CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP018629	Staphylococcus aureus strain MRSA107 chromosome, complete genome	8 crisprs	DEDDh,csa3,cas3,DinG,WYL	8	2	17	1

1. NZ_CP018629

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP018629_1

• CRISPR_ID: NZ_CP018629_1
• CRISPR_location: 1310368-1310453
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP018629_1

Consensus_repeat	Method
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP018629_1

>1.1|1310398|26|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder
CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018629_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP018629_1

>merge|NZ_CP018629|1|1310368-1310453|CRISPRCasFinder
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT

>NZ_CP018629|1|1|1310368-1310453|CRISPRCasFinder
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT	CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG
CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP018629.1|WP_001245802.1|1301476_1301665_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP018629.1|WP_000584398.1|1317581_1318088_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000791587.1|1316825_1317323_-|complement-convertase-inhibitor-Efb	unknown	unknown	gnl|CDD|289007
NZ_CP018629.1|WP_001823392.1|1303700_1305206_-|YfcC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224207
NZ_CP018629.1|WP_000231632.1|1314460_1314694_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000669537.1|1316321_1316672_-|complement-inhibitor-SCIN-B	unknown	unknown	gnl|CDD|371594
NZ_CP018629.1|WP_000041896.1|1309475_1310192_+|superantigen-like-protein-SSL12	unknown	unknown	gnl|CDD|171995
NZ_CP018629.1|WP_000765708.1|1310873_1311020_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000398672.1|1300430_1300565_-|beta-class-phenol-soluble-modulin	unknown	unknown	gnl|CDD|368464
NZ_CP018629.1|WP_000739523.1|1307822_1308548_+|superantigen-like-protein-SSL14	unknown	unknown	gnl|CDD|171855
NZ_CP018629.1|WP_000793606.1|1306383_1307385_-|ornithine-carbamoyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|235269
NZ_CP018629.1|WP_001032814.1|1315315_1315501_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_103067891.1|1308642_1309368_+|superantigen-like-protein-SSL13	unknown	unknown	gnl|CDD|106307
NZ_CP018629.1|WP_001074342.1|1305428_1306361_-|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237071
NZ_CP018629.1|WP_000739563.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171849
NZ_CP018629.1|WP_001791789.1|1319120_1319213_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000149423.1|1303165_1303393_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000848124.1|1313024_1313984_+|beta-channel-forming-cytolysin	unknown	unknown	gnl|CDD|273388
NZ_CP018629.1|WP_001239288.1|1301913_1302861_+|TDT-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|187765
NZ_CP018629.1|WP_000195429.1|1311587_1312760_-|IS256-like-element-IS256-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|307151

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP018629.1|WP_001245802.1|1301476_1301665_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	0.00787195
NZ_CP018629.1|WP_000791587.1|1316825_1317323_-|complement-convertase-inhibitor-Efb	gnl|CDD|289007	pfam12199, efb-c, Extracellular fibrinogen binding protein C terminal. This domain family is found in bacteria, and is approximately 70 amino acids in length. There is a conserved VLK sequence motif. It is the C terminal domain of bacterial extracellular fibrinogen binding protein. It contains a helical motif involved in complement regulation. This motif binds to complement and changes its conformation to a form which cannot activate downstream components of the complement cascade.	5.40265e-27
NZ_CP018629.1|WP_001823392.1|1303700_1305206_-|YfcC-family-protein	gnl|CDD|224207	COG1288, COG1288, Predicted membrane protein [Function unknown].	0
NZ_CP018629.1|WP_000041896.1|1309475_1310192_+|superantigen-like-protein-SSL12	gnl|CDD|171995	PRK13350, PRK13350, superantigen-like protein; Reviewed.	1.29441e-152
NZ_CP018629.1|WP_000195429.1|1311587_1312760_-|IS256-like-element-IS256-family-transposase	gnl|CDD|307151	pfam00872, Transposase_mut, Transposase, Mutator family.	0
NZ_CP018629.1|WP_000398672.1|1300430_1300565_-|beta-class-phenol-soluble-modulin	gnl|CDD|368464	pfam05480, Staph_haemo, Staphylococcus haemolytic protein. This family consists of several different short Staphylococcal proteins, it contains SLUSH A, B and C proteins as well as haemolysin and gonococcal growth inhibitor. Some strains of the coagulase-negative Staphylococcus lugdunensis produce a synergistic hemolytic activity (SLUSH), phenotypically similar to the delta-hemolysin of S. aureus. Gonococcal growth inhibitor from Staphylococcus act on the cytoplasmic membrane of the gonococcal cell causing cytoplasmic leakage and, eventually, death.	6.35158e-13
NZ_CP018629.1|WP_000739523.1|1307822_1308548_+|superantigen-like-protein-SSL14	gnl|CDD|171855	PRK13043, PRK13043, superantigen-like protein; Reviewed.	8.18566e-161
NZ_CP018629.1|WP_000848124.1|1313024_1313984_+|beta-channel-forming-cytolysin	gnl|CDD|273388	TIGR01002, synergohymenotropic_toxin, beta-channel forming cytolysin. This family of cytolytic pore-forming proteins includes alpha toxin and leukocidin F and S subunits from Staphylococcus aureus, hemolysin II of Bacillus cereus, and related toxins. [Cellular processes, Toxin production and resistance].	1.62736e-140
NZ_CP018629.1|WP_103067891.1|1308642_1309368_+|superantigen-like-protein-SSL13	gnl|CDD|106307	PRK13349, PRK13349, superantigen-like protein; Reviewed.	7.3468e-148
NZ_CP018629.1|WP_001074342.1|1305428_1306361_-|carbamate-kinase	gnl|CDD|237071	PRK12353, PRK12353, putative amino acid kinase; Reviewed.	0
NZ_CP018629.1|WP_000739563.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	gnl|CDD|171849	PRK13033, PRK13033, formyl peptide receptor-like 1 inhibitory protein; Reviewed.	3.87075e-77
NZ_CP018629.1|WP_000793606.1|1306383_1307385_-|ornithine-carbamoyltransferase	gnl|CDD|235269	PRK04284, PRK04284, ornithine carbamoyltransferase; Provisional.	0
NZ_CP018629.1|WP_001239288.1|1301913_1302861_+|TDT-family-transporter	gnl|CDD|187765	cd09325, TDT_C4-dicarb_trans, C4-dicarboxylate transporters of the Tellurite-resistance/Dicarboxylate Transporter (TDT) family. This subfamily contains bacterial C4-dicarboxylate transporters, which is part of the Tellurite-resistance/Dicarboxylate Transporter (TDT) family. It includes Tellurite resistance protein tehA; the tehA gene encodes an integral membrane protein that has been shown to have efflux activity of quaternary ammonium compounds. TehA protein of Escherichia coli functions as a tellurite-resistance uptake permease.	1.39126e-83
NZ_CP018629.1|WP_000669537.1|1316321_1316672_-|complement-inhibitor-SCIN-B	gnl|CDD|371594	pfam11546, CompInhib_SCIN, Staphylococcal complement inhibitor SCIN. SCIN is released by Staphylococcus aureus to counteract the host immune defense. The protein binds to and inhibits C3 convertases on the bacterial surface, reducing phagocytosis and blocking downstream effector functions by C3b deposition on its surface. An 18 residue stretch 31-48 is crucial for SCIN activity.	2.0882e-48

Protein sequences

>NZ_CP018629.1|WP_000041896.1|1309475_1310192_+|superantigen-like-protein-SSL12
MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD
>NZ_CP018629.1|WP_103067891.1|1308642_1309368_+|superantigen-like-protein-SSL13
MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAHYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQEIIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN
>NZ_CP018629.1|WP_000739523.1|1307822_1308548_+|superantigen-like-protein-SSL14
MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN
>NZ_CP018629.1|WP_000793606.1|1306383_1307385_-|ornithine-carbamoyltransferase
MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEIMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVLESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF
>NZ_CP018629.1|WP_001074342.1|1305428_1306361_-|carbamate-kinase
MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK
>NZ_CP018629.1|WP_001823392.1|1303700_1305206_-|YfcC-family-protein
MPGAFMILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKNDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSAHFTLRKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGVLITQVLIYS
>NZ_CP018629.1|WP_000149423.1|1303165_1303393_-|hypothetical-protein
MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWNLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV
>NZ_CP018629.1|WP_001239288.1|1301913_1302861_+|TDT-family-transporter
MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMIKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLKNVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIIFLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPDIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKEKQDKFLRNASQ
>NZ_CP018629.1|WP_001245802.1|1301476_1301665_-|hypothetical-protein
MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANSIFSNEN
>NZ_CP018629.1|WP_000398672.1|1300430_1300565_-|beta-class-phenol-soluble-modulin
MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF
>NZ_CP018629.1|WP_000765708.1|1310873_1311020_-|hypothetical-protein
MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE
>NZ_CP018629.1|WP_000195429.1|1311587_1312760_-|IS256-like-element-IS256-family-transposase
MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK
>NZ_CP018629.1|WP_000848124.1|1313024_1313984_+|beta-channel-forming-cytolysin
MKTHIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN
>NZ_CP018629.1|WP_000231632.1|1314460_1314694_+|hypothetical-protein
MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH
>NZ_CP018629.1|WP_001032814.1|1315315_1315501_+|hypothetical-protein
MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ
>NZ_CP018629.1|WP_000669537.1|1316321_1316672_-|complement-inhibitor-SCIN-B
MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR
>NZ_CP018629.1|WP_000791587.1|1316825_1317323_-|complement-convertase-inhibitor-Efb
MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK
>NZ_CP018629.1|WP_000584398.1|1317581_1318088_-|hypothetical-protein
MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK
>NZ_CP018629.1|WP_000739563.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein
MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWY
>NZ_CP018629.1|WP_001791789.1|1319120_1319213_+|hypothetical-protein
MLKTVKSTRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC

Crispr_ID: NZ_CP018629_2

• CRISPR_ID: NZ_CP018629_2
• CRISPR_location: 1315713-1315958
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 4 spacers

Consensus repeat of NZ_CP018629_2

Consensus_repeat	Method
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CRT

spacers of NZ_CP018629_2

>2.1|1315734|35|NZ_CP018629|CRT
CATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATA
>2.2|1315790|35|NZ_CP018629|CRT
TTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG
>2.3|1315846|36|NZ_CP018629|CRT
CATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGT
>2.4|1315903|35|NZ_CP018629|CRT
TTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018629_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP018629_2

>merge|NZ_CP018629|2|1315713-1315958|CRT
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATATTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA

>NZ_CP018629|2|1|1315713-1315958|CRT
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATA
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	TTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGT
TGGGCCCCACCCCAACTTGCA	TTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTG
TTGGGGCCCCGCCAACTTGCA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP018629.1|WP_000739209.1|1319529_1319859_-|complement-convertase-inhibitor-Ecb	unknown	unknown	gnl|CDD|289007
NZ_CP018629.1|WP_000584398.1|1317581_1318088_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000791587.1|1316825_1317323_-|complement-convertase-inhibitor-Efb	unknown	unknown	gnl|CDD|289007
NZ_CP018629.1|WP_001803346.1|1320052_1320220_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000231632.1|1314460_1314694_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001791789.1|1319120_1319213_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000195429.1|1311587_1312760_-|IS256-like-element-IS256-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|307151
NZ_CP018629.1|WP_000765708.1|1310873_1311020_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000739523.1|1307822_1308548_+|superantigen-like-protein-SSL14	unknown	unknown	gnl|CDD|171855
NZ_CP018629.1|WP_000793606.1|1306383_1307385_-|ornithine-carbamoyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|235269
NZ_CP018629.1|WP_001032814.1|1315315_1315501_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_103067891.1|1308642_1309368_+|superantigen-like-protein-SSL13	unknown	unknown	gnl|CDD|106307
NZ_CP018629.1|WP_001074342.1|1305428_1306361_-|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237071
NZ_CP018629.1|WP_000049484.1|1320347_1320851_-|metallophosphoesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|223695
NZ_CP018629.1|WP_000739563.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171849
NZ_CP018629.1|WP_001039659.1|1321442_1322243_-|glutamate-racemase	unknown	unknown	gnl|CDD|234851
NZ_CP018629.1|WP_000848124.1|1313024_1313984_+|beta-channel-forming-cytolysin	unknown	unknown	gnl|CDD|273388
NZ_CP018629.1|WP_000041896.1|1309475_1310192_+|superantigen-like-protein-SSL12	unknown	unknown	gnl|CDD|171995
NZ_CP018629.1|WP_000669537.1|1316321_1316672_-|complement-inhibitor-SCIN-B	unknown	unknown	gnl|CDD|371594
NZ_CP018629.1|WP_000659317.1|1320843_1321431_-|XTP/dITP-diphosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|184835

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP018629.1|WP_000739209.1|1319529_1319859_-|complement-convertase-inhibitor-Ecb	gnl|CDD|289007	pfam12199, efb-c, Extracellular fibrinogen binding protein C terminal. This domain family is found in bacteria, and is approximately 70 amino acids in length. There is a conserved VLK sequence motif. It is the C terminal domain of bacterial extracellular fibrinogen binding protein. It contains a helical motif involved in complement regulation. This motif binds to complement and changes its conformation to a form which cannot activate downstream components of the complement cascade.	4.63429e-22
NZ_CP018629.1|WP_000049484.1|1320347_1320851_-|metallophosphoesterase	gnl|CDD|223695	COG0622, COG0622, Predicted phosphoesterase [General function prediction only].	9.91823e-44
NZ_CP018629.1|WP_000669537.1|1316321_1316672_-|complement-inhibitor-SCIN-B	gnl|CDD|371594	pfam11546, CompInhib_SCIN, Staphylococcal complement inhibitor SCIN. SCIN is released by Staphylococcus aureus to counteract the host immune defense. The protein binds to and inhibits C3 convertases on the bacterial surface, reducing phagocytosis and blocking downstream effector functions by C3b deposition on its surface. An 18 residue stretch 31-48 is crucial for SCIN activity.	2.0882e-48
NZ_CP018629.1|WP_000659317.1|1320843_1321431_-|XTP/dITP-diphosphatase	gnl|CDD|184835	PRK14822, PRK14822, XTP/dITP diphosphatase.	1.88157e-114
NZ_CP018629.1|WP_000791587.1|1316825_1317323_-|complement-convertase-inhibitor-Efb	gnl|CDD|289007	pfam12199, efb-c, Extracellular fibrinogen binding protein C terminal. This domain family is found in bacteria, and is approximately 70 amino acids in length. There is a conserved VLK sequence motif. It is the C terminal domain of bacterial extracellular fibrinogen binding protein. It contains a helical motif involved in complement regulation. This motif binds to complement and changes its conformation to a form which cannot activate downstream components of the complement cascade.	5.40265e-27
NZ_CP018629.1|WP_000739523.1|1307822_1308548_+|superantigen-like-protein-SSL14	gnl|CDD|171855	PRK13043, PRK13043, superantigen-like protein; Reviewed.	8.18566e-161
NZ_CP018629.1|WP_000793606.1|1306383_1307385_-|ornithine-carbamoyltransferase	gnl|CDD|235269	PRK04284, PRK04284, ornithine carbamoyltransferase; Provisional.	0
NZ_CP018629.1|WP_103067891.1|1308642_1309368_+|superantigen-like-protein-SSL13	gnl|CDD|106307	PRK13349, PRK13349, superantigen-like protein; Reviewed.	7.3468e-148
NZ_CP018629.1|WP_001074342.1|1305428_1306361_-|carbamate-kinase	gnl|CDD|237071	PRK12353, PRK12353, putative amino acid kinase; Reviewed.	0
NZ_CP018629.1|WP_001039659.1|1321442_1322243_-|glutamate-racemase	gnl|CDD|234851	PRK00865, PRK00865, glutamate racemase; Provisional.	2.38427e-134
NZ_CP018629.1|WP_000739563.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein	gnl|CDD|171849	PRK13033, PRK13033, formyl peptide receptor-like 1 inhibitory protein; Reviewed.	3.87075e-77
NZ_CP018629.1|WP_000848124.1|1313024_1313984_+|beta-channel-forming-cytolysin	gnl|CDD|273388	TIGR01002, synergohymenotropic_toxin, beta-channel forming cytolysin. This family of cytolytic pore-forming proteins includes alpha toxin and leukocidin F and S subunits from Staphylococcus aureus, hemolysin II of Bacillus cereus, and related toxins. [Cellular processes, Toxin production and resistance].	1.62736e-140
NZ_CP018629.1|WP_000041896.1|1309475_1310192_+|superantigen-like-protein-SSL12	gnl|CDD|171995	PRK13350, PRK13350, superantigen-like protein; Reviewed.	1.29441e-152
NZ_CP018629.1|WP_000195429.1|1311587_1312760_-|IS256-like-element-IS256-family-transposase	gnl|CDD|307151	pfam00872, Transposase_mut, Transposase, Mutator family.	0

Protein sequences

>NZ_CP018629.1|WP_001032814.1|1315315_1315501_+|hypothetical-protein
MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ
>NZ_CP018629.1|WP_000231632.1|1314460_1314694_+|hypothetical-protein
MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH
>NZ_CP018629.1|WP_000848124.1|1313024_1313984_+|beta-channel-forming-cytolysin
MKTHIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN
>NZ_CP018629.1|WP_000195429.1|1311587_1312760_-|IS256-like-element-IS256-family-transposase
MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK
>NZ_CP018629.1|WP_000765708.1|1310873_1311020_-|hypothetical-protein
MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE
>NZ_CP018629.1|WP_000041896.1|1309475_1310192_+|superantigen-like-protein-SSL12
MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD
>NZ_CP018629.1|WP_103067891.1|1308642_1309368_+|superantigen-like-protein-SSL13
MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAHYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQEIIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN
>NZ_CP018629.1|WP_000739523.1|1307822_1308548_+|superantigen-like-protein-SSL14
MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN
>NZ_CP018629.1|WP_000793606.1|1306383_1307385_-|ornithine-carbamoyltransferase
MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEIMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVLESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF
>NZ_CP018629.1|WP_001074342.1|1305428_1306361_-|carbamate-kinase
MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK
>NZ_CP018629.1|WP_000669537.1|1316321_1316672_-|complement-inhibitor-SCIN-B
MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR
>NZ_CP018629.1|WP_000791587.1|1316825_1317323_-|complement-convertase-inhibitor-Efb
MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK
>NZ_CP018629.1|WP_000584398.1|1317581_1318088_-|hypothetical-protein
MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK
>NZ_CP018629.1|WP_000739563.1|1318759_1319161_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein
MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWY
>NZ_CP018629.1|WP_001791789.1|1319120_1319213_+|hypothetical-protein
MLKTVKSTRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC
>NZ_CP018629.1|WP_000739209.1|1319529_1319859_-|complement-convertase-inhibitor-Ecb
MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNVEAAKKYDQYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNFFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK
>NZ_CP018629.1|WP_001803346.1|1320052_1320220_-|hypothetical-protein
MKRIVILENVIVDNPIWLNHVDYLVKSVLLKSIKLRFQEVKKFEILVKIMNRIHI
>NZ_CP018629.1|WP_000049484.1|1320347_1320851_-|metallophosphoesterase
MSKWIIVSDNHTESGVLYQIYEMHPDADVYLHLGDSEFAYDDTELSLFNRVKGNCDFYPEFENEAVAKYNDVKAFYTHGHLYQVNRTRDLLAEKGLELGCLFAFYGHTHVAKYEYINGVHVINPGSISQSRSSMEETYAEVIIDDQTLHGTINFKNRHHETISHTTF
>NZ_CP018629.1|WP_000659317.1|1320843_1321431_-|XTP/dITP-diphosphatase
MKEIVIASNNQGKINDFKVIFPDYHVIGISELIPDFDVEETGSTFEENAILKSEAAAKALNKTVIADDSGLEVFALNGEPGIYSARYAGENKSDEANIEKLLNKLGNTTDRRAQFVCVISMSGPDMETKVFKGTVSGEIADGKYGENGFGYDPIFYVPKLDKTMAQLSKEQKGQISHRRNAINLLQAFLEGDKNV
>NZ_CP018629.1|WP_001039659.1|1321442_1322243_-|glutamate-racemase
MNKPIGVIDSGVGGLTVAKEIMRQLPNETIYYLGDIGRCPYGPRPGEQVKQYTVEIARKLMEFDIKMLVIACNTATAVALEYLQKTLSIPVIGVIEPGARTAIMTTRNQNVLVLGTEGTIKSEAYRTHIKRINPHVEVHGVACPGFVPLVEQMRYSDPTITSIVIHQTLKRWRNSESDTVILGCTHYPLLYKPIYDYFGGKKTVISSGLETAREVSALLTFSNEHASYTEHPDHRFFATGDPTHITNIIKEWLNLSVNVERISVND

Crispr_ID: NZ_CP018629_3

• CRISPR_ID: NZ_CP018629_3
• CRISPR_location: 1594516-1594597
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP018629_3

Consensus_repeat	Method
TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP018629_3

>3.1|1594540|34|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder
ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018629_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP018629_3

>merge|NZ_CP018629|3|1594516-1594597|CRISPRCasFinder
TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG

>NZ_CP018629|3|2|1594516-1594597|CRISPRCasFinder
TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG	ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT
TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP018629.1|WP_000290485.1|1595757_1596138_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH	unknown	unknown	gnl|CDD|234918
NZ_CP018629.1|WP_000571218.1|1592009_1593035_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224058
NZ_CP018629.1|WP_000142630.1|1586641_1587376_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|238045
NZ_CP018629.1|WP_000150017.1|1597887_1598604_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|184156
NZ_CP018629.1|WP_001190695.1|1596795_1597116_+|thioredoxin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239245
NZ_CP018629.1|WP_001063624.1|1586279_1586492_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|379188
NZ_CP018629.1|WP_000422909.1|1597265_1597805_-|nitroreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|380312
NZ_CP018629.1|WP_000264182.1|1589118_1590339_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271189
NZ_CP018629.1|WP_000733773.1|1588302_1589031_+|staphylococcal-enterotoxin-type-K	unknown	unknown	gnl|CDD|280949
NZ_CP018629.1|WP_000974460.1|1598751_1599174_+|organic-hydroperoxide-resistance-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274649
NZ_CP018629.1|WP_000660172.1|1595580_1595694_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001065801.1|1593284_1593581_-|thioredoxin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239245
NZ_CP018629.1|WP_001018962.1|1593573_1593960_-|topiosmerase	unknown	unknown	gnl|CDD|224572
NZ_CP018629.1|WP_000520233.1|1591321_1592017_-|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224922
NZ_CP018629.1|WP_000732326.1|1590482_1591304_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224381
NZ_CP018629.1|WP_000589549.1|1596295_1596652_-|arsenate-reductase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239334
NZ_CP018629.1|WP_000569884.1|1599572_1600067_+|GNAT-family-N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|372596
NZ_CP018629.1|WP_001033317.1|1587550_1588279_+|staphylococcal-enterotoxin-type-Q	unknown	unknown	gnl|CDD|280949
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NZ_CP018629.1|WP_000932216.1|1594700_1595579_-|DUF1963-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226395

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP018629.1|WP_000290485.1|1595757_1596138_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH	gnl|CDD|234918	PRK01202, PRK01202, glycine cleavage system protein GcvH.	2.81086e-68
NZ_CP018629.1|WP_000571218.1|1592009_1593035_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224058	COG1135, AbcC, ABC-type metal ion transport system, ATPase component [Inorganic ion transport and metabolism].	3.37873e-170
NZ_CP018629.1|WP_000142630.1|1586641_1587376_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|238045	cd00093, HTH_XRE, Helix-turn-helix XRE-family like proteins. Prokaryotic DNA binding proteins belonging to the xenobiotic response element family of transcriptional regulators.	5.1934e-12
NZ_CP018629.1|WP_001190695.1|1596795_1597116_+|thioredoxin-family-protein	gnl|CDD|239245	cd02947, TRX_family, TRX family; composed of two groups: Group I, which includes proteins that exclusively encode a TRX domain; and Group II, which are composed of fusion proteins of TRX and additional domains. Group I TRX is a small ancient protein that alter the redox state of target proteins via the reversible oxidation of an active site dithiol, present in a CXXC motif, partially exposed at the protein's surface. TRX reduces protein disulfide bonds, resulting in a disulfide bond at its active site. Oxidized TRX is converted to the active form by TRX reductase, using reducing equivalents derived from either NADPH or ferredoxins. By altering their redox state, TRX regulates the functions of at least 30 target proteins, some of which are enzymes and transcription factors. It also plays an important role in the defense against oxidative stress by directly reducing hydrogen peroxide and certain radicals, and by serving as a reductant for peroxiredoxins. At least two major types of functional TRXs have been reported in most organisms; in eukaryotes, they are located in the cytoplasm and the mitochondria. Higher plants contain more types (at least 20 TRX genes have been detected in the genome of Arabidopsis thaliana), two of which (types f amd m) are located in the same compartment, the chloroplast. Also included in the alignment are TRX-like domains which show sequence homology to TRX but do not contain the redox active CXXC motif. Group II proteins, in addition to either a redox active TRX or a TRX-like domain, also contain additional domains, which may or may not possess homology to known proteins.	2.70086e-24
NZ_CP018629.1|WP_001063624.1|1586279_1586492_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|379188	pfam13443, HTH_26, Cro/C1-type HTH DNA-binding domain. This is a helix-turn-helix domain that probably binds to DNA.	7.52525e-13
NZ_CP018629.1|WP_000422909.1|1597265_1597805_-|nitroreductase	gnl|CDD|380312	cd02135, YdjA-like, nitroreductase family protein similar to Escherichia coli YdjA. A subfamily of the nitroreductase family containing uncharacterized proteins that are similar to nitroreductase YdjA from Escherichia coli. Nitroreductase catalyzes the reduction of nitroaromatic compounds such as nitrotoluenes, nitrofurans and nitroimidazoles. This process requires NAD(P)H as electron donor in an obligatory two-electron transfer and uses FMN as cofactor. The enzyme is typically a homodimer. Members of this family are also called NADH dehydrogenase, oxygen-insensitive NAD(P)H nitrogenase or dihydropteridine reductase.	1.47647e-49
NZ_CP018629.1|WP_000264182.1|1589118_1590339_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271189	cd01189, INT_ICEBs1_C_like, C-terminal catalytic domain of integrases from bacterial phages and conjugate transposons. This family of tyrosine based site-specific integrases is has origins in bacterial phages and conjugate transposons. One member is the integrase from Bacillus subtilis conjugative transposon ICEBs1. ICEBs1 can be excised and transfered to various recipients in response to DNA damage or high concentrations of potential mating partners. The family belongs to the superfamily of DNA breaking-rejoining enzymes, which share the same fold in their catalytic domain and the overall reaction mechanism. The catalytic domain contains six conserved active site residues. Their overall reaction mechanism involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA.	1.81902e-37
NZ_CP018629.1|WP_000733773.1|1588302_1589031_+|staphylococcal-enterotoxin-type-K	gnl|CDD|280949	pfam02876, Stap_Strp_tox_C, Staphylococcal/Streptococcal toxin, beta-grasp domain.	3.87599e-25
NZ_CP018629.1|WP_000974460.1|1598751_1599174_+|organic-hydroperoxide-resistance-protein	gnl|CDD|274649	TIGR03561, organ_hyd_perox, peroxiredoxin, Ohr subfamily. pfam02566, OsmC-like protein, contains several deeply split clades of homologous proteins. The clade modeled here includes the protein Ohr, or organic hydroperoxide resistance protein. [Cellular processes, Detoxification].	5.58225e-61
NZ_CP018629.1|WP_000150017.1|1597887_1598604_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase	gnl|CDD|184156	PRK13575, PRK13575, type I 3-dehydroquinate dehydratase.	1.26721e-148
NZ_CP018629.1|WP_001065801.1|1593284_1593581_-|thioredoxin-family-protein	gnl|CDD|239245	cd02947, TRX_family, TRX family; composed of two groups: Group I, which includes proteins that exclusively encode a TRX domain; and Group II, which are composed of fusion proteins of TRX and additional domains. Group I TRX is a small ancient protein that alter the redox state of target proteins via the reversible oxidation of an active site dithiol, present in a CXXC motif, partially exposed at the protein's surface. TRX reduces protein disulfide bonds, resulting in a disulfide bond at its active site. Oxidized TRX is converted to the active form by TRX reductase, using reducing equivalents derived from either NADPH or ferredoxins. By altering their redox state, TRX regulates the functions of at least 30 target proteins, some of which are enzymes and transcription factors. It also plays an important role in the defense against oxidative stress by directly reducing hydrogen peroxide and certain radicals, and by serving as a reductant for peroxiredoxins. At least two major types of functional TRXs have been reported in most organisms; in eukaryotes, they are located in the cytoplasm and the mitochondria. Higher plants contain more types (at least 20 TRX genes have been detected in the genome of Arabidopsis thaliana), two of which (types f amd m) are located in the same compartment, the chloroplast. Also included in the alignment are TRX-like domains which show sequence homology to TRX but do not contain the redox active CXXC motif. Group II proteins, in addition to either a redox active TRX or a TRX-like domain, also contain additional domains, which may or may not possess homology to known proteins.	7.01368e-14
NZ_CP018629.1|WP_001018962.1|1593573_1593960_-|topiosmerase	gnl|CDD|224572	COG1658, COG1658, Small primase-like proteins (Toprim domain) [DNA replication, recombination, and repair].	2.45102e-36
NZ_CP018629.1|WP_000520233.1|1591321_1592017_-|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224922	COG2011, AbcD, ABC-type metal ion transport system, permease component [Inorganic ion transport and metabolism].	9.67625e-100
NZ_CP018629.1|WP_000732326.1|1590482_1591304_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|224381	COG1464, NlpA, ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen [Inorganic ion transport and metabolism].	2.15951e-112
NZ_CP018629.1|WP_000589549.1|1596295_1596652_-|arsenate-reductase-family-protein	gnl|CDD|239334	cd03036, ArsC_like, Arsenate Reductase (ArsC) family, unknown subfamily; uncharacterized proteins containing a CXXC motif with similarity to thioredoxin (TRX)-fold arsenic reductases, ArsC. Proteins containing a redox active CXXC motif like TRX and glutaredoxin (GRX) function as protein disulfide oxidoreductases, altering the redox state of target proteins via the reversible oxidation of the active site dithiol. ArsC catalyzes the reduction of arsenate [As(V)] to arsenite [As(III)], using reducing equivalents derived from glutathione via GRX, through a single catalytic cysteine.	1.06191e-56
NZ_CP018629.1|WP_000569884.1|1599572_1600067_+|GNAT-family-N-acetyltransferase	gnl|CDD|372596	pfam13420, Acetyltransf_4, Acetyltransferase (GNAT) domain.	2.53639e-47
NZ_CP018629.1|WP_001033317.1|1587550_1588279_+|staphylococcal-enterotoxin-type-Q	gnl|CDD|280949	pfam02876, Stap_Strp_tox_C, Staphylococcal/Streptococcal toxin, beta-grasp domain.	7.79999e-28
NZ_CP018629.1|WP_000255561.1|1600221_1600839_+|amino-acid-transporter	gnl|CDD|224198	COG1279, COG1279, Lysine efflux permease [General function prediction only].	9.12336e-62
NZ_CP018629.1|WP_000932216.1|1594700_1595579_-|DUF1963-domain-containing-protein	gnl|CDD|226395	COG3878, COG3878, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	1.16579e-75

