Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP026707 | Acinetobacter baumannii strain AR_0056 chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,RT,DEDDh,cas3,WYL | 0 | 0 | 9 | 0 |
NZ_CP026705 | Acinetobacter baumannii strain AR_0056 plasmid tig00000058_pilon, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
NZ_CP026708 | Acinetobacter baumannii strain AR_0056 plasmid tig00000534_pilon, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP026706 | Acinetobacter baumannii strain AR_0056 plasmid tig00000059_pilon, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP026707_1 | 836443-836528 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026707_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP026707_1
>1.1|836466|40|NZ_CP026707|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026707_1
The CRISPR arrays of NZ_CP026707_1 >merge|NZ_CP026707|1|836443-836528|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP026707|1|1|836443-836528|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP026707.1|WP_000795915.1|835205_835442_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP026707.1|WP_001124846.1|834311_834923_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP026707.1|WP_000885229.1|833629_834241_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP026707.1|WP_000376215.1|833017_833473_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP026707.1|WP_001990047.1|831312_832959_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP026707.1|WP_000115408.1|827682_831147_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP026707.1|WP_000107128.1|826726_827686_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP026707.1|WP_001025680.1|826298_826583_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP026707.1|WP_002017921.1|826075_826189_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP026707.1|WP_000937460.1|825351_825987_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP026707.1|WP_000983628.1|837159_837573_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP026707.1|WP_000432330.1|837714_838593_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP026707.1|WP_001990041.1|838649_840794_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP026707.1|WP_001145693.1|840848_842258_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP026707.1|WP_000482091.1|842573_843053_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP026707.1|WP_000108365.1|843337_843559_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP026707.1|WP_000132044.1|843664_843982_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP026707.1|WP_000498477.1|844066_844288_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP026707.1|WP_001136759.1|844375_844804_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP026707.1|WP_000251637.1|845073_845217_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
79992 : 127877
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026707|79992:127877|DBSCAN-SWA