAAAACTGCCTTAGGTGGTTTTGTATAAATTCAAATCCATGCATCATATCTCTTATATATATATCATTTATACTTGGAGTTATATTTAATGCATTTTCTAAAGCTAAAGTAGATGCCGTAGCATGGGCAGTAGAACATATGCCACATATTCTTTCAGTAAAATATATAGAATCTAAAGGAGGTCTTCCTTCTAACATTTTTTCAAAGCCTCTAAATAATAATCCGCTGGTTTCACCATCTACAATAATGTTGTCTTCTACCTTTACCTTTATTTCTAAAAATCCACTAATCCTAGTTATAGGATCAATAGTAATAATCTTTCCCATAATGACCTCCCATTTTTATAATTCAAAGTTTACTTAGTTATCTTAAGCATAAATAATTTAAACTAAAAAATTAATATACTTTATTTTTTAAACTATAGAAATTAATACCTAACAAAGGGCTCCATACCATCTGGAAATCTTTCTTGGGCACAGCCTATACAATTTGTGTTGTCTCCAATAGGCCAATTTACATAACCATTCCATTTTCTTCTGGGGCAATCTGTTTTTGTAACAGGTCCTCTACATCCTAACTTAAACATACATCCTTCTTCTCCAAATTTTTTGGCAAAGATTCTTTTATCAAAAAAGCCTCTTCTTGTACAACTATCATGAATAGTTATTCCATAAAATAATATAGGTCTCCCTTTATTATCTAATTCTGGTTTACCGTAAGTAACTAGATGAGCTAAAGTACCTACCACCCAGTCAGGATGACAAGGACACCCTGGTAATTTTATTACTTCTTTATTTATAACAGCGTCTACGCTTTTGCTACCAGAAGGATTAGGCTTAGCTGCAGAAATACCACCATAAGAAGAACAGGTTCCTACAGTTACCACATATTTTGCTTTTTCACCTGCCATTTTTATTGCTTCTAATGCGGTAACAGGTTTTCCTTTATAATTAGCAATAATGTTATAATAGCCATTTTCTTTAGTGGACACAGCTCCATCTACTAATAATATAAATTCTGTGTCCAAGGTATTTAAAAACTGTTCATATGCAAATTCTCCTTCAGCTCCCATTAAAGAATTATTAAAAGTTAAATTAACTATATTTCTAAGTATATAAATAAGCCCTGGATTTTCTGCGTTCAAAAGAGAAATTATATTTCCGGAACAGCCTGTTACTTCTAGCCATATAGCATTTATTTTTTTTGTTTTTTTATGATTAATTGATTCCATAGCTTCTTTGCAAAGCATTTTTGAAGTGGTATCTTTCCTTTCAATTAATGGGCAAAAGCTATTATTCATTACTCCTCCTAAAAATTTATTAATTACCATATAAAAAATATACTCCAATAAATTATATAAATAAAAATTATTTATTATGCTATTGGAACATAAATAAAGTTTGTGTGGATCTATTAATAATACTTAAAATTATTAATGATTATTAGAATTAATTAAGTTTTTTATTACATTATTGTAATGTTTCTGTAATATAAATAAATTCCTCTATGTCTTGTAAACATATATAATTCTATTCATAAAAGGAATGCTTAAAGGAGGTTTTATATTATGAAATTAGATAGTTTTAAATTAAAAATTATAGCAATGATACTTATGGTGTTAGATCATTTGCCTAAAGCTTTTAATAACACTCCAATATGGTTTGGATGGCTTGGTAGGTTGGTAGCTCCTATATTTTTCTTTTTTGTGGCAGAAGGATTTTTTCACACAAGGAGTAAGAGTAAATATTTAATAAGGTTATTTGGATGGGGCGCAATCATGTTTGCAGGATCATCAATATTAAATTATGCTCTACCAGGAAAGGAGCCTTTACAAAATAATATATTTTTATCCTTAGGATTATCAGTACTTTTGATGTGTATTATTGATTATACTAGAAAAAGTAAAAATTATAAATTTGGTATTCCGTTAGCTATTATAGTGAGTATAGTATCTTTGTTTACAGAAGCATCTTTTGATGGAGTATTAATGACTTTAGTTTTCTACTTTTTTAGAGAGGATAAAATTAAATTATCTATTGGATATATTTTAATTTCTTTATTTGAATTTATTATGGTTAGTGGTGAAGGGCTAACTTATTTGAATTTATTCGTATTAAATTACCAATGGTTAATGATTTTTGCTCTTCCTCTTATTCTTATGTATAACGGTGAAAGAGGACTAAACAATAAATTTATAAAATATATGTTTTATGCTTTTTATCCTATACATTTATGGATAATTACTATAATATCTCACTTTCTAAAATAATATAAAAAGGTTAGTACTTATACTGTATAATTGTAGATTTTACCCGTGGTGGTTATTTAATATCTACAATTATATTTTTATTTCTGATATAAAAATTAGGTAGGGTTAATATTTTTTTACTTAAAATATTAACCCTACTACATATAATAAATAAATAAAAATAAGTATTTAATATATATTAATATTATATTAGAAAAAACTTTAAAAAAGCATTGTAGTTATATGAGTTTTTTTTGCATATAATGATAGTATAGAGATATAACAAAACCTAATTAGTGTTTACTTATGACTATACTAGGTGGTAAAATTATGGTATACTATAAAAAAATTCAAATTTCGTAGAAGTGGATGGCTACGGTGGTTGTACGTTTTCCACCTTGGGCTATAGATGATTTTTCATTATAGCTTAAGGGGGTGGTATTGGATATGCTAGAACTTTTAATAAAAGGAGTTTTTGTGATTTGTATTATTAGTTTAATATTGAAACACAATCTTTTTATTTCCACTATAAAAATTAAGGTTAGATTTCTTGGTTTAGATATAGAAGTTGATAGCAAAGAGAAAAAGCACCCATCCTCCAAAGATTAGTGCCTTTTCCCTTGTTTAACATATTTATAATTTAAAAATCCAATAGCCCTAAAACAACACCATTAAAGTGGTAAGCAGTTGTACCAAATAATAAATTTGGACTTTTGCTTAAAAACGTTCTAGGATCGGCTTAGTGTTCTCAGCACTGAGCCTTTTCTAATTAGAATTTTTAAAAACTTGGTTTTAAAGTTCTGTACTTCTCAGTTTGCCTGTGAATTTTACCTAATATATATTATAACAAAAATTATATAAAAATAAACATAATAACTTAATTAATATAAATATTTTATAACCATAAATATTATATTCATATACAGTACTTTCAGTACTATAAAAATTAAAAAATATATTTAGTACTTTTTATTAATGACCCTAAACTTTATTTATTATAAATCCGAAGAAATTATTACATAAATTCAAAAAATATAATAAAATTTTTGAACTGTATTCCATTGCTCTAGACATATATACTTGTAAATTTTTTTATTCAGTATATATTTATATTAATTATTTTCTATGAAACATAGATTTTATATTATCATTATATGTTATTAAGGGTACTTTTTCAATGATTTTATTGTAAATATAGTTAAATCATACATT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86 | Clostridium_phage(56.25%) | protease,capsid,terminase,head,integrase,portal,tail | attL 2102953:2103012|attR 2145240:2145337 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2565788 : 2614259