Protein sequences

>NZ_CP018629.1|WP_001018962.1|1593573_1593960_-|topiosmerase
MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE
>NZ_CP018629.1|WP_001065801.1|1593284_1593581_-|thioredoxin-family-protein
MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK
>NZ_CP018629.1|WP_000571218.1|1592009_1593035_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein
MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG
>NZ_CP018629.1|WP_000520233.1|1591321_1592017_-|ABC-transporter-permease
MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR
>NZ_CP018629.1|WP_000732326.1|1590482_1591304_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK
>NZ_CP018629.1|WP_000264182.1|1589118_1590339_+|site-specific-integrase
MWFEKFKNKNKETKYRYYEKYKDPLTNKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQRLLNERIEAKLNDKTPTTLKSLTFHAASDEWFQNYIKTSGSKRTTIKTKLSKLNTLKKFVDEDILINKITLSYAQQVFDEMDSKGYVYQVNKDALSIFKNVFEYTRRIYKLQDLEFLKDITLNKRIKSYDEVKAKRNKYLELNEIQSIIKDINMKAQKMHSGIHKRFYLFVALMTEFQALNGMRIGEMLAIQNEDIDFDNKSLNINGTIHWFHDESGGFGVKDTTKTESSYRTIGLSSRSCEILKKAILENKKDSKWNDGYLNRNFVFTNHKGNPMQTERFNKILREAAKDVGIDKEVSSHILRHSHISLLSQQGVSLKAIMDRVGHSDHRTTLSIYSHVTEQMDKDMMNKLEQVKLG
>NZ_CP018629.1|WP_000733773.1|1588302_1589031_+|staphylococcal-enterotoxin-type-K
MKKLISILLINIIILGVSNNASAQGDIGIDNLRNFYTKKDFVDLKDVKDNDTPIANQLQFSNESYDLISESKDFNKFSNFKGKKLDVFGISYNGQCNTKYIYGGVTATNEYLDKSRNIPINIWINGNHKTISTNKVSTNKKLVTAQEIDVKLRKYLQEEYNIYGHNGTKKGEEYGHKSKFYSGFNIGKVTFHLNNNDTFSYDLFYTGDDGLPKSFLKIYEDNKTVESEKFHLDVDISYKETI
>NZ_CP018629.1|WP_001033317.1|1587550_1588279_+|staphylococcal-enterotoxin-type-Q
MNKIFRILTVSLFFFTFLIKNNLAYADVGVINLRNFYANYEPEKLQGVSSGNFSTSHQLEYIDGKYTLYSQFHNEYEAKRLKDHKVDIFGISYSGLCNTKYMYGGITLANQNLDKPRNIPINLWVNGKQNTISTDKVSTQKKEVTAQEIDIKLRKYLQNEYNIYGFNKTKKGQEYGYQSKFNSGFNKGKITFHLNNEPSFTYDLFYTGTGQAESFLKIYNDNKTIDAENFHLDVEISYEKTE
>NZ_CP018629.1|WP_000142630.1|1586641_1587376_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
MTFGEILKKERVSWKLSVKELSTLSGVSQTYISKLENGKRNFPSLETIFNLLIGFKTHIEYKMGSESPFYEINNSYLDEILIMFINSSNSTISDRDPNELITQFNEYYDVTIKKKQNENSKIESDIFSNKIKLVKGTTKKEVIEKPYFDLNWLLTQNEYEVFFDRSFLLDNNFLNKKHFTEKDMYYYNVLNDNDLKTIKDLIVVFLLNKYNYIKNKDDFFNIFTNSEDDKTKRDALYKILYETD
>NZ_CP018629.1|WP_001063624.1|1586279_1586492_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
MNNNLSLLMGKHRVTASKLSTVTGISRTSIHGLYHERTENPDTKTVMKLCEYFNITPNEFFGIIEKEGVK
>NZ_CP018629.1|WP_000932216.1|1594700_1595579_-|DUF1963-domain-containing-protein
MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS
>NZ_CP018629.1|WP_000660172.1|1595580_1595694_-|hypothetical-protein
MKEKLLGTIIWSIATFYYSRMMEIMNLAILKIKIGGS
>NZ_CP018629.1|WP_000290485.1|1595757_1596138_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH
MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVAIIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSEMIGE
>NZ_CP018629.1|WP_000589549.1|1596295_1596652_-|arsenate-reductase-family-protein
MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA
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MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK
>NZ_CP018629.1|WP_000422909.1|1597265_1597805_-|nitroreductase
MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEGDMPKAPRKNRNLITLY
>NZ_CP018629.1|WP_000150017.1|1597887_1598604_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase
MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGVPQAPGQIDVTDLKAQVTLY
>NZ_CP018629.1|WP_000974460.1|1598751_1599174_+|organic-hydroperoxide-resistance-protein
MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD
>NZ_CP018629.1|WP_000569884.1|1599572_1600067_+|GNAT-family-N-acetyltransferase
MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK
>NZ_CP018629.1|WP_000255561.1|1600221_1600839_+|amino-acid-transporter
MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGETQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF

Crispr_ID: NZ_CP018629_4

• CRISPR_ID: NZ_CP018629_4
• CRISPR_location: 1644363-1644443
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP018629_4

Consensus_repeat	Method
AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP018629_4

>4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder
TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018629_4

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP018629_4

>merge|NZ_CP018629|4|1644363-1644443|CRISPRCasFinder
AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA

>NZ_CP018629|4|3|1644363-1644443|CRISPRCasFinder
AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA	TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA
AGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP018629.1|WP_001248939.1|1636679_1637675_-|YvcK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|211689
NZ_CP018629.1|WP_001790092.1|1653424_1653529_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001049165.1|1634465_1635053_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	unknown	unknown	gnl|CDD|178955
NZ_CP018629.1|WP_000134963.1|1639406_1640342_-|thioredoxin-disulfide-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|273540
NZ_CP018629.1|WP_000749380.1|1650897_1651737_-|CHAP-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226451
NZ_CP018629.1|WP_000816295.1|1633320_1634223_+|TIGR01777-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224015
NZ_CP018629.1|WP_000538141.1|1650073_1650724_-|HD-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378993
NZ_CP018629.1|WP_000369732.1|1637671_1638583_-|RNase-adapter-RapZ	unknown	unknown	gnl|CDD|224574
NZ_CP018629.1|WP_000662681.1|1644732_1647579_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	unknown	unknown	gnl|CDD|234734
NZ_CP018629.1|WP_000057549.1|1640408_1641848_-|tetratricopeptide-repeat-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|276808
NZ_CP018629.1|WP_000513308.1|1642348_1643188_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	unknown	unknown	gnl|CDD|183527
NZ_CP018629.1|WP_010956549.1|1652145_1653256_-|peptide-chain-release-factor-2	unknown	unknown	gnl|CDD|234799
NZ_CP018629.1|WP_000229253.1|1647586_1649572_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	unknown	unknown	gnl|CDD|235395
NZ_CP018629.1|WP_000506532.1|1653570_1656102_-|preprotein-translocase-subunit-SecA	unknown	unknown	gnl|CDD|237259
NZ_CP018629.1|WP_000006551.1|1635625_1636570_-|DNA-binding-protein-WhiA	unknown	unknown	gnl|CDD|273194
NZ_CP018629.1|WP_000638419.1|1649840_1650077_-|CsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227234
NZ_CP018629.1|WP_000958224.1|1643193_1644126_-|HPr-kinase/phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|235459
NZ_CP018629.1|WP_000617735.1|1656515_1657088_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA	unknown	unknown	gnl|CDD|224461
NZ_CP018629.1|WP_001790093.1|1651884_1651992_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001224793.1|1641855_1642341_-|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|100053

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP018629.1|WP_001248939.1|1636679_1637675_-|YvcK-family-protein	gnl|CDD|211689	TIGR01826, Putative_gluconeogenesis_factor, conserved hypothetical protein, cofD-related. This model represents a subfamily of conserved hypothetical proteins that forms a sister group to the family of CofD, (TIGR01819), LPPG:Fo 2-phospho-L-lactate transferase, an enzyme of cytochrome F420 biosynthesis. Both this family and TIGR01819 are within the scope of the pfam01933. [Hypothetical proteins, Conserved].	5.06652e-172
NZ_CP018629.1|WP_001049165.1|1634465_1635053_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP	gnl|CDD|178955	PRK00277, clpP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit; Reviewed.	4.59321e-148
NZ_CP018629.1|WP_000134963.1|1639406_1640342_-|thioredoxin-disulfide-reductase	gnl|CDD|273540	TIGR01292, Thioredoxin_reductase, thioredoxin-disulfide reductase. This model describes thioredoxin-disulfide reductase, a member of the pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductases (pfam00070). [Energy metabolism, Electron transport].	4.19425e-154
NZ_CP018629.1|WP_000749380.1|1650897_1651737_-|CHAP-domain-containing-protein	gnl|CDD|226451	COG3942, COG3942, Surface antigen [General function prediction only].	2.23913e-42
NZ_CP018629.1|WP_000816295.1|1633320_1634223_+|TIGR01777-family-protein	gnl|CDD|224015	COG1090, COG1090, Predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase [General function prediction only].	4.94096e-153
NZ_CP018629.1|WP_000538141.1|1650073_1650724_-|HD-domain-containing-protein	gnl|CDD|378993	pfam12917, HD_2, HD containing hydrolase-like enzyme. This is a family of bacterial and archaeal hydrolases.	6.51021e-58
NZ_CP018629.1|WP_000369732.1|1637671_1638583_-|RNase-adapter-RapZ	gnl|CDD|224574	COG1660, COG1660, Predicted P-loop-containing kinase [General function prediction only].	1.09727e-168
NZ_CP018629.1|WP_000662681.1|1644732_1647579_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA	gnl|CDD|234734	PRK00349, uvrA, excinuclease ABC subunit UvrA.	0
NZ_CP018629.1|WP_000057549.1|1640408_1641848_-|tetratricopeptide-repeat-protein	gnl|CDD|276808	sd00008, TPR_YbbN, C-terminal Tetratricopeptide repeat (TPR) region of YbbN and similar motifs. The Tetratricopeptide repeat (TPR) typically contains 34 amino acids and is found in a variety of organisms including bacteria, cyanobacteria, yeast, fungi, plants, and humans. It is present in a variety of proteins including those involved in chaperone, cell-cycle, transcription, and protein transport complexes. YbbN is a thioredoxin-like protein containing two tandem TPR repeats at the C-terminus, separated by two alpha helices. Its N-terminal thioredoxin-like domain is not a functional oxidoreductase. It functions in heat stress response and DNA synthesis as a chaperone or co-chaperone.	4.31987e-06
NZ_CP018629.1|WP_000513308.1|1642348_1643188_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase	gnl|CDD|183527	PRK12437, PRK12437, prolipoprotein diacylglyceryl transferase; Reviewed.	1.39921e-119
NZ_CP018629.1|WP_010956549.1|1652145_1653256_-|peptide-chain-release-factor-2	gnl|CDD|234799	PRK00578, prfB, peptide chain release factor 2; Validated.	0
NZ_CP018629.1|WP_000229253.1|1647586_1649572_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB	gnl|CDD|235395	PRK05298, PRK05298, excinuclease ABC subunit UvrB.	0
NZ_CP018629.1|WP_000506532.1|1653570_1656102_-|preprotein-translocase-subunit-SecA	gnl|CDD|237259	PRK12904, PRK12904, preprotein translocase subunit SecA; Reviewed.	0
NZ_CP018629.1|WP_000006551.1|1635625_1636570_-|DNA-binding-protein-WhiA	gnl|CDD|273194	TIGR00647, DNA_bind_WhiA, DNA-binding protein WhiA. This family describes a DNA-binding protein widely conserved in Gram-positive bacteria, and occasionally occurring elsewhere, such as in Thermotoga. It is associated with cell division, and in sporulating organisms with sporulation. [Cellular processes, Cell division].	7.40812e-153
NZ_CP018629.1|WP_000638419.1|1649840_1650077_-|CsbA-family-protein	gnl|CDD|227234	COG4897, CsbA, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	4.73465e-34
NZ_CP018629.1|WP_000958224.1|1643193_1644126_-|HPr-kinase/phosphorylase	gnl|CDD|235459	PRK05428, PRK05428, HPr kinase/phosphorylase; Provisional.	1.22623e-170
NZ_CP018629.1|WP_000617735.1|1656515_1657088_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA	gnl|CDD|224461	COG1544, COG1544, Ribosome-associated protein Y (PSrp-1) [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	1.13584e-37
NZ_CP018629.1|WP_001224793.1|1641855_1642341_-|acetyltransferase	gnl|CDD|100053	cd04647, LbH_MAT_like, Maltose O-acyltransferase (MAT)-like: This family is composed of maltose O-acetyltransferase, galactoside O-acetyltransferase (GAT), xenobiotic acyltransferase (XAT) and similar proteins. MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively while GAT specifically acetylates galactopyranosides. XAT catalyzes the CoA-dependent acetylation of a variety of hydroxyl-bearing acceptors such as chloramphenicol and streptogramin, among others. XATs are implicated in inactivating xenobiotics leading to xenobiotic resistance in patients. Members of this family contain a a left-handed parallel beta-helix (LbH) domain with at least 5 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X). They are trimeric in their active form.	4.85181e-30

Protein sequences

>NZ_CP018629.1|WP_000958224.1|1643193_1644126_-|HPr-kinase/phosphorylase
MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE
>NZ_CP018629.1|WP_000513308.1|1642348_1643188_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase
MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGSVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK
>NZ_CP018629.1|WP_001224793.1|1641855_1642341_-|acetyltransferase
MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR
>NZ_CP018629.1|WP_000057549.1|1640408_1641848_-|tetratricopeptide-repeat-protein
MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDMEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLSDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI
>NZ_CP018629.1|WP_000134963.1|1639406_1640342_-|thioredoxin-disulfide-reductase
MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA
>NZ_CP018629.1|WP_000369732.1|1637671_1638583_-|RNase-adapter-RapZ
MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGVGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK
>NZ_CP018629.1|WP_001248939.1|1636679_1637675_-|YvcK-family-protein
MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK
>NZ_CP018629.1|WP_000006551.1|1635625_1636570_-|DNA-binding-protein-WhiA
MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL
>NZ_CP018629.1|WP_001049165.1|1634465_1635053_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP
MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK
>NZ_CP018629.1|WP_000816295.1|1633320_1634223_+|TIGR01777-family-protein
MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKALFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE
>NZ_CP018629.1|WP_000662681.1|1644732_1647579_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA
MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK
>NZ_CP018629.1|WP_000229253.1|1647586_1649572_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB
MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG
>NZ_CP018629.1|WP_000638419.1|1649840_1650077_-|CsbA-family-protein
MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR
>NZ_CP018629.1|WP_000538141.1|1650073_1650724_-|HD-domain-containing-protein
MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE
>NZ_CP018629.1|WP_000749380.1|1650897_1651737_-|CHAP-domain-containing-protein
MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVTKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH
>NZ_CP018629.1|WP_001790093.1|1651884_1651992_-|hypothetical-protein
MCLLKQHMQCAFSNITYGDFQGIELIIENVLNYMV
>NZ_CP018629.1|WP_010956549.1|1652145_1653256_-|peptide-chain-release-factor-2
MELSEIKRNIDKYNQDLTQIRGSLDLENKETNIQEYEEMMAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDEEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVETVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD
>NZ_CP018629.1|WP_001790092.1|1653424_1653529_-|hypothetical-protein
MLWEESFYFTSVKYFKKCEEVVKRCYVLSFKKSV
>NZ_CP018629.1|WP_000506532.1|1653570_1656102_-|preprotein-translocase-subunit-SecA
MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNESHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK
>NZ_CP018629.1|WP_000617735.1|1656515_1657088_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA
MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ

Crispr_ID: NZ_CP018629_5

• CRISPR_ID: NZ_CP018629_5
• CRISPR_location: 1801091-1801183
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP018629_5

Consensus_repeat	Method
TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP018629_5

>5.1|1801123|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder
CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018629_5

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP018629_5

>merge|NZ_CP018629|5|1801091-1801183|CRISPRCasFinder
TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAGCGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCTTAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG

>NZ_CP018629|5|4|1801091-1801183|CRISPRCasFinder
TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG	CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT
TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP018629.1|WP_001018677.1|1794376_1794751_+|transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|130944
NZ_CP018629.1|WP_000365354.1|1798262_1798982_-|HAD-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223943
NZ_CP018629.1|WP_001813976.1|1800134_1800962_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238563
NZ_CP018629.1|WP_103067899.1|1802424_1804086_-|arginine--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234964
NZ_CP018629.1|WP_001790232.1|1799036_1799987_-|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_CP018629.1|WP_000180232.1|1806831_1808127_-|HD-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224004
NZ_CP018629.1|WP_001222133.1|1795958_1796675_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000477504.1|1808166_1808643_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|366181
NZ_CP018629.1|WP_000169042.1|1792080_1792305_+|DUF2922-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378571
NZ_CP018629.1|WP_000362972.1|1797478_1798279_-|alpha/beta-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223669
NZ_CP018629.1|WP_001200748.1|1804773_1805784_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP	unknown	unknown	gnl|CDD|181842
NZ_CP018629.1|WP_000633782.1|1808811_1809348_-|flavodoxin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223728
NZ_CP018629.1|WP_001819741.1|1804082_1804466_-|DUF1934-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226896
NZ_CP018629.1|WP_001788287.1|1806282_1806804_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378039
NZ_CP018629.1|WP_000735558.1|1796836_1797343_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001553862.1|1792499_1793429_+|DMT-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|225778
NZ_CP018629.1|WP_000655099.1|1804591_1804699_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001045421.1|1795001_1795790_-|alpha/beta-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223669
NZ_CP018629.1|WP_000901764.1|1801400_1802036_-|endonuclease-III-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225140
NZ_CP018629.1|WP_000808902.1|1809558_1810497_-|aldo/keto-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381309

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP018629.1|WP_001018677.1|1794376_1794751_+|transcriptional-regulator	gnl|CDD|130944	TIGR01889, Pleiotropic_Regulator_Of_Virulence, staphylococcal accessory regulator family. This model represents a family of transcriptional regulatory proteins in Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis. Some members contain two tandem copies of this region. This family is related to the MarR transcriptional regulator family described by pfam01047. [Regulatory functions, DNA interactions].	1.77309e-26
NZ_CP018629.1|WP_000365354.1|1798262_1798982_-|HAD-family-hydrolase	gnl|CDD|223943	COG1011, COG1011, Predicted hydrolase (HAD superfamily) [General function prediction only].	3.6864e-38
NZ_CP018629.1|WP_001813976.1|1800134_1800962_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|238563	cd01143, YvrC, Periplasmic binding protein YvrC. These proteins are predicted to function as initial receptors in ABC transport of metal ions in eubacteria and archaea. They belong to the TroA superfamily of periplasmic metal binding proteins that share a distinct fold and ligand binding mechanism. A typical TroA protein is comprised of two globular subdomains connected by a single helix and can bind the metal ion in the cleft between these domains.	1.32108e-72
NZ_CP018629.1|WP_103067899.1|1802424_1804086_-|arginine--tRNA-ligase	gnl|CDD|234964	PRK01611, argS, arginyl-tRNA synthetase; Reviewed.	0
NZ_CP018629.1|WP_001790232.1|1799036_1799987_-|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	5.19191e-48
NZ_CP018629.1|WP_000180232.1|1806831_1808127_-|HD-domain-containing-protein	gnl|CDD|224004	COG1078, COG1078, HD superfamily phosphohydrolases [General function prediction only].	5.76708e-150
NZ_CP018629.1|WP_000477504.1|1808166_1808643_-|GNAT-family-N-acetyltransferase	gnl|CDD|366181	pfam00583, Acetyltransf_1, Acetyltransferase (GNAT) family. This family contains proteins with N-acetyltransferase functions such as Elp3-related proteins.	1.13315e-11
NZ_CP018629.1|WP_000169042.1|1792080_1792305_+|DUF2922-domain-containing-protein	gnl|CDD|378571	pfam11148, DUF2922, Protein of unknown function (DUF2922). This bacterial family of proteins has no known function.	1.74707e-13
NZ_CP018629.1|WP_000362972.1|1797478_1798279_-|alpha/beta-hydrolase	gnl|CDD|223669	COG0596, MhpC, Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) [General function prediction only].	1.35732e-24
NZ_CP018629.1|WP_001200748.1|1804773_1805784_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP	gnl|CDD|181842	PRK09422, PRK09422, ethanol-active dehydrogenase/acetaldehyde-active reductase; Provisional.	0
NZ_CP018629.1|WP_000633782.1|1808811_1809348_-|flavodoxin-family-protein	gnl|CDD|223728	COG0655, WrbA, Multimeric flavodoxin WrbA [General function prediction only].	3.16348e-26
NZ_CP018629.1|WP_001819741.1|1804082_1804466_-|DUF1934-family-protein	gnl|CDD|226896	COG4506, COG4506, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	9.50091e-54
NZ_CP018629.1|WP_001788287.1|1806282_1806804_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|378039	pfam08741, YwhD, YwhD family. This family of proteins are currently uncharacterized. They are around 170 amino acids in length.	8.7406e-98
NZ_CP018629.1|WP_001553862.1|1792499_1793429_+|DMT-family-transporter	gnl|CDD|225778	COG3238, COG3238, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	7.93315e-37
NZ_CP018629.1|WP_001045421.1|1795001_1795790_-|alpha/beta-hydrolase	gnl|CDD|223669	COG0596, MhpC, Predicted hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily) [General function prediction only].	1.55978e-34
NZ_CP018629.1|WP_000901764.1|1801400_1802036_-|endonuclease-III-domain-containing-protein	gnl|CDD|225140	COG2231, COG2231, Uncharacterized protein related to Endonuclease III [DNA replication, recombination, and repair].	3.98158e-90
NZ_CP018629.1|WP_000808902.1|1809558_1810497_-|aldo/keto-reductase	gnl|CDD|381309	cd19083, AKR_AKR11A1_11D1, AKR11A and AKR11D families of aldo-keto reductase (AKR). Bacillus subtilis aldo-keto reductase IolS, also called vegetative protein 147 (VEG147), is a founding member of aldo-keto reductase family 11 member A1 (AKR11A1). It is able to reduce the standard aldo-keto reductase (AKR) substrates DL-glyceraldehyde, D-erythrose, and methylglyoxal in the presence of NADPH, albeit with poor efficiency in vitro. Bacillus aryabhattai aldo keto reductase is a founding member of aldo-keto reductase family 11 member D1 (AKR11D1).	7.3194e-168

Protein sequences

>NZ_CP018629.1|WP_001813976.1|1800134_1800962_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK
>NZ_CP018629.1|WP_001790232.1|1799036_1799987_-|iron-ABC-transporter-permease
MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVTGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH
>NZ_CP018629.1|WP_000365354.1|1798262_1798982_-|HAD-family-hydrolase
MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY
>NZ_CP018629.1|WP_000362972.1|1797478_1798279_-|alpha/beta-hydrolase
MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMSGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV
>NZ_CP018629.1|WP_000735558.1|1796836_1797343_-|hypothetical-protein
MKKLLTASIIACSVVMGVGLVNTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK
>NZ_CP018629.1|WP_001222133.1|1795958_1796675_-|hypothetical-protein
MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL
>NZ_CP018629.1|WP_001045421.1|1795001_1795790_-|alpha/beta-hydrolase
MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLKFLKSVS
>NZ_CP018629.1|WP_001018677.1|1794376_1794751_+|transcriptional-regulator
MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL
>NZ_CP018629.1|WP_001553862.1|1792499_1793429_+|DMT-family-transporter
MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIILNIIINPEVFTIHFYNNQSFNYTWVVGGLLGVSFLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF
>NZ_CP018629.1|WP_000169042.1|1792080_1792305_+|DUF2922-domain-containing-protein
MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNVVTEQVARDSMNALVDLNIIKSNSGTITKVHSAQIIDKTTTVLFEDKK
>NZ_CP018629.1|WP_000901764.1|1801400_1802036_-|endonuclease-III-domain-containing-protein
MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK
>NZ_CP018629.1|WP_103067899.1|1802424_1804086_-|arginine--tRNA-ligase
MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIKKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM
>NZ_CP018629.1|WP_001819741.1|1804082_1804466_-|DUF1934-family-protein
MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE
>NZ_CP018629.1|WP_000655099.1|1804591_1804699_-|hypothetical-protein
MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN
>NZ_CP018629.1|WP_001200748.1|1804773_1805784_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP
MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF
>NZ_CP018629.1|WP_001788287.1|1806282_1806804_-|hypothetical-protein
MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN
>NZ_CP018629.1|WP_000180232.1|1806831_1808127_-|HD-domain-containing-protein
MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERLLRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQYGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN
>NZ_CP018629.1|WP_000477504.1|1808166_1808643_-|GNAT-family-N-acetyltransferase
MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF
>NZ_CP018629.1|WP_000633782.1|1808811_1809348_-|flavodoxin-family-protein
MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ
>NZ_CP018629.1|WP_000808902.1|1809558_1810497_-|aldo/keto-reductase
MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDNNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED

Crispr_ID: NZ_CP018629_6

• CRISPR_ID: NZ_CP018629_6
• CRISPR_location: 2067867-2067968
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP018629_6

Consensus_repeat	Method
CAAATTTAATACTCAATTCATATA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP018629_6

>6.1|2067891|54|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder
TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018629_6

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP018629_6

>merge|NZ_CP018629|6|2067867-2067968|CRISPRCasFinder
CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA

>NZ_CP018629|6|5|2067867-2067968|CRISPRCasFinder
CAAATTTAATACTCAATTCATATA	TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT
CAAATTTAATACTCAATTCATAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP018629.1|WP_000956132.1|2066893_2067850_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235334
NZ_CP018629.1|WP_000052781.1|2071542_2072112_+|peroxiredoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|211789
NZ_CP018629.1|WP_000868248.1|2074976_2075360_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001795623.1|2073729_2074023_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000633907.1|2058646_2058847_+|DUF3173-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|371495
NZ_CP018629.1|WP_000793010.1|2063204_2064473_-|purine-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|274468
NZ_CP018629.1|WP_000763768.1|2065563_2065971_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378584
NZ_CP018629.1|WP_000158374.1|2075425_2076007_-|histidine-phosphatase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223483
NZ_CP018629.1|WP_000264071.1|2061700_2063167_-|IMP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|235507
NZ_CP018629.1|WP_000930486.1|2072127_2073651_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F	unknown	unknown	gnl|CDD|237942
NZ_CP018629.1|WP_001789518.1|2068640_2068742_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000394699.1|2066113_2066776_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000991007.1|2068826_2070215_+|L-cystine-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224736
NZ_CP018629.1|WP_000211676.1|2076184_2076394_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001289311.1|2070295_2071051_-|NADPH-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|380322
NZ_CP018629.1|WP_000421410.1|2064472_2065051_-|xanthine-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|181705
NZ_CP018629.1|WP_000746687.1|2074095_2074722_+|NDxxF-motif-lipoprotein	unknown	unknown	gnl|CDD|380196
NZ_CP018629.1|WP_000237797.1|2058873_2060067_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271189
NZ_CP018629.1|WP_000424966.1|2060134_2061676_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234614
NZ_CP018629.1|WP_000845143.1|2057918_2058149_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378900

