Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP025778 | Francisella tularensis strain 12T0050_FLI chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,DEDDh,RT,cas4,cas2 | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. NZ_CP025778
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
67523 : 75338
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP025778|67523:75338|DBSCAN-SWA TATGAAAAATATCAGAAACTTTTCGATAATTGCGCATATTGACCATGGTAAGTCTACTCTTTCAGACAGGTTTATACAAGTCTGTAATGGTCTAAGTGAGCGTGAAATGAAAGAGCAGGTTCTTGATTCTATGGATATAGAAAGAGAGCGTGGGATTACGATTAAGGCGCAATCTGTGACGCTTGACTATACAGCTAGAGATGGACAAACATATCAGCTTAATTTCATTGATACACCAGGACACGTTGATTTCTCTTATGAGGTGTCGCGCTCATTAGCAGCTTGTGAAGGAGCTTTACTTGTAGTAGATGCCGCTCAAGGCGTAGAAGCCCAGACAGTAGCAAACTGTTATACTGCCATTGAGCAGAATTTAGAGGTTATACCTATATTAAATAAAATTGATTTACCTTTTGCAGAGCCGGATAGAGTAGCTCAAGAAATTGAAGAAATAATCGGTATTGATGCTACAGGGGCTACTACATGCAGCGCTAAGATAGGTATTGGTGTAGAAGATGTTTTAGAAACTATTGTTGCTAAAGTTCCAGCTCCTGAAGGTGATGTTAATGCAAAGCTGCAAGCTTTGATTATAGATTCATGGTTTGATAACTATCTTGGCGTGGTTTCACTTGTCAGAGTCAAAAATGGTACCATAAAGAAAGGTGAAAAGTTCAAGGTTATGTCAACAGGAGTTGCTTACCAGGTTGATAGACTCGGAGTATTTACGCCGAAAATGAAAGACCTAGATCATCTCAAAGCAGGAGAGGTCGGTTTTATCGTTGCTGGGATTAAGGATATTCATGGTGCACCAGTTGGTGATACGCTCACTCATGCACATAACCCAACAGATAAGCCTGTACCTGGATTTAAAAAGGTTCAACCTCAAGTTTATGCAGGGATGTTTACTATAAGTTCTGACGATTATCCTGATTTTAGAGAAGCTCTCGAAAAGTTAAGTTTAAATGATGCGTCACTATTTTTTGAGCCAGAGGTATCACAAGCTTTAGGTTTTGGCTTTAGATGTGGTTTCTTGGGTATGCTACACATGGAGATTATTCAAGAGAGATTAGAAAGAGAGTATAACCTTGATTTAATCACTTCTGCACCAACAGTTGTTTATAAAGCTATTAAGAAAGATGGTGAAATTATCGAAGTTGATAATCTATCTAAACTACCAGAGCCAGGAGCGATAGCTGAGATACAAGAGCCAATTGTAAGGGCAAATATTCTTGTACCAAAAGATTATGTTGGTAGTGTAATTACTATCTGTATTGAAAAAAGAGGTGTACAGGTTGATCTTAATTATGTGGGGAATCAAGTTTCTATAACTTATGACCTACCAATGATTGAAGTTGTGTCTGATTTCTTTGATACTCTTAAATCTGTAACGAAAGGTTATGGATCATTAGATTATGAGTTGATTCGTTATGAGCCAGCGAATATGGTGTGTCTAGATGTGCTCATAAATGGCGATAAGGTTGATGCATTAGCAAGTATTGTGCATAAAGATCAGGCTAAATACAAAGGTAGAGAACTAGTTGAGCGTCTCAAAGAGTTGATTCCTAGACAAATGTTTGAGGTCGCAATTCAAGCAGCTATAGGTGGAACTATCGTTGCAAGAAGTACAGTTAAAGCATTGCGTAAGAACGTTTTAGCGAAATGCTATGGTGGTGACGTTTCACGTAAGAAAAAACTATTAGAGAAGCAAAAAGAGGGTAAAAAGAGAATGAAGAATATTGGCTCTGTTGAAATTCCTCAAGAAGCTTTTTTATCAGTGCTTAAAAAATAAAATTATAGTTATTATGGAAAATAAAAAAGTAATAGTAGGTATCTCAGGAGGTGTGGACTCATCAGTTTCAGCTTTGCTCTTGAAACAGCAAGGTTATGATGTAACAGGTGTTTTTATGAAAAACTGGGAAGAAGATGATACAGATGAGTTTTGCTCAGCGGAGCAAGATATCGCTGATGCTCAAGCTGTTTGTGACTCTATAGGGATACCTTTCAAAAAGATTAATTTTACCGCTGAATACTGGGATAATGTTTTTGAGCATTTTCTAATAGAGTATAAAGCTGGCAGAACACCTAATCCTGATATCTTATGCAATAAGGAAATCAAATTTAAAGCCTTTCTGAGCTATGTACATCTTTTAGGCGGTGATTATATTGCTACAGGACATTATGCTCAAACAAGACTAGCCGCTGATGGTTCAGTACAGTTAGTCAAAGGACTTGATGATAATAAGGATCAAACATATTTTTTATATACTCTAGGTCAAGAGCAACTTAGACAGACGATATTTCCTATAGGCAACATTGAAAAATCTAAAGTGCGTGAAATTGCCAAAGAAAATAATCTTGTAACATTTGATAAAAAAGATAGTACTGGTATCTGCTTCATAGGTGAGCGTAAGTTTAAAGAATTTTTGTCTAAGTATTTGCCTGCTCAAAAAGGTGAAATCCATGATGAAAATGGTATCAAGATCGGTATGCATGATGGATTGATGTATTATACAATTGGTCAAAGACAGGGGCTTGGTATAGGTGGTGTAAAAGATCGCCCTGAGGTACCTTGGTTTGCAGCTAAAAAAGATTTAGAAAACAATGTCTTGATTGCTGTGCAAGGTCATGATCATCCATTACTATTTAAGCAGTCACTACAAGCTATCGAGCTAAGTTGGGTTGCAGGTATGGCTCCGGCAGATAAATTTAGATGTGCAGCAAAAGTCCGCTATAGACAAAAAGATCAGTCTTGTGAAGTCGAAGTAAATCAAGATGGTTCAGTTAATGTAACTTTTGATCAGCCACAAAGAGCAATCACACCAGGACAGTCAGTAGTATTTTATATTGATGATGTTTGCTTAGGTGGGGGAGTAATTATTTAGAATTACTCTTATTTAATTTCTATTTATTGTCACTTGCTAGAGTTGTTTTTGGAGTATCATTGCTATCAACTTGAGTGGTTGAAGCAGTTTTTGTGGCTGTTTGTATTGTACTACCACTACTTTCTTGATTGATAGGCTTTTTCGCTATAGTACTAATACTACTACCACTTGCTAGTGTGGTTTCTTTGTCTTCGCGTTGCTCATCTGCCTTAGTTATTAGATCGTTATCTAGCGCTGCGACACTACTTGCAACTTCTTGGTGAGTGTATCCTGTATCTTTTTTATCGCTGTCGACAACATCTTTAAGATAGTCATCAACTTTCTTTTTGACATTTGTTTGACTCTTCATAACATCTCTCTGCATGAATTGAGCTTCATGGACAGCGTCAATAGTCATATGTGTATATAAGTATTCTGGATCAATAATAAATGGTCTAAGCTCGGTACTATACTCTTTCTCTAAGCCAGGAAAATAAACAGTATAAGCAACTTTTATACGTTTTTTACCTTCTTTATCATTAACAACCATTGCTACAAGATTTGAATCTATTTCATATTCTTTTCTAACAAGGTGATATTGTTGCTTTCTATCAAGGACAATCTGCTTAACTGGAGTTGCAAAAACTTTTTTAGTTTTAATTGGTTTATTAACCGTGGTAACCCCAGCTTTTCGTAACTCTTCAATAGCGTAGTTTCCATAGTCGTCCTTAGCAAGTCTAACATCTATTTCAATCATCTTAGCTAAAACATATTCTCTAAATTCACGAGCTTGTTTTAATGTAAATGCAAGACAAGTACCTGTATCATCTTTCTGAAAACAACCATTTCTCTTATCAATTAGCACAAAAAGTTTTTGTGTCTTATCGTAATAGAGCTGATAGTCAGGAGAGTTCTCACCATGACCTAGATAAACAAACTGGTCGTTAGATAGCATACCACATGATGCTATAATTACGCTTAGTAATAATATTAATAATGTTTTTTTGAATATATTGCGCATACTAAATTCCATGATTTAATAACAATTACAGGAGATAATTTTTGCGTAATGCTGCTAAAAAGTAAAGTATTGATTATACAAAATAATCAAAAATTAACTCTTAGCATTTTCTTGCATTAGTTTTTTATACTTTTTCTCTATCATTTTGCGCTTTAGTGAACCAAGATGGTCAAAGAAAGTTATACCATTAAGATGATCTATCTCATGTTGGATGCATCTAGCTAAAAATCCATCTTTTTCAACTTCAATCTCTTCTCCAAATTCATTAAGTGCCTTTATTTTGACTACAGTGGCCCTATTTACCTTTGCGGAAACACCAGGAAAAGAAAGACAGCCCTCTTCATCAATTATTTTACCGTTTTGTTCAATTATTTCAGGGTTAATGATAGTGATTATTTCAGGGTTTTGCTCTTCTAAGTTATCATACATGATAAAGAATCTTTTTTTGATACCAACTTGTATTGCTGCTAAACCCACGCCATTTGCTTCTAGCATTAGCTCATGCATTTCAGCAATAGTTGCACGTAAATCATCATTGATTTCATCTTTTGTAACTTCTTTAGCAACCTCTTTTAAAACTGGGTGAGGGTACTTTAGAATTTCTAAAGACATATTCATACTCCTTGTTCTAAAATATCTTTTTTCATCTTTGCCATCGTTATGGCAGCTTGGATAGAGTATTTACCTTTATGACCTTTTTTGCCACCGACTCTTTCTAAGGCTTGCTCTTTGTTGTGTGTGGTTAATATACCAAAAATTACTGGTAAATTATATTGGTGCATGACTTTTTGTGTACCATAACTTACCTGATCGCAAACATAATCATAGTGATCTGTCTCGCCTCGGATTACGCAACCTAGTAATACTATTGCATCAAACTCTTTAGTTTCTGCTAGGAGCTTTGCTGCATATGGAAGTTCAACTGCTCCAGTAACTTTTTTGATACAAATTTGACTATCTTTTAAGCCTTGAGCATATGCTTCTTCTAATGCACCCTCAAGCATTTTATCAGTTATCAAAGAGTTAAATTCACTTACAACGATTGCTAATTTTCTCATAATTTATACCTATATTCCTTTAATTGTATGTTTTGCTTTAATTTTTTTAGTTATCAAGTAGTTTCTATTGTGAGAGTTTACAAATGCCTCACAATATACTGGTTGTGTTTCTATATCAACGTTTCTAAGAGCAGCTAGCTTTTCAGGATTATTAGATATTAATCGGCAGCGGTTGACATTGTTATATTTTAGGACTTGTATAGCTAGATCGTATTTTCTTGCGTCAGCGGGTAAGCCAAGAGCTAAATTAGCTTCAAGAGTGTCCATATTTTCATTCATCTGCAAATTATAGGCTTTAAGCTTATTTGTTAAACCAATACCTCTACCTTCTTGGTCAAGATATATAAAAAAGCCACCCTCTTCGCTAATCATTTCAATTCCTTTATGTAATTGATCTTGGCAGTCACAGCGTAGCGAGCCAAAAATATCTCCTGTTATGCAAGATGAATGCATTCTTACTAAAGGATTATTACCAGAATAAGGTTTAGATAAAACAACAACTTCATCACCACTAAAGTTATCTTTATACACACTCATTTCCAATTCGCCAATTTTCTTGAATGGTATAGTAGAGCTTGCCATTTTCGTGACAAAAATTTCAGTTGCTAAACGATATTGGTAAAGCTCTGCAATAGTTAAAAGAGGCAGATCGTGCTTTTTAGCAAATGCTTCTAGTTCAGCAGCTTTCATCATGGTGCCATCTTTATTCATTAGCTCACATAGAACTCCAGCGCTATTAAAACCACTTAGTTTCATAAGATCAACAGTTGCCTCAGTATGACCATTTCTACCAAGTACGCCTTTATCATTGGCTATAAGAGGGAATATATGTCCAGGTCTAGCTAATTCTTCTGCTTTAGCATCAGCTTTTGATGCAACTTGAATAGTATGTGCTCTATCCTTTGCTGATACTCCTGTAGTTACCCCTTCTTTAGCCTCTATAGTTACAGTAAAAGGAGTTGTAAAAGTACTATTGTTTTGGTCAGCAGCTACCATTGGCGTTAGATTTAATTCTCGTGCTTTCTTTGAGTCCATTGCCAAACAAATGATGCCACTTGTATGCTCAAGCATAAATGTGATATTTTCTTCTGTGGCTTTTTGACCCGGTAGAATTAGATCACCCTCATTTTCTCTATCATAATCATCAAGTACAACTACGGGTTTGCCTTGCTTAAGAGCTTCTATGGCATTCTCAACATTATTTTTTATTTGCTCAAACATTTTCTTTAAATCCTTGTATATATTTATAGATATATTTACCTGTTGCATCAGCTTCAAGATTTACCATAGAACCATTACTATAGTTTTTTGCGATAGTAACTTCAATGGTGTGAGGTATCAAAGTTACAGTAAATGAATCTTTGAGTACATTTATTACAGTTATACTCATACCATCTATGGTTACAAAACCTTTCTTTATTAAGTATTTTAGAAATTCTCTAGAAGCAGAAATTTCAATTAACCATGCACCACCGACATTTTGAATACTTTTGATTTGCCCTGGTTCATCAATATGACCTTGTACCATATGCCCACCAATATGATCACCATAGCGCATTGCAAGTTCGATATTTACTAGTTGGTTCTCCTTAAGAGTATCAAGATTAGTTTTTTTAAGTGTCTCTGGTACTGCATCAAAATTAGCTGTTAAGTTTTGCTTATCAAGTTTTGTAACAGTAAGACAGGTACCATTAATCGCAACACTATCACCAATGCTACATTGAAGACTATTATCAAATTTGATACAAAAAGTTTTTAGACTATCTTTAGTTGTTATTTTTTTAATTGTTCCTAGTTGCTGAACTATGCCACTAAACATTAGAATTTTCCTTAAAACAAGAGTTTATTATTATATCCTCTCTTACAGAGATTTGATTGAAGCTTAGCTGCTGTTTGGGGTTATAATCAGCTATTATTACCGGAGCTAAGTATGTATAAAATTCATTAACAAGTTTTTGATTAATAAAACTATTTAGGGTTTTATTACCACCTTCAACAAGAAGACTAGTTATTCCAATCTTACCCATCTTCTCAAGTAAGGTATCTAAACAAACCTGATGTTGACTTTGTGGTAATAGCCAATATTCAATGCCAAGTTGGTTAAGCTTGGTTGCTACTCGTGCAGAGATCTTTGAACAAACAAAAATCGTTTTGGCATGCCTTTGATCTAAAACTCGCCAATTATGATTTATTGTTGTCAGATGATTAGCAAGTATAAATCTAGTTGAATGTTTTATTTTATTGATATTTATTCTTACATCAAGACTTGGATTGTCATCAATTAGAGTTTGCTTGCCAATTAAGATAGCGTCACAAATATTGCGCAATTCATGAGTATTTACGAATGCTTGATGTGAGCTTATTTTTTTTGAGTCACCATCATTAACAGCTATTTTACCATCTAATGACATAGCCCATTTTGCATAAACAAAAGGTTTTTTGGTTGTTTGATAATGAAAAAATATTTTATTTAACTCTTGTGCTTGTTTCTCTAGTAAGCCTACTTCGACTGTTATACCAGCATTTTTGAGTCTTTCGACGCCTTTGCCAGCAACTTTAGGGTTTGGATCAAGAGTAGCAATAATTACTTTTTTTATCCCAGCTTTGATTATGGTATCAGTACAGGGAGGAGTTCTTCCACAGTGACAGCATGGTTCTAGTGTTACGTATGCTGTAGCTCCTTTTGCTTTATCAACCGCTTTTGTCAGTGCGTGAACCTCTGCATGCGCTTCTCCTACAGTTTCATGCCAACCTTCCGAGATAATTGCACCATTTTTTACTATTATGCAACCAACCATTGGATTAGGTGATACTGTAAGTCTACCTCTATTTGCTAGAGTAAGTGCTTGTTGCATATAATATTTATCGATATTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP025778|67523:75338|71494_72019_-|WP_003017613.1|DBSCAN-SWA MNMSLEILKYPHPVLKEVAKEVTKDEINDDLRATIAEMHELMLEANGVGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEEQNPEIITIINPEIIEQNGKIIDEEGCLSFPGVSAKVNRATVVKIKALNEFGEEIEVEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLMQENAKS >NZ_CP025778|67523:75338|74270_75338_-|WP_003014043.1|DBSCAN-SWA