Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026704 | Providencia stuartii strain AR_0026 | 5 crisprs | csa3,DEDDh,WYL,cas3,cas14j,DinG,cas1,cas3-cas2,cas5f,cas7f,cas6f | 0 | 12 | 12 | 0 |
1. NZ_CP026704
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026704_1 | 283410-283558 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP026704_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP026704_1
>1.1|283439|31|NZ_CP026704|PILER-CR TGCTGACGGCAAAATGATGCTGCCTAAACGC >1.2|283499|31|NZ_CP026704|PILER-CR CATGCCCCCCAGAAGCTTGGGATGCGCATAT >1.3|283438|32|NZ_CP026704|CRISPRCasFinder ATGCTGACGGCAAAATGATGCTGCCTAAACGC >1.4|283498|32|NZ_CP026704|CRISPRCasFinder ACATGCCCCCCAGAAGCTTGGGATGCGCATAT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026704_1
The CRISPR arrays of NZ_CP026704_1 >merge|NZ_CP026704|1|283410-283558|PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTTAGGCTGCCTATACGGCAGTACACATGCTGACGGCAAAATGATGCTGCCTAAACGCTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTACACACATGCCCCCCAGAAGCTTGGGATGCGCATATTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTACACT >NZ_CP026704|1|1|283410-283558|PILER-CR TTTTTAGGCTGCCTATACGGCAGTACACA TGCTGACGGCAAAATGATGCTGCCTAAACGC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTACACA CATGCCCCCCAGAAGCTTGGGATGCGCATAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTACACT >NZ_CP026704|1|1|283410-283557|CRISPRCasFinder TTTTTAGGCTGCCTATACGGCAGTACAC ATGCTGACGGCAAAATGATGCTGCCTAAACGC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTACAC ACATGCCCCCCAGAAGCTTGGGATGCGCATAT TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTACAC
>NZ_CP026704.1|WP_004922288.1|282908_283256_-|hypothetical-protein MKLLNKTIYTLIVAFISTAAMAEECIGDSTYQACTRSSTNAQGDNIIESYDTEGNSYSITSGSRDYADGSSEVFSVDSEGNEYSIKSWCDSSGCHTSDSEGNTCTITNTGEMIGC >NZ_CP026704.1|WP_004922284.1|282587_282908_-|hypothetical-protein MIKKILIIFIVLISAISVFAYNKLTIFTVQPIGAIPDGVTVVMWKKGDMRFFESPDGLCMQRVGKVNLLCRMTMLGSAIDKDNIIIRLPYSEYAYLKSTNGRKFDR >NZ_CP026704.1|WP_036941256.1|281386_282310_-|LpxL/LpxP-family-Kdo(2)-lipid-IV(A)-lauroyl/palmitoleoyl-acyltransferase MYANNLFSLKLLHPKYATTWLGIVILFLLVQLPYKWLVRLGAFLGVNSKYFIKRRVSIIKRNLELCFPNKNRKEIDDLVIENLRSLGIALFETGIAWFWSDKRIKKLFQVKGISNYQEAIAKNKGVIIVGVHFMSLELGGRIMGLCFPVNAMYRPHNNKAMEYIQTKGRCRSGKGMIDRKNLRFMVQELKSGKAIWFAPDQDFGRKGTVFAPFFSVKNTSTSKGTSTLAQLSHSPTLTVTLLRNRNGISYDLVLGKEIVNYPTSDALHDAATINSVLEKEIMKAPEQYLWAHRRFKTRPDGEPSLYI >NZ_CP026704.1|WP_104873612.1|280885_281218_+|hypothetical-protein MGVSIYYSATKKTHFNFEEKNTFETMVNQLNQAFPYKEDAETLYFYEEPSDQFLLQGSTKLPLDDESILLESIDYWLDCLSQLTLAFSTAQWSVSIEDSEATWVDDHWEM >NZ_CP026704.1|WP_014656465.1|279295_279868_-|hypothetical-protein MKKHILSITVLSAATLLVTGCSSNNDMWGEFANILSDANPVVQESEEWEAYSIKTTQQGVTYASASSADQQFVSKKMDAEYADALYRVSSPFARSDKTKEQLAKDNQGYRFKYNEIMVVKDKKTANTIGYCVNYDSDQIENGQVKPVKEKDKIRNHFIYVDKVKPLSVMTVGSDFTKVMCGEEFYNKYKK >NZ_CP026704.1|WP_004922269.1|276821_278237_-|FAD-binding-oxidoreductase MAITRRKFLIGGAVVAVAGGAGILTPMLTREGRFVPGTPRHGFVEGTAGPLPKQADVVVIGAGILGIMTAINLVERGLSVVIVEKGNIAGEQSSRFYGQVITYKMPDETFLLHHIGKQRWREMNAKVGVDTSYRTQGRVEVPLDEEDLDHVRKWIDTRSKNVGSDIPFKTRIIEGDELNQRLRGATSNWTIAGFEEDSGSLDAEIATFVMAEYAKKIGVKIYTNCAARGLETQAGAISDVVTEKGAIKTSRVVVAGGVWSRLFMQNLNVDVPTLPAYQSQQLISGSPTAPGGNVALPGNIFFREQADGTYATSPRVIVAPVVKESFIYGYKYLPLLSMPDFPVHISLNEQLINSFTQPTHWELDEVSPFEKNRNMTALPDIPELNSSLEKLKAEFPAFKDSKLIDQWSGAMAIAPDENPIISQVNEYPGLVINTATGWGMTESPVSSEITADLLLGKEPSLDVKPFSLYRF >NZ_CP026704.1|WP_104872884.1|273062_274493_-|6-phospho-beta-glucosidase MPGSLFPQDFLWGGAIAANQAEGACFEGGKGLSIADVIPYGANRHPVKMGIEKRFKLRDDEYYPSHLAIDFYHQYKRDIALMAEMGFSVFRTSIAWSRLFPRGDEVTPNPEGIAYYLDLFNECKKYHIEPLVTLCHFDVPMHLVTEYGSWRDRKMIDFFVTYAKACFEAFDGIVKYWLTFNEINLLLHTPFSSSGLVFEEGENSEQVKYQAAHHQLVASALATKIAHEVNAQNQVGCMLAGGGYYPWSPKPEDVWAAMEKDRENLFFIDVQVRGYYPAYAQRVFRENKVTLLVTEEDEQILKNTVDFVSFSYYASRCASADMGDGTNPSINAAQSLSSPYIKQSEWGWGIDPLGLRLTANMLYDRYQKPLFLVENGLGAHDKLNEDGEIIDDYRIDYHRSHIQALGDAIADGIPIMGYISWGCIDLVSASTGEMSKRYGFVYVDKDDQGAGSLTRIRKKSFWWYKKVIASHGNDLY >NZ_CP026704.1|WP_004922246.1|271856_272273_+|hypothetical-protein MKKNIFSYLIIALIAGGSFVAGMMANYTPDLDIVKKSQKAVEDFLTFPETAEYKNVHYYEIRQTLDHGILGYVCGEVLVFKSENSFGYKRFLVKTYMHQDGRNVVSIPLIERSGNIFPNDNFNIIWDQFCREQSDKKE >NZ_CP026704.1|WP_104872883.1|270523_271621_+|heme-lyase-NrfEFG-subunit-NrfF MNKLLHYVVLTLLLMATNIAKADIVDTWQFATAEQQTTSLQIAAQLRCPQCQNQNLLESNAPTAVSMRHQVYKMVAEGKTEAEIRSYMTERYGDFVLYNPPLHMGTIVLWSLPFIGFIFVIALLYYLIKKRASVPRTNQHNSTEATITPTSKLSIQLTHEIPSQHAEVKRNDTLSYYAIHLCVALLLLLTIAGYFFLPRFSVTYHEYQRISDPLHILTPLQQQQSDLIRLQNNIRQSPQNGDLWAILGEYYLYQNSYDNALIAYNQALKYTGENAQLYSAIATVLYYQAGQQMTEDTMQVIEHALSIDKHEVTALMLLASDAFMHANYEKAISLWQQLLDSNSPRINRSQLIEAINMATIMKNNH >NZ_CP026704.1|WP_104872882.1|268650_270531_+|heme-lyase-CcmF/NrfE-family-subunit MELILPEIGFISLLLTLCITNFHALFGLVSTYKHTQKSRLLGVYWSTLQFIFLVIAFLCLTISFIQSDFSVVYVAQHSHRLSPLLIKIAAVWGGHEGSLLLWVLLLSTWHLLFAWRYRKQDHPFFALTLAILAAMSAALLWFIVLYSDPFMRLFPPAIEGRDLNPMLQHWGLILHPPLLYLGYSGLMVVTSCVLASLIAGNFSQTIAWVCWRWAVPSWCILTMGITLGSWWAYSELGWGGWWFWDPVENASLLPWLAATALLHSLVASRKQGSYRHWSMILAIVTFILSLLGTLIVRSGILVSVHAFALDNVRAIPLFLLFISMSIVALLIYGCKAKPAVSASKRALTLREIYLQMTLILFVVVLFIVLVGTLYPMLYSLLGWGKISVGAPYFNQTLLPFGLIMLMVIGAWAVGSLKSSTRSFFRWRLSVSIIAAVIALLLRWSDAKFIASATAIMVGLLLLLWLRPLNEIQKRLASLLAHTGVIIFATGIAFSTVSKQEISANMTVNHTVSLAGYQFNFKQLQLDTQSNYTTEKALIAVYQKDTFITHLETERRFYTARQQIMIEPGMHWGWMRNWYAVLGEKTGNNRYALRFYVQDGIQWIWGGAFIMCIGLFIGWFKGRSQHE >NZ_CP026704.1|WP_104872885.1|283762_284943_-|IS3-family-transposase MAKRIRRLFSAEFKLEAAQLVLDQSYSVVEAANAMGVGKSTMDKWVRQLKLERKGISPKASPMTPEQVEIRELKKKIARLEEHNENLKKGYSAGDVGLSEQFSLIEKLSRRFSIKQLCNVFSVHRSSYQYWRHRSKIPSVEQTRLRALVREAHESSHGSAGARTIADIVSNTKQVPLTRYRASKLMKLLGLVSCQTSKHRYKKTTQEHVEIPNHLRRQFAVTEPNQVWVGDVTYIWSGNRWMYLAVVMDLFARKPIGWAMSFSPDSQLTGKALSMAFESRGKPRNILFHSDQGSHYTSRQYRQLLWRYQIKQSLSRRGNCWDNAPMERFFRSLKTEWVPILGYRNSIEAQQEITRYIIGYYSQLRPHQYNGGLTPNESERLYWENSKTVTNFC >NZ_CP026704.1|WP_113742863.1|285201_285318_+|hypothetical-protein MDWFCVPCHDDFTNNQKYCPTCHKGIWSIPTKNVADKH >NZ_CP026704.1|WP_014656469.1|285345_285771_-|glutaredoxin-dependent-arsenate-reductase MNEITIYHNPNCGTSRNTLAMIRNSGIEPAIIHYLETPPSRDVLVKLIADMKITVRALLRKNVEPYEQLNLEQDSYTDDQLIDFMLQYPILINRPIVVTPLGVKLCRPSEVVLDILPNQQQNEFIKEDGEVVVDKQGCRIK >NZ_CP026704.1|WP_004922295.1|285781_287071_-|arsenic-transporter MFIAALIFVLTITFVIWQPKGLGIGWSATVGAVLALIFGVISFQDIPIVWNIVWNATATFVAVIIISLLLDESGFFEWAALHVAKWGGGKGRLLFSYIVLLGATVAALFANDGAALILTPIVIAMLLALGFNKGTTLAFVMAAGFIADTASLPLIVSNLVNIVSADFFNIGFTEYASIMVPVDIAAIIATLVMLHWFFRKDIPKQYDMTKLSEPALAIKDMTTFKAGWLVLVLLLIGFFVLEPLGIPVSAIAAIGALILWVIAARGHTINTKKVLRGAPWQIVIFSLGMYLVVYGLRNAGLTDYLSETLNYLADKGLWVATLGTGFITAFLSSIMNNMPTVLIGALSIEGSEASGVIQQAMVYANVIGADLGPKITPIGSLATLLWLHVLSQKNMTITWGYYFKTGIIMTIPVLIVTLVALVLRLSLLN >NZ_CP026704.1|WP_042116859.1|287126_288878_-|arsenical-pump-driving-ATPase MNFLDSTPNYLFFTGKGGVGKTSISCATAIKLAEEGKKVLLVSTDPASNVGQVFSQSIGNNIQPITLVPNLFAIEIDPQAAAEEYRNKIINPIKESLPEAVIQSITEQLSGACTTEIAAFDEFTGLLTNTEITRQFDHIIFDTAPTGHTIRLLQLPSAWSDFISDNPDGATCLGPMSGLEKQREQYSMAVQALSDNSLTRLVLVARPQSAALREVARTYSELSSLGIKNQQLIINGVFPETAMTENDKLSHALYSREQAALKSLPEALRSLPIDILYLQNINMVGVDALKQLLSNDMPQFSTITPTKQPISLPSLSELVGEISQQQHGLIMLMGKGGVGKTTIAASIAVKLAEKGLDVHLTTSDPAAHVESTLDGVLPNLQVSRIDPIAETERYRNYVLETKGKDLDAEGRALLEEDLRSPCTEEIAVFQAFSRIIRDAGKRFVVMDTAPTGHTLLLLDATGAYHKEIAKKMGKKGHFLTPMMQLQDPERTKVIITTLAETTPVLEAENLQNDLIRADIHPWAWVINNSLSITETTSPLLLSRAEQEVVQIEKVASTLAKRVAIVPLLETEPVGISALSQLAE >NZ_CP026704.1|WP_004922301.1|288891_289257_-|arsenite-efflux-transporter-metallochaperone-ArsD MKKLEVFDPALCCSTGVCGTEVDQALVDFATDADWLKKQGANVKRFNLAQEPMAFVNNIKVKTFLETAGAESLPLFILDGEIVLTGRYPKRHELARWFGIRLNIEKVETVKSCCGNDKTCC >NZ_CP026704.1|WP_004922304.1|289304_289640_-|metalloregulator-ArsR/SmtB-family-transcription-factor MEPLQLFKILGDQTRLDIVLLLKASGELCVCDIYTALNLSQPKTSRHLAMLREAGLLLDSKHGKWVHYRLSPALLPWVKSIIDVTYATEKNRVADLLKSLEKKESANRCSI >NZ_CP026704.1|WP_004922311.1|290258_291116_+|bifunctional-methylenetetrahydrofolate-dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate-cyclohydrolase-FolD MLAKIIDGKTIAQTIRQEVAQKVQQRIEQGKRAPGLAVILVGANPASQIYVGSKRRACEEVGFLSRSYDLPDTTTEAELLKLIDDLNQDTEIDGILVQLPLPAGIDNVKVIERIHPDKDVDGFHPYNVGRLCQRAPRLRPCTPRGIVTLLDRYGINTYGLNAVIIGASNIVGRPMSLELLLAGCTTTVTHRFTKDLEQHVRNADLLVVAVGKPNFIPGEWVKPGAIVIDVGINRLENGKVTGDVDFDEASKYASWITPVPGGVGPMTVATLIQNTLQACEEYHDI >NZ_CP026704.1|WP_014656527.1|291133_291346_+|ribosome-associated-protein-YbcJ MDIFRLEGHPHIELCDLLKIEGWAESGAMAKAMIAEGLVQVDGVIETRKRCKIAAGKVVSMGDQKIKVQD >NZ_CP026704.1|WP_004922316.1|291810_292953_-|hypothetical-protein MKYYYFKYKTMMSSVFNKYMTSTVIAFGFIHPVALAANFNAMPGQEIISLGNVNAEITLTKISAVNSSSAIRADGFGINTSSSKVDCLPSSYEMTVGKMKGYRVDQDIIIGFRSTNATGVASVGAGASTSGPFHDVTVKGAWDNYGNYTPSPVQNASTMWCGSAWPEATQHQWNTNRKNNKASIRGELFLYVGNNAKPGSYTLPSLYLIKSASSGDLVSHLIFPSGTVTVSYPPCSISTPTEVSFDTRKGLPVINPTSSISVNCGANDGRAFQIAISGQPVAPSTAVGNHAISLHYSDGTIGGLVRGYIGSNAAADAVGCVDRTSSIPFSVNNQGLNFMQIGAQTASSSQSQPLVWSLCPNKTEKPGKATGAAQLDIIFK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026704_2 | 3006937-3007040 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026704_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP026704_2
>2.1|3006967|44|NZ_CP026704|CRISPRCasFinder TATCAATAGAAACAGTGCCCTCAAAATTGAGGAGGGTTAACGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026704_2
The CRISPR arrays of NZ_CP026704_2 >merge|NZ_CP026704|2|3006937-3007040|CRISPRCasFinder TGTGATTATTGCCATAGCCGGAAAGGGTAATATCAATAGAAACAGTGCCCTCAAAATTGAGGAGGGTTAACGATTGTGATTATTGCCATAGTCGGAAAGGGTAA >NZ_CP026704|2|2|3006937-3007040|CRISPRCasFinder TGTGATTATTGCCATAGCCGGAAAGGGTAA TATCAATAGAAACAGTGCCCTCAAAATTGAGGAGGGTTAACGAT TGTGATTATTGCCATAGTCGGAAAGGGTAA
>NZ_CP026704.1|WP_014657967.1|3006622_3006814_+|hypothetical-protein MQKTTKKKTNRYFNGVPTTRLIVTCEQSVIDKVDAHIRADRVTRGNRAEFVRQAIIEKLQRDT >NZ_CP026704.1|WP_014657966.1|3006093_3006546_+|ProQ/FinO-family-protein MTINQRKTLTLKRKNPPATNTPKSIQAKTPQEAPQQPKKKNKADIHAKKKQRRIDRIAKHWTLFSEPEAKPLMIGIKEAMIAEVADKGLDIPESHIKQGLHAYINRKAYLKALILGGNRFDIHGQPSGEVTPEQQATAAQKLKQWGKPEQ >NZ_CP026704.1|WP_014657965.1|3005313_3006051_+|competence-protein-CoiA-like-family-protein MLTANTDLGDRIVAKEAVKKGVRYFCPECHSEVILKQGKVLTAHFAHKPPVSCYYGSGESEQHRRAKEEISKALQFWEDTEYVEIEKSFGDVRADIYAVIRNVKVAIEIQKSTLTPEIIVKRTEAYTKKGIYILWIALADERINKYSYIPKWWEKWLHAAYFGRLYYWDCLDSVIPVSFGDVQTYVEETSWGGGYMKTLKRYKRPIQHSPVSIVESFTPAFGKAWSYGSFQIPNRLIFTQRKEIK >NZ_CP026704.1|WP_014657964.1|3002561_3004934_+|toprim-domain-containing-protein MKPIDIIREVKLKANGQWQNILSSLGVEVPLNTHTACPACGGKDRFRFDDKDGNGTFICSQCGAGDGLDLIQRIFGGSVTEAAQEVASIIGIDTRSDNPPTYSSDEVKAQQEAQRAQQEETKAREKAEKHKRFTERYSRTIAHIKRGESDYIKAKGFQGVEMDLLPDGSLIIPLLDGNGTITAAQTIKPNGEKRLLLDSSKNGSYYPINEPINVHTVIIAEGLATAMTCHLIQPEAYTVAAIDAGNLIHVAKVMRTKYPESKIIIAGDNDIKPDQSNTGKLAAEKAAKAVNGITALPPTDDKADWDDYRLSHGIEAARQAFNEVLGLQGGKAIMKPKNTKRKMKPRNNLAQLADNEKALLLAEQYEGVAVHPESEAFYTYQQGVWLKTSFLDLSREMGRVYMQHNTNFSKRALNNVVEALKIVAPVMGEPCQSLIPFSNGVFDIKTKLFSPHSPSNWLLNHNGIEYTPAKPDENLRDDAPNFHKWIDHAANSDPYKMKRIFAALYMVLANRYDWQLFLEITGEGGSGKSVFTQVATLLAGQHNTASGNMAALDTARGRAQFVGKSMITLPDQPKYTGEGTGIKAITGGDAVEIDPKHEQQYTEIIRAVVIATNNTPMIFTERAGGVARRRVIFQFNNKVKDEDKDPLLSKKIAEEIPVIVRRLLATFDDPEEAKMLLIEQRDSAEALEVKRASNPVLDLCAALAFMSEPRGLEMGGGRKVEEERQPRKYLYHLYLSFIEYQGLGRPLSVTEFGKAIKEAAKEYKSEYLTRTINGRRQTNVQLTDDVNAFL >NZ_CP026704.1|WP_014657963.1|3001950_3002547_+|hypothetical-protein MNISNINAFEHSEYGVILITGAANQEAISYSEALDALNDGSFDGDLLLGFELVLAISKGERDAFFNPTNQQRVVLWRWIVAASFVMEQADNNGSHQADNGKGGKITAAVYRNKHAALTIYAASERLLLANHVEGVAYEAFGSNDGASMAIRMYMDFINLEPRQGCRLSDRGREGLSILHDDLIRAIENGEFGNTATIH >NZ_CP026704.1|WP_014657962.1|3001756_3001951_+|hypothetical-protein MKQEQKRELEMLLEPHQSKVLMLITLLSTWLEAEECNETRDMIWAVLIVVYSIRDEMNEAAEGK >NZ_CP026704.1|WP_014657961.1|3001583_3001757_+|hypothetical-protein MRTFQIAGYGTTPKGLTLGINRRVISATQKEAQSQVMREAQRDGLTDIRINYVREVK >NZ_CP026704.1|WP_014657960.1|3001377_3001587_+|hypothetical-protein MKTIKLKVGHLSALKEVEHINEEIQALLTPLLTAVENEADTDTHFPLRAVNRLVCAQGKEITRLAEVLK >NZ_CP026704.1|WP_014657959.1|3001201_3001381_+|hypothetical-protein MSKPIPLDVATYKAQQCNSLFTVILEQASNECSKELLDLISIACDLNEEIWQSLAEATK >NZ_CP026704.1|WP_014657958.1|3000263_3001205_+|host-cell-division-inhibitor-Icd-like-protein MITLCSIKGIAYQVNDSLLAGNNSILANRSLTKNLVNQSAKIYANQSGEYFSDCNSGEHLSTPKRGSAKRGEFTPFDKGDFSHLIQGLIGVTTQGRIEFFEFIKKGSQSATLGNVDIEYRASENYQDSDHFAVSTDKSECLVKNFDDNHFTFLLTFGYSKNALAKSSVRIGVLNQLTATHDAPCVFFCVNAYAHLLNAVLYRAYSMVAAAEQPKGWLESVNSSNANSTVVTTPEIGVSSGDSLTKLTEIIVMMATPTQTQFKFLFLAVKRTDKTDTPHRIEATASNEHDARLMLVRDYILSFAGRLPVKEVAA >NZ_CP026704.1|WP_158309817.1|3007323_3007497_+|hypothetical-protein MMLRKGTQAGTQRNDIIRIGNYLIIPRTSLWVCTEIAYFNLLTWLPLWLPAKRHILR >NZ_CP026704.1|WP_014657968.1|3007574_3007763_+|hypothetical-protein MLQREAIEAVMMELAHQQGLSLNGRDRLDIRTGVAQIIQAKERHRRRMTAPTYQWTMPEPKR >NZ_CP026704.1|WP_104873370.1|3008213_3008786_+|cytochrome-b/b6-domain-containing-protein MSILKSIWDFLGLYQTKKIRILHVLILLLVISQIIVSNWMTGTKSVVIPFFEETYLFTWIHIVSGFVLFFLTFFLVVLCFNQRGFRYFYPYLWGDFKQIKEDINSLLAKKLPDSSPKGLAATVQGLGLGALSIVILSGIAWFFLWLQQSPLALEARSIHKSLTILIEIYIYGHGGLGIIHFIIWKKSKNK >NZ_CP026704.1|WP_014657971.1|3010361_3010766_-|hypothetical-protein MSQDFNVYLSSKSLPSPFEWQAEIAKVNKSLIMDTDFDLLTFSGFLPYQLDNEITGFEYGSWFMDDDHKKEINIPTADFCILFSVGNRPLELIAAVISAYCLVKLTDGVLSDPQAGIHIPPSQIDSWMKAMLAK >NZ_CP026704.1|WP_039021677.1|3010870_3011527_-|IS1595-like-element-ISEc75-family-transposase MRKSRLSQYKQERLLELFIAGSTARIAAELVGVHRNTAAYYFHRLRVLIAEHVDKHSWFDGEIELDESYFGGRRKGLRGRGAAGKVPVFGLLKRGGKVYTKVIPDAKSRTLLPIIESKIYPDSIVYTDNFASYDVLDVSDFKHYRINHSTQFVDKKDRQNHINGIENFWNQAKRHMRKFNGIPKAHFELYLKECEWRFNTPSAKQQLTMLKQIVKGKI >NZ_CP026704.1|WP_036943657.1|3012394_3012799_-|DUF2251-domain-containing-protein MTILVTAQEQIIVGQEKVIESLAPEGTFAAVFEDDGETGYFYALDESADGNPIQDALHIYNVEDISDRNIPSDVKIGWSEDSLKCVLLINNYPHGIFNFETKNGYCRSGFPPPTNHKWSILGHEWNDTVHDFFK >NZ_CP026704.1|WP_004918271.1|3013083_3013971_-|PhzF-family-phenazine-biosynthesis-protein MQNEATYSVEHGVKVYLVNSFTQNNSGGNPAGVVLNPPNLSIAQKIAIARQVGFSETAFVYTGKETDFEVDFFTSEGEVDFCGHATLAVFFTLASLNLLTPGSYTQKTKAGILNVTVSPDSIVMDQALPITRHGPDVEDIAAAIGIRPEAITGTGFPIEIISTGLPDIIIPVQAGQLDILHPDHDAIANLSREFGTIGFHVFELSHHAPITAHCRNFAPLYGIDEESATGSASGALGCYLVNHVLPNETHFLLEQGRAMGCSSMIQVTIDRQAQAIRRVRVGGQATMIGTRVISI >NZ_CP026704.1|WP_014657981.1|3014611_3015280_+|hypothetical-protein MRKLSVLCVCMVALSGCAVTEYNYTPSSHKVSEPKIGTVNTISIGQPLVRDGVISEIDGIKVLDSTQIDLAYKVTPGTFKKVGESDKGDFYMPTNTNDSGSVVVEVIGQPWTSLLVKKESHELCVVTEFNVFICSDKAKFDKVKLSNPAGNSFEEALIFNGKNGDSVNIGYRQIGSNIENQGFNNDIQYDLKKSNIISYKGAKIKVLDSSEQSITYEVLSHF >NZ_CP026704.1|WP_088498581.1|3016017_3016470_+|hypothetical-protein MKKPISLWIIQIIIIINISSFLFYLLKNTSFLFVVYKMNIPLYLKIETYFFNAIMLLVLVIQVAALYLSFKRNRLARIFTLLGWFCFLISFLYSNFSGGWASIPEGPIRYDSDLERLGALWGKYEETALCLLLTAFLCFSKKMKQYFQFN >NZ_CP026704.1|WP_061064789.1|3016636_3016921_-|hypothetical-protein MFNLYTEDNYILALQKAIAQKNLDWHVYRDDTESDIKKLIEQGARLLVCAPGLKYMFYRKGFDRKNIIYLDTLEYANNVTTPVIDRIVELENLQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP026704_3 | 3157730-3158135 | Unclear |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP026704_3
|
6 spacers
spacers of NZ_CP026704_3
>3.1|3157758|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAAACAGCACCCGAATTCCATCTGCATCAA >3.2|3157818|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCAAACATGGCATTTATCATTGTCATCTTTT >3.3|3157878|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTACGATGCGTACTGGTAAGACTGCTAGTGC >3.4|3157938|33|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCATCACGAATACACCAGGCTATCGAGTAAGG >3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGAGCAAGCGAAAGCTAAAGAAGTTTATGAC >3.6|3158059|49|NZ_CP026704|CRISPRCasFinder TAAGACGCGGGTTCAACTCCCGCCAGCGCAGTAATAAAGGGAAAATAAA |
cas1,cas3-cas2,cas5f,cas7f,cas6f |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026704_3