CATGATTACACGTCGTAAATTTTTAAATTACTCTTTAAATATGGGCTTTGGCGCTGCAGCGTTAGCGGCTTTCCCATCGAGTATTCAAAAAGCTCTAGCAATTCCTGCAAATAATAAAACGGGCACTATTCAGGATGTTGAACATGTCATCATCTTAATGCAGGAAAACCGATCTTTTGACCATTATTTTGGTACGTTAAAGGGCGTTCGAGGCTTTGCTGACCGTTTTACAATCCCTCTGCCAAATGGTCGCCGTGTCTGGGAACAGCTGAGAAGTAATGGTCAGGTTTTAACCCCATTTCACTTAGATGGAACAGCCAATAATGCACAGCGTGCAGATGGCACGCCTCATACGTGGGATGACAGTCAGTTGGCGTGGGACAATGGACGTATGGCAAACTGGCCAACTCATAAAACCGATATATCTATGGGCTATTTTAAAGAAAAAGAAATCCCATATCAGTTTGCACTTGCCAATGCCTTTACGATTTGTGATGCCTACCATTGTTCTATGCACACCGGAACAGATGCGAACCGCTCTTTTCATTTAACTGGTACCAATGGTGCAACACCGACCAAGCGTTCATTTGTAAATAATGAATGGGACTGGATTGATGGTAACCCAGCAACGGCAGACCGTGGTTACACTTGGAAAACCTATGCCGAAAGATTAGAAGAAGCAGGGATAAGCTGGATTTGTTATCAGAATATGCCAGATGAATGGGGCGATAATATGTTGGGTGCATTCCGTTCTTTTAGAAAGGCCAACATTGCATCCGGTTATCCCGTTTCAAGCGGTGGAGAGCCGAATAAACCGTATGCCGATACGGGTCAAAAACTACCGTATAAAGCCTATGATGCGGCTACTGATAATGCCAAAAATCCACTCTATAAAGGCATTGCAAATACGCTACCGGGCAATAAACCAGAAGAGTATCTCGACGCTTTTAAAAGAGACATTCGTGAAGGGAAGTTACCTCAAGTTTCTTGGATTAACGCGCCATCGATATACTGCGAACATCCAGACCCTTCAAGTCCGGTTCAAGGAGCTTGGTTTATTCAAGAAATTATTGATGCATTAACTGCTGTGCCAGAGGTGTGGAGTAAAACGGCTCTGCTCATCAACTTTGATGAAAATGATGGTTACTTTGACCATATGCCATCGCCATCAGCACCATCTCGACTCAAAAATGGCCAGTACGCAGGTAAATCGACACTAAGCAATGCTGATATGCAAGATGAATATTTTGATCATGCTGCACCTGAGGGGAGCCATTCACAGCCTACACCTGATGGACGAGTTTATGGTCCGGGTCCTCGTGTTCCTTTATATGTGATTTCTCCATGGAGTCGTGGCGGTTGGGTCAACTCACAAGTGTTTGACCATACTTCCGTGCTCATGTTTTTAGAAAAACGTTTTGGTGTAAAAGAGCCGAATATCAGTCCATACCGCCGTGCAGTGTGTGGTGATTTAACAAGTGCATTTAACTTTAAAACACCAAATGCAGATGTTTTACCGCAGCTGAGTGGTAAACAAACACGTCTGCAGGCAGATGCGCTAAGGGAAAACCAAGAAGCTTTGCCAGCTGTTCCTGTACCCACGGATATTAAGTTACCCATTCAGCAAAGTGGGATCCGTCTATCACGGGCGCTACCTTATGAGTTGCATACCAGTGCGCGTTGTAAAGCAGATGGTAAGGTGCAATTGATTTTTTCTAATACGGGTAAGCAGGCAGCGGTTTTCCATGTATATGACAAGCTCAATTTAGACCGTATTCCAAAGCGTTATATTGTCGAGCCGAATAAAACTTTAGATGATGAGTGGGATGCTTTAAACGATAACTTAGGCCGTTATGACCTATGGGTACTTGGTCCAAATGGCTACCATCGTCATTTTAAAGGGGATGCTCAACGTATTATCGATAGTGGTGTTAAACCTGAAATTCGAGTGTGCTATGACATTGCTAATGGTGATGTTTATGTCGAACTCATGAATGAGGGAACCAAGGATACAATATTGACAGTAAAACCTTGTGCATATCGACAAGATGCGCCATTGCAACTGACCGTAAAAGCGGGACAAGTTGTTAAGCAACATTGGTCGTTGGCTGATGTTGGGCATTGGTATGATTTTGAAGTTACGAGCGAGAGTGATCCGTATTATTACCGACGTTTTGCTGGCCGAGTCGAAACAGGTGAGGACTCCTTTAGTGATCCTGCAATGATCTAAGTTAGGATGAGGCAAAAAGAGGAACTTATTTTCTTTTTGCCTCATTTTTTATAATAAAAAATTCTCTAAAACTTCACGGACTGACTCGGATATTGGAACAGTCTTGCGTGTTTCACGGTCAACAAACACATGCACAAAATGTCCTTGAGCTGATGCTTGGTCTTGACCTTGTTTAAAGATTGCCAATTCATAGCGTAAAGATGTTGTACCAATTTTACCAATCGCAACACCTACCTGAATAACTTCTGGAAATGATAACTCTTGAAAAAAGCTACAAGCTGAGTCGACGACTAAACCAATTGATTTTGCTTCATGAATATCAAAACCTGTTTTCTGGATGAGCAAAGCATTGGCTGCCGTATCAAAATAGCTATAGTAAGTCACATTATTCACATGACCGTAAATATCGTTATCTGCCCAGCGAGTTTGAATATCTAAAAAGAACTTAAATTGATCACGAGTTTTTAAAACGGGTTTAGTCATTAATAAATCGCCTGATAAATTGCTAAAGCAGCTGCTTCTGTCATGTCACGTGGATTATTTTGCAGTAATCGAGTTTGCAACATGGCATCTTGAGCAAGTCTTGGTAAGCTAGACTCTTCAATACCCAAATCGCTAAGTTTTAAAGTCAAACCACTACGGTCTAAGTGATTTTGCATATGGTCAATAAACAGATCACATAACCCATCGGTGCTACCGTTACTATATGGGTCTAGCCATTGCATAAGTTCTGCATAGTATTGTTTGGCATAAGGCGCATTAAATTTCAGTACTTCAACGAGCACCAAAGCATTGGTATGTCCATGCGACAAATGAAAATGCCCACCCAATGGATAGGCTAAAGCATGCACGGCAGCAACAGGTGAGTTTGCAAATGCCTGACCCGCAAGCATTGAGCCGAACAGCATGTTCTGACGTGCCTCTAAATCATTACCGTTTTTAAGAACTTTCGGTAAGTTATGGTTTAGCAGCTTTAAAGCGTGCTTCGCTAAAATATCGGTATAAATATTTTTCTTATGTTTAGAGGTATATGCCTCAATGGCATGGACCATCGCATCAATACCTGTAGCAGCCGTAATATGGGCAGGTAGATTTTGAGTAAAAGTTGCATCAAGAATTGCTGTATCGGCATAGAGTACCGGAGAGACAATTCCCATTTTTGTCGTTTCACCTGTAGTCACTATTGATATGGGCGTCACTTCCGAGCCAGTACCGGCTGTAGTGGGAATTAAAATAAGTGGAAGTCGGGCTGTTTTGACCTGATTTACCCCATACATTTCTTGTAGGTTTTGAGTTTGGTTGGGATGTGCGAGTAAGGCAATCACTTTGGCTACATCTAAAGAACTTCCGCCTCCAAAGCCGACAATAACATCTACATTTTGCTGTTTAGCATAATTCGCTGCATCTAATACCACTTGCTCTGGTGGGTCGGCCTGAACATCAGCATAAATGACATGTTCAATTTTAAGAGTATCTAAAATTTGAAGAATAGGCAGGTGTAACTGATTTTTAATCATACCCGCATCAGTTACCAGTAATAACTTTCGGTAAGTTTTTGATGCCAACACATTCTGTAATTCTTGTATAGAACCGAGTCCTGAAATAATGTTGGGAACGGTCTGAAACTGAAAATGGCTCATATACATTATTTCCTTATTTTTGAAAATTATTATAGATGCATTCTATAGGATTCATTCTGCAAATTCTCTTAAAAGTAGCTGTGCTTTTAAGCTGCATTTAGTTAAAGAAAATTCACTTGAAAATTGGCATTTTATAAACTAATTTTCAAAATCATTAAATGAAATTAGATTGTGAATACCTTATTGGTAAATGCAAATAAGGTAAATTTTTTTAAGGATATGCATGTGAAAATAGATACTGATGTCAATACTGGATACGGCAAGGATACCGACAAAAATGGATATGCAAATATTAAGTATCGTGAGCTAATTCAAAAATTAACAGCAACATTATCATTGACGCTTTTGTCATTTGGATGGGGCTCTACAGTAAACGCAGCACAACAACAAATCGCTTTAGTAGGAACCTGGACATCTATCCCAGATGCACCGCTTGTGCAAAAACCAGAAAAAGCCAGTGAAGGTCTGTACCAGCTACAAGTTAATGCTGACGGGACCTTAACTCCTGTTAAGGTATTGCAAATGAAAAGTCCATCTTGGGTTGTAAAATCGAAAGATGGCCGTTTTGCATATACCACTAATGAAGAAAATGAAGGGGCGGTAACGGCATTATCGGTTCAAAACGGAAAGGTAGAGGTATTGAACACGGTAAATAGTCATGGCGGGCATCCAACACATGCATCCATCAGTTTAGATGGTAAATTCCTATTTGTGTCGAATTATTCTGCATTTGATAAAGGACGTGGCGGTGTCGCTGTTTTGCCAATTTTACCAAATGGACATTTGGGTGAAATGGTACAAAATATTGTTTTTGCGGAGGGTTCTGGTCATGTTAAAGGGCGTCAGGATAGTGGCCATGCCCATTCGACAACTTTTAGCCCAGATGGTAAGTATTTATATGCAAGTGATCTTGGAAATGACAAAGTCTATGCTTTTCGTTACAACCCAAGTAAGCCTCAACCACTTGAAGCGGATAAGAGCCGAGATGTGAGTTTTAAGCATGGTTCTGGTCCACGTCATATGGTCTTTTCACCAAATGGTAAACAGGCATACATTACCGCGGAAATGCGAAGTGAAATTGTGACGTTTAACGTACAAGATGGCCATTTGAAAAAAGTCGCTGAGCTAAA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52 | Acinetobacter_phage(64.71%) | integrase,tail,transposase,holin,terminase | attL 70093:70108|attR 118299:118314 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
940764 : 977592
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026707|940764:977592|DBSCAN-SWA TATGACACATCTCAATGAGTTATATCTTATCTTAAACAAATCTCTAAAATGGAACAAGTCACATTTAAAGTGCTTTGCGCTCATCATGCTTGTGATTATTTTAAAGCAAACATGTAATCTTTCTTCTGCATCTAAAGCCTTGCCCATCAAGTGCTTACCACAATCATTTTATCGACGTATGCAGCGCTTCTTTGCAGGTCAGTATTTTGATTATCGTCAAATTTCTCAGTTGATTTTCAATATGTTTTCATTCGACCAAGTGCAACTGACTTTAGATAGAACCAATTGGAAATGGGGAAAACGAAATATTAATATCCTGATGCTCGCAATCGTTTATCGTGGAATAGCGATACCTATCCTTTGGACATTGCTTAATAAACGTGGAAATTCAGATACGAAAGAGCGCATTGCTTTGATTCAACGCTTTATAGCCATTTTTGGTAAAGACCGTATTGTGAATGTGTTCGCAGACAGAGAGTTTATCGGTGAGCAGTGGTTTACATGGTTAATTGAACAAGACATCAACTTCTGCATTCGTGTTAAAAAAACTTCATTGTCACCAATCATTTAGGAAAGAATCATAAAATTAGTGATTTATTTCGCCATCTTAAAGTTGGTCAAATTGAATGTCGTAAACGACGGATTTTGGTTGGTCGGGTGAAACTATATATAAGTGCACTACAGTTAGAAAATGGAGAGCTTTTACTCGTCGTTTCTCCTCAGTTTAATGCCAATGCTATTCAGGATTATGCATTACGCTGGGAAATTGAAACCTTATTCAGTTGTCTCAAAGGACGCGGGTTTAATCTTGAAAATACGCGCTTGACAGACCCTAGACGAGTGAAAAAATTGATTGCGGTGTTAGCTATAAGCTTCTGTTGGTGTTACTTAACGGGTGAATGGCAACATGATCAAAAAAAAGCGATAAAAATAAAGAAGCATGGACGACTCTCAATGAGTTTATTTCGCTATGGTTTAGACTATGTTCAAATGGCGATTCAGCGTTTAATTGGTTTTGGGAAAAAAGAAGAGTTTAAGGAAATTTTGGCAATTTTAAGAAGGCAGAATCCTGATAGGATAAGGGTTCTGTGAAATTTGTCGTGTACAGAGACCATTTTGTAAAAAGCAGGATGTGTATTTTCAGGCACATTTAAATCATTAGAAATACCCGCTATTCCTACTAGGTTTCCATCCGCATCAAATAAAGGTTCTTTATAAGTTAAACACCAACCCGACTGATTTTTTGCATATAAATGTAGTTCTAATTGCTCTGTTAACTTTTTACCGCGGCGAATGACTTGCAAGTCTTGCGATGTATATATTTTCCCAAGTGAATGAGGAAAAACTTCAGAAGAGGTTTTTCCCAATATTGCAGTTTTATCCTTTAGACCGCAGCGATTTACTAATGTTTGATTGACAAAGACATAGCGTGCTTCGGTATTTTTGATGAAAAAAACCACCGAAGATAAAGCATCAAACAATGGTTCTATACTTTCCAGATTTTTTAAGAAATCTTCCAAAGTGGTAGTTAGTTTCGGAATTTGAACCAAAGTCATGAGCTAGAGCGGACAAAGTTATAACTTGTCTACTCTAGAACATTTCATTTTTGATTTAAAGGAGAAGTAGACATCGCCATGAGGCTTTTTACACGAGTAGGCAGTAATGGTGGTCGAGAGTTAGGCAACTGCCAATCAAATAAACAAGCTGCTGCTGTTGCACACGTGCTTCCTTGGCACGCTCCCATTCCACAGCGTGTATGTAATTTTGCATCAATCCAACTATTACGCTCGGCAACTTTATCAAAAGTTACATCTTCACATCGACAAAAAATAGTTTCTGGCCGTGCAAGCGTTTTTAACTCAGCACGTAACTTAAAGCTTTTCTCAAGGAGATGTGCAAATAAACGATACCGTTGTCTTTGAGCAAATAATTGTCTCGCTTTTTCATTTTGGCCTATAGCTGCATAACCTGCGATGCTACCTTCAACCATCGCCAGCTCACTTCCGCCAAAACCTGTACACTCACCTGCTGCCCACACCTGTGGCTGTGATGTACGTTGATAGTCATCGACCGTAATCGCATTGTCCTTAATTTGACAACCCATTAACTGCCCTAATTGAGTATTCGGGACTAAACCAAACCCGCACGCGAGTCGATCACACTCAATTTCAATGATTCCTTTCGGCGTTTGTAGCCTTACTCGTTCAAGACGCTCCTGACCAATCGCCTCAACCACATAACTGTTAGGTTGATATAAACGATAAGGCAAAGATAACGCCTGTATTATTTTCGAAGGCCAACGCCAAAGTTGTAGTGCAAACTTACGAACGGAAGATGAAGCCGCCTGTTCGGCAACATAGAGAACTTGAGCCTCTGCTTTTTTTGCCGTATCCGCACTTGCTAAAAGTAATGGCCCTGAACCTGCAATCACAATGCGTTCATTTTTGACAGGTGTGCCTGCTTTAATTAAGGCTTGCAAACCACCTACCCCTGTTACGCCAGGTAAAGTCCAACCGGGAAAAGGCAAAAACAGTTCTCTTGCTCCCGTACACAATATAAGCTGGCGATAAGACAAGTTTAGGCTGTCGTGAGGTCGCTCAACAAGCAATTGGCCTGCAAAAGGTGCGGCGACAATTTTCGCACCAAACATAAATTCAATATTAGAATGAGCCTTAATTTGTTGATATTTCTGCTGCGCCATTTCAGGTACAGGGAAAATCGGTCCAGCGCGCCAGATTTGACCGCCCGCCTGTGGGTTATTATCCAATATTAAAATTCGCCCGCCACTTTCGGCGGCTGCAATAGCAGCTGACAACCCTGCAGGCCCAGCACCGACAACCACCACATCGTATTGTTTTTCCATTATTGTGTTTCCACTTTCATGTCTTGCTGGCACAGCGTCTGACAAGCAAGCACTCTGAGTCCATTAATATTGACACGGCATTCCTGACAAACTCCCATTCCACAAAATGGAGTACGTTTTTCACCACAAACTGATAAACGGCTGTAAGACTTCGCTTGTGCTAAAGCAGCAGCAACACTCGTACCTTCAATCACAGAAACCGGTTGGCCGTTAATAAAAAGCTGAATCATCTATGCAGCTCCTATAAAACGATGAGGTAAAAAAGGTTCTGGATCTATATCAAAAGTTAATCCACATATGTGTGAGACAATCAGTTTTGCTGTACCTGTTGCTGTGGTTACACCTAATCCTTCATGACCTACCGCTAAATAAACCGATTCAAGTGCAGGATGTCGTCCAATTACTGGAATACCATCTGGAGTAGCAGCGCGAAAGCCAGTCCATGCCCGAATAACATTAAGATCAGCCAAAGCTGGAAAATAATCGACAGCCTCTTTAAGCACCCGAGTAAAGACTTCTGGCTCTACAGTTGGATCAACCGTATTGAACTGACGAGATGACCCAATAAAAAGCTGGCCCGTCGGTCTAGGCTGAATATTACAAGCCACCGAAATTCCACTTGTCGCTTGAGTACTGGCCGCATAAGCCAAAGCCACCAATGTATGCTTTACATTTAATTCAGGGTAACGGTCAGTAATCGCCAGATGACCTTTTTTAGGTTCAATCGGTAACACTGGGAAAAAATCTGTCGCATGAATGCCGTTAGCCAAAACGATATGCGCAGCTTCTAGCCATGTTCCATCACTTAACTGAACCCGATTTTCTTCAATATGGATAACTTTAGCTTGTTGAACCTGAACCTTGTGGGGAAATTTTTTTAATAACCATTCAGCAGCACAAGGTGCATATAAAATTCCATCATCAAAAACTTCTAAACCACCATAAAGACCCTGCTTTAAGTGAGGTTCAAGCTGATGAACTTCATCTGAGTTTCGAAGTTGGCAACGGACACCTTGTGCAGTGAGACGTTGATATTTTTCCTCAGCAATCTGCATTTCTTCTGGGCTACTTGCCAGCCATAAAGTTGGCGTTTGGCGATAGGCACAGTCTTCCGAAAGTTCGTGTCCTAATTCATGCCATAGCTGAACTGACCAATGACTAAGTTTTAATTCGGCGTCCAAGTCATCCATAATGACCAAATGCCCCATGCCCGCGGCTGTTGCACCACCGATCCGAGCATCCAAAACTTGCACATTTAACCCTTGCCGAGCCAATTCATAAGCACATGCAGCACCTACAATGCCTGCCCCAATGACGATGGCATCGGTTCTCATAGCTGAATACCCCAAGCAAATGGGTCATTTTCATCCATAAATAAAGTTGCTTCGGCACTCATGTAAGCTTCACCACGAATGGTTGGAATCACATATTCCCCTGCTTGTTCATACGAGGCAATAAACTGGCTACCGATAATGCTGGCTTGTTTCCATAACTTTCCTGGCTCAAGTTTGCCATCTGCGGCCAAGCAAGCAATTTTCGCACTGGTTCCAGTTCCACACGGTGAACGGTCATAGGCCTTGCCTGGACAAAGCACGAAATTTTTACTGTCTGCTTCGGTGTCACTTGCAAATAACTCAATATGGTCAATTTCTTGCCCATCTTTACCGGTTATTCCTTGTGCCGTAAGCGCTTGTCTAACCGTCCACGCATATTCAGTAAGTTGATCCAAATTATCACTTGCAACACGTTGACCATGATCATTAATCAAGAAGAACCAGTTACCGCCCCATGCAATATCACCAGTAACTTTTCCATATTTTTCAACATTAACTTCGACTGCTTTTTTATAACGATATGCCGGTACATTTCGCACACTCACTGAATGATCTTCATGCAGTGTCGCTTCAACATCACCTACTGGAGTTTCAATTAAATGCGTGCCTACTTGTATTTTTCCCAAGTGTGCTAACGAAGCCACTAAACCAATCGTGCCATGACCACACATGCCAAGGTAGCCTGTGTTATTAAAGAAAATAACGCCCGCACTCGCTTTGGGATTCACTGGCTTACACAATAACGCTCCAACCAGAACATCATTACCGCGCGGCTCTAACATGGTTGCTCTACGGAAATGGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026707|940764:977592|972916_974329_-|WP_000591882.1|DBSCAN-SWA MIKKILLSFIAIFTVVSGIIIFYWRDVQYNPNKIDFFLYFLLLPAIITLVILSPWLIYSVYKSYKEKKEQAANQSQDDDSQKSSAAIEQPLEQLDFNVYSAFAIHALGENETIIEEIQNFKSPELDEQLLNSYGLPLLSYRIKDLAETNDEDIQYAASPRQVRIMSLIRQQLEQNIENLYRLAEHLKRSILFYESHQIREYHMHPAWVDPNSEYEDVETPVVEVHRLNRLNLHIFLPEDLLHVWNDEQSNDLILEFFTEIGIISQKVHIEYHFLGERVAYQEFIHLLKRIQKKEHEVFLMLAVDSEIDQDLIDEKSWMVKDYIPAEFAASCLLADPSLKIEELEPAKNLKIVVGQEKAAKVLHTLNLNELPQYEGDEPYVLILSDQTDIKTAKQLQQQFAQTSVEPHHYIYVKSSLGHTQHLVDIYGFMLSMHFPEHIVPFVFGENTVSAHTFVQSVTENSEDDAMVLNS >NZ_CP026707|940764:977592|964113_966795_-|WP_002001416.