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013847|2565788:2614259|DBSCAN-SWA 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81 | Clostridium_phage(37.74%) | tail,capsid,terminase,integrase,portal,plate | attL 2589925:2589942|attR 2611340:2611357 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2658514 : 2698278
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013847|2658514:2698278|DBSCAN-SWA 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51 | Clostridium_phage(85.71%) | tail,capsid,terminase,head,portal,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
3254740 : 3264161
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013847|3254740:3264161|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013847|3254740:3264161|3258253_3259696_-|WP_003357998.1|DBSCAN-SWA MCYMLDDLNENMPFDLEGDKFKEECGVFGVFSKDNESKSAEITYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGEKFKYHKGMGLVSDVFSKETIEGLIGNSAIGHVRYSTTGASKSDNAQPIVGTYKLGSIAIAHNGNLVNAAVIRELLEDGGCIFQTSIDTEVLLNLIARSAKKGIDKAVVDAIQAIKGSYAIVILTEDKLIGARDPHGIRPMCLGKIGDDYLLSSESCAFDCVGGEFIRDIEPGEIVIIDESGINSIKFTEKTKCHTCAFEYIYFARPDSTMDGINVYESRVRAGRKLYEEYPVEADIVIGVPDSGIPAAVGYAEASGIPYGIGFIKNKYVGRTFIAPSQELREKAVSVKLNPLKINVEGKRVVIIDDSIVRGTTSKRLVQILRKAGAKEVHFRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRKDLIGAHSEVEEIREKIGADSLAYISMEGLVETLNKDKGFCLGCFNGVYPISAPIEMPKDSLE >NZ_CP013847|3254740:3264161|3260497_3260977_-|WP_012705495.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSKSDTDKMKGAAKALKEFSIEYKAYILSAHRVPEKLMETIEDLEKEGYECIIAGAGLAAHLPGVIASHTVLPVIGVPIEAAVGGMDSLLSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQILSLKYEKLREKLIEYRKNMKEKFINDNKEGVEL >NZ_CP013847|3254740:3264161|3261605_3264161_-|WP_012704621.1|DBSCAN-SWA MYEFILNERNVSVSEDINLLEYLRDNEDLTSVKNGCAEGACGACMILVNGKALRACICTTAKVNGKDVKTVEGLTEFEKDVFTWAFSKAGAVQCGYCIPGMIISAKALLDKNLNPNKKEIKTAIRGNVCRCTGYVKIIKAIEMAAEAFRNGKLPFAKEYKGKIGENIPRIDAKDKILGIGKYVDDMKIEGMVYGSALRSKYPRALVKSIDISEALKHPEVEAILTAEDVPGNRLIGHIVKDWPAMIAVGEETRYVGDAVALVAAKSKKTLKEILNLIKVEYEELEPISNPNIAIAEDAPKIHPKGNILTVEKVNRGDVDEAIANSKYVVTNHYSTPFTEHAFLEPESALAMPDGDGVIIYTGSQGIYDEQREISELLGLPKEKVRTISKYVGGGFGGKEDMSVQHHAALLAWTIKKPVKITLSRKESIKIHPKRHAMEMTITTACDEKGNLTAFKADIISDTGAYASLGGPVLQRACTHAAGPYKCPNVKIKGTAVYTNNPPGGAFRGFGVTQSVFGSECNLNLLAEKVGISPWEIRFKNAVEPGDALPNGQIADKGTAIKETILAVKDVYKKSKCAGIACCMKNSGVGVGIPDIGRCNLIVIDGKVHIRTSAACIGQGLGTILTQIICETIGLLPEQIILDLPDTKFAPDSGTTTASRQTVFTGEATRMASLKLKEKLLTTSLEECEGEEFYGEYESITDPINSDKKNPVSHVAYGYATQVVILDDDGKVEKVVAAHDVGKAINLTNVEGQIEGGIVMGLGYAFTEDYPLNKSIPTAKFGTLGLFRATDIPEIETTIIEKNTNDLAYGAKGIGEITTIPTAPAAQGAYYKFDGNFRKKLPLEDTAYRRKK >NZ_CP013847|3254740:3264161|3257197_3258193_-|WP_012099415.1|DBSCAN-SWA MVSYKEAGVNIEEGYKSVDLIKKHASKTFTKGVLNNLGSFAGMFELPKYKNPVLVSGTDGVGTKLDIAFRMKKYNTVGIDCVAMCINDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVAAQLVEGVSNGCIQSECALIGGETAEMPGFYRDGEYDIAGFAVGIAEKDEIIDGSKIEDGDILIGIASSGPHSNGYSLIRKLVEDLHKDFEGNKIGNTLLTPTKIYVKPVMKLLEKYNIKGMAHVTGGGFYENIPRMFKEDFTAVINKKSYPLPNIFSHLISLGIEEDHMYNTFNMGIGFVLCVNEKDGENIIKDLIEMGEKGYKIGYVKKGDKSVELI >NZ_CP013847|3254740:3264161|3256453_3257071_-|WP_012705191.