Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP026750 | Acinetobacter baumannii strain WCHAB005133 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 7 | 0 |
NZ_CP026748 | Acinetobacter baumannii strain WCHAB005133 plasmid p1_005133, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP026749 | Acinetobacter baumannii strain WCHAB005133 plasmid pOXA58_005133, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP026750_1 | 2324603-2324688 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026750_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP026750_1
>1.1|2324626|40|NZ_CP026750|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026750_1
The CRISPR arrays of NZ_CP026750_1 >merge|NZ_CP026750|1|2324603-2324688|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP026750|1|1|2324603-2324688|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP026750.2|WP_000795915.1|2323365_2323602_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP026750.2|WP_001124846.1|2322471_2323083_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP026750.2|WP_000885229.1|2321789_2322401_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP026750.2|WP_000376215.1|2321177_2321633_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP026750.2|WP_001990047.1|2319472_2321119_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP026750.2|WP_000115408.1|2315842_2319307_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP026750.2|WP_000107128.1|2314886_2315846_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP026750.2|WP_001025680.1|2314458_2314743_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP026750.2|WP_002017921.1|2314235_2314349_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP026750.2|WP_000937460.1|2313511_2314147_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP026750.2|WP_000983628.1|2325319_2325733_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP026750.2|WP_000432330.1|2325874_2326753_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP026750.2|WP_001990041.1|2326809_2328954_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP026750.2|WP_001145693.1|2329008_2330418_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP026750.2|WP_000482091.1|2330733_2331213_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP026750.2|WP_000108365.1|2331497_2331719_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP026750.2|WP_000132044.1|2331824_2332142_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP026750.2|WP_000498477.1|2332226_2332448_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP026750.2|WP_001136759.1|2332535_2332964_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP026750.2|WP_000251637.1|2333233_2333377_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
996205 : 1041565
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026750|996205:1041565|DBSCAN-SWA CATGTCTACTGTATCAAATCAGATGAATAAAGACAAATTGTTAGAGTTAAAGCGCCAGCAAAGTTACCAGTCCTGGCATGGGCCAGCTTTAAAAACGCTTGCCGATTTATTGAAAGAACGCAAAGCGAACTTAAAGAAACGTAACCATGATGAAAACCAAGCAGCGGTAACACGTGATGAGTTTATGCAAGGCCTAGTTAATGATCATGGTGTACACGGCATAAATCTTTATCACGCGGGTGTAATTATCTCGAGTCTGTATAGGGCTAAAAAAATTCGATATTTGGGTAGCTTCATCCAAATTATTGAAGGGGATGGTGGCGCGTGATCCCACAAGAACTAATTAATGAAATTAGGCAAAATGCCCTTTTTGTTATAAATCATAGCGGTGGAAAAGATAGCCAAGCCATGATGATAAAACTACTTGAGTTTGTTCCTAAGGAGCAAATTCTTGTAGTTCATGCAAGTCTTGGTTTTATGGAATGGCCAGGAGCATTAGAGCTTGCACAGAGTCAAGCTGCTGCAGCTGGCGTTGATTTTATTGTGGCCAAAGCAAGTAAAACATTTCTTGATATGGTTCTGAAACGATTTTCTGAACGCCCTGAGGTTCCTTCATTTCCTTCACCTAAGTACCGCCAATGCACCAGTGACTTAAAAAGAGATCCTATCAAGCGAGAGGTACGCCGTTACGCAAAGGCTAATGATTTCAATCGAATAGTAAATTGTGTTGGTTTGCGTGCTGAGGAATCTAGCCATCGTGCAAAGCAAATGATCTTTAAACCTGCAGCTGAGAATGGTAAAGCAGGTCGCACCTGGCATGACTATCTTCCGATACATTCTCTTACAACCAATGAGGTTTTTCAGACCATTAAAAATGCTGGTCAATCACCTCATTGGGCGTACCAGGATAATGATCGTTTAAGTTGTATCACTTGCATTATGGCAAGCGCGAGAGACTTAATTAATGGTGCAACAAAAAATCCTGAATTCTATGCATTGATGTGTCTGGTAGAACAAATTACTGGATATGCAATGCACGCTAGTTTGCGGTTCCTTCCTGATCTAACCGGTATACATCCTAATTATTCACTTTTAAGCGAATACCAAGATCTAGTTTCAAAGTTTTCAAATACGCGCTCTAACAGAAAACGTATACAAATGCTGGAGGTTGCAGCATGAGTAAGTATGTCCCTAATTCATTCCAAGTTGCGAACGCTTTTGTAGATGAAGCAATGAGTAAAATCTCTGATGCTTCAGTAAAAATCTATTTGATTATTAACCGTAAAACACGTGGCTGGGCAAAAGAATGTGATGCGCTTTCACTTACGCAACTAGAAGAACTGTCAGGGAAAAGTCATCCAACAGTCGTTAGATGTACAAAAGAGCTTGTTAAAGTTGGTTTAGTAAGAAAACATGAGCAATCTGTATATGGGAATGTTTACTCATTAATAGACAATTATTTTGTTGGTGAGCATGTAAACTTCCCAAACAAGAGTTCAGTACTTGTTCAGTCTTTTAGCTTATTTAATGGGCAGCTAGTTAAAATTTTTAACTACCAAAAGCCTGTGTCTAAAAAATCAGTTAAGAGCAAAAAGAGTAAAAATCTGTGTTTAAATTTTCCACAAAAATCTCGGTTGCTAGTTAAAAATTTTAACTACCTTGAAAATACTAGCCAGTTAAATTTTTTAACTACTGCTAGTAAAAATTTTTTACCCCTACTAGTTAAAATTTTTAACACACAAAACACACTATCAAAACCAACTTATCAAAATAAAAAAAATACATGGTTTGTTTTAGAAAATTTGAAGTTTGAAATTTGTTCTATCAATCCGTCAATTGATACGGATGAGATTTTCAAGGCCTCTTGGTTTGAGAGAGAGTTAAAAGCATTCAAAGGTTTTAACGAAGGTCGCAATCACTCTGATTACGATATGGTTCGATTCTTTGCTGAGTGGATGCTTAAAGCACGCGCTAAATACGCCAAGATGAAAACACCGGCACCTCGCCAAAACAATTATTCAAATGGTCAGTCAGCTAAACCAGCTAATCAAATTCCTGAAGTAATTACTTTCGCATCTGAAAAACAACTATTCGCGTTCGCACGCCGTTTAGTAAACCATCCTGATTTCAAAGATACATTTTGCCATACCGGTGAATCATGGATGGATGCTGGAAAGCGTATGGCTCAAAAGTTGGTAGATCCTCAGGAACAAAAACCATTTATTCCGTATTTGATCGAGATGGGTTTTAAAAACTCATCCAAGGAGACGGCTGCATGATTACTCTAAATAAAACTACCGGCATTCAAAAATTAAAAGAGATTCTTCAAGAATTTGATTCTTGTATGTACATCGAACGTGACAATTTTTTTGACAAGCATTATGACCTAGTTAAAAGCGAAAGTGATATTGAGCAAATTCGTATTGCAGTCAAAGCAGCTGAATTAAAGAGGGGTACACGTGTCAAAGTAAATTTCACACATGTACCAGACAAGGGTCAAAACAAAATTCATTTTGTTGGCAATGGTACTGTCGATCTGTTTGAAGATAACCGGGTATTTGGTCGTTTAGATGATGGCCGACCTTTTTGCTGTTTAGTCTCAGATATAGAAATTTTGGTTTCAGAAAAATTAGAAAAGGAAGATGGCTACGAAGAATCTAAGGCAGTCAATAAAGTCTATTTTTTTCTTTGTTTGGTCTTGGGCTGTGCAGTAGTTAAGGGGTGTGGCCTATGAAAAAGGTTATCAGTTTTAGTGGTGGACGTACTTCAGGGTATGCAGTCAATCTCTTTAAAAATGATCCTGATGCTTATTTTATTTTTATGGATACTGGCGCAGAGCATCCAGCTACTTACCAATTTATTAAAGATATTGTTAAACATTGGAAAATAAATCTTGTATGTCTTCGTGTAGTCGTTAATCCACAAATGAAAAAGGGTGTGGGCTACAAAATTATACCCCTTGATGAGCTCAAACAAGACTTGGAACCTTGGAGAGATATGCTCAAAAAGTATGGAAGTCCTTATTACGATATGCCGTTTTGTACAGCTCGTATGAAAACTGAACCTTTTGAAAAATATTGCAATGATGTGTTTGGGAAAAACAACTATGAACGATGGATTGGTATTAGATCTGATGAGCCAAAACGGTTGCCAATTGAGGTTTTAGAAAAGCTTGGTTTACCTATTCATAAAGACGCAAAGAAGCAGAAAGCCGGGTTTAGATATTTAGCTGAAATTAGTGATTTCACTAAAGAAGATGTTTTGGACTGGTGGGAACAACAACCTTTTGATTTAGCAATTACAGAACATCTAGGTAATTGTGTTTTTTGTATTAAAAAACACTTAAACAAAGTTGCACTAGCTGCCAAAGACGAACCTGAACAAGCAGTGAAATGGATAGCGGTTACTGAAGGCGAAAACGTCAGATCTGAAGGTAGAAAATACAACCATCATCGGATGTATCGAACGCGGTTACATTTGAGCGATGTTATAGAGGCTTTCAAAAATCATGACAGAGATGAGCTTTACAACGCTCTTAGAAGTAGCAAGCGCTATGAAACAGGCTCTTGTACTGAATCATGCGAAGCCATTATTTGAGGGAATGGTGGATGAAGTTAACTAAACAACAACGGGCAGAGTTAAAACAAAAATTTGGCGGCCATTGTGCGTATTGCGGTGAAATGCTCGGTGATAAATGGCATGCGGATCATATCGAAGCTGTGAAACGAGATTTAATTCATGTTGGCGGTGGCAAGTTGATTACTGGAGAAATGACTAGACCGCAAAACGACACTTTGGAAAACATGAATCCAGCGTGTGTTCCTTGTAATACAAACAAGTCGTCTATGCCCTTGGAAGGGTGGCGGAGGATGCTCACACATTATCGTGATGTTCAGTTGTTACGAGATAGCACACATGCTCGTCATTTACTACGTTTTGGGCTGATTGAAATCAAATCTGAGCCTGTGAAGTTTTTCTTTGAGAGTTATAAAGAGGGCCAGTCATGAATAAACCATTAGAAACTTTTGATATAGACGCAGCAAAGGCTCGCTACGAAAAATTACGAGGCCGATATAACCGGAGTGGGCTATCTAATACTGATTACAACGAGCTACTTCAATTAGAAAAGGCAATCGAGCAAGCAAAGAAAGTTAATGAAGGAGCGCCGATTGATGAGCGAAAATAAGTTATCACCAAGACAGTTGGTACTCATTCGACGGGCAGCTGAAGATGCTATACATGCTTGCAATAGACATTACGGCCCATTTGTTGACTATGTTGCTCACCCATTAAATATCATTTCATTGGTTGATATGGCGCAAGAAAGCCTACACCAGCAAGAGCTAATAAAACAAAAGGATACAGTAATAAAATTTGCTAACAGTATGGCGAATTTAGATCAACAGAAGTTCAAGGAATTACAAGAACGGATAAATCTTGCCCTGCAACAAATACAAGGCAATTTGCAATATGTTGAGCAGGATAAGAGAGAAAACTTTGAATTTCTGCAAATGGCTATGATTCGAGCATTTAAAGAATTAGAGAAAGTGCTCAATGGTGGTGAGCCTAAATGACATCGATGAGTTTAGCGGATTATCACTCTAAATTTCCAAACGGCCATAAAGCTAAAAAGGGCCGTAATAAATTTAATGCTTCAAAAGTCACATTAGATGGGATGACTTTCGACAGCAAAAAAGAACTCAAGCGATATATCGAACTTAAAGCCATGCAGCAACGCGGTGAAATCTTTGGATTAGAGCACCATGCAAAATTTGAATTGGCTCCTAAAACTAAGATAGAGGGGGAAAAGAGAACAAAGCCGGCACTTAGATATTTTGCTGATTTTACTTACTACCTCATCAATGGCGAGTACATCGTTGAGGACGTTAAGTCTATTGCTACTAGGAAATTACCTAGTTATCGCAATAAGAAACATTTAATGAAAACTGTACACGGTATTGATATTAGAGAGGTTTGAGAAAAGTTTATGAGCGACATTG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54 | Acinetobacter_phage(66.67%) | terminase,capsid,holin,tail,integrase | attL 1025885:1025899|attR 1051430:1051444 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1204726 : 1219523
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026750|1204726:1219523|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1606394 : 1650002
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026750|1606394:1650002|DBSCAN-SWA 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40 | Bacillus_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
2584922 : 2641111
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP026750|2584922:2641111|DBSCAN-SWA 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54 | Escherichia_phage(29.41%) | transposase,integrase,tRNA | attL 2627808:2627867|attR 2638201:2639026 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2721909 : 2750583
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP026750|2721909:2750583|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_6 |
2754541 : 2766889
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP026750|2754541:2766889|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3580158 : 3637710
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP026750|3580158:3637710|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(15.38%) | transposase,integrase,tRNA | attL 3619567:3619626|attR 3644781:3646972 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 11066
