Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020007 | Haemophilus influenzae strain 48P153H1 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,WYL | 1 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020007_1 | 245969-246082 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020007_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020007_1
>1.1|245996|60|NZ_CP020007|CRISPRCasFinder TTTGACGTGCAACTCTTTCTCTTTCCGCCTCAGCTTGTTGACGGCGAGCTTCTGCTTGAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020007_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020007_1 >merge|NZ_CP020007|1|245969-246082|CRISPRCasFinder CTTGCTGGCGTTTTGCCTCTTCGGCTTTTTGACGTGCAACTCTTTCTCTTTCCGCCTCAGCTTGTTGACGGCGAGCTTCTGCTTGAGCTTGCTGGCGTTTTGCTTCTTCGGCTT >NZ_CP020007|1|1|245969-246082|CRISPRCasFinder CTTGCTGGCGTTTTGCCTCTTCGGCTT TTTGACGTGCAACTCTTTCTCTTTCCGCCTCAGCTTGTTGACGGCGAGCTTCTGCTTGAG CTTGCTGGCGTTTTGCTTCTTCGGCTT
>NZ_CP020007.1|WP_005687986.1|241539_242883_-|Na(+)-translocating-NADH-quinone-reductase-subunit-A MITIKKGLDLPIAGKPAQVIHSGNAVNQVAILGEEYVGMRPSMKVREGDVVKKGQVLFEDKKNPGVIFTAPASGTITAINRGEKRVLQSVVINVEGDEKITFAKYSTEQLNTLSSEQVKQNLIESGLWTALRTRPFSKVPSIESEASSLFVNAMDTNPLAADPSVVLKEYSQDFTNGLTVLSRLFPSKPLHLCKAGDSNIPTTDLENLQIHDFTGVHPAGLVGTHIHFIDPVGIQKTVWHINYQDVIAVGKLFTTGELYSERVISLAGPQVKEPRLVRTIIGVNLSQLTQNELSAGKNRVISGSVLCGQIAKDSHDYLGRYALQVSVIAEGNEKEFFGWIMPQANKYSVTRTVLGHFSKKLFNFTTSENGGERAMVPIGSYERVMPLDILPTLLLRDLIVGDTDGAQELGCLELDEEDLALCSFVCPGKYEYGSILRQVLDKIEKEG >NZ_CP020007.1|WP_005653793.1|240301_241537_-|NADH:ubiquinone-reductase-(Na(+)-transporting)-subunit-B MGLKNLFEKMEPAFLPGGKYSKLYPIFESIYTLLYTPGTVTHKNTHVRDALDSKRMMITVFLALFPAIFYGMYNVGNQAIPALNQLGNLDQLIANDWHYALASSLGLDLTANATWGSKMALGAIFFLPIYLVVFTVCTIWELLFSVVRGHEVNEGMFVSTILFALIVPPTLPLWQAALGITFGIIVAKEIFGGVGRNFMNPALAGRAFLFFAYPAQISGDTVWTAADGFSGATALSQWSQGGQGALQHTVTGAPITWMDAFVGNLPGSMGEVSTLAILIGGAVIVFTRIAAWRIIAGVMIGMIATSTLFNLIGSETNPMFSMPWHWHFVLGGFALGMVFMATDPVSASFTNTGKWWYGALIGVMAVLIRTVNPAYPEGMMLAILFANLFAPIFDYIVVQANIKRRRARTNG >NZ_CP020007.1|WP_005653794.1|239574_240309_-|Na(+)-translocating-NADH-quinone-reductase-subunit-C MAKFNKDSVGGTILVVLLLSLVCSIIVAGSAVMLKPAQEEQKLLDKQKNILNVAGLLQENTNVKETYAKFIEPRFVDLATGEYTQQADDSQQAIPADADKARIRSRSKTTEVYLVKDEQGQTQQVILPIYGTGLWSVMYGLVSVQPDGNTINGITYYQHGETPGLGGEIENPNWASLFKGKKLFDEQHQPAIRIVKGQAPQDEHSIDGLSGATLTGNGVQGTFNYWFSKDGFGPYLEKLHSGAN >NZ_CP020007.1|WP_005648665.1|238948_239575_-|NADH:ubiquinone-reductase-(Na(+)-transporting)-subunit-D MSGKTSYKDLLLAPIAKNNPIALQILGICSALAVTTKLETAFVMAIAVTLVTGLSNLFVSLIRNYIPNSIRIIVQLAIIASLVIVVDQILKAYAYGLSKQLSVFVGLIITNCIVMGRAEAFAMKSPPVESFVDGIGNGLGYGSMLIIVAFFRELIGSGKLFGMTIFETIQNGGWYQANGLFLLAPSAFFIIGFVIWGLRTWKPEQQEK >NZ_CP020007.1|WP_005631374.1|238348_238945_-|NADH:ubiquinone-reductase-(Na(+)-transporting)-subunit-E MEHYISLFVKAVFIENMALSFFLGMCTFLAVSKKVSTAFGLGIAVTFVLGIAVPVNQLIYANVLKENALIEGVDLSFLNFITFIGVIAGLVQILEMVLDKFMPSLYNALGIFLPLIAVNCAIFGGVSFMVQRDYNFPESIVYGFGSGLGWMLAIVALAGLTEKMKYADIPAGLKGLGITFISVGLMALGFMSFSGIQL >NZ_CP020007.1|WP_005687983.1|237100_238336_-|NADH:ubiquinone-reductase-(Na(+)-transporting)-subunit-F MSDSVILALGIAAFTVIVLVLVAIILFAKSKLVDSGDITIGINDDPEKAITLPAGSKLLGALASKGIFVSSACGGGGSCGQCIVKVKNGGGEILPTELSHINKREAKEGYRLACQVNVKGNMEVELPEEIFGVKKWECTVISNDNKATFIKELKLAIPEGEEVPFRAGGYIQIEAEPHVVNYKDFDIPEEYHEDWDKYDLWRYVSKVDEHIIRAYSMASYPEEKGIIMLNVRIATPPPRQPDAPPGQMSSYIWSLKAGDKVTISGPFGEFFAKETDAEMVFIGGGAGMAPMRSHIFDQLKRLHSKRKMSFWYGARSKREIFYQEDFDQLQAENPNFVWHVALSDALPEDNWTGYTGFIHNVLYENYLKNHEAPEDCEYYMCGPPVMNAAVIKMLKDLGVEDENILLDDFGG >NZ_CP020007.1|WP_005687981.1|235916_236957_-|FAD:protein-FMN-transferase MKKLISGIIAVAMALSLAACQKETKVISLSGKTMGTTYHVKYIDDGSIKATSEKTHEEIEAILKDVNAKMSTYKKDSELSRFNQNTQVNTPIEISADFAKVLAEAIRLNKVTEGALDVTVGPVVNLWGFGPEKRPEKQPTPEQLAERQAWVGIDKITLDTNKEKATLSKALPQVYVDLSSIAKGFGVDQVAEKLEQLNAQNYMVEIGGEIRAKGKNIEGKPWQIAIEKPTTTGERAVEAVIGLNNMGMASSGDYRIYFEENGKRFAHEIDPKTGYPIQHHLASITVLAPTSMTADGLSTGLFVLGEDKALEVAEKNNLAVYLIIRTDNGFVTKSSSAFKKLTETKE >NZ_CP020007.1|WP_005687979.1|235653_235914_-|(Na+)-NQR-maturation-NqrM MQTLFFTLIAFVAIILLMSIGFIIKKQSLKGSCGGLSTLGIDKACDCDKPCDTLQSKLDAGDEQAKAEYEQKFAKKDDDSQFYEVK >NZ_CP020007.1|WP_005658170.1|234385_235537_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MLISNTYNQHFPQLTQEQLARNATKKVICGMSGGVDSSVSAFILQQQGYQVEGLFMKNWEEDDDTDYCTAAADLADAQAVCDKLGIKLHKINFAAEYWDNVFEHFLTEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLEYAAEDLCADYIATGHYVRRTGDNENAKLLRGLDANKDQSYFLYTLSHKQVGQSLFPVGEIEKPIVRAIAEDLGLITAKKKDSTGICFIGERKFKDFLARYLPAQPGNIRTVDGEIIGRHDGLMYHTLGQRKGLGIGGLKNAGDEAWYVVDKDVENNELIVAQGHDHPRLFSKGLIASQLHWVDREPIRESLRCTVKTRYRQQDIPCVIEPIDDETIRVIFDEPQSAVTPGQSAVFYLDEVCLGGGIIAERI >NZ_CP020007.1|WP_005658168.1|233607_234342_+|peptidoglycan-editing-factor-PgeF MQAINPNWNVPKNIHAFTTTREGGVSLAPYLSFNLGDHVGDDKSAVKTNRTLLVEKFGLPQTPIFLTQTHSTQVIQLPYLGQNLEADAVYTNVPNQVCVVMTADCLPVLFTTTSGNEVAVAHAGWRGLCDGVLEETVKYFQAKSEDIIVWFGPAIGPKAFQVGIDVVEKFVAVDEKAKLAFQADVIEDGKYLGNLYQIATQRLNNLGITQIYGGNHCTFNEKEKFFSYRRDNQTGRMASVIWFE >NZ_CP020007.1|WP_005688077.1|249671_250499_-|S-formylglutathione-hydrolase MKLIEQHQIFGGSQQVWAHNAQTLQCEMKFAVYLPNNPENRPLGVIYWLSGLTCTEQNFITKSGFQRYAAEHQVIVVAPDTSPRGEQVPNDAAYDLGQGAGFYLNATEQPWATNYQMYDYILNELPDLIEANFPTNGKRSIMGHSMGGHGALVLALRNRERYQSVSAFSPILSPSQVPWGEKAFTAYLGEDREKWQQYDASSLIQQGYKVQGIRIDQGLEDEFLPTQLRTEDFIETCRVASQPVDVRFHKGYDHSYYFIASFIGEHIAYHAAFLK >NZ_CP020007.1|WP_005688078.1|250507_251644_-|S-(hydroxymethyl)glutathione-dehydrogenase/class-III-alcohol-dehydrogenase MEIKQINSIIKSRAAVAFAPNQPLQIVEIDVEMPRKGEVLIRNTHTGVCHTDAFTLSGSDPEGVFPVVLGHEGAGVVVAVGEGVLSVKPGDHVIPLYTAECGECEFCRSGKTNLCVSVRDTQGKGLMPDCTTRFSYQGQPIYHYMGCSTFSEYSVVAEVSLAKINPEANHEQVCLLGCGVTTGIGAVHNTAKVQEGDSVAVFGLGAIGLAVVQGARQAKAGRIIAIDTNPAKFELAKQFGATDCLNPNDYDKPIKDVLLDINKWGIDHTFECIGNVNVMRQALESAHRGWGQSIIIGVAGAGQEISTRPFQLVTGRVWKGSAFGGVKGRSELPQMVEDSMKGDIQLEPFVTHTMPLDQINEAFELMHEGKSIRTVIHY >NZ_CP020007.1|WP_005688079.1|251765_252173_+|MerR-family-transcriptional-regulator MTYTTAKAAEKIGISAYTLRFYDKEGLLPNIGRDEYGNRRFTDKDLQWLSLLQCLKNTGMSLKDIKRFAECTIIGDDTIEERLSLFENQTKNVKCQIAELKRYLDLLEYKLAFYQKAKALGSVKAVNLPQIPETS >NZ_CP020007.1|WP_005648696.1|252390_252618_+|twin-arginine-translocase-TatA/TatE-family-subunit MFGLSPAQLIILLVVILLIFGTKKLRNAGSDLGAAVKGFKKAMKEDEKVKDAEFKSIDNETASAKKENIKEKEQA >NZ_CP020007.1|WP_005688082.1|252621_253182_+|Sec-independent-protein-translocase-subunit-TatB MFDIGFSELILLMVLGLVVLGPKRLPIAIRTVMDWVKTIRGLAANVQNELKQELKLQELQDSIKKAESLNLQALSPELSKTVEELKAQADKMKAELEDKAAQAGTTVEDQIKEIKNAAENAEKPQNAISVEEAAETLSEAEKTPTDLTALETHEKVELNTHLSSYYPPDDIEIAPASKSQSSKTKS >NZ_CP020007.1|WP_005658522.1|253191_253962_+|twin-arginine-translocase-subunit-TatC MSNVDESQPLITHLVELRNRLLRCVICVVLVFVALVYFSNDIYHFVAAPLTAVMPKGATMIATNIQTPFFTPIKLTAIVAIFISVPYLLYQIWAFIAPALYQHEKRMIYPLLFSSTILFYCGVAFAYYVVFPLVFSFFTQTAPEGVTIATDISSYLDFALALFLAFGVCFEVPIAIILLCWTGITTVKALSEKRPYIIVAAFFIGMLLTPPDVFSQTLLAIPMCLLFELGLLVARFYQPKDDESAVKNNDESEKTQ >NZ_CP020007.1|WP_005688084.1|254322_255672_+|NADP-specific-glutamate-dehydrogenase MSKVASLDAFLTKVAQRDGYQPEFLQAVREVFTSIWPFLEANPKYRSEALLERLVEPERAFQFRVAWTDDKGQVQVNRAFRVQFNSAIGPFKGGMRFHPSVNLSILKFLGFEQIFKNALTTLPMGGAKGGSDFDPKGKSDAEVMRFCQALMAELYRHVGADTDVPAGDIGVGGREVGYLAGYMKKLSNQSACVFTGRGLSFGGSLIRPEATGYGLIYFAQAMLAEKGDSFAGKVVSVSGSGNVAQYAIEKALSLGAKVVTCSDSSGYVYDPNGFTTEKLAALLEIKNVKRGRVKDYAELFGLQYFEGKRPWEVQVDIALPCATQNELELSDAQRLIKNGVKLVAEGANMPTTIEATEALLAADVLFGPGKAANAGGVATSGLEMAQSSQRLYWTAEEVDAQLHRIMLDIHANCKKYGTIEGQENINYVVGANVAGFVKVADAMLAQGVY >NZ_CP020007.1|WP_005658517.1|255779_256220_-|ferric-iron-uptake-transcriptional-regulator