CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP025988	Lactiplantibacillus plantarum strain LM1004 isolate kimchi chromosome, complete genome	1 crisprs	DEDDh,cas3,csa3,RT,WYL,DinG	0	0	9	0

1. NZ_CP025988

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP025988_1

• CRISPR_ID: NZ_CP025988_1
• CRISPR_location: 1537008-1537093
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP025988_1

Consensus_repeat	Method
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP025988_1

>1.1|1537031|40|NZ_CP025988|CRISPRCasFinder
CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP025988_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP025988_1

>merge|NZ_CP025988|1|1537008-1537093|CRISPRCasFinder
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATTCGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAATAAGAAACTTAAAGTATCTTATT

>NZ_CP025988|1|1|1537008-1537093|CRISPRCasFinder
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT	CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA
TAAGAAACTTAAAGTATCTTATT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP025988.1|WP_013355931.1|1534506_1534698_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP025988.1|WP_003642342.1|1529489_1530218_+|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674
NZ_CP025988.1|WP_003643398.1|1537110_1537710_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP025988.1|WP_003642351.1|1539787_1540786_+|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_CP025988.1|WP_103002146.1|1531069_1532107_+|aldehyde-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187538
NZ_CP025988.1|WP_050577158.1|1537830_1538712_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238558
NZ_CP025988.1|WP_003642340.1|1528423_1528708_+|DUF1905-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378097
NZ_CP025988.1|WP_011102039.1|1528991_1529357_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224647
NZ_CP025988.1|WP_003642355.1|1543702_1544449_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674
NZ_CP025988.1|WP_003642350.1|1538996_1539791_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224045
NZ_CP025988.1|WP_003642357.1|1545230_1546067_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|212492
NZ_CP025988.1|WP_003642347.1|1535514_1536993_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|129794
NZ_CP025988.1|WP_013355935.1|1540782_1541778_+|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_CP025988.1|WP_003643401.1|1542022_1542535_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|274100
NZ_CP025988.1|WP_016511871.1|1534944_1535184_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP025988.1|WP_011102040.1|1530376_1530943_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP025988.1|WP_003643403.1|1544465_1544972_-|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|100047
NZ_CP025988.1|WP_003642345.1|1532255_1532822_-|DUF1211-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226078
NZ_CP025988.1|WP_003642346.1|1533041_1533995_-|aldo/keto-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381318
NZ_CP025988.1|WP_013355936.1|1542515_1543409_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187572

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP025988.1|WP_003642342.1|1529489_1530218_+|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	1.6523e-89
NZ_CP025988.1|WP_013355936.1|1542515_1543409_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|187572	cd05262, SDR_a7, atypical (a) SDRs, subgroup 7. This subgroup contains atypical SDRs of unknown function. Members of this subgroup have a glycine-rich NAD(P)-binding motif consensus that matches the extended SDRs, TGXXGXXG, but lacks the characteristic active site residues of the SDRs. This subgroup has basic residues (HXXXR) in place of the active site motif YXXXK, these may have a catalytic role. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	3.70513e-130
NZ_CP025988.1|WP_003643398.1|1537110_1537710_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	4.95133e-09
NZ_CP025988.1|WP_003642351.1|1539787_1540786_+|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	6.03952e-81
NZ_CP025988.1|WP_103002146.1|1531069_1532107_+|aldehyde-reductase	gnl|CDD|187538	cd05227, AR_SDR_e, aldehyde reductase, extended (e) SDRs. This subgroup contains aldehyde reductase of the extended SDR-type and related proteins. Aldehyde reductase I (aka carbonyl reductase) is an NADP-binding SDR; it has an NADP-binding motif consensus that is slightly different from the canonical SDR form and lacks the Asn of the extended SDR active site tetrad. Aldehyde reductase I catalyzes the NADP-dependent reduction of ethyl 4-chloro-3-oxobutanoate to ethyl (R)-4-chloro-3-hydroxybutanoate. Extended SDRs are distinct from classical SDRs. In addition to the Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet) core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids. Extended SDRs are a diverse collection of proteins, and include isomerases, epimerases, oxidoreductases, and lyases; they typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	2.0783e-93
NZ_CP025988.1|WP_050577158.1|1537830_1538712_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|238558	cd01138, FeuA, Periplasmic binding protein FeuA. These proteins have predicted to function as initial receptors in ABC transport of metal ions in some eubacterial species. They belong to the TroA superfamily of periplasmic metal binding proteins that share a distinct fold and ligand binding mechanism. A typical TroA protein is comprised of two globular subdomains connected by a single helix and can bind their ligands in the cleft between these domains.	3.71721e-55
NZ_CP025988.1|WP_003642340.1|1528423_1528708_+|DUF1905-domain-containing-protein	gnl|CDD|378097	pfam08922, DUF1905, Domain of unknown function (DUF1905). This domain is found in a set of hypothetical bacterial proteins.	1.07383e-22
NZ_CP025988.1|WP_011102039.1|1528991_1529357_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224647	COG1733, COG1733, Predicted transcriptional regulators [Transcription].	1.16334e-31
NZ_CP025988.1|WP_003642355.1|1543702_1544449_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	2.40011e-91
NZ_CP025988.1|WP_003642350.1|1538996_1539791_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224045	COG1120, FepC, ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components [Inorganic ion transport and metabolism / Coenzyme metabolism].	5.60764e-114
NZ_CP025988.1|WP_003642357.1|1545230_1546067_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|212492	cd05327, retinol-DH_like_SDR_c_like, retinol dehydrogenase (retinol-DH), Light dependent Protochlorophyllide (Pchlide) OxidoReductase (LPOR) and related proteins, classical (c) SDRs. Classical SDR subgroup containing retinol-DHs, LPORs, and related proteins. Retinol is processed by a medium chain alcohol dehydrogenase followed by retinol-DHs. Pchlide reductases act in chlorophyll biosynthesis. There are distinct enzymes that catalyze Pchlide reduction in light or dark conditions. Light-dependent reduction is via an NADP-dependent SDR, LPOR. Proteins in this subfamily share the glycine-rich NAD-binding motif of the classical SDRs, have a partial match to the canonical active site tetrad, but lack the typical active site Ser. This subgroup includes the human proteins: retinol dehydrogenase -12, -13 ,and -14, dehydrogenase/reductase SDR family member (DHRS)-12 , -13 and -X (a DHRS on chromosome X), and WWOX (WW domain-containing oxidoreductase), as well as a Neurospora crassa SDR encoded by the blue light inducible bli-4 gene. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet), an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Classical SDRs are typically about 250 residues long, while extended SDRs are approximately 350 residues. Sequence identity between different SDR enzymes are typically in the 15-30% range, but the enzymes share the Rossmann fold NAD-binding motif and characteristic NAD-binding and catalytic sequence patterns. These enzymes catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser (Ser-138, 15-PGDH numbering) and/or an Asn (Asn-107, 15-PGDH numbering) contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Extended SDRs have additional elements in the C-terminal region, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif. Some atypical SDRs have lost catalytic activity and/or have an unusual NAD(P)-binding motif and missing or unusual active site residues. Reactions catalyzed within the SDR family include isomerization, decarboxylation, epimerization, C=N bond reduction, dehydratase activity, dehalogenation, Enoyl-CoA reduction, and carbonyl-alcohol oxidoreduction.	4.07613e-56
NZ_CP025988.1|WP_003642347.1|1535514_1536993_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit	gnl|CDD|129794	TIGR00711, Uncharacterized_MFS-type_transporter_YhcA, drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily. This subfamily of drug efflux proteins, a part of the major faciliator family, is predicted to have 14 potential membrane-spanning regions. Members with known activities include EmrB (multiple drug resistance efflux pump) in E. coli, FarB (antibacterial fatty acid resistance) in Neisseria gonorrhoeae, TcmA (tetracenomycin C resistance) in Streptomyces glaucescens, etc. In most cases, the efflux pump is described as having a second component encoded in the same operon, such as EmrA of E. coli. [Cellular processes, Toxin production and resistance, Transport and binding proteins, Other].	1.62212e-72
NZ_CP025988.1|WP_013355935.1|1540782_1541778_+|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	1.35687e-78
NZ_CP025988.1|WP_003643401.1|1542022_1542535_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|274100	TIGR02366, conserved_hypothetical_protein, probable dihydroxyacetone kinase regulator. The seed alignment for this family was built from a set of closely related uncharacterized proteins associated with operons for the type of bacterial dihydroxyacetone kinase that transfers PEP-derived phosphate from a phosphoprotein, as in phosphotransferase system transport, rather than from ATP. Members have a TetR transcriptional regulator domain (pfam00440) at the N-terminus and sequence homology throughout.	3.33884e-08
NZ_CP025988.1|WP_011102040.1|1530376_1530943_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	7.31502e-05
NZ_CP025988.1|WP_003643403.1|1544465_1544972_-|acetyltransferase	gnl|CDD|100047	cd03357, LbH_MAT_GAT, Maltose O-acetyltransferase (MAT) and Galactoside O-acetyltransferase (GAT): MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively at the C6 position of the nonreducing end glucosyl moiety. GAT specifically acetylates galactopyranosides. Furthermore, MAT shows higher affinity toward artificial substrates containing an alkyl or hydrophobic chain as well as a glucosyl unit. Active MAT and GAT are homotrimers, with each subunit consisting of an N-terminal alpha-helical region and a C-terminal left-handed parallel alpha-helix (LbH) subdomain with 6 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X).	1.58107e-53
NZ_CP025988.1|WP_003642345.1|1532255_1532822_-|DUF1211-domain-containing-protein	gnl|CDD|226078	COG3548, COG3548, Predicted integral membrane protein [Function unknown].	5.75015e-29
NZ_CP025988.1|WP_003642346.1|1533041_1533995_-|aldo/keto-reductase	gnl|CDD|381318	cd19092, AKR_BsYcsN_EcYdhF-like, Bacillus subtilis YcsN, Escherichia coli YdhF and similar proteins. Bacillus subtilis YcsN and Escherichia coli YdhF are prototypes of this family. They are uncharacterized aldo/keto reductase family oxidoreductases.	5.65843e-131