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026749|0:11066|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026749|0:11066|2604_3579_-|WP_104915062.1|DBSCAN-SWA MWLAMLAVVVVGLAILVWSADVFIDGAVALANKLNVPSFLIGVIILGVGTSAPEMIVSMLAALEGSPGLALGNAYGSNIVNIALVLGATVLISPIIIRKSIINRDMPLLLLVTAVAAWQLSDGVLGNTDGIVLIVLLVVVLGIQIILSMREGNHEHEDDTVEETAKAEHSMAQGLGRLFLGLFVLILSSRAIVWGATELATLWGLSELIIGLTIVAIGTSLPELVSSLSAARKGEHDMALGNIIGSNVFNTLGVVGIAALIAPITPSSIILSRDILAMSLLTLLLFVMCLFAFKTKRVFGRTSGTTLVLFFVGYTVWLIQTVSL >NZ_CP026749|0:11066|6815_7199_-|WP_019837527.1|DBSCAN-SWA MTTNNQTSIASLAKKRRTYSAEFKQQIVQACKAPDVSIASVALQHGLNTNLVSKWIRLFDGKPKNDRSPLPNKPAFIALSCSAPLDPISTNMLTVQITLPHSKAEIGLKWQVSEISALAELLKALAT >NZ_CP026749|0:11066|5500_6409_-|WP_148255833.1|transposase|DBSCAN-SWA MNTLPDLSQLTHEQLLEFTRQLAMQHQSLAQSNQKLDAKVQHLEASNQHLSILNQKYEHELALFKQHKFGSKNEHLTAKQIHLWDEAVEEDIAAVDLELERLNADKTDAATQKATVNKPKRRLLPDHLHTIRIEHEPASTQCSCGCQLRRIGEDISEKLHFRPAQFYKEQHVRGKWVCDQCDTLTQQAMPAYVIDKGIASPELLSHVLVSKYADHLPLYRQRLIYQRAGIDLSRSTLSDWIGRCGVELEPLANALKEVVLQQRVLHADDPYAYLSDVLKRLPTHKVTQIEELLPHRWKSDQN >NZ_CP026749|0:11066|1339_1675_-|WP_171489061.1|DBSCAN-SWA MIRIDEIWLSTQPLDMRAGMDTVMAQIMKAFGYIKPHCAYLFCNKRGHRMKVLVHDGLGIWLCARRLEQGKFHWAKVHQGESVALSPEQLQALIQGLPWQRIGRQQVVTML >NZ_CP026749|0:11066|7820_11066_-|WP_171489062.1|DBSCAN-SWA MTKMTESDIELMAIEQLEGLGYTYVYGPEIESKGTNPLRSYKQVILEDKVLDALQRLNPHLSQDKCTEALKQVTNIQSPDLLSNNQAFHRLLTEGINIEVSKEGNTQGEYAWLIDFENPTNNEFLVVNQVTIKEDRWTRRPDIILYVNGLPLVVIELKNATDENATVEGAYKQIQTYQSQIPSLFTYNAFNVISDGLEAKAGTVSADYSRYMAWKTNNGQTKAKKTQAQLEVLIHGLLNPVTLLDMIRHFIVYESTKHEDTNGLITIKTIKKMAAYHQYYAVNAAVLSTIRASAVNSDSKSAEVAMQHQGRSKLELVQQQAVGDKKAGVVWHTQGSGKSLSMVFYTGKIVLALDNPTVVVITDRNDLDDQLFGTFAASSQLLRQTPRQADSREELKELLKVGSGGVIFTTIQKFQPDDGTSVYEQLSDRTNIVVIADEAHRSQYGFNAKEVDVKDEDGKVVGKRTVYGFAKYMRDALPNATYLGFTGTPIEKTDVNTPAVFGNYVDIYDISQAVEDGATVRIFYESRLAKIAISEEGKELIEDFDDQFTEDDLNQTQKERAKWARVEGLIGSKERIKAIAKDIVEHFEQRLKANANQGKGMIVSMSRRIAVDLYNEIVKIKPEWHSDDLNDGVIKVVMTASASDGEVIAKHHTTKQQRQRLADRMKDNDDKLKLVIVRDMWLTGFDAPSMHTLYIDKPMKGHNLMQAIARVNRVYKDKAGGLVVDYLGIASDLKEALSFYSEAGGKGDPALVQDEAATILQEKLEVLDGILHGFNYQEYFTADTSRKLNIILEAEEHILGVDQGEGKTRFLTAVTAMSQAFALAVPHPHAMEVAPLVAFFQAIKARLAKFSDGSGKISGLSNAELETKVKQTIDQALVTEQVVDIFDAAGIQKPDISILSDEFMQEMKGYKHKNIALETLKKLLGDEIKMREQRSVTQGKKLMDMLSSAIKGYQNKVLTAAEVIDELIKLAKTIQESDKLAEELNLTEYEYAFYSAVADNDSARELMQKDILRELAVVLTDSIRKNVTLDWTIKEAARAKLRVIVKRLLKKYGYPPDMALLATETVLEQAEQLAEELSSSK >NZ_CP026749|0:11066|1671_2055_-|WP_004691518.1|DBSCAN-SWA MTTNHQTSIASLAKKRRTYSAEFKQQIVQACKAPDVSIASVALQHGLNTNLVSKWIRLIDAKPGNDRSPLPNKPAFIALSCSAPLDPTPTDMLTVQITLPHSKAEIGLKWQVSEISALAELLKALAT >NZ_CP026749|0:11066|2111_2324_+|WP_104915063.1|DBSCAN-SWA MHKVCSADAYEISQKELAETLGIKQPSLSAIENRGNDLKISTMKKYVEAMGGKLRIDVELPTGKHIGFNV >NZ_CP026749|0:11066|3806_4511_+|WP_001067784.