MSEENIKLLKKVGLKITEPRLTILALMQNHKNEHFSAEDVYKILLEQGCEIGLATVYRVLNQFDEAHIVIRHNFEGNKSVFELAPTEHHDHIICEDCGKVFEFTDNIIEQRQREISEKYGIKLKTHNVYLYGKCSDINHCDENNSK >NZ_CP020007.1|WP_005648709.1|256248_256773_-|flavodoxin-FldA MAIVGLFYGSDTGNTENIAKQIQKQLGSDLIDIRDIAKSSKEDIEAYDFLLFGIPTWYYGEAQADWDDFFPTLEEIDFTDKLVGIFGCGDQEDYADYFCDAIGTVRDIIEPHGAIVVGNWPTEGYNFEASKALLEDGTFIGLCIDEDRQPELTAERVEKWCKQIYDEMCLAELA >NZ_CP020007.1|WP_005688086.1|256867_257650_-|alpha/beta-fold-hydrolase MAKSLLNYQFHQVKQTINTPVLIFIHGLFGDMDNLGVIARAFSEHYNILRIDLRNHGHSFHSEKMNYQLMAEDVIAVIRHLNLSKVILIGHSMGGKTAMKITALCPELVEKLIVIDMSPLPYEGFGHKDVFNGLFAVKNSKPKNRQQAKPILKQEINDEDVVQFMLKSFDVNSTDCFRFNLTALFNNYANIMDWEKVRVFTPTLFIKGGNSSYIKIENSEKILEQFPNATAFTINGSGHWVHAEKPDFVIRAIKRFLNKN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020007_1 | 1.1|245996|60|NZ_CP020007|CRISPRCasFinder | 245996-246055 | 60 | NZ_CP020007.1 | 245264-245323 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020007_1 | 1.1|245996|60|NZ_CP020007|CRISPRCasFinder | 245996-246055 | 60 | NZ_CP020007.1 | 245630-245689 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020007_1 | 1.1|245996|60|NZ_CP020007|CRISPRCasFinder | 245996-246055 | 60 | NZ_CP020007.1 | 244898-244957 | 1 | 0.983 |
1. spacer 1.1|245996|60|NZ_CP020007|CRISPRCasFinder matches to position: 245264-245323, mismatch: 0, identity: 1.0
tttgacgtgcaactctttctctttccgcctcagcttgttgacggcgagcttctgcttgag CRISPR spacer tttgacgtgcaactctttctctttccgcctcagcttgttgacggcgagcttctgcttgag Protospacer ************************************************************
2. spacer 1.1|245996|60|NZ_CP020007|CRISPRCasFinder matches to position: 245630-245689, mismatch: 0, identity: 1.0
tttgacgtgcaactctttctctttccgcctcagcttgttgacggcgagcttctgcttgag CRISPR spacer tttgacgtgcaactctttctctttccgcctcagcttgttgacggcgagcttctgcttgag Protospacer ************************************************************
3. spacer 1.1|245996|60|NZ_CP020007|CRISPRCasFinder matches to position: 244898-244957, mismatch: 1, identity: 0.983
tttgacgtgcaactctttctctttccgcctcagcttgttgacggcgagcttctgcttgag CRISPR spacer tttgacgtgcaactctttctctttccgcctcagcttgttgacggcgagcttctgtttgag Protospacer ******************************************************.*****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
80574 : 92670
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020007|80574:92670|DBSCAN-SWA CATGAGTAACTTTGGGGTCATCAAGCGCGATGGTTCTCGTGCGGAGTTTGAGATTCAACGTATCATTAATGCCATTAAAAAAGCCGCAAGTGCGGTCAATATTTCCGATGAATTTTATTGCCACCAAATTGGGCAAGAAGTAGGGAATGAAATTTTCACCCGTCATCAAGACGAAATTGATATTAATCAGATTCAAAAAATCGTTGAAGATAAATTGATGGCAAGTCGTTATCCTGAGATTGCTCGTGCGTATATCGAATATCGTCATGATCGTGATTTAGCGCGAGAAAAACGTAGCCAGCTAACAAAAGAAATTGAAGGTTTGATTGAACAAAGCAACGTAGAATTACTTAATGAAAACGCCAATAAAGACGCGAAAGTGATTCCAACGCAACGAGATTTGCTTGCTGGAATTGTGGCAAAACATTATGCCAAGCACCATATTCTTCCACGCGATGTGGTAGAGGCTCACGAAAAAGGTGAAATTCATTATCACGATTTAGATTACGCGCCGTTCTTTCCAATGTTTAACTGTATGTTAGTTGATTTAGAAGGGATGCTTTCTCGTGGTTTCAAAATGGGCAATGCGGAAATCGAACCCCCTAAATCTATCGGCACCGCAACGGCAGTGACAGCACAAATTATCGCCCAAGTTGCCAGCCATATTTACGGTGGCACAACCATTAATCGTATTGATGAAGTACTTTCCCCTTATGTGCAAATCAGTTACGAAAAACATCTCAAACATGCCCAAGAATGGAACGTGCCTGATGTTGAAGGTTATGCCAAAGCATTGATTGAAAAAGAATGTTTCGATGCCTTCCAATCCTTAGAATATGAAGTTAATACACTACATACTTCAAATGGGCAAACACCATTTGTGACCTTTGGTTTTGGTTTAGGTACAAGCTGGCAATCTCGCTTAATTCAGCAAGCTATTTTAAAAAATCGGATTCGTGGACTCGGAAAAAATCATAAAACGCCTGTATTTCCAAAACTCGTTTTCACCATTAAAAAAGGCTTGAACCAAACTAAAGGCGATCCGAATTACGATATCAAACAACTCGCATTAGAATGCGCATCAAAACGTATGTATCCAGATATTCTCAATTACGATCAGGTTGTCAAAGTCACGGGCTCTTTTAAAGCCCCAATGGGATGCCGTAGCTTTTTAGGTGCATACGAAGAAAAAGGTCACGAAATTCACGATGGGCGTAATAATCTTGGCGTGGTGAGTTTGAATTTACCGCGTATTGCGTTGGAGTCTAAAAACGAAGAAGATTTCTACCGCACTTTAGATGAACGTTTGGCTATTGCGAAAAAAGCATTAATGACGCGCATTGCCCGCCTTGAGAATACCAAAGCTCGCGTCGCTCCTATTCTTTATATGGAAGGTGCTTGCGGAGTGCGGTTAAAAGCGGATGAAAATGTGGCACAAATTTTCAAAAATGGACGTGCCTCTATTTCACTTGGCTATATCGGTATTCATGAAACCATTAATGCGCTATATAAAAAAGGACATATTTTTGATGATGAACAATTACGCGAAAAAGGCATTGCGATTGTTCGCCACCTTAGCGAGGCAGTGAAACGCTGGCAAAAAGAAACAGGTTATGCCTTCAGCCTTTACTCCACGCCAAGCGAAAACTTATGCGACCGCTTCTGCCGTCTAGATACCAAAAAATTTGGCGTAATTGAAGGCGTCACGGATAAAGGCTACTACACGAACAGTTACCACTTAGATGTAGAAAAGAAAGTGAATCCTTACGATAAACTAGATTTCGAAATGACATATCCCCCACTCGCCAGCGGCGGTTTTATTTGCTACGGCGAATATCCCAATATTCAACACAACTTAAAAGCATTGGAAGATGTGTGGGATTATAGCTACGATCGCGTACCTTACTACGGCACAAACACACCGATTGACGAATGTTATGAATGTGGTTTCACCGGCGAATTTGAATGTACCAGCAAAGGTTTTGTTTGCCCGAAATGTGGCAATCACGACAGCACAAAAGTGTCTGTCACTCGCCGCGTCTGTGGCTATCTAGGCAGCCCTGATGCCCGCCCATTTAATGCGGGAAAACAAGAAGAAGTGAAGAGAAGAGTTAAACACCTTTGATTTAACACGATAGCAAAAGCACGCATTTTTTAATGCGTGCTTTTTGTTTCCAACTTTGGCATTCCCAAAATCTCCGCTAAAATAACCGCACTTTTTCTTATCTTCTAGGAAAGCAATATGTCAGATATTCTCAATAACCTTATTCATCTTCTTAAACTTGAAAAAATTGATGATTTAATCTTTCGTGGTGAAAGCCAAGATTTAGGTTTTCGCCAAGTATTTGGCGGGCAAGTAGTGGCACAGGCGTTATCTGCAGCAATGCAGGTGGCGCCAGAAGATCGCATTTTGCATTCTTGTCATGCCTATTTTCTTGCACCAGGAGACAGTCAATATCCGATTATTTACGATGTAGAAACCTTGCGTGAAGGGCGTAATTTTTCTGCATTACGCGTAAAAGCCATTCAACATAAAAATACCATTTGTCATGTAACCGCTTCTTTCCAAGTGCCAGAAAAAGGTTTTGAACATCAAAATTCAATGCCAAATGTTGGCACGCCTGAAGACTTTACAGATGAAAATGTGATGCTACAAAAAGTGGCTCAAATCTTGCCAGAACCACTCAATGAAAAATTTGCGGCAGAGCGTCCATTTGAGGTACGTACCAAATATTTGAATAACCCATTTAACGGGACAAAATTGCCAGCCGAGCAATATTCTTGGTTTAAAACCAATGGTGAAACGCCGCTTGATATAAAAATTCAGCAATGTTTATTGGCTTATTTTTCCGATTTTCACTGTATTTTGACCGCACTTCATCCGCACGAAAAAGGCTTTTTACAAAAAGGAATGAAAGTGGCAACCATTGATCATAGTATTTGGTTCCATCGTCCGTTTGATTTAAATCACTGGCATTTGCACGCAATTGAAAGCAATAATGCCTTTGGAGGGCGAGGCTTAGCTCGCGGGCAAATTTTCTCACAAGATGGTCAATTAATCGCAACAACACAACAAGAAGGCTTGATCCGTTTTAACGAATAAGAAAGAAAAAATGACCGCACTTATTACACAATTTTGGCAACAGGTTGAAACCGCACAAACATTAAAATCCTATATTAAGAAATGATGAAAGAATAAAAAGACTAAATTCTATTACATTCTGAACTTAGTCTTTTTAATAAAAGTGATTTAACGTTTGAATTTATTGCTTACGCCAAGTTGTTCCATTCGCACCATCTTCTAATACGATGCCCATAGCGGTAAGCTCATTACGCGCAGCATCAGCAGTAGCCCAATCTTTAGCCGCGCGGGCTTCATTGCGTTGTTTAATCAGCGCTTCAATTTTTGCCACTTCATCATCGTTAGAACCTGCTTGTAAGAATTTTTCTGGTTCTTGTTGAAGTAATCCTAAAATCGCCCCTAATTCACGCAAACGCGCGGCAAGTCCATTGGCTTTCTCAACATCCTCTGCTTTTAACTTGTTAATTTCACGCGCCATTTCGAATAAAACAGAAAGTGCATTTGGCGTATTAAAATCATCATCCATTGCTTCACGGAAGGTTTCCACAAAATTTTCTCCGCCAAAAACAACCGCACTTTGATCCGTTCCACGTAAAGCCGTGTATAAGCGCTCCAACGCACCTTGCGCTAAATTCAAGTTTTCTTCGCTGTAATTTAGCTGGCTACGATAATGTGCCGTTAATAAGAAATAACGTACCGCCTCTGCATTATAGTGATTTAATACATCACGAATAGTAAAGAAATTACCGAGGGATTTCGACATTTTTTCTTTATCCACCATAATCATGCCAGAATGGATCCAATAATTCACATATTGGCCACCATGCGCACAGCAAGATTGTGCGATTTCATTTTCGTGGTGAGGGAACATTAAATCAGAGCCACCACCGTGAATATCAAAATGCTCGCCAAGCTGTTTGCAGTTCATTGCAGAACATTCAATATGCCAACCTGGACGACCGGCACCCCAAGGGGAAGCCCAACTTGGTTCGTTTTCTTTCGACATTTTCCAAAGCACGAAATCCATTGGATTTTTCTTGATTTCATTGATTTCAATGCGTGCGCCCGCTTGTAATTGCTCAAGATCTTGACGAGATAATTTGCCGTATTCTTTGAAGCTTTCTACATCAAACATCACATCGCCATTATCCGCAACATAAGCATGTCCACGTTTAATCAATTTTTCCACAATTTCAATAATTTCAGGAATATGATGGGTTGCGCGAGGCTCAAAATCAGGGCGTAATACATTAAGTGCATCAAAATCTTTATACATTTCCTGCACCATGCGATCCACTAGCTGATCGCAGGTTTCTTTGTTTTCTAACGCACGTTTAATAATTTTGTCATCTACGTCCGTAATATTGCGCACATAAGTTAAATCGTAACCCAAAGAACGTAAATAACGAGCTATCACATCAAAACACACAAAAGTGCGTCCATGACCGATATGGCACAAATCATAAACAGTGACGCCACAAACATACATTCCCACTTTATTTTCGTGGATAGGTTTAAAGATTTCTTTTTCTCTCGTTAAGGTATTGAAAATTTTTAGCATTTTTAAGCTCGTAAAATGAAATAAAAACAAACCGCACTTTTATAGCACTTTTACCTCGATTGTGGAATAATACGACCCTTAATTTTTTAGAGGGAAAACAAAATGGTTACATTACACACAAATTTTGGCGACATTAAAATTAAATTGGATTTTGATAAAGCTCCAGTTACGGCAGAAAATTTCTTAAATTACTGCAAAGAAGGTTTTTATAATAACACAATTTTTCATCGTGTTATTGATGGCTTTATGATTCAAGGCGGTGGTATGGAAAGCGGTATGCGTGAAAAAGCAACTAAAGCACCAATCCAAAATGAAGCGAACAATCGTTTAAGCAACAAACGTGGAACCATTGCAATG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020007|80574:92670|87767_88763_-|WP_005658379.1|DBSCAN-SWA