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP026707|940764:977592|977115_977592_-|WP_001047031.1|plate|DBSCAN-SWA MNLDRLYPYGFRSTLFDRLIPESEDYAKGLSIQQLRESVAKDLEDLLNSRVAKLDHVIDDYPLVKKSILQFGIIDFVGLSTANPLDRDKICQSIEQSIAAHEPRLRQIRVEMLLDGHNMGALCLSIQAYLNIHPLYEPVVFDALLKPTTQQYVISART >NZ_CP026707|940764:977592|974325_975324_-|WP_001190395.1|plate|DBSCAN-SWA MQSERWWQDSSVTAELFQRPKSFEFIQATRLLRHMPANDAALSWSDHFKFETSFNLNFPATEIESLELVDERVHLTNLIVGLTGIQGALPYTYTNKIKQAPRQQRAETKEFLSLFNHKLTSQYVESSITYHLPVRYEIENKNDYLDILHALNGYVRSQHQQQDLDEYFAEFSGLMQGQNNTVHALKTMLSCIFKHEITIKEFVQESFKLAGDQLTTLGGSQPSLLGINTFCGETIQQIDGKIEIQIGPLKRQQYLKFLPHQELSLKLKKIVETWCSPTLSIDLRLILDETEIQPVRLTQGQESGLGQGAFLMSRKPNTHNDETCYSLIGEQI >NZ_CP026707|940764:977592|962995_964090_-|WP_000020713.1|DBSCAN-SWA MSIDISELLKPINDSLLCGEDYSFSNEFHEIKKARTQDDLLLDQGDWVAERKQADWDFVAKSVSTLLIEKTKDIRLLTWVIEAWTHLNGFEGMVKGITLTHTMLNQYWQDIHPIIEDDDLDQRIGLLQGLINQLPMLLKKVPLTNTAPYYNLLDYDNFLYHENIRRKQTEEYESQSGPSELEQFDQAIFNTSKTFQYSNYQEFNSVLTEWNVLKQTLDHLMGLDSPSFAAIDSAFETIHSTLRKIYKAEAFGTGLAPSQEQAAVITTPSMENQVPVQIVSDQPMFQPQAQTHLANREQAMKVLQEIADYFQANEPHSPVSYMLQKTIKWSQMPLHEWLAQVIKDEHPLQMVQEMLGVQPKNEYE |
33 | Pandoravirus(33.33%) | transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1122088 : 1191278
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026707|1122088:1191278|DBSCAN-SWA AATGACATCTGCTGAAATTCGTGAAGCATTTTTGCGCTACTTTGAAACGCAAGGGCATACACGTGTTGCATCGAGTTCTCTTGTTCCTGCCAACGACCCAACTTTATTATTTACAAATGCTGGGATGAACCAGTTTAAAGACTGTTTTTTAGGTCTTGAAAAACGTGATTATGTACGTGCAACAACATCACAAAAATGTGTACGTGCAGGCGGTAAACATAACGATTTAGATAATGTTGGTTATACAGCTCGTCACCATACATTCTTTGAAATGTTGGGTAACTTCTCATTTGGTGACTATTTCAAACGTGATGCTCTCAAGTTCGCATGGGAATTTTTAACTAGCGAACAATGGCTTGCTTTACCGAAAGATAAACTTTATGTCACGGTTTACCATACTGATGACGAAGCTTATGACATTTGGAATAAAGAAATCGGCCTAGCACCAGAACGTATTATCCGTATTGGTGATAACAAAGGCGAAAAATACGCATCAGATAACTTCTGGGCAATGGGTGATACAGGTCCTTGCGGTCCATGTTCAGAAATTTTCTTCGACCACGGTGAACACATTTGGGGTGGTTTACCTGGCTCACCTGAAGAAGACGGTGACCGTTTCATTGAAATCTGGAACAACGTTTTCATGCAGTTTAACCGTACTGCTGATGGCGTACTTCACCCACTCCCTGCTCCATCTGTAGATACAGGTATGGGCTTAGAGCGTATTTCTGCCGTATTGCAACATGTTAATTCAAACTATGACATTGACCTGTTCCAACACTTATTAAAAGCTGCTGCAAACATCATTGGTATTGAAGATGAAGGTCAGCCTTCTTTACGTGTAGTTGCAGACCATGCCCGCTCTTGCTGCTTCTTAATTGCTGATGGTGTAAACCCAAGTAATGAAGGACGTGGTTATGTATTACGTCGTATTATCCGCCGTGCTGTCCGTCACGGTAACAAGCTTGGCGCAACAGGTACGTTCTTCTACAAAATGTTGCAACCATTAATTGAAGTAATGGGACAGGCTTATCCTGAGTTAGAAGCTCGCCGTGAAGTCATTGAAGCAACATTAATTCGTGAAGAAGAACAGTTTGCTAAAACCTTAGAGCAAGGTTTAAAACTTCTTGAAGGTGAACTTGCTCAGTTAAAAGATAAAACTATTCCGGGTGCGACTGTATTTAAACTTTACGATACTTATGGTTTCCCAACAGATTTAACTGCTGATATTGCACGTGAACGTGGCTTTATTATTGATGAAGCAGGTTTTGAAGTTGAAATGGCTGCACAGCGTCAACGTGCGCGTGATGCTGGTAAATTTGCTGTTGACTATAACAACATTGTAAAAGTTGAAGGCGAAACTCAGTTCGACGGTTATACCAACACAACCGGTCAAGGCCAGATTGTAGCGATCTATAAAGATGGCGTACAAGTTGATGAAGTTTCTGAAGGCGACGAAGCACTTATCGTTTTAAACCAAACTCCTTTCTATGCTGAAAGCGGTGGTCAGATTGGTGATACTGGTATCTTCAAAAACGAAACAGGTATTTTTGAAGTTCAGGATACGAAAAAGTCTGGTGGTGCCTTTGTTCATCAAGGTATTGTGACTGTTGGTAACCTTAAAACCAGTCAAAATGTAGAAGCGATTGTTAAAGCCGACATTCGTGAAGCTACTGCGCGTAACCACTCAGCAACTCACTTGTTGCATGCTGCCCTTCGTCAAATTTTAGGTTCGCATGTACAACAAAAAGGCTCTTTGGTTGCAAGTGATATCTTACGTTTTGACTTTGCAAATGACCAACCTGTGTCATTTGAACAACTACAACAAGTTGAACGTCTCGTAAATGCTGAAATCATTGCAAATACTGCTGTAACAACTGAACTACTCGACATTGAAACTGCGAAAGCAAAAGGCGCAATGATGTTGTTCGGTGAAAAATACGGTGATGAAGTTCGTGTGCTCTCTATGGGCTCAGTCATTGACGAGAAAAACTTCTCAATCGAACTTTGTGGCGGAATTCACGTAAAACGTACAGGTGATATTGGTTTATTCAAAATCACTTCTGAAGGTGGTGTGGCTGCCGGCGTACGTCGTATTGAAGCAGTGACCGGTACTAAAGCATTAGAAGTAGTACAAAAAGCTGATCATGATATCCAGCACATTAATAGCTTATTAAAAGCACAGAAAGACCAAACGGTTGAGCGTGTACAAGCTAATGTAGAATTGGTTTCTGCATTACAAAAGCAGATTGAACAACTCAACCAAAAATTGGCAAACTTCCAAGCGGCTGATTTGATTGACCAAGTTCAAACTATTGCTGGTCGTCAAACGCTTATTACTACTGTTCAGGGTGTTGATGCTAAAGCGCTTCGCAACTTACATGACAGTGTAAAATCAAAATTAGAGAACGCAGTGATTGTGTTAGCAGGTGTAGAGGGTGACAAAGTCAGCCTGCTTGCATCAGTCGCGTCGCAATACACTGCAAATCTAAAAGCAGGTGACATCATCAAACATCTAGCGACCGAGTTAGGTGGTAAAGGTGGTGGTAAACCTGACTTAGCACAAGGTGGCGCGCCACTTAACGAGAAGTTTGGACAAGTTATGGCAGCATTACCTGCTTGGCTTGAACAAAAATAAGACTTCACTTTTTGTGTAACTGACCCTGACAAGCCTCTCAGGGTCATGGCTTATATGGAACAACTATGGCATTAATCGTTCAAAAATATGGCGGTACTTCTATGGGTACCCCCGAGCGCATTTTAAATGTTGCTCGTCGTGTGAAGCGTTGGCATGATCACGGTCACAAAGTTGTTGTGGTCGTATCTGCAATGAGTGGTGAAACAAACCGCTTACTTGCCCTCGCTAAAGCCATTACCGAAACACCTGACCCACGTGAGTTAGACCAAATGGTTTCAACCGGTGAACAGGTGACGATTTCCATGTTAGCTATGGCACTTAATTCGATTGGTGTGGAAGCTAAATCCTATACCGGACGTCAAGTCGGTATTAAAACTGACAGTGCATTTACTAAGGCGCGTATTGAGTCGATTGACACAGATGTCATGACCAATGACCTAGATGCGGGCCGTGTTATTGTAGTTGCAGGCTTCCAAGGCTTCGATGCCAACGGAAATACTACAACTCTAGGACGTGGTGGTTCAGATACTTCTGGTGTTGCCATTGCAGCTGCCCTAAAAGCAGATGAATGCCAAATTTATACTGACGTTGATGGGGTTTATACTACAGACCCTCGTGTTGCCCCTAAAGCGAAGAAAATCGATCGCATTTCTTTTGAAGAAATGCTAGAAATGGCATCATTAGGTTCTAAAGTTTTACAGATTCGCTCAGTAGAATTTGCCGGAAAATATCAAGTTCCTTTACGCGTATTATCAAGTTTTGATAATGATGACGACGGCGCATTTGACGACGAATTTAAAGAAAATGTAGGTACACTCATTACTACTGAGGCAGAAGACACTATGGAACAGCCAATCATTGCAGGTATCGCTTTTAACCGTGACGAAGCAAAATTAACAATTTTAGGTGTACCTGATGAACCGGGTATTGCTTCTAAAATTTTATCACCAGTAAGTGATGCCAACATTGAAGTGGATATGATAGTCCAAAATGTTGAAGAAGATGGCACAACAGATTTCACGTTTACTGTAAACCGTGTTGATTTAGCAAAAGCTGAAAAAATCTTAAATGAAACTGCCAAAAATATTGGTGCACGTGAAGTTTCAACACGCGATGACATCGTTAAAGTATCTATCGTGGGTGTAGGTATGCGCTCGCATGCGGGTGTAGCAAGCAAAATGTTTACTGCCCTTGCTGACGAAGGTATTAACATCCTTATGATTTCAACATCTGAAATTAAGGTTTCTGTCATTATTGATGAAAAATACCTTGAGCTTGCAGTTCGTTGCTTACATACCGCTTTTGGTTTAGATCGTGAACATGGTGAAAGCAGCGCACGCGCTTAATTTTACCGAACGGTCAAGAATTCATTAAAAAATGTTTACTTGTCCGACAATAATCAAAGAAAACACAGAGCCGCTATAGTTTTTTTTATAGCGGCTCTGTTATATTAAACGGAAAGTTTTTTGGCAGTGATTATCAAAATATGACTTTGTTCTCATATTTCTGTTAGAATCTGACTGAAAACTGAGGTTGAGCTTTTTATTTGGGTACCAATATTGCAGTTTTAAGCGTTTAGCAAGGAGATAAACATGCTGATTCTGACCCGCCGTGTCGGGGAAACATTAATGATTGGGGATCAAGTCAGTGTTACTGTGCTTGGCGTCAAAGGAAACCAAGTTCGAATTGGTGTAAATGCACCAAAAGAGGTTTCTGTTCATCGCGAAGAAATTTATCAACGTATTCAACATGAACGTGCAATGCATGAACACCTTCAACATCTTGATCAAGATTATCAAGTTTCATATGAAGATGATAATTATGCACAGAAAAACTTCAATCGTTAGTATGAAGTTGTTCTCTCCCTAATTAAAGCGACTTTATAGTCGCTTTAAATTTTTTGGGAATATATAAATTTATAGTCCTAATGCCCGTTTTACAGGTGCATAACTACGACGGTGTTGATCAATCACGCCATGAGCAGCAATGGCTTCAAAGTGTGCTTTGGTTGGATACCCCTTATGCTTGGCAAAACCAAATAATGGATATTGTTGATCTAATTCTGCCATTTGACGATCACGCGTAACTTTAGCCAAGATACTCGCCGCACTAATTTCGGCATGGCTTGCATCTCCCCCTACAATCGCCTCACAAGGAATAATAATTCCTTTGGGGATTTGATTGCCGTCTACAATTACCTTTTGAGGTTGTGTTTTCAGACCTTCCACTGCACGTTGCATAGCCAAAAAAGTTGCCTGCAAGATATTCAGCTCATCAATTTCTGCATGTGTAGCTTCTGCTATTGACCATGCTAAAGCTTTTTCTTGAATTTCAATAAACAACTTTTCACGTTTCTTTTCAG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57 | Escherichia_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1263980 : 1292654
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP026707|1263980:1292654|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1296612 : 1324827