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGSNLQSIIDKIEEGYIKNCKIEMVIGDRSNIYGIERAEKKGIKTLTLDRKIYKSNLSNKICECLYGNVDLIVLAGWLSILNGDLVNKFENKIINIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHQKALEYGVKVSGCTVHFVDEGTDSGPIIIQKSVPVFAEDTAEILQKRVLEKEHEALPEAIKLISEEKVKLQGRKVFIKTY >NZ_CP013847|3254740:3264161|3254740_3256240_-|WP_012705771.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVFDKTGILDLAKFLESRDVEIISTGGTYKHLKENGVKVIDIEEVTGFPEMLDGRVKTLNPLIHGGILAIRDNEEHMKVIEEKGINPIDMVVVNLYPFFNKVEENLSFDEKVEFIDIGGPTMIRAAAKNFKDVVVLTDTKDYENVINEIKENNQVNTQTRKKLAGKVFNLMSAYDAAISNFLLEEEYPEYLTLSYKKNMDLRYGENPHQTAAYYTSTVGKYPMKNFEKLNGKELSYNNIKDMDIAWKTVCEFEEVACCALKHNTPCGVAIGDTVQEAYTKAYECDPISIFGGIVAFNRKVDKETAENLAKIFLEIVVAPDFDEDALEVLKNKKNLRVIKCEEKSTEGKDMAKVDGGILVQKSDNKLLENTKVVTEKSPTEQEMKDLIFGMKVVKYVKSNAIVVVKDGMAKGIGGGQVNRIWAAKEALDRAGDGVVLASDAFFPFGDVAEEAAKWGIKAIIQPGGSIRDEESIKVCNEKGISMVFTGIRHFKH >NZ_CP013847|3254740:3264161|3259793_3260498_-|WP_012047943.1|DBSCAN-SWA MEKKDMLYEGKAKKIFRTDDKDTVVVYYKDDATAFNGEKKGTIEDKGVMNNSITAMLFELLEKKGVKTHFIEKINEREQLCKKVEIVPLEVIVRNIAAGSMAKRLGLSEGRKLDTTVFEISYKNDDLNDPLINDYHAVAIGLTTFEELKEMYSIAEKVNNTLKEFFDEQGINLVDFKIEIGRFNGELLLADEISPDTCRLWDKSTGEKLDKDRFRRDMGNVKEAYMEILKRVNK |
7 | Synechococcus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
3413683 : 3436543
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013847|3413683:3436543|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013847|3413683:3436543|3432725_3432935_-|WP_012704308.1|DBSCAN-SWA MTTAKKLKAYRCLKGAKQEDIARLIGVSLNTYNFKENGKKSFTLNEAKIISDFFDTTIDELFFRRNGKL >NZ_CP013847|3413683:3436543|3422434_3422776_-|WP_012705004.1|DBSCAN-SWA MAHMGYKNFREPVVYILDQELRKRNFKNQINTNEDSKYIGELPEYPCRIIRDSNNKAYKFIYANGTDMQWQEELIRNAEGKVYRIKTTYPNNTNKTIQLIKDNHGKLEIIDYV >NZ_CP013847|3413683:3436543|3416923_3418819_-|WP_012704958.1|DBSCAN-SWA 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MSEFFNVTLDKDIILDDSVISNKTGWSSEKIQKEIIDKRITKFEELEDVDVTNKKNKQLVAYSEETGKFTTIDGIDAGEIVGAGMKQISKMGIVGSAETPRSVNIPVNTVDFKVPRVNVLRYDTENTQDLISVKNEFTNDESNDFIDDNMMIFDGKAHLETNHISDFEVVQDTESSTEYSVNVDKTLFKKIEGFETFEDGVIQKLKTTAIPFDRLLIPKGDMNLSNVDHIDYFRLTANGNNITIVCSVDSGNTWKTFSGEKWKNVNLTVDDVRKSGMNIATFNAINDVFWNELVTTKKIRFAYLFSMDSITDIEEIDKLDLQYDGVGRWRQVKEDLYEVIYASNTLLQVECKFSGDIKINY >NZ_CP013847|3413683:3436543|3426666_3427554_-|WP_012704139.1|DBSCAN-SWA MISGKTLVNVVKVNFIDEVTNTKHTIETSNEIDIEPINSKGKRDILRIKNKIYGINETDDIVIGYKLKMKDNLFNIETMALIDGGTIQDNKYCGTEVGIAVERHPFTMEIFTEEKDYSRTTGYVKFVYKHCKGKPAKYKIQDGKFLVSSYEAESIPFRNEKPVEIEFINKLEENDNGEKPGESTPIEDIGVEGGEVENNNPDVGVSITNRVVWSFSNQINQDDVNLENFIIKRKSDNSRVNGNVTIDDTKKIVTFVPDSLAIDTVYIAEAKEINKLDGSGKTTALSTEFKTIKIR >NZ_CP013847|3413683:3436543|3423860_3424295_-|WP_012704056.1|DBSCAN-SWA MDLNRIKDFKVDLLYEDRKNTGGVITNYKPPRPAYFRKGIRTVQGYTYFEKSVKSDCIIEFTVAFNIKGENDEKTQSNITKFLNFRKNYSGRFIFIDEFGIQYKGYLQNKFEIDTPIEGDIYYINLELLCNHEASGWVKDNDKV >NZ_CP013847|3413683:3436543|3424307_3425849_-|WP_012705047.1|DBSCAN-SWA