MKNIDKYYMQQALTLANRGRLTVSPNPMVGCIIVKNGAIISEGWHETVGEAHAEVHALTKAVDKAKGATAYVTLEPCCHCGRTPPCTDTIIKAGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVERLKNAGITVEVGLLEKQAQELNKIFFHYQTTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNDGDSKKISSHQAFVNTHELRNICDAILIGKQTLIDDNPSLDVRININKIKHSTRFILANHLTTINHNWRVLDQRHAKTIFVCSKISARVATKLNQLGIEYWLLPQSQHQVCLDTLLEKMGKIGITSLLVEGGNKTLNSFINQKLVNEFYTYLAPVIIADYNPKQQLSFNQISVREDIIINSCFKENSNV >NZ_CP025778|67523:75338|70420_71413_-|WP_003014029.1|DBSCAN-SWA MEFSMRNIFKKTLLILLLSVIIASCGMLSNDQFVYLGHGENSPDYQLYYDKTQKLFVLIDKRNGCFQKDDTGTCLAFTLKQAREFREYVLAKMIEIDVRLAKDDYGNYAIEELRKAGVTTVNKPIKTKKVFATPVKQIVLDRKQQYHLVRKEYEIDSNLVAMVVNDKEGKKRIKVAYTVYFPGLEKEYSTELRPFIIDPEYLYTHMTIDAVHEAQFMQRDVMKSQTNVKKKVDDYLKDVVDSDKKDTGYTHQEVASSVAALDNDLITKADEQREDKETTLASGSSISTIAKKPINQESSGSTIQTATKTASTTQVDSNDTPKTTLASDNK >NZ_CP025778|67523:75338|69255_70401_+|WP_003014024.1|tRNA|DBSCAN-SWA MALLKFLKKLFYQCLKNKIIVIMENKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCSAEQDIADAQAVCDSIGIPFKKINFTAEYWDNVFEHFLIEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLSYVHLLGGDYIATGHYAQTRLAADGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLRQTIFPIGNIEKSKVREIAKENNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPAQKGEIHDENGIKIGMHDGLMYYTIGQRQGLGIGGVKDRPEVPWFAAKKDLENNVLIAVQGHDHPLLFKQSLQAIELSWVAGMAPADKFRCAAKVRYRQKDQSCEVEVNQDGSVNVTFDQPQRAITPGQSVVFYIDDVCLGGGVII >NZ_CP025778|67523:75338|67523_69308_+|WP_003014022.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQVCNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQTYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPILNKIDLPFAEPDRVAQEIEEIIGIDATGATTCSAKIGIGVEDVLETIVAKVPAPEGDVNAKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRVKNGTIKKGEKFKVMSTGVAYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGAPVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKAIKKDGEIIEVDNLSKLPEPGAIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVITICIEKRGVQVDLNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSVTKGYGSLDYELIRYEPANMVCLDVLINGDKVDALASIVHKDQAKYKGRELVERLKELIPRQMFEVAIQAAIGGTIVARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNIGSVEIPQEAFLSVLKK >NZ_CP025778|67523:75338|73672_74278_-|WP_003014040.1|DBSCAN-SWA