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP026707|1296612:1324827|DBSCAN-SWA 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39 | Acinetobacter_phage(97.44%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1774340 : 1823278
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP026707|1774340:1823278|DBSCAN-SWA 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68 | Acinetobacter_phage(94.23%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3507520 : 3555864
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP026707|3507520:3555864|DBSCAN-SWA 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67 | Acinetobacter_phage(91.23%) | integrase,transposase,terminase,capsid | attL 3507330:3507345|attR 3552011:3552026 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3704485 : 3743075
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP026707|3704485:3743075|DBSCAN-SWA 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65 | Acinetobacter_phage(92.16%) | capsid,transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3856935 : 3918177
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP026707|3856935:3918177|DBSCAN-SWA 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56 | Enterobacteria_phage(28.57%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 14275
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026705|0:14275|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026705|0:14275|3505_4393_+|WP_000191696.1|DBSCAN-SWA MTQFVLDPAKLMETAANKQNAIRSREKTLKPKDGSNRYVLLPGWGWKQGKQDVWFHDFGMHFIKDANGDLQSTYVCLDKTFGKDCPICGALKQAANIATTEAQVEALKECGSRQTYLMNVLALDSDRPNDPQILEVPKTVFSAIFDVLAKWGARLFDPNGSQVIVINRNGSGMNTKYTVLPDAETKPVPPQVYEKLNNLDEYVSQENDERLQRSLGHVQQVVGLLPPAQSNDTPRTAPAAIGLAAGGAAQPAYQQTAEEISYTEVTQPAQPQTVEHAPINLNTDLEALLDLDIPV >NZ_CP026705|0:14275|7093_7447_+|WP_000683860.1|DBSCAN-SWA MKHYVLDFVPPLQGMDDHFNTIRLGVTWSKKLAAGDRVYLQNSKTKMIEGLAIVDRVIVGKLGELCAYYGADNHTEIDSEDKCRSAERLYKLTLKLYGPHIASAMKKSTVIYLRRIE >NZ_CP026705|0:14275|8275_8794_+|WP_000875209.1|DBSCAN-SWA MKYIPNLNAELSVLEYRFRNEYENSRLMIISTLDRTKMAYVKGHTRRDVPELGSQRPEVKLSNDEEHFNVGELYSYALDEIHTYMREHNDATHHKCEREEYTVFFNNSFRAGELIGKIEGAVGGSKAREVLCFLGAYFALTKESVDQPEVPNPKRTNPNYSKRTNPNWGLFS >NZ_CP026705|0:14275|9190_9439_+|WP_000470758.1|DBSCAN-SWA MFISETNKEFKDMNISNNRTIDRAAKALIKEGWTYRQSKGGHVVLKDPKTGFSLPAPVSPSCHRAEKNWLSAVKKIRQGVRP >NZ_CP026705|0:14275|9438_9837_+|WP_000604170.1|DBSCAN-SWA MILTSALTCLALNIYHEARGEPKLGKELVAITTLNRAEGDNSKICQEVLRKHQFSWTASKVSGRTLNSSGKPKEKEAWEDSKRIAEQALNGRFSVPVRYSGVTHFCSHRKRGWEKQLKYVGQIGNHHFYMAK >NZ_CP026705|0:14275|2248_3355_+|WP_000211837.1|DBSCAN-SWA MTTQTQDFATEQDLDKLFEELDMLGEMHSTPAEQPSAPAAEPQPQVVQQTVTAPSPQPQAVPEPPVQQVITPEPTPVASTPQAMFANFNVGGMLKHAEGKVELEPETQTPPPQQQTTLQPPVPERVDNDADQKVVDQIFATTASTPSAAPANTSVVPPIATAPKNPQPIAEQAAPSPAQQTSAMAQQKRATGYVGKLGITLENLKYKPDVHAFQIETAISDVTIDQCMTAQPSLMAYWSAQQALADHQQALAKRQLEHVEATLFQVYRKSLIKAGEKPTERLIDAYIRRDPTWELAYDVHATATQYANIHKGNVFALVHRRDMLIQRGSSLRAELQGQMRILNQDNHNDDSMAAVENAARSLNRTYTQ >NZ_CP026705|0:14275|9898_10993_+|WP_000806093.1|DBSCAN-SWA MKPYGIQSDSHHHNWSAFSHTTANGINNRLEGCLNEVRRLAAEVKSAGGNTIYHTGDLFHVRGQIAPSVLNPTLDVYRQLIEEGFIIRILAGNHDLEDRHVTRTGSAVTALEGIGCQIVNKPTFFNDDRVVMIPWIESVKGLKDEIEKAKKHIESMPSPPPLRSMESISDWTLMIHAPVDGVIAGLPEHGLTASDLEQYGFKLVFSGHYHHHKQLSETVYSVGALAHYTWSDVGHKAGFLVVNNTDVRWYKSHLPAFVEIDGSMDELDIQAVVPGNYVRAKIKIVKQIEIEQFRKYLTDIGAQGVTIIASKPVADVQRANAAVKAGASIESSVTQFITNSPLNSPQLDALCQSILTEARMEVAE >NZ_CP026705|0:14275|8790_9156_+|WP_001231033.1|DBSCAN-SWA