Protein sequences

>NZ_CP025988.1|WP_003642347.1|1535514_1536993_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit
MQAKAKISKATMTIAWVVVFGAMAPLLDSTMINIAINNLVTSFHSSVTTVQWAVTGYLLATGVAVPFSSWLLNRFDGKAVFVAGEILFGLGSIFAAVAPNIQLLIIARLVQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAVMGQMMATVGLPMILGPLIGPVIGGIIIKFASWHWIFWINVPVVLISIALILWKMPNYPAQNRTAKMDFIGILLLIVSSSAIIYSLVNAAHTDRFNNATSIEMLILGAIALISYVVWAAWQKERAVVPLHLFKFASFDGAGLGLFIAGTVLNGAMLLLPLYFQNVRGMSVINAALALLPQGAGMLVSRTLTGRLTDQIGAKYVVLGSVVITFVGTLPFYWFGQQTSYWILALILFVRGIGAGGILMPLMADAYTGMQPGQVPAATIGTRIIQNIGSAFGSALITTIVTAYSTHQVNVFERHLKAGTYHVDAAHLQVFTTSHLQAIRLAAFQQGFLVIAIAAIVIILPTLLLTNKLKAAK
>NZ_CP025988.1|WP_016511871.1|1534944_1535184_-|hypothetical-protein
MKKVYLRYQKQVDSFININKIMLMLEFVLLFVVKGSIDRYNQLPYDWFAYLTTLIHYFLGTFTFFGIILVIECVWNKFK
>NZ_CP025988.1|WP_013355931.1|1534506_1534698_+|hypothetical-protein
MAAFSEKQLKKAPITDQEFEKVVAVAKPDVQGIHSVCQQLVISFIAEERFLAVFGDGTCHPSN
>NZ_CP025988.1|WP_003642346.1|1533041_1533995_-|aldo/keto-reductase
MKTIQIGASQLKASAVALGIMRMVRLDTDAAANVLETVHDRGVNFIDSADIYGNGDSERIFGQALKQSSLKREDFFIQSKGGIVLDPEKSSGELVFGQRYDFSKQHLIATVDKILQRMQLDYLDSFLLHRPDPLMDPAEVAAAFDELQATGKVRHFGVSNFNPMQVEMLQAAVSQKLMINQLQFGVMHTGPIQFGLHTNMQDTASLNHDGEIIEYSRLHHMTIQAWSPYQYGMFAGTFIDNPKFPELNAKLQELADQYHVTKNAIATAWILRHPANMQVILGSMNPQHLDESIAGTDVTLTRQEWYDVYFAAGNDLP
>NZ_CP025988.1|WP_003642345.1|1532255_1532822_-|DUF1211-domain-containing-protein
MNKARLEAFTDAIIAIVLTLLVLDLPRPQTPSVRALFAEWQSIYVYIITFTLLISIWLNHHDLFVQVKKIDRVVFWANSFWLLCQSFIPFMASWITKFPHSKWPAVFYILTGFVWMLAYQLLVAAVRRLNPHIHRMSSPALSVVFGGFLVVLTVALINPDVGLFLIPVHAFASVILATKRKWHLRKYF
>NZ_CP025988.1|WP_103002146.1|1531069_1532107_+|aldehyde-reductase
MQKQLVVVTGGSGFIAIHIIRQLLQQGYAVRTTVRSLAKAPVIKEMLTNGGITDLSALEIVVADLAHDEHWSEAMAGATYAIDVASPTPKLNFKNKAEMIRPAVDGVRRVLTASRDAGVKRVVLTSAYGAIFAGHKNRTTPYTEADRSDLNWKAIHPYQESKTRAELAAWDFINHEGRGLELTTVNPVAVMGPVLSAKYSHSNIQIQQFLEGQVKAVPNVDSGYVDVRDVASLHLLAMTAPQANGERFLATTGETLSMLDVANVLRQAFPAFASQLPTKTIPNAAVKLAAKARPELRMVASLVGTYAETSNHKAQTLLDWHPRPAAESIIATAQSMIDLGIVTKP
>NZ_CP025988.1|WP_011102040.1|1530376_1530943_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
MAATNHAQAIKKDSQTYLTTALLQLLRTHDLDTITVTQVVKRAGVSRMAFYRNFTTLEDLLTAYFAPAIAARFQDVLQHVPANRKLLAMGQFFSDFAPTLRLAEQRGFENIIQQLFNANMTNYYQATMTNGMLTAVQLKYWTRFMSAGVYAIWREWLLGGQLESLTTIHEILATLQTATMQALTQAQK
>NZ_CP025988.1|WP_003642342.1|1529489_1530218_+|SDR-family-oxidoreductase
MKPLVVITGASSGFGAEIAKLFAADNYPLLLLGRRQAKLAALSANFENAMIDTVDVTNYHQFETAVRKAEAKYGKTDLLVNNAGLMLLGNVQNQDPQEWQTMLNTNVMGVLNGTQIVLNDMRDREHGTILNMSSLAGKKTFVNHAAYVASKFGVHGLSETLREENAPKNVRVMLVAPGAAETELLTHVTSKSALSDYEAWKASMGGLTLDPKHVAATVKFMYDMPQNVNIREVDIAATAQDA
>NZ_CP025988.1|WP_011102039.1|1528991_1529357_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
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>NZ_CP025988.1|WP_003642340.1|1528423_1528708_+|DUF1905-domain-containing-protein
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>NZ_CP025988.1|WP_003643398.1|1537110_1537710_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
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>NZ_CP025988.1|WP_003642350.1|1538996_1539791_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
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>NZ_CP025988.1|WP_013355935.1|1540782_1541778_+|iron-ABC-transporter-permease
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>NZ_CP025988.1|WP_003643401.1|1542022_1542535_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
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>NZ_CP025988.1|WP_003642357.1|1545230_1546067_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase
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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	884 : 46295	44	Lactobacillus_phage(89.29%)	tRNA,terminase,portal,tail,capsid,protease,lysis	NA
DBSCAN-SWA_2	72396 : 81359	9	Lactobacillus_phage(100.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	581994 : 665342	92	Lactobacillus_phage(78.72%)	tRNA,capsid,head,integrase,terminase,tail,holin,protease	attL 607576:607593|attR 672284:672301
DBSCAN-SWA_4	959713 : 978070	24	Lactobacillus_phage(57.14%)	holin,tail,capsid,head	NA
DBSCAN-SWA_5	985003 : 1001948	30	Lactobacillus_phage(73.68%)	integrase	attL 980389:980403|attR 1009626:1009640
DBSCAN-SWA_6	1202706 : 1211217	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_7	2339600 : 2387671	47	Bacillus_virus(50.0%)	protease,bacteriocin	NA
DBSCAN-SWA_8	2577683 : 2586307	11	Streptococcus_phage(66.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_9	3182843 : 3198375	20	Lactobacillus_phage(82.35%)	integrase	attL 3184232:3184245|attR 3187717:3187730