MAVNVGEAVAHLTLDTSEFKKALNGAGKDLEIFVHKVEKEKTRIEKLQEALAKEAGTLSKIGKSMEKPSAAAQNLLKTGMKNTLAEEAKSKNPKKGPANIAKGNYDKIQKDIQASIKKVQDSFAQLQTSIVKQLIPIFNNQLVPILNNKLIPIFTKLANKAVELMNSFNKLPNPVKNAIAIIIVSIAGVAKTFTVLSKLVGTINNVIGIFGKLKKAGGIFGLLKTIITSKTLLILVAIAAIGLIVYEVIKHWDTLKKYATRFGNFIANIFKGIGRVINSIIQGAIHAFQGFIRILQWVGGMVHNIINGCIAIFRGVGTILHGIVQGWINIFRGLGNLAGALFNIGRNIVEGLINGIRAMFGRVGQVIGNLASEISSRFKKMLGINSPSRVFADYGNFIGEGLIHGIDNQESAINNKFKGIANKIKGLGNVRPNFNGLNNMSLSGAYGGTYASPYGPNNMNKSMGLTQDIKMYVTIPNADKEGANKIANEFKQMTESSMKNVMTGLFMNDVLRD >NZ_CP013847|3413683:3436543|3435055_3436543_+|WP_012704213.1|DBSCAN-SWA MLFNSMHFLLFFPIVTFIYFFIPHKFRYIWLLITSYYFYMSWNPKYALLIGISTIITYLSGILIEKSNKITDKQKSKFFKKLWVFLSLFINLSILFLFKYCNFFTYTLTKIFSLINITIKVPSFDFILPVGISFYTFQALSYTIDVYRGNIKFEKNLGKYALFVSFFPQLVAGPIEKSKDLLNQFNEKHIFDYNRVKNGLVLMLWGFFQKVFVSDRLAILVDTVFNNPSNYKGLEIIVASVFFAIQIYCDFSSYSNIARGAAEVMGFDLSLNFKQPYFSKSIQEFWRRWHITLGAWFKDYLYIPLGGNKCSKWRRYFNNMVVFLISGLWHGAAINFIIWGGLHGFYIIIGDMLKPLKEKIISNLKIKTNVFSFKLFQTLFTFILVDFSWIFFRANSFSEAKLLIKNMFYFNPWIFTYGSIYKLGLDQKDFKMSILGILIVFIIDSIARNKDVRVELSNQNIVFRWAIYLSAIFFVLILGIYGAGYDANQFIYFQF >NZ_CP013847|3413683:3436543|3430285_3430606_-|WP_012704130.1|DBSCAN-SWA MSTILVKEIENKVFEEIGSFREENAVLKILLKEYVKKSIDYEKLLKESINLLDKHQEALEFLRVAKNSWTDEVVKHYFTIKDLQKALDIVGKEIMIYELNKNNKEM >NZ_CP013847|3413683:3436543|3426033_3426276_-|WP_162266843.1|DBSCAN-SWA MKSQRILSVISISKQYRQRPSEIIGLTNDYEAFCFDEACVYILNEISKEDARDPKFIDGDRTNKTNNEDVIQWLNANNKS >NZ_CP013847|3413683:3436543|3427983_3428331_-|WP_012704384.1|DBSCAN-SWA MREFEVNIDSVIDGLSEFEMQSKTAISGYADIAAKKLEEDAKKNAPWKDQSGKDIETIKGGKQWEGDKCNIYISGNKDYYSSLELCNDKKYAILKPTIDKLSPQILKGMSNLFGK >NZ_CP013847|3413683:3436543|3415653_3416652_-|WP_012705721.1|DBSCAN-SWA MKLIQVKNGLLEAENFFLASSFADFAGESNITRDIKTGKLKLISNNKIERKFDYKEFVIEVEKENFNDIKDMDYSMLYLGNSDHIFGIKDLKSNEQNRYWKILKKDNYIQAYSSNDGKNYTNMGGMEFAEPLTKQGFMKYSDEDFILNNYKVYANPYVTIQNFPENTLCELYDLDNNLIKTRLFNSDMECKVFIDSKISGYFTFKDRDGKVIYTSDALQLQYGDMWVFSPYNFEIIYHGNVVTNVSPAMLQDLEELITIKNIGDKDYNNIKIGTETPSNDLIQLSFDGINYADSLTIDSIRQSESKGIYVKITKNAENHNFVVRDFHLVISE >NZ_CP013847|3413683:3436543|3422788_3423874_-|WP_012705384.1|DBSCAN-SWA MTKCKVEFYKKNGYQAFENGDANKITLEHCLVSVKINRNLTTPTAEATITAQYENLPTAIFAGGTQGIIDNFAQVKIYIEDVLQFTGVIKKYDYNTLDKTIEMTCHDMYYRMLNLCDKELKFYNKTAADIISTVVSDAKCSFQRSGGNNYTVPKLECEIGTMYNDIISNLVETMYARIRANKNGAIILEEQYPAYNESNHEANHHDYVLSVDTNLSSETASRDSSLMRNILKICCNDKYSIFESKAMTSYLNGERWVDIIDNPLASTSLLKQKVAGYKFLDMWRESTALNVVPVAGIPNIDLGQVVKLVNNQRGNGWYLIVGISTEINADTYVDTLQLQGMRDKTKVYDQCIQIGSGRLKQ >NZ_CP013847|3413683:3436543|3433838_3433988_+|WP_012705276.1|DBSCAN-SWA MFNFSGVLSIKKEGEIIYEKKDTFTLNRKKTSCKKSSKDKIQLVHKVNT >NZ_CP013847|3413683:3436543|3428700_3428985_-|WP_003357791.1|DBSCAN-SWA MRTPLEILKFNLQEKQYPYFEDKELELLLEINNNDVEKSSYKGCILKAIADDGIEVAGVKLQSNRAYWLTLAEHFKEEQKILKNQISVERVDEH >NZ_CP013847|3413683:3436543|3416663_3416918_-|WP_003360052.1|DBSCAN-SWA MLTSTIDFKKTRQKMWGILKNKTLAQLPYGHETDKNGSEITSYATNCYEDALEEAHTLLANGIGTKDIQIVEFVPYDYIMQPRV >NZ_CP013847|3413683:3436543|3431452_3432358_-|WP_012705580.1|DBSCAN-SWA MDKKESGDMLAEVKWIKITTNMFDDEKIKLIDAMPERDTVHYIWMRLLVQAGKTNANGYIFLNDNVPYTEEMLSTIFNRPLNSLRFALKVLRDFGMIQIQEDKLIKITNWSKHQNIEGMEKVRQQTRERVAKHRAKKKELLEETKKQSCKNNDNKKNVMLHETLSNGRDIDIEDIDIEIKEDRKSDIRKNLDKINEAYFNTFYRQISATYLNQVLKVMAKEDYTDLLIYALNITKRREQEQGKIKGFKYTMSILESWINKGYKLPQDVKKNEISKKWREGEVYETSRRSFGEDLKKQGIGL >NZ_CP013847|3413683:3436543|3426235_3426652_-|WP_003357967.1|DBSCAN-SWA MDLKVTNIEDLKKVAQGEVIQLPQFGQGIPFNARVKRVSLLNLVRKGVVPNKLLSAAEELFYGKQSSKENVDLTQMTDVMYIMAENALVEPSIEDLKSVELELTDEQIVALFNYTQEGVSELDSFREESENTECNINK >NZ_CP013847|3413683:3436543|3430662_3431463_-|WP_012704131.1|DBSCAN-SWA MDYNIAGENERVEICSVCGEAIEKITYIPGLNRCIKGPVMCKCKREALMAKEKEEINKEKQLRLKKIIKNSLIDEKFRNSKLKNWDFTKGNDKMYKIANKYTKKFENMKKESVGLLLYGSPGNGKTYTVACIANFLIEKMLPVICVNADSLLNRIKDTYKKSGKEVEEDILRGLDNADLLIINDLGTEQDTEWTRTKIYNILDSRYRNGLPLIITTNLSLIELKNRYEKRTYYRILEMCTPILNDGKNIREEKAKEKTEILKELLK >NZ_CP013847|3413683:3436543|3432451_3432664_-|WP_012704458.1|DBSCAN-SWA MTVIKTKEYRIIRNLSISKLSCKSKIARSYITELEEGKYGNPGLKVICNLCKALQITPNELIDQELWKWW >NZ_CP013847|3413683:3436543|3429651_3430173_-|WP_012704555.1|DBSCAN-SWA MLDKKLYIKTEERLYRYFRSKKELSKLKNRIKHLSNRIEIIMDKIKNNNVTLEEESRSRTYDEIVQTSSNGTSYAERELIRQIERLEIELGEKIKKKGKVEYKIREIEEEISVMEDNLSSLNEENKKFIRLKYGENKSVDWIAVEMFGRARSTAYRKKNELVEHVAQLNNLIV >NZ_CP013847|3413683:3436543|3413683_3414466_-|WP_012705457.1|DBSCAN-SWA MNAYYLNPNDRGTVQLSNNNRSVTSVLTSWQGVRSTLPVNKTQKQKIYIEIYINSFNANNSIIALAKKDASLTNYNIGNSYWSDGNGYGEAWKIGDTIGILYDSTINNGTLEFYKNGISEGVRSTNLNNSELYLEILVFKGSKLQELIVNFGEKPFKYNKPNGYDKLNINSLFLIKQKSNYYTIKSEFYKNGQVVPINKLEGKETLTKTDFEAYGIDDLNLLTKPMDAQDVKGTDKGSLGNGKLFEILFSNDFLSIGEVK >NZ_CP013847|3413683:3436543|3420091_3421069_-|WP_012703835.1|DBSCAN-SWA MSLPKYIINFEELTEDLKNHLLSLIDDNIRINYPEINTNNIQNLLQQLKDLLPSVQYEGLKKKIDTFIYRKIEGIQKVKGILLDIPAIQNDYKEQIKFDKDIYITGLHFNQTGWKKDDRYSLEVNKIKIIDNATTKEIGEHKYFNTFYKVNANTLISFIFHNLSGNSRQTMIDLEYIDGEDSNIPIEPPGIEDIDNEWDIAVVMNWEENTDADIDLHGEIDGKKVWYGNKSYDGFYLNFDYTSHKTNKNPEIISVKGYKNKKLLISIKNFNGVELKEPVTLEIYQYRPYGNKLLKKFNVNLDTNRDLKDIFIMDLNTLKITNLNK >NZ_CP013847|3413683:3436543|3421070_3422420_-|WP_012704658.1|DBSCAN-SWA MGLPSYVVNFDELSDLIKDYLQNGVKVDIGNINFSTKDMENLLSEIKDKIQGVDYNDLINALNALGVKLDNLSGNLGISGTQKIYGKMLEIPAVKGQHIIEFKGNGQITGITYSQSSWRFEDSWDLQVGNDKLFESVRTKEYGEHKFLNVFYPINGTVKFIYNNISGTSKILWVDFNILENSNLPTPTTPTIPTTSEKNYRFLAIGESEYTLQGANNLMGCTYDADNMSNLFKEHKESAKFTKNIVAKNKTKSEALNLIKSTFQDAQDNDISYLFWSGHGTVYEDKFALVAKDNIITVYELQTILDDIKGTKVIFIDTCHSGLAIDKNFAYTLAVVEEKLRSIDKTLNKQGYKVLTASAGSETSGDLSAGYNGNPNPSGAFTWALTQSIKTKKSDKDKNRIVTLEELYQSVLHFYDEFNIKNPYLKITQTAQVYPRNDTSSIFEYKEGA >NZ_CP013847|3413683:3436543|3418833_3420069_-|WP_012703961.1|DBSCAN-SWA MATDNFYFVEGNTSVKNLVKTLATEITQNSGIYKWDLVYPDSMDKIGSTGEESTINLITDDSKTDKVDTVFTVGSQNDKCIIKVITTYGKEFYVKIDREKADLNKEEKKALVDFKSLHRYSTASGYGTRTDAQVLEVMAGISDRWSKSGDYNAYVSAMTKSNSINNIKLQISDKLNADKTDLGISKNIQAEYNYRLAWYRKLQPEIKDFLPVQYWINITKDSINLVLRGDPSADVHPYENYLTSYAYIGALKPVEDSAYTDDKYNFGITVSSDIEPNYSKFYGERTATGVTDMCMIANKIGMPYQPHYPAFYATNPFMDKCNVEGSRYNHKKHQFSDITLVHPVDMERGKMINVLVGDASAINDTDRLAYKKDTEEEEYYKKFKITAPYCFLNNSANINYCVAIRCYKTTK >NZ_CP013847|3413683:3436543|3433126_3433537_+|WP_003360073.1|DBSCAN-SWA MAEIKDRLKCERLRKDLNQTELAKFLNVSKQTVSNWENGNRIPDTLTLSKLADFFNCSVDYILGRSENRNGIISKANIDGSNYEFELDKSIFPNGITREQMINYIKELEERNKELEKEAEISRKLKEAGFDFNPDK >NZ_CP013847|3413683:3436543|3427558_3427978_-|WP_012704829.1|DBSCAN-SWA MSKFNYKVPGDSIQQDIINNAIPETLWQKVYLYLKKLGYNVYAPGQKRNKCTESYVVIRENGVHALVGNISGYKLFDIIVYRPMDQYSTMEFYVENLKEALKKIEDLRPTGNETPSIIDYDVQAYTTSIEYQQFKSLRR >NZ_CP013847|3413683:3436543|3428335_3428701_-|WP_003357709.1|DBSCAN-SWA MANMNRGKISKKIYEQLEKKDLLREIKILRIGKNAFDEKLDEVYVCTIKGYYYRNNSNIITTSMEGLEFNNLYNDKLLIIYNDISSKIQKDDYFILDGTKYEIVDTGNIQNLVFDMILNRV |
28 | Clostridium_phage(81.82%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013847.1|WP_012704391.1|1688727_1688889_+|hypothetical-protein |
1688727_1688889_+