MKIAIYSTKSYDRKYIELINAKYNFDLEFFDFMLNESTVRLAEHCEVVCIFVNDNGSRKVLEKLAALGVKIVALRCAGFNNVDLKAAQELGIQVVRVPAYSPEAVAEHTIGLMMTLNRRIHRAYQRTREANFSLEGLIGFNMYGRTVGVIGTGKIGIAVMRILKGFGMNILAYDPFKNPVVEELGGQYVELDELYAKSHVITLHCPATPENYHLLNREAFAKMKDGVMIVNTSRGSLIDTQAAIDALKQRKIGALGMDVYENERDLFFEDKSNEVIQDDIFRRLSSCHNVLLTGHQAFLTEEALTNIADVTLSNVYKLKSGKVCENIVLPS >NZ_CP020007|80574:92670|90476_91313_+|WP_005653598.1|DBSCAN-SWA MDFSSISKKPYIITVACTKGGSAKSTNAANIGAFCADHGLRTLLIDTDTQPTLSSYYALTEEAPGGIYEFLTRRDIEPSHIISKTSIPNLDLIQSNDPSNNVSQTLRNAPDGAIRFSHLIKNIDNYDVIVVDTRGTRDITVDMSVLAADILFCPILPHILSAKEFIRGTIGMYQDLETFESFGFKLPPLKAIANCVDNTNDVKFVLNQLHVLFETNFDESKTFLDFSIPAHVAYREAATYSLPVYRHSQAEYPVIKELCCLLLPQFKTLFDKPMKKEG >NZ_CP020007|80574:92670|86732_87266_+|WP_005687542.1|DBSCAN-SWA MVTSGNYASYYLALLPSENGETIDNWVLPLGTQGLTFEADSWNSLGMRSNVSCFMRMADMPLDRSWRVAWNSPLITVCHGNWSKDESVLLRGPYTSLVDLFESALPDILMLEFSTPRAGELSSLLESEILRQKCILGLGVINPRSDEVETVTQIVQRAEKALNYLPPEQISKFQTKK >NZ_CP020007|80574:92670|80574_82698_+|WP_005658393.1|DBSCAN-SWA MSNFGVIKRDGSRAEFEIQRIINAIKKAASAVNISDEFYCHQIGQEVGNEIFTRHQDEIDINQIQKIVEDKLMASRYPEIARAYIEYRHDRDLAREKRSQLTKEIEGLIEQSNVELLNENANKDAKVIPTQRDLLAGIVAKHYAKHHILPRDVVEAHEKGEIHYHDLDYAPFFPMFNCMLVDLEGMLSRGFKMGNAEIEPPKSIGTATAVTAQIIAQVASHIYGGTTINRIDEVLSPYVQISYEKHLKHAQEWNVPDVEGYAKALIEKECFDAFQSLEYEVNTLHTSNGQTPFVTFGFGLGTSWQSRLIQQAILKNRIRGLGKNHKTPVFPKLVFTIKKGLNQTKGDPNYDIKQLALECASKRMYPDILNYDQVVKVTGSFKAPMGCRSFLGAYEEKGHEIHDGRNNLGVVSLNLPRIALESKNEEDFYRTLDERLAIAKKALMTRIARLENTKARVAPILYMEGACGVRLKADENVAQIFKNGRASISLGYIGIHETINALYKKGHIFDDEQLREKGIAIVRHLSEAVKRWQKETGYAFSLYSTPSENLCDRFCRLDTKKFGVIEGVTDKGYYTNSYHLDVEKKVNPYDKLDFEMTYPPLASGGFICYGEYPNIQHNLKALEDVWDYSYDRVPYYGTNTPIDECYECGFTGEFECTSKGFVCPKCGNHDSTKVSVTRRVCGYLGSPDARPFNAGKQEEVKRRVKHL >NZ_CP020007|80574:92670|82815_83676_+|WP_005687536.1|DBSCAN-SWA MSDILNNLIHLLKLEKIDDLIFRGESQDLGFRQVFGGQVVAQALSAAMQVAPEDRILHSCHAYFLAPGDSQYPIIYDVETLREGRNFSALRVKAIQHKNTICHVTASFQVPEKGFEHQNSMPNVGTPEDFTDENVMLQKVAQILPEPLNEKFAAERPFEVRTKYLNNPFNGTKLPAEQYSWFKTNGETPLDIKIQQCLLAYFSDFHCILTALHPHEKGFLQKGMKVATIDHSIWFHRPFDLNHWHLHAIESNNAFGGRGLARGQIFSQDGQLIATTQQEGLIRFNE >NZ_CP020007|80574:92670|87324_87648_-|WP_005658381.1|DBSCAN-SWA MSEVLHINDVDFESVVVNSDIPVLLDFWAPWCGPCKMIAPVLDELAPEFAGKVKIVKMNVDDNQATPAQFGVRSIPTLLLIKNGQVVATQVGALPKTQLANFINQHI >NZ_CP020007|80574:92670|85882_86689_+|WP_005687540.1|DBSCAN-SWA MPFFDTHTHLDYLQQFTGEPLSQLIDNAKQADVQKILVVAVKEADFKTIQNMTALFPDNLCYGLGLHPLYIQEHAENDLILLEQALKNRDANCMAVAEIGLERTIPDLLTDELWAKQCHFFESQLYLAKQFNLPVNIHSRKTHDQIFTFLKRIPLSKLGVVHGFSGSYAQAKRFVDLGYKIGVGGTITYERANKTRQAIAKLPLDALVLETDSPDMPVFGFQGQPNRPERIVESFKALCTLRNEPAELIKKLTWENACQIFSCSTSHY >NZ_CP020007|80574:92670|83836_85216_-|WP_005687538.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLKIFNTLTREKEIFKPIHENKVGMYVCGVTVYDLCHIGHGRTFVCFDVIARYLRSLGYDLTYVRNITDVDDKIIKRALENKETCDQLVDRMVQEMYKDFDALNVLRPDFEPRATHHIPEIIEIVEKLIKRGHAYVADNGDVMFDVESFKEYGKLSRQDLEQLQAGARIEINEIKKNPMDFVLWKMSKENEPSWASPWGAGRPGWHIECSAMNCKQLGEHFDIHGGGSDLMFPHHENEIAQSCCAHGGQYVNYWIHSGMIMVDKEKMSKSLGNFFTIRDVLNHYNAEAVRYFLLTAHYRSQLNYSEENLNLAQGALERLYTALRGTDQSAVVFGGENFVETFREAMDDDFNTPNALSVLFEMAREINKLKAEDVEKANGLAARLRELGAILGLLQQEPEKFLQAGSNDDEVAKIEALIKQRNEARAAKDWATADAARNELTAMGIVLEDGANGTTWRKQ >NZ_CP020007|80574:92670|85318_85828_+|WP_005652519.1|DBSCAN-SWA MVTLHTNFGDIKIKLDFDKAPVTAENFLNYCKEGFYNNTIFHRVIDGFMIQGGGMESGMREKATKAPIQNEANNRLSNKRGTIAMARTSDPHSATAQFFINVADNDFLNYRSKEMFGREVVQEWGYAVFGEVVEGMDVVDKIKKVKTGNKGFHQDVPTEDVVITLVSVE >NZ_CP020007|80574:92670|88775_89921_-|WP_074032767.1|DBSCAN-SWA MRSIFSLFLEDVMTQQYAIDTLLAQAGNRSDERTGAVSAPIFLSTAYGHCGIGESTGFDYTRTKNPTRTVLEETIAKLENGDRGFAFSSGMAAIQVLMTLFTAPDEWIVSSDVYGGTYRLLDFSYKNNNSVKPVYVNTASASEIEAAINPNTKAIFIETPSNPLMEECDVVEIAKIAKKHNLMLIVDNTFLTPVLSRPLDLGADVVIHSGTKYIAGHNDALVGLIVAKGQELCDRIAYIQNGAGAVLSPFDSWLTIRGMKTLSLRMKRHQENAQAIAEFLKDQPQVESVLYPNKGGMLSFRLQDEAWVNTFLKSIKLITFAESLGGTESFITYPATQTHMDIPETERVARGITNTLLRFSVGIEDVEDIKADLLQAFANLK >NZ_CP020007|80574:92670|91314_92670_+|WP_005687545.1|DBSCAN-SWA MTDKLIASIEAESAVIGALIIDNDKFDEIATLLRSDDFYVSAHKVLFEGVSHLLTQGKPADILTLEQYFKDKKLIDQIGGLAYLAEVIHNTPSASNITAYAEIISRYSKQRRFLTLGQFIVTEMQSSKDEIELTSFEESVDKQYTNIVIEQETDGVADLNASFERILSRMETSSINADPVSGTPTGIIELDRATTGGQPGELIIIAARPAMGKTTFAQTIAASTLDKFPDSPIQFYSQEMPADQLLERFMAMRSRVSLQSIRQATELEEEEWTRLANAMGTIKKDWKDRLLIDDEASLTPHRLRAKVRKNTRLYGKPKAIFIDYIQLMRTGNKTENRNLELAEISNDLKKLAKETGCPIYALSQLNRGLENRANKRPINADLRDSGSLEQDADVIIHLYRDEIYNPDTEDKGIAEIIIGKQRNGPLATVKTLFQGQYSIFENLTTQDRYYE |
11 | Vibrio_phage(14.29%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1297216 : 1305734
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020007|1297216:1305734|DBSCAN-SWA TTTAATCAATATGGAAACAAGCGATTAATTTGCCATCAGTATGTTGTTCCAAGTGCGGTTGATTTTCACGACATTTTTCTGTCGCTTTCCAACAACGAGGATTAAATGCACAGCCTTTGGGCGGATTAATCGGACTTGGCAATTCGCCTGTTAGTTTTATTCGCTCACGGCGTAAGTTTGGCGACAAACGTGGTGTCGCTGAAAGTAACGCTTTGGTATAAGGATGCTGAGGATTAGAGAAGATTTGCTCTGTTGTTCCTTTTTCGACACAACGACCTAAATACATTACCATCACTTCATCGGCGATATGTTCTACCACAGAAAGATCGTGTGAAATGAACACGTAAGACAAGCCTAATTCATCTTGTAAATCCATCATTAAATTTAGTACTTGCGCACGCACGGAAACATCTAATGCAGAAACAGGTTCATCGGCAACAACGACATCGGGATCTAACATTAAACCTCGTGCAATGGCTATACGCTGGCGTTGTCCGCCTGAGAACATGTGAGGATAACGGTCATAAAATTCAGCACGCAAGCCCACTTTTTCCATCATCGATAAAACTTTTTCCCGACGTTCTTTGGCGGAAAGTTTTGTGTTGATGATTAATGGTTCTTCCAAAATTGAACCAATCTTTTTGCGTGGATTTAATGATGCATAAGGATTTTGGAAAACTATTTGAATTTTTTTACGGCGTAGTGCTTTTGTTTCAGAATCATTTTCTAAAAAATTATGCCCTTTGTAATACAGCTCGCCTTCCGTTGGTTGTTCAATCATTGTCAATAAACGACCTAGCGTTGATTTTCCACAACCTGATTCCCCCACGACAGCTAAAGTTTTACCGCGTTCGAGCTGAAAAGAGACACCATCTAACGCTTTCACTTGCTGTGGTTTTGCAAACAAGCCTTTTTTTACAGGGTAATATTTTTTTAAGCCAATCGCATTTAATAATGGCGTATTTTCTTTTACTTCATTCGTCATTATTAAGCTCCTTGATATTCAACGGGATTGCCTTGCTCGTTCAGTGGAGTATGGCATTTTACTTTACGCGAACCGATATGATGCAATTGAGGTTCAACTTGGCGACAATATTCGGTGGCATAAGGGCAGCGAGGATTTAATAAACAGCCTGTTGGGCGATCGTATTTTCCAGGTACCACACCTTGTAATGACGCTAAGCGAGATTTTCCTTCTGCAAATTCAGGTAATGAACGTAACAAGGCTTGCGTGTAAGGATGTTTTGGCTCGCGGAAAATATCTTTTGCTGTGCCTTCTTCAACGATTTGTCCAGCATACATCACGATAATGCGATCTGCTGCTTCTGCCACAAGTGCTAGATCGTGAGTAATCAAAATTAGGGACATACATTCTTTCTTTTGCAATTCAAGTAAGAGTTCCATAATTTGTGCTTGAATAGTCACGTCCAATGCGGTGGTTGGTTCGTCAGCAATCAATAATTTAGGTCTGCAGGCAATTGCCATCGCAATCATCACACGTTGGCTCATACCGCCAGAAAGTTGATGGGGATAAACATTCATTCGAGATTCAGGATCAGGAATACCGACCAATCTTAAAAGCTCTAAAGTGCGGTCTTTTCTCGCCCTTTTTGTGCCACCCTCGTGAGTTTTTAACGCTTCCATAATTTGGAAACCCACAGTATAAGCAGGATTCAAGCTTGTCATCGGATCTTGGAAAATCATTGCGACATCAGCACCAATAAGCTGGCGTTTGGCTTTATTATCCAAAGTGAGTAAATTAGTGTTTTCAAATTGCAAGGATTCTGCCGATACACGCCCAGGATGATCAATTAATCCCATAATAGCGAGCGAACTCACAGATTTACCCGAACCTGATTCTCCCACAATGCCAAGCACTTCGCCTTGTGCGACTTGATAGCTGATGCGATCCACTGCTTTAAATGGCGTTTTTTTGTCGCCAAAGTGAACAGAAAGTTCTTTTACGTCTAATAATGCCATTCTGTTTTCCTATTGTTTGAGTTTTGGATCAAGGGCATCACGCAAGCCATCGCCCATTAAGTTGAAAGCTAATACCAAAGATAAAATCACTAAACCGGGAATTGTAACCAACCAGTTTGCCGCTTGCATAAAACCACGTGCTTCTGAAAGCATTGTGCCAAGTTCAGGTGTTGGCGGTTTTGCACCAATGCCTAAGAAACCAAGTGTTGCAAGTTCTAAGATCGCATTGGAAATACCCATTGTCATTTGCACAATTAAAGGGGCTAAACAGTTCGGTAAAATCACAATAAACATTAGGCGTAAAATACCTGCACCAGCCACTTTAGATGAAGTCACATAATCACGATTTTTTTCATTCATCACTGCTGCTCGAGTTAAACGCACATAGCTAGGAATTGATACAACGGCGATAGCTAAAGTGGCGTTGGCGAGTGATGGCTCTAAAATAGAGACGACCACAATCGTCAAGAGTAAGTTTGGAATCGCGAGCATAATATCAATTAGGCGAATGATAATTGTATCTAGCATGCCGCCATAATAGCCAGAAACCAAGCCAAGACTGGTACCAAAGGCACAAGATAGCAATACAATAACAAATCCCGCAAAGACGGAAATTCGTGTTCCGTAAATGATGCGAGAAAGAATATCTCGCCCAATATCATCTGTTCCGAGTAAATAGGCAGGATTGCCACCATCATACCAAGCAGGGGGAAGTAAAAGTGCGGTACGATTTTGCTCTGTTGGATCAAAAGGCGCAATATAAGGCGCAAGAATGCTGATTAAGGCAACAATCAAAATAAAAATTAAACCAATTAGCGCACCACGGTTTTGTTTGAAGTAAAACCAAAATTCTTGCAAGGGCGTTTTCGGCGCGAAAGTTGAAGGCGTGTCAGACATAATTTCTCCTACAATTAATGACGGATACGCGGATTGACCACGCCGTAAAGTAAATCGACAGTTAAATTTACCACAACAATAATTGTTGCAATAATCAGTACAGAACCTTGCAACACTGGATAATCACGGGCTTGAATAGCATCAATAATCCATTTCCCAATCCCCGGCCAAGAGAAAATGGTTTCTGTGAGAACGGCTCCAGAAAGCAATTGACCTACAATTAATCCAACCACAGTGACAACAGGAATTAACGCATTACGCAATGCGTGAACAATAACAATTCGAGTATAGCTTAAACCTTTTGCTTTTGCTGTGCGAATGTAATCTTCGCCTAATACTTCCAGCATCGCAGAGCGTGTCATACGAGTGATAATGGCGAGAGGAACTGTACCTAAGACTATGGCAGGAAGAATTAAAGATTTCACTGCATTTTCAAAAGCACCAGAAACACCAGAAATCCAGCTGTCAATAAGCATAAATCCTGTTGGTGTATCGATCCAAAATTCATTATTTAAACGCCCACCTTGTGGCAAACCGAGTTGTGGCGAAACATATAAAATTAAAATTAAACCCCACCAGAAAATTGGCATAGAATAACCTGTGAGCGATGCAGCTGTAACGGTGTGAGAAATCCAACTATCTTTTTTTACCGCGGCAATCGTGCCTAAAATTATTCCACCTAATAATGACCAAAATAACGCAAAAAATGCTAATTCAGCGGTGGCAGGGAAAAGTGTAAAAAATTCAGTAAGAACAGGTTGTTGAGTGCGGAACGATGCACCGAAATCCCCTTGAATTACATTGCCAATATAGCGGAAATATTGCTGATAAAGAGGTAAATCTAAACCCAATTGGTGCATCATTTGTTGATGTACTTCTGCCGTTAAGCCACGTTCCCCCATCATAATTTCCACAGGATCACCGGGAATAAAATGCACAAGGGCAAAGGTAATAAAAGTAATGGCAATAAAAGTAGGGATCACCATTAAGATTCGTTTGAATACAAATTTAAACATTCCATCACTCGTAGATAATAAAAGTGCGGTAAAAATTCACCGCACTTTTCAAAGAAATTAATCGGTAAAAAATATAATACTCTTGAATTCTACCGCACTTTTTCCAATGTTGCCAAATGCGCAATCAACCATTTAATGCCTTGAGCTTGGAACGCTATTTGTAAACGTGTGTTATTTTCAGATCCTTCCACATTAATCACTGTGCCGAAACCAAATTTTTCGTGTTTAACTTTTTGACCCATTTTCCATTCATTTTCGACCGCACTGGTATTCGACAATGAACCGACTTTTGCTAGGTTCATCGCACGCGTGACTGTCCCTCGTAAACGAATTTCTTGGATACATTCTCTCGGTAATTCTGCGATAAACCGTGATGGCAAATGGCGTTCTTCTTTGGCATATAATCGACGGCTTTCCGCATAAGAGATGGTCAGTTTTTTCTGTGCGCGAGTAATACCGACATAAGCTAAACGACGCTCTTCTTCTAAACGTCCGGGTTCTTCAAAAGAACGAAAACTTGGGAATAATCCTTCTTCTACGCCCACCATAAATACACGAGGAAATTCTAAGCCTTTCGCAGAGTGCAACGTCATCATTTCTACACAAGATTGATGCGGCGAGGCTTGTTCTTCACCAGCTTCTAAAGAGGCATGAGTTAAAAAGGCAGTGAGTTCGGTCATTTCTTCCGCATCATCAGGTTTGATAAATTCACGGGTTGCGGTAACTAATTCTTCCAAATTTTCAATCCGCACTTCGCCTTTTTCGCCTTTTTCTTGTTGATACATTTCATATAAGCCCGAATGTTTAATCACAAAATCAGTTTGTGCGAAAAGCGGCATTTCTGCGGTATCAAGTTGTAGTGAATTAATTAATTCTTGGAAACGTAATAAGGCTGTTGAGGCTCGCCCTGCCAACATATTTTCTTGTGTTGCGACTTGTACTGCTTGCCATAAGGTAATTTGGCGTTCGCGTGTTAAGTTACGCAATATATCTAAAGTGCGGTCGCCAATGCCACGGGTTGGCGTATTAATTACACGCTCAAAAGCCGCATCATCTTGACGATTATTAATCAAACGAAGATAGGCTAACGCATCTTTAATTTCTTGACGTTCGAAGAAACGCATACCGCCATAAATACGGTATGGAATTTGACAACGAATTAAAGCTTCTTCAATAACCCGTGATTGGCTATTACTACGATAAAGTACAGCGCAATCATCAAGTTTTCCGCCATGTTCTACCCAATCCTGAATTTGTGAAGCGACAAATTTTGCTTCATCTAATTCATTAAAGGCAGAATAGATGCCCACAGGATCGCCTTTCTCACCCTCTGTCCATAAATTTTTACCAAGACGATCACTATTGTTTGCAATTAATTCATTTGCGCTGTTTAGGATATTGGCGGTAGAACGGTAGTTTTGTTCAAGGCGAATTGTTTCGGCTTTGAAATCTTTCAAGAATTTTTGGATATTTTCAATTTGTGCGCCACGCCAACCGTATATAGATTGATCATCATCGCCTACGATCATGACTTTGCCTGTTTTTCCAGCAAGAATTTTAATCCACTTATATTGAATTTTATTGGTGTCTTGAAACTCATCCACCAAAATATGCTGAAAACGTTGTTGATAACGTTGCAAAATTAATGGTTTTTTCTCAAATAATTCATAGACCCGAATTAATAATTCAGCAAAATCGACCAACCCTGCGCGATCGCAAGTGTCTTGATAGATCTGATAAATTTTAATCCATTCACGTTCTTGGCGATCATTAAAATCTTCAATATCATTTGGTCGCAAGCCTTCATCTTTTTTGTTATTGATGTACCAACAAGCCTGTTTAGGCGGAAAAGCTTTTTCATCAAAATTATGTAATTTTAATAATCGTTTAATTAAACGACGTTGATCTTCTGAATCTAAAATTTGGAAATCTTGTGGCAATCCCACATCTAAATGATGAGCTCGCAACAAACGATGAGCAATGCTATGGAAGGTGCCAATCCACATACCAAATAATTGATGTTGTGCGTGTTTGGCAAGGGTAGATTGAATACGATGACGCATTTCTGCTGCGGCTTTATTGGTAAAGGTCACCGCCATAATGCTGCCTTCAGAAATATTTTCGACCGCAATTAACCAAGCAATACGGTGCGTCAATACACGCGTTTTGCCCGAGCCTGCACCAGCTAGCACTAAGTGATTACCAAGAGGAGCAGCTACGGCTTCGCGTTGTTTATCGTTGAGTCCGTCAAGTAATTCAGAAATATCCATCATAAACTATCTTTAATCTGTTTAAATTTACAGTTATTATAGTCCCATCTATCTTGTGAAACAATAAGATTTGTGAGTATATCAAAAGTAGGGTAGAACATTTTAAGAATAATATTAAGCGGGATTCTCCTATATCCTTAAACTCAACATCAAAATTATATGCTTTGAAAGCTATTTTTATACTATTTATAAACAAACTTTTAATTCGTTTACCTCTCATTCCTAAAATGCAAGGTTTCTCATTTTTCCAAAAATACCCATGATGAACAATAAATAATAGTATAGGAATGTTGTTTAATGGCTTAATCAATACTTGATTTGCTAGGATTCCTGTAATGATTTTATAAACATTTGCTTTTCCTTCTACTTGCACGCCATTTTACGCATAGTCGGTGATTTTGTCCGAATTAAGTTTTAGGTTAAAAAGTTACTCAAATTCAATGTTATTCATAATTAATACAAATAAGAAAGAGTGAGATATGGTACAAAATTCCAAAAAATGGTTAGCACAAAGGAATGGGAGAAGTGTGCTATCCAAGTTTCATTATGATCACTCTCTAAAGTAGAAAACGTCATATACTAAATTATATATTGATCAAAAAATAATATTTCCTTCTATTACTCAATACCAATCAATTTATGTGTTTGTAAACTTAGCTGCCATTTAGGTTTATTTGAACGTTGATTCAATTGACCAAGTAAAGTGATAGTCTCAAGTAAATTCATTTTCCCATCAATTTCACAAGGTGAAAGATAGTAATTCTTTGCTTTTATTTTTTGCTCGATCAATTCACAAAATGATGGCATATTACTGTCCATTACAATACGTACTTCATTTGCAAATGGAATGCAACGCTTTTCATACTTATGAGCATAAAGGCTCTTAGGACTCGTCGCAATATAATCTATTTGTGCAGGAATTGCTTTTAGACCATTGGTTTCAATTGCAAGAAAATAGCCATCTGATTTAAATTGCTCAAGTAAGTATTCAATTTTTGGTACAATTGTTGGCTCACCACCTGTGATGATAATATTCTTTGACGAAAATGACCGCACTTTTTCTAGAATTTGTGATACAGACCAGCGTTTAAAATTATTATAAGGTGTATCACACCAAGGACAGTCTAGATTGCATTTACCAAATCGTACAAAAACACTTGGCATTCCCGTATTGAAGCCCTCCCCTTGCAGACTTTCAAAAATTTCGACTATGTTAAAGTTCGGTTCAAAATCATGATATTTTTCCATCAACATTTACTCCTGATACTCGCAAAATGAAGTTGGGGTTTCCCATAAACGAATGGATGATATGGACAGTTGTTCATCATGTTTTAAACGATTAAAAATAAAACGAGCTATTTCTTCTGCCGTAGTTCTAAAGGGAACACCAAAAGTTTTTGAGTTTAACTTTTGCAATAGAGTGGCAATTTGGCTTTCTCGCTCATTGGTTTGATCATAAATAAAGGCGTGATCCATCGGATCTAAAATAACTTTTTTCACAATAGACTTTAGATCTGAAAAATCAATGACCATTGCTTTTTTTGCACCTGATTCATATAAGTCACCCGAAATTTCAACTTGTAATTTATATGTGTGTCCATGTAAATTTTGACATTTCCCATCATGTCCATCTAATAAATGTGCCATGTCAAAGCTAAATTCTTTGGAAATTTTAAACATTTTTTCTACCTTTTTGAGTCAAATATTTCTTTAGACCTTTATTGCGTAAAATACAGCTTGGGCATTTTCCGCATCCACCTTCGATGCCTTCATAGCAAGTGTGAGTATGTTTTTGTACATAATTTAATACGCCTAATTCATCAGCAAGCTGCCAAGTTTGGGCTTTAGTGAGATACATTAATGGTGTTTTGATATTGAATTGATAATCCATAGCTAAATTTAATGTGACATTCATTGACTTGATAAACACATCTCGGCAATCGGGATAACCGCTGAAATCTGTTTCACATACGCCAGTGATAATATCTTGAATGCCTTGGCCTTTCGCATAAATCGCGGCATAAAGTAAAAATAGGGCATTGCGACCATCAACAAAAGTGTTTGGCAATTCATTCTCTTTTTGCTCAATATGCGCTTGTTCATCCATTAATGCATTATGCGTGATAGCTTTCATAACAGATGTATCAATCAAGGTTTGTTTAATGCCTAAATCTTGCACAATGGCGCGCGCCTTTTCTAACTCAATAGCATGACGCTGCCCATATTGAAAGGTAATGGCTTCTATGTTTTCTTTGCCGTATTCAGCAATAGCTTGGAATAAACAAGTCGTGGAGTCTTGTCCACCAGAAAAGATGACAATCGCTTTACGATCGTGGTTTGGATTGAAAATATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020007|1297216:1305734|1297216_1298200_-|WP_005686497.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEQPTEGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCVEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQHTDGKLIACFHID >NZ_CP020007|1297216:1305734|1301197_1303381_-|WP_074032815.1|DBSCAN-SWA MMDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLFGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQRRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILAGKTGKVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETIRLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYSAFNELDEAKFVASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDDAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAQKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLATLEKVR >NZ_CP020007|1297216:1305734|1305050_1305734_-|WP_005686508.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENIEAITFQYGQRHAIELEKARAIVQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKENELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLNYVQKHTHTCYEGIEGGCGKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV >NZ_CP020007|1297216:1305734|1304632_1305058_-|WP_005647466.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYESGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPTSFCEYQE >NZ_CP020007|1297216:1305734|1300106_1301078_-|WP_074032816.1|DBSCAN-SWA MVIPTFIAITFITFALVHFIPGDPVEIMMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFRYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLNNEFWIDTPTGFMLIDSWISGVSGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVGQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIVVVNLTVDLLYGVVNPRIRH >NZ_CP020007|1297216:1305734|1299204_1300092_-|WP_005686499.1|DBSCAN-SWA MSDTPSTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYDGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFVIVLLSCAFGTSLGLVSGYYGGMLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAVMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ >NZ_CP020007|1297216:1305734|1298202_1299195_-|WP_005686498.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTNLLTLDNKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKRARKDRTLELLRLVGIPDPESRMNVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAADRIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLASLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSRKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >NZ_CP020007|1297216:1305734|1303996_1304632_-|WP_005686506.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE |
8 | Planktothrix_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1493761 : 1500440
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020007|1493761:1500440|DBSCAN-SWA TATGGCTACGATAACTAAACTTGATATTATTGAATATTTAAGCGATAAATATCACTTATCTAAACAAGATACGAAAAATGTAGTGGAGAACTTTTTGGAAGAGATCCGTTTATCGCTAGAATCTGGTCAAGATGTGAAATTATCAGGATTTGGTAATTTTGAATTACGCGATAAGTCATCTCGCCCAGGGCGTAACCCAAAAACAGGTGATGTTGTGGCAGTTTCTGCTCGCCGAGTTGTCACATTTAAACCTGGGCAAAAGTTACGTGCTCGTGTAGAAAAAACTAAATAGTAAGCAACAAAAAGTGCGGTGAATTTCTACCGCACTTTTCATATGAAAAGGTATGAAAGTATATAAATTATTTTTAATCGCTACTGCCTCGCTGTTTTTATTCGCTTGTTCCAGTTTTCAAAACGATGATTATGCGATGAACTATAAAGGTCAAATCGGCGATCCTATTATGGCTATAGCCATGTTGAGCGAACAACAACATGAATGGGCAGGTACACCTTATGTGCTCGGCGGTGTTTCACGCCGTGGGGTAGATTGTTCTGGTTTTGTGCAGAAAACTTTCTTCGATCGTTTTAATCTTCGTTTGCCTAGAAGCACTGTTGAACAAGCTAATTATGGTAAACATGTACGCAAAGAAGATATTCAAACTGGCGATTTAATTTTCTTTAAAACTGGCCGAGGCCCTAATGGTTATCATGTGGGGATTTATGTAAAAGAAGATAAATTCCTTCATGCTTCCACCAGAGGGGGAGTCGTCTATTCTTCAATGAATAACCCTTATTGGTCAAAAGCCTTCTGGCAAGTCAGACGGATTTAGAAAATATAATGCTGGAATTTTCCAGCATTTTTTATAATGATTTTTTTCAAATTTGGGAGATAAAAATGCCCTCAAACTTAACCGCACTTCAAATTCAACTTGAAATTTTACGCCTTATTCCAAAAACTCGTTTTATTACCGCAGAAGAAATCTTACAAAAACTTGCTGATATTGGCGTTCAACGTGATATTCGTTCAATCCAACGCCAGCTAGAAAGTTTGTCTCAACAGTTTGAAATTGAGCGAGATATGCGTGATAAACCTTATGGATATCGATGGAAATCAAATGCTAAAGGCTTGGATTTACCGATTTTAAATGAACAGCAATCACTTGTGCTTATGCTTGCTAAACAATATCTCAATGGCATTTTGCCTTCTAGCATTATGAACTCAATGGAGGCGTTCTTTCAACAGGCCGAATATAATTTGGTTTATGACAGCCATAAAAAATCAGGGGCAGAATGGCTTAATAAAGTTGCTATTGCCCCAACTAGTCAGCCGTTATTACCTGCCAAAATCAATCCAGAAATTTTTTCTCAAATTAGTACCGCACTTTATCAAAATCGATTTTTGCAGGTGCATTATCGGAGTATTCACGGTAAAGAACATAAGGCACAGGTCAAGCCATTGGCTTTGGTTCAACAAGGACCAAGTAGCTATTTAGTCGCACAATATGAGAATGGCGATATTTTACACCTTGCTTTGCATCGCTTGCTTAAGGTAACAGTGAGTACAATGATATTTGAACGCCCTGATTTTAATTTGAAATCTTATGTAGAAAGCCAAAAGTTTGGTTTTACCTATGGTCGAAAAATTCGATTAACTTTCCGCATTAATAAAGATATTGGTGGCTTTTTAACAGAAACACCATTATCAATGGATCAAACAGTAAAAGATTGTGGCACTGAATATGAAATTTCCGCTACCGTGATTAAGAGTGCTATGCTGGAATGGTGGATAGCCCATTTTGGTGAAGATTACCAAGAAATTGACCGCACTTATTTAGACGAAAATGCCTAACGACATAAATTGTCGCTTCATCTTTTATCATTAAGCCATCAACAGAGAGGACATTAAAATGAAGAAAATTGTTTATATTGATATGGATAATGTGATGGTTGATTTTCCGTCTGGTATTGCAAAATTAGATGAGAAAACCAAGCAAGAGTACGAAGGTCGATATGATGAAGTAGAGGGTATTTTTAGCTTAATGGAGCCAATGCCTAATGCGATTTCTGCTGTGCATAAATTGATGAAAAAATATCATATTTATGTGCTTTCTACTGCGCCTTGGCATAATCCATCCGTTTGGAGTGATAAAGTAAAATGGATTCAACATTATTTCGGTGAAGAAAAAGGTTCAGCCTTATACAAACGATTGATTTTATCCCATCATAAAAATCTCAACCAAGGCAATTATTTAATTGATGATCGCACTAAAAATGGAGCTGGTAAATTTCAAGGTGAACATGTTCATTTTGGTACAGAACAGTTTGCTAATAAAAGGAGCCTGAAAAATGACAGAGAAAAATAAACCAATTTGCGTGGTATTAACGGGAGCTGGAATTAGTGCCGAAAGTGGTATTCCTACTTTTAGAGCTGAAGATGGATTGTGGGCAGGGCATAAAGTAGAAGAAGTTTGCACGCCCGAAGCCTTGCAAAAGAACCGTGCGAAAGTGCTTGATTTCTATAACCAACGCCGTAAAAATGCGGCAGCAGCTAAGCCAAACGCTGCGCATCTCGCCTTAGTTGAACTAGAAAAAGCCTATGATGTAAGAATCATCACGCAAAATGTGGATGATTTACATGAACGTGCCGGTAGCTCGAAGGTGTTGCATTTACACGGTGAATTAAATAAAGCTCGCAGTAGCTTTGATGAAAGTTATATTGTGGATTGTTTTGGTGATCAGAAATTAGAAGATAAAGATCCAAATGGACACCCAATGCGCCCTTACATCGTCTTTTTTGGTGAAATGGTGCCGATGTTAGAACGAGCGGTTGATATTGTGGAACAAGCAGATGTTGTGTTAGTGATTGGTACTTCATTACAAGTTTATCCAGCCAACGGCTTAGTCAATGAAGCTCCAAGAAAAGCGCCAATTTATCTGATTGATCCTAACCCAAATACAGGCTTTGTTCGTAAGCAAGTTATTGCAATAAAAGAAAAAGCAGGCGAGGGTGTGCCGAAAGTGGTGGCAGAGTTATTAGAGAACACCAAAAACTCATAGAAAAATGACCGCACTTTTCACATAAATAGCGAGTTTTATATCACTATACTGTATGACTGATGAATTAACGAGAAACGTATGCATCCAGTAATTGAATTTTATTTAGAACAAAGAAAAAGCCAACATAATTTATCTTTGCAAGATATGCGGGCAATGCCAAAAAGAATGATTGGCGATGCTTATTTTTATATTCCTTGGCTTTTACCTGTTACTGAAAGTTCCAAATGGAATCGTTCAGTACCGGTTTTTAACGAAGAAGACCTGGCTATTTTTATTGGAGATGAAGCAATTCAAAATAAATATTTACATTCTATTGATATTATTCTGGATTACTTCTGTTTATATCGTGAAGATAATAAAATATTCCCTAAACCTGAATTAACTGAACGTAAAGTTTGGCTACGCAATATTGGGCATGAAAGTAAGAAGATTTCCCGCATCATTCGTAGTTTAAATTATTGCGGTCATACTGAGTTGGCTAAAAGTTTACAGCAACTGGCAATAAAATTAGGTCAAGAAAAAGGCGTAATTCAAGAAGAAACCATAGGGATTTGGACAAATCTACTTAAATAATGAGGATAAAATAATGGTAACAGAAGAGTTTAAAAAAGTGGCAGTATCCTTCGCTGGAGGAGATGGCGGAAATCCTAACTCAGATGTTTGGTTTTGTGGGTTAGAATGGGGGATTGGTGATGAAGCTTCTCCTGATGATTTTTATAAGAAATTTAGTTTAAGCCCTAAATTAATACCGCACTCTTGGTTAGAGGACGATTTTGATGGTAGTTGGACTACGCAATATAATCAAAAATTATGTTGGTTTTTGTGGTACTACTATAATTTAGATTGGAAAAGTGGTGAAAGCTATGAGTATTTTGTTAGTACTTATAATGTGCTTTATCCACAGGGTATTGGTTTTAAACTAAATATGCTACCAATCAATTTCAAAAATAGAGCATCAATTCAATGGAATGAACAATTCATTAAGATGACAGGATTTGAAACATTCGATCAATATAGAGAATGGTGTGTTGAAAATCGTGGTGCTTTTTATCGTCAACTTATAGATGAATGTAATCCTAAAGTTATTATTTGTACGGGAGTCACTGAAAAAGATAACTTCTTTAAGTTTTTTACTGGAGAAGCCGTATATGAAACTAAAGCGTTGAAAGAATTTAATATCTTCTATCGCAAGTACAATGATACTTTAATTTGTGTTTGTCCGTTTTTTGGTGGTCCAAGTGGCATTAATTCTTACGACAAAATGGAAGCATTAGTAGAGTCAGTAAAAGAATTATGTAAATAAATTTTTTATTAAGTTTAACATTGATAGATAAATAGCGACTTCGGTCGCTATTTATCATTACTTCTCTTGTTTTTGCTTAAGCATGTGCATAATAAGCCTAATAAGCGTTTCTTTTTGTTTCGGATCAGATTCAGCAACTAATAAAGTGAGTGCTGCAAGCCCAGTATCATTGATAACTGGATGCCCATTATGATCAAACAAACGCCCATTTCTATGTAAGAAATCTACAAATAAAAATGCGCCACTACGTTTATTACCATCTGAAAAAGGATGATTCTTGACGACAAAATAAAGTAAATGTGCCGCTTTTGCTTCAATGCTTGGATAAGCAGGTTCACCAAATACACTTTGATCTAAATTGCCTAGCATCGCAGATAAGCCGTTATCTCGTTCACGTCCAAATAGATCACTTGCTTCACCTTTTGCCATCAGCTGTGATTTTAACTCTGCTAGTGCAGAACAGGTTTCTGCATAAGTCGGTAATGTACCGCCTTGCTGTGTTTGTGGTTCGGCAAGTAAACCTTCATCATATTGTTGTAGCCATAAAAACGTATGCGTATAACGGCTGACAATATCCACTAATCCGCGACCGCTTTCTAGCGTTAATTCTGATGAATTTGCCGTTTTTTGAATAAGCGCAAGTGCTTGTTCTAATTCGTGACCATTTTGCTGTAAACGTTTTTGGTTAATAGTATAGCCTTGAGTCAGATATTCTTTTAAACGTGCAGTTGCCCAAATTCTAAAATTTGTTGCAGACTTAGACTTCACTCGATAGCCTACAGAAATAATAGCATCCAGATTATAATGTTTAACCTTACGAGTAACTTGCCTTTTTCCTTCTTGTCGAACTACCGAGAAATCCTCGGTAGTTAAATTTTCATCAAGTTCTTCTTCATTAAAAATATTTTTTAAGTGTAGGCCTATGTTATCTGAGCTAGTATCAAAAATATTTGCCATTTGTGCCTGGGAAAGCCAAACGGTGCCATTTTCAAATCTCACTTCCACTTGCGTTGTGCCATCTTGAGCTTGGTAAATTTCAATCGGGTTTTGGTTATTCATATTATTTTCCTTAATAACTTACATGTATATATAACCAGATAAATATGCATATTGCAATACAGATCATCTTATTTGCAAAAAATCTTCTAAAAATAACCGCTTTCAATATTCGCAAACGACACAAGTTGTCGCTTCCTTTCATATAATTTTTCCATAAAGGGAGATTTTTTACTTCTTACATATCTATCAAGCCTTTAATTAATAAAAAGGAGCAAATAATGGCAATGAAAGTAATTATGGCAAGAGATCCACTTTTTGAGGATGTAAAAAAATATGTGCAACAACAAAAAGTTGCATCTTGCTCAATGATTCAACGCAGATTTATGTTGGGTTTTAATCGAGCTGGGCAAATTTTAGAACAGTTGGAACAAGCGGGTATTATTTCATCAATGAAAAATGGACAGAGAAAAGTATTATGAAAAATGATTTGAATTATGCTGTGGAACTTATCCGCAAAGCGGATGGCATTTTAATTACAGCTGGTGCGGGTATGAGCGTGGATTCTGGGCTGCCCGATTTTCGCAGCGTTGGCGGATTTTGGAATGCTTATCCTATGTTTAAAGAACATAATATATCTTTTGAAGACATCGCGACGCCATTAGCTTATAAGCATAATCAGGAACTTGCCTATTGGTTTTATGGACATCGATTAATTCAATACCGAAATACTATTCCTCACGAAGGGTATCAGATTTTAAAACGCTGGGCGGGAGATAAATCTCATGGATATTTCGTTTTTACCAGTAATGTGGATGGGCATTTTCAAAAGGCTGGTTTTGATGATAGCCATGTTTATGAAGTACACGGTACTTTGGAGCGTCTTCAATGTGTCAATAATTGTCGAGGATTAAGTTGGTCTGCATCAAGTTTTCAACCTGTCGTGGATAATAAAAATTTATGTTTAACCAGTGAAAAACCACATTGTCCTTATTGTGGTGGCTTTGCTCGTCAAAATGTACTAATGTTTAATGATTGGAGTTATGTAAGTCAATATCAGGATTTTAAAAAAGTGCGGTTAGAATCGTGGTTAAAAGAAGTGCAAAATCTTATCGTCATCGAACTGGGAGCGGGGAAAGTTATTCCTACTGTGCGTTGCTTTTCTGAACGTACGGCGAAAGCAAAAAAGGGTGGATTTATCCGTATTAACCCACAAGATGCTGGTGTGCCGAAAATGCACTTTTTAAGTCTAGAAATGAAAGCGTTAGATGCGCTAAAAGCGATTGATCGCCTTCTAAATCCTTCTCAACAAGCGGTTGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020007|1493761:1500440|1498177_1499179_-|WP_005688186.1|DBSCAN-SWA MNNQNPIEIYQAQDGTTQVEVRFENGTVWLSQAQMANIFDTSSDNIGLHLKNIFNEEELDENLTTEDFSVVRQEGKRQVTRKVKHYNLDAIISVGYRVKSKSATNFRIWATARLKEYLTQGYTINQKRLQQNGHELEQALALIQKTANSSELTLESGRGLVDIVSRYTHTFLWLQQYDEGLLAEPQTQQGGTLPTYAETCSALAELKSQLMAKGEASDLFGRERDNGLSAMLGNLDQSVFGEPAYPSIEAKAAHLLYFVVKNHPFSDGNKRSGAFLFVDFLHRNGRLFDHNGHPVINDTGLAALTLLVAESDPKQKETLIRLIMHMLKQKQEK >NZ_CP020007|1493761:1500440|1496106_1496817_+|WP_005671438.1|DBSCAN-SWA MTEKNKPICVVLTGAGISAESGIPTFRAEDGLWAGHKVEEVCTPEALQKNRAKVLDFYNQRRKNAAAAKPNAAHLALVELEKAYDVRIITQNVDDLHERAGSSKVLHLHGELNKARSSFDESYIVDCFGDQKLEDKDPNGHPMRPYIVFFGEMVPMLERAVDIVEQADVVLVIGTSLQVYPANGLVNEAPRKAPIYLIDPNPNTGFVRKQVIAIKEKAGEGVPKVVAELLENTKNS >NZ_CP020007|1493761:1500440|1493761_1494052_+|WP_005688173.1|DBSCAN-SWA MATITKLDIIEYLSDKYHLSKQDTKNVVENFLEEIRLSLESGQDVKLSGFGNFELRDKSSRPGRNPKTGDVVAVSARRVVTFKPGQKLRARVEKTK >NZ_CP020007|1493761:1500440|1497403_1498120_+|WP_005688183.1|DBSCAN-SWA MVTEEFKKVAVSFAGGDGGNPNSDVWFCGLEWGIGDEASPDDFYKKFSLSPKLIPHSWLEDDFDGSWTTQYNQKLCWFLWYYYNLDWKSGESYEYFVSTYNVLYPQGIGFKLNMLPINFKNRASIQWNEQFIKMTGFETFDQYREWCVENRGAFYRQLIDECNPKVIICTGVTEKDNFFKFFTGEAVYETKALKEFNIFYRKYNDTLICVCPFFGGPSGINSYDKMEALVESVKELCK >NZ_CP020007|1493761:1500440|1499594_1500440_+|WP_005688189.1|DBSCAN-SWA MKNDLNYAVELIRKADGILITAGAGMSVDSGLPDFRSVGGFWNAYPMFKEHNISFEDIATPLAYKHNQELAYWFYGHRLIQYRNTIPHEGYQILKRWAGDKSHGYFVFTSNVDGHFQKAGFDDSHVYEVHGTLERLQCVNNCRGLSWSASSFQPVVDNKNLCLTSEKPHCPYCGGFARQNVLMFNDWSYVSQYQDFKKVRLESWLKEVQNLIVIELGAGKVIPTVRCFSERTAKAKKGGFIRINPQDAGVPKMHFLSLEMKALDALKAIDRLLNPSQQAVE >NZ_CP020007|1493761:1500440|1499397_1499598_+|WP_005688188.1|DBSCAN-SWA MAMKVIMARDPLFEDVKKYVQQQKVASCSMIQRRFMLGFNRAGQILEQLEQAGIISSMKNGQRKVL >NZ_CP020007|1493761:1500440|1494655_1495609_+|WP_012054395.1|DBSCAN-SWA MPSNLTALQIQLEILRLIPKTRFITAEEILQKLADIGVQRDIRSIQRQLESLSQQFEIERDMRDKPYGYRWKSNAKGLDLPILNEQQSLVLMLAKQYLNGILPSSIMNSMEAFFQQAEYNLVYDSHKKSGAEWLNKVAIAPTSQPLLPAKINPEIFSQISTALYQNRFLQVHYRSIHGKEHKAQVKPLALVQQGPSSYLVAQYENGDILHLALHRLLKVTVSTMIFERPDFNLKSYVESQKFGFTYGRKIRLTFRINKDIGGFLTETPLSMDQTVKDCGTEYEISATVIKSAMLEWWIAHFGEDYQEIDRTYLDENA >NZ_CP020007|1493761:1500440|1496895_1497390_+|WP_005688182.1|DBSCAN-SWA MHPVIEFYLEQRKSQHNLSLQDMRAMPKRMIGDAYFYIPWLLPVTESSKWNRSVPVFNEEDLAIFIGDEAIQNKYLHSIDIILDYFCLYREDNKIFPKPELTERKVWLRNIGHESKKISRIIRSLNYCGHTELAKSLQQLAIKLGQEKGVIQEETIGIWTNLLK >NZ_CP020007|1493761:1500440|1494104_1494590_+|WP_005688175.1|DBSCAN-SWA MKVYKLFLIATASLFLFACSSFQNDDYAMNYKGQIGDPIMAIAMLSEQQHEWAGTPYVLGGVSRRGVDCSGFVQKTFFDRFNLRLPRSTVEQANYGKHVRKEDIQTGDLIFFKTGRGPNGYHVGIYVKEDKFLHASTRGGVVYSSMNNPYWSKAFWQVRRI >NZ_CP020007|1493761:1500440|1495667_1496123_+|WP_005688179.1|DBSCAN-SWA MKKIVYIDMDNVMVDFPSGIAKLDEKTKQEYEGRYDEVEGIFSLMEPMPNAISAVHKLMKKYHIYVLSTAPWHNPSVWSDKVKWIQHYFGEEKGSALYKRLILSHHKNLNQGNYLIDDRTKNGAGKFQGEHVHFGTEQFANKRSLKNDREK |
10 | Sodalis_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1560577 : 1566771
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020007|1560577:1566771|DBSCAN-SWA TATGGCTAATTTAATTCTTACCTATGATTTAAGAAATCAACGTGATTACAAATCATTAATTGAGGCAATTAAATCCTACGGAACTTATGCGAAGCTATTTGAATCGGTCTGGTATATTCGTTCAAGAACACATACGGCCGAGCAATGTCGGGATTATTTACTTCAATTTATAGATAATGATGATCGTCTTGGCGTATTTGATTGCTCAAATAATGACTTTGCAACTATGAGAGCGTTAAATAAAGTTAGCAACCTATGGTCTAACTAACACGTAAACTTCACCAGTTTTATTATCAATTAGCTCTTCTTTTGTTTGGGCGTCACTAAATCGATTTATATAAGAAATTGCTTGGCATGCTCGCTCCTCTAAGCCAGGATGATAAGCACCGTTTTCAATCGCTTTCAAAATACAAGCGCGAATATGTTCTTTTTGAATTTCAGTTATGGTGTTGCTGGTAACACTGCCAGCCTCTGAATAGCGTTTTTCTTCCATTTTTAACCTCGTTTGTTTTATGTTTGCCATTTCAAAACACACTTCATCTATCATTCGCAACGGTTTCACATGCCGTTGTGTCTCTGTACTAGCAAATGTGTTTTGAAATATCCACATTGGGATATTCGCCTGCTTGAGCTCCACTTTCGGCAACTGCACCGTTTTTCACTGGCTTTGCATGGGCAGACTTTAAAACTCACTCTTAACTAAGTAGGTTAGGGCTTTCAATCTAACGACCGCTTAGCACCGTTGGGCTTCCGTCTGCGCTTCCGCCGAGTGAGTTTCTTTAACCAAATTGTTTAAAATTTGTGATGAAAGTCACTGACTTACATAAACTTTTTAGCTATTCTTGTAATCAACCTTGATACTTTCGATAGCGGATTTTCAGGAATGTAAACTGAAAGGTGAATCTCGCCGTCAACAGTACCTTGGGACATTGCTTTTAGCTTTTCTTCCGCTTCTTCGAATGAATGGGCGTAAACATCTGTCGCCCACCTTTTGCCGTCGAAGTGATAAGAAATTGCATAGCGTTTCATTTCTTCTTGCATAAGGAACTACCTCTATGTATTTTCAGATATTTCAGGGTGTAAACAATCAGTGGTATTGGCGACTAAAAGCCGCCAATCATGAAACCATTGCAGTTAGCGAGGGTTATACAACCAAACAAAACTGCCTACATTGCATTGGTCTAGTTATGGATACTGATAGAAAGACACCTATTTATGAATCTTAATAACTAAGCCCTGTTCGCAGGGCTTTTTTCATCACAAATTTTTAAATAGCATTGAGATTGTGTATCTCGTTTTGATGGGGCTATTATCACATTTTGAAATAACATAATCAATACAAATTGTTATTTGTCTATCTAAAAAAATTTCATTATGTGATTATATTGTTGATTTCTAAAGAAATAAATTTTTGAAAATGGCGTTTAATTGCTTGTTTTTTAATCAATAGATGAGCAAGAATAGAAAAGTGCGGTTGATTTTTGAGGTGCTTTTGTGAGTGTAAGCAAGTTTTAGTTGTAATTAAGCAAGTATGATGAGGGTGGATTTTTAGAGGGTTGCAGTAAATTGAGATGGAGATAAGCAAGATTTGGCGAATTTAAGCAAGGGTAGATTTGAGTAATAAAAAACCGCCAGAAGAGGCAGTTTATTGTGGTTGATATGTCTTAGACATAAATGTCGGAGACATCGAAGCAAGTAGCGTCAGTGCATAGTTTTAGTTAGTTTTTCTTCTTGTATTATTCTTTTTGCAATATCTAAATTGAGCTTTTGTATGGCTTGAAAATTAATAATATAGTAAATAATGGCAATTATCGACATAACAAGTGTAAATGTTTTAACGTCTAAAATAATAGTAATATCAATAAAGTCAAAACCTATCGCAATCCGATAGCTTAAATCAAAAATAGTTTGCGCTATAAACAGAATGGTAGATAAAGCAAAATAGAACAAAAATGAACTTCTTACTTTAAATATATTATTTTCAATGATGGAATATATATTCTCATTCTTTATCCCACTTGGATTGAAGGTGCAAATAACCCCCATACCAATGGAAAACATAATTCCAGATATGGTATAAATCGTATTAACTAAGTTTCCCATCTTTTCATCATTATATTCAGGAAAAAATAATGATGATATGGAGATAGTTAATAGAATGCCGATTGTTAGCATTGCCATTTTATTTTTGTTCGTTTTCAAGGTCTTTTATAAATATTTCCATTTGTTGTAATAATGTTTGTTCGTTGAGCTTACCGGTTTCGGTAGTATCAACTTCAACCATCTTAGACTTTTCTAATTGACTACCGGTGACGGATGCCCCGCGTCTAGTCTTAAATGAAATATTATCTAAGTCAGACACTGGTTTCAAGACTGCACTAAATGCTTTTTTAACTTCTTCTGGTGATTTTTTTGTTGGATTTTTTAGTTGAATAAGTAGTTTTGCCGACACAATCTGACTTAAATCAACATCTTGCAAATCAGTTGCATCTTTGAACAAAGCTTTCACTTGATCAAAAGCCAAATCTTTAAGGCGAGAGAGTATCGTTGAGTTATCCGACTGCGTTTCGTCTATGTGGCTTTTATTTTTTATTTGCGGATCTTGAATAACAAATGATTTAATACTTGCCAAGTCATACTCTTCTTTGATTTCTATGACGGGAGATAAATCAATCAATTCTTTTAACAGCCAATTTAAATAAGTTTGCAGCCTTGTTATGGTTGTTCTGCTGTACAAATTTGTTACGAGGAAATTATTTGAAAGAGCAAAATAATAATGATCTTTATAAATGGCACTGGTATTCAATTTTGCATTAAGTAGGTCACTAATGGAGAAGTTGGCTTTATTAAATAAGGCTTCATCAATATGTTGAACATTATCCCCTGGCGCAATACGAAGCATTGTCGCAAAAATAAAATTTTCTTTTTCGATATTAAAATGTGAAATTAAATCTTCTTCTTTCTTTGGATCATCTTCACTTAAACGCATTCTTCGCTCATTGCTTGATTTTGAATTAGCCAAAACTTCTTTTAGCAAGTCTGAGACTGTAACTGTGCCACTAAATTTATCTTGAGAAATACTAAAAGCGCGCAATTTAACTTGTTTATTCATTTCTTACCTCTAATATCATTGAAAATATATTTACTTACAACCAGTTAAGCCCACATTACACGCCGCACTATAACGTTTCTACACGCTCTCTTGCCACACCAATAATGCGGATCTCTTGGTTGAGTGAGCTTAATGTTGGGAACATTGGATTAAGCGGAACAAGCTCAAAGTGCGGTATGCCTTCTGGTGTTTTCGTGCCAAGCTCTCTGTATTGTTTAAATGTTGCCTCGTTGTCGCCATTAATTGCTGCCACGAATTTTCCTGGCGTTGGCACAATATCAGGATCGATTAAAACCAGATCGCCCTCGTTGAATCGGGGGAGCATAGATTTCCCTTCAATTCGTAGATAAAAGGAATTTTCAGAGGCGATGGCAGTGCTTGGGATCATCTCGTAACCGTCAAATCCTTCGAGCGATCTAATATCAGTCCATAGTCCTGCTTGGATTGGGCTTAATAATGGATAACGACAAATTGACTCTTTGATCTCGCTTATGTTTGAATCGAAGGCTAAAACCTCAGGCAGGATATTAAGTGCTTTACTTATGATAGATATATCTTCGAGGTCAGGCGTTCTATTGCCTTTTTCATAATTAGCAATTCTCGGTTGTCCCCAACGCGCATTCTCACTTTTGGTATCAATATTATTGCATCTCTCAGCTAATTCTTTTTGACTGATTTTTAACTGTTCTCGATACGCTTTTATTCTTTCGCCAAGTGTAGCCATTTAATTTCTCCTTCTTTTAGTTCAAATAATAACACGTTACGTTATATTTAGATAATTTCAATTTGTGATTGATAGAAATTGCATTATGTGATTAAATAGATTATAGAAAATCACAAAAGGAAATTTATCAATGAATAACCTTTCACAGATTCGAGGACAGCTTGGGATTACTCAGCGACAACTAGCCAACCATATCGGATGGAGCCAACCACGAATTGCTAATTATGAGACTGGATTACGTTCTCCATCGTTAAGTGTTGCTCAGAAGATTGTTCAAACTCTGAACTCACTTGGAGCAAAAGTTTGTATCGAGGATGTATTTCCGCCTCAAAGCTAATTTACCAACAGGAATACGCAATGGCACGCAATAAATTAACGCGATCTGCAAGAGTGCTTTCGGATCAGGTTATCGACAAATATTACAAGCAAAAGCAATACGAGGTGGCAGAAGGTATGGAAACCACGCCTAGCACACTGAGTCGTTTTATTAGTAATGAAGAGTTTACTCAGACATTTAACTTTATCGCCGCTTGTCAATTCGGTGTTTTTGATACGGATACGCACATTGCGGTTGAGAAAAGTGAATTTGAAATGTTACTCCTTGCGTCACAAGGCTTTGATAAGCGGTTACGTGAGAAGTATTTGGGTGAATAAAAAAGCCACGAGGAGATTTCGTGGCTAATTCATTAAGGAATATACAGATGAATCAATTATTAACGATGACGAAAGAAAACGCAAGTATTTTGACAATGAGCAATCGGGAAATTGCGGAGATTACACATAAAGAACACAAAAATGTATTACGTGTTATTCGTGATTTGATTGAACAAAATTTAGTCGCTCAAATTGAGCCACTAAAATTTGAGTATAGAAATCAATGGTTTGATTACTATGAGTTAAACAAGCGAGATACGTTTGTTGTCGATCGCTGTCAAGCGTTGGAAAATCGACAAAAACCAACCGCACTTATTCCGCAATCTTTTTCTGAGGCGTTGATGTTAGCCGCTCAGTTGCAAGCAGAAAAAGAGCGCAATGCACCTAAAGTCGCTTTTGTTGATCACTATGTGGAAGTGGGGACGAGTAAATCATTTCGTGAGACGGCGAAGATTTTGAAAATACCTGAGCGTGCATTGGTCAATCGCTTGGTGGAAGATAAATATTTGTATCGTCAATCGGGCGTGCTTTTGCCTTATCAATCGGCTCACACCAAAGATCTTTTTACGGTTAAAACAGGCACCGCTGAACACGGTCACAATTACACTCAGACGCGTATAACAAGCAAAGGCATTGAATTGAGCGTGCTAAGGGCGTAAGATTCCTAAAAGGTTCATTTACTGGGGCGAAGATTAAGTTCATGTTTTTAGGGTAGGGAAGTGCGGTCTATTTTGACCGCATTTTTCTTACATCCATTCTTGATTTGTGTGTATTTGTGTATTATAATTCATTTTGATTAAGACAAAGGAGGATGCATGCACTCAGGTGACTTAATCAAGGAACTTAAAGCAAATGGTTGTTATTTTGTTAGGCATGGAAAAGGTGATCATCAAATTTGGTTCTCGCCGAAAACTGGAAAACGATTTCCAGTTCCGCACCCAAAACAAGATTTAGCAATCGGAACTTTAAAATCCATTAAAAAATCGGCAGGGCTTTAAGCTCTGCCGAGCTTAGTAGGAGGAGTATTAAATGATTTTTACCGTAGGTGTTGAGACCCCAGAAAATGAAAACCAAGCATACGGAATGATTGTCCCTGCACTTTGCCAATTAGATTATGGTTGTTTTAGCGGTGCTGATGATGTCGATGATTTATTACCAATGGTAACAGAAGCCATTACAATGATGCTTGAAGCGATGGTTGAAGATGGTTTTGATCTTACCACGCTAAAGGATAAAGGCGTAACACACTATAAAGCCGATCCTGAATATGCTGATTTTGATACTTGGCTTTTAGTTGATGTCGATATTTCAGAATACTTAGGTAAGAAACAGCGTATTAATGTATCTTTACCTGAATATTTATTAACGCGCATTGATCGCCGTGTTGCAGCAATGGGTAACTACTATAAAGATCGTAGCCATTTCTTAGCAAATGCGGCGCACCGCGAATTGCATGCGCATTCAGATAAAGAAATGTAATCTCTGACTACCCTTGACAATCTCCTATTTCAAGGGTAGTTCTTTATTTATAGTTTTTCTCCATCGCTAAAATCCCTTCCGTTACAATCGCCGTTTTAGATTTGCCTGTTTTCTCGGAAAGTTCAGCAAGCAATTTGATAATATCTTCGTGTAGTTTGTAAGATTGTAGGCGTACACCACGTTTTTTATCGCTTTTGGCGTTAATTTCTGCGCGAGTCATTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020007|1560577:1566771|1562758_1563688_-|WP_005687162.1|DBSCAN-SWA MNKQVKLRAFSISQDKFSGTVTVSDLLKEVLANSKSSNERRMRLSEDDPKKEEDLISHFNIEKENFIFATMLRIAPGDNVQHIDEALFNKANFSISDLLNAKLNTSAIYKDHYYFALSNNFLVTNLYSRTTITRLQTYLNWLLKELIDLSPVIEIKEEYDLASIKSFVIQDPQIKNKSHIDETQSDNSTILSRLKDLAFDQVKALFKDATDLQDVDLSQIVSAKLLIQLKNPTKKSPEEVKKAFSAVLKPVSDLDNISFKTRRGASVTGSQLEKSKMVEVDTTETGKLNEQTLLQQMEIFIKDLENEQK >NZ_CP020007|1560577:1566771|1565881_1566064_+|WP_005653907.1|DBSCAN-SWA MHSGDLIKELKANGCYFVRHGKGDHQIWFSPKTGKRFPVPHPKQDLAIGTLKSIKKSAGL >NZ_CP020007|1560577:1566771|1560829_1561228_-|WP_080281386.1|DBSCAN-SWA MQLPKVELKQANIPMWIFQNTFASTETQRHVKPLRMIDEVCFEMANIKQTRLKMEEKRYSEAGSVTSNTITEIQKEHIRACILKAIENGAYHPGLEERACQAISYINRFSDAQTKEELIDNKTGEVYVLVRP >NZ_CP020007|1560577:1566771|1564542_1564749_+|WP_005687166.1|DBSCAN-SWA MNNLSQIRGQLGITQRQLANHIGWSQPRIANYETGLRSPSLSVAQKIVQTLNSLGAKVCIEDVFPPQS >NZ_CP020007|1560577:1566771|1562277_1562757_-|WP_005687161.1|DBSCAN-SWA MAMLTIGILLTISISSLFFPEYNDEKMGNLVNTIYTISGIMFSIGMGVICTFNPSGIKNENIYSIIENNIFKVRSSFLFYFALSTILFIAQTIFDLSYRIAIGFDFIDITIILDVKTFTLVMSIIAIIYYIINFQAIQKLNLDIAKRIIQEEKLTKTMH >NZ_CP020007|1560577:1566771|1566095_1566545_+|WP_005653910.1|DBSCAN-SWA MIFTVGVETPENENQAYGMIVPALCQLDYGCFSGADDVDDLLPMVTEAITMMLEAMVEDGFDLTTLKDKGVTHYKADPEYADFDTWLLVDVDISEYLGKKQRINVSLPEYLLTRIDRRVAAMGNYYKDRSHFLANAAHRELHAHSDKEM >NZ_CP020007|1560577:1566771|1564769_1565066_+|WP_005687168.1|DBSCAN-SWA MARNKLTRSARVLSDQVIDKYYKQKQYEVAEGMETTPSTLSRFISNEEFTQTFNFIAACQFGVFDTDTHIAVEKSEFEMLLLASQGFDKRLREKYLGE >NZ_CP020007|1560577:1566771|1563755_1564412_-|WP_005687164.1|DBSCAN-SWA MATLGERIKAYREQLKISQKELAERCNNIDTKSENARWGQPRIANYEKGNRTPDLEDISIISKALNILPEVLAFDSNISEIKESICRYPLLSPIQAGLWTDIRSLEGFDGYEMIPSTAIASENSFYLRIEGKSMLPRFNEGDLVLIDPDIVPTPGKFVAAINGDNEATFKQYRELGTKTPEGIPHFELVPLNPMFPTLSSLNQEIRIIGVARERVETL >NZ_CP020007|1560577:1566771|1561395_1561617_-|WP_005650500.1|DBSCAN-SWA MQEEMKRYAISYHFDGKRWATDVYAHSFEEAEEKLKAMSQGTVDGEIHLSVYIPENPLSKVSRLITRIAKKFM >NZ_CP020007|1560577:1566771|1561631_1561802_+|WP_005650502.1|DBSCAN-SWA MYFQIFQGVNNQWYWRLKAANHETIAVSEGYTTKQNCLHCIGLVMDTDRKTPIYES >NZ_CP020007|1560577:1566771|1566588_1566771_-|WP_005687174.1|DBSCAN-SWA MAMTRAEINAKSDKKRGVRLQSYKLHEDIIKLLAELSEKTGKSKTAIVTEGILAMEKNYK >NZ_CP020007|1560577:1566771|1565113_1565725_+|WP_005687170.1|DBSCAN-SWA MNQLLTMTKENASILTMSNREIAEITHKEHKNVLRVIRDLIEQNLVAQIEPLKFEYRNQWFDYYELNKRDTFVVDRCQALENRQKPTALIPQSFSEALMLAAQLQAEKERNAPKVAFVDHYVEVGTSKSFRETAKILKIPERALVNRLVEDKYLYRQSGVLLPYQSAHTKDLFTVKTGTAEHGHNYTQTRITSKGIELSVLRA >NZ_CP020007|1560577:1566771|1560577_1560844_+|WP_005687157.1|DBSCAN-SWA MANLILTYDLRNQRDYKSLIEAIKSYGTYAKLFESVWYIRSRTHTAEQCRDYLLQFIDNDDRLGVFDCSNNDFATMRALNKVSNLWSN |
13 | Mannheimia_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1575169 : 1587164
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020007|1575169:1587164|DBSCAN-SWA AATGACACAAAAATTCGAAATGGCAGACCGTTTTAATCCGTCTGCGGTAGAACAAGCCCTTTATCAACATTGGGAAGAGAGCGGTTATTTTAAACCGTCTGAAAATGAAAATGCGCCGAGCTATTGCATTGCAATTCCGCCGCCGAACGTAACAGGTTCTTTACATATGGGACACGCATTCCAACAAACCTTAATGGATACCTTAATCCGTTTTAACCGTATGGAAGGGCATAACACCTTATGGCAAGCGGGGACAGACCACGCAGGTATTGCAACCCAAATGGTGGTGGAACGTAAAATTGCGGCTGAAGAAGGCAAAACTCGCCACGATTATGGTCGTGAAGCGTTCATCAACAAAATTTGGGATTGGAAAGCTTATTCAGGTGGCACAATCAGCCAACAAATGCGCCGTTTAGGGAACTCAATCGACTGGGAACGTGAGCGTTTCACCATGGACGATGGTTTATCGAATGCAGTAAAAGAAGTGTTTGTTCGTTTGCACGAAGAAGGTTTGATTTACCGTGGCAAACGCTTAGTAAACTGGGATCCAAAACTTCACACCGCAATTTCTGATTTAGAAGTAGAAAACAAAGAGAGCAAAGGCTCCCTTTGGCATTTCCGTTATCCGTTAGCAAACGGTGCAAAAACGGCAGATGGTAAAGATTATTTAGTGGTGGCAACCACCCGTCCAGAAACCATGTTGGGCGATACGGCTGTTGCAGTGCATCCTGAAGATGAGCGTTATCAATCTTTAATTGGTAAAACTGTTGTTCTACCACTGGCTAATCGTGAAATTCCGATTATTGCCGATGAATATGTGGATCGTGAATTCGGTACAGGTGTCGTGAAAATCACCCCAGCACACGATTTCAACGACTACGAAGTGGGTAAACGTCATAACTTACCAATGGTAAATGTATTGACGCTGAACGCAAATATTCGTGATGAAGCGGAAATTATCGGTACTGACGGCAAACCACTTGCTGGCTATGAAGCGACAATTCCTGCGGATTACCGTGGCTTAGAACGTTTTGCTGCGCGTAAGAAAATTGTCGCAGATTTTGAAGCACTGGGTTTATTAGACGAAATTAAACCACACGATTTGAAAGTGCCTTATGGCGACCGTGGCGGTGTGCCAATCGAGCCGATGCTAACCGACCAATGGTATGTGAGCGTGAAGCCGCTTGCTGATGTGGCAATTAAAGCGGTGGAAGATGGCGAAATCCAATTCGTGCCGAAACAATACGAAAACCTTTACTTCTCTTGGATGCGTGATATTCAAGATTGGTGTATTTCTCGCCAACTTTGGTGGGGACACCGTATTCCAGCGTGGTATGACGCGGAAGGCAATGTTTATGTCGCACGTAACGAAGAAGAAGTGCGGTCAAAATATAACTTAGATTCTGCGGTTGAACTCAAACAAGATGAAGACGTATTAGACACGTGGTTCTCATCAGGTTTATGGACGTTCTTTACTTTAGGTTGGCCAGAGCAAACTAAAGAGCTCAAAATGTTCCACCCAACGGATGTGTTAATCACTGGTTTTGACATCATCTTCTTCTGGGTTGCACGTATGATTATGTTTACGATGCACTTCGTAAAAGATGAAAACGGCAAACCCCAAGTACCATTCAAAACGGTGTATGTAACAGGCTTGATCCGTGATGAACAAGGTCAAAAAATGTCGAAATCAAAAGGTAACGTGCTTGATCCAATCGATATGATTGACGGTATCAGCCTTGAAGATTTACTTGAAAAACGCACTGGTAACATGATGCAGCCGCAATTAGCAGAGAAAATTGCAAAAGCGACCCGTAAAGAGTTTGCTGAGGGTATTGCCGCTCACGGCACAGACGCATTGCGTTTCACATTAGCTGCGTTAGCTTCAAACGGTCGTGACATCAACTGGGATATGAAACGTTTAGAAGGTTACCGTAACTTCTGTAATAAATTATGGAATGCAAGCCGTTTCGTCTTAACGAATGACAAATTAGATTTAAGTCAAGGCGAAATTGAATTCTCATTAGCGGATCGTTGGATTCAATCTGAATTCAATCGCACAGTGGAAACTTTCCGTAGCTCATTAAGCCAATATCGTTTCGACCTTTGTGCCAATGCGATTTATGAGTTTACTTGGAACCAATTCTGTGACTGGTATTTAGAATTGACTAAACCAGTATTTGCCAACGGCAACGCAGCACAAATCCGTGCGGCAAGCCAAACCTTGGTTCACGTGTTAGAAAAATTATTACGTTTAGCGCATCCGCTTATTCCATTTATTACCGAAGAAATTTGGCAAAAAGTGAAAGGATTTGTCGGCATTACGGCTGACAGCATTATGCTGCAACCTTTCCCACAAGTGGAAGAGAACGGCTTTGATCTAGAGGCAGAAGCTGAAATTGAGTGGTTAAAAGAAGTGATTGTTGCGGTACGTAATATTCGTGCAGAAAGCAACATCGCACCAAGCAAAGGTTTAGATCTGTTATTCCGTAATTTAAGTGCAGAAAATGCAAAAATTCTCGAAAAACAGACCGCTCTTTTAAAAGCCATGGCGAAATTAGACAACGTTCAAGTGTTAGCCGCAAACGAAACAGCACCACTTGCCGTAGCGAAATTAGTCGGCAATGCTGAATTGCTTGTGCCAATGGCTGGATTTATCAATAAAGAAGCAGAGCTTGCCCGTTTAACTAAAGAGATTGAAAAATATCAAAACGAAGTGAAACGTATCGAAAACAAACTTAGCAATGAAGCTTTCGTGGCTAAAGCACCTGAAGCAGTGATTGCGAAAGAACGTGAAAAACAAGCAGAATACCAATCTGGATTAGAAAAAATCCAAGAGCAGTATAAGGCGATTGAGGCGTTGTAACAAAACATAAAAAGTAGGCATTATGCCTACTTTTTATTTTTGATTTAGTCCTAAAAAATCTCCAACTTCATGTTCGAGTTGGCTCATTGTGATCAGAGCCTCTTGGGTTTTCTTAGCTTCATCTTCATCAATAACACTCATTGCAAAGCCCACACGAACAAGCACCCATTTGCCAAGTAAATCGGCTGGATTTCCCGTGCAGACTAGTGAAATATTTACTTCACGTTGTACGCCACATACATCTACTGTGGCAAGTTGAAGAGAATTTTCATCAATTTTGACAATTTGACCGGAACGCCTAAACACATAATATTTTTACTCCTATTAGTATTTAAGCTGAAATTTAGTGATTTCTATGTTATTAAAATTAATAAATATTATTAAAAACTAACCGCACTTTTTCTTGATCTTTTACGCCCGCAGAACTTTCCACCCCAGAATTAAGATCTAAACCTAAGCAACCTTGCGCAATGGCTTGTTCCACATTATTTGGTGAAATGCCGCCAGCTAAAATAATCTTGTGTTTAAGATTTTCAGGAATTAATGACCAATCAAAAGTTTTCCCCGTGCCACCTTGCTGGTTCGATGTTTGGCTATCAAAAATATAACGATCCACATTCAAATCATCTGTAAAATCGACCGCACTTTGGGCTTCGATATTGACTGAAATCGCTTTCCAGATTTGCGTGTTTTTTGGTAGTTGTTGGCGAAGTGCGGTAATAAATGCCTCAGTTTCTGCACCATGTAATTGCACCGCATAAAGCTGTAATTGGTTGGCTATTTTGACGATAAAGTCAATTTCTTGATTCTGAAAAACACCAACAAATCGAAGTGGAGCAGCGGTTACTAATTCTTGCGCTTGGCGTAAACTCACACAACGTTTTGAATGTTCTACGAAGATTAATCCGCCGTAAAGTGCCCCGTTTTCGTAAACGATTTTGACATCTTGTGCGCGTGTTAAACCGCATACTTTATTTTCTCCAAAAATTACCGAGCGAACCGCATTATTCAAATCTTGGTTGCCCATTAAGCTACTCCCAATTAAGAAACCATGCGCCACCTTTTGTAATTGATGAATTTGCTTGTGATTGTAAATGCCTGATTCGCTAATAATACGTACATCAGCAGGGATTCGGTCGGCGTATTTTTCAGTGAGTTTAACAACACGATTTAAATCCACAGTTAAATCGTGCAAGTTACGATTATTAACACCAATGATTTTCGCACCAAGCGCAAGGGCGCGTTCAAATTCTTCTTCATTGCTGGTTTCTGTCAATACGCCCATGCCAAGAGAATGTGCAAGCTCTGCCAGCACACGATAAGTTTCATCATTTACCACAGAAAGCATTAATAAAATCGCATCCGCTTGATAGTAGCGAGCAAGGTAAACTTGATATTCGCTAATCATAAAATCTTTGCAAAGCACAGGTTGGCTCACGATACCGCGAACTAACGGCAAGAACTCAAAATTGCCTTGGAAGTATTTTTCATCTGTCAGAACAGATACAGCAGAGGCATAATGTTTATAGACATTGGCGATTTCTTCCAAATTAAATTCAGCACGAATTAATCCCTTAGAAGGGGAGGCTTTTTTACATTCCAAAATGTAAGCGGGCTTTTGATGCGTACCTTTTGCTAACGCATCATAAAAAGAGCGGTCAGAGTTTTGAATGTTTTGTTTAAATTGTGAAAGGGGAAATTCCTTTTCTTTTGCTTTAACCCATTGTGCTTTATCAAGCACGATTTTTTGTAGCACCGTAGCGGAATCAATGGGTTTGGTAAAATCTTGAGTGATCATCATTTTTCTTCTTATTGTGGTGTATCAAATTAGCTTTTTATTAATATGTGGTTAATTTCTGTAATGTTTTAAAGGCGTTACCTGATGCAAGATGCGCCAATACATTTTGCACATTTTGTTTTAAATCATCGTAACCGAATAATTTCAATAATAATGCCGTATTTGCAGCCACCGCATTAGCATGTTCAGCCTTTCCTTTGCCTTGTAAAAGTGCGGTCAGATATTGGGTATTTTCTTGTGGTTCACCACCGCGAAGACTTTCGAGGGATTGCGTTTTTAAGCCAAAATCTTCAGGCGTTAAAGTGAAATATTCAATTTTGCCATTTTTAATTTCTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020007|1575169:1587164|1579872_1580874_-|WP_005687194.1|DBSCAN-SWA MQHNQLLEQLYSGHSLSTSESTALFNAVIQGELSNEQIAAMLIALKVREANTEEITGAVAASLQNAKVFPRPDYPFADIVGTGGDGQNTINISTASAIVAASMGAKVAKHGNRSVSSKSGASDVLTALGVNVNVTPEQARQALDEIGVCFLFAQQYHSGFRHVAPVRTALKTHTIFNILGPLINPARPTYHLLGVYAPELVKTYAETAVALEHQHSFVVHGSGLDEVALHGETQVAEIKNGKIEYFTLTPEDFGLKTQSLESLRGGEPQENTQYLTALLQGKGKAEHANAVAANTALLLKLFGYDDLKQNVQNVLAHLASGNAFKTLQKLTTY >NZ_CP020007|1575169:1587164|1581961_1583518_-|WP_005687196.1|DBSCAN-SWA MNIQTQAFIAVTAQSIPYYADTTAIFNTLCQPNSNSLLLDSAEIGSKNSLQSLILVNAAVKITCLGHNVTFKALNKNGKQVLKEIHPKLTALGKISAVNFEDEFSVQFSPLDNQLDEDNKLQSATIFDGLRVVSTLYQHSQTPIFLGGLFAYDLVANFIPMDGITLKNDGINCPDYSFYLAEHLITIDHQNQQATLKSFCFAQEEQVNIAKTSLSIAQKLKNIDHVLSIKSASDEVKTNFDDPEFTGIVKALKHHINIGDVFQIVPSRRFSLACPNTLASYAQLKQNNPSPYMFYMNDEDFILFGASPESALKYAPENRQLEIYPIAGSRPRGFDAHGNIDPELDARLELELRLDHKEQAEHLMLVDLARNDIARVCQNGTRKVAELMQVDRYSHIMHLVSRVVGKLRPELDALHAYQACMNMGTLTGAPKIKAMQLIYQFEQQKRHSYGGAVGYLTSDGHFDTCIVIRSAFVQNGIAHVQAGCGEVLDSDPQMEADETRHKAAAVLKAIRQVNTQAK >NZ_CP020007|1575169:1587164|1575169_1578034_+|WP_005687191.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTQKFEMADRFNPSAVEQALYQHWEESGYFKPSENENAPSYCIAIPPPNVTGSLHMGHAFQQTLMDTLIRFNRMEGHNTLWQAGTDHAGIATQMVVERKIAAEEGKTRHDYGREAFINKIWDWKAYSGGTISQQMRRLGNSIDWERERFTMDDGLSNAVKEVFVRLHEEGLIYRGKRLVNWDPKLHTAISDLEVENKESKGSLWHFRYPLANGAKTADGKDYLVVATTRPETMLGDTAVAVHPEDERYQSLIGKTVVLPLANREIPIIADEYVDREFGTGVVKITPAHDFNDYEVGKRHNLPMVNVLTLNANIRDEAEIIGTDGKPLAGYEATIPADYRGLERFAARKKIVADFEALGLLDEIKPHDLKVPYGDRGGVPIEPMLTDQWYVSVKPLADVAIKAVEDGEIQFVPKQYENLYFSWMRDIQDWCISRQLWWGHRIPAWYDAEGNVYVARNEEEVRSKYNLDSAVELKQDEDVLDTWFSSGLWTFFTLGWPEQTKELKMFHPTDVLITGFDIIFFWVARMIMFTMHFVKDENGKPQVPFKTVYVTGLIRDEQGQKMSKSKGNVLDPIDMIDGISLEDLLEKRTGNMMQPQLAEKIAKATRKEFAEGIAAHGTDALRFTLAALASNGRDINWDMKRLEGYRNFCNKLWNASRFVLTNDKLDLSQGEIEFSLADRWIQSEFNRTVETFRSSLSQYRFDLCANAIYEFTWNQFCDWYLELTKPVFANGNAAQIRAASQTLVHVLEKLLRLAHPLIPFITEEIWQKVKGFVGITADSIMLQPFPQVEENGFDLEAEAEIEWLKEVIVAVRNIRAESNIAPSKGLDLLFRNLSAENAKILEKQTALLKAMAKLDNVQVLAANETAPLAVAKLVGNAELLVPMAGFINKEAELARLTKEIEKYQNEVKRIENKLSNEAFVAKAPEAVIAKEREKQAEYQSGLEKIQEQYKAIEAL >NZ_CP020007|1575169:1587164|1585153_1585642_-|WP_005650594.1|DBSCAN-SWA MLNQIIINKLNDQINLEFYSSNVYLQMSAWCSKHGYEGAATFLLRHADEELEHMQKLFNYVSETSGMPILGKIDAPKHDYSSLREVFEITLEHEKLVTSKINELVEVTFESKDYSTFNFLQWYVAEQHEEEKLFSGIIDRFNLVGEDGKGLFFIDRELATLE >NZ_CP020007|1575169:1587164|1578401_1579835_-|WP_079995721.1|DBSCAN-SWA MMITQDFTKPIDSATVLQKIVLDKAQWVKAKEKEFPLSQFKQNIQNSDRSFYDALAKGTHQKPAYILECKKASPSKGLIRAEFNLEEIANVYKHYASAVSVLTDEKYFQGNFEFLPLVRGIVSQPVLCKDFMISEYQVYLARYYQADAILLMLSVVNDETYRVLAELAHSLGMGVLTETSNEEEFERALALGAKIIGVNNRNLHDLTVDLNRVVKLTEKYADRIPADVRIISESGIYNHKQIHQLQKVAHGFLIGSSLMGNQDLNNAVRSVIFGENKVCGLTRAQDVKIVYENGALYGGLIFVEHSKRCVSLRQAQELVTAAPLRFVGVFQNQEIDFIVKIANQLQLYAVQLHGAETEAFITALRQQLPKNTQIWKAISVNIEAQSAVDFTDDLNVDRYIFDSQTSNQQGGTGKTFDWSLIPENLKHKIILAGGISPNNVEQAIAQGCLGLDLNSGVESSAGVKDQEKVRLVFNNIY >NZ_CP020007|1575169:1587164|1586159_1587164_+|WP_074031221.1|DBSCAN-SWA MKKNLIIVLTLGTLPFAQANSITGAGASFPYPIYAKWASLYEKETGNKVNYQSIGSGGGQQQIIAKTVDFGASDDPMKSELLQQHQLVQFPAVIGGIVPVVNLPEIKPGKLKLSGKLLAEIFLGKIKKWNDPDLVALNPTLPLPNKNIIVIHRSDGSGTTFGFTNYLSKVSNDWKNQVGEGKSVKWLTGQGGKGNEGVASYVRQMKYSIGYVEYAYAKQNQLAWISLQNQAGQFVQPSNESFMAAASHAKWHEKAGMGVILTNETGEKSWPITAASFILLNKYSDNPETTKNVLAFFDWAFSRGQDAATELDYVPIPADVVSTIKSQWKTELKQ >NZ_CP020007|1575169:1587164|1583619_1584384_-|WP_005688459.1|DBSCAN-SWA MAIKSVQNQTYPCKHYVFVDGNIFWDKAKSILEQFPDVIPIYLPMNTGKNGILNGAINAVAAFLVEEDIICYLDDDNQLREDHVESLVNVIEQGADFAYSLRSFYDSNHQFICNDDFDSLGNWNTKSDIFVDVKIEDIQKQIHFTFNEVNGHIDTNCYAVPREIAQKTSYSWNTPLIGDRSFLSALKSLGLIGQTSGKYTVKYRADFNKLIAVRRVFPQLSLSDEDNNNISAKILEVINQQNIEYYGGRPWAKE >NZ_CP020007|1575169:1587164|1584640_1585138_-|WP_005656740.1|DBSCAN-SWA MLSENVVKLLNDQMNLEFYSSNLYLQMSAWCDQQGFEGTAKFLSVHAAEEMQHMRKLFTYLNETGSLAVISAIEAPAHEYKSLKEVIEATYEHEKLITSKINELVGKTFEEKDYSAFNFLQWYVEEQHEEEKLFSSILDKLNFLGEDGKGLFLIDKDLGNLSTKA >NZ_CP020007|1575169:1587164|1580926_1581313_-|WP_005662273.1|DBSCAN-SWA MITVFGLKSKLAPRREQLAEVIYNSLHLGLDIPKGKHAIRFLCLEKEDFYYPFDRSDDYTVIEINLMAGRMEGTKKRLIKMLFSELEYKLGIRAHDVEITIKEQPAHCWGFRGMTGDEARDLDYDIYV >NZ_CP020007|1575169:1587164|1581361_1581949_-|WP_005687195.1|DBSCAN-SWA MANILFLDNFDSFTYNLVDQFRVLGHNVTIYRNDCDLEKLVETALNINTLDTILALSPGPGTPSEAGILLPLIERLKNQVPIIGICLGHQALIQAFGGKVVHAGEVLHGKVSRISHDNEAMFKDLANPMPAARYHSLMGQDLPKEFIVNAEYNGIIMAIRHRDLPICAFQFHPESILTVQGSQLLQQSIEWLLNR >NZ_CP020007|1575169:1587164|1578067_1578340_-|WP_005659477.1|DBSCAN-SWA MFRRSGQIVKIDENSLQLATVDVCGVQREVNISLVCTGNPADLLGKWVLVRVGFAMSVIDEDEAKKTQEALITMSQLEHEVGDFLGLNQK |
11 | Acinetobacter_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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