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP025988|884:46295|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_103001960.1|2227_2908_+|terminase	terminase	Q20DE0	Lactobacillus_phage	2.5e-45	47.4
WP_103001961.1|3078_3279_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLC2	Lactobacillus_phage	8.7e-15	86.4
WP_103001962.1|3262_3601_+	HNH endonuclease	A0A2P0ZLC6	Lactobacillus_phage	4.3e-62	97.3
WP_103001963.1|3860_4103_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLD2	Lactobacillus_phage	1.6e-39	98.8
WP_063722965.1|4211_4499_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	A0A2P0ZLC8	Lactobacillus_phage	7.6e-28	67.4
WP_103001964.1|4495_6175_+|terminase	terminase large subunit	A0A2P0ZLE5	Lactobacillus_phage	8.2e-231	70.0
WP_024002305.1|6193_7336_+|portal	phage portal protein	A0A2P0ZLC9	Lactobacillus_phage	2.5e-215	98.9
WP_103001965.1|7322_8075_+|protease	Clp protease ClpP	A0A2P0ZLE3	Lactobacillus_phage	3.4e-128	94.8
WP_054396964.1|8095_9274_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2P0ZLD6	Lactobacillus_phage	2.1e-217	99.0
WP_103001966.1|9412_9718_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLD5	Lactobacillus_phage	5.0e-46	91.1
WP_103001967.1|9698_10088_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLD1	Lactobacillus_phage	2.5e-66	94.6
WP_103001968.1|10084_10492_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLD7	Lactobacillus_phage	3.1e-67	94.8
WP_027822446.1|10488_10911_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLE4	Lactobacillus_phage	1.7e-71	97.9
WP_054396956.1|10925_11531_+|tail	phage tail protein	A0A2P0ZLF5	Lactobacillus_phage	3.7e-109	99.5
WP_061871521.1|11505_11778_+	Ig-like domain-containing protein	A0A2P0ZLD8	Lactobacillus_phage	7.2e-36	98.9
WP_076656057.1|11848_12163_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLF3	Lactobacillus_phage	1.9e-48	91.3
WP_054396950.1|12186_12408_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLD9	Lactobacillus_phage	1.0e-32	100.0
WP_103001969.1|12426_16971_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A2P0ZLF1	Lactobacillus_phage	0.0e+00	96.8
WP_103001970.1|16974_17796_+|tail	phage tail protein	A0A2P0ZLE2	Lactobacillus_phage	1.1e-151	98.2
WP_103001971.1|17815_21730_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLE1	Lactobacillus_phage	0.0e+00	84.8
WP_103002278.1|21755_22238_+	DUF1617 family protein	A0A2P0ZLE0	Lactobacillus_phage	5.7e-76	93.1
WP_003643917.1|22239_22674_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLE9	Lactobacillus_phage	1.2e-72	100.0
WP_103001972.1|22703_23081_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103001973.1|23080_23353_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103001974.1|23352_23637_+|lysis	lysis protein	A0A2P0ZLE8	Lactobacillus_phage	1.5e-31	78.7
WP_103001975.1|23636_24539_+	SH3 domain-containing protein	A0A2P0ZLG2	Lactobacillus_phage	8.0e-116	94.3
WP_033608566.1|25102_25528_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_003643143.1|25692_26706_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_187344847.1|26811_27333_+	GtrA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003645248.1|27432_27792_-	YisL family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_103001977.1|29734_32041_-	5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_103001978.1|32929_34567_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101379.1|34544_35720_+	sulfate adenylyltransferase	A0A2P1ELS9	Moumouvirus	2.2e-49	31.9
WP_103001979.1|35722_36346_+	adenylyl-sulfate kinase	A0A2K9L4R9	Tupanvirus	6.3e-27	40.6
WP_024971593.1|36335_37292_+	bifunctional oligoribonuclease/PAP phosphatase NrnA	NA	NA	NA	NA
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WP_003643130.1|43254_43500_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063485337.1|43888_44335_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_046038934.1|44606_46295_+|tRNA	arginine--tRNA ligase	A0A2I2L3K1	Orpheovirus	1.2e-75	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP025988|72396:81359|DBSCAN-SWA
TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACACGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGACGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGATGACGAATTAGTGCTACCAGCTGGGGTACGACCAGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAACGCGTTTTTGCAGGCACAAGATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGTCAGAGCATGCATCCGGAGTCTGCCGCCCCGCTGACGTTGACTGCTGAACAATTACCAGCCGTGATGTGGGCCTTTTTCGATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAATCAACTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTTGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCGCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCGATTGAGTTCTTTGATCAGCTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAATAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACACGCTCAATGATGAGACGACAGCCAACTGGACGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGACGAGAGTGAAGAAGATGGCGCGGCTCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTGCTACGGCCTGAGAGTGTACCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCGGCCACCGTCAGTATTGGTATCGTGTTAGTTGCTTGGTTGGTCACGGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGCTGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCTAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCCAGCAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGCGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTCGTAACTCGGACAGAAAATCGGCATCTAAGTGGGGCGGTTGTCCTAATTGTAATGGTGCCACTGGCTGATATAACGTTGGTATGTCTGGCTTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTTCCAATCGTCATGACGACCACGGCAGTACTTAAAAAGACGCCACCATTGAGACTAGTATATCCAGCGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGGTCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGCATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCTGTTGGTTGCGAAAAGTTAAAGTCATCTTGACCGAGTCCACCAGTGATTCGGCCATGGTACATCATACGTGGCCGGTTGCGATGATGGTTCGTGATGCCGGTGTAGAGGGTGCCGTCTGGAATGATGGCGGCCAGGCCAGCAATCATCGGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGCTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTGGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGACTTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGAGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGCAGCATGGCTTGCCATTGCGGGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATAGCCGGCATAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAATTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTTAACTGATGCGTGTTTGAAATAATGGTTCCTGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGTAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCGGCTGGAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAAGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGCTGGGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAATACCCAGTCCAGCAGTGGCTAGTTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACGATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGAGACAAAACTAGAGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTAAGGGGTAGCGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGGGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAGTACCCGTCCCGACCGCGGTCATAACTTTCAAGCACCGGCGCGATGGTTTCCGGATTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGCTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAAAAATAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATTACTTGCTGGTTGGCATGTGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTAATCCTTCTCGTTTTCGAGCGCCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGCCCAGCCGTGGTCAGTCGCAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAATTCTTTTTCAACATTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGGGTAAAATTGCCGTGCTTGAGCAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTGGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAGGTGAGTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTCATGTTGAGTTAGTTGCATCGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCTGTCAACATCCTGGCGATAGTGGCAAATAGCATTATGACCAACCATTTTAACATAATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGGGTATAGATAAATAAATATTTCACAAGCAGAGCGCTTTCACTTACACTAATCAGTATTAAGAGTGGCCAATCATTCAATAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAGCAACAAGCCACGATTGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTAAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGCTCACTGGGAACCTCACGCGCTCAAGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAAGCGCCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGCGACCTGACTTATCCGGATAAAGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTGGATTTAACGAATAAAATCATGCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGGCAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGAACGAATGCTCAGCATTCGTACAATCGGATGTTGCTGGAATTTATGCAACGACATTTTGCGACACAAGCCGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTGATGTCCCGATGTTTGATGAATCGAATGATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACTAAAATTGCGACGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTGCCTTCCGCGTTGAAAAGCATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTTACCCATTAGATGGTCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGTGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTGCACCTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAATTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCCACTGGACATAATGGCGAATTGCCAATGCGAGTGACCCTCTCCGCTGACCGGATTGAAAATATTGAAATTGATACCAGTAGTGAAACGCAGGGGATTGCCGATGTGGCTTTTGAACGCATTCCCAAGGAGATTATTGCGGGTCAAACGCTCGCTGTTGATGCGATTTCCGGGGCTTCAATTACCAGTCATGGTGTTATCGATGGGGTCGCTCGTGCGGTCAAAGAAGCTGGTGCCAATCCTGATGATTTGAAGAAACGGCGTGCGACTAAGCAGGTCGCTCAACCTGCTGTCAAAGAAGTGACGACTGATGTCGTAGTGGTTGGTGCTGGTGGGGCTGGTTTGACTGCAGCGGCCAAAGTGTTACAGGCTGGTCATCAAGCCGTTGTCCTAGAAAAATTCCCAGCTGTCGGTGGTAATACCGTTCGCGCTGGGGGGCCCATGAATGCGGCTGATCCGGATTGGCAACGACAGTTTGCAGCTTTGCCAGGTGAAAAGCAAACGTTGAAGGATCTGAGTGAGCGTGATGAAAGTACAATTGCACCTGAATATCGGGCTGATTTCCGTAAATTGAAACAGCAGATTGACGCATACCTGACTGCCAATACCAATCAAAAGGGCACCTTATTTGATTCAACCTTGTTACATCGGATTCAAACTTATTTAGGTGGTCAACGGACTGATTTGAACGGTCAAGAGATTCACGGTCAGTATGATTTGGTAAAAGAATTGACGGATAACGCCCTGGATTCAGTCAAGTGGTTACAATCGATTGGTGTGAAATTTGATGAAAGCCAAGTGACAATGCCAGTTGGAGCCATCTGGCGGCGCGGGCATAAGCCAATGGGCGATCTAGGGTTTGCTTACATCAAGACTTTACGGGCCTTTGTTGAACAACAGGGTGGTACGATTATGACGGAAACGCCGGTAAAAGAATTACTGGTGACGGATGGGCAAGTTCGTGGCGTCATTGCGACTAATGCGGCTCATGAGAAAGTTATTGTCCATGCTGATGCGGTGATTTTAGCTTCTGGTGGTTTCGCAGCGAATACTAAAATGTTACAAAAGTACAATACGTACTGGACGGCCATCGACGATGATGTCAAGACGACTAATTCACCCGCAATGACTGGTGATGGAATTCGGCTAGGGACTAGTGTTGGTGCAGCATTAGTTGGGATGGGCTTCTCACAAATGATGCCGGTATCTGATCCGGAGACCGGCGAATTATTCAGTGGGCTCCAAGTGCCACCGGCTAACTTTGTGATGGTAAACCAGCAAGGAAAACGGTTCGTCAATGAGTACGGCAGTCGTGATGAGTTAACTCAGGCGGCCATTGATAATGGGAGTCTCTTCTATTTAATTGCCGATGATGAAATTAAAAAGACGGCTTACAACACGACACAAGCTAAAATTGACCAGCAGGTGGCGAATGGGACCTTGTTCCGTGCTGATACTTTGACAGATTTAGCGCAACAAATTGGCATGGACCCGACAGCCCTGACCAAGACGATTGCGGATTACAATCGTTACGTTGATGCCGGCGAGGATCCTGAATTTCATAAGACGGCCTTTGATTTGAAAGTTGCCGTGGCACCATTTTACGCAACGCCGCGTAAACCAGCAACCCACCACACGATGGGGGGCTTGAAGATTGATCCGGATGCTCACGTTTTAAATACGGACGGTCAGATTATCGACGGGCTATACGCGGCGGGAGAAGTAGCCGGTGGAATTCACGCGGGTAACCGGCTAGGTGGTAACTCGCTTAGTGATATCTTTACGTTCGGTCGAATCGCGGCGGCTCATGCTGTTGCTGAGCACGTTGATCCGGTGACGGCCTAAGGCAATTATTAAGTCGCTACGTTGGTTGAGTCGTGTTAGTGTATAATCGACTGTAGAGAGAAGCAGATCGACAAGGGAGATTATCACATGCAAAAACCAATGCCAGTCGCGGTGACGAACATTGCGGACAATATTACGCACCAACCAGCTTATATGACGATTGTTTTAAATGATCACAAGTATTCGACCGCGCGCAAAAAGACGCCGTTTATCTTGAAAGCGTTGAATGAGGGCGCGGCTGCTCATGGGCGTTTGACGATCACGCCTAGTCGGCTGAGTTTGGCCGATGAGCGCGGCACAGTCTTTCAAACCTTGGCGCCAATACCCACAGTCATCACGGACGTCGAGCTGGGATTGTATCGCTCAATCGTGCGGCAACTTGGTAATGGCGTACGAATGAAGGCCCGTTACACATTGGCGGTGACGTTGACCAGCGATACCGCTACTTATCAGATGTTAAATACCGATTTGTCAGTGTTGAAACCGCTGTTGGCTTGGATCACCGACTTTCATCTTCACTTAACCGATTCGTTACAATTGGCAACCAGTGACATCGACTGGCCCAATTTGACGGCTGATCAATTTGAAGCATTGACAAAGGGCACCCCGTACTTTGCTTGGCAACAGACGATTGGGGCCCACTGGTAAGTAAAATTAAGAACTACAAAATATGAAGCCAGACTTTCGATAATAGTCGAAAGTCTGGCTTCGTTTTTTATTATAAAATTTCACCGATAAAGTCGCCTTTAGGTAATTGTTGGAAGTCGTAAGTTTCAAAATCACTCACTTGTTTGGTATACCAGTGTAAGCTTTCGGTAATCATCAGGTTGACGGCCTCATCTTTTTCCTGCAAGGCGATGATGGGCAAGTCGCGCATGGTAGCCACACCTAGCTCGTAGGCGGTACCAGAATCTAAGTTTTTGGCTTCAAAGTCTAAGACAGTCACGATGACTTGCGCGGCCGCAATTTGGGCCATGTCACGGTGGAAAATTTCGGTCGCCCAAGCTTTGGTGAACTGTTCGGCTTGAGCGTCCTGGTGTAGACGTGGTGAATAAAAATCCGTGACCGTTGGATTTTTTGCTAAAGCTTCCTCAAGTTGTGTGACCCGCGTCACTTGTTCGGGACTGAAAAACGGACTAGCAATATAGATTTGCGCCATGAAGACACTCCTTAAAATTAATTTGATAATAAAGACCAATGGGTTCATTTTAGAGATTTTAGGCGCTAACGTCAAACAGTTTTTAATGGATGGTCTGAGTGGAGACGTGTCATGTCAGGTTGGTAAAAAATACGGTGACGTTGGCCATTGGAAGGCTAAATAAGTAACGTGGGTAGCGATTGATTAATCATCAACTTGTTTGTAAATCTACCAATGACAACTTATTAATAACACTGATGAAAAAGATGGGCTTATTATAAAGGGATCGTAGAACTATTGGTAATTCCAATGGATATTCTAAGTATCAAAGTTGGTTGTGTTTGGCAGAGAATGGGGGCAGTTTTATGCGAAATAAATTGTTTTCAGTCCTACTAGGTCTGTTAACAGTTTTAGTGACAGTCATAGTATTAGGACGGATTGGACAAGCGGATGATGTGCCGACGGCTGGCCTAACGGGGAATGAGGCCAGAGTGACTGATCGGTATGGCAATGTCATCACAGATACAAGTCAATTAAGCAAATGGGAGGATTTTACAGTCGAGTATGACTGGGCTATTCGCAATGGTCAACCAATTGCGGCCGGTGATACAGAATTGCCGAATGGGACGGTTGCACCCGTTGATTTGGGGTTTCCATTGAAAGACGATAATGGTCGAGTTGCTGGTCATTTTAAAATTAAAGCGGGTGAAACCGCTGGACTGATTACTTTCAACGATGCCTTATCACAAATGGGGACGAATCGCGCGAGTACCCTCCAGTTTTACGTGAAAGGCACGGCTGATTCTGATGTATATTTTGATTGGAAGCTATGATGAGCATGGCCTGCCTGCAACTTTAACATGGAATATTGCATTCAATCCAAGCGGTAAGAAGCTTGGAACAGTTGTTGTCAATGACACATTGGGTTCCAATCAAAGTTACCTCTCCGATTCAGTAATTGCGCAAACGGGCGCCTACAACGATGCCGGTAATTTTGTGTAG