Protein sequences of NZ_CP013847.1|WP_012704391.1|1688727_1688889_+|hypothetical-protein>NZ_CP013847.1|WP_012704391.1|1688727_1688889_+|hypothetical-protein MFYTVDQITEMLQISKSKAYKITASLNKELKKMGYITIAGRVPKKFFEEKYYM |
53 aa aa | NA |
HTH_3,HTH_XRE
HTH_3,HTH_XRE HTH domain information
|
NA | 1685572-1708298 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.2|2456608|37|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013847 position: 1695148-1695184, mismatch: 1 aggttaagtcagtaatgataccttacttagaagatta CRISPR spacer aggttaaatcagtaatgataccttacttagaagatta Protospacer *******.***************************** 2. spacer 5.5|2657220|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013847 position: 1696708-1696743, mismatch: 1 taatacattaaaaaaatacaaagcatatctaaatgg CRISPR spacer taatacattgaaaaaatacaaagcatatctaaatgg Protospacer *********.************************** |
|||||||||||||||||||||||||
| NZ_CP013847.1|WP_012705140.1|1689254_1689452_+|hypothetical-protein |
1689254_1689452_+
Protein sequences of NZ_CP013847.1|WP_012705140.1|1689254_1689452_+|hypothetical-protein>NZ_CP013847.1|WP_012705140.1|1689254_1689452_+|hypothetical-protein MKKYRVKKEFIYDNTQLEYTDLYQQACNLGYAFVKDGNDYRMITINEYKTKPSLLQVDLVNLEII |
65 aa aa | NA |
HTH_7
HTH_7 HTH domain information
|
NA | 1685572-1708298 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.2|2456608|37|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013847 position: 1695148-1695184, mismatch: 1 aggttaagtcagtaatgataccttacttagaagatta CRISPR spacer aggttaaatcagtaatgataccttacttagaagatta Protospacer *******.***************************** 2. spacer 5.5|2657220|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013847 position: 1696708-1696743, mismatch: 1 taatacattaaaaaaatacaaagcatatctaaatgg CRISPR spacer taatacattgaaaaaatacaaagcatatctaaatgg Protospacer *********.************************** |
|||||||||||||||||||||||||
| NZ_CP013847.1|WP_012704628.1|1689465_1689609_+|hypothetical-protein |
1689465_1689609_+
Protein sequences of NZ_CP013847.1|WP_012704628.1|1689465_1689609_+|hypothetical-protein>NZ_CP013847.1|WP_012704628.1|1689465_1689609_+|hypothetical-protein MTPYEQLIKQIEESFNYSNADAEEYGKKLKHLSLVALEEIEEEFKNA |
47 aa aa | NA |
HTH_7
HTH_7 HTH domain information
|
NA | 1685572-1708298 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.2|2456608|37|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013847 position: 1695148-1695184, mismatch: 1 aggttaagtcagtaatgataccttacttagaagatta CRISPR spacer aggttaaatcagtaatgataccttacttagaagatta Protospacer *******.***************************** 2. spacer 5.5|2657220|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013847 position: 1696708-1696743, mismatch: 1 taatacattaaaaaaatacaaagcatatctaaatgg CRISPR spacer taatacattgaaaaaatacaaagcatatctaaatgg Protospacer *********.************************** |
|||||||||||||||||||||||||
| NZ_CP013847.1|WP_012703798.1|1689601_1689769_+|hypothetical-protein |
1689601_1689769_+
Protein sequences of NZ_CP013847.1|WP_012703798.1|1689601_1689769_+|hypothetical-protein>NZ_CP013847.1|WP_012703798.1|1689601_1689769_+|hypothetical-protein MLRLGEIILAIYSLVILLAFIGVDIKQLKKIKDTGWITVIFIPIIIFLLNIIWRC |
55 aa aa | NA |
HTH_7
HTH_7 HTH domain information
|