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP018629.1|WP_000956132.1|2066893_2067850_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|235334	PRK05035, PRK05035, electron transport complex protein RnfC; Provisional.	0.000748442
NZ_CP018629.1|WP_000052781.1|2071542_2072112_+|peroxiredoxin	gnl|CDD|211789	TIGR03137, AhpC, peroxiredoxin. This peroxiredoxin (AhpC, alkylhydroperoxide reductase subunit C) is one subunit of a two-subunit complex with subunit F(TIGR03140). Usually these are found as an apparent operon. The gene has been characterized in Bacteroides fragilis, where it is important in oxidative stress defense. This gene contains two invariant cysteine residues, one near the N-terminus and one near the C-terminus, each followed immediately by a proline residue. [Cellular processes, Detoxification, Cellular processes, Adaptations to atypical conditions].	1.50623e-124
NZ_CP018629.1|WP_000633907.1|2058646_2058847_+|DUF3173-family-protein	gnl|CDD|371495	pfam11372, DUF3173, Domain of unknown function (DUF3173). This family of proteins with unknown function appears to be restricted to Firmicutes. These proteins appear to be distantly related to HHH domains and are therefore likely to be DNA-binding. Genomic environment-visualisation confirms the likely function as being DNA-binding, as this short protein lies very closely between an integrase and a replication protein (http://www.microbesonline.org/).	2.02242e-22
NZ_CP018629.1|WP_000793010.1|2063204_2064473_-|purine-permease	gnl|CDD|274468	TIGR03173, pbuX, xanthine permease. All the seed members of this model are observed adjacent to genes for either xanthine phosphoribosyltransferase (for the conversion of xanthine to guanine, GenProp0696) or genes for the conversion of xanthine to urate and its concomitant catabolism (GenProp0640, GenProp0688, GenProp0686 and GenProp0687). A number of sequences scoring higher than trusted to this model are found in different genomic contexts, and the possibility exist that these transport related compounds in addition to or instead of xanthine itself. The outgroup to this family are sequences which are characterized as uracil permeases or are adjacent to established uracil phosphoribosyltransferases.	3.16192e-170
NZ_CP018629.1|WP_000763768.1|2065563_2065971_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|378584	pfam11181, YflT, Heat induced stress protein YflT. YflT is a heat induced protein.	2.0219e-12
NZ_CP018629.1|WP_000158374.1|2075425_2076007_-|histidine-phosphatase-family-protein	gnl|CDD|223483	COG0406, phoE, Broad specificity phosphatase PhoE and related phosphatases [General function prediction only].	2.78414e-49
NZ_CP018629.1|WP_000930486.1|2072127_2073651_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F	gnl|CDD|237942	PRK15317, PRK15317, alkyl hydroperoxide reductase subunit F; Provisional.	0
NZ_CP018629.1|WP_000264071.1|2061700_2063167_-|IMP-dehydrogenase	gnl|CDD|235507	PRK05567, PRK05567, inosine 5'-monophosphate dehydrogenase; Reviewed.	0
NZ_CP018629.1|WP_000991007.1|2068826_2070215_+|L-cystine-transporter	gnl|CDD|224736	COG1823, COG1823, Predicted Na+/dicarboxylate symporter [General function prediction only].	0
NZ_CP018629.1|WP_001289311.1|2070295_2071051_-|NADPH-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|380322	cd02146, NfsA-like, nitroreductase similar to Escherichia coli NfsA. This family contains NADPH-dependent flavin reductase and oxygen-insensitive nitroreductase. These enzymes are homodimeric flavoproteins that contain one FMN per monomer as a cofactor. Flavin reductase catalyzes the reduction of flavin by using NADPH as an electron donor. Oxygen-insensitive nitroreductase, such as NfsA protein in Escherichia coli, catalyzes reduction of nitrocompounds using NADPH as electron donor.	5.03864e-88
NZ_CP018629.1|WP_000421410.1|2064472_2065051_-|xanthine-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|181705	PRK09219, PRK09219, xanthine phosphoribosyltransferase; Validated.	9.01486e-119
NZ_CP018629.1|WP_000746687.1|2074095_2074722_+|NDxxF-motif-lipoprotein	gnl|CDD|380196	NF033193, lipo_NDxxF, NDxxF motif lipoprotein. Members of this family are lipoproteins, about 200 amino acids long in precursor form, found in Staphylococcus aureus, Bacillus cereus, and various other Firmicutes. The protein family is named for one of its several highly conserved motifs.	1.67126e-71
NZ_CP018629.1|WP_000237797.1|2058873_2060067_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271189	cd01189, INT_ICEBs1_C_like, C-terminal catalytic domain of integrases from bacterial phages and conjugate transposons. This family of tyrosine based site-specific integrases is has origins in bacterial phages and conjugate transposons. One member is the integrase from Bacillus subtilis conjugative transposon ICEBs1. ICEBs1 can be excised and transfered to various recipients in response to DNA damage or high concentrations of potential mating partners. The family belongs to the superfamily of DNA breaking-rejoining enzymes, which share the same fold in their catalytic domain and the overall reaction mechanism. The catalytic domain contains six conserved active site residues. Their overall reaction mechanism involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA.	1.36769e-47
NZ_CP018629.1|WP_000424966.1|2060134_2061676_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase	gnl|CDD|234614	PRK00074, guaA, GMP synthase; Reviewed.	0
NZ_CP018629.1|WP_000845143.1|2057918_2058149_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|378900	pfam12645, HTH_16, Helix-turn-helix domain. This domain appears to be a helix-turn-helix domain suggesting that this might be a transcriptional regulatory protein. Some members of this family are annotated as conjugative transposon domains.	2.04673e-25

Protein sequences

>NZ_CP018629.1|WP_000956132.1|2066893_2067850_+|hypothetical-protein
MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL
>NZ_CP018629.1|WP_000394699.1|2066113_2066776_+|hypothetical-protein
MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEETDLRKPF
>NZ_CP018629.1|WP_000763768.1|2065563_2065971_+|hypothetical-protein
MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA
>NZ_CP018629.1|WP_000421410.1|2064472_2065051_-|xanthine-phosphoribosyltransferase
MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE
>NZ_CP018629.1|WP_000793010.1|2063204_2064473_-|purine-permease
MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILLLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVQ
>NZ_CP018629.1|WP_000264071.1|2061700_2063167_-|IMP-dehydrogenase
MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF
>NZ_CP018629.1|WP_000424966.1|2060134_2061676_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase
MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE
>NZ_CP018629.1|WP_000237797.1|2058873_2060067_+|site-specific-integrase
MVKDPIKKAKNGTYYFRANLGYDSKGKKIQKYRSGFTTKKEAREEYSKLLLMKPEELSENKDKMTFKHYIFEIFLPWYKTQVKLRTYENRLPTIKKHFSYFDKMAVSDIEPIDVQNWQLKLSKKCKSSYVRAVQGLFSVAMDRAIVLGITTTNPSKIIGNVKKQKSKIEFWTKEEFEKVISLIYKEDYYQHFLFISLWFLFMTGMRIGEATAIQWEDIDFDSGVLTINKTLYYKNQSNYRFVEPKTKASVRHIVLDKCTLTYLSEWKEVQQNLIQTDFVMSYNGIPTQKHTLSYAIERYAKLAGIHRIRIHGLRHSHASLLISMGENPLIIKDRLGHEDIETTLGTYGHLYPNSNFEVANKLNGAISFKEAKQNYDTSPKNQFTVDYLRNKEMKKVQ
>NZ_CP018629.1|WP_000633907.1|2058646_2058847_+|DUF3173-family-protein
MITVTKKDLVELGYGTSFSADIIKKAKELMITKGHIYYQSRKLDRVPREAVEEILGIRFSNENRSE
>NZ_CP018629.1|WP_000845143.1|2057918_2058149_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKTAYPRVPFPLIVKATDGDVEAINQIVKHYRGYTSKRSLRRMTDEYGNSHMVIDETLRGRMETKLISKILSFEIK
>NZ_CP018629.1|WP_001789518.1|2068640_2068742_-|hypothetical-protein
MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNSVVIGGKGK
>NZ_CP018629.1|WP_000991007.1|2068826_2070215_+|L-cystine-transporter
MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH
>NZ_CP018629.1|WP_001289311.1|2070295_2071051_-|NADPH-dependent-oxidoreductase
MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR
>NZ_CP018629.1|WP_000052781.1|2071542_2072112_+|peroxiredoxin
MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI
>NZ_CP018629.1|WP_000930486.1|2072127_2073651_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F
MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDDKSKELKDLLTEITDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKKLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMNTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLNDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN
>NZ_CP018629.1|WP_001795623.1|2073729_2074023_+|hypothetical-protein
MINLIYTTRCAIMLKVCTSRKQINMKNDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLVQPIMQLFIDKAILNNVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN
>NZ_CP018629.1|WP_000746687.1|2074095_2074722_+|NDxxF-motif-lipoprotein
MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK
>NZ_CP018629.1|WP_000868248.1|2074976_2075360_+|hypothetical-protein
MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVEKNDSP
>NZ_CP018629.1|WP_000158374.1|2075425_2076007_-|histidine-phosphatase-family-protein
MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSRAEAVDLKVENCKPYIIE
>NZ_CP018629.1|WP_000211676.1|2076184_2076394_+|hypothetical-protein
MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPKFPHINLLLFNPILSTFSNIIIHIDHFHANKKDDN

Crispr_ID: NZ_CP018629_7

• CRISPR_ID: NZ_CP018629_7
• CRISPR_location: 2432601-2432751
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers
• Cas_protein_info: csa3

Consensus repeat of NZ_CP018629_7

Consensus_repeat	Method
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP018629_7

>7.1|2432629|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder
TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA
>7.2|2432686|38|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder
GTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018629_7

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP018629_7

>merge|NZ_CP018629|7|2432601-2432751|CRISPRCasFinder
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCATGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTAAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCTTTCTA

>NZ_CP018629|7|6|2432601-2432751|CRISPRCasFinder
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA	TGCGCTTAGCGCAGGCGCTCCTACTTTTA
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCA	GTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTC
AACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCTTTCTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP018629.1|WP_000160304.1|2423082_2423793_+|purine-nucleoside-phosphorylase	unknown	unknown	gnl|CDD|180275
NZ_CP018629.1|WP_000019744.1|2430245_2431226_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB	unknown	unknown	gnl|CDD|224151
NZ_CP018629.1|WP_001123303.1|2424556_2424970_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225556
NZ_CP018629.1|WP_000334467.1|2438034_2439840_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)	unknown	unknown	gnl|CDD|234729
NZ_CP018629.1|WP_000115564.1|2433873_2435010_-|SAP-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366887
NZ_CP018629.1|WP_001127960.1|2427733_2428672_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|224399
NZ_CP018629.1|WP_000808817.1|2427472_2427703_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000370924.1|2436095_2436953_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223635
NZ_CP018629.1|WP_000003759.1|2429923_2430244_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA	csa3	COG0640_csa3_CAS-I-A	gnl|CDD|238042
NZ_CP018629.1|WP_000070866.1|2423913_2424357_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223854
NZ_CP018629.1|WP_001802298.1|2433082_2433187_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001024094.1|2429106_2429772_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187554
NZ_CP018629.1|WP_000648718.1|2444671_2445778_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|235031
NZ_CP018629.1|WP_000927363.1|2442093_2444226_+|BglG-family-transcription-antiterminator	unknown	unknown	gnl|CDD|226234
NZ_CP018629.1|WP_000083789.1|2440520_2442059_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB	unknown	unknown	gnl|CDD|225123
NZ_CP018629.1|WP_000123393.1|2425427_2426801_-|EVE-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376640
NZ_CP018629.1|WP_001292149.1|2444237_2444672_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA	unknown	unknown	gnl|CDD|227014
NZ_CP018629.1|WP_000908176.1|2437020_2437803_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224044
NZ_CP018629.1|WP_000495671.1|2431491_2432583_+|lytic-regulatory-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001790138.1|2435298_2435391_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP018629.1|WP_000003759.1|2429923_2430244_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA	csa3	COG0640_csa3_CAS-I-A	3.8e-21	70.4	0.1

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP018629.1|WP_000160304.1|2423082_2423793_+|purine-nucleoside-phosphorylase	gnl|CDD|180275	PRK05819, deoD, DeoD-type purine-nucleoside phosphorylase.	2.10672e-157
NZ_CP018629.1|WP_000370924.1|2436095_2436953_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase	gnl|CDD|223635	COG0561, Cof, Predicted hydrolases of the HAD superfamily [General function prediction only].	5.39747e-59
NZ_CP018629.1|WP_001123303.1|2424556_2424970_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein	gnl|CDD|225556	COG3011, COG3011, Predicted thiol-disulfide oxidoreductase [General function prediction only].	3.14887e-46
NZ_CP018629.1|WP_001292149.1|2444237_2444672_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA	gnl|CDD|227014	COG4668, MtlA, Mannitol/fructose-specific phosphotransferase system, IIA domain [Carbohydrate transport and metabolism].	2.08822e-62
NZ_CP018629.1|WP_000908176.1|2437020_2437803_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224044	COG1119, ModF, ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA [Inorganic ion transport and metabolism].	4.88024e-103
NZ_CP018629.1|WP_001127960.1|2427733_2428672_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase	gnl|CDD|224399	COG1482, ManA, Phosphomannose isomerase [Carbohydrate transport and metabolism].	7.24075e-129
NZ_CP018629.1|WP_000019744.1|2430245_2431226_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB	gnl|CDD|224151	COG1230, CzcD, Co/Zn/Cd efflux system component [Inorganic ion transport and metabolism].	1.049e-108
NZ_CP018629.1|WP_000003759.1|2429923_2430244_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA	gnl|CDD|238042	cd00090, HTH_ARSR, Arsenical Resistance Operon Repressor and similar prokaryotic, metal regulated homodimeric repressors. ARSR subfamily of helix-turn-helix bacterial transcription regulatory proteins (winged helix topology). Includes several proteins that appear to dissociate from DNA in the presence of metal ions.	1.8473e-17
NZ_CP018629.1|WP_000070866.1|2423913_2424357_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein	gnl|CDD|223854	COG0783, Dps, DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant) [Inorganic ion transport and metabolism].	1.22744e-67
NZ_CP018629.1|WP_000083789.1|2440520_2442059_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB	gnl|CDD|225123	COG2213, MtlA, Phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component [Carbohydrate transport and metabolism].	0
NZ_CP018629.1|WP_000115564.1|2433873_2435010_-|SAP-domain-containing-protein	gnl|CDD|366887	pfam02037, SAP, SAP domain. The SAP (after SAF-A/B, Acinus and PIAS) motif is a putative DNA/RNA binding domain found in diverse nuclear and cytoplasmic proteins.	3.91533e-06
NZ_CP018629.1|WP_000648718.1|2444671_2445778_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase	gnl|CDD|235031	PRK02318, PRK02318, mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase; Provisional.	0
NZ_CP018629.1|WP_000927363.1|2442093_2444226_+|BglG-family-transcription-antiterminator	gnl|CDD|226234	COG3711, BglG, Transcriptional antiterminator [Transcription].	4.09729e-67
NZ_CP018629.1|WP_000123393.1|2425427_2426801_-|EVE-domain-containing-protein	gnl|CDD|376640	pfam01878, EVE, EVE domain. This domain was formerly known as DUF55. Crystal structures have shown that this domain is part of the PUA superfamily. This domain has been named EVE and is thought to be RNA-binding.	3.86989e-06
NZ_CP018629.1|WP_001024094.1|2429106_2429772_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|187554	cd05243, SDR_a5, atypical (a) SDRs, subgroup 5. This subgroup contains atypical SDRs, some of which are identified as putative NAD(P)-dependent epimerases, one as a putative NAD-dependent epimerase/dehydratase. Atypical SDRs are distinct from classical SDRs. Members of this subgroup have a glycine-rich NAD(P)-binding motif that is very similar to the extended SDRs, GXXGXXG, and binds NADP. Generally, this subgroup has poor conservation of the active site tetrad; however, individual sequences do contain matches to the YXXXK active site motif, the upstream Ser, and there is a highly conserved Asp in place of the usual active site Asn throughout the subgroup. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	5.74381e-48
NZ_CP018629.1|WP_000334467.1|2438034_2439840_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)	gnl|CDD|234729	PRK00331, PRK00331, isomerizing glutamine--fructose-6-phosphate transaminase.	0

Protein sequences

>NZ_CP018629.1|WP_000495671.1|2431491_2432583_+|lytic-regulatory-protein
MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK
>NZ_CP018629.1|WP_000019744.1|2430245_2431226_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB
MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH
>NZ_CP018629.1|WP_000003759.1|2429923_2430244_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA
MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL
>NZ_CP018629.1|WP_001024094.1|2429106_2429772_-|SDR-family-oxidoreductase
MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD
>NZ_CP018629.1|WP_001127960.1|2427733_2428672_-|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase
MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV
>NZ_CP018629.1|WP_000808817.1|2427472_2427703_-|hypothetical-protein
MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN
>NZ_CP018629.1|WP_000123393.1|2425427_2426801_-|EVE-domain-containing-protein
MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRISNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD
>NZ_CP018629.1|WP_001123303.1|2424556_2424970_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein
MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD
>NZ_CP018629.1|WP_000070866.1|2423913_2424357_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein
MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS
>NZ_CP018629.1|WP_000160304.1|2423082_2423793_+|purine-nucleoside-phosphorylase
MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE
>NZ_CP018629.1|WP_001802298.1|2433082_2433187_-|hypothetical-protein
MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK
>NZ_CP018629.1|WP_000115564.1|2433873_2435010_-|SAP-domain-containing-protein
MSVNARDLLVLHTNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPTKKGEEILKKTEYLTSFIQSYGEISLERAYYLVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYDNGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNIYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSNVKKESRSNTLIELSKILENGYTIDKEEFKKEDDYLSKYIFTDIDYLKKLESKINVAIDIRSGEIHLVLDDDSLDILIQNQKYGNEF
>NZ_CP018629.1|WP_001790138.1|2435298_2435391_+|hypothetical-protein
MFIFKTTSKSHFHNNVKSLECIKIPINKNR
>NZ_CP018629.1|WP_000370924.1|2436095_2436953_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase
MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAEHFLAE
>NZ_CP018629.1|WP_000908176.1|2437020_2437803_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMFAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE
>NZ_CP018629.1|WP_000334467.1|2438034_2439840_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing)
MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDTPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE
>NZ_CP018629.1|WP_000083789.1|2440520_2442059_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB
MSQTEEKKGIGRRFQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA
>NZ_CP018629.1|WP_000927363.1|2442093_2444226_+|BglG-family-transcription-antiterminator
MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI
>NZ_CP018629.1|WP_001292149.1|2444237_2444672_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA
MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA
>NZ_CP018629.1|WP_000648718.1|2444671_2445778_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase
MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVEDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAAYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS

Crispr_ID: NZ_CP018629_8

• CRISPR_ID: NZ_CP018629_8
• CRISPR_location: 2556764-2556957
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers

Consensus repeat of NZ_CP018629_8

Consensus_repeat	Method
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CRT

spacers of NZ_CP018629_8

>8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT
CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTG
>8.2|2556843|36|NZ_CP018629|CRT
TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA
>8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT
CATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018629_8

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP018629_8

>merge|NZ_CP018629|8|2556764-2556957|CRT
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA

>NZ_CP018629|8|2|2556764-2556957|CRT
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTG
TGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACT	TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA	CATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTG
TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP018629.1|WP_000184419.1|2554744_2555956_+|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|341042
NZ_CP018629.1|WP_000503817.1|2561745_2562252_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB	unknown	unknown	gnl|CDD|223595
NZ_CP018629.1|WP_000808500.1|2558985_2559432_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE	unknown	unknown	gnl|CDD|223391
NZ_CP018629.1|WP_000600967.1|2553385_2554150_-|VOC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379203
NZ_CP018629.1|WP_000951058.1|2554311_2554752_+|winged-helix-DNA-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|197670
NZ_CP018629.1|WP_000259718.1|2559927_2561187_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA	unknown	unknown	gnl|CDD|238452
NZ_CP018629.1|WP_000134528.1|2561249_2561744_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC	unknown	unknown	gnl|CDD|236483
NZ_CP018629.1|WP_000230173.1|2557098_2558121_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA	unknown	unknown	gnl|CDD|274250
NZ_CP018629.1|WP_000602937.1|2559445_2559931_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B	unknown	unknown	gnl|CDD|224677
NZ_CP018629.1|WP_000866971.1|2558746_2558980_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1	unknown	unknown	gnl|CDD|340452
NZ_CP018629.1|WP_000592303.1|2548204_2551372_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|223911
NZ_CP018629.1|WP_001790034.1|2556533_2556704_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_001549681.1|2553142_2553394_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP018629.1|WP_000066900.1|2556057_2556408_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV	unknown	unknown	gnl|CDD|130944
NZ_CP018629.1|WP_000413865.1|2551488_2552754_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX	unknown	unknown	gnl|CDD|225224
NZ_CP018629.1|WP_000643988.1|2558140_2558740_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA	unknown	unknown	gnl|CDD|234725
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rpsblast for functional proteins

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NZ_CP018629.1|WP_000184419.1|2554744_2555956_+|MFS-transporter	gnl|CDD|341042	cd17489, MFS_YfcJ_like, Escherichia coli YfcJ, YhhS, and similar transporters of the Major Facilitator Superfamily. This subfamily is composed of Escherichia coli membrane proteins, YfcJ and YhhS, Bacillus subtilis uncharacterized MFS-type transporter YwoG, and similar proteins. YfcJ and YhhS are putative arabinose efflux transporters. YhhS has been implicated glyphosate resistance. YfcJ-like arabinose efflux transporters belong to the bacterial MdtG-like and eukaryotic solute carrier 18 (SLC18) family of the Major Facilitator Superfamily (MFS) of transporters. MFS proteins are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	1.27961e-72
NZ_CP018629.1|WP_000503817.1|2561745_2562252_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB	gnl|CDD|223595	COG0521, MoaB, Molybdopterin biosynthesis enzymes [Coenzyme metabolism].	1.02752e-64
NZ_CP018629.1|WP_000600967.1|2553385_2554150_-|VOC-family-protein	gnl|CDD|379203	pfam13468, Glyoxalase_3, Glyoxalase-like domain. This domain is related to the Glyoxalase domain pfam00903.	1.50083e-38
NZ_CP018629.1|WP_000808500.1|2558985_2559432_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE	gnl|CDD|223391	COG0314, MoaE, Molybdopterin converting factor, large subunit [Coenzyme metabolism].	5.56799e-58
NZ_CP018629.1|WP_000134528.1|2561249_2561744_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC	gnl|CDD|236483	PRK09364, moaC, cyclic pyranopterin monophosphate synthase MoaC.	3.63862e-98
NZ_CP018629.1|WP_000230173.1|2557098_2558121_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA	gnl|CDD|274250	TIGR02666, Cyclic_pyranopterin_monophosphate_synthase, molybdenum cofactor biosynthesis protein A, bacterial. The model for this family describes molybdenum cofactor biosynthesis protein A, or MoaA, as found in bacteria. It does not include the family of probable functional equivalent proteins from the archaea. MoaA works together with MoaC to synthesize precursor Z from guanine. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Molybdopterin].	1.0538e-165
NZ_CP018629.1|WP_000602937.1|2559445_2559931_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B	gnl|CDD|224677	COG1763, MobB, Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein [Coenzyme metabolism].	4.35501e-50
NZ_CP018629.1|WP_000866971.1|2558746_2558980_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1	gnl|CDD|340452	cd00754, Ubl_MoaD, ubiquitin-like (Ubl) domain found in molybdenum cofactor biosynthesis protein D (MoaD) and similar proteins. MoaD, also termed molybdopterin synthase sulfur carrier subunit, or MPT synthase subunit 1, or MPT synthase small subunit, or molybdopterin-converting factor small subunit, or molybdopterin-converting factor subunit 1, is a conserved small sulfur carrier protein that has beta-grasp ubiquitin-like (Ubl) fold involved in biosynthesis of the molybdenum cofactor (Moco), an essential cofactor of a diverse group of redox enzymes. MoaD is activated in an ATP-dependent manner by sulfurtransferases similar to the activation mechanism of ubiquitin-activating enzyme E1.	8.16473e-25
NZ_CP018629.1|WP_000592303.1|2548204_2551372_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit	gnl|CDD|223911	COG0841, AcrB, Cation/multidrug efflux pump [Defense mechanisms].	0
NZ_CP018629.1|WP_000951058.1|2554311_2554752_+|winged-helix-DNA-binding-protein	gnl|CDD|197670	smart00347, HTH_MARR, helix_turn_helix multiple antibiotic resistance protein.	2.35323e-15
NZ_CP018629.1|WP_000259718.1|2559927_2561187_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA	gnl|CDD|238452	cd00887, MoeA, MoeA family. Members of this family are involved in biosynthesis of the molybdenum cofactor (MoCF), an essential cofactor of a diverse group of redox enzymes. MoCF biosynthesis is an evolutionarily conserved pathway present in eubacteria, archaea and eukaryotes. MoCF contains a tricyclic pyranopterin, termed molybdopterin (MPT). MoeA, together with MoaB, is responsible for the metal incorporation into MPT, the third step in MoCF biosynthesis. The plant homolog Cnx1 is a MoeA-MogA fusion protein. The mammalian homolog gephyrin is a MogA-MoeA fusion protein, that plays a critical role in postsynaptic anchoring of inhibitory glycine receptors and major GABAa receptor subtypes.	9.49423e-160
NZ_CP018629.1|WP_000413865.1|2551488_2552754_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX	gnl|CDD|225224	COG2348, COG2348, Peptidoglycan interpeptide bridge formation enzyme [Cell wall/membrane/envelope biogenesis].	4.8324e-143
NZ_CP018629.1|WP_000643988.1|2558140_2558740_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA	gnl|CDD|234725	PRK00317, mobA, molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA; Reviewed.	5.68918e-67
NZ_CP018629.1|WP_000076929.1|2562282_2563287_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB	gnl|CDD|181084	PRK07688, PRK07688, thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein; Validated.	3.67241e-132
NZ_CP018629.1|WP_000066900.1|2556057_2556408_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV	gnl|CDD|130944	TIGR01889, Pleiotropic_Regulator_Of_Virulence, staphylococcal accessory regulator family. This model represents a family of transcriptional regulatory proteins in Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis. Some members contain two tandem copies of this region. This family is related to the MarR transcriptional regulator family described by pfam01047. [Regulatory functions, DNA interactions].	2.64009e-20
NZ_CP018629.1|WP_000913019.1|2563456_2564062_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|226628	COG4148, ModC, ABC-type molybdate transport system, ATPase component [Inorganic ion transport and metabolism].	3.32197e-115

Protein sequences

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NZ_CP018629_4	4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder	1644389-1644417	29	NZ_CP018629.1	1511541-1511569	2	0.931
NZ_CP018629_4	4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder	1644389-1644417	29	NZ_CP018629.1	1594503-1594531	2	0.931
NZ_CP018629_4	4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder	1644389-1644417	29	NZ_CP018629.1	2749703-2749731	2	0.931
NZ_CP018629_8	8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT	2556787-2556819	33	NZ_CP018629.1	439370-439402	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT	2556787-2556819	33	NZ_CP018629.1	1010367-1010399	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT	2556787-2556819	33	NZ_CP018629.1	1099646-1099678	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT	2556787-2556819	33	NZ_CP018629.1	1310434-1310466	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT	2556787-2556819	33	NZ_CP018629.1	1412482-1412514	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT	2556787-2556819	33	NZ_CP018629.1	2830049-2830081	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.2|2556843|36|NZ_CP018629|CRT	2556843-2556878	36	NZ_CP018629.1	281038-281073	2	0.944
NZ_CP018629_8	8.2|2556843|36|NZ_CP018629|CRT	2556843-2556878	36	NZ_CP018629.1	428623-428658	2	0.944
NZ_CP018629_8	8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT	2556902-2556934	33	NZ_CP018629.1	439370-439402	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT	2556902-2556934	33	NZ_CP018629.1	1099646-1099678	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT	2556902-2556934	33	NZ_CP018629.1	1310434-1310466	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT	2556902-2556934	33	NZ_CP018629.1	1412482-1412514	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT	2556902-2556934	33	NZ_CP018629.1	1639003-1639035	2	0.939
NZ_CP018629_8	8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT	2556902-2556934	33	NZ_CP018629.1	2830049-2830081	2	0.939

1. spacer 3.1|1594540|34|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1010412-1010445, mismatch: 0, identity: 1.0

atgggccccaacaaagagaaattggattcccaat	CRISPR spacer
atgggccccaacaaagagaaattggattcccaat	Protospacer
**********************************

2. spacer 3.1|1594540|34|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1099600-1099633, mismatch: 0, identity: 1.0

atgggccccaacaaagagaaattggattcccaat	CRISPR spacer
atgggccccaacaaagagaaattggattcccaat	Protospacer
**********************************

3. spacer 8.2|2556843|36|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1310487-1310522, mismatch: 0, identity: 1.0

tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta	CRISPR spacer
tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta	Protospacer
************************************

4. spacer 1.1|1310398|26|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 280913-280938, mismatch: 1, identity: 0.962

ccgccagcttctatgttggggccccg	CRISPR spacer
ccgccagcttctatgttgggggcccg	Protospacer
********************* ****

5. spacer 1.1|1310398|26|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1638990-1639015, mismatch: 1, identity: 0.962

ccgccagcttctatgttggggccccg	CRISPR spacer
ccgccagcttctgtgttggggccccg	Protospacer
************.*************

6. spacer 1.1|1310398|26|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1675942-1675967, mismatch: 1, identity: 0.962

ccgccagcttctatgttggggccccg	CRISPR spacer
ccgcctgcttctatgttggggccccg	Protospacer
***** ********************

7. spacer 2.2|1315790|35|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1315959-1315993, mismatch: 1, identity: 0.971

ttgtttgttggaattggtgatcctatttctctctg	CRISPR spacer
ttgtctgttggaattggtgatcctatttctctctg	Protospacer
****.******************************

8. spacer 2.4|1315903|35|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1315959-1315993, mismatch: 1, identity: 0.971

ttgtctgttgaaattggtgatcctatttctctctg	CRISPR spacer
ttgtctgttggaattggtgatcctatttctctctg	Protospacer
**********.************************

9. spacer 4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 598892-598920, mismatch: 1, identity: 0.966

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
tttcgaaaagaaattctacagacaatgca	Protospacer
********************.********

10. spacer 4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 2106416-2106444, mismatch: 1, identity: 0.966

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
tttcgaaaagaaattctacaagcaatgca	Protospacer
*********************.*******

11. spacer 8.2|2556843|36|NZ_CP018629|CRT matches to position: 598892-598927, mismatch: 1, identity: 0.972

tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta	CRISPR spacer
tgcattgtctgtagaatttcttttcgaaattctcta	Protospacer
************************.***********

12. spacer 1.1|1310398|26|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1531184-1531209, mismatch: 2, identity: 0.923

ccgccagcttctatgttggggccccg	CRISPR spacer
ccgccagcctctgtgttggggccccg	Protospacer
********.***.*************

13. spacer 1.1|1310398|26|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1675886-1675911, mismatch: 2, identity: 0.923

ccgccagcttctatgttggggccccg	CRISPR spacer
ccgcctgcttttatgttggggccccg	Protospacer
***** ****.***************

14. spacer 1.1|1310398|26|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1675998-1676023, mismatch: 2, identity: 0.923

ccgccagcttctatgttggggccccg	CRISPR spacer
ccgcctgcttctgtgttggggccccg	Protospacer
***** ******.*************

15. spacer 4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 281045-281073, mismatch: 2, identity: 0.931

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca	Protospacer
********************..*******

16. spacer 4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 428630-428658, mismatch: 2, identity: 0.931

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
tttcgaaaggaaattctacagacaatgca	Protospacer
********.***********.********

17. spacer 4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1310487-1310515, mismatch: 2, identity: 0.931

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
tttcaaaaagaaattctacagacaatgca	Protospacer
****.***************.********

18. spacer 4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1511541-1511569, mismatch: 2, identity: 0.931

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca	Protospacer
********************..*******

19. spacer 4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 1594503-1594531, mismatch: 2, identity: 0.931

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca	Protospacer
********************..*******

20. spacer 4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to position: 2749703-2749731, mismatch: 2, identity: 0.931

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
tttcgaaaagaaattctacaggcaatgca	Protospacer
********************..*******

21. spacer 8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 439370-439402, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********** *************** ******

22. spacer 8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1010367-1010399, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcatcttctg	Protospacer
********** ***************.******