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP025988|72396:81359|73716_74688_-|WP_103001986.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP025988|72396:81359|74873_75821_-|WP_103001987.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP025988|72396:81359|76780_79219_+|WP_103001988.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP025988|72396:81359|79306_79867_+|WP_003643095.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_103001987.1|74873_75821_-	LysR family transcriptional regulator	A0A2P0ZL89	Lactobacillus_phage	2.9e-177	99.7
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WP_103001988.1|76780_79219_+	flavocytochrome c	A0A2P0ZL82	Lactobacillus_phage	0.0e+00	99.5
WP_003643095.1|79306_79867_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL75	Lactobacillus_phage	2.7e-101	100.0
WP_053267624.1|79937_80378_-	nucleoside 2-deoxyribosyltransferase	A0A2P0ZL88	Lactobacillus_phage	4.0e-76	98.6
WP_052098033.1|80722_81190_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL91	Lactobacillus_phage	6.1e-83	99.4
WP_103001989.1|81164_81359_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL95	Lactobacillus_phage	5.5e-30	100.0

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP025988|581994:665342|DBSCAN-SWA
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MIDMKIDQYHLTSDKYEVKVNRMSLDSQGHPVTSYDDKSGINRLVEAPLAHCKNVEDALHWLRGYLIRTGSERITTVDQLARESRKIERQFDTYIKERVPEGL
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MELVDALKMAGRNGKIVRASDLKYDSTYYVQATDTKGRLIAFTHGEQLSVCWEPTFTDLVANNWLVVQKGDPYREQGSLKNL
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MVNEQDLIAAIRLHAPSHLPGPVSIDGLLSELGINDESLLTNALKSLQDKGYLQFGYGNGKIKRISLNTSFPL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_024521658.1|585026_586325_-	3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_063487838.1|606813_607692_-	elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
607576:607593	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_003640741.1|609833_610832_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HKI4	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	2.3e-47	34.9
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WP_003645630.1|612075_612711_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_003644501.1|613101_613341_-	DUF896 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003641361.1|661563_661890_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A1B0Y2R0	Lactobacillus_phage	6.9e-17	44.1
WP_003641360.1|661920_662310_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	D6PSS8	Lactobacillus_phage	4.6e-36	54.3
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WP_003641358.1|663162_663363_+	hypothetical protein	E9LUS6	Lactobacillus_phage	4.9e-26	100.0
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672284:672301	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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MDSEISKYELIATMKKDIQTFMDSESMLYLKKDSYSTEEYDRMLTEVKDDLKTRLLQK
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MSDTILIRHEAPKGFQFISEEEYERFQAWQQAQRGICTWKLKDLARYKYGTKSTERASRYLTKHRHDLDIEQGGFIDYVNTHNGWQIPAAEMMDYLLDHPD
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MNWGNQLVNLAANHAYEPAALHWTKQHMKRHLKAGGSAQDEVCAHEYKLFALEVLIIEYQRDGLNFDLTQCWGKPAEYFIDLEQARQGLQTEVSA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_080440469.1|985592_985760_-	hypothetical protein	E9LUP4	Lactobacillus_phage	5.6e-15	93.6
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WP_187330242.1|986668_986845_-	hypothetical protein	E9LUP2	Lactobacillus_phage	1.1e-24	94.8
WP_103002092.1|986847_987006_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLB5	Lactobacillus_phage	1.9e-17	92.3
WP_047673732.1|986998_987379_-	endodeoxyribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_103002093.1|987375_987894_-	hypothetical protein	O03915	Lactobacillus_phage	4.5e-55	69.1
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WP_103002094.1|988417_988705_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103002095.1|988701_989610_-	DnaD domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_060684052.1|990056_990263_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_063492987.1|990344_991097_-	PD-(D/E)XK nuclease-like domain-containing protein	A0A0P0IZH9	Lactobacillus_phage	2.4e-73	51.4
WP_103002096.1|991128_992016_-	recombinase RecT	E9LUM3	Lactobacillus_phage	3.9e-62	47.4
WP_103002097.1|992012_992399_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103002098.1|992769_993282_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	D6PST4	Lactobacillus_phage	2.3e-27	42.9
WP_016511199.1|993349_993655_-	DUF771 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642792.1|993666_993837_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_076634767.1|993833_994088_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2H4JFN1	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-06	39.4
WP_063204180.1|994229_994748_+	helix-turn-helix domain-containing protein	S6C481	Thermus_phage	3.5e-15	34.1
WP_103002099.1|994762_995185_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	A0A0S2SXM3	Bacillus_phage	6.0e-13	35.1
WP_103002100.1|995242_995944_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103002101.1|996042_996606_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103002102.1|996598_997030_+	hypothetical protein	A0A1Q1PVT2	Staphylococcus_phage	8.0e-05	25.2
WP_076637223.1|997172_997349_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL93	Lactobacillus_phage	1.6e-07	53.4
WP_060684061.1|997844_998405_+	DUF5067 domain-containing protein	Q6SEF8	Lactobacillus_prophage	1.3e-44	65.9
WP_060684062.1|998459_998795_+	hypothetical protein	A0A1B0Y4P2	Lactobacillus_phage	6.4e-26	53.9
WP_076640401.1|999071_999248_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL93	Lactobacillus_phage	3.3e-10	51.7
WP_103002103.1|999442_1000537_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103002104.1|1000826_1001948_+|integrase	site-specific integrase	D6PSS4	Lactobacillus_phage	6.4e-46	32.1
1009626:1009640	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP025988|1202706:1211217|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_076670405.1|1203277_1204303_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	R9TMC7	Synechococcus_phage	1.9e-60	42.4
WP_103002118.1|1204299_1205754_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	1.5e-50	34.0
WP_021356102.1|1205738_1207958_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	3.5e-144	39.1
WP_021356103.1|1207950_1208631_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_003642588.1|1208630_1208885_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_021356104.1|1208886_1209618_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4SM18	Cyanophage	2.1e-37	37.3
WP_024521791.1|1209620_1210751_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_187331169.1|1210734_1211217_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	3.0e-16	41.0