The CRISPR arrays of NZ_CP026704_3 >merge|NZ_CP026704|3|3157730-3158135|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAATTAAACAGCACCCGAATTCCATCTGCATCAAGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATGCAAACATGGCATTTATCATTGTCATCTTTTGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATCTACGATGCGTACTGGTAAGACTGCTAGTGCGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAATCATCACGAATACACCAGGCTATCGAGTAAGGGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAACAGAGCAAGCGAAAGCTAAAGAAGTTTATGACGTTCACTGCCGTATGGGCAGCTTAGAAATAAGACGCGGGTTCAACTCCCGCCAGCGCAGTAATAAAGGGAAAATAAAACTCACATTGGTATAGGAAGATTAGACA >NZ_CP026704|3|2|3157730-3158058|PILER-CR GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTAAACAGCACCCGAATTCCATCTGCATCAA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGCAAACATGGCATTTATCATTGTCATCTTTT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TCTACGATGCGTACTGGTAAGACTGCTAGTGC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATCATCACGAATACACCAGGCTATCGAGTAAGG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CAGAGCAAGCGAAAGCTAAAGAAGTTTATGAC GTTCACTGCCGTATGGGCAGCTTAGAAA >NZ_CP026704|3|3|3157730-3158135|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTAAACAGCACCCGAATTCCATCTGCATCAA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGCAAACATGGCATTTATCATTGTCATCTTTT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TCTACGATGCGTACTGGTAAGACTGCTAGTGC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATCATCACGAATACACCAGGCTATCGAGTAAGG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CAGAGCAAGCGAAAGCTAAAGAAGTTTATGAC GTTCACTGCCGTATGGGCAGCTTAGAAA TAAGACGCGGGTTCAACTCCCGCCAGCGCAGTAATAAAGGGAAAATAAA ACTCACATTGGTATAGGAAGATTAGACA >NZ_CP026704|3|1|3157730-3158058|CRT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTAAACAGCACCCGAATTCCATCTGCATCAA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGCAAACATGGCATTTATCATTGTCATCTTTT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TCTACGATGCGTACTGGTAAGACTGCTAGTGC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATCATCACGAATACACCAGGCTATCGAGTAAGG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA CAGAGCAAGCGAAAGCTAAAGAAGTTTATGAC GTTCACTGCCGTATGGGCAGCTTAGAAA
>NZ_CP026704.1|WP_014658063.1|3156536_3157472_+|flagellar-hook-associated-protein-FlgL MRLSTNMIYHQRLQDMNNAQARWMDAGSQLASGKRVSKPSDDPQASSQAVRVNQSENRNQQYVASRGFAKTGMLLQMSVLTQMTEVTTQIDTTIIQASNQGSLSDSDRMSLAEQLSGLKDQLVALGNTTDGNGRYIFAGYKSDKPPFEVNAAGDVIYKGGDKAIMQNVSSDREMTTYFTGAQVFATDSNNVVNVFKALNEGIAALKTPQDQATQSEKEAAQKALDSANTAVKSALDKISNIESKQGLQLQEIDQLNFLADTRSIQNSQRISELLDTNWTGVTTDYYKEMAMFQASQDIFKDLNSMSLFGGR >NZ_CP026704.1|WP_014658062.1|3154868_3156509_+|flagellar-hook-associated-protein-FlgK MLNNVMNNALSGVNAAQGGLSVISNNLANAGVGYYHRQSAVFGENPGTMTPNGYFGNGTYFSHVRREFDEFINQQYGQSRARSGEYEAYAKNSSQVDDLLTNDIEDISSNIGSFFTALDAASSDASDKTLIDVFLGKSNALVGQFKEADRRLQEMERDVNRQIETKVKDINTYAEKIAGLNQQIARVRSVSGSEPNDLLDVRDRLVSEINSLIGVKVIEQNGNYNVTFANGLPLVTGENANRLEAVPSSQDDSRFSIGFVGANGQVREIADDAFRGGELSGVLRSRKEVIDPAYQKLNKLALVFASKFNEVHKKGFDANGNPGKDFFEIGKGNVVSNTFNRGKAEFDFNYSDVSQVTGNNYEMRFDGKEWNVTRLPEGFAVTVDRSTPDTLKFDGIELKITQNNAQSGDSFLVKPVNGVINGMQSLISDAANFAAAGEKGSGPGDNDNLKELVKLQDQKLIGGTSTFSDYYATIVNDVGNQTKQAQIDSETQNKMTESFYQQEQAVSGVNMNEESIQMQKIQQFFNANAQVLKTVDDLFNALMRAF >NZ_CP026704.1|WP_004918619.1|3153643_3154624_+|flagellar-assembly-peptidoglycan-hydrolase-FlgJ MNDMQLMQGAAFDLQSLSHLKRELTDSPDKGLRQVTQQLEATFVQMMLKSMRDALPQDGLFSSDQTRMLTSMYDQQIAQDLSQKGLGFGEMMYQQLTQMQGDTSSEDVPVKPFNMDDRLIDSLPNQAMAQIVRRFAPLGDALSSSMQKVKSLSLNSQNFISRLIEPAKVASQKSGISHLLVLAQAALESGWGRREILTAEGKTSHNLFGIKAGKSWQGPVTNIMTTEVINGKSIKMRDDFRVYGSYEEAIADYINLLTENPRYRDVKHAQSPEVAARRLHQAGYATDPNYADKLITLINQIRGYQTADKAASRAVQAYTVDLSDIF >NZ_CP026704.1|WP_014658061.1|3152540_3153644_+|flagellar-basal-body-P-ring-protein-FlgI MNKLVTLLLTLLCLFATSAYSERIKDLTTVQGVRDNALIGYGLVVGLDGTGDQTMQTPFTTQSLSNMLSQMGITVPPGTNMQLKNVAAVMVTAKLPPFARSGQAVDVVVSSMGNAKSLRGGTLLMTPLKGVDGQVYAMAQGNILVGGAGASAGGSSIKVNQLAGGRITGGATIERELPTSFGQNGIINLQLNDDSFTLAQDISDAINRLRGAGTATPLDSRTVQLRVPMNNSDQVRFLAQIQELNVRTPIAEAKVILNSRTGSVVINRSVTLESCAVAHGSLSVMVERQTQVSQPNTPFAGGQTVVTRNTNIGVREQGGALQKVNASVQLNQVIQALNTLGATPTDLMSILQAMESAGCLRAKLEII >NZ_CP026704.1|WP_014658060.1|3151767_3152499_+|flagellar-basal-body-L-ring-protein-FlgH MTKNGFTPEIKGDSFFSPSKVLVIALVLATSGCAYVKPRPLVDTQTSALPTAPTAPAPNGAIFQSAQPAYYGYQPLFEDRRPRNVGDILTINLQENVSASKNSSANANRSGKTGFLAAILPGFMQGWLGGSNTELDVKGSSDFSGKGGANANNTFRGTITVTVDQLLANGNLHVVGEKRIAINQGTESIRFSGVVNPRTIGADNNVSSTQVADARIEYVGDGYINESQTMGWLQRFFLNVSPY >NZ_CP026704.1|WP_104873393.1|3150859_3151642_+|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgG MIRSLWIAKTGLDTQQTNLDVISNNLANVSTNGFKRQRAVFEDLLYQNIRQPGAMSSEQTSLPSGLQLGTGSRPVATMRIHSQGALNKTGNTTDIAIKGQGFLHVQLPDGTDAYTRDGALQPNQDGQLVTSSGYQIVPAITIPDNANSLTIARDGTVSITVYGDNQPQQIGQITLTTFINDAGLESMGENLYMETASSGASNESAPGTNGAGLLYQHMLETSNVNVAEELVNMIQTQRAYEINSKAVSASDQMLQRLTQL >NZ_CP026704.1|WP_004918610.1|3150084_3150840_+|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgF MDHVIYTAMGGARHALENQAIVSNNIANVSTSGFKAQLAAMRAVPIHGDSEQTRTLVVASTPGADMSQGPLNYTGRPMDVALNDKHFLAVELADGSEAYTRNGNIQISPDGELVIGERRLQGDGGPINVPPNAELTIGEDGTVTALLATDPPTMLGQIGRLKVVEAQPQDLIRGEDGLFHLSPQAAAANGNGLAQSERASVTSGVIEGSNVNAAEAMVSMIANARYFEMQMKVVRSADENAQKANQLLAVS >NZ_CP026704.1|WP_104873392.1|3148848_3150069_+|flagellar-hook-protein-FlgE MSFSQAVSGLNAASAGLDSIGNNIANSATNGFKGATTSFADMFAGSGVGLGVNVAAVTQNFKDGPITRTDRPTDVAISGNGFFRVRDQNGDIFYSRDGQFIRDKSGNLVNNQGMTVTGYPAGLDENGNVVVQSGGVPQGLNIPTDMMDAQASDLAKLTINLNSEDKVKSKPFDINNPDDTGSYNFSTTMTAFDSQGNTHEISVYFVKTDDNKWTAYAKDAGDKVAKKLGDMEFDGNGRLNSPTNAVFAFDYQGLNGANNGTLQIDLNKTRQQKVSESSVSAIDVNGYPAGEYTNFKVEDNGLIVANYSNQQKRVVGQVALSAFANPNGLVSQGGNVWAPSNASGNPMDGVPGVGQFGKLTSGALESSNVDMSQELINMIVMQRNYQSNAQTIKTQDQMLQTMVNLR >NZ_CP026704.1|WP_061064158.1|3147978_3148818_+|flagellar-basal-body-rod-modification-protein MGIAATMYDSLDNTTAGPEPLKSNIPNKNKSQTDDMRDTFLKMIVTQMQNQDPTKPMENAELTSQLAQIATLESMNKLSDKVSGISSQIGSGQSLQATQLVGKGVLIPRNEIVLAPLKTQNDSDNTAISKPTNPLPDDETSRALSAANDNGGDDDASQGDYISSPFGFFLPKMADSVEITIRDKNRAIIRTISYDTEVKPDIYDMSWDGRDDNGKLVADTNSKYFFDVRAVSNGAEIEVTKLGYTRVNGVTPGTDAPLLDVGIGQSVPLSSIFKVYPSS >NZ_CP026704.1|WP_004918605.1|3147561_3147966_+|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgC MALLSIFDISASALTAQSQRLNVSASNMANAESVVGPDGEPFRAKQVVFQMTPQGRNGVGGVRVSQLIEDPTPPRMEYKPGHPLADEKGYVRMPNVDMVGEMINTISASRSYQANLEVMNTAKTLLQKTLTIGQ >NZ_CP026704.1|WP_104873394.1|3158400_3159378_+|type-I-F-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MDDFSPADLKTILHSKRANMYYLEHCRVMQKDGRVLYFTEAKNENLYFNIPIANTTVLLLGTGTSITQAAMRMLSQAGVLVGFCGGGGTPLYMSTEVEWLTPQSEYRPTEYLQGWMRFWFDDKKRLAAAKTLQRSRISYLQKTWQSSRELQNEGFIYNDTLIQNALETFHTRTEAADDPQTLLLTEAQLTKALYKYAANNTGQKNFTRQHQAMDKANAFLNHGNYLAYGLAASCLWVLGIPHGFAVMHGKTRRGALVFDVADLIKDAIVLPWSFICAKEGASEQEFRQQILQSFIDNHALDFLFDTVKTIALHTGSEQQIQEPKL >NZ_CP026704.1|WP_004918638.1|3159374_3162923_+|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MMVTFVSQCEKHALKRTRRVLDAFANRIGDNTWQTLITEDGLQTVKKMLRQSASRNTAVSCHWIRSRSRSQLLWVVGNRNKFNSQGHVPVNRTEKSFLGSEFENDWKYLSLIAAVARLAALFHDWGKASRLFQDKLNPAVKMPFKGDPVRHEWVSSILFSSLVKIHSAEGSEEKWLDALIHQEWDESQLQQCVNDNCLASNPLAELPDAAALLTWLILTHHKLPFLDEQELCNWQDKAINLHTQLLAKIKQSWGYRNGNDDAQFQQRIKMCFEFPNGLLSNSKAWVQAVQQAATDLKNQLPLFQQAMADGSWRVIAHYARLCLMLGDHNYSSQGNDPQWHSDIALYANTHKIRNINNIPQVTFKQKLDEHLVKVAETARDIAETLPYFESEPPFASDVPKLAYDKNSTGKFSWQEDAVNSIYQYRKERNDDIKGYFIVNMASTGCGKTRANAKIMQALSEDKQSLRYILALGLRTLTLQTGDEYKDQNKIGLGERDLAVLIGSKAVAQLHQNAKENENASEASNDTSSHQTNSESNDLKPHQTGSESQEMLFDENEEMLRWDENKWSGILPEEVLSTVLTREKDRALLYAPVLACTIDHIIGATETIRGGRYILPCLRLMSSDLVIDEVDDFIEADSAAIARLIHMVGLLGRKVMISSATITPDTALAYFHAYQSGWHAHAKSRQQSLEIGCMWIDEGEYDPVKEKCKSSTLAATLVANDENTPYFYQQYHGKFIDKRAKVLGQQPARRKALIVPTPKDNTQESQQCYFNHILNAVLTQHHYHAFLDKRTGIQVSFGVIRVANILPCIDLTRFLLECECPDEVEIRTMAYHSQQVLLLRHEQEQHLDSVLKRKEKSGEEPDALNDAIIRQHLAQVSAEGKAKHLIFILVATPVEEVGRDHDFDWAVVEPSSWRSIIQIAGRVRRHREGEVAQPNMALLQYNLKGFEEGNDNPFSRPGYENRYINLGLSTHDLYELVDEQQLNKSVDAIPRIQKQANYESKKHTNLACLEHAAIKYTFKIEHIFPPKRAENSATSSRRTTRRSNHQTIPSNAASHIWGYTHGNWWMTAISQQIASFRSGAPSFRLVLEILPRGEMQFSEYHRENGWVNVGAQNGIHFIEFPESMKKRLWLVRDYAKSLESQTEEAEQITSLSRFYGEITFLKCLNVHDGYRYDDQMGVYPIKR >NZ_CP026704.1|WP_173914470.1|3163744_3164550_-|IS5-family-transposase MVGNKWQISDELWEKMAPLIPEHKTHHPLGTHRKRVDNRAAMNAIFFVLRTGCQWNALNATGICSSSSAHRRFQEWRDAGVFERFWQNGLLASEQLDAIDWSWLSIDGCMTKSPLAGKKTGRNPTDRGKQGVKRSLMTDANGLPLALVVAGANTHDIKLVADTLDALQTGRPCKRLRLCMDKGYEAEWLGSYLKSRRYEPHIQSRKDESEAIKNTDFKAHRWVVERTHSWMNRYRRVLTRWEKKVENYEAMLHFACGVIVWNKNLLG >NZ_CP026704.1|WP_104873395.1|3165213_3166161_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MNNSMNLIKLSHLKVHNANALSSPFTIGFPAMTAWLGFMHALELKLRKIGFLELQLESIAVISHECNLQTYKGPSDFVSSIVGTGNPLDKEGNRSAFIEEARCHLDVSLLIEFSDRNDEYGNVLTDKSIIDRIYELIPMMKLAGGDILSVDLPQMHYLPANDDMGKYRRSLFNSLMPGYALIERRDLMVSAMEDGQDAMDALLDYVTVHNQCVEVDIQNESKNKHYEWKVQRKTAGWIVPIATGYQGISPLGQAKNQRDPNVPHRFAESLVTLGQFVMVNKIGHPNEILWKYSNNLENSLYLCQQVESKYFTSGE >NZ_CP026704.1|WP_104873396.1|3166163_3167189_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 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MLTITSETLTLWLSQGFYPFIRLLALFGTAPFFNEKQSITKVRVILAFFIILIVSPQLPVVNIPLFSAMGLWVIVQQIVIGVAIGLTMQMAFAAVRHAGEVIGLQMGLSFATFFDPTGGPNMPILGRILNLIMLLLFLSFDGHLWLIYILIHSFELIPIQVSPLSRDGFWSLAQFASSIFINGLMLALPFITLFLILNLALGILNRMTPQLSVFVVGFPLTLTIGISMLGLIISILPRYSERLIHQAFEQLSLMFGLLGG >NZ_CP026704.1|WP_004918656.1|3170766_3171036_-|flagellar-biosynthesis-protein-FliQ MTPESVMALGTEAMKIALMLAAPLLLAALVAGLTISLLQAATQVNEMTLSFIPKILSVIAVIIIAGPWMLNLLLDYMRTLFSNLPFIIG >NZ_CP026704.1|WP_004918662.1|3172673_3173102_-|flagellar-biosynthetic-protein-FliO MKTTPFISQTEQPSSQISPAISNSDSLVQVSGALGGIILLILAGAWLVKKLGFAPRNLGKPSLIKVKSSCSLGNKERVVVVEMNNEWLVLGVTAQSVNLLHQCPAKNETALTSVTEPLTFQSILKKKQDAANHAASNLSNYN >NZ_CP026704.1|WP_004918665.1|3173126_3173543_-|flagellar-motor-switch-protein-FliN MSEAKNSPDASTNHDSEDLWAEALEQQKKAESASAGAQAFANLDGQNALNQLSDINLIMDIPVRLSVELGRTKMTIKKLLSLSQGSVVSLDGLAGEPLDILINGYLIAQGEVVVVSDNYGIRITDIITPSERMRRLSR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026704_4 | 3167974-3168542 | Unclear |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP026704_4
|
9 spacers
spacers of NZ_CP026704_4
>4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACAAAGATTATTTTTTCAAGCCTTCATTTG >4.2|3168062|33|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCACGGAAGTGATTGACGCAAAGTTACGCTAC >4.3|3168123|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACGATTTACATATAGTGATATCCGTCTAACAT >4.4|3168183|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCCGCATTTGCTATTGGAGTGTCATCAAGAA >4.5|3168243|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAGTTGACCATTTCGAATATTGCATAAAGT >4.6|3168303|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAATAATAGGAGCTCTATCTAGCCATTGCCA >4.7|3168363|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGAGATATACCTGTTCCGCTCCCGTAAATGC >4.8|3168423|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGCTGAACCTCTTCATGCACTGAGTCTCGCC >4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGTTGTTCGTGTTGAACAAGGCGAAACCGA |
cas6f,cas7f,cas5f,cas3-cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026704_4
The CRISPR arrays of NZ_CP026704_4 >merge|NZ_CP026704|4|3167974-3168542|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATGACAAAGATTATTTTTTCAAGCCTTCATTTGGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAATCACGGAAGTGATTGACGCAAAGTTACGCTACGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAACGATTTACATATAGTGATATCCGTCTAACATGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAAGTCCGCATTTGCTATTGGAGTGTCATCAAGAAGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATTTAGTTGACCATTTCGAATATTGCATAAAGTGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATTAATAATAGGAGCTCTATCTAGCCATTGCCAGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAACAGAGATATACCTGTTCCGCTCCCGTAAATGCGTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAATTGCTGAACCTCTTCATGCACTGAGTCTCGCCGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAGTTGTTGTTCGTGTTGAACAAGGCGAAACCGAGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA >NZ_CP026704|4|3|3167974-3168542|PILER-CR GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TGACAAAGATTATTTTTTCAAGCCTTCATTTG GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA ATCACGGAAGTGATTGACGCAAAGTTACGCTAC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA ACGATTTACATATAGTGATATCCGTCTAACAT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA GTCCGCATTTGCTATTGGAGTGTCATCAAGAA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTTAGTTGACCATTTCGAATATTGCATAAAGT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTAATAATAGGAGCTCTATCTAGCCATTGCCA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA CAGAGATATACCTGTTCCGCTCCCGTAAATGC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTGCTGAACCTCTTCATGCACTGAGTCTCGCC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GTTGTTGTTCGTGTTGAACAAGGCGAAACCGA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA >NZ_CP026704|4|4|3167974-3168542|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TGACAAAGATTATTTTTTCAAGCCTTCATTTG GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA ATCACGGAAGTGATTGACGCAAAGTTACGCTAC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA ACGATTTACATATAGTGATATCCGTCTAACAT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA GTCCGCATTTGCTATTGGAGTGTCATCAAGAA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTTAGTTGACCATTTCGAATATTGCATAAAGT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTAATAATAGGAGCTCTATCTAGCCATTGCCA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA CAGAGATATACCTGTTCCGCTCCCGTAAATGC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTGCTGAACCTCTTCATGCACTGAGTCTCGCC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GTTGTTGTTCGTGTTGAACAAGGCGAAACCGA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA >NZ_CP026704|4|2|3167974-3168542|CRT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TGACAAAGATTATTTTTTCAAGCCTTCATTTG GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA ATCACGGAAGTGATTGACGCAAAGTTACGCTAC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA ACGATTTACATATAGTGATATCCGTCTAACAT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA GTCCGCATTTGCTATTGGAGTGTCATCAAGAA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTTAGTTGACCATTTCGAATATTGCATAAAGT GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTAATAATAGGAGCTCTATCTAGCCATTGCCA GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA CAGAGATATACCTGTTCCGCTCCCGTAAATGC GTTCACTGCCGCATAGGCAGCTTAGAAA TTGCTGAACCTCTTCATGCACTGAGTCTCGCC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA GTTGTTGTTCGTGTTGAACAAGGCGAAACCGA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA
>NZ_CP026704.1|WP_004918644.1|3167197_3167833_+|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MDYYQEITLLPDSTIPLDFLWQKVYQQIHIALVENKSEAGDSEVAVAFPEYGSVGFRLGKKLRLLAKTEKTLTQLNISHWLMRLADYVHIKSIQAVPEHATPISYVRQHVKGAKRLELDRYKKAQLYSVKSGQPIEVCLSAIKEPQTRSRLPFIWMESQQTKSKTEGDGHRPFPLFIRCVAAKEAKAGTFNCYGLSQSMGKGEEVATVPHF >NZ_CP026704.1|WP_104873396.1|3166163_3167189_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy3 MAKNNDVASVLAFEKKLVPSDGYFYGTSWDHKSQCTPLVLQEKSVRGTISNRLKGPVKNDPLKLNAEVEKANLQTVDACALGTQQDTLKHQFTLKILGGVETPSACNNASFKESYTKAAKEYIAREGFRELGRRYAHNIANARFLWRNRVGAEKIEVEVRVLNKGQEQQWTFDATQYSIRSFEKQDDKVNELGAKIAAALANSEGALLLEITTYAQLGQSQEVYPSEELVLDKGKGDKSKILYHVNGHAAMHSQKIGNALRSIDTWYPDYNDEVNSAGAIAIEPYGAVTNLGRAYRTPSDKQDFYTHFDKWARGEKLARLEDEHYVMAVLVRGGVFGESDK >NZ_CP026704.1|WP_104873395.1|3165213_3166161_+|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MNNSMNLIKLSHLKVHNANALSSPFTIGFPAMTAWLGFMHALELKLRKIGFLELQLESIAVISHECNLQTYKGPSDFVSSIVGTGNPLDKEGNRSAFIEEARCHLDVSLLIEFSDRNDEYGNVLTDKSIIDRIYELIPMMKLAGGDILSVDLPQMHYLPANDDMGKYRRSLFNSLMPGYALIERRDLMVSAMEDGQDAMDALLDYVTVHNQCVEVDIQNESKNKHYEWKVQRKTAGWIVPIATGYQGISPLGQAKNQRDPNVPHRFAESLVTLGQFVMVNKIGHPNEILWKYSNNLENSLYLCQQVESKYFTSGE >NZ_CP026704.1|WP_173914470.1|3163744_3164550_-|IS5-family-transposase MVGNKWQISDELWEKMAPLIPEHKTHHPLGTHRKRVDNRAAMNAIFFVLRTGCQWNALNATGICSSSSAHRRFQEWRDAGVFERFWQNGLLASEQLDAIDWSWLSIDGCMTKSPLAGKKTGRNPTDRGKQGVKRSLMTDANGLPLALVVAGANTHDIKLVADTLDALQTGRPCKRLRLCMDKGYEAEWLGSYLKSRRYEPHIQSRKDESEAIKNTDFKAHRWVVERTHSWMNRYRRVLTRWEKKVENYEAMLHFACGVIVWNKNLLG >NZ_CP026704.1|WP_004918638.1|3159374_3162923_+|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MMVTFVSQCEKHALKRTRRVLDAFANRIGDNTWQTLITEDGLQTVKKMLRQSASRNTAVSCHWIRSRSRSQLLWVVGNRNKFNSQGHVPVNRTEKSFLGSEFENDWKYLSLIAAVARLAALFHDWGKASRLFQDKLNPAVKMPFKGDPVRHEWVSSILFSSLVKIHSAEGSEEKWLDALIHQEWDESQLQQCVNDNCLASNPLAELPDAAALLTWLILTHHKLPFLDEQELCNWQDKAINLHTQLLAKIKQSWGYRNGNDDAQFQQRIKMCFEFPNGLLSNSKAWVQAVQQAATDLKNQLPLFQQAMADGSWRVIAHYARLCLMLGDHNYSSQGNDPQWHSDIALYANTHKIRNINNIPQVTFKQKLDEHLVKVAETARDIAETLPYFESEPPFASDVPKLAYDKNSTGKFSWQEDAVNSIYQYRKERNDDIKGYFIVNMASTGCGKTRANAKIMQALSEDKQSLRYILALGLRTLTLQTGDEYKDQNKIGLGERDLAVLIGSKAVAQLHQNAKENENASEASNDTSSHQTNSESNDLKPHQTGSESQEMLFDENEEMLRWDENKWSGILPEEVLSTVLTREKDRALLYAPVLACTIDHIIGATETIRGGRYILPCLRLMSSDLVIDEVDDFIEADSAAIARLIHMVGLLGRKVMISSATITPDTALAYFHAYQSGWHAHAKSRQQSLEIGCMWIDEGEYDPVKEKCKSSTLAATLVANDENTPYFYQQYHGKFIDKRAKVLGQQPARRKALIVPTPKDNTQESQQCYFNHILNAVLTQHHYHAFLDKRTGIQVSFGVIRVANILPCIDLTRFLLECECPDEVEIRTMAYHSQQVLLLRHEQEQHLDSVLKRKEKSGEEPDALNDAIIRQHLAQVSAEGKAKHLIFILVATPVEEVGRDHDFDWAVVEPSSWRSIIQIAGRVRRHREGEVAQPNMALLQYNLKGFEEGNDNPFSRPGYENRYINLGLSTHDLYELVDEQQLNKSVDAIPRIQKQANYESKKHTNLACLEHAAIKYTFKIEHIFPPKRAENSATSSRRTTRRSNHQTIPSNAASHIWGYTHGNWWMTAISQQIASFRSGAPSFRLVLEILPRGEMQFSEYHRENGWVNVGAQNGIHFIEFPESMKKRLWLVRDYAKSLESQTEEAEQITSLSRFYGEITFLKCLNVHDGYRYDDQMGVYPIKR >NZ_CP026704.1|WP_104873394.1|3158400_3159378_+|type-I-F-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MDDFSPADLKTILHSKRANMYYLEHCRVMQKDGRVLYFTEAKNENLYFNIPIANTTVLLLGTGTSITQAAMRMLSQAGVLVGFCGGGGTPLYMSTEVEWLTPQSEYRPTEYLQGWMRFWFDDKKRLAAAKTLQRSRISYLQKTWQSSRELQNEGFIYNDTLIQNALETFHTRTEAADDPQTLLLTEAQLTKALYKYAANNTGQKNFTRQHQAMDKANAFLNHGNYLAYGLAASCLWVLGIPHGFAVMHGKTRRGALVFDVADLIKDAIVLPWSFICAKEGASEQEFRQQILQSFIDNHALDFLFDTVKTIALHTGSEQQIQEPKL >NZ_CP026704.1|WP_014658063.1|3156536_3157472_+|flagellar-hook-associated-protein-FlgL MRLSTNMIYHQRLQDMNNAQARWMDAGSQLASGKRVSKPSDDPQASSQAVRVNQSENRNQQYVASRGFAKTGMLLQMSVLTQMTEVTTQIDTTIIQASNQGSLSDSDRMSLAEQLSGLKDQLVALGNTTDGNGRYIFAGYKSDKPPFEVNAAGDVIYKGGDKAIMQNVSSDREMTTYFTGAQVFATDSNNVVNVFKALNEGIAALKTPQDQATQSEKEAAQKALDSANTAVKSALDKISNIESKQGLQLQEIDQLNFLADTRSIQNSQRISELLDTNWTGVTTDYYKEMAMFQASQDIFKDLNSMSLFGGR >NZ_CP026704.1|WP_014658062.1|3154868_3156509_+|flagellar-hook-associated-protein-FlgK 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>NZ_CP026704.1|WP_014658061.1|3152540_3153644_+|flagellar-basal-body-P-ring-protein-FlgI MNKLVTLLLTLLCLFATSAYSERIKDLTTVQGVRDNALIGYGLVVGLDGTGDQTMQTPFTTQSLSNMLSQMGITVPPGTNMQLKNVAAVMVTAKLPPFARSGQAVDVVVSSMGNAKSLRGGTLLMTPLKGVDGQVYAMAQGNILVGGAGASAGGSSIKVNQLAGGRITGGATIERELPTSFGQNGIINLQLNDDSFTLAQDISDAINRLRGAGTATPLDSRTVQLRVPMNNSDQVRFLAQIQELNVRTPIAEAKVILNSRTGSVVINRSVTLESCAVAHGSLSVMVERQTQVSQPNTPFAGGQTVVTRNTNIGVREQGGALQKVNASVQLNQVIQALNTLGATPTDLMSILQAMESAGCLRAKLEII >NZ_CP026704.1|WP_004918654.1|3169981_3170764_-|flagellar-type-III-secretion-system-protein-FliR MLTITSETLTLWLSQGFYPFIRLLALFGTAPFFNEKQSITKVRVILAFFIILIVSPQLPVVNIPLFSAMGLWVIVQQIVIGVAIGLTMQMAFAAVRHAGEVIGLQMGLSFATFFDPTGGPNMPILGRILNLIMLLLFLSFDGHLWLIYILIHSFELIPIQVSPLSRDGFWSLAQFASSIFINGLMLALPFITLFLILNLALGILNRMTPQLSVFVVGFPLTLTIGISMLGLIISILPRYSERLIHQAFEQLSLMFGLLGG >NZ_CP026704.1|WP_004918656.1|3170766_3171036_-|flagellar-biosynthesis-protein-FliQ MTPESVMALGTEAMKIALMLAAPLLLAALVAGLTISLLQAATQVNEMTLSFIPKILSVIAVIIIAGPWMLNLLLDYMRTLFSNLPFIIG >NZ_CP026704.1|WP_004918662.1|3172673_3173102_-|flagellar-biosynthetic-protein-FliO MKTTPFISQTEQPSSQISPAISNSDSLVQVSGALGGIILLILAGAWLVKKLGFAPRNLGKPSLIKVKSSCSLGNKERVVVVEMNNEWLVLGVTAQSVNLLHQCPAKNETALTSVTEPLTFQSILKKKQDAANHAASNLSNYN >NZ_CP026704.1|WP_004918665.1|3173126_3173543_-|flagellar-motor-switch-protein-FliN MSEAKNSPDASTNHDSEDLWAEALEQQKKAESASAGAQAFANLDGQNALNQLSDINLIMDIPVRLSVELGRTKMTIKKLLSLSQGSVVSLDGLAGEPLDILINGYLIAQGEVVVVSDNYGIRITDIITPSERMRRLSR >NZ_CP026704.1|WP_004918669.1|3173535_3174543_-|flagellar-motor-switch-protein-FliM MSDNILSQAEIDALLNDDAPSSNESATQPKDKEQVRPYDPNTQRRVIRERMQSLEIINERFARQFRMGLFNMLRRSPDITVGGIKIEPYHEFARNLPVPTNLNLIHMPPLRGTALFTFEPALVYIAVDNLFGGDGRFPVRSEGKEFTNTEQRIIHRMLKLALSAYRDAWRPIADIDVEYVRSEMQVKFTNITTSPNDIVVTTPFLVEIGNTIGEFSICIPIAMIEPLRERLINPPVEQGHQENEAWVSNLVTQVKRSELELVANFVDIPLRISRLLQLQKGDVIPIEKPDRLIVSVDGVPVLTSQYGTQNGQYALRVEHLINPVLNTLDEESTNE >NZ_CP026704.1|WP_004918672.1|3174548_3175031_-|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL MSSSSNTSKNSNKGLLVLFALLAIAGAGFGGYTWWTTQQTANSVNEEEKSPKLSQPIFMDLEPFTVNLPGLNESPDRVLYINITLRLANEKSRKQLHDFLPEVRSRLLLLLSEQKPKALSTHDGKLQLMQAIKKTLSPTVIPGENDQEITDVLFTTFILR >NZ_CP026704.1|WP_104873397.1|3175196_3176558_-|flagellar-hook-length-control-protein-FliK MDVNNTGSPAITAANGAKNGHTQPNQSRADDNQEVVVPFQAALESQQPTPQKASTSEPTMDKQANQKPTSADERLTTKAHEPSTGKEKEQAEQAIEQLNYSRHLRNGSEQPALQSQLLAQSDAVEQVWLANLKNAVDQQTLSSATTKFADGQRAALVPFAQKTQPLNDSLVAMATMDEPIDLSAQMQLAGEEESPSLGAFIKNEREPRKDQPLFSLNEGRESLTKNLSSDFMPLNKKLADKEAPSSIVPTFATADNGALIKGAFTPTTGSDAIQMAPSSPTQTVSLTPLPNSSQIVSTNVPVIPMQPGVPLGSEAWQQQLNQHMLFFSRQGVSHAQIRLHPEELGSLNVHLRIEDNQAVMHFVSPHSQVRAAMETMMPILRNALQESGIHLAQGSVGQDNFSDQSNADTHSEQGHEKNLYGGQTLSSVTSTEMAAVSPTTSTIRTRGGIDTFA >NZ_CP026704.1|WP_004918676.1|3176558_3177002_-|flagella-biosynthesis-chaperone-FliJ MSKNNALDTLLSLAVEASEEAAKVLAQVRQTQVQMTQQLNMLENYQAEYRQKLNQTLHSGIDADKWQNYQQFLVTLELTIEQQQQQLSLWEQRVSEANRHWQEKQQRVNAFDTLIQRAEQTKNQRLNRLEQKQMDEYAQRAMLRRNQ >NZ_CP026704.1|WP_004918680.1|3177012_3178377_-|flagellum-specific-ATP-synthase-FliI MTVRMSRWIAALEGFESRMKGIPMIRRYGRLTKITGLVMEAEGIKMPLGATCFVERAINDRHDEVVCEVVGFNGPRMLLMPLADLEGIAPGARVYAQTNGDDGQTSRLLPLGDELLGRILDAQGTPLDGKGPLDAKQRAPLITPPINPLERTPIHSVLDVGVRAINALLTVGRGQRMGLFAGSGVGKSVLLGMMARFTQADIIVVGLIGERGREVKDFIENILGAEGLKRAVVVAAPADVSPLLRMQGASYATRIAEYFRDLGKNVLLIMDSLTRYSMAQREIALAIGEPPATKGYPPSVFAKLPALVERAGNGKNGGSITAFYTVLTEGDDQQDPIADSARAILDGHIVLSRSLAESGHYPAIDIEASISRAMTELIDKQHYRQIQRFKQLTSSYQRNRDLINVGAYATGSDPLLDMAIQYYPRMSKFLQQDIDERCDYQSACEQLVHAVPNE >NZ_CP026704.1|WP_014658075.1|3178373_3179105_-|flagellar-assembly-protein-FliH MSKSPINPEAWQPWQLRELNQWDLNASGVSSPEELPEPTKPAVPCLEPQEVLEQINILDNLKEEAQRTGFQQGYELGKKEGYQAGFEQGQREGTEQGRQQALAQEQPIIDTWQKLLSEFHYSLDSFDTVITTKLLQIALTAAKQVLGQSTICDGTALLEEISHLLQQKPLFSGQPELHVNPAHTALIEQHLGSLLNLNGWRLVGDPKLHLGGCRVVAEDGEIDMTVATRWQELCRLYAPETLS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026704_5 | 3242121-3242688 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NZ_CP026704_5
|
9 spacers
spacers of NZ_CP026704_5
>5.1|3242149|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTAAACAAGGCATCAATAGCCATTTGCTCAT >5.2|3242209|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACTTCGGGGCGATGTGATCATGGTGCGAGT >5.3|3242269|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAAGCAGGTGCGCGCTTCTATTTTCGCGCT >5.4|3242329|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTAGCTCAGGAATTAGTAGTATTTATGTCA >5.5|3242389|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTAGCTCAGGAATTAGTAGTATTTATGTCA >5.6|3242449|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTGCCATGCCAGCTGACGCACCACCAAGAC >5.7|3242509|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACAAACAAGGCTCACAACCTGCCTCAACTG >5.8|3242569|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATAAACACGTTTTGGATAGCAATTATCTT >5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTGTGAGGTTGATTTACTGGTGCTTGATGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026704_5
The CRISPR arrays of NZ_CP026704_5 >merge|NZ_CP026704|5|3242121-3242688|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAATTAAACAAGGCATCAATAGCCATTTGCTCATGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATGACTTCGGGGCGATGTGATCATGGTGCGAGTGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATTAAAGCAGGTGCGCGCTTCTATTTTCGCGCTGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAACTTAGCTCAGGAATTAGTAGTATTTATGTCAGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAACTTAGCTCAGGAATTAGTAGTATTTATGTCAGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATATTGCCATGCCAGCTGACGCACCACCAAGACGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAAATACAAACAAGGCTCACAACCTGCCTCAACTGGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATCTATAAACACGTTTTGGATAGCAATTATCTTGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAATGTGTGAGGTTGATTTACTGGTGCTTGATGACGTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAAAAA >NZ_CP026704|5|4|3242121-3242688|PILER-CR GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTAAACAAGGCATCAATAGCCATTTGCTCAT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGACTTCGGGGCGATGTGATCATGGTGCGAGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTAAAGCAGGTGCGCGCTTCTATTTTCGCGCT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ACTTAGCTCAGGAATTAGTAGTATTTATGTCA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ACTTAGCTCAGGAATTAGTAGTATTTATGTCA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TATTGCCATGCCAGCTGACGCACCACCAAGAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATACAAACAAGGCTCACAACCTGCCTCAACTG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TCTATAAACACGTTTTGGATAGCAATTATCTT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGTGTGAGGTTGATTTACTGGTGCTTGATGAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAAAAA >NZ_CP026704|5|5|3242121-3242688|CRISPRCasFinder GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTAAACAAGGCATCAATAGCCATTTGCTCAT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGACTTCGGGGCGATGTGATCATGGTGCGAGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTAAAGCAGGTGCGCGCTTCTATTTTCGCGCT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ACTTAGCTCAGGAATTAGTAGTATTTATGTCA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ACTTAGCTCAGGAATTAGTAGTATTTATGTCA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TATTGCCATGCCAGCTGACGCACCACCAAGAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATACAAACAAGGCTCACAACCTGCCTCAACTG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TCTATAAACACGTTTTGGATAGCAATTATCTT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGTGTGAGGTTGATTTACTGGTGCTTGATGAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAAAAA >NZ_CP026704|5|3|3242121-3242688|CRT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATTAAACAAGGCATCAATAGCCATTTGCTCAT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGACTTCGGGGCGATGTGATCATGGTGCGAGT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TTAAAGCAGGTGCGCGCTTCTATTTTCGCGCT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ACTTAGCTCAGGAATTAGTAGTATTTATGTCA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ACTTAGCTCAGGAATTAGTAGTATTTATGTCA GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TATTGCCATGCCAGCTGACGCACCACCAAGAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA ATACAAACAAGGCTCACAACCTGCCTCAACTG GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TCTATAAACACGTTTTGGATAGCAATTATCTT GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAGAAA TGTGTGAGGTTGATTTACTGGTGCTTGATGAC GTTCACTGCCGTATAGGCAGCTTAAAAA
>NZ_CP026704.1|WP_004918798.1|3241388_3241559_+|hypothetical-protein MKKSVYKASGLWNQQSFITLFVATSEKDVLSTIAFLANLGGARVDELSIERFCSVH >NZ_CP026704.1|WP_014658106.1|3239763_3240312_+|CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate-3-phosphatidyltransferase MKLNIPTWLTLFRVILIPFFVLAFYLPVSWGPFVCALIFVIAAVTDWFDGYLARLWKQTTKFGAFLDPVADKVMVATALVLVTESFDVWYVTLPAATMIAREIIISSLREWMAEIGKRSSVAVSWIGKFKTTAQMISLVGLLWRPNLLIENLAIALLYVAAILTFWSMYQYLKAAWSDLSEA >NZ_CP026704.1|WP_004918794.1|3237873_3239706_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MSEQFEPKAFLKTVTNQPGVYRMYDAGGTVIYVGKAKDLKKRLSSYFRTNVSSRKTEQLVKNIASIDVTVTHTETEALLLEHNYIKLYQPRYNVLLRDDKSYPYIFLSKETHPRLSMHRGAKHAKGEYFGPFPNSYAVRETLALMQKLFPIRQCEDSVYKNRSRPCLQYQIGRCLGPCVKGLVSDEEYEQQVNYVRLFLTGKDQQVLTGLIERMEKASQALRFEEAARFRDQIQAVRAVTEQQFVSGDSDDLDVIGVAFEAGLACIHVLFIRQGKVLGSRSYYPKIPADTLLEEVVQTFLGQFYLQGSENRTLPGEILLDFALPEKTLLADSLSHIAGRKIQIQTQPRGARARYLKLARTNASTALLTKLAQQSTIHQRMSSLAKTVGLDSIARMECFDISHTMGEQTVASCVVFDKNGPVKSEYRRYNITGITPGDDYAAMHQVLTRRYGKHIDESKVPDIIFIDGGKGQLGQAKDVFNSLDVDWDKNRPLLIGVAKGSDRKAGLETLFFKPEGEGVALPPDSPALHVIQHIRDESHNHAITGHRQRRAKVKNTSALESIEGVGPKRRQMLLKYMGGLQPLKNASIEEIAKVPSISYALAEKIYNALKQ >NZ_CP026704.1|WP_072502186.1|3235759_3236992_+|peptidase-T MNKLGKQLEQRFFRYLAIESQSDAAATVVPSTEGQRDLAKLLAKELESYGLKEIYIDEHAILYAVRPGNKPSAPKIGFVTHLDTVDVGLSPVIKPQTLKYEGKDLCLNAQEDIWFKASEHPEAAPYIGEEIIFSDGTSVLGADNKAAVTVVMELMDKLQQADFDCGDIYIAFVPDEEIGLRGSKIMDLSRFKVDFAYTIDCCDLGEVVYETFNAASIEVTIKGVTAHPMSAKNVLLNPIRVAHDFIGCFDRFDTPEHTEQREGYFYVTDLVANPDNAKIKMAIRDFDRNSYEARKRYIGEAIELIRARHPRAKIDFKIEDVYSNISDSLGDDRTAIDLIFEALKIQNVEPKVIPMRGGTDGSALSARGVLTPNYFTGALNFHSRFEFLPLSSFEKSYLVSESICRLVGQK >NZ_CP026704.1|WP_014658104.1|3234170_3235724_+|AbgT-family-transporter MTTNTLPKKKGFLNRVERIGNVMPDVTMLFIYALIICWFLSYLLSFVDFNYYHPVSKEKITVINMFNYEEIILFITAAVKNFINFPPLGITIVATLGIGIAESSGFINTALKKMLSFITPKMLTPTVVFVGIVSHIASDSAYVILMPVAAMMFYASGRHPLAGIAAAFAGLAGGFTASYTPSIIDPIMQSFTQDAAQMMAPGYSVNVLCNYFFSLGGTFGVIFTCWFITEKIVEPWLNKNCPITTKDVDTDADQDLGKITPLENRAFRVSGLVVLALAAGLFALLWPENSLLRGPDGSLTSPKAPIMQIVVPLLFIFFALPGIVYGYMTKSFTSTKDVVKAMENITKSLIPFIVFAFFAAQFLYSFQHSNLGTLLALSGAELLRTLDMPSGLTVFGVILLTAILNIMITSATSKWAIMAPVLVPMLMAVGISPELTQAAFRVSDSAMNVSTPMFPFYPLILMYCQKYYKNAGIGTLCSMMIPFTVGLLITLTATLYLFWAFDIPIGFDSGYTWQPTP >NZ_CP026704.1|WP_014658103.1|3233459_3233876_+|phosphate-starvation-inducible-protein-PsiE MNSMRNMRHASNIAWVLQWVLNIGLIALAIVLVFFLAKETYTMASLMFSGQKEATAYELLEGIVIYFLYFEFIALITKYFLSGYHFPLRYFIYIGITAVIRLIIVDHSDPLTTLLHSAAILVLVVALYIANTEKLKRE >NZ_CP026704.1|WP_004918784.1|3232846_3233251_+|GFA-family-protein MYQGQCLCGAVKISTHQPIDKISVCHCGMCQRWNGGPGFSVDCHDDVVIEGEEAVTRFASSQWGERAFCQRCGTHLFYHLHSPSSYYVSAALFEESQHAEMAMQIFVESKPKYYNFIEKTPMLTEQDIMKLMAK >NZ_CP026704.1|WP_014658102.1|3232506_3232773_+|hypothetical-protein MRTRFFSKLFIAIALLTSASLFAEAAETVTSYEQVNVKIEHPLKQNKMQDLGDIESMREQAEVRRVELTETTTDRRFNGRQFRIGDKQ >NZ_CP026704.1|WP_004918779.1|3230832_3232305_+|DUF3999-family-protein MKLTKSKGKWLTFVYLSFSFLLSSFVHAQEQKALTPYDFYQGIELKYSSDNSSFAWLELPSEAYINSAYPQTLQDVRVFNGTGQEVPSALFYDTEERRKISQVSFALQRLIIRADQVNSKEETHDDQQYLLIETQPSKLTRIELPAMQQAKDAVYQSYLLTRQNNNQEDFPIQTLSLQWMNNQQDWQGKVFIYASDNKQDWVNISAYQPVMSLNSNSGGIYSNTIKLLEGHYVALRAPYLMVIIVAAKETKIPDLTMAQGTSMVVHSTRRQETCHFITNNEGVSLNQLIYRLPSPQPLSAIVIQLRQANRVLPLHIEYTSTSGEEWLPLTNIVAYNQIQNGQEIRNPELVLNDLMVKKLRITALKGSWDDKPPYIEGKRDAVNLMFNVQGASPYLLVWGSQLAGIDNISYQELLGQPLTIDELMHRYPKLYVPEEIIELGGEEQLTSNDFVINEFDWMTITLWVLLGVGIIVLLYFCWYLLKEVNAKSSE >NZ_CP026704.1|WP_014658101.1|3228056_3230846_+|DUF2339-domain-containing-protein MDGLILIGLIIAILAAVSPILAIIAIVFVQRVKYQLFQQNQRILSLEQTLKRYQDREINQQTELSPPETIVASEKPQQYQSASEELSHYSNELEPLPTAPPVLNSQVTEEVPQRQFQPTVDVNRVAQSSNNVGHPSNNKVSGQNNEVVPLFSHFFSWIWKGNPLAKIGILLLFFGIAYLLKFSIQNNMLSPQVRLIASAVACLALLGVGWYLRHKKSLFALILQGGSIGCFYITVFAAFKLYTMLPYSMAFVAMILICAASILLALLQRAISLAVLASLGGYLAPILLSTGGGNHILLFSYYLMLSIAILVISVWQAWRPLNLVGMFMTYAVALLWGVQYYQIDYYVSSQLFLIANLIVFNVLTQLFALRYPHEKQLVVDYTLLLVPPFISMAMQCAISWQISFAPAFSALLLGLLYLLAGLRIHKRYAVVGKNLALGNIIIGIGFVTLAIPLALTYEWTSILWSVEGLLLLYYGFSQQNKKLIVIGPWLISVSALILLAGFSFNIWSRTSTYLVPVLLAACFSAGAIFHVKRGTSENYKVLSYAFLILGLMIWIVWLPVITDILSWSGESESFIIMALVIISAWLWRMLAIKTDWVPLLLCQSFIWLIGYYYLALDFINDQNPMGRGDGSLIWPVMLGSSILFVIHAQKARNIWLQRILHGATFWLILAFIATQVNWFVAILPWGMNELGYFIYVMAITLTILVMYWLQSQKMPPMKRNGIIYWYSFLPVIVVLIGLSFIANFEDGKLTFWNYVPLINPLDEAGLFSIASLLLMRRGLIQKLKKIREFDLWIIRGLGFSAIVLSGVWFNGIIIRIISDFAEINWNVDALFNSRLVQTVLSISWSLVALGFMIFASIKQNRMSWFLGAGIFACVIAKLFLVDIYGQDGLSRAISFIVVAVLILVVGYFSPLPPKTAQHKGTNEVEDEAN >NZ_CP026704.1|WP_036943812.1|3242916_3243390_+|membrane-protein MNKLFRMCNLLLLTASFSMVSLSSYADPNGGHGHGQGKEHQKNKPNKGHNGNGKEKADHLSLNKSNSISVSLTYNEARALALDSGITGYHALPPGIAKNLARGKPLPPGIAKKVVPPSMLVQLPHYPGYEWSIVGNDLVLIALSTAVVTSIINNVFD >NZ_CP026704.1|WP_036943814.1|3243515_3243881_-|DUF305-domain-containing-protein MKKMLPIAAILTISIASFSSFANSNHSMHAQAPASNEMQKELNQSMDKMHADMAKSMNEENADIAFAQGMIAHHLGAIDMAKIELKYGTDPEMRKLAEEIINAQGPEIEQMQKWLEKNKTK >NZ_CP026704.1|WP_104873403.1|3245225_3245990_+|hypothetical-protein MARNIMKNLSLTALTIVLSSVAFSTSGETVSGQSQAYDSNGVEVNVGKTQFAQGTHSGVIGDPGVGLKTIANGTRIGFSGFKSLAPENEQGVNVLPASSGGHGGAMGEFHFTQVANAEVYFGDWSKTGSVGDQSHTAFFSGKEATESVPTAGQAEYTIAGINQFDGQGKLSGVFNADFGSKKYTGALNGQSLNITMNGNIQDKGQFSGSAIANGSIQGKSSGQFFGKNADVVAGITTFDSDHTKDTSFGGSKVQ >NZ_CP026704.1|WP_104873404.1|3246057_3247518_+|DUF560-domain-containing-protein MGLFRAGILWLLLYSSVAIGEISDIDNYRFLLKDKAEFSRKSPVIENNKPFIKDDIKINFDGKEYQVSNTLNEMGMAIYIALNRGQYDDVERLLSYYQQLSGYDVLLVEFAKAQMARANHDYAQAIFHYQTILALKPDFLRVELELARTYFEDQQNNEASSQFKRVLEKYQQQLPQSVLATISQFITELSKRNSWSGSFSVGYGYNSNINQVPGDKRQRCYRNAVQQFCYGAGLADKGTKFIYDGDIKRTFSLYQHHSLLFKAYTYGYKYDGAAEYNENTSHIRVYYQYQDAKKSFAIGPISEFKWVGERRHYYGVGVGMEAEYRFLPQFSLSTVIDHQKINYRSPYQSQDGNKSQAYITGIYALSSDAVIFGGVDSGYVNKVYDSDSYKQYGIRGGIFKDVSQYYHLLGIASYKQTRFNAPQYALGSQNRMDDEQLYLAKLSLPKYSIATMTPSISYRYRVNKSNIDALYSYQQSEIEIRLEKRF >NZ_CP026704.1|WP_104873405.1|3247535_3250535_+|TonB-dependent-receptor MKIKKIITMNIVTGISLTLISGLVLAKEQEDLGTIIVKDNAETIKERDQKGYDDQYDKNESNIYLGKDLVERYKGTNPADVLNSAVGVYSGDARNSGALDPNIRGIQGQGRVPVTVDGTEQAQTVWRGYNGANNRNYVDPNMISSITIQKSASLNPNVKTSVGGGIAIKTLNIDDVVAPDETFGFDLKLETSSNSTKPRVPNLGYGHDYRDDPAIMDNIKNGNKARMLFNDPGLLVTPKSRGDANFFNFKDNAVRVAVGTRQSRFDIMAAYSYRDQGNYFAGKRGANRYKDDVFSYDPKNPSKPVDPYLPFAANVFAPGKEVTNTSSEMESYLVKTNLFLSDSQKVSLGYTHTTNHYGEIMPSRISFMELDGKVPQWTLAKFNIQAFHADYYLNPEDNPYVNMKLGYWMTKTTSDTNTSGGFPREPKERDMGFEYGWMPRNPNIDGTLVPGASLNSTNKRQGLNLSNQMALTDSLDLTLMGSFSKETVDTEDDIFEYSGSSTSTIFRAVPREGERQENTFAFNFEWRPTDWLNVTAGAQRTSYWSKDHLLDKRRDAKDVNFARPHQLLSKNYDISRTITQNEYDTLTRFTNAEGQKLDDVMDSPYYLERFVEEALNLQKHSLDYAGFRSANGQGEFRIDEKNKAKWRPDGKNKLTRETNPFYNGTIDTKAQTVDPFTGKVVNQYIPNQSRSSDEQEDIRYLSEEERFRHQGKKKAHAWAPSFSASAYLTDNDRVYASYTETVRMPSIFEDTVGFSGSRGYASLTEKFEPERGKTVEVGYVRNLQSLLGAERFADVRINYYHTVIENAFERDIYLKFTQVDKHKTSGIELQARYDNGNYFGDIGLDYRLQNEVCDSASIAALDPTNKFNMSECVDAGFPGGFLRTQLQPKYSINANLGMRFLDERLEIGSRMRYHSRAENNDEKKMMDKYPANYAPLNNSPMRWEPVFVADAYVSYGISDNVKMELLATNILDEYYVDPLTRTMMPAPGRTLRLNFTSHF >NZ_CP026704.1|WP_004918928.1|3250583_3251339_+|energy-transducer-TonB MKKTRFLTVTLSVLLHAVIIMGFIHLAQEEKNQQHQAVMDAPVMSIALTHAIEETAPTDSDMTPMVEPEAEIVPPVVVETAQVVLPKKEKKIERPKKKVKEPNKRLSEKKEVEQQKVSTNKITKSAITPQQSQQGETAASSPSMGKVGQPKNGMSNLADTQQINAYREKLRQEVERHKRYPRRAKSMKKQGVAQVQFRLTETGEITSARIVSSSGSELLDNAALAAVEKSQSVGKPPSGFAHIVTFKIEFK >NZ_CP026704.1|WP_004918937.1|3251358_3251790_-|hypothetical-protein MKKYLLPISLFVNVVLLITIIVVGALFFNLKSKIDSTVEQIKNGQYAELVKDNTANLIPEGLKNFKKIEPNQSQCDYFYQQIDSLIGYLEENPTIAGSEKYVKQLNNLKKSAEKTPSTLKETACEKGISTINFIGEKISTATE >NZ_CP026704.1|WP_104873406.1|3252813_3254457_-|thiamine-pyrophosphate-binding-protein MYETITVGEAIARTLEQYQVSTVYGVISIHNLPIADAIGRRGVIDFTPSRGEAGAVTMADAHGRFTGLGVALTSTGAGAGNAVGSMIEAMNACSPIIHITGQVEKAYLDMDAGFIHETRDQLGFLKASSKQAFRVHSAEQAVAVLHKAIQVAQTVPCGPVSIEIPIDIQSAQVPLSLLSAPLTVQPLPEATADQVDAIWQKLQHAQRPLLWIGGGALHASDAIKKLADQGVAVISSTHGRGILSDEHPFSLRAFHNADAIDKLMRSCDITLVAGSRLRSNETKTWSLPLPQPLIQIDIDPLAANRNYRADLVVTADCHSILNALASKLEQSKRTISPQWQQQVQEATQQAEAQLRAQCGPYSQLSDAVEQALPDHGIFVRDITVSGSLWGSRLLKATQPLHNIHSLAGAIGLGLAMAIGSAKANPQTPVIGLVGDGGLMLGIGELATMAQEQLPIVLLIMNDHGYGVMRGIQEKYFADRQYYNELLTPSFTRLAESMGIKALTVDKAEDFKSTLQRAVELKQPVVVEVLMENIGKMNFSGPPQKKLF >NZ_CP026704.1|WP_104873407.1|3254525_3255995_-|aldehyde-dehydrogenase MKKLDIFVGGRWQQGRGNEMCSRFPGDQHIIATLNSASVSDVEEAVQAAERAWRAPSWRNMPPHQRATILHNVSMLIEEQADELTRLQTLDNGKPWAEARGLVMSAAATARYFAAVCEVSGGELPPRRQPDMMTLSTYQPLGVIAAITPWNSPIASDMQKIAPALAAGNAVILKPAEATPLISLKLAELFEQAGLPSGLLSVLPGKGSIVGDALVRHPLVKKISFTGGTNTGRQLAHIAAEKLITTSLELGGKSPTIVLEDADLNLAAHGVCYGIFSSMGQACIAGSRLFVSRAVYEPFMEKLTALTQQLIIGDPRQERVHVGPLISPEHRESVIRYVNQAIAEGGTIRLGGAIPQDPNLQAGNYYLPTIIEGLNNQASVCQEEIFGPVLVVIPFDNETQLIEEANDSIYGLAAGIWTQDYTRAFKLADALDVGTVWINTYKVFSISTPFGGFKESGLGREKGLESLKAYMQQKSIFLALNPQPNRWCE >NZ_CP026704.1|WP_104873408.1|3256008_3256803_-|aspartate-dehydrogenase MKTLMLIGYGAMANEVIQRLPAGIELGWIVAREHHHNDIKQRFQNRVIPLSCPTHASQKPDLILECASQHAVKQYAPMVLEKGWTLAVISTGALADAQLAQTLSQKAQQHHAIFIPLSGAVAGLDGLRCAKEAAIRQVTYQSRKSPASWRNGPAENYIDLDTVTEPTVFFHGTAREAALKFPANANVAATVALYGIGMDKTKVELMVDPTTKQNSHRIEVTGDFGHFCIELNGNPLPSNPKTSLLSALSAVEICRRIADQDAII |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP026704_4 | 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168002-3168033 | 32 | MW145137 | Providencia phage PSTNGR2lys, complete genome | 36775-36806 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP026704_5 | 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242629-3242660 | 32 | MK448589 | Streptococcus satellite phage Javan632, complete genome | 6216-6247 | 5 | 0.844 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | HQ906666 | Wolbachia endosymbiont wVitB of Nasonia vitripennis phage WOVitB segment 2, partial genome | 23266-23297 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | KX522565 | Wolbachia phage WO, complete genome | 28802-28833 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | HQ906662 | Wolbachia endosymbiont wVitA of Nasonia vitripennis phage WOVitA1, complete sequence | 53894-53925 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026704_5 | 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242629-3242660 | 32 | MK672805 | Vibrio phage Va_PF430-3_p42, complete genome | 19868-19899 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026704_5 | 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242629-3242660 | 32 | NC_008761 | Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP05, complete sequence | 25159-25190 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026704_5 | 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242629-3242660 | 32 | NC_008757 | Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP01, complete sequence | 193871-193902 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026704_5 | 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242629-3242660 | 32 | NC_008757 | Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP01, complete sequence | 316066-316097 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026704_5 | 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242629-3242660 | 32 | MN856005 | Myoviridae sp. isolate 302, complete genome | 3071-3102 | 6 | 0.812 |
| NZ_CP026704_4 | 4.4|3168183|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168183-3168214 | 32 | MN693436 | Marine virus AFVG_25M57, complete genome | 14332-14363 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026704_4 | 4.4|3168183|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168183-3168214 | 32 | MN693320 | Marine virus AFVG_25M58, complete genome | 14329-14360 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026704_4 | 4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168483-3168514 | 32 | NZ_CP026273 | Klebsiella oxytoca strain KONIH4 plasmid pKOX-ea2b, complete sequence | 139298-139329 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP026704_3 | 3.2|3157818|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157818-3157849 | 32 | NC_015250 | Acinetobacter phage 133, complete genome | 120243-120274 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | NC_019739 | Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.01, complete sequence | 63427-63458 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026704_4 | 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168002-3168033 | 32 | NZ_CP044357 | Acinetobacter baumannii strain CAM180-1 plasmid pCAM180A, complete sequence | 67184-67215 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026704_4 | 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168002-3168033 | 32 | NZ_CP041149 | Acinetobacter baumannii strain CUVET-MIC596 plasmid pCUVET596, complete sequence | 60108-60139 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026704_4 | 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168002-3168033 | 32 | NZ_CP040913 | Acinetobacter pittii strain AB17H194 plasmid pAB17H194-2, complete sequence | 17491-17522 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026704_4 | 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168002-3168033 | 32 | NZ_CP014652 | Acinetobacter sp. DUT-2 plasmid unnamed1, complete sequence | 6131-6162 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026704_4 | 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168002-3168033 | 32 | NZ_CP014654 | Acinetobacter sp. DUT-2 plasmid unnamed3, complete sequence | 7187-7218 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026704_4 | 4.7|3168363|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168363-3168394 | 32 | NZ_CP019037 | Massilia putida strain 6NM-7 plasmid unnamed2, complete sequence | 245089-245120 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026704_4 | 4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168483-3168514 | 32 | NC_019893 | Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC01, complete sequence | 46472-46503 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | MN693644 | Marine virus AFVG_250M1161, complete genome | 30248-30279 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | NZ_CP035561 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5 | 23517-23548 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | JQ692107 | Vibrio vulnificus phage SSP002, complete genome | 46826-46857 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | MN215888 | Vibrio phage vB_VpaS_HCMJ, complete genome | 46939-46970 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | MF754116 | Vibrio phage vB_VpaS_KF6, complete genome | 45028-45059 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | MF754115 | Vibrio phage vB_VpaS_KF5, complete genome | 46945-46976 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | MN694432 | Marine virus AFVG_250M20, complete genome | 25511-25542 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | MG602476 | Vibrio phage VVP001, complete genome | 28095-28126 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | MN693757 | Marine virus AFVG_250M21, complete genome | 25568-25599 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_3 | 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3157999-3158030 | 32 | MH925090 | UNVERIFIED: Vibrio phage ValLY_3, complete genome | 24370-24401 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_4 | 4.5|3168243|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168243-3168274 | 32 | MT478991 | Escherichia phage vB_EcoM_011D4, complete genome | 14850-14881 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_4 | 4.5|3168243|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168243-3168274 | 32 | NC_041936 | Escherichia phage ECD7, complete genome | 64025-64056 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_5 | 5.1|3242149|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242149-3242180 | 32 | NZ_CP045351 | Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence | 1154525-1154556 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_5 | 5.4|3242329|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242329-3242360 | 32 | NZ_CP015595 | Acinetobacter sp. NCu2D-2 plasmid unnamed, complete sequence | 73645-73676 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_5 | 5.5|3242389|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242389-3242420 | 32 | NZ_CP015595 | Acinetobacter sp. NCu2D-2 plasmid unnamed, complete sequence | 73645-73676 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_5 | 5.7|3242509|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242509-3242540 | 32 | MT670420 | Pseudomonas phage phiPsa347, complete genome | 74089-74120 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_5 | 5.7|3242509|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242509-3242540 | 32 | MT670417 | Pseudomonas phage phiPsa267, complete genome | 74104-74135 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP026704_4 | 4.5|3168243|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168243-3168274 | 32 | AP014012 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C102A-MedDCM-OCT-S39-C98, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 23905-23936 | 10 | 0.688 |
| NZ_CP026704_4 | 4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168483-3168514 | 32 | NZ_CP020331 | Martelella mediterranea DSM 17316 strain MACL11 plasmid pMM593, complete sequence | 345137-345168 | 10 | 0.688 |
| NZ_CP026704_4 | 4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168483-3168514 | 32 | NC_023600 | Mycobacterium phage Jolie1, complete genome | 56807-56838 | 10 | 0.688 |
| NZ_CP026704_4 | 4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3168483-3168514 | 32 | NC_024145 | Mycobacterium phage Hosp, complete genome | 54889-54920 | 10 | 0.688 |
| NZ_CP026704_5 | 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3242629-3242660 | 32 | NZ_CP012104 | Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-5, complete sequence | 33195-33226 | 10 | 0.688 |
1. spacer 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MW145137 (Providencia phage PSTNGR2lys, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tgacaaagattattttttcaagccttcatttg CRISPR spacer tgacaaagattattttttcaagccttcatttg Protospacer ********************************
2. spacer 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448589 (Streptococcus satellite phage Javan632, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
tgtgtgaggttgatttactggtgcttgatgac CRISPR spacer tgaaagaggttgattacctggtgcttgatgac Protospacer ** . ********** ***************
3. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ906666 (Wolbachia endosymbiont wVitB of Nasonia vitripennis phage WOVitB segment 2, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer gcagaa-aagcaaaagctaaagaactttatctc Protospacer ****. ****.************ ***** *
4. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KX522565 (Wolbachia phage WO, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer gcagaa-aagcaaaagctaaagaactttatctc Protospacer ****. ****.************ ***** *
5. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ906662 (Wolbachia endosymbiont wVitA of Nasonia vitripennis phage WOVitA1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
-cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer gcagaa-aagcaaaagctaaagaactttatctc Protospacer ****. ****.************ ***** *
6. spacer 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK672805 (Vibrio phage Va_PF430-3_p42, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tgtgtgaggttgatttactggtgcttgatgac CRISPR spacer ttagccaggttgatctactggtgcttgatgaa Protospacer * *. ********.****************
7. spacer 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008761 (Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP05, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tgtgtgaggttgatttactggtgcttgatgac CRISPR spacer tggccaagcttgatttactggtgattgatgac Protospacer ** ..** ************** ********
8. spacer 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008757 (Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tgtgtgaggttgatttactggtgcttgatgac CRISPR spacer tggccaagcttgatttactggtgattgatgac Protospacer ** ..** ************** ********
9. spacer 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008757 (Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tgtgtgaggttgatttactggtgcttgatgac CRISPR spacer tggccaagcttgatttactggtgattgatgac Protospacer ** ..** ************** ********
10. spacer 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN856005 (Myoviridae sp. isolate 302, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
tgtgtgaggttgatttactggtgcttgatgac CRISPR spacer tgaaagaggttgatgtcctggtgcttgatgat Protospacer ** . ********* * **************.