23. spacer 8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1099646-1099678, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********** *************** ******

24. spacer 8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1310434-1310466, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********** *************** ******

25. spacer 8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1412482-1412514, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********** *************** ******

26. spacer 8.1|2556787|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 2830049-2830081, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********** *************** ******

27. spacer 8.2|2556843|36|NZ_CP018629|CRT matches to position: 281038-281073, mismatch: 2, identity: 0.944

tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta	CRISPR spacer
tgcattgcctgtagaatttcttttcgaaattctcta	Protospacer
*******.****************.***********

28. spacer 8.2|2556843|36|NZ_CP018629|CRT matches to position: 428623-428658, mismatch: 2, identity: 0.944

tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta	CRISPR spacer
tgcattgtctgtagaatttcctttcgaaattctcta	Protospacer
********************.***.***********

29. spacer 8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 439370-439402, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

30. spacer 8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1099646-1099678, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

31. spacer 8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1310434-1310466, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

32. spacer 8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1412482-1412514, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

33. spacer 8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 1639003-1639035, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgactttccgccagcttctg	Protospacer
*********************.*.*********

34. spacer 8.3|2556902|33|NZ_CP018629|CRT matches to position: 2830049-2830081, mismatch: 2, identity: 0.939

cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg	CRISPR spacer
cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg	Protospacer
********************..***********

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP018629_4	4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder	1644389-1644417	29	MN693281	Marine virus AFVG_25M371, complete genome	6448-6476	7	0.759
NZ_CP018629_2	2.4|1315903|35|NZ_CP018629|CRT	1315903-1315937	35	KY971610	Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome	73937-73971	11	0.686

1. spacer 4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to MN693281 (Marine virus AFVG_25M371, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
cacttagaagaaatcctacaaacaatgca	Protospacer
. .. *.*******.**************

2. spacer 2.4|1315903|35|NZ_CP018629|CRT matches to KY971610 (Pseudomonas phage PspYZU05, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686

ttgtctgttgaaattggtgatcctatttctctctg	CRISPR spacer
aaagctgttcaaattggtgaccctatttcatgtgg	Protospacer
  . ***** **********.******** . . *

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1483 : 54770	54	Streptococcus_phage(27.27%)	integrase,tRNA,transposase	attL 8598:8614|attR 55547:55563
DBSCAN-SWA_2	338722 : 413967	106	Staphylococcus_phage(86.42%)	tail,protease,head,terminase,portal,integrase,capsid,holin	attL 325623:325638|attR 356213:356228
DBSCAN-SWA_3	474028 : 593863	109	Staphylococcus_phage(90.62%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_4	726048 : 735091	7	uncultured_Mediterranean_phage(50.0%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	805504 : 813816	7	Caulobacter_phage(16.67%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_6	868940 : 956677	107	Staphylococcus_phage(80.77%)	tRNA,tail,protease,head,plate,terminase,portal,integrase,capsid,holin	attL 864768:864785|attR 930839:930856
DBSCAN-SWA_7	1138416 : 1144408	10	Staphylococcus_phage(83.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	1402536 : 1411009	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_9	1430995 : 1458557	31	Enterococcus_phage(25.0%)	bacteriocin,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_10	1578227 : 1593035	23	Staphylococcus_phage(89.47%)	integrase,terminase,coat	attL 1575922:1575940|attR 1590483:1590501
DBSCAN-SWA_11	1631732 : 1640342	7	Streptococcus_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_12	1672808 : 1687538	14	uncultured_Caudovirales_phage(50.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_13	1699510 : 1707330	10	Pandoravirus(16.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_14	2032556 : 2040723	10	Streptococcus_phage(85.71%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_15	2053038 : 2063167	11	Streptococcus_phage(62.5%)	integrase	attL 2051314:2051328|attR 2067246:2067260
DBSCAN-SWA_16	2079845 : 2179557	116	Staphylococcus_phage(94.2%)	tail,protease,head,terminase,portal,integrase,capsid,holin	attL 2119507:2119526|attR 2171314:2171333
DBSCAN-SWA_17	2194427 : 2323838	141	Staphylococcus_phage(94.16%)	tail,transposase,terminase,integrase,holin	attL 2214248:2214267|attR 2322514:2322533

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP018629|1483:54770|DBSCAN-SWA
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MNASSKRKIISQSEISKKIAVMNEEMQGFWANNSWDIRKCPHPSAIELSKNPALRNRWVRFERVKNLWLRTELKYFYFYHLNNGIWNAKTVWIRKGTVINKMLDFLDLKYPSITSITEVPIDKAMTEYRTYLTKRGVRITTTNYKITANQEKTPVKANSYYVTNLKQFMEFYENFYFDGEEWDKDVWDRRNLPLPDDKVNPTQYEYTINFKGFRNTYFKQLVKRYCKLRLNMDSFSYVSDIAQKLKEFFNFLDIKFKHVQRVHQLTRVEIEAYLSELNMMGIKPSTITGRISILEGLFSTLHRLEWDDVPSKLLIYPEDYPKIPRAKPRFIDEFVLEQLNSHLDKLPEYIATMTMIVQECGMRISELCTLKKGCLLEDKDGDYFLKYYQWKMKKEHIVPISKEVVLLIKVREDKVSEEFPDSEYLFPRKDGSPLKQKTFRGELNKLAYEQNIVDKLGEIYRFHAHAFRHSVGTRMINNGVPQHIVQKFLGHESPEMTSRYAHIFDETLKNEFTKFQEKLVTNNGDVLNLDDDSEVDDVELQWFKKNINAQVLPNGYCRLPVIAGGCPHANACLDCTHFCTSKQFLPQHEEQLERTEELLTIAKDKQWQRQIETNSRVKERLEQIIGSLTG
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000362509.1|1483_2863_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis GTPase MnmE	NA	NA	NA	NA
WP_000249657.1|2929_4807_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
WP_000215590.1|4806_5526_+	16S rRNA (guanine(527)-N(7))-methyltransferase RsmG	NA	NA	NA	NA
WP_000742839.1|5568_6408_+	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	A0A2K9V477	Faecalibacterium_phage	1.8e-05	23.4
WP_000093392.1|6614_7100_+|transposase	IS200/IS605 family transposase	A0A1P8BMC0	Lactococcus_phage	4.9e-19	35.4
WP_000175892.1|7391_7730_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080004721.1|7729_7822_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001166716.1|7823_8135_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000848380.1|8150_8657_+	DUF1643 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
8598:8614	attL	NA	NA	NA	NA
WP_000659046.1|8677_8995_+	RadC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000868132.1|9113_10199_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A0A8WIF9	Clostridium_phage	4.5e-12	28.3
WP_014532403.1|10195_12088_+|integrase	phage integrase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001041907.1|12094_12472_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000159127.1|12651_13017_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	E4ZFI8	Streptococcus_phage	7.7e-25	49.6
WP_103067844.1|13009_15424_+	cadmium-translocating P-type ATPase CadA	E4ZFI9	Streptococcus_phage	2.3e-250	63.6
WP_000562107.1|15504_16122_+	CadD family cadmium resistance transporter	NA	NA	NA	NA
WP_000350222.1|16389_17034_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000220507.1|17033_17294_-	persulfide-sensing transcriptional repressor CstR	NA	NA	NA	NA
WP_000438836.1|17429_18494_+	dihydroneopterin aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_000465482.1|18525_19464_+	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_001136659.1|19554_19860_+	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000427807.1|19973_21122_-	ROK family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_014532405.1|21441_21510_+	phenol-soluble modulin PSM-mec	NA	NA	NA	NA
WP_000952923.1|21965_23723_-	beta-lactam sensor/signal transducer MecR1	NA	NA	NA	NA
WP_078056052.1|23819_25829_+	PBP2a family beta-lactam-resistant peptidoglycan transpeptidase MecA	NA	NA	NA	NA
WP_000872606.1|25874_26303_-	MaoC family dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_000958858.1|26399_27143_-	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_020444595.1|28219_28609_-	hydroxymethylglutaryl-CoA synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001106057.1|28644_29319_+|transposase	IS6-like element IS257 family transposase	A0A0N9RU54	Staphylococcus_phage	2.6e-127	99.1
WP_000122374.1|30888_32130_-	plasmid recombination protein	NA	NA	NA	NA
WP_000492283.1|32318_33698_-	tetracycline efflux MFS transporter Tet(K)	NA	NA	NA	NA
WP_001105988.1|33894_34569_+|transposase	IS6-like element IS257 family transposase	A0A0N9RU54	Staphylococcus_phage	2.6e-127	99.1
WP_001794375.1|34654_35203_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000790333.1|35397_36048_-	organomercurial lyase MerB	NA	NA	NA	NA
WP_000193219.1|36129_37773_-	mercury(II) reductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	1.7e-50	29.4
WP_002380761.1|37830_38178_-	mercury transporter	NA	NA	NA	NA
WP_000010351.1|38304_38985_-	cytochrome c biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_103067845.1|38981_39335_-	TlpA family protein disulfide reductase	NA	NA	NA	NA
WP_000425271.1|39351_39759_-	Hg(II)-responsive transcriptional regulator MerR	NA	NA	NA	NA
WP_103067846.1|40058_41420_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_001105999.1|41687_42362_+|transposase	IS6-like element IS257 family transposase	A0A0N9RU54	Staphylococcus_phage	2.0e-127	99.1
WP_000231163.1|42447_44637_+	type I restriction endonuclease subunit R	A0A220A398	Liberibacter_phage	1.4e-41	25.8
WP_000759939.1|44716_45283_-	peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_001070883.1|45432_45654_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000941331.1|46120_46537_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000717928.1|46599_47127_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000397419.1|47261_47750_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000065262.1|47765_48056_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000373151.1|48112_48985_-	HTH domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_001092058.1|49532_50195_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_001072201.1|50703_51435_+	23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(A)	E4ZFQ0	Streptococcus_phage	1.9e-51	47.5
WP_000067268.1|51560_52343_-	aminoglycoside nucleotidyltransferase ANT(9)-Ia	NA	NA	NA	NA
WP_001041907.1|52493_52871_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014532403.1|52877_54770_-|integrase	phage integrase family protein	NA	NA	NA	NA
55547:55563	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP018629|338722:413967|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP018629|474028:593863|DBSCAN-SWA
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MKQISIGYEEIYGDRIFHSHFLKEHEVKNWKTVNQIIEKEHLDKNEYEAEPPLFFFSGSLD

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_011443644.1|529199_530939_+	type I restriction-modification system subunit M	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	4.4e-288	99.4
WP_000072576.1|530931_532131_+	restriction endonuclease subunit S	A0A2H4PQP5	Staphylococcus_phage	5.5e-229	99.7
WP_000195429.1|533638_534811_-|transposase	IS256-like element IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	3.5e-135	100.0
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WP_001801861.1|541226_541322_-	type I toxin-antitoxin system Fst family toxin PepA1	NA	NA	NA	NA
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WP_000809857.1|542843_543029_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_001795535.1|546813_547464_-	calcium-binding protein	A0A2H4PQM8	Staphylococcus_phage	2.7e-44	88.4
WP_011443643.1|547766_548222_+	DUF4909 domain-containing protein	A0A2H4PQN7	Staphylococcus_phage	3.0e-79	98.6
WP_000348360.1|548380_549859_+	o-succinylbenzoate--CoA ligase	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	2.0e-281	97.0
WP_000778523.1|549863_550865_+	o-succinylbenzoate synthase	A0A2H4PQM0	Staphylococcus_phage	4.8e-186	97.6
WP_000718107.1|550861_551119_-	membrane protein insertion efficiency factor YidD	A0A2H4PQM5	Staphylococcus_phage	7.2e-46	100.0
WP_000672014.1|551184_551658_+	nucleoside triphosphatase YtkD	A0A2H4PQM4	Staphylococcus_phage	4.7e-83	98.1
WP_002868962.1|551662_552409_+	S9 family peptidase	A0A2H4PQM6	Staphylococcus_phage	7.1e-142	98.4
WP_000093392.1|552783_553269_+|transposase	IS200/IS605 family transposase	A0A1P8BMC0	Lactococcus_phage	4.9e-19	35.4
WP_000109906.1|553404_554997_-	phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)	A0A2H4PQN1	Staphylococcus_phage	0.0e+00	100.0
WP_000933822.1|555367_556561_+	methionine adenosyltransferase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	1.9e-218	99.7
WP_000366154.1|556685_557594_+	NERD domain-containing protein	A0A2H4PQQ8	Staphylococcus_phage	3.2e-136	98.7
WP_000453322.1|557805_558657_+	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	7.0e-154	97.8
WP_000623471.1|560720_561074_-	CrcB family protein	A0A2H4PQQ7	Staphylococcus_phage	1.0e-21	99.1
WP_001200542.1|561070_561436_-	fluoride efflux transporter CrcB	A0A2H4PQR0	Staphylococcus_phage	3.6e-59	100.0
WP_000091445.1|561691_561994_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001096494.1|562253_562967_+	transaldolase	M1PR54	Cyanophage	5.5e-19	35.3
WP_001168904.1|563406_564042_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease SdpA	NA	NA	NA	NA
WP_001030465.1|564337_564781_+	hypothetical protein	A0A2H4PQT8	Staphylococcus_phage	3.0e-55	85.0
WP_103067863.1|564767_565211_-	competence protein ComK	NA	NA	NA	NA
WP_000671052.1|565323_565794_-	RNA polymerase sigma factor	A0A2H4PQT5	Staphylococcus_phage	1.0e-82	99.4
WP_000384171.1|565992_566217_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001032833.1|566492_567347_+	autolysin	Q4ZCC7	Staphylococcus_virus	9.8e-39	38.6
WP_000163235.1|567641_568037_-	arsenate reductase (thioredoxin)	A0A2H4PQT9	Staphylococcus_phage	6.3e-73	100.0
WP_000989121.1|568054_569347_-	arsenite efflux transporter membrane subunit ArsB	A0A2H4PQU3	Staphylococcus_phage	5.0e-228	99.5
WP_000221179.1|569346_569661_-	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2H4PQT4	Staphylococcus_phage	2.0e-53	100.0
WP_001261678.1|570183_571686_+	FAD-dependent oxidoreductase	A0A2H4PQX2	Staphylococcus_phage	2.3e-30	100.0
WP_000384181.1|572178_573210_+	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A2H4PQS8	Staphylococcus_phage	4.8e-197	99.4
WP_103067864.1|573216_573849_+	riboflavin synthase	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	6.4e-112	99.0
WP_001159024.1|573859_575041_+	bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	1.6e-225	99.2
WP_001008551.1|575053_575518_+	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	5.8e-70	99.4
WP_001196354.1|575639_576641_-	proline dehydrogenase	A0A2H4PQT6	Staphylococcus_phage	9.0e-185	99.7
WP_001790712.1|576752_576872_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000266096.1|576874_577702_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_000195429.1|579153_580326_+|transposase	IS256-like element IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	3.5e-135	100.0
WP_000757543.1|580613_581015_+	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_000764419.1|581134_581698_-	methyltransferase domain-containing protein	A0A2H4PQV0	Staphylococcus_phage	8.3e-103	99.5
WP_000526539.1|581694_582648_-	TIGR01212 family radical SAM protein	A0A2H4PQV5	Staphylococcus_phage	2.2e-79	100.0
WP_001025061.1|582757_583939_+	MFS transporter	A0A2H4PQR6	Staphylococcus_phage	5.6e-218	100.0
WP_001108732.1|584229_586644_+|tRNA	leucine--tRNA ligase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.2
WP_000836465.1|586665_586977_+	rhodanese-like domain-containing protein	A0A2H4PQR9	Staphylococcus_phage	1.6e-52	100.0
WP_001050552.1|587302_593863_+	LPXTG-anchored repetitive surface protein SasC	A0A2H4PQU6	Staphylococcus_phage	2.0e-304	98.1

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP018629|726048:735091|DBSCAN-SWA
CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTTTTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAACGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGCGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGAATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAATGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAATTGAAATTAAAAATAAAGGTGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTAGACGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGTACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTAGTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACGGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATACGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAATGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTACAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATATTCAAAAATCAATTTTGGTTATTTGGTGTTAAAAAGAATAAACGACATGATATTAATGAAGGTGTAGATGTTCATGACCTTAAAACTTCATTCGAGAAATGGAATTTTGTTAAATTAGCTAAGCCATTAATTGGAGTAAGTATTTTAATTGTAGTTGTCGGTTTAGTTATTCTTTATATCTTCAAGTTAAACTTAGGAATTGATTTCTCAAGTGGTACACGCGTAGATTTCCAATCTAAACAAGCAATTACTCAACAAAAGGTAGAGCAAGTTGTAAAAGATAGTGGACTTAAAGCGGATCAAATTCAGATCAATGGTAAAGACAATAAAGTAGCAACTGTTCAATTTAAAGACGATTTAACGCGTGCTCAAGATAATAAATTGAGTGATAATATTAAATCGAAATTCGGTGACACACCTCAAATTAACACTGTATCACCAATTATTGGACAGGAATTAGCAAAAAATGCAATGCTTGCATTAATCTATGCATCGATAGGTATCATCATCTATGTATCATTACGATTTGAATGGCGCATGGGTCTTTCATCTGTATTGGCATTATTACATGATGTATTCATTATAGTAGCGATTTTCAGTTTATTTAGAATTGAAGTAGATTTAACATTTATCGCCGCTGTATTAACAATTGTCGGTTATTCAATTAATGATACAATCGTAACGTTTGACCGTGTACGTGAAAACTTACAAAAGGTTAAAGTGATTACGACAACAGAACAAATTGATGATATCGTTAATAGATCAATTAGACAGACAATGACACGTTCAATTAATACAGTATTAACAGTTATTGTAGTAGTAGTTGCTATACTATTCTTCGGTGCTCCTACGATATTCAACTTTACTTTAGCATTATTTATCGGATTGATTTCTGGTGTATTCTCTTCAATCTTCATTGCCGTTCCGCTATGGGGAATAATGAAAAAACGTCAGTTGAAAAAATCGCCGAAACACAAATTAGTTGTATATAAAGAAAAGAAATCGAACGATGAAAAGATTTTAGTTTAAAATGAATTAAGCGGTATGTGAAACAATAAAGAGTTCACATACCGCTTTTTACTTTATTTAAATTTAACAAAATATATATAAATAAGTTCCCGCATTCATTTTTAAAAAATGGTATAATTAAAGTCTTGATTATTTAGATAAGTGCTTTTTATTTAAAGTAATTTTAGATATAATGTCTTTTGGAAATGAGGCGTAAATATATATGATTAAACCGAAGTATAAGTGGAAATTAACTAAACCAGCTGAATACATAAGTGATGAATTAACATCAAAATTAAAGTTAACGCCAATCGTAAAAAAAATATTAGAAAGTAAATCGATTATTGATGAACAAGCAATAGAATCCATCATTTCAGATACAGATATCAATCATGATGCACTGCAATTGAGCGATATGACTAAGACTATTGAAAGAATTAAAAGAGCGATAGCGAATGATGAGAAAATCCTAGTTTATGGTGATTACGATGCCGACGGTGTTACCGCAACTACAATTTTAGTGATAACATTACAACTTTTAGGTGCACAAGTAGGATGGCATATTCCTAACCGCTTTACCGAAGGATATGGACCAAACGAACTAGCATTTAGAAATGCTCATGATGAAGGCATAACATTAATCATAACTGTTGATAATGGCATACAAGGTCATAATGAAATTAAAATGGTTCAAGATTTAGGAGTTGATGTCATTGTAACTGATCATCATGAAATTGGTAGTACATTACCAGAAGCATATGCAATCGTACATCCAATGCATCCATCGTTTAATTATCCGTTCCAACAATTGTGTGGTGCAGGTGTTGCATACAAATTAGCACAAGCATTGATTGAAAATGTACCTGATTATTTTAAAGCATTAGTTGCGATAGGTACCATTGCGGATTTAGTATCCTTAACTGATGAAAATCGATCATTAGTGAAACAAGGATTAAAAGTCTTAAATGATCAATGTCCGACCTCTGTTAAAGCATTGCTAAAAGAAGCGGGATACAATGACAATATTGATGAAGAAACAATTGGTTTTATTATTGGACCTAGACTTAATGCTGTAGGTCGTTTAGATGACGCATCATTAGCTTGCGAATTGTTGATGACTGACGTCGAAGAAGAAGCTGCATTTTTAGCAGAACAAGTTGAACATTTTAACCGTGAAAGAAAAGATATTGTAGCAACTATCACAGAAGAAGCAATGGCTATGGCAGAAACGAAAGTTAAAAAGGGAGATTTATTTTTACTTTTAGCAAAAGAAAATTGGCATGAAGGTGTCTTAGGTATTGTTGCTTCGAAAATTGTCGAAACATTTGCTTTGCCAACATTAATTTTAAATATTGATAGGGAGCAAAATCATGCAAAAGGCTCCGCCAGATCAATTGATCAAGTGTCGATGTTTGAAATACTATCAGCACATCAAGAGTTAATCGCTAAATTTGGCGGCCATCATATGGCTGCAGGTATGACGATGGATATTGAAAATATAGAATCGTTAGCTGAAGGTTTAAATAAATGGATGAAAGAATTATCTAAAACAACTTCGTTAGATCCCGTAAAGCAAGTAGATGTATTATTAACAGAAAATGATATAACGATTAAAAATATTCGTGATATGAATCGTTTAAGACCCTTCGGAACAGATTTTTCTAGACCTATTTTTGAAATGGATGATTTATCAGTTTCTTCAGTTAAGGCGATAGGTCAACAAAAAAATCATCTAAAATTGACACTTGGTGAAAGTAATATCGCCGCGCTATTTTGGCAAAATGGACACTTAGAACCTGAGTTACAAGATGAACAGCCAATTAATATATTAGGATCTGTTCAAATCAACGAATGGAATGGTAATCAATCACCGCAAATAATTATTCAAGATATTGCGATGAATGAACAGCAAATATTAGATTATAGAAGTAAGCGAAAAAGTTTACCTTTTACAGAAAATGATGAAAATATTGTCGTGCTTATTCATCCTAAAAGTGATAAAGTAAATGCGAATGAATATTATTATGGTGAAGAAATTAAACAACAAACTGATAAAGTAGTATTAAGAGATTTACCAACGTCAATGGAAGACTTGTCTAATTCCTTGCAACAACTGCAATTTTCTCAACTTTATATAGTTTTGCAACATAATCATTCGATTTACTTCGATGGTATACCTAATATGGATATTTTTAAAAAGTGTTATAAAGCATTAATAACTAAACAAGAAACAAATATCCAGAAAGAGGGTATGTTATTGTGTCAACATTTAAGTGTGAAACCAGATACACTTAAATTCATGTTGAAAGTTTTCTTAGACTTAAAATTTGTAACACAAGAAGATGGTTTAATTCGAATCAATCAACAACCTGATAAAAGATCGATTGATTCCAGCAAAGTATATCAATTAAGACAACAACGTATGGATGTTGAAAAGCAATTATTATATCAAGATTTTTCAGAAATAAAAAATTGGATAAAGTCACAATTGTCGTGAGCAATTTAGGAGGAAATATTAATGGATTTAAAGCAATACGTATCAGAAGTTCAAGATTGGCCGAAACCAGGTGTTAGTTTCAAGGATATTACTACAATTATGGATAATGGTGAAGCATATGGCTATGCAACAGATAAAATTGTAGAATACGCAAAAGACAGAGATGTTGATATCGTTGTAGGACCTGAAGCGCGTGGCTTTATCATTGGCTGTCCTGTAGCTTATTCAATGGGGATTGGCTTTGCACCTGTTAGAAAAGAAGGGAAATTACCTCGTGAAGTCATTCGTTATGAGTATGACCTAGAATATGGTACAAATGTTTTAACAATGCACAAAGATGCAATTAAACCAGGTCAACGTGTGTTAATTACAGATGATTTATTAGCTACTGGTGGTACGATTGAAGCAGCAATAAAATTAGTTGAAAAATTAGGCGGTATCGTAGTAGGTATTGCATTTATAATTGAATTGAAATATTTAAATGGTATTGAAAAAATTAAAGATTACGATGTTATGAGTTTAATCTCATACGACGAATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP018629|726048:735091|732277_734551_+|WP_000594993.1|DBSCAN-SWA
MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTATTILVITLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDVEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS
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MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV
>NZ_CP018629|726048:735091|734572_735091_+|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP018629|726048:735091|727054_728080_+|WP_001019171.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLIEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGCTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII
>NZ_CP018629|726048:735091|726048_727053_+|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA
MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE
>NZ_CP018629|726048:735091|728102_729242_+|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF
>NZ_CP018629|726048:735091|729260_729521_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA
MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_001005767.1|726048_727053_+	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	1.7e-05	29.1
WP_001019171.1|727054_728080_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_001112045.1|728102_729242_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	5.4e-85	44.7
WP_001160682.1|729260_729521_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	8.2e-05	35.3
WP_000749795.1|729795_732075_+	protein translocase subunit SecDF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-31	35.8
WP_000594993.1|732277_734551_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	1.2e-62	28.8
WP_000364542.1|734572_735091_+	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	5.6e-29	46.5