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP025988|2339600:2387671|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

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CATGTATCGGGCACTATATCGGGTTTGGCGTCCCCAACGCTTTGATGAGATTGTCGGGCAACAGATGATTACCCAGACACTAAAAAATGCCATTATGACCCACCAGACGAGTCATGCGTATCTGTTTACCGGTCCCCGGGGAACTGGGAAAACGTCGGCAGCAAAGATTTTTGCTAAGGCAATTAACTGTCACCATCTTGTTGATGGGGAACCTTGCAATGAATGTGAGACTTGTACGGCGATTACCAAGGGGCAACTAAATGATGTCATCGAAATTGATGCGGCTTCTAATAATGGCGTGGAAGAGATTCGTGATATTCGGGACAAAGCGAAGTATGCTCCAACGCAAGCGGACTATAAAGTCTACATTATTGATGAAGTTCATATGTTATCGACTGGCGCGTTTAATGCGTTGCTCAAAACGCTAGAAGAACCCCCGGCTAACGTTATATTTATCTTAGCGACAACGGAGCCCCATAAGATTCCATTAACGATTATTTCACGGACGCAACGGTTTGATTTTCGGCGGATTACAGCTAAGGATAGCTACGATCGGATGGTGTACATCCTCAATGAGAAGGATGTGACCTATGATGAAAAAGCGCTACGCGTCATTGCAGCGGCTGCTGAAGGTGGAATGCGGGATGCTTTAAGTATTCTGGATCAAGTAATTTCGTTTGGAGATAACACGGTTACGTTGGATGATGCGTTAATGGTGACGGGAAGTGTGACCAAGCAGTTGTTGGCTAACTATGTCAGTGAGGTCACCGACCATGATACGAAGCCGGCACTAGAGACGATGCGACAAATCTTACAAGAAGGTAAAGATGCGAACCGTTTCATTGAAGATTTGATCAGTTATACGCGTGACGTGTTACTCTATCAACAGGCCCCTGAAATGGTCGATAGTGTGGCGATGGGCGAGGATGATCAACAATTTGAAGCATTTGCCAAGCAAATCGATGCTGAAGTCCTGTATCAAATGGTCAAGACGTTGAACGATATTCAACAACAAATGCGGTTCACGACGCACCCCGACGTTTATTTAGAAGTGTTGACGGTCAAGTTAGCTCAGTTGGATGGTCAAGCGGCCGTTCAACCGGTAGCTGCGGCAACGGTCAATCCTGAAGATCCCACTGTGCATAAACTGGCACAACAAGTTGAACAGTTGCAAAGCGAGGTCAAAACGTTACGTTCTCAAGGTGGTAGTGTCACTAAACCCGCACCGGCTAAGCCGCGGTCGAGTAATGGCCCGGTTGTTAAGAAGGTTAATGTCAGTCAGATTTATCCTATTCTGGGAGCGGCAACGAAGAATGATCTCATTAAGGTGCGCGATGTTTGGACTGATTTGATGAACATTTTGAGTGTGACGCAGCGGGCCCTAATGCACGTGGCCCAACCAGTTGCGGCCAGTTCAGAAGGTGTTGTGGTTGCGTTTGACTATGCGTTTGTTTATCAAAAAGCGATTGATGACCAGACCTTGATCGATGCACTCGGAAATGGTTTGGATCGGCTGATGGGACAGGCACCCAAGATTGTCTGTGTGCCTAAAGAACAGTGGCCACAAATTCGTAAGGATTATTTGGCCACTCACCAGCCAGGAGGTGCAACATCAGAGCAACAAGCACCGGCCAAAGAACCGGTCGTTGAAGAAGCTAAGAACATGTTCGGTGATTTAGTTGAAGTACAGCCGGACTAAAGACGAAAGGAACTGATAATTATGATGCGTGGAATGGGCAATATGCAAAGTATGATGAAACAAATGAAGAAGATGCAGGCGCAAATGACAGCCGAACAAGCGGCTTTAAATGAACAAACCTTTACGGGTGCGGCGCCAGACGACATGGTCAAAGTCACTTTTACTGGTGATAAGAAGATGAAGGATATTACGATTAACCCTGATGCTGTTGATCCTGATGATGTGGATATGTTACAGGACTTAGTCGTTGCTGCGGTGAACGACGCGTTGACTAAGGTCGATGAACAGACACAAAGTACGATGGGAAAATATACTAAGGGATTACAGTAAAAACGAGGTAAGTACATGCAGTATCCAGAACCAATTGCTAAGTTGATTGATAGTTATATGAAGTTGCCCGGCATTGGTGGCAAGACTGCGACGCGGCTGGCGTTTTATACAATTGATATGAACGGTGATGACGTCACCGAGTTCGCTAAGTCGCTGATTGCGGCCAAACGGGACCTGCATTTTTGTAGTATTTGCGGTAATATCACCGAAGATGATCCGTGTGTGATTTGTAAGGATAAGTCGCGTGATCAAAGCACCGTTCTGGTTGTTGAAGAGGCCAAGGATGTCATGGCAATGGAAAAGATTAAGGAATACAACGGGCTGTATCACGTCTTACATGGGGTATTGTCACCCATTGATGGCAAAGGTCCGGAAGATATCAACATTGCCAGTTTATTGAAACGGCTACAGCAAAATGAAGCCATCAAGGAAGTCATTATTGCCACCAACGCTACGCCTGAAGGTGAAGCAACAGCGATGTACATCTCGCGGTTAGTTAAGCCGGCGGGAATCAAAGTGACCCGATTGGCGCACGGCTTGTCGGTTGGTAGTGATATTCAATATGCGGATGAAATGACCTTATTCAAAGCCGTTGAAGGTCGCCAAGAAATGTAATTGGAGGTGCCACCATGTTTAAACGTAAACAGAAGATCAAGCATCCCAAGGAAGTTTTTGATGAACAGTTGTTGTCGACCCTGAATGCCGCTAAGTTGGACTGGGACCGTGCGAAGCAGAACCAAGAAGCGGTCTATGATAATAATACGAGTGAACTAGTTACGCAGACCGCCTTAGCGCGTGCTAAGTATTTATATCTGTATCGTGAAGCACGTTTACGTCAAGTTCATGGGCAGACGATTCAGCGCTCGGTCATTGATAAATAGACTGTTAGTGATTTAAGAGATAACTTGTTTCAAAATAAAGACGCACGTCGTTGATTTTTGTAAATCTACGGCGTGCGTTTTTGATTTAGAACCCTAGCATTATTTTACCAGTTAATCTGTCATGCATTGTGATTAAGACATGCTAGGTGCGGCAATTGGAATAGAAGATGTGTATCTACTAATGAATAACAAACTAAAATCGGTATTTATCAATCGTGGGTAGTACTACCTAATAACTTTTTAGCAATTCACCGAATAAATCATCAAAACCACAATTGGTAGTAGCCGACCCACGTAAAAATCGTGAAAAAGTACCCTCACTAGTGGTAACCGTATTAGACAGGTACTCAAAAATCAAGTACAATTGCTACATATAAGAAAATAGATGGGATTGGGAATGTTGACAGGAAAATTAGTTACTTTTGAAGGGCCAGACGGTGCCGGCAAAACGTCAGCTTTAAACGCGATTGTGGCCAAATTACAGCCACAATTAGGGGATCGCTTAGTTGTGACGCGTGAACCGGGCGGGAATCAAATCTCAGAAGCAATTCGAAAAATCATTTTAGACCGTCATAATACGGCGATGGACGACCGTACGGAAGCGTTACTCTATGCGGCAGCACGGCGACAACATATCGTCCAAACCATTCAACCAGCATTGCAGAACGACCAACTTGTCTTGTGTGATCGCTACATCGATAGCTCGGTCGCTTATCAGGGGGCCGGTCGTGGTATTGGGGAACAAGCGGTTTATGATATGAATCAGTTCGCGACCGCGGGGTTAACCGCAGATTTAACGTTGTATTTTGACGTAGATGCTGCCGTTGGATTAAACCGCATTCAACAACATCGCCAAAATGAAATTAATCGCTTGGACGTGGAAGCCTTAAGTTTTCATCACCGGGTGCAAGCAGCGTATTTGAGATTACTGGCTGATCATCCTGACCGTATCAAGCGCGTCGATGCAAGTCAGCCATTGGACCAAGTTGTGACGCAGGCCTTAGAGATTATGGCGTCACAGTTACCGACTTATGTGGCATCCAAGGGAGGGGAAGACCAATGAAATTAATTATTGCAATCGTTCAAGATAAGGACAGTAACCGGTTGAGCAGCCAGTTCATTGAAGCCAATGTTCGGGCCACGAAGCTCTCAACGACGGGGGGCTTCCTACGTTCAGGTAATACCACTTTTATGATCGGTATTGATGATGACCGTGTGGATGAAGTTTTAGCCATGATTAAAGAAACGAGTCATGCGCGGGAACAGTTTATGACACCACCAGTCAATCTAGACGTGACGATGGATGGCGCAGCTGCCTATCCAGTTGAAGTTCAAGTCGGTGGCGCCACGGTCTTTGTTCTACCAATTGAACAATTTCACCAATTTTAATGAAGGATGATTATTAATGGCAACAACCGAGTCATTTGCGCAAACGTTAGCGGCGAAACAGCCCCGCTTATTAGCGGCATTTAAACACATCATCGCCCAGAACCATCTGGCCCACGCGTACTTATTCGCGGGGATGGAAGGCGCTGGACAACCAGAACTGGCCCATTGGATTGCGCAACGGTTGTTCTGCCTGCATATTAATGATGGTGAACCAGATGGCACTTGTGAGGAGTGCGTCCGGATTGCTAATGGGTCGCACCCTGATATTGTGACAGTGGCTCCCGAGGGTCAGCGAATTCACGTTGATCAGGTTCGTTACTTAAAAGCTGAATTCTCTAAGAGTGCGGTCGAAGGTAACCGGAAACTGTTCATCATTAATGATGCGGAGAAGATGACAGCGAGTGCTGCCAATAGCTTATTGAAGTTTATTGAGGAGCCAAGTGGTAACGTCACGGCCTTGTTATTAACGACTAATAAGCAACTGATGCTACCAACGATTATTTCACGAACCCAGGTGATCGAATTCCCACCATTAAATGCGCAGGCGTTACAGCAGACGTTTGAACAGGCCGGGATTGCGCCAAACCAAGCACAGATGTTACGGGGCCTGACAAATAGCGTGACCCAGGCGCAGGCGTTGCTAGCGGATGATTGGTTACCACAAGCTGCGCAAGCATTGTGGCGGTGGTTTGACCAGGCTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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METQQSFADHAGIGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVATLKTVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLIEKLQTGVNLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIAANIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAKLARRHETVVLYESPFRVAKTLTLLATVCEGTRPIVACRELTKRYEEFARGTLAEMVTWAQDHQLKGEFVLLIGGNPDKDEPETTDELAQLPVKAQVEALIAAGDKPNVAIKTIAKRRNIPRQSVYNQFHELNTNDEES
>NZ_CP025988|2577683:2586307|2577683_2579381_+|WP_003644909.1|DBSCAN-SWA
MYRALYRVWRPQRFDEIVGQQMITQTLKNAIMTHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCHHLVDGEPCNECETCTAITKGQLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRTQRFDFRRITAKDSYDRMVYILNEKDVTYDEKALRVIAAAAEGGMRDALSILDQVISFGDNTVTLDDALMVTGSVTKQLLANYVSEVTDHDTKPALETMRQILQEGKDANRFIEDLISYTRDVLLYQQAPEMVDSVAMGEDDQQFEAFAKQIDAEVLYQMVKTLNDIQQQMRFTTHPDVYLEVLTVKLAQLDGQAAVQPVAAATVNPEDPTVHKLAQQVEQLQSEVKTLRSQGGSVTKPAPAKPRSSNGPVVKKVNVSQIYPILGAATKNDLIKVRDVWTDLMNILSVTQRALMHVAQPVAASSEGVVVAFDYAFVYQKAIDDQTLIDALGNGLDRLMGQAPKIVCVPKEQWPQIRKDYLATHQPGGATSEQQAPAKEPVVEEAKNMFGDLVEVQPD
>NZ_CP025988|2577683:2586307|2585311_2586307_+|WP_013355240.1|DBSCAN-SWA
MSILVLGGAGYIGSHMVDRLVEHGTDVVVVDNLVTGHRAAVNSAAKFYQGDLRDADFLNHVFDTEDIEAVVHFAAFSIVPESMSKPLKYFDNNTGGMITLLETMQAHNVKQIVFSSTAATYGTPKQIPIKETDPQLPINPYGASKLMMEQIMHWADVAYGIKFVALRYFNVAGAKPDGSIGEDHGPETHLVPIILQVAQGKRDELKIFGDDYNTPDGTNVRDYVHVVDLADAHILALKYLAAGNDSNAFNLGSSTGFSNKQMLAAAREVTGQPIPAKLAPRRPGDPDSLVAASDKARDVLGWQPNYDNVNDIIETAWAWTQKHPNGYDDRD
>NZ_CP025988|2577683:2586307|2580989_2581655_+|WP_011101140.1|DBSCAN-SWA
MLTGKLVTFEGPDGAGKTSALNAIVAKLQPQLGDRLVVTREPGGNQISEAIRKIILDRHNTAMDDRTEALLYAAARRQHIVQTIQPALQNDQLVLCDRYIDSSVAYQGAGRGIGEQAVYDMNQFATAGLTADLTLYFDVDAAVGLNRIQQHRQNEINRLDVEALSFHHRVQAAYLRLLADHPDRIKRVDASQPLDQVVTQALEIMASQLPTYVASKGGEDQ
>NZ_CP025988|2577683:2586307|2579726_2580326_+|WP_003637790.1|DBSCAN-SWA
MQYPEPIAKLIDSYMKLPGIGGKTATRLAFYTIDMNGDDVTEFAKSLIAAKRDLHFCSICGNITEDDPCVICKDKSRDQSTVLVVEEAKDVMAMEKIKEYNGLYHVLHGVLSPIDGKGPEDINIASLLKRLQQNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIQYADEMTLFKAVEGRQEM

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003644909.1|2577683_2579381_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1U9WR94	Streptococcus_virus	3.9e-55	37.0
WP_003640956.1|2579402_2579711_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_003637790.1|2579726_2580326_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_003640957.1|2580340_2580592_+	YaaL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101140.1|2580989_2581655_+	dTMP kinase	M1PSC7	Streptococcus_phage	1.4e-53	52.7
WP_003640965.1|2581651_2581981_+	cyclic-di-AMP receptor	NA	NA	NA	NA
WP_003640966.1|2581997_2583017_+	DNA polymerase III subunit delta'	M1NSC1	Streptococcus_phage	2.1e-32	33.5
WP_003640967.1|2583041_2583389_+	DNA replication initiation control protein YabA	M1PFV3	Streptococcus_phage	2.4e-12	33.3
WP_003643942.1|2583487_2584384_+	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	9.9e-82	55.7
WP_003640969.1|2584387_2585173_+	acyl-ACP thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_013355240.1|2585311_2586307_+	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	2.0e-51	38.5

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP025988|3182843:3198375|DBSCAN-SWA
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MASITKRFGSWQTRISYKKRNGKYATFSKAGFKTKKAAQLYSNSIEDNIALGILPNDKKDSHVFAEYFNSWFEDFKKAKISERTQHRYIITYHELQNYFNQTEIENITRRKYQQFINAYGANHAKDTVKKVNSLIRACVHNAIYEDMITKDFTENVELVFNPKKSRKIEYLNIQEIQQLSEYSFTHINKNFTSHQMILTAIYTGMRLGEIQGLQWKDINTDFKTITVRHALNESTQELIPTKNEASNRIIRINQELTDMFIEMKQHKRADLIFINQYGTVPTSAAVNKTLRESLKSLNIKRAGFHFHSLRHTHVAYLLYCGADLYAISKRLGHSDLATTTRIYSYLIEEYKVKTDNKIEQYLDDITVPKSVKEIAE
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MYNESEIETALSYRNYYIAAKAYQEAEQELLTTIKFTTVREVSTASNKKYRPAFLNSLSSHGIYYRTPANSKDGKWYFTLPDAKEVTDENLFS
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MNNYKSQAKHWYRKLMKTPVGYVCLATYRFKQWQHYKHLARQKTLDHLRGEDHADIQSEND
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MKTRITELREQRGLSQGSLADLVGLKDNTICQYETDKRTPNIYVLIKLADIFGVTIDYLIKRSDSNNVNSSKE
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MSLLDIAANTLDNFDPKNDSVNSGSTGLPDGDYLTAVESIEHRSFDSGWDCLQIVFTVLDGDHAGEKEYDRISFATKSKAGKAIPDFILSRSIKFVIKLGSLLGVEMKPEYFASDNETDTHEMLANVLASEKGKSVILHVKHRPNKKDPDNPYVEYDLDATEQPETADITDADLPGDLGGAPMPTDAEAPLPTDADAPADPTDEAPF
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MRNLVNYAVRYAKAGFSVLPMIGKKPMIKFADQPALTIDQIQSYWRSHPYAQLALRTTNFFVVDIDEHPGGADGFKSISDYPNPEYLRDTLSQNTAGGGRQLFYLKRDDCTIQQRIGWLPGVDVKAHVNNYVMVAPSERNGKQYRWENHNPIVTASRELVTAINATRDDAVNATTDFKIDYTEKSGTATLFETIVDGLGATGGRNNALASFVGGLLFRGVDPRAVIQLGLLANANTDDSLTQREAKTTIESMIKKEIRRREANQ
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MNLYEMATNYRDLTNRDDLNPDTIADTLDALTDSMNVKVDNIASWIDENQANIDFLDKKMKSFREEKQRLKNLNGRLNHYVTDTLDQAEIKKLTTDQHIVSVRNYRASTVVSEPDKLTADFVKEVHEYQPDKAAIYKALSAGKNVPGAHLEPNRKAVIK
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MNAKKIATLGAVLFIGIGMAGCGNNSNKSSSNSQKVSGPLKKVGTYTKDNETGKITLLAIKNYHNKAKNTKSATYYFKEAKLLKIETTKKSQRANDENNFGKKLNNTYYEYQLGYSLKNNSKKRVSSNGVELITPSGNQLSSNHGAIDELVGDKIQPGTKKTGLLQAIAKKGDIKKMNQYKFVSAELIEDSGNYYGVDNQTTINFNK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_060683879.1|3182843_3185111_+	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	1.1e-118	31.5
3184232:3184245	attL	NA	NA	NA	NA
WP_103002263.1|3185698_3186829_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A0M9JJ77	Lactobacillus_phage	7.0e-93	48.2
WP_103002264.1|3186934_3187423_-	cupin domain-containing protein	A0A291ATU0	Pandoravirus	2.2e-11	34.8
WP_103002266.1|3188100_3188724_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
3187717:3187730	attR	NA	NA	NA	NA
WP_103002267.1|3188815_3189247_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLA0	Lactobacillus_phage	1.7e-79	99.3
WP_027822424.1|3189256_3189634_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2P0ZLA1	Lactobacillus_phage	4.0e-45	69.4
WP_015380155.1|3189946_3190156_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL97	Lactobacillus_phage	1.6e-30	98.6
WP_102170767.1|3190159_3190363_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLA4	Lactobacillus_phage	1.5e-25	86.6
WP_103002268.1|3190362_3190701_+	DUF771 domain-containing protein	E9LUT3	Lactobacillus_phage	3.3e-30	66.7
WP_103002269.1|3190815_3191097_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103002270.1|3191246_3191432_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLA3	Lactobacillus_phage	9.2e-27	91.8
WP_103002271.1|3191676_3192156_+	siphovirus Gp157 family protein	A0A2P0ZLB3	Lactobacillus_phage	4.5e-81	96.2
WP_103002272.1|3192155_3193532_+	DEAD/DEAH box helicase family protein	A0A2P0ZLA5	Lactobacillus_phage	1.9e-233	95.3
WP_054397017.1|3193528_3193750_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0A7RUJ5	Clostridium_phage	5.7e-07	40.3
WP_054397014.1|3193727_3194444_+	AAA family ATPase	A0A2P0ZLB2	Lactobacillus_phage	1.3e-113	99.1
WP_063964021.1|3194446_3195070_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLB9	Lactobacillus_phage	2.3e-101	97.9
WP_103002273.1|3195083_3195638_+	DNA primase	NA	NA	NA	NA
WP_103002274.1|3195710_3196505_+	bifunctional DNA primase/polymerase	A0A2P0ZLB0	Lactobacillus_phage	1.7e-138	92.4
WP_103002275.1|3196501_3197776_+	helicase	A0A2P0ZLC4	Lactobacillus_phage	7.1e-243	98.8
WP_103002276.1|3198033_3198375_+	VRR-NUC domain-containing protein	A0A2P0ZLB6	Lactobacillus_phage	3.9e-55	89.4