MRKPHSINGKQVGMVYTQGGKSIYLAMRSGAKNRNIDLKTNSWLFEPIIISHCINNSIDAIGVVHRVNKKCTYYLTPLSHFLENCEPHSTSKGLYKRLNMNKFMINSERFHGNLEKSLKIK >NZ_CP026705|0:14275|7443_7842_+|WP_000152774.1|DBSCAN-SWA MTIKFDEKFPEGKYKGRTPAELILMLQNDSDFEGVDYLLWLRKFRAGKFGGLASTFDETVNAIIDLIVFEVPELKKRYPVTVYTKLEAKEIFDKYHKEAQEAAKQEAIRKEMKARADRERAERYKGKWGSWA >NZ_CP026705|0:14275|7841_8279_+|WP_000888911.1|DBSCAN-SWA MLEEQLEPDLNVVEHLFQQGNYVYRLMFLSNANETKMAFLKGLYNWREPHAPPMETILLTSENTDKEELFANGKTFIEEVKRDVAGKAEYIWWASPLYFNDDSQMCMLETKLTRTVGFYYKNAVLKFFRDPPVPKRNNPNWGAWS >NZ_CP026705|0:14275|5524_7021_+|WP_000126617.1|DBSCAN-SWA MTAQAQIDALNDALFKAIGDNHAEQAVTRWIDTGNPELNRIISGSYEGGLPFGRMVEVFGESSTGKTADATEWMVRAQKMGGCAIFIDWERSFDVRLAEGFGLNTQRPYWIYAKPATWEEGNTLAAKACQLIRASKAIPDDAPILVVFDSIAAALPKSQAGKEIDEYTMNDTTALARVTSSTLKTMSHRAEEFSATFVYLNQMRLKPGVMFGDPRCLRGDVQIPFVDGTTATIKEIVKNKINKEVWSYNETTGEIEPKFIVDWHDNGSIADTDKRWIHIRATTPETKNGVSAVTATNDHKILTRECGWINAEDVKVGYHLVTHKHKTAYAVVTEVREGGKKLDTRMYDITIEGNHNFLAGNKDNGFIVHNCTPGGKAMEFYASARLALGRQKIMDKDEVGEKEFVGQNITVQCVKTKFTRPFQECNLRMMYNEFDVAYFDHIAAMLDHLIKRGWIEYNKPRVTWTDGKKYFVKELVAKLNAEPNGMEQLKAFLPKSDK >NZ_CP026705|0:14275|13681_14275_+|WP_004716729.1|DBSCAN-SWA MSNTVRVIGIDPSLKNFGIVVADVNLDDPDLSFSVVSMNLIKSEENKATKKVVRKNSDDLRRAKSLHDGLKEACKGASFAICEVPVGSQSARAMASYGICIGVLSSCPLPLIQVTPTEVKLAGTGIKTATKGEMIEAAMNAHPEAKWPMRKIKGVLEPLSSNEHLADATFAIKAGLDTDEFKSAIQMLKQLKNAQLN >NZ_CP026705|0:14275|10992_12945_+|WP_000395295.1|DBSCAN-SWA MEFLTLKINNFLTIGEARLDLANRGLLLVQGENKDNSSADSNGSGKSSIVDALCWCLYGTTARDVTGDLVINKTAKKDCAVELTIHDNGQCYKIARHRKHATHKNALIVLKTDIYGNELPNGNITKGTDKETQELVVDIVGSTLDVFMSSVYAGQEMMPNLPALTDKNLKVLIEEAAGIQVLEQAHTIAKRKLAEVKAKLSNKLTIRDNFATVLATMQSQLAETQAKLKQFDDTKESRARAVLSEALPLKKAIEDIKVQMGNTDINALNAEKQSIETAISKAEDLVNEAKKLTQIRDDLGIKYRITNNNYSSLKTNLNNLATKIRGIDGLVGTPCTQCGKEYCASDLQQARSVQMNQAQVAKQDALKAKAEMEQVKAEFEAAEKNLNDFLQNNSLDVRKLYADKAAVEGAIAAFTSSSSEIDRNLKDIERIKKRAKDVMNEANPFSAMEADQQAKIADYIAKNSAIDQEVQELQALVELHEHAVLIYGPSGVRAHILDTVTPFLNERTEDYLGALTDGNTHAVWSTLTLNSKKELKEKFTIDVRDNTGGESFKGLSGGEKRKVRLATALALQDLVASRATKPISLFIGDEIDDALDKSGLERLMGVLERKARERGTVIVVSHSELRDWIDDVVVVTKENGYSTVSGANLV >NZ_CP026705|0:14275|13045_13678_+|WP_001028833.1|DBSCAN-SWA MNIYEAIEDEVLAQLEKEDSLIQQHLNLCANEDAKLASKVKEILSGVVHQMNAELDMNANDSEFSPLSFANEFMLAQGGNIQVRKIYKSGTDSWTQREFLGGESFLLFKAGINESLIEQMDFWKVQEDILDLIHLRFRPAFAADFAEIMVDINRGRQLFNGLHETLTEVFDSLSFRPAIKSIQEAKAEIKKLRCVREQKIQSLKNNVAVW >NZ_CP026705|0:14275|4449_5514_+|WP_001120333.1|DBSCAN-SWA MPHLTILIDANSIGYAAHHATKLHSGVMQTQAVYGFLRTVRELRIRNPLATIYVLWDGKAQFRFDMCPEYKIKRVADTPEKVADKEAYKAQLPFIKAALSALGITQILSYIHEADDLAGILVKQIMKNPDQEILLASGDVDWVQLIRRGVRWQDLRDKRNEKVITFENFVEKTGYKTPLAFLEGKALQGDSSDCIPGVGGIGEATAPLFLAEHGSVGKFIQRCESGEIKPANKAQRSLWKGTSPYTKEQWKNLFHYQRDDSLSDEENEKEHKKQLKKHMDAYIGQGRSIFIRNMKIMQLINPHPLEKQHLEIDKGNFDLDKFIDICAELNFASILNVIDNFVQPFKQALPTQTN |
15 | Pseudomonas_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
17543 : 46218
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026705|17543:46218|DBSCAN-SWA 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44 | Escherichia_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
53448 : 110905
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026705|53448:110905|DBSCAN-SWA 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57 | Salmonella_phage(33.33%) | integrase,portal,holin,terminase,tail | attL 55208:55224|attR 109604:109620 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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