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP018629|805504:813816|DBSCAN-SWA
TTTGCGAATAGATCAATCGATCATTAATGAAATAAAAGATAAAACCGACATTTTAGACTTGGTAAGTGAATATGTAAAATTAGAAAAGAGAGGACGCAATTATATAGGTTTGTGTCCTTTTCATGATGAAAAGACACCTTCATTTACAGTTTCTGAAGATAAACAAATTTGTCATTGTTTTGGTTGTAAAAAAGGTGGCAATGTTTTTCAATTTACTCAAGAAATTAAAGACATATCATTTGTTGAAGCGGTTAAAGAATTAGGTGATAGAGTTAATGTTGCTGTAGATATTGAGGCAACACAATCTAACTCAAATGTTCAAATTGCTTCTGATGATTTACAAATGATTGAAATGCATGAGTTAATACAAGAATTTTATTATTACGCTTTAACAAAGACAGTCGAAGGCGAACAAGCATTAACGTACTTACAAGAACGTGGTTTTACAGATGCGCTTATTAAAGAGCGAGGCATTGGCTTTGCACCCGATAGCTCACATTTTTGTCATGATTTTCTTCAAAAAAAGGGTTACGATATTGAATTAGCATATGAAGCCGGATTATTATCACGTAACGAAGAAAATTTCAGTTATTACGATAGATTTCGAAATCGTATTATGTTTCCTTTGAAAAATGCGCAAGGAAGAATTGTTGGATATTCAGGTCGAACATATACCGGTCAAGAACCAAAATACTTAAATAGTCCTGAAACACCTATCTTTCAAAAAAGAAAGTTGTTATACAACTTAGATAAAGCGCGTAAATCAATTAGAAAATTAGATGAAATCGTATTACTAGAAGGTTTTATGGATGTTATAAAATCTGATACTGCTGGCTTGAAAAACGTTGTTGCAACAATGGGTACACAGTTGTCAGATGAACATATTACTTTTATACGAAAGTTAACATCAAATATAACATTAATGTTTGATGGGGATTTTGCGGGTAGTGAAGCAACACTTAAAACAGGTCAAAATTTGTTACAGCAAGGGCTAAATGTATTTGTTATACAATTGCCATCAGGCATGGATCCGGATGAATACATTGGTAAGTATGGCAACGATGCATTTACTGCTTTTGTAAAAAATGACAAAAAGTCATTTGCACATTATAAAGTGAGTATATTAAAAGATGAAATTGCACATAATGACCTTTCATATGAACGTTATTTGAAAGAACTAAGTCATGATATTTCGCTTATGAAATCATCGATTTTGCAACAAAAGGCTTTAAATGATGTTGCACCATTTTTCAATGTTAGTCCTGAGCAATTAGCTAACGAAATACAATTCAATCAAGCACCAGCCAATTATTATCCAGAAGATGAGTATGGCGGTTACATTGAACCTGAGCCAATTGGTATGGCACAATTTGACAATTTGAGCCGTCAAGAAAAAGCGGAGCGAGCATTTTTAAAACATTTAATGAGAGATAAAGATACATTTTTAAATTATTATGAAAGTGTTGATAAGGATAACTTCACAAATCAGCATTTTAAATATGTATTCGAAGTCTTACATGATTTTTATGCGGAAAATGATCAATATAATATCAGTGATGCTGTGCAGTATGTTAATTCAAATGAGTTGAGAGAAACACTAATTAGCTTAGAACAATATAATTTGAATGACGAACCATATGAAAATGAAATTGATGATTATGTCAATGTTATTAATGAAAAAGGACAAGAAACAATTGAGTCATTGAATCATAAATTAAGGGAAGCTACAAGGATTGGCGATGTAGAATTACAAAAATACTATTTACAGCAAATTGTTGCTAAGAATAAAGAACGCATGTAGCATGTGATTTTAAAGAATAATACGAATAATGATTATGTCAAAATGTATAAGGGTAAATGATAGTTACCGCATTTAAACAACACTATTGAAAAATAAATATTGGGATTAGTTCCAATTTGTAAAATAAAATTAAAAATATGGATGAATTAATTAAGAATTTAGTTTAAAATAGCAATATTGAATAAATTTCGAATGTTCATATTTAAAATCGGGAGGCCGTTTCATGTCTGATAACACAGTTAAAATTAAAAAACAAACAATTGATCCGACATTAACATTAGAAGATGTTAAGAAGCAATTAATTGAAAAAGGTAAAAAAGAGGGTCATTTAAGTCATGAAGAAATTGCTGAAAAACTTCAGATTTTTGATATCGACTCTGATCAAATGGATGATTTCTTTGATCAATTAAATGATAATGATATTTCACTAGTTAATGAAAAAGATAGTTCAGATACTGACGAGAAACTGAATCCAAGTGATCTTAGTGCCCCTCCAGGTGTTAAAATAAATGACCCAGTTCGTATGTACCTTAAAGAAATTGGGCGTGTTAACTTATTAAGTGCACAAGAAGAAATCGAATTAGCCAAACGTATTGAACAAGGTGATGAAGTAGCAAAATCAAGACTTGCAGAAGCGAACTTACGTTTAGTTGTAAGTATTGCTAAAAGATACGTAGGTCGTGGTATGTTATTCCTTGATTTAATCCAAGAAGGTAATATGGGTCTTATTAAAGCTGTTGAAAAATTTGACTTTAACAAAGGATTTAAGTTTTCAACATATGCAACATGGTGGATTAGACAAGCAATCACTCGTGCAATTGCTGACCAAGCACGTACGATTCGTATCCCTGTGCATATGGTAGAAACAATTAATAAATTAATTCGTGTTCAACGTCAATTATTACAGGACTTAGGTCGAGATCCAGCACCAGAAGAAATTGGTGAAGAAATGGATTTACCAGCAGAAAAAGTTCGTGAAATTTTAAAAATTGCGCAAGAACCTGTTTCATTAGAAACACCAATTGGTGAAGAAGATGATAGTCATTTAGGAGACTTTATTGAGGATCAGGAAGCACAAAGTCCTTCAGATCATGCTGCTTATGAATTATTAAAAGAGCAATTAGAAGATGTGCTTGATACATTAACTGATAGAGAAGAAAATGTATTACGATTAAGATTTGGTCTTGATGACGGCAGAACAAGAACACTTGAAGAAGTTGGTAAAGTTTTCGGTGTTACACGTGAACGTATTCGACAAATTGAAGCAAAAGCACTTAGAAAATTAAGACATCCAAGTCGTAGTAAACGTTTGAAAGACTTTATGGATTAATTTATATCAATTTTAATGATTGATACCAAGACATGAATAAGCGCTTATTTATTTTTAGATTAAGATTTAACTTGAGTGAGGTTGGTACATTGAATAATGTTCAACCTCTTTTTTCATAAAGGAGAATAAAATGATTTCGTTAAATAACCGATTAACGACGGTAAGTCGATTTTTAAAACAAGGTACAATCGCGGATATTGGCTCAGATCATGCTTATTTGCCAATCTATGCAATTCAAAACCATTTATGCGAATGCGGTATTGCTGGAGAAGTTATTCAAGGCCCTTTTCAAGCTGCTGTGAAAAATGTAGCTGCAAACCAATTAGTAGATAGAATTGATGTACGTTTGGGGGATGGCTTAAGTGTTATTCAACCTGAGGACGTAATCGATAATATCACAATTTGTGGTATGGGCGGACCACTTATTGCTAAAATTTTAAAAGATGGGCAAGATAAGTTAAGTCAACATCCAAGGTTGATTTTACAAAGTAATATCCAAACTGAAAATTTAAGACAAACATTACAACAATTGAATTATGAAATAATTGATGAAATAATAATGGAAGAAAAAGGCCATATTTATGAAATTGTTGTAGCAGAATATTCTACAGAATTAATAGAGCTATCATCTGATGAATTGAAATTCGGACCAAAATTGCTGAACAACAAAAATGAATATTTTATAAAAAAATGGCAAAGAGAGTTAGAAGCACTTTATCATATTAAATCGAAACTCAATACTGAACAACATCATCAACGTTTAGCTCAAATTAATGACGAAATTGCTGTAATTGAAAGGGTGTTATAGTAATGAAAATAGCTGATTTAATGACATTGTTAGATCATCATGTGCCATTTAGTACTGCTGAATCTTGGGATAATGTAGGATTGTTAATAGGTGATGAAGATGTTGAAGTTACTGGTGTTTTAACAGCATTAGACTGTACGTTGGAAGTAGTAAATGAAGCAATCGAAAAAGGTTATAATACTATTATTAGTCATCATCCTCTAATCTTTAAAGGCGTAACATCATTAAAAGCTAATGGTTATGGTTTGATCATTAGAAAACTAATTCAACATGACATTAATTTAATAGCGATGCATACAAATTTAGATGTAAATCCGTATGGTGTCAATATGATGTTGGCGAAGGCGATGGGTTTGAAGAACATTTCAATAATAAATAATCAACAAGATGTATACTATAAAGTTCAAACATATATACCTAAGGATAATGTTGGACCATTTAAAGATAAGCTTAGTGAAAATGGATTAGCGCAAGAAGGTAATTATGAATATTGTTTCTTTGAAAGTGAAGGAAGAGGGCAATTCAAACCAGTTGGTGAAGCTAATCCAACAATAGGACAAATTGATAAAATTGAATATGTAGATGAAGTTAAAATTGAATTTATGATAGATGCATATCAAAAGTCAAGGGCTGAGCAATTAATTAAACAATACCATCCATATGAAACACCGGTATTTGATTTTATTGAGATAAAACAAACATCCCTTTATGGACTTGGCGTTATGGCAGAAGTGGATAATCAAATGACATTGGAAGATTTCGCAGCTGATATTAAATCTAAATTAAATATCCCAAGTGTCCGTTTTGTTGGTGAGTCTAATCAGAAAATTAAACGTATTGCAATTATTGGTGGTTCAGGTATTGGATATGAATATCAAGCTGTCCAACAAGGCGCAGATGTCTTTGTTACAGGTGATATTAAACATCATGATGCCTTAGATGCTAAAATTCATGGTGTGAATTTAATTGATATTAATCATTACAGCGAATATGTGATGAAAGAAGGTTTAAAAGCGTTACTAATGAATTGGTTCAATACAGAAAAAATAAATTTAGATGTTGAAGCATCTACAATTAATACAGATCCATTTCAATATATTTAAACTAAAATCTCGGGATTTCTAAATTTTGAAATTTCGAGGTTTTAATATTTTTATTTAAAATAGCACATTTATACTTTATAATAGTAAAGATGAACATATAAGGAGGCCAAATCATGGCAAAACATCCATTCGAACAATTTAATCTAGAATCTAGTTTAATTGACGCTGTGAAAGACCTTAATTTTGAAAAACCAACTGAAATTCAGAATCGAATTATTCCAAGAATACTAAAGAGAACAAATTTAATTGGTCAATCTCAAACGGGTACAGGGAAATCTCATGCATTTTTATTACCATTAATGCAGTTAATTGATAGTGAAATAAAAGAACCACAAGCAATCGTAGTTGCACCAACAAGAGAACTTGCACAACAACTATACGATGCAGCGAACCATTTAAGCCAATTTAAAGCTGGTGTTTCAGTTAAAGTTTTTATTGGTGGTACAGATATAGAGAAAGATAGACAACGTTGTAATGCACAACCACAATTGATTATAGGCACCCCTACTAGAATTAATGACTTAGCTAAAACGGGACATTTACATGTGCACTTAGCATCATATTTAGTTATTGATGAAGCGGATCTTATGATTGACTTAGGATTAATTGAAGATGTAGATTACATTGCTGCAAGATTGGAAGATAATGCAAATATTGCGGTGTTTAGTGCTACAATCCCACAACAGTTACAACCATTTTTAAATAAATATTTAAGTCATCCAGAATATGTAGCTGTCGACAGTAAAAAACAAAATAAAAAGAACATCGAATTCTATTTAATACCTACTAAAGGTGCAGCTAAAGTTGAAAAGACTTTAAATTTAATTGATATACTAAATCCATACTTATGTATTATTTTCTGTAATAGTAGAGATAATGCAAATGATTTAGCACGTTCACTAAATGAAGCTGGTATTAAAGTTGGTATGATTCATGGTGGCTTAACGCCACGTGAACGTAAACAACAAATGAAACGTATACGTAATTTAGAATTCCAATACGTTATTGCCAGCGATTTAGCATCTCGTGGTATTGATATTGAAGGTGTTAGTCATGTCATCAATTTTGATGTGCCAAATGATATTGACTTCTTTACGCATAGAGTCGGACGAACTGGTCGTGGGAATTATAAAGGTGTAGCAATTACGCTTTATAGTCCTGATGAAGAACACAATATTTCATTAATAGAAGATCGCGGTTTTGTATTCAATACTGTTGATATTAAAGATGGTGAGTTAAAAGAAGTTAAAGCGCACAATCAGCGTCAAGCAAGAATGCGCAAAGATGACCATTTAACTAATCAAGTGAAGAACAAAGTTCGAAGTAAAATTAAAAACAAAGTTAAACCAGGTTATAAGAAGAAATTTAAACAAGAAGTTGAAAAAATGAAACGTCAAGAGCGTAAGCAATTTAGTAAGCAGCAAAATAGACAAAAACGTAAGCAAAACAAAAAAGGTTAGGTGTGTTTTATGTTATTAGGATCACATGTTTCAATGAGTGGTAAAAAGATGTTAGAAGGTTCTGCTATAGAAGCGCATGAATATGGTGAAACAACATTTATGATTTATACTGGTGCACCTCAAAACACGCGCCGTAAAAGTATTGAAGATTTAAATATAACTAAAGGTCATGAAGTGATGGAAAAATATGGTTTATCTAATATTGTTGTTCATGCACCATACATCATTAATATTGCAAATACAACCAAACCAGAAACGTTTAATCTTGGTGTAGATTTCTTGCAACAAGAAATTGAAAGAACGCAAGCTATAGGGGCTAAAGATATTGTATTACATCCAGGTGCGCATGTTGGAGCTGGTGTTGATGCCGGAATTAATAAGATTATTGAAGGATTAAATGAAGTTTTAACGAATGACAATAATGTACGTATTGCGCTTGAAACGATGGCAGGTAAAGGTACAGAGATTGGTCGCTCATTTGAAGAGTTAGCACGTATTATTGATGGAGTTCATAATAACGAACGTTTATCAGTATGTTTTGATACATGTCATACGCATGATGCTGGATATAATGTTAAAGAGGACTTTGATGGCGTATTAAATGAATTTGATAAAATCATTGGAGTCGACAGAATCAAAGTTGTTCATGTCAATGATTCTAAAAATGACCGTGGCGCTCAAAAAGACCGACATGAAAATATTGGCTTCGGTTACATTGGTTTTGATGCATTAAATTACATTGTGCATCATGATAGTTTTAAAGATATTCCGAAAATCTTAGAAACACCTTATGTTGGTGAAGATAAGAAAAATAAAAAACCGCCATATAAACTTGAAATTGAAATGTTAAAACAACAGCAATTTGACCCAGAATTAAAAAATAAGGTTATGCAACAATAAAATGATAATGCTCTCTTCAAGAAATGCGATAAATAAAACTTGAAGGGGGCATATCTCTTTATTTTGTCTAATTTTGAGTCGTAAACATTACTGTTTACATATGTTACTAGGAGTTGTATAGTTGAATGCGAGGTGAGAATACGATGACACCAGTCTTTGAATTGAAAAATGTCAATTACTACTATGATCATAAAAAAGTGTTAGAAAATATAAACATTAAAATAAATAAAGGTGAATTTTTAGCAATTGTTGGACCAAATGGTGCTGGTAAATCAACATTATTGAAGTTGATTCTAGGGTTATTACCTTTACAAAGTGGTGAGATTTTTGTTGAAGGTATTGATTTTAAAAATAAGAAAACATCAATTAAATTAAGCTATGTATCACAAAAAGCAAATGCCTTTAATTCAGGTTTCCCAGCAAGTGTTAAAGAAGTTGTTTTAAGCGGATTAACAAAGACAAAACGTCTTTTCCAAACATTTAATAGCAAAGATAATGAAAAAGTGATTAAAGTACTAGAAAGACTGAATATAAGTGATTTAATTCATAAAAATATAGCAGAATTATCAGGTGGTCAACAACAACGTGTAATGATTGCTCGAGCATTGATTTCAGAACCTGCAGTATTAGTACTTGATGAACCAACGAATGGTATTGATGCAAAACATGTAAGTGAATTTTATAATACTTTAGATCAATTAAAACAAGAAGGTATCACCATTATCTTAGTTACTCATGATATCGGTGTTGTAGCAGATACTGCTACTGAAGTAGCATGTTTAAATAAGCATTTGCATTTCCATGGTACAACTGATGAGTTTAAATCACTTGATGAAGTTGAAATTTCAAAAATTTATGGACATCCTGTACGTTTTGTCGATCATCAGCATAATCGAGAATGTTGTAATTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP018629|805504:813816|808764_809442_+|WP_000624584.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTELIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL
>NZ_CP018629|805504:813816|810658_812005_+|WP_001062180.1|DBSCAN-SWA
MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG
>NZ_CP018629|805504:813816|805504_807304_+|WP_001217261.1|DBSCAN-SWA
MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM
>NZ_CP018629|805504:813816|813030_813816_+|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP018629|805504:813816|809444_810545_+|WP_000683931.1|DBSCAN-SWA
MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKALLMNWFNTEKINLDVEASTINTDPFQYI
>NZ_CP018629|805504:813816|807527_808634_+|WP_103067866.1|DBSCAN-SWA
MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQIFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD
>NZ_CP018629|805504:813816|812014_812905_+|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA
MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_001217261.1|805504_807304_+	DNA primase	A0A0K1LMQ9	Caulobacter_phage	4.6e-54	36.0
WP_103067866.1|807527_808634_+	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	1.1e-37	38.1
WP_000624584.1|808764_809442_+|tRNA	tRNA (adenine-N(1))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_000683931.1|809444_810545_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	A0A1S5V250	Saudi_moumouvirus	5.2e-08	29.6
WP_001062180.1|810658_812005_+	DEAD/DEAH box helicase	A0A1V0SIR5	Klosneuvirus	5.3e-55	33.7
WP_000924214.1|812014_812905_+	deoxyribonuclease IV	A0A2H4UU70	Bodo_saltans_virus	2.0e-26	33.1
WP_001213908.1|813030_813816_+	metal ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	8.0e-19	28.3

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP018629|868940:956677|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001023806.1|902358_902754_+	DUF3168 domain-containing protein	A0A2I6PEQ4	Staphylococcus_phage	8.8e-67	100.0
WP_103067882.1|902788_903430_+|tail	phage tail protein	A0A2K9VBP7	Staphylococcus_phage	1.0e-120	100.0
WP_000169127.1|903521_903977_+	Ig domain-containing protein	A0A2I6PER6	Staphylococcus_phage	5.7e-78	100.0
WP_000589167.1|904034_904385_+	hypothetical protein	A0A2I6PEQ2	Staphylococcus_phage	1.1e-55	100.0
WP_000438833.1|904426_904585_+	hypothetical protein	A0A2I6PES8	Staphylococcus_phage	1.2e-19	100.0
WP_103067883.1|904598_910799_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A2K9VBQ5	Staphylococcus_phage	0.0e+00	100.0
WP_001190533.1|910798_911623_+|tail	phage tail family protein	A0A2I6PER3	Staphylococcus_phage	4.1e-159	100.0
WP_001668972.1|911631_913215_+	phage protein	A0A2K9VBV8	Staphylococcus_phage	1.2e-308	100.0
WP_000179860.1|913214_913505_+	hypothetical protein	A0A2I6PF46	Staphylococcus_phage	2.1e-49	100.0
WP_000429552.1|913520_915431_+	hypothetical protein	A0A2K9VBU3	Staphylococcus_phage	0.0e+00	100.0
WP_000067129.1|915430_916897_+|plate	BppU family phage baseplate upper protein	A0A2I6PDE3	Staphylococcus_phage	1.8e-274	100.0
WP_001166599.1|916896_917286_+	DUF2977 domain-containing protein	A0A2I6PER1	Staphylococcus_phage	2.2e-62	100.0
WP_000916020.1|917278_917443_+	XkdX family protein	A0A2I6PES4	Staphylococcus_phage	4.9e-24	100.0
WP_103067884.1|917488_917788_+	DUF2951 family protein	A0A2K9VBS0	Staphylococcus_phage	4.2e-29	100.0
WP_000387656.1|917923_918226_+|holin	phage holin	A0A2K9VBR4	Staphylococcus_phage	9.1e-48	100.0
WP_103067885.1|918237_919692_+	CHAP domain-containing protein	A0A2K9VBR6	Staphylococcus_phage	1.4e-290	100.0
WP_061390271.1|920375_920627_+	hypothetical protein	A0ZS61	Staphylococcus_virus	2.4e-25	100.0
WP_000476873.1|920717_921635_+	DUF1672 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000472936.1|921692_922631_+	DUF1672 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_000913218.1|922844_923759_+	DUF1672 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_001789947.1|923957_924077_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001186912.1|924355_924901_+	ECF transporter S component	NA	NA	NA	NA
WP_001151997.1|925006_925255_-	ferredoxin	A0A127AYY7	Bacillus_phage	8.3e-15	48.0
WP_001163801.1|925362_926316_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000902119.1|926305_927685_+	ATP-dependent DNA helicase RecQ	L7RCS0	Acanthamoeba_polyphaga_moumouvirus	2.9e-56	33.6
WP_000069282.1|927837_929298_+	elastin-binding protein EbpS	NA	NA	NA	NA
WP_001789943.1|929422_929539_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001174260.1|929699_930686_+	YpdA family putative bacillithiol disulfide reductase	NA	NA	NA	NA
WP_000681758.1|930800_931769_-	asparaginase	NA	NA	NA	NA
930839:930856	attR	NA	NA	NA	NA
WP_000644391.1|931845_932505_+	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_001789945.1|932535_932652_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001789944.1|932768_932960_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000133954.1|933216_934392_+	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
WP_000165530.1|934613_935924_+	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
WP_000161738.1|935940_936939_+	NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_001043863.1|937109_937382_+	HU family DNA-binding protein	A7KV42	Bacillus_phage	4.2e-28	73.3
WP_000450553.1|937812_938385_+	heptaprenyl diphosphate synthase component 1	NA	NA	NA	NA
WP_000774684.1|938387_939113_+	demethylmenaquinone methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_001817755.1|939129_940074_+	heptaprenyl diphosphate synthase subunit II	A0A1V0SE37	Indivirus	1.3e-10	24.4
WP_000442480.1|940165_940615_+	nucleoside-diphosphate kinase	D2E8E1	Anguillid_herpesvirus	2.4e-28	43.8
WP_000789521.1|940823_941012_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001269929.1|941410_942577_+	chorismate synthase	A0A291AU41	Pandoravirus	7.6e-34	32.1
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WP_000245895.1|943676_944975_+	3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_000389524.1|944981_946226_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000004947.1|946239_946815_+	IDEAL domain-containing protein	G3MAV7	Bacillus_virus	2.7e-08	27.2
WP_000152734.1|946804_947392_+	DUF1405 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_000839926.1|948480_948798_+	nucleotide pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_000690027.1|949038_950181_+	N-acetyl-alpha-D-glucosaminyl L-malate synthase BshA	NA	NA	NA	NA
WP_000361544.1|950185_951388_+|tRNA	CCA tRNA nucleotidyltransferase	H7BUW3	unidentified_phage	3.2e-35	42.5
WP_000049919.1|951374_952346_+	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_103067886.1|952369_955063_+	ATP-dependent helicase	A0A1X9I5C8	Streptococcus_phage	8.2e-47	34.4
WP_000858789.1|955384_956677_+|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A2P1EMB4	Moumouvirus	1.9e-54	30.0

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP018629|1138416:1144408|DBSCAN-SWA
TCTACATTATTATATCCATTTTTTTAATATTTTTCCCTTCTCTTAAACGTTGCCAACTTTGAGCCATATAAAAGTCAGGATCAAATTGTTTAAATCCACTTTCTAATAAATACTTATTTTCAAATATATGTTCATAAACTCTTTGAATTAAATCTTTATTTATATTAGTATTTTTAGCAATTTTAGAAATCTCTATCTGTTTATCTCGATTTCTAACTGAATTATAATAAATTTGAGCATGTCTGTTCCTTTTGATACCGTATTCATCACTTTTATTATTAAGTGCACCTGATTCAATAAAACAACCTTCTACTTGATATTTACCTTCACGCTCTTTAAAGAACTTGTCTCGCCAATTGCCGACATGTGGCACTGTGGTACTTCTACACCAAGGATGCATAGGTGGCGCATTCACACCTGGTATCATATCTTTAACTTTAAATATTTTTCCGTTGAGTGAATGACATAATTTAGATGTTTTACTATCTATTTTGGCAACATATTTATATTCGCCATCTTCACCAAGTTCTTTTAAATATGTTAACTTTTGTGACTCTTCTTTTTCAACGAATAATGAAAAAAGCATATAAAAATAGCATCGCTTTCTCTTTATCTGTGTAGAAAGGATGCTTTAATACCATGCTATTTTATAATTTTCGGGAAATTCTTGCTTCTCGATAAAGTCTCTTACTACAGAAAAAGACTTATTACGATATAACATAAAATATTCTTCATTTTCTATTTCAGATAATGAGAAATCTATAACCTCTGCATCTTTTTTATTAAAAGTTACTGAACCTTTACCGTTACTTATATCATCTTCAGGTATATATTCATATATTATAACCTGTTCATCTTCTTTCAATTTTATTAATGTAAGCATTTAATCCACCTTCTTTTTTATAAAAATTGAATAATCGTATTTTTTTGATACAATTTTATGTGCATAATCATAGTTGAAATTATACTTATTCATCAAATAATGTTCAAGCGCCTCATGACGCAGCAGTATTAAATCTTGTTTTTTATTGTTTTTCCTTCTCTTAAACGTTGCCAACTTACTGCGATATTATATTCTGGATAATAACTTAAAATCGAATAATTCACTTTGAACATAACAACTCACTCCTTGTATAGTGGTGAAGCAAGTATTATTATTAAATTGTAGGAGGGAAAGTCCCTCCTGACTGATTAACGCTCGAATGTCCATTCAATCTTTATAAAGTAGAGATTTATTAAGATTAACAATTTGGTACATTTGAGCTTTTTTATTTCCTTCACTCGCACCTTCTTAAACTTATATGTTCATTATACAAATATAAAAAGCTATAACAATTTAATGAAAATGCCCCCTTCGAAGTCGACATTGAAAAAATGAAAACTTTGAAGGGAGCATTTCAAGACGATCCATTCCAATCTTTTTTATCATTTAAAACTTAACACTTATTTTCCCTTATTCGATGCTAATTTCGTGCAATAAATTCTAAATGAAACGACATACTCCTTTTTCACAAATTGGAATCTACTATTTTTGTATTTTAATTATTATAATATCCATTCACCATATGATTTTTATTAATAGTTAAATCAAATAAACATAGCTTGATTAATTTATACATTAGTTAAATTACAAAACTTTATTGGCATATTCATATAATTTTTCTGTTGTATTCAGGGTTAGATTATCTACTTCGCGTTTGCCCTGTCTTAATTGTGAAAGTACGTATTGAGAAACTCCAGTTTTTTTAGAAATTTCATATCCTGTTAAATTACTTTCAATTAATTCAATTATTTTTTTCTTGTATTCTGACATTTTTTCATCTCCATATCTGTACAATGTTTTCTGCTTTTTTTCGAAATTCTGTGAACTTAACGTATTTTTTATCTATAAATGATTTTATTATTTTTCTATTCATTAATGGCTATCATCACTTCATAATAGTTAAATTTTATATTTTCAATTTTTGTTTCTACATATTAACGACTTTTCATCATCAATTACTTTGTCAAAGATAAACGATTTGTCTTGTATACCTTACGCCTTTTACAAAACTTCAATGTTTAGTATTCATTGAAGTTTACAGCCACTTCTAAAGTTTAACCTTTTATGTATTTTTATTAGATTAGTGTCTTTCAATATTCAAACTACTAACTCCAGTAGTCTATTAAATTTGAGATATTGAGATATCTTTAGAATTTAATTTTTCCGGAGTCATATAGACTTCTCAAATACTATACATTTATTTCATAATTTTGAACCCTAATATTACTAAAATAATTATAAACGTCCCTATTAAAAATTCTATTTTCTCTTTTTTATTTGTTTTTCGCACTTTAATAGTCATCTTCATTTTACTAATGGTGAGAAAGTAATATTTTATTCAAAGAATATGACTTCATATTAAATCAAACCTCACATTCTTATTAGATTGCAAATTCAATAGTCCTACCAGAATTGAAATCAAAACATTCAAACTATTTTATCGTTTTAACTTCCTCGACCATTTTCACCTCCTTATAATCTATATAAATTATGTTTACCACACGATTCTTTACACTCGAAAAATTAATTTTGTTAAGAAACATTTAGCCATGTAACTTTGTAATAAAAACATTTTCAAATAAATGTACCAAAAACTTTCATGAAATAAAGTATACTTTTCAAATCTATTAATTTTAGAATCATAAAACCAAATGCTATATTACAATATAATTATCACAAATCATCATATATGCCAATTACACAATTTAATATAAAAAATTGTCAATGAAAAATTGATAAAGTCCGTATAATTGTGTAAAAGTAAAAAGGCCATATAACAGTCCTTTTACGGTACAATGTTTTTAACGACAAAAACATACCCAGGAGGACTTTTACATGACCCAAGTACATTTTACACTGAAAAGCGAAGAGATTCAAAGCATTATTGAATATTCTGTAAAGGATGACGTTTCTAAAAATATTTTAACAACGGTATTTAATCAACTAATGGAAAATCAACGAACAGAATATATTCAAGCAAAAGAATATGAACGAACAGAAAACCGACAAAGTCAACGAAATGGCTATTATGAGCGCAGCTTTACGACACGTGTAGGCACGCTAGAATTAAAAGTACCCAGAACACGTGATGGCCATTTTTCACCCACAGTGTTTGAACGTTATCAACGAAACGAAAAAGCCCTCATGGCTTCAATGTTGGAAATGTATGTATCAGGCGTTTCAACTCGTAAAGTATCAAAAATTGTGGAAGAACTTTGTGGTAAATCCGTCTCTAAGTCCTTCGTTTCTAGCTTAACAGAACAGCTAGAACCTATGGTTAACGAGTGGCAGAATCGTTTATTATCAGAAAAAAATTATCCTTACTTAATGACCGATGTACTCTATATAAAAGTACGAGAAGAAAATCGAGTACTCTCAAAAAGCTGTCATATAGCGATTGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTGAAAAATTATGTGCATAAACATTATTACAAAATATGTATAGTATAGAATACTGCATTAAAGTTAACTTATTTACTGTGTTCAGCCTTTTATATCATCGCTTAAAGATCATTCAAGATTTAATGGCAATGATAATTTCATAATATGCATTTTTGATTATTTAACCATGTACAATTTCTAAAACTAAGAGATTATCTTATTGAGGTGGACAAAACGTGGACAGACAACCATGAAATCATTAGAAATTTAATTTCTTGTCCACCTAACCTAACAAAATATTTTTGTTAACATTCTGTTTTATTTTCTAATGTTCTTTGATATTCATATAACTTGATTATCGTTTTAAATTTAGCTTCTTTTATTTTAGTTTTACCTACCTTTAAATCAGTAACTGTTTGACGTGGTACACCTGAGTTTTTTGAAATACTATATGGTGTATTGTTAGTTAATAACTTTTCTATTTCACTTATAATAGTTTCAATCTCATTCATTATTAATCACACTCTCTTTCTATTTATAATTATAATAATCCTAATGCAGTAACTACGTTTAGCAATACATTGTTTTTTTCTAGTTGCCAAACTAGTTAATTCATAAACTAATACCTAATAGTATTGGCGTTTTTTTTATATATTGATAAAATTTCTTGTCTCCATCTATTCTATATTATATTATTTGATAATTTTTTATTTATATTCACATTAAGTTATCCATATTTAATATACTTTAAAATTAGATGACTTAAAAGGCTCACTCCATGATATTTCAAAAATATGGCCTTATTTTAATCTTCAATCATTATTTCTAATTGTTTTTGGTAATTATAGAGTTTTTCCGCTGTTTCTAAAGTTAAATTATTCACTTTTCTTTTCCCGCTTCTTAATTCACTTATACCACCATAAGAAACATCAGTGTCTTGATTAATTCTATAATTAGATATTGATTTATCATTTAGTAATTTTTCTATTGTATTATAAATTTCTTTAAACTGGTTCATAATTTTTGTCAAAATGAAAGAATAATTTATTTTTTCTAGTTAAATTAATAATAAATAATATTAAAGTTGCAATGTTAAGATAGAGAGTTAATTTTTTCCTTAATTCTCTTGTCATAAATACCACCTCCCTATTTAATGTGGTAAAGGTCTTTTGCCCTTTACCTTTTTAAAAGAACGATTTGATAAAATTAAGTACTTGAATTATTAAGCTCGTCACAGCTATTCGAAATTTAATTTTGCTATTCGTTCTTTTTCTTTAACCATTCTTATCATTTTTTCTCCTTTCCTCTTTATAGTTATTTAACATTCCACAAATTGGGGTAAGTGACATGTTGAACTCCCATATCCACTGGCAAGATTTATAATTTGTAATTCTAAAGTATAATAGCCTATATTTTTCAAAATCTCTTTTTTTATGATTAACATCCCTCTAAGTGCACCTAAAGGTTTTTATGTAATGTATTAAATATTTCCATTTATACATATACATCTTGTATAAAAAGAAAGAACTCCATATATACTCAAAAGGTATACTGAAGCTCTATATATTATATAAAATTATTATACTATTTTGAAAAACATAAGTAAATCACTAAACATGATTTCTTTCACTTTTAGAAAACTTTTAATACTATAAAAGCACCCACTCAGTCACTAGTTTGGGCAGTTATTGTATGCCTATTGAACTCAATGCTTATATTACAATACCTTTTTCGCATATTCATATAAGATCTTTGCATTCTTTAAGCTTAAATTTTCTATTCTTCTTTCTCTACGGCGCATAGCATTAATATTACCGTAACTTATCCCAGTATCTTTATTAATTTGATAACTCGATATCTCTTTGTTTTCTATCAATTCTTTGATTGTATTGAATATTTCATCATAGCAATTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK
>NZ_CP018629|1138416:1144408|1143298_1143523_-|WP_001789892.1|DBSCAN-SWA
MTKIMNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTDVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED
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MATFKRRKNNKKQDLILLRHEALEHYLMNKYNFNYDYAHKIVSKKYDYSIFIKKKVD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000899336.1|1138416_1139001_-	hypothetical protein	Q4ZE35	Staphylococcus_virus	2.0e-30	72.0
WP_000956747.1|1139046_1139298_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001791646.1|1139298_1139472_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000477492.1|1139426_1139531_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000006110.1|1140042_1140228_-	hypothetical protein	A0A0F6N3H3	Staphylococcus_phage	2.4e-19	78.7
WP_001788716.1|1140655_1140766_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000195429.1|1141293_1142466_+|transposase	IS256-like element IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	3.5e-135	100.0
WP_001002340.1|1142798_1143005_-	hypothetical protein	A0A2H4PQT0	Staphylococcus_phage	1.3e-13	59.7
WP_001789892.1|1143298_1143523_-	hypothetical protein	A0A1W6JNK0	Staphylococcus_phage	4.3e-18	71.0
WP_001789891.1|1144210_1144408_-	hypothetical protein	A0A1W6JNK0	Staphylococcus_phage	1.7e-10	48.4