NA | 1685572-1708298 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.2|2456608|37|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013847 position: 1695148-1695184, mismatch: 1 aggttaagtcagtaatgataccttacttagaagatta CRISPR spacer aggttaaatcagtaatgataccttacttagaagatta Protospacer *******.***************************** 2. spacer 5.5|2657220|36|NZ_CP013847|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013847 position: 1696708-1696743, mismatch: 1 taatacattaaaaaaatacaaagcatatctaaatgg CRISPR spacer taatacattgaaaaaatacaaagcatatctaaatgg Protospacer *********.************************** |
2. NZ_CP013848
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
0 : 8940
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013848|0:8940|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013848|0:8940|8580_8940_+|WP_061322252.1|DBSCAN-SWA MHKRIALVRKDNNLSQAAFGKKLGVSRDVISNIEYNRVAPKQLFIDHLCKVCKVNKEWLMTGTGQMYSVPEEDLLLAKALADIASSENSTVHTIVSKLTKLDEEHLDLVLNLITALSKK >NZ_CP013848|0:8940|1833_1965_-|WP_053338055.1|DBSCAN-SWA MNIYQKKIAKRAKLIKKQTGFPWSACKGIAKYRALYDFIRICG >NZ_CP013848|0:8940|148_322_-|WP_169989762.1|DBSCAN-SWA MSYVDELLNRAFKSVVSKIWADARPKNKHRKRVKNRNRLYKIKLQLGRVTRKKKGGR >NZ_CP013848|0:8940|3829_4549_-|WP_101526888.1|DBSCAN-SWA MNNLENSIKDCITKEIEKGIIEKVIAEQLEKCIEKSISDMFSWGGDVKKVVEEKVKSVMIPYLENYDYSQYIVKLDSVLTDVLKSSTLENRNLLENFKNLMVSEDGSREVKISDIFSEWNEYCKSEIDNDELDFDCGGAYITTSFDVEEVSETWSSYKTFMVRFECEEDEKLKFEFSIHAWKPEEGSKYTSQYMKTTDLRSLRYLNDFEILMMRISEGYENIILDSEGDSEDTFIEYEE >NZ_CP013848|0:8940|1991_2138_-|WP_169989764.1|DBSCAN-SWA MLYKEDFESLKLLAENIQIYTELNKKDVVKELIKEMREQLNIIEKFYN >NZ_CP013848|0:8940|507_867_-|WP_101526907.1|DBSCAN-SWA MKKRQCWFKAEFIQNKNIQHLSDDKRFYTSDNKSRRHKEICKQLNKIYESKNHDYGDSFGETYKNLGIISAVTRITDKVNRLQSLCIKEHKVKDESIKDTLKDLANYTIMTLIELKEGE >NZ_CP013848|0:8940|5275_5677_-|WP_101526891.1|DBSCAN-SWA MLKRWSPKEIQLLKKYCGKIPNKELFKMFSNRTKRAVLNKAVEKGYLERNGIVEKEQKIREKENNFNIKIQNGDYVKVDILHENARKTRNIKGTITDITKYFILIKSNKYKECFLKNDLKCGRVKIEVLNKCS >NZ_CP013848|0:8940|3359_3788_-|WP_101526887.1|DBSCAN-SWA MNAAVMFSSETDLWATPQDFFDKLNKEFNFDLDPCATKENAKCSKYFTKEIDGLKQDWGGYKVFCNPPYGREISKWVEKAYKESKKQNTTVVMLIPARTDTKYFHSYIYHKAKEIRFIKGRLKFGNAKNSAPFPSMIVVFRG >NZ_CP013848|0:8940|8260_8422_-|WP_154695592.1|DBSCAN-SWA MNSEKILEIIPRLKLLDETELDTINKAIDSCIIVQSLKNMEKREMKNFKKIES >NZ_CP013848|0:8940|4967_5285_-|WP_101526890.1|DBSCAN-SWA MQLMVLEHSTKLGIDNRKLTLENFVDKLQEEVTELKEAVKNKNNTDHIVEEAWDCLQMCTEVLDKLESKHNVNLKTSLNKHHKKIKERGWKAKKMIIFQVFNDYH >NZ_CP013848|0:8940|4655_4955_-|WP_101526889.1|DBSCAN-SWA MKVEITKRYCDICKKEIQWHDDSRTNEIIVKVVFGNEKGHCRDSIYETKEVCDECMEEMGFTVLPNSWELNKEKNNLDGKFKNIIRKIFNRESGGIKNK >NZ_CP013848|0:8940|5654_6080_-|WP_101526892.1|DBSCAN-SWA MEDVRNQLYSFIEKYGTLDPRTLEKSRELDSLIVKEMKKIKPISMLEAVKEIEELKSLNKSLAQKLSEKTVLNMELESQLKKAKEEIKILKDSASLWADEVAKNYHLTGDLEKSQRMTGIEIMAYELSKGRENNSAKEMES >NZ_CP013848|0:8940|6096_7377_-|WP_101526893.1|DBSCAN-SWA MLPHSIEAEKNLLGSILIENDIISDISEILTPDDFYNKSNKILYSKMLDMHYKNIAIDTLTLSNTLGVENLEAIGGISYITEIASGVVTVSNAKSYADIVKDKANRRKLIKVCTLALGEAKEKDIKSVSVKLEDILLEINNTKKEEIVTDEELMNDTLAVIQKNYENGGEIPGMKTGLKSLDKATNGLKRGDVIVIAGRPSMGKTCLALNIGSNMERKVALFELEMRKEDLGMRRLAAKSLINSYKLQQGKLDDKEWTRLATRANQIAYNNNVFTDTSSCLTMIEIKSRCKKIKIKYDLDVVIIDHLGLIEPTNKNDSKNNQIAEMTRQAKIIAKDLDVAVILLSQLSREVEKRVDKRPILSDLRDSGAIEQDADLIMFVYRDEYYDNETEDKGIMEVIIGKQRNGKTGTLKYAYKPEYQLIAEMF >NZ_CP013848|0:8940|2170_2626_-|WP_101526886.1|DBSCAN-SWA MRLEKVENRNRGYDIYLIIANREYKSWWTSPPKSVDHAGLEYLKDRYPKINTKARMETFKELYKNLWIDITKTQRQNMKHCIGLDYKKKPYRNYYCTSYKDENWNNLVEKGLAVKSSKELNSYGCTCFWLSKQGVEFILDKSISDKVYEEL >NZ_CP013848|0:8940|1027_1414_-|WP_101526908.1|DBSCAN-SWA MKEKLTKIWRLCETKQLSEIFEEYMKSIGIRKHDGRRKNNNNTYMIDGHCTGWNRVQCYYHKDSFKYSEENLLIVLRKRAGNYFIIERKGIRAFEVDYSGIRHYEENLLNEIMKEHKPLFDSLMRLVN >NZ_CP013848|0:8940|1480_1801_-|WP_061316892.1|DBSCAN-SWA MKNQQLSFLKPIEKPIKKHEIYDVTICDRCCCNQCKHSVEICPNLSDKECKTLKYSCFNCDECYYYGMDNENLSRNKIKFKCDKFEMSNYYKELEAKRKRKSFKII >NZ_CP013848|0:8940|2658_3318_-|WP_101526909.1|DBSCAN-SWA MEGMKQIPDKYFELAIVDPPYFDGPNKRKYYGRTVNKLNIKRKQYNVIEDWSVPGKEYFKELLRVSKNQIVWGCNYFDYYLGPGLIIWDKVNGKSSFSDCEVAYCSMHNKTKMFRYMWNGMMQGKSISEGHIMQGDKSKNEIRIHPTQKPVNLYKWILLNYAKQGDKILDTHVGSASSLIACYEMGFDFLGFEKDREIFKLASNRLESIINQLNMFNII >NZ_CP013848|0:8940|7393_7954_-|WP_101526910.1|DBSCAN-SWA MAEKCSISRQSAIDAITVLKKNNLIAKKIRKSNKEQYTNEYFVNVLLATSQPSRPGVVYEVDHPSQPSIPKKELYKKNNINIYTLVINHLNQKCGTNFKSTTKKTQQLINARLRDGFVVEDFYTVIDTKVKDWKGQITADGKNMEDYLRPETLFGNKFEGYLNQKTKKVVSNEKANNNAYKEFEFD |
18 | Clostridium_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
15362 : 42512
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013848|15362:42512|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013848|15362:42512|18730_18946_-|WP_024933450.1|DBSCAN-SWA MILYDLLKNLINNNYYEKEDMNNKLNVFYTFNQINLEQYSELMATVNPAEKEDLGNQGLNVEDTTEEVVTQ >NZ_CP013848|15362:42512|27096_27618_-|WP_061329280.1|tail|DBSCAN-SWA MVSKIGNKTINYNIYVRQNNKLNKILDTSEVTLPSIENLTDTIKGSGILGEIDFPAYYQPGAMSLEISTRVSNADLGILISAIDIEIRWVTDEFDSSNAKIGINSHKAFFKVINKKFEEGKLAMGEAQEGSLEYEVLAYKRVINGKEVLNIDKLNGIFAINGKNLAQDIQAAL >NZ_CP013848|15362:42512|37209_37803_-|WP_061329292.1|DBSCAN-SWA MAESKKIQNVDSVTVSSSVLSDIFGLTERRVRQLAEEGIIVKIKRGRYDLSSSVRNYIIHLKTNNDLKEDKTDKEIDYDMEHALLERARREKVELELAAMRGQMHHSEDVERVMNDMLANFRSKLLALPTKASPMLIARDDIGTIQEILHNQMLEVLQELSDYNPEEFYNDQYIDIEDDNLEGDVVAEKTEDKNKNN >NZ_CP013848|15362:42512|22614_23031_-|WP_061322260.1|tail|DBSCAN-SWA MAIAVWGPMVFSVSLNKIYTFDGFSLSSSIDIEEQEREGSKPSTYIKGLNSDEISFTIPLIKQRKVNIRNEYINWINTQNKRIPYMLIINNKPVTSSKFLLTSVKLSNTLLDRKGDYFKATIEVTFKEFVRKGKKENN >NZ_CP013848|15362:42512|17428_17845_-|WP_101526901.1|holin|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013848|15362:42512|35236_35404_-|WP_154695590.1|DBSCAN-SWA MSTAVQITLIICITIIVLNLISFIDGRSLKNQSYVEFKTKDEDFDEIKKVIDLNK >NZ_CP013848|15362:42512|40855_41299_-|WP_061329296.1|DBSCAN-SWA MEYKKNDIAKLERLLYRYREMIAEIKNIDIEIEYIKQHPDGVNSISYEEKSSPTNKFNSSVENEVIAIDKKIEMLKEQKAEQVYWTSKIDNALEVLDQRSKQIIEMKYFEKINNTKIAARLNLTEEWICKLKNDSLKQLFKLILIKN >NZ_CP013848|15362:42512|27614_29069_-|WP_061329281.1|DBSCAN-SWA MPYKHGAYGELVETTQQISTLNQGTIPFYVGTAPVHRLKDFSNAINKPILINNLDEAKTKIGYSDLDNFEKFTLSASVYAHFKNKLQPIGPIVVVNVLNPLENSKSDSEEIILINKIGYIAKDALISSVTVDTFKKDVDFTLEYTPEGKIKFTAINDSITSPVTVNFNVADISMVSEKEIIGAYDPNTDKRTGLNNINIAYEELGVVPSVISAPGFNHKPNVEKALVEATKNIGGHWDAICVTDIDPTADTLEEAKKWKKENKYDNEREKVCWPFGEMNGKKMWMSILAIVRMQQTDFKNTGIPYESSSNKQLDITNLLIGDNPVKFNQEQGNKLNEKGITTAIYSGGKWVLWGPHMGNYEYGVTEISPSNFGKIFDINIRTNIYLSNDFQLRNAGLVDAPIARNDIDGIMNIEQIRLDALKSEGKILYGKIEFIPENNQINDLVQGNFVFNTAVTNTPPGKSLTNRIQYTSTGINTLLEGGDE >NZ_CP013848|15362:42512|40166_40361_-|WP_061322241.1|DBSCAN-SWA 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36 | Bacteriophage(30.43%) | plate,capsid,portal,terminase,holin,protease,integrase,tail | attL 21196:21211|attR 41746:41761 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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