11. spacer 4.4|3168183|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693436 (Marine virus AFVG_25M57, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
gtccgcatttgctattggagtgtcatcaagaa CRISPR spacer tgttgaatttagtattggagtgtcatcaagaa Protospacer ..* ****. ********************
12. spacer 4.4|3168183|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693320 (Marine virus AFVG_25M58, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
gtccgcatttgctattggagtgtcatcaagaa CRISPR spacer tgttgaatttagtattggagtgtcatcaagaa Protospacer ..* ****. ********************
13. spacer 4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026273 (Klebsiella oxytoca strain KONIH4 plasmid pKOX-ea2b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
gttgttgttcgtgttgaacaaggcgaaaccga CRISPR spacer gttgttgttgatgttgaacaaggcactcctga Protospacer ********* .*************. *.**
14. spacer 3.2|3157818|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015250 (Acinetobacter phage 133, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgcaaaca---tggcatttatcattgtcatctttt CRISPR spacer ---gaataggttgccattcatcattgtcatctttg Protospacer .**.* ** ****.***************
15. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019739 (Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer caccccaagcgaaagctaaaacagtttaagtt Protospacer ** ***************. ****** * .
16. spacer 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP044357 (Acinetobacter baumannii strain CAM180-1 plasmid pCAM180A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgacaaagattattttttcaagccttcatttg CRISPR spacer tgaaaaagattatttttttaagcttagttctt Protospacer *** **************.****.* *.*
17. spacer 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041149 (Acinetobacter baumannii strain CUVET-MIC596 plasmid pCUVET596, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgacaaagattattttttcaagccttcatttg CRISPR spacer tgaaaaagattatttttttaagcttagttctt Protospacer *** **************.****.* *.*
18. spacer 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040913 (Acinetobacter pittii strain AB17H194 plasmid pAB17H194-2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgacaaagattattttttcaagccttcatttg CRISPR spacer tgaaaaagattatttttttaagcttagttctt Protospacer *** **************.****.* *.*
19. spacer 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014652 (Acinetobacter sp. DUT-2 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgacaaagattattttttcaagccttcatttg CRISPR spacer tgaaaaagattatttttttaagcttagttctt Protospacer *** **************.****.* *.*
20. spacer 4.1|3168002|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014654 (Acinetobacter sp. DUT-2 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgacaaagattattttttcaagccttcatttg CRISPR spacer tgaaaaagattatttttttaagcttagttctt Protospacer *** **************.****.* *.*
21. spacer 4.7|3168363|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019037 (Massilia putida strain 6NM-7 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
-cagagatatacctgttccgctcccgtaaatgc CRISPR spacer tcaaccacg-acctgttccgctccgggaaatgc Protospacer **. *.. ************** * ******
22. spacer 4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019893 (Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gttgttgttcgtgttgaacaaggcga-aaccga CRISPR spacer aaggttgttcgcgttgaacaagacgacgatcg- Protospacer . ********.**********.*** .*.**
23. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693644 (Marine virus AFVG_250M1161, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer cgttagcagctaaagctaaagaattttatgat Protospacer *. . *** ************ *******.
24. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035561 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer acaaacaggcgaaagcttaagaagtttaatcc Protospacer .*.**.********* ********** *
25. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JQ692107 (Vibrio vulnificus phage SSP002, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer aagagcaagcgccagctaaagaagaaaaagca Protospacer ********** *********** * *
26. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN215888 (Vibrio phage vB_VpaS_HCMJ, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer aagagcaagcgccagctaaagaagaaaaagca Protospacer ********** *********** * *
27. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF754116 (Vibrio phage vB_VpaS_KF6, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer aagagcaagcgccagctaaagaagaaaaagca Protospacer ********** *********** * *
28. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF754115 (Vibrio phage vB_VpaS_KF5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer aagagcaagcgccagctaaagaagaaaaagca Protospacer ********** *********** * *
29. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694432 (Marine virus AFVG_250M20, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer aaagacttgctaaagctaaaaaagtttatgaa Protospacer *...* ** *********.**********
30. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG602476 (Vibrio phage VVP001, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer aagagcaagcgccagctaaagaagaaaaagca Protospacer ********** *********** * *
31. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693757 (Marine virus AFVG_250M21, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer aaagacttgctaaagctaaaaaagtttatgaa Protospacer *...* ** *********.**********
32. spacer 3.5|3157999|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH925090 (UNVERIFIED: Vibrio phage ValLY_3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cagagcaagcgaaagctaaagaagtttatgac CRISPR spacer aagagcaagcgccagctaaagaagaaaaagca Protospacer ********** *********** * *
33. spacer 4.5|3168243|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT478991 (Escherichia phage vB_EcoM_011D4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tttagttgaccatttcgaatattg------cataaagt CRISPR spacer gttagttgaccatctggaatattgatctgcca------ Protospacer ************.* ******** **
34. spacer 4.5|3168243|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_041936 (Escherichia phage ECD7, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tttagttgaccatttcgaatattg------cataaagt CRISPR spacer gttagttgaccatctggaatattgatctgcca------ Protospacer ************.* ******** **
35. spacer 5.1|3242149|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045351 (Vibrio sp. THAF100 plasmid pTHAF100_a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
attaaacaaggcatcaatagccatttgctcat CRISPR spacer atcaaacaaggcataaatagccaccaatgcaa Protospacer **.*********** ********.. .. **
36. spacer 5.4|3242329|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015595 (Acinetobacter sp. NCu2D-2 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
acttagctcaggaattagtagtatttatgtca CRISPR spacer ctgtagctcaggaattagcaggatttcctgca Protospacer . ***************.** **** . **
37. spacer 5.5|3242389|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015595 (Acinetobacter sp. NCu2D-2 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
acttagctcaggaattagtagtatttatgtca CRISPR spacer ctgtagctcaggaattagcaggatttcctgca Protospacer . ***************.** **** . **
38. spacer 5.7|3242509|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT670420 (Pseudomonas phage phiPsa347, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atacaaacaaggctcacaacctgcctcaactg CRISPR spacer atacagacaaggctcacaacctgttcaggcgt Protospacer *****.*****************... ..*
39. spacer 5.7|3242509|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT670417 (Pseudomonas phage phiPsa267, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atacaaacaaggctcacaacctgcctcaactg CRISPR spacer atacagacaaggctcacaacctgttcaggcgt Protospacer *****.*****************... ..*
40. spacer 4.5|3168243|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014012 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C102A-MedDCM-OCT-S39-C98, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttagttgaccatttcgaatattgcataaagt CRISPR spacer gatgtttgaccatttcaaatactgcatatgcc Protospacer *. ***********.****.****** . .
41. spacer 4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020331 (Martelella mediterranea DSM 17316 strain MACL11 plasmid pMM593, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gttgttgttcgtgttgaacaaggcgaaaccga CRISPR spacer catcatggtcgtgatgaacaaggcgaaatacg Protospacer * ** ***** **************. .
42. spacer 4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_023600 (Mycobacterium phage Jolie1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gttgttgttcgtgttgaacaaggcgaaaccga CRISPR spacer gagccccgtcgtgctgaacaaggcgaacccgg Protospacer * .. *****.************* ***.
43. spacer 4.9|3168483|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_024145 (Mycobacterium phage Hosp, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gttgttgttcgtgttgaacaaggcgaaaccga CRISPR spacer gagccccgtcgtgctgaacaaggcgaacccgg Protospacer * .. *****.************* ***.
44. spacer 5.9|3242629|32|NZ_CP026704|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012104 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-5, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tgtgtgaggttgatttactggtgcttgatgac CRISPR spacer taacaagcgttgatttcctggtacttgatgat Protospacer *. .. ******** *****.********.
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
598859 : 641039
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026704|598859:641039|DBSCAN-SWA ATTATTTTGTCCTCTCAAACATTAAATCCCATACACCGTGCCCCAACCGCTGGCCGCGTTTTTCAAATTTTGTTTCAGGTCGTGTTTCAGGCCGAGGTACATAATCCCCTGATGCAGATAAGTTTTTATACCCATCTGCATGGCTCATCACTTCCAACATATGTTCCGCATATGGCTCCCAATCCGTCGCCATATGAAAAACACCGCCCTTCACCAGTTTAGCGCGAATTTTATCGGCAAAAGGCCCTTGCACAATACGGCGCTTGTTATGTTTTGCCTTATGCCATGGATCTGGGAAAAATAGCTGAACCATAGATAAACTTTCATCGGGGATCATACGGTCCAACACTTCAATTGCGTCATGACACATGACACGTAAATTTGTCACATTTTCTTCTTTTGCGGAAGCAAGGCATGCTCCAACACCAGGCGCATGGACTTCAATCCCTAGAAAGTTTTTTTCAGGATTTTGTGAGGCCATTGTGACTAAAGAGGCCCCCATACCAAACCCTATCTCAAGTACAACAGGATTTTGGTTATTAAAAATTGCGGCAAAATCTAAAGGCTGTGCAACAAAATCGACTCCCATCGTTGCCCATTCACTTTGTAGCGCATCTTCTTGGCGTTGCGTCAAACGTCCTTGACGACGGACAAAGCTGCGAACGCGGCGCATAACCCGCCCTTCTTCATTATATTCTGGGGAGATGACGTTATTGATCATAATATAAAAATTCTACGAATTGATTGCCTAATCAAGTAAATAAGCGAAAATGACTACCCTTGCCGACTATTTTCAACAAGTTAGTAAAACGATTAATAATACAAACTTCACATGAAAGTGCAGGGAGTTTATCAAAACTCATCCAAGGTTGCAGGTGAAAATTGGATAACTTTACACTCCAGCACACAATAAGCGGTTTACAGCTTGTCCGGTCTATGTTGCAATCCTGACTATCTCTGATTTTAATAGAATTACCGATAAAAATAATATACTCAATGGAAGCTCAACAATTTTCGCTCGCCGTGCTTAATTGGTATCACCAATATGGCCGGAAAACTTTGCCGTGGCAAAAAGAAAAAACGTCATACCATGTCTGGCTCTCGGAAGTCATGCTACAACAAACTCAAGTCAGTACGGTTATTCCCTATTTCGAAAAATTTATTCGCCGTTTTCCCGATGTAAAAGACCTCGCGAATGCCCCCTTAGATGAAGTATTACATCTATGGACGGGGCTGGGCTATTACGCACGCGCTCGCAATTTGCATAAGGCCGCAAAAGTCATAGCAGAACGTTTCAATGGGCAGTTTCCAACTACATTCGATGATGTTGTGGCCCTTCCTGGTGTTGGTCGCTCTACAGCAGGCGCTATTTTGTCGTTATCACAACAACAGCACTATCCAATATTAGATGGTAATGTTAAACGCGTGCTCGCTCGCTGCTATGCCGTCGAAGGATGGCCGGGGAAAAAAGAGGTCGAAAATCGCTTATGGGATATCAGTACTGAGGTTACCCCTAAAGAAGGCGTCCAGTTCTTTAATCAGGCTATGATGGATTTAGGTGCTATGGTATGCACCCGTAGTAAACCGAAATGCGAACTTTGCCCCCTGCATTTAGGTTGCATAGCCTATGCTAACCACTCATGGCAGGATTACCCTGGTAAAAAGCCGAAACAAAAGATCCCTGAAAAGACAGCTTGGTTTCTAATTATGCAGCAAGGCGATCACGTTTGGCTTGAACAGCGACCACCTTCAGGTATTTGGGGAGGGCTATTTGCCTTCCCTCAATTTGAAACTCAAGAGCAAATGAATGCGTGGCTTTCTCAATCCGGTATTCAACATGATACGCCAGAACAATTAATTGCGTTTCGCCACACATTCAGCCATTTTCATCTGGATATTATTCCTGTTAAAGTTAATATTCAGGCATTTACTTCAGCCATGGATGAAGGTAAAGGACTTTGGTATAACTTAAATCTCGGTGCAACAATCGGCCTCGCTGCGCCGGTTGAAAGCTTACTTCAACAGCTTGCCGTGCCGCCTGATATTCTGAGGAAAAAATAATGAGTAGAACAATTTTTTGTACTTTTTTACAACGTGACGCTGAGGGGCAAGATTTTCAGCTCTATCCGGGTGAGCTAGGAAAGCGCATTTTTAATGAGATTTCGAAAGAGGCTTGGGGTCAGTGGATGGCAAAACAAACCATGCTGATTAATGAGAAAAAGCTCAATACCATGAACCCTGATGACCGTAAAATGCTAGAGCAAGAAATGGTTAAGTTCCTATTTGAGGGACACGATATTCATATCGACGGCTACACACCTGAAAAATAATTGATTGGTCTACCTATCTTAGGTAGACCATGAGCTTGAATACTGTGGAATGTATGAAAAAACTGTTAGCCTTAACGCTGCTGGTGCCTCTTCTTATCTCCTGCTCCAGCAATAAAGAGTCTGATTTTAATCCTAACTATGTGAAAGACACCAATGGGTTCGATATCCTTATGGGGCAATTTGCCCACAATATCGAAAATATCTGGGGGATCAAAGAAGTTCTCATTGCAGGCCCTAAAGATTATGTTAAGTATACCGATGAGTATCGTACCCGTAGTCATATCAACTTTGATGCTGGGACGATTACAGTAGAAACCATCTCCGCCGTAGAGCCTTCAGAACATTTGAAAAAGGCTATCATCACTACCCTATTAATGGGTGATGACCCAAATTCTATCGATTTGTATTCTGATATTAATGATATACCTCACAGCCAAGAACCTTTTCTATTTGGGCAGGTATTAGATAACACAGGTGAACCCATTCGTTGGGAATGGCGCGCAAATAAATACGCTGAATACCTTGTTAATAATAAGTTGCAGCGCCGGCAATCAGGTATGAATGTCATTTGGTCTGTGACCATGCAACTGGTTCCTAACCACCTTGATAAACGCGCTCATAAGTACCTTCCTTTTATCAGGAAGGCATCGGCTAAATATGGGGTTGATGAGTCACTTATTTTAGCCATTATGCAAATCGAATCGAGCTTTAACCCTTACGCGGTAAGTCGTTCCGATGCGTTAGGCTTGATGCAAATCATGCCAAATACCGCGGGTAAAGATGTTTTCCGTTCGCAAGGTAAGTCAGGGGTTCCGAGCCGTAGTTACCTTTTCGATCCGGAAAAAAATATTGATACGGGAACTGCTTATTTGGCAATTTTACAAAATAGCTATTTAGGTGATATTCAAAACCCAGTGTCACGCCGTTATGCCGTAATAACCGCTTATAACGGTGGTGCTGGTAGCGTCCTTAGAGTCTTCCACAGCGATAAAAAAGTAGCTGCACAGAAGATCAATCAGCTCGCCCCTGGCGAAGTTTATCAAACGCTATCAACAAAGCATCCTGCTGCCGAATCGCGTAATTATCTGATAAAAGTCGATAAGGCTCAGAAGAATTACCGTCTCTAAAGGCGATTAATATTAGTACAAAAAGCACTCGTTTCAGTATATAACTGGCGAGTGTTTTTTATTTTATCGTCTTTTTATTAGCCTTACTGTTCAATAATCAGCTAACCTGTTGAAAAAAAGCGCATACGAAATAAAGTTTTTCGAATGTTCCTTGACTCCAACTGTGAAATCAGGTTTAATACGCCTCGTTGCCCGGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAGGGGATTGAAAATCCCCGTGTCCTTGGTTCGATTCCGAGTCCGGGCACCACTTTCACTTCTATAGTGGTCTCCTCAAGTCAAGTAAACTCCTTTATATTCATTGATTTACCTTGTATTATCACTCATCGAGCTCCACCGAACTCAACACGACTCAACTTAAATCAAGTGTCTGTTGGGGGCTTTTTTGGGGGCTCATCGTGTTCAATGTAATTTAGGGGCCCCCATTATGGCACTCAGCGCTCGGCAGATACAGACTGCCAAACCTAAAGACAAAGAATATAAGCTCTCTGATGAGCGTGGACTTTACCTTCTCGTTAAACCCAATGGTGCTCGTTACTGGCGAATGAAATATCGCTTCGCTGGTAAAGAGAAAAAATTATCGATTGGTGTATACCCTGATGTTTCTCTTGCTGATGCGCGAGTTAAACGCGATGAAGCCAGAAAGCTATTAGCTGAAGGTAACGATCCGGCTGAACAAAAGAAGTTAGAAAAGCTCGCGAAGAAGATCACCGTAGAAAATACGTTTAAAGCGATTGCCATTGAATGGCACACTCATAAATCATCCGAATGGTCCGAAAGCTATGCGGAAAGTGTTCTTGATGCTTTAGATAAAGATATCTTTCCTTATTTAGCTAAACGTCCTATCGCTGAGATCCTACCTTTAGAAATGTTGGAGATCTTACGGATGATTGAAAAGCGTGGCGCTTTAGAAAAAATGCGTAAGGTTAGACAGTTCTGTAATCAAATTTTTCGTTATGCCATTGCAACAGGACGAGCAACCGTAAATCCAGCTGCTGAGCTCACTGGAACACTAAAGGCACCAAAAACAAAACACTTCCCTCACCTTACCGCTCAAGAGCTTCCTGAGTTCTTGCAGAAGCTTTCGGAATATACAGGCAGTCCTATTACCCGTTTAGCCACTAAACTGCTGTTACTAACAGGAGTGAGAACGATTGAGCTAAGGGCTGCTCACTGGAGTGAGTTTGATTTTGATACTGCACTCTGGTTAATTCCCGAAGAAAGAATGAAGATGCGTAGACCACACTCTGTTCCGCTTTCCAAACAAGTGCTTGAGATCTTAAAAGAGCTACATGCCTTTACGGGCCAATATCAACTGGTTTTTCCGGGGCGTTGCAATATCAATCAACCCATGAGTGAAGCCAGTATCAACATGGTATTAAAACGAATTGGGTATGACGGTAAGGCGACAGGGCATGGCTTTCGTCACACGATGAGTACAATCCTGCATGAACAAGGATTTAATTCAGCGTGGATTGAAATGCAGCTAGCACATAAGGATAAAAACTCTATTCGAGGAACCTATAA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31 | Escherichia_phage(30.77%) | transposase,integrase,tRNA | attL 629439:629498|attR 639376:640162 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
672216 : 714357
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026704|672216:714357|DBSCAN-SWA 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39 | Enterobacteria_phage(10.0%) | transposase,integrase,holin | attL 667128:667143|attR 687354:687369 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1414513 : 1451757
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026704|1414513:1451757|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP026704|1414513:1451757|1416269_1416749_-|WP_004926326.1|DBSCAN-SWA MANMIYLTLKGSKQGAISQGCGSLDSIGNKYQNGHEDEIFVLRLGNGFSRTQNINFQPVTLIKLLDKSSPLLANAIANNETLEMTFNFYRTSQTGSQEKYYTITLREASIINLESDYPHSSNNNEQLPEETLTVKYKDIIFQHVMAGTSGYCSWQENTI >NZ_CP026704|1414513:1451757|1443852_1445028_-|WP_036942320.1|DBSCAN-SWA MSVSASHSSMPLFRISAAMFFSYMTVGLPLTVIPLFVHQELGFSDVWVGVVVGIQFLATVLTRGYAGRLADQKGAKRTTLQGMCACGISGGFCLLAVLLPLAPLYQILLLMVGRLVLGLGESQLLTGNLTWGMRLVGATQAGKVMSWNGMAIYGSLAVGAPLGLVIYQHYGFVAVSAMVMLLPCISLLINGTVPAVAPLHGKWLPFWSVIRKIWKMGIILALKGIGFAAIGTFISLYFVSEQWGNAGLALSAFGCTFVLVRVLWGGLPDKMNGYRVAVVSLAVEFVGLLILWAAPVYGVALLGAALTGAGCSLVYPAVGTEVVKTVAPQMRGTALGGYSAFQDIAYGITGPLAGMAVVYLGYRGIYFIAALCVLFALIMTLSAIRHTQKVT >NZ_CP026704|1414513:1451757|1432148_1433930_-|WP_004926305.1|plate|DBSCAN-SWA 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28 | Synechococcus_phage(40.0%) | transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1719411 : 1793175
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP026704|1719411:1793175|DBSCAN-SWA 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59 | Escherichia_phage(15.38%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2324959 : 2371196
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP026704|2324959:2371196|DBSCAN-SWA 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42 | Enterobacteria_phage(16.67%) | holin,integrase,transposase | attL 2333987:2334025|attR 2372565:2372603 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2515912 : 2556791
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP026704|2515912:2556791|DBSCAN-SWA 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67 | Acinetobacter_phage(15.79%) | transposase,lysis,holin,coat,capsid,terminase,integrase | attL 2512650:2512664|attR 2559204:2559218 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2566818 : 2575983
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP026704|2566818:2575983|DBSCAN-SWA TATGTCTATTATCGAATGGCCTTCGGGTATTAACCCTAGCGAGATGTCGTGGCGATTAATTAGTAACAGTAAAACCTTCACCTCAGTATTCACTGGTAGCTCTCAAACGGTACGTTTTCCCGGCAGTAAATGGCATTGTTCACTCAACTTCACAAATCTAACGGATGATGAGTCAAGAGAGCTTGAGGCTCTTATGGCTTCACTAGATGGTGAGAGTGGACGAGTTAAGATATCGCACTGGGCGCGGAAAGGCGTTGCTAATATGGGAACGCCTTTAGTAAATGCACCCAATCAAACTGGGAGGTATCTGCAAACGAAAGGATGGAAACCTAACACTGACGTACTGAGAAAAGGCGATTATCTCACTGTTAATAATGAGCTAAAAATGGTGACCGAGAATATAAAAAGTGATGTTGATGGGAATGCGGTTATTGCCATTTCCCCTATGCTTCGATATTCACCGACTCTCAATGAGAAAGTGGAAGTTGCCAAACCTTATGGGATTTTTAAGCCGGTAGACAATGAGCAAGGGGATTTTCAATTTCACCCTTACTTACTGTCTGATGTTTCACTCGAATTTGAGGAGGCACTTTACTGATGATTTACCATCCCTTATCTGACGAAATGGTTAAAGCCATTAATGATGATTGCTATTTGGTTGTCGCTGCAAAGCTTGATTTAAAATCGGGCGTAACGTGTGTTCATACAGGAACAGGTAATCTCATTATCGCGGGTGAAGTTTATCAAGGTGTGGGCCAACTTGGCGCAGTTGAATCAGTAAAAGAGGGACTATCAACCAGCCCAACTCAGCTATTGCTATCACTAAGTGGTTTTGATTCAAAGCTAGTAGGTGAAGTGCTCAATGAACGCAGTCGTGGGCGAGACGTTCGTCTTATGCTGGTGGCAATAGATGATGATAATGGGCAACCGATGTTAGCGGATGTTATTTTTGCCGGGCAAATAGCGAATCTAAGCGTTACCACAGGCGAAGAGAATAAAATAGGACTCACGGTATCAAATCGTTTTGAGCGTTGGTCAATGGGGCTGCCTGATCGTTTCACAGATGAATCCTGGTCTAAACGTCACAGTGGTGACCGTATATTTCGATATGTTGCTCAGATGGCAGAGCGTTCGATTTATTGGGGCAGCAAAAAGGATGCGCCAGCCTTCATTTATAAATAAGCGCTAAAACTTATTCGCACGCAAGGCCTCTTAACTGAGGATTTTTTACATTTGGAGGTAAGTAAATGCGACATCCTCAATGGACCATACAATTACCTGAAACCTTAAGGGCGGCAATGAGTCGCCCTTTTTCATGGGGGGAGCATGACTGCTGTTTGTTTGCGGCTGATTGCGCACTTGCTGTATGTGGTATCGATATCGCTGAAAAAGTTCGTGGTCGCTATAAGACAAAATCAGGGGCTATGCGAGTCTTAAAGTCGGAATTTGGTGACATAGAGTCCGGCCTATCAAGTTTCTTTACCGAAATCGAACCAGACAAAGCCACGAGGGGCGACATTGTTATGTTTAATGGCGATGAAGGCAAAACTCTTGGGGTGCTTTGGGCTGGCAAGGTGTGGTCTGTCACTGAAAACGGGGTATTACCTGTTAACCATCAACCAATCAAGGCATGGAGGGTCGAGTAGATGGGGAAAGTTGTATCAAATATCGTTTCGACGGGTTTGATGATTGCTGGGGCGATCATGGGCGGCCCTGCTGGCTGGGCTGTTATTGCGGCTGGCATGGCAACACAGTTTGCTGGCTCAATGATATTCAAAGACAAGGTGCCGTCAGGTTATCGAGACCAGTCAGAGCGCAAGCAGATGCTTCGTTCATCAAAAGCACCAGAGACCATCATTGTCGGTAAGACAGTGTGTTCAGGGCTGCTCTTTTTTGCCGAAGAAGAAAAGGGTGACCAAACAGAAAACGAACGCTTATTTATGGCACTAGCCATTGCAGCACATAAAGTAGACCACATTGGTCAAATTTGGCTGAATGACGATTTGATTAGTGAATTCGGCGATAAAGCGGATTATGAGTTTCACAATAGCCGCACGGATTGTGACCCCTACATGTTAAAAAATGCCCCGTCATGGAAGGAAGACATGATAGGGGATGGCTTAGCGTGGTTACGTTTAACACTTAAATACGATGCTGAGAAATTTCCATACGGCGTACCAAACGTCAAAGTCGAAGTGTGGGGGAAGCAAATCTATGACCCGCGCACTGGTAAAACCGTGTGGAGTAATAACGGCGCATTAGTCATTCTTGATTATTATCGTAGTTATTTAAACGTTCCTGATTCCGACATTGATTTTGATGCGTTCAAAGTCGCTGCTGATTTATGTGATGAGCCTGTAATGACCCCGGAGGGTAATACGGAGCCTCGCTATACAATTAATGGCGCTTATGAGCTTTCCGAATCGCCAGCATCAGTGCTTGACCACATGCACAAATGCATAGCTGCTGAGCCAACCTATGTGGCTGGAAAGCACGGTATCTTGATGCAAGCGTACAATGGGCCTGCTGTATTGCGTATCGAGCCAAATCAAATCATTGATACAGTCAATATCACACCAGAATTAGGGTTACGTGATGCAACCAATGCGATTTACGGTACGTTTGTCGATGCAGAGCAACAATATATTCAAACAGACTTTGAGCCTGTTATTGTTGAAGAGTGGGTTGAAGAAGACGGATTAGAGATAAAAGAGAACATTGACTATCGTTTTATTGTTAGCCCGTATCAAGCCGCAAGAGTCACAAACTTGTATCTACGTAAAAAACGTGCCGGTCGTCGTATTCAGTCAAAGATGAATATGGATGGTTATGCATATAGACCGGGGGATGTTTGCTTACTTAACTTGCCCCATATTGGTATACAGGACTTTGAGTGCCGCGTGGCTGAGTGGAAGTTTCATCCGCAGGAGGGTGTCGAGTTACTGCTCGAAGAGGATGGGCCACATATCTATGAAGACATCATCGGCAAGCCTTTTGTGCGCCCGCCATTTACGGTTTTACCGACTGGCGGTGTCGCTCCACCACTAAATCTAACCTTTGTGCCAACAAATATTGGTGAAGTGGTTCAAGGCTATCTGAGTTGGCAGTCAGCCGCTGCCGATGTTCGCTATAACACAGTGAATATTCTTGAAAATGGCAAGGTTATCCAATCGATTCAAGTGCCAAGTGACCGCGTTGATTTATCGGGGCTTGTGCGTGGCTCATATCGTGCCGAAGTTCGGTCAATTAATGCGGCTGGCGCGATGTCTGCCCCAGCGATTGTGGATTTTGATATCCAAGCTCCACCTAAACCGGTCAGTGTTGAAATGGTTGGCGGCATGTTCTCATTGACCTGTATTCCGCATGGTGGTGAAACCGCGCAGCATGGCTATACATTTGAATTCTGGTTCAGCGACAAAAAACTGGCCAGTACGAATGACGTCGAAGTCACCACAAAAGCCAACCGACAAGGTCAGGGGCAATTTTGGACTAAGGATAACTTAAAGGCGGGTACAGATTATTGGTTTTATGTTCGTACTGTTAACAGCTATGGAAAATCGCAATTTGTCGAAGCTGTGGGTCAAGCTAGTGGAACGCCAAAGGATATGGTTGACGAGCTGGGCGACACCTTCCTCACCAACGAAGCAGGCAAGCAGATGCAAGAGCAGATTGACTTTAGCAAAGAAGCGATTGCAGAGCTTGAGTTGGACACGATTGATGTGAAGCAGAAAGTTGTCAGCATTGACAGAGATGTTGAAGCGGTCAACGAAGCGGTGATGATGAACACTCAGTTCACTACAGAATTACATTTCAGCTTGAAAGAAGAGGTTGCTGATAGAAAAGCTGAGATATTCCGCATTGAGCAAGTGCAAGTCACTGACAGAGAAGCGGCGGCGCGCTGGCAAGAGAAAATAAGTGCTGAAGTAAGCTATAACGCCGCTGAAATTCTCAATATCAAAGATACTCAAACGAGCTATGAGAAAGCAACGGCGCAGCAAATCAGTCAAGTAAAAGCTGATGTCGATGGTGTTAAATCACGCGTCACAACAGTTGAGACAGCAACCGCCGATTTAAAGCAATCACAAGCGAAGTTTGAACAATCAACTGCAGCTGAATTCGGCGAGATGCGCGGCTATATCACGCACTTTGAGACGTCATTGTCAAATGTGGAGCTTGCAGTTTCAGAAGCGATAATGCAGACGACAGCTCAAGTTAACCAACATAGCTCTGAGTTGCTACAGTCGAAAGCGGACGTCAAGCGTATTGCGAATGCAACAGCGACGAATGAAAAAGCAACAGCCGAGCTTGCAGAGAGCGTGAAAGCGCACTACGAAGATTCGCAAGCTGAATTCGTGGATGTGCGTAAATCAATTGCTGAGAAAGACAAAGCACACTCAGAACGCACAGAACAAGTGCGCGCAGAACTCGGGAAAGATATTAACGCTAATAAAGAGGAAATAGACAAGACAAACAAAGAGTTATCAGATATCAGCGCCGCAGTGACAACTAACACAAAGGCCATCGCTGAGACTGATAAGACATTGACGGAGCTTCAGCAAGTGTCTTCTTCACGCTTTGATAGCAATGAAGCGACGATAGCGAACATTCAAAACACTCAAGCAAACGCTGAGTCATCGCAAGCTGAAACGACGTTACAGCTCGCAGCGCAGCAAAATGAGCAAGGGTCTGAGCTTTTACGTGCTAAAGCCTCTATTCGTGAGACCAACAAAATTATTGTTGATAACGATAAAGCTTATGCGCAGAAGTTCACGCAAATTGATGCTCAACTCGGTGAGAACGGCGCTCGTTTTACGCGAGTAGAAGAAGCGCTGGCAGATACTCAGCGGTCAGTTGCAAAAAGCCATGAACAGCTCAACGCGAAGTTTGATAGCAGGATTGACACCGTTCAAGCCCAAATTGACACGCAGAAAGAAGCGATTGCGAAGCAAGACCAGGCGATTGCTAAAGTTAACACAGATTTATCTACTCGAATCGGTCAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP026704|2566818:2575983|2568463_2572795_+|WP_104873317.1|DBSCAN-SWA MGKVVSNIVSTGLMIAGAIMGGPAGWAVIAAGMATQFAGSMIFKDKVPSGYRDQSERKQMLRSSKAPETIIVGKTVCSGLLFFAEEEKGDQTENERLFMALAIAAHKVDHIGQIWLNDDLISEFGDKADYEFHNSRTDCDPYMLKNAPSWKEDMIGDGLAWLRLTLKYDAEKFPYGVPNVKVEVWGKQIYDPRTGKTVWSNNGALVILDYYRSYLNVPDSDIDFDAFKVAADLCDEPVMTPEGNTEPRYTINGAYELSESPASVLDHMHKCIAAEPTYVAGKHGILMQAYNGPAVLRIEPNQIIDTVNITPELGLRDATNAIYGTFVDAEQQYIQTDFEPVIVEEWVEEDGLEIKENIDYRFIVSPYQAARVTNLYLRKKRAGRRIQSKMNMDGYAYRPGDVCLLNLPHIGIQDFECRVAEWKFHPQEGVELLLEEDGPHIYEDIIGKPFVRPPFTVLPTGGVAPPLNLTFVPTNIGEVVQGYLSWQSAAADVRYNTVNILENGKVIQSIQVPSDRVDLSGLVRGSYRAEVRSINAAGAMSAPAIVDFDIQAPPKPVSVEMVGGMFSLTCIPHGGETAQHGYTFEFWFSDKKLASTNDVEVTTKANRQGQGQFWTKDNLKAGTDYWFYVRTVNSYGKSQFVEAVGQASGTPKDMVDELGDTFLTNEAGKQMQEQIDFSKEAIAELELDTIDVKQKVVSIDRDVEAVNEAVMMNTQFTTELHFSLKEEVADRKAEIFRIEQVQVTDREAAARWQEKISAEVSYNAAEILNIKDTQTSYEKATAQQISQVKADVDGVKSRVTTVETATADLKQSQAKFEQSTAAEFGEMRGYITHFETSLSNVELAVSEAIMQTTAQVNQHSSELLQSKADVKRIANATATNEKATAELAESVKAHYEDSQAEFVDVRKSIAEKDKAHSERTEQVRAELGKDINANKEEIDKTNKELSDISAAVTTNTKAIAETDKTLTELQQVSSSRFDSNEATIANIQNTQANAESSQAETTLQLAAQQNEQGSELLRAKASIRETNKIIVDNDKAYAQKFTQIDAQLGENGARFTRVEEALADTQRSVAKSHEQLNAKFDSRIDTVQAQIDTQKEAIAKQDQAIAKVNTDLSTRIGQAESSISDNKQSISDNEQALADFSQLTRAEFDNQQSAIEQRGQTIFDHNGNGSAIYTIKTGINWNNQYYDAKFMMGAEVRNGKVVTQIGFSADTFGIFNPSSGKLEPVFFVENGQVFINEAFINQATIEKLLIGSTIKSKNWDPLAKKGLMLDFENGKLIANDAEITGKIYATDGEFNGTVYVEKLIGDNAVAATYKYATKEEIHGSKYDQVIESKIIYTGGMPYDVDLLMPTMQFESAGSYSDAIIDAYVQIIIDGVTHTPQTTKVINGSSWKLVCSFYATIPASKKDVVVTVRYTTYHAGKCTTKILPAMVIACKHNSSSFKIS >NZ_CP026704|2566818:2575983|2575137_2575983_-|WP_004915363.1|DBSCAN-SWA MSHYQNNPALDNLTLGKKTAYYDQYDPSLLQAVPRSLNRDPLDIHADNLPFHGADIWTLYELSWLNKKGVPQVAIGSVHVDAQSENLIESKSFKLYLNSFNQTRYDSWENVRSVLQNDLSNCANGKVSVTLHKLDEFSQQAICQFEGICIDEQDIEINQYEFSRDYLANSTENENVEETLVSHLLKSNCLITNQPDWGSVQIRYRGPKINREALLRYLVSFRHHNEFHEQCVERIFNDITQLCKPEQLSVYARYTRRGGLDINPWRSNTQFTPEIGRLARQ >NZ_CP026704|2566818:2575983|2567414_2567999_+|WP_104873315.1|DBSCAN-SWA MIYHPLSDEMVKAINDDCYLVVAAKLDLKSGVTCVHTGTGNLIIAGEVYQGVGQLGAVESVKEGLSTSPTQLLLSLSGFDSKLVGEVLNERSRGRDVRLMLVAIDDDNGQPMLADVIFAGQIANLSVTTGEENKIGLTVSNRFERWSMGLPDRFTDESWSKRHSGDRIFRYVAQMAERSIYWGSKKDAPAFIYK >NZ_CP026704|2566818:2575983|2572860_2574315_+|WP_104873318.1|DBSCAN-SWA MYNTGTVTTTANSTKLIGTNTKWKDNNSRVSAEQVILIQNGATIYINSIASIQSNTEITLSFPVPASVSNAPYQILTTMVNSVSDAANKIVAMNVANVQFSDILNRWATESGTITVTLPDGTTQQLRTAKEMDKQLDGKFDKTGGVVDGGVTAIALGSIQKSTNSTVYLYPAPNGLPDGYAYLQYRVGDQWYGRLEIPRPVSNQVTRLMQIGECGVAGKSINLENGLAPDAQFTPSMLDSKENGFYAWGGGRSAPVPSQYNFMALQKWQSNHGAGVIGVSSAGDLFTYGMMNANWTQKITAYTTKNTTKDSNGNLKAASPVVKLFADKIELNEESEGVEMEHLGVGRYLIKGVVGFNSDGAWGINNGFVIPQDHNGKNMVLIDYKVRPDGDIEVFVFHQQNADLPERFQNKRIKYIDKDGNPVYYENYEPCDVPESRWIDMRVEMPPNSIYNLKQAEAERLAKEEAERQAEEAKNAEIEAEEDI >NZ_CP026704|2566818:2575983|2566818_2567415_+|WP_104873314.1|DBSCAN-SWA MSIIEWPSGINPSEMSWRLISNSKTFTSVFTGSSQTVRFPGSKWHCSLNFTNLTDDESRELEALMASLDGESGRVKISHWARKGVANMGTPLVNAPNQTGRYLQTKGWKPNTDVLRKGDYLTVNNELKMVTENIKSDVDGNAVIAISPMLRYSPTLNEKVEVAKPYGIFKPVDNEQGDFQFHPYLLSDVSLEFEEALY >NZ_CP026704|2566818:2575983|2568064_2568463_+|WP_104873316.1|DBSCAN-SWA MRHPQWTIQLPETLRAAMSRPFSWGEHDCCLFAADCALAVCGIDIAEKVRGRYKTKSGAMRVLKSEFGDIESGLSSFFTEIEPDKATRGDIVMFNGDEGKTLGVLWAGKVWSVTENGVLPVNHQPIKAWRVE |