MFSGIVQQLGTIKKITTKDSLKTFCIKFDNSLQCSIGDSVAINGTCLTVTKLDKQNLTANFDAVPETLKKTNLDTLKENQLVNIELAMRYGDHIGGHMVQGHIDEPGQIKSIQNVGGAWLIEISASREFLKYLIKKGFVTIDGMSITVINVLKDSFTVTLIPHTIEVTIAKNYSNGSMVNLEADATGKYIYKYIQGFKENV >NZ_CP025778|67523:75338|72468_73680_-|WP_003014037.1|DBSCAN-SWA MFEQIKNNVENAIEALKQGKPVVVLDDYDRENEGDLILPGQKATEENITFMLEHTSGIICLAMDSKKARELNLTPMVAADQNNSTFTTPFTVTIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASKADAKAEELARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMKLSGFNSAGVLCELMNKDGTMMKAAELEAFAKKHDLPLLTIAELYQYRLATEIFVTKMASSTIPFKKIGELEMSVYKDNFSGDEVVVLSKPYSGNNPLVRMHSSCITGDIFGSLRCDCQDQLHKGIEMISEEGGFFIYLDQEGRGIGLTNKLKAYNLQMNENMDTLEANLALGLPADARKYDLAIQVLKYNNVNRCRLISNNPEKLAALRNVDIETQPVYCEAFVNSHNRNYLITKKIKAKHTIKGI >NZ_CP025778|67523:75338|72015_72459_-|WP_003014034.1|DBSCAN-SWA MRKLAIVVSEFNSLITDKMLEGALEEAYAQGLKDSQICIKKVTGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCVIRGETDHYDYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGKYSIQAAITMAKMKKDILEQGV |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
872018 : 939747
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP025778|872018:939747|DBSCAN-SWA AATGGCTAAAATTCTATATTGTTCTTTTTGTGGTAAATCACAACAAGAAGTCAAAAATATTATCTCAGGAAGAGATGGTAATATTTGTAACGAATGTGTAAGTAAATGTGCCGAAAAAATTCGTAGTACTGGTAGTACTAGTGCTGAAGATATCTCATTTGAAAAATTACCAAAGCCAGTTGAAATCAAAAAATACTTAGATGATTATATTATCGGTCAAGATAATGCTAAAAAAGTGTTATCAGTAGCTGTATACAATCATTATAAAAGAATTACATCTAACCTAACAAAAGATGATGATACTGAGCTTAAAAAAAGTAACGTGCTGTTAATTGGTCCAACGGGATCAGGTAAGACATTATTTGCCCAGACTTTAGCAAAGTTGTTAAATGTTCCTTTTGCTATAGCAGATGCCACTACTCTTACTGAGGCTGGTTATGTTGGTGATGATGTTGAAAATATAATTGTTCGACTTTTGCAAAATGCTGATTTTGATGTTGCTAAAGCACAAAAGGGTATTATTTATATTGATGAGATAGATAAAATCGCACGCAAATCAGAAAGTACGTCAATAACTCGTGATGTTTCTGGTGAGGGTGTGCAGCAGGCATTATTAAAACTTATTGAGGGTACAGTGTCTTCTGTGCCTCCTAAAGGCGGCAGAAAGCATCCTAATCAAGATATGATTCAAGTGGATACTTCAGATATATTATTTATTTGTGGTGGAGCATTTGCTGGTATCGAGAAGGTTATAAAGCACAGAATGGATAAGGTCAGTATTGGGTTTAATGCTGATGTTATTCAACAAAAAAATAGCTTAGATAGCGATAAACTTATGCAAAAGATTGAAAGTGAAGATTTGACTAGATTTGGGCTTATTCCAGAATTGATTGGTCGTTTGCCAATAGTTACAGTTCTAAATGAACTTAAAGAAGAAGATTTAGTTAGAATCCTTACAGAACCTAAAAATGCTTTAATTAAACAGTATATTAAGCTGTTTAAGTTTGATAATGTTAATATTGAGTTTACCGATCAAGCTCTTGTTGAGATAGCTAAAAAAGCAATAACTAAAAAGACAGGCGCGAGAGGTCTAAGAACTATTTTAGAAAATGTACTTCTTGAAGTGATGTTTCATATACCTTCATCTGAAGATATTGAAAAAGTTATTATCAATGACAAAGTAATTCTAGAGCAGCAAGAACCAATCTTAGCGATAAAAACACAACAGCAAAAACAATTAAAAGATATAATCTAATAATTTACAGGAGGATGTAAGTTTATGTCAGAACCCCTAAATGTCGTTCCTGTTATTCCTTTAAGAGATGTTGTTATTTATCCATCGATGACTCTACCACTTAATGTTGGGCGTAAAAAGTCAATAGAGGCAGTTAAACAGGCATCAAATAATTATAATAACTATATTTTATTAGCTACACAAAAAAATGGTTCGAGTGGCGGTGATGTTGTAGAAAATATATATGATATTGCAACTCTTGCTAAAGTTGTTCAGATAATGAAACTTCCTGATGGTAGTCTGAAAATAATAGTCGAGGGTATTGCTAAAAGACTAGTAGCTAAGTATGAAGATATTGATGGTTGTATCTATGCAAATTTAGATAGTTTACATATTGATGATAACTATGATCCCAGCCAAGTTGATAAAGAACTAAAAGCTATTTTACTATCAGTTTCTGATTCGCTTAAAAGATTTGTTGATATCAGTGGTAGAGTTTCGAAAGAATCATTAGCTACATTGATAAATACGGAAGAGCCACATAAATTTATTTATGAAATAGCTACTATACTTAATACAGAAATAGCTAAAAAACAAAAAATCCTTGAGGCAACGGATATAAAAAATAAAGCCTTGCTACTACTTTCATATCTTTATGAAGAGCTAGAGATACTAGAGCTAGAAGCTAAGATCAAAGATAGAGTCAAAGCTCAAGTTGATAAGAATCAGCGTGAATACTATCTAAATGAGCAAGTCAAAGCGATATATAAAGAGCTTGGTGAAGCTGATGAAGAATCAGAAGTATCTGTTTTGAAAAAAAGGATTGAGCATACTAAGATGTCTAAAGAGGCAAAAGAGAAATGCTTAAAAGAGCTCAAGAAACTTAAGGCTATGCCGCCTTCTTCATCAGAATCAGCTGTTTCGAGAAACTATATTGAAACTATACTTTCTCTACCATGGGGTAAGAGGGCAAAAGTTAAAAGAGATATTAATCTTGCTGAGAAAGTTTTAGAAAAAGATCATTACGGTATCAAAAAAGTTAAAGAAAGGATCCTTGAGCATTTAGCTGTTCAGATTAAAAGAGACAGTAATACTAAAGCACCAATTCTGTGCTTAGTAGGACCTCCAGGAGTAGGTAAAACATCTATAGGACAGTCGATTGCTAGAGCAACAGGGCGTGAGTATGTGCGTATGGCTTTAGGTGGTGTACGTGATGAGTCTGAGATTAGGGGACATCGTCGTACATACATAGGTTCTATGCCTGGTCAAATTATCCAAAAGATAATTAAATCAAAGACAGAGAATCCACTTTTCTTATTAGACGAGATTGATAAAATTTCTTCTGATTTCCGTGGTGATCCATCTGCCGCGCTCTTAGAAGTACTTGATCCAGAGCAAAATAGTACATTTAACGATCATTACCTTGAGATAGACTATGATTTATCAAAGGTAATGTTTGTTGCTACAGCAAATTCCTTAGATATAGATCCAGCATTACGTGATAGATTAGAGATTATCAACTTATCAGGCTATACCGAAATAGAGAAGCAAGCTATCGCAAAACAGTATTTAATACCTAAAGCATTAGAAAATAATGGTTTGACTAAGGATGAAATTAATTTCACACCAAAAGCTATCCTTGATATTATCAGATATTATACAAGAGAGGCTGGTGTAAGAAATCTTCAGCAAAAAATAGATGGTGTTTGCCGTAAAGCAGTTAAAAATCTCTTAAAGGATTCAAATACTGGCAAAATTTCGATTACACAAAAAAATCTCGAAGATTATCTTGGTGTACATCAGTATGATTATGGTGTTAAAAATGCTAAAGCAAAAGTAGGTCAAGTAACAGGTTTAGCTTGGACATCAGTTGGTGGAGAGCTTTTGACTATAGAAGCTCTAGCAATGCCAGGAAAAGGTAAAGTTAAATATACTGGTAGTCTTGGTGATGTAATGAAAGAATCTATAGATGCTGCTTTTAGTGTGGTACGCTCAATGTCAAAAGACTATAAGTTAGAAGATGATTTCTATGAGAAAAAAGATATACATATTCATGTCCCTGAAGGAGCTACACCAAAAGATGGTCCAAGTGCTGGTATTGCGATGACAACGGCTTTAGTTTCTGTATATACAAACAAACCAGTTAGAAATGATGTGGCAATGACAGGTGAGGTGACACTCCGTGGTGAAGTGCTAGCTATAGGCGGTTTAAAAGAAAAGCTTTTGGCAGCATTAAGAGGTGGAATTAAGGAGGTTTTGATCCCAAAACAGAATGTTAAAAATTTAGCCGATGTTGATAAAGAAATCCTGGAAAAACTCGAAATAACCCCTGTAAGTAGCATAAAAGAGGTTTTAGAGAGAGTTTTTTGATATTTAACTGTTGAAACACTGCATTTTTAGTGTTATAAAGTTAACTGACACTTGTCAATTGTATAAAAATAAAGGAGTTTAAAAACATGAACAAGAGTGAATTAGTAAGTGCTATAGCTAAAGAAGCAGATGTTACTAAAGAAGTTGCTAGCAACACTCTAGATGCTACTATTGCGGCAGTAACTAAAGCTTTAAAAAATGGTGATAGCGTAACTCTAGTAGGTTTTGGTACTTTTCAGGTAAAAGAAAGAAGTCCTAGAGAGGGTAGAAACCCAAAGACTGGTGAAACTATTAAGATCCCTGCTTCTAAAGTTCCTAGCTTTAAAGCTAGTAAGGGTCTTAAAGACGCTGTAAAATAATAAAAAGTTACAAAAAAGTAATTTTTTTAAAGGCATGCTTAACAGTATGCCTTTTTTTTATCTATAATATTTACAAGTTAATTAAATTACTCATTAATTAAGGTCAATAAAAATGTTACAGTCTTTTAATGATAGACTCAAAGGTCCTTTTACATGGATTGTGGTTATCTCGATAAGCTTTATTTTTGTAATTTCTGGAATGACATTCTTTTTTACAAATATTGGTAGTAGTAGAGCATATGTTGCTAAAGTTGGTGATAATGAAATAAGCTCACAACAATTCCAACAATATGTTCAAAGTGCTACTACAGAAGAACAAAAGAGAGCTATTTTATCTCAAATGATAGATCAGTATTTGATATTAGCCGATGCACAACGCCATGATATTGTAGTGTCAAAACTAGCGCTACAATCAGCAATATTTACTAACCCAATGTTCTTTGATAAAGATGGAAAGTTTTCTGCTGAAAAGCTAAAACAGGTTGTAGCTTATTTAGGTGGAATGGATAAACTTGAGCAGATATTAGCTCAAAATATTCAAGCGACTATAATTCCTAAAACTATAGTAGATACATCTATTGTTACAGATTATGATACTAAGTTACTTAATAGTATATACTCTGTGAATAAGTATATAGACTATCTCAAGGTTTCTCCAACAGATTTTAAATCACAAATTAAACCAAGCCAACAAGATTTACAAAGCTATTATGATAGTCATAAAAATGAGTATATAACACCAGCACAAAAGACAATTAGCTACTTTATAATTACAAAAGATAATTTTGTGCCTAAAAATAAAATTAGTGAAGATGAAATAAAAGCATATTATCAAGCACATAAAGAATTGTTCAAAGATTTTGATAATAATGCCAAGTCTACTATTCAAAAGATAATCCAAAATAGGTATGCCTTAGAGCAGTTTAATGAGTACACACAAAATATTGATAGTATTAAGTATACTAAATTAGAGAAACAATTTGGCAAAGCTAAAACAGCTACAATTGTTGATAATAATGATACGACAATTAGTAATG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55 | Bacillus_virus(12.5%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1529224 : 1606377
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP025778|1529224:1606377|DBSCAN-SWA 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57 | Phaeocystis_globosa_virus(25.0%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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