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFHGRHFQGEIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHTTIYRWVQRYAPEIEKRLRWYWRNPTDLSSWHIDETYVKVNGRWSYLYRAVDQRGDTIDFYLSSRRNTKSAYCFLGKILNNVKKWQIPQVINTDKAPTYGRALSRLKREGKCPPDLEHRQIKYKNNVIECDHGKLKRIIRATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASSFYYGQPQGEVCLINRVFGL >NZ_CP026749|0:11066|6483_6819_-|WP_019838498.1|DBSCAN-SWA MIRIDEIWLSTQPMDMRAGMDTAMAQVLRAFGSIKPHCAYLFCNKRGHRMKVLVHDGLGIWLCARRLEQGKFHWAQLHQGETVALSLEQLQALIQGLPWQRIGRQQVVTML |
9 | Vibrio_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
15524 : 17223
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026749|15524:17223|DBSCAN-SWA GCTACACTTTTTCACTTTTCTGTATAAGCTGTTTTAAAAAATCTTCTAATTGTAAAAGACTATCTTCATCAATTTCTGAAATTTTAAGAGAGATCTTGAGCTGTTTTTGATTCAGTTTGATATTTCCAGCAACCTTACCATCATATTCAATTTTTCTTACCACTGATGTCGTGGTTACTTTTTCTGGATCCTGACTCAATAGTTTTTCAGCATAAGAAGTAACTTTGCTTTGCTCCAGTTTTTTTTCTTTTAATTTCTCCCAAGCACCGAGTAAAGCTGTTTCCGCCTCCGAAAGTTGCTCTATATGATCCGACAAAAATTTCTTGAACGCTGTTGCAGCAGTACGACCGACTAGACCTGGCTCCAAGTCTAGGTCATTCAACATTGCTTTAGGCAGCTTTTCATACGATAGATATTTGTACATATCTTCACGATTTAAACCCAATGAATTAGCTAAACGTTGCTTGTTCTTCTTCAACTTTTCATCAAGTGAGTTCAAACCAATAAAAATTTCATAATCTGTCAGATCTTGACGCTTTAAATTTTCAGCTAGAGTTAACAAAGATGCTTCTTCATTATTAGCATCAATGATAATGGCTTCAATCACCGACTTCCCGAGTAACTGATGTGCCCGTAAGCGTCGCTCGCCTGCAATCAGTTCATATTTCAGATTATCAAGTTTACGCACTGTAATGGGCTGTAAAAGGCCTATTTCATTAATAGAATCCGCCAGTTCTTTTAATTGAGAATCTTCAAATACTTTACGCGGTTGGTTGGGACTGCGATTAATATCCTCAATAGGAACATTACGTCTAAATTCTTTTAGCTCTTTAATATTGTCTTTCTGTGCTAGCTGATGTTTTTCTGTATTTTGTTTCAATTTTTGAGCTAAAAGCTCTTTAGTGCTCGCCATAATACTCTCAGATTTATACTTTCGCTACAATTTCATAAGCAAGGCTTTCAAAAGCCTTACGTACTTTCGAATTTTTCTCAACTTTCAAAAGTGGCTGTTGCAGAATTGCTGCTTGATTAACTTTAGTACTTTGAGGAATGGTAGTTTCTAAAATTTTGCCTACCTGTTTTAAAGCTTCATCCCGAATCAATTTACAAACATTCTGACGTTCATCATGTTTAATCAGTAAAGCGCCTAAAAGCTCTAAATTTGGATTAATACGTTTTATCTTTTCAAGATGGTTTAAAAGATCTGTTACCCCATACAGTCCATATTGTGATCCAGATTCGATAGGGATAATGACATGTGTTGAGGATGCTAAGGCATTACTAGTTAATAGTTTAAGACTAGGTGGGCAATCAATTAATATGAAGTCGTAAAGATCTTTTAACAGTTCTAGCTTGATGCTTAATTCTTCTGAAGGACGAGGAGCTTCTTCTTTAAGCTGGTCTTCAGTTTTTCCTAAATTTAATGAGCCATAAATTAATGATACTTTTTCAAAGTTTGTTTCTTCTTGTAATGCATCAGCTAATAATGAAATATCACCAACGAGTAATTCTGCTGAAGTAACAACAATTTCGCTTGGATGTTGGATCCCAATGTGTAAACTTGCGTTTGCTTGAGGATCTAAATCAATGACTAAAACTTTATTGCCAAGATTTGCAAGTTCAGAGGCTAGATGTACAACGGTCGTTGTTTTGCCACATCCACCTTTGTGGTTAGCAACCGTAATAATTTTTGCAGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026749|15524:17223|15524_16436_-|WP_104915057.1|DBSCAN-SWA MASTKELLAQKLKQNTEKHQLAQKDNIKELKEFRRNVPIEDINRSPNQPRKVFEDSQLKELADSINEIGLLQPITVRKLDNLKYELIAGERRLRAHQLLGKSVIEAIIIDANNEEASLLTLAENLKRQDLTDYEIFIGLNSLDEKLKKNKQRLANSLGLNREDMYKYLSYEKLPKAMLNDLDLEPGLVGRTAATAFKKFLSDHIEQLSEAETALLGAWEKLKEKKLEQSKVTSYAEKLLSQDPEKVTTTSVVRKIEYDGKVAGNIKLNQKQLKISLKISEIDEDSLLQLEDFLKQLIQKSEKV >NZ_CP026749|15524:17223|16449_17223_-|WP_070153144.1|DBSCAN-SWA MSAKIITVANHKGGCGKTTTVVHLASELANLGNKVLVIDLDPQANASLHIGIQHPSEIVVTSAELLVGDISLLADALQEETNFEKVSLIYGSLNLGKTEDQLKEEAPRPSEELSIKLELLKDLYDFILIDCPPSLKLLTSNALASSTHVIIPIESGSQYGLYGVTDLLNHLEKIKRINPNLELLGALLIKHDERQNVCKLIRDEALKQVGKILETTIPQSTKVNQAAILQQPLLKVEKNSKVRKAFESLAYEIVAKV |
2 | Leptospira_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
21583 : 39564
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026749|21583:39564|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026749|21583:39564|26681_27896_+|WP_000214119.1|DBSCAN-SWA MTTTRPAWAYTLPAALLLMAPFDILASLAMDIYLPVVPAMPGILNTTPAMIQLTLSLYMVMLGVGQVIFGPLSDRIGRRPILLAGATAFVIASLGAAWSSTAPAFVAFRLLQAVGASAMLVATFATVRDVYANRPEGVVIYGLFSSMLAFVPALGPIAGALIGEFLGWQAIFITLAILAMLALLNAGFRWHETRPLDQVKTRRSVLPIFASPAFWVYTVGFSAGMGTFFVFFSTAPRVLIGQAEYSEIGFSFAFATVALVMIVTTRFAKSFVARWGIAGCVARGMALLVCGAVLLGIGELYGSPSFLTFILPMWVVAVGIVFTVSVTANGALAEFDDIAGSAVAFYFCVQSLIVSIVGTLAVALLNGDTAWPVICYATAMAVLVSLGLVLLRLRGAATEKSPVV >NZ_CP026749|21583:39564|27923_28907_+|WP_014386425.1|DBSCAN-SWA MRRTNHRNLVNVGILSGRIPLISLVQFIAVAEHLNFRHAAKALGISQSSVSARVKALEDNLGVLLFERHARGVRLTDAGRHFMERVTAGVDQLDHAVKTAGMTAQGEYGRLRIGIHALIPRSFLTELIRHYREEHTGIEVEITEGTARDAVMQLRADQLDVVFVAGKPEMPDCHTRPIWTEPLVAVLSDGHRLAGQSAITWSDLVGETFIVRYGGTGPQVHDHIVLRLAGRWPAPSIRRFDVGRDTLLSMVGQGFGITIVGEATSLLPTTGIVFLPFLDEPEPVAFTAVWSPFNRNSALKNLLNLAGKMKRDGDSPNRFLDGTRPAR >NZ_CP026749|21583:39564|31695_32400_+|WP_001067784.1|transposase|DBSCAN-SWA 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19 | Escherichia_phage(36.36%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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