6 | Salmonella_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2644917 : 2655509
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP026704|2644917:2655509|DBSCAN-SWA GTTATTGCTCATTAGAAGTCTCCTTATCCAGCGCCTGTAGTAGCATTCCCTTCGATATCACACCAAGATAGCGATTTTTTTCATTAATAACGGGAACGGCGCAGGGAGCTTGTGCAACGGTTGAGATGACCTCATTGAGTGGGGTTTCTCCCTGAATTGGTTCTATGCTAGAAATCACCGCTGATTCAATGCCTTGGTTGTTTTGTAGCGCTTTTTCGAGTGATTCAACAGATACGACACCTGCAAATGTGTGTCCTCGAGAGATGAGATAACCATAGTATCGGTCATCATCATTAAGCACTTTCAATGCGGAACGTGGGCCAAAACCAGGCGCAATATGCAATAGGGCATCGGCTCTTCGTCGCGCAATATCTTTGGCACTAAAGACCTGACTAATATCAACACCACGGAAGAAGGTTTTGACGTAATCATTCGCGGGATTATTGAGTATCTCATCGGGAGTGCCTATTTGCACAACGACACCACCTTGCATGATGGCAATTCGGTCTCCTATGCGCATGGCTTCATCAAGGTCGTGGGAGATAAACACAATGGTGCGTTGTTTATCACCTTGAAGAGAGAGCAACTCATCTTGCATTTCGGTTCGGATCAAGGGATCTAACGCAGAAAAGGCTTCATCCATTAACAAGATATCGGGATCATTTGCCAAGGCTCGTGCAAGACCAATACGCTGCCTCATACCGCCGGATAATTCATCAGGATAAGAGTAAGCCCATTTTTCAAGGTTAACTTGTCGAAGGGCATCCATTGCTTTTTGATGACGCAGCTCTTTTGAGATCCCCGAGAGTTCCATACCAAAAGCGGTGTTATCGAGAACATTCATATGTGGCATGAGCGCAAAGGATTGGAACACCATACTGATTTTTGTGCGTCTGACCTGACGTAGCGCTTTTTCTGAAATATTCGAGATATCTTCACCATCAATCAGCACTTGTCCGCTGGTGGGTTCAATTAGGCGATTGAGAAGCCGTACCAATGTTGATTTCCCAGATCCCGAAAGCCCCATCACAACAAAGATTTCACCCTCATTAATGGCTAAATTTGCATCTTGAACACCAACCGTTTGGCCTGTTTTTTCAAAGATATCATCTTTGCTCATTCCTGATTCTAAAAGTTTGAAGGCTTGATCAGGGTGTTCCCCAAAAATTTTATATAAATTTTTAACTTCTAATTTTATTGGCATACAGTAATTACCCATTTTTCAATTAATAAATTGTTCAAAGCACTTATCGAATGAAACTGGTCTTTTTATCAATTGGCCAAAAACTCGATTATCAGCTTTAGACTATTGGTTGAAAATATTTAGGGTAGATATTCCTATTTCGCTTAAGGTGAATTTAATAATTATGATTTGAATTCAACGGCTCCACTTAAAATTATTAGAAAAATAAACAAGCAATATAACCTAGCATAATAAATTGAGCTGACAACCCTTGGTTAAGGAGTATTAATCAAAAAAATAGCGAGTAAAAATAGAATACAAATTAGGAAAGTGTTGTTTTTATGGGATTCAACATTAAGGTGATTTATTTTCAAAATAAATAGGTTAACGTTTTGTTGTATATACATTTATTTTACTATTGTGCATTTGAAAACTAACCATAACAAATTAAAAAGAATAGAGATTATAACGGTTAGGTCAATTAGCAAATAAAATTGAAAATAATTTCAATATAAGGCCTTATTGATTAGTTATATTAATTAATTTTTAAGCGAAAATATTTATTCTTAAAAATTATTGCCTGATATGCATATTAAAAATGAATTATTTAACAGTAAAAAATGTAAATCTCGAGTTGTCATGATGGTTTTTTATACTAAAAGATATCCCGCTAAATAAAGTTATTATTATTCAGCGGGATATGCTTATTTAGGATGTTTAAAACAATTGGTTAACTAAATTGATTGATTAAAAATCCCAATCATCATCTTCGGTGCTTACTGCTTTGCCAATGACATATGAAGATCCTGAACCCGAAAAGAAGTCATGATTCTCATTTGCATCCGGTGAAAGTGCCGATAATATTGCTGGGCTAACATCAGTAACCACATCGGGAAATAGGGCTTCATAACCTAAATTCATTAATGCCTTATTGGCATTATAATGAAGGAACTTTTTAACATCCTCTGTCCAACCAACAGTGTCATATAATTCTTGTGTATAATTCACTTCATTTTCATATAAATCAAAAAGTAAACTGAAAGTAAAATCTTTAATTTCCTTCTGTGTTTTTTCATCATATTTTAATAAGGATTTCTGAAATTTATAACCAATATAATAGCCGTGAATTGCCTCATCACGAATAATTAAACGAATGAGGTCAGCAGTATTGGTTAACTTGCCTCGACTGGACCAATACATAGGTAAATAGAATCCCGAATAAAATAAAAATGATTCTAAAAAAACACTTGCGACTTTTTTCTTTAATGGATGTGAATCACAGTAATAAGACATAATGATTTTTGCCTTATTTTGTAGCGCAGAATTTTCTTCACTCCAACGATAAGCATCATCAACATCGCTAGTTGAGCAAAGCGTTGAAAATATAGAACTATAAGAGCGAGCGTGTACTGCTTCCATAAAACTGATATTTGATAATACCGCTTCTTCATGTGGTGTAAGGGCATCGGACATGAGGCTCGGTGCGCCAACGGTATTTTGAATTGTGTCGAGCAGCGTTAACCCAGTAAAGACTCGGATAGTTAACTGTTGCTCGGCAGCCGTTAATGTATTCCATGAAGAGATATCGTTTGATAGAGGTATTTTCTCTGGTAACCAAAAGTTGGTGGTTAAGCGGTTCCAGACCTCCAAATCTTTATCATCTTCGATTCGATTCCAGTTGATCGCTTTAACTGGTGCAGATGAAATGTGCGTTGTCATACTGATTTTCCTTTTAAAGCGTACATGAAACACAACCGTCAATTTCTGTGCCTTCTAGGGCGGTTTGGCGAAGCCTAATGTAATACAAGGTTTTTATACCTTTACGCCACGCGTAGATCTGAGCGCGGTTGATATCGCGAGTTGTTGCATCGTCTTTGAAGAACAAGGTTAGAGATAGCCCTTGGTCGACATGTTGTGTGGCAACGGCATAGGTATCGATGATTTTTTCAGGGCCAATTTGATAAGCATCTTGATAATATTCAAGGTTATCATTATTCATAAATGGGGCAGGGTAGTAGACGCGACCTATTTTCCCCTCTTTACGGATCTCTATCCGGGCAACTATCGGGTGAATACTCGATGTTGAGTTATTGATATAAGATATTGAACCAGTAGGCGGAATTGCCTGTAAGTTTTGGTTATAAATACCGTGCTCCATCACTGATTGTTTCAATGATAGCCAATCCGCCTGAGTTGGAATTTCGATGCCCGAACGTCGGAATAATTCCTGAACGGTTTGTGTTTTTGGTAGCCAGCTTTGGTTGATATATTTATCAAAATAACGACCATTGGCATACTCAGAATGCTCGAAACCTTTAAAAGTGGCTTTGCGTTCAATTGCCAATTGATTTGAAGTTTTTAAAGCATGATAAGTGATGGTATAAAAATAGATATTAGTGAAATCAAGCGCTTCTTCTGAACCATAGTGGATACGCTCTCTTGCAAGATAGCCATGTAAGTTCATTTGCCCAAGCCCAATGGCGTGGGATTGATGGTTACCTTGTTCGATAGAAGGCACTGAGCGAATATGGCTCATATCGGAGACCGCCGTTAGCGCTCTGATCGCAATGGCAACGGATTGGGCAAAATCGGGAGCATCCATCATTTTGGCTATATTCATGGAGCCTAAGTTACAACTGATATCTTTCCCGACTTCGCGGTAACTTAAATCGTCTTCATAGAAGCTAGGGCGATTAACTTGCAGAATTTCTGAGCACAAGTTACTCATATTAATGCGTCCCGCTATTGGGTTCGCACGATTCGCCGTATCTTCAAATAAAATATAAGGATAACCAGACTCAAATTGGATTTCGGCGAGGGTTTGGAAGAATTCGCGTGCGTTGATTTTGTATTTTTTTATGGCCTTATTATTGACCATCTCATGATATTTTTCAGTCACGCTGATTTCTGACATGGGAACGCCATATTCACGTTCAATATCATAAGGTGAAAACAGATACATCTCTTTGTTTTCTTTCGCCAATTGGAAAGTAATATCAGGGATCACTACACCAAGTGATAATGTTTTAATGCGAATTTTTTCATCGGCATTTTCCCGCTTAGTATCCAGAAAACGCATGATGTCAGGGTGATGAGCATGCAGATAGACAGCGCCTGCACCTTGTCGCGCCCCTAATTGATTTGCGTAGGAAAAGGCATCCTCTAACATTTTCATGACCGGAACGACGCCAGAGGATTGGTTTTCGATCAGCTTGATCGGCGCGCCTTGTTCCCGCAGGTTGGTCATCAGAAAAGCAACACCACCACCACGTTTTGATAGCTGTAGGGCTGAATTGACGGAACGACCAATTGATTCCATGTTGTCTTCAATACGCAGTAAGAAGCAGGAAACCAGCTCTCCGCGTTGTTTTTTCCCACAGTTAAGGAAAGTAGGGGTGGCCGGTTGAAAGCGTCCACTAATAATTTCGTCGACTAAATAGCTAGCAAGTGCTTGATTACCTTGAGCGAGTGTTAGCGCGACCATGCAAACACGATCTTCATAGCGTTCAAGGTAACGTTTGCCATCAAAGGTTTTTAAGGTGTAGCTGGTGTAGTATTTGAATGCACCTAAAAAAGTTTGAAAACGGAATTTATGTGCATAGGCTTGCTTAAAAAGCTTCTTGATAAAGGCAAAATCATATTGCTCAATGACTTGTGGTTCATAATAATTTTCGTTAACTAAGAAATCGAGCTTCTCTTTTAAGTCATGAAAAAAGACAGTATTTTGATTTACATGTTGGCGAAAATAGTGGTGAGCCGCTTCTTTATCTTTCTCAAACTGGATCTCGCCCGCACTGTTGTACAAATTCAACATGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP026704|2644917:2655509|2647831_2649964_-|WP_071599640.1|DBSCAN-SWA MENTKNKTTVDYHALNAMLNLYNSAGEIQFEKDKEAAHHYFRQHVNQNTVFFHDLKEKLDFLVNENYYEPQVIEQYDFAFIKKLFKQAYAHKFRFQTFLGAFKYYTSYTLKTFDGKRYLERYEDRVCMVALTLAQGNQALASYLVDEIISGRFQPATPTFLNCGKKQRGELVSCFLLRIEDNMESIGRSVNSALQLSKRGGGVAFLMTNLREQGAPIKLIENQSSGVVPVMKMLEDAFSYANQLGARQGAGAVYLHAHHPDIMRFLDTKRENADEKIRIKTLSLGVVIPDITFQLAKENKEMYLFSPYDIEREYGVPMSEISVTEKYHEMVNNKAIKKYKINAREFFQTLAEIQFESGYPYILFEDTANRANPIAGRINMSNLCSEILQVNRPSFYEDDLSYREVGKDISCNLGSMNIAKMMDAPDFAQSVAIAIRALTAVSDMSHIRSVPSIEQGNHQSHAIGLGQMNLHGYLARERIHYGSEEALDFTNIYFYTITYHALKTSNQLAIERKATFKGFEHSEYANGRYFDKYINQSWLPKTQTVQELFRRSGIEIPTQADWLSLKQSVMEHGIYNQNLQAIPPTGSISYINNSTSSIHPIVARIEIRKEGKIGRVYYPAPFMNNDNLEYYQDAYQIGPEKIIDTYAVATQHVDQGLSLTLFFKDDATTRDINRAQIYAWRKGIKTLYYIRLRQTALEGTEIDGCVSCTL >NZ_CP026704|2644917:2655509|2644917_2646120_-|WP_061064333.1|DBSCAN-SWA MPIKLEVKNLYKIFGEHPDQAFKLLESGMSKDDIFEKTGQTVGVQDANLAINEGEIFVVMGLSGSGKSTLVRLLNRLIEPTSGQVLIDGEDISNISEKALRQVRRTKISMVFQSFALMPHMNVLDNTAFGMELSGISKELRHQKAMDALRQVNLEKWAYSYPDELSGGMRQRIGLARALANDPDILLMDEAFSALDPLIRTEMQDELLSLQGDKQRTIVFISHDLDEAMRIGDRIAIMQGGVVVQIGTPDEILNNPANDYVKTFFRGVDISQVFSAKDIARRRADALLHIAPGFGPRSALKVLNDDDRYYGYLISRGHTFAGVVSVESLEKALQNNQGIESAVISSIEPIQGETPLNEVISTVAQAPCAVPVINEKNRYLGVISKGMLLQALDKETSNEQ >NZ_CP026704|2644917:2655509|2649974_2650388_-|WP_004917606.1|DBSCAN-SWA MQTESLIYFSSRSGNCHRFVEKVGLPATRLPIGEQQSSIIATTPFVLLLPTYGGGGSRGAVPKEVIRFLNIESNRRLIRGVIAAGNTNFGEAYAIAGDIIATKCQVPYLYRFELLGTERDVQRVRDGLNAFWQQRHN >NZ_CP026704|2644917:2655509|2651592_2651802_+|WP_014657708.1|DBSCAN-SWA MSKVKGNVKWFNESKGFGFITPEDGSKDVFVHFSAIASEGFKTLAEGQKVEFEITEGAKGPSAVNVVSL >NZ_CP026704|2644917:2655509|2653033_2653678_-|WP_014657709.1|DBSCAN-SWA MDVKTLSARTIIVRQLGLAPYQRVSDAMHQFTENRDKETADELWLVEHPRVFTQGQAGKAEHLLAPGEIPVIQSDRGGQVTYHGPGQQVMYVMLDLKRNKLGVRDLVTALETTVVKTLAHYQIEAYPRPDAPGVYINGDKVCSLGLRIRKGCSFHGLALNINMDLEPFNRINPCGYSQLKMTQMCHFIPNLTLPDVQPVLIEQFCDTLGFHIVQ >NZ_CP026704|2644917:2655509|2654300_2655509_-|WP_004917615.1|DBSCAN-SWA MKNFAPSRTLRHTLLGASLLFTMTQANANEPFPNSPVPAVPEIDAEAYILIDYNSGKVLAEKNADQRRDPASLTKMMTSYVIGQAIKSGKIGAEDIVTVNEDAWATGNPIFKGSSLMFLKPGDRVSVSQLTRGINLQSGNDACVAMADYVAGDQANFIQLMNGYVSKLGLQNTHFQTVHGLDAEGQYSSARDMALLGQALIRDVPDEYAIYKEKEFTFNNIRQTNRNGLLWDKSLSVDGIKTGHTNAAGYNLVASATEGQMRLISVVMGGKSMKGRDAESKKLLTYGFRFYETVKPLQAGVEFASEPVWFGDENNVKLGVTEDLFLTIPRGRLKDLKASYDISTSELEAPLKKGQAVGTINFQLDGKTIEQRPLVVLKDVEEGGFFSRLIDYIKLLFHRWFG >NZ_CP026704|2644917:2655509|2646846_2647818_-|WP_004917602.1|DBSCAN-SWA MTTHISSAPVKAINWNRIEDDKDLEVWNRLTTNFWLPEKIPLSNDISSWNTLTAAEQQLTIRVFTGLTLLDTIQNTVGAPSLMSDALTPHEEAVLSNISFMEAVHARSYSSIFSTLCSTSDVDDAYRWSEENSALQNKAKIIMSYYCDSHPLKKKVASVFLESFLFYSGFYLPMYWSSRGKLTNTADLIRLIIRDEAIHGYYIGYKFQKSLLKYDEKTQKEIKDFTFSLLFDLYENEVNYTQELYDTVGWTEDVKKFLHYNANKALMNLGYEALFPDVVTDVSPAILSALSPDANENHDFFSGSGSSYVIGKAVSTEDDDWDF >NZ_CP026704|2644917:2655509|2650915_2651386_+|WP_004917609.1|DBSCAN-SWA MYCQYLAAPEKFPKPWVQITADDEGVTSIYFVEQKSYPEQKNTHSELCVKQLTEYFNHQRKEFTVKLNPQGTEFQKKVWGHLCSIPFGERWSYKDLALKLGSVNYCRAVGMANSRNPISLIVPCHRVLGHDGKLVGYTGGLDIKDWLLAHEKEYAN >NZ_CP026704|2644917:2655509|2651944_2652910_-|WP_004917612.1|DBSCAN-SWA MSKPIQIERGIKYRDADKMALIPVKNVVTEREEILRKPDWMKIRLPADSTRIQGIKAAMRKNGLHSVCEEASCPNLSECFNHGTATFMILGAICTRRCPFCDVAHGRPNAPDANEPVKLAQTIKDMGLRYVVITSVDRDDLRDGGAQHFADCISAIREKSPSIKIETLVPDFRGRMDRALEILTETPPDVFNHNLENVPRLYRQVRPGANYDWSLKLLERFKEAHPDIPTKSGLMVGLGETNEEIIEVMRDLRRHGVTMLTLGQYLQPSRHHLPVKRYVSPAEFDEMKEEAMAMGFTHAACGPFVRSSYHADLQAKGEEVK >NZ_CP026704|2644917:2655509|2650397_2650625_-|WP_014657707.1|DBSCAN-SWA MAIITIYSKPDCVQCHATYQALERKSIPYQVIDLTQDDEALQFVRKLGYQQVPVVVADQEHWSGFRPDMISRLSA >NZ_CP026704|2644917:2655509|2653937_2654201_-|WP_004917614.1|DBSCAN-SWA MKTKLNELLEFPCSFTYKVMGLAEPELVDQVVEVVQRHAPGDYSPEVKPSSKGNYHSVSITINATHIEQIEKLYEELGALERVRMVL |
11 | Mycobacterium_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2831951 : 2839959