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP018629|1402536:1411009|DBSCAN-SWA
CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAGAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGTGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCGATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCAATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTACCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCGTAAAAACTTGGAAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACAGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCAGGCCCCATAAGCACATGGTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGCTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCTACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAATCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCTGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCTATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGATCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGAAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC

Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP018629|1402536:1411009|1404126_1405611_-|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA
MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV
>NZ_CP018629|1402536:1411009|1405589_1407779_-|WP_000032727.1|DBSCAN-SWA
MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD
>NZ_CP018629|1402536:1411009|1403105_1404134_-|WP_000030812.1|DBSCAN-SWA
MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV
>NZ_CP018629|1402536:1411009|1407771_1408443_-|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA
MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV
>NZ_CP018629|1402536:1411009|1408444_1408708_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA
MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA
>NZ_CP018629|1402536:1411009|1410526_1411009_-|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA
MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ
>NZ_CP018629|1402536:1411009|1402536_1403103_-|WP_000238664.1|DBSCAN-SWA
MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK
>NZ_CP018629|1402536:1411009|1408707_1409412_-|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA
MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK
>NZ_CP018629|1402536:1411009|1409415_1410540_-|WP_001010412.1|DBSCAN-SWA
MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000238664.1|1402536_1403103_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	6.1e-29	40.1
WP_000030812.1|1403105_1404134_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.3e-61	41.4
WP_000483713.1|1404126_1405611_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	3.2e-45	31.7
WP_000032727.1|1405589_1407779_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	1.0e-140	39.7
WP_000666799.1|1407771_1408443_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase I	NA	NA	NA	NA
WP_000848350.1|1408444_1408708_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_000174053.1|1408707_1409412_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4R1E8	Synechococcus_phage	7.3e-48	42.1
WP_001010412.1|1409415_1410540_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_000861572.1|1410526_1411009_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	6.2e-22	44.7

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP018629|1430995:1458557|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001804449.1|1436046_1437258_-	isochorismate synthase	NA	NA	NA	NA
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WP_001795544.1|1445017_1445308_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_000668623.1|1446033_1446354_-	YxeA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000870806.1|1446356_1448321_-|bacteriocin	bacteriocin-associated integral membrane family protein	NA	NA	NA	NA
WP_001790097.1|1448364_1448637_-|bacteriocin	lactococcin 972 family bacteriocin	NA	NA	NA	NA
WP_001790623.1|1448646_1448748_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001033867.1|1449664_1450267_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_000214898.1|1450281_1450458_-	YkvS family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000668820.1|1450656_1451643_+	lipoate--protein ligase	NA	NA	NA	NA
WP_000876826.1|1451723_1451942_-	IDEAL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000287265.1|1452151_1452721_+	competence protein ComK	NA	NA	NA	NA
WP_000414177.1|1453207_1454719_-	bifunctional metallophosphatase/5'-nucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_000021864.1|1454857_1456216_-	TrkH family potassium uptake protein	NA	NA	NA	NA
WP_000455278.1|1456232_1458557_-|protease	serine protease	W5SAB9	Pithovirus	2.8e-11	27.4

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP018629|1578227:1593035|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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MTDDNIDDHIVKNHLEMIVDRVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000771365.1|1579137_1579665_-|coat	spore coat protein	Q4ZE87	Staphylococcus_phage	1.6e-87	96.0
WP_000448776.1|1579715_1579934_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000846279.1|1579951_1580530_-	hypothetical protein	A0A2H4JBG0	uncultured_Caudovirales_phage	3.3e-30	40.0
WP_001190616.1|1580541_1580883_-	hypothetical protein	Q4ZE66	Staphylococcus_phage	1.6e-56	98.2
WP_001019783.1|1581331_1581973_-	hypothetical protein	Q4ZE67	Staphylococcus_phage	2.7e-113	94.8
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WP_000432707.1|1582919_1584377_-	hypothetical protein	A0A1W6JQD6	Staphylococcus_phage	1.4e-279	96.7
WP_001002691.1|1584393_1585263_-	hypothetical protein	A0A1W6JQL5	Staphylococcus_phage	4.2e-162	96.9
WP_001103946.1|1585350_1585644_-	DUF1474 family protein	A0A1W6JQH0	Staphylococcus_phage	1.8e-24	61.8
WP_001058492.1|1585646_1585856_-	hypothetical protein	Q4ZE76	Staphylococcus_phage	7.7e-30	95.7
WP_000784885.1|1585848_1585995_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001138298.1|1586006_1586279_-	winged helix-turn-helix domain-containing protein	Q4ZE77	Staphylococcus_phage	3.4e-46	100.0
WP_001063624.1|1586279_1586492_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	Q4ZE78	Staphylococcus_phage	3.4e-33	98.6
WP_000142630.1|1586641_1587376_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	Q4ZE79	Staphylococcus_phage	8.5e-132	98.4
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WP_000733773.1|1588302_1589031_+	staphylococcal enterotoxin type K	A0EX09	Staphylococcus_phage	2.4e-22	32.3
WP_000264182.1|1589118_1590339_+|integrase	site-specific integrase	Q4ZE80	Staphylococcus_phage	3.5e-98	47.3
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1590483:1590501	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_000571218.1|1592009_1593035_-	methionine ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.2e-27	36.8

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP018629|1631732:1640342|DBSCAN-SWA
CATGACCCAAGTACATTTTACACTGAAAAGCGAAGAGATTCAAAGCATTATTGAATATTCTGTAAAGGATGACGTTTCTAAAAATATTTTAACAACGGTATTTAATCAACTAATGGAAAATCAACGAACAGAATATATTCAAGCAAAAGAATATGAACGAACAGAAAACCGACAAAGTCAACGAAATGGCTATTATGAGCGCAGCTTTACGACACGTGTAGGCACGCTAGAATTAAAAGTACCCAGAACACGTGATGGCCATTTTTCACCCACAGTGTTTGAACGTTATCAACGAAACGAAAAAGCCCTCATGGCTTCAATGTTGGAAATGTATGTATCAGGCGTTTCAACTCGTAAAGTATCAAAAATTGTGGAAGAACTTTGTGGTAAATCCGTCTCTAAGTCCTTCGTTTCTAGCTTAACAGAACAGCTAGAACCTATGGTTAACGAGTGGCAGAATCGTTTATTATCAGAAAAAAATTATCCTTACTTAATGACCGATGTACTCTATATAAAAGTACGAGAAGAAAATCGAGTACTCTCAAAAAGCTGTCATATAGCGATTGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTAAGTTTTTTAGATTGTTATATTACTATGTATTCTTAAATTTGTTTAAAAAATTAATGCTTTAAATTGATGTATAATGGGAATAAGAAATAAATAAAAACGACCCGCACGATTAACGTACGGGTCCACTACTAAAGGGAGTCAAATTTTTACCTTCGTTTGTATCATGCAGCGTTTTACACATACTTTTAAGAGATGTTTATTCGTTATCGAAGGTACACCTTTATTATAACTTATATCATTTTTATTAAAATACAATTCAAAAAAAGTTATTGACATATTATTGTCTAAATAATGTATAACCTTTGAACAACAATAATGATTATTAAATAGTAACTAAATACAAAATTACATGGGGTGAATGATAATGAAACAATACTTAATTACTGGTGGGACTGGTATGGTTGGATCTCAATTAGTTAATGAAATTAAAAAATCAGATTCACATATCACGATATTAACGCGACACGACCAAATTTCAAATGATAAGAAAATTTCATATGTCAACTGGGCTAAATCTGGGTGGGAACACAAAGTTCCTCAAAATATCGATGTGGTCATCAACTTAGCAGGTGCTACATTGAATAAACGATGGACACCGGAATATAAACAAACGCTAATGCTAAGTAGAATTCAATCTACGCAAGCTTTATATGAATTGTTTAAATCACGTAATAAAGCACCTAAAGCTTTATTTAATGCTAGTGCCACTGGTTACTATCCTCCTGATTTATTTATGAGTTACACAGAAGTTTATAAAACTTTACCTTTTGATTTCTTATCAGATATTGTGTATCAATGGGAACGTTTCGCACAACAATTTGAACAATTAGGTACACGAGTTGTCATCGGTCGTTTCGGTATAATTTTATCGAATGAAGGCGGTGCGTTACAAACAATGAAACTACCATACGAATATTACATTGGTGGTAAATTAGGTTCTGGTCAACAATGGTATTCATGGATTCATATCAATGATTTAATTCAAGCTATTTTATTTTTAATAAATAACGAGTCAGCTAGTGGTCCGTTTAATTTAACTGCACCTATACCTGAACGTCAAAATTTATTTGGCTACACTTTAGCAAGAGCTATGCATAAGCCTCATGAAACTTGGGCACCAAGTCTTGCAATGCGTCTCATACTTGGTCAAATGTCAACAGTAGTATTGGATACTCAAAAAGTATTACCTAATAAAATTCAAGCATTGGGATTCCAATTTAAATATAGTAATTTAAAAATGGCACTTGAAGATTTAATTAAAGAATAATCAATACCATTAATGAGCATTAGAAACAACATATGTACTAAATGTAATGTCTAGAGCGACTTACAAACAAAGGATTGAAATGTTCCTTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAACATTTCATATAGTTACGGTTCAACTAGCTTCATTCAATCATATTTCCGCTCAAAGTATAGTAAACAAATTATTGACACCTTGGTTTACTCATACAAAAAGAGCAGACAGCTTAGTCTACTCTTTACTTTGAATTATTTTGTTTCAGGTACCATCACTTCATCAATTAAGCCATATTCTTTAGCTTCTTCTGCAGTTAAGAAGTTATCACGATCTGTGTCTTTTTGTATTTTTTCAATACTTTGACCAGTACGCTCTGATAAAATGCGGTTTAATTTTTCACGTGTTTTTAAAATGTGATTTGCAGCAATTTCGATTTCAGTTGCTTGTCCTTGAGCACCACCTAATGGTTGGTGAATCATTACTTCTGCATTTGGTAACGCGAAACGTTTACCTTTTGCACCAGCTGCTAATAAGAATGATCCCATTGATGCAGCCATACCGATACAAATTGTTTGAACATCAGGTTTAATGTGTTGAATTGTATCATAAATCGCAAAACCAGCTGTTACACTTCCACCTGGTGAATTAATGTATAAATAAATATCTTTCTCTGAGTCTTGCGCTTGTAAGAATAATAACTGTGATACGATTGAATTTGCTACGTTGTCATCAATTTGTGAACCTAACATAATAATACGGTCTTTTAATAAACGTGAGTATATATCATATGCACGTTCACCGCGGTTTGTTGTTTCAATAACTGTAGGAATTAAATTCATCTATATTTCCTCCTTGTAATAACTGTTACTCATTATTTTACATATTAAGTCAAATTTGGTCAAACACTTTGACTTTAAATAGTTACATTGTTTGACGCTTTTCTCTTTCCTTTGTAAACTGATAATATCTATTTTAGATTGTACTTATTTTACTTCTCATAGTACAGAGATATGATTACATATTTGCTCCTTGTGGTGTAATGGATAACACGTAAGATTCCGGTTCTTAAGATAGGGGTTCAATTCCCTTCAAGGAGGCTGTTTTAATAAAATACAATACTTTTCAATACAGAGAATCCCGCAATGTCGGGATTCTTATTTATGCTGATTTTGTTTTTGTCTATGATCAGGGACTTTCAGGGACTCAATTAATTATCACATTCATATTTTCTTATGACCAAATTGATACATATGATGCTATTTAATGAGAAAATTAGGCATCACTTGGTTATTGAATTTCCTTCATTAAACTTTCCAGCTCAATTTAATAGTTAGTCGACTATTATTCATTAAACACTTTTTAATCATAAAAAAGTGTTTTTGATAATTCACTACCAAAAACACCTTCTTACTTATAATTCTATTTGTTCACCATTTCTAATCTTATCGGCTAAATCATTCAGTTTTCTTAATCGGTGATTTACACCTGATTTTGAAATTGGACCAGTTGATACCATTTCTCCAAGCTCTTTCAACGAAATTTCTTGATGTTCTACTCGAATTCTAGCAATCTCTCTCAACCTGTCTGGTAAATTTTCAATACCAATTTCTTTATCAATCAATTTAATGCTCTCAACTTGTTTCATCGCAGCACTAACTGTTTTATTTAGATTGGCCGTTTCACAATTAACGAGTCGGTTAACAGAATTACGCATATCTCTTACAATACGTACGTCTTCAAATTTTAATAACGCTTGATAGCCACCTATCAAACTAAGAAAATCCGAAATCTTTTCCGCTTCTTTTAAATACGTAATACTTCCTTTTTTTCGCTCTAAATGTTTTGCATTCAACTCATAACTATTCATTAGTTTCGTTAAGCCTTCTGCATGACTCTCATTTTGAGAAAAAATTTCCAAATGGTACGAAGATGTTTCAGGGTTATTCACTGAGCCACCTGCCAGAAAAGCTCCTCTCAAGTAACTGCGTCTCATTTCGTCATCTTGAATCATTGAATGATCAATTTCATGCGTAAAAATGCCGTCTTTTAAAATTCCTAATTCATCAAGAATTTCTTTCGCTTTCATCTTTGTACGACAAATATAAATATTATTTTTTTTAAGTTTCATTTTTTTACGGACTAATATTTCAACTTCCACATTAAAGACACGTTTAATCAACGAATAAATACGTCTTGCCGTTGTTGCATTTTCCGTTTGAACATTTATAACAAATTGTTGATTTGAAAGACTAAGTGCACCATTCATTCGAATCAGTGCACTGAGCTCTGCTTTTGCATTCATTTCATCGACGTCTATTCTAGTTAATTCATTTTTCATTTCTGATGCAAAGCTCATCGTACAGTCATTCCTTTCTTATTTAAAACATGATTCACCTTAGAACCACTGTCTATTTTCATTTTTTTCACAGCTCTATTATCATATCATAATATGATTACGTTCTATATTATTTACGTTTATCACTTGGTACGAAAGGAATAGTACTAATTAATTCTAAAGCTATGTCATAAATCATTGTCGATAACACTTTAGTATTATGTCTTACTAAATGATTTTCAGAAATTTCAACTAAATTTGAAGATGTTTTTACATTTATGCTTTCTTTTTCAAGTTCAGCCTTATTAACTTCAACTGGTTTAGAATGTTTTTCTTCATATTTTTTCAAAACTTGAGCATTGAAAGTTTGTGTACTACAAATGACATAATCAATAAACGGTTGTCCAGCTTGTCTATGAATCGCATCGATATGATCTTTCACGCTATAACCATCTGTTTCCCCAGGTTGCGTCATCACATTAGAAACATATAGCTTAGGCGCATCAGAATGAATTAACGCATCTGAAATACCATTCACACATAAGTTAGAAATAACGCTCGTATATAATGACCCTGGTCCAAGAACGATTAAATCTGCTTCCCTTAAAGCATCGATTGCTTCTTCCATTGGTTGCACATCGTTAGGTTCTAAAAACACACGATCAATTTTTTTATGTTTTTTAGGAATATTTGTTTCTCCAAAAACAATTTCTCCATCTTCCATAACAGCATTTAATTGCACACTTGTATTTGTAGATGGAATGACTCTACCTTTAATATTTAAAATTTTACTTAATGCTTTAATGGCATGTCCGAAATCATTCGTAATATTAGTCATACCTGCGATTAATAAATTACCTAATGAGTGACCGCTAATTTGATTTTCTTCAAAGCGATACTGAAAAAGTTGGCTTAAAACTGACTCAGAATCACTTAAAGCTGCAATCACATTTCTGATGTCTCCTGGTGCTGGTATATCCATTTCATCTCTGATTTTCCCTGTACTCCCACCATTATCAGCAACTGTTACAATCGCCGTAATATCAATTGGGAATTCTCTTAATCCCCTAGCCATAACTGATAAGCCAGTGCCACCACCGATAAGTACAACTTTTATTTGTCTCATTTTTTCTCGCCACTTTCAATATGTGCGTCCCTATGATGCACATAAACATTATATTCAAATACTTCATTTAGATAATTACCTAGTCGTTCTGCTAATGCTACAGATCGATGTTGTCCACCCGTACAACCGATGGCAATTACTAATTGAGATTTCCCTTCTTTTTTATACCCGGGTATCATAAAATCTAACAAATCAGTTAATTTTTCAAAGAAAATCTCCGTCTCTTTCCATTTCATAACATAATTATAAACGTCTTTATCTAATCCTGTTAAAGGTCTTAAATCTACTACATAATATGGATTTGGTAAAAATCGTACATCAAATACTAAATCTGCATCCATCTGAATCCCATGTTTAAAACCGAAACTTGTGACATTAATTGTAAAAGTTTCAAACTCTTCATCTTCATAGTATCGACGAATGCGTTCTTTTAATTCTTTAGGTGATAACTTTGTAGTATCTATAACAAAATTAGCTATACTTCTAATTTGAGACAAATGCTCTCGCTCATCATTAATTGCATTGATTAACGATCTTTTACCTTGTTCCATCAAAGGATGTGCACGACGCGTTTCCTTATATCTTGAAATTAATTTTTCAGTACTTGCTTCTAAAAACATAACATCAATGATGACGTCACTTTCACTTTTGACTTTATCCACTACTGCAACTAATGAATTAAATAGTTCCTTACCTCTTAAATCAATTGCAATTGCCACTTTTCTTAAGGATGGATTTCCTTGTTCCATCAACTCTACAAATTTAGGCAATAACACTGGTGGTAGATTATCTACACAAAAATATCCCATGTCTTCTAAACATTGAATAACCAAAGATTTACCTACGCCAGATAAACCTGTTACAACTAATAGTTCACTTTTACTTTTTTCTTTTTCATTATTATCCATTATTTTTTCACCGCCAAAACGAATTTCATGATGTTAATTTAAATGTTCTATGACAAAATTAAGCAACGATGTTTTATATTTATTTCCAACTATGTCTAGATTAAATTTCTAAAAATATACATCATTTAAAAGGAGCTTGGGACATAAATCAATGTCCTAGGGTCTATAATATTATATTGCTAGTAGTTGACTGAATGAAAATGCGCTTGCAACAAGCTTTTTTCAACTCTAGTCAGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGGGTGGGACAACGATAAAGTAATACTTTTTCTATAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTTTTACTCATGTATTCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGGCTAATGTTTAAGAACCACTACATAATAAATCATTAGTGGCTCTTTATCATTTCTGTCCCACTCCCATAAAGTTATAAGTTTAATATAACATATAAAAAAACTAGAACTCATTGAAACGCACAAATGATACGTACTAAGTTCTAGTTTTCTATATAATTTGCTTTAATTTAAAAGTAAGACATTATTTTAACGCTGTGATGACACTATTAAAATAAATATCCAAATAATTTACAGCTCAACATCTTAATTCGACTTCGAATTAAGCTTGATCGTTTAAATGTTCAATATATTCCGCTGCACTTTGCGCTGCAATACTACCATCGCCAGTAGCAGTGACAATTTGGCGTAAACCTTTGTCGCGAACATCTCCTGCTGCAAAAATACCTGGTACTGATGTTGTCATATCATCTTTTGTTACAATATAACCAACATCATTTGTAATACCTAAGTCTTTAAATGGCGCTGTTAATGGTTTCATACCAATATAGATGAATACACCATCAGCCTCGTGTGTTTCTTCTGAACCATCTTTTGTAGACGTTAATGTCACAGAACCCACTTTGCCGTCTTTTTCATTAATTGATTTCAAAGTATGACTCCAAATAAAGTCGATTTTATCATTTTTGAATGCTCTATCTTGTAAAATACGCTGTGCACGTAACTCATCACGACGGTGAACGATTGTTACTTTGTCAGCAAATTTAGTTAAGAATGTTCCCTCTTCTACTGCTGAATCACCACCACCGATAACGAATAGGCGTTTATTTTTAAAGAATGCACCATCACATACTGCACAATAACTTACACCGCGTCCACCAAGTTCTTGTTCACCCGGAACACCAATTTTCTTGTATTCTGCACCTGTAGCAATAATAACCGCTTTCGCTGTTAATTCTTTATTACCAAAGTTAATCACTTTATATTCGCCTTTATCTTCTACAGATTTAATATCTCCATATTGATAAACTGCACCAAACTTTTTAGCGTGTTCAAACATTTTTGTAGATAAATCTGGACCTGTAATCATTTCGAAACCAGGGAAGTTCTCTACTTCTTCTGTATTAGCCATTTGACCGCCTGGAATACCTCTTTCAATCATAACTGTTTTTAAATTAGCACGTGATGCGTATACTGCAGCAGTCATACCAGCTGGACCTGCACCGATAATTGCTATATCAAAATCTATTTCAGTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP018629|1631732:1640342|1631732_1632905_+|WP_000195429.1|transposase|DBSCAN-SWA
MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK
>NZ_CP018629|1631732:1640342|1636679_1637675_-|WP_001248939.1|DBSCAN-SWA
MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK
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MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK
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MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR
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MVINEIDFYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIS
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MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ
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MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY
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MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_000876318.1|1674509_1675481_-	ABC transporter permease	A0A2H4IY97	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-139	78.9
WP_000499195.1|1675519_1675675_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000562498.1|1676188_1677160_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A2H4J4P3	uncultured_Caudovirales_phage	4.2e-171	91.3
WP_000855505.1|1677277_1679383_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4J2N6	uncultured_Caudovirales_phage	0.0e+00	91.7
WP_000692521.1|1679345_1679744_-	class Ib ribonucleoside-diphosphate reductase assembly flavoprotein NrdI	A0A2H4J545	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-52	72.0
WP_001068497.1|1680544_1681411_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_000930014.1|1681430_1681931_+	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	E7DN65	Pneumococcus_phage	5.9e-52	71.5
WP_000193751.1|1682271_1683777_+	peptide MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	2.0e-58	32.2
WP_001790641.1|1683854_1683956_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000429014.1|1684046_1684964_+	diacylglycerol kinase family lipid kinase	A0A1V0SBJ0	Catovirus	3.7e-07	22.0
WP_000197271.1|1685586_1686129_-	5'-3'-deoxyribonucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_000663030.1|1686479_1687538_-	histidinol-phosphate transaminase	A0A1X6WGT4	Pacmanvirus	7.9e-22	26.7

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP018629|1699510:1707330|DBSCAN-SWA
ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTCACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTGCGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTATTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATACTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTGCTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAGCATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCATGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACCGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCATCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGCAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTGCAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATTAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAAACGCCCTCCTCTTATTTTGACCCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGCTGGTGCTGTTATCACAACATTAGCTTTAGGTGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAACACCTAACAGGTACATTCAGTTCTAAAAACGGTGAAACTGTTGAAGGTAAAGCTGAGATTAAAAATGGTAAATTAATGCTTACTAACTACAAATCATCAAAAGGTCCAGATTTATACGTCTACCTAACAAAAAATGGCGACATTAAAAACGGTAAAGAAATCGCAATGGTTGACTACGATAAAGAAAAACAAACATTTGATCTTAAAAATGTAGATTTAAGCAAATATGATGAAGTAACAATCTATTGTAAAAAAGCTCACGTCATCTTCGGCGGCGCTAAATTAAAATAATCAATTTCTGAGTTAAACTTTTATTTACAACATACTATTACTATACATTACAAATTTTTAAAATATACATTACACTCATTACTCAATGGAAAGCGTATGATTTCACAGCCCCCCTAGCTTGTAGAAATCATACTTTCCTTTTTTCAATATATATACAACTATTAAATCCCATAAGATTGCAGAGCACATAAGTAAATTTTTTTAGAGCTTGAGGTTTGTTTAGCTTAAGCAACCCATGAGCTCAAACACTTCCTGTTCACATAACACTACAAATCGCATTATGTTGCTTAATCTTATGTTTATATAAATTACACACAATAAATAGAAAGAATGTGAACATCATGAATAAATTATTGCTACTCGTTACATTTATCATTCGTGTGGGTTCAGGTATTGTTATGTTAATGCAAGGCTACGAAAAATTAACGGGCGGATTTACGCTGAAAGGTTTAGTACCAGTCATCGCTAACAATACTGATTCACCAGAGTGGTATAAGTGGTTTTTCGCAAATATAGTTGCACATACGACGTCATTATTTGATATTGTTGTCCCACTCGGAGAGATTGCAATTGGATTAGGTTTAATTTTTGGAGTTTTTGCATATGCTGCTAGTTTCTTTGGAGCCTTTGTTATGATAAATTATATCTTAGCAGATATGATATTTACGTATCCTCTTCAATTAACTTTCTTTATCCTTTTACTAATGAGTCACTCATTGTTAAAACAGATTTCACTTAAAGAAATCATTAATTACTTTAGAGGTCGTAAGAACAGAGGTGAAAAAATAGATGACCCACTTACTGATCGTGGATGATGAACAAGACATTGTAGACATTTGTCAAACCTATTTTGAATATGAAGGTTACAAAGTAACAACGACAACTAGCGGTAAAGAAGCAATTTCTTTACTATCAAATGATATTGATATCATGGTACTTGATATCATGATGCCAGAAGTTAATGGTTACGACATTGTCAAAGAAATGAAAAGGCAAAAATTAGATATCCCCTTTATCTATTTAACTGCCAAAACACAAGAACATGATACCATTTACGCCTTAACTTTAGGTGCAGATGACTATGTCAAAAAACCATTTAGTCCAAGGGAACTCGTTTTACGTATTAATAATTTACTTACAAGAATGAAGAAATACCATCATCAACCAGTTGAACAACTGTCGTTTGATGAATTAACACTTATTAACTTAAGTAAAGTTGTGACTGTAAATGGTCACGAAGTCCCTATGCGTATTAAGGAATTTGAGTTATTGTGGTATTTAGCTTCTAGAGAAAATGAAGTTATTTCTAAATCAGAATTACTTGAAAAAGTTTGGGGATATGACTATTACGAAGATGCTAATACCGTGAATGTCCATATACACCGTATTAGAGAAAAATTAGAAAAAGAGAGCTTTACAACATATACCATCACAACTGTATGGGGATTAGGATATAAATTTGAAAGGAGCCGATAATGGTGTTATCAATTAGAAGTCAAATCATTATTGGCGTCGTATCGAGTATACTATTAACTTCAACTATTTTAGCAATTGCATATATTTTAATGTGGTTTAACGGCCATATGACACTAACTTTGACCTTAACGACAATAATTACAAGCTGTTTAACCTTATTAATATGTAGTATTTTTATTAATCCACTTATACAAAAAATTAAGCAGTTTAATATAAAAACTAAGCAATTTGCTAACGGAAATTACGCAAGCAATGATAAAACGTTTAATTCACCAAAAGAAATTTATGAATTAAATCAATCTTTTAATAAAATGGCTTCTGAAATTACGCAACAAATGAATCAAATTAAATCCGAACAACAAGAAAAAACAGAACTGATTCAAAACTTAGCCCATGATTTAAAAACACCTTTAGCAAGCATTATTTCATATTCTGAAGGACTACGTGATGGTATAATCACTAAGGATCATGAGATTAAAGAGTCATACGACATATTAATTAAACAAGCAAACAGATTATCAACATTATTTGATGATATGACTCATATTATCACTTTAAATACAGGTAAAACATATCCCCCAGAATTAATACAACTAGACCAATTACTTGTATCAATATTGCAACCATATGAGCAACGTATCAAACATGAAAACCGCACATTAGAAGTGAATTTCTGTAACGAAATTGATGCATTTTATCAATATCGAACGCCACTTGAGCGTATTTTAACAAACTTACTTGATAATGCGCTAAAATTTTCAAATGTTGGTAGTCGCATTGATATTAATATTAGTGAAAACGAAGATCAAGATACTATCGACATTGCTATTAGCGATGAAGGTATTGGCATTATACCAGAACTACAAGAACGTATATTCGAACGTACATTCAGAGTAGAAAACTCTCGTAATACAAAAACGGGTGGTTCTGGATTAGGCTTATATATAGCTAATGAACTCGCGCAACAAAATAACGCAAAAATCAGTGTAAGCAGTGATATAGATGTAGGAACTACGATGACTGTAACATTACACAAATTAGACATTACGTCATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_13

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MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR
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MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQPLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV
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>NZ_CP018629|1699510:1707330|1706274_1707330_+|WP_000244412.1|DBSCAN-SWA
MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCNEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENEDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS
>NZ_CP018629|1699510:1707330|1702682_1703396_+|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA
MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV
>NZ_CP018629|1699510:1707330|1704358_1704799_+|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA
MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK
>NZ_CP018629|1699510:1707330|1699510_1700662_-|WP_001217785.1|DBSCAN-SWA
MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHAMCTHSLAKDDIYAAAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKYHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_001217785.1|1699510_1700662_-	anthranilate synthase component I family protein	A0A0B5J984	Pandoravirus	1.6e-23	35.7
WP_000604514.1|1700645_1701239_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	4.4e-38	42.9
WP_000446724.1|1701589_1702258_+	7-cyano-7-deazaguanine synthase QueC	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	9.6e-66	57.5
WP_000941338.1|1702259_1702679_+	6-carboxytetrahydropterin synthase QueD	S4U060	uncultured_phage	3.7e-07	28.7
WP_001062972.1|1702682_1703396_+	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	A0A1U9WRB6	Streptococcus_virus	6.5e-52	43.5
WP_000637687.1|1703494_1704079_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001093553.1|1704358_1704799_+	DM13 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_001037807.1|1705140_1705614_+	DoxX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000149344.1|1705588_1706275_+	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_000244412.1|1706274_1707330_+	HAMP domain-containing histidine kinase	A0A1V0SGX0	Hokovirus	2.1e-14	30.0

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP018629|2032556:2040723|DBSCAN-SWA
AATGACAAATATCTTCGAAAAAATCGTAAATGATTTAAATTTAGAACAAAAAGATGTTGTGGAAAGTGAAGATAACCTTTATGTAAATGCATGTCCTGGGAGTGGGAAAACAAGGGTACTTACAAGGAAAATTGCTTACCAAGCAATTAAACACGATGGATCACTAAAAAGAATAATTGCTATCACATACACTAATAGAGCTGCTGAAGAAATTAAGGAACGCCTAAGTTTACTTAGTATAGATGATGATATTAATATTTGGGTGGGGACAATACATCAGTTTTGTCTTGAATTTATTATTTATCCTTTTAAAATGAATCTCTCAAGAGTATCAAAAGGATTTACAATTATTGATGATTATACTCAAAGAGCTTACGTCAGCCAAATTAATAATATGCTGAATTTAAATCTCAAAACGTATGAACTGAACAAAATTGATTTGTCACTTTCTCATGATTTTAAAATTAATGAAGTTCAGTATACTCAAGTTTCTGAAATGTATCACACTATGTTGGAAAAAAATAAAGAAATTGATTTTGATATGATTTTACTAGTAGCGTATAAAATTTTAACTGTAAACAGTAACGTTGCACGTAATATTGCTAGTAATATAAGGGCGATTTATGTGGATGAATTTCAAGATACTAGAGAATTACAATACAATGTAATAGCTAAATTACTTCAAAACAACCCTCAAATTCAGTCAATGTTTGTTGGAGATATTGACCAAGCAATTTATGGATCATTAGATGGTATAGCTAAATCAGTTGAAGAACTAGAAATGCTAACTAGTCACACTTTTCAATCAAAGACGCTACATGGCTGTTACAGGTCTAATCAGAGATTAGTAGACTTCTACTCTAATTTTCAGAGTTGTCCTTACGAGATTGAAAGCAGAGGGAATAATAAAAACGACCGTGGTTTTATAAGTTATGATTGCAAAGTTACTAAGGAGGATTTACCCAACATAATAAAAAATATAATAAAGGAAAAGATTGAAAGCGGCATTCATGAAAAAGATATTTGTGTACTTGCTCCTCAACACTATCCTCTGTTTTCACTGGGTGAGTATTTAAAGAAAGAATTACCGTATTGCAATTTTGATGCTATAAATATATCACCAATTAAGGTAAATAATCATAGTTTATTTTTCAAGTTAGCAATTTTGTACTTTACTGAATCAGGTGAAAAGGTTCGAAGAAAAAAGCTAATTGCAAACGATATTTTAATTATATTAAAAAATGAATTTGGAATAGAAGTTAAAGATTATTTTATTGACTTAGATTTATTACAGCTAATAAACAGTGTGAAAAGAATGTATAGTGGAGACGACAACGGTGTTGATTTATACAAATTTGTTACCAAACATATATTTGTTAATCTTAATATTGACGAGAAAAATTACCCGTCTATTTTTAAGCACTATCTATTTTTTATTAACGAAGTAGAAGATCGGATAAAAAATAATTCATTATCTAGTAGTGTATCTAGTTTTAAGAAGATGTTTAAATCTCGAGATGGTATCACACTTACTACAGCACATAAAGTTAAAGGAAATGAGTATGATACTGTTATCGCTATTAATCTTCTAAACGGGAAAATTCCTCATTGGAATGAAATTTTTAATGTTTCTGATAAAGGAATTAGTTCAGCGAGAAAACTACTATACGTAATTTGTTCAAGAGCAAAAAATAATTTATTTCTTTTCTCAGAGGTGGGTTATTTTACGAGTAAAGGAGACTTGCTTTATCCCACTCAATTATTAGATAAAATAGAATTTGATTATAATATTTAAAATACCTAGGTAGTCGTTGTTTTAAATATAGTAGGAATCGGACGCTCAGTACGGAGCGTCTATTTTTTTACCCAATTTTGAAAGGAAGTGAACTTATGAAAATAAAAAACCAAGAATCAAAAGGTCGCTCTCCCCCCTTTAAAACCATCACACAAATAAGATTCATTCAAACATAAAAACAGAAAGGATAGGTAAAAATATGGAACTTAAATATGTCATTCCCAATATGGAAAAAACATTTGGACAATTAGAATATGCTGGTGAAGGGAACATTGAACAACGTCGAATAAATGGCAGACCAACCATTCTCTCTCGTAGTTACAATTTATACTCAACGATTCAACGAGCAGATGATATTGTTGTCATTCTTCCCTCCGAAGCTGGCGAGAAACATTTTGAATCCGACGAAAAAGTCAAACTCATCAACCCACATATTACCGCAGAAGGTTATAAAATTGGCAATCGAGGATTTACCAATTACATTATGCACGCAGACGATATGGTGAAAGCATAAGAAAGGAAAGGTGAAAAAATATGAGATTAGCAGAAGGTATTGTGATTGAAAAAGACCAGACATTTGGCACATTGAAATTTTCCGCCTTGCGTCGTGAGGTTCGTATCCAGAATGAAGATGGTACGGTTTCCGAAGAAATTAAAGAACGTACCTATGACTTAAAATCAAAAGGACAAGGACGCATGATACAAGTCAGTATCCCCGCTTCTGTTCCTTTGAAAGAATTTGACTACAACGCAGAAGTGGAATTAATCAATCCTGTGGCAGATACCGTAGCGACGGCTACTTTTCGAGGGGCAGACGTTGATTGGTACGTGAAAGCAGACGATCTTGTATTAAAAGGACAGACAAAACCTCATCAGAAATATAAAAAAGAAGCGTCCGAAAGTGAAAAATAGGTGTTGCTTATGACAAACACACCATTGATTTTGAAAGAAATTCCGAAAGATGAAGCCATTTCTTTTATTCGGCAATACCATTATTCAAAGATACTCCCTAGATTGTGTAAATACTTTCTAGGGATTTTTTCAGAAGAAAAATTATTAGGCGTTGTGGAATTAGGCTGGGGTACGCAACCCCTACAAACCATACGCAAACTCTTTCCCGACAGTTCCCTTCAAACCACAGATTATTTAGAAATTGGAAAGATGTGTTTTCTTCCAGAAATGAATCAAACCAATTATTTTGGCAGTCAAGCTCTTTCAGCTCTAATTAAGTGGTTGAAAGAACATACGGACTGTCATTTTTTATATACACTGGCAGATGGAATTGAGGGAAAATGTGGCTATGTCTATCAAGCGTCCAACTTCTTTTACTGCGGGTATTTCAAGACAAGTGTCTATCGTGATAAGCAGTCATGGGAAAAGATACACCCTCGAAGTGCTCGCCTTTTATTAGAGGAAAATGCTCGCTTTGAACAGGTAGAGAAAAAGCATTGGCTTTCCCAGGCATTTTGCGAATACAAAGGGATTGAGAAAATCAATGGACGCATGTTTCGCTATCTCTATCCGTTGACAAAAGAAGCGAAAAAACTGTTAGGACACACTCTCTATCGACGTCATTATTATCCGAAAGAAAAAAATTTACGCTTTGAAAAGCGAATCGCTTATCAGAAATATGAAGCCATTTCTCAACCAACTTTTGATAAACAGGCTCGTATCTACAATACACAATTATTTTGATAGGTGGAAAGGAGGATTTTTATGCCATTGCTTCATGACAGAGGAGAGCGAATCAAAGCCAACGATAAGCACTTGGTCTATCATTTTGTACTAATTTCATTGCTGGTAGTTTTTCTAGTCGTCCTACTCCCTTTTCATTGGAGAACGTTACAATCGGTGAACTGGCAAGCAGTTCAGTTAGATACATTTTTCTATCAACTTCATACGCCATACTTTTGGAGCAGTATTCTCACTGCTCTTTTTGTATGCGGACTTATCAGCTGGCTTTATTATCACTATCGTATAGATTCTATAAAACAGTTAGAGCACCGTCAAAAGTTAGCTCGTATGATTTTAGAAAATCATTGGTATGAAGCCGAAGAAACTCAATCAGAGGGATTCTTTAAAGATTTACCCAGCAAGAAAACCAAACAACGAATCCGCCATTTTCCTAAAATATATTATCGAATGAAAGATGGACTAATCCATATTCATGTAGAAATCACCTTAGGGAAATATCAAGATCAGCTTTTGCACCTAGAAAACAAACTAGAAACAGGATTGTATTGTGAATTAGTGGAAAAAACGTTGAAAGATTCTTATGTAGAGTATGTCCTACTTTATGATACTATTGGCAATCGAATTGGCATTGAAGACGTGGTAGCTCAAGATGGACGTGTCAAATTGATGGAATCGGTCTATTGGGAGTTCGATTCTCTCCCTCACATGTTAATTGCTGGGGGCACTGGTAGTGGAAAATCCTATTTTATTCTCACATTGATTGAATCTCTCCTGCATACAAATGCAAAGCTTTATATTCTTGACCCTAAAAATGCTGATTTGGCAGACTTAGGGGCGGTCATGAATAATGTCTATTACCGTAAAGAAGATATGTTGGCATGTATCAATCAATTTTACGAAGATATGATTGATCGCAGTGAAACCATGAAACAACACCCTAACTATAAAACAGGAGAAAATTATGCTTATCTTGGTTTGTCTGCCAATTTTCTTATTTTTGATGAATATGTGGCAATGATGGATATGCTAGGTCGTGAAAGTACCACCGTTATTCATAAACTCAAACAAATTGTAATGTTAGGACGACAAGCAGGCTTCTTTTTAATTCTTGCCTGTCAACGTCCAGACGCAAAATATTTTAGTGATGGGATTCGGGACAACTTTAACTTCCGTGTGGCTTTGGGTCGTATGTCTGAAATGGGCTTTGGTATGATGTTCGGAAGCGATACACAAAAACAATTTTTCTTAAAACCCATCAAGGGAAGAGGTTACGTGGATACAGGAAAAAGTGTGATTAGTGAGTTTTATACACCCCTTGTACCAAAAAGGTACGATTTCTTAGGAGAAATAGGAAAAGTCATTCAAAAAAAGCAATCTGAGCCTGTACCGCACGAAGTGAAAGGTACAGGTTCAGACTTGCTTTGATTGGTGTGGCGTTAGCCACGCCAATCCTTTAGCCCCCTCTATCTAACAGGGGGGCACAAATACAACTGAAAACAGGCAATTCTCATCAACCAATGTTGATGGTACAAAGGATTGCGGAAAATATGAAAGGTGTAAACTCAAGGGTCATAGTTTACATCTTTTTTAGATTGGAGGTTTGCGAATGGAAAACGAAAAAATTTGGATTAAGGAATTGAAAGAAAAGCGACTGGCTTATGGCGTTTCTCAAAATAAACTGGCGGTTGCTTCTCATATTACCAGACCTTACCTATCGGATATTGAAACAGGCAAGGCAGTCCCTACTCAACAGGTGAAAGAAGATTTACTGAACGCTTTGGAACGCTTCAATCCCGATAACCCATTGGAGATGTTATTCGACTATGTACGGATTCGATTCCCTACCAATGATGTGGCTCAAATTATCGGTGAGGTTTTACGTTTGAATATGGATTATATGCTACACGAAGACTTTGGCTATTATTCTTATCCCGAACACTATCGTTTCGGTGATATTGTTGTCCTAGTCTCTCATGATGTAAGTAAAGGTGTTTTATTAGAACTGAAAGGAAAAGGCTGTCGGCAATTTGAAAACTTTCTATTGGCTCAACATCGGAGCTGGTATGATTTCTTTCAAGATTGCATGGAACATAAAGGTATTTTCAAACGCTTGGATTTAGCTATCAACGATAAAACAGGGATTTTGAATATTCCAGATTTGGCAAAGAAATGTAAACAGGAAGAATGCATTTCCGTCTTTCGAAGCTTTAAAAATTATCGCAGTGGTGAATTGGTTCACCGTGATGAAAAACCATACATGGGAAACACACTTTATATTGGCTCATTAAAAAGTGAAGTCTATTTCTGTATATATGAGAAAGATTATGAGCAATACGTGAAAAATGATGTTCCCTTAGAAGACGCAGAAGTAAAGAATCGGTTTGAAATTCGGTTAAAAAATGACCGAGCCACCCAAGCCATGAAAGATTTATTGGCACATCAACAGGCGGAAAAAACAGCCTTTGAAATTATCAATCGCTATATCCGCTTTGCAGATAAAGACGACACTAAACGTCGGAGTGATTGGAAAACTAATGAACGTTGGGAATGGTTTATCGGTAAAAATCGTGGAGCATTACGCCTAACCACACAGCCAGAGCCTTATTCTTTTGAACGAACATTGAACTGGTTACATCATCAAGTCGCCCCTACATTAAAAATCGCAAGCATTTTAGATGTTCTCAACGGTACAACCATTATCTCCACCATGATTCAGGAAGCCAAACTGACAGAAAAACATGAGAAATTAATTGAACAACAACATCTAGCCATGGAGGATTTGATTACATGAGCCTTTTAACAAAAGAATTAAAGAAGTTAGGGTTTCAGTGTGGCATTGAGTTTCAAGCGTATATACAAAATACAGGGAAATATACGTCTCTCATTATTGAGGGAAAACGGCAAGCTGGTGATACCATCTATACCTATGATTTTTACAAGGTGAGATTTTATAATAATTATACCAATCGAGTAACCGTCTATGGAGAGCATTTAACCCCTTTTCAATTATTAAGGCGTGTAAAAAGCTATATCTATTATCGAGAAAAATATCTTAAGGAAAGGAGGACAATCACATGAATTTTGGGCAGAATTTGTACAACTGGTTCTTGGATAATGCACAGTCATTGGTATTGTTAGCGATTGTTGTCATTGGACTGTTTTTAGGTTTTAAACGAGAATTTTCAAAACTCATTGGCTTCTTGATTATTGCTCTAATCGCCGTCGGACTTGTGTTCAATGCAGCTGGCGTGAAAGATGTGTTATTAAACTTATTTAACCGAATCATTGGTGCTTAACAGATATTTTTCATGATAAAATAGGAAGTATATATTTTGTTATGAAAGGATTTATGAATATGTTTACAAATGATCAATTTAAATCTCTTTTAATTAAAACATTAGAAAGAAAGAGCTCTTCAAATTATTATGAAGGAGGTAATGAGATTGTTTCTAAAATGAAAATATCAGAGGTAACTTTAGATGAGACTGACGATTTTACTTATTATAAAGGATATAAAAAGGGCTGGAATACGCTTTGCACATATCTTAAAATAAGAGTTCCTTTTGATGATTTAGACTTTTTTGAAAGTCATAAAGATTTGATTACCCAGACAGCAAGCTCCATATATGATAAACAAGGTGATAATGTATTAGTGGATACTATTTTAGTACCACTTCCAGAGAATTACGAAGTAATTAACTTTAGTCAGTTGAAAATTAGTGATGTGGTTTCACAAGCTATTGAAGACGCTGAGTCTTTTATGAGTAATGGTGAATATCAACGTGCCTTTGACAGAGTTCACACTGCTTTTCATGGATATTTAATTGAAATACTAAAAAAATATGAAATTACAGTTCCTAGAGACGAAAATCTATCTAAATTATATAGTAGGATACAACAATTAATTGAAAAAGAAATTCAACCTACTGAACTTGCTGATATAGTGAAGACAACGATAAGGTCATCAAATGGAATGATTAGCTCTCTTAATGAAGCAAGAAATAGGCATTCACTTGCACACCCTAATACAAATATTATTGGAAAGAGAGAAGCAAAACTAATAATAGGTATTTCAAGTACAGTTACAGATTATATTAGCGGATACCTTGATAAGTAGCGTCATTAACTGATTGCTACTTTTTTTATGACTATTTTTATAAAAAGGATGTGATAAGAATTGGAAATGAAAGTCTATGTGGCAAATTTAGGACGGTATAATGAAGGTGAATTAGTCGGAGCATGGTTTACTCCACCAATTGATGAGGAAGAAATGGCAGAAAGAATCGGTTTAAATGAGGACTACGAAGAATATGCAATACATGATTTTGAGCTTCCTTTTGATGTGGACGAATACACGCCGATTAGTGAAATCAACCGTCTATGTGAAGCCATTCAAGAAATCGAAGGTACACCTATTTATAATGAACTCAAAGAAATTCAAGGCATGTGGTTTAGTAGCTTGGAAGAATTACTGGAAAACAAAGAGGATATTCATTGTTATAGTGATTGTGATTCGATGGAAGATGTCGCCCGTTATTACGTGGAAGAAACAGGACAGCTTGGTGAAGTCCCTTCCAATTTACAAAATTATATTGACTACCAATCTTTGGGACGTGATATGGAAATAGAGGGTAATTACCTAGTTACCTCTCATGGGGTATTTGAATATTGTCAGTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP018629|2032556:2040723|2040222_2040723_+|WP_000425404.1|DBSCAN-SWA
MEMKVYVANLGRYNEGELVGAWFTPPIDEEEMAERIGLNEDYEEYAIHDFELPFDVDEYTPISEINRLCEAIQEIEGTPIYNELKEIQGMWFSSLEELLENKEDIHCYSDCDSMEDVARYYVEETGQLGEVPSNLQNYIDYQSLGRDMEIEGNYLVTSHGVFEYCQ
>NZ_CP018629|2032556:2040723|2036066_2037470_+|WP_001130245.1|DBSCAN-SWA
MPLLHDRGERIKANDKHLVYHFVLISLLVVFLVVLLPFHWRTLQSVNWQAVQLDTFFYQLHTPYFWSSILTALFVCGLISWLYYHYRIDSIKQLEHRQKLARMILENHWYEAEETQSEGFFKDLPSKKTKQRIRHFPKIYYRMKDGLIHIHVEITLGKYQDQLLHLENKLETGLYCELVEKTLKDSYVEYVLLYDTIGNRIGIEDVVAQDGRVKLMESVYWEFDSLPHMLIAGGTGSGKSYFILTLIESLLHTNAKLYILDPKNADLADLGAVMNNVYYRKEDMLACINQFYEDMIDRSETMKQHPNYKTGENYAYLGLSANFLIFDEYVAMMDMLGRESTTVIHKLKQIVMLGRQAGFFLILACQRPDAKYFSDGIRDNFNFRVALGRMSEMGFGMMFGSDTQKQFFLKPIKGRGYVDTGKSVISEFYTPLVPKRYDFLGEIGKVIQKKQSEPVPHEVKGTGSDLL
>NZ_CP018629|2032556:2040723|2034549_2034864_+|WP_000421279.1|DBSCAN-SWA
MELKYVIPNMEKTFGQLEYAGEGNIEQRRINGRPTILSRSYNLYSTIQRADDIVVILPSEAGEKHFESDEKVKLINPHITAEGYKIGNRGFTNYIMHADDMVKA
>NZ_CP018629|2032556:2040723|2035271_2036045_+|WP_000185761.1|DBSCAN-SWA
MTNTPLILKEIPKDEAISFIRQYHYSKILPRLCKYFLGIFSEEKLLGVVELGWGTQPLQTIRKLFPDSSLQTTDYLEIGKMCFLPEMNQTNYFGSQALSALIKWLKEHTDCHFLYTLADGIEGKCGYVYQASNFFYCGYFKTSVYRDKQSWEKIHPRSARLLLEENARFEQVEKKHWLSQAFCEYKGIEKINGRMFRYLYPLTKEAKKLLGHTLYRRHYYPKEKNLRFEKRIAYQKYEAISQPTFDKQARIYNTQLF
>NZ_CP018629|2032556:2040723|2034884_2035262_+|WP_001234191.1|DBSCAN-SWA
MRLAEGIVIEKDQTFGTLKFSALRREVRIQNEDGTVSEEIKERTYDLKSKGQGRMIQVSIPASVPLKEFDYNAEVELINPVADTVATATFRGADVDWYVKADDLVLKGQTKPHQKYKKEASESEK
>NZ_CP018629|2032556:2040723|2032556_2034350_+|WP_103067903.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP018629|2032556:2040723|2038832_2039123_+|WP_000055376.1|DBSCAN-SWA
MSLLTKELKKLGFQCGIEFQAYIQNTGKYTSLIIEGKRQAGDTIYTYDFYKVRFYNNYTNRVTVYGEHLTPFQLLRRVKSYIYYREKYLKERRTIT
>NZ_CP018629|2032556:2040723|2039119_2039341_+|WP_001009054.1|DBSCAN-SWA
MNFGQNLYNWFLDNAQSLVLLAIVVIGLFLGFKREFSKLIGFLIIALIAVGLVFNAAGVKDVLLNLFNRIIGA
>NZ_CP018629|2032556:2040723|2037651_2038836_+|WP_000426689.1|DBSCAN-SWA
MENEKIWIKELKEKRLAYGVSQNKLAVASHITRPYLSDIETGKAVPTQQVKEDLLNALERFNPDNPLEMLFDYVRIRFPTNDVAQIIGEVLRLNMDYMLHEDFGYYSYPEHYRFGDIVVLVSHDVSKGVLLELKGKGCRQFENFLLAQHRSWYDFFQDCMEHKGIFKRLDLAINDKTGILNIPDLAKKCKQEECISVFRSFKNYRSGELVHRDEKPYMGNTLYIGSLKSEVYFCIYEKDYEQYVKNDVPLEDAEVKNRFEIRLKNDRATQAMKDLLAHQQAEKTAFEIINRYIRFADKDDTKRRSDWKTNERWEWFIGKNRGALRLTTQPEPYSFERTLNWLHHQVAPTLKIASILDVLNGTTIISTMIQEAKLTEKHEKLIEQQHLAMEDLIT
>NZ_CP018629|2032556:2040723|2039382_2040162_+|WP_000675717.1|DBSCAN-SWA
MKGFMNMFTNDQFKSLLIKTLERKSSSNYYEGGNEIVSKMKISEVTLDETDDFTYYKGYKKGWNTLCTYLKIRVPFDDLDFFESHKDLITQTASSIYDKQGDNVLVDTILVPLPENYEVINFSQLKISDVVSQAIEDAESFMSNGEYQRAFDRVHTAFHGYLIEILKKYEITVPRDENLSKLYSRIQQLIEKEIQPTELADIVKTTIRSSNGMISSLNEARNRHSLAHPNTNIIGKREAKLIIGISSTVTDYISGYLDK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_103067903.1|2032556_2034350_+	ATP-dependent helicase	E3T5J8	Cafeteria_roenbergensis_virus	9.0e-26	23.8
WP_000421279.1|2034549_2034864_+	YdcP family protein	A0A1S5SF38	Streptococcus_phage	1.2e-42	77.7
WP_001234191.1|2034884_2035262_+	YdcP family protein	A0A1S5SF96	Streptococcus_phage	9.6e-47	76.4
WP_000185761.1|2035271_2036045_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001130245.1|2036066_2037470_+	DUF87 domain-containing protein	A0A1S5SFB5	Streptococcus_phage	7.5e-177	66.7
WP_000426689.1|2037651_2038836_+	XRE family transcriptional regulator	A0A1S5SEX3	Streptococcus_phage	6.3e-161	68.1
WP_000055376.1|2038832_2039123_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001009054.1|2039119_2039341_+	hypothetical protein	A0A1S5SEY0	Streptococcus_phage	3.1e-29	93.2
WP_000675717.1|2039382_2040162_+	abortive infection family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000425404.1|2040222_2040723_+	antirestriction protein ArdA	A0A1S5SF25	Streptococcus_phage	1.7e-54	63.0