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP026704|2831951:2839959|DBSCAN-SWA TATGAGTCATCAATCCGGTCACGATAATGAAAAATCCGGCACTCTCGGCGAAATAAGCCGACGCCGTTTCATACAGGCCAGTTCTGTATTATCTGCGGTGCCGTTTCTGGCATCCGAAAGTATTGCATCCGTTCCGTCCGATCCTACACAGATTCCTGTTCATCAAACGGATGACGGGGTTCGCATTGTACCGACATGCAGCAGTTTTGACTGCGGTGGGAAATGTGATATCCGGGCACATATCAAAGACGGAAAAGCCATCCGCATCAGTACCCGACCGGATGCGGAACTGAATGAAGATATGCCGATCATGCGGGCTTGTGTGCGCGGACGCGGTTACCGGAAATTTATTTATCACCCAGACCGCCTGAAATACCCGATGAAGCGGGTCGGTAAGCGCGGTGAAGGGCGTTTTGAGCGCATCAGCTGGCAAGAAGCAACCAGCCTGATCGCCGCAGAATGGCAACGTATCAGTGACACATACGGCCCCGCGTCACGGTTTGTCAGCCTGAGTACAGGCGTGACCGGCGGGATTTTTTCCGGTGCGAATATGCTGCGCCGTCTGTTTAATCTGACGGGCGGGTTTCTGGAAAACTACCATTCCGTCAGTAACGGTAACACCATGGCAGCCACGCCGTATACCTACGGCACCGCCGCCAGCGGCAGCACACTTGATACCCTAGAAAATACCCCACTGGTGATCCTGTGGGGGCATAACCCGAACGAAACTATTTTCGGGCACAGTAACCACTATTTCCAGAAGATGAAAAAGAACGGCACTCGGTTTATTGTGGTCGATCCGCGCTATTCCGATACCGCCTCCTCATTAGCCGATCAGTGGATCCCGATCCTACCGACGACAGATAACGCCATGATGGATGCGATGATGTATGTCATCGTCACAGAAAATCTACATGATCAGGCGTTTATTGATAAATACACGCTGGGTTTTAGCGAAGAGCAGATGCCGGAAGGTGTAGCGGATAATGAATCACTGGTGGCCTATCTAACGGGTAAAAAAGACGGCATAGCCAAAACCCCAGAATGGGCAGAGAGAATCACTAAAGTTCCGGCGGAAACTATCCGTCAGCTGGCGCGTGAATATGCCACAACCAAACCGGCGGTGCTGATGCAGGGCTGGGGACCACAGCGTCATATCTGCGGTGAACGCAGTGCGCGCGGTGCAACGCTGCTGGCAACCATCACTGGTAATGTCGGCGTGCGCGGCGGCTGGGCGGCAGGTTACGGCATGGCACTGAATCCGGAACTGCGCAAAACCATCGCCGGACCAAAGCTGTTTGATAACCCAGTAAAAGCCAAAATCAACATCACCAACTGGGTGCAGGCGTGTGAGGACAAAAATCTGGTCACGCCGGATAACGGACTGAAAAATGCAGACAAACTCGACACCGAAATCAAAATGATTTTCTCAATGGCGGGTAACTATTTGACCAACCAAAATACCGATATTCTCCATGCCGCAAAAGTGCTGGAGGATGAATCGAAAGTCGAATTTATTGTCTGTAGCGATCTCTATCTTACCCCGAGTGCGAAATATGCGGATTTGCTACTGCCGGAAACCAGTTTTTTGGAACGCTGGAATATCGGTGGCACTTGGAGTTACGGCGATTACCTGATCCTATCTGAAAAAGCAATTGAACCGGAATTTGAACGTCGTACCGATTACGACTGGCTGTGCGACGTAGCCGAAAAACTGGGGGTTCGTGATGCATTCACCGAAGGGCATGAGACAGATCGTGACTGGATAGAATTCCTCGTCAATGATGCAGCACAAAAGCGCCCAGAAGATAATATTCCGACGTTTGATGAGCTGCTGATAAAACGCCGTCATTTGTTAACTCATCGTCCACATACCCAAAATGTGGCTTTTGAAAAAAATATTCAGGATTTTGAGAACAACCCGTTCCCGACTCCGTCCGGCAAAATCGAGATTTTCTCCAAACGCCTGTATGACATGCACAATCCGGACATTCCCGCGCTATCTCATTATGTTCCAGCCATCGAAGGACCGGAAGATAGCCTTACCGCGAAATACCCGTTACAGCTGATCACTTGGAAAGGTCGCAACCGCGCGAACTCCACGCAGTTCGCTAACCCGTGGTTGCAAGAAGTGCAGCGGCAGGAGCTGTGGATTAATCCATTCGATGCGGCGGATCGCGGTATCAGTGACGGTGAAAAAGTGAAAGTACATAACGATCGCGGTATCACCATGATCCCAGTAAAAATCACACAGCGCATTATGCCCGGTGTGGTTGCATTACAAGCCGGAGCTTGGTGGCTGCCGGACAACAATGGCATTGATCAGGGCGGATGTGCCAACGTGCTCACCTCGTCACGCCGTACCGCGCTCGCCCACGGCAATGCGCACCAAACATTATTGGTTGAGGTGGAAAAAGCATGAGCAAATTCATCGTTTATCCGGCAGTCAGCAGCAAACAGTTAGGTTTTTATATTGATTCCGCCCGCTGCTCCGGTTGTAAAGCGTGTCAGGTAGCGTGCAAGGACAAAAATAATCTTGATGTCGGCCGCCGCTTCCGTCGGGTGTATGAAATGACCGGCGGCGGGTATAGCCGCAATCAAAACGGCGCACTGATTAATAACGTGTTCGCCTATACGCTTTCTATTTCCTGTAATCACTGTAAAGACTCGATCTGTGTGCGCAACTGTCCGACAACTGCAATGCATAAACGCGAAGGTGACGGCATTGTGATGGTCAATACTGATAAATGTGTTGGCTGTGGTGCCTGTGCGTGGTCGTGTCCGTACGGCGCGCCGCAGATGAATCCGGAAACAAAGCAGATGTCGAAATGCGATTTTTGTATCGATCTTCAACAAAAAGGTGAACAGCCGGTATGCGTTAGCACCTGTCCACTCGGGGCGATTCAGTTCGGCCCAATAGACGAACTGAGGGCGAAATACGGCGACCTTGATTACGTGACTGGGCTGCCAGATCCGTCAATAACTCATCCGAATCTGGTGATTAACCCGCACTGGGGCGCGAACTTTGATGATATGAACAGTGAGAGAAAAGAAAAATGAATGAGTGGTCACTTTTAATTTTCACTTACATGATGAATGCGGCGGTGGGGCTGTGCGTTGTGAGTGGGGTATTTGCCATGCATTTCAGCCATCGCCTCCCGACAGACAGCTTTAAGCGTTTTATGATGCTGACGATTTTTATTATCTGCGGTATTGCGGGTGTGGGATCTGTTGCATCAATTACTCACCTCGGCGTGCCACTCAATGCGCCGAATGCCATTAATAACGTATTCAGTGCTTGGCTTAGCCGTGAAGTAGTGGTTACCGCATCATTTGTTGGCGTATTGGGTATCAGTTTTCTCTGGTTGTGGAAGACGGGCAAATTTTCTTTTCTGTTATATGGTGGAGCGATGGCGATCGGGCTGTTCGATATCTTCTGTATGGCATCGATTTACCGTTATACCTCGATTCTGACTTGGAATGATATCAATACCTATCTGATGTTTTACGGTACGACGCTGACACTTGGTGCAGTGCTGTTTATTCTGCTGGTGGTGATAGTTGAGAAAACCGGACACAGAGTTGGGATTGCGCTGCCCGCTGATACATTGTCATTATCACAGCTGTGGCTGTTGTGGGGGATGATGGCGGTAAGCCTAGCTGGTCGTCTGCTGTATCAGCCATTTTATGAGCATTACCTGACCCTCACACAGTTGACTCATAAATCCATTACATTTCCGCTGTCACCGATTGATGCGTATGACAGTATTGCCGAGCTGCGGATTGGTGTCCTAGCGGCAGCCGCAATTGGTGTGGCACTCTGCTGTATATCTCTTGTTCGAGCGCAGAAAAAAGCACATAACGGCGTACCGGTCTGCGGCGGGTTTATCACCGGCTGTTTACTGACTATTGCGGCAGAATTTATGTTGCGTTATGTGTTCTATTATATTCATATCTGAAGGGAGATGTAATGAATAAGACAGCTCACTATGCGGCCGCGTTTAATGTACTGGGGATCTGCTATCTGTTCCCGCCGGATGATGACAGCAACCGGATGGCGATGCGTCTGTTTACCCTGCCGGGATTTGCCCAGCAGTGGCCGTGTGAGGTGGATAGTACACTCTGCATGCAACTGAGCCGCACGGCCGCAGAGGGGGCGGAGGTACTGAAATCGGCATGGCAATCTCTGTTCGTCGGGCCAGGGTCGTTACCGGCGCCACCTTGGGGCTCGGTGTATCTCGATGCGGAAGGATTGTTGCAGGGGGATTCGACTCTTGCGCTGAGCGCTTTTCTAAAACAGGAGCGGCTAAAACTAAATACCCCGTATCCGGAACCCGCAGATCACATCGGGCTGATTTTATTTCAGGCGGCGGTACTGGCATCTGAAATGCGAGAAGTAGCGGTTAATACACTGCTCAGTCAGCACCTGATGAGTTGGTTACCGCGTTATTCGCAGCGTCTGGACACGCACGGAAACAGTCCGTTTTACTCCGCACTGACCCGACTGACAGTGACCACCGTGCAATCATTTATAAAAGCATAATCTTCACAGTGATTGATTACATCCCCATAATCTGATGCGCCTCTTTCTCTGGGGCGTTTTTTTGTGGCAGCACCAAGTGCCTTTCCTTAAGGTAAATTACCTGCCCAGACTTCATTAGGGGCTAAAAGATTAAAATTTTGATTCAGCAAATTATCCGCCACGGCATCACTGTGTTTGCGTTTGGTAGCCATTTTATAAACGATACGTTGAGTAACGATGAGACCCAATTGAGCTATTAGCCTTCGAACATAAAGATTAACGAGATAGACCAATTGGAAGAGCGGTTAAAAGTCAATTATAACCACGCAAATTTCATGGATCACAGCTTGTGGCATCAATACCTCAAAGCACCCAAAAGCGGTAAATCAGTAGAAATTCTTCAATACGACTATGTCGCTTATACATACAAAGAAACCAGCATTTACTTCAAACCTAACAAAGTTGGTATCGAAGGGGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP026704|2831951:2839959|2834368_2835010_+|WP_104873352.1|DBSCAN-SWA MSKFIVYPAVSSKQLGFYIDSARCSGCKACQVACKDKNNLDVGRRFRRVYEMTGGGYSRNQNGALINNVFAYTLSISCNHCKDSICVRNCPTTAMHKREGDGIVMVNTDKCVGCGACAWSCPYGAPQMNPETKQMSKCDFCIDLQQKGEQPVCVSTCPLGAIQFGPIDELRAKYGDLDYVTGLPDPSITHPNLVINPHWGANFDDMNSERKEK >NZ_CP026704|2831951:2839959|2835920_2836493_+|WP_004917969.1|DBSCAN-SWA MNKTAHYAAAFNVLGICYLFPPDDDSNRMAMRLFTLPGFAQQWPCEVDSTLCMQLSRTAAEGAEVLKSAWQSLFVGPGSLPAPPWGSVYLDAEGLLQGDSTLALSAFLKQERLKLNTPYPEPADHIGLILFQAAVLASEMREVAVNTLLSQHLMSWLPRYSQRLDTHGNSPFYSALTRLTVTTVQSFIKA >NZ_CP026704|2831951:2839959|2835006_2835909_+|WP_104873353.1|DBSCAN-SWA MNEWSLLIFTYMMNAAVGLCVVSGVFAMHFSHRLPTDSFKRFMMLTIFIICGIAGVGSVASITHLGVPLNAPNAINNVFSAWLSREVVVTASFVGVLGISFLWLWKTGKFSFLLYGGAMAIGLFDIFCMASIYRYTSILTWNDINTYLMFYGTTLTLGAVLFILLVVIVEKTGHRVGIALPADTLSLSQLWLLWGMMAVSLAGRLLYQPFYEHYLTLTQLTHKSITFPLSPIDAYDSIAELRIGVLAAAAIGVALCCISLVRAQKKAHNGVPVCGGFITGCLLTIAAEFMLRYVFYYIHI >NZ_CP026704|2831951:2839959|2837265_2837799_+|WP_104873355.1|DBSCAN-SWA MRLCDRDIIQLMDEGKLVINPRPSIEQINGAAVDVHLSGIYRIFHGYTSTAINLSESDDAINSEISGVMSDRIVLKAYEPFYLYPGQLAQALLDEIITIPDNLVGWIEARSSLSRLGLMVHINPQRLDPGWSGLINLEFYNAGRLPLILGSNKMFGTLSFEPLSGCADRPYNSRQDA >NZ_CP026704|2831951:2839959|2831951_2834372_+|WP_104873351.1|DBSCAN-SWA MSHQSGHDNEKSGTLGEISRRRFIQASSVLSAVPFLASESIASVPSDPTQIPVHQTDDGVRIVPTCSSFDCGGKCDIRAHIKDGKAIRISTRPDAELNEDMPIMRACVRGRGYRKFIYHPDRLKYPMKRVGKRGEGRFERISWQEATSLIAAEWQRISDTYGPASRFVSLSTGVTGGIFSGANMLRRLFNLTGGFLENYHSVSNGNTMAATPYTYGTAASGSTLDTLENTPLVILWGHNPNETIFGHSNHYFQKMKKNGTRFIVVDPRYSDTASSLADQWIPILPTTDNAMMDAMMYVIVTENLHDQAFIDKYTLGFSEEQMPEGVADNESLVAYLTGKKDGIAKTPEWAERITKVPAETIRQLAREYATTKPAVLMQGWGPQRHICGERSARGATLLATITGNVGVRGGWAAGYGMALNPELRKTIAGPKLFDNPVKAKINITNWVQACEDKNLVTPDNGLKNADKLDTEIKMIFSMAGNYLTNQNTDILHAAKVLEDESKVEFIVCSDLYLTPSAKYADLLLPETSFLERWNIGGTWSYGDYLILSEKAIEPEFERRTDYDWLCDVAEKLGVRDAFTEGHETDRDWIEFLVNDAAQKRPEDNIPTFDELLIKRRHLLTHRPHTQNVAFEKNIQDFENNPFPTPSGKIEIFSKRLYDMHNPDIPALSHYVPAIEGPEDSLTAKYPLQLITWKGRNRANSTQFANPWLQEVQRQELWINPFDAADRGISDGEKVKVHNDRGITMIPVKITQRIMPGVVALQAGAWWLPDNNGIDQGGCANVLTSSRRTALAHGNAHQTLLVEVEKA >NZ_CP026704|2831951:2839959|2838681_2839326_+|WP_004917981.1|DBSCAN-SWA MTDIAHHCTIVGISGASASGKSLIASTLYRELREKVGDHNIGVIPEDCYYKDQRDIPMEERLKVNYDHPNSMDHSLLYQHLKALKSGKSVEIPQYDYVAHTRKETSIHFKPKKVIIIEGILLLTDKRLREEMDFSIFVDTPLDICLMRRIKRDVNERGRTLDSVIEQYNRTVRPMFLQFIEPSKQYADIIVPRGGKNRVAIDILKAKIGEFCQD >NZ_CP026704|2831951:2839959|2839377_2839959_+|WP_014657808.1|DBSCAN-SWA MRLCDRDIIQWMDEGKLVISPRPPIERINGATADVRLGNQFRVFRGHTAAFIDLSGPKDEVNAALDRVMSDEIILKDNEPFFLHPGELALAVTLESVTLPDNLVGWLDGRSSLARLGLMVHVTAHRIDPGWCGQIVLEFYNSGKLPLALRPGMVIGALSFEPLSGSADRPYNSRQDAKYKNQQGAVGSRISED >NZ_CP026704|2831951:2839959|2836807_2837017_+|WP_104873354.1|DBSCAN-SWA MDHSLWHQYLKAPKSGKSVEILQYDYVAYTYKETSIYFKPNKVGIEGVLLLTDKRLYEERDFSILSVLV |
8 | Escherichia_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
2885495 : 2896191
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP026704|2885495:2896191|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP026704|2885495:2896191|2894424_2896191_-|WP_014657832.1|DBSCAN-SWA MDKTRQTELVRWLKQHSTSAKRWLRISMLLGVVSGLLIIAQAWFLAVILQALIMEHTPREQLLTPFILLLAVFVLRALLTVIRERVGFRCGQVVRQEVRNMVLNKLQALGPVWVKGKPAGSWATIVLEQIEDMQEYYSRYLPQMYLAGIIPIMILIAIFPFNWAAALILFATAPLIPIFMALVGLGAADANRRNFVALGRLSGSFLDRLRGLDTLRLFFREKAEVQQIRESTEDFRSRTMEVLRMAFLSSGVLEFFASISIAIVAVYFGFSYLGELNFGSYGLPVTMFAGFLALILSPEFFQPLRDLGTYYHAKAQAVGAAESLVTLLESDGEQKTETGDKTPQDKPIQIEANKLEIYSHDGQRLVGPLDFTIEPQQRIAVVGQSGAGKSSLLNLLLGFLPYKGSIKINGDELKELCPDKWRALIGWVGQNPHLPEQTLIENICLGKPTASEAEIQQAIDDAYVSEFLPMLPDGLNTRLGDYAARLSVGQAQRVAVARTLLKPSRILLLDEPAASLDAHSEKRVMHTLNQLAQQQTTIMVTHLLEETVNYDQIWVMANGQIIQRGHYAQLSQSEGPFARLLAHRSEEL >NZ_CP026704|2885495:2896191|2891969_2892671_-|WP_004918075.1|tRNA|DBSCAN-SWA MYQLDDDSYLFPPVHEAMREPNGLLAIGGDLAPDRLKAAYYDGIFPWFNPGEMPLWWSPDPRAVLMVGELHISRSMKKLLRKQKYRVTVNHAFKDVIAACAIRDEGTWILPEVREGYQALHEQGIAHSIEAWYGEELVGGLYGVNMGHLFCGESMFSRMNDASKFAFITFYFHFLRYNGQLFDCQVLNHHTASLGAKEISRRDFLHILYRWRNKAIDPACWLPQSIEIPPLFE >NZ_CP026704|2885495:2896191|2887230_2888169_+|WP_014657829.1|DBSCAN-SWA MSLKQTLCAYELIDSAVVNGDDIVALFKNFTTIEASSKTVRDGKGQSDFVRIVIPGTHGKRQGNHAPTLGIIGRLGGIGARPSRIGLVSDADGAIAAIATALKLAEMREKGDVLMGDVIITTHICPTAPTRPHSPVDFMDSPLNDETMNENEAIPEADAILSVDTTKGNRLINHKGYALSPTVKDGYILPVSEDLLHLMEWSSGQNAVTFPLAVQDITPYGNGLHHINSIMQPAVSTTAPVVGVAICTQTIVPGCSTGASHEVDIAASVKFMIEVAKAFGSGNCQFYDEEQFALLKSLYGDVSFLQTHGRPH >NZ_CP026704|2885495:2896191|2891610_2891829_-|WP_004244560.1|DBSCAN-SWA MAKEDNIEMQGTVLDTLPNTMFRVELENGHVVTAHISGKMRKNYIRILTGDKVTVELTPYDLSKGRIIFRSR >NZ_CP026704|2885495:2896191|2885495_2886341_+|WP_014657828.1|DBSCAN-SWA MDHSSVKVALAQFNSLLGQKQHNLERMAAFCHQAAEQGAKLICFPELATTGYRGDLLATQLWDLSDDEGSETYRLFSALATQLDLTIVSGFAERGSYLGEVYNAVGVWNPGCEGVSGVYRKVHAFGIEKQWFSSGNSYPVFDTPFGKIGVMICYDMGFPEVARILTLNGAELLLVPSAWRIQDKDMWDINTACRALENGSHLLAVNRWGNEEDLHLFGGSKIVGPRGQVLSEASCDGETLLIGEVDFRVQAHTRLNIPYLRDRKPQSYEALVQNSQVTGEL >NZ_CP026704|2885495:2896191|2888907_2889228_+|WP_004918070.1|protease|DBSCAN-SWA MSDFLGTFKTDVVFKDEVEQVLQPPSMYKVILNNDDYTPMDFVVEVLQKYFSFDEERATQIMLDVHFQGKGVCGIFTAEVAETKAAQVNSYAREHEYPLLCTIEKV >NZ_CP026704|2885495:2896191|2888272_2888524_-|WP_004918068.1|DBSCAN-SWA METGTVKWFNNAKGFGFICPENGGEDIFAHYSCIQMEGYRTLKAGQKVNFSINTGPKGNHANLIIPIESSTLNHTSAEATPQE >NZ_CP026704|2885495:2896191|2892679_2894422_-|WP_014657831.1|DBSCAN-SWA MRVLLPFLALYRRHWFLILLGMILAIVTLLASIGLLTLSGWFLAGAAIAGFPGLYYFNYMLPAAGVRGAAIFRTAGRYAERLVSHDATFRVLAHLRVFAFSKILPLSPGGISRFRQGEILNRLVADVETLDHLYLRVLSPIFAAFVVIFVLIFGLSFLDPRLAWTLGCIMLFLLFTLPFVFYRAGKPIGQELTYLRAHYRTVLTSALQGQAELTLFGALPRFRQTLANIESQWQVRQQQQANLTGVSQAIILFASGFTATLLLWMAADHVGGNTNPGALIALFVFCALAAFEALGPVAVAFQHMGQVIASAERVSQLIDAKPEVTFPDNGLSLPQLESLVVDNISFTYPEQPFAVLKQVSLSLLPGQHIALLGKTGCGKSTLLQLLTRAWDVDSGMIKINGQNISDYSEQALRSLMSVVPQRVHIFSDTLRNNLLLANDKATDKQLIEVLDQVGLGNLLENEQKLNAWMGEGGRQLSGGEQRRLGIARALLHNTPLILMDEPTEGLDAQTEQQILALLKEKCADKALIVITHRMQGIEQMDTICVMDNGEIVEQGSHQALLDLKGRYFQFRQRHLQQQAL >NZ_CP026704|2885495:2896191|2889258_2891544_+|WP_004918072.1|protease|DBSCAN-SWA MLNQELELSLNVAFAKAKDNRHEFMTVEHLLLALLSNASAREALDACKVDLVVLRQELEHFIAQTTPLLPENDNRDTQPTLSFQRVLQRAVFHVQSSGRNEVSGANVLVAIFSEQESQAAYLLRKHDVSRLDVVNFISHGTIKGEASASSEQDTPNSNVNHEEQPVSDDHMDNFTTNLNQLAKQGKIDPLVGRQAELERTIQVLCRRRKNNPLLVGESGVGKTAIAEGLAWRIEQGDVPEVMNGCTIYSLDIGSLLAGTKYRGDFEKRFKSLLKMLEKDSKSILFIDEIHTIIGAGAASGGQVDAANLIKPLLSGGRIRVIGSTTYQEFSNIFEKDRALARRFQKIDIVEPTTEETVRIINGLKPKYESHHDVRYTAKAIQAAVDLSVKYITDRHLPDKAIDVIDEAGARTRLVAPSKRRKTIGVPEIESVVARIARIPEKTVSSSDKERLKTLDSRLKMLVFGQDDAITALTEAIKMSRAGLGQDHKPVGSFLFAGPTGVGKTEVTVQLAKALDIKLLRFDMSEYMERHTVSRLIGAPPGYVGFDQGGLLTDAVIKHPHSVVLLDEIEKAHPDVFNILLQVMDHGTLTDNNGRKADFRNVIVVMTTNAGVQETQRRSIGFAEQDNSTDAMSEIKKVFSPEFRNRLDGIIWFNSLSMDIIIQVVDKFIVELQAQLDEKGVSIEVSQEARRWLCEKGYDKAMGARPMARVIQDNLKKPLANELLFGSLTNGGSVRIGLDNKSNTLTYSFSSVHKASPEDAVF >NZ_CP026704|2885495:2896191|2886337_2887087_+|WP_004918066.1|DBSCAN-SWA MSILSSVVDVYRLFLRSGDELTVTTLVNELGMPKSSASRLLKQMAEHGLLEKKNDAPIYRPGLIIMELAHRARGMNPLIDMALESLDELTKETGFTTYVSLRDKDKVRVVHARIGNSMLQVITQPGTKLPIAGTSTGKALLARYSLSEREVIICQEPQEKQDKLRQELNQIEERGWAFSINESVPGVASVSSTVYDPAQGTLYALCLSLPASQITSELLAQLATKICHKASYLGSMVGDPYWLKRSSES |
10 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(16.67%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
2991366 : 3006546
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP026704|2991366:3006546|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP026704|2991366:3006546|2993460_2993919_-|WP_014657950.1|DBSCAN-SWA MESTTRTIKNTKNIALVAHDHCKSSLLAWATKNSEQLKSHQLFGTGTTAKLISHHTGLHVTGMLSGPMGGDQQIGAMISEQKIDVLIFFWDPLNAVPHDPDVKALLRLAAVWNIPVATNPATADFIITSPYFNGAIDIVIPDYQQYLQERTK >NZ_CP026704|2991366:3006546|2999023_2999419_+|WP_014657956.1|DBSCAN-SWA MEKKNHPSQVASQNNVASSILPKNPPKKHRARLYMLGTGINGFTENEILIHCRLSSGRNYPNELERLLNIELERIDEPNPDGIGSHYRYRFKTAQDVQKVINLINKRAEQGNYQRIDNALINNILSLYPTE >NZ_CP026704|2991366:3006546|2995498_2995828_-|WP_004918228.1|DBSCAN-SWA MLLFNGQEIETDPQGYLIDSQQWSEDLIPLLAEQENITLTEEHLEIIRFVRAFYLEFNTSPAIRMLVKAVSQQFGEDKGNSRYLYRLFPKGPAKQATKLAGLPKPVKCI >NZ_CP026704|2991366:3006546|3002561_3004934_+|WP_014657964.1|DBSCAN-SWA 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20 | Morganella_phage(40.0%) | integrase | attL 2994156:2994169|attR 2998917:2998930 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
4106647 : 4164728
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP026704|4106647:4164728|DBSCAN-SWA 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52 | Haemophilus_phage(19.05%) | transposase,plate,tail,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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