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP018629|2053038:2063167|DBSCAN-SWA
AATGAATCAAATGATTATAAAAATCGAGCGAAAAGAAAAGAAGGAGAAACCAAAGAAATCTAAAAAACCGAGCAAGCAAAGAAAAGTTCCGATGATTAAAGTTGGCACGCATAAGAAATTAACCTTTGTTTTATGGGTTTTATTGATTGGTAGTGTCGGATTTGGAATCTATAAAAATTTTACTGCCATTGACACTCATACTGTCCGTGAAACAGAAATCATTAAACAGCAGATTGTCGATACCAACCAAGTAGAAAGTTTTGTGAAATCCTTTGCGAAAGACTACTTTTCGTGGCAACAATCCCAAGAAGCCATTGATAAACGAAATGAAAAATTGACCCATTATTTGACGGAAGAATTGCAGGTATTAAATGAAGAAATGATTCGTAAGGATATTCCTACTAGTTCTAGTGTGAACGATATACAGGTGTGGCAGGTTTCTCAAGTGAATGAGAACACCTTTGAGGTACTGTTTTCTGTTGAACAAGTTATTACCGAAGACAAAGACAAGGAAACTATATCGTCTAGCTTTCATGTGGTTGTCCATATAGATGAATCAGATAATATGGTTATTATCAAAAATCCGACAATGAGTAAGAAACCTCAAAAATCGGACTACCAACCCAAACAGCTAGAAAGTGACCATACAGTAGATACAGAAACGATGGACGAAATCACTAGCTTTTTAGAAACGTTCTTCCAGCTCTATCCTACCGCCACAGAAAAAGAATTGACTTACTATGTAAGTAATCATGTGTTACCTATGATTAACAAGGAATATGTTTTCGAGGAATTGGTGAATCCTATCTTTACCAGAAAAGATAACCAAGTAATCGTGAATGTCGCTGTGAAATATTTAGATCAAGAAACAAAGGCAACCCAAATCTCGCAATTTGAGTTGATATTAGAAAAACAAGATAATTGGAAGATTGTAAAATAACAAATATTGGTACATGATTACAGATACTTTGTAATCATGTACTCTTTTTGATAAAAAATTGGAGATTCCTTTACAAATATGCTCTTACGTGCTATTATTTAAGTGACTATTTAAAAGGAGTTAATAAATATGCGGCAAGGTATTCTTAAATAAACTGTCAATTTGATAGCGGGAACAAATAATTAGATGTCCTTTTTTAGGAGGGCTTAGTTTTTTGTACCCAGTTTAAGAATACCTTTATCATGTGATTCTAAAGTATCCAGAGAATATCTGTATGCTTTGTATACCTATGGTTATGCATAAAAATCCCAGTGATAAAAGTATTTATCACTGGGATTTTTATGCCCTTTTGGGTTTTTGAATGGAGGAAAATCACATGAAAATTATTAATATTGGAGTTTTAGCTCATGTTGATGCAGGAAAAACTACCTTAACAGAAAGCTTATTATATAACAGTGGAGCGATTACAGAATTAGGAAGCGTGGACAAAGGTACAACGAGGACGGATAATACGCTTTTAGAACGTCAGAGAGGAATTACAATTCAGACAGGAATAACCTCTTTTCAGTGGGAAAATACGAAGGTGAACATCATAGACACGCCAGGACATATGGATTTCTTAGCAGAAGTATATCGTTCATTATCAGTTTTAGATGGGGCAATTCTACTGATTTCTGCAAAAGATGGCGTACAAGCACAAACTCGTATATTATTTCATGCACTTAGGAAAATGGGGATTCCCACAATCTTTTTTATCAATAAGATTGACCAAAATGGAATTGATTTATCAACGGTTTATCAGGATATTAAAGAGAAACTTTCTGCCGAAATTGTAATCAAACAGAAGGTAGAACTGTATCCTAATATGTGTGTGACGAACTTTACCGAATCTGAACAATGGGATACGGTAATAGAGGGAAACGATGACCTTTTAGAGAAATATATGTCCGGTAAATCATTAGAAGCATTGGAACTCGAACAAGAGGAAAGCATAAGATTTCAGAATTGTTCTCTGTTCCCTCTTTATCATGGAAGTGCAAAAAGTAATATAGGGATTGATAACCTTATAGAAGTTATTACTAATAAATTTTATTCATCAACACATCGAGGTCCGTCTGAACTTTGCGGAAATGTTTTCAAAATTGAATATACAAAAAAAAGACAACGTCTTGCATATATACGCCTTTATAGTGGAGTACTACATTTACGAGATTCGGTTAGAGTATCAGAAAAAGAAAAAATAAAAGTTACAGAAATGTATACTTCAATAAATGGTGAATTATGTAAGATTGATAGAGCTTATTCTGGAGAAATTGTTATTTTGCAAAATGAGTTTTTGAAGTTAAATAGTGTTCTTGGAGATACAAAACTATTGCCACAGAGAAAAAAGATTGAAAATCCGCACCCTCTACTACAAACAACTGTTGAACCGAGTAAACCTGAACAGAGAGAAATGTTGCTTGATGCCCTTTTGGAAATCTCAGATAGTGATCCGCTTCTACGATATTACGTGGATTCTACGACACATGAAATTATACTTTCTTTCTTAGGGAAAGTACAAATGGAAGTGATTAGTGCACTGTTGCAAGAAAAGTATCATGTGGAGATAGAACTAAAAGAGCCTACAGTCATTTATATGGAGAGACCGTTAAAAAATGCAGAATATACCATTCACATCGAAGTGCCGCCAAATCCTTTCTGGGCTTCCATTGGTTTATCTGTATCACCGCTTCCGTTGGGAAGTGGAATGCAGTATGAGAGCTCGGTTTCTCTTGGATACTTAAATCAATCATTTCAAAATGCAGTTATGGAAGGGATACGCTATGGTTGCGAACAAGGATTATATGGTTGGAATGTGACGGATTGTAAAATCTGTTTTAAGTACGGTTTATACTATAGCCCTGTTAGTACTCCAGCAGATTTTCGGATGCTTACTCCTATTGTACTGGAGCAAGCCTTTAGAAAAGCTGGAACAGAATTGTTAGAGCCATATCTTAGTTTTAAAGTTTATGCACCACAGGAATATCTTTCACGGGCATATAACGATGCTCCCAAATATTGTGCAAATATCGTAAATACTCAACTGAAAAATAATGAGGTCATTATTATTGGAGAAATTCCTGCTCGATGTATTCAAGATTATCGCAATGATTTAACTTTTTTACAAATGGGCTTAGTGTTTGTTTAGCAGAGCTAAAAGGATATCAGGTTACCACTGGCGAACCTGTTTGCCAGACCCGTCGTCTAAATAGTCGGATAGATAAAGTAAGATATATGTTCAATAAAATAACTTAGTGCGTTTTATGTTGTTATATAAATATGGTTTCTTATTAAATAAGATGAAATATTCTTTAATATAGATTTGAATTAAAGTGGAAAGGAGGAGATTGTTATTATAAACTACAAGTGGATATTGTGTCCTATTTGTGGAAATAAAACAAGACTACGAATACGAGTGGATACTATACTTAAAAATTTCCCTTTATACTGCCCCAAATGTAAGAACGAAACTTTAATTAATGTTCAAAAAATGAATATAATAACAATCAAAGAGCCAGACGCCAAGACGCAGAGCCGATAATTTGAGAAATGAAACTCTCATCTTATCGGCTCTTTTTGTTTATCTGAATTTTACTGACTAGCCTTCAATATTTCTTGCTTCATTGATACCTTTTGCTAGTGCTTCCATTAAGGATAGTTCTTTGTCTGTAAAGCTATCCATGTATTTTTCTACCTGTAACCTTCGAGTGCTTTTAATCAAATTATCTGTAGGTAAGAAAAATTCATCAATAGATACATGGAGTAATGATACAAGATCATACAGCACTTGTGTACTTGGGTGTTGTCCTTTGTTTTCTATATTTGTTAAATAACGTGGGTCAATTTCAATCATTGTTCCCACTTGTTCACGAGTGAGACCCCGTTTCATTCGAGCCTCTTTAATCGCTAAACCAACGGCTCTAAAATCGTATTTATCTTCTTTTTTACGCATACTAAATCACCTCTATACATTTTACTGTTCCTATATAGCCATAAACAGGTATAGAAAAACATGTTATATAGTTTATGAGTTCCTATAGAACACTGTGGAATTTATTAATGCGATGAATCCAATTTCAAATAGAAAGGTCGCTGATTTTATTTACCTATACAACTTTATAAAATTTAGTCATACTCCTAGAAAGTAGATAAAATTGGCGACTTAATGGAGGGAAAAGTCGCCATGAGAAAGATAATCTGTCATCTAGTTCTCTTAATTAAGTTCTTATCAAAAAAACTTATCCACCTGTACTGGATAGATATGACCATCAATGTGGTTTTGCAGATTACATAGATAGAAAAATCAAAGCATATGAACAGAGAAAACAATCTGTTTATGTGCTTTTTTGGTCACTTAATAAATATCTTTTAGGATTTCTCTTCATTTATGCAACAAATCCCCCTTTCGTGTCGGGGCTTAGTATGAAGGGAGATAAAGAAGCACATGCCACTCCCTTTCACGACAGAAAGGGGGTGAAAAGCATGAAACCATCTTCTTTTCAAGAAACCATAGAAAATCAGTTTGACTATATCTGCAAACAAGTTATTGAAGATGAACGAAAAGATTACTTCAAACATCTAGACAGACTATCAGCAAAAGAAGTCTCGTTTTCTGATATAGATAACTACCTTGTCAACTCTTTTTCTACTGTTGATACGTACGTCACTGATTTCCAACTATTTAAATTATTTGGATTAAGAATCAATGTTGAAAGTGATTTATTAAGTGAAGCCCTGCGTCATCTTTCAGAGAAAAAACGGAACATTATTTTACTTCATTACTTTATGGATATGAGTGATGTGGAGATTGCGGAGTTACTAAATTTGAATCGTTCGACTGTTTATCGTCATCGAATAAGTGGACTAGCCATGATTAAAGAATTCATGAAGGAGTGTAAAGAATGAAAACAGCTTATCCAAGGGTTCCCTTCCCCCTCATTGTAAAGGCGACAGATGGCGACGTGGAAGCAATTAATCAGATTGTTAAACATTATCGAGGGTATACCTCAAAACGTTCATTACGTCGCATGACAGACGAATATGGAAATTCTCATATGGTTATTGATGAAACCCTACGTGGCAGAATGGAAACGAAACTCATCTCTAAGATTTTATCGTTCGAAATTAAATAGTCCCATTTTTTCGTGGAAGCGTGTCGAATCGTATCCACGCTTCCCGATTTGGGAGGTTTGTTATTCCATCAAAGCATATTGTGTGTTCAGTAGGTTTTGATAGGCTAACAAGCCAAACGTTCTTTGACAACCAAATAAAGGCAATCGAATACGTTTCGGTAAGAAAAGAGCTGATGAACTAACACGCCATGACCTACAAAATTAGTGAGCGATTCATGTTAGTAATTCGAAAGTAATCTTTAGCAGGATTGCTGCCATGACTTTCTTATCGTGATAATGATACTCCCGTATAGCCATAGTCCGAGCGTTAGAAGCGTCACAGGCAATGGGTACGGCTACATGAGAACCATGCAGAAGTGAAATTCCTGTGAGCTTTGCTAGAGCTGTTCGATTGCTAAGATATTCTTCTCTTGTCAGTGTATTATTATAAAACTATTTGATATAATTATAGGTGAATATTGGAGTTTTCCTAGCCTATAATTGGGAAAGGAGTAATAATGATAACGGTCACAAAAAAGGATTTAGTTGAGCTAGGATATGGAACTTCTTTTTCAGCAGACATCATAAAAAAAGCAAAAGAATTGATGATTACAAAAGGGCATATCTACTATCAATCTCGAAAGCTAGATAGAGTCCCTCGTGAAGCTGTTGAAGAAATTCTAGGAATTCGGTTTTCAAATGAAAACAGGTCTGAGTAGTTTTTGCACAGTAAGGAGTAAAAACTATGGTTAAAGACCCAATAAAAAAAGCAAAGAATGGAACCTATTATTTTCGTGCAAATCTAGGTTATGATTCTAAAGGGAAAAAAATTCAAAAATATCGTAGTGGATTCACTACTAAAAAAGAAGCAAGAGAAGAATATTCGAAACTGCTATTGATGAAACCAGAAGAATTAAGTGAGAATAAGGATAAAATGACGTTTAAACATTATATCTTTGAAATTTTCCTTCCATGGTATAAGACACAGGTAAAGCTCAGAACATATGAAAATCGCTTACCAACTATTAAGAAGCATTTCTCTTATTTTGATAAAATGGCTGTTTCCGATATTGAGCCTATTGATGTGCAAAATTGGCAACTAAAATTATCAAAGAAGTGTAAGTCTTCTTATGTAAGAGCTGTTCAAGGACTATTTTCAGTTGCTATGGATCGAGCAATTGTCCTTGGGATAACCACCACAAATCCATCTAAGATTATTGGCAATGTGAAAAAGCAAAAGTCTAAAATTGAATTTTGGACAAAAGAAGAATTTGAAAAAGTAATCTCTCTAATTTACAAAGAAGATTACTATCAACACTTTTTATTTATCTCTCTGTGGTTTTTATTTATGACTGGAATGCGAATTGGTGAAGCTACTGCCATTCAATGGGAAGATATTGATTTTGACTCAGGAGTACTAACCATCAACAAAACACTCTATTACAAGAATCAATCGAATTATAGATTTGTTGAACCAAAAACAAAGGCGAGCGTTCGTCATATTGTATTAGATAAATGCACATTAACTTATTTATCCGAATGGAAGGAAGTACAACAAAATCTAATTCAGACAGACTTTGTAATGAGCTATAACGGTATTCCTACCCAAAAACATACACTATCATATGCTATTGAACGCTATGCTAAGCTGGCTGGTATCCATCGAATCAGAATCCATGGGTTACGGCATTCTCATGCTTCCTTGTTAATCAGTATGGGAGAAAATCCACTTATCATTAAAGATCGTCTAGGACACGAAGATATTGAGACGACTTTAGGAACGTATGGACATCTTTATCCTAACAGTAATTTCGAGGTAGCTAACAAATTAAATGGAGCCATTTCCTTTAAAGAAGCAAAACAAAATTATGATACTTCACCAAAGAATCAATTTACTGTAGACTACTTGCGAAACAAAGAAATGAAAAAAGTGCAATAAAAGTGCAGTAAAAAGATAAGAAGAGCCAGAAACCCTTGGTATAAGAGGATTTCTAGCTCTCCTACAACTACTCCCACTCAATTGTGCTTGGTGGTTTTGATGTAATGTCATAGACTACGCGGTTGACGTGATCTACTTCGTTTACGATACGACTAGAAATCTTTTGTAAGACTTCCCAATCGATGCGTGCGAAGTCACTTGTCATACCGTCGATAGATGTTACTGCACGAATACCTACTGTGTGATCATACGTACGGTAGTCTCCCATAACACCTACTGATTGAATGTTTGGTAACACTGTGAAGTATTGCCAAATTTCTCTTTCAAGACCTTCTTCTCTAATCACTTGGCGTAAAATCGCGTCTGATTCTCTAACGATTTCTAGTTTATCTTCAGTAATTTCTCCAAGTACACGAATACCAAGACCAGGTCCTGGGAATGGTTGTCTCCATACTAAATGTTCTGGAATACCTAACTCAATACCTAATTTACGTACTTCATCTTTAAACAATGTATTGATTGGTTCGATTAATTCGAATTCCATGTCTTCTGGTAATCCACCAACATTGTGGTGTGATTTGATTGTTTGTGCTGTTTTAGTACCTGATTCGATGACGTCTGTATATAGTGTTCCTTGCGCAAGGAAGTCTACACCTTTCAGTTTTGATGCTTCATCATCAAATACGTATACAAATTCATTACCAATGATTTTACGTTTTTGTTCAGGATCTGAAACACCTTTTAATTTATTCATAAAGCGATCTTTCGCATTAACACGAATAATATTCATGTTGAAACCTTCACCGAATTGCTCCATAACCATGTCGCCTTCACCTTTACGAAGTAAGCCATGGTCTACAAAGATACATGTTAGTTGATCACCTATTGCTTTATGCAATAGTACAGCTACAACAGATGAATCTACGCCGCCACTCATCGCACATAATACACGACGGTCTCCTACGCGTTGACGAATCTTTTCAATTTCGATTTCGATAAAGTTTTCCATTGTCCATTGACCTCTACAATCACAAACACGACGGACAAAATTATTTAATAAATCATTACCATATTCTGTATGACGTACTTCTGGATGGAATTGAACACCATAAATGCGACGTTTCTTATCTTCGATTGCTGCATAGTCTGTGCTTGGGCTATCAGCGATAACTTCAAAGCCTTCTGGAATTTCAATAACTTTATCAGAATGACTCATCCAAACAGTTTGTTCTGCTGGTAAGCCAGCGAATAACTCATCTGACTTCGCATTAATGATTGCTTTACCGTATTCACGTTCATTGGCACGTTCAACTTTACCACCTAATAATTTAGTAGTTAATTGCATGCCGTAACAAATACCAAGTACTGGAATTCCTAAATTATATATTTCCGGATCAATTGTAAATGAACCTTCTTCATAAACTGAATTTGGACCACCTGATAAGATAATACCTTTTGGATTCATTTTCTTAATTTCTTCAATTGAAATTTCATGATCGTGTAATTCACTATAAACGCCCATTTCACGAATTCGGCGTGTAATTAATTGGTTGTATTGGCTACCAAAGTCTAAGACAAGGATTAACTCTTGTTCTTTTGCCATTTCCATATTTGTCGTTCTCCTTTATCTTAATTAGAATGAGTAGTTCGGTGATTCTTTCGTAATTTGAATATTATGTGGATGGCTTTCTGCTAAACCAGCAGGACCCATACGTGTAAATTGTGCTTCTTCGCGTAATTCTCTTAAATCGTGTGAACCAGTATAACCCATACCAGCACGCACACCGCCCATTAATTGGTAAATTGTATCTTGTAACGCACCTTTATAAGCCGTACGTCCTTCGATACCTTCAGGAACAAATTTCTTAGGCGCTTTGTCCTCTTGGAAGTAACGGTCGTTTGAACCTTTTTCCATCGCACCTAAAGAGCCCATACCACGGTATACTTTATATTGTCTACCTTGGAAAATTTCTGTTGCGCCTGGGCTTTCTTCAGTACCTGCTAATAAGCTACCTAACATAACCGCATGTCCACCAGCAGCTAATGCTTTAATGATATCTCCTGAGAATTTAATACCACCATCAGCAATGATAGCTTTACCATGTTTGCGTGCTTCAGTTGCACAATCATAAATTGCTGTAATTTGTGGTACACCAACACCTGCTACAACACGCGTCGTACAAATTGAACCTGGGCCAATACCAACTTTAACAATATCTGCACCCGCTTCAAATAAATCTTTTGTTGCTTCTGCAGTTGCTACGTTACCTGCTACTAATGTGATTTCTGGGTAAGTCTTCTTAATATGTTTCACTTGATCGATAACACCTTTAGAGTGACCATGTGCTGTATCGATAACTAAGACATCCACACCTGCTTCGACTAATTTTTGAGCACGAATATCAGTATCTTTTGAAATACCAATTGCTGCGGCTACAAGTAGACGACCATGTTCATCTTTTGCTGCATTAGGGAATTCGATAACTTTTTCAATATCTTTAATAGTAATAAGACCTTCTAGACGTCCGTCTTTAACTAATGGTAACTTTTCAATCTTATGTTTTTGGAGAATTTTTTCTGCTTCTTCAAGTGTTGTATTCACTGGAGCTGTAATTAAATTTTCTTGCGTCATTACATCTACAATTTTAATCGAGAAGTCTTCAATAAAACGTAAGTCACGGTTTGTTAAAATACCTACTAAGTTGCGATCTTCTTTATTATCAACAATTGGTACACCTGAAATACGGTATTTACCCATTAATGCTTCTGCTTCATAAACGCTTTCTTCTGGCGTTAAGAAAAATGGGTTTGAAATGACACCATTTTCTGAGCGTTTTACTTTTTGAACTTCGTCCGCTTGTTCTTCAACGCCCATATTTTTATGAATAACACCTAAACCACCTTGACGAGCCATAGCAATCGCCATTTTAGATTCAGTTACAGTATCCATACCAGCAGAAATAACTGGAATATTTAATTTAACTTTGTCTGATAATTGTACGCTTAAATCAACGTCTTTCGGTAAAATATCAGATTGTGCTGGAATTAATAACACATCATCAAACGTTAATGATTCTTTTGCAAATTTACTTTCCCACAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP018629|2053038:2063167|2054251_2054338_+|WP_011058339.1|DBSCAN-SWA
MLCIPMVMHKNPSDKSIYHWDFYALLGF
>NZ_CP018629|2053038:2063167|2057200_2057311_+|WP_010924747.1|DBSCAN-SWA
MRKIICHLVLLIKFLSKKLIHLYWIDMTINVVLQIT
>NZ_CP018629|2053038:2063167|2060134_2061676_-|WP_000424966.1|DBSCAN-SWA
MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE
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>NZ_CP018629|2053038:2063167|2058646_2058847_+|WP_000633907.1|DBSCAN-SWA
MITVTKKDLVELGYGTSFSADIIKKAKELMITKGHIYYQSRKLDRVPREAVEEILGIRFSNENRSE
>NZ_CP018629|2053038:2063167|2053038_2053977_+|WP_012972536.1|DBSCAN-SWA
MNQMIIKIERKEKKEKPKKSKKPSKQRKVPMIKVGTHKKLTFVLWVLLIGSVGFGIYKNFTAIDTHTVRETEIIKQQIVDTNQVESFVKSFAKDYFSWQQSQEAIDKRNEKLTHYLTEELQVLNEEMIRKDIPTSSSVNDIQVWQVSQVNENTFEVLFSVEQVITEDKDKETISSSFHVVVHIDESDNMVIIKNPTMSKKPQKSDYQPKQLESDHTVDTETMDEITSFLETFFQLYPTATEKELTYYVSNHVLPMINKEYVFEELVNPIFTRKDNQVIVNVAVKYLDQETKATQISQFELILEKQDNWKIVK
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MCPICGNKTRLRIRVDTILKNFPLYCPKCKNETLINVQKMNIITIKEPDAKTQSR
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MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF
>NZ_CP018629|2053038:2063167|2058873_2060067_+|WP_000237797.1|integrase|DBSCAN-SWA
MVKDPIKKAKNGTYYFRANLGYDSKGKKIQKYRSGFTTKKEAREEYSKLLLMKPEELSENKDKMTFKHYIFEIFLPWYKTQVKLRTYENRLPTIKKHFSYFDKMAVSDIEPIDVQNWQLKLSKKCKSSYVRAVQGLFSVAMDRAIVLGITTTNPSKIIGNVKKQKSKIEFWTKEEFEKVISLIYKEDYYQHFLFISLWFLFMTGMRIGEATAIQWEDIDFDSGVLTINKTLYYKNQSNYRFVEPKTKASVRHIVLDKCTLTYLSEWKEVQQNLIQTDFVMSYNGIPTQKHTLSYAIERYAKLAGIHRIRIHGLRHSHASLLISMGENPLIIKDRLGHEDIETTLGTYGHLYPNSNFEVANKLNGAISFKEAKQNYDTSPKNQFTVDYLRNKEMKKVQ
>NZ_CP018629|2053038:2063167|2057439_2057922_+|WP_000675479.1|DBSCAN-SWA
MKGDKEAHATPFHDRKGVKSMKPSSFQETIENQFDYICKQVIEDERKDYFKHLDRLSAKEVSFSDIDNYLVNSFSTVDTYVTDFQLFKLFGLRINVESDLLSEALRHLSEKKRNIILLHYFMDMSDVEIAELLNLNRSTVYRHRISGLAMIKEFMKECKE
>NZ_CP018629|2053038:2063167|2057918_2058149_+|WP_000845143.1|DBSCAN-SWA
MKTAYPRVPFPLIVKATDGDVEAINQIVKHYRGYTSKRSLRRMTDEYGNSHMVIDETLRGRMETKLISKILSFEIK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
2051314:2051328	attL	NA	NA	NA	NA
WP_012972536.1|2053038_2053977_+	conjugal transfer protein	A0A1S5SF22	Streptococcus_phage	1.1e-83	56.6
WP_011058339.1|2054251_2054338_+	tetracycline resistance determinant leader peptide	NA	NA	NA	NA
WP_001803271.1|2056390_2056558_+	conjugal transfer protein	D0R0F6	Streptococcus_phage	2.3e-13	62.0
WP_001227350.1|2056615_2056969_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A1S5SFA6	Streptococcus_phage	2.2e-53	89.7
WP_010924747.1|2057200_2057311_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000675479.1|2057439_2057922_+	sigma-70 family RNA polymerase sigma factor	A0A1S5SEW0	Streptococcus_phage	8.5e-48	68.6
WP_000845143.1|2057918_2058149_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A1S5SEX1	Streptococcus_phage	1.0e-27	78.9
WP_000633907.1|2058646_2058847_+	DUF3173 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000237797.1|2058873_2060067_+|integrase	site-specific integrase	A0A0S2MV79	Bacillus_phage	8.3e-44	34.2
WP_000424966.1|2060134_2061676_-	glutamine-hydrolyzing GMP synthase	A0A1V0SH76	Hokovirus	1.2e-23	32.6
WP_000264071.1|2061700_2063167_-	IMP dehydrogenase	A0A1V0SHK8	Klosneuvirus	5.2e-96	40.5
2067246:2067260	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP018629|2079845:2179557|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000655692.1|2087159_2088263_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	A0A0B5JD48	Pandoravirus	3.9e-11	28.0
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2119507:2119526	attL	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP018629|2194427:2323838|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001187008.1|2239537_2239723_-	hypothetical protein	A0A0N9SKE7	Staphylococcus_phage	1.5e-24	100.0
WP_000401832.1|2239707_2239887_-	hypothetical protein	A0A0N9RRR6	Staphylococcus_phage	1.1e-21	91.5
WP_000833764.1|2239900_2240383_-	hypothetical protein	A0A0N9SJ15	Staphylococcus_phage	8.8e-69	94.3
WP_000924986.1|2240384_2240573_-	hypothetical protein	A0A0N9S8F9	Staphylococcus_phage	4.5e-29	95.2
WP_000867237.1|2240578_2240770_-	hypothetical protein	A0A0N9SH33	Staphylococcus_phage	6.2e-18	88.0
WP_000742009.1|2240766_2240994_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000403510.1|2240998_2241265_-	hypothetical protein	A0A0N9RU37	Staphylococcus_phage	3.6e-40	95.5
WP_000800820.1|2241254_2241458_-	hypothetical protein	A0A1W6JP82	Staphylococcus_phage	9.2e-20	72.3
WP_001041170.1|2241476_2241728_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000042824.1|2242001_2242235_-	hypothetical protein	A0A0N7GFH5	Staphylococcus_phage	2.6e-34	97.4
WP_000359469.1|2242256_2242481_-	hypothetical protein	A0A0N9SI40	Staphylococcus_phage	2.0e-31	100.0
WP_000862563.1|2242486_2242834_-	nuclease	A0A0N9STK3	Staphylococcus_phage	4.4e-62	100.0
WP_000937215.1|2242830_2243241_-	hypothetical protein	A0A0N9RZZ6	Staphylococcus_phage	1.1e-72	97.1
WP_000312937.1|2243280_2243544_-	hypothetical protein	A0A0N9SKF2	Staphylococcus_phage	6.9e-44	100.0
WP_000239839.1|2243546_2243918_-	hypothetical protein	A0A2H4JFL4	uncultured_Caudovirales_phage	3.9e-16	38.7
WP_048666632.1|2243920_2244229_-	hypothetical protein	A0A0N9RRS4	Staphylococcus_phage	1.3e-41	85.3
WP_000022947.1|2244521_2244797_-	hypothetical protein	A0A0N7GFH6	Staphylococcus_phage	2.0e-41	92.3
WP_000404899.1|2244809_2245007_-	hypothetical protein	A0A0N9SH39	Staphylococcus_phage	3.2e-25	92.3
WP_000542668.1|2245017_2246055_-	hypothetical protein	A0A0N9RU46	Staphylococcus_phage	8.8e-191	97.7
WP_000389289.1|2246311_2247049_-	ribonuclease Z	A0A0N9RZK9	Staphylococcus_phage	7.0e-134	99.6
WP_000865239.1|2247242_2249009_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A0N9SK20	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.7
WP_000459730.1|2249011_2250124_-	hypothetical protein	A0A0N9RRG7	Staphylococcus_phage	1.8e-218	99.7
WP_001048214.1|2250140_2251673_-	helicase DnaB	A0A0N9SIU7	Staphylococcus_phage	2.4e-293	99.0
WP_001807409.1|2251694_2252213_-	hypothetical protein	A0A0N9S850	Staphylococcus_phage	1.8e-91	99.4
WP_000050755.1|2252289_2253258_-	ATP-binding protein	A0A0N9SGS5	Staphylococcus_phage	1.0e-180	99.4
WP_103067908.1|2253380_2254340_-	hypothetical protein	A0A0N7GFF9	Staphylococcus_phage	2.5e-168	99.7
WP_000668931.1|2254383_2255064_-	hypothetical protein	A0A0N9RTS7	Staphylococcus_phage	2.0e-127	100.0
WP_000364656.1|2255081_2255570_-	hypothetical protein	A0A0N9SK25	Staphylococcus_phage	2.3e-53	99.4
WP_000035084.1|2255585_2255834_-	hypothetical protein	A0A0N9SHT9	Staphylococcus_phage	1.7e-39	97.6
WP_103067909.1|2255992_2256997_-	hypothetical protein	A0A0N9ST56	Staphylococcus_phage	3.8e-183	99.1
WP_001030860.1|2257008_2258289_-	hypothetical protein	A0A0N9RZM2	Staphylococcus_phage	1.1e-235	99.8
WP_000993078.1|2258587_2259631_-|integrase	site-specific integrase	A0A0N9SK33	Staphylococcus_phage	8.0e-192	98.6
WP_000759940.1|2260322_2260751_-	hypothetical protein	A0A0N9RRH5	Staphylococcus_phage	9.5e-75	98.6
WP_000725702.1|2260828_2261350_-	hypothetical protein	A0A0N7GFG0	Staphylococcus_phage	1.7e-89	98.3
WP_000228097.1|2261349_2261613_-	hypothetical protein	A0A0N9SIV3	Staphylococcus_phage	4.3e-38	89.7
WP_000195429.1|2261782_2262955_+|transposase	IS256-like element IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	3.5e-135	100.0
WP_001825093.1|2262981_2263134_-	hypothetical protein	A0A0N9SIV3	Staphylococcus_phage	1.3e-15	95.3
WP_000997332.1|2263247_2263928_-	hypothetical protein	A0A0N9S858	Staphylococcus_phage	8.5e-118	93.4
WP_000688801.1|2264023_2264347_-	hypothetical protein	A0A0N9RTT7	Staphylococcus_phage	1.7e-52	92.5
WP_000793801.1|2264394_2265054_-	antirestriction protein ArdA	A0A0N9SK30	Staphylococcus_phage	7.7e-116	93.2
WP_000931951.1|2265208_2265598_-	hypothetical protein	A0A0N9SHU5	Staphylococcus_phage	1.3e-62	93.0
WP_000353835.1|2265734_2265995_-	hypothetical protein	A0A0N9ST70	Staphylococcus_phage	3.5e-40	98.8
WP_032605705.1|2266069_2266285_-	hypothetical protein	A0A0N7GFG1	Staphylococcus_phage	2.2e-32	94.4
WP_000424936.1|2266736_2267021_-	hypothetical protein	A0A0N9SK40	Staphylococcus_phage	1.2e-44	96.8
WP_001003199.1|2267066_2267345_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000622391.1|2269018_2269276_-	hypothetical protein	A0A0N9RRI7	Staphylococcus_phage	4.3e-14	95.0
WP_000391470.1|2271140_2272016_-	hypothetical protein	A0A0N9SIV7	Staphylococcus_phage	6.3e-166	99.7
WP_000409961.1|2272051_2274337_-	AAA family ATPase	A0A0N9S864	Staphylococcus_phage	0.0e+00	100.0
WP_000587450.1|2274472_2275969_+	hypothetical protein	A0A0N9SGU3	Staphylococcus_phage	8.3e-267	98.6
WP_000163487.1|2276227_2276557_+	HU family DNA-binding protein	A0A0N9RTU9	Staphylococcus_phage	8.1e-50	95.4
WP_000057341.1|2276582_2276768_+	hypothetical protein	A0A0N7GFG2	Staphylococcus_phage	1.7e-25	100.0
WP_000055837.1|2276776_2277961_+	hypothetical protein	A0A0N9SK37	Staphylococcus_phage	4.8e-217	97.5
WP_001007716.1|2279659_2280544_+	hypothetical protein	A0A0N9SHV5	Staphylococcus_phage	4.5e-172	100.0
WP_000033345.1|2280536_2282336_+|terminase	terminase	A0A0N9RZP6	Staphylococcus_phage	2.0e-206	99.7
WP_000389594.1|2282353_2283916_+	hypothetical protein	A0A0N9SK48	Staphylococcus_phage	6.6e-299	100.0
WP_001043654.1|2283908_2285288_+	hypothetical protein	A0A0N9RRJ7	Staphylococcus_phage	4.1e-244	97.8
WP_001096464.1|2285315_2285756_+	hypothetical protein	A0A0N9SIW4	Staphylococcus_phage	3.0e-76	98.6
WP_001123863.1|2285795_2286797_+	hypothetical protein	A0A0N9S885	Staphylococcus_phage	5.6e-110	99.5
WP_000985467.1|2286871_2287423_+	hypothetical protein	A0A0N9SGV3	Staphylococcus_phage	1.5e-80	100.0
WP_000134539.1|2287440_2287875_+	hypothetical protein	A0A0N9RTW0	Staphylococcus_phage	3.5e-69	100.0
WP_001086334.1|2287864_2288182_+	hypothetical protein	A0A0N9SK47	Staphylococcus_phage	2.6e-53	100.0
WP_000384370.1|2288185_2288851_+	hypothetical protein	A0A0N9SHW2	Staphylococcus_phage	3.8e-123	99.5
WP_001177112.1|2288840_2289362_+	hypothetical protein	A0A0N9ST98	Staphylococcus_phage	2.0e-95	100.0
WP_000391855.1|2289367_2290240_+	hypothetical protein	A0A0N9RZR7	Staphylococcus_phage	1.5e-159	100.0
WP_001131910.1|2290278_2291070_+	hypothetical protein	A0A0N7GFG4	Staphylococcus_phage	8.6e-138	97.7
WP_000700062.1|2291153_2291711_+	hypothetical protein	A0A0N9SK55	Staphylococcus_phage	2.7e-98	100.0
WP_001135527.1|2291710_2292184_+	hypothetical protein	A0A0N9RRK6	Staphylococcus_phage	2.5e-84	98.1
WP_000963689.1|2292199_2293216_+|integrase	site-specific integrase	A0A0N9SIX3	Staphylococcus_phage	2.3e-196	99.4
WP_000135455.1|2293312_2301586_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A0N9S894	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.8
WP_001112868.1|2301607_2303689_+	hypothetical protein	A0A0N9SGW2	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.3
WP_000174342.1|2303749_2311951_+	hypothetical protein	A0A0N9RTX0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	89.9
WP_000402626.1|2311953_2312328_+	hypothetical protein	A0A0N9SK58	Staphylococcus_phage	8.6e-56	87.9
WP_001807370.1|2312529_2315199_+	hypothetical protein	A0A0N9SHX2	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.8
WP_000628684.1|2315245_2315707_+	hypothetical protein	A0A0N9STA8	Staphylococcus_phage	7.3e-65	96.2
WP_000426834.1|2315688_2316201_+	hypothetical protein	A0A0N9RZS7	Staphylococcus_phage	7.9e-44	85.3
WP_000593050.1|2316222_2316552_+|holin	phage holin	A0A0N9SK62	Staphylococcus_phage	1.0e-52	96.3
WP_001253875.1|2316603_2318265_+	hypothetical protein	A0A0N9RRL9	Staphylococcus_phage	1.9e-115	91.3
WP_000991542.1|2318264_2318792_+	hypothetical protein	A1BU75	Staphylococcus_virus	2.9e-09	29.4
WP_000856958.1|2318948_2320451_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	A0A0N9SGX6	Staphylococcus_phage	9.8e-276	95.4
WP_000348472.1|2321421_2323071_-	hypothetical protein	A0A0N9SHY1	Staphylococcus_phage	6.1e-312	94.5
2322514:2322533	attR	NA	NA	NA	NA
WP_000748898.1|2323223_2323838_-	LPXTG cell wall anchor domain-containing protein	A0A0N9STB7	Staphylococcus_phage	6.8e-74	96.6

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP018629.1|WP_000178986.1|2153494_2153743_-|hypothetical-protein	2153494_2153743_-	82 aa aa	NA	NA	NA	2079845-2179557	yes

Protein sequences of NZ_CP018629.1|WP_000178986.1|2153494_2153743_-|hypothetical-protein

>NZ_CP018629.1|WP_000178986.1|2153494_2153743_-|hypothetical-protein
MTMTYNARKEYLNQFFGSKRYLYQDNERVAHIHVVNGTYYFHGHIVPGWQGVKKTFDTAEELEIYIKQHGLEYEEQKQLTLF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP018629_4	Unclear	4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder	1644389-1644417	29	2106444-2106416	1

1. spacer 4.1|1644389|29|NZ_CP018629|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018629 position: 2106444-2106416, mismatch: 1

tttcgaaaagaaattctacaaacaatgca	CRISPR spacer
tttcgaaaagaaattctacaagcaatgca